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gi|17                         : agCTATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTTA------------------CGGTGTGATTCTCATAGGAGTAT
gi|9                          :   gTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCACACCGTCCGTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTTGTTAT-G----TACATTCAGG-AA-AAAA-T-ATA--TTTgtaaa
gi|16                         :    TATAACTAGCTGATAATTGATAGTTA-CTGGGATGCCGACACTTTAAAGGTAAGGTGCACTTTGCAGCATG
gi|12                         :    TATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTT----------------TTTG--GTGTGATTCTCATAGGACTGT--GT-AAATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAGCGT---TAA-AAAATTATGTCTAGGCAA-AAAA-TACAA--TTTccttt
gi|11                         :     ATCACTAGCTGATAGGTGATGATTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTTTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCGCCATCCCTTTTGACATT---TGAAATTA--AGGTAATG-------------TACATGCAGG-AA-AAAATT-CTA--tgt
gi|14                         :     ATCACTAGCTGATAGGTGATAGTTATTTGAAATGCAG-CACTTTAAAAGTAAGGTTCGCTT-------TGATTCTCATTGGAGTGTTA---GAACAACGCATCTTTCTATTTGATAGT---TG
gi|10                         :          aAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAATGTAAGGTGCGCTTTGCAGCATGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCTCACCGTCCCTTTT-ACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTAG-TGATG----TACATGCAGG-AATAAAA-T-CTA--TTTGttg
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gi|3                          :                                                                                                                                     A--AGGTAATGTAG-TGATG----TACATGCAGG-AA-CTAA-TTCTA--TGTGTTTCCCTCTCACCACGCC-C------TTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTT---AACCATTTGCAAAACATTTAACACGAGTAAACAGGATAAATGTATTGCAATGAAGTCCTCTATTTTACAAACGCAATGAAGCAACATAATTTTAAGCTTTTAAAATTTGAAACTCGTAAATCAAGCTGTTGATATCTTTATCATTTTACCTTTGCCGTGTTGTCTTGATTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGGGATACTT--TTTGTTT--ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGATATGTATCATTG-GATTTTGAACAAGACTGTAACATACCTGACGTCACAAC---ATCTGGTGGGAAAC--TTTATGGAGAGTTGCCACTTGGACTTGGAACACGAGTTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGATTCCATACACTTTG-------------CG--AA--GCGGTCAGCGAAATATTAAAAAGTTTATAATAAATAGAATTTGTGTGTCCAATCACTGTCTCTCAGGATTGGTTTCAGTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTG-AATGAACATGTACAATTTTAACTTATATATGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCTCATGAAGGGG-TTGTG-ATTTGTGTGAAATATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACATAATTTAAAGCATTTGACATTTGAAACTCGTAATACACGCTGTTGGTATTTTGATCCCTTAACCTCTGCCGAGTTGTCTTGG-TATGCTTATTAGTATAATTTTGAAAAGATA-CTTGTTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCTTACTCCTGAGATGTACCATAAGGACTTGGAATATCACTGTTACATACCCAACGTCACGGCTCAATCTGGTGGAAAACGTT--TTGGAGGGTTACTATTTAGATTTGGAACACGATTTTATACAAGCTACAACGTAATGGTTCAATCTAAAT--AGAAACTTTGAAAAAGTTACTTCTGACAGTTGCGGTCAGCAAAATATGAAACATTTTAAAATTAATATGATTTGTGTTTCCAATCACTTTCACTCAGGATCGGTTTCATTTAGTTTAGCTGATCGTTTAATGTGAATTTAAGGTTACAAAGGgagccgtagccaaacaatgccaaacttaacataaaataaaatttactaatagtatttgttgttctgcattctccaata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 caTCACCCAGAATTGGTTTCATTTAATTTAGCTGATCGTTTCATATGCAATGAAATTGG-AAATAACATATAATATTTT-----------GAAATATTTGCCC-ATGAAGGGGATTGTACTTTAT---ATTAACTATTTTCCCCATGAAGGGGATTATG-ATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGG-----TGT--TGTTA------AGGGCTACC-CAT----TTATTGTTGACGGCAGCCCGAACTGTTGAGCCGTAGCCAAGTAATGCCAAACTT--AAATTAAGATATAATATACTAA---TATTATCTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAttattgatatgtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcCTT-TATATTAACTATT-GTCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATT--TTTTTG-CCTTAAGAAGGGGGTTATG-ATTTGTGTGAATTATTTGCCCCACGAGGAGGGGGAGGGGGGGGG-----G-T--TGTTG------AAGGCTACC-CAT----TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTCAGCCGTAGCCAAACAA---------TATAAAATAAAATATAATTAACTAA---TATTAT---CTGTTCTGCATTCTCCAATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgtgaaagatttgccccatgaaggggattatgTGTATGTGAACTTTTTGTCCCATGACGGGGATTATA---TAT---AT---TTGTTG-TGCT-TG--GGAG-CTGTATATCTGT-TGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatttgccccatgaaggggattgtgaTATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGATGTAT---GTGAAcggcagcccgacatattgagtcgaaactatgctaaacttaaaataaaatgtagttaataaaaacatcatttgttgttctgtattctccaata
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Reference ( family-3628 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACGCTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGNGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATNA--AGGTAACGTAG-TAAGAAA-TACGTGCAGG-AA-AAAA-T-CTA--TTTGTTTCCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTCTTCACTTAATTGCCACTTTTTCAACCATTTGCAAAACANTNNACACGAGTANACAGGATGAATGTATTGCANTGAAGTCCTCTGTTTTACAAACGCAATNGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTAAAACAAGCTGTTGATATCTTGATCATTTTACCTTTGCCGTGTTGTCTTGGTTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTANCAT-TGGACTTGGAANANGACTGTTACATACCCGACGTCGCGAC---ATCTGGTGGGAAAC--T--ATGGAGNGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGANTTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGATT--ANACACTTTG-------------CG--AG--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATANAATTTGTGTTTCCAATCACTGTCACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTTTAACTTATATGTGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCCCATGAAGGGGATTGTGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGANG--------GGGATTGT-----T-T--TG------T-TGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-T--TG------T-TAAGGACTGCC-CAT-------TTGTGGTTGACGGCAGCCTGAAATATTGAGCCGTAGCCAAATAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTttg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATAACTAGCTGATAATTGATAGTTA-CTGGGATGCCGACACTTTAAAGGTAAGGTGCACTTTGCAGCATG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTTA------------------CGGTGTGATTCTCATAGGAGTAT--GTAAAccttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATGCAGACACTTTAAAAGTAAAGTGCACTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATGA--AGGTATTGTAG-TAAGAAAGTACATGCAGG-AA-AAA--T-CTA--TTTGTTTTCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTCTTCACTTAATTGTCACTTTTTCAACCATTTGCAAAACAATGTACACAAGTATACAGGATGAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAATGCAATTGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAACATGTTGATATCTTGTTCATTTTACCTTTGCCGT-TTGTCTTGGTTATGTAAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTT-ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTAGCAT-TGGACTTGGAAGAGGACTGTTACATACCTGACGTCGAAAC---ATCTGGTAGGAAAC--T--ATGGAGCGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTGTAACGTTACGGCTCAATATGGTT--GAACACTTTG-------------CG--AG--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTTACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTGTAACTTATATGTGAAAAATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCCCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTCTGATTTATTTGCCCCATGATG--------GGGATTGT-----T-T--TG------T-CGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGTAGCCCGAAATATTGATCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATCATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A--AGGTAATGTAG-T--GATG-TACATGCAGG-AA-CTAA-TTCTA--TGTGTTTCCCTCTCACCACGCC-C------TTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTT---AACCATTTGCAAAACATTTAACACGAGTAAACAGGATAAATGTATTGCAATGAAGTCCTCTATTTTACAAACGCAATGAAGCAACATAATTTTAAGCTTTTAAAATTTGAAACTCGTAAATCAAGCTGTTGATATCTTTATCATTTTACCTTTGCCGTGTTGTCTTGATTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGGGATACTT-TTTGTTT--ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGATATGTATCAT-TGGATTTTGAACAAGACTGTAACATACCTGACGTCACAAC---ATCTGGTGGGAAAC--TTTATGGAGAGTTGCCACTTGGACTTGGAACACGAGTTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGATTCCATACACTTTG-------------CG--AA--GCGGTCAGCGAAATATTAAAAAGTTTATAATAAATAGAATTTGTGTGTCCAATCACTGTCTCTCAGGATTGGTTTCAGTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAATGAACATGTACAATTTTAACTTATATATGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCTCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTGTGAAATATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATATGAAATATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGTGC---T-TTATA------T-TAACTATTGCCTCATGAAGGGGTTGTGATTTGTG------TGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AACATAAAATAAAATTTACT---AATAGTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAgagccgtagccaaacaatgccaaacttaacataaaataaaatttactaatagtatttgttgttctgcattctccaata
gi|4                          : aaggtaatgtagtgatgtacatgcaggaactaattctatgtgtttccctctcaccacgcccttgttacacacttttcacttaattgccactttaaccatttgcaaaacatttaacacgagtaaacaggataaatgtattgcaatgaagtcctctattttacaaacgcaatgaagcaacataattttaagcttttaaaatttgaaactcgtaaatcaagctgttgatatctttatcattttacctttgccgtgttgtcttgattatgttaattagtataatttagaagggatactttttgtttatgaatgttgcaggtttccatactcctgatatgtatcattggattttgaacaagactgtaacatacctgacgtcacaacatctggtgggaaactttatggagagttgccacttggacttggaacacgagtttacataccctacaacgttacggctcaatatgattccatacactttgcgaagcggtcagcgaaatattaaaaagtttataataaatagaatttgtgtgtccaatcactgtctctcaggattggtttcagtcagtttagctgatcgtttcatgtgaaatgaaacttgaatgaacatgtacaattttaacttaAACATAATTTAAAGCATTTGACATTTGAAACTCGTAATACACGCTGTTGGTATTTTGATCCCTTAACCTCTGCCGAGTTGTCTTGG-TATGCTTATTAGTATAATTTTGAAAAGATACTTGTTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCTTACTCCTGAGATGTACCATAAGGACTTGGAATATCACTGTTACATACCCAACGTCACGGCTCAATCTGGTGGAAAACGTT--TTGGAGGGTTACTATTTAGATTTGGAACACGATTTTATACAAGCTACAACGTAATGGTTCAATCTAAAT--AGAAACTTTGAAAAAGTTACTTCTGACAGTTGCGGTCAGCAAAATATGAAACATTTTAAAATTAATATGATTTGTGTTTCCAATCACTTTCACTCAGGATCGGTTTCATTTAGTTTAGCTGATCGTTTAATGTGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caTCACCCAGAATTGGTTTCATTTAATTTAGCTGATCGTTTCATATGCAATGAAATTGGAAATAACATATAATATTTT-----------GAAATATTTGCCC-ATGAAGGGGATTGTACTTTAT---ATTAACTATTTTCCCCATGAAGGGGATTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGG-----TGT--TG------T-TAAGGGCTACC-CAT-------TTATTGTTGACGGCAGCCCGAACTGTTGAGCCGTAGCCAAGTAATGCCAAACTT--AAATTAAGATATAATATACT---AATATTATCTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAtttaaggttacaaaggttattgatatgtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTGTGAAAGATTTGCCCCATGAAGGGGATTATGCTTTAT---ATTAACTATTG-TCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATTTTTTTGCCTTAAGAAG--------GGGGTTATGA---T-T--TG------TGTGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTT-TATATTAACTATT-GTCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATT--TTTTTG-CCTTAAGAAGGGGGTTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCACGAGGAGGGGGAGGGGGGGGG-----G-T--TG------T-TGAAGGCTACC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTCAGCCGTAGCCAAACAATA-------T--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTAT---CTGTTCTGCATTCTCCAATAattatttgccccacgaggagggggaggggggggggttgttgaaggctacccatttgttgttgacggcagcccgaaatattcagccgtagccaaacaatataaaataaaatataattaactaatattatctgttctgcattctccaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgaaagatttgccccatgaaggggattatgTTG-CCCCATGAAGGGGATTGTGATGTATGTGAACTTTTTGTCCCATGACG--------GGGATTATATATAT-T--TGTTGTGCT-TGGGAGCTGTA-TAT----------CTGTTGACGGCAGCCCGACATATTGAGTCG-----AAACTATGCTAAACTT--AAAATAAAATGTAGTTAA-TAAAAACATCATTTGTTGTTCTGTATTCTCCAATA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatCTATCTCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTT----------------TTG--GTGTGATTCTCATAGGAGTGT--GTA-AATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAACGT---TAAAAAATTATGTCTAGGCAA-AAAA-T-ACAATTTTCTTTCCCTCCCTCCACACCATAAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCACACCGTCCGTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTTGTTATG----TACATTCAGG-AA-AAAA-T-ATA--TTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CCGTTGTGTAAATAACGGTTGAGGAGGTTGAATTATACACTGTT






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Reference ( family-3628 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACGCTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTAG-TAAGAAA-TACGTGCAGG-AA-AAAA-T-CTA--TTTGTTTCCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTTT-CAACCATTTGCAAAACAATGTACACGAGTANACAGGATAAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAACGCAATGGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAAGNTGTTGATATCTTGNTCATTTTACCTTTGCCGNGTTGTCTTGGTTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTATCATT-GGACTTGGAANAGGACTGTTACATACCCGACGTCANAAC---ATCTGGTGGGAAAC--T--ATGGAGNGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGANT--GAACACTTTG-------------CGA--G--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTCACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTTTAACTTATATGTGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCCCATGAAGGGGATTGTGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGANG--------GGGATTGT-----T-T--TG------T-TGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAATGTAAGGTGCGCTTTGCAGCATGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCTCACCGTCCCTTTT-ACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTAG-T--GATG-TACATGCAGG-AATAAAA-T-CTA--TTTGa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCACTAGCTGATAGGTGATGATTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTTTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCGCCATCCCTTTTGACATT---TGAAATTA--AGGTAATGTA------------CATGCAGG-AA-AAAATT-CTA--
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTT----------------TTG--GTGTGATTCTCATAGGACTGT--GTA-AATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAGCGT---TAAAAAATTATGTCTAGGCAA-AAAA-TACAA--TTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GT-----TGT--TG------T-TAAGGGCTACC-TAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGGTATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATAAA-----AATAATATCTGTTGTTCTTCATTCTCCAATAtgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taATCACTAGCTGATAGGTGATAGTTATTTGAAATGCAG-CACTTTAAAAGTAAGGTTCGCTT-------TGATTCTCATTGGAGTGT---TAGAACAACGCATCTTTCTATTTGATAGT---TG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-T--TG------T-TAAGGACTGCC-CAT-------TTGTGGTTGACGGCAGCCTGAAATATTGAGCCGTAGCCAAATAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTttg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATAACTAGCTGATAATTGATAGTTA-CTGGGATGCCGACACTTTAAAGGTAAGGTGCACTTTGCAGCATG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTTA------------------CGGTGTGATTCTCATAGGAGTAT--GTAAAccttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATGCAGACACTTTAAAAGTAAAGTGCACTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATGA--AGGTATTGTAG-TAAGAAAGTACATGCAGG-AA-AAA--T-CTA--TTTGTTTTCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTCTTCACTTAATTGTCACTTTTTCAACCATTTGCAAAACAATGTACACAAGTATACAGGATGAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAATGCAATTGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAACATGTTGATATCTTGTTCATTTTACCTTTGCCGT-TTGTCTTGGTTATGTAAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTT-ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTAGCATT-GGACTTGGAAGAGGACTGTTACATACCTGACGTCGAAAC---ATCTGGTAGGAAAC--T--ATGGAGCGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTGTAACGTTACGGCTCAATATGGTT--GAACACTTTG-------------CGA--G--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTTACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTGTAACTTATATGTGAAAAATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCCCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTCTGATTTATTTGCCCCATGATG--------GGGATTGT-----T-T--TG------T-CGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGTAGCCCGAAATATTGATCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATCATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A--AGGTAATGTAG-T--GATG-TACATGCAGG-AA-CTAA-TTCTA--TGTGTTTCCCTCTCACCACGCC-C------TTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTT---AACCATTTGCAAAACATTTAACACGAGTAAACAGGATAAATGTATTGCAATGAAGTCCTCTATTTTACAAACGCAATGAAGCAACATAATTTTAAGCTTTTAAAATTTGAAACTCGTAAATCAAGCTGTTGATATCTTTATCATTTTACCTTTGCCGTGTTGTCTTGATTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGGGATACTT-TTTGTTT--ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGATATGTATCATT-GGATTTTGAACAAGACTGTAACATACCTGACGTCACAAC---ATCTGGTGGGAAAC--TTTATGGAGAGTTGCCACTTGGACTTGGAACACGAGTTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGATTCCATACACTTTG-------------CGA--A--GCGGTCAGCGAAATATTAAAAAGTTTATAATAAATAGAATTTGTGTGTCCAATCACTGTCTCTCAGGATTGGTTTCAGTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAATGAACATGTACAATTTTAACTTATATATGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCTCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTGTGAAATATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATATGAAATATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGTGC---T-TTATA------T-TAACTATTGCCTCATGAAGGGGTTGTGATTTGTG------TGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AACATAAAATAAAATTTACT---AATAGTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAgagccgtagccaaacaatgccaaacttaacataaaataaaatttactaatagtatttgttgttctgcattctccaata
gi|4                          : aaggtaatgtagtgatgtacatgcaggaactaattctatgtgtttccctctcaccacgcccttgttacacacttttcacttaattgccactttaaccatttgcaaaacatttaacacgagtaaacaggataaatgtattgcaatgaagtcctctattttacaaacgcaatgaagcaacataattttaagcttttaaaatttgaaactcgtaaatcaagctgttgatatctttatcattttacctttgccgtgttgtcttgattatgttaattagtataatttagaagggatactttttgtttatgaatgttgcaggtttccatactcctgatatgtatcattggattttgaacaagactgtaacatacctgacgtcacaacatctggtgggaaactttatggagagttgccacttggacttggaacacgagtttacataccctacaacgttacggctcaatatgattccatacactttgcgaagcggtcagcgaaatattaaaaagtttataataaatagaatttgtgtgtccaatcactgtctctcaggattggtttcagtcagtttagctgatcgtttcatgtgaaatgaaacttgaatgaacatgtacaattttaacttaAACATAATTTAAAGCATTTGACATTTGAAACTCGTAATACACGCTGTTGGTATTTTGATCCCTTAACCTCTGCCGAGTTGTCTTGGT-ATGCTTATTAGTATAATTTTGAAAAGATACTTGTTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCTTACTCCTGAGATGTACCATAAGGACTTGGAATATCACTGTTACATACCCAACGTCACGGCTCAATCTGGTGGAAAACGTT--TTGGAGGGTTACTATTTAGATTTGGAACACGATTTTATACAAGCTACAACGTAATGGTTCAATCTAAAT--AGAAACTTTGAAAAAGTTACTTCTGACAGTTGCGGTCAGCAAAATATGAAACATTTTAAAATTAATATGATTTGTGTTTCCAATCACTTTCACTCAGGATCGGTTTCATTTAGTTTAGCTGATCGTTTAATGTGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caTCACCCAGAATTGGTTTCATTTAATTTAGCTGATCGTTTCATATGCAATGAAATTGGAAATAACATATAATATTTT-----------GAAATATTTGCCC-ATGAAGGGGATTGTACTTTAT---ATTAACTATTTTCCCCATGAAGGGGATTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGG-----TGT--TG------T-TAAGGGCTACC-CAT-------TTATTGTTGACGGCAGCCCGAACTGTTGAGCCGTAGCCAAGTAATGCCAAACTT--AAATTAAGATATAATATACT---AATATTATCTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAtttaaggttacaaaggttattgatatgtg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTT-TATATTAACTATT-GTCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATT--TTTTTG-CCTTAAGAAGGGGGTTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCACGAGGAGGGGGAGGGGGGGGG-----G-T--TG------T-TGAAGGCTACC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTCAGCCGTAGCCAAACAATA-------T--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTAT---CTGTTCTGCATTCTCCAATAattatttgccccacgaggagggggaggggggggggttgttgaaggctacccatttgttgttgacggcagcccgaaatattcagccgtagccaaacaatataaaataaaatataattaactaatattatctgttctgcattctccaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgaaagatttgccccatgaaggggattatgTTG-CCCCATGAAGGGGATTGTGATGTATGTGAACTTTTTGTCCCATGACG--------GGGATTATATATAT-T--TGTTGTGCT-TGGGAGCTGTA-TAT----------CTGTTGACGGCAGCCCGACATATTGAGTCG-----AAACTATGCTAAACTT--AAAATAAAATGTAGTTAA-TAAAAACATCATTTGTTGTTCTGTATTCTCCAATA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3628 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACGCTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTAG-TAAGAAA-TACGTGCAGG-AA-AAAA-T-CTA--TTTGTTTCCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTTT-CAACCATTTGCAAAACAATGTACACGAGTANACAGGATAAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAACGCAATGGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAAGNTGTTGATATCTTGNTCATTTTACCTTTGCCGNGTTGTCTTGGTTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTATCATT-GGACTTGGAANAGGACTGTTACATACCCGACGTCANAAC---ATCTGGTGGGAAAC--T--ATGGAGNGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGANT--GAACACTTTG-------------CGA--G--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTCACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTTTAACTTATATGTGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCCCATGAAGGGGATTGTGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGANG--------GGGATTGT-----T-T--TG------T-TGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCACTAGCTGATAGGTGATGATTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTTTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCGCCATCCCTTTTGACATT---TGAAATTA--AGGTAATGTA------------CATGCAGG-AA-AAAATT-CTA--
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTT----------------TTG--GTGTGATTCTCATAGGACTGT--GTA-AATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAGCGT---TAAAAAATTATGTCTAGGCAA-AAAA-TACAA--TTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GT-----TGT--TG------T-TAAGGGCTACC-TAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGGTATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATAAA-----AATAATATCTGTTGTTCTTCATTCTCCAATAtgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taATCACTAGCTGATAGGTGATAGTTATTTGAAATGCAG-CACTTTAAAAGTAAGGTTCGCTT-------TGATTCTCATTGGAGTGT---TAGAACAACGCATCTTTCTATTTGATAGT---TG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-T--TG------T-TAAGGACTGCC-CAT-------TTGTGGTTGACGGCAGCCTGAAATATTGAGCCGTAGCCAAATAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTttg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATAACTAGCTGATAATTGATAGTTA-CTGGGATGCCGACACTTTAAAGGTAAGGTGCACTTTGCAGCATG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTTA------------------CGGTGTGATTCTCATAGGAGTAT--GTAAAccttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATGCAGACACTTTAAAAGTAAAGTGCACTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATGA--AGGTATTGTAG-TAAGAAAGTACATGCAGG-AA-AAA--T-CTA--TTTGTTTTCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTCTTCACTTAATTGTCACTTTTTCAACCATTTGCAAAACAATGTACACAAGTATACAGGATGAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAATGCAATTGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAACATGTTGATATCTTGTTCATTTTACCTTTGCCGT-TTGTCTTGGTTATGTAAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTT-ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTAGCATT-GGACTTGGAAGAGGACTGTTACATACCTGACGTCGAAAC---ATCTGGTAGGAAAC--T--ATGGAGCGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTGTAACGTTACGGCTCAATATGGTT--GAACACTTTG-------------CGA--G--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTTACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTGTAACTTATATGTGAAAAATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCCCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTCTGATTTATTTGCCCCATGATG--------GGGATTGT-----T-T--TG------T-CGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGTAGCCCGAAATATTGATCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATCATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A--AGGTAATGTAG-T--GATG-TACATGCAGG-AA-CTAA-TTCTA--TGTGTTTCCCTCTCACCACGCC-C------TTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTT---AACCATTTGCAAAACATTTAACACGAGTAAACAGGATAAATGTATTGCAATGAAGTCCTCTATTTTACAAACGCAATGAAGCAACATAATTTTAAGCTTTTAAAATTTGAAACTCGTAAATCAAGCTGTTGATATCTTTATCATTTTACCTTTGCCGTGTTGTCTTGATTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGGGATACTT-TTTGTTT--ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGATATGTATCATT-GGATTTTGAACAAGACTGTAACATACCTGACGTCACAAC---ATCTGGTGGGAAAC--TTTATGGAGAGTTGCCACTTGGACTTGGAACACGAGTTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGATTCCATACACTTTG-------------CGA--A--GCGGTCAGCGAAATATTAAAAAGTTTATAATAAATAGAATTTGTGTGTCCAATCACTGTCTCTCAGGATTGGTTTCAGTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAATGAACATGTACAATTTTAACTTATATATGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTATTG-CCTCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTGTGAAATATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATATGAAATATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGTGC---T-TTATA------T-TAACTATTGCCTCATGAAGGGGTTGTGATTTGTG------TGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AACATAAAATAAAATTTACT---AATAGTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAgagccgtagccaaacaatgccaaacttaacataaaataaaatttactaatagtatttgttgttctgcattctccaata
gi|4                          : aaggtaatgtagtgatgtacatgcaggaactaattctatgtgtttccctctcaccacgcccttgttacacacttttcacttaattgccactttaaccatttgcaaaacatttaacacgagtaaacaggataaatgtattgcaatgaagtcctctattttacaaacgcaatgaagcaacataattttaagcttttaaaatttgaaactcgtaaatcaagctgttgatatctttatcattttacctttgccgtgttgtcttgattatgttaattagtataatttagaagggatactttttgtttatgaatgttgcaggtttccatactcctgatatgtatcattggattttgaacaagactgtaacatacctgacgtcacaacatctggtgggaaactttatggagagttgccacttggacttggaacacgagtttacataccctacaacgttacggctcaatatgattccatacactttgcgaagcggtcagcgaaatattaaaaagtttataataaatagaatttgtgtgtccaatcactgtctctcaggattggtttcagtcagtttagctgatcgtttcatgtgaaatgaaacttgaatgaacatgtacaattttaacttaAACATAATTTAAAGCATTTGACATTTGAAACTCGTAATACACGCTGTTGGTATTTTGATCCCTTAACCTCTGCCGAGTTGTCTTGGT-ATGCTTATTAGTATAATTTTGAAAAGATACTTGTTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCTTACTCCTGAGATGTACCATAAGGACTTGGAATATCACTGTTACATACCCAACGTCACGGCTCAATCTGGTGGAAAACGTT--TTGGAGGGTTACTATTTAGATTTGGAACACGATTTTATACAAGCTACAACGTAATGGTTCAATCTAAAT--AGAAACTTTGAAAAAGTTACTTCTGACAGTTGCGGTCAGCAAAATATGAAACATTTTAAAATTAATATGATTTGTGTTTCCAATCACTTTCACTCAGGATCGGTTTCATTTAGTTTAGCTGATCGTTTAATGTGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caTCACCCAGAATTGGTTTCATTTAATTTAGCTGATCGTTTCATATGCAATGAAATTGGAAATAACATATAATATTTT-----------GAAATATTTGCCC-ATGAAGGGGATTGTACTTTAT---ATTAACTATTTTCCCCATGAAGGGGATTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGAAG--------GGGATTGG-----TGT--TG------T-TAAGGGCTACC-CAT-------TTATTGTTGACGGCAGCCCGAACTGTTGAGCCGTAGCCAAGTAATGCCAAACTT--AAATTAAGATATAATATACT---AATATTATCTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAtttaaggttacaaaggttattgatatgtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTGTGAAAGATTTGCCCCATGAAGGGGATTATGCTTTAT---ATTAACTATTG-TCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATTTTTTTGCCTTAAGAAG--------GGGGTTATGA---T-T--TG------TGTGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTT-TATATTAACTATT-GTCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATT--TTTTTG-CCTTAAGAAGGGGGTTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCACGAGGAGGGGGAGGGGGGGGG-----G-T--TG------T-TGAAGGCTACC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTCAGCCGTAGCCAAACAATA-------T--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTAT---CTGTTCTGCATTCTCCAATAattatttgccccacgaggagggggaggggggggggttgttgaaggctacccatttgttgttgacggcagcccgaaatattcagccgtagccaaacaatataaaataaaatataattaactaatattatctgttctgcattctccaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgaaagatttgccccatgaaggggattatgTTG-CCCCATGAAGGGGATTGTGATGTATGTGAACTTTTTGTCCCATGACG--------GGGATTATATATAT-T--TGTTGTGCT-TGGGAGCTGTA-TAT----------CTGTTGACGGCAGCCCGACATATTGAGTCG-----AAACTATGCTAAACTT--AAAATAAAATGTAGTTAA-TAAAAACATCATTTGTTGTTCTGTATTCTCCAATA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatCTATCTCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTT----------------TTG--GTGTGATTCTCATAGGAGTGT--GTA-AATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAACGT---TAAAAAATTATGTCTAGGCAA-AAAA-T-ACAATTTTCTTTCCCTCCCTCCACACCATAAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCACACCGTCCGTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGTTGTTATG----TACATTCAGG-AA-AAAA-T-ATA--TTT


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Reference ( family-3628 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACGCTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGT--AGTAAT---G----TACGTGCAGG-AA-AAAA-T-CTA--TTTGTTTCCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTTT-CAACCATTTGCAAAACAATGTACACGAGTANACAGGATAAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAACGCAATGGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAAGNTGTTGATATCTTGNTCATTTTACCTTTGCCGNGTTGTCTTGGTTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTATCATT-GGACTTGGAANAGGACTGTTACATACCCGACGTCANAAC---ATCTGGTGGGAAAC--T--ATGGAGNGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGANT--GAACACTTTG-------------CGA--G--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTCACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTTTAACTTATATGTGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTA-TTGCCCCATGAAGGGGATTGTGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGANG-------GGGAT----TGTG-T-T---TG------T-TGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCACTAGCTGATAGGTGATGATTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTTTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCGCCATCCCTTTTGACATT---TGAAATTA--AG----------GTAAT---G----TACATGCAGG-AA-AAAATT-CTA--
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTT----------------TTTG--GTGTGATTCTCATAGGACTGT--GTA-AATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAGCGTTAAAAAAT--------TATGTCTAGGCAA-AAAA-TACAA--TTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -T---TG------T-TAAGGGCTACC-TAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGGTATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATAAA-----AATAATATCTGTTGTTCTTCATTCTCCAATAtgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tagttgATCACTAGCTGATAGGTGATAGTTATTTGAAATGCAG-CACTTTAAAAGTAAGGTTCGCTT-------TGATTCTCATTGGAGTGT---TAGAACAACGCATCTTTCTATTTGATAGT---TG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-T---TG------T-TAAGGACTGCC-CAT-------TTGTGGTTGACGGCAGCCTGAAATATTGAGCCGTAGCCAAATAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTATTTttg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATAACTAGCTGATAATTGATAGTTA-CTGGGATGCCGACACTTTAAAGGTAAGGTGCACTTTGCAGCATG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTATCCCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTTA------------------CGGTGTGATTCTCATAGGAGTAT--GTAAAccttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gATGCAGACACTTTAAAAGTAAAGTGCACTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCGCACCGTCCCTTTTGACATT---TGGAATGA--AGGTATTGT--AGTAAGAAAG----TACATGCAGG-AA-AAA--T-CTA--TTTGTTTTCCTCCCACCACGCC-CAAAAATTTGTTACACACTCTTCACTTAATTGTCACTTTTTCAACCATTTGCAAAACAATGTACACAAGTATACAGGATGAA-GTATTGCATTGAAATCCTCTGTTTTACAAATGCAATTGAGCAACATAATTTAAAGCTTTTGAAATTTGAAACTCGTGAAACAACATGTTGATATCTTGTTCATTTTACCTTTGCCGT-TTGTCTTGGTTATGTAAATTAGTATAATTTAGAAGAGATACTT-TTTGTTTT-ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGAGATGTAGCATT-GGACTTGGAAGAGGACTGTTACATACCTGACGTCGAAAC---ATCTGGTAGGAAAC--T--ATGGAGCGTTGCCATTTGGACTTGGAACACGAATTTACATACCCTGTAACGTTACGGCTCAATATGGTT--GAACACTTTG-------------CGA--G--GCGGTCAGCGAAATATTAAACAGTTTATAATAAATAAAATTTGTGTTTCCAATCACTGTTACCCAGGATTGGTTTCATTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAAAGAACATGTACAATTGTAACTTATATGTGAAAAATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTA-TTGCCCCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTCTGATTTATTTGCCCCATGATG-------GGGAT----TGT--T-T---TG------T-CGAGGGCTGCC-CAT-------TTGTTGTTGACGGTAGCCCGAAATATTGATCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATCATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A--AGGTAATGT--AGTGAT---G----TACATGCAGG-AA-CTAA-TTCTA--TGTGTTTCCCTCTCACCACGCC-C------TTGTTACACACTTTTCACTTAATTGCCACTTT---AACCATTTGCAAAACATTTAACACGAGTAAACAGGATAAATGTATTGCAATGAAGTCCTCTATTTTACAAACGCAATGAAGCAACATAATTTTAAGCTTTTAAAATTTGAAACTCGTAAATCAAGCTGTTGATATCTTTATCATTTTACCTTTGCCGTGTTGTCTTGATTATGTTAATTAGTATAATTTAGAAGGGATACTT-TTTGTTT--ATGAATGTTGCAGGTTTCCATACTCCTGATATGTATCATT-GGATTTTGAACAAGACTGTAACATACCTGACGTCACAAC---ATCTGGTGGGAAAC--TTTATGGAGAGTTGCCACTTGGACTTGGAACACGAGTTTACATACCCTACAACGTTACGGCTCAATATGATTCCATACACTTTG-------------CGA--A--GCGGTCAGCGAAATATTAAAAAGTTTATAATAAATAGAATTTGTGTGTCCAATCACTGTCTCTCAGGATTGGTTTCAGTCAGTTTAGCTGATCGTTTCATGTGAAATGAAACTTGAATGAACATGTACAATTTTAACTTATATATGAAATATTTGCCCCATGAAGGGGATTGTGCTTTAT---ATTAACTA-TTGCCTCATGAAGGGG-TTGTGATTTGTGTGAAATATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATATGAAATATTTGCCCCATGAAG-------GGGAT----TGTG-C-TTTATA------T-TAACTATTGCCTCATGAAGGGGTTGTGATTTGTG------TGAAATATTGAGCCGTAGCCAAACAATGCCAAACTT--AACATAAAATAAAATTTACT---AATAGTATTTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAgagccgtagccaaacaatgccaaacttaacataaaataaaatttactaatagtatttgttgttctgcattctccaata
gi|4                          : aaggtaatgtagtgatgtacatgcaggaactaattctatgtgtttccctctcaccacgcccttgttacacacttttcacttaattgccactttaaccatttgcaaaacatttaacacgagtaaacaggataaatgtattgcaatgaagtcctctattttacaaacgcaatgaagcaacataattttaagcttttaaaatttgaaactcgtaaatcaagctgttgatatctttatcattttacctttgccgtgttgtcttgattatgttaattagtataatttagaagggatactttttgtttatgaatgttgcaggtttccatactcctgatatgtatcattggattttgaacaagactgtaacatacctgacgtcacaacatctggtgggaaactttatggagagttgccacttggacttggaacacgagtttacataccctacaacgttacggctcaatatgattccatacactttgcgaagcggtcagcgaaatattaaaaagtttataataaatagaatttgtgtgtccaatcactgtctctcaggattggtttcagtcagtttagctgatcgtttcatgtgaaatgaaacttgaatgaacatgtacaattttaacttaAACATAATTTAAAGCATTTGACATTTGAAACTCGTAATACACGCTGTTGGTATTTTGATCCCTTAACCTCTGCCGAGTTGTCTTGGT-ATGCTTATTAGTATAATTTTGAAAAGATACTTGTTTGTTTTTATGAATGTTGCAGGTTTCCTTACTCCTGAGATGTACCATAAGGACTTGGAATATCACTGTTACATACCCAACGTCACGGCTCAATCTGGTGGAAAACGTT--TTGGAGGGTTACTATTTAGATTTGGAACACGATTTTATACAAGCTACAACGTAATGGTTCAATCTAAAT--AGAAACTTTGAAAAAGTTACTTCTGACAGTTGCGGTCAGCAAAATATGAAACATTTTAAAATTAATATGATTTGTGTTTCCAATCACTTTCACTCAGGATCGGTTTCATTTAGTTTAGCTGATCGTTTAATGTGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caTCACCCAGAATTGGTTTCATTTAATTTAGCTGATCGTTTCATATGCAATGAAATTGGAAATAACATATAATATTTT-----------GAAATATTTG-CCCATGAAGGGGATTGTACTTTAT---ATTAACTATTTTCCCCATGAAGGGGATTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCATGAAG-------GGGAT----TG-G-TGT---TG------T-TAAGGGCTACC-CAT-------TTATTGTTGACGGCAGCCCGAACTGTTGAGCCGTAGCCAAGTAATGCCAAACTT--AAATTAAGATATAATATACT---AATATTATCTGTTGTTCTGCATTCTCCAATAtttaaggttacaaaggttattgatatgtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTGTGAAAGATTTGCCCCATGAAGGGGATTATGCTTTAT---ATTAACTA-TTGTCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATTTTTTTGCCTTAAGAAG-------GGGGT----TATGAT-T---TG------TGTGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTT-TATATTAACTATT-GTCCCATGAAGGAGATTGTGATTTGTGTGATT--TTT-TTGCCTTAAGAAGGGGGTTATGATTTGTGTGAATTATTTGCCCCACGAGGAGGGGGAGGGGG----GGGG-G-T---TG------T-TGAAGGCTACC-CAT-------TTGTTGTTGACGGCAGCCCGAAATATTCAGCCGTAGCCAAACAATA-------T--AAAATAAAATATAATTAACT---AATATTAT---CTGTTCTGCATTCTCCAATAattatttgccccacgaggagggggaggggggggggttgttgaaggctacccatttgttgttgacggcagcccgaaatattcagccgtagccaaacaatataaaataaaatataattaactaatattatctgttctgcattctccaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgaaagatttgccccatgaaggggattatg-TTGCCCCATGAAGGGGATTGTGATGTATGTGAACTTTTTGTCCCATGACG-------GGGATTATATATA-T-T---TGTTGTGCT-TGGGAGCTGTA-TAT----------CTGTTGACGGCAGCCCGACATATTGAGTCG-----AAACTATGCTAAACTT--AAAATAAAATGTAGTTAA-TAAAAACATCATTTGTTGTTCTGTATTCTCCAATA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatCTATCTCTAGCGGATAGGTGATGGTTA-TTGGGAGGCATACGCTTT----------------TTG--GTGTGATTCTCATAGGAGTGT--GTA-AATAATGCATCACCCCTTTCGA-ATTGTCTGGAACAAAGAGGTAACGTTAAAAAAT--------TATGTCTAGGCAA-AAAA-T-ACAATTTTCTTTCCCTCCCTCCACACCATAAAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agTATCACTAGCTGATAGGTGATGGTTA-TTGGGATGCAGACACTTTAAAAGTAAGGTGCGCTTTGCAGCGTGATTCTCATGTGAGTGTTAGTAGAACAGCACACCGTCCGTTTTGACATT---TGGAATTA--AGGTAATGT--TGTTAT---G----TACATTCAGG-AA-AAAA-T-ATA--TTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CCGTTGTGTAAATAACGGTTGAGGAGGTTGAATTATACACTGTT