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15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : TTCTTTA--TTTAAGTCTCAT---CATGGT----TAATACACA-GTA--TA--------TACATNA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T---T-A------T-AT--T-----TA-A-C---AA-A-T--A----A---------C-CATGCC-AT--TCT--AT-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-AC--T-A--T---A-TTAC--A--T-----T--AA--AAC---A-----TAT-C------AAT-ACA---T-A---T--TT-A--------AACCA-ATTT-ATCA---C-----A---------A--TT--TAT--AATCACAT
Reference ( family-3287 ) : TTCTTTA--TTTAAGTCTCAT---CATGGT----TAATACACA-GTA--TA--------TACATNA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T---T-A------T-AT--T-----TA-A-C---AA-A-T--A----A---------C-CATGCC-AT--TCT--AT-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-AC--T-A--T---A-TTAC--A--T-----T--AA--AAC---A-----TAT-C------AAT-ACA---T-A---T--TT-A--------AACCA-ATTT-ATCA---C-----A---------A--TT--TAT--AATCACAT
gi|1 : TTATTTA--TTGAAGTCTCAT---CATGGC----TAACACATA-AAA--CA--------TACATAA-------A--CATA--AT-C-A--------G---T-A------T-AT--A-----T--A-C---AG------A----A---------C-CATGTC-AT--TCT--AT-----TT-AGAATTACAAG-------------AG-GC--T-A--T-----TTG---------------AA--AA---------------------AAT-ACA---T-----T--TT-A--------
gi|10 : taTTCTTTT--TGTTAGTCCCAT---CATGGT----TTAAATACA-GCA--TA--------TACAGAA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T---A-A------G-AT--T-----TA-A-C---AA-A-T--G----A---------C-CATCTC-AT--TCT--AT-----AT-ATATTTATAAG-------------AG-AC-------T---A-TTACT-A--T-----T--CA--TAC---A-----TAT-T--------T-CTT---T-A---T--TT-------------TA-GTTTCATCA---T-----G---------G--TT--TAT--Agctactacatcgtaatccagatgttaacttacattataacaatggcaaagttatctaaaaataaataatattattcttaagcagacctatttactttatcaaaattaatatgtcga
gi|10 : TTCTTTA--TTTTAGTTTCAT---CATGGT----TTATATACA-GCA--TA--------TAGAAAA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T---T-A------G-AT--T-----TA-A-C---Atacagcatatagaaaatataaaacattagatttaaca
gi|11 : ttctttttgttagtcccatcatggtttaaatacagcatatacagaatataaaacataagatttaacaaatgaccatctcattctatatatatttataagagactattactattcatacatatTTCTTTT--TGTTAGTCCCAT---CATGGT----TTAAATACA-GCA--TA--------TACAGAA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T---A-A------G-AT--T-----TA-A-C---AA-A-T--G----A---------C-CATCTC-AT--TCT--AT-----AT-ATATTTATAAG-------------AG-AC-------T---A-TTACT-A--T-----T--CA--TAC---A-----TAT-T--------T-CTT---T-A---T--TT-------------TA-GTTTCATCA---T-----G---------G--TT--TAT--A
gi|11 : tTTCTTTA--TTTTAGTTTCAT---CATGGT----TTATATACA-GCA--TA--------TAGAAAA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T---T-A------G-AT--T-----TA-A-C---tacagcatatagaaaatataaaacattagatttaac
gi|12 : tttctttttgttagtcccatcatggtttaaatacagcatatacagaatataaaacataagatttaacaaatgaccatctcattctatatatatttataagagactattactattcatacatatTTCTTTA--TATATGTCTCAG---CATGGC----TAATACAAA-GTA--TA--------TACGTGA-T-----A--TA-A--AA-T-G--------T---T-A------T-AT--T-----TA-A-C---AA-A-T--A----A---------C-CATGCC-AT--ACC--GT-----AA-AGAATTAAGAG-------------AG-AC--C-A--T---A-TTTT--T--T-----TTAAA--AAA---A-----TAT-T------AAA-ACA---T-A---TC-TT-A--------AACCA-ATTT-ATCA---CACACAA---------G--TT--TAT---ATCACAT
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gi|14 : ggttttaTTCTTTA--TTTAAGTATCAT---CATGGT----TAATACACA-ATA--TA--------TACATTA-T-----A--TA-A--AA-C-A--------G---T-ATACTAGT-AT--T-----TA-A-C---AA-A-T--A----A---------C-AATGTC-AT--TTT--AT-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-AC--T-A--T---A-T--------T-----T--AA--AAC---C-----TAT-C------AAT-TCA---T-AT--T--TT-A--------AACCA-A-TT-ATTA---C-----AC--------A--TT--TAT---ATAACATttgctaaaacgtaatttagctactacatagtattcaaaagaattactgacattttaactatggtaaagttattttaaaaataaacattt
gi|15 : tatTTCTTTA--TTTAAGTCACAT---CGTGGT----TAATACACA-GTA--TA--------TACATAA-A-----A--AA-A--AA-T-A--------T---T-ACTAGTAT-AT--T-----TA-A-C---AA-T-T--A----A---------C-CATGCC-AT--TCT--AT-----AA-AGAATTATAAA-------------AG-AC--T-A--T---ATTTAC--A--T------------------G-----TAT-C------AAT-ACA---T-AT--T--TT-A--------AACCA-ATTT-ATCA---C-----A---------A--TT--TA---AATCACATtgctgttt
gi|16 : agTTCTTTA--TTTAAGTCACAT---CGTGGT----TAATACACA-GTA--TA--------TACATCA-A-----A--TA-A--AA-T-A--------T---T-ACTAGTAT-AT--T-----TA-A-C---AA-T-T--A----A---------C-CATGCC-AT--TCT--AT-----AA-ATAATTATAAG-------------AG-AC--T-A--T---A-T-----A--T-----T--TA--CAT---G-----TAT-C------AAT-ACA---T-AT--T--TT-A--------AACCA-ATTT-ATCA---C-----A---------A--TT--TA---AATCACATtgctgttta
gi|17 : -CATGTC-AT--TCT--AT-----TT-AGAATTACAAG-------------AG-GC--T-A--T--------------T-----T--GA--AAT---A-----TAtgctgttt
gi|18 : atacagaaccaTA--TTTAAGTCTCAT---CATGGT----TAATATACA-GTA--TA--------AACATTA-A-----A--TA-A--AA-C-A--------T---T-A------T-AT--T-----TA-A-C----A-A-T--A----AG--------C-CACGTC-AT--TCT--AA-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-AC--T-A--T---ATTTAC--A--TG----T--AA--ATC---A-----TAT-C------AAT-ACA---T-A---TC-TT-A--------AAGCA-ATTT-ATCG---C-----A---------A--TT--AAT--AATcattttagctactacatcgtaatccagatgttcttacattataactatgacaaagttatctaaaaataaataatattatccttaagcagacctatttacattatcaaaattgagatgtcga
gi|19 : tttatgTTTTTCA--TTTAAATCTT-T---CATGGT----TAATACACA-GAA--TA--------TACATAA-T-----A--TA-A--AA-C-AATAT----T---T-A------C-AT--C-----TA-C-T---AA-A-T--A----G---------C-CATGCC-ATTCTCT--AT-----AA-AGAATTGTAAG-------------AT-AC--TAA--T---A-GAGC--A-----------AA--AAC---A-----TGT-C------AAA-TCA---T-GTTTT--TT-A--------A--CA-TTTT-ATCA---C-----AC--------A--TT--CAT---GTCACATacttgctgttt
gi|2 : TTATTTA--TTCATGTCTCAT---CATATG----TAGAACA-----A--TA--------TAGA--A-C-----A--TA-A--TA-C-A--------T-----A------T-AG--A-----TA-A------A-A-C--A----A---------CATATGCC-AT--TCT--AA-----AA-AGAATTATTAG-------------AG-AC--A-A--T---A-C-AC--AACTCA---T--AA--AAT---A-----TTT-CT-----AAT-TCA---T-A---T--TT-TTTTGTTCTAATCACATTA-ATCATTAC-----A---------A--TT--TAT----TTACATttcct
gi|20 : atatTTCTTTA--TTCTAATCTCAT---CATGAC----TTATACACG-TTA--TA--------TACACGA-T-----A--TA-A--AATC-AGTTTTTTTT---T-G------C-AT--T-----TT-A-C---AA-A-C--A----T---------C-CATGTC-AT--TCT--TT-----AG-GGA--TATAAATT-----------AGTAC--C-A--T---A-CT-------T-----T--AAGCAAT---T-----TAT--------GAT-ATA---G-T---T--TT-A--------AAACA-AT----------C-----A---------A--TT--GAG--GCTCACATtatatttcaataaaagttaaaaacccattgcttatcttgacttgcg
gi|21 : aTTATTTA--TTCATGTCTTAT---CAT---------ATGTACA-GCA-------------ACAT---------A--GA-A--CA-T-A--------T---T-G------T-AT--T-----TACA-T---AA-AAT--T----A---------CATATGTC-AT--TCT--AA-----AA-AGAATTATAAA-------------AG-ACAAT-A--T---A-CAAC--C--C-----T--AA--AGT---A-----TTT-CTTCT--AATCACA---T-A---T--------------AATAA-ATT---------C-----A---------A--TTGATATGAAATAACATt
gi|22 : tatTCTTTA--TTTAAATCTCAT---CATGGT----TAATACACC-GTA--TA--------TACATTA-T-----A--CA-A--AA-C-G--------T---T-A------T-AT--T-----CA-A-C---AA-A-T--A----A---------C-CATGTC-AT--TCT--AT-----AA-AGAATAATAAG-------------AG-AC--T-A--T---A-TT-------T---------A--AAC---A-----TAT------------------------T--TT-A--------GATCA-ATTT-ATCtttt
gi|23 : TTCTTTA--TTCAAGTCTCAT---CATGGT----TAATACACA-GTG--TA--------TACATTA-A-----A--TA-A--AA-C-A--------T---T-A------T-AT--T-----TA-A-C---AA-T-T--A----G---------C-CATGCC-AT--TCT--AT-----AA-AGAACTATAAG-------------AG-AC--T-A--T---A-TTAC--A--TG----T--AA--AAC---A-----TAT-C------AAT-ACA---T-A---T--TT-A--------AACCA-ATTT-ATCA---C-----A---------A--TT--AAT--AAGCATATttcagagaattataaaaaaaatacatgcagattc
gi|24 : TTCTTTA--TTTACGTCTCAT---TATTGT----TAATAAACA-GTA--TA--------TACCTTA-T-----G--TA-A--AG-C-G--------T---T-A------T-ATC-C-----CA-A-C---TA-A-T--A----A---------C-CATGTA-AT--TCT--AA-----AA-AGAATGATAAG-------------AG-AC--A-A--T---G-T------------------A--AAC---A-----TAT-C------AAT-ACA---T-GT--T--TT-A--------AACCA-ATTT-GTCG---T-----AC--------A--TT--TAT---ATCACAT
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gi|26 : GTCTCAT---CAT---------ATATACA-GCA------------------A-T-----A--TA-A--AA-C-A--------T-----A------C-AT--TACAA-TA-A-C---AC-A-T--A----AGAAGATGTACATATGTC-AT--TCT--AA-----AATAGAATTATAAG-------------AG-AC--C-A--T---A-TT--------------------AAC---A-----TAT-CTAAGAAAAC-ATA---C-A---T--TT-A--------A---T-ATAT-ACCA---C-----A-------------T--TAT--Atactttt
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gi|28 : aatTTCTTTC--TTTAAGTCTCAT---CATGGT----AAATACACA-GTA--TACTATATATTACGTAA-T-----A--TA-A--AA-C-AATCT----T---T-A------T-AT--T-----TA-A-C---AA-A-TAAA----A---------A-CATGCC-AT--TCT--AT-----AA-AGAGTTATAAG-------------AG-AT--T-A--T---A-T--------T-----T--AA--AACAAGA-----CGT-C-------GT-ACATACT-A---T--TT-A--------Aagaaaatccatagacttcttgtattcacatagtattttatatcaacttgagaacattgttt
gi|29 : caTTTA--TTTAAGTAGAAT---CATTTT----AAATACACA-GTA--TT--------AACATTA-T-----A--TA-A--AT-T-A--------G---T-A------T-AT--C-----TA-A-C---AA-A-C--A----A---------C-CACCCC-AT--TCT--AT-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-AC--T-G--T---G-T--------T-----T--AA--AAC---A-----TAC-C------GAT-ACA---T-AT--T--TT-T--------AACCG-ATTT-ATCA---C-----A---------t
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gi|32 : taTTCTTTA--TTTAAGTCTCAT---CATGGT----TAGCACACA-GTA--TA--------TACACAA-TATCAAA--TA-A--AA-C-ATTCT----T---T-A------C-AT--T-----TA-A-CAAAAA-A-A--A----A---------A-CATGTC-GT--TCT--AT-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-ACTGT-A--T---A-TTAC--A--cgtttat
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gi|36 : tatatTTCA--TTCATGTCTCAT---CAT---------ATGTACA-------------------ATAA-T-----A--TA-G--AA-C-A--------GAG-T-A------T-AT--T-----TACA-T---AA-AAT--A----A---------CATATGTC-AT--TCT--AA-----AA-CGAATCAAAAG-------------A------T-A--T---A----------------T--AA--AAT---G-----TATAC------TAT-ACA---taacactatacaagtctctgaaaatgggtatagcgtattgattttgatgtataacttgatccaattttatact
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gi|42 : tatttataATGCCCAT--TCT--AA-----AA-AGAATTATAAG-------------AG-AC--A-A--T---G-ATACAAA--T-----C--AT--AAA---A-----TGT-T-------AT-ATA---T-G---T--TT-ttttttacatttttgtataaaaaaagatgaaaatccattgcttaacttgatttccgt
gi|43 : catTTCTTTA--TTTAAGTCTCAT---CATGGT----TAATACATA-GTG--TA--------TACATCA-T-----A--TA-A--AG-C-AATCC----T---T-A------C-AC--C-----TA-A-C---AA-A-T--A----A---------C-CATCCC-ATTATCT--TT-----AG-AGAATTATAAG-------------AG-AC--T-tgtgtagacagtctaaatatattcattattttattcatttgaaccttatgt
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