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Reference ( gi|1 )            :     AATTATGTGGTAGTGTGTATTTTGACTCCAAGCGATGTTAAC--TTTTATAAGATCT----GTGTATATTTATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACTTCCCAAATATG-GTATTG---------------AAT-A-T-----TGG------AA----A-TAATGTATTAATC-T--TG-TG---ATTGGTCAGTTACACA-GG---TCATTCCGTTATATAAAATTTCATTGG---------------TC--------------CAAAATGGTATAA-ATACTAGATTTTAA-ATAGT--AATA-ACTGTAGGCAGTCAATAATGAAATTT-CA--AAGTGAATAAGTAGTAAAA---TAAATAAGTGTTG---AGGTTGGATTTGGAAAT---------------------TT-------------------TTTAATTTTATGATGTTGTAAGGATGACAAATGTGAAGTACATATCAAATTGTTTCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGAAACATAATGAATATTACTGAATTTGTGTTATTTATTAGTT-TTTT-ATACACTTGTATTGGAATCATAAAGCTTGAATATTATTTTACCACA--GTACTCTACAACTATTAATTGTTGATTACGGTTTA-TAGAATATATGTAAATGTGATTTTTTAAA-ATGT----------ATGTGTGTAAATA---------------ACTACGTAATTATTATTTATGTAATAAAA-------------------CACATATAATACAG--AAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCAGTGTATCTGAATTCAAAACATT--GATGGAAATCTGTGAGAAAT---ATTC---ATAGAGTAAAT--ATTAATATATTGTAATGTTGTATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAAATGCAGATTTGATTTATAT
gi|12                         :     AATTA-ATGACAGCTTGTATCTTACCACTGAGTAATGCTTAC--ATTTACAAAATCT----GAGTATAATTATTATAAGCAGTGTTGTGTGA------AAAAA---GTATTT-----------------T-T-T-----TGT------AA----A--AATGTAT--GTT-T--TGTTC---ATTGGCTAGTTACACT-GG---TAATTATGGTATA
gi|14                         :        TGTGTGGTAGTGTATATTTTGACACTGGGTGATGATTAC--TTTTACAAGATCT----GTGTATATTTA-TTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTGT----TATGAATATTG---------------AATCACT-----TTA------AA----A-TAATc
gi|6                          : gtaatacaATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTTACAAAATCT----GTGTATATTCA-ATTTAGCTGTGTTGTGTAACTTTTCAAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAAT-A-TTCATATAG------AAT---A-TAATGTATTATTC-G--TGTTG---ATTGGTCAGTTATATA-GATTTTCATT-GGTTGTTTGGTCTTT-ACC-----------------TC--------------CAAAACAGTATAATATA--AGAATTTAA-ATAGT--A------TTTAGTCAGTC--TAA-GAGGTTT-TACTAA---AATAACCAGTAAACTCTTAAATAA
gi|2                          :                                   AACGATGTTAAC--TTTTACAAGATATATATGTGTATATTCATTTT-AGCTGTTTTGTGTAGGT-CTTGAACATG-GTGTTG---------------AAT-A-TGGAT-TGGGTCAAAAAGAGCA-TAATGTATTAATT-TATTG-TG---ATTGGTCAGTT-TAAATGG---TCATTCAGTTATATACAATTTCATTGG---------------TTGAAGTCTTTACCTACAAAATAGTATAA-ACAT---ATTTGAATATAATTGAATATATTGTGGA--------AATGAGTTGTGCT--AAG---ATAAATA-----A---TAAATAAGTGCTGTTTAAG--GAATTTGGAAATATTCGATGAGTGTAACTTATATT-------------------TTTA-TTTTATAAAGCTGTAAAGATCACAAATTTTAAGTACATATCGTATTGTTGCTATGTTATTATTCAATGTTGCATATAAGTCAAACAGAATGAATATCACTG-ATTTTTGTTATCAATTAGTT-TTTGAATGTTCTTGGATTGAAACCCTAAAGCTTGACTAT--TTGTATCATAATATACTCTACACCTATTAA--------TAC-GTTTACCAGAATATACGTAAATGTGAACTTGTAGGTGTGTCCGTGCGTACATCTGTGTTAATA---------------ACTACATAATTATCTTTGATGTGATGTAA-------------------CATATATAAGACAG--AATTGGATATGTGTCCATTCGTCCGCATATCTAAATTTAAGTAATT--TATTGAAATCTGT---AAAT---ATag
gi|7                          :                                tacAGTAATGTTAACCGTTTAACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTCC-ATACAAG-GTCTTG---------------AAT-A-TGCAAATAG------AA----AATAATGCA--AATG-T--TA-TTTTCATAGGTCAACAACACT-GG---TCATTACGCTATACAATATATCATTGG---------------TT--------------GAAAattattacattttatcttcaaat
gi|16                         :                                                                                                                                                           tcaacacAATGAATTAATCAT--TT-TG---ATTGGTCAGTTACACT-AG---TCATTCCGTTATATACAATgcatttacttccaaaacagttataaatatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                       ACT-GG---TCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCTGTAGGGCTTTACCTC--------------CAAAACAGTATAA-ATATTAGAATTTCA-ATAGT--A------TTTAGTCAGTCAAAAGTGAAATTT-CG--AAGTGA-TA--CAGTAAAA---TAAATAAGTGTTA---AATACGGATTTGGAAAT---------------------TTGGGATGAGTACAACTTATTTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTTA-ATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCG-TAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-Aatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATTAATTGTTGAATACGTTTCA-TAGAGTATATGTAAATGCGAGTTTT-AAA-ATGT----------ATGTGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAAACTATGTAATTATTATTGATGTGATAAAG-------------------GACTTAGA---CAG--AAAT--ATGTGTGTTCATGGGTCCGCGTATCTAAATCTAAGACATT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataacgatgttattatttttgatgagatgtaacttgcataggacagatatatatgtggtcatgcgtctacgtatcttaatttaagacatttacggaaatctgtgaagaatatttatagagtgaacatttatatgttgtaatgttatatttccatatagaatttataaggaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATA---------------ACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAA-------------------CTTGCATAGGACAG--ATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATT--TACGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGTGAAC--ATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       actggtcattctgtatatacaatttcattggctgtagggctttacctccaaaacagtataaatattagaatttcaatagtatttagtcagtcaaaagtgaaatttcgaagtgatacagtaaaataaataagtgttaaatacggatttggaaatttgggatgagtacaacttattttttattttataatgctgtaaagatgacaaatgcaaagaacatatcaaattgctcctatgttattagacattgttacatgtaaatgaaacagaatgaacattactgaatttgtgttattaattagtcatttaatacacttgcgctggacgcctaaagcttgaatattgttttaccataatgcactctacaactattaattgttgaatacgtttcgtagaatgtatgttaatgtgaattttaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATGTAATAAAAGTGAGAATTCAATTCAATTCAAATGTAA-A-AGTTAAAT--GTGTATATATATGCATTTGTGTGTGTGAATCGAATACACT--TATGGAAATTGGTAAGAAAT---ATTC---ATAGAGTGAAT--ATGTATGTATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTACAACATTTAGATGCAGGTGT-TAAAAAGTCACATTCTCCATTGAGT---TCGATTAA-ATATTGAAATGTTATATTTCCATATAGAAACTATAAGGAAAATGTAAATTTGCTTTATAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATATaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ATATTTCCCCGCAAATTTAAACTATGTAATGAAAATAACGCCAATTTTCGATGAGGGGTTTCTTTATATTGTCAGTGTATGTACTTGATGTACAAATATGACATATTGTTTCTTTTTAACTATATATAGGATAGATTGAGTGTTTGTGAAATAGTTTAAAACAGTTCACCATCATAGTACCATATAATTGTAAGTGACATGTATTCTTTATTGCAATGTTTATCGTATTTATTGTACCACTTATTATTGCTCTTAGCTATAATGATGATTTAAATATAATAAAATGTTAAATTGTGTAAAGAATTATGAGCAAAAGATATACTCAGTTTAAAATCAGCATAATTGATTAAATCATTGTAATGAAATGTAATATTTATTATAATGTATTTTAAGTGTGTTTTGTATATATGGGATAGTAAATGTGATACATTATTACTCTGTATTTA
Unaligned ( gi|9 ): GTATTGAATGTGTAATATATGTAATAAATTGTTACTCTGTATATATTATATGTAATGTTATATGTATTTTCAGTGATAAAAATGCGGCAAATAAAATTGTATAATGAAGAAAGTCTGTAAAAAGTTGTAAATCAAATAACCAGGACTCCATAGAGAGAGTTAACCCCGGTTACATAT
Unaligned ( gi|10 ): ATATATTTTAAATATGTTTTAGATATGTTTTAATATATATATGATAAAAAGTTACTACATTGTATGTATTTATGTAAAATGTTGTATGCTTTTTTTGTCAGTGATGACATGTGATGAAACATGAATGATTAAAGAAATGAGATAAAGAAACATTGTGGGAGGTTTTAT
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Reference ( family-3435 )     : AATTATGTGGTAGCGTGTATTTTGACACTGAGTGATGCTNAC--TTTTACAAGATCT----GTGTATATTTATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTCT-AAACATG-GTATTG---------------AATATGCATAT-GG------AA----ATAATGTATTAATCT--TG--TTGATTGGTCAGTTACACTGGTCATTCCGTTA--TATACAAT-TTCATTGG---------------TC--------------CAAAACAG-TATAAATA-T-A---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAA---T---GAGNTTT--CNAAG-AATAA-CAGTAAAA---TAAATAAGTGCTGTTTAANACGGATTTGGAAATATTCGATGAGTGT--AACTTATATTGGGATGAGTACAACTTATTTTTNATTTTATAANGCTGTAAAGATNACAAATNCNAAGNACATATCGNATTGCTNCTATGTTATTANNCANTGTTGCATGTAAGTNAAACAGAATGAACATCACTGAATTTNTGTTATCAATTAGTCATTTGAATGCNCTTGCGCTGGANNCCTAAAGCTTGANTATTGTTNTACCATAATGCACTCTACANCTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATATACGTAAATGCGAGNTTTTAAA-A--------------------TGTCCGTG--------CGTACATNTGTGTCAATAACTACGTAATTATTTTTGATGTGATGNAACACGTATAAGACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCCGCGTATCTAAATTTAAGACATTTA--TGGAAATCTGTAAAAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATTTATATATTGTAATGNTGTATCTCCATATAG-AA-CCATAAGGAANATGCATAGTAGATTTATAT
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gi|15                         :                                         gtaatacaACAATATCT----GTGTATATACATTTTT----------TGAAATGCCT-ATACATG-ATGCTG---------------AATTCAAATA--GA------AA----ACAATGCA
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gi|2                          :                                  GATGTTAAC--TTTTACAAGATATATATGTGTATATTCATTTT-AGCTGTTTTGTGTAG-GTCTTGAACATG-GTGTTG---------------AATATGGAT-T-GGGTCAAAAAGAGCATAATGTATTAATTTATTG--T-GATTGGTCAGTTTAAATGGTCATTCAGTTA--TATACAAT-TTCATTGG---------------TTGAAGTCTTTACCTACAAAATAG-TATAAACA-T-ATTTGAATATAATTGAATA-TA-----TT--GT--GGAAA---T---GAGTTGTG-CTAAG-A-TAA-----ATAA---TAAATAAGTGCTGTTTAAG--GAATTTGGAAATATTCGATGAGTGT--AACTTATATT--------------------TTTATTTTATAAAGCTGTAAAGATCACAAATTTTAAGTACATATCGTATTGTTGCTATGTTATTATTCAATGTTGCATATAAGTCAAACAGAATGAATATCACTG-ATTTTTGTTATCAATTAGTT-TTTGAATGTTCTTGGATTGAAACCCTAAAGCTTGACTAT--TTGTATCATAATATACTCTACACCTATT--------AATACGTTTACCAGAATATACGTAAATGTGAACTTGTAGGTG--------------------TGTCCGTG--------CGTACATCTGTGTTAATAACTACATAATTATCTTTGATGTGATGTAACATATATAAGACAGAATTGGATATGTGTCCATTCGTCCGCATATCTAAATTTAAGTAATTTA--TTGAAATCTGT-AAATAT---ATTatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacaacTTTACAACATTTAGATGCAGGTGT-TAAAAAGTCACATTCTCCATTGAGTTCGA----TTAAATATTGAAATGTTATATTTCCATATAGAAA-CTATAAGGAAAATGTAAATTTGCTTTATATattacattttatcttcaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                               ACTGGTCATTCTGT-A--TATACAAT-TTCATTGGCTGTAGGGCTTTACCTC--------------CAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGTGATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG---TTAAATACGGATTTGGAAAT-----------------------TTGGGATGAGTACAACTTATTTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAG-AATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
gi|6                          :     ATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTTACAAAATCT----GTGTATATTCA-ATTTAGCTGTGTTGTGTAACTTTTCAAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAATATTCATAT-AG------AAT---ATAATGTATTATTCG--TG--TTGATTGGTCAGTTATATAGAT--TTTCATTGGTTGTTTGGTCTTTACC-----------------TC--------------CAAAACAG-TAT-AATA-TAA---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCTA---A---GAGGTTTTACTAA--AATAACCAGTAAACTCTTAAATAAa
gi|7                          :                         ACAC--AGTAATGTTAACCGTTTAACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTCC-ATACAAG-GTCTTG---------------AATATGCAAATAGA------AA----ATAATGCA--AATGT--TATTTTCATAGGTCAACAACACTGGTCATTACGCTA--TACAATAT-ATCATTGGTTGAAAGCATTTACTTC--------------CAAAACAGTTATAAATA-T-A---ag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcaAAAT--GTGTATATATATGCATTTGTGTGTGTGAATCGAATACACTTA--TGGAAATTGGTAAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATGTATGTATTGTAATGGTGTATCTTCATATAG-AA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3435 )     : AATTATGTGGTAGTGTGTATTTTGACACCGAGTGATGTTNAC--TTTT------ACAAGATCT----GTGTATATTCATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTCT-AAACATG-GTATTGAA---------------TAT---------CATAT-GGAA-ATAATGTATTAATCT--TG--TTGATTGGTCAGTTACACTGGTCATTCCGTTATATACAATTTCATTGG-T------G-A----G---T--TTAC-TCCAAAACAG-TATAAATA-T-A---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAA---T---GAGATTT--CNAAG--AATAA-CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAA-TA-GGATTTGGAAAT---A---GATGAGTGTAGTTGATTGGAAACTTTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCGAAGTACATATCGAATTGTTNCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGAAACAGAATGAATATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTT-TTT-AATACACTTGNATTGGAANCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGTACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATATATGTAAATGTGANNTTTTAAA-A--------------------TGTNCGTG--------CGTACATCTGTGTNAATAACTACGTAATTATTNTTGATGTGATGNAACACGTATAAGACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCCGCGTATCTGAATTTAAGACATTTA--TGGAAATCTGTGAAAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATTTATATATTGTAATGTTGTATTTCCATATAGAATCTATAAGGAANATGCANANTNGATTTATAT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                    ACTGGTCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCT------GTA----GGGCT--TTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGT-GATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAATACGGATTTGGAAATTTGG---GATGAGTACAACTTATT--------TTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
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gi|2                          :                                  GATGTTAAC--TTTT------ACAAGATATATATGTGTATATTCATTTT-AGCTGTTTTGTGTAG-GTCTTGAACATG-GTGTTG---------------AATA-TGGATTGGGTCAAAA-AGAGCATAATGTATTAATTTATTG--T-GATTGGTCAGTTTAAATGGTCATTCAGTTATATACAATTTCATTGGTTG--AA---G---TCTTTACCTACAAAATAG-TATAAACA-T-ATTTGAATATAATTGAATA-TA-----TT--GT--GGAAA---T---GAGTTGTG-CTAAG---ATAA-----ATAA---TAAATAAGTGCTGTTTAAG---G---AATTTGGAAAT---ATTCGATGAGTGTAACTTATATTTTTATTTTATAAAGCTGTAAAGATCACAAATTTTAAGTACATATCGTATTGTTGCTATGTTATTATTCAATGTTGCATATAAGTCAAACAGAATGAATATCACTG-ATTTTTGTTATCAATTAGTT-TTTGAATGTTCTTGGATTGAAACCCTAAAGCTTGACTAT--TTGTATCATAATATACTCTACACCTATT--------AATACGTTTACCAGAATATACGTAAATGTGAACTTGTAGGTG--------------------TGTCCGTG--------CGTACATCTGTGTTAATAACTACATAATTATCTTTGATGTGATGTAACATATATAAGACAGAATTGGATATGTGTCCATTCGTCCGCATATCTAAATTTAAGTAATTTA--TTGAAATCTGT-AAATAT---ATTatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacaacTTTACAACATTTAGATGCAGGTGT-TAAAAAGTCACATTCTCCATTGAGTTCGA----TTAAATATTGAAATGTTATATTTCCATATAGAAACTATAAGGAAAATGTAAATTTGCTTTATATattacattttatcttcaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                     ACTGGTCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCTG--TA---GGGCT--TTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGT-GATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAATACG---GATTTGGAAATTTGG---GATGAGTACAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
gi|6                          :     ATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTT------ACAAAATCT----GTGTATATTCA-ATTTAGCTGTGTTGTGTAACTTTTCAAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAATATT---------CATAT-AGAATATAATGTATTATTCG--TG--TTGATTGGTCA-----------------GTTATATAGATTTTCATTGGTTGTTTG---GTC-T--TTACCTCCAAAACAG-TAT-AATA-TAA---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCTA---A---GAGGTTTTACTAA---AATAACCAGTAAACTCTTAAATAAa
gi|7                          :                         ACAC--AGTAATGTTAACCGTTTA------ACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTCC-ATACAAG-GTCTTG---------------AATA-TG--------CAAATAGAAA-ATAATGCA--AATGT--TATTTTCATAGGTCAACAACACTGGTCATTACGCTATACAATATATCATTGGTTG--AAAGCA---T--TTACTTCCAAAACAGTTATAAATA-T-A---ag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcaAAAT--GTGTATATATATGCATTTGTGTGTGTGAATCGAATACACTTA--TGGAAATTGGTAAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATGTATGTATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3435 )     : AATTATGTGGTAGTGTGTATTTTGACACCGAGTGATGTTNAC--TTTT------ACAAGATCT----GTGTATATTCATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTCT-AAACATG-GTATTGAA---------------TAT---------CAAAT-GGAA-ATAATGTATTAATCT--TG--TTGATTGGTCAGTTACACTGGTCATTCCGTTATATANAATTTCATTGGTTGN--A---G---T--TTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-T-A---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAA---T---GAGATTT--CNAAGT-AATAA-CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAG---G---GATTTGGAAAT---G---GATGAGTGCAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCGAAGTACATATCGAATTGTTNCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGAAACAGAATGAATATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTT-TTT-AATACACTTGNATTGGAANCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGTACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATATATGTAAATGTGANNTTTTAAA-A--------------------TGTACGTG--------CGTACATCTGTGTAAATAACTACGTAATTATTNTTGATGTGATGNAACACGTATAAGACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCCGCGTATCTGAATTTAAGACATTTA--TGGAAATCTGTGAAAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATTTATATATTGTAATGTTGTATTTCCATATAGAATTTATAAGGAANATGCANANTNGATTTATAT
gi|1                          : AATTATGTGGTAGTGTGTATTTTGACTCCAAGCGATGTTAAC--TTTT------ATAAGATCT----GTGTATATTTATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACTTCCCAAATATG-GTATTGAA---------------TAT-------------T-GGAA-ATAATGTATTAATCT--TG--T-GATTGGTCAGTTACACAGGTCATTCCGTTATATAAAATTTCATTGGT----------------------CCAAAATGG-TATAAATACT-A---GATT----TTAAATAGTAATAACTGTAGGCAGTCAA---TAATGAAATTT--CAAAGTGAATAAGTAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTGAG---GTTGGATTTGGAAAT----------------------T-TTTTAATTTTATGATGTTGTAAGGATGACAAATGTGAAGTACATATCAAATTGTTTCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGAAACATAATGAATATTACTGAATTTGTGTTATTTATTAGTT-TTT-TATACACTTGTATTGGAATCATAAAGCTTGAATATTATTTTACCACA--GTACTCTACAACTATTAATTGTTGATTACGGTTTATAGAATATATGTAAATGTGATTTTTTAAA-A--------------------TGTATGTG------------------TGTAAATAACTACGTAATTATTATTTATGTAATAAAACACATATAATACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCAGTGTATCTGAATTCAAAACATTGA--TGGAAATCTGTGAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--AAATATTAATATATTGTAATGTTGTATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAAATGCAGATTTGATTTATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATTAATTGTTGAATACGTTTCATAGAGTATATGTAAATGCGAG-TTTTAAA-A--------------------TGTATGTGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAAA---CTATGTAATTATTATTGATGTGATAAAGGACTTA---GACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGGGTCCGCGTATCTAAATCTAAGACATTT
gi|12                         : AATTA-ATGACAGCTTGTATCTTACCACTGAGTAATGCTTAC--ATTT------ACAAAATCT----GAGTATAATTATTATAAGCAGTGTTGTGTGA------AAAAA---GTATT------------------TTT---------T---T-GTAA-A-AATGTAT--GTTT--TG--TTCATTGGCTAGTTACACTGGTAATTATGGTATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATATc
gi|14                         :    TGTGTGGTAGTGTATATTTTGACACTGGGTGATGATTAC--TTTT------ACAAGATCT----GTGTATATTTA-TTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTGT----TATGAATATTGA-----------------AT---------CACTT-TAAA-ATAATgtgttaaaactgttaatgtacacacatgacggaattgtttcttttttattttaggataaagctcgagtg
gi|15                         :                        gtaatacaGTAATGTT-----TTTTCATATAACAATATCT----GTGTATATACATTTTT----------TGAAATGCCT-ATACATG-ATGCTGAA---------------T-T---------CAAATAGAAA-ACAATGCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                 AATGAATTAATCA--TT--TTGATTGGTCAGTTACACTAGTCATTCCGTTATATACAATaaagctcactttaacag
gi|2                          :                                  GATGTTAAC--TTTT------ACAAGATATATATGTGTATATTCATTTT-AGCTGTTTTGTGTAG-GTCTTGAACATG-GTGTTGAA---------------TATGGATTGGGTCAAAA-AGAGCATAATGTATTAATTTATTG--T-GATTGGTCAGTTTAAATGGTCATTCAGTTATATACAATTTCATTGGTTGA--A---G---TCTTTACCTACAAAATAG-TATAAACA-T-ATTTGAATATAATTGAATA-TA-----TT--GT--GGAAA---T---GAGTTGTG-CTAAG---ATAA-----ATAA---TAAATAAGTGCTGTTTAAG---G---AATTTGGAAAT---ATTCGATGAGTGTAACTTATATTTTTATTTTATAAAGCTGTAAAGATCACAAATTTTAAGTACATATCGTATTGTTGCTATGTTATTATTCAATGTTGCATATAAGTCAAACAGAATGAATATCACTG-ATTTTTGTTATCAATTAGTT-TTTGAATGTTCTTGGATTGAAACCCTAAAGCTTGACTAT--TTGTATCATAATATACTCTACACCTATT--------AATACGTTTACCAGAATATACGTAAATGTGAACTTGTAGGTG--------------------TGTCCGTG--------CGTACATCTGTGTTAATAACTACATAATTATCTTTGATGTGATGTAACATATATAAGACAGAATTGGATATGTGTCCATTCGTCCGCATATCTAAATTTAAGTAATTTA--TTGAAATCTGT-AAATAT---ATTatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacaacTTTACAACATTTAGATGCAGGTGT-TAAAAAGTCACATTCTCCATTGAGTTCGA----TTAAATATTGAAATGTTATATTTCCATATAGAAACTATAAGGAAAATGTAAATTTGCTTTATATattacattttatcttcaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                    ACTGGTCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCTGT--A---GGGCT--TTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGT-GATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAATACG---GATTTGGAAATTTGG---GATGAGTACAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
gi|6                          :     ATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTT------ACAAAATCT----GTGTATATTCAATTT-AGCTGTGTTGTGTAACTTTTCAAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAATATT--------CATAT-AGAATATAATGTATTATTCG--TG--TTGATTGGTCAGTTA-----------------TATAGATTTTCATTGGTTGTTTG---G---TCTTTACCTCCAAAACAG-TAT-AATA-TAA---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCTA---A---GAGGTTTTACTAA---AATAACCAGTAAACTCTTAAATAAa
gi|7                          :                         ACAC--AGTAATGTTAACCGTTTA------ACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTCC-ATACAAG-GTCTTGAA---------------TATG--------CAAATAGAAA-ATAATGCA--AATGT--TATTTTCATAGGTCAACAACACTGGTCATTACGCTATACAATATATCATTGGTTGA--AAGCA---T--TTACTTCCAAAACAGTTATAAATA-T-A---ag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcaAAAT--GTGTATATATATGCATTTGTGTGTGTGAATCGAATACACTTA--TGGAAATTGGTAAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATGTATGTATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATAt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                    ACTGGTCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCTG-T--AGGGCTTTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGT-GATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAATACG---GATTTGGAAATTTGG---GATGAGTACAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
gi|6                          :     ATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTT------ACAAAATCT----GTGTATATTCAATTT-AGCTGTGTTGTGTAACTTTTCAAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAATATT--------CATAT-AGAATATAATGTATTATTCG--TG--TTGATTGGTCAGTTA-----------------TATAGATTTTCATTGGTTG-TTTGGT-CTTTACCTCCAAAACAG-TAT-AATA-TAA---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCTA---A---GAGGTTTTACTAA---AATAACCAGTAAACTCTTAAATAAa
gi|7                          :                         ACAC--AGTAATGTTAACCGTTTA------ACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTCC-ATACAAG-GTCTTGAA---------------TATG--------CAAATAGAAA-ATAATGCA--AATGT--TATTTTCATAGGTCAACAACACTGGTCATTACGCTATACAATATATCATTGGTTGAA--AGC-ATTTACTTCCAAAACAGTTATAAATA-T-A---ag
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Reference ( family-3435 )     : AATTATGTGGTAGTGTGTATTTTGACACCGAGTGATGTTNAC--TTTT------ACAAGATCT----GTGTATATTCATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTCT-AAACATG-GTATTGAA---------------TAT---------CAAAT-GGAA-ATAATGTATTAATCT--TG--TTGATTGGTCAGTTACACTGGTCATTCCGTTATATANAATTTCATTGGTTG-N--AGT-CTTTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-T-A---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAA---T---GAGATTT--CNAAGT-AATAA-CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAG---G---GATTTGGAAAT---G---GATGAGTGCAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCGAAGTACATATCGAATTGTTNCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGAAACAGAATGAATATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTT-TTT-AATACACTTGNATTGGAANCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGTACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATATATGTAAATGTGANNTTTTAAA-A--------------------TGTACGTG--------CGTACATCTGTGTAAATAACTACGTAATTATTNTTGATGTGATGNAACACGTATAAGACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCCGCGTATCTGAATTTAAGACATTTA--TGGAAATCTGTGAAAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATTTATATATTGTAATGTTGTATTTCCATATAGAATTTATAAGGAANATGCANANTNGATTTATAT
gi|1                          : AATTATGTGGTAGTGTGTATTTTGACTCCAAGCGATGTTAAC--TTTT------ATAAGATCT----GTGTATATTTATTTTTAGCTGTGTTGTGTAACTTCCCAAATATG-GTATTGAA---------------TAT-------------T-GGAA-ATAATGTATTAATCT--TG--T-GATTGGTCAGTTACACAGGTCATTCCGTTATATAAAATTTCATTGGT------------------CCAAAATGG-TATAAATACT-A---GATT----TTAAATAGTAATAACTGTAGGCAGTCAA---TAATGAAATTT--CAAAGTGAATAAGTAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTGAG---GTTGGATTTGGAAAT----------------------T-TTTTAATTTTATGATGTTGTAAGGATGACAAATGTGAAGTACATATCAAATTGTTTCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGAAACATAATGAATATTACTGAATTTGTGTTATTTATTAGTT-TTT-TATACACTTGTATTGGAATCATAAAGCTTGAATATTATTTTACCACA--GTACTCTACAACTATTAATTGTTGATTACGGTTTATAGAATATATGTAAATGTGATTTTTTAAA-A--------------------TGTATGTG------------------TGTAAATAACTACGTAATTATTATTTATGTAATAAAACACATATAATACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGCGTCAGTGTATCTGAATTCAAAACATTGA--TGGAAATCTGTGAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--AAATATTAATATATTGTAATGTTGTATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAAATGCAGATTTGATTTATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTAATTGTTGAATACGTTTCATAGAGTATATGTAAATGCGAG-TTTTAAA-A--------------------TGTATGTGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAAA---CTATGTAATTATTATTGATGTGATAAAGGACTTA---GACAGAAAT--ATGTGTGTTCATGGGTCCGCGTATCTAAATCTAAGACATTT
gi|12                         : AATTA-ATGACAGCTTGTATCTTACCACTGAGTAATGCTTAC--ATTT------ACAAAATCT----GAGTATAATTATTATAAGCAGTGTTGTGTGA------AAAAA---GTATT------------------TTT---------T---T-GTAA-A-AATGTAT--GTTT--TG--TTCATTGGCTAGTTACACTGGTAATTATGGTATA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATATc
gi|14                         :    TGTGTGGTAGTGTATATTTTGACACTGGGTGATGATTAC--TTTT------ACAAGATCT----GTGTATATTTA-TTTTAGCTGTGTTGTGTAACGTGT----TATGAATATTGA-----------------AT---------CACTT-TAAA-ATAATgtgttaaaactgttaatgtacacacatgacggaattgtttcttttttattttaggataaagctcgagtg
gi|15                         :                        gtaatacaGTAATGTT-----TTTTCATATAACAATATCT----GTGTATATACATTTTT----------TGAAATGCCT-ATACATG-ATGCTGAA---------------T-T---------CAAATAGAAA-ACAATGCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                 AATGAATTAATCA--TT--TTGATTGGTCAGTTACACTAGTCATTCCGTTATATACAATaaagctcactttaacag
gi|2                          :                                  GATGTTAAC--TTTT------ACAAGATATATATGTGTATATTCATTTT-AGCTGTTTTGTGTAG-GTCTTGAACATG-GTGTTGAA---------------TATGGATTGGGTCAAAA-AGAGCATAATGTATTAATTTATTG--T-GATTGGTCAGTTTAAATGGTCATTCAGTTATATACAATTTCATTGGTTG-A--AGT-CTTTACCTACAAAATAG-TATAAACA-T-ATTTGAATATAATTGAATA-TA-----TT--GT--GGAAA---T---GAGTTGTG-CTAAG---ATAA-----ATAA---TAAATAAGTGCTGTTTAAG---G---AATTTGGAAAT---ATTCGATGAGTGTAACTTATATTTTTATTTTATAAAGCTGTAAAGATCACAAATTTTAAGTACATATCGTATTGTTGCTATGTTATTATTCAATGTTGCATATAAGTCAAACAGAATGAATATCACTG-ATTTTTGTTATCAATTAGTT-TTTGAATGTTCTTGGATTGAAACCCTAAAGCTTGACTAT--TTGTATCATAATATACTCTACACCTATT--------AATACGTTTACCAGAATATACGTAAATGTGAACTTGTAGGTG--------------------TGTCCGTG--------CGTACATCTGTGTTAATAACTACATAATTATCTTTGATGTGATGTAACATATATAAGACAGAATTGGATATGTGTCCATTCGTCCGCATATCTAAATTTAAGTAATTTA--TTGAAATCTGT-AAATAT---ATTatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacaacTTTACAACATTTAGATGCAGGTGT-TAAAAAGTCACATTCTCCATTGAGTTCGA----TTAAATATTGAAATGTTATATTTCCATATAGAAACTATAAGGAAAATGTAAATTTGCTTTATATattacattttatcttcaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                    ACTGGTCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCTG-T--AGGGCTTTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGT-GATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAATACG---GATTTGGAAATTTGG---GATGAGTACAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAGAATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
gi|6                          :     ATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTT------ACAAAATCT----GTGTATATTCAATTT-AGCTGTGTTGTGTAACTTTTCAAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAATATT--------CATAT-AGAATATAATGTATTATTCG--TG--TTGATTGGTCAGTTA-----------------TATAGATTTTCATTGGTTG-TTTGGT-CTTTACCTCCAAAACAG-TAT-AATA-TAA---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCTA---A---GAGGTTTTACTAA---AATAACCAGTAAACTCTTAAATAAa
gi|7                          :                         ACAC--AGTAATGTTAACCGTTTA------ACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTCC-ATACAAG-GTCTTGAA---------------TATG--------CAAATAGAAA-ATAATGCA--AATGT--TATTTTCATAGGTCAACAACACTGGTCATTACGCTATACAATATATCATTGGTTGAA--AGC-ATTTACTTCCAAAACAGTTATAAATA-T-A---ag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcaAAAT--GTGTATATATATGCATTTGTGTGTGTGAATCGAATACACTTA--TGGAAATTGGTAAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATGTATGTATTGTAATGGTGTATCTTCATATAGAA--CATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATAt


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacaacTTTACAACATTTAGATGCAGGTGT-TAAAAAGTCACATTCTCCATTGAGTTCGA----TTAAATATTGAAATGTTATATTTCCATATAGAAA-CTATAAGGAAAATGTAAATTTGCTTTATATattacattttatcttcaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                    ACTGGTCATTCTGT-ATATACAATTTCATTGGCTGTA--GGGC-TTTACCTCCAAAACAG-TATAAATA-TTA---GAAT----TTCAATAGTA-----TTTAGTCAGTCAAAAGT---GAAATTT--CGAAGT-GATA--CAGTAAAA---TAAATAAGTG----TTAAATACG---GATTTGGAAATTTGG---GATGAGTACAACTTAT-TTTTTATTTTATAATGCTGTAAAGATGACAAATGCAAAGAACATATCAAATTGCTCCTATGTTATTAGACATTGTTACATGTAAATGAAACAGAATGAACATTACTGAATTTGTGTTATTAATTAGTCATTT-AATACACTTGCGCTGGACGCCTAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGCACTCTACAACTATTAATTGTTGAATACGTTTCGTAGAATGTATGTTAATGTGA-ATTTTAAA-ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNAATAACGATGTTATTATTTTTGATGAGATGTAACTTGCATAGGACAGATAT--ATATGTGGTCATGCGTCTACGTATCTTAATTTAAGACATTTA--CGGAAATCTGTGAAGAAT---ATTT---ATAGAGT--GAACATTTATATGTTGTAATGTTATATTTCCATATAG-AATTTATAAGGAAaatgtacacgatgtacaaatatgatagaattgtttcttttttaatatactggttaaagattgagtgtttgtcaaatttgtctaagcagtcgttcactatcatagtaccgtatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatcttatttattgtaccacgcattgatgctcttagctataatgatgattaaatagaataaactcttaaattgggtaaagaagtataagcaaaagataaactcagtttgaactcagcgaaatatataaaactatacaaaaagcaagctattattaaaattattttaatgtttattataatgtactttaaatgtgtattgtatatgtgatatatgtgataaattgttactctatatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaaaacatgtgataataaaataatatacgagtattaataaacagataatgaagaaacattctaagaaattgtgttcaaatcttcagtgtgctcaaaatagagagtcaccccggttacatatttgt
gi|6                          :     ATGTGGTAGTGTGTATTTTGAAATTGAGTGATGCTCGC--ATTT------ACAAAATCT----GTGTATATTCAATTT-AGCTGTGTTGTGTAACTTTTC-AAATATG-GTATTGAAATTTGATTTGTTCAATATT--------CATATAGAATATAATGTATTATTCG--TGTTG--ATTGGTCAGTTA-----------------TATAGATTTTCATTGGTTG-TTTGGTC-TTTACCTCCAAAACAG-TAT-AATA-TAA---GAAT----TTAAATAGTA-----TTTAGTCAGTCTA---A---GAGGTTTTACTAA---AATAACCAGTAAACTCTTAAATAAa
gi|7                          :                         ACAC--AGTAATGTTAACCGTTTA------ACAATATTT----GTGTATATGTAGTTTTAGATGTGCCATGCAATGTC-C-ATACAAG-GTCTTGAA---------------TATG--------CAAATAGAAAATAATGCA--AATGT--TATTTTCATAGGTCAACAACACTGGTCATTACGCTATACAATATATCATTGGTTG-A--AAGCATTTACTTCCAAAACAGTTATAAATA-T-A---ag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcaAAAT--GTGTATATATATGCATTTGTGTGTGTGAATCGAATACACTTA--TGGAAATTGGTAAGAAAT---ATTC---ATAGAGT--GAATATGTATGTATTGTAATGGTGTATCTTCATATAG-AA-C-ATAAGGAATATGCATAGTAGATTTATAt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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