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Reference ( gi|3 ) : AATAGCTATGAAAATCATAGCGCGTTTTATAACTCGAGCTAAGGGCAGCGTGTATTGTATAATCAGTTTTTATCGCAGGCCTCACC--GCACTTACAC--AA---GCTCTGTGGGAAGCATCACCGTTTAGCTCGTCAATGTTTGGTCAGTTACCGGGCCAGTGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCT-CGGACC-------------GCACA-GGTCTTATCGCTAGCCTTTTCACGCATACGCAATTAGCTCTGCTGGGA-GCATGACGGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTGGTCA-GTGGAGATAATTTGTC----TCAGTTATTACTCAAGACACTCTCGGAACACACGTAGTTAT-TTGTTACACCCCACC-A-CCC-C-C--TGCTTCACA-C-AGATCAGG------TATATGGTCCATAATTC-CGTTT-AGAT-----------TTTTAACATATATGTTTGAGTGGCGTATTCTATCGAACC
gi|2 : AATAGCTATGAAAATCATAGCGCGTTTTATAACTCGAGCTAAGGGCAGCGTGTATTGTATAATCAGTTTTTAT-GCAAGCCTCACC--GCACTTACAC--AA---GCTCTGTGGGAAGCATCACCGTTTAGCTCGTCAATGTTTGGTCAGTTACCGGGCCAATGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCT-CGGACC-------------GCACA-GGTCTTATCGCTAGCCTTTTCACACATACGCAATTAGCTCTGCGGGGA-GCATGACGGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTGGTCA-GTGGAGATAATTTGTC----TCAGTTATAACTCAAAACACTCTCGGATCACACGTAGTTAT-TTGTTACCCCCCACC-A-CCC-A-C--TGCTCCACA-C-AGATCAGG------TATATGGTCCATAATTC-CGTTT-AGAT-----------TTTTAACATATATGTTGGAGTGGCGTATTCTATCGAACC
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gi|6 : acataatacaaaattaaaaatataatatatatatatAATAGCTATGAACATCAAAGCGTGCTTTATAA-TTGAGCAAAGGGCAGC
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gi|9 : ataatagctatgaaaatcatatcgtgttttataattcgagctaagggcaacgtgtattgattaaacggtcttatcgcagtcttttcacactgacgcttaactctttggcaaaccttaatCA-GGTCTTATCGCAACTCTCTCCACACATACGCAATTAGCTCTCTTGGAA-GCCTGGCCGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTTGTCA-ATGGAGAT------CC----T------TTACTCTAACCACATACGGCTCGCACATAGTTTTATTGTTACCCGCCACC-AGCCC-G-A--TGCTCCAAA-C-AGATAACGAATAATTATATAGTCCATAATTC-AGTTT------------------------TAGATGTTGGAGTGGCGTATTCTATCGAACC
gi|16 : tCA-GGTCTTATCGC-AGTCTTTTCACACATACGC--TTAACTCTGc
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Reference ( family-2593 ) : AATAGCTATGAAAATCATAGCGCGTTTTATAACTCGAGCTAAGGGCAGCGTGTATTGTATAATCAGTTTTTATCGCAAGCCTCACC--GCACNTACGC--AA---GCTCTGTTGGAAGCATNACCGATTAGCTCGTCGATGNTTGGTCAGTTACCGGGTCAGTGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTANTCTAGACACTCTCG-------------GACCGCACAGGTCTTATCGCTAGCCTCTTCACACATACGCAATTAGCTCTGCTGGGAGCATGACNGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTGGTCAGTGGAGATCCTTTGTC----TCAGTTATTACTCTAGACACTCTCGGANCGCACGTAGTTATATTGTTACCCNCCACC-A-CCC-C-C--TGCTCCAC-AC-AGATCAGG------TATATGGTCCATAATTC-CG-TTT-AGATATTTAA-----------CATATATGTTGGAGTGGCGTATTCTATCGAACC
gi|1 : AATAGCTATGAAAATCATAGCGTGTTTTATAACTCGAGCTAAGGGCAGCGTGTATTGTATAGTCAGTTTTTATCGCAAGCCTCCCC--GCACATACAC--AA---GCTCTGTTGGCAGCATTACCGATTAGCTCGTCGATGTTTGGTCAGTTACCGGGTCAGTTGAAATCTTTTGTCTTAGTTATTACTCTAG--ACTCTCG-------------GAACGCACATGTCTTACCGCTAGCCTTTTCACACATACGCAATTAGCTCTTCTGGAAGCATGGCGGATTAGCTTGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTGGTCGGTGGAGATCCTTTGTCCCAGTCAGTTAGTACTCTAGACACTCTCGGAACACACATAGTTATATTGTTACCC-CCACCAA-CCC-C-A--TGCTCCAC-AC-AGATCAGG------TATATGGTCCTTTATTC-TG-TTTAAGATATTGAA-----------CATATATGTTAGAGTGGCGTATTCTATCGAA
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gi|8 : ataatagctatgaaaatcatatcgtgttttataattcgagctaagggcaacgtgtattgattaaacggtcttatcgcagtcttttcacactgacgcttaactctttggcaaaccttaatAATA-CTATGAAAATCATAGCGCGTTTTATAACTCGAACTAAGGGCAGCGTGAATTGTATACTCAGTTTTTATCGTAAGCCTCACC--GCACATACAT--AA---GCTCTGTTGGAAGCATCACCGTTTAGCTCGTCAAT------TAA---ACTGGGCAAGTGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCTCG-------------GACCGCACAGGTCTTATCGCTAGCCTTTTCACACATACGCA
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Alignments
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gi|13 : TTGGTCAACTGCCGGGTCAGTAGAGAACCTTTGTC----TTAATCATTACTTTAGACACTTTCGGATCGCACATAATTTTATTGTTACCCACCATC-A-CTC-CAC--TGCTTCAC-AC-AGATCA------------------ATAATTC-TG-T----G-----TAA-----------CATACATATTAGAGTGGCGCATTCTAT
gi|14 : ATACCCATGGATATGATAGCGTATTTAACAATTCTAGCCAATGGCAGTGTATATTGACTAA---------AT---AGGTCTAA------A-TTAC-----------TCTGTTGGGAGCCTTTCCGATTATCTCGTCGCTGATTGGTCAGTataac
gi|15 : aatacgttgacgACC-A-CCC-A-C--AACACCACAACGATATCG---------ATATTGTCAATAACCC-CGTTTT-AAATATCCAATGAAGTCCTACTATATATGTGTGAGTGGCGTATTCCATCGACCC
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gi|2 : taAATAGCTATGAAAATCATAGCGCGTTTTATAACTCGAGCTAAGGGCAGCGTGTATTGTATAATCAGTTTTTAT-GCAAGCCTCACC--GCACTTACAC--AA---GCTCTGTGGGAAGCATCACCGTTTAGCTCGTCAATGTTTGGTCAGTTACCGGGCCAATGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCTCG-------------GACCGCACAGGTCTTATCGCTAGCCTTTTCACACATACGCAATTAGCTCTGCGGGGAGCATGACGGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTGGTCAGTGGAGATAATTTGTC----TCAGTTATAACTCAAAACACTCTCGGATCACACGTAGTTAT-TTGTTACCCCCCACC-A-CCC-A-C--TGCTCCAC-AC-AGATCAGG------TATATGGTCCATAATTC-CG-TTT-AGATTTTTAA-----------CATATATGTTGGAGTGGCGTATTCTATCGAACCgacaaa
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gi|4 : AGCGCGTTTTATAACTCGAGCTAAGGGCAGCGTTTATTGTATAATCAGTTTTTATCGCAAGCCTCACC--GCACTTACAC--AA---GCTCTGTGGGAAGCATCACCGTTTAGCTCGTCAATGTTTGGTCAGTTACCGGGCCAATGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCTCG-------------GACCGCACAGGTCTTATCGCTAGCCTTTTCACACATACGCAATTAGCTCTGCTTGGAGCATGACAGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACTTGGTCAGTGGAGATAATTTGTC----TCAGTTATTACTAAAGACACTCTCGGAACACACGTAGTTAT-TTGTTACCC-CCACC-A-TCC-C-C--TGCTCCAC-AC-AAATCAGG------TATATGGTCCATAATTC-CG-TTT-AAATATTTAA-----------CATATATGTTGGAGTGGCGTATTCGATCGAACC
gi|5 : AACAGCTATAAAAATCATAGCGCGGTTCACAACTCGAGCTAAGAGCAGCGTGTATTGTATAATCAGTTTTTATCGCAAGCCTCACC--GCACTTACAC--AA---GCTCTGTTGGAAGCATTACCGATTAGCTCGTCAATGTTTTGTCAGTTACCAGGCCAGTGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCTCG-------------GACCGCACAGGTCTTATCGCTAGCCTTTTCAGACACA-GCAATTAGCTCTGCTGGAAGCAAGACGGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTGGTCAGTGGAGATCATTTGTC----TCAGTTATTACTCAAGACATTCTCGGAA--CACTTATTTTTA-TGTT
gi|6 : atacaatatgatattacgagttatgaacacatgtataaatAATAGCTATGAACATCAAAGCGTGCTTTATAA-TTGAGCAAAGGGCAGC
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gi|8 : ataatagctatgaaaatcatatcgtgttttataattcgagctaagggcaacgtgtattgattaaacggtcttatcgcagtcttttcacactgacgcttaactctttggcaaaccttaatAATA-CTATGAAAATCATAGCGCGTTTTATAACTCGAACTAAGGGCAGCGTGAATTGTATACTCAGTTTTTATCGTAAGCCTCACC--GCACATACAT--AA---GCTCTGTTGGAAGCATCACCGTTTAGCTCGTCAAT------TAA---ACTGGGCAAGTGGAGATCCTTTATCTTAGTTACTAATCTAGACACTCTCG-------------GACCGCACAGGTCTTATCGCTAGCCTTTTCACACATACGCA
gi|9 : acataatacaaaattaaaaatataatatatatatatCAGGTCTTATCGCAACTCTCTCCACACATACGCAATTAGCTCTCTTGGAAGCCTGGCCGATTAGCTCGTCGCTGATTGGTCAGTTACCTTGTCAATGGAGATCCT----------------TTACTCTAACCACATACGGCTCGCACATAGTTTTATTGTTACCCGCCACC-AGCCC-G-A--TGCTCCAA-AC-AGATAACGAATAATTATATAGTCCATAATTC-AG-TTT------------------------TAGATGTTGGAGTGGCGTATTCTATCGAACC