lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 222222222222222 555555555 3333333 222222222222222 1111111111 11 1111111111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 22 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111 111 11111111111 11111111111 1 1 111111111111111111111 111 11111 22222222222 11111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 0 2 111111111111111 444444444 1 22 0 7777777 444 11 44444444444 2 222 0 666666666666666 111 0 0 0 44444444444 222 4444444444 33 11 3333333333 0 1111111111111 0 4444444 0 11 666666666666 0 99999999999999999999999999 1111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 00 1 888 33333 66 0 0 0 1 22222222222 00 22222222222 0 22222222222 4 33333333333 1 111 1111 22222222 00 1 11 2222222222 4444444444444444444 0 0 44 111 11 2222 44 11111 3333333 22222 222 11 11111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 1111 22 0 111 0 0 0 0 55555555555 1 44 33 9999 1 444 11 99999999 1 11 22 33333333333 1 999999999999 3333333 11111111111 55 222 11 666 1 1 777 444 3 2 7 3 0 6 2 3 33 6 9999 22 22 2 555 4444 2 222222222222222222222 66666666666 77777777777 2 11 222 2222 33333 333333 44444444444 555555555 88888888888 1 222 22 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777
lowQualScore : . . . ............... ......... . .. . ....... ... .. ........... . ... . ............... ... . . . ........... ... .......... .. .. .......... . ............. . ....... . .. ............ . .......................... .... ............................................................................................... .. .. . ... ..... .. . . . . ........... .. ........... . ........... . ........... . ... .... ........ .. . .. .......... ................... . . .. ... .. .... .. ..... ....... ..... ... .. ..... ..................................................... . .... .. . ... . . . . ........... . .. .. .... . ... .. ........ . .. .. ........... . ............ ....... ........... .. ... .. ... . . ... ... . . . . . . . . .. . .... .. .. . ... .... . ..................... ........... ........... . .. ... .... ..... ...... ........... ......... ........... . ... .. . .............................................................
lowQualScore : 7 7 0 000000000000000 444444444 3 66 5 2222222 444 22 33333333333 0 444 9 555555555555555 333 8 7 8 33333333333 333 3333333333 66 00 1111111111 7 4444444444444 7 6666666 7 66 000000000000 7 44444444444444444444444444 4444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 88 88 8 333 33333 77 6 6 6 1 88888888888 88 77777777777 6 88888888888 7 22222222222 1 999 9999 88888888 88 7 33 5555555555 4444444444444444444 6 6 66 000 66 3333 33 88888 1111111 88888 666 00 88888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 5555 55 7 333 7 7 8 8 66666666666 5 33 99 3333 8 555 33 77777777 0 33 77 11111111111 0 111111111111 5555555 33333333333 11 111 77 444 2 3 999 222 6 1 4 3 1 0 7 9 22 2 1111 99 99 2 555 5555 1 111111111111111111111 33333333333 22222222222 4 77 333 6666 11111 777777 44444444444 222222222 77777777777 3 777 22 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTG-AACCCCTTAGTG----------GCTCCTTAGTG---C-CCC-TT-TGAACC-CCTTAG-AGGC-CC---TT--AG-----------TGG---TCCTTA-GTG-C-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTGGCTCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTG-----------G-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CC---------TTA-G--AG-GC----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TNGA--G-A-CTCCTTAGT--GG--T-C--T---A---G--G----------G-TCCTTAGTGNCC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT-AG--TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--T-----A-A--C--CC----------C-TTAGTG-G----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TN--CCT-AGT-G---CCTCTT-T-GT-TG-TCCNTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATNATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCNTT-G-TAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TG----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-TGCCCCC---TT--TGACC--------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( gi|1 ) : CCCCTTTG-AACTCATTAATG----------GCTCCTTAGTG---C-AAA-TT-TGAACT-CCTTAG-AGGCAAC---TT--AG-----------TGG---TCCTTA-GTG-G-C-A-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CA---------TTAGTGGTTCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----A-T-T--T----------A-A-AC---------------------T----CCTTA----GTG-----------G-----------C--A-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CA---------TTA-A--AG-GC----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G-T-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---CCCCCAT-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TTGA--G-A-CTTCTTAGT--GG--TAC--TA--A---G-GG----------G-TCCTTAGTGGCC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TA----------AGT-AG--TC--CTTAGT--A-C-CCTCAT--T--T-----A-A--C--CT----------C-TTAGTG-A----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCT-AGT-G---CCTTTT-T-GT-TG-TCCCTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTG--TCCATT-G-CAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CTCCCTT----TC----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-TGCCCCC---TT--TGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|15 : CCCCTTTG-AACCCCTTA--G----------GTCCCCC-------------TT-TGAA---CCT--G-----------TT--AG-----------TAG---TCCTTA-GTG-C-C-C-----C---TT---T-C-A-A-----------C----------------------TCC--TTG----------G-TG-----------C-C-C-----C-T-T--T----------C-A-AC---------------------T----CCTTG----GTG-----------G-----------T--C-C----T------------------AA-G---T---------------------G-GC----------TCCTT--AA--T----------------------A-GCC----------CTTT--A-----------G-TG-----------G-TATTTAG-----------T-G-
gi|13 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaccccttagtgaCCCCTTTG-AATCCCTTAGTA----------G-TCTTTAGTG---T-CCC-CT-TAAAATCCCTTTG-AATC-CC---TT--AG-----------TAT---TCCTTA-TTACC-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TAAG-AATTCC--TAA----------G-TG-----------CAC-C-----C-T-T--T----------A-A-AC---------------------C----CCTTA----GTA-----------G-----------T----C----T-------T--TAG-----TG-C---C--CAT--------TTA-A--A-----------------------------C-CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CATA--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-gcat
gi|16 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaaaccccttagtgaCCCCTTTG-AACCCCTTAGTA----------G-TCCTTAATG---C------------CC-CCTTTG-----AACCTGTT--AA-----------AAG---TCCTTA-G-G-G-C-C-----CCT-TT---T-G-A-A-----------Cc
gi|21 : tgattaatgacctgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacagtcctaatcttaatatgaaaccccttattgaCCCCTTTG-AACTCCTTTGTG----------GCTCCATAGTG---G-TGC-TT-AGTAGT-CCTTAG-TGGC-AT---TT--AG-----------TAG---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|7 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaaccccttaatgacctctttcaagcactttgtagttataagtgcCCCCTTTT-AACCCCTTAGAG----------ACTCCTTAGTG---C-CCCCTT-TTAAC--CCTTAG-AGACTCC---TT--AG-----------TAG---TCCTTA-GTG-G-C-CTCTTTC---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTga
gi|19 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccCCCCTTTG-AA-TC--------------------CCTTAGTG---C-CCATTT-TGAAAT-CA-TA----------------AG-----------TAG---TCCTTC-GTGCC-C-C-----C---TT---T-GTG-G-----------CC--C----------TTAGTAGTT-C--TAA----------G-TG-----------G-C-T-----A-T-T--
gi|29 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagtccttagtgaCCCCTTTG-AACTCCTTAGTA----------G-TCCTAAGTG---agca
gi|34 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaaacactttattagtccttagtgcaccctctgaaacccttagtgcaccctttgaaacccttagtgtCCCCTTTA-AACCCCTTATTG----------ACCCC---------------TT-TGAACC-CATTA----GCA------------------------G---TCCTTA-GTG-GTC-C-----C---TT---T-A-A-A-----------CC--TC---------TTAGTgcatttagt
gi|38 : agtagtccttagtgcCCCCTTTG-AACTCCTTAGAG----------GCTCCTTAGTG---
gi|6 : gtccttagtgCCTTTTG-AA-TCCTTAGTGCCCACTTTCAACTCCTTAGTG---CTCCC-TT-TAAACC-CCTCAG-AGAC-----------------------------TCCTTA-GTG-C-C-C-----CC--TT---T-T-A-A-----------CA--CC---------TTAGAGACTCC--TTA----------G-TGG----------C-C-T-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----TCTTA----GTG-----------C-----------C--C-CC---T-------T--T-T-----AA-C---C--CC---------TTA-C--AG-AC----------TCCTT--AG--T-GGC-CC-----C--T-TT-T-A-ACT----------CCTT--ACAGACTCCTCAG-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-G-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-AC-T---C--CTT
gi|4 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCCTTTG-AACTCATAAGTG----------CCCCCTT--------------T-T-AACC-CCTGAG-AGACTAC---TT--AG-----------TAG---TCCTTA-ATG-C-CTC-----C---TT---T-T-A-A-----------CC--CC---------TTAGAGACTCC--TTA----------G-T--------------------------------------------AG---------------------T----CCTTA----GTG-----------GC----------C--C-C----T-------T--T-G-----TA-----T--CC---------CTA-AGTAG-------------TCCTA--AG--G-G-T-CC-----C--T-TT-T-A-ACC----------CCTT--A-----------G-tgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTTTG-AATGCCTTAGTGCCCACTTTCAACTCCTTAGTGCC-C-CCC-TT-TTAACC-CCTTAG-AGACTCC---TT--AG-----------TGC---CCCCTT-TTA-A-C-C-----C---TT---A-G-AGA-----------CT--CC---------TTAGTAG-TCC--TTA----------G-TG-----------G-C-CTCTTTC-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTgaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|26 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCCTTTA-AATGCCTAAGTG----------ACTCTTTAGT-------------TG---T-CCTTAG-TG---AC---CC--AT-----------TTGAACCCCTTA-GTG-T-C-A-----C---TT---T-T-A-A-----------CC--CC---------TTAGCGGCTCC--TTA----------G-TGA----------C-C-C-----C-T-T--T----------
gi|36 : ccccttagtagtcctaaataaCCCTTTG-AACCCCTTAGTG----------G-TCCTTAGTGC--C-CCC-TT-TGAAC--CCT--------------TT--AG-----------TGG---TCCTTA-GTG-C-C-C-----C---CT---T-gcagtacctattgatttttggttgtctgtaataaga
gi|28 : gtgctCCCATTGTAACCCCTTAGTA----------G-TCCTTAGTG---C-TCC-TT-TGAACT-CCTTAG-AGGCTAC---TT--AGAGGCTTGTTAGTGA---TCCTAA-GTG-C-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CC---------TTAGAGGCTAC--TTA----------G-tg
gi|3 : gctcattagtggtccaaagtgaCCTTTG-AACTCATAAGTG----------CCCCCTT--------------T-T-AACC-CCTGAG-AGACTAC---TT--AG-----------TAG---TCCTTA-ATG-C-CTC-----C---TT---T-T-A-A-----------CC--CC---------TTAGAGACTCC--TTA----------G-T--------------------------------------------AG---------------------T----CCTTA----GTG-----------GC----------C--C-C----T-------T--T-G-----TA-----T--CC---------CTA-AGTAG-------------TCCTA--AG--G-G-T-CC-----C--T-TT-T-A-ACC----------CCTT--A-----------G-
gi|12 : CTTTG-AACTCCTAAGTG----------GCTCCTAAGTG---T-CCC-TT-TGAACT-CCTTAG-AAGCTCC---TC--AG-----------TGG---TTCTTA-GTG-G-C-A-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CA---------TAAGTGACTCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-G-ACTCCTTAGAGGTTCCTTAGTGGT----CCTTA----GTG-----------G-----------C--A-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CA---------TTA-T--TG-GC----------TCCTT--AG--T-G-T-CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CCTA--A-----------G-AG-----------GCTCCTTAG--------------------------------------AA-G--CTC----------CTTAA-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG------GCAT-----T-------T----TGA---------------------------TCTTA-------------TA--A---GTGG----------C-TCCTTAGT-GTC----CC--TT-T---G-A-ACgaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|23 : cttagtggtccttagtggcaCTTTG-AATTCCTTAGAG----------GCTCCTAAATG---T-CCC-TT-TGAACT-CTTTAA-AAGCCCC---TT--AG-----------TAG---TCCTTA-GTG-C-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CA---------TAAGTGGCCCC--TTA----------G-TG-----------C-C-A-----A-T-T--T----------G-A-AC---------------------T----CCTTA----GAG-----------G-----------CT-A-C----T-------T--
gi|39 : ggcaatttgaactctttagtggtccttagtggcaCTTTG-AACTCATTAGTG----------GCTCCTTAGTG---agtggtcct
gi|25 : ggcaTG-AAACCCTTAGTA----------GA-CCTTAGTG---CTCCA-TT-TAAACC-CC-----------C---TT--AG-----------TGG---TCCTTA-GTGCC-C-C-----C---TT---T-T-A-A-----------CT--C----------TTAGTGGCTCC--TTA----------G-TG-------------G-C-----A-T-T--T----------A-tccctttga
gi|5 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaata-AACCCATTGGTA----------G-TCCTTAGTG---CTCCC-TT-TGAACC-CCTTA-----------------G-----------TGG---TCCTAA-GTG-C-C-C-----C---CT---TAG-A-A-----------C
gi|18 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-AACCCCTTAGTA----------G-TCCTTAGTG---C------------CC-CCTTTG-A-ACCCC---TC--AG-----------TGG---TCCTTA-GTGCC-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTGG-TCC--TTA----------G-TGC----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------T----CCTTA----GTG-----------G-----------T--C-C----T-------T--A-G-----TA-G---T--CC---------TTA-G--TG-G-----------TCCTT--AG--T-G-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|29 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatga-AACACTTTATTA----------G-TCCTTAGTG---C-ACC-CTCTGAAAC-CCTTAG--TGCACCC--TT--TG-----------AAA---CCCTTA-GTG-T-C-C-----CC--TT---T-G-A-A-----------CT--CC---------TTAGTAG-TCC--TAA----------G-TG-------------G-C-----A-T-T--T----------A-gcatttag
gi|32 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaTTAGTA----------G-TCCTTAGTG---CTCCC-TT-TGAACC-C------------C---TC--AG-----------TGG---TCCTTA-GTGCC-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------C----------------------CCC--TTA----------G-TGC----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------T----CCTTA----GTG-----------G-----------T--C-C----T-------T--A-G-----TA-G---T--CC---------TTA-G--TG-GC----------gt
gi|41 : ccccG----------GCTCCTTAGTG---G-CAC-TT-TGAACT-CCTAAG-Aatttagt
gi|28 : ----------GCTCATTAGTGGTCC-AAA-GT---GACC-CATT-----GTAACCCCTT--AG-----------TAG---TCCTTA-GTG-C-T-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CC---------TTAGAGGCTAC--TTA----------GAGG-----------C-T-T-----G-T-TAGT----------G-A------------------------T----CCTAA----GTG-----------C-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CC---------TTA-G--AG-GC----------TACTT--AG--
gi|19 : TCCTTAGTG---------------ACC-CCTTTG-AATC------------------------------CCTTA-GTGCC-C-A-----T---TT---T-G-A-A-----------AT--CA---------TAAGTAG-TCC--TTC----------G-TG-----------C-C-C-------------------------------------------------------CCTTT----GTG-----------G-----------C--C-C----T-------T--
gi|38 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagTCCTTAGTG---C-CCC-TT-TGAACT-CCTTAG-AGGCTCC---TT--AG-----------TGagtagttctaagtggctattagca
gi|23 : gAA-TT-TGAACT-C------------T---TT--AG-----------TGG---TCCTTA-GTG-G-C-A-----C---TT---T-G-A-A-----------TT--CC---------TTAGAGGCTCC--TAA----------A-TG-----------T-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------T----CTTTA----AAA-----------G-----------C--C-C--------------------------C---T--TA---------GTA-G-----------------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CATA--A-----------G-TG-----------GCCCCTTAG-----------T-G---CC----A--------ATT--TGA-A--CTC----------CTTAG---------------------A-G--G---CTACTTAGTG---
gi|22 : ggc-TT-TGAACT-CCTTAG-TGGCTCC---TT--AG-----------TAG---TCCTAA-GTG-T-C-C-----CA--TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTAGTT-C--TAA----------G-TG-----------C-C-CA----A-T-T--T----------T-A-AC---------------------C----CATT------TG-----------A-----------G--A-C----T-------TC-T-T-----AG-T---TG-TA---------CTA-A--GG-GG----------TCCTT--AG--TGG-C-CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CCTA--A-----------G-TA-----------G-TCCTGAG-----------T-A-C-CC----T--------CAT--TTA-A--CCT----------CTTGG-------------------T-gtcct
gi|7 : -TT-TGAATG-CCTTAG-TGCCCAC---TTTCAA-----------C-----TCCTTA-GTG-C-C-C-----CCC-TT---T-T-A-A-----------CC--CC---------TTAGAGACTCC--TTA----------G-TGC----------C-C-C-----C-T-T--T----------T-A-AC--------------------------CCTTA----GAG-----------------------------------------------------A-C---T--CC---------TTA-GT-AG-------------TCCTT--AG--T-G-G-CCTCTTTC--T-TT-G-A-ACC----------CCTT--A-----------G-Tgacctc
gi|39 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncct-TT-TGAACT-CATTAG-TGGCTCC---TT--AG-----------TGT---CCCTT
gi|16 : ggcacT-TGA-CC-CCTTTG-AACCC-C---TT--AG-----------TAG---TCCTTA-ATGCC-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--TG---------TTAAAAG-TCC--TTA----------G-GG-----------C-C-C-----C-T-T--T----------tga
gi|21 : tgattaatgacctgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacagtcctaatcttaatatgaaacccctta-TGACCT-CTTTCA-AG-CA-C---TT--TG-----------TAG---TTATAA-GTG-C-C-C-----CC--TT---T-G-A-A-----------CT--CC---------TTTGTGGCTCC--ATA----------G-TG-----------G-T-------G-C-T--T----------A-GTAG---------------------T----CCTTA----GTG-----------G-----------C--A-T----T-------T--tgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|11 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaaccccttaaGAAGT-CCTTAG-TAACAGC---TT--TG-----------TTG---TA-TTATGTG-G-T-C-----C---TT---T-G-T-A-----------CC--TT---------TTGATGGT-CT--TT--------------------------------------T-T--T----------A-G------------------------T----ACTAA----GTG-----------C-----------C--T-C----T-------T--G-C-----GG-T---C--CA---------TGG-A--AG-------------TCCTT--AG--T-G-A-CAG----C--T-TT-G-A-TAT----------ATTT--A-----------G-TG-----------G-TCATTTG-----------T-G-C-CT----C--------TTT--TGT-G--GTC----------TTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTACGTG---CCTCTCT-----T-------G----TGG---TCCT--TAAAAGTTTAGTG-A-CTGCTTTGT--AG--TAT--TA--A---G-TG----------A-TCCTTTGTGCCT----CT--TT-T---G-T-GGTA-T-TT----------ATT-AG--TC--CTGAGT--G-C-CTTagtagga
gi|2 : cagtgcctcttgtggtccatgACT-CCTTAGTAGTC--C---TT--TA-----------TGA---CCCT---ATG-A---A-----C---GT---T-A-A-A-----------GTGACACT-------TTTGTGGTT-C--TTA----------C-TGA----------C-C-C-----A-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTG-----------T-----------C--C-C----C-------T--T----------------------------TTA-A------C----------GCCTT--AG--T-ATC-TC-----C--T-TT------------------CCAT--A-----------GATG-----------T-TCCTTAG-----------T-G-A-CC----C--------CTT--TGttatggtccttggaagtccttattt
gi|19 : tgT-CCTTAG-TGACCCC---TT--TG-----------AAT---CCCTTA-GTG-C-CCA-----T---TT---T-G-A-A-----------AT--CA---------TAAGTAGT-CC--TTC----------G-TG-----------C-C-C-----CCT-T--T----------G-T-GG---------------------C----CCTTA----GTA-----------G-----------cagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|9 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttagG-AGACTCC---TT--AG-----------TAG---TCCTAA-GTG-G-C-CT----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTAGT-CC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----C-T-T--T----------T-A-AC---------------------T----CCTTA----GTG-----------C-----------C--C-CCCCTT-------T--T-A-----AC-C---T--C-----------TA-AG-AG-ACTTGTTAGTAGTCCTT--AG--T-GCC-CC-----C--T-TT-A-A-ACC----------CCTT--A-----------C-AG-----------ATTCCTAAG-----------T-G-C-CC----C--------CTA--AGAGA--CTC----------GTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG----CCCCA------T-------T----TAA---CCCC--T-----TACA--G-A-CTCCTAA-----G--CAC------------------------------------CC----CC--TT-A---G-AGACTC-C-TT----------AGT-AT--TC--CTTAGT--G-C-CGCC-T--T--T-----A-A--C--CC----------C-TTACAG-A----------CTCC--------TT-----------A-CA---GACTC--CTT-AGC-G---CCCCCT-TAGT-AG-TCCTTAGTGGttctaagtggctattagca
gi|29 : G-AAACACT---TT--AT-----------TAG---TCCTTA-GTGCA-C-C-----C---TC---T-G-A-A----------------A-----------------CCC--TTA----------G-TG-----------CAC-C-----C-T-T--T----------G-A-AA---------------------C----CCTTA----GTGT----------C-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CC---------TTA-GT-AG-------------TCCTA--AG--T-G-cctctttga
gi|8 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatAAC---TT--AG-----------TGGC--TCCTTA-GTG-GCC-A-----C---TT---T-G-gcatttagt
gi|25 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggC---TT--AG-----------TAG---ACCTTA-GTG-C-T-C-----CA--TT---T-A-A-A-----------CC--CCC--------TTAGTGGT-CC--TTA----------G-TGC----------C-C-C-----C-T-T--T----------T-A-AC---------------------T-----CTTA----GTG-----------G-----------C--T-C----C-------T--T-c
gi|32 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaatatgaaaccC---TT--AG-----------TAG---TCCTTA-GTG-CTC-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TCAGTGG-TCC--TTA----------G-TGC----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTGC----------C-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CC---------TTA-G--TG-G-----------TCCTT--AG--T------------------------AGT----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-CATTTAG-----------T-agtggcattta
gi|26 : cccC---TT--AG-----------TAG---TCCTAA-ATA-A-C-C-----C---TT---T-A-A-ATGCCTAAGTGACT--CT---------TTAGTTGT-CC--TTA----------G-TGA----------C-C-C-----A-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTG-----------T-----------C--A-C----T-------T--T-T-----AA-C---C--CC---------TTA-G--CG-GC----------TCCTT--AG--T-GAC-CC-----C--T-TT-G-C-AGT----------ACCT--A-----------T-TG-----------A-TTTTTGGT----------T-G-T-C
gi|36 : cccC---TT--AG-----------TGG---TCCTTA-GTGCC-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CT---------TTAGTGG-TCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----tgtaataaga
gi|5 : gtgctccctttgaaccc---TT--GG-----------TAG---TCCTTA-GTG-CTC-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTGG-TCC--TAA----------G-TG-----------C-C-C-----C-C-T--T----------A-G-Acctttg
gi|30 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccaT--AG-----------TGG---TCCTT---TG-G-T-C-----CTCTTT---T-G-T-A-----------GT--CT---------TAAGTAGTCCT--TTA------------TG-----------C-CTC-----G-T-T--TGTAGTTCTTGA-A-AG---------------------T----CCTTA----ATG-----------A-----------C--A-T----T-------T--T-acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|34 : --AG-----------TAG---TCCTTA-GTG-C-C-C-----CC--TT---T-A-A-A-----------CC--CC---------TTATTGACCCC--TTT----------G-AA-----------C-C-C-----A-T-T--A----------G-C-AG---------------------T----CCTTA----GTG-----------GT----------C--C-C----T-------T--T-A-----AA-C---tgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|31 : --AG-----------TGG---TCCTTG-GT--C-C-T-----C---TTTTGT-G-A--------------T--CT---------TTAGTAGTCCT--TTATTCCTCTTTTG-TG-----------G-T-C-----C-T-T--G----------A-A-GG---------------------T----CCTTA----ATG-----------A-----------C--AGC----T-------T--T-G--------T---TG-TA---------TTT-A--AT-GG----------TCTTT--TG--T-G-C-CT-----CA-T-TT-G-ctcttagt
gi|38 : G---TCCTTA-GTG-C-C-C-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CC---------TTAGAGGCTCC--TTA----------G-TG-----------tggtcttatt
gi|41 : ---TCCTTA-GTG-G-C-A-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--C
gi|15 : ggcCCTTA-GTG-A-C-C-----CC--TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAG--GTCCCCCTTT----------G-AA-----------C-C-T-----G-T-T--A----------G-T-AG---------------------T----CCTTA----GTG-----------C-----------C--C-C----T-------T--T-C-----AA-C---T--C----------------------------------CTT--GG--T-G-C-CC-----C--T-TT-C-A-ACT----------CCTT--G-----------G-TG-----------G-TCCTAAG-----------T-G-G-CT----C--------CTTAAT-A-G--CCC----------TTTAG-------------------T-G-G--T---A--TTTAGTG---ctaaga
gi|13 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaccCCTTA-GTG-A-C-C-----CC--TT---T-G-A-A-----------TC--CC---------TTAGTAGT-CT--TTA----------G-TG-----------T-C-C-----C-C-T--T----------A-A-AA---------------------T----CC--------------------------------------C----T-------T--T-G-----AA-T---C--CC---------TTA-----GTAT----------TCCTT--AT--T-A-C-CC-----CC-T-TT-G-A-ACC----------CCTA--A-----------G-AA-----------T-TCCTAAG-----------T-G-C-AC----C--------CTT--TAA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--TTTAGTG-----CCCAT-----T-------T----AAA---CCCC--T-----TTGA--A------CCCA-------------TA--A---G-TA----------G-TCCTTAGTGgcat
gi|16 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaaaccCCTTA-TTG-A-C-C-----CC--TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTAG-TCC--TTA----------A-TG-----------C-C-C----------------------------C------------------------------------------------------------------C----T-------T--T-G-----AA-C---C--TG---------TTA-A--AA-G-----------TCCTT--AG--G-G-C-CC-----CT-T-TT-G-A-ACc
gi|8 : tgattaatgacctgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacagtcctaatcttaatatgaaaccCTAA-ATG-A-C-A-----C---TT---T-T-A-AT----------CT--TAATATGGAACTTAGTGGCTCC--TTA----------G-TG-----------G-C-C-----A-C-T--T----------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|39 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataaG-G-C-A-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CA---------TTAGTGGCTCC--TTA----------G-TG-----------T-C-C-----C-T-T--T----------G-A-tgc
gi|29 : -C-A-----C---TT---T----------------------A---------TTAGT----CC--TTA----------G-TG-----------CAC-C-----C-T-C--T----------G-A-AA---------------------C----CCTTA----GTG-----------------------C--A-CCC--T-------T--T-G-----AA-----------------------------AC-----------CCTT--AG--T-GTC-CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTAAG-----------T-G-
gi|4 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaaa-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CA---------TAAGTG---CC------------------------------C-C-C-----T-T-T--T----------A-A--C---------------------C----CCTGA----GAG-----------A-----------CT-A-C----T-------T--A-G-----TA-G---T--CC---------TTA-A--TG-CC----------TCCTT--TT--A-A-C-CC-----C--T-TA-G-AGACT----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-G-CC----C--------CTT--TGT-A--TCC----------CTAAG-------------------T-A-G--T---C--CTAAGGG---TCCC--T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TAGG--A-A-CCCATTTGC--AG--TAC--CT--A---G-AG-------------CCTTgcatttagt
gi|3 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc-----C---TT---T-G-A-A-----------CT--CA---------TAAGTG---CC------------------------------C-C-C-----T-T-T--T----------A-A--C---------------------C----CCTGA----GAG-----------A-----------CT-A-C----T-------T--A-G-----TA-G---T--CC---------TTA-A--TG-CC----------TCCTT--TT--A-A-C-CC-----C--T-TA-G-AGACT----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-G-CC----C--------CTT--TGT-A--TCC----------CTAAG-------------------T-A-G--T---C--CTAAGGG---TCCC--T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TAGG--A-A-CCCATTTGC--AG--TAC--CT--A---G-AG-------------CCTTttctgtatgtaatagg
gi|36 : c-----C---TT---T-G-A-A-----------CC--CC---------TTAGTGG-TCC--TTA----------G-TGC----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CTTTA----GTG-----------G-----------------------------------------------------------------------------------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----C--C-TT-ttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|22 : gtgctcc---TT---T-G-A-A-----------CT--CC---------TTAGTGGCTCC--TTA----------G-TAGTCCTAAGTGTC-C-C-----A-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTA-----------GTTCTAAGTGCCC--A-A----T-------T--T-T-----AA-C---C--CA---------TTT-G--AG-AC----------TTCTT--AG--T------------------T-G-T-AC-------------TA--A-----------G-GG-----------G-TCCTTAG-----------T-G-G-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTAAG-------------------T-A-G--T---C--CTGAGTA---CCCTCA------T-------T----TAA---CCTC--T-----TGGT--G-A-CCTCtg
gi|5 : -A-A-----------CC--CA---------TTGGTAGT-CC--TTA----------G-TG-----------CTC-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTTA----GTG-----------G-----------
gi|18 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-A-----------CC--CC---------TTAGTAGT-CC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----CCT-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTCA----GTG-----------GTCCTTAGTGCCC--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---C--CC---------TTA-G--TG-G-----------TCCTT--AG--T-GCC-CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------TAG-T------------------------------C----------CTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---tcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|28 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatga-----------CT--CA---------TTAGTGGT-CC--AAA----------G-TGA----------C-C-C-----A-T-TG-T----------A-A-CCCCTTAGTAG------------T----CCTTA----GTG-----------C-----------T--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CC---------TTA-G--AG-GC----------TACTT--AG--A-G-G-C-----------TT-G------------------TT--A-----------G-TG-----------A-TCCTAAG-----------T-G---CC----C--------CTT--TGA-A--CTC----------CTTAG---------------------A-G--G---CTACTTAGgcatttag
gi|25 : gA---------TTAATG----C--CTA----------G-TC-----------A-T-C-----A-T-T--T----------A-A-AT---------------------C----ACTTAAAATGTG-----------T-----------C----C----A-------T--T-GTAGCTAA-C---TGACAATC------TTA-A--A----------------CTT--AA--T-A----------------T-G-A-AAC----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-ACCTTAG-----------T-G-C-TC----C--------ATT--TAA-AC-CCC----------CTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----TAA----CTC--T-----TAGT--G-G-CTCCTTAGT--GG--CAT--T
gi|32 : tg---------TTAGTAGT-CC--TTA----------G-TG-----------CTC-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------C----CCTCA----GTG-----------G-----------T--C-C----T-------TAGT-G-----CC-C---C--CT---------TTG-A--A---C----------CCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-G-A-ACT----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------TAG-T-CC---------------------------------------TTAG-------------------T-G-G--C---A--TTTAGTta
gi|34 : ccccAGTAGT-CC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----CCT-T--T----------A-A-AC---------------------C----CCTTA----TTG-----------A-----------C--C-CC---T-------T--T-G-----AA-C---C--CA---------TTA-G--CA-G-----------TCCTT--AG--TGG-T-CC-----C--T-TT-A-A-ACC----------TCTT--A-----------G-T
gi|31 : AGTGGT-CC--TTG----------G-TC-----------C-T-C-----T-T-T--T----------G-T-GA---------------------T----CTTTA----GTA-----------G-----------T--C-C----T-------T--T--------A-T---T--C---------------------C----------TCTTT--TG--T-G-G-TC-----C--T-T--G-A-A---------------------------------G-----------G-TCCTTAA-----------T-G-A-CA----G--------CTT--TGT-T--GTA----------TTTAA-------------------T-G-G--T---C--TTTTGTG----CCTCAT-----T-------T----
gi|6 : TCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----ACT-T--T----------C-A-AC---------------------T----CCTTA----GTG-----------CT----------C--C-C----T-------T--T-A-----AA-C---C--CC---------TCA-G--AG-AC----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-T-A-ACA----------CCTT--A-----------G-AG-----------ACTCCTTAG-----------T-G-G-CC----T--------CTT--TGA-A--CCT----------CTTAG-------------------T-------------------G---CCCCC-T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TACA--G-A-CTCCTT------------------A---G-TG----------G-CCCCTTTTAACT----CC--TTAC---A-G-ACTC-C-TC----------AGT-AG--TC--CTTAGT--G-G-CCCCTT--T--G-----A-A--C--CC----------C-TTAGTA-A----------CTCCT-------TT-----------G-CA---T--TA--CCT-AGT-G---CCTTTT-T-TT-TG-TCTGTAGTAGGAgtggtcttatt
gi|38 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaaTCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----C-T-T--T----------G-A-AC---------------------T----CCTTA----GAG-----------G-----------C--T-C----C-------T--T-
gi|7 : gCC--TTA----------G-TG-----------C-C-C-----ACT-T--T----------C-A-AC---------------------T----CCTTA----GTG-----------C-----------C--C-CCC--T-------T--T-T-----AA-C---C--CC---------TTA-G--AG-AC----------TCCTT--AG--T-GCC-CC-----C--T-TT-T-A-ACCCTTAGAGACTCCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-G-CCTCTTT--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-agtg
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgA----------G-TG-----------T-C-T-------T-T--T----------ATA-AC---------------------T----A---A----ATG-----------A-----------C--A-C----T-------T--T-T-----AATC---T--TAATATGGAACTTA-G--TG-GC----------TCCTT--AG--TGG-C-CA-----C--T-TT-G-
gi|5 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaa-----------C-C-C-----A-T-T--G----------G-T-AG---------------------T----CCTTA----GTGC----------T-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---C--CC---------TTA-G--TG-G-----------TCCTA--AG--T-G-C-CC-----C--C-TTAG-A-ACc
gi|7 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaa-C-C-----T-T-T--T----------G-A-AT---------------------G----CCTTA----GTG-----------C-----------CC-A-C----T-------T--T-C-----AA-C---T--C----------------------------------CTT--AG--T-G-C-CC-----CCCT-TT-T-A-ACC----------CCTT--A-----------G-AG-----------ACTCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TTA-A--CCCTTAGAGACTCCTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---GCCTC-T-----T-------T-------------C--T-----TTGA----A-CCCCTTAGT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|19 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C-C-----A-TGT--T----------A-G------------------------T----CCTTA----GTG-----------A-----------C--C-CC---T-------T--T-G-----AA-----T--C---------------------------------CCTT--AG--T-G-C-CCA----T--T-TT-G-A-AAT----------CATA--A-----------G-TA-----------G-TCCTTCG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGT-G--GCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---T--CTAAGTG---
gi|16 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaaca-C-----A-T-T--T----------A-A-AA---------------------TGTGTCCATA----GTA-----------G-----------CTAA-C----TGACAGTCC--T-A-----AT-C---T--TA---------ATATG--AA-AC----------CCCTT--AT--T-GAC-CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAA-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CCT----------GTTAA-------------------A-A-G--T---C--CTTAGGG---CCCC--T-----T-------T----TGA---gctattagca
gi|15 : tgattaatgacctgtcataattcaaat----------A-A-AC---------------------C----CCTTA----GTG-----------A-----------C--C-CC---T-------T--T-G-----AA-C---C--CC---------TTA-----G-G-----------TCC--------------CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------TGTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G---CC----C--------CTT--TCA-A--C-------------------------------------------T---C--CTTGGTG---CCCC--T-----T-------T----CAA---CTC----------------------CTTGGT--GG--TCC--TA--A---GTGG----------C-TCCTTAATAGCC----CT--TT-acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|21 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatg----------A-A-AC---------------------C----CCTTA----ATGACCTCTTTCAAG-----------C--A-C----T-------T--T-G-----TA-G---T--TA---------T---A--AGTGC-------------------------C-CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CCTT--T-----------G-TG-----------GCTCCATAG-----------T-G--------------------G--TG------------------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---agtggtatttagtggcat
gi|20 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatg----------A-A-AC---------------------C----CCTTA----GTGC----------C-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-CCTGT--AA---------CTA-G--A----------------CTT--AATTT-C-C-CC-----C--T-TT-G-A-ACgcatttagtagga
gi|33 : gattaatgacgtgacataattcaaatcacttaaaatgtgtcttttatagctaactgacaatcttaatatg----------A-A-AC---------------------A----CTTTA----GTG-----------A-----------C--C-C----C-------T--T--------------T--CA---------AT--------------------TTCTT--AG--T-G-C-CC-----C--CATT-G-T-ATC----------CCTT--T-----------G-TG-----------G-GTTTTAG-----------T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|2 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatg-AC---------------------T----CCTTA----GTA-----------G-----------T--C-C----T-------TTAT-G-----AC-C---C--TA---------TGA-A------------------CGTTAAAG--T-G----------------------ACA----------CTTT--T-----------G-TG-----------G-TTCTTAC-----------T-G-A-CC----C--------ATT--TGA-A--CCC----------C--------------------------------------TTAGTG---TCCCC-T-----T-------T----TAA---CGCC--T-----TAGT--A-T-CTCCTT---------TCCA-TA--G---A-TG----------T-TCCTTAGTGACC----CC--TT-T---G-C-AGTA-C-CA----------AGT-G----C--CTTa
gi|26 : tgC---------------------C----CCTTA----GTA-----------G-----------T--C-C----TAAA----T----------AA-C---C--CT---------TTA-A--AT-GC------------CTA--AG--T-G----------------------ACT----------CTTT--A-----------G-TT-----------G-TCCTTAG-----------T-G-A-CC----C--------ATT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T---G--T---C--------A---C-----T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TAGC--G-G-CTCCTTAGT--Gtttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|41 : C---------------------T----CCTTA----GTG-----------G-----------C--A-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--Cacccctttgcagtacctattgatttttggttgtctgtaataaga
gi|32 : gg---------------------T----CCTTA----GTG-----------CT----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---C--CC---------TCA-G--TG-G-----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-G-A-ACC----------------------------------------------CCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CTC----------CTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTctaaga
gi|34 : ccccttagtag---------------------T----CCTTA----GTG-----------C-----------C--C-C----C-------T--T-----------------------------TA-A--A---C----------CCCTT--AT--T-GAC-CC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CATT--A-----------G-CA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-G-TC----C--------CTT--TAA-A--CCT----------CTTAG-------------------T-agtccttagtggcatttagt
gi|38 : agtag---------------------T----CCTTA----GTG-----------C-----------C--C-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CC---------TTA-G--AG-GC----------TCCTT--AG--T-G-
gi|23 : gG-----------G-----------C--A-A----T-------T--T-G-----AA-C---T--CT---------TTA-G--TG-G-----------TCCTT--AG--T-G-G-CA-----C--T-TT-G-A-AT----------------------------------------------TCCTTAGAGGCTCCTAAAT-G-T-CC----CTTTGAACTCTT--TAA-AAGCCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG----------------------------------CCCC--T-----TTGA----A-CTCATAAGT--GG--C----------------------------CCCTTAGT-GCC----AA--TT-T---G-A-ACTC-C-TT----------AG--AG--GCTACTTAGT--
gi|39 : G-----------G-----------C--A-C----T-------T--T-G-----AA-C---T--CA---------TTA-G--TG-GC----------TCCTT--AG--T-G-T-CC-----C--T-TT-G-A-ggtcct
gi|36 : -C----T-------T--T-G-----AA-C---C--CC---------TTA-G--TG-G-----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-G-A-ACC----------CTTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TG
gi|5 : gtgctcc-----AA-C---C--CA---------TTG-GT-AG-------------TCCTT--AG--T-G-CTCC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTAAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--AGA-A--C
gi|18 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-----AA-C---C--CC---------TTA-GT-AG-------------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-G-A-ACC----------CCTC--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----GAA---CTCC--T-----TAGT--G-G--TCCTTAGT--AG--TCC--TT--A---G-TG----------G-TCCTTAGTGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|28 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatga-C---T--CA---------TTA-G--TG-G-----------TCCAA--AG--T-G-A-CC-----C--A-TT-GTA-ACC----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G---CT----C--------CTT--TGA-A--CTC----------CTTAGAGGCTACTTAGAGGCTTGTT-A-G--TGATC--CTAAGTG---CCCC--T-----T-------T----GAA---CTCC--T-----TAGA--G-G-CTACTTAGatttag
gi|21 : g--CA---------TGA-A--A---C----------CCCTT--AA--T-GAC-CT-----C--T-TT-C-A-AGC----------ACTT--T-----------G-TA-----------G-TTATAAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CTC----------CTTTG-------------------T-G-GC-T---C--CATAGTG---
gi|41 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaaG-GC----------TCCTT--AG--T-G-G-CA-----C--T-TT-G-A-ACT----------CCTA--A-----------G-gtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|30 : G-GT----------CCTTT--GG--T-C-C-TC-----T--T-TT-G-T-AGT----------CTTA--A-----------G-TA-----------G-TCCTTTA-----------T-G-C-CT----C--------GTT--TGT-A--GTT----------CTTGA-------------------A-A-G--T---C--CTTAATG------ACAT-----T-------T----Ta
gi|22 : tagtC----------TCCTT--AG--T-G----------------------GCT----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTAAG-----------T-G-T-CC----C--------ATT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---T--CTAAGTG---CCCA-AT-----T-------T----TAA---CCCA--T-----TTGA--G-A-CTTCTTAGT--TG--TAC--TA--A---G-GG----------G-TCCTTAGTGGCC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TA----------AGT-AG--TC--CTGAGT--A-C-CCTCAT--T--T-----A-A--C--CT----------C-TTGGTG-A----------CCTCtgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|13 : tttgaaC----------CCCTT--AG--T-GAC-CC-----C--T-TT-G-A-ATC----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCTTTAG-----------T-G-T-CC----C--------CTT--AAA-A--TCC----------CTTTG-------------------A-A-T--C---C--CTTAGTA---TTCC--T-----TA------T----TAC---CCCC--T-----TTGA----A-CCCCT----------------A--A---G-AA----------T-TCCTAAGTGCAC----CC--TT-T---A-A-ACCC-C-TT----------AGT-AG--TC--TTTAGT--G-C-CC--AT--T--TA----A-A--C--CC----------C-TT--TGAA----------CCCAT-------AA-----------G-TA---G--TC--CTT-AGT-G---C
gi|20 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaaaC----------CCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-G-A-ACC----------TGTA--A-----------C-TA-----------G--ACTTAA-----------T-T-TCCC----C--------CTT--TGA-A--C
gi|19 : gattaatgacgtgacataattcaaatcacttaaaatgtgtcttttatagctaactgacaatcttaatatgaaa----------TCCTT--AG--T-GAC-CC-----C--T-TT-G-A-ATC----------CCTT--A-----------G-TG-------------------------------------CC----CA-------TTT--TGA-A--ATC----------ATAAG-------------------T-A-G--T---C--CTTCGTG---CCCCCTT-----T-------G----TGG---CCCT--T--------A--GTA-GTTCTAAGT--GGC-TAT--TA--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|29 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttag----------TCCTT--AG--T-G-CACC-----C--T-CT-G-A-AAC----------CCTT--A-----------G-TGCACCCTTTGAAA-CCCTTAG-----------T-G-T-CC----C--------CTT--TGA-A--CTC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTAAGTG---gca
gi|34 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaaacactttattag----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----CC-T-TT-A-A-ACC----------CCTT--A-----------T-TG-----------A-------------------------CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------ATTAG-------------------C-A-G--T---C--CTTAGTG---GTCCC-T-----T-------T----AAA---CCTC--T-----Tgcatttagt
gi|38 : agtag----------TCCTT--AG--T-G-C-CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CCTT--A-----------G-AG-----------GCTCCTTAG-----------T-G-agt
gi|31 : g----------TCCTT--GG--T-C-C-TC-----T--T-TT-G-T-GAT----------CTTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTTA-----------T-T-C-CT----C--------TTT--TGT-G--GTC----------CTTGA-------------------A-G-G--T---C--CTTAATG---
gi|7 : agtggCCTT--AG--T-G-C-CCA----C--T-TT-C-A-AC----------------------------------------------TCCTTAG-----------T-GCC-CC----C--------CTT--TTA-A--CCC----------CTTAG---------------------A-GACT---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----TAA----CCC--T-----TAGA--G-A-CTCCTTAGT----------------------A----------G-TCCTTAGTGGCCTCTTTC--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT-acagctttgttgtatttaatggtcttttgtgcctcatttgtggtcttatt
gi|17 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgCTT--AG--T-GTC-CC-----C--T-TT-T-A-ATC----------CCTT--A-----------G-TG-----------A-CCCCT
gi|36 : agtaG--T-G-CTCC-----C--T-TT-G-A-ACC----------CCTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------TTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----ttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|4 : -CC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CATA--A-----------G-TG-----------C-CCCCTTT-----------T-A-A-CC----C--------CTG--AGAGA--CTA----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAATG---CCTCC-T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TAGA--G-A-CTCCTTAGT--AG--T-----------------------------CCTTAGTGGCC----CC--TT-T---G-T-ATCC-C-TA----------AGT-AG--TC--CTAAGG--GTC-CCT--T--T--T-----A-A--C--CC----------C-TTAGGA-A----------CCCAT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCT-AGA-G---CCTTTTCT-GTATG-----TAATAGGg
gi|3 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-----C--T-TT-G-A-ACT----------CATA--A-----------G-TG-----------C-CCCCTTT-----------T-A-A-CC----C--------CTG--AGAGA--CTA----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAATG---CCTCC-T-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TAGA--G-A-CTCCTTAGT--AG--T-----------------------------CCTTAGTGGCC----CC--TT-T---G-T-ATCC-C-TA----------AGT-AG--TC--CTAAGG--GTC-CCT--T--T--T-----A-A--C--CC----------C-TTAGGA-A----------CCCAT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCT-AGA-G---CCTTTTCT-GTATG-----TAATAGG
gi|39 : -----C--T-TT-G-A-ACT----------CATT--A-----------G-TG-----------GCTCCTTAG-----------T-G-T--C----C--------CTT--TGA-tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|23 : ggca--T-TT-G-A-ACT----------CTTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G---GC----A--------CTT--TGA-A--TTC----------CTTAG---------------------A-GGCT---C--CTAAATG---TCCC--------T-------T----TGA---ACTC--T-----TTAA--A-AGCCCCTTAGT----------------------A----------G-TCCTTAGT-GCC----CC--TT-T---G-A-ACTC-A-TA----------AGT-GGC-CC--CTTAGT--G-C-C--AAT--T--TG----A-A--C--TC----------C-TTAGAG-G----------CTACT-------TA-----------G-TG---G--T---CCT-
gi|5 : ggcaa-A-ACC----------CATT--G-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-TC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTAAGTG---CCCCC
gi|18 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-ACC----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTCAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----GAA---CCCC--T-----T---------------AGT--GG--T-----------------------------CCTTAGTGCCC----CC--TT-T---G-A-ACTC-C-TT----------AGT-GG--TC--CTTAGT--AGT-CCTTAG--T--G-----G-T--C--------------C-TTAGTG-G----------Cttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|16 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-ACC----------CCTT--A-----------T-TG-----------A-------------------------CC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAATG---C------------------------------CCCC--T-----TTGA----A-CCTGTTA--------------A--A------A----------G-TCCTTAG-GGCC----CCT-TT-T---G-A-ACatttag
gi|29 : tgattaatgacctgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacagtcctaatcttaatatga-A-ACA----------CTTT--A-----------T-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-AC----C--------CTC--TGA-A--ACC----------CTTAG-------------------T-GCA--C---C--CTT--TGAAACCCTTAG-----T-------G----T-----CCCC--T-----TTGA----A-CTCCTTAGT--AG--TCC--TA--A---G-TG----------G-CATTTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|33 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatga-ACC----------CCTTTCA-----------A-T--------------TTCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CAT--TGT-A--TCC----------CTTTG-------------------T-G-G--G---T--TTTAGT
gi|32 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacactttagtgCC----------CCTT--A-----------G-TA-----------G-TCCTTAG-----------T-G-C-TC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTCAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---CCCCCTT-----TGAACCCCT----TAGTGCCCCC--T-----TTGA----A-CTCCTTAGT--GG--TCC--TT--A---G-TA----------G-TCCTTAGTGGCa
gi|12 : CTT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTAG-----------T-G---GC----A--------CTT--TGA-A--CTC----------CTAAG-------------------T-G-GC-T---C--CTAAGTG---TCCC--T-----T-------T----GAA---CTCC--T-----TAGA--A-G-CTCCTCAGT----------------------G----------G-TTCTTAGTGG-C----AC--TT-T---G-A-ACTC-A-TA----------AGTGAC--TC--CTTAGT--G-C-CC-CTT--T--G-----G-A--C--TC----------C-TTAGAG-G----------TTCCT-------TA-----------G-TG---G--TC--CTT-AGT-G---GCACTT-T-Gatttagt
gi|28 : TT--A-----------G-TG-----------G-TCCAAAG-----------T-G-A-CC----C--------ATT--GTA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---CTCC--T-----T-------T----GAA---CTCC--T-----TAGA--G-G-CTACTTAGA--GGCTTGT--T---A---G-TG----------A-TCCTAAGT-GCC----CC--TT-T---G-A-ACTC-C-TT----------AG--AG--GCTACTTAGaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|30 : gctcaT--A-----------G-TG-----------G-TCCTTTG-------------G-T-CCT---C--------TTT--TGT-A--GTC----------TTAAG-------------------T-A-G--T---C--CTTTATG---CCTCGTT-----T-------G----TAG---TTC---------TTGA--A-A-GTCCTTAAT--G
gi|31 : --A-----------G-TG-----------G-TCCTTGG-----------T---C-CT----C--------TTT--TGT-G--ATC----------TTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTT-----------TAT-----T--------------------CC--T---------------CTTTT--GT--GG--TCC--TT--G---A-AG----------G-TCCTTAATGACA----GC--TT-T---G-----TT-G-TATTT-------AAT-GG--TC--TTTTGT--G-C-C-TCAT--T--T-----acatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|38 : -----------G-TCCTTAG-----------T-G---CC----C--------CTT--TGA-A--CTC----------CTTAG---------------------A-GGCT---C--CTTAGTG---gtggtcttatt
gi|17 : -----------G-TACTTAG-----------T-G-T-CC----C--------CTT--TTA-A--TCC----------CTTAG-------------------T-G-A--C---C--CCT
gi|21 : aCCTTAA-----------T-G-A-CC----T--------CTT--TCA-A--GCA----------CTTTG-------------------T-A-G--T---T--ATAAGTG---CCCCC-T-----T-------T----GAA---CTCC--T-----TTGT--G-G-CTCCATAGT--GG--TGC--TT--A---G-TA----------G-TCCTTAGTGGCttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|7 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaaccCCTTAG-----------T-G-C-CC----A--------CTT--TCA-A--C-------------------------------------------T---C--CTTAGTG---CCCCCCT-----T-------T----TAA---CCCC--T-----TAGA--G-A-CT-------------------------------------------CCTTAGTGCCC----CC--TT-T---T-A-ACCC-T-TAGAGACTCCTTAGT-AG--TC--CTTAGT--G-G-CCTC-T--T--TCTTTGA-A--C--CC----------C-TTAGTatttagtagga
gi|20 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgCCTTAG-----------T-G-C-CC----C--------CTT--TGA-A--CCT----------GTAAC-------------------T-A-G------A--CTTAATT---TCCCCCT-----T-------T----GAA---C
gi|33 : gattaatgacgtgacataattcaaatcacttaaaatgtgtcttttatagctaactgacaatcttaatatgaaaccCTTTAG-----------T-G-A-CC----C--------CTT--TCA-A--T-------------------------------------------T---T--CTTAGTG---CCCCCAT-----T-------G----T-A---TCCC--T-----TTGT--G-G-GTT-TTAGT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|36 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaG-----------T-G-C-TC----C--------CTT--TGA-A--CCC----------CTTAG-------------------T-G-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-------T-------T----TGA---ACCC--T-----TT--------------AGT--GG--T-----------------------------CCTTAGTGCCC----CC--TT-T---G-a
gi|39 : --------CTT--TGA-A--CTC----------ATTAG-------------------T-G-GC-T---C--CTTAGTG---TCCC
gi|25 : ggca--TGA-A--ACC----------CTTAG-------------------T-A-G--A---C--CTTAGTG---CTCC-AT-----T-------T----AAA---CCCC---------------------CTTAGT----------------------G----------G-TCCTTAGTGCCC----CC--TT-T---T-A-ACTC-T-T-----------AGT-GGC-TC--CTTAGT--tttga
gi|5 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataA-A--CCC----------ATTGG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---CTCCC-T-----T-------T----GAA---CCC----------------------CTTAGT--GG--TCC--TA---------------------------AGTGCCC----CC--TT-A---G-A-ACggcattta
gi|15 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaA-A--CCC----------CTTAG-------------------TGA-C--C---C--CTTTGAA---CCCC----------------T----TAGGTCCCCC--T-----TTGA----A-CCTGTTAGT--AG--TCC--TT--A---G-TGCCCCTTTCAAC-TCCTTGGT-GCC----CC--TT-T---C-A-ACTC-C-TT----------GGT-GG--TC--CTAAGT--G---GCTCCT--TAAT-----A-G--C--CC----------T-TTAGTG-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|19 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaA-A--CAC----------CATGT-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---ACCCC-T-----T-------T----GAA---TCCC--T-----TAGT--G-C-CCATTTTGA--AA--TCA--TA--A---G-TA----------G-TCCTTCGTGCCC----CC--TT-T---G-T-GGCC-C-TT----------AGT-AG--TT--CTAAGT--gtatttagtggcat
gi|29 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaA-A--CAC----------TTTAT-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---C--------------------------A---CCC---T-----CTGA--A-A-CC-CTTAGT--G---CACCCTT--T---G-AA----------A-CCCTTAGTGTCC----CC--TT-T---G-A-ACTC-C-TT----------AGT-AG--TC--CTAAGT--ggctattagca
gi|2 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatga-A--CTC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTTATG---ACCCTATGAACGT-------TAAAGTGA---CACT--T-----TTGT--G-G--TTCTTACT--G----AC--CC--ATTTG-AA----------C-CCCTTAGTGTCC----CC--TT-T---T-A-ACGC-C-TT----------AGT-ATC-TC--CTT----------TCCAT--A--G-----ATG--T--TC----------C-TTAGTG-A----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCA-AGT-G---CCTTTT-T-GT-TG-TCTGTAATAGGAAggcatttagt
gi|32 : tg--CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---CTCCC-T-----T-------T----GAA---CCCC--T-----C---------------AGT--GG--T-----------------------------CCTTAGTGCCC----CC--TT-T---G-A-ACC-------------------------C--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--G-----A-A--C--TC----------C-TTAGTG-G-----------TCCT-------TA-----------G-TA---G--TC--CTT-AGT-G---GCATTT-A-GT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|26 : --CCC----------CTTAG-------------------T-A-G--T---C--CTAAATA---ACCC--T-----T-------T----AAA---TGCC--T-----AAGT--G-A-CTCTTTAGT-----------T---------------------G-TCCTTAGTGACC----CA--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT--G--TCA-CTT-TT--A-A-CCCC----T--T-----A-G--CGGCT----------CCTTAGTG-A----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCT-ATT-G---ATTTTT-G-GT-TG-TCTGTAATAAGA
gi|28 : TTAG-------------------T-G-G--T---C--CAAAGTG---ACCC-AT-----T-------G----TAA---CCCC--T-----T--------------------AG--TA-------------------------G-TCCTTAGTG-CT----CC--TT-T---G-A-ACTC-C-TT----------AG--AG--GCTACTTAG---A-G-GCTTGT--TAGT-----G-A--T--C-----------C-TAAGTG------------CCCCT-------TT-----------G-AA---C--TC--CTT-AG
gi|34 : gctcaAG-------------------T-A-G--T---C--CTTAGTG---CCCCC-T-----T-------T----AAA---CCCC--T-----TATT--G-A-CCCCTT--T--GA--ACC--CATTA---G-CA----------G-TCCTTAGTGGTC----CC--TT-T---A-A-ACCT-C-TT----------AGT-aggctacttag
gi|17 : -A-G--T---A--CTTAGTG---TCCCC-T-----T-------T----TAA---TCCC--T-----TAGT--G-A-CCCCTT
gi|38 : -G--T---C--CTTAGTG---CCCC--T-----T-------T----GAA---CTCC--T-----TAGA--G-G-CTCCTTAGT--Gtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|16 : CCCCTT-----A-------T----TGA---CCCC--T-----TTGA----A-CCCCTTAGT----------------------A----------G-TCCTTAATGCCC----CC--TT-T---G-A-ACCTGT-TA----------AA--AG--TC--CTTAGG--G-C-CCCTTT--T--G-----A-A--C--
gi|18 : tgattaatgacctgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacagtcctaatcttaatatgaaaAT-----C-------T----TAA---TCTTAAT-----ATGA--A-A-CCCCTTAGT--AG--T-----------------------------CCTTAGTGCCC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TC----------AGT-GG--TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--G-----A-A--C--CC----------C-TTAGTG-GTCCTTAGTGCCCCCT-------TT-----------G-AA---C--TC--CTT-AGT-G---GTCCTT-A-GT-AG-TCCTTAGTGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|8 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgaca----TGA---CACT--T-----TTAA--------TCTTAATATGG--AAC--TT--A---G-TG----------GCTCCTTAGTGGCC----AC--TT-T---G-tccttagtggcatttag
gi|15 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaaAA---CCCC--T-----TAGT--G-A-CCCCTT--T--GA---AC--C------------------------CCTTAGGTCCC----CC--TT-T---G-A-ACCT-G-TT----------AGT-AG--TC--CTTAGT--G-C-CC-CTT--T--C-----A-A--C--TC----------C-TTGGTG------------CCCCT-------TT-----------C-AA---C--TC--CTT-GGT-G---GTCCTA-A-GT-GGCTCCTTAATAGc
gi|36 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaCCC--T-----TTGA----A-CCCCTTAGT--GG--T-----------------------------CCTTAGTGCCC----CC--TT-T---G-A-ACCC-T-TT----------AGT-GG--TC--CTTAGT--G-C-CCCC-T--T--T-----ccctttagtggtatttagtggcat
gi|30 : gtgctCC--T-----TTGG--T-C-CTCTTTTGT--AG--TCT--TA--A---G-TA----------G-TCCTTTATGCCT----CG--TT-T---GTA-GTTC-T-TG----------AA--AG--TC--CTTAATG-A-C-ATTTTT--G--T-----T-A--T--AT----------T-TT-GTG-G------------TCT-------TT-----------ATTA---G--TA--CTC-AGT-G---CCTCTT-g
gi|22 : tagtggt--T-----TTGA----A-CTCCTTAGT--GGC-TCC--TT--A---G-TA----------G-TCCTAAGTGTCC----CA--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT-AG--TT--CTAAGT--G-C-CCAATT--T--T-----A-A--C--CC----------A-TTTGAG-A----------CTTCT-------TA-----------G-TT---G--TA--CTA-AGG-G---GTCCTT-A-GT-GG-CCCCTgtgg
gi|27 : CTTGGA--AG--TAC--TA--A---G-TG----------G-TCCTTTGTGCCT----CT--TT-T---------------------------GT-GG--TC--TTTAGT------TGTAATAAC--T-----A-C--C--AT----------T-TTTGTG-G-----------TCCT-------TG-----------G-AA---G--TC--TCT-AGT-GA--CAGCTT-T-GT-TG-Tttgaacccctaagtagtcctgagtaccctcatttaacctcttggtgacctc
gi|9 : tttattagtcctaagtgtgtcttgtgtta--TAC--TA--A---G-GG----------G-TTCAAAGAGGCC----AC--TT-A---G-G-ACTA-C-TA----------AGG-AG--TC--attta
gi|28 : ga--A---G-TG----------G-TCCAAAGTGACC----CA--TT-G---T-A-ACCC-C-TT----------AGT-AG--TC--CTTAGT--G-CTCCT--T--T--G-----A-A--C--TC----------C-TTAGAG-G----------CTACTTAGAGGCTT-----------GTTA---G--TGATCCTAAGT-G---CCCCTT-T-Ggtccttagtgccccttttaactccttagtgcccccccttttaacctctaagagacttgttagtagtccttagtgccccctttaaaccccttacagattcctaagtgccccctaagagactcgttagtagtccttagtgccccatttaaccccttacagactcctaagcacccccttagagactccttagtattccttagtgccgcctttaaccccttacagactccttacagactccttagcgcccccttagtagtccttagtggcctctttga
gi|30 : gctcatt--A---G-TG----------G-TCCTT--TGGTC----CTCTTT-T---G-T-AGTC-T-TA----------AGT-AG--TC--CTT--T--A-TGCCTCGT--T--T-----G----------------------TAGT---------------TCT-------TG-----------A-AA---G--TC--CTT-AAT-GA--CATTTT-T-GT-TA-Taactccttagaggctacttag
gi|31 : t--A---G-TG----------G-TCCTTGGT--CC----TC--TT-TTGTG-A---TC-T-TT----------AGT-AG--TC--CTT--T--ATT-CCTCTT--T--TGTG--G-T--C--CTTGAAGGTC--C-TTAATG-A----------CAGCT-------TT-----------G-TT---G--TA--TTT-AAT-G---GTCTTT-T-GT-attttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|41 : -GG----------C-TCCTTAGTGGCA----C---TT-T---G-A-ACTC-C-TA----------AGgcctcatttgtggtcttatt
gi|5 : ----------G-TCCTTAGTGCTC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT-GG--TC--CTAAGT--G-C-CCCCa
gi|32 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggta----------G-TCCTTAGTGCTC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TC----------AGT-GG--TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--G-----A-A--C--CC----------C-TTAGTG-C----------CCCCT-------TT-----------G-AA---C--TC--CTT-AGT-G---GTCCTT-A-GT-AG-TCCTTAGTGGttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|29 : ccccttagta----------G-TCCTTAGTGCAC----CC--TC-T---G-A-AACC-C-T-------------T-AG--T-------GC--A-C-CCT--T--T--G-----A-A--A--CC----------C-TTAGTG-T----------CCCCT-------TT-----------G-AA---C--TC--CTT-AGT-catttagt
gi|34 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaaacactttatta----------G-TCCTTAGTGCCC----CC--TT-T---A-A-ACCC-C-TT----------ATTGAC--CC--CTTTGA--A-C-C--CA---T--T-----A-G--CAGTC----------C-TTAGTG-G----------TCCCT-------TT-----------agtcctaagtggcatttagt
gi|38 : agta----------G-TCCTTAGT-GCC----CC--TT-T---G-A-ACTC-C-TT----------AG--AGGCTC--CTTAGT--aaacctcttagt
gi|17 : ----------G-TACTTAGTGTCC----CC--TT-T---T-A-ATCC-C-TT----------AGT-GA--CC--CCTg
gi|7 : a-TCCTTAGTGCCC----CCC-TT-T---T-A-ACCC-C-TT----------AG--AGACTC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--T-----A-A--C--C-----------C-TTAGAG-A----------CTCCT-------TA-----------G-TA---G--TC--CTT-AGTGG---CCTCTT-T-CT-Tttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|25 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaacCCTTAGTGCTC----CA--TT-T---A-A-ACCC-CCTT----------AGT-GG--TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--T-----A-A-----CT----------C-TTAGTG-G----------CTCCT-------Ttgaaccccttagt
gi|16 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaatatgaaacccttagtagaCCTTATTGACC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT-AG--TC--CTTAAT--G-C-CCCCTT--T--G-----A-A--C--CTGTTAAAAGTCC-TTAG-G-G----------CCCCT-------TT-----------agtggcattta
gi|20 : tgattaatgacctgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacagtcctaatcttaatatgaaaccCCTTAGTGCCC----CC--TT-T---G-A-ACCT-G-TA----------ACT-AG---A--CTTAAT--T-T-CCCCCT--T--T-----G-A--tgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|33 : gattaatgacgtgacataattcaaatcacttaaaatgtgtcttttatagctaactgacaatcttaatatgaaaccCTTTAGTGACC----CC--TT-T---C-A-AT-------------------------TT--CTTAGT--G-C-CCCCAT--T--G-----T-A--T--CC----------C-TTTGTG-acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|36 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaGTGCTC----CC--TT-T---G-A-ACCC-C-TT----------AGT-GG--TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--G-----A-A--C--CC----------T-TTAGTG-G----------TCCTT-----------------------A---G--TG--CCC---------CCTTTggttttagta
gi|25 : -T---G-A-AACC-C-TT----------AGT-AG--AC--CTTAGT--G-C-TC-CAT--T--T-----A-AACC--CC----------C-TTAGTG-G----------TCCTT-----------------------A---G--TG--CCC---------CCTTTT-g
gi|5 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaata-A-ACCC-A-TT----------GGT-AG--TC--CTTAGT--G-C-TCCCTT--T--G-----A-A--C--CC----------C-TTAGTG-G----------TCCaactcttagtggctccttagtggcattta
gi|29 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga-A-ACAC-T-TT----------ATT-AG--TC--CTTAGTGCA-C-CCTC----T--G-----A-A--A--CC----------C-TTAGTG-C----------ACCCT-------TT-----------G-AA---A--CC--CTT-AGT-GT--CCCCTT-T-GA-AC-TCCTTAGTAGtaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|34 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatga----------AGT-AG--TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--A-----A-A--C--CC----------C-TTATTG-A----------CCCCT-------TTGAACCCATTA-G-CA---G--TC--CTT-AGT-GGTCCCTTTtcctaagtggcatttagt
gi|19 : T-AG--TC--CTTAGT--G-A-CCCCTT--T--G-----A-A--T--CC----------C-TTAGTG------------CCCAT-------TTTGAAATCATAAG-TA---G--TC--CTT-CGT-GC--CCCCTT-T-GT-GG-CCCTTAGTAGaaacctcttagt
gi|17 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgt-AG--TA--CTTAGT--G-T-CCCCTT--T--T-----A-A--T--CC----------C-TTAGTG-A----------CCCCT-------TT-----------G-Cttctaagtggctattagca
gi|7 : --TC--CTTAGT--G-C-CCCCTT--T--A-----A-A--C--CC----------C-TTAGTA-A----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCT-AGT-G---CCTTTT-T-GT-TA-TCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|5 : -C-CCTCAT--T--T-----A-A--C--CT----------C-TTAGTG-A----------CCCCC-------ATA----------G-CA---G--TA--CCT-AGT-G---CCTTTT-T-GT-TG-TCCCTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|20 : -----A-A--C--CC----------C-TTAGTG-C----------CCCCT-------TT-----------G-AACCTG--TA--ACT-AGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|10 : gattaatgacgtgacataattcaaatcacttaaaatgtgtcttttatagctaactgacaatcttaatatga-A----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TA--TTT-AGT-G---CCTTTT-T-GT-TG-TCTGTAATAGGAAacttaatttccccctttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|14 : a----------CCCCT-------TT-----------G-CA---G--TA--CCT-AGT-G---CCTTTT----T-TG-TCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|8 : T-------TT-----------G-CA---G--TA--CTT-ATT-G---CCCTTT-T-AT-TG-TCTCTGATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCATT-G-TAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCATTG-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CTCCCTT----TG----A------ACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTA-AG-TGCCCCC---TT--AGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|18 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCATT-G-CAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TG----A------ACCCCTCAGTGGT-C---------CTT-----------AG-TGCCCCC---TT--TGA
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATG--TGCTTT-A-TAG--CC--AACTGAC----------AAT----CT-TAATATGA---------------------AATCCCTTAATGACCACTTTGT----------AG-TCT--TTAGTG-CCGCCTT----TG----A------ACT-----------C---------CTT-----------AG-TGaccccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|15 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTG--TCCATA-G-TAG--CT--AACTGAC-AATCCT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AACC--------------------------------CC--TTAGTG-ACCCCTT----TG----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-GTCCCCC---TT--TGAgtatttag
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCTTT-A-TAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAT----CT-TAACATGA---------------------AACCCCTTA-----------AT-----------G-ACC--T----------CTT----TC----A------AGC-----------A---------CTTTGTAGTTATA-AG-TGCCCCC---TT--TGAacctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|2 : GTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCTTT-A-TAG--CT--AACTGAC-AAACTT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCCTAA-----------GT-----------G-CCCCATTTGAA----CCTT----TT----A------GTCG----------T---------CTTA----------AG-TGCCCCC---TT--TGAactcctttgtggctccatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|19 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACG--TTCTTT--------CTTAAACTGAC-ACACTT---AGT----CT-TAATATGA---------------------AACACCATG-----------TT----------AG-TCC--TTAGTG-ACCCCTT----TG----A------ATC-----------C---------CTT-----------AG-TGCCCAT---TT--TGAactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|10 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCATT-G-TAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAaatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|8 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTG--TCTTTT-A-TAA--CT--AAATGAC-ACTTTT---AAT----CT-TAATATGG---------------------AA---CTTA-----------GT----------GGCTCC--TTAGTG-GCCACTT----T
gi|25 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCATT-G-TAG--CT--AACTGAC-AATCTT---AAA----CT-TAATATGA---------------------AA-CCCTTA-----------GT----------AG-ACC--TTAGTG-CTCCATT----TA----A------ACCCCCTTAGTGGTC---------CTT-----------AG-TGCCCCC---TT--Tgc
gi|13 : TGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTG--TCCTTT-G-TAG--CT--ACCTGAC-AATCTTATCAAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCCTTA-----------GTG---------AC-CCC--TT--TGAATCCCTT----AG----T------AGT-----------C---------TTT-----------AG-TGTCCCC---TT--taactcttagtggctccttagtggcattta
gi|16 : TGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTG--TCCATA-G-TAG--CT--AACTGAC-AGTCCT---AAT----CT-TAATATGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAATG-CCCCCTT----TG----A------ACCTGTTAAAAGT-C---------CTT-----------AG-GGCCCCT---TT--TGAaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|20 : GATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTG--TCTTTT-A-TAG--CT--AACTGAC----------AAT----CT-TAATATGA---------------------AACC--------------------------------CC--TTAGTG-CCCCCTT----TG----A------ACC-----------TGTAACTAGACTT-----------AATTTCCCCC---TT--TGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttagtaggacc
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTG--TCCTTT-A-TAG--CT--AAC
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTG--TT-ATT-AATAG--CT--AACTGAC-AATCTC---TAT----CT-TAATATGA---------------------AACCCag
gi|33 : aTAAAATATG--ACCTGT-G-TAG--TA--AACTTAC-AATCTT---AAT----CT-TAATATGA---------------------AAC-----A---------------------------CT--TTAGTG-ACCCCTT----TC----A------ATT-----------T---------CTT-----------AG-TGCCCCC---AT--TGt
gi|22 : ATTTGAACCCCTTAG-TAGTTCT--AAGTGCCCAATTTT---AAC----CC---ATTTGA---------------------GACTTCTTA-----------GTTGTACTAAGGGG-TCC--TTAGTG-GCCCCTT----TG----A------ACC-----------C---------CTA-----------AG-Ttatccctttgtgggttttagta
gi|29 : tttgaactccttagtggctccttagtagtcctaagtgtcccTT-G-TAG--CT--AAATGAC-AATC-------------T-TAATATGA---------------------AACACTTTA-----------TT----------AG-TCC--TTAGTG-CACCCTC----TG----A------AAC-----------C---------CTT-----------AG-TGCACCC---TT--TGAagtcctgagtaccctcatttaacctcttggtgacctc
gi|26 : --CT--AAGTGAC---TCTTT--AGTTGTCCT-TAGTG-------------------------ACCCATTT-----------GA----------AC-CCC--TTAGTG--TCACTT----TT----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-CGGCTCC---TTAGTGACCaacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|9 : ccccttagtagtcctaaataaccctttaaatgcTTTT---AAC----CTCTAA---GA---------------------GACTTGTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TA----A------ACC-----------C---------CTTACAGATTCCTAAG-TGCCCCC---Tcctttgcagtacctattgatttttggttgtctgtaataaga
gi|7 : gagactccttagtagtcctaagtggcctctttgaaccccttagtagtccttagtgccccttttaactccttagtgcccccccTTTT---AAC----CC-T--TA-GA---------------------GACTCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-GCCTCTT----TCTTTGA------ACC-----------C---------CTT-----------AG-Taagagactcgttagtagtccttagtgccccatttaaccccttacagactcctaagcacccccttagagactccttagtattccttagtgccgcctttaaccccttacagactccttacagactccttagcgcccccttagtagtccttagtggcctctttga
gi|28 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccTGT---------------------AACCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CT-CCTT----TG----A------ACT-----------C---------CTT-----------AG-
gi|12 : gctcattagtggtccaaagtgacccatGA---------------------AGCTCCTCA-----------GT----------GG-TTC--TTAGTG-GCACTTTGAACTC----ATAAGTGACT-----------C---------CTT-----------AG-TGCCCCT---TT--GGACaggctacttagaggcttgttagtgatcctaagtgcccctttgaactccttagaggctacttag
gi|4 : cttagtggtccttagtggcactttgaactcctaagtggctcctaagtgtccctttgaactccttaGA---------------------GACTACTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAATG-CCTCCTT----TT----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-AGACTCC---TT--tccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|6 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgaA---------------------GACTCCTCA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-GCCCCTT----TG----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-TAACTCC---TT--TGagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|23 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacA---------------------AGCCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-C-CCCTT----TG----A------ACT-----------C---------ATA-----------AG-TGGCCCC---TT--cattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|9 : ggcaatttgaactctttagtggtccttagtggcactttgaattccttagaggctcctaaatgtccctttgaactctttaa---------------------AACCCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-C-CCCTT----TT----A------ACT-----------C---------CTT-----------AG-TGCCCCCCCTTT--TAACCagtgccaatttgaactccttagaggctacttagtggtcct
gi|32 : gagactccttagtagtcctaagtggcctctttg---------------------AACCCCTCA-----------GT----------GG-TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TG----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-TGCCCCC---TT--TGAtctaagagacttgttagtagtccttagtgccccctttaaaccccttacagattcctaagtgccccctaagagactcgttagtagtccttagtgccccatttaaccccttacagactcctaagcacccccttagagactccttagtattccttagtgccgcctttaaccccttacagactccttacagactccttagcgcccccttagtagtccttagtggcctctttga
gi|36 : ccccttagtagtccttagtgctccctttg---------------------AACCCCTTA-----------GT----------GG-TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TG----A------ACCCTTTAGTGGT-C---------CTT-----------AG-TGCCCCC---TT--TGactccttagtggtccttagtagtccttagtggcatttagt
gi|39 : gtgctccctttg---------------------AACTCATTA-----------GT----------GGCTCC--TTAGTG--TCCCTT----T
gi|26 : ggcactttgACTCTTTA-----------GT----------TG-TCC--TTAGTG-ACCCATT----TG----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-TGTCACT---TT--TAACCga
gi|22 : ccccttagtagtcctaaataaccctttaaatgcctaagtgCTCCTTA-----------GT----------AG-TCC--TAAGTG-TCCCATT----TG----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-Tccttagcggctccttagtgacccctttgcagtacctattgatttttggttgtctgtaataaga
gi|34 : tttgaactccttagtggA-----------GT----------AG-TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TA----A------ACC-----------C---------CTT-----------AT-TGACCCC---TT--TGAagttctaagtgcccaattttaacccatttgagacttcttagttgtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtcctgagtaccctcatttaacctcttggtgacctc
gi|17 : ----------AG-TAC--TTAGTG-TCCCCTT----TT----A------ATC-----------C---------CTT-----------AG-TGACCCC---TT--TGacccattagcagtccttagtggtccctttaaacctcttagt
gi|38 : G-TCC--TTAGTG-C-CCCTT----TG----A------ACT-----------C---------CTT-----------AG-AGGCTCC---TT--cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|7 : -TCC--TTAGTG-CCCCCTT----TA----A------ACC-----------C---------CTT-----------AG-TAACCCC---TT--TGagtg
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 2222222 11 1 222222222222222222 2222222 111 22222222222 11111111 777777777777777 111111111111 2222222222222222 1111111111 1111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 5 6 3 3 8888888 2 55 3 55 0 0 8 2 5 3 3 3 222222222222222222 2 0 2222222 666666 2 2 555 2 8888888888 22 0 7 8888888888 2 2 00000000000 444 00000000 333 1 1 33 333 555555555555555 1 2 5 0 4 1 2 2 222222222222 5 2 0000000000000000 444 4 0000000000 2 33 1111111111 2 6 88 11 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 444444444444444444444 0000000000 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . ....... . .. . .. . . . . . . . . .................. . . ....... ...... . . ... . .......... .. . . .......... . . ........... ... ........ ... . . .. ... ............... . . . . . . . . ............ . . ................ ... . .......... . .. .......... . . .. .. . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ...............................................................
lowQualScore : 8 0 7 3 7 8888888 1 66 6 00 4 8 4 9 7 1 1 1 555555555555555555 2 6 7777777 888888 2 2 666 0 8888888888 66 7 6 0000000000 2 1 00000000000 777 33333333 333 8 0 99 555 777777777777777 0 9 7 4 0 4 4 4 111111111111 7 4 8888888888888888 111 5 9999999999 5 77 7777777777 7 1 77 77 0 0 0 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 000000000000000000000 3333333333 4 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555
consensus : CCCCTTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G-CCNCTTTGAACTCCTTAGAGGC-C-CTTAGTGGTCCTTAGTGN-CCCTTTG-AA--CCCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAACCCCTTAGTG-G-CC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG--A-GGCTCC------TTA-GT-G-C-CCC-T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTT----------AGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCC-C-TTT--------TAAC--CCCTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--TA--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T-----------T----AA---CCCCTTAGTGAC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCT-AGTGCCTTTTT-GTTGTCCGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACCCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G-CCCCTTTGAACCCCTTAGAGGC-C-CTTAGTGGTCCTTAGTGC-CCCTTTG-AA--CCCCTTAGTGGCTCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAACCCCTTAGTG-G-CC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG--A-GGCTCC------TTA-GT-G-C-CCC-T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTT----------AGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCC-C-TTT--------TAAC--CCCTTNG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--TA--G-GGTCCTTAGTGNCCCCTT-TGA-ACCCCTTAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T-----------T----AA---CCCCTTAGTGGC----------CCCTTT-GCAG--T---------NCCT-AGTGCCTCTTT-GTTGTCCNTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATNATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCNTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGACC--------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGT-G-CAAATTTGAACTCCTTAGAGGC-AACTTAGTGGTCCTTAGTGG-CACTTTG-AA--CTCATTAGTGGTTCCTTAGT-G-C-CC-A-TTTAAACTCCTTAGTG-G-CA-C-----------TTTGA-ACTCATTAA--A-GGCTCC------TTA-GT-G-C-CCC-T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTT----------AGTGTCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCC-CATTT--------TAAC--CCCTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA-C--TAAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T-----------T----AA---CCTCTTAGTGAC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCT-AGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----------CCCTTT-GCAG--T---------ATTT-AGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aaGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggCCTCTT-GTG-G-TC-C-----------ATGGA-AGTCCTTAGTAACAGCTTTGTTGTATTATGT-G-G-TCC-T----------TTG--TACCTTTTGATGG-TCTTTTTTAGTACTAAGTGCCTC--TTGC-GGTCC-A-----------TGGAAGTCCTTAGTGACAG-C-TTTGATATATTTAGTGGTCATTTG-TG--CCTCTTTTGTGGT--CTTTA--GTAGTCCTACGTGCCTCTCT-TGT-GGTCCTTAAAAG-T---------------TTAGTGACTGCTT-TGTAGTATTAAGT----GA---TCCTTT-GTGCC----------TCTTTT-GTGG--TATTTATTAGTCCTGAGTGCCT-TTT-ATGGTCCTT
gi|12 : cagtgCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTggaagtccttattt
gi|12 : CTTAGTGG-TC-C------------TTAGTG-GCACTT-T-----------G----AA---CTCCTAAGTGGCTCCTAAGTGTCCCTTT-GAAC--T---------CCTT-AGAAGCTCCTCAGTGGTTCTTAGTGGaagtgtccctttgaactccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGT-G-TCCCTTTGAACTCCTTAGAAGCTC-CTCAGTGGTTCTTAGTGG-CACTTTG-AA--CTCATAAGTGACTCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGGACTCCTTAGAG-G-----------------------TTCCTTAG--T-GG-TCC------TTA-GT-G-G-CAC-T----------TTG--AACTCATTATTGGCTCCTT----------AGTG-TCCCTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG-----------------------------GC--TCCTTAG-AA--GCTCCTTAAT--------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T-----------G----AA---Ccactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : -AA--CCCCTTAGTG-----------A-C-CC-C-TTTGAATCCCTTAGTA-G------------------------TCTTTAG--T-GTCCCC------TTA-AA-A-T-CCC-T----------TTG--AATCCCTTAGTAT-TCCTT----------ATTACCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCACC-C-TTT--------AAAC--CCCTTAGTAG----TCTTTAGT-GC--C--CA--------TTTA--AACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCT-AGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GTCCCCCTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGT-GACCCCTTTGAACCCCTTAG--------------GTCC--------CCCTTTG-AA--CCTGTTAGTAG-TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTCAACTCCTTGGTG-C-CC-C-----------TTTCA-ACTCCTTGG--T-GG-TCC------TAA-GT-G-G-CTC-C----------TTAATAGCCCTTTAGTGG-TATTT----------AGTGacctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GGCCCCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T-----------T----AA---TCCCTTAGTGAC----------CCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCCTTAGT-A-G--TCC------TTA-GT-G-C-CCCCT----------TTG--AACCCCTCAGTGG-TCCTT----------AGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCCCC-C-TTT--------GAAC--TCCTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT--CCTTA--GTGGTCCTTAGTGGCaccccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCATTTTGAatttag
gi|19 : TCCTTAGT-GAC-CC-C-TTTGAATCCCTTAGT--G-CC-CAT---------TTTGA-AATCATAAGT-A-G--TCC------TTC-GT-GCC-CCC-T----------TTG--TGGCCCTTAGTAG-TTCTA----------AGTGaatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttag-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGACCC---TAT--------GAAC--G--TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT--T------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCA--------T----AGATGTTCCTTAGTGAC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCA-AGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TGCCCCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTTCCCCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TGGCTCC
gi|21 : CCTT----------AATGACCTCTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCCCC-C-TTT--------GAAC--TCCTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGCT--TA--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaacc-----------TTTGA-ACTCCTTAG--T-GGCTCC------TTA-GT-A-----------------------------------G-TCCTA----------AGTGTCCCATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCCCA-A-TTT--------TAAC--CCATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA-C--TAAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T-----------T----AA---CCTCTTGGTGAC----------CTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGT-G-GCACTTTGAATTCCTTAGAGGCTC-CTAAATGTCCCTT--TGAACTCTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG-TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAACTCATAAGTG-G-CC-CCTTAGTGCCAATTTGA-ACTCCTTAG--A-GGCTAC------TTA-GT-G-G-TCC-T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TGCCCCCTTT
gi|25 : TG--AAACCCTTAGTAG-ACCTT----------AGTGCTCCATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCCCC-C-TTT--------TAAC--TC-TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGtaactcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAACCC---TTT--------AAAT--GCCTAAG-TG--ACTCTTTAGT--------T------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG-----------C----GG---CTCCTTAGTGAC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCT-ATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|28 : TTAGTGGTCCAAAGTGA-CCCATTGTAA--CCCCTTAGTAG-TCCTTAGT-G-C-TC-C-TTTGAACTCCTTAGAG-G-CTAC-----------TTAGAGGCTTGTTAG--T-GA-TCC------TAA-GT-G-C-CCC-T----------TTG--AACTCCTTAGAGGCTACTT----------AG
gi|29 : gctcaTTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TGCACCCTTTGA
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Taacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG-TCCTTAGT-G-CACC-C-TCTGAAACCCTTAGTGCA-CC-C-----------TTTGA-A-------------AC-CC------TTA-GT-GTC-CCC-T----------TTG--AACTCCTTAGTAG-TCCTA----------AGTGagtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaCC-T----------TTG--AAC-----------TCATA----------AGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCCTC-C-TTT--------TAAC--CCCTTAG-AG--ACTCCTTAGT--------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T-----------T----AA---CCCCTTAGGAAC----------CCATTT-GCAG--T---------ACCT-AGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TGtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGG-TCCTT----------TGGTCCTCTTTTGT-AGTCT-T-----------AAGTAGTCCTTTATGCCTC-G-TTTG-------TAGT--TC--TTG-AA--AGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-TCCTT----------GGT-CCTCTTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TCCT-C-TTT--------TG--------TGG-------TCCTTG-----------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T-----------acatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|32 : C-C-CTTAGTAGTCCTTAGTGCTCCCTTTG-AA--CCCCTCAGTGG-TCCTTAGT-GCC-CC-C-TTTGAACCCCTTAGTGCC-CC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG--T-GG-TCC------TTA-GT--------------------------AGTCCTTAGTGG-CATTT----------AGTgtggtcttatt
gi|33 : cTAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TGCCCCCATTG
gi|33 : CTTTAGTGACCCCTT-TCA-AT-----------TT-C------------TTAGTGCCCCCAT-T-----------G----TA---TCCCTTTGTGGtatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAG-TCCTTAGT-G-C-CC-CCTTTAAACCCCTTATTG-ACCC-C-----------TTTGA-ACCCATTAGC-A-G--TCC------TTA-GTGG-T-CCC-T----------TTA--AACCTCTTAGTgttttagta
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : a-GT-G-CTCCC-T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTT----------AGTGCCCCCTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCCCC-C-TTT--------t
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : GTCCTTAGTGC-CCCTTTG-AA--CTCCTTAGAGGCTCCTTAGT-G-ag
gi|39 : G-G-CA-C-----------TTTGA-ACTCATTAG--T-GGCTCC------TTA-GT-G-T-CCC-T----------TTG--A
gi|4 : C-C-CTTAGTAGTCCTTAATGA-CCCTTTG-AA--TGCCTAAGTGACTCTTTAGTCG-T-CC-C-TTTGAACCCCTTAGTGTC-CC-C-----------TTTGA-ACCCCTTAG--A-GGCTAC------TTA-GT-GAC-TCC-TTTGCAGTACATTG--AGCCCTTTAGTTG-TC
gi|4 : gtggc-CCC-T----------TTG--AAC-----------TCATA----------AGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCCTC-C-TTT--------TAAC--CCCTTAG-AG--ACTCCTTAGT--------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T-----------T----AA---CCCCTTAGGAAC----------CCATTT-GCAG--T---------ACCT-AGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTCCTTAGTG-G-CA-C-----------TTTGA-ACTCCTAAG--A-
gi|5 : ggCCCTCAT-T-----------T----AA---CCTCTTAGTGAC----------CCCCATAGCAG--T---------ACCT-AGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|5 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--AACCCATTGGTAG-TCCTT----------AGTGCTCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTAAGTGCCCC-C-TTgtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatga----AA---CCTCTTAGTAAC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCT-AGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaTCCTTAGT-G-C-CCAC-TTTCAACTCCTTAGTGCT-CC-C-----------TTTAA-ACCCCTCAG--A-GACTCC------TTA-GT-GCC-CCC-T----------TTT--AACACCTTAGAGACTCCTT----------AGTGGCCTCTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCCCC-C-TTT--------TAAC--CCCTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC--C-----------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T-----------G----AA---CCCCTTAGTAAC----------TCCTTT-GCAT--T---------ACCT-AGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T-----------A----AA---CCCCTTAGTAAC----------CCCTTT-GCAG--T---------ACCT-AGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TGCCCACTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTT----------AGTGCCCACTTTCA-AC----------------------TCCTTAGTGCCCCCC-TTT--------TAAC--CCCTTAG-AG--ACTCCTTAGTGCC--C-----------CCTT--TTAACCCTT-AGAGACTCCTTAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCTCTT-T-----------CTTTGAA---CCCCTTAGTcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--T---------ACTT-ATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagACTCCTTAGTAG-TCCTAAGT-GGCCTCTTTGAACCCCTTAG------------TAGTCCTTAGTGC-CCCTTTT-AA--CTCCTTAGT-GCCC---------C-CC-C-TTTTAACCTCTAAGAG-A-C---------------TTG-------TTAGT-A-G--TCC------TTA-GT-GCC-CCC-T----------TTA--AACCCCTTACAGATTCCTA----------AGTGCCCCCTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCC-A--TT--------TAAC--CCCTTAC-AG--ACTCC-TA-----------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T-----------T----AA---CCCCTTACAGAC----------TCC-TT-ACAGACT---------CCTT-AGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
gi|9 : gagCCCCTTAGTAG-TCCTTAGTGG-CCTCTTTGAcctctttga
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|27 ): TTTATTAGTCCTAAGTGTGTCTTGTGTTACTTGGAAGTACTAAGTGGTCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGTCTTTAGTTGTAATAACTACCATTTTTGTGGTCCTTGGAAGTCTCTAGTGACAGCTTTGTTGTATTTA
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 1 111 11111111 11 111 22222222222222222 11111 111 22222222222 7777777777777777777 111111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 0 6 1 1 5 0 55 111 66666666 66666 00 3 44 1 999 2 5 2 5 99999999999999999 2 44444 555 2 4 8888888888 22 999999999999 7 2 444 2 2 00000000000 2 33 33 7777777 55 33 8888888888888888888 3 33 1 0 2 2 444444444444 5 0 2 555 555 2 44 77 2 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111111111111111111 9999999999 2 444 8888888 3333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . .. ... ........ ..... .. . .. . ... . . . . ................. . ..... ... . . .......... .. ............ . . ... . . ........... . .. .. ....... .. .. ................... . .. . . . . ............ . . . ... ... . .. .. . . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ... ....... .......... .................................................
lowQualScore : 2 7 4 0 7 1 11 222 11111111 22222 44 3 66 0 555 7 3 7 3 77777777777777777 4 22222 333 0 0 8888888888 88 000000000000 3 0 111 2 1 00000000000 2 33 55 6666666 44 22 6666666666666666666 1 22 0 8 9 9 666666666666 5 1 9 000 444 9 22 22 3 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 666666666666666666666 4444444444 2 444 7777777 5555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-CCNCTT-TGAACTCCTTAGAGGC-C-CTTAGTG--------GTCCT--TA-GTGG-CCCTTTG-AA--CCCCTTAGTGGC--TCCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAACCCCTTAGTG-NCC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG-AGGCTCCTTAGTG-C-CC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C----T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-CCNCTT-TGAACTCCTTAGAGGC-C-CTTAGTG--------GTCCT--TA-GTGN-CCCTTTG-AA--CCCCTTAGTGGC--TCCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAACCCCTTAGTG-GCC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG-AGGCTCCTTAGTG-C-CC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C----T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG-CAAATT-TGAACTCCTTAGAGGC-AACTTAGTG--------GTCCT--TA-GTGG-CACTTTG-AA--CTCATTAGTGGT--TCCTTAGT-G-C-CC-ATTTAAACTCCTTAGTG-GCA-C-----------TTTGA-ACTCATTAA-AGGCTCCTTAGTG-C-CC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-TCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCCATTT-TAACCC-------CTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA-C----T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAG--TATTTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTG-CCTCTTGTGG--TCCATGGAAGT-C-CTTAGTAACAGCTTTGTTGTATTATGTGG-TCCTTTG-TA--CCTTTTGATGGTCTTTTTTAGT-A-C---------------TAAGTG--CC-T-----------CTTGC-GGTCCATGG-AAG-TCCTTAGTG-A-CAGC-T----------TTG--ATATA----------TTTAGTGG-TCATTTGTG-CCTC---TTTTGT-GGTCT-T-----------TAGTAGTCCTACGTGCCTCTC-TTG-TGGTCCTTAAAAGTTTAG-TG--ACTGCTTTGTAGT--A----TTAA--GTGATCCTTTGTGCCTCTTT-TGT-GGTATTTATTAG-TC-C------------TGAGTG---CCTT-T---TA
gi|12 : cCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTAAGTGTCCCTTTGA----------ACTtggtccttggaagtccttattt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTG-TCCCTT-TGAACTCCTTAGAAGCTC-CTCAGTG--------GTTCT--TA-GTGG-CACTTTG-AA--CTCATAAGTGAC--TCCTTAGT-G-C-CC-CTTTGGACTCCTTAGAG-G----------------------TTCCTTAG-TGG-TCCTTAGTG-G-CA-C-T----------TTG--AACTC----------ATTATTGGCTCCTTAGTG--TCC---CTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG----------------------GCTC-------CTTAG-AA--GCTCCTTAAT------------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---GAA---Cccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : -AA--CCCCTTAGTG-------------A-C-CC-CTTTGAATCCCTTAGTA-G-----------------------TCTTTAG-TGTCCCCTTAAAA-T-CC-C-T----------TTG--AATCC----------CTTAGTAT-TCCTTATTA-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCA-CCC-TTT-AAACCC-------CTTAGTAG----TCTTTAGT-GC--C----C--A--------TTTA--AACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GT---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTT-TGAACCCCTTAG----------------------GTCC-----------CCCTTTG-AA--CCTGTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-CC-CTTTCAACTCCTTGGTG-CCC-C-----------TTTCA-ACTCCTTGG-TGG-TCCTAAGTG-G-CT-C-C----------TTAATAGCCC----------TTTAGTGG-TATTTAGTG-ctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GG---CC-------CCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---TAA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCCTTAGTAG--TCCTTAGTG-C-CC-CCT----------TTG--AACCC----------CTCAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-GAACTC-------CTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT--CCT--T--A--GTGGTCCTTAGTGGCcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CATTTTGA----------Aatttag
gi|19 : --TCCTTAGT-GAC-CC-CTTTGAATCCCTTAGT--GCC-CAT---------TTTGA-AATCATAAGTAG--TCCTTCGTGCC-CC-C-T----------TTG--TGGCC----------CTTAGTAG-TTCTAAGTG-atcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttag-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGAC-CC--TAT-GAACG---------TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT--T----------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCATAGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCAAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTT---CC-------CCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TG---GC-------TCC
gi|21 : CCTTAATG-ACCT---CTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCC-CCC-TTT-GAACTC-------CTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGCT----T--A--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaacc-----------TTTGA-ACTCCTTAG-TGGCTCCTTAGTA----------------------------------------------G-TCCTAAGTG-TCCC---ATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCC-CAA-TTT-TAACCC-------ATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA-C----T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTGGTGACCTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTG-GCACTT-TGAATTCCTTAGAGGCTC-CTAAATG--------TCCCT--T---TGAACTCTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAACTCATAAGTG-GCC-CCTTAGTGCCAATTTGA-ACTCCTTAG-AGGCTACTTAGTG-G-TC-C-T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTTA----------ACT
gi|25 : TG--AAACC----------CTTAGTAG-ACCTTAGTG-CTCC---ATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACTC--------TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAAC-CC--TTT-AAATGC-------CTAAG-TG--ACTCTTTAGT----------T--------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---CGG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|28 : TTAGTG--------GTCCA--AA-GTGA-CCCATTGTAA--CCCCTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-TC-CTTTGAACTCCTTAGAG-GCTAC-----------TTAGAGGCTTGTTAG-TGA-TCCTAAGTG-C-CC-C-T----------TTG--AACTC----------CTTAGAGGCTACTTAG
gi|29 : gctcaTTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TG---CA-------CCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG---TCCTTAGT-G-CACC-CTCTGAAACCCTTAGTGCACC-C-----------TTTGA-A-----------AC-CCTTAGTGTC-CC-C-T----------TTG--AACTC----------CTTAGTAG-TCCTAAGTG-agtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaC-C-T----------TTG--AAC---------------------TCATAAGTG-CCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT------------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TG---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGG-TCCTTTGGT-CCTC---TTTTGT-AGTCT-T-----------AAGTAGTCCTTTATGCC-TCG-TTTGTAGTTC-------TT--G-AA--AGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT--CCTC---TTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TC-CTC-TTT-TG-------------TGG-------TCCTTG---------------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---acatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|32 : C-C-CTTAGTA--------GTCCT--TA-GTGCTCCCTTTG-AA--CCCCTCAGTGG---TCCTTAGT-GCC-CC-CTTTGAACCCCTTAGTGCCCC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG-TGG-TCCTTAGT--------------------------AGTC----------CTTAGTGG-CATTTAGTgtggtcttatt
gi|33 : cTAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCATTG
gi|33 : CTTTAGTGAC-CC-C-T----------TTC--AAT---------------------TTCTTAGTG-CCCC---CATTGT-ATCCC-T-----------TTGTGGGTTTTAGTtatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-AAACCC-------CTTAT-TG--ACCCCTT--TGAA--CCCATT--A--GCAGTCCTTAGTGGTCCCTT-TAA-ACCTCTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGTG-CTCC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-t
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : CCTTAGTG-CCC-C-----------TTTGA-ACTCCTTAG-AGGCTCCTTAGTG-ag
gi|39 : gtGG-CACTTTG-AA--CTCATTAGTGGC--TCCTTAGT-G-T-CC-CTTTGA
gi|4 : C-C-CTTAGTA--------GTCCT--TA-ATGA-CCCTTTG-AA--TGCCTAAGTGAC--TCTTTAGTCG-T-CC-CTTTGAACCCCTTAGTGTCCC-C-----------TTTGA-ACCCCTTAG-AGGCTACTTAGTGAC-TC-C-TTTGCAGTACATTG--AGCCC----------TTTAGTTG-TC
gi|4 : gtggc-CC-C-T----------TTG--AAC---------------------TCATAAGTG-CCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT------------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTG-GCACTT-TGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TG---CC-------CCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TCCTTAGT-G-C-CCACTTTCAACTCCTTAGTGCTCC-C-----------TTTAA-ACCCCTCAG-AGACTCCTTAGTGCC-CC-C-T----------TTT--AACAC----------CTTAGAGACTCCTTAGTG-GCCT---CTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACCC-------CTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC--C---------------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---GAA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCAT--TACCTAGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---AAA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTAGT-G-C-CCACTTTCAACTCCTTAGTG-CCC-CCC---------TTTTA-ACCCCTTAG-AGACTCCTTAGTG-C-CC-CCT----------TTT--AACCCTTAGAGACTCCTTAGTAG-TCCTTAGTGGCCTCTTTCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--TACTTATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagACTCCTTAGTAG-TCCTAAGTGGCCTCTT-TGAAC----------C-C-CTTAGTA--------GTCCT--TA-GTGC-CCCTTTT-AA--CTCCTTAGT-GC--CC---------C-CC-CTTTTAACCTCTAAGAG-AC---------------TTG-------TTAGTAG--TCCTTAGTGCC-CC-C-T----------TTA--AACCC----------CTTACAGATTCCTAAGTG-CCCC---CTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCA--TT-TAACCC-------CTTAC-AG--ACTCC-TA---------------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T---TAA---CCCCTTACAGACTCC-TT-ACAGACTCCTTAGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|27 ): TTTATTAGTCCTAAGTGTGTCTTGTGTTACTTGGAAGTACTAAGTGGTCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGTCTTTAGTTGTAATAACTACCATTTTTGTGGTCCTTGGAAGTCTCTAGTGACAGCTTTGTTGTATTTA
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 22 11111111111 11111111 222222222222 111 11111111111 22222222222 111111111111 88888888888888888888 111111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 3 77 1 6 666 66666666 99999 8 4 3 44 1 11 99999999 2 5 2 5 99999999 2 33333333333 99999999 33 2 77 000000000000 666 2 8888888888 2 22 22222222222 7 1 444 2 2 00000000000 33 444444444444 0 55 333 00000000000000000000 0 3 33 1 0 2 2 444444444444 3 0 3 555 555 2 44 77 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111111111111111111 9999999999 2 444 8888888 3333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . .. . . ... ........ ..... . . . .. . .. ........ . . . . ........ . ........... ........ .. . .. ............ ... . .......... . .. ........... . . ... . . ........... .. ............ . .. ... .................... . . .. . . . . ............ . . . ... ... . .. .. . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ... ....... .......... .................................................
lowQualScore : 7 77 0 7 222 11111111 11111 0 0 3 66 0 88 77777777 7 3 7 3 77777777 7 66666666666 77777777 44 4 88 000000000000 111 0 8888888888 0 88 88888888888 3 9 111 2 1 00000000000 33 000000000000 8 44 555 77777777777777777777 3 1 22 0 8 9 9 666666666666 0 8 1 444 444 9 22 22 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 666666666666666666666 4444444444 2 444 7777777 5555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTG-CCNCTT-TGAACTCCTTAGAGGCTC-CTTAGTG--------GTCCT--TA-GTGG-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-CTCCTT--------AGT-G-C-CC-CTT--------TG-AAC-----------CCCTTAGTG---C-CC-C--TTTGA-ACTCCTTAG-NGGC----------TCCTTAGTG-C-CCC-T----------TT-G--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCCC-TTT-----------TAACCCCTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT-----C----TA--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCCTTAGTGGCTCCTTAGTG-CCNCTT-TGAACTCCTTAGAGGC-C-CTTAGTG--------GTCCT--TA-GTGG-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-CTCCTT--------AGT-G-C-CC-CTT--------TG-AAC-----------CCCTTAGTG---N-CC-C--TTTGA-ACTCCTTAG-AGGC----------TCCTTAGTG-C-CCC-T----------TT-G--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCCC-TTT-----------TAACCCCTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT-----C----TA--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG-CAAATT-TGAACTCCTTAGAGGC-AACTTAGTG--------GTCCT--TA-GTGG-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGG-TTCCTT--------AGT-G-C-CC-ATT--------TA-AAC-----------TCCTTAGTG---G-CA-C--TTTGA-ACTCATTAA-AGGC----------TCCTTAGTG-C-CCC-T----------TT-G--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GTCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCCCATTT-----------TAACCCCTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA----C----TAAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAG--TATTTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTG-CCTCTTGTGG--TCCATGGAAGT-C-CTTAGTAACAGCTTTGTTGTATTATGTGG-TC-CTTTG-TA--CCTTTTGATGGTCTTTTTTAGTACTAAGT-G-C-CT-CTTGCGGTCCATGGAAG-----------TCCTTAGTG---A-CAGC--TTTGA-TATATTTAG-TGG-----------TCATTTGTG-C-CTC-T----------TTTG--TGGT----------CTTTAGTAG-TCCTACGT-GCCTC---TCTTGT-GGTCC-T-----------TAAAAGT--TTAGTGACTGC-TTTGTAGTATTAAGTGATCCTTT-G-TG--CCTCTTTTGTGGTATTTAT----TA--G---TCCTGAGTG--CCTTT-TAT-GGTCCTTGGAAG-TC-C------------TTA
gi|12 : cCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTAAGTGTCCCTTTGA----------ACTttt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTG-TCCCTT-TGAACTCCTTAGAAGCTC-CTCAGTG--------GTTCT--TA-GTGG-CA-CTTTG-AA--CTCATAAGTGA-CTCCTT--------AGT-G-C-CC-CTT--------TG-GAC-----------TCCTTAGAG---G--------------TTCCTTAG-TGG-----------TCCTTAGTG-G-CAC-T----------TT-G--AACT----------CATTATTGGCTCCTTAGT-G-TCC---CTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG-------------------------------GCTCCTTAG-AA--GCTCCTTAAT-------------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---GAA---Cccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : -AA--CCCCTTAGTG--------------------A-C-CC-CTT--------TG-AAT-----------CCCTTAGT------------------AGTCTTTAG-TGTC----------CCCTTAAAA-T-CCC-T----------TT-G--AATC----------CCTTAGTAT-TCCTTATT-ACCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCACCC-TTT-----------AAACCCCTTAGTAG----TCTTTAGT-GC-----C----CA--------TTTA--AACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GT---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTT-TGAACCCCTTAG----------------------GTCC-----------CC-CTTTG-AA--CCTGTTAGTAG--TCCTT--------AGT-G-C-CC-CTT--------TC-AAC-----------TCCTTGGTG---C-CC-C--TTTCA-ACTCCTTGG-TGG-----------TCCTAAGTG-G-CTC-C----------TT-AATAGCC----------CTTTAGTGG-TATTTAGT-Gctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GG---CC-------CCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---TAA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCCTTAGTAG------------TCCTTAGTG-C-CCCCT----------TT-G--AACC----------CCTCAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCCCCC-TTT-----------GAACTCCTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT-----CCT--TA--GTGGTCCTTAGTGGCcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CATTTTGA----------Aatttag
gi|19 : TCCTT--------AGT-GAC-CC-CTT--------TG-AAT-----------CCCTTAGTG---C-CCAT--TTTGA-AATCATAAGTAG------------TCCTTCGTGCC-CCC-T----------TT-G--TGGC----------CCTTAGTAG-TTCTAAGT-Gatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttag-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGACCC--TAT-----------GAACG--TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT-----T--------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCATAGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCAAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTT---CC-------CCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TG---GC-------TCC
gi|21 : CCTTAAT-GACCT---CTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCCCCC-TTT-----------GAACTCCTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGC---T----TA--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaacc--TTTGA-ACTCCTTAG-TGGC----------TCCTTAGTA----------------------------------------------G-TCCTAAGT-GTCCC---ATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCCCAA-TTT-----------TAACCCATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA----C----TAAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTGGTGACCTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTG-GCACTT-TGAATTCCTTAGAGGCTC-CTAAATG--------TCCCT--T---TGAACT-CTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG--TCCTT--------AGT-G-C-CC-CTT--------TG-AACTCATAAGTGGCCCCTTAGTG---C-CA-A--TTTGA-ACTCCTTAG-AGGC----------TACTTAGTG-G-TCC-T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTTA----------ACT
gi|25 : T-G--AAAC----------CCTTAGTAG-ACCTTAGT-GCTCC---ATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCCCCC-TTT-----------TAACTC-TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAACCC--TTT-----------AAATGCCTAAG-TG--ACTCTTTAGT-------------T------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---CGG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|28 : TTAGTG--------GTCCA--AA-GTGA-CC-CATTGTAA--CCCCTTAGTAG--TCCTT--------AGT-G-C-TC-CTT--------TG-AAC-----------TCCTTAGAG---G-CTAC--TTAGAGGCTTGTTAG-TGA-----------TCCTAAGTG-C-CCC-T----------TT-G--AACT----------CCTTAGAGGCTACTTAG
gi|29 : gctcaTTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TG---CA-------CCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG--TCCTT--------AGT-G-CACC-CTC--------TG-AAA-----------CCCTTAGTG---CACC-C--TTTGA-A-----------AC-----------CCTTAGTGTC-CCC-T----------TT-G--AACT----------CCTTAGTAG-TCCTAAGT-Gagtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaCC-T----------TT-G--AAC---------------------TCATAAGT-GCCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCCTCC-TTT-----------TAACCCCTTAG-AG--ACTCCTTAGT-------------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TG---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGG-TCCTTTGG-TCCTC---TTTTGT-AGTCT-T-----------AAGTAGTCCTTTATGCCTCG-TTTG----------TAGTTCTT--G-AA--AGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT--CCTC---TTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TCCTC-TTT-----------TG------TGG-------TCCTTG----------------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---acatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|32 : C-C-CTTAGTA--------GTCCT--TA-GTGCTCC-CTTTG-AA--CCCCTCAGTGG--TCCTT--------AGT-GCC-CC-CTT--------TG-AAC-----------CCCTTAGTGC--C-CC-C--TTTGA-ACTCCTTAG-TGG-----------TCCTTAGT--------------------------AGT----------CCTTAGTGG-CATTTAGT-gtggtcttatt
gi|33 : cTAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCATTG
gi|33 : CTTTAGTGAC-CCC-T----------TT-C--AAT---------------------TTCTTAGT-GCCCC---CATTGT-ATCCC-T-----------TTGTGGGTTTTAGTtatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAGTCCTTAGTGCCCCC-TTT-----------AAACCCCTTAT-TG--ACCCCTT--TGAA-----CCCATTA--GCAGTCCTTAGTGGTCCCTT-TAA-ACCTCTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGTG-CTCCC-T----------TT-G--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCCCCC-TTT-----------t
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : CCTTAGTG---C-CC-C--TTTGA-ACTCCTTAG-AGGC----------TCCTTAGTG-ag
gi|39 : gtGG-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGG-CTCCTT--------AGT-G-T-CC-CTT--------TG-A
gi|4 : C-C-CTTAGTA--------GTCCT--TA-ATGA-CC-CTTTG-AA--TGCCTAAGTGA-CTCTTT--------AGTCG-T-CC-CTT--------TG-AAC-----------CCCTTAGTGT--C-CC-C--TTTGA-ACCCCTTAG-AGGC----------TACTTAGTGAC-TCC-TTTGCAGTACATT-G--AGCC----------CTTTAGTTG-TC
gi|4 : gtggc-CCC-T----------TT-G--AAC---------------------TCATAAGT-GCCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCCTCC-TTT-----------TAACCCCTTAG-AG--ACTCCTTAGT-------------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTG-GCACTT-TGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TG---CC-------CCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCTT--------AGT-G-C-CCACTT--------TC-AAC-----------TCCTTAGTGC--T-CC-C--TTTAA-ACCCCTCAG-AGAC----------TCCTTAGTGCC-CCC-T----------TT-T--AACA----------CCTTAGAGACTCCTTAGT-GGCCT---CTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCCCCC-TTT-----------TAACCCCTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC-----C-------------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---GAA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCAT--TACCTAGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---AAA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTT--------AGT-G-C-CCACTT--------TC-AAC-----------TCCTTAGTG---C-CC-CCCTTTTA-ACCCCTTAG-AGAC----------TCCTTAGTGCC-CCC-T----------TT-T--AACCCTTAGAGACTCCTTAGTAG-TCCTTAGTGGCCTCTTTCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--TACTTATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGAGACTC-CTTAGTA--------GTCCT--AA-GTGG-CCTCTTTG-AA--CCCCTTAGTAG--TCCTT--------AGT-G-C-CC-CTT--------TT-AAC-----------TCCTTAGTGCCCC-CC-C--TTTTA-ACCTCTAAG-AGACTTGTTAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-T----------TT-A--AACC----------CCTTACAGATTCCTAAGT-GCCCC---CTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCCCCA--TT-----------TAACCCCTTAC-AG--ACTCC-TA----------------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T---TAA---CCCCTTACAGACTCC-TT-ACAGACTCCTTAGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|27 ): TTTATTAGTCCTAAGTGTGTCTTGTGTTACTTGGAAGTACTAAGTGGTCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGTCTTTAGTTGTAATAACTACCATTTTTGTGGTCCTTGGAAGTCTCTAGTGACAGCTTTGTTGTATTTA
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 222 11111111111 11111 22222222222 111 22222222222 77777777777777777 111111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 1 88 1 0 1 4 8 4 3 44 1 555 2 7 2 4 2 0 11111111111 2 33333 2 33 2 2 1 55555555555 2 111 1 3 8888888888 22 1 8888888888 7 2 444 2 2 00000000000 2 33 22 8888888 44 33 66666666666666666 3 44 1 0 2 2 444444444444 5 0 2 555 555 2 44 77 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111111111111111111 9999999999 2 444 8888888 3333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . .. . . . . . . . .. . ... . . . . . . ........... . ..... . .. . . . ........... . ... . . .......... .. . .......... . . ... . . ........... . .. .. ....... .. .. ................. . .. . . . . ............ . . . ... ... . .. .. . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ... ....... .......... .................................................
lowQualScore : 0 7 77 0 4 6 4 0 0 3 66 0 000 4 1 4 7 4 7 99999999999 5 11111 5 22 4 2 0 55555555555 0 333 9 8 3333333333 66 7 3333333333 3 0 111 2 1 00000000000 2 33 55 1111111 77 44 55555555555555555 3 22 0 8 9 9 666666666666 5 1 9 000 444 9 22 22 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 666666666666666666666 4444444444 2 444 7777777 5555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTG-NCCCTTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGGTCCTTA-GTGG-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG---TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-C--T-TTGA-ACCCCTTAGTGGC----------TCCTTAGT-G-C-CC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTG-CCNCTTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGGTCCTTA-GTGG-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGGC--TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-C--T-TTGA-ACTCCTTAGNGGC----------TCCTTAGT-G-C-CC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTG-CAAATTTGAACTCCTTAGAGGCAACTTAGTGGTCCTTA-GTGG-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGGT--TCCTTAGT-G-C-CC-A-TTTAAA-----------CTCCTTAG-TG---G-CA-C--T-TTGA-ACTCATTAAAGGC----------TCCTTAGT-G-C-CC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-TCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCCATTT-TAACCC-------CTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAG--TATTTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTGCCTCTT--GTG-GTCCATGGAAGTCCTTAGTAACAGCTTTGTTGTA-TTATGTGG-TC-CTTTG-TA--CCTTTTGATGGTCTTTTTTAGT-A-C---------------------------TAAG-TG---C-CT-C--T-T-GC-GGTCCATGGAAG-----------TCCTTAGT-G-A-CAGC-T----------TTG--ATATA----------TTTAGTGG-TCATTTGTG-CCTC---TTTTGT-GGTCT-T-----------TAGTAGTCCTACGTGCCTCTC-TTG-TGGTCCTTAAAAGTTTAG-TG--ACTGCTTTGTAGT--A--TTAA--GTGATCCTTTGTGCCTCTTT-TGT-GGTATTTATTAG-TC-C------------TGAGTG---CCTT-T---TA
gi|12 : cCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTAAGTGTCCCTTTGA----------ACTtggtccttggaagtccttattt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTG-TCCCTTTGAACTCCTTAGAAGCTCCTCAGTGGTTCTTA-GTGG-CA-CTTTG-AA--CTCATAAGTGAC--TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGGA-----------CTCCTTAG-AG------------------GTTCCTTAGTGG-----------TCCTTAGT-G-G-CA-C-T----------TTG--AACTC----------ATTATTGGCTCCTTAGTG--TCC---CTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG----------------------GCTC-------CTTAG-AA--GCTCCTTAAT----------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---GAA---Cccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : -AA--CCCCTTAGTG-------------A-C-CC-C-TTTGAA-----------TCCCTTAG-T-------------------AGTCTTTAGTGTC----------CCCTTAAA-A-T-CC-C-T----------TTG--AATCC----------CTTAGTAT-TCCTTATTA-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCA-CCC-TTT-AAACCC-------CTTAGTAG----TCTTTAGT-GC--C--C--A--------TTTA--AACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GT---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTTTGAACCCCTTAG-------------GTCC---------CC-CTTTG-AA--CCTGTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTCAA-----------CTCCTTGG-TG---C-CC-C--T-TTCA-ACTCCTTGGTGG-----------TCCTAAGT-G-G-CT-C-C----------TTAATAGCCC----------TTTAGTGG-TATTTAGTG-ctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GG---CC-------CCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---TAA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCCTTAGTAG-----------TCCTTAGT-G-C-CC-CCT----------TTG--AACCC----------CTCAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-GAACTC-------CTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT--CCTT--A--GTGGTCCTTAGTGGCcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CATTTTGA----------Aatttag
gi|19 : --TCCTTAGT-GAC-CC-C-TTTGAA-----------TCCCTTAG-TG---C-CCAT--T-TTGA-AATCATAAGTAG-----------TCCTTCGT-GCC-CC-C-T----------TTG--TGGCC----------CTTAGTAG-TTCTAAGTG-atcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatgaaacaccatgttag-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGAC-CC--TAT-GAACG---------TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT--T--------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCATAGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCAAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTT---CC-------CCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TG---GC-------TCC
gi|21 : CCTTAATG-ACCT---CTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCC-CCC-TTT-GAACTC-------CTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGCT--T--A--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaacc--T-TTGA-ACTCCTTAGTGGC----------TCCTTAGT-A----------------------------------------------G-TCCTAAGTG-TCCC---ATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCC-CAA-TTT-TAACCC-------ATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTGGTGACCTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAATTCCTTAGAGGCTCCTAAATGTCCCTT---TGAACT-CTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAACTCATAAGTGGCCCCTTAG-TG---C-CA-A--T-TTGA-ACTCCTTAGAGGC----------TACTTAGT-G-G-TC-C-T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTTA----------ACT
gi|25 : TG--AAACC----------CTTAGTAG-ACCTTAGTG-CTCC---ATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACTC--------TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAAC-CC--TTT-AAATGC-------CTAAG-TG--ACTCTTTAGT--------T--------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---CGG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|28 : GCTCATTAGTGGTCCAAA-GTGA-CC-CATTGTAA--CCCCTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-TC-C-TTTGAA-----------CTCCTTAGAGG---C-TA-C--T-TAGAGGCTTGTTAGTGA-----------TCCTAAGT-G-C-CC-C-T----------TTG--AACTC----------CTTAGAGGCTACTTAG
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TG---CA-------CCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG---TCCTTAGT-G-CACC-C-TCTGAA-----------ACCCTTAG-TG---CACC-C--T-TTGA-AACCCTTAGTG------------T----------C-CC-C-T----------TTG--AACTC----------CTTAGTAG-TCCTAAGTG-agtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaC-C-T----------TTG--AAC---------------------TCATAAGTG-CCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TG---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGG-TCCTTTGGT-CCTC---TTTTGT-AGTCT-T-----------AAGTAGTCCTTTATGCC-TCG-TTTGTAGTTC-------TT--G-AA--AGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-----------TCCTTGGT-C-C-TC-T-T----------TTG--TGATC----------TTTAGTAG-TCCTTTATT-CCTC---TTTTGT-GGTCC-T-----------TGAAGGTCCTTAATGAC-AGC-TTT-acatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT--CCTC---TTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TC-CTC-TTT-TG-------------TGG-------TCCTTG-------------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---gttgtatttaatggtcttttgtgcctcatttgtggtcttatt
gi|32 : CCCCTTAGTAGTCCTTA-GTGCTCC-CTTTG-AA--CCCCTCAGTGG---TCCTTAGT-GCC-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TGC--C-CC-C--T-TTGA-ACTCCTTAGTGG-----------TCCTTAGT---------------------------AGTC----------CTTAGTGG-CATTTAGTgtggtcttatt
gi|33 : TAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCATTG
gi|33 : CTTTAGT-GAC-CC-C-TTTCAA-----------TTTCTTAG-TG---C-CC-C--CATTGT-ATCCCTTTGTGGG----------T-TTTAGT-tatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAG---TCCTTAGT-G-C-CC-CCTTTAAA-----------CCCCTTAT-TGA--C-CC-C--T-TTGA-ACCCATTAGCAG-----------TCCTTAGTGG-T-CC-C-T----------TTA--AACCT----------CTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGT-G-CTCC-C-T----------TTG--AACCC----------CTTAGTGG-TCCTTAGTG-CCCC---CTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTT-t
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : TCCTTAGTG-CCCCTTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTGag
gi|39 : gGG-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGGC--TCCTTAGT-G-T-CC-C-TTTGA
gi|4 : GGCCCCTTAGTAGTCCTTA-ATGA-CC-CTTTG-AA--TGCCTAAGTGAC--TCTTTAGTCG-T-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TGT--C-CC-C--T-TTGA-ACCCCTTAGAGGC----------TACTTAGT-GAC-TC-C-TTTGCAGTACATTG--AGCCC----------TTTAGTTG-TC
gi|4 : gt-CC-C-T----------TTG--AAC---------------------TCATAAGTG-CCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TCC-TTT-TAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTG-GCACTTTGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TG---CC-------CCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TCCTTAGT-G-C-CCAC-TTTCAA-----------CTCCTTAG-TG---CTCC-C--T-TTAA-ACCCCTCAGAGAC----------TCCTTAGT-GCC-CC-C-T----------TTT--AACAC----------CTTAGAGACTCCTTAGTG-GCCT---CTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCC-CCC-TTT-TAACCC-------CTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC--C-------------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---GAA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCAT--TACCTAGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---AAA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTAGT-G-C-CCAC-TTTCAA-----------CTCCTTAG-TG---C-CC-CCCT-TTTA-ACCCCTTAGAGAC----------TCCTTAGT-G-C-CC-CCT----------TTT--AACCCTTAGAGACTCCTTAGTAG-TCCTTAGTGGCCTCTTTCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--TACTTATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGAGACTCCTTAGTAGTCCTAA-GTGG-CCTCTTTG-AA--CCCCTTAGTAG---TCCTTAGT-G-C-CC-C-TTTTAA-----------CTCCTTAG-TGCCCC-CC-C--T-TTTA-ACCTCTAAGAGACTTGTTAGTAGTCCTTAGT-GCC-CC-C-T----------TTA--AACCC----------CTTACAGATTCCTAAGTG-CCCC---CTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCA--TT-TAACCC-------CTTAC-AG--ACTCC-TA-------------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T---TAA---CCCCTTACAGACTCC-TT-ACAGACTCCTTAGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|27 ): TTTATTAGTCCTAAGTGTGTCTTGTGTTACTTGGAAGTACTAAGTGGTCCTTTGTGCCTCTTTTGTGGTCTTTAGTTGTAATAACTACCATTTTTGTGGTCCTTGGAAGTCTCTAGTGACAGCTTTGTTGTATTTA
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 111 11111111111 111 11111111111 2 2222222222222 22222222222 77777777777777777 111111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 0 1 5 0 0 3 888 000 4 3 44 0 5 2 2 7 2 5 2 3 11111111111 2 444 5 2 33 2 2 00000000000 0 1 4444444444444 8888888888 22 99999999999 7 1 444 2 2 00000000000 2 22 0 8888888 55 33 77777777777777777 3 44 1 0 2 2 444444444444 5 0 2 555 555 2 44 77 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111111111111111111 9999999999 2 444 8888888 3333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . . ... ... . . .. . . . . . . . . . ........... . ... . . .. . . ........... . . ............. .......... .. ........... . . ... . . ........... . .. . ....... .. .. ................. . .. . . . . ............ . . . ... ... . .. .. . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ... ....... .......... .................................................
lowQualScore : 0 4 0 0 4 6 6 222 333 0 3 66 2 7 5 5 5 5 0 5 8 99999999999 5 444 0 5 22 4 2 66666666666 8 9 5555555555555 0000000000 55 99999999999 3 9 111 2 1 00000000000 4 66 9 7777777 66 77 99999999999999999 3 22 0 8 9 9 666666666666 5 1 9 000 444 9 22 22 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 666666666666666666666 4444444444 2 444 7777777 5555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-C--T-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTTAGT-G-----------C-CCCT----------TTG--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-C--T-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGGCTCCTTAGT-G-----------C-CCCT----------TTG--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTGCAAA-TTTGAACTCCTTAGAGGCAACTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGG-TTCCTTAGT-G-C-CC-A-TTTAAA-----------CTCCTTAG-TG---G-CA-C--T-TTGA-ACTCA-----------TTAAAGGCTCCTTAGT-G-----------C-CCCT----------TTG--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GTCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCCATTTTAACCC-------CTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAG--TATTTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTGCCTCTT--GTGGTCC-ATGGAAGTCCTTAGTAACAGCTTTGTT-GT-ATTATGTG-G-TC-CTTTG-TA--CCTTTTGATGG-T-CTTT-------------TTT--A-----------GTACTAAG-TG---C-CT-C----TTGC-GGTCC-----------ATGGAAG-TCCTTAGT-GA----------C-AGCT----------TTG--ATAT----------ATTTAGTGG-TCATTTGT-GCCTC---TTTTGT-GGTCT-T-----------TAGTAGTCCTACGTGCCTCTC-TTGTGGTCCTTAAAAGTTTAG-TG--ACTGCTTTGTAGT--A--TTAA--GTGATCCTTTGTGCCTCTTT-TGT-GGTATTTATTAG-TC-C------------TGAGTG---CCTT-T---TA
gi|12 : cCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTAAGTGTCCCTTTGA----------ACTtggtccttggaagtccttattt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTGTCCC-TTTGAACTCCTTAGAAGCTCCTCAGTG-GTTCTTA-GTG-G-CA-CTTTG-AA--CTCATAAGTGACT-CCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGGA-----------CTCCTTAG-AG--------G--T-T-------CC-----------TTAGTGG-TCCTTAGT-G-----------G-CACT----------TTG--AACT----------CATTATTGGCTCCTTAGT-G-TCC---CTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG---------------------GCTC-------CTTAG-AA--GCTCCTTAAT----------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---GAA---Cccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : AA-----------CCCCTTAG-TGA--C-CC-C--T-TTGA-ATCCC-----------TTAGTAG-TCTTTAGT-GTCCCCTTAAAAT-CCCT----------TTG--AATC----------CCTTAGTAT-TCCTTATT-ACCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCA-CCC-TTTAAACCC-------CTTAGTAG----TCTTTAGT-GC--C--C--A--------TTTA--AACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GT---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTTTGAACCCCTTAG--------------GTCC----------CC-CTTTG-AA--CCTGTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-C-TTTCAA-----------CTCCTTGG-TG---C-CC-C--T-TTCA-ACTCC-----------TTGGTGG-TCCTAAGT-G-----------G-CTCC----------TTAATAGCC----------CTTTAGTGG-TATTTAGT-Gctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GG---CC-------CCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---TAA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCC-----------TTAGTAG-TCCTTAGT-GC----------C-CCCT----------TTG--AACC----------CCTCAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTTGAACTC-------CTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT--CCTT--A--GTGGTCCTTAGTGGCcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CATTTTGA----------Aatttag
gi|19 : -AA--CACCATGTTAG-T-CCTTAGT-GAC-CC-C-TTTGAA-----------TCCCTTAG-TG---C-CCAT--T-TTGA-AATCA-----------TAAGTAG-TCCTTCGT-GC----------C-CCCT----------TTG--TGGC----------CCTTAGTAG-TTCTAAGT-Gatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatga-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGAC-CC--TATGAACG---------TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT--T--------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCATAGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCAAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTT---CC-------CCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TG---GC-------TCC
gi|21 : CCTTAAT-GACCT---CTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCC-CCC-TTTGAACTC-------CTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGCT--T--A--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaacc--T-TTGA-ACTCC-----------TTAGTGGCTCCTTAGT-A------------------------------------------------------G-TCCTAAGT-GTCCC---ATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCC-CAA-TTTTAACCC-------ATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---TAA---CCTCTTGGTGACCTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTGGCAC-TTTGAATTCCTTAGAGGCTCCTAAATG-TCCCTT---TGAA-CT-CTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-C-TTTGAACTCATAAGTGGCCCCTTAG-TG---C-CA-A--T-TTGA-ACTCC-----------TTAGAGGCTACTTAGT-G-----------G-TCCT----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTTA----------ACT
gi|25 : TG--AAAC----------CCTTAGTAG-ACCTTAGT-GCTCC---ATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTTTAACTC--------TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAAC-CC--TTTAAATGC-------CTAAG-TG--ACTCTTTAGT--------T--------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---CGG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|27 : TCCTAAGTGTGTCTT---GTG-T-TA-CTTGG-AA--GTACTAAGTGG-T-CCTTTGT-G-C-CT-C-TTT
gi|28 : tttattagGCTCATTAGTG-GTCCAAA-GTG-A-CC-CATTGTAA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-TC-C-TTTGAA-----------CTCCTTAGAGG---C-TA-C--T-TAGAGGCTTG-----------TTAGTGA-TCCTAAGT-G-----------C-CCCT----------TTG--AACT----------CCTTAGAGGCTACTTAGtgtggtctttagttgtaataactaccatttttgtggtccttggaagtctctagtgacagctttgttgtattta
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TG---CA-------CCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG-T-CCTTAGT-G-CACC-C-TCTGAA-----------ACCCTTAG-TG---CACC-C--T-TTGA-AACCC-----------TTAGTG--T--------------------C-CCCT----------TTG--AACT----------CCTTAGTAG-TCCTAAGT-Gagtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaCCT----------TTG--AAC---------------------TCATAAGT-GCCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TCC-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TG---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGGTCCTTTGGT-C-----------C-TCTT----------TTG--TAGT----------CTTAAGTAG-TCCTTTAT-GCCTC---GTTTGT-AGTTC-T-----------TGAAAGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT-C-----------C-TCTT----------TTG--TGAT----------CTTTAGTAG-TCCTTTAT-TCCTC---TTTTGT-GGTCC-T-----------TGAAGGTCCTTAATGAC-AGC-TTTacatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT--CCTC---TTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TC-CTC-TTTTG-------------TGG-------TCCTTG-------------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---gttgtatttaatggtcttttgtgcctcatttgtggtcttatt
gi|32 : CCCCTTAGTA-GTCCTTA-GTG-CTCC-CTTTG-AA--CCCCTCAGTGG-T-CCTTAGT-GCC-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TGC--C-CC-C--T-TTGA-ACTCC-----------TTAGTGG-TCCTTAGT-----------------------------------AGT----------CCTTAGTGG-CATTTAGT-gtggtcttatt
gi|33 : TAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCATTG
gi|33 : -CTTTAGT-GAC-CC-C-TTTCAA-----------TTTCTTAG-TG---C-CC-C--CATTGT-ATCCC-----------TTTGTGGGT-TTTAGT-tatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CCTTTAAA-----------CCCCTTAT-TGA--C-CC-C--T-TTGA-ACCCA-----------TTAGCAG-TCCTTAGTGG-----------T-CCCT----------TTA--AACC----------TCTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGT-G-----------CTCCCT----------TTG--AACC----------CCTTAGTGG-TCCTTAGT-GCCCC---CTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CCC-TTTt
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : TCCTTAGTGCCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-ag
gi|39 : gCTTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTGTCCC-TTTGA
gi|4 : ggcaGGCCCCTTAGTA-GTCCTTA-ATG-A-CC-CTTTG-AA--TGCCTAAGTGACT-CTTTAGTCG-T-CC-C-TTTGAA-----------CCCCTTAG-TGT--C-CC-C--T-TTGA-ACCCC-----------TTAGAGGCTACTTAGT-GA----------C-TCCTTTGCAGTACATTG--AGCC----------CTTTAGTTG-TC
gi|4 : gt-CCCT----------TTG--AAC---------------------TCATAAGT-GCCCC---CTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TCC-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---TAA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTGGCAC-TTTGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---TAA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TG---CC-------CCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-T-CCTTAGT-G-C-CCAC-TTTCAA-----------CTCCTTAG-TG---CTCC-C--T-TTAA-ACCCC-----------TCAGAGACTCCTTAGT-GC----------C-CCCT----------TTT--AACA----------CCTTAGAGACTCCTTAGT-GGCCT---CTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCC-CCC-TTTTAACCC-------CTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC--C-------------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---GAA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCAT--TACCTAGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---AAA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCTTAGT-G-C-CCAC-TTTCAA-----------CTCCTTAG-TG---C-CC-CCCT-TTTA-ACCCC-----------TTAGAGACTCCTTAGT-GC----------C-CCCT----------TTT--AACCCTTAGAGACTCCTTAGTAG-TCCTTAGTGGCCTCTTTCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--TACTTATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGAGACTCCTTAGTA-GTCCTAA-GTG-G-CCTCTTTG-AA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-C-TTTTAA-----------CTCCTTAG-TGCCCC-CC-C--T-TTTA-ACCTCTAAGAGACTTGTTAGTAG-TCCTTAGT-GC----------C-CCCT----------TTA--AACC----------CCTTACAGATTCCTAAGT-GCCCC---CTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCA--TTTAACCC-------CTTAC-AG--ACTCC-TA-------------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T---TAA---CCCCTTACAGACTCC-TT-ACAGACTCCTTAGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 111 1 11111111111 11111 11111111111 111 1111111111111111111111 22222222222 77777777777777777 111111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 0 1 5 0 0 3 888 000 4 3 44 0 5 2 2 0 2 2 3 22222222222 2 55555 2 2 2 11111111111 8 2 2 000 3333333333333333333333 22 2 7 2 2 00000000000 0 2 444 0 8888888 44 33 88888888888888888 3 66 1 0 2 2 333333333333 6 2 88888888 555 2 44 77 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111111111111111111 9999999999 2 444 8888888 3333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . . ... ... . . .. . . . . . . . . ........... . ..... . . . ........... . . . ... ...................... .. . . . . ........... . . ... . ....... .. .. ................. . .. . . . . ............ . . ........ ... . .. .. . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ... ....... .......... .................................................
lowQualScore : 0 4 0 0 4 6 6 222 333 0 3 66 2 7 7 7 7 7 7 0 77777777777 7 77777 7 5 4 22222222222 4 1 0 888 3333333333333333333333 66 0 6 2 1 00000000000 2 2 222 2 1111111 77 44 55555555555555555 1 33 0 1 7 7 777777777777 1 7 88888888 000 9 22 22 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 666666666666666666666 4444444444 2 444 7777777 5555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTGCAAA-TTTGAACTCCTTAGAGGCAACTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGG-TTCCTTAGT-G-C-CC-ATTTAAA-----------CTCCTTAG-TG---G-CA-CT-TTGA-ACTCA-----------TTAAAGGCTCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-CATTTTAACCC-------CTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAG--TATTTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTGCCTCTT--GTGGTCC-ATGGAAGTCCTTAGTAACAGCTTTGTT-GT-ATTATGTG-G-TC-CTTTG-TA--CCTTTTGATGG-T-CTTT------------TTT--A-----------GTACTAAG-TG---C-CT-C--TTGC-GGTCC-----------ATGGAAG-TCCTT-AGT-GAC-AGC-----------T----------TTG--ATATATTTAGTGG-TCATTTGTGCCTCTTTTGT-GGTCT-T-----------TAGTAGTCCTACGTGCCTCT-C-TTGTGGTCCTTAAAAGTTTAG-TG--ACTGCTTTGTAGT--A--TTAA--GTGATCCTTTGTGCCTCTTT-TGT-GGTATTTATTAG-TC-C------------TGAGTG---CCTT-T---T----A
gi|12 : cCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTAAGTGTCCCTTTGA----------ACTtggtccttggaagtccttattt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTGTCCC-TTTGAACTCCTTAGAAGCTCCTCAGTG-GTTCTTA-GTG-G-CA-CTTTG-AA--CTCATAAGTGACT-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGGA-----------CTCCTTAG-AG--------GT-T-------CC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-G-CAC-----------T----------TTG--AACTCATTATTGGCTCCTTAGTG-TCCCTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG----------------------GCTC-------CTTAG-AA--GCTCCTTAAT----------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---G----AA---Cccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : AA-----------CCCCTTAG-TGA--C-CC-CT-TTGA-ATCCC-----------TTAGTAG-TCTTT-AGT-G-T-CCCCTTAAAATCCCT----------TTG--AATCCCTTAGTAT-TCCTTATTACCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCA-CC-C-TTTAAACCC-------CTTAGTAG----TCTTTAGTG-C--C--C--A--------TTTAA--ACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GT---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTTTGAACCCCTTAG--------------GTCC----------CC-CTTTG-AA--CCTGTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTCAA-----------CTCCTTGG-TG---C-CC-CT-TTCA-ACTCC-----------TTGGTGG-TCCTA-AGT-G-G-CTC-----------C----------TTAATAGCCCTTTAGTGG-TATTTAGTGctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GG---CC-------CCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---T----AA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCC-----------TTAGTAG-TCCTT-AGT-G-C-CCCC----------T----------TTG--AACCCCTCAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTGAACTC-------CTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT--CCTT--A--GTGGTCCTTAGTGGCcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CATTTTGA----------Aatttag
gi|19 : -AA--CACCATGTTAG-T-CCTTAGT-GAC-CC-CTTTGAA-----------TCCCTTAG-TG---C-CCATT-TTGA-AATCA-----------TAAGTAG-TCCTT-CGT-GCC-CCC-----------T----------TTG--TGGCCCTTAGTAG-TTCTAAGTGatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatga-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGAC-CC---TATGAACG---------TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT--T--------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCAT----AGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCAAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTT---CC-------CCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TG---GC-------TCC
gi|21 : CCTTAATGACCTCTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCC-CC-C-TTTGAACTC-------CTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGCT--T--A--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaaccT-TTGA-ACTCC-----------TTAGTGG-----------------------------------------------CTCCTTAGTAG-TCCTAAGTGTCCCATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCC-CA-A-TTTTAACCC-------ATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTGGTGACCTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTGGCAC-TTTGAATTCCTTAGAGGCTCCTAAATG-TCCCTT---TGAA-CT-CTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAACTCATAAGTGGCCCCTTAG-TG---C-CA-AT-TTGA-ACTCC-----------TTAGAGGCTACTT-AGT-G-G-TCC-----------T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTTA----------ACT
gi|25 : TG--AAACCCTTAGTAG-ACCTTAGTGCTCCATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACTC--------TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAAC-CC---TTTAAATGC-------CTAAG-TG--ACTCTTTAGT--------T--------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---C----GG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|27 : TCCTAAGTGTGTCTT---GTG-T-TA-CTTGG-AA--GTACTAAGTGG-T-CCTTTGT-G-C-CT-CTTT
gi|28 : tttattagGCTCATTAGTG-GTCCAAA-GTG-A-CC-CATTGTAA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-TC-CTTTGAA-----------CTCCTTAGAGG---C-TA-CT-TAGAGGCTTG-----------TTAGTGA-TCCTA-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACTCCTTAGAGGCTACTTAGtgtggtctttagttgtaataactaccatttttgtggtccttggaagtctctagtgacagctttgttgtattta
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TG---CA-------CCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG-T-CCTTAGT-G-CACC-CTCTGAA-----------ACCCTTAG-TG---CACC-CT-TTGA-AACCC-----------TTAGT-G-T-----------C-CCC-----------T----------TTG--AACTCCTTAGTAG-TCCTAAGTGagtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaCC-----------T----------TTG--AAC-----------TCATAAGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TG---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGG-TCCTTTGGT-C-C-TCT-----------T----------TTG--TAGTCTTAAGTAG-TCCTTTATGCCTCGTTTGT-AGTTC-T-----------TGAAAGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-TCCTT-GGT-C-C-TCT-----------T----------TTG--TGATCTTTAGTAG-TCCTTTATTCCTCTTTTGT-GGTCC-T-----------TGAAGGTCCTTAATGAC-AG-C-TTTacatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT-CCTCTTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TC-CT-C-TTTTG-------------TGG-------TCCTTG-------------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---gttgtatttaatggtcttttgtgcctcatttgtggtcttatt
gi|32 : CCCCTTAGTA-GTCCTTA-GTG-CTCC-CTTTG-AA--CCCCTCAGTGG-T-CCTTAGT-GCC-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TGC--C-CC-CT-TTGA-ACTCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT------------------------------------AGTCCTTAGTGG-CATTTAGTgtggtcttatt
gi|33 : TAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCATTG
gi|33 : -CTTTAGT-GAC-CC-CTTTCAA-----------TTTCTTAG-TG---C-CC-CCATTGT-ATCCC-----------TTTGTGG-GTTTT-AGT-tatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAG-T-CCTTAGT-GCC-CC-CTTTAAA-----------CCCCTTAT-TGA--C-CC-CT-TTGA-ACCCA-----------TTAGCAG-TCCTT-AGTGG-T-CCC-----------T----------TTA--AACCTCTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGT-G-CTCCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTt
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : TCCTTAGTGCCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-ag
gi|39 : gCTTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTGTCCC-TTTGA
gi|4 : ggcaGGCCCCTTAGTA-GTCCTTA-ATG-A-CC-CTTTG-AA--TGCCTAAGTGACT-CTTTAGTCG-T-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TGT--C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGAGGCTACTT-AGT-GAC-TCC-----------TTTGCAGTACATTG--AGCCCTTTAGTTG-TC
gi|4 : gt-CCC-----------T----------TTG--AAC-----------TCATAAGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTGGCAC-TTTGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TG---CC-------CCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-T-CCTTAGT-G-C-CCACTTTCAA-----------CTCCTTAG-TG---CTCC-CT-TTAA-ACCCC-----------TCAGAGACTCCTT-AGT-GCC-CCC-----------T----------TTT--AACACCTTAGAGACTCCTTAGTGGCCTCTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC--C-------------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---G----AA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCAT--TACCTAGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---A----AA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTAGTGCCCACTTTCA-AC----------------------TCCTTAGTGCC-CCCC-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGCC--C-------------CCTT--TTAACCCTT-AGAGACTCCTTAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCTCTT-T---CTTTGAA---CCCCTTAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--TACTTATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGAGACTCCTTAGTA-GTCCTAA-GTG-G-CCTCTTTG-AA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTTAA-----------CTCCTTAG-TGCCCC-CC-CT-TTTA-ACCTCTAAGAGACTTGTTAGTAG-TCCTT-AGT-GCC-CCC-----------T----------TTA--AACCCCTTACAGATTCCTAAGTGCCCCCTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-A--TTTAACCC-------CTTAC-AG--ACTCC-TA-------------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T---T----AA---CCCCTTACAGACTCC-TT-ACAGACTCCTTAGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 111 1 11111111111 11111 11111111111 111 1111111111111111111111 22222222222 77777777777777777 111111111111 1111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333 1111111111 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 0 1 5 0 0 3 888 000 4 3 44 0 5 2 2 0 2 2 3 22222222222 2 55555 2 2 2 11111111111 8 2 2 000 3333333333333333333333 22 2 7 2 2 00000000000 0 2 444 0 8888888 44 33 88888888888888888 3 66 1 0 2 2 333333333333 6 2 88888888 555 2 44 77 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111111111111111111 9999999999 2 444 8888888 3333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . . ... ... . . .. . . . . . . . . ........... . ..... . . . ........... . . . ... ...................... .. . . . . ........... . . ... . ....... .. .. ................. . .. . . . . ............ . . ........ ... . .. .. . . . .. ... ................... ....... .................................................................. . ..................... .......... . ... ....... .......... .................................................
lowQualScore : 0 4 0 0 4 6 6 222 333 0 3 66 2 7 7 7 7 7 7 0 77777777777 7 77777 7 5 4 22222222222 4 1 0 888 3333333333333333333333 66 0 6 2 1 00000000000 2 2 222 2 1111111 77 44 55555555555555555 1 33 0 1 7 7 777777777777 1 7 88888888 000 9 22 22 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 666666666666666666666 4444444444 2 444 7777777 5555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTGCAAA-TTTGAACTCCTTAGAGGCAACTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGG-TTCCTTAGT-G-C-CC-ATTTAAA-----------CTCCTTAG-TG---G-CA-CT-TTGA-ACTCA-----------TTAAAGGCTCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-CATTTTAACCC-------CTTTG-AG--ACTTCTTAGTGGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAG--TATTTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTGCCTCTT--GTGGTCC-ATGGAAGTCCTTAGTAACAGCTTTGTT-GT-ATTATGTG-G-TC-CTTTG-TA--CCTTTTGATGG-T-CTTT------------TTT--A-----------GTACTAAG-TG---C-CT-C--TTGC-GGTCC-----------ATGGAAG-TCCTT-AGT-GAC-AGC-----------T----------TTG--ATATATTTAGTGG-TCATTTGTGCCTCTTTTGT-GGTCT-T-----------TAGTAGTCCTACGTGCCTCT-C-TTGTGGTCCTTAAAAGTTTAG-TG--ACTGCTTTGTAGT--A--TTAA--GTGATCCTTTGTGCCTCTTT-TGT-GGTATTTATTAG-TC-C------------TGAGTG---CCTT-T---T----A
gi|12 : cCTTA---------------------GT-----------GG-TCCTTAGTG-GCACTTTGAACT-----------C---------CTA----------AG-TGGCTCCTAAGTGTCCCTTTGA----------ACTtggtccttggaagtccttattt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTGTCCC-TTTGAACTCCTTAGAAGCTCCTCAGTG-GTTCTTA-GTG-G-CA-CTTTG-AA--CTCATAAGTGACT-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGGA-----------CTCCTTAG-AG--------GT-T-------CC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-G-CAC-----------T----------TTG--AACTCATTATTGGCTCCTTAGTG-TCCCTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG----------------------GCTC-------CTTAG-AA--GCTCCTTAAT----------------GGTCCTTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAAGTGGCTC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---G----AA---Cccttagaagctcctcagtggttcttagtggcactttgaactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : AA-----------CCCCTTAG-TGA--C-CC-CT-TTGA-ATCCC-----------TTAGTAG-TCTTT-AGT-G-T-CCCCTTAAAATCCCT----------TTG--AATCCCTTAGTAT-TCCTTATTACCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCA-CC-C-TTTAAACCC-------CTTAGTAG----TCTTTAGTG-C--C--C--A--------TTTAA--ACCCCTT-TGA-ACCCATAAGTAG-TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTT---TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GT---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTTTGAACCCCTTAG--------------GTCC----------CC-CTTTG-AA--CCTGTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTCAA-----------CTCCTTGG-TG---C-CC-CT-TTCA-ACTCC-----------TTGGTGG-TCCTA-AGT-G-G-CTC-----------C----------TTAATAGCCCTTTAGTGG-TATTTAGTGctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GG---CC-------CCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG-TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---T----AA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCC-----------TTAGTAG-TCCTT-AGT-G-C-CCCC----------T----------TTG--AACCCCTCAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTGAACTC-------CTTAG-TG--G-TCCTTAGTAGT--CCTT--A--GTGGTCCTTAGTGGCcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CATTTTGA----------Aatttag
gi|19 : -AA--CACCATGTTAG-T-CCTTAGT-GAC-CC-CTTTGAA-----------TCCCTTAG-TG---C-CCATT-TTGA-AATCA-----------TAAGTAG-TCCTT-CGT-GCC-CCC-----------T----------TTG--TGGCCCTTAGTAG-TTCTAAGTGatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatga-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGAC-CC---TATGAACG---------TTAA-AGTGACACTTTTGTGGT--T--------------CTTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCAT----AGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCAAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTT---CC-------CCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TG---GC-------TCC
gi|21 : CCTTAATGACCTCTTTCA-AGCAC-T-----------TTGTAGTTATAAGTGCC-CC-C-TTTGAACTC-------CTTTG-TG--GCTCCATAGTGGTGCT--T--A--GTAGTCCTTAGTGGCatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatgaaaccT-TTGA-ACTCC-----------TTAGTGG-----------------------------------------------CTCCTTAGTAG-TCCTAAGTGTCCCATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCC-CA-A-TTTTAACCC-------ATTTG-AG--ACTTCTTAGTTGTA-C--T--AAGG-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAAGTAG-TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTGGTGACCTCatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTGGCAC-TTTGAATTCCTTAGAGGCTCCTAAATG-TCCCTT---TGAA-CT-CTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAACTCATAAGTGGCCCCTTAG-TG---C-CA-AT-TTGA-ACTCC-----------TTAGAGGCTACTT-AGT-G-G-TCC-----------T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTTA----------ACT
gi|25 : TG--AAACCCTTAGTAG-ACCTTAGTGCTCCATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACTC--------TTAG-TG--GCTCCTTAGTGGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAAC-CC---TTTAAATGC-------CTAAG-TG--ACTCTTTAGT--------T--------GTCCTTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTAGT-G-TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---C----GG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTATTGATTTTTG-GTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|27 : TCCTAAGTGTGTCTT---GTG-T-TA-CTTGG-AA--GTACTAAGTGG-T-CCTTTGT-G-C-CT-CTTT
gi|28 : tttattagGCTCATTAGTG-GTCCAAA-GTG-A-CC-CATTGTAA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-TC-CTTTGAA-----------CTCCTTAGAGG---C-TA-CT-TAGAGGCTTG-----------TTAGTGA-TCCTA-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACTCCTTAGAGGCTACTTAGtgtggtctttagttgtaataactaccatttttgtggtccttggaagtctctagtgacagctttgttgtattta
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TG---CA-------CCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG-T-CCTTAGT-G-CACC-CTCTGAA-----------ACCCTTAG-TG---CACC-CT-TTGA-AACCC-----------TTAGT-G-T-----------C-CCC-----------T----------TTG--AACTCCTTAGTAG-TCCTAAGTGagtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaCC-----------T----------TTG--AAC-----------TCATAAGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TG---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAGTGG-TCCTTTGGT-C-C-TCT-----------T----------TTG--TAGTCTTAAGTAG-TCCTTTATGCCTCGTTTGT-AGTTC-T-----------TGAAAGTCCTTAATGgtatttag
gi|31 : AGTGG-TCCTT-GGT-C-C-TCT-----------T----------TTG--TGATCTTTAGTAG-TCCTTTATTCCTCTTTTGT-GGTCC-T-----------TGAAGGTCCTTAATGAC-AG-C-TTTacatttttgttatattttgtggtctttattagtactcagtgcctcttgtgg
gi|31 : AGTGG-TCCTTGGT-CCTCTTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TC-CT-C-TTTTG-------------TGG-------TCCTTG-------------A--A-GGTCCTTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTAATGG-TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---gttgtatttaatggtcttttgtgcctcatttgtggtcttatt
gi|32 : CCCCTTAGTA-GTCCTTA-GTG-CTCC-CTTTG-AA--CCCCTCAGTGG-T-CCTTAGT-GCC-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TGC--C-CC-CT-TTGA-ACTCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT------------------------------------AGTCCTTAGTGG-CATTTAGTgtggtcttatt
gi|33 : TAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCATTG
gi|33 : -CTTTAGT-GAC-CC-CTTTCAA-----------TTTCTTAG-TG---C-CC-CCATTGT-ATCCC-----------TTTGTGG-GTTTT-AGT-tatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAG-T-CCTTAGT-GCC-CC-CTTTAAA-----------CCCCTTAT-TGA--C-CC-CT-TTGA-ACCCA-----------TTAGCAG-TCCTT-AGTGG-T-CCC-----------T----------TTA--AACCTCTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGT-G-CTCCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTt
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : TCCTTAGTGCCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-ag
gi|39 : gCTTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTGTCCC-TTTGA
gi|4 : ggcaGGCCCCTTAGTA-GTCCTTA-ATG-A-CC-CTTTG-AA--TGCCTAAGTGACT-CTTTAGTCG-T-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TGT--C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGAGGCTACTT-AGT-GAC-TCC-----------TTTGCAGTACATTG--AGCCCTTTAGTTG-TC
gi|4 : gt-CCC-----------T----------TTG--AAC-----------TCATAAGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGT----------------AGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAAGTAG-TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAG--TACCTAGAGCCTTTT---CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTGGCAC-TTTGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TG---CC-------CCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-T-CCTTAGT-G-C-CCACTTTCAA-----------CTCCTTAG-TG---CTCC-CT-TTAA-ACCCC-----------TCAGAGACTCCTT-AGT-GCC-CCC-----------T----------TTT--AACACCTTAGAGACTCCTTAGTGGCCTCTTTGA-ACC----------------------TCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAC-AG--ACTCCTTAGTGGC--C-------------CCTT-TTAACTCCTTACAG-ACTCCTCAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---G----AA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCAT--TACCTAGTGCCTTTTT-TTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---A----AA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTAGTGCCCACTTTCA-AC----------------------TCCTTAGTGCC-CCCC-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGCC--C-------------CCTT--TTAACCCTT-AGAGACTCCTTAGTAG-TC-C------------TTAGTGGCCTCTT-T---CTTTGAA---CCCCTTAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAG--TACTTATTGCCCTTTT-ATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGAGACTCCTTAGTA-GTCCTAA-GTG-G-CCTCTTTG-AA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTTAA-----------CTCCTTAG-TGCCCC-CC-CT-TTTA-ACCTCTAAGAGACTTGTTAGTAG-TCCTT-AGT-GCC-CCC-----------T----------TTA--AACCCCTTACAGATTCCTAAGTGCCCCCTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-A--TTTAACCC-------CTTAC-AG--ACTCC-TA-------------------------AGCACCCCCTT-AGAGACTCCTTAGTAT-TC-C------------TTAGTGCCGCC-T-T---T----AA---CCCCTTACAGACTCC-TT-ACAGACTCCTTAGCGCCCCCTTAGTAGTCCTTAGTGGc
blockSeqs : C G C T TAT AA T T AG C . C A A A G CTCATAAGTGG A CCCC A A G TAAGAGACTTG C T G AC CTTAAAATCCCT AT T C G C GAGAGACTACT T CC TTAAAAG TA TG AGTATTAAGTG A AG T C A CCTTTTAACGCC C A CTTTG ATG A AC TA C C A TA ATC ATGAAACACTTTATTAGTC CACCCTC CCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTAGTAGT A CCCTTAGTGGTC AGTCGTCTTA T GCT TAAGTGT . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
blockSeqs : T T . . TA CT . . . C . . C . . C . . AC . . . . C . . CC TTTGCAGTACA . T C . . GAGAGACTACT . C . T . AGTCCTTAGTG . AG A . . . T . CCAT . . . T C G T . . . . CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGTAGT A TGTTAAAAGTC AGTGGTCCTA . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
blockSeqs : A A . . AA G . . . . . . A . . G . . CA . . . . C . . CT CT . C C . . . . C . A . GGTGCTTAGTA . T A . . . T . T . . . T A A A . . . . TCCCTTAATGACCACTTTGTAGT C CCTCAGTGGTC . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
blockSeqs : G . . TA G . . . . . . C . . G . . CC . . . . . . . AC T . C T . . . . C . T . TGTACTAAGGG . A T . . . C . G . . . G A A A . . . . CCCTTAGTGCACCCTTTGAAAC C TGTAACTAGA . . . . .
blockSeqs : C . . TA T . . . . . . . . . G . . AC . . . . . . . CC T . C . . . . . C . A . GCCCA . A A . . . A . T . . . T C C A . . . . CCCCTTAGTAGT A C . . . . .
blockSeqs : T . . AA A . . . . . . . . . G . . TC . . . . . . . CC C . C . . . . . A . T . GGTT . A T . . . G . T . . . T C A T . . . . CACCATGTTAGT C C . . . . .
blockSeqs : G . . T A . . . . . . . . . G . . CT . . . . . . . G T . T . . . . . C . A . GGCC . A A . . . C . C . . . T A C T . . . . CACTTTATTAGT C C . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . T T . C . . . . . C . T . GCCC . A T . . . G . T . . . T A A T . . . . CCCATTGGTAGT C C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . G T . T . . . . . C . T . AAG . T A . . . C . T . . . T A A T . . . . CCCTTAGTAGA C T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . C T . T . . . . . C . A . G . T C . . . G . T . . . . C C A . . . . CTTAGTGGCT C C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . C . . . . . . . G T . T . . . . . C . A . T . T T . . . C . G . . . . A T T . . . . CCCCTA T C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . C . . . . . . . C T . T . . . . . C . A . A . G T . . . G . A . . . . A C T . . . . CC C C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . . C T . T . . . . . C . A . A . . . C . T . . A C T . . . . CC A C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C T . C . . . . . A . A . . . . . . . C C T . . . . CC C T . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . C . . . . . . . . . . C A A . . . . CA G C . . .
blockSeqs : . . . . . T T . C . . . . . . T . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . T . A . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . T . C . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : C** G**************** **********
originalCons : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTGGT--C--T--A--G-GGTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
finalCons : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-G-CC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG---C-CC-CT-TTGA-ACCCC-----------TTAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CCC--TTTTAACCC-------CTTAG-AG--ACTCCTTAGTG----------------GTCCTTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNAGTAG-TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAG--TACCTAGTGCCTTTTT-GTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TG---CC-------CCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111 111 11111111111 1111111111111111111111 22222222222 11111111111111111 1111111111 1111111111 111111111111 1111111111111111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 333333333333333333333 2222222222 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 2 2 1 4 2 3 888 55 44 3 55 1 6 2 2 8 2 2 4 22222222222 2 111 2 444 2 2 00000000000 8 2 2 777 7777777777777777777777 22 1 7 1 2 2 00000000000 2 555 77777777777777777 5555 7777777 44 5555 9999999999 9999999999 0000000000 777 2 2 1 2222222222 0 88 2 222222222222 8 5 99999999 444 2 4 1 1 1 22 333 8888888888888888888 7777777 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 444444444444444444444 0000000000 2 4444444444 0 9999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : . . . . . . . ... .. .. . .. . . . . . . . . ........... . ... . ... . . ........... . . . ... ...................... .. . . . . . ........... . ... ................. .... ....... .. .... .......... .......... .......... ... . . . .......... . .. . ............ . . ........ ... . . . . . .. ... ................... ....... .................................................................. ..................... .......... . .......... . .................................................
lowQualScore : 0 5 6 1 4 2 6 222 33 66 6 00 2 2 9 9 6 9 9 0 77777777777 7 000 7 444 5 4 00000000000 4 1 0 333 9999999999999999999999 66 3 6 8 2 1 00000000000 2 111 88888888888888888 0000 6666666 88 2222 7777777777 7777777777 3333333333 444 7 9 0 5555555555 5 44 5 888888888888 1 0 22222222 777 7 2 0 9 7 99 999 2222222222222222222 6666666 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 000000000000000000000 6666666666 4 6666666666 9 0000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-GCC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG-C-CC-C---T-TTGA-ACCCCT-----------TAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-T-CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTT-----------------TAA----CCC-------CTTAG-AG--ACTCCTT----------AGT----------GGT----------CC---TTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNA----------GTAG--TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
Reference ( family-2496 ) : CCCCTTTGAACTCNTTAGTGGCTCCTTAGTGNCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-GTCCTTA-GTG-GCC-CTTTG-AA--CCCCTTAGTGG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TG-C-CC-C---T-TTGA-ACCCCT-----------TAGTGG-TCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-T-CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTT-----------------TAA----CCC-------CTTAG-AG--ACTCCTT----------AGT----------GGT----------CC---TTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTNA----------GTAG--TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGTGACCCCTTT-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTGTCTGTAATAGGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGATTAATGNCGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|1 : CCCCTTTGAACTCATTAATGGCTCCTTAGTGCAAA-TTTGAACTCCTTAGAGGCAACTTAGTG-GTCCTTA-GTG-GCA-CTTTG-AA--CTCATTAGTGG-TTCCTTAGT-G-C-CC-ATTTAAA-----------CTCCTTAG-TG-G-CA-C---T-TTGA-ACTCAT-----------TAAAGGCTCCTT-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-T-CCTTAGTGTCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-CATTT-----------------TAA----CCC-------CTTTG-AG--ACTTCTT----------AGT----------GGTACTAAGGGGTCC---TTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAA----------GTAG--TC-C------------TTAGTACCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTAGTGACCCCTTT-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTGTCCCTAATAGGAA
gi|1 : ATGTGATTAATGCCGAGTTATCATTTAAATCACTTAAAATTTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTAGTAGTCCTTA---------------------------------GTGCTCCCTTTCAACC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagttatcatttaaatcacttaaaatttgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgctccctttcaaccccttagtgccccctttgaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaggacc
gi|10 : cccctttgaactcattaatggctccttagtgcaaatttgaactccttagaggcaacttagtggtccttagtggcactttgaactcattagtggttccttagtgcccatttaaactccttagtggcactttgaactcattaaaggctccttagtgcccctttgaaccccttagtggtccttagtgtcccctttgaaccccttagtagtccttagtgcccccattttaacccctttgagacttcttagtggtactaaggggtccttagtggcccctttgaacccctaagtagtccttagtaccctcatttaacctcttagtgacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCCCTTT-GCAGTATTTAGTGCCTTTTTGTTGTCTGTAATAGGAA
gi|10 : aGTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaa
gi|11 : aacccctttgcagtatttagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAGTGCCTCTT--GTGGTCC-ATGGAAGTCCTTAGTAACAGCTTTGTT-GT-ATTATGTG-GTC-CTTTG-TA--CCTTTTGATGG-T-CTTT------------TTT--A-----------GTACTAAG-TG-C-CT-C-----TTGC-GGTCCA-----------TGGAAG-TCCTT-AGT-GAC-AGC-----------T----------TTG--ATATATTTAGTGG-T-CATTTGTGCCTCTTTTGT-GGTCT-T-----------TAGTAGTCCTACGTGCCTCT-C-TTG-----------------TGG----TCCTTAAAAGTTTAG-TG--ACTGCTTTGTAGTATTAAGT----------GAT----------CC---TTTGTGCCTCTTT-TGT-GGTATTTA----------TTAG--TC-C------------TGAGTG---CCTT-T---T----A
gi|12 : cCTT----------AGT----------GGT----------CC---TTAGTGGCAC-TT-TGA-ACTCCTAA----------GTGGC-TC-C------------TAAGTG-TCCCTT-T---G----AA---CTCCTTAGAAGCTCCTCA-GTGGTTCTTAGTGGCACTTTGtggtccttggaagtccttattt
gi|12 : CTTTGAACTCCTAAGTGGCTCCTAAGTGTCCC-TTTGAACTCCTTAGAAGCTCCTCAGTG-GTTCTTA-GTG-GCA-CTTTG-AA--CTCATAAGTGACT-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGGA-----------CTCCTTAG-AG------G---T-T-------CCT-----------TAGTGG-TCCTT-AGT-G-G-CAC-----------T----------TTG--AACTCATTATTGGCT-CCTTAGTG-TCCCTTTGA-ACTCC-T-----------AAG-AG---------------------------------------G----CTC-------CTTAG-AA--GCTCCTT----------AAT----------GGT----------CC---TTAGTGG-CATTT-TGA-TCTTATAA----------GTGGC-TC-C------------TTAGTG-TCCCTT-T---G----AA---Caactcataagtgactccttagtgcccctttggactccttagaggttccttagtggtccttagtggcactttgaactcattattggctccttagtgtccctttgaactcctaagaggctccttagaagctccttaatggtccttagtggcattttgatcttataagtggctccttagtgtccctttgaac
gi|13 : cttagtggtccttagtggcaTGATAACTGCCATGTCATGATTTAAATCAATTAAAATGTGTCCTTTGTAGCT--ACCTGACAATCTTATCAAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-T
gi|13 : AA-----------CCCCTTAG-TGAC-CC-C---T-TTGA-ATCCCT-----------TAGTAG-TCTTT-AGT-G-T-CCCCTTAAAATCCCT----------TTG--AATCCCTTAGTAT-T-CCTTATTACCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------AAGAATTCCTAAGTGCA-CC-C-TTT-----------------AAA----CCC-------CTTAGTAG----TCTTT----------AGT-----------GC----------CCAT-TTA--AACCCCTT-TGA-ACCCATAA----------GTAG--TC-C------------TTAGTGCagtctttagtgtccccttaaaatccctttgaatcccttagtattccttattaccccctttgaacccctaagaattcctaagtgcaccctttaaaccccttagtagtctttagtgcccatttaaacccctttgaacccataagtagtccttagtgc
gi|14 : tgataactgccatgtcatgatttaaatcaattaaaatgtgtcctttgtagctacctgacaatcttatcaatcttaatatgaCCCCTTT-GCAGTACCTAGTGCCTTTT--TTGTCTGTAATAGGAA
gi|15 : GTGATTAATAACGTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAATCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGACCCCTTTGAACC-----------C---------CTT----------AG-GTCCCCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnag
gi|15 : CCCCTTAGTGACCCCTTTGAACCCCTTAG--------------GTCC---------CC-CTTTG-AA--CCTGTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTCAA-----------CTCCTTGG-TG-C-CC-C---T-TTCA-ACTCCT-----------TGGTGG-TCCTA-AGT-G-G-CTC-----------C----------TTAATAGCCCTTTAGTGG-T-ATTTAGTGctgttagtagtccttagtgcccctttcaactccttggtgcccctttcaactccttggtggtcctaagtggctccttaatagccctttagtggtatttagtggcat
gi|16 : gtgattaataacgtgtcataattcaaatcatttaaaatgtgtccatagtagctaactgacaatcctaatcttaatatgaaaTGATTAATGACCTGTCATAATTCAAATCATTTAAAATGTGTCCATAGTAGCT--AACTGACAGTCCT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAACCCCTTATTGACCCCTTTGAACCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAATGCCCCCTTTGAACCTGTTAAAAGT-C---------CTT----------AG-GGCCCCTTTTGA----------AC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTAGTAGGACCgcat
gi|17 : AG--TA-C------------TTAGTGTCCCCTT-T---T----AA---TCCCTTAGTGACCCCTTT-GC
gi|18 : GTTATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGCAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCCTTA---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCCCCCTTTGAACCCCTCAGTGGT-C---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntnnnnnnnnnnttaatatga
gi|18 : A-ACCCCT-----------TAGTAG-TCCTT-AGT-G-C-CCCC----------T----------TTG--AACCCCTCAGTGG-T-CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCC-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTT-----------------GAA----CTC-------CTTAG-TG--G-TCCTT----------AGT----------AGT----------CC---TTAGTGGTCCTTcccttagtggtccttagtgccccctttgaactccttagtggtccttagtagtccttagtggtccttagtggcatttag
gi|18 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaCCCCTTTGAACTCCTTAGTGG-TCCTTAGT-----------AGTCCTTAGTGG-TCCTTAGTG-GCATTTA-Gagtggcatttag
gi|19 : gttattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgcagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaaccccttagtagtccttagtgccccctttgaacccctcagtggtccttagtgccccctttgaaccccttagtggtccttagtgcGTGATGAATGCCATATCATAATTTAAATTAATTGAAATACGTTCTTT----CTTAAACTGACACACTT---AGT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CACCATG---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGACCCCTTTGAATC-----------C---------CTT----------AG-TGCCCATTTTGA----------A
gi|19 : -AA--CACCATGTTAG-T-CCTTAGT-GAC-CC-CTTTGAA-----------TCCCTTAG-TG-C-CCAT---T-TTGA-AATCAT-----------AAGTAG-TCCTT-CGT-GCC-CCC-----------T----------TTG--TGGCCCTTAGTAG-T-TCTAAGTGatcataagtagtccttcgtgccccctttgtggcccttagtagttctaagtggctattagca
gi|2 : gtgatgaatgccatatcataatttaaattaattgaaatacgttctttcttaaactgacacacttagtcttaatatga-ACTCC-T-----------TAGTAGTCCTTTATGAC-CC---TAT-----------------GAA----CG---------TTAA-AGTGACACTTT----------TGT----------GGT----------TC---TTACTGACCCATT-TGA-ACCCCTTA----------GT-G--TC-CCCTTTTAACGCCTTAGTATCTCCTT-TCCAT----AGATGTTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAGTACCAAGTGCCTTTTTGTTGTCTGTAATAGGAAgctattagca
gi|2 : tgGTGATAAATGACATGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAAACTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCC-TA------------------------------------------AGTGCCCCATTTGAACC-----------T---------TTTAGTCGTCTTAAG-TGCCCCCTTTGA----------ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAAGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtgataaatgacatgtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaaacttaatcttaatatgaaacccctaagtgccccatttgaaccttttagtcgtcttaagtgccccctttgaactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtaagacc
gi|20 : tgactccttagtagtcctttatgaccctatgaacgttaaagtgacacttttgtggttcttactgacccatttgaaccccttagtgtccccttttaacgccttagtatctcctttccatagatgttccttagtgacccctttgcagtaccaagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGATTAATGACGTGACATAATTCAAATCACTTAAAATGTGTCTTTTATAGCT--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CC-------------------------------------------CCTTAGTGCCCCCTTTGAACC-----------TGTAACTAGACTT----------AATTTCCCCCTTTGA----------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTAGTAGGACC
gi|21 : GTGATTAATGATGTGTCATAATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAACA-------TGAAA---------------------CCCCTTAATGACCTCTTTCAAGCACTTTGT-----------AG-TTATAAGTGCCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------TG-TGGCTCC
gi|21 : AA-----------CCCCTTAA-TGAC-CT-C---T-TTCA-AGCACT-----------TTGTAG-TTATA-AGT-G-C-CCCC----------T----------TTG--AACTCCTTTGTGGCT-CCATAGTG------GTG------C-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGatagtggtgcttagtagtccttagtggcatttagtagga
gi|22 : gtgattaatgatgtgtcataatttaaatcacttaaaatgtgtcctttatagctaactgacaatcttaatcttaacatga---T-TTGA-ACTCCT-----------TAGTGG-----------------------------------------------CTCCTTAGTAG-T-CCTAAGTGTCCCATTTGA-ACCCC-T-----------TAGTAGTTCTAAGTGCC-CA-A-TTT-----------------TAA----CCC-------ATTTG-AG--ACTTCTT----------AGTTGTACTAAGGGGT----------CC---TTAGTGGCCCCTT-TGA-ACCCCTAA----------GTAG--TC-C------------TGAGTACCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTGGTGACCTCgcatttagtagga
gi|23 : TTTGAACTCTTTAGTGG-TCCTTAGTGGCAC-TTTGAATTCCTTAGAGGCTCCTAAATG-TCCCTT---TGAACT-CTTTA-AAAGCCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTGAACTCATAAGTGGCCCCTTAG-TG-C-CA-A---T-TTGA-ACTCCT-----------TAGAGGCTACTT-AGT-G-G-TCC-----------T----------
gi|25 : ggcaaTGATTAATGCCTAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAA-------------------CTTAATA-------TGAAA----------------------CCCTTA---------------------GT-----------AG-ACCTTAGTGCTCCATTTAAACCCCCTTAGTGGTC---------CTT----------AG-TGCCCCCTTTTA----------ACT
gi|25 : TG--AAACCCTTAGTAG-A-CCTTAGTGCTCCATTTAA-ACCCCCT-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTT-----------------TAA----CTC--------TTAG-TG--GCTCCTT----------AGT----------GGcttagtggctccttagtggcattta
gi|26 : tgattaatgcctagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaaacttaataCCCC-T-----------TAGTAGTCCTAAATAAC-CC---TTT-----------------AAA----TGC-------CTAAG-TG--ACTCTTT----------AGT----------TGT----------CC---TTAGTGACCCATT-TGA-ACCCCTTA----------GT-G--TCAC------------TT-TTAACCCCTTAG---C----GG---CTCCTTAGTGACCCCTTT-GCAGTACCTATTGATTTTTGGTTGTCTGTAATAAGAcattta
gi|27 : TCCTAAGTGTGTCTT---GTG-TTA-CTTGG-AA--GTACTAAGTGG-T-CCTTTGT-G-C-CT-CTTT
gi|28 : tttattagGCTCATTAGTG-GTCCAAA-GTG-ACC-CATTGTAA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-TC-CTTTGAA-----------CTCCTTAGAGG-C-TA-C---T-TAGAGGCTTGT-----------TAGTGA-TCCTA-AGT-G-C-CCC-----------T----------TTG--AACTCCTTAGAGGCT-ACTTAGtgtggtctttagttgtaataactaccatttttgtggtccttggaagtctctagtgacagctttgttgtattta
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATC----------------------------TTAATA-------TGAAA---------------------CACTTTA---------------------TT-----------AG-TCCTTAGTGCACCCTCTGAAAC-----------C---------CTT----------AG-TGCACCCTTTGA----------A
gi|29 : TTGTAGCT--AAATGACAATCTT---AATATGAAACACTTTATTAGTCCTTAGTGCACCCTCTGAAA---------------------CCC-TTA---------------------GTGCACCCTTTGAAA-CCCTTAGTGTCCCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-Tacccttagtgtcccctttgaactccttagtagtcctaagtggcatttagt
gi|29 : -AA--CACTTTATTAG-T-CCTTAGT-G-CACC-CTCTGAA-----------ACCCTTAG-TG-CACC-C---T-TTGA-AACCCT-----------TAGT-G-T-----------C-CCC-----------T----------TTG--AACTCCTTAGTAG-T-CCTAAGTGagtcctaagtggcatttagt
gi|3 : ttgtagctaaatgacaatcttaatatgaCC-----------T----------TTG--AAC-----------T-CATAAGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TC-C-TTT-----------------TAA----CCC-------CTTAG-AG--ACTCCTT----------AGT----------AGT----------CC---TTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAA----------GTAG--TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAGTACCTAGAGCCTTTT--CTGTATGTAATAGGgcatttagt
gi|3 : GTAATTAATGACGTGTCATTATTTAAATCACTTAAAATATGTGCTTTATAGCC--AACTGAC---------AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------TCCCTTAATGACCACTTT----------GT-----------AG-TCTTTAGTGCCGCCTTTGAACT-----------C---------CTT----------AG-TGtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattaatgacgtgtcattatttaaatcacttaaaatatgtgctttatagccaactgacaatcttaatatgaaatcccttaatgaccactttgtagtctttagtgccgcctttgaactccttagtggtatttag
gi|30 : cctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----------TAGTGG-TCCTTTGGT-C-C-TCT-----------T----------TTG--TAGTCTTAAGTAG-T-CCTTTATGCCTCGTTTGT-AGTTC-T-----------TGAAAGTCCTTAATGAC-AT-T-TTTG----------------TTA----TAT-------TTTGT-GG----TCTTT----------ATT----------AGT----------AC---TCAGT-GCCTCTT-gtatttag
gi|31 : AGTGG-T-CCTTGGT-CCTCTTTTGT-GATCT-T-----------TAGTAGTCCTTTAT-TC-CT-C-TTT-----------------TG-----------------TGG-------TCCTT----------GAA----------GGT----------CC---TTAATGACAGCTT-TGT-TGTATTTA----------ATGG--TC-T------------TTTGTGCCTCATT-T---gtgg
gi|32 : CCCCT-----------TAGTAG-TCCTT-AGT-G-CTCCC-----------T----------TTG--AACCCCTCAGTGG-T-CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACC----------------------CCTTAGTGCC-CC-C-TTT-----------------GAA----CTC-------CTTAG-TG--G-TCCTT----------AGT----------AGT----------CC---TTAGTGGCgtggtcttatt
gi|33 : TAAAATATGACCTGTGTAGTA--AACTTACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------C-----A--------------------------------------CTTTAGTGACCCCTTTCAATT-----------T---------CTT----------AG-TGCCCCCATTGatttagt
gi|33 : -CTTTAGT-GAC-CC-CTTTCAA-----------TTTCTTAG-TG-C-CC-C---CATTGT-ATCCCT-----------TTGTGG-GTTTT-AGT-tatccctttgtgggttttagta
gi|34 : taaaatatgacctgtgtagtaaacttacaatcttaatcttaatatgaaacaAGTAG-T-CCTTAGT-GCC-CC-CTTTAAA-----------CCCCTTAT-TGAC-CC-C---T-TTGA-ACCCAT-----------TAGCAG-TCCTT-AGTGG-T-CCC-----------T----------TTA--AACCTCTTAGTa
gi|35 : AATGACGTGTCATCATTTTAATCACTTAAAATGTGTTATTAATAGCT--AACTGACAATCTC---TAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCC
gi|36 : aGT-G-CTCCC-----------T----------TTG--AACCCCTTAGTGG-T-CCTTAGTGCCCCCTTTGA-ACCCT-T-----------TAGTGGTCCTTAGTGCC-CC-C-TTT-----------------t
gi|37 : TTACTGACGTGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCTTTATAGCT--AACg
gi|38 : TCCTTAGTGCCCC-TTTGAACTCCTTAGAGGCTCCTTAGTG-ag
gi|39 : gCTTTGAACTCATTAGTGGCTCCTTAGTGTCCC-TTTGA
gi|4 : ggcaGGCCCCTTAGTA-GTCCTTA-ATG-ACC-CTTTG-AA--TGCCTAAGTGACT-CTTTAGTCG-T-CC-CTTTGAA-----------CCCCTTAG-TGTC-CC-C---T-TTGA-ACCCCT-----------TAGAGGCTACTT-AGT-GAC-TCC-----------TTTGCAGTACATTG--AGCCCTTTAGTTG-T-C
gi|4 : gt-CCC-----------T----------TTG--AAC-----------T-CATAAGTGCCCCCTTTTA-ACCCC-TGAGAGACTACTTAGTAGTCCTTAATGCC-TC-C-TTT-----------------TAA----CCC-------CTTAG-AG--ACTCCTT----------AGT----------AGT----------CC---TTAGTGGCCCCTT-TGT-ATCCCTAA----------GTAG--TC-C------------TAAG-GGTCCCTT-T---T----AA---CCCCTTAGGAACCCATTT-GCAGTACCTAGAGCCTTTT--CTGTATGTAATAGGtgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttgaactcataagtgcccccttttaacccctgagagactacttagtagtccttaatgcctccttttaaccccttagagactccttagtagtccttagtggcccctttgtatccctaagtagtcctaagggtcccttttaaccccttaggaacccatttgcagtacctagagccttttctgtatgtaatagg
gi|41 : gtggccccttagtagtccttaatgaccctttgaatgcctaagtgactctttagtcgtccctttgaaccccttagtgtcccctttgaaccccttagaggctacttagtgactcctttgcagtacattgagccctttagttgtctgtaaaaggaactttccttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTCCTTAGTGGCAC-TTTGAACTCCTAAGA
gi|5 : CCCTCAT-T---T----AA---CCTCTTAGTGACCCCCATAGCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTGTCCCTAATAGGAA
gi|5 : ATGTGATTAATGCCGAGTCATCATTTAAATCACTTAAAATGTGTCCATTGTAGCT--AACTGACAATCTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGAAA---------------------CCCATTG---------------------GT-----------AG-TCCTTAGTGCTCCCTTTGAACC-----------C---------CTTAGTGGTCCTAAG-TGCCCCCTTAGA----------ACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtgattaatgccgagtcatcatttaaatcacttaaaatgtgtccattgtagctaactgacaatcttaatcttaatatgaaacccattggtagtccttagtgctccctttgaaccccttagtggtcctaagtgcccccttagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : ccctcatttaacctcttagtgacccccatagcagtacctagtgcctttttgttgtccctaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----AA---CCTCTTAGTAACCCCTTT-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTGTCTGTAATAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttagtagga
gi|6 : tagaCCTTTTGAATC-----------C----------TT----------AG-TGCCCACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatccttagtgcccactttcaactccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|6 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-T-CCTTAGT-G-C-CCACTTTCAA-----------CTCCTTAG-TG-CTCC-C---T-TTAA-ACCCCT-----------CAGAGACTCCTT-AGT-G-C-CCCC----------T----------TTT--AACACCTTAGAGACT-CCTTAGTGGCCTCTTTGA-ACCTC-T-----------TAGT----------GCC-CC-C-TTT-----------------TAA----CCC-------CTTAC-AG--ACTCCTT----------AGT----------GGC----------CC---CTTTTAACTCCTTACAG-ACTCCTCA----------GTAG--TC-C------------TTAGTGGCCCCTT-T---G----AA---CCCCTTAGTAACTCCTTT-GCATTACCTAGTGCCTTTTTTTTGTCTGTAGTAGGAccttagtgctccctttaaacccctcagagactccttagtgcccccttttaacaccttagagactccttagtggcctctttgaacctcttagtgcccccttttaaccccttacagactccttagtggccccttttaactccttacagactcctcagtagtccttagtggcccctttgaaccccttagtaactcctttgcattacctagtgccttttttttgtctgtagtagga
gi|7 : tagaaacctcttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttgtctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaa--TC-C------------TTAGTGCCCCCTT-T---A----AA---CCCCTTAGTAACCCCTTT-GCAGTACCTAGTGCCTTTTTGTTATCTGTAATAGGAA
gi|7 : CCTTTTGAATG-----------C---------CTT----------AG-TGCCCACTTTCA----------ACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgccttagtgcccactttcaactccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|7 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CCTTAGTGCCCACTTTCA-AC----------------------TCCTTAGTGCC-CCCC-TTT-----------------TAA----CCC-------CTTAG-AG--ACTCCTT----------AGT----------GCC----------CCCTTTTAA----CCCTT-AGAGACTCCTTA----------GTAG--TC-C------------TTAGTGGCCTCTT-T---CTTTGAA---CCCCTTAGTccttagtgccccccttttaaccccttagagactccttagtgcccccttttaacccttagagactccttagtagtccttagtggcctctttctttgaaccccttagt
gi|8 : tccttagtgccccctttaaaccccttagtaacccctttgcagtacctagtgcctttttgttatctgtaataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttttgaatgTTT-GCAGTACTTATTGCCCTTTTATTGTCTCTGATAGGAA
gi|8 : GTGGTTAATGCAATGTCATAATTTAAATCAATTAAAAAGTGTCTTTTATAACT--AAATGACACTTTT---AAT-------------------CTTAATA-------TGGAA------------------------CTTA---------------------GT-----------GGCTCCTTAGTGGCCACTTTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtggttaatgcaatgtcataatttaaatcaattaaaaagtgtcttttataactaaatgacacttttaatcttaatatggaacttagtggctccttagtggccactttgc
gi|9 : tttgcagtacttattgcccttttattgtctctgataggaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagGAGACTCCTTAGTA-GTCCTAA-GTG-GCCTCTTTG-AA--CCCCTTAGTAG-T-CCTTAGT-G-C-CC-CTTTTAA-----------CTCCTTAG-TG-C-CC-CCCCT-TTTA-ACCTCTAAGAGACTTGTTAGTAG-TCCTT-AGT-G-C-CCCC----------T----------TTA--AACCCCTTACAGA-TTCCTAAGTGCCCCCTAAGAGACTCG-T-----------TAGTAGTCCTTAGTGCC-CC-A-TTTAACCCCTTACAGACTCCTAAGCACCCC-------CTTAG-AG--ACTCCTT----------AGT----------ATT----------CC---TTAGTGCCGCCTT-T-A-ACCCCTTACAGACTCCTTACAGACTC-C------------TTAGCGCCCCCTTAG---T----AG----TCCTTAGTGGCCTCTTT-Gc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): TGCAGTAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAG
Unaligned ( gi|40 ): ACAATCAGATGCTCTCGACATTTGGTAACTCA