lowQualScore                  :                           2222       777777777777777777777    33333     1111     2222                            1   333333333333        1111111          555555555                  111                  111111                                                                                         2222222        222222222222222222                                                                                                                            111111111111                       444444444444444                                      22     1   1    222222222222222222222                 11    222222                                  1                
lowQualScore                  :                           0000  6    111111111111111111111    33333     4444     6666      5            2     55 6   999999999999    66  6666666    66    000000000  55 99999    3 3 555    3             444444    3  3        3  9   1  9999       11          3                   666      0          9999999  3   3 666666666666666666    5  4  0 0 3   2  333    3               1   1     6666  3       888888 2        66             3    3    3      0       777777777777 555              3    000000000000000  55         0               5    2   66     5   7    999999999999999999999  1              11    333333 4       8 1   77      66         7     6          
lowQualScore                  :                           ....  .    .....................    .....     ....     ....      .            .     .. .   ............    ..  .......    ..    .........  .. .....    . . ...    .             ......    .  .        .  .   .  ....       ..          .                   ...      .          .......  .   . ..................    .  .  . . .   .  ...    .               .   .     ....  .       ...... .        ..             .    .    .      .       ............ ...              .    ...............  ..         .               .    .   ..     .   .    .....................  .              ..    ...... .       . .   ..      ..         .     .          
lowQualScore                  :                           0000  0    555555555555555555555    55555     2222     8888      0            1     66 7   333333333333    11  6666666    11    666666666  55 11111    6 6 111    3             888888    1  1        3  3   0  3333       00          3                   444      5          7777777  6   6 555555555555555555    0  9  4 4 1   3  888    8               0   8     5555  1       888888 3        11             2    1    1      5       111111111111 888              6    000000000000000  55         1               0    2   66     2   7    666666666666666666666  7              00    000000 6       2 2   00      00         0     0          
consensus                     :                       AGTGCATATCTATTTGTTCAACA-GTTATTATCAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAAT--TTTTTA-TTGATTTAAACTNTTACA-GTTTCT----------C-ATCA--TAT------AAAA--CATATAT------AC--A-----ATAC-A-TTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAAA-TTTT-AA-CAATTACA-AANGTTCAACATCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTA---ATTTTATTATGTTCTAT-N----TTA-ATT-AT-TA-AAAAN------ANTCAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTANTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT----TA-CATAATG------CNTCTGAAAGA-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA---AA-NC---G---AC--ATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTACTTCTTATTTC-CTNTNT----GTTT--GACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATNNCTACAANNTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
Reference ( gi|1 )            :                       AGTGTGTTTCCATTT--TCAACGCATTACAATT---TATAGTGTGTAGAA----GAAGAAT-TTTTTTA-TTGATTTAAACTATTACA-GTATCT----------A-ATCA--TAT------AAAA--CATA-A-------AC--A-----ATAC-A-TAT-ACGT-GACAAATCAATGCGCACA-TTTT-AA-CAATTACA-AATGTTCAACATATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTA---ATTTTATTATGTTCTAT-T----GTA-ATT-AT-TA-AAAAA------AATCAACATTAAAGGAGGATGAA-CACTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT----TA-CATAATG------CTTCTGAAAGG-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA---AA-AT---A---AC--ATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTAATAATTTTACATCTGATTTGACTGTTT----GTTT--GACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CGTCTTCAACGTCATTTTTACAATATATATTATATGGCATCCAGTTTTATT
gi|4                          :                       AGTGCATATCTATTTGTTCAACA-GTTATTATTAGCTATA-TAC-TAGAA----GAAG------TTTTA-TTGATTTTAAGTCATACATGT-TCTCNNNNNNNNNN-NNNN--NNN------NNNN--NNNN-N-------NC--ATGTTCATAC-A-TGT-TCGT-GCCAAATCAATGCAAAAG-TTTT-AA-CAATTACA-AA----------------AG---TCGGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGATT---ATTTCATTATGTTGTAT-A----TTA-ATT-AT-------AA------AGT----GTTAAAT----ATCAA----------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT----TA-CAGGATG------CTTCTGAAAGA-AGTTTACTAAAATGTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA---TG-TC---C---AC--GTGTTAGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTACTTCTTATTTG-TTCTTT-----TTT--GA-A-ATTAATACGAA--GGTTTATT------CCTGTTCGAAGT
gi|15                         :                                                    tgTC---TATAATATGAATAAATAGGAAGAATATTTTTTA-TTGATTTAAACTATTACA-GTTTCT----------C-ATCA--TAT------AAAA--CATATAT------AC--A-----ATAC-A-TTG-ACAT-GACAATTCAATGCACACA-TTTT-AA-CAA
gi|5                          :                                  atgcatttcttttatatgaggcaatattctttatTAGAA----AAAAA------TTTA-TTGATTTTAACTTTTACA-GGTTCT----------C-ATCattttagccacat
gi|2                          :                            gtgcatatttatttgtttaacagttaacataagctatatacAGAG----GAAGAAC-ATTTTTAATTGATTTAAACTATTACA-GTTTCT----------C-ATCA--TAA------AAAAAACATATAT------AC--A-----ATAC-A-TTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAAA-TTTT-AA-CAATTACA-AATGTTCAACATAAACATAGCACTCACTCAC--TTTTTTGAGTAAGAAGGTA---ATTTTATTATGTTCTAT-C----TTA-ATT-AT-AA-AAAAA------AATCAATATCAAAGGAGGATGAA-CACTTATCTGTTGTTTATTATGGAACGCCTTT----TA-CATAATG------CTTCTGAAACG-AATTTACTAAAATCTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAGGAG-----AA---AA-ATTTCA---AC--ATGTTAAGTCTCTGTATATAAAATC-GTTTAATATATTTACTTCTTATTTCACTATCT----GTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacacacaaaacatgtacgtatgtacgtgccaaatcaatgcaacagttttaaaattacaaacgtttagtcatattttacgagtaagaaggttatttcattatgttgtatattaattataaagtgttcaatatcaagttgtttattatagagcttcttttacaggatgcttctgaaagacatttactaaaatgtatgatttatttattgtttgttgattgaataagagacaaaaatgtccaatgctgggcctctgtgtataaaatcgtttgatataattacttcttattttttcttatttgaaattta
gi|7                          : aatgtaaattctgaataattagatcagtgatagcgagttaggggagtgtttagtgttctcagataagaAAAA----GAAGAAT-TTT--TA-TTGATTTAAACCTTTAAA-GTTTCT----------C-ATCAACTATAACATAAAAA--CATA-AATTATAGAC--A-----ATAC-A-TTT-ACCT-AATAAATCAATGCACAAA-TTTT-AA-CAATAACA-AAAGTTTAACATATACATAGCTCTCAATCACA--TTTTCGAGAAAGAAGGTAATTATTTTATTATGTTCTAT-A----TTA-ATT-ATATA-AAAAA------ATTCAATATCAAAGGAAGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATAGAACTTCTTT----TA-CATAATG------CTTCTGAAAGT-AGTTTACTAAACTTTGTG-ATTT-CTTTATTGTTTCTT------------G---ATTGGAGAAGGAATAAAAA---AA-
gi|12                         :                atacttatttctatatagttataccttaaactacatgtatgtattgatatagaAGAA----GAAGA-T-GTTTTTA-TAGATTTAAACTATTACA-GTTTCT----------C-ATCA--TAT------AAAA--CATATAT------AC--A-----ATAC-A-TTT-ACAT-GACAAATCAATGCACAAA-TGTT-AA-CAATATCA-AATGTTCAACATATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAATAATAAGCTT---ATTTCATTATGTTCTAT-T----TAA-ATT-AT----AAAAC------AATCAATATCAAAGGAAGATAAA-CACTTAATGGCTGTTTATTATGGAAt
gi|3                          :                                                                                     gaTTTTA-TTTACTCCAACTATTACA-TTTTCT----------C-ATCA--TA---------------------------C--A-----ATAC-ACTA--ACCT-GACAAATATATGCTAATG-TTTT-AA-CAATTACA-AAAGTTCAACATCTCCATAACTCTCAATCAAA-TTTTTCGAGTAATTAAGTA---AGTCTAATGTGTTTT-T-T--------ATT-GA-TA-ATAGAGTTTGCAAT-AACAT---AGGAGGGTAAAACAATTAGTGATTGTTTATAATTAAACGTCTTT----TA-CAATATG------CCTCTGTTAGA-AATTTACTAAAATTTATG-ATTTGCTTTCTCGTTTGTTTACAGTTTCTTGGTTTACTGAAGGAGAGATAAAAA---AATATC--A---AC--ATGTTAGATGTCCGTGTATAACAAC-GTTTGATATATTAACGTTT--TTTAA-TGTCTCTCAGTTT-----ATGTT-AAACATAAT
gi|13                         :                                                                                         TTA-TTGATTTAAACTATAACA-TTTTTC----------T-ATCG--TAT------AAAA--CATATAT------AC--A-----ATAC-A-TTTTAGGT-GACAAATCAATGCACAAA-TTTA-AA-CAATTACA-CATGTTTAACATATACATAGCTCTCACTCACA-TTTTTCAAGTAAGAAGGTA---ATTTTATTATGTTCTAT-T----TTA-ATT-A--TA-AAAAC------AATCAATATAAAAGacctcgtacaagatgaattattgaaaaaaaataatgaagtttagtttaatgtttt
gi|6                          :                                                                                                 TTTAAATTCATATA--TATTTT---------ACATCA--TAC------AAAA--CATA-T-------ATGAA-----ATACGA-T-T-ACGC-GACAAATCAATACAAAAA-GTGT-AA-CGTTTATACAAT-TTCAAAACCTACATTGCCCTCAATCACA-TTTT
gi|5                          :                                                                                                                                    CA--CAC------AAAA--CATG-T-------AC--G--------T-A-TGT-ACGT-GCCAAATCAATGCA-ACAGTTTT-AA--AATTACA-AACGTT-----------TAG-------TCATA-TTTTACGAGTAAGAAGGTT---ATTTCATTATGTTGTAT-A----TTA-ATT-AT----AAAGT------GTTCAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT----TA-CAGGATG------CTTCTGAAAGA-CATTTACTAAAATGTATG-ATTT-ATTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGAC---AA---AA-AT---G---TCCAATGCTGGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTACTTCTTATTT--TTTCTT----ATTT--GAAAT-TTAcaataacaactgaggattaacgcttgttgtttgtttatgatgtcgtactttatataaagcatcggaaagaaattgactaatatttgtaatagctgtactatttattgattggagaagacataaacatttcaacatgttaggtctccgtgtataaaatcgtttggtatatttacttctagtttctctatataacggacatattaaaacaatatggcgttcgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|9                          :                                           gtgcatatttatttgtttaacagttaacataagctatatactagaaaaaaatttattgattttaacttttacaggttctcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca--A-----ACAC-A-TTT-ACGT-GGCAATTTAATGCGCAAG-TTTTTAA-CAGTTATA-AAAGTTCAAATTCTACATATCACTCGATCATA-TTCTTCGAATAAGGAGGTA---ATTTTATTATGTTTTAT-A----CTA-ATA-AT----AAAAT------GTTCAATATTAAAGCAGAATGAA-CATTCAATGATTGTTTATTATGAAACGTTTTTGATATAGCACAATG------CTTCTGAAAGA-AATTTACCAACATTTATT-ATTC-CTTTATTGTCTGTT------------G---ATTATAGCAGAGATAAAAA---AA-TC---C---AC--TTCTTAAACATTTGTTCCTAATATCAGTTTAAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         -----ATGC-A-TTT-ACATTAACAAGACAAAG-------TTTT-AA-CAATTACA-AAAGTTCAAAATCTACATAGCTCTCAATCACCTTTTTTTGAGTAAGAAGAAA---AATTAAATATGTTCTAT-A----TCA-ATT-A---A-AAAAC------AATCAATATCAttgtgcactataagctaaaatgatattcaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                     atT-ATGT-GACAAATCAATGCAAATG-TTTT-GA-TAATTATA-ATAGTTAAA-ATCTACATAAATCTCAATCACA-GTTTTTAGGTAAGAAGATA---ATTCAAATATCATCTACAT----GTATATTGAT-TATACAGT------TTTCAACATCAAATGAGGGTAAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGTAACGTCTTT----TA-CATAATGATACTACCTCTGAACGA-CAGTTACTAAAATTT-TA-AT----TGTATAGTTTGTG------------T---ATTGATAAAGTGATCAATATTTA-------A---AC--ATGTTAGCTTTCTGTTTATAAcgttttttacctaatgcatatgaaaggaaatacattaatgtttgttgattgaaaaattgatgaaaatctcctcatgtaatatatctgagtattaaatcgtttgattatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                    tCAATGCAAACT-TTAT-AAACAATTACA-AAATTGCAAAAACTACATAGCTCCCAATAACA-TTTTTTAAGTATGTAGGTA---ATTGTAATATGTTTTTT-TTTACATA-ACT-TT-TG-CAGTA------A--CAAAAATAA------ATGAA-TACTTACTG---------TATG------CCTA----CA-CATAAAG------CATCTGAAAAA-AAAAAATGAAAA---ATGAATTT-CTTgtatcaatgctttttggtccagttataagattgatttccaacacttgaattatcgaaaaaagtgaacaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCAATATTAAAGGAGGATGGA-CACTTACTGGTTGTTT--TATGGAATATCTTA----TA-CATTATG------AGCATGAAACACAATTT-CTGAAATTGATG-ATTT--TTTATTGTTTGCT------------G---TTTGAAGAAGAGA-----A---AA-AT---GTCCAC--ATGTTAAGTCTTTGTGTATACAATC-GTTTGATATATATATTTCTTATTTCTCTGTGT----GTTTATGACATATTAAAACAAAATCG--TATT------CATCTTCAATGACATTATTACAATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attaatgatagcgtttTCAATAACAACTGAGGATTAA-CGCTTGTTGTTTGTTTATGATGT--CGTACTT----TA-TATAAAG------CATCGGAAAGA-AATTGACTAATATTTGTA-ATAG-CTGTACTATTTATT------------G---ATTGGAGAAGACATAAACA---TT-TC---A---AC--ATGTTAGGTCTCCGTGTATAAAATC-GTTTGGTATATTTACTTCTAGTTTCTCTATAT----AACG--GACATATTAAAACAATATGG--CGTT------CGACTaggcaaatacgatcgtgtcattaagtatttccc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                 tttaaattcatatatattttacatcatacaaaacatatatgaaatacgattacgcgacaaatcaatacaaaaagtgtaacgtttatacaatttcaaaacctacattgccctcaatcacatttTCAATATCAAAGGA--------------TTGGTAGTCTATTATAGAACCTCCTT----TA-CGTAATG------CCTCTGAACGA-AATTGATTAAAGTGTATT-ATTT-CTTTAT--ATTGTT------------G---ATTGACGAAGAGATAAAAA---attaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtttACGTTTTT----TA-CCTAATG------CATATGAAAGG-AA-------------ATA------CATTAATGTTTGTT------------G---ATTGAAAAATTGATGAAAA---TC-TC---C---TC--ATGTAATATATCTGAGTATTAAATC-GTTTGATTAT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                          atatgcatttacattaacaagacaaagttttaacaattacaaaagttcaaaatctacatagctctcaatcacctttttttgagtaagaagaaaaattaaatatgttctatatcaattaaaaaacaatcaatatcT----TA-CATAAAG------CTTCTAATAGG-AATCTAATACGATGAATG-ATTC-CATCA--ATTTGTT------------G---AGTAAAGGAGGGTTGAAAG---CT-TC---A---AC--ATGTTg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTT----GT----GGCATATTAAAACAAAACGG--TATT------TATCTTAAATATC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aATGG--TATTTTATACCACCTTCAATGCCATGTCTACAAGCTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATTcagattaccaaaaaggcaaatgtgttcgtttatgtatt
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAAAAGAGGAAGTTTTGTTGACTTAGACAATTATAGTTTCTCATTATAAAAATACAATATATATATACATGTATATACAATCCAATACATTTACTTAAAATGTCGATGCAAAAGTTTTAAAAAAATACAACAGTTAAAACAATTCTACAATGCTCTCAA
Unaligned ( gi|21 ): ACCATTACGGTTTCTCATCACGAAAAAAACATGCATACAATACA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                    22222222             1111       222    1111     222222                                        1111                         44444444444444444                                                                                                                                                                    333                                                                                                                                       111111111111                       2222222222                                                      222                                      111111                      111                          
lowQualScore                  :                                                                                            4   3   55555555     8       0000   44  222    0000     000000    77             1     3           44 1111 2  999999  44    555    00000000000000000  77777        2    2              1  777 2   444 5 999  777777   555      1 2  2   4 33 4                   3                      7777777        555 0   1        222    111 888             1   1  444    3               0   0     33  555       888888 1        2 2             2    2    2              555555555555 555                   8888888888                           4               66         444  1 6 1  66   4  0              99    999999               222    888                          
lowQualScore                  :                                                                                            .   .   ........     .       ....   ..  ...    ....     ......    ..             .     .           .. .... .  ......  ..    ...    .................  .....        .    .              .  ... .   ... . ...  ......   ...      . .  .   . .. .                   .                      .......        ... .   .        ...    ... ...             .   .  ...    .               .   .     ..  ...       ...... .        . .             .    .    .              ............ ...                   ..........                           .               ..         ...  . . .  ..   .  .              ..    ......               ...    ...                          
lowQualScore                  :                                                                                            0   2   88888888     8       4444   66  444    6666     111111    44             0     3           66 7777 3  666666  66    888    00000000000000000  11111        9    9              1  333 7   777 3 333  777777   000      0 9  9   3 99 3                   1                      2222222        888 2   0        111    111 333             4   4  555    2               2   8     99  000       222222 0        9 9             4    9    9              888888888888 444                   8888888888                           4               99         666  0 6 7  99   3  1              22    222222               777    777                          
consensus                     :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACTATTACA-GTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT--AAAAACGNT---CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA---NNT--CNACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACAA--TATATTATAAGGCATCCAGTTTTATT
Reference ( family-394 )      :                                                                                     AGTGCATATCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATCAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACTNTTACA-GTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAANG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATNTTAATTAT-TAAAAANANT---CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTANTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CNTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA---AAN--CGACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATNNCTACAANNTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
gi|1                          :                                                                                     AGTGTGTTTCCATTT---T----CAACG--CATTACAATTTATAGTGTGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTTTATTGATTTAAACTATTACA-GTATCTAATCA--T----ATAA------AA--CATA----A-A-----------------CA-----ATACATAT-ACGT-GACAAATCAATGCGCAC---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTGTAATTAT-TAAAAAAAAT---CAACATTAAAGGAGGATGAA-CACTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-G-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA---AAA--TAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTAATAATTTTAC--ATCTGATTTGA-CTGTTTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CGTCTTCAACGTCATTTTTACAATATATATTATATGGCATCCAGTTTTATT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---CAATATTAAAGGAGGATGGA-CACTTACTGGTTGTTT--TATGGAATATCTTA--TA---CATTATG------AGCATGAAAC-ACAATTT-CTGAAATTGATG-ATTT--TTTATTGTTTGCT------------G---TTTGAAGAAGAGA--AAAA---TGT--CCACATGTTAAGTCTTTGTGTATACAATC-GTTTGATATATATAT--TTCTTATTT-CTCTGTGTGTTTATGACATATTAAAACAAAATCG--TATT------CATCTTCAATGACATTATTACA---------ATAAGGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                  attaatgatagcgttt-----ATGCATTT-ACATTAACAAG-------ACAA---AGTTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAAAA--TCTACATAGCTCTCAATCACCTTTTTTTGAGTAAGAAGAAAAAT---T---AAATATGT---TCTATATCAATTA---AAAAACAAT---CAATATCAaatacgatcgtgtcattaagtatttccc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atACGTTTTT--TA---CCTAATG------CATATGAAAGGA-AATACATTAA--------------------TGTTTGTT------------G---ATTGAAAAATTGATGAAAA---TCT--CCTCATGTAATATATCTGAGTATTAAATC-GTTTGAT-TATcgttttttacctaatgcatatgaaaggaaatacattaatgtttgttgattgaaaaattgatgaaaatctcctcatgtaatatatctgagtattaaatcgtttgattatg
gi|12                         : atatgcatttacattaacaagacaaagttttaacaattacaaaagttcaaaatctacatagctctcaatcacctttttttgagtaagaagaaaaattaaatatgttctatatcaattaaaaaacaatcaatatcAGAA----GAAGAT--G--TTTTT-ATAGATTTAAACTATTACA-GTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACAT-GACAAATCAATGCACAA---A-TGT---T-A---AC------AAT---ATCAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAATAATAAGCTTATT---T---CATTATGT---TCTATTTAAATTAT---AAAACAAT---CAATATCAAAGGAAGATAAA-CACTTAATGGCTGTTTATTATGGAAg
gi|13                         :                                                                                                                                                           gaTT-ATTGATTTAAACTATAACA-TTTTTCTATCG--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTTTAGGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---A-A---AC------AAT---TACACATG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCACTCACA-TTTTTCAAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTTTAATTA--TAAAAACAAT---CAATATAAAAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATGCA--A---A-CTT---T-ATAAAC------AAT---TACAAAAT-TG-CAAAA--ACTACATAGCTCCCAATAACA-TTTTTTAAGTATGTAGGTAATT---G---TAATATGT---TTTTTTTTA--CAT-----AACTTTTG-CAGTAACAAAAATAAATGAA-TACTTACTG---------TATG------CCTA--CA---CATAAAG------CATCTGAAAA-A-AAAAAATGAAAA---ATGAATTT-CTT
gi|15                         :                                                                                       TGCATTTCT-TTTATATGAGGCAATATTCTTTATT--CTATAATATGAATAAATAGGAAGAA--TATTTTTT-ATTGATTTAAACTATTACA-GTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTG-ACAT-GACAATTCAATGCACAC---A-TTT---T-A---AC------AA
gi|16                         :                                                                                                                                      aAAAA----GAGGAA--G--TTTT--GTTGACTTAGACAATTATA-GTTTCTCATTA--TAAAAATAC------AA--TATA---TATATACATGTATATACAATCCA-----ATACATTT-ACTT-AAAATGTCGATGCAAAA---G-TTT---TAA---AA------AAA---TACAACAG-TTAAAACAATTCTACAATGCTCTCAAattttagccacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aT---CAATATCAAAGGA--------------TTGGTAGTCTATTATAGAACCTCCTT--TA---CGTAATG------CCTCTGAACG-A-AATTGATTAAAGTGTATT-ATTT-CTTTAT--ATTGTT------------G---ATTGACGAAGAGATAAAAA---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agtttT--TA---CATAAAG------CTTCTAATAG-G-AATCTAATACGATGAATG-ATTC-CATCA--ATTTGTT------------G---AGTAAAGGAGGGTTGAAAG---CTT--CAACATGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --TGGCATATTAAAACAAAACGG--TATT------TATCTTAAATATC
gi|2                          :                                                                                                              atttgTGTTCTCAG--ATAAGA---AGAG----GAAGAACAT--TTTTA-ATTGATTTAAACTATTACA-GTTTCTCATCA--T----AAAA------AAAACATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TAAACATAGCACTCACTCAC--TTTTTTGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATCTTAATTAT-AAAAAAAAAT---CAATATCAAAGGAGGATGAA-CACTTATCTGTTGTTTATTATGGAACGCCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAC-G-AATTTACTAAAATCTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAGGAG--AAAAA---TTT--CAACATGTTAAGTCTCTGTATATAAAATC-GTTTAATATATTTAC--TTCTTATTT-CACTATCTGTT--cagattaccaaaaaggcaaatgtgttcgtttatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatgtaaattctgaataattagatcagtgatagcgagttaggggagtgtttagATGG--TATTTTATACCACCTTCAATGCCATGTCTACAAGCTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
gi|21                         :                                                                                                                                                               aaacaattgttACCATTACG-GTTTCTCATCA--CGA--AAAA------AA--CATG---CATA-----------------CA-----ATACA
gi|3                          :                                                                                                                                                           TTTT-ATTTACTCCAACTATTACA-TTTTCTCATCA--T----A-----------------------------------------CA-----ATACACTA-ACCT-GACAAATATATGC-TAAT--G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTCCATAACTCTCAATCAAA-TTTTTCGAGTAATTAAGTAAGT---C---TAATGTGT---TTTTTATTGATAAT------AGAGTTTGCAATAACATAGGAGGGTAAAACAATTAGTGATTGTTTATAATTAAACGTCTTT--TA---CAATATG------CCTCTGTTAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTTGCTTTCTCGTTTGTTTACAGTTTCTTGGTTTACTGAAGGAGAGATAAAAA---AATATCAACATGTTAGATGTCCGTGTATAACAAC-GTTTGATATATTAACGTTTTTTAATG-T-CTCTCAGTT--T---ATGTT-AAACATAAT
gi|4                          :                                                                                     AGTGCATATCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATTAGCTATA-TAC-TAGAA----GAAG--------TTTT-ATTGATTTTAAGTCATACA-TGTTCTCNNNN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNNNNNNNNNN---------CATGTTCATACATGT-TCGT-GCCAAATCAATGCAAAA---G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-T----------------------CGGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGATTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT---AAAGTGTT---AAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-AGTTTACTAAAATGTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA---TGT--CCACGTGTTAGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-G-TTCTTT-TT--TGA-A-ATTAATACGAA--GGTTTATT------CCTGTTCGAAGTacctcgtacaagatgaattattgaaaaaaaataatgaagtttagtttaatgtttt
gi|5                          :                                                                                    tgGTGCATATTTATTTGT-T----TAACAGTTAACATAAGCTAT-ATAC-TAGAA----AAAAA--------TTT-ATTGATTTTAACTTTTACA-GGTTCTCATCN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNN-----------------NN-----NNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCACACACAAAACA-TGTACGT-ATGTACGTGCCAAATCAATGCAACAGTTT-TAAAA--T-TACA-AACGTTTAGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGGTTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT---AAAGTGTT---CAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-CATTTACTAAAATGTATG-ATTT-ATTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA---TGT--CCA-ATGCTGGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-T-TTCT-TATT--TGAAAT-TTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                     TTTAAATTCATATATATTTTACATCA--T----ACAA------AA--CATA---TATG-----------------AA-----ATACGATT-ACGC-GACAAATCAATACAAAA---A-GTG---T-A---AC------GTT---TATACAAT-TT-CAAAA--CCTACATTGCCCTCAATCACA-TTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---CAATAACAACTGAGGATTAA-CGCTTGTTGTTTGTTTATGATGT--CGTACTT--TA---TATAAAG------CATCGGAAAG-A-AATTGACTAATATTTGTA-ATAG-CTGTACTATTTATT------------G---ATTGGAGAAGACATAAACA---TTT--CAACATGTTAGGTCTCCGTGTATAAAATC-GTTTGGTATATTTAC--TTCTAGTTT-CTCTATATAAC--GGACATATTAAAACAATATGG--CGTT------Ccaataacaactgaggattaacgcttgttgtttgtttatgatgtcgtactttatataaagcatcggaaagaaattgactaatatttgtaatagctgtactatttattgattggagaagacataaacatttcaacatgttaggtctccgtgtataaaatcgtttggtatatttacttctagtttctctatataacggacatattaaaacaatatggcgttcgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|7                          :             tttaaattcatatatattttacatcatacaaaacatatatgaaatacgattacgcgacaaatcaatacaaaaagtgtaacgtttatacaatttcaaaacctacattgccctcaatcacatttAAAA----GAAGAA--T--TTTT--ATTGATTTAAACCTTTAAA-GTTTCTCATCAACT----ATAACATAAAAA--CATAAATTATAGA---------------CA-----ATACATTT-ACCT-AATAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---AACAAAAG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTT-CGAGAAAGAAGGTAATTATTT---TATTATGT---TCTATATTAATTATATAAAAAAATT---CAATATCAAAGGAAGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATAGAACTTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-T-AGTTTACTAAACTTTGTG-ATTT-CTTTATTGTTTCTT------------G---ATTGGAGAAGGAATAAAAA---AAgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                        atacttatttctatatagttataccttaaactacatgtatgtattgatatagaTT-ATGT-GACAAATCAATGCAAAT---G-TTT---T-G---AT------AAT---TATAATAG-TT-AAA-A--TCTACATAAATCTCAATCACA-GTTTTTAGGTAAGAAGATAATT---CAAATATCATCTACATGTATATTGATTAT---ACAGTTTT---CAACATCAAATGAGGGTAAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGTAACGTCTTT--TA---CATAATGATACTACCTCTGAACG-A-CAGTTACTAAAATTT-TA-AT----TGTATAGTTTGTG------------T---ATTGATAAAGTGATCAATATTTAA-----ACATGTTAGCTTTCTGTTTATAAt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                 A-----ACACATTT-ACGT-GGCAATTTAATGCGCAA---G-TTT---TTA---AC------AGT---TATAAAAG-TT-CAAAT--TCTACATATCACTCGATCATA-TTCTTCGAATAAGGAGGTAATT---T---TATTATGT---TTTATACTAATAAT---AAAATGTT---CAATATTAAAGCAGAATGAA-CATTCAATGATTGTTTATTATGAAACGTTTTTGATATAGCACAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACCAACATTTATT-ATTC-CTTTATTGTCTGTT------------G---ATTATAGCAGAGATAAAAA---AAT--CCACTTCTTAAACATTTGTTCCTAATATCAGTTTAATTTGTGCAC--Tgtatcaatgctttttggtccagttataagattgatttccaacacttgaattatcgaaaaaagtgaacaat





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                    22222222                        111    1111     222222                                         1111                         44444444444444444                                                                                                                                                                    11111111111111                                                                                                                            111111111111                                                                                    222                                      111111                      22222                          
lowQualScore                  :                                                                                          2 1   3   55555555     8       666    77  222    0000     000000    77             3  3    0          44 1111 2  999999  44    555    00000000000000000  77777        2    2              1  777 2   444 5 999  777777   555        2  2   4 33 4                   3                      7777777        555 0   0        99999999999999             1   1  444    2               0   0     33  555       888888 1        2 2             2    2    2              555555555555 555                   22 44 1                           4               66         444  1 6 1  66   4  0              99    999999                      77777         4                
lowQualScore                  :                                                                                          . .   .   ........     .       ...    ..  ...    ....     ......    ..             .  .    .          .. .... .  ......  ..    ...    .................  .....        .    .              .  ... .   ... . ...  ......   ...        .  .   . .. .                   .                      .......        ... .   .        ..............             .   .  ...    .               .   .     ..  ...       ...... .        . .             .    .    .              ............ ...                   .. .. .                           .               ..         ...  . . .  ..   .  .              ..    ......                      .....         .                
lowQualScore                  :                                                                                          0 0   2   88888888     8       888    11  888    6666     111111    44             3  3    4          66 7777 3  666666  66    888    00000000000000000  11111        9    9              1  333 7   777 3 333  777777   000        9  9   3 99 3                   1                      2222222        888 2   8        22222222222222             4   4  555    8               2   8     99  000       222222 5        9 9             4    9    9              888888888888 444                   00 66 0                           4               99         666  0 6 7  99   3  1              22    222222                      77777         0                
consensus                     :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGTT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAATNT--CAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
Reference ( family-394 )      :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGNT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAANNT--CNACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATAAGGCATCCAGTTTTATT
gi|1                          :                                                                                     AGTGTGTTTCCATTT---T----CAACG--CATTACAATTTATAGTGTGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTTTATTGATTTAAACT-AT-TACAGTATCTAATCA--T----ATAA------AA--CATA----A-A-----------------CA-----ATACATAT-ACGT-GACAAATCAATGCGCAC---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTGTAATTATTA--AAAAAAAT--CAACATTAAAGGAGGATGAA-CACTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-G-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAAAAA--TAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTAATAATTTTAC--ATCTGATTTGA-CTGTTTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CGTCTTCAACGTCATTTTTACAATA--TATATTATATGGCATCCAGTTTTATT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTAATGAT-A--G---CGTTTTCAATATTAAAGGAGGATGGA-CACTTACTGGTTGTTT--TATGGAATATCTTA--TA---CATTATG------AGCATGAAAC-ACAATTT-CTGAAATTGATG-ATTT--TTTATTGTTTGCT------------G---TTTGAAGAAGAGA--AAAATGT--CCACATGTTAAGTCTTTGTGTATACAATC-GTTTGATATATATAT--TTCTTATTT-CTCTGTGTGTTTATGACATATTAAAACAAAATCG--TATT------CATCTTCAATGACATTATTACA--A--TA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                   -----ATGCATTT-ACATTAACAAG-------ACAA---AGTTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAAAA--TCTACATAGCTCTCAATCACCTTTTTTTGAGTAAGAAGAAAAAT---T---AAATATGT---TCTATATCAATTA--A--AAAACAAT--CAATATCAaggcaaatacgatcgtgtcattaagtatttccc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atACGTTTTT--TA---CCTAATG------CATATGAAAGGA-AATACATTAA--------------------TGTTTGTT------------G---ATTGAAAAATTGATGAAAATCT--CCTCATGTAATATATCTGAGTATTAAATC-GTTTGAT-TATcgttttttacctaatgcatatgaaaggaaatacattaatgtttgttgattgaaaaattgatgaaaatctcctcatgtaatatatctgagtattaaatcgtttgattatg
gi|12                         : atatgcatttacattaacaagacaaagttttaacaattacaaaagttcaaaatctacatagctctcaatcacctttttttgagtaagaagaaaaattaaatatgttctatatcaattaaaaaacaatcaatatcAGAA----GAAGAT--G--TTTTT-ATAGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACAT-GACAAATCAATGCACAA---A-TGT---T-A---AC------AAT---ATCAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAATAATAAGCTTATT---T---CATTATGT---TCTATTTAAATTAT----AAAACAAT--CAATATCAAAGGAAGATAAA-CACTTAATGGCTGTTTATTATGGAAg
gi|13                         :                                                                                                                                                           gaTT-ATTGATTTAAACT-AT-AACATTTTTCTATCG--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTTTAGGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---A-A---AC------AAT---TACACATG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCACTCACA-TTTTTCAAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTTTAATTAT-A--AAAACAAT--CAATATAAAAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             CAATGCA--A---A-CTT---T-ATAAAC------AAT---TACAAAAT-TG-CAAAA--ACTACATAGCTCCCAATAACA-TTTTTTAAGTATGTAGGTAATT---G---TAATATGT---TTTTTTTTA--CAT------AACTTTTGCAGTAACAAAAATAAATGAA-TACTTACTG---------TATG------CCTA--CA---CATAAAG------CATCTGAAAA-A-AAAAAATGAAAA---ATGAATTT-CTT
gi|15                         :                                                                                       TGCATTTCT-TTTATATGAGGCAATATTCTTTATT--CTATAATATGAATAAATAGGAAGAA--TATTTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTG-ACAT-GACAATTCAATGCACAC---A-TTT---T-A---AC------AA
gi|16                         :                                                                                                                                      aAAAA----GAGGAA--G--TTTT--GTTGACTTAGACA-AT-TATAGTTTCTCATTA--TAAAAATAC------AA--TATA---TATATACATGTATATACAATCCA-----ATACATTT-ACTT-AAAATGTCGATGCAAAA---G-TTT---TAA---AA------AAA---TACAACAG-TTAAAACAATTCTACAATGCTCTCAAattttagccacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aT--CAATATCAAAGGA--------------TTGGTAGTCTATTATAGAACCTCCTT--TA---CGTAATG------CCTCTGAACG-A-AATTGATTAAAGTGTATT-ATTT-CTTTAT--ATTGTT------------G---ATTGACGAAGAGATAAAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtttT--TA---CATAAAG------CTTCTAATAG-G-AATCTAATACGATGAATG-ATTC-CATCA--ATTTGTT------------G---AGTAAAGGAGGGTTGAAAGCTT--CAACATGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --TGGCATATTAAAACAAAACGG--TATT------TATCTTAAATATC
gi|2                          :                                                                                                                            atttgATAAGAAGAG----GAAGAACAT--TTTTA-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----AAAA------AAAACATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TAAACATAGCACTCACTCAC--TTTTTTGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATCTTAATTATAA--AAAAAAAT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CACTTATCTGTTGTTTATTATGGAACGCCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAC-G-AATTTACTAAAATCTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAGGAG--AAAAATTT--CAACATGTTAAGTCTCTGTATATAAAATC-GTTTAATATATTTAC--TTCTTATTT-CACTATCTGTT--cagattaccaaaaaggcaaatgtgttcgtttatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgtaaattctgaataattagatcagtgatagcgagttaggggagtgtttagtgttctcagATGG--TATTTTATACCACCTTCAATGCCATGTCTACA--AGCTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
gi|21                         :                                                                                                                                                               aaacaattgttACC-AT-TACGGTTTCTCATCA--CGA--AAAA------AA--CATG---CATA-----------------CA-----ATACA
gi|3                          :                                                                                                                                                           TTTT-ATTTACTCCAACT-AT-TACATTTTCTCATCA--T----A-----------------------------------------CA-----ATACACTA-ACCT-GACAAATATATGC-TAAT--G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTCCATAACTCTCAATCAAA-TTTTTCGAGTAATTAAGTAAGT---C---TAATGTGT---TTTTTATTGATAAT-A--GA---GTTTGCAATAACATAGGAGGGTAAAACAATTAGTGATTGTTTATAATTAAACGTCTTT--TA---CAATATG------CCTCTGTTAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTTGCTTTCTCGTTTGTTTACAGTTTCTTGGTTTACTGAAGGAGAGATAAAAAAATATCAACATGTTAGATGTCCGTGTATAACAAC-GTTTGATATATTAACGTTTTTTAATG-T-CTCTCAGTT--T---ATGTT-AAACATAAT
gi|4                          :                                                                                     AGTGCATATCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATTAGCTATA-TAC-TAGAA----GAAG--------TTTT-ATTGATTTTAAGT-CA-TACATGTTCTCNNNN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNNNNNNNNNN---------CATGTTCATACATGT-TCGT-GCCAAATCAATGCAAAA---G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-T----------------------CGGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGATTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT-A--AAG-TGTT--AAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-AGTTTACTAAAATGTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAATGT--CCACGTGTTAGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-G-TTCTTT-TT--TGA-A-ATTAATACGAA--GGTTTATT------CCTGTTCGAAGTacctcgtacaagatgaattattgaaaaaaaataatgaagtttagtttaatgtttt
gi|5                          :                                                                                    tgGTGCATATTTATTTGT-T----TAACAGTTAACATAAGCTAT-ATAC-TAGAA----AAAAA--------TTT-ATTGATTTTAACT-TT-TACAGGTTCTCATCN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNN-----------------NN-----NNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCACACACAAAACA-TGTACGT-ATGTACGTGCCAAATCAATGCAACAGTTT-TAAAA--T-TACA-AACGTTTAGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGGTTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT----AAAGTGTT--CAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-CATTTACTAAAATGTATG-ATTT-ATTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAATGT--CCA-ATGCTGGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-T-TTCT-TATT--TGAAAT-TTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                     TTTAAATTCATATATA-TTTTACATCA--T----ACAA------AA--CATA---TATG-----------------AA-----ATACGATT-ACGC-GACAAATCAATACAAAA---A-GTG---T-A---AC------GTT---TATACAAT-TT-CAAAA--CCTACATTGCCCTCAATCACA-TTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T--CAATAACAACTGAGGATTAA-CGCTTGTTGTTTGTTTATGATGT--CGTACTT--TA---TATAAAG------CATCGGAAAG-A-AATTGACTAATATTTGTA-ATAG-CTGTACTATTTATT------------G---ATTGGAGAAGACATAAACATTT--CAACATGTTAGGTCTCCGTGTATAAAATC-GTTTGGTATATTTAC--TTCTAGTTT-CTCTATATAAC--GGACATATTAAAACAATATGG--CGTT------Ccaataacaactgaggattaacgcttgttgtttgtttatgatgtcgtactttatataaagcatcggaaagaaattgactaatatttgtaatagctgtactatttattgattggagaagacataaacatttcaacatgttaggtctccgtgtataaaatcgtttggtatatttacttctagtttctctatataacggacatattaaaacaatatggcgttcgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|7                          :             tttaaattcatatatattttacatcatacaaaacatatatgaaatacgattacgcgacaaatcaatacaaaaagtgtaacgtttatacaatttcaaaacctacattgccctcaatcacatttAAAA----GAAGAA--T--TTTT--ATTGATTTAAACC-TT-TAAAGTTTCTCATCAACT----ATAACATAAAAA--CATAAATTATAGA---------------CA-----ATACATTT-ACCT-AATAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---AACAAAAG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTT-CGAGAAAGAAGGTAATTATTT---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-ATAAAAAAATT--CAATATCAAAGGAAGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATAGAACTTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-T-AGTTTACTAAACTTTGTG-ATTT-CTTTATTGTTTCTT------------G---ATTGGAGAAGGAATAAAAAAAT--gactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                         atacttatttctatatagttataccttaaactacatgtatgtattgatatagaTT-ATGT-GACAAATCAATGCAAAT---G-TTT---T-G---AT------AAT---TATAATAG-TT-AAA-A--TCTACATAAATCTCAATCACA-GTTTTTAGGTAAGAAGATAATT---CAAATATCATCTACATGTATATTGATTAT-A--CAG-TTTT--CAACATCAAATGAGGGTAAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGTAACGTCTTT--TA---CATAATGATACTACCTCTGAACG-A-CAGTTACTAAAATTT-TA-AT----TGTATAGTTTGTG------------T---ATTGATAAAGTGATCAATATTT--AAACATGTTAGCTTTCTGTTTATAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                  A-----ACACATTT-ACGT-GGCAATTTAATGCGCAA---G-TTT---TTA---AC------AGT---TATAAAAG-TT-CAAAT--TCTACATATCACTCGATCATA-TTCTTCGAATAAGGAGGTAATT---T---TATTATGT---TTTATACTAATAAT----AAAATGTT--CAATATTAAAGCAGAATGAA-CATTCAATGATTGTTTATTATGAAACGTTTTTGATATAGCACAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACCAACATTTATT-ATTC-CTTTATTGTCTGTT------------G---ATTATAGCAGAGATAAAAAAAT--CCACTTCTTAAACATTTGTTCCTAATATCAGTTTAATTTGTGCAC--Tgtatcaatgctttttggtccagttataagattgatttccaacacttgaattatcgaaaaaagtgaacaat





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                    22222222                        111    1111     222222                                         1111                         44444444444444444                                                                                                                                                                    11111111111111                                                                                                                            111111111111                                                                                    222                                      111111                      22222                          
lowQualScore                  :                                                                                          2 1   3   55555555     8       666    77  222    0000     000000    77             3  3    0          44 1111 2  999999  44    555    00000000000000000  77777        2    2              1  777 2   444 5 999  777777   555        2  2   4 33 4                   3                      7777777        555 0   0        77777777777777             1   1  444    2               0   0     33  555       888888 1        2 2             2    2    2              555555555555 555                   44 1  1                           4               66         444  1 6 1  66   4  0              99    999999                      77777         1                
lowQualScore                  :                                                                                          . .   .   ........     .       ...    ..  ...    ....     ......    ..             .  .    .          .. .... .  ......  ..    ...    .................  .....        .    .              .  ... .   ... . ...  ......   ...        .  .   . .. .                   .                      .......        ... .   .        ..............             .   .  ...    .               .   .     ..  ...       ...... .        . .             .    .    .              ............ ...                   .. .  .                           .               ..         ...  . . .  ..   .  .              ..    ......                      .....         .                
lowQualScore                  :                                                                                          0 0   2   88888888     8       888    11  888    6666     111111    44             3  3    4          66 7777 3  666666  66    888    00000000000000000  11111        9    9              1  333 7   777 3 333  777777   000        9  9   3 99 3                   1                      2222222        888 2   8        99999999999999             4   4  555    8               2   8     99  000       222222 5        9 9             4    9    9              888888888888 444                   22 0  9                           4               99         666  0 6 7  99   3  1              22    222222                      77777         0                
consensus                     :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGTT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
Reference ( family-394 )      :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGTT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
gi|1                          :                                                                                     AGTGTGTTTCCATTT---T----CAACG--CATTACAATTTATAGTGTGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTTTATTGATTTAAACT-AT-TACAGTATCTAATCA--T----ATAA------AA--CATA----A-A-----------------CA-----ATACATAT-ACGT-GACAAATCAATGCGCAC---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTGTAATTATTA--AAAAAAAT--CAACATTAAAGGAGGATGAA-CACTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-G-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--AAATAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTAATAATTTTAC--ATCTGATTTGA-CTGTTTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CGTCTTCAACGTCATTTTTACAATA--TATATTATATGGCATCCAGTTTTATT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTAATGAT-A--G---CGTTTTCAATATTAAAGGAGGATGGA-CACTTACTGGTTGTTT--TATGGAATATCTTA--TA---CATTATG------AGCATGAAAC-ACAATTT-CTGAAATTGATG-ATTT--TTTATTGTTTGCT------------G---TTTGAAGAAGAGA--AAAA--TGTCCACATGTTAAGTCTTTGTGTATACAATC-GTTTGATATATATAT--TTCTTATTT-CTCTGTGTGTTTATGACATATTAAAACAAAATCG--TATT------CATCTTCAATGACATTATTACA--A--TA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                   -----ATGCATTT-ACATTAACAAG-------ACAA---AGTTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAAAA--TCTACATAGCTCTCAATCACCTTTTTTTGAGTAAGAAGAAAAAT---T---AAATATGT---TCTATATCAATTA--A--AAAACAAT--CAATATCAaggcaaatacgatcgtgtcattaagtatttccc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atACGTTTTT--TA---CCTAATG------CATATGAAAGGA-AATACATTAA--------------------TGTTTGTT------------G---ATTGAAAAATTGATGAAAA--TCTCCTCATGTAATATATCTGAGTATTAAATC-GTTTGAT-TATcgttttttacctaatgcatatgaaaggaaatacattaatgtttgttgattgaaaaattgatgaaaatctcctcatgtaatatatctgagtattaaatcgtttgattatg
gi|12                         : atatgcatttacattaacaagacaaagttttaacaattacaaaagttcaaaatctacatagctctcaatcacctttttttgagtaagaagaaaaattaaatatgttctatatcaattaaaaaacaatcaatatcAGAA----GAAGAT--G--TTTTT-ATAGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACAT-GACAAATCAATGCACAA---A-TGT---T-A---AC------AAT---ATCAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAATAATAAGCTTATT---T---CATTATGT---TCTATTTAAATTAT----AAAACAAT--CAATATCAAAGGAAGATAAA-CACTTAATGGCTGTTTATTATGGAAg
gi|13                         :                                                                                                                                                           gaTT-ATTGATTTAAACT-AT-AACATTTTTCTATCG--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTTTAGGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---A-A---AC------AAT---TACACATG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCACTCACA-TTTTTCAAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTTTAATTAT-A--AAAACAAT--CAATATAAAAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             CAATGCA--A---A-CTT---T-ATAAAC------AAT---TACAAAAT-TG-CAAAA--ACTACATAGCTCCCAATAACA-TTTTTTAAGTATGTAGGTAATT---G---TAATATGT---TTTTTTTTA--CAT------AACTTTTGCAGTAACAAAAATAAATGAA-TACTTACTG---------TATG------CCTA--CA---CATAAAG------CATCTGAAAA-A-AAAAAATGAAAA---ATGAATTT-CTT
gi|15                         :                                                                                       TGCATTTCT-TTTATATGAGGCAATATTCTTTATT--CTATAATATGAATAAATAGGAAGAA--TATTTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTG-ACAT-GACAATTCAATGCACAC---A-TTT---T-A---AC------AA
gi|16                         :                                                                                                                                      aAAAA----GAGGAA--G--TTTT--GTTGACTTAGACA-AT-TATAGTTTCTCATTA--TAAAAATAC------AA--TATA---TATATACATGTATATACAATCCA-----ATACATTT-ACTT-AAAATGTCGATGCAAAA---G-TTT---TAA---AA------AAA---TACAACAG-TTAAAACAATTCTACAATGCTCTCAAattttagccacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aTT--CAATATCAAAGGA--------------TTGGTAGTCTATTATAGAACCTCCTT--TA---CGTAATG------CCTCTGAACG-A-AATTGATTAAAGTGTATT-ATTT-CTTTAT--ATTGTT------------G---ATTGACGAAGAGATAAAAA--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agttT--TA---CATAAAG------CTTCTAATAG-G-AATCTAATACGATGAATG-ATTC-CATCA--ATTTGTT------------G---AGTAAAGGAGGGTTGAAAG--CTTCAACATGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --TGGCATATTAAAACAAAACGG--TATT------TATCTTAAATATC
gi|2                          :                                                                                                                            atttgATAAGAAGAG----GAAGAACAT--TTTTA-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----AAAA------AAAACATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TAAACATAGCACTCACTCAC--TTTTTTGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATCTTAATTATAA--AAAAAAAT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CACTTATCTGTTGTTTATTATGGAACGCCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAC-G-AATTTACTAAAATCTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAGGAG--AAAAA--TTTCAACATGTTAAGTCTCTGTATATAAAATC-GTTTAATATATTTAC--TTCTTATTT-CACTATCTGTT--cagattaccaaaaaggcaaatgtgttcgtttatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgtaaattctgaataattagatcagtgatagcgagttaggggagtgtttagtgttctcagATGG--TATTTTATACCACCTTCAATGCCATGTCTACA--AGCTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
gi|21                         :                                                                                                                                                               aaacaattgttACC-AT-TACGGTTTCTCATCA--CGA--AAAA------AA--CATG---CATA-----------------CA-----ATACA
gi|3                          :                                                                                                                                                           TTTT-ATTTACTCCAACT-AT-TACATTTTCTCATCA--T----A-----------------------------------------CA-----ATACACTA-ACCT-GACAAATATATGC-TAAT--G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTCCATAACTCTCAATCAAA-TTTTTCGAGTAATTAAGTAAGT---C---TAATGTGT---TTTTTATTGATAAT-A--GA---GTTTGCAATAACATAGGAGGGTAAAACAATTAGTGATTGTTTATAATTAAACGTCTTT--TA---CAATATG------CCTCTGTTAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTTGCTTTCTCGTTTGTTTACAGTTTCTTGGTTTACTGAAGGAGAGATAAAAAAATATCAACATGTTAGATGTCCGTGTATAACAAC-GTTTGATATATTAACGTTTTTTAATG-T-CTCTCAGTT--T---ATGTT-AAACATAAT
gi|4                          :                                                                                     AGTGCATATCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATTAGCTATA-TAC-TAGAA----GAAG--------TTTT-ATTGATTTTAAGT-CA-TACATGTTCTCNNNN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNNNNNNNNNN---------CATGTTCATACATGT-TCGT-GCCAAATCAATGCAAAA---G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-T----------------------CGGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGATTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT-A--AAG-TGTT--AAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-AGTTTACTAAAATGTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA--TGTCCACGTGTTAGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-G-TTCTTT-TT--TGA-A-ATTAATACGAA--GGTTTATT------CCTGTTCGAAGTacctcgtacaagatgaattattgaaaaaaaataatgaagtttagtttaatgtttt
gi|5                          :                                                                                    tgGTGCATATTTATTTGT-T----TAACAGTTAACATAAGCTAT-ATAC-TAGAA----AAAAA--------TTT-ATTGATTTTAACT-TT-TACAGGTTCTCATCN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNN-----------------NN-----NNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCACACACAAAACA-TGTACGT-ATGTACGTGCCAAATCAATGCAACAGTTT-TAAAA--T-TACA-AACGTTTAGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGGTTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT----AAAGTGTT--CAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-CATTTACTAAAATGTATG-ATTT-ATTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA--TGTCCA-ATGCTGGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-T-TTCT-TATT--TGAAAT-TTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                     TTTAAATTCATATATA-TTTTACATCA--T----ACAA------AA--CATA---TATG-----------------AA-----ATACGATT-ACGC-GACAAATCAATACAAAA---A-GTG---T-A---AC------GTT---TATACAAT-TT-CAAAA--CCTACATTGCCCTCAATCACA-TTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TT--CAATAACAACTGAGGATTAA-CGCTTGTTGTTTGTTTATGATGT--CGTACTT--TA---TATAAAG------CATCGGAAAG-A-AATTGACTAATATTTGTA-ATAG-CTGTACTATTTATT------------G---ATTGGAGAAGACATAAACA--TTTCAACATGTTAGGTCTCCGTGTATAAAATC-GTTTGGTATATTTAC--TTCTAGTTT-CTCTATATAAC--GGACATATTAAAACAATATGG--CGTT------Ccaataacaactgaggattaacgcttgttgtttgtttatgatgtcgtactttatataaagcatcggaaagaaattgactaatatttgtaatagctgtactatttattgattggagaagacataaacatttcaacatgttaggtctccgtgtataaaatcgtttggtatatttacttctagtttctctatataacggacatattaaaacaatatggcgttcgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|7                          :              tttaaattcatatatattttacatcatacaaaacatatatgaaatacgattacgcgacaaatcaatacaaaaagtgtaacgtttatacaatttcaaaacctacattgccctcaatcacattAAAA----GAAGAA--T--TTTT--ATTGATTTAAACC-TT-TAAAGTTTCTCATCAACT----ATAACATAAAAA--CATAAATTATAGA---------------CA-----ATACATTT-ACCT-AATAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---AACAAAAG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTT-CGAGAAAGAAGGTAATTATTT---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-ATAAAAAAATT--CAATATCAAAGGAAGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATAGAACTTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-T-AGTTTACTAAACTTTGTG-ATTT-CTTTATTGTTTCTT------------G---ATTGGAGAAGGAATAAAAA--gactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                         atacttatttctatatagttataccttaaactacatgtatgtattgatatagaTT-ATGT-GACAAATCAATGCAAAT---G-TTT---T-G---AT------AAT---TATAATAG-TT-AAA-A--TCTACATAAATCTCAATCACA-GTTTTTAGGTAAGAAGATAATT---CAAATATCATCTACATGTATATTGATTAT-A--CAG-TTTT--CAACATCAAATGAGGGTAAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGTAACGTCTTT--TA---CATAATGATACTACCTCTGAACG-A-CAGTTACTAAAATTT-TA-AT----TGTATAGTTTGTG------------T---ATTGATAAAGTGATCAATA--TTTAAACATGTTAGCTTTCTGTTTATAAaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                  A-----ACACATTT-ACGT-GGCAATTTAATGCGCAA---G-TTT---TTA---AC------AGT---TATAAAAG-TT-CAAAT--TCTACATATCACTCGATCATA-TTCTTCGAATAAGGAGGTAATT---T---TATTATGT---TTTATACTAATAAT----AAAATGTT--CAATATTAAAGCAGAATGAA-CATTCAATGATTGTTTATTATGAAACGTTTTTGATATAGCACAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACCAACATTTATT-ATTC-CTTTATTGTCTGTT------------G---ATTATAGCAGAGATAAAAA--AATCCACTTCTTAAACATTTGTTCCTAATATCAGTTTAATTTGTGCAC--Tgtatcaatgctttttggtccagttataagattgatttccaacacttgaattatcgaaaaaagtgaacaat





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                    22222222                        111    1111     222222                                         1111                         44444444444444444                                                                                                                                                                    11111111111111                                                                                                                            111111111111                                                                                    222                                      111111                      22222                          
lowQualScore                  :                                                                                          2 1   3   55555555     8       666    77  222    0000     000000    77             3  3    0          44 1111 2  999999  44    555    00000000000000000  77777        2    2              1  777 2   444 5 999  777777   555        2  2   4 33 4                   3                      7777777        555 0   0        77777777777777             1   1  444    2               0   0     33  555       888888 1        2 2             2    2    2              555555555555 555                   44 1  1                           4               66         444  1 6 1  66   4  0              99    999999                      77777         1                
lowQualScore                  :                                                                                          . .   .   ........     .       ...    ..  ...    ....     ......    ..             .  .    .          .. .... .  ......  ..    ...    .................  .....        .    .              .  ... .   ... . ...  ......   ...        .  .   . .. .                   .                      .......        ... .   .        ..............             .   .  ...    .               .   .     ..  ...       ...... .        . .             .    .    .              ............ ...                   .. .  .                           .               ..         ...  . . .  ..   .  .              ..    ......                      .....         .                
lowQualScore                  :                                                                                          0 0   2   88888888     8       888    11  888    6666     111111    44             3  3    4          66 7777 3  666666  66    888    00000000000000000  11111        9    9              1  333 7   777 3 333  777777   000        9  9   3 99 3                   1                      2222222        888 2   8        99999999999999             4   4  555    8               2   8     99  000       222222 5        9 9             4    9    9              888888888888 444                   22 0  9                           4               99         666  0 6 7  99   3  1              22    222222                      77777         0                
consensus                     :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGTT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
Reference ( family-394 )      :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGTT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
gi|1                          :                                                                                     AGTGTGTTTCCATTT---T----CAACG--CATTACAATTTATAGTGTGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTTTATTGATTTAAACT-AT-TACAGTATCTAATCA--T----ATAA------AA--CATA----A-A-----------------CA-----ATACATAT-ACGT-GACAAATCAATGCGCAC---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTGTAATTATTA--AAAAAAAT--CAACATTAAAGGAGGATGAA-CACTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-G-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--AAATAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTAATAATTTTAC--ATCTGATTTGA-CTGTTTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CGTCTTCAACGTCATTTTTACAATA--TATATTATATGGCATCCAGTTTTATT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTAATGAT-A--G---CGTTTTCAATATTAAAGGAGGATGGA-CACTTACTGGTTGTTT--TATGGAATATCTTA--TA---CATTATG------AGCATGAAAC-ACAATTT-CTGAAATTGATG-ATTT--TTTATTGTTTGCT------------G---TTTGAAGAAGAGA--AAAA--TGTCCACATGTTAAGTCTTTGTGTATACAATC-GTTTGATATATATAT--TTCTTATTT-CTCTGTGTGTTTATGACATATTAAAACAAAATCG--TATT------CATCTTCAATGACATTATTACA--A--TA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                   -----ATGCATTT-ACATTAACAAG-------ACAA---AGTTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAAAA--TCTACATAGCTCTCAATCACCTTTTTTTGAGTAAGAAGAAAAAT---T---AAATATGT---TCTATATCAATTA--A--AAAACAAT--CAATATCAaggcaaatacgatcgtgtcattaagtatttccc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atACGTTTTT--TA---CCTAATG------CATATGAAAGGA-AATACATTAA--------------------TGTTTGTT------------G---ATTGAAAAATTGATGAAAA--TCTCCTCATGTAATATATCTGAGTATTAAATC-GTTTGAT-TATcgttttttacctaatgcatatgaaaggaaatacattaatgtttgttgattgaaaaattgatgaaaatctcctcatgtaatatatctgagtattaaatcgtttgattatg
gi|12                         : atatgcatttacattaacaagacaaagttttaacaattacaaaagttcaaaatctacatagctctcaatcacctttttttgagtaagaagaaaaattaaatatgttctatatcaattaaaaaacaatcaatatcAGAA----GAAGAT--G--TTTTT-ATAGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACAT-GACAAATCAATGCACAA---A-TGT---T-A---AC------AAT---ATCAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAATAATAAGCTTATT---T---CATTATGT---TCTATTTAAATTAT----AAAACAAT--CAATATCAAAGGAAGATAAA-CACTTAATGGCTGTTTATTATGGAAg
gi|13                         :                                                                                                                                                           gaTT-ATTGATTTAAACT-AT-AACATTTTTCTATCG--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTTTAGGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---A-A---AC------AAT---TACACATG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCACTCACA-TTTTTCAAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTTTAATTAT-A--AAAACAAT--CAATATAAAAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             CAATGCA--A---A-CTT---T-ATAAAC------AAT---TACAAAAT-TG-CAAAA--ACTACATAGCTCCCAATAACA-TTTTTTAAGTATGTAGGTAATT---G---TAATATGT---TTTTTTTTA--CAT------AACTTTTGCAGTAACAAAAATAAATGAA-TACTTACTG---------TATG------CCTA--CA---CATAAAG------CATCTGAAAA-A-AAAAAATGAAAA---ATGAATTT-CTT
gi|15                         :                                                                                       TGCATTTCT-TTTATATGAGGCAATATTCTTTATT--CTATAATATGAATAAATAGGAAGAA--TATTTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTG-ACAT-GACAATTCAATGCACAC---A-TTT---T-A---AC------AA
gi|16                         :                                                                                                                                      aAAAA----GAGGAA--G--TTTT--GTTGACTTAGACA-AT-TATAGTTTCTCATTA--TAAAAATAC------AA--TATA---TATATACATGTATATACAATCCA-----ATACATTT-ACTT-AAAATGTCGATGCAAAA---G-TTT---TAA---AA------AAA---TACAACAG-TTAAAACAATTCTACAATGCTCTCAAattttagccacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aTT--CAATATCAAAGGA--------------TTGGTAGTCTATTATAGAACCTCCTT--TA---CGTAATG------CCTCTGAACG-A-AATTGATTAAAGTGTATT-ATTT-CTTTAT--ATTGTT------------G---ATTGACGAAGAGATAAAAA--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agttT--TA---CATAAAG------CTTCTAATAG-G-AATCTAATACGATGAATG-ATTC-CATCA--ATTTGTT------------G---AGTAAAGGAGGGTTGAAAG--CTTCAACATGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --TGGCATATTAAAACAAAACGG--TATT------TATCTTAAATATC
gi|2                          :                                                                                                                            atttgATAAGAAGAG----GAAGAACAT--TTTTA-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----AAAA------AAAACATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TAAACATAGCACTCACTCAC--TTTTTTGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATCTTAATTATAA--AAAAAAAT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CACTTATCTGTTGTTTATTATGGAACGCCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAC-G-AATTTACTAAAATCTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAGGAG--AAAAA--TTTCAACATGTTAAGTCTCTGTATATAAAATC-GTTTAATATATTTAC--TTCTTATTT-CACTATCTGTT--cagattaccaaaaaggcaaatgtgttcgtttatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgtaaattctgaataattagatcagtgatagcgagttaggggagtgtttagtgttctcagATGG--TATTTTATACCACCTTCAATGCCATGTCTACA--AGCTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
gi|21                         :                                                                                                                                                               aaacaattgttACC-AT-TACGGTTTCTCATCA--CGA--AAAA------AA--CATG---CATA-----------------CA-----ATACA
gi|3                          :                                                                                                                                                           TTTT-ATTTACTCCAACT-AT-TACATTTTCTCATCA--T----A-----------------------------------------CA-----ATACACTA-ACCT-GACAAATATATGC-TAAT--G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTCCATAACTCTCAATCAAA-TTTTTCGAGTAATTAAGTAAGT---C---TAATGTGT---TTTTTATTGATAAT-A--GA---GTTTGCAATAACATAGGAGGGTAAAACAATTAGTGATTGTTTATAATTAAACGTCTTT--TA---CAATATG------CCTCTGTTAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTTGCTTTCTCGTTTGTTTACAGTTTCTTGGTTTACTGAAGGAGAGATAAAAAAATATCAACATGTTAGATGTCCGTGTATAACAAC-GTTTGATATATTAACGTTTTTTAATG-T-CTCTCAGTT--T---ATGTT-AAACATAAT
gi|4                          :                                                                                     AGTGCATATCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATTAGCTATA-TAC-TAGAA----GAAG--------TTTT-ATTGATTTTAAGT-CA-TACATGTTCTCNNNN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNNNNNNNNNN---------CATGTTCATACATGT-TCGT-GCCAAATCAATGCAAAA---G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-T----------------------CGGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGATTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT-A--AAG-TGTT--AAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-AGTTTACTAAAATGTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA--TGTCCACGTGTTAGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-G-TTCTTT-TT--TGA-A-ATTAATACGAA--GGTTTATT------CCTGTTCGAAGTacctcgtacaagatgaattattgaaaaaaaataatgaagtttagtttaatgtttt
gi|5                          :                                                                                    tgGTGCATATTTATTTGT-T----TAACAGTTAACATAAGCTAT-ATAC-TAGAA----AAAAA--------TTT-ATTGATTTTAACT-TT-TACAGGTTCTCATCN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNN-----------------NN-----NNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCACACACAAAACA-TGTACGT-ATGTACGTGCCAAATCAATGCAACAGTTT-TAAAA--T-TACA-AACGTTTAGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGGTTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT----AAAGTGTT--CAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-CATTTACTAAAATGTATG-ATTT-ATTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA--TGTCCA-ATGCTGGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-T-TTCT-TATT--TGAAAT-TTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                     TTTAAATTCATATATA-TTTTACATCA--T----ACAA------AA--CATA---TATG-----------------AA-----ATACGATT-ACGC-GACAAATCAATACAAAA---A-GTG---T-A---AC------GTT---TATACAAT-TT-CAAAA--CCTACATTGCCCTCAATCACA-TTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TT--CAATAACAACTGAGGATTAA-CGCTTGTTGTTTGTTTATGATGT--CGTACTT--TA---TATAAAG------CATCGGAAAG-A-AATTGACTAATATTTGTA-ATAG-CTGTACTATTTATT------------G---ATTGGAGAAGACATAAACA--TTTCAACATGTTAGGTCTCCGTGTATAAAATC-GTTTGGTATATTTAC--TTCTAGTTT-CTCTATATAAC--GGACATATTAAAACAATATGG--CGTT------Ccaataacaactgaggattaacgcttgttgtttgtttatgatgtcgtactttatataaagcatcggaaagaaattgactaatatttgtaatagctgtactatttattgattggagaagacataaacatttcaacatgttaggtctccgtgtataaaatcgtttggtatatttacttctagtttctctatataacggacatattaaaacaatatggcgttcgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|7                          :              tttaaattcatatatattttacatcatacaaaacatatatgaaatacgattacgcgacaaatcaatacaaaaagtgtaacgtttatacaatttcaaaacctacattgccctcaatcacattAAAA----GAAGAA--T--TTTT--ATTGATTTAAACC-TT-TAAAGTTTCTCATCAACT----ATAACATAAAAA--CATAAATTATAGA---------------CA-----ATACATTT-ACCT-AATAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---AACAAAAG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTT-CGAGAAAGAAGGTAATTATTT---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-ATAAAAAAATT--CAATATCAAAGGAAGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATAGAACTTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-T-AGTTTACTAAACTTTGTG-ATTT-CTTTATTGTTTCTT------------G---ATTGGAGAAGGAATAAAAA--gactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                         atacttatttctatatagttataccttaaactacatgtatgtattgatatagaTT-ATGT-GACAAATCAATGCAAAT---G-TTT---T-G---AT------AAT---TATAATAG-TT-AAA-A--TCTACATAAATCTCAATCACA-GTTTTTAGGTAAGAAGATAATT---CAAATATCATCTACATGTATATTGATTAT-A--CAG-TTTT--CAACATCAAATGAGGGTAAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGTAACGTCTTT--TA---CATAATGATACTACCTCTGAACG-A-CAGTTACTAAAATTT-TA-AT----TGTATAGTTTGTG------------T---ATTGATAAAGTGATCAATA--TTTAAACATGTTAGCTTTCTGTTTATAAaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                  A-----ACACATTT-ACGT-GGCAATTTAATGCGCAA---G-TTT---TTA---AC------AGT---TATAAAAG-TT-CAAAT--TCTACATATCACTCGATCATA-TTCTTCGAATAAGGAGGTAATT---T---TATTATGT---TTTATACTAATAAT----AAAATGTT--CAATATTAAAGCAGAATGAA-CATTCAATGATTGTTTATTATGAAACGTTTTTGATATAGCACAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACCAACATTTATT-ATTC-CTTTATTGTCTGTT------------G---ATTATAGCAGAGATAAAAA--AATCCACTTCTTAAACATTTGTTCCTAATATCAGTTTAATTTGTGCAC--Tgtatcaatgctttttggtccagttataagattgatttccaacacttgaattatcgaaaaaagtgaacaat


blockSeqs                     :                                                                                          A T   A   ATATGAGG     T       TAG    AA  TGA    ATAG     ATAT      T              C  A               AC AAAA T  CATAAA  AA    AAT    TACATGTATATACAATC  TGTTC        T    T              C  AAC G   ACG A TAA  GTGCCA   CAA        T  A   A AT C                   T                      ATTT           ACA              ATAAAAAAATT                G   G  ACA    C                         GA  TAG       ATACTA G        G C             T    A    G              TACAGTTTCTTG TTT                   AA G  C                           A               GT         CT   G G G  TA   C                 TT    TTATAC                      AGC           A
blockSeqs                     :                                                                                          A A   A   GTT          G       AAG    A   AGA    .        ACAT      T              .  .               .  GA   T  .       .     .      NNNNNNNN           .            .    .              C  T   .   .   T TGT  .        .          .  .   C .  A                   .                      CAAA           .                AAAAAAAAAT                 A   A  CA     A                         .   .         .      A        . .             G    .    .              .            .                     .  C  C                           .               .          CA   A C G  .    C                 .     .                           A              
blockSeqs                     :                                                                                          A A   .   GTT          G       T      A   CT     .        TG        T              .  .               .  .    T  .       .     .      GA                 .            .    .              C  .   .   .   . .    .        .          .  .   C .  A                   .                      T              .                AAAAACAAT                  A   G  CA     C                         .   .         .      A        . .             G    .    .              .            .                     .  T  A                           .               .          CT   C C G  .    A                 .     .                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                    CT     .        AG        A              .  .               .  .    T  .       .     .      .                  .            .    .              C  .   .   .   . .    .        .          .  .   A .  C                   .                      T              .                AAAAACAAT                  G   G  TA     T                         .   .         .      C        . .             C    .    .              .            .                     .  T  A                           .               .          T    C T A  .    C                 .     .                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                           .        AT        T              .  .               .  .    A  .       .     .      .                  .            .    .              A  .   .   .   . .    .        .          .  .   C .  C                   .                      T              .                AGCGTTTT                   G   A  CA     T                         .   .         .      T        . .             T    .    .              .            .                     .  A  A                           .               .          G    C A A  .    .                 .     .                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                           .        .         T              .  .               .  .    A  .       .     .      .                  .            .    .              C  .   .   .   . .    .        .          .  .   C .  A                   .                      G              .                AAAACAAT                   G   T  CG     G                         .   .         .      T        . .             G    .    .              .            .                     .  G  C                           .               .          T    A . .  .    .                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                           .        .         T              .  .               .  .    N  .       .     .      .                  .            .    .              T  .   .   .   . .    .        .          .  .   C .  C                   .                      T              .                AACTTTTG                   A   G  CG     T                         .   .         .      C        . .             G    .    .              .            .                     .  G  C                           .               .                      .                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              .              .  .               .  .    N  .       .     .      .                  .            .    .              A  .   .   .   . .    .        .          .  .   A .  C                   .                      C              .                AGAGTTTG                   G   A  CG     T                         .   .         .      T        . .             T    .    .              .            .                     .  T  A                           .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              .              .  .               .  .    C  .       .     .      .                  .            .    .              C  .   .   .   . .    .        .          .  .   A .  A                   .                      T              .                AAAGTGTT                   G   G  CA     T                         .   .         .      T        . .             T    .    .              .            .                     .  T  A                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .               .  .    T  .       .     .      .                  .            .    .              A  .   .   .   . .    .        .          .  .   C .  C                   .                      T              .                AAAGTGTT                   .   .  .      A                         .   .         .      A        . .             T    .    .              .            .                     .  A  C                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                             .  .               .  .    .  .       .     .      .                  .            .    .              C  .   .   .   . .    .        .          .  .   A .  C                   .                      T              .                ACAGTTTT                   .   .  .      .                         .   .         .      T        . .             T    .    .              .            .                     .                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .            .    .              A  .   .   .   . .    .        .          .  .   . .  .                   .                                                      AAAATGTT                   .   .  .      .                         .   .         .      C        . .             .    .    .              .            .                     .                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .            .    .              C  .   .   .   . .    .        .          .  .   . .  .                                                                                                                                             .   .         .      T        . .             .    .    .                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .   .   .   . .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                    TG*                       T*                                                                                                                                                                                                                                                     AAAGTNTT******
originalCons                  :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACGTAGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT-A--AAAACGTT--CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
finalCons                     :                                                                                     AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATATG-AGAA----GAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTATAAAGTNTT------CAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                     22222222                     1  111  11111       222222                                         1111                         44444444444444444                                                                                                                                                                                                                                                                                                               111111111111                                                                                    222                                      111111                      22222                          
lowQualScore                  :                                                                                           2 1   3   55555555     8       666     3  000  22222       000000    77             3  3    0          44 1111 2  999999  44    555    00000000000000000  77777        2    2              1  777 2   444 5 999  777777   555        2  2   4 33 4                   3                      7777777        555 0   0        66 555  0 4444              1   1  444    2               0   0     33  555       888888 1        2 2             2    2    2              555555555555 555                   44 1  1                           4               66         444  1 6 1  66   4  0              99    999999                      77777         1                
lowQualScore                  :                                                                                           . .   .   ........     .       ...     .  ...  .....       ......    ..             .  .    .          .. .... .  ......  ..    ...    .................  .....        .    .              .  ... .   ... . ...  ......   ...        .  .   . .. .                   .                      .......        ... .   .        .. ...  . ....              .   .  ...    .               .   .     ..  ...       ...... .        . .             .    .    .              ............ ...                   .. .  .                           .               ..         ...  . . .  ..   .  .              ..    ......                      .....         .                
lowQualScore                  :                                                                                           0 0   2   88888888     8       888     6  000  55555       111111    44             3  3    4          66 7777 3  666666  66    888    00000000000000000  11111        9    9              1  333 7   777 3 333  777777   000        9  9   3 99 3                   1                      2222222        888 2   8        88 000  8 3333              4   4  555    8               2   8     99  000       222222 5        9 9             4    9    9              888888888888 444                   22 0  9                           4               99         666  0 6 7  99   3  1              22    222222                      77777         0                
consensus                     :                                                                                      AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATACG-AG-----AAGAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT--A---AAGTNT--TCAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
Reference ( family-394 )      :                                                                                      AGTGCGTNTCTATTTGT-T----CAACAGTCATTATNAGCTATAATATG-AG-----AAGAAGAA--T--TTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATATTAATTAT--A---AAGTNT--TCAATATCAAAGGAGGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--TNTCAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATATTTAC--TTCTTATTT-C-CTNTNTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CATCTTCAATGTCATTTTTACA--A--TATATTATANGGCATCCAGTTTTATT
gi|1                          :                                                                                      AGTGTGTTTCCATTT---T----CAACG--CATTACAATTTATAGTGTGTAG-----AAGAAGAA--T--TTTTTTATTGATTTAAACT-AT-TACAGTATCTAATCA--T----ATAA------AA--CATA----A-A-----------------CA-----ATACATAT-ACGT-GACAAATCAATGCGCAC---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTGTAATTATTAA---AAAAAA--TCAACATTAAAGGAGGATGAA-CACTTATTGGTTGTTTATTATGGAACGTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-G-AATTTACTAAAATTTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAAGAGATAAAAA--AAATAACATGTTAGGTCTCTGTGTATAAAATC-GTTTAATAATTTTAC--ATCTGATTTGA-CTGTTTGTT--TGACATATTAAAACAAAATGG--TATT------CGTCTTCAACGTCATTTTTACAATA--TATATTATATGGCATCCAGTTTTATT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTAATGAT--A---GCGTTT--TCAATATTAAAGGAGGATGGA-CACTTACTGGTTGTTT--TATGGAATATCTTA--TA---CATTATG------AGCATGAAAC-ACAATTT-CTGAAATTGATG-ATTT--TTTATTGTTTGCT------------G---TTTGAAGAAGAGA--AAAA--TGTCCACATGTTAAGTCTTTGTGTATACAATC-GTTTGATATATATAT--TTCTTATTT-CTCTGTGTGTTTATGACATATTAAAACAAAATCG--TATT------CATCTTCAATGACATTATTACA--A--TA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                     -----ATGCATTT-ACATTAACAAG-------ACAA---AGTTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAAAA--TCTACATAGCTCTCAATCACCTTTTTTTGAGTAAGAAGAAAAAT---T---AAATATGT---TCTATATCAATTAA--A---AAACAA--TCAATATCAaggcaaatacgatcgtgtcattaagtatttccc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atACGTTTTT--TA---CCTAATG------CATATGAAAGGA-AATACATTAA--------------------TGTTTGTT------------G---ATTGAAAAATTGATGAAAA--TCTCCTCATGTAATATATCTGAGTATTAAATC-GTTTGAT-TATcgttttttacctaatgcatatgaaaggaaatacattaatgtttgttgattgaaaaattgatgaaaatctcctcatgtaatatatctgagtattaaatcgtttgattatg
gi|12                         : atatgcatttacattaacaagacaaagttttaacaattacaaaagttcaaaatctacatagctctcaatcacctttttttgagtaagaagaaaaattaaatatgttctatatcaattaaaaaacaatcaatatc-AG-----AAGAAGAT--G--TTTTT-ATAGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACAT-GACAAATCAATGCACAA---A-TGT---T-A---AC------AAT---ATCAAATG-TT-CAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTTTCGAATAATAAGCTTATT---T---CATTATGT---TCTATTTAAATTAT--A---AAACAA--TCAATATCAAAGGAAGATAAA-CACTTAATGGCTGTTTATTATGGAAg
gi|13                         :                                                                                                                                                             gaTT-ATTGATTTAAACT-AT-AACATTTTTCTATCG--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTTTAGGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---A-A---AC------AAT---TACACATG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCACTCACA-TTTTTCAAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATTTTAATTATA-A---AAACAA--TCAATATAAAAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               CAATGCA--A---A-CTT---T-ATAAAC------AAT---TACAAAAT-TG-CAAAA--ACTACATAGCTCCCAATAACA-TTTTTTAAGTATGTAGGTAATT---G---TAATATGT---TTTTTTTTA--CAT--A---ACTTTT--GCAGTAACAAAAATAAATGAA-TACTTACTG---------TATG------CCTA--CA---CATAAAG------CATCTGAAAA-A-AAAAAATGAAAA---ATGAATTT-CTT
gi|15                         :                                                                                        TGCATTTCT-TTTATATGAGGCAATATTCTTTATT--CTATAATATG-AATAAATAGGAAGAA--TATTTTTT-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----ATAA------AA--CATA---TATA-----------------CA-----ATACATTG-ACAT-GACAATTCAATGCACAC---A-TTT---T-A---AC------AA
gi|16                         :                                                                                                                                      a-AA-----AAGAGGAA--G--TTTT--GTTGACTTAGACA-AT-TATAGTTTCTCATTA--TAAAAATAC------AA--TATA---TATATACATGTATATACAATCCA-----ATACATTT-ACTT-AAAATGTCGATGCAAAA---G-TTT---TAA---AA------AAA---TACAACAG-TTAAAACAATTCTACAATGCTCTCAAattttagccacat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aAGTTT--TCAATATCAAAGGA--------------TTGGTAGTCTATTATAGAACCTCCTT--TA---CGTAATG------CCTCTGAACG-A-AATTGATTAAAGTGTATT-ATTT-CTTTAT--ATTGTT------------G---ATTGACGAAGAGATAAAAA--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T--TA---CATAAAG------CTTCTAATAG-G-AATCTAATACGATGAATG-ATTC-CATCA--ATTTGTT------------G---AGTAAAGGAGGGTTGAAAG--CTTCAACATGTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --TGGCATATTAAAACAAAACGG--TATT------TATCTTAAATATC
gi|2                          :                                                                                                                                  atttg-AG-----AGGAAGAACAT--TTTTA-ATTGATTTAAACT-AT-TACAGTTTCTCATCA--T----AAAA------AAAACATA---TATA-----------------CA-----ATACATTT-ACGT-GACAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAATG-TT-CAACA--TAAACATAGCACTCACTCAC--TTTTTTGAGTAAGAAGGTAATT---T---TATTATGT---TCTATCTTAATTAT--A---AAAAAAAATCAATATCAAAGGAGGATGAA-CACTTATCTGTTGTTTATTATGGAACGCCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAC-G-AATTTACTAAAATCTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAAGAGGAG--AAAAA--TTTCAACATGTTAAGTCTCTGTATATAAAATC-GTTTAATATATTTAC--TTCTTATTT-CACTATCTGTT--cagattaccaaaaaggcaaatgtgttcgtttatgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatgtaaattctgaataattagatcagtgatagcgagttaggggagtgtttagtgttctcagataagaATGG--TATTTTATACCACCTTCAATGCCATGTCTACA--AGCTATATTATAAGGCATTCAGTTTTATT
gi|21                         :                                                                                                                                                                 aaacaattgttACC-AT-TACGGTTTCTCATCA--CGA--AAAA------AA--CATG---CATA-----------------CA-----ATACA
gi|3                          :                                                                                                                                                             TTTT-ATTTACTCCAACT-AT-TACATTTTCTCATCA--T----A-----------------------------------------CA-----ATACACTA-ACCT-GACAAATATATGC-TAAT--G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-TT-CAACA--TCTCCATAACTCTCAATCAAA-TTTTTCGAGTAATTAAGTAAGT---C---TAATGTGT---TTTTTATTGATAAT--A---GAGTTT--GCAATAACATAGGAGGGTAAAACAATTAGTGATTGTTTATAATTAAACGTCTTT--TA---CAATATG------CCTCTGTTAG-A-AATTTACTAAAATTTATG-ATTTGCTTTCTCGTTTGTTTACAGTTTCTTGGTTTACTGAAGGAGAGATAAAAAAATATCAACATGTTAGATGTCCGTGTATAACAAC-GTTTGATATATTAACGTTTTTTAATG-T-CTCTCAGTT--T---ATGTT-AAACATAAT
gi|4                          :                                                                                      AGTGCATATCTATTTGT-T----CAACAGTTATTATTAGCTATA-TACT-AG-----AAGAAG--------TTTT-ATTGATTTTAAGT-CA-TACATGTTCTCNNNN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNNNNNNNNNN---------CATGTTCATACATGT-TCGT-GCCAAATCAATGCAAAA---G-TTT---T-A---AC------AAT---TACAAAAG-T----------------------CGGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGATTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT--A---AAGTGT--TAAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-AGTTTACTAAAATGTATG-ATTT-CTTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA--TGTCCACGTGTTAGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-G-TTCTTT-TT--TGA-A-ATTAATACGAA--GGTTTATT------CCTGTTCGAAGTacctcgtacaagatgaattattgaaaaaaaataatgaagtttagtttaatgtttt
gi|5                          :                                                                                     tgGTGCATATTTATTTGT-T----TAACAGTTAACATAAGCTATA-TACT-AG-----AAAAAAA--------TTT-ATTGATTTTAACT-TT-TACAGGTTCTCATCN--N----NNNN------NN--NNNN---NNNN-----------------NN-----NNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCACACACAAAACA-TGTACGT-ATGTACGTGCCAAATCAATGCAACAGTTT-TAAAA--T-TACA-AACGTTTAGTCATA-TTTTACGAGTAAGAAGGTTATT---T---CATTATGT---TGTATATTAATTAT--A---AAGTGT--TCAATATCAA---------------------GTTGTTTATTATAGAGCTTCTTT--TA---CAGGATG------CTTCTGAAAG-A-CATTTACTAAAATGTATG-ATTT-ATTTATTGTTTGTT------------G---ATTGAATAAGAGACAAAAA--TGTCCA-ATGCTGGGCCTCTGTGTATAAAATC-GTTTGATATAATTAC--TTCTTATTT-T-TTCT-TATT--TGAAAT-TTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                       TTTAAATTCATATATA-TTTTACATCA--T----ACAA------AA--CATA---TATG-----------------AA-----ATACGATT-ACGC-GACAAATCAATACAAAA---A-GTG---T-A---AC------GTT---TATACAAT-TT-CAAAA--CCTACATTGCCCTCAATCACA-TTTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCAATCAC--A------TTT--TCAATAACAACTGAGGATTAA-CGCTTGTTGTTTGTTTATGATGT--CGTACTT--TA---TATAAAG------CATCGGAAAG-A-AATTGACTAATATTTGTA-ATAG-CTGTACTATTTATT------------G---ATTGGAGAAGACATAAACA--TTTCAACATGTTAGGTCTCCGTGTATAAAATC-GTTTGGTATATTTAC--TTCTAGTTT-CTCTATATAAC--GGACATATTAAAACAATATGG--CGTT------Ccaataacaactgaggattaacgcttgttgtttgtttatgatgtcgtactttatataaagcatcggaaagaaattgactaatatttgtaatagctgtactatttattgattggagaagacataaacatttcaacatgttaggtctccgtgtataaaatcgtttggtatatttacttctagtttctctatataacggacatattaaaacaatatggcgttcgactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|7                          :                    tttaaattcatatatattttacatcatacaaaacatatatgaaatacgattacgcgacaaatcaatacaaaaagtgtaacgtttatacaatttcaaaacctacattgcccATAGA-AA-----AAGAAGAA--T--TTTT--ATTGATTTAAACC-TT-TAAAGTTTCTCATCAACT----ATAACATAAAAA--CATAAATTATAGA---------------CA-----ATACATTT-ACCT-AATAAATCAATGCACAA---A-TTT---T-A---AC------AAT---AACAAAAG-TT-TAACA--TATACATAGCTCTCAATCACA-TTTT-CGAGAAAGAAGGTAATTATTT---TATTATGT---TCTATATTAATTAT--ATAAAAAAAT--TCAATATCAAAGGAAGATGAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATAGAACTTCTTT--TA---CATAATG------CTTCTGAAAG-T-AGTTTACTAAACTTTGTG-ATTT-CTTTATTGTTTCTT------------G---ATTGGAGAAGGAATAAAAA--gactattaaataaaggcaaaaacgtttatggcgtttacttcgttttgttctccaccataccttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                atacttatttctatatagttataccttaaactacatgtatgtattgatTT-ATGT-GACAAATCAATGCAAAT---G-TTT---T-G---AT------AAT---TATAATAG-TT-AAA-A--TCTACATAAATCTCAATCACA-GTTTTTAGGTAAGAAGATAATT---CAAATATCATCTACATGTATATTGATTAT--A---CAGTTT--TCAACATCAAATGAGGGTAAA-CGCTTATTGGTTGTTTATTATGTAACGTCTTT--TA---CATAATGATACTACCTCTGAACG-A-CAGTTACTAAAATTT-TA-AT----TGTATAGTTTGTG------------T---ATTGATAAAGTGATCAATA--TTTAAACATGTTAGCTTTCTGTTTATAAaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                    A-----ACACATTT-ACGT-GGCAATTTAATGCGCAA---G-TTT---TTA---AC------AGT---TATAAAAG-TT-CAAAT--TCTACATATCACTCGATCATA-TTCTTCGAATAAGGAGGTAATT---T---TATTATGT---TTTATACTAATAAT--A---AAATGT--TCAATATTAAAGCAGAATGAA-CATTCAATGATTGTTTATTATGAAACGTTTTTGATATAGCACAATG------CTTCTGAAAG-A-AATTTACCAACATTTATT-ATTC-CTTTATTGTCTGTT------------G---ATTATAGCAGAGATAAAAA--AATCCACTTCTTAAACATTTGTTCCTAATATCAGTTTAATTTGTGCAC--Tgtatcaatgctttttggtccagttataagattgatttccaacacttgaattatcgaaaaaagtgaacaat