lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 111111 444444444444444444444444444 11111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 2222 111111111111111111111 111111111111111111111 1 111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 1111111 22222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222222222222222 11111 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 444444444444444444444444444444444444444444 11 1111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444 1111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111111 22222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222222222222 111111 1111 11 11111 33333333333333333333333333333333333 1 111 11 11
lowQualScore : 3 555 333333333 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88 7 2 00000 44444 000000 44444 444444444444444444444444444 55 1 4 22 0 3 66 3 1 222 22222222 222 1 666666 5 333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 1 1 333 2 1111 1 1 222 777777777777777777777 1 111 22 777777777777777777777 111 1 3 666666 1 6 33 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 999999999999 1 1 2 222 0 111 44 1 111 1 4444 22222 666 3333333 222 11111 2 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 9 1 1 11 1 000000000000000 2 44444 2 3 999999999 1 1 22222 3333 2222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 9 1 1 1 11 5555555 11 5 2 22 777777777777777777 1 333333333333333333333333333333333333333333 0 0 4 2 4444444 33 0 333 9 0 2222222222222222222 4 111 11 0 55555 666 33 111 555555555555555555555555555555555555555 0 6 55555555 33333333 2 2222 11 5 1 11 6666666666666 11 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 6 3 333 22222222222222 00000000000 33 2 1 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 11 2222 1 22222 2 1 333 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 1 22 1 11 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 1 333333 444 999 22 1 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222 444 0000000000000000000 2 1 1 1 444 333 777777 22 7777 3 8 11 22222 6 1 6666 1 44444444444444444444444444444444444 3 3 2 1 77777 4 55 4 444 00 00
lowQualScore : . ... ......... . .......................................................... .. . . ..... ..... ...... ..... ........................... .. . . .. . . .. . . ... ........ ... . ...... . ... ......................................................................................................................................................... . . . . ... . .... . . ... ..................... . ... .. ..................... ... . . ...... . . .. ..................................................... .. ............ . . . ... . ... .. . ... . .... ..... ... ....... ... ..... . . ....................................................... . . . . .. . ............... . ..... . . ......... . . ..... .... .... ........................................................................... .. . . . . .. ....... .. . . .. .................. . .......................................... . . . . ....... .. . ... . . ................... . ... .. . ..... ... .. ... ....................................... . . ........ ........ . .... .. . . .. ............. .. . ................................................... . . . ... .............. ........... .. . . . .............................................................................................................. . .. .... . ..... . . ... . ................................................................... . . .. . .. ........................................................ ... . ...... ... ... .. . . ............................................................ ... ... ................... . . . . ... ... ...... .. .... . . .. ..... . . .... . ................................... . . . . ..... . .. . ... .. ..
lowQualScore : 8 888 333333333 9 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 77 6 3 77777 55555 555555 55555 111111111111111111111111111 88 6 0 44 5 8 55 0 5 666 22222222 555 4 999999 9 999 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 2 3 2 999 1 9999 0 0 888 000000000000000000000 0 888 55 999999999999999999999 888 1 4 555555 1 2 99 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 999999999999 0 0 6 777 2 888 66 1 999 1 5555 77777 333 4444444 333 22222 8 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 3 3 3 77 2 222222222222222 5 77777 2 2 000000000 2 4 88888 5555 3333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44 2 1 2 0 44 4444444 44 9 9 33 333333333333333333 0 666666666666666666666666666666666666666666 9 9 7 7 8888888 44 9 000 2 9 9999999999999999999 6 444 11 9 66666 777 77 777 000000000000000000000000000000000000000 8 7 77777777 88888888 1 2222 55 1 0 44 4444444444444 44 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 5 8 777 77777777777777 33333333333 99 1 0 9 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 77 5555 1 66666 5 2 111 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6 1 22 3 66 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111 5 444444 111 000 99 0 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 333 777 7777777777777777777 3 3 3 4 666 999 999999 11 5555 5 8 99 77777 0 9 3333 9 00000000000000000000000000000000000 1 1 3 1 77777 3 00 0 444 11 66
consensus : TAATGGTCAAAGGGAAACAA---CT-----GT--AGTT-GAATT------A--ATAGAGT--TTA----CG---T-A-TA-----TN--TAA----T-AACGGTC-AAAGGGAAATAA----CTCT-----AGT------T-----CA---G---N------------N--G---AATTA-TTGTGA--CTTATAGTCNAT--A-ATG-GTCAAAGG---GAAACAA--CTN-T---AG-TTCAG-----TTGAAT--TAT-GTG-A--TTATCGTCAA-T-----AATGG----TCAA-----AGG---GA-A-A--A-AC-T---C--TAGT--TC---AG--T-TGA-AA--T------A--N-----T-GT-A-A-C-T--A---TA-T------------CTAA----TA-A-TGGTCAAAG-GGA---AACAACTCTAGTTCA--GNT-G-A---A--T-A-A---T-G-TNACG--T-ATAG---T-CA------A-T-----A--A-TGG---TC-AAAGGGAAACAA-C----TC-TAGT--TC----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--TGC-GA-C---T--ATAG--TTA-----A-----T-AATGGTC-AAAGG---GAAACAACTCTAGT---TC-AGTT-G---A-A-A--TA-----TT-G-TAAC----TTATA---GT--NTAT-A-ATGGTCN---A-A--GGGAAACAA----------------T-AA-TTA--T-NT------AGTTCAGTTNA-A-A--T-A---GT-G-T-A-CC-T-ATA---G-TCANTAATGGT-C---AAAGGGAAATAAC-----TCTA----GT----T----C-A---G---ANNAA----TT--A-------TT--GTGA-------CTN----ATAG-TN--CA--T----AA--TGGTC-AAAGG-GAA--ACAA-------CTC--TNGTT-CA-GTT-----------------AA-A--A-T-----ANTG-T--A-------A-C---T--A-N-AN-T-T-ANT-A-------ATGGTC-AA-A---GGG-AAAC-------------------AACTCTAGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTNACT-T---ATAG-TC--T---AT---T----A-T---G----G--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----CTC--TAGTT-C--A-G-----------T--TG-AATN---A--------------TTGT--N-ACT-T-AT----A-GTCN-A-T-A-ATGGTCAAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-C--T-AGTT-C-AGTT--------GAA------A------N----A--ANT-GTA-ACT--T-T---A----TC-----AAA--------------AATA----ATA-A---------------GGTC-AAAGGG--AAACAA----CT-CT----AGTTCAGT-TG--A-A-A-A-----N-TTG------T-------AAC-T-AT-GT------T-TTA-T-NAN-G---------GTCAAAGGGAAATAACTCTNG-TT-CAGTTGA--AT---TA---T-AC-TA-AA-----TATGAC--TNAT-AGTC---TNTAAT-GGT-CA---AAGGG------A---AACAAC-TCTA--GTTCAGTTGA-A---A-T-A-NT-G-TN-AC----G-A-T-----A--TT---------A-----AA-----TAAT---GGTCAAAGG---GAAAC-------------------AACTCTNGTTCAG-TT-GA-AA-TA---TTGTGA--CTT--ATAGTC--ANTAATGGTCAAAGGGAAACAAC-TCTAGTT-NAG----TTGA-A--ATA-TTG-T-AC-NT-A-TA-NN--TAA--T--A-ACGGTTCAAA-G-G-AAATAACTC-----TAGT--TCAG-T--TGAATTATTG-TGACATAT
Reference ( gi|2 ) : TAATGGTCAAAGGGATACAA---CT-----GT--AGTT-GAATT-----TA-AATAGAGT--TTA----TA---T-A-TA-----TA--TAA----T-AACTGTT-AAAGGCAAACAG----CTCT-----AGT------T-----CA---A---A------------A--G---AATTA-TTATGA--CTTATAGTCTAT--A-ATG-GTCAAAGG---GAAACTA--TTA-T---AG-TTCAA-----TTTAAT--TATCATG-A-ATTATCGTCAA-T-----AATTA----TCAA-----AAA---GA-A-A--A-AT-T---C--TAGT--TT---AC--T-TGA-AA--T------A--G-----T-GT-A-A-T-T--A---TA-T------------CTAA----TA-A-TGTTCAAAG-GGA---AACATCTCTAGTTCA--TAT-G-A---A--T-A-A---T-G-TGACA--T-ATAG---T-CA------A-T-----G--A-TTG---TC-AAAGGGAAAGAA-A----TC-TAAT--TT----GGT---GG---AA-T---TA-----------T--TAC-GA-C---T--ATAG--TTA-----A-----T-AATGGTC-ATAGG---GAAACAACTCTAGT---TC-TGTT-G---A-A-A--TA-----TT-A-TAGC----TTATA---GT--ATAT-A-ATGGTGT---A-A--GAGAAACAAAA--------------TGAA-TTAA-T-GT------AGTTGAGTTTA-A-A--T-A---GT-G-T-A-TC-T-ATA---T-TTAATAACGAT-T---AAATGGAAACAAC-----TCTA----GT----T----T-A---G---AACAA----TT--A-------TT--ATGA-------CTA----ATAG-TA--CA--T----AA--TGATC-AAATG-GAA--ACAA-------CTC--TTGTT-CA-TTT-----------------AA-A--A-T-----AGTG-G--A-------A-C---T--A-A-AT-T-T-AAT-A-------ATGGTC-TA-A---GTG-AAAC-------------------AACTCCAGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTATGACT-T---ATAG-TC--T---GT---T----A-T---T----T--------TCAAATGG--------A--------AACAA----CTC--TAATT-C--A-T-----------T--TG-AATA---A--------------TTGG--G-ACT-T-AG----A-GTCT-A-C-A-ATGGTCGAAAG---GAAAC--------------AAA-----T-G--T-AGTT-C-AATT--------GAA------A------G----A--AGT-GTA-ACT--T-T---A----TC-----AAA--------------AATA----ATG-AA--------------GATC-AAAGGG--AAACAA----CT-CG----AGTTCAAT-TG--A-A-A-A-----T-TTG------T-------AAC-T-AT-GT------T-TTA-T-GAA-G---------GTCAAAGGGAAATAACTCTAG-TT-AAGTTGA--AT---TAGCCTAACCTA-AAC-CC-TACGAC--TAAT-AGTC---TGTAAT-CGT-GA---AATGG------A---AACAAC-TATA--GTTCAGTTGA-A---A-T-A-GT-G-CA-AC----G-A-T-----A--TT---------A-----AA-----TAAT---GGTCAAAGG---GAAAC-------------------AACTCTAGTTCAG-TT-GA-AA-TA---TTATGG--CTT--ATAGTC--TTTAATGGTCAAAGGGAAACAAC-TGTAGTT-AAG----TTTA-A--ATA-TTG-T-AT-CT-A-TA-TC--TAA--T--A-ACGGTTCAAA-G-G-AAACAACTC-----TAAT--TCAG-T--AGAATTATTA-TGATTTAT
gi|1 : TAATAATTAAAGGACAACAA---CC-----CT--AGTT-CAGTT------------GAAC--TTA----TGACTT-ACTA-----T---TAA----T-ATTAGCC-AAAGGAAAATAA----CTCT-----TGT------T-----CA---A---A------------AATG---AACTG---GTGA--CATGTAATCAATTAA-ATA--TCAAAGG---AAAACAA--CTG-A---AG-TTCAG-----TTGAAC--TCCCCTG-A-CTTATAATCAA-T-----AATGG----CCAC-----AGT---GA-A-A--ACAT-T---A--TA---------AA--T-CAA-AA--TTC----A--ATT---T-GC-A-A-T-TTAA---AA-T------------CAAT----TA-A-TGGTCAAAG-GAA---AACAACTCTATTCCA--TTT-G-A---AC-T-------T-G-AGGCT--T-TTAG---T-CA-----------------A-TTGAAATC-AAAGGAAAAAAA-C----TCATTAT--TG----AAA---AG---AA------AC----------T--TGT-GA-CT--T--GTTA--TCA-----AT----T-GATGGTC-AAAAG---G-AATAACTCTTGT---TC-AGTA-G---A-A-T--TA-----TT------C----TCATA---G------T-A-ATGGT----------------C-ATA--------------TGGATTTAACT-CT------AGTTCAGACGA-ACG--T-A----T-G-C-ATTC-T-ATACACT-TCAAT-----T-T----AATGGAAA-AAC------CTAT---GT----T----TCG---G---AACAAAATCTT--G-------TTCAGTAAAGTTCTTCTC----GTAA-TC--AA--T----AA--TGGTG-AAAGG-AAA--ACAA-------CTC--TTGTA-TA-CTT-----------------GA-G--C-T-----TCTG-T--G-------A-CA--T--A-T-AA-T-C-AAG-A-------ATGGTC-AATA---GGG-CTAC-------------------AACTTAAGTT---TAAAGTT-G-AT-T---TCGCGATT-T---GTAA-TT--A---AT---TG---A-T---G----A--------TCAAATGG--------A--------CACAA----CTC--TGATT-T--A-G-----------T--TG-TGCA---ATT------------TTGT--G-ACT-G-AT----A-ATAT-T-T-A-ATGGTTAAAAA---GAAGT--------------AAC-----T-G--T-AATT-CAAATT--------GAACTTT--A------C----A--TTT-ATA---T--T-T---A----TT-----------------------ACC----AT--------------------TC-AAAGGG--AAACGA----GT-CT----AGTTCAGT-TT--A-ATT-A-----T-TT-------T-------GAC-T-TT-AG------T-CAA-T-GAT-G---------ATCGAAGGGAAACAACTCTAGATT-AA-TTGA--AA---TAGTGTGATATA-G------TAAAA----AAT-AGTC---------------A---AAGGG------A---AACTAC-TATA--GTTCAGATGA-A---T-T-A------TA-AT----G-A-------A--TT---------A----------------------TAAAGG---AAAAT-------------------AACTGTAGTTCAGATT-G--AA-CA---TTAC-A--TTT--GTAGTA--AATGATGGT-AATGTGGAACAAA-TCTACTT-CAG----TTTA-ATTATC-TTG---AT-TT-G-TA-GT--CAA--T--A-CTGGT
gi|12 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaattaacgatcaaacggaaacttaaaattaaccttttactcaatTAATGGTCATAGAGAAACAA---AT-----CT--AGTTCGAA-------------AAAGT--CTAACCATA---TCA-TT-----TT--TTA----T-AAAGGTC-GAAGGGAAACAAGTTTCTCT-----ATT------T-----CA---ATT-G------------A--A---AATCAGTTAC----CTTAT--TTTAT--A-AAG-GTCAAAGG---GAAACAA--CTC-T---AG-TTAAG-----TTGGAA--TGTTGTG-A-CGTATAGTATA-T-----AATGG----TCAA-------------------------------------------C--------AA--T------A--A-----T-GT-A-A-C-T--A---TA-G------------CTTA----TA-T-TGGCCGAAG-GGA---AACAACTCTAGTTCA--GAT-G-A---A--T-A-AG--T-A-TGCTT--T-TTAG---T-CT------A-T-----A--C-TTG---TG-AAAGGGAAGCAA-C----TA-TAGT--TA----AGT---TA---AA-----AA-----------T--T-T-GAGT---T--GTTG--TTA-----A-----T--ATTGTC-AAAGG---GAAATAACTATAATAGAT----TT-A---A-A-G--TA-----TT-G-T
gi|6 : tTAATGGTGAAATGGAGATAA---CTCCAGAAC--AGTT-GAATT-------------AGTG-TTA----CG---T-A-GA-----TT--TAT----G-AATTGTC-AAAAGCACAAAA----CTCC-----AATCATTATT-----TA---A---ATTAACTCAGTTCA--GTTAGATTA-TTGTTA--CGTGGAA-CTATT-A-ATG-ATCAAAGG---GAAATAA--TTC-C---AG-TTCAA-----GTGAAC--TAT--TG----TTA-CGTAAAGT-----AATCAAACGTCAA-----AGG---AA-A-AT-A-AC-T---C--T--T--TTTCCAG--T-TAA-AA---------A--A-----T-GT-A-A-C-TG-A---TAGT------------CT-A----TA-A-TACTCAAAA-GGATTTAACA---CTAGTTCA--tac
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctagttattaatggtctaagtgaaataactctaattcagttgaattattgtaacgcatagttggTAATGGTGAAATGGAGATAA---CTCCAGAAC--AGTT-GAATT-------------AGTG-TTA----CG---T-A-GA-----TT--TAT----G-AATTGTC-AAAAGCACAAAA----CTCC-----AATCATTATT-----TA---A---ATTAACTCAGTTCA--GTTAGATTA-TTGTTA--CGTGGAA-CTATT-A-ATG-ATCAAAGG---GAAATAA--TTC-C---AG-TTCAA-----GTGAAC--TAT--TG----TTA-CGTAAAGT-----AATCAAACGTCAA-----AGG---AA-A-AT-A-AC-T---C--T--T--TTTCCAG--T-TAA-AA---------A--A-----T-GT-A-A-C-TG-A---TAGT------------CT-A----TA-A-TACTCAAAA-GGATTTAACA---CTAGTTCA--g
gi|15 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctagttattaatggtctaagtgaaataactctaattcagttgaattattgtaacgcatagttggTAGTGGTCAAAGGGAAACGA---CT-----CT--TGGT-AAGTT-----AACAATA------TTA----TA---T---TA-----TAATCAA----T-AATGGTC-AAAGGGAAGCAT----CTCT-----AGT------T-----TA---G---T------------T--G---AAATA-TT-TGA--C--ATATTCTAC--A-TTGTTTCATCTG-----AACTA--CAA-T---CGTTTCCC-----TTTGGT--CATTTTT-T-AGTAT--TC---------AATTG----TTAA-----AAT---GA-G-A--A-------------------------------------------A--G-----C-AT-A-A-C-T--A---TG-T------------CTTA----TA-G--GGTCAAAG-GGA---AACAACTCTAGTTAA--GTT-G-A---AC-T-A-T---T-A-TGACA--ga
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccaTAATTATCAAAGGGATATAATACCA-----GTTCAGTT-GAATT---------ATTG-----TTA----CG---T-A-TA-----GT--TAT----T-AAAGGTC-AAAGGGTATTAA----CTCTTTTCCAGT------T-----AA---A---A------------A-------------TGTAA--CTGATAGTCTAT--A-ATA-CACAAAAG---G-AATTA--TCACT---AG-TTCAagttctgtta
gi|11 : aattaaccaagttcaattaaataattgttacgtaaaactatAATGGTCAAAGGCAGATGA---CTCCA--GTTTAGTT-GAATTATTGTTA-CGTAGAGT--T----------------A-----T---TAA----T-GATCG----ACGGAAAATAA----CTCT-----TGT------T-----CA---G---TT-----------A--G---AAATA-TCA-----CTTATAGTTTTT--A-ATC-GTCAAAGG---GAAATAA--CTG-T---TG-TTCAA-----TTAAAA--TGT--TG-C--TTATAGTCAA-T-----AATGG----TTAA-----AGA---GA-A-T--A-AC-T---T--TTAT--TC---AG--T-TGA-AT--T------A--G-----T-GC-C-A-CGT--A---TA-G------------TTAT----TA-A-TGGTGAAAG-GGA---AATATCTCTAGTTCA--TTT-G-A---AT-T-G-T---T-G-TTAGG--T-ACAG---T-TA------T-T-----A--A-AGG---CC-AAAGGAAAATAA-------C-TGTT--TTCC--AGTTA-AA---AA-A---TG-----------T--TACTG---------ATAG--TCT-----A-----T-AAT-CTT-AAAAG---GAATTAACTgatgattctttaacgtatagt
gi|15 : tttttataAATGACCAAAGGGAAACGA---TT-----GT--AGTT-t
gi|14 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaatatttgacatattctacattgtttcatctgGTCAAAAGGA---AA---CT-----TT--AGTT-AAATT--------------------------G---C-A-TA-----AA--TAA----G-AAC----------CAAATA--------T-----AGT------T-----CA---G---T------------T--G---AAATA-GTGTAA--CT-ATATTTAAT--G-GTG-TTCAAAGG---GAAACAA--CTC-T---AG-TTCAG-----TTGAAT--AAAAATG-A-TTTATAGTCAA-C-----TATGA----TCAA-----AGG---GA-A-GC-A-AC-T---A--TAGT--TC---AG--T-TGA-AT--T------A--T-----TAAT-A-C-T-T--A---TA-G------------TAAA----TA-A-TGGTAAAAA-GGA---AACAGCTCAAGTTCA--GTT-G-AT--A--T-A-T---T-G-TAGTT--T-ATAT---T-CA------A-T-----A--A-TGC---TC-AAAGGAAAACAA-C----TG-TAGT--T------------G---AG-T----------------T--TA---A--------ATAG--TTT-----A-------AATAGTC-AATGG---GAAACAttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|9 : ttgttactatattttatgaaaTCAAAGGGAATTAG---CT-----GT--AGTT-TAATT-----GA-ATTAGTGTGACTA-----A---T-AGTA-----TG--TTA----T-G---GTC-AAATGTTAATAA----CTCT-----AGT------T-----CA---G---T------------T--G---AATAA-GTGTTA--CTTATAGTGAAT--A-ATG-GTCAAAGG---GAATCAA--CTT-T---AG-TTCAG-----TTTTAT--TATTTTG-A-CTGATTGTTAA-A-----AATGG----TCAA-----AGG---GA-A-AT-A-AT-T---T--AAGT--T-----C--TGTGA-AA--A------A--A-----T-GTGA-A-A-T--A----A-T------------C-AG----TA-A-TGGTCAAAG-GGA---CACAACTCTTATTCT--TTTAA-A---A--T-A-G---T-G-TGACT--A-ATAG---T-TT------A-T-----A--A-TGA---TCAAAAAGGAAACAA-C----AC-AAGT--TC----GAT---TG---AA-A---AA-----------T--T-T-GA-C---T--ATAA--TCA-----A-----T-AATGGTC-GAAGA---CAAACTACTCTAGT---TC-CGTT-G---A-A-A--TA-----TT-G-TGAC----TTAT
gi|4 : GGATACAA---CT-----GT--AGTT-GAATT-----TA-AATAGAGT--ATA----TA---T-A-TA-----TA--TAA----T-AACTGTT-AAAGGCAAACAG----CTCT-----AGT------T-----CA---A---A------------A--G---AATTA-TTATGA--CTTATAGTCTAT--A-ATG-GTCAAAGG---GAAACTA--TTA-T---AG-TTCAA-----TTTAAT--TATCATG-A-ATTATCGTCAA-T-----AATTA----TCAA-----AAA---GA-A-A--A-AT-T---C--TAGT--TT---AC--T-TGA-AA--T------A--G-----T-GT-A-A-T-T--A---TA-T------------CTAA----TA-A-TGTTCAAAG-GGA---AACATCTCTAGTTCA--TAT-G-A---A--T-A-A---T-G-TGACA--T-ATAG---T-CA------G-T-----G--A-TTG---TC-AAAGGGAAAGAA-A----TC-TAGT--TT----GGT---GG---AA-T---TA-----------T--TAC-GA-C---T--ATAG--TTA-----A-----T-AATGGTC-ATAGG---GAAACAACTCTAGT---TC-TGTT-G---A-A-A--TA-----TT-A-TAGC----TTATA---GT--ATAT-A-ATGGTGT---A-A--GAGAAACAAAA--------------TTAA-TTAA-T-GT------AGTTGAGTTTA-A-A--T-A---GT-G-T-A-TC-T-ATA---T-TTAATAACGAT-T---AAATGGAAACAAC-----TCTA----GT----T----T-A---G---AATAA----TT--A-------TT--ATGA-------CTA----ATAG-TA--CA--T----AA--TGATC-AAATG-GAA--ACAA-------CTT--TTGTT-CA-TTT-----------------AA-A--A-T-----AGTG-G--A-------A-C---T--A-A-AT-T-T-AAT-A-------ATGGTC-TA-A---GTG-AAAC-------------------AACTCCAGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTATGACT-T---ATAG-TC--T---GT---T----A-T---T----T--------TCAAATGG--------A--------AACAA----CTC--TAATT-C--A-T-----------T--TG-AATA---A--------------TTGG--G-ACT-T-AG----A-GTCT-A-C-A-ATGGTCAAAAG---GAAAC--------------AAA-----T-G--T-AGTT-C-AATT--------GAA------A------G----A--AGT-GTA-ACT--T-T---A----TC-----AAA--------------AATA----ATG-AA--------------GATC-AAAGGG--AAACAA----CT-CG----AGTTCAAT-TG--A-A-A-A-----T-TTG------T-------AAC-T-AT-AT------T-TTA-T-GAA-G---------GTCAAAGGGAAATAACTCTAG-TT-AAGTTGA--AT---TAGCCTAACCTA-AAC-Ctcgagaaaataactgtagttctgattgaactgtacattaaataattccactgtttactttgtaacttaaaaataatggtcatatggaaaaaagtatagttgaatt
gi|14 : CAA---AT-----AT--AGTT-CAGTT-----GA-AATAG------TG----TAAC-T-A-TA-----TT--TAA----T-GG-TGTTCAAAGGGAAACAA----CTCT-----AGT------T-----CA---G---T------------T--G---AATAA-AAATGA--TTTATAGTCAAC--T-ATG-ATCAAAGG---GAAGCAA--CTA-T---AG-TTCAG-----TTGAAT--TATTAAT-A-CTTATAGTAAA-T-----AATGG----TAAA-----AAG---GA-A-AC-A-GC-T---C--AAGT--TC---AG--T-TGA-TA--T------A--T-----T-GT-A-GTT-T--A---TA-T------------TCAA----TA-A-TGCTCAAAG-GAA---AACAACTGTAGTTGAG-TTT-A-A---A--T-A-G---T-T-TAA------ATAG---T-CA------A-T-----G--
gi|3 : ttgttactatattttatgaaagtcaaaaggaaactttagttaaattgcataaataagaacT-----GT--ATTT-GAATT---------ATTG-----CTA----CG---T-A-TA-----TA---AA----TCAACGGTC-AAATGCCAATCA----CTCT-----AGT------TGTGTTTA---A---A------------A--A----------TGTAA--CTGGTAGTCATT--A-ATG-GTCAAAGG---GAAATAA--CTC-C---AT-TTCAG-----TTGAAT--TAT--TG----TTA-CGT--A-T-----AATTA----TAAATGAACAAAGTTGA-A-T--A-AC-T---CTTTTGT--TC---AG--T-TGA-AT--T------A--T-----T-G--A-----T--A---TA-T------------ATAGGCATTA-A-TGGTCAAAG-GGA---ATTACCTCTTGTTCA---GT-T-A---A--A-A-A---T-G-TAACT--T-ATAGAAAT-AA------A-T-----G------G---TC-AAAGGGAAATAA-T----TC-AAGT--TT----GTT---TG---AA-T---CA-----------T--TGT-TA-CT--T--ATAG--TTC-----T-----A-AATGGTC-ATAGG---GAAATAACTCT---------TGTT-G---A-A-ATTTT-----TT-T-TAAC----TTATATTCGT--A----A-ATGGTCC---A-A--G-GAAAGAACA--------------C------------T------AGTTCAGTTTA-A-T--T-A---TT-GTT-A-TG-T-ATA---G-TTATTAAAGGT-C---AAAGGGAAATAACCATTTTCCA----GT----T----A-A---G---A------------A-------TT--GTAA-------CTG----ATAG-TC--TA--T----AA--TTCTC-AAAGG-GAA--TTAA-------CAC--TAGGT-C------------------------------------AGAG-G--ATTTTTTTA-CG--T--A-T-AG-T-T-ATT-A-------ATGTTC-CA-A---GGG-GAAT-------------------AACTCCAGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTTACT-T---ATAG-TC------AT---TA---A-T---G----G--------TCAAGGGG--------A--------AA-AA----CT-----ATT-T--A-G-----------CAGTG-A--A---A--------------TTG---------T-AT----A-GTCA-T-T-A-ATGGTCAAAGT---GAA----------------AAATTTCTT-GTTT-AGTT-C-TATTATTGTTACGTA------A------T----A----T-ATA-AAT--T-A---ATGG-TC-----AAATGCCAATAATTAATAATA----ATA-AT--------------GGTC-AAACGG--AAATTA----CTCCGTTCCAGTTCAAT-TA----------------TTG------T-------TACGT-AT--T------G-TTA-T------------------AAAGTGGAATAGCTCAGG-TT-CAGTTGA--AT---TATTGTTACTTA----------------TAATCATTA---TG-AAT-GGT-CA---AAGGG------A---AATAAC-Tggaaaca
gi|17 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttg--AGTT-GAATT-----TA---TTG-----TTA----TC---T-T-TAGTCATTA--T------T-AATTGTA-AAATGGAAATAG----TTCT-----TGT------T-----CAGTTA---A------------A--A---AATTG-GTA-----CTTATTGTCGTT--A-ATG-GTCAACGG---AAAA-TAACTTG-T----G-ATCGG------TTAAA--AATGAT--A-CTTATTGTCAT-T-----AATTA----ACA
gi|8 : gttcaaaatggaataatttttattcA----TG---T-A-TA-----TA--TAGTCATT-AACGGTG-AAAGGGAAATAA----CTCG-----AGT------T-----CA---G---T------------T--A---AATTA-CTGTAA--CTTATAGT-TAT--A-ATG-GTCAAATG---CAAATAA--TTC-C---AG-TTCAG-----TTGAAT--TATTAAT-A-GGTATAGTCAT-T-----AATGG----TCAATGG--GGA---AA-A-A--A-AC-T---T--TTGT--TT---AG--T-TGA-AT--T------A--T-----T-GT-T-A-CGT--A---CA-T------------TTAT----TA-A-TGGCCTAAT-GAT---AATAACGCTTGTTAG--T-T-A-A---A--A-A-A---T-G-TTACT--T-ATAG---G-CA------T-T-----A--G-TAG---TC-AAAGGGAAATAA-C----TC-TATT--TC----AGT---TT---AA-T---TA-----------T--T----------------G--TC------A-----T---TGTTC-AAAGT---GAAATAAATCTTGT---TC-AGTT-G---A-A-T--TA-----TT-G-TTAC----GTATA---GT--TAAT-A-CTGGTCA---A-A--GGGAAACA------------------------AC-T-CT------TGTTCAGTTGA-A-T--T-A---TT-G-TCA-CC-T-ATA---G-TCATTAATGGT-C---AAAGGAAAATAAC-----TCTT----GT----T----C-A---GT--TAGAA----AT--G-------TT-----A-------CTT----ATAG-TC--AA--T----AA--Tctagttctgttgaattattgttact
gi|6 : agtgattaatatatatatatgatacgtac--TAT----T-AATGGTC-TAAGTGAAATAA----CTCT-----AAT------T-----CA---G---T------------T--G---AATTA-TTGTAA--CGCATAGTTGGT--A-ATG-GTGAAATG---GAGATAA--CTC-C---AG-AACAG-----TTGAAT--TA--GTG----TTA-CGTAGA-TTTATGAATTG----TCAA-----AAG---CACA-A--A-AC-T---C--CAATCATT---AT--T-T-A-AA--TTAACTCA--G-----T-TC-A-G-T-T--AGATTA-TTGTTACGTGGAACTAT----TA-A-TGATCAAAG-GGA---AATAATTCCAGTTCA--AGT-G-A---AC-T-A-T---T-G-TTACG--T-AAAG---T--A------A-TC----A--A-ACG---TC-AAAGGAAAATAA-C----TC-T--T--TTTCCAGTT---AA---AA------A-----------A--TGT-AA-C---TG-ATAG--TCT-----A-----T-AATACTC-AAAAG---GATTTAACACTAGT---TC-
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctagt--TAT----T-AATGGTC-TAAGTGAAATAA----CTCT-----AAT------T-----CA---G---T------------T--G---AATTA-TTGTAA--CGCATAGTTGGT--A-ATG-GTGAAATG---GAGATAA--CTC-C---AG-AACAG-----TTGAAT--TA--GTG----TTA-CGTAGA-TTTATGAATTG----TCAA-----AAG---CACA-A--A-AC-T---C--CAATCATT---AT--T-T-A-AA--TTAACTCA--G-----T-TC-A-G-T-T--AGATTA-TTGTTACGTGGAACTAT----TA-A-TGATCAAAG-GGA---AATAATTCCAGTTCA--AGT-G-A---AC-T-A-T---T-G-TTACG--T-AAAG---T--A------A-TC----A--A-ACG---TC-AAAGGAAAATAA-C----TC-T--T--TTTCCAGTT---AA---AA------A-----------A--TGT-AA-C---TG-ATAG--TCT-----A-----T-AATACTC-AAAAG---GATTTAACACTAGT---TC-ag
gi|13 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctagtGTC-AAAGGGAAATAA----CTCT-----TGT------T-----TA---A---A------------AAAG---AA--ACTTATGA--CTTGTAATCAAT--TTATG-GTCAAAGG---GAAACAA--CTA-T---AG-TTTAG-----TTAAAC--ACTTGCG-A-CTTA---TAAA-T-----AAT----------------AA---CA-A-A-------T---T--TAGT--TA---A------GA-AA--T---------------T-GC-A-T-T-T--A----A-T------------C-GA----TA-G----TCATTG-GGA---AACAACTCTGGTTTAATTAT-C-G---A--T-A-A---aga
gi|9 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcaatgTC-AAAGGGAATTAG----CTGT-----AGT------T-----TA---A---T------------T--G---AATTA-GTGTGA--CTAATAGTATGT--T-ATG-GTCAAATG---TTAATAA--CTC-T---AG-TTCAG-----TTGAAT--AAGTGTT-A-CTTATAGTGAA-T-----AATGG----TCAA-----AGG---GA-ATC--A-AC-T---T--TAGT--TC---AG--T-TTT-AT--T------A--T-----T-TT-G-A-C-TG-A---TT-G------------TTAA----AA-A-TGGTCAAAG-GGA---AATAATTTAAGTTC---TGT-G-A---A--A-A-AA--T-G-TGA-A----ATAA---T-CA------G-T-----A--A-TGG---TC-AAAGGGACACAA-C----TC-TTAT--TC----TTT---TA---AA-A---TA-----------G--TGT-GA-C---TA-ATAG--TTT-----A-----T-AATGATCAAAAAG---GAAACAACACAAGT---TC-GATT-G---A-A-A--AA-----TT---TGAC-----TATA---AT--CAAT-A-ATGGTCG---A-A--GACAAAC------------------------TAC-T-CT------AGTTCCGTTGA-A-A--T-A---TT-G-T-G-AC-T--TA---T-T------CGA----------GAAAATAAC-----TGTA----GT----T----C------------------TG--A-------TT--G-AA-------CT--------G-TA--CA--T--------T------------AA--ATAA-------TTCCACTGTT-TA-CTT---------------------------------TG-T--A-------A-CT--T--A-A-A------AAT-A-------ATGGTCATA------TG-GAAA-------------------AA----AGTA---T--AGTT-GAAT-T--aattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|10 : AAACAA----CTCT-----AGT------T-----TA---G---T------------T--G---AATTA-TAATGA--CTTACAGTCTAT--A-ATG-GTCAAAGG---GAAACAA--CTT-T---AG-TTCAT-----TTTAA----AAAGTGTA-ATTATC-TCTT-T-----AA--AGGG-CCAT-----AGT---GA-A-AC-A-AC-T---C--AAGT--TC---AG--T-TTA-AA--T------ATGG-----T-G--A-C-T-T--A---TAGT------------CTT-----TA-A-TGGTCAAAG-GGA---AACAACTCTTGTTCA---AT-T-G---A--T-A-A---T-G-TG--------TAG---TTCT------A-TCTGAAA--A-TAT---TC-AAAAGGAAACAA-C----TC-TAGT--AT----AGT---TG---AA-C---TA-----------T-------A-T---T--------TTA-----A-----A-AATG-TC-AAAGG---GAAATAACTCTAGT---TA-AGTT-G---A-A-T--TA-----GT-A-TGAC----TTATA---GT--CTAT-A-ATGTT-T---A-A--ATGAAA-ACAA--------------T---------T-CT------AGTTTTGTTGA-A-A--T-A---GT-G-T-A-AC-T-ATA---T-ATGATAACGTT-T---AAAGGGAAACAAC-----TCTA----GT----T----C-A---G---TTGAA----TT--A-------TT--AGGA-------CAT----ATAG-TC--TA--T----AA--T
gi|7 : gAATAT----CTCT-----AGT------T-----CA---G---A------------T--A---AATTA-TTGT---------------T--A-AAG-GTCAAAGGTAAAAAACTC--TT-------G-TTTAG------TTAA----AACATG-GTACTAAAGTTAT-T-----AATGG----CCAA-----AGG---GA-A-AT-A-AC-T---T--TTGT--TC---AG--T-TGA-AG--T------A--T-----T-GT-A-A-CGT--A---TA-G------------CT-A----TACA-TGATCAAA-------------CTCTTGTTAA--TTT-A-A---A----A-A---T-A-TTTCA--TAATA----T-CA------T-T-----A--A-TGG---TC-AAAAGGAAATAA-------C-TAGTG-TTCA--GGT----G---AA-T---TG-----------T--TGT-TA-C---TTGA-AG--TCA-----T-----A-AATTGTC-AATGA---GAAATAACTCTTCT---TC-AGTT-A---A-ATA--TA-----TT-A-T-------TAATA---GTC-AT-T-G-ATGATCG---A-A--GGGATAT--------------------AA-CTCG-T-GTTC----AGTTAA----A-A-A--T-G---AT-G-----TT-T-ATA---G-TCATTAATGAT-C---AAAGGGAAATAAC-----TCTA----GT----T----------------CAA----T----------------TGA-------ATT----ATTG-TA-----------AA--TGTTC-AAAGA-GAA--ATAA-------CTC--TTGTT-TA-GTT-----------------AA-A--A-C-----A-TG-T--T-------T-C---T--A-T-AG-T-C-ATT-A-------ATGGCC-AA-A---GAG-AAAT-------------------AACTCCAGTT---C--AGTT-AAAC-T--ATTGTTACC-T---A
gi|13 : AACAT----TTCT-----AGT------T-----TA---A---A------------A------AATGA-ATGCGAGACTTGAAATCAAT--TTATT-GTCAAAGT---CAATCAG--TTG-T---AT-TTCAG-----TTGAAC--T----TG----TT-TCGTCAA-T-----GGT-------CAA-----AGG---GA-A-AT-A-AC-T---C--TTGT--TT---A-------A-AA--A------A--GAAACTT-AT-G-ACT-T--G---TAAT------------CAAT----TT-A-TGGTCAAAG-GGA---AACAACTATAGTTTA--GTT-A-A---A--C-A-CT--T-G-CGACT--T-ATA-------A------A-T-----A--A-T---------------AACAA-A----TT-TAGT--T-------A---AG---AA------A-----------T--TGC-----------AT----TTA-----A-----TCGATAGTC-ATTGG---GAAACAACTCTGGT---T
gi|16 : tcactaaatcacc-----AGT------T-----CA---ATTAA------------A--T---AATTG-TTACG-----TAAAA-CTATT-A-ATT-ATCAAAGG---GA---TA--TAA-TACCAG-TTCAG-----TTGAAT--TAT--TG----TTA-CGT--A-T-----AGTTA----TTAAAGGTCAAA---GG-GTATTA-AC-T---C--T--T--TT---CCAGT-TAA-A----------A--A-----T-GT-A-A-C-TG-A---TAGT------------CT-A----TA-A-TACACAAAA-GGA---ATTATCACTAGTTCA--GAT-G-----A--T-T-C---T-T-TAACG--T-ATAG---T-taattatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|15 : aattaacca-TTATGA--ATTATAGTCCAT--A-GTG-GTCAAAGG---GAAACGA--CTC-T---TG-GT-AA-----GTTAACAATATTAT----ATTATAATCAA-T-----AATGG----TCAA-----AGG---GA-A-G--C-ATCT---C--TAGT--TT---AG--T-TGA-AA--T------A--
gi|14 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtTATATTTTAT--G-AAA-GTCAAAAG---GAAACT-------------------------TTAGT--TA------A-ATTG-CATAAA-T-----AAGAA----CCAA-----A------------------T---A--TAGT--TC---AG--T-TGA-AA--T------A--G-----T-GT-A-A-C-T--A---TA-T------------TTAA----TG-G-TGTTCAAAG-GGA---AACAACTCTAGTTCA--GTT-G-A---A--T-A-A---A-AATGATT--T-ATAG---T-CA------A-C-----T--A-TGA---TC-AAAGGGAAGCAA-C----TA-TAGT--TC----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--TAA-TA-C---TT-ATAG--TAA-----A-----T-AATGGTA-AAAAG---GAAACAGCTCAAGT---TC-AGTT-G---A-T-A--TA-----TT-G-TAGT----TTATA---TT--CAAT-A-ATGCTCA---A-A--GGAAAACAAC-------------------------T-GT------AGTTGAGTTTA-A-A--T-A---GT-T-T-A-tttgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|19 : ttgttacTACAGTCATT--A-ATG-GCCAAAGG---GAAATAA--ATC-T---CG-TTCAG-----TTGAAT--TATaatagtcaatgggaaaca
gi|12 : acatgttacT--A-ATG-GTCATAGA---GAAACAA--ATC-T---AG-TTCGAAAAAGTCTAAC--CAT-------ATCATTTTTTA-T-----AAAGG----TCGA-----AGG---GA-A-ACAA-GT-TTCTC--TATT--TC---AA--T-TGA-AAATC------A--G-----T--T-A-C-C-T------TA-T------------TTTA----TA-A-AGGTCAAAG-GGA---AACAACTCTAGTTAAG-TTG-G-A---A--T-G-T---T-G-TGACG--T-ATAG---T-AT------A-T-----A--A-TGG---TC-AA-------------------CAAT-------------------AA-TG--TA-------------------A-C---T--ATAG--CTT-----A-----T-ATTGGCC-GAAGG---GAAACAACTCTAGT---TC-AGAT-G---A-A-T--AA-----GT-A-TGCT----TTTTA---GT--CTAT-A-CTTGTGA---A-A--GGGAAGC--------------------AA-CTA-----T------AGTTAAGTTAA-A-AATT-T---GA-G-T------T-GTT---G-TTAATATTG-T-C---AAAGGGAAATAAC-----TATAATAGAT----T----T-A---A---AGT-A----TT--G-------TT--Atgtacgaccagatataaatgg
gi|15 : t--A-ATG-ACCAAAGG---GAAACGA--TTG-T---AG-TTCAc
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaatatttgacatattctacattgtttcatcA-T---AA-TTACA-----TTTGTT--TAT---G-A-ATTATAGTCCA-T-----AGTGG----TCAA-----AGG---GA-A-AC-G-AC-T---C--TTGG--TA---AG--T-TAACAA--T------A--T-----T-AT-A---T-T--A---TA-A------------TCAA----TA-A-TGGTCAAAG-GGA---AGCATCTCTAGTTTA--GTT-G-A---A--A-T-A---T-T-TGACA--T-ATttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|6 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaGTTAT-T-----AATGG----TCTA-----AGT---GA-A-AT-A-AC-T---C--TAAT--TC---AG--T-TGA-AT--T------A--T-----T-GT-A-A-CGC--A---TA-G------------TTGG----TA-A-TGGTGAAAT-GGA---GATAACTCCAGAACA--GTT-G-A---A--TTA-G---T-G-TTACG--T-AGAT---T-TA--------T-----G--AATTG---TC-AAAAGCACAAAA-C----TC-CAATCATT----ATT---TA---AA-T---TAACTCAGTTCAGT--TA--GA-T---T--ATTG--TTACGTGGAACTATT-AATGATC-AAAGG---GAAATAATTCCAGT---TC-AAGT-G---A-A-C--TA-----TT-G-TTAC----GTAAA---GT--A-AT-C-A-AACGT---C-A--AAGG---AAAA--------------T-AA-CTCT-T-TT--------TCCAG-TTA-A-A--A-A---AT-G-T-A-AC-TGATA---G-TCTATAATACT-C---AAAAGGATTTAAC-----ACTA----GT----T----C-A---G---tctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctaGTTAT-T-----AATGG----TCTA-----AGT---GA-A-AT-A-AC-T---C--TAAT--TC---AG--T-TGA-AT--T------A--T-----T-GT-A-A-CGC--A---TA-G------------TTGG----TA-A-TGGTGAAAT-GGA---GATAACTCCAGAACA--GTT-G-A---A--TTA-G---T-G-TTACG--T-AGAT---T-TA--------T-----G--AATTG---TC-AAAAGCACAAAA-C----TC-CAATCATT----ATT---TA---AA-T---TAACTCAGTTCAGT--TA--GA-T---T--ATTG--TTACGTGGAACTATT-AATGATC-AAAGG---GAAATAATTCCAGT---TC-AAGT-G---A-A-C--TA-----TT-G-TTAC----GTAAA---GT--A-AT-C-A-AACGT---C-A--AAGG---AAAA--------------T-AA-CTCT-T-TT--------TCCAG-TTA-A-A--A-A---AT-G-T-A-AC-TGATA---G-TCTATAATACT-C---AAAAGGATTTAAC-----ACTA----GT----T----C-A---G---A
gi|4 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtcta--A-AC-T---G--TAGT--TG---AA--T-TTA-AA--T------A--G-----A-GT-ATA-TAT--A---TA-T------------ATAA----TA-ACTGTT-AAAG-GCA---AACAGCTCTAGTTCA--AAA-G-A---A--T-T-A---TTA-TGACT--T-ATAG---T-CT------A-T-----A--A-TGG---TC-AAAGGGAAACTA-T----TA-TAGT--TC----AAT---TT---AA-T---TA-----------T--CAT-GAAT---T--ATCG--TCA-----A-----T-AATTATC-AAAAA---GAAA-AATTCTAGT---TT-ACTT-G---A-A-A--TA-----GT-G-TAA-----TTATA--------TCT-A-ATAATGTTCAA-A--GGGAAACA----------------------TC---T-CT------AGTTCA-TATG-A-A--T-A---AT-G-TGA-CA-T-ATA---G-TCAGTGATTGT-C---AAAGGGAAAGAAA-----TCTA----GT----T----T-G---G---TGGAA----TT--A-------TT--ACGA-------CTA-----TAG-TT--AA--T----AA--TGGTC-ATAGG-GAA--ACAA-------CTC--TAGTT-CT-GTT-----------------GA-A--A-T-----ATTA-T--A-------G-C---TT-ATA-GT-A-T-A-T-A-------ATGGTG-TA-A---GAG-AAAC-------------------AA----AATT------AATT--AATGT--AGT-TGAGT-TTAAATAG-TG--T---ATCTAT----A-T---T----TAATAACGATTAAATGG--------A--------AACAA----CTC--TAGTT-T--A-----------------G-AATAATTA--------------TTAT--G-ACT-A-AT----A-GTAC-A-T-A-ATGATCAAATG---GAAAC--------------AAC-----T-T--T-TGTT-C--ATT--------TAA------A------A----T--AGT-GGA-ACT--------------------AAA--------------TTTA----ATA-AT--------------GGTC-TAAGTG--AAACAA----CT-CC----AGTTCAGT-TG--A-A-T-T-----A-TTA------T-------GACTT-AT-AG------T-CTG-T-TAT-T---------TTCAAATGGAAACAACTCTAA-TT-CATTTGA--A---------TAA----------T-TGGGAC--TTAG-AGTC---TACAAT-GGT-CA---AAAGG------A---AACAAA-TGTA--GTTCAATTGA-A---A-GAA-GT-G-TA-AC----T-T-T-----A--TCAA-------A-----AA-----TAATGAAGATCAAAGG---GAAAC-------------------AACTCGAGTTCAA-TT-GA-AA-AT---TTGTAA--C-T--ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAAC-TCTAGTT-AAG----TTGA-A--TTA-
gi|16 : ggatacAGT--TC---AA--T-T-A-AA--T------A--A-----TTGT-T-A-CGT--A---AA-A------------CTAT----TA-A-TTATCAAAG-GGA---TATAATACCAGTTCA--GTT-G-A---A--T-T-A---TTG-TTACG--T-ATAG---T-TA------T-T-----A--A-AGG---TC-AAAGGGTATTAA-C----TC-T--T--TTCC--AGT---TA---AA------A-----------A--TGT-AA-C---TG-ATAG--TCT-----A-----T-AATACAC-AAAAG---GAATTATCACTAGT---TC-AGAT-G-------A--TT-----CT-T-TAAC----GTATA---GT--gcctaacctaaacc
gi|14 : aattaacca-----T-GT-T-A-C-T--A---TA-T------------TTTA----TG-A-AAGTCAAAA-GGA---AAC---TTTAGTT--------A-A---A--T-----------TG-CA--T-A---------A------A-T-----A--A---------------GAACCAA-A----TA-TAGT--TC----AGT---TG---AA-A---TA-----------G--TGT-AA-C---T--ATAT--TTA-----A-----T-GGTGTTC-AAAGG---GAAACAACTCTAGT---TC-AGTT-GAATA-A-A--AA-----TG-A-T-------TTATA---GT--CAAC-T-ATGATCA---A-A--GGGAAGC--------------------AA-CTA-----T------AGTTCAGTTGA-A-T--T-A---TTAA-T-A-CT-T-ATA---G-TAAATAATGGT-A---AAAAGGAAACAGC-----TCAA----GT----T----C-A---GTT-GATA------T--A-------TT--GTAG-------TTT----ATAT-TC--AA--T----AA--TGCTC-AAAGG-AAA--ACAA-------CTG--TAGTT-GA-GTT-----------------TA-A--A-T-----AGT---------------T---T--A-A-A----T-AGTCA-------ATGG------------G-AAAC-------------------A
gi|15 : t-A-A-T-T--A---TAGT------------CCA-----TA-G-TGGTCAAAG-GGA---AACGACTCTTGGTAA---GT-T-A---A--C-A-A---T-A-TTATAT-T-ATAA---T-CA------A-T-----A--A-TGG---TC-AAAGGGAAGCAT-C----TC-TAGT--TT----AGT---TG---AA-A---TA-----------T--T
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatg-A-A-T-TGAA---TA-C------------TAAA----AA-A-TGACCAAAG-GGA---AACGATTGTAGTTCA--GAT-GAA---A--C-A-A---T-G-TAGAA--T-AT-G---T-CA------A-A-----T--A-TT----TC-AAtgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|12 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttag----TA-A-TGGTCATAG-AGA---AACAAATCTAGTTC-------G-A---A--A-A-AG--T-C-TAAC---C-ATA----T-CATTTTTTA-T-----A--A-AGG---TC-GAAGGGAAACAA-GTTTCTC-TATT--TC----AAT---TGAA-AA-T---CAG----------T--TAC----C---T---TAT--TTT-----A-----T-AAAGGTC-AAAGG---GAAACAACTCTAGT---TA-AGTT-G---G-A-A--TG-----TT-G-TGAC----GTATA---GT--ATAT-A-ATGGT-------------CAACAA----------------------TAA-T-GT------AACT----------A--T-A---G--------CT-T-ATA---T-T-------GGC-C---GAAGGGAAACAAC-----TCTA----GT----T----C-A---G---ATGAA----TA--A-------GT--ATGC-------TTT----TTAG-TC--TA--T----AC--TTGTG-AAAGG-GAA--GCAA-------CTA--TAGTT-AA-GTT-----------------AA-A--A-------ATTT-G--A-------G-T---T--G-T-TG-T-T-AAT---------ATTGTC-AA-A---GGG-AAAT-------------------AACTATAATA---G--ATTT-AAAG-T--ATTGTTACgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|13 : tA-A-TGGTCAAAG-GGA---AATAACTCTTGTTTA--AA--A-A---A--G-A-AACTT-A-TGACT--T-GTAA---T-CA------A-T-----TT-A-TGG---TC-AAAGGGAAACAA-C----TA-TAGT--TT----AGT---TA---AA-C---AC-----------T--TGC-GA-CT--T--ATAA--ATA-----A-----T-AA
gi|17 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcGTTCAAAATGGA---ATAATTTTTA-TTCA--GTT-G-A---ATTT-A-T---T-G-TTATC--T-TTAG---T-CATT----ATT-----A--A-TTG---TA-AAATGGAAATAG-T----TC-TTGT--TC----AGTTAAAA---AA-T---TG-----------G--TAC----T---T--ATTG--TCG-----T-----T-AATGGTC-AACGG---AAAATAACTTGTGA---TC-GGTT-A---A-A-A---A-----TG-A-TA-C----TTATT---GTC-AT-T-A-ATcaaatttagttaagaaattgcatttaatcgatagtcattgggaaacaactctggtttaattatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|9 : TCAAAG-GGA---ATTAGCTGTAGTTTA--ATT-G-A---A--TTA-G---T-G-TGACT--A-ATAG---T---------A-T-----GTTA-TGG---TC-AAATGTTAATAA-C----TC-TAGT--TC----AGT---TG---AA-TAAGTG-----------T--TAC----T---T--ATAG--TGA-----A-----T-AATGGTC-AAAGG---GAATCAACTTTAGT---TC-AGTT-T---T-A-T--TA-----TT-T-TGAC----TGATT---GT--TAAA-A-ATGGTCA---A-A--GGGAAATAA----------------T----TTAA------------GTTCTGTGAA-A-A--A-AT--GT-G-A-A------ATA---A-TCAGTAATGGT-C---AAAGGGACACAAC-----TCTT----AT----TCTTTT-A---A---AA--------T--A-------GT--GTGA-------CTA----ATAG-TT--TA--T----AA--TGATCAAAAAG-GAA--ACAA-------CAC--AAGTT-CG-ATT-----------------GA-A--A-A-----ATTT-G----------A-C---T--A-T-AA-T-C-AAT-A-------ATGGTC-GA-A---GAC-AAAC-------------------TACTCTAGTT---C--CGTT-GAAA-T--ATTGTGACT-T---A---------------------------------T--------TCGA--GA--------A--------AATAA----CTG--TAGTT-CTGA-TTGAACTGTACAT--TA-AATA---ATTCCACTGTTTACTTTGT--A-ACT-T-AA----A-A----A-T-A-ATGGTCATATG---GAAAA--------------AAG-----T-A--T-AGTT-G-AATT--------taacactagttctgttgaattattgttact
gi|7 : ---AATATCTCTAGTTCA--GAT-A-A---A--T------------------T-ATTG---T-TA------A-A-----G------G---TC-AAAGGTAAAAAA-C----TC-TTGT--TT----AGT---TA---AA-A---CA-----------T--GGT--A-C---T--AAAG--TTA-----T-----T-AATGGCC-AAAGG---GAAATAACTTTTGT---TC-AGTT-G---A-A-G--TA-----TT-G-TAAC----GTATA---GC---TAT-ACATGAT----------------CAAAC--------------TC---TT--------------GTTAA-TTTA-A-A----A---AT-A-T-T-TC---ATAA--TATCATTAATGGT-C---AAAAGGAAATAAC-----TAGT----GT----T----C-A---G---GTGAA----TT--G-------TT--GTTA-------CTT----GAAG-T---CA--T----AAATTG-TC-AA-TGAGAA--ATAA-------CTC--TTCTT-CA-GTT-----------------AA-AT-A-T-----ATT-------------A-T---T--A-ATAG-T-C-ATT-G-------ATGATC-GA-A---GGG-ATAT-------------------AACTCGTGTT---C--AGTT-AAAA----ATGATG-TT-T---ATAG-TC------AT---TA---A-T---G----A--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----CTC--TAGTT-C--A-A-----------T--TG-AATT---A--------------TTG---------T-A----------------A-ATGTTCAAAGA---GAAAT--------------AAC-----T-C--T-TGTT-T-AGTT--------AAA------A------C----A----T-GT---TT--C-T---A----T-----------------------AGTC----ATT-AAT-------------GGCC-AAAGAG--AAATAA----CT-CC----AGTTCAGT-TA--A-A-
gi|13 : ---AACATTTCTAGTTTA---AA-A-A---A--TGA-A---T-G-CGAGACTT-GAAA---T-CA------ATT-----T--A-TTG---TC-AAAGTCAATCAG-T----TG-TATT--TC----AGT---TG---AACT---TG-----------T--TTC-GT-C----------------------------AATGGTC-AAAGG---GAAATAACTCTTGT--------TT-A---A-A-A--AAGAAACTT-A-TGAC----TTGTA---ATCAAT-T-T-ATGGTCA---A-A--GGGAAAC--------------------AA-CTA-----T------AGTTTAG-TTA-A-A--C-ACTTGC-G---A-CT-T-ATA-------AATAAT---------------AACAAA-----TTTA----GT----T----A-A---G---A--AA----TTGCA-------TT---TAA-------TCG----ATAG-T---CA--T--------TG--------G-GAA--ACAA-------CTC--TGGTT-TA-ATT-----------------Actattgttaccta
gi|15 : tcactaaatcaccACATTT---GTT----TAT-G-A---A--T------------------T-ATAG---T-CC------A-T-----A--G-TGG---TC-AAAGGGAAACGA-C----TC-------TT----GGT---AAGTTAA-CAA-TA-----------T--TAT--A-T---T--ATAA--TCA-----A-----T-AATGGTC-AAAGG---GAAGCATCTCTAGT---TT-AGTT-G---A-A-A--TA-----TT-tcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|18 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattCTCTTGATCA--GTT-A-A---A----A-A---T-A-TTACT--T-ATAG---T-AA------T-T-----A--A-TGA---TC-AAAGGGAAATAACA----CG-TG-T--TC----AGT---TA---AA------A---------------AC-GA-TATTT--ATAGCCTTA-----A--------ATTATC-TTAGT---GAAATAACTCTAGT---TA-AGTT-G---A-A-T--TA-----Ttgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|14 : cctatagttttacctaTAGTTCA--GTT-G-A---AA-T-A-G---T-G-TAAC---T-ATAT---T-TA------A-T-----G--G-TGT---TC-AAAGGGAAACAA-C----TC-TAGT--TC----AGT---TG---AA-T---AA-----------A--AAT-GA-T---TT-ATAG--TCA-----A-----C-TATGATC-AAAGG---GAAGCAACTATAGT---TC-AGTT-G---A-A-T--TA-----TT-AATA-C----TTATA---GT--AAAT-A-ATGGTAA---A-A--AGGAAACA-------------------GC-TCA------------AGTTCAGTTGA-T-A--T-A---TT-G-T-AGTT-T-ATA---T-TCAATAATGCT-C---AAAGGAAAACAAC-----TGTA----GT----T----G-A---G------------T-----------TT--A------------A----ATAG-TT--TA-------AA--TAGTC-AATGG-GAA--ACA
gi|16 : ttgttactatattttatgaaagtcaaaaggaaactttagttaaattgcataaataagaaccaaataAGTTCA--ATT-A-A---A--T-A-A---TTG-TTACG--T-AAAA---C-TA------T-T-----A--A-TTA---TC-AAAGGGATATAA-T----AC-CAGT--TC----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--TGT-TA-CG--T--ATAG--TTA-----T-----T-AAAGGTC-AAAGG---GTATTAACTCTTTT---CC-AGTT-A---A-A-A---A------T-G-TAAC----TGATA---GT--CTAT-A-AT----------------ACACAAAA--------------GGAA-TTA
gi|8 : aattaaccaA--TAT-G-ATACG--T-ACA---T-G-T-ATA--T-ATAG---T-CA------T-T-----A--A-CGG---TG-AAAGGGAAATAA-C----TC-GAGT--TC----AGT---TA---AA-T---TA-----------C--TGT-AA-C---TT-ATAG--TTA-----------T-AATGGTC-AAATG---CAAATAATTCCAGT---TC-AGTT-G---A-A-T--TA-----TTAA-TAG-----GTATA---GTC-AT-T-A-ATGGT-C---A-ATGGGGAAAAAAAC--------------T----TTTG-T-TT------AGTTGAATT-----A--T-T---GT---T-A-CG-T-ACA---T-TTATTAATGGC-C---TAATGATAATAAC-----GCTT----G-----T----T-A---GTT-AAAAA----AT--G-------TT-----A-------CTT----ATAG--G--CAT-T----AG--TAGTC-AAAGG-GAA--ATAA-------CTC--TATTT-CA-GTT-----------------TA-A--T-T-----ATTG------------------------------T-CAT----------TGTTC-AA-A---GTG-AAAT-------------------AAATCTTGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTTACG-T---ATAG-T---T---AA---T----A-C---TG---G--------TCAAAGGG--------A--------AACAA----CTC--TTGTT-C--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------TTGT--C-ACC-T-AT----A-GTCA-T-T-A-ATGGTCAAAGG---AAAAT--------------AAC-----T-C--T-TGTT-C-AGTT-----------------A------G----A--AAT-GTT-ACT--TAT---AG---TC-----AAT--------------AATtcactagttcagatgattctttaacgtatagt
gi|6 : agtgattaatatatat--T-A-G---T-G-TTTCG--T-CTAG---T-TA------T-T-----A--A-TGG---TC-TAAGTGAAATAA-C----TC-TAAT--TC----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--TGT-AA-CG--C--ATAG--TTG-----G-----T-AATGGTG-AAATG---GAGATAACTCCAGA---AC-AGTT-G---A-A-T--TA-----GT-G-TTAC----GTAGA---TT---TATGA-AT--TGT---C-A--AAAGCACAAAACTCCAATCATTATTTAAA-TTAA-C-TC------AGTTCAGTTAG-A-T--T-A---TT-G-TTA-CG-T-GGA---A-CTATTAATGAT-C---AAAGGGAAATAAT-----TCCA----GT----T----C-AAGTG---AACTA----TT--G-------TT--ACG---------TA----A-AG-TAATCA-------AA--CG-TC-AAAGG-AAA--ATAA-------CTC--TTTTTCCA-GTT-----------------AA-A--A-------AATG-T--A-------A-C---T--G-ATAG-T-C-TAT-A-------ATACTC-AA-A---AGG-ATTT-------------------AACACTAGTT---C--AG
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--T-A-G---T-G-TTTCG--T-CTAG---T-TA------T-T-----A--A-TGG---TC-TAAGTGAAATAA-C----TC-TAAT--TC----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--TGT-AA-CG--C--ATAG--TTG-----G-----T-AATGGTG-AAATG---GAGATAACTCCAGA---AC-AGTT-G---A-A-T--TA-----GT-G-TTAC----GTAGA---TT---TATGA-AT--TGT---C-A--AAAGCACAAAACTCCAATCATTATTTAAA-TTAA-C-TC------AGTTCAGTTAG-A-T--T-A---TT-G-TTA-CG-T-GGA---A-CTATTAATGAT-C---AAAGGGAAATAAT-----TCCA----GT----T----C-AAGTG---AACTA----TT--G-------TT--ACG---------TA----A-AG-TAATCA-------AA--CG-TC-AAAGG-AAA--ATAA-------CTC--TTTTTCCA-GTT-----------------AA-A--A-------AATG-T--A-------A-C---T--G-ATAG-T-C-TAT-A-------ATACTC-AA-A---AGG-ATTT-------------------AACACTAGTT---C--AG
gi|19 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-A---T-G-TTAC---T-ACAG---T-CA------T-T-----A--A-TGG---CC-AAAGGGAAATAA-A----TC-TCGT--TC----AGT---TG---AA-T---TA-----------TTGTAC-GA-C---C--Aa
gi|11 : ac--A-TGG---TC-AAAGGCAGATGA-C----TC-CAGT--TT----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--TGT-TA-CG--T--AGAG--TTA-----T-----T-AATGATC-GACGG---AAAATAACTCTTGT---TC-AGTTAG---A-A-A--TA-----TC-A----C----TTATA---GT--TTTT-A-ATCGTCA---A-A--GGGAAATAAC-------------------------T-GT------TGTTCAATTAA-A-A--T-----GT---T-G-CT-T-ATA---G-TCAATAATGGT-T---AAA-GAGAATAAC-----TTTT----AT----T----C-A---G---TTGAA----TT--A-------GT--GCCA-------CGT----ATAG-T---TA--TT---AA--TGGTG-AAAGG-GAA--ATAT-------CTC--TAGTT-CA-TTT------------------G-A--A-T-----TGTT-GTTA-------G-G---T--A-C-AG-T-T-ATT-A-------AAGGCC-AA-A---GGA-AAAT-------------------AACT---GTTTTCC--AGTT-AAA--A--AATGTTACT-G---ATAG-TC--T---AT---A----A-T---C----T--------TAAAA-GG--------A--------ATTAA----CTgatataaatgg
gi|10 : tttttataaGAAACAA-C----TC-TAGT--TT----AGT---TG---AA-T---TA-----------T--AAT-GA-C---TT-ACAG--TCT-----A-----T-AATGGTC-AAAGG---GAAACAACTTTAGT---TCATTTT-A---A-A-A---A-----GT-G-TAA-----TTATC----T--CTTT-A-AAGGGCC---ATA--GTGAAACAAC--------------------TCAA------------GTTCAGTTTA-A-A--T-ATG-GT-G---A-CT-T-ATAGTCT-TTAAT---GGT-C---AAAGGGAAACAAC-----TCTT----GT----T----------------CAA----TTG-A-------TA--ATGT-------GTA----GTTC-TA--TC--TGAA-AA--TATTC-AAAAG-GAA--ACAA-------CTC--TAGT-------------------------------A-T-----AGTT-G--A-------A-C---T--A-T-AT-T-TTAAA-A-------ATG-TC-AA-A---GGG-AAAT-------------------AACTCTAGTT---A--AGTT-GAAT-T--AGTATGACT-T---ATAG-TC--T---AT---A----A-T---G----T--------TTAAATGA--------A--------AACAA----TTC--TAGTT-T--T-G-----------T--TGAAATA---G---------------TGT--A-ACTAT-AT----ATG----A-T-A-ACGTTTAAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-C--T-AGTT-C-AGTT--------GAA------t
gi|22 : A-T---TG-----------T--TAC-GA-A---T--AT----TTA-----T-----T-AATGGTT--TAAGT--GAAATAACTCTTGT---TC-TGTT-ttattaggacatatagtctataat
gi|15 : tagtagaatc-----------T--TAT-GAAT---T--ATAG--TCC-----A-----T-AGTGGTC-AAAGG---GAAACGACTCTTGG---TA-AGTT-A---ACA-A--TA-----TT-A-TA------TTATA---AT--CAAT-A-ATGGTCA---A-A--GGGAAGC---------------------A-TC---T-CT------AGTTTAGTTGA-A-A--T-A---a
gi|14 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtA-C---T--TTAG--TTA-----A--------ATTG-C-ATAAATAAGAACCAAATATAGT---TC-AGTT-G---A-A-A--TA-----GT-G-TAAC----T-------AT--ATTT-A-ATGGTGTTCAA-A--GGGAAACAAC---------------T----CTAG-T-TC------AGTTGAAT--A-A-A----A---AT-G---A-TT-T-ATA---G-TCAACTATGAT-C---AAAGGGAAGCAAC-----TATA----GT----T----C-A---G---TTGAA----TT--A-------TT--AATA-------CTT----ATAG-TA--AA--T----AA--TGGTA-AAAAG-GAA--ACAG-------CTC--AAGTT-CA-GTT-----------------GA-T--A-T-----ATTG-T--A-------GTT---T--A-T-AT-T-C-AAT-A-------ATGCTC-AA-A---GGA-AAAC-------------------AACTGTAGTT---G--AGTT-TAAA-T--AGTTTAA-------ATAG-TC--tttgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|19 : ttgttactatattttatgaaagtcaaaaggaaA-C---T--ACAG--TCA-----T-----T-AATGGCC-AAAGG---GAAATAAATCTCGT---TC-AGTT-G---A-A-T--TA-----TT-G-TAaatgggaaaca
gi|15 : acatgtt--ATAC--TAA-----A-----A-AATGACC-AAAGG---GAAACGATTGTAGT---TC-AGAT-G---A-A-A--CA-----AT-G-TAGcgaccagatataaatgg
gi|12 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaatatttgacatatt-----T-AATGGTC-ATAGA---GAAACAAATCTAGT---TC------G---A-A-A--AA-----GT-C-TAACCATATCATT---TT--TTAT-A-AAGGTCG---A-A--GGGAAACAAGT--------------TTCT-CTAT-T-TC------AATTGA----A-A-A--TCA---GT---T-A-CC-T--TA---T-TTTATAAAGGT-C---AAAGGGAAACAAC-----TCTA----GTTAAGT----T-G---G---AA--------T--G-------TT--GTGA-------CGT----ATAG-TA--TA--T----AA--TGGTC---------A--AC----------------------------------------------A--A-T-----AATG-T--A-------A-C---T--ATA-GC-T-T--AT-A-------TTGGCC-GA-A---GGG-AAAC-------------------AACTCTAGTT---C--AGAT-GAAT-A--AGTATGCTT-T---TTAG-TC--T---AT---A----C-T---T----G--------TGAAAGGG--------A--------AGCAA----CTA--TAGTT-A--A-G-----------T--TA-AAAA---T--------------TTGA--G---T-T-GT----T-GT-T-A-A-T-ATTGTCAAAGG---GAAAT--------------AAC-----T-A--T-AA-T-A-GATT--------TAA------A------G----T--ATT-GTT-ACtcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|20 : tAACACTAGT---TC-TGTT-G---A-A-T--TA-----TT-G-TTAC----TTAT
gi|15 : gtgatcggttaaaaatgatacttattgtcattaatt-----TT-A-TGAA----TTATA---GT--CCAT-A-GTGGTCA---A-A--GGGAAAC-------------------GAC-TC------T------TGGTAAGTTAACA-A--T-A---TT-A-T-A-T--T-ATA---A-TCAATAATGGT-C---AAAGGGAAGCATC-----TCTA----GT----T----T-A---G---TTGAA----AT--A-------TT---TGA-------CAT----ATTC-TA--CA--T--------TGTTT-CATCT-GAACTACAATCGTTTCCCT--TTGGT-CA-TTTTTTAGTATTCAATTGTTAA-A--A-TGAGAAAGCA-T--A-------A-C---T--A-T-GT-C-T-TAT-A-------G-GGTC-AA-A---GGG-AAAC-------------------AACTCTAGTT---A--AGTT-GAAC-T--ATTATGAC------A-AGTTC--T---GT---T----A-
gi|13 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtCAAAG--------------TCAA-TCAG-TTGT------ATTTCAGTTGA-A-C--T------T-G-T-T-TC-G---------TCAAT---GGT-C---AAAGGGAAATAAC-----TCTT----GT----T----T-A---A---AA-AA----GA--AAC-----TT--ATGA-------CTT----GTAA-T---CAATT----TA--TGGTC-AAAGG-GAA--ACAA-------CTA--TAGTT-TA-GTT-----------------AA-A--C-A-----CTTG-C--G-------A-C---T--T-A----T-A-AAT-A-------AT-----------------AAC-------------------AAATTTAGTT---A--AG---AAAT-TGCATT-TAATC-G---ATAG-TC----------------A-T---T------------------GGG--------A--------AACAA----CTC--TGGTT-T--A-A-----------T--T
gi|17 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtCAAAA--------------TGGA-ATAA-T-TTTTATTCAGTTGAATTTA------T-T---GT---T-A-TC-T-TTA---G-TCATTATTAAT-TGTAAAATGGAAATAGT-----TCTT----GT----T----C-A---GTTAAAAAA----TT--G-------GT-----A-------CTT----ATTG-T---CGT-T----AA--TGGTC-AACGG-AAA--ATAA-------CTT--GTGAT-CG-GTT-----------------AA-A----------AATG-A--T-------A-C---T--T-A-TT-G-T-CAT----------------TA-A---TT---AAC-------------------A---CTAGTT---C--TGTT-GAAT-T--ATTGTTACT-atcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|16 : gttAA-TTAA-C-CA------AGTTCAATT-A-A-A--T-A---ATTG-TTA-CG-T-AAA---A-CTATTAATTAT-C---AAAGGGATATAAT-----ACCA----GT----T----C-A---G---TTGAA----TT--A-------TT--GTTA-------CGT----ATAGTTA--T---T----AA--AGGTC-AAAGG-GTA--TTAA-------CTC--TTTTC-CA-GTT-----------------AA-A----------AATG-T--A-------A-C---T--G-ATAG-T-C-TAT-A-------ATACAC-AA-A---AGG-AATT-------------------ATCACTAGTT---C--AGAT-G-AT-T--CTT-TAACG-T---ATAG-T
gi|11 : ------AGTTTAGTTGA-A-T--T-A---TT-G-TTA-CG-T-AGA---G-TTATTAATGAT-C---GACGGAAAATAAC-----TCTT----GT----T----C-A---GTT-AGAAA----T---------------ATCA-------CTT----ATAG-TT--TT--T----AA--TCGTC-AAAGG-GAA--ATAA-------CTG--TTGTT-CA-ATT-----------------AA-A--A-T-----GTTG--------------C---T--T-ATAG-T-C-AAT-A-------ATGGTT-AA-A---GAG-AA-T-------------------AACTTTTATT---C--AGTT-GAAT-T--AGTGCCACG-T---ATAG-T---T---AT---TA---A-T---G----G--------TGAAAGGG--------A--------AATAT----CTC--TAGTT-C--A-T-----------T--TG-AATT---G--------------TTG-------T-T-AGGTACA-GT-T-ATT-A-AAGGCCAAAGG---AAAAT--------------AAC-----T-G--T-TTTC-C-AGTT----------A------A------A----A--AAT-GTT-ACT--
gi|6 : tttttataaatggtcaaaggcagatgactcc--T-A---GT-G-T-T-TCGT-CTA---G-TTATTAATGGTCT---AAGTG-AAATAAC-----TCTA----AT----T----C-A---G---TTGAA----TT--A-------TT--GTAA-------CGC----ATAG-TT--GG--T----AA--TGGTG-AAATG-GAG--ATAA-------CTC--CAGAA-CA-GTT-----------------GA-A--T-T-----AGTG-T--T-------A-CG--T--A-G-AT-T-T-ATG-A-------ATTGTC-AA-AAGCACA-AAACTCCAATCATTATTTAAATTAACT-CAGTT---C--AGTT-AGAT-T--ATTGTTACG-T---GGAA--C--T---AT---TA---A-T---G----A--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----TTC--CAGTT-C--A-A-----------G--TG-AACT---A--------------TTGT--T-ACG-T-AA----A-GTAA-T-C-A-AACGTCAAAGG---AAAAT--------------AAC-----T-C--T-TTTTCC-AGTT----------A------A------A----A--AAT-GTA-ACTGAT-A---G----TC-----TAT--------------AATA-------------------------CTC-AAAAGG--ATTTAA----CA-CT----AGTTCAgatagtctataatcttaaaaggaattaactt
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--T-A---GT-G-T-T-TCGT-CTA---G-TTATTAATGGTCT---AAGTG-AAATAAC-----TCTA----AT----T----C-A---G---TTGAA----TT--A-------TT--GTAA-------CGC----ATAG-TT--GG--T----AA--TGGTG-AAATG-GAG--ATAA-------CTC--CAGAA-CA-GTT-----------------GA-A--T-T-----AGTG-T--T-------A-CG--T--A-G-AT-T-T-ATG-A-------ATTGTC-AA-AAGCACA-AAACTCCAATCATTATTTAAATTAACT-CAGTT---C--AGTT-AGAT-T--ATTGTTACG-T---GGAA--C--T---AT---TA---A-T---G----A--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----TTC--CAGTT-C--A-A-----------G--TG-AACT---A--------------TTGT--T-ACG-T-AA----A-GTAA-T-C-A-AACGTCAAAGG---AAAAT--------------AAC-----T-C--T-TTTTCC-AGTT----------A------A------A----A--AAT-GTA-ACTGAT-A---G----TC-----TAT--------------AATA-------------------------CTC-AAAAGG--ATTTAA----CA-CT----AGTTCAg
gi|14 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatC-T-ATA---T-TTTATGAAAGT-C---AAAAGGAAAC-----------------T----T----T-A---G------------------------TT--A------------A----AT---TG--CA--T----AA----AT---AA---GAA--CCAA-------ATA--TAGTT-CA-GTT-----------------GA-A--A-T-----AGTG-T--A-------A-C---T--A-T-AT-T-T-AAT-G-------GTGTTC-AA-A---GGG-AAAC-------------------AACTCTAGTT---C--AGTT-GAAT-A--AAAATGATT-T---ATAG-TC--A---AC---T----A-T---G----A--------TCAAAGGG--------A--------AGCAA----CTA--TAGTT-C--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------TTAA--T-ACT-T-AT----A-GTAA-A-T-A-ATGGTAAAAAG---GAAAC--------------AGC-----T-C--A-AGTT-C-AGTT--------GAT------A------T-------ATT-GTA-GTT--TAT---AT---TC----------------------AATA----AT------------------GCTC-AAAGGA--AAACAA----CT-GT----AGTTGAGT-TT--A-A-A------------------T-------A--------GT------T-TAA----AT-A---------GTCAATGGGAAACAga
gi|12 : ttgttaTAATGGT-C---ATAGAGAAACAAA-----TCTA----GT----T----C-G---A---AAAAG----TC---------------TAA-------CCATATCATTT-TT--TA--T----AA--AGGTC-GAAGG-GAA--ACAAGTTT---CTC--TATTT-CAATTG-----------------AA-A--A-TC----AGTT------------A-C---C--T-T-AT-T-T-TAT-A-------AAGGTC-AA-A---GGG-AAAC-------------------AACTCTAGTT---A--AGTT-GGAA-T--GTTGTGACG-T---ATAG-TA--T---AT-------------------------------AATGG------------------TCAA----C---------------------------------AATA---A---------------TGT--A-AC--T-AT----A-GCTT-A-T-A-TTGGCCGAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-C--T-AGTT-C-AGAT--------G-A------A------T----A--AGT-AT--GCT--T-TTTAG----TC-----TAT--------------ACTT----GTG----------------------AAAGGG--AAGCAA----CT-AT----AGTTAAGT-TA--A-A-A-A-----T-TTG---------------AG-T--T-GT------TGTTA-A-TAT-T---------GTCAAAGGGAAATAACTATAA-TA-GATTTAA--AG---TA
gi|9 : tT-C---AAAGGGAATTAGC-----TGTA----GT----T----T-A---A---TTGAA----TT--A-------GT--GTGA-------CTA----ATAG-TA--TG--T----TA--TGGTC-AAATG-TTA--ATAA-------CTC--TAGTT-CA-GTT-----------------GA-A--T-A-----AGTG-T--T-------A-CT--T--A-T-AG-T-G-AAT-A-------ATGGTC-AA-A---GGG-AATC-------------------AACTTTAGTT---C--AGTT-TTAT-T--ATTTTGACT-G---AT-------T---GT---TAAAAA-T---G----G--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----TTT--AAGTT-C----T-----------G--TG-AAAA---A--------------ATGT--G-AA----AT----A-ATCA-G-T-A-ATGGTCAAAGG---GACAC--------------AAC-----T-C--T-TATT-C--TTT--------TAA------A------A----T--AGT-GTG-ACT-------------------------------------AATAGTTTATA-AT--------------GATCAAAAAGG--AAACAA----CA-CA----AGTTCGAT-TGA-A-A-A-A-----T-TTG---------------AC-T-AT-AA------T-CAA-T-AAT-G---------GTCGAAGACAAACTACTCTAG-TT-CCGTTGA--AA---TATTGTGACTT---AT-TC-GAGAA----AAT-AA-C---TGTAGT-TCT-GATTGAACTGTACATTA---AATAAT-TCCACTGTTTACTT--------------T-G-TA-AC-----------------TTAA-------A-----AA-----TAAT---GGTCATATG---GAAAA-------------------AAGTATAGTTGAA-TT-ttgttac
gi|17 : ---AAATGGAA-TAAT-----TTTT----AT----T----C-A---GTTGAAT------TT--A-------TT--GTTA-------TCT----TTAG-T---CA--TTATTAA--TTGTA-AAATG-GAA--ATAG-------TTC--TTGTT-CA-GTT-----------------AA-A--A-A-----ATTG-G--T-------A-C---T--T-A-TTGT-C-GTT-A-------ATGGTC-AA-C---GGA-AAAT-------------------AACTTGTGAT---C--GGTT-AAA--A--ATGAT-ACT-T---AT-------T---GT---C----A-T---T----------------AAT---------------------TAA----CAC--TAGTT-C--T-G-----------T--TG-AATT---A--------------TTG
gi|7 : gttcaAATATC-----TCTA----GT----T----C-A---G---ATAAA----TT--A-------TT--GT-----------------------------T----AA--AGGTC-AAAGG-TAA--AAAA-------CTC--TTGTT-TA-GTT-----------------AA-A--A-C-----A-TG-G--T-------A-C---T--A-A-AG-T-T-ATT-A-------ATGGCC-AA-A---GGG-AAAT-------------------AACTTTTGTT---C--AGTT-GAAG-T--ATTGTAACG-T---ATAG--C--T---ATA--C----A-T---G----A--------TCAAA-----------------------------CTC--TTGTT-A--A-T-----------T--TA-AA-A---A--------------T-------ATT-TCAT----A-ATATCA-TTA-ATGGTCAAAAG---GAAAT--------------AAC-----TAG--T--GTT-C-AGGT--------GAA------T------T--------GTTGTT-ACT--T-G---AAG--TC-----ATA--------------AAT------TG-------------------TC-AATGAG--AAATAA----CT-CT----TCTTCAGT-TA--A-A-T-A-----TATTA------T-------TAA-T-A--GT------C-AT--T-GAT-G---------ATCGAAGGGATATAACTC--G-T----GTTCA--GT---TA---------A-AA------ATGATGTTTAT-AGTC---ATTAAT-GAT-CA---AAGGG------A---AATAAC-TCTA--GTTCAATTGA-A---T-T-A-TT-G-TA-A--------------------------------------------AT---GTTCAAAGA---GAAAT-------------------AACTCTTGTTTAG-TT-AA-AA-CA---T----G--TTTCTATAGTC--ATTAATGGCCAAAGAGAAATAAC-TCCAGTT-CAG----TTAA-A--CTA-TTGTT-AC-CT-A-ttact
gi|16 : ----T----T-A-------AATAA----TT--G-------TT--ACG---------TA----AAAC-TA--T---T----AA--TTATC-AAAGG-GAT--ATAA-------TAC--CAGTT-CA-GTT-----------------GA-A--T-T-----ATTG-T--T-------A-CG--T--A-T-AG-T-T-ATT-A-------AAGGTC-AA-A---GGG-TATT-------------------AACTCTTTTC---C--AGTT-AAA-----AATGTAACT-G---ATAG-TC--T---AT---A----A-T---A----C--------ACAAAAGG--------A--------ATTAT----CAC--TAGTT-C--A-
gi|15 : aattaaccaagttcaa---G---AATAA----TT--ACATTTGTTT--ATGA-------ATT----ATAG-TC--CA--T----AG--TGGTC-AAAGG-GAA--ACGA-------CTC--TTGGT-AA-GTT-----------------AACA--A-T-----ATTA-T--A---------T---T--A-T-AA-T-C-AAT-A-------ATGGTC-AA-A---GGG-AAGC-------------------ATCTCTAGTT---T--AGTT-GAAA-T--ATT-TGAC------ATAT-TC--TAC-AT---T----G-T---T----T--------gatgattctttaacgtatagt
gi|3 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcAA----TT--A-------TT--GCTA-------CGT----ATA--TA--AA--TC---AA--CGGTC-AAATG-CCA--ATCA-------CTC--TAGTTGTG-TTT-----------------AA-A--A--------ATG-T--A-------A-C---T--G-GTAG-T-C-ATT-A-------ATGGTC-AA-A---GGG-AAAT-------------------AACTCCATTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTTACG-T---ATA----------AT---T----A-T-------------------AAATGA--------ACAAAGTTGAATAA----CTCTTTTGTT-C--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------TTGA--T-ATA-T-AT----A-GGCA-T-T-A-ATGGTCAAAGG---GAATT--------------ACC-----T-C--T-TGTT-C-AGTT-----------------A------A----A--AAT-GTA-AC---T-T---A----T------AGA--------------AATA----A---AT--------------GGTC-AAAGGG--AAATAA----TT-CA----AGTTTGTT-TG--A-A-T-C-----A-TTG------T-------TACTT-ATAGT------T-CTA----AATG---------GTCATAGGGAAATAACTCTTG-TTGAAATT-----T---T-TTTTAACTTA-TAT-TCGTA-------AAT-GGTC-----CAA--------------GG------A---AAGAAC-ACTA--GTTCAGTTTA-A---T-T-A-TT-G-TT-AT----GTA-T-----A--GT---------T-----AT-----TAAA---GGTCAAAGG---GAAAT-------------------AACCATTTTCCAG-TT-AA-GA--A---TTGTAA--CTG--ATAGTC--TATAATTCTCAAAGGGAATTAAC-ACTAGGT-CAGAGGATTT---------TTT-T-AC-GT-A-TA-GT--TAT--T--A-ATGTTCCAAG-G-G-GAATAACTC-----CAGT--TCAG-T--TGAATTATTG-TTACTTATcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|18 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgtgtatttgT--ATTA-------CTT----ATAG-TA--AT--T----AA--TGATC-AAAGG-GAA--ATAA-------CAC--GTGTT-CA-GTT-----------------AA-A--A-----------------------A-C---G--A-T-AT-T-T-A-T-AGCCTTAAATTATC-TT-A---GTG-AAAT-------------------AACTCTAGTT---A--AGTT-GAAT-T--ATagtcattaatggtcaaggggaaaaactatttagcagtgaaattgtatagtcattaatggtcaaagtgaaaaatttcttgtttagttctattattgttacgtaatatataaattaatggtcaaatgccaataattaataataataatggtcaaacggaaattactccgttccagttcaattattgttacgtattgttataaagtggaatagctcaggttcagttgaattattgttacttataatcattatgaatggtcaaagggaaataact
gi|8 : cctatagttttacctactcttgatcagttaaaaa----ATAG-T---CA--TT---AA--CGGTG-AAAGG-GAA--ATAA-------CTC--GAGTT-CA-GTT-----------------AA-A--T-T-----ACTG-T--A-------A-C---T--T-ATAG-T-T-A-T-A-------ATGGTC--A-A---ATGCAAAT-------------------AATTCCAGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTAATAGG-T---ATAG-TC------AT---TA---A-T---G----G--------TC-AATGGGGA-----A--------AAAAA----CTT--TTGTT-T--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------TTGT--T-ACG-T-AC----A--TTT-ATT-A-ATGGCCTAATG---ATAAT--------------AAC-----G-C--T-TGTT---AGTT----------A------A------A----A--AAT-GTT-AC---T-T---A----TA-----GGC--------------ATTA----GT---A--------------G-TC-AAAGGG--AAATAA----CT-CT----ATTTCAGT-T--------------------------T-------AAT-T-AT--T------G-TCA-T-T---G---------TTCAAAGTGAAATAAATCTTG-TT-CAGTTGA--AT---TATTGTTACGTA--------TA--GT--TAAT-A--C---TG------GT-CA---AAGGG------A---AACAAC-TCTT--GTTCAGTTGA-A---T-T-A-TT-GTCA-CC----T-A-T-----A--GT---------C-----AT-----TAAT---GGTCAAAGG---AAAAT-------------------AACTCTTGTTCAG-TTAGA-AA-TG---TTA-----CTT--ATAGTC--AATAAT
gi|11 : agtgattaatatatatatatgatacgtacatgtatat----AA--TGGTC-AAAGG-CAG--ATGA-------CTC--CAGTT-TA-GTT-----------------GA-A--T-T-----ATTG-T--T-------A-CG--T--A-G-AG-T-T-ATT-A-------ATGATC-GA-C---GGA-AAAT-------------------AACTCTTGTT---C--AGTTAGAAA-T--ATCA---CT-T---ATAG-TT--T---TT---A----A-T---C----G--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----CTG--TTGTT-C--A-A-----------T--TA-AAAT---G--------------TTG------CT-T-AT----A-GTCA-A-T-A-ATGGTT-AAAG---AGAAT--------------AAC-----T-T--T-TATT-C-AGTT--------GAATT----A------GTGCCA--CGT-ATA-G----T-T---A----T-------------------------TA----AT------------------GGTG-AAAGGG--AAATAT----CT-CT----AGTTCATT-TG--A-A-----------TTG------T-------TGT-T-AG-GTACA---G-TTATT-AAA-G---------GCCAAAGGAAAATAACTGTTT-TC-CAGTTAA--A---------------A-AA-----TGTTAC--TGAT-AGTC---TATAAT-CTT-AA---AA-GG------A---ATTAAC-T
gi|13 : tttttata----AA--TGGTC-AAAGG-GAA--ATAA-------CTC--TTG------TTT-----------------AA-A--A-A-----A--G-A--A-------A-CTTAT--G-A-CT-TGT-AATCAATTT---ATGGTC-AA-A---GGG-AAAC-------------------AACTATAGTT---T--AGTT-AAAC-A--CTTGCGACT-T---ATAA-------------------A-T--------------------AAT-------------------AACA-----------AATT-T--A-G-----------T--TA-AGAA---A--------------TT-G--C-ATT-T-------A-ATCG-A-T-A-GTCATTG---G---GAAAC--------------AAC-----T-C--T-GGTT-T-AATT--------t
gi|10 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtc-GAA--ACAA-------CTC--TAGTT-TA-GTT-----------------GA-ATTA-T-----AATG------------A-C---TT-A-C-AG-T-C-TAT-A-------ATGGTC-AA-A---GGG-AAAC-------------------AACTTTAGTT---C--ATTT-TAAA-A--AGTGTAA-T-T---AT----C--T-------------------C----T--------TTAAAGGGCCATAGTGA--------AACAA----CTC--AAGTT-C--AGT-----------T--TA-AATA-------------------TGGT-G-ACT-T-AT----A-GTCT-T-T-A-ATGGTCAAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-C--T-TGTT-C-AATT--------GAT------A-----------A--TGT-GTA-GTT--C-T---A----TCT----GAA--------------AATA-----T--------------------TC-AAAAGG--AAACAA----CT-CT----AGTATAGT-TG--A-A------------------------------C-T-AT-AT------T-TTA-A-AAA-T---------GTCAAAGGGAAATAACTCTAG-TT-AAGTTGA--AT---TAG-----------------TATGAC--TTAT-AGTC---TATAAT-GTT-TA---AATGA------A---AACAAT-TCTA--GTTTTGTTGA-A---A-T-A-GT-G-TA-AC----T-A-T-----A--TA---------T-----GA-----TAAC---GTTTAAAGG---GAAAC-------------------AACTCTAGTTCAG-TT-GA-AT-TA---TTAGGA--CAT--ATAGTC--TATAATatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|13 : A--ACAT-------TTC--TAGTT-TA-A-------------------AA-A--A-TG----AATGCG--AG------A-C---TTGA-A-AT-C-A-ATT-T-------ATTGTC-AA-A---GTC-AATC-------------------AGTTGTATTT---C--AGTT-GAA------------CT-T---GT---TT--C---GT---C----AAT---G----G--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----CTC--T-----T--G-T-----------T--TA-AAAA---AGAAAC---------TTAT--G-ACT-T-GT----A-ATCA-A-T-TTATGGTCAAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-A--T-AGTT-T-AGTT---------AA------A------C----A--CTT-GCG-AC---T-T---A----T--------A--------------AATA----AT--------------------------------AACA--------------AATTTAGT-TA--A-G-A-A-----A-TTG------C-------A---------T------T-TAA-TCGAT-A---------GTCATTGGGAAACAACTCTGG-TT-TAATT
gi|18 : tcactaaatcaccA-------CTC--TTGAT-CA-GTT-----------------AA-A--AAT-----ATT-------------A-C---T--T-A-TA-G-T-AATTA-------ATGATC-AA-A---GGG-AAAT-------------------AACACGTGTT---C--AGTT-AAA--A--ACGAT-ATT-T---ATAG-CC--TTAAAT---T----A-T---C----T--------T--AGT-G--------A--------AATAA----CTC--TAGTT-A--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------Tatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|16 : cctatagttttacctGTT-CA-ATT-----------------AA-A----T-----AATT-G--TT------A-CG--T--A-A-AA-C-T-ATT-A-------ATTATC-AA-A---GGG-ATAT-------------------AATACCAGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTTACG-T---ATA----------GT---T----A-T---TAAAGG--------TCAAAGGG--------T--------ATTAA----CTC--TTTTC-C--A-G-----------T--TA-AA-A---A---------------TGT--A-ACT-G-AT----A-GTCT-A-T-A-ATACACAAAAG---GAA
gi|19 : aattaaccaa-------A-C---T--A-C-AG-T-C-ATT-A-------ATGGCC-AA-A---GGG-AAAT-------------------AAATCTCGTT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTttatcactagttcagatgattctttaacgtatagt
gi|22 : acatgtt-AT-T-T-ATT-A-------ATGGTT-TA-A---GTG-AAAT-------------------AACTCTTGTT---C--TGTT-acgaccagatataaatgg
gi|6 : tagtagaatcattgttacgaat-T-T-ATT-A-------ATGGTC-TA-A---GTG-AAAT-------------------AACTCTAATT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTAACG-C---ATAG-TT--G---GT---A----A-T---G----G--------TGAAATGG--------A--------GATAA----CTC--CAGAA-C--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------GTGT--T-ACG-T-AG----A--TTT-A-TGA-ATTGTCAAAAGCACAAAACTCCAATCATTATTTAAA-----T----T-AACT-C-AGTT--------CAGTT----A------G----ATTATT-GTT-ACG--T-----------------GGA--------------ACTA----TTA-AT--------------GATC-AAAGGG--AAATAA----TT-CC----AGTTCAAG-TG--A-A-C-T-----A-TTG------T-----------T-AC-GTAAA---G-TAA-TCAAA-C---------GTCAAAGGAAAATAACTCTTT-TTCCAGTTAA--A---------------A-AA-----TGTAAC--TGAT-AGTC---TATAAT-ACT-CA---AAAGG------ATTTAAC-AC---TA--GTTCAGa
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctag-T-T-ATT-A-------ATGGTC-TA-A---GTG-AAAT-------------------AACTCTAATT---C--AGTT-GAAT-T--ATTGTAACG-C---ATAG-TT--G---GT---A----A-T---G----G--------TGAAATGG--------A--------GATAA----CTC--CAGAA-C--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------GTGT--T-ACG-T-AG----A--TTT-A-TGA-ATTGTCAAAAGCACAAAACTCCAATCATTATTTAAA-----T----T-AACT-C-AGTT--------CAGTT----A------G----ATTATT-GTT-ACG--T-----------------GGA--------------ACTA----TTA-AT--------------GATC-AAAGGG--AAATAA----TT-CC----AGTTCAAG-TG--A-A-C-T-----A-TTG------T-----------T-AC-GTAAA---G-TAA-TCAAA-C---------GTCAAAGGAAAATAACTCTTT-TTCCAGTTAA--A---------------A-AA-----TGTAAC--TGAT-AGTC---TATAAT-ACT-CA---AAAGG------ATTTAAC-AC---TA--GTTCAG
gi|12 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctagT-A-------ATGGTC-AT-A---GAG-AAAC-------------------AAATCTAGTT---C-------GAAA-A--AGTCTAACCAT---ATCA-TT--T---TT---T----A-TAAAG----G--------TCGAAGGG--------A--------AACAAGTTTCTC--TATTT-C--A-A-----------T--TG-AA-A---A--------------TCAGTTA-CCT-T-AT-------TTT-A-T-A-AAGGTCAAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-C--T-AGTT-A-AGTT--------GGA------ATGTTGTG----A--CGT-ATA-GTA--TAT---AATGGTC-----AAC--------------AATA----ATGTAACTATAGCTTATATTGGCC-GAAGGG--AAACAA----CT-CT----AGTTCAGA-TG--A-A--------------------T-------AAG-T-AT-GC------T-TTT-T---A-GTCTATACTTGTGAAAGGGAAGCAACTATAG-TT-AAGTTAA--A----------AATTTG-AG---T-TGTTGT--TAAT------------AT-TGT-CA---AAGGG------A---AATAAC-TATA--ATAGATTTAA-A---G-T-A-TT-G-a
gi|9 : tTC-AA-A---GGG-AATT-------------------AGCTGTAGTT---T--AATT-GAAT-T--AGTGTGACT-A---ATAG-TA--T---GT---T----A-T---G----G--------TCAAATGT--------T--------AATAA----CTC--TAGTT-C--A-G-----------T--TG-AATA---A--------------GTGT--T-ACT-T-AT----A-GTGA-A-T-A-ATGGTCAAAGG---GAATC--------------AAC-----T-T--T-AGTT-C-AGTT--------TTA------T------T----A---TT-TTG-ACTGAT-T---G----TT-----AAA--------------AAT-------------------------GGTC-AAAGGG--AAATAA----TT-TA----AGTTC--TGTG--A-A-A-A-----A-ATG------TG------AA----AT-AA------T-CAG-T-AAT-G---------GTCAAAGGGACACAACTCTTA-TT-CTTTTAA--AA---TAG-----------------TGTGAC--TAAT-AGTT---TATAAT-GATCAA---AAAGG------A---AACAACACA-A--GTTCGATTGA-A---A---A-AT-T-TG-AC----T-A-T-----A--AT---------C-----AA-----TAAT---GGTCGAAGA---CAAAC-------------------TACTCTAGTTCCG-TT-GA-AA-TA---TTGTGA--CTT--AT--------------TCGA--GAAAATAAC-TGTAGTT-ttac
gi|17 : TC-AA-A---ATG-GAAT-------------------AATTTTTATT---C--AGTT-GAAT-TT-ATTGTTATC-T---TTAG-TCATT---AT---T----AAT---T----G--------TAAAATGG--------A--------AATAG----TTC--TTGTT-C--A-G-----------T--TA-AAAA---A--------------TTGG--T-ACT-T-AT----T-GTCG-T-T-A-ATGGTCAACGG---AAAAT--------------AACT----T-G--T--GAT-C-GGTT--------AAA------A------ctgattgaactgtacattaaataattccactgtttactttgtaacttaaaaataatggtcatatggaaaaaagtatagttgaatt
gi|20 : gt-------------------AACACTAGTT---C--TGTT-GAAT-T--ATTGTTACT-T---ATatgatacttattgtcattaattaacactagttctgttgaattattgttact
gi|18 : gtgatcggttaaaaatgatacttattgtcattaattACTCTTGAT---C--AGTT-AAA-----AATATTACT-T---ATAG-TA------AT---TA---A-T---G----A--------TCAAAGGG--------A--------AATAA----CAC--GTGTT-C--A-G-----------T--TA-AA-A---A---------------CGA--T-ATT-T-AT----A-GCCT-T-A-A-ATTATCTTAGT---GAAAT--------------AAC-----T-C--T-AGTT-A-AGTT--------GAA------
gi|16 : cctatagttttacctAGTT---C--AATT-AAAT-A--ATTGTTACG-T---AAAA--C--T---AT---T----A-A---T----TA-------TCAAAGGG--------A--------TATAA----TAC--CAGTT-C--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------TTGT--T-ACG-T-AT----A-GT-T-A-TTA-AAGGTCAAAGG---GTATT--------------AAC-----T-C--T-TTTC-C-AGTT--------AAA------A------A---------T-GTA-ACTGAT-A---G----TC----------------------TATA----ATA-CA-----------------C-AAAAGG--AATTAT----CA-CT----AGTTCAGA-TG--A-ttat
gi|15 : aattaacca-TT--T---GT---T----A-C---TGT--T--------TTGAATCG--------A--------A-------------TAATTAC--A-T-----------T--TG---T-------------------TTAT--G-AAT-T-AT----A-GTCC-A-T-A-GTGGTCAAAGG---GAAAC--------------GAC-----T-C--T-TGGT-A-AGTT--------AAC------A------A----T--ATT-ATA------T-T---A----TA-----ATC--------------AATA----ATG-G-----------------TC-AAAGGG--AAGCAT----CT-CT----AGTTTAGT-TG--A-A-ATA-----T-TTG---------------AC---AT-AT------T-CTA-ttctttaacgtatagt
gi|8 : gaaaatatcatacgctAAAGGG--------A--------AATAA----CTC--GAGTT-C--A-G-----------T--TA-AATT---A--------------CTGT--A-ACT-T-AT----A-GT-T-A-T-A-ATGGTCAAATG---CAAAT--------------AAT-----T-C--C-AGTT-C-AGTT--------GAATTATTAA------T----A--GGT-ATA-G----T-C---A----T-------------------------TA----ATG-G-----------------TC-AATGGGGAAAAAAA----CT-TT----TGTTTAGT-TG--A-A-----------TTA------T-------TGT-T-AC-GTACA---T-TTA-T-TAATG---------GCCTAATGATAATAACGCTTG-TT-A-GTTAA--A---------------A-AAT-GT-TAC-----TTAT-AGGC---ATTAGT-AGT-CA---AAGGG------A---AATAAC-TCTA--TTTCAGTTTA-A---T-T-A-TT-G-T------------C-----A--TT-----------------------------GTTCAAAGT---GAAAT-------------------AAATCTTGTTCAG-TT-GA-AT-TA---TTGTTA--CGT--ATAGTT--AATACTGGTCAAAGGGAAACAAC-TCTTGTT-CAG----TTGA-A--TTA-TTG-TCAC-CT-A-TA-GT--CAT--T--A-ATGG-TCAAA-G-GAAAATAACTC-----TTGT--TCAGTT--AGAAATGTTA-cattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|10 : agtgattaatatatatatatgatacgtacatgtatatatagtcattaacggtgG--------A--------AACAA----CTC--TAGTT-T--A-G-----------T--TG-AATT---A--------------TAAT--G-ACT-T-AC----A-GTCT-A-T-A-ATGGTCAAAGG---GAAAC--------------AAC-----T-T--T-AGTT-C-ATTT--------TAA------A-----------A--AGT-GTA-A----T-T---A----TCTCTTTAAA--------------G---------------------------GGCC-ATAGTG--AAACAA----CT-CA----AGTTCAGT-TT--A-A-A-T-----A-TGG------T-------GAC-TTATAGT------C-TT--T-AAT-G---------GTCAAAGGGAAACAACTCTTG-TT-CAATTGATAATGTGTAGTTCTATCTG-AA--------------AAT-ATTC---------------A---AAAGG------A---AACAAC-TCTA--GTATAGTTGA-A---C-T-A--T--------------A-T-----T--TT---------A-----AA------AAT---G-TCAAAGG---GAAAT-------------------AACTCTAGTTAAG-TT-GA-AT-TA---GTATGA--CTT--ATAGTC--TATAATGTTTAAATGAAAACAAT-TCTAGTT-TTG----TTGA-A--ATA-GTG-T-AA-CT-A-TA-TA--TGA--T--A-ACGTTTAAAG-G-G-AAACAACTC-----TAGT--TCAG-T--TGAATTATTA-GGACATATcttatagtcaataat
gi|16 : AGTT-C--A-A-----------T--TA-AATA---A--------------TTGT--T-ACG-T-AA----A-A-CT-A-TTA-ATTATCAAAGG---GATAT--------------AA------T-A--CCAGTT-C-AGTT--------GAA------T------T----A---TT-GTT-ACG--T-----A----T--------A--------------GTTA----TTA-AA--------------GGTC-AAAGGG--TATTAA----CT-CT----TTTCCAGT-TA--A-A-A-A--------TG------T-------AAC-TGAT-AG------T-CTA-T-AAT-A---------CACAAAAGGAATTATCACTAG-TT-CAGATGA--agtctataat
gi|15 : aattaaccaT-C--A-T-----------T--TT-AACA---A--------------TTGA--ATACT-A-AA----A----------A-ATGACCAAAGG---GAAAC--------------GAT-----T-G--T-AGTT-C-AGAT--------GAA------A------C----A--A-T-GTAGAAT--A-T---G----TC-----AAA--------------TATttctttaacgtatagt
gi|13 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaa--TG-AATG-------------------CGA--G-ACT-T-GA----A-ATCA-A-T-TTATTGTCAAAGT---CAATC--------------AGT-----T-G--T-ATTT-C-AGTT--------GAA------C------T---------T-GT----T--T-C---G----TC-----AA------------------------TG-G-----------------TC-AAAGGG--AAATAA----CT-CT----TGTTTAAA-AA--AGA-A-A-----C-TTA------T-------GAC-T--T-GTAATCAAT-TTA-T-G-------------GTCAAAGGGAAACAACTATAG-TT-TAGT--------------------TA-AACACT-TGCGAC--TTAT-A---------AAT----------AAT------------AACAAA-TTTA--GTTAA---GA-A---A-T----T-G-C----------A-T--------TT---------A-----AT-----CGAT---AGTCATTGG---GAAAC-------------------AACTCTGGTTTAA-TT-gaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|12 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaa-A-ATGGTCATAGA---GAAAC--------------AAA-----T-C--T-AGTT-C-------------GAA------A-----------A--AGT-CTA-ACC--A-T---A----TC-----ATT--------------TTTT----ATA-AA--------------GGTC-GAAGGG--AAACAAGTTTCT-CT----ATTTCAAT-TG--A-A-A-A-----T-CAG------T-------TAC-C-TT-AT------T-TTA-T-AAA-G---------GTCAAAGGGAAACAACTCTAG-TT-A-----A--GT---TGG----------AAT-GT-TGTGAC--GTAT-AGTA---TATAAT-GGT-----------------------CAAC------------------A---A-T-A-AT-G-TA-AC----T-A-T-----AGCTT---------A-----TA-----T--T---GGCCGAAGG---GAAAC-------------------AACTCTAGTTCAG-AT-GA-AT-AA---GTATGC--TTT--TTAGTC--TATACTTGTGAAAGGGAAGCAAC-TATAGTT-AAG-----TTA-A--AAA-TTT-G-AG-TT-G-TT-GT--TAA--T--A-TTG--TCAAAGG-G-AAATAACTA-----TAAT--atcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|14 : ttGTCAAAAG---GAAAC----------------------T-T--T-AGTT-A-AATT--------G------------------------------------------------C-----ATA--------------AATA----A-----------------------------G--AACCAA----AT-AT----AGTTCAGT-TG--A-A-A-T-----A-GTG------T-------AAC-T-AT-AT------T-TAA-T-GGT-G---------TTCAAAGGGAAACAACTCTAG-TT-CAGTTGA--AT----------A---A-AA------ATGAT--TTAT-AGTCAACTATGAT-C----A---AAGGG------A---AGCAAC-TATA--GTTCAGTTGA-A---T-T-A-TT-A-AT-AC----TTA-T-----A--GT---------A-----AA-----TAAT---GGTAAAAAG---GAAAC-------------------AGCTCAAGTTCAG-TT-GA-TA-TA---TTGTAG--TTT--ATATTC--AATAATGCTCAAAGGAAAACAAC-TGTAGTT-GAG----TTTA-A--ATA-agatttaaagtattgttac
gi|16 : ttgttactatattttatgaaa-AGTT-C-AATT---------AA------A------T----A--ATT-GTT-ACG--T-----------------AAA--------------ACTA----TTA-AT--------------TATC-AAAGGG--ATATAA----TA-CC----AGTTCAGT-TG--A-A-T-T-----A-TTG------T-------TACGT-ATAGT------TATTA----AA-G---------GTCAAAGGGTATTAACTCTTT-TC-CAGTTAA--A----------AATGTA------------AC--TGAT-AGTC---TATAATACAC-AA---AA-GG------A---ATTATC-ACTA--GTTCAGATGA-gtttaaatagtcaatgggaaaca
gi|18 : aattaaccaT-C-AGTT--------AAA------A------A---------T-ATT-ACT--T-----A----T-----------------------AGTA----ATT-AAT-------------GATC-AAAGGG--AAATAA----CA-CG----TGTTCAGT-TA--A-A-A-ACGATAT-TTA------T-------AGC-C-TT-AA------A-TTA-T-----------------CTTAGTGAAATAACTCTAG-TT-AAGTTGA--AT---TAttctttaacgtatagt
gi|11 : cctatagttttacctactcttga----ATA-AAT-------------GGTC-AAAGGC--AGATGA----CT-CC----AGTTTAGT-TG--A-A-----------TTA------T-------TGT-T-AC-GTAGA---G-TTA-T-TAATG---------ATCGACGGAAAATAACTCTTG-TT-CAGTT----------AG--------A-AA-----TATCAC--TTAT-AGTT---TTTAAT-CGT-CA---AAGGG------A---AATAAC-TGTT--GTTCAATTAA-A---A-T-G-TT-G-C---T----T-A-T-----A--GT---------C-----AA-----TAAT---GGTTAAAGA---GAA-T-------------------AACTTTTATTCAG-TT-GA-AT-TA---GTGCCA--CGT--ATAGTT--ATTAATGGTGAAAGGGAAATATC-TCTAGTT-CAT----TTGA-A--TTG-TTGTT-AG-GT-A-CA-GT--TAT--T--A-AAGG-CCAAA-G-GAAAATAACTG-----TTTT--CCAG-TTAAAAAATGTTACTGATt
gi|15 : ttttt--------------GGTC-AAAGGG--AAACGA----CT-CT----TGGTAAGT-TA--A-C-A-A-----TATTA------T--------AT-T-AT-AA------T-CAA-T-AAT-G---------GTCAAAGGGAAGCATCTCTAG-TT-TAGTTGA--AA---TAagtctataatcttaaaaggaattaactt
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtAA----C--CA----AGTTCAAT-TA--A-A-T-A-----A-TTG------TTACGTAAAAC-T-AT-----------TAA-T-TA-------------TCAAAGGGATATAATACCAG-TT-CAGTTGA--AT---TATTGT--------------TACG----T-AT-AGTT---ATTAAA-GGT-CA---AAGGG------T---ATTAAC-TCTT--TTCCAGTTAA-A-------A-AT-G-TA-ACT---G-A-T-----A--GT---------C-----TA-----TAAT---ACACAAAAG---GAATT-------------------ATCACTAGTTCAG-AT-GA-tttgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|18 : aatt----CT-TG----A--TCAGT-TA--A-A-A-A-----T-AT-------T-------ACT-T-ATAGTAA----T-TAA-T-GA-------------TCAAAGGGAAATAACACGTG-TT-CAGTTAA--A-----AACGATATTTATAGC-CT-TA-------AAT-TATC---T-TA----GT-GA---AAT---------------AAC-TCTA--GTTAAGTTGA-A---T-T-A-ttctttaacgtatagt
gi|15 : cctatagttttacctactT-CG----AAT--AAT-T-----A-C-A-----T-TTG------TTTATG--AAT-T-AT-AG------T-CCA-T-AGT-G---------GTCAAAGGGAAACGACTCTTG-GT-AAGTT---------------AAC----AAT-AT-TAT-AT--TA-T-AATC---AATAAT-GGT-CA---AAGGG------A---AGCATC-TCTA--GTTTAGTTGA-A---A-T-A-t
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaaTTCAAT-TGTTA-A-A-A-----T-GAGAAAGCAT-------AAC-T-AT-GT------C-TTA-T--AG-G---------GTCAAAGGGAAACAACTCTAG-TT-AAGTTGA--AC---TAtttgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|13 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaatatttgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagta-TTG--------------AAC-T--T-GT------T-TCG-T-CAATG---------GTCAAAGGGAAATAACTCTTG-TT-----TAA--AA---AAG--------A-AAC-T--TATGAC--TTGT-AATCAA-TTTA-T-GGT-CA---AAGGG------A---AACAAC-TATA--GTTTAGTT-A-A---A-C-ACTT-G-CG-AC----T---T-----A---T---------A-----AA-----TAAT-----------------AAC-------------------AAATTTAGTTAA-----GA-AA-T-------TGC--ATT---TAATC-----GATAGTCATTGGGAAACAAC-TCTGGTT-TAA----TTttatgacaagttctgtta
gi|6 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcag-TTA-T-TAATG---------GTCTAAGTGAAATAACTCTAA-TT-CAGTTGA--AT---TATTGTAAC-----GC--------------AT-AGTT---GGTAAT-GGT-GA---AATGG------A---GATAAC-TCCA--GAACAGTTGA-A---T-T-A-GT-G-TT-AC----GTA-G-----A--TT---------T-----AT-----GAAT---TGTCAAAAGCACAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACTC-AGTTCAG-TT-AG-AT-TA---TTGTTA--CGT--GGAACT--ATTAATGATCAAAGGGAAATAAT-TCCAGTTCAAG-----TGA-A--CTA-TTGTT-AC-GT-A--A-AG--TAA--TCAA-ACG--TCAAA-G-GAAAATAACTC-----Tatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctag-TTA-T-TAATG---------GTCTAAGTGAAATAACTCTAA-TT-CAGTTGA--AT---TATTGTAAC-----GC--------------AT-AGTT---GGTAAT-GGT-GA---AATGG------A---GATAAC-TCCA--GAACAGTTGA-A---T-T-A-GT-G-TT-AC----GTA-G-----A--TT---------T-----AT-----GAAT---TGTCAAAAGCACAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACTC-AGTTCAG-TT-AG-AT-TA---TTGTTA--CGT--GGAACT--ATTAATGATCAAAGGGAAATAAT-TCCAGTTCAAG-----TGA-A--CTA-TTGTT-AC-GT-A--A-AG--TAA--TCAA-ACG--TCAAA-G-GAAAATAACTC-----Tttttccagttaaaaaatgtaactgatagtctataatactcaaaaggatttaacactagttcag
gi|19 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattagtgtttcgtctag-G---------GCCAAAGGGAAATAAATCTCG-TT-CAGTTGA--AT---TAttttccagttaaaaaatgtaactgatagtctataatactcaaaaggatttaacactagttcaga
gi|17 : acatgttactacagtcattaatTCAAAATGGAATAATTTTTA-TT-CAGTTGA--AT---T----TATTGTT-ATC-TT-TA-G----TCAT-TAT------TAAT-TGT-AA---AATGG------A---AATAGT-TCTT--GTTCAGTTAA-A---A-A-A-TT-G-GT-AC----T---T-----A--TT---------GTC---GT-----TAAT---GGTCAACGG---AAAAT-------------------AACTTGTGATCGG-TT-AA-AA--A---TGAT-A--CTT--ATTGTC--ATTAATttgtacgaccagatataaatgg
gi|15 : gt-TATGAA--TTAT-AGTC---CATAGT-GGT-CA---AAGGG------A---AACGAC-TCTT--GGTAAGTTAACA---A-T-A-TT--------------A-T-----A--TT---------ATAATCAA-----TAAT---GGTCAAAGG---GAAGC-------------------ATCTCTAGTTTAG-TT-GA-AA-TA---TT-TGA--CAT--ATtaacactagttctgttgaattattgttact
gi|18 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttAC--TTAT-AGTA---ATTAAT-GAT-CA---AAGGG------A---AATAAC--ACGT-GTTCAGTTAA-A---A-------------AC----G-A-T-----A--TTTATAGCCTTA-----AA-----TTAT---CTT---AGT---GAAAT-------------------AACTCTAGTTAAG-TT-GA-AT-TA---Ttctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|19 : cctatagttttacctactcttgatcagttaaaaatattAC--TA-C-AGTC---ATTAAT-GGC-CA---AAGGG------A---AATAAA-TCTC--GTTCAGTTGA-ATT-A-T-T-GT-A-CG-ACCA--G-A-T-----A---T---------A-----AA-----T
gi|13 : acatgttAAT-GGT-CA---AAGGG------A---AATAAC-TCTT--GTTTA----A-A---A-A-A-G----AA-ACTTATG-A-CTTGTAA--TC---------A-----AT-----TTAT---GGTCAAAGG---GAAAC-------------------AACTATAGTTTAG-TT--A-AA-CAC--TTGCGA--CTT--ATA--------AATAAT--------AACAAA-TTTAGTT-AAG---------A--A-A-TTG-C-AT-TT-A--A-TC---GA--T--A-GTCATT---G-G-G-AAACAACTCTGGTTTAATTATCGA-T--AAAATTAgg
gi|15 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcA---AAGGG------A---AACGAT-TGTA--GTTCAGATGA-A---A-C-A-AT-G-TAGAA----T-A-T-----G--TC---------A-----AA-----TAagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|17 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaaA---AATGG------A---A-TAAT-TTTT--ATTCAGTTGA-ATTTA-T-T-GT---TA-TCTTTAG-T-C-----A--TT---------A-----T------TAAT---TGTAAAATG---GAAAT-------------------AGTTCTTGTTCAG-TT-AA-AA-AA---TT--GGTACTT--ATTGTC--GTTAATGGTCAACGGAAAATAACTTGTGATC---G----GTTA-A--AAA-TGA-T-AC-TT-ATTG-TC---AT--T--A-A---TT----------AACA---C-----TAGT--TCTG-T--TGAATTATTG-Tggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|13 : gttca------A---ATCAGT-TGTA--TTTCAGTTGA-A---C-T-T-GT-------------------------TT---------C-----GT-----CAAT---GGTCAAAGG---GAAAT-------------------AACTCTTGTTTAA----AA-AA-GAAACTTATGA--CTT--GTAATCAATTTA-TGGTCAAAGGGAAACAAC-TATAGTT-TAG-----TTA-A--ACACTTG-CGAC-TT-A-TA-AA--TAA--T--A-ACtact
gi|16 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcAAC-CA-A--GTTCAATT-A-A---A-T-A-ATTG-TT-AC----G-------------T---------A-----AAACTATTAAT---TATCAAAGG---GATAT-------------------AATACCAGTTCAG-TT-GA-AT-TA---TTGTTA--CGT--ATAGTT--ATTAAAGGTCAAAGGGTATTAAC-TCTTTTC-CAG-----TTA-A--A-A-ATG-T-AA-CTGA-TAGTCTATAA--T--ACACA----AAA-G-G-AATTATCAC-----TAGT--TCAG-aaatttagttaagaaattgcatttaatcgatagtcattgggaaacaactctggtttaattatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|18 : aattTCAGTTAA-A---AAT-A-TT-A-C---T----T-A-T-----A--GT---------A-----AT-----TAAT---GATCAAAGG---GAAAT-------------------AACACGTGTTCAG-TT-AA-AA--A---CGAT-A--TTT--ATAGCC--TTAAATTATCTTAGTGAAATAAC-TCTAGTT-AAG----TTGA-A--TTA-Tatgattctttaacgtatagt
gi|22 : cctatagttttacctactcttgaAGTAGA-A---T-C-A-TT-G-TT-AC----G-AAT-----A--TT---------T-----AT-----TAAT---GGTTTAAGT---GAAAT-------------------AACTCTTGTTCTG-TT-
gi|15 : t-A-T-----A--CT---------A-----AA-----AAAT---GACCAAAGG---GAAAC-------------------GATTGTAGTTCAG-AT-GA-AA-CA---a
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaatatttgacatattctacatA-----TAGT---GGTCAAAGG---GAAAC-------------------GACTCTTGGTAAG-TT-AACAA-TA---TTATA----TT--ATAATC--AATAATGGTCAAAGGGAAGCATC-TCTAGTT-TAG----TTGA-A--ATA-TTtcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|19 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtcc-----TAAT---GGCCAAAGG---GAAAT-------------------AAATCTCGTTCAG-TT-GA-AT-TA---TTGTtgacatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|18 : acatgttactacagtcatACTCTTGATCAG-TT-AA-AAATA---TTA-----CTT--ATAGTA--ATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGT-GTT-CAG-----TTA-A--AAA-CGA-T-AT-TT-A-TA-GCCTTAAATT--A-TC--TT---A-GTG-AAATAACTC-----TAGT--TAAG-T--TGAATTATacgaccagatataaatgg
gi|15 : cctatagttttacct---TTATGA--ATT--ATAGTC--CATAGTGGTCAAAGGGAAACGAC-TCTTGGT-AAG----TTAACA--ATA-TTA-T-AT--T-A-TA-AT--CAA--T--A-ATGGTCAAAG-G-G-AAGCATCTC-----TAGT--TTAG-T--TGAAATATT--TGACATAT
gi|19 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtT--ACAGTC--ATTAATGGCCAAAGGGAAATAAA-TCTCGTT-CAG----TTGA-A--TTA-TTG-T-Atctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|15 : acatgttacAATGACCAAAGGGAAACGAT-TGTAGTT-CAG----ATGA-A--ACA-ATG-T-AGAAT-A-TG-TC--AAA--T--A-cgaccagatataaatgg
gi|19 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaattatagtccatagtggtcaaagggaaacgactcttggtaagttaacaatattatattataatcaataatggtcaaagggaagcatctctagtttagttgaaa--T--A-ATGGCCAAAG-G-G-AAATAAATC-----TCGT--TCAG-T--TGAATTATTG-Tttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1111 444444444444444444 11111 11111111 11111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111 1 1111 1111 111 1 1111111 22222222222 1 1111 111 999999999999999999999999999999999999 11111111111 111 11111 11111111111 1111111111 22222222222222222222 11 111111111111111 22222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333333333333 1111111111 11111 888888888888888888888 1111 2222222222 222222222222 1111 11 111 11 1 11 1 1 1 22
lowQualScore : 0 33 4 0 0 2222 5 666666666666666666 1 33333 00000000 5 44 5 4 88 0 0 22 5 2 0 777 0 1 1 66 777 4 2 2 00000 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7777 44 2222222 0 3 99999 5 1 5 0 99 5 0 0000 1 0 0 3333 000 88 55 1 3 0000000 6 3 0 7777 1 3 44 3 33333333333 3 0 44 44 1 1 2 0 999 5 7 77 3 0 4 4444 44 111 555555555555555555555555555555555555 44 555 44 55 5 44444444444 55 0 222 44 3 77777 11111 77 3 8 8888 88888888888 1 3333333333 3 1 5 33 99999999999999999999 1 1 0 1 2 00 1 888888888888888 2 2 2 33 0 33 22222222 2 2 1 7 3 1 1 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 1 3 0 4 0000000000000 8888 3333333333 66 11111 9999 1 0 888888888888888888888 1 11 1111 5 0 5 0 22 1 1 0000000000 1 5 1 77 6 666666666666 0 5 1 8888 11 000 1 3 11 0 0 44 3 1 9 3 0 33
lowQualScore : . .. . . . .... . .................. . ..... ........ . .. . . .. . . .. . . . ... . . . .. ... . . . ..... .................................................................... .... .. ....... . . ..... . . . . .. . . .... . . . .... ... .. .. . . ....... . . . .... . . .. . ........... . . .. .. . . . . ... . . .. . . . .... .. ... .................................... .. ... .. .. . ........... .. . ... .. . ..... ..... .. . . .... ........... . .......... . . . .. .................... . . . . . .. . ............... . . . .. . .. ........ . . . . . . . . ........................................................................ . . . . . ............. .... .......... .. ..... .... . . ..................... . .. .... . . . . .. . . .......... . . . .. . ............ . . . .... .. ... . . .. . . .. . . . . . ..
lowQualScore : 7 77 0 8 7 1111 7 777777777777777777 4 22222 88888888 0 88 0 5 66 1 2 00 0 6 1 888 8 9 0 11 888 4 2 6 66666 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555 55 5555555 0 4 44444 3 0 7 3 77 7 4 6666 4 5 8 2222 666 66 00 0 4 5555555 7 3 8 1111 6 3 66 3 66666666666 6 5 66 66 0 7 6 2 222 1 2 66 3 0 2 6666 66 777 111111111111111111111111111111111111 66 888 66 55 8 99999999999 44 2 333 66 3 77777 66666 55 1 5 0000 33333333333 4 6666666666 8 0 3 77 99999999999999999999 0 0 5 0 7 99 0 333333333333333 9 5 4 99 1 99 99999999 9 1 0 3 6 0 6 9 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 7 6 1 4 4444444444444 6666 1111111111 77 11111 4444 0 1 555555555555555555555 4 11 0000 7 4 7 4 00 0 0 3333333333 6 7 0 99 0 999999999999 8 0 0 0000 22 000 0 8 88 0 7 00 3 0 0 3 5 00
consensus : TAACGATCAAAN-GGANACAACTGT----AGTTGAA-TT--AA--T----AGA---GTTTACG---TATATATAA----T-AACGGTCAA-AGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTGTGAC---TTATAGTCNAT--AAT---GGTCAAAGG-GAAACAACTCTAGTTCAG--T--TGAA-------TTAT-ATGA-T---T--A---------------------TCGT-C----------------AAT----AATGGTCAAAGG-G---AAA-AACTNTA--GTTTAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATCTAA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAT--AA--T--GTNACNTATAGTCA------AT-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTTGA-A--TTA-TTG--CGAC-T-AT-AGTTAATAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGT--NACTTATAGTC-TA-T-AATGGTCAAAGG---GAA--AC---AA--------------T-AATT--TCTA----------G--TTCA---GT--T-NAANT-----ANTGT-ACCTATAGTTATT--A-ATGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAG--ATGAAC-T-ATTGTGACTT---ATAGTCCA---T----AATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-T---ANT-GTAA--C-T--ANAGTCANT-AATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTGTTACTTATAGTCT---AT-T---ATGGTCAA-AGGGAAATAAC--TCTAGTTCA--GTTGAATNA-----T-TGTGACTTATAGTCNA-T-AATGGTCAAAAGGAAACAACTCTNGTTCAGTT-------------GA-AANA-TTGTAACT--TTA---TC-AAA-----------AATAAT-A----A----GGTCAAAGGGAAATAACTCNAGTTCAG-TTGAANAT-TTGT-A-ACTAT--ATTT--TA---T-GATGGTCAAA-----G----GGAAATAACTCTNGTTCAGTTGAATTA---T---CT-AG---T-ATGACTTATAGTC--NAT-AATGGTC-AAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTGAC-A-TAT--TNAATAATGGTCAA-AGGGAAACAACTCTAGTTC--AGTTGAAATATTGTGACTTATAGTC--TTAATGGTCAAAGGGAAATAACTGTAGTTCAGAT--TGAAATATTG-T-ACCTATANNTA-ATAACGGTT-AAAG-GAAACAACTCTAATTC-AGTTGAATTATCNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAATGGTCAAAG-GGAAACAACTGT----AGTTGAA-TT--AA--T----AGA---GTTTACG---TATATNTAA----T-AACGGTCAA-AGGGAAATAACTCTAGTTCAGNNGA-ATTATTGTGAC---TTATAGTCNAT--AAT---GGTCAAAGG-GAAACAACTNTAGTTCAG--T--TGAA-------TTAT-GTGA-T---T--A---------------------TCGT-C----------------AAT----AATGGTCAAAGG-G---AAA-AACTCTA--GTTCAGTTGAAATANTG-TAAC-T-ATATCTAA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGNTGAAT--AA--T--GTNACGTATAGTCA------AT-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCAGTTGA-A--TTA-TTG--CGAC-T-AT-AGTTAATAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGT--AACTTATAGTN-TA-T-AATGGTCNAAGG---GAA--AC---AA--------------T-AATTA-TNTA----------G--TTCA---GT--T-NAAAT-----AGTGT-ACCTATAGTCANT--A-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAG--ANNAAT-T-ATTGTGACTN---ATAGTNCA---T----AATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTNGTT-CAGTTAAA--A-T---ANT-GTAA--C-T--ANANTTANT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTGTNACTTATAGTCT---AT-T---ATGGTCAA-AGGGAAATAAC--TCTAGTTCA--GTTGAATNA-----T-TGTNACTTATAGTCNA-T-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTT-------------GA-AANAANTGTAACT--TTA---TC-AAA-----------AATAAT-A----A----GGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAAAN-TTGT-A-ACTAT--GTTT--TA---T-NANGGTCAAA-----G----GGAAATAACTCTNGTTCAGTTGAATTA---TA--CTAAA---T-ATGACTNATAGTC--TNT-AATGGTC-AAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTNACGA-TAT--TAAATAATGGTCAA-AGGGAAACAACTCTNGTTC--AGTTGAAATATTGTGACTTATAGTC-ANTAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTNAG-T--TGAAATATTG-T-ACNTATANNTA-ATAACGGTTCAAAG-GAAATAACTCTAGTTC-AGTTGAATTATTGTGACATAT
gi|1 : CAACTCT----AGTTAAA-TT--TA--CCTTAAGA---CTT---G---T-TATCAAT----T-AATTGTCAATAAAGAAA---CCC-------GATGA-ATTCTTGTGACAACTCCAATTCAATTGAATTAAGGTAAAAGGTAAAACAACTTTTGATCACATT--TGAA-------CT-T-GTGACT---T--AAACCCTGGTTCAGCTGTACTCTTGT-G----------------AA-----AACGGTCAAAGG-G---AAACAACTATT--GTTTAATTGAACTTTTGATATT-T-AT-TCAAA----TAATAATCAAAGAAAAACAATTCGTGTTCAATC---T--AACTT--GTCACTTTTATTTA------ATTAA-CGATCAAACGGAAAC--------TTAA---AATTAA-C--CTT-TT-----AC-T--C-AATTAATAAT-----TAAAGGACAACAACCC--TAGTTCAGTTGAACT--TAT--GACTTACTATT-AA-T-ATTAGCCAAAGG---AAA--AT---AA--------------C-------TCTT----------G--TTCA---AAAAT-GAACT-----GGTG--ACATGTAATCAATTAA-ATA-TCAAAGGAAAACAAC-----TGAAGTTCAG--TTGAAC-T-CCCCTGACTT---ATAATCAA---T----AATGGCCACA-----G----TGAAA--ACATTA--T-AAATCAAA--A-TTCAATTTGCAA--T-TT-AAAATCAATTAATGGTCAAAGGAAAACAACTCTATTCCATTTGAAC--TTGAGGCTTTTAGTCA---AT-T---GAAATCAA-AGGAAAAAAAC--TC--ATT----ATTGAA-AAGAAACT-TGTGACTTGTTATCAATT-GATGGTCAAAAGG-AATAACTCTTGTTCAGT------------------AGAATTA-------TTC---TC----------------ATAGT-A----AT---GGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAG-ACGAACGT-ATGC-ATTCTATACACTT--CAATTT-AATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGTAAAGTT--------CT------T-----CTCGTAATC--AAT-AATGGTG-AAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGAC-A-TATAATCAAGAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG--ATTTCGCGATTTGTAATTAATTGATGATCAAATGGACACAACTCTGATTTAG-TTGTGCAATTTTG-TGACTGATA-ATATTTAATGGTTAAAAA-GAAGTAACTGTAATTCAAATTGAACT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAAC-GGAAAC------------TTAAAATT--AACCT-----------TTTACT---CA-AT-TAA----T-AA---TTAA-AGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGA-ACT--TATGAC---TTACTATTAAT--ATT---AGCCAAAGG-AAAATAACTCTTGTTCAA--AAATGAA-------CTG--GTGA-CA--T--G---------------------TAAT-C----------------AATTA--AATA-TCAAAGG-A---AAACAACTGAA--GTTCAGTTGAACTCCCC-TGAC-TTATAATCAA----TAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAA---AATTCAA--TTTGCAATTTAAAATCA------ATTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTTGA-A--CT---TG--AGGC-T-TTTAGTCAAT--TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGT--GACTTGTTATC-AA-TTGATGGTCAAAAG---GAA-----------------------T-AACTC-TT------------G--TTCA---GT--A-GAATT-----ATT----CTCATAGT------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAG--ACGAACGT-AT-GC-ATTCTATACACTTCAATTT----AATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-T---TCT--T----C-TC-GTAATCAAT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCA---AG-A---ATGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTTGATT-------T-CGCGATTTGTAATTAA-TTGATGATCAAATGGACACAACTCTGATTTAGTT-------------G--------TGCAATT--TTG---TG-ACT-----------GATAAT-ATTTAAT---GGTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC-T-TTAC-A-TTTAT--ATTTATTA---C-CAT--TCAAA-----G----GGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA---T-----------T-TTGACTT-TAGTC--AAT-GATGATC-GAAGGGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGAT-A-TAG--TAAAAAATAGTCAA-AGGGAAACTACTATAGTTC--AGATGAATTATAATGAATTATA---------------AAGGAAAATAACTGTAGTTCAGAT--TGAA-CATTA-C-ATTTGTAGTAA-ATGATGGT--AATGTGGAACAAATCTACTTC-AGTTTAATTATCTTGAttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-T---AAT-G--A--C-TT-ACAGTCTAT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCATTTTAAAAAGTGTAA-TTAT---CT---CT-TTAAAGGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-----T-GGTGACTTATAGTCTT-T-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTTGTTCAATT-------------GATAAT--GTGTAGTT--CTA---TCTGAA-----------AATA-T-------------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CTAT--ATTT--TA---A-AAATGTCAAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----------G---T-ATGACTTATAGTC--TAT-AATGTTT-AAATGAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAACTA-TAT--ATGATAACGTTTAA-AGGGAAACAACTCTAGTTC--AGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATtttgtagtcaatactggt
gi|11 : AATGG--TCAAAGGCAGATGACTC--CAGTTTAGTTGAATTATTGT--TACGTAGAGT--TATT-AATGATCGACGG---AAA--AT---AA--------------C-------TCTT----------G--TTCA---GT--TAGAAAT-----A-T-C-ACTTATAGTTTTT--A-ATCGTCAAAGGGAAATAAC-----TGTTGTTCAA--TTAAAA-T-GTTG---CTT---ATAGTCAA---T----AATGGTTAAA-----G----AG-AATAACTTTTATT-CAGTTGAA--T-T---AGT-GCCA--CGT--ATAGTTATT-AATGGTGAAAGGGAAATATCTCTAGTTCATTTGAATTGTTGTTAGGTACAGT-T---AT-TA--AAGGCCAA-AGGAAAATAAC--TGTTTTCCA--GTTAAA-AA-----A-TGTTACTGATAGTCTA-T-AAT-CTTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : tttttata----TAATGGTCATAGAGAAACAAATCTAGTTC----GAAA--AAG-T--CTAAC-CATA-TCATTTTTTAT-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATTGA-AAATCAGTTA--C--C-T--T-ATTTTATAAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGT--GACGTATAGTA-TA-T-AATGGTC----------A--AC---AA--------------T-AA----------------------------------------------TGT-AACTATAGCTTAT--A-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAG--ATGAAT-A-AGTATGCTTT---TTAGTCTA---T----ACTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A-----ATT-TGAG--T-T--GTTGTTAAT--ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGATTTAAAGTATTGTTACt
gi|13 : tAACATTTCTAGTT-TAA--AAA--A-TG--AAT-GCGAGAC-TTGAAATCAATT-TATTGTCAAAGTCAATCAGTTGTATTTCAGTTGAAC--TTGTT-----TCGTC----A------ATGGTCAA-AGGGAAATAAC--TCTTGTTTA--A--AAAAGAAAC--T-TATGACTTGTAATCAATT-TATGGTCAAAGGGAAACAACTATAGTTTAGTT--------------A-AACACTTGCGAC---TTA---T----A-----------AATAAT-A----A-------CAAA---------------TTTAG-TTAAGAAA-TTGC-A---------TTT--AA---TCGATAGTCATT-----G----GGAAACAACTCTGGTTTAATT
gi|14 : tcactaaatcaccTTGTTAC---T-ATATTTTAT--GAA---AGTCAAAAG-GAAAC--------TTTAG--T--TAAA-------TTG-------------------------------------CAT-A----------------AAT----AAGAACCAAA--------------TATA--GTTCAGTTGAAATAGTG-TAAC-T-ATATTTAA----TGGTGTTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATA-AA--A--ATGATTTATAGTCA------AC-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTTGA-A--TTA-TTA--ATACTT-AT-AGTAAATAATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGT--AGTTTATATTC-AA-T-AATGCTCAAAGG---AAA--AC---AA--------------C-------TGTA----------G--TTGA---GT--T-TAAAT-----AGTTT-A--------------A-ATAGTCAATGGGAAACAatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|15 : ACTGTTTTGAATCGAA-TA--AT--T----ACATTTGTTTATGAATTATAGTCCA----T-AGTGGTCAA-AGGGAAACGACTCTTGGTAAGTTAACAATATTATA-----TTATAATCAAT--AAT---GGTCAAAGG-GAAGCATCTCTAGTTTAG--T--TGAA-------ATAT-TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgttTATAGTCC------AT-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTTAACA--ATA-TTA--T-AT-T-AT-AATCAATAATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-T--GAC--ATATTC-TA-C-ATTGTTTCATCT---GAACTAC---AATCGTTTCCCTTTGGT-CATTT-TTTA----------GTATTCAATTGT--T-AAAATGAGAAAGCAT-AACTAT-GTC-TT--ATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAG--TTGAAC-T-ATTATGACcatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgtttatgaatGTT-CAATTAAA--T-A---ATT-GTTA--CGT--AAAACTATT-AATTATCAAAGGGATATAATACCAGTTCAGTTGAATTATTGTTACGTATAGT-T---AT-TA--AAGGTCAA-AGGGTATTAAC--TCTTTTCCA--GTTAAA--A-----A-TGTAACTGATAGTCTA-T-AATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAGAT-------------GA-aagttctgtta
gi|17 : aattaaccaaTCAAAATGGAATAAT-----TTTTATTCAG--TTGAAT-TTATTGTTATCT---TTAGT-CA---TTATTAATTGTAAAA-----T----GGAAATAGTTCTTGTT-CAGTTAAA--A-A---ATTGGTAC--T-T--ATTGTCGTT-AATGGTCAACGGAAAATAACTTGTGATCGGTTAAA--AATGATACTTATTGTC----AT-T----------------AATTAAC--ACTAGTTCT--GTTGAATTA-----T-TGTTACTttctttaacgtatagt
gi|18 : gtACTCTTGAT-CAGTTAAA--AAT---ATT----A--C-TT-ATAGTAATT-AATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAGTTAAA--AACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---ATCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTTGAATTA-----T-
gi|19 : cctatagttttacctA--T--GTTAC-TACAGTCA------TT-AA-TGGCCAAAGGGAAATAA----ATCTCGTTCAGTTGA-A--TTA-TTGTACGAC-C-A
gi|2 : acTAATGGTCAAAG-GGATACAACTGT----AGTTGAA-TTTAAA--T----AGA---GTTTATA---TATATATAA----T-AACTGTTAA-AGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGAC---TTATAGTCTAT--AAT---GGTCAAAGG-GAAACTATTATAGTTCAA--T--TTAA-------TTATCATGAAT---T--A---------------------TCGT-C----------------AAT----AATTATCAAAAA-G---AAA-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCATATGAAT--AA--T--GTGACATATAGTCA------AT-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTGGA-A--TTA-TTA--CGAC-T-AT-AGTTAATAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTAT--AGCTTATAGTA-TA-T-AATGGTGTAAGA---GAA--AC---AAAA------------TGAATTAATGTA----------G--TTGA---GT--T-TAAAT-----AGTGT-ATCTATATTTAAT--A-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAG--AACAAT-T-ATTATGACTA---ATAGTACA---T----AATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-T---AGT-GGAA--C-T--AAATTTAAT-AATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAGTTGAATTATTATGACTTATAGTCT---GT-T---ATTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTTGAATAA-----T-TGGGACTTAGAGTCTA-C-AATGGTCGAAAGGAAACAAATGTAGTTCAATT-------------GA-AAGAAGTGTAACT--TTA---TC-AAA-----------AATAATGA----A----GATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAAAT-TTGT-A-ACTAT--GTTT--TA---T-GAAGGTCAAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACGACTAATAGTC--TGT-AATCGTG-AAATGGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAACGA-TAT--TAAATAATGGTCAA-AGGGAAACAACTCTAGTTC--AGTTGAAATATTATGGCTTATAGTC-TTTAATGGTCAAAGGGAAACAACTGTAGTTAAG-T--TTAAATATTG-T-ATCTATATCTA-ATAACGGTTCAAAG-GAAACAACTCTAATTC-AGTAGAATTATTATGATTTATgatataaatgg
gi|20 : TCGGTTAAA--AATGATACTTATTGTC----AT-T---A-------------ATTAAC--ACTAGTTCT--GTTGAATTA-----T-TGTTACTTAT
gi|20 : gtgaAACACTAGTTCTGTTGAATTATTGTTACTTAT
gi|22 : gtgatcggttaaaaatgatacttattgtcattaattAGTAGAATCATTGTTACGAATAT--TTATTAATGGTTTA-AGTGAAATAACTCTTGTTC--TGTT
gi|3 : tTGT----ATTTGAA-TT--AT--T----G-------CTACG---TATATA-AA----TCAACGGTCAA-ATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTA-AAAAT-GTAAC---TGGTAGTCATT--AAT---GGTCAAAGG-GAAATAACTCCATTTCAG--T--TGAA-------TTAT--TG--T---T--A----------------------CGTAT----------------AATTATAAATGAACAAAGTTG---AAT-AACTCTTTTGTTCAGTTGAATTATTG---A--T-ATATATAGGCATTAATGGTCAAAGGGAATTACCTCTTGTTCAGTTAAA---AA--T--GTAACTTATAG-AA------AT-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTTGA-A--TCA-TTG--TTAC-TTAT-AGTTCTAAATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAACTTATATTCGTA---AATGGTCCAAGG----AA--AG---AA--------------C-A------CTA----------G--TTCA---GT--T-TAATT-----ATTGTTATGTATAGTTATT--A-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAG--A--------ATTGTAACTG---ATAGTCTA---T----AATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-T---TTT-TTTA--CGT--ATAGTTATT-AATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAGTTGAATTATTGTTACTTATAGTC----AT-TA--ATGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-TGAA--A-----T-TG-----TATAGTCAT-T-AATGGTCAAAGTGAAAAATTTCTTGTTTAGTTCTATTATTGTTACGT-AATA--TATAAAT--TAATGGTC-AAATGCCAATAATTAATAAT-A----ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAG-TTCAATTA-TTGT-----TAC--GTAT--TG---T-TAT----AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTA---T-----------T-GTTACTTATAATCATTATGAATGGTC-AAAGGGAAATAACTa
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttg-GGATACAACTGT----AGTTGAA-TTTAAA--T----AGA---GTATATA---TATATATAA----T-AACTGTTAA-AGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGAC---TTATAGTCTAT--AAT---GGTCAAAGG-GAAACTATTATAGTTCAA--T--TTAA-------TTATCATGAAT---T--A---------------------TCGT-C----------------AAT----AATTATCAAAAA-G---AAA-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCATATGAAT--AA--T--GTGACATATAGTCA------GT-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTGGA-A--TTA-TTA--CGAC-T-AT-AGTTAATAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTAT--AGCTTATAGTA-TA-T-AATGGTGTAAGA---GAA--AC---AAAAT-----------T-AATTAATGTA----------G--TTGA---GT--T-TAAAT-----AGTGT-ATCTATATTTAAT--A-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAG--AATAAT-T-ATTATGACTA---ATAGTACA---T----AATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-T---AGT-GGAA--C-T--AAATTTAAT-AATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAGTTGAATTATTATGACTTATAGTCT---GT-T---ATTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTTGAATAA-----T-TGGGACTTAGAGTCTA-C-AATGGTCAAAAGGAAACAAATGTAGTTCAATT-------------GA-AAGAAGTGTAACT--TTA---TC-AAA-----------AATAATGA----A----GATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAAAT-TTGT-A-ACTAT--ATTT--TA---T-GAAGGTCAAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA---GC--CTAA
gi|5 : T--AG--T--GTTTCGTCTAGTTA------TT-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTTGA-A--TTA-TTG--TAACGC-AT-AGTTGGTAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGT--TACGTAGA-TT-TA-TGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA--------------T-CATTA-TTTAAATTAACTCAG--TTCA---GT--T-AGATT-----ATTGTTACGTGGAACTATT--A-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAA--GTGAAC-T-ATTGTTACGT---AAAGTA-A---TC---AAACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A-----AAT-GTAA--C-TG-ATAGTCTAT-AATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAGcctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatT--AG--T--GTTTCGTCTAGTTA------TT-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTTGA-A--TTA-TTG--TAACGC-AT-AGTTGGTAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGT--TACGTAGA-TT-TA-TGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA--------------T-CATTA-TTTAAATTAACTCAG--TTCA---GT--T-AGATT-----ATTGTTACGTGGAACTATT--A-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAA--GTGAAC-T-ATTGTTACGT---AAAGTA-A---TC---AAACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A-----AAT-GTAA--C-TG-ATAGTCTAT-AATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAGa
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAG--ATAAAT-T-ATTGT-------------------T----AAAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-C---ATG-GTA---C-T--AAAGTTATT-AATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAGTTGAAGTATTGTAACGTATAG-CT---ATAC---ATGATCAA-A---------C--TCTTGTTAA--TTTAAA-AA-----TATTTCA-TAATA-TCAT-T-AATGGTCAAAAGGAAATAACTAGTGTTCAGGT-------------GA-ATTG-TTGTTACT--TGAAG-TC-ATA-----------AAT--T------------GTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAATATATTAT-T-AATA---GTCA--T----T-GATGATCGAA-----G----GGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------------AA---TGATG-TTTATAGTC--ATT-AATGATC-AAAGGGAAATAACTCTAGTTCAATTGAATTATTGTAA---------------ATGTTCAA-AGAGAAATAACTCTTGTTT--AGTTAAAACAT-GTTTCT-ATAGTC-ATTAATGGCCAAAGAGAAATAACTCCAGTTCAG-T--TAAACTATTGTT-ACCTA
gi|8 : ATG---TATATATAGTCATT-AACGGTGAA-AGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAA-ATTACTGTAAC---TTATAGT-TAT--AAT---GGTCAAATG-CAAATAATTCCAGTTCAG--T--TGAA-------TTAT--TAA-TAGGT--A---------------------TAGT-C----------------ATT----AATGGTCAATGG-GGAAAAA-AACTTTT--GTTTAGTTGAATTATTG-TTACGT-ACATTTAT----TAATGGCCTAATGATAATAACGCTTGTT-AGTTAAAA--AA--T--GTTACTTATAGGCA------TT-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTTTA-A--TTA-TTG---------------TCAT--TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGT--TACGTATAGTT-AA-T-ACTGGTCAAAGG---GAA--AC---AA--------------C-------TCTT----------G--TTCA---GT--T-GAATT-----ATTGTCACCTATAGTCATT--A-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGTTAGAAA------TGTTACTT---ATAGTCAA---T----AAT
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAATTGAATTAGTGTGACTAATAGTAT---GT-T---ATGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTTGAATAA-----G-TGTTACTTATAGTGAA-T-AATGGTCAAAGGGAATCAACTTTAGTTCAGTT-------------TT-ATTA-TTTTGACTGATTG---TT-AAA-----------AAT--------------GGTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAAAA-ATGTGA-A--AT--AATC--AG---T-AATGGTCAAA-----G----GGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---T------AG---T-GTGACTAATAGTT--TAT-AATGATCAAAAAGGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGACTA-TAA--TCAATAATGGTCGA-AGACAAACTACTCTAGTTC--CGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA--GAAAATAACTGTAGTTCTGAT--TGA---ACTG-T-ACAT-TAAATA-AT
gi|9 : TAATGATCAAAAAGGAAACAACACA----AGTTCGA-TT--GA--A----AAA---TTTGAC----TATAATCAA----T-AATGGTCGA-AGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGA-AATATTGTGAC---TTAT--TCGA-----------------G-AAAATAACTGTAGTTCTGA-T--TGAACTGTACATTAA-ATAA-T---TCCA---------------------CTGT-TTACTTTGTAACTTAAAAAT----AATGGTCATATG-G---AAA-AA----A--GTATAGTTGAAtccactgtttactttgtaacttaaaaataatggtcatatggaaaaaagtatagttgaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 11 1 1111 44444444444444 111111111 22222222222222222 1111111111 55555555555555555555555555 11 11111111111111 11111 33333333333333 22222222 1111 111111 11111111 2222222222 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111111 11111111111 1111111111 222222222222222222222 111 22 2222222 11 55555555555 555555555555555 111111 77777777777777777777 111 1111 2222222222 333333333333333333333 3333 2222222222222 111 1 22 2 1 1111
lowQualScore : 0 11 0 2 4444 00000000000000 5 5 777777777 5 22 1 4 1 7 0 0 3 4 4 55 88888888888888888 1 4444444444 33333333333333333333333333 4 00 99999999999999 00000 777 2 44 777 55555555555555 4 00000000 8888 1 1 1111 555555 2 1 11111111 3 3 7777 2 0 3 44 3 0000000000 3 44 44 3 2 0 555 77 6 777 3 2 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 555 44 2 555555555555 2 2 555 5 2 0 77777 88888 55 8 555 77777777777 5 1111111111 0 5 444444444444444444444 1 1 1 0 33 4 77777 3 555 6 3 0 3 44 44 33 88 4 55 1 4 55 44 1 1111111 1 66 33 66 5 22222222222 444 55 222222222222222 777777 1 0 0 1 0 55555555555555555555 5 5 000 1 888 0000 5555555555 0 9999 1 5 555555555555555555555 5 1 55 3 44 6666 6 2 7777777777777 666 2 6 22 6 5 2 00 0 0 0 7777 9 33
lowQualScore : . .. . . .... .............. . . ......... . .. . . . . . . . . . .. ................. . .......... .......................... . .. .............. ..... ... . .. ... .............. . ........ .... . . .... ...... . . ........ . . .... . . . .. . .......... . .. .. . . . ... .. . ... . . . ....................................................... .. ... .. . ............ . . ... . . . ..... ..... .. . ... ........... . .......... . . ..................... . . . . .. . ..... . ... . . . . .. .. .. .. . .. . . .. .. . ....... . .. .. .. . ........... ... .. ............... ...... . . . . . .................... . . ... . ... .... .......... . .... . . ..................... . . .. . .. .... . . ............. ... . . .. . . . .. . . . .... . ..
lowQualScore : 7 00 8 5 2222 22222222222222 3 7 444444444 7 44 0 4 0 3 5 8 5 9 0 55 00000000000000000 1 4444444444 77777777777777777777777777 4 11 33333333333333 33333 222 6 44 888 22222222222222 4 33333333 5555 0 6 3333 666666 2 0 77777777 3 3 1111 3 7 3 66 3 2222222222 1 22 66 1 6 2 222 11 6 444 1 3 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99 000 99 0 555555555555 4 9 000 3 9 3 77777 55555 77 5 888 22222222222 1 4444444444 8 3 222222222222222222222 9 0 4 2 11 1 00000 3 888 7 3 4 3 66 66 22 88 0 55 0 0 55 66 0 0000000 2 99 88 99 0 44444444444 666 11 111111111111111 666666 1 8 5 0 2 77777777777777777777 7 7 000 0 000 9999 9999999999 1 0000 0 4 222222222222222222222 3 7 66 9 44 1111 7 5 2222222222222 000 2 7 00 0 0 0 88 0 0 8 8888 2 00
consensus : TAACGATCAAAN-GGATACAACTGT----AGTTGAATT--AA--TAGA---GTTTACGTATATAT-A----A----T-AACGGTCAAAGGCAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTGTGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCA-----G-T--TGAATTAT--ATGA-T-TAT-GT-CAAT----A-ATGGTCAAAGG-G---AAA-A--ACTNTA--GTTCAG--TTGAANTANTG---TAA------------C-T-ATA-TCT----AA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-T-AA-TGTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTTGA-A--TTA-TTGCGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTC-TA-T-AATGGTCAAAGG---GAA--A---C--AA---T---------AATT---TC---------------TAG--TTCA---GTT-GAANT-----ATTG-T-ACCTATAG-T---TATTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA--T-GAAC-TATTGTGACT---TATAGT--CCA---T--AATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANT----G-TAAC-T-ATAGTCANTAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTATTGTTACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTTGAATAATTGNGACTT-ATAGT--CNAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTGA-AN-TATTGTAACT--T--TA--TC-AAAAATAAT-A----A-GGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAA--T-ANTGTGACT-ATANTNA--A------T-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTNTAGTTCAGA-TTGAAATA---TTG-T-ACTTGTAATTAATTGATGGTC-AAA-G-GAAACAACTCTAATTCAGTTG---AATTATTGTGACTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGATCAAAN-GGANACAACTGT----AGTTGAATT--AA--TAGA---GTTTACGTATATAT-A----A----T-AACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTGTGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCA-----G-T--TGAATTAT--ATGA-T-TATCGT-CAAT----A-ATGGTCAAAGG-G---AAA-A--ACTNTA--GTTTAG--TTGAANTANTG---TAA------------C-T-ATA-TCT----AA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-T-AA-TGTNACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTTGA-A--TTA-TTGCGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTC-TA-T-AATGGTCAAAGG---GAA--A---C--AA---T---------AATT---TC---------------TAG--TTCA---GTT-NAANT-----ANTG-T-ACCTATAG-T---TATTA-ATGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA--T-GAAC-TATTGTGACT---TATAGT--CCA---T--AATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANT----G-TAAC-T-ANAGTCANTAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTATTGTTACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAATAAC--TCTAGTTCA--GTTGAATNATTGTGACTT-ATAGT--CNAT-AATGG--TCAAAAGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTGA-AA-NATTGTAACT--T--TA--TC-AAAAATAAT-A----A-GGTCAAAGGGAAATAACTCNAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTNGTTCAGTTGAATTA-TCTAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGGTC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAA--T-ANTGTGAC--ATATTNA--A------T-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAAATA---TTG-T-ACCTATANNTAA-TAACGGTT-AAA-G-GAAACAACTCTAATTCAGTTG---AATTATCNTGATTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTA-CCT--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCA-----A-T--TGAATT--------------------------A-A-GGTAAAAGG-T---AAA-ACAACTTTT--GATCACATTTGAACTTGTGACTTAAACCCTGGTTCAGC-T-GTACTCTTGTGAA-----AACGGTCAAAGGGAAACAACTATTGTTTAA--TTGAACT----TTTGATATTTATTCA------AAT-AA-TAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATCTA-A--CT---TGTCAC-T-TTTATTTAATTAACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAAT----TA--ACCTTTTACTC-AA-TTAATAATTAAAGG--------A---C--AA---C---------AACC----C---------------TAG--TTCA---GTT-GAACT-----TATG---ACTTACTA-T---TAATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAAT-GAAC-TG--GTGACA---TGTAAT--CAA---TTAAATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTTGAA--C-TCCC----C-TGAC-TTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT--TGCAATTTAAAATCA---AT-T---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTTGAAC--TTGAGGCTT-TTAGT--CAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAGA-AA-C-TTGTGACT--TGTTA--TC-AAT--TGAT--------GGTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAGAATTAT-T------CTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC-------G---------T-ATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT--AAAGTT-CTTCT--C--GTAATCA--A------T-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG--ATT---TCG-CGATTTGTAATTAATTGATGATC-AAATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAAC-GGA---AACT-T----AA---AATT--AACCT-------TTTACTCA-AT-T-A----A----T-AA---TTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGA-ACT--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCA-----A-AAATGAACTG---GTGA-CATGTAAT-CAATTA--A-ATA-TCAAAGG-A---AAACA--ACTGAA--GTTCAG--TTGAACTCCCC---TGA------------C-TTATA-ATC----AA----TAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAA-T-T--TGCAATTTAAAATCA------A-TTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTTGA-A--CT---TGAGGC-T-TTTAGTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGTG--AC-TTGTTATC-AA-TTGATGGTCAAAAG---GAA--------------T---------AACT----C---------------TTG--TTCA---GTA-GAATT-----ATT-----CTCATAG-T-------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA--C-GAACGTAT-GC-ATTCTATACACT--TCAATTT--AATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-TTCTTCTCG-TAA--------TCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTTCTGTGACATATAATCA---AG-A---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTTGATT--TCGCGATTT-GTAAT--TAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTG--------TGCAATT--T--TG--TG-ACTGATAAT-ATTTAATGGTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC--T-TTAC-ATTT-ATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA-TTT--------------TG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAA--T-AGTGTGAT--ATAGTAA--A------A-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA-CA---TTA-C-ATTTGTAGTAAA-TGATGGT--AAT-GTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-TAAT----G---AC-TTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAAGTGT-AATTAT---CT---CT-TTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATATGGTGACTT-ATAGT--CTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTGATAA-TGT-GTAGTT--C--TA--TCTGAAAATA-T----------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CT-ATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----G---------T-ATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAA--T-AGTGTAACT-ATATATG--A------T-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : -AATGG--TCAAAGGCAGATGACTC--CAGTTTAGTTGAATTATTGTT--AC-GTAGAGT--TATT-AATGATCGACGG---AAA--A---T--AA----------------C---TC---------------TTG--TTCA---GTTAGAAAT-----AT---C-ACTTATAG-T---TTTTA-ATCGTCAAAGGGAAATAAC-----TGTTGTTCAAT--T-AAAA-TGTTG---CT---TATAGT--CAA---T--AATGGTTAAA-----G----AG-AATAACTTTTATT-CAGTTGAA--T-TAGT----G-CCACGT-ATAGTTATTAATGGTGAAAGGGAAATATCTCTAGTTCAT--TTGAATTGTTGTTAGGTACAGT-T---AT-TA--A-AGGCCAA-AGGAAAATAAC--TGTTTTCCA--GTTAAA-AAATGTTACTG-ATAGT--CTAT-AAT-C--TTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : tttttata----TAATGGTCATAGAGAAACAAATCTAGTTC------GAA-A-AAGTCTAACC-ATA-TCATTTTTTA-T-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATTGA-AAATCAGTTAC--C-T--T-ATTTTAT-AAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGTG--AC-GTATAGTA-TA-T-AATGGTC----------A--A---C--AA---T---------AA--------------------------------------------------TG-T-AACTATAGCT---TA-TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA--T-GAAT-AAGTATGCTT---TTTAGT--CTA---T--ACTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A--ATT----T-GAGT-T-GTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTATTGTTACt
gi|13 : tAACATTTCTAGTTTAA--AAAA--TGAATGCGAG--AC-TTGA--AATCAATT-TATTGTCAAAGTCAATCAGTTGTATTTCAGTTGAACT----TG--TT-TCGTC----AATGGTCAA-AGGGAAATAACTCTTGTTTAAA----AAAGAAACTTA-TGACTTGTAATCAATTTATGGTC-AAAGG-GAAACAACTATAGTTTAGTTA---AACACTTGCGACTTAT
gi|13 : tcactaaatcaccGTCAAAGTCAATCAGTTGTATTTCAGTTGA-ACT----TG--TT-TCGTC----AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCTTGTTTAAAAAAG-----AAACT-T--ATGACT-TGTAAT-CAAT----TTATGGTCAAAGG-G---AAACA--ACTATA--GTTTAG--TTAAACACTTG---CGA------------CTT-ATA--------AA----TAAT-----------AACAAATTTAGTTAAG----AAA-T----TG---CATTTAATCG------A-T-A----GTCATTGGGAAACAA----CTCT-----GGTTTA-A--TTA-T--CGA--T-AA-AATTAAG-AAAGT--TTAAAAGGaaataataacaaatttagttaagaaattgcatttaatcgatagtcattgggaaacaactctggtttaattatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|14 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattTTGTTACT-ATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTA-----G-T--TAAATTGC--ATAA------------AT----A-AGAACCAAA----------------TATA--GTTCAG--TTGAAATAGTG---TAA------------C-T-ATA-TTT----AA----TGGTGTTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-TAAA-AATGATTTATAGTCA------A-C-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTTGA-A--TTA-TTAATACTT-AT-AGTAAAT-AATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGTA--GT-TTATATTC-AA-T-AATGCTCAAAGG---AAA--A---C--AA----------------C---TG---------------TAG--TTGA---GTT-TAAAT-----AGT-------------T---TA--A-ATAGTCAATGGGAAACAccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|15 : ACTGTTTTGAATCGAATA--AT--TACATTTGTTTATGAAT-TAT-AGTCCA----T-AGTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTTAACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTA-----G-T--TGAAATAT--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-TATGAATTATAGTCC------A-T-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTTAACA--ATA-TTAT-AT-T-AT-AATCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-TG--AC---ATATTC-TA-C-ATTGTTTCATCT---GAACTA---C--AA---T---------CGTT---TCCCTTTGGTCATTTTTTAGTATTCAATTGTT-AAAATGAGAAAGCA-T-AACTAT-G-T---C-TTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT--T-GAAC-TATTATGACcatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttGTT-CAATTAAA--T-AATT----G-TTACGT-AAAACTATTAATTATCAAAGGGATATAATACCAGTTCAG--TTGAATTATTGTTACGTATAGT-T---AT-TA--A-AGGTCAA-AGGGTATTAAC--TCTTTTCCA--GTTAAA--AATGTAACTG-ATAGT--CTAT-AATAC--ACAAAAGGAATTATCAC-TAGTTCAGATGA-aagttctgtta
gi|17 : aattaaccaa--AA---T---------AATT---TT---------------TA---TTCA---GTT-GAATTT----ATTG-TTATCTTTAG-TCATTATTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT--T-AAAA-AATTGGTACT---TATTGT--CGT---T--AATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTTAAA-----AAT----GATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTATTGTTACTttctttaacgtatagt
gi|18 : gttcaaaatggACTCTTGAT-CAGTTAAA--AATATT--------AC-TTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--AACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTTGAATTAT
gi|19 : cctatagttttacctT----G-TTAC-T-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTATTGT
gi|19 : acaTGTT--AC-T-ACAGTC-AT-T-AATGGCCAAAGG---GAA--A---T--A--------------AATC---TC-----------------G--TTCA---GTT-GAATT-----ATTG-T-ACGACCAG-A---TATAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAG-GGATACAACTGT----AGTTGAATTTAAA--TAGA---GTTTATATATATAT-A----A----T-AACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCA-----A-T--TTAATTATC-ATGAAT-TATCGT-CAAT----A-ATTATCAAAAA-G---AAA-A--ATTCTA--GTTTAC--TTGAAATAGTG---TAA------------T-T-ATA-TCT----AA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCAT--ATGAA-T-AA-TGTGACATATAGTCA------A-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTGGA-A--TTA-TTACGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTA-TA-T-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAA---TG--------AATTAA-TG---------------TAG--TTGA---GTT-TAAAT-----AGTG-T-ATCTATAT-T---TAATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA--A-CAAT-TATTATGACT---AATAGT--ACA---T--AATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-TAGT----G-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTATTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTTGAATAATTGGGACTT-AGAGT--CTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTGA-AAGAAGTGTAACT--T--TA--TC-AAAAATAATGA----A-GATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAA--T-AGTGCAACG-ATATTAA--A------T-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTAAG--TTTAAATA---TTG-T-ATCTATATCTAA-TAACGGTTCAAA-G-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTTAAA--A---AT----GATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTATTGTTACTTAT
gi|22 : gAG--TAGAATCATTGTTACGAATA-TTT---AT-T---AATGGTTTA-AGTGAAATAAC--TCTTGTTCT--GTT
gi|3 : tTGT----ATTTGAATT--AT--TG-------CTACGTATATA--A----A----TCAACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTA-AAAAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCA-----G-T--TGAATTAT---TG--T-TA-CGTATAATTATAA-ATGAACAAAGTTG---AAT-A--ACTCTTTTGTTCAG--TTGAATTATTG-----A--------------T-ATA-TAT----AGGCATTAATGGTCAAAGGGAATTACCTCTTGTTCAG--TTAAA---AA-TGTAACTTATAG-AA------A-T-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTTGA-A--TCA-TTGTTAC-TTAT-AGTTCTA-AATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA---AATGGTCCAAGG----AA--A---G--AA---C---------A-------C---------------TAG--TTCA---GTT-TAATT-----ATTG-TTATGTATAG-T---TATTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA----------ATTGTAACT---GATAGT--CTA---T--AATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-TTTT----T-TTACGT-ATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTATTGTTACTTATAGTC----AT-TA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-TGAA--ATTG-----T-ATAGT--CATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTCT-AT-TATTGTTACG--TAATA--TA-TAAATTAAT--------GGTCAAATGCCAATAATT-------------AAT-A------------ATA------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA-T-------------T-GTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAAT--T-ATTGTTACTTATAATCATTA------TGAATGGTCAAAGGGAAATAACTa
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttg-GGATACAACTGT----AGTTGAATTTAAA--TAGA---GTATATATATATAT-A----A----T-AACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCA-----A-T--TTAATTATC-ATGAAT-TATCGT-CAAT----A-ATTATCAAAAA-G---AAA-A--ATTCTA--GTTTAC--TTGAAATAGTG---TAA------------T-T-ATA-TCT----AA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCAT--ATGAA-T-AA-TGTGACATATAGTCA------G-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTGGA-A--TTA-TTACGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTA-TA-T-AATGGTGTAAGA---GAA--A---C--AAAATT---------AATTAA-TG---------------TAG--TTGA---GTT-TAAAT-----AGTG-T-ATCTATAT-T---TAATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA--A-TAAT-TATTATGACT---AATAGT--ACA---T--AATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-TAGT----G-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTATTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTTGAATAATTGGGACTT-AGAGT--CTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTGA-AAGAAGTGTAACT--T--TA--TC-AAAAATAATGA----A-GATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-
gi|5 : -T-AG-TGTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTTGA-A--TTA-TTGTAACGC-AT-AGTTGGT-AATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TT-TA-TGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCC--AA---TCATTATTTAAATTAACTC----------------AG--TTCA---GTT-AGATT-----ATTGTT-ACGTGGAA-C---TATTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG--T-GAAC-TATTGTTACG---TAAAGTAATCA------AAC-GTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AAT----G-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--gcctaacctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-T-AG-TGTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTTGA-A--TTA-TTGTAACGC-AT-AGTTGGT-AATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TT-TA-TGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCC--AA---TCATTATTTAAATTAACTC----------------AG--TTCA---GTT-AGATT-----ATTGTT-ACGTGGAA-C---TATTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG--T-GAAC-TATTGTTACG---TAAAGTAATCA------AAC-GTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AAT----G-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAGA--T-AAAT-TATTGT---------------------T--AAAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-CATG----G-TA-C-T-AAAGTTATTAATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAG--TTGAAGTATTGTAACGTATAG-CT---ATAC---A-TGATCAA-A---------C--TCTTGTTAA--TTTAAA-AAT----ATTTCATAATATCATT-AATGG--TCAAAAGGAAATAACTA-GTGTTCAGGTGA-AT-TGTTGTTACT--T--GAAGTC-ATAAAT--T---------GTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAAT-ATATTAT-TA---ATAGTC--ATTGATGATCGAAGGGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------AA---------TGATG--TT-TATAG---TCATT--AATGATC-AAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTCAATTGAAT--T-ATTGTAA----------------------ATGTTCAAAGAGAAATAACTCTTGTTTAGTTAAAACAT-GTTTCT-ATAGTCAT-TAATGGCCAA-AGAGAAATAACTCCAGTTCAG--TTAAACTA---TTGTT-ACCTA
gi|8 : ATGTATATAT-A----GTCATT-AACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAA-ATTACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCA-----G-T--TGAATTATTAATAG-G-TATAGT-CATT----A-ATGGTCAATGG-GGAAAAA-A--ACTTTT--GTTTAG--TTGAATTATTG---TTA------------CGT-ACA-TTT----AT----TAATGGCCTAATGATAATAACGCTTGTT-AG--TTAAA-A-AA-TGTTACTTATAGGCA------T-T-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTTTA-A--TTA-TTG-------------TCAT---TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGTT--AC-GTATAGTT-AA-T-ACTGGTCAAAGG---GAA--A---C--AA----------------C---TC---------------TTG--TTCA---GTT-GAATT-----ATTG-TCACCTATAG-T---CATTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT--TAGAAA-TGTT---ACT---TATAGT--CAA---T--AAT
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTAGTGTGACTAATAGTAT---GT-T---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTTGAATAAGTGTTACTT-ATAGT--GAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTTT-AT-TATTTTGACTGAT--TG--TT-AAAAAT-----------GGTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAA-AA-ATGTGAA---ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---TAG---------T-GTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA----AATTTGACT-ATAATCA--A------T-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTCTGA-TTGA---A---CTG-T-ACAT-TAAATAA-T
gi|9 : TAATGATCAAAAAGGAAACAACACA----AGTTCGATT--GA--AAAA---TTTGAC-TATA-ATCA----A----T-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGA-AATATTGTGACTTAT--TCGA---------------GAAA-----------------ATAACTGTAGTTCT-----GAT--TGAACTGT--AC-A-T-TA------AAT----A-AT--TC--------------C--ACT-----GTTTAC--TT-------TG---TAA------------CTT-AAA--------AA----TAATGGTCATATGGAAAAAAGTATAGTTGAA--TTtccactgtttactttgtaacttaaaaataatggtcatatggaaaaaagtatagttgaatt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111 4444444444444 222222222 33333333333333333 777777777777777777777777777 1111111 111 111 33333333333333 1111 1111 1111 111111 11111111 2222222222 1 1111 111 88888888888888888888888888888888888888 111 111111 11111111111 22222222222222222 111 2222 444444444444444444444444444 555555555555555 111111 555555555555555555 111 2222222222 111111 3333333 11 22222 55555555555555555555 111 11 1 1111 1 111
lowQualScore : 1 7 7777 22 4444444444444 0 111111111 6 33 2 2 0 1 5 1 5 0 11 5 66 55555555555555555 3 66 555555555555555555555555555 999 8888888 8888 1 000 888 1 1 000 0 66666666666666 5 5 0 2222 0000 0 0 0000 222222 1 1 33333333 3 3 0 7777 1 1 3 55 3 1111111111 0 3 44 44 3 2 0 555 77 6 777 5 3 5555 44 000 44444444444444444444444444444444444444 33 444 44 9999999 0 666 3 2 444 00 2 66666 111111 88 7 33 555 55555555555 2 4 8888888888 33 5 99999999999999999 1 0 33 1 444 7 8888 3 777 3 3 1 55 55 3 999 6 4 55 1 4 55 1 66 1 2 99999 0000 1 999999999999999999999999999 333 4 222222222222222 777777 1 0 0 0 555555555555555555 5 5 5 000 1 888 9999 5555555555 0 1 0 999999 888888 5 1 1 7 5555555 88 1 88 0 22222 88888888888888888888 1 777 33 0 2 5555 0 2 2 0 33 777 7 3 0
lowQualScore : . . .... .. ............. . ......... . .. . . . . . . . . .. . .. ................. . .. ........................... ... ....... .... . ... ... . . ... . .............. . . . .... .... . . .... ...... . . ........ . . . .... . . . .. . .......... . . .. .. . . . ... .. . ... . . .... .. ... ...................................... .. ... .. ....... . ... . . ... .. . ..... ...... .. . .. ... ........... . . .......... .. . ................. . . .. . ... . .... . ... . . . .. .. . ... . . .. . . .. . .. . . ..... .... . ........................... ... . ............... ...... . . . . .................. . . . ... . ... .... .......... . . . ...... ...... . . . . ....... .. . .. . ..... .................... . ... .. . . .... . . . . .. ... . . .
lowQualScore : 0 3 0000 22 8888888888888 7 888888888 7 55 2 5 7 7 7 0 0 1 22 0 99 00000000000000000 6 99 666666666666666666666666666 444 6666666 0000 0 000 666 0 0 000 3 77777777777777 7 7 4 1111 6666 5 8 8888 555555 2 0 55555555 6 6 4 7777 2 6 6 00 6 2222222222 5 3 66 66 1 6 2 222 11 6 444 4 6 3333 22 888 00000000000000000000000000000000000000 77 444 33 6666666 1 111 9 5 444 77 5 22222 444444 00 7 77 000 99999999999 9 7 1111111111 33 0 99999999999999999 0 2 11 2 444 5 9999 6 333 6 6 2 00 00 6 111 3 0 55 0 0 55 4 33 0 7 00000 1111 8 111111111111111111111111111 111 4 111111111111111 666666 1 8 5 2 333333333333333333 7 7 7 000 0 000 3333 9999999999 6 0 7 000000 666666 7 0 7 8 5555555 88 0 66 8 66666 00000000000000000000 2 555 00 0 5 0000 0 5 5 8 55 555 3 7 7
consensus : TAACGGTCAAANGGATACAACTGT----AGTTGAATTTAAA--TAGA---GTTTACGTATATATA----A----T-AACGGTTAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCCAGTTCAGT--TGAATTAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT----AATGATCAAAGG-G---AAA-A--ACTCTN--GTTCAG--TTGAANTAGTG---TAA------------C-T-ATA-TCT----AA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-T-AA-TGTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTTGA-A--TTA-TTGCGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTC-TAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC---------------TAG--TTCA---GTT-GAATT-----ATTG-T-ACNTATAG-T---TATTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CT---TATAGT--CNA---T--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCANTAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--T-ATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATTG---------------T-AT-TTGTAACT---AATTGATGG-TCA-AN-G-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGATCAAANGGATACAACTGT----AGTTGAATT--AA--TAGA---GTTTACGTATATATA----A----T-AACGGTCAAAGGCAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTGTGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAATTAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT----AATGGTCAAAGG-G---AAA-A--ACTNTA--GTTCAG--TTGAANTANTG---TAA------------C-T-ATA-TCT----AA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-T-AA-TGTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTTGA-A--TTA-TTGCGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTC-TAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC---------------TAG--TTCA---GTT-GAANT-----ATTG-T-ACCTATAG-T---TATTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CT---TATAGT--CCA---T--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCANTAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCNAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTAACT--T--T-ATC-AAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTGAC-T-ATANTNA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTNTAGTTCAGA-TTGAA----ATATTG---------------T-AC-TTGTAATT---AATTGATGG-TCA-AA-G-GAAACAACTCTAATTCAGTTG---AATTATTGTGACTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTA-CCT--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCAAT--TGAATT---------------------------AA-GGTAAAAGG-T---AAA-ACAACTTTT--GATCACATTTGAACTTGTGACTTAAACCCTGGTTCAGC-T-GTACTCTTGTGAA-----AACGGTCAAAGGGAAACAACTATTGTTTAA--TTGAACT----TTTGATATTTATTCA------AAT-AA-TAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATCTA-A--CT---TGTCAC-T-TTTATTTAATTAACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAAT----TA--ACCTTTTACTC-AATTAATAATTAAAGG--------A---CAA---C---------AACC----C---------------TAG--TTCA---GTT-GAACT-----TATG---ACTTACTA-T---TAATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAA-T-GAAC-TG--GTGA--CA---TGTAAT--CAA---TTAA-ATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTTGAA--C-TCCCC-TGAC-TTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT-----TGCAATTTAAAATCA---AT-T---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTT-GAAC--TTGAGGCTT-TTA--GTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAG---A-AAC--TTGTGACT--TGTT-ATC-AAT--TGAT----G--GTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAGAATTAT-T------CTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC-------G---------T-ATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT-AAAGTTCT-T--C-TCGTAATCA--AT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG------ATTTCG---------------CGAT-TTGTAATT---AATTGATGA-TCA-AATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAACGGA---AACT-T----AA---AATT--AACCT-------TTTACTCA-AT-TA----A----T-AA---TTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGA-ACT--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCAAAAATGAACTG---GTGA-C-AT-GTAATCAATTA--AATA-TCAAAGG-A---AAACA--ACTGAA--GTTCAG--TTGAACTCCCC---TGA------------C-TTATA-ATC----AA----TAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAA-T-T--TGCAATTTAAAATCA------A-TTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTTGA-A--CT---TGAGGC-T-TTTAGTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGTG--AC-TTGTTATC-AATTGATGGTCAAAAG---GAA------------T---------AACT----C---------------TTG--TTCA---GTA-GAATT-----ATT-----CTCATAG-T-------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA---C-GAACGTAT-GC-A--TTCTATACACT--TCAATTT--A-ATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-TTCT--T--C-TCGTAATCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTT---CTGTGACATATAATCA---AG-A---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTT-GATT--TCGCGATTT-GTA--ATTAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTGTGCA-ATT--TTGTGACT-----------GATAATATTTAATG--GTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC--T-TTAC-ATTT-ATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA---T-----------T-TTG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGA--T-ATAGTAA--AA-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA-----CATTA---------------C-AT-TTGTAGTA---AAT-GATGG-T-A-AT-GTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-TAATG---AC-TTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAA---GTGT-AATTAT---CT---CT-TTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-TGGTGACTT-ATA--GTCTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTG---ATAAT-GT-GTAGTT--C--T-ATCTGAAAATA-T--------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CT-ATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----G---------T-ATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATATG--AT-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : -AATGG--TCAAAGGCAGATGACTC--CAGTTTAGTTGAATTATTGTT--AC-GTAGAGT--TATTAATGATCGACGG---AAA--A---TAA---C----------------TC---------------TTG--TTCA---GTTAGAAAT-----ATC----ACTTATAG-T---TTTTA-ATCGTCAAAGGGAAATAAC-----TGTTGTTCAAT---T-AAAA-TGTTG-----CT---TATAGT--CAA---T--A-ATGGTTAAA-----G----AGAA-TAACTTTTATT-CAGTTGAA--T-TAGTG-CCACGT-ATAGTTATTAATGGTGAAAGGGAAATATCTCTAGTTCAT--TTGAATTG---TTGTTAGGTACAGT-T---AT-TA--A-AGGCCAA-AGGAAAATAAC--TGTTTTCCA--GTT-AAA-AAATGTTACTG-ATA--GTCTAT-AAT-C--TTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : tttttata----TAATGGTCATAGAGAAACAAATCTAGTTC------GAA-A-AAGTCTAACC-ATA-TCATTTTTTA-T-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATTGA-AAATCAGTTAC--C-T--T-ATTTTAT-AAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGTG--AC-GTATAGTA-TAT-AATGGTC----------A--A---CAA---T---------AA--------------------------------------------------TG-T-AACTATAGCT---TA-TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAT-AAGTATGC--TT---TTTAGT--CTA---T--A-CTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A--ATTT-GAGT-T-GTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTA---TTGTTACt
gi|13 : t-----TCTAGTTTAAAAAAT-GAA-----TGCGAGACT---TGAAAT--CAA---T--TTATTGTCAAA-----G----TCAATCAGTTGTATTT-CAGTTGAA--C-T--TG-T-------T--TCGTCAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA----AAAAGAAACTTATGACTTGTAATCA---AT-TT--A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TATAGTTTA--GTT-AAACACTTGCGACTT-ATA-----AAT-AAT-------------AACAAATT-TAGTTAA---G---A-A---ATTGCA--T--T--TAATC----GATA---------GTCATTGGGAAACAACTCTGGTTTAA-TT
gi|14 : tcactaaatcaccaacattTTGTTACT-ATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTAGT--TAAATTGC--ATAA-------------AT----AAGAACCAAA----------------TATA--GTTCAG--TTGAAATAGTG---TAA------------C-T-ATA-TTT----AA----TGGTGTTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-TAAA-AATGATTTATAGTCA------A-C-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTTGA-A--TTA-TTAATACTT-AT-AGTAAAT-AATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGTA--GT-TTATATTC-AAT-AATGCTCAAAGG---AAA--A---CAA----------------C---TG---------------TAG--TTGA---GTT-TAA------------------ATAG-T---T-TAA-ATAGTCAATGGGAAACAatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|15 : ACTGTTTTGAATCGAATA--AT--TACATTTGTTTATGAAT-TATAGTCCA----T-AGTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTTAACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTAGT--TGAAATAT--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-TATGAATTATAGTCC------A-T-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTTAACA--ATA-TTAT-AT-T-AT-AATCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-TG--AC---ATATTC-TAC-ATTGTTTCATCT---GAACTA---CAA---T---------CGTT---TCCCTTTGGTCATTTTTTAGTATTCAATTGTT-AAAATGAGAAAGCA-T-AACTAT-G-T---C-TTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT---T-GAAC-TATTATGA--Ccatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttAG--TTCA---ATT-AAATA-----ATTG-TTACGTAAAA-C---TATTA-ATTATCAAAGGGATATAAT-----ACCAGTTCAGT---T-GAAT-TATTGTTA--CG---TATAGT--TAT---T--A-AAGGTCAAA-----G----GGTATTAACTCTTTTC-CAGTTAAA-----AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAG--ATG-ATTC---TT-TAACGTATAGTaagttctgtta
gi|17 : aattaaccaAA---T---------AATT---TT---------------TA---TTCA---GTT-GAATTT----ATTG-TTATCTTTAG-TCATTATTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT---T-AAAA-AATTGGTA--CT---TATTGT--CGT---T--A-ATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTTAAA-----AATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACT
gi|18 : gttcaaaatggACTCTTGAT-CAGTTAAA--AATATT----AC-TTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--A---ACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTT-GAATTAT
gi|19 : cctatagttttacctTG-TTAC-T-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTA---TTGT
gi|19 : acaTGTT--AC-T-ACAGTC-ATT-AATGGCCAAAGG---GAA--A---TAA--------------ATC---TC-----------------G--TTCA---GTT-GAATT-----ATTG-T-ACGACCAG-A---TATAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAGGGATACAACTGT----AGTTGAATTTAAA--TAGA---GTTTATATATATATA----A----T-AACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAATTATC-ATGAATTATCGT---CAAT----AATTATCAAAAA-G---AAA-A--ATTCTA--GTTTAC--TTGAAATAGTG---TAA------------T-T-ATA-TCT----AA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCAT--ATGAA-T-AA-TGTGACATATAGTCA------A-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTGGA-A--TTA-TTACGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTA-TAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAA-TG--------AATTAA-TG---------------TAG--TTGA---GTT-TAAAT-----AGTG-T-ATCTATAT-T---TAATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-CAAT-TATTATGA--CT---AATAGT--ACA---T--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--T-ATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAAC-G-ATATTAA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTAAG--TTTAA----ATATTG---------------T-AT-CTATATCT---AA-TAACGGTTCA-AA-G-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTTAAA--A---ATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACTTAT
gi|22 : gA---GTA-GAATC-----ATTG-TTACGAATAT-T---TATTA-ATGGTTTAAGTGAAATAAC-----TCTTGTTC
gi|3 : tTGT----ATTTGAATT--AT--TG-------CTACGTATATA-A----A----TCAACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTA-AAAAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCAGT--TGAATTAT---TG--TTAC-GTA--TAATTATAAATGAACAAAGTTG---AAT-A--ACTCTTTTGTTCAG--TTGAATTATTG-----A--------------T-ATA-TAT----AGGCATTAATGGTCAAAGGGAATTACCTCTTGTTCAG--TTAAA---AA-TGTAACTTATAG-AA------A-T-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTTGA-A--TCA-TTGTTAC-TTAT-AGTTCTA-AATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA--AATGGTCCAAGG----AA--A---GAA---C---------A-------C---------------TAG--TTCA---GTT-TAATT-----ATTG-TTATGTATAG-T---TATTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA-----------ATTGTAA--CT---GATAGT--CTA---T--A-ATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-TTTTT-TTACGT-ATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTC----AT-TA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-T-GA--AATTG-----T-ATA--GTCATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTC---T-ATT-ATTGTTACG--TAAT-ATA-TAAATTAAT----G--GTCAAATGCCAATAATT-------------AAT-A------------ATA------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA---T-----------T-GTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTATTGTTACTT-ATAATCATTATGAATGGTCAAAGGGAAATAACTtgtta
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgGGATACAACTGT----AGTTGAATTTAAA--TAGA---GTATATATATATATA----A----T-AACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAATTATC-ATGAATTATCGT---CAAT----AATTATCAAAAA-G---AAA-A--ATTCTA--GTTTAC--TTGAAATAGTG---TAA------------T-T-ATA-TCT----AA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCAT--ATGAA-T-AA-TGTGACATATAGTCA------G-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTGGA-A--TTA-TTACGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTA-TAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAATT---------AATTAA-TG---------------TAG--TTGA---GTT-TAAAT-----AGTG-T-ATCTATAT-T---TAATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-TAAT-TATTATGA--CT---AATAGT--ACA---T--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--T-ATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA---
gi|5 : -T-AG-TGTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTTGA-A--TTA-TTGTAACGC-AT-AGTTGGT-AATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TT-TATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC----------------AG--TTCA---GTT-AGATT-----ATTGTT-ACGTGGAA-C---TATTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CG---TAAAGTAATCA------A-AC-GTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--gcctaacctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-T-AG-TGTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTTGA-A--TTA-TTGTAACGC-AT-AGTTGGT-AATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TT-TATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC----------------AG--TTCA---GTT-AGATT-----ATTGTT-ACGTGGAA-C---TATTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CG---TAAAGTAATCA------A-AC-GTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAGA---T-AAAT-TATTGT-----------------------T--A-AAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-CATGG-TA-C-T-AAAGTTATTAATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAG--TTGAAGTA---TTGTAACGTATAG-CT---ATAC---A-TGATCA----------AAC--TCTTGTTAA--TTT-AAA-AAT----ATTTCATAATATCATT-AATGG--TCAAAAGGAAATAACTA-GTGTTCAGGTG---A-ATT-GTTGTTACT--T---------GAAGTCAT-AA-ATTGTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAAT-ATATTAT-TA---ATAGTC--ATTGATGATCGAAGGGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------AA---------TGATG--TT-TATAG---TCATT--AATGATC-AAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTCAATTGAATTATTGTA-----------------AATGTTCAAAGAGAAATAACTCTTGTTTAGTTAAAACA-TGTTTC-TATAGTCAT-TAATGGCCAA-AGAGAAATAACTCCAGTTCAG--TTAAA----CTATTG---------------T-
gi|8 : ATGTATATATA----GTCATT-AACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAA-ATTACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCAGT--TGAATTATTAATAG-GTATAGT---CATT----AATGGTCAATGG-GGAAAAA-A--ACTTTT--GTTTAG--TTGAATTATTG---TTA------------CGT-ACA-TTT----AT----TAATGGCCTAATGATAATAACGCTTGTT-AG--TTAAA-A-AA-TGTTACTTATAGGCA------T-T-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTTTA-A--TTA-TTG-------------TCAT---TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGTT--AC-GTATAGTT-AAT-ACTGGTCAAAGG---GAA--A---CAA----------------C---TC---------------TTG--TTCA---GTT-GAATT-----ATTG-TCACCTATAG-T---CATTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT---TAGAAA-TGTT---A--CT---TATAGT--CAA---T--A-ATtaccta
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTA---GTGTGACTAATAGTAT---GT-T---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAAGTGTTACTT-ATA--GTGAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTT---T-ATT-ATTTTGACTGAT--T-GTT-AAAAAT-------G--GTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAA-AA-ATGTGAA---ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---TAG---------T-GTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGAC-T-ATAATCA--AT-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTCTGA-TTGAACTGTACATTAAATAATTCCACTGTTT-ACTTTGTAACTTAAAAATAATGG-TCATAT-G-GAAAAAAGT---AT--AGTTG---AATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 11 22222222222222 222222222 33333333333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 1111 111111 11111111 22222222 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 111111 11 33333333333333333 11111111111 2222 44444444444444444444444444 555555555555555 111111 555555555555555555 111 2222222222 111111 3333333 11 66666666666666666666666666666 111 1 111111 1 111
lowQualScore : 1 7 00 77777777777777 0 111111111 6 33 1 0 1 5 1 5 11 5 66 55555555555555555 3 1 66 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888 1 4 2 4444 4 0000 888 111111 3 2 1 33333333 3 3 0 7777 0 2 3 3 44 3 11111111 6 1 3 44 44 1 1 3 0 666 55 6 66 2 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 2 2 2 22222222222 1 2 444 55555 2 66666 111111 77 5 33 2 555 66 33 2 11 8888888888 0 5 00000000000000000 1 44 0 33 1 444 1 66666666666 4 44 0 55 55 4 777 0 6 4 66 4 66 0 0 66 1 2 99999 0000 6 77777777777777777777777777 333 4 222222222222222 777777 1 0 0 0 555555555555555555 5 5 5 000 1 888 9999 5555555555 0 1 0 777777 888888 5 1 1 7 5555555 88 88 0 22222222222222222222222222222 77 777 6 444444 1 0 1 2 0 33 777 7 1
lowQualScore : . . .. .............. . ......... . .. . . . . . . .. . .. ................. . . .. .................................................................. ... . . . .... . .... ... ...... . . . ........ . . . .... . . . . .. . ........ . . . .. .. . . . . ... .. . .. . . .................................................... .. . . . ........... . . ... ..... . ..... ...... .. . .. . ... .. .. . .. .......... . . ................. . .. . .. . ... . ........... . .. . .. .. . ... . . . .. . .. . . .. . . ..... .... . .......................... ... . ............... ...... . . . . .................. . . . ... . ... .... .......... . . . ...... ...... . . . . ....... .. .. . ............................. .. ... . ...... . . . . . .. ... . .
lowQualScore : 0 3 66 00000000000000 7 888888888 7 55 0 7 7 7 0 0 22 0 99 00000000000000000 6 1 99 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999 0 3 4 7777 0 6666 000 333333 3 3 0 88888888 3 3 8 1111 2 0 3 3 66 3 88888888 7 8 3 66 66 4 8 8 2 333 22 6 11 3 5 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 4 5 5 44444444444 9 5 444 88888 5 22222 444444 44 5 77 5 000 88 66 9 11 1111111111 4 0 66666666666666666 0 44 9 22 9 777 0 11111111111 0 99 7 55 55 0 888 8 9 4 11 4 11 9 1 33 0 7 00000 1111 4 00000000000000000000000000 111 4 111111111111111 666666 1 8 5 2 333333333333333333 7 7 7 000 0 000 3333 9999999999 6 0 7 444444 666666 7 0 7 8 5555555 88 66 8 99999999999999999999999999999 88 555 2 555555 0 0 0 5 8 55 555 3 0
consensus : TAACGGTCAAANGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---GTTTACGTATATATA----A----T-AACGGTTAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCCAGTTCAGT--TGAATTA---T--ATGA-TTAT-GT---CAA-T----AA----TGATCA------AA---GN-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTGTAAC-T-ATATTTAA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TTGC-AC-T-AT-AGTTNAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTC-NAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---C--AA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGGTCAAANGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---GTTTACGTATATATA----A----T-AACGGTTAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCCAGTTCAGT--TGAATTA---T--ATGA-TTAT-GT---CAA-T----AA----TGATCA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTN--GTTCAGTTGAANTAGTGTAAC-T-ATATCTAA----TAATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TTGCGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTC-TAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---C--AA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACNTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCNAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCANTAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AATTGATGG-TC-A-ANG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTA-CCT--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCAAT--TGAATTAAGGT--A-AA---AG-GT---AAAAC----AACTTTTGATCACATTTGAACTTGT-G---ACTTA-AACCCTG--GTTCAGCTGTACTCTTGTGA-----------A-----AACGGTCAAAGGGAAACAACTATTGTTTAA--TTGAACT----T-TTGATATTTATTCA------AAT-AA-TAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATC-TA-A--CT---TGTCAC-T-TTTATTTAATTAACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAAT----TA--ACCTTTTACTC-AATTAATAATTAAAGG--------A---C--AA---C---------AACC----C----TAG------TTCAG--TTGAACTT-AT--------G---ACTTACTA-T---TA----ATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAA-T-GAAC-TG--GTGA--CATGTAA---TCAATTAA-ATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTTGAA--C-TCCCC-TGAC-TTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT-----TGCAATTTAAAATCA---AT-T---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTT-GAAC--TTGAGGCTT-TTA--GTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAG---A-AAC--TTGTGACT--TGTTATC---AATTGAT----G--GTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAGAATTAT-T------CTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC-------G---------T-ATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT-AAAGTTCT-T--C-TCGTAATCA--AT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG------ATTTC--GCGA--------------TTTGTAATT---AATTGATGA-TCAA-ATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAACGGA---AACT-----TAAAAT---TAACC------TTTTACTCA-AT-TA----A----T-AA---TTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGA-ACT--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCAAAAATGAACTG------GTGA-C-AT-GTAATCAA-TTA--AA----T-ATCA------AA---GG-A---AA--ACAACTGAA--GTTCAGTTGAACTCCCCTGAC-TTATAATCAA----TAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAA-T-T--T-GCAATTTAAAATCA------A-TTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTT-GA-A--CT---TGAGGC-T-TTTAGTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGTG--AC-TTGTTATC-AATTGATGGTCAAAAG---GAA--------------T---------AACT----C----TTG------TTCAG--TAGAA-TT-ATT------------CTCATAG-T-----------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA---C-GAACGTAT-GCAT--TCTATACACTTCAATTTA-ATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-TTCT--T--C-TCGTAATCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTT---CTGTGACATATAATCA---AG-A---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTT-GATT--TCGCGATTT-GTA--ATTAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTGTGCA-ATT--TTGTGACT----------GATAATATTTAATG--GTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC--T-TTAC-ATTT-ATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA---T-----------T-TTG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGA--T-ATAGTAA--AA-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA-----CATT--AC-A--------------TTTGTAG-T---AAATGATGG-T--A-ATGTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-TAATG---AC-TTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAA---GTGTAA-TTAT---CT---CT-TTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-TGGTGACTT-ATA--GTCTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTG---ATAAT-GT-GTAGTT--C--TATCTGAAAATA-T--------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CT-ATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----G---------T-ATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATATG--AT-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : AATGGTCAAAGGCAGATGACTCCAGTTTAG--TTGAA-T-TA-TTGTTACGTAGAGTTA------T-T-AA-TGATCGACGGAAAATAA----CTCTTGTTCAGTTAGA-A--ATA-TCAC--T-T-AT-AGTTTTT-AATCG--TCAAAGGGAAATAACTG--TTGTTCAATTAAAATGTTG-----C-TTATAGTC-AAT-AATGGTTAAAGA---GAA--------------T---------AACT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TT-AGT-------G-CCACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTGAAAGGGAAATATC-----TCTAGTTCATT---T-GAAT-TGTTGTTA--GGTACAG---TTATT--A-AAGGCCAAA-----G----GAAAATAACTGTTTTC-CAGTTAAA--A--AATG-TTAC-TGATAGTCTATAAT-CTTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : tttttata----TAATGGTCATAGAGAAACAAATCTAGTTC------GAA-A-AAGT-CTAACC-ATA-TCATTTTTTA-T-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATT-GA-AAATCAGTTAC--C-T--T-ATTTTAT-AAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGTG--AC-GTATAGTA-TAT-AATGGTC----------A--A---C--AA---T---------AA--------------------------------------T-------G-T-AACTATAGCT---TA-----TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAT-AAGTATGC--TTTTTAG---TCTAT--A-CTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A--ATTT-GAGT-T-GTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTA---TTGTTACt
gi|13 : t-----TCTAGTTTAAAAAAT-GAA-----TGCGAGACTTGAAA---TCAAT--TTATTGTCAAA-----G----TCAATCAGTTGTATTT-CAGTTGAA--C-T--TG-T-------T--TCGTCAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA----AAAAGAAACTTATGACTTGTAATCA---AT-TT--A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TATAGTTTA--GTT-AAACACTTGCGACTT-ATA-----AAT-AAT-------------AACAAATT-TAGTTAA---G---A-A---ATTGC-ATT--T--AATC-G---ATA---------GTCATTGGGAAACAACTCTGGTTTAA-TT
gi|14 : tcactaaatcaccaacattTATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTAGT--TAAATTG---C--ATAA-------------A-T----AA----GAACCA------AA-------------------TATA--GTTCAGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATTTAA----TGGTGTTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG--TTGAA-TAAA-A-ATGATTTATAGTCA------A-C-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTT-GA-A--TTA-TTAATACTT-AT-AGTAAAT-AATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGTA--GT-TTATATTC-AAT-AATGCTCAAAGG---AAA--A---C--AA----------------C---TG----TAG------TTGAG--TTTAA----------------------ATAG-T---T-----TAA-ATAGTCAATGGGAAACAatcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|15 : ttgttacACTGT-TTTGAATCGAATAATTACATTTGTTTATGAAT-TATAGTCCA----T-AGTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTTAACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTAGT--TGAAATA---T--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-T-ATGAATTATAGTCC------A-T-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTT-AACA--ATA-TTAT-AT-T-AT-AATCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-TG--AC---ATATTC-TAC-ATTGTTTCATCT---GAACTA---C--AA---T---------CGTT---TCCCTTTGGTCATTTTTTAGTATTCAA-TT-GTTAAAATGAG-A-AAGCATAA-C---TATGTCTTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT---T-GAAC-TATTATGA--Ccatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttAG------TTCAA--TTAAA-TA-ATT-------G-TTACGTAAAA-C---TA----TTA-ATTATCAAAGGGATATAAT-----ACCAGTTCAGT---T-GAAT-TATTGTTA--CGTATAG---TTATT--A-AAGGTCAAA-----G----GGTATTAACTCTTTTC-CAGTTAAA-----AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAG--ATG-ATTC---TT-TAACGTATAGTaagttctgtta
gi|17 : aattaacca--AA---T---------AATT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TTTATT-------G-TTATCTTTAG-TCATTA----TTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT---T-AAAA-AATTGGTA--CTTATTG---TCGTT--A-ATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTTAAA-----AATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACT
gi|18 : gttcaaaatggACTCTTGAT-CAGTTAAA--AATATT----AC-TTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--A---ACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTT-GAATTAT
gi|19 : cctatagttttacctTG-TTAC-T-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTA---TTGT
gi|19 : acaTGTT--AC-T-ACAGTC-ATT-AATGGCCAAAGG---GAA--A---T--AA--------------ATC---TC------G------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGACCAG-A---TA----TAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---GTTTATATATATATA----A----T-AACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAATTA---TC-ATGAATTATCGT---CAA-T----AA----TTATCA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTGTAAT-T-ATATCTAA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------A-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTG-GA-A--TTA-TTACGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTA-TAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAA---TG--------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-CAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAAC-G-ATATTAA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTAAG--TTTAA----ATATT--GT-A--------------TCTATATCT---AA-TAACGGTTC-A-AAG-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTTAAA--A---ATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACTTAT
gi|22 : gAG--TAGAA-TC-ATT-------G-TTACGAATAT-T---TA----TTA-ATGGTTTAAGTGAAATAAC-----TCTTGTTC
gi|3 : tTGTATTTGAATT------ATTG------CTACGTATATA-A----A----TCAACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTA-AAAAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCAGT--TGAATTA---T---TG--TTAC-GTA--TAA-TTATAAA----TGAACA------AA---GTTG---AA--T-AACTCTTTTGTTCAGTTGAATTATTG--A--T-ATATATAGGCATTAATGGTCAAAGGGAATTACCTCTTGTTCAG--TTAAA---AA-T-GTAACTTATAG-AA------A-T-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTT-GA-A--TCA-TTGTTAC-TTAT-AGTTCTA-AATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA--AATGGTCCAAGG----AA--A---G--AA---C---------A-------C----TAG------TTCAG--TTTAA-TT-ATT-------G-TTATGTATAG-T---TA----TTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA-----------ATTGTAA--CTGATAG---TCTAT--A-ATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-TTTTT-TTACGT-ATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTC----AT-TA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-T-GA--AATTG-----T-ATA--GTCATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTC---T-ATT-ATTGTTACG--TAATATA-TAAATTAAT----G--GTCAAATGCCAATAATT-------------AAT-A------------ATA------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA---T-----------T-GTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTATTGTTACTT-ATAATCATTATGAATGGTCAAAGGGAAATAACTtgtta
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---GTATATATATATATA----A----T-AACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAATTA---TC-ATGAATTATCGT---CAA-T----AA----TTATCA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTGTAAT-T-ATATCTAA----TAATGTTCAAAGGGAAACATCTCTAGTTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------G-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTG-GA-A--TTA-TTACGAC-T-AT-AGTTAAT-AATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTA-TAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---C--AAAATT---------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-TAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA---
gi|5 : -T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TTGTAACGC-AT-AGTTGGT-AATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TT-TATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCC--AA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--gcctaacctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TTGTAACGC-AT-AGTTGGT-AATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TT-TATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCC--AA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAGA---T-AAAT-TATTGT------------------T--A-AAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-CATGG-TA-C-T-AAAGTTATTAATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAG--TTGAAGTA---TTGTAACGTATAG-CT---ATAC---A-TGATCA----------AAC--TCTTGTTAA--TTT-AAA-AAT----ATTTCATAATATCATT-AATGG--TCAAAAGGAAATAACTA-GTGTTCAGGTG---A-ATT-GTTGTTACT--T--------GAAGTCAT-AA-ATTGTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAAT-ATATTAT-TA---ATAGTC--ATTGATGATCGAAGGGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------AA---------TGATG--TT-TATAG---TCATT--AATGATC-AAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTCAATTGAATTATTGTA-----------------AATGTTCAAAGAGAAATAACTCTTGTTTAGTTAAAACA-TGTTTC-TATAGTCAT-TAATGGCCAA-AGAGAAATAACTCCAGTTCAG--TTAAA----CTATT--GT-
gi|8 : ATGTATATATA----GTCATT-AACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAA-ATTACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCAGT--TGAATTA---TTAATAG-GTATAGT---CAT-T----AA----TGGTCA------AT---GG-GGAAAA--A-AACTTTT--GTTTAGTTGAATTATTGTTACGT-ACATTTAT----TAATGGCCTAATGATAATAACGCTTGTT-AG--TTAAA-A-AA-T-GTTACTTATAGGCA------T-T-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTT-TA-A--TTA-TTG-------------TCAT---TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGTT--AC-GTATAGTT-AAT-ACTGGTCAAAGG---GAA--A---C--AA----------------C---TC----TTG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-TCACCTATAG-T---CA----TTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT---TAGAAA-TGTT---A--CTTATAG---TCAAT--A-ATtaccta
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTA---GTGTGACTAATAGTAT---GT-T---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAAGTGTTACTT-ATA--GTGAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTT---T-ATT-ATTTTGACTGAT--TGTT-AAAAAT-------G--GTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAA-AA-ATGTGAA---ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---TAG---------T-GTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGAC-T-ATAATCA--AT-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTCTGA-TTGAACTGTACATTAAAT-AATTCCACTGTTTACTTTGTAACTTAAAAATAATGG-TC-ATATG-GAAAAAAGT---AT--AGTTG---AATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111 333333333333333333 1111 22222222 33333333333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 11111111 2222222222 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 111111 11 22222222222222222 11111111111 2222 44444444444444444444444444 555555555555555 111111 555555555555555555 111 2222222222 111111 3333333 11 66666666666666666666666666666 2222 111111 1 111
lowQualScore : 0 1 9 0 6666 111111111111111111 1 3 11 0 2222 66666666 22 0 1 1 2 5 1 6 3 22 4 1 66 11111111111111111 2 0 11 66 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888 1 1 5 1 9999 8888 4 0 55 7777 888888 3 2 1 33333333 3 3 0 7777 0 2 3 3 77 3 8888888888 1 44 44 44 1 1 3 0 666 55 6 1 2 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000 33 2 2 2 22222222222 2 2 444 55555 2 66666 111111 77 5 33 2 555 55 33 2 11 8888888888 0 5 99999999999999999 0 44 0 33 1 444 1 66666666666 4 4 2 0 55 55 4 777 0 6 4 66 4 66 0 0 66 1 2 99999 0000 6 77777777777777777777777777 333 4 222222222222222 777777 1 0 0 0 555555555555555555 5 5 5 000 1 888 9999 5555555555 0 1 0 777777 888888 5 1 1 7 5555555 88 88 0 22222222222222222222222222222 77 0000 444444 0 1 2 0 33 777 7 1
lowQualScore : . . . . .... .................. . . .. . .... ........ .. . . . . . . . . .. . . .. ................. . . .. .. .................................................................. ... . . . . .... .... . . .. .... ...... . . . ........ . . . .... . . . . .. . .......... . .. .. .. . . . . ... .. . . . . .................................................. .. . . . ........... . . ... ..... . ..... ...... .. . .. . ... .. .. . .. .......... . . ................. . .. . .. . ... . ........... . . . . .. .. . ... . . . .. . .. . . .. . . ..... .... . .......................... ... . ............... ...... . . . . .................. . . . ... . ... .... .......... . . . ...... ...... . . . . ....... .. .. . ............................. .. .... ...... . . . . .. ... . .
lowQualScore : 7 0 8 2 2222 222222222222222222 4 9 99 1 1111 77777777 44 9 0 4 2 0 0 2 7 99 4 9 11 11111111111111111 2 9 88 11 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 0 0 0 0 8888 5555 0 3 55 0000 222222 3 3 0 88888888 3 3 8 1111 2 0 3 3 99 3 3333333333 0 66 66 66 4 8 8 2 333 22 6 0 3 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444 44 4 5 5 44444444444 5 5 444 88888 5 22222 444444 44 5 77 5 000 77 66 9 11 1111111111 4 0 22222222222222222 2 44 9 22 9 777 0 11111111111 0 0 5 7 55 55 0 888 8 9 4 11 4 11 9 1 33 0 7 00000 1111 4 00000000000000000000000000 111 4 111111111111111 666666 1 8 5 2 333333333333333333 7 7 7 000 0 000 3333 9999999999 6 0 7 444444 666666 7 0 7 8 5555555 88 66 8 99999999999999999999999999999 88 8888 555555 0 0 5 8 55 555 3 0
consensus : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATGTATATATA----ATC---A---ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ACTATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAATTA---T--ATGA-TTAT-GT---CAA-T----AA----TNATCA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATAGT--CAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGGTCAAANGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTACGTATATATA----AT----A---ACGGTTAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGA-ANTATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCCAGTTCAGT--TGAATTA---T--ATGA-TTAT-GT---CAA-T----AA----TGATCA------AA---GN-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATAGT--CAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTA-CCT--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCAAT--TGAATTAAGGT--A-AA---AG-GT---AAAAC----AACTTTTGATCACATTTGAACTTGT-G---ACTTA-AACCCTG--GTTCAGCTGTACTCTTG-TGA-----------A-----AA-CGGTCAAAGGGAAACAACTATTG--TTTAA--TTGAACT----T-TTGATATTTATTCA------AAT-AA-TAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATC-TA-A--CT---T-GTC-AC-T-TTTATTTAATTAACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAAT----TA--ACCTTTTACTCAATTAATAATTAAAGG--------A---CAA---C---------AACC----C----TAG------TTCAG--TTGAACTT-AT--------G---ACTTACTA-T---TA----ATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAA-T-GAAC-TG--GTGA--CATGTAA---TCAATTAA-ATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTTGAA--C-TCCCC-TGAC-TTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT-----TGCAATTTAAAATCA---AT-T---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTT-GAAC--TTGAGGCTT-TTAGT--CAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAG---A-AAC--TTGTGACT--TGTTATC---AATTGAT----G--GTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAGAATTAT-T------CTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC-------G---------T-ATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT-AAAGTTCT-T--C-TCGTAATCA--AT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG------ATTTC--GCGA--------------TTTGTAATT---AATTGATGA-TCAA-ATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAACGGA---AACT-----TAAAAT---TAACC------T---TTTACTCA-AT-TA----AT----A---A---TTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGA-ACT--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCAAAAATGAACTG------GTGA-C-AT-GTAATCAA-TTA--AA----T-ATCA------AA---GG-A---AA--ACAACTGAA--GTTCAGTTGAACTCCCC-TGAC-TTATAATCAA----TAA-TGGCCACAGTGAAAACATTATAA--ATCAAAATTCAA-T-T--T-GCAATTTAAAATCA------A-TTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTT-GA-AC-TTG-AG-G-C-TT-T--TAGTCAA--T--TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGTG--AC-TTGTTATCAATTGATGGTCAAAAG---GAA------------T---------AACT----C----TTG------TTCAG--TAGAA-TT-ATT------------CTCATAG-T-----------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA---C-GAACGTAT-GCAT--TCTATACACTTCAATTTA-ATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-TTCT--T--C-TCGTAATCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTT---CTGTGACATATAATCA---AG-A---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTT-GATT--TCGCGATTT-GTAAT--TAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTGTGCA-ATT--TTGTGACT----------GATAATATTTAATG--GTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC--T-TTAC-ATTT-ATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA---T-----------T-TTG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGA--T-ATAGTAA--AA-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA-----CATT--AC-A--------------TTTGTAG-T---AAATGATGG-T--A-ATGTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-TAATG---AC-TTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAA---GTGTAA-TTAT---CT---CT-TTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-TGGTGACTT-ATAGT--CTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTG---ATAAT-GT-GTAGTT--C--TATCTGAAAATA-T--------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CT-ATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----G---------T-ATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATATG--AT-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : TTTTA----TAAATGGTCAAAGGCAGATGACTCCAG--TTTAG--TTGAA-T-TA-TTGTTACGTAGAGTTA------T-T-AA-TGATCGACGGAAAATAA----CTCTTGTTCAGTTAGA-A--ATA-T----C-AC-TTATAGTTTT--TAATCG--TCAAAGGGAAATAACTG--TTGTTCAATTAAAATGTTG-----C-TTATAGTCAAT-AATGGTTAAAGA---GAA------------T---------AACT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TT-AGT-------G-CCACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTGAAAGGGAAATATC-----TCTAGTTCATT---T-GAAT-TGTTGTTA--GGTACAG---TTATT--A-AAGGCCAAA-----G----GAAAATAACTGTTTTC-CAGTTAAA--A--AATG-TTAC-TGATAGTCTATAAT-CTTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : t----TAA-TGGTCATAGAGAAACAAATCTAG--TTC------GAA-A-AAGT-CTAACC-ATA-TCATTTTTTA-T-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATT-GA-AAATCAGTT-A-C-CT-T-AT--TTTA--TAAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGTG--AC-GTATAGTATAT-AATGGTC----------A--A---CAA---T---------AA--------------------------------------T-------G-T-AACTATAGCT---TA-----TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAT-AAGTATGC--TTTTTAG---TCTAT--A-CTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A--ATTT-GAGT-T-GTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTA---TTGTTACt
gi|13 : t-----TCTAGTTTAAAAAAT-GAA-----TGCGAGACTTGAAA---TCAAT--TTATTGTCAAA-----G----TCAATCAGTTGTATTT-CAGTTGAA--C-T--TG-T----T--TCGTCAAT---GGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA----AAAAGAAACTTATGACTTGTAATCA---AT-TT--A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TATAGTTTA--GTT-AAACACTTGCGACTT-ATA-----AAT-AAT-------------AACAAATT-TAGTTAA---G---A-A---ATTGC-ATT--T--AATC-G---ATA---------GTCATTGGGAAACAACTCTGGTTTAA-TT
gi|13 : tcactaaatcaccaacattAATGGTCAAAGGGAAATAACT---CTTG--TT---TAAA-AAA---GAAACTTATG-ACTTGTA----ATCA--ATTTATGGTCAAAGGGAAACAACTATAGTTTAGTTAA-ACACTTGCGACTTATA---AAT-AAT-------------A-----------------ACAAATTTAGTTAAG----AAATTG---C--AT---TTA--AT---CGA-T----AG----TCATT------------GG-G---AA--ACAACTCTG--GTTT-----AATTATCGATAA------AATTAA----GAA-AGTTTAAAAGG--CCAATTTTGGGCTTT-G--TTAAA-T-AA-atcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|14 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcTATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTAGT--TAAATTG---C--ATAA-------------A-T----AA----GAACCA------AA-------------------TATA--GTTCAGTTGAAATAGTG-TAAC-T-ATATTTAA----TGG-TGTTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-TAAA-A-ATGATTTATAGTCA------A-C-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTT-GA-A--TTA-TTAA-T-ACTT-ATAGTAAA--TAATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGTA--GT-TTATATTCAAT-AATGCTCAAAGG---AAA--A---CAA----------------C---TG----TAG------TTGAG--TTTAA----------------------ATAG-T---T-----TAA-ATAGTCAATGGGAAACAaata
gi|15 : ttgttacACTGT-TTTGAATCGAATAATTACATTTG---TTTATGAAT-TATAGTCCAT----A---GTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTTAACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTAGT--TGAAATA---T--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-T-ATGAATTATAGTCC------A-T-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTT-AACA--ATA-TT-A-T-AT-T-ATAATCAA--TAATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-TG--AC---ATATTCTAC-ATTGTTTCATCT---GAACTA---CAA---T---------CGTT---TCCCTTTGGTCATTTTTTAGTATTCAA-TT-GTTAAAATGAG-A-AAGCATAA-C---TATGTCTTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT---T-GAAC-TATTATGA--Ccatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttAG------TTCAA--TTAAA-TA-ATT-------G-TTACGTAAAA-C---TA----TTA-ATTATCAAAGGGATATAAT-----ACCAGTTCAGT---T-GAAT-TATTGTTA--CGTATAG---TTATT--A-AAGGTCAAA-----G----GGTATTAACTCTTTTC-CAGTTAAA-----AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAG--ATG-ATTC---TT-TAACGTATAGTaagttctgtta
gi|17 : aattaaccaAA---T---------AATT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TTTATT-------G-TTATCTTTAG-TCATTA----TTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT---T-AAAA-AATTGGTA--CTTATTG---TCGTT--A-ATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTTAAA-----AATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACT
gi|18 : gttcaaaatggACTCTTGAT-CAGTTAAA--AATATT----AC-TTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--A---ACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTT-GAATTAT
gi|19 : cctatagttttacctTG-TTAC-T-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTA---TTGT
gi|19 : acaTGTT--AC-T-ACAGTCATT-AATGGCCAAAGG---GAA--A---TAA--------------ATC---TC------G------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGACCAG-A---TA----TAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATATATATATA----AT----A---ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAATTA---TC-ATGAATTATCGT---CAA-T----AA----TTATCA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------A-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTG-GA-A--TTA-TT-A-CGAC-T-ATAGTTAA--TAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAA-TG--------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-CAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGAGT--CTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAAC-G-ATATTAA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTAAG--TTTAA----ATATT--GT-A--------------TCTATATCT----AATAACGGTTC-A-AAG-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTTAAA--A---ATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACTTAT
gi|22 : gAG--TAGAA-TC-ATT-------G-TTACGAATAT-T---TA----TTA-ATGGTTTAAGTGAAATAAC-----TCTTGTTC
gi|3 : tTGTATTTGAATT------ATTG---------CTACGTATATA-A----ATC---A---ACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTA-AAAAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCAGT--TGAATTA---T---TG--TTAC-GTA--TAA-TTATAAA----TGAACA------AA---GTTG---AA--T-AACTCTTTTGTTCAGTTGAATTATTG---A--T-ATATATAGGCATTAA-TGGTCAAAGGGAATTACCTCTTG--TTCAG--TTAAA---AA-T-GTAACTTATAG-AA------A-T-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTT-GA-A--TCA-TT-G-TTAC-TTATAGTTCT--AAATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA-AATGGTCCAAGG----AA--A---GAA---C---------A-------C----TAG------TTCAG--TTTAA-TT-ATT-------G-TTATGTATAG-T---TA----TTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA-----------ATTGTAA--CTGATAG---TCTAT--A-ATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-TTTTT-TTACGT-ATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTC----AT-TA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-T-GA--AATTG-----T-ATAGT--CATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTC---T-ATT-ATTGTTACG--TAATATA-TAAATTAAT----G--GTCAAATGCCAATAATT-------------AAT-A------------ATA------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA---T-----------T-GTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTATTGTTACTT-ATAATCATTATGAATGGTCAAAGGGAAATAACTtgtta
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---G---TATATATATATATA----AT----A---ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGA-ATTATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAATTA---TC-ATGAATTATCGT---CAA-T----AA----TTATCA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------G-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTG-GA-A--TTA-TT-A-CGAC-T-ATAGTTAA--TAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAATT---------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-TAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGAGT--CTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA---
gi|5 : -T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TT-G-TAACGC-ATAGTTGG--TAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--gcctaacctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TT-G-TAACGC-ATAGTTGG--TAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAGA---T-AAAT-TATTGT------------------T--A-AAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-CATGG-TA-C-T-AAAGTTATTAATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAG--TTGAAGTA---TTGTAACGTATAG-CT---ATAC---A-TGATCAA-A---------C--TCTTGTTAA--TTT-AAA-AAT----ATTTCATAATATCATT-AATGG--TCAAAAGGAAATAACTA-GTGTTCAGGTG---A-ATT-GTTGTTACT--T--------GAAGTCAT-AA-ATTGTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAAT-ATATTAT-TA---ATAGTC--ATTGATGATCGAAGGGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------AA---------TGATG--TT-TATAG---TCATT--AATGATC-AAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTCAATTGAATTATTGTA-----------------AATGTTCAAAGAGAAATAACTCTTGTTTAGTTAAAACA-TGTTTC-TATAGTCAT-TAATGGCCAA-AGAGAAATAACTCCAGTTCAG--TTAAA----CTATT--GT-
gi|8 : ATGTATATATA----GTCATTA---ACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAA-ATTACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCAGT--TGAATTA---TTAATAG-GTATAGT---CAT-T----AA----TGGTCA------AT---GG-GGAAAA--A-AACTTTT--GTTTAGTTGAATTATTG-TTACGT-ACATTTAT----TAA-TGGCCTAATGATAATAACGCTTG--TT-AG--TTAAA-A-AA-T-GTTACTTATAGGCA------T-T-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTT-TA-A--TTA-TT-G-------------TCA--T--TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGTT--AC-GTATAGTTAAT-ACTGGTCAAAGG---GAA--A---CAA----------------C---TC----TTG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-TCACCTATAG-T---CA----TTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT---TAGAAA-TGTT---A--CTTATAG---TCAAT--A-ATtaccta
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTA---GTGTGACTAATAGTAT---GT-T---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAAGTGTTACTT-ATAGT--GAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTT---T-ATT-ATTTTGACTGAT--TGTT-AAAAAT-------G--GTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAA-AA-ATGTGAA---ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---TAG---------T-GTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGAC-T-ATAATCA--AT-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTCTGA-TTGAACTGTACATTAAAT-AATTCCACTGTTTACTTTGTAACTTAAAAATAATGG-TC-ATATG-GAAAAAAGT---AT--AGTTG---AATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111 333333333333333333 222222222 1111 33333333333333333 11111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 11111111 2222222222 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 111111 11 22222222222222222 11111111111 2222 44444444444444444444444444 555555555555555 111111 555555555555555555 111 2222222222 111111 3333333 11 66666666666666666666666666666 2222 111111 1 111
lowQualScore : 0 9 0 6666 111111111111111111 5 1 0 999999999 0 1 1 6 0000 3 22 4 1 66 11111111111111111 2 0 0 66 11111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888 1 1 5 1 9999 8888 4 0 55 7777 888888 3 2 1 33333333 3 3 0 7777 0 2 3 3 77 3 8888888888 1 44 44 44 1 1 3 0 666 55 6 1 2 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000 33 2 2 2 22222222222 2 2 444 55555 2 66666 111111 77 5 33 2 555 55 33 2 11 8888888888 0 5 99999999999999999 0 44 0 33 1 444 1 66666666666 4 44 0 55 55 4 777 0 6 4 66 4 66 0 0 66 1 2 99999 0000 6 77777777777777777777777777 333 4 222222222222222 777777 1 0 0 0 555555555555555555 5 5 5 000 1 888 9999 5555555555 0 1 0 777777 888888 5 1 1 7 5555555 88 88 0 22222222222222222222222222222 77 0000 444444 0 1 2 0 33 777 7 1
lowQualScore : . . . .... .................. . . . ......... . . . . .... . .. . . .. ................. . . . .. ..... .................................................................. ... . . . . .... .... . . .. .... ...... . . . ........ . . . .... . . . . .. . .......... . .. .. .. . . . . ... .. . . . . .................................................. .. . . . ........... . . ... ..... . ..... ...... .. . .. . ... .. .. . .. .......... . . ................. . .. . .. . ... . ........... . .. . .. .. . ... . . . .. . .. . . .. . . ..... .... . .......................... ... . ............... ...... . . . . .................. . . . ... . ... .... .......... . . . ...... ...... . . . . ....... .. .. . ............................. .. .... ...... . . . . .. ... . .
lowQualScore : 7 8 2 2222 222222222222222222 1 7 1 777777777 4 0 4 5 6666 7 99 4 9 11 11111111111111111 2 9 1 11 11111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 0 0 0 0 8888 5555 0 3 55 0000 222222 3 3 0 88888888 3 3 8 1111 2 0 3 3 99 3 3333333333 0 66 66 66 4 8 8 2 333 22 6 0 3 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444 44 4 5 5 44444444444 5 5 444 88888 5 22222 444444 44 5 77 5 000 77 66 9 11 1111111111 4 0 22222222222222222 2 44 9 22 9 777 0 11111111111 0 99 7 55 55 0 888 8 9 4 11 4 11 9 1 33 0 7 00000 1111 4 00000000000000000000000000 111 4 111111111111111 666666 1 8 5 2 333333333333333333 7 7 7 000 0 000 3333 9999999999 6 0 7 444444 666666 7 0 7 8 5555555 88 66 8 99999999999999999999999999999 88 8888 555555 0 0 5 8 55 555 3 0
consensus : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATGTATATATAATC---A----ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATGTATATATAATC---A----ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTACC--T--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCAAT--TGAATTAAGGTAA--AAGG-TAA--------AAC-AACTTTTGAT-------CACATTTGAACTTGT-G---ACTTA-AACCCTG--GTTCAGCTGTACTCTTG-TGA-----------A-----AA-CGGTCAAAGGGAAACAACTATTG--TTTAA--TTGAACT----T-TTGATATTTATTCA------AAT-AA-TAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATC-TA-A--CT---T-GTC-AC-T-TTTATTTAATTAACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAAT----TA--ACCTTTTACTCAATTAATAATTAAAGG--------A---CAA---C---------AACC----C----TAG------TTCAG--TTGAACTT-AT--------G---ACTTACTA-T---TA----ATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAA-T-GAAC-TG--GTGA--CATGTAA---TCAATTAA-ATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTTGAA--C-TCCCC-TGAC-TTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT-----TGCAATTTAAAATCA---AT-T---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTT-GAAC--TTGAGGCTT-TTA--GTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAG---A-AAC--TTGTGACT--TGTTATC---AATTGAT----G--GTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAGAATTAT-T------CTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC-------G---------T-ATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT-AAAGTTCT-T--C-TCGTAATCA--AT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG------ATTTC--GCGA--------------TTTGTAATT---AATTGATGA-TCAA-ATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAACGGA---AACT-----TAAAAT---TAACC----------TTT-----TACTCAATT---A----ATAATTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGAAC--T--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCAAAAATGAAC-----TG---GTGA-C-AT-GTAATCAATTAA----ATAT-------CA------AA---GG-A---AA--ACAACTGAA--GTTCAGTTGAACTCCCC-TGAC-TTATAATCAA----TAA-TGGCCACAGTGAAAACATTATAA--ATCAAAATTCAA-T-T--T-GCAATTTAAAATCA------A-TTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTT-GA-AC-TTG-AG-G-C-TT-T--TAGTCAA--T--TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGTG--AC-TTGTTATCAATTGATGGTCAAAAG---GAA------------T---------AACT----C----TTG------TTCAG--TAGAA-TT-ATT------------CTCATAG-T-----------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA---C-GAACGTAT-GCAT--TCTATACACTTCAATTTA-ATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-TTCT--T--C-TCGTAATCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTT---CTGTGACATATAATCA---AG-A---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTT-GATT--TCGCGATTT-GTA--ATTAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTGTGCA-ATT--TTGTGACT----------GATAATATTTAATG--GTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC--T-TTAC-ATTT-ATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA---T-----------T-TTG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGA--T-ATAGTAA--AA-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA-----CATT--AC-A--------------TTTGTAG-T---AAATGATGG-T--A-ATGTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-TAATG---AC-TTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAA---GTGTAA-TTAT---CT---CT-TTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-TGGTGACTT-ATA--GTCTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTG---ATAAT-GT-GTAGTT--C--TATCTGAAAATA-T--------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CT-ATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----G---------T-ATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATATG--AT-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : TTTTA----TAAATGGTCAAAGGCAGATGACTCCAG--TTTAG--TTGAA-T-TA-TTGTTACGTAGAGTTA------T-T-AA-TGATCGACGGAAAATAA----CTCTTGTTCAGTTAGA-A--ATA-T----C-AC-TTATAGTTTT--TAATCG--TCAAAGGGAAATAACTG--TTGTTCAATTAAAATGTTG-----C-TTATAGTCAAT-AATGGTTAAAGA---GAA------------T---------AACT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TT-AGT-------G-CCACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTGAAAGGGAAATATC-----TCTAGTTCATT---T-GAAT-TGTTGTTA--GGTACAG---TTATT--A-AAGGCCAAA-----G----GAAAATAACTGTTTTC-CAGTTAAA--A--AATG-TTAC-TGATAGTCTATAAT-CTTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : t----TAA-TGGTCATAGAGAAACAAATCTAG--TTC------GAA-A-AAGT-CTAACC-ATA-TCATTTTTTA-T-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATT-GA-AAATCAGTT-A-C-CT-T-AT--TTTA--TAAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGTG--AC-GTATAGTATAT-AATGGTC----------A--A---CAA---T---------AA--------------------------------------T-------G-T-AACTATAGCT---TA-----TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAT-AAGTATGC--TTTTTAG---TCTAT--A-CTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A--ATTT-GAGT-T-GTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTA---TTGTTACt
gi|13 : t-----TCTAGTTTAAAAAAT-GAA-----TGCGAGACTTGAAA---TCAAT--TTATTGTCAAA-----G----TCAATCAGTTGTATTT-CAGTTGAA--C-T--TG-T----T--TCGTCAAT---GGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA----AAAAGAAACTTATGACTTGTAATCA---AT-TT--A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TATAGTTTA--GTT-AAACACTTGCGACTT-ATA-----AAT-AAT-------------AACAAATT-TAGTTAA---G---A-A---ATTGC-ATT--T--AATC-G---ATA---------GTCATTGGGAAACAACTCTGGTTTAA-TT
gi|13 : tcactaaatcaccaacattAATGGTCAAAGGGAAATAACT---CTTG--TT---TAAA-AAA---GAAACTTATG-ACTTGTAATC---AATTTATGGTCAAAGGGAAACAACTATAGTTTAGTTAAAC--ACTTGCGACTTATA---AAT-AAT-------------A-----------------ACAAATTTAGTTAAG----AAAT-----TGC--AT---TTA--AT---CGAT-AG----TCAT-------T------------GG-G---AA--ACAACTCTG--GTTT-----AATTATCGATAA------AATTAA----GAA-AGTTTAAAAGG--CCAATTTTGGGCTTT-G--TTAAA-T-AA-atcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|14 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcTATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTAGT--TAAAT-----TGC--ATAA-------------AT-AA----GAAC-------CA------AA-------------------TATA--GTTCAGTTGAAATAGTG-TAAC-T-ATATTTAA----TGG-TGTTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-TAAA-A-ATGATTTATAGTCA------A-C-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTT-GA-A--TTA-TTAA-T-ACTT-ATAGTAAA--TAATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGTA--GT-TTATATTCAAT-AATGCTCAAAGG---AAA--A---CAA----------------C---TG----TAG------TTGAG--TTTAA----------------------ATAG-T---T-----TAA-ATAGTCAATGGGAAACAaata
gi|15 : ttgttacACTGT-TTTGAATCGAATAATTACATTTG---TTTATGAAT-TATAGTCCATA----GTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTT-AACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTAGT--TGAAA-----TAT--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-T-ATGAATTATAGTCC------A-T-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTT-AACA--ATA-TT-A-T-AT-T-ATAATCAA--TAATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-TG--AC---ATATTCTAC-ATTGTTTCATCT---GAACTA---CAA---T---------CGTT---TCCCTTTGGTCATTTTTTAGTATTCAA-TT-GTTAAAATGAG-A-AAGCATAA-C---TATGTCTTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT---T-GAAC-TATTATGA--Ccatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttAG------TTCAA--TTAAA-TA-ATT-------G-TTACGTAAAA-C---TA----TTA-ATTATCAAAGGGATATAAT-----ACCAGTTCAGT---T-GAAT-TATTGTTA--CGTATAG---TTATT--A-AAGGTCAAA-----G----GGTATTAACTCTTTTC-CAGTTAAA-----AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAG--ATG-ATTC---TT-TAACGTATAGTaagttctgtta
gi|17 : aattaaccaAA---T---------AATT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TTTATT-------G-TTATCTTTAG-TCATTA----TTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT---T-AAAA-AATTGGTA--CTTATTG---TCGTT--A-ATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTTAAA-----AATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACT
gi|18 : gttcaaaatggACTCTTGAT-CAGTTAAA--AATATT----AC-TTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--A---ACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTT-GAATTAT
gi|19 : cctatagttttacctTG-TTAC-T-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTA---TTGT
gi|19 : acaTGTT--AC-T-ACAGTCATT-AATGGCCAAAGG---GAA--A---TAA--------------ATC---TC------G------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGACCAG-A---TA----TAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATATATATATAAT----A----ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGAAT--TATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAAT-----TATC-ATGAATTATCGT---CAAT-AA----TTAT-------CA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------A-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTG-GA-A--TTA-TT-A-CGAC-T-ATAGTTAA--TAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAA-TG--------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-CAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAAC-G-ATATTAA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTAAG--TTTAA----ATATT--GT-A--------------TCTATATCT----AATAACGGTTC-A-AAG-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTTAAA--A---ATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACTTAT
gi|22 : gAG--TAGAA-TC-ATT-------G-TTACGAATAT-T---TA----TTA-ATGGTTTAAGTGAAATAAC-----TCTTGTTC
gi|3 : tTGTATTTGAATT------ATTG---------CTACGTATATA-AATC---A----ACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTAAA--AAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCAGT--TGAAT-----TAT---TG--TTAC-GT-----AT-AA----TTATAAATGAACA------AA---GTTG---AA--T-AACTCTTTTGTTCAGTTGAATTATTG---A--T-ATATATAGGCATTAA-TGGTCAAAGGGAATTACCTCTTG--TTCAG--TTAAA---AA-T-GTAACTTATAG-AA------A-T-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTT-GA-A--TCA-TT-G-TTAC-TTATAGTTCT--AAATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA-AATGGTCCAAGG----AA--A---GAA---C---------A-------C----TAG------TTCAG--TTTAA-TT-ATT-------G-TTATGTATAG-T---TA----TTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA-----------ATTGTAA--CTGATAG---TCTAT--A-ATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-TTTTT-TTACGT-ATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTC----AT-TA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-T-GA--AATTG-----T-ATA--GTCATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTC---T-ATT-ATTGTTACG--TAATATA-TAAATTAAT----G--GTCAAATGCCAATAATT-------------AAT-A------------ATA------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA---T-----------T-GTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTATTGTTACTT-ATAATCATTATGAATGGTCAAAGGGAAATAACTtgtta
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---G---TATATATATATATAAT----A----ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGAAT--TATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAAT-----TATC-ATGAATTATCGT---CAAT-AA----TTAT-------CA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------G-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTG-GA-A--TTA-TT-A-CGAC-T-ATAGTTAA--TAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAATT---------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-TAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA---
gi|5 : -T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TT-G-TAACGC-ATAGTTGG--TAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--gcctaacctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TT-G-TAACGC-ATAGTTGG--TAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAGA---T-AAAT-TATTGT------------------T--A-AAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-CATGG-TA-C-T-AAAGTTATTAATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAG--TTGAAGTA---TTGTAACGTATAG-CT---ATAC---A-TGATCA----------AAC--TCTTGTTAA--TTT-AAA-AAT----ATTTCATAATATCATT-AATGG--TCAAAAGGAAATAACTA-GTGTTCAGGTG---A-ATT-GTTGTTACT--T--------GAAGTCAT-AA-ATTGTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAAT-ATATTAT-TA---ATAGTC--ATTGATGATCGAAGGGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------AA---------TGATG--TT-TATAG---TCATT--AATGATC-AAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTCAATTGAATTATTGTA-----------------AATGTTCAAAGAGAAATAACTCTTGTTTAGTTAAAACA-TGTTTC-TATAGTCAT-TAATGGCCAA-AGAGAAATAACTCCAGTTCAG--TTAAA----CTATT--GT-
gi|8 : ATGTATATATAGTC---ATTA-ACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAAAT--TACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCAGT--TGAAT-----TATTAATAG-GTATAGT---CATT-AA----TGGT-------CA------AT---GG-GGAAAA--A-AACTTTT--GTTTAGTTGAATTATTG-TTACGT-ACATTTAT----TAA-TGGCCTAATGATAATAACGCTTG--TT-AG--TTAAA-A-AA-T-GTTACTTATAGGCA------T-T-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTT-TA-A--TTA-TT-G-------------TCA--T--TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGTT--AC-GTATAGTTAAT-ACTGGTCAAAGG---GAA--A---CAA----------------C---TC----TTG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-TCACCTATAG-T---CA----TTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT---TAGAAA-TGTT---A--CTTATAG---TCAAT--A-ATtaccta
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTA---GTGTGACTAATAGTAT---GT-T---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAAGTGTTACTT-ATA--GTGAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTT---T-ATT-ATTTTGACTGAT--TGTT-AAAAAT-------G--GTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAA-AA-ATGTGAA---ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---TAG---------T-GTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGAC-T-ATAATCA--AT-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTCTGA-TTGAACTGTACATTAAAT-AATTCCACTGTTTACTTTGTAACTTAAAAATAATGG-TC-ATATG-GAAAAAAGT---AT--AGTTG---AATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1111 333333333333333333 222222222 1111 33333333333333333 11111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 11111111 2222222222 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 111111 11 22222222222222222 11111111111 2222 44444444444444444444444444 555555555555555 111111 555555555555555555 111 2222222222 111111 3333333 11 66666666666666666666666666666 2222 111111 1 111
lowQualScore : 0 9 0 6666 111111111111111111 5 1 0 999999999 0 1 1 6 0000 3 22 4 1 66 11111111111111111 2 0 0 66 11111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888 1 1 5 1 9999 8888 4 0 55 7777 888888 3 2 1 33333333 3 3 0 7777 0 2 3 3 77 3 8888888888 1 44 44 44 1 1 3 0 666 55 6 1 2 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000 33 2 2 2 22222222222 2 2 444 55555 2 66666 111111 77 5 33 2 555 55 33 2 11 8888888888 0 5 99999999999999999 0 44 0 33 1 444 1 66666666666 4 44 0 55 55 4 777 0 6 4 66 4 66 0 0 66 1 2 99999 0000 6 77777777777777777777777777 333 4 222222222222222 777777 1 0 0 0 555555555555555555 5 5 5 000 1 888 9999 5555555555 0 1 0 777777 888888 5 1 1 7 5555555 88 88 0 22222222222222222222222222222 77 0000 444444 0 1 2 0 33 777 7 1
lowQualScore : . . . .... .................. . . . ......... . . . . .... . .. . . .. ................. . . . .. ..... .................................................................. ... . . . . .... .... . . .. .... ...... . . . ........ . . . .... . . . . .. . .......... . .. .. .. . . . . ... .. . . . . .................................................. .. . . . ........... . . ... ..... . ..... ...... .. . .. . ... .. .. . .. .......... . . ................. . .. . .. . ... . ........... . .. . .. .. . ... . . . .. . .. . . .. . . ..... .... . .......................... ... . ............... ...... . . . . .................. . . . ... . ... .... .......... . . . ...... ...... . . . . ....... .. .. . ............................. .. .... ...... . . . . .. ... . .
lowQualScore : 7 8 2 2222 222222222222222222 1 7 1 777777777 4 0 4 5 6666 7 99 4 9 11 11111111111111111 2 9 1 11 11111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 0 0 0 0 8888 5555 0 3 55 0000 222222 3 3 0 88888888 3 3 8 1111 2 0 3 3 99 3 3333333333 0 66 66 66 4 8 8 2 333 22 6 0 3 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444 44 4 5 5 44444444444 5 5 444 88888 5 22222 444444 44 5 77 5 000 77 66 9 11 1111111111 4 0 22222222222222222 2 44 9 22 9 777 0 11111111111 0 99 7 55 55 0 888 8 9 4 11 4 11 9 1 33 0 7 00000 1111 4 00000000000000000000000000 111 4 111111111111111 666666 1 8 5 2 333333333333333333 7 7 7 000 0 000 3333 9999999999 6 0 7 444444 666666 7 0 7 8 5555555 88 66 8 99999999999999999999999999999 88 8888 555555 0 0 5 8 55 555 3 0
consensus : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATGTATATATAATC---A----ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATGTATATATAATC---A----ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTACC--T--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCAAT--TGAATTAAGGTAA--AAGG-TAA--------AAC-AACTTTTGAT-------CACATTTGAACTTGT-G---ACTTA-AACCCTG--GTTCAGCTGTACTCTTG-TGA-----------A-----AA-CGGTCAAAGGGAAACAACTATTG--TTTAA--TTGAACT----T-TTGATATTTATTCA------AAT-AA-TAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATC-TA-A--CT---T-GTC-AC-T-TTTATTTAATTAACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAAT----TA--ACCTTTTACTCAATTAATAATTAAAGG--------A---CAA---C---------AACC----C----TAG------TTCAG--TTGAACTT-AT--------G---ACTTACTA-T---TA----ATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAA-T-GAAC-TG--GTGA--CATGTAA---TCAATTAA-ATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTTGAA--C-TCCCC-TGAC-TTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT-----TGCAATTTAAAATCA---AT-T---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTT-GAAC--TTGAGGCTT-TTA--GTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAG---A-AAC--TTGTGACT--TGTTATC---AATTGAT----G--GTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAGAATTAT-T------CTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC-------G---------T-ATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT-AAAGTTCT-T--C-TCGTAATCA--AT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAGTTG------ATTTC--GCGA--------------TTTGTAATT---AATTGATGA-TCAA-ATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAACGGA---AACT-----TAAAAT---TAACC----------TTT-----TACTCAATT---A----ATAATTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGAAC--T--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCAAAAATGAAC-----TG---GTGA-C-AT-GTAATCAATTAA----ATAT-------CA------AA---GG-A---AA--ACAACTGAA--GTTCAGTTGAACTCCCC-TGAC-TTATAATCAA----TAA-TGGCCACAGTGAAAACATTATAA--ATCAAAATTCAA-T-T--T-GCAATTTAAAATCA------A-TTAA-TGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTT-GA-AC-TTG-AG-G-C-TT-T--TAGTCAA--T--TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAAC-TTGTG--AC-TTGTTATCAATTGATGGTCAAAAG---GAA------------T---------AACT----C----TTG------TTCAG--TAGAA-TT-ATT------------CTCATAG-T-----------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA---C-GAACGTAT-GCAT--TCTATACACTTCAATTTA-ATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT-AAA--G-TTCT--T--C-TCGTAATCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTT---CTGTGACATATAATCA---AG-A---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTT-GATT--TCGCGATTT-GTA--ATTAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTGTGCA-ATT--TTGTGACT----------GATAATATTTAATG--GTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTGAAC--T-TTAC-ATTT-ATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA---T-----------T-TTG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGA--T-ATAGTAA--AA-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA-----CATT--AC-A--------------TTTGTAG-T---AAATGATGG-T--A-ATGTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTTGAATTA-TAATG---AC-TTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAA---GTGTAA-TTAT---CT---CT-TTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-TGGTGACTT-ATA--GTCTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTG---ATAAT-GT-GTAGTT--C--TATCTGAAAATA-T--------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTGAA------------CT-ATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA-----G---------T-ATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATATG--AT-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : TTTTA----TAAATGGTCAAAGGCAGATGACTCCAG--TTTAG--TTGAA-T-TA-TTGTTACGTAGAGTTA------T-T-AA-TGATCGACGGAAAATAA----CTCTTGTTCAGTTAGA-A--ATA-T----C-AC-TTATAGTTTT--TAATCG--TCAAAGGGAAATAACTG--TTGTTCAATTAAAATGTTG-----C-TTATAGTCAAT-AATGGTTAAAGA---GAA------------T---------AACT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TT-AGT-------G-CCACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTGAAAGGGAAATATC-----TCTAGTTCATT---T-GAAT-TGTTGTTA--GGTACAG---TTATT--A-AAGGCCAAA-----G----GAAAATAACTGTTTTC-CAGTTAAA--A--AATG-TTAC-TGATAGTCTATAAT-CTTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : t----TAA-TGGTCATAGAGAAACAAATCTAG--TTC------GAA-A-AAGT-CTAACC-ATA-TCATTTTTTA-T-AA-AGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATT-GA-AAATCAGTT-A-C-CT-T-AT--TTTA--TAAAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAATGTTGTG--AC-GTATAGTATAT-AATGGTC----------A--A---CAA---T---------AA--------------------------------------T-------G-T-AACTATAGCT---TA-----TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAT-AAGTATGC--TTTTTAG---TCTAT--A-CTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTTAAA--A--ATTT-GAGT-T-GTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTA---TTGTTACt
gi|13 : t-----TCTAGTTTAAAAAAT-GAA-----TGCGAGACTTGAAA---TCAAT--TTATTGTCAAA-----G----TCAATCAGTTGTATTT-CAGTTGAA--C-T--TG-T----T--TCGTCAAT---GGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA----AAAAGAAACTTATGACTTGTAATCA---AT-TT--A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TATAGTTTA--GTT-AAACACTTGCGACTT-ATA-----AAT-AAT-------------AACAAATT-TAGTTAA---G---A-A---ATTGC-ATT--T--AATC-G---ATA---------GTCATTGGGAAACAACTCTGGTTTAA-TT
gi|13 : tcactaaatcaccaacattAATGGTCAAAGGGAAATAACT---CTTG--TT---TAAA-AAA---GAAACTTATG-ACTTGTAATC---AATTTATGGTCAAAGGGAAACAACTATAGTTTAGTTAAAC--ACTTGCGACTTATA---AAT-AAT-------------A-----------------ACAAATTTAGTTAAG----AAAT-----TGC--AT---TTA--AT---CGAT-AG----TCAT-------T------------GG-G---AA--ACAACTCTG--GTTT-----AATTATCGATAA------AATTAA----GAA-AGTTTAAAAGG--CCAATTTTGGGCTTT-G--TTAAA-T-AA-atcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|14 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcTATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTAGT--TAAAT-----TGC--ATAA-------------AT-AA----GAAC-------CA------AA-------------------TATA--GTTCAGTTGAAATAGTG-TAAC-T-ATATTTAA----TGG-TGTTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-TAAA-A-ATGATTTATAGTCA------A-C-TA-TGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTT-GA-A--TTA-TTAA-T-ACTT-ATAGTAAA--TAATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATATATTGTA--GT-TTATATTCAAT-AATGCTCAAAGG---AAA--A---CAA----------------C---TG----TAG------TTGAG--TTTAA----------------------ATAG-T---T-----TAA-ATAGTCAATGGGAAACAaata
gi|15 : ttgttacACTGT-TTTGAATCGAATAATTACATTTG---TTTATGAAT-TATAGTCCATA----GTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTT-AACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTAGT--TGAAA-----TAT--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-T-ATGAATTATAGTCC------A-T-AG-TGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTT-AACA--ATA-TT-A-T-AT-T-ATAATCAA--TAATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAATATT-TG--AC---ATATTCTAC-ATTGTTTCATCT---GAACTA---CAA---T---------CGTT---TCCCTTTGGTCATTTTTTAGTATTCAA-TT-GTTAAAATGAG-A-AAGCATAA-C---TATGTCTTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT---T-GAAC-TATTATGA--Ccatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttAG------TTCAA--TTAAA-TA-ATT-------G-TTACGTAAAA-C---TA----TTA-ATTATCAAAGGGATATAAT-----ACCAGTTCAGT---T-GAAT-TATTGTTA--CGTATAG---TTATT--A-AAGGTCAAA-----G----GGTATTAACTCTTTTC-CAGTTAAA-----AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAG--ATG-ATTC---TT-TAACGTATAGTaagttctgtta
gi|17 : aattaaccaAA---T---------AATT---TT----TA-------TTCAG--TTGAA-TTTATT-------G-TTATCTTTAG-TCATTA----TTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT---T-AAAA-AATTGGTA--CTTATTG---TCGTT--A-ATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTTAAA-----AATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACT
gi|18 : gttcaaaatggACTCTTGAT-CAGTTAAA--AATATT----AC-TTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--A---ACGATATTTATAGCCTTAAAT-T---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTT-GAATTAT
gi|19 : cctatagttttacctTG-TTAC-T-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTA---TTGT
gi|19 : acaTGTT--AC-T-ACAGTCATT-AATGGCCAAAGG---GAA--A---TAA--------------ATC---TC------G------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGACCAG-A---TA----TAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATATATATATAAT----A----ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGAAT--TATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAAT-----TATC-ATGAATTATCGT---CAAT-AA----TTAT-------CA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------A-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTG-GA-A--TTA-TT-A-CGAC-T-ATAGTTAA--TAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAA-TG--------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-CAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCT-ACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAAC-G-ATATTAA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTAAG--TTTAA----ATATT--GT-A--------------TCTATATCT----AATAACGGTTC-A-AAG-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTTAAA--A---ATGATACT-T-ATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACTTAT
gi|22 : gAG--TAGAA-TC-ATT-------G-TTACGAATAT-T---TA----TTA-ATGGTTTAAGTGAAATAAC-----TCTTGTTC
gi|3 : tTGTATTTGAATT------ATTG---------CTACGTATATA-AATC---A----ACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTAAA--AAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCAGT--TGAAT-----TAT---TG--TTAC-GT-----AT-AA----TTATAAATGAACA------AA---GTTG---AA--T-AACTCTTTTGTTCAGTTGAATTATTG---A--T-ATATATAGGCATTAA-TGGTCAAAGGGAATTACCTCTTG--TTCAG--TTAAA---AA-T-GTAACTTATAG-AA------A-T-AAATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTT-GA-A--TCA-TT-G-TTAC-TTATAGTTCT--AAATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAATTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA-AATGGTCCAAGG----AA--A---GAA---C---------A-------C----TAG------TTCAG--TTTAA-TT-ATT-------G-TTATGTATAG-T---TA----TTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA-----------ATTGTAA--CTGATAG---TCTAT--A-ATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG--AGG--A-TTTTT-TTACGT-ATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTC----AT-TA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-T-GA--AATTG-----T-ATA--GTCATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTC---T-ATT-ATTGTTACG--TAATATA-TAAATTAAT----G--GTCAAATGCCAATAATT-------------AAT-A------------ATA------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA---T-----------T-GTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTATTGTTACTT-ATAATCATTATGAATGGTCAAAGGGAAATAACTtgtta
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---G---TATATATATATATAAT----A----ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGAAT--TATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAAT-----TATC-ATGAATTATCGT---CAAT-AA----TTAT-------CA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-T-AA-T-GTGACATATAGTCA------G-T-GA-TTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTG-GA-A--TTA-TT-A-CGAC-T-ATAGTTAA--TAATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAATATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--A---CAAAATT---------AATTAA-TG----TAG------TTGAG--TTTAA-AT-AGT-------G-T-ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-TAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTTAAA--A-TAGTG-GAAC-T-AAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---GT-T---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTT-AGA--GTCTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AAAAATAATGAA-G--ATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAA-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA---
gi|5 : -T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TT-G-TAACGC-ATAGTTGG--TAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--gcctaacctaaacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-T-AG-T-GTTTCGTCTAGTTA------T-T-AA-TGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TT-G-TAACGC-ATAGTTGG--TAATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAATTAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAA---TCATTATTTAAATTAACTC-----AG------TTCAG--TTAGA-TT-ATT-------GTT-ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAA--A--AATG-TAAC-TGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATATC-----TCTAGTTCAGA---T-AAAT-TATTGT------------------T--A-AAGGTCAAA-----G----GTAAAAAACTCTTGTT-TAGTTAAA--A-CATGG-TA-C-T-AAAGTTATTAATGGCCAAAGGGAAATAACTTTTGTTCAG--TTGAAGTA---TTGTAACGTATAG-CT---ATAC---A-TGATCA----------AAC--TCTTGTTAA--TTT-AAA-AAT----ATTTCATAATATCATT-AATGG--TCAAAAGGAAATAACTA-GTGTTCAGGTG---A-ATT-GTTGTTACT--T--------GAAGTCAT-AA-ATTGTCAATGAGAAATAACTCTTCTTCAG-TTAAAT-ATATTAT-TA---ATAGTC--ATTGATGATCGAAGGGATATAACTCGTGTTCAGTTAAA-------AA---------TGATG--TT-TATAG---TCATT--AATGATC-AAA-----G----GGAAATAACTCTAGTTCAATTGAATTATTGTA-----------------AATGTTCAAAGAGAAATAACTCTTGTTTAGTTAAAACA-TGTTTC-TATAGTCAT-TAATGGCCAA-AGAGAAATAACTCCAGTTCAG--TTAAA----CTATT--GT-
gi|8 : ATGTATATATAGTC---ATTA-ACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAAAT--TACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCAGT--TGAAT-----TATTAATAG-GTATAGT---CATT-AA----TGGT-------CA------AT---GG-GGAAAA--A-AACTTTT--GTTTAGTTGAATTATTG-TTACGT-ACATTTAT----TAA-TGGCCTAATGATAATAACGCTTG--TT-AG--TTAAA-A-AA-T-GTTACTTATAGGCA------T-T-AG-TAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTT-TA-A--TTA-TT-G-------------TCA--T--TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAATTATTGTT--AC-GTATAGTTAAT-ACTGGTCAAAGG---GAA--A---CAA----------------C---TC----TTG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-TCACCTATAG-T---CA----TTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT---TAGAAA-TGTT---A--CTTATAG---TCAAT--A-ATtaccta
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTA---GTGTGACTAATAGTAT---GT-T---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAAGTGTTACTT-ATA--GTGAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTT---T-ATT-ATTTTGACTGAT--TGTT-AAAAAT-------G--GTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG--TGAAA-AA-ATGTGAA---ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAA--A---TAG---------T-GTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGAC-T-ATAATCA--AT-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTCTGA-TTGAACTGTACATTAAAT-AATTCCACTGTTTACTTTGTAACTTAAAAATAATGG-TC-ATATG-GAAAAAAGT---AT--AGTTG---AATT
blockSeqs : A GTAG GAATAATTACATTTG A T CAATTT G C G AATA A TA . A . . A AA . TTAATAGGTATAGTCATTAATGGTCAATGGGGAAAAA TTT C C A G CTT GCAT A GC AAAA AAAG T A T TTTTTTA T A GTTT A A C AA G AATACTT A . AA AT A G G TTA T A A T A CACAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACTCAG TA G . T AAAATGAGA T C CAT TGTCT T CATTT AAAAT CG A GA C ACT CA TT T TG CCTATGTTTC C TTATAATGACTT GG . C AAC G TCTTTAA . AT TA AA T CAC C C AT T . C G G TGCA AGAA G TTATCAAAAATAATGAAG GTA A AATTTGTAACT TTTATT C TTAGCCTAACCTAAACCC G . . . A G ATCA G G TACTT ATCATT G T T T GTCTAT A A CTGTACATTAAATAATTCCACTGTTTAC TC TAAA TTCA T A C TC . A T
blockSeqs : T GTAT TAAAAAAGAAA T A CCATA G T A AC T TT . A . . A . . TTGTTACGTATAATTATAAATGAACAAAGTTGAAT A T T . A CGT . . . AG TAAA . T G A . . . A . . C . GTTACTT T . . . T C G G T G A G A CACAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACTCAG . G . . GCC G . . T . . TTA T T . G . TA C . AG G C ATTTTTTTACGT GG . A . A TTAAATT . T . . . TTA T . . . . C T A AT AGAA A TTATCAAAAATAATGAAG CTA . AATTTGTAACT TTTT A TTAT . . . . T A ATC T G AACT GTAA . T T A GTCTTT A A ATATTGTA AC A TCAT . C C TC . A A
blockSeqs : T GTAG TAAATAGAG T A CATTA C A G TA A CA . G . . A . . GTGACATGTAATCAATTAAATATCAAAGGAAAAC G A G . A CT . . . AG TTA . A C T . . . A . . . . GTAACGC T . . . A A A G G G T G A GAACTACAATCGTTTCCCTTTGGTCATTT . T . . GTT C . . T . . AC T G . T . CT C . TT G . AAATGTTACTG TG . G . T AATTT . A . . . TAA C . . . . T A A A ATG A TAATATATAAATTAATG CTG . CTTTACATTT TTTT G TTAG . . . . T A TTT T G AACG TATG . A T T GTCATT A . CATTACA G . TA . G . . .
blockSeqs : GTT TAAATAGAG T A CA C C T AA G CT . G . . T . . TCATGAATTATCGTCAATAATTATCAAAAAGAAA A A G . A TT . . . AT TAA . G T A . . . A . . . . GTAACGC A . . . A C A A T T A . C GAAACAAAATGAATTAATGTAG . C . . GTT G . . T . . TT C G . T . CA . . TT G . ATAGTGGAACT GG . A . G TATAC . A . . . TAA G . . . . G A G A TTA T GATAATATTTAATG CGA . TATATTATTA TTTT A TTAT . . . . T A GTG G T GACT TTAA . A T T . . .
blockSeqs : C ATTG T A A C G G TA G CA . G . . A . . TCATGAATTATCGTCAATAATTATCAAAAAGAAA A T T . A TT . . . AG TAA . G T A . . . A . . . . ACGACT A . . . A T A G T T T . A GAAACAAAATTAATTAATGTAG . A . . GTT G . . T . . AT T G . G . TA . . AG G . ATAGTGGAACT AC . T . A AAGA . A . . . TAA G . . . . C T A T TTG A CTATCTGAAAATAT CGA . AAAATGTGAA GTCA G ATAG . . . . A A ATC G T GAT ATCA . A . . .
blockSeqs : . . A G C A TA G CT . G . . T . . CATTTAATCGATAGTCATTGGGAAAC A A G . T T . . . AT TAA . G A A . . . G . . . . ACGACT A . . . A C T T T G A . T AAAACAACTGTAG . G . . GTT C . . T . . TT A T . T . CG . . TG G . AAATGTAACTG GA . T . T TGTT . A . . . TA T . . . . G A G A TTA T TGAAGTCATAAATT CTT . CT ATCA G AA . . . . T . . A A A . .
blockSeqs : C . T G A . G . . A . . CATAAATAAGAACCAAA T T T . . . . . . AG TAG . A T A . . . G . . . . GCTTT C . . . A C A A T G T . C GAAATAAATCTCG . G . . GTT G . . A . . TT T T . T . AC . . TG T . AAATGTAACTG GG . T . T ATTA . A . . . AA . . . . . A T G A TT G GATTGTTAAAAATG TAA . TA . A
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . G TAG . G A G . . . G . . . . CACTT A . . . A C A A T T G . T GAAACAACTCTTG . T . . GTT C . . T . . TT T G . T . CT . . TT G . AATTTGAGTT GG . T . G TGTT . . . . . AA . . . . . T A . T A . TAATCGATA . .
blockSeqs : . . . . AAA . T G T . . . A . . . . ACCTT G . . . A C A T G G T . A GAATAACTCTTG . G . . GTC G . . T . . AA C A . T . AC . . TG T . AATGTAACTG GT . T . T TGTT . . . . . T
blockSeqs : TT . T G T . . . A . . . . ATATT G . . . T C A T G G T . A GAATAACTTTTA . T . . GT G . . A . . AA C G . G . CA . . AC G . AATGATACTT GG . T . T
blockSeqs : AA . T T T . . . A . . . . G C . . . . . . T G . T . A AAAGAACACTAG . T . . GT C . . T . . GT T T . G . A . . AC G . AATATTACTT AC . T . G
blockSeqs : . . . A . . AACAATAA . A . . GT G . . T . . GT A T . T . A . . AG G . AATGATACTT AC . G . A
blockSeqs : . A . . GT G . . T . . AT . . . . . . . . . ACATGGTACT GG . T . G
blockSeqs : . G . . . C . . . . . A . . . . GTTCTTCTC C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CTTGTT . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : GTAG TAAATANAG********* CTA****** TA** ** ***************** ***** CT** TAA*** N******* GCNACTT*** ** T* GAAACAACTCTNG************************************* GTT******** NT**** ** AATGTTACTT******* ** TAA ** N* NTA* TTATCGAAAATATG************ ATTTGTAACT***** TTTT** TTAN************** *** A** G********* GACT** A* **
originalCons : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTANTTGAATT---TAAATAGA---G---TTTATGTATATATAATC---A----ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-T-AA-T-GTGACNTATAGTCA------A-T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TT-G-C-AC-T-ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--A---CAA---T---------AATT---TC----TAG------TTCAG--TTGAA-TT-ATT-------G-T-ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAA--A-TANTG-TAAC-T-ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GAAAATAAT-AA-G--GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAN-AT-TTGT-AACT-ATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA---TAG---------T-ATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTAAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTCAGA-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
finalCons : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATTTAAATANAG---------TTTATGTATATATAATCTA------ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAACTA--TTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAACT--ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAATAA---T-GTGACNTATAGTCAN-------T-AA-TGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TTGCNACTT---ATAGTTNA--TAATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAATATTGTN--ACT-TATAGTCNAT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTNG-------------------------------------TTCAG--TTGAA-TT-ATTGTT--------ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGNT----GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTTAAAAATGTTACTT-------ATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---AT-T---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTT-ATA--GTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTN-TNGTTCAGTTG---A-ANTA-TTGTGACTTTATCGAAAATATG------------GTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTGAAATTTGTAACT-----ATATTTT--ATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTAN--------------T-ATG-ACT-TATAG---TCNATA--ATGATC-AAAG---------GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTGACT--ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAAA-GGGAAATAACTGTAGTTCAG--TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 11 2222222222222222 33333333 1111 33333333333333333 11111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222 111111 11 1 444444444444444444444444444444444444444444 111111111111 11 11 1111 11111 22222222222 1111 111111 44444444444444444 1 1111111111 111111 333333333333333 111 111 1111 3333333333 5555555555555 11 222222 7777777777777777777777777777777 2222 111111 1 111
lowQualScore : 0 9 0 2 00 7777777777777777 5 1 0 66666666 0 1 1 6 0000 3 22 4 1 66 11111111111111111 2 0 0 66 11111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 666 1 1 666 0000 0 22 7777 3 1 55 0 55 66666 3 3 3 4 44 111111 1 6666 2 3 3 44 3 22 5 4 444 44 0 44 2 2 3 2 3 555 44 9 1 1 0 999 33 333333333333333333333333333333333333333333 5555 5555 999 000000000000 4 2 444 5555 2 66666 999999 00 3 33 2 555 3 33 2 0 8888888888 5 7 2222 5555 22222 1 0 55 0 33 0 444 1 00000000000 4 4 55 55 4 88 0 5 4 66 0 55 1 2 99999 8888 6 000000 22222222222222222 2 2 0 66 0 1 7777777777 222222 2 22 0 444444444444444 2 5 5 111 22 000 5555 1111111111 1 2 999999 1 1 99 6 1 1 1111111111111 0 33 111111 6666666666666666666666666666666 77 0000 444444 0 1 2 0 33 777 7 1
lowQualScore : . . . . .. ................ . . . ........ . . . . .... . .. . . .. ................. . . . .. ..... .................................................................. ... . . ... .... . .. .... . . .. . .. ..... . . . . .. ...... . .... . . . .. . .. . . ... .. . .. . . . . . ... .. . . . . ... .. .......................................... .... .... ... ............ . . ... .... . ..... ...... .. . .. . ... . .. . . .......... . . .... .... ..... . . .. . .. . ... . ........... . . .. .. . .. . . . .. . .. . . ..... .... . ...... ................. . . . .. . . .......... ...... . .. . ............... . . . ... .. ... .... .......... . . ...... . . .. . . . ............. . .. ...... ............................... .. .... ...... . . . . .. ... . .
lowQualScore : 7 8 2 5 00 0000000000000000 1 7 1 77777777 4 0 4 5 6666 7 99 4 9 11 11111111111111111 2 9 1 11 11111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222 0 0 222 9999 7 44 7777 6 8 00 4 00 22222 1 1 3 0 11 999999 2 5555 3 1 1 22 1 11 9 0 777 22 8 22 6 8 1 8 0 999 22 0 0 4 9 333 77 777777777777777777777777777777777777777777 3333 0000 777 888888888888 7 4 111 0000 4 22222 666666 11 8 77 5 000 0 66 9 8 1111111111 0 5 2222 0000 11111 8 2 33 9 22 3 777 0 22222222222 0 0 55 55 0 99 8 3 4 11 1 44 0 7 00000 4444 4 888888 66666666666666666 0 1 4 11 2 4 6666666666 444444 7 99 7 666666666666666 4 7 7 777 00 888 5555 8888888888 0 5 555555 0 0 22 7 0 4 6666666666666 8 22 555555 5555555555555555555555555555555 88 8888 555555 0 0 5 8 55 555 3 0
consensus : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATANA---GTTTATGTATATATAATC--TA---ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTATTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTNG--TTCAG--TTGAA-TAA-T-G-TNACNTATAGTCAN-T------AATGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TTGTNACTTATAGTTNAT-A-ATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAA-TATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--AC-------------------A---------A-------CTCTNGTT----CAGTT----GAATT---ATTGT-T---------ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGN---T-GAAC-TATTGTNA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTT-AAA----A----ATGTT---ACTTATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---A-TT---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTTATAGTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TAGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GA-AAAT--AT--A--GGTCAAAGGGAAACAACTCNAGTTCAG-TTG-AAATTTGT-AACTATATTT--TATAANGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA--------------GTNTG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGGTN-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATAGTGTGAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTATGACTTATAGTC-T-TAATGGTCGA-AGGGAAACAACTGTAGTTC--AGATTGAA----ACATT--GC-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
Reference ( family-2650 ) : TAACGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATANA---GTTTATGTATATATAATC--TA---ACGGTCAAAGGNAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAC--TATTATGACTTATAGTCNAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACAACTCTAGTTCAGT--TGAAT-----TAT--ATGA-TTAT-GT---CAAT-AA----TNAT-------CA------AA---GG-G---AA--A-AACTCTA--GTTCAGTTGAANTANTG-TAAC-T-ATATTTAA----TAA-TGGTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-TAA-T-G-TGACNTATAGTCAN-T------AATGGTCAAAGGGAAACAA----CTCTAGTTCGGTT-GA-A--TTA-TTGCNACTTATAGTTNAT-A-ATGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTCAGTTGAAA-TATTGTN--AC-TTATAGTCNAT-AATGGTCAAAGG---GAA--AC-------------------A---------A-------CTCTNGTT----CAGTT----GAATT---ATTGT-T---------ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTCAAAGGGAAATAAC-----TCTAGTTCAGN---T-GAAC-TATTGTGA--CTTATAG---TCAAT--A-ATGGTCAAA-----G----GGAAACAACTCTTGTT-CAGTT-AAA----A----ATGTT---ACTTATAGTCAATAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTNACTTATAGTCT---A-TT---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAATTGNGACTTATAGTCAAT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTN-TNGTTCAGTTG---A-ANT-ATTGTGACT--T--TATC-GA-AAAT--AT-----GGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAG-TTG-AAATTTGT-AACTATATTT--TATGATGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAGTTGAATTA--------------NTATG-ACT-TATAG---TCNAT--AATGATC-AAA-----G----GGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATANTGTGAC-T-ATANTCA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAANTATTGTGACTTATAGTC-T-TAATGGTCAA-AGGGAAATAACTGTAGTTC--AG-TTGAA----ATATT--GT-A--------------TTTGTAACT---AAATGATGG-TC-A-ATG-GAAACAANTCTAATTCAGTTG---AATTATTNTGATTTAT
gi|1 : CAACTCTAGTTAAATTTACC--T--TAAGACTTGTTATCAATTAATTGTCAATAAAGAAACCCGATGAATTCTTGTGACAACTCCAATTCAAT--TGAATTAAGGTAA--AAGG-TAA--------AAC-AACTTTTGAT-------CACATTTGAACTTGT-G---ACTTA-AACCCTG--GTTCAGCTGTACTCTTG-TGA-----------A-----AA-CGGTCAAAGGGAAACAACTATTG--TTTAA--TTGAACT---T-T-TGATATTTATTCAAAT------AATAATCAAAGAAAAACAA----TTCGTGTTCAATC-TA-A--CT---TGTCACTTTTATTTAATTA-ACGA--TCAAACGGAAAC---------------TTAAAA-T----TA--ACCTTTTACTCAATTAATAATTAAAGG---ACA--AC-------------------A---------A-------CCCTAGTT----CAGTT----GAACT-----TAT-G---------ACTTACTA-T---TA----ATA-TTAGCCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAAAAA-T-GAAC-TG--GTGA--CATGTAA---TCAATTAA-ATA-TCAAA-----G----GAAAACAACTGAAGTT-CAGTT-GAA----CTCCCCTG-----ACTTATAATCAATAATGGCCACAGTGAAAACATTATAAATCAAAATTCAATT-----TGCAATTTAAAATCA---A-TT---AATGGTCAA-AGGAAAACAAC--TCTATTCCA--TTT-GAAC--TTGAGGCTTTTAGTCAAT---TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTATTGAAAAG---A-AAC--TTGTGACT--TGTTATC-----AATTGAT-----GGTCAAAAGGAA-TAACTCTTGTTCAG-TAG-AA--TTAT-TCTCATA------GTAATGGTCATATGGATTTAACTCTAGTTCAGACGAAC----------------GTATGCATTCTATACACTTCAATTTAATGGAA-AAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTTCAGT-AAAGTTCT-T--C-TCGTAATCA--AT-AATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATACTTGAGCTTCTGTGACATATAATCAA-GAATGGTCAATAGGGCTACAACTTAAGTTTAAAG-TTG------ATTTC--GCGA--------------TTTGTAATT---AATTGATGA-TCAA-ATG-GACACAACTCTGATTTAGTTGTGCAATT-TTGTGACTGAT
gi|1 : aaaatggTAACGATCAAACGGA---AACT-----TAAAAT---TAACC-------TTT-----TACTCAAT---TA---ATAATTAAAGGACAACAACCCTAGTTCAGTTGAAC--T--TATGACTTACTATTAAT-ATTAGCCAA--AGGAAA-----------------ATAACTCTTGTTCAAAAATGAAC-----TG---GTGA-C-AT-GTAATCAATTAA----ATAT-------CA------AA---GG-A---AA--ACAACTGAA--GTTCAGTTGAACTCCCC-TGAC-TTATAATCAA----TAA-TGGCCACAGTGAAAACATTATAA--ATCAAAATTCAA-TT--T-G-CAATTTAAAATCAA-TT-----AATGGTCAAAGGAAAACAA----CTCTATTCCATTT-GA-A--CT---TGAGGCTTTTAGTCAAT----TGAAATCAAAGGAAAAAAACTCATTA-TTGAAAAGAAA-C-TTGTG--AC-TTGTTATCAATTGATGGTCAAAAG---GAA---T-------------------A---------A-------CTCTTGTT----CAGTA----GAATT---ATT--------------CTCATAG-T-----------A-ATGGTCATATGGATTTAAC-----TCTAGTTCAGA---C-GAACGTAT-GCAT--TCTATACACTTCAATTTA-ATGGAAAAACCTATGTTTCGGAACAAAATCTTGTT-CAGT---AA----A----GTTCT---TCTCGTAATCAATAATGGTGAAAGGAAAACAACTCTTGTATAC--TTGAGCTT---CTGTGACATATAATCA---A-GA---A-TGGTCAATAGGGCTACAAC--TTAAGTTTAAAGTT-GATT--TCGCGATTTGTAATTAATTGATGA--TCAAATGGACACAACTC-TGATTTAGTTGTGCA-ATT--TTGTGACT----------GA-TAAT--ATTTAATGGTTAAAAAGAAGTAACTGTAATTCAAATTG-AACTTTAC-ATTTATATTTATTACCAT--TCAAAGGGAAACGAGTCTAGTTCAGTTTAATTA--------------TTTTG-ACT-T-TAG---TCAAT--GATGATC-GAA-----G----GGAAACAACTCTAGATTAATTGAAATAGTGTGA--T-ATAGTAA--AA-AATAGTCAAAGGGAAACTACTATAGTTCAGATGAATTATAATGAATTATA---------------A-AGGAAAATAACTGTAGTTC--AGATTGAA-----CATT--AC-A--------------TTTGTAG-T---AAATGATGG-T--A-ATGTGGAACAAATCTACTTCAGTTT---AATTATCTTGATTTGTaatatttaatggttaaaaagaagtaactgtaattcaaattgaactttacatttatatttattaccattcaaagggaaacgagtctagttcagtttaattattttgactttagtcaatgatgatcgaagggaaacaactctagattaattgaaatagtgtgatatagtaaaaaatagtcaaagggaaactactatagttcagatgaattataatgaattataaaggaaaataactgtagttcagattgaacattacatttgtagtaaatgatggtaatgtggaacaaatctacttcagtttaattatcttgatttgtagtcaatactggt
gi|10 : aaaatggcaactctagttaaatttaccttaagacttgttatcaattaattgtcaataaagaaacccgatgaattcttgtgacaactccaattcaattgaattaaggtaaaaggtaaaacaacttttgatcacatttgaacttgtgacttaaaccctggttcagctgtactcttgtgaaaacggtcaaagggaaacaactattgtttaattgaacttttgatatttattcaaataataatcaaagaaaaacaattcgtgttcaatctaacttgtcacttttatttaatGAAACAACTCTAGTT-TAGTT-GAATTATA----ATG-----ACTTACAGTCTATAATGGTCAAAGGGAAACAACTTTAGTTCAT--TTTAAAAA---GTGTAA-TTAT---CT---C-TTTAAA-GGGCCAT-AGTGAAACAAC--TCAAGTTCA--GTTTAAATA-TGGTGACTTATAGTCTTT-AATGG--TCAAAGGGAAACAACTC-TTGTTCAATTG---ATAAT-GT-GTAGTT--C--TATCTGA-AAAT--AT-------TCAAAAGGAAACAACTCTAGTATAG-TTG-AA---------CTATATTT--TAAAAATGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA--------------GTATG-ACT-TATAG---TCTAT--AATGTTT-AAA-----T----GAAAACAATTCTAGTTTTGTTGAAATAGTGTAAC-T-ATATATG--AT-AACGTTTAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAATTATTAGGACATATAGTC-TATAATagtcaatactggt
gi|11 : TTTTA----TAAATGGTCAAAGGCAGATGACTCCAG--TTTAG--TTGAA-TTA-TTG-TTACGTAGAGTTAT-T------AATGATCGACGGAAAATAA----CTCTTGTTCAGTTAGA-A--ATA-T---CACTTATAGTTTTT-A-ATCG--TCAAAGGGAAATAACTG--TTGTTCAATTAAAA-TGTTG-----C-TTATAGTCAAT-AATGGTTAAAGA---GAA---T-------------------A---------A-------CTTTTATT----CAGTT----GAATT---AGTGC-C---------ACGTATAG-T---TA----TTA-ATGGTGAAAGGGAAATATC-----TCTAGTTCATT---T-GAAT-TGTTGTTA--GGTACAG---TTATT--A-AAGGCCAAA-----G----GAAAATAACTGTTTTC-CAGTTAAAA----A----ATGTT---ACTGATAGTCTATAAT-CTTAAAAGGAATTAACT
gi|12 : t----TAA-TGGTCATAGAGAAACAAATCTAG--TTC------GAA-AAAGT-C-TAACC-ATA-TCAT-TTTTTATAAAGGTCGAAGGGAAACAAGTTTCTCTATTTCAATT-GA-AAATCAGTTAC--CTTAT--TTTAT-A-AAGG--TCAAAGGGAAACAACTC--TAGTTAAGTTGGAA-TGTTGTG--AC-GTATAGTATAT-AATGGTC----------A--AC-------------------A---------A--------------------------------T---AATGT-A---------AC-TATAGCT---TA-----TA-TTGGCCGAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTCAGA---T-GAAT-AAGTATGC--TTTTTAG---TCTAT--A-CTTGTGAAA-----G----GGAAGCAACTATAGTT-AAGTT-AAA----A----ATTTG---AGTTGTTGTTAAT-ATTGTCAAAGGGAAATAACTATAATAGAT--TTAAAGTA---TTGTTACt
gi|13 : t-----TCTAGTTTAAAAAAT-GAA-----TGCGAGACTTGAAA---TCAAT--TTATTGTCAAA-----G----TCAATCAGTTGTATTT-CAGTT-GAA----C----TTGTT--------TCGTCAAT---GGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA----AAAAGAAACTTATGACTTGTAATCA---ATTT---A-TGGTCAA-AGGGAAACAAC--TATAGTTTA--GTT-AAACACTTGCGACTTATA---AAT-AAT-------------AACAAATT-TAGTTAA---G---A-A---ATTGC-ATT--T--AATC-G--------AT-----AGTCATTGGGAAACAACTCTGGTTTAA-TT
gi|13 : tcactaaatcaccaacattAATGGTCAAAGGGAAATAACTCTTGTTTAA------AAAAGAA---ACTTATG-ACTTGTAATC--AATTTATGGTCAAAGGGAAACAACTATAGTTTAGTTAAAC--ACTTGCGACTTATA---AAT-AAT-------------A-----------------ACAAATTTAGTTAAG----AAAT-----TGC--AT---TTA--AT---CGAT-AG----TCAT-------T------------GG-G---AA--ACAACTCTG--GTTT-----AATTATCGATAA------AATTAA----GAA-AGTTTAAAAGG--CCAATTTTGGGCTTT-G--TTAAA-TAA-atcgataaaattaagaaagtttaaaaggccaattttgggctttgttaaataaaata
gi|14 : tcactaaatcaccaacatttctagtttaaaaaatgaatgcgagacttgaaatcaatttattgtcaaagtcaatcagttgtatttcagttgaacttgtttcgtcTATATTTTAT-GAAAGTCAA--AAGGAA-----------------AC--------TTTAGT--TAAAT-----TGC--ATAA-------------AT-AA----GAAC-------CA------AA-------------------TATA--GTTCAGTTGAAATAGTG-TAAC-T-ATATTTAA----TGG-TGTTCAAAGGGAAACAACTCTAG--TTCAG--TTGAA-TAA-A-AATGATTTATAGTCAA-C------TATGATCAAAGGGAAGCAA----CTATAGTTCAGTT-GA-A--TTA-TTAATACTTATAGTAAAT-A-ATGG--TAAAAAGGAAACAGCTC--AAGTTCAGTTGATA-TATTGTA--GT-TTATATTCAAT-AATGCTCAAAGG---AAA--AC-------------------A---------A-------CTGTAGTT----GAGTT----TAA-------------------------ATAG-T---T-----TAA-ATAGTCAATGGGAAACAaata
gi|15 : ttgttacACTGT-TTTGAATCGAATAATTACATTTGTTTATGAAT-TATAGTCCATA---GTGGTCAAAGGGAAACGACTCTTGGTAAGTT-AACAATATTATA--TTATAATCAAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------GCATCTCTAGTTTAGT--TGAAA-----TAT--TTGA-
gi|15 : gaaaatatcatacgcttttgtt-T-A-TGAATTATAGTCCA-T------AGTGGTCAAAGGGAAACGA----CTCTTGGTAAGTT-AACA--ATA-TTATA--TTATAATCAAT-A-ATGG--TCAAAGGGAAGCATCTC--TAGTTTAGTTGAAA-TATT-TG--AC---ATATTCTAC-ATTGTTTCATCT---GAACTAC-------------------A---------ATCGTTTCCCTTTGGT----CATTTTTTAGTATTCA-ATTGT-TAAAATGAGAAAGCATAA-C---TATGTCTTATAGGGTCAAAGGGAAACAAC-----TCTAGTTAAGT---T-GAAC-TATTATGA--Ccatattctacattgtttcatctgaactacaatcgtttccctttggtcattttttagtattcaattgttaaaatgagaaagcataactatgtcttatagggtcaaagggaaacaactctagttaagttgaactattatgacaagttctgtta
gi|16 : gaaaatatcatacgcttttgttactgttttgaatcgaataattacatttgttGTT----CAATT----AAATA---ATTGT-T---------ACGTAAAA-C---TA----TTA-ATTATCAAAGGGATATAAT-----ACCAGTTCAGT---T-GAAT-TATTGTTA--CGTATAG---TTATT--A-AAGGTCAAA-----G----GGTATTAACTCTTTTC-CAGTT-AAA----A----ATGTA---ACTGATAGTCTATAATACACAAAAGGAATTATCACTAGTTCAG--ATG-ATTC---TT-TAACGTATAGTaagttctgtta
gi|17 : aattaaccaaTCAAAAT---GGA--AT-------------------A---------A-------TTTTTATT----CAGTT----GAATTT--ATTGT-T---------ATCTTTAG-TCATTA----TTA-ATTGTAAAATGGAAATAGT-----TCTTGTTCAGT---T-AAAA-AATTGGTA--CTTATTG---TCGTT--A-ATGGTCAAC-----G----GAAAATAACTTGTGAT-CGGTT-AAA----A----ATGAT---ACTTATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACT
gi|18 : gtACTCTTGAT-CAGTT-AAA----A----ATATT---ACTTATAGTAATTAATGATCAAAGGGAAATAACACGTGTTCAG--TTAAA--A---ACGATATTTATAGCCTTAAA-TT---A-TCTT----AGTGAAATAAC--TCTAGTTAA--GTT-GAATTAT
gi|19 : cctatagttttacct----ATGTT---ACT-ACAGTCATTAATGGCCAAAGGGAAATAAATCTCGTTCAG--TTGAATTA---TTGT
gi|19 : acTGTT--AC-T-ACAGTCATT-AATGGCCAAAGG---GAA--AT-------------------A---------A-------ATCTCGTT----CAGTT----GAATT---ATTG--T---------ACGACCAG-A---TA----TAA-ATGGacgaccagatataaatgg
gi|2 : acaTAATGGTCAAAGGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---GTTTATATATATATAAT----A---ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGAAT--TATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAAT-----TATC-ATGAATTATCGT---CAAT-AA----TTAT-------CA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-TAA-T-G-TGACATATAGTCAA-T------GATTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAATTTGGTG-GA-A--TTA-TTACGAC-TATAGTTAAT-A-ATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAA-TATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--AC-------------------AAAATGAATTA-------ATGTAGTT----GAGTT----TAAAT---AGTG--T---------ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-CAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTCTTGTT-CATTT-AAAAT--A----GTGGA---AC-TAAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---G-TT---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTTAGAGTCTAC-AATGG--TCGAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AA-AAATA-ATGAA--GATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAAATTTGT-AACTATGTTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTAGCCTAACCTAAACCCTACG-ACT-AATAG---TCTGT--AATCGTG-AAA-----T----GGAAACAACTATAGTTCAGTTGAAATAGTGCAAC-G-ATATTAA--AT-AATGGTCAAAGGGAAACAACTCTAGTTCAGTTGAAATATTATGGCTTATAGTCTT-TAATGGTCAA-AGGGAAACAACTGTAGTTA--AG-TTTAA----ATATT--GT-A--------------TCTATATCT----AATAACGGTTC-A-AAG-GAAACAACTCTAATTCAGTAG---AATTATTATGATTTAT
gi|20 : TGAT-CGGTT-AAA----A----ATGAT---ACTTATTGTCATTAAT-------------TAACACTAGTTCTG--TTGAATTA---TTGTTACTTAT
gi|22 : gAGTA----GAATC---ATTGT-T---------ACGAATAT-T---TA----TTA-ATGGTTTAAGTGAAATAAC-----TCTTGTTCTGT---T-
gi|3 : tTGTATTTGAATT--------ATT---GCT-ACGTATATA-AATC---A---ACGGTCAAATGCCAATCACTCTAGTTGTGTTTAAA--AAT-GTAACTGGTAGTCATT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ATAACTCCATTTCAGT--TGAAT-----TAT---TG--TTAC-GT-----AT-AA----TTATAAATGAACA------AA---GTTG---AA--T-AACTCTTTTGTTCAGTTGAATTATTG---A--T-ATATATAGGCATTAA-TGGTCAAAGGGAATTACCTCTTG--TTCAG--TTAAA--AA-T-G-TAACTTATAGAAAT-A------AATGGTCAAAGGGAAATAA----TTCAAGTTTGTTT-GA-A--TCA-TTGTTACTTATAGTTCTA-A-ATGG--TCATAGGGAAATAACTC--T---T--GTTGAAA-TTTTTTTTAAC-TTATATTCGTA-AATGGTCCAAGG----AA--AG-------------------A---------A-------CACTAGTT----CAGTT----TAATT---ATTGT-T---------ATGTATAG-T---TA----TTA-AAGGTCAAAGGGAAATAACCATTTTCCAGTTAAGA-----------ATTGTAA--CTGATAG---TCTAT--A-ATTCTCAAA-----G----GGAATTAACACTAGGT-CAG----AG----G----ATTTTTTTACGTATAGTTATTAATGTTCCAAGGGGAATAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTGTTACTTATAGTC----A-TTA--A-TGGTCAA-GGGGAAA-AACTATTTAG--CA--G-T-GA--AATTG-----TATAGTCATT-AATGG--TCAAAGTGAAAAATTTC-TTGTTTAGTTC---T-ATT-ATTGTTACG--T--AATA-TATAAATTAAT-----GGTCAAATG---------CCAAT----------AATTAAT-AA-TA--------ATAATGGTCAAACGGAAATTACTCCGTTCCAGTTCAATTA--------------TTGTT-ACG-TATTG---T-TAT----------AAA-----G----TGGAATAGCTCAGGTTCAGTTGAATTATTGTTACTT-ATAATCATTATGAATGGTCAAAGGGAAATAACTa
gi|4 : tgaaagcccaagtatatatcaaagtaaatcaaatcaaatataaactgttttgcggaattccaatatattcttgGGATACAACTGTAGTTGAATT---TAAATAGA---GTATATATATATATAAT----A---ACTGTTAAAGGCAAACAGCTCTAGTTCAAAAGAAT--TATTATGACTTATAGTCTAT-AATGGTCAA--AGGGAA-----------------ACTATTATAGTTCAAT--TTAAT-----TATC-ATGAATTATCGT---CAAT-AA----TTAT-------CA------AA---AA-G---AA--A-AATTCTA--GTTTACTTGAAATAGTG-TAAT-T-ATATCTAA----TAA-TGTTCAAAGGGAAACATCTCTAG--TTCAT--ATGAA-TAA-T-G-TGACATATAGTCAG-T------GATTGTCAAAGGGAAAGAA----ATCTAGTTTGGTG-GA-A--TTA-TTACGAC-TATAGTTAAT-A-ATGG--TCATAGGGAAACAACTC--TAGTTCTGTTGAAA-TATTATA--GC-TTATAGTATAT-AATGGTGTAAGA---GAA--AC-------------------A---------A-------AATTAATTAATGTAGTT----GAGTTTAAATAGTGT---------ATCTATAT-T---TA----ATA-ACGATTAAATGGAAACAAC-----TCTAGTTTAGA---A-TAAT-TATTATGA--CTAATAG---TACAT--A-ATGATCAAA-----T----GGAAACAACTTTTGTT-CATTT-AAAAT--A----GTGGA---AC-TAAATTTAATAATGGTCTAAGTGAAACAACTCCAGTTCAG--TTGAATTA---TTATGACTTATAGTCT---G-TT---A-TTTTCAA-ATGGAAACAAC--TCTAATTCA--TTT-GAATAATTGGGACTTAGAGTCTAC-AATGG--TCAAAAGGAAACAAATG-TAGTTCAATTG---A-AAGAAGTGTAACT--T--TATC-AA-AAATA-ATGAA--GATCAAAGGGAAACAACTCGAGTTCAA-TTGAAAATTTGT-AACTATATTT--TATGAAGGTCAAAGGGAAATAACTCTAGTTAAGTTGAATTA--------------GCCTA-ACC-TA
gi|5 : -TAG-T-G-TTTCGTCTAGTTAT-T------AATGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TTGTAACGCATAGTTGGT-A-ATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAAT-TAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAATCATTATTTAAATTA---------A-------CTC-AGTT----CAGTT----AGATT---ATTGT-T---------ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAAA----A----ATGTA---ACTGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--aacc
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat-TAG-T-G-TTTCGTCTAGTTAT-T------AATGGTCTAAGTGAAATAA----CTCTAATTCAGTT-GA-A--TTA-TTGTAACGCATAGTTGGT-A-ATGG--TGAAATGGAGATAACTC--CAGAACAGTTGAAT-TAGTGTT--AC-GTAGA-TTTATGAATTGTCAAAAGCACAAA--ACTCCAATCATTATTTAAATTA---------A-------CTC-AGTT----CAGTT----AGATT---ATTGT-T---------ACGTGGAA-C---TA----TTA-ATGATCAAAGGGAAATAAT-----TCCAGTTCAAG---T-GAAC-TATTGTTA--CGTAAAG---T-AATC-A-AACGTCAAA-----G----GAAAATAACTCTTTTTCCAGTTAAAA----A----ATGTA---ACTGATAGTCTATAATACTCAAAAGGATTTAACACTAGTTCAG--a
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCTCTA--GTTCAGATAAATTATTG-T------------------TAA-AGGTCAAAGGTAAAAAACTCTTG--TTTAG--TTAAA-ACA-T-G-GTAC-TAAAGTTAT-T------AATGGCCAAAGGGAAATAA----CTTTTGTTCAGTT-GA-A--GTA-TTGTAACGTATAGCT-AT-ACATGA--TCAAA---------CTC--TTGTTAATTTAAAAATATT-TC--A--TAATA-TCATT-AATGGTCAAAAG---GAA--AT-------------------A---------A-------CTAGTGTT----CAGGT----GAATT---GTTGT-T---------ACTTGAAG-T---CA----TAA-ATTGTCAATGAGAAATAAC-----TCTTCTTCAGT---T-AAATATATTATTA-----ATAG---TCATT--G-ATGATCGAA-----G----GGATATAACTCGTGTT-CAGTT-AAA----A----ATGAT---GTTTATAGTCATTAATGATCAAAGGGAAATAACTCTAGTTCAA--TTGAATTA---TTGTAA--------------------A-TGTTCAA-AGAGAAATAAC--TCTTGTTTA--GTT-AAAACAT-GTTTCT-ATAGTCATT-AATGG--CCAAAGAGAAATAACTC-CAGTTCAGTTA---A-ACT-ATTGTTACC--T--
gi|8 : aatatATGTATATATAGTCATTA---ACGGTGAAAGGGAAATAACTCGAGTTCAGTTAAAT--TACTGTAACTTATAGT-TAT-AATGGTCAA--ATGCAA-----------------ATAATTCCAGTTCAGT--TGAAT-----TATTAATAG-GTATAGT---CATT-AA----TGGT-------CA------AT---GG-GGAAAA--A-AACTTTT--GTTTAGTTGAATTATTG-TTACGT-ACATTTAT----TAA-TGGCCTAATGATAATAACGCTTG--TT-AG--TTAAA-AAA-T-G-TTACTTATAGGCAT-T------AGTAGTCAAAGGGAAATAA----CTCTATTTCAGTT-TA-A--TTA-TTG-----------TCAT----TGT--TCAAAGTGAAATAAATC--TTGTTCAGTTGAAT-TATTGTT--AC-GTATAGTTAAT-ACTGGTCAAAGG---GAA--AC-------------------A---------A-------CTCTTGTT----CAGTT----GAATT---ATTGT-C---------ACCTATAG-T---CA----TTA-ATGGTCAAAGGAAAATAAC-----TCTTGTTCAGT---TAGAAA-TGTT---A--CTTATAG---TCAAT--A-ATa
gi|9 : agtgattaatatatatatatgatacgtacTCAAAGGGAATTAGCTGTAGTTTAA--TTGAATTA---GTGTGACTAATAGTAT---G-TT---A-TGGTCAA-ATGTTAATAAC--TCTAGTTCA--GTT-GAATAAGTGTTACTTATAGTGAAT-AATGG--TCAAAGGGAATCAACTT-TAGTTCAGTTT---T-ATT-ATTTTGACTGAT--TGTT-AA-AA----AT-----GGTCAAAGGGAAATAATTTAAGTTCTG-TGA-AAAAATGTGAA--ATAATC--AGTAATGGTCAAAGGGACACAACTCTTATTCTTTTAAAATA--------------GTGTG-ACT-AATAG---TTTAT--AATGATCAAAA-----A----GGAAACAACACAAGTTCGATTGAAA-AATTTGAC-T-ATAATCA--AT-AATGGTCGAAGACAAACTACTCTAGTTCCGTTGAAATATTGTGACTTAT-------------TCGA---GAAAATAACTGTAGTTC--TGATTGAACTGTACATTAAAT-AATTCCACTGTTTACTTTGTAACTTAAAAATAATGG-TC-ATATG-GAAAAAAGT---AT--AGTTG---AATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGCAAAAAACTCCAATCATTATTTAAATTAACCAAGTTCAATTAAATAATTGTTACGTAAAAC