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lowQualScore                  :    0                                    5    33 8    4     5            8888         99999999999 44444      6666  22 22      2  8888  55 1       1     1    4  9   333       99999     33         2           3   3 33 888888888888888     11   33   222            3333333   0  888888888888888 55  5555 1  0              22222 2 88888    5555    333333    1    2222         000000   22222222222222    22   33 22 888888     1     22 777 22  88 11   333333   33333          0         3333  2       4           
lowQualScore                  :    .                                    .    .. .    .     .            ....         ........... .....      ....  .. ..      .  ....  .. .       .     .    .  .   ...       .....     ..         .           .   . .. ...............     ..   ..   ...            .......   .  ............... ..  .... .  .              ..... . .....    ....    ......    .    ....         ......   ..............    ..   .. .. ......     .     .. ... ..  .. ..   ......   .....          .         ....  .       .           
lowQualScore                  :    3                                    6    44 1    7     7            9999         00000000000 88888      0000  66 66      0  1111  22 9       9     9    8  1   222       11111     55         3           1   2 11 000000000000000     66   11   000            7777777   4  777777777777777 66  4444 4  9              99999 3 22222    2222    777777    2    6666         111111   55555555555555    00   99 00 222222     4     00 000 00  77 99   222222   66666          2         3333  0       0           
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Reference ( gi|1 )            : CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTACTTTT--ATAATT-TGATGCATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTTACTCCC---TTTGTAA-----TGAGTGAAGGGAATGTATTTGGACAGGGTACCGG-AC---AATTTCT---AATGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--TA--ATTC-TAACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----ACACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATG-T--TTGA-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GATTCTAAATGCAGCCTTACAC
gi|8                          : CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--AGAATT-TGATGCATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT----CA--G--TCGTGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCGAA-TGTTCACTCCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTATTTCGACAGGGTACCGG-AC---TATTTTG---AGTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTGA--T--AA--ATCC-TAACTT----CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCG----AAAT--T---ACAG-ACTG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG------A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCCGAATTCGC----GACTCTAAATACGGCC
gi|3                          : CTTTGTGTCAGGTTAAACATTACTTGCTGCGTGAAATGTATTTTT--AGAATT-TGATGTATGTTTTGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCAC-CCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAG-AC---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATTA-TAACTTC---CCATTGAAACGTTCAATGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CACA--AGA--A--G------TTGCA-AATGG--A---A--TTA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAAAT-CAATCTTACAC
gi|5                          : CTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--A-GATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCAGGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACCCCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAACGAATGTTTTTGGACAAGGTACCAG-AC---TATTTTG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T------------AACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----AACTCTAAATACAGCCTTA
gi|12                         : CTTTGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--AGAATT-TGATGTAAGTTTCGATTT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACTCCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCGG-AC---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTA------TA--AATCACAACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AATT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACG--------A-----CCTA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATT
gi|4                          : CTTTGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAA-TGTATTTTT--AGAATT-TGATGCAAGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--CTTTTTTAT-TCAAA-TGTTCACCCCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGCCAGGGTACCGA-AC---TATTTCG---ACT-TGC--TGC--CGC---TGAACATCATCA-------CTGTTA--T--AA--ATCA-CAAATTC---GGATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCCGT----AAACA--------A-----CCTA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GACTCAAAATACAGTCTTACag
gi|10                         : CTTCATGTCAGATTAAACATTATTTGCTACGTAAAAGGTATTTTT--AGAATT-TGATGCAAGTTTCGATGT----GTGTTTCTG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCAAGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACTCCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTA-------------CTGG-AC---TATTTCG---ACTGTAA--TGC--CGC---TGAACTTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCC-TAACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----CTCG----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCA-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGT----GACATTAAATACAGCCTTAC
gi|16                         : CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCATAAAATGTATTTTA--AGAATT-TGATGTACGTTCCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAAT----CA--G--ACACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCGA-TGTTTAC-CCC---TTTGTAA-----TGAGTTTAGGGAATGTATTTGGATAGGATACCGG-AC---
gi|21                         : CTTTGTGTCAGATTAAACAATACTTGCTGCGTAGAAT---------------T-TGATGTAAGTTTCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGCTCACCCCC---TTTGTAA-----TGAGTCAAtcgaacgttcaatggctctgcaaaatcacagacaggtccctgtaaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagagttcgcgactctaaatacagccttac
gi|24                         : CTTTGTGTCAGAATAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--AGAATT-TGATG--TGTTTCGATAT----GTGTTTCAG-----------C-----TGCAGCA---CA--G--TCctgtgctgccgctgaacgtcatcattgtaataaatccagcttccc
gi|9                          :  TTCGTGCCCGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--AGAATT-TGATGTATGTTTCAATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--A-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACCCCC---TTTATAA-----TGAGTTTAGGGAATGTATTTGGACAGGGTACCGG-AC---TATTTCG---ACCGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCC-CAACTTC---CCCTTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--A---ACAG-ACAG----GTCCCCAGT----AATCA--------A-----CTCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--G---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAATAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAAATACAGgaaatagtttggtaccctgtcca
gi|7                          :  TTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--A-GATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCAGGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACCCCC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGCGAATGTTTTTGGACATGGTACCAG-AC---TATTTTG---ACTGTGC--TGC--CAC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T------------AACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----AACTCTAAATACAGCCTTA
gi|2                          :  TTTGTGTCAGATTAAACATTACTGGCTGTGTAAAATGTATTTTT--AGAATT--GATATATAGTTCGATAT----GTGTTCCGC-----------C-----TGCAGTCAGTCA--G--TCACAA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TATTAACATAC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAG-AC---TATTTCA---ACTGTGC--TGC--TGC---TGAACATCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCA-CAACTTC---CAATTATAACGTTCAGTGG-----T-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCAT----GACTCTAAATATAGCCT
gi|13                         : tTTTGTGTCCGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT------TT-TAAT-------TTGATGT----ATGTTT----------------------------------------CGATAT----GT--G-TTTCGGC-TGCAG-T---CAGTCACGAATTTGTAA-----TGAGTTTATGGAATGTATTTGGACAAGGCACCGG-AC---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CAC---TGAACGTCATCA-------TCGTAA--T--AA--ATCC-CAACTTC---CCCTTATAGCGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCAGT----AAACA--------A-----CTCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--G---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAATAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAAATACAGCCT
gi|11                         :   TCGTGTCCGATTAAACATTACATGCTGCGTAAAATGT-CTTTTTTAGAATT-TGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--G-TTTTTAT-TCGAA-TGGTCAA-CCC---TTTGCAA-----TAAGTGTAGGGAATGTATTTGGACAGGGTACCGG-AG---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TCGTAA--T--AA--ATCC-CAACTTC---CCCTTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CTCA--AGA--A--G-------TGCG-AATGG--A---A-------------------GT-----AGACA-TCAT---AATTCGC----GGCCTTAAATACAGCCT
gi|6                          :      TGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT--AGAATT-TGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCAAA-TGTTCATCCCC---TGCGTAA-----TGATTGTAGGGAATGTTTTTGCACAGGGTACAGG-AC---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TAAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCA-CAACTTC---CCATTATAAAGTTCATTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--A---ACAG-ACAT----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCT-TGTGC--A---A------T--ATGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAAATACA-CCTTAC
gi|14                         :                    ttttTTGTTGCGTAAAATGTATTTTT--AGAAAT-TGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTTGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-GT----AT--C-TTTTTAT-TTCAA-TGT----------------AA-----TGAATGTAGGGAATGTATGTGTACAGGGTATCGG-AC---TATTTCG---ACTATGC--TGC--CAC---TGAACGTCATCA-------TTGCAA--T--AA--ATCC-CAACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-AT----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCTCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGTG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----CAACAGTCATCAGAATTCGT----GACTTTAAAT
gi|17                         :                                              taaaAATT-TGATGTATGTTTCGATGT----GTGTTTTGGATGCAGTCAGTCAGGAATGCAGT----CA--G--TCAGGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAT-TGTTCACCCCA---TTTGTAA-----TGAGTGAAACGAATGTATTTGGACAGGGTTCCGG-AC---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACATCATCA-------TTGTAA--------------TAACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGA--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAATA
gi|15                         :                                                       agATGTAAGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AT--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACCCCC---TTTGTAA-----TGAGTTTAGGGAATGTATTTGGACAGAGTTCTGG-AT---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCC-CAACTTC---CCATTGTAACGTTCAATGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCA-AATGG--A---A--ATA-T--TTGT-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAACTACAGCCTTAcagcctttaca
gi|18                         :                                                           GTATGTCTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CA--G--TCACGA-AT----AG--C-TTTTTAT-TCCAA-TGTCCATCCCA---TTTTTAA-----TGAGTGAAGGGAATGTATTTGGACAGGGTATCGGTAT----ATTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCC-CAACTCC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----CGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CACA--AGA--A--G------TTGCA-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----TAACTGTCATCAGAATTCAC----GACTCTAAAT
gi|10                         :                                                                                    GG-----------C-----TGTATT----TAATG--TCACGA-ATTCTGATGAC-TGTTTACAGCAAA-TATTT---CCA---TTTGCAACTTCTTGGGT----------TGTTT--ACAGGGGACCTG-TCTGTAATTTCG---AG---GC---GC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGGAAG-T--TAGGATT--TA--TTA---CAATGATGAAGTTCAGCGG-----C-AT----TACAGTCGAAATAGT---CCAGTACA------TTCCCTAC----ACTCATT------A-----CAAA--GGG--A--GTGAACATTG-G-AATAA--A---AAGATA-TTCTTGACTGACTGCAGCAGAAACACACATCGAAACTTGCATCAAATTCTAAAat
gi|15                         :                                          cttcatgtcagattaaacattatttgctacgtaaaaggtattGG-----------C-----TGTAGT----TA--GAGTCGCGA-ATTCTGATGAC-TGTTTAC-AACAAATATTT---CCA---TTTGCAACTTCTTGGGT----------TGTTT--ACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCAG--CGC--CAT---TGAACGTTACAA-------TGGGAAG-T--TGGGATT--TA--TTA---CAATGATGACGTTCAGCGG-----C-ttac
gi|19                         : atgtaagtttcgatatgtgtttcggctgcagtcagtcacgaatatctttttattccaatgttcaccccctttgtaatgagtttagggaatgtatttggacagagttctggattatttcgactgtgctT----AT--A-TTTTTAT-TCCAA-TGTTCACTCCT---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTATTTCGAC----------------------------TGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCC-TAACTTC---CCATTAGAAGGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----AAACA--------A-----CCAA--AGA--A--G------TTGCG-AA----------------T--TTGA-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAAATACAGCCTTACAtta
gi|20                         :                                                                                                                                                                  CC---TTTGTAA-----TGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTATCAG-AC---TGTTTCG---ACTGTGC--TGC--CGC---TGAACGTCATCA-------TTGTAA--T--AA--ATCA-CAACTTC---CCTTTATAACGTTCAG---------------------------T--T---ACAG-ACAG----GTCCCCTGT----TAACA--------A-----CCCA--AGA--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--TTGC-----TGT-----AAACAATCATCAGAATTCGC----GACTCTAAATACAGCCTTA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                      TGGACAGGGTACCAA-AC---TATTTCG---ACTGTGC--TGC--AGC---TGAA
gi|8                          :                                                                                                                                  ctttgtgtcagaataaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagaatttgatgtgtttcgatatgtgtACAGGGGACCAG-TCTGTAATTTCG---CA---GC---GC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGAAG--T--TAGGATT--TA---TCA--CAATGATGACGTTCAGCGGCAGCAC-AC----T-CA----AAAT--------AG-TCCG----GTACCCTGTCGAAATACATTCCCTACA-----CTCA-----------------TTACA-AAGGG--AGTGA--ACA-T--TCGA------AT-----AAAAAG--AT----ATTCAC----GA--CTGACTGCAACC
gi|3                          :                                                                                                                             cttcgtgtcagattaaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagaatttgatgcatgtttcgatatgtgtttcACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCAG--CGC--CAT---TGAACGTT-TCA-------ATGGGA------A--GTTA-TAATTTATTACAATGATGACGTTCAGCGG-----C-A------GCA----CAGT--CGAAATAG-TCTG----GTACCCTGT----CCAAA--------AACATTCCCT--ACACTC--A------TTACA-AAGGGGTG---A--ACA-T--TGGA------AT-----AAAAAG--AT----ATTCGT----GA--CTGACTGCAGCCaaacaacccaagaagttgcgaatggaatatttgctgtaaacagtcatccgaattcgcgactctaaatacggcc
gi|5                          :                                                                                                                             ctttgtgtcaggttaaacattacttgctgcgtgaaatgtatttttagaatttgatgtatgttttgatatgtgtttcACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCAG--CGC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGGAAG-T--TA-----------TTA---CAATGATGACGTTCAGCGG-----CAGCACAGT-CA----AAAT--------AG-TCTG----GTACCTTGT----CCAAA--------A-----aaacaacacaagaagttgcaaatggaattatttgctgtaaacagtcatcagaattcgcgactctaaatcaatcttacac
gi|7                          :                                                    ctttgtgtcagattaaatattacttgctgcgtaaaatgtatttttagattatgatgtatgtttcgatatatatgtgtttcggctgcagtcagtcaggaatatctttttattccaatgttcaccccctttgtaatgagtgtaacgaatgtACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCAG--CGC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGGAAG-T--TA-----------TTA---CAATGATGACGTTCAGTGG-----CAGCACAGT-CA----AAAT--------AG-TCTG----GTACCATGT----CCAAA--------A-----aaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagaattcgcaactctaaatacagcctta
gi|12                         :                                                     tttgtgtcagattaaatattacttgctgcgtaaaatgtatttttagattatgatgtatgtttcgatatatatgtgtttcggctgcagtcagtcaggaatatctttttattccaatgttcaccccctttgtaatgagtgtagcgaatgtACAGGGGACCTG----------TCTGTAAATTTGCAGCGC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGGAA---------GTTG-TGATTTATA-CAATGATGACGTTCAGCGG-----C-A------GCA----CAGT--CGAAATAG-TCCG----GTACCCTGT----CCAAA--------AACATTCCCT--ACACTC--A------TTACA-AAGGG--AGTGA--ACA-T--TGGA------AT-----AAAAAG--AT----ATTCGT----GA--CTGACTGCAGCCaaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagaattcgcaactctaaatacagcctta
gi|2                          :                                                                                                                             ctttgtgtcagattaaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagaatttgatgtaagtttcgatttgtgtttcACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT---------TGC--AGCACCAC---TGAACGTTATAA-------TTGGAAG-TTGTG--ATT--TA--TTA---CAATGATGATGTTCAGCAG-----C-A------GCA----CAGT--TGAAATAG-TCTG----GTACCCTGT----CCAAA--------A-----aaacgacctaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagaattag
gi|6                          :                                                     ttttgtgtcagattaaacattactggctgtgtaaaatgtatttttagaattgatatatagttcgatatgtgttccgcctgcagtcagtcagtcacaaatatctttttattccaatattaacatactttgtaatgagtgtagggaatgtACAGGG-----G-AC---A-TGTCT---GTTATTT--TGCAGCGCCAATGAACTTTATAA-------TGGGAAGTTG-TG--ATT--TA--TTA---CAATGATGACGTTTAGCGG-----C-A------GCA----CAGT--C---G-AA-ATAGTCCTGTACCCTGT----GCAAA--------AACATTCCCT--ACA--ATCA------TTACGCAGGGG--ATG-A--ACA-T--TTGA------AT-----AAAAAG--AT----ATTCGT----GA--CTGACTGCAGCCaaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagaattcatgactctaaatatagcct
gi|14                         :                                                                                                                              tttttgtcagattaaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagaatttgatgtatgtttcgatatgtgtttcACAGGAGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCAA--TGC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGGAAG-T--TGGGATT--TA--TTG---CAATGATGACGTTCAGTGG-----C-A------GCA----TAGT--CGAAATAG-TCCG----ATACCCTGT----ACACA--------aaacaacccaagaagttgcttgtgcaatatgctgtaaacagtcatcagaattcgcgactctaaatacaccttac
gi|18                         :                                                                                       taaattgttgcgtaaaatgtatttttagaaattgatgtatgtttcgatatgtgttttggctgcagtcagtcacgagtatctttttatttcaatgtaatgaatgtagggaatgtaACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCGG--CGC--CAC---TGAACGTTATAA-------TGGGGAG-T--TGGGATT--TA--TTA---CAATGATGACGTTCAGCGG-----C-AG----CACAGTCGAAATA-T---ACCG-ATA--------CCCTGTCCAAATACATTCCCTTCA-----CTCATTAAA--A--A-------TG-G-GATGG--A---C--A------TTGG-----AAT-----AAAAAGCT------ATTCGT----GA--CTGACTGCAGCCaaacaacccaagaagttgtgaatggaaatatttgctgtcaacagtcatcagaattcgtgactttaaat
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gi|19                         :                                                  agaatttgatgtatgtttcgatgtgtgttttggatgcagtcagtcaggaatgcagtcagtcaggaatatctttttattccattgttcaccccatttgtaatgagtgaaacgaatgtatttggacagggttccggactatttcgactgtgctACAGGGGACCTG-TCTGTAATTT-------TGCAG--CGC--CAC---TGAACCTTCTAA-------TGGGAAG-T--TAGGATT--TA--TTA---CAATGATGACGTTCAGCGG-----C-A------GCA----CAGT--C---G-AA-ATAC----ATTCCCTAC----ACTCATT------A-----CAAA--AGG--A--GTGAACATTG-G-AATAA--A---A--ATA-T--aaacaacccaagaagttgcgaatgaaaatatttgctgtaaatacagcctttaca
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gi|23                         :                                                                                                                                ctttgtgtcagattaaacaatacttgctgcgtagaatttgatgtaagtttcgatatgtgcttcggctgcagtcagtcacgaatatctttttattccaatgctcaccccctttgtaatgagtcaacCGCCA--A-------TTGTAA--C--AC--ACCA-CAACTTC---CCATTATAACGTTCAGTGG-----C-GC----TGCA----AAAT--T---ACAG-ACAG----GCCCCCTAT-------TA--------A-----------AGG--A--G------TTGCG-AATGG--A---A--ATA-T--CTGC-----TGT-----AAACAGTCATCAGAATTCGC----GACTCTAAACACGGCCTTGC
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Reference ( family-251 )      :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTNTTTGGACAGGGTACCGGACTATTTCGACTGCGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATNAA-T-C-C-AACTTCCCATTATAACGTTCAGCGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACAC
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACGTTCAATGGCTCTGCAAAATCACAGACAGGTCCC-TGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAGTTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACcgaacgttcaatggctctgcaaaatcacagacaggtccctgtaaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagagttcgcgactctaaatacagccttac
gi|17                         : cttcgtgtcagattaaacattacttgctgcataaaatgtattttaagaatttgatgtacgttccgatatgtgcttcggctgcaatcagacacgaatatctttttattccgatgtttacccctttgtaatgagtttagggaatgtatttggataggataccggactcg-AGAATTTGATGTATGTTTCGATGT----GTGTTTTGGATGCAGTCAGTCAGGAATGCAGT-CAGTCA----GGA-ATATCTTTTT-ATTCCATTGTTCACCCCA---TTTGTAATGAGTGAAACGAATGTATTTGGACAGGGTTCCGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACATCATCATTGTAAT----------AACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-AAAATA-TTTGCTGTAAATA
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gi|2                          :                                                                                                                            TTTGTGTCAGATTAAACATTACTGGCTGTGTAAAATGTATTTTT-AGAATT-GATATATAGTTCGATAT----GTGTTCCGC-----------C-----TGCAGT-CAGTCAGTCACAA-ATATCTTTTT-ATTCCAATATTAACATAC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAGACTATTTCAACTGTGCTGCTGCTGAACATCATCATTGTAATAAA-T-CAC-AACTTCCAATTATAACGTTCAGTGGTGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCATGACTCTAAATATAGCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              tCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTATCAGACTGTTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAA-T-CAC-AACTTCCCTTTATAACGTTCAG-------------TTACAGACAGGTCCCCTGTTAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAATCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTA
gi|21                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACAATACTTGCTGCGTA--------------GAATTTGATGTAAGTTTCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGCTCACCCCC---TTTGTAATGAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCAACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAA-T-C-C-AGCTTCCCcaactgtgctgccgctgaacgtcatcattgtaataaatccagcttccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ctttgtgtcagattaaacaatacttgctgcgtagaatttgatgtaagtttcgatatgtgcttcggctgcagtcagtcacgaatatctttttattccaatgctcaccccctttgtaatgagACTGTGCTGCCACCGAACGTCATCATTGTAATAAA-C-CAC-AACCTCCCAGTA-----------GGCTCTGCAAAACTACAGACAGGTCCCCTGCAAACAAGCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATATTTTGCTGTAAACAGTCATCGGAATTCGCGACTCTAAACACAGTCTT
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gi|13                         :                                                                                                                            TTTGTGTCCGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-----TTTAAT-------TTGATGT----ATGTTT-------------------------------------CGATATGTG-TTTCGGCTGCAGT---CAGTCACGAATTTGTAATGAGTTTATGGAATGTATTTGGACAAGGCACCGGACTATTTCGACTGTGCTGCCACTG-AACGTCATCATCGTAA-TAAAT-C-CCAACTTCCCCTTATAGCGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCAGTAAACAACTCAAGAAGTTGCGAATG-GGAATA-TTTGCTGTAAATAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTag
gi|14                         :                                                                                                                                                  TTGTTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAAATTGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTTGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-GTATC-TTTTTATTTCAATGT----------------AATGAATGTAGGGAATGTATGTGTACAGGGTATCGGACTATTTCGACTATGCTGCCACTG-AACGTCATCATTGCAA-TAAAT-C-CCAACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCATTGCAAAATTACAGACAGGTCTCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGTGAATG-GAAATA-TTTGCTGTCAACAGTCATCAGAATTCGTGACTTTAAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                             taaaATGTAAGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTTTAGGGAATGTATTTGGACAGAGTTCTGGATTATTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAATCC-C-AACTTCCCATTGTAACGTTCAATGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCAAATG-GAAATA-TTTGTTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAACTACAGCCTTA
gi|16                         :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCATAAAATGTATTTTA-AGAATTTGATGTACGTTCCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAAT-CAGACA----CGA-ATATC-TTTTTATTCCGATGTTTA-CCCC---TTTGTAATGAGTTTAGGGAATGTATTTGGATAGGATACCGGACT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACGTTCAATGGCTCTGCAAAATCACAGACAGGTCCC-TGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAGTTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACcgaacgttcaatggctctgcaaaatcacagacaggtccctgtaaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagagttcgcgactctaaatacagccttac
gi|17                         : cttcgtgtcagattaaacattacttgctgcataaaatgtattttaagaatttgatgtacgttccgatatgtgcttcggctgcaatcagacacgaatatctttttattccgatgtttacccctttgtaatgagtttagggaatgtatttggataggataccggactcg-AGAATTTGATGTATGTTTCGATGT----GTGTTTTGGATGCAGTCAGTCAGGAATGCAGT-CAGTCA----GGA-ATATC-TTTTTATTCCATTGTTCACCCCA---TTTGTAATGAGTGAAACGAATGTATTTGGACAGGGTTCCGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACATCATCATTGTAA-T---------AACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-AAAATA-TTTGCTGTAAATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                   GTATGTCTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATAGC-TTTTTATTCCAATGTCCATCCCA---TTTTTAATGAGTGAAGGGAATGTATTTGGACAGGGTATCGGTATATTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAATCC-C-AACTCCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCCGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACACAAGAAGTTGCAAATG-GAAATA-TTTGCTGTTAACTGTCATCAGAATTCACGACTCTAAATAcagcctttaca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATA-TTTTTATTCCAATGTTCACTCCT---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGT---------------------ATTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-C-CTAACTTCCCATTAGAAGGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCAAAGAAGTTGCGA---------A-TTTGATGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACAt
gi|2                          :                                                                                                                            TTTGTGTCAGATTAAACATTACTGGCTGTGTAAAATGTATTTTT-AGAATT-GATATATAGTTCGATAT----GTGTTCCGC-----------C-----TGCAGT-CAGTCAGTCACAA-ATATC-TTTTTATTCCAATATTAACATAC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAGACTATTTCAACTGTGCTGCTGCTG-AACATCATCATTGTAA-TAAAT-CAC-AACTTCCAATTATAACGTTCAGTGGTGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCATGACTCTAAATATAGCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              tCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTATCAGACTGTTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-CAC-AACTTCCCTTTATAACGTTCAG-------------TTACAGACAGGTCCCCTGTTAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAATCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTA
gi|21                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACAATACTTGCTGCGTA--------------GAATTTGATGTAAGTTTCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGCTCACCCCC---TTTGTAATGAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCAACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-C-C-AGCTTCCCcaactgtgctgccgctgaacgtcatcattgtaataaatccagcttccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ctttgtgtcagattaaacaatacttgctgcgtagaatttgatgtaagtttcgatatgtgcttcggctgcagtcagtcacgaatatctttttattccaatgctcaccccctttgtaatgagACTGTGCTGCCACCG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAC-CAC-AACCTCCCAGTA-----------GGCTCTGCAAAACTACAGACAGGTCCCCTGCAAACAAGCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATATTTTGCTGTAAACAGTCATCGGAATTCGCGACTCTAAACACAGTCTT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGCCA--ATTGTAA-CACAC-CAC-AACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGCCCCCTATTAA-------AGGAGTTGCGAATG-GAAATA-TCTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAACACGGCCTTGC
gi|24                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGAATAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATG--TGTTTCGATAT----GTGTTTCAG-----------C-----TGCAGCACAGTC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGACAGGGTACCAAACTATTTCGACTGTGCTGCAGCTGAAACA-CAT-ATCGAAA-CACAT-C-A-AATTgaaatagtttggtaccctgtcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctttgtgtcagaataaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagATA-ATTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATAAAGCCTTA
gi|3                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGGTTAAACATTACTTGCTGCGTGAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTTGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCA-CCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-TAT-AACTTCCCATTGAAACGTTCAATGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACACAAGAAGTTGCAAATG-GAATTA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAAT-CAATCTTACAC
gi|4                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGT-AAATGTATTTTT-AGAATTTGATGCAAGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATCTTTTTTATTCAAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGCCAGGGTACCGAACTATTTCGACT-TGCTGCCGCTG-AACATCATCACTGTTA-TAAAT-CAC-AAATTCGGATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCCGTAAACAACCTAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCAAAATACAGTCTTAC
gi|5                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----GGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAACGAATGTTTTTGGACAAGGTACCAGACTATTTTGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAA---------CTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATACAGCCTTA
gi|6                          :                                                                                                                                TGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCAAATGTTCATCCCC---TGCGTAATGATTGTAGGGAATGTTTTTGCACAGGGTACAGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTA-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-CAC-AACTTCCCATTATAAAGTTCATTGGCGCTGCAAAATAACAGACATGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCT--TGTGCAATA---TGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACA-CCTTAC
gi|7                          :                                                                                                                        ttttTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----GGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGCGAATGTTTTTGGACATGGTACCAGACTATTTTGACTGTGCTGCCACTG-AACGTCATCATTGTAA-TAA---------CTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATACAGCCTTA
gi|8                          :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGCATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT-CAGTCG----TGA-ATATC-TTTTTATTCGAATGTTCACTCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTATTTCGACAGGGTACCGGACTATTTTGAGTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTGA-TAAAT-C-CTAACTT-CCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCGAAATTACAGACTGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-G-AATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCCGAATTCGCGACTCTAAATACGGCC
gi|9                          :                                                                                                                            TTCGTGCCCGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCAATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATA-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTATAATGAGTTTAGGGAATGTATTTGGACAGGGTACCGGACTATTTCGACCGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAATCC-C-AACTTCCCCTTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATAACAGACAGGTCCCCAGTAATCAACTCAAGAAGTTGCGAATG-GGAATA-TTTGCTGTAAATAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAG





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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              tCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTATCAGACTGTTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-CAC-AACTTCCCTTTATAACGTTCAG-------------TTACAGACAGGTCCCCTGTTAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAATCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTA
gi|21                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACAATACTTGCTGCGTA--------------GAATTTGATGTAAGTTTCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGCTCACCCCC---TTTGTAATGAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCAACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-C-C-AGCTTCCCcaactgtgctgccgctgaacgtcatcattgtaataaatccagcttccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ctttgtgtcagattaaacaatacttgctgcgtagaatttgatgtaagtttcgatatgtgcttcggctgcagtcagtcacgaatatctttttattccaatgctcaccccctttgtaatgagACTGTGCTGCCACCG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAC-CAC-AACCTCCCAGTA-----------GGCTCTGCAAAACTACAGACAGGTCCCCTGCAAACAAGCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATATTTTGCTGTAAACAGTCATCGGAATTCGCGACTCTAAACACAGTCTT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGCCA--ATTGTAA-CACAC-CAC-AACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGCCCCCTATTAA-------AGGAGTTGCGAATG-GAAATA-TCTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAACACGGCCTTGC
gi|24                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGAATAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATG--TGTTTCGATAT----GTGTTTCAG-----------C-----TGCAGCACAGTC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGACAGGGTACCAAACTATTTCGACTGTGCTGCAGCTGAAACA-CAT-ATCGAAA-CACAT-C-A-AATTgaaatagtttggtaccctgtcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctttgtgtcagaataaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagATA-ATTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATAAAGCCTTA
gi|3                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGGTTAAACATTACTTGCTGCGTGAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTTGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCA-CCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-TAT-AACTTCCCATTGAAACGTTCAATGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACACAAGAAGTTGCAAATG-GAATTA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAAT-CAATCTTACAC
gi|4                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGT-AAATGTATTTTT-AGAATTTGATGCAAGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATCTTTTTTATTCAAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGCCAGGGTACCGAACTATTTCGACT-TGCTGCCGCTG-AACATCATCACTGTTA-TAAAT-CAC-AAATTCGGATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCCGTAAACAACCTAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCAAAATACAGTCTTAC
gi|5                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----GGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAACGAATGTTTTTGGACAAGGTACCAGACTATTTTGACTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAA---------CTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATACAGCCTTA
gi|6                          :                                                                                                                                TGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATC-TTTTTATTCAAATGTTCATCCCC---TGCGTAATGATTGTAGGGAATGTTTTTGCACAGGGTACAGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTA-AACGTCATCATTGTAA-TAAAT-CAC-AACTTCCCATTATAAAGTTCATTGGCGCTGCAAAATAACAGACATGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCT--TGTGCAATA---TGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACA-CCTTAC
gi|7                          :                                                                                                                        ttttTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----GGA-ATATC-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGCGAATGTTTTTGGACATGGTACCAGACTATTTTGACTGTGCTGCCACTG-AACGTCATCATTGTAA-TAA---------CTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATACAGCCTTA
gi|8                          :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGCATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT-CAGTCG----TGA-ATATC-TTTTTATTCGAATGTTCACTCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTATTTCGACAGGGTACCGGACTATTTTGAGTGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTGA-TAAAT-C-CTAACTT-CCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCGAAATTACAGACTGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-G-AATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCCGAATTCGCGACTCTAAATACGGCC
gi|9                          :                                                                                                                            TTCGTGCCCGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCAATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT-CAGTCA----CGA-ATATA-TTTTTATTCCAATGTTCACCCCC---TTTATAATGAGTTTAGGGAATGTATTTGGACAGGGTACCGGACTATTTCGACCGTGCTGCCGCTG-AACGTCATCATTGTAA-TAAATCC-C-AACTTCCCCTTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATAACAGACAGGTCCCCAGTAATCAACTCAAGAAGTTGCGAATG-GGAATA-TTTGCTGTAAATAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAG


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        T                        ATAT         ATGCAGTCAGT AGGAA      A      GTCA   T     T                       GAA                       A                                         A                .     CCT                                                                                T      T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        ATAT         .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CCC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCT                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     TAT                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         T                                         .                .     CAC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCT                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        .                        .            .           .          .      .      .     .                       .                         A                                         .                .     CCC                                                                                .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 .            .           .          .      .      .     .                       .                         .                                         .                .     CC                                                                                 .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                 .            .           .          .                   .                       .                         .                                         .                .     CA                                                                                 .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 .                                                                   .                .     .                                                                                  .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                .     .                                                                                  .      .
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Reference ( family-251 )      :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTNTTTGGACAGGGTACCGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAATCCCAACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACAC
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gi|16                         :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCATAAAATGTATTTTA-AGAATTTGATGTACGTTCCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAAT----CAGACACGA-ATATCTTTTT-ATTCCGATGTTTA-CCCC---TTTGTAATGAGTTTAGGGAATGTATTTGGATAGGATACCGGACT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACGTTCAATGGCTCTGCAAAATCACAGACAGGTCCC-TGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAGTTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACcgaacgttcaatggctctgcaaaatcacagacaggtccctgtaaacaacccaagaagttgcgaatggaaatatttgctgtaaacagtcatcagagttcgcgactctaaatacagccttac
gi|17                         : cttcgtgtcagattaaacattacttgctgcataaaatgtattttaagaatttgatgtacgttccgatatgtgcttcggctgcaatcagacacgaatatctttttattccgatgtttacccctttgtaatgagtttagggaatgtatttggataggataccggactcg-AGAATTTGATGTATGTTTCGATGT----GTGTTTTGGATGCAGTCAGTCAGGAATGCAGT----CAGTCAGGA-ATATCTTTTT-ATTCCATTGTTCACCCCA---TTTGTAATGAGTGAAACGAATGTATTTGGACAGGGTTCCGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACATCATCATTGTAAT-------AACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-AAAATA-TTTGCTGTAAATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                   GTATGTCTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATAGCTTTTT-ATTCCAATGTCCATCCCA---TTTTTAATGAGTGAAGGGAATGTATTTGGACAGGGTATCGGTATATTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAATCCCAACTCCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCCGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACACAAGAAGTTGCAAATG-GAAATA-TTTGCTGTTAACTGTCATCAGAATTCACGACTCTAAATAcagcctttaca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                    TATATTTTT-ATTCCAATGTTCACTCCT---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGT---------------------ATTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAATCCTAACTTCCCATTAGAAGGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCAAAGAAGTTGCGA---------A-TTTGATGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTACAt
gi|2                          :                                                                                                                            TTTGTGTCAGATTAAACATTACTGGCTGTGTAAAATGTATTTTT-AGAATT-GATATATAGTTCGATAT----GTGTTCCGC-----------C-----TGCAGTCAGTCAGTCACAA-ATATCTTTTT-ATTCCAATATTAACATAC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAGACTATTTCAACTGTGCTGCTGCTGAACATCATCATTGTAATAAATCACAACTTCCAATTATAACGTTCAGTGGTGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCATGACTCTAAATATAGCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             tCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTATCAGACTGTTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAATCACAACTTCCCTTTATAACGTTCAG-------------TTACAGACAGGTCCCCTGTTAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAATCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAGCCTTA
gi|21                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACAATACTTGCTGCGTA--------------GAATTTGATGTAAGTTTCGATAT----GTGCTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGCTCACCCCC---TTTGTAATGAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAAT-CCAGCTTCCCcaactgtgctgccgctgaacgtcatcattgtaataaatccagcttccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                             ctttgtgtcagattaaacaatacttgctgcgtagaatttgatgtaagtttcgatatgtgcttcggctgcagtcagtcacgaatatctttttattccaatgctcaccccctttgtaatgagACTGTGCTGCCACCGAACGTCATCATTGTAATAAACCACAACCTCCCAGTA-----------GGCTCTGCAAAACTACAGACAGGTCCCCTGCAAACAAGCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATATTTTGCTGTAAACAGTCATCGGAATTCGCGACTCTAAACACAGTCTT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGCCA--ATTGTAACACACCACAACTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGCCCCCTATTAA-------AGGAGTTGCGAATG-GAAATA-TCTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAACACGGCCTTGC
gi|24                         :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGAATAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATG--TGTTTCGATAT----GTGTTTCAG-----------C-----TGCAGCA---CAGTC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGGACAGGGTACCAAACTATTTCGACTGTGCTGCAGCTGAAgaaatagtttggtaccctgtcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctttgtgtcagaataaacattacttgctgcgtaaaatgtatttttagaatttgatgtgtttcgatatgtgtATA-ATTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATAAAGCCTTA
gi|3                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGGTTAAACATTACTTGCTGCGTGAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTTGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGTTCACCCC----TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGACAGGGTACCAGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAATTATAACTTCCCATTGAAACGTTCAATGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACACAAGAAGTTGCAAATG-GAATTA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAAT-CAATCTTACAC
gi|4                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAA-TGTATTTTT-AGAATTTGATGCAAGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATATCTTTTTTATTCAAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTTTTTGGCCAGGGTACCGAACTATTTCGACT-TGCTGCCGCTGAACATCATCACTGTTATAAATCACAAATTCGGATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCCGTAAACAACCTAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCAAAATACAGTCTTAC
gi|5                          :                                                                                                                           CTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCAGGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAACGAATGTTTTTGGACAAGGTACCAGACTATTTTGACTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAA-------CTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATACAGCCTTA
gi|6                          :                                                                                                                                TGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATATCTTTTT-ATTCAAATGTTCATCCCC---TGCGTAATGATTGTAGGGAATGTTTTTGCACAGGGTACAGGACTATTTCGACTGTGCTGCCGCTAAACGTCATCATTGTAATAAATCACAACTTCCCATTATAAAGTTCATTGGCGCTGCAAAATAACAGACATGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCT--TGTGCAATA---TGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACA-CCTTAC
gi|7                          :                                                                                                                        ttttTTTGTGTCAGATTAAATATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGATTATGATGTATGTTTCGATATATATGTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCAGGA-ATATCTTTTT-ATTCCAATGTTCACCCCC---TTTGTAATGAGTGTAGCGAATGTTTTTGGACATGGTACCAGACTATTTTGACTGTGCTGCCACTGAACGTCATCATTGTAATAA-------CTTCCCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATTACAGACAGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-GAAATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCAGAATTCGCAACTCTAAATACAGCCTTA
gi|8                          :                                                                                                                           CTTCGTGTCAGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGCATGTTTCGATAT----GTGTTTCGG-----------T-----TGCAGT----CAGTCGTGA-ATATCTTTTT-ATTCGAATGTTCACTCCC---TTTGTAATGAGTGTAGGGAATGTATTTCGACAGGGTACCGGACTATTTTGAGTGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTGATAAATCCTAACTT-CCATTATAACGTTCAGTGGCGCTGCGAAATTACAGACTGGTCCCCTGTAAACAACCCAAGAAGTTGCGAATG-G-AATA-TTTGCTGTAAACAGTCATCCGAATTCGCGACTCTAAATACGGCC
gi|9                          :                                                                                                                            TTCGTGCCCGATTAAACATTACTTGCTGCGTAAAATGTATTTTT-AGAATTTGATGTATGTTTCAATAT----GTGTTTCGG-----------C-----TGCAGT----CAGTCACGA-ATATATTTTT-ATTCCAATGTTCACCCCC---TTTATAATGAGTTTAGGGAATGTATTTGGACAGGGTACCGGACTATTTCGACCGTGCTGCCGCTGAACGTCATCATTGTAATAAATCCCAACTTCCCCTTATAACGTTCAGTGGCGCTGCAAAATAACAGACAGGTCCCCAGTAATCAACTCAAGAAGTTGCGAATG-GGAATA-TTTGCTGTAAATAGTCATCAGAATTCGCGACTCTAAATACAG