lowQualScore                  :                                                                                                                               111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                             333333        1                                                                   000000000000000000                               1111                           22222222       11111                                      1111111       2222222222222222222222222222222222                                               1111111111111             22222222222222                                                                         2222222222222                                   22222222222222                               
lowQualScore                  :                                6 8   33333  777777  11    4          11 222          11     1   11     11 1    777     1 5    777777777777777777    1             1      1     7777     22222    11     1   1 00000000       88888  2 11  111         11 1 111  1    2  9999999 2  1  9999999999999999999999999999999999 2 555555 333 111 1             111  1 77    1 7777777777777    11 1 1 3 99999999999999 11  11   999 111   4444     1 2222 66 2     333 333     1  3333333      2222222222222      2   1  1   11                11111111111111 1  1 555  333 222           5 
lowQualScore                  :                                . .   .....  ......  ..    .          .. ...          ..     .   ..     .. .    ...     . .    ..................    .             .      .     ....     .....    ..     .   . ........       .....  . ..  ...         .. . ...  .    .  ....... .  .  .................................. . ...... ... ... .             ...  . ..    . .............    .. . . . .............. ..  ..   ... ...   ....     . .... .. .     ... ...     .  .......      .............      .   .  .   ..                .............. .  . ...  ... ...           . 
lowQualScore                  :                                3 3   22222  000000  88    7          66 000          22     2   77     77 2    444     2 2    333333333333333333    2             2      2     8888     66666    55     1   1 11111111       44444  6 55  999         44 0 888  0    1  2222222 0  0  0000000000000000000000000000000000 1 111111 666 888 0             888  0 11    0 5555555555555    44 0 0 0 99999999999999 44  44   888 888   2222     0 1111 55 0     111 111     0  3333333      0000000000000      1   1  1   55                88888888888888 1  1 111  666 000           1 
consensus                     :                        TCTGTGCCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGTCCTTT--G---GACTAGAGACA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTCCG-AATTC-AATTCTTATA---GT-----C-C-GTAA-ATAACAGAAGACC-TAAAAT-TTACA-TTTAAGTT-----TCAT--TTTCT-AAA-TT-------TTTATCA----TTTAA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC---G---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------GAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CGGG-CTATA---CG--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCCGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------G--G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTCGCA
Reference ( gi|5 )            :                        TCTGTGCCGAGAAC-----TT---AA-CA--GGACAATAGTCCTTT--G---GACTAGAGACA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTCTA-AATTC-AGTTCTAATA-CGGT--AAGT-G-GTAA-ATAACAGAAGACC-TAAAAT-TTACA-TTTAAGTT-----TTAT--TTTCT-AAA-TG-------TTTATCA----GTTAA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--T----C-AA-AG-------TA-AT--TAC---T---T--------CA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-AAGAT-T------A------TTCC--A-T-T-T-------GAT-T-TA--AA--GTC-G-T---AGA----AATAG-T----CGAG-CTATA---CG--TTTGG-AA-------AACTTTA------------GTAGTCTGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTATC--------T--G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTCGTA
gi|20                         :                        TCTGTGCCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGTCCTTT--C---GACTAGATACA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AATCTA-AAATC-AATTCT--TA-------AAGC-CTGTAA-ATAAAAAAA--------------------TAAATT-----TCAT--TTTCA-GAA-TT-------ATTACCA----TTAAA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC---T---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---CT-T-AAGAT-T------G------CTTC--A-T-T-TC------AAT-A-TA--AA--GTC-------AGA----AATAG-T----CTGG-CTATA---CA--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCTGGT-TA-AAA--ATGCCATATACTGGGTCTT--------G--G-AC-A---AT---A---TCTATTTTTC
gi|14                         :                       aTCTGTGTCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGTCCTT---G---GAGTAGAGACT-TTCCA-AAA--TTAAA--T-AGTCCG-AATTC-AATTCTTATA---GT-----C-T-GTAA-ATGACAGAAGACC-TAAAAT-TTACC-TATA-------------------T-AAC-TT-------TTTATCA----TTTCA--TC---ATAGTTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-GT--TTT---G---T--------AA-A------TAAAT---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-T-------CCT-T-TT--AA--GTC-C-T---AGA----AATAG-T----TTGG-CTATA---CA--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCCAAT-AA-AAA--ATGTCATAAACTGGGTCTC--------G--A-AC-T---AT---A---CCTATTTTTcgc
gi|7                          :                       gTCTGTGCCAAAAAC-----TT---TT-AA--GGACCATAGTCCTTT--G---GACTAGAGACA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTCCC-AGTTC-AATTCTTATA---GT-----C-T-GTAA-ATAACAGAAGACC-TAAAAT-TTACA--TAAAGTT-----TCAT--TTTCT-AAA-TT-------TTTATCA----TTTAA--TA---ATAGTTTTA--T-T---CA-TTTT-CA--G----A-AG-AA--------A-AC--TGC---A---T--------CA-A------T---T---T-CT-------TCTT---GT-T-CATAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------GAT-A-TATTCG--GTC-A-T---AGT----AATAT-T----TGGG-CCATA---CA--TTTGG-AA-------AACTTCT------------GTTGTCCGGT-TA-AAAATATATGATAGACTGGGTCT---------T--GTAG-T---AT---A---TCTATTTTTCGCtcgaa
gi|4                          :                       gTCTGTGCCAA-AAC-----TTTTCAATCA--GCACTATATTCCCTA--G---GACAAGAGACA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGGTCG-AATAA-AATTCT--T----GT--AGTC-T-GTAA-ATAACAGAAGACC-TAAAAT-TTACAGTTTAAGTT-----ATTT--TTTCT-AAA-TT-------CCTATCA----AGTAA--TTGTTATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TACATGTACAT--------AA-A------T---A---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-AAAAA-T------G------TTAC--A-T-T-T-------AAT-TATC--AA--GTT-A-T---TGA----AATAG-T----CGAA-CTATT---CA--TTTGG-AA-------AACTTAT------------GTAGTCCGCT-TA-AAA--ATGTAATTGACTGGGTCTC--------A--G-GC-T---AT---A---TCTATTTTTCg
gi|16                         :                       gTCTGTGCTAAAAAC-----AT---TT-CA--GGACTATAATCCTTT--G---GACTAGAGACA-TTCCA-AAA--TGAAA--T-AGTCCG-AATTC-AATTCTTATA---GT-----C-C-ATAA-ATAACAGAAGATC-TAAAGT-TTACG-TT-ACTTT-----TTAT--TTTCT-A----------------TCA----TTTAA--TC---ATAATTTTG--T-T---AA-A-TT-CA--G----C-TA-AG-------AA-AC--TAC---G---T--------AA-A------T---T---T-CTTCCATCATCTT---GCAC-AAG-T-T------G------TTCC--A-T-TGT-------GAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AAAAG-T----GGGA-TTACA---CA--TTTCG-AA-------AACTTTT------------ATGGTCTGAT-TA-AAA--ATATCATAGACTGGGTCTC--------G--G-AC-T---TT---A---TTTATTTTTCGacag
gi|19                         :                        TCTGTACCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGTCCTTT--G---GACTAGAGATA-TTCAA-AAAAATGATA--T-AGTCCA-AATTC-AATTCTTATA---GTCAAAA------AA-ATAACAAAAGACC-TAAAAT-----------AGTT-----TTAT--TT-CT-AAA-TT-------TATATCA------TAAAGTC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAT---G---T--------GA-A------A---T---T-CTCCTAACATCTT---AC-T-CAGGT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------AAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-C----CAGG-CTATA---CA--TTTTG-AA-------AACTTTT------------GTAATCGGGT-TA-AGA-------ATAGACTGGGTGTA--------G--G-AC-T---AT---A---TCC-TTTT
gi|9                          :                       gTCTGTGCCAAAAACATTTCCT---AA-C------TAA-AGTCCTTT--A---GACTAGAGACA-TTCCA-AAA--TGACAATT-AGTCCA-AATTC-AATTC-AATA---GT-----C-T-GTAA-ATAACAGAAGACC-TAAC-C-TTACA-TT-AAGGT-----TCAT--TTTCT-AAA-T--------CTTATCA----TTTGA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--AAC---G---T--------AA-C------T---G---T-CTCCCAGCATCTT---GC-T-GAGAT-T------G------TCTC--A---T-C-------GAT-A-AA--AA--GTC-A-A---AAA----AATAG-C----CGGG-CCATA---CA--TTTGG-TA-------AACTTTT------------GTAGTCTGGT-TA-AAA--AT------GACTGGGTCTC--------G--G-AC-TA--AT---ACTTTTCATTTTTCGC
gi|3                          :                       gTCTGTGCCAAATAC-----TT---TT-CA--GGGCTATAGTCGTTT--G---GGCTAGAGACT-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTTTG-GATTC-ATTTCTTATACCGGT--AGTC-C-ATAA-ATGACCGAAGACC-TCAAAT-TTATA--TTAGGTT-----T--T--TTACT-AAT-TT-------TTTACTC----TTTCA--TA---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC---G---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAATAT-TT---GC-T-CAGAT-TC-----AATCTGCTTCC--A-T-T-TC------GA--C-AA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CGGA-CTATA---CA--TTCAG-AA-------AATTTT-------------GTAGTCAGGT-TA-AAA--ATGTCATAACCTGGGTCTCGGACTAGTT--G-AC-T---ATAG-A---TCCATTTTTTGC
gi|2                          :                        TCTGTGACAAAAAT-----TT------CA--GGAATATTGTCCTTT--G---GACTAGAGACA-TTCCA-AGA--TTACA--T-ATTCCA-AATTC-AGTTAT--TA----T--AGGT-T-GTAA-GTAACAGAAGACC-TAAAAT-TAACA--TTAAGTT-----TTAT--TTTTTCAAA-TACCATTTTTCTACCA----TTTAA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-ACTGTAA---T---T--------AG-A------T---T---T-CTCCCAACATCTC---AC-T-CAGAT-T------G------TTTC--A-T-T-TC------AAT-A-TA--AA--GCC-A-T---AGA----AATAG-T----CTTG-CCACA---CA--TCTGT-AGTCCACACATCTGTAGTCCACACATCTGTAGTCTGGT-TT-GAT--ATGTCATGGGCTTGGTCTC--------G--G-AC-T---AT---A---TATATTTTTCg
gi|30                         :                       gTCTGTACCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGAGTATAGTCCTTT--G---GACTAGAGACA-TTCCA-AAA--TTAGA--T-AGTCCT-AATTC-AGTTCTTATA---GT----CT-G-A-AA-ATAACAGTATACC-TAA-------------AAGTT-----TTAT--TTCTT-GAA-TT-------TTTATCA----TTTAA--TC---ATAA--TTA--T-T---CA-GTTC-CA--G----C-AA-AA-------AA-AC--TAC---A---T--------AA-A------T---T---T-CTCCTATCATCTT---GG-T-AAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------AAC-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AACAG-T----CAGG-CTATA---CT--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCacc
gi|8                          :                       gTCTTTGTCATAAAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGCTCTTT--G---GACTAAAGTCA-TTCCA-AAA--TTACT--T-AGTCCG-AATTC-AATTCT--T--C--T--TAGTCC-GTAA-ATAACAAAAGACC-TAAACT-TGAGA--TTAAGAT-----TTAT--TTTCT-AAA-TT-------ATTATCA----TTTAG--TC---ATCATTTCA--T-T---CA-GTTT-TA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC-------A--------CACA------T---T---T-TCCCCAAAATCAT---GC-T-CAGAT-T------G------TTTC--A-T-T-TC------GA----TA--CA--GTC-A-T---AGA----TATCG-T----CGGG-CTATC---CG--TTCGG-AA-------AATGTT-------------GTAGCCCGTT-T---AA--ATGTCATTGACCGGGTCTC--------G--G-AC-T---AT---A---TATATTTTT
gi|22                         :                        TCTATGCCAAAACC-----TT---TT-CA--GGAC--TAGTCCTTT--G---TACAAGAGACA-TTCCA-AAA--TTATA--T-ATTCCG-CATTC-AGTTC--ATA----T--AGGC-A-GTAA-ATAACAGCAGACC-TACCAT-TTATA--TCAAGTT-----TCAT--TTTCT-AAATTT-------TTTATCA----TTTAA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----CAAA-AG-------AA-AC--TA----T---G--------CA-----------------------AATATCTT---GC-T-A------------A------TTTC--A-A-T----------AT-T-----AA--CTC-A-T---GAA----AATAG-T----C-AG-CTATA---CA--TTTCG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCCAGT-TA-ATT--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------C--T-AC-T---TG---A---TCTATTTTTTGCagcag
gi|15                         :                       gTCTGTGTCAAACAC-----TT---TT-CA--AGACTATAGTCATTT--A---GACAAGAGACT-TTCCA-AAA--CTA-------GTCCG-AATTC-AGTTCTTATA---GT-----C-C-GTAA-ATGACAGAAGACC-ATAAAT-TTACA-TT-AAGTT-----TC-T--TTTCC-AAC-TT-------TTTATCA----TTTTA--TG---TTAGTTTTA--C-T---CA-GCTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AT--TAT---G---T--------AA-A----------T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-GAGAT-T------G------TGTC--A-T-T-TC------CAT-A-TA--AA--GTA-A-T-----------ATAG-T----CAGG-CTGTT---CA---TTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCCGGT-TA-AAA--A-AAAACAGACTGGATTTC--------A--G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTCGCg
gi|33                         :                        TCTGTGCCAAAAAC-----TT---A------------TAGTCCTTT--G---GACTAGAGATA-TCTTA-AAC--TTTCA--T-AGTCCG-AATTC-AATTCTTATA---GT-----C-C-ATAA-ATAACAGAAGATA-TAAAAT-TTACA-TTTAAGTT-----TTAT--TTTCT-AAA-TT-------TATACCA----TTTCA--TC---ATAGTTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG--------A------AC---A---T--------AA-T------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTTC--A-T-TGC-------AAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AAA----AATTG-T----CAGG-CTAT----CG--TTTAA-AA-------g
gi|31                         :                       gTCTGAACCAAAATC-----TT---TT-CA--GGACTATGGTCCT------------------A-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTCTG-AATTC-AATTCTTATA---GT-----C-T-GTAA-ATAAC---TGACC-T-AAAT-TTACA-TTC-AGTT-----TCA
gi|25                         :                       aTCTGTGCCATAAAC-----TT---TT-CA--GGACTACTGCCCTTA--A---GACTAGAAACA-TTCCA-AAA--TTTTA----AGTCCG-AATTC-AATTCT--T--C--T--TAGT-CCATAA-ATAACAGAAGACC-TAAACT-TTACA-TC-AAGTT-----TTAT--TTTCT-AAA-TT-------ATTATCA----TTTAA--TC---ATAATTTTA--A-TAAGTA-GTTT-CATTT----C-AATAG-------TC-AT--gcaaagaaactacgtaaatttctcccaacatcttgctatgattgctctatttcaatataaagtcatagaaatagtcagactatacgtttggaaaaacttttgtactcttgttgaaaaagtaagactgggtctcagactgtatttatatttcgc
gi|34                         :                       gTCTATGCCAAACAC-----TT---TT-CT--TGACTATAGTTCTTT--G---GACTacaaatggtcagactatatgtttggaaagttcttgcagtctgcttataaaatttcatagactgggtctttgactatatctattttatcacgg
gi|43                         : gacaatttaggatattattccagTCAGTGCCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGACTACAGTCCTTT--G---AACT--AGACATTTCCA-AAC--TTAC-----AGTCCG-CATTC-AATTCTTATA---GT--CTGT---GTAT-TTGATAGAATACC-GTAAAT-CTACA--TTAAGTT-----TCAT--TAT-T-AAA-TT-------TTTATC--------------------ATTGTA--T-T---CA-ATTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC---G---T--------AA-AGTGACCT---TTAGT-CACCCATCATCTT---GC-T-GAGAT-ttttatcatttcatcataaatttattcagtatcagcaaagaaactaagtaaattctgcttacatcttgctcagattgtttcatttcaataaaaatcaatagatatagtaagttgggctatgcttttggaaaacatttgtagcccggttaaaaatgtcatggactatctatatttttcgcag
gi|58                         :                       gTCAGTGCCAAAAAC-----AT---TT-CA--GGACTACAGTCCTTT--G---GACTAGAGACT-TTTAA-AAA--TCACA--TAAATCAG-AATTC-AATTTTTATA---GT-----C-T-GTAA-ATAACACAAAAGC-TAAAAT-TTACA--TTAAGAT-----TCAT--TTT
gi|68                         :                      agTCTGTGCTAA-AAC-----TT---TT-CA--AAACTATAATGCATT--G---GACTAGAGACT-TTCC
gi|6                          :                        gCTGTACTCAAAAC-----TT---TT-CATTAGACGATATTCCTTT--G---AACTAGAGACA-TT--A-AAA----A-A--T-AGTCCG-AATTC-A--TTTATTA----T--AGCC-C-ATAC-ATAACAGAAGAAG-TAAAAT-TTATA-TC-ATGTT-----TTAT--TTTTT-AAA-TT-------TATATCA----TTTAA--TA---ATAATTTCA--T-T---TA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AC-AC--TTC---T---T--------CA-T------T---T---G-CTCCCAACATCTT---GT-TTAAAAT-T------G------TTTC--A-T-T-TC------GAT-A-TA--AA--ATC-A-T---AGA----AATGG-T----CAGG-CTATA---CG--TCTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCCAGT-TT-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------G--G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTCGC
gi|17                         :                       gcCTGTGCCAAAAAC-----TG---TT-CA--GAGTTATAGTCATTT--G---AACTAGAGATA-ATCCA-AAA--TTACA--T-AGTCCA-AATT--AATTCTTATA-TTCC--A-------TAA-ATAACAGAAGACC-TAAAGT-TTG-----TAA----------AT--TTTCT-AAA-T--------TTTATTATTATTTTAA--TC---GTAATTTTA--T-T---CA-ATTT-CA--G----T-AA-AG-------AA-AC--TAT---G---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-AATAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------GAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AGTAG-C----CCGA-CTATA---CA--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAG--TAGTATA-AAA--ATGTCCAAGACTTG----------------G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTg
gi|21                         :                         CTGTGTCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGGCTATAGACCTTT--G---GACTAGAGA-----------A--TTACA--T-AGTCCG-AATTC-AGTTCT--TA-CGGT-----C-C-ATAA-ATGACAGA-GAC-------T-TTACA-TT-AAGTT-----TC-T--TTTAT-AAC-T--------TTTA-------ATT----TC---ATAATTCTA--T-T---CA-GTTT-TT--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAA---TA--TG-------TA-A------A---T---T-CTCCCAATATCTT---GC-T-CATAT-T------G------TTCCCCA-T-T-TCCA----GAT----A--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CAGG-CTGT----TA--TTTTG-AA-------AACTTTA------------GTAGTCCGTT-TA-TAA--ATGTCATAGACTTGGTCTC--------A--G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTCGCttgca
gi|56                         :                       gcCTGTGCCAAAAAC-----TT---TG-CA--GGACTATATTATTTT--G---AATTAGAGGCT-TTCCAAAAA--TTACA--T-TAT-TACAA--C-A-TTTTGATATCGGT--TA-C-A-GTAATATAAC--AAG--C-TCATATCTTAC--TATAACTA-----TTAC--TTTGT-GAA-TG-------CTg
gi|13                         :                         cTGTGCCAAAAAC-----TT---TTTCA--ATACAGTACTGCTTT--G---GACTAGAGACT-TTACA-AAA--CTACA--T-ATTCAG-GATTC-AATTCTTATA---GT-----C-T-GTAA-ATGACAGAAGACC-TTAAAT-TTACA-TTAAA--T-----TTCT--CTTCT-CAT-TT-------TGTATCA----TTTCA--TC---ATGATCTTA--T-C---CA-GTTTTCA--G----C-AA-AG-------AA-AC--T-C---TG--T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAAAT-T-------------------------T-------GAT-T---------GGC-T-T---CCATTTTAATA--T----TAAGTCTGTA---CA--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTTCAAT-GA-AAA--GTGTCATATACTAGGTCTC--------G--G-GA-T---AT---A---TCTATTTTTCGC
gi|12                         :                       gtgTGTGCCAAAAAC-----TT---TTTCA--ATACAGTACTGCTTT--G---GACTAGAGACT-TTACA-AAA--CTACA--T-ATTCAG-GATTC-AATTCTTATA---GT-----C-T-GTAA-ATGACAGAAGACC-TTAAAT-TTACA-TTAAA--T-----TTCT--CTTCT-CAT-TT-------TGTATCA----TTTCA--TC---ATGATCTTA--T-C---CA-GTTTTCA--G----C-AA-AG-------AA-AC--T-C---TG--T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAAAT-T-------------------------T-------GAT-T---------GGC-T-T---CCATTTTAATA--T----TAAGTCTGTA---CA--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTTCAAT-GA-AAA--GTGTCATATACTAGGTCTC--------G--G-GA-T---AT---A---TCTATTTTTCGC
gi|67                         :                       gtgTATGCCAAACAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGAGTTTT--G---GACTAGAGACC-TTTCA-GA
gi|18                         :                           GCGCCAAAAAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGTCCTTG--G---AATTAGAGACA-TTCCA-AAA--TTACA--T-TGTCCG-AATTT-AATTATTATA---GT--CTGT---------TAACAGAAGACC-TACAAT-TAACA-TT-AAGTT-----ACAT--TTTCT-ATA-TT-------TTTATCA----TTTAA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-G-------------C-AA-AA-------TC-AC--TAT---G---T--------TA-A------T---T---C-CCCCCAACATCTG---GC-T-AAGAT-T------G------TCCC--A-T-T-TCAAA---AAT-------AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----TGGG-CTATA---TA--TTTGG-AA-------AACTTAT------------GTAATTCAGT-TC-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------A--G-AC------T---A---TCTATTTTTCt
gi|11                         :                            TGCCAAACAC-----TT---TT-CA--GGACTGTAGTTCTTC--A---GACTAGAGACT-TTCCA-AA----TACA--T-AGTCTA-AATT---GTTATAGT-------------------------------CC-TAAAAT-TTGCA-TTTAATTTAAGTATTAT--TTTCA-AAA-CT-------TTTATTG----TTTCG--CC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CT--G----C-AA-GGACTTATATA-GC--TCC---T---TGGTTTCAGCA-AAGAA--T---T---T-ACGTGAACTTCTT---GC-T-CAGAT-T------A------TTTC----------------GAT-A-AA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CTGG-CTATG---CA--T--GG-AA-------AACTTTT------------GTAGACAGGT-TA-AAA--ATGTCATCGACTGTGTCTC--------A--G-AA-T---AT---A---TCTAGTTTTTGCaca
gi|44                         :                         ttcTGCCAAAAAC-----AT---TT-CT--GGACTATAGTCCTTC--G---GACTAGAGAAT-TTCCA-AAA--GTACA--T-TGTCTG-CATTC-AATTCTTATA---GT-----C-T-GTAA-TTA-------ACC-TAACAT-TTACA--TTAAGTT-----TCAT--TGTCT-AAA-TA-------TTT-TCA----TTTTA--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-GG--------A-CT--TAC---g
gi|10                         :                                   AAC-----TT---TT-CA--GGACTATAGTCCTTT--G---AACTAGAGACA-TTCAA-AAA--TTACA--T-AGCCTG-TATTC-ATTTTTTATA-GCCT---------GTAA-ATAACAGAAGACC-TAAAAT-TTACA-TT-AAGTT-----TCGT--TTTCT-AAA-TT-------TTTATCA----TTTAA--TC---AAAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--AAC---G---T--------TT-A------T---T---T-CTCCCAACATTTT---GC-T-AAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------AAT-A-AA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----TGGG-TTATA---CA--TTTGG-A-----------------------------AGTCCGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------A--C-AC-T---GT---A---TCTTTTTTTatagtggtctttggtttcagaatagtagctacataaa
gi|51                         :                                                 gtctgtgaaaaaaacaCCTTTCAG---GACTCGAGACA-TTCCA-AAA--TTTCA--C-AGTCCA-AATTgcag
gi|29                         :                                                     tctgtgccaaaaaCTTT--GCAGGACTTGAGACA-TTTCA-AAA--TTACA--T-AGTCAA-AATTC-AGTTCTtcttcctttattcatgtagaaataaaaaaaaaatattgaacttaaaagagagtgaagtttctttttttgctgagtatatataatctaaatccctatatat
gi|28                         :                                                             tgccaaaaa--G---GACTAGA--CA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTCCG-AATTC-TATTGT--TA-TGGT-------------------------CCATAAAAT-TTACA-TC---GTT-----TCAT--TTAAT-AAA-TT-------TTTATCA--------------------TTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----T-AA-AG-------AA-AC--TAC----------------AA-A------T---T---T-CTCACGGCATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------GAT-A-TA--AA--GTC-A-T---TGA----AATAG-T----TGGA-CTATA---TG--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTTCAGT-T--AAA--ATGTCATAGACT--GTTTC--------CAGG-AC-TATGAT---A---TCTATTttacattacattttattttctaaatttatatcatttaatcataattttatccagtttcagctaaaaaaactatgtaactttctcccaacatcttgctcaaattgttccattacaatataaaatcatagaaatagtcagactttacgtttggaaattttttgtagtccagttaaaaatgtcatagactgggtctcggactatatatat
gi|27                         :                                                     ttcaggactattataca--G---GACTAGA--CA-TTCCA-AAA--TTACA--T-AGTCCG-AATTC-TATTGTTATA--------------GTCA-ATAA-------------AAT-TTACA-TC---GTT-----TCAT--TTAAT-AAA-TT-------TTTATCA--------------------TTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----T-AA-AG-------AA-AC--TAC-----------------ACA------T---T---T-CTCATGACATCTT---GC-T-CATAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------GAT-A-TA--AA--GTC-A-T---TGA----AATAG-T----TGGA-CTATA---TG--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTTCAGT-T--AAA--ATGTCATAGACT--GTTTC--------TAGG-AC-TATGAT---A---TCTATTTTc
gi|46                         :                                                                          ttcaggactattatacaCA-AAA--TAACA-----GTCCA-AATTTTAATTCTTATA---GT--CAGT-----AA-ATATCAGAAGACC-TAAAAT-TTACG-TT-AAGTT-----TTAT--TTTCT-CAA-T--------TTTATAA----TTTAA--CC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AGA------CA-CT--TAC---A---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACGCCTT---AC-A-CAGAT-T------G------TTTC--A-T-T-TC------AAT-A-TA--A----TC-A-T---AGA----AATAG-T----CGGG-CTATA---CG--T
gi|37                         :                                                                                                                                                  TAA-ATGACATGAGACC-TAAAAT-CT----TT----TC-----TTAC--TT-----------------TTTATCA----TTTCA--TC---ATAA-TTTA--T-T---CA-GTTT-CA--GAAAAG-AA-AG-------TACATG-TAC---G---T--------TA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAGTT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------AAT-T-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----TGGG-CTTAA---CA--TTTGG-GA-------AGCTTTA------------TTAATCCGGT-TC-AGA--ATGTCATACACTGGGTCTC--------T--G-AC-T---AT---A---TCTATATTTTG
gi|38                         :                                                                                                                                                                     AAAAT-TGACA-TT-AGATT-----TCTT--TTTCT-AA--TT-------TTTATCA----TTTAA--TC---ATAATCTTG--T-T---TC-ATTT-CA--G----C-AA-GG-------AA-AG--TAT---G---T--------AA-A------T---T---T-TTCCCAACATCTT---GG-T-CATAT-T------G------TTCC--G-T-A-TA------GAT-A-TA--TA--GTC---T---AGA----AATAG-T----CAGG-CTATA---AG--TTTGG-AA-------AACATTT------------GTAGTCTGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------G--A-ACTT---ATAAAA---TCTATAATTCGCc
gi|29                         :                                                                                                                                                                        aT-TTACA-TT-ACATT-----TTAT--TTTCT-AAA-TT-------TATATCA----TTTAA--TC---ATAATTTTA--T-C---CA-GTTT-CA--G----CTAA-AA-------AA-AC--TAT---G---T--------AA-C------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAAAT-T------G------TTCC--A-T-TAC-------AAT-A-TA--AA--ATC-A-T---AGA----AATAG-T----CAGA-CTTTA---CG--TTTGG-AA-------ATTTTTT------------GTAGTCCAGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------G--G-AC-T---AT---A---TATATga
gi|41                         :                                                                                                                  tgccaaaaactttgcaggacttgagacatttcaaaattacatagtcaaaattcagttcTACA-TT-AAGTT-----TCAT--TT-----AA-TG-------GTTATTA----AT-AA--TC---ATAGTTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC---T---T--------AA-A------T---T---T-TTCCCAACATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTCC--ATT-T-T-------GAT-A-TA--AA--GTCTG-TCAAATA----AAT-G-T----TTGG-TTATA---CG--TTTGG-AC-------AACTGT-------------GTAGTCTGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGCCCA--------A--G-AC-T---AT---A---TATAATTTTC
gi|31                         :                                                                                                                                                                               A-TTCAATTC-----TTATAGTCTGT-AAA-T--------------A----ACTGA--CC----TAAATTTACAT-T---CA-GTTT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAC---G---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-ATGAT-T------G------CTCT--A-T-T-TC------AAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CAGA-CTATA---CG--TTTGGAAA-------AACTTTT------------GTACTCTTGT-TG-AAA--AAGT-A-AGACTGGGTCTC--------A--G-AC-T---GT---A---TTTATATTTCGac
gi|39                         :                                                                                                                          atctgaaccaaaatcttttcaggactatggtcctattccaaaattacatagtctgaTTAAGTT-----TTAT--TTTCT-AAA-AT-------TTTATCA----TTTAA--TC---AAAATTTTA--T-T---CA-GTAT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TGG---C---T--------AA-A------T---G---T-CTCCCAACATCTT---GC-T-CAAAC-TGTTGAAG------TTCC--A-T-T-TC------AAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----TGGG-CTATA---TG--TTTGG-AA-------AACTTTC------------GTAGTAAGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGCTCTC--------TTGG-AC-T---AT---A---TCTATTTTTCGCc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                      aTT-----TT-T--TTTTT--------------TTTGCCA----TTTCA--TC---ACAATTTAA--T-T---CA-GTTT-CA--G----C-TA-AG-------AT-AC--TAT---G---T--------AA-G------T---T---T-CTACCAACAACTT---GC-T-CAGAC-T------G------TTTA--A-T-T-TC------AAT-A-TA--AA--GCT-A-T---AGA----AATGA-T----TGGA-CTTTA---CG--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                -------TTTATCA----TTTCA--TC---ATAAATTTA--T-T---CA-GTAT-CA--G----C-AA-AG-------AA-AC--TAA---G---T--------AA-A------T---T-----CTGCTTACATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTTC--A-T-T-T-------CAA-T-AA--AA--ATC-AAT---AGA----TATAG-TAAGTTGGG-CTATG---CT--TTTGG-AA-------AACATTT------------GTAGCCCGGT-TA-AAA--ATGTCATGGAC----TATC--------T--A-------------------TATTTTTCGCc
gi|48                         :                                                                                                                                                                       gacaatttaggatattattccagtctatgccaaacacttttcttgactatagttctttggactt--TC---ATAATTTTA--T-T---CA-GTTT-TA--A----C-AA-AG-------AA-AC--TAT---G---T--------AA-A------TAAAT---CACTTCCAATATCTT---GC-T-CAAATCT------AATTTGCTTCC--A-T-T-TT------GAT-A-GA--AAAAGTC-G-T---AGA----AATAG-T----CAGG-CTATA---TG--TTTAG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCTGGT-TG-AAA--ATGTCATAGACg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                AACTTTA--CAT---CAAGTTT-TA--TTTT-C-TA-AA-------TT-AT--TA--------T--------CA-T------T---T---A-ATCATAA--TTTT---AA-T-AAG---T------AG-----TTTC--A-T-T-T-------CAA-T------A--GTC-A-T---ACA----AATGG-T----CAGA-CTATA---TG--TTTGG-AA-------AGTTCTT------------GCAGTCTGCT-TATAAA--ATTTCATAGACTGGGTCTT--------T--G-AC-T---AT---A---TCTATTTTatctattttttg
gi|49                         :                                                                                                                                         gtctgtgccataaacttttcaggactactgcccttaagactagaaacattccaaaattttaagtccgaattcaattcttcttagtccataaataacagaagacctaTTTA--T-T---CA-GTTT-CA--G----A-AA-AG-------AA-ATA-TA--------T--------CA-A------T---T---T-C----ATCATCTT---GC-T-CAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TT------GAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CGGG-CTATACT-CC--TTTGG-AA-------AAATTTT------------GTAATCATGT-TT-AAA--ATGTC--AGACTGAGTCTC--------C--G-TA-T---AT---G---TCT-TTTTTCGCatcacgg
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AA-AA-------TT-AT--TAT---G---T--------TA-A------T---T---T-CTCCCAACACCTT---GC-T-AAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TCCATTTTGAT-A-TA--AA--GTC-A-T---AGA----AATAG-T----CTGG-CTATAGTACAAATTTGG-AA-------AACTTTT------------GTTGTTCAGT-TA-AAA--ATGTCATAAAATGGGTCTC--------G--G-AC-C---TT---A---TCTATTTTTCGT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                           tttccatttcatgaacctatttgtcgacaaaaaagctgggtactC---T---T--------AA-A------T---T---T-CTCCCAACATCTTCTTGC-T-CAGAT-T------G------TTCC--A-T-T-TC------AAT-A-TG--AA--GTC-A-T---ACA----GAAAG-T----CAGG-CTTTA---CG--TTTGG-AA-------ATTTTTA------------GTAGACTGGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--------A--G-AC-T---GT---A---TCTATTTTg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gcaatgatactAATATTTT---A--T-AAAAT-TGTC---A------TTTT--A-TGC-T-------GAT-A-TA--AA--GTT-G-T---AGA----AATAGAT----GGA---TATA---GT--TTTGG-AA-------AACTTTT------------GTAGTCTGAT-TA-AAA--ATGTCGTAGACTGGGT-TC--------A--T-AC-T---AT---A-----TATTTTTCc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             gtcataaatcaatcaaaatcaagaaggcgaactccatgtaacagtttttatactgaattaaagtcattttactaaattaaaaa-AAAAG-T------A------CTGT--A-T-T-T-------GATCT-T-------GTTTG-T---AGA----CATA-------------TATA---C---TTTG--AA-------AACTTT-------------GTAGTCTGGT-TA-AAA--ATGTCATAGCCTGG----------------G-AC-T---AT---A---TCTATTTTTTGCacagactgt

Unaligned ( gi|1 ): GTGTAGACACGAATTTGATATGGGTGCGGCTAAATATTTTACAAAACTTGTAATGGTGTAGTCTTTAAAGCGAGGAGCACCTTTGATATCACCGGCCACATTTAAGACAATTAAAAACGAGGAAATATGGGAAATTATTGGTGCGGCATACACAATAAATTTAGAAAATATTAGAAATTAGCTGAAAATGTAGAAACGTTTTGATATTATTGGTAAGGCATTCCGCGGCAATATTAGCATTGGCGCACCATACCGCACCTGTGTCTATACGTCAATGAGAAAGATGAGTATATAATACAAACTTTATATTGTTTTAAAGAACCCGTAACAAAATATTATATTAGAATAACATACATTTTATTTGATTCGAATTCGTTACCAATACAAGATGTTAGTCGTTTTCAAAAAAATGAAAATA
Unaligned ( gi|23 ): GTAGACACGAATTTGATATTGATGCGGCTAAATATTTTACAAAACTTGTAATTTCGTAGACTTTAAAAGCTCTGCACAAAATTGTTTATTTTTTCGAATAAGAATCAACAATTACAAACGCCATCATTGTTCAAATTTAAGATAATTATAAAACAATCGAAATGGGAAATTATTGTTGCGGCATACAAAATAAATGTAAAAAAATGTGGGAATTAGCTAAAAATGTATAAAAGTTTTTTATTTATTGATTGCCGCACCATGCCGCACCCGTGTCTACGCC
Unaligned ( gi|24 ): GCGCAGACACGAATTTGACATTGGTGCGGCTAAATATTTTACAAATTTAAGATAATTATAAAACAAGGAAAATGTAAAATTATTGGTGCGATTTACACAATAAATGTAAGAAATTGTTTTTAAATAACCTCAAAATATGGAAAGTTTTGAAATTATTGTTGCTACATGACGCACCAATATTGCTTATTGCCGTACCACGCCGCATCCTTGTCTACATCCATGTAAGTTTAAGTATACATGCAATTCCATTTTATTCGTAGTTTGTTTTCCTGTAACCAA
Unaligned ( gi|26 ): AGACACGAATTTGATATTGGTGCGGGTAAATGTGTCAAAACTTGTAATTTTGTTGACGTAAAACGAGTAGCGCTAGTCGTGGCAGTTCTACACTAAACGAATCAACAATGGCAAATGTAAACATCTTTTGAATTCAAGAAAATTATAAAACAAGACAAAAATGGAACTTACAAAATATATGTAAAAAAAAATACAATAAGCTAAAATGCGTAGAAAAATCTTGGAATAATCAGTGCCACAATACCGCGCCATGCTGCACTTGTGTCTACGCA
Unaligned ( gi|32 ): GTATAGATACAAATTTGATATTGGTGCAGCTAAATATTTAACAAACTTGCAATCAATTCTAATTTATGCTGATTTGTTTGAAAGAAACAATGCCGTCATCGTCCGAATTTACGATAAATTACAAAACAAGAATAAATGGGAAATTATTGTCGAGGCATACAAAATAAATGTAAACAATTTTTGAAATTAGCAAAAGATGTAGAAAAGTGTTGAAATAATTGATGAGGCTTGTTGCAGCAATATTTATTATTGATGCAGC
Unaligned ( gi|36 ): GATACGAATTTGATATTGGCTAATTATTTTTCAAAACTTGTAATCAATTCTAAAATGTTGATTTGTTCGAAAACGAAAGAGCTATGGCAAATTTAAGATAATGATAAAGCGAGGAAAAATGTGAAATTATTGGTGAGACATACAAAATAGATGTAAAAAATGTTGAAATAAGCTAAACATATAAAATCAAGTTACTAATTATGGGTGCCGCATCATGCCGCACCAGTGCCTACGT
Unaligned ( gi|45 ): CGTAGAAACAGATTCGATAATGGTGTGGCTGAATATTTTACAAATTTAAGATAATCATAAACTAAGAAAAAAATGAGAAATTATTTGTGTGGCAATAAATGTAAAAAAAAGTTTAGAAATTAGCTTAAAAATGAAGAAATTGGAAATTATTGTACTGCACCAATATAATTGATAATGCCGCACCCATGTCTTAAGCCCATGTG
Unaligned ( gi|47 ): GGCGAAGACACGAATTTGGTAGTGGTGCGACTAAATATATAAGATAATTATAATACAAGAAAAAAAAGGGATATTATTGGTGCGGCATACAAAATGTATGTAAATAAAAGTGGGGAAATTAGCTTAAGATTTGTAGAAAAGTAATTGGTGCACTATGACGCACACATGTCTACAC
Unaligned ( gi|50 ): AGCAATGACAAATGTCATCATCTTCCGAATATAAGATTATTATACAAAAATTAATAAAATATTTGTGAGGCATAGAAAATAAATGTAAAAATGTTTGGCAACTGGCTAAAATTGTAGAAAAGTTTTGAAATTATTGGTGCGGACGCACCTATGTTTGCAC
Unaligned ( gi|52 ): TGTATTATTCCTAGCCAACTTAGTTTGATTAGCCTACAGTATTAAAAGTAATATTTCATGAATCTTTCAGATATCTGTAGGAGACTTTTAAATGTTTCAAATGATGTTTCAGTATTACTAGCAAATTTAAAAGTAAGATTTCATGAATCTTTCA
Unaligned ( gi|53 ): ATAGTGCGCGGCTTAATATTTTAACAATTTAAGATGATTATAAAACAAGAAAAACTTCGATGTTACTGATGCGGCAAACAAAATAAATGTAAAAAGGTTTGAAAATTAGCTAGAATTGAAATTATTGGCGCGGTAATGATTCACCTCTACGCCC
Unaligned ( gi|57 ): ATAGACACGAATTTGGTATTGGTGCGGCTAAATATTTTAAAAAAACACGATTTGTTTAAAACTGAATCGACAATGACAAATGTCATCATTGTTTTAAGTTTTAAGATAGTTATAAAAATAAGAAAAAATGGCTGAT
Unaligned ( gi|59 ): TTAAGATAATTATAAAACAAAATAAATGTAGCGGACGTTTAGAAATTAGCTAAAAACGGTAGAAATGTTTTAAAATTATTGATGCGACATGCCCACGTGTCTATGTCC
Unaligned ( gi|60 ): TTTTTTTACAAAACACCGATCAATTCTAAAATGTTGTTGTGTGCGAATCCGAAGTTAAGACATATAAGATAATTATAAAACAAGGGAAATATGGGAAAGTATTCGGT
Unaligned ( gi|61 ): CATAGATACAAATTTGATATTGGTGCACCTAAATCTGTAAAAAAAAACTTGTAGACATAAAAATGAGCAGCACCAACAAATCAACAATGCTATCATCGTCCGA
Unaligned ( gi|62 ): GCATAGACACAAATTTTATATTGGTACGACTAATTATTTTACAAAACTCATAATTTTGTAGACTTTAAACAAGCACTAC
Unaligned ( gi|63 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT
Unaligned ( gi|64 ): GTGTAGATACAAACTTGATATTGGTGTGGCCAAATATTTTATCATTCGTGAAATGGTGTTTTTA
Unaligned ( gi|65 ): TGTAGATACAAACTTGATATTGGTGTGGCCAAATATTTTATCATTCGTGAAATGGTGTTTTTAA
Unaligned ( gi|66 ): AAAGTTTAGAAATTAGCTAAAAAAACCATTAAAATTAATGGTGCGACATTAGTGTCTACGCCC
Unaligned ( gi|69 ): TGCCTGTGCCAAAAACTTTGCAGGACTATATTNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|70 ): AAATGAAATCATTTTATGAAATTAAATATACTGTC
Unaligned ( gi|71 ): GCGTAGACACGAATTTGATATTGGTGCGGCTAAAT
Unaligned ( gi|72 ): GTCTGTGCCAAAAACTTTTCAGAGCTATAGA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                 2222    2  3333                           1    1    11     11 1        1   1        555555  11  222 33  11   22        44444444               0000     22222  0    111  1   3333333    11 1       4444  333333 111   22222   6666666666666666   11 33333333 111   2       1   1     1  111 11  222222 2222 2222 222222 333 111 1             111     55555  1 555555  44  222222  11     5555555     11  3333   1        2222    1       333 222     1 2222               666666666666666   1  1   11                   11    1 555 1 666666666 111             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                 ....    .  ....                           .    .    ..     .. .        .   .        ......  ..  ... ..  ..   ..        ........               ....     .....  .    ...  .   .......    .. .       ....  ...... ...   .....   ................   .. ........ ...   .       .   .     .  ... ..  ...... .... .... ...... ... ... .             ...     .....  . ......  ..  ......  ..     .......     ..  ....   .        ....    .       ... ...     . ....               ...............   .  .   ..                   ..    . ... . ......... ...             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                 4444    1  7777                           1    1    66     66 2        2   2        999999  77  111 55  66   88        33333333               7777     66666  5    888  1   4444444    44 1       5555  000000 888   66666   8888888888888888   44 77777777 888   1       0   0     0  888 44  999999 2222 2222 999999 666 888 0             888     00000  0 888888  88  999999  44     9999999     44  5555   0        1111    7       000 888     0 1111               666666666666666   1  1   55                   55    1 000 1 444444444 999             
consensus                     :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
Reference ( family-3062 )     :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
gi|10                         :                                                                                                                                                   TCTGTGAAAAAAACAAACTTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGAACTAGAGACA-TTCA-AAAA--TTACA--T-AGCCTGTA-TTC-ATTTTTTA------TA--GC---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TT-AAGTT-----TCGTTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---AAA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-AA---C--GT------T----T----A------T---T---T-CTCCCAACATTTT---GCTAA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATAAA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGTTATA---CA--TTTGG-A--------------AGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--ACAC-T---G-T---------A---TCT-TTTTTTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                      gTGCCAAACAC----TTTT-CA----GGACTGTAGTTCTTCAGACTAGAGACT-TTCC-AAA----TACA--T-AGTC------TA-AATTGTTA------TA--GT---C-C-----------------------------TAAAATTTGCA-TTTAATTTAAGTATTATTTT---CA-AAA-------CTTT--T-ATTGTTT---CGC------C---ATAATTTTATTCAGTTTCTGCAAGGACTTA--TATAGCTCCT---TGG-TTTCAGC-AAA-GAATT-TA---C--GT------G----A----A------C---T--------------TCTT---GCTCA-----GA-T------T---------------ATTTC------GATAAA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCTGGCTATG---CA----TGG-A----AAACTTTTGTAGACA---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATCGACTGTGTCTC--AGAA-T---A-T---------A---TCTAGTTTTTGCAg
gi|12                         :                                                                                                                                                  ttcTGTGCCAAAAAC----TTTTTCA----ATACAGTACTGCTTTGGACTAGAGACT-TTAC-AAAA--CTACA--T-ATTCAGGA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TGACAGAA--------GACCTTAAATTTACA--TTAAATT-----TC-TCTT---CT-CAT-------TTTG--T-ATCATTT---CAT------C---ATG-----ATC----------------TTA--T--------C---CAGTTTTCAGC-AAA-GAAAC-TC---T--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCAAATTTGA-T------TGGCTT------CC--ATTTT------AATATT--AA----GT---------------------CTGTA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AAT-GA-AAA--GTGTCATATACTAGGTCTC--GGGA-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAg
gi|13                         :                                                                                                                                                  gtgTGTGCCAAAAAC----TTTTTCA----ATACAGTACTGCTTTGGACTAGAGACT-TTAC-AAAA--CTACA--T-ATTCAGGA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TGACAGAA--------GACCTTAAATTTACA--TTAAATT-----TC-TCTT---CT-CAT-------TTTG--T-ATCATTT---CAT------C---ATG-----ATC----------------TTA--T--------C---CAGTTTTCAGC-AAA-GAAAC-TC---T--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCAAATTTGA-T------TGGCTT------CC--ATTTT------AATATT--AA----GT---------------------CTGTA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AAT-GA-AAA--GTGTCATATACTAGGTCTC--GGGA-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
gi|14                         :                                                                                                                                                gtgTCTGTGTCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTT-GGAGTAGAGACT-TTCC-AAAA--TTAAA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TGACAGAA--------GACCTAAAATTTACC-TATA--------------------T-AAC-------TTTT--T-ATCATTT---CAT------C---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAGT-TT---T--GT------A----A----A------TAAAT---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC-------CTTTT--AA----GTC-CTAGAAAT----AGTTTGGCTATA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------AAT-AA-AAA--ATGTCATAAACTGGGTCTC--GAAC-T---A-T---------A---CCTATTTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGTCAAACAC----TTTT-CA----AGACTATAGTCATTTAGACAAGAGACT-TTCC-AAAA--CTA-------GTCCGAA-TTC-AGTTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TGACAGAA--------GACCATAAATTTACA--TTAAGTT-----TC-TTTT---CC-AAC-------TTTT--T-ATCATTT---TAT------G---TTA-----GTT----------------TTA--C--------T---CAG-CTTCAGC-AAA-GAAAT-TA---T--GT------A----A----A----------T---T-CTCCCAACATCTT---GCTGA-----GA-T------TG--TG------TC--ATTTC------CATATA--AA----GTA-AT----AT----AGTCAGGCTGTT---CA---TTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--A-AAAACAGACTGGATTTC--AGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAtcgaa
gi|16                         :                                                                                                                                                   TCTGTGCTAAAAAC----ATTT-CA----GGACTATAATCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TGAAA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GATCTAAAGTTTACG-TT-ACTTT-----TTATTTT---CT-A------------------TCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTG--T--------T---AAA-TT-CAGC-TAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTTCCATCATCTT---GCACA-----AG-T------TG--TT------CC--ATTGT------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAA----AGTGGGATTACA---CA--TTTCG-A----AAACTTTTATGGTCT---------------GAT-TA-AAA--ATATCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---T-T---------A---TTTATTTTTCGg
gi|17                         :                                                                                                                                                    CTGTGCCAAAAAC----TGTT-CA----GAGTTATAGTCATTTGAACTAGAGATA-ATCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCAAA-TT--AATTCTTA------TA--TT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAGTTTG-----TAA----------ATTTT---CT-AAA-------TTTTATT-ATTATTTT--AAT------C---GTA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAA-TTTCAGT-AAA-GAAAC-TA---T--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTAA-----TA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAGT----AGCCCGACTATA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGT-----------------AGTATA-AAA--ATGTCCAAGA------CTT--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                      GCGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTGGAATTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-TGTCCGAA-TTT-AATTATTA------TA--GT---C-TGT-------TAACAGAA--------GACCTACAATTAACA-TT-AAGTT-----ACATTTT---CT-ATA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-------C-AAA-ATCAC-TA---T--GT------T----A----A------T---T---C-CCCCCAACATCTG---GCTAA-----GA-T------TG--TC------CC--ATTTC------AAAAAT--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGCTATA---TA--TTTGG-A----AAACTTATGTAATTC---------------AGT-TC-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--AGAC-------T---------A---TCTATTTTTCACAttgca
gi|19                         :                                                                                                                                                   TCTGTACCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGATA-TTCA-AAAAAATGATA--T-AGTCCAAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-AAA--AAAA-TAACAAAA--------GACCTAAAAT----------AGTT-----TTATTT----CT-AAA-------TTTA--T-ATCATAA---AGT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---T--GT------G----A----A------A---T---T-CTCCTAACATCTT---ACTCA-----GG-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGCCAGGCTATA---CA--TTTTG-A----AAACTTTTGTAATCG---------------GGT-TA-AGA-------ATAGACTGGGTGTA--GGAC-T---A-T---------A---TCC-TTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                  gTCTGTGACAAAAA------TTT-CA----GGAATATTGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAGA--TTACA--T-ATTCCAAA-TTC-AGTTATTA------TA--GG---T-TGT--AAG--TAACAGAA--------GACCTAAAATTAACA--TTAAGTT-----TTATTTT---TTCAAATACCATTTTTC--T-ACCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-T-------GT------A----ATTAGA------T---T---T-CTCCCAACATCTC---ACTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------AATATA--AA----GCC-ATAGAAAT----AGTCTTGCCACA---CA--TCTGT-AGTCCACACATCTGTAGTCCACACATCTGTAGTCTGGT-TT-GAT--ATGTCATGGGCTTGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TATATTTTTCAC
gi|20                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTCGACTAGATACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AATCTAAA-ATC-AATTCTTA------AA--GC---C-TGT--AAA--TAAAAAAA--------------------------TAAATT-----TCATTTT---CA-GAA-------TTAT--T-ACCATTA---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--TT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---CTTAA-----GA-T------TG--CT------TC--ATTTC------AATATA--AA----GTC---AGAAAT----AGTCTGGCTATA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGCCATATACTGGGTCTT--GGAC-A---A-T---------A---TCTATTTTTCc
gi|21                         :                                                                                                                                                   aCTGTGTCAAAAAC----TTTT-CA----GGGCTATAGACCTTTGGACTAGAGA-----------A--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AGTTCTTA------CG--GT---C-CAT--AAA--TGACAGA---------GAC------TTTACA-TT-AAGTT-----TC-TTTT---AT-AA--------CTTT--T-A--ATTT------------C---ATA-----ATT----------------CTA--T--------T---CAG-TTTTTGC-AAA-GAAAC-TAATAT--GT------A----A----A------T---T-----CTCCCAATATCTT---GCTCA-----TA-T------TG--TT------CCCCATTTC------CAGATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCAGGCTGT----TA--TTTTG-A----AAACTTTAGTAGTCC---------------GTT-TA-TAA--ATGTCATAGACTTGGTCTC--AGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAcgc
gi|22                         :                                                                                                                                                 gcTCTATGCCAAAACC----TTTT-CA----GGACTA--GTCCTTTGTACAAGAGACA-TTCC-AAAA--TTATA--T-ATTCCGCA-TTC-AGTTCATA------TA--GG---C-AGT--AAA--TAACAGCA--------GACCTACCATTTATA-TC-AAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--TTATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAAAGAAAC-TA---T--GC------A----A----A------T-----------------ATCTT---GCT-A-------------------------------ATTTC------AATATT--AA----CTC-ATGAAAAT----AGTC-AGCTATA---CA--TTTCG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------AGT-TA-ATT--ATGTCATAGACTGGGTCTC--CTAC-T---T-G---------A---TCTATTTTTTGCAg
gi|25                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGCCATAAAC----TTTT-CA----GGACTACTGCCCTTAAGACTAGAAACA-TTCC-AAAA--TTTTA----AGTCCGAA-TTC-AATTCTTCT-----TA--GT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAACTTTACA--TCAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTAT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--A--------TAAGTAG-TTTCAg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gG--TT------TC--ATTTC------AATA----------GTC-ATACAAAT----GGTCAGACTATA---TG--TTTGG-A----AAGTTCTTGCAGTCT---------------GCT-TATAAA--ATTTCATAGACTGGGTCTT--TGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTtttcaatagtcatacaaatggtcagactatatgtttggaaagttcttgcagtctgcttataaaatttcatagactgggtctttgactatatctattttatcacgg
gi|27                         : gtctgtgccataaacttttcaggactactgcccttaagactagaaacattccaaaattttaagtccgaattcaattcttcttagtccataaataacagaagacctaaactttacatcaagttttattttctaaattattatcatttaatcataattttaataagtaTT-CA----GGACTATTATACA--GGACTAGA--CA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-TATTGTTA------TA--GT---C-----------------AA------------TAAAATTTACA-TC---GTT-----TCATTTA---AT-AAA-------TTTT--T-ATC----------------------------ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGT-AAA-GAAAC-TA---C----------A----C----A------T---T---T-CTCATGACATCTT---GCTCA-----TA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATTGAAAT----AGTTGGACTATA---TG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AGT-T--AAA--ATGTCATAGACTGTTTCTA--GGAC-TATGA-T---------A---TCTATTTTatcacgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                       TT-CA----GGACTATTATACA--GGACTAGA--CA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-TATTGTTA------TG--GT---C-CAT--AAA--------------------------ATTTACA-TC---GTT-----TCATTTA---AT-AAA-------TTTT--T-ATC----------------------------ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGT-AAA-GAAAC-TA---C----------A----A----A------T---T---T-CTCACGGCATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATTGAAAT----AGTTGGACTATA---TG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AGT-T--AAA--ATGTCATAGACTGTTTCCA--GGAC-TATGA-T---------A---TCTATT
gi|29                         :                                                                                                                                                       TGCCAAAAAC----TTTG-CA----GGACT--------------T-GAGACA-TTTC-AAAA--TTACA--T-AGTC--AA-----AATTC----------A--GT---T-C----------------------------------TTTACA-TT-ACATT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTTA--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------C---CAG-TTTCAGCTAAA-AAAAC-TA---T--GT------A----A----C------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----AA-T------TG--TT------CC--ATTAC------AATATA--AA----ATC-ATAGAAAT----AGTCAGACTTTA---CG--TTTGG-A----AATTTTTTGTAGTCC---------------AGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TATATc
gi|3                          :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAATAC----TTTT-CA----GGGCTATAGTCGTTTGGGCTAGAGACT-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTTTGGA-TTC-ATTTCTTATACCGGTA--GT---C-CAT--AAA--TGACCGAA--------GACCTCAAATTTATA--TTAGGTT-----T--TTTA---CT-AAT-------TTTT--T-ACTCTTT---CAT------A---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAATAT-TT---GCTCA-----GA-TTCAATCTGC-TT------CC--ATTTC------GACA-A--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGACTATA---CA--TTCAG-A----AAA-TTTTGTAGTCA---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAACCTGGGTCTC--GGAC-T---AGTTGACTATAGA---TCCATTTTTTGCA
gi|30                         :                                                                                                                                                   TCTGTACCAAAAAC----TTTT-CA----GGAGTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTAGA--T-AGTCCTAA-TTC-AGTTCTTA------TA--GT---C-TGA--AAA--TAACAGTA--------TACCTAAAA------------GTT-----TTATTTC---TT-GAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT------------------A--T--------T---CAG-TTCCAGC-AAA-AAAAC-TA---C--AT------A----A----A------T---T---T-CTCCTATCATCTT---GGTAA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------AACATA--AA----GTC-ATAGAAAC----AGTCAGGCTATA---CT--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCg
gi|31                         :                                                                                                                                                  gTCTGAACCAAAATC----TTTT-CA----GGACTATGGTCCT-------------A-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCTGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TAAC---T--------GACCT-AAATTTACA-TTC-AGTT-----TCA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aCCAAAATT-ACA-T---AGTC-----TGAATTC-------AA-------TTCT--T-ATAGTCTGTAAATAACTGAC---CTA-----AAT----------------TTACAT--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTAT-----GA-T------TG--CT------CT--ATTTC------AATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCAGACTATA---CG--TTTGGAA----AAACTTTTGTACTCT---------------TGT-TG-AAA--AAGT-A-AGACTGGGTCTC--AGAC-T---G-T---------A---TTTATATTTCGCgcaaagaaactacgtaaatttctcccaacatcttgctatgattgctctatttcaatataaagtcatagaaatagtcagactatacgtttggaaaaacttttgtactcttgttgaaaaagtaagactgggtctcagactgtatttatatttcgc
gi|33                         :                                                                                                              atctgaaccaaaatcttttcaggactatggtcctattTCTGTGCCAAAAAC----TT--------------ATAGTCCTTTGGACTAGAGATA-TCTT-AAAC--TTTCA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GATATAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTTA--T-ACCATTT---CAT------C---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GA-----A---C--AT------A----A----T------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTGC------AATATA--AA----GTC-ATAAAAAT----TGTCAGGCTAT----CG--TTTAA-A----A
gi|34                         :                                                                                                                                                  gTCTATGCCAAACAC----TTTT-CT----TGACTATAGTTCTTTGGACT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gacaatttaggatattattccag-------TTTT--T-ATCATTT---CAT------C---ATA-----AAT----------------TTA--T--------T---CAG-TATCAGC-AAA-GAAAC-TA---A--GT------A----A----A----------T---T-CTGCTTACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------AATA-A--AA----ATCAATAGATATAGTAAGTTGGGCTATG---CT--TTTGG-A----AAACATTTGTAGCCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCAT--------------GGAC-T---A-T---------C---TATATTTTTCGCAttttatcatttcatcataaatttattcagtatcagcaaagaaactaagtaaattctgcttacatcttgctcagattgtttcatttcaataaaaatcaatagatatagtaagttgggctatgcttttggaaaacatttgtagcccggttaaaaatgtcatggactatctatatttttcgcag
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacaatttaggatattattccagtctatgccaaacacttttcttgactatagttctttggacTATA---C---TTTG--A----AAACTTT-GTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGCCTG--------GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTTGCAg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaagtactgtatttgatcttgtttgtagacataT--AAA--TGACATGA--------GACCTAAAATCT---------------------TTT---CT-TAC-------TTTT--T-ATCATTT---CAT------C---ATA-----ATT----------------T-A--T--------T---CAG-TTTCAGA-AAA-GAAAG-TA---CATGT------ACGTTA----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GT-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATTTA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGCTTAA---CA--TTTGG-G----AAGCTTTATTAATCC---------------GGT-TC-AGA--ATGTCATACACTGGGTCTC--TGAC-T---A-T---------A---TCTATATTTTGCgactggttacctctcgtgtttgagcccagtgcaatggtgaaccgttgtattttctatccctagcatccttttgttcatcatgttttctaatgagcagttctacacatctgaaagtaaaaagttcatgggtctatc
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAAATTGACA-TT-AGATT-----TCTTTTT---CT-AA--------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATC----------------TTG--T--------T---TCA-TTTCAGC-AAG-GAAAG-TA---T--GT------A----A----A------T---T---T-TTCCCAACATCTT---GGTCA-----TA-T------TG--TT------CC--GTATA------GATATA--TA----GTC--TAGAAAT----AGTCAGGCTATA---AG--TTTGG-A----AAACATTTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GAACTT---A-TAAA------A---TCTATAATTCGCA
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTTAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------ATTT--T-ATCATTT---AAT------C---AAA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TATCAGC-AAA-GAAAC-TG---G--CT------A----A----A------T---G---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----AA-C------TG--TTGAAGTTCC--ATTTC------AATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGCTATA---TG--TTTGG-A----AAACTTTCGTAGTAA---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGCTCTCTTGGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAga
gi|4                          :                                                                                                                                                  aTCTGTGCCAAAA-C----TTTT-CAATCAGCACTATATTCCCTAGGACAAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGGTCGAA-TAA-AATTCTTG------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACAGTTTAAGTT-----ATTTTTT---CT-AAA-------TTCC--T-ATCAAGT---AAT------TGTTATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--ATGTACATA----A----A------T---A---T-CTCCCAACATCTT---GCTAA-----AA-A------TG--TT------AC--ATTTA------ATTATC--AA----GTT-ATTGAAAT----AGTCGAACTATT---CA--TTTGG-A----AAACTTATGTAGTCC---------------GCT-TA-AAA--ATGTAATTGACTGGGTCTC--AGGC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCACAg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gAATATTTT---A-TAA-----AA-T------TG--T--------C--ATTTTATGCT-GATATA--AA----GTT-GTAGAAAT----AGATGGA-TATA---GT--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCT---------------GAT-TA-AAA--ATGTCGTAGACTGGGT-TC--ATAC-T---A-T---------A-----TATTTTTCACAg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                        gtcataaatcaatcaaaatcaagaaggcgaactccatgtaacagtttttatactgaattaaagtcattttactaaattaaaaaTACA-TT-AAGTT-----TCATTT--------AA-------TGGT--T-ATTAAT----AAT------C---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--TT------A----A----A------T---T---T-TTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTT------GATATA--AAGTCTGTC-AAATAAAT-----GTTTGGTTATA---CG--TTTGG-A----CAAC-TGTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGCCCA--AGAC-T---A-T---------A---TATAATTTTCACgactgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AT-TA---T--GT------T----A----A------T---T---T-CTCCCAACACCTT---GCTAA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTCCATTTTGATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCTGGCTATAGTACAAATTTGG-A----AAACTTTTGTTGTTC---------------AGT-TA-AAA--ATGTCATAAAATGGGTCTC--GGAC-C---T-T---------A---TCTATTTTTCGTA
gi|43                         :                                                                                                 tttccatttcatgaacctatttgtcgacaaaaaagctgggtactaaaattTCAGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTACAGTCCTTTGAACT--AGACATTTCC-AAAC--TTAC-----AGTCCGCA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--GTATTTGATAGAA--------TACCGTAAATCTACA--TTAAGTT-----TCATTAT----T-AAA-------TTTT--T-ATC----------------------------ATT----------------GTA--T--------T---CAA-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----AGTGACCT---TTAGT-CACCCATCATCTT---GCTGA-----GA-T------g
gi|44                         :                                                                                                                                                      gTGCCAAAAAC----ATTT-CT----GGACTATAGTCCTTCGGACTAGAGAAT-TTCC-AAAA--GTACA--T-TGTCTGCA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAT--TA---------------ACCTAACATTTACA--TTAAGTT-----TCATTGT---CT-AAA-------TATT--T--TCATTT---TAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAG-GA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                               C-AAAA--TAACA-----GTCCAAA-TTTTAATTCTTA------TA--GT---C-AGT--AAA--TATCAGAA--------GACCTAAAATTTACG--TTAAGTT-----TTATTTT---CT-CAA--------TTT--T-ATAATTT---AAC------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GACACTTA---C--AT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACGCCTT---ACACA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------AATATA--A------TC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--Tcttacatagtggtctttggtttcagaatagtagctacataaa
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTTAAC-AAA-GAAAC-TA---T--GT------A----A----A------TAAAT---CACTTCCAATATCTT---GCTCA-----AA-TCTAATTTGC-TT------CC--ATTTT------GATAGA--AAAA--GTC-GTAGAAAT----AGTCAGGCTATA---TG--TTTAG-A----AAACTTTTGTAGTCT---------------GGT-TG-AAA--ATGTCATAGAC
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGA-AAA-GAAA--TA---T--AT------C----A----A------T---T---T-C----ATCATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTT------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATACT-CC--TTTGG-A----AAAATTTTGTAATCA---------------TGT-TT-AAA--ATGTC--AGACTGAGTCTC--CGTA-T---A-T---------G---TCT-TTTTTCGCAatctattttttg
gi|5                          :                                                                                                                                                   TCTGTGCCGAGAAC----TTAA-CA----GGACAATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCTAAA-TTC-AGTTCTAA------TACGGTAAGT-GGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------TGTT--T-ATCAGTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCATC-AAA-GTAAT-TA---C--TT------C----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTAA-----GA-T------TA--TT------CC--ATTT-------GATTTA--AA----GTC-GTAGAAAT----AGTCGAGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTAGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTATC--TGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGTA
gi|51                         :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----CTTT-CA----GGACT-------------C--GAGACA-TTCC-AAAA--TTTCA--C-AGTCCAAATTTC---TTCCTT------TA--TT---CATGTAGAAA--TAAAAAAAAAATATTGAACTTAAAA--GAGA-GTGAAGTT-----TCTTTTTTTGCT-GAG-------TATA--T-ATAATCT---AA
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GC-AAT-GATAC-T----C--TT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTTCTTGCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATATG--AA----GTC-ATACAGAA----AGTCAGGCTTTA---CG--TTTGG-A----AATTTTTAGTAGACT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--AGAC-T---G-T---------A---TCTATTTTatccctatatat
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTT---TT-----------TTTT--T-GCCATTT---CAT------C---ACA-----ATT----------------TAA--T--------T---CAG-TTTCAGC-TAA-GATAC-TA---T--GT------A----A----G------T---T---T-CTACCAACAACTT---GCTCA-----GA-C------TG--TT------TA--ATTTC------AATATA--AA----GCT-ATAGAAAT----GATTGGACTTTA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------c
gi|56                         :                                                                                                                                                  ttCTGTGCCAAAAAC----TTTG-CA----GGACTATATTATTTTGAATTAGAGGCT-TTCCAAAAA--TTACA--T-
gi|58                         :                                                                                                                                                  cTCAGTGCCAAAAAC----ATTT-CA----GGACTACAGTCCTTTGGACTAGAGACT-TTTA-AAAA--TCACA--TAAATCAGAA-TTC-AATTTTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACACAA--------AAGCTAAAATTTACA--TTAAGAT-----TCATTTT---tattacaacattttgatatcggttacagtaatataacaagctcatatcttactataactattactttgtgaatgct
gi|6                          :                                                                                                                                                  agCTGTACTCAAAAC----TTTT-CATT--AGACGATATTCCTTTGAACTAGAGACA-TT---AAAA----A-A--T-AGTCCGAA-TTC-ATTTATTA------TA--GC---C-CAT--ACA--TAACAGAA--------GAAGTAAAATTTATA-TC-ATGTT-----TTATTTT---TT-AAA-------TTTA--T-ATCATTT---AAT------A---ATA-----ATT----------------TCA--T--------T---TAG-TTTCAGC-AAA-GACAC-TT---C--TT------C----A----T------T---T---G-CTCCCAACATCTT---GTTTA-----AAAT------TG--TT------TC--ATTTC------GATATA--AA----ATC-ATAGAAAT----GGTCAGGCTATA---CG--TCTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------AGT-TT-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
gi|67                         :                                                                                                                                                   gcTATGCCAAACAC----TTTT-CA----GGACTATAGAGTTTTGGACTAGAGACC-TTTC-AGAg
gi|68                         :                                                                                                                                                   TCTGTGCTAAAA-C----TTTT-CA----AAACTATAATGCATTGGACTAGAGACT-TTCC-t
gi|69                         :                                                                                                                                                   gCTGTGCCAAAAAC----TTTG-CA----GGACTATA
gi|7                          :                                                                                                                                                tgcTCTGTGCCAAAAAC----TTTT-AA----GGACCATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCCAG-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA--TAAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------A---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAT-TTTCAG--AAG-AAAAC-TG---C--AT------C----A----A------T---T---T-CT-------TCTT---GTTCA-----TA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATATTCG----GTC-ATAGTAAT----ATTTGGGCCATA---CA--TTTGG-A----AAACTTCTGTTGTCC---------------GGT-TA-AAAATATATGATAGACTGGGTCTT--GTAG-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAttnnnnnnnnnna
gi|72                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GAGCTATAGg
gi|8                          :                                                                                                                                                  gTCTTTGTCATAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGCTCTTTGGACTAAAGTCA-TTCC-AAAA--TTACT--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTCT-----TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAAAA--------GACCTAAACTTGAGA--TTAAGAT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTAT--T-ATCATTT---AGT------C---ATC-----ATT----------------TCA--T--------T---CAG-TTTTAGC-AAA-GAAAC-TA---C--AC------A----C----A------T---T---T-TCCCCAAAATCAT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------GATAC----A----GTC-ATAGATAT----CGTCGGGCTATC---CG--TTCGG-A----AAA-TGTTGTAGCCC---------------GTT-T---AA--ATGTCATTGACCGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TATATTTTTAGCAa
gi|9                          :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----ATTT-CC----TAACTAAAGTCCTTTAGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TGACAATT-AGTCCAAA-TTC-AATTCA-A------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAC-CTTACA-TT-AAGGT-----TCATTTT---CT-AAA-------TCTT----ATCATTT---GAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-AA---C--GT------A----A----C------T---G---T-CTCCCAGCATCTT---GCTGA-----GA-T------TG--TC------TC--A--TC------GATAAA--AA----GTC-AAAAAAAT----AGCCGGGCCATA---CA--TTTGG-T----AAACTTTTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--AT------GACTGGGTCTC--GGAC-TA--A-T---------ACTTTTCATTTTTCGCAg

Unaligned ( gi|1 ): GTGTAGACACGAATTTGATATGGGTGCGGCTAAATATTTTACAAAACTTGTAATGGTGTAGTCTTTAAAGCGAGGAGCACCTTTGATATCACCGGCCACATTTAAGACAATTAAAAACGAGGAAATATGGGAAATTATTGGTGCGGCATACACAATAAATTTAGAAAATATTAGAAATTAGCTGAAAATGTAGAAACGTTTTGATATTATTGGTAAGGCATTCCGCGGCAATATTAGCATTGGCGCACCATACCGCACCTGTGTCTATACGTCAATGAGAAAGATGAGTATATAATACAAACTTTATATTGTTTTAAAGAACCCGTAACAAAATATTATATTAGAATAACATACATTTTATTTGATTCGAATTCGTTACCAATACAAGATGTTAGTCGTTTTCAAAAAAATGAAAATA
Unaligned ( gi|23 ): GTAGACACGAATTTGATATTGATGCGGCTAAATATTTTACAAAACTTGTAATTTCGTAGACTTTAAAAGCTCTGCACAAAATTGTTTATTTTTTCGAATAAGAATCAACAATTACAAACGCCATCATTGTTCAAATTTAAGATAATTATAAAACAATCGAAATGGGAAATTATTGTTGCGGCATACAAAATAAATGTAAAAAAATGTGGGAATTAGCTAAAAATGTATAAAAGTTTTTTATTTATTGATTGCCGCACCATGCCGCACCCGTGTCTACGCC
Unaligned ( gi|24 ): GCGCAGACACGAATTTGACATTGGTGCGGCTAAATATTTTACAAATTTAAGATAATTATAAAACAAGGAAAATGTAAAATTATTGGTGCGATTTACACAATAAATGTAAGAAATTGTTTTTAAATAACCTCAAAATATGGAAAGTTTTGAAATTATTGTTGCTACATGACGCACCAATATTGCTTATTGCCGTACCACGCCGCATCCTTGTCTACATCCATGTAAGTTTAAGTATACATGCAATTCCATTTTATTCGTAGTTTGTTTTCCTGTAACCAA
Unaligned ( gi|26 ): AGACACGAATTTGATATTGGTGCGGGTAAATGTGTCAAAACTTGTAATTTTGTTGACGTAAAACGAGTAGCGCTAGTCGTGGCAGTTCTACACTAAACGAATCAACAATGGCAAATGTAAACATCTTTTGAATTCAAGAAAATTATAAAACAAGACAAAAATGGAACTTACAAAATATATGTAAAAAAAAATACAATAAGCTAAAATGCGTAGAAAAATCTTGGAATAATCAGTGCCACAATACCGCGCCATGCTGCACTTGTGTCTACGCA
Unaligned ( gi|32 ): GTATAGATACAAATTTGATATTGGTGCAGCTAAATATTTAACAAACTTGCAATCAATTCTAATTTATGCTGATTTGTTTGAAAGAAACAATGCCGTCATCGTCCGAATTTACGATAAATTACAAAACAAGAATAAATGGGAAATTATTGTCGAGGCATACAAAATAAATGTAAACAATTTTTGAAATTAGCAAAAGATGTAGAAAAGTGTTGAAATAATTGATGAGGCTTGTTGCAGCAATATTTATTATTGATGCAGC
Unaligned ( gi|36 ): GATACGAATTTGATATTGGCTAATTATTTTTCAAAACTTGTAATCAATTCTAAAATGTTGATTTGTTCGAAAACGAAAGAGCTATGGCAAATTTAAGATAATGATAAAGCGAGGAAAAATGTGAAATTATTGGTGAGACATACAAAATAGATGTAAAAAATGTTGAAATAAGCTAAACATATAAAATCAAGTTACTAATTATGGGTGCCGCATCATGCCGCACCAGTGCCTACGT
Unaligned ( gi|45 ): CGTAGAAACAGATTCGATAATGGTGTGGCTGAATATTTTACAAATTTAAGATAATCATAAACTAAGAAAAAAATGAGAAATTATTTGTGTGGCAATAAATGTAAAAAAAAGTTTAGAAATTAGCTTAAAAATGAAGAAATTGGAAATTATTGTACTGCACCAATATAATTGATAATGCCGCACCCATGTCTTAAGCCCATGTG
Unaligned ( gi|47 ): GGCGAAGACACGAATTTGGTAGTGGTGCGACTAAATATATAAGATAATTATAATACAAGAAAAAAAAGGGATATTATTGGTGCGGCATACAAAATGTATGTAAATAAAAGTGGGGAAATTAGCTTAAGATTTGTAGAAAAGTAATTGGTGCACTATGACGCACACATGTCTACAC
Unaligned ( gi|50 ): AGCAATGACAAATGTCATCATCTTCCGAATATAAGATTATTATACAAAAATTAATAAAATATTTGTGAGGCATAGAAAATAAATGTAAAAATGTTTGGCAACTGGCTAAAATTGTAGAAAAGTTTTGAAATTATTGGTGCGGACGCACCTATGTTTGCAC
Unaligned ( gi|52 ): TGTATTATTCCTAGCCAACTTAGTTTGATTAGCCTACAGTATTAAAAGTAATATTTCATGAATCTTTCAGATATCTGTAGGAGACTTTTAAATGTTTCAAATGATGTTTCAGTATTACTAGCAAATTTAAAAGTAAGATTTCATGAATCTTTCA
Unaligned ( gi|53 ): ATAGTGCGCGGCTTAATATTTTAACAATTTAAGATGATTATAAAACAAGAAAAACTTCGATGTTACTGATGCGGCAAACAAAATAAATGTAAAAAGGTTTGAAAATTAGCTAGAATTGAAATTATTGGCGCGGTAATGATTCACCTCTACGCCC
Unaligned ( gi|57 ): ATAGACACGAATTTGGTATTGGTGCGGCTAAATATTTTAAAAAAACACGATTTGTTTAAAACTGAATCGACAATGACAAATGTCATCATTGTTTTAAGTTTTAAGATAGTTATAAAAATAAGAAAAAATGGCTGAT
Unaligned ( gi|59 ): TTAAGATAATTATAAAACAAAATAAATGTAGCGGACGTTTAGAAATTAGCTAAAAACGGTAGAAATGTTTTAAAATTATTGATGCGACATGCCCACGTGTCTATGTCC
Unaligned ( gi|60 ): TTTTTTTACAAAACACCGATCAATTCTAAAATGTTGTTGTGTGCGAATCCGAAGTTAAGACATATAAGATAATTATAAAACAAGGGAAATATGGGAAAGTATTCGGT
Unaligned ( gi|61 ): CATAGATACAAATTTGATATTGGTGCACCTAAATCTGTAAAAAAAAACTTGTAGACATAAAAATGAGCAGCACCAACAAATCAACAATGCTATCATCGTCCGA
Unaligned ( gi|62 ): GCATAGACACAAATTTTATATTGGTACGACTAATTATTTTACAAAACTCATAATTTTGTAGACTTTAAACAAGCACTAC
Unaligned ( gi|63 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT
Unaligned ( gi|64 ): GTGTAGATACAAACTTGATATTGGTGTGGCCAAATATTTTATCATTCGTGAAATGGTGTTTTTA
Unaligned ( gi|65 ): TGTAGATACAAACTTGATATTGGTGTGGCCAAATATTTTATCATTCGTGAAATGGTGTTTTTAA
Unaligned ( gi|66 ): AAAGTTTAGAAATTAGCTAAAAAAACCATTAAAATTAATGGTGCGACATTAGTGTCTACGCCC
Unaligned ( gi|70 ): AAATGAAATCATTTTATGAAATTAAATATACTGTC
Unaligned ( gi|71 ): GCGTAGACACGAATTTGATATTGGTGCGGCTAAAT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                 2222    2  3333                           1    1    11     11 1        1   1        555555  11  222 33  11   22        44444444               0000     22222  0    111  1   3333333    11 1       4444  333333 111   22222   6666666666666666   11 33333333 111   2       1   1     1  111 11  222222 2222 2222 222222 333 111 1             111     55555  1 555555  44  222222  11     5555555     11  3333   1        2222    1       333 222     1 2222               666666666666666   1  1   11                   11    1 555 1 666666666 111             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                 ....    .  ....                           .    .    ..     .. .        .   .        ......  ..  ... ..  ..   ..        ........               ....     .....  .    ...  .   .......    .. .       ....  ...... ...   .....   ................   .. ........ ...   .       .   .     .  ... ..  ...... .... .... ...... ... ... .             ...     .....  . ......  ..  ......  ..     .......     ..  ....   .        ....    .       ... ...     . ....               ...............   .  .   ..                   ..    . ... . ......... ...             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                 4444    1  7777                           1    1    66     66 2        2   2        999999  77  111 55  66   88        33333333               7777     66666  5    888  1   4444444    44 1       5555  000000 888   66666   8888888888888888   44 77777777 888   1       0   0     0  888 44  999999 2222 2222 999999 666 888 0             888     00000  0 888888  88  999999  44     9999999     44  5555   0        1111    7       000 888     0 1111               666666666666666   1  1   55                   55    1 000 1 444444444 999             
consensus                     :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
Reference ( family-3062 )     :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
gi|10                         :                                                                                                                                                   TCTGTGAAAAAAACAAACTTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGAACTAGAGACA-TTCA-AAAA--TTACA--T-AGCCTGTA-TTC-ATTTTTTA------TA--GC---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TT-AAGTT-----TCGTTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---AAA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-AA---C--GT------T----T----A------T---T---T-CTCCCAACATTTT---GCTAA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATAAA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGTTATA---CA--TTTGG-A--------------AGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--ACAC-T---G-T---------A---TCT-TTTTTTGCA
gi|11                         :                                                                                                                                                      gTGCCAAACAC----TTTT-CA----GGACTGTAGTTCTTCAGACTAGAGACT-TTCC-AAA----TACA--T-AGTC------TA-AATTGTTA------TA--GT---C-C-----------------------------TAAAATTTGCA-TTTAATTTAAGTATTATTTT---CA-AAA-------CTTT--T-ATTGTTT---CGC------C---ATAATTTTATTCAGTTTCTGCAAGGACTTA--TATAGCTCCT---TGG-TTTCAGC-AAA-GAATT-TA---C--GT------G----A----A------C---T--------------TCTT---GCTCA-----GA-T------T---------------ATTTC------GATAAA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCTGGCTATG---CA----TGG-A----AAACTTTTGTAGACA---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATCGACTGTGTCTC--AGAA-T---A-T---------A---TCTAGTTTTTGCAg
gi|12                         :                                                                                                                                                  ttcTGTGCCAAAAAC----TTTTTCA----ATACAGTACTGCTTTGGACTAGAGACT-TTAC-AAAA--CTACA--T-ATTCAGGA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TGACAGAA--------GACCTTAAATTTACA--TTAAATT-----TC-TCTT---CT-CAT-------TTTG--T-ATCATTT---CAT------C---ATG-----ATC----------------TTA--T--------C---CAGTTTTCAGC-AAA-GAAAC-TC---T--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCAAATTTGA-T------TGGCTT------CC--ATTTT------AATATT--AA----GT---------------------CTGTA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AAT-GA-AAA--GTGTCATATACTAGGTCTC--GGGA-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAg
gi|13                         :                                                                                                                                                  gtgTGTGCCAAAAAC----TTTTTCA----ATACAGTACTGCTTTGGACTAGAGACT-TTAC-AAAA--CTACA--T-ATTCAGGA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TGACAGAA--------GACCTTAAATTTACA--TTAAATT-----TC-TCTT---CT-CAT-------TTTG--T-ATCATTT---CAT------C---ATG-----ATC----------------TTA--T--------C---CAGTTTTCAGC-AAA-GAAAC-TC---T--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCAAATTTGA-T------TGGCTT------CC--ATTTT------AATATT--AA----GT---------------------CTGTA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AAT-GA-AAA--GTGTCATATACTAGGTCTC--GGGA-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
gi|14                         :                                                                                                                                                gtgTCTGTGTCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTT-GGAGTAGAGACT-TTCC-AAAA--TTAAA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TGACAGAA--------GACCTAAAATTTACC-TATA--------------------T-AAC-------TTTT--T-ATCATTT---CAT------C---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAGT-TT---T--GT------A----A----A------TAAAT---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC-------CTTTT--AA----GTC-CTAGAAAT----AGTTTGGCTATA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------AAT-AA-AAA--ATGTCATAAACTGGGTCTC--GAAC-T---A-T---------A---CCTATTTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGTCAAACAC----TTTT-CA----AGACTATAGTCATTTAGACAAGAGACT-TTCC-AAAA--CTA-------GTCCGAA-TTC-AGTTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TGACAGAA--------GACCATAAATTTACA--TTAAGTT-----TC-TTTT---CC-AAC-------TTTT--T-ATCATTT---TAT------G---TTA-----GTT----------------TTA--C--------T---CAG-CTTCAGC-AAA-GAAAT-TA---T--GT------A----A----A----------T---T-CTCCCAACATCTT---GCTGA-----GA-T------TG--TG------TC--ATTTC------CATATA--AA----GTA-AT----AT----AGTCAGGCTGTT---CA---TTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--A-AAAACAGACTGGATTTC--AGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAtcgaa
gi|16                         :                                                                                                                                                   TCTGTGCTAAAAAC----ATTT-CA----GGACTATAATCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TGAAA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GATCTAAAGTTTACG-TT-ACTTT-----TTATTTT---CT-A------------------TCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTG--T--------T---AAA-TT-CAGC-TAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTTCCATCATCTT---GCACA-----AG-T------TG--TT------CC--ATTGT------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAA----AGTGGGATTACA---CA--TTTCG-A----AAACTTTTATGGTCT---------------GAT-TA-AAA--ATATCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---T-T---------A---TTTATTTTTCGg
gi|17                         :                                                                                                                                                    CTGTGCCAAAAAC----TGTT-CA----GAGTTATAGTCATTTGAACTAGAGATA-ATCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCAAA-TT--AATTCTTA------TA--TT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAGTTTG-----TAA----------ATTTT---CT-AAA-------TTTTATT-ATTATTTT--AAT------C---GTA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAA-TTTCAGT-AAA-GAAAC-TA---T--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTAA-----TA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAGT----AGCCCGACTATA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGT-----------------AGTATA-AAA--ATGTCCAAGA------CTT--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                      GCGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTGGAATTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-TGTCCGAA-TTT-AATTATTA------TA--GT---C-TGT-------TAACAGAA--------GACCTACAATTAACA-TT-AAGTT-----ACATTTT---CT-ATA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-------C-AAA-ATCAC-TA---T--GT------T----A----A------T---T---C-CCCCCAACATCTG---GCTAA-----GA-T------TG--TC------CC--ATTTC------AAAAAT--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGCTATA---TA--TTTGG-A----AAACTTATGTAATTC---------------AGT-TC-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--AGAC-------T---------A---TCTATTTTTCACAttgca
gi|19                         :                                                                                                                                                   TCTGTACCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGATA-TTCA-AAAAAATGATA--T-AGTCCAAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-AAA--AAAA-TAACAAAA--------GACCTAAAAT----------AGTT-----TTATTT----CT-AAA-------TTTA--T-ATCATAA---AGT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---T--GT------G----A----A------A---T---T-CTCCTAACATCTT---ACTCA-----GG-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGCCAGGCTATA---CA--TTTTG-A----AAACTTTTGTAATCG---------------GGT-TA-AGA-------ATAGACTGGGTGTA--GGAC-T---A-T---------A---TCC-TTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                  gTCTGTGACAAAAA------TTT-CA----GGAATATTGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAGA--TTACA--T-ATTCCAAA-TTC-AGTTATTA------TA--GG---T-TGT--AAG--TAACAGAA--------GACCTAAAATTAACA--TTAAGTT-----TTATTTT---TTCAAATACCATTTTTC--T-ACCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-T-------GT------A----ATTAGA------T---T---T-CTCCCAACATCTC---ACTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------AATATA--AA----GCC-ATAGAAAT----AGTCTTGCCACA---CA--TCTGT-AGTCCACACATCTGTAGTCCACACATCTGTAGTCTGGT-TT-GAT--ATGTCATGGGCTTGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TATATTTTTCAC
gi|20                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTCGACTAGATACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AATCTAAA-ATC-AATTCTTA------AA--GC---C-TGT--AAA--TAAAAAAA--------------------------TAAATT-----TCATTTT---CA-GAA-------TTAT--T-ACCATTA---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--TT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---CTTAA-----GA-T------TG--CT------TC--ATTTC------AATATA--AA----GTC---AGAAAT----AGTCTGGCTATA---CA--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGCCATATACTGGGTCTT--GGAC-A---A-T---------A---TCTATTTTTCc
gi|21                         :                                                                                                                                                   aCTGTGTCAAAAAC----TTTT-CA----GGGCTATAGACCTTTGGACTAGAGA-----------A--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AGTTCTTA------CG--GT---C-CAT--AAA--TGACAGA---------GAC------TTTACA-TT-AAGTT-----TC-TTTT---AT-AA--------CTTT--T-A--ATTT------------C---ATA-----ATT----------------CTA--T--------T---CAG-TTTTTGC-AAA-GAAAC-TAATAT--GT------A----A----A------T---T-----CTCCCAATATCTT---GCTCA-----TA-T------TG--TT------CCCCATTTC------CAGATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCAGGCTGT----TA--TTTTG-A----AAACTTTAGTAGTCC---------------GTT-TA-TAA--ATGTCATAGACTTGGTCTC--AGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAcgc
gi|22                         :                                                                                                                                                 gcTCTATGCCAAAACC----TTTT-CA----GGACTA--GTCCTTTGTACAAGAGACA-TTCC-AAAA--TTATA--T-ATTCCGCA-TTC-AGTTCATA------TA--GG---C-AGT--AAA--TAACAGCA--------GACCTACCATTTATA-TC-AAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--TTATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAAAGAAAC-TA---T--GC------A----A----A------T-----------------ATCTT---GCT-A-------------------------------ATTTC------AATATT--AA----CTC-ATGAAAAT----AGTC-AGCTATA---CA--TTTCG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------AGT-TA-ATT--ATGTCATAGACTGGGTCTC--CTAC-T---T-G---------A---TCTATTTTTTGCAg
gi|25                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGCCATAAAC----TTTT-CA----GGACTACTGCCCTTAAGACTAGAAACA-TTCC-AAAA--TTTTA----AGTCCGAA-TTC-AATTCTTCT-----TA--GT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAACTTTACA--TCAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTAT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--A--------TAAGTAG-TTTCAg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gG--TT------TC--ATTTC------AATA----------GTC-ATACAAAT----GGTCAGACTATA---TG--TTTGG-A----AAGTTCTTGCAGTCT---------------GCT-TATAAA--ATTTCATAGACTGGGTCTT--TGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTtttcaatagtcatacaaatggtcagactatatgtttggaaagttcttgcagtctgcttataaaatttcatagactgggtctttgactatatctattttatcacgg
gi|27                         : gtctgtgccataaacttttcaggactactgcccttaagactagaaacattccaaaattttaagtccgaattcaattcttcttagtccataaataacagaagacctaaactttacatcaagttttattttctaaattattatcatttaatcataattttaataagtaTT-CA----GGACTATTATACA--GGACTAGA--CA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-TATTGTTA------TA--GT---C-----------------AA------------TAAAATTTACA-TC---GTT-----TCATTTA---AT-AAA-------TTTT--T-ATC----------------------------ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGT-AAA-GAAAC-TA---C----------A----C----A------T---T---T-CTCATGACATCTT---GCTCA-----TA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATTGAAAT----AGTTGGACTATA---TG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AGT-T--AAA--ATGTCATAGACTGTTTCTA--GGAC-TATGA-T---------A---TCTATTTTatcacgg
gi|28                         :                                                                                                                                                                       TT-CA----GGACTATTATACA--GGACTAGA--CA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-TATTGTTA------TG--GT---C-CAT--AAA--------------------------ATTTACA-TC---GTT-----TCATTTA---AT-AAA-------TTTT--T-ATC----------------------------ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGT-AAA-GAAAC-TA---C----------A----A----A------T---T---T-CTCACGGCATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATTGAAAT----AGTTGGACTATA---TG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTTC---------------AGT-T--AAA--ATGTCATAGACTGTTTCCA--GGAC-TATGA-T---------A---TCTATT
gi|29                         :                                                                                                                                                       TGCCAAAAAC----TTTG-CA----GGACT--------------T-GAGACA-TTTC-AAAA--TTACA--T-AGTC--AA-----AATTC----------A--GT---T-C----------------------------------TTTACA-TT-ACATT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTTA--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------C---CAG-TTTCAGCTAAA-AAAAC-TA---T--GT------A----A----C------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----AA-T------TG--TT------CC--ATTAC------AATATA--AA----ATC-ATAGAAAT----AGTCAGACTTTA---CG--TTTGG-A----AATTTTTTGTAGTCC---------------AGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TATATc
gi|3                          :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAATAC----TTTT-CA----GGGCTATAGTCGTTTGGGCTAGAGACT-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTTTGGA-TTC-ATTTCTTATACCGGTA--GT---C-CAT--AAA--TGACCGAA--------GACCTCAAATTTATA--TTAGGTT-----T--TTTA---CT-AAT-------TTTT--T-ACTCTTT---CAT------A---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAATAT-TT---GCTCA-----GA-TTCAATCTGC-TT------CC--ATTTC------GACA-A--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGACTATA---CA--TTCAG-A----AAA-TTTTGTAGTCA---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAACCTGGGTCTC--GGAC-T---AGTTGACTATAGA---TCCATTTTTTGCA
gi|30                         :                                                                                                                                                   TCTGTACCAAAAAC----TTTT-CA----GGAGTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTAGA--T-AGTCCTAA-TTC-AGTTCTTA------TA--GT---C-TGA--AAA--TAACAGTA--------TACCTAAAA------------GTT-----TTATTTC---TT-GAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT------------------A--T--------T---CAG-TTCCAGC-AAA-AAAAC-TA---C--AT------A----A----A------T---T---T-CTCCTATCATCTT---GGTAA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------AACATA--AA----GTC-ATAGAAAC----AGTCAGGCTATA---CT--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCg
gi|31                         :                                                                                                                                                  gTCTGAACCAAAATC----TTTT-CA----GGACTATGGTCCT-------------A-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCTGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TAAC---T--------GACCT-AAATTTACA-TTC-AGTT-----TCA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aCCAAAATT-ACA-T---AGTC-----TGAATTC-------AA-------TTCT--T-ATAGTCTGTAAATAACTGAC---CTA-----AAT----------------TTACAT--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTAT-----GA-T------TG--CT------CT--ATTTC------AATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCAGACTATA---CG--TTTGGAA----AAACTTTTGTACTCT---------------TGT-TG-AAA--AAGT-A-AGACTGGGTCTC--AGAC-T---G-T---------A---TTTATATTTCGCgcaaagaaactacgtaaatttctcccaacatcttgctatgattgctctatttcaatataaagtcatagaaatagtcagactatacgtttggaaaaacttttgtactcttgttgaaaaagtaagactgggtctcagactgtatttatatttcgc
gi|33                         :                                                                                                              atctgaaccaaaatcttttcaggactatggtcctattTCTGTGCCAAAAAC----TT--------------ATAGTCCTTTGGACTAGAGATA-TCTT-AAAC--TTTCA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CAT--AAA--TAACAGAA--------GATATAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTTA--T-ACCATTT---CAT------C---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GA-----A---C--AT------A----A----T------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTGC------AATATA--AA----GTC-ATAAAAAT----TGTCAGGCTAT----CG--TTTAA-A----A
gi|34                         :                                                                                                                                                  gTCTATGCCAAACAC----TTTT-CT----TGACTATAGTTCTTTGGACT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gacaatttaggatattattccag-------TTTT--T-ATCATTT---CAT------C---ATA-----AAT----------------TTA--T--------T---CAG-TATCAGC-AAA-GAAAC-TA---A--GT------A----A----A----------T---T-CTGCTTACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------AATA-A--AA----ATCAATAGATATAGTAAGTTGGGCTATG---CT--TTTGG-A----AAACATTTGTAGCCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCAT--------------GGAC-T---A-T---------C---TATATTTTTCGCAttttatcatttcatcataaatttattcagtatcagcaaagaaactaagtaaattctgcttacatcttgctcagattgtttcatttcaataaaaatcaatagatatagtaagttgggctatgcttttggaaaacatttgtagcccggttaaaaatgtcatggactatctatatttttcgcag
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacaatttaggatattattccagtctatgccaaacacttttcttgactatagttctttggacTATA---C---TTTG--A----AAACTTT-GTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGCCTG--------GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTTGCAg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaagtactgtatttgatcttgtttgtagacataT--AAA--TGACATGA--------GACCTAAAATCT---------------------TTT---CT-TAC-------TTTT--T-ATCATTT---CAT------C---ATA-----ATT----------------T-A--T--------T---CAG-TTTCAGA-AAA-GAAAG-TA---CATGT------ACGTTA----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GT-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATTTA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGCTTAA---CA--TTTGG-G----AAGCTTTATTAATCC---------------GGT-TC-AGA--ATGTCATACACTGGGTCTC--TGAC-T---A-T---------A---TCTATATTTTGCgactggttacctctcgtgtttgagcccagtgcaatggtgaaccgttgtattttctatccctagcatccttttgttcatcatgttttctaatgagcagttctacacatctgaaagtaaaaagttcatgggtctatc
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAAATTGACA-TT-AGATT-----TCTTTTT---CT-AA--------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATC----------------TTG--T--------T---TCA-TTTCAGC-AAG-GAAAG-TA---T--GT------A----A----A------T---T---T-TTCCCAACATCTT---GGTCA-----TA-T------TG--TT------CC--GTATA------GATATA--TA----GTC--TAGAAAT----AGTCAGGCTATA---AG--TTTGG-A----AAACATTTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GAACTT---A-TAAA------A---TCTATAATTCGCA
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTTAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------ATTT--T-ATCATTT---AAT------C---AAA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TATCAGC-AAA-GAAAC-TG---G--CT------A----A----A------T---G---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----AA-C------TG--TTGAAGTTCC--ATTTC------AATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTTGGGCTATA---TG--TTTGG-A----AAACTTTCGTAGTAA---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGCTCTCTTGGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAga
gi|4                          :                                                                                                                                                  aTCTGTGCCAAAA-C----TTTT-CAATCAGCACTATATTCCCTAGGACAAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGGTCGAA-TAA-AATTCTTG------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACAGTTTAAGTT-----ATTTTTT---CT-AAA-------TTCC--T-ATCAAGT---AAT------TGTTATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--ATGTACATA----A----A------T---A---T-CTCCCAACATCTT---GCTAA-----AA-A------TG--TT------AC--ATTTA------ATTATC--AA----GTT-ATTGAAAT----AGTCGAACTATT---CA--TTTGG-A----AAACTTATGTAGTCC---------------GCT-TA-AAA--ATGTAATTGACTGGGTCTC--AGGC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCACAg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gAATATTTT---A-TAA-----AA-T------TG--T--------C--ATTTTATGCT-GATATA--AA----GTT-GTAGAAAT----AGATGGA-TATA---GT--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCT---------------GAT-TA-AAA--ATGTCGTAGACTGGGT-TC--ATAC-T---A-T---------A-----TATTTTTCACAg
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                        gtcataaatcaatcaaaatcaagaaggcgaactccatgtaacagtttttatactgaattaaagtcattttactaaattaaaaaTACA-TT-AAGTT-----TCATTT--------AA-------TGGT--T-ATTAAT----AAT------C---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--TT------A----A----A------T---T---T-TTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTT------GATATA--AAGTCTGTC-AAATAAAT-----GTTTGGTTATA---CG--TTTGG-A----CAAC-TGTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGCCCA--AGAC-T---A-T---------A---TATAATTTTCACgactgt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AT-TA---T--GT------T----A----A------T---T---T-CTCCCAACACCTT---GCTAA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTCCATTTTGATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCTGGCTATAGTACAAATTTGG-A----AAACTTTTGTTGTTC---------------AGT-TA-AAA--ATGTCATAAAATGGGTCTC--GGAC-C---T-T---------A---TCTATTTTTCGTA
gi|43                         :                                                                                                 tttccatttcatgaacctatttgtcgacaaaaaagctgggtactaaaattTCAGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTACAGTCCTTTGAACT--AGACATTTCC-AAAC--TTAC-----AGTCCGCA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--GTATTTGATAGAA--------TACCGTAAATCTACA--TTAAGTT-----TCATTAT----T-AAA-------TTTT--T-ATC----------------------------ATT----------------GTA--T--------T---CAA-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----AGTGACCT---TTAGT-CACCCATCATCTT---GCTGA-----GA-T------g
gi|44                         :                                                                                                                                                      gTGCCAAAAAC----ATTT-CT----GGACTATAGTCCTTCGGACTAGAGAAT-TTCC-AAAA--GTACA--T-TGTCTGCA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAT--TA---------------ACCTAACATTTACA--TTAAGTT-----TCATTGT---CT-AAA-------TATT--T--TCATTT---TAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAG-GA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                               C-AAAA--TAACA-----GTCCAAA-TTTTAATTCTTA------TA--GT---C-AGT--AAA--TATCAGAA--------GACCTAAAATTTACG--TTAAGTT-----TTATTTT---CT-CAA--------TTT--T-ATAATTT---AAC------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GACACTTA---C--AT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACGCCTT---ACACA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------AATATA--A------TC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--Tcttacatagtggtctttggtttcagaatagtagctacataaa
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTTAAC-AAA-GAAAC-TA---T--GT------A----A----A------TAAAT---CACTTCCAATATCTT---GCTCA-----AA-TCTAATTTGC-TT------CC--ATTTT------GATAGA--AAAA--GTC-GTAGAAAT----AGTCAGGCTATA---TG--TTTAG-A----AAACTTTTGTAGTCT---------------GGT-TG-AAA--ATGTCATAGAC
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGA-AAA-GAAA--TA---T--AT------C----A----A------T---T---T-C----ATCATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTT------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATACT-CC--TTTGG-A----AAAATTTTGTAATCA---------------TGT-TT-AAA--ATGTC--AGACTGAGTCTC--CGTA-T---A-T---------G---TCT-TTTTTCGCAatctattttttg
gi|5                          :                                                                                                                                                   TCTGTGCCGAGAAC----TTAA-CA----GGACAATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCTAAA-TTC-AGTTCTAA------TACGGTAAGT-GGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TTATTTT---CT-AAA-------TGTT--T-ATCAGTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCATC-AAA-GTAAT-TA---C--TT------C----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTAA-----GA-T------TA--TT------CC--ATTT-------GATTTA--AA----GTC-GTAGAAAT----AGTCGAGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTAGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTATC--TGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGTA
gi|51                         :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----CTTT-CA----GGACT-------------C--GAGACA-TTCC-AAAA--TTTCA--C-AGTCCAAATTTC---TTCCTT------TA--TT---CATGTAGAAA--TAAAAAAAAAATATTGAACTTAAAA--GAGA-GTGAAGTT-----TCTTTTTTTGCT-GAG-------TATA--T-ATAATCT---AA
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GC-AAT-GATAC-T----C--TT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTTCTTGCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------AATATG--AA----GTC-ATACAGAA----AGTCAGGCTTTA---CG--TTTGG-A----AATTTTTAGTAGACT---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--AGAC-T---G-T---------A---TCTATTTTatccctatatat
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTT---TT-----------TTTT--T-GCCATTT---CAT------C---ACA-----ATT----------------TAA--T--------T---CAG-TTTCAGC-TAA-GATAC-TA---T--GT------A----A----G------T---T---T-CTACCAACAACTT---GCTCA-----GA-C------TG--TT------TA--ATTTC------AATATA--AA----GCT-ATAGAAAT----GATTGGACTTTA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------c
gi|56                         :                                                                                                                                                  ttCTGTGCCAAAAAC----TTTG-CA----GGACTATATTATTTTGAATTAGAGGCT-TTCCAAAAA--TTACA--T-
gi|58                         :                                                                                                                                                  cTCAGTGCCAAAAAC----ATTT-CA----GGACTACAGTCCTTTGGACTAGAGACT-TTTA-AAAA--TCACA--TAAATCAGAA-TTC-AATTTTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACACAA--------AAGCTAAAATTTACA--TTAAGAT-----TCATTTT---tattacaacattttgatatcggttacagtaatataacaagctcatatcttactataactattactttgtgaatgct
gi|6                          :                                                                                                                                                  agCTGTACTCAAAAC----TTTT-CATT--AGACGATATTCCTTTGAACTAGAGACA-TT---AAAA----A-A--T-AGTCCGAA-TTC-ATTTATTA------TA--GC---C-CAT--ACA--TAACAGAA--------GAAGTAAAATTTATA-TC-ATGTT-----TTATTTT---TT-AAA-------TTTA--T-ATCATTT---AAT------A---ATA-----ATT----------------TCA--T--------T---TAG-TTTCAGC-AAA-GACAC-TT---C--TT------C----A----T------T---T---G-CTCCCAACATCTT---GTTTA-----AAAT------TG--TT------TC--ATTTC------GATATA--AA----ATC-ATAGAAAT----GGTCAGGCTATA---CG--TCTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------AGT-TT-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
gi|67                         :                                                                                                                                                   gcTATGCCAAACAC----TTTT-CA----GGACTATAGAGTTTTGGACTAGAGACC-TTTC-AGAg
gi|68                         :                                                                                                                                                   TCTGTGCTAAAA-C----TTTT-CA----AAACTATAATGCATTGGACTAGAGACT-TTCC-t
gi|69                         :                                                                                                                                                   gCTGTGCCAAAAAC----TTTG-CA----GGACTATA
gi|7                          :                                                                                                                                                tgcTCTGTGCCAAAAAC----TTTT-AA----GGACCATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCCAG-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA--TAAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------A---ATA-----GTT----------------TTA--T--------T---CAT-TTTCAG--AAG-AAAAC-TG---C--AT------C----A----A------T---T---T-CT-------TCTT---GTTCA-----TA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATATTCG----GTC-ATAGTAAT----ATTTGGGCCATA---CA--TTTGG-A----AAACTTCTGTTGTCC---------------GGT-TA-AAAATATATGATAGACTGGGTCTT--GTAG-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCAttnnnnnnnnnna
gi|72                         :                                                                                                                                                  gTCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GAGCTATAGg
gi|8                          :                                                                                                                                                  gTCTTTGTCATAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGCTCTTTGGACTAAAGTCA-TTCC-AAAA--TTACT--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTCT-----TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAAAA--------GACCTAAACTTGAGA--TTAAGAT-----TTATTTT---CT-AAA-------TTAT--T-ATCATTT---AGT------C---ATC-----ATT----------------TCA--T--------T---CAG-TTTTAGC-AAA-GAAAC-TA---C--AC------A----C----A------T---T---T-TCCCCAAAATCAT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------TC--ATTTC------GATAC----A----GTC-ATAGATAT----CGTCGGGCTATC---CG--TTCGG-A----AAA-TGTTGTAGCCC---------------GTT-T---AA--ATGTCATTGACCGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TATATTTTTAGCAa
gi|9                          :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----ATTT-CC----TAACTAAAGTCCTTTAGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TGACAATT-AGTCCAAA-TTC-AATTCA-A------TA--GT---C-TGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAC-CTTACA-TT-AAGGT-----TCATTTT---CT-AAA-------TCTT----ATCATTT---GAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-AA---C--GT------A----A----C------T---G---T-CTCCCAGCATCTT---GCTGA-----GA-T------TG--TC------TC--A--TC------GATAAA--AA----GTC-AAAAAAAT----AGCCGGGCCATA---CA--TTTGG-T----AAACTTTTGTAGTCT---------------GGT-TA-AAA--AT------GACTGGGTCTC--GGAC-TA--A-T---------ACTTTTCATTTTTCGCAg


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       T  ATCA                           T    A    AA     AT A        T   T        TACCGG  CG  AAG AT  AG   TT        AAATATTG               GTTT     AAGTA       TTG  C   TACCATT    AT T       GTAA  AACTGA GTT   ATTTT   CAGTTTCTGCAAGGAC   CA ATAGCTCC AAG   T       T   A     T  ATA AT  GTACAT CGTT TTAG GTGACC AAA TAG A             CTT     AATTT  A TCAATC  GC  GAAGTT  CC     CATTTTG     TT  GTCT   A        AGTA    T       GTA AAA     A GTCC               ACACATCTGTAGTCT   A  T   AT                   TT    T ATG G TGACTATAG CTT
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       T  TT                             .    .    .      .  .        .   .        T       .   .   C   .    A         .                      TTT      .           .    .   .          .  .       TA    .      .     .       .                  .  .        .     T       .   .     .  .   .   .      .    .    .      AAA .   .             .       AATTT  . CTAATT  GC  .       .      ATGCTG      .   AA     .        .       T       CT  A       . .                  .                 .  .   .                    .     . ATG . AAA       .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        T       .   .   T   .    .         .                      TAT      .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       C   .       .      G           .   .      .        .       A       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . A   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TTC      .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       C   .       .      A           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TTT      .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       C       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TTT      .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      C           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      GTG      .           .    .   .          .  .       T     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       A       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       T       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       T       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   A   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       A       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       A       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      C           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   A   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       A       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TC       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TC       .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       A       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TC       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       A       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TC       .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       A       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   T       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       A       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   T       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   A   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       T     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       T       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   G   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       T       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TC       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   A       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TA       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       A       .   T       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       C     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   C   .    .         .                      TT       .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   T   .    .         .                      T        .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       A       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .        .   .        .       .   .   .   .    .         .                      T        .           .    .   .          .  .       A     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       G       .   C       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .    .      .  .                                         .    .         .                      T        .           .    .   .          .  .       G     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       A       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                              .    .                                                                                              .        .           .    .   .          .  .       .     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      A           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                 .       .  .                                   .                                                                                              .        .           .    .   .          .  .       .     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                    .     . .   . .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         .  .                                                                                                                                  .        .           .    .   .          .  .       .     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       G       .   G       . .                  .                 .  .   .                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         .  .                                                                                                                                           .           .        .          .  .       .     .      .     .       .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       .       .   A       . .                  .                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .                  .  .        .     .       .   .     .  .   .   .      .    .    .      .   .   .             .       .      . .       .   .       .      G           .   .      .        .       .       .   G       . .                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .       .      . .       .   .       .      .           .   .      .        .       .       .   A       . .                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .                                                                                                     


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                 ****
originalCons                  :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA
finalCons                     :                                                                                                                                                   TCTGTGCCAAAAAC----TTTT-CA----GGACTATAGTCCTTTGGACTAGAGACA-TTCC-AAAA--TTACA--T-AGTCCGAA-TTC-AATTCTTA------TA--GT---C-CGT--AAA--TAACAGAA--------GACCTAAAATTTACA-TTTAAGTT-----TCATTTT---CT-AAA-------TTTT--T-ATCATTT---AAT------C---ATA-----ATT----------------TTA--T--------T---CAG-TTTCAGC-AAA-GAAAC-TA---C--GT------A----A----A------T---T---T-CTCCCAACATCTT---GCTCA-----GA-T------TG--TT------CC--ATTTC------GATATA--AA----GTC-ATAGAAAT----AGTCGGGCTATA---CG--TTTGG-A----AAACTTTTGTAGTCC---------------GGT-TA-AAA--ATGTCATAGACTGGGTCTC--GGAC-T---A-T---------A---TCTATTTTTCGCA