lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222222 1111 2222222 1111 11111 111 111 1 444444444444444444 1111 1111 1 11111 1 1111 5555555555555 1 1111 11 2222222222222222222222222222222222222222 11111111111 1 1111111111111 11 11 222222 222222222 1 000000000000000000000000000000000000000 1111 111 222222 1111111 1 222222222222222222222222222 111 111111 888888888888888888888888888888888888888888 22 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 7777777777777777777777777777 11 333333333333 1
lowQualScore : 3 44 33 1111111111 33 4444 33 2 2 7 555 66 0000000 3 3 7 55 8888 22222 2 33 2 222 2 6 2 2 77 33 2 000 5 2 333 666666 333333333333333333 7777 444 3 444 99 0000 22 55 55 4 4 2 22 6 22 55 00000 22 4444 55 4 2 55555 33 33 666 4444 2 0000000000000 33 3 1 33 2 555 5 33 0 0 8888 2 7 2 00 3333333333333333333333333333333333333333 33333333333 0 77777 33 6666 0 2 1 6 5 8 55 33 88 4 9999999999999 7 0 777 0 88888 5 88 0 3 2 3 4 2 5 4 66 00 7 111111 2 1 555555555 2 66 0 1 4 222222222222222222222222222222222222222 4 8888 444 0 0 1 3 4 4 333333 2222222 66 1 1 888 2 1 222222222222222222222222222 8 444 111111 444444444444444444444444444444444444444444 22 5 4 2 8 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 2 7 8 333 2 7777777777777777777777777777 2 1 22 2 8 555555555555 66 3333 0 0
lowQualScore : . .. .. .......... .. .... .. . . . ... .. ....... . . . .. .... ..... . .. . ... . . . . .. .. . ... . . ... ...... .................. .... ... . ... .. .... .. .. .. . . . .. . .. .. ..... .. .... .. . . ..... .. .. ... .... . ............. .. . . .. . ... . .. . . .... . . . .. ........................................ ........... . ..... .. .... . . . . . . .. .. .. . ............. . . ... . ..... . .. . . . . . . . . .. .. . ...... . . ......... . .. . . . ....................................... . .... ... . . . . . . ...... ....... .. . . ... . . ........................... . ... ...... .......................................... .. . . . . ...................................................... .. . . . ... . ............................ . . .. . . ............ .. .... . .
lowQualScore : 3 66 77 0000000000 44 1111 77 7 9 4 000 99 8888888 1 1 5 66 7777 00000 7 77 7 444 7 5 7 7 33 88 2 111 2 2 666 444444 555555555555555555 2222 111 7 111 22 8888 99 77 55 0 5 6 55 8 88 88 99999 99 5555 00 5 5 00000 11 11 111 7777 4 1111111111111 44 6 8 77 7 777 9 44 1 8 5555 7 4 4 22 3333333333333333333333333333333333333333 66666666666 6 11111 99 1111 2 9 7 8 5 3 55 77 99 0 9999999999999 2 1 888 1 99999 5 88 5 4 5 4 9 2 6 0 11 22 2 000000 6 4 111111111 9 11 7 6 0 111111111111111111111111111111111111111 4 7777 111 9 9 7 7 4 4 444444 1111111 11 9 7 888 6 6 000000000000000000000000000 3 555 666666 888888888888888888888888888888888888888888 22 0 0 1 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 0 4 6 000 0 4444444444444444444444444444 2 8 44 0 6 222222222222 44 8888 6 5
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGC--CACACGCCTTCACA----G-----GCAT--AATC---GGGCAGCTGCGCG--T-C-GTGTC---TTANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATAAGGAN-AAG---GGT-----A-A--A-A--TAGTGTAAAA-GGTGTTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATAAA--AGAAGATTAAAAACA-A--ACTCAAA------ATGC----------------TCATGGTTT-GGTG---TGCTGGA---GCTGG--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-GAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGA--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA-----CT--T--GTA---GT----A-ATC----C-T-A----GTGT--GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCA---AA-GTAATGAGGTATAGAGATGGC-GACCAAC-T----C----G-TGAACA-----ATTN----------TGTAA-----------AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCNAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TTTNTAG-C-A--TNTC-A-----GTCACACT---GGAGTAACG-GGAGTAATCATTTNATGGTCCANCGNGCCGCACGNCGTTGGACCGTTTCCAGNTTN-TCNATATTG-----GNTTTGGT--GTGNGGG-TC--A--CCATA---C-----TNG--C-----ATACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGCGCACGCTCTNAC-CTTAGG--NGNGTTTG-----CCT--TGATGTTCCTTTTCAGAAAGCCCAG---GGTNCTGTTCG-CN----TTNGCGGCTACCCTGTT--TAC--G---TGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA-GTCTACACCNAGATA-CGA------GCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGNAGCATGTAAGTAGTTG-----G-NNTGGGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTATT--ACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCNCATGTCCCGT-------AN--GANTNACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGGAGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( gi|2 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGC--CACACGCCTTCACA----T-----GCAT--AATC---AGGCAGCTGCGCG--T-C-GTATC---TTGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATAAGGAA-AAC---GGT-----A-A--A-A--TAGTGTAAAA-GGTGTTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATAAA--GGAAGATTATAAACA-A--ACTCAAA------ATTA----------------TCATGGTTT-AACG---TGCTGTA---GCTGG--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-AAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGA--G--TTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATA-----CT--T--GTA---GT----A-ATC----C-T-T----GTGT--GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCC---AA-GTAATGAGGTATGGAGATAGC-AACCAAT-T----C----T-TGAACA-----ATTA----------TGTAA-----------AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTC--TTTGTAA-C-A--CGTT-A-----GTAACACT---GGAGTGATG-GGAATAATTATT-AATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTTCAAGATTT-TCAATATTG-----GACCTGGT--GTGGGGG-TCAAAATTCATA---C-----TTT--C-----ATACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGCACACTCTCTGAT-CTTGGG--GGACTTTA-----CCT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTG-CC----TTTGCAGCAACTCTGTC--TAT--G---TGGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA------GA------GCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTG-----G-TTTGAGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACA--ACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGAC-------AA--GGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGTAAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATG
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGC--CACATGCCTTCACA----G-----ACAT--AATC---GGGCAGCTGCGCG--T-C-CTGTC---TTACATTAAAAGAGAAAA--AAA-AGT-AA-AGCATAATAAGGAA-AAAAAGGGT-----A-A--A-A--TAGTGTAAAA-GGTGTTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATAAC--AGAAGATTAAAAACA-A--ACTTAAA------ATGC----------------TCATTGTTT-AGTG---TGCTGTA---GCTGG--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC---AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGA--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA-----
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGC--CACATGCCTTCACA----G-----ACAT--AATC---GGGCAGCTGCGCG--T-C-CTGTC---TTACATTAAAAGAGAAAA--AAAT-GT-AA-AGCATAATAAGGAA-AA-----------------A-A---AGGGTAAAACAGTGTTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATAAG--AGAAGATTAAAAACG-A--ACTTAAA------ATGC----------------TCATTGTTT-AGTG---TGCTGTA---GCTGG--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC---AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAA--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA-----C
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGC--CAGACGCCCTCACAG---TCAAAGGCAT--AATC---CGGCAGCTGTGTG--T-C-ATGTC---TTAAATCAGTAGAAAA----GAAAGGA-AA-AGCACAATAAGAAA-------GG--------------------GTAAAA-GGTGTTAA---T--AGATTGGCA-ACATAAA--AACAG-TTAAAACCA-A--TCTCAAT------ATGT----------------TAACGGTTT-GGTG---TGCTGGA---GCTGG--TT----AACTGCAAGCTTGAA--TGATTT-AAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAA--G--TTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTG-----AC--T--ATA---TT----ACATG----C-T-T----ATAT--G--TC--TCTGGAAG-A---ATATTATAATAAT--AT
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGC--CACAC-TCTCCACAGTCAT-----ACATGTAATC---GGGCAGATGTGCG--T-C-GT-TC---TTAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATAAG-AC-AAC---TTT-----ACA--A-A--TAATGTTACA-GGTGTTGAA-AT--AGTTCGACA-AGATAAA--AGAAGGTTAAAAACA-T--TCTCAAAAAGAAGATTAAAAAAGCTTAAAATGCTCATGGTTT-GGTG---TGCTGGA---GCTGG--TT----AACTGCAAGTATGAG--TGATTC-GAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA--acataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|9 : aCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGC--CACACGTCTTCACA----G-----GCAT--ATTC---GGGCAGCTGCGCG--T-T-GTGTT---TTATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATAAGGAA-AAG---GAT-----A-A--A-AA-TAGTGTTAGA-GGTGTTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATAAA--AGAAGATTAAAAACA-A--ACTCAAA------ATGC----------------TCATGGTTT-AGTA---TGTTGTA---GCTGG--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-AAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGA--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA-----CT--T--GTA---GTTATCA-ACC----C-T-A----GTGT--GATTCTGTTTGAAAG-AC----AGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCA---AA-GTAATGAGGTATAAAGATGGC-GACCAAC-T----C----A-TGAACA-----ATTATGAACAATTTTGTAC-----------AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
gi|43 : cCTATCCATCG-TCAT--ATTT-GC--CACATACCTTCACA----T-----TCAT--AATC---TGGCAGCTGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGC--CACATGCCTTCACA----G-----GAAT--AATC---GGGCAACTGCGCAATTAT-GTGTC---TTATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATAAGGAA-AAG---GGT-----A-A--A-AA-TAGTGTTAAT-GGTGTTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATAAA--AGAAGATTAAAAACA-A--ACTCAAA------ATGC----------------TCATGGTTT-AGTG---TGCTGTA---GCTGA--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-AAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAG--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATA-----CT--T--GTA---GT----A-ATCAACCC-T-A----GTGT--GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCA---AA-GTAATGAGGTATAGAGATGGC-CACCAAC-T----C----A-TGAGCA-----ATTT----------TGTAA-----------AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTC--TTTTTAA-C-A--TGTT-A-----GTAGCACT---GGAGTAATG-GGAATAATCATT-CATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTTCAAGTTTG-TCAATATTG-----GACCTGTT--GTGGGGG-TCat
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGC--CACACGCTTTCACA----G-----GCAT--AATC---GGGCAGCTGCGCG--T-C-GTGTC---TTATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATAAGGAT-AAG---GGTA----A-A--A-A--TAGTGT-AAA-GGTGTTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATAAA--AGAAGATTAAAAACA-A--ACTCAAA------ATGC----------------TCATGGTTT-AGTG---TGCTGTA---GCTGG--CT----AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-AAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGA--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA-----CT--T--GTA---GT----A-ATC----
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTC-------------GGGT--AATTTT-AAGCAGTTGCGCG--C-C--TGTC---T-GTA--AGTAGAAAAAA------AGT-TATAATATAA-AAGTAGGAAT---AGTTGAAAA-G--A-A--TAG-GTGAAG-AATATTAAA-ATTGAATGTGAAGTAGGTAAA--ATCAGGTTAAAAAAACA--ATTCAA--------TGC----------------TTACGGTTT----G---TTGTGGG---GGTGGTGCA----GACTGCAACTTT---------TC-GAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-TAG--AGCA------TTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATA-----TT--T--GTA---GT----A-GTC----AGT-TACA-GTAT--GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCC--TA-TTA-CTTTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGC-TACTAGG-T----T----G-TGTATT-----ATTT----------TGTAA-----------AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-C--TTAGTAG-T-A--ATTTCA-----GTCACACT---GGAGTATCC-AGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATTCCA-ATGTGTCTACATTG-----ATTTTGGT--GTGTGTG-TCG-----CATA---CAGCG-CTT--C---------TCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGCGCATGCTCTTAC-CTTAGG--TGTGTTGG-----TCC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTG-GA----TTTGTGGCTACTCTATT--GAC--A---TGAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGATATCGA------GCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATG-TTT---TTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATT--ACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT----------TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGGAGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTaaccctagtgt
gi|1 : tTATTTATTTCTTA---ATTCTGC--TGCACACTCTC-TA----G-----G-GT--AATTTTTGAGCAGTTGTGCA--C-CTGTGTC---T---GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTAGGAAT-AAT---TGT-----A-AGGA-A--TAG-GTGAGG-AATATTAAATATGAAGT-------AGGTAAA--ATCAGGTTATTTA-A-A--AC--AAC------ATT-----------------TCAAGGCTT-A-CGGCTTGTTGTGAGGGATGGTGCC----AACACCGAGTTTAAA--CTTATC-GAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGC--A--TTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATA-----TT--T--GTA---GT----A-GTCAGTTC-C-A----GTAT--GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTG---GATGTAGTTTAGCATCGGAATGGC-TACCAGG-T----T----G-TGTATT-----ATAA----------TGTAA-----------AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATG-----GT---C-A--TTTC-A-----GTCACACT---GGA-TGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTTCCA-ATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTG-T--GTGTGGG-TC-----CCATA---CAGCGCTAG--C-----ATACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGCACTTGCTCTAAC-CTTAGG------TTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA--------TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT--GAC--A---TGAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGA------GCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTG-----GAAATGGGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACT--ACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCAT-------AT--GAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGGAGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATAgc
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGC--TACACGCTTTCACA----G-----GCAT--AATT---GAGCAGATAAGCG--G-C-GTATCTATTTGTACTc
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-C--CACATGCCTTCAGA----G-----GTAT--AATC---GGGCAGCGGTGCG--T-caa
gi|20 : TTGC--CACACGCTTTCACA----C-----GCAT--AATC---GGGCTGCTGCGCG--T-C-GTGTC---TTATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATAAGGAT-AAG---GGTA----A-A--A-A--TAGTGT-AAA-GGTGTTAAA-AC--AGTGCGACA-AAATAAAAGAGAAGATTAAAAACA-A--ACTCAAA------AT
gi|11 : TGC--CACACACCTTCACA----T-----GCAT--AATC---GGGCAGCTGCGCG--T-C-GTGTC---TTACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATAAGGAA-AAG---GGT-----A-A--A-A---AATGTAAAA-GGTGTTAAA-AC--AGTT-GA-A-AGATAAA--AGAAGATTAAAAACA-A--ACTCAAA------ATGC----------------TGATGGTTT-AGTG---TGCTGTA---GCTGG--CTTG--AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-AAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGA--G--TTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTA-----CT--T---------C----A-ACC----C-T-A----GTGT--GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCA---AA-GTAATGAGGTATAGAGATGGC-GACCAAC-T----C----A-TGAACA-----CTTT----------TGTAA-----------AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCAacatagtatgtttggagtatagccagagcgaatagttaacttattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|10 : TGC--CACACACCTTCACA----T-----GCAT--AATC---GGGCAGCTGCGTG--T-C-GTGTC---TTACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATAAGGAA-AAG---GGT-----A-A--A-A---AATGTAAAA-GGTGTTAAA-AT--AGTT-GACA-AGATAAA--AGAAGATTAAAAACA-A--ATTCAAA------ATGC----------------TGATGGTTT-AGTG---TGCTGTA---GCTGG--CTTG--AACTGCAAGCTTGAA--TGAATC-AAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGA--G--TTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA-----CT--T---------C----A-ACC----C-T-A----GTGT--GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCA---AA-GTAATGAGGTATAGAGATGGC-GACCAAC-T----C----A-TGAACA-----ATTT----------TGTAA-----------AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCC
gi|25 : CA----G-----GCAA--AATC---GGACATTTGGCCA--T-C-GTGTC---TTAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA----GAC-AAG---GGT-----A-A--A-A--TAGCATAAAA-GATGCTAAA--T--AGTTCGACA-AGATAAA--AGAAGGTTAAACACA-A--TCTCAAA------ATGC----------------CTATTGTTT-GGTG---TGCTGGA---ACTGG--CT----GACTGCAAGCTTAAA--TGATTC-GAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTG
gi|34 : ccAAGAC-AAG---GGT-----A-A--A-AAACAGCGTTAAA-GGTGTTAAA-AT--TGTTTGACA-AGATCAA--ACAAGATCA-AAACA-A--TCTCAAA------ATGC----------------TCATACTTT-GGTG---TGCTGGA---GTTGG--CT----AACGGCAAACT
gi|7 : agGT-----A-A--ATA--TAATGTAGAA-GGTGTTAAA-AT--AGTTCGACA-AGATAAA--AGAAGGTTA-------A--ACTC-----------------------------TCATAGTTT-GGTT---TGCTGGA---GCTGG--CT----ATCTGCAAGCTTGAA--------------------GGATTACAACATGTGCAGGTAACGA--G--TTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACA-----CT--T--GTA---CT----A-GTC---------------------------------A-AC--CTAG--TGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCA---AC-GTAATAACGTATAGAAATAGC-GACCATC-T----CATATT-TAATC-------TTA-------------AA-----------AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTC--TTTCTAG-C-A--TGTC-----------CA----------AATG-GGAA--ATTATT-TATGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATTCAAGTTTG-TCAATATTG-----GACTTGG---GTGAG---TCAAAAT-CGTG---T-----TGG--T-----ATACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCCAACCTCTGTAAT-CTTAGG--GGACTTTA-----CCT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGG-CC----TTGGCTGCTATCCTGTC--TAT--G---TAGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAA------GA------ga
gi|28 : ACA-CGATAAA--TAAAGATTAAAAACA-A--TCTC--A------ATTGC---------------TTATATTTTCAGTG---TGCTGGA---GATGG--CC----AACAGCAATCTGGAA--TGATTT-AAA------------------ATCCACAGGTAGCTA--G--TTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTA-----TT--T--ATA---taacgagctctctc
gi|12 : tA-AGCTATA--CGAAGGTTATAAACA-A--TCTCAAA------ATAC----------------TTATGGTTT-GGTG---TGCTGGA---GCTGG--TTGATTAACTGCAAGCTTGAA--CGATTTTAAAAC-TTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGA--G--TTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATA-----CT--T--GTA---AT----A-GGCAA--C-TGTA---GTGT--GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCA---AA-GTAATGAGGTATGGA-----C-AA------T----C----T--------------------------TATAA-----------AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAGACGATATGTAA-CTAATCGTT-ACCGTGGTAACACTAGCGGAGTaaagtcgacactgt
gi|4 : attaaattctgttgaatgaaatgaggtta-AGGTAAA--ATCGGGTTATAAACA-ACAGTTTAAA------GCT------------------TACGGTTT-GTTG---TG--GGG---GATGGTGCC----GACTACAAGTTTAAA--CTTATC-GAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTA--GA--GCATTCCACTGAAC--------A----AT----GGCCAAAGAAAGAATA-----TT--T--GTA---GT----A-ACCAGTTC-C-G----GTAT--GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGG---AT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGC-TACCAGG-T----T----G-TGAATT-----ATCG----------TGTAA-----------AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-C--TTAGTAGTC-A--TTTC-A-----GTCACACT---GAAATATCC-AGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTTCCAGTTTG-TCTATATTG-----TTTTTGGT--GTGTGGG-TC-----CCATA---CAGCGGTAG--C-----ATACTCTAGTTGA-GGACGTA-CAAGCG-TTTTGTATGCGCATGCTCTTAC-CTTAGG--AGTGTTGG-----TCC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCG-CA----TTTGTGACTACTCTGTTGACATTCA---TGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGATATCGA------GCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTG-----G----AAATGT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTT--ATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAAT-------TT--GAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTCT-----GT-CTG--TGTC-G----TTTATTGTTacacataattttgtaatg
gi|31 : agtG--CT----GACAGCAAGTTTAAACTTG--TC-AAAGTATTGCACCA--AC-ACATCTTTTAGTAGTAC--A--TTCTACTGAA-----G---A----GC--CAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTT--T--GTA---AC----A-GTC----G-G-TACAAGTAT--GAATTTGTTaggta
gi|6 : gttgtgatggtCTGCGAGTTTAAA--CTTATC-GAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTA--GAACG--TTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATA-----TT--T--GTA---GT----A-GTCAGTTC-C-A----GTAT--AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTC--TATTT---TTTT---AT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGC-TACTAGG-T----T----G-TGTATT-----ATTT----------TGTAA-----------AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-C--TTAGCGGTC-A--TTTC-A-----GTCGCACT---GGAGTATCT-AGAGTAATCATT-TAAAGACCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTTCCA-ATTTGTTTGCATTG-----TTTTTGGT--GTGCGGG-TC-----CCATACAGC-----TCTACC-----ATACACCAGCTGA-GGGCG-------------TAGAAGCGCATGCTCTTAC-CTTAGG--TGTGTTGG-----TCC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTG-CA----TTTGTGGCTACTCTGTTGACAT--GACATGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGA------GCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|27 : ttgtgggggatggtaccacGCAAACTTGAA--TG--------------CAGCAGTACAACAT------GCA--GA--G--TCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAAGAAA-GAATA-----TTAAT--GT----GT----C-AAC--------------TAT--GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCA---AA-CTA
gi|29 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaAATGCAACATCTTTTGGTA--GA--GCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATA-----TT--T--CTA---GTTGTCA-GTT----C-C-A----GTATAAAATT-TGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATA
gi|19 : cGA--G--TTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATA-----CT--T--GTAAAAGTC---A-ATT----C-T-A----GTGC--ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCA---AA-GCATTGAGGTATAGAGGTGAT-TACCACT-TATAGC----TATGAACAGTGCGATGA----------TGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCTttctattatttttttggatgta
gi|5 : AATAAT--ATA-----CA--TAAGTAA--GTC---A-ATC----C-C-A----GTGT--GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCA---AA-GTAATGAGGTATAGAGATAGG-AACCAAC-T----T----A-TAAACA-----ATCT----------TATAA-----------AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATC--TTTCTAA-C-A--TGTC-A-----GTTACAAT---GGAGTAATG-GGAACAGTCATT-TATGGTCCAGATTGTTGTA-GTTTT---AC-CTTTGTAAATAT-TCAA-------------CTGCT---TG-------------CATA---C-------T--C-----A-A-----GCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGCACGCTTTCTGAT-CTTTGA--GGCCTTTA-----CCTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTG--------------ACTGCAACCCTGTC--TAT--G---AGGGTatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|30 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattatAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCA---AA-GTAATGATGTATAGAGATAGC-GACCAAC-T----C----A-TGAACA-----ATTT----------TGTAA-----------AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTC--TTTCTAA-C-A--TG
gi|13 : TGGTAAGCGTAA---AC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAAC--ATAT----C----A-TAAATA-----CTTA----------TAAAA-----------AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCGGCTCTACT----------TCAACCAAGTT--CTTTTAG-C-A--ATCC-A-----CTAACATT---GTTGTAATG-GGAATAGTAAAT-A-----CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTTCAAGTTCG-TCAATATTG-----G--TTTATACGTAAGAA-TCAGATATGATG---C-----TAG--A-----AAACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTCACATTTTCTGAT-CCTTTG--AGAGTTTG-----CAT--TGATAT---------------CTAG---GTTACGGTTCA-GT----TTGGCTGCAATCCTGT
gi|26 : TTTCCAGTTTA-GTAATACTG-----GATTTGGT--ATGTGGGCTCCAAA--CAGG---C-----------GAAGGATACTCA-ACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGCCTCTCTAATACCTGGATTGG--TAGA-----TCT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTG-CA----GAGGAGGTTACCCTATT--TAT--G---TGATTATTCCatctgcattttgatgtgttat
gi|21 : acattttaccaGGGGG-TCAAAAATCGTA---C-----TTG--C-----ATACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGCACACTCTCTGAT-CTTGGG--TGACTTTA-----CCT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGG-CC----GTGGCTGCAACTCTGTC--TAT--G---TGGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGATAGCGA------GCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAA
gi|22 : GTCTACACCAA------GATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGAANNNNNNNNNNNN-----N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNTGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTAT
gi|44 : GTCTACACCAA------GATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGaca
gi|45 : CACCAA------GATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|36 : taATTTTGATGTGTTATATTCGATATTCTGC-------AA--GGCTTTCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG-CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATG
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TCAGTTCCAGTATAATTTTATCCAATTGTTATTGATATTCATGACAATTTATATTGAGATTCTAGTGTTTTTTTTTATATATAATCTGATATTGAAATGGTTAAAAGGCTATTTACTTAATTGAAAAATCGTTACCGGCACTTCCAACTGTATTTTGATGTTGAGTATTTTAGAAACATTGGCGTGCCATGACATTTAATGTCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTTCCACTTTACCAATGTTCTTTTTGATGTGTGGGTC
Unaligned ( gi|23 ): TATCCATCTCTTCATTTTGTTACACATCCTCACGGGTAATTTTTAGTAGGTGTGCGTCTTTGTTTGTTACTAGAGAAAGTTAAAATGTAAACGAAGGAATTGTTTAAATGAAAAGGTGAAGAATATTAAAATTGAATGTGAAGAATGTAAATACGGGTAAAAACAACATGGCAAGATTTACGGTTTGTTGTGAGGGACGGTGCTGACTGCGAATTTA
Unaligned ( gi|24 ): AGGACAGTATTTTGAGATTCCATTGTTTCTTTAGATAAAGCCTGGCAACTAGGCTTTGAACTTCAATCTTGGAAAATATATGCAAGCATGTGTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACATATTGAGCATATCATTGACACTGGAGTAGCCTGAGCAATCATGTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTTCA
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|37 ): AGCAGAGAAAGAGTACTCAACTAGCGCCTTGTATGCAGCCTCTGTAATAGCTGGGTTGGTAGACCAGAGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTTTATGTGACTGTTCCAAC
Unaligned ( gi|38 ): GTGAATGATGGTGCCAACAGCTTATTTAAACTTATTAATGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAAAAGAGCCAAAGGAAAAT
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA
Unaligned ( gi|40 ): ATCTATCTCTTCTTTCTGCTGCACACCATCACGGGTAATTTTGAGCAGTTCCGCCCCTTTGTTTGTAAGTAAAGAAA
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111111111111 22222222222222222222222 1111111111111111111 11111111111111 1 44444444444444444444 11111 1 111111 11 22 2 1 1 44444444444444 1 2222 1 1 222222222222
lowQualScore : 2 33 666666 2 666666 22 666 22 33 2 2 2 2 5 777 2 2 33 1 888 33 4 2 55 2 000 8 7777777 2 99 33 9999999999 2 11111111111111 2 22 333 2 666 44 4444 2 333 0 333 3 77 9999 0 5 2 0 4444 22 4444 44 0 33 66666666666666666666666 33 2 1 11 2 444 5 33 0 0 1 2 0 5 333 2222222222222222222 99999999999999 1 33 0 66666 33 5555 0 1 0 1 0 2 1 5 44 7 3 1 4 555 3 5 1 44 1 2 3 1 0 5 55 1 1 1 44 8888 2 77777777777777777777 1 00000 4 4 4 1 77 2 4 4 555 1 4 0 1 1 3 4 55 0 4 2 1 666 1 1 444 2 2 00 0 000000 8888 22 55 1 4 8 4 7 2 1 1 55555555555555 0 1111 2 0 1 66 22 1 22 0 5 1 1 0 888888888888 666666
lowQualScore : . .. ...... . ...... .. ... .. .. . . . . . ... . . .. . ... .. . . .. . ... . ....... . .. .. .......... . .............. . .. ... . ... .. .... . ... . ... . .. .... . . . . .... .. .... .. . .. ....................... .. . . .. . ... . .. . . . . . . ... ................... .............. . .. . ..... .. .... . . . . . . . . .. . . . . ... . . . .. . . . . . . .. . . . .. .... . .................... . ..... . . . . .. . . . ... . . . . . . . .. . . . . ... . . ... . . .. . ...... .... .. .. . . . . . . . . .............. . .... . . . .. .. . .. . . . . . ............ ......
lowQualScore : 7 77 111111 7 111111 99 666 99 22 4 5 5 5 5 888 7 7 44 0 888 44 7 4 66 4 888 9 6666666 4 77 55 2222222222 0 88888888888888 0 88 555 0 111 88 2222 0 333 3 333 8 99 3333 4 9 1 7 7777 88 2222 88 5 22 33333333333333333333333 22 4 0 33 5 111 2 22 1 4 8 5 4 5 333 9999999999999999999 11111111111111 0 44 8 22222 44 3333 5 9 8 0 6 0 0 7 88 3 6 0 1 000 9 7 6 66 0 4 0 0 5 5 00 0 0 0 00 5555 3 55555555555555555555 0 00000 0 1 0 0 33 0 0 0 444 0 0 7 0 0 0 0 55 7 1 5 8 444 0 9 666 3 3 99 5 777777 5555 77 66 0 0 0 0 8 2 0 0 88888888888888 0 2222 5 2 0 00 44 0 00 0 4 0 4 8 000000000000 222222
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTCTTTNTAG-CA-TNTCAGTNACACTGGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCANCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGNTTTG----GTGTGNGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACTCTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTNCTGTTCGCATTNGCGGCTACCCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGAT-AGC-GAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTG-----G-NN-TGGGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATATGAGTNACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( family-3480 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGANAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTNTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCNAAGGTTCTCCAACCNAGTCTTTNTAG-CA-TNTCAGTCACACTGGAGTAACGGGAGTAATCATTTNATGGTCCANCGNGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGNTTNTCNATATTGGNTTTG----GTGTGNGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACGCTCTNAC-CTTAGGNGNGTTTGC-CT--TGATGTTCCTTTTCAGAAAGCCCAG---GGTNCTGTTCGCNTTNGCGGCTACCCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA-GTCTACACCNAGAT-A-C-GAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGNAGCATGTAAGTAGTTG-----G-NN-TGGGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCNCATGTCCCGTANGANTNACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
gi|1 : TATTTATTTCTTA---ATTCTGCTGCACACTCTC-TAG------G-GTA------A--TTTTTG--AGCAGTTGTGCA--C-CTGT-GTCT----GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTA--GGAATAA---T--TGT-A-AGGA-A--TAG-GTGAGGAATA-------TTAAATATGAAGT-----------------AGGT--------------A-AA--ATCAGGTTATTTAAAACA-AC-ATTT-CAAG--GCTTACG----GCTT-GTTGT---GAGGGA-----TG-GTGCC----AACACCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTGGATGTAGTTTAGCATCGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATAATGTAA--AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATGGT------CA-TTTCAGTCACACTGGATGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTGTGTGTGGGTC---------CCATACAGCGCTAGC-----A-TACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGC-ACTTGCTCTAAC-CTTAGGTTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA---TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT----G-A----CATGAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGAT-A-CCGAGCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTG-----G-AAATGGGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCATATGAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATA
gi|10 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGTG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTT-GAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ATT--CAAAATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCc
gi|11 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTT-GA-----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------ACTTTTGTAA--AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCA
gi|12 : ----------A-AGCT--------------A-TA--CGAAGGTTA---TAAACA-A--TCT--CAAAATACTTATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TTGATTAACTGCAAGCTTGAACGATTTTAAAACTTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGAGTTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATACT--TGTAATAGGC----A-AC----T----GTA--GTGT-GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCAAA-GTAATGAGGTA---------------------------T----------GGAC--------------AATCTTATAA--AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAG
gi|13 : attaaattctgttgaatgaaatgaggttaTGGTAAGCGTAAAC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAACAT-AT------CAT----------AAAT--------------ACTTATAAAA--AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCG-----GCTCTA-----CTTCAACCAAGTTCTTTTAG-CA-ATCCACTAACATTGTTGTAATGGGAATAGTAA----ATA--CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTT--CAAGTTCGTCAATATTGGTTTAT----ACGTAAGAATCAGATA----TGATGC-----TAGA-----A-AACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTC-ACATTTTCTGAT-CCTTTGAGAGTTTGC-AT--TGATAT---------------CTAG---GTTACGGTTCAGTTTGGCTGCAATCCTGTacgatatgtaactaatcgttaccgtggtaacactagcggagtacacataattttgtaatg
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-ATCAACC----CTA--GTGT-atctgcattttgatgtgttat
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCAAC----------A-AGAT--------------A-AC--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--TAAAATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAATGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--CAGTGT----------------TAAA-AC--AGTTCAAC----------A-AGAT--------------A-AG--AGAAGATTA---AAAACG-A--ACT--TAAAATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATAC
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGCCACAC-TCTCCACAG------TCATACATGTAA--TC---G--GGCAGATGTGCG--T-C-GT--TCT-TAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATA--AG-ACAA---C--TTT-ACA--A-A--TAATGTTACAGGTG-------TTGAA-AT--AGTTCGACAAGATAAAAGA-AGGTTAAAAACATTCTCAA-AA--AGAAGATTA---AAAA---A--GCT--TAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGTATGAGTGATTCGAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA
gi|19 : aGAGTTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATACT--TGTAAAA-GTC---A-AT----T----CTA--GTGC-ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCAAA-GCATTGAGGTATAGAGGTGATTACC-A-CTTATAGCTAT----------GAACAGTGCGATGATGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCT
gi|2 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAT------GCATA------A--TC---A--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-ATCT-TGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATA--AGGAAAA---C--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--GGAAGATTA---TAAACA-A--ACT--CAAAATTATCATG----GTTT-AACGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTT--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCCAA-GTAATGAGGTATGGAGATAGCAACCAA-TT------CTT----------GAAC--------------AATTATGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTCTTTGTAA-CA-CGTTAGTAACACTGGAGTGATGGGAATAATTA-TTAATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTT--CAAGATTTTCAATATTGGACCTG----GTGTGGGGGTC----AAAATTCATAC-----TTTC-----A-TACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACTCTCTGAT-CTTGGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTGCCTTTGCAGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA--------GAGCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTG-----G-TT-TGAGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACAACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGACAAGGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGT-AAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATGatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|20 : TTGCCACACGCTTTCACAC------GCATA------A--TC---G--GGCTGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGAC----------A-AAAT--------------A-AAAGAGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATA--CATAGTATGTTT-GGAGTATAGCCAGAGCGAATA-G--TT----AACT
gi|21 : GGGGGTC----AAAAATCGTAC-----TTGC-----A-TACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACTCTCTGAT-CTTGGGTGACTTTAC-CT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGGCCGTGGCTGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGAT-AGC-GAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAAtattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|22 : -GTCTACACCAAGAT-AGC-GAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|22 : TGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtcttttcatccttgatcgtaaggtataca
gi|23 : gtctacaccaagatagcgagcattctcagttgtctttagaacctgtccatgaagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATCCATCT-CTTC--ATTTTGTTACACATCCTCACGG------G--TA------A--TT---TTTAGTAGGTGTGCG--T-C-TTTGTTT----GTTACTAGAGAAAGTTAAAATGT-AA-A-CG----A--AGGAATT---G--TTT-A-A--A-------TG-AAAAGGTGAAGAATATTAAA-ATTGAATGTGA-----------A-GAAT--------------GTAA--ATACGGGTA---AAAACA-A--CATGGCAAGAT--TTACG----GTTT-GTTGT---GAGGGA-C---GGTG--CT----GACTGCGAATTTaca
gi|24 : TGGCAACTAGGCT------T-T----------GAACTTC-----------AATCTTGGAA--AATATATGCA-----AGCATG--T----GTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACATATTGAG-CA-TATCATTGACACTGGAGTAGCCTGAGCAATCAT------GTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTT--Ca
gi|25 : aggacagtattttgagattccattgtttctttagataaagccCAG------GCAAA------A--TC---G--GACATTTGGCCA--T-C-GT-GTCT-TAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA------GACAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGCATAAAAGATG-------CTAAA--T--AGTTCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGGTTA---AACACA-A--TCT--CAAAATGCCTATT----GTTT-GGTGT---GCTGGAAC---TG-G--CT----GACTGCAAGCTTAAATGATTCGAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTGa
gi|26 : ccACCATTT--CCAGTTTAGTAATACTGGATTTG----GTATGTGGG-C----T----CCAAAC-----AGGCGAAGGA-TACTC-AACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGC-CTCTCTAATACCTGGATTGGTAGAT-CT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTGCAGAGGAGGTTACCCTATT----T-A----TGTGATTATTCC
gi|27 : acattttTGCAGCAATACAACATGCACAGGTAGCAA
gi|27 : cttaaaGCAAACTTGAATG-------------CAGCAGTACAACAT--GCAG------AGTCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAA-GAAAGAATATTAATGTG----TC----A-A----------CTA-----T-GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCAAA-CTAacttgaatgcagcagtacaacatgcagagtcccactgcactacagtaaagagaagaaagaatattaatgtgtcaactatggttctgtttgaaagacaggagtggcaattaagcttgaaatcctgtggttagcctcaaacta
gi|28 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaAC----------A-CGAT--------------A-AA--TAAAGATTA---AAAACA-A--TCT--C-AATTGCTTATA----TTTTCAGTGT---GCTGGAGA---TG-G--CC----AACAGCAATCTGGAATGATTTAAA------------------ATCCACAGGTAGCTAGTTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTATT--TATA----
gi|29 : tCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATATT--TCTA----GTTGTCA-GT----T----CCA--GTATAAAATTTGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATATTCTATaaagtcgacactgt
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTCGG------G--TA------A--TTTT-A--AGCAGTTGCGCG--C-C--T-GTCTGTA----AGTAGAAAAA------AAGT-TATAATATAAAAGTAGGAATA---GTTGAA-A-AG-A-A--TAG-GTGAAGAATA-------TTAAA-ATTGAATGTGAA----------GTAGGT--------------A-AA--ATCAGGTTA---AAAAAACA--ATT--CAA--TGCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGT---GGTG--CA----GACTGCAACTTT-------TCGAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-----TAGAGCATTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAG--TTACAGTAT-GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCCTATTACT-TTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-CTTAGTAG-TAATTTCAGTCACACTGGAGTATCCAGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATT--CCAATGTGTCTACATTGATTTTG----GTGTGTGTGTC----G----C-ATAC------AGC-----GCTTCTCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGC-GCATGCTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTGGATTTGTGGCTACTCTATT----G-A----CATGAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGAT-ATC-GAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATG-TT-T---TTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT-TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGG-AGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTtatttttttggatgta
gi|30 : tAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGATGTATAGAGATAGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTCTTTCTAA-CA-Tgc
gi|34 : --AAGACAA---G--GGT-A-A--A-AAACAGCGTTAAAGGTG-------TTAAA-AT--TGTTTGAC----------A-AGAT--------------C-AA--ACAAGATCA---AAA-CA-A--TCT--CAAAATGCTCATA----CTTT-GGTGT---GCTGGAGT---TG-G--CT----AACGGCAAACTg
gi|36 : agATATTCTGCAAGGCTTTCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG--CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATGga
gi|37 : attttgatgtgttatattcgAGACCAG---AGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTT----T-A----TGTGACTGTTCCAcagc
gi|38 : agcagagaaagagtactcaactagcgccttgtatgcagcctctgtaatagctgggttggtGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAA---AAG--A----GC--CAAAGGAAAac
gi|4 : gtgaatgatggtgccaacagcttatttaaacttattaat-AGGT--------------A-AA--ATCGGGTTA---TAAACA-ACAGTT--TAAA--GCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGA---TG-GTGCC----GACTACAAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT-------------GGCCAAAGAAAGAATATT--TGTA----GT----A-AC----CAGTTCCG--GTAT-GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGGAT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GAAT--------------TATCGTGTAA--AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-CTTAGTAGTCA-TTTCAGTCACACTGAAATATCCAGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAGTTTGTCTATATTGTTTTTG----GTGTGTGGGTC---------CCATACAGCGGTAGC-----A-TACTCTAGTTGA-GGACGTA-CAAGCG-TTTTGTATGC-GCATGCTCTTAC-CTTAGGAGTGTTGGT-CC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCGCATTTGTGACTACTCTGTT----G-ACATTCATGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGAT-ATC-GAGCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTG-----GAAA-TG----T-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAATTTGAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTC---------------TGTCTGT------GTCGTTTATTGTTAGGTAat
gi|40 : agtATCTATCT-CTTC--TTTCTGCTGCACACCATCACGG------G--TA------ATTTT---G--AGCAGTTCCGC
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGCTACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TT---G--AGCAGATAAGCG--G-C-GT-ATCT-ccctttgtttgtaagtaaagaaa
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-CCACATGCCTTCAGAG------GTATA------A--TC---G--GGCAGCGGTGCG--T-atttgtactcaa
gi|43 : CTATCCATCG-TCAT--ATTT-GCCACATACCTTCACAT------TCATA------A--TC---T--GGCAGCTGC
gi|44 : -GTCTACACCAAGAT-AGC-GAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGat
gi|45 : TACACCAAGAT-AGC-GAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGCCAGACGCCCTCACAGTCAAAGGCATA------A--TC---C--GGCAGCTGTGTG--T-C-AT-GTCT-TAAATCAGTAGAAAAG----AAAGGA-AA-AGCACAATA--AG--AAA---G--GGT-A-A--A-A------------GGTG-------TTAA---T--AGATTGGC----------A-ACAT--------------A-AA--AACAG-TTA---AAACCA-A--TCT--CAATATGTTAACG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGCTTGAATGATTTAAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAAGTTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTGAC--TATA----TT----ACAT----G----CTT--ATAT-GTCTCTG---GAAGA-AT--ATT--ATAATAAT--A
gi|5 : A----GTC---A-AT----C----CCA--GTGT-GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATAGGAACCAA-CT------TAT----------AAAC--------------AATCTTATAA--AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATCTTTCTAA-CA-TGTCAGTTACAATGGAGTAATGGGAACAGTCATTT-ATGGTCCAG----------ATTGTTGTA--GTTTTACC--TTTGTAAATAT---------------------TC----A----AC-TGC-----TTGC-----A-TACTCAAGCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGC-ACGCTTTCTGAT-CTTTGAGGCCTTTAC-CTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTG---------ACTGCAACCCTGTC----T-A----TGAGGGTtacataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|6 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattataataatatacataagtaTGT---G--GGGGA---TG-GTACC----ACCTGCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTAGAACGTTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTCTAT--TT---TTTTAT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-CTTAGCGGTCA-TTTCAGTCGCACTGGAGTATCTAGAGTAATCATTTAAAGA-CCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTTTGCATTGTTTTTG----GTGTGCGGGTC---------CCATACAGCTCTACC-----A-TACACCAGCTGA-GGGCGTA------------G-AAGC-GCATGCTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTGCATTTGTGGCTACTCTGTTGACATGA----CATGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGAT-ACC-GAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|7 : tGT-A-A--ATA--TAATGTAGAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTTCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGGTTA---AA---------CT--C-------TCATA----GTTT-GGTTT---GCTGGAGC---TG-G--CT----ATCTGCAAGCTTGAA-GGAT----------------TACAACATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACACT--TGTA----CT----A-GT----C---------------AACCT------------------AGTGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCAAC-GTAATAACGTATAGAAATAGCGACCAT-CT------CAT----------ATTT--------------AATCTTA-AA--AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTCTTTCTAG-CA-TGTC-----CA-------AATGGGA--AATTATTT-ATGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATT--CAAGTTTGTCAATATTGGACTTG----G---GTGAGTC----AAAA-TCGTGT-----TGGT-----A-TACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCC-AACCTCTGTAAT-CTTAGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGGCCTTGGCTGCTATCCTGTC----T-A----TGTAGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAAGATAA-C-GAGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGCCACATGCCTTCACAG------GAATA------A--TC---G--GGCAACTGCGCAATTAT-GT-GTCT-TATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-AA-TAGTGTTAATGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-A--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAGGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----CAACCCTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCCACCAA-CT------CAT----------GAGC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTCTTTTTAA-CA-TGTTAGTAGCACTGGAGTAATGGGAATAATCA-TTCATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTT--CAAGTTTGTCAATATTGGACCTG----TTGTGGGGGTC----tctctc
gi|9 : CTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGTCTTCACAG------GCATA------T--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-T-GT-GTTT-TATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATA--AGGAAAA---G--GAT-A-A--A-AA-TAGTGTTAGAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGAC----------A-AGAT--------------A-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAAAATGCTCATG----GTTT-AGTAT---GTTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GTTATCA-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--A--GAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCAAA-GTAATGAGGTATAAAGATGGCGACCAA-CT------CATGAACAATTATGAAC--------------AATTTTGTAC--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TCAGTTCCAGTATAATTTTATCCAATTGTTATTGATATTCATGACAATTTATATTGAGATTCTAGTGTTTTTTTTTATATATAATCTGATATTGAAATGGTTAAAAGGCTATTTACTTAATTGAAAAATCGTTACCGGCACTTCCAACTGTATTTTGATGTTGAGTATTTTAGAAACATTGGCGTGCCATGACATTTAATGTCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTTCCACTTTACCAATGTTCTTTTTGATGTGTGGGTC
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGATGGTGCTGACAGCAAGTTTAAACTTGTCAAAGTATTGCACCAACACATCTTTTAGTAGTACATTCTACTGAAGAGCCAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTTTGTAACAGTCGGTACAAGTATGAATTTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111 22222222222222222222222 1111111111111111111 11111111111111 4444444444444444444444444 11111 1 111 111111 11 22 1 1 4444444444444 1 2222 1 1 222222222222
lowQualScore : 2 33 666666 2 666666 22 666 22 33 2 2 2 2 5 777 2 2 33 0 888 33 4 2 55 2 000 8 7777777 2 99 33 2 2 22 333 2 666 44 7777777777777777777777 4444 2 333 0 333 3 77 9999 0 5 2 0 4444 22 4444 44 0 33 66666666666666666666666 33 2 1 11 2 444 5 33 0 0 1 2 0 1 333 2222222222222222222 99999999999999 33 0 66666 33 5555 0 1 0 1 0 2 1 6666 7777777 6 44 3 44 88888 2 555 1 33 7 2 1 1 3 1 5 44 0 55 7777 2 6666666666666666666666666 1 00000 4 4 4 11 0 444 77 55 2 4 0 1 1 1 4 55 0 0 2 2 1 666 1 1 3 2 2 33 0 000000 8888 1 22 55 1 4 7 2 1 0 5555555555555 0 1111 2 0 1 1 4 1 0 5 1 1 0 666666666666 666666
lowQualScore : . .. ...... . ...... .. ... .. .. . . . . . ... . . .. . ... .. . . .. . ... . ....... . .. .. . . .. ... . ... .. ...................... .... . ... . ... . .. .... . . . . .... .. .... .. . .. ....................... .. . . .. . ... . .. . . . . . . ... ................... .............. .. . ..... .. .... . . . . . . . .... ....... . .. . .. ..... . ... . .. . . . . . . . .. . .. .... . ......................... . ..... . . . .. . ... .. .. . . . . . . . .. . . . . . ... . . . . . .. . ...... .... . .. .. . . . . . . ............. . .... . . . . . . . . . . . ............ ......
lowQualScore : 7 77 111111 7 111111 99 666 99 22 4 5 5 5 5 888 7 7 44 4 888 44 7 4 66 4 888 9 6666666 4 77 55 0 0 88 555 0 777 88 8888888888888888888888 2222 0 333 3 333 8 99 3333 4 9 1 7 7777 88 2222 88 5 22 33333333333333333333333 22 4 0 33 5 111 2 22 1 4 8 5 4 9 333 9999999999999999999 11111111111111 44 8 22222 44 3333 5 9 8 4 6 0 0 0000 2222222 2 22 1 11 33333 2 888 0 22 2 1 0 4 3 0 6 66 5 11 7777 2 9999999999999999999999999 0 00000 0 1 0 88 7 222 00 55 3 0 7 0 0 0 0 55 7 5 4 5 8 444 0 9 3 0 3 22 3 777777 5555 4 77 66 4 1 8 2 0 8 8888888888888 0 2222 5 2 2 0 0 0 0 4 0 4 8 888888888888 222222
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATA-----C-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTNCTGTCCGCATTNGCGGCTACCCTGTT----T-ACGT----GAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTG-----GNNATGGGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( family-3480 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCANCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGNTTTG----GTGTGNGGGTC----A----CCATA-----C-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTNCTGTTCGCATTNGCGGCTACCCTGTT----T-ACGT----GAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATAGCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTG-----GNN-TGGGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATATGAGTNACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
gi|1 : TATTTATTTCTTA---ATTCTGCTGCACACTCTC-TAG------G-GTA------A--TTTTTG--AGCAGTTGTGCA--C-CTGT-GTCT----GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTA--GGAATAA---T--TGT-A-AGGA-A--TAG-GTGAGGAATA-------TTAAATATGAAGT-------AGGTA-AA--ATCAGGTTATTTAAAACA-AC-ATTT-CAA----------------------G--GCTTACG----GCTT-GTTGT---GAGGGA-----TG-GTGCC----AACACCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTGGATGTAGTTTAGCATCGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATAATGTAA--AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATG--GT----------C--A-T-TTCA-----GTCACACT---GGATGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTGTGTGTGGGTC---------CCATA-----CAGCGCTAGC-----A-TACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGC---ACTTGCTCTAAC-CTTAGGTTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA---TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT----G-ACAT----GAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTG-----GAAATGGGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCATATGAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATA
gi|10 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGTG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTT-GACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ATT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCc
gi|11 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTT-GA-A-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------ACTTTTGTAA--AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCA
gi|12 : A-AGCTA-TA--CGAAGGTTA---TAAACA-A--TCT--CAA----------------------AATACTTATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TTGATTAACTGCAAGCTTGAACGATTTTAAAACTTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGAGTTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATACT--TGTAATAGGC----A-AC----T----GTA--GTGT-GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCAAA-GTAATGAGGTA---------------------------T----------GGAC--------------AATCTTATAA--AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAGACGATA--TGT--AA-CTAA-TCGTTACCGTGGTAACACTAGCGGAGTA
gi|13 : attaaattctgttgaatgaaatgaggttaTGGTAAGCGTAAAC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAACAT-AT------CAT----------AAAT--------------ACTTATAAAA--AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCG-----GCTCTA-----CTTCAACCAAGTT--CT--TTT--AG-C--A-A-TCCA-----CTAACATT---GTTGTAATGGGAATAGT-A---AATA--CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTT--CAAGTTCGTCAATATTGGTTTAT----ACGTAAGAATCAGATA----TGATG-----C-----TAGA-----A-AACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTC-ACATT--TTCTGAT-CCTTTGAGAGTTTGC-AT--TGATAT---------------CTAG---GTTACGGTTCAGTTTGGCTGCAATCCTGTcacataattttgtaatg
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-ATCAACC----CTA--GTGT-atctgcattttgatgtgttat
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AC--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAATGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--CAGTGT----------------TAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AG--AGAAGATTA---AAAACG-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATAC
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGCCACAC-TCTCCACAG------TCATACATGTAA--TC---G--GGCAGATGTGCG--T-C-GT--TCT-TAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATA--AG-ACAA---C--TTT-ACA--A-A--TAATGTTACAGGTG-------TTGAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-T--TCT--CAAAAAGAAGATTAAAAAAGCTTAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGTATGAGTGATTCGAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA
gi|18 : aTCCAACTGTATT--TTGATGTTGAG-T--A-T-TTTA-----GAAACATT---GGCGTGCCATGA-----CATTTAAT-GTCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTT--CCACTTTACCAATGTTCTTTTTG----ATGTGTGGGTC----
gi|19 : tcagttccagtataattttatccaattgttattgatattcatgacaatttatattgagattctagtgtttttttttatatataatctgatattgaaatggttaaaaggctatttacttaattgaaaaatcgttaccggcactGAGTTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATACT--TGTAAAA-GTC---A-AT----T----CTA--GTGC-ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCAAA-GCATTGAGGTATAGAGGTGATTACC-A-CTTATAGCTAT----------GAACAGTGCGATGATGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCT
gi|2 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAT------GCATA------A--TC---A--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-ATCT-TGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATA--AGGAAAA---C--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--GGAAGATTA---TAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATTATCATG----GTTT-AACGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTT--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCCAA-GTAATGAGGTATGGAGATAGCAACCAA-TT------CTT----------GAAC--------------AATTATGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTC--TT--TGT--AA-C--A-C-GTTA-----GTAACACT---GGAGTGATGGGAATAATTA-TTAATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTT--CAAGATTTTCAATATTGGACCTG----GTGTGGGGGTC----AAAATTCATA-----C-----TTTC-----A-TACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTGCCTTTGCAGCAACTCTGTC----T-ATGT----GGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA------GAGCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTG-----GTT-TGAGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACAACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGACAAGGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGT-AAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATGatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|20 : TTGCCACACGCTTTCACAC------GCATA------A--TC---G--GGCTGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AAATA-AAAGAGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATA--CATAGTATGTTT-GGAGTATAGCCAGAGCGAATA-G--TT----AACT
gi|21 : GGGGGTC----AAAAATCGTA-----C-----TTGC-----A-TACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGTGACTTTAC-CT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGGCCGTGGCTGCAACTCTGTC----T-ATGT----GGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAAtattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|22 : -GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|22 : TGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtcttttcatccttgatcgtaaggtataca
gi|23 : gtctacaccaagatagcgagcattctcagttgtctttagaacctgtccatgaagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATCCATCT-CTTC--ATTTTGTTACACATCCTCACGG------G--TA------A--TT---TTTAGTAGGTGTGCG--T-C-TTTGTTT----GTTACTAGAGAAAGTTAAAATGT-AA-A-CG----A--AGGAATT---G--TTT-A-A--A-------TG-AAAAGGTGAAGAATATTAAA-ATTGAATGTGA-A-GAATGTAA--ATACGGGTA---AAAACA-A--CATGGCAA----------------------GAT--TTACG----GTTT-GTTGT---GAGGGA-C---GGTG--CT----GACTGCGAATTTaca
gi|24 : TGGCAACTAGGCT------T-T----------GAACTTC-----------AATCTTGGAA--AATATATGCA-----AGCATG--T----GTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACA--TA--TTG--AG-C--A-T-ATCA-----TTGACACT---GGAGTAGCCTGAGCAATCAT------GTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTT--Ca
gi|25 : aggacagtattttgagattccattgtttctttagataaagccCAG------GCAAA------A--TC---G--GACATTTGGCCA--T-C-GT-GTCT-TAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA------GACAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGCATAAAAGATG-------CTAAA--T--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AACACA-A--TCT--CAA----------------------AATGCCTATT----GTTT-GGTGT---GCTGGAAC---TG-G--CT----GACTGCAAGCTTAAATGATTCGAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTGa
gi|26 : ccACCATTT--CCAGTTTAGTAATACTGGATTTG----GTATGTGGG-C----T----CCAAA-----C-----AGGCGAAGGA-TACTC-AACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGC-CT--CTCTAATACCTGGATTGGTAGAT-CT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTGCAGAGGAGGTTACCCTATT----T-ATGT----GATTATTCC
gi|27 : acattttTGCAGCAATACAACATGCACAGGTAGCAA
gi|27 : cttaaaGCAAACTTGAATG-------------CAGCAGTACAACAT--GCAG------AGTCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAA-GAAAGAATATTAATGTG----TC----A-A----------CTA-----T-GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCAAA-CTAacttgaatgcagcagtacaacatgcagagtcccactgcactacagtaaagagaagaaagaatattaatgtgtcaactatggttctgtttgaaagacaggagtggcaattaagcttgaaatcctgtggttagcctcaaacta
gi|28 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaACA-CGATA-AA--TAAAGATTA---AAAACA-A--TCT--C-A----------------------ATTGCTTATA----TTTTCAGTGT---GCTGGAGA---TG-G--CC----AACAGCAATCTGGAATGATTTAAA------------------ATCCACAGGTAGCTAGTTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTATT--TATA----
gi|29 : tCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATATT--TCTA----GTTGTCA-GT----T----CCA--GTATAAAATTTGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATATTCTATaaagtcgacactgt
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTCGG------G--TA------A--TTTT-A--AGCAGTTGCGCG--C-C--T-GTCTGTA----AGTAGAAAAA------AAGT-TATAATATAAAAGTAGGAATA---GTTGAA-A-AG-A-A--TAG-GTGAAGAATA-------TTAAA-ATTGAATGTGAAGTAGGTA-AA--ATCAGGTTA---AAAAAACA--ATT--CAA------------------------TGCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGT---GGTG--CA----GACTGCAACTTT-------TCGAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-----TAGAGCATTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAG--TTACAGTAT-GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCCTATTACT-TTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AG-T--AAT-TTCA-----GTCACACT---GGAGTATCCAGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATT--CCAATGTGTCTACATTGATTTTG----GTGTGTGTGTC----G----C-ATA-----C------AGC-----GCTTCTCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTGGATTTGTGGCTACTCTATT----G-ACAT----GAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGATATCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATGTT-T---TTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT-TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGG-AGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTtatttttttggatgta
gi|30 : tAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGATGTATAGAGATAGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTC--TT--TCT--AA-C--A-T-gc
gi|34 : --AAGACAA---G--GGT-A-A--A-AAACAGCGTTAAAGGTG-------TTAAA-AT--TGTTTGACA-AGATC-AA--ACAAGATCA---AAA-CA-A--TCT--CAA----------------------AATGCTCATA----CTTT-GGTGT---GCTGGAGT---TG-G--CT----AACGGCAAACTg
gi|36 : agCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG--CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATGga
gi|37 : attttgatgtgttatattcgatattctgcaaggctttAGACCAG---AGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTT----T-ATGT----GACTGTTCCAcagc
gi|38 : agcagagaaagagtactcaactagcgccttgtatgcagcctctgtaatagctgggttggtGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAA---AAG--A----GC--CAAAGGAAAac
gi|4 : gtgaatgatggtgccaacagcttatttaaacttattaat-AGGTA-AA--ATCGGGTTA---TAAACA-ACAGTT--TAA----------------------A--GCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGA---TG-GTGCC----GACTACAAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT-------------GGCCAAAGAAAGAATATT--TGTA----GT----A-AC----CAGTTCCG--GTAT-GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGGAT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GAAT--------------TATCGTGTAA--AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AGTC--A-T-TTCA-----GTCACACT---GAAATATCCAGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAGTTTGTCTATATTGTTTTTG----GTGTGTGGGTC---------CCATA-----CAGCGGTAGC-----A-TACTCTAGTTGA-GGACGTAC-AAGCG-TTTTGTATGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGAGTGTTGGT-CC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCGCATTTGTGACTACTCTGTT----G-ACATTCATGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGATATCGAGCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTG-----GAAATG----T-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAATTTGAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTC---------------TGTCTGT------GTCGTTTATTGTTAGGTAat
gi|40 : agtATCTATCT-CTTC--TTTCTGCTGCACACCATCACGG------G--TA------ATTTT---G--AGCAGTTCCGC
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGCTACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TT---G--AGCAGATAAGCG--G-C-GT-ATCT-ccctttgtttgtaagtaaagaaa
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-CCACATGCCTTCAGAG------GTATA------A--TC---G--GGCAGCGGTGCG--T-atttgtactcaa
gi|43 : CTATCCATCG-TCAT--ATTT-GCCACATACCTTCACAT------TCATA------A--TC---T--GGCAGCTGC
gi|44 : -GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGat
gi|45 : TACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGCCAGACGCCCTCACAGTCAAAGGCATA------A--TC---C--GGCAGCTGTGTG--T-C-AT-GTCT-TAAATCAGTAGAAAAG----AAAGGA-AA-AGCACAATA--AG--AAA---G--GGT-A-A--A-A------------GGTG-------TTAA---T--AGATTGGCA-ACATA-AA--AACAG-TTA---AAACCA-A--TCT--CAA----------------------TATGTTAACG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGCTTGAATGATTTAAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAAGTTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTGAC--TATA----TT----ACAT----G----CTT--ATAT-GTCTCTG---GAAGA-AT--ATT--ATAATAAT--A
gi|5 : A----GTC---A-AT----C----CCA--GTGT-GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATAGGAACCAA-CT------TAT----------AAAC--------------AATCTTATAA--AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATC--TT--TCT--AA-C--A-T-GTCA-----GTTACAAT---GGAGTAATGGGAACAGTCATTT-ATGGTCCAG----------ATTGTTGTA--GTTTTACC--TTTGTAAATAT---------------------TC----A----AC-TG-----C-----TTGC-----A-TACTCAAGCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGC-ACGCT--TTCTGAT-CTTTGAGGCCTTTAC-CTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTGACTGCA---------ACCCTGTC----T-ATGA----GGGTtacataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|6 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattataataatatacataagtaTGT---G--GGGGA---TG-GTACC----ACCTGCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTAGAACGTTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTCTAT--TT---TTTTAT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-C--TT--AGC--GGTC--A-T-TTCA-----GTCGCACT---GGAGTATCTAGAGTAATCATTTAA-AGACCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTTTGCATTGTTTTTG----GTGTGCGGGTC---------CCATACAGCTC-----TACC-----A-TACACCAGCTGA-GGGCGT----AG---------AAGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTGCATTTGTGGCTACTCTGTTGACATGACAT----GAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|7 : tGT-A-A--ATA--TAATGTAGAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AA---------CT--C-----------------------------TCATA----GTTT-GGTTT---GCTGGAGC---TG-G--CT----ATCTGCAAGCTTGAA-GGAT----------------TACAACATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACACT--TGTA----CT----A-GT----C---------------AACCT------------------AGTGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCAAC-GTAATAACGTATAGAAATAGCGACCAT-CT------CAT----------ATTT--------------AATCTTA-AA--AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTC--TT--TCT--AG-C--A-T-GTC----------CA----------AATGGGA--AATTATTTA-TGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATT--CAAGTTTGTCAATATTGGACTTG----G---GTGAGTC----AAAA-TCGTG-----T-----TGGT-----A-TACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCC-AACCT--CTGTAAT-CTTAGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGGCCTTGGCTGCTATCCTGTC----T-ATGT----AGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAAGATAACGAGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGCCACATGCCTTCACAG------GAATA------A--TC---G--GGCAACTGCGCAATTAT-GT-GTCT-TATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-AA-TAGTGTTAATGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-A--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAGGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----CAACCCTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCCACCAA-CT------CAT----------GAGC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTC--TT--TTT--AA-C--A-T-GTTA-----GTAGCACT---GGAGTAATGGGAATAATCATTC-ATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTT--CAAGTTTGTCAATATTGGACCTG----TTGTGGGGGTC----tctctc
gi|9 : CTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGTCTTCACAG------GCATA------T--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-T-GT-GTTT-TATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATA--AGGAAAA---G--GAT-A-A--A-AA-TAGTGTTAGAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTAT---GTTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GTTATCA-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--A--GAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCAAA-GTAATGAGGTATAAAGATGGCGACCAA-CT------CATGAACAATTATGAAC--------------AATTTTGTAC--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGATGGTGCTGACAGCAAGTTTAAACTTGTCAAAGTATTGCACCAACACATCTTTTAGTAGTACATTCTACTGAAGAGCCAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTTTGTAACAGTCGGTACAAGTATGAATTTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111 22222222222222222222222 1111111111111111111 11111111111111 4444444444444444444444444 11111 111 111111 11 22 1 1 222 1 2222 1 1 222222222222
lowQualScore : 2 33 666666 2 666666 22 666 22 33 2 2 2 2 5 777 2 2 33 0 888 33 4 2 55 2 000 8 7777777 2 99 33 2 2 22 1 333 2 666 44 7777777777777777777777 0 4444 2 333 0 333 3 77 9999 0 5 2 0 4444 22 4444 44 0 33 66666666666666666666666 33 2 1 11 2 444 5 33 0 0 1 2 0 1 333 2222222222222222222 99999999999999 33 0 66666 33 5555 0 1 0 1 0 2 1 6666 7777777 6 44 3 44 88888 2 555 1 33 7 2 77 2 1 3 1 5 44 0 55 7777 1 6666666666666666666666666 1 00000 4 4 4 6666 444 77 55 2 4 0 1 1 1 4 55 1 1 1 777 1 0 0 4 444 3 000000 8888 1 22 55 1 2 7 2 1 0 555 555 0 1111 2 0 1 1 1 0 0 5 1 1 0 666666666666 666666
lowQualScore : . .. ...... . ...... .. ... .. .. . . . . . ... . . .. . ... .. . . .. . ... . ....... . .. .. . . .. . ... . ... .. ...................... . .... . ... . ... . .. .... . . . . .... .. .... .. . .. ....................... .. . . .. . ... . .. . . . . . . ... ................... .............. .. . ..... .. .... . . . . . . . .... ....... . .. . .. ..... . ... . .. . . .. . . . . . .. . .. .... . ......................... . ..... . . . .... ... .. .. . . . . . . . .. . . . ... . . . . ... . ...... .... . .. .. . . . . . . ... ... . .... . . . . . . . . . . . ............ ......
lowQualScore : 7 77 111111 7 111111 99 666 99 22 4 5 5 5 5 888 7 7 44 4 888 44 7 4 66 4 888 9 6666666 4 77 55 0 0 88 3 555 0 777 88 8888888888888888888888 8 2222 0 333 3 333 8 99 3333 4 9 1 7 7777 88 2222 88 5 22 33333333333333333333333 22 4 0 33 5 111 2 22 1 4 8 5 4 9 333 9999999999999999999 11111111111111 44 8 22222 44 3333 5 9 8 4 6 0 0 0000 2222222 2 22 1 11 33333 2 888 0 22 2 1 00 0 4 3 0 6 66 5 55 7777 3 9999999999999999999999999 0 00000 0 1 0 6666 222 00 55 3 0 7 0 0 0 0 55 0 1 4 000 0 6 7 6 111 9 777777 5555 4 77 66 4 4 8 2 0 8 222 222 0 2222 5 2 2 0 0 2 0 4 0 4 8 888888888888 222222
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATA-----C-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( family-3480 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATA-----C-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTNCTGTCCGCATTNGCGGCTACCCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNNATG-GGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
gi|1 : TATTTATTTCTTA---ATTCTGCTGCACACTCTC-TAG------G-GTA------A--TTTTTG--AGCAGTTGTGCA--C-CTGT-GTCT----GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTA--GGAATAA---T--TGT-A-AGGA-A--TAG-GTGAGGAATA-------TTAAATATGAAGT-------AGGTA-AA--ATCAGGTTATTTAAAACA-AC-ATTT-CAA----------------------G--GCTTACG----GCTT-GTTGT---GAGGGA-----TG-GTGCC----AACACCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTGGATGTAGTTTAGCATCGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATAATGTAA--AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATG--GT----------C--A-T-TTCA-----GTCACACT---GGATGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTGTGTGTGGGTC---------CCATA-----CAGCGCTAGC-----A-TACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGC---ACTTGCTCTAAC-CTTAGGTTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA---TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT----G-A----CATGAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-GGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCATATGAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATA
gi|10 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGTG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTT-GACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ATT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCc
gi|11 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTT-GA-A-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------ACTTTTGTAA--AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCA
gi|12 : A-AGCTA-TA--CGAAGGTTA---TAAACA-A--TCT--CAA----------------------AATACTTATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TTGATTAACTGCAAGCTTGAACGATTTTAAAACTTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGAGTTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATACT--TGTAATAGGC----A-AC----T----GTA--GTGT-GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCAAA-GTAATGAGGTA---------------------------T----------GGAC--------------AATCTTATAA--AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAGACGATA--TGT--AA-CTAA-TCGTTACCGTGGTAACACTAGCGGAGTA
gi|13 : attaaattctgttgaatgaaatgaggttaTGGTAAGCGTAAAC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAACAT-AT------CAT----------AAAT--------------ACTTATAAAA--AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCG-----GCTCTA-----CTTCAACCAAGTT--CT--TTT--AG-C--A-A-TCCA-----CTAACATT---GTTGTAATGGGAATAGT-A---AATA--CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTT--CAAGTTCGTCAATATTGGTTTAT----ACGTAAGAATCAGATA----TGATG-----C-----TAGA-----A-AACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTC-ACATT--TTCTGAT-CCTTTGAGAGTTTGC-AT--TGATATcacataattttgtaatg
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-ATCAACC----CTA--GTGT-ctaggttacggttcagtttggctgcaatcctgtatctgcattttgatgtgttat
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AC--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAATGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--CAGTGT----------------TAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AG--AGAAGATTA---AAAACG-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATAC
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGCCACAC-TCTCCACAG------TCATACATGTAA--TC---G--GGCAGATGTGCG--T-C-GT--TCT-TAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATA--AG-ACAA---C--TTT-ACA--A-A--TAATGTTACAGGTG-------TTGAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-T--TCT--CAAAAAGAAGATTAAAAAAGCTTAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGTATGAGTGATTCGAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA
gi|18 : aTCCAACTGTATT--TTGATGTTGAG-T--A-T-TTTA-----GAAACATT---GGCGTGCCATGA-----CATTTAATG-TCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTT--CCACTTTACCAATGTTCTTTTTG----ATGTGTGGGTC----
gi|19 : tcagttccagtataattttatccaattgttattgatattcatgacaatttatattgagattctagtgtttttttttatatataatctgatattgaaatggttaaaaggctatttacttaattgaaaaatcgttaccggcactGAGTTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATACT--TGTAAAA-GTC---A-AT----T----CTA--GTGC-ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCAAA-GCATTGAGGTATAGAGGTGATTACC-A-CTTATAGCTAT----------GAACAGTGCGATGATGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCT
gi|2 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAT------GCATA------A--TC---A--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-ATCT-TGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATA--AGGAAAA---C--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--GGAAGATTA---TAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATTATCATG----GTTT-AACGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTT--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCCAA-GTAATGAGGTATGGAGATAGCAACCAA-TT------CTT----------GAAC--------------AATTATGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTC--TT--TGT--AA-C--A-C-GTTA-----GTAACACT---GGAGTGATGGGAATAATTA-TTAATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTT--CAAGATTTTCAATATTGGACCTG----GTGTGGGGGTC----AAAATTCATA-----C-----TTTC-----A-TACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTGCCTTTGCAGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA------GAGCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTGGTT-TG-AGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACAACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGACAAGGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGT-AAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATGatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|20 : TTGCCACACGCTTTCACAC------GCATA------A--TC---G--GGCTGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AAATA-AAAGAGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATA--CATAGTATGTTT-GGAGTATAGCCAGAGCGAATA-G--TT----AACT
gi|21 : GGGTC----AAAAATCGTA-----C-----TTGC-----A-TACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGTGACTTTAC-CT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGGCCGTGGCTGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAAtattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|22 : gg-GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|22 : TGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtcttttcatccttgatcgtaaggtataca
gi|23 : gtctacaccaagatagcgagcattctcagttgtctttagaacctgtccatgaagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATCCATCT-CTTC--ATTTTGTTACACATCCTCACGG------G--TA------A--TT---TTTAGTAGGTGTGCG--T-C-TTTGTTT----GTTACTAGAGAAAGTTAAAATGT-AA-A-CG----A--AGGAATT---G--TTT-A-A--A-------TG-AAAAGGTGAAGAATATTAAA-ATTGAATGTGA-A-GAATGTAA--ATACGGGTA---AAAACA-A--CATGGCAA----------------------GAT--TTACG----GTTT-GTTGT---GAGGGA-C---GGTG--CT----GACTGCGAATTTaca
gi|24 : TGGCAACTAGGCT------T-T----------GAACTTC-----------AATCTTGGAA--AATATATGCA-----AGCATG--T----GTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACA--TA--TTG--AG-C--A-T-ATCA-----TTGACACT---GGAGTAGCCTGAGCAATCAT------GTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTT--Ca
gi|25 : aggacagtattttgagattccattgtttctttagataaagccCAG------GCAAA------A--TC---G--GACATTTGGCCA--T-C-GT-GTCT-TAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA------GACAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGCATAAAAGATG-------CTAAA--T--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AACACA-A--TCT--CAA----------------------AATGCCTATT----GTTT-GGTGT---GCTGGAAC---TG-G--CT----GACTGCAAGCTTAAATGATTCGAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTGa
gi|26 : ccACCATTT--CCAGTTTAGTAATACTGGATTTG----GTATGTGGG-C----T----CCAAA-----C-----AGGCGAAGGA-TACTC-AACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGC-CT--CTCTAATACCTGGATTGGTAGAT-CT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTGCAGAGGAGGTTACCCTATT----T-A----TGTGATTATTCC
gi|27 : acattttTGCAGCAATACAACATGCACAGGTAGCAA
gi|27 : cttaaaGCAAACTTGAATG-------------CAGCAGTACAACAT--GCAG------AGTCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAA-GAAAGAATATTAATGTG----TC----A-A----------CTA-----T-GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCAAA-CTAacttgaatgcagcagtacaacatgcagagtcccactgcactacagtaaagagaagaaagaatattaatgtgtcaactatggttctgtttgaaagacaggagtggcaattaagcttgaaatcctgtggttagcctcaaacta
gi|28 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaACA-CGATA-AA--TAAAGATTA---AAAACA-A--TCT--CAA----------------------T-TGCTTATA----TTTTCAGTGT---GCTGGAGA---TG-G--CC----AACAGCAATCTGGAATGATTTAAA------------------ATCCACAGGTAGCTAGTTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTATT--TATA----
gi|29 : tCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATATT--TCTA----GTTGTCA-GT----T----CCA--GTATAAAATTTGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATATTCTATaaagtcgacactgt
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTCGG------G--TA------A--TTTT-A--AGCAGTTGCGCG--C-C--T-GTCTGTA----AGTAGAAAAA------AAGT-TATAATATAAAAGTAGGAATA---GTTGAA-A-AG-A-A--TAG-GTGAAGAATA-------TTAAA-ATTGAATGTGAAGTAGGTA-AA--ATCAGGTTA---AAAAAACA--ATT--CAA------------------------TGCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGT---GGTG--CA----GACTGCAACTTT-------TCGAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-----TAGAGCATTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAG--TTACAGTAT-GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCCTATTACT-TTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AG-T--AAT-TTCA-----GTCACACT---GGAGTATCCAGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATT--CCAATGTGTCTACATTGATTTTG----GTGTGTGTGTC----G----C-ATA-----C------AGC-----GCTTCTCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTGGATTTGTGGCTACTCTATT----G-A----CATGAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGATATCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATGTTTTTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT-TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGG-AGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTtatttttttggatgta
gi|30 : tAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGATGTATAGAGATAGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTC--TT--TCT--AA-C--A-T-gc
gi|34 : --AAGACAA---G--GGT-A-A--A-AAACAGCGTTAAAGGTG-------TTAAA-AT--TGTTTGACA-AGATC-AA--ACAAGATCA---AAA-CA-A--TCT--CAA----------------------AATGCTCATA----CTTT-GGTGT---GCTGGAGT---TG-G--CT----AACGGCAAACTg
gi|36 : agCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG--CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATGga
gi|37 : attttgatgtgttatattcgatattctgcaaggctttAGACCAG---AGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTT----T-A----TGTGACTGTTCCAcagc
gi|38 : agcagagaaagagtactcaactagcgccttgtatgcagcctctgtaatagctgggttggtGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAA---AAG--A----GC--CAAAGGAAAac
gi|4 : gtgaatgatggtgccaacagcttatttaaacttattaat-AGGTA-AA--ATCGGGTTA---TAAACA-ACAGTT--TAA----------------------A--GCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGA---TG-GTGCC----GACTACAAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT-------------GGCCAAAGAAAGAATATT--TGTA----GT----A-AC----CAGTTCCG--GTAT-GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGGAT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GAAT--------------TATCGTGTAA--AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AGTC--A-T-TTCA-----GTCACACT---GAAATATCCAGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAGTTTGTCTATATTGTTTTTG----GTGTGTGGGTC---------CCATA-----CAGCGGTAGC-----A-TACTCTAGTTGA-GGACGTA-CAAGCG-TTTTGTATGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGAGTGTTGGT-CC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCGCATTTGTGACTACTCTGTT----G-ACATTCATGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGATATCGAGCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-----T-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAATTTGAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTC---------------TGTCTGT------GTCGTTTATTGTTAGGTAat
gi|40 : agtATCTATCT-CTTC--TTTCTGCTGCACACCATCACGG------G--TA------ATTTT---G--AGCAGTTCCGC
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGCTACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TT---G--AGCAGATAAGCG--G-C-GT-ATCT-ccctttgtttgtaagtaaagaaa
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-CCACATGCCTTCAGAG------GTATA------A--TC---G--GGCAGCGGTGCG--T-atttgtactcaa
gi|43 : CTATCCATCG-TCAT--ATTT-GCCACATACCTTCACAT------TCATA------A--TC---T--GGCAGCTGC
gi|44 : -GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGat
gi|45 : TACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGCCAGACGCCCTCACAGTCAAAGGCATA------A--TC---C--GGCAGCTGTGTG--T-C-AT-GTCT-TAAATCAGTAGAAAAG----AAAGGA-AA-AGCACAATA--AG--AAA---G--GGT-A-A--A-A------------GGTG-------TTAA---T--AGATTGGCA-ACATA-AA--AACAG-TTA---AAACCA-A--TCT--CAA----------------------TATGTTAACG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGCTTGAATGATTTAAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAAGTTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTGAC--TATA----TT----ACAT----G----CTT--ATAT-GTCTCTG---GAAGA-AT--ATT--ATAATAAT--A
gi|5 : A----GTC---A-AT----C----CCA--GTGT-GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATAGGAACCAA-CT------TAT----------AAAC--------------AATCTTATAA--AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATC--TT--TCT--AA-C--A-T-GTCA-----GTTACAAT---GGAGTAATGGGAACAGTCATTT-ATGGTCCAG----------ATTGTTGTA--GTTTTACC--TTTGTAAATAT---------------------TC----A----AC-TG-----C-----TTGC-----A-TACTCAAGCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGC-ACGCT--TTCTGAT-CTTTGAGGCCTTTAC-CTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTGACTGCA---------ACCCTGTC----T-A----TGAGGGTtacataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|6 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattataataatatacataagtaTGT---G--GGGGA---TG-GTACC----ACCTGCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTAGAACGTTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTCTAT--TT---TTTTAT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-C--TT--AGC--GGTC--A-T-TTCA-----GTCGCACT---GGAGTATCTAGAGTAATCATTTAAAGA-CCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTTTGCATTGTTTTTG----GTGTGCGGGTC---------CCATACAGCTC-----TACC-----A-TACACCAGCTGA-GGGCGT----AG---------AAGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTGCATTTGTGGCTACTCTGTTGACATGA----CATGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|7 : tGT-A-A--ATA--TAATGTAGAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AA---------CT--C-----------------------------TCATA----GTTT-GGTTT---GCTGGAGC---TG-G--CT----ATCTGCAAGCTTGAA-GGAT----------------TACAACATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACACT--TGTA----CT----A-GT----C---------------AACCT------------------AGTGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCAAC-GTAATAACGTATAGAAATAGCGACCAT-CT------CAT----------ATTT--------------AATCTTA-AA--AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTC--TT--TCT--AG-C--A-T-GTC----------CA----------AATGGGA--AATTATTTA-TGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATT--CAAGTTTGTCAATATTGGACTTG----G---GTGAGTC----AAAA-TCGTG-----T-----TGGT-----A-TACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCC-AACCT--CTGTAAT-CTTAGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGGCCTTGGCTGCTATCCTGTC----T-A----TGTAGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAAGATAACGAGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGCCACATGCCTTCACAG------GAATA------A--TC---G--GGCAACTGCGCAATTAT-GT-GTCT-TATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-AA-TAGTGTTAATGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-A--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAGGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----CAACCCTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCCACCAA-CT------CAT----------GAGC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTC--TT--TTT--AA-C--A-T-GTTA-----GTAGCACT---GGAGTAATGGGAATAATCATTC-ATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTT--CAAGTTTGTCAATATTGGACCTG----TTGTGGGGGTC----tctctc
gi|9 : CTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGTCTTCACAG------GCATA------T--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-T-GT-GTTT-TATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATA--AGGAAAA---G--GAT-A-A--A-AA-TAGTGTTAGAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTAT---GTTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GTTATCA-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--A--GAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCAAA-GTAATGAGGTATAAAGATGGCGACCAA-CT------CATGAACAATTATGAAC--------------AATTTTGTAC--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGATGGTGCTGACAGCAAGTTTAAACTTGTCAAAGTATTGCACCAACACATCTTTTAGTAGTACATTCTACTGAAGAGCCAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTTTGTAACAGTCGGTACAAGTATGAATTTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111 22222222222222222222222 1111111111111111111 11111111111111 44444444444444444444 11111 1 111111 11 22 1 1 222 1 2222 1 1 222222222222
lowQualScore : 2 33 666666 2 666666 22 666 22 33 2 2 2 2 5 777 2 2 33 0 888 33 4 2 55 2 000 8 7777777 2 99 33 2 2 22 1 333 2 666 44 7777777777777777777777 0 4444 2 333 0 333 3 77 9999 0 5 2 0 4444 22 4444 44 0 33 66666666666666666666666 33 2 1 11 2 444 5 33 0 0 1 2 0 1 333 2222222222222222222 99999999999999 33 0 66666 33 5555 0 1 0 1 0 2 1 6666 7777777 6 44 3 44 88888 2 555 1 33 7 2 77 2 1 3 1 5 44 0 55 7777 1 66666666666666666666 1 00000 4 4 4 1 77 2 4 77 55 2 4 0 1 1 1 4 55 1 1 1 777 0 0 0 444 3 000000 8888 1 22 55 1 2 7 2 1 0 44 333 0 1111 2 0 1 1 1 0 0 5 1 1 0 666666666666 666666
lowQualScore : . .. ...... . ...... .. ... .. .. . . . . . ... . . .. . ... .. . . .. . ... . ....... . .. .. . . .. . ... . ... .. ...................... . .... . ... . ... . .. .... . . . . .... .. .... .. . .. ....................... .. . . .. . ... . .. . . . . . . ... ................... .............. .. . ..... .. .... . . . . . . . .... ....... . .. . .. ..... . ... . .. . . .. . . . . . .. . .. .... . .................... . ..... . . . . .. . . .. .. . . . . . . . .. . . . ... . . . ... . ...... .... . .. .. . . . . . . .. ... . .... . . . . . . . . . . . ............ ......
lowQualScore : 7 77 111111 7 111111 99 666 99 22 4 5 5 5 5 888 7 7 44 4 888 44 7 4 66 4 888 9 6666666 4 77 55 0 0 88 3 555 0 777 88 8888888888888888888888 8 2222 0 333 3 333 8 99 3333 4 9 1 7 7777 88 2222 88 5 22 33333333333333333333333 22 4 0 33 5 111 2 22 1 4 8 5 4 9 333 9999999999999999999 11111111111111 44 8 22222 44 3333 5 9 8 4 6 0 0 0000 2222222 2 22 1 11 33333 2 888 0 22 2 1 00 0 4 3 0 6 66 5 55 7777 3 99999999999999999999 0 00000 0 1 0 0 33 0 0 00 55 3 0 7 0 0 0 0 55 0 1 4 000 8 6 7 777 9 777777 5555 4 77 66 4 4 8 2 0 8 22 222 0 2222 5 2 2 0 0 2 0 4 0 4 8 888888888888 222222
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( family-3480 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
gi|1 : TATTTATTTCTTA---ATTCTGCTGCACACTCTC-TAG------G-GTA------A--TTTTTG--AGCAGTTGTGCA--C-CTGT-GTCT----GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTA--GGAATAA---T--TGT-A-AGGA-A--TAG-GTGAGGAATA-------TTAAATATGAAGT-------AGGTA-AA--ATCAGGTTATTTAAAACA-AC-ATTT-CAA----------------------G--GCTTACG----GCTT-GTTGT---GAGGGA-----TG-GTGCC----AACACCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTGGATGTAGTTTAGCATCGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATAATGTAA--AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATG--GT----------C--A-T-TTCA-----GTCACACT---GGATGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTGTGTGTGGGTC---------CCATACAGCGCTAGC-----A-TACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGC---ACTTGCTCTAAC-CTTAGGTTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA---TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT----G-A----CATGAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-GGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCATATGAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATA
gi|10 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGTG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTT-GACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ATT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCc
gi|11 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTT-GA-A-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------ACTTTTGTAA--AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCA
gi|12 : A-AGCTA-TA--CGAAGGTTA---TAAACA-A--TCT--CAA----------------------AATACTTATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TTGATTAACTGCAAGCTTGAACGATTTTAAAACTTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGAGTTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATACT--TGTAATAGGC----A-AC----T----GTA--GTGT-GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCAAA-GTAATGAGGTA---------------------------T----------GGAC--------------AATCTTATAA--AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAGACGATA--TGT--AA-CTAA-TCGTTACCGTGGTAACACTAGCGGAGTA
gi|13 : attaaattctgttgaatgaaatgaggttaTGGTAAGCGTAAAC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAACAT-AT------CAT----------AAAT--------------ACTTATAAAA--AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCG-----GCTCTA-----CTTCAACCAAGTT--CT--TTT--AG-C--A-A-TCCA-----CTAACATT---GTTGTAATGGGAATAGT-A---AATA--CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTT--CAAGTTCGTCAATATTGGTTTAT----ACGTAAGAATCAGATA----TGATGC-----TAGA-----A-AACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTC-ACATT--TTCTGAT-CCTTTGAGAGTTTGC-AT--TGATATcacataattttgtaatg
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-ATCAACC----CTA--GTGT-ctaggttacggttcagtttggctgcaatcctgtatctgcattttgatgtgttat
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AC--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAATGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--CAGTGT----------------TAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AG--AGAAGATTA---AAAACG-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATAC
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGCCACAC-TCTCCACAG------TCATACATGTAA--TC---G--GGCAGATGTGCG--T-C-GT--TCT-TAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATA--AG-ACAA---C--TTT-ACA--A-A--TAATGTTACAGGTG-------TTGAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-T--TCT--CAAAAAGAAGATTAAAAAAGCTTAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGTATGAGTGATTCGAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA
gi|18 : aTCCAACTGTATT--TTGATGTTGAG-T--A-T-TTTA-----GAAACATT---GGCGTGCCATGA-----CATTTAATG-TCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTT--CCACTTTACCAATGTTCTTTTTG----ATGTGTGGGTC----
gi|19 : tcagttccagtataattttatccaattgttattgatattcatgacaatttatattgagattctagtgtttttttttatatataatctgatattgaaatggttaaaaggctatttacttaattgaaaaatcgttaccggcactGAGTTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATACT--TGTAAAA-GTC---A-AT----T----CTA--GTGC-ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCAAA-GCATTGAGGTATAGAGGTGATTACC-A-CTTATAGCTAT----------GAACAGTGCGATGATGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCT
gi|2 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAT------GCATA------A--TC---A--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-ATCT-TGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATA--AGGAAAA---C--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--GGAAGATTA---TAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATTATCATG----GTTT-AACGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTT--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCCAA-GTAATGAGGTATGGAGATAGCAACCAA-TT------CTT----------GAAC--------------AATTATGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTC--TT--TGT--AA-C--A-C-GTTA-----GTAACACT---GGAGTGATGGGAATAATTA-TTAATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTT--CAAGATTTTCAATATTGGACCTG----GTGTGGGGGTC----AAAATTCATAC-----TTTC-----A-TACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTGCCTTTGCAGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA------GAGCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTGGT-TTG-AGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACAACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGACAAGGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGT-AAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATGatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|20 : TTGCCACACGCTTTCACAC------GCATA------A--TC---G--GGCTGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AAATA-AAAGAGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATA--CATAGTATGTTT-GGAGTATAGCCAGAGCGAATA-G--TT----AACT
gi|21 : GGGTC----AAAAATCGTAC-----TTGC-----A-TACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGTGACTTTAC-CT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGGCCGTGGCTGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAAtattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|22 : gg-GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|22 : TGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtcttttcatccttgatcgtaaggtataca
gi|23 : gtctacaccaagatagcgagcattctcagttgtctttagaacctgtccatgaagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATCCATCT-CTTC--ATTTTGTTACACATCCTCACGG------G--TA------A--TT---TTTAGTAGGTGTGCG--T-C-TTTGTTT----GTTACTAGAGAAAGTTAAAATGT-AA-A-CG----A--AGGAATT---G--TTT-A-A--A-------TG-AAAAGGTGAAGAATATTAAA-ATTGAATGTGA-A-GAATGTAA--ATACGGGTA---AAAACA-A--CATGGCAA----------------------GAT--TTACG----GTTT-GTTGT---GAGGGA-C---GGTG--CT----GACTGCGAATTTaca
gi|24 : TGGCAACTAGGCT------T-T----------GAACTTC-----------AATCTTGGAA--AATATATGCA-----AGCATG--T----GTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACA--TA--TTG--AG-C--A-T-ATCA-----TTGACACT---GGAGTAGCCTGAGCAATCAT------GTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTT--Ca
gi|25 : aggacagtattttgagattccattgtttctttagataaagccCAG------GCAAA------A--TC---G--GACATTTGGCCA--T-C-GT-GTCT-TAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA------GACAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGCATAAAAGATG-------CTAAA--T--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AACACA-A--TCT--CAA----------------------AATGCCTATT----GTTT-GGTGT---GCTGGAAC---TG-G--CT----GACTGCAAGCTTAAATGATTCGAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTGa
gi|26 : ccACCATTT--CCAGTTTAGTAATACTGGATTTG----GTATGTGGG-C----T----CCAAAC-----AGGCGAAGGA-TACTC-AACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGC-CT--CTCTAATACCTGGATTGGTAGAT-CT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTGCAGAGGAGGTTACCCTATT----T-A----TGTGATTATTCC
gi|27 : acattttTGCAGCAATACAACATGCACAGGTAGCAA
gi|27 : cttaaaGCAAACTTGAATG-------------CAGCAGTACAACAT--GCAG------AGTCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAA-GAAAGAATATTAATGTG----TC----A-A----------CTA-----T-GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCAAA-CTAacttgaatgcagcagtacaacatgcagagtcccactgcactacagtaaagagaagaaagaatattaatgtgtcaactatggttctgtttgaaagacaggagtggcaattaagcttgaaatcctgtggttagcctcaaacta
gi|28 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaACA-CGATA-AA--TAAAGATTA---AAAACA-A--TCT--CAA----------------------T-TGCTTATA----TTTTCAGTGT---GCTGGAGA---TG-G--CC----AACAGCAATCTGGAATGATTTAAA------------------ATCCACAGGTAGCTAGTTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTATT--TATA----
gi|29 : tCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATATT--TCTA----GTTGTCA-GT----T----CCA--GTATAAAATTTGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATATTCTATaaagtcgacactgt
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTCGG------G--TA------A--TTTT-A--AGCAGTTGCGCG--C-C--T-GTCTGTA----AGTAGAAAAA------AAGT-TATAATATAAAAGTAGGAATA---GTTGAA-A-AG-A-A--TAG-GTGAAGAATA-------TTAAA-ATTGAATGTGAAGTAGGTA-AA--ATCAGGTTA---AAAAAACA--ATT--CAA------------------------TGCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGT---GGTG--CA----GACTGCAACTTT-------TCGAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-----TAGAGCATTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAG--TTACAGTAT-GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCCTATTACT-TTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AG-T--AAT-TTCA-----GTCACACT---GGAGTATCCAGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATT--CCAATGTGTCTACATTGATTTTG----GTGTGTGTGTC----G----C-ATAC------AGC-----GCTTCTCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTGGATTTGTGGCTACTCTATT----G-A----CATGAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGATATCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATGTTTTTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT-TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGG-AGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTtatttttttggatgta
gi|30 : tAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGATGTATAGAGATAGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTC--TT--TCT--AA-C--A-T-gc
gi|34 : --AAGACAA---G--GGT-A-A--A-AAACAGCGTTAAAGGTG-------TTAAA-AT--TGTTTGACA-AGATC-AA--ACAAGATCA---AAA-CA-A--TCT--CAA----------------------AATGCTCATA----CTTT-GGTGT---GCTGGAGT---TG-G--CT----AACGGCAAACTg
gi|36 : agCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG--CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATGga
gi|37 : attttgatgtgttatattcgatattctgcaaggctttAGACCAG---AGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTT----T-A----TGTGACTGTTCCAcagc
gi|38 : agcagagaaagagtactcaactagcgccttgtatgcagcctctgtaatagctgggttggtGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAA---AAG--A----GC--CAAAGGAAAac
gi|4 : gtgaatgatggtgccaacagcttatttaaacttattaat-AGGTA-AA--ATCGGGTTA---TAAACA-ACAGTT--TAA----------------------A--GCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGA---TG-GTGCC----GACTACAAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT-------------GGCCAAAGAAAGAATATT--TGTA----GT----A-AC----CAGTTCCG--GTAT-GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGGAT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GAAT--------------TATCGTGTAA--AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AGTC--A-T-TTCA-----GTCACACT---GAAATATCCAGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAGTTTGTCTATATTGTTTTTG----GTGTGTGGGTC---------CCATACAGCGGTAGC-----A-TACTCTAGTTGA-GGACGTA-CAAGCG-TTTTGTATGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGAGTGTTGGT-CC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCGCATTTGTGACTACTCTGTT----G-ACATTCATGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGATATCGAGCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-----T-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAATTTGAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTC---------------TGTCTGT------GTCGTTTATTGTTAGGTAat
gi|40 : agtATCTATCT-CTTC--TTTCTGCTGCACACCATCACGG------G--TA------ATTTT---G--AGCAGTTCCGC
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGCTACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TT---G--AGCAGATAAGCG--G-C-GT-ATCT-ccctttgtttgtaagtaaagaaa
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-CCACATGCCTTCAGAG------GTATA------A--TC---G--GGCAGCGGTGCG--T-atttgtactcaa
gi|43 : CTATCCATCG-TCAT--ATTT-GCCACATACCTTCACAT------TCATA------A--TC---T--GGCAGCTGC
gi|44 : -GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGat
gi|45 : TACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGCCAGACGCCCTCACAGTCAAAGGCATA------A--TC---C--GGCAGCTGTGTG--T-C-AT-GTCT-TAAATCAGTAGAAAAG----AAAGGA-AA-AGCACAATA--AG--AAA---G--GGT-A-A--A-A------------GGTG-------TTAA---T--AGATTGGCA-ACATA-AA--AACAG-TTA---AAACCA-A--TCT--CAA----------------------TATGTTAACG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGCTTGAATGATTTAAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAAGTTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTGAC--TATA----TT----ACAT----G----CTT--ATAT-GTCTCTG---GAAGA-AT--ATT--ATAATAAT--A
gi|5 : A----GTC---A-AT----C----CCA--GTGT-GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATAGGAACCAA-CT------TAT----------AAAC--------------AATCTTATAA--AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATC--TT--TCT--AA-C--A-T-GTCA-----GTTACAAT---GGAGTAATGGGAACAGTCATTT-ATGGTCCAG----------ATTGTTGTA--GTTTTACC--TTTGTAAATAT---------------------TC----A----AC-TGC-----TTGC-----A-TACTCAAGCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGC-ACGCT--TTCTGAT-CTTTGAGGCCTTTAC-CTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTGACTGCA---------ACCCTGTC----T-A----TGAGGGTtacataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|6 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattataataatatacataagtaTGT---G--GGGGA---TG-GTACC----ACCTGCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTAGAACGTTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTCTAT--TT---TTTTAT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-C--TT--AGC--GGTC--A-T-TTCA-----GTCGCACT---GGAGTATCTAGAGTAATCATTTAAAGA-CCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTTTGCATTGTTTTTG----GTGTGCGGGTC---------CCATACAGCTCTACC-----A-TACACCAGCTGA-GGGCGTA------------G-AAGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTGCATTTGTGGCTACTCTGTTGACATGA----CATGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|7 : tGT-A-A--ATA--TAATGTAGAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AA---------CT--C-----------------------------TCATA----GTTT-GGTTT---GCTGGAGC---TG-G--CT----ATCTGCAAGCTTGAA-GGAT----------------TACAACATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACACT--TGTA----CT----A-GT----C---------------AACCT------------------AGTGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCAAC-GTAATAACGTATAGAAATAGCGACCAT-CT------CAT----------ATTT--------------AATCTTA-AA--AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTC--TT--TCT--AG-C--A-T-GTC----------CA----------AATGGGA--AATTATTTA-TGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATT--CAAGTTTGTCAATATTGGACTTG----G---GTGAGTC----AAAA-TCGTGT-----TGGT-----A-TACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCC-AACCT--CTGTAAT-CTTAGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGGCCTTGGCTGCTATCCTGTC----T-A----TGTAGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAAGATAACGAGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGCCACATGCCTTCACAG------GAATA------A--TC---G--GGCAACTGCGCAATTAT-GT-GTCT-TATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-AA-TAGTGTTAATGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-A--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAGGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----CAACCCTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCCACCAA-CT------CAT----------GAGC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTC--TT--TTT--AA-C--A-T-GTTA-----GTAGCACT---GGAGTAATGGGAATAATCATTC-ATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTT--CAAGTTTGTCAATATTGGACCTG----TTGTGGGGGTC----tctctc
gi|9 : CTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGTCTTCACAG------GCATA------T--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-T-GT-GTTT-TATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATA--AGGAAAA---G--GAT-A-A--A-AA-TAGTGTTAGAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTAT---GTTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GTTATCA-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--A--GAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCAAA-GTAATGAGGTATAAAGATGGCGACCAA-CT------CATGAACAATTATGAAC--------------AATTTTGTAC--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGATGGTGCTGACAGCAAGTTTAAACTTGTCAAAGTATTGCACCAACACATCTTTTAGTAGTACATTCTACTGAAGAGCCAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTTTGTAACAGTCGGTACAAGTATGAATTTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111 22222222222222222222222 1111111111111111111 11111111111111 44444444444444444444 11111 1 111111 11 22 1 1 222 1 2222 1 1 222222222222
lowQualScore : 2 33 666666 2 666666 22 666 22 33 2 2 2 2 5 777 2 2 33 0 888 33 4 2 55 2 000 8 7777777 2 99 33 2 2 22 1 333 2 666 44 7777777777777777777777 0 4444 2 333 0 333 3 77 9999 0 5 2 0 4444 22 4444 44 0 33 66666666666666666666666 33 2 1 11 2 444 5 33 0 0 1 2 0 1 333 2222222222222222222 99999999999999 33 0 66666 33 5555 0 1 0 1 0 2 1 6666 7777777 6 44 3 44 88888 2 555 1 33 7 2 77 2 1 3 1 5 44 0 55 7777 1 66666666666666666666 1 00000 4 4 4 1 77 2 4 77 55 2 4 0 1 1 1 4 55 1 1 1 777 0 0 0 444 3 000000 8888 1 22 55 1 2 7 2 1 0 44 333 0 1111 2 0 1 1 1 0 0 5 1 1 0 666666666666 666666
lowQualScore : . .. ...... . ...... .. ... .. .. . . . . . ... . . .. . ... .. . . .. . ... . ....... . .. .. . . .. . ... . ... .. ...................... . .... . ... . ... . .. .... . . . . .... .. .... .. . .. ....................... .. . . .. . ... . .. . . . . . . ... ................... .............. .. . ..... .. .... . . . . . . . .... ....... . .. . .. ..... . ... . .. . . .. . . . . . .. . .. .... . .................... . ..... . . . . .. . . .. .. . . . . . . . .. . . . ... . . . ... . ...... .... . .. .. . . . . . . .. ... . .... . . . . . . . . . . . ............ ......
lowQualScore : 7 77 111111 7 111111 99 666 99 22 4 5 5 5 5 888 7 7 44 4 888 44 7 4 66 4 888 9 6666666 4 77 55 0 0 88 3 555 0 777 88 8888888888888888888888 8 2222 0 333 3 333 8 99 3333 4 9 1 7 7777 88 2222 88 5 22 33333333333333333333333 22 4 0 33 5 111 2 22 1 4 8 5 4 9 333 9999999999999999999 11111111111111 44 8 22222 44 3333 5 9 8 4 6 0 0 0000 2222222 2 22 1 11 33333 2 888 0 22 2 1 00 0 4 3 0 6 66 5 55 7777 3 99999999999999999999 0 00000 0 1 0 0 33 0 0 00 55 3 0 7 0 0 0 0 55 0 1 4 000 8 6 7 777 9 777777 5555 4 77 66 4 4 8 2 0 8 22 222 0 2222 5 2 2 0 0 2 0 4 0 4 8 888888888888 222222
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( family-3480 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
gi|1 : TATTTATTTCTTA---ATTCTGCTGCACACTCTC-TAG------G-GTA------A--TTTTTG--AGCAGTTGTGCA--C-CTGT-GTCT----GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTA--GGAATAA---T--TGT-A-AGGA-A--TAG-GTGAGGAATA-------TTAAATATGAAGT-------AGGTA-AA--ATCAGGTTATTTAAAACA-AC-ATTT-CAA----------------------G--GCTTACG----GCTT-GTTGT---GAGGGA-----TG-GTGCC----AACACCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTGGATGTAGTTTAGCATCGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATAATGTAA--AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATG--GT----------C--A-T-TTCA-----GTCACACT---GGATGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTGTGTGTGGGTC---------CCATACAGCGCTAGC-----A-TACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGC---ACTTGCTCTAAC-CTTAGGTTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA---TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT----G-A----CATGAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-GGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCATATGAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATA
gi|10 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGTG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTT-GACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ATT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCc
gi|11 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTT-GA-A-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------ACTTTTGTAA--AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCA
gi|12 : A-AGCTA-TA--CGAAGGTTA---TAAACA-A--TCT--CAA----------------------AATACTTATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TTGATTAACTGCAAGCTTGAACGATTTTAAAACTTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGAGTTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATACT--TGTAATAGGC----A-AC----T----GTA--GTGT-GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCAAA-GTAATGAGGTA---------------------------T----------GGAC--------------AATCTTATAA--AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAGACGATA--TGT--AA-CTAA-TCGTTACCGTGGTAACACTAGCGGAGTA
gi|13 : attaaattctgttgaatgaaatgaggttaTGGTAAGCGTAAAC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAACAT-AT------CAT----------AAAT--------------ACTTATAAAA--AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCG-----GCTCTA-----CTTCAACCAAGTT--CT--TTT--AG-C--A-A-TCCA-----CTAACATT---GTTGTAATGGGAATAGT-A---AATA--CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTT--CAAGTTCGTCAATATTGGTTTAT----ACGTAAGAATCAGATA----TGATGC-----TAGA-----A-AACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTC-ACATT--TTCTGAT-CCTTTGAGAGTTTGC-AT--TGATATcacataattttgtaatg
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-ATCAACC----CTA--GTGT-ctaggttacggttcagtttggctgcaatcctgtatctgcattttgatgtgttat
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AC--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAATGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--CAGTGT----------------TAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AG--AGAAGATTA---AAAACG-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATAC
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGCCACAC-TCTCCACAG------TCATACATGTAA--TC---G--GGCAGATGTGCG--T-C-GT--TCT-TAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATA--AG-ACAA---C--TTT-ACA--A-A--TAATGTTACAGGTG-------TTGAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-T--TCT--CAAAAAGAAGATTAAAAAAGCTTAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGTATGAGTGATTCGAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA
gi|18 : aTCCAACTGTATT--TTGATGTTGAG-T--A-T-TTTA-----GAAACATT---GGCGTGCCATGA-----CATTTAATG-TCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTT--CCACTTTACCAATGTTCTTTTTG----ATGTGTGGGTC----
gi|19 : tcagttccagtataattttatccaattgttattgatattcatgacaatttatattgagattctagtgtttttttttatatataatctgatattgaaatggttaaaaggctatttacttaattgaaaaatcgttaccggcactGAGTTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATACT--TGTAAAA-GTC---A-AT----T----CTA--GTGC-ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCAAA-GCATTGAGGTATAGAGGTGATTACC-A-CTTATAGCTAT----------GAACAGTGCGATGATGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCT
gi|2 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAT------GCATA------A--TC---A--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-ATCT-TGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATA--AGGAAAA---C--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--GGAAGATTA---TAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATTATCATG----GTTT-AACGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTT--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCCAA-GTAATGAGGTATGGAGATAGCAACCAA-TT------CTT----------GAAC--------------AATTATGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTC--TT--TGT--AA-C--A-C-GTTA-----GTAACACT---GGAGTGATGGGAATAATTA-TTAATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTT--CAAGATTTTCAATATTGGACCTG----GTGTGGGGGTC----AAAATTCATAC-----TTTC-----A-TACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTGCCTTTGCAGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA------GAGCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTGGT-TTG-AGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACAACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGACAAGGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGT-AAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATGatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|20 : TTGCCACACGCTTTCACAC------GCATA------A--TC---G--GGCTGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AAATA-AAAGAGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATA--CATAGTATGTTT-GGAGTATAGCCAGAGCGAATA-G--TT----AACT
gi|21 : GGGTC----AAAAATCGTAC-----TTGC-----A-TACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGC-ACACT--CTCTGAT-CTTGGGTGACTTTAC-CT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGGCCGTGGCTGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAAtattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|22 : gg-GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|22 : TGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtcttttcatccttgatcgtaaggtataca
gi|23 : gtctacaccaagatagcgagcattctcagttgtctttagaacctgtccatgaagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATCCATCT-CTTC--ATTTTGTTACACATCCTCACGG------G--TA------A--TT---TTTAGTAGGTGTGCG--T-C-TTTGTTT----GTTACTAGAGAAAGTTAAAATGT-AA-A-CG----A--AGGAATT---G--TTT-A-A--A-------TG-AAAAGGTGAAGAATATTAAA-ATTGAATGTGA-A-GAATGTAA--ATACGGGTA---AAAACA-A--CATGGCAA----------------------GAT--TTACG----GTTT-GTTGT---GAGGGA-C---GGTG--CT----GACTGCGAATTTaca
gi|24 : TGGCAACTAGGCT------T-T----------GAACTTC-----------AATCTTGGAA--AATATATGCA-----AGCATG--T----GTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACA--TA--TTG--AG-C--A-T-ATCA-----TTGACACT---GGAGTAGCCTGAGCAATCAT------GTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTT--Ca
gi|25 : aggacagtattttgagattccattgtttctttagataaagccCAG------GCAAA------A--TC---G--GACATTTGGCCA--T-C-GT-GTCT-TAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA------GACAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGCATAAAAGATG-------CTAAA--T--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AACACA-A--TCT--CAA----------------------AATGCCTATT----GTTT-GGTGT---GCTGGAAC---TG-G--CT----GACTGCAAGCTTAAATGATTCGAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTGa
gi|26 : ccACCATTT--CCAGTTTAGTAATACTGGATTTG----GTATGTGGG-C----T----CCAAAC-----AGGCGAAGGA-TACTC-AACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGC-CT--CTCTAATACCTGGATTGGTAGAT-CT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTGCAGAGGAGGTTACCCTATT----T-A----TGTGATTATTCC
gi|27 : acattttTGCAGCAATACAACATGCACAGGTAGCAA
gi|27 : cttaaaGCAAACTTGAATG-------------CAGCAGTACAACAT--GCAG------AGTCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAA-GAAAGAATATTAATGTG----TC----A-A----------CTA-----T-GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCAAA-CTAacttgaatgcagcagtacaacatgcagagtcccactgcactacagtaaagagaagaaagaatattaatgtgtcaactatggttctgtttgaaagacaggagtggcaattaagcttgaaatcctgtggttagcctcaaacta
gi|28 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaACA-CGATA-AA--TAAAGATTA---AAAACA-A--TCT--CAA----------------------T-TGCTTATA----TTTTCAGTGT---GCTGGAGA---TG-G--CC----AACAGCAATCTGGAATGATTTAAA------------------ATCCACAGGTAGCTAGTTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTATT--TATA----
gi|29 : tCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATATT--TCTA----GTTGTCA-GT----T----CCA--GTATAAAATTTGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATATTCTATaaagtcgacactgt
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTCGG------G--TA------A--TTTT-A--AGCAGTTGCGCG--C-C--T-GTCTGTA----AGTAGAAAAA------AAGT-TATAATATAAAAGTAGGAATA---GTTGAA-A-AG-A-A--TAG-GTGAAGAATA-------TTAAA-ATTGAATGTGAAGTAGGTA-AA--ATCAGGTTA---AAAAAACA--ATT--CAA------------------------TGCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGT---GGTG--CA----GACTGCAACTTT-------TCGAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-----TAGAGCATTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAG--TTACAGTAT-GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCCTATTACT-TTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AG-T--AAT-TTCA-----GTCACACT---GGAGTATCCAGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATT--CCAATGTGTCTACATTGATTTTG----GTGTGTGTGTC----G----C-ATAC------AGC-----GCTTCTCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTGGATTTGTGGCTACTCTATT----G-A----CATGAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGATATCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATGTTTTTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT-TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGG-AGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTtatttttttggatgta
gi|30 : tAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGATGTATAGAGATAGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTC--TT--TCT--AA-C--A-T-gc
gi|34 : --AAGACAA---G--GGT-A-A--A-AAACAGCGTTAAAGGTG-------TTAAA-AT--TGTTTGACA-AGATC-AA--ACAAGATCA---AAA-CA-A--TCT--CAA----------------------AATGCTCATA----CTTT-GGTGT---GCTGGAGT---TG-G--CT----AACGGCAAACTg
gi|36 : agCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG--CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATGga
gi|37 : attttgatgtgttatattcgatattctgcaaggctttAGACCAG---AGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTT----T-A----TGTGACTGTTCCAcagc
gi|38 : agcagagaaagagtactcaactagcgccttgtatgcagcctctgtaatagctgggttggtGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAA---AAG--A----GC--CAAAGGAAAac
gi|4 : gtgaatgatggtgccaacagcttatttaaacttattaat-AGGTA-AA--ATCGGGTTA---TAAACA-ACAGTT--TAA----------------------A--GCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGA---TG-GTGCC----GACTACAAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT-------------GGCCAAAGAAAGAATATT--TGTA----GT----A-AC----CAGTTCCG--GTAT-GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGGAT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GAAT--------------TATCGTGTAA--AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AGTC--A-T-TTCA-----GTCACACT---GAAATATCCAGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAGTTTGTCTATATTGTTTTTG----GTGTGTGGGTC---------CCATACAGCGGTAGC-----A-TACTCTAGTTGA-GGACGTA-CAAGCG-TTTTGTATGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGAGTGTTGGT-CC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCGCATTTGTGACTACTCTGTT----G-ACATTCATGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGATATCGAGCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-----T-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAATTTGAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTC---------------TGTCTGT------GTCGTTTATTGTTAGGTAat
gi|40 : agtATCTATCT-CTTC--TTTCTGCTGCACACCATCACGG------G--TA------ATTTT---G--AGCAGTTCCGC
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGCTACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TT---G--AGCAGATAAGCG--G-C-GT-ATCT-ccctttgtttgtaagtaaagaaa
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-CCACATGCCTTCAGAG------GTATA------A--TC---G--GGCAGCGGTGCG--T-atttgtactcaa
gi|43 : CTATCCATCG-TCAT--ATTT-GCCACATACCTTCACAT------TCATA------A--TC---T--GGCAGCTGC
gi|44 : -GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGat
gi|45 : TACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGCCAGACGCCCTCACAGTCAAAGGCATA------A--TC---C--GGCAGCTGTGTG--T-C-AT-GTCT-TAAATCAGTAGAAAAG----AAAGGA-AA-AGCACAATA--AG--AAA---G--GGT-A-A--A-A------------GGTG-------TTAA---T--AGATTGGCA-ACATA-AA--AACAG-TTA---AAACCA-A--TCT--CAA----------------------TATGTTAACG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGCTTGAATGATTTAAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAAGTTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTGAC--TATA----TT----ACAT----G----CTT--ATAT-GTCTCTG---GAAGA-AT--ATT--ATAATAAT--A
gi|5 : A----GTC---A-AT----C----CCA--GTGT-GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATAGGAACCAA-CT------TAT----------AAAC--------------AATCTTATAA--AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATC--TT--TCT--AA-C--A-T-GTCA-----GTTACAAT---GGAGTAATGGGAACAGTCATTT-ATGGTCCAG----------ATTGTTGTA--GTTTTACC--TTTGTAAATAT---------------------TC----A----AC-TGC-----TTGC-----A-TACTCAAGCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGC-ACGCT--TTCTGAT-CTTTGAGGCCTTTAC-CTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTGACTGCA---------ACCCTGTC----T-A----TGAGGGTtacataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|6 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattataataatatacataagtaTGT---G--GGGGA---TG-GTACC----ACCTGCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTAGAACGTTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTCTAT--TT---TTTTAT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-C--TT--AGC--GGTC--A-T-TTCA-----GTCGCACT---GGAGTATCTAGAGTAATCATTTAAAGA-CCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTTTGCATTGTTTTTG----GTGTGCGGGTC---------CCATACAGCTCTACC-----A-TACACCAGCTGA-GGGCGTA------------G-AAGC-GCATG--CTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTGCATTTGTGGCTACTCTGTTGACATGA----CATGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|7 : tGT-A-A--ATA--TAATGTAGAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AA---------CT--C-----------------------------TCATA----GTTT-GGTTT---GCTGGAGC---TG-G--CT----ATCTGCAAGCTTGAA-GGAT----------------TACAACATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACACT--TGTA----CT----A-GT----C---------------AACCT------------------AGTGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCAAC-GTAATAACGTATAGAAATAGCGACCAT-CT------CAT----------ATTT--------------AATCTTA-AA--AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTC--TT--TCT--AG-C--A-T-GTC----------CA----------AATGGGA--AATTATTTA-TGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATT--CAAGTTTGTCAATATTGGACTTG----G---GTGAGTC----AAAA-TCGTGT-----TGGT-----A-TACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCC-AACCT--CTGTAAT-CTTAGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGGCCTTGGCTGCTATCCTGTC----T-A----TGTAGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAAGATAACGAGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGCCACATGCCTTCACAG------GAATA------A--TC---G--GGCAACTGCGCAATTAT-GT-GTCT-TATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-AA-TAGTGTTAATGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-A--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAGGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----CAACCCTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCCACCAA-CT------CAT----------GAGC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTC--TT--TTT--AA-C--A-T-GTTA-----GTAGCACT---GGAGTAATGGGAATAATCATTC-ATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTT--CAAGTTTGTCAATATTGGACCTG----TTGTGGGGGTC----tctctc
gi|9 : CTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGTCTTCACAG------GCATA------T--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-T-GT-GTTT-TATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATA--AGGAAAA---G--GAT-A-A--A-AA-TAGTGTTAGAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTAT---GTTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GTTATCA-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--A--GAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCAAA-GTAATGAGGTATAAAGATGGCGACCAA-CT------CATGAACAATTATGAAC--------------AATTTTGTAC--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
blockSeqs : . CA TCAAAG C CATGTA TT TT TT AT A . T G C GTT A T GT AAA TT A C G T AAC A AAGAATA . TG GC T T AG A . C CAG GG AAAGAAGATTAAAAAAGCTTAA GTAT C ATA GAA T TG GATT A G TAGT TT TGTT CA AA ATAGGCAACT CA A T AA T TTA A TA A . G GGC CATGAACAATTAT AGTGCGATGATGCA TG TCATG TG ATAG G T T A ACGA GATGTTG T TA A CG CCGTG A AGC A GG A A GT G T T T G TA GT . A AGATATGATGC A GAAGG C T T A CT C T AG . G A A A T . GA G C T GTA TTT C GACATG CATT C TC TG A G G G A TA TTT . GTTA C C G A G C G A TAAAGTCTGA CTTTTT
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . C A . . . AAA . A . . . AT A . . TG TC . . . A . . A . . . . . . T TA TG A G T . . . . GTAATCAACC . . T AA . C A . A . G AC TATAGCTAT TTC . . . . G T T A TT TGT T . . T . A . C AT A A GT G G T C A . TT . T AAAATTCATAC T . . T . G CC C . A . G . G A T . . G C T . GTG C T . T TC TG A G G G A AA AG . . C T C T G A T T GAGTGCATTA CTTTTC
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . AT A . . . TC . . . G . . A . . . . . . . . TG T C T . . . . AAAGTCAATT . . G GA . C G . A . T AC CAT . . . . . A T T G TT TTT . . . T . A . A GG G A AT G T T T C . GA . G AAAAATCGTAC T . . T . G CC . . A . G . T A T . . A G T . GAG A T . T TC TG A T G G A T . . . . A A T . . A A TCAATGCTGA TTTTGT
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . C G . . . . . . . . . T T . . . TC . . . A . . T . . . . . . . . . A G T . . . . GTTGTCAGTT . . T CA . C T . A . T TA CAT . . . . . G T T C TC TGT . . . G . A . G CT G A GT C G T G A . GA . T CCATACAGCGG G . . C . T CA . . A . A . T G G . . C G C . TTT T T . C . G T T . G T . . T T . CATGTC
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . T A . . . TC . . . A . . A . . . . . . . . . G G T . . . . GTAACCAGTT . . T GA . G A . A . A AC CAT . . . . . A T A A CA TTG . . . A . G . T CA G A GT C G A A A . AT . T CCATACAGCTC A . . T . T CA . . G . T . T T G . . C G C . GAG A G . T . G T G . G T .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . C A . . . GC . . . A . . A . . . . . . . . . A G T . . . . GTAGTCAGTT . . T GA . C G . A . A AT CTT . . . . . A A A T TC AGT . . . T . C . T CA A A GT A G C A A . TT . T AAAATCGTGT A . . A . T CT . . G . T . A T G . . C C C . TTT T T . T . . A G . . A
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . T A . . . GT . . . G . . A . . . . . . . . . G C T . . . . GTAATCAACC . . A AT . C T . A . T GG TGT . . . . . G A T C TC TCT . . . T . C . A GG G A T G G C T A . TT . C TCCAAAC T . . C . A C . . A . G . G C T . . C G G . TTT T G . . A C . . A
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . T G . . . TC . . . A . . T . . . . . . . . . A G T . . . . GTTATCAACC . . A AT . A T . A . G AC CAT . . . . . A T A T TC AGT . . . G . T . T TA A . A A C T A G . GA . T GCATAC A . . T . T C . . G . T . T T G . . G C A . TTG C T . . T A . . T
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . T T . . . GT . . . A . . A . . . . . . . . . G C T . . . . GTAGTCAG . . A GT . T T . T . T GG TGT . . . . . A A T T TC TCT . . . T . C . A GG . . A T T T T A . GA . G AACTGC G . . . . A . . . A . A . G A T . . T . . . T . A .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T A . . . TT . . . G . . A . . . . . . . . . G C T . . . . TTACATG . . C GA . T G . A . A AC TAT . . . . . A C A T C AGC . . . G . A . A GG . . . G . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T T . . . TT . . . G . . C . . . . . . . . . A C A . . . . GTCAATC . . T AT . T T . A . T GG TGT . . . . . A A T T C TCT . . . G . . . C .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T T . . . TC . . . A . . T . . . . . . . . . G C A . . . . GTAATC . . A GA . T A . A . G TC CAT . . . . . G T T C C TTT . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . G . . T . . . . . . . . . A C A . . . . CTAGTC . . A GA . C . . A . C AC CAT . . . . . G T .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . A . . A . . . . . . . . . A C A . . . . CAACC . . T A . C . . . . G AC TT . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . T . . . . . . . . . . C A . . . . CAACC . . T . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . T . . . . . . . . . . C G . . . . TCAA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . T T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . G T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : *** G** ** ** TC *** A** ** ** ** TNT**** **** A* **
originalCons : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGC-GCACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
finalCons : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-AA--CT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TTTNT----AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATAC-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGCA-CACT--CTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGATGGTGCTGACAGCAAGTTTAAACTTGTCAAAGTATTGCACCAACACATCTTTTAGTAGTACATTCTACTGAAGAGCCAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTTTGTAACAGTCGGTACAAGTATGAATTTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111 22222222222222222222222 1111111111111111111 11111111111111 4444444444444444444444444 11111 111 111111 11 22 1 1 222 1 2222 1 1 222222222222
lowQualScore : 2 33 666666 2 666666 22 666 22 33 2 2 2 2 5 777 2 2 33 0 888 33 4 2 55 2 000 8 7777777 2 99 33 2 2 22 1 333 2 666 44 7777777777777777777777 0 4444 2 333 0 333 3 77 9999 0 5 2 0 4444 22 4444 44 0 33 66666666666666666666666 33 2 1 11 2 444 5 33 0 0 1 2 0 1 333 2222222222222222222 99999999999999 33 0 66666 33 5555 0 1 0 1 0 2 1 6666 7777777 6 44 3 44 88888 2 555 1 33 7 2 77 2 1 3 1 5 44 0 55 7777 1 6666666666666666666666666 1 00000 4 4 4 6666 444 0 2 4 0 1 1 1 4 55 1 1 1 777 0 0 0 444 3 000000 8888 1 22 55 1 2 7 2 1 0 44 333 0 1111 2 0 1 1 1 0 0 5 1 1 0 666666666666 666666
lowQualScore : . .. ...... . ...... .. ... .. .. . . . . . ... . . .. . ... .. . . .. . ... . ....... . .. .. . . .. . ... . ... .. ...................... . .... . ... . ... . .. .... . . . . .... .. .... .. . .. ....................... .. . . .. . ... . .. . . . . . . ... ................... .............. .. . ..... .. .... . . . . . . . .... ....... . .. . .. ..... . ... . .. . . .. . . . . . .. . .. .... . ......................... . ..... . . . .... ... . . . . . . . . .. . . . ... . . . ... . ...... .... . .. .. . . . . . . .. ... . .... . . . . . . . . . . . ............ ......
lowQualScore : 7 77 111111 7 111111 99 666 99 22 4 5 5 5 5 888 7 7 44 4 888 44 7 4 66 4 888 9 6666666 4 77 55 0 0 88 3 555 0 777 88 8888888888888888888888 8 2222 0 333 3 333 8 99 3333 4 9 1 7 7777 88 2222 88 5 22 33333333333333333333333 22 4 0 33 5 111 2 22 1 4 8 5 4 9 333 9999999999999999999 11111111111111 44 8 22222 44 3333 5 9 8 4 6 0 0 0000 2222222 2 22 1 11 33333 2 888 0 22 2 1 00 0 4 3 0 6 66 5 55 7777 3 9999999999999999999999999 0 00000 0 1 0 6666 222 6 3 0 7 0 0 0 0 55 0 1 4 000 8 6 7 777 9 777777 5555 4 77 66 4 4 8 2 0 8 22 222 0 2222 5 2 2 0 0 2 0 4 0 4 8 888888888888 222222
consensus : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATA-----C-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGCGCACTCTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
Reference ( family-3480 ) : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TANATTAATAGAAAAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCGAAGTCTTGCAGCAGTACAACATCTGCAGGTAGCGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTA--GTGT-GANTCTGTTTGAAAG-AC--ATNGAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCNACCAA-CT------CGT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCNAGTC--TT--TNT--AG-C--A-T-NTCA-----GTNACACT---GGAGTANCGGGAGTAATCATTTAATGGTCCAGCGGGCCGCACGNCGTTGGACCGTTT--CCAGTTTGTCAATATTGGTTTTG----GTGTGTGGGTC----A----CCATA-----C-----TNGC-----A-TACTCTAGCTGG-GGGCGNACCAAG-G-TTTTGTAGGCACACTCTCTGAT-CTTAGGNGNGTTNGC-CT--TGATGTTCCTCTTNAGAAAGCCCAG---GGTTCTGTCTGCATTTGCGGCTACTCTGTT----T-A----CGTGAGTATTCCATGACAAGTTGCCCGTCAGA-GTCTACACCAAGATANCGAGCATTGCTCAGCTGTCTCTAGNACCTGTCCATGAAGCATGTAAGTAGTTGGNAATG-NGTTT-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCNATNTGAGTGACCAGTCTATGAAGTTTATTGAGGTCTGTCTGN-AGTGT-CTNATTGTCTGTCTTTTCGTCGTTGATCGTTAGGTATG
gi|1 : TATTTATTTCTTA---ATTCTGCTGCACACTCTC-TAG------G-GTA------A--TTTTTG--AGCAGTTGTGCA--C-CTGT-GTCT----GTTAGTAGACAAAGTTAAATGAT-AA-AA---AGTA--GGAATAA---T--TGT-A-AGGA-A--TAG-GTGAGGAATA-------TTAAATATGAAGT-------AGGTA-AA--ATCAGGTTATTTAAAACA-AC-ATTT-CAA----------------------G--GCTTACG----GCTT-GTTGT---GAGGGA-----TG-GTGCC----AACACCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGGGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GCC-AAGGGGAAAAAAT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-GAATTTGTTTATAGG-TT--ATTGAATGGCAGT--ATTTTGAGATTCTTTTATT--TTTTGGATGTAGTTTAGCATCGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATAATGTAA--AACAGATACA-----AGCGAA--C----ATCTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAACTGAATG--GT----------C--A-T-TTCA-----GTCACACT---GGATGATTTAGATTTATCATTTAAAGATC-ACCGGGTCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTCTACATTGTTTTAGAACTGTGTGTGGGTC---------CCATA-----CAGCGCTAGC-----A-TACTCAAGCTGA-GGGCGT-TCAAGCG-TTTTGTAAGCACTTGCTCTAAC-CTTAGGTTTGTTGGTTCG--TGATGTTCTTTTTTAGTAAGCCCAA---TGTTCGACCCCCATTTGTGGCTACTCTGTT----G-A----CATGAGTATTCAATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-GGTTTCTTTTTGCCTT----TGTGGCTTGTACTACTTGGCACTTGGAAGGATCGAAGCTCATGCCCCATATGAGTGACCAGTCTAT--AGTTTATTGAGGTCTGTCTGG-AGTGTACTT-TTGTATGTTTGTGTGTCGTTGATTGTTAGATA
gi|10 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGTG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAA--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTT-GACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ATT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCTCTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTATGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGGGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGAAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCc
gi|11 : TGCCACACACCTTCACAT------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TACATTAATAGAAAAAC--GAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-A---AATGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTT-GA-A-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTGATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CTTG--AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGATTTGTAGGAGTAAAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGACTACT--T--------C----A-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTAAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATTTTGATACCCGGTGGTAAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------ACTTTTGTAA--AGGAGTCATA-----AACGCG--T----ATCTGCCCGGTGTTGCTTTAAGGTTCTCCA
gi|12 : A-AGCTA-TA--CGAAGGTTA---TAAACA-A--TCT--CAA----------------------AATACTTATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TTGATTAACTGCAAGCTTGAACGATTTTAAAACTTGCAACATTACAACATGTGCAGGTTGCGAGTTCCCTTGTAC---TGTTTATGTTGT--AAGTGGGAAGAAAGAATACT--TGTAATAGGC----A-AC----T----GTA--GTGT-GGGTCTGTTTGAAAG-AC--ATGGAGTGACAAT--ACCTCGACACCCAGTGGTTAGCTCCAAA-GTAATGAGGTA---------------------------T----------GGAC--------------AATCTTATAA--AGGAGACATA-----GACGCG--C----ATCTGCCCAAGGCTGCTCTAAGGTTCTCCAACCAAGACGATA--TGT--AA-CTAA-TCGTTACCGTGGTAACACTAGCGGAGTA
gi|13 : attaaattctgttgaatgaaatgaggttaTGGTAAGCGTAAAC-GTAATGATATATAGAGATAGCTAACAT-AT------CAT----------AAAT--------------ACTTATAAAA--AAGAGGCTTA-----TGCGCG--C----ATCTATCCG-----GCTCTA-----CTTCAACCAAGTT--CT--TTT--AG-C--A-A-TCCA-----CTAACATT---GTTGTAATGGGAATAGT-A---AATA--CCAGCGTTCTGCAAGTATACGAACTGCTT--CAAGTTCGTCAATATTGGTTTAT----ACGTAAGAATCAGATA----TGATG-----C-----TAGA-----A-AACTCTAGCTGG-CGCCAAACTTAG-A-TTTT-TAGTCACATTTTCTGAT-CCTTTGAGAGTTTGC-AT--TGATATcacataattttgtaatg
gi|14 : TATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTAACAGGAGTACAACATCTGCAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-ATCAACC----CTA--GTGT-ctaggttacggttcagtttggctgcaatcctgtatctgcattttgatgtgttat
gi|15 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AC--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATA
gi|16 : aTCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACATGCCTTCACAG------ACATA------A--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-C-CT-GTCT-TACATTAAAAGAGAAA---AAAATGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAAAAAG--GGT-A-A--A-A--CAGTGT----------------TAAA-AC--AGTTCAACA-AGATA-AG--AGAAGATTA---AAAACG-A--ACT--TAA----------------------AATGCTCATT----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATC--AGTCTTACAGGAGTACAACATCTGCAAGTAACAAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATAC
gi|17 : TCTATCTGTCT-TTAT--ATTTTGCCACAC-TCTCCACAG------TCATACATGTAA--TC---G--GGCAGATGTGCG--T-C-GT--TCT-TAAGTTAGTAGAAAAAA--GAAAAGT-AA-AGCTTAATA--AG-ACAA---C--TTT-ACA--A-A--TAATGTTACAGGTG-------TTGAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AAAACA-T--TCT--CAAAAAGAAGATTAAAAAAGCTTAAAATGCTCATG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGTATGAGTGATTCGAAGTCGTGCAGCAATAGGACATGTGCAGGTAGCGA
gi|18 : aTCCAACTGTATT--TTGATGTTGAG-T--A-T-TTTA-----GAAACATT---GGCGTGCCATGA-----CATTTAATG-TCCAGCTGGCTACTCCCAGATGGACAATTT--CCACTTTACCAATGTTCTTTTTG----ATGTGTGGGTC----
gi|19 : tcagttccagtataattttatccaattgttattgatattcatgacaatttatattgagattctagtgtttttttttatatataatctgatattgaaatggttaaaaggctatttacttaattgaaaaatcgttaccggcactGAGTTCCAGTGTA------T--A----GT--ACGATAAAAGAATGAATACT--TGTAAAA-GTC---A-AT----T----CTA--GTGC-ATTTCAGTTTCAAAG-AG--ATTGTGTGACAAT--ACCTTGATACCCTGTTGTTAGTTTCAAA-GCATTGAGGTATAGAGGTGATTACC-A-CTTATAGCTAT----------GAACAGTGCGATGATGCAAATCTTATAATGAGAATGTATA-----AACATG--C----ATCT
gi|2 : TCTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGCCTTCACAT------GCATA------A--TC---A--GGCAGCTGCGCG--T-C-GT-ATCT-TGTATTAATAGAAAAAG--GAACAGT-AA-AGTATAATA--AGGAAAA---C--GGT-A-A--A-A--TAGTGTAAAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTTCGACA-AGATA-AA--GGAAGATTA---TAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATTATCATG----GTTT-AACGT---GCTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGTACAACATCTGTAGGTAACGAGTTCCACTGTAC---TGT--A----GT--AAGGGGAAATAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----C----CTT--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ATCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCCAA-GTAATGAGGTATGGAGATAGCAACCAA-TT------CTT----------GAAC--------------AATTATGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCTGCTCTAAGGTTCACCAACCCAGTC--TT--TGT--AA-C--A-C-GTTA-----GTAACACT---GGAGTGATGGGAATAATTA-TTAATGGTCCAGCGTGTTGCACGTCTCTGAACTCTTT--CAAGATTTTCAATATTGGACCTG----GTGTGGGGGTC----AAAATTCATA-----C-----TTTC-----A-TACTCTTACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGCACACTCTCTGAT-CTTGGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCCTCTTGACAAATCCTAG---GGTGCTGTTTGCCTTTGCAGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTATTCCATGAAAAAATATTCG--AGATGTCTCCACCAA------GAGCATT-TTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGTATGTACCTTGTTGGT-TTG-AGTTT-TTTCTACCTTGTTATGTGG-----ACAACTTAACATTTTGATGGATTGAATTCCATATCCGACAAGGCTTCCCA-TCTCTGAAGTTTGTGAAAGTCAGTCTGT-AAAGT-CTGATTGTCTGTCTTTTTATCGTTGATCGTAAGGTATGatatctatcatatgctgtgcaaagatcagcttccattctccaa
gi|20 : TTGCCACACGCTTTCACAC------GCATA------A--TC---G--GGCTGCTGCGCG--T-C-GT-GTCT-TATATTAATAGAACAAG--AAAAAGTAAA-AGCATAATA--AGGATAA---G--GGTAA-A--A-A--TAGTGT-AAAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AAATA-AAAGAGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATA--CATAGTATGTTT-GGAGTATAGCCAGAGCGAATA-G--TT----AACT
gi|21 : GGGTC----AAAAATCGTA-----C-----TTGC-----A-TACTCTAACTGG-GGGCGGACCAAG-G-TTTTGTAGGCACACTCTCTGAT-CTTGGGTGACTTTAC-CT--TGTTGTTCCTCTTGACAAAGCCTAG---GGTGCTGTTGGCCGTGGCTGCAACTCTGTC----T-A----TGTGGGTGTTCCATGACAAATTATTTG--AGATGTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAATCTGTCCATGAAtattggttaaacataaaaataaaacctacattgaaagt
gi|22 : gg-GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|22 : TGTCTTTTCATCCTTGATCGTAAGGTATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtcttttcatccttgatcgtaaggtataca
gi|23 : gtctacaccaagatagcgagcattctcagttgtctttagaacctgtccatgaagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATCCATCT-CTTC--ATTTTGTTACACATCCTCACGG------G--TA------A--TT---TTTAGTAGGTGTGCG--T-C-TTTGTTT----GTTACTAGAGAAAGTTAAAATGT-AA-A-CG----A--AGGAATT---G--TTT-A-A--A-------TG-AAAAGGTGAAGAATATTAAA-ATTGAATGTGA-A-GAATGTAA--ATACGGGTA---AAAACA-A--CATGGCAA----------------------GAT--TTACG----GTTT-GTTGT---GAGGGA-C---GGTG--CT----GACTGCGAATTTaca
gi|24 : TGGCAACTAGGCT------T-T----------GAACTTC-----------AATCTTGGAA--AATATATGCA-----AGCATG--T----GTCTGAACGACATTGTTCAAGGGACCTCTAACAAAACA--TA--TTG--AG-C--A-T-ATCA-----TTGACACT---GGAGTAGCCTGAGCAATCAT------GTTCACCAGGCTGCTCAGTGTGGGACCATTT--Ca
gi|25 : aggacagtattttgagattccattgtttctttagataaagccCAG------GCAAA------A--TC---G--GACATTTGGCCA--T-C-GT-GTCT-TAAGTTAGTAGAA-------------------CATAA------GACAA---G--GGT-A-A--A-A--TAGCATAAAAGATG-------CTAAA--T--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AACACA-A--TCT--CAA----------------------AATGCCTATT----GTTT-GGTGT---GCTGGAAC---TG-G--CT----GACTGCAAGCTTAAATGATTCGAAGTCTT-CAGCAATACAACATGTGa
gi|26 : ccACCATTT--CCAGTTTAGTAATACTGGATTTG----GTATGTGGG-C----T----CCAAA-----C-----AGGCGAAGGA-TACTC-AACTAGTGGGCGTACAAGG-A-CCTTGTATGCAGCCTCTCTAATACCTGGATTGGTAGAT-CT--T-ATATTCATTCCAAGAAAGCATAG---ACTTCTGTTTGCAGAGGAGGTTACCCTATT----T-A----TGTGATTATTCC
gi|27 : acattttTGCAGCAATACAACATGCACAGGTAGCAA
gi|27 : cttaaaGCAAACTTGAATG-------------CAGCAGTACAACAT--GCAG------AGTCCCACTGCAC---TAC--A----GT--AAAGAGAA-GAAAGAATATTAATGTG----TC----A-A----------CTA-----T-GGTTCTGTTTGAAAG-AC--A-GGAGTGGCAATTAAGCTTGAAATCCTGTGGTTAGCCTCAAA-CTAacttgaatgcagcagtacaacatgcagagtcccactgcactacagtaaagagaagaaagaatattaatgtgtcaactatggttctgtttgaaagacaggagtggcaattaagcttgaaatcctgtggttagcctcaaacta
gi|28 : cttaaatgcagcaatacaacatgcacaggtaACA-CGATA-AA--TAAAGATTA---AAAACA-A--TCT--CAA----------------------T-TGCTTATA----TTTTCAGTGT---GCTGGAGA---TG-G--CC----AACAGCAATCTGGAATGATTTAAA------------------ATCCACAGGTAGCTAGTTTAACTGTAC---TAT--A----GT--AAGAAGGAATAAAGACTATT--TATA----
gi|29 : tCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT--G----GC--AAAAGGAAA-AAGGAATATT--TCTA----GTTGTCA-GT----T----CCA--GTATAAAATTTGTTTATAGGTAA--AT-GAGTGACAGT--ATTTTGATATTCTATaaagtcgacactgt
gi|3 : TATCTATCT-CTTTCAATTCTGCAGCACACCCTTTCGG------G--TA------A--TTTT-A--AGCAGTTGCGCG--C-C--T-GTCTGTA----AGTAGAAAAA------AAGT-TATAATATAAAAGTAGGAATA---GTTGAA-A-AG-A-A--TAG-GTGAAGAATA-------TTAAA-ATTGAATGTGAAGTAGGTA-AA--ATCAGGTTA---AAAAAACA--ATT--CAA------------------------TGCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGT---GGTG--CA----GACTGCAACTTT-------TCGAAGTCTAGCATCAATGCAACATCT-----TAGAGCATTCTACTGAAC---AGT--G----GC--CAAGGGAAAAAGT-AATATT--TGTA----GT----A-GT----CAG--TTACAGTAT-GAATTTGTTTATATG-AT--ATTGTATGACAGT--ATTTTGAGATCCTATTACT-TTTTTGGT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----CGCGTG--C----ATCTGAACGAAGTTGTTCAAGGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AG-T--AAT-TTCA-----GTCACACT---GGAGTATCCAGAGTAACCATTTAATGA-CCACCTGGCAGCACGACGTTGAACCAATT--CCAATGTGTCTACATTGATTTTG----GTGTGTGTGTC----G----C-ATA-----C------AGC-----GCTTCTCCTGTTGA-GGGCGTAC-AAGCG-TTTTGTAGGCGCATGCTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCCAA---GGTTCGAACTGGATTTGTGGCTACTCTATT----G-A----CATGAGTATTCCATGACGAGGTGCCTGTCAGA--TCAACACCTAGATATCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTTACATGTAAGTAGTTGATAATGTTTTTT-TTTTTACCTT----TGTGGCTTGTATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCTCATGTCCCATTTGAGTGAACGGACT-TGAAATTTATTGAGGTCTGCCTGG-AGTGC-ATTATTGTCTGTTTTTGTGTCGTTTACTGTTAGGTtatttttttggatgta
gi|30 : tAT--ACCTTGATACCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGATGTATAGAGATAGCGACCAA-CT------CAT----------GAAC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGCCCGGCGCAGCTCTAAGTTTCTCCAACCCAGTC--TT--TCT--AA-C--A-T-gc
gi|34 : --AAGACAA---G--GGT-A-A--A-AAACAGCGTTAAAGGTG-------TTAAA-AT--TGTTTGACA-AGATC-AA--ACAAGATCA---AAA-CA-A--TCT--CAA----------------------AATGCTCATA----CTTT-GGTGT---GCTGGAGT---TG-G--CT----AACGGCAAACTg
gi|36 : agCCA-TCTATGAAATCTGTAAAGGCCAGTGTGTCAATG--CTGATTGTTAATCATGTCATCACTGATCGTTAGATATGga
gi|37 : attttgatgtgttatattcgatattctgcaaggctttAGACCAG---AGTTCTGTTTACAGAGGAGGTTACCCTGTT----T-A----TGTGACTGTTCCAcagc
gi|38 : agcagagaaagagtactcaactagcgccttgtatgcagcctctgtaatagctgggttggtGTCTTGCATCAACATCGCATCTGTTGGTAGGGCATTCCACCATAA---AAG--A----GC--CAAAGGAAAac
gi|4 : gtgaatgatggtgccaacagcttatttaaacttattaat-AGGTA-AA--ATCGGGTTA---TAAACA-ACAGTT--TAA----------------------A--GCTTACG----GTTT-GTTGT---G--GGGGA---TG-GTGCC----GACTACAAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATCAATGCAACATCTTTTGGTAGAGCATTCCACTGAAC---AAT-------------GGCCAAAGAAAGAATATT--TGTA----GT----A-AC----CAGTTCCG--GTAT-GAATATATATGT-----T--ATTGAATGACAGT--TTTTTGAGATTCTATTATTTTTTTGGAT-GTAGTCTGGCATTGGAATGGCTACCAG-GT------TGT----------GAAT--------------TATCGTGTAA--AATAGACACATCATGGACGTGTGC----ATCTAAACGAAGTTGTTCAATGGACCTCCAACCTAG-C--TT--AGT--AGTC--A-T-TTCA-----GTCACACT---GAAATATCCAGAGTAATCATTTAATGATA-AACGGGCCGCACGACGTTGGACCATTT--CCAGTTTGTCTATATTGTTTTTG----GTGTGTGGGTC---------CCATA-----CAGCGGTAGC-----A-TACTCTAGTTGA-GGACGTA-CAAGCG-TTTTGTATGCGCATGCTCTTAC-CTTAGGAGTGTTGGT-CC--TGATGTTCACTTTCAGAAAGCCCAA---GGTTCGACCCGCATTTGTGACTACTCTGTT----G-ACATTCATGAGTATTCCATTACAAGTTGCCCGTCAGA--TCCACACTTAGATATCGAGCATTGCTTA-CTGTCTCTAGTACTTGTCCATGTAGCATGTAAGTAGTTGGAAATG-----T-TTTTTGCCTT----TGTGGCTTATATTACTTGGCACTTGGAAGGATTGAAGCACATGTCCAATTTGAGTAACCAGTCT-TGAAGTTTATTGAAGTCTGTC---------------TGTCTGT------GTCGTTTATTGTTAGGTAat
gi|40 : agtATCTATCT-CTTC--TTTCTGCTGCACACCATCACGG------G--TA------ATTTT---G--AGCAGTTCCGC
gi|41 : TATATATCT-ATAT--ATTTTGCTACACGCTTTCACAG------GCATA------A--TT---G--AGCAGATAAGCG--G-C-GT-ATCT-ccctttgtttgtaagtaaagaaa
gi|42 : TATCTGTCT-TTGC--ATATC-CCACATGCCTTCAGAG------GTATA------A--TC---G--GGCAGCGGTGCG--T-atttgtactcaa
gi|43 : CTATCCATCG-TCAT--ATTT-GCCACATACCTTCACAT------TCATA------A--TC---T--GGCAGCTGC
gi|44 : -GTCTACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAGat
gi|45 : TACACCAAGATAGCGAGCATT-CTCAGTTGTCTTTAGAACCTGTCCATGAAG
gi|5 : TCTGTCTATTT-TCAT--AGTTTGCCAGACGCCCTCACAGTCAAAGGCATA------A--TC---C--GGCAGCTGTGTG--T-C-AT-GTCT-TAAATCAGTAGAAAAG----AAAGGA-AA-AGCACAATA--AG--AAA---G--GGT-A-A--A-A------------GGTG-------TTAA---T--AGATTGGCA-ACATA-AA--AACAG-TTA---AAACCA-A--TCT--CAA----------------------TATGTTAACG----GTTT-GGTGT---GCTGGAGC---TG-G--TT----AACTGCAAGCTTGAATGATTTAAAGTCTTGCAGCAATAAAACATCTACAGGTAGAAAGTTCCACTGTACTAGTAT--A----GT--AAAAGGGAAAAATCAGTGAC--TATA----TT----ACAT----G----CTT--ATAT-GTCTCTG---GAAGA-AT--ATT--ATAATAAT--A
gi|5 : A----GTC---A-AT----C----CCA--GTGT-GATTCTGTT--AACA-ATTAATGGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCTGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATAGGAACCAA-CT------TAT----------AAAC--------------AATCTTATAA--AGAAGGCATA-----AATGTG--CATAGATCTGCCTGACACTGCTCC-AGCTTCTCCAACCTAATC--TT--TCT--AA-C--A-T-GTCA-----GTTACAAT---GGAGTAATGGGAACAGTCATTT-ATGGTCCAG----------ATTGTTGTA--GTTTTACC--TTTGTAAATAT---------------------TC----A----AC-TG-----C-----TTGC-----A-TACTCAAGCTGG-GGGTGAACAAAG-GTTTTTGTAAGCACGCTTTCTGAT-CTTTGAGGCCTTTAC-CTGACGATGTTTCTCTTCACAAAATCGAGGTAGATACTGACTGCA---------ACCCTGTC----T-A----TGAGGGTtacataagtaagtcaatcccagtgtgattctgttaacaattaatggagtgacaataccttgatatcctgtggttagcttcaaagtaatgaggtatagagataggaaccaacttataaacaatcttataaagaaggcataaatgtgcatagatctgcctgacactgctccagcttctccaacctaatctttctaacatgtcagttacaatggagtaatgggaacagtcatttatggtccagattgttgtagttttacctttgtaaatattcaactgcttgcatactcaagctgggggtgaacaaaggtttttgtaagcacgctttctgatctttgaggcctttacctgacgatgtttctcttcacaaaatcgaggtagatactgactgcaaccctgtctatgagggt
gi|6 : tctgtctattttcatagtttgccagacgccctcacagtcaaaggcataatccggcagctgtgtgtcatgtcttaaatcagtagaaaagaaaggaaaagcacaataagaaagggtaaaaggtgttaatagattggcaacataaaaacagttaaaaccaatctcaatatgttaacggtttggtgtgctggagctggttaactgcaagcttgaatgatttaaagtcttgcagcaataaaacatctacaggtagaaagttccactgtactagtatagtaaaagggaaaaatcagtgactatattacatgcttatatgtctctggaagaatattataataatatacataagtaTGT---G--GGGGA---TG-GTACC----ACCTGCGAGTTTAAACTTATCGAAGTCTCGCATTAATGCAACTTTTTTTGGTAGAACGTTCCTCTGAAC---AAT--G----GCCAAGGGGGAAAAAAAGAATATT--TGTA----GT----A-GT----CAGTTCCA--GTAT-AAATTTGTTTATAAG-TT--ATTGAATGACAGT--ATTTTGAGATTCTAT--TT---TTTTAT-TTAGTCTGGCATTGGATTGGCTACTAG-GT------TGT----------GTAT--------------TATTTTGTAA--AACAGACACA-----AGCGTG--C----ATGTGAACAACGTTGTTCAAGGGACCTCCAGTCTAG-C--TT--AGC--GGTC--A-T-TTCA-----GTCGCACT---GGAGTATCTAGAGTAATCATTTAAAGA-CCAACGGGCCTCACGACGTTGGACCATTT--CCAATTTGTTTGCATTGTTTTTG----GTGTGCGGGTC---------CCATACAGCTC-----TACC-----A-TACACCAGCTGA-GGGCGT----AG---------AAGCGCATGCTCTTAC-CTTAGGTGTGTTGGT-CC--TGATGTTCCTTTTCAGGAAGCCAAA---TGTTCGACCTGCATTTGTGGCTACTCTGTTGACATGA----CATGAGTATTCCATGACAAGTTGCCTGTCAGA--TCTACACCTAGATACCGAGCACTGTTTA-CTGTCTCTAGTATTTGTCC
gi|7 : tGT-A-A--ATA--TAATGTAGAAGGTG-------TTAAA-AT--AGTTCGACA-AGATA-AA--AGAAGGTTA---AA---------CT--C-----------------------------TCATA----GTTT-GGTTT---GCTGGAGC---TG-G--CT----ATCTGCAAGCTTGAA-GGAT----------------TACAACATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGTAC---GAT--A----GT--AAGTTGGAAGAAAGAACACT--TGTA----CT----A-GT----C---------------AACCT------------------AGTGCCAAT--ACCTTGATACCCTGTAGTTAGCTTCAAC-GTAATAACGTATAGAAATAGCGACCAT-CT------CAT----------ATTT--------------AATCTTA-AA--AGGTGGCATA-----CGCGCG--C----ATATGCCCGAC--TGCTCTAATGTTGTCCAACTTAGTC--TT--TCT--AG-C--A-T-GTC----------CA----------AATGGGA--AATTATTTA-TGGTCCATCGCTCTGCACGTCTCTGAATTCATT--CAAGTTTGTCAATATTGGACTTG----G---GTGAGTC----AAAA-TCGTG-----T-----TGGT-----A-TACTGTAACTGT-GGG-GAACTAAG-G-TATTGTAGCCAACCTCTGTAAT-CTTAGGGGACTTTAC-CT--TGATGTTCTTCTTGACAAATTCTAG---GGAGCTGTTGGCCTTGGCTGCTATCCTGTC----T-A----TGTAGGTGTTTCATGGTATGTTATTTG--AGGTGGCTACCCCAAGATAACGAGC
gi|8 : TATCTATCT-TTAT--ATTTCGCCACATGCCTTCACAG------GAATA------A--TC---G--GGCAACTGCGCAATTAT-GT-GTCT-TATAGTAATAGAAAGAG--AAGAAGT-AA-AGCATAATA--AGGAAAA---G--GGT-A-A--A-AA-TAGTGTTAATGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTGT---GCTGTAGC---TG-A--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTCTTACAGGAGTACA---TCTGCAGGTAACAGGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGTAAGAATGAATACT--TGTA----GT----A-AT----CAACCCTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--ATAGAGTGACAAT--ACCTTGATATCCGGTGGTTAGCTTCAAA-GTAATGAGGTATAGAGATGGCCACCAA-CT------CAT----------GAGC--------------AATTTTGTAA--AGGAGGCATA-----AAAGCG--C----ATCTGCCCGGCACTGCTGTAAGGTTCTCCAACCCAGTC--TT--TTT--AA-C--A-T-GTTA-----GTAGCACT---GGAGTAATGGGAATAATCATTC-ATGGTCCAGCGTGCTGCA-GTCTCTGAACTCTTT--CAAGTTTGTCAATATTGGACCTG----TTGTGGGGGTC----tctctc
gi|9 : CTATCTATCT-TTAT--ATTTTGCCACACGTCTTCACAG------GCATA------T--TC---G--GGCAGCTGCGCG--T-T-GT-GTTT-TATATTAATAGAAAAAT--AAAAAAT-AA-ACCATAATA--AGGAAAA---G--GAT-A-A--A-AA-TAGTGTTAGAGGTG-------TTAAA-AC--AGTGCGACA-AGATA-AA--AGAAGATTA---AAAACA-A--ACT--CAA----------------------AATGCTCATG----GTTT-AGTAT---GTTGTAGC---TG-G--CT----AACTGCAAGCTTGAATGAATCAAAGTATTGCAGGAGCACAGCATCTGTAGGAAACGAGTTCCACTGTAC---TAT--A----GT--AAGGGGAAAGAATGAATACT--TGTA----GTTATCA-AC----C----CTA--GTGT-GATTCTGTTTGAAAG-AC--A--GAGTGACAAT--ACCTTGATACCCTATGGTTAGTTTCAAA-GTAATGAGGTATAAAGATGGCGACCAA-CT------CATGAACAATTATGAAC--------------AATTTTGTAC--AGGAGGCATA-----AACGCG--C----ATCTGTCCGGCGCTGCTC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGATGGTGCTGACAGCAAGTTTAAACTTGTCAAAGTATTGCACCAACACATCTTTTAGTAGTACATTCTACTGAAGAGCCAAAGGAAAAAAAGAATATTAATTTTGTAACAGTCGGTACAAGTATGAATTTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TTCTATAGTTGACTGAGTTGCAGTATTTTGAGATTCCGTTGTTTATGATATAGCTGGACATTGGAATGGCTAGAAGGCTGTGAGAATTTATAGACATTTAGCATCTGAATGATATTGTTCAAGGTACCTCCTGAACT
Unaligned ( gi|33 ): ACACCCTAACAGGTAATTTTAAGCAGTTGTGCTGTAAATAGGAATAGTTAAAAGTAAAAAGTAGAAATAGTTTAAGTAAAGTTGAAGAATATTATAATTCAGTGTGCAATAGGTAAAATTAGGTTAAAACAACA
Unaligned ( gi|35 ): AGTATGTGGAGATTCTATTGTTTCTTTGTATATACTTTGGCATAGGAATGAATGGCTACTAGGCTGGGATTATTTTGAAAATAAATTTAACTTTAGCATGCATCTGAATGATGTTGTCAA
Unaligned ( gi|39 ): GGAAAAACAAAGGATCATTTGTAGCAGTCAGTTCGTGTATGAATTGGTTTGATATGGATACGTATTGGATGCATATTTTTAGA