lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 111
lowQualScore : 6 6 6 6 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 88 333 7 00 6 444 55555 666 4
lowQualScore : . . . . .................................................................... . .. ... . .. . ... ..... ... .
lowQualScore : 0 0 0 0 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 44 777 0 44 6 111 99999 222 0
consensus : NTTTTGCATACTAA-AGTATCNTTANT--ATGTCAC-----ATACGT-----ATG-----AACTCGT-CA---GA-ATGC--GTATA-C-ACTCA---AGAGATATGAAAACGCAACACAGGAAGAGATATGA---AA-----ACGC--AACATATTTAGCACG
Reference ( gi|5 ) : ATTTTACACATTGACAATATCCTTAAT--ATGTTAT-----ATACAT-----ATG-----AATGCGT-CA---GA-ATGC--GTATA-C-GCTCA---AGATATATGAAAACGCAACACAGGTGGAGATGTGA---AA-----ACGC--CACATGTTTAGCACG
gi|4 : TTTTGCATACTAA--GTA--CTTATTGAATGTTATTCACTATACATTTTCCATA-----AACCTGT-TA---TA-A-----ATATA-T-ACTCA---AGTGATATGAAAATGCAACACAGGAAGAGATATGA---AA-----ACGA--AACATATTTAGCAC
gi|3 : tgAGTATCATTAGT--ATGT--------ATATGT-----GT------AGTACGT---------ATA-----ATA-C-ACTCA---ACAAATATGAAAACGCAACAAAGGAAGGGAAATGA---TA-----ACGC--AACATATTTAGCACaa
gi|8 : ttaggtgtatgcatatgtgt--ATATCAC-----ATATCT-----ATGTTAGAAACTTGT-CAC--GATATAT--ACATA-C-ATTCA---ACATATATGAAAACGCAATAGACGAAGAGATATGaagtgtatatatccgtatc
gi|10 : ttgcTG-----AACTCGTTCAATTGA-ATGTAAGTACAAC-ACTTA---AGAAATATGAAAACGCAACACAAGAAGAGATATTA---AA-----TTGC--AACACATTTAGCctaaatcaacaaattgtgca
gi|7 : tggaaatcacaat-ATGC--AAAAA-C-ACTCA---AGAGATTTGAAACCGCAACGCAGGAAGATATATGA---AA-----ACGC--AACAAATTTACCACG
gi|6 : atattccattgttatctcattgtatttgtatttgcaaag--GTACA-A-ACTCA---GGAAATATTAAAACGCAACACAGGAAGAGATATGA---AA-----ACGC--AAAATATTTAGCACa
gi|1 : tgtattgcagttgatatgacacgagatcatactatgtgattgtcgttttcaatgag--GTATG-CCACTAA---GAAGATATGAAAACGTAACACAGACAGAAATATAA---CA-----ACGC--AACATATTTAGCACGa
gi|19 : ctgcatatatttccttattgttaaca--GTATA-C-ATTCA---AGAGATATGAAAATTCAACACAGaatattcatatccgtccagatacagaattattatctgttgattttatagttgttataggttgtaaatgaat
gi|12 : gatattcagtaagttcataTATA-C-ACTCA---TAATACATGAAAACGTAACACAGGAAGAGATATGG---AA-----ATGT--AATATATATA
gi|23 : atgtgcctttgacaatttcagtgaTGTA-C-ACTCG---GGAGATATGAAAACGCAACACA
gi|2 : aATA-C-ACTCA---AGAGATATGAAAATGCAACACAG-----GACGTGA---AATGATGACGC--AGCATATTCA
gi|24 : aaactcacacactttgatctatacactactggatataagttgatacaATA-C-ACTCA---AGATATATGAAAACGCAACACAGtaacgagtgtatatatgtttatccataccaaactgtaa
gi|18 : ATA-C-ACACA---AGATATATGAAAACGCAACAC--GTGAAGA
gi|11 : ATA-C-ACTCACTAAGAAATATGAATACGAAATACAGGAAGAGATATAA---AA-----GCAC--AACAAATTTaatagctcatcatagctagcatga
gi|22 : atctttcctttaacagttatcaATA-C-ACTCA---AGAGATATGAAAATGCAACACAgctcgagtg
gi|15 : gtcatttgatatagtcccaTA-C-ACTCG---AGAGATATGAAAACGCAACACAGGAAAAGAAATTA---AA-----ACGC--AACAT
gi|16 : gTA-C-ATTCA---AGAGGTATGGATATGCACCACAGGAAGAAATGTGC---AA-----GCGT--AGCATATT-AGCACGttacatatttag
gi|14 : A---AGATATATGAAAAGAGAACATGGGAAGAGATATGA---AA-----AGGG--AACATATTTAGCACG
gi|9 : aacgtaacacagg---AGATATTTTAAAGCACTACATAGGAAGAGATATGA---AA-----ACACAATATATGTTTAagt
gi|13 : ctttgtgagtcattatcaaatattttgtggtaccaagtttATATATTAAA-CGTTACTCAGGAAGAGATATGA---AA-----ACGC--AACATATTTAGAACtaacaagt
gi|17 : cctaactttatatagacctacatacatATGGAAGCGCAACACAGGAAGAGAT-TGA---AA-----AAAA--AACATATTTtga
gi|21 : tataatactcatgcgagaaGCAACGCAGGAAGAGATATGACAAAA-----ACGC--CACATATTAAGCACG
gi|25 : AGATTTGA---AA-----ACGT--AACATGTTTAGCACGagtgt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): AAGTGATCAGAAAATGCAACATATTTAGCACAAGTGTACATATCTTCTTAT
Alignments
lowQualScore : 2222222 11 4444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 6666666 7 1 1 11 5555555555555555555555555555555555555555555 66 777 2 666 333 0 22 333 555555
lowQualScore : ....... . . . .. ........................................... .. ... . ... ... . .. ... ......
lowQualScore : 3333333 3 0 0 00 6666666666666666666666666666666666666666666 11 999 1 000 333 2 66 222 222222
consensus : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGT----CAC-ATACGT-----ATG-----AACTCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
Reference ( family-4018 ) : NTTTTGCATAC-TAA-AGTATCNTTANT--ATGT----CAC-ATACGT-----ATG-----AACTCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
gi|1 : --GTATG---CCACTAA---GA---AGATATG--AAAACGTAACACAGACAGAAATATA---ACAACGCA------ACATATTTAGCACG
gi|10 : ctgcatatatttccttattgttaacaTG-----AACTCGTTCAATTGA-ATGTAAGTACAA--C-ACTTA---AG---AAATATG--AAAACGCAACACAAGAAGAGATATT---AAATTGCA------ACACATTTAGCaatattcatatccgtccagatacagaattattatctgttgattttatagttgttataggttgtaaatgaat
gi|11 : tggaaatcacaatATA---C-ACTCACTAAG---AAATATG--AATACGAAATACAGGAAGAGATATA---AAAGCACA------ACAAATTT
gi|12 : atctttcctttaacagttatcaTATA---C-ACTCA---TA---ATACATG--AAAACGTAACACAGGAAGAGATATG---GAAATGTA------ATATATATAgctcgagtg
gi|13 : atgtgcctttgacaatttcagtgaAAACGTTACTCAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGAAC
gi|14 : cctaactttatatagacctacatacatatatattAACGTAACACAGGAAGATATATG---AAAAGAGA------ACATtga
gi|14 : A---AG---ATATATG--AAAAGAGAACATGGGAAGAGATATG---AAAAGGGA------ACATATTTAGCACGgggaagagatatgaaaagggaacatatttagcacgagt
gi|15 : aacgtaacacaggTA---C-ACTCG---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAAAGAAATT---AAAACGCAACATTTACATATTTAGagt
gi|16 : gTA---C-ATTCA---AG---AGGTATG--GATATGCACCACAGGAAGAAATGTG---CAAGCGTA------GCATA-TTAGCACG
gi|17 : TATAA--T-ACTCATG-CG---AGAAATG--GAAGCGCAACACAGGAAGAGAT-TG---AAAAAAAA------ACATATTT
gi|18 : ATA---C-ACACA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACGTGAAGAAAT--------AGCTCA------TCATAGCTAGCATG
gi|19 : --GTATA---C-ATTCA---AG---AGATATG--AAAATTCAACACAGa
gi|2 : gatattcagtaagttcataATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAATGCAACACAGGACGTGAAATG---ATGACGCA------GCATATTCA
gi|20 : aaactcacacactttgatctatacactactggatataagttgatacaAAGTGATCAG---AAAATGCA------ACATATTTAGCACtaacgagtgtatatatgtttatccataccaaactgtaa
gi|21 : GCAACGCAGGAAGAGATATGACAAAAACGCC------ACATATTAAGCACGaagtgtacatatcttcttat
gi|22 : ATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAATGCAACACAagtgt
gi|23 : gtcatttgatatagtcccaTGTA---C-ACTCG---GG---AGATATG--AAAACGCAACACA
gi|24 : aATA---C-ACTCA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACAG
gi|25 : AGATTTG---AAAACGTA------ACATGTTTAGCACG
gi|3 : TGCATATGTGT-AGTATCATTAGT--ATGT--------ATATGT-----GT--------------------A-GTAC--GTATAATAC-ACTCA---AC---AAATATG--AAAACGCAACAAAGGAAGGGAAATG---ATAACGCA------ACATATTTAGCACag
gi|4 : ttaggtgtaTTTTGCATAC-TAA--GTA--CTTATTGAATGTTATTCACTATACATTTTCCATA-----AACCTGT-TA---TA-A-----ATATA---T-ACTCA---AG---TGATATG--AAAATGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGAA------ACATATTTAGCACaagtgtatatatccgtatc
gi|5 : tgTTTTACACAT-TGACAATATCCTTAAT--ATGT----TAT-ATACAT-----ATG-----AATGCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-GCTCA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACAGGTGGAGATGTG---AAAACGCC------ACATGTTTAGCACGaa
gi|6 : a--GTACA---A-ACTCA---GG---AAATATT--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------AAATATTTAGCAC
gi|7 : tgtattgcagttgatatgacacgagatcatactatgtgattgtcgttttcaatgagCATTGTT--ATCT----CAT--TGTAT-----TTG-----TATTTGC-AA---AG-ATGC--AAAAA---C-ACTCA---AG---AGATTTG--AAACCGCAACGCAGGAAGATATATG---AAAACGCA------ACAAATTTACCACGa
gi|8 : atattc--ATAT----CAC-ATATCT-----ATGTTAGAAACTTGT-CAC--GATATAT--ACATA---C-ATTCA---AC---ATATATG--AAAACGCAATAGACGAAGAGATATG---CTAAATCA------ACAAATTa
gi|9 : ttgcCA---AGTTTAGATATTTTAAAGCACTACATAGGAAGAGATATG---AAAACACA------ATATATgtgca
Alignments
lowQualScore : 22222 11 4444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 44444 7 1 1 11 5555555555555555555555555555555555555555555 66 777 2 666 333 0 22 333 555555
lowQualScore : ..... . . . .. ........................................... .. ... . ... ... . .. ... ......
lowQualScore : 00000 3 0 0 00 6666666666666666666666666666666666666666666 11 999 1 000 333 2 66 222 222222
consensus : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGT----CAC-ATACGT-----ATG-----AACTCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
Reference ( family-4018 ) : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGT----CAC-ATACGT-----ATG-----AACTCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
gi|1 : --GTATG---CCACTAA---GA---AGATATG--AAAACGTAACACAGACAGAAATATA---ACAACGCA------ACATATTTAGCACG
gi|10 : ctgcatatatttccttattgttaacaTG-----AACTCGTTCAATTGA-ATGTAAGTACAA--C-ACTTA---AG---AAATATG--AAAACGCAACACAAGAAGAGATATT---AAATTGCA------ACACATTTAGCaatattcatatccgtccagatacagaattattatctgttgattttatagttgttataggttgtaaatgaat
gi|11 : tggaaatcacaatATA---C-ACTCACTAAG---AAATATG--AATACGAAATACAGGAAGAGATATA---AAAGCACA------ACAAATTT
gi|12 : atctttcctttaacagttatcaTATA---C-ACTCA---TA---ATACATG--AAAACGTAACACAGGAAGAGATATG---GAAATGTA------ATATATATAgctcgagtg
gi|13 : atgtgcctttgacaatttcagtgaAAACGTTACTCAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGAAC
gi|14 : cctaactttatatagacctacatacatatatattAACGTAACACAGGAAGATATATG---AAAAGAGA------ACATtga
gi|14 : A---AG---ATATATG--AAAAGAGAACATGGGAAGAGATATG---AAAAGGGA------ACATATTTAGCACGgggaagagatatgaaaagggaacatatttagcacgagt
gi|15 : aacgtaacacaggTA---C-ACTCG---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAAAGAAATT---AAAACGCAACATTTACATATTTAGagt
gi|16 : gTA---C-ATTCA---AG---AGGTATG--GATATGCACCACAGGAAGAAATGTG---CAAGCGTA------GCATA-TTAGCACG
gi|17 : TATAA--T-ACTCATG-CG---AGAAATG--GAAGCGCAACACAGGAAGAGAT-TG---AAAAAAAA------ACATATTT
gi|18 : ATA---C-ACACA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACGTGAAGAAAT--------AGCTCA------TCATAGCTAGCATG
gi|19 : --GTATA---C-ATTCA---AG---AGATATG--AAAATTCAACACAGa
gi|2 : gatattcagtaagttcataATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAATGCAACACAGGACGTGAAATG---ATGACGCA------GCATATTCA
gi|20 : aaactcacacactttgatctatacactactggatataagttgatacaAAGTGATCAG---AAAATGCA------ACATATTTAGCACtaacgagtgtatatatgtttatccataccaaactgtaa
gi|21 : GCAACGCAGGAAGAGATATGACAAAAACGCC------ACATATTAAGCACGaagtgtacatatcttcttat
gi|22 : ATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAATGCAACACAagtgt
gi|23 : gtcatttgatatagtcccaTGTA---C-ACTCG---GG---AGATATG--AAAACGCAACACA
gi|24 : aATA---C-ACTCA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACAG
gi|25 : AGATTTG---AAAACGTA------ACATGTTTAGCACG
gi|3 : TGCATATGTGT-AGTATCATTAGT--ATGT--------ATATGT-----GT--------------------A-GTAC--GTATAATAC-ACTCA---AC---AAATATG--AAAACGCAACAAAGGAAGGGAAATG---ATAACGCA------ACATATTTAGCACag
gi|4 : ttaggtgtaTTTTGCATAC-T-A-AGTA--CTTATTGAATGTTATTCACTATACATTTTCCATA-----AACCTGT-TA---TA-A-----ATATA---T-ACTCA---AG---TGATATG--AAAATGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGAA------ACATATTTAGCACaagtgtatatatccgtatc
gi|5 : tgTTTTACACAT-TGACAATATCCTTAAT--ATGT----TAT-ATACAT-----ATG-----AATGCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-GCTCA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACAGGTGGAGATGTG---AAAACGCC------ACATGTTTAGCACGaa
gi|6 : a--GTACA---A-ACTCA---GG---AAATATT--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------AAATATTTAGCAC
gi|7 : tgtattgcagttgatatgacacgagatcatactatgtgattgtcgttttcaatgagCATTGTT--ATCT----CAT--TGTAT-----TTG-----TATTTGC-AA---AG-ATGC--AAAAA---C-ACTCA---AG---AGATTTG--AAACCGCAACGCAGGAAGATATATG---AAAACGCA------ACAAATTTACCACGa
gi|8 : atattc--ATAT----CAC-ATATCT-----ATGTTAGAAACTTGT-CAC--GATATAT--ACATA---C-ATTCA---AC---ATATATG--AAAACGCAATAGACGAAGAGATATG---CTAAATCA------ACAAATTa
gi|9 : ttgcCA---AGTTTAGATATTTTAAAGCACTACATAGGAAGAGATATG---AAAACACA------ATATATgtgca
blockSeqs : TGAC T C T GA TATTCACTATACATTTTCCATAAACCTGTTATA AA ATA . CTA TTT TT ACA ACATTT
blockSeqs : TA . C A . CACATATCTATGTTAGAAACTTGTCACGAT . A . TG . . . .
blockSeqs : A T . TATATACATATGAATGCGTCAGA . A . . . . . .
blockSeqs : . CATTGTATTTGTATTTGCAAAG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : CATATATATATGAACTTGTNANA********************
originalCons : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGT----CAC-ATACGT-----ATG-----AACTCGT-CA---GA-ATGC--GTATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
finalCons : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGTCATATATATATGAACTTGTNANA--------------------ATGC--GTATA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
Alignments
lowQualScore : 22222 11 11111111 11111 4444444444444444444444444444
lowQualScore : 44444 7 1 1 11 1 88888888 44444 2222222222222222222222222222 3 22 777 2 888 333 22 333 555555
lowQualScore : ..... . . . .. . ........ ..... ............................ . .. ... . ... ... .. ... ......
lowQualScore : 00000 3 0 0 00 7 00000000 33333 4444444444444444444444444444 1 88 555 0 999 222 55 222 222222
consensus : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGTCAT-----ATATAT-----ATG-----AACTTGTC--AN----AATGC--G-TA--TA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
Reference ( family-4018 ) : NTTTTGCATAT-TGA-AGTATCNTTANT--ATGTCAT-----ATATAT-----ATG-----AACTTGTN--AN----AATGC--G-TA--TA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGCACG
gi|1 : TTGTT--AA----CA-----G-TA--TG---CCACTAA---GA---AGATATG--AAAACGTAACACAGACAGAAATATA---ACAACGCA------ACATATTTAGCACG
gi|10 : ctgcatatatttccttaTG-----AACTCGTTCAATTG--AATGTAAG-TA--CAA--C-ACTTA---AG---AAATATG--AAAACGCAACACAAGAAGAGATATT---AAATTGCA------ACACATTTAGCaatattcatatccgtccagatacagaattattatctgttgattttatagttgttataggttgtaaatgaat
gi|11 : tggaaatcacaatA--TA---C-ACTCACTAAG---AAATATG--AATACGAAATACAGGAAGAGATATA---AAAGCACA------ACAAATTT
gi|12 : atctttcctttaacagttatca-TA--TA---C-ACTCA---TA---ATACATG--AAAACGTAACACAGGAAGAGATATG---GAAATGTA------ATATATATAgctcgagtg
gi|13 : atgtgcctttgacaatttcagtgaCAT-----ACATAT-----ATA-----------TT--AA----A---C--G-T--------T-ACTCAGGAAG---AGATATG--AAAACGCAACATA
gi|13 : cctaactttatatagacctaAAACGTTACTCAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------ACATATTTAGAACtttagaactga
gi|14 : cctaactttatatagacctacatacatatatattAACGTAACACAGGAAGATATATG---AAAAGAGA------ACATtga
gi|14 : A---AG---ATATATG--AAAAGAGAACATGGGAAGAGATATG---AAAAGGGA------ACATATTTAGCACGgggaagagatatgaaaagggaacatatttagcacgagt
gi|15 : aacgtaacacagg--TA---C-ACTCG---AG---AGATATG--AAAACGCAACACAGGAAAAGAAATT---AAAACGCAACATTTACATATTTAGagt
gi|16 : g--TA---C-ATTCA---AG---AGGTATG--GATATGCACCACAGGAAGAAATGTG---CAAGCGTA------GCATA-TTAGCACG
gi|17 : -TA--TAA--T-ACTCATG-CG---AGAAATG--GAAGCGCAACACAGGAAGAGAT-TG---AAAAAAAA------ACATATTT
gi|18 : A--TA---C-ACACA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACGTGAAGAAAT--------AGCTCA------TCATAGCTAGCATG
gi|19 : --G-TA--TA---C-ATTCA---AG---AGATATG--AAAATTCAACACAGa
gi|2 : gatattcagtaagttcataA--TA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAATGCAACACAGGACGTGAAATG---ATGACGCA------GCATATTCA
gi|20 : aaactcacacactttgatctatacactactggatataagttgatacaAAGTGATCAG---AAAATGCA------ACATATTTAGCACtaacgagtgtatatatgtttatccataccaaactgtaa
gi|21 : GCAACGCAGGAAGAGATATGACAAAAACGCC------ACATATTAAGCACGaagtgtacatatcttcttat
gi|22 : A--TA---C-ACTCA---AG---AGATATG--AAAATGCAACACAagtgt
gi|23 : gtcatttgatatagtccca-TG--TA---C-ACTCG---GG---AGATATG--AAAACGCAACACA
gi|24 : aA--TA---C-ACTCA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACAG
gi|25 : AGATTTG---AAAACGTA------ACATGTTTAGCACG
gi|3 : TGCATATGTGT-AGTATCATTAGT--ATGT------------AT-----ATG---------TGT---------AGTAC--G-TA--TAATAC-ACTCA---AC---AAATATG--AAAACGCAACAAAGGAAGGGAAATG---ATAACGCA------ACATATTTAGCACag
gi|4 : ttaggtgtaTTTTGCATAC-T-A-AGTA--CTTATTGAATGTTATTCACTATACATTTTCCATA-----AACCTGTT--AT----AA-----A-TA--TA---T-ACTCA---AG---TGATATG--AAAATGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGAA------ACATATTTAGCACaagtgtatatatccgtatc
gi|5 : tgTTTTACACAT-TGACAATATCCTTAAT--ATGTTAT-----ATACAT-----ATG-----AATGCGTC--AG----AATGC--G-TA--TA---C-GCTCA---AG---ATATATG--AAAACGCAACACAGGTGGAGATGTG---AAAACGCC------ACATGTTTAGCACGaa
gi|6 : aTCAT-----AC-TAT-----GTG-----A--TTGTC--GTTTTCAATGA--GGTA--CA---A-ACTCA---GG---AAATATT--AAAACGCAACACAGGAAGAGATATG---AAAACGCA------AAATATTTAGCAC
gi|7 : tgtattgcagttgatatgacacgagaCATTGTT--ATCTCAT------TGTAT-----TTG-----TATTTGCA--AA----GATGC--A-AA--AA---C-ACTCA---AG---AGATTTG--AAACCGCAACGCAGGAAGATATATG---AAAACGCA------ACAAATTTACCACGa
gi|8 : atattc--ATATCAC-----ATATCT-----ATGTTAGAAACTTGTC--AC----GATAT--A-TACATA---C-ATTCA---AC---ATATATG--AAAACGCAATAGACGAAGAGATATG---CTAAATCA------ACAAATTa
gi|9 : ttgcCA---AGTTTAGATATTTTAAAGCACTACATAGGAAGAGATATG---AAAACACA------ATATATgtgca