lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111
lowQualScore : 55555555 33333333333333333333 1111111111111111 1111 1 1111111111111111 11111 111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222 11 777777777 111 000000
lowQualScore : 4 00000000 99 88888888888888888888 999 44 1111111111111111 5 5 0 3333 2 5 5 7 2 2 6666666666666666 33 1 777777 33 2 2 5555 00000 444 5555 3 000000 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 00 33 6 888888888 000 777777 6
lowQualScore : . ........ .. .................... ... .. ................ . . . .... . . . . . . ................ .. . ...... .. . . .... ..... ... .... . ...... . .............................................................................................................................................................................. ... .. .. . ......... ... ...... .
lowQualScore : 7 00000000 55 77777777777777777777 444 66 9999999999999999 7 0 6 1111 5 0 0 5 5 5 8888888888888888 44 5 555555 77 7 7 7777 00000 777 7777 4 555555 6 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 22 88 0 888888888 000 000000 0
consensus : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----C---TGAACGAATGAATGAG--GATNT-------ACGACC-CGTTA--ACA---GCCAGG-------GTCAT-ATTGAGT--CGGGACTGGG-GATGGA-A-A-TGAG-AA---A---AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATA-TGA-A---A----GTCCTGAATT------C-AAAT-CCCAATC-A-TAAA---GAATCN-----AA---GACCTCCN--TATCTT----GACATGGTATTGCGAC--GTCCG--TACCTCATTTACACAN--AAT-AATTGATATGG--TGCGG--AT--TAATGTGGTCGTTTTATGCCACGT-----CCTC-----CNAATCTGAGGAATCT---TG-CCCNTATGCATGGGAGGGTA-------TATATACAGCAGTGGGTA-AA---ATTATGCCC
Reference ( gi|1 ) : GCCTCCATTCTGAATGAATGA----C---TGACTGAATGAATGGG--GATAT-------AGAACC-CATTA--ACA---ACTAGG-------GTCAT-ACTGAGT--AGGGACTGGG-GAT-AA-A-A-TGAG-AA---A---AA--A-TGCCAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATA-TGG-A---A----GTCTTGAATT------C-AAAT-ACGAATCAAATAAA---GGATCA-----AA---GACTGCTT--TATCTT----GACATAGTTTTTTGAT--GCCCA--TAACTCATTTGCACAT--TATAAATTGATATGGAATACAAATAT--TAATGTGATCATTTTATGCAACAT-----CCTC-----CCAATCTGCGAAATCT---TA-CCCCTATGTATGGGAGGGTACA-AATTTATATACAGCAGTAGATATGACTTACTATGCCC
gi|9 : TGAATGAATGAAACACAAAGGAACGAATGCATGGG--AGTTT-------ACGATC-CGTTA---CAGTCACT--G-------GTCAT-ATATAGT--CGGGACTGGG-AATGAA-A-A-TGAG-AA---A---AA--A-AGACAAT--ACTGAATATGAAGA-------A--TA-TG-GT----ACA-TGG-ATGTA----GTC
gi|7 : gaaAACGAATTA----A---TAAATGAATGAATGAG---ATTT-------ACCACC---TTT--ACA---GTCAGG-------GTCAT-ATTAAGT--AGAGAGGCGG-GAT-CA-ACA-TGTT-AA---A---AATGA-TGGTAAT--AATAAGTATGAAGAC---G--A--TA-TC-AG----ATA-T---A---A----------AATT------C-AA------AATTAA----------ATCC-----AA---GATT--TTCATATCGT----GACATGATATTGTGAC--Gcctcccaatttgaacaaaattaacccc
gi|12 : AAAGAAAGA----C---TGACGGAATGACTGAGTGAATGT-------TGTTTCACGTTATAACA---GCCATT-------TTCAT-ATTGAGT--CCGGACTTGG-AATGAA-A-A-TGAG-AA---C---AA--A-TG--------ATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TT-AG----ATG-TGA-A---A----Gaagttcaaatcttattgtcacaa
gi|14 : aatgaatgaatgaaaaGAATGCATTAATAGG--GATAT-------ATGACC-GGTTA--ACA---GCCA---------GTCGT-ATTAATT--CAGGAATGGG-GAT-GA-A-A--AAG-AATGGA---AA--A-TGACAGT--GA
gi|16 : cGAATGAATGA----ATATTATCTTGAGA-CC-CGTAA--ACA---TTCAGG-------GTCAT-ATTAAGTCTA---ACTGGT-GAT-GA-A-A-TGAG-AA---A---GC--A-AGACAAT--A------ATGAAAAT---T--A--CA-TC-AT----A-A-TAC-A---A----GTCCTGcatttatgtatggtaggttggatatagcc
gi|15 : AATGAATTTA--GTTTT-------ATGACC-CATGA--ACA---GCCAGG-------GTCAT-ATTGAAT--AGG-ATAGGG-GATGAA-A-A-TGAG-AA---A---TA--T-TA-CAAT--TATGATCACGAACATTACGGTA--TG-TC-AG----ATA--GG-A---A----
gi|11 : ACC-CATCA--ACA---GCCTGG-------GTCAT-ATTGAGT--TGGGACTGGC-AAT-GA-A-A-AGAG-AA---C---AA--A-TGACAAT--AGGGAAAATGAAGAT---G--A--TA-TC-AGATAAATA-TGA-A---A----GTATTAAATT------C-AAAT-CCCAATC---TAAAATTGAATCC-----AA---GACCTCCT--TGTCTT----AA
gi|3 : ttTTT--ACA---GCCAGG-------ATCATTATTGGTT--AGTGACAGAG-GAA-GACA-A-TGAGTAA---A---AG--A-TGACACT--AATGAA------GAC---G--A--TA-TC-AG----ATATTGA-A---A----GTCCTGAATT------CAAAAT-CCCAATCCAAAACT---GAATCA-----AA---GAC--------A---T----GGTATGG-TATCAGAC--GTCTA--TACCTCATTTACACAA--TAT------ATATG--ATGC----AT--GGATGGGGTAGTTTTATGCCACAT-----TATC-----CAACACTGAGGGATCT---TG-GCAACATGCATAGGAGGA---------TATATATAGTAGTGGtta
gi|8 : tgTTA--ACA---ACCAGGACCCAGGGTCATCACTTGGT--AAGTACT-----AT-GA-ACA-TGAG-AA---A---AA--AATGACAATTTAATGAAAATGA---T---A--A--TAATT-AG----ATA--GG-A---ATTAAGTCCTGCATT------C-AAAT-CTCAACC---TAAAATTGAACCA-----AA---GACCTCCA--TAGCTT----GACATAATATTg
gi|10 : gTTA--ACA---GCCAG---------TCAC-AATGAGT--TCGGACTGAG-GGT-GA-A-AGTGAA-AA---AT--AA--G-TGAAAAC--TAT--ACATGGAAAT---A--A--TA-TC-AG----ATA-TG--------------------T------C-AAAT-ACCAATC--------------CA-----A-----ACCTCTA--TACTTT----TAAGTGGTATTGCGAT--GCCCA--TTCCTGATTAACAC--------AATTAATATGGgcagcatccgt
gi|18 : cTA--ATA---ACCAGG-------GTCAT-ACT-AGT--TGGGACTGAA-GATGAA-A-A-TGAA-AA---ATAAAA--A-----AAT--AACAAACATGAAGAT---G--A--TG-TT-AA----AT------------------TCAAATC------C-AAAT-CCAAAcacatggaaa
gi|4 : A--ACAG--ACCAAG--------TCAT-ATTGAGT--TTGGACTGGG-AATGAA-A-A-TTAG-AT-------------TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--T-----------ATA-TGGTA---A----ATCCGGATGT------C-AAAT-CTCAAT--AACAAA----AATCAATCGCAA---GACCTCCG--TATCTT----G--ATGGTT------------CA--TACCTCATTTCTACA
gi|2 : ctgccAGG-------GTTAT-ATTGAGT--CCTGTATGTA-GAT-AA-ATA-TGAG-AA---A---AC----TGACATT--ATTGAATACGACAAT---G--A--TG-TG-AA----ATA-GGA-A---A----ATCCTGAATTCACAACC-AAAT-CCCAATCTAATACC---AAATCT-----AA---AATTCCCT--TATCTT----GACATGGTATTGCGAC--AACCG--CGTCTTA--TGTATAT--AAC-AATTGCT------TATGAATATGGTAAT-TAATCA--------GACGT--------------------------AGCT---TA-TCCGTACGCATGCAAGGG---------TATATACAGCAGTGAGTA-AA---ATTATGCCCaaagatttgaactttgggtgtattatttctacatttgatagatcttacacatatgcataaaaggataaatatgaaagtgg
gi|5 : tctacgaccttcaTCAT-AGTGATT--CGGGACCCGG-GAT-GGCA-A-TGAA-AA---G---AA--A-TGACAAC--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAAA----ATA-TAA-A---A----GTCACAA-----------AAATCAC-AATC---TAAAATTGAACCC-----AA---GACCACCA--TATCTT----GGCATGGTATTGTGAC--ATACA--TACGTCAGTTACACACAAAATAAA---ACATTG--TGCAG------TAGTGTGGTAGTTCT-TCTAAAATTTATGCCTC-----CAAATCTGAGTAACCT---
gi|19 : GGGACTGGGAGGG-AA-A-A-TGAG-AA---G---AA--T-TGACAAC--AATGACCATGAATAT---GTTAATTA-TC-AG----ATA-CGA-A---A----GTCTTAAAAT------C-c
gi|13 : acatattatcagct-GATGAA-A-A-TGAG-AA---C---AA--A-GGC-AAT--TATATTCGTGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATA-TGA-A---A----GTCTTGAATT------T-AAAT-TC---TAAACTAAA-----ATTT-----AATCTGATT-CTT--CCTCGTCCGGGACA-AGTCTTTT-ATCCGTCCGGCTAACTCA
gi|6 : ATTTTATGTCAGAT-----CTTC-----CCAATCTAAAGAATCCCTATG-CCCCTGTACATGGGAGGGTAgtcgt
gi|17 : tgcaagtcaaacaatccaaagttgagtccaatgagtatttcgacatccataccatatttagaaaaaaaaaataggacatgaaagaggtaATTTTATGCCACGT-----CCTCGATTACC--CCTGAGGAATCTG--TAACCCCAATGCATGGGAGGGTATATAATTtgggagggtattcttagtggattctcagtggtgtattcttagccctattccactggaca
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCCTTGTCCATCTTCAATTAATCAATGGATGGGGTTTCATTTAATAAAT
Alignments
lowQualScore : 333333333 11111 111111 555555555555555555 111 88888888888888888888888888 222222222222222222222 11 11111 111 111111 444444
lowQualScore : 4 888888888 2 999 11111 2 66 4 33 2 2 9999999 5 333 55 9 2 88888 3333 33 0 444 66 33 2 2 5555 2 2 888 0 1 1 3 000000 888888888888888888 55 1 2 1 4 6 777 2 222 44 44444444444444444444444444 9 555555555555555555555 11 44444 555 77 1 44 999999 0 1 444444
lowQualScore : . ......... . ... ..... . .. . .. . . ....... . ... .. . . ..... .... .. . ... .. .. . . .... . . ... . . . . ...... .................. .. . . . . . ... . ... .. .......................... . ..................... .. ..... ... .. . .. ...... . . ......
lowQualScore : 2 000000000 8 444 66666 2 11 1 99 9 9 3333333 0 777 22 1 4 77777 3333 22 8 444 99 44 5 5 3333 5 5 888 5 5 2 3 555555 777777777777777777 00 4 4 4 4 4 888 4 111 99 33333333333333333333333333 3 777777777777777777777 33 33333 777 33 0 22 222222 8 4 555555
consensus : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----C---NGAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GA-A---AGTCCTGAATTC-A------AATCCCAATC--ATAAA-T-G---A---ATCN-AAGACCTCCNTATCTTGACATG-GTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACAAAAN-AATTGA-TATGG--TGC----AT-AATGTGGTAGT----------TTTATGCCACATCCTCC-AAT-----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
Reference ( family-3405 ) : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----C---TGAACGAATGAATGAGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGGAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GA-A---AGTCCTGAATTC-A------AATCCCAATC--ATAAA---G---A---ATCN-AAGACCTCCNTATCTTGACATG-GTATTGCGAC---GTCCGTACCTCATTT--ACACANAAT-AATTGA-TATGG--TGCGG--ATTAATGTGGTCGT----------TTTATGCCACGTCCTCCNAAT-----CTGAGGAATCT---TG-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTA-AA---ATTATGCCC
gi|1 : TGAATGAATGA----C---TGACTGAATGAATGGGGATA----TAGAA--CCCATTA--ACAA-CTAG-G-------GTCAT-ACTG--AGTAGGGACTGGGGATA-AAATGAG-AA---A-AA--A-TGCCAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GG-A---AGTCTTGAATTC-A------AATACGAATCAAATAAA---G---G---ATCA-AAGACTGCTTTATCTTGACATA-GTTTTTTGAT---GCCCATAACTCATTT--GCACATTATAAATTGA-TATGGAATACAAATATTAATGTGATCAT----------TTTATGCAACATCCTCCCAAT-----CTGCGAAATCT---TA-CCCCTATGTATGGGAGGGTACAAATTTATATACAGCAGTAGATATGACTTACTATGCCC
gi|10 : gcctccattcTTA--ACAG-CCAG----------TCAC-AATG--AGTTCGGACTGAGGGTGAAAGTGAA-AA---ATAA--G-TGAAAAC--TAT--ACATGGAAAT---A--A--TA-TC-AG----ATAT-G----------------TC-A------AATACCAATC--------------------CA-A--ACCTCTATACTTTTAAGTG-GTATTGCGAT---GCCCATTCCTGATTA--ACAC------AATTAA-TATGG--
gi|11 : cA--CCCATCA--ACAG-CCTG-G-------GTCAT-ATTG--AGTTGGGACTGGCAATGAAAA-GAG-AA---C-AA--A-TGACAAT--AGGGAAAATGAAGAT---G--A--TA-TC-AGATAAATAT-GA-A---AGTATTAAATTC-A------AATCCCAATC---TAAAATTG---A---ATCC-AAGACCTCCTTGTCTTAAcacatggaaa
gi|12 : ttGAAAGACTGA----C---GGAATGACTGAGTGA--ATG----T-TGTTTCACGTTATAACAG-CCAT-T-------TTCAT-ATTG--AGTCCGGACTTGGAATGAAAATGAG-AA---C-AA--A-TG--------ATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TT-AG----ATGT-GA-A---AGtta
gi|13 : aatgaatgaatgaaaaaaaGATGAAAATGAG-AA---C-AA--A--GGCAAT--TATATTCGTGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GA-A---AGTCTTGAATTT-A------AATTCTAAAC---TAAA---ATTTA---ATCT-GATTCTTCCTCGTC
gi|14 : GAATGCATTAATAGGGATA----TATGA--CCGGTTA--ACAG-CCA----------GTCGT-ATTA--ATTCAGGAATGGGGATGAAAA--AG-AATGGA-AA--A-TGACAGT--GAcgggacaagtcttttatccgtccggctaactcagtcgt
gi|15 : cAATGAATTTAGTTT----TATGA--CCCATGA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AAT-AGGATAGGGGATGAAAATGAG--A---A-AT--A-TTACAAT--TATGATCACGAACATTACGGTA--TG-TC-AG----ATAG-GA-A---catttatgtatggtaggttggatatagcc
gi|16 : GAATGAATGAATATTATCTTGAGA--CCCGTAA--ACAT-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTCTA-ACTGGTGATG-AAATGAG-AA---A-GC--A-AGACAAT--A------ATGAAAAT---T--A--CA-TC-AT----A-AT-AC-A---AGTCCTG
gi|17 : T----------TTTATGCCACGTCCTC--GATTACCCCTGAGGAATCTG--TAACCCCAATGCATGGGAGGGTA------TATA-ATTGCAGTGTGT
gi|18 : aTA--ATAA-CCAG-G-------GTCAT-ACT---AGTTGGGACTGAAGATGAAAATGAA-AA---ATAA--A---AAAAT--AACAAACATGAAGAT---G--A--TG-TT-AA----AT-T-CA-A---A-TCC-AAATCC-A------AAgtattcttatccctatcccagagggc
gi|19 : CAT-ATTATCAGCTGGGACTGGGAGGGAAAATGAG-AA---G-AA--T-TGACAAC--AATGACCATGAATAT---GTTAATTA-TC-AG----ATAC-GA-A---AGTCTTAAAATC-
gi|2 : aTC----TACGA--CC--TT----CA----AG-G-------GTTAT-ATTG--AGTCCTGTATGTAGATAAATATGAG-AA---A-AC----TGACATT--ATTGAATACGACAAT---G--A--TG-TG-AA----ATAG-GA-A---AATCCTGAATTC-ACAACCAAATCCCAATCTAATACC---A---A---ATCT-AAAATTCCCTTATCTTGACATG-GTATTGCGAC---AACCGCGTCTTATGT----ATATAAC-AATTGCTTATG-------------AATATGGTAAT----------T-----------------AAT-----CAGACGTAGCT---TA-TCCGTACGCATGCAAGGG--------TATATACAGCAGTGAGTA-AA---ATTATGCCC
gi|3 : GTTT--ACAG-CCAG-G-------ATCATTATTG--GTTAGTGACAGAGGAAGACAATGAGTAA---A-AG--A-TGACACT--AATGAA------GAC---G--A--TA-TC-AG----ATATTGA-A---AGTCCTGAATTCAA------AATCCCAATC--CAAAACT-G---A---ATCA-AAGAC------A---TGGTATG-GTATCA-GAC---GTCTATACCTCATTT--ACACAATAT------A-TATGA--TGC----ATGGATGGGGTAGT----------TTTATGCCACATTATCCAACA-----CTGAGGGATCT---TG-GCAACATGCATAGGAGG--A------TATATATAGTAGTGGG
gi|4 : tCTGCCA--ACAGACCAA-G--------TCAT-ATTG--AGTTTGGACTGGGAATGAAAATTAG-AT-----------TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-T----------AT-GGTA---AATCCGGATGTC-A------AATCTCAATA--ACAAA---A---ATCAATCGCAAGACCTCCGTATCTTGA---------TG-------GTTCATACCTCATTT--CTACAAAAG-ATTTGA------------------ACTTTGGGTGT----------ATTAT------TTCTAC--AT-----TTGATAGATCT---TA-CACATATGCATAAAAGGATA------AATATGAA--AGTGG
gi|5 : TCAT-AGTG--ATTCGGGACCCGGGATGGCAATGAA-AA---G-AA--A-TGACAAC--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAAA----ATAT-AA-A---AGTCACAA-----A------AATCACAATC---TAAAATTG---A---ACCC-AAGACCACCATATCTTGGCATG-GTATTGTGAC---ATACATACGTCAGTTACACACAAAAT-AA--AA-CATTG--TGCAG----TAGTGTGGTAGTTCTTCTAAAATTTATG------CCTCCAAAT-----CTGAGTAACCT---
gi|6 : ATGAGTATTTCGAC---ATCCATACCATATTT--AGAAAAAAA-AA------ATAG--GAC----ATGAAAGAGGTAAT----------TTTATGTCAGATCTTCCCAAT-----CTAAAGAATCCCTATG-CCCCTGTACATGGGAGGGTA------Tc
gi|7 : tgcaagtcaaacaatccaaagttgagtccaAACGAATTA----A---TAAATGAATGAATGAG-ATT----TACCA--CC--TTT--ACAG-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTAGAGAGGCGGGATCAACATGTT-AA---A-AATGA-TGGTAAT--AATAAGTATGAAGAC---G--A--TA-TC-AG----ATAT-AA-A---A--------TTC-A------AA-----ATT--A-----------A---ATCC-AAGATTTTCATATCGTGACATG-ATATTGTGACGAAGTTCAAATCTTATTG--TCACAgggagggtattcttagtggattctcagtggtgtattcttagccctattccactggaca
gi|8 : GTTA--ACAA-CCAG-GACCCAGGGTCATCACTT--GGTAAGTACT----ATGAACATGAG-AA---A-AA--AATGACAATTTAATGAAAATGA---T---A--A--TAATT-AG----ATAG-GA-ATTAAGTCCTGCATTC-A------AATCTCAACC---TAAAATTG---A---ACCA-AAGACCTCCATAGCTTGACATA-ATATTGCAGC---ATCCGTa
gi|9 : TGAATGAATGAAACACAAAGGAACGAATGCATGGGAGTT----TACGA--TCCGTTA---CAG-TCACTG-------GTCAT-ATAT--AGTCGGGACTGGGAATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-AGACAAT--ACTGAATATGAAGA-------A--TA-TG-GT----ACAT-GG-ATGTAGTCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCCTTGTCCATCTTCAATTAATCAATGGATGGGGTTTCATTTAATAAAT
Alignments
lowQualScore : 333333333 1111 11111 555555555555555 44444444444444444444444444444444 22222222222222222222222222222222222222 111 111111 222
lowQualScore : 4 000000000 4444 11111 2 66 4 33 2 2 9999999 5 333 55 2 77777 3333 33 0 444 66 33 2 2 5555 2 2 888 1 999999 3 444444444444444 55 1 2 4 33 777 66 77777777777777777777777777777777 77777777777777777777777777777777777777 555 6 1 44 999999 0 1 7 111
lowQualScore : . ......... .... ..... . .. . .. . . ....... . ... .. . ..... .... .. . ... .. .. . . .... . . ... . ...... . ............... .. . . . .. ... .. ................................ ...................................... ... . . .. ...... . . . ...
lowQualScore : 2 222222222 3333 66666 2 11 1 99 9 9 3333333 0 777 22 4 22222 4444 22 8 444 99 44 5 5 3333 5 5 888 5 666666 3 111111111111111 00 4 4 4 88 888 99 55555555555555555555555555555555 00000000000000000000000000000000000000 777 7 0 22 222222 8 4 3 000
consensus : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GA-A---AGTCCTGAATT------C-AAATCCCAAT--C---TAA-AATTGAATC-NAAGACCTCCNTATCTTGACATG-GTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--CGCA-----T-AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
Reference ( family-3405 ) : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GA-A---AGTCCTGAATT------C-AAATCCCAAT--C--ATAA-A--TGAATC-NAAGACCTCCNTATCTTGACATG-GTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--TGCA-----T-AATGTGGTAGT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
gi|1 : TGAATGAATGA----CT---GACTGAATGAATGGGGATA----TAGAA--CCCATTA--ACAA-CTAG-G-------GTCAT-ACTG--AGTAGGGACTGGGGAT-AAAATGAG-AA---A-AA--A-TGCCAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GG-A---AGTCTTGAATT------C-AAATACGAAT--CAAATAA-A---GGATC-AAAGACTGCTTTATCTTGACATA-GTTTTTTGAT---GCCCATAACTCATTT--GCACATTATAAATTGA--TATGGAATACAAATATT-AATGTGATCAT----------TTTATGCAACATCCTCCC-AAT----CTGCGAAATCT---TA-CCCCTATGTATGGGAGGGTACAAATTTATATACAGCAGTAGATATGACTTACTATGCCC
gi|10 : gcctccattcTTA--ACAG-CCAG----------TCAC-AATG--AGTTCGGACTGAGGGTGAAAGTGAA-AA---ATAA--G-TGAAAAC--TAT--ACATGGAAAT---A--A--TA-TC-AG----ATAT-G----------------T------C-AAATACCAAT--C---------------C-AAA--CCTCTATACTTTTAAGTG-GTATTGCGAT---GCCCATTCCTGATTA--ACAC------AATTAA--TATGG--CACA-----T-
gi|11 : cA--CCCATCA--ACAG-CCTG-G-------GTCAT-ATTG--AGTTGGGACTGGCAATGAAAA-GAG-AA---C-AA--A-TGACAAT--AGGGAAAATGAAGAT---G--A--TA-TC-AGATAAATAT-GA-A---AGTATTAAATT------C-AAATCCCAAT--C---TAA-AATTGAATC-CAAGACCTCCTTGTCTTAAggaaa
gi|12 : ttGAAAGACTGA----CG---GAATGACTGAGTGA--ATG----T-TGTTTCACGTTATAACAG-CCAT-T-------TTCAT-ATTG--AGTCCGGACTTGGAATGAAAATGAG-AA---C-AA--A-TG--------ATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TT-AG----ATGT-GA-A---AGtta
gi|13 : aatgaatgaatgaaaaaaaGATGAAAATGAG-AA---C-AA--A--GGCAAT--TATATTCGTGAAGAT---G--A--TA-TC-AG----ATAT-GA-A---AGTCTTGAATT------T-AAATTCTAAA--C---TAA-AATTTAATC-TGATTCTTCCTCGTC
gi|14 : ---GAATGCATTAATAGGGATA----TATGA--CCGGTTA--ACAG-CCA----------GTCGT-ATTA--ATTCAGGAATGGGGATGAAAA--AG-AATGGA-AA--A-TGACAGT--GAcgggacaagtcttttatccgtccggctaactcagtcgt
gi|15 : cAATGAATTTAGTTT----TATGA--CCCATGA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AAT-AGGATAGGGGATGAAAATGAG--A---A-AT--A-TTACAAT--TATGATCACGAACATTACGGTA--TG-TC-AG----ATAG-GA-A---catttatgtatggtaggttggatatagcc
gi|16 : ---GAATGAATGAAT----ATTATCTTGAGA--CCCGTAA--ACAT-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTCTA-ACTGGTGATGAAA-TGAG-AA---A-GC--A-AGACAAT--A------ATGAAAAT---T--A--CA-TC-AT----A-AT-AC-A---AGTCCTG
gi|17 : T----------TTTATGCCACGTCCT-CG-ATTACCCCTGAGGAATCTG--TAACCCCAATGCATGGGAGGGTA------TATA-ATTGCAGTGTGTGT
gi|18 : aTA--ATAA-CCAG-G-------GTCAT-ACT---AGTTGGGACTGAAGATGAAAATGAA-AA---ATAA--A---AAAAT--AACAAACATGAAGAT---G--A--TG-TT-AA----AT-T-CA-A---A-TCC-AAATC------C-AAAattcttatccctatcccagagggc
gi|19 : CAT-ATTATCAGCTGGGACTGGGAGGGAAAATGAG-AA---G-AA--T-TGACAAC--AATGACCATGAATAT---GTTAATTA-TC-AG----ATAC-GA-A---AGTCTTAAAAT------C-
gi|2 : aTC----TACGA--CC--TT----CA----AG-G-------GTTAT-ATTG--AGTCCTGTATGTAGATAAATATGAG-AA---A-AC----TGACATT--ATTGAATACGACAAT---G--A--TG-TG-AA----ATAG-GA-A---AATCCTGAATTCACAACC-AAATCCCAAT--C---TAATAC-CAAATC-TAAAATTCCCTTATCTTGACATG-GTATTGCGAC---AACCGCGTCTTATGT--ATAT---AACAATTGCT-TATG--------------AATATGGTAAT----------T------------------AAT----CAGACGTAGCT---TA-TCCGTACGCATGCAAGGG--------TATATACAGCAGTGAGTA-AA---ATTATGCCC
gi|3 : GTTT--ACAG-CCAG-G-------ATCATTATTG--GTTAGTGACAGAGGAAGACAATGAGTAA---A-AG--A-TGACACT--AATGAA------GAC---G--A--TA-TC-AG----ATATTGA-A---AGTCCTGAATT------CAAAATCCCAATC-C--AAAA-C--TGAATC-AAAGAC------A---TGGTATG-GTATCA-GAC---GTCTATACCTCATTT--ACACA-ATAT-----A--TATGA--TGCA-----TGGATGGGGTAGT----------TTTATGCCACATTAT-CC-AACA---CTGAGGGATCT---TG-GCAACATGCATAGGAGG--A------TATATATAGTAGTGGG
gi|4 : tCTGCCA--ACAGACCAA-G--------TCAT-ATTG--AGTTTGGACTGGGAATGAAAATTAG---------A--T-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--T-----------ATAT-GGTA---AATCCGGATGT------C-AAATCTCAATAAC--AAAA-A--TCAATCGCAAGACCTCCGTATCTTG--ATG--------------GTTCATACCTCATTT--CTACA-AAAGATTTGAACTTTGG----------------GT-GTA-------------TTAT------TTCT-AC--AT----TTGATAGATCT---TA-CACATATGCATAAAAGGATA------AATATGAA--AGTGG
gi|5 : TCAT-AGTG--ATTCGGGACCCGGGATGGCAATGAA-AA---G-AA--A-TGACAAC--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAAA----ATAT-AA-A---AGTCACAA-----------AAATCACAAT--C---TAA-AATTGAACC-CAAGACCACCATATCTTGGCATG-GTATTGTGAC---ATACATACGTCAGTTACACACA-AAATAA--AA--CATTG--TGCAG----T-AGTGTGGTAGTTCTTCTAAAATTTATG------CCT-CCAAAT----CTGAGTAACCT---
gi|6 : ATGAGTATTTCGAC---ATCCATACCATATTT--AGAAA-AAAAAA-------ATAG--GACA-----TGAAAGAGGTAAT----------TTTATGTCAGATCTT-CCCAAT----CTAAAGAATCCCTATG-CCCCTGTACATGGGAGGGTA------Tc
gi|7 : tgcaagtcaaacaatccaaagttgagtccaAACGAATTA----AT---AAATGAATGAATGAG-ATT----TACCA--CC--TTT--ACAG-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTAGAGAGGCGGGATCAACATGTT-AA---A-AATGA-TGGTAAT--AATAAGTATGAAGAC---G--A--TA-TC-AG----ATAT-AA------------AATT------C-AA-----AAT-------------TAAATC-CAAGATTTTCATATCGTGACATG-ATATTGTGACGAAGTTCAAATCTTATTG--TCACA-Agggagggtattcttagtggattctcagtggtgtattcttagccctattccactggaca
gi|8 : GTTA--ACAA-CCAG-GACCCAGGGTCATCACTT--GGTAAGTACT----ATGAACATGAG-AA---A-AA--AATGACAATTTAATGAAAATGA---T---A--A--TAATT-AG----ATAG-GA-ATTAAGTCCTGCATT------C-AAATCTCAAC--C---TAA-AATTGAACC-AAAGACCTCCATAGCTTGACATA-ATATTGCAGC---ATCCGT
gi|9 : TGAATGAATGAAACACAAAGGAACGAATGCATGGGAGTT----TACGA--TCCGTTA---CAG-TCACTG-------GTCAT-ATAT--AGTCGGGACTGGGAATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-AGACAAT--ACTGAATATGAAGA-------A--TA-TG-GT----ACAT-GG-ATGTAGTCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCCTTGTCCATCTTCAATTAATCAATGGATGGGGTTTCATTTAATAAAT
Alignments
lowQualScore : 333333333 1111 11111 11111111 55555555555555555555555555555555 222222222222222222222222222222222222 111 111111 222
lowQualScore : 4 000000000 4444 11111 2 66 4 33 2 2 9999999 5 333 55 2 77777 3333 33 0 444 66 33 2 2 555555 2 888 1 1 3 888888 3 44 11111111 0 2 55 0 33 3 1 2 33 777 66 11111111111111111111111111111111 2 666666666666666666666666666666666666 555 6 1 44 999999 0 1 7 111
lowQualScore : . ......... .... ..... . .. . .. . . ....... . ... .. . ..... .... .. . ... .. .. . . ...... . ... . . . ...... . .. ........ . . .. . .. . . . .. ... .. ................................ . .................................... ... . . .. ...... . . . ...
lowQualScore : 2 222222222 3333 66666 2 11 1 99 9 9 3333333 0 777 22 4 22222 4444 22 8 444 99 44 5 5 888888 5 888 7 7 2 888888 1 22 44444444 4 3 99 5 99 5 2 9 88 888 99 66666666666666666666666666666666 3 333333333333333333333333333333333333 777 7 0 22 222222 8 4 3 000
consensus : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--CGCA-----T-AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
Reference ( family-3405 ) : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-NAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--CGCA-----T-AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
gi|1 : TGAATGAATGA----CT---GACTGAATGAATGGGGATA----TAGAA--CCCATTA--ACAA-CTAG-G-------GTCAT-ACTG--AGTAGGGACTGGGGAT-AAAATGAG-AA---A-AA--A-TGCCAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GG-A---AGTCTTGAATTCA------AA-TACGAAT--CAAAT----AAA---GGATC-AAAGACTGCTTTATCTTGACATAGTTTTTTGAT---GCCCATAACTCATTT--GCACATTATAAATTGA--TATGGAATACAAATATT-AATGTGATCAT----------TTTATGCAACATCCTCCC-AAT----CTGCGAAATCT---TA-CCCCTATGTATGGGAGGGTACAAATTTATATACAGCAGTAGATATGACTTACTATGCCC
gi|10 : gcctccattcTTA--ACAG-CCAG----------TCAC-AATG--AGTTCGGACTGAGGGTGAAAGTGAA-AA---ATAA--G-TGAAAAC--TAT--ACATGGAAAT---A--A--TA-TCAGA-TA----T-G----------------TCA------AA-TACCAAT--C---C----AAA--------------CCTCTATACTTTTAAGTGGTATTGCGAT---GCCCATTCCTGATTA--ACAC------AATTAA--TATGG--CACA-----T-
gi|11 : cA--CCCATCA--ACAG-CCTG-G-------GTCAT-ATTG--AGTTGGGACTGGCAATGAAAA-GAG-AA---C-AA--A-TGACAAT--AGGGAAAATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TAAATAT-GA-A---AGTATTAAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-CAAGACCTCCTTGTCTTAAggaaa
gi|12 : ttGAAAGACTGA----CG---GAATGACTGAGTGA--ATG----T-TGTTTCACGTTATAACAG-CCAT-T-------TTCAT-ATTG--AGTCCGGACTTGGAATGAAAATGAG-AA---C-AA--A-TG--------ATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TTAGA-TG----T-GA-A---AGtta
gi|13 : aatgaatgaatgaaaaaaaGATGAAAATGAG-AA---C-AA--A--GGCAAT--TATATTCGTGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCTTGAATTTA------AA-TTCTAAA--C---T----AAAATTTAATC-TGATTCTTCCTCGTC
gi|14 : ---GAATGCATTAATAGGGATA----TATGA--CCGGTTA--ACAG-CCA----------GTCGT-ATTA--ATTCAGGAATGGGGATGAAAA--AG-AATGGA-AA--A-TGACAGT--GAcgggacaagtcttttatccgtccggctaactcagtcgt
gi|15 : cAATGAATTTAGTTT----TATGA--CCCATGA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AAT-AGGATAGGGGATGAAAATGAG--A---A-AT--A-TTACAAT--TATGATCACGAACATTACGGTA--TG-TCAGA-TA----G-GA-A---catttatgtatggtaggttggatatagcc
gi|16 : ---GAATGAATGAAT----ATTATCTTGAGA--CCCGTAA--ACAT-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTCTA-ACTGGTGATGAAA-TGAG-AA---A-GC--A-AGACAAT--A------ATGAAAAT---T--A--CA-TCATA--A----T-AC-A---AGTCCTG
gi|17 : AT----------TTTATGCCACGTCCT-CG-ATTACCCCTGAGGAATCTG--TAACCCCAATGCATGGGAGGGTA------TATA-ATTGCAGTGTGTGT
gi|18 : TA--ATAA-CCAG-G-------GTCAT-ACT---AGTTGGGACTGAAGATGAAAATGAA-AA---ATAA--A---AAAAT--AACAAACATGAAGAT---G--A--TG-T-------------------------TAAATTCA------AA-TCCAAAT--C---C----AAAattcttatccctatcccagagggc
gi|19 : CAT-ATTATCAGCTGGGACTGGGAGGGAAAATGAG-AA---G-AA--T-TGACAAC--AATGACCATGAATAT---GTTAATTA-TCAGA-TA----C-GA-A---AGTCTTAAAATC
gi|2 : aTC----TACGA--CC--TT----CA----AG-G-------GTTAT-ATTG--AGTCCTGTATGTAGATAAATATGAG-AA---A-AC----TGACATT--ATTGAATACGACAAT---G--A--TG-TGAAA-TA----G-GA-A---AATCCTGAATTCACAACCAAA-TCCCAAT--C---T----AATACCAAATC-TAAAATTCCCTTATCTTGACATGGTATTGCGAC---AACCGCGTCTTATGT--ATAT---AACAATTGCT-TATG--------------AATATGGTAAT----------T------------------AAT----CAGACGTAGCT---TA-TCCGTACGCATGCAAGGG--------TATATACAGCAGTGAGTA-AA---ATTATGCCC
gi|3 : GTTT--ACAG-CCAG-G-------ATCATTATTG--GTTAGTGACAGAGGAAGACAATGAGTAA---A-AG--A-TGACACT--AATGAA------GAC---G--A--TA-TCAGA-TA----TTGA-A---AGTCCTGAATTCA------AAATCCCAAT--C---C----AAAACTGAATC-AAAGAC------A---TGGTATGGTATCA-GAC---GTCTATACCTCATTT--ACACA-ATAT-----A--TATGA--TGCA-----TGGATGGGGTAGT----------TTTATGCCACATTAT-CC-AACA---CTGAGGGATCT---TG-GCAACATGCATAGGAGG--A------TATATATAGTAGTGGG
gi|4 : tCTGCCA--ACAGACCAA-G--------TCAT-ATTG--AGTTTGGACTGGGAATGAAAATTAG---------A--T-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--T------A-TA----T-GGTA---AATCCGGATGTCA------AA-TCTCAATAAC---A----AAAATC-AATCGCAAGACCTCCGTATCTTG--ATG-------------GTTCATACCTCATTT--CTACA-AAAGATTTGAACTTTGG----------------GT-GTA-------------TTAT------TTCT-AC--AT----TTGATAGATCT---TA-CACATATGCATAAAAGGATA------AATATGAA--AGTGG
gi|5 : TCAT-AGTG--ATTCGGGACCCGGGATGGCAATGAA-AA---G-AA--A-TGACAAC--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAAAATA----T-AA-A---AGTCACAAA----------AA-TCACAAT--C---T----AAAATTGAACC-CAAGACCACCATATCTTGGCATGGTATTGTGAC---ATACATACGTCAGTTACACACA-AAATAA--AA--CATTG--TGCAG----T-AGTGTGGTAGTTCTTCTAAAATTTATG------CCT-CCAAAT----CTGAGTAACCT---
gi|6 : AAGTCA------AA----CAAT--C---C----AAAGTTGAGTC-CAA-------------TGA----GTATTTCGAC---ATCCATACCATATTT--AGAAA-AAAAAA-------ATAG--GACA-----TGAAAGAGGTAAT----------TTTATGTCAGATCTT-CCCAAT----CTAAAGAATCCCTATG-CCCCTGTACATGGGAGGGTA------Tc
gi|7 : tgcAACGAATTA----AT---AAATGAATGAATGAG-ATT----TACCA--CC--TTT--ACAG-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTAGAGAGGCGGGATCAACATGTT-AA---A-AATGA-TGGTAAT--AATAAGTATGAAGAC---G--A--TA-TCAGA-TA----T-AA------------AATTC----------------------------AAAATTAAATC-CAAGATTTTCATATCGTGACATGATATTGTGACGAAGTTCAAATCTTATTG--TCACA-Agggagggtattcttagtggattctcagtggtgtattcttagccctattccactggaca
gi|8 : GTTA--ACAA-CCAG-GACCCAGGGTCATCACTT--GGTAAGTACT----ATGAACATGAG-AA---A-AA--AATGACAATTTAATGAAAATGA---T---A--A--TAATTAGA-TA----G-GA-ATTAAGTCCTGCATTCA------AA-TCTCAAC--C---T----AAAATTGAACC-AAAGACCTCCATAGCTTGACATAATATTGCAGC---ATCCGT
gi|9 : TGAATGAATGAAACACAAAGGAACGAATGCATGGGAGTT----TACGA--TCCGTTA---CAG-TCACTG-------GTCAT-ATAT--AGTCGGGACTGGGAATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-AGACAAT--ACTGAATATGAAGA-------A--TA-TGGTA-CA----T-GG-ATGTAGTCCC----------------TCCCAAT--T---TGAACAAAATTAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCCTTGTCCATCTTCAATTAATCAATGGATGGGGTTTCATTTAATAAAT
Alignments
lowQualScore : 333333333 1111 11111 11111111 55555555555555555555555555555555 222222222222222222222222222222222222 111 111111 222
lowQualScore : 4 000000000 4444 11111 2 66 4 33 2 2 9999999 5 333 55 2 77777 3333 33 0 444 66 33 2 2 555555 2 888 1 1 3 888888 3 44 11111111 0 5 44 0 33 3 1 2 33 777 66 11111111111111111111111111111111 2 666666666666666666666666666666666666 555 6 1 44 999999 0 1 7 111
lowQualScore : . ......... .... ..... . .. . .. . . ....... . ... .. . ..... .... .. . ... .. .. . . ...... . ... . . . ...... . .. ........ . . .. . .. . . . .. ... .. ................................ . .................................... ... . . .. ...... . . . ...
lowQualScore : 2 222222222 3333 66666 2 11 1 99 9 9 3333333 0 777 22 4 22222 4444 22 8 444 99 44 5 5 888888 5 888 7 7 2 888888 1 22 44444444 4 2 33 5 99 5 2 9 88 888 99 66666666666666666666666666666666 3 333333333333333333333333333333333333 777 7 0 22 222222 8 4 3 000
consensus : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--CGCA-----T-AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
Reference ( family-3405 ) : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--CGCA-----T-AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
gi|1 : TGAATGAATGA----CT---GACTGAATGAATGGGGATA----TAGAA--CCCATTA--ACAA-CTAG-G-------GTCAT-ACTG--AGTAGGGACTGGGGAT-AAAATGAG-AA---A-AA--A-TGCCAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GG-A---AGTCTTGAATTCA------AA-TACGAAT--CAAAT----AAA---GGATC-AAAGACTGCTTTATCTTGACATAGTTTTTTGAT---GCCCATAACTCATTT--GCACATTATAAATTGA--TATGGAATACAAATATT-AATGTGATCAT----------TTTATGCAACATCCTCCC-AAT----CTGCGAAATCT---TA-CCCCTATGTATGGGAGGGTACAAATTTATATACAGCAGTAGATATGACTTACTATGCCC
gi|10 : gcctccattcTTA--ACAG-CCAG----------TCAC-AATG--AGTTCGGACTGAGGGTGAAAGTGAA-AA---ATAA--G-TGAAAAC--TAT--ACATGGAAAT---A--A--TA-TCAGA-TA----T-G----------------TCA------AA-TACCAAT--C---C----AAA--------------CCTCTATACTTTTAAGTGGTATTGCGAT---GCCCATTCCTGATTA--ACAC------AATTAA--TATGG--CACA-----T-
gi|11 : cA--CCCATCA--ACAG-CCTG-G-------GTCAT-ATTG--AGTTGGGACTGGCAATGAAAA-GAG-AA---C-AA--A-TGACAAT--AGGGAAAATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TAAATAT-GA-A---AGTATTAAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-CAAGACCTCCTTGTCTTAAggaaa
gi|12 : ttGAAAGACTGA----CG---GAATGACTGAGTGA--ATG----T-TGTTTCACGTTATAACAG-CCAT-T-------TTCAT-ATTG--AGTCCGGACTTGGAATGAAAATGAG-AA---C-AA--A-TG--------ATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TTAGA-TG----T-GA-A---AGtta
gi|13 : aatgaatgaatgaaaaaaaGATGAAAATGAG-AA---C-AA--A--GGCAAT--TATATTCGTGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCTTGAATTTA------AA-TTCTAAA--C---T----AAAATTTAATC-TGATTCTTCCTCGTC
gi|14 : ---GAATGCATTAATAGGGATA----TATGA--CCGGTTA--ACAG-CCA----------GTCGT-ATTA--ATTCAGGAATGGGGATGAAAA--AG-AATGGA-AA--A-TGACAGT--GAcgggacaagtcttttatccgtccggctaactcagtcgt
gi|15 : cAATGAATTTAGTTT----TATGA--CCCATGA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AAT-AGGATAGGGGATGAAAATGAG--A---A-AT--A-TTACAAT--TATGATCACGAACATTACGGTA--TG-TCAGA-TA----G-GA-A---catttatgtatggtaggttggatatagcc
gi|16 : ---GAATGAATGAAT----ATTATCTTGAGA--CCCGTAA--ACAT-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTCTA-ACTGGTGATGAAA-TGAG-AA---A-GC--A-AGACAAT--A------ATGAAAAT---T--A--CA-TCATA--A----T-AC-A---AGTCCTG
gi|17 : AT----------TTTATGCCACGTCCT-CG-ATTACCCCTGAGGAATCTG--TAACCCCAATGCATGGGAGGGTA------TATA-ATTGCAGTGTGTGT
gi|18 : TA--ATAA-CCAG-G-------GTCAT-ACT---AGTTGGGACTGAAGATGAAAATGAA-AA---ATAA--A---AAAAT--AACAAACATGAAGAT---G--A--TG-T-------------------------TAAATTCA------AA-TCCAAAT--C---C----AAAattcttatccctatcccagagggc
gi|19 : CAT-ATTATCAGCTGGGACTGGGAGGGAAAATGAG-AA---G-AA--T-TGACAAC--AATGACCATGAATAT---GTTAATTA-TCAGA-TA----C-GA-A---AGTCTTAAAATC
gi|2 : aTC----TACGA--CC--TT----CA----AG-G-------GTTAT-ATTG--AGTCCTGTATGTAGATAAATATGAG-AA---A-AC----TGACATT--ATTGAATACGACAAT---G--A--TG-TGAAA-TA----G-GA-A---AATCCTGAATTCACAACCAAA-TCCCAAT--C---T----AATACCAAATC-TAAAATTCCCTTATCTTGACATGGTATTGCGAC---AACCGCGTCTTATGT--ATAT---AACAATTGCT-TATG--------------AATATGGTAAT----------T------------------AAT----CAGACGTAGCT---TA-TCCGTACGCATGCAAGGG--------TATATACAGCAGTGAGTA-AA---ATTATGCCC
gi|3 : GTTT--ACAG-CCAG-G-------ATCATTATTG--GTTAGTGACAGAGGAAGACAATGAGTAA---A-AG--A-TGACACT--AATGAA------GAC---G--A--TA-TCAGA-TA----TTGA-A---AGTCCTGAATTCA------AAATCCCAAT--C---C----AAAACTGAATC-AAAGAC------A---TGGTATGGTATCA-GAC---GTCTATACCTCATTT--ACACA-ATAT-----A--TATGA--TGCA-----TGGATGGGGTAGT----------TTTATGCCACATTAT-CC-AACA---CTGAGGGATCT---TG-GCAACATGCATAGGAGG--A------TATATATAGTAGTGGG
gi|4 : tCTGCCA--ACAGACCAA-G--------TCAT-ATTG--AGTTTGGACTGGGAATGAAAATTAG---------A--T-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--T------A-TA----T-GGTA---AATCCGGATGTCA------AA-TCTCAATAAC---A----AAAATC-AATCGCAAGACCTCCGTATCTTG--ATG-------------GTTCATACCTCATTT--CTACA-AAAGATTTGAACTTTGG----------------GT-GTA-------------TTAT------TTCT-AC--AT----TTGATAGATCT---TA-CACATATGCATAAAAGGATA------AATATGAA--AGTGG
gi|5 : TCAT-AGTG--ATTCGGGACCCGGGATGGCAATGAA-AA---G-AA--A-TGACAAC--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAAAATA----T-AA-A---AGTCACAAA----------AA-TCACAAT--C---T----AAAATTGAACC-CAAGACCACCATATCTTGGCATGGTATTGTGAC---ATACATACGTCAGTTACACACA-AAATAA--AA--CATTG--TGCAG----T-AGTGTGGTAGTTCTTCTAAAATTTATG------CCT-CCAAAT----CTGAGTAACCT---
gi|6 : AAGTCA------AA----CAAT--C---C----AAAGTTGAGTC-CAA-------------TGA----GTATTTCGAC---ATCCATACCATATTT--AGAAA-AAAAAA-------ATAG--GACA-----TGAAAGAGGTAAT----------TTTATGTCAGATCTT-CCCAAT----CTAAAGAATCCCTATG-CCCCTGTACATGGGAGGGTA------Tc
gi|7 : tgcAACGAATTA----AT---AAATGAATGAATGAG-ATT----TACCA--CC--TTT--ACAG-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTAGAGAGGCGGGATCAACATGTT-AA---A-AATGA-TGGTAAT--AATAAGTATGAAGAC---G--A--TA-TCAGA-TA----T-AA------------AATTC----------------------------AAAATTAAATC-CAAGATTTTCATATCGTGACATGATATTGTGACGAAGTTCAAATCTTATTG--TCACA-Agggagggtattcttagtggattctcagtggtgtattcttagccctattccactggaca
gi|8 : GTTA--ACAA-CCAG-GACCCAGGGTCATCACTT--GGTAAGTACT----ATGAACATGAG-AA---A-AA--AATGACAATTTAATGAAAATGA---T---A--A--TAATTAGA-TA----G-GA-ATTAAGTCCTGCATTCA------AA-TCTCAAC--C---T----AAAATTGAACC-AAAGACCTCCATAGCTTGACATAATATTGCAGC---ATCCGT
gi|9 : TGAATGAATGAAACACAAAGGAACGAATGCATGGGAGTT----TACGA--TCCGTTA---CAG-TCACTG-------GTCAT-ATAT--AGTCGGGACTGGGAATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-AGACAAT--ACTGAATATGAAGA-------A--TA-TGGTA-CA----T-GG-ATGTAGTCCC----------------TCCCAAT--T---TGAACAAAATT-AACC-C
blockSeqs : A AACACAAAG AGGG TATCT T TT C TA A T ACCCAGG T ATC TC T TGGA TGA TT TAC GT AT A A AATAT T TTA T A T CAACCA A AA TGAAC G GC CT A C A GC GAA AC AAAATAAAACATTGTGCAGT A TCTTCTAAAATTTATGCCTCCAAAT CTA A C GT . T T .
blockSeqs : C CG TTAG G T . C . . . . C G TG . AT AA . . TT . . . TT . TGT T G T . . . C T C CT T T C GC . . AAAAGATTTGAACTTTGG A TTTATGCCACGTCCTCGATTACCC G . G AT . C .
blockSeqs : T AT GGGA A T . G . . . . . G CC . AT G . . . . . . T . . C G T . . . T A T TT T T T GT . . AATATATATGATGCATG G TTTATGCCACATTATCCAACA . . A GT . T
blockSeqs : GAG T A . C . . . . . G CA . C A . . . . . . T . . T A A . . . T G T TC T T C TC . . AAAAAAAATAGGACATG G TTTATGTCAGATCTTCCCAAT . . A G . A
blockSeqs : GA C C . C . . . . . A CT . C A . . . . . . T . . C A T . . . C G A CT G T C GT . . AATTAATATGGCACAT A TTATTTCTACAT . . C . .
blockSeqs : . T C . T . . . . . G TG . C A . . . . . . G . . C G T . . . T G C CA A T C GC . . AACAATTGCTTATG . TAAT .
blockSeqs : T C . C . . . . . A TG . A A . . . . . . T . . C G G . . . C A C TT A T . A . .
blockSeqs : . . . . . . . G CC . A A . . . . . . C . . A G G . . . A G C CT A G . . .
blockSeqs : . . . . . . G AG . G A . . . . . . G . . C A T . . . T . A . . .
blockSeqs : . . . . . G TT . A A . . . . . . T . . C G T . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . G CG . A T . . . . . . T . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . A AG . G A . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T AA . A T . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . T CG . A A . . . . . . T . .
blockSeqs : . . A . A A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : C******* AAAAAATATGGCGCATG*************** ******
originalCons : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT--C---T----AAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACA-AAANAATTGA--TATGG--CGCA-----T-AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
finalCons : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT--CC-------AAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTT--ACACAAAAAATATGGCGCATG---------------AATGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCCTTGTCCATCTTCAATTAATCAATGGATGGGGTTTCATTTAATAAAT
Alignments
lowQualScore : 333333333 1111 11111 33333333333333333333333333333 222222222222222222222222222222222222 111 111111 222
lowQualScore : 4 000000000 4444 11111 2 66 4 33 2 2 9999999 5 333 55 2 77777 3333 33 0 444 66 33 2 2 555555 2 888 1 1 4 888888 3 3 6666 3 44 0 33 3 1 2 33 777 99999999999999999999999999999 5 666666666666666666666666666666666666 555 6 1 44 999999 0 1 7 111
lowQualScore : . ......... .... ..... . .. . .. . . ....... . ... .. . ..... .... .. . ... .. .. . . ...... . ... . . . ...... . . .... . .. . .. . . . .. ... ............................. . .................................... ... . . .. ...... . . . ...
lowQualScore : 2 222222222 3333 66666 2 11 1 99 9 9 3333333 0 777 22 4 22222 4444 22 8 444 99 44 5 5 888888 5 888 7 7 9 888888 1 1 5555 1 33 5 99 5 2 9 88 888 11111111111111111111111111111 7 666666666666666666666666666666666666 777 7 0 22 222222 8 4 3 000
consensus : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT-C----CAAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTTACACA----AAA--AAT-----ATGG----C--GCATGAA-TGTGGTAGT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
Reference ( family-3405 ) : NNNNNNNNNNTGAACGAATGA----CN---GAATGAATGAATGGGGATN----TACGA--CCCGTTA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AGTCGGGACTGGGGATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCCTGAATTCA------AA-TCCCAAT-C----CAAAATTGAATC-CAAGACCTCCNTATCTTGACATGGTATTGCGAC---GTCCATACCTCATTTACACA----AAA--AAT-----ATGG----C--GCATGAA-TGTGGTAAT----------TTTATGCCACATCCT-CC-AAT----CTGAGGAATCT---TA-CCCNTATGCATGGGAGGGTA------TATATACAGCAGTGGGTATGACTTACTATGCCC
gi|1 : TGAATGAATGA----CT---GACTGAATGAATGGGGATA----TAGAA--CCCATTA--ACAA-CTAG-G-------GTCAT-ACTG--AGTAGGGACTGGGGAT-AAAATGAG-AA---A-AA--A-TGCCAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GG-A---AGTCTTGAATTCA------AA-TACGAAT-C----AAATAAAGGATC-AAAGACTGCTTTATCTTGACATAGTTTTTTGAT---GCCCATAACTCATTTGCACATTATAAATTGAT-----ATGGAATACAAATATTAA-TGTGATCAT----------TTTATGCAACATCCTCCC-AAT----CTGCGAAATCT---TA-CCCCTATGTATGGGAGGGTACAAATTTATATACAGCAGTAGATATGACTTACTATGCCC
gi|10 : gcctccattcTTA--ACAG-CCAG----------TCAC-AATG--AGTTCGGACTGAGGGTGAAAGTGAA-AA---ATAA--G-TGAAAAC--TAT--ACATGGAAAT---A--A--TA-TCAGA-TA----T-G----------------TCA------AA-TACCAAT-C----CAAA--------------CCTCTATACTTTTAAGTGGTATTGCGAT---GCCCATTCCTGATTAACACA----ATT--AAT-----ATGG----C--ACATGGA-
gi|11 : cA--CCCATCA--ACAG-CCTG-G-------GTCAT-ATTG--AGTTGGGACTGGCAATGAAAA-GAG-AA---C-AA--A-TGACAAT--AGGGAAAATGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TAAATAT-GA-A---AGTATTAAATTCA------AA-TCCCAAT-C----TAAAATTGAATC-CAAGACCTCCTTGTCTTAAaa
gi|12 : ttGAAAGACTGA----CG---GAATGACTGAGTGA--ATG----T-TGTTTCACGTTATAACAG-CCAT-T-------TTCAT-ATTG--AGTCCGGACTTGGAATGAAAATGAG-AA---C-AA--A-TG--------ATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TTAGA-TG----T-GA-A---AGtta
gi|13 : aatgaatgaatgaaaaaaaGATGAAAATGAG-AA---C-AA--A--GGCAAT--TATATTCGTGAAGAT---G--A--TA-TCAGA-TA----T-GA-A---AGTCTTGAATTTA------AA-TTCTAAA-C----TAAAATTTAATC-TGATTCTTCCTCGTC
gi|14 : ---GAATGCATTAATAGGGATA----TATGA--CCGGTTA--ACAG-CCA----------GTCGT-ATTA--ATTCAGGAATGGGGATGAAAA--AG-AATGGA-AA--A-TGACAGT--GAcgggacaagtcttttatccgtccggctaactcagtcgt
gi|15 : cAATGAATTTAGTTT----TATGA--CCCATGA--ACAG-CCAG-G-------GTCAT-ATTG--AAT-AGGATAGGGGATGAAAATGAG--A---A-AT--A-TTACAAT--TATGATCACGAACATTACGGTA--TG-TCAGA-TA----G-GA-A---catttatgtatggtaggttggatatagcc
gi|16 : ---GAATGAATGAAT----ATTATCTTGAGA--CCCGTAA--ACAT-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTCTA-ACTGGTGATGAAA-TGAG-AA---A-GC--A-AGACAAT--A------ATGAAAAT---T--A--CA-TCATA--A----T-AC-A---AGTCCTG
gi|17 : AT----------TTTATGCCACGTCCT-CG-ATTACCCCTGAGGAATCTG--TAACCCCAATGCATGGGAGGGTA------TATA-ATTGCAGTGTGTGT
gi|18 : TA--ATAA-CCAG-G-------GTCAT-ACT---AGTTGGGACTGAAGATGAAAATGAA-AA---ATAA--A---AAAAT--AACAAACATGAAGAT---G--A--TG-T-------------------------TAAATTCA------AA-TCCAAAT-C----CAAAattcttatccctatcccagagggc
gi|19 : CAT-ATTATCAGCTGGGACTGGGAGGGAAAATGAG-AA---G-AA--T-TGACAAC--AATGACCATGAATAT---GTTAATTA-TCAGA-TA----C-GA-A---AGTCTTAAAATC
gi|2 : aTC----TACGA--CC--TT----CA----AG-G-------GTTAT-ATTG--AGTCCTGTATGTAGATAAATATGAG-AA---A-AC----TGACATT--ATTGAATACGACAAT---G--A--TG-TGAAA-TA----G-GA-A---AATCCTGAATTCACAACCAAA-TCCCAAT-C----TAATACCAAATC-TAAAATTCCCTTATCTTGACATGGTATTGCGAC---AACCGCGTCTTATGTATATA----ACA----------ATTG----C--TTATGAA-TATGGTAAT----------T------------------AAT----CAGACGTAGCT---TA-TCCGTACGCATGCAAGGG--------TATATACAGCAGTGAGTA-AA---ATTATGCCC
gi|3 : GTTT--ACAG-CCAG-G-------ATCATTATTG--GTTAGTGACAGAGGAAGACAATGAGTAA---A-AG--A-TGACACT--AATGAA------GAC---G--A--TA-TCAGA-TA----TTGA-A---AGTCCTGAATTCA------AAATCCCAAT-C----CAAAACTGAATC-AAAGAC------A---TGGTATGGTATCA-GAC---GTCTATACCTCATTTACACA----ATA--TAT-----ATGA----T--GCATGGA-TGGGGTAGT----------TTTATGCCACATTAT-CC-AACA---CTGAGGGATCT---TG-GCAACATGCATAGGAGG--A------TATATATAGTAGTGGG
gi|4 : tCTGCCA--ACAGACCAA-G--------TCAT-ATTG--AGTTTGGACTGGGAATGAAAATTAG---------A--T-TGACAAT--AATGAACATGAAGAT---G--A--T------A-TA----T-GGTA---AATCCGGATGTCA------AA-TCTCAATAA----CAAAAATCAATCGCAAGACCTCCGTATCTTG--ATG-------------GTTCATACCTCATTTCTACA----AAA--GAT------T------------TGAACTTTGGGTGT----------ATTAT------TTCT-AC--AT----TTGATAGATCT---TA-CACATATGCATAAAAGGATA------AATATGAA--AGTGG
gi|5 : TCAT-AGTG--ATTCGGGACCCGGGATGGCAATGAA-AA---G-AA--A-TGACAAC--AATGAACATGAAGAT---G--A--TA-TCAAAATA----T-AA-A---AGTCACAAA----------AA-TCACAAT-C----TAAAATTGAACC-CAAGACCACCATATCTTGGCATGGTATTGTGAC---ATACATACGTCAGTTACACA----CAA--AATAAAACATTG----T--GCAGTAG-TGTGGTAGTTCTTCTAAAATTTATG------CCT-CCAAAT----CTGAGTAACCT---
gi|6 : AAGTCA------AA----CAAT-C----CAAAGTTGAGTC-CAA-------------TGA----GTATTTCGAC---ATCCATACCATATTTAGAAA----AAA--AAA-----ATAG----G--ACATGAA-AGAGGTAAT----------TTTATGTCAGATCTTCCC-AAT----CTAAAGAATCCCTATG-CCCCTGTACATGGGAGGGTA------Tc
gi|7 : tgcAACGAATTA----AT---AAATGAATGAATGAG-ATT----TACCA--CC--TTT--ACAG-TCAG-G-------GTCAT-ATTA--AGTAGAGAGGCGGGATCAACATGTT-AA---A-AATGA-TGGTAAT--AATAAGTATGAAGAC---G--A--TA-TCAGA-TA----T-AA-------------------------------AAT-T----CAAAATTAAATC-CAAGATTTTCATATCGTGACATGATATTGTGACGAAGTTCAAATCTTATTGTCACA----Agggagggtattcttagtggattctcagtggtgtattcttagccctattccactggaca
gi|8 : GTTA--ACAA-CCAG-GACCCAGGGTCATCACTT--GGTAAGTACT----ATGAACATGAG-AA---A-AA--AATGACAATTTAATGAAAATGA---T---A--A--TAATTAGA-TA----G-GA-ATTAAGTCCTGCATTCA------AA-TCTCAAC-C----TAAAATTGAACC-AAAGACCTCCATAGCTTGACATAATATTGCAGC---ATCCGT
gi|9 : TGAATGAATGAAACACAAAGGAACGAATGCATGGGAGTT----TACGA--TCCGTTA---CAG-TCACTG-------GTCAT-ATAT--AGTCGGGACTGGGAATGAAAATGAG-AA---A-AA--A-AGACAAT--ACTGAATATGAAGA-------A--TA-TGGTA-CA----T-GG-ATGTAGTCCC----------------TCCCAAT-TTGAACAAAATT-AACC-C
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGCCTTGTCCATCTTCAATTAATCAATGGATGGGGTTTCATTTAATAAAT