lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111
lowQualScore : 11111 1 1111 1 1 11111 1111 1111 1111 1 1 111 111111111 1111111111111 55555555555555555555555555555 22222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111 11 22222222 111 111111 11 11111 1 111111 22222222222 11 111 11 11111 11111 1 1 1 11 11111 11111 1111 11111111 1111111 11111 22222222222222222222222 22222222222222 2222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 1 2222 44444444 1111 2222 222 11111 4444 3333333333333333333333333 1 444444444444 333333333 11 4444444444 1 3333 33333333333 55555555555555555 111 111 111 111 11 222222 1111 1111 1 2222 1 1 333333 11 1 1 333333 1 1 1 000000 1
lowQualScore : 4 2 66 5 0 7777 5 4 55555 4 6666 0 5 2 6 0 66 4 1 2 0 99999 4 1 1 3 0 44 2222 8 55 1 0 777 1 4 2 6 4 4 777 777 0000 2 9999 8888 0 77777 66 3 0 2 444 3 444444444 3 7777777777777 888888 33333333333333333333333333333 4 8 4 5 8 4 66666666666666666666666666666666666666666666666 99999999999 555 4 4 22 55 8 11111111 777 999999 4 111 111111 4 8 11 00000 1 4 4 88 3 2 2 55 333333 2 33333333333 55 4 3 55 0 6 11 111 4 11 4 00000 44444 1 0 55 1 1 77 4 1 2 77 1 1 33 55555 0 4 4 1 0 2 1 44444 8888 1 4 555 2222 8 0 777 3 2 1 4 55 55555555 5 8888888 5 11111 4 22222222222222222222222 3 66 0 3 66 4 8 33 66 9999 88888888888888 888 1 3 55 6666666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 000 77 5 0 1111 00000000 777 0 2 6 6 8888 1 99 1111 5 7 000 7 22 0 5 22222 0 5 1111 0 55 5 4 3 2 7777777777777777777777777 1 6 555555555555 0 3 55 8 999999999 11 3333333333 8 4 3 9 3 7 4 6 9 9 4 3 1 99 1111 6 4 4 8 8 11111111111 66666666666666666 6 111 111 111 6 111 0 11 333333 11 99 7777 88 3 0 7777 2 3 11 0 2 4 2 7 5555 0 0 1 888888 88 7 7 6 3 6 6 4 888888 7 7 7 2 777777 6 5
lowQualScore : . . .. . . .... . . ..... . .... . . . . . .. . . . . ..... . . . . . .. .... . .. . . ... . . . . . . ... ... .... . .... .... . ..... .. . . . ... . ......... . ............. ...... ............................. . . . . . . ............................................... ........... ... . . .. .. . ........ ... ...... . ... ...... . . .. ..... . . . .. . . . .. ...... . ........... .. . . .. . . .. ... . .. . ..... ..... . . .. . . .. . . . .. . . .. ..... . . . . . . . ..... .... . . ... .... . . ... . . . . .. ........ . ....... . ..... . ....................... . .. . . .. . . .. .. .... .............. ... . . .. ....... ............................................................................................................................................................................................................................................................................. . ... .. . . .... ........ ... . . . . .... . .. .... . . ... . .. . . ..... . . .... . .. . . . . ......................... . . ............ . . .. . ......... .. .......... . . . . . . . . . . . . . .. .... . . . . . ........... ................. . ... ... ... . ... . .. ...... .. .. .... .. . . .... . . .. . . . . . .... . . . ...... .. . . . . . . . ...... . . . . ...... . .
lowQualScore : 0 5 99 0 9 8888 0 5 99999 8 9999 0 0 4 5 1 11 4 3 6 9 22222 4 0 7 6 8 33 5555 3 77 6 5 000 2 0 3 3 0 9 666 000 3333 1 4444 7777 1 99999 55 6 9 3 111 6 555555555 6 1111111111111 888888 66666666666666666666666666666 0 9 0 8 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333 00000000000 333 0 0 11 55 0 11111111 000 444444 0 000 555555 0 6 55 00000 2 4 0 11 0 7 5 22 333333 3 00000000000 55 0 5 55 5 7 00 222 0 55 0 00000 44444 4 0 22 6 2 88 0 4 7 44 2 1 55 22222 7 6 0 2 3 1 2 00000 5555 1 1 888 3333 0 7 888 7 0 0 4 22 55555555 0 6666666 0 99999 2 66666666666666666666666 4 99 2 4 99 2 9 88 11 4444 00000000000000 000 4 5 55 0000000 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 111 99 0 4 6666 55555555 666 2 8 5 0 1111 2 55 2222 0 2 000 4 66 8 0 55555 5 0 7777 1 88 0 7 3 2 0000000000000000000000000 4 2 666666666666 2 2 00 0 000000000 00 2222222222 3 7 5 2 7 8 2 7 3 3 8 3 0 22 2222 7 8 3 0 0 77777777777 99999999999999999 7 777 777 777 0 666 8 00 000000 88 22 0000 88 2 8 0000 5 0 00 0 5 2 2 0 8888 0 0 0 333333 33 3 3 0 3 0 0 7 333333 3 0 0 3 333333 7 0
consensus : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCNAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTG--CGTACAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATCTGTNATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAAAAA-TATTTGGNTG-GTTTTTCATCATCTTC---TATN---ANTT----GNGCACGTGATCT--A--AT-NAA-TAT-ACCCTGCATTTTTGGCTTTC-T---------TATA-TTTCTCAAG-G-----AAT----C-TTTT---A-----------ATGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-AT-TNTG-TGNTAG---TN-----TTGTTC-ATT---TTA---TT------TCAATT-----------TC-ATCTA-TTAAT-TN-CT--TTTC-AACT----CT---T--TC--AT-TT---TCTT------TCTTT-TTAAAACATGAATANGAAATTGATTT-NCCC-----CTAATTTCCATTAATAGNGTTTC-TAAAAATAGTTGGTCATTTATAGTAAACTG-AATT--TCATCATTN---GGT----AT--A-TTTTTTA--TGTTNTC--TTTA--TT-ATATACTGGTA-ATG-----CATACTGAGN--TTTTATTTC-ATTAATTTTN-TC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TT---GCAACAAACTA-TTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTAATA-TTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTT-GAT------GTA-ATTTAG--CA-ATT-GTTNACCGATGATAATAGTGA---TTC---T--GTTACAAGGAAGAAATCNAGCCT--AGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCCTT--CTCCA----TGTATATCGCCTTGT---ATC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCT-T---------N-AA--CT----T--CAAG--T----AATT-----------TA---T-T------ATGT----GAT----GCANTTGTAATTG------T-------T---AA---T---A------T-GT----------ACC--AN-ATTGA-----A---ATC-NC----C------GCA-------GAAA-----ATAA---TTGA----G---GTATTATCGAAGGTATTA-ACTTTTG--AAATA------A-ATTN-----TCAAAAAA-GNTA--GGGCGAGTCACTGATTTGGGCCATATA---TTGANAC--AAGTGTAAACCTGTTATTATCAACAGTTAAATC-N-ATTATCAA----AT-AATTACCCC-CGGGGTCANTTATATGAT-TATGA-----ACTTCA-AAGTCAACA-TTTTTATTAAATAANACTGCTACNCCTCTNGAATT-------NGAAGAAT-AA--GAANNAAATANGCAATCAT--T--T-CCCCGCTGCGATTC-AATATGT---A--ATTTTT--CAGTATNTNTG--GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAAACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TATTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTTTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGAT-AATTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGA--ATAATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGG-AAAAATAGATCCTAATAATGTATAAAAC-TAGAATTTAATTGCAAAATATNACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACT
Reference ( gi|1 ) : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTT--TGTACAACGTT-TAGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATTTGGATG-GTTTTTCATCATTTTC---TATT---ATTT----GAGTATGTGTTCT--A--AT-TAA-TAT-ACCTTGCATTTTTAGCTTTC-T---------TATA-TTTCTTAAG-G-----AAT----C-TTTT---A-----------ATGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-AT-TATG-TGATAG--TTC-----TTGTTC-ATT---TT----TT------TCAATT-----------TC-ACCTA-TTAAT-TC-CT--TTTC-AATT----CT---T--TC--AT-TT---TCTT------TCTTT-TTAAAACATGAATACGAAATTGATTT-CCCC-----CTAATTACCATTAATAGAGTTTT-TAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTG-AATT--TCATCATTT---GTT----AT--A-TTTTTTA--TGTTATC--TTTA--TT-ATATATCGGTA-ATG-----CATACTGAGT--TTTTATGTC-ATTTATCTTT-TC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TT---GCAACAAGCTA-TTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATGATA-TTTAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAACTT-GAT------GTA-ATTTAG--CA-ATT-ACTAACCGATAATAATAGTGA---TTC---T--GTTACAAGGAAGAAATCCAGCCT--AGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCCTT--CTCCA----TGTATATCGCCTTGT---ATC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCT-T---------A-AA--CT----T--CAAG--T----TATT-----------TA---T-T------ATGT----GAT----GCAAT----ATTG------T-------T---AA---T---A------T-GT----------ACC--AC-ATTAA-----A---ATC-AC----G------GCA-------GAAA-----ATAA---TTGA----G---GTATTATTGAAGGTATTA-ACCTGTG--AAATG------AGGTTT-----TCAAAAAA-GGTA--GGGC-AATCACT-ATTTGGGCCATATA---TTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTATCAACATTTAAATC-G-ATTAACAA----AT-AATTTCCGC-CGGGGTCATTTATATGAT-TGTGA-----ACTTTA-AAATCACCATTTTTTATTAAATAGGACTACTACTCCTCTTGAGTT-------TGAAGAAT-AA--GAAGAAAAAATGCATTTAC--T--T-CCCCACTGTGATTC-AATA------A--ACTTTT--CAG-ATATATGA-GTTGAATGAACATCTTGAAGACAATACATATCACAGTTTTTCGACTTTAAGTAATT--GAAAACATCTCTCCG-TTTTTCCACAGAACCAAGACCCT-----------GACAGT-----------------TATTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATTGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGAT-AATTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTA------ATTGTAAAGA--ATAATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAGTAAAGG-AAAAATAGATCCTAATAATATATAAAACTTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTTATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTTATTGGTACACAATCAAGTACTACATGTAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATATTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|7 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTT--TGTACAACGTT-TGGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATTTGGATG-GTTTTTCATCTTCTTC---TATT---ATTT----GAGCATGTGTTCT--A--AT-TAA-TAT-ACCTTGCATTTTTAGCTTTC-T---------TATA-CTTCTTAAG-G-----AAT----C-TTTT---A-----------ATGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-AT-TATG-TGATAG--ATC-----TTGTTC-AAT---TT----TT------TCAATT-----------TC-ACCTA-TTAAT-TC-CT--TTTC-AATT----CT---T--TC--AT-TT---TCTT------TCTTT-TTAAAACATGAATACGAAATTGATTT-CCCC-----CTAATTTCCATTAATAGAGTTTC-TAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTG-AATT--TCATCATTC---GGT----AT--A-TTTTTTA--TGTTATC--TTTA--TT-ATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGT--TTTTATGTC-ATTTATCTTT-TC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TT---GCAACAAGCTG-TTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATGATA-TTCAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAACTT-GAT------GTA-ATTGAG--CA-ATT-ACTAACTGATGATAATAGTGA---TTC---T--GTTACAAGGAAGAAATCCAGCCT--AGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCCTT--CTCCA----TGTATATCGCCTTGT---ATC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGATCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCT-T---------T-AA--CTAA--TAATAAG--T----AATT-----------TA---T-T------ATGT----GAT----GCAAT----ATTG------T-------T---AA---T---A------T-GT-----------CT--ATAATTAA-----A---A
gi|8 : AGAGGATTCCTGCATGCTTTGTTTGGGCACAGTGCAATTTTCAAGTTCAATTT--CATAA-------TC----AAAAT-TCAGGGTGTTTATTTT--TGTACAATGAC-TGGTAAA-A-TTATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATA-TACC-GTTTTCTTTTTCTGTTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAACAACTATGAAACTCAAAGT---TACGGAAA-TATTTGGATG-GTTTTTTATCATCTTC---TATT---ATTT----GAGCATGTGATCT--A--AT-TAA-TAT-A-CTTGCATTTTTAGCTATC-T---------TACA-TTTCTTATG-G-----AAT----C-TTTA---A-----------ATGT--TTC-----TT-ATCGTT-CAATATT-AT-CG-G-TGA---------------------------T----TT------TCAATT-----------TC-ACCTA-TTAAT-TC-CT--TTTC-ATTT----CT---T--AC--GT-TT---TCTT------TCTTT-TTAAAACATGAATATGAAATTGATTT--CCC-----CTAATTTCCATTAATAAAGTTTC-TATAAACAGTTGGTCATTTATGGTAAATTG-AATT--TCATCATTT---GGT----TT--A-TTTGTCA--TGTTAAC--TTTA--TT-ATATTTTGGTA-ATG-----CATACAGAAT--TTTTATGTC-ATTAATCTTT-TT-ATTTATAGCAGTTAAGTAATTTATATC--TT---GCAACAACCTA-TTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTCAAAAGGCCT--AGACACAATA-TTCAAAGAAATCATACTAGAA-----TGATCTGTAACTT-GAT------GTA-ATTTAG--CA-ATT-ATTAATCGATGATTATAGTGA---TTC---T--GTTACAAGGAAGAAATCGAGCCT--AGCTTGTTTTAAAGG-ATTTTTCCTT--CTCCATTCCTGCATGTA-----GT---ATC--CGGATTGAGTTCTCTAAATGTGTCAACTAAAT--TGTT-------TTGATCT-T---------T-TA--TT----T--CAAG--T----AATT-----------TA---T-T------ATGT----GAC----GCAAT----ATTG------T-------T---AA---T---A------T-AT----------caatctagttttggatcttgtaccacattgaaatcaccgcagaaaataattgaggtattattgaaggtattaacctgtgaaatgaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgaaacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccgccggggtcatttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaataggactgctactcctcttgagt
gi|22 : cAGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTT--ttat
gi|2 : acGAGGATTCCAGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTGTCTT--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTT--T-TACAATGTT-TGCTAAA-A-TGATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-GCTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTCAATAACTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAG-TATTTGGATG-GTTTTTCATTATCTTC---TATT---ATTT----GAGCATGTGATCT--A--AT-TAA-TAT-ACCTTGCATTTTTAGCTTTC-T---------TATA-TTTCTTAAA-G-----AAT----C-TTTT---
gi|10 : ATTCTTTATTATCCAGTTAAGGCACAGAACAACCTTTAAGTTCCATTT--C-TATGTTTGTATCTA--AGGAC-GCAATGTCTCTATTTtaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcatttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|5 : TTCTTCATTATTAAGTTTAGGCACAGAACAACCTTCAAGTTTCATTT--C-TATATTTGTATCTA--ACAGT-TCATTGTCTCTATTTG--AATATAAAGTT-TCGTAAA-AATG-TTTGGCTTCATC--TAAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG--ACCGATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---ATTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATTTACTTG-GTTTTTCATCCTCTTC---GATA---AGCT----GTGCTCTTGATCT--A--AT-AAG-TAT-TCCCTGCATTTTTGTTTTCC-T---------TATA-TTT-TCAAG-A-----GAT----T-CTTT------------------T--TTCATATGTA-ACTGTT-CAATGTT-AT-TTTG-CGTTAA----A-----TTGG---ATT---CTAATATA------TCGATT-----------TC-TTCAA-CTAAT-TG-TT--TTTCTAACT-----T---T--TC--AT-TT---TCTT------TCTTT-TTAAAACATGAGTAAGAAATTGATTT-GCCT-----CTAATTTCCATTAATAGTGTTTC-TAAAAATAGTTGATCACTTATTGAAAATTG-AAGT--TGGTCATTG---GGA----AT--A-TCTTTTA--TATTTTCAATTTG-----ATATACTGGTA-GTG-----CATATTGTAA--TTTAACTTC-ATTAATTTTA-CC-TTTTATTGTTTTTAAATAATCTATGTC--TT---TAAGCAAACTA-TTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTAATG-TTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTT-GGA------GTA-A--TAGTACA-ATT-GTTTACAGACGGTATTA--AA---TTT---TCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCT--AGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTT--CTCCA----AGTATA---CCTTTTAAAATT--TGGGTTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTGT-C---------T-AA--TT----T--CTAG--T----AACT-----------TG---T-T------ATGT----GAT----TTAAC----ATTA------T-------T---CA---T---GCACT--T-GT----------A-------ATTAA-----AGTTATCAACTTTAGGGTCTTGCACTAAGTTGAAATCCACACAAAAATTGATTGAG---GTGTTATCAAAGGTATTA-ACTTTTAATAAAAG------AG--TA-----TCAAAAAA-ACTA--GGGC-AGTC-CTGATTTGGACCATATA---AAGAGACTAAAGTG--AATCGATTACTATCAACATTTAAGTC-T-ATAATTAG----GT-AATTACTTT-CCAGGTCATTTATATAAT-TATGC-----ACTTCA-TAGTCAACA-TTTTTATCAAATAATACTGCAACACCTCTAGAATT-------GGAAGAGA-AT--GAAGAAAATAAACA---ACGGT--TGCCCCATTGTGACTC-AATA------A--ACTTTT--CAG-ATGCAATA-GTTGAATGTATATCCTACAGACAATATATATCACATTGTTTTGATTTTATGTAGTT--AAAAACATCCAAACG-CTTTTCAACCGGTCCCAAACCCT-----------GACAGTTAACAGTTAACAGATACTATTTTA-ACT---TCCATAT---TTA---CT-C---TTAA-AGT--AGATTAA---TGCACACAGTG------GAGTC----CAAATCTTA-ATA-AATATATTGAATTGTTTCAACAT----------TTCATGTGACTGC-TGTACTTTCATTTCAAAAAT--ACTGCACAAAAAATCTGAT-gaaatttgatcttgatcgtttataaaagacccatcttctttttcaatttttggaatatttttatttaaacagttatgagattccaaattacaaaaatatttactgtgtttttcatcatcttctataagctgtgcgcttcatctaagtatactctgcatttttgtttttcttatattttcaagagaatcttttttcatatgttattgttcaatgttatttgcttttaattggattctataatatcaatatcttcaattaattgttttctaacttttcatattcgttctttttaaaacatgagtaagatattgatttgcctcttattttcattaatagtgtttctaaaaaaagtttattggaatttgaagtttatcattgggaatatttttttatattttcaatttgataaactggtacatgtagttcatattataatttaacttcattaatttttatcttttattgttgttaaataatctatgtctttaagcaaactattattatgttaccatagtggttttccttttttaagatgtgaaagtaatttttaaaataaccatagagtggtctgaccttaataa
gi|15 : AGTTCATTTTTTC-TAAGTTTATATCTT--CTAGT-TCATGATCTCTACTTGAGTATACAATTTT-CA-TAAA-A-AGCTTTTGT---GTCCATAAATATATCTTTTTTATCAGTTATTATAT--TACC-ATCTGTTATTTCTATTTTGGGG-ATA---ATTTTACTTGTAAAGTTGTGCGACTCAAGGC---AGCAAAAG-TA-TTATATG-TGTTTTCTCCATCTTC---TAT
gi|6 : ctcttcagctgttaattttgatacatttatatcaaaaTT--C-TAAATTAATATCAATTAAATTGTCA---TCTTTACTAG--AGTAAAGATTT-TCATAAG-A-ACATTTTGCTTCGTT--TAAA-ATTTCGTTTTGGTCTGTTATGA--TGCTACC-ATCTGATTTTCCGAATTTAGGTTATC---ATTTTATTTAAAGATTTAAAAGTTTCTTAGT---TACAAAAAGTAGTTTGTTG-GTTTTTCGTCATTTTC---TATT---ATTT----G------TGCTCTTGAGCATATCA-TATGACCTCGCATTTT--GTTTTAAG---------TATA-TCTTTTAAA-----------------TTC---A--------------T--TTT-----TAGATT-TT-CAATATA-ATCTATA-T----------------------------------TT------TCATTT-----------GCGACCT---TATT-TT-CT--TGTT-A--T----CTAATTGGTC--AT-TA---TTTT------TCTTT-TTATTGCATGAATATGAAATTGGCTT-CCCC-----CTTATTTCCATTAATAAAACTTA-GAGGAATAGCTGGTCATCTATAGTGAACTGTAATTGGTTATCGGGG---ATC----AA--A-TTA---A--TGTTTTC--AAGA--TT-TTATACAGGCA-ATG-----AATATTG-GA--TTTAATTTCGAT--ATTTTA-TT-ACCAATGATCTTTAAATGATCTAGATCGGTT---AAAAGAGA--A-TTATTGTGTTTCCATAACAGACGCCCAGGAATGAAATTTGTAAAAGAC-----------ATA-TTAAGAATTACCA---TTGAGTGATCTGACCTATAACTA-GGT------TCA-ATAGAA--CA-TTT-GTTTACTGA--AGCAT-GTAAATTTTC---T--GATAAAAGAAAATAATCAAGCCT--GGCTTGTTGCAACGG-TGTTTTATTC--CTCCA----TGCATATCTTCTT-----AACAATGGATTATTTTCTCTAAA-GGATCAA-TAA-----------------GATT--------------AA--CA----T--CGTGCAT----AATT-----------TA---TCT------AGGT------T----GTAGT----CTTG------T-----------------------------------------ACA--AC-ATTGA-----A---ATC-TC----C------GCA-------GAGA-----ATAT---ATGG----GTTAGTATTATTTATGG-ATCGTGCTTTTG--ACATA------ATATTA-----TTAAAAAATGATG--GTG--AGTCAAT-ATTTGGCCCATATA------AATT--AA---TAAA---GTGATTATCAACTGTTATGTC-T-ATTAT--A----ATGAAGTTCCCCTCAGTGTCAGATAAGTGTT-TATGA-----ATTGTA-AAGTCAAGGTTTTT-ATTAAATAAAACTGTTACCCCTCTTTTATT----------AGAATTAACTGAGCTAAATAGGCAATTAT--TGTTACCCCACTGTGTCTG-AATA------A--ATTTTT--CAGTGTGT-TGT-GCAGAATGTATGTTCTGCAGACAATAAATATGACAATTTTTGGCTTTTAAATAATTAAAAAAACATCTAGTCT-TTTTTCCACAGAACCTAGCCCCTAGCAATTGACAGACAG------------------TATTTTA-AAC---TCCATAC---TTA---aacctgtactctttgtcttggcaaggatggtattctct
gi|4 : ttcttctgtactaagtttaggaatgtcataattaataaatccccgTCGTTATTTG--CATATAA-GTTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTTGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TGCAAAAA-TATTTTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTC---AATA---AATT----GTGCCCGTGATCT--T--AT-AAA-AATGACCCTCCATTTT---CTTT--T---------TGTG-C-----AAG-GTTACAAGTTCTCC-TTTT---A-----------A--------------A-AT-ATT-GAG-ATTGAC-TATAATGCTAGCATTAAAAAATTGTTCTATT---TTA---TT------T--ATT-----------TC-ATGTA-TGATT-TCACA--TTCC-AG------CT---T------AT-TTG--TCTC------TTTTTCTTACAAGAAGAATAAGATATTGTTTT-ACCT-----GTAATTTCCATTAAAAGTGTTTT-TAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTG-TAT-----ATC-TTT---ATT----ACAAA-TATCATAAGTATTGTC--TATG--TT-ATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACA--TTTTATTTC-TTTAATTTTA-TC-ATTAAT--TGTTTAAATAATTTACATCA-TT---G-AGTAGACTA-TTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAA-ATTACATTTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCCGACTTATAGCTG-GCT------TCA-A--TAG--TACATT-------TGAT-----TATTGA---TGCAAGT--G-----AGGAAAAAATCTTATCT--TGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT---TT--CTCCA----TGTA----G---TGG---AT----GGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCT---------A-AAACCTTTTCT--CTAGC-T----TTTC-----------TA---T-T------AT-T----AAT----ACATTTGTAATTA------TAG-----T---AA---TCTAA------T-TTTGGATCTTGAACT--AA-ATTGT-----A---ATC-CC----C------GC---------AAT-----GTCA---T------------TATTATTTACAGTGTT-------TG--AAATACTCATTATATTA-----T-AAAAAA-AACAATGGGCGAGTC-CTGATTTGGGGCATATAAGGTT---AT--TAGTGTCAACCTATTATCATC--CAGTGTAAT----GTCAACAATTATAT-AGTTTCCCT-CAGGGTCAGATATATGTT-TATGG-----ATGACA-AAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTACACCCCTGGAATTGCTTTTCTCAAAACT----------AAATATGCAATCA-----------TGCTGCCATTC-AGTATGT---ATTATTTTTTCCAT-ATTTTTG--GTAAAATAGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAGATCATCAGTACG-TTTTTCTACGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TAtctataa
gi|3 : aaactttccaatgtcatggactctgtattagttaacttatTCGTTATTTG--CATATAA-GCTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTCGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TACAAAAA-TATTTTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTC---AATA---AATT----GTGCCCATGATCT--T--AT-AAA-AATGACCCTCCATTTT---CTTTT-TGCGCAAAGTTACAAGTTCTT-----------------C-TTTT---A-----------A--------------A-AT-ATT-GAG-ATTGAC-TATAATGCTAGCATTAAAAAATTGTTCTATT---TTA---TT------T--ATT-----------TC-ATGTA-TGATT-TCACA--TTCC-AG------CT---T------AT-TTGTCTCTT------TTTTC-TTATAAGAAGAATAAGATATTGTTTT-ACCT-----CTAATTTCCATTAAAAGTGTTTTCTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTG-TAT-----ATC-TTT---ATTACAAAT--A-TCATAAA--TATTGTC--TATG--TT-ATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACA--TTTTATTTC-TTTAATTTTA-TT-ATTAAT--TGTTTAAATAATTTACATCA-TT---G-AGTAGACTA-TTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAA-ATTACATTTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCTGACCTATAGCTG-GCTTCAAAAGTACATTT-----A-ATTCGCTTATTGAT-GCA--AGTG-------------------AGGAA-AAATCTTATCT--TGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT---TT--CTCCA----TGTA---------GT---GGA--CGGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCT---------A-AAACCTTTTCT--CTAGC-T----TTTC-----------TA---T-T------AT-T----AAT----ACATTTGTAATTA------TAGTAATCT---AA---T---T------T-GG----------ATCTTGA-ACTAAACTGTA---ATC-CC----C------GC----------AA-----ATAA---TTAT----G---TCATTATT--ATTTA-TA-GTGTCTG--AAATACTC---A--TTTTATTATAAAAAAA-ATTT--GGGCGAGTC-CTGATTTGGGGCATATAAGGTT---AT--TAGTGTCAACCTATTATCATC--CAGTGTAAT----GTCAACAATTATAT-AGTTTCCCT-CAGGGTCAGATATATGTT-TATGG-----ATGACA-AAATCactgacataatatcaatatctgtcatttatatatattttcttagatagtagtatgaccagatggagagagggaatccatagaaacataacaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgaaaatcaaagcaagccatttaaccatttgctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatataagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaatgttaacac
gi|10 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttatCTCTATT--TGAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG-ACCC-ATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---TTTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATTTAC-TGTGTTTTTCATCATCTTC---TATA---AGCT----G----TGCGCTTC--A--TC-TAAGTAT-ACTCTGCATTTTTGTTTTTC-T---------TATA-TTT-TCAAGAG-----AAT----C-TTTTTTCAT----------ATGT--T----------ATTGTT-CAATGTT-AT-T----TG--------C-----TT-TTA-ATTGGATT----CTATAATATCAATA-----------TC-TTCAA-TTAAT-TG-TT--TTCT-AACT-----T---T--TC--AT-AT---TCGT------TCTTT-TTAAAACATGAGTAAGATATTGATTT-GCCT-----CTTATTTTCATTAATAGTGTTTC-TAAAAAAAG-------TTTATTGGAATTTG-AAGT--TTATCATTG---GGA----AT--ATTTTTTTA--TATTTTCAATTTG-----ATAAACTGGTACATGTAGTTCATATTATAA--TTTAACTTC-ATTAATTTTTATC-TTTTATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TT---TAAGCAAACTA-TTATTATGTTACCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTT--AAGATGT--GAAAGTAATT-TTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCT-TAAtagatccttgctaaacaatattcgtccatccctggaattgcttttcccaaaactaaatatgcaatcatgctgccattcagtatgtattattttttccgtatttttggtaaaatggacatcctgcagacaaaaaatgtgacattttttggaatttaaattgttgaaaacatcagtacgttttttctatggaacctaatccctgacagttaactgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|16 : attctttattatccagttaaggcacagaacaacctttaagttccatttctatgtttgtatctaaggacgcaatgtATTTCTGCA-GTTCTGATCCCACTCTAAAAA--ATGA----CTAAATGACTACCGAAA-TATT-GGATG-TTTTTTCATCGTCTTCAATTATTGCCATTTATTGGAGCATGT-------------TAA-TAC-A--TTGCATTTTTAGTTTTC-T---------TATA-TTT-TCAAT-G-----ACT----A-TTTT---A-----------ATGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAAGATT-AT-TTTG-TCATAG--AGC-----TTGTCC-A-A---TT----TA------TCAATT-----------TC-GTCTA-TTAAT-TA-ATAATTTC-AATT----CT---T--TC--AT-TT---TCTT------TCATT-TTAATTCACGAATATGAAAATGATtaa
gi|9 : TGATCT--A--AT-AAG-TAT-ACCCTGCATTTTTGTTTTTC-T---------TATA-TTT-TCAAGAG-----AAT----C-TTTT---T-----------TCAT--ATG-----TA-ATTGTT-CAATGTT-AT-TTTG-CTTTAA----A-----TTG--A-ATT---CTAAA-TTA-----TCAATA-----------TC-CTCAA-TTAAT-TG-CT--TTTCTAACT-----T---T--TC--AT-TT---TCAT------TCTTT-TTAAAACATGAATGAGAAATTGATTT-GCCT-----TTTATTTCCATTGATAATGTTAC-TAAAAAAAGTTGATCATTTATTGAAAATTG-AAGT--TGATCATTG---GGA----AT--A-TTTTTTA--TATT-----TTCAACTTGATATACTGGTA-GTG-----CATAT--AGTAATTTAACTTC-TTTAATTTTG-TC-TTTAATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TTTAGGTAAC----TA-TTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTAATA-TTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTTTGA-------GTA-AT--AGTACA-TTT-ATAAACAGATGATATTAA--A---TTT---TCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCTCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTTTTCTCCA----TGTAGA---CCAAGT---ATT--TGGGGTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTCT-TTTATTTCTAATAA--CT----T---ATG--T----GATT-----------TAACAT-T------AT-T----CAT----GCACTTGTAATTAAAATAAT-------C---AACTTT---AGGGTCTT-GC----------ATT--AA-GTTGA-----A---ATC-CT----T------GCA-------AAAA-----ATAA---CTGA----G---GTGTTATCAAAGGTATTA-A
gi|2 : ctctTTGT--A--AT-AAA-TGT-ACC--GCTTTCTT---TTTC-T------------A-TTTTT---G-G-----AAT----TATTTT---ACTTCAATAACTATGAGACTC-----TA-A--GTTACAGAAGT-AT-T-TG--GATGG--TTT-----TT---C-ATT---AT----CT------TCTATTATTTGAGCATGTG-ATCTAATTAATATA-CC--TTGC-ATTTTTAGCT---T--TCTTATATT---TCTTAAAGAATCTTT-TTAAAACATGAATATGAAATTGATTT-CACC-----CTAATTTCCATTAATAAAGTTTC-TAAAAACAGTTGGTCATTT-------------------CATCATTT---GGT----AT--A-TTGTTTA--TGTTATC--TTTA--TT-ATATATTGGTA-ATG-----TATACTGAGT--TTTTATGTC-ATTAATCTTT-TC-ATTTATAGTTGTTAAGTAATATGTATC--TT---GCAACAAACTA-TTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--CAACCTAATA-TTCAAAGTAATCA---TAGACTGATCTGATCTGTAACTT-GAT------GTA-ATTGAG--CA-ATT-ATTAACCTATGATAATTGTGA---TTC---T--GTTACAAGGAAGAAATCGAGCCT--AGCTTATTTTAAAGG-GTTTTTCTTT--CTTCA----TGTATATCGCCTAGT---ATC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCT-T---------T-AA--CT----T--CAAG--TAATTTATTATGTAATGCAATA---T-TGTTAATATGTCTATAATTAAAACAAT----CTAG------T-------TTTGAA---T---C------TTGT----------ACC--TT-ATTAA-----A---ATC-GT----C------GCA-------GAAA-----ATAA---TTGA----T---GTATTATTGAAGG-----------------------------TTT-----TCAAAAAA-GGTA--GGGC-AATCACT-ATTTGGGCCATATA---TTGATAC--AAGTGTAAATCTGTTATTATCAACATTTAAATC-G-ATTATCAA----AT-AATTACCAC-CGTGGTCGTTTATATGAT-TGTGA-----ACTTTA-AAATCAACA-TTTTTATTAAA-AGGACTGCTTCTCCTCTTTAGTT-------TGAAGAAT-AA--GAAGAAAAAATGCATTTAG--T--T-tttttaataaaagagtat
gi|17 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatACATGCATATGAACTTGATTTACCTCGTTTTCTCATCAATATTATTTGAAATTC-TAAAAATAATTGGTCATTTGTAACAAACTG-TATA--TCATTATTTTACG-T----AA--A-TTTT-------CCATT--TTTA---T-AGATA-----A-ATA-----CACAAT--AT--CATTAT-----TTTATTTCT-TCGATGTATTATATTTACATATTCAATATT--AT---TCAA-AAGATAGTTATTATGCTCCAATGAACATTTACCG----T----GGTTTAAA--TCATTAAAACATA--A-TTTAAgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|21 : GG-GTTTTTCCTT--CTCCA----TGTATATCGCCTTGT---ATC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCT-T---------T-AA--CT----T--CAAG--T----AATT-----------TA---T-T------ATGT----GAT----GCAgaa
gi|20 : GGATGGTATTCTCTAAAGGGGTCAATAAGATTATGTG-------TTGATTT-T---------A-
gi|7 : tctttgtcttggcaa------T-GT----------ACC--AC-ATTGA-----A---ATC-AC----C------GCA-------GAAA-----ATAA---TTGA----G---GTATTATTGAAGGTATTA-ACCTGTG--AAATG------AGGTTT-----TCAAAAAA-GGTA--GGGC-AATCACT-ATTTGGGCCATATA---TTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTATCAACATTTAAATC-G-ATTATCAA----AT-AATTACCGC-CGGGGTCATTTATATGAT-TGTGA-----ACTTTA-AAATCAACA-TTTTTATTAAATAGGACTGCTACTCCTCTTGAGTtttctaatagctgttcacgggcatttttattatttatatgtttgtaattatagtatatcta
gi|18 : agaggattcctggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttctaaatttgtatctaaaagttcagggtctttatttttgtacaacgtttggtaaaatgattttgcttcgtctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccattttctttttctatttttggaattattttacttgaataactatgagactctaagttgcagaaatatttggatggtttttcatcttcttctattatttgagcatgtgttctaattaatataccttgcatttttagctttcttatacttcttaaggaatcttttaatgtttctaatcgttcaatattattatgtgatagatcttgttcaattttttcaatttcacctattaattccttttcaattctttcattttctttctttttaaaacatgaatacgaaattgatttccccctaatttccattaatagagtttctaaaaacagttggtcatttatagtaaattgaatttcatcattcggtatattttttatgttatctttattatatattggtaatgcatactgagtttttatgtcatttatcttttcatttatagtatttaagtaatttatatcttgcaacaagctgttgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtaaacatgatattcaaagtaatcatagaatgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattactaactgatgataatagtgattctgttacaaggaagaaatccagcctagcttgttttaaagggtttttccttctccatgtatatcgccttgtatccggattgaattctctaaatggatcaactaaattgtattgatctttaactaataataagtaatttattatgtgatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttggatctAAAAAA-ACTA--GGGC-AGTC-CTGATCTGGACCATATA---AAGAGAC--TAATGTAAGTCGATTACTATCAACAGTTAAGTC-T-ATAATTGA----GC-AATTACCTT-CAGGGTCATTTATATAAG-TATGA-----ACTTCA-TAGTCAACA-TTTTTATTAAATA
gi|14 : tagtatGGCGAATCATT-ATTGGGACCATAAA---GGGCTAC--AAATGTAAACCTGTTATTATCTACAGTTAAATCTGCAATGATAA----A---ATTACC---C----TCACT-ATCCGAAATGTGACATGTATTTTATAGGCTACG--TTCTTGCCAAATAATAAAACAACCCCAAGGGATTT-------GGAAGTAC-CA--GAACTAAACAAGCAGTCAT--T--T-CCCAA-TGGAGTACGAATA------A--ACTGTT--CAG--TAGGTGGTGTAGAGTGAATGTCCTG--------ACAT-------TTTTTGGCTTTTAGATAGTT--AAGTAAATCAATTCT-TTTCTCTGCTGAACCAAGACCTT-----------GGCAAT-----------------TAACTGACAATATCTTTATATCTGTCATTTATTC--TTTGATTATAAAAATTAACCTCACAGATACAGCTTCTAGAATCAATGAAAA----ATATTAAATGCAAT-AAGAA----AATAata
gi|3 : cCTGCCATTC-AGTATGTATTA--TTTTTT--CCGTATTTTTG--GTAAAATGGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGAATTTAAATTGTT--GAAAACATCAGTACGTTTTTTCTATGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA
gi|2 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttattcgttatttgcatataagctatcataaacatgtttagcttgttttaaaatatcttctcgttttgtaatcatgctatcaacagcatttctaatttgggtataattttacttgtgaagttatgatgttctaggttacaaaaatattttgtaggtttttctccttcaataaattgtgcccatgatcttataaaaatgaccctccattttctttttgcgcaaagttacaagttcttcttttaaaatattgagattgactataatgctagcattaaaaaattgttctattttatttatttcatgtatgatttcacattccagcttatttgtctcttttttcttataagaagaataagatattgttttacctctaatttccattaaaagtgttttctaaaaatagttggtcattaatagtaaactgtatatctttattacaaatatcataaatattgtctatgttataaataggtacagcatactgacattttatttctttaattttattattaattgtttaaataatttacatcattgagtagactattatttagcttccatagaggtttacctttaataaattggttaaaattacattttaatatgataactgagtggtctgacctatagctggcttcaaaagtacatttaattcgcttattgatgcaagtgaggaaaaatcttatcttgcttgctgtaggggtgttttttctccatgtagtggacgggtaatattctctgtaagggtcgactagattgtaaatggatttgatttctaaaaccttttctctagcttttctattattaatacatttgtaattatagtaatctaatttggatcttgaactaaactgtaatccccgcaaataattatgtcattattatttatagtgtctgaaatactcattttattataaaaaaaatttgggcgagtcctgatttggggcatataaggttattagtgtcaacctattatcatccagtgtaatgtcaacaattatatagtttccctcagggtcagatatatgtttatggatgacaaaatctagatccttgctaaacaatattcgtccatccctggaattgcttttcccaaaactaaatatgcaatcatgA-GTTGAATGAACATCTTGCAGACAATATATATCACAGTTTTTCGACTTTGAATAATT--GAAAACATCTCGTAG-TTTTTATACAGAACTAAGTCCCT-----------GACAATTAACTGATAA-------TATTTTA-AGT---TCCGTAT---TCA---ATATAGATTAATTGT--GAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATT--AAA----A-ATAGAATATAATG-AAAA----AATATGAAAACAATATTCGCCTAAA-ACGTGCACTTTCATCG-------AAAATGCAC-AAAACTCTGATAAATTATAAAAGCCATTGTTGCTCATATTCAGTGTTTTGGAATTACAATTTAACCATTTGAATTAAGGAGCTA------TTTTTGAAGAATATAATTCTGAGCATT-T-TTTTACTATTACAAAATATATGTAATAATGGAAAAAATATAATCTAATAATGTATAAAAC------TTTACATGCAAAATATCACTTGCTGTCATAATATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATAAAAATGTTTACTTTTATCTATA---TGTATCTAATGTTGAGAAAACATAATAAAACATACATGATATTCTCTGTGTTGAGCTTATAACTATTAAATGATACACAATCAAGTACT---T---AATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATTTACCATAATTTCTAAGTG-TTAAATAATCCATAactgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|11 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccgctttctttttctatttttggaattattttacttcaataactatgagactctaagttacagaagtatttggatggtttttcattatcttctattatttgagcatgtgatctaattaatataccttgcatttttagctttcttatatttcttaaagaatctttttaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcattt-----------------TATTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGAT-AATTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTACCCGTAATTGTAAAGA--ATAATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTTATAAAGG-AAAAATAGATCCTAATAATGTATAAAACTTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTGTATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACTactt
gi|12 : -----------------TATTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A--TAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCAATTGAA-GCGTGCACTGTCATCGTAAATG--AAATGCAC-AAAACTCTGAT-AATTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGGATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGA--ATAATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGG-AAAAATAGATCCTAATAATGTATAAAACATAGAATTTAATTTCAAAATATATCTTACTGTCATATTATTTATTTATCATATATGTAGCTTACATGTGCAAAAATGGATTTAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATATTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAGTC---TAC------TAAATATTCGACTTACAAACAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTCCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACTagacagacagacag
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TAATTAAACTTTGAATCAAGCACAAGATTAAAATCGCCACCTGTCATATATGTATCATTACCTATATCATTTATAATCTTAACACATATTTTCAAAAAATAAAAAGGATGAAAAGATTTGGGTCCATATACTGTAAGAAGTGTAAATTGTTTTGATTCTGCTGTCATGTCAAGTGTCATGAAATTACCTTCCTTATATTCATTATGCACCTTGCACTCAAAGTTTTTACTGAATAATATTGCAACGCCTCATGCATTAGATTTGATAAAATTAAAAATAGCAGTCACCGTTCTATTGAGCGTAAATAAACTTGTTTTGTGACTCAGTAAAATGTGTTTATGACATTTTTTATCTTGTAAATATCGAAAGACGTCTACTCTCTTTTGGTTGCCATTTAGGCCTAGGCAATTCAGGGATAGAATCTTGATATTAATGTCTATCAC
Unaligned ( gi|19 ): CGCTTTTTTATTCTTACACACAAGTAGTTTAATTTAAATTTTATTTCAAGCCAAAATAAGCTATACTGGTTTTATTGAGCGTGCATGCTTCATGATTTTTGCTTTAAACACTCTGAATAGCCTCAGAATCTTTTTACAGCTTTTAT
Unaligned ( gi|23 ): TGTTTAGATTTTATGTAGTTAAAAACATCCAAACACTTTTCAACCGATT
Unaligned ( gi|24 ): AGACCTGATTTGGACCATATAAAGAGACTAAAG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1 111 1 1111111 44444444444444444444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11 111111 111111 11 11 11 11111 111111 11 11111 11 111111 2222222 222222222222222222222222222 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 4444444444 1111111 1111 1111 2222222222222222 22222222 444444444 222222222 22222222222 33333333333333333333333333333 111 111 111 111111 2222222 1111 11 1 222222 11 1 2222 222222 1 222222
lowQualScore : 1 1 66 4 66 4 2 66 66 66 4 1 8 4 0 1 55 4 0 1 44444 4 0 2 3 7777 1 0 0 666 3 3 111 3 5 5 666 7777 1 7777 1 2 44 2 0 2 222 2 2 1 5555555 3 88888 7777 3 22222222222222222222222222222222 3 7 3 4 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 55 0 3 000000 88 3 55 7 33 55 3 000000 1 4 3 2 3 1 444444 1 1 1 1 2 22 55 1 5 666 3 0 0 2 55 8 44 3 99999 0 999 2 2 3 7777 3 1 3 0 1 44 22 00 0 22222 7777 0 2 55 88 7 3 777 4 222222 4 888 88 4 1 2 22222 9999 22 44 1 66 1 8 11 55 8888 555555 11 9999999 0 2 55 3333333 1 4 555555555555555555555555555 666 3 3 1 11111111111111 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 33 888 99 0 5555555555 0 1 4 4 0000000000 1 1111111 8 8 5555 4 4444 22 666 11 2 4 6 8 8 1 4 3 2 55 1 33 5 22 4 1 1 0 4 1 1 1 5 6666666666666666 22 2 66 88888888 0 1 33 5 77 444444444 1 55 1 000000000 0 1 00 555 0 1 0 66 4 2222 44 1 5 1 1 77777777777 22222222222222222222222222222 5 000 000 000 3 7 99 999999 3333333 1 4444 0 8 1 3 1 33 8 0 888888 33 3 3 0 4444 1 888888 3 0 888888 2 0 0
lowQualScore : . . .. . .. . . .. .. .. . . . . . . .. . . . ..... . . . . .... . . . ... . . ... . . . ... .... . .... . . .. . . . ... . . . ....... . ..... .... . ................................ . . . . . .................................................... . .. . . ...... .. . .. . .. .. . ...... . . . . . . ...... . . . . . .. .. . . ... . . . . .. . .. . ..... . ... . . . .... . . . . . .. .. .. . ..... .... . . .. .. . . ... . ...... . ... .. . . . ..... .... .. .. . .. . . .. .. .... ...... .. ....... . . .. ....... . . ........................... ... . . . .............. . ......................................................................................... . . . .. ... .. . .......... . . . . .......... . ....... . . .... . .... .. ... .. . . . . . . . . . .. . .. . .. . . . . . . . . . ................ .. . .. ........ . . .. . .. ......... . .. . ......... . . .. ... . . . .. . .... .. . . . . ........... ............................. . ... ... ... . . .. ...... ....... . .... . . . . . .. . . ...... .. . . . .... . ...... . . ...... . . .
lowQualScore : 0 0 11 4 11 4 9 33 11 44 4 1 9 4 0 0 55 0 3 0 55555 0 6 3 6 4444 0 9 5 444 6 6 333 6 7 8 444 4444 0 7777 0 5 66 2 0 9 888 5 2 6 5555555 3 33333 1111 3 33333333333333333333333333333333 6 2 6 5 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 00 3 6 555555 33 6 00 3 99 00 6 555555 0 5 6 5 6 0 111111 2 6 5 0 6 44 00 0 0 444 6 3 6 3 00 8 99 6 11111 4 666 6 1 6 7777 6 0 6 5 0 88 33 22 3 77777 7777 2 8 00 55 3 6 000 4 888888 4 222 33 4 0 7 00000 7777 22 00 0 11 0 0 55 55 5555 222222 88 2222222 5 4 00 6666666 2 5 555555555555555555555555555 444 6 6 2 44444444444444 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 0 0 55 888 66 2 0000000000 7 9 4 4 2222222222 0 0000000 2 2 8888 0 2222 22 222 44 1 0 0 0 0 0 0 9 9 55 2 55 5 44 0 4 2 5 0 0 0 0 9 6666666666666666 00 6 00 33333333 7 7 44 7 99 333333333 3 11 0 888888888 8 0 44 000 2 9 9 11 4 7777 66 2 4 0 0 11111111111 66666666666666666666666666666 7 000 000 000 5 3 22 222222 2222222 0 2222 6 0 8 8 0 88 0 0 888888 88 2 2 0 2222 0 888888 2 5 888888 5 7 7
consensus : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTC---TATN---ATTT----GNGCNCGTGATCT--AATNAATAT-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T----C-TTTT---A-----------A---CGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TT--AT--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC--TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--C-NA--------G--TAATTT---AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATA--NNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAA--TTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA--AGNAT----AA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-A--GTA--TA--A-CTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
Reference ( family-2881 ) : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCNAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATCTGTNATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAAAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTC---TATN---ANTT----GNGCACGTGATCT--AATNAATAT-ACCCTGCATTTTTGGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T----C-TTTT---A-----------A---TGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TT--AT--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAATAGTTGGTCATTTATAGTAAACTGAATTTCATCA--TTNGGTAT---A-TTTTTTATGTTNTC--TTTATTATATACTGGTA-ATG-----CATACTGAGNTTTTATTTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAACAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCNAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTNAA---CT----T--C-AA--------G--TAATTT---AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCNCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATA--TTGANAC--AAGTGTAAACCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-ATCNATTATCAAATAA--TTACCCCCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTCAAAGTCAACA-TTTTTATTAAATAANACTGCTACNCCTCTNGAATTNGA--AGAAT----AA--GAANNAAATA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-A--ATATGTA--A-TTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTTTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATNACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACT
gi|1 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TAGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCATTTTC---TATT---ATTT----GAGTATGTGTTCT--AATTAATAT-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAG-G-----A-A-----T----C-TTTT---A-----------A---TGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGTTCTT--------G--TT-C-ATT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTAC-CATTAATAGAGTTT------TTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGTTAT---A-TTTTTTATGTTATC--TTTATTATATATCGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTTAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ACTAACCGATA-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTAAA---CT----T--C-AA--------G--TTATTT---AT-TATGTGAT--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCACATTAAAATCACGGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AATGA---G----G-TTTTCAAAAAA--GGTA-GGGC-AATCACT-ATTTGGG-CCATATA--TTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTAACAAATAA--TTTCCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCACCATTTTTTATTAAATAGGACTACTACTCCTCTTGAGTTTGA--AGAAT----AA--GAAGAAAAAA-TGCATTTACT-T--CCCCACTGTGATTC-A--ATA---A--A-CTTTTCAG-ATAT-ATGA----GTTGAATGAACATCTTGAAGACAATACATATCACAGTTTTTCGACTTTAAGTAATT--GAAA-ACATCTCTCCG-TTTTTCCACAGAACCAAGACCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATTGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAGTAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATATATAAAACTT-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTTATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTTATTGGTACACAATCAAGTACTACATGTAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATATTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|10 : ATTCTTTATTATCCAGTTAAGGCACAGAACAACCTTTAAGTTCCATTT--C-TATGTTTGTATCTA--AGGAC-GCAATGTCTCTATTTG
gi|10 : CTCTATT--TGAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG-ACCC-ATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---TTTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TA-CTGTGTTTTTCATCATCTTC---TATA---AGCT----GTGCGCTTCATCT--A---AGTAT-ACTCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T----C-TTTTTTCAT----------A---TGT--T----------ATTGTT-CAATGTT-ATT----TGCT---TTTA--------A--TTGG-ATT--------CT--ATAATATCA--ATATCTTCAA-TTAAT------TG-T-T--TTCT-AACT--TT--TCAT-ATTCGT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGATATTGATTTGCCTC-TTATTTT-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAAAAG-------TTTATTGGAATTTGAAGTTTATCA--TTGGGAAT---ATTTTTTTATATTTTCAATTTG--ATAAACTGGTACATGTAGTTCATATTATAATTTAACTTC-ATTA----ATTTTTATC-TTTTATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTACCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTT--AAGATGT--GAAAGTA-ATTTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTaaatttgatcttgatcgtttataaaagacccatcttctttttcaatttttggaatatttttatttaaacagttatgagattccaaattacaaaaatatttactgtgtttttcatcatcttctataagctgtgcgcttcatctaagtatactctgcatttttgtttttcttatattttcaagagaatcttttttcatatgttattgttcaatgttatttgcttttaattggattctataatatcaatatcttcaattaattgttttctaacttttcatattcgttctttttaaaacatgagtaagatattgatttgcctcttattttcattaatagtgtttctaaaaaaagtttattggaatttgaagtttatcattgggaatatttttttatattttcaatttgataaactggtacatgtagttcatattataatttaacttcattaatttttatcttttattgttgttaaataatctatgtctttaagcaaactattattatgttaccatagtggttttccttttttaagatgtgaaagtaatttttaaaataaccatagagtggtctgaccttaataa
gi|11 : attctttattatccagttaaggcacagaacaacctttaagttccatttctatgtttgtatctaaggacgcaatgt-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTACCCGTAATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTTATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-TTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTGTATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACTtaataa
gi|12 : -----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A--TAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCAATTGAA-GCGTGCACTGTCATCGTAAATG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGGATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAACAT-AGAATTTAATTTCAAAATATATCTTACTGTCATATTATTTATTTATCATATATGTAGCTTACATGTGCAAAAATGGATTTAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATATTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAGTC---TAC------TAAATATTCGACTTACAAACAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTCCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACTagacagacagacag
gi|13 : ---TA-A-TCTTAA-CAC-A---T----A-TTTTCAAAAAATAAAAA-GGATGA---AAAGATTTGGGTCCATATA--CTGTAAG--AAGTGTAAAT-TGTTTTGATTCTGCTGT-CAT-GTCAAGTGTCATGAAA--TTACCTTC-------CTTATATTCATTATGCACCTTGCACTCAAAG-TTTTTACTGAATAATATTGCAACGCCTCATGCATTAGATTTG-AT----AA---AATTAAAAATAGCAGTCA--------CCGTT-CTATTG-AGCGTAAATA--A-ACTT---GT-TTT-GTGACTCAGTAAAATGT--GTT--------------TATGACATTTTTTATCTTGTAAATA-TC--GAAAGACGTCTACTCT-CTTTTaccaggcaggca
gi|14 : taattaaactttgaatcaagcacaagattaaaatcgccacctgtcatatatgtatcattacctatatcatttaGGCGAATCATT-ATTGGGA-CCATAAA--GGGCTAC--AAATGTAAACCTGTTATTAT-CTACAGT-TAA-ATCTGCAATGATAAAA--TTACCCTCACTATCCGAAATGTG-AC-ATGTATTTTATAGGCTACG-TTCTTGCCAAATAATAAAACAACCCCAAGGGATTTGGA--AGTAC----CA--GAACTAAACA-AGCAGTCATT-T--CCCAA-TGGAGTACGA--ATA---A--A-CTGTTCAGTAGGT-GGT-----GTAGAGTGAATGTCC---------------TGACATTTTTTGGCTTTTAGATAGTT--AAGT-AAATCAATTCT-TTTCTCTGCTGAACCAAGACCTT-----------GGCAAT-----------------TA----------ACTGACAATATCTTTATATCTGTCATTTATTC--TTTGATTATAAAAATTAACCTCACAGATACAGCTTCTAGAATCAATGAAAA----ATATTAAATGCAAT-AAGAA----AATAggttgccatttaggcctaggcaattcagggatagaatcttgatattaatgtctatcac
gi|15 : cAGTTCATTTTTTC-TAAGTTTATATCTT--CTAGT-TCATGATCTCTACTTGAGTATACAAT-TT-TCATAAA-A-AGCTTTTGT---GTCCATAAATATATCTTTTTTATCAGTTATTATAT--TACC-ATCTGTTATTTCTATTTTGGGG-ATA---ATTTTACTTGTAAAGTTGTGCGACTCAAGGC---AGCAAAAG-TATTATATGTG-TTTTCTC--CATCTTC---TATA---ACCT----GTAC
gi|16 : ctcttcagctgttaattttgatacatttatatcaaaaATTTCTGCA-GTTCTGATCCCACTCTAAAAA--ATGA----CTAAATGACTACCGAAA-TATT--GGATG-TTTTTTCATCGTCTTCAATTATTGCCATTTATTGGAGCATGT----T--AATACAT-------TGCATTTTTAGTTTTCTTATATTT-TCAAT-G-----A-C-----T----A-TTTT---A-----------A---TGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAAGATT-ATTTTG-TCATAGAGCTT--------G--TC-C-AAT--------TT--A-----TCA--ATTTCGTCTA-TTAAT------TA-A-TAATTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCATTTTAATTCACGAATATGAAAATGATtctttgtcttggcaaggatggtattctct
gi|17 : ACATGCATATGAACTTGATTTACCTCGT--TTTCTCATCAATATTATTTGAAATTCTAAAAATAATTGGTCATTTGTAACAAACTGTATATCATTATTTTACGTAA---A-TTTTCCA-----TT--TTTA-TAGATA-----A-ATA-----CACA----------ATATC-ATTATTTTA-TTTCTTCGATGTATTATATTTACATATTCAATATT--ATTCAAAAGATAGTTATTATGCTCCAATGAACATTTACCG----T----GGTTTAAA--TCATTAAAACATA---ATTTAAGA
gi|18 : AAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATCTGGA-CCATATA--AAGAGAC--TAATGTAAGTCGATTACTAT-CAACAGT-TAA-GTCTATAATTGAGCAA--TTACCTTCAGGGTCATTTATATA-AGTATGAACTTCATAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATAa
gi|2 : tagtatGAGGATTCCAGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTGTCTT--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTT-TA--CAATGTT-TGCTAAA-A-TGATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-GCTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTCAATAACTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAG-TATT-TGGATG-GTTTTTCATTATCTTC---TATT---ATTT----GAGCATGTGATCT--AATTAATAT-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAA-G-----A-A-----T----C-TTTT---
gi|2 : TGATTTGTAATAAATGT-ACC--GCTTTCTT---TTTCT---ATTTTT---G-G-----A-A-----T----TATTTT---ACTTCAATAACTA---TGAGACTC-----TA-A--GTTACAGAAGT-ATT-TG--GATGG-TTTT------------T-C-ATTATCTTCTATT--AT--T-TGAGCATGTGATCTAATTAATATACCTTG-CAT--TTTT-AGCTT-TC--TTATATTTCTTAAAGAATCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTTCACCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTT----------------CATCA--TTTGGTAT---A-TTGTTTATGTTATC--TTTATTATATATTGGTA-ATG-----TATACTGAGTTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTC-ATTTATAGTTGTTAAGTAATATGTATC--TTGCAACAAACTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--CAACCTA-ATATTCAAAGTAATCA---TAGACTGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ATTAACCTATG-ATAATTGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTATTTTAAAGG-GTTTTTCT--TTCTTCA----TGTATATCGCCTAGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--C-AA--------G--TAATTT---AT-TATGTAAT--------------GCAATATTGTTAATATGTCTAT-AAT-TAAAACAATCTAGT-------TTTGA---A-------T---C-----------TTGT----------ACCTTATTAAAATCGTCGCAGAAAATAATTGAT---GTATTATTGAAGGT---------------------------------TTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATA--TTGATAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAA--TTACCACCGTGGTCGTTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAA-AGGACTGCTTCTCCTCTTTAGTTTGA--AGAAT----AA--GAAGAAAAAA-TGCAtaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcatttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|2 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatctT-TTA-----GTTGAATGAACATCTTGCAGACAATATATATCACAGTTTTTCGACTTTGAATAATT--GAAA-ACATCTCGTAG-TTTTTATACAGAACTAAGTCCCT-----------GACAAT-----------------TAACTGATAATATTTTA-AGT---TCCGTAT---TCA---ATATAGATTAATTGT--GAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA-------TAGAATATAATGAAAAA----A-TATGAAAACAATATTCGCCTAAA-ACGTGCACTTTCATCG-------AAAATGCAC-AAAACTCTGATAAATTATAAAAGCCATTGTTGCTCATATTCAGTGTTTTGGAATTACAATTTAACCATTTGAATTAAGGAGCTA------TTTTTGAAGAATATAATTCTGAGCATT-T-TTTTACTATTACAAAATATATGTAATAATGGAAAAAATATAATCTAATAATGTATAAAAC-T------TTACATGCAAAATATCACTTGCTGTCATAATATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATAAAAATGTTTACTTTTATCTATAT---GTATCTAATGTTGAGAAAACATAATAAAACATACATGATATTCTCTGTGTTGAGCTTATAACTATTAAATGATACACAATCAAGTAC------TTAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATTTACCATAATTTCTAAGTG-TTAAATAATCCATAACTTtttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|20 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccgctttctttttctatttttggaattattttacttcaataactatgagactctaagttacagaagtatttggatggtttttcattatcttctattatttgagcatgtgatctaattaatataccttgcatttttagctttcttatatttcttaaagaatctttttaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcaGGATGGTATTCTCTAAAGGGGTCAATAAGATTATGTG-------TTGATTTT--A---TT----T--C-TA--------A--TAGCTG---TT-CACG-G----------------GCATT--------------TTT--AT-T-----------AT-------T---T---A-------T---A-----------T-GT----------
gi|21 : tctttgtcttggcaaGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--C-AA--------G--TAATTT---AT-TATGTGAT--------------GCAttgtaattatagtatatcta
gi|22 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTT
gi|23 : acTTTAGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACA-CTTTTCAACCGAt
gi|3 : tgTCGTTATTTGCATA--TAAGCTA-TCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTCGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TACAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTC---AATA---AATT----GTGCCCATGATCT--TATAAAAATGACCCTCCATTTT---CTTT------TTGCGCAAA-GTTAC-A-AGTTCTT----C-TTTT---A-----------A-----------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TT--AT--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------TTTTCTTATAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTC-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTTT-----CTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAATATTGTC--TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATT-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCTGACCTATAGC-TGGCTTCAAAAGTACATTT-----AATTCGCTTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAA-AAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA---------GTG---GA--CGGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--C-TA--------GC-TTTTCT---AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTGGATCTTGA-ACTAAACTGTAATCCCCGC---AAATAATTATG---TCATTAT------TATTTATA-GTGTCTGA-AAT-ACTCATTTTA-TTATAAAAAAA--ATTT-GGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATA--AGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAG--TTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTCCATCCCTGGAATT------GCTTTTCCCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-A--GTATGTATTATTTTTTCCGTATTT-TTG-----GTAAAATGGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGAATTTAAATTGTT--GAAA-ACATCAGTACGTTTTTTCTATGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------tt
gi|4 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttatTCGTTATTTGCATA--TAA-GTTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTTGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TGCAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTC---AATA---AATT----GTGCCCGTGATCT--TATAAAAATGACCCTCCATTTT---CTTT-TTGTG-----CAAG-GTTACAA-G-----TTCTCC-TTTT---A-----------A-----------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TT--AT--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------T-TTCTTACAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTG-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTT------TTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAGTATTGTC--TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATC-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCCGACTTATAGC-TGGCT------TCA-A--TAGTACATTT-GATTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAAAAAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA----G---TGGA---T----GGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--C-TA--------GC-TTTTCT---AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTTGGATCTTGAACTAAATTGTAATCCCCGC--AATGTCAT--------TATTATTTACAGTG----------TTTGA-AAT-ACTCATTATA-TTATAAAAAAA--ACAATGGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATA--AGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAG--TTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTACACCCCTGGAATTGCT--TTTCT----CA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-A--GTATGTATTATTTTTTCCATATTT-TTG-----GTAAAATAGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAGA-TCATCAGTACG-TTTTTCTACGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------actgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|5 : aaactttccaatgtcatggactctgtattagttaacttatTTCTTCATTATTAAGTTTAGGCACAGAACAACCTTCAAGTTTCATTT--C-TATATTTGTATCTA--ACAGT-TCATTGTCTCTATTTGAATA--TAAAGTT-TCGTAAA-AATG-TTTGGCTTCATC--TAAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG--ACCGATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---ATTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TACTTG-GTTTTTCATCCTCTTC---GATA---AGCT----GTGCTCTTGATCT--AATAAGTAT-TCCCTGCATTTTTGTTTTCCTTATATTT-TCAAG-A-----G-A-----T----T-CTTT---------------------T--TTCATATGTA-ACTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CGTTAA--ATT--------GGATT-C--TA--------AT--AT--A-TCG--ATTTCTTCAA-CTAAT------TG-T-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGAAATTGATTTGCCTC-TAATTTC-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAATAGTTGATCACTTATTGAAAATTGAAGTTGGTCA--TTGGGAAT---A-TCTTTTATATTTTCAATTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATTGTAATTTAACTTC-ATTA----A-TTTTACC-TTTTATTGTTTTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATGTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGGA------GTA-AT--AGTACAATT-GTTTACAGACG-GTATTAA--A---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAG--TCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTC--TTCTCCA----AGTATA---CCTTTTAAAATT--TGGGTTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTGTCTAA---TT----T--C-TA--------G--TAACTT---GT-TATGTGATTTAACATTATTCATGCACT--------------TGT-AAT-TAAA--------GT-------T---ATCAACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ACTAAGTTGAAATCCACACAAAAATTGATTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ACTTTTAATAAA-A---G----A-GTATCAAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATTTGGA-CCATATA--AAGAGACTAAAGTG--AATCGATTACTAT-CAACATT-TAA-GTCTATAATTAGGTAA--TTACTTTCCAGGTCATTTATATA-ATTATGCACTTCATAGTCAACA-TTTTTATCAAATAATACTGCAACACCTCTAGAATTGGA--AGAGA----AT--GAAGAAAATA-AACAACGGTT-G--CCCCATTGTGACTC-A--ATA---A--A-CTTTTCAG-ATGCAATA-----GTTGAATGTATATCCTACAGACAATATATATCACATTGTTTTGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACG-CTTTTCAACCGGTCCCAAACCCT-----------GACAGTTAACAGTTAACAGATACTA----------TTTTA-ACT---TCCATAT---TTA---CT-C---TTAA-AGT--AGATTAA---TGCACACAGTG------GAGTC----CAAATCTTA-ATA-AATATATTGAATTGTTTCAACAT----------TTCATGTGACTGC-TGTACTTTCATTTCAAAAAT--ACTGCACAAAAAATCTGATactgacataatatcaatatctgtcatttatatatattttcttagatagtagtatgaccagatggagagagggaatccatagaaacataacaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgaaaatcaaagcaagccatttaaccatttgctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatataagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaatgttaacac
gi|6 : TT--C-TAAATTAATATCAATTAAATTGTCA---TCTTTACTAGAGTA--AAGATTT-TCATAAG-A-ACATTTTGCTTCGTT--TAAA-ATTTCGTTTTGGTCTGTTATGA--TGCTACC-ATCTGATTTTCCGAATTTAGGTTATC---ATTTTATTTAAAGATTTAAAAGTTTCTTAGT---TACAAAAAGTAGT-TTGTTG-GTTTTTCGTCATTTTC---TATT---ATTT----GTGCTCTTGAGCA--TATCA-TATGACCTCGCATTTT--GTTTT------------AAG-T-----ATA-----T----C-TTTT---A-----------AATTCAT--TTT-----TAGATT-TT-CAATATA-AT-------CTA--TATT-----------TT-C-ATT--------TG---------CG--ACCTTAT--------T------TT-C-T--TGTT-ATCTAATTGGTCAT-TATTTT------TCTTTTTATTGCATGAATATGAAATTGGCTTCCCCC-TTATTTC-CATTAATAAAACTT------AGAGGAATAGCTGGTCATCTATAGTGAACTGTAATTGGTTA--TCGGGGATCAAA-TTA---ATGTTTTC--AAGATTTTATACAGGCA-ATG-----AATATTG-GATTTAATTTCGAT------A-TTTTATT-ACCAATGATCTTTAAATGATCTAGATCGGTTAAAAGAGA--ATTATTGTGTTTCCATAACAGACGCCCAGGAATGAAATTTGTAAAAGAC------------ATATTAAGAATTACCA---TTGAGTGATCTGACCTATAAC-TAGGT------TCA-ATAGAA--CATTT-GTTTACTGAAGCAT----GTAAATTTTCT--GATAAAAGAAAATAATCAAG--CCTGGCTTGTTGCAACGG-TGTTTTAT--TCCTCCA----TGCATATCTTCTT--A---ACAATGGATTATTTTCTCTAAA-GGATCAA-TAA-----------------GAT---TAA---CA----T--C-GT--------GCATAATTT---ATCTAGGT------------------------------------TGT-AGT-C------------------------------------T---------------T-GT----------ACAACATTGAAATCTCCGCAGAGAATATATGGGTTAGTATTATTTATGG-AT---CGTGCTTTTGA-CAT-A---AT---A-TTATTAAAAAAT-GAT---GGTGAGTCAAT-ATTTGGC-CCATATAAATTAATA---AAGTG----------ATTAT-CAACTGT-TAT-GTCTATTAT--AATGAAGTTCCCCTCAGTGTCAGATAAGTG-TTTATGAATTGTAAAGTCAAGG-TTTTTATTAAATAAAACTGTTACCCCTCTTTTATTAGA--AT--T----AACTGAGCTAAATA-GGCAATTATTGTTACCCCACTGTGTCTG-A--ATA---A--A-TTTTTCAGTGTGT-TGT-----GCAGAATGTATGTTCTGCAGACAATAAATATGACAATTTTTGGCTTTTAAATAATTAAAAAA-ACATCTAGTCT-TTTTTCCACAGAACCTAGCCCCTAGCAATTGACAGACAG------------------TA----------TTTTA-AAC---TCCATAC---TTA---
gi|7 : ttcttctgtactaagtttaggaatgtcataattaataaatccccgAGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TGGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCTTCTTC---TATT---ATTT----GAGCATGTGTTCT--AATTAATAT-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATACTTCTTAAG-G-----A-A-----T----C-TTTT---A-----------A---TGT--TTC-----TA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGATCTT--------G--TT-C-AAT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTTC-CATTAATAGAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTCGGTAT---A-TTTTTTATGTTATC--TTTATTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTGTTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTCAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ACTAACTGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGATCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CTAA--TAAT-AA--------G--TAATTT---AT-TATGTGAT--------------GCAATAT------------TGTTAATAT-----------GTCTATAATT---A---AAACAATCT---AGTTTTGGATCTT-GT----------ACCACATTGAAATCACCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AAT-G---A----GGTTTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATA--TTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAA--TTACCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAATAGGACTGCTACTCCTCTTGAGTtctataa
gi|8 : AGAGGATTCCTGCATGCTTTGTTTGGGCACAGTGCAATTTTCAAGTTCAATTT--CATAA-------TC----AAAAT-TCAGGGTGTTTATTTTTGTA--CAATGAC-TGGTAAA-A-TTATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATA-TACC-GTTTTCTTTTTCTGTTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAACAACTATGAAACTCAAAGT---TACGGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTTATCATCTTC---TATT---ATTT----GAGCATGTGATCT--AATTAATAT-A-CTTGCATTTTTAGCTATCTTACATTTCTTATG-G-----A-A-----T----C-TTTA---A-----------A---TGT--TTC-----TT-ATCGTT-CAATATT-ATCG-G-TGAT---------------------------------------T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-ATTTC-TT--ACGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTT-CCCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTATAAACAGTTGGTCATTTATGGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGGTTT---A-TTTGTCATGTTAAC--TTTATTATATTTTGGTA-ATG-----CATACAGAATTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTT-ATTTATAGCAGTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAACCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTCAAAAGGCCT--AGACACA-ATATTCAAAGAAATCATACTAGAATGATCTG-----TAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ATTAATCGATG-ATTATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-ATTTTTCC--TTCTCCATTCCTGCATGTA-----GTA---TC--CGGATTGAGTTCTCTAAATGTGTCAACTAAAT--TGTT-------TTGATCTTTTA---TT----T--C-AA--------G--TAATTT---AT-TATGTGAC--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-AT----------
gi|9 : cTGATCT--AATAAGTAT-ACCCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T----C-TTTT---T-----------T---CAT--ATG-----TA-ATTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CTTTAA--ATT--------G-----A-ATT--------CTAAAT--TATCA--ATATCCTCAA-TTAAT------TG-C-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCAT------TCTTTTTAAAACATGAATGAGAAATTGATTTGCCTT-TTATTTC-CATTGATAATGTTA------CTAAAAAAAGTTGATCATTTATTGAAAATTGAAGTTGATCA--TTGGGAAT---A-TTTTTTATATTTTCAACTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATAGTAATTTAACTTC-TTTA----A-TTTTGTC-TTTAATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TT-TAGGTAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATATTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTTTGA-------GTA-A--TAGTACATTT-ATAAACAGATG-ATATTA--AA---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCTCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTTTTCTCCA----TGTAGA---CCAAGTA---TT--TGGGGTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTCTTTTA---TT----T--CTAATAACTTATG--TGATTTAACAT-TAT-TCAT--------------GCACT--------------TGT-AAT-TAAAATA-----AT-------C---A---ACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ATTAAGTTGAAATCCTTGCAAAAAATAACTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ATTTTT---AAT-A---A----A-ttat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CGCTTTTTTATTCTTACACACAAGTAGTTTAATTTAAATTTTATTTCAAGCCAAAATAAGCTATACTGGTTTTATTGAGCGTGCATGCTTCATGATTTTTGCTTTAAACACTCTGAATAGCCTCAGAATCTTTTTACAGCTTTTAT
Unaligned ( gi|24 ): AGACCTGATTTGGACCATATAAAGAGACTAAAG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1 111 1 22222222222222222222222 222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11 111111 111111 2222 11 11 11111 111111 11 11111 11 111111 2222222 222222222 11 111111111111 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 4444444444 1111111 1 1 11111 33333333 66666666666 222222222 22222222222 33333333333333333333333333333 111 111 111 111111 2222222 1111 11 1 222222 11 1 2222 222222 1 222222
lowQualScore : 1 0 66 4 66 4 2 66 66 66 4 1 8 4 0 1 55 4 0 1 44444 4 0 2 3 7777 1 0 0 666 3 3 111 3 5 5 0 1 1 2 444 44 2 999999 3 0 2 000 2 2 1 55555555555555555555555 44 222222222222 2 3 7 3 4 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 55 0 3 000000 88 3 55 7 33 55 1 3 000000 1 4 3 2 3 1 444444 1 1 1 2 22 55 1 1 666 3 0 0 1 4 2222 99 3 33 3 0 99999 0 555 2 1 3 7777 3 1 3 0 1 44 22 00 0 22222 7777 0 2 55 88 7 3 777 4 222222 4 888 88 4 1 2 22222 9999 22 44 1 66 1 8 11 55 8888 555555 11 9999999 0 2 55 3333333 1 222222222 55 1 22 888888888888 3 3 1 11111111111111 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 33 888 99 0 5555555555 0 1 4 4 0000000000 1 1111111 8 8 0 2 3 66 11 55 0 4 6 8 8 1 1 1 1 0 1 2 5 22 4 1 1 0 55 0 1 1 0 66666 777 22 1 66 55555555 33 5 11111111111 1 55 1 000000000 0 1 00 555 0 1 0 66 4 2222 44 1 5 1 1 77777777777 22222222222222222222222222222 5 000 000 000 3 7 99 999999 3333333 1 4444 0 8 1 3 1 33 8 0 888888 33 3 3 0 4444 1 888888 3 0 888888 2
lowQualScore : . . .. . .. . . .. .. .. . . . . . . .. . . . ..... . . . . .... . . . ... . . ... . . . . . . . ... .. . ...... . . . ... . . . ....................... .. ............ . . . . . . .................................................... . .. . . ...... .. . .. . .. .. . . ...... . . . . . . ...... . . . . .. .. . . ... . . . . . .... .. . .. . . ..... . ... . . . .... . . . . . .. .. .. . ..... .... . . .. .. . . ... . ...... . ... .. . . . ..... .... .. .. . .. . . .. .. .... ...... .. ....... . . .. ....... . ......... .. . .. ............ . . . .............. . ......................................................................................... . . . .. ... .. . .......... . . . . .......... . ....... . . . . . .. .. .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . . .. . . . . ..... ... .. . .. ........ .. . ........... . .. . ......... . . .. ... . . . .. . .... .. . . . . ........... ............................. . ... ... ... . . .. ...... ....... . .... . . . . . .. . . ...... .. . . . .... . ...... . . ...... .
lowQualScore : 0 7 11 4 11 4 9 33 11 44 4 1 9 4 0 0 55 0 3 4 55555 0 6 3 6 4444 0 9 5 444 6 6 333 6 7 8 3 0 5 3 333 22 2 666666 3 0 2 666 5 2 6 55555555555555555555555 66 333333333333 8 6 2 6 5 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 00 3 6 555555 33 6 00 3 99 00 6 6 555555 0 5 6 5 6 0 111111 8 6 5 6 44 00 0 0 444 6 3 6 8 5 7777 22 9 22 6 2 11111 2 666 6 0 6 7777 6 0 6 5 0 88 33 22 3 77777 7777 2 8 00 55 3 6 000 4 888888 4 222 33 4 0 7 00000 7777 22 00 9 11 0 0 55 55 5555 222222 88 2222222 5 4 00 6666666 2 444444444 00 0 33 666666666666 6 6 2 44444444444444 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 0 4 55 888 66 2 0000000000 7 9 4 4 2222222222 0 0000000 2 2 6 7 6 88 33 00 4 0 0 0 0 0 0 4 0 3 2 3 5 44 0 4 2 5 22 8 0 9 2 00000 111 11 0 00 44444444 44 7 99999999999 3 11 0 888888888 8 0 44 000 2 9 9 11 4 7777 66 2 4 0 0 11111111111 66666666666666666666666666666 7 000 000 000 5 3 22 222222 2222222 0 2222 6 0 4 8 0 88 0 0 888888 88 2 2 0 2222 2 888888 2 5 888888 5
consensus : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TT--AT--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
Reference ( family-2881 ) : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGNGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TT--AT--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-AGNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|1 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TAGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCATTTTCTATTATTTGAGTATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGTTCTT--------G--TT-C-ATT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTAC-CATTAATAGAGTTT------TTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGTTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATCGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTTAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ACTAACCGATA-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTAAA---CT----T--CAAG--TTATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCACATTAAAATCACGGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AATGA---G----G-TTTTCAAAAAA--GGTA-GGGC-AATCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTAACAAATAATTTCCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCACCATTTTTTATTAAATAGGACTACTACTCCTCTTGAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCATTTACT-T--CCCCACTGTGATTC-AATA-----------AACTTTTCAG-ATAT-ATGA----GTTGAATGAACATCTTGAAGACAATACATATCACAGTTTTTCGACTTTAAGTAATT--GAAA-ACATCTCTCCG-TTTTTCCACAGAACCAAGACCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATTGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAGTAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATATATAAAACTT-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTTATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTTATTGGTACACAATCAAGTACTACATGTAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATATTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|10 : ATTCTTTATTATCCAGTTAAGGCACAGAACAACCTTTAAGTTCCATTT--C-TATGTTTGTATCTA--AGGAC-GCAATGTCTCTATTTG
gi|10 : CTCTATT--TGAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG-ACCC-ATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---TTTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TA-CTGTGTTTTTCATCATCTTCTATAAGCTGTGCGCTTCATCT--A---AG------TA-T-ACTCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTT-ATTGTT-CAATGTT-ATT----TGCT---TTTA--------A--TTGG-ATT--------CT--ATAATATCA--ATATCTTCAA-TTAAT------TG-T-T--TTCT-AACT--TT--TCAT-ATTCGT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGATATTGATTTGCCTC-TTATTTT-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAAAAG-------TTTATTGGAATTTGAAGTTTATCA--TTGGGAAT---ATTTTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATAAACTGGTACATGTAGTTCATATTATAATTTAACTTC-ATTA----ATTTTTATC-TTTTATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTACCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTT--AAGATGT--GAAAGTA-ATTTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTaaatttgatcttgatcgtttataaaagacccatcttctttttcaatttttggaatatttttatttaaacagttatgagattccaaattacaaaaatatttactgtgtttttcatcatcttctataagctgtgcgcttcatctaagtatactctgcatttttgtttttcttatattttcaagagaatcttttttcatatgttattgttcaatgttatttgcttttaattggattctataatatcaatatcttcaattaattgttttctaacttttcatattcgttctttttaaaacatgagtaagatattgatttgcctcttattttcattaatagtgtttctaaaaaaagtttattggaatttgaagtttatcattgggaatatttttttatattttcaatttgataaactggtacatgtagttcatattataatttaacttcattaatttttatcttttattgttgttaaataatctatgtctttaagcaaactattattatgttaccatagtggttttccttttttaagatgtgaaagtaatttttaaaataaccatagagtggtctgaccttaataa
gi|11 : attctttattatccagttaaggcacagaacaacctttaagttccatttctatgtttgtatctaaggacgcaatgt-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTACCCGTAATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTTATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-TTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTGTATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACTtaataa
gi|12 : -----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A--TAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCAATTGAA-GCGTGCACTGTCATCGTAAATG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGGATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAACAT-AGAATTTAATTTCAAAATATATCTTACTGTCATATTATTTATTTATCATATATGTAGCTTACATGTGCAAAAATGGATTTAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATATTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAGTC---TAC------TAAATATTCGACTTACAAACAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTCCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACTagacagacagacag
gi|13 : ---TA-A-TCTTAA-CAC-A---T----A-TTTTCAAAAAATAAAAA-GGATGA---AAAGATTTGGGTCCATATACTGTAAG--AAGTGTAAAT-TGTTTTGATTCTGCTGT-CAT-GTCAAGTGTCATGAAATTACCTTC-------CTTATATTCATTATGCACCTTGCACTCAAAG-TTTTTACTGAATAATATTGCAACGCCTCATGCATTAGATTTGATAA---AATTAAAAATAGCAGTCA--------CCGTT-CTATTG-AGCG-----TAAATAAACTT----GT-TTT-GTGACTCAGTAAAATGT--GTT--------------TATGACATTTTTTATCTTGTAAATA-TC--GAAAGACGTCTACTCT-CTTTTaccaggcaggca
gi|14 : taattaaactttgaatcaagcacaagattaaaatcgccacctgtcatatatgtatcattacctatatcatttaGGCGAATCATT-ATTGGGA-CCATAAAGGGCTAC--AAATGTAAACCTGTTATTAT-CTACAGT-TAA-ATCTGCAATGATAAAATTACCCTCACTATCCGAAATGTG-A-CATGTATTTTATAGGCTACG-TTCTTGCCAAATAATAAAACAACCCCAAGGGATTTGGA-AGTACCA--GAACTAAACA-AGCAGTCATT-T---CCCAATGGAGTACGAATA-----------AACTGTTCAGTAGGT-GGT-----GTAGAGTGAATGTCC---------------TGACATTTTTTGGCTTTTAGATAGTT--AAGT-AAATCAATTCT-TTTCTCTGCTGAACCAAGACCTT-----------GGCAAT-----------------TA----------ACTGACAATATCTTTATATCTGTCATTTATTC--TTTGATTATAAAAATTAACCTCACAGATACAGCTTCTAGAATCAATGAAAA----ATATTAAATGCAAT-AAGAA----AATAggttgccatttaggcctaggcaattcagggatagaatcttgatattaatgtctatcac
gi|15 : cAGTTCATTTTTTC-TAAGTTTATATCTT--CTAGT-TCATGATCTCTACTTGAGTATACAAT-TT-TCATAAA-A-AGCTTTTGT---GTCCATAAATATATCTTTTTTATCAGTTATTATAT--TACC-ATCTGTTATTTCTATTTTGGGG-ATA---ATTTTACTTGTAAAGTTGTGCGACTCAAGGC---AGCAAAAG-TATTATATGTG-TTTTCTC--CATCTTCTATAACCTGTACTCTTTGTCT--
gi|16 : ctcttcagctgttaattttgatacatttatatcaaaaATTTCTGCA-GTTCTGATCCCACTCTAAAAA--ATGA----CTAAATGACTACCGAAA-TATT--GGATG-TTTTTTCATCGTCTTCAATTATT---GCC----ATTT--ATTGGAGCATGTTAAT-ACATTGCATTTTTAGTTTTCTTATATTT-TCAAT-G-----A-C-----T-------ATTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAAGATT-ATTTTG-TCATAGAGCTT--------G--TC-C-AAT--------TT--A-----TCA--ATTTCGTCTA-TTAAT------TA-A-TAATTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCATTTTAATTCACGAATATGAAAATGATtggcaaggatggtattctct
gi|17 : ACATGCATATGAACTTGATTTACCTCGT--TTTCTCATCAATATTATTTGAAATTCTAAAAATAATTGGTCATTTGTAACAAACTGTATATCATTATTTTACGTAA---A-TTTTCCAT-TT-----------TTATA----GATA-A--------ATAC--ACA----ATATC-ATTATTTTA-TTTCTTCGATGTATTATATTTACATATTCAATATT--ATTCAAAAGATAGTTATTATGCTCCAATGAACATTTACCG----T----GGTTTAAA--TCATTAAAACATA---ATTTAAGA
gi|18 : AAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATCTGGA-CCATATAAAGAGAC--TAATGTAAGTCGATTACTAT-CAACAGT-TAA-GTCTATAATTGAGCAATTACCTTCAGGGTCATTTATATA-AGTATGAACTTCATAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATAa
gi|2 : tagtatGAGGATTCCAGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTGTCTT--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTT-TA--CAATGTT-TGCTAAA-A-TGATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-GCTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTCAATAACTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAG-TATT-TGGATG-GTTTTTCATTATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAA-G-----A-A-----T-------CTTT--T
gi|2 : TGATTTGTAATAAA------TG-T-ACC--GCTTTCTT---TTTCT---ATTTTT---G-G-----A-A-----TTATTTTACTTCAATAA---CTATGAGACTCTA-A--GTTACAGAAGT-ATT-TG--GATGG-TTTT------------T-C-ATTATCTTCTATT--AT--T-TGAGCATGTGATCTAATTAATATACCTTG-CAT--TTTT-AGCTT-TC--TTATATTTCTTAAAGAATCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTTCACCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTT----------------CATCA--TTTGGTAT---A-TTGTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----TATACTGAGTTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTC-ATTTATAGTTGTTAAGTAATATGTATC--TTGCAACAAACTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--CAACCTA-ATATTCAAAGTAATCA---TAGACTGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ATTAACCTATG-ATAATTGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTATTTTAAAGG-GTTTTTCT--TTCTTCA----TGTATATCGCCTAGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTAAT--------------GCAATATTGTTAATATGTCTAT-AAT-TAAAACAATCTAGT-------TTTGA---A-------T---C-----------TTGT----------ACCTTATTAAAATCGTCGCAGAAAATAATTGAT---GTATTATTGAAGGT---------------------------------TTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGATAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCACCGTGGTCGTTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAA-AGGACTGCTTCTCCTCTTTAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCAtaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcatttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|2 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatctT-TTA-----GTTGAATGAACATCTTGCAGACAATATATATCACAGTTTTTCGACTTTGAATAATT--GAAA-ACATCTCGTAG-TTTTTATACAGAACTAAGTCCCT-----------GACAAT-----------------TAACTGATAATATTTTA-AGT---TCCGTAT---TCA---ATATAGATTAATTGT--GAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA-------TAGAATATAATGAAAAA----A-TATGAAAACAATATTCGCCTAAA-ACGTGCACTTTCATCG-------AAAATGCAC-AAAACTCTGATAAATTATAAAAGCCATTGTTGCTCATATTCAGTGTTTTGGAATTACAATTTAACCATTTGAATTAAGGAGCTA------TTTTTGAAGAATATAATTCTGAGCATT-T-TTTTACTATTACAAAATATATGTAATAATGGAAAAAATATAATCTAATAATGTATAAAAC-T------TTACATGCAAAATATCACTTGCTGTCATAATATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATAAAAATGTTTACTTTTATCTATAT---GTATCTAATGTTGAGAAAACATAATAAAACATACATGATATTCTCTGTGTTGAGCTTATAACTATTAAATGATACACAATCAAGTAC------TTAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATTTACCATAATTTCTAAGTG-TTAAATAATCCATAACTTtttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|20 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccgctttctttttctatttttggaattattttacttcaataactatgagactctaagttacagaagtatttggatggtttttcattatcttctattatttgagcatgtgatctaattaatataccttgcatttttagctttcttatatttcttaaagaatctttttaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcaGGATGGTATTCTCTAAAGGGGTCAATAAGATTATGTG-------TTGATTTT--A---TT----T--CTAA--TAGCTG------------TT-CACG-G----------------GCATT--------------TTT--AT-T-----------AT-------T---T---A-------T---A-----------T-GT----------
gi|21 : tctttgtcttggcaaGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAttgtaattatagtatatcta
gi|22 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTT
gi|23 : acTTTAGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACA-CTTTTCAACCGAt
gi|24 : tgCTGATTTGGA-CCATATAAAGAGAC--tt
gi|3 : agacTCGTTATTTGCATA--TAAGCTA-TCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTCGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TACAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCATGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT------TTGCGCAAA-GTTAC-A-AGTTCTT-------CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TT--AT--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------TTTTCTTATAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTC-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTTT-----CTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAATATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATT-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCTGACCTATAGC-TGGCTTCAAAAGTACATTT-----AATTCGCTTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAA-AAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA---------GTG---GA--CGGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTGGATCTTGA-ACTAAACTGTAATCCCCGC---AAATAATTATG---TCATTAT------TATTTATA-GTGTCTGA-AAT-ACTCATTTTA-TTATAAAAAAA--ATTT-GGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTCCATCCCTGGAATTGCT-TTTCCCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-AGTATGTATT-----ATTTTTTCCGTATTT-TTG-----GTAAAATGGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGAATTTAAATTGTT--GAAA-ACATCAGTACGTTTTTTCTATGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------taaag
gi|4 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttatTCGTTATTTGCATA--TAA-GTTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTTGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TGCAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCGTGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT-TTGTG-----CAAG-GTTACAA-G-----TTCTC---CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TT--AT--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------T-TTCTTACAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTG-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTT------TTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAGTATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATC-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCCGACTTATAGC-TGGCT------TCA-A--TAGTACATTT-GATTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAAAAAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA----G---TGGA---T----GGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTTGGATCTTGAACTAAATTGTAATCCCCGC--AATGTCAT--------TATTATTTACAGTG----------TTTGA-AAT-ACTCATTATA-TTATAAAAAAA--ACAATGGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTACACCCCTGGAATTGCT-TTTCTCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-AGTATGTATT-----ATTTTTTCCATATTT-TTG-----GTAAAATAGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAGA-TCATCAGTACG-TTTTTCTACGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------actgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|5 : aaactttccaatgtcatggactctgtattagttaacttatTTCTTCATTATTAAGTTTAGGCACAGAACAACCTTCAAGTTTCATTT--C-TATATTTGTATCTA--ACAGT-TCATTGTCTCTATTTGAATA--TAAAGTT-TCGTAAA-AATG-TTTGGCTTCATC--TAAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG--ACCGATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---ATTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TACTTG-GTTTTTCATCCTCTTCGATAAGCTGTGCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-TCCCTGCATTTTTGTTTTCCTTATATTT-TCAAGAG-----A-T-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ACTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CGTTAA--ATT--------GGATT-C--TA--------AT--AT--A-TCG--ATTTCTTCAA-CTAAT------TG-T-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGAAATTGATTTGCCTC-TAATTTC-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAATAGTTGATCACTTATTGAAAATTGAAGTTGGTCA--TTGGGAAT---A-TCTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATTGTAATTTAACTTC-ATTA----A-TTTTACC-TTTTATTGTTTTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATGTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGGA------GTA-AT--AGTACAATT-GTTTACAGACG-GTATTAA--A---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAG--TCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTC--TTCTCCA----AGTATA---CCTTTTAAAATT--TGGGTTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTGTCTAA---TT----T--CTAG--TAACTT------------GT-TATGTGATTTAACATTATTCATGCACT--------------TGT-AAT-TAAA--------GT-------T---ATCAACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ACTAAGTTGAAATCCACACAAAAATTGATTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ACTTTTAATAAA-A---G----A-GTATCAAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATTTGGA-CCATATAAAGAGACTAAAGTG--AATCGATTACTAT-CAACATT-TAA-GTCTATAATTAGGTAATTACTTTCCAGGTCATTTATATA-ATTATGCACTTCATAGTCAACA-TTTTTATCAAATAATACTGCAACACCTCTAGAATTGGA-AGAGAAT--GAAGAAAATA-AACAACGGTT-G--CCCCATTGTGACTC-AATA-----------AACTTTTCAG-ATGCAATA-----GTTGAATGTATATCCTACAGACAATATATATCACATTGTTTTGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACG-CTTTTCAACCGGTCCCAAACCCT-----------GACAGTTAACAGTTAACAGATACTA----------TTTTA-ACT---TCCATAT---TTA---CT-C---TTAA-AGT--AGATTAA---TGCACACAGTG------GAGTC----CAAATCTTA-ATA-AATATATTGAATTGTTTCAACAT----------TTCATGTGACTGC-TGTACTTTCATTTCAAAAAT--ACTGCACAAAAAATCTGATactgacataatatcaatatctgtcatttatatatattttcttagatagtagtatgaccagatggagagagggaatccatagaaacataacaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgaaaatcaaagcaagccatttaaccatttgctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatataagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaatgttaacac
gi|6 : TT--C-TAAATTAATATCAATTAAATTGTCA---TCTTTACTAGAGTA--AAGATTT-TCATAAG-A-ACATTTTGCTTCGTT--TAAA-ATTTCGTTTTGGTCTGTTATGA--TGCTACC-ATCTGATTTTCCGAATTTAGGTTATC---ATTTTATTTAAAGATTTAAAAGTTTCTTAGT---TACAAAAAGTAGT-TTGTTG-GTTTTTCGTCATTTTCTATTATTTGTGCTCTTGAGCA--TATCA-------TA-TGACCTCGCATTTT--GTTTT------------AAG-T-----ATA-----T-------CTTT--TAAATTC-----ATTTTTAGATT-TT-CAATATA-AT-------CTA--TATT-----------TT-C-ATT--------TG---------CG--ACCTTAT--------T------TT-C-T--TGTT-ATCTAATTGGTCAT-TATTTT------TCTTTTTATTGCATGAATATGAAATTGGCTTCCCCC-TTATTTC-CATTAATAAAACTT------AGAGGAATAGCTGGTCATCTATAGTGAACTGTAATTGGTTA--TCGGGGATCAAA-TTA---ATGTTTTCAAGATTT--TATACA--GGCA-ATG-----AATATTG-GATTTAATTTCGAT------A-TTTTATT-ACCAATGATCTTTAAATGATCTAGATCGGTTAAAAGAGA--ATTATTGTGTTTCCATAACAGACGCCCAGGAATGAAATTTGTAAAAGAC------------ATATTAAGAATTACCA---TTGAGTGATCTGACCTATAAC-TAGGT------TCA-ATAGAA--CATTT-GTTTACTGAAGCAT----GTAAATTTTCT--GATAAAAGAAAATAATCAAG--CCTGGCTTGTTGCAACGG-TGTTTTAT--TCCTCCA----TGCATATCTTCTT--A---ACAATGGATTATTTTCTCTAAA-GGATCAA-TAA-----------------GAT---TAA---CA----T--CGTGCATAATTT------------ATCTAGGT------------------------------------TGT-AGT-C------------------------------------T---------------T-GT----------ACAACATTGAAATCTCCGCAGAGAATATATGGGTTAGTATTATTTATGG-AT---CGTGCTTTTGA-CAT-A---AT---A-TTATTAAAAAAT-GAT---GGTGAGTCAAT-ATTTGGC-CCATATA---AATT--AA---TAAA---GTGATTAT-CAACTGT-TAT-GTCTATTATAATGAAGTTCCCCTCAGTGTCAGATAAGTG-TTTATGAATTGTAAAGTCAAGG-TTTTTATTAAATAAAACTGTTACCCCTCTTTTATTAGA-AT--TAACTGAGCTAAATA-GGCAATTATTGTTACCCCACTGTGTCTG-AATA-----------AATTTTTCAGTGTGT-TGT-----GCAGAATGTATGTTCTGCAGACAATAAATATGACAATTTTTGGCTTTTAAATAATTAAAAAA-ACATCTAGTCT-TTTTTCCACAGAACCTAGCCCCTAGCAATTGACAGACAG------------------TA----------TTTTA-AAC---TCCATAC---TTA---
gi|7 : ttcttctgtactaagtttaggaatgtcataattaataaatccccgAGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TGGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCTTCTTCTATTATTTGAGCATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATACTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGATCTT--------G--TT-C-AAT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTTC-CATTAATAGAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTCGGTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTGTTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTCAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ACTAACTGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGATCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CTAA--TAATAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAATAT------------TGTTAATAT-----------GTCTATAATT---A---AAACAATCT---AGTTTTGGATCTT-GT----------ACCACATTGAAATCACCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AAT-G---A----GGTTTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAATAGGACTGCTACTCCTCTTGAGTtctataa
gi|8 : AGAGGATTCCTGCATGCTTTGTTTGGGCACAGTGCAATTTTCAAGTTCAATTT--CATAA-------TC----AAAAT-TCAGGGTGTTTATTTTTGTA--CAATGAC-TGGTAAA-A-TTATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATA-TACC-GTTTTCTTTTTCTGTTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAACAACTATGAAACTCAAAGT---TACGGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTTATCATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-A-CTTGCATTTTTAGCTATCTTACATTTCTTATG-G-----A-A-----T-------CTTT--AAA---T-----GTTTCTT-ATCGTT-CAATATT-ATCG-G-TGAT---------------------------------------T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-ATTTC-TT--ACGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTT-CCCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTATAAACAGTTGGTCATTTATGGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGGTTT---A-TTTGTCATGTTAAC----TTTATTATATTTTGGTA-ATG-----CATACAGAATTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTT-ATTTATAGCAGTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAACCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTCAAAAGGCCT--AGACACA-ATATTCAAAGAAATCATACTAGAATGATCTG-----TAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ATTAATCGATG-ATTATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-ATTTTTCC--TTCTCCATTCCTGCATGTA-----GTA---TC--CGGATTGAGTTCTCTAAATGTGTCAACTAAAT--TGTT-------TTGATCTTTTA---TT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAC--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-AT----------
gi|9 : cCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-ACCCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ATTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CTTTAA--ATT--------G-----A-ATT--------CTAAAT--TATCA--ATATCCTCAA-TTAAT------TG-C-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCAT------TCTTTTTAAAACATGAATGAGAAATTGATTTGCCTT-TTATTTC-CATTGATAATGTTA------CTAAAAAAAGTTGATCATTTATTGAAAATTGAAGTTGATCA--TTGGGAAT---A-TTTTTTATATTTTCAA--CTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATAGTAATTTAACTTC-TTTA----A-TTTTGTC-TTTAATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TT-TAGGTAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATATTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTTTGA-------GTA-A--TAGTACATTT-ATAAACAGATG-ATATTA--AA---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCTCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTTTTCTCCA----TGTAGA---CCAAGTA---TT--TGGGGTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTCTTTTA---TT----T--CTAA--TAACTTATGTGATTTAACAT-TAT-TCAT--------------GCACT--------------TGT-AAT-TAAAATA-----AT-------C---A---ACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ATTAAGTTGAAATCCTTGCAAAAAATAACTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ATTTTT---AAT-A---A----A-ttat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CGCTTTTTTATTCTTACACACAAGTAGTTTAATTTAAATTTTATTTCAAGCCAAAATAAGCTATACTGGTTTTATTGAGCGTGCATGCTTCATGATTTTTGCTTTAAACACTCTGAATAGCCTCAGAATCTTTTTACAGCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1 111 1 22222222222222222222222 222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11 111111 111111 2222 11 11 11111 111111 11 11111 11 111111 2222222 222222222 11 111111111111 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 4444444444 1111111 1 1 11111 33333333 66666666666 222222222 22222222222 33333333333333333333333333333 111 111 111 111111 2222222 1111 11 1 222222 11 1 2222 222222 1 222222
lowQualScore : 1 0 66 4 66 4 2 66 66 66 4 1 8 4 0 1 55 4 0 1 44444 4 0 2 3 7777 1 0 0 666 3 3 111 3 5 5 0 1 1 2 444 44 2 999999 3 0 2 000 2 2 1 55555555555555555555555 44 222222222222 2 3 7 3 4 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 55 0 3 000000 88 3 55 7 33 55 1 3 000000 1 4 3 2 3 1 444444 1 1 1 2 22 55 1 1 666 3 0 0 1 4 2222 99 3 33 3 0 99999 0 555 2 1 3 7777 3 1 3 0 1 44 22 00 0 22222 7777 0 2 55 88 7 3 777 4 222222 4 888 88 4 1 2 22222 9999 22 44 1 66 1 8 11 55 8888 555555 11 9999999 0 2 55 3333333 1 222222222 55 1 22 888888888888 3 3 1 11111111111111 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 33 888 99 0 5555555555 0 1 4 4 0000000000 1 1111111 8 8 0 2 3 66 11 55 0 4 6 8 8 1 1 1 1 0 1 2 5 22 4 1 1 0 55 0 1 1 0 44444 777 22 1 66 55555555 33 5 11111111111 1 55 1 000000000 0 1 00 555 0 1 0 66 4 2222 44 1 5 1 1 77777777777 22222222222222222222222222222 5 000 000 000 3 7 99 999999 3333333 1 4444 0 8 1 3 1 33 8 0 888888 33 3 3 0 4444 1 888888 3 0 888888 2
lowQualScore : . . .. . .. . . .. .. .. . . . . . . .. . . . ..... . . . . .... . . . ... . . ... . . . . . . . ... .. . ...... . . . ... . . . ....................... .. ............ . . . . . . .................................................... . .. . . ...... .. . .. . .. .. . . ...... . . . . . . ...... . . . . .. .. . . ... . . . . . .... .. . .. . . ..... . ... . . . .... . . . . . .. .. .. . ..... .... . . .. .. . . ... . ...... . ... .. . . . ..... .... .. .. . .. . . .. .. .... ...... .. ....... . . .. ....... . ......... .. . .. ............ . . . .............. . ......................................................................................... . . . .. ... .. . .......... . . . . .......... . ....... . . . . . .. .. .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . . .. . . . . ..... ... .. . .. ........ .. . ........... . .. . ......... . . .. ... . . . .. . .... .. . . . . ........... ............................. . ... ... ... . . .. ...... ....... . .... . . . . . .. . . ...... .. . . . .... . ...... . . ...... .
lowQualScore : 0 7 11 4 11 4 9 33 11 44 4 1 9 4 0 0 55 0 3 4 55555 0 6 3 6 4444 0 9 5 444 6 6 333 6 7 8 3 0 5 6 333 22 2 666666 3 0 2 666 5 2 6 55555555555555555555555 66 333333333333 8 6 2 6 5 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 00 3 6 555555 33 6 00 3 99 00 6 6 555555 0 5 6 5 6 0 111111 8 6 5 6 44 00 0 0 444 6 3 6 8 5 7777 22 9 22 6 2 11111 2 666 6 0 6 7777 6 0 6 5 0 88 33 22 3 77777 7777 2 8 00 55 3 6 000 4 888888 4 222 33 4 0 7 00000 7777 22 00 9 11 0 0 55 55 5555 222222 88 2222222 5 4 00 6666666 2 444444444 00 0 33 666666666666 6 6 2 44444444444444 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 0 4 55 888 66 2 0000000000 7 9 4 4 2222222222 0 0000000 2 2 6 7 6 88 33 00 4 0 0 0 0 0 0 4 0 3 2 3 5 44 0 4 2 5 22 8 0 9 2 55555 111 11 0 00 44444444 44 7 99999999999 3 11 0 888888888 8 0 44 000 2 9 9 11 4 7777 66 2 4 0 0 11111111111 66666666666666666666666666666 7 000 000 000 5 3 22 222222 2222222 0 2222 6 0 4 8 0 88 0 0 888888 88 2 2 0 2222 2 888888 2 5 888888 5
consensus : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
Reference ( family-2881 ) : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|1 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TAGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCATTTTCTATTATTTGAGTATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGTTCTT--------G--TT-C-ATT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTAC-CATTAATAGAGTTT------TTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGTTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATCGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTTAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ACTAACCGATA-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTAAA---CT----T--CAAG--TTATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCACATTAAAATCACGGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AATGA---G----G-TTTTCAAAAAA--GGTA-GGGC-AATCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTAACAAATAATTTCCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCACCATTTTTTATTAAATAGGACTACTACTCCTCTTGAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCATTTACT-T--CCCCACTGTGATTC-AATA-----------AACTTTTCAG-ATAT-ATGA----GTTGAATGAACATCTTGAAGACAATACATATCACAGTTTTTCGACTTTAAGTAATT--GAAA-ACATCTCTCCG-TTTTTCCACAGAACCAAGACCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATTGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAGTAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATATATAAAACTT-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTTATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTTATTGGTACACAATCAAGTACTACATGTAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATATTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|10 : ATTCTTTATTATCCAGTTAAGGCACAGAACAACCTTTAAGTTCCATTT--C-TATGTTTGTATCTA--AGGAC-GCAATGTCTCTATTTG
gi|10 : CTCTATT--TGAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG-ACCC-ATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---TTTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TA-CTGTGTTTTTCATCATCTTCTATAAGCTGTGCGCTTCATCT--A---AG------TA-T-ACTCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTT-ATTGTT-CAATGTT-ATT----TGCT---TTTA--------A--TTGG-ATT--------CTA--TAATATCA--ATATCTTCAA-TTAAT------TG-T-T--TTCT-AACT--TT--TCAT-ATTCGT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGATATTGATTTGCCTC-TTATTTT-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAAAAG-------TTTATTGGAATTTGAAGTTTATCA--TTGGGAAT---ATTTTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATAAACTGGTACATGTAGTTCATATTATAATTTAACTTC-ATTA----ATTTTTATC-TTTTATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTACCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTT--AAGATGT--GAAAGTA-ATTTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTaaatttgatcttgatcgtttataaaagacccatcttctttttcaatttttggaatatttttatttaaacagttatgagattccaaattacaaaaatatttactgtgtttttcatcatcttctataagctgtgcgcttcatctaagtatactctgcatttttgtttttcttatattttcaagagaatcttttttcatatgttattgttcaatgttatttgcttttaattggattctataatatcaatatcttcaattaattgttttctaacttttcatattcgttctttttaaaacatgagtaagatattgatttgcctcttattttcattaatagtgtttctaaaaaaagtttattggaatttgaagtttatcattgggaatatttttttatattttcaatttgataaactggtacatgtagttcatattataatttaacttcattaatttttatcttttattgttgttaaataatctatgtctttaagcaaactattattatgttaccatagtggttttccttttttaagatgtgaaagtaatttttaaaataaccatagagtggtctgaccttaataa
gi|11 : attctttattatccagttaaggcacagaacaacctttaagttccatttctatgtttgtatctaaggacgcaatgt-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTACCCGTAATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTTATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-TTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTGTATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACTtaataa
gi|12 : -----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A--TAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCAATTGAA-GCGTGCACTGTCATCGTAAATG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGGATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAACAT-AGAATTTAATTTCAAAATATATCTTACTGTCATATTATTTATTTATCATATATGTAGCTTACATGTGCAAAAATGGATTTAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATATTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAGTC---TAC------TAAATATTCGACTTACAAACAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTCCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACTagacagacagacag
gi|13 : ---TA-A-TCTTAA-CAC-A---T----A-TTTTCAAAAAATAAAAA-GGATGA---AAAGATTTGGGTCCATATACTGTAAG--AAGTGTAAAT-TGTTTTGATTCTGCTGT-CAT-GTCAAGTGTCATGAAATTACCTTC-------CTTATATTCATTATGCACCTTGCACTCAAAG-TTTTTACTGAATAATATTGCAACGCCTCATGCATTAGATTTGATAA---AATTAAAAATAGCAGTCA--------CCGTT-CTATTG-AGCG-----TAAATAAACTT----GT-TTT-GTGACTCAGTAAAATGT--GTT--------------TATGACATTTTTTATCTTGTAAATA-TC--GAAAGACGTCTACTCT-CTTTTaccaggcaggca
gi|14 : taattaaactttgaatcaagcacaagattaaaatcgccacctgtcatatatgtatcattacctatatcatttaGGCGAATCATT-ATTGGGA-CCATAAAGGGCTAC--AAATGTAAACCTGTTATTAT-CTACAGT-TAA-ATCTGCAATGATAAAATTACCCTCACTATCCGAAATGTG-A-CATGTATTTTATAGGCTACG-TTCTTGCCAAATAATAAAACAACCCCAAGGGATTTGGA-AGTACCA--GAACTAAACA-AGCAGTCATT-T---CCCAATGGAGTACGAATA-----------AACTGTTCAGTAGGT-GGT-----GTAGAGTGAATGTCC---------------TGACATTTTTTGGCTTTTAGATAGTT--AAGT-AAATCAATTCT-TTTCTCTGCTGAACCAAGACCTT-----------GGCAAT-----------------TA----------ACTGACAATATCTTTATATCTGTCATTTATTC--TTTGATTATAAAAATTAACCTCACAGATACAGCTTCTAGAATCAATGAAAA----ATATTAAATGCAAT-AAGAA----AATAggttgccatttaggcctaggcaattcagggatagaatcttgatattaatgtctatcac
gi|15 : cAGTTCATTTTTTC-TAAGTTTATATCTT--CTAGT-TCATGATCTCTACTTGAGTATACAAT-TT-TCATAAA-A-AGCTTTTGT---GTCCATAAATATATCTTTTTTATCAGTTATTATAT--TACC-ATCTGTTATTTCTATTTTGGGG-ATA---ATTTTACTTGTAAAGTTGTGCGACTCAAGGC---AGCAAAAG-TATTATATGTG-TTTTCTC--CATCTTCTATAACCTGTACTCTTTGTCT--
gi|16 : ctcttcagctgttaattttgatacatttatatcaaaaATTTCTGCA-GTTCTGATCCCACTCTAAAAA--ATGA----CTAAATGACTACCGAAA-TATT--GGATG-TTTTTTCATCGTCTTCAATTATT---GCC----ATTT--ATTGGAGCATGTTAAT-ACATTGCATTTTTAGTTTTCTTATATTT-TCAAT-G-----A-C-----T-------ATTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAAGATT-ATTTTG-TCATAGAGCTT--------G--TC-C-AAT--------TTA-------TCA--ATTTCGTCTA-TTAAT------TA-A-TAATTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCATTTTAATTCACGAATATGAAAATGATtggcaaggatggtattctct
gi|17 : ACATGCATATGAACTTGATTTACCTCGT--TTTCTCATCAATATTATTTGAAATTCTAAAAATAATTGGTCATTTGTAACAAACTGTATATCATTATTTTACGTAA---A-TTTTCCAT-TT-----------TTATA----GATA-A--------ATAC--ACA----ATATC-ATTATTTTA-TTTCTTCGATGTATTATATTTACATATTCAATATT--ATTCAAAAGATAGTTATTATGCTCCAATGAACATTTACCG----T----GGTTTAAA--TCATTAAAACATA---ATTTAAGA
gi|18 : AAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATCTGGA-CCATATAAAGAGAC--TAATGTAAGTCGATTACTAT-CAACAGT-TAA-GTCTATAATTGAGCAATTACCTTCAGGGTCATTTATATA-AGTATGAACTTCATAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATAa
gi|2 : tagtatGAGGATTCCAGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTGTCTT--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTT-TA--CAATGTT-TGCTAAA-A-TGATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-GCTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTCAATAACTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAG-TATT-TGGATG-GTTTTTCATTATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAA-G-----A-A-----T-------CTTT--T
gi|2 : TGATTTGTAATAAA------TG-T-ACC--GCTTTCTT---TTTCT---ATTTTT---G-G-----A-A-----TTATTTTACTTCAATAA---CTATGAGACTCTA-A--GTTACAGAAGT-ATT-TG--GATGG-TTTT------------T-C-ATTATCTTCTATTA--T--T-TGAGCATGTGATCTAATTAATATACCTTG-CAT--TTTT-AGCTT-TC--TTATATTTCTTAAAGAATCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTTCACCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTT----------------CATCA--TTTGGTAT---A-TTGTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----TATACTGAGTTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTC-ATTTATAGTTGTTAAGTAATATGTATC--TTGCAACAAACTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--CAACCTA-ATATTCAAAGTAATCA---TAGACTGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ATTAACCTATG-ATAATTGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTATTTTAAAGG-GTTTTTCT--TTCTTCA----TGTATATCGCCTAGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTAAT--------------GCAATATTGTTAATATGTCTAT-AAT-TAAAACAATCTAGT-------TTTGA---A-------T---C-----------TTGT----------ACCTTATTAAAATCGTCGCAGAAAATAATTGAT---GTATTATTGAAGGT---------------------------------TTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGATAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCACCGTGGTCGTTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAA-AGGACTGCTTCTCCTCTTTAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCAtaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcatttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|2 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatctT-TTA-----GTTGAATGAACATCTTGCAGACAATATATATCACAGTTTTTCGACTTTGAATAATT--GAAA-ACATCTCGTAG-TTTTTATACAGAACTAAGTCCCT-----------GACAAT-----------------TAACTGATAATATTTTA-AGT---TCCGTAT---TCA---ATATAGATTAATTGT--GAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA-------TAGAATATAATGAAAAA----A-TATGAAAACAATATTCGCCTAAA-ACGTGCACTTTCATCG-------AAAATGCAC-AAAACTCTGATAAATTATAAAAGCCATTGTTGCTCATATTCAGTGTTTTGGAATTACAATTTAACCATTTGAATTAAGGAGCTA------TTTTTGAAGAATATAATTCTGAGCATT-T-TTTTACTATTACAAAATATATGTAATAATGGAAAAAATATAATCTAATAATGTATAAAAC-T------TTACATGCAAAATATCACTTGCTGTCATAATATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATAAAAATGTTTACTTTTATCTATAT---GTATCTAATGTTGAGAAAACATAATAAAACATACATGATATTCTCTGTGTTGAGCTTATAACTATTAAATGATACACAATCAAGTAC------TTAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATTTACCATAATTTCTAAGTG-TTAAATAATCCATAACTTtttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|20 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccgctttctttttctatttttggaattattttacttcaataactatgagactctaagttacagaagtatttggatggtttttcattatcttctattatttgagcatgtgatctaattaatataccttgcatttttagctttcttatatttcttaaagaatctttttaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcaGGATGGTATTCTCTAAAGGGGTCAATAAGATTATGTG-------TTGATTTT--A---TT----T--CTAA--TAGCTG------------TT-CACG-G----------------GCATT--------------TTT--AT-T-----------AT-------T---T---A-------T---A-----------T-GT----------
gi|21 : tctttgtcttggcaaGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAttgtaattatagtatatcta
gi|22 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTT
gi|23 : acTTTAGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACA-CTTTTCAACCGAt
gi|24 : tgCTGATTTGGA-CCATATAAAGAGAC--tt
gi|3 : agacTCGTTATTTGCATA--TAAGCTA-TCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTCGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TACAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCATGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT------TTGCGCAAA-GTTAC-A-AGTTCTT-------CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TTA--T--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------TTTTCTTATAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTC-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTTT-----CTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAATATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATT-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCTGACCTATAGC-TGGCTTCAAAAGTACATTT-----AATTCGCTTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAA-AAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA---------GTG---GA--CGGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTGGATCTTGA-ACTAAACTGTAATCCCCGC---AAATAATTATG---TCATTAT------TATTTATA-GTGTCTGA-AAT-ACTCATTTTA-TTATAAAAAAA--ATTT-GGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTCCATCCCTGGAATTGCT-TTTCCCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-AGTATGTATT-----ATTTTTTCCGTATTT-TTG-----GTAAAATGGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGAATTTAAATTGTT--GAAA-ACATCAGTACGTTTTTTCTATGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------taaag
gi|4 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttatTCGTTATTTGCATA--TAA-GTTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTTGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TGCAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCGTGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT-TTGTG-----CAAG-GTTACAA-G-----TTCTC---CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TTA--T--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------T-TTCTTACAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTG-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTT------TTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAGTATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATC-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCCGACTTATAGC-TGGCT------TCA-A--TAGTACATTT-GATTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAAAAAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA----G---TGGA---T----GGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTTGGATCTTGAACTAAATTGTAATCCCCGC--AATGTCAT--------TATTATTTACAGTG----------TTTGA-AAT-ACTCATTATA-TTATAAAAAAA--ACAATGGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTACACCCCTGGAATTGCT-TTTCTCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-AGTATGTATT-----ATTTTTTCCATATTT-TTG-----GTAAAATAGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAGA-TCATCAGTACG-TTTTTCTACGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------actgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|5 : aaactttccaatgtcatggactctgtattagttaacttatTTCTTCATTATTAAGTTTAGGCACAGAACAACCTTCAAGTTTCATTT--C-TATATTTGTATCTA--ACAGT-TCATTGTCTCTATTTGAATA--TAAAGTT-TCGTAAA-AATG-TTTGGCTTCATC--TAAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG--ACCGATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---ATTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TACTTG-GTTTTTCATCCTCTTCGATAAGCTGTGCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-TCCCTGCATTTTTGTTTTCCTTATATTT-TCAAGAG-----A-T-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ACTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CGTTAA--ATT--------GGATT-C--TA--------ATA--T--A-TCG--ATTTCTTCAA-CTAAT------TG-T-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGAAATTGATTTGCCTC-TAATTTC-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAATAGTTGATCACTTATTGAAAATTGAAGTTGGTCA--TTGGGAAT---A-TCTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATTGTAATTTAACTTC-ATTA----A-TTTTACC-TTTTATTGTTTTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATGTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGGA------GTA-AT--AGTACAATT-GTTTACAGACG-GTATTAA--A---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAG--TCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTC--TTCTCCA----AGTATA---CCTTTTAAAATT--TGGGTTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTGTCTAA---TT----T--CTAG--TAACTT------------GT-TATGTGATTTAACATTATTCATGCACT--------------TGT-AAT-TAAA--------GT-------T---ATCAACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ACTAAGTTGAAATCCACACAAAAATTGATTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ACTTTTAATAAA-A---G----A-GTATCAAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATTTGGA-CCATATAAAGAGACTAAAGTG--AATCGATTACTAT-CAACATT-TAA-GTCTATAATTAGGTAATTACTTTCCAGGTCATTTATATA-ATTATGCACTTCATAGTCAACA-TTTTTATCAAATAATACTGCAACACCTCTAGAATTGGA-AGAGAAT--GAAGAAAATA-AACAACGGTT-G--CCCCATTGTGACTC-AATA-----------AACTTTTCAG-ATGCAATA-----GTTGAATGTATATCCTACAGACAATATATATCACATTGTTTTGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACG-CTTTTCAACCGGTCCCAAACCCT-----------GACAGTTAACAGTTAACAGATACTA----------TTTTA-ACT---TCCATAT---TTA---CT-C---TTAA-AGT--AGATTAA---TGCACACAGTG------GAGTC----CAAATCTTA-ATA-AATATATTGAATTGTTTCAACAT----------TTCATGTGACTGC-TGTACTTTCATTTCAAAAAT--ACTGCACAAAAAATCTGATactgacataatatcaatatctgtcatttatatatattttcttagatagtagtatgaccagatggagagagggaatccatagaaacataacaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgaaaatcaaagcaagccatttaaccatttgctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatataagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaatgttaacac
gi|6 : TT--C-TAAATTAATATCAATTAAATTGTCA---TCTTTACTAGAGTA--AAGATTT-TCATAAG-A-ACATTTTGCTTCGTT--TAAA-ATTTCGTTTTGGTCTGTTATGA--TGCTACC-ATCTGATTTTCCGAATTTAGGTTATC---ATTTTATTTAAAGATTTAAAAGTTTCTTAGT---TACAAAAAGTAGT-TTGTTG-GTTTTTCGTCATTTTCTATTATTTGTGCTCTTGAGCA--TATCA-------TA-TGACCTCGCATTTT--GTTTT------------AAG-T-----ATA-----T-------CTTT--TAAATTC-----ATTTTTAGATT-TT-CAATATA-AT-------CTA--TATT-----------TT-C-ATT--------TG---------CG--ACCTTAT--------T------TT-C-T--TGTT-ATCTAATTGGTCAT-TATTTT------TCTTTTTATTGCATGAATATGAAATTGGCTTCCCCC-TTATTTC-CATTAATAAAACTT------AGAGGAATAGCTGGTCATCTATAGTGAACTGTAATTGGTTA--TCGGGGATCAAA-TTA---ATGTTTTCAAGATTT--TATACA--GGCA-ATG-----AATATTG-GATTTAATTTCGAT------A-TTTTATT-ACCAATGATCTTTAAATGATCTAGATCGGTTAAAAGAGA--ATTATTGTGTTTCCATAACAGACGCCCAGGAATGAAATTTGTAAAAGAC------------ATATTAAGAATTACCA---TTGAGTGATCTGACCTATAAC-TAGGT------TCA-ATAGAA--CATTT-GTTTACTGAAGCAT----GTAAATTTTCT--GATAAAAGAAAATAATCAAG--CCTGGCTTGTTGCAACGG-TGTTTTAT--TCCTCCA----TGCATATCTTCTT--A---ACAATGGATTATTTTCTCTAAA-GGATCAA-TAA-----------------GAT---TAA---CA----T--CGTGCATAATTT------------ATCTAGGT------------------------------------TGT-AGT-C------------------------------------T---------------T-GT----------ACAACATTGAAATCTCCGCAGAGAATATATGGGTTAGTATTATTTATGG-AT---CGTGCTTTTGA-CAT-A---AT---A-TTATTAAAAAAT-GAT---GGTGAGTCAAT-ATTTGGC-CCATATA---AATT--AA---TAAA---GTGATTAT-CAACTGT-TAT-GTCTATTATAATGAAGTTCCCCTCAGTGTCAGATAAGTG-TTTATGAATTGTAAAGTCAAGG-TTTTTATTAAATAAAACTGTTACCCCTCTTTTATTAGA-AT--TAACTGAGCTAAATA-GGCAATTATTGTTACCCCACTGTGTCTG-AATA-----------AATTTTTCAGTGTGT-TGT-----GCAGAATGTATGTTCTGCAGACAATAAATATGACAATTTTTGGCTTTTAAATAATTAAAAAA-ACATCTAGTCT-TTTTTCCACAGAACCTAGCCCCTAGCAATTGACAGACAG------------------TA----------TTTTA-AAC---TCCATAC---TTA---
gi|7 : ttcttctgtactaagtttaggaatgtcataattaataaatccccgAGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TGGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCTTCTTCTATTATTTGAGCATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATACTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGATCTT--------G--TT-C-AAT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTTC-CATTAATAGAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTCGGTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTGTTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTCAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ACTAACTGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGATCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CTAA--TAATAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAATAT------------TGTTAATAT-----------GTCTATAATT---A---AAACAATCT---AGTTTTGGATCTT-GT----------ACCACATTGAAATCACCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AAT-G---A----GGTTTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAATAGGACTGCTACTCCTCTTGAGTtctataa
gi|8 : AGAGGATTCCTGCATGCTTTGTTTGGGCACAGTGCAATTTTCAAGTTCAATTT--CATAA-------TC----AAAAT-TCAGGGTGTTTATTTTTGTA--CAATGAC-TGGTAAA-A-TTATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATA-TACC-GTTTTCTTTTTCTGTTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAACAACTATGAAACTCAAAGT---TACGGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTTATCATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-A-CTTGCATTTTTAGCTATCTTACATTTCTTATG-G-----A-A-----T-------CTTT--AAA---T-----GTTTCTT-ATCGTT-CAATATT-ATCG-G-TGAT---------------------------------------T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-ATTTC-TT--ACGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTT-CCCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTATAAACAGTTGGTCATTTATGGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGGTTT---A-TTTGTCATGTTAAC----TTTATTATATTTTGGTA-ATG-----CATACAGAATTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTT-ATTTATAGCAGTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAACCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTCAAAAGGCCT--AGACACA-ATATTCAAAGAAATCATACTAGAATGATCTG-----TAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ATTAATCGATG-ATTATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-ATTTTTCC--TTCTCCATTCCTGCATGTA-----GTA---TC--CGGATTGAGTTCTCTAAATGTGTCAACTAAAT--TGTT-------TTGATCTTTTA---TT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAC--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-AT----------
gi|9 : cCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-ACCCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ATTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CTTTAA--ATT--------G-----A-ATT--------CTAAAT--TATCA--ATATCCTCAA-TTAAT------TG-C-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCAT------TCTTTTTAAAACATGAATGAGAAATTGATTTGCCTT-TTATTTC-CATTGATAATGTTA------CTAAAAAAAGTTGATCATTTATTGAAAATTGAAGTTGATCA--TTGGGAAT---A-TTTTTTATATTTTCAA--CTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATAGTAATTTAACTTC-TTTA----A-TTTTGTC-TTTAATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TT-TAGGTAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATATTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTTTGA-------GTA-A--TAGTACATTT-ATAAACAGATG-ATATTA--AA---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCTCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTTTTCTCCA----TGTAGA---CCAAGTA---TT--TGGGGTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTCTTTTA---TT----T--CTAA--TAACTTATGTGATTTAACAT-TAT-TCAT--------------GCACT--------------TGT-AAT-TAAAATA-----AT-------C---A---ACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ATTAAGTTGAAATCCTTGCAAAAAATAACTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ATTTTT---AAT-A---A----A-ttat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CGCTTTTTTATTCTTACACACAAGTAGTTTAATTTAAATTTTATTTCAAGCCAAAATAAGCTATACTGGTTTTATTGAGCGTGCATGCTTCATGATTTTTGCTTTAAACACTCTGAATAGCCTCAGAATCTTTTTACAGCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1 111 1 22222222222222222222222 222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11 111111 111111 2222 11 11 11111 111111 11 11111 11 111111 2222222 222222222 11 111111111111 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 4444444444 1111111 1 1 11111 33333333 66666666666 222222222 22222222222 33333333333333333333333333333 111 111 111 111111 2222222 1111 11 1 222222 11 1 2222 222222 1 222222
lowQualScore : 1 0 66 4 66 4 2 66 66 66 4 1 8 4 0 1 55 4 0 1 44444 4 0 2 3 7777 1 0 0 666 3 3 111 3 5 5 0 1 1 2 444 44 2 999999 3 0 2 000 2 2 1 55555555555555555555555 44 222222222222 2 3 7 3 4 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 55 0 3 000000 88 3 55 7 33 55 1 3 000000 1 4 3 2 3 1 444444 1 1 1 2 22 55 1 1 666 3 0 0 1 4 2222 99 3 33 3 0 99999 0 555 2 1 3 7777 3 1 3 0 1 44 22 00 0 22222 7777 0 2 55 88 7 3 777 4 222222 4 888 88 4 1 2 22222 9999 22 44 1 66 1 8 11 55 8888 555555 11 9999999 0 2 55 3333333 1 222222222 55 1 22 888888888888 3 3 1 11111111111111 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 33 888 99 0 5555555555 0 1 4 4 0000000000 1 1111111 8 8 0 2 3 66 11 55 0 4 6 8 8 1 1 1 1 0 1 2 5 22 4 1 1 0 55 0 1 1 0 44444 777 22 1 66 55555555 33 5 11111111111 1 55 1 000000000 0 1 00 555 0 1 0 66 4 2222 44 1 5 1 1 77777777777 22222222222222222222222222222 5 000 000 000 3 7 99 999999 3333333 1 4444 0 8 1 3 1 33 8 0 888888 33 3 3 0 4444 1 888888 3 0 888888 2
lowQualScore : . . .. . .. . . .. .. .. . . . . . . .. . . . ..... . . . . .... . . . ... . . ... . . . . . . . ... .. . ...... . . . ... . . . ....................... .. ............ . . . . . . .................................................... . .. . . ...... .. . .. . .. .. . . ...... . . . . . . ...... . . . . .. .. . . ... . . . . . .... .. . .. . . ..... . ... . . . .... . . . . . .. .. .. . ..... .... . . .. .. . . ... . ...... . ... .. . . . ..... .... .. .. . .. . . .. .. .... ...... .. ....... . . .. ....... . ......... .. . .. ............ . . . .............. . ......................................................................................... . . . .. ... .. . .......... . . . . .......... . ....... . . . . . .. .. .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . . .. . . . . ..... ... .. . .. ........ .. . ........... . .. . ......... . . .. ... . . . .. . .... .. . . . . ........... ............................. . ... ... ... . . .. ...... ....... . .... . . . . . .. . . ...... .. . . . .... . ...... . . ...... .
lowQualScore : 0 7 11 4 11 4 9 33 11 44 4 1 9 4 0 0 55 0 3 4 55555 0 6 3 6 4444 0 9 5 444 6 6 333 6 7 8 3 0 5 6 333 22 2 666666 3 0 2 666 5 2 6 55555555555555555555555 66 333333333333 8 6 2 6 5 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 00 3 6 555555 33 6 00 3 99 00 6 6 555555 0 5 6 5 6 0 111111 8 6 5 6 44 00 0 0 444 6 3 6 8 5 7777 22 9 22 6 2 11111 2 666 6 0 6 7777 6 0 6 5 0 88 33 22 3 77777 7777 2 8 00 55 3 6 000 4 888888 4 222 33 4 0 7 00000 7777 22 00 9 11 0 0 55 55 5555 222222 88 2222222 5 4 00 6666666 2 444444444 00 0 33 666666666666 6 6 2 44444444444444 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 0 4 55 888 66 2 0000000000 7 9 4 4 2222222222 0 0000000 2 2 6 7 6 88 33 00 4 0 0 0 0 0 0 4 0 3 2 3 5 44 0 4 2 5 22 8 0 9 2 55555 111 11 0 00 44444444 44 7 99999999999 3 11 0 888888888 8 0 44 000 2 9 9 11 4 7777 66 2 4 0 0 11111111111 66666666666666666666666666666 7 000 000 000 5 3 22 222222 2222222 0 2222 6 0 4 8 0 88 0 0 888888 88 2 2 0 2222 2 888888 2 5 888888 5
consensus : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
Reference ( family-2881 ) : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|1 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TAGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCATTTTCTATTATTTGAGTATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGTTCTT--------G--TT-C-ATT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTAC-CATTAATAGAGTTT------TTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGTTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATCGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTTAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ACTAACCGATA-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTAAA---CT----T--CAAG--TTATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCACATTAAAATCACGGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AATGA---G----G-TTTTCAAAAAA--GGTA-GGGC-AATCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTAACAAATAATTTCCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCACCATTTTTTATTAAATAGGACTACTACTCCTCTTGAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCATTTACT-T--CCCCACTGTGATTC-AATA-----------AACTTTTCAG-ATAT-ATGA----GTTGAATGAACATCTTGAAGACAATACATATCACAGTTTTTCGACTTTAAGTAATT--GAAA-ACATCTCTCCG-TTTTTCCACAGAACCAAGACCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATTGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAGTAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATATATAAAACTT-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTTATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTTATTGGTACACAATCAAGTACTACATGTAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATATTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|10 : ATTCTTTATTATCCAGTTAAGGCACAGAACAACCTTTAAGTTCCATTT--C-TATGTTTGTATCTA--AGGAC-GCAATGTCTCTATTTG
gi|10 : CTCTATT--TGAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG-ACCC-ATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---TTTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TA-CTGTGTTTTTCATCATCTTCTATAAGCTGTGCGCTTCATCT--A---AG------TA-T-ACTCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTT-ATTGTT-CAATGTT-ATT----TGCT---TTTA--------A--TTGG-ATT--------CTA--TAATATCA--ATATCTTCAA-TTAAT------TG-T-T--TTCT-AACT--TT--TCAT-ATTCGT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGATATTGATTTGCCTC-TTATTTT-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAAAAG-------TTTATTGGAATTTGAAGTTTATCA--TTGGGAAT---ATTTTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATAAACTGGTACATGTAGTTCATATTATAATTTAACTTC-ATTA----ATTTTTATC-TTTTATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTACCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTT--AAGATGT--GAAAGTA-ATTTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTaaatttgatcttgatcgtttataaaagacccatcttctttttcaatttttggaatatttttatttaaacagttatgagattccaaattacaaaaatatttactgtgtttttcatcatcttctataagctgtgcgcttcatctaagtatactctgcatttttgtttttcttatattttcaagagaatcttttttcatatgttattgttcaatgttatttgcttttaattggattctataatatcaatatcttcaattaattgttttctaacttttcatattcgttctttttaaaacatgagtaagatattgatttgcctcttattttcattaatagtgtttctaaaaaaagtttattggaatttgaagtttatcattgggaatatttttttatattttcaatttgataaactggtacatgtagttcatattataatttaacttcattaatttttatcttttattgttgttaaataatctatgtctttaagcaaactattattatgttaccatagtggttttccttttttaagatgtgaaagtaatttttaaaataaccatagagtggtctgaccttaataa
gi|11 : attctttattatccagttaaggcacagaacaacctttaagttccatttctatgtttgtatctaaggacgcaatgt-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTACCCGTAATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTTATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-TTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTGTATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACTtaataa
gi|12 : -----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A--TAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCAATTGAA-GCGTGCACTGTCATCGTAAATG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGGATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAACAT-AGAATTTAATTTCAAAATATATCTTACTGTCATATTATTTATTTATCATATATGTAGCTTACATGTGCAAAAATGGATTTAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATATTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAGTC---TAC------TAAATATTCGACTTACAAACAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTCCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACTagacagacagacag
gi|13 : ---TA-A-TCTTAA-CAC-A---T----A-TTTTCAAAAAATAAAAA-GGATGA---AAAGATTTGGGTCCATATACTGTAAG--AAGTGTAAAT-TGTTTTGATTCTGCTGT-CAT-GTCAAGTGTCATGAAATTACCTTC-------CTTATATTCATTATGCACCTTGCACTCAAAG-TTTTTACTGAATAATATTGCAACGCCTCATGCATTAGATTTGATAA---AATTAAAAATAGCAGTCA--------CCGTT-CTATTG-AGCG-----TAAATAAACTT----GT-TTT-GTGACTCAGTAAAATGT--GTT--------------TATGACATTTTTTATCTTGTAAATA-TC--GAAAGACGTCTACTCT-CTTTTaccaggcaggca
gi|14 : taattaaactttgaatcaagcacaagattaaaatcgccacctgtcatatatgtatcattacctatatcatttaGGCGAATCATT-ATTGGGA-CCATAAAGGGCTAC--AAATGTAAACCTGTTATTAT-CTACAGT-TAA-ATCTGCAATGATAAAATTACCCTCACTATCCGAAATGTG-A-CATGTATTTTATAGGCTACG-TTCTTGCCAAATAATAAAACAACCCCAAGGGATTTGGA-AGTACCA--GAACTAAACA-AGCAGTCATT-T---CCCAATGGAGTACGAATA-----------AACTGTTCAGTAGGT-GGT-----GTAGAGTGAATGTCC---------------TGACATTTTTTGGCTTTTAGATAGTT--AAGT-AAATCAATTCT-TTTCTCTGCTGAACCAAGACCTT-----------GGCAAT-----------------TA----------ACTGACAATATCTTTATATCTGTCATTTATTC--TTTGATTATAAAAATTAACCTCACAGATACAGCTTCTAGAATCAATGAAAA----ATATTAAATGCAAT-AAGAA----AATAggttgccatttaggcctaggcaattcagggatagaatcttgatattaatgtctatcac
gi|15 : cAGTTCATTTTTTC-TAAGTTTATATCTT--CTAGT-TCATGATCTCTACTTGAGTATACAAT-TT-TCATAAA-A-AGCTTTTGT---GTCCATAAATATATCTTTTTTATCAGTTATTATAT--TACC-ATCTGTTATTTCTATTTTGGGG-ATA---ATTTTACTTGTAAAGTTGTGCGACTCAAGGC---AGCAAAAG-TATTATATGTG-TTTTCTC--CATCTTCTATAACCTGTACTCTTTGTCT--
gi|16 : ctcttcagctgttaattttgatacatttatatcaaaaATTTCTGCA-GTTCTGATCCCACTCTAAAAA--ATGA----CTAAATGACTACCGAAA-TATT--GGATG-TTTTTTCATCGTCTTCAATTATT---GCC----ATTT--ATTGGAGCATGTTAAT-ACATTGCATTTTTAGTTTTCTTATATTT-TCAAT-G-----A-C-----T-------ATTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAAGATT-ATTTTG-TCATAGAGCTT--------G--TC-C-AAT--------TTA-------TCA--ATTTCGTCTA-TTAAT------TA-A-TAATTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCATTTTAATTCACGAATATGAAAATGATtggcaaggatggtattctct
gi|17 : ACATGCATATGAACTTGATTTACCTCGT--TTTCTCATCAATATTATTTGAAATTCTAAAAATAATTGGTCATTTGTAACAAACTGTATATCATTATTTTACGTAA---A-TTTTCCAT-TT-----------TTATA----GATA-A--------ATAC--ACA----ATATC-ATTATTTTA-TTTCTTCGATGTATTATATTTACATATTCAATATT--ATTCAAAAGATAGTTATTATGCTCCAATGAACATTTACCG----T----GGTTTAAA--TCATTAAAACATA---ATTTAAGA
gi|18 : AAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATCTGGA-CCATATAAAGAGAC--TAATGTAAGTCGATTACTAT-CAACAGT-TAA-GTCTATAATTGAGCAATTACCTTCAGGGTCATTTATATA-AGTATGAACTTCATAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATAa
gi|2 : tagtatGAGGATTCCAGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTGTCTT--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTT-TA--CAATGTT-TGCTAAA-A-TGATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-GCTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTCAATAACTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAG-TATT-TGGATG-GTTTTTCATTATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAA-G-----A-A-----T-------CTTT--T
gi|2 : TGATTTGTAATAAA------TG-T-ACC--GCTTTCTT---TTTCT---ATTTTT---G-G-----A-A-----TTATTTTACTTCAATAA---CTATGAGACTCTA-A--GTTACAGAAGT-ATT-TG--GATGG-TTTT------------T-C-ATTATCTTCTATTA--T--T-TGAGCATGTGATCTAATTAATATACCTTG-CAT--TTTT-AGCTT-TC--TTATATTTCTTAAAGAATCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTTCACCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTT----------------CATCA--TTTGGTAT---A-TTGTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----TATACTGAGTTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTC-ATTTATAGTTGTTAAGTAATATGTATC--TTGCAACAAACTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--CAACCTA-ATATTCAAAGTAATCA---TAGACTGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ATTAACCTATG-ATAATTGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTATTTTAAAGG-GTTTTTCT--TTCTTCA----TGTATATCGCCTAGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTAAT--------------GCAATATTGTTAATATGTCTAT-AAT-TAAAACAATCTAGT-------TTTGA---A-------T---C-----------TTGT----------ACCTTATTAAAATCGTCGCAGAAAATAATTGAT---GTATTATTGAAGGT---------------------------------TTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGATAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCACCGTGGTCGTTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAA-AGGACTGCTTCTCCTCTTTAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCAtaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcatttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|2 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatctT-TTA-----GTTGAATGAACATCTTGCAGACAATATATATCACAGTTTTTCGACTTTGAATAATT--GAAA-ACATCTCGTAG-TTTTTATACAGAACTAAGTCCCT-----------GACAAT-----------------TAACTGATAATATTTTA-AGT---TCCGTAT---TCA---ATATAGATTAATTGT--GAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA-------TAGAATATAATGAAAAA----A-TATGAAAACAATATTCGCCTAAA-ACGTGCACTTTCATCG-------AAAATGCAC-AAAACTCTGATAAATTATAAAAGCCATTGTTGCTCATATTCAGTGTTTTGGAATTACAATTTAACCATTTGAATTAAGGAGCTA------TTTTTGAAGAATATAATTCTGAGCATT-T-TTTTACTATTACAAAATATATGTAATAATGGAAAAAATATAATCTAATAATGTATAAAAC-T------TTACATGCAAAATATCACTTGCTGTCATAATATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATAAAAATGTTTACTTTTATCTATAT---GTATCTAATGTTGAGAAAACATAATAAAACATACATGATATTCTCTGTGTTGAGCTTATAACTATTAAATGATACACAATCAAGTAC------TTAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATTTACCATAATTTCTAAGTG-TTAAATAATCCATAACTTtttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|20 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccgctttctttttctatttttggaattattttacttcaataactatgagactctaagttacagaagtatttggatggtttttcattatcttctattatttgagcatgtgatctaattaatataccttgcatttttagctttcttatatttcttaaagaatctttttaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcaGGATGGTATTCTCTAAAGGGGTCAATAAGATTATGTG-------TTGATTTT--A---TT----T--CTAA--TAGCTG------------TT-CACG-G----------------GCATT--------------TTT--AT-T-----------AT-------T---T---A-------T---A-----------T-GT----------
gi|21 : tctttgtcttggcaaGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAttgtaattatagtatatcta
gi|22 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTT
gi|23 : acTTTAGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACA-CTTTTCAACCGAt
gi|24 : tgCTGATTTGGA-CCATATAAAGAGAC--tt
gi|3 : agacTCGTTATTTGCATA--TAAGCTA-TCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTCGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TACAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCATGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT------TTGCGCAAA-GTTAC-A-AGTTCTT-------CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TTA--T--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------TTTTCTTATAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTC-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTTT-----CTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAATATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATT-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCTGACCTATAGC-TGGCTTCAAAAGTACATTT-----AATTCGCTTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAA-AAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA---------GTG---GA--CGGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTGGATCTTGA-ACTAAACTGTAATCCCCGC---AAATAATTATG---TCATTAT------TATTTATA-GTGTCTGA-AAT-ACTCATTTTA-TTATAAAAAAA--ATTT-GGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTCCATCCCTGGAATTGCT-TTTCCCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-AGTATGTATT-----ATTTTTTCCGTATTT-TTG-----GTAAAATGGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGAATTTAAATTGTT--GAAA-ACATCAGTACGTTTTTTCTATGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------taaag
gi|4 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttatTCGTTATTTGCATA--TAA-GTTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTTGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TGCAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCGTGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT-TTGTG-----CAAG-GTTACAA-G-----TTCTC---CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TTA--T--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------T-TTCTTACAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTG-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTT------TTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAGTATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATC-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCCGACTTATAGC-TGGCT------TCA-A--TAGTACATTT-GATTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAAAAAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA----G---TGGA---T----GGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTTGGATCTTGAACTAAATTGTAATCCCCGC--AATGTCAT--------TATTATTTACAGTG----------TTTGA-AAT-ACTCATTATA-TTATAAAAAAA--ACAATGGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTACACCCCTGGAATTGCT-TTTCTCA--AAACTAAATA-TGCAATCAT---------GCTGCCATTC-AGTATGTATT-----ATTTTTTCCATATTT-TTG-----GTAAAATAGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAGA-TCATCAGTACG-TTTTTCTACGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------actgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|5 : aaactttccaatgtcatggactctgtattagttaacttatTTCTTCATTATTAAGTTTAGGCACAGAACAACCTTCAAGTTTCATTT--C-TATATTTGTATCTA--ACAGT-TCATTGTCTCTATTTGAATA--TAAAGTT-TCGTAAA-AATG-TTTGGCTTCATC--TAAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG--ACCGATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---ATTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TACTTG-GTTTTTCATCCTCTTCGATAAGCTGTGCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-TCCCTGCATTTTTGTTTTCCTTATATTT-TCAAGAG-----A-T-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ACTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CGTTAA--ATT--------GGATT-C--TA--------ATA--T--A-TCG--ATTTCTTCAA-CTAAT------TG-T-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGAAATTGATTTGCCTC-TAATTTC-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAATAGTTGATCACTTATTGAAAATTGAAGTTGGTCA--TTGGGAAT---A-TCTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATTGTAATTTAACTTC-ATTA----A-TTTTACC-TTTTATTGTTTTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATGTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGGA------GTA-AT--AGTACAATT-GTTTACAGACG-GTATTAA--A---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAG--TCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTC--TTCTCCA----AGTATA---CCTTTTAAAATT--TGGGTTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTGTCTAA---TT----T--CTAG--TAACTT------------GT-TATGTGATTTAACATTATTCATGCACT--------------TGT-AAT-TAAA--------GT-------T---ATCAACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ACTAAGTTGAAATCCACACAAAAATTGATTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ACTTTTAATAAA-A---G----A-GTATCAAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATTTGGA-CCATATAAAGAGACTAAAGTG--AATCGATTACTAT-CAACATT-TAA-GTCTATAATTAGGTAATTACTTTCCAGGTCATTTATATA-ATTATGCACTTCATAGTCAACA-TTTTTATCAAATAATACTGCAACACCTCTAGAATTGGA-AGAGAAT--GAAGAAAATA-AACAACGGTT-G--CCCCATTGTGACTC-AATA-----------AACTTTTCAG-ATGCAATA-----GTTGAATGTATATCCTACAGACAATATATATCACATTGTTTTGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACG-CTTTTCAACCGGTCCCAAACCCT-----------GACAGTTAACAGTTAACAGATACTA----------TTTTA-ACT---TCCATAT---TTA---CT-C---TTAA-AGT--AGATTAA---TGCACACAGTG------GAGTC----CAAATCTTA-ATA-AATATATTGAATTGTTTCAACAT----------TTCATGTGACTGC-TGTACTTTCATTTCAAAAAT--ACTGCACAAAAAATCTGATactgacataatatcaatatctgtcatttatatatattttcttagatagtagtatgaccagatggagagagggaatccatagaaacataacaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgaaaatcaaagcaagccatttaaccatttgctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatataagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaatgttaacac
gi|6 : TT--C-TAAATTAATATCAATTAAATTGTCA---TCTTTACTAGAGTA--AAGATTT-TCATAAG-A-ACATTTTGCTTCGTT--TAAA-ATTTCGTTTTGGTCTGTTATGA--TGCTACC-ATCTGATTTTCCGAATTTAGGTTATC---ATTTTATTTAAAGATTTAAAAGTTTCTTAGT---TACAAAAAGTAGT-TTGTTG-GTTTTTCGTCATTTTCTATTATTTGTGCTCTTGAGCA--TATCA-------TA-TGACCTCGCATTTT--GTTTT------------AAG-T-----ATA-----T-------CTTT--TAAATTC-----ATTTTTAGATT-TT-CAATATA-AT-------CTA--TATT-----------TT-C-ATT--------TG---------CG--ACCTTAT--------T------TT-C-T--TGTT-ATCTAATTGGTCAT-TATTTT------TCTTTTTATTGCATGAATATGAAATTGGCTTCCCCC-TTATTTC-CATTAATAAAACTT------AGAGGAATAGCTGGTCATCTATAGTGAACTGTAATTGGTTA--TCGGGGATCAAA-TTA---ATGTTTTCAAGATTT--TATACA--GGCA-ATG-----AATATTG-GATTTAATTTCGAT------A-TTTTATT-ACCAATGATCTTTAAATGATCTAGATCGGTTAAAAGAGA--ATTATTGTGTTTCCATAACAGACGCCCAGGAATGAAATTTGTAAAAGAC------------ATATTAAGAATTACCA---TTGAGTGATCTGACCTATAAC-TAGGT------TCA-ATAGAA--CATTT-GTTTACTGAAGCAT----GTAAATTTTCT--GATAAAAGAAAATAATCAAG--CCTGGCTTGTTGCAACGG-TGTTTTAT--TCCTCCA----TGCATATCTTCTT--A---ACAATGGATTATTTTCTCTAAA-GGATCAA-TAA-----------------GAT---TAA---CA----T--CGTGCATAATTT------------ATCTAGGT------------------------------------TGT-AGT-C------------------------------------T---------------T-GT----------ACAACATTGAAATCTCCGCAGAGAATATATGGGTTAGTATTATTTATGG-AT---CGTGCTTTTGA-CAT-A---AT---A-TTATTAAAAAAT-GAT---GGTGAGTCAAT-ATTTGGC-CCATATA---AATT--AA---TAAA---GTGATTAT-CAACTGT-TAT-GTCTATTATAATGAAGTTCCCCTCAGTGTCAGATAAGTG-TTTATGAATTGTAAAGTCAAGG-TTTTTATTAAATAAAACTGTTACCCCTCTTTTATTAGA-AT--TAACTGAGCTAAATA-GGCAATTATTGTTACCCCACTGTGTCTG-AATA-----------AATTTTTCAGTGTGT-TGT-----GCAGAATGTATGTTCTGCAGACAATAAATATGACAATTTTTGGCTTTTAAATAATTAAAAAA-ACATCTAGTCT-TTTTTCCACAGAACCTAGCCCCTAGCAATTGACAGACAG------------------TA----------TTTTA-AAC---TCCATAC---TTA---
gi|7 : ttcttctgtactaagtttaggaatgtcataattaataaatccccgAGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TGGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCTTCTTCTATTATTTGAGCATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATACTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGATCTT--------G--TT-C-AAT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTTC-CATTAATAGAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTCGGTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTGTTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTCAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ACTAACTGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGATCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CTAA--TAATAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAATAT------------TGTTAATAT-----------GTCTATAATT---A---AAACAATCT---AGTTTTGGATCTT-GT----------ACCACATTGAAATCACCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AAT-G---A----GGTTTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAATAGGACTGCTACTCCTCTTGAGTtctataa
gi|8 : AGAGGATTCCTGCATGCTTTGTTTGGGCACAGTGCAATTTTCAAGTTCAATTT--CATAA-------TC----AAAAT-TCAGGGTGTTTATTTTTGTA--CAATGAC-TGGTAAA-A-TTATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATA-TACC-GTTTTCTTTTTCTGTTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAACAACTATGAAACTCAAAGT---TACGGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTTATCATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-A-CTTGCATTTTTAGCTATCTTACATTTCTTATG-G-----A-A-----T-------CTTT--AAA---T-----GTTTCTT-ATCGTT-CAATATT-ATCG-G-TGAT---------------------------------------T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-ATTTC-TT--ACGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTT-CCCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTATAAACAGTTGGTCATTTATGGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGGTTT---A-TTTGTCATGTTAAC----TTTATTATATTTTGGTA-ATG-----CATACAGAATTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTT-ATTTATAGCAGTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAACCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTCAAAAGGCCT--AGACACA-ATATTCAAAGAAATCATACTAGAATGATCTG-----TAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ATTAATCGATG-ATTATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-ATTTTTCC--TTCTCCATTCCTGCATGTA-----GTA---TC--CGGATTGAGTTCTCTAAATGTGTCAACTAAAT--TGTT-------TTGATCTTTTA---TT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAC--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-AT----------
gi|9 : cCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-ACCCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ATTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CTTTAA--ATT--------G-----A-ATT--------CTAAAT--TATCA--ATATCCTCAA-TTAAT------TG-C-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCAT------TCTTTTTAAAACATGAATGAGAAATTGATTTGCCTT-TTATTTC-CATTGATAATGTTA------CTAAAAAAAGTTGATCATTTATTGAAAATTGAAGTTGATCA--TTGGGAAT---A-TTTTTTATATTTTCAA--CTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATAGTAATTTAACTTC-TTTA----A-TTTTGTC-TTTAATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TT-TAGGTAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATATTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTTTGA-------GTA-A--TAGTACATTT-ATAAACAGATG-ATATTA--AA---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCTCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTTTTCTCCA----TGTAGA---CCAAGTA---TT--TGGGGTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTCTTTTA---TT----T--CTAA--TAACTTATGTGATTTAACAT-TAT-TCAT--------------GCACT--------------TGT-AAT-TAAAATA-----AT-------C---A---ACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ATTAAGTTGAAATCCTTGCAAAAAATAACTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ATTTTT---AAT-A---A----A-ttat
blockSeqs : A TT A TT G A AG TA TG A C C A C T CA T T AAG G T T TCTG C GAC G A ATG T A A A G T GCT GT G GCATGT A G C TGT C C C GTTACAAGTTCTT AA CTATGAGAC G G T A T G ATAATGCTAGCATTAAAAAATTGTTCTATTTTATT C GC A ATACCT CA A AA T AA GG A A AAAGAA A G G T T T GAAATT A T G A GT TT G A CAA T A T AAGA AT A CT C TAGTT TAA A T G TTTT T A G T TT GG TA AGGAA GAAA G TA AG C T TAC T TCAAAA C TTG TA C A C ATAA AATT CA CA G TC A T TC TT TTCC TATCGC TA AAATT T TA AATGGAT C AACCTTTTC AA A CA ATGTGATTTAAC C G A TTAACATTATTCAT A ATTGTTAATATGTCTATAATTAAAACAATCTAGTTTTGAATCTTGT C T G AG TTA TG TTTATAGTG A T . CTCATTTTA T TAAAAA G A A G T CT TA TA T T G T A T C T A T A CT C C C G G T TTTGA CTG TT A TA TTGTTACC CT G TAAATA A TA T GTGACTCA T TAT A AA G TACT GT T T A A AGCAATTGACA TAACAGTTAACAGATACTA C ATC CTG TTT A A AA CTTCTA TCTTAA G TTTC T C T T TG A A CCCGTA TA A A A TTA T TATATG A G . C
blockSeqs : T . . . . T CA . GC . G C . A G . . T TAT . T . A A . . . GGA . A A A C T TCT . T . . G T TAG C T C GTTACAAGTTCTC . ATTCATT C . C . G G ATAATGCTAGCATTAAAAAATTGTTCTATTTTATT C . . . CA . . T C . A . . T A . A . T T T A C T TA . A T . . G A AA GT T TT . . ACA T A . . . T . T TA A TC G . A . CA C A . . . . TTT TA . T T GTAT A CA TT T . G T TC . . TATCGC TT ACAA G . AATGGAT T AACCTTTTC . T C . . G G . T ATTGTTAATATGTCTATAATTAAAACAATCTAGTTTTGGATCTTGT T A C AA . TT TCGTGCT G . . CTCATTATA T ACAAT G G A G . GG CT . . T G T T A G T A C A GA . T T G C G AGTA G CT C A TTGCC GA . TGTATT C TA G AATA A AAA G . . AATT T T A A T . TAACTGATAATA . . . . A A . . ATA G . . G T T A . . . . A A . ATA A . A A . C
blockSeqs : T . . . . G CA . AG . C . . A A . . A ATG . T . A A . . . GGA . A G T T A ATG . A . . G T TAG C C T GAATTATTTTA . CATA C . T . A . TGGATGGTTTTTCATTATCTTCTATTATT G . . . G . . . T . A . . T C . A . A . C A T T TA . T T . . A G AA GT A TA . . AGT T G . . . T . A TT A GC . . G . CC . A . . . . TAG TA . T T ATAA A . AA T . G . TT . . TATCTT TT TC T . . C CTAA . A C . . G G . T TGTAATTATAGTAATCTAATTTTGGATCTTGA T A C AG . CA TTAACT G . . ATA A ACTA A G A G . AA AG . . A . . T A T A A T G TT . A T A T T AGAA G GA A T TTTC CC . TGTATT C TA T GGT A AAA C . . TCGT T A C T T . TA . . . . T A . . AA A . . T C A T . . . . . . . T C . . . . .
blockSeqs : A . . . . G AA . AT . C . . A A . . A TGC . T . T T . . . TGT . A A T T T CCA . A . . . C TGT C C C AGAAT . TGTT G . T . T . TTGCGTTAAATTGGATTCTAATATA C . . . A . . . T . G . . T A . A . T . T A T T TA . A A . . A G AA AT A TA . . ACA T T . . . A . T TT . TA . . T . AT . G . . . . TTG . . T A ATTA A . CA C . T . TA . . TATCGC TT TC A . . T CT . T . . . G A . T TGTAATTAAAGTTATCAACTTTAGGGTCTTGC T A C AG . TT TTAACC A . . AGG A GGTA G G A G . TT AT . . A . . G T C A A A A TT . A A A A G TTTC A CT T T T CC . . A TG T TTA G TAT A . . CAAA G T G T T . TA . . . . A . . . A G . . T . . . .
blockSeqs : T . . . . T AG . CG . C . . A G . . A TGC . C . A A . . . TGT . G C A A T CCG . A . . . C TAG C C C AGATT . CATA T . C . T . ATGTGATAGATCTTGTTCAATTTTT C . . . G . . . T . G . . A A . A . T . T T A A GT . A A . . A T . AT T CT . . ACA A T . . . A . T TC . AA . . T . AT . A . . . . TTT . . T T ATAT A . CA A . C . TC . . TGTA TT GA A . . T TT . T . . . G A . C TGTAATTAAAATAATCAACTTTAGGGTCTTGC A C T AA . TG TTAATT G . . TA A ATTT G G A G . AA AG . . A . . A A T T T C A GA . G A A A G TTTC A CT T T T TG . . A T G TTG G TAA G . . AGTA A T G C A . TA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . G TG . TG . C . . . T . . T AAG . T . A A . . . ACT . A A A A T TCT . A . . . C TAG C . C TATAT . TGTT C . C . T . TTGCTTTAAATTGAATTCTAAATTA C . . . G . . . C . A . . A G . T . T . T A T T AT . G A . . G T . G C TT . . TAA A T . . . A . T TA . GC . . G . AG . A . . . . T . . A T CAT A . TT C . A . TC . . TAC AA TC T . . G CT . T . . . G G . A TGTAATTATAGTAATCTAATTTGGATCTTGA C C A . . CA . G . . GA A ACTA G G . G . AG TT . . A . . A A T T T C C GA . G A A A A AGAG G GA T A . TG . . . A G TTG T . G . . AGTA G A C T C . TA . . . .
blockSeqs : . . . . G TG . T . G . . . T . . T TGC . T . A C . . . TGT . A T A G T TCT . C . . . T TGT C . T AGAAT . TGTT C . T . T . TGCTTTTAATTGGATTCTATAATA C . . . T . . . C . A . . A C . A . A . T A T A TT . G G . . G A . T T TT . . AGT T T . . . A . G CA . GC . . G . CA . A . . . . T . . A C CA . . . G . A . TT . . GAC T TC T . . C TT . G . . . G G . A TTTATTATTTATATGT T A C . . . . . . . AA T TGAT A . . . . AG TT . . A . . T A T G A T A TT . C T A C T AT . CT T G TGT T . T . . CAAA G C A TA
blockSeqs : . . . . . T . G . G . . . G . . A ATG . . . C G . . . GGA . . A T T A ATG . T . . . T T C . T GACT . CATA G . . . T . TTGTCATAGAGCTTGTCCAATTTA C . . . C . . . . . A . . T C . A . A . C G T A TT . C T . . G A . G T CT . . AAT T G . . . T . A TT . G . . C . CA . A . . . . T . . A A CA . . . C . T . . . . G . TT T . . C CA . A . . . . G . C ATTGTTAATATAT . . . . GGTA . . . . . AA AG . . . . . T T A T C C G GA . A A G T T G . . TAGT T TA
blockSeqs : . . A ATA . . . T T . . . GGA . . . T T A ATG . T . . . T G . . C GAAT . . . . . . . . CTATATTTTCATTTG . . . . C . . . . . G . . C G . T . A . C T A A GT . T T . . A T . G T . . . TAA A G . . . T . A . . G . . G . AG . . . . . . . . . T T . . C TT . A . . . . C . . TGTAGTCTTGT . . . . . TT AA . . . . . G T C A A G . TT . A A A
blockSeqs : . T C . . . AC . . . T T . TCT . A . . . C . . . . GAAT . . . . . . . . GGTGATTT . . . . G . . . . . A . . T . . . . T . A . . . . . G A . . . . . . . . . . GA . T . . . G . T . . T . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . . . . AA .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . GAAT . A
blockSeqs : .
blockSeqCons : GAAT******************* A* TTC***** TA TTN****** AA***** **
originalCons : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATT-T--CCCCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNT-NTG-----GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
finalCons : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAGGAAT-------------------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCATTC-----CCGCTGCGATTC-AGTA-----T-----AACTTTTCAGTATNTTTN------GTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAAAA-----TAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCATCGTAAATG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CGCTTTTTTATTCTTACACACAAGTAGTTTAATTTAAATTTTATTTCAAGCCAAAATAAGCTATACTGGTTTTATTGAGCGTGCATGCTTCATGATTTTTGCTTTAAACACTCTGAATAGCCTCAGAATCTTTTTACAGCTTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1 111 1 22222222222222222222222 222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11 111111 111111 2222 11 11 11111 111111 11 11111 11 111111 2222222 222222222 11 111111111111 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111 4444444444 1111111 1 1 11111 4444444444 77777777777 1111 22222222222 33333333333333333333333333333 111 111 111 111111 222222 1111 11 222222 1 222222 11 1 2222 222222 1 222222
lowQualScore : 1 0 66 4 66 4 2 66 66 66 4 1 8 4 0 1 55 4 0 1 44444 4 0 2 3 7777 1 0 0 666 3 3 111 3 5 5 0 1 1 2 444 44 2 999999 3 0 2 000 2 2 1 55555555555555555555555 44 222222222222 2 3 7 3 4 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 55 0 3 000000 88 3 55 7 33 55 1 3 000000 1 4 3 2 3 1 444444 1 1 1 2 22 55 1 1 666 3 0 0 1 4 2222 99 3 33 3 0 99999 0 555 2 1 3 7777 3 1 3 0 1 44 22 00 0 22222 7777 0 2 55 88 7 3 777 4 222222 4 888 88 4 1 2 22222 9999 22 44 1 66 1 8 11 55 8888 555555 11 9999999 0 2 55 3333333 1 222222222 55 1 22 888888888888 3 3 1 11111111111111 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 33 888 99 0 5555555555 0 1 4 4 0000000000 1 1111111 8 8 0 2 3 66 11 55 0 4 6 8 8 1 1 1 1 0 1 2 5 22 4 1 1 0 4 0 1 1 0 44444 777 22 1 66 1111111111 4 0 3 0 11111111111 5 1 5 22 0000 0 1 00 555 0 1 0 66 4 2222 44 1 5 1 1 77777777777 22222222222222222222222222222 5 000 000 000 3 7 99 999999 000000 1 4444 0 8 1 11 6 111111 8 0 888888 33 3 3 0 4444 1 888888 3 0 888888 2
lowQualScore : . . .. . .. . . .. .. .. . . . . . . .. . . . ..... . . . . .... . . . ... . . ... . . . . . . . ... .. . ...... . . . ... . . . ....................... .. ............ . . . . . . .................................................... . .. . . ...... .. . .. . .. .. . . ...... . . . . . . ...... . . . . .. .. . . ... . . . . . .... .. . .. . . ..... . ... . . . .... . . . . . .. .. .. . ..... .... . . .. .. . . ... . ...... . ... .. . . . ..... .... .. .. . .. . . .. .. .... ...... .. ....... . . .. ....... . ......... .. . .. ............ . . . .............. . ......................................................................................... . . . .. ... .. . .......... . . . . .......... . ....... . . . . . .. .. .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . ..... ... .. . .. .......... . . . . ........... . . . .. .... . . .. ... . . . .. . .... .. . . . . ........... ............................. . ... ... ... . . .. ...... ...... . .... . . . .. . ...... . . ...... .. . . . .... . ...... . . ...... .
lowQualScore : 0 7 11 4 11 4 9 33 11 44 4 1 9 4 0 0 55 0 3 4 55555 0 6 3 6 4444 0 9 5 444 6 6 333 6 7 8 3 0 5 6 333 22 2 666666 3 0 2 666 5 2 6 55555555555555555555555 66 333333333333 8 6 2 6 5 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 00 3 6 555555 33 6 00 3 99 00 6 6 555555 0 5 6 5 6 0 111111 8 6 5 6 44 00 0 0 444 6 3 6 8 5 7777 22 9 22 6 2 11111 2 666 6 0 6 7777 6 0 6 5 0 88 33 22 3 77777 7777 2 8 00 55 3 6 000 4 888888 4 222 33 4 0 7 00000 7777 22 00 9 11 0 0 55 55 5555 222222 88 2222222 5 4 00 6666666 2 444444444 00 0 33 666666666666 6 6 2 44444444444444 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 0 4 55 888 66 2 0000000000 7 9 4 4 2222222222 0 0000000 2 2 6 7 6 88 33 00 4 0 0 0 0 0 0 4 0 3 2 3 5 44 0 4 2 5 0 8 0 9 2 55555 111 11 0 00 6666666666 0 7 0 7 33333333333 7 6 0 44 1111 8 0 44 000 2 9 9 11 4 7777 66 2 4 0 0 11111111111 66666666666666666666666666666 7 000 000 000 5 3 22 222222 000000 0 2222 6 0 4 00 0 000000 0 0 888888 88 2 2 0 2222 2 888888 2 5 888888 5
consensus : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACG-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCA--TT-----CCCGCTGCGATTCAGTA-----T-----AACTT-TTCAGTATGT-TNAGTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCA--TCGTAAA--TG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
Reference ( family-2881 ) : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACNGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTGCGTA--CAANGTT-TCGTAAA-A-TGATTTNGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATCTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATN---ATTTTACTTGAANAGTTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAA-TATT-TGGNTG-GTTTTTCATCATCTTCTATNATTTGTGCNCGTGATCT--AATNAA------TA-T-ACCCTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTCAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---C-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTNTG-TGNTAG-TNTT--------G--TT-C-ATT--------TTA--T--T-TCA--ATTTCATCTA-TTAAT------TN-C-T--TTTC-AACTC-TT--TCGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATANGAAATTGATTTNCCCC-TAATTTC-CATTAATAGNGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTNGGNAT---A-TTTTTTATGTTNTC----TTTGTTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGATTTTATNTC-ATTA----A-TTTTNTC-ATTTATNGTNTTTAAATAATCTATATC--TTGCAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACGTA-ATATTTAAAATAATCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-GTTNACCGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAANGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CNAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCANT--------------TGT-AAT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCANATTGAAATCCCCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATCGAAGGTAT---TA-ACTTTTGA-AAT-A---A----A-TTNTCAAAAAA--GNTA-GGGCGAGTCACTGATTTGGG-CCATATANNGANAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACAGT-TAA-GTCNATNATCANATAATTACCCTCGGGGTCANTTATATG-ATTATGAACTTTAAAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATACTGCTACNCCTCTTGAATTGGA-ANNATAA--GAACTAAANA-NGCAATCA--TT-----CCCGCTGCGATTCAGTA-----T-----AACTT-TTCAGTATNT-TTNGTAGAATGNACGTCCTGCAGACAATANATATGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAAA-ACATCNANNCG-TTTTTCTACGGAACCNAGNCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCA--TCGTAAA--TG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-T-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|1 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TAGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCATTTTCTATTATTTGAGTATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGTTCTT--------G--TT-C-ATT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTAC-CATTAATAGAGTTT------TTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGTTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATCGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTTAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ACTAACCGATA-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTAAA---CT----T--CAAG--TTATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-GT----------ACCACATTAAAATCACGGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AATGA---G----G-TTTTCAAAAAA--GGTA-GGGC-AATCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTAACAAATAATTTCCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCACCATTTTTTATTAAATAGGACTACTACTCCTCTTGAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCATTTACTTC-----CCCACTGTGATTCAATA-----------AACTT-TTCAG-ATATATGAGTTGAATGAACATCTTGAAGACAATACATATCACAGTTTTTCGACTTTAAGTAATT--GAAA-ACATCTCTCCG-TTTTTCCACAGAACCAAGACCCT-----------GACAGT-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCA--TTGTAAATGTG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAGTAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATATATAAAACTT-AGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTTATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTTATTGGTACACAATCAAGTACTACATGTAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATATTTACAGCAGACATCTTATACT
gi|10 : ATTCTTTATTATCCAGTTAAGGCACAGAACAACCTTTAAGTTCCATTT--C-TATGTTTGTATCTA--AGGAC-GCAATGTCTCTATTTG
gi|10 : CTCTATT--TGAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG-ACCC-ATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---TTTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TA-CTGTGTTTTTCATCATCTTCTATAAGCTGTGCGCTTCATCT--A---AG------TA-T-ACTCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTT-ATTGTT-CAATGTT-ATT----TGCT---TTTA--------A--TTGG-ATT--------CTA--TAATATCA--ATATCTTCAA-TTAAT------TG-T-T--TTCT-AACT--TT--TCAT-ATTCGT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGATATTGATTTGCCTC-TTATTTT-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAAAAG-------TTTATTGGAATTTGAAGTTTATCA--TTGGGAAT---ATTTTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATAAACTGGTACATGTAGTTCATATTATAATTTAACTTC-ATTA----ATTTTTATC-TTTTATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTACCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTT--AAGATGT--GAAAGTA-ATTTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTaaatttgatcttgatcgtttataaaagacccatcttctttttcaatttttggaatatttttatttaaacagttatgagattccaaattacaaaaatatttactgtgtttttcatcatcttctataagctgtgcgcttcatctaagtatactctgcatttttgtttttcttatattttcaagagaatcttttttcatatgttattgttcaatgttatttgcttttaattggattctataatatcaatatcttcaattaattgttttctaacttttcatattcgttctttttaaaacatgagtaagatattgatttgcctcttattttcattaatagtgtttctaaaaaaagtttattggaatttgaagtttatcattgggaatatttttttatattttcaatttgataaactggtacatgtagttcatattataatttaacttcattaatttttatcttttattgttgttaaataatctatgtctttaagcaaactattattatgttaccatagtggttttccttttttaagatgtgaaagtaatttttaaaataaccatagagtggtctgaccttaataa
gi|11 : attctttattatccagttaaggcacagaacaacctttaagttccatttctatgtttgtatctaaggacgcaatgt-----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCACTTGAA-GCGTGCACTCTCA--TCGTAAA--TGTGAAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGAATAAAGAAGCTACCCGTAATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTTATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAAC-TTAGAATTTAATTGCAAAATATTACTTGCTGTCATATTATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATATAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATGTTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAATCGAGTAC------TAAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTGTATACCATAGCTTCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTCACAGCAGGCATCTTATACTtaataa
gi|12 : -----------------TA----------TTTTA-AGT---TCCATAT---TCA---ATACAGATTAATTGT--AAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAA-----A-ATAGAATATAATGAAAAA----AATATGAAAAAAATATTCAATTGAA-GCGTGCACTGTCA--TCGTAAA--TG--AAATGCAC-AAAACTCTGATAA-TTATAAATGCCATTGTTGTTCATATTCAGTATTTTAGAATTACAATTTAGTCATTTGGATAAAGGAGCTA------ATTGTAAAGAATA--ATTCTTAATAGTATATTCTACTATTACAAAATATATGTAATAAAGGAAAAA-TAGATCCTAATAATGTATAAAACAT-AGAATTTAATTTCAAAATATATCTTACTGTCATATTATTTATTTATCATATATGTAGCTTACATGTGCAAAAATGGATTTAAATGTTTACTTTTATTCATATACTGTATCTAATATTGAGAATACATAATAACACATATATGATATTCTATGTGTTGAGCTTATAACTATTAATTGGTACACAGTC---TAC------TAAATATTCGACTTACAAACAAACACCTACATGATGTCATCTGTATATACCATAGCTCCTAAGTGCTTAGATCATCCACATCTTTACAGCAGACATCTTATACTagacagacagacag
gi|13 : ---TA-A-TCTTAA-CAC-A---T----A-TTTTCAAAAAATAAAAA-GGATGA---AAAGATTTGGGTCCATATACTGTAAG--AAGTGTAAAT-TGTTTTGATTCTGCTGT-CAT-GTCAAGTGTCATGAAATTACCTTC-------CTTATATTCATTATGCACCTTGCACTCAAAG-TTTTTACTGAATAATATTGCAACGCCTCATGCATTAGATTTGATAA---AATTAAAAATAGCAGTCA----------CCGTT-CTATTGAGCG-----TAAATAAACTTGTTTTGTG-AC-TCAGTAAAATGT--GTT--------------TATGACATTTTTTATCTTGTAAATA-TC--GAAAGACGTCTACTCT-CTTTTaccaggcaggca
gi|14 : taattaaactttgaatcaagcacaagattaaaatcgccacctgtcatatatgtatcattacctatatcatttaGGCGAATCATT-ATTGGGA-CCATAAAGGGCTAC--AAATGTAAACCTGTTATTAT-CTACAGT-TAA-ATCTGCAATGATAAAATTACCCTCACTATCCGAAATGTG-AC-ATGTATTTTATAGGCTACG-TTCTTGCCAAATAATAAAACAACCCCAAGGGATTTGGA-AGTACCA--GAACTAAACA-AGCAGTCA--TT-----TCC----CAATGGAGTA-----CGAATAAACTG-TTCAGTAGGT-GGTGTAGAGTGAATGTCC---------------TGACATTTTTTGGCTTTTAGATAGTT--AAGT-AAATCAATTCT-TTTCTCTGCTGAACCAAGACCTT-----------GGCAAT-----------------TA----------ACTGACAATATCTTTATATCTGTCATTTATTC--TTTGATTATAAAAATTAACCTCACAGATACAGCTTCTAGAATCAATGAAAA----ATATTAAATGCAAT-AAGAA----AATAggttgccatttaggcctaggcaattcagggatagaatcttgatattaatgtctatcac
gi|15 : cAGTTCATTTTTTC-TAAGTTTATATCTT--CTAGT-TCATGATCTCTACTTGAGTATACAAT-TT-TCATAAA-A-AGCTTTTGT---GTCCATAAATATATCTTTTTTATCAGTTATTATAT--TACC-ATCTGTTATTTCTATTTTGGGG-ATA---ATTTTACTTGTAAAGTTGTGCGACTCAAGGC---AGCAAAAG-TATTATATGTG-TTTTCTC--CATCTTCTATAACCTGTACTCTTTGTCT--
gi|16 : ctcttcagctgttaattttgatacatttatatcaaaaATTTCTGCA-GTTCTGATCCCACTCTAAAAA--ATGA----CTAAATGACTACCGAAA-TATT--GGATG-TTTTTTCATCGTCTTCAATTATT---GCC----ATTT--ATTGGAGCATGTTAAT-ACATTGCATTTTTAGTTTTCTTATATTT-TCAAT-G-----A-C-----T-------ATTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAAGATT-ATTTTG-TCATAGAGCTT--------G--TC-C-AAT--------TTA-------TCA--ATTTCGTCTA-TTAAT------TA-A-TAATTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCATTTTAATTCACGAATATGAAAATGATtggcaaggatggtattctct
gi|17 : ACATGCATATGAACTTGATTTACCTCGT--TTTCTCATCAATATTATTTGAAATTCTAAAAATAATTGGTCATTTGTAACAAACTGTATATCATTATTTTACGTAA---A-TTTTCCAT-TT-----------TTATA----GATA-A--------ATAC--ACA----ATATC-ATTATTTTA-TTTCTTCGATGTATTATATTTACATATTCAATATT--ATTCAAAAGATAGTTATTATGCTCCAATGAACATTTACCG----T----GGTTTAAA--TCATTAAAACATA---ATTTAAGA
gi|18 : AAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATCTGGA-CCATATAAAGAGAC--TAATGTAAGTCGATTACTAT-CAACAGT-TAA-GTCTATAATTGAGCAATTACCTTCAGGGTCATTTATATA-AGTATGAACTTCATAGTCAACA-TTTTTATTAAATAATAa
gi|2 : tagtatGAGGATTCCAGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTGTCTT--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTT-TA--CAATGTT-TGCTAAA-A-TGATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-GCTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTCAATAACTATGAGACTCTAAGT---TACAGAAG-TATT-TGGATG-GTTTTTCATTATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATATTTCTTAAA-G-----A-A-----T-------CTTT--T
gi|2 : TGATTTGTAATAAA------TG-T-ACC--GCTTTCTT---TTTCT---ATTTTT---G-G-----A-A-----TTATTTTACTTCAATAA---CTATGAGACTCTA-A--GTTACAGAAGT-ATT-TG--GATGG-TTTT------------T-C-ATTATCTTCTATTA--T--T-TGAGCATGTGATCTAATTAATATACCTTG-CAT--TTTT-AGCTT-TC--TTATATTTCTTAAAGAATCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTTCACCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTT----------------CATCA--TTTGGTAT---A-TTGTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----TATACTGAGTTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTC-ATTTATAGTTGTTAAGTAATATGTATC--TTGCAACAAACTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--CAACCTA-ATATTCAAAGTAATCA---TAGACTGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ATTAACCTATG-ATAATTGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTATTTTAAAGG-GTTTTTCT--TTCTTCA----TGTATATCGCCTAGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTAAT--------------GCAATATTGTTAATATGTCTAT-AAT-TAAAACAATCTAGT-------TTTGA---A-------T---C-----------TTGT----------ACCTTATTAAAATCGTCGCAGAAAATAATTGAT---GTATTATTGAAGGT---------------------------------TTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGATAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCACCGTGGTCGTTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAA-AGGACTGCTTCTCCTCTTTAGTTTGA-AGAATAA--GAAGAAAAAA-TGCAtaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcatttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|2 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatctT-TTAGTTGAATGAACATCTTGCAGACAATATATATCACAGTTTTTCGACTTTGAATAATT--GAAA-ACATCTCGTAG-TTTTTATACAGAACTAAGTCCCT-----------GACAAT-----------------TAACTGATAATATTTTA-AGT---TCCGTAT---TCA---ATATAGATTAATTGT--GAATTACCGTTGCACACAGAG------GAGTCATTAAAAA-------TAGAATATAATGAAAAA----A-TATGAAAACAATATTCGCCTAAA-ACGTGCACTTTCA--TCG-------A--AAATGCAC-AAAACTCTGATAAATTATAAAAGCCATTGTTGCTCATATTCAGTGTTTTGGAATTACAATTTAACCATTTGAATTAAGGAGCTA------TTTTTGAAGAATATAATTCTGAGCATT-T-TTTTACTATTACAAAATATATGTAATAATGGAAAAAATATAATCTAATAATGTATAAAAC-T------TTACATGCAAAATATCACTTGCTGTCATAATATTTATTTATCA------TAGCTTACATGTGCAAAAATGGATAAAAATGTTTACTTTTATCTATAT---GTATCTAATGTTGAGAAAACATAATAAAACATACATGATATTCTCTGTGTTGAGCTTATAACTATTAAATGATACACAATCAAGTAC------TTAATATTAGACATACAGTCAAACACCTACATGATGTCATCTGTATTTACCATAATTTCTAAGTG-TTAAATAATCCATAACTTtttagttgaatgaacatcttgcagacaatatatatcacagtttttcgactttgaataattgaaaacatctcgtagtttttatacagaactaagtccctgacaattaactgataatattttaagttccgtattcaatatagattaattgtgaattaccgttgcacacagaggagtcattaaaaatagaatataatgaaaaaatatgaaaacaatattcgcctaaaacgtgcactttcatcgaaaatgcacaaaactctgataaattataaaagccattgttgctcatattcagtgttttggaattacaatttaaccatttgaattaaggagctatttttgaagaatataattctgagcatttttttactattacaaaatatatgtaataatggaaaaaatataatctaataatgtataaaactttacatgcaaaatatcacttgctgtcataatatttatttatcatagcttacatgtgcaaaaatggataaaaatgtttacttttatctatatgtatctaatgttgagaaaacataataaaacatacatgatattctctgtgttgagcttataactattaaatgatacacaatcaagtacttaatattagacatacagtcaaacacctacatgatgtcatctgtatttaccataatttctaagtgttaaataatccataactt
gi|20 : gaggattccaggttgcttagtttgggcactgtgcaattttccagttcaatttcttaatttgtgtcttaaagttcagggtctttattttttacaatgtttgctaaaatgatttggattcgcctaaaatttcatcttgatttgtaataaatgtaccgctttctttttctatttttggaattattttacttcaataactatgagactctaagttacagaagtatttggatggtttttcattatcttctattatttgagcatgtgatctaattaatataccttgcatttttagctttcttatatttcttaaagaatctttttaaaacatgaatatgaaattgatttcaccctaatttccattaataaagtttctaaaaacagttggtcatttcatcatttggtatattgtttatgttatctttattatatattggtaatgtatactgagtttttatgtcattaatcttttcatttatagttgttaagtaatatgtatcttgcaacaaactattgttatgtttccataatggcttaccttttttaaaaggcgtcaacctaatattcaaagtaatcatagactgatctgatctgtaacttgatgtaattgagcaattattaacctatgataattgtgattctgttacaaggaagaaatcgagcctagcttattttaaagggtttttctttcttcatgtatatcgcctagtatccggattgaattctctaaatgggtcaactaaattgtattgatctttaacttcaagtaatttattatgtaatgcaatattgttaatatgtctataattaaaacaatctagttttgaatcttgtaccttattaaaatcgtcgcagaaaataattgatgtattattgaaggttttcaaaaaaggtagggcaatcactatttgggccatatattgatacaagtgtaaatctgttattatcaacatttaaatcgattatcaaataattaccaccgtggtcgtttatatgattgtgaactttaaaatcaacatttttattaaaaggactgcttctcctctttagtttgaagaataagaagaaaaaatgcaGGATGGTATTCTCTAAAGGGGTCAATAAGATTATGTG-------TTGATTTT--A---TT----T--CTAA--TAGCTG------------TT-CACG-G----------------GCATT--------------TTT--AT-T-----------AT-------T---T---A-------T---A-----------T-GT----------
gi|21 : tctttgtcttggcaaGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGGTCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAttgtaattatagtatatcta
gi|22 : AGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TTAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTT
gi|23 : acTTTAGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACA-CTTTTCAACCGAt
gi|24 : tgCTGATTTGGA-CCATATAAAGAGAC--tt
gi|3 : agacTCGTTATTTGCATA--TAAGCTA-TCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTCGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TACAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCATGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT------TTGCGCAAA-GTTAC-A-AGTTCTT-------CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TTA--T--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------TTTTCTTATAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTC-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTTT-----CTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAATATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATT-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCTGACCTATAGC-TGGCTTCAAAAGTACATTT-----AATTCGCTTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAA-AAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA---------GTG---GA--CGGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTGGATCTTGA-ACTAAACTGTAATCCCCGC---AAATAATTATG---TCATTAT------TATTTATA-GTGTCTGA-AAT-ACTCATTTTA-TTATAAAAAAA--ATTT-GGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTCCATCCCTGGAATTGCT-TTTCCCA--AAACTAAATA-TGCAATCA--T---------GCTGCCATTCAGTATGTATT-----ATTTT-TTCCGTATTT-TTGGTAAAATGGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGAATTTAAATTGTT--GAAA-ACATCAGTACGTTTTTTCTATGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------taaag
gi|4 : ctaagtgaagatgaatccctgatcatatgtaattaaactttccaatgtcatggactatgtatcagttaacttatTCGTTATTTGCATA--TAA-GTTATCATAAACA-TG-TTTAGCTTGTTT--TAAA-ATATCTTCTTGTTTTGTAATCA--TGCTATC-AACAGCATTT-CTAATTTGGGT-ATA---ATTTTACTTGTGAAGTTATGATGTTCTAGGT---TGCAAAAA-TATT-TTGTAG-GTTTTTC-TC--CTTCAATAAATTGTGCCCGTGATCT--TATAAA------AA-TGACCCTCCATTTT---CTTT-TTGTG-----CAAG-GTTACAA-G-----TTCTC---CTTT--TAA---------------A-AT-ATT-GAG-ATTGACTATAATGCTAG-CATTAAAAAATTG--TT-CTATT--------TTA--T--T-T----ATTTCATGTA-TGATT------TCAC-A--TTCC-AGCTT-AT--TTGT-CT-CTT------T-TTCTTACAAGAAGAATAAGATATTGTTTTACCTG-TAATTTC-CATTAAAAGTGTTT------TTAAAAATAGTTGGTCATTAATAGTAAACTGTATATCTTTA--TTACAAAT---A-TCATAAGTATTGTC----TATGTTATAAATAGGTA-CAG-----CATACTGACATTTTATTTC-TTTA----A-TTTTATC-ATTAATTG--TTTAAATAATTTACATCA-TTG-AGTAGACTATTATTTAGCTTCCATAGAGGTTTACC-----T----TTAATAAATTGGTT--AAAATTACAT-TTTAATATGATAA---CTGAGTGGTCCGACTTATAGC-TGGCT------TCA-A--TAGTACATTT-GATTATTGATG--CA--AGTG----------------AGGAAAAAATCTTA--TCTTGCTTGCTGTAGGGGTGTTTT-----TTCTCCA----TGTA----G---TGGA---T----GGGTAATATTCTCTGTAAGGGTCGACTAGAT--TGTAAATGGATTTGATTTCTAAAACCTTTTCT--CTAGC-TTTTCT------------AT-TAT-TAAT--------------ACATT--------------TGT-AAT-T-----------ATAG-----T---A---A-------TCTAA-----------T-TTTGGATCTTGAACTAAATTGTAATCCCCGC--AATGTCAT--------TATTATTTACAGTG----------TTTGA-AAT-ACTCATTATA-TTATAAAAAAA--ACAATGGGCGAGTC-CTGATTTGGG-GCATATAAGGTTAT--TAGTGTCAACCTATTATCAT-C--CAGTGTAATGTCAACAATTATATAGTTTCCCTCAGGGTCAGATATATG-TTTATGGATGACAAAATCTAGA-TCCTTGCTAAACAATATTCGTACACCCCTGGAATTGCT-TTTCTCA--AAACTAAATA-TGCAATCA--T---------GCTGCCATTCAGTATGTATT-----ATTTT-TTCCATATTT-TTGGTAAAATAGACATCCTGCAGACAAAAAATGTGACATTTTTTGGATTTTAAATAGTT--GAGA-TCATCAGTACG-TTTTTCTACGGAACCTAATCCCT-----------GACAGT-----------------TA----------actgacataatatcaatatatgtcatttatatatattttcttggatagtagtatgaccagatggaaagagcgaatccatagaaacataacaaaattcacacacacacacacacaaatgaaaatcaaaccatcagctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatattagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaacgttaacac
gi|5 : aaactttccaatgtcatggactctgtattagttaacttatTTCTTCATTATTAAGTTTAGGCACAGAACAACCTTCAAGTTTCATTT--C-TATATTTGTATCTA--ACAGT-TCATTGTCTCTATTTGAATA--TAAAGTT-TCGTAAA-AATG-TTTGGCTTCATC--TAAA-ATTTGATCTTGATCGTTTATAA-AAG--ACCGATCTTCTTTTTCAATTTTTGGA-ATA---ATTTTATTTAAACAGTTATGAGATTCCAAAT---TACAAAAA-TATT-TACTTG-GTTTTTCATCCTCTTCGATAAGCTGTGCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-TCCCTGCATTTTTGTTTTCCTTATATTT-TCAAGAG-----A-T-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ACTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CGTTAA--ATT--------GGATT-C--TA--------ATA--T--A-TCG--ATTTCTTCAA-CTAAT------TG-T-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAGTAAGAAATTGATTTGCCTC-TAATTTC-CATTAATAGTGTTT------CTAAAAATAGTTGATCACTTATTGAAAATTGAAGTTGGTCA--TTGGGAAT---A-TCTTTTATATTTTCAA--TTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATTGTAATTTAACTTC-ATTA----A-TTTTACC-TTTTATTGTTTTTAAATAATCTATGTC--TTTAAGCAAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATGTTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGC-TTGGA------GTA-AT--AGTACAATT-GTTTACAGACG-GTATTAA--A---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAG--TCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTC--TTCTCCA----AGTATA---CCTTTTAAAATT--TGGGTTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTGTCTAA---TT----T--CTAG--TAACTT------------GT-TATGTGATTTAACATTATTCATGCACT--------------TGT-AAT-TAAA--------GT-------T---ATCAACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ACTAAGTTGAAATCCACACAAAAATTGATTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ACTTTTAATAAA-A---G----A-GTATCAAAAAA--ACTA-GGGC-AGTC-CTGATTTGGA-CCATATAAAGAGACTAAAGTG--AATCGATTACTAT-CAACATT-TAA-GTCTATAATTAGGTAATTACTTTCCAGGTCATTTATATA-ATTATGCACTTCATAGTCAACA-TTTTTATCAAATAATACTGCAACACCTCTAGAATTGGA-AGAGAAT--GAAGAAAATA-AACAACGG--TTGC---CCCATTGTGACTCAATA-----------AACTT-TTCAG-ATGCAATAGTTGAATGTATATCCTACAGACAATATATATCACATTGTTTTGATTTTATGTAGTT--AAAA-ACATCCAAACG-CTTTTCAACCGGTCCCAAACCCT-----------GACAGTTAACAGTTAACAGATACTA----------TTTTA-ACT---TCCATAT---TTA---CT-C---TTAA-AGT--AGATTAA---TGCACACAGTG------GAGTC----CAAATCTTA-ATA-AATATATTGAATTGTTTCAACAT----------TTCATGTGACTGC-TGTACTTTCATTTCAAAAA--T----ACTGCACAAAAAATCTGATactgacataatatcaatatctgtcatttatatatattttcttagatagtagtatgaccagatggagagagggaatccatagaaacataacaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgaaaatcaaagcaagccatttaaccatttgctttggatcaatgtatgcccttaattttagcaaaaccaattttcatataagttgtaatattattaatatttgaccaaaaaaaaccccatcaatccaggtaaatgttaacac
gi|6 : TT--C-TAAATTAATATCAATTAAATTGTCA---TCTTTACTAGAGTA--AAGATTT-TCATAAG-A-ACATTTTGCTTCGTT--TAAA-ATTTCGTTTTGGTCTGTTATGA--TGCTACC-ATCTGATTTTCCGAATTTAGGTTATC---ATTTTATTTAAAGATTTAAAAGTTTCTTAGT---TACAAAAAGTAGT-TTGTTG-GTTTTTCGTCATTTTCTATTATTTGTGCTCTTGAGCA--TATCA-------TA-TGACCTCGCATTTT--GTTTT------------AAG-T-----ATA-----T-------CTTT--TAAATTC-----ATTTTTAGATT-TT-CAATATA-AT-------CTA--TATT-----------TT-C-ATT--------TG---------CG--ACCTTAT--------T------TT-C-T--TGTT-ATCTAATTGGTCAT-TATTTT------TCTTTTTATTGCATGAATATGAAATTGGCTTCCCCC-TTATTTC-CATTAATAAAACTT------AGAGGAATAGCTGGTCATCTATAGTGAACTGTAATTGGTTA--TCGGGGATCAAA-TTA---ATGTTTTCAAGATTT--TATACA--GGCA-ATG-----AATATTG-GATTTAATTTCGAT------A-TTTTATT-ACCAATGATCTTTAAATGATCTAGATCGGTTAAAAGAGA--ATTATTGTGTTTCCATAACAGACGCCCAGGAATGAAATTTGTAAAAGAC------------ATATTAAGAATTACCA---TTGAGTGATCTGACCTATAAC-TAGGT------TCA-ATAGAA--CATTT-GTTTACTGAAGCAT----GTAAATTTTCT--GATAAAAGAAAATAATCAAG--CCTGGCTTGTTGCAACGG-TGTTTTAT--TCCTCCA----TGCATATCTTCTT--A---ACAATGGATTATTTTCTCTAAA-GGATCAA-TAA-----------------GAT---TAA---CA----T--CGTGCATAATTT------------ATCTAGGT------------------------------------TGT-AGT-C------------------------------------T---------------T-GT----------ACAACATTGAAATCTCCGCAGAGAATATATGGGTTAGTATTATTTATGG-AT---CGTGCTTTTGA-CAT-A---AT---A-TTATTAAAAAAT-GAT---GGTGAGTCAAT-ATTTGGC-CCATATA---AATT--AA---TAAA---GTGATTAT-CAACTGT-TAT-GTCTATTATAATGAAGTTCCCCTCAGTGTCAGATAAGTG-TTTATGAATTGTAAAGTCAAGG-TTTTTATTAAATAAAACTGTTACCCCTCTTTTATTAGA-AT--TAACTGAGCTAAATA-GGCAATTA--TTGTTACCCCACTGTGTCTGAATA-----------AATTT-TTCAGTGTGT-TGTGCAGAATGTATGTTCTGCAGACAATAAATATGACAATTTTTGGCTTTTAAATAATTAAAAAA-ACATCTAGTCT-TTTTTCCACAGAACCTAGCCCCTAGCAATTGACAGACAG------------------TA----------TTTTA-AAC---TCCATAC---TTA---
gi|7 : ttcttctgtactaagtttaggaatgtcataattaataaatccccgAGAGGATTCCTGGTTGCTTAGTTTGGGCACTGTGCAATTTTCCAGTTCAATTT--C-TAAATTTGTATCTA--AAAGT-TCAGGGTCTTTATTTTTGTA--CAACGTT-TGGTAAA-A-TGATTTTGCTTCGTC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATG-TACC-ATTTTCTTTTTCTATTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAATAACTATGAGACTCTAAGT---TGCAGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTCATCTTCTTCTATTATTTGAGCATGTGTTCT--AATTAA------TA-T-ACCTTGCATTTTTAGCTTTCTTATACTTCTTAAG-G-----A-A-----T-------CTTT--TAA---T-----GTTTCTA-ATCGTT-CAATATT-ATTATG-TGATAGATCTT--------G--TT-C-AAT--------TT---T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-AATTC-TT--TCAT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATACGAAATTGATTTCCCCC-TAATTTC-CATTAATAGAGTTT------CTAAAAACAGTTGGTCATTTATAGTAAATTGAATTTCATCA--TTCGGTAT---A-TTTTTTATGTTATC----TTTATTATATATTGGTA-ATG-----CATACTGAGTTTTTATGTC-ATTT----A-TCTTTTC-ATTTATAGTATTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAAGCTGTTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTTAAAAGGCGT--AAACATG-ATATTCAAAGTAATCA---TAGAATGATCTGATCTGTAAC-TTGAT------GTA-ATTGAG--CAATT-ACTAACTGATG-ATAATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCCAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-GTTTTTCC--TTCTCCA----TGTATATCGCCTTGTA---TC--CGGATTGAATTCTCTAAATGGATCAACTAAAT--TGTA-------TTGATCTTTAA---CTAA--TAATAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAT--------------GCAATAT------------TGTTAATAT-----------GTCTATAATT---A---AAACAATCT---AGTTTTGGATCTT-GT----------ACCACATTGAAATCACCGCAGAAAATAATTGAG---GTATTATTGAAGGTAT---TA-ACCTGTGA-AAT-G---A----GGTTTTCAAAAAA--GGTA-GGGCAA-TCACT-ATTTGGG-CCATATATTGAAAC--AAGTGTAAATCTGTTATTAT-CAACATT-TAA-ATCGATTATCAAATAATTACCGCCGGGGTCATTTATATG-ATTGTGAACTTTAAAATCAACA-TTTTTATTAAATAGGACTGCTACTCCTCTTGAGTtctataa
gi|8 : AGAGGATTCCTGCATGCTTTGTTTGGGCACAGTGCAATTTTCAAGTTCAATTT--CATAA-------TC----AAAAT-TCAGGGTGTTTATTTTTGTA--CAATGAC-TGGTAAA-A-TTATTTGGATTCGCC--TAAA-ATTTCATCTTGATTTGTAATAA-ATA-TACC-GTTTTCTTTTTCTGTTTTTGGA-ATT---ATTTTACTTGAACAACTATGAAACTCAAAGT---TACGGAAA-TATT-TGGATG-GTTTTTTATCATCTTCTATTATTTGAGCATGTGATCT--AATTAA------TA-T-A-CTTGCATTTTTAGCTATCTTACATTTCTTATG-G-----A-A-----T-------CTTT--AAA---T-----GTTTCTT-ATCGTT-CAATATT-ATCG-G-TGAT---------------------------------------T--T-TCA--ATTTCACCTA-TTAAT------TC-C-T--TTTC-ATTTC-TT--ACGT-TTTCTT------TCTTTTTAAAACATGAATATGAAATTGATTT-CCCC-TAATTTC-CATTAATAAAGTTT------CTATAAACAGTTGGTCATTTATGGTAAATTGAATTTCATCA--TTTGGTTT---A-TTTGTCATGTTAAC----TTTATTATATTTTGGTA-ATG-----CATACAGAATTTTTATGTC-ATTA----A-TCTTTTT-ATTTATAGCAGTTAAGTAATTTATATC--TTGCAACAACCTATTGTTATGTTTCCATAATGGCTTACC-----T----TTTTCAAAAGGCCT--AGACACA-ATATTCAAAGAAATCATACTAGAATGATCTG-----TAAC-TTGAT------GTA-ATTTAG--CAATT-ATTAATCGATG-ATTATAGTGA---TTCT--GTTACAAGGAAGAAATCGAG--CCTAGCTTGTTTTAAAGG-ATTTTTCC--TTCTCCATTCCTGCATGTA-----GTA---TC--CGGATTGAGTTCTCTAAATGTGTCAACTAAAT--TGTT-------TTGATCTTTTA---TT----T--CAAG--TAATTT------------AT-TATGTGAC--------------GCAAT-------------------AT-T-----------GT-------T---A---A-------T---A-----------T-AT----------
gi|9 : cCTCTTGATCT--AATAAG------TA-T-ACCCTGCATTTTTGTTTTTCTTATATTT-TCAAGAG-----A-A-----T-------CTTT--TTT---C-----ATATGTA-ATTGTT-CAATGTT-ATTTTG-CTTTAA--ATT--------G-----A-ATT--------CTAAAT--TATCA--ATATCCTCAA-TTAAT------TG-C-T--TTTCTAACT--TT--TCAT-TTTCAT------TCTTTTTAAAACATGAATGAGAAATTGATTTGCCTT-TTATTTC-CATTGATAATGTTA------CTAAAAAAAGTTGATCATTTATTGAAAATTGAAGTTGATCA--TTGGGAAT---A-TTTTTTATATTTTCAA--CTTG--ATATACTGGTA-GTG-----CATATAGTAATTTAACTTC-TTTA----A-TTTTGTC-TTTAATTGTTGTTAAATAATCTATGTC--TT-TAGGTAACTATTATTATGTTTCCATAGTGGTTTTCC-----T----TTTTTAAAAGGTGT--GAAAGTA-ATATTTAAAATAACCA---TAGAGTGGTCTGACCTATAGCTTTGA-------GTA-A--TAGTACATTT-ATAAACAGATG-ATATTA--AA---TTTTCAGTTATTAAAAAGAAATCCAGTCTCTAGCTTGTTTTAATGG-GCTTTTTCTTTTCTCCA----TGTAGA---CCAAGTA---TT--TGGGGTTAATTCCCTAAATGGGTCAATTAAGT--TGTA-------TTGGTCTTTTA---TT----T--CTAA--TAACTTATGTGATTTAACAT-TAT-TCAT--------------GCACT--------------TGT-AAT-TAAAATA-----AT-------C---A---ACTT----T---AGGGTCT-----T-GC----------ATTAAGTTGAAATCCTTGCAAAAAATAACTGAG---GTGTTATCAAAGGTAT---TA-ATTTTT---AAT-A---A----A-ttat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CGCTTTTTTATTCTTACACACAAGTAGTTTAATTTAAATTTTATTTCAAGCCAAAATAAGCTATACTGGTTTTATTGAGCGTGCATGCTTCATGATTTTTGCTTTAAACACTCTGAATAGCCTCAGAATCTTTTTACAGCTTTTAT