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Reference ( gi|6 )            :           TATGTTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCTA--TTAAACTAACATATATT-TT----T-----ATAATAGATTACACAGACACATGATATAAGTTACTGATGTACGTGTATGACAGTAAAC--AT-T-AATAATAATTATA-ATGTTGT------GTG-----------CTTCTT-----------TATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAATTCAATCTACACTGAGGTC
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gi|18                         : aaataatataTATAGTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCccaaggttgatttaagttcagtctacaccgaggtc
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Reference ( family-2800 )     :  TATATTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCTA--TTAAACTAACATACATTTT---TT----ATAATANATTACACAGACACATGATATAAGTTACTGATATACGTGTATGACAGTAAAC--AT-T-AATAATAATGATAATGTTGT------GTG----------TTTC-T--TTATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAATCTACACTGAGGTC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                         aaataatata--TTATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAGTCTACACCGAGGTCccaaggttgatttaagttcagtctacaccgaggtc
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Reference ( family-2800 )     :  TATATTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCTA--TTAAACTAACATACATTTT---TT----ATAATAGATTACACAGACACATGATATAAGTTACTGATATACGTGTATGACAGTAAAC--AT-T-AATAATAATGATAATGTTGT------GTG----------TTTC-T--TTATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAATCTACACTGAGGTC
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lowQualScore                  :                             888888    9999999         44                   888  6666      1              0                                    33  2 2                    777777   1111111111    5 33                                                    
lowQualScore                  :                             ......    .......         ..                   ...  ....      .              .                                    ..  . .                    ......   ..........    . ..                                                    
lowQualScore                  :                             222222    3333333         22                   555  5555      5              2                                    99  9 9                    222222   9999999999    3 44                                                    
consensus                     :  TATATTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCTA--TTAAACTAACATACATTTT---TT----ATAATAGATTACACAGACACATGATATAAGTTACTGATATACGTGTATGACAGTAAAC--AT-T-AATAATAATGATAATGTTGT------GTG----------TTTC-T--TTATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAATCTACACTGAGGTC
Reference ( family-2800 )     :  TATATTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCTA--TTAAACTAACATACATTTT---TT----ATAATAGATTACACAGACACATGATATAAGTTACTGATATACGTGTATGACAGTAAAC--AT-T-AATAATAATGATAATGTTGT------GTG----------TTTC-T--TTATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAATCTACACTGAGGTC
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gi|10                         :      TTTTATGACTTTTTCTTATTGAA------AATA-------TTAACCCTA--TTAAACTAACATACATTTT---TT----ATAATATATTACACAGATACATGATATAAGTTACTGATATACGTGTATGACATTAAAC--AT-T-AATACTACTGAAAATGTTGT------GTG----------ATTC-T--TTATTTTACGTTAAATTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAGTCTACACTGAGGTC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                         aaataatata--TTATTTTACGTTAAACTCCAAGGTTGATTTAAGTTCAGTCTACACCGAGGTCccaaggttgatttaagttcagtctacaccgaggtc
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