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Reference ( gi|1 ) : CCGAACTCCAAATCGTGCCTAATTATTATCGGCCTTTTGGTTCTAACCAGTTGGTGTA---AGCTTAAGCAAG-TGGGGAATTAGCTGGA-AGGCAGCCTACACACAACTGGTATTTT--GATGACACACGTTCGGTCAGTGTAACTTCTAGCCGTAGACTTAATTCAATGTCCAA-TACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTT-------TGATT-A-ATAACAATAA-AGT--AAGATAGTTT-ATAGG-TTCCGAAA--TAT-TA---AATTAACACAGTTTGAAT--AAGTTGT----TA--A--GT-AAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATAAT---TTTAA-AATAACTGAC-TAAA-TATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCAATTTAAAATACTAAGTCCTA----TCTCTCCCTCTAT----TACT-TATCTATATGTAAT-TCCT-----TCCCCT--CT---ATA-T-TTTAAAAACCTTTCTTTATATAATAAGTTCCTAAAATGGATTAGCCAATAAAATTAACTTTGAATATT------TAACCAATAAAAATCATTTTAACAATTAACCAATGAATTCTGATTTTACAT----A-TATTTTGACCTAAAGCTGCTAAGCTG--CTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATC-AAATGTAATCAACATTATATAATCAAACAAACTAT--AACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATATCAACACATGTCAACTCTAAATCAGATGATTAT-------ATCA---A--CATCTGGAGGCTTTTCTCCAAA----ACAATAAT--ACTTGGA-TTTTATAACTGATTGACTAAGATTTCAAAATT-TG--ATATT----ACATAGAAA--TGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACT-AAAAT-ACAGTTGTATTT---AACACCTCACGGG---TTTCTTGTTACACC--ATGGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAA--ACTT--------GTATAT-AC---TG----CATAT------TAACA-------AAATTCTCACCTACTAACAAAGTTCTACAAAC-ATCAGATACATATACTA-TTTTACAGTAAACATAGAT--AAAAA--TTT-AGG-TTTTA---------CCTTTTTAATTAAAATTTATTATTTATATTTATTTCATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAAT---TATAACAGTAATTTTATGCCTGTTAC
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gi|12 : T-ATAGT-ACAGTCATAGTT---TCCATTTAAT------TCTCTT-TTACACC--ATGGCTT-GTATAATGATTACTCTAATCAA--ACTT--------GTATAA-AC---TG----TATCT------TAACA-------AAATTCTCAC---CTAACAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACAAATATACCA-TTTTACAATAAACCTAACT--GAAAC--TTT-AAG-CCTTAATAAAGTTTACTTTTTAATTGAAGTTT-TTATTTAT-TTTATT------TTTTTATTATTTGATAACAGGAATAA---------------AATTTTATGCCTGTTAC
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Reference ( family-2505 ) : CCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTTGATTCTAACCAGTTGGTGTA---AGCTTAAGCAAG-TGGGGAATTAGCTGG-TAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT--CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTAATTCAATGTCCAA-TACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTT-------TGATT-A-ATAACAATAAATT-AAGATAGTTT-ATAGG-TTCCAA-A---ATAT-TAAATTAACACAGTTTGAAT--AAGTTCT----TA--A--GT-AAA-TAATAGTAGTCCTTAGTAATAATTTNAAAATAACTGACTAAAG-ATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAATACTAAGTCCTA----TCTCT-CCCTCTAT----TACT-T--ATCTATATGTAAT-TCCT-----TCCCCT--CT---ATA-T-TTTAAAAACCTTTCTTTATATCATAAGTTCCTAAAATGGATT--AGCCAATA--AAATTAACTTTGAATATT------TAACCAATAAAAATCATTTTAACAATTAAC--CAATGAATTCTAGTTTTACAT----A-TATTTTG--ACCTA-AAGCT------GTT-----AAGCTG--CTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATC-AAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTAT--AACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACACATGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------ATCA---A--CATCTGGAGGCTTTTCTCCAAA----ACAATAAT--ACTTGGA-TTTTATAACT--GATTGA-CTAAGAT------T---TTAAAATTTGA----TATNACATAG----AAA--TGAAAA------TTTAAATACCTTCTCTTATTAACT-AAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACA--ACATGGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAA--ACTT--------GTATAT-AC---TG----CATATT------AACA-------AAATTCTCACCTATTAACAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACACATATACCA-TTTTACAATAAACATAANT--AAAAA--TTT-AGG-TTTTA---------CCTTTTTAATTGAAATTTATTGTTTTTATTTATTTTATTNTTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAAT---TATAACAGTAATTTTATGCCTGTTAC
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gi|9 : ggggaattagctggtaggcagcctacacacaactagtatttttatgacgtcagtctaacttctagcagtagactttattcaatgtccaatagagtacacaagtcttttggtgtttaacacttttattttggtttgACAT----A-TATTTTG--ACCTA-AAGTT------GTT-----AAGCTG--CTAAAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATC-AAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTAT--AACAATCAAACAAGTCCTAGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACTCATGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------ATCA---A--CATCTGGAGGCTTTTCTCCAAA----TCTATAAT--ACTTGGATTTTTATAACT--GATTGA-CTTAGAT------T---TTAAAATTTGA----TATCACATAG----AAA--TGAAAA------TTTAAATACCTTCTTTTATTAACT-AAAAT-ACAATTGTTATTAACACCTCAAGGATTTCTTGTTACA--ACATGGTTT-GT---ATGATTACTATAATGAA--ACTT--------GCATAT-AC---
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blockSeqs : G . . T . . . . G . T AT . A A AT A . . . T . TCT A . . A G A C . . ATA . . A . T . TTTAA A . . . . . . . . . . . . T . . T . . TGTCAACTCA . A . AG . . . . . . . G . . . . . . . T . . T . . . . TAT . C . A AA . . G C NNN .
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blockSeqs : A . . . . T . TC A . . A G . . . . AA . . . . . . TTA . . . . . . . . . T . . T . . . . A . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . A . . . . T . C . A CT . . T C TT .
blockSeqs : . . CT A . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . A . . . . . . . G . . . . . . . G . . T . . . . A . A . T GT . . G C . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . A . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . A . A T . . C . .
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Reference ( family-2505 ) : CCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTTGATTCTAACCAGTTGGTGTA---AGCTTAAGCAAG-TGGGGAATTAGCTGG-TAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT--CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTAATTCAATGTCCAA-TACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTT-------TGATT-A-ATAACAATAAATT-AAGATAGTTT-ATAGG-TTCCAA-A---ATAT-TAAATTAACACAGTTTGAAT--AAGTTCT----TA--A--GT-AAA-TAATAGTAGTCCTTAGTAATAATTTNAAAATAACTGACTAAAG-ATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAATACTAAGTCCTA----TCT-----CT-CCCTCTAT----TACTT--AT---CTATATGTAATTCCTTCTCC-CT----ATATTTTAAAAA-CCTTTCTTTATATCATAAGTTCCTAAAATGGATT--AGCCAATA--AAATTAACTTTGAATATT------TAACCAATAAAAATCATTTTAACAATTAAC--CAATGAATTCTAGTTTTACATA----TATTTTG--ACCTA-AAGCT------GTT-----AAGCTG--CTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATC-AAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTAT--AACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACACATGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------ATCA---A--CATCTGGAGGCTTTTCTCCAAA----ACAATAAT--ACTTGGA-TTTTATAACT--GATTGA-CTAAGAT------T---TTAAAATTTGA----TATNACATAG----AAA--TGAAAA------TTTAAATACCTTCTCTTATTAACT-AAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACA--ACATGGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAA--ACTT--------GTATAT-AC---TG----CATATT------AACA-------AAATTCTCACCTATTAACAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACACATATACCA-TTTTACAATAAACATAANT--AAAAA--TTT-AGG-TTTTA---------CCTTTTTAATTGAAATTTATTGTTTTTATTTATTTTATTNTTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAAT---TATAACAGTAATTTTATGCCTGTTAC
gi|1 : CCGAACTCCAAATCGTGCCTAATTATTATCGGCCTTTTGGTTCTAACCAGTTGGTGTA---AGCTTAAGCAAG-TGGGGAATTAGCTGG-AAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT--TGATGACACACGTTCGGTCAGTGTAACTTCTAGCCGTAGACTTAATTCAATGTCCAA-TACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTT-------TGATT-A-ATAACAATAAAGT-AAGATAGTTT-ATAGG-TTCCGA-A---ATAT-TAAATTAACACAGTTTGAAT--AAGTTGT----TA--A--GT-AAG-TAATCGTAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAACTGACTAAAT-ATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCAATTTAAAATACTAAGTCCTA----TCT-----CT-CCCTCTAT----TACTT--AT---CTATATGTAATTCCTTCCCCTCT----ATATTTTAAAAA-CCTTTCTTTATATAATAAGTTCCTAAAATGGATT--AGCCAATA--AAATTAACTTTGAATATT------TAACCAATAAAAATCATTTTAACAATTAAC--CAATGAATTCTGATTTTACATA----TATTTTG--ACCTA-AAGCT------GCT-----AAGCTG--CTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATC-AAATGTAATCAACATTATATAATCAAACAAACTAT--AACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATATCAACACATGTCAACTCTAAATCAGATGATTAT-------ATCA---A--CATCTGGAGGCTTTTCTCCAAA----ACAATAAT--ACTTGGA-TTTTATAACT--GATTGA-CTAAGAT------T---TCAAAATTTGA----TATTACATAG----AAA--TGAAAA------TTTAAATACCTTCTCTTATTAACT-AAAAT-ACAGTTGTATTTAACACCTCACGGGTTTCTTGTTACA--CCATGGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAA--ACTT--------GTATAT-AC---TG----CATATT------AACA-------AAATTCTCACCTACTAACAAAGTTCTACAAAC-ATCAGATACATATACTA-TTTTACAGTAAACATAGAT--AAAAA--TTT-AGG-TTTTA---------CCTTTTTAATTAAAATTTATTATTTATATTTATTTCATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAAT---TATAACAGTAATTTTATGCCTGTTAC
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gi|12 : TCTCTT-TTACA--CCATGGCTT-GTATAATGATTACTCTAATCAA--ACTT--------GTATAA-AC---TG----TATCTT------AACA-------AAATTCTCACC---TAACAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACAAATATACCA-TTTTACAATAAACCTAACT--GAAAC--TTT-AAG-CCTTAATAAAGTTTACTTTTTAATTGAA-------GTTTTTATTTATTTTATT-TTTTTATTATTTGATAACAGGAATAA---------------AATTTTATGCCTGTTAC
gi|13 : tatagtacagtcatagtttccatttaatTAGACTTAATTCAATGTCCAA-TAGAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTT-------TGATT-A-ATAACAATAAATT-A--GTAGTCC--TAAG-T---AATA---ATTT-TGAAATAAC
gi|13 : GTTTGATT--AA---------TA--ACAAT-AAA-T--TAGTAGTCCTAAGTAATAATTTTGAAATAACTGACTAAAG-GTTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTGAAAT---------TA----T-T-----TG-CCCT----------CTT--AT---CTATATGT-ATTCTCTTTCC--------TATTTTAAAAA-CCTTTCTTTATATCATAtgactaaaggtttagttccgtttggctatcgtaaattatataatggctagcgttatgccatttgaaattatttgccctcttatctatatgtattctctttcctattttaaaaacctttctttatatcata
gi|14 : tagacttaattcaatgtccaatagagtacacaagtcttttggtgtttaacacttttattttgTAGTTT-CAAGAATTCCAA-A---ATAT-AAAACTAATAAAGTATGTAT--AAGTTCC----TA--A--GT-AAAATAGTAGAAGTCCTTAGCAATAATTTAATAATTACTGAC-AAAA-ATATA---TAGTTTGGCTAT------------------------TATGCCATTC--AACGCTAAGTTCAA----CTT-----CGACCGTATAT----TGCCTAAAT---CTAGAT
gi|15 : attttagatttgtatgcaaaacttgattatctgtatTT--------ATATAT-AC---AG----CAAATT------AACA-------AAATTC--AT---TTAACAAAGTTTTACAAAC-ATGAGGCACATACCCAA-TATTTCAATAAACATAACT--GAATA--TTTTAGC-TTTTA---------CCTCTTAAATTGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTTTTTTTATTATTTGCTAACAGCAATAAAATTAATATAACAGTAATTTTATGCCTGTAACtcttaactatcctaaaataatgtt
gi|16 : acttCTGAACTCTGAATTGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTTAATTCTTACCAGTTGGTGTATTGAGCTTAAGCAAG-TGGGGAATTGGCTGG-TAGGCAGCCATCACACAACCGATATTT--CGATGACATA-GTGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTAAA
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