lowQualScore : 111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111 111111
lowQualScore : 1 1 22222 1 222222 22222222222222222222 9999999999999999 111 11 1 111111111111111111111111111 222222 1111 111111 1111 88888888888888888888888888888888888888 11 444444444444444444444 11 222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 1 4444 000000 111
lowQualScore : 2 0 5 0 4 1 5 6 44444 0 0 333333 5 6 88888888888888888888 0000000000000000 111 6 4 44 5 000000000000000000000000000 333333 8 8 9 4 6 3 5555 3 77 6 0 222222 1 777 1 6 4 8 4 3333 99 33 2 9999 9999 22222222222222222222222222222222222222 77 9 77 77 1 666666666666666666666 8 555555 11 4 4 1 4 1 4 0 888 777777777 5 8 8 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 0 4 1 8 4 1 6 6 6 55555555 2 6 2222 7 222222 6 3 6 6 6 1 6 111
lowQualScore : . . . . . . . . ..... . . ...... . . .................... ................ ... . . .. . ........................... ...... . . . . . . .... . .. . . ...... . ... . . . . . .... .. .. . .... .... ...................................... .. . .. .. . ..................... . ...... .. . . . . . . . ... ......... . . . .................................................................................................................... . . . . . . . . . . ........ . . .... . ...... . . . . . . . ...
lowQualScore : 0 8 0 2 0 2 0 0 44444 8 6 000000 4 0 33333333333333333333 2222222222222222 777 0 0 22 0 000000000000000000000000000 000000 8 8 0 0 7 2 3333 9 99 6 1 888888 0 888 0 4 4 9 4 4444 66 00 0 4444 4444 33333333333333333333333333333333333333 55 8 33 99 4 111111111111111111111 9 888888 99 4 4 9 4 7 4 4 888 666666666 0 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 8 0 4 0 0 4 0 7 7 55555555 7 7 5555 8 888888 0 5 7 0 0 0 7 777
consensus : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGNGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAA-TAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA------AATCAATGAACAAC-A---TT---TGTT-----TTAAATGT--C---GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCCGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATA--ACTCTCAGACT------ATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATNGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACATTGATGT------GCCGA---ACCTAATGAACT-T-GTA-GCAACA--GT-CTTTTCTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GC-------------NG-----CTG---AGGTTTCA-ATAACAATATCTTGGACAACTA-TTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCTGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGG-TTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATATTA-ATGC---ATGA---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------ATAATTGTGTGATTTGTTTT-CAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
Reference ( gi|1 ) : TTTGTTGTGTAGACCTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAAGTACTTTACTGTACTATTAGTTCCAGTTTT-A-TAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA------AATAAATGAACAAC-A---TT---TGTT-----TTAAATG-------GGAT---GGATTG---GTTTTTGCTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATCACATAATCA-TAAT-TCTATAATATA--AC------ACT------ATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGCCCAGCTCTGCTAAG--GCAGTGTTACATTGATGT------GCCAA---ATCTAATGAACT-T-GTA-GCAACG--GT-TTTTTCTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GC-------------AG-----CTG---AGGTTTCA-CTAACAATATCTTGGACAACTG-TTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCGGCCAAATAAACTTACAGTAGTATG-TTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTA-ATAC---ATGA---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGTTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCACTATACTATATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGAAGGTC-AA-GATTATAACTGATTACATGTAATTGTGTGATTTGATTT-CAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATACATGTATATCTATGAACCCTGGAATACACTAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAAGATTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGTAGATGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA
gi|6 : TTTGTTGCGTAGACGTACATCAAATATTAATGTGCATGTAAATTTAAATTTCTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTT-A---GTAACCTGTGTAAAATAAAAA------ATTCAATGAACAAT-A---TT---TTTT-----TTAAATGTGTTACTGGCTAAAGGATTGATTGTTTTTGTTCAAGTATTTTATCTTTGGTGTCAGTACAATCGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATA--ACTCTCAGACT------ATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGTCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCGA
gi|17 : TTTGTTGTATAGGTGTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAA-TAGTAAACTGTGTAAAAT-AAAA------AATCAATGAACAAC-A---TT---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggccggctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccgaatataatgaacttgtagcaacagtctttttctatagtattttgtttatcctgc
gi|14 : gcTTTGATGTATGGCTGTACATTTACTGTTAATGACCACACAAATTTTAACTATTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAA-TCGTAAACTGTGTAAA--AGAAA------AATAATTAAACACCTA---TT-----TT-----TTAAGTGTTTTTTTAAGT---GGATTA---GTTATTGTTCAAGTATTGTATCTTTGt
gi|24 : tTTTGTTGTATAGACATACATAAAATGTTAATGAGCAAGCAAATTTTAACTAC
gi|4 : gcTACTTTACTGTGTTATAAATTCTAGTTTT-AATAGTAAACTGTGTCAAATAGTTACTGGTTAATAG-TTAATAA------TTAAGTGTTACTAGCTAAA---------GGAC---AGATTG---GATTTTGTTCAATTATTTTATC------------ACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATATCACTCAG--ACT------ATCTATACTCTTGATGTTCTTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATAGTCAA
gi|21 : acTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAA-TAGTAAACTGTGTAAAAT-AAGA------AATCAATGAACAAC-ATTTTT---TGTG-----TTAAGTGTTACT--GGCTAAAGGATTG---ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|18 : -----TTAAA----------GTT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGATGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATA--ACTATCAGGCT------ATCTATACTCCTGATGTCATTATGA
gi|2 : ctggcTAAA---------GGAT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTTGTATCCGCACAATTGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATA--ACTCTCAGACT------ATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAA
gi|3 : ctggcTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATA--AC------ACTCAGGCTATCTATACCCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATATTCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggtcggctctgctgaggcactgttacgttgatgtgcagaacctaatgaacttgtagcaacagtcttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataacaatatcttggacaactagtttgaaggaagaaatcaaagtagtctgaatgaaggtttaccagccaaataacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattatgtcgaatgttaatgcatgatgctaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtactaaaactatatatccgctatactatatcacattcatgacatctgttgtgatctggaggtcaagattataactggataattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacgatatatctatgaaccctgaaatacaccagagaatgtccagaaagcaaccatgtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaacacagacgcaagcaaactttgtatggatggaatgaaacaagttcaccaaatattttttctacgtaaatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : tTATACTGCTGATGGCATTGTGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcataaaggcaaggccacctctgctgaggcagcgtttcattgatgtgccaaatctaataacttgaagcaacagatttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataactatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtttaaatgaaggttaaccggccaaattaacttacagtattagttttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatgcatgatgctaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaactaaaaatatatatccgctatactctatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcgaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccaccacaatatatctatgaaccctggaatacaccagggagtgtccagaaagcaaccaagtgcattttgggaaaaagactatccagtacctatagtgaaccatgcagacgtgagcaaactttgtatggataggataaataagtccaccagatatagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|2 : cagaatcactggtagcttaacagaactatcagactccaAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGTCGGCTCTGCTGAG--GCACTGTTACGTTGATGT------GCAGA---ACCTAATGAACT-T-GTA-GCAACA--GT-CTTTTCTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GC-------------TG-----CTG---AGGTTTCA-ATAACAATATCTTGGACAACTA-GTTTGAAGGAAGAAATCAAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCAGCCAAATAA-CTTACAGTAGTAGG-TTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCGAATGTTA-ATGCATGATGC---T---AGG-NNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGT---ACTAAAACTA-TATATCCGCTATACTATATCACATTCATGACATCTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------ATAATTGTGTGATTTGTTTT-CAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACGATA------TATCTATGAACCCTGAAATACACCAGAGAATGTCCAGAAAGCAACCATGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAAC---ACAGACGCAAGCAAACTTTGTATGGATGGAATGAAACAAGTTCACCAAATATTTTTTC---TACGTAAATCAAAAGGTAATATTGTTTTt
gi|6 : ctggctaaaggatggattggtttttgttcaagtattgtatcttttgtatccgcacaattgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCTGAG--GCAGTGTTACATTGATGT------GCCGA---ATATAATGAACT-T-GTA-GCAACA--GTCTTTTTCTATAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GC-------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|9 : tttgttgcgtagacgtacatcaaatattaatgtgcatgtaaatttaaatttctttactgtactattaattccagttttagtaacctgtgtaaaataaaaaattcaatgaacaatattttttttaaatgtgttactggctaaaggattgattgtttttgttcaagtattttatctttggtgtcagtacaatcgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgtctttgacatggagaagaatgtgtgaacacatagagtcaatagtcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGAAAACA-T---GACAAGGTGAGCTCTGCCAAACTGTAATGTTGTGTTTTTAT------GCTGA---ACCAACT--ATT-T-GTAAGGAAAG--GT-ACTAAC-CTAGTTTTC----TAT----TTATCC-----TTTTGGCTAAAATGTT----AG------TGCGTAGGTTTCAACTG-CAATATCTTGGACA--TAATTTTGAAGGAAGGAATCCAAATGGAATATT-ATAATGGT--------A--CA--------TGTACCAAA-ACATTT-CA--AGT-TGATTAAATAGGGTCACCC-TTTTATTGCCTCAAATAATGTATA----ATTA---T---G-G-GATA
gi|16 : atacaattttataggtgagatatatagataaaaatctgttagtttataagacgattctaAAGCAATAAAGCTATGCCT-----TGCTGAG--CCATTACTGCATTAACAT------GCTGA---ACATAAAAAGCT-TTGTA-GTAAAG--GT-CGTT-CTCTAGTATTC----TAT----TTaaataaata
gi|3 : aatactaggttggtgcccatccatacaataattattaagtgtggctaagacgAGCA-TAAAGGCAAGGCCACCTCTGCTGAG--GCAGCGTTTCATTGATGT------GCCAA---ATCTAAT-AACT-T-GAA-GCAACA--GA-TTTTTCTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GC-------------TG-----CTG---AGGTTTCA-ATAACTATATCTTGGACAACTG-TTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TTTAAATGAAGGT--------T--AA--------CCGGCCAAATTAACTTACAGTATTAGT-TTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTA-ATGC---ATGA---TGCTA-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTCTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTCGAA-GATTATAACTGG------GTAATTGTGTGATTTGTTTT-CAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCACCACAA------TATATCTATGAACCCTGGAATACACCAGGGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTTTGGGAAAAAGACTATCCAGTACCTATAGTGAACCATGCAGACGTGAGCAAACTTTGTATGGATAGGAT-AAATAAGTCCACCAGATA--------------TAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
gi|8 : ttcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatggcagaatcactagtagcttaatataacactcaggctatctatacccctgatgtcattgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCA-TCAAGGTGAGACTGGGTCTGCCGAG--GTACTGTTATATTTTCGT------ACCAA---ACCTAATAAACTCT-GTA-GGAAAA--AT-CTTCTCATAAATATTA----TGT----TTAGAC-----T----GTTGACTAAAAATGTAA-----TTGTGTAAGTTTCA-ATAACAATGTCTTGGTGAGTTA-TTTTAAAGGAAGAAATGCAAGTAA--TCTGAATGAAGGTTTATTTGGT--TA--------CCTGTCGACTAAACT-----TAGTAAG-TTTGATA-GGTCACCT-CTTTGTTATGTCTAATGTTA-ATGA---ATGATAGT---A-G-GATATATAT-TA-CAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : AAAGCAAAGTTGGCACTGCTGAG--GCACTGTAACATTGATGT------GCCGA---ACCTAATGCACT-T-GAA-GCAACA--GT-CTTTTCTCTAGTGTTT----TGT----TTATCC-----T----GT-------------TG-----TTG---AGGTTTCA-ATAACAATATCTTGGACAACTG-TTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAATGT--------T--TA--------CCAGCCAAGTAAACTTAAAGTAGTAGG-TTTAATA-GGTCAACC-CTTTATTATGTCAAATATTT-ATGC---ATGA---TGGTA-G-GATATATAT-TA-CAGAcattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggtttgactaaagaaatatatccactatacaatgtcacatacaagccatttgttgtgatcttgtggccaatgata
gi|23 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACATTGATGT------GCTGA---ACCTAATGAACT-T-GTA-GCAA----GT-CTTTTCTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|12 : CATTCATGTTTCAAGGTCAATTCATCTAATAAACT-TTGTA-ACAACAAAGT-ATT----CTAATATTTAATCTGTCCTTTTGTCCAAAAAT----AC-------------AGTATTTCTT---AGATTTCA-ATCATAATATCTCAGACA-CAA-ATTTAAAGGTAAAAATCCAAGTAT--TCCGCATGAAAAT--------T--TATAGTGCTTCCTTCCAAATAAAGTTA----ATTTTA-TTT------GT-AACTGCTTTATTATCTTTGATATTA-
gi|19 : ctgttaaagtcattcaaggtTTGACGGAAGGAA-CTGAATCA--TTTGAACGAAAGT--------TGTTATGTTT---CCTGCCAAATAAATT--CAA------G-TTTATCA-GTTCACCA-CTTTGTTATTTCAAA---TA-ATAC---ATAA---T---G-GTAATATA
gi|5 : aacATAAACTTACAGTAGTAGG-TTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTTTGTCAAATATTA-ATGC---ATGATGCT---A-G-GATATATATATATCAGAa
gi|7 : atAAACTTACAGTTGTAGG-TTTAATA-TGTCATCT-CTTTATTATGTTAAATATTA-ATAC---ATGG---T---G-G-cattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaattaaaaatgtatatccgctatactttatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgctacaatatatctatgaaccctggaaaacaccagagagtgtccaaaaagcaaccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcaaatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctagtacgtagatcaaaaggtaatattgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|5 : -TATGCTATGGTTTAATTAAAAATG-TATATCCGCTATACTTTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAATTGTGTGATTTGTTTT-CAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCTACAATA------TATCTATGAACCCTGGAAAACACCAGAGAGTGTCCAAAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAAATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTCTAGTACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgttatggttttactaaaaaaaatatatccactatactgtgtcccatacaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattatgactggataattgtgtaatttgtttacaggcattacttacctgtattgaaccgttatccgcctcaatatatctatgaaccctggaatacaccagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaaactatccagtacctatggtgaaccatgcagacgcgagcaacatttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatccttattctacatagatcaaaaggtaatattg
gi|7 : atataaacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattttgtcaaatattaatgcatgatgctaggatatatatatatcagacattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTATGGTTTTACTAAAAAAAATATATCCACTATACTGTGTCCCATACAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATGACTGG------ATAATTGTGTAATTTGTTTA-CAGGCATTACTTACCTGTATTGAACCGTTATCCGCCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAA-ACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAACATTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATCCTTATTC---TACATAGATCAAAAGGTAATATTGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|8 : aaacttacagttgtaggtttaatatgtcatctctttattatgttaaatattaatacatggtggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTGGTTTGACTAAAGAAA-TATATCCACTATACAATGTCACATACAAGCCATTTGTTGTGATCTTGTGGCC-AATGAT
gi|4 : gcatcaaggtgagactgggtctgccgaggtactgttatattttcgtaccaaacctaataaactctgtaggaaaaatcttctcataaatattatgtttagactgttgactaaaaatgtaattgtgtaagtttcaataacaatgtcttggtgagttattttaaaggaagaaatgcaagtaatctgaatgaaggtttatttggttacctgtcgactaaacttagtaagtttgataggtcacctctttgttatgtctaatgttaatgaatgatagtaggatatatattacagacattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGATCTGGAGGTC-AA-GAATATAACTGG------ATAAT---GTGATTTGTTTT-CAGGCATTACTTACCTGTACTGAAAGGTTATCCGCT-CAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTTTTCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACATGTCCACCAAACACTTATTC---TATGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTa
gi|11 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATAACTGGATA-----AATTTTGTGATT--ATTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCACCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCTGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGCATGGATAGGATGAAGCAGGTCTATCAAACACTTATTC---TACGTCGATCAAAAGGTAATATTGTTT
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTAAGATATTTTAGAACATTCAGCTGTTGTTAACCGCGGTAAAGGTAAATAGTGAATATTATGTTTGTGCCTTTCTCTACCAAGTATTAGATAAGGCTAAGAATGTGCAACGAGGCGATGGACTACCGAACCATTGCTGCGTTTCCCTACTGAACCTAATAAACTATGTAAGGAAATGCAACTTTGTATTCTATTTTGCCTGTCGAGTAATGTTTTCGTTATTTGCATTATTCTCAAGTTCTCCAGTAAACAATATCTT
Unaligned ( gi|13 ): TTATATACAGGGAGAAGGAACACAAGGTTAGATCTTATCATATCTATTAAATGGTGAGAGTAGAAAAATGCAACAAGATGAGACTATGGCATACCATTGTTACATCTTCATGCCAAATCTAATTAATTAGATAGGGAAAAGCACTATACCCTGGTATACTATTTATTCTGTTGACCGAAAATGTAGTGTACTAATGTTTCAATCACATTGTCTTGGATGTGTTATGTGATTGAAAGTA
Unaligned ( gi|15 ): AATTTTTGAAATTAGAACATAAACTACAATACTGAGTACAAGGTAAGTGTCTCTCTGTACCAAAGTTATCACTGAGGCGAATGAAATGTTACAAGGCGATGTTCTGGCGAGCATCTGTTGTATTTTCATACAAATCCTATTAAACTTTGTAGAGAAAAGCTTTATTC
Unaligned ( gi|20 ): AATGCACTGAAATGACAGTAGAAATACAACTGTTAGTTTAAACACTTCATACAAAATCTAATAAACTTCATAGGGTAATGCACAACTCTAGTATTCCATTTATCTTGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 9999999999999999999999 222 111 1111111 777777777777777777777777777777 333333333333333333333 2222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 3333 111111 111
lowQualScore : 1 4 7 7 6 5 6 111 3 11 1111111111111111111111 1 000 000 6 2 5 66 0 0 1 5 1 2 0 66 1 00 5 6 6 3 7777777 5555 3 88 2 7777 7777 99999 8888 888888888888888888888888888888 888 0 55 66 0 777777777777777777777 3 555 4 0 4 22 777 5555555555555 4 6 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 6 1 5 5 666666 5 2222 5 666666 5 4 000
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. ...................... . ... ... . . . .. . . . . . . . .. . .. . . . . ....... .... . .. . .... .... ..... .... .............................. ... . .. .. . ..................... . ... . . . .. ... ............. . . . .................................................................................................................... . . . . . ...... . .... . ...... . . ...
lowQualScore : 0 6 3 3 7 2 7 777 2 00 8888888888888888888888 0 000 000 3 5 7 11 6 6 0 7 4 2 7 11 0 88 8 7 7 3 5555555 9999 3 88 5 1111 1111 11111 5555 888888888888888888888888888888 888 2 99 99 1 000000000000000000000 5 777 0 8 0 66 888 7777777777777 4 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 7 0 7 7 444444 7 7777 4 444444 7 0 000
consensus : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTG-----T-----T----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAACA--GT-CTTTT-CTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GCT-----------G-----------------CTG---AGGTTTCAATAACAATATCTTGGACA-ACTGTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GT-AATTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
Reference ( family-2768 ) : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGNGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAATG-----T-----C----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCCGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATNGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACATTGATGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAACA--GT-CTTTT-CTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GCN-----------G-----------------CTG---AGGTTTCAATAACAATATCTTGGACA-ACTATTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCTGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATATTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------AT-AATTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
gi|1 : TTTGTTGTGTAGACCTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAAGTACTTTACTGTACTATTAGTTCCAGTTTTA-TAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATAAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAATG----------------------GGAT---GGATTG---GTTTTTGCTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATCACATAATCA-TAAT-TCTATAATATAAC------ACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAA
gi|1 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGCCCAGCTCTGCTAAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCAAATCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAACG--GT-TTTTT-CTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GCA-----------G-----------------CTG---AGGTTTCACTAACAATATCTTGGACA-ACTGTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCGGCCAAATAAACTTACAGTAGTATGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATAC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGTTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCACTATACTATATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGAAGGTC-AA-GATTATAACTGATTACATGT-AATTGTGTGATTTGATTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATACATGTATATCTATGAACCCTGGAATACACTAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAAGATTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGTAGATGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaagcccagctctgctaaggcagtgttacattgatgtgccaaatctaatgaacttgtagcaacggttttttctctagtattttgtttatcctgcagctgaggtttcactaacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaaggtttaccggccaaataaacttacagtagtatgtttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatacatgataggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgttatggtttaactaaaaatatatatccactatactatatcacattcaagccatttgttgtgatctgaaggtcaagattataactgattacatgtaattgtgtgatttgatttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacaatacatgtatatctatgaaccctggaatacactagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaagattatccagtacctatggtgaaccatgtagatgcgagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctacgtagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|10 : tttgttgtgtagacctacatcaaatgttaatgtgcatgcaaattttaagtactttactgtactattagttccagttttatagtaaactgtgtaaaataaaaaaataaatgaacaacatttgttttaaatgggatggattggtttttgctcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatcacataatcataattctataatataacactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTACCGAA--CCATTGCTGCGTTTCCCTACTGAACCTAATAAACTAT-G-TAAGGAAATGCAA-------CTTT-------GTATTC----TAT----TTTGCC-----T----GTC-----------G-----------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11 : ttaagatattttagaacattcagctgttgttaaccgcggtaaaggtaaatagtgaatattatgtttgtgcctttctctaccaagtattagataaggctaagaatgtgcaacgaggcgatggaTTATAACTGG------ATAAATTTTGTGA-TTATTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCACCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCTGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGCATGGATAGGATGAAGCAGGTCTATCAAACACTTATTC---TACGTCGATCAAAAGGTAATATTGTTTagtaatgttttcgttatttgcattattctcaagttctccagtaaacaatatctt
gi|12 : gATCTAATAAACT-TTG-TA-------ACAACAAAGT-ATT-----CTAATATTTAATCTGTCCTTTTGTCCAAAAAT----ACA-----------GTATTT------------CTT---AGATTTCAATCATAATATCTCAGACA--CAAATTTAAAGGTAAAAATCCAAGTAT--TCCGCATGAAAAT--------T--TATAGTGCTTCCTTCCAAATAAAGTTA---------ATTTTATT-TGT-AACTGCTTTATTATCTTTGATATTA
gi|13 : ctgttaaagtcattcaaggtcattcatgtttcaaggtcaattcCATTGTTACATCTTCATGCCAAATCTAATTAATT-A-GATAG------GGAAAA--GCACTATA-CCCTGGTATAC----TAT----TTATTC-----T----GTT-----------GACCGAAAATGTAGTGTACTA---ATGTTTCAATCACATTGTCTTGGA
gi|14 : ttatatacagggagaaggaacacaaggttagatcttatcatatctattaaatggtgagagtagaaaaatgcaacaagatgagactatggcatacTTTGATGTATGGCTGTACATTTACTGTTAATGACCACACAAATTTTAACTATTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATCGTAAACTGTGTAAAAGAAAAATAAT---TAAACACCTA---TT--TT--TTAAGTGTTTTTT-----T----------AAGT---GGATTA---GTTATTGTTCAAGTATTGTATCTTTGtgtgttatgtgattgaaagta
gi|16 : tAAGCAATAAAG-CTATGCC----TTGCTGAG--CCATTACTGCATTAACATGCTGAACATAAAAAGCT-TTG-TA-------GTAAAG--GT-CGTT--CTCTAGTATTC----TAT----TT
gi|17 : aatactaggttggtgcccatccatacaataattattaagtgtggctaagacgTTTGTTGTATAGGTGTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTT
gi|18 : gcGTT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGATGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTATCAGGCTATCTATACTCCTGATGTCATTATGAt
gi|19 : ctggcttaaaTTGACGGAAGGAA-CTGAATCA--TTTGAACGAAAGT--------TGTTATGTTT---CCTGCCAAATAAATTCA--------AGTTTATCA-GTTCACCA-CTTTGTTATTTCAAA---TAATAC---ATA---A---T---G-GTAATATA
gi|2 : aac----------GGAT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTTGTATCCGCACAATTGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAAa
gi|2 : ctggctaaaAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGTCGGCTCTGCTGAG--GCACTGTTACGTTGATGTGCAGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAACA--GT-CTTTT-CTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GCT-----------G-----------------CTG---AGGTTTCAATAACAATATCTTGGACA-ACTAGTTTGAAGGAAGAAATCAAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCAGCCAAATAA-CTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCGAATGTTAATGCATGATG---C---T---AGG-NNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGT---ACTAAAACTA-TATATCCGCTATACTATATCACATTCATGACATCTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------AT-AATTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACGATA------TATCTATGAACCCTGAAATACACCAGAGAATGTCCAGAAAGCAACCATGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAAC---ACAGACGCAAGCAAACTTTGTATGGATGGAATGAAACAAGTTCACCAAATATTTTTTC---TACGTAAATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggtcggctctgctgaggcactgttacgttgatgtgcagaacctaatgaacttgtagcaacagtcttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataacaatatcttggacaactagtttgaaggaagaaatcaaagtagtctgaatgaaggtttaccagccaaataacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattatgtcgaatgttaatgcatgatgctaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtactaaaactatatatccgctatactatatcacattcatgacatctgttgtgatctggaggtcaagattataactggataattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacgatatatctatgaaccctgaaatacaccagagaatgtccagaaagcaaccatgtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaacacagacgcaagcaaactttgtatggatggaatgaaacaagttcaccaaatattttttctacgtaaatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|21 : ctggctaaaggatggattggtttttgttcaagtattgtatcttttgtatccgcacaattgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAGA-AATCAATGAACAAC-ATTTTTTGTG--TTAAGTG-----TTAC--T----------GGCTAAAGGATTG---ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : CAGAATCACTGGTAGCT-TAACAGAACTATCAGACTCCATATACTGCTGATGGCATTGTGATG
gi|23 : ACATTGATGTGCTGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCA--A--GT-CTTTT-CTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----t
gi|24 : TTTGTTGTATAGACATACATAAAATGTTAATGAGCAAGCAAATTTTAACTAC
gi|3 : gcTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACACTCAGGCTATCTATACCCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATATTCAA
gi|3 : AGCA-TAAAGGCAAGGCCACCTCTGCTGAG--GCAGCGTTTCATTGATGTGCCAAATCTAAT-AACT-T-G-AA-------GCAACA--GA-TTTTT-CTCTAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GCT-----------G-----------------CTG---AGGTTTCAATAACTATATCTTGGACA-ACTGTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TTTAAATGAAGGT--------T--AA--------CCGGCCAAATTAACTTACAGTATTAGTTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---TGCTA-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTCTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTCGAA-GATTATAACTGG------GT-AATTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCACCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGGGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTTTGGGAAAAAGACTATCCAGTACCTATAGTGAACCATGCAGACGTGAGCAAACTTTGTATGGATAGGAT-AAATAAGTCCACCAGATA--------------TAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcataaaggcaaggccacctctgctgaggcagcgtttcattgatgtgccaaatctaataacttgaagcaacagatttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataactatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtttaaatgaaggttaaccggccaaattaacttacagtattagttttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatgcatgatgctaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaactaaaaatatatatccgctatactctatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcgaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccaccacaatatatctatgaaccctggaatacaccagggagtgtccagaaagcaaccaagtgcattttgggaaaaagactatccagtacctatagtgaaccatgcagacgtgagcaaactttgtatggataggataaataagtccaccagatatagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : ttcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatggcagaatcactagtagcttaatataacactcaggctatctatacccctgatgtcattgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTACTTTACTGTGTTATAAATTCTAGTTTTAATAGTAAACTGTGTCAAATAG------TTACTGGTTAAT-A---GTTAATAATTAAGTG-----T-----TACTAGCTAAAGGAC---AGATTG---GATTTTGTTCAATTATTTTATC------------ACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATATCACTCAGACTATCTATACTCTTGATGTTCTTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATAGTCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : AAAGCAAAGTTGGCACTGCTGAG--GCACTGTAACATTGATGTGCCGAACCTAATGCACT-T-G-AA-------GCAACA--GT-CTTTT-CTCTAGTGTTT----TGT----TTATCC-----T----GTT-----------G-----------------TTG---AGGTTTCAATAACAATATCTTGGACA-ACTGTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAATGT--------T--TA--------CCAGCCAAGTAAACTTAAAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACC-CTTTATTATGTCAAATATTTATGC---ATG---A---TGGTA-G-GATATATAT-TA-CAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|4 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCTGGAGGTC-AA-GAATATAACTGG------AT-AAT---GTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTACTGAAAGGTTATCCGCT-CAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTTTTCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACATGTCCACCAAACACTTATTC---TATGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|5 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTTTGTCAAATATTAATGC---ATG---ATGCT---A-G-GATATATATATATCAGA
gi|5 : at-TATGCTATGGTTTAATTAAAAATG-TATATCCGCTATACTTTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GT-AATTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCTACAATA------TATCTATGAACCCTGGAAAACACCAGAGAGTGTCCAAAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAAATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTCTAGTACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTcattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaattaaaaatgtatatccgctatactttatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgctacaatatatctatgaaccctggaaaacaccagagagtgtccaaaaagcaaccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcaaatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctagtacgtagatcaaaaggtaatattgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : atataaacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattttgtcaaatattaatgcatgatgctaggatatatatatatcagacattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTGCGTAGACGTACATCAAATATTAATGTGCATGTAAATTTAAATTTCTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTA---GTAACCTGTGTAAAATAAAAA-ATTCAATGAACAAT-A---TTTTTT--TTAAATG-----TGTTACT----------GGCTAAAGGATTGATTGTTTTTGTTCAAGTATTTTATCTTTGGTGTCAGTACAATCGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGTCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCGAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCTGAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCGAATATAATGAACT-T-G-TA-------GCAACA--GT-CTTTTTCTATAGTATTT----TGT----TTATCC-----T----GCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggccggctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccgaatataatgaacttgtagcaacagtctttttctatagtattttgtttatcctgc
gi|7 : tttgttgcgtagacgtacatcaaatattaatgtgcatgtaaatttaaatttctttactgtactattaattccagttttagtaacctgtgtaaaataaaaaattcaatgaacaatattttttttaaatgtgttactggctaaaggattgattgtttttgttcaagtattttatctttggtgtcagtacaatcgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgtctttgacatggagaagaatgtgtgaacacatagagtcaatagtcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACTTACAGTTGTAGGTTTAATA-TGTCATCT-CTTTATTATGTTAAATATTAATAC---ATG---G---T---G-G-
gi|7 : TGTTATGGTTTTACTAAAAAAAATATATCCACTATACTGTGTCCCATACAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATGACTGG------AT-AATTGTGTAATTTGTTTACAGGCATTACTTACCTGTATTGAACCGTTATCCGCCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAA-ACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAACATTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATCCTTATTC---TACATAGATCAAAAGGTAATATTGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgttatggttttactaaaaaaaatatatccactatactgtgtcccatacaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattatgactggataattgtgtaatttgtttacaggcattacttacctgtattgaaccgttatccgcctcaatatatctatgaaccctggaatacaccagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaaactatccagtacctatggtgaaccatgcagacgcgagcaacatttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatccttattctacatagatcaaaaggtaatattg
gi|8 : aaacttacagttgtaggtttaatatgtcatctctttattatgttaaatattaatacatggtggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttGCA-TCAAGGTGAGACTGGGTCTGCCGAG--GTACTGTTATATTTTCGTACCAAACCTAATAAACTCT-G-TA-------GGAAAA--AT-CTTCT-CATAAATATTA----TGT----TTAGAC-----T----GTT-----------GACTAAAAATGTAA----TTGTGTAAGTTTCAATAACAATGTCTTGGTGA-GTTATTTTAAAGGAAGAAATGCAAGTAA--TCTGAATGAAGGTTTATTTGGT--TA--------CCTGTCGACTAAACT-----TAGTAAGTTTGATA-GGTCACCT-CTTTGTTATGTCTAATGTTAATGA---ATG---ATAGT---A-G-GATATATAT-TA-CAGA
gi|8 : TGGTTTGACTAAAGAAA-TATATCCACTATACAATGTCACATACAAGCCATTTGTTGTGATCTTGTGGCC-AATGATcattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggtttgactaaagaaatatatccactatacaatgtcacatacaagccatttgttgtgatcttgtggccaatgata
gi|9 : gcatcaaggtgagactgggtctgccgaggtactgttatattttcgtaccaaacctaataaactctgtaggaaaaatcttctcataaatattatgtttagactgttgactaaaaatgtaattgtgtaagtttcaataacaatgtcttggtgagttattttaaaggaagaaatgcaagtaatctgaatgaaggtttatttggttacctgtcgactaaacttagtaagtttgataggtcacctctttgttatgtctaatgttaatgaatgatagtaggatatatattacagacattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGAAAACA-T---GACAAGGTGAGCTCTGCCAAACTGTAATGTTGTGTTTTTATGCTGAACCAACT--ATT-T-G-TAA------GGAAAG--GT-ACTAA-C-CTAGTTTTC----TAT----TTATCC-----TTTTGGCTAAAATGTTAGTG-----------------CGT---AGGTTTCAACTGCAATATCTTGGACATA--ATTTTGAAGGAAGGAATCCAAATGGAATATT-ATAATGGT--------A--CA--------TGTACCAAA-ACATTT-CA--AGTTGATTAAATAGGGTCACCC-TTTTATTGCCTCAAA---TAATGT---ATAATTA---T---G-G-GATAa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): AATTTTTGAAATTAGAACATAAACTACAATACTGAGTACAAGGTAAGTGTCTCTCTGTACCAAAGTTATCACTGAGGCGAATGAAATGTTACAAGGCGATGTTCTGGCGAGCATCTGTTGTATTTTCATACAAATCCTATTAAACTTTGTAGAGAAAAGCTTTATTC
Unaligned ( gi|20 ): AATGCACTGAAATGACAGTAGAAATACAACTGTTAGTTTAAACACTTCATACAAAATCTAATAAACTTCATAGGGTAATGCACAACTCTAGTATTCCATTTATCTTGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 7777777777777777777777 222 111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 2222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 3333 111111 111
lowQualScore : 1 4 7 7 6 5 6 111 3 11 9999999999999999999999 1 000 000 1 1 5 66 0 0 1 5 1 2 0 66 1 1 111 5 6 6 3 7777777 888888 44 3 3 44 888888 555 7777 7777 888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 66 4 7 5 66 0 777777777777777777777 1 44444 4 0 4 22 777 5555555555555 4 6 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 6 1 5 5 666666 5 2222 5 666666 5 4 000
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. ...................... . ... ... . . . .. . . . . . . . .. . . ... . . . . ....... ...... .. . . .. ...... ... .... .... ................................................... .... .. . . . .. . ..................... . ..... . . . .. ... ............. . . . .................................................................................................................... . . . . . ...... . .... . ...... . . ...
lowQualScore : 4 6 3 3 7 2 7 777 2 00 8888888888888888888888 0 000 000 8 0 7 11 6 6 4 7 4 2 7 11 0 6 000 8 7 7 3 5555555 888888 66 3 3 88 888888 888 1111 1111 000000000000000000000000000000000000000000000000000 9999 11 4 1 7 99 1 000000000000000000000 0 77777 0 8 0 22 888 7777777777777 4 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 7 0 7 7 444444 7 7777 4 444444 7 0 000
consensus : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTG-----T-----T----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
Reference ( family-2768 ) : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTG-----T-----T----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
gi|1 : TTTGTTGTGTAGACCTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAAGTACTTTACTGTACTATTAGTTCCAGTTTTA-TAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATAAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAATG----------------------GGAT---GGATTG---GTTTTTGCTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATCACATAATCA-TAAT-TCTATAATATAAC------ACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAA
gi|1 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGCCCAGCTCTGCTAAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCAAATCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----G--GT-TT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----A-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCACT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCGGCCAAATAAACTTACAGTAGTATGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATAC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGTTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCACTATACTATATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGAAGGTC-AA-GATTATAACTGATTACATGTAA-TTGTGTGATTTGATTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATACATGTATATCTATGAACCCTGGAATACACTAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAAGATTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGTAGATGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaagcccagctctgctaaggcagtgttacattgatgtgccaaatctaatgaacttgtagcaacggttttttctctagtattttgtttatcctgcagctgaggtttcactaacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaaggtttaccggccaaataaacttacagtagtatgtttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatacatgataggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgttatggtttaactaaaaatatatatccactatactatatcacattcaagccatttgttgtgatctgaaggtcaagattataactgattacatgtaattgtgtgatttgatttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacaatacatgtatatctatgaaccctggaatacactagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaagattatccagtacctatggtgaaccatgtagatgcgagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctacgtagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|10 : tttgttgtgtagacctacatcaaatgttaatgtgcatgcaaattttaagtactttactgtactattagttccagttttatagtaaactgtgtaaaataaaaaaataaatgaacaacatttgttttaaatgggatggattggtttttgctcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatcacataatcataattctataatataacactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTACCGAA--CCATTGCTGCGTTTCCCTACTGAACCTAATAAACTAT-G-TAAGGAAATGCAACTTTGTA--TT-CTATTT-TGCCTGTCGAGTAATGTTT----TCG----TTAT-T----------T----GCATTAT-----------T-----------------CTC---AAGTTCTCCAGTAAACAATATCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11 : ttaagatattttagaacattcagctgttgttaaccgcggtaaaggtaaatagtgaatattatgtttgtgcctttctctaccaagtattagataaggctaagaatgtgcaacgaggcgatggaTTATAACTGG------ATAAATTTTGTGATT-ATTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCACCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCTGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGCATGGATAGGATGAAGCAGGTCTATCAAACACTTATTC---TACGTCGATCAAAAGGTAATATTGTTT
gi|12 : gATCTAATAAACT-TTG-TA-------ACAAC-----AAAGT-AT-T----------CTAATA---TTTAATCTGTCCTTTTGTCCAAAAATACAGT----AT----T-----------T-----------------CTT---AGAT--TTCAAT-CATAATATCTCAGACA-CA-AATTTAAAGGTAAAAATCCAAGTAT--TCCGCATGAAAAT--------T--TATAGTGCTTCCTTCCAAATAAAGTTA---------ATTTTATT-TGT-AACTGCTTTATTATCTTTGATATTA
gi|13 : ctgttaaagtcattcaaggtcattcatgtttcaaggtcaattcCATTGTTACATCTTCATGCCAAATCTAATTAATT-A-GATAG------GGAAA-----A--GCACT-ATA-C-----CCTGGTA---TAC----TAT----TTATTC----------T----GT----T-----------GACCGAAAATGTAGTGTACTA---ATGT--TTCAAT-CACATTGTCTTGGA
gi|14 : ttatatacagggagaaggaacacaaggttagatcttatcatatctattaaatggtgagagtagaaaaatgcaacaagatgagactatggcatacTTTGATGTATGGCTGTACATTTACTGTTAATGACCACACAAATTTTAACTATTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATCGTAAACTGTGTAAAAGAAAAATAAT---TAAACACCTA---TT--TT--TTAAGTGTTTTTT-----T----------AAGT---GGATTA---GTTATTGTTCAAGTATTGTATCTTTGtgtgttatgtgattgaaagta
gi|16 : tAAGCAATAAAG-CTATGCC----TTGCTGAG--CCATTACTGCATTAACATGCTGAACATAAAAAGCT-TTG-TA-------GTAAA-----G--GT-CG-TT--C-----TCTAGTA---TTC----TAT----TT
gi|17 : aatactaggttggtgcccatccatacaataattattaagtgtggctaagacgTTTGTTGTATAGGTGTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTT
gi|18 : gcGTT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGATGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTATCAGGCTATCTATACTCCTGATGTCATTATGAt
gi|19 : ctggcttaaaTTGACGGAAGGAA-CTGAATCA--TTTGAACGAAAGT--------TGTTATGTTT---CCTGCCAAATAAATT--------CAAGTTTATCA-GTTCACCA-CTTTGTTATTTCAAA---TAATAC---ATA---A---T---G-GTAATATA
gi|2 : aac----------GGAT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTTGTATCCGCACAATTGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAAa
gi|2 : ctggctaaaAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGTCGGCTCTGCTGAG--GCACTGTTACGTTGATGTGCAGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-AGTTTGAAGGAAGAAATCAAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCAGCCAAATAA-CTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCGAATGTTAATGCATGATG---C---T---AGG-NNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGT---ACTAAAACTA-TATATCCGCTATACTATATCACATTCATGACATCTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------ATAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACGATA------TATCTATGAACCCTGAAATACACCAGAGAATGTCCAGAAAGCAACCATGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAAC---ACAGACGCAAGCAAACTTTGTATGGATGGAATGAAACAAGTTCACCAAATATTTTTTC---TACGTAAATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggtcggctctgctgaggcactgttacgttgatgtgcagaacctaatgaacttgtagcaacagtcttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataacaatatcttggacaactagtttgaaggaagaaatcaaagtagtctgaatgaaggtttaccagccaaataacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattatgtcgaatgttaatgcatgatgctaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtactaaaactatatatccgctatactatatcacattcatgacatctgttgtgatctggaggtcaagattataactggataattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacgatatatctatgaaccctgaaatacaccagagaatgtccagaaagcaaccatgtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaacacagacgcaagcaaactttgtatggatggaatgaaacaagttcaccaaatattttttctacgtaaatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|21 : ctggctaaaggatggattggtttttgttcaagtattgtatcttttgtatccgcacaattgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAGA-AATCAATGAACAAC-ATTTTTTGTG--TTAAGTG-----TTAC--T----------GGCTAAAGGATTG---ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : CAGAATCACTGGTAGCT-TAACAGAACTATCAGACTCCATATACTGCTGATGGCATTGTGATG
gi|23 : ACATTGATGTGCTGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCA-------A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------t
gi|24 : TTTGTTGTATAGACATACATAAAATGTTAATGAGCAAGCAAATTTTAACTAC
gi|3 : gcTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACACTCAGGCTATCTATACCCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATATTCAA
gi|3 : AGCA-TAAAGGCAAGGCCACCTCTGCTGAG--GCAGCGTTTCATTGATGTGCCAAATCTAAT-AACT-T-G-AA-------GCAAC-----A--GA-TT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACTATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TTTAAATGAAGGT--------T--AA--------CCGGCCAAATTAACTTACAGTATTAGTTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---TGCTA-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTCTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTCGAA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCACCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGGGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTTTGGGAAAAAGACTATCCAGTACCTATAGTGAACCATGCAGACGTGAGCAAACTTTGTATGGATAGGAT-AAATAAGTCCACCAGATA--------------TAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcataaaggcaaggccacctctgctgaggcagcgtttcattgatgtgccaaatctaataacttgaagcaacagatttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataactatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtttaaatgaaggttaaccggccaaattaacttacagtattagttttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatgcatgatgctaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaactaaaaatatatatccgctatactctatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcgaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccaccacaatatatctatgaaccctggaatacaccagggagtgtccagaaagcaaccaagtgcattttgggaaaaagactatccagtacctatagtgaaccatgcagacgtgagcaaactttgtatggataggataaataagtccaccagatatagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : ttcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatggcagaatcactagtagcttaatataacactcaggctatctatacccctgatgtcattgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTACTTTACTGTGTTATAAATTCTAGTTTTAATAGTAAACTGTGTCAAATAG------TTACTGGTTAAT-A---GTTAATAATTAAGTG-----T-----TACTAGCTAAAGGAC---AGATTG---GATTTTGTTCAATTATTTTATC------------ACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATATCACTCAGACTATCTATACTCTTGATGTTCTTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATAGTCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : AAAGCAAAGTTGGCACTGCTGAG--GCACTGTAACATTGATGTGCCGAACCTAATGCACT-T-G-AA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTG---TTT----TGT----TTATCC----------T----GT----T-----------G-----------------TTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAATGT--------T--TA--------CCAGCCAAGTAAACTTAAAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACC-CTTTATTATGTCAAATATTTATGC---ATG---A---TGGTA-G-GATATATAT-TA-CAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|4 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCTGGAGGTC-AA-GAATATAACTGG------ATAA-T---GTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTACTGAAAGGTTATCCGCT-CAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTTTTCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACATGTCCACCAAACACTTATTC---TATGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|5 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTTTGTCAAATATTAATGC---ATG---ATGCT---A-G-GATATATATATATCAGA
gi|5 : at-TATGCTATGGTTTAATTAAAAATG-TATATCCGCTATACTTTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCTACAATA------TATCTATGAACCCTGGAAAACACCAGAGAGTGTCCAAAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAAATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTCTAGTACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTcattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaattaaaaatgtatatccgctatactttatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgctacaatatatctatgaaccctggaaaacaccagagagtgtccaaaaagcaaccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcaaatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctagtacgtagatcaaaaggtaatattgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : atataaacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattttgtcaaatattaatgcatgatgctaggatatatatatatcagacattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTGCGTAGACGTACATCAAATATTAATGTGCATGTAAATTTAAATTTCTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTA---GTAACCTGTGTAAAATAAAAA-ATTCAATGAACAAT-A---TTTTTT--TTAAATG-----TGTTACT----------GGCTAAAGGATTGATTGTTTTTGTTCAAGTATTTTATCTTTGGTGTCAGTACAATCGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGTCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCGAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCTGAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCGAATATAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTTTC-----TATAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggccggctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccgaatataatgaacttgtagcaacagtctttttctatagtattttgtttatcctgc
gi|7 : tttgttgcgtagacgtacatcaaatattaatgtgcatgtaaatttaaatttctttactgtactattaattccagttttagtaacctgtgtaaaataaaaaattcaatgaacaatattttttttaaatgtgttactggctaaaggattgattgtttttgttcaagtattttatctttggtgtcagtacaatcgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgtctttgacatggagaagaatgtgtgaacacatagagtcaatagtcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACTTACAGTTGTAGGTTTAATA-TGTCATCT-CTTTATTATGTTAAATATTAATAC---ATG---G---T---G-G-
gi|7 : TGTTATGGTTTTACTAAAAAAAATATATCCACTATACTGTGTCCCATACAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATGACTGG------ATAA-TTGTGTAATTTGTTTACAGGCATTACTTACCTGTATTGAACCGTTATCCGCCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAA-ACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAACATTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATCCTTATTC---TACATAGATCAAAAGGTAATATTGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgttatggttttactaaaaaaaatatatccactatactgtgtcccatacaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattatgactggataattgtgtaatttgtttacaggcattacttacctgtattgaaccgttatccgcctcaatatatctatgaaccctggaatacaccagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaaactatccagtacctatggtgaaccatgcagacgcgagcaacatttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatccttattctacatagatcaaaaggtaatattg
gi|8 : aaacttacagttgtaggtttaatatgtcatctctttattatgttaaatattaatacatggtggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttGCA-TCAAGGTGAGACTGGGTCTGCCGAG--GTACTGTTATATTTTCGTACCAAACCTAATAAACTCT-G-TA-------GGAAA-----A--AT-CT-TCT-C-----ATAAATA---TTA----TGT----TTAGAC----------T----GT----T-----------GACTAAAAATGTAA----TTGTGTAAGT--TTCAAT-AACAATGTCTTGGTGAGTT-ATTTTAAAGGAAGAAATGCAAGTAA--TCTGAATGAAGGTTTATTTGGT--TA--------CCTGTCGACTAAACT-----TAGTAAGTTTGATA-GGTCACCT-CTTTGTTATGTCTAATGTTAATGA---ATG---ATAGT---A-G-GATATATAT-TA-CAGA
gi|8 : TGGTTTGACTAAAGAAA-TATATCCACTATACAATGTCACATACAAGCCATTTGTTGTGATCTTGTGGCC-AATGATcattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggtttgactaaagaaatatatccactatacaatgtcacatacaagccatttgttgtgatcttgtggccaatgata
gi|9 : gcatcaaggtgagactgggtctgccgaggtactgttatattttcgtaccaaacctaataaactctgtaggaaaaatcttctcataaatattatgtttagactgttgactaaaaatgtaattgtgtaagtttcaataacaatgtcttggtgagttattttaaaggaagaaatgcaagtaatctgaatgaaggtttatttggttacctgtcgactaaacttagtaagtttgataggtcacctctttgttatgtctaatgttaatgaatgatagtaggatatatattacagacattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGAAAACA-T---GACAAGGTGAGCTCTGCCAAACTGTAATGTTGTGTTTTTATGCTGAACCAACT--ATT-T-G-TAA------GGAAA-----G--GT-AC-TAA-C------CTAGTT---TTC----TAT----TTATCC----------TTTTGGC----TAAAATGTTAGTG-----------------CGT---AGGT--TTCAAC-TGCAATATCTTGGACA--TAATTTTGAAGGAAGGAATCCAAATGGAATATT-ATAATGGT--------A--CA--------TGTACCAAA-ACATTT-CA--AGTTGATTAAATAGGGTCACCC-TTTTATTGCCTCAAA---TAATGT---ATAATTA---T---G-G-GATAa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): AATTTTTGAAATTAGAACATAAACTACAATACTGAGTACAAGGTAAGTGTCTCTCTGTACCAAAGTTATCACTGAGGCGAATGAAATGTTACAAGGCGATGTTCTGGCGAGCATCTGTTGTATTTTCATACAAATCCTATTAAACTTTGTAGAGAAAAGCTTTATTC
Unaligned ( gi|20 ): AATGCACTGAAATGACAGTAGAAATACAACTGTTAGTTTAAACACTTCATACAAAATCTAATAAACTTCATAGGGTAATGCACAACTCTAGTATTCCATTTATCTTGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 7777777777777777777777 222 111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 2222222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 3333 111111 111
lowQualScore : 1 4 7 7 6 5 6 111 3 11 9999999999999999999999 1 000 000 1 1 5 66 0 0 1 5 1 2 0 66 1 1 111 5 6 6 3 7777777 888888 44 3 3 44 888888 555 7777 7777 888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 66 4 7 5 66 0 777777777777777777777 1 44444 4 0 4 22 777 5555555555555 4 6 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 6 1 5 5 666666 5 2222 5 666666 5 4 000
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. ...................... . ... ... . . . .. . . . . . . . .. . . ... . . . . ....... ...... .. . . .. ...... ... .... .... ................................................... .... .. . . . .. . ..................... . ..... . . . .. ... ............. . . . .................................................................................................................... . . . . . ...... . .... . ...... . . ...
lowQualScore : 4 6 3 3 7 2 7 777 2 00 8888888888888888888888 0 000 000 8 0 7 11 6 6 4 7 4 2 7 11 0 6 000 8 7 7 3 5555555 888888 66 3 3 88 888888 888 1111 1111 000000000000000000000000000000000000000000000000000 9999 11 4 1 7 99 1 000000000000000000000 0 77777 0 8 0 22 888 7777777777777 4 7 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 7 0 7 7 444444 7 7777 4 444444 7 0 000
consensus : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTG-----T-----T----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
Reference ( family-2768 ) : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTG-----T-----T----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
gi|1 : TTTGTTGTGTAGACCTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAAGTACTTTACTGTACTATTAGTTCCAGTTTTA-TAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATAAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAATG----------------------GGAT---GGATTG---GTTTTTGCTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATCACATAATCA-TAAT-TCTATAATATAAC------ACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAA
gi|1 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGCCCAGCTCTGCTAAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCAAATCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----G--GT-TT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----A-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCACT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCGGCCAAATAAACTTACAGTAGTATGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATAC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGTTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCACTATACTATATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGAAGGTC-AA-GATTATAACTGATTACATGTAA-TTGTGTGATTTGATTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATACATGTATATCTATGAACCCTGGAATACACTAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAAGATTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGTAGATGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaagcccagctctgctaaggcagtgttacattgatgtgccaaatctaatgaacttgtagcaacggttttttctctagtattttgtttatcctgcagctgaggtttcactaacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaaggtttaccggccaaataaacttacagtagtatgtttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatacatgataggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgttatggtttaactaaaaatatatatccactatactatatcacattcaagccatttgttgtgatctgaaggtcaagattataactgattacatgtaattgtgtgatttgatttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacaatacatgtatatctatgaaccctggaatacactagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaagattatccagtacctatggtgaaccatgtagatgcgagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctacgtagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|10 : tttgttgtgtagacctacatcaaatgttaatgtgcatgcaaattttaagtactttactgtactattagttccagttttatagtaaactgtgtaaaataaaaaaataaatgaacaacatttgttttaaatgggatggattggtttttgctcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatcacataatcataattctataatataacactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTACCGAA--CCATTGCTGCGTTTCCCTACTGAACCTAATAAACTAT-G-TAAGGAAATGCAACTTTGTA--TT-CTATTT-TGCCTGTCGAGTAATGTTT----TCG----TTAT-T----------T----GCATTAT-----------T-----------------CTC---AAGTTCTCCAGTAAACAATATCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11 : ttaagatattttagaacattcagctgttgttaaccgcggtaaaggtaaatagtgaatattatgtttgtgcctttctctaccaagtattagataaggctaagaatgtgcaacgaggcgatggaTTATAACTGG------ATAAATTTTGTGATT-ATTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCACCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCTGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGCATGGATAGGATGAAGCAGGTCTATCAAACACTTATTC---TACGTCGATCAAAAGGTAATATTGTTT
gi|12 : gATCTAATAAACT-TTG-TA-------ACAAC-----AAAGT-AT-T----------CTAATA---TTTAATCTGTCCTTTTGTCCAAAAATACAGT----AT----T-----------T-----------------CTT---AGAT--TTCAAT-CATAATATCTCAGACA-CA-AATTTAAAGGTAAAAATCCAAGTAT--TCCGCATGAAAAT--------T--TATAGTGCTTCCTTCCAAATAAAGTTA---------ATTTTATT-TGT-AACTGCTTTATTATCTTTGATATTA
gi|13 : ctgttaaagtcattcaaggtcattcatgtttcaaggtcaattcCATTGTTACATCTTCATGCCAAATCTAATTAATT-A-GATAG------GGAAA-----A--GCACT-ATA-C-----CCTGGTA---TAC----TAT----TTATTC----------T----GT----T-----------GACCGAAAATGTAGTGTACTA---ATGT--TTCAAT-CACATTGTCTTGGA
gi|14 : ttatatacagggagaaggaacacaaggttagatcttatcatatctattaaatggtgagagtagaaaaatgcaacaagatgagactatggcatacTTTGATGTATGGCTGTACATTTACTGTTAATGACCACACAAATTTTAACTATTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATCGTAAACTGTGTAAAAGAAAAATAAT---TAAACACCTA---TT--TT--TTAAGTGTTTTTT-----T----------AAGT---GGATTA---GTTATTGTTCAAGTATTGTATCTTTGtgtgttatgtgattgaaagta
gi|16 : tAAGCAATAAAG-CTATGCC----TTGCTGAG--CCATTACTGCATTAACATGCTGAACATAAAAAGCT-TTG-TA-------GTAAA-----G--GT-CG-TT--C-----TCTAGTA---TTC----TAT----TT
gi|17 : aatactaggttggtgcccatccatacaataattattaagtgtggctaagacgTTTGTTGTATAGGTGTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTT
gi|18 : gcGTT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGATGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTATCAGGCTATCTATACTCCTGATGTCATTATGAt
gi|19 : ctggcttaaaTTGACGGAAGGAA-CTGAATCA--TTTGAACGAAAGT--------TGTTATGTTT---CCTGCCAAATAAATT--------CAAGTTTATCA-GTTCACCA-CTTTGTTATTTCAAA---TAATAC---ATA---A---T---G-GTAATATA
gi|2 : aac----------GGAT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTTGTATCCGCACAATTGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAAa
gi|2 : ctggctaaaAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGTCGGCTCTGCTGAG--GCACTGTTACGTTGATGTGCAGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-AGTTTGAAGGAAGAAATCAAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCAGCCAAATAA-CTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCGAATGTTAATGCATGATG---C---T---AGG-NNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGT---ACTAAAACTA-TATATCCGCTATACTATATCACATTCATGACATCTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------ATAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACGATA------TATCTATGAACCCTGAAATACACCAGAGAATGTCCAGAAAGCAACCATGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAAC---ACAGACGCAAGCAAACTTTGTATGGATGGAATGAAACAAGTTCACCAAATATTTTTTC---TACGTAAATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggtcggctctgctgaggcactgttacgttgatgtgcagaacctaatgaacttgtagcaacagtcttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataacaatatcttggacaactagtttgaaggaagaaatcaaagtagtctgaatgaaggtttaccagccaaataacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattatgtcgaatgttaatgcatgatgctaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtactaaaactatatatccgctatactatatcacattcatgacatctgttgtgatctggaggtcaagattataactggataattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacgatatatctatgaaccctgaaatacaccagagaatgtccagaaagcaaccatgtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaacacagacgcaagcaaactttgtatggatggaatgaaacaagttcaccaaatattttttctacgtaaatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|21 : ctggctaaaggatggattggtttttgttcaagtattgtatcttttgtatccgcacaattgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAGA-AATCAATGAACAAC-ATTTTTTGTG--TTAAGTG-----TTAC--T----------GGCTAAAGGATTG---ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : CAGAATCACTGGTAGCT-TAACAGAACTATCAGACTCCATATACTGCTGATGGCATTGTGATG
gi|23 : ACATTGATGTGCTGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCA-------A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------t
gi|24 : TTTGTTGTATAGACATACATAAAATGTTAATGAGCAAGCAAATTTTAACTAC
gi|3 : gcTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACACTCAGGCTATCTATACCCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATATTCAA
gi|3 : AGCA-TAAAGGCAAGGCCACCTCTGCTGAG--GCAGCGTTTCATTGATGTGCCAAATCTAAT-AACT-T-G-AA-------GCAAC-----A--GA-TT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACTATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TTTAAATGAAGGT--------T--AA--------CCGGCCAAATTAACTTACAGTATTAGTTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---TGCTA-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTCTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTCGAA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCACCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGGGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTTTGGGAAAAAGACTATCCAGTACCTATAGTGAACCATGCAGACGTGAGCAAACTTTGTATGGATAGGAT-AAATAAGTCCACCAGATA--------------TAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcataaaggcaaggccacctctgctgaggcagcgtttcattgatgtgccaaatctaataacttgaagcaacagatttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataactatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtttaaatgaaggttaaccggccaaattaacttacagtattagttttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatgcatgatgctaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaactaaaaatatatatccgctatactctatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcgaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccaccacaatatatctatgaaccctggaatacaccagggagtgtccagaaagcaaccaagtgcattttgggaaaaagactatccagtacctatagtgaaccatgcagacgtgagcaaactttgtatggataggataaataagtccaccagatatagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : ttcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatggcagaatcactagtagcttaatataacactcaggctatctatacccctgatgtcattgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTACTTTACTGTGTTATAAATTCTAGTTTTAATAGTAAACTGTGTCAAATAG------TTACTGGTTAAT-A---GTTAATAATTAAGTG-----T-----TACTAGCTAAAGGAC---AGATTG---GATTTTGTTCAATTATTTTATC------------ACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATATCACTCAGACTATCTATACTCTTGATGTTCTTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATAGTCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : AAAGCAAAGTTGGCACTGCTGAG--GCACTGTAACATTGATGTGCCGAACCTAATGCACT-T-G-AA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTG---TTT----TGT----TTATCC----------T----GT----T-----------G-----------------TTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAATGT--------T--TA--------CCAGCCAAGTAAACTTAAAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACC-CTTTATTATGTCAAATATTTATGC---ATG---A---TGGTA-G-GATATATAT-TA-CAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|4 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATCTGGAGGTC-AA-GAATATAACTGG------ATAA-T---GTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTACTGAAAGGTTATCCGCT-CAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTTTTCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACATGTCCACCAAACACTTATTC---TATGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|5 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTTTGTCAAATATTAATGC---ATG---ATGCT---A-G-GATATATATATATCAGA
gi|5 : at-TATGCTATGGTTTAATTAAAAATG-TATATCCGCTATACTTTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCTACAATA------TATCTATGAACCCTGGAAAACACCAGAGAGTGTCCAAAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAAATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTCTAGTACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTcattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaattaaaaatgtatatccgctatactttatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgctacaatatatctatgaaccctggaaaacaccagagagtgtccaaaaagcaaccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcaaatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctagtacgtagatcaaaaggtaatattgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : atataaacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattttgtcaaatattaatgcatgatgctaggatatatatatatcagacattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTGCGTAGACGTACATCAAATATTAATGTGCATGTAAATTTAAATTTCTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTA---GTAACCTGTGTAAAATAAAAA-ATTCAATGAACAAT-A---TTTTTT--TTAAATG-----TGTTACT----------GGCTAAAGGATTGATTGTTTTTGTTCAAGTATTTTATCTTTGGTGTCAGTACAATCGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGTCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCGAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCTGAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCGAATATAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTTTC-----TATAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggccggctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccgaatataatgaacttgtagcaacagtctttttctatagtattttgtttatcctgc
gi|7 : tttgttgcgtagacgtacatcaaatattaatgtgcatgtaaatttaaatttctttactgtactattaattccagttttagtaacctgtgtaaaataaaaaattcaatgaacaatattttttttaaatgtgttactggctaaaggattgattgtttttgttcaagtattttatctttggtgtcagtacaatcgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgtctttgacatggagaagaatgtgtgaacacatagagtcaatagtcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACTTACAGTTGTAGGTTTAATA-TGTCATCT-CTTTATTATGTTAAATATTAATAC---ATG---G---T---G-G-
gi|7 : TGTTATGGTTTTACTAAAAAAAATATATCCACTATACTGTGTCCCATACAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATGACTGG------ATAA-TTGTGTAATTTGTTTACAGGCATTACTTACCTGTATTGAACCGTTATCCGCCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAA-ACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAACATTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATCCTTATTC---TACATAGATCAAAAGGTAATATTGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgttatggttttactaaaaaaaatatatccactatactgtgtcccatacaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattatgactggataattgtgtaatttgtttacaggcattacttacctgtattgaaccgttatccgcctcaatatatctatgaaccctggaatacaccagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaaactatccagtacctatggtgaaccatgcagacgcgagcaacatttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatccttattctacatagatcaaaaggtaatattg
gi|8 : aaacttacagttgtaggtttaatatgtcatctctttattatgttaaatattaatacatggtggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttGCA-TCAAGGTGAGACTGGGTCTGCCGAG--GTACTGTTATATTTTCGTACCAAACCTAATAAACTCT-G-TA-------GGAAA-----A--AT-CT-TCT-C-----ATAAATA---TTA----TGT----TTAGAC----------T----GT----T-----------GACTAAAAATGTAA----TTGTGTAAGT--TTCAAT-AACAATGTCTTGGTGAGTT-ATTTTAAAGGAAGAAATGCAAGTAA--TCTGAATGAAGGTTTATTTGGT--TA--------CCTGTCGACTAAACT-----TAGTAAGTTTGATA-GGTCACCT-CTTTGTTATGTCTAATGTTAATGA---ATG---ATAGT---A-G-GATATATAT-TA-CAGA
gi|8 : TGGTTTGACTAAAGAAA-TATATCCACTATACAATGTCACATACAAGCCATTTGTTGTGATCTTGTGGCC-AATGATcattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggtttgactaaagaaatatatccactatacaatgtcacatacaagccatttgttgtgatcttgtggccaatgata
gi|9 : gcatcaaggtgagactgggtctgccgaggtactgttatattttcgtaccaaacctaataaactctgtaggaaaaatcttctcataaatattatgtttagactgttgactaaaaatgtaattgtgtaagtttcaataacaatgtcttggtgagttattttaaaggaagaaatgcaagtaatctgaatgaaggtttatttggttacctgtcgactaaacttagtaagtttgataggtcacctctttgttatgtctaatgttaatgaatgatagtaggatatatattacagacattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGAAAACA-T---GACAAGGTGAGCTCTGCCAAACTGTAATGTTGTGTTTTTATGCTGAACCAACT--ATT-T-G-TAA------GGAAA-----G--GT-AC-TAA-C------CTAGTT---TTC----TAT----TTATCC----------TTTTGGC----TAAAATGTTAGTG-----------------CGT---AGGT--TTCAAC-TGCAATATCTTGGACA--TAATTTTGAAGGAAGGAATCCAAATGGAATATT-ATAATGGT--------A--CA--------TGTACCAAA-ACATTT-CA--AGTTGATTAAATAGGGTCACCC-TTTTATTGCCTCAAA---TAATGT---ATAATTA---T---G-G-GATAa
blockSeqs : A C A A T C T TTT G AA TTACTAGCTAAA G AAA ATT T G . TA A A A G CT T G TCC A A T A AGGAAAT CTTTGT AA A A TT GCCTGT ATG AATC CCTT TGTTGACCGAAAATGTAGTGTA GTGT TC A A A AA TTATAGTGCTT T TACAG G G TA ATG ATGCTA T A T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A A A G T . A TTAC T . A C TAG
blockSeqs : T T A A . C . . A . TTTTTTT T AAA . C T . TC T . A A . T A TTC A C T . G C . . . T C . . . TTTTGGCTAAAATGTTAGTG C . . A . . TTATTTGGTTA T TACAG . . TG . ATGGTA . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A . C . . . . TTAC A . . T .
blockSeqs : A A A A . T . . T . TGTTACT A . . T G . TA T . A G . T A AAC T . . . A A . . . A T . . . TGTTGACTAAAAATGTAA T . . A . . TGTTATGTTT A TAAAG . . TG . ATGCTA . . . T . T . . . . TTAC A . . C .
blockSeqs : T T A . . C . . . . TTACT C . . A G . AC A . A G . C G GAT A . . . . A . . . T T . . . AAAAATACAGTATTT A . . G . . TTA G TACAG . . TA . ATAGTA . . . G . G . . . . . A . . T .
blockSeqs : . . . . . . A . . . C . AC . C G . G A GAT G . . . . C . . . T T . . . TGCATTATT G . . . . . TAA A TACAG . . TA . ATTATG . . . . . A . . . . . T . . C .
blockSeqs : C . . . TC . . A . C A GAT G . . . . C . . . T T . . . TGCTG G . . . . . TTA T TCA . . TA . CTAG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G A GAT G . . . . C . . . T T . . . TGCTG G . . . ACA T TA . . TG . ATG .
blockSeqs : . C A GAT G . . . . C . . . T T . . . TGTTG T . . . . . . . GTG .
blockSeqs : A A TTC A . . . . A . . . A A . . . . . . .
blockSeqs : G TTT . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TTACT***************** TC ATGNTA******* ****** TTAC ******
originalCons : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTG-----T-----T----------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATG---A---T---A-G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
finalCons : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAAGTGTTACT-----------------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-G-TA-------GCAAC-----A--GT-CT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-----------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGT--------T--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGC---ATGATGNTA-------G-GATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): AATTTTTGAAATTAGAACATAAACTACAATACTGAGTACAAGGTAAGTGTCTCTCTGTACCAAAGTTATCACTGAGGCGAATGAAATGTTACAAGGCGATGTTCTGGCGAGCATCTGTTGTATTTTCATACAAATCCTATTAAACTTTGTAGAGAAAAGCTTTATTC
Unaligned ( gi|20 ): AATGCACTGAAATGACAGTAGAAATACAACTGTTAGTTTAAACACTTCATACAAAATCTAATAAACTTCATAGGGTAATGCACAACTCTAGTATTCCATTTATCTTGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 11 22222222222222 222 111 1111111 11111111 111111 66666666666666666666666666666666666666666666666 1111 55555555 11111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 3333 111111 111
lowQualScore : 1 4 7 7 6 5 6 111 3 11 11 44444444444444 1 000 000 1 1 5 66 0 0 1 5 1 4 66 1 0 0 0 6 8 8 7777777 11111111 4 44 000000 777 8888 8888 88888888888888888888888888888888888888888888888 0000 77 5 9 77 77 1 77 55555555 1 00000 4 1 4 22 44 5 8 8 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 6 1 5 5 666666 5 2222 5 666666 5 4 000
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. .. .............. . ... ... . . . .. . . . . . . .. . . . . . . . ....... ........ . .. ...... ... .... .... ............................................... .... .. . . .. .. . .. ........ . ..... . . . .. .. . . . .................................................................................................................... . . . . . ...... . .... . ...... . . ...
lowQualScore : 4 6 3 3 7 2 7 777 2 00 00 33333333333333 0 000 000 8 0 7 11 6 6 4 7 4 0 99 0 7 1 7 4 0 0 0000000 00000000 0 99 999999 000 5555 5555 11111111111111111111111111111111111111111111111 7777 99 7 8 33 99 4 99 77777777 0 33333 4 9 4 88 11 7 0 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 7 0 7 7 444444 7 7777 4 444444 7 0 000
consensus : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAA--GTG--TTACT-------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-GTA-------GCAAC-----A--GTCT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-ATTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGTT--TAT-------CCTGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGCATGATGNTA-GGATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
Reference ( family-2768 ) : TTTGTTGTATAGACGTACATCAAATGTTAATGTGCACGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAA--GTG--TTACT-------GGNT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATNGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCCGAG--GCANTGTTACGTTGACGTGCCGAACCTAATGAACT-T-GTA-------GCAAC-----A--GTCT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGTT--TA--------CCNGCCAAATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGCATGATGNTA-GGATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTNTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATACTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTT
gi|1 : TTTGTTGTGTAGACCTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAAGTACTTTACTGTACTATTAGTTCCAGTTTTA-TAGTAAACTGTGTAAAATAAAAA-AATAAATGAACAAC-A---TTTGTT--TTAA--ATG--------------GGAT---GGATTG---GTTTTTGCTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATCACATAATCA-TAAT-TCTATAATATAAC------ACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAA
gi|1 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGCCCAGCTCTGCTAAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCAAATCTAATGAACT-T-GTA-------GCAAC-----G--GTTT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----A-----------G-------------CTG---AGGT--TTCACT-AACAATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TCTGAATGAAGGTT--TA--------CCGGCCAAATAAACTTACAGTAGTATGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATACATGAT---A-GGATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGTTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCACTATACTATATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGAAGGTC-AA-GATTATAACTGATTACATGTAA-TTGTGTGATTTGATTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACAATACATGTATATCTATGAACCCTGGAATACACTAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAAGATTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGTAGATGCGAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTC---TACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaagcccagctctgctaaggcagtgttacattgatgtgccaaatctaatgaacttgtagcaacggttttttctctagtattttgtttatcctgcagctgaggtttcactaacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaaggtttaccggccaaataaacttacagtagtatgtttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatacatgataggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgttatggtttaactaaaaatatatatccactatactatatcacattcaagccatttgttgtgatctgaaggtcaagattataactgattacatgtaattgtgtgatttgatttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacaatacatgtatatctatgaaccctggaatacactagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaagattatccagtacctatggtgaaccatgtagatgcgagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctacgtagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|10 : tttgttgtgtagacctacatcaaatgttaatgtgcatgcaaattttaagtactttactgtactattagttccagttttatagtaaactgtgtaaaataaaaaaataaatgaacaacatttgttttaaatgggatggattggtttttgctcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatcacataatcataattctataatataacactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTACCGAA--CCATTGCTGCGTTTCCCTACTGAACCTAATAAACTAT-GTAAGGAAATGCAACTTTGTA--TTCTATTT-TGCCTGTCGAGTAATGTTT----TCG----TTAT-T----------T----GCATTAT-----------T-------------CTC---AAGTTCTCCAGTAAACAATATCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11 : ttaagatattttagaacattcagctgttgttaaccgcggtaaaggtaaatagtgaatattatgtttgtgcctttctctaccaagtattagataaggctaagaatgtgcaacgaggcgatggaTTATAACTGG------ATAAATTTTGTGATT-ATTTTCAGGCATTACTTACCTGTATTGAAAGGTTATCCACCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCTGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAAACTTTGCATGGATAGGATGAAGCAGGTCTATCAAACACTTATTC---TACGTCGATCAAAAGGTAATATTGTTT
gi|12 : gATCTAATAAACT-TTGTA-------ACAAC-----AAAGTAT-T----------CTAATA---TTTAATCTGTCCTTTTGTCCAAAAATACAGT----AT----T-----------T-------------CTT---AGAT--TTCAAT-CATAATATCTCAGACA-CA-AATTTAAAGGTAAAAATCCAAGTAT--TCCGCATGAAAATT--TATAGTGCTTCCTTCCAAATAAAGTTA---------ATTTTATT-TGT-AACTGCTTTATTATCTTTGATATTA
gi|14 : ctgttaaagtcattcaaggtcattcatgtttcaaggtcaattcTTTGATGTATGGCTGTACATTTACTGTTAATGACCACACAAATTTTAACTATTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATCGTAAACTGTGTAAAAGAAAAATAAT---TAAACACCTA---TT--TT--TTAA--GTGTTTTTTT-------AAGT---GGATTA---GTTATTGTTCAAGTATTGTATCTTTG
gi|16 : tAAGCAATAAAG-CTATGCC----TTGCTGAG--CCATTACTGCATTAACATGCTGAACATAAAAAGCT-TTGTA-------GTAAA-----G--GTCG-TT--C-----TCTAGTA---TTC----TAT----TT
gi|17 : aatactaggttggtgcccatccatacaataattattaagtgtggctaagacgTTTGTTGTATAGGTGTACATCAAATGTTAATGTGCATGCAAATTTTAACTACTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAAA-AATCAATGAACAAC-A---TTT
gi|18 : gcGTT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTGATGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTATCAGGCTATCTATACTCCTGATGTCATTATGAt
gi|19 : ctggcttaaaTTGACGGAAGGAA-CTGAATCA--TTTGAACGAAAGTTGTTATGTTT---CCTGCCAAATAAATT--------CAAGTTTATCA-GTTCACCA-CTTTGTTATTTCAAA---TAATACATAATGGTA---ATATA
gi|2 : aac-------GGAT---GGATTG---GTTTTTGTTCAAGTATTGTATCTTTTGTATCCGCACAATTGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGCCTGTGACCTGGAGAATAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCAAa
gi|2 : ctggctaaaAAAAAGCA-TAAAGGCAAGGTCGGCTCTGCTGAG--GCACTGTTACGTTGATGTGCAGAACCTAATGAACT-T-GTA-------GCAAC-----A--GTCT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACAATATCTTGGACAACT-AGTTTGAAGGAAGAAATCAAAGTAG--TCTGAATGAAGGTT--TA--------CCAGCCAAATAA-CTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCGAATGTTAATGCATGATGCTAGGNNNNNNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATGCTATGGT---ACTAAAACTA-TATATCCGCTATACTATATCACATTCATGACATCTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------ATAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCCACGATA------TATCTATGAACCCTGAAATACACCAGAGAATGTCCAGAAAGCAACCATGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAAC---ACAGACGCAAGCAAACTTTGTATGGATGGAATGAAACAAGTTCACCAAATATTTTTTC---TACGTAAATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggtcggctctgctgaggcactgttacgttgatgtgcagaacctaatgaacttgtagcaacagtcttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataacaatatcttggacaactagtttgaaggaagaaatcaaagtagtctgaatgaaggtttaccagccaaataacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattatgtcgaatgttaatgcatgatgctaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtactaaaactatatatccgctatactatatcacattcatgacatctgttgtgatctggaggtcaagattataactggataattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgccacgatatatctatgaaccctgaaatacaccagagaatgtccagaaagcaaccatgtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaacacagacgcaagcaaactttgtatggatggaatgaaacaagttcaccaaatattttttctacgtaaatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|21 : ctggctaaaggatggattggtttttgttcaagtattgtatcttttgtatccgcacaattgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgcctgtgacctggagaataatgtgtgaacacatagagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTAATAGTAAACTGTGTAAAAT-AAGA-AATCAATGAACAAC-ATTTTTTGTG--TTAA--GTG--TTACT-------GGCTAAAGGATTG---ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : CAGAATCACTGGTAGCT-TAACAGAACTATCAGACTCCATATACTGCTGATGGCATTGTGATG
gi|23 : ACATTGATGTGCTGAACCTAATGAACT-T-GTA-------GCA-------A--GTCT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------t
gi|24 : TTTGTTGTATAGACATACATAAAATGTTAATGAGCAAGCAAATTTTAACTAC
gi|3 : gcTTCAAGTATTGTATCTTTGGTGTCTGCACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACACTCAGGCTATCTATACCCCTGATGTCATTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATATTCAA
gi|3 : AGCA-TAAAGGCAAGGCCACCTCTGCTGAG--GCAGCGTTTCATTGATGTGCCAAATCTAAT-AACT-T-GAA-------GCAAC-----A--GATT-TTT-C-----TCTAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----T-----------G-------------CTG---AGGT--TTCAAT-AACTATATCTTGGACAACT-GTTTTGAAGGAAGAAATCCAAGTAG--TTTAAATGAAGGTT--AA--------CCGGCCAAATTAACTTACAGTATTAGTTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTATGTCAAATGTTAATGCATGATGCTA-GGATATATAT-TA-CAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGCTATGGTTTAACTAAAAATA-TATATCCGCTATACTCTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTCGAA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCACCACAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGGGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAGTGCATTTTGGGAAAAAGACTATCCAGTACCTATAGTGAACCATGCAGACGTGAGCAAACTTTGTATGGATAGGAT-AAATAAGTCCACCAGATA--------------TAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcataaaggcaaggccacctctgctgaggcagcgtttcattgatgtgccaaatctaataacttgaagcaacagatttttctctagtattttgtttatcctgctgctgaggtttcaataactatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtttaaatgaaggttaaccggccaaattaacttacagtattagttttaataggtcaactctttattatgtcaaatgttaatgcatgatgctaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaactaaaaatatatatccgctatactctatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcgaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccaccacaatatatctatgaaccctggaatacaccagggagtgtccagaaagcaaccaagtgcattttgggaaaaagactatccagtacctatagtgaaccatgcagacgtgagcaaactttgtatggataggataaataagtccaccagatatagatcaaaaggtaatattgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : ttcaagtattgtatctttggtgtctgcacaatggcagaatcactagtagcttaatataacactcaggctatctatacccctgatgtcattgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatattcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTACTTTACTGTGTTATAAATTCTAGTTTTAATAGTAAACTGTGTCAAATAG------TTACTGGTTAAT-A---GTTAATAATTAA--GTG--TTACTAGCTAAAGGAC---AGATTG---GATTTTGTTCAATTATTTTATC------------ACAATGGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATATCACTCAGACTATCTATACTCTTGATGTTCTTGTGATGCCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATTGAGTCAATAGTCAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|4 : GATCTGGAGGTC-AA-GAATATAACTGG------ATAA-T---GTGATTTGTTTTCAGGCATTACTTACCTGTACTGAAAGGTTATCCGCT-CAATA------TATCTATGAACCCTGGAATGCACCAGAGAGTTTTCAGAAAGCAGCCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACATGTCCACCAAACACTTATTC---TATGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatctggaggtcaagaatataactggataatgtgatttgttttcaggcattacttacctgtactgaaaggttatccgctcaatatatctatgaaccctggaatgcaccagagagttttcagaaagcagccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcagatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacatgtccaccaaacacttattctatgtagatcaaaaggtaatattgtttt
gi|5 : actactttactgtgttataaattctagttttaatagtaaactgtgtcaaatagttactggttaatagttaataattaagtgttactagctaaaggacagattggattttgttcaattattttatcacaatggcagaatcactagtagcttaatatatcactcagactatctatactcttgatgttcttgtgatgcctttgacatggagaagaatgtgtgaacacattgagtcaatagtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcaaagttggcactgctgaggcactgtaacattgatgtgccgaacctaatgcacttgaagcaacagtcttttctctagtgttttgtttatcctgttgttgaggtttcaataacaatatcttggacaactgttttgaaggaagaaatccaagtagtctgaatgaatgtttaccagccaagtaaacttaaagtagtaggtttaataggtcaaccctttattatgtcaaatatttatgcatgatggtaggatatatattacagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAACTTACAGTAGTAGGTTTAATA-GGTCAACT-CTTTATTTTGTCAAATATTAATGCATGATGCTA-GGATATATATATATCAGA
gi|5 : at-TATGCTATGGTTTAATTAAAAATG-TATATCCGCTATACTTTATCACATTCAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATAACTGG------GTAA-TTGTGTGATTTGTTTTCAGGCATTAC----CTGTATTGAAAGGTTATCCGCTACAATA------TATCTATGAACCCTGGAAAACACCAGAGAGTGTCCAAAAAGCAACCAAGTGCATTGTGGG-AAAAGACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAAATGCAAGCAAACTTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATATTTATTCTAGTACGTAGATCAAAAGGTAATATTGTTTTcattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgctatggtttaattaaaaatgtatatccgctatactttatcacattcaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattataactgggtaattgtgtgatttgttttcaggcattacctgtattgaaaggttatccgctacaatatatctatgaaccctggaaaacaccagagagtgtccaaaaagcaaccaagtgcattgtgggaaaagactatccagtacctatggtgaaccatgcaaatgcaagcaaactttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatatttattctagtacgtagatcaaaaggtaatattgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : atataaacttacagtagtaggtttaataggtcaactctttattttgtcaaatattaatgcatgatgctaggatatatatatatcagacattccttaccaagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTGCGTAGACGTACATCAAATATTAATGTGCATGTAAATTTAAATTTCTTTACTGTACTATTAATTCCAGTTTTA---GTAACCTGTGTAAAATAAAAA-ATTCAATGAACAAT-A---TTTTTT--TTAAATGTG--TTACT-------GGCTAAAGGATTGATTGTTTTTGTTCAAGTATTTTATCTTTGGTGTCAGTACAATCGCAGAATCACTAGTAGCT-TAATATAACTCTCAGACTATCTATACTCCTGATGTCATTGTGATGTCTTTGACATGGAGAAGAATGTGTGAACACATAGAGTCAATAGTCGAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|6 : AAAAAGCA-TAAAGGCAAGGCCGGCTCTGCTGAG--GCAGTGTTACATTGATGTGCCGAATATAATGAACT-T-GTA-------GCAAC-----A--GTCT-TTTTC-----TATAGTA---TTT----TGT----TTATCC----------T----GC----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaagcataaaggcaaggccggctctgctgaggcagtgttacattgatgtgccgaatataatgaacttgtagcaacagtctttttctatagtattttgtttatcctgc
gi|7 : tttgttgcgtagacgtacatcaaatattaatgtgcatgtaaatttaaatttctttactgtactattaattccagttttagtaacctgtgtaaaataaaaaattcaatgaacaatattttttttaaatgtgttactggctaaaggattgattgtttttgttcaagtattttatctttggtgtcagtacaatcgcagaatcactagtagcttaatataactctcagactatctatactcctgatgtcattgtgatgtctttgacatggagaagaatgtgtgaacacatagagtcaatagtcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACTTACAGTTGTAGGTTTAATA-TGTCATCT-CTTTATTATGTTAAATATTAATACATGGTGGT
gi|7 : TGTTATGGTTTTACTAAAAAAAATATATCCACTATACTGTGTCCCATACAAGCCATTTGTTGTGATCTGGAGGTC-AA-GATTATGACTGG------ATAA-TTGTGTAATTTGTTTACAGGCATTACTTACCTGTATTGAACCGTTATCCGCCTCAATA------TATCTATGAACCCTGGAATACACCAGAGAGTGTCCAGAAAGCAACCAAATGCATTGTGGG-AAAA-ACTATCCAGTACCTATGGTGAACCATGCAGACGCGAGCAACATTTGTATGGATAGGATGAAACAAGTCCACCAAATCCTTATTC---TACATAGATCAAAAGGTAATATTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgttatggttttactaaaaaaaatatatccactatactgtgtcccatacaagccatttgttgtgatctggaggtcaagattatgactggataattgtgtaatttgtttacaggcattacttacctgtattgaaccgttatccgcctcaatatatctatgaaccctggaatacaccagagagtgtccagaaagcaaccaaatgcattgtgggaaaaactatccagtacctatggtgaaccatgcagacgcgagcaacatttgtatggataggatgaaacaagtccaccaaatccttattctacatagatcaaaaggtaatattg
gi|8 : aaacttacagttgtaggtttaatatgtcatctctttattatgttaaatattaatacatggtggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttGCA-TCAAGGTGAGACTGGGTCTGCCGAG--GTACTGTTATATTTTCGTACCAAACCTAATAAACTCT-GTA-------GGAAA-----A--ATCT-TCT-C-----ATAAATA---TTA----TGT----TTAGAC----------T----GT----T-----------GACTAAAAATGTAATTGTGTAAGT--TTCAAT-AACAATGTCTTGGTGAGTT-ATTTTAAAGGAAGAAATGCAAGTAA--TCTGAATGAAGGTT--TATTTGGTTACCTGTCGACTAAACTTA-----GTAAGTTTGATA-GGTCACCT-CTTTGTTATGTCTAATGTTAATGAATGATAGTA-GGATATATAT-TA-CAGA
gi|8 : TGGTTTGACTAAAGAAA-TATATCCACTATACAATGTCACATACAAGCCATTTGTTGTGATCTTGTGGCC-AATGATcattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggtttgactaaagaaatatatccactatacaatgtcacatacaagccatttgttgtgatcttgtggccaatgata
gi|9 : gcatcaaggtgagactgggtctgccgaggtactgttatattttcgtaccaaacctaataaactctgtaggaaaaatcttctcataaatattatgtttagactgttgactaaaaatgtaattgtgtaagtttcaataacaatgtcttggtgagttattttaaaggaagaaatgcaagtaatctgaatgaaggtttatttggttacctgtcgactaaacttagtaagtttgataggtcacctctttgttatgtctaatgttaatgaatgatagtaggatatatattacagacattctatacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGAAAACA-T---GACAAGGTGAGCTCTGCCAAACTGTAATGTTGTGTTTTTATGCTGAACCAACT--ATT-T-GTAA------GGAAA-----G--GTAC-TAA-C------CTAGTT---TTC----TAT----TTATCC----------TTTTGGC----TAAAATGTTAGTG-------------CGT---AGGT--TTCAAC-TGCAATATCTTGGACA--TAATTTTGAAGGAAGGAATCCAAATGGAATATT-ATAATGGTA--CA--------TGTACCAAA-ACATTT-CA--AGTTGATTAAATAGGGTCACCC-TTTTATTGCCTCAAA---TAATGTATAATTATG-GGATAa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): TTATATACAGGGAGAAGGAACACAAGGTTAGATCTTATCATATCTATTAAATGGTGAGAGTAGAAAAATGCAACAAGATGAGACTATGGCATACCATTGTTACATCTTCATGCCAAATCTAATTAATTAGATAGGGAAAAGCACTATACCCTGGTATACTATTTATTCTGTTGACCGAAAATGTAGTGTACTAATGTTTCAATCACATTGTCTTGGATGTGTTATGTGATTGAAAGTA
Unaligned ( gi|15 ): AATTTTTGAAATTAGAACATAAACTACAATACTGAGTACAAGGTAAGTGTCTCTCTGTACCAAAGTTATCACTGAGGCGAATGAAATGTTACAAGGCGATGTTCTGGCGAGCATCTGTTGTATTTTCATACAAATCCTATTAAACTTTGTAGAGAAAAGCTTTATTC
Unaligned ( gi|20 ): AATGCACTGAAATGACAGTAGAAATACAACTGTTAGTTTAAACACTTCATACAAAATCTAATAAACTTCATAGGGTAATGCACAACTCTAGTATTCCATTTATCTTGTT