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Reference ( gi|2 )            :                                      AAACAGAAGTAAATAAGCATGCATGCATGGGCATTATACTTACAATTTAGTGGTTTTATTTTACATAACAAATGCAGTA-ATTATACATTACGAACCTATTT-G-CTGTTTGAAATGTTAGTTCCAAGCCCAGTATGGGAGGTATGC--TTATT-TAAGTGATAACTAACACAGTTTTGACAGTTTGCAG---TTTTTGTCCATTAATTAACTGTCATTAGTCCCAT--TTAAAG-TTAAATAAACAAGTCAAGTGCATTCCAGATTTGCAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTGCATCAATA-------ACACA--TT---AATAAACA-T-------A-A-T-T----AT--ATATCACA-TATCTTTTAT-TTAAAGAACTGTGCTAAATGAATTCGTGACT
gi|1                          :                                      AAACCCAAATAAATAAACGTGCATGAATGGGCATTATACTTATGATTTAATGGTTTTATTTTACGTTACATTTGCA-CATATTAAAAATTATGAACCTATTC-G-CAGT-----A----AGTTCCAAGCCCTGCATGGGAGGTATTC--TTATT-TAAGTGATAATCAACACAGTTTTAAAAGTTTGCAG---TTTTTGACCGTTAATTAACTGTCATTAGTCCCAT-----AGG-TTTAATAA--AAGTCAATTACATTCCCAATCCACAGAAGATGATTCATGTCAGCATATCTTTTGCACCAAT------------A--TT------------------------T-T----AT---TG-CACA-TTTTTTTTAT-TTAAAGAACTACGGTAACTGGATTCGTGA
gi|9                          : ctggatattgtcttttgatgtaagataaataaatttaAAACAAAAATAAATAAACGTGCACGCATTGGCATAATACTTACGATTAAGTGATTTTATTTTACATAA---ATGCAGTT-ATTATACATTACGAACCTTTTT-G-CAGTTTGAAATGTAAGTTCCAAACCCTGCATGGGAGGTATGC--TTATT-TAAGTGATt
gi|5                          :  ctggatattaactttgatgtaaagtaaatgaatttaAAACAAAAATAAATCAACGTGCATGCATGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTT-ATTATAAATTACGAACATATTT-GACAGTTTc
gi|6                          : ctgggtcttgacttttgaagtaaaatgaataaatttaAAACAAAAATAAATCAACGTGCCTGCCAGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTT-ATTATAAATTACGAACATATTT-GACAGTTTGCAGTTTTTGTCCtgacagtttgcagtttttgtccgttaattatctgtcattagtcccgtgggttaaataaacaattacattcccaatctgcaggagacgaatgtcagcatatcttttgataaaaa
gi|17                         : ctggatcttgacttttgatgtaaaataaacaaatttaAAACACAAATAAATAAACGTGCATGCATGGGCgttaattatctgtgcttagtcccgtggcttaaataaacaagtcaattacattcccaatctacaggagatgaatgtcagcatatctttttataaaaaaaca
gi|15                         :                                              taAAATAAACGTGCTTGCAT-------------ACAATTTAGTGGTTTTATTTGACGTAACATATGCATTT-ATTAT
gi|3                          :              ctggatactgacttttgatgtaagaaaaataaatttaaaacacTGCATGTATCGGTATTATACTTACAATTTA-TGGATTTATTTTACATAACAAATGCAGTT-ATTATACATTATGAACCTATTT-G-CAGTTAGAAATGATAGGTCCAAACCCTGCATGGGAGGTATG---TTATT-TAAGTGATAGTTAACACAA-TTTGACAGTTTGCAGTTTTTTTTTTCTGTTAATTAACTGTCATTAGTTCTGT--T---AG-TTAAATTAACAAGTCAAGTACATTCTCAATTTGCAGGAGATGA---ATGTCGGCATATCTTTTGCATCAACA-------ACACA--TT-----TTATTG-T-------ACA-T-T----AG--AAAAAACA-TA-----TACGTCACAGAA-----CTAAATGAATTTGTGAC
gi|7                          :                                                       agTGCATGCATTGGCAGTAAACTCATGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTT-ATTATAAATTACGAACATATTT-GACAGTTT
gi|8                          :                                                         TGCATGCATGGGCATTATACTTACGATTTAATTGTTT--TTTTACGTAACAAATGCATTT-GTTATAAATTACGAACATATTT-GACAGTTTtgacaatttgcaatttttgtccataattatctgtcattagtccctggggttaaataaacaagtcaattacattcccaatcagcaggagatgaatgtcagcatatattttgataaaaaa
gi|10                         :                                                        gTGCATGCATGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGCTTTATTTTACGTAACAAGTGCATTT-ATTATAAATTACGAACATATTT-G-tgacaatttgaagtttttgtcctttaattatctgtcattactcctatgggttaaataaacaagtcaacaacattcccaatctgcaggagacgaatgtccgcatatcttttgataa
gi|11                         :                                                        gTGCATGCATGGGCATTATACTTAAGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTT-ATTATAAATTACGAACATATTTGG-CAGTTTGCAGTTTTTGTCCaaagtttgcagtttttgtccgttaattatctgacattagtcccatgggttaaataaacaagtcaattacattcccaatctgcaagagatgaatgtca
gi|13                         :                                                        gTGCATGCACGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTT-ATTATAAATTACGAATATATTT-G-gttaattatctttcatagacctctgggttaaataaacaagtcaattacattcccaatctgcaggagatgaatgt
gi|12                         :                                                           gATGCATGGGCATTATACTTACTATTAAGTTGTTTTATTTC-TGTAACAAATGCATTT-ATTATAAATTACAAACATATTT-GACAGTTTGCAGTTTTTGTCCacagatttgacagtttgcagtttttgtccgttaattatctgtcattagtcc
gi|4                          :                                                                                                                                                       AATGTTAGGTTCAAGCCCTGCATGAGAGGTGTGC--TTATT-TAAGTGATAATAAACACAGTTTTGACAGTTTGACG---TTTTTGTCCGTTAATTAACTGTCAATAGTCCCGT-----GGG-TTAAATAAACATGTCAATTACATTCCCAATCCACAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTGCACCAATATTTTATTGCACA--TTAGAAAAAAATA-T-------A-ATT-T----AT--ATCTCACA-TATTTTTTAT-TTAAAGAACTGTGGTAAATGAATTTGTGACgttaattatctgtcattagtcccgtgggtaaaaataaacaagtcaattacattcctaatctgcaggagatgaatgtca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                   ccATGCATTTATTATAA---ATTACGAACATA--TTTGACAGTTTGCAG---TTTTTGTCCGTTAATTATCTGTGCTTAGTCCCGT------GGCTTAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCTACAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTT
gi|12                         :                                                                         ctggatcttgacttttgatgtaaaataaacaaatttaaaacaaaaataaatcaacgtgcctgccagggcaatatacttacgatttagttgttttattttacgtaacaaATGCATTTATTATAA---ATTACAAACATA--TTTGACAGTTTGCAG---TTTTTGTCCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGTGGGTAA-----AAATAAACAAGTCAATTACATTCCTAATCTGCAGGAGATGA---ATGTCAtataaaaaaaca
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gi|10                         :                                                                                                                                    gtgcatgcatgggcattatacttaagatttagttgttttattttacgtaacaa--TTATTATAA---ATTACGAACATA--TTTGAAAGTTTGCAG---TTTTTGTCCGTTAATTATCTGACATTAGTCCCAT-----GGG-TTAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCTGCAAGAGATGA---ATGTCA
gi|7                          :                                                                                                                                                     gtgcatgcatgggcaatatacttacgatttagttgctttattttacgtaacaagtgcatACAGTTTTGACAATTTGCAA---TTTTTGTCCAT-AATTATCTGTCATTAGTCCC-----TGGGG-TTAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCAGCAGGAGATGA---ATGTCAGCATATATTTTG
gi|5                          :                                                                                                                             tgcatgcattggcagtaaactcatgatttagttgttttattttacgtaacaaatgcatttattataaattacgaacatatttgACAGTTTTGACAGTTTGCAG---TTTTTGTCCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGT-----GGG-TTAAATAAACAA-T----TACATTCCCAATCTGCAGGAGACGA---ATGTCAGCATATCTTTTGataaaaaa
gi|8                          :                                                                     ctgggtcttgacttttgaagtaaaatgaataaatttaaaacaaaaataaatcaacgtgcatgcatgggcaatatacttacgatttagttgttttattttacgtaacaaatgcatttattataaattacgaacatatttgACAGTTTTGACAATTTGAAG---TTTTTGTCCTTTAATTATCTGTCATTACTCCTAT-----GGG-TTAAATAAACAAGTCAACAACATTCCCAATCTGCAGGAGACGA---ATGTCCGCATATCTTTTGataaaaa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                ctgggtcttgacttttgaagtaaaatgaataaatttaATGCATTTATTATAA---ATTACGAACATATTTGACAGTTTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGT---GGGT-TAAATAAA-----CAATTACATTCCCAATCTGCAGGAGACGA---ATGTCAGCATATCTTTTGgttaattatctgtcattagtcccgtgggttaaataaacaattacattcccaatctgcaggagacgaatgtcagcatatcttttgataaaaa
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Reference ( family-3677 )     :                                                                                                             AAACAAAAATAAATAAACGTGCATGCATGGGCATTATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTTATTATAAATTACGAACAT---------A---------TTTGACAG---------TTTGCAGTTTTTGTCCCAAGCCCTGCATGGGAGGTATGCATTTATTATAAGTGATTACGAACA-------CAGTTTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGT---GGGT-TAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCTGCAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTGCATCAATAACACATTTTATTGCACA-T-------AA-----------T-T----AT--ATATCACA-TATTTTTTAT-TTAAAGAACTGTGCTAAATGAATTCGTGACT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGCATTTATTATAA---ATTACAAACA-------TA--TTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGT---GGGTAAAAATAAACAAGTCAATTACATTCCTAATCTGCAGGAGATGA---ATGTCAgttaattatctgtcattagtcccgtgggtaaaaataaacaagtcaattacattcctaatctgcaggagatgaatgtca
gi|13                         :                                                                               atgcatgggcattatacttactattaagttgttttatttctgtaacaaGTGCATGCACGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTTATTATAAATTACGAATATATTTGACAGA---------TTTGACAG---------TTTGCAGTTTTTGTCC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGCATTTATTATAA---ATTACGAATATATTTGACAGATTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCgttaattatctgtcattagtcc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtgcatgcacgggcaatatacttacgatttagttgttttattttacgtaacaaGTCAGCATATCTTTCGCATCAATAACACATTTTATTGCACATT-------AG-----------T-TCAACATAAATATCACATTTTTTTTTAT-TTAAAGAACTGTGCTAAATGTAGTTGTGACT
gi|15                         :                                                                                                                 AAACACAAATAAACGTGCTTGCAT-------------ACAATTTAGTGGTTTTATTTGACGTAACATATGCATTTATTAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctggatactgacttttgatgtaagaaaaataaatttaCTTTTGCATCAATAACACATTTTATTGCACA-TTAGAAAAAA-----------CAT----AT--ATATCACA-TATTTTTTAT-TTAAAGAACTGTGCTAAATGAATTTGTGTCT
gi|17                         :                                                                                                             AAACACAAATAAATAAACGTGCATGCATGGGC
gi|2                          :                                                                                                           taAAACAGAAGTAAATAAGCATGCATGCATGGGCATTATACTTACAATTTAGTGGTTTTATTTTACATAACAAATGCAGTAATTATACATTACGAACCT---------A---------TTTG-CTG---------TTTGAAATGTTAGTTCCAAGCCCAGTATGGGAGGTATGC--TTATT-TAAGTGATAACTAACA-------CAGTTTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCATTAATTAACTGTCATTAGTCCCATTTAAAGT-TAAATAAACAAGTCAAGTGCATTCCAGATTTGCAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTGCATCAATAACACA--TTAATAAACA-T-------AA-----------T-T----AT--ATATCACA-TATCTTTTAT-TTAAAGAACTGTGCTAAATGAATTCGTGACT
gi|3                          :                                                                                                                               GTGCATGTATCGGTATTATACTTACAATTTA-TGGATTTATTTTACATAACAAATGCAGTTATTATACATTATGAACCT---------A---------TTTG-CAG---------TTAGAAATGATAGGTCCAAACCCTGCATGGGAGGTATG---TTATT-TAAGTGATAGTTAACA-------CAATTT-GACAGTTTGCAGTTTTTTTTTTCTGTTAATTAACTGTCATTAGTTCTGT---TAGT-TAAATTAACAAGTCAAGTACATTCTCAATTTGCAGGAGATGA---ATGTCGGCATATCTTTTGCATCAACAACACATTTTATTGTACA-T----------------------T----AG--AAAAAACA-TAT-----ACGTCACAGAACT-----AAATGAATTTGTGAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 aCAAGCCCTGCATGAGAGGTGTGC--TTATT-TAAGTGATAATAAACA-------CAGTTTTGACAGTTTGACGTTTTTGT---CCGTTAATTAACTGTCAATAGTCCCGT---GGGT-TAAATAAACATGTCAATTACATTCCCAATCCACAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTGCACCAAT-----ATTTTATTGCACA-TTAG----AAAAAAATATAATT-T----AT--ATCTCACA-TATTTTTTAT-TTAAAGAACTGTGGTAAATGAATTTGTGAC
gi|5                          :                                                                                                ccaatgttaggttAAACAAAAATAAATCAACGTGCATGCATGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTTATTATAAATTACGAACAT---------ATTTGACAGTTTTGACAG---------TTTGCAGTTTTTGTCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                ctgggtcttgacttttgaagtaaaatgaataaatttaATGCATTTATTATAA---ATTACGAACATATTTGACAGTTTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGT---GGGT-TAAATAAA-----CAATTACATTCCCAATCTGCAGGAGACGA---ATGTCAGCATATCTTTTGgttaattatctgtcattagtcccgtgggttaaataaacaattacattcccaatctgcaggagacgaatgtcagcatatcttttgataaaaa
gi|6                          : ctgggtcttgacttttgaagtaaaatgaataaatttaaaacaaaaataaatcaacgtgcatgcatgggcaatatacttacgatttagttgttttattttacgtaacaaAAACAAAAATAAATCAACGTGCCTGCCAGGGCAATATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTTATTATAAATTACGAACAT---------A---------TTTGACAG---------TTTGCAGTTTTTGTCCataaaaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                ctggatcttgacttttgatgtaaaataaacaaatttaATGCATTTATTATAA---ATTACGAACA-------TA--TTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTGCTTAGTCCCGT---GGCT-TAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCTACAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTgttaattatctgtgcttagtcccgtggcttaaataaacaagtcaattacattcccaatctacaggagatgaatgtcagcatatctttttataaaaaaaca
gi|7                          :                    ctggatcttgacttttgatgtaaaataaacaaatttaaaacaaaaataaatcaacgtgcctgccagggcaatatacttacgatttagttgttttattttacgtaacaaTGCATGCATTGGCAGTAAACTCATGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTTATTATAAATTACGAACAT---------A---------TTTGACAGTTTTGACAATTTGCAATTTTTGTCCtataaaaaaaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGCATTTATTATAA---ATTACGAACATATTTGACAGTTTTGACAATTTGCAATTTTTGT---CCAT-AATTATCTGTCATTAGTCCCTG---GGGT-TAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCAGCAGGAGATGA---ATGTCAGCATATATTTTGataattatctgtcattagtccctggggttaaataaacaagtcaattacattcccaatcagcaggagatgaatgtcagcatatattttgataaaaaa
gi|8                          :                                                                           tgcatgcattggcagtaaactcatgatttagttgttttattttacgtaacaaGTGCATGCATGGGCATTATACTTACGATTTAATTGTTTT--TTTACGTAACAAATGCATTTGTTATAAATTACGAACAT---------A---------TTTGACAGTTTTGACAATTTGAAGTTTTTGTCCataaaaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGCATTTGTTATAA---ATTACGAACATATTTGACAGTTTTGACAATTTGAAGTTTTTGT---CCTTTAATTATCTGTCATTACTCCTAT---GGGT-TAAATAAACAAGTCAACAACATTCCCAATCTGCAGGAGACGA---ATGTCCGCATATCTTTTGtttaattatctgtcattactcctatgggttaaataaacaagtcaacaacattcccaatctgcaggagacgaatgtccgcatatcttttgataa
gi|9                          :                                                          gtgcatgcatgggcattatacttacgatttaattgtttttttacgtaacaaAAACAAAAATAAATAAACGTGCACGCATTGGCATAATACTTACGATTAAGTGATTTTATTTTAC---ATAAATGCAGTTATTATACATTACGAACCT---------T---------TTTG-CAG---------TTTGAAATGTAAGTTCCAAACCCTGCATGGGAGGTATGC--TTATT-TAAGTGATataa


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Reference ( family-3677 )     :                                                                                                             AAACAAAAATAAATAAACGTGCATGCATGGGCATTATACTTACGATTTAGTTGTTTTATTTTACGTAACAAATGCATTTATTATAAATTACGAACAT---------A---------TTTGACAG---------TTTGCAGTTTTTGTCCCAAGCCCTGCATGGGAGGTATGCATTTATTATAA---ATTACG---AACA-------CAGTTTTGACAGTTTGCAGTTTTTGT---CCGTTAATTATCTGTCATTAGTCCCGT---GGGT-TAAATAAACAAGTCAATTACATTCCCAATCTGCAGGAGATGA---ATGTCAGCATATCTTTTGCATCAATAACACATTTTATTGCACATTAG---AGAA--TATA---TATA--TCACA-TATTTTTTATTTAAAGAACTGTGCTAAATGAATTCGTGACT
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