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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgtgctgttgcacggtaataaatggggtgatcttaaaaagataaaaagaggtccttttgcagtccaataaaactttagtatacaatttaatacaacgattcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtacctttTATATAATGAAACGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTATTAGCTGCGAAAAAT-GGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGC
gi|4                          : caaaccctactgttacacaatttaataaaacgactcacagatgttaagtgaagttaaatgaatagcatatagaacagaatagaatataacacaattacaaataaactaaatatcaatgcgttttccatcaatatatatccaaggtgttataaacaaaaccaatctcacatagaatataaataaaattattcacagtctgttgactgtttttgtaaaagcaacacgccaaattaaactgaaatttaacacgaaagctgaatcaattcaattaataataatctaaactattcacgtcttaccatagaatccatttctaaattttaaaacaagtataattacaaaaacttgtgaacaatttataaatttccaattataaattttgttttgtacaactttaatttacgagagtacattatttaacttatggaaccgaaagagacaaataccgaaaagactggaaaggtattttgtactgttgaagattgtacatctataaataagataattttgtttcattaagatactgcaagcgttaaagagaaaaacattaacaataatgttcatatgaacctaaaaagtacttaactgaataaaccgtcttggacttcatgtctatcattttatcaacaaactcgaaacaaatcaactcatgaatatacaattctgataactttcaactgaatttcatatattttaaactttcacactgtatatttattatggcagaacataagatctattttaaaacaaaataacatatatctacaaataaacttcaagaaaagatcacttacctaaaaagataaaaagaggtccctttccagtccaataaaactttattacacaatttaataaaacgagtcacagatgttaagtgactggacctagagtaaggtacctTATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGTAAAAAAAAAATGCTG----TATATTAATTAGGGTTGGTTTCTCGACCAATCATTTCACAG-CGTCTTAGCTGCCAAAAAG-GGGCATTTACATAAAA--ATAATGCGATCATACTT-------AAATTAATC---CC-AGAAAACCTCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTAAATAAATTTAC--GTGTATCGACTACCTTTGATTAA-CTGATTATTTCTAT-CCGGCCAAGCT-CTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGAATCTATCGCTAAAATGGAACCCTTGTTTCAGT--------GATCCGGTTAGTATATTGGACGAGCTGCGAA--A----ATATT-CAAAAA-TGCAAA-TATCAAACTAGAGAAGTTTATCACTAATGTTAAAATTACGAGTTACCTAAAAT---ATTTAAATTTTGGACAATTTATAATTGTTTAAAATACTCAAAATTTACTGTATGACA--TAATTTTCAGCTT-TTCAAAAA-TATTATAAACAAATTGAAATAAAACTTG---TCT----TTTTCT-GTGATTCA---AAACAAATATT-ACAACAAA-TTTTACTGAAACTTGCCGCATAAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattttgcgcggctttgtgcggtaaatggggtgatcctaaaaggataaaaagatgtccttttccagtccaataaaactttattttacaatttaatacaacgagtcacagatattaagtgactggacctggagtaaggtacctttTGTAATGAGAATTGGCTTGTCAGTTTATGCCAATGGAA--TGCTG----AATATTAATTAGGGGTGATTTTTTTACCAATCATTTTATAC-TGTGTTAGCTGCGAAAAAGTGGAT-TTTAC-CAAAA--ATAATGCGATTAAGCTT-------AAATTAATT---CC-AGGAAACCC-----------ATATATAACATGGTGTTGCATCAATTTAC--GTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATAATTTATAT-CCGGCCAAGCT-CTTCCAGTCAAAAACACTTGCGGATTATTACTTTAAGTCAAGACCCTATCGCTGGAATTGAACTC----TTAAGAGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAATT----ATTTT-AAAAAA-TGCAAA-TATCGAACCAGAAAAGTTTATCACTGATGTT--AATTA----TT--------TGTAATT---TTT-----CAA---AATA---CTCAAA----TCAAAGTTGACAGTATGACATTTTTTTTTCAGTTA-TTTCAAAA-TATTATAAACAAATTTAAATGAAATTTGTCGTTT----TTTTCT-GTGATTCA---AAACAAATATTATAAACCAA-TTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttttgtgctgtgtgggataatggggttatcctaaaagataaaaaggtctttttccaagtccaataaaactttattttacaatttaatacgagtcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtaccttcTAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGttgtga
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aattttgtgccgttagcgaggtaataatggggtgatcctaaaaagataaaaagaggcccttttccagtccaataaaactttattacacaatttaatacaacgagtcacatatgttaagtgactggacctagagtaaggtaccttcttGCGTCTTGTCAGTTTA-TCCAATGAAA--TGCTGGATGCATATTTGTT----GTGCTTTCCTGATCATTCATTGCAAAGACGCGTACACTGCCAAAGAG-GGGCGTTTACATCAAA--ATAATACCGTAAGGCTCTTTCAAAGAACCTATTAATCTCAGGAAATCCCAGTTTTGAAAATCTGTAACATATTGTTATA--AAGTTACCCATGTTTGGGCTAGATTTTATTTAACTTATCAGATACATGCCGTACGGGCTTCTTCTG-----AAACACTTCCA--TAATTGCTTAAAGTCAAAACCGTGTCGCTATATTTG-ACCC--ATTTCAATG----GG----CCGACTAGTGTATTC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaccaatt---CTCAGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTAC--GTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTGTAT-CCGGCCAAGCT-CTTCCAGTC-AAAACAATTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCAATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAA--A----ATATT-CAAAAAATGCAAA-TATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAATGTTAAAATTACGAGTT--------T---ATT---ATT-----CAA---AATA---CTCAAA----TCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTA-TTCAAAAA-TATTATAAACAAATTTAAATAAAATTTGTCGTCT----TTTTCC-GTGATTCA---AAACAAATATTATAAACAAA-TTTCACTGAAATTTGCCGCATAACacca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaatCTGTAAA--CTTTGAT-TT-GAGTATTTTCAAAATTTTGAACTAGAAAAGTTTATCACTAATGTTTGAATTATATGTT--------T---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---ATT---TTT-----CAA---AATA---CTCAAA----TCAAAGTTTACCGTACAACA--CAATTTTCAGTCA-TTCAAAAA-TATTATAAACAAATTTAAGTAAAATTTGATGTCT----TTTTCC-GTGATTCA---CAACAAATTTTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCGTtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttttttcagagattcaaaacaaatattacgaacaaatttttaatgtaatttgtcgccttttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgta---ATT----TT-----GAA---AATA---CTCAAA----TCAAAGTTTACAGTACAACA--TAATTTTCAGTTACTC--AAAATTATTATAAACAAATTTTAAAGAAATTTGTTGGCT----TTTTTCAGAGATTCA---AAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taattatTTAAGTCCACAATTTGCACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAACTGATTTTAAAAAATTGTTTCTTATAAAGAAAAAAATCCGAAAACATCACCAGGTAGATCAACATCTCTAGCGACAGGCAACATTTTTTAAAAATCAGGGAAAACCTGAGGGTTTTTTTGCCGAAAAACAGATTCATTACTATAATTGCACTTAAGAATTGTAAATCAAGCGATTCTTGAatac
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATGGAAAACAAGTCTTTTTAAGGGCGACCCTACTATGACGCCTGTGTTGAAAATGGCTGCTGAATGGCAGCAGGCAAGGTAAATTTGAATGTTTTTTTTGCATGGTTTGTATGAATTATTTATTATTTTACCAGTTTCGATCAACATTTTAAGGAATTAACAATTTTTACTCTATATTTGCCTTTGGAAAAGACATATGTATGTCGGTTAATTTTCTGTTTGGTTTTGTTCGGGAAAGAAATGAGACTTAAAGGGGCTTGTCTCTTCCCTATTACAGCATTCAAATAAGATTATTCGACCTCCATCTTGTCTGCTCTGAGAGATAACTCACCAGTGGCTGGGATCCATTGATTCTGCACCGACGTTTCGTTCTGGTGGCACGGTATTAATGGACTGTTCCTAAAAAGATAAAAAGAGGTCCTCTTCCAGTTTCAACAAAACTTTTATTACACAATTTACGATTTAATATAACGAGTCACAGGATGTTATAAATAGTTATTAAATGAATTACGTATAGAATAGAATAGA
Unaligned ( gi|15 ): CTTGCCTTTACTATGAAAGGTATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTCTCCACCACGTTTTGTGTCATTTTCACGGTATTAATGGGTTGTTCCTTAAAAGGTAAACAGAGGTCTCCAGTTCCAATAACACTTTAATTACACAATTTACAATTTAAAATAACGAGTCACAGATGTTAAATGCAGTTCTTAAATGAATAACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): CAAGGACCGTAAACATGTCCATTTTGCAATGTAGTTT






Alignments
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Reference ( family-2609 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----TAATCCCCAGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-NAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---A---T---TATTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTANAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCATAACACTTTTGAATGACTAGNNAANTGTGTTGATCATACGGTAAAATAAATCAAACATTCATTTAAGCAACAGGTGATATGGTCTCGTGCAAAGCATGAAACTCATTTGACTTGGCCAAGCATGAAAAGTAGACTCATCTATATTTGTCAAGGACGCACCTTATTGGATAAGTAAAACATAGCCGTGTCAATAATATGATAAATGATTGACACGTGGACAAACAGTCATTTAGAAAATACTAATTACGTTAATGTTTTTGTTTTTAGCCGATAACAATACTGAGAGCTCAATCATAAGAACATAGAAAATGATATAATTTTTATGGTATTAACTATTTATCACCGGNAAATGAAAATAGTCTTTACAAAGTGGATATAATCTGAACTTATAATCGGNNGANAGGAATGGNTATTACATCNCANAGTTCGTNANCCACTTTATACATAAACTTATANTATATCCAACCGATTTNAAACACAATTCTCAACANTGAAATGCATCTGTATGTCTTACNATTCTAATGTATCATCNGNAATNNGCCAAGTACAGTAGCGGATTATGAGACAACTTAGATGTTGTTTANATGTATTCCTACGGTATAAGAAAATGTATGAATATTTGCAATTGATACGATNCATGNNGGAAAATACTTATATAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACGTTGGTGTCGGTGACGTCGCGTAAGAACTAGACCGCGGTAAGGCCTATGGTAGCTAATTCCCCGTTCTCTAAGCCGATTCCTAACTAAATGTCGACTAACAGGGCGTCCATGGTTACCTATCACTAAATGTGACGTGGATTCAGCCGTCAGAAATCTGTCAGATCTGTTTGCCTATCGACAAACGCGCCCGTGTCTCTGACACGGCGAACGAGAGGCAATATTTTCGAACGAGAGAAGTTAAAACGTCTAGCGACTTGTTCTTACGCTCGCCCACATTCAAGCATGGCCAAAACTTTGGCCCTCTCTTCGAAATTTAGCCTCGGCATTATAAGAAACTGGATAAGTGTTAGAAATTCTCTGAAAATATGGTTGTATGTCGACTAACGCATGTCCCTGTCTAAAATTCACTCAATAAAACCACACGGTTGACATGCACGGGATGCACGAGCAAGTACATGACTTAAACAATGCGCTTAATAAAATAGTACGAGTTTCGGTTGGTTGGGTTAGTCGGTCAGAGTACATGTACATTTTTGACATTTCCCCCAAATTTAAACTTTGTAACGAAAATAACGCCAGTTTTCGATGAGGCGTTTCTTTATCTCGTCAGTGTAGTAGTTTACACTGAAAGATTGGTCAATTTGTCATTTTTTGTCAAGATAGTGATTCCTTTAATATCATCAATTTATTTTCGGGAAGCATATTTAACATTGCTATACACCACGTAAATCGAATCTCAAGTCCACAATTTGCACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAANTGATTTTAAAAANTCGNTCCTTACAGNGGNAAAAANCCGAAAACGTCACCAGGTAGATCAACATCTCTNGCGACAGGCAACATTTTTTAAAAATCNGGGAAAACCTGAGGGTTTTTTTGCCGAAAAACAGATTCATCACTATAATTGCACTTAAGAATTGTAAATCGAGCGGTTNTTGAAAAATCGACTCACTCTATAATAAATGATATAATAAATTGATATTAATTATTATTAATTGCGATGGATTGTGGACAAATTTTCCATTCCGCAGATGATCTTAAAGTGCAGACTTTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taattatAAATTTTGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTT------------GAATT----A-TATGTTT---A---atac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTAGT-------------GATA------------AACTT----TTCTAGTTC---AAAAT---T-TTGAAAATACTCAAATCAAAGTTTACAGTACAACA--TAATTTTCAGTTACTCAAAA---TTATTATAAACAAATTTT-AAAGAAATTTGTTGGCTTTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCtgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttttttcagagattcaaaacaaatattacgaacaaatttttaatgtaatttgtcgccttttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taaacatataattcaaaTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCCTTTTCCA-GTTATTCAAAACAAATGTTATAAACAAA-TTTTAATGTAGTTTGCCGCATAACACTcttttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taaacatataattcaaacattagtgataaacttttctagttcaaaattttgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttTTAAGTCCACAATTTGCACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAACTGATTTTAAAAAATTGTTTCTTATAAAGAAAAAAATCCGAAAACATCACCAGGTAGATCAACATCTCTAGCGACAGGCAACATTTTTTAAAAATCAGGGAAAACCTGAGGGTTTTTTTGCCGAAAAACAGATTCATTACTATAATTGCACTTAAGAATTGTAAATCAAGCGATTCTTGAaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaatcaaatagctattgaTAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aattttgtgccgttagcgaggtaataatggggtgatcctaaaaagataaaaagaggcccttttccagtccaataaaactttattacacaatttaatacaacgagtcacatatgttaagtgactggacctagagtaaggtaccttctt---A---T---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACAACA--CAATTTTCAGTCATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AGTAAAATTTGATGTCTTTTTCC-GTGATTCACAACAAATTTTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgtaTTCTTGAAAA---ATGTTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAAT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAACGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTATTAGCTGCGAAAAATGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGC
gi|4                          : caaaccctactgttacacaatttaataaaacgactcacagatgttaagtgaagttaaatgaatagcatatagaacagaatagaatataacacaattacaaataaactaaatatcaatgcgttttccatcaatatatatccaaggtgttataaacaaaaccaatctcacatagaatataaataaaattattcacagtctgttgactgtttttgtaaaagcaacacgccaaattaaactgaaatttaacacgaaagctgaatcaattcaattaataataatctaaactattcacgtcttaccatagaatccatttctaaattttaaaacaagtataattacaaaaacttgtgaacaatttataaatttccaattataaattttgttttgtacaactttaatttacgagagtacattatttaacttatggaaccgaaagagacaaataccgaaaagactggaaaggtattttgtactgttgaagattgtacatctataaataagataattttgtttcattaagatactgcaagcgttaaagagaaaaacattaacaataatgttcatatgaacctaaaaagtacttaactgaataaaccgtcttggacttcatgtctatcattttatcaacaaactcgaaacaaatcaactcatgaatatacaattctgataactttcaactgaatttcatatattttaaactttcacactgtatatttattatggcagaacataagatctattttaaaacaaaataacatatatctacaaataaacttcaagaaaagatcacttacctaaaaagataaaaagaggtccctttccagtccaataaaactttattacacaatttaataaaacgagtcacagatgttaagtgactggacctagagtaaggtacctTATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGTAAAAAAAAAATGCTG----TATATTAATTAGGGTTGGTTTCTCGACCAATCATTTCACAG-CGTCTTAGCTGCCAAAAAGGGGCATTTACATAAAA--ATAATGCGATCATACTT-------AAAT----TAATCCC-AGAAAACCTCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTAAATAAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAA-CTGATTATTTCTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGAATCTATCGCTAAAATGGAACCCTTGTTTCAGTGAT--------CCGGTTAGTATATTGGACGAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAA-TGCAAATATCAAACTAGAGAAGTTTATCACTAATGTTAAAATTACGAGTTACCTAAAATATTTAAATTTTGGA-CAA-TTT---A---TAATTGTTTAAAATACTCAAA-----ATTTACTGTATGACA--TAATTTTCAGCTTTTCAAAA---ATATTATAAACAAATTGA-AATAAAACTT---GTCTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTAC-AACAAA-TTTTACTGAAACTTGCCGCATAAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattttgcgcggctttgtgcggtaaatggggtgatcctaaaaggataaaaagatgtccttttccagtccaataaaactttattttacaatttaatacaacgagtcacagatattaagtgactggacctggagtaaggtacctttTGTAATGAGAATTGGCTTGTCAGTTTATGCCAATGGAA--TGCTG----AATATTAATTAGGGGTGATTTTTTTACCAATCATTTTATAC-TGTGTTAGCTGCGAAAAAGTGGATTTTAC-CAAAA--ATAATGCGATTAAGCTT-------AAAT----TAATTCC-AGGAAACCC-----------ATATATAACATGGTGTTGCATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATAATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTCAAAAACACTTGCGGATTATTACTTTAAGTCAAGACCCTATCGCTGGAATTGAACTC----TTAAGAGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAATTATTT-TAAAAAATGCAAATATCGAACCAGAAAAGTTTATCACTGAT-------------GTT--------------AATT----A-----TTTGTAA---T---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTGACAGTATGACATTTTTTTTTCAGTTATTTCAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATGAAATTTGTCGTTTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACCAA-TTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttttgtgctgtgtgggataatggggttatcctaaaagataaaaaggtctttttccaagtccaataaaactttattttacaatttaatacgagtcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtaccttcTAT-TAA-GAAAAGTAACCTGGAAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TTTATTAATGAGAGGTAATTTATTGACATATCATTTCCTAG-CGTGTTAGCTGCAAAAAATGGGCATTAACATAAAAGAATAATGCGATTAGACTT-------AAAT----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTGGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTAA--CGTGTTTCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TTTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGA--CTATCGCTAAAA-CGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGATAAGCTGCGAAAATA-TTCAAAAAAATGCAAATATCAAtgtga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgtgctgttgcacggtaataaatggggtgatcttaaaaagataaaaagaggtccttttgcagtccaataaaactttagtatacaatttaatacaacgattcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtacctttTATATAATGAAAAGTGTCTTGTCAGTTTAAGCAAATGCAA--TGCTG----TATATTAATGAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CATGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCAACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----CAATCCC-AGGAAA------TTTTGTACATCTATAACAAGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCAAATACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGACCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGTGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACGCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCAAACTAGAAAAGTGTATCACTAAT-------------GTTA------------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cctaaaaagataaaaagaggtccttttccagtccaattaaactttattacacaatttattataacgagtcacagattttaagtgactggacctggagtaaggtacctC----TAATCTC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTGTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACAATTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCAATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---A---T---TATTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTCACTGAAATTTGCCGCATAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATGGAAAACAAGTCTTTTTAAGGGCGACCCTACTATGACGCCTGTGTTGAAAATGGCTGCTGAATGGCAGCAGGCAAGGTAAATTTGAATGTTTTTTTTGCATGGTTTGTATGAATTATTTATTATTTTACCAGTTTCGATCAACATTTTAAGGAATTAACAATTTTTACTCTATATTTGCCTTTGGAAAAGACATATGTATGTCGGTTAATTTTCTGTTTGGTTTTGTTCGGGAAAGAAATGAGACTTAAAGGGGCTTGTCTCTTCCCTATTACAGCATTCAAATAAGATTATTCGACCTCCATCTTGTCTGCTCTGAGAGATAACTCACCAGTGGCTGGGATCCATTGATTCTGCACCGACGTTTCGTTCTGGTGGCACGGTATTAATGGACTGTTCCTAAAAAGATAAAAAGAGGTCCTCTTCCAGTTTCAACAAAACTTTTATTACACAATTTACGATTTAATATAACGAGTCACAGGATGTTATAAATAGTTATTAAATGAATTACGTATAGAATAGAATAGA
Unaligned ( gi|15 ): CTTGCCTTTACTATGAAAGGTATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTCTCCACCACGTTTTGTGTCATTTTCACGGTATTAATGGGTTGTTCCTTAAAAGGTAAACAGAGGTCTCCAGTTCCAATAACACTTTAATTACACAATTTACAATTTAAAATAACGAGTCACAGATGTTAAATGCAGTTCTTAAATGAATAACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): CAAGGACCGTAAACATGTCCATTTTGCAATGTAGTTT






Alignments
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Reference ( family-2609 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGCGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-NAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---AT---TNTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCATAACACTATGACTAGTCAAGTGTATTGATCATACGGTAAAATAAATCAAACATTCATTTAAGCAACAGGTGATATGGTCTCGTGCAAAGCATGAAACTCATTTGACTTGGCCAAGCATGAAAAGTAGACTCATCTATATTTGTCAAGGACGCACCTTATTGGATAAGTAAAACATAGCCGTGTCAATAATATGATAAATGATTGACACGTGGACAAACAGTCATTTAGAAAATACTAATTACGTTAATGTTTTTGTTTTTAGCCGATAACAATACTGAGAGCTCAATCATAAGAACATAGAAAATGATATAATTTTTATGGTATTAACTATTT--CACCGGAAAAT-AAAATAGT---------GTGGATATAATTTG--CTTATAATCGGCTGAAAGGAATGGATATTATATCGTAGAGTTGGTAAGCCACTTTATACATAAACTTATAATATATCTAACCGATTTTAAACACAA-TCTCAACATTGAAATGCATCTATATATCTTACAA---TAATGTATCATTTGGAATATGCTAAATACAGTAGCGGATTATGAGACAACTTAGATGTTGTTTATAT-TATTCCTACGGTATAAGAAAATGTATGAATATTTGCAATTGATACGATGCATGATGAAAAATACTTATATAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACGTTGGTGTCGGTGACGTCGCGTAAGAACTAGACCGCGGTAAGGCCTATGGTAGCTAATTCCCCGTTCTCTAAGCCGATTCCTAACTAAATGTCGACTAACAGGGCGTCCATGGTTACCTATCACTAAATGTGACGTGGATTCAGCCGTCAGAAATCTGTCAGATCTGTTTGCCTATCGACAAACGCGCCCGTGTCTCTGACACGGCGAACGAGAGGCAATATTTTCGAACGAGAGAAGTTAAAACGTCTAGCGACTTGTTCTTACGCTCGCCCACATTCAAGCATGGCCAAAACTTTGGCCCTCTCTTCGAAATTTAGCCTCGGCATTATAAGAAACTGGATAAGTGTTAGAAATTCTCTGAAAATATGGTTGTATGTCGACTAACGCATGTCCCTGTCTAAAATTCACTCAATAAAACCACACGGTTGACATGCACGGGATGCACGAGCAAGTACATGACTTAAACAATGCGCTTAATAAAATAGTACGAGTTTCGGTTGGTTGGGTTAGTCGGTCAGAGTACATGTACATTTTTGACATTTCCCCCAAATTTAAACTTTGTAACGAAAATAACGCCAGTTTTCGATGAGGCGTTTCTTTATCTCGTCAGTGTAGTAGTTTACACTGAAAGATTGGTCAATTTGTCATTTTTTGTCAAGATAGTGATTCCTTTAATATCATCAATTTATTTTCGGGAAGCATATTTAACATTGCTATACACCACGTAAATCGAATCTCAAGTCCACAATTTACACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAAATGA-TTTAAAAACTCGGTCCTTACAGCGGTAAAAAACCGAAAACGTC------TA---------CTCTCGCGACAGGC-ACATTTTTT-----TCCGG---------------------CCGAAAAACAGATTCATCACT---ATTGCACTTAAGAATTATAAATCGAGCGGTTATTGAAAAATCGACTCACTCTATAATAAATGATATAATAAATTGATATTAATTATTATTAATTGCGATGGATTGTGGACAAATTTTCCATTCCGCAGATGATCTTAAAGTGCAGACTTTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taattatAAATTTTGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTT------------GAATT----A-TATGTTT---Aatac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTAGT-------------GATA------------AACTT----TTCTAGTTC---AAAA-TTTTGAAAATACTCAAATCAAAGTTTACAGTACAACA--TAATTTTCAGTTACTCAAAA---TTATTATAAACAAATTTT-AAAGAAATTTGTTGGCTTTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCtgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttttttcagagattcaaaacaaatattacgaacaaatttttaatgtaatttgtcgccttttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaacatataattcaaaTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCCTTTTCCA-GTTATTCAAAACAAATGTTATAAACAAA-TTTTAATGTAGTTTGCCGCATAACACTActtttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaacatataattcaaacattagtgataaacttttctagttcaaaattttgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttTTAAGTCCACAATTTGCACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAACTGATTTTAAAAAATTGTTTCTTATAAAGAAAAAAATCCGAAAACATCACCAGGTAGATCAACATCTCTAGCGACAGGCAACATTTTTTAAAAATCAGGGAAAACCTGAGGGTTTTTTTGCCGAAAAACAGATTCATTACTATAATTGCACTTAAGAATTGTAAATCAAGCGATTCTTGAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaatcaaatagctattgaTAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aattttgtgccgttagcgaggtaataatggggtgatcctaaaaagataaaaagaggcccttttccagtccaataaaactttattacacaatttaatacaacgagtcacatatgttaagtgactggacctagagtaaggtaccttctt---AT---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACAACA--CAATTTTCAGTCATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AGTAAAATTTGATGTCTTTTTCC-GTGATTCACAACAAATTTTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgtaTTCTTGAAAA---ATGTTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAAT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAACGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTATTAGCTGCGAAAAATGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGC
gi|4                          : caaaccctactgttacacaatttaataaaacgactcacagatgttaagtgaagttaaatgaatagcatatagaacagaatagaatataacacaattacaaataaactaaatatcaatgcgttttccatcaatatatatccaaggtgttataaacaaaaccaatctcacatagaatataaataaaattattcacagtctgttgactgtttttgtaaaagcaacacgccaaattaaactgaaatttaacacgaaagctgaatcaattcaattaataataatctaaactattcacgtcttaccatagaatccatttctaaattttaaaacaagtataattacaaaaacttgtgaacaatttataaatttccaattataaattttgttttgtacaactttaatttacgagagtacattatttaacttatggaaccgaaagagacaaataccgaaaagactggaaaggtattttgtactgttgaagattgtacatctataaataagataattttgtttcattaagatactgcaagcgttaaagagaaaaacattaacaataatgttcatatgaacctaaaaagtacttaactgaataaaccgtcttggacttcatgtctatcattttatcaacaaactcgaaacaaatcaactcatgaatatacaattctgataactttcaactgaatttcatatattttaaactttcacactgtatatttattatggcagaacataagatctattttaaaacaaaataacatatatctacaaataaacttcaagaaaagatcacttacctaaaaagataaaaagaggtccctttccagtccaataaaactttattacacaatttaataaaacgagtcacagatgttaagtgactggacctagagtaaggtacctTATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGTAAAAAAAAAATGCTG----TATATTAATTAGGGTTGGTTTCTCGACCAATCATTTCACAG-CGTCTTAGCTGCCAAAAAGGGGCATTTACATAAAA--ATAATGCGATCATACTT-------AAAT----TAATCCC-AGAAAACCTCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTAAATAAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAA-CTGATTATTTCTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGAATCTATCGCTAAAATGGAACCCTTGTTTCAGTGAT--------CCGGTTAGTATATTGGACGAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAA-TGCAAATATCAAACTAGAGAAGTTTATCACTAATGTTAAAATTACGAGTTACCTAAAATATTTAAATTTTGGA-CAA-TTT---ATAATTGTTTAAAATACTCAAA-----ATTTACTGTATGACA--TAATTTTCAGCTTTTCAAAA---ATATTATAAACAAATTGA-AATAAAACTT---GTCTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTAC-AACAAA-TTTTACTGAAACTTGCCGCATAAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattttgcgcggctttgtgcggtaaatggggtgatcctaaaaggataaaaagatgtccttttccagtccaataaaactttattttacaatttaatacaacgagtcacagatattaagtgactggacctggagtaaggtacctttTGTAATGAGAATTGGCTTGTCAGTTTATGCCAATGGAA--TGCTG----AATATTAATTAGGGGTGATTTTTTTACCAATCATTTTATAC-TGTGTTAGCTGCGAAAAAGTGGATTTTAC-CAAAA--ATAATGCGATTAAGCTT-------AAAT----TAATTCC-AGGAAACCC-----------ATATATAACATGGTGTTGCATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATAATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTCAAAAACACTTGCGGATTATTACTTTAAGTCAAGACCCTATCGCTGGAATTGAACTC----TTAAGAGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAATTATTT-TAAAAAATGCAAATATCGAACCAGAAAAGTTTATCACTGAT-------------GTT--------------AATT----A-----TTTGTAAT---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTGACAGTATGACATTTTTTTTTCAGTTATTTCAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATGAAATTTGTCGTTTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACCAA-TTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttttgtgctgtgtgggataatggggttatcctaaaagataaaaaggtctttttccaagtccaataaaactttattttacaatttaatacgagtcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtaccttcTAT-TAA-GAAAAGTAACCTGGAAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TTTATTAATGAGAGGTAATTTATTGACATATCATTTCCTAG-CGTGTTAGCTGCAAAAAATGGGCATTAACATAAAAGAATAATGCGATTAGACTT-------AAAT----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTGGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTAA--CGTGTTTCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TTTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGA--CTATCGCTAAAA-CGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGATAAGCTGCGAAAATA-TTCAAAAAAATGCAAATATCAAtgtga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgtgctgttgcacggtaataaatggggtgatcttaaaaagataaaaagaggtccttttgcagtccaataaaactttagtatacaatttaatacaacgattcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtacctttTATATAATGAAAAGTGTCTTGTCAGTTTAAGCAAATGCAA--TGCTG----TATATTAATGAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CATGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCAACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----CAATCCC-AGGAAA------TTTTGTACATCTATAACAAGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCAAATACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGACCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGTGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACGCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCAAACTAGAAAAGTGTATCACTAAT-------------GTTA------------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cctaaaaagataaaaagaggtccttttccagtccaattaaactttattacacaatttattataacgagtcacagattttaagtgactggacctggagtaaggtacctC----TAATCTC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTGTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACAATTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCAATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---AT---TATTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTCACTGAAATTTGCCGCATAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATGGAAAACAAGTCTTTTTAAGGGCGACCCTACTATGACGCCTGTGTTGAAAATGGCTGCTGAATGGCAGCAGGCAAGGTAAATTTGAATGTTTTTTTTGCATGGTTTGTATGAATTATTTATTATTTTACCAGTTTCGATCAACATTTTAAGGAATTAACAATTTTTACTCTATATTTGCCTTTGGAAAAGACATATGTATGTCGGTTAATTTTCTGTTTGGTTTTGTTCGGGAAAGAAATGAGACTTAAAGGGGCTTGTCTCTTCCCTATTACAGCATTCAAATAAGATTATTCGACCTCCATCTTGTCTGCTCTGAGAGATAACTCACCAGTGGCTGGGATCCATTGATTCTGCACCGACGTTTCGTTCTGGTGGCACGGTATTAATGGACTGTTCCTAAAAAGATAAAAAGAGGTCCTCTTCCAGTTTCAACAAAACTTTTATTACACAATTTACGATTTAATATAACGAGTCACAGGATGTTATAAATAGTTATTAAATGAATTACGTATAGAATAGAATAGA
Unaligned ( gi|15 ): CTTGCCTTTACTATGAAAGGTATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTCTCCACCACGTTTTGTGTCATTTTCACGGTATTAATGGGTTGTTCCTTAAAAGGTAAACAGAGGTCTCCAGTTCCAATAACACTTTAATTACACAATTTACAATTTAAAATAACGAGTCACAGATGTTAAATGCAGTTCTTAAATGAATAACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): CAAGGACCGTAAACATGTCCATTTTGCAATGTAGTTT






Alignments
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Reference ( family-2609 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGCGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-NAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---AT---TNTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCATAACACTATGACTAGTCAAGTGTATTGATCATACGGTAAAATAAATCAAACATTCATTTAAGCAACAGGTGATATGGTCTCGTGCAAAGCATGAAACTCATTTGACTTGGCCAAGCATGAAAAGTAGACTCATCTATATTTGTCAAGGACGCACCTTATTGGATAAGTAAAACATAGCCGTGTCAATAATATGATAAATGATTGACACGTGGACAAACAGTCATTTAGAAAATACTAATTACGTTAATGTTTTTGTTTTTAGCCGATAACAATACTGAGAGCTCAATCATAAGAACATAGAAAATGATATAATTTTTATGGTATTAACTATTT--CACCGGAAAAT-AAAATAGT---------GTGGATATAATTTG--CTTATAATCGGCTGAAAGGAATGGATATTATATCGTAGAGTTGGTAAGCCACTTTATACATAAACTTATAATATATCTAACCGATTTTAAACACAA-TCTCAACATTGAAATGCATCTATATATCTTACAA---TAATGTATCATTTGGAATATGCTAAATACAGTAGCGGATTATGAGACAACTTAGATGTTGTTTATAT-TATTCCTACGGTATAAGAAAATGTATGAATATTTGCAATTGATACGATGCATGATGAAAAATACTTATATAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACGTTGGTGTCGGTGACGTCGCGTAAGAACTAGACCGCGGTAAGGCCTATGGTAGCTAATTCCCCGTTCTCTAAGCCGATTCCTAACTAAATGTCGACTAACAGGGCGTCCATGGTTACCTATCACTAAATGTGACGTGGATTCAGCCGTCAGAAATCTGTCAGATCTGTTTGCCTATCGACAAACGCGCCCGTGTCTCTGACACGGCGAACGAGAGGCAATATTTTCGAACGAGAGAAGTTAAAACGTCTAGCGACTTGTTCTTACGCTCGCCCACATTCAAGCATGGCCAAAACTTTGGCCCTCTCTTCGAAATTTAGCCTCGGCATTATAAGAAACTGGATAAGTGTTAGAAATTCTCTGAAAATATGGTTGTATGTCGACTAACGCATGTCCCTGTCTAAAATTCACTCAATAAAACCACACGGTTGACATGCACGGGATGCACGAGCAAGTACATGACTTAAACAATGCGCTTAATAAAATAGTACGAGTTTCGGTTGGTTGGGTTAGTCGGTCAGAGTACATGTACATTTTTGACATTTCCCCCAAATTTAAACTTTGTAACGAAAATAACGCCAGTTTTCGATGAGGCGTTTCTTTATCTCGTCAGTGTAGTAGTTTACACTGAAAGATTGGTCAATTTGTCATTTTTTGTCAAGATAGTGATTCCTTTAATATCATCAATTTATTTTCGGGAAGCATATTTAACATTGCTATACACCACGTAAATCGAATCTCAAGTCCACAATTTACACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAAATGA-TTTAAAAACTCGGTCCTTACAGCGGTAAAAAACCGAAAACGTC------TA---------CTCTCGCGACAGGC-ACATTTTTT-----TCCGG---------------------CCGAAAAACAGATTCATCACT---ATTGCACTTAAGAATTATAAATCGAGCGGTTATTGAAAAATCGACTCACTCTATAATAAATGATATAATAAATTGATATTAATTATTATTAATTGCGATGGATTGTGGACAAATTTTCCATTCCGCAGATGATCTTAAAGTGCAGACTTTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taattatAAATTTTGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTT------------GAATT----A-TATGTTT---Aatac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTAGT-------------GATA------------AACTT----TTCTAGTTC---AAAA-TTTTGAAAATACTCAAATCAAAGTTTACAGTACAACA--TAATTTTCAGTTACTCAAAA---TTATTATAAACAAATTTT-AAAGAAATTTGTTGGCTTTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCtgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttttttcagagattcaaaacaaatattacgaacaaatttttaatgtaatttgtcgccttttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaacatataattcaaaTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCCTTTTCCA-GTTATTCAAAACAAATGTTATAAACAAA-TTTTAATGTAGTTTGCCGCATAACACTActtttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaacatataattcaaacattagtgataaacttttctagttcaaaattttgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttTTAAGTCCACAATTTGCACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAACTGATTTTAAAAAATTGTTTCTTATAAAGAAAAAAATCCGAAAACATCACCAGGTAGATCAACATCTCTAGCGACAGGCAACATTTTTTAAAAATCAGGGAAAACCTGAGGGTTTTTTTGCCGAAAAACAGATTCATTACTATAATTGCACTTAAGAATTGTAAATCAAGCGATTCTTGAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaatcaaatagctattgaTAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aattttgtgccgttagcgaggtaataatggggtgatcctaaaaagataaaaagaggcccttttccagtccaataaaactttattacacaatttaatacaacgagtcacatatgttaagtgactggacctagagtaaggtaccttctt---AT---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACAACA--CAATTTTCAGTCATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AGTAAAATTTGATGTCTTTTTCC-GTGATTCACAACAAATTTTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgtaTTCTTGAAAA---ATGTTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAAT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAACGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTATTAGCTGCGAAAAATGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGC
gi|4                          : caaaccctactgttacacaatttaataaaacgactcacagatgttaagtgaagttaaatgaatagcatatagaacagaatagaatataacacaattacaaataaactaaatatcaatgcgttttccatcaatatatatccaaggtgttataaacaaaaccaatctcacatagaatataaataaaattattcacagtctgttgactgtttttgtaaaagcaacacgccaaattaaactgaaatttaacacgaaagctgaatcaattcaattaataataatctaaactattcacgtcttaccatagaatccatttctaaattttaaaacaagtataattacaaaaacttgtgaacaatttataaatttccaattataaattttgttttgtacaactttaatttacgagagtacattatttaacttatggaaccgaaagagacaaataccgaaaagactggaaaggtattttgtactgttgaagattgtacatctataaataagataattttgtttcattaagatactgcaagcgttaaagagaaaaacattaacaataatgttcatatgaacctaaaaagtacttaactgaataaaccgtcttggacttcatgtctatcattttatcaacaaactcgaaacaaatcaactcatgaatatacaattctgataactttcaactgaatttcatatattttaaactttcacactgtatatttattatggcagaacataagatctattttaaaacaaaataacatatatctacaaataaacttcaagaaaagatcacttacctaaaaagataaaaagaggtccctttccagtccaataaaactttattacacaatttaataaaacgagtcacagatgttaagtgactggacctagagtaaggtacctTATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGTAAAAAAAAAATGCTG----TATATTAATTAGGGTTGGTTTCTCGACCAATCATTTCACAG-CGTCTTAGCTGCCAAAAAGGGGCATTTACATAAAA--ATAATGCGATCATACTT-------AAAT----TAATCCC-AGAAAACCTCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTAAATAAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAA-CTGATTATTTCTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGAATCTATCGCTAAAATGGAACCCTTGTTTCAGTGAT--------CCGGTTAGTATATTGGACGAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAA-TGCAAATATCAAACTAGAGAAGTTTATCACTAATGTTAAAATTACGAGTTACCTAAAATATTTAAATTTTGGA-CAA-TTT---ATAATTGTTTAAAATACTCAAA-----ATTTACTGTATGACA--TAATTTTCAGCTTTTCAAAA---ATATTATAAACAAATTGA-AATAAAACTT---GTCTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTAC-AACAAA-TTTTACTGAAACTTGCCGCATAAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattttgcgcggctttgtgcggtaaatggggtgatcctaaaaggataaaaagatgtccttttccagtccaataaaactttattttacaatttaatacaacgagtcacagatattaagtgactggacctggagtaaggtacctttTGTAATGAGAATTGGCTTGTCAGTTTATGCCAATGGAA--TGCTG----AATATTAATTAGGGGTGATTTTTTTACCAATCATTTTATAC-TGTGTTAGCTGCGAAAAAGTGGATTTTAC-CAAAA--ATAATGCGATTAAGCTT-------AAAT----TAATTCC-AGGAAACCC-----------ATATATAACATGGTGTTGCATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATAATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTCAAAAACACTTGCGGATTATTACTTTAAGTCAAGACCCTATCGCTGGAATTGAACTC----TTAAGAGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAATTATTT-TAAAAAATGCAAATATCGAACCAGAAAAGTTTATCACTGAT-------------GTT--------------AATT----A-----TTTGTAAT---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTGACAGTATGACATTTTTTTTTCAGTTATTTCAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATGAAATTTGTCGTTTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACCAA-TTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttttgtgctgtgtgggataatggggttatcctaaaagataaaaaggtctttttccaagtccaataaaactttattttacaatttaatacgagtcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtaccttcTAT-TAA-GAAAAGTAACCTGGAAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TTTATTAATGAGAGGTAATTTATTGACATATCATTTCCTAG-CGTGTTAGCTGCAAAAAATGGGCATTAACATAAAAGAATAATGCGATTAGACTT-------AAAT----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTGGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTAA--CGTGTTTCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TTTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGA--CTATCGCTAAAA-CGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGATAAGCTGCGAAAATA-TTCAAAAAAATGCAAATATCAAtgtga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgtgctgttgcacggtaataaatggggtgatcttaaaaagataaaaagaggtccttttgcagtccaataaaactttagtatacaatttaatacaacgattcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtacctttTATATAATGAAAAGTGTCTTGTCAGTTTAAGCAAATGCAA--TGCTG----TATATTAATGAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CATGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCAACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----CAATCCC-AGGAAA------TTTTGTACATCTATAACAAGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCAAATACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGACCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGTGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACGCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCAAACTAGAAAAGTGTATCACTAAT-------------GTTA------------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cctaaaaagataaaaagaggtccttttccagtccaattaaactttattacacaatttattataacgagtcacagattttaagtgactggacctggagtaaggtacctC----TAATCTC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTGTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACAATTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCAATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---AT---TATTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTCACTGAAATTTGCCGCATAAC


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-2609 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGCGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-NAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---AT---TNTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCATAACACTATGACTAGTCAAGTGTATTGATCATACGGTAAAATAAATCAAACATTCATTTAAGCAACAGGTGATATGGTCTCGTGCAAAGCATGAAACTCATTTGACTTGGCCAAGCATGAAAAGTAGACTCATCTATATTTGTCAAGGACGCACCTTATTGGATAAGTAAAACATAGCCGTGTCAATAATATGATAAATGATTGACACGTGGACAAACAGTCATTTAGAAAATACTAATTACGTTAATGTTTTTGTTTTTAGCCGATAACAATACTGAGAGCTCAATCATAAGAACATAGAAAATGATATAATTTTTATGGTATTAACTATTT--CACCGGAAAAT-AAAATAGT---------GTGGATATAATTTG--CTTATAATCGGCTGAAAGGAATGGATATTATATCGTAGAGTTGGTAAGCCACTTTATACATAAACTTATAATATATCTAACCGATTTTAAACACAA-TCTCAACATTGAAATGCATCTATATATCTTACAA---TAATGTATCATTTGGAATATGCTAAATACAGTAGCGGATTATGAGACAACTTAGATGTTGTTTATAT-TATTCCTACGGTATAAGAAAATGTATGAATATTTGCAATTGATACGATGCATGATGAAAAATACTTATATAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAACGTTGGTGTCGGTGACGTCGCGTAAGAACTAGACCGCGGTAAGGCCTATGGTAGCTAATTCCCCGTTCTCTAAGCCGATTCCTAACTAAATGTCGACTAACAGGGCGTCCATGGTTACCTATCACTAAATGTGACGTGGATTCAGCCGTCAGAAATCTGTCAGATCTGTTTGCCTATCGACAAACGCGCCCGTGTCTCTGACACGGCGAACGAGAGGCAATATTTTCGAACGAGAGAAGTTAAAACGTCTAGCGACTTGTTCTTACGCTCGCCCACATTCAAGCATGGCCAAAACTTTGGCCCTCTCTTCGAAATTTAGCCTCGGCATTATAAGAAACTGGATAAGTGTTAGAAATTCTCTGAAAATATGGTTGTATGTCGACTAACGCATGTCCCTGTCTAAAATTCACTCAATAAAACCACACGGTTGACATGCACGGGATGCACGAGCAAGTACATGACTTAAACAATGCGCTTAATAAAATAGTACGAGTTTCGGTTGGTTGGGTTAGTCGGTCAGAGTACATGTACATTTTTGACATTTCCCCCAAATTTAAACTTTGTAACGAAAATAACGCCAGTTTTCGATGAGGCGTTTCTTTATCTCGTCAGTGTAGTAGTTTACACTGAAAGATTGGTCAATTTGTCATTTTTTGTCAAGATAGTGATTCCTTTAATATCATCAATTTATTTTCGGGAAGCATATTTAACATTGCTATACACCACGTAAATCGAATCTCAAGTCCACAATTTACACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAAATGA-TTTAAAAACTCGGTCCTTACAGCGGTAAAAAACCGAAAACGTC------TA---------CTCTCGCGACAGGC-ACATTTTTT-----TCCGG---------------------CCGAAAAACAGATTCATCACT---ATTGCACTTAAGAATTATAAATCGAGCGGTTATTGAAAAATCGACTCACTCTATAATAAATGATATAATAAATTGATATTAATTATTATTAATTGCGATGGATTGTGGACAAATTTTCCATTCCGCAGATGATCTTAAAGTGCAGACTTTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taattatAAATTTTGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTT------------GAATT----A-TATGTTT---Aatac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTAGT-------------GATA------------AACTT----TTCTAGTTC---AAAA-TTTTGAAAATACTCAAATCAAAGTTTACAGTACAACA--TAATTTTCAGTTACTCAAAA---TTATTATAAACAAATTTT-AAAGAAATTTGTTGGCTTTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCtgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttttttcagagattcaaaacaaatattacgaacaaatttttaatgtaatttgtcgccttttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaacatataattcaaaTTTTCAGAGATTCAAAACAAATATTACGAACAAATTTTTAATGTAATTTGTCGCCTTTTCCA-GTTATTCAAAACAAATGTTATAAACAAA-TTTTAATGTAGTTTGCCGCATAACACTActtttccagttattcaaaacaaatgttataaacaaattttaatgtagtttgccgcataacactaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaacatataattcaaacattagtgataaacttttctagttcaaaattttgaaaatactcaaatcaaagtttacagtacaacataattttcagttactcaaaattattataaacaaattttaaagaaatttgttggcttTTAAGTCCACAATTTGCACCTAAAATTTCACTTTTAAACAAACTGATTTTAAAAAATTGTTTCTTATAAAGAAAAAAATCCGAAAACATCACCAGGTAGATCAACATCTCTAGCGACAGGCAACATTTTTTAAAAATCAGGGAAAACCTGAGGGTTTTTTTGCCGAAAAACAGATTCATTACTATAATTGCACTTAAGAATTGTAAATCAAGCGATTCTTGAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaatcaaatagctattgaTAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aattttgtgccgttagcgaggtaataatggggtgatcctaaaaagataaaaagaggcccttttccagtccaataaaactttattacacaatttaatacaacgagtcacatatgttaagtgactggacctagagtaaggtaccttctt---AT---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACAACA--CAATTTTCAGTCATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AGTAAAATTTGATGTCTTTTTCC-GTGATTCACAACAAATTTTATAAACAAA-TTTTACTGAAATTTGCCGCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgtaTTCTTGAAAA---ATGTTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAAT
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAATGAAACGTGTCCTGTCAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TATATTAATTAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CGTATTAGCTGCGAAAAATGGGCATCTACATAAAA--ATAATGCGATTAGGC
gi|4                          : caaaccctactgttacacaatttaataaaacgactcacagatgttaagtgaagttaaatgaatagcatatagaacagaatagaatataacacaattacaaataaactaaatatcaatgcgttttccatcaatatatatccaaggtgttataaacaaaaccaatctcacatagaatataaataaaattattcacagtctgttgactgtttttgtaaaagcaacacgccaaattaaactgaaatttaacacgaaagctgaatcaattcaattaataataatctaaactattcacgtcttaccatagaatccatttctaaattttaaaacaagtataattacaaaaacttgtgaacaatttataaatttccaattataaattttgttttgtacaactttaatttacgagagtacattatttaacttatggaaccgaaagagacaaataccgaaaagactggaaaggtattttgtactgttgaagattgtacatctataaataagataattttgtttcattaagatactgcaagcgttaaagagaaaaacattaacaataatgttcatatgaacctaaaaagtacttaactgaataaaccgtcttggacttcatgtctatcattttatcaacaaactcgaaacaaatcaactcatgaatatacaattctgataactttcaactgaatttcatatattttaaactttcacactgtatatttattatggcagaacataagatctattttaaaacaaaataacatatatctacaaataaacttcaagaaaagatcacttacctaaaaagataaaaagaggtccctttccagtccaataaaactttattacacaatttaataaaacgagtcacagatgttaagtgactggacctagagtaaggtacctTATAATGAAAAGTGTCCTGTCAGTTTAAGTAAAAAAAAAATGCTG----TATATTAATTAGGGTTGGTTTCTCGACCAATCATTTCACAG-CGTCTTAGCTGCCAAAAAGGGGCATTTACATAAAA--ATAATGCGATCATACTT-------AAAT----TAATCCC-AGAAAACCTCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTAAATAAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAA-CTGATTATTTCTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGAATCTATCGCTAAAATGGAACCCTTGTTTCAGTGAT--------CCGGTTAGTATATTGGACGAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAA-TGCAAATATCAAACTAGAGAAGTTTATCACTAATGTTAAAATTACGAGTTACCTAAAATATTTAAATTTTGGA-CAA-TTT---ATAATTGTTTAAAATACTCAAA-----ATTTACTGTATGACA--TAATTTTCAGCTTTTCAAAA---ATATTATAAACAAATTGA-AATAAAACTT---GTCTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTAC-AACAAA-TTTTACTGAAACTTGCCGCATAAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattttgcgcggctttgtgcggtaaatggggtgatcctaaaaggataaaaagatgtccttttccagtccaataaaactttattttacaatttaatacaacgagtcacagatattaagtgactggacctggagtaaggtacctttTGTAATGAGAATTGGCTTGTCAGTTTATGCCAATGGAA--TGCTG----AATATTAATTAGGGGTGATTTTTTTACCAATCATTTTATAC-TGTGTTAGCTGCGAAAAAGTGGATTTTAC-CAAAA--ATAATGCGATTAAGCTT-------AAAT----TAATTCC-AGGAAACCC-----------ATATATAACATGGTGTTGCATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATAATTTATAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTCAAAAACACTTGCGGATTATTACTTTAAGTCAAGACCCTATCGCTGGAATTGAACTC----TTAAGAGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAATTATTT-TAAAAAATGCAAATATCGAACCAGAAAAGTTTATCACTGAT-------------GTT--------------AATT----A-----TTTGTAAT---TTTTCAAAATACTCAAATCAAAGTTGACAGTATGACATTTTTTTTTCAGTTATTTCAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATGAAATTTGTCGTTTTTTTCT-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACCAA-TTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttttgtgctgtgtgggataatggggttatcctaaaagataaaaaggtctttttccaagtccaataaaactttattttacaatttaatacgagtcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtaccttcTAT-TAA-GAAAAGTAACCTGGAAGTTTAAGCCAATGAAA--TGCTG----TTTATTAATGAGAGGTAATTTATTGACATATCATTTCCTAG-CGTGTTAGCTGCAAAAAATGGGCATTAACATAAAAGAATAATGCGATTAGACTT-------AAAT----TAATCCC-AGGAAACCCCAATTTGGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTAA--CGTGTTTCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGGCCAAGC-TTTTCCAGTC-AAAACACTTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGA--CTATCGCTAAAA-CGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGATAAGCTGCGAAAATA-TTCAAAAAAATGCAAATATCAAtgtga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgtgctgttgcacggtaataaatggggtgatcttaaaaagataaaaagaggtccttttgcagtccaataaaactttagtatacaatttaatacaacgattcacagatgttaagtgactggacctggagtaaggtacctttTATATAATGAAAAGTGTCTTGTCAGTTTAAGCAAATGCAA--TGCTG----TATATTAATGAGGGGTGATTTCTTGACCAATCATTTCATAG-CATGTTAGCTGCGAAAAAGGGGCATCAACATAAAA--ATAATGCGATTAGGCTT-------AAAC----CAATCCC-AGGAAA------TTTTGTACATCTATAACAAGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCAAATACCTTTGATTAAACTGATTATTTATAT-CCGACCAAGC-TCTTCCAGCC-AAAACACTTGTGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACGCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCGATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCAAACTAGAAAAGTGTATCACTAAT-------------GTTA------------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cctaaaaagataaaaagaggtccttttccagtccaattaaactttattacacaatttattataacgagtcacagattttaagtgactggacctggagtaaggtacctC----TAATCTC-AGGAAACCCCAATTTTGTACATCTATAACATGTTGTTACATCAATTTA--CGTGTATCGACTACCTTTGATTAAACTGATTATTTGTAT-CCGGCCAAGC-TCTTCCAGTC-AAAACAATTGCGGATAATTGCTTTAAGTCAAGACTCTATCGCTAAAATTGAACCCTTGTTTAAGTGATTAAGTGATCCAATTAGTATGTTCGACAAGCTGCGAAAATA-TT-CAAAAAATGCAAATATCGAACTAGAAAAGTTTATCACTAAT-------------GTTA------------AAATT----A-CGAGTTT---AT---TATTCAAAATACTCAAATCAAAGTTTACCGTACGACA--CAATTTTCAGTTATTCAAAA---ATATTATAAACAAATTTA-AATAAAATTTGTCGTCTTTTTCC-GTGATTCAAAACAAATATTATAAACAAA-TTTCACTGAAATTTGCCGCATAAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATGGAAAACAAGTCTTTTTAAGGGCGACCCTACTATGACGCCTGTGTTGAAAATGGCTGCTGAATGGCAGCAGGCAAGGTAAATTTGAATGTTTTTTTTGCATGGTTTGTATGAATTATTTATTATTTTACCAGTTTCGATCAACATTTTAAGGAATTAACAATTTTTACTCTATATTTGCCTTTGGAAAAGACATATGTATGTCGGTTAATTTTCTGTTTGGTTTTGTTCGGGAAAGAAATGAGACTTAAAGGGGCTTGTCTCTTCCCTATTACAGCATTCAAATAAGATTATTCGACCTCCATCTTGTCTGCTCTGAGAGATAACTCACCAGTGGCTGGGATCCATTGATTCTGCACCGACGTTTCGTTCTGGTGGCACGGTATTAATGGACTGTTCCTAAAAAGATAAAAAGAGGTCCTCTTCCAGTTTCAACAAAACTTTTATTACACAATTTACGATTTAATATAACGAGTCACAGGATGTTATAAATAGTTATTAAATGAATTACGTATAGAATAGAATAGA
Unaligned ( gi|15 ): CTTGCCTTTACTATGAAAGGTATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTCTCCACCACGTTTTGTGTCATTTTCACGGTATTAATGGGTTGTTCCTTAAAAGGTAAACAGAGGTCTCCAGTTCCAATAACACTTTAATTACACAATTTACAATTTAAAATAACGAGTCACAGATGTTAAATGCAGTTCTTAAATGAATAACAAAT
Unaligned ( gi|18 ): CAAGGACCGTAAACATGTCCATTTTGCAATGTAGTTT