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blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
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originalCons : CTACTTC-A-ACATGTCCGATACCTCAGCATA--ATAATATCGCTTTTCATACAAA-CACAAC-----ATG----T----A-----TACTTCTACATCACAGGATTGC--GAGA-GAGATTGTGATTTT-GTC-GTCGCTTTAAG--TTGACATATTT---TT--CA-AGTGTGTTAGTTGAATACCGGTAACAGTTTCAAT-----A--AAAA-AA----GAT---AAA---A-AGA--ATAAAATAAAT
finalCons : CTACTTC-A-ACATGTCCGATACCTCAGCATA--ATAATATCGCTTTTCATACAAA-CACAAC-----ATG----T----A-----TACTTCTACATCACAGGATTGC--GAGA-GAGATTGTGATTTT-GTC-GTCGCTTTAAG--TTGACATATTT---TT--CA-AGTGTGTTAGTTGAATACCGGTAACAGTTTCAAT-----A--AAAA-AA----GAT---AAA---A-AGA--ATAAAATAAAT
Alignments
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consensus : CTACTTC-A-ACATGTCCGATACCTCAGCATA--ATAATATCGCTTTTCATACAAA-CACAAC-----ATG----T----A-----TACTTCTACATCACAGGATTGC--GAGA-GAGATTGTGATTTT-GTC-GTCGCTTTAAG--TTGACATATTT---TT--CA-AGTGTGTTAGTTGAATACCGGTAACAGTTTCAAT-----A--AAAA-AA----GAT---AAA---A-AGA--ATAAAATAAAT
Reference ( family-2968 ) : CTACTTC-A-ACATGTCCGATACCTCAGCATA--ATAATATCGCTTTTCATACAAA-CACAAC-----ATG----T----A-----TACTTCTACATCACAGGATTGC--GAGA-GAGATTGTGATTTT-GTC-GTCGCTTTAAG--TTGACATATTT---TT--CA-AGTGTGTTAGTTGAATACCGGTAACAGTTTCAAT-----A--AAAA-AA----GAT---AAA---A-AGA--ATAAAATAAAT
gi|1 : CTACTTC-A-ACATGTCCGATACCCCAGCATA--ATAATGTCGCTTTTCATACAAA-CACAAT-----ATGACTGT----A-----TACATCTACATCGCAGGATTGC--GAGA-AAGTTTGTGATTTTTGTC-GTTGGTTTAAA--TGGACACATTT---TT--CA-AGTGTGTAAGTTGCATTCTGGTAACAGTTTCAAT-----A--AAAA-AA----GATAAAAAA---A-AGA--ATAAAATAA
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gi|6 : CTACTTC-A-ACATGTCCGATACCTCAGCATA--ATAATATCGCTTTTCATACCAA-CACAAC-----ATG----T----A-----TACTTCTACATCAGAGGATTGC--GAGA-GAGATTGTGATTTT-GTC-GTTGCTTTAAG--TTGACATATTT---TT--CA-AGTGTGTTAGTTGAATACCGGTAACAGTTTCAAT--------CAAA-AA----GGT---AAA---A-ACAT-ATAAAATAAAT
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gi|9 : TACTTC-A-ACATGTCCGATACATCAGCATA--ATAACATCGCTTTTTATGCAAA-CACAAC-----GTA----C----G-----AACTTCCTCATCACAAAATTGC--AAGA-AAGAATGTAATTTT-TTC-GTTGCTTTAAG--GTGACACATTT---TT--CG-AGTGTGTTAGTTGAATACAGGTAACTGCTTTAATAA---A--AAAA-AA----GATA--AAA---A-AGA--ATAAt