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lowQualScore                  :                                .      .              ..      ....       .           . ...                                            ...     .....           .   ..                               . .       .         .                . .  . ....                    ..         ....      .  ..  .     ........  .... . . .    .          .   .              . .     .     .....     .        ......         .               .         ..  .    .      . . .  . .   .. .. ..  .                  
lowQualScore                  :                                0      7              88      5555       2           0 111                                            222     22222           7   77                               5 6       1         5                2 7  2 6666                    66         7777      3  00  4     66666666  0000 4 4 4    7          5   0              9 5     5     88888     5        444444         6               5         77  5    5      5 1 5  5 5   11 11 11  5                  
consensus                     :                    TTTCAATATAACACGTTGTCGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATGTACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTTATTTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATACAAGCAATGGTTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
Reference ( gi|5 )            :                    TTTCAATATAACCCGTTGTCGTTATATTTACACA-CGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTATTTTCTTCAACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATATACATT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTAATTTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAAAAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATACAATCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|14                         :                    TTTTAATATAACACGTTGTGGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTGTATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAGTTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTATTTCCTTCTACG--CAAGCGTGTGTTGTGTGTTGTTATCCATGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTT-T-AT-A---TTTTTGAGTAT-----------------CAAA----ATATACTTT--TA-TTTTT--------TA----T-A-C-TTTTTAATTACATAA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGTTACATGTATATACAAGCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAATAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AGGTCAATAACGTCTTCT
gi|19                         :                    TTTCAATATAACACGTTG-----ATAT---------GATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGAAAATTCTACCGTTTAC---ATGCG-----GTATTTTCTTCTACG--CAAATGTATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTA--CTAATTATCTATTTGCACAGTGAGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--AA-ATTTG--------TA----T-A-C-TCTTAATTTACATGA-ATA-TCAAATAAACAG--------AC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGC------AATATACAATCAATGGTTAC-ACAATTTTACAAAT--AG-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AAGTCAAAAACGTCTTCT
gi|6                          :                     TTCAATATAACACTTTGTCGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTAGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTAATTTACATGA-ATA-TCAAATTAATAGAATAGCCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATGCAATCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCGAATACGTCTTCT
gi|7                          :                     TTCAAAATAACACGT---CGTTATATTAACACA-TGATATA----AACTGTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTGGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGCTATAAATG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------CA----T-A-C-TTTTAATTTACATAA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-TCACAGGT------TATATACAATCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--CATAC-ATGTCAAAATCGTCTTCT
gi|2                          :                     TTCAATATAACACGTTGTCTTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTATTTCCTTCTACG--CAAGCGTATGTTGTCTGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A----CTTTGAGTGTGATATACTAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTTAATTACATGA-ATA-TCAAATAACTAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATGTACAAGCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AATAAAA-AAAGAC-G-A-AA-A-ATAACA--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|4                          :                    cTTTAATATAACA---TGTCGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTCAACTGTGGTAAGTTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCATTTTCTTCTATG--CAAACGTATATTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGAATATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATCATAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTTATTTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAAATATTTATAA-GCACAGGT------TATATACAAGCAATGGTTACAACAGATTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-A-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTC-AAAACATCTTCT
gi|15                         :                    aTTCAGTATAACACGTTGTCATTATATTTGCCCA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTT----------GTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCATGAACATTG-T-TT-A---TTTTTGAGTGTGATAAAATAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-C-C-TTTTTATTTACATAA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGACAAC-TGAAA-----TTTAA-ACACAGGT------TATATACAAGCAATGGTTACAATAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAT-G-A-AA-C-ATG--G--C--AC-ATGTTAAAAACGTCTTCT
gi|29                         :                     TTCAATATAACACGTT------ATATTTACACA-TGGTATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTAATGTGGATTTATCTTAAGTCGTGGTAAATTCTACTGTTTACAAAATGTACTT--TTATTTTTT
gi|41                         :                  ttaTTCA-TATAACACGTTGTCGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTACATTGATGC---GCACTGTGGATTTATataccttttatttacatgaatataaaataaacagaatatgcaacagaaatataaacacaggttatatacaagcaatggttacagtaactttacaaataaaaaataagatgaataatagcacatgtcaaaaacgtcttct
gi|8                          :                      TCAATAAAACACGTTGTGGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTGTATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGTT-----TTATTTCCTTCTACG--CAAGCGTATGTTGTGTGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTT-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-TTTTT--------TA----T-A-C-TTTTTAATTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAGC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATACAAGCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AGGTCAAAAACGTCTTCt
gi|9                          :                     cTCAATATAACACGTTATTGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG----ATATTGATGT---GTACTGTGGACTTATCTAAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCGTAATCTTCTACG--CAAACGTATATTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-GT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATGTATCTT--TA-ATTTT--------CA----T-A-C-TTTTTATTTGCATGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TGTAA-ACACAGGT------TTTATACAAGCAATGGTTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAC-TAAGAC-GAA-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|3                          :                      TCAATATAACACGTTGTTGTTATATTCACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGTATTTATCTTAAATCATGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCATTTTTTTCTACG--CCAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAAGTTATTTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAAT---TTTTATTTT--TA-TTTTT--------TA----T-A-C-TATTTATTTACATG--ATAGTCAAATAAATAGAATATGCAACATAAAA------ATAA-ACACAGGT------GATATACAAACAATGGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-GAA-AA-A-ATA--G--C--ACAATATCAAAAACGTCTTCT
gi|24                         :                      TCAATATAACATGCTGTTGTTATATTTACACA-CAATATA----AAGTTTG-TTTATATTAATGA---GTACTGTGGATTTATCTTACATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCTTGTG-----TAATTGTCTTTTTGCCCAGTGCGTGAACATTA-A-AA-A------TAAAGTGTGATAAAACAG--TTAAACAAA----ATGTGT-TT--TATATGTT--------TA----T-A-CTTTTTTATTTAAATGC-ATA-TCAAATAGATAGAATATGCAAC-
gi|1                          :                      TCAATATAACACGTT------ATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG----------ATGT---GTAATGTGGATTTATCTTAAATCAAGGTAAATTCTATTGTTTAT---GTGCG-----TCATTTTCTTCGATG--CGAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAG--ATGAACAAA----ATGTATTTT--TA-ATTTTTAACATTGTA----T-A-T-TTTTGATT---GTGATATA-ATAGATAAACAAAAatgtagtaccatttgaaaacatttaatgcgcactg
gi|32                         :                      TCAATATAACACGTTGTCGTTATATTTACACA-TGATATA----AACAATG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTGTTTTCTTCTACG--CACACGTA-------------TATCCGTGTGTAGGGTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTTATATAATAG--Atgtatttttaatttttatactttttatttacataaatatcaaataaatagaatatgcaacagaaatataaacacaggtgatatacaagcaatggttacaacaactttacaaataaagaataagacaaaaaaagcacatgtcaaaaacgtcttct
gi|22                         :                      TCAATATAATGTGTTGTTGTTATATTTACACA-TTATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAT---ATGCG-----TCATTTTCTTCTAGG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAATGCGTGAACATTG-T-A--A------TTAAGTGTGATATAATAG--AAAAACAAA----ATGT--GTT--TA-AT
gi|25                         :                      TCAATTTAACACGTTGTTGTTATATTTACACA-TGATATA----ACCTTTG-TTTATATTAATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAACTCTACTGTTTAT---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-ATCA--------AAGTGTGATATAATAA--AAAAACAAA----gagattacttggcatttcagacatcgtgaataatgattcttgtttgaaaatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
gi|20                         :                      TCAATATAAGACATTGTTGTTATATTTACACA-TGATATA----AAATTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTAAT---ATGCG-----TCATTTTCTTCTATG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTGTA-ATTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACA-TG-TAAT-A--------AAGTGTGATATAATAGAAAAAAACAAA----ATGTctgtttttcatgagattacttttgtgaataatgaatctgtttgacgatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|30                         :                      TCATTATAACATGTTGTTGTTATATTTACAC---GATATA------CTTTGGTTTATATTGATTT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAACTCTACTGTTTAC---ATGCA-----ACATTTTCTTCTACG--CAACCGTATACTGTGCGTTGTTATGCGTGTGTAGGCTAATTGACTATTTGCCCAGTGCGCGAACATTG-T-AT-ATTTTTTTTAATTGTGATATAATAC--TTAAACAAA----ATgtttcatgcgattactttgtgtttcagacattgtgaataatgattcttgtttaaagatcttatgtttatattcatatcaaacgactgtcaatat
gi|33                         :                     cTCAATATAACACAATGTTGTTACATCTAGGTA-TAATATA----AACTTTG-TTCATATTAATGT---GCACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTTAATTCTACTGTTTAC---ATTCG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTATTATCCATGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---T
gi|23                         :                      TCAATATAACACGTTGT---TATATTTACCCA-TGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTTCTGTTTAT---ATGCGTCTTTTTATTCTGTTGTACGTTC---TGTATGTTGAACGTTGTTATCAGTGTG------AATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTGAA-AC-A--------AAGTGTGATATGATAT--AAAAACAAA----ATGT
gi|13                         :                       CAATATTACACATTGTCGTTATATATACACA-TGATAAA----AACTTTG-TTTATATTGTTGTACAGTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGCG-----TCTTTTTCTTCTACG--CAAATGTATGTTGTGCGTTGTTCTCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGTAAAGTGCGTGAACATT--T-AT-ATT-TTTTTGAGCGTGAAATAATAG--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------T----------------ATTTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATACAAGCAATGGTCACAACAACTTTATAAAT--AT-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACTTTTTCTgtttcatgagattacgttgtgtttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
gi|21                         :                       CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACA-TGATATACATAAACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTAT---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACATATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-TAAC-A--------AAGTGTGATATAATAG--AAAAACAAA----ATGT
gi|28                         :                       CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACA-TGAAATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAAGCGTGGTGCATTCTACTGTTTAT---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACA--CAAATGTATGTTGTACGTTATTAACCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A--------AAGTGTGATATAATAA--AAAAACAAA----ATG---------A-ATTTTA-------TAAGATT-A-C-TTTgtttcatgagatcactttgcatttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|31                         :                       CAATATAACAACTTATTGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTAGATTGAT--------------------CTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAT---ATGCG-----TCATTTTCTTCTACA--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGACTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A--------AAGTGTGAAATAATAG--AAAAACAAA----ATGTgcgtttcagacattgaaaataatga
gi|17                         :                        AAAATAACACGTTGTCGTTATATTTACACA-TGATACA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACGGTGGATTTATCTTAAAT----------TCTACTGTTTAC---ATGCG-----TTATTTTCTTCTATG--CAAACGTATGTT-TGCGTTGTTATCCTTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTTGAGTGTGATATAATAA--ATAAACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTAATTTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAAAAGGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATACAATCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT-----AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTGCTgtt
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gi|11                         :                          TATAACACGTTGTGGTTATATTTACACA-TGATATA----AACTTTG-TTTTTATTGATGT---ATACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTAC---ATGTG-----TTATTTCCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTGTGTTGTTATCCGTGTGTAAGCTAAATGCCTATTTGCACAGTGCGAGAACATTT-T-AT-A---TTTTTGAGCGTGATATAATAG--AT-AACAAA----ATATACTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTTAATTACATGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-TGAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATACAAGCAATGGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-GAAC-TAAGAC-G---AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACTTCTTCT
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gi|32                         :                                          ataacaTACACATCAATATA----AACATTG-TTTATATC-ATGT---GTA
gi|27                         :                                                                                                                   tcaatataacacgttgtcgttatattG-----TCATTTTCTTCTACG--CAAACGTATGTTGTCCGTTGTCATCCGTATGTAAGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCACTG-T-AT-A---TTTTTAAGTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATGT---TT------TTTT--------TA----T-A-C-TTTTTGTTTACATGA-AAG-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAA-ACACAGGT------TATATAAAAGCAATCGGTACAAC---TTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AATA-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTTTTCTctgtggatttatcttaaatcgtggtaaattctactgtttacatgcgttgttttcttctacgcacacgtatatccgtgtgtagggtaattgtctatttgcacagtgcgtgaacattgtatatttttgagtgttatataataga
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                 AACATTG-T-AT-A---TTTTTGATTGTGATATAATAG--ATAAACAAA----ATGTATTTT--TA-ATTTT--------TA----T-A-C-TTTTTATTTACATAA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAA-ACACAGGT------GATATACAAGCAATGGTTACAACAACTTTACAAAT--AA-AGAA-TAAGAC-A-A-AA-A-A-A--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|34                         : tcaatataacacgttatatttacacatgatataaactttgatgtgtaatgtggatttatcttaaatcaaggtaaattctattgtttatgtgcgtcattttcttcgatgcgaacgtatgttgtgcgttgttatccgtgtgtaggctaattgtctatttgcccagtgcgtgaacattgtatatttttgagtgtgatataatagatgaacaaaatgtatttttaatttttATTG-T-AT-A---TTTTTAAGTGTGATATAATAG--ATAAGCAAA----ATGTTTTTTGTTT-TTTTT--------TA----T-G-C-TTTTTATTTACATGA--TAGTCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAA-ACACAGGC------TATATACAAGCATTGGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGACAA-A-AA-A-ATA--G--C--AC-TTGTC--AAACGTTTTCT
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                TTTCAATATAACACGTTG-------------ATATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGAAAATTCTACCGTTTACATGCGGTATTTTCTTC-----TACG--CAAATGTATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTA--CTAATTATCTATTTGCACAGTGAGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--AA----ATTTG--------TATAC-TCTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAACAG--------AC-TGAAA-----TATAAACACAGGC------AATATACAATCAAT-GGTTAC-ACAATTTTACAAAT--AG-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AAGTCAAAAACGTCTTCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACGTTGTCTTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTCCTTC-----TACG--CAAGCGTATGTTGTCTGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A----CTTT--GAGTGTG--ATATA---CTAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTTAATT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAACTAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATGTACAAGCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AATAAAA-AAAGAC-G-A-AA-A-ATAACA--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                 cTCAATATAAGACATTGTTGTTATATTTACACATGATATA----AAATTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTAATATGCGTCATTTTCTTC-----TATG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTGTA-ATTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACA-TG-TAAT-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAGAA-AAAAACAA--A-ATGTG-TTT--CATGCGAT-------------TAC-TTTGTGTTTCAGACATTGTGA-ATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                   CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGATATACATAAACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACATATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-TAAC-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGTGTTTatgattcttgtttaaagatcttatgtttatattcatatcaaacgactgtcaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAATGTGTTGTTGTTATATTTACACATTATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TAGG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAATGCGTGAACATTG-T-A--A------TT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGTG--TT--TA----ATcatgagatcactttgcatttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACGTTGT---TATATTTACCCATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTTCTGTTTATATGCGTCTTTTTATTCTGTTGTACGTTC---TGTATGTTGAACGTTGTTATCAGTGTG------AATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTGAA-AC-A----------AAGTGTG--ATATG---ATAT---AAAAACAA--A-ATGTGTTTgagattacttggcatttcagacatcgtgaataatgattcttgtttgaaaatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACATGCTGTTGTTATATTTACACACAATATA----AAGTTTG-TTTATATTAATGA---GTACTGTGGATTTATCTTACATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCTTGTG-----TAATTGTCTTTTTGCCCAGTGCGTGAACATTA-A-AA-A------TA--AAGTGTG--ATAAA---ACAG---TTAAACAA--A-ATGTG-TTT--TAT---ATGTT--------TATACTTTTTTATTT---AAA---TGC-ATA-TCAAATAGATAGAATATGCAAC-catgagattacgttgtgtttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATTTAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGATATA----ACCTTTG-TTTATATTAATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAACTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-ATCA----------AAGTGTG--ATATA---ATAA---AAAAACAA--A-CTGT--TTT--TC----ATatgtagtaccatttgaaaacatttaatgcgcactg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                    AATATAACATGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TT----------------ACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACATATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGAGTGAAATATAAACACAGGTTATAAACAATCA-ATGgagattacttttgtgaataatgaatctgtttgacgatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATAAACAATCAAT-GGTTACAACAGTTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--GCAC--AC-ATGTTCAAAACGTCTTCTgttacaacagttttacaaataaaaaataagacgaaaaatagcacacatgttcaaaacgtcttct
gi|27                         :                                                                                                                                                       aatataacatgttgtcgttatatttacacatgatataaactttgttactgtggatttatcttaaatcgtggtaaattctactgtttacatgcgttattttcttctacgcaaacatatgttgtgcattgttatccgtgtgtaggctaattgtctatttgcacagtgcgtgaacattgtatatttttgagagGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTCCGTTGTCATCCGTATGTAAGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCACTG-T-AT-A---TTTTT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATGT--TT----------TTTT--------TATAC-TTTTTGTTT---ACA---TGA-AAG-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAAACACAGGT------TATATAAAAGCAATCGGT----ACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AATA-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTTTTCT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                   CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGAAATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAAGCGTGGTGCATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACA--CAAATGTATGTTGTACGTTATTAACCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAA---AAAAACAA--A-ATGAATTTTA-TA----AGAT-----------TAC-TTTGCGTTTCAGACAT--TGA-AAA-T
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACGTT------ATATTTACACATGGTATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTAATGTGGATTTATCTTAAGTCGTGGTAAATTCTACTGTTTACAaatga
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaACAA--A-ATGTACTTT--TA----TTTTT--------TATAC-CTTTTATTT---ACA---TGA-ATA-TAAAATAAACAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAGTAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAT-G-A-AT-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCTaaatgtacttttattttttataccttttatttacatgaatataaaataaacagaatatgcaacagaaatataaacacaggttatatacaagcaatggttacagtaactttacaaataaaaaataagatgaataatagcacatgtcaaaaacgtcttct
gi|3                          :                                                                                                                               ttattcaatataacacgttatatttacacatggtataaactttgtttatattgatgtgtaatgtggatttatcttaagtcgtggtaaattctactgtttTCAATATAACACGTTGTTGTTATATTCACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGTATTTATCTTAAATCATGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTTTTC-----TACG--CCAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAAGTTATTTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--ATTTTTATTTT--TA----TTTTT--------TATAC-TATTTATTT---ACA---TG--ATAGTCAAATAAATAGAATATGCAACATAAAA------ATAAACACAGGT------GATATACAAACAAT-GGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-GAA-AA-A-ATA--G--C--ACAATATCAAAAACGTCTTCT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCATTATAACATGTTGTTGTTATATTTACAC--GATATA------CTTTGGTTTATATTGATTT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAACTCTACTGTTTACATGCAACATTTTCTTC-----TACG--CAACCGTATACTGTGCGTTGTTATGCGTGTGTAGGCTAATTGACTATTTGCCCAGTGCGCGAACATTG-T-AT-ATTTTTTTT--AATTGTG--ATATA---ATAC---TTAAACAA--A-AT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                  cCAATATAACAACTTATTGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTAGATTGAT--------------------CTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACA--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGACTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A----------AAGTGTG--AAATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACAATG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTGTTTTCTTC-----TACG--CACACGTA-------------TATCCGTGTGTAGGGTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTT--ATATA---ATAG---Agtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACAATGTTGTTACATCTAGGTATAATATA----AACTTTG-TTCATATTAATGT---GCACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTTAATTCTACTGTTTACATTCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTATTATCCATGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---T
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTG-T-AT-A---TTTTT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAGCAA--A-ATGTTTTTTGTTT----TTTTT--------TATGC-TTTTTATTT---ACA---TG--ATAGTCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAAACACAGGC------TATATACAAGCATT-GGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGACAA-A-AA-A-ATA--G--C--AC-TTGTC--AAACGTTTTCT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTCTG--ATATT---AAAG---ATAAACAA--A-ACGTGTTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TATTTATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAT-TAAGAC-G-ACAA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T--------TA-AC-TTTTTAGTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAACTTAATAG----AA-AAAA-TAAGAC-A-A-AA-ACATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACATCTTC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                      TATAACACGTTGTGGTTATATTTACACATGCTATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---ATACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTAGTGTTTACATGCGTTACTTCCTTC-----TACG--CAAACGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               acTTTAATATAACA---TGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTCAACTGTGGTAAGTTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTCTTC-----TATG--CAAACGTATATTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGAATATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATC---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTTATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAAATATTTATAAGCACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAGATTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-A-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTC-AAAACATCTTCT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTATACAATCAAT-TGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-GAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACCTCTTCT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                gTTCA-TATAACACGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTACATTGATGC---GCACTGTGGATTTAT
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGTATGTTGTGCATTG--A---------AGGCTAATTGTC--------CAGTGCGTGAACAT---T-AT-A---TTTTt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                TTTCAATATAACCCGTTGTCGTTATATTTACACACGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----AACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACATT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAAAAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACTTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTAGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATTAATAGAATAGCCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATGCAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCGAATACGTCTTCT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                    AATATAACACATTGT---TATATTTACACATGATAGA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAACTGTACTGTTTACATGTGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAAC--ATGT-GTGCATTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCAAGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---TTAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTC--------TATAC-TTTTTATTT---ACG---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTT---ACAACTTTACAAATA-AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--A--C--AC-ATGTCAAAAATGTCTTC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                    AAAATAACACGTTGTCGTTATATTTACACATGATACA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACGGTGGATTTATCTTAAAT----------TCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TATG--CAAACGTATGTT-TGCGTTGTTATCCTTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAA---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAAAAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT-----AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTGCT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                       ATAACACGTT------ATATTTACACATGATAGA----AACT--G-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTGTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAAC--ATGT-GTGCATTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCAAGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---TTAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTC--------TATAC-TTTTTATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTT---ACAACTTTACAAATAAAA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--A--C--AC-ATGTCAAAAATGTCTTCT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                TTTCAATATAACACGTTG-------------ATATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGAAAATTCTACCGTTTACATGCGGTATTTTCTTC-----TACG--CAAATGTATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTA--CTAATTATCTATTTGCACAGTGAGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--AA----ATTTG--------TATAC-TCTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAACAG--------AC-TGAAA-----TATAAACACAGGC------AATATACAATCAAT-GGTTAC-ACAATTTTACAAAT--AG-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AAGTCAAAAACGTCTTCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACGTTGTCTTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTCCTTC-----TACG--CAAGCGTATGTTGTCTGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A----CTTT--GAGTGTG--ATATA---CTAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTTAATT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAACTAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATGTACAAGCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AATAAAA-AAAGAC-G-A-AA-A-ATAACA--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                 cTCAATATAAGACATTGTTGTTATATTTACACATGATATA----AAATTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTAATATGCGTCATTTTCTTC-----TATG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTGTA-ATTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACA-TG-TAAT-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAGAA-AAAAACAA--A-ATGTG-TTT--CATGCGAT-------------TAC-TTTGTGTTTCAGACATTGTGA-ATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                   CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGATATACATAAACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACATATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-TAAC-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGTGTTTatgattcttgtttaaagatcttatgtttatattcatatcaaacgactgtcaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAATGTGTTGTTGTTATATTTACACATTATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TAGG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAATGCGTGAACATTG-T-A--A------TT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGTG--TT--TA----ATcatgagatcactttgcatttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACGTTGT---TATATTTACCCATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTTCTGTTTATATGCGTCTTTTTATTCTGTTGTACGTTC---TGTATGTTGAACGTTGTTATCAGTGTG------AATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTGAA-AC-A----------AAGTGTG--ATATG---ATAT---AAAAACAA--A-ATGTGTTTgagattacttggcatttcagacatcgtgaataatgattcttgtttgaaaatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACATGCTGTTGTTATATTTACACACAATATA----AAGTTTG-TTTATATTAATGA---GTACTGTGGATTTATCTTACATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCTTGTG-----TAATTGTCTTTTTGCCCAGTGCGTGAACATTA-A-AA-A------TA--AAGTGTG--ATAAA---ACAG---TTAAACAA--A-ATGTG-TTT--TAT---ATGTT--------TATACTTTTTTATTT---AAA---TGC-ATA-TCAAATAGATAGAATATGCAAC-catgagattacgttgtgtttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                    AATATAACATGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TT----------------ACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACATATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGAGTGAAATATAAACACAGGTTATAAACAATCA-ATGgagattacttttgtgaataatgaatctgtttgacgatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATAAACAATCAAT-GGTTACAACAGTTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--GCAC--AC-ATGTTCAAAACGTCTTCTgttacaacagttttacaaataaaaaataagacgaaaaatagcacacatgttcaaaacgtcttct
gi|27                         :                                                                                                                                                       aatataacatgttgtcgttatatttacacatgatataaactttgttactgtggatttatcttaaatcgtggtaaattctactgtttacatgcgttattttcttctacgcaaacatatgttgtgcattgttatccgtgtgtaggctaattgtctatttgcacagtgcgtgaacattgtatatttttgagagGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTCCGTTGTCATCCGTATGTAAGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCACTG-T-AT-A---TTTTT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATGT--TT----------TTTT--------TATAC-TTTTTGTTT---ACA---TGA-AAG-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAAACACAGGT------TATATAAAAGCAATCGGT----ACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AATA-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTTTTCT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                   CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGAAATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAAGCGTGGTGCATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACA--CAAATGTATGTTGTACGTTATTAACCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAA---AAAAACAA--A-ATGAATTTTA-TA----AGAT-----------TAC-TTTGCGTTTCAGACAT--TGA-AAA-T
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACGTT------ATATTTACACATGGTATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTAATGTGGATTTATCTTAAGTCGTGGTAAATTCTACTGTTTACAaatga
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaACAA--A-ATGTACTTT--TA----TTTTT--------TATAC-CTTTTATTT---ACA---TGA-ATA-TAAAATAAACAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAGTAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAT-G-A-AT-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCTaaatgtacttttattttttataccttttatttacatgaatataaaataaacagaatatgcaacagaaatataaacacaggttatatacaagcaatggttacagtaactttacaaataaaaaataagatgaataatagcacatgtcaaaaacgtcttct
gi|3                          :                                                                                                                               ttattcaatataacacgttatatttacacatggtataaactttgtttatattgatgtgtaatgtggatttatcttaagtcgtggtaaattctactgtttTCAATATAACACGTTGTTGTTATATTCACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGTATTTATCTTAAATCATGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTTTTC-----TACG--CCAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAAGTTATTTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--ATTTTTATTTT--TA----TTTTT--------TATAC-TATTTATTT---ACA---TG--ATAGTCAAATAAATAGAATATGCAACATAAAA------ATAAACACAGGT------GATATACAAACAAT-GGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-GAA-AA-A-ATA--G--C--ACAATATCAAAAACGTCTTCT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCATTATAACATGTTGTTGTTATATTTACAC--GATATA------CTTTGGTTTATATTGATTT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAACTCTACTGTTTACATGCAACATTTTCTTC-----TACG--CAACCGTATACTGTGCGTTGTTATGCGTGTGTAGGCTAATTGACTATTTGCCCAGTGCGCGAACATTG-T-AT-ATTTTTTTT--AATTGTG--ATATA---ATAC---TTAAACAA--A-AT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                  cCAATATAACAACTTATTGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTAGATTGAT--------------------CTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACA--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGACTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A----------AAGTGTG--AAATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACAATG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTGTTTTCTTC-----TACG--CACACGTA-------------TATCCGTGTGTAGGGTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTT--ATATA---ATAG---Agtt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACAATGTTGTTACATCTAGGTATAATATA----AACTTTG-TTCATATTAATGT---GCACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTTAATTCTACTGTTTACATTCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTATTATCCATGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---T
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTG-T-AT-A---TTTTT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAGCAA--A-ATGTTTTTTGTTT----TTTTT--------TATGC-TTTTTATTT---ACA---TG--ATAGTCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAAACACAGGC------TATATACAAGCATT-GGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGACAA-A-AA-A-ATA--G--C--AC-TTGTC--AAACGTTTTCT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTCTG--ATATT---AAAG---ATAAACAA--A-ACGTGTTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TATTTATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAT-TAAGAC-G-ACAA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGTG--ATATA---ATAG---ATAA-CAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-CTTTTAATT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-GAAC-TAAGAC-G---AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACTTCTTCT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T--------TA-AC-TTTTTAGTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAACTTAATAG----AA-AAAA-TAAGAC-A-A-AA-ACATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACATCTTC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                      TATAACACGTTGTGGTTATATTTACACATGCTATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---ATACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTAGTGTTTACATGCGTTACTTCCTTC-----TACG--CAAACGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                               acTTTAATATAACA---TGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTCAACTGTGGTAAGTTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTCTTC-----TATG--CAAACGTATATTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGAATATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATC---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTTATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAAATATTTATAAGCACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAGATTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-A-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTC-AAAACATCTTCT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTATACAATCAAT-TGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-GAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACCTCTTCT
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                gTTCA-TATAACACGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTACATTGATGC---GCACTGTGGATTTAT
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGTATGTTGTGCATTG--A---------AGGCTAATTGTC--------CAGTGCGTGAACAT---T-AT-A---TTTTt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                TTTCAATATAACCCGTTGTCGTTATATTTACACACGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----AACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACATT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAAAAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACTTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTAGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATTAATAGAATAGCCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATGCAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCGAATACGTCTTCT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAAAATAACACGT---CGTTATATTAACACATGATATA----AACTGTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTGGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--CTATA---AATG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------CATAC-TTTTAATTT---ACA---TAA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAATCACAGGT------TATATACAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--CATAC-ATGTCAAAATCGTCTTCT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATAAAACACGTTGTGGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTGTATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGTTTTATTTCCTTC-----TACG--CAAGCGTATGTTGTGTGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTT-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----TTTTT--------TATAC-TTTTTAATT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAGC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AGGTCAAAAACGTCTTC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 cTCAATATAACACGTTATTGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG----ATATTGATGT---GTACTGTGGACTTATCTAAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCGTAATCTTC-----TACG--CAAACGTATATTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-T-GT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATGTATCTT--TA----ATTTT--------CATAC-TTTTTATTT---GCA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TGTAAACACAGGT------TTTATACAAGCAAT-GGTTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAC-TAAGAC-GAA-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   T                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   G                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                G     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                T                   A                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                T     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   C                     .          .             .                                                              .        .                                .                   C                . .  . T       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                .     .     .                 .                   .                     .   .    .      . . .  . .   .  .  .   .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   G                     .          .             .                                                              .        .                                .                   A                . .  . .       .        .      .      .          .  .         .   .        .            .         .     .     .   .                                                                                                                                
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): ATAGAAAGTAAATTATACAAGAACACAGGTGGGTTTGAAACATGAGAATATGCGCTTTTAGACATTGTAAATATTAATTCTTGTTTGAAATCTGAATTTTATACTGAT
Unaligned ( gi|42 ): GAATCATGAGAATATTGCGTTTTTAGACATTGTAAATAATGTTCTTGTCTGAAAAT






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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                TTTCAATATAACACGTTG-------------ATATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGAAAATTCTACCGTTTACATGCGGTATTTTCTTC-----TACG--CAAATGTATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTA--CTAATTATCTATTTGCACAGTGAGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--AA----ATTTG--------TATAC-TCTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAACAG--------AC-TGAAA-----TATAAACACAGGC------AATATACAATCAAT-GGTTAC-ACAATTTTACAAAT--AG-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-AAGTCAAAAACGTCTTCT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAATATAACACGTTGTCTTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTCCTTC-----TACG--CAAGCGTATGTTGTCTGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A----CTTT--GAGTGTG--ATATA---CTAG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTTAATT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAACTAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATGTACAAGCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AATAAAA-AAAGAC-G-A-AA-A-ATAACA--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                 cTCAATATAAGACATTGTTGTTATATTTACACATGATATA----AAATTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTAATATGCGTCATTTTCTTC-----TATG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTGTA-ATTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACA-TG-TAAT-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAGAA-AAAAACAA--A-ATGTG-TTT--CATGCGAT-------------TAC-TTTGTGTTTCAGACATTGTGA-ATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                   CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGATATACATAAACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATTGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACATATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-TAAC-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGTGTTTatgattcttgtttaaagatcttatgtttatattcatatcaaacgactgtcaatat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAATGTGTTGTTGTTATATTTACACATTATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TAGG--CAAACGTATGTTGTACGTTGTTATCCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAATGCGTGAACATTG-T-A--A------TT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---AAAAACAA--A-ATGTG--TT--TA----ATcatgagatcactttgcatttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACGTTGT---TATATTTACCCATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAATCGTGGTAAATTCTTCTGTTTATATGCGTCTTTTTATTCTGTTGTACGTTC---TGTATGTTGAACGTTGTTATCAGTGTG------AATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTGAA-AC-A----------AAGTGTG--ATATG---ATAT---AAAAACAA--A-ATGTGTTTgagattacttggcatttcagacatcgtgaataatgattcttgtttgaaaatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACATGCTGTTGTTATATTTACACACAATATA----AAGTTTG-TTTATATTAATGA---GTACTGTGGATTTATCTTACATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCTTGTG-----TAATTGTCTTTTTGCCCAGTGCGTGAACATTA-A-AA-A------TA--AAGTGTG--ATAAA---ACAG---TTAAACAA--A-ATGTG-TTT--TAT---ATGTT--------TATACTTTTTTATTT---AAA---TGC-ATA-TCAAATAGATAGAATATGCAAC-catgagattacgttgtgtttcagacattgtgaataatgattcttgtttgaagatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatatt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                    AATATAACATGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACTTTG-TT----------------ACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACATATGTTGTGCATTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGAGTGAAATATAAACACAGGTTATAAACAATCA-ATGgagattacttttgtgaataatgaatctgtttgacgatcttaagtttatattcatatcagacgactgtcaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATAAACAATCAAT-GGTTACAACAGTTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--GCAC--AC-ATGTTCAAAACGTCTTCTgttacaacagttttacaaataaaaaataagacgaaaaatagcacacatgttcaaaacgtcttct
gi|27                         :                                                                                                                                                       aatataacatgttgtcgttatatttacacatgatataaactttgttactgtggatttatcttaaatcgtggtaaattctactgtttacatgcgttattttcttctacgcaaacatatgttgtgcattgttatccgtgtgtaggctaattgtctatttgcacagtgcgtgaacattgtatatttttgagagGTCATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTCCGTTGTCATCCGTATGTAAGCTAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCACTG-T-AT-A---TTTTT--AAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATGT--TT----------TTTT--------TATAC-TTTTTGTTT---ACA---TGA-AAG-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-ATAAA-----TATAAACACAGGT------TATATAAAAGCAATCGGT----ACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AATA-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTTTTCT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                   CAATATAACACGTTGTTGTTATATTTACACATGAAATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTGATCTTAAAGCGTGGTGCATTCTACTGTTTATATGCGTCATTTTCTTC-----TACA--CAAATGTATGTTGTACGTTATTAACCGTGTG-----TAATTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAACATTG-TAAT-A----------AAGTGTG--ATATA---ATAA---AAAAACAA--A-ATGAATTTTA-TA----AGAT-----------TAC-TTTGCGTTTCAGACAT--TGA-AAA-T
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaACAA--A-ATGTACTTT--TA----TTTTT--------TATAC-CTTTTATTT---ACA---TGA-ATA-TAAAATAAACAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAGTAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAT-G-A-AT-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCTaaatgtacttttattttttataccttttatttacatgaatataaaataaacagaatatgcaacagaaatataaacacaggttatatacaagcaatggttacagtaactttacaaataaaaaataagatgaataatagcacatgtcaaaaacgtcttct
gi|3                          :                                                                                                                               ttattcaatataacacgttatatttacacatggtataaactttgtttatattgatgtgtaatgtggatttatcttaagtcgtggtaaattctactgtttTCAATATAACACGTTGTTGTTATATTCACACATGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGTATTTATCTTAAATCATGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTCATTTTTTTC-----TACG--CCAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAAGTTATTTGTCTATTTGCCCAGTGCGTGAGCATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--ATTTTTATTTT--TA----TTTTT--------TATAC-TATTTATTT---ACA---TG--ATAGTCAAATAAATAGAATATGCAACATAAAA------ATAAACACAGGT------GATATACAAACAAT-GGGTACAACAACTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-GAA-AA-A-ATA--G--C--ACAATATCAAAAACGTCTTCT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCATTATAACATGTTGTTGTTATATTTACAC--GATATA------CTTTGGTTTATATTGATTT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAACTCTACTGTTTACATGCAACATTTTCTTC-----TACG--CAACCGTATACTGTGCGTTGTTATGCGTGTGTAGGCTAATTGACTATTTGCCCAGTGCGCGAACATTG-T-AT-ATTTTTTTT--AATTGTG--ATATA---ATAC---TTAAACAA--A-AT
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                  TCAATATAACACGTTGTCGTTATATTTACACATGATATA----AACAATG-TTTATATTGATGT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTGTTTTCTTC-----TACG--CACACGTA-------------TATCCGTGTGTAGGGTAATTGTCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTT--ATATA---ATAG---Agtt
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T--------TA-AC-TTTTTAGTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAATATGCAAC-AGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAAGCAAT-GGTTACAACAACTTAATAG----AA-AAAA-TAAGAC-A-A-AA-ACATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACATCTTC
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTATACAATCAAT-TGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-GAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACCTCTTCT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                TTTCAATATAACCCGTTGTCGTTATATTTACACACGATATA----AACTTTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----AACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTTGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--ATATA---ATAG---ATAAACAA--A-ATATACATT--TA----ATTTT--------TATAC-TTTTAATTT---ACA---TGA-ATA-TCAAATAAATAGAAAAGGCAAC-TGAAA-----TATAAACACAGGT------TATATACAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--C--AC-ATGTCAAAAACGTCTTCT
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                 TTCAAAATAACACGT---CGTTATATTAACACATGATATA----AACTGTG-TTTATATTGATAT---GTACTGTGGATTTATCTTAAATCGTGGTAAATTCTACTGTTTACATGCGTTATTTTCTTC-----TACG--CAAACGTATGTTGTGCGTTGTTATCCGTGTGTAGGCTAATTATCTATTGGCACAGTGCGTGAACATTG-T-AT-A---TTTTT--GAGTGTG--CTATA---AATG---ATAAACAA--A-ATATACTTT--TA----ATTTT--------CATAC-TTTTAATTT---ACA---TAA-ATA-TCAAATAAATAGAATAGGCAAC-TGAAA-----TATAATCACAGGT------TATATACAATCAAT-GGTTACAACAATTTTACAAAT--AA-AAAA-TAAGAC-G-A-AA-A-ATA--G--CATAC-ATGTCAAAATCGTCTTCT
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