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lowQualScore                  :            .          ......              ...... ....  ...   ...............    .  .......................... .....    .    . .                              ......  . ................  .....   .... . .     ... ..   .     .  . .......  .. . ............  .  .. . .......  .  .   . ............                  ..     .. .. ................................................................................     .       .....................                ...........      .   .....     .      .... . .......... . ..       ..   . .    .       ......   ...  .  . ..           ..... ........ ......     .   .....          ..   ...................   . . .               .  .  .       
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Reference ( gi|7 )            :      TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTT-TT-----------------A--------A-----TGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGT-----TAC-AGT------GG------TA-----TTT---TA-A-TAAAAAAGT-GAAA-TAAATCTA-ACTT----AA--A-ATGA--G--A---TA-TT-GA-A-------AACAA-AAT-TTACCCA---T--TGGGATTCGAACCATGGC-GGAAAA--A-AA-CACTAAATCTTGCATAAG--------CTC-A-ACGT--------C--------AC-----T-C--GGCT--ATGAAG--ACATC-TTGATAA----CTG-T-TTA-T------TATTTTTATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGT--AGA-TT-A----TT-G-C--GAAATAT--ATTCA-TTGGTTTAAACA-----CATT---TTTTT-TTCCGAATATCTTA----TA--------A------TATTATATA-----TTTACAAACA--ATT---T----C--T-------AAA-G-G-ATTGGAATGAAAGACCAG-CTGATAGAAT
gi|10                         :      TATAATTTATAAATAGGCCTACGTGAATTCTGAGTCT------T----TA---CTA---------------GCTT-TTTTCGTATATCTACTAGAA--------A-----TGAC-AAAA-A-ATCACAAAGTTAAGATTATACATTGTATGT-----TAC-AAT------AG------TA-----TTA---AG-A-TAAAAGAGT-GAAA-TAAATCTA-ACTTAAAAAA--A-AAAA--A--A---TA-TT-GA-A-------AATAA-AAT-TT--CCG---TGGTGAGATTCAAATCATGGC-GGAAAA--A-AA-CACAAAATCTTGCCTAAGCTTAATTTCTT-A-ACAC--------C--------AC-----T-C--GGCC--ATGAAG--ACATT-TTGATAA----CTG-T-TTG-T------TATTTTTATATT--------CTGTT--TCATTCTAA---------------CGT--AAA-TA-A----TG-G-C--GAAATAT--ATAAA-TT-GCTCGAACAGTTG-CGTT---TTTT
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gi|46                         :     aTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----TA---TAA---------------GTTT-GT-----------------A--------AGGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGT-----AAC-A-T------AG------TA-----TATAGATA-A--AAAAAAAT-GAAA-TAAATTTA-ATAT----AA--A-AAAAATG--T---TA-TT-TA-A-------AACAA-AAT-TC-CCCAGG-T--T-GGATTtatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|50                         :    gaTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----TA---GTAA--------------GTTT-TTTCGTACGGGA-------A--------A-----TGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGT-----CAC-AAT------AG------TA------TT---TA-A-TATAAACAT-GAA
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gi|51                         :  attaTATAAAATATAAATAAA------TCTAGTCTAA-CTT------TGTCGTA---CGG---------------GA----------------------A--------A-----TGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGT-----AAC-AATATTATAGGAGACC-TA-----TTT---AA-A-TAAATAAAT-AGAA-ttaaccac
gi|70                         :      aATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|22                         :        TAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----TA---CTA---------------GTTT-TTTTTGTACGGGA------A--------A-----TGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGT-----TAC-AAT------AG------TA-----TTT---AA-A-AAAAAACGT-GAAAGTAACTTTA-A-------AA--A-AAG---G--A---TA-TT-GA-A-------AATAA-AAT-CCCCCCA------TGGGATTCGAACCATGGT-GGGAAA--A-AA-CATAAAATCTTTCTTAAT--------CTT-A-AC-------------------------------------------------C-TTGAATA----CGG----TG-T------TATTTTTCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGT--AAA-TA-A----TG-G-C--AAAACAT--ATTAA-TT-GTTTGAACA-----ac
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gi|21                         :               TAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----AA---CTA---------------GCTT-TTCCGTAAGCTATA-----G--------A-----TGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGT-----AAC-AAC------AT------TG-----TAT---AG-A-TAAAA------AAA-TAAATTTG-A-TT----AA--A-AAG---G--C---TA-TT-TA-A-------AATAA-AAT-TCCTCGG---A--TGGGATTCGAACCATAGC-----AA--A-AA-CAACAA--TTTATATAAG--------TTT-A-ACGTCTTAAC--C--------AC-----T-G--GGCC--ACGGCC--ACATG-TTGATAA----CAG-T-----T------TATTTTTATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGT--AAA-TA-A----TG-G-C--GAAATAT--ATTAA-CTGA-TTGAACA------GTTGCCTTTTT-GTC---ATATCgtatc
gi|36                         :              gTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----CA---CGA---------------GTTTATT-----------------ATATAGGAAA-----TGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGT-----AAG-ACT------AG------AA-----TTT---TA-AATAGTAAAAT-GAAA-T-----------T----AA--A-ATAA--A--AGT-TG-TT-TA-A-------AATAA-AAT-TC-CTCA---GG-TAGGATTCGAACCATTGC-GGAAA------------AAGTCTTATTTAAG--------TTC-A-ACGT--------C--------
gi|24                         :   atcacaaaacactccgTAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTT-TTTTGTATAGG--------A--------A-----AGAA-CAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGT-----TAC-ACT------AG------TA-----TTT-------------------AAA-TAAATTTG-ATTT----A---------------------TT-AATA-------AGTAA-AAT-TCCCCGA---T--ATGGATTTGAACCATGGC-GGAAAA--A-------TA--TCTTACATCAG--------TTT-T-ACGT--------CTTA-----AC-----CAC--GCCTCCACGAA----CACC-TTGATAA----AAG-A-TAA-T------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGT--AAA-TA-A----TG-G-A--GAAACAT--TTTAA-CTGA-TTGAACAGTTG-CATT---TTTtaagccactc
gi|23                         :                   TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTT-TTTTGTATAGG--------A--------A-----AGAA-CAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGT-----TAC-ACT------AG------TA-----TTT-------------------AAA-TAAATTTG-ATTT----A---------------------TT-AATA-------AGTAA-AAT-TCCCCGA---T--ATGGATTTGAACCATGGC-GGAAAA--A-------TA--TCTTACATCAG--------TTT-T-ACGT--------CTTA-----AC-----CAC--GCCTCCACGAA----CACC-TTGATAA----AAG-A-TAA-T------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGT--AAA-TA-A----TG-G-A--GAAACAT--TTTAA-CTGA-TTGAACAGTTG-CATT---TTTcgtcgtatc
gi|31                         :                                                                                                                                 TCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGT-----AAC-AAT------AG------CAGACCTTTT---TACA-TAAA----T-AAAG-TAAAT---------------------A--G------TA-TT-GA-A-------AATAA-AAT-TCCCCGG---T--TGGGAT-CGAGCCATGGC-AGGAAA--A-AA-CA--AAATCT-----AAG--------TTCCA-ACATTTTAAGACC--------AC-----T-C--GGCG--ACAGAT--ACATC-ATGATAA----ATA-----G-T------TATCTTTATATTTAAACTA----ATA---ATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGT---GA-AT-A----CTGG-T--GACATAT--ATTAA-TTGATTcgtcgtatc
gi|6                          :                                                                                                                                                          ATAT-----AAC-AAT------AG------TG-----TTT---GA-A-TAAAAAAAAAGAAA-TAAATTTA-ACTT----AA--A-A-GA--T--ATG-TA-TT----A-------AACAATAATATTGCCCG---TG-TGGGATTCGAACCATAGC-GGGAAA-----------AAATCTTGCATGAG---------TC-A-ACGTGTTGACACC--------AC-----T-T--GACC--ACGGCC--ACATA-TGGATAA----ATG-T-TTG-T------TATCTTAATA--TAAAC-------------------T-----TGTTTCTCTTGT--AAA-TA-A----TA-C-C--GAAATAT--ATTAA-TTGA-TTGAACA------GTT---TTTTT-TT
gi|37                         :                                                  atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaaGT-GAAA-TAAATTTA-ATTC----AA--A-A-AA--G--T---TA-TC-GA-ATTTTAAAAATAA-AAT-TTCCCGG---G--TGTGATTCGAACCATGGC-GAAAAA--A-AAGCA--------TACATAAG--------TTC-A-ACGTCTTAAC--C--------GC-----T-A--GATC--ATGGAC--ACATT-TTGATAC----AAG-T-TTG-T------TATC--------------------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGT---TA-TTAA----TG-G-C--GAAATAT--ATTAA-CTGATTT-AACAGTTG-CATT---TTattcgtatttttggcgtatcg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                        -TAGATC-A-ACAT----AA--A-AAAA--T--A---TA-TT-GA-A-------AATAA-AAT-TC-CTCA---TG-TGGGATTCGAACCATGAC-GGAAAA--A-AA-CA--AAATCTTGCAT---------------A-ACAC--------C--------AC-----T-C--TGCC--ACAGAC--ACATC-TTGATAA----ATA-G-TTG-T------TATATTTATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGT--TAA--T-A----CT-GAC--GACATAT--ATGTA-TTAA-TGGAACATTTGCCATT---TTTatgtcgta
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                  atataaaataaaaataaatgaattagtttactttac----AA--A-AT-A--G--T---TA-TT-TA-A-------AATAA-AAT-TCCCCGG---A--TGGGATTCGAACCATGCT-ATAAAA--G-AA-CA--AAAT--TGTA------------CTG-A-A-GT------------------------T-C----------------ACACC-TTAACAA----TAT-T-TTAGT------TATTTTAATATTTAAACTA-------GTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGT--AAA-TA-A----TG-G-C--GATATAT--GTgtcgtatc
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             aattaa--TAGGATTCGAACCATGAC---AAAA--A-AA----TAAATCTTACTTATG--------TTC-C-ACGT--------CTTAACC--AC-----T-C--TGC-----AGAC--ACATC-TTAATAA----AGG-T-TTG-A------TATTTTTACATTTAAACTG-ACG------ATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGT--AAA-TA-A----TT-G-C--GAAATAT--GTTagttggacagtttcctttttgttgaa
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccagg--TGGGATTCAAACCATGGC-GCAAAACTA-AA-AAC---ATCTTGCATAAG--------CTC-A-ACGT--------C--------gcttatttttgccgt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cggCATC-TTGATAA----ATG-T-TTG-T------TTTCTTTATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGT--TAA-TA-A----TG-G-T--GACATAT--ATCAA-TTGA-TTGAACAGTTG-CCTT---TTTTT-TTttaaccc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattgaccgaagtggtag-AAC-----TATGTTTCTTGTTCAAACTT-AGCATTT-G-T--GA----T--ATTAAATTGATTTTAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATTTCA----TA--------A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTA--T----G--T-------CAA----------AATGAAAGACAAG-CTTATAGAATgtcgtatcg
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtatA-TTGGTTTAAAC--------TT---ATCTTATTCCAAATACTTTACATATA--------A------TATTTCATA-----TTATCAAGCA--ATT---T-------T-------GAA-T-G-ATTAGAATGGAAGACAAG-TTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atacagtgt-TTGGTTTAAACA-----TAGT---TTATT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGTAATGAAAGACAGG-CTTATAGAAtaattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTGGTTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGAAATGAActcctctc
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t-TTGGTTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TATtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTGATTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTTA----GA--------A------TATAACTTA-----TTTACAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atTGATTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGATTATCTTA----CA--------A------TATTATATA-----TTTACAAATA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-TATGAAATTAAGGACAAG-CTTATTGAATttttgtcataatgactgggatttgacgatgtgagctgctataga
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATTTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATT---TTAC-C--A-------AAA-G-G-A-TGGAATGAAAAACAAG-CTTATAGAAtcctttcctaaatgcaatacaataacacaaactatgatgacaaatgcggatttctagttatatatacaagataacattattgactttatgataatgatcaattgtaaagatatattagaatagaaatggaaattgcggaaaacatggatattatataatgcaatatgttaaatacatatttgggggagttatgggcaacgttgggatgggaggatttgttaactttcatgtcagttaaaactatatgtgtgatattagaaacgatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GATTTAGACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--CTTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGGAATGAAGGACAAG-CCTATAGAATgtcttc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GATCTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATTTTA----CA--------A------TATTACATT-----TTTACAAACA--ATT---TTG--T--C-------AAA-G-G-TTTGGAATGAAAGACAAG-CTTATAGAATtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTTTAAACA-----TATT---TTAGT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TATCACATA-----TTTACAAACA--ACTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGAAGTAAAtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGCTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTCA----CA--------AAATAGTTATCATTTA-----TCTACAAATA--GTT---TTG--T--T-------AAA-ATG-GTGAGAAT-AAAG-CCAGTCTTATAGAATgtgctatta
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTATAAACA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGGAATGAAAGACAAG-CTTACATAATtctccta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tGTTTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCTTA----CA--------A------TA-TATATA-----TTTAGTAACA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-TTTGGAATGAAAGACAAG-CCTATAGAATtactctcctaaatactatacaattacacaaactatgttgacaaatttatatttctagttaagtatacaagattacaacataattttaaacgatcaaatggaaatatatattagaatagaaatagagttgctgaaaaactttgatattatagaatgcaaatacatattagcgggaattatgggcgacattgggatgggagaatttattaacgttcatgccagttaaaactacatatgtgacattaaatacgatgtgtattttcgatgtaattatgtactgcactgaatatgatgatatttatatcgatagaagacgtttcgtttccggaaatggggtgatataatgatctttcaagtactgttcgtgagttgcgatgtgagatgcaatgaagtaaaacatgttctgcgtcttcaatttcgccacacatacaaagaggataaataatgttt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTAAACA-----TATT---TTATT-TT--GAATATTTTA----CA--------A------AACGACATA-----TTTACAGACA--ATTTTAT----C--A-------AAA-G-T-ATTGGAATGGAAGACGAG-CTTATAGAATtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaTTTAAGCA-----CATT---TTATT-T--AAAATATCTTA----CA--------A--------------A-----TTTACAAACA--CTT---T----TATC-------AAATG-G-ATTGGAATAAAATACAAG-CTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaTTTAAACA-----TATT---TAATT-T--CGAATA-CTTG----TAGCTTTACCA------TATTACATA-----TTTAAATATATTATT---T----T--TCA-----AAA-A-A-ATTGGAATAAAACATAAG-CTTATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAAACA-----TATT---TTATT-T--CGAATATCGTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGTAATGAAAGGCAAG-TTTATAGAAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAAA-A-----CATG---TCTAT-TTCAAAATATTTTA----CA--------A------TATTACTTA-----TAAACAAACA--ATT---TTG--T--C-------AAA-G-GAATTGGAAAGAAATACAAG-CGTATAGAATtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tag-----CATG---TTTTA-TTTAAAATATCTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATT---TTGTCC--A-------AAA-G-G-ATTGGAATGAAAGACAAG-CTTATAGAATtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aat---TTTTA-TTTCGAATATCTTA----CA--------A------TTTTACATA-----TTTACAAACA--GTT---T----TG-TCAA----AAA-G-G-ATTGAAATGAAAGATAAG-CTTATAGAAtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaacttttgaa---TTTTA-TTTCAAACATCTTA----CA--------C------TATTACATG-----TTTACAAGCA--ACT---T----TGGT-------AAAGG-G-ATTAGAATGAAG----AG-CTTATAGAATaacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tg---TTTTA-TTCGGAATATTTTA----CA--------T------TAATACATA-----TTT-C---CA--ATT---T----T--TTTTGTCAAAA-G-A-ATTGGAATGAAAGACtcctgtt
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggttttcatgtaAATATTTTA----CA--------A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT----C--A-------AAC-T-G-ATTGGAATGAAAGACaatctcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttaaatgtactatgaATATCTTA----CA--------A------TATTACATA-----CTTAGAAACA--ATTTTGT----C--A-------AAA-G-G-ATTGGAATGAAAGACAAG-CTTTTAGAATaattat
17 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TTTATAAAAATTGATCGGAATGAAACAAACTTATATTATTCCTATCTTAAATACAATACAATTGCATAACATAATGTTTTATGATGACAAATGTTGATTTCTAGAAAGGTATACATGATAATATTTATTTATAATAAACATTGAATGTAAGGATTTATTAGAATAGAAATGAGTGTTATAAAATGCAATATGTCATATACATATTAGGGGGAACTGTGGACGACATTGGGAAGTAAGGATTTATTAAGACTATAAGAGTGACGATATCAACGATATGTTTTTTCAATGTAAATACATGTATGTTCTGCACTGGAAATGATAATATTTGTATTGATAGAAACAGTTTCGTCTCCAATGAAAAGTATATGAATAGTTATTCGAAGATAGGGTGGTAATATGTCGTGTATTGTTCGTGTAAATAATAATGAATATAATATTTCAGTTATTTAATTACACTATGCTAAGACGAAAGGTATGCTT
Unaligned ( gi|5 ): AAAGATCAAATCTAAAAATATATTAGAATAGAAATTGTTTTTGGATACTATATAATAGAATGTAACATAATCCATATTAGCGGAAAGTTTTGGCGACATTGGGGTGAGAGGATTTATTAACGTTCATGCCAATAAACAGTATATAAATTATGTAACGTTAGAAACGAAATGTATTTTCGATGTTATTATGTATTGCACTGAATATGATTATATTTGTATAGATAGAAAAAAGTTTGTCTCCAAAGAGAAGTAGATGGGTAGTTATTCACAGTGGGATTGTAATGATCTTTCGAGTACTGTTCGTGAGTCGCGATATGAGATGCAATGAAGTAGAACATGTTCTGCGTCCACAGTTTCGCCACACACATACATTGAGAGGCTACACCTATGTTTATCGAGTCTATATTGAGTAATTTAGATTGATC
Unaligned ( gi|8 ): AAACGGTTTTTTATGAAGTTGAACACCAATCGTAAAATATTTTACAGTATTCCTCTGCTGCATACAATATAATTTCACAAAAAATGATAACAAGCGTGGATTTTTAGTATAGTATACAAGATAACAACATACATAATAAACATCAATTGTAAAGATGAATTAGAGAAAACGGAACGGGAAAAAAACATAAATATAATACAATGTCTTGTGTTAAATACATACTGGGGGTGGGGGGGTGGGGGGGTCATTTTTGGGATGGGGAGGTTTTATTAACGTTCATGTTAGGTAAAACGACCTGAGTGACGTAAAAAAAAAACGATGTTTGTTTTCAATGTAATTTTTACCACACAAAATGATAATATTTGTATCTACTGAAAAAGTTTTATCTCAAAAGA
Unaligned ( gi|15 ): TTCTGTCAACGTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATTCCTTTACTAAATACAATTACACAAAATGTCAACAAATGTGGATTTATGGTCGAGTATATACAAGATGACATTAATTTTATAATAAAGATCAAATATAAAGAATAGAAATGGAAGCTGGGGGTGGGGGGGAACATTGATATTATATGATGTAGTGTGTTGAATACATATTACCGGTAGGGGGAATTGTGGGCGACATTGGGATGGGAGAATTTAATAATGTTCATGCCAGTTTAAACTATAATTATAATACTATGTGGCGTTAGAAGCAATGTGTATGTTCTTGGATTTAAAATCAATACACTGAACA
Unaligned ( gi|29 ): TATCAACATTCAGTGACGGTAAAGACGATGTGTATTTTCAATGTAATTATGTTTTTCACTGAAAATAATAAACTTTGTATTGACAGAAATAGTTTCATCCTTAAAGACACGTAGATGTGGTTGAGTTGAAATCATGCTCTCAATCACATATCAAACTGTTTTCACAAGGGTCATGGTTGTCCGACCGTTCATGCCACTGCGAGAGCATTAAGGCCAGCAGATTTACAGAACAAGTTACTGGATAACTTAAA
Unaligned ( gi|32 ): AAATATAATATAAAATTACACAAACTATGATGACAGATGCAGATTTCTAGTTAAGTATACAAGATAACAACATTGATTTTATAGTAAAAATCAGTTGTGAAAATATATTAGAATAGAACATGGATATTATAGAATGCAATATGTAAAATACATATTTGGGGGAGGTATGGGCGACATTGGGATGGGAGGATTTATTAACGTTCATGCCATTTAAAACTACAGGTATATGTGTGACATCTT
Unaligned ( gi|43 ): TTAATTAACATGGAAGAAAACGATAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATAATTATATGATTATACACGGNNNNNNNNNNATTAGAATAGAAATGGAAGTTGCGGAAAACATGGGTATTATAGAATGCAATATGTTAAATATATATTCGTGGGAACTGTGGACGACATTTGAAT
Unaligned ( gi|44 ): ATTTTGGCGACATTGCGATGAAAAGATTTATTAACGTTCATACCTGTTCAAAAGATATAAGTGCAATGAGCAATGATCTGAATAGTCAATGCAATTATGTACTGCGCAGAAAATGATAATATTTATATGGATGGAAAATATTTTATCGCCAAAGAGAAGTAGACGGGAAGTGATTCATAAA
Unaligned ( gi|45 ): AATACAATACAATACATAAACTATGATGACAACTGTGAATTTCTAGTACGCAAGATAACAACATTAATTTTATAATAACGATCAAATGGAAGGACATATTATAGTAGAAATGGAAAACATGGCTATTAAATAATGCAATATGTTAAGTACATATTAGGGGGAATTATTGGCAACATTG
Unaligned ( gi|48 ): GGGAGTTGTGGTCGTCCATGCCAGTTAAAACTATATGTGAGACATTAGAAACGATGTAATTATGCACTGCACTGAATATGATAATATTTGTGTCGATAGGATTCGTCTCCAAAGAGAAGATGGTTAGTTATTTGCAGATGGGGTGGTAATGAT
Unaligned ( gi|54 ): TACTACTTTTTGCTGATGCACCATGTAAAACAGAGTACTGACTAAAAAGGAGGAGCAGCATTTACGTATTTTCCAATTTTCGTTACTTGAAAAATAAAATCGACA
Unaligned ( gi|60 ): GCACGAAAGATGATGACAAAATGTGGATTTCTAGTGTAGTATACAAGATAACAACATTTATAACAAAGATGAAAAATAAAAGATAAATTAAA
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Reference ( family-2913 )     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTTAAAT--AAAA--AAAT-GAAA-TA----A----ATTT--------AACT---TA-AAA-GA-G---A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCCGNTG-GGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAG------T-TC--A-ACGT--------C--------AC---TCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATATTAA-TTGATTTGAACA------TA-TT----TTNTT-TT-CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-NAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
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gi|12                         :                   TATAAACTATAAATGTA------TGAATTCTGAGCTT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GCA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTCACTAAGTAACGATTACAAATTTTATTTAACA-----C------TAG------TA------TTTAAAT--AATT--AAAT-GAAA-TG----A----ATTT--------AATCAAATACAAA-AA-G---T-----T--ATCAA-T-------AA-TGACATTCCCCGGTTG-GGATTCTAACCCTGGC-GGATA---C--AAA-T-----A-AATCGTACAT-TG------T-TT--AGACGTCATAAC--C--------AT---CCAAGCACGGGCACGTA-ATGAT--A-ATA-TAATGT------TATTTTTATATTCAAAC-------TGATTATTC-AAT-----TGTTTTTCTTGTAAAAAATGGCAGGAAATATTAA-CTGATTtcctttcctaaatgcaatacaataacacaaactatgatgacaaatgcggatttctagttatatatacaagataacattattgactttatgataatgatcaattgtaaagatatattagaatagaaatggaaattgcggaaaacatggatattatataatgcaatatgttaaatacatatttgggggagttatgggcaacgttgggatgggaggatttgttaactttcatgtcagttaaaactatatgtgtgatattagaaacgatgt
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gi|14                         :                   TATACACTATAAAAAAA-------GAATTTTGAGCCT------T----TA---ATA---------------GTTTTTC-C-GTA------AGCTATAGGAGATGAC-AAAA-A-GTCACCAATTTGAGATAATACATTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TATAGAT----AA--AAAT-GAAA-TC----A----ATTC--------AATT---TA-AAA-AA-AGCTA-----T--ATT---A-------CA-TAATATTCCCCAGGTG-GGATTCGAACCATGGCTGGAAAAACA--AAA-A--A--A-AA---TG---AAG------T-TC--A-ACATCTTAAC--C--------AC---TCGGCCATCTACACACT-TTAACAAA-ATG---CAGT------T-TTTTTATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAC-----TGTTTCTTTCGTAAACAATGGCG-AATATATTAA-CTGG-TTGAACA-------G-TT----GCCTT-TT-tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaTTCTGT-C--AACGTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATggtcgtatcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TAT-ATATATT-----TAGTAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCCTATAGAATtcctttactaaatacaattacacaaaatgtcaacaaatgtggatttatggtcgagtatatacaagatgacattaattttataataaagatcaaatataaagaatagaaatggaagctgggggtgggggggaacattgatattatatgatgtagtgtgttgaatacatattaccggtagggggaattgtgggcgacattgggatgggagaatttaataatgttcatgccagtttaaactataattataatactatgtggcgttagaagcaatgtgtatgttcttggatttaaaatcaatacactgaaca
gi|17                         :                     gAAAATATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAGGCCTACTC------------GCTTTTT-C-GCA------CG-----GGCAATCGC-AAAA-ATATGAACAAGTTAAGATTATATAGTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TTTAAAT--AAAA--TAA---AAA-AA----G----ATAT--------A-C------------A-T---G-----T--ATT-A-A-------AA-TAAAAT---------G-TGATTCAAACCATGGC-GGAAA---A--AGA----A--A-AATCTTGTATAAG------T-TC--A-ACGC--------CTTAACACCGC---TCGCCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATGTT-TTTT------TTTTTTTATATTTAAAC-------GAATCATTC-ATG-----TGATTCTTTCGTTAATAATGGCAAAATATATTTA-TTGA-TTGGACAGTTGC-CA-TT----TTTTT-TT-tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|18                         :                   TATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTTAAAT--AAAA--AAAT-GCCA-TA----A----ATTT--------AACT---TA-AAA-AA-G---A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTG-GGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C-------CGTCTT-------------------A-ACAC--------C--------AG---TCGGC------CACATCTTTGAT-AA-ATG-T-TTATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAATTAA-TTGA-TTGAACAGT----TGCCT----TTCTT-GT-C---ATATCgtatc
gi|19                         :                 taTATAAA-TATAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAA--TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----G-AAATGAC-AAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTAAGAAACA-----A------TAG------CG------TTTAAAT--GAAA--AAAT-GAAA-TA----A----ATTT--------AACT---TT-AAA--A-G---A-----T--ATTAA-A-------AAATGAAATTGCCTGGGTG-GGATTCGAACCATGGC-AGAAA---A--AAA----------ATCTTGCATAAG------T--C--A-ACGTGTTGA---C--------ACCAGTTGGCCACAGCCACAAC-TGGAT-AA-ATG-T-T-GT------TGTTTTT-TATATAAACT------T------------------GTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATATTAA-TTGA-TTGAACAGT----TG-CC----TTTTT-AT-CG---TATC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTGAA-----------TT----TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TTTTACATATT-----TACAAACA--GTTTTGT-CAAAAAGGATTGAAATGAAAGATAAGCTTATAGAA
gi|20                         :             aaaactTATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTTAAAT--AAAA--AAAT-GCCA-TA----A----ATTT--------AACT---TA-AAA-AA-G---A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTG-GGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C-------CGTCTT-------------------A-ACAC--------C--------AG---TCGGC------CACATCTTTGAT-AA-ATG-T-TTATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAATTAA-TTGA-TTGAACAGT----TGCCT----TTCTT-GT-C---ATATCaacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|21                         :                           aTAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----AA---CTA---------------GCTTTTC-C-GTA------AGCT---ATAGATGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGTAACA-----A------CAT------TG------TATAGAT--AAAA--------AAA-TA----A----ATTT--------GA-T---TA-AAA-AG-G---C-----T--ATTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCGGATG-GGATTCGAACCATAGC-----A---A--AAA-C--A--ACAAT-TTATATAAG------T-TT--A-ACGTCTTAAC--C--------AC---TGGGCCACGGCCACATG-TTGAT-AA-CAG-T----T------TATTTTTATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATATTAA-CTGA-TTGAACAGT----TG-CC----TTTTT-GT-C---ATATC
gi|22                         :                    gTAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----TA---CTA---------------GTTTTTT-TTGTA------CG-----GGAAATGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTTAAAA--AAAA--ACGT-GAAAGTA----A----CTTT--------AA------A-AAA-AG-G---A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATCCCCCC-ATG-GGATTCGAACCATGGT-GGGAA---A--AAA-CATA--A-AATCTTTCTTAAT------C-TT--A-AC--------------------C---TTGAATACGG------------------------TGT------TATTTTTCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGTAAATAATGGCAAAACATATTAA-TTG-TTTGAACA-------G-TTGCCCTTTTT-GT-CG---TATC
gi|23                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTTAAAT--AAA-------------------------TTT--------GATT---TA----------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCC-GATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAG------T-TT--T-ACGT--------CTTAACC--AC---GCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AA-AAG-A-TAAT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTTTAA-CTGA-TTGAACA-------G-TT----GCATT-TT-
gi|24                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTTAAAT--AAA-------------------------TTT--------GATT---TA----------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCC-GATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAG------T-TT--T-ACGT--------CTTAACC--AC---GCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AA-AAG-A-TAAT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTTTAA-CTGA-TTGAACA-------G-TT----GCATT-TT-tcgtcgtatc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CA------TG-TT----TTATT-T--AA-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGTCC-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAATtcgtcgtatc
gi|26                         :                aatTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCTGTAGGCC----TA---CTC---------------ACTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATTCATTTAATGTAACA-----A------TAG------CA------TTGAAATG-AAAA--AAAT-AAAA-------A----AT----------AA------A-AAA-GA-G---A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTG-GGATTCGAACCGTGGC-AGAAA---A--AAA----------AT--TGCCTAAG------TCTT--A-GCAG--------C--------AC---TGGGCCAAGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TAT-----------AA-T------TA--CATTC-GTT-----TGTTTCTCTCGTCAATtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taGATCTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATTT-------TACA----A------TATTACATTTT-----TACAAACA--ATTTTGT-C--AAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                       AAAT--AAAAATAAAT-GAAT-TAGTTTA----CTTTACTAGATCAACA---TA-AAA-AA-AT--A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCTCATGTG-GGATTCGAACCATGAC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCAT---------------A-ACAC--------C--------AC---TCTGCCACAGACACATC-TTGAT-AA-ATA-G-TTGT------TATATTTATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGTTAATACTGACGACATATATGTA-TTAA-TGGAACA------T--TTGCCATTTTT-GT-CG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atataATATTAAATTGATTTTAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATTT-------CATA----A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTATGT-C-AAAA---------TGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtataactatgtttcttgttcaaacttagcatttgtg------TA-TT----TTATT----CGGAATATTT-------TACA----T------TAATACATATT-----TCCAATTT--TTTTTGT-C-AAAAGAATTGGAATGAAAGACAATCTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|31                         :                                                                                                                            ggttttcatgTCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGTAACA-----A------TAG------CAGACCTTTTTACAT--AAA------T-AAAG-TA----A----AT-------------------------A-G---------T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGTTG-GGAT-CGAGCCATGGC-AGGAA---A--AAA-C--A--A-AATCT-----AAG------T-TCC-A-ACATTTTAAGACC--------AC---TCGGCGACAGATACATC-ATGAT-AA-ATA-----GT------TATCTTTATATTTAAACT-------AATAATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGTGAATACTGGTGACATATATTAA-TTGATTcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|33                         :                   TATTAACTAAAAATAAA------TGAATTCTGAGGCA------------A---CTA---------------GCTTTTT-------------A-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTGACCAAGATAAGATTATACATTTTATATAATA-----ATACCGGTAA------TA------TTTAAAT--AAAA--TAAT-GAAA-TA----A----ATTT--------AATT---TA-AAA-GA-A---AAGT--T--ATC-A-A-------AA-TAAAA-TCCTCGGTTG-GGATTCGAACCATGGC-GAGAA---A--AAA-A--A--A-AATCTT--ATAAG------T-GC--A-ACGTCTTAAA--C--------AC---TCGGCCACAGAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAACA------TG-TC----T-ATT-TC-AA-AATATTT-------TACA----A------TATTACTTATA-----AACAAACA--ATTTTGT-C-AAAGGAATTGGAAAGAAATACAAGCGTATAGAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tagttaaA-TTGGTTTAAACT------TA-TC----TTATT-C--CA-AATACTT-------TACATATAA------TATTTCATATT-----ATCAAGCA--ATTTTG------AATGATTAGAATGGAAGACAAGTTTAtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|36                         :                   atacagtgtTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----CA---CGA---------------G-TTTAT-T-ATA------TA-----GGAAATGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGTAAGA-----C------TAG------AAT-----TTTAAAT--AGTA--AAAT-GAAA-TT----A----A-----------AA-----TA-AA---A-G---T-----T--GTTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCAGGTA-GGATTCGAACCATTGC-GGAA--------------A--A-AGTCTTATTTAAG------T-TC--A-ACGT------------------C---TAAGCCACattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                      atcacaaaacactccgT-GAAA-TA----A----ATTT--------AATT---CA-AAA-AA-G---T-----T--ATCGA-ATTTTAAAAA-TAAAATTTCCCGGGTG-TGATTCGAACCATGGC-GAAAA---A--AAAGC--A---------TACATAAG------T-TC--A-ACGTCTTAAC--C--------GC---TAGATCATGGACACATT-TTGAT-AC-AAG-T-TTGT------TAT--------------C------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGTTATTAATGGCGAAATATATTAA-CTGATTT-AACAGTTG--CA-TT----TTATtc
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gATTTAAACA------TA-TT----TTATT-TT--G-AATATTT-------TACA----A------AACGACATATT-----TACAGACA--ATTTTAT-C-AAAAGTATTGGAATGGAAGACGAGCTTATAGAATgtcgta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aATTTAAGCA------CA-TT----TTATT-T--AA-AATATCT-------TACA----A--------------ATT-----TACAAACA--CTTTTAT-C-AAATGGATTGGAATAAAATACAAGCTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATCG-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGGCAAGTTTATAGAATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|41                         :                   TATAAACCATAAAT--------------------CCT------T----AA---CTA----------------CTTTTT-C-GTA------TA-----GGA--TGAC-AAAA-A-GTCACCAGGTCAGGATTATACATTTTATG---CA-----A------CAG------TA------TTCCAA---AACA--AAAT-TAAATTA----A----AGTT---------ACT---TA-------------------------A-A-------CA-TAAAATTCCCCAGGTG-AGATTCGAACCATGGC-GG-TA---A--AAA-T--A--A-AATATTACATGGA------T-TC--A-ACGT--------C--------tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                      attaTT--------AA------A-AAA-TA-G---T-----T--ATTTA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGATG-GGATTCGAACCATGCT-ATAAA---A--GAA-C--A--A-AATTGTACTGAAG------T-TC--A----------------------------------------CACC-TTAAC-AATATT-T-TAGT------TATTTTAATATTTAAACT-------AGTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGTAAATAATGGCGATATATGT-------AGTTGGACA-------G-TT----TCCTT-TT-TG-ttaaccac
gi|46                         :                 aaTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----TA---TAA---------------GTTT------GTA-------A-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAAC------A------TAG------TA------TATAGATAAAAAA--AAAT-GAAA-TA----A----ATTT--------AATA---TA-AAA-AA-A---ATGT--T--ATTTA-A-------AA-CAAAATTCCCCAGGTT-GGATTttgaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaCCAGGTA-GGATTCGAACCATGAC---AAA---A--AAA-T--A--A-A-TCTTACTTATG------T-TC--C-ACGT--------CTTAACC--AC---TCTGC---AGACACATC-TTAAT-AA-AGG-T-TTGA------TATTTTTACATTTAAACT-------GACGATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGTAAATAATTGCGAAATATGTTGC-TT-ATTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TTTCTTTATATTTAAACT-------AATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTTAATAATGGTGACATATATCAA-TTGA-TTGAACAGTTGCCTT-TT----TTTTT-GT-CG---TATCttgccgt
gi|50                         : tattgaccgaagtggtagTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----TA---GTAA--------------GTTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTCACA-----A------TAG------TA------TTT-AAT--ATAA--ACAT-GAAg
gi|51                         :                 ttTATAAAATATAAATAAA------T-----CT-AGTCT------------------A---------------ACTTTGT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGTAACAATATTA------TAGGAGACCTA------TTTAAAT--AAAT--AAAT-AGAA-ct
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aATATCT-------TACA----A------TATTACATACT-----TAGAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTTTAGAAT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taaacTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATCT-------CACA----AAATAGTTATCATTTATC-----TACAAATA--GTTTTGT-T-AAAATGGTGAGAAT-AAAGCCAGTCTTATAGAATtcctctccttaacacaatacaattacacaaacta
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggc-TTGGTTTAAACA------TA-GT----TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGACAGGCTTATAGAAtctccta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TTGGTTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGAAATGAActcctctc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGGTTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATTT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTAC-C-AAAAGGA-TGGAATGAAAAACAAGCTTATAGAAtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TTGATTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATCT-------TAGA----A------TATAACTTATT-----T----ACA--ATTTTGT-C-ATAATGACTGGGATgtcttc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atTTTAAACA------TA-TT----TAATT-T--CG-AATACTTGTAGCTTTACC----A------TATTACATATT-----TAAATATATTATTTT-T-C-AAAAAAATTGGAATAAAACATAAGCTTATttgacgatgtgagctgctataga
gi|6                          :                   TATAAAATATAACTAA-----------TTCTGAGACT------TAATTTA---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCATCAAG------------ATTTTACGCAACA-----A------AAG------TG------TTTAAAT--AAAA--ATAT-ATAA-CA----ATAGTGTTT--------AAAT---AA-AAA-AA-T---A-----T--A
gi|6                          :                                                                                                                                                              aATATAACA-----A------TAG------TG------TTTAAAT--AAAA--AAAT-acaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|6                          :                           atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaATATAACA-----A------TAG------TG------TTTGAAT--AAAA--AAAAAGAAA-TA----A----ATTT--------AACT---TA-AAA-GA-T---A-----TGTATTAA-AC------AA-TAATATTGCCCGTGTG-GGATTCGAACCATAGC-GGGAA---A--AAA-----------TCTTGCATGAG------T--C--A-ACGTGTTGACACC--------AC---TTGACCACGGCCACATA-TGGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATCTTAATAT--AAACT------T------------------GTTTCTCTTGTAAATAATACCGAAATATATTAA-TTGA-TTGAACAG-----TT-TT----TTTTTATT-CG---TATTT-------Tataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaa------TG-TT----TTATT-T--CA-AACATCT-------TACA----C------TATTACATGTT-----TACAAGCA--ACTTTGG-T-AAAGGGATTAGAATGAA----GAGCTTATAGAATtggcgtatcg
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTTTAAACA------TA-TT----TTAGT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATCACATATT-----TACAAACA--ACTTTGT-C-AAAAGGATTGAAGTAAAtcctgtt
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AATATTT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAACTGATTGGAATGAAAGACAA--TTATgtgctatta
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaatgtactatgaCGGTG-GGATTCAAACCATGGC-GCAAA---ACTAAA----A--A-CATCTTGCATAAG------C-TC--A-ACGT--------C--------
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TTGGTTTAAACA------TA-TT----TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATttaaccc
gi|7                          :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTT-----------------------AATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----G------TGG------TA------TTTTAAT--AAAA--AAGT-GAAA-TA----A----ATCT--------AACT---TA-AAATGA-G---A-----T--ATTGA-A-------AA-CAAAATTTACCCATTG-GGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACTA-AATCTTGCATAAG------C-TC--A-ACGT--------C--------AC---TCGGCTATGAAGACATC-TTGAT-AA-CTG-T-TTAT------TATTTTTATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGTAGATTATTGCGAAATATATTCA-TTGGTTTAAACA------CA-TT----TTTTT-TTCCG-AATATCT-------TATA----A------TATTATATATT-----TACAAACA--ATT---T-C-TAAAGGATTGGAATGAAAGACCAGCTGATAGAAT
gi|70                         :                    ATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|9                          :                   TATAAA-TATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTAAATTAAGCTAGTCTAGTTTTTT-C-CTA------CG-----GGTAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAATTAAGATGATACATTTGATGCAACA-----A------TGGAAGCTCTA------ATTAAAT--AAAG--AAAT-TAAA-TA----A----ATTT--------AACT---TA-AGA-AATG---A-----T--ATTGA-A-------AA-TAAAATTCCACAGCTG-TGATTCGAACCAAGGC-GGAGA---A--AAA-T--A--A-AATCTTTCATAAG------T-TC--A-ACGTCTTAACAAC--------AC---TCTGCCACGGAAACATC-TTGAT-AA-ATA---TTGT------TATCTTTATATTGAAA-G------TAATCATTC-GAT-----TGTTACTCTTGTAAATACTGGCGACATATAATAA-TTGA-TTGAACA-------G-TTGCCATTTTT-GT-C---ATATCac
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TTTATAAAAATTGATCGGAATGAAACAAACTTATATTATTCCTATCTTAAATACAATACAATTGCATAACATAATGTTTTATGATGACAAATGTTGATTTCTAGAAAGGTATACATGATAATATTTATTTATAATAAACATTGAATGTAAGGATTTATTAGAATAGAAATGAGTGTTATAAAATGCAATATGTCATATACATATTAGGGGGAACTGTGGACGACATTGGGAAGTAAGGATTTATTAAGACTATAAGAGTGACGATATCAACGATATGTTTTTTCAATGTAAATACATGTATGTTCTGCACTGGAAATGATAATATTTGTATTGATAGAAACAGTTTCGTCTCCAATGAAAAGTATATGAATAGTTATTCGAAGATAGGGTGGTAATATGTCGTGTATTGTTCGTGTAAATAATAATGAATATAATATTTCAGTTATTTAATTACACTATGCTAAGACGAAAGGTATGCTT
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Unaligned ( gi|44 ): ATTTTGGCGACATTGCGATGAAAAGATTTATTAACGTTCATACCTGTTCAAAAGATATAAGTGCAATGAGCAATGATCTGAATAGTCAATGCAATTATGTACTGCGCAGAAAATGATAATATTTATATGGATGGAAAATATTTTATCGCCAAAGAGAAGTAGACGGGAAGTGATTCATAAA
Unaligned ( gi|45 ): AATACAATACAATACATAAACTATGATGACAACTGTGAATTTCTAGTACGCAAGATAACAACATTAATTTTATAATAACGATCAAATGGAAGGACATATTATAGTAGAAATGGAAAACATGGCTATTAAATAATGCAATATGTTAAGTACATATTAGGGGGAATTATTGGCAACATTG
Unaligned ( gi|48 ): GGGAGTTGTGGTCGTCCATGCCAGTTAAAACTATATGTGAGACATTAGAAACGATGTAATTATGCACTGCACTGAATATGATAATATTTGTGTCGATAGGATTCGTCTCCAAAGAGAAGATGGTTAGTTATTTGCAGATGGGGTGGTAATGAT
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Unaligned ( gi|65 ): CCGCAGTTCCACCAAAGATCTCAACTTGAGAGGTTTCATCTATATTGATCATTTATATTGATCATTTATATTGATCA
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Reference ( family-2913 )     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGT-TC-A-A---CG--T-----T------A----C-AC---TCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATATTAA-TTGATTTGAACA-----TATT--TTATT-TT-CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tattaGATTTAGACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--CTTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAGGACAAGCCTATAGAATccgtatc
gi|14                         :                   TATACACTATAAAAAAA-------GAATTTTGAGCCT------T----TA---ATA---------------GTTTTTC-C-GTA------AGCTATAGGAGATGAC-AAAA-A-GTCACCAATTTGAGATAATACATTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TAT-AGAT----AA--AAAT-GAAA-T--C----A----ATTC--------AATT---TA-A---AA-AA-AGCTA-----T--A-TT---A-------CA-TAATATTCCCCAGGTGGGATTCGAACCATGGCTGGAAAAACA--AAA-A--A--A-AA---TG---AAGT-TC-A-A---CATCT-----T------AAC--C-AC---TCGGCCATCTACACACT-TTAACAAA-ATG---CAGT------T-TTTTTATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAC-----TGTTTCTTTCGTAAACAATGGCG-AATATATTAA-CTGG-TTGAACA-----tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaTTCTGT-C-AAC-GTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATgttgccttttggtcgtatcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TAT-ATATATT-----TAGTAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCCTATAGAATtcctttactaaatacaattacacaaaatgtcaacaaatgtggatttatggtcgagtatatacaagatgacattaattttataataaagatcaaatataaagaatagaaatggaagctgggggtgggggggaacattgatattatatgatgtagtgtgttgaatacatattaccggtagggggaattgtgggcgacattgggatgggagaatttaataatgttcatgccagtttaaactataattataatactatgtggcgttagaagcaatgtgtatgttcttggatttaaaatcaatacactgaaca
gi|17                         :                     gAAAATATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAGGCCTACTC------------GCTTTTT-C-GCA------CG-----GGCAATCGC-AAAA-ATATGAACAAGTTAAGATTATATAGTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--TAA---AAA-A--A----G----ATAT--------A-C---------------A-T---G-----T--A-TT-A-A-------AA-TAAAAT-------GTG--ATTCAAACCATGGC-GGAAA---A--AGA----A--A-AATCTTGTATAAGT-TC-A-A---CGCCT-----T------AACACC-GC---TCGCCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATGTT-TTTT------TTTTTTTATATTTAAAC-------GAATCATTC-ATG-----TGATTCTTTCGTTAATAATGGCAAAATATATTTA-TTGA-TTGGACAGTTGCCATT--TT-TT-TT-TG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|18                         :                   TATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GCCA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C-------CGTCTT------------A-A---CA--C-----------------C-AG---TCGGC------CACATCTTTGAT-AA-ATG-T-TTATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAATTAA-TTGA-TTGAACA-----
gi|19                         :                 taTATAAA-TATAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAA--TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----G-AAATGAC-AAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTAAGAAACA-----A------TAG------CG------TTT-AAAT--GAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TT-A---AA-A--G---A-----T--A-TTAA-A-------AAATGAAATTGCCTGGGTGGGATTCGAACCATGGC-AGAAA---A--AAA----------ATCTTGCATAAGT--C-A-A---CG--TGT---TG-----A----C-ACCAGTTGGCCACAGCCACAAC-TGGAT-AA-ATG-T-T-GT------TGTTTTT-TATATAAACT------T------------------GTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATATTAA-TTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTGAA---------TT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TTTTACATATT-----TACAAACA--GTTTTGT-CAAAAAGGATTGAAATGAAAGATAAGCTTATAGAAgttgcctttttatcgtatc
gi|20                         :             aaaactTATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GCCA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C-------CGTCTT------------A-A---CA--C-----------------C-AG---TCGGC------CACATCTTTGAT-AA-ATG-T-TTATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAATTAA-TTGA-TTGAACA-----aacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|21                         :                           aTAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----AA---CTA---------------GCTTTTC-C-GTA------AGCT---ATAGATGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGTAACA-----A------CAT------TG------TAT-AGAT--AAAA--------AAA-T--A----A----ATTT--------GA-T---TA-A---AA-AG-G---C-----T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCGGATGGGATTCGAACCATAGC-----A---A--AAA-C--A--ACAAT-TTATATAAGT-TT-A-A---CGTCT-----T------AAC--C-AC---TGGGCCACGGCCACATG-TTGAT-AA-CAG-T----T------TATTTTTATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATATTAA-CTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|22                         :                    gTAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----TA---CTA---------------GTTTTTT-TTGTA------CG-----GGAAATGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAA--AAAA--ACGT-GAAAGT--A----A----CTTT--------AA------A-A---AA-AG-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATCCCCC-CATGGGATTCGAACCATGGT-GGGAA---A--AAA-CATA--A-AATCTTTCTTAATC-TT-A-A---C------------------------C---TTGAATACGG------------------------TGT------TATTTTTCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGTAAATAATGGCAAAACATATTAA-TTG-TTTGAACA-----gttgcctttttgtcatatc
gi|23                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTT--------GATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGT-TT-T-A---CG--TCT---T------AAC--C-AC---GCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AA-AAG-A-TAAT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTTTAA-CTGA-TTGAACA------GTT--GCATT-TT-gttgccctttttgtcgtatc
gi|24                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTT--------GATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGT-TT-T-A---CG--TCT---T------AAC--C-AC---GCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AA-AAG-A-TAAT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTTTAA-CTGA-TTGAACA------GTT--GCATT-TT-tcgtcgtatc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CA-----TGTT--TTATT-T--AA-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGTCC-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAATtcgtcgtatc
gi|26                         :                aatTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCTGTAGGCC----TA---CTC---------------ACTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATTCATTTAATGTAACA-----A------TAG------CA------TTG-AAATG-AAAA--AAAT-AAAA---------A----AT----------AA------A-A---AA-GA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCGTGGC-AGAAA---A--AAA----------AT--TGCCTAAGTCTT-A-G---CA---------------G----C-AC---TGGGCCAAGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TAT-----------AA-T------TA--CATTC-GTT-----TGTTTCTCTCGTCAATtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taGATCTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATTT-------TACA----A------TATTACATTTT-----TACAAACA--ATTTTGT-C--AAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                       -AAAT--AAAAATAAAT-GAAT-T--AGTTTA----CTTTACTAGATCAACA---TA-A---AA-AA-AT--A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCTCATGTGGGATTCGAACCATGAC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAA----C---A---C---------------------C-AC---TCTGCCACAGACACATC-TTGAT-AA-ATA-G-TTGT------TATATTTATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGTTAATACTGACGACATATATGTA-TTAA-TGGAACA-----TTTG--CCATT-TT-TG-tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atataATATTAAATTGATTTTAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATTT-------CATA----A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTATGT-C-AAAA---------TGAAAGACAAGCTTATAGAATtcgtatc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtataactatgtttcttgttcaaacttagcatttgtg-----TATT--TTATT----CGGAATATTT-------TACA----T------TAATACATATT-----TCCAATTT--TTTTTGT-C-AAAAGAATTGGAATGAAAGACAATCTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|31                         :                                                                                                                            ggttttcatgTCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGTAACA-----A------TAG------CAGACCTTTTT-ACAT--AAA------T-AAAG-T--A----A----AT----------------------------A-G---------T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGTTGGGAT-CGAGCCATGGC-AGGAA---A--AAA-C--A--A-AATCT-----AAGT-TCCA-A---CA--T-----TTTAAG-A----CCAC---TCGGCGACAGATACATC-ATGAT-AA-ATA-----GT------TATCTTTATATTTAAACT-------AATAATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGTGAATACTGGTGACATATATTAA-TTGATTcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|33                         :                   TATTAACTAAAAATAAA------TGAATTCTGAGGCA------------A---CTA---------------GCTTTTT-------------A-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTGACCAAGATAAGATTATACATTTTATATAATA-----ATACCGGTAA------TA------TTT-AAAT--AAAA--TAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AATT---TA-AAAGAA-AA-G---T-----T--A-TC-A-A-------AA-TAAAA-TCCTCGGTTGGGATTCGAACCATGGC-GAGAA---A--AAA-A--A--A-AATCTT--ATAAGT-GC-A-A---CG--T-----CTTAA--A----C-AC---TCGGCCACAGAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aAACA-----TGTC--T-ATT-TC-AA-AATATTT-------TACA----A------TATTACTTATA-----AACAAACA--ATTTTGT-C-AAAGGAATTGGAAAGAAATACAAGCGTATAGAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagttaaA-TTGGTTTAAACT-----TATC--TTATT-C--CA-AATACTT-------TACATATAA------TATTTCATATT-----ATCAAGCA--ATTTTG------AATGATTAGAATGGAAGACAAGTTTAtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|36                         :                   atacagtgtTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----CA---CGA---------------GTTTATT---ATA------TA-----GGAAATGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGTAAGA-----C------TAG------AA------TTTTAAAT--AGTA--AAAT-GAAA-TTAA----A----AT------------------------AA-AA-G---T-----T--G-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCAGGTAGGATTCGAACCATTGC-GGAA--------------A--A-AGTCTTATTTAAGT-TC-A-A---CG--T--------------------C---TAAGCCACattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                       atcacaaaacactccgT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AATT---CA-A---AA-AA-G---T-----T--A-TCGA-ATTTTAAAAA-TAAAATTTCCCGGGTGTGATTCGAACCATGGC-GAAAA---A--AAAGC--A---------TACATAAGT-TC-A-A---CGTCT-----T------AAC--C-GC---TAGATCATGGACACATT-TTGAT-AC-AAG-T-TTGT------TAT--------------C------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGTTATTAATGGCGAAATATATTAA-CTGATTT-AACAGTTG-CATT--TTATtc
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gATTTAAACA-----TATT--TTATT-TT--G-AATATTT-------TACA----A------AACGACATATT-----TACAGACA--ATTTTAT-C-AAAAGTATTGGAATGGAAGACGAGCTTATAGAATgtcgta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aATTTAAGCA-----CATT--TTATT-T--AA-AATATCT-------TACA----A--------------ATT-----TACAAACA--CTTTTAT-C-AAATGGATTGGAATAAAATACAAGCTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCG-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGGCAAGTTTATAGAATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|41                         :                   TATAAACCATAAAT--------------------CCT------T----AA---CTA----------------CTTTTT-C-GTA------TA-----GGA--TGAC-AAAA-A-GTCACCAGGTCAGGATTATACATTTTATG---CA-----A------CAG------TA------TTC-CAA---AACA--AAAT------T--A----A----ATT------------------------A-AA-G---T-----T--ACTTAA-A-------CA-TAAAATTCCCCAGGTGAGATTCGAACCATGGC-GG-TA---A--AAA-T--A--A-AATATTACATGGAT-TC-A-A---CG--T-----tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                      attaT---TA-A---AA-AA-T---AGT---T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGATGGGATTCGAACCATGCT-ATAAA---A--GAA-C--A--A-AATTGTACTGAAGT-TC-A-----------------------------------------------CACC-TTAAC-AATATT-T-TAGT------TATTTTAATATTTAAACT-------AGTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGTAAATAATGGCGATATATGT-------AGTTGGACA------GTT--TCCTT-TT-TG-cttaaccac
gi|46                         :                 aaTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----TA---TAA---------------GTTT------GTA-------A-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAAC------A------TAG------TA------TAT-AGATAAAAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AATA---TA-A---AA-AA-A---ATGT--T--A-TTTA-A-------AA-CAAAATTCCCCAGGTTGGATTttgaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaCCAGGTAGGATTCGAACCATGAC---AAA---A--AAA-T--A--A-A-TCTTACTTATGT-TC-C-A---CG--TCT---T------AAC--C-AC---TCTGC---AGACACATC-TTAAT-AA-AGG-T-TTGA------TATTTTTACATTTAAACT-------GACGATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGTAAATAATTGCGAAATATGTTGC-TT-ATTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TTTCTTTATATTTAAACT-------AATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTTAATAATGGTGACATATATCAA-TTGA-TTGAACA-----ttgccgt
gi|50                         : tattgaccgaagtggtagTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----TA---GTAA--------------GTTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTCACA-----A------TAG------TA------TTT--AAT--ATAA--ACAT-GAAgttgcctttttttttgtcgtatcg
gi|51                         :                 ttTATAAAATATAAATAAA------T-----CT-AGTCT------------------A---------------ACTTTGT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGTAACAATATTA------TAGGAGACCTA------TTT-AAAT--AAAT--AAAT-AGAA-ct
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aATATCT-------TACA----A------TATTACATACT-----TAGAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTTTAGAAT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taaacTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCT-------CACA----AAATAGTTATCATTTATC-----TACAAATA--GTTTTGT-T-AAAATGGTGAGAAT-AAAGCCAGTCTTATAGAATtcctctccttaacacaatacaattacacaaacta
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggc-TTGGTTTAAACA-----TAGT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGACAGGCTTATAGAAtctccta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TTGGTTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGAAATGAActcctctc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGGTTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATTT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTAC-C-AAAAGGA-TGGAATGAAAAACAAGCTTATAGAAtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TTGATTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TAGA----A------TATAACTTATT-----T----ACA--ATTTTGT-C-ATAATGACTGGGATgtcttc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atTTTAAACA-----TATT--TAATT-T--CG-AATACTTGTAGCTTTACC----A------TATTACATATT-----TAAATATATTATTTT-T-C-AAAAAAATTGGAATAAAACATAAGCTTATttgacgatgtgagctgctataga
gi|6                          :                   TATAAAATATAACTAA-----------TTCTGAGACT------TAATTTA---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCATCAAG------------ATTTTACGCAACA-----A------AAG------TG------TTT-AAAT--AAAA--ATAT-ATAA-C--A----ATAGTGTTT--------AAAT---AA-A---AA-AA-T---A-----T--A-
gi|6                          :                                                                                                                                                              aATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-acaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|6                          :                           atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-GAAT--AAAA--AAAAAGAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-GA-T---A-----TGTA-TTAA-AC------AA-TAATATTGCCCGTGTGGGATTCGAACCATAGC-GGGAA---A--AAA-----------TCTTGCATGAGT--C-A-A---CG--TGTTGAC------A----CCAC---TTGACCACGGCCACATA-TGGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATCTTAATAT--AAACT------T------------------GTTTCTCTTGTAAATAATACCGAAATATATTAA-TTGA-TTGAACAG----TTTT--TTTTTATT-CG---TATTT-------Tataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaa-----TGTT--TTATT-T--CA-AACATCT-------TACA----C------TATTACATGTT-----TACAAGCA--ACTTTGG-T-AAAGGGATTAGAATGAA----GAGCTTATAGAATtggcgtatcg
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGTTTAAACA-----TATT--TTAGT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATCACATATT-----TACAAACA--ACTTTGT-C-AAAAGGATTGAAGTAAAtcctgtt
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AATATTT-------TACA----A------TATTACATATT-----TACAAACA--ATTTTGT-C-AAACTGATTGGAATGAAAGACAA--TTATgtgctatta
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaaatgtactatgaGGTGGGATTCAAACCATGGC-GCAAA---ACTAAA----A--A-CATCTTGCATAAGC-TC-A-A---CG--T-----
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             c-TTGGTTTAAACA-----TATT--TTATT-T--CG-AATATCT-------TACA----A------TATcttaaccc
gi|7                          :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTT-----------------------AATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----G------TGG------TA------TTT-TAAT--AAAA--AAGT-GAAA-T--A----A----ATCT--------AACT---TA-A---AATGA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-CAAAATTTACCCATTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACTA-AATCTTGCATAAGC-TC-A-A---CG--T-----------------C-AC---TCGGCTATGAAGACATC-TTGAT-AA-CTG-T-TTAT------TATTTTTATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGTAGATTATTGCGAAATATATTCA-TTGGTTTAAACA-----CATT--TTTTT-TTCCG-AATATCT-------TATA----A------TATTATATATT-----TACAAACA--ATT---T-C-TAAAGGATTGGAATGAAAGACCAGCTGATAGAAT
gi|70                         :                    ATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|9                          :                   TATAAA-TATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTAAATTAAGCTAGTCTAGTTTTTT-C-CTA------CG-----GGTAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAATTAAGATGATACATTTGATGCAACA-----A------TGGAAGCTCTA------ATT-AAAT--AAAG--AAAT-TAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---GA-AATG---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCACAGCTGTGATTCGAACCAAGGC-GGAGA---A--AAA-T--A--A-AATCTTTCATAAGT-TC-A-A---CG--T-----CTTAACAA----C-AC---TCTGCCACGGAAACATC-TTGAT-AA-ATA---TTGT------TATCTTTATATTGAAA-G------TAATCATTC-GAT-----TGTTACTCTTGTAAATACTGGCGACATATAATAA-TTGA-TTGAACA-----GTTG--CCATT-TT-TGTCATATCac
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|5 ): AAAGATCAAATCTAAAAATATATTAGAATAGAAATTGTTTTTGGATACTATATAATAGAATGTAACATAATCCATATTAGCGGAAAGTTTTGGCGACATTGGGGTGAGAGGATTTATTAACGTTCATGCCAATAAACAGTATATAAATTATGTAACGTTAGAAACGAAATGTATTTTCGATGTTATTATGTATTGCACTGAATATGATTATATTTGTATAGATAGAAAAAAGTTTGTCTCCAAAGAGAAGTAGATGGGTAGTTATTCACAGTGGGATTGTAATGATCTTTCGAGTACTGTTCGTGAGTCGCGATATGAGATGCAATGAAGTAGAACATGTTCTGCGTCCACAGTTTCGCCACACACATACATTGAGAGGCTACACCTATGTTTATCGAGTCTATATTGAGTAATTTAGATTGATC
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Unaligned ( gi|32 ): AAATATAATATAAAATTACACAAACTATGATGACAGATGCAGATTTCTAGTTAAGTATACAAGATAACAACATTGATTTTATAGTAAAAATCAGTTGTGAAAATATATTAGAATAGAACATGGATATTATAGAATGCAATATGTAAAATACATATTTGGGGGAGGTATGGGCGACATTGGGATGGGAGGATTTATTAACGTTCATGCCATTTAAAACTACAGGTATATGTGTGACATCTT
Unaligned ( gi|43 ): TTAATTAACATGGAAGAAAACGATAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATAATTATATGATTATACACGGNNNNNNNNNNATTAGAATAGAAATGGAAGTTGCGGAAAACATGGGTATTATAGAATGCAATATGTTAAATATATATTCGTGGGAACTGTGGACGACATTTGAAT
Unaligned ( gi|44 ): ATTTTGGCGACATTGCGATGAAAAGATTTATTAACGTTCATACCTGTTCAAAAGATATAAGTGCAATGAGCAATGATCTGAATAGTCAATGCAATTATGTACTGCGCAGAAAATGATAATATTTATATGGATGGAAAATATTTTATCGCCAAAGAGAAGTAGACGGGAAGTGATTCATAAA
Unaligned ( gi|45 ): AATACAATACAATACATAAACTATGATGACAACTGTGAATTTCTAGTACGCAAGATAACAACATTAATTTTATAATAACGATCAAATGGAAGGACATATTATAGTAGAAATGGAAAACATGGCTATTAAATAATGCAATATGTTAAGTACATATTAGGGGGAATTATTGGCAACATTG
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consensus                     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGT-TC-A-ACG--T-----CTTA--A---C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
Reference ( family-2913 )     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGT-TC-A-ACG--T-----T-----A---C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTATAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTACATAAT
gi|10                         :                 tgTATAATTTATAAATAGGCCTACGTGAATTCTGAGTCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTTTC-GTATATCTACT-----AGAAATGAC-AAAA-A-ATCACAAAGTTAAGATTATACATTGTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTA-AGAT--AAAA--GAGT-GAAA-T--A----A----ATCT--------AACT---TA-A---AA-AA-A---AAAAAAT--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTTCCGTGGTGAGATTCAAATCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACAA-AATCTTGCCTAAGC-TT-A-ATT--T-----CTTAACA---C--CACTCGGCCATGAAGACATT-TTGAT-AA-CTG-T-TTGT------TATTTTTATATT----CT--------GT--TTC-A----------TTCTAACGTAAATAATGGCGAAATATAT-AAA-TTG-CTCGAACA-----tactctcctaaatactatacaattacacaaactatgttgacaaatttatatttctagttaagtatacaagattacaacataattttaaacgatcaaatggaaatatatattagaatagaaatagagttgctgaaaaactttgatattatagaatgcaaatacatattagcgggaattatgggcgacattgggatgggagaatttattaacgttcatgccagttaaaactacatatgtgacattaaatacgatgtgtattttcgatgtaattatgtactgcactgaatatgatgatatttatatcgatagaagacgtttcgtttccggaaatggggtgatataatgatctttcaagtactgttcgtgagttgcgatgtgagatgcaatgaagtaaaacatgttctgcgtcttcaatttcgccacacatacaaagaggataaataatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attaTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAT-TATCT-------TACA----A------TATTATATA-----TTTACAAATA--ATTTTGT-C-AAAAGGTATGAAATTAAGGACAAGCTTATTGAATgttgcgttttttgtcgtat
gi|12                         :                   TATAAACTATAAATGTA------TGAATTCTGAGCTT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GCA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTCACTAAGTAACGATTACAAATTTTATTTAACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AATT--AAAT-GAAA-T--G----A----ATTT--------AATCAAATACA---AA-AA-G---T-----T--A-TCAA-T-------AA-TGACATTCCCCGGTTGGGATTCTAACCCTGGC-GGATA---C--AAA-T-----A-AATCGTACAT-TGT-TT-AGACG--T-----CATA--A---C--CATCCAAGCACGGGCACGTA-ATGAT--A-ATA-TAATGT------TATTTTTATATTCAAAC-------TGATTATTC-AAT-----TGTTTTTCTTGTAAAAAATGGCAGGAAATAT-TAA-CTGATTtcctttcctaaatgcaatacaataacacaaactatgatgacaaatgcggatttctagttatatatacaagataacattattgactttatgataatgatcaattgtaaagatatattagaatagaaatggaaattgcggaaaacatggatattatataatgcaatatgttaaatacatatttgggggagttatgggcaacgttgggatgggaggatttgttaactttcatgtcagttaaaactatatgtgtgatattagaaacgatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tattaGATTTAGACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--CTTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAGGACAAGCCTATAGAATgatcagttgcctactttcgccgtatc
gi|14                         :                   TATACACTATAAAAAAA-------GAATTTTGAGCCT------T----TA---ATA---------------GTTTTTC-C-GTA------AGCTATAGGAGATGAC-AAAA-A-GTCACCAATTTGAGATAATACATTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TAT-AGAT----AA--AAAT-GAAA-T--C----A----ATTC--------AATT---TA-A---AA-AA-AGCTA-----T--A-TT---A-------CA-TAATATTCCCCAGGTGGGATTCGAACCATGGCTGGAAAAACA--AAA-A--A--A-AA---TG---AAGT-TC-A-ACA--T-----CTTA--A---C--CACTCGGCCATCTACACACT-TTAACAAA-ATG---CAGT------T-TTTTTATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAC-----TGTTTCTTTCGTAAACAATGGCG-AATATAT-TAA-CTGG-TTGAACA-----tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttaTTCTGT-C-AAC-GTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATgttgccttttggtcgtatcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TAT-ATATA-----TTTAGTAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCCTATAGAATtcctttactaaatacaattacacaaaatgtcaacaaatgtggatttatggtcgagtatatacaagatgacattaattttataataaagatcaaatataaagaatagaaatggaagctgggggtgggggggaacattgatattatatgatgtagtgtgttgaatacatattaccggtagggggaattgtgggcgacattgggatgggagaatttaataatgttcatgccagtttaaactataattataatactatgtggcgttagaagcaatgtgtatgttcttggatttaaaatcaatacactgaaca
gi|17                         :                     gAAAATATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAGGCCTACTC------------GCTTTTT-C-GCA------CG-----GGCAATCGC-AAAA-ATATGAACAAGTTAAGATTATATAGTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--TAA---AAA-A--A----G----ATAT--------A-C---------------A-T---G-----T--A-TT-A-A-------AA-TAAAAT-------GTG--ATTCAAACCATGGC-GGAAA---A--AGA----A--A-AATCTTGTATAAGT-TC-A-ACGCCT-----T-----AACAC--CGCTCGCCCACGGACACATC-TTGAT-AA-ATGTT-TTTT------TTTTTTTATATTTAAAC-------GAATCATTC-ATG-----TGATTCTTTCGTTAATAATGGCAAAATATAT-TTA-TTGA-TTGGACAGTTGCC-----ATTTTTTTT--TG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|18                         :                   TATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GCCA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C-------CGTCTT------------A-AC---------------A---C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AA-ATG-T-TTATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----
gi|19                         :                 taTATAAA-TATAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAA--TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----G-AAATGAC-AAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTAAGAAACA-----A------TAG------CG------TTT-AAAT--GAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TT-A---AA-A--G---A-----T--A-TTAA-A-------AAATGAAATTGCCTGGGTGGGATTCGAACCATGGC-AGAAA---A--AAA----------ATCTTGCATAAGT--C-A-ACG--TGTTGAC-----A---C--CAGTTGGCCACAGCCACAAC-TGGAT-AA-ATG-T-T-GT------TGTTTTT-TATATAAACT------T------------------GTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTGAA--------------TTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TTTTACATA-----TTTACAAACA--GTTTTGT-CAAAAAGGATTGAAATGAAAGATAAGCTTATAGAAgttgcctttttatcgtatc
gi|20                         :             aaaactTATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-GCCA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C-------CGTCTT------------A-AC---------------A---C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AA-ATG-T-TTATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----aacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|21                         :                           aTAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----AA---CTA---------------GCTTTTC-C-GTA------AGCT---ATAGATGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGTAACA-----A------CAT------TG------TAT-AGAT--AAAA--------AAA-T--A----A----ATTT--------GA-T---TA-A---AA-AG-G---C-----T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCGGATGGGATTCGAACCATAGC-----A---A--AAA-C--A--ACAAT-TTATATAAGT-TT-A-ACG--T-----CTTA--A---C--CACTGGGCCACGGCCACATG-TTGAT-AA-CAG-T----T------TATTTTTATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|22                         :                    gTAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----TA---CTA---------------GTTTTTT-TTGTA------CG-----GGAAATGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAA--AAAA--ACGT-GAAAGT--A----A----CTTT--------AA------A-A---AA-AG-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATCCCCC-CATGGGATTCGAACCATGGT-GGGAA---A--AAA-CATA--A-AATCTTTCTTAATC-TT-A-AC------------------------CTTGAATACGG------------------------TGT------TATTTTTCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGTAAATAATGGCAAAACATAT-TAA-TTG-TTTGAACA-----gttgcctttttgtcatatc
gi|23                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTT--------GATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGT-TT-T-ACG--T-----CTTA--A---C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AA-AAG-A-TAAT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--gttgccctttttgtcgtatc
gi|24                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTT--------GATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGT-TT-T-ACG--T-----CTTA--A---C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AA-AAG-A-TAAT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--ttcgtcgtatc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CA-----T-----GTTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGTCC-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAATttcgtcgtatc
gi|26                         :                aatTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCTGTAGGCC----TA---CTC---------------ACTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATTCATTTAATGTAACA-----A------TAG------CA------TTG-AAATG-AAAA--AAAT-AAAA---------A----AT----------AA------A-A---AA-GA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCGTGGC-AGAAA---A--AAA----------AT--TGCCTAAGTCTT-A-GC---------------A---G--CACTGGGCCAAGGACACATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TAT-----------AA-T------TA--CATTC-GTT-----TGTTTCTCTCGTCAATtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taGATCTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATT-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C--AAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                       -AAAT--AAAAATAAAT-GAAT-T--AGTTTA----CTTTACTAGATCAACA---TA-A---AA-AA-AT--A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCTCATGTGGGATTCGAACCATGAC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAA-------------------C-----A---C--CACTCTGCCACAGACACATC-TTGAT-AA-ATA-G-TTGT------TATATTTATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGTTAATACTGACGACATATAT-GTA-TTAA-TGGAACA-----TTTGCCATTTT-TGT--CG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atataATAT-TAAATTGATTTTAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------CATA----A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTATGT-C-AA---------AATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtataactatgtttcttgttcaaacttagcatttgtg-----T-----ATTTTATTC--GGAA-TATTT-------TACA----T------TAATACATA-----TTTCCAATTT--TTTTTGT-C-AAAAGAATTGGAATGAAAGACAATCTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|31                         :                                                                                                                            ggttttcatgTCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGTAACA-----A------TAG------CAGACCTTTTT-ACAT--AAA------T-AAAG-T--A----A----AT----------------------------A-G---------T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGTTGGGAT-CGAGCCATGGC-AGGAA---A--AAA-C--A--A-AATCT-----AAGT-TCCA-ACA--T-----TTTAAGA---C--CACTCGGCGACAGATACATC-ATGAT-AA-ATA-----GT------TATCTTTATATTTAAACT-------AATAATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGTGAATACTGGTGACATATAT-TAA-TTGATTcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|33                         :                   TATTAACTAAAAATAAA------TGAATTCTGAGGCA------------A---CTA---------------GCTTTTT-------------A-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTGACCAAGATAAGATTATACATTTTATATAATA-----ATACCGGTAA------TA------TTT-AAAT--AAAA--TAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AATT---TA-AAAGAA-AA-G---T-----T--A-TC-A-A-------AA-TAAAA-TCCTCGGTTGGGATTCGAACCATGGC-GAGAA---A--AAA-A--A--A-AATCTT--ATAAGT-GC-A-ACG--T-----CTTA--A---A--CACTCGGCCACAGAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aAACA-----T-----GTCT-ATTT--CAAAATATTT-------TACA----A------TATTACTTA-----TAAACAAACA--ATTTTGT-C-AAAGGAATTGGAAAGAAATACAAGCGTATAGAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tagttaaA-TTGGTTTAAACT-----T-----ATCTTATTC--CAAA-TACTT-------TACATATAA------TATTTCATA-----TTATCAAGCA--ATTTTG------AATGATTAGAATGGAAGACAAGTTTAtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|36                         :                   atacagtgtTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----CA---CGA---------------GTTTATT---ATA------TA-----GGAAATGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGTAAGA-----C------TAG------AA------TTTTAAAT--AGTA--AAAT-GAAA-TTAA----A----AT------------------------AA-AA-G---T-----T--G-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCAGGTAGGATTCGAACCATTGC-GGAA--------------A--A-AGTCTTATTTAAGT-TC-A-ACG--TC----T-----AAG-C--CACTCattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                       atcacaaaacactccgT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AATT---CA-A---AA-AA-G---T-----T--A-TCGA-ATTTTAAAAA-TAAAATTTCCCGGGTGTGATTCGAACCATGGC-GAAAA---A--AAAGC--A---------TACATAAGT-TC-A-ACG--T-----CTTA--A---C--CGCTAGATCATGGACACATT-TTGAT-AC-AAG-T-TTGT------TAT--------------C------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGTTATTAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGATTT-AACAGTTG-C-----ATTTTATGT--CG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--TGAA-TATTT-------TACA----A------AACGACATA-----TTTACAGACA--ATTTTAT-C-AAAAGTATTGGAATGGAAGACGAGCTTATAGAATta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aATTTAAGCA-----C-----ATTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A--------------A-----TTTACAAACA--CTTTTAT-C-AAATGGATTGGAATAAAATACAAGCTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCG-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGGCAAGTTTATAGAATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|41                         :                   TATAAACCATAAAT--------------------CCT------T----AA---CTA----------------CTTTTT-C-GTA------TA-----GGA--TGAC-AAAA-A-GTCACCAGGTCAGGATTATACATTTTATG---CA-----A------CAG------TA------TTC-CAA---AACA--AAAT------T--A----A----ATT------------------------A-AA-G---T-----T--ACTTAA-A-------CA-TAAAATTCCCCAGGTGAGATTCGAACCATGGC-GG-TA---A--AAA-T--A--A-AATATTACATGGAT-TC-A-ACG--T-----CTTA--A---C--CACtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                      attaT---TA-A---AA-AA-T---AGT---T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGATGGGATTCGAACCATGCT-ATAAA---A--GAA-C--A--A-AATTGTACTGAAGT-TC-A-----------------------------------------CACC-TTAAC-AATATT-T-TAGT------TATTTTAATATTTAAACT-------AGTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGTAAATAATGGCG--ATATATGTAG-TTG
gi|46                         :                 aaTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----TA---TAA---------------GTTT------GTA-------A-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAAC------A------TAG------TA------TAT-AGATAAAAAA--AAAT-GAAA-T--A----A----ATTT--------AATA---TA-A---AA-AA-A---ATGT--T--A-TTTA-A-------AA-CAAAATTCCCCAGGTTGGATTgacagtttcctttttgttgaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaCCAGGTAGGATTCGAACCATGAC---AAA---A--AAA-T--A--A-A-TCTTACTTATGT-TC-C-ACG--T-----CTTA--A---C--CACTCTGC---AGACACATC-TTAAT-AA-AGG-T-TTGA------TATTTTTACATTTAAAC-------TGACGATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGTAAATAATTGCGAAATATGT-TGC-TT-ATTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATC-TTGAT-AA-ATG-T-TTGT------TTTCTTTATATTTAAACT-------AATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTTAATAATGGTGACATATAT-CAA-TTGA-TTGAACA-----ttgccgt
gi|50                         : tattgaccgaagtggtagTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----TA---GTAA--------------GTTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTCACA-----A------TAG------TA------TTT--AAT--ATAA--ACAT-GAAgttgcctttttttttgtcgtatcg
gi|51                         :                 ttTATAAAATATAAATAAA------T-----CT-AGTCT------------------A---------------ACTTTGT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGTAACAATATTA------TAGGAGACCTA------TTT-AAAT--AAAT--AAAT-AGAA-ct
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----CTTAGAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTTTAGAAT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taaacTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------CACA----AAATAGTTATCATTTA-----TCTACAAATA--GTTTTGT-T-AAAATGGTGAGAAT-AAAGCCAGTCTTATAGAATtcctctccttaacacaatacaattacacaaacta
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggc-TTGGTTTAAACA-----T-----AGTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGACAGGCTTATAGAAtctccta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGAAATGAActcctctc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTAC-C-AAAAGGA-TGGAATGAAAAACAAGCTTATAGAAtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TAGA----A------TATAACTTA-----TTT----ACA--ATTTTGT-C-ATAATGACTGGGATgtcttc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atTTTAAACA-----T-----ATTTAATTT--CGAA-TACTTGTAGCTTTACC----A------TATTACATA-----TTTAAATATATTATTTT-T-C-AAAAAAATTGGAATAAAACATAAGCTTATttgacgatgtgagctgctataga
gi|6                          :                   TATAAAATATAACTAA-----------TTCTGAGACT------TAATTTA---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCATCAAG------------ATTTTACGCAACA-----A------AAG------TG------TTT-AAAT--AAAA--ATAT-ATAA-C--A----ATAGTGTTT--------AAAT---AA-A---AA-AA-T---A-----T--A-
gi|6                          :                                                                                                                                                              aATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-AAAT--AAAA--AAAT-acaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|6                          :                           atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-GAAT--AAAA--AAAAAGAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---AA-GA-T---A-----TGTA-TTAA-AC------AA-TAATATTGCCCGTGTGGGATTCGAACCATAGC-GGGAA---A--AAA-----------TCTTGCATGAGT--C-A-ACG--TGTTGAC-----A---C--CACTTGACCACGGCCACATA-TGGAT-AA-ATG-T-TTGT------TATCTTAATAT--AAACT------T------------------GTTTCTCTTGTAAATAATACCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACAGTTT-T-----TTTTTA-TT--CG---TATTT-------Tataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaa-----T-----GTTTTATTT--CAAA-CATCT-------TACA----C------TATTACATG-----TTTACAAGCA--ACTTTGG-T-AAAGGGATTAGAATGAA----GAGCTTATAGAATtggcgtatcg
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTTTAAACA-----T-----ATTTTAGTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATCACATA-----TTTACAAACA--ACTTTGT-C-AAAAGGATTGAAGTAAAtcctgtt
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAACTGATTGGAATGAAAGACAA--TTATgtgctatta
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaaatgtactatgaGGTGGGATTCAAACCATGGC-GCAAA---ACTAAA----A--A-CATCTTGCATAAGC-TC-A-ACG--T-----
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c-TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATcttaaccc
gi|7                          :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTT-----------------------AATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----G------TGG------TA------TTT-TAAT--AAAA--AAGT-GAAA-T--A----A----ATCT--------AACT---TA-A---AATGA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-CAAAATTTACCCATTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACTA-AATCTTGCATAAGC-TC-A-ACG--T------------------CACTCGGCTATGAAGACATC-TTGAT-AA-CTG-T-TTAT------TATTTTTATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGTAGATTATTGCGAAATATAT-TCA-TTGGTTTAAACA-----C-----ATTTTTTTTTCCGAA-TATCT-------TATA----A------TATTATATA-----TTTACAAACA--ATT---T-C-TAAAGGATTGGAATGAAAGACCAGCTGATAGAAT
gi|70                         :                    ATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|9                          :                   TATAAA-TATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTAAATTAAGCTAGTCTAGTTTTTT-C-CTA------CG-----GGTAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAATTAAGATGATACATTTGATGCAACA-----A------TGGAAGCTCTA------ATT-AAAT--AAAG--AAAT-TAAA-T--A----A----ATTT--------AACT---TA-A---GA-AATG---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCACAGCTGTGATTCGAACCAAGGC-GGAGA---A--AAA-T--A--A-AATCTTTCATAAGT-TC-A-ACG--T-----CTTA--A---CAACACTCTGCCACGGAAACATC-TTGAT-AA-ATA---TTGT------TATCTTTATATTGAAA-G------TAATCATTC-GAT-----TGTTACTCTTGTAAATACTGGCGACATATAA-TAA-TTGA-TTGAACA-----ac
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TTTATAAAAATTGATCGGAATGAAACAAACTTATATTATTCCTATCTTAAATACAATACAATTGCATAACATAATGTTTTATGATGACAAATGTTGATTTCTAGAAAGGTATACATGATAATATTTATTTATAATAAACATTGAATGTAAGGATTTATTAGAATAGAAATGAGTGTTATAAAATGCAATATGTCATATACATATTAGGGGGAACTGTGGACGACATTGGGAAGTAAGGATTTATTAAGACTATAAGAGTGACGATATCAACGATATGTTTTTTCAATGTAAATACATGTATGTTCTGCACTGGAAATGATAATATTTGTATTGATAGAAACAGTTTCGTCTCCAATGAAAAGTATATGAATAGTTATTCGAAGATAGGGTGGTAATATGTCGTGTATTGTTCGTGTAAATAATAATGAATATAATATTTCAGTTATTTAATTACACTATGCTAAGACGAAAGGTATGCTT
Unaligned ( gi|5 ): AAAGATCAAATCTAAAAATATATTAGAATAGAAATTGTTTTTGGATACTATATAATAGAATGTAACATAATCCATATTAGCGGAAAGTTTTGGCGACATTGGGGTGAGAGGATTTATTAACGTTCATGCCAATAAACAGTATATAAATTATGTAACGTTAGAAACGAAATGTATTTTCGATGTTATTATGTATTGCACTGAATATGATTATATTTGTATAGATAGAAAAAAGTTTGTCTCCAAAGAGAAGTAGATGGGTAGTTATTCACAGTGGGATTGTAATGATCTTTCGAGTACTGTTCGTGAGTCGCGATATGAGATGCAATGAAGTAGAACATGTTCTGCGTCCACAGTTTCGCCACACACATACATTGAGAGGCTACACCTATGTTTATCGAGTCTATATTGAGTAATTTAGATTGATC
Unaligned ( gi|8 ): AAACGGTTTTTTATGAAGTTGAACACCAATCGTAAAATATTTTACAGTATTCCTCTGCTGCATACAATATAATTTCACAAAAAATGATAACAAGCGTGGATTTTTAGTATAGTATACAAGATAACAACATACATAATAAACATCAATTGTAAAGATGAATTAGAGAAAACGGAACGGGAAAAAAACATAAATATAATACAATGTCTTGTGTTAAATACATACTGGGGGTGGGGGGGTGGGGGGGTCATTTTTGGGATGGGGAGGTTTTATTAACGTTCATGTTAGGTAAAACGACCTGAGTGACGTAAAAAAAAAACGATGTTTGTTTTCAATGTAATTTTTACCACACAAAATGATAATATTTGTATCTACTGAAAAAGTTTTATCTCAAAAGA
Unaligned ( gi|29 ): TATCAACATTCAGTGACGGTAAAGACGATGTGTATTTTCAATGTAATTATGTTTTTCACTGAAAATAATAAACTTTGTATTGACAGAAATAGTTTCATCCTTAAAGACACGTAGATGTGGTTGAGTTGAAATCATGCTCTCAATCACATATCAAACTGTTTTCACAAGGGTCATGGTTGTCCGACCGTTCATGCCACTGCGAGAGCATTAAGGCCAGCAGATTTACAGAACAAGTTACTGGATAACTTAAA
Unaligned ( gi|32 ): AAATATAATATAAAATTACACAAACTATGATGACAGATGCAGATTTCTAGTTAAGTATACAAGATAACAACATTGATTTTATAGTAAAAATCAGTTGTGAAAATATATTAGAATAGAACATGGATATTATAGAATGCAATATGTAAAATACATATTTGGGGGAGGTATGGGCGACATTGGGATGGGAGGATTTATTAACGTTCATGCCATTTAAAACTACAGGTATATGTGTGACATCTT
Unaligned ( gi|43 ): TTAATTAACATGGAAGAAAACGATAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATAATTATATGATTATACACGGNNNNNNNNNNATTAGAATAGAAATGGAAGTTGCGGAAAACATGGGTATTATAGAATGCAATATGTTAAATATATATTCGTGGGAACTGTGGACGACATTTGAAT
Unaligned ( gi|44 ): ATTTTGGCGACATTGCGATGAAAAGATTTATTAACGTTCATACCTGTTCAAAAGATATAAGTGCAATGAGCAATGATCTGAATAGTCAATGCAATTATGTACTGCGCAGAAAATGATAATATTTATATGGATGGAAAATATTTTATCGCCAAAGAGAAGTAGACGGGAAGTGATTCATAAA
Unaligned ( gi|45 ): AATACAATACAATACATAAACTATGATGACAACTGTGAATTTCTAGTACGCAAGATAACAACATTAATTTTATAATAACGATCAAATGGAAGGACATATTATAGTAGAAATGGAAAACATGGCTATTAAATAATGCAATATGTTAAGTACATATTAGGGGGAATTATTGGCAACATTG
Unaligned ( gi|48 ): GGGAGTTGTGGTCGTCCATGCCAGTTAAAACTATATGTGAGACATTAGAAACGATGTAATTATGCACTGCACTGAATATGATAATATTTGTGTCGATAGGATTCGTCTCCAAAGAGAAGATGGTTAGTTATTTGCAGATGGGGTGGTAATGAT
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Unaligned ( gi|60 ): GCACGAAAGATGATGACAAAATGTGGATTTCTAGTGTAGTATACAAGATAACAACATTTATAACAAAGATGAAAAATAAAAGATAAATTAAA
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Unaligned ( gi|65 ): CCGCAGTTCCACCAAAGATCTCAACTTGAGAGGTTTCATCTATATTGATCATTTATATTGATCATTTATATTGATCA
Unaligned ( gi|67 ): TATTTACGTTTTGTATTTATAGACGTGCGATTTAGATCACATCATGTATTTA
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consensus                     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
Reference ( family-2913 )     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTATAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTACATAAT
gi|10                         :                 tgTATAATTTATAAATAGGCCTACGTGAATTCTGAGTCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTTTC-GTATATCTACT-----AGAAATGAC-AAAA-A-ATCACAAAGTTAAGATTATACATTGTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTA-AGAT--AAAAG--AGT-GAAA-T--A----A----ATCTA--------ACT---TA-A---AA-AA-A---AAAAAAT--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTTCCGTGGTGAGATTCAAATCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACAA-AATCTTGCCTAAGCTT-A-ATTTCTTA--A--CACCACTCGGCCATGAAGACATT-TTGAT-AACTG-T-TT--GT------TATTTTTATATT----CT--------GT--TTC-A----------TTCTAACGTAAATAATGGCGAAATATAT-AAA-TTG-CTCGAACA-----tactctcctaaatactatacaattacacaaactatgttgacaaatttatatttctagttaagtatacaagattacaacataattttaaacgatcaaatggaaatatatattagaatagaaatagagttgctgaaaaactttgatattatagaatgcaaatacatattagcgggaattatgggcgacattgggatgggagaatttattaacgttcatgccagttaaaactacatatgtgacattaaatacgatgtgtattttcgatgtaattatgtactgcactgaatatgatgatatttatatcgatagaagacgtttcgtttccggaaatggggtgatataatgatctttcaagtactgttcgtgagttgcgatgtgagatgcaatgaagtaaaacatgttctgcgtcttcaatttcgccacacatacaaagaggataaataatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attaTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAT-TATCT-------TACA----A------TATTATATA-----TTTACAAATA--ATTTTGT-C-AAAAGGTATGAAATTAAGGACAAGCTTATTGAATgttgcgttttttgtcgtat
gi|12                         :                   TATAAACTATAAATGTA------TGAATTCTGAGCTT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GCA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTCACTAAGTAACGATTACAAATTTTATTTAACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AATTA--AAT-GAAA-T--G----A----ATTTA--------ATCAAATACA---AA-AA-G---T-----T--A-TCAA-T-------AA-TGACATTCCCCGGTTGGGATTCTAACCCTGGC-GGATA---C--AAA-T-----A-AATCGTACAT-TGTTT-AGACGTCATA--A--C--CATCCAAGCACGGGCACGTA-ATGAT--AATA-TAAT--GT------TATTTTTATATTCAAAC-------TGATTATTC-AAT-----TGTTTTTCTTGTAAAAAATGGCAGGAAATAT-TAA-CTGATTtcctttcctaaatgcaatacaataacacaaactatgatgacaaatgcggatttctagttatatatacaagataacattattgactttatgataatgatcaattgtaaagatatattagaatagaaatggaaattgcggaaaacatggatattatataatgcaatatgttaaatacatatttgggggagttatgggcaacgttgggatgggaggatttgttaactttcatgtcagttaaaactatatgtgtgatattagaaacgatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tattaGATTTAGACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--CTTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAGGACAAGCCTATAGAATgatcagttgcctactttcgccgtatc
gi|14                         :                   TATACACTATAAAAAAA-------GAATTTTGAGCCT------T----TA---ATA---------------GTTTTTC-C-GTA------AGCTATAGGAGATGAC-AAAA-A-GTCACCAATTTGAGATAATACATTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TAT-AGAT----AAA--AAT-GAAA-T--C----A----ATTCA--------ATT---TA-A---AA-AA-AGCTA-----T--A-TT---A-------CA-TAATATTCCCCAGGTGGGATTCGAACCATGGCTGGAAAAACA--AAA-A--A--A-AA---TG---AAGTTC-A-ACATCTTA--A--C--CACTCGGCCATCTACACACT-TTAACAAAATG---CA--GT------T-TTTTTATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAC-----TGTTTCTTTCGTAAACAATGGCG-AATATAT-TAA-CTGG-TTGAACA-----tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaTTCTGT-C-AAC-GTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATgttgccttttggtcgtatcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TAT-ATATA-----TTTAGTAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCCTATAGAATtcctttactaaatacaattacacaaaatgtcaacaaatgtggatttatggtcgagtatatacaagatgacattaattttataataaagatcaaatataaagaatagaaatggaagctgggggtgggggggaacattgatattatatgatgtagtgtgttgaatacatattaccggtagggggaattgtgggcgacattgggatgggagaatttaataatgttcatgccagtttaaactataattataatactatgtggcgttagaagcaatgtgtatgttcttggatttaaaatcaatacactgaaca
gi|17                         :                     gAAAATATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAGGCCTACTC------------GCTTTTT-C-GCA------CG-----GGCAATCGC-AAAA-ATATGAACAAGTTAAGATTATATAGTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAT--AA---AAA-A--A----G----ATATA---------C---------------A-T---G-----T--A-TT-A-A-------AA-TAAAAT-------GTG--ATTCAAACCATGGC-GGAAA---A--AGA----A--A-AATCTTGTATAAGTTC-A-ACGCCTTA--A--CACCGCTCGCCCACGGACACATC-TTGAT-AAATGTT-TT--TT------TTTTTTTATATTTAAAC-------GAATCATTC-ATG-----TGATTCTTTCGTTAATAATGGCAAAATATAT-TTA-TTGA-TTGGACAGTTGCC-----ATTTTTTTT--TG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|18                         :                   TATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GCCA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C---------------------------CGTCTTAACA--C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AAATG-T-TT--ATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----
gi|19                         :                 taTATAAA-TATAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAA--TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----G-AAATGAC-AAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTAAGAAACA-----A------TAG------CG------TTT-AAAT--GAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TT-A---AA-A--G---A-----T--A-TTAA-A-------AAATGAAATTGCCTGGGTGGGATTCGAACCATGGC-AGAAA---A--AAA----------ATCTTGCATAAGT-C-A-ACGTGTTG--A--CACCAGTTGGCCACAGCCACAAC-TGGAT-AAATG-T-T---GT------TGTTTTT-TATATAAACT------T------------------GTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTGAA--------------TTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TTTTACATA-----TTTACAAACA--GTTTTGT-CAAAAAGGATTGAAATGAAAGATAAGCTTATAGAAgttgcctttttatcgtatc
gi|20                         :             aaaactTATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GCCA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C---------------------------CGTCTTAACA--C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AAATG-T-TT--ATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----aacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|21                         :                           aTAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----AA---CTA---------------GCTTTTC-C-GTA------AGCT---ATAGATGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGTAACA-----A------CAT------TG------TAT-AGAT--AAAA--------AAA-T--A----A----ATTTG--------A-T---TA-A---AA-AG-G---C-----T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCGGATGGGATTCGAACCATAGC-----A---A--AAA-C--A--ACAAT-TTATATAAGTTT-A-ACGTCTTA--A--C--CACTGGGCCACGGCCACATG-TTGAT-AACAG-T------T------TATTTTTATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|22                         :                    gTAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----TA---CTA---------------GTTTTTT-TTGTA------CG-----GGAAATGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAA--AAAAA--CGT-GAAAGT--A----A----CTTTA--------A------A-A---AA-AG-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATCCCCC-CATGGGATTCGAACCATGGT-GGGAA---A--AAA-CATA--A-AATCTTTCTTAA----------TCTTA--A--C----CTTGAATACGG-----------------------T--GT------TATTTTTCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGTAAATAATGGCAAAACATAT-TAA-TTG-TTTGAACA-----gttgcctttttgtcatatc
gi|23                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTTG--------ATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGTTT-T-ACGTCTTA--A--C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AAAAG-A-TA--AT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--gttgccctttttgtcgtatc
gi|24                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTTG--------ATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGTTT-T-ACGTCTTA--A--C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AAAAG-A-TA--AT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--ttcgtcgtatc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CA-----T-----GTTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGTCC-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAATttcgtcgtatc
gi|26                         :                aatTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCTGTAGGCC----TA---CTC---------------ACTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATTCATTTAATGTAACA-----A------TAG------CA------TTG-AAATG-AAAAA--AAT-AAAA---------A----AT--A--------A------A-A---AA-GA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCGTGGC-AGAAA---A--AAA----------AT--TGCCTAAGT---------CTTA--G--CAGCACTGGGCCAAGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TAT-----------AA-T------TA--CATTC-GTT-----TGTTTCTCTCGTCAATtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taGATCTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATT-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C--AAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                       -AAAT--AAAAATAAAT-GAAT-T--AGTTTA----CTTTACTAGATCAACA---TA-A---AA-AA-AT--A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCTCATGTGGGATTCGAACCATGAC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAA-----------C-----A--C--CACTCTGCCACAGACACATC-TTGAT-AAATA-G-TT--GT------TATATTTATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGTTAATACTGACGACATATAT-GTA-TTAA-TGGAACA-----TTTGCCATTTT-TGT--CG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atataATAT-TAAATTGATTTTAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------CATA----A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTATGT-C-AA---------AATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtataactatgtttcttgttcaaacttagcatttgtg-----T-----ATTTTATTC--GGAA-TATTT-------TACA----T------TAATACATA-----TTTCCAATTT--TTTTTGT-C-AAAAGAATTGGAATGAAAGACAATCTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|31                         :                                                                                                                            ggttttcatgTCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGTAACA-----A------TAG------CAGACCTTTTT-ACAT--AAA------T-AAAG-T--A----A----AT----------------------------A-G---------T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGTTGGGAT-CGAGCCATGGC-AGGAA---A--AAA-C--A--A-AATCT-----AAGTTCCA-ACATTTTA--AGAC--CACTCGGCGACAGATACATC-ATGAT-AAATA-------GT------TATCTTTATATTTAAACT-------AATAATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGTGAATACTGGTGACATATAT-TAA-TTGATTcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|33                         :                   TATTAACTAAAAATAAA------TGAATTCTGAGGCA------------A---CTA---------------GCTTTTT-------------A-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTGACCAAGATAAGATTATACATTTTATATAATA-----ATACCGGTAA------TA------TTT-AAAT--AAAAT--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATT---TA-AAAGAA-AA-G---T-----T--A-TC-A-A-------AA-TAAAA-TCCTCGGTTGGGATTCGAACCATGGC-GAGAA---A--AAA-A--A--A-AATCTT--ATAAGTGC-A-ACGTCTTA--A--A--CACTCGGCCACAGAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aAACA-----T-----GTCT-ATTT--CAAAATATTT-------TACA----A------TATTACTTA-----TAAACAAACA--ATTTTGT-C-AAAGGAATTGGAAAGAAATACAAGCGTATAGAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagttaaA-TTGGTTTAAACT-----T-----ATCTTATTC--CAAA-TACTT-------TACATATAA------TATTTCATA-----TTATCAAGCA--ATTTTG------AATGATTAGAATGGAAGACAAGTTTAtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|36                         :                   atacagtgtTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----CA---CGA---------------GTTTATT---ATA------TA-----GGAAATGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGTAAGA-----C------TAG------AA------TTTTAAAT--AGTAA--AAT-GAAA-TTAA----A----AT------------------------AA-AA-G---T-----T--G-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCAGGTAGGATTCGAACCATTGC-GGAA--------------A--A-AGTCTTATTTAAGTTC-A-ACGTCTAA--G--C--CACTCattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                       atcacaaaacactccgT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATT---CA-A---AA-AA-G---T-----T--A-TCGA-ATTTTAAAAA-TAAAATTTCCCGGGTGTGATTCGAACCATGGC-GAAAA---A--AAAGC--A---------TACATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CGCTAGATCATGGACACATT-TTGAT-ACAAG-T-TT--GT------TAT--------------C------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGTTATTAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGATTT-AACAGTTG-C-----ATTTTATGT--CG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--TGAA-TATTT-------TACA----A------AACGACATA-----TTTACAGACA--ATTTTAT-C-AAAAGTATTGGAATGGAAGACGAGCTTATAGAATta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aATTTAAGCA-----C-----ATTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A--------------A-----TTTACAAACA--CTTTTAT-C-AAATGGATTGGAATAAAATACAAGCTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCG-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGGCAAGTTTATAGAATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|41                         :                   TATAAACCATAAAT--------------------CCT------T----AA---CTA----------------CTTTTT-C-GTA------TA-----GGA--TGAC-AAAA-A-GTCACCAGGTCAGGATTATACATTTTATG---CA-----A------CAG------TA------TTC-CAA---AACAA--AAT------T--A----A----ATT------------------------A-AA-G---T-----T--ACTTAA-A-------CA-TAAAATTCCCCAGGTGAGATTCGAACCATGGC-GG-TA---A--AAA-T--A--A-AATATTACATGGATTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                      attaT---TA-A---AA-AA-T---AGT---T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGATGGGATTCGAACCATGCT-ATAAA---A--GAA-C--A--A-AATTGTACTGAAGTTC-A--CACCTTA--A--C------------------------------AATA-T-TTTAGT------TATTTTAATATTTAAACT-------AGTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGTAAATAATGGCG--ATATATGTAG-TTG
gi|46                         :                 aaTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----TA---TAA---------------GTTT------GTA-------A-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAAC------A------TAG------TA------TAT-AGATAAAAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATA---TA-A---AA-AA-A---ATGT--T--A-TTTA-A-------AA-CAAAATTCCCCAGGTTGGATTgacagtttcctttttgttgaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaCCAGGTAGGATTCGAACCATGAC---AAA---A--AAA-T--A--A-A-TCTTACTTATGTTC-C-ACGTCTTA--A--C--CACTCTGC---AGACACATC-TTAAT-AAAGG-T-TT--GA------TATTTTTACATTTAAAC-------TGACGATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGTAAATAATTGCGAAATATGT-TGC-TT-ATTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TTTCTTTATATTTAAACT-------AATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTTAATAATGGTGACATATAT-CAA-TTGA-TTGAACA-----ttgccgt
gi|50                         : tattgaccgaagtggtagTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----TA---GTAA--------------GTTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTCACA-----A------TAG------TA------TTT--AAT--ATAAA--CAT-GAAgttgcctttttttttgtcgtatcg
gi|51                         :                 ttTATAAAATATAAATAAA------T-----CT-AGTCT------------------A---------------ACTTTGT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGTAACAATATTA------TAGGAGACCTA------TTT-AAAT--AAATA--AAT-AGAA-ct
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----CTTAGAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTTTAGAAT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taaacTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------CACA----AAATAGTTATCATTTA-----TCTACAAATA--GTTTTGT-T-AAAATGGTGAGAAT-AAAGCCAGTCTTATAGAATtcctctccttaacacaatacaattacacaaacta
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggc-TTGGTTTAAACA-----T-----AGTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGACAGGCTTATAGAAtctccta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGAAATGAActcctctc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTAC-C-AAAAGGA-TGGAATGAAAAACAAGCTTATAGAAtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TAGA----A------TATAACTTA-----TTT----ACA--ATTTTGT-C-ATAATGACTGGGATgtcttc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTTTAAACA-----T-----ATTTAATTT--CGAA-TACTTGTAGCTTTACC----A------TATTACATA-----TTTAAATATATTATTTT-T-C-AAAAAAATTGGAATAAAACATAAGCTTATttgacgatgtgagctgctataga
gi|6                          :                   TATAAAATATAACTAA-----------TTCTGAGACT------TAATTTA---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCATCAAG------------ATTTTACGCAACA-----A------AAG------TG------TTT-AAAT--AAAAA--TAT-ATAA-C--A----ATAGTGTTTA--------AAT---AA-A---AA-AA-T---A-----T--A-
gi|6                          :                                                                                                                                                              aATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-acaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|6                          :                           atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-GAAT--AAAAA--AAAAGAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-GA-T---A-----TGTA-TTAA-AC------AA-TAATATTGCCCGTGTGGGATTCGAACCATAGC-GGGAA---A--AAA-----------TCTTGCATGAGT-C-A-ACGTGTTG--A--CACCACTTGACCACGGCCACATA-TGGAT-AAATG-T-TT--GT------TATCTTAATAT--AAACT------T------------------GTTTCTCTTGTAAATAATACCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACAGTTT-T-----TTTTTA-TT--CG---TATTT-------Tataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
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gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAACTGATTGGAATGAAAGACAA--TTATgtgctatta
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaaatgtactatgaGGTGGGATTCAAACCATGGC-GCAAA---ACTAAA----A--A-CATCTTGCATAAGCTC-A-ACGTCTTA--A--C--C
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c-TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATc
gi|7                          :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTT-----------------------AATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----G------TGG------TA------TTT-TAAT--AAAAA--AGT-GAAA-T--A----A----ATCTA--------ACT---TA-A---AATGA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-CAAAATTTACCCATTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACTA-AATCTTGCATAAGCTC-A-ACGT------------CACTCGGCTATGAAGACATC-TTGAT-AACTG-T-TT--AT------TATTTTTATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGTAGATTATTGCGAAATATAT-TCA-TTGGTTTAAACA-----C-----ATTTTTTTTTCCGAA-TATCT-------TATA----A------TATTATATA-----TTTACAAACA--ATT---T-C-TAAAGGATTGGAATGAAAGACCAGCTGATAGAAT
gi|70                         :                    ATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|9                          :                   TATAAA-TATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTAAATTAAGCTAGTCTAGTTTTTT-C-CTA------CG-----GGTAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAATTAAGATGATACATTTGATGCAACA-----A------TGGAAGCTCTA------ATT-AAAT--AAAGA--AAT-TAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---GA-AATG---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCACAGCTGTGATTCGAACCAAGGC-GGAGA---A--AAA-T--A--A-AATCTTTCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--CAACACTCTGCCACGGAAACATC-TTGAT-AAATA---TT--GT------TATCTTTATATTGAAA-G------TAATCATTC-GAT-----TGTTACTCTTGTAAATACTGGCGACATATAA-TAA-TTGA-TTGAACA-----ac
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|45 ): AATACAATACAATACATAAACTATGATGACAACTGTGAATTTCTAGTACGCAAGATAACAACATTAATTTTATAATAACGATCAAATGGAAGGACATATTATAGTAGAAATGGAAAACATGGCTATTAAATAATGCAATATGTTAAGTACATATTAGGGGGAATTATTGGCAACATTG
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Unaligned ( gi|60 ): GCACGAAAGATGATGACAAAATGTGGATTTCTAGTGTAGTATACAAGATAACAACATTTATAACAAAGATGAAAAATAAAAGATAAATTAAA
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Unaligned ( gi|65 ): CCGCAGTTCCACCAAAGATCTCAACTTGAGAGGTTTCATCTATATTGATCATTTATATTGATCATTTATATTGATCA
Unaligned ( gi|67 ): TATTTACGTTTTGTATTTATAGACGTGCGATTTAGATCACATCATGTATTTA
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consensus                     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
Reference ( family-2913 )     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTATAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTACATAAT
gi|10                         :                 tgTATAATTTATAAATAGGCCTACGTGAATTCTGAGTCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTTTC-GTATATCTACT-----AGAAATGAC-AAAA-A-ATCACAAAGTTAAGATTATACATTGTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTA-AGAT--AAAAG--AGT-GAAA-T--A----A----ATCTA--------ACT---TA-A---AA-AA-A---AAAAAAT--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTTCCGTGGTGAGATTCAAATCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACAA-AATCTTGCCTAAGCTT-A-ATTTCTTA--A--CACCACTCGGCCATGAAGACATT-TTGAT-AACTG-T-TT--GT------TATTTTTATATT----CT--------GT--TTC-A----------TTCTAACGTAAATAATGGCGAAATATAT-AAA-TTG-CTCGAACA-----tactctcctaaatactatacaattacacaaactatgttgacaaatttatatttctagttaagtatacaagattacaacataattttaaacgatcaaatggaaatatatattagaatagaaatagagttgctgaaaaactttgatattatagaatgcaaatacatattagcgggaattatgggcgacattgggatgggagaatttattaacgttcatgccagttaaaactacatatgtgacattaaatacgatgtgtattttcgatgtaattatgtactgcactgaatatgatgatatttatatcgatagaagacgtttcgtttccggaaatggggtgatataatgatctttcaagtactgttcgtgagttgcgatgtgagatgcaatgaagtaaaacatgttctgcgtcttcaatttcgccacacatacaaagaggataaataatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attaTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAT-TATCT-------TACA----A------TATTATATA-----TTTACAAATA--ATTTTGT-C-AAAAGGTATGAAATTAAGGACAAGCTTATTGAATgttgcgttttttgtcgtat
gi|12                         :                   TATAAACTATAAATGTA------TGAATTCTGAGCTT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GCA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTCACTAAGTAACGATTACAAATTTTATTTAACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AATTA--AAT-GAAA-T--G----A----ATTTA--------ATCAAATACA---AA-AA-G---T-----T--A-TCAA-T-------AA-TGACATTCCCCGGTTGGGATTCTAACCCTGGC-GGATA---C--AAA-T-----A-AATCGTACAT-TGTTT-AGACGTCATA--A--C--CATCCAAGCACGGGCACGTA-ATGAT--AATA-TAAT--GT------TATTTTTATATTCAAAC-------TGATTATTC-AAT-----TGTTTTTCTTGTAAAAAATGGCAGGAAATAT-TAA-CTGATTtcctttcctaaatgcaatacaataacacaaactatgatgacaaatgcggatttctagttatatatacaagataacattattgactttatgataatgatcaattgtaaagatatattagaatagaaatggaaattgcggaaaacatggatattatataatgcaatatgttaaatacatatttgggggagttatgggcaacgttgggatgggaggatttgttaactttcatgtcagttaaaactatatgtgtgatattagaaacgatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tattaGATTTAGACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--CTTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAGGACAAGCCTATAGAATgatcagttgcctactttcgccgtatc
gi|14                         :                   TATACACTATAAAAAAA-------GAATTTTGAGCCT------T----TA---ATA---------------GTTTTTC-C-GTA------AGCTATAGGAGATGAC-AAAA-A-GTCACCAATTTGAGATAATACATTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TAT-AGAT----AAA--AAT-GAAA-T--C----A----ATTCA--------ATT---TA-A---AA-AA-AGCTA-----T--A-TT---A-------CA-TAATATTCCCCAGGTGGGATTCGAACCATGGCTGGAAAAACA--AAA-A--A--A-AA---TG---AAGTTC-A-ACATCTTA--A--C--CACTCGGCCATCTACACACT-TTAACAAAATG---CA--GT------T-TTTTTATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAC-----TGTTTCTTTCGTAAACAATGGCG-AATATAT-TAA-CTGG-TTGAACA-----tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaTTCTGT-C-AAC-GTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATgttgccttttggtcgtatcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TAT-ATATA-----TTTAGTAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCCTATAGAATtcctttactaaatacaattacacaaaatgtcaacaaatgtggatttatggtcgagtatatacaagatgacattaattttataataaagatcaaatataaagaatagaaatggaagctgggggtgggggggaacattgatattatatgatgtagtgtgttgaatacatattaccggtagggggaattgtgggcgacattgggatgggagaatttaataatgttcatgccagtttaaactataattataatactatgtggcgttagaagcaatgtgtatgttcttggatttaaaatcaatacactgaaca
gi|17                         :                     gAAAATATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAGGCCTACTC------------GCTTTTT-C-GCA------CG-----GGCAATCGC-AAAA-ATATGAACAAGTTAAGATTATATAGTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAT--AA---AAA-A--A----G----ATATA---------C---------------A-T---G-----T--A-TT-A-A-------AA-TAAAAT-------GTG--ATTCAAACCATGGC-GGAAA---A--AGA----A--A-AATCTTGTATAAGTTC-A-ACGCCTTA--A--CACCGCTCGCCCACGGACACATC-TTGAT-AAATGTT-TT--TT------TTTTTTTATATTTAAAC-------GAATCATTC-ATG-----TGATTCTTTCGTTAATAATGGCAAAATATAT-TTA-TTGA-TTGGACAGTTGCC-----ATTTTTTTT--TG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|18                         :                   TATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GCCA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C---------------------------CGTCTTAACA--C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AAATG-T-TT--ATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----
gi|19                         :                 taTATAAA-TATAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAA--TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----G-AAATGAC-AAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTAAGAAACA-----A------TAG------CG------TTT-AAAT--GAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TT-A---AA-A--G---A-----T--A-TTAA-A-------AAATGAAATTGCCTGGGTGGGATTCGAACCATGGC-AGAAA---A--AAA----------ATCTTGCATAAGT-C-A-ACGTGTTG--A--CACCAGTTGGCCACAGCCACAAC-TGGAT-AAATG-T-T---GT------TGTTTTT-TATATAAACT------T------------------GTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTGAA--------------TTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TTTTACATA-----TTTACAAACA--GTTTTGT-CAAAAAGGATTGAAATGAAAGATAAGCTTATAGAAgttgcctttttatcgtatc
gi|20                         :             aaaactTATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GCCA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C---------------------------CGTCTTAACA--C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AAATG-T-TT--ATCAGATCTACTTTTATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----aacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|21                         :                           aTAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----AA---CTA---------------GCTTTTC-C-GTA------AGCT---ATAGATGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGTAACA-----A------CAT------TG------TAT-AGAT--AAAA--------AAA-T--A----A----ATTTG--------A-T---TA-A---AA-AG-G---C-----T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCGGATGGGATTCGAACCATAGC-----A---A--AAA-C--A--ACAAT-TTATATAAGTTT-A-ACGTCTTA--A--C--CACTGGGCCACGGCCACATG-TTGAT-AACAG-T------T------TATTTTTATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|22                         :                    gTAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----TA---CTA---------------GTTTTTT-TTGTA------CG-----GGAAATGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAA--AAAAA--CGT-GAAAGT--A----A----CTTTA--------A------A-A---AA-AG-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATCCCCC-CATGGGATTCGAACCATGGT-GGGAA---A--AAA-CATA--A-AATCTTTCTTAA----------TCTTA--A--C----CTTGAATACGG-----------------------T--GT------TATTTTTCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGTAAATAATGGCAAAACATAT-TAA-TTG-TTTGAACA-----gttgcctttttgtcatatc
gi|23                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTTG--------ATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGTTT-T-ACGTCTTA--A--C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AAAAG-A-TA--AT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--gttgccctttttgtcgtatc
gi|24                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----TA---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTTG--------ATT---TA--------------------------TTAATA-------AG-TAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGTTT-T-ACGTCTTA--A--C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AAAAG-A-TA--AT------TATTTTTATATTTATACT------TA-TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--ttcgtcgtatc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CA-----T-----GTTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGTCC-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAATttcgtcgtatc
gi|26                         :                aatTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCTGTAGGCC----TA---CTC---------------ACTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATTCATTTAATGTAACA-----A------TAG------CA------TTG-AAATG-AAAAA--AAT-AAAA---------A----AT--A--------A------A-A---AA-GA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCGTGGC-AGAAA---A--AAA----------AT--TGCCTAAGT---------CTTA--G--CAGCACTGGGCCAAGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TAT-----------AA-T------TA--CATTC-GTT-----TGTTTCTCTCGTCAATtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taGATCTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATT-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C--AAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                       -AAAT--AAAAATAAAT-GAAT-T--AGTTTA----CTTTACTAGATCAACA---TA-A---AA-AA-AT--A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCTCATGTGGGATTCGAACCATGAC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAA-----------C-----A--C--CACTCTGCCACAGACACATC-TTGAT-AAATA-G-TT--GT------TATATTTATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGTTAATACTGACGACATATAT-GTA-TTAA-TGGAACA-----TTTGCCATTTT-TGT--CG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atataATAT-TAAATTGATTTTAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------CATA----A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTATGT-C-AA---------AATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtataactatgtttcttgttcaaacttagcatttgtg-----T-----ATTTTATTC--GGAA-TATTT-------TACA----T------TAATACATA-----TTTCCAATTT--TTTTTGT-C-AAAAGAATTGGAATGAAAGACAATCTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|31                         :                                                                                                                            ggttttcatgTCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGTAACA-----A------TAG------CAGACCTTTTT-ACAT--AAA------T-AAAG-T--A----A----AT----------------------------A-G---------T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGTTGGGAT-CGAGCCATGGC-AGGAA---A--AAA-C--A--A-AATCT-----AAGTTCCA-ACATTTTA--AGAC--CACTCGGCGACAGATACATC-ATGAT-AAATA-------GT------TATCTTTATATTTAAACT-------AATAATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGTGAATACTGGTGACATATAT-TAA-TTGATTcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|33                         :                   TATTAACTAAAAATAAA------TGAATTCTGAGGCA------------A---CTA---------------GCTTTTT-------------A-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTGACCAAGATAAGATTATACATTTTATATAATA-----ATACCGGTAA------TA------TTT-AAAT--AAAAT--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATT---TA-AAAGAA-AA-G---T-----T--A-TC-A-A-------AA-TAAAA-TCCTCGGTTGGGATTCGAACCATGGC-GAGAA---A--AAA-A--A--A-AATCTT--ATAAGTGC-A-ACGTCTTA--A--A--CACTCGGCCACAGAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aAACA-----T-----GTCT-ATTT--CAAAATATTT-------TACA----A------TATTACTTA-----TAAACAAACA--ATTTTGT-C-AAAGGAATTGGAAAGAAATACAAGCGTATAGAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagttaaA-TTGGTTTAAACT-----T-----ATCTTATTC--CAAA-TACTT-------TACATATAA------TATTTCATA-----TTATCAAGCA--ATTTTG------AATGATTAGAATGGAAGACAAGTTTAtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|36                         :                   atacagtgtTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----CA---CGA---------------GTTTATT---ATA------TA-----GGAAATGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGTAAGA-----C------TAG------AA------TTTTAAAT--AGTAA--AAT-GAAA-TTAA----A----AT------------------------AA-AA-G---T-----T--G-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCTCAGGTAGGATTCGAACCATTGC-GGAA--------------A--A-AGTCTTATTTAAGTTC-A-ACGTCTAA--G--C--CACTCattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                       atcacaaaacactccgT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATT---CA-A---AA-AA-G---T-----T--A-TCGA-ATTTTAAAAA-TAAAATTTCCCGGGTGTGATTCGAACCATGGC-GAAAA---A--AAAGC--A---------TACATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CGCTAGATCATGGACACATT-TTGAT-ACAAG-T-TT--GT------TAT--------------C------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGTTATTAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGATTT-AACAGTTG-C-----ATTTTATGT--CG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--TGAA-TATTT-------TACA----A------AACGACATA-----TTTACAGACA--ATTTTAT-C-AAAAGTATTGGAATGGAAGACGAGCTTATAGAATta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aATTTAAGCA-----C-----ATTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A--------------A-----TTTACAAACA--CTTTTAT-C-AAATGGATTGGAATAAAATACAAGCTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCG-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGGCAAGTTTATAGAATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|41                         :                   TATAAACCATAAAT--------------------CCT------T----AA---CTA----------------CTTTTT-C-GTA------TA-----GGA--TGAC-AAAA-A-GTCACCAGGTCAGGATTATACATTTTATG---CA-----A------CAG------TA------TTC-CAA---AACAA--AAT------T--A----A----ATT------------------------A-AA-G---T-----T--ACTTAA-A-------CA-TAAAATTCCCCAGGTGAGATTCGAACCATGGC-GG-TA---A--AAA-T--A--A-AATATTACATGGATTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                      attaT---TA-A---AA-AA-T---AGT---T--A-TTTA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGATGGGATTCGAACCATGCT-ATAAA---A--GAA-C--A--A-AATTGTACTGAAGTTC-A--CACCTTA--A--C------------------------------AATA-T-TTTAGT------TATTTTAATATTTAAACT-------AGTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGTAAATAATGGCG--ATATATGTAG-TTG
gi|46                         :                 aaTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----TA---TAA---------------GTTT------GTA-------A-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAAC------A------TAG------TA------TAT-AGATAAAAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATA---TA-A---AA-AA-A---ATGT--T--A-TTTA-A-------AA-CAAAATTCCCCAGGTTGGATTgacagtttcctttttgttgaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaCCAGGTAGGATTCGAACCATGAC---AAA---A--AAA-T--A--A-A-TCTTACTTATGTTC-C-ACGTCTTA--A--C--CACTCTGC---AGACACATC-TTAAT-AAAGG-T-TT--GA------TATTTTTACATTTAAAC-------TGACGATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGTAAATAATTGCGAAATATGT-TGC-TT-ATTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TTTCTTTATATTTAAACT-------AATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTTAATAATGGTGACATATAT-CAA-TTGA-TTGAACA-----ttgccgt
gi|50                         : tattgaccgaagtggtagTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----TA---GTAA--------------GTTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTCACA-----A------TAG------TA------TTT--AAT--ATAAA--CAT-GAAgttgcctttttttttgtcgtatcg
gi|51                         :                 ttTATAAAATATAAATAAA------T-----CT-AGTCT------------------A---------------ACTTTGT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGTAACAATATTA------TAGGAGACCTA------TTT-AAAT--AAATA--AAT-AGAA-ct
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----CTTAGAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTTTAGAAT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taaacTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------CACA----AAATAGTTATCATTTA-----TCTACAAATA--GTTTTGT-T-AAAATGGTGAGAAT-AAAGCCAGTCTTATAGAATtcctctccttaacacaatacaattacacaaacta
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggc-TTGGTTTAAACA-----T-----AGTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGACAGGCTTATAGAAtctccta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGAAATGAActcctctc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTAC-C-AAAAGGA-TGGAATGAAAAACAAGCTTATAGAAtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TAGA----A------TATAACTTA-----TTT----ACA--ATTTTGT-C-ATAATGACTGGGATgtcttc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTTTAAACA-----T-----ATTTAATTT--CGAA-TACTTGTAGCTTTACC----A------TATTACATA-----TTTAAATATATTATTTT-T-C-AAAAAAATTGGAATAAAACATAAGCTTATttgacgatgtgagctgctataga
gi|6                          :                   TATAAAATATAACTAA-----------TTCTGAGACT------TAATTTA---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCATCAAG------------ATTTTACGCAACA-----A------AAG------TG------TTT-AAAT--AAAAA--TAT-ATAA-C--A----ATAGTGTTTA--------AAT---AA-A---AA-AA-T---A-----T--A-
gi|6                          :                                                                                                                                                              aATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-acaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|6                          :                           atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-GAAT--AAAAA--AAAAGAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-GA-T---A-----TGTA-TTAA-AC------AA-TAATATTGCCCGTGTGGGATTCGAACCATAGC-GGGAA---A--AAA-----------TCTTGCATGAGT-C-A-ACGTGTTG--A--CACCACTTGACCACGGCCACATA-TGGAT-AAATG-T-TT--GT------TATCTTAATAT--AAACT------T------------------GTTTCTCTTGTAAATAATACCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACAGTTT-T-----TTTTTA-TT--CG---TATTT-------Tataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaa-----T-----GTTTTATTT--CAAA-CATCT-------TACA----C------TATTACATG-----TTTACAAGCA--ACTTTGG-T-AAAGGGATTAGAATGAA----GAGCTTATAGAATtggcgtatcg
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTTTAAACA-----T-----ATTTTAGTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATCACATA-----TTTACAAACA--ACTTTGT-C-AAAAGGATTGAAGTAAAtcctgtt
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAACTGATTGGAATGAAAGACAA--TTATgtgctatta
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaaatgtactatgaGGTGGGATTCAAACCATGGC-GCAAA---ACTAAA----A--A-CATCTTGCATAAGCTC-A-ACGTCTTA--A--C--C
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                c-TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATc
gi|7                          :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTT-----------------------AATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----G------TGG------TA------TTT-TAAT--AAAAA--AGT-GAAA-T--A----A----ATCTA--------ACT---TA-A---AATGA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-CAAAATTTACCCATTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACTA-AATCTTGCATAAGCTC-A-ACGT------------CACTCGGCTATGAAGACATC-TTGAT-AACTG-T-TT--AT------TATTTTTATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGTAGATTATTGCGAAATATAT-TCA-TTGGTTTAAACA-----C-----ATTTTTTTTTCCGAA-TATCT-------TATA----A------TATTATATA-----TTTACAAACA--ATT---T-C-TAAAGGATTGGAATGAAAGACCAGCTGATAGAAT
gi|70                         :                    ATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|9                          :                   TATAAA-TATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTAAATTAAGCTAGTCTAGTTTTTT-C-CTA------CG-----GGTAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAATTAAGATGATACATTTGATGCAACA-----A------TGGAAGCTCTA------ATT-AAAT--AAAGA--AAT-TAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---GA-AATG---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCACAGCTGTGATTCGAACCAAGGC-GGAGA---A--AAA-T--A--A-AATCTTTCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--CAACACTCTGCCACGGAAACATC-TTGAT-AAATA---TT--GT------TATCTTTATATTGAAA-G------TAATCATTC-GAT-----TGTTACTCTTGTAAATACTGGCGACATATAA-TAA-TTGA-TTGAACA-----ac


blockSeqs                     :                         C          .                   GTAGGC AATT  GGC   AATTAAGCTAGTCTA       TT    AGCTATA               A    AT                                   ATATT TACCGG   GAGACC  GACCTT   T    AA     TA   A    G TA GTTT TAGT     CTAGATCAACA     AAAG   T  AGCTA       GT C  A T TTTTAAA  A           G                    TG    AAC CT   CATAA          A A     TTAG         AC GA AC        C           T     A     TA   TA  CAGATC                 TACCCGGTAG      G   GTTTG                               G   A    C       GTTGCC              TC    A     GTAGCTT    TATA AATAGT         TTAAT          TT       C A
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     A     CTC                   C     AGCT                  .    CA                                   .     .        AAGCTC  .        .    G      .    .    . .  .    .        ATCAAA          CA     .  AATGT       .  .  G T C        .           A                    G     .   .    CACTA          G A     TCCA         AC .  AC        C           T     .     TT   .   CAGATC                 CTGG            .   .                                   .   .    T       TTTGCC              .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         A          .                   .      .     .     A                     C     TA                    .    T                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ATT             A      .  TAGT        .  .  A . .        .           A                    G     .   .    CAAC           G A     TCA          .  .  AG        C           .     .     T    .   .                      GTAA            .   .                                   .   .    T       GTTGC               .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         A          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ACT             A      .  ATA         .  .  G . .        .           G                    A     .   .    AAA            G A     TCA          .  .  AC        C           .     .     T    .   .                      TGA             .   .                                   .   .    T       GTTTT               .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         A          .                   .      .     .     .                     C     TA                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ACT             A      .  TGA         .  .  T . .        .           A                    G     .   .    CAA            A T     TTA          .  .  AA        C           .     .     T    .   .                      TAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ACT             A      .  GT          .  .  G . .        .           G                    G     .   .    CAA            T A     TTT          .  .  .         T           .     .     T    .   .                      GAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     C     TA                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ATT             A      .  TG          .  .  A . .        .           G                    G     .   .    AAA            A A     TTT          .  .  .         C           .     .     A    .   .                      TAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ATT             A      .  GA          .  .  A . .        .           G                    A     .   .    GCA            A C     GCA          .  .  .         C           .     .     A    .   .                      TAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     T     TA                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ATT             A      .  GA          .  .  G . .        .           G                    G     .   .    TAA            G A     TCA          .  .  .         C           .     .     T    .   .                      TAG             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     T     TA                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ATT             A      .  GA          .  .  G . .        .           A                    A     .   .    CAA            G A     TCA          .  .  .         C           .     .     G    .   .                      TTA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    T                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ATA             A      .  GC          .  .  G . .        .           G                    G     .   .    TAA            A T     TCA          .  .  .         G           .     .     T    .   .                      TTA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         A          .                   .      .     .     .                     C     TA                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        AAT             A      .  GA          .  .  T . .        .           G                    G     .   .    TAA            A A     TCA          .  .  .         C           .     .     T    .   .                      TTA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         A          .                   .      .     .     .                     C     TA                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ACT             A      .  GA          .  .  G . .        .           A                    G     .   .    TA             A A     TCC          .  .  .         C           .     .     T    .   .                      TAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         C          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ACT             A      .  GT          .  .  A . .        .           G                    G     .   .    AA             A T     TCA          .  .  .         C           .     .     T    .   .                      TAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         A          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    T                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        ACT             A      .  GT          .  .  T . .        .           A                    A     .   .    AA             A T     TCA          .  .  .         T           .     .     T    .   .                      TAG             .   .                                   .   .    T       C                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         .          .                   .      .     .     .                     C     CG                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        AT              A      .  GT          .  .  T . .        .           G                    G     .   .    AA             G A     TCA          .  .  .         C           .     .     T    .   .                      TGA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                         .          .                   .      .     .     .                     .     CG                    .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        C               A      .  GT          .  .  A . .        .           A                    G     .   .    C              G A     CA           .  .  .         .           .     .     .    .   .                      TAA             .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                    .                   .      .     .     .                     .     A                     .    A                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        A               .      .  TA          .  .  G . .        .           A                    G     .   .    C              G A     CA           .  .  .         .           .     .     .    .   .                      TT              .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                    .                   .      .     .     .                     .     A                     .    .                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        A               .      .  TA          .  .  G . .        .           G                    G     .   .    .              T A     .            .  .  .         .           .     .     .    .   .                      AA              .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                    .                   .      .     .     .                     .     .                     .    .                                    .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        .               .      .  GA          .  .  . . .        .           C                    .     .   .    .              . .     .            .  .  .         .           .     .     .    .   .                      TT              .   .                                   .   .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                    .                   .      .                                                                                                       .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        .               .      .  G           .  .  . . .        .           A                    .     .   .    .              . .     .            .  .  .                                                                                                                             .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                       .     .        .       .        .    .      .    .    . .  .    .        .               .      .  .           .  .  . . .        .           .                    .     .   .    .              . .     .            .  .  .                                                                                                                             .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                       .     .        .       .        .    .      .    .    .                                  .      .  .           .  .                           .                    .     .   .    .              . .     .            .  .  .                                                                                                                             .    T       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                       .    .      .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .       T                   .     .     .          .    .              .              .        . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .       T                   .     .     .          .    .                                      . .
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blockSeqCons                  :                                    ******                                                       C**   CG***********                                                                                                                                                      GN*********                                                                    CAA******                                 **                                                                TAA*******
originalCons                  :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA-G---A-----T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TATTTTTATATTTAAACT------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
finalCons                     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TA---CTA---------------GCTTTTTC--GTACG-----------GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AAGN---------T--A-TTGA-A-------AA-TAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAACAA------AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATG-T-TT--GT------TATTTTTATATTTAAACTAA-------TCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TTTATAAAAATTGATCGGAATGAAACAAACTTATATTATTCCTATCTTAAATACAATACAATTGCATAACATAATGTTTTATGATGACAAATGTTGATTTCTAGAAAGGTATACATGATAATATTTATTTATAATAAACATTGAATGTAAGGATTTATTAGAATAGAAATGAGTGTTATAAAATGCAATATGTCATATACATATTAGGGGGAACTGTGGACGACATTGGGAAGTAAGGATTTATTAAGACTATAAGAGTGACGATATCAACGATATGTTTTTTCAATGTAAATACATGTATGTTCTGCACTGGAAATGATAATATTTGTATTGATAGAAACAGTTTCGTCTCCAATGAAAAGTATATGAATAGTTATTCGAAGATAGGGTGGTAATATGTCGTGTATTGTTCGTGTAAATAATAATGAATATAATATTTCAGTTATTTAATTACACTATGCTAAGACGAAAGGTATGCTT
Unaligned ( gi|5 ): AAAGATCAAATCTAAAAATATATTAGAATAGAAATTGTTTTTGGATACTATATAATAGAATGTAACATAATCCATATTAGCGGAAAGTTTTGGCGACATTGGGGTGAGAGGATTTATTAACGTTCATGCCAATAAACAGTATATAAATTATGTAACGTTAGAAACGAAATGTATTTTCGATGTTATTATGTATTGCACTGAATATGATTATATTTGTATAGATAGAAAAAAGTTTGTCTCCAAAGAGAAGTAGATGGGTAGTTATTCACAGTGGGATTGTAATGATCTTTCGAGTACTGTTCGTGAGTCGCGATATGAGATGCAATGAAGTAGAACATGTTCTGCGTCCACAGTTTCGCCACACACATACATTGAGAGGCTACACCTATGTTTATCGAGTCTATATTGAGTAATTTAGATTGATC
Unaligned ( gi|8 ): AAACGGTTTTTTATGAAGTTGAACACCAATCGTAAAATATTTTACAGTATTCCTCTGCTGCATACAATATAATTTCACAAAAAATGATAACAAGCGTGGATTTTTAGTATAGTATACAAGATAACAACATACATAATAAACATCAATTGTAAAGATGAATTAGAGAAAACGGAACGGGAAAAAAACATAAATATAATACAATGTCTTGTGTTAAATACATACTGGGGGTGGGGGGGTGGGGGGGTCATTTTTGGGATGGGGAGGTTTTATTAACGTTCATGTTAGGTAAAACGACCTGAGTGACGTAAAAAAAAAACGATGTTTGTTTTCAATGTAATTTTTACCACACAAAATGATAATATTTGTATCTACTGAAAAAGTTTTATCTCAAAAGA
Unaligned ( gi|29 ): TATCAACATTCAGTGACGGTAAAGACGATGTGTATTTTCAATGTAATTATGTTTTTCACTGAAAATAATAAACTTTGTATTGACAGAAATAGTTTCATCCTTAAAGACACGTAGATGTGGTTGAGTTGAAATCATGCTCTCAATCACATATCAAACTGTTTTCACAAGGGTCATGGTTGTCCGACCGTTCATGCCACTGCGAGAGCATTAAGGCCAGCAGATTTACAGAACAAGTTACTGGATAACTTAAA
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Reference ( family-2913 )     :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----T-A---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA---G---N-----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACTCGGCCACGGACACATC-TTGAT-AAATGT-TT--GT------TATTTT-TATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGATTTGAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTATAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTACATAAT
gi|10                         :                 tgTATAATTTATAAATAGGCCTACGTGAATTCTGAGTCT------T----T-A---CTA---------------GCTTTTTTC-GTATATCTACT-----AGAAATGAC-AAAA-A-ATCACAAAGTTAAGATTATACATTGTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTA-AGAT--AAAAG--AGT-GAAA-T--A----A----ATCTA--------ACT---TA-A---AA-AA---A---AAAAAAT--A-TT-GA-A-------AATAAAATTTCCGTGGTGAGATTCAAATCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACAA-AATCTTGCCTAAGCTT-A-ATTTCTTA--A--CACCACTCGGCCATGAAGACATT-TTGAT-AACTGT-TT--GT------TATTTT-TATATT----C-------TG-T--TTC-A----------TTCTAACGTAAATAATGGCGAAATATAT-AAA-TTG-CTCGAACA-----tactctcctaaatactatacaattacacaaactatgttgacaaatttatatttctagttaagtatacaagattacaacataattttaaacgatcaaatggaaatatatattagaatagaaatagagttgctgaaaaactttgatattatagaatgcaaatacatattagcgggaattatgggcgacattgggatgggagaatttattaacgttcatgccagttaaaactacatatgtgacattaaatacgatgtgtattttcgatgtaattatgtactgcactgaatatgatgatatttatatcgatagaagacgtttcgtttccggaaatggggtgatataatgatctttcaagtactgttcgtgagttgcgatgtgagatgcaatgaagtaaaacatgttctgcgtcttcaatttcgccacacatacaaagaggataaataatgttt
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gi|12                         :                   TATAAACTATAAATGTA------TGAATTCTGAGCTT------T----T-A---CTA---------------GCTTTTT-C-GCA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTCACTAAGTAACGATTACAAATTTTATTTAACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AATTA--AAT-GAAA-T--G----A----ATTTA--------ATCAAATACA---AA-AA---G---T-----T--A-TC-AA-T-------AATGACATTCCCCGGTTGGGATTCTAACCCTGGC-GGATA---C--AAA-T-----A-AATCGTACAT-TGTTT-AGACGTCATA--A--C--CATCCAAGCACGGGCACGTA-ATGAT--AATATAAT--GT------TATTTT-TATATTCAAAC-------TGATTATTC-AAT-----TGTTTTTCTTGTAAAAAATGGCAGGAAATAT-TAA-CTGATTtcctttcctaaatgcaatacaataacacaaactatgatgacaaatgcggatttctagttatatatacaagataacattattgactttatgataatgatcaattgtaaagatatattagaatagaaatggaaattgcggaaaacatggatattatataatgcaatatgttaaatacatatttgggggagttatgggcaacgttgggatgggaggatttgttaactttcatgtcagttaaaactatatgtgtgatattagaaacgatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattaGATTTAGACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--CTTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAGGACAAGCCTATAGAATgatcagttgcctactttcgccgtatc
gi|14                         :                   TATACACTATAAAAAAA-------GAATTTTGAGCCT------T----T-A---ATA---------------GTTTTTC-C-GTA------AGCTATAGGAGATGAC-AAAA-A-GTCACCAATTTGAGATAATACATTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TAT-AGAT----AAA--AAT-GAAA-T--C----A----ATTCA--------ATT---TA-A---AA-AA---AGCTA-----T--A-TT----A-------CATAATATTCCCCAGGTGGGATTCGAACCATGGCTGGAAAAACA--AAA-A--A--A-AA---TG---AAGTTC-A-ACATCTTA--A--C--CACTCGGCCATCTACACACT-TTAACAAAATG--CA--GT------T-TTTT-TATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAC-----TGTTTCTTTCGTAAACAATGGCG-AATATAT-TAA-CTGG-TTGAACA-----tcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtgcatttctagttaagtatacaagataacaacattaattttataataacgatcaaatgtaaagatatattagaataaaatggaagttgcggaaaacatggatattacagaatatattaaatacatattaggggtaattatgggcgacattgggatgagaagatttattaactgtctctttgatgtatgactattacaagtagtaactgagaagcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaTTCTGT-C-AAC-GTTTTGGAATGAAAGGCAAGCCTATATAATgttgccttttggtcgtatcg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TAT-ATATA-----TTTAGTAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCCTATAGAATtcctttactaaatacaattacacaaaatgtcaacaaatgtggatttatggtcgagtatatacaagatgacattaattttataataaagatcaaatataaagaatagaaatggaagctgggggtgggggggaacattgatattatatgatgtagtgtgttgaatacatattaccggtagggggaattgtgggcgacattgggatgggagaatttaataatgttcatgccagtttaaactataattataatactatgtggcgttagaagcaatgtgtatgttcttggatttaaaatcaatacactgaaca
gi|17                         :                     gAAAATATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----T-AGGCCTACTC------------GCTTTTT-C-GCA------CG-----GGCAATCGC-AAAA-ATATGAACAAGTTAAGATTATATAGTTGATGTAACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAT--AA---AAA-A--A----G----ATATA---------C---------------A---T---G-----T--A-TT--A-A-------AATAAAAT-------GTG--ATTCAAACCATGGC-GGAAA---A--AGA----A--A-AATCTTGTATAAGTTC-A-ACGCCTTA--A--CACCGCTCGCCCACGGACACATC-TTGAT-AAATGT-TT--TT------TTTTTTTTATATTTAAAC-------GAATCATTC-ATG-----TGATTCTTTCGTTAATAATGGCAAAATATAT-TTA-TTGA-TTGGACAGTTGCC-----ATTTTTTTT--TG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgcggatttcttgttaagtttacaagataacaacattgattttatagtaaagatcaattgtaaagatatattagaatagaaatgtaagttgcggtaaacatggatattacagaatacaatatgttaaatacacatttgggggagttatcggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatgccagttaaaactgtaagtgt
gi|18                         :                   TATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----T-A---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GCCA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA---G---A-----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C---------------------------CGTCTTAACA--C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AAATGT-TT--ATCAGATCTACTTT-TATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----
gi|19                         :                 taTATAAA-TATAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----TAA---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------C------GGAAATGAC-AAAA-A-GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTAAGAAACA-----A------TAG------CG------TTT-AAAT--GAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---T--T---AA-AA---G---A-----T--A-TTAAA-A-------AATGAAATTGCCTGGGTGGGATTCGAACCATGGC-AGAAA---A---------A--A-AATCTTGCATAAG-TC-A-ACGTGTTGACA--C--CAGTTGGCCACAGCCACAAC-TGGAT-AAATG--TT--GT------TGTTTT-T-TATATAAAC-------------------T-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTGAA--------------TTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TTTTACATA-----TTTACAAACA--GTTTTGT-CAAAAAGGATTGAAATGAAAGATAAGCTTATAGAAgttgcctttttatcgtatc
gi|20                         :             aaaactTATAAAATATAAATAAA------TGAATTATGAGCCT------T----T-A---CTA---------------GCTTTTT-C-GTA------TA-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTAATGTAACG-----A------TAG------TA------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-GCCA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-AA---G---A-----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCCCACCTGGGATTCAAACCATGGC----AA---A--AAA-C---------------------------CGTCTTAACA--C--CAGTCGGC------CACATCTTTGAT-AAATGT-TT--ATCAGATCTACTTT-TATATCTAAAC-------TAACCATTC-TAT-----TGTTTCTCTCTTAAATAATAACGAAAGAAAT-TAA-TTGA-TTGAACA-----aacctctcctaaatataatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttctagttaagtatacaaaataacaacattaattttataataacgatcgaatggaaagatatataagaatggaaattaaagttgcggaaaacttgaatattataaaatgcaatattttaaatacatattagggggaagtatgggcgacattgggatgggaggatttattaacgttcatggcagttaaaacttcatatgtgacattggaagcgctatgtaatgcactaaatatgataatatttgtatcgataaaagaaatttcatcttcaaagagaagtagatgggtagttatgcgcagattggctggtaatgctctttcaagtactgttcctgagtcgtgatatgagatgcaatgcagtagaacatgttctgcgtcttcaatttcgc
gi|21                         :                           aTAAATAAG------TGAATTTTGAGACT------T----A-A---CTA---------------GCTTTTC-C-GTA------AGCT---ATAGATGAC-AAAA-A-GTCACAAAGTTAAGATTATACATTTGATGTAACA-----A------CAT------TG------TAT-AGAT--AAAA--------AAA-T--A----A----ATTTG--------A-T---TA-A---AA-AG---G---C-----T--A-TT-TA-A-------AATAAAATTCCTCGGATGGGATTCGAACCATAGC-----A---A--AAA-C--A--ACAAT-TTATATAAGTTT-A-ACGTCTTA--A--C--CACTGGGCCACGGCCACATG-TTGAT-AACAGT------T------TATTTT-TATATTTAAA---------AATTAATC-AAC-----TGTTCCTCTCGTAAATAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGA-TTGAACA-----gttgcctttcttgtcatatc
gi|22                         :                    gTAAACTATGAAAAAA------TGAATTATGAGCTT------T----T-A---CTA---------------GTTTTTT-TTGTA------CG-----GGAAATGACAAAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATCA-ACATTTTATGTTACA-----A------TAG------TA------TTT-AAAA--AAAAA--CGT-GAAAGT--A----A----CTTTA--------A------A-A---AA-AG---G---A-----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATCCCCC-CATGGGATTCGAACCATGGT-GGGAA---A--AAA-CATA--A-AATCTTTCTTAA----------TCTTA--A--C----CTTGAATACGG----------------------T--GT------TATTTT-TCTATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TTTTTCTCTCGTAAATAATGGCAAAACATAT-TAA-TTG-TTTGAACA-----gttgcctttttgtcatatc
gi|23                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----T-A---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTTG--------ATT---TA----------------------------TT-AATA-------AGTAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGTTT-T-ACGTCTTA--A--C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AAAAGA-TA--AT------TATTTT-TATATTTATAC-------TTATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--gttgccctttttgtcgtatc
gi|24                         :                                TAAC------TGAATGCTGGGCCT------T----T-A---CTG---------------GCTTTTT-T-GTA------TA-----GGAAAGAAC-AAAA---GTCAACAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----C------TAG------TA------TTT-AAAT--AAA---------------------------TTTG--------ATT---TA----------------------------TT-AATA-------AGTAAAATTCCCCGATATGGATTTGAACCATGGC-GGAAA---A--ATA-----------TCTTACATCAGTTT-T-ACGTCTTA--A--C--CACGCCTCCACGAACAC--C-TTGAT-AAAAGA-TA--AT------TATTTT-TATATTTATAC-------TTATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTAAATAATGGAGAAACATTT-TAA-CTGA-TTGAACA-----------GTTGCATTT--ttcgtcgtatc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CA-----T-----GTTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGTCC-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAATttcgtcgtatc
gi|26                         :                aatTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCTGTAGGCC----T-A---CTC---------------ACTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATTCATTTAATGTAACA-----A------TAG------CA------TTG-AAATG-AAAAA--AAT-AAAA---------A----AT--A--------A------A-A---AA-GA---G---A-----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCCCGGGTGGGATTCGAACCGTGGC-AGAAA---A--AAA----------AT--TGCCTAAGT---------CTTA--G--CAGCACTGGGCCAAGGACACATC-TTGAT-AAATGT-TT--GT------TAT------------AAT-------TA--CATTC-GTT-----TGTTTCTCTCGTCAATtcctctcctaaattcaatacaattacaccaactatgatgacaaatgtggatttctaattaagcacatacaagataacaacattaattcaaaatatctgaaataaaatatgtttaaactaacattaattttattattaagataaaatgtaaagatagattagaatagaaatggaagttgcggaaaacatgggtattatagaat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taGATCTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATT-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C--AAAGGTTTGGAATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                        -AAAT--AAAAATAAAT-GAAT-T--AGTTTA----CTTTACTAGATCAACA---TA-A---AA-AA---A---TA----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCTCATGTGGGATTCGAACCATGAC-GGAAA---A--AAA-C--A--A-AATCTTGCATAA-----------C-----A--C--CACTCTGCCACAGACACATC-TTGAT-AAATAG-TT--GT------TATATT-TATATTTAAAC-------TAATTATTTGAATGTTTGTGTTTTTCTTGTTAATACTGACGACATATAT-GTA-TTAA-TGGAACA-----TTTGCCATTTT-TGT--CG---TATCtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgataaatgtggatttctagttaagtatacaatataacaacattgatttttttataattaagatcaattgtaaatatattagaataataaatagaaaacattgatattataaaatgcaatatgttaaaatgggggaattatgggcgacat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atataATAT-TAAATTGATTTTAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------CATA----A------AATTATATATTAATTTTGCAAACA--AGTATGT-C-AA---------AATGAAAGACAAGCTTATAGAAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctcctacaaggttggtaaatcagcagttgtcatgaaaagtcaaacgttgcaatattgtataactatgtttcttgttcaaacttagcatttgtg-----T-----ATTTTATTC--GGAA-TATTT-------TACA----T------TAATACATA-----TTTCCAATTT--TTTTTGT-C-AAAAGAATTGGAATGAAAGACAATCTtcctctcctcaatacaatacaattacactatgataacaaatgaggatttctagttaagtatggaagctaacaacgttaatttatatttagatatatataagaatagaaatggaagtaaacacggacattttaaaatgtaatatgttaaatacatgttatagggaattatgggcgacattggtttggaaggatttattatcgttgatgccagttataactatatttatgacattagaaacgatgtgtattttcgatgtgattatgtactgcactgaatatgaaagcatttgtttcgatagagaaagtttcgtcttcaaagagaagtagatgg
gi|31                         :                                                                                                                             ggttttcatgTCATCAAATTAAGATTGTACATTTTATGTAACA-----A------TAG------CAGACCTTTTT-ACAT--AAA------T-AAAG-T--A----A----AT----------------------------A---G---------T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCCCGGTTGGGAT-CGAGCCATGGC-AGGAA---A--AAA-C--A--A-AATCT-----AAGTTCCA-ACATTTTA--AGAC--CACTCGGCGACAGATACATC-ATGAT-AAATA------GT------TATCTT-TATATTTAAAC-------TAATAATTC-GAT-----TGTTTCTCTCGTGAATACTGGTGACATATAT-TAA-TTGATTcctcaatacaataaaattacacaagagatgtgcgcttctaatatagtaaacaagataacaaccttagtttttaataaagatcaactctaaagatcaatagaaaaatgaaccttgtgaaaacataactataaaaacataggtataattgaatgttatata
gi|33                         :                   TATTAACTAAAAATAAA------TGAATTCTGAGGCA-------------A---CTA---------------GCTTTTT-------------A-----GGAAATGAC-AAAA-T-GTGACCAAGATAAGATTATACATTTTATATAATA-----ATACCGGTAA------TA------TTT-AAAT--AAAAT--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATT---TA-AAAGAA-AA---G---T-----T--A-TC--A-A-------AATAAAA-TCCTCGGTTGGGATTCGAACCATGGC-GAGAA---A--AAA-A--A--A-AATCTT--ATAAGTGC-A-ACGTCTTA--A--A--CACTCGGCCACAGAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAACA-----T-----GTCT-ATTT--CAAAATATTT-------TACA----A------TATTACTTA-----TAAACAAACA--ATTTTGT-C-AAAGGAATTGGAAAGAAATACAAGCGTATAGAAT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagttaaA-TTGGTTTAAACT-----T-----ATCTTATTC--CAAA-TACTT-------TACATATAA------TATTTCATA-----TTATCAAGCA--ATTTTG------AATGATTAGAATGGAAGACAAGTTTAtttcctccttaatacaatatcgggtacttaatgccatgatggctatgtcactgacaatataataacacaatctaaaattgattagtttgaacgtaatataatgcaatttacacgtgatgaatgttgacatta
gi|36                         :                   atacagtgtTAAATGAA------TGAATTCTGAGCCT------T----C-A---CGA---------------GTTTATT---ATA------TA-----GGAAATGAC-AAAACA-ATCATCAAGTTAAAAGTATACATTATATGTAAGA-----C------TAG------AA------TTTTAAAT--AGTAA--AAT-GAAA-TTAA----A----AT------------------------AA-AA---G---T-----T--G-TT-TA-A-------AATAAAATTCCTCAGGTAGGATTCGAACCATTGC-GGAA--------------A--A-AGTCTTATTTAAGTTC-A-ACGTCTAA--G--C--CACTCattttatcaattgcatagatactctcctacaatgactgacagaatcatggagaaacacgacatggatatcaaatttgcgaatgtgtatgcttagttgcgtaattcattgacaacataacaacat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                        atcacaaaacactccgT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATT---CA-A---AA-AA---G---T-----T--A-TC-GA-ATTTTAAAAATAAAATTTCCCGGGTGTGATTCGAACCATGGC-GAAAA---A--AAAGC--A---------TACATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--C--CGCTAGATCATGGACACATT-TTGAT-ACAAGT-TT--GT------TAT--------------C-------TGGTCATTC-AAA-----TGTTCCATTCGTTATTAATGGCGAAATATAT-TAA-CTGATTT-AACAGTTG-C-----ATTTTATGT--CG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--TGAA-TATTT-------TACA----A------AACGACATA-----TTTACAGACA--ATTTTAT-C-AAAAGTATTGGAATGGAAGACGAGCTTATAGAATta
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aATTTAAGCA-----C-----ATTTTATTT--AAAA-TATCT-------TACA----A--------------A-----TTTACAAACA--CTTTTAT-C-AAATGGATTGGAATAAAATACAAGCTTATGTAATttctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgatgacaaatgtggatttccagttaagtatacaggataaccacattaattttataataaagatcaaatgtaaagatatactagaat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCG-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGGCAAGTTTATAGAATaatgatatataaatacaatacaattacacaaaatatgattaaaaaatgtgaatttctagtaaagtatacaagataacaacattaattttagaaataaagatcaaatctaaaaatatattagaatagaa
gi|41                         :                   TATAAACCATAAAT--------------------CCT------T----A-A---CTA----------------CTTTTT-C-GTA------TA-----GGA--TGAC-AAAA-A-GTCACCAGGTCAGGATTATACATTTTATG---CA-----A------CAG------TA------TTC-CAA---AACAA--AAT------T--A----A----ATT------------------------A-AA---G---T-----T--ACTT-AA-A-------CATAAAATTCCCCAGGTGAGATTCGAACCATGGC-GG-TA---A--AAA-T--A--A-AATATTACATGGATTC-A-ACGTCTTA--A--C--CACtcctctcctaaatacaatacaattacacaaactatgacgacaaatatggatttgcatcttacagtgtcttttcttttatcacaataaaactgtcaaaacattaggaca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                       attaT---TA-A---AA-AATA-G---T-----T--A-TT-TA-A-------AATAAAATTCCCCGGATGGGATTCGAACCATGCT-ATAAA---A--GAA-C--A--A-AATTGTACTGAAGTTC-A--CACCTTA--A--C------------------------------AATAT-TTTAGT------TATTTT-AATATTTAAAC-------TAGTCATTC-AAT-----TGTTTCTCTTGTAAATAATGGCG--ATATATGTAG-TTG
gi|46                         :                 aaTATAAACTATAAATAGA------TTGACTATGAGCCT------T----T-A---TAA---------------GTTT------GTA-------A-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTAAC------A------TAG------TA------TAT-AGATAAAAAAA--AAT-GAAA-T--A----A----ATTTA--------ATA---TA-A---AA-AAAATG---T-----T--A-TT-TA-A-------AACAAAATTCCCCAGGTTGGATTgacagtttcctttttgttgaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaCCAGGTAGGATTCGAACCATGAC---AAA---A--AAA-T--A--A-A-TCTTACTTATGTTC-C-ACGTCTTA--A--C--CACTCTGC---AGACACATC-TTAAT-AAAGGT-TT--GA------TATTTT-TACATTTAAAC-------TGACGATTC-CAT-----TGTTTTTCTTGTAAATAATTGCGAAATATGT-TGC-TT-ATTT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATC-TTGAT-AAATGT-TT--GT------TTTCTT-TATATTTAAAC-------TAATCATTC-AAT-----TGTTTCTCTCGTTAATAATGGTGACATATAT-CAA-TTGA-TTGAACA-----ttgccgt
gi|50                         : tattgaccgaagtggtagTATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGATCCT------T----T-A---GTAA--------------GTTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTCACA-----A------TAG------TA------TTT--AAT--ATAAA--CAT-GAAgttgcctttttttttgtcgtatcg
gi|51                         :                 ttTATAAAATATAAATAAA------T-----CT-AGTCT-------------------A---------------ACTTTGT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-T-ATCACCAAATTAAGAGTATACATTATATGTAACAATATTA------TAGGAGACCTA------TTT-AAAT--AAATA--AAT-AGAA-ct
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----CTTAGAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGGAATGAAAGACAAGCTTTTAGAAT
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taaacTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------CACA----AAATAGTTATCATTTA-----TCTACAAATA--GTTTTGT-T-AAAATGGTGAGAAT-AAAGCCAGTCTTATAGAATtcctctccttaacacaatacaattacacaaacta
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggc-TTGGTTTAAACA-----T-----AGTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGTAATGAAAGACAGGCTTATAGAAtctccta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAAAGGATTGAAATGAActcctctc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTAC-C-AAAAGGA-TGGAATGAAAAACAAGCTTATAGAAtgtttcgatactgtttataga
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTGATTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TAGA----A------TATAACTTA-----TTT----ACA--ATTTTGT-C-ATAATGACTGGGATgtcttc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atTTTAAACA-----T-----ATTTAATTT--CGAA-TACTTGTAGCTTTACC----A------TATTACATA-----TTTAAATATATTATTTT-T-C-AAAAAAATTGGAATAAAACATAAGCTTATttgacgatgtgagctgctataga
gi|6                          :                   TATAAAATATAACTAA-----------TTCTGAGACT------TAATTT-A---TTA---------------GCTTTTT-C-GTA------CG-----GGAAATGAC-AAAA-A-GTCATCAAG------------ATTTTACGCAACA-----A------AAG------TG------TTT-AAAT--AAAAA--TAT-ATAA-C--A----ATAGTGTTTA--------AAT---AA-A---AA-AA---T---A-----T--A-
gi|6                          :                                                                                                                                                               aATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-AAAT--AAAAA--AAT-acaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|6                          :                            atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaATATAACA-----A------TAG------TG------TTT-GAAT--AAAAA--AAAAGAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---AA-GA---T---A-----TGTA-TT-AA-AC------AATAATATTGCCCGTGTGGGATTCGAACCATAGC-GGGAA---A--AAA-----------TCTTGCATGAGT-C-A-ACGTGTTG--A--CACCACTTGACCACGGCCACATA-TGGAT-AAATGT-TT--GT------TATCTT-AATAT--AAAC-------T-----------------TGTTTCTCTTGTAAATAATACCGAAATATAT-TAA-TTGA-TTGAACAGTTT-T-----TTTTTA-TT--CG---TATTT-------Tataacaatagtgtttgaataaaaaaaaagaaataaatttaacttaaaagatatgtattaaacaataatattgcccgtgtgggattcgaaccatagcgggaaaaaatcttgcatgagtcaacgtgttgacaccacttgaccacggccacatatggataaatgtttgttatcttaatataaacttgtttctcttgtaaataataccgaaatatattaattgattgaacagtttttttttattcgtatttttggcgtatcg
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atataaaatataactaattctgagacttaatttattagctttttcgtacgggaaatgacaaaaagtcatcaagattttacgcaacaaaagtgtttaaataaaaatatataacaatagtgtttaaataaaaaaatataacaatagtgtttaaataaaaaa-----T-----GTTTTATTT--CAAA-CATCT-------TACA----C------TATTACATG-----TTTACAAGCA--ACTTTGG-T-AAAGGGATTAGAATGAA----GAGCTTATAGAATtggcgtatcg
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTTTAAACA-----T-----ATTTTAGTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATCACATA-----TTTACAAACA--ACTTTGT-C-AAAAGGATTGAAGTAAAtcctgtt
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA-TATTT-------TACA----A------TATTACATA-----TTTACAAACA--ATTTTGT-C-AAACTGATTGGAATGAAAGACAA--TTATgtgctatta
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaaatgtactatgaGGTGGGATTCAAACCATGGC-GCAAA---ACTAAA----A--A-CATCTTGCATAAGCTC-A-ACGTCTTA--A--C--C
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   c-TTGGTTTAAACA-----T-----ATTTTATTT--CGAA-TATCT-------TACA----A------TATc
gi|7                          :                   TATAAACTATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----T-A---CTA---------------GCTTTT-----------------------AATGAC-AAAA-A-GTCACCAAGTTAAGATTATACATTTTATGTTACA-----G------TGG------TA------TTT-TAAT--AAAAA--AGT-GAAA-T--A----A----ATCTA--------ACT---TA-A---AATGA---G---A-----T--A-TT-GA-A-------AACAAAATTTACCCATTGGGATTCGAACCATGGC-GGAAA---A--AAA-C--ACTA-AATCTTGCATAAGCTC-A-ACGT------------CACTCGGCTATGAAGACATC-TTGAT-AACTGT-TT--AT------TATTTT-TATATTTAAACTACCCGGTAGTCATTC-AAT-----TGTTTTTCTCGTAGATTATTGCGAAATATAT-TCA-TTGGTTTAAACA-----C-----ATTTTTTTTTCCGAA-TATCT-------TATA----A------TATTATATA-----TTTACAAACA--ATT---T-C-TAAAGGATTGGAATGAAAGACCAGCTGATAGAAT
gi|70                         :                    ATAAAATGTAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----
gi|9                          :                   TATAAA-TATAAATAAA------TGAATTCTGAGCCT------T----T-A---CTAAATTAAGCTAGTCTAGTTTTTT-C-CTA------CG-----GGTAATGAC-AAAA-A-GTCACCAAATTAAGATGATACATTTGATGCAACA-----A------TGGAAGCTCTA------ATT-AAAT--AAAGA--AAT-TAAA-T--A----A----ATTTA--------ACT---TA-A---GA-AAT--G---A-----T--A-TT-GA-A-------AATAAAATTCCACAGCTGTGATTCGAACCAAGGC-GGAGA---A--AAA-T--A--A-AATCTTTCATAAGTTC-A-ACGTCTTA--A--CAACACTCTGCCACGGAAACATC-TTGAT-AAATA--TT--GT------TATCTT-TATATTGAAAG-------TAATCATTC-GAT-----TGTTACTCTTGTAAATACTGGCGACATATAA-TAA-TTGA-TTGAACA-----ac
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TTTATAAAAATTGATCGGAATGAAACAAACTTATATTATTCCTATCTTAAATACAATACAATTGCATAACATAATGTTTTATGATGACAAATGTTGATTTCTAGAAAGGTATACATGATAATATTTATTTATAATAAACATTGAATGTAAGGATTTATTAGAATAGAAATGAGTGTTATAAAATGCAATATGTCATATACATATTAGGGGGAACTGTGGACGACATTGGGAAGTAAGGATTTATTAAGACTATAAGAGTGACGATATCAACGATATGTTTTTTCAATGTAAATACATGTATGTTCTGCACTGGAAATGATAATATTTGTATTGATAGAAACAGTTTCGTCTCCAATGAAAAGTATATGAATAGTTATTCGAAGATAGGGTGGTAATATGTCGTGTATTGTTCGTGTAAATAATAATGAATATAATATTTCAGTTATTTAATTACACTATGCTAAGACGAAAGGTATGCTT
Unaligned ( gi|5 ): AAAGATCAAATCTAAAAATATATTAGAATAGAAATTGTTTTTGGATACTATATAATAGAATGTAACATAATCCATATTAGCGGAAAGTTTTGGCGACATTGGGGTGAGAGGATTTATTAACGTTCATGCCAATAAACAGTATATAAATTATGTAACGTTAGAAACGAAATGTATTTTCGATGTTATTATGTATTGCACTGAATATGATTATATTTGTATAGATAGAAAAAAGTTTGTCTCCAAAGAGAAGTAGATGGGTAGTTATTCACAGTGGGATTGTAATGATCTTTCGAGTACTGTTCGTGAGTCGCGATATGAGATGCAATGAAGTAGAACATGTTCTGCGTCCACAGTTTCGCCACACACATACATTGAGAGGCTACACCTATGTTTATCGAGTCTATATTGAGTAATTTAGATTGATC
Unaligned ( gi|8 ): AAACGGTTTTTTATGAAGTTGAACACCAATCGTAAAATATTTTACAGTATTCCTCTGCTGCATACAATATAATTTCACAAAAAATGATAACAAGCGTGGATTTTTAGTATAGTATACAAGATAACAACATACATAATAAACATCAATTGTAAAGATGAATTAGAGAAAACGGAACGGGAAAAAAACATAAATATAATACAATGTCTTGTGTTAAATACATACTGGGGGTGGGGGGGTGGGGGGGTCATTTTTGGGATGGGGAGGTTTTATTAACGTTCATGTTAGGTAAAACGACCTGAGTGACGTAAAAAAAAAACGATGTTTGTTTTCAATGTAATTTTTACCACACAAAATGATAATATTTGTATCTACTGAAAAAGTTTTATCTCAAAAGA
Unaligned ( gi|29 ): TATCAACATTCAGTGACGGTAAAGACGATGTGTATTTTCAATGTAATTATGTTTTTCACTGAAAATAATAAACTTTGTATTGACAGAAATAGTTTCATCCTTAAAGACACGTAGATGTGGTTGAGTTGAAATCATGCTCTCAATCACATATCAAACTGTTTTCACAAGGGTCATGGTTGTCCGACCGTTCATGCCACTGCGAGAGCATTAAGGCCAGCAGATTTACAGAACAAGTTACTGGATAACTTAAA
Unaligned ( gi|32 ): AAATATAATATAAAATTACACAAACTATGATGACAGATGCAGATTTCTAGTTAAGTATACAAGATAACAACATTGATTTTATAGTAAAAATCAGTTGTGAAAATATATTAGAATAGAACATGGATATTATAGAATGCAATATGTAAAATACATATTTGGGGGAGGTATGGGCGACATTGGGATGGGAGGATTTATTAACGTTCATGCCATTTAAAACTACAGGTATATGTGTGACATCTT
Unaligned ( gi|43 ): TTAATTAACATGGAAGAAAACGATAATAATCATTGTAATACCGATATCAACTGACAAGTTTATAATTATATGATTATACACGGNNNNNNNNNNATTAGAATAGAAATGGAAGTTGCGGAAAACATGGGTATTATAGAATGCAATATGTTAAATATATATTCGTGGGAACTGTGGACGACATTTGAAT
Unaligned ( gi|44 ): ATTTTGGCGACATTGCGATGAAAAGATTTATTAACGTTCATACCTGTTCAAAAGATATAAGTGCAATGAGCAATGATCTGAATAGTCAATGCAATTATGTACTGCGCAGAAAATGATAATATTTATATGGATGGAAAATATTTTATCGCCAAAGAGAAGTAGACGGGAAGTGATTCATAAA
Unaligned ( gi|45 ): AATACAATACAATACATAAACTATGATGACAACTGTGAATTTCTAGTACGCAAGATAACAACATTAATTTTATAATAACGATCAAATGGAAGGACATATTATAGTAGAAATGGAAAACATGGCTATTAAATAATGCAATATGTTAAGTACATATTAGGGGGAATTATTGGCAACATTG
Unaligned ( gi|48 ): GGGAGTTGTGGTCGTCCATGCCAGTTAAAACTATATGTGAGACATTAGAAACGATGTAATTATGCACTGCACTGAATATGATAATATTTGTGTCGATAGGATTCGTCTCCAAAGAGAAGATGGTTAGTTATTTGCAGATGGGGTGGTAATGAT
Unaligned ( gi|54 ): TACTACTTTTTGCTGATGCACCATGTAAAACAGAGTACTGACTAAAAAGGAGGAGCAGCATTTACGTATTTTCCAATTTTCGTTACTTGAAAAATAAAATCGACA
Unaligned ( gi|60 ): GCACGAAAGATGATGACAAAATGTGGATTTCTAGTGTAGTATACAAGATAACAACATTTATAACAAAGATGAAAAATAAAAGATAAATTAAA
Unaligned ( gi|63 ): ATGATAAGATTTGATTACTATTATATACATGTTTTAAAAGTATCGCGTAGAATCTTACATTTATAGTAATCACGTGTCTTTT
Unaligned ( gi|65 ): CCGCAGTTCCACCAAAGATCTCAACTTGAGAGGTTTCATCTATATTGATCATTTATATTGATCATTTATATTGATCA
Unaligned ( gi|67 ): TATTTACGTTTTGTATTTATAGACGTGCGATTTAGATCACATCATGTATTTA
Unaligned ( gi|69 ): ATTGATTGAACAGTTGCCATTTTTGTCATATTGG
Unaligned ( gi|71 ): CACACTAAAGTGATCATCGACTGTTCGGATGA