lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111111111 111 22 1 1 1 1111 1111111111 77777777 1 11 1111111 1 11 111111111111 4444444444444444444444444444444444444444 1 1 888888888888888888888888888888888888888888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 1 333333333333 1 2222 111111 11 111111 111111 555555555555 111111111111 2222222 111 11
lowQualScore : 6 55 4 2 1 2 22 44444444444444 3 111 1 4444 00 2 5 6 7 2 4 33 9999 4 33 66 2 3333333333 5 55555 11111111 2 88888 4 5 2 33 2 5 2222222 7 6 5 8 5 2 2 1 2 2 22 1 888888888 3 1 11 55 1 1 555555555555 4444 66666666 77777 8888888888888888888888888888888888888888 2 3 22 555555 2 4 2 22 0 8 4 5 2 000000000000000000000000000000000000000000 888888888 6 3 2 7 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4444 44 66 1 1 5 3 2 2 2 6666 666666666666 0 2 3333 2 55555 99999 555555 99 55 2 666666 9 2 2 3 33 33 444444 55555 333333333333 333333333333 6666666 2 1111111 1 7777 66666666 1 1 444 22 2 00
lowQualScore : . .. . . . . .. .............. . ... . .... .. . . . . . . .. .... . .. .. . .......... . ..... ........ . ..... . . . .. . . ....... . . . . . . . . . . .. . ......... . . .. .. . . ............ .... ........ ..... ........................................ . . .. ...... . . . .. . . . . . .......................................... ......... . . . . . ........................................................... .... .. .. . . . . . . . .... ............ . . .... . ..... ..... ...... .. .. . ...... . . . . .. .. ...... ..... ............ ............ ....... . ....... . .... ........ . . ... .. . ..
lowQualScore : 0 55 8 5 8 1 99 44444444444444 8 777 3 5555 11 1 4 9 0 1 3 11 8888 4 11 11 2 4444444444 8 66666 55555555 1 99999 3 4 5 88 7 2 4444444 1 6 2 1 6 1 2 3 0 0 88 6 000000000 4 4 77 22 9 9 888888888888 0000 99999999 00000 3333333333333333333333333333333333333333 7 8 88 888888 0 9 2 66 5 4 6 8 0 666666666666666666666666666666666666666666 000000000 5 1 0 9 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222 88 77 4 8 3 3 1 1 1 6666 777777777777 3 5 8888 0 00000 88888 888888 22 11 1 111111 3 2 2 4 22 22 888888 66666 999999999999 666666666666 5555555 0 9999999 7 1111 00000000 7 7 666 88 5 11
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTG-TAAGCGGTCAGATGTA-GCGGCC-GACCCT--T-A-TCA---CTTAGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAGCGA-GA-GTA-T--G--TATAT-AC---------GGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNA-----TGAC-TTAATTCGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-A-CA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------GCG------------ATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA------TAA-C------GTA--A--CC--------GCG--------GA---------AGA----ATACGAGCTACACNTTTTTACTGGATTGTACGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AC---G----G---ATTTATTTTATGCTAA--ATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT--AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATT--TAAATGNACTTCTATATA-AA-ATANTGTCAGTTCAAATATTTTCT--TC--CTG-CGG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---CATG--TGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( gi|1 ) : CAATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTG-TAAGTGGTCAGATGTA-GCGGCC-AACCAT--T-C-TTA---CTTAGTGGTCACA----CTGTT-TGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTAC--CCAGAGCGA-CA-GTA-T--G--TATAT-AT---------GGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAA-----TGA--------TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-TATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-A-CA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------GTA------------AATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---TAGTAA-C------GTA--A--CC--------AC---------GA---------AGA----ATAAGAGCTACACTTTTTTAATGGATTGTATGGCATCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AC---A----T---ATTTATTTAATGCTAT--ATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT--AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATT--TAAATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCT--TC--CTG-CAG-GTTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---T---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---CATG--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCATA
gi|6 : ATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTG-TA-GCGGTCAGATGTA-GCGCCC-GAC-----T-C-TTAGCACTTAGCGGTCACA----CATTT-TGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTAC--CCATAGTGA-GA-ATA-A--G--TATAT-AC---------GGTCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAA-----TGA--------CGTTA------------CCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-A-CG-------------TTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------ACA------------ATTGACT----------CG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAA-C------GTA--A--CC--------GCGAGATAATGGA---------AGA----ATACGAGCTGCAC------------------------TGCG-AAATG-AAAAAT-TCAT----AC---G----G---A---A-------------ATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT--AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATT--TAAATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCT--TC--CTG-CGGAATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTA-------ACA-G---G---CA-TGGTA----TA--------T-GTACC-AT---CA----TGTGATCACTTTTTAT-
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTG-TAAGCGGTCAGATGTA-GAGGCC-GACCCT--T-A-TCA---CTTAGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTAC--CAAGAGCGA-GA-ATAAT--G--TATAT-AT---------GGTCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAA-----TGA--------CGTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-A-CA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------ATG------------ATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCG
gi|16 : tgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTG-TAAGCGGTCAGATGTA-GAGGCC-GACCCT--T-A-TCA---CTTAGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTAC--CAAGAGCGA-GA-ATAAT--G--TATAT-AT---------GGTCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAA-----TGA--------CGTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-A-CA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------ATG------------ATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|31 : aatgcccATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTG-TAAGCGGTCAGATGAA-GCAGCC-GACCCT--T-T-AGA---CTAAGAGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGCc
gi|33 : gcccATAAGCGGTCAGC-----CAGGTG-TAAGCGGTCAGATGTA-GTGGCC-GACCCT--T-A-TCA---CTTAGCGATCACA----CCTTT-TGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTC
gi|5 : gtccTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTG-TA-GTGGT----TG--------------AC--T-C-TTAGCACTTTGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAGCGA--A-GTA-C--G--TATAT-ACGGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAA-----TGA--------TG-TA-----------ACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTT--------------TATTTACGGCAGTTATATTTAGATT-TA-AGTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGG--TTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG---AAA-A-TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------GCG------------ATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-G-AAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTC--------GTAA-C------GTA--A--CC--------GCGAGATAATGGA---------AAA----ATACG-GCTGCACTATTTTACTGGATTGTACGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCA--------------------------TAAGG--AA--ATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT--AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATT--TAAAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCT--TC--CTGCCCA-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------AGA-G---G---CA-TG--------------------------------TG--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|7 : ctgTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTG-TATGCGGTCAGATGTA-GTGGCC-GACCCT--T-A-TCA---CTTAGCGGTCAAA----CCTTT-TGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTAC--CCATAGTG---A-GTG-T--GCATATAT-AC---------GGTCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCA-----TGg
gi|8 : atacccgTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCG-TATGCGGTCAGATGTA-GTGGCT-GACCTT--T-A-TCA---CTTAGCGGTCAAAAAACCT-TT-TGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTAC--CCAGAGCA---A-GTG-T--GCATATAT-AC---------GGTCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCA-----TGtaaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|25 : aatacccgAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTG-TAAGCGGTCAGTTGTA-GCAGCC---TTATGAT-A-TCA---CTTAGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAA--CCAGAGCGA-GA-GTA-T--G--TATAT-AC---------GGTATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-A-----TGA--------CGTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATAtaaacacattggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|21 : AACG--GTCAGGTG-TAAGCGGTCAGATGTA--------------------TCA---CTTAGCTGTCACA----CCTTT-TGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTAT--CCAGAAC---TT-GCA-TTGG--TATAT-AG---------GGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCA-----TGACATTAAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TG-TGACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|26 : caatacctgtaCAGGTG-TAAGCGGTCAGATGTA-GC--CTTGACCAT--T-A-TCA---CTTAGTGGCCGCA----CCTTT-TGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTAC--CCAGAACAA-GA-GTA-T--G----TAT-AT---------GGTCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTA-----TGACTTTTATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTGGCCAGATGTAAGCCGCA-TACCCT--T-A-TCA---CTTAGTGGCC--------T-TT-TGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTCCCAG------CA-GTA-T--G--TATAT-AC---------AGTTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATTTCTTGAAT------TTTTAGC-AAACT
gi|2 : TG-TAAGCGGTCATATGTA-GTACCC-AACCCT--T-A-TCA---CTAAGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAGTGA-GC-GTG-C--A--TATAT-AC---------AGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCA-----TTACATTAATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGTA-TGACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-A-TA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T----------GCG------------ATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---ATGTAA-CT-----GCAAGA--TT--------ATG--------GA---------AGA----ATACCAGCAACATATTTTTACTGGATTTTATGGTGTCTGCT-AAATG-AAAAGT-TCAT----AT---G----G---ATTTATTTTATTCTA---AAT-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT--AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT------ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCT--TC--CTC-TGG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGTACATATTTCCAAACA------------ACTT-------GCA-G---G---CATTGG------CA--------TGGTA--------CATG--TGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|3 : G-TAAGTGGTCAGATGTA-GTGGCT-GACCCT--T-A-TAA---CCC--TTGTCACA----CCTTT-TGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAGCGAGCA--TG-T--G--TATAT-AC---------TGTCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCA-----TGACATTAATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CTGACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGTA-GATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ACT--------------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-A-CA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----A------------TTTTTTTATTTGCG------------ATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAA-C------GTA--A--CCGAGAGATAACG--------GA---------AGA----ATACGAGCTTCACATTTTTACTGGATTTTATAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AT---G----C---ATTTATTTTATGCTA---AAT-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT--AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT------ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT------------------------G-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGTACTTATTTCCAAACA------------ACTT-------GCA-GGCATTGGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATG--CATG--TGTGATCACTGTTTGT-C
gi|9 : G-TTAGTGGCCAGGTGTA-GCGGCT-GAC-----T-C-TTAGCACTTAGCAGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAAC--CTAGAGCGA--G-GTA-A--G--TATAA-AC---------GGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAA-----TG--------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTATGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-A-CA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------ATG------------ATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---CTGTAA-CCGCGAGATA--A--T----------G---------GA---------AGA----ATACGAGCTGCACTGTTTTGCTTGATTGTACAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AC---G----G---A---A-------------ATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT--AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|41 : ccttaagcg-TAAGCGGTCAGATGTG-GCCGCT-GACCAT--TAA-TTA---CTTTGTGcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
gi|13 : cttAAGTGGTCAGATGTA-ATGGCT--GCTAT--T-C-
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTG-GCTGTC-GACCCT--T-AATCA---CTTAGTGGTCACA----CCATT-TGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTAC--CTAAAGCAA-AC-CTA-T--G--TATAT-GC---------GGTCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAA-----AGACTTTAATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCACGTGTccatcatattttataatcctgtgatcaattaatgcttctgcttgttacgaaaacacaccactttacccagaacaagcatgcgtgtatattatggtctaattagcaaatagaatagcgagagtcatgacatcaatttgtaaacgaaactattacctagggtgggtacatgactgtttaagcatgtgtatttacggtatttttatttaggtttatgacctgtgtaaacacattgaaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaaatatcaaactgggtaagatcaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattgtaagggtgcaaatgcaatggaaaaactttattttttcataacatttttttttatttgcgattgactcagttcatatcgtacacaaaatctgctgcaaaaaagaatttgcctttggatgaacgtgtaagagtggttaaatgcctgaattttttataaaagtatcgataaaacagaatcagaatgtgtctcaacgtaaccgcgtgataatggaagaatacgagctacacatttttaacggattttatggtgtctgctaaatgcaaaaattctgactatttggaacatga
gi|28 : ATGTA-GTGGCG-GACCCT--T-A-TCA---CTAAGCGGTCACA----CCTTT-TGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAGTGA-GC-GTG-C--G--TATAT-AC---------GGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCA-----TGACATTAATTTGTTAGCAAAACTGTTAttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : AGTGGTCAGA-----TGTAATGGCTG----CTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAACAAGCATGCG-T--G--TATATTAT---------GGTCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCA-----TGACATCAATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-TA-TGACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGTGCAAATGC-------AATGGAA-------AA-A-CT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T----------GCG------------ATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT--------CAA-C------GTA--A--CC--------GCGTGATAATGGA---------AGA----ATACGAGCTACACATTTTTAACGGATTTTATGGTGTCTGCT-AAATGCAAAAAT-TCTG----AC--------T---ATTT
gi|38 : aTGGACACA----CCTAT-GGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTggaacatga
gi|4 : aTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTAC--CCAGAGCAA----GCA-T--G--CATAT-ATAC-------GGTCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCG-----TGACATTAATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-A-CA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTT----GTG------------ATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCCCA--------A-T------GTA--A--CC--------GC---------GAGATAATGGTAGA----ATATGAGCTACACATTTTTACTGAATTTTACAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AT---G----G---ATTTATTTTATGCTAA--AT--GAAACA------------AT-G-T--TTTTTG-AATTAAATGATATAAATTAT-----TTATT--TATATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCT--TT--CTG-TGG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGTACATATTTCGAAACA------------ACTT-------ACA-GGCATGGGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATG--CATG--TGTGATCACTGTTTGT-C
gi|10 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtgGTTATGAAAACACATCACTTTAC--CCAGAGCGA-GA-GTA-T--G--CATAT-AT---------GGTCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAA-----TGA--------CGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAA-CA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T----------ACG------------ATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---ACATGA-G------ATA--A--T----------G---------GA---------AGA----ATATGAGCTACACTTTTTTACTGGATTGTACGGTGTCTGCT-AAATG-AAATAT-TCAT----AC---G----G---ATTTATTTTATGCTTA--ATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT--AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATT--TGAATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCT--TC--CTG-GAG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTACAATCA--------T-GTACC-AT---CATG--CGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|11 : --------TGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-A-CA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------GCG------------ATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGT-CTA-------AA-C------GTC--A--CC--------GCGAGATAATGGA---------AGA----ATACAAGCTACAAATTCTTTCTGGATTGTGCGGCATCTGCT-AAATG-ACAAAT-TCATATGAAC---C----TGG-ACTTATTTAATGCTTA--ATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT--AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAATTG--CTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAAGGTTTTTTACTC--ATA-CA--------CCCCTGTACATGATTCCAA-------------ACA------------ACTT-------ACA-G---A---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATG--CATG--TGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|30 : ttGGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAG
gi|32 : tCTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-TAT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTAattttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|34 : ctagattaatgactttaatttgtaagcaaagcTTGTTTAGGTT-TATT-TCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--Ac
gi|7 : cCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-A-CA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT----------GTG------------ATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC--------TAA-C------GTA--A--CC--------AC---------G----------AGA-----------------TT-----ATGGA---TA----A--TGCT-TAATA-AAAATT-TCAT----AT---G----G---ATTTATTTTATGCTATTAAAT-GAAACA-----T-----AA--A-ATTTTTTT--AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT------ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCT--TC--CTG-TGG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCATTACATATTTCGAAACA------------ACTT-------ATG-G---G---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATG--CATG--TGTGATCACTGTTTGT-
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-A-C--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----A------------T----------TTATTTTTATTTGCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC--------TGA-C------ATA--A--CC--------AC---------GA---------AA-----------------------TAATGGA---TA----A--TGCT-TAATA-AAAAAT-ACAT----AT---G----G---ATTTATTTTATGCT-T--AAT-GAAACA-----TA----AAT-T-T--TTTTT--AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCT--TC--CTG-TGG-ATTTTTCTCATTTA-----CCCCAGTACATATTTCAAAACA------------ACTT-------ATG-G---G---CA-TGGTT----CA--------T-GTACC-ATG--CATG--TGTGATCACTGTTTGT-
gi|14 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-A-CG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------GCG------------ATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCCTAATGTATCAG-C------GAA--A--TA--------ATG--------GA---------AGAAATTATAAGAGCTGCATTGTTTTACTGGATTGTACGGTGTCTGCT-AAATG--AAAAT-TCAT----AC---G----G---A---A-------------ATT-GAAACA-----TAC---AGT-A-A------T--GATC------------TTAT-TTATTTATT--TAAATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCT--TC--CTG-CAGAATTTTTCTCATTTAC----CTCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---CA----TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-
gi|18 : GGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-A-CA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T----------GTG------------ATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAACAA---AAGTAACC------GTG--AGGTT--------ACA--------GA---------AGA----ATACAAGCTACAAATTTTTACTGGATTGTATGGCGTCTGCTCAAATA-AATATT-TCAT----ATGAAA----CTGAATTTTTTTTATGCTAA--ATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT--AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT------ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCT--TC--CTG-TTG-ATTTTTCTCATTTA-----CCCAAGT------------ACA------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A--A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T----------CTG------------ATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAA--G-TT-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAA-T------GTA--A--CC--------GCGAGATAATGGA---------AGA----ATACAAACTACACTTTTTTACTGGATTt
gi|15 : gA-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAA-AACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T----------ACG------------ATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---ACATGA-G------ATA--A--TG-------------------GA---------AGA----ATATGAGCTACACTTTTTTACTGGATTGTACGGTGTCTGCT-AAATG-AAATAT-TCAT----AC---G----G---ATTTATTTTATGCTTA--ATT-GAAACA-----T-----AAT-GGA--TTTTT--AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATT--TAAATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCT--TC--CTG-CAG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTACAATCA--------T-GTACC-AT---CATG--CGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTT-TTG-CTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-A-CAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N----------NNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC------A--AA-C------GTT--G--CT--------GC---------GAGATAATGAAAGA----ATATAAGCTACAAATTCTTTCTGGACTGTACGGCATCTGCT-GAATG-AAAAAT-TCACG---ACT--G----G---ATTTATTTTATGCTTA--ATT-GAAACA-----T-----
gi|30 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-A-CA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------T
gi|19 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacAATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA------------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T----------ACG------------ATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTG-TTTGACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATCGCA-CAG-GTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCCTA-------AA-C------ATA--A--CC--------GC---------GAGACAATGGAAGA----ATCCAAGCTACAATTTTTTGCTGGATTTTACAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAAATCAT----AC---G----G---ATTTATTTCATGCTTA--ATT-GAAACA-----T-----ACT-G-A--TTTTTTTAATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATT--GAAATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCT--TC--CTG-CGG-TTCTTTCACATTTA-----CCCCAGT------------A-A------------ACCT-------ACA-G---G---CA-TGGTT----CA--------T-GTACA-AT---CATG--TGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCA
gi|20 : aCTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA---CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT--------GCG------------ATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTCT-------TA--T------GTA--A--CC--------AC---------GAGATAATGGAAGA----ATACAAGCTACACATTTTTACTGGATTTTATGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----CT---G----G---ATTTATTTAATGCT-T--AAT-GAAACA-----T-----AA----G--TTTTT-------T-TAA-ATAAATGAT-T-----AT------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCT--TC--ATG-TGG-ATTTTTCTAATTTAC----CCTCAGT------------ACATATTTCCAAACAACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTA----CA--------T-GTGCCAAG---CATG--TGTGATCACT
gi|23 : AG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCCT-------TA--C------ATA--A--CC--------GCAAGATAATGGA---------AGA----ATACAAGATACAAATTTTTACTAGATTGTACGGCGTCCGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AC---GAAACTGG-ATTCATTTTAAACTAA--ATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTTT-AATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATT--CATATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCT--TCCTCTG-CA----TTTTCTCATTTA-----CCCCAGT------------
gi|22 : ACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA--------A-T------GTA--A--CC--------GC---------GAGATAATGGAAGA----ATACTAGCTGCACTGTTTTACTGGATTGTGTGGTGTCTGCT-AAATG-AAAAAT-TCAT----AC---A----G---ATTTATTTTATGCTAA--ATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT--AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATT--TAAATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCT--TC--CTG-CGGAATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACCT-------ACA-G---G---CA-TGGTC----CA--------T-GTACC-AT---CATG--TGTGATCACTTTTTAT-
gi|35 : tc---ATTTATTTTATGCTAA--ATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-A--TTTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TT----ATT--GATATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|29 : ataatgcataagaatatgaaacttgTAA--ATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT--AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTT--TAAATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCT--TC--CTG-CAG-ATTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---CATG--TATGATCACTTTT
gi|9 : tacgaaacataaaacaTTTTTCTCATTTAC----CCCCAGT------------ACA------------ACTT-------ACA-G---G---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---GATG--TGTGATCACTTTTTAT-CT
gi|39 : ccttaagcggttagtggccaggtgtagcggctgactcttagcacttagcagtcacaccttttggctggccgctattccgatcatattgtataatcccgcgattaattaacgcttctgtttctattatgaaaacacaccacttaacctagagcgaggtaagtataaacggtctaataagcaaatagaatagcaagattaatgctgttacctaggctgggtacatgactgtttaagtgtgtgtatttagggtcgttttatttagattttatgtcgcgtgtaaacacattggaagcaaatttcactgtggtgtttatgcacaattgggtaagatcaaaaaggttattataaaaggtcttgtttaatttataattgaattaatttaattaaattttattggctatgaaagcaggtgtgaatgcaatggaaaaacaatattttttcatatcataatatgattgactcgacgcatattgtacacaatatctgctacgaaaagaaagtgttgactttagatgaattaaaacatctgaatttttggaaaaggtgttgataaaacacagaatcagaatgtgtcctactgtaaccgcgagataatggaagaatacgagctgcactgttttgcttgattgtacagcgtctgctaaatgaaaaattcatacggaaattggaacatacagtaatgatttttaattttttaacataa----CCCCAGT------------ACAT-----------AATTCCAAATAACA-G---G---CA-TGGGA----CA--------A-GTACC-ATG--CATG--TGTGATCAC
gi|29 : atataT-------ACA-----T---GA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---
gi|36 : tacgaaacataaaacataaattgaaacataatgatttttaatttcataacaaaagttatttatttttttaaatgaacttctatgtaaaatagtgtcagttcagatattttcttcctgcagatttttctcatttacccccagtacaacttacaggcT-------ACAAG---T---C--TGGTA----CAATTAATTAT-GTACA-ATG--CATG--TGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCATtgatcactttt
gi|9 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaa-------ACA-----T---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---g
gi|3 : ccttaagcggttagtggccaggtgtagcggctgactcttagcacttagcagtcacaccttttggctggccgctattccgatcatattgtataatcccgcgattaattaacgcttctgtttctattatgaaaacacaccacttaacctagagcgaggtaagtataaacggtctaataagcaaatagaatagcaagattaatgctgttacctaggctgggtacatgactgtttaagtgtgtgtatttagggtcgttttatttagattttatgtcgcgtgtaaacacattggaagcaaatttcactgtggtgtttatgcacaattgggtaagatcaaaaaggttattataaaaggtcttgtttaatttataattgaattaatttaattaaattttattggctatgaaagcaggtgtgaatgcaatggaaaaacaatattttttcatatcataatatgattgactcgacgcatattgtacacaatatctgctacgaaaagaaagtgttgactttagatgaattaaaacatctgaatttttggaaaaggtgttgataaaacacagaatcagaatgtgtcctactgtaaccgcgagataatggaagaatacgagctgcactgttttgcttgattgtacagcgtctgctaaatgaaaaattcatacggaaattggaacatacagtaatgatttttaattttttaacataatttttctcatttacccccagtacaacttacaggc---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---gtgatcactttttatct
gi|4 : gtaagtggtcagatgtagtggctgacccttataacccttgtcacaccttttgactggcggccattccaatcatattgtgtaatttcgcgatcaaataacgcttctgcttttgttacgaaaacacaccactttacccagagcgagcatgtgtatatactgtctaataagcaaatcgaatagcaagattcatgacattaatttgttagagaaactgttaactaggccaggtacatgactatttaagcgcgtgtattaacggtagttttattaaggtttctgacacgtgtagacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcgaaatgggtagatcaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataactaaattttatcggctatgaaagtgggtgcgaatgcgatggaaaaacattttttttcctatcataatttttttatttgcgattgactcaatgcatattgtatacaatatctgttgcgaaaaaaatgtgtttgactttggatcaacgtgtaagagtggttaaacgtctgaatttttggaaacggtatcgataaaacacagaatcagaatgtgtcctaacgtaaccgagagataacggaagaatacgagcttcacatttttactggattttatagcgtctgctaaatgaaaaattcatatgcatttattttatgctaaatgaaacgtaatgtttttttaattaaataatataaattatttatttatacgtacttctgtagaaaatgttgatttttctcatttacccccagtacttatttccaaacaacttgcaggcattggc---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATGCCCATGCCTGTAAcatgtgtgatcactgtttgtc
gi|7 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtgttctgttacgaaaacacaccactttacccagagcaagcatgcatatatacggtctaataagcaaatagaatagcgagattcgtgacattaatttgttagcgaaacggttacctaggctgggtacatgactgtttaagcgcatgtatttacggtagttttatttaggtttatgacgcgtgtaaacacattgaaagcaaatttcactgaggtgttaatgcacaattatcaaacttggtaagattaaaaaggtaattgcaattggtcagtttgtttaaattataatcaaattatattttatcggctattaaagtgggtgcgaatgcaatggaaaaacattcttttttcatatcgcaatttttttgtgattgacttgatgcatatcatacaagaaatcatatctctgctgctgcacataaagtgtttgactttggatgaatgtgtaagagtggttaaacgtctgaatttttggaaaaggtatcgataaaacacagaatcggaatgtgtcccaatgtaaccgcgagataatggtagaatatgagctacacatttttactgaattttacagcgtctgctaaatgaaaaattcatatggatttattttatgctaaatgaaacaatgttttttgaattaaatgatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagttcaaatattttctttctgtggatttttctcatttacccccagtacatatttcgaaacaac---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---catgtgtgatcactgtttgtc
gi|11 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattcatgtaaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggc---CA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT---catgtgtgatcactgtttgt
gi|40 : tttgtttgcaaatctgttacctaggctgggcatatttctgtttaagtatgtgtatttacattagttttatttaggtttatgtctcgtgtaaacacattcaaatcaattttcactgagatgtttatgcacaattatcgaacttggtaaaatcaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattattattcaattagattttatcgaatataatggaacaacaatatttttcatatcataatgcgattgactgctaacgtatatacattgtctgcagcaaagagaaaagtgtttgactttggatgaacgtgtaagggtgggtaaattcagaattgtgggaatatgtgctgataaaacacagattcagaatgtgtctaaacgtcaccgcgagataatggaagaatacaagctacaaattctttctggattgtgcggcatctgctaaatgacaaattcatatgaacctggacttatttaatgcttaatagaaacataatgttttaaataacataaattatatatttattcataattgcttctatacaaaatatggtcaattcaaaggttttttactcatacacccctgtacatgattccaaacaacttacagacATA--TGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCAcatgtgtgatcacattttgtctgtcacaataaacatcat
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA
Alignments
lowQualScore : 555555555 11 11111111111 333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777 333333333 88888888888888888888888888888888888 11111111 1111 11111 777777777777 111111 1
lowQualScore : 44 2 11 6666 2 2 22 333 3 2 3 888 4 2 888888888 3 000000000 1 4444 2 11 666666 0 2 2 0 1 1 22 777777777 2 55 3 11111111111 3333 66666666 66666 666666666666 888888 22 555555 1 2 2 2 6 1 555555555555555555555555555555555555555555 777777777 2 1 888888888 44444444444444444444444444444444444 6666666 4444 22 1 777777777 333 2 2 4 2 44444444 555555 0 0 22 1 44444 44444 4 3333 4 66 2 55555 3 2 2 1 444 4 2 0 111111111111 2 6666666 222222 2 8888 77777777 2 2 4 2 4
lowQualScore : .. . .. .... . . .. ... . . . ... . . ......... . ......... . .... . .. ...... . . . . . . .. ......... . .. . ........... .... ........ ..... ............ ...... .. ...... . . . . . . .......................................... ......... . . ......... ................................... ....... .... .. . ......... ... . . . . ........ ...... . . .. . ..... ..... . .... . .. . ..... . . . . ... . . . ............ . ....... ...... . .... ........ . . . . .
lowQualScore : 22 1 66 6666 1 1 99 777 4 0 4 111 2 1 444444444 0 111111111 6 7777 4 99 111111 6 0 1 8 9 9 66 666666666 5 00 6 44444444444 9999 66666666 77777 222222222222 111111 66 555555 9 1 0 0 0 9 999999999999999999999999999999999999999999 666666666 5 9 111111111 00000000000000000000000000000000000 2222222 0000 66 9 666666666 777 1 0 0 1 11111111 888888 8 4 66 9 88888 88888 0 8888 0 99 0 77777 1 1 1 7 888 2 1 5 888888888888 1 8888888 111111 1 9999 66666666 1 1 7 4 4
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAG-A-GTA-CGTATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCT---A---TAACGTAACCG--------CGAGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACGA-GCT---------ACACNTTTTTACTGGATTGTACGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-G------GATTTATTTTATGCTA--AATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( family-3654 ) : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAG-A-GTA-TGTATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTCGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCT---A---TAACGTAACCG--------C--------G--------G--------A-------AGA----AT--ACGA-GCT---------ACACNTTTTTACTGGATTGTACGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-G------GATTTATTTTATGCTA--AATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATANTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT-CATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|1 : ATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTGTAAGTGGTCAGATGTAGCGGCC----AACCATT-C-T--TACTTAGTGGTCACA---CTGTTTGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTACCCAGAGCGAC-A-GTA-TGTATAT-ATGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGAT---------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-TATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTAAATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCT---ATAGTAACGTAACCA--------C-----------------G--------A-------AGA----AT--AAGA-GCT---------ACACTTTTTTAATGGATTGTATGGCATCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-A------TATTTATTTAATGCTA--TATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-AG-GTTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GTCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCAT
gi|10 : caGTTATGAAAACACATCACTTTACCCAGAGCGAG-A-GTA-TGCATAT-ATGG---------TCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTAACA---TGAGATAA-----------T--------G--------G--------A-------AGA----AT--ATGA-GCT---------ACACTTTTTTACTGGATTGTACGGTGTCTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C-G------GATTTATTTTATGCTT--AATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTG-AATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-G-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------T-GTACC-AT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCa
gi|11 : TTTGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGT-CT---A----AACGTCACCG--------CGAGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACAA-GCT---------ACAAATTCTTTCTGGATTGTGCGGCATCTGCT-AAATG-ACAAATTCAT-ATGAACCT-G------GACTTATTTAATGCTT--AATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT-AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAAT-TGCTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAA----------------GG-TTTTTTACTCATACACCCCT-GTACATGATTCCAAACA-ACTT-------ACA------GACA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATGCATGTGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTGGCTGTC----GACCCTT-AAT--CACTTAGTGGTCACA---CCATTTGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTACCTAAAGCAAA-C-CTA-TGTATAT-GCGG---------TCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAAAGACTTT-AATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCACGTGT
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTTTT--GCTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-ACAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC----A----AACGTTGCTG--------C--------G--------AGATAATGAA-------AGA----AT--ATAA-GCT---------ACAAATTCTTTCTGGACTGTACGGCATCTGCT-GAATG-AAAAATTCACGA------CTG------GATTTATTTTATGCTT--AATT-GAAACA-----T-----ttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagTGGCTGCTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGCATGCG-TGTATATTATGG---------TCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCATGACATC-AATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-TA-TGACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGT------GCAAATGC-AATG-----G--AAAA-ACT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T------GCGATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT--------CAACGTAACCG--------CGTGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACGA-GCT---------ACACATTTTTAACGGATTTTATGGTGTCTGCT-AAATGCAAAAATTC
gi|14 : aagtggtcagatgtaaAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-ACG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCC--------TAATGTATCAG--------CGAAATAATG--------G--------A-------AGAAATTAT--AAGA-GCT---------GCATTGTTTTACTGGATTGTACGGTGTCTGCT-AAATG--AAAATTCAT-A------C-G------G--------------A--AATT-GAAACA-----T-----ACA-G--------T-AAT--GAT--C-----TTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-CAGA-ATTTTT-CTCATTTACCTCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-tgactatttggaacatga
gi|15 : A-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTAACA---TGAGATAA-----------T--------G--------G--------A-------AGA----AT--ATGA-GCT---------ACACTTTTTTACTGGATTGTACGGTGTCTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C-G------GATTTATTTTATGCTT--AATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------T-GTACC-AT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|16 : ATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAG-A-ATAATGTATAT-ATGG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAG-A-ATAATGTATAT-ATGG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCGc
gi|18 : tgcccGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTGATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAAC----A----AAAGTAACCGTGAGGTTAC--------A--------G--------A-------AGA----AT--ACAA-GCT---------ACAAATTTTTACTGGATTGTATGGCGTCTGCTCAAATA-AATATTTCAT-ATGAAACT-G------AATTTTTTTTATGCTA--AATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT-AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT-----ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCTTCCTG-T-TG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCAAGT------------ACA-
gi|19 : AATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA-----------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T------ACGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTGTTT-GACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATC-GC-ACAGGTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCCT---A----AACATAACCG--------CGAGACAATG--------G--------A-------AGA----AT--CCAA-GCT---------ACAATTTTTTGCTGGATTTTACAGCGTCTGCT-AAATGAAAAAAATCAT-A------C-G------GATTTATTTCATGCTT--AATT-GAAACA-----T-----ACT-G-ATTTTTTT-AATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATTGA-AATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-TTCTTT-CACATTTA-CCCCAGT------------A-A-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTT----CA--------T-GTACA-AT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCAt
gi|2 : aTGTAAGCGGTCATATGTAGTACCC----AACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAG-C-GTG-CATATAT-ACAG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCATTACATT-AATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGTA-TGACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-ATA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAATGTAACTG--------CAAGATTATG--------G--------A-------AGA----AT--ACCA-GCA---------ACATATTTTTACTGGATTTTATGGTGTCTGCT-AAATG-AAAAGTTCAT-A------T-G------GATTTATTTTATTCTA--AA-T-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCTTCCTC-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------GCA------GGCATTGG------CA--------TGGTA------CATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|20 : CTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA--CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT----GCGATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTCT-------TA-TGTAACCA--------C--------GAGATAATGG--------A-------AGA----AT--ACAA-GCT---------ACACATTTTTACTGGATTTTATGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-C------T-G------GATTTATTTAATGCTT--AA-T-GAAACA-----T-----AA--G-T--TTTTT--------TAA-ATAAATGA--TTAT---------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCTTCATG-T-GG-ATTTTT-CTAATTTACCCTCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTGCCAAG-CATGTGTGATCACT
gi|21 : GTAAACG--GTCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTA--------------------T--CACTTAGCTGTCACA---CCTTTTGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTATCCAGAACTTG-C-ATT-GGTATAT-AGGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TG-TGACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|22 : caatacctACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCT---A-----ATGTAACCG--------C--------GAGATAATGG--------A-------AGA----AT--ACTA-GCT---------GCACTGTTTTACTGGATTGTGTGGTGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-A------GATTTATTTTATGCTA--AATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTC----CA--------T-GTACC-AT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-
gi|23 : tcAG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCCT-------TA-CATAACCG--------CAAGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACAA-GAT---------ACAAATTTTTACTAGATTGTACGGCGTCCGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-GAAACTGGATTCATTTTAAACTA--AATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTTTAATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATTCA-TATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCTTCCTC-T-GC-A-TTTT-CTCATTTA-CCCCAGT------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A-A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T------CTGATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAA--G-TT-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAATGTAACCG--------CGAGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACAA-ACT---------ACACTTTTTTACTGGATT
gi|25 : gAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTGTAAGCGGTCAGTTGTAGCAGCCTTATGA----T-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAACCAGAGCGAG-A-GTA-TGTATAT-ACGG---------TATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-ATGA---------CGTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATA
gi|26 : CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGC--CTT---GACCATT-A-T--CACTTAGTGGCCGCA---CCTTTTGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAG-A-GTA-TGTATAT---GG---------TCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTATGACTTT-TATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTG--GCCAGATGTAAGCCGC---AT--------------ACCCTT-A-T--CACTTAGTGG--------CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTCCCAGC----A-GTA-TGTATAT-ACAG---------TTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATTTC-TTGAATTT-TTAGC-AAACT
gi|28 : ATGTAGTGGCG----GACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAG-C-GTG-CGTATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGCAAAACTGTTA
gi|29 : TA--AATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTTTA-AATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT-CATGTATGATCACTTTT
gi|3 : tacgaaacataaaacaGTAAGTGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCCTT-A-TAACCCTT----GTCACA---CCTTTTGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAG-C-ATG-TGTATAT-ACTG---------TCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CTGACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGT-AGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TAT-------AACT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAACGTAACCGAGAGATAAC--------G--------G--------A-------AGA----AT--ACGA-GCT---------TCACATTTTTACTGGATTTTATAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T-G------CATTTATTTTATGCTA--AA-T-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT---------------------G-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACTTATTTCCAAACA-ACTT-------GCAGGCATTGGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|30 : GGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAGAT
gi|30 : tAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------Ttttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|31 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGAAGCAGCC----GACCCTT-T-A--GACTAAGAGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGC
gi|32 : gcccAGATTAATGAC-TTTAATTTGTAAGCAAAGC-----------------------CTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-TAT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTA
gi|33 : ctATAAGCGGTCAGC-----CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGATCACA---CCTTTTGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCc
gi|34 : gtccTTGTTTAGGTT-TATT-TCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--A
gi|35 : c------GATTTATTTTATGCTA--AATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-AT-TTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TTATTGAT-----ATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|36 : ataatgcataagaatatgaaacttT-------ACA------AGTC-TGGTA----CAATTAATTAT-GTACA-ATGCATGTGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCAT
gi|38 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaaGGACACA---CCTATGGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTg
gi|39 : atCCCCAGT------------ACATAATTCCAAATAACA------GGCA-TGGGA----CA--------A-GTACC-ATGCATGTGTGATCAC
gi|4 : atataTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCAAG-C-ATG-CATATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCGTGACATT-AATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTTGTGATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCCC---A-----ATGTAACCG--------C--------GA-------G--------ATAATGGTAGA----AT--ATGA-GCT---------ACACATTTTTACTGAATTTTACAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T-G------GATTTATTTTATGCTA--AAT--GAAACA------------AT-G-T--TTTTTGAATTAAATGATATAAATTAT-----TTATTTA-TATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCTTTCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ACAGGCATGGGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|40 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtgATATGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCA
gi|41 : ctgatacactatgttcaacgtTAAGCGGTCAGATGTGGCCGCT----GACCATTAA-T--TACTTgg
gi|5 : cttTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTGTA--------------GTGGTT----GACTCTT-A-G--CACTTTGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGA--A-GTA-CGTATAT-ACGGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------------------TGTAACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTTTA--------------TTTACGGCAGTTATATTTAGATT-TAA-GTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGT--TTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG--AAAA--TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAA-G-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTC-----G---TAACGTAACCG--------CGAGATAATG--------G--------A-------AAA----AT--ACG--GCT---------GCACTATTTTACTGGATTGTACGGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------A-G------G--------------A--AATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATTTA-AAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCTTCCTGCC-CA-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------AGA------GGCA-TG------------------------------TGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCATtgtg
gi|6 : ctgATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTA-GCGGTCAGATGTAGCGCCC----GACTCTT-A-G--CACTTAGCGGTCACA---CATTTTGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAG-A-ATA-AGTATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAATGAC---------------------GTTACCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-ACG-------T-T-----TTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ACAATTGACTCG------------TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC--------TAACGTAACCG--------CGAGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACGA-GCT---------GCA------------------------CTGCG-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-G------G--------------A--AATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTA-------ACA------GGCA-TGGTA----TA--------T-GTACC-AT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-g
gi|7 : aatgcccTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAA---CCTTTTGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAG-T-GTG-CATATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|7 : atacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GTGATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC--------TAACGTAACCA--------C--------G-------------------------AGA---------------------------------TTA-TGGATAA---------TGCT-TAATA-AAAATTTCAT-A------T-G------GATTTATTTTATGCTATTAAAT-GAAACA-----T-----AA--A-ATTTTTTT-AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCATTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-ATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCTTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAAAAACCTTTTGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTACCCAGAGCAAG-T-GTG-CATATAT-ACGG---------TCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|8 : aatacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-AC--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC--------TGACATAACCA--------C--------G--------A--------A-------ATA----ATGGATAATGCTTAATAAAAAATACA----TA-TGGATT-TAT--TTTATGCT-TAATG-AAA----CAT-A---------------AATTTTTTTT--------AATT-AA---A-----T-----AAT-----------------------ATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCCAGTACATATTTCAAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTT----CA--------T-GTACC-ATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|9 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattTAAGCGGTTAGTG--GCCAGGTGTA--------------GCGGCT----GACTCTT-A-G--CACTTAGCAGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAACCTAGAGCGAG---GTA-AGTATAA-ACGG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAATG---------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTATGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCT---A---C--TGTAACCG--------CGAGATAATG--------G--------A-------AGA----AT--ACGA-GCT---------GCACTGTTTTGCTTGATTGTACAGCGTCTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C-G------G--------------A--AATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|9 : cct-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------T-GTACC-AT-GATGTGTGATCACTTTTTAT-CTcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA
Alignments
lowQualScore : 44444444 11 11111111111 333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777 333333 2222222222222 1111 22222 777777777777 111111 11111111 1
lowQualScore : 44 2 11 6666 2 2 22 333 3 2 3 5 55 333 888888888 3 11111111 1 4444 2 11 666666 0 2 2 0 1 1 22 777777777 2 55 3 11111111111 3333 66666666 66666 666666666666 888888 22 555555 1 2 2 2 6 1 555555555555555555555555555555555555555555 777777777 2 1 888888 1 44444 4444 55 1 3 2 2 4 2 1111111111111 2 0 1 1 1 55555555555 4 4444 2 66 2 00000 3 2 2 2 444 4 2 0 111111111111 2 6666666 222222 2 8888 00000000 2 2 4
lowQualScore : .. . .. .... . . .. ... . . . . .. ... ......... . ........ . .... . .. ...... . . . . . . .. ......... . .. . ........... .... ........ ..... ............ ...... .. ...... . . . . . . .......................................... ......... . . ...... . ..... .... .. . . . . . . ............. . . . . . ........... . .... . .. . ..... . . . . ... . . . ............ . ....... ...... . .... ........ . . .
lowQualScore : 22 1 66 6666 1 1 99 777 4 0 4 2 77 777 444444444 0 66666666 6 7777 4 99 111111 6 0 1 8 9 9 66 666666666 5 00 6 44444444444 9999 66666666 77777 222222222222 111111 66 555555 9 1 0 0 0 9 999999999999999999999999999999999999999999 666666666 5 9 444444 9 88888 0000 88 9 8 0 0 0 1 9999999999999 0 8 6 5 9 22222222222 0 2222 0 99 0 77777 1 1 1 7 888 2 1 5 888888888888 1 8888888 111111 0 5555 88888888 1 4 4
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGCGTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-A---TAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( family-3654 ) : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGAGTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---TAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|1 : ATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTGTAAGTGGTCAGATGTAGCGGCC----AACCATT-C-T--TACTTAGTGGTCACA---CTGTTTGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTACCCAGAGCGACAGTA-TGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-TATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTAAATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTATAGTAACGTAACCAC---------GA-AG-----A----ATAAGAGCTACACTTTTT-TAATGGATTGTATGGCAT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------ATATTTATTTAATGCTATATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-AG-GTTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GTCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCAT
gi|10 : caGTTATGAAAACACATCACTTTACCCAGAGCGAGAGTA-TGCATATAT---GG---------TCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTG-AATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-G-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCa
gi|11 : TTTGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGT-CTA----AACGTCACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTCT-TTCTGGATTGTGCGGCAT-CTGCT-AAATG-ACAAATTCAT-ATGAACCT------GGACTTATTTAATGCTTAATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT-AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAAT-TGCTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAA----------------GG-TTTTTTACTCATACACCCCT-GTACATGATTCCAAACA-ACTT-------ACA------GACA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTGGCTGTC----GACCCTT-AAT--CACTTAGTGGTCACA---CCATTTGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTACCTAAAGCAAACCTA-TGTATATGC---GG---------TCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAAAGACTTT-AATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCACGTGT
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTTTT--GCTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-ACAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC-A----AACGTTGCTGCGAGATAATGAA-AG-----A----ATATAAGCTACAAATTCT-TTCTGGACTGTACGGCAT-CTGCT-GAATG-AAAAATTCACGA------CT-----GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagTGGCTGCTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGCATG-CGTGTATATTATGG---------TCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCATGACATC-AATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-TA-TGACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGT------GCAAATGC-AATG-----G--AAAA-ACT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T------GCGATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT-----CAACGTAACCGCGTGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACATTTT-TAACGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATGCAAAAATTC
gi|14 : aagtggtcagatgtaaAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-ACG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCC-----TAATGTATCAGCGAAATAATGGA-AG-----AAATTATAAGAGCTGCATTGTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG--AAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----ACA-G--------T-AAT--GAT--C-----TTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-CAGA-ATTTTT-CTCATTTACCTCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-tgactatttggaacatga
gi|15 : A-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|16 : ATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGAATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGAATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCGc
gi|18 : tgcccGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTGATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAAC-A----AAAGTAACCGTGAGGTTACAGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTTT-TACTGGATTGTATGGCGT-CTGCTCAAATA-AATATTTCAT-ATGAAACT------GAATTTTTTTTATGCTAAATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT-AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT-----ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCTTCCTG-T-TG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCAAGT------------ACA-
gi|19 : AATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA-----------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T------ACGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTGTTT-GACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATC-GC-ACAGGTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCCTA----AACATAACCGCGAGACAATGGA-AG-----A----ATCCAAGCTACAATTTTT-TGCTGGATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATGAAAAAAATCAT-A------C------GGATTTATTTCATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ACT-G-ATTTTTTT-AATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATTGA-AATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-TTCTTT-CACATTTA-CCCCAGT------------A-A-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACAAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCAt
gi|2 : aTGTAAGCGGTCATATGTAGTACCC----AACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGCGTG-CATATATAC---AG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCATTACATT-AATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGTA-TGACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-ATA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAATGTAACTGCAAGATTATGGA-AG-----A----ATACCAGCAACATATTTT-TACTGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAGTTCAT-A------T------GGATTTATTTTATTCTAAA-T-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCTTCCTC-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------GCA------GGCATTGG------CA--------TG----GTACATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|20 : CTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA--CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT----GCGATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTCT----TA-TGTAACCACGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACACATTTT-TACTGGATTTTATGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-C------T------GGATTTATTTAATGCTTAA-T-GAAACA-----T-----AA--G-T--TTTTT--------TAA-ATAAATGA--TTAT---------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCTTCATG-T-GG-ATTTTT-CTAATTTACCCTCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTGCCAAGCATGTGTGATCACT
gi|21 : GTAAACG--GTCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTA--------------------T--CACTTAGCTGTCACA---CCTTTTGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTATCCAGAACTTGCATT-GGTATATAG---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TG-TGACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|22 : caatacctACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA-----ATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACTAGCTGCACTGTTT-TACTGGATTGTGTGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------AGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTC----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-
gi|23 : tcAG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCCT----TA-CATAACCGCAAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGATACAAATTTT-TACTAGATTGTACGGCGT-CCGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------CGAAACTGGATTCATTTTAAACTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-AT-TTTTT-AATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATTCA-TATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCTTCCTC-T-GC-A-TTTT-CTCATTTA-CCCCAGT------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A-A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T------CTGATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAA--G-TT-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAACTACACTTTTT-TACTGGATT
gi|25 : gAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTGTAAGCGGTCAGTTGTAGCAGCCTTATGA----T-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAACCAGAGCGAGAGTA-TGTATATAC---GG---------TATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-ATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATA
gi|26 : CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGC--CTT---GACCATT-A-T--CACTTAGTGGCCGCA---CCTTTTGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGAGTA-TGTATAT-----GG---------TCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTATGACTTT-TATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTG--GCCAGATGTAAGCCGC---AT--------------ACCCTT-A-T--CACTTAGTGG--------CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTCCCAGC---AGTA-TGTATATAC---AG---------TTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATTTC-TTGAATTT-TTAGC-AAACT
gi|28 : ATGTAGTGGCG----GACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGCGTG-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGCAAAACTGTTA
gi|29 : TAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTTTA-AATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTATGATCACTTTT
gi|3 : tacgaaacataaaacaGTAAGTGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCCTT-A-TAACCCTT----GTCACA---CCTTTTGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGCATG-TGTATATAC---TG---------TCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CTGACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGT-AGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TAT-------AACT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACGTAACCGAGAGATAACGGA-AG-----A----ATACGAGCTTCACATTTT-TACTGGATTTTATAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GCATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT---------------------G-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACTTATTTCCAAACA-ACTT-------GCAGGCATTGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|30 : GGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAGAT
gi|30 : tAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------Ttttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|31 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGAAGCAGCC----GACCCTT-T-A--GACTAAGAGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGC
gi|32 : gcccAGATTAATGAC-TTTAATTTGTAAGCAAAGC-----------------------CTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-TAT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTA
gi|33 : ctATAAGCGGTCAGC-----CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGATCACA---CCTTTTGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCc
gi|34 : gtccTTGTTTAGGTT-TATT-TCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--A
gi|35 : cGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-AT-TTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TTATTGAT-----ATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|36 : ataatgcataagaatatgaaacttT-------ACA------AGTC-TGGTA----CAATTAATTATGTACAATGCATGTGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCAT
gi|38 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaaGGACACA---CCTATGGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTg
gi|39 : atCCCCAGT------------ACATAATTCCAAATAACA------GGCA-TGGGA----CA--------AGTACCATGCATGTGTGATCAC
gi|4 : atataTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCAAGCATG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCGTGACATT-AATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTTGTGATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCCCA-----ATGTAACCGCGAGATAATGGT-AG-----A----ATATGAGCTACACATTTT-TACTGAATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GGATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAAC------------AAT-G-T--TTTTTGAATTAAATGATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCTTTCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ACAGGCATGGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|40 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtg-TGATA----CACTA-----TGTTCAACGTATATGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCA
gi|41 : cTAAGCGGTCAGATGTGGCCGCT----GACCATTAA-T--TACTTgg
gi|5 : cttTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTGTA--------------GTGGTT----GACTCTT-A-G--CACTTTGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGA-AGTA-CGTATATAC---GGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------------------TGTAACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTTTA--------------TTTACGGCAGTTATATTTAGATT-TAA-GTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGT--TTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG--AAAA--TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAA-G-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTC--G---TAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AA-----A----ATACG-GCTGCACTATTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------A------GG--------------AAATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATTTA-AAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCTTCCTGCC-CA-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------AGA------GGCA-TG----------------------------TGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCATtgtg
gi|6 : ctgATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTA-GCGGTCAGATGTAGCGCCC----GACTCTT-A-G--CACTTAGCGGTCACA---CATTTTGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGAATA-AGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAATGAC---------------------GTTACCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-ACG-------T-T-----TTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ACAATTGACTCG------------TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCA--------------------------CTGCG-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTA-------ACA------GGCA-TGGTA----TA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-g
gi|7 : aatgcccTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAA---CCTTTTGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGTGTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|7 : atacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GTGATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC-----TAACGTAACCACGAGATTATGG--AT-----A----ATGCTTAATAAAAATTTCATA-TGGATT-TATTTTATGCTATT-AAATG-AAA----CAT-A-----------------------------AAATT---------------------------TTTTT-AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCATTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCTTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAAAAACCTTTTGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTACCCAGAGCAAGTGTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|8 : aatacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-AC--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC-----TGACATAACCACGAAATAATGGATAATGCTTA----ATAAAAAATACA-------TA-TGGATT-TAT--TTT-ATGCT-TAATG-AAA----CAT-A--------------AATTT-TTTT----TAA---------------------------------TT-AA----ATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCCAGTACATATTTCAAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|9 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattTAAGCGGTTAGTG--GCCAGGTGTA--------------GCGGCT----GACTCTT-A-G--CACTTAGCAGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAACCTAGAGCGAG-GTA-AGTATAAAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAATG---------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTATGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTA---C--TGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCACTGTTT-TGCTTGATTGTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|9 : cct-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATG-ATGTGTGATCACTTTTTAT-CTcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA
Alignments
lowQualScore : 44444444 11 11111111111 333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777 333333 2222222222222 1111 22222 777777777777 111111 11111111 1
lowQualScore : 44 2 11 6666 2 2 22 333 3 2 3 88 55 333 888888888 3 11111111 1 4444 2 11 666666 0 2 2 0 1 1 22 777777777 2 55 3 11111111111 3333 66666666 66666 666666666666 888888 22 555555 1 2 2 2 6 1 555555555555555555555555555555555555555555 777777777 2 1 111111 1 44444 4444 55 1 3 2 2 4 2 1111111111111 2 0 1 1 1 55555555555 4 4444 2 66 2 00000 3 2 2 2 444 4 2 0 111111111111 2 6666666 222222 2 8888 00000000 2 2 4
lowQualScore : .. . .. .... . . .. ... . . . .. .. ... ......... . ........ . .... . .. ...... . . . . . . .. ......... . .. . ........... .... ........ ..... ............ ...... .. ...... . . . . . . .......................................... ......... . . ...... . ..... .... .. . . . . . . ............. . . . . . ........... . .... . .. . ..... . . . . ... . . . ............ . ....... ...... . .... ........ . . .
lowQualScore : 22 1 66 6666 1 1 99 777 4 0 4 33 77 777 444444444 0 66666666 6 7777 4 99 111111 6 0 1 8 9 9 66 666666666 5 00 6 44444444444 9999 66666666 77777 222222222222 111111 66 555555 9 1 0 0 0 9 999999999999999999999999999999999999999999 666666666 5 9 222222 9 88888 0000 88 9 8 0 0 0 1 9999999999999 0 8 6 5 9 22222222222 0 2222 0 99 0 77777 1 1 1 7 888 2 1 5 888888888888 1 8888888 111111 0 5555 88888888 1 4 4
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( family-3654 ) : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC----ATAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|1 : ATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTGTAAGTGGTCAGATGTAGCGGCC----AACCATT-C-T--TACTTAGTGGTCACA---CTGTTTGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTACCCAGAGCGACA-GTA-TGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-TATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTAAATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTATAGTAACGTAACCAC---------GA-AG-----A----ATAAGAGCTACACTTTTT-TAATGGATTGTATGGCAT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------ATATTTATTTAATGCTATATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-AG-GTTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GTCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCAT
gi|10 : caGTTATGAAAACACATCACTTTACCCAGAGCGAGA-GTA-TGCATATAT---GG---------TCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTG-AATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-G-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCa
gi|11 : TTTGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGTCT----A-AACGTCACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTCT-TTCTGGATTGTGCGGCAT-CTGCT-AAATG-ACAAATTCAT-ATGAACCT------GGACTTATTTAATGCTTAATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT-AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAAT-TGCTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAA----------------GG-TTTTTTACTCATACACCCCT-GTACATGATTCCAAACA-ACTT-------ACA------GACA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTGGCTGTC----GACCCTT-AAT--CACTTAGTGGTCACA---CCATTTGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTACCTAAAGCAAAC-CTA-TGTATATGC---GG---------TCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAAAGACTTT-AATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCACGTGT
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTTTT--GCTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-ACAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC----A-AACGTTGCTGCGAGATAATGAA-AG-----A----ATATAAGCTACAAATTCT-TTCTGGACTGTACGGCAT-CTGCT-GAATG-AAAAATTCACGA------CT-----GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagTGGCTGCTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGC-ATG-CGTGTATATTATGG---------TCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCATGACATC-AATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-TA-TGACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGT------GCAAATGC-AATG-----G--AAAA-ACT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T------GCGATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT-----CAACGTAACCGCGTGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACATTTT-TAACGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATGCAAAAATTC
gi|14 : aagtggtcagatgtaaAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-ACG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCC-----TAATGTATCAGCGAAATAATGGA-AG-----AAATTATAAGAGCTGCATTGTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG--AAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----ACA-G--------T-AAT--GAT--C-----TTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-CAGA-ATTTTT-CTCATTTACCTCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-tgactatttggaacatga
gi|15 : A-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|16 : ATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCGc
gi|18 : tgcccGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTGATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAAC----A-AAAGTAACCGTGAGGTTACAGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTTT-TACTGGATTGTATGGCGT-CTGCTCAAATA-AATATTTCAT-ATGAAACT------GAATTTTTTTTATGCTAAATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT-AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT-----ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCTTCCTG-T-TG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCAAGT------------ACA-
gi|19 : AATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA-----------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T------ACGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTGTTT-GACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATC-GC-ACAGGTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCC----TAAACATAACCGCGAGACAATGGA-AG-----A----ATCCAAGCTACAATTTTT-TGCTGGATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATGAAAAAAATCAT-A------C------GGATTTATTTCATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ACT-G-ATTTTTTT-AATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATTGA-AATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-TTCTTT-CACATTTA-CCCCAGT------------A-A-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACAAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCAt
gi|2 : aTGTAAGCGGTCATATGTAGTACCC----AACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CATATATAC---AG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCATTACATT-AATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGTA-TGACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-ATA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAATGTAACTGCAAGATTATGGA-AG-----A----ATACCAGCAACATATTTT-TACTGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAGTTCAT-A------T------GGATTTATTTTATTCTAAA-T-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCTTCCTC-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------GCA------GGCATTGG------CA--------TG----GTACATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|20 : CTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA--CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT----GCGATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTC----TTA-TGTAACCACGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACACATTTT-TACTGGATTTTATGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-C------T------GGATTTATTTAATGCTTAA-T-GAAACA-----T-----AA--G-T--TTTTT--------TAA-ATAAATGA--TTAT---------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCTTCATG-T-GG-ATTTTT-CTAATTTACCCTCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTGCCAAGCATGTGTGATCACT
gi|21 : GTAAACG--GTCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTA--------------------T--CACTTAGCTGTCACA---CCTTTTGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTATCCAGAACTTGC-ATT-GGTATATAG---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TG-TGACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|22 : caatacctACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACTAGCTGCACTGTTT-TACTGGATTGTGTGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------AGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTC----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-
gi|23 : tcAG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCC----TTA-CATAACCGCAAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGATACAAATTTT-TACTAGATTGTACGGCGT-CCGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------CGAAACTGGATTCATTTTAAACTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-AT-TTTTT-AATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATTCA-TATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCTTCCTC-T-GC-A-TTTT-CTCATTTA-CCCCAGT------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A-A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T------CTGATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAA--G-TT-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAACTACACTTTTT-TACTGGATT
gi|25 : gAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTGTAAGCGGTCAGTTGTAGCAGCCTTATGA----T-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAACCAGAGCGAGA-GTA-TGTATATAC---GG---------TATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-ATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATA
gi|26 : CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGC--CTT---GACCATT-A-T--CACTTAGTGGCCGCA---CCTTTTGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGA-GTA-TGTATAT-----GG---------TCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTATGACTTT-TATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTG--GCCAGATGTAAGCCGC---AT--------------ACCCTT-A-T--CACTTAGTGG--------CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTC----CCAGCAGTA-TGTATATAC---AG---------TTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATTTC-TTGAATTT-TTAGC-AAACT
gi|28 : ATGTAGTGGCG----GACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGCAAAACTGTTA
gi|29 : TAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTTTA-AATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTATGATCACTTTT
gi|3 : tacgaaacataaaacaGTAAGTGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCCTT-A-TAACCCTT----GTCACA---CCTTTTGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-ATG-TGTATATAC---TG---------TCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CTGACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGT-AGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TAT-------AACT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACGTAACCGAGAGATAACGGA-AG-----A----ATACGAGCTTCACATTTT-TACTGGATTTTATAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GCATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT---------------------G-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACTTATTTCCAAACA-ACTT-------GCAGGCATTGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|30 : GGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAGAT
gi|30 : tAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------Ttttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|31 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGAAGCAGCC----GACCCTT-T-A--GACTAAGAGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGC
gi|32 : gcccAGATTAATGAC-TTTAATTTGTAAGCAAAGC-----------------------CTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-TAT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTA
gi|33 : ctATAAGCGGTCAGC-----CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGATCACA---CCTTTTGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCc
gi|34 : gtccTTGTTTAGGTT-TATT-TCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--A
gi|35 : cGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-AT-TTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TTATTGAT-----ATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|36 : ataatgcataagaatatgaaacttT-------ACA------AGTC-TGGTA----CAATTAATTATGTACAATGCATGTGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCAT
gi|38 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaaGGACACA---CCTATGGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTg
gi|39 : atCCCCAGT------------ACATAATTCCAAATAACA------GGCA-TGGGA----CA--------AGTACCATGCATGTGTGATCAC
gi|4 : atataTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCAAGC-ATG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCGTGACATT-AATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTTGTGATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCC-----CAATGTAACCGCGAGATAATGGT-AG-----A----ATATGAGCTACACATTTT-TACTGAATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GGATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAAC------------AAT-G-T--TTTTTGAATTAAATGATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCTTTCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ACAGGCATGGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|40 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtg-TGATA----CACTA-----TGTTCAACGTATATGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCA
gi|41 : cTAAGCGGTCAGATGTGGCCGCT----GACCATTAA-T--TACTTgg
gi|5 : cttTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTGTA--------------GTGGTT----GACTCTT-A-G--CACTTTGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAA--GTA-CGTATATAC---GGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------------------TGTAACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTTTA--------------TTTACGGCAGTTATATTTAGATT-TAA-GTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGT--TTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG--AAAA--TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAA-G-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGT-C----GTAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AA-----A----ATACG-GCTGCACTATTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------A------GG--------------AAATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATTTA-AAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCTTCCTGCC-CA-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------AGA------GGCA-TG----------------------------TGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCATtgtg
gi|6 : ctgATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTA-GCGGTCAGATGTAGCGCCC----GACTCTT-A-G--CACTTAGCGGTCACA---CATTTTGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGA-ATA-AGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAATGAC---------------------GTTACCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-ACG-------T-T-----TTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ACAATTGACTCG------------TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TAACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCA--------------------------CTGCG-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTA-------ACA------GGCA-TGGTA----TA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-g
gi|7 : aatgcccTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAA---CCTTTTGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|7 : atacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GTGATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC-----TAACGTAACCACGAGATTATGG--AT-----A----ATGCTTAATAAAAATTTCATA-TGGATT-TATTTTATGCTATT-AAATG-AAA----CAT-A-----------------------------AAATT---------------------------TTTTT-AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCATTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCTTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAAAAACCTTTTGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTACCCAGAGCAAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|8 : aatacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-AC--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC-----TGACATAACCACGAAATAATGGATAATGCTTA----ATAAAAAATACA-------TA-TGGATT-TAT--TTT-ATGCT-TAATG-AAA----CAT-A--------------AATTT-TTTT----TAA---------------------------------TT-AA----ATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCCAGTACATATTTCAAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|9 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattTAAGCGGTTAGTG--GCCAGGTGTA--------------GCGGCT----GACTCTT-A-G--CACTTAGCAGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAACCTAGAGCGAG--GTA-AGTATAAAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAATG---------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTATGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----TACTGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCACTGTTT-TGCTTGATTGTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|9 : cct-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATG-ATGTGTGATCACTTTTTAT-CTcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA
Alignments
lowQualScore : 44444444 11 11111111111 333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777 2222222222222 1111 22222 777777777777 111111 11111111 1
lowQualScore : 44 2 11 6666 2 2 22 333 3 2 3 88 55 333 888888888 3 11111111 1 4444 2 11 666666 0 2 2 0 1 1 22 777777777 2 55 3 11111111111 3333 66666666 66666 666666666666 888888 22 555555 1 2 2 2 6 1 555555555555555555555555555555555555555555 777777777 2 1 44444 1 1 44444 4444 55 1 3 2 2 4 2 1111111111111 2 0 1 1 1 55555555555 4 4444 2 66 2 00000 3 2 2 2 444 4 2 0 111111111111 2 6666666 222222 2 8888 00000000 2 2 4
lowQualScore : .. . .. .... . . .. ... . . . .. .. ... ......... . ........ . .... . .. ...... . . . . . . .. ......... . .. . ........... .... ........ ..... ............ ...... .. ...... . . . . . . .......................................... ......... . . ..... . . ..... .... .. . . . . . . ............. . . . . . ........... . .... . .. . ..... . . . . ... . . . ............ . ....... ...... . .... ........ . . .
lowQualScore : 22 1 66 6666 1 1 99 777 4 0 4 33 77 777 444444444 0 66666666 6 7777 4 99 111111 6 0 1 8 9 9 66 666666666 5 00 6 44444444444 9999 66666666 77777 222222222222 111111 66 555555 9 1 0 0 0 9 999999999999999999999999999999999999999999 666666666 5 9 88888 9 9 88888 0000 88 9 8 0 0 0 1 9999999999999 0 8 6 5 9 22222222222 0 2222 0 99 0 77777 1 1 1 7 888 2 1 5 888888888888 1 8888888 111111 0 5555 88888888 1 4 4
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( family-3654 ) : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|1 : ATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTGTAAGTGGTCAGATGTAGCGGCC----AACCATT-C-T--TACTTAGTGGTCACA---CTGTTTGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTACCCAGAGCGACA-GTA-TGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-TATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTAAATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTATAGT-AACGTAACCAC---------GA-AG-----A----ATAAGAGCTACACTTTTT-TAATGGATTGTATGGCAT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------ATATTTATTTAATGCTATATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-AG-GTTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GTCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCAT
gi|10 : caGTTATGAAAACACATCACTTTACCCAGAGCGAGA-GTA-TGCATATAT---GG---------TCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTG-AATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-G-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCa
gi|11 : TTTGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGTCT-----A-AACGTCACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTCT-TTCTGGATTGTGCGGCAT-CTGCT-AAATG-ACAAATTCAT-ATGAACCT------GGACTTATTTAATGCTTAATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT-AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAAT-TGCTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAA----------------GG-TTTTTTACTCATACACCCCT-GTACATGATTCCAAACA-ACTT-------ACA------GACA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTGGCTGTC----GACCCTT-AAT--CACTTAGTGGTCACA---CCATTTGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTACCTAAAGCAAAC-CTA-TGTATATGC---GG---------TCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAAAGACTTT-AATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCACGTGT
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTTTT--GCTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-ACAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC-----A-AACGTTGCTGCGAGATAATGAA-AG-----A----ATATAAGCTACAAATTCT-TTCTGGACTGTACGGCAT-CTGCT-GAATG-AAAAATTCACGA------CT-----GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagTGGCTGCTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGC-ATG-CGTGTATATTATGG---------TCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCATGACATC-AATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-TA-TGACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGT------GCAAATGC-AATG-----G--AAAA-ACT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T------GCGATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT-----C-AACGTAACCGCGTGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACATTTT-TAACGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATGCAAAAATTC
gi|14 : aagtggtcagatgtaaAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-ACG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCC-----T-AATGTATCAGCGAAATAATGGA-AG-----AAATTATAAGAGCTGCATTGTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG--AAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----ACA-G--------T-AAT--GAT--C-----TTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-CAGA-ATTTTT-CTCATTTACCTCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-tgactatttggaacatga
gi|15 : A-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|16 : ATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCGc
gi|18 : tgcccGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTGATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAAC-----A-AAAGTAACCGTGAGGTTACAGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTTT-TACTGGATTGTATGGCGT-CTGCTCAAATA-AATATTTCAT-ATGAAACT------GAATTTTTTTTATGCTAAATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT-AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT-----ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCTTCCTG-T-TG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCAAGT------------ACA-
gi|19 : AATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA-----------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T------ACGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTGTTT-GACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATC-GC-ACAGGTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCC-----TAAACATAACCGCGAGACAATGGA-AG-----A----ATCCAAGCTACAATTTTT-TGCTGGATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATGAAAAAAATCAT-A------C------GGATTTATTTCATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ACT-G-ATTTTTTT-AATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATTGA-AATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-TTCTTT-CACATTTA-CCCCAGT------------A-A-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACAAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCAt
gi|2 : aTGTAAGCGGTCATATGTAGTACCC----AACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CATATATAC---AG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCATTACATT-AATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGTA-TGACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-ATA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACTGCAAGATTATGGA-AG-----A----ATACCAGCAACATATTTT-TACTGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAGTTCAT-A------T------GGATTTATTTTATTCTAAA-T-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCTTCCTC-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------GCA------GGCATTGG------CA--------TG----GTACATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|20 : CTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA--CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT----GCGATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTC-----T-TATGTAACCACGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACACATTTT-TACTGGATTTTATGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-C------T------GGATTTATTTAATGCTTAA-T-GAAACA-----T-----AA--G-T--TTTTT--------TAA-ATAAATGA--TTAT---------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCTTCATG-T-GG-ATTTTT-CTAATTTACCCTCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTGCCAAGCATGTGTGATCACT
gi|21 : GTAAACG--GTCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTA--------------------T--CACTTAGCTGTCACA---CCTTTTGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTATCCAGAACTTGC-ATT-GGTATATAG---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TG-TGACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|22 : caatacctACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACTAGCTGCACTGTTT-TACTGGATTGTGTGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------AGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTC----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-
gi|23 : tcAG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCC-----T-TACATAACCGCAAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGATACAAATTTT-TACTAGATTGTACGGCGT-CCGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------CGAAACTGGATTCATTTTAAACTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-AT-TTTTT-AATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATTCA-TATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCTTCCTC-T-GC-A-TTTT-CTCATTTA-CCCCAGT------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A-A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T------CTGATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGT---T-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAACTACACTTTTT-TACTGGATT
gi|25 : gAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTGTAAGCGGTCAGTTGTAGCAGCCTTATGA----T-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAACCAGAGCGAGA-GTA-TGTATATAC---GG---------TATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-ATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATA
gi|26 : CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGC--CTT---GACCATT-A-T--CACTTAGTGGCCGCA---CCTTTTGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGA-GTA-TGTATAT-----GG---------TCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTATGACTTT-TATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTG--GCCAGATGTAAGCCGC---AT--------------ACCCTT-A-T--CACTTAGTGG--------CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTC----CCAGCAGTA-TGTATATAC---AG---------TTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATTTC-TTGAATTT-TTAGC-AAACT
gi|28 : ATGTAGTGGCG----GACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGCAAAACTGTTA
gi|29 : TAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTTTA-AATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTATGATCACTTTT
gi|3 : tacgaaacataaaacaGTAAGTGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCCTT-A-TAACCCTT----GTCACA---CCTTTTGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-ATG-TGTATATAC---TG---------TCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CTGACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGT-AGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TAT-------AACT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGAGAGATAACGGA-AG-----A----ATACGAGCTTCACATTTT-TACTGGATTTTATAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GCATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT---------------------G-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACTTATTTCCAAACA-ACTT-------GCAGGCATTGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|30 : GGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAGAT
gi|30 : tAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------Ttttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|31 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGAAGCAGCC----GACCCTT-T-A--GACTAAGAGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGC
gi|32 : gcccAGATTAATGAC-TTTAATTTGTAAGCAAAGC-----------------------CTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-TAT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTA
gi|33 : ctATAAGCGGTCAGC-----CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGATCACA---CCTTTTGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCc
gi|34 : gtccTTGTTTAGGTT-TATT-TCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--A
gi|35 : cGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-AT-TTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TTATTGAT-----ATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|36 : ataatgcataagaatatgaaacttT-------ACA------AGTC-TGGTA----CAATTAATTATGTACAATGCATGTGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCAT
gi|38 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaaGGACACA---CCTATGGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTg
gi|39 : atCCCCAGT------------ACATAATTCCAAATAACA------GGCA-TGGGA----CA--------AGTACCATGCATGTGTGATCAC
gi|4 : atataTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCAAGC-ATG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCGTGACATT-AATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTTGTGATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCC-----C-AATGTAACCGCGAGATAATGGT-AG-----A----ATATGAGCTACACATTTT-TACTGAATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GGATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAAC------------AAT-G-T--TTTTTGAATTAAATGATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCTTTCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ACAGGCATGGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|40 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtg-TGATA----CACTA-----TGTTCAACGTATATGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCA
gi|41 : cTAAGCGGTCAGATGTGGCCGCT----GACCATTAA-T--TACTTgg
gi|5 : cttTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTGTA--------------GTGGTT----GACTCTT-A-G--CACTTTGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAA--GTA-CGTATATAC---GGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------------------TGTAACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTTTA--------------TTTACGGCAGTTATATTTAGATT-TAA-GTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGT--TTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG--AAAA--TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAA-G-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCG-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AA-----A----ATACG-GCTGCACTATTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------A------GG--------------AAATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATTTA-AAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCTTCCTGCC-CA-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------AGA------GGCA-TG----------------------------TGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCATtgtg
gi|6 : ctgATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTA-GCGGTCAGATGTAGCGCCC----GACTCTT-A-G--CACTTAGCGGTCACA---CATTTTGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGA-ATA-AGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAATGAC---------------------GTTACCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-ACG-------T-T-----TTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ACAATTGACTCG------------TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCA--------------------------CTGCG-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTA-------ACA------GGCA-TGGTA----TA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-g
gi|7 : aatgcccTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAA---CCTTTTGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|7 : atacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GTGATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC-----T-AACGTAACCACGAGATTATGG--AT-----A----ATGCTTAATAAAAATTTCATA-TGGATT-TATTTTATGCTATT-AAATG-AAA----CAT-A-----------------------------AAATT---------------------------TTTTT-AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCATTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCTTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAAAAACCTTTTGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTACCCAGAGCAAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|8 : aatacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-AC--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC-----T-GACATAACCACGAAATAATGGATAATGCTTA----ATAAAAAATACA-------TA-TGGATT-TAT--TTT-ATGCT-TAATG-AAA----CAT-A--------------AATTT-TTTT----TAA---------------------------------TT-AA----ATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCCAGTACATATTTCAAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|9 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattTAAGCGGTTAGTG--GCCAGGTGTA--------------GCGGCT----GACTCTT-A-G--CACTTAGCAGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAACCTAGAGCGAG--GTA-AGTATAAAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAATG---------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTATGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-ACTGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCACTGTTT-TGCTTGATTGTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|9 : cct-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATG-ATGTGTGATCACTTTTTAT-CTcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA
Alignments
lowQualScore : 44444444 11 11111111111 333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777 2222222222222 1111 22222 777777777777 111111 11111111 1
lowQualScore : 44 2 11 6666 2 2 22 333 3 2 3 88 55 333 888888888 3 11111111 1 4444 2 11 666666 0 2 2 0 1 1 22 777777777 2 55 3 11111111111 3333 66666666 66666 666666666666 888888 22 555555 1 2 2 2 6 1 555555555555555555555555555555555555555555 777777777 2 1 44444 1 1 44444 4444 55 1 3 2 2 4 2 1111111111111 2 0 1 1 1 55555555555 4 4444 2 66 2 00000 3 2 2 2 444 4 2 0 111111111111 2 6666666 222222 2 8888 00000000 2 2 4
lowQualScore : .. . .. .... . . .. ... . . . .. .. ... ......... . ........ . .... . .. ...... . . . . . . .. ......... . .. . ........... .... ........ ..... ............ ...... .. ...... . . . . . . .......................................... ......... . . ..... . . ..... .... .. . . . . . . ............. . . . . . ........... . .... . .. . ..... . . . . ... . . . ............ . ....... ...... . .... ........ . . .
lowQualScore : 22 1 66 6666 1 1 99 777 4 0 4 33 77 777 444444444 0 66666666 6 7777 4 99 111111 6 0 1 8 9 9 66 666666666 5 00 6 44444444444 9999 66666666 77777 222222222222 111111 66 555555 9 1 0 0 0 9 999999999999999999999999999999999999999999 666666666 5 9 88888 9 9 88888 0000 88 9 8 0 0 0 1 9999999999999 0 8 6 5 9 22222222222 0 2222 0 99 0 77777 1 1 1 7 888 2 1 5 888888888888 1 8888888 111111 0 5555 88888888 1 4 4
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( family-3654 ) : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|1 : ATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTGTAAGTGGTCAGATGTAGCGGCC----AACCATT-C-T--TACTTAGTGGTCACA---CTGTTTGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTACCCAGAGCGACA-GTA-TGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-TATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTAAATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTATAGT-AACGTAACCAC---------GA-AG-----A----ATAAGAGCTACACTTTTT-TAATGGATTGTATGGCAT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------ATATTTATTTAATGCTATATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-AG-GTTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GTCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCAT
gi|10 : caGTTATGAAAACACATCACTTTACCCAGAGCGAGA-GTA-TGCATATAT---GG---------TCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTG-AATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-G-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCa
gi|11 : TTTGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGTCT-----A-AACGTCACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTCT-TTCTGGATTGTGCGGCAT-CTGCT-AAATG-ACAAATTCAT-ATGAACCT------GGACTTATTTAATGCTTAATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT-AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAAT-TGCTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAA----------------GG-TTTTTTACTCATACACCCCT-GTACATGATTCCAAACA-ACTT-------ACA------GACA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTGGCTGTC----GACCCTT-AAT--CACTTAGTGGTCACA---CCATTTGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTACCTAAAGCAAAC-CTA-TGTATATGC---GG---------TCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAAAGACTTT-AATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-TA-TGTCACGTGT
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTTTT--GCTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-ACAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC-----A-AACGTTGCTGCGAGATAATGAA-AG-----A----ATATAAGCTACAAATTCT-TTCTGGACTGTACGGCAT-CTGCT-GAATG-AAAAATTCACGA------CT-----GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagTGGCTGCTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGC-ATG-CGTGTATATTATGG---------TCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCATGACATC-AATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-TA-TGACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGT------GCAAATGC-AATG-----G--AAAA-ACT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T------GCGATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT-----C-AACGTAACCGCGTGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACATTTT-TAACGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATGCAAAAATTC
gi|14 : aagtggtcagatgtaaAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-ACG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCC-----T-AATGTATCAGCGAAATAATGGA-AG-----AAATTATAAGAGCTGCATTGTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG--AAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----ACA-G--------T-AAT--GAT--C-----TTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-CAGA-ATTTTT-CTCATTTACCTCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-tgactatttggaacatga
gi|15 : A-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|16 : ATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATGAC---------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCGc
gi|18 : tgcccGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTGATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAAC-----A-AAAGTAACCGTGAGGTTACAGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTTT-TACTGGATTGTATGGCGT-CTGCTCAAATA-AATATTTCAT-ATGAAACT------GAATTTTTTTTATGCTAAATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT-AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT-----ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCTTCCTG-T-TG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCAAGT------------ACA-
gi|19 : AATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA-----------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T------ACGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTGTTT-GACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATC-GC-ACAGGTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCC-----TAAACATAACCGCGAGACAATGGA-AG-----A----ATCCAAGCTACAATTTTT-TGCTGGATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATGAAAAAAATCAT-A------C------GGATTTATTTCATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ACT-G-ATTTTTTT-AATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATTGA-AATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-TTCTTT-CACATTTA-CCCCAGT------------A-A-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACAAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCAt
gi|2 : aTGTAAGCGGTCATATGTAGTACCC----AACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CATATATAC---AG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCATTACATT-AATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGTA-TGACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-ATA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACTGCAAGATTATGGA-AG-----A----ATACCAGCAACATATTTT-TACTGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAGTTCAT-A------T------GGATTTATTTTATTCTAAA-T-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCTTCCTC-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------GCA------GGCATTGG------CA--------TG----GTACATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|20 : CTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA--CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT----GCGATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTC-----T-TATGTAACCACGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACACATTTT-TACTGGATTTTATGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-C------T------GGATTTATTTAATGCTTAA-T-GAAACA-----T-----AA--G-T--TTTTT--------TAA-ATAAATGA--TTAT---------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCTTCATG-T-GG-ATTTTT-CTAATTTACCCTCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTGCCAAGCATGTGTGATCACT
gi|21 : GTAAACG--GTCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTA--------------------T--CACTTAGCTGTCACA---CCTTTTGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTATCCAGAACTTGC-ATT-GGTATATAG---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TG-TGACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|22 : caatacctACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACTAGCTGCACTGTTT-TACTGGATTGTGTGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------AGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTC----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-
gi|23 : tcAG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCC-----T-TACATAACCGCAAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGATACAAATTTT-TACTAGATTGTACGGCGT-CCGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------CGAAACTGGATTCATTTTAAACTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-AT-TTTTT-AATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATTCA-TATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCTTCCTC-T-GC-A-TTTT-CTCATTTA-CCCCAGT------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A-A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T------CTGATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGT---T-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAACTACACTTTTT-TACTGGATT
gi|25 : gAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTGTAAGCGGTCAGTTGTAGCAGCCTTATGA----T-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAACCAGAGCGAGA-GTA-TGTATATAC---GG---------TATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-ATGAC---------GTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATA
gi|26 : CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGC--CTT---GACCATT-A-T--CACTTAGTGGCCGCA---CCTTTTGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGA-GTA-TGTATAT-----GG---------TCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTATGACTTT-TATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTG--GCCAGATGTAAGCCGC---AT--------------ACCCTT-A-T--CACTTAGTGG--------CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTC----CCAGCAGTA-TGTATATAC---AG---------TTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATTTC-TTGAATTT-TTAGC-AAACT
gi|28 : ATGTAGTGGCG----GACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGCAAAACTGTTA
gi|29 : TAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTTTA-AATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTATGATCACTTTT
gi|3 : tacgaaacataaaacaGTAAGTGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCCTT-A-TAACCCTT----GTCACA---CCTTTTGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-ATG-TGTATATAC---TG---------TCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCATGACATT-AATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CTGACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGT-AGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TAT-------AACT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGAGAGATAACGGA-AG-----A----ATACGAGCTTCACATTTT-TACTGGATTTTATAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GCATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT---------------------G-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACTTATTTCCAAACA-ACTT-------GCAGGCATTGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|30 : GGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAGAT
gi|30 : tAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------Ttttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|31 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGAAGCAGCC----GACCCTT-T-A--GACTAAGAGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGC
gi|32 : gcccAGATTAATGAC-TTTAATTTGTAAGCAAAGC-----------------------CTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-TAT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTA
gi|33 : ctATAAGCGGTCAGC-----CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGATCACA---CCTTTTGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCc
gi|34 : gtccTTGTTTAGGTT-TATT-TCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--A
gi|35 : cGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-AT-TTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TTATTGAT-----ATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|36 : ataatgcataagaatatgaaacttT-------ACA------AGTC-TGGTA----CAATTAATTATGTACAATGCATGTGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCAT
gi|38 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaaGGACACA---CCTATGGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTg
gi|39 : atCCCCAGT------------ACATAATTCCAAATAACA------GGCA-TGGGA----CA--------AGTACCATGCATGTGTGATCAC
gi|4 : atataTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCAAGC-ATG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCGTGACATT-AATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTTGTGATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCC-----C-AATGTAACCGCGAGATAATGGT-AG-----A----ATATGAGCTACACATTTT-TACTGAATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GGATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAAC------------AAT-G-T--TTTTTGAATTAAATGATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCTTTCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ACAGGCATGGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|40 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtg-TGATA----CACTA-----TGTTCAACGTATATGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCA
gi|41 : cTAAGCGGTCAGATGTGGCCGCT----GACCATTAA-T--TACTTgg
gi|5 : cttTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTGTA--------------GTGGTT----GACTCTT-A-G--CACTTTGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAA--GTA-CGTATATAC---GGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATGA---------------------TGTAACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTTTA--------------TTTACGGCAGTTATATTTAGATT-TAA-GTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGT--TTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG--AAAA--TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAA-G-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCG-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AA-----A----ATACG-GCTGCACTATTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------A------GG--------------AAATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATTTA-AAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCTTCCTGCC-CA-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------AGA------GGCA-TG----------------------------TGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCATtgtg
gi|6 : ctgATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTA-GCGGTCAGATGTAGCGCCC----GACTCTT-A-G--CACTTAGCGGTCACA---CATTTTGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGA-ATA-AGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAATGAC---------------------GTTACCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-ACG-------T-T-----TTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ACAATTGACTCG------------TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCA--------------------------CTGCG-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTA-------ACA------GGCA-TGGTA----TA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-g
gi|7 : aatgcccTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAA---CCTTTTGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|7 : atacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GTGATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC-----T-AACGTAACCACGAGATTATGG--AT-----A----ATGCTTAATAAAAATTTCATA-TGGATT-TATTTTATGCTATT-AAATG-AAA----CAT-A-----------------------------AAATT---------------------------TTTTT-AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCATTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCTTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAAAAACCTTTTGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTACCCAGAGCAAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCATG
gi|8 : aatacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-AC--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC-----T-GACATAACCACGAAATAATGGATAATGCTTA----ATAAAAAATACA-------TA-TGGATT-TAT--TTT-ATGCT-TAATG-AAA----CAT-A--------------AATTT-TTTT----TAA---------------------------------TT-AA----ATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCCAGTACATATTTCAAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-taaacacattggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|9 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattTAAGCGGTTAGTG--GCCAGGTGTA--------------GCGGCT----GACTCTT-A-G--CACTTAGCAGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAACCTAGAGCGAG--GTA-AGTATAAAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAATG---------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTATGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-ACTGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCACTGTTT-TGCTTGATTGTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|9 : cct-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATG-ATGTGTGATCACTTTTTAT-CTcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
blockSeqs : CG A CT TTAT A A AA AAA C T T CA AT TAT AATATAGGG A TTTAATT G TATA G TT GCTGTC C A G A GA AATTTAATT T AA A ATNNNNNNNN TTGT TTTTTTTT TTTTT TTTATTTTTATT TTTTTT TA AGAAAT T T A T T T CAAGATGTAAGAGTGGTA GAGTGGTTT C T . A T TGCTT AATT CT A G G C C G TGAACCT A T T A TACAGG G ATT G TT C TCATA A T T G CA A A ACATGATTCCAA T CCAAATA GGCATT T CAAT ATTAATTA G C C
blockSeqs : . A AG T . . . . C . T A AT . . A ATCAATT A . . TT . . . . . . . A AA A TGTA . . T TTTATTTTTATT TT . . . . . T T . CGTGTAAGGGTGGGT . G . . . . . . AA . G . . A . TGAAACT A A T . TACAGT G TT . TT . TTGA T . . T CC A . ACATATTTCCAA . . GGCATG . CAAT CTA A . .
blockSeqs : . A AG . . . . . G . T C T . . C ATTAATT A . . TT . . . . . . . T . . TTA . . . TTTTTTTATT . . . . . . T T . CGTGTAAGAGTGGTT . G . . . . . . AA . G . . . . CGAAACT A T T . T . AT . AA . TTAA A . . G G . . ACATATTTCCAA . . . . . . G . .
blockSeqs : . A TA . . . . . G . C C T . . A ATTAAGT G . . CT . . . . . . . C . . ATA . . . TTTTTTTATT . . . . . . T . . CGTGTAAGAGTGGTT . T . . . . . . CA . T . . . . CT A T T . T . TT . AA . TTAA A . . G C . . ACTTATTTCCAA . . . . . . G . .
blockSeqs : . A CA . . . . . A . T A C . . A TTTTATT G . . TT . . . . . . . C . . TTA . . . . . . . . . . T . . TGTGTAAGAGTGGTT . C . . . . . . TT . G . . . . C A T T . T . AT . AA . TGAA T . . C T . . ACATATTTCGAA . . . . . . G . .
blockSeqs : . A TG . . . . . A . T A C . . C TTGAATT G . . TT . . . . . . . C . . TTA . . . . . . . . . . T . . CGTTTAAGAGTGGTA . C . . . . . . CT . G . . . . C A C T . T . A . TT . TTAA T . . G C . . ACATATTTCGAA . . . . . . G . .
blockSeqs : . A TG . . . . . A . T C G . . C ATTAATT A . . AT . . . . . . . C . . TTA . . . . . . . . . . . . . CGTTTAAGAGTGGTT . C . . . . . . AA . G . . . . C A T T . T . A . AA . TCAT T . . C T . . ACATATTTCAAA . . . . . . G . .
blockSeqs : . A CA . . . . . A . T C T . . T ATTAATT G . . T . . . . . . . C . . ATA . . . . . . . . . . . . . CATGTAAGAGTT . C . . . . . . AT . T . . . . C A A T . A . A . TC . TTAA A . . C T . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . A TG . . . . . A . C A T . . A TTTAATT G . . T . . . . . . . C . . TTA . . . . . . . . . . . . . CATGTT . T . . . . . . TA . T . . . . T A T T . T . T . AA . TTAA C . . G C . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . A CC . . . . . A . T A T . . C ATTAATT A . . T . . . . . . . C . . TCA . . . . . . . . . . . . . TTA . T . . . . . . CA . T . . . . T A T T . T . A . AA . TTAA A . . A T . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . A TG . . . . . A . T C C . . C . A . . T . . . . . . . C . . TTC . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . CT . G . . . . C A T T . T . A . AA . . T . . G C . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . A CG . . . . . G . T C T . . A . G . . T . . . . . . . C . . TAA . . . . . . . . . . . . . NN . C . . . . . . AA . G . . . . T A T T . T . T . TT . . T . . C T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T TG . . . . . A . C C C . . C . A . . T . . . . . . . T . . ATA . . . . . . . . . . . . . TT . C . . . . . . CT . T . . . . T A T T . T . A . TT . . T . . C C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T TG . . . . . A . C A C . . A . G . . T . . . . . . . C . . TA . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . CA . T . . . . A A T T . T . A . AA . . A . . G T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CG . . . . . T . T T A . . A . . . . A . . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . CA . G . . . . C . . T . T . A . TT . . A . . G T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . G . C T C . . C . . . . T . . . . . . . T . . TT . . . . . . . . . . . . . TT . C . . . . . . CT . G . . . . C . . . . T . . . G . . T . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . C . C . . C . . . . . . . . . . T . . TT . . . . . . . . . . . . . TT . C . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . A . . A . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : ATTAATT* T* *****
originalCons : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGAC-TT-AATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
finalCons : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATGACATTAATT-TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-TAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 1 11111111111 333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777 2222222222222 1111 22222 777777777777 111111 11111111 1
lowQualScore : 44 2 11 6666 2 2 22 333 3 2 3 88 55 333 888888888 3 44444444444444 1 4444 2 2 1 666666 0 2 2 0 1 1 22 777777777 2 55 3 33333333333 3333 66666666 66666 666666666666 888888 1 22 555555 1 2 2 2 6 1 555555555555555555555555555555555555555555 777777777 2 1 44444 1 1 44444 4444 55 1 3 2 2 4 2 1111111111111 2 0 1 1 1 55555555555 4 4444 2 66 2 00000 3 2 2 2 444 4 2 0 111111111111 2 6666666 222222 2 8888 00000000 2 2 4
lowQualScore : .. . .. .... . . .. ... . . . .. .. ... ......... . .............. . .... . . . ...... . . . . . . .. ......... . .. . ........... .... ........ ..... ............ ...... . .. ...... . . . . . . .......................................... ......... . . ..... . . ..... .... .. . . . . . . ............. . . . . . ........... . .... . .. . ..... . . . . ... . . . ............ . ....... ...... . .... ........ . . .
lowQualScore : 22 1 66 6666 1 1 99 777 4 0 4 33 77 777 444444444 0 55555555555555 6 7777 4 4 8 111111 6 0 1 8 9 9 66 666666666 5 00 6 66666666666 9999 66666666 77777 222222222222 111111 1 66 555555 9 1 0 0 0 9 999999999999999999999999999999999999999999 666666666 5 9 88888 9 9 88888 0000 88 9 8 0 0 0 1 9999999999999 0 8 6 5 9 22222222222 0 2222 0 99 0 77777 1 1 1 7 888 2 1 5 888888888888 1 8888888 111111 0 5555 88888888 1 4 4
consensus : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATG-----ACATTAATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-AT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
Reference ( family-3654 ) : NNATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGCGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-GTA-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTNATG-----ACATTAATTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-AT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACNTTTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTNNATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGNACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCTCAA-TAAACATCAT
gi|1 : ATAAGCGATCAGCG--GCCAAGTGTAAGTGGTCAGATGTAGCGGCC----AACCATT-C-T--TACTTAGTGGTCACA---CTGTTTGGCTGGCAGCTTTTCCAATCAAATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTGCTTCTGTTATGAAAATACACCACTTTACCCAGAGCGACA-GTA-TGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATG-----A--------TGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ACGTGTATTTATGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-ATTGTCGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTT------ACTGAGGTATTCATACACAATTATAGAACTGGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCGGGTATGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTAAATGACCCGATGCATAGCG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTCGAATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAAGTGTCAATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCCTATAGT-AACGTAACCAC---------GA-AG-----A----ATAAGAGCTACACTTTTT-TAATGGATTGTATGGCAT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------ATATTTATTTAATGCTATATT-GAAACA-----T-----AAT-A-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-AG-GTTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GTCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAG-TAAACATCAT
gi|10 : caGTTATGAAAACACATCACTTTACCCAGAGCGAGA-GTA-TGCATATAT---GG---------TCTAATAAACAAATAGAATAGCGAGATTAATG-----AC--------GTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGCTATAAC-TGTATTTATGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-ATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTCGCTGTCACTGAGGTGTTTATGCATAATTATAGAACTGGGTTAGATCAA-AAAAAATAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGTT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTG-AATGAATTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-G-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCa
gi|11 : TTTGTTTGCAAATCTGTTACCTAGGCTGGGCATATTTCTGTTTAAGT----ATGTGTATTTACATTAGTTTTATTTAGGTT-T-AT-GTCTCGTGTAAACACATTCAAATCAATTTTC------ACTGAGATGTTTATGCACAATTATCGAACTTGGTAAAATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATT--ATTCAATT---------AGATTTTAT------------------CGAATATAATGG--AACA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGAC----TGC-TAACGTATATA------CA-TTGTCTGCAGC-AAAGAGAAAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AA----------------CGTGTAAGGGTGGGT-----------A---------AAT-TCAGAATTGTGGGA-ATATGTGCTGATAAAACACAGATTCAGAATGTGTCT-----A-AACGTCACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTCT-TTCTGGATTGTGCGGCAT-CTGCT-AAATG-ACAAATTCAT-ATGAACCT------GGACTTATTTAATGCTTAATA-GAAACA-----T-----AAT-G-----TTTT-AA----ATAACATAAATTAT-ATATTTATTCATAAT-TGCTTCTATACA-AA-ATATGGTCAATTCAAA----------------GG-TTTTTTACTCATACACCCCT-GTACATGATTCCAAACA-ACTT-------ACA------GACA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACATTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCAT
gi|12 : AAGCGGTCAGGTGTGGCTGTC----GACCCTT-AAT--CACTTAGTGGTCACA---CCATTTGGCTGGATGCTATTCCCATCATATTGTATAAG-CTCG--ATCTATTTACGCTTCTGCTTCTGTTACGAAAACATACCGCTTTACCTAAAGCAAAC-CTA-TGTATATGC---GG---------TCTAATAAGCAGAGAAAATAGCGAGATTAAAG-----ACTTTAATTTGTTTGCAACGTTGTTACCTAGGCTGGGCACATGGCTGTTTGTGC----GCGTACATATACAATAGTTTTATTTAGGTT-T-AT-GTCACGTGT
gi|12 : AATTGCAATTGGTTAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--ATTAAATT---------AAATTTTTT--GCTATAGATGTGGTTGTGAATACAATGG--AACA-ACAATNNNNNN-NNNNNNNNN----NNNNNN--------NN-----N------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN------NN-NNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NNNNNNNNNNN-NN----------------N-------------N-----------N---------NNNNTCTGAAATCTGGGA-AAAGGTGTCAATAAAACATAGACTCAGAGTGTGTCC-----A-AACGTTGCTGCGAGATAATGAA-AG-----A----ATATAAGCTACAAATTCT-TTCTGGACTGTACGGCAT-CTGCT-GAATG-AAAAATTCACGA------CT-----GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ttagaattgcaattggttagtttgtttaaattttaattaaattaaattttttgctatagatgtggttgtgaatacaatggaacaacaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctgaaatctgggaaaaggtgtcaataaaacatagactcagagtgtgtccaaacgttgctgcgagataatgaaagaatataagctacaaattctttctggactgtacggcatctgctgaatgaaaaattcacgactggatttattttatgcttaattgaaacat
gi|13 : aagcggtcaggtgtggctgtcgacccttaatcacttagtggtcacaccatttggctggatgctattcccatcatattgtataagctcgatctatttacgcttctgcttctgttacgaaaacataccgctttacctaaagcaaacctatgtatatgcggtctaataagcagagaaaatagcgagattaaagactttaatttgtttgcaacgttgttacctaggctgggcacatggctgtttgtgcgcgtacatatacaatagttttatttaggtttatgtcacgtgtttagTGGCTGCTATTCCCATCATATTTTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTTCTGCTT--GTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGC-ATG-CGTGTATATTATGG---------TCTAATTAGCAAATAGAATAGCGAGAGTCATG-----ACATCAATTTGTAAACGAAACTATTACCTAGGGTGGGTACATGACTGTTTAAGC----ATGTGTATTTACGGTATTTTTATTTAGGTT-T-AT-GACCTGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAAATATCAAACTGGGTAAGATC-A-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TGTA--A--------------------------GGGT------GCAAATGC-AATG-----G--AAAA-ACT-------T-TATTTTTTC----ATAACATTTTTTTTTAT----T------------T------GCGATTGACTCAGTTCATATCG--TACA------CA-AAATCTGCTGC--AAAAA-AGAAT--TT-GCCTTTGGATG-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AATGCCTGAATTTTTTAT-AAAAGTATCGATAAA--ACAGAATCAGAATGTGTCT-----C-AACGTAACCGCGTGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTACACATTTT-TAACGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATGCAAAAATTC
gi|14 : aagtggtcagatgtaaAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACAAGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTTATAGGCTGTGAAAGCCGGTGCGCATGCAATAG--AAAA-ACG-------T-TACTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTCGATGTATATGG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAATGG-TT-GACTTCGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTC------------CA--AAAACAC--AATCAGAATGGGTCC-----T-AATGTATCAGCGAAATAATGGA-AG-----AAATTATAAGAGCTGCATTGTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG--AAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----ACA-G--------T-AAT--GAT--C-----TTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATACA-AT-ATAGTGTAAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-CAGA-ATTTTT-CTCATTTACCTCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-tgactatttggaacatga
gi|15 : A-AAAAA-TAATTGCAATTTGTCAGTTTGTTTAAA-T-CATA--ATTGAGGT---------AAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAGTGG--AAAAAACA-------T-TATATTTTC----ATATCA--------TG-----A------------T------ACGATTGACCTGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGT-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGGTTTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACAT------GAGATAATGGA-AG-----A----ATATGAGCTACACTTTTT-TACTGGATTGTACGGTGT-CTGCT-AAATG-AAATATTCAT-A------C------GGATTTATTTTATGCTTAATT-GAAACA-----T-----AATGG-A--TTTTT-AATTTTATAACAAAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTACAATCA--------TGTACCAT-CATGCGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATC
gi|16 : ATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATG-----AC--------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-ATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATC
gi|17 : aatgcccATAAGCGGTCAGTG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGAGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCGAGCATTTTGTATAAT-CCCGTGATCAATTTATGCTTCTGCTTCTGTTCTGAAAATACACCACTTTACCAAGAGCGAGA-ATAATGTATATAT---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAACAGCGAGATTAATG-----AC--------GTTAGCGAAACTATATCCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GCATGTATTTGTGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-ATTGTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGTATGCACAATTATAGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGCTGGTGGGAATGCAATGGAAAAAA-ACA------------TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACCCGATGCATATCG--TACA------CA-ATATCCGc
gi|18 : tgcccGGTAAGTTCAA-AAAGA-TAACTGTAATTGGTCAGTTTGTTTAAG-T-TATA--ATTAAATT---------AAATTTAATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------A-TA-TTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GTGATTGACTTGACGCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTGTTT-GACTTTGGATGTGG----------------T-------------T-----------A---------AACTTCTCGATTTTCAGA-AAAGGTGTCAATAAAACACAGAATCAAAATGTGAAC-----A-AAAGTAACCGTGAGGTTACAGA-AG-----A----ATACAAGCTACAAATTTT-TACTGGATTGTATGGCGT-CTGCTCAAATA-AATATTTCAT-ATGAAACT------GAATTTTTTTTATGCTAAATTAAAAAAA-----A-----AAT-G-A--TTTTT-AATTAAATAACATAAATTA--TTAATTAT-----ATGTACTTCTTTATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATGTTTCCTTCCTG-T-TG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCAAGT------------ACA-
gi|19 : AATT---------GAATGCTATCAGCTATAAATGTGGGTGCGAATGCA-----------------------TAT-----C----ATTTCA--------AA-----A------------T------ACGATTGACTCGATGCATATCG--TACA------AA-ATATCTGCTGC-GAATAC-AAAGTGTTT-GACTTTGGATA-AT----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATCATC-GC-ACAGGTGTCGATACAACACAGAATAAGAATGTGCCC-----TAAACATAACCGCGAGACAATGGA-AG-----A----ATCCAAGCTACAATTTTT-TGCTGGATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATGAAAAAAATCAT-A------C------GGATTTATTTCATGCTTAATT-GAAACA-----T-----ACT-G-ATTTTTTT-AATTAAATAGCATAATCTAT-TTTTTTATTGA-AATG---TTCTATATA-AA-ATAGTGTCATTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GG-TTCTTT-CACATTTA-CCCCAGT------------A-A-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACAAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-CGGTCTCAt
gi|2 : aTGTAAGCGGTCATATGTAGTACCC----AACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CC----------------------TTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CATATATAC---AG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGTGATTCATT-----ACATTAATTTGTTAACAAAACTGTTACCAAGGCTAGGTGCATAACTGTTTAAGA----GCGTGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTTGT-AT-GACGCATGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGAGTTTATGCACAATTATTGTACTGGGTAAGATCAA-TAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAAGTATATA--ATTAAAAT---------ATATTTTATCAACTATGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG---AAA-ATA-------T-TATTTTTTC----ATATCA--------GG-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGATCGGATGCAAATTG--TACA------CT-ATATCTGCTGC-GAAAAA-AAGGGT-TT-GACTTTGGATG-AACATG------------T-------------T-----------AGAGTGGTTTAACGTCTGAATTTTTTGA-GAAGATATCGGTAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACTGCAAGATTATGGA-AG-----A----ATACCAGCAACATATTTT-TACTGGATTTTATGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAGTTCAT-A------T------GGATTTATTTTATTCTAAA-T-GAAACA-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTTTATATA-AA-ATACTGTCAGTTAAAATATTTTCTTCCTC-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------GCA------GGCATTGG------CA--------TG----GTACATGTGTGATCACTTTTTGT-CTGTCACAA-TAAACATCA
gi|20 : CTATGAAAGTGGGTGCAAATGCAATGG--AAAA--CA-------TGTATGTTTTC----ATATCA--------TTTTTTTA------------TTT----GCGATTGACTCGATGCATATCA--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAA--AAAGTA-TTTGACTTTGGATG-AACATGTAAGAG------T-------------T-----------A---------AATGTCAGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTATTC-----T-TATGTAACCACGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGCTACACATTTT-TACTGGATTTTATGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-C------T------GGATTTATTTAATGCTTAA-T-GAAACA-----T-----AA--G-T--TTTTT--------TAA-ATAAATGA--TTAT---------ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAAAATGTTCTTCATG-T-GG-ATTTTT-CTAATTTACCCTCAGTACATATTTCCAAACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTGCCAAGCATGTGTGATCACT
gi|21 : GTAAACG--GTCAGGTGTAAGCGGTCAGATGTA--------------------T--CACTTAGCTGTCACA---CCTTTTGGCGAACCGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGCGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTACGAAAACACATGACTTTATCCAGAACTTGC-ATT-GGTATATAG---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATG-----ACATTAAGTTGTTAGCGAAACTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTAACGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-GT-GACGCGTGAAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATAATAGATCTGGGTAAGATCAA-A
gi|22 : caatacctACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AATGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACTAGCTGCACTGTTT-TACTGGATTGTGTGGTGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------AGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAGCTTCTATTTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACCT-------ACA------GGCA-TGGTC----CA--------TGTACCAT-CATGTGTGATCACTTTTTAT-
gi|23 : tcAG-AAAGTG-TTTGACCTAGGATG-AACAAGATGTAAGAGTGGT-------------A-----------A---------AACGTTTGGATTTTCGGA-AAAGTTG-------------GAATCAGAATGTATCC-----T-TACATAACCGCAAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAGATACAAATTTT-TACTAGATTGTACGGCGT-CCGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------CGAAACTGGATTCATTTTAAACTAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-AT-TTTTT-AATTAAATAAAATAAATTAT-TTATTTATTCA-TATGCCCTTCTGTATA-AA-ATAATATCAGTTCAAATATTTTCTTCCTC-T-GC-A-TTTT-CTCATTTA-CCCCAGT------------
gi|24 : AAGATCAA-AAAGA-TAGTTGAAATTGGTCAGTTGGTTTAAA-T-TATA--ATTTAATT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGGAAATGCAAAGG--AAAA-A-A-------C-T-TTTTTTCTTGTGTATCA--------TA-----A------------T------CTGATTGACCCGATTCATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGT---T-GACACTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AATGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACAAACTACACTTTTT-TACTGGATT
gi|25 : gAGCGGTCAGCGCGGTCAGGTGTAAGCGGTCAGTTGTAGCAGCCTTATGA----T-A-T--CACTTAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGTTATTCCAATTCTATTGTATAAT-CCT-TGATCAAT-----------CTTCTGTTTTGAAAACACACCACTTTAACCAGAGCGAGA-GTA-TGTATATAC---GG---------TATAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATT-ATG-----AC--------GTTAGCGAAACTGTTATCTTGGCTGGGTACATTACTGTTTAAGC----GCGTGTATTTAGGATA
gi|26 : CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGC--CTT---GACCATT-A-T--CACTTAGTGGCCGCA---CCTTTTGGCTGGCTGTTGTTCCAATCATATTGTATAAT-CCCATGATCAATTAATGCTTCTCCTTCTGTTACAAAAACACACCACTTTACCCAGAACAAGA-GTA-TGTATAT-----GG---------TCTAATAAGCAACTAGAATAGCGAGATTTATG-----ACTTTTATTTGTTAGCAAAGCTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTAAAGC----GCGTGTCTT
gi|27 : tAAGTGGTCAGTG--GCCAGATGTAAGCCGC---AT--------------ACCCTT-A-T--CACTTAGTGG--------CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCAATCATATTTTATAATTCCCGTGATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAA-CACACCACTTAACTC----CCAGCAGTA-TGTATATAC---AG---------TTTAATAAGCAGACAGAATAGCGAGATTAATT-----TCTTGAATTT-TTAGC-AAACT
gi|28 : ATGTAGTGGCG----GACCCTT-A-T--CACTAAGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCTAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAATGCTTCTGCTTCTTTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGTGAGC-GTG-CGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCATG-----ACATTAATTTGTTAGCAAAACTGTTA
gi|29 : TAAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTCATAACAAAAGTTAT-TTATTTTTTTA-AATGAACTTCTATGTA-AA-ATAGTGTCAGTTCAGATATTTTCTTCCTG-C-AG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCAT-CATGTATGATCACTTTT
gi|3 : tacgaaacataaaacaGTAAGTGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCCTT-A-TAACCCTT----GTCACA---CCTTTTGACTGGCGGCCATTCCAATCATATTGTGTAAT-TTCGCGATCAAATAACGCTTCTGCTTTTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAGC-ATG-TGTATATAC---TG---------TCTAATAAGCAAATCGAATAGCAAGATTCATG-----ACATTAATTTGTTAGAGAAACTGTTAACTAGGCCAGGTACATGACTATTTAAGC----GCGTGTATTAACGGTAGTTTTATTAAGGTT-T-CT-GACACGTGTAGACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCGAAATGGGT-AGATCAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TAT-------AACT---------AAATTTTATCGGCTATGAAAGTGGGTGCGAATGCGATGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTC----CTATCA--------TA-----ATTTTTTTATT--T------GCGATTGACTCAATGCATATTG--TATA------CA-ATATCTGTTGC-GAAAAA-AATGTGTTT-GACTTTGGATC-AACGTGTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AACGGTATCGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGAGAGATAACGGA-AG-----A----ATACGAGCTTCACATTTT-TACTGGATTTTATAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GCATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAACG-----T-----AAT-GTT--TTTTT-AATTAAATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ACGTACTTCTGTAGA-AA-AT-------GTT---------------------G-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACTTATTTCCAAACA-ACTT-------GCAGGCATTGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|30 : GGTACATGACTGTTTAAGT----GCGTGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTT-T-ATTGTTGCATGTAAATACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTGCATGCACAATTGTAGAACTGGGTAAGAT
gi|30 : tAA-T-TGTAGAACTGGGTA---------AGATTTTATCGCCTATGAAAGCGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-CATTTTTTC----ATATCA--------Ttttatcgcctatgaaagcgggtgcgaatgcaatggaaaaacatcattttttcatatcat
gi|31 : tggtacatgactgtttaagtgcgtgtatttacagtagttttatttaggtttattgttgcatgtaaatacattggaagcaaatttcactgaggcgtgcatgcacATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTAAGCGGTCAGATGAAGCAGCC----GACCCTT-T-A--GACTAAGAGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAAATAACGCTTCTGC
gi|32 : gcccAGATTAATG-----ACTTTAATTTGTAAGCAAAGC-----------------------CTATTTAACC----GCATGTATTTACAGTAGTTTTATTTAGGTG-T-AT-GTCCCGTGTAAACACATTGGAAACAAATTTC------ACTGACATTTTTATGCACAATTA
gi|33 : ctATAAGCGGTCAGC-----CAGGTGTAAGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGATCACA---CCTTTTGGCTGGTCGCTATTCCAGTCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCc
gi|34 : gtccTTGTTTAGGTT-T-AT-TTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TTTA--A
gi|35 : cGATTTATTTTATGCTAAATT-GAAGCA-----T-----AAC-A-AT-TTTTT-AATTAAATAACAACAATTAT-TTATTGAT-----ATGTACTTCTGTATA-AA-ATACTGTCAGTTC
gi|36 : ataatgcataagaatatgaaacttT-------ACA------AGTC-TGGTA----CAATTAATTATGTACAATGCATGTGTGATCA-TTTTTGTCCTG--TCAGCTAAACATCAT
gi|38 : gtttatcacttgtctgacctcagtaaattaattaaaaaaaaGGACACA---CCTATGGGCTGGCTGCTATTCCAATCATATTGTATAAT-CCCGTGATCAATTAACGCTTCTg
gi|39 : atCCCCAGT------------ACATAATTCCAAATAACA------GGCA-TGGGA----CA--------AGTACCATGCATGTGTGATCAC
gi|4 : atataTTCTGTTACGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCAAGC-ATG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTCGTG-----ACATTAATTTGTTAGCGAAACGGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGC----GCATGTATTTACGGTAGTTTTATTTAGGTT-T-AT-GACGCGTGTAAACACATTGAAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTAATGCACAATTATCAAACTTGGTAAGATTAA-AAAGG-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATCAAATT---------ATATTTTATCGGCTATTAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------T-TCTTTTTTC----ATATCG--------CA-----A------------TTTTTTTGTGATTGACTTGATGCATATCA--TACAAGAAATCATATCTCTGCTGCTGCACAT-AAAGTG-TTTGACTTTGGATG-AA----------------TGTGTAAGAGTGGTT-----------A---------AACGTCTGAATTTTTGGA-AAAGGTATCGATAAAACACAGAATCGGAATGTGTCC-----C-AATGTAACCGCGAGATAATGGT-AG-----A----ATATGAGCTACACATTTT-TACTGAATTTTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------T------GGATTTATTTTATGCTAAA-T-GAAAC------------AAT-G-T--TTTTTGAATTAAATGATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTTCAAATATTTTCTTTCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ACAGGCATGGGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-C
gi|40 : agtctaagttgtccttgcggccatctcttataagcagtcacctgtg-TGATA----CACTA-----TGTTCAACGTATATGTGATCACTTTTTGT-CCGTCATAC-TACACATCA
gi|41 : cTAAGCGGTCAGATGTGGCCGCT----GACCATTAA-T--TACTTgg
gi|5 : cttTAAACGGTCAGCG--GCCAGGTGTA--------------GTGGTT----GACTCTT-A-G--CACTTTGCGGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCACTATTCCTATCATATTGTATAAT-CCAGCAATCAATTAACACTTCTGCTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCAGAGCGAA--GTA-CGTATATAC---GGAATATAGGGTCTTATAAGCAAATAGAATAGCGAGATTAATG-----A--------------------TGTAACCTAGGCTGGTTAAATGACGGTTTA--------------TTTACGGCAGTTATATTTAGATT-T-AA-GTCGCGTGTTAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGT--TTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATAAACAAAAA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTTAAA-T-TATA--ATTGAATT---------AAATTTTATTGTCTATGAAAGCAGGTGCAAATGCAGTGG--AAAA--TG-------T-AATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------GCGATTGACTGGATGTATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAA-G-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACATCTGAATTTTCGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCG-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AA-----A----ATACG-GCTGCACTATTT-TACTGGATTGTACGGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------A------GG--------------AAATT-GAAACA-----TACAGGAAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACGTAAATTAT-TCATTTATTTA-AAAAAACTTCTAAATA-AT-ATAGTGTCAGTTCAAGTATTTTCTTCCTGCC-CA-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------AGA------GGCA-TG----------------------------TGTGTGATCACTTTTTAT-CTGTCTCAA-TAAACATCATtgtg
gi|6 : ctgATAAGCGGTCAGCG--GCCAGGTGTA-GCGGTCAGATGTAGCGCCC----GACTCTT-A-G--CACTTAGCGGTCACA---CATTTTGGCTGGCTGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCAATCAATTAACGCTTCTACTTCTGTTATGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGA-ATA-AGTATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAAAATAGCCAGATTAATG-----AC--------------------GTTACCTAGACTGGGTACATGATTGTTTAAGC----GCGTGTATTTACAACAGTTTTATTTAGATT-T-AT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATTATCGAACTGGGTAAGATCAA-AAAGA-TAATTACAATTGGTC---TTGTTAAAA-T-TTTA--ATTGAATT---------AAATTTCATCAGCTATGAAAGCTGGTGCGAATAAAATGG--AAAA-ACG-------------TTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ACAATTGAC----------TCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTGGATG-AA----------------T-------------T-----------A---------AACGTCTGAATTTTCGAA-AAAGGTGTCGATAATACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-AACGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCA--------------------------CTGCG-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GAAACA-----T-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTATAACATAAATTAT-TTATTTATTTA-AATGAACTTCTATATATAATATAGTGTCAGTTCAAATATTTTCTTCCTG-C-GGAATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTA-------ACA------GGCA-TGGTA----TA--------TGTACCAT-CA--TGTGATCACTTTTTAT-g
gi|7 : aatgcccTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGTGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCC----GACCCTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAA---CCTTTTGGTTGGCTGCTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGTGATCAATTAATGCTATTGCTTCTGTGACGAAAACACACCACTTTACCCATAGTGAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAAAAAGAATAGCAAGATTCATGTAAACACATT
gi|7 : atacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGTGTTTATGCACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAAA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGATTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAGTGG--AAAA-ACA-------T-T-TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GTGATTGACTCGATACATATCG--TATA------CA-ATATCTGCTGC-GA-----AAAGTGTTT-GACTTTGGATG-AACG--------------T-------------TTAAGAGTGGTAA---------AAAGTCTAAATTTT-GGA-AAAGGTATCAATAAAACACAGAATCAGAATATGTCC-----T-AACGTAACCACGAGATTATGG--AT-----A----ATGCTTAATAAAAATTTCATA-TGGATT-TATTTTATGCTATT-AAATG-AAA----CAT-A-----------------------------AAATT---------------------------TTTTT-AATTAAAAAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATATTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTACCCCCATTACATATTTCGAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-ggaagcaaatttcactgaggtgtttatgcacaattatcaaactgggtaagattaaaaaaataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggatttgaaagtgggtgcgaatgcagtggaaaaacattttttttaatatcataatttatttttatttgtgattgactcgatacatatcgtatacaatatctgctgcgaaaagtgtttgactttggatgaacgtttaagagtggtaaaaagtctaaattttggaaaaggtatcaataaaacacagaatcagaatatgtcctaacgtaaccacgagattatggataatgcttaataaaaatttcatatggatttattttatgctattaaatgaaacataaaatttttttaattaaaaaatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatattgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttacccccattacatatttcgaaacaacttatgggcatggtacatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|8 : atacccgtaagtggtcagcagccaggtgtatgcggtcagatgtagtggccgacccttatcacttagcggtcaaaccttttggttggctgctatttcaaccatattgtataatcctgtgatcaattaatgctattgcttctgtgacgaaaacacaccactttacccatagtgagtgtgcatatatacggtctaataagcaaaaagaatagcaagattTAAGTGGTCAGCA--GCCAGGCGTATGCGGTCAGATGTAGTGGCT----GACCTTT-A-T--CACTTAGCGGTCAAAAAACCTTTTGGTTGGCCACTATTTCAACCATATTGTATAAT-CCTGCGATCAATTAACACTATTGCTTCTGTTACGAAAACACACCTCTTTACCCAGAGCAAGT-GTG-CATATATAC---GG---------TCTAATAAGCAATAAGAATAGCAAGATTCATGTAAACACATT
gi|8 : aatacccgCATGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGAGGCGTTTATACACAATTATCAAACTGGGTAAGATTAA-AAAGA-TAATTGCAATTGGTCAGTTTGTTTAAA-T-TATA--ATTAAATT---------AATTTTTATTGGCTTTGAAAGTGGGTGCGAATGCAATGG--AATA-AC--------T---TTTTTTA----ATATCA--------TA-----ATTTATTTTTATTT------GCGATTAACTCGATACATATCG--TACA------CA-ATATCTGCTGC-----AA-AAAGTGTTT-GACTTCGGATG-AACGTTTAAGAGTGG---T-------------T-----------A---------AAAGTGTAAATTTT--GATAAAGGTATCGATAAAACACAGAACCAAAATATGTCC-----T-GACATAACCACGAAATAATGGATAATGCTTA----ATAAAAAATACA-------TA-TGGATT-TAT--TTT-ATGCT-TAATG-AAA----CAT-A--------------AATTT-TTTT----TAA---------------------------------TT-AA----ATAATATAAATTAT-TTATTTAT-----ATGTACTTCTATATA-AA-ATACTGTCAGTT----TATTTTCTTCCTG-T-GG-ATTTTT-CTCATTTA-CCCCAGTACATATTTCAAAACA-ACTT-------ATG------GGCA-TGGTT----CA--------TGTACCATGCATGTGTGATCACTGTTTGT-ggaagcaaatttcactgaggcgtttatacacaattatcaaactgggtaagattaaaaagataattgcaattggtcagtttgtttaaattataattaaattaatttttattggctttgaaagtgggtgcgaatgcaatggaataactttttttaatatcataatttatttttatttgcgattaactcgatacatatcgtacacaatatctgctgcaaaaagtgtttgacttcggatgaacgtttaagagtggttaaaagtgtaaattttgataaaggtatcgataaaacacagaaccaaaatatgtcctgacataaccacgaaataatggataatgcttaataaaaaatacatatggatttattttatgcttaatgaaacataaattttttttaattaaataatataaattatttatttatatgtacttctatataaaatactgtcagtttattttcttcctgtggatttttctcatttaccccagtacatatttcaaaacaacttatgggcatggttcatgtaccatgcatgtgtgatcactgtttgt
gi|9 : aatacccgtaagtggtcagcagccaggcgtatgcggtcagatgtagtggctgacctttatcacttagcggtcaaaaaaccttttggttggccactatttcaaccatattgtataatcctgcgatcaattaacactattgcttctgttacgaaaacacacctctttacccagagcaagtgtgcatatatacggtctaataagcaataagaatagcaagattTAAGCGGTTAGTG--GCCAGGTGTA--------------GCGGCT----GACTCTT-A-G--CACTTAGCAGTCACA---CCTTTTGGCTGGCCGCTATTCCGATCATATTGTATAAT-CCCGCGATTAATTAACGCTTCTGTTTCTATTATGAAAACACACCACTTAACCTAGAGCGAG--GTA-AGTATAAAC---GG---------TCTAATAAGCAAATAGAATAGCAAGATTAATG-------------------------CTGTTACCTAGGCTGGGTACATGACTGTTTAAGT----GTGTGTATTTAGGGTCGTTTTATTTAGATT-TTAT-GTCGCGTGTAAACACATTGGAAGCAAATTTC------ACTGTGGTGTTTATGCACAATT--------GGGTAAGATCAA-AAAGG-TTATTATAAAAGGTC---TTGTTTAAT-T-TATA--ATTGAATTAATTTAATTAAATTTTATTGGCTATGAAAGCAGGTGTGAATGCAATGG--AAAA-ACA-------A-TATTTTTTC----ATATCA--------TA-----A------------T------ATGATTGACTCGACGCATATTG--TACA------CA-ATATCTGCTAC-GAAAAG-AAAGTG-TT-GACTTTAGATG-AA----------------T-------------TA----------A---------AACATCTGAATTTTTGGA-AAAGGTGTTGATAAAACACAGAATCAGAATGTGTCC-----T-ACTGTAACCGCGAGATAATGGA-AG-----A----ATACGAGCTGCACTGTTT-TGCTTGATTGTACAGCGT-CTGCT-AAATG-AAAAATTCAT-A------C------GG--------------AAATT-GGAACATACAGT-----AAT-G-A--TTTTT-AATTTTTTAACATAATTTTTCTCATTTA
gi|9 : cct-ATTTTT-CTCATTTACCCCCAGT------------ACA-ACTT-------ACA------GGCA-TGGTA----CA--------TGTACCATG-ATGTGTGATCACTTTTTAT-CTcccccagtacaacttacaggcatggtacatgtaccatgatgtgtgatcactttttatct
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): AGTCTAACTGTCCATGTGGCCACCTCTTATAAGTGGTCACCTCTCTTACGCGGTCAGCAGCCAGTCTATTTCACCCAAAACA