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lowQualScore                  :                        2 2 33   5555 0000000000      222222222222                            00000000                       
lowQualScore                  :                        . . ..   .... ..........      ............                            ........                       
lowQualScore                  :                        5 5 44   3333 9999999999      888888888888                            33333333                       
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Alignments
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lowQualScore                  :                         . . ..   .... ..........      ............                            ........                       
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lowQualScore                  :                         . . ..   .... ..........      ............                            ........                       
lowQualScore                  :                         4 4 22   0000 3333333333      111111111111                            44444444                       
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blockSeqs                     :                         . . .    .    .               .                                       ATTT    
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blockSeqs                     :                         . . .    .    .               .                                       .       
blockSeqs                     :                         . . .    .    .               .                                       .       
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