lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :        1                          22    1            1                     333              444444444444                                    11                      1      1                          111                                      111                                                                                                                              1      1111                 111   2222      11                  111                            11        33333333                                                                                       111                                           11        11                                 444444444              1   2222                                1                1                       1               222                             222                                   1            44444444444       11   11      11        11                 5555555555555555555            1    1  3333333                    1         555555555555555555         11  11    1     1    22222222           1   1     333    1      2222                               33333333              99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999                                        1          1                          11               11     11           1     8888888888888888888888       2   1                    11         333      2           11                                  11     4444              22222       222                        111            1111     11             111                                            111      55555555555           1111111111111111111111111111111       33333333  11                                     1       1                          33                         1                                                   22   11      33                 44444444444444                       33333333333333      555555555555555555555   1   222        11                          11     1    3333333       333333333                                                 11         22        22222    1                                          55555   2       1                2                 99999999999                                                                        1         11                                     2        5555555555555555555555555555555555555               333333333                                                                                                                                                          22222             1                                          222                             1           1         22     1    22    1            1  1         333        1   22     11              6666666      2       1    22    333         33       11      22         333333333        3333        1    22  11                                                                22     2     11                                           1                        1                    1                         1         1  
lowQualScore                  :        5                          33    5            5                     555      2       888888888888  4    9999 2   6              6    88       9          2   0      0      3       3           666      0                      4        777      2    2                                             8                 8                                                  0      4444         2     3 222   1111      33        22        777    2 8               44    33  7     66666666                3   3                   3                                              444        0   8   1            0             11  5555  11            3          3         000000000       2      0   1111  4       3                3    0     2    3     0              2        0       8       333     6       3     1  6  3   333                    4  1 3         0    3       11111111111 1     33   88  0   11   7    22                 4444444444444444444            2    3  3333333   7777      6    0 3       0 555555555555555555    0    44  11    6 4 3 3    99999999     3   0 3   3  0  666  0 3  3 1 5555     0     8       0           66666666              22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222       44    8   6     0  4             3          2    4    1        7 4     44 4       2   2 88  4  88 2 2   4   1 2   1111111111111111111111       0   5        3     4     88    2    555   2  7           44          2     4                 66  0  0000              44444       333                   0  1 777       0 0  1111     66        1    222      0    4   9     3              4   3   777  0   22222222222    4 1    3333333333333333333333333333333       22222222  33       1          0                  7       7                          22                         7                     6           4              4  77   88      33 999       7     55555555555555    7 1                44444444444444      888888888888888888888   3   333 3      44  0  8  6      1    3 7   55 0   3    9999999       222222222              0  3              1  4     3  4  4 88         77     6  66666    5                                 55       00000   0   77  5   2            0    4        4   55555555555          2                3                    6              2 2      5         99       4                    3    66  0   2    2222222222222222222222222222222222222   4           777777777         444   4     777          4       4              2    4     66     2     3  4  2     2                                                 2          66666   2         0                            0        5    222   1                         7   6       5         11     7    33    7            7  5      2  555 2      5   77     88              1111111  4   7       5 2  44    666         11       88      11  2      444444444        1111        0    77  77           2         4            66                4     2     77   3 3  2  88                                   6       7                        7      6             5                 6       7         5  
lowQualScore                  :        .                          ..    .            .                     ...      .       ............  .    .... .   .              .    ..       .          .   .      .      .       .           ...      .                      .        ...      .    .                                             .                 .                                                  .      ....         .     . ...   ....      ..        ..        ...    . .               ..    ..  .     ........                .   .                   .                                              ...        .   .   .            .             ..  ....  ..            .          .         .........       .      .   ....  .       .                .    .     .    .     .              .        .       .       ...     .       .     .  .  .   ...                    .  . .         .    .       ........... .     ..   ..  .   ..   .    ..                 ...................            .    .  .......   ....      .    . .       . ..................    .    ..  ..    . . . .    ........     .   . .   .  .  ...  . .  . . ....     .     .       .           ........              ................................................................................       ..    .   .     .  .             .          .    .    .        . .     .. .       .   . ..  .  .. . .   .   . .   ......................       .   .        .     .     ..    .    ...   .  .           ..          .     .                 ..  .  ....              .....       ...                   .  . ...       . .  ....     ..        .    ...      .    .   .     .              .   .   ...  .   ...........    . .    ...............................       ........  ..       .          .                  .       .                          ..                         .                     .           .              .  ..   ..      .. ...       .     ..............    . .                ..............      .....................   .   ... .      ..  .  .  .      .    . .   .. .   .    .......       .........              .  .              .  .     .  .  . ..         ..     .  .....    .                                 ..       .....   .   ..  .   .            .    .        .   ...........          .                .                    .              . .      .         ..       .                    .    ..  .   .    .....................................   .           .........         ...   .     ...          .       .              .    .     ..     .     .  .  .     .                                                 .          .....   .         .                            .        .    ...   .                         .   .       .         ..     .    ..    .            .  .      .  ... .      .   ..     ..              .......  .   .       . .  ..    ...         ..       ..      ..  .      .........        ....        .    ..  ..           .         .            ..                .     .     ..   . .  .  ..                                   .       .                        .      .             .                 .       .         .  
lowQualScore                  :        0                          00    0            0                     000      5       000000000000  0    5555 5   0              7    33       0          5   0      0      2       2           222      8                      0        555      5    5                                             2                 2                                                  0      2222         5     2 000   2222      88        88        555    5 2               55    88  0     22222222                2   2                   2                                              000        8   0   0            8             00  7777  88            2          2         000000000       5      0   2222  2       2                2    0     5    2     0              5        0       3       333     7       7     0  7  7   333                    0  2 0         0    2       77777777777 0     77   33  7   00   7    33                 0000000000000000000            0    3  7777777   7777      0    7 3       7 777777777777777777    7    33  33    0 7 7 3    77777777     7   7 3   3  7  777  7 3  7 0 3333     7     3       7           33333333              33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333       33    3   7     7  7             3          0    0    0        3 7     55 0       5   5 00  0  55 5 5   0   5 5   5555555555555555555555       0   5        0     0     00    5    000   5  5           55          5     0                 77  7  0000              77777       333                   7  2 555       2 2  0000     55        2    000      2    0   5     5              0   2   555  8   00000000000    7 0    3333333333333333333333333333333       88888888  88       2          7                  0       0                          00                         0                     0           0              0  55   00      00 000       3     33333333333333    3 0                77777777777777      333333333333333333333   3   333 7      33  7  3  7      0    7 0   77 7   3    7777777       777777777              7  7              0  0     7  0  0 00         55     0  55555    5                                 00       00000   0   00  5   5            0    0        0   00000000000          5                0                    0              5 5      0         55       0                    0    55  0   5    0000000000000000000000000000000000000   0           000000000         000   0     555          0       0              5    0     55     5     0  0  5     5                                                 5          00000   5         5                            2        0    000   0                         0   0       0         00     0    00    0            0  0      5  000 5      0   55     55              5555555  0   5       0 5  00    555         00       00      55  5      000000000        5555        5    00  55           5         0            55                0     5     55   0 0  5  00                                   0       0                        0      0             0                 0       0         0  
consensus                     : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCAGAGATGTCTNCCTTAAACTTTGGGACTGTCANAGTTNNGNTNATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATNACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATANGTATC----TGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCG--TCGACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-TACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTNATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-TCTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTAACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGAANACA---GGCCTATGTGTAGACACATTNACGGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AACA-TGACAAGATC-GTT--TGTTCTTNTGANATAACGATATGATCTATTAAAGA--TTT-TCG-TT-A-C---ATCATATGAAACGAATG-AG---TC--ACTAGCGCCAGTACACGTAT-CAAGGGAATTAAC-GA-A-TA----GCGTATAGTTAT-AATCAACG-CGGNA-GTAA--TANA--CTTCTNTCGTC-AAC-GTTCT---TGAA-TTNTCTG-AAGAGTTAAGATGAGCGTTTATATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTG--TG-GTA-TA----------ATAT-AGA-AGTTCT----NATAATT---TNTTT--ACCGATTC-T-A-A-CTTTTC-AAAGAATNATTACTACTTGGTAAATANACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTNTGAACATTCAAATTGNACACCNNTNATTCTGTCGTCNTNTACNTGAAGNANTGGNACANTNCTAGCGTGTTTACACAATANATTATTCCATAATGATAGCCACCCCNCCCTTNCGTACGTTGCANACACAAGCGGNGAAGCGCAAGTCATNNTCACATACAGCGTGACNTTTGCATTTGCTATCGATTCAATC--T-AAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCNTTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACANGATGCCAGTNGCATTCCATGTTAANATGTTCA---AATTAT----CAAC---CATTNAGAAGT---TTCTNCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATATCTGACCGTGTGTACTGTCTATTATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCCTTTCTGATCGCTGGTTACGGCGATATTTCAATTTATTCCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCACTGGAGGCCAGAAGTNNNGGTCATCTAGCAG---AGC-----GG-ATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCC-NAT-AAT---AGCCGA----CC-CG----TATCG---GTT-TCT---ANTTACGAA-ACTTTTGTNACTTTTGGGCCNCGCTTTGTAACA-AATTC-GC---AATCTTT---GTCTC-GTGATCGACGGCTTAAANCCCCCAATATAGAAGCTNTTTGTNCGNTTNCTGATATATGTCCAGCAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTCCCTATTTTGAGTTTTANNCGAAGTAGTCTGCTATAATNNCCTATCNGGTTTATGTCTATTGGTNCGTTATGGNAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTNATTTAGCCGGCCTAGCNGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGNANCTTCTTGTTGCTACCANTGCCCGTANAGCGGTCCTGTGGCATCGGANTATCNNCACACGNCATGGTCATCAATGCTGACATTTTTACACGAAATGATT--ATTTNCCTGGACATCAGCGGTATAGTCAAAACGANCNACANTATCANNNCTGTTTAACANGCCATTANCAACGGTTATGTTTCGACANATATTNNCGTCANGTGAANCANTANGCATGNGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAGTCCTTGATGANGTTCCCAGACAGACNACTNGCTGAACAGNCGTGGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACGTGAC-A-TTCCCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTANCTATCGNCAGTAGCATGACCACGCTACTGTGTGAACTTTTAGCCACNGTNACAGTATCATCCTNTGNCAAAANNAACCGAGCGAGTCTCATTTTNGCACGCACTTNAGCTGATATCATCTCCAGGTCCGAAACCATTCATANTTTGGNTACNCGATTTAATGTNTTGTCTCGANTTCCTGTTTGGCNNCTTTTCGAGAGAAACTNGTTTTNTGTTTGAAAANTGTTNATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAA
Reference ( gi|1 )            : GACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAATTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAGTTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTTGTCAACTTCGCGGTTTAGTAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGAATC----TGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCAACCCAGGCTTTACGACGATCA--TCAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-TACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-TCTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTAAACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTT-TTG-TT-A-C---ATCATATGAAACGAATG-AG---TT--ACTAGCGCCAGTATACATGT-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACC-AAT-GTCCT---TGGA-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTA----------ATAT-AGA-AGTTCT----GATAATT---TATTT--ACCGATTCCTGAAATCTTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGACTGAAACATTGCTAGCGGGTTTA------ACAT---TCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGACGCGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGAAACAGTC--A-AAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCA---AATTAT----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTG---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACATCTGATCGTGTGTACTGACTATTATTGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGTTTCATAATTCCTTTCTGATCGCTGGTAACGGCGATATTTCAATTTATTTCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTCT--TGGAGGCCAGATTTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTCAT-AAT---AGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCT---AGTTATGAAAACCTTAGTCACTTTTAGGCCCCTCTTCCTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAGTCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATCATTGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCA-ACGCCATGGTCACCACTGCTCACATTTTTACACGACATGTTTTTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACAGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGGCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGAC-G-TTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCATCTGGCGAGTAAGTATCGCCAGTGGGTAATGCTGATTGATTGACAGAAAACGAGCCGTCATAGTT---GGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTT------AGTAACACTATCATCATGTGA-AAAATAGACCGAGTGAGACTCATTTTGGCACACATTTGAGTTAATCTCATTTCCAGGTTTGGAACCATTTATAGTTTGAATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTT--AAATTATTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAATACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCTCAACGCCGGTTAGCTTGTCCGACTCAATCCTTTCAATACACATGTTAATCTGTTCTAAACTG
gi|6                          : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAATTGATCGAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATAACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT-----------TCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAATCTTCCAAAGTGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTTGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCCCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTTG-A--TTTTTATATGAGATATAAATATC----TGAATT--AGTATCATGAGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGGCAATCA--TCGACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGTTTT-AATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGTATATATGTATATGACGAACT---AATTAAAGATGA-TACGAGTGTCTGGTATAGAACATCAAGTCC--ATTTG
gi|3                          :                                                                      TTTTCAGAGATATCTTCCTTAAA----GGGACTGTCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATT-CATATGCAATGCTATTA-GAATCCC--CATAAACGTTACCACCAAACTTTATTTCATTACCTATTAAATTATTAGATTTGCTTTTTC-TCAA--ATTAATAATTTTACAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCGATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTC-TGTTTACATCTTTTTACAT-AGTTA-AGAAAACAGGATGAAGTCGAGATTCTT--GGCCTACCGTTATTT---ATCCAAGTAGTACGA-GCTTGTTTC-ATTTTGTTATGTAACGAGGATAAGTCGTT-ATT-------CTAGTAGTGTTTTAAAATATTTCTAAACTTTGCCTTCGGGAAACACATATCAGA--AGCTTTCAATAAAGG--GATTACAAGTGTGTCATATAAATTATCAATTTTTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACG-AGCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTACCATAGTCTAC-----TAAATTCTGAGTAGTCGACTTTT-CCCA-TTTAGTTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATACACTCAGACTCAACATGCTGT-----ATAGAGACTGCA-CATACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTACTGCATCGTCATC-TAGAATTTCACATCTTAAC----ACAAGGT--GTTAATGTTCTTCACATATAATTATATAATCTATCAAAGA----T-TCA-TTAA-CAAGATCATATGACAC--ATA-GG---TCGAATTAGCACCAGTACATAGAC-CCAAGGTATTAACAAAAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAA--T-TA--CCTCTTACGTC-AAC-ATTCTTAGTGAA-TTTTCT---AGAGTTAATATGAGTGTTAATGTCTCCCATAA--TC----ATAATTCGACCTTTG--TGCATA-TACATGTTTATTATATGAGATAGTTTTTCAATATAATT---TTTAT--ATCG--------------CTCTACAGAGTAATTACTGCTTGGTAGATATACCTGGAATATGT-ACATATTACA-TTTTGAGAGCATTCATATTGTATACCAATAATTCTGTAATCATA-ACATG--GCAATGGTACAATTTTA------TTACACAATACATTATTCCATAATAAT-GCCACTCCCCCTTTTCGTAC--TGTACACATAAGCGGTGA-ACGCAAGTCATTTTCACATACAGAGTGACTTTTGCATTTACTATCAATTTTATC--T-AAAAAGTACAAATCAGAT-TCACGCA---ACCAATGCTCCGAGATAGCACATA-T-ATCAATATTCTTATCATTTAAAGTATCACACAAATATGAGCTACTTGACAAAATACCAGTAGCGTTCCATGTCATAATGTTTATTGAGTTAG----C------CATTTGGAAGTGTATTCTACTTATT---CATCAACCCCATACAGGTTCAA-------GT--AGGGATTTTAGTCAGTAACATCTG
gi|5                          :                                                                                                                           ATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATTTTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCATGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATC----TGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCA--TCAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-TACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-TCTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGtcctctgatacagtgtttctgtgtcctcacaattactttggttaccacgatttttccatttattctgaaccccacctgatctacgccatctatttgcacacttaagtttagaccgtggcaaccatttgctacattcaataccattaggccaaaaggaggaattttctaccaggtgagcgttaccgtcatcctcaacatttaaccgtatcacagctgagtcaaacttatcgtttctatagacggacacttttgtaacctttggacatcgcttagcaacatatcttgcgataatatcttctgtgattgatggcttaaatcccccaataaacaagctgattggtcgtttacatatatgttcaacaaaatccgactcatcat
gi|2                          :                                                                                                                                                          CCCCAGTGCAT-TGTTAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCGTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATC----TGAATT--AGTATTATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCA--TCAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGTCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-TACTAGTGTCTCGTAT-GAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-TCTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTAACTCAA---GTTGTGGAACACATATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTT-TTG-TT-C-C---ATCATATGAAACGAATG-AG---TT--ACTAGCGCCAGTACACATGT-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTTACC-AAT-GTCCT---TGGA-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTA----------ATAT-AGA-AGTTCT----GATAATT---TATTT--ACCGATTCCTGAAATCTTTTT-AAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGCTTTTTGAATATTCAAAT-GAACACCTTTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGACTGAAACACTGCTAGCGTGTTTA------AAAT---TCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCAGACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATAATCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGATACAGTC--T-AAAAAGAGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTACAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCA---AATTAT----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTC---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATATCTGATCGTGTGTACTGTCTATTATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCCTTTCTGATCGCTGGTTACGGCGATATTTCAATTTATTCCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTCT--TGGAGGCCAGAAGTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTAAT-AAT---AGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCT---AGTTATGAAAACCTTAGTCACTTTAAGGCCCCTCTTTCTGGCA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTCCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGCAGCTTCTTGTTGCTATCAATGCCCGTAAAACGGTCCTGTGACATCGGATTATTTTTACACGACATG----------------TTTTTA---------------TTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAACCATTAACAACAGTTATGTTTGGACAAATATTACCGTCACGTGAAACAATATGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTCGCTGAATAGACGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGAC-G-T
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTATGTGACAAACT---GATTAACGATGG-TACTAGTGTCTCATATAGAACATCAATTCC--AT--------ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCG---------ACATTTTTGTCTAA-TGA----CAAAGTGTACTGTAGAAGAACCTCGTG-GTCG-CTTTTGACCATTTTAG-TCTAGGCTCTGTATCAGAACTAT-TAGTGTTTAACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTGCAGAAAACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACATAGCTATCGTC-AATAAATGCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACACATTTAAGGCATTATCATCCAATA-TTTCACA----TATAATAACATAATCCATA--TGTTCA-ATGACATAACGATATGATCTATTAATGA--TTCATTGTTT-ACC---ATCATAGGAAACAAAGGTAGATTTC--ACT----CTAGTACACGTATCCAAGAAAAT-------------------TATAGTTTTGAATCAATA-CGGTA-CTAAATTAAATGCTTCTATCATCGAGTGGTTTTA--TGAATTTATCTGTA----TCAAGATAAGCATTTATATCGCCCACTATTACAATAATAACACTGTCCCT------GTATTA----------AT----GA-A---CTA---AATCATTACATCTTTCAACATATTCAT-ATAGCTTTGCAAAACAATCATTACTATTTGGGAAACAGACTTGTAAGACATAATATGAAGCCATTTGCTGAACATTCAAATTGGAgctatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatttATTGAATCAATCCTATAAGAAATGTAGGTC----CTTTTTAAAGAGCCAGTGCTCAGAGATACCACTAATATATTTATGGTTTTTTTTTTTAA---ATCACATTAGTACAAACAGCTGGACAAGACGCCAGTGGCATTCCATGTTAATATA-TCT---AACTGTTTCGCAACAGACATTGAGATGT---GTGGGTT-AGTCCACG------------GGGTACCGTTAACTTATAAATGGGTTATtttacagttttttcatcaccaacaggcaatgaagtaattatattggaatgtctattattccatagaattcaaatataatgc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgtttaccttgcagttttaagtcaaaatcagcagttaaatggctactgtacCAGA-A-ATCAACACTATTGTTTCTTCAGATATTACGTGAATAACAGCAACTAGACATAATGCCTATTGAATTCAAGGTTGATATGTTTA---AAGTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACAC-------AT--GTGGGTTGTAGTCCGTGATATCGGACCGctgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaatatacacatgtgggttgtagtccgtgatatcggaccg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cagaaatcaacactattgtttcttcagatattacgtgaataacagcaactagacataatgcctattgaattcaaggttgatatgtttaaagtactgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaataACCCATGGCTTACATGTTACACCACTGG--GCCAGAAATAACGGTCATC-AGTAA---TGTTACGAGGCATTCTCGTCATCTTCAACATTGA----CACGAATTACAACCGAGTTTCCACA----TATTG---GTTCTCTGAAAATTGTTA---CTTTTGTGACTTCTGGGCCACGTTTTGTAATATAATT-------AGTCATTACAGACACTGTAATCGACGACTGAAAACCCCTCACATAGAAGCGCTTTGTACG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCTACCAGGTGAGC-----GT--TAC-CGTCATCCTCAACATTTAACCGTAT-CAC---AGCTGA----GT-CAAACTTATC----GTT-TCT---ATAGACGGACACTTTTGTAACCTTTGGACATCGCTTAGCAACA-TATCTTGCGATAATATCT----TCT--GTGATTGATGGCTTAAATCCCCCAATAAACAAGCTGATTGGTCGTTTAC--ATATATGTTCAACAAAATC-----CGAC-TCATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttcagagatatcttccttaaagggactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccccataaacgttaccaccaaactttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttacaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagcgatcctatgaactcttcgaaattctctgtttacatctttttacatagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattctagtagtgttttaaaatatttctaaactttgccttcgggaaacacatatcagaagctttcaataaagggattacaagtgtgtcatataaattatcaatttttgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgctgtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttactgcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtgttaatgttcttcacatataattatataatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatagacccaaggtattaacaaaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagtgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttattatatgagatagtttttcaatataatttttatatcgctctacagagtaattactgcttggtagatatacctggaatatgtacatattacattttgagagcattcatattgtataccaataattctgtaatcataacatggcaatggtacaattttattacacaatacattattccataataatgccactcccccttttcgtactgtacacataagcggtgaacgcaagtcattttcacatacagagtgacttttgcatttactatcaattttatctaaaaagtacaaatcagattcacgcaaccaatgctccgagatagcacatatatcaatattcttatcatttaaagtatcacacaaatatgagctacttgacaaaataccagtagcgttccatgtcataatgtttattgagttagccatttggaagtgtattctacttattcatcaaccccatacaggttcaagtagggattttagtcagtaacatctgtcctctgatacagtgtttctgtgtcctcacaattactttggttaccacgatttttccatttattctgaaccccacctgatctacgccatctatttgcacacttaagtttagaccgtggcaaccatttgctacattcaataccattaggccaaaaggaggaatttACGTTCCTATTTTGAGTTTTATTCGAAGTAGTCTGCTATAATAGCC-ATCAGGTTTATGTCTATTGGTACGTTATGGAAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTCATTTAACCGGCTTAGCCGAAACTTat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCCGAAACTTTCTT-TTGCTACCAT-ACCCATATAGTGGTCCTGTGGCATTGGAGTATCAGCA-ATGCCATGGTCATCAATGCTGACATTTTTACACGAAATGATT--ATTTTCCTGAACATCA---------TCAAAACGAGCAACAATATCAGGTCTGTTTAACATGTCATTATCAACGATTATGTTTCAACATATATTTACGTCAAGTGAACCATTAGGCATGTGACGATACTGCGAAGCAATCTTAACATTGATTTGTTCAGTCCTTGATGAGGTTCCCAGAC----TATTGGCTGAACAGTCGTGGACAGAACTGCATGGGAATTGCCACGTTGCAAATTGAC-A-TTTTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTACTT---GGCAGTAGCATAACCACGT--CTATGTGAACTTTTAGCCACAGTTACAGTATTATCCTGTGACAAAACA-ACTGAGTGAGTCTCATTTTTGCACGCACTTTAACTAA---CAT---CAGGTCCA----CATTCATATTTTG-ATA-ACGATTTAATGTCTTGTTTCGAATTCCTGTTTGGCTATTTTTCGAAAGAAACTTATTTTCTGTTTGAAAAGT-TTGAT--ATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTtcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcatgggaattgccacgttgcaaattgacattttcataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttaGAAAATGTCAATTTGCAACGTGGCAA-TTCCCAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttagccgaaactttcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcACGTCATGTTGCAACGTGAC-ATTTCCCATataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ccccagtgcattgttatttgttctgcatttctacaaaaacattcaccaaatttcatttcattacctacagaattacacgatttttgccgtcggctgtttataaccttccaaaatgtcatactatcaagttcaagggattcgtcaacttcgcggtttaataacagtaaatattcgtcaatagcgcgtctatgttccctgcgaaaatttgtttttgattttttatatgagatatatgtatctgaattagtattatggggtctaccatttgcgacccaggctttacgacaatcatcaactttacgacggtaattggtcaattttgctgaccagtatgtctttaaataatgcctaaatttagcttttgggatatatgtatgtgacgaactaattaacgatgatactagtgtctcgtatgaacatcaattccattcgtatcaacaatatcaccttgtaataaatgaagcaaatccacattttgatctaaagacaaagtgtactgtagtagaacctcgggagtcgcttttgaccattttagtctaggctctgtatcaaaactattagtgtttaactcaagttgtggaacacatatactacagaacacaggcctatgtgtagacacattaacagagctatcatcaataatttcacaagcattgataagatcagtttgctcttgtgaaataaaaatatgatctattaaagagctttttgttccatcatatgaaacgaatgagttactagcgccagtacacatgtcaagggagttaactgatactagcgtatggttattaattaatgtcagcagtaatagacttctgttaccaatgtccttggattgtttagaagagttgagatgtgcatttacatctcccattaacataactctacccctggttgagtagtaatatagaagttctgataatttatttaccgattcctgaaatctttttaaagaatggttacaactgggtaagtaaacttgtaagatatacataaaacagctttttgaatattcaaatgaacaccttttattctatcgtcctctatttgaaggactgaaacactgctagcgtgtttaaaattccataagatagctaccccacccttacgtacgttgcagacaccggggaagcgcaagtcataatcacatacagcatgacatttatatttgctatcgatacagtctaaaaagagtaaatcgatctctctaagccagtgctcagagataccgcaaaaatcaatgctcttggcatttaatatatcacataaatatgtacagctggacatgattccagttgcattccatgttaaaatgttcaaattatcaatcattaaaaagtttctcagtcggggtacagatatgggttatagtccgtaatatctgatcgtgtgtactgtctattatagtacactcttgacgtgcgttgactaggatcataattcctttctgatcgctggttacggcgatatttcaatttattccttgttacccaaggcctgcatgttactcttggaggccagaagttcgggtcatctagcagagcggaatactcatcatcctcaacatttagcttaataatagctgacccgtatcgcaagtttctagttatgaaaaccttagtcactttaaggcccctctttctggcaaattcagcaatctttgtctcggtgatcgacggcttgaagcccccaatatagaaactttttgtccgatttctgatatatgtcgtaaaatcatcgtcgacatcatccgtttccatgtccctattttgagttttaggcgaagtactaaatttcctatccggtttatgtctataattcgttatagtaggtatgtactgtgatttagccggcctagcagaaacctcagcatagctatcagaaatacgcgccggcagcttcttgttgctatcaatgcccgtaaaacggtcctgtgacatcggattatttttacacgacatgtttttatttacctggacatcagcggtatagttaaaacgattcacattatcaccgctatttaacaaaccattaacaacagttatgtttggacaaatattaccgtcacgtgaaacaatatgcatgggacgatgctgcgaagcagtctcaacgttgatttgttcaattcttgatgacgtttccagacagacgactcgctgaatagacgtagacagagctgcCATAGCTATCGTCAATAA-ATG--CACGCTATTGTGTGAACTTTT------TGTAACA-TATCATCCTTTGT-AAAAGCAACCAAGCGA--CTCATTT-GGCACAT-CTTGAGTTGATATCATCTCCAGATTTGAAACCATTTATAATTTGGTTACCCGATTTAATATATTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAATTAGTTTTATGTTT--AAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAA
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): AAAACCACTTACTGTTCATTTCAGCACCCTGATCTAGTTCGCGATTAACTAGTTTTGAATAGTTTCCAACAGCTATCCTGTGAATTTTTTGAAATTCTCATTCTGCATTTTCATAGTTATCAAATGATGACAAAGTCGAGATTCTTGGCCAACCCTTACCTTTCCAAAAAGTGTGAGCTTGTTTCATTTTGTTATGTACGAAGTCAAGTCGTTAATCCAGTAGGGTTTGAAGAATTTTCTTAATTTTGCCTTCAGAATACACGTATCAAAGCCTTCAAGAAAGTGATTACAAATGCGTCGTAAAACTTAATTAATTTGTAATTAATAGACAGTGGCAGTCGCAGTTAAATTCCTGGTCACTATATCATTGTTCAACATTTTACTACAACGTGTCAGACTCCGAGTGGTCAACTTTTCCAATTTAATTCTTGGTACTGAATAATATGAGATACATTCATGCTCAAGATGAGGTGCAGATGTGTAGAGACTATACATACAAGTCGTCTATGCGCGGACACGATAACCGCATCGCCATCTATAATTTCAC
Unaligned ( gi|14 ): GTGGTTTGGCACGTTTAAGACAGTGTTGTCCACAGTTTCATATTTAACAACACAATCTCGTATGGTCATTTGGTAAAGTGAAATTAGTTATAATAATTGTTTTTACCACTATAGGAAACAAACATATAGTTCGCTCCTGTATGTATATCCGATGGATTTATAG
Unaligned ( gi|15 ): AAATTCCTGAGCACTATATCATTATCTGACATACTACTATAGTCTACAAGATTCTGAGTAGTCGACTTTTAGTTCTTTGTACTGGATAATGTGGGATAAACTCAGGCCCAATGTG
Unaligned ( gi|16 ): ACAACGTTTAAATGTTATTCACGCATATTTATATGTTCTATCAAATATTCATTACCAGGATTATATGACATATAGATCGAATTAGCACCAGTACATAGACTCAAAGTACTAATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                            333              1     444444                                    11                                                        11                                        111                                                                                                                                                 222222                    11                  111                              11       22222222                                                                                       111                                                                                        222222222                  1111                                 1                 1                          111      1      111                        3333333333   111    111                                            33333333333       33   11                11                 33333333333333333333333           11      2222222                     1            888888888888           333        3     1    11    11             111     11111     11   222                                22222222               888888888888888888888  111   1      333333      111     11       6666666666666         11                                   1                                                      11  222222                             888888888888         2                                   333                                                             111               11          111                        111                                                                                        2222222    111           111    666666666666666666666666        2222222  11                    3333333     11                  1                                         22222          2222    1       1      1  1     22222222                             222                             44444444444    222                      1  3333           3333333333333     3333  1   33333333333333                                 1   333333333       44444444444                                                            33                                                            55555   2                        2                 99999999999                                                                                  1                                      2        1111111111111              2222222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               3333              33                     5555555      1            22    11          11                                           1                                                                                      33     1                                                                                                                                       
lowQualScore                  :        2                           4    2            3                     777      1 0     2     111111  1    3333 1                  2    33       1              8      8      0       0           11                              1         444                              2                                                                                              8      8 88         333333    0   1 6         11                  444                      8 3   2 11 9     99999999                 0                      0                                              111             6                             99   1 1  55            0           0        666666666       22     6   4444  0        2   1   3       88    3     55          3             6    1   6   111    2 6      444       66    1          0000000000   444    444                1  6 2         6            55555555555       22   33      44   1    00                 44444444444444444444444        0  33   8  3333333   0  1         2    0          3 222222222222 0         333  77  2 0 4 1 0    33 44 33     1  2    888     88888     11   666 2          4  2                22222222               999999999999999999999  000   0 2    222222      777 1   33    3  3333333333333   3     33  1     4   3        1             0          6    1            3  444   22 1     4     1 00  666666  3  1 1 777   1 99999999    777777777777         3   7  0     1     1     6     1    777   1   6          22           0    1   11            88     777               22  2       777                        222             0 1     8              4 1           1   3     1              1   0   0    3333333    777    1      777    444444444444444444444444        6666666  11                    2222222     33        7         3     7    6   7        6         7 7     77777          8888    3       3      3  3     88888888            1              1 000 2 3        0 333       3    00000000000  2 555   3                  0  5555  3     2  0000000000000     7777  0   00000000000000     4  1           1 2   33     0   777777777       22222222222                 1                 1     1  1  1 7          00 0      7        7             0  0                22       00000   3   22  7   1            3 11 1      0 1   22222222222     0    1                1                                  11 1      6      0  4        1            0       1    22  3   1    2222222222222       7      9999999      1           6         0       222   1     333  0       1       1    0         6    1     22     1     1  1  1     1                                      0 0        1   0      7   1   1      0  1   0                                 9    1   6                         4           2          2     4     4    4            4  3   0  8888 0 1      6   00     7               5555555  1   5         1  44    55       0  44       88    0 7   1  0 0    8888       11 2       0   1   6 1  77           1         1     0    0 22                1     1     00   1 2  1  7                                            4                        4                    2                         4         2  
lowQualScore                  :        .                           .    .            .                     ...      . .     .     ......  .    .... .                  .    ..       .              .      .      .       .           ..                              .         ...                              .                                                                                              .      . ..         ......    .   . .         ..                  ...                      . .   . .. .     ........                 .                      .                                              ...             .                             ..   . .  ..            .           .        .........       ..     .   ....  .        .   .   .       ..    .     ..          .             .    .   .   ...    . .      ...       ..    .          ..........   ...    ...                .  . .         .            ...........       ..   ..      ..   .    ..                 .......................        .  ..   .  .......   .  .         .    .          . ............ .         ...  ..  . . . . .    .. .. ..     .  .    ...     .....     ..   ... .          .  .                ........               .....................  ...   . .    ......      ... .   ..    .  .............   .     ..  .     .   .        .             .          .    .            .  ...   .. .     .     . ..  ......  .  . . ...   . ........    ............         .   .  .     .     .     .     .    ...   .   .          ..           .    .   ..            ..     ...               ..  .       ...                        ...             . .     .              . .           .   .     .              .   .   .    .......    ...    .      ...    ........................        .......  ..                    .......     ..        .         .     .    .   .        .         . .     .....          ....    .       .      .  .     ........            .              . ... . .        . ...       .    ...........  . ...   .                  .  ....  .     .  .............     ....  .   ..............     .  .           . .   ..     .   .........       ...........                 .                 .     .  .  . .          .. .      .        .             .  .                ..       .....   .   ..  .   .            . .. .      . .   ...........     .    .                .                                  .. .      .      .  .        .            .       .    ..  .   .    .............       .      .......      .           .         .       ...   .     ...  .       .       .    .         .    .     ..     .     .  .  .     .                                      . .        .   .      .   .   .      .  .   .                                 .    .   .                         .           .          .     .     .    .            .  .   .  .... . .      .   ..     .               .......  .   .         .  ..    ..       .  ..       ..    . .   .  . .    ....       .. .       .   .   . .  ..           .         .     .    . ..                .     .     ..   . .  .  .                                            .                        .                    .                         .         .  
lowQualScore                  :        5                           0    5            0                     000      0 7     0     777777  0    7777 0                  5    88       2              0      0      8       8           00                              0         000                              8                                                                                              0      0 88         000000    8   0 0         00                  000                      0 8   8 00 6     00000000                 8                      8                                              777             7                             22   0 0  66            8           8        777777777       77     7   2222  3        5   8   5       33    3     77          3             7    0   7   777    2 0      000       22    0          8888888888   000    000                0  3 5         7            88888888888       55   88      22   0    88                 88888888888888888888888        6  88   0  4444444   8  4         0    0          2 000000000000 2         222  55  0 0 2 0 0    88 22 88     0  0    000     55555     00   000 5          0  0                55555555               000000000000000000000  222   0 5    222222      555 0   88    2  0000000000000   0     22  0     0   0        0             0          5    0            2  555   00 0     2     0 88  000000  2  0 0 888   0 88888888    000000000000         7   3  7     0     0     7     0    333   0   7          00           7    0   33            00     555               55  5       555                        222             6 0     8              6 4           0   2     0              0   8   8    2222222    555    0      555    000000000000000000000000        0000000  00                    5555555     88        3         3     3    7   3        7         3 3     77777          3333    3       3      3  3     77777777            0              0 000 5 2        2 000       2    00000000000  5 888   2                  0  2222  5     0  8888888888888     5555  0   22222222222222     0  0           0 5   88     0   555555555       22222222222                 0                 0     0  0  0 3          33 7      3        3             7  7                00       77777   7   00  3   0            7 33 0      7 0   33333333333     7    0                0                                  77 0      7      7  0        0            7       0    00  3   0    7777777777777       3      3333333      0           7         7       777   0     000  7       0       0    7         7    0     00     0     0  0  0     0                                      7 7        0   7      3   0   0      7  0   7                                 0    0   0                         0           5          5     0     0    0            0  0   7  3333 7 0      7   33     3               0000000  0   0         0  33    00       7  33       33    7 3   0  7 7    3333       33 3       7   0   7 0  77           0         0     7    7 00                0     0     33   0 0  0  3                                            0                        0                    5                         0         5  
consensus                     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATTT---TTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATAT------GAGATATATGTATCTGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGA-CAATCAT--CAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTA-CC---A---TCATATGAAACGAATG-AG---TCGAACTAGCGCCAGTACACATGTC-AAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATT-AATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAAC--GTCCT-T---GGATTN-TCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTA----------ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TNTTT--ACCGATTCC---TGAAAT-CTTTTCAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAA---ATTATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCA-------G---AGCGNAATACTCGTCATCCTCAACATTTA-GCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCT---AGTTACGAAA-ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AAT-TCAGC---AATCTTTGT-----CTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATCA-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCA-ACGCCATGGTCACCA-TGCT-ACATTTTTACACGA-ATG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTAG---TCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTA------GTAACA-TATCATCCTGTGA-AAAA-CGACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATCTCCAGGTTCGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTT--AAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
Reference ( family-2464 )     : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCAGAGATGTCTNCCTTAAACTTTGGGACTGTCANAGTTNNGNTNATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATNACACGATTT---TTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATAT------GAGATATANGTATCTGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGA-CAATCGT--CGACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTNATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ANACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTNACGGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AACA-TGACAAGATC-GTT--TGTTCTTNTGANATAACGATATGATCTATTAAAGA--TT--TTCGTTA-C----A---TCATATGAAACGAATG-AG---TC--ACTAGCGCCAGTACACGTATC-AAGGGAATTAACGAA---TA----GCGTATAGTTA-T-AATCAACG-CGGNA-GTAA--TANA--CTTCTNTCGTCAAC--GTTCT-T---GAATTN-TCT-GAAGAGTTAAGATGAGCGTTTATATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTG--TG-GTA-TA----------ATAT-AGA-AGTTCT-N----ATAATT---TNTTT--ACCGATT-C---TAA----CTTTTCAAAG-AATNATTACTACTTGGTAAATANACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTNTGAACATTCAAATTGNACACCNNTNATTCTGTCGTCNTNTAC-----NTGAAGNANTGGNACANTNCTAGCGTGTTTACACAATANATTATTCCATAATGATAGCCACCCCNCCCTTNCGTACGTTGCANACACAAGCGGNGAAGCGCAAGTCATNNTCACATACAGCGTGACNTTTGCATTTGCTATCGATTCAATC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCNTTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACANGATGCCAGTNGCATTCCATGTTAANATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTNAGAAGT---TTCTNCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCACTGGAGGCCAGAAGTNNNGGTCATCTAGCA-------G---AGCGG-ATACTCGTCATCCTCAACATTTA-GC-CN-ATAATAGCCGA----CC-CG----TATCG---GTT-TCT---ANTTACG-AA-ACTTTTGTNACTTTTGGGCCNCGCTTTGTAACA-AAT-TC-GC---AATCTTTGT-----CTC-GTGATCGACGGCTTAAANCCCCCAATATAGAAGCTNTTTGTNCGNTTNCTGATATATGTCCAGCAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTCCCTATTTTGAGTTTTANNCGAAGTAGTCTGCTATAATNNCCTATCNGGTTTATGTCTATTGGTNCGTTATGGNAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTNATTTAGCCGGCCTAGCNGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGNANCTTCTTGTTGCTACCANTGCCCGTANAGCGGTCCTGTGGCATCGGANTATCNNCACACGNCATGGTCATCAATGCTGACATTTTTACACGAAATG--ATTATTTNCCTGGACATCAGCGGTATAGTCAAAACGANCNACANTATCANNNCTGTTTAACANGCCATTANCAACGGTTATGTTTCGACANATATTNNCGTCANGTGAANCANTANGCATGNGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAGTCCTTGATGANGTTCCCAGACAGACNACTNGCTGAACAGNCGTGGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACGTGACATTCCCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTANCTATCGNCAGTAGCATGACCACGCTACTGTGTGAACTTTTAGCCACNGTNACAGTATCATCCTNTGNCAAAANNAACCGAGCGAGTCTCATTTTNGCACGCACTTNAGCTGATATCATCTCCAGGTCCGAAACCATTCATANTTTGGNTACNCGATTTAATGTNTTGTCTCGANTTCCTGTTTGGCNNCTTTTCGAGAGAAACTNGTTTTNTGTTTGAAAANTGTTNATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAA
gi|1                          : GACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAATTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAGTTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATTT---TTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTTGTCAACTTCGCGGTTTAGTAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATAT------GAGATATATGAATCTGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCAACCCAGGCTTTACGA-CGATCAT--CAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTAA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTTA-C----A---TCATATGAAACGAATG-AG---TT--ACTAGCGCCAGTATACATGTC-AAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATT-AATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAAT--GTCCT-T---GGATTG-TTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTA----------ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TATTT--ACCGATTCC---TGAAATCTTTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACATTGCTAGCGGGTTTA-AC--------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGACGCGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGAAACAGTC---AAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTG---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGACTATT-ATTGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGTTTCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-AACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---TCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGATTTTCGGGTCATCTAGCA-------G---AGCGGAATACTCATCATCCTCAACATTTA-GCTTC-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCT---AGTTATGAAA-ACCTTAGTCACTTTTAGGCCCCTCTTCCTGACA-AAT-TCAGC---AATCTTTGT-----CTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAGTCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATCATTGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCA-ACGCCATGGTCACCACTGCTCACATTTTTACACGACATGTTTTTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACAGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGGCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCATCTGGCGAGTAAGTATCGCCAGTGGGTAATGCTGATTGATTGACAGAAAACGAGCCGTCATAG---TTGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTA------GTAACACTATCATCATGTGA-AAAATAGACCGAGTGAGACTCATTTTGGCACACATTTGAGTTAATCTCATTTCCAGGTTTGGAACCATTTATAGTTTGAATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTT--AAATTATTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAATACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCTCAACGCCGGTTAGCTTGTCCGACTCAATCCTTTCAATACACATGTTAATCTGTTCTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTATGTGACAAACT---GATTAACGATGGT-ACTAGTGTCTCATATAGAACATCAATTCC--AT--------ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCG---------ACATTTTTGTCTAA-TGA----CAAAGTGTACTGTAGAAGAACCTCGTG--GTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAGAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTGCAGA--------AAACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACATAGCTATCGTC-AATAAATGCACctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTGAATCAATCCTATAAGAAATGTAGGTC----CTTTTTAAAGAGCCAGTGCTCAGAGATACCACTAATATATTTATGGTTTTTTTTTTTAA---ATCACATTAGTACAAACAGCTGGACAAGACGCCAGTGGCATTCCATGTTAATATA-TCTAACTG--TTTCGCAACAGACATTGAGATGT---GTGGGTT-AGTCCACG------------GGGTACCGTTAACTTATAAATGGGTTATgctatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgtttaccttgcagttttaagtcaaaatcagcagttaaatggctactgtacACCCATGGCTTACATGTTACACCACTGG--GCCAGAAATAACGGTCATC-AGTAATGTTACG---AG-GC-ATTCTCGTCATCTTCAACATTGACAC-GA-ATTACAACCGAGTTTCCACA----TATTG---GTTCTCTGAAAATT--G-TT-ACTTTTGTGACTTCTGGGCCACGTTTTGTAATATAAT-T-------AGTCATTACAGACACT--GTAATCGACGACTGAAAACCCCTCACATAGAAGCGCTTTGTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGA-A-ATCAACACTATTGTTTCTTCAGATATTACGTGAATAACAGCAACTAGACATAATGCCTATTGAATTCAAGGTTGATATGTTTAAAGTA--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TACAC-------AT--GTGGGTTGTAGTCCGTGATA-------TCGGA--CCGctgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaatatacacatgtgggttgtagtccgtgatatcggaccg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cagaaatcaacactattgtttcttcagatattacgtgaataacagcaactagacataatgcctattgaattcaaggttgatatgtttaaagtactgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaataATATGTTCTATCAAATA--TT----CATTA-CCAGGA---TTATATGACAT--ATA-GA---TCGAATTAGCACCAGTACA
gi|2                          :                                                                                                                            acaacgtttaaatgttattcacgcatatttCCCCAGTGCAT-TGTTAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATTT---TTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCGTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATAT------GAGATATATGTATCTGAATT--AGTATTATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGA-CAATCAT--CAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGTCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTAT-GAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACATATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTTC-C----A---TCATATGAAACGAATG-AG---TT--ACTAGCGCCAGTACACATGTC-AAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATT-AATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTTACCAAT--GTCCT-T---GGATTG-TTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTA----------ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TATTT--ACCGATTCC---TGAAAT-CTTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGCTTTTTGAATATTCAAA-TGAACACCTTTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACACTGCTAGCGTGTTTA---AA------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCAGACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATAATCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGATACAGTC---TAAAAAGAGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTACAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTC---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGAAGTTCGGGTCATCTAGCA-------G---AGCGGAATACTCATCATCCTCAACATTTA-GCTTA-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCT---AGTTATGAAA-ACCTTAGTCACTTTAAGGCCCCTCTTTCTGGCA-AAT-TCAGC---AATCTTTGT-----CTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTCCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGCAGCTTCTTGTTGCTATCAATGCCCGTAAAACGGTCCTGTGACATCGGATTATTTTTACACGACATG----------------TTTT---------------TATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAACCATTAACAACAGTTATGTTTGGACAAATATTACCGTCACGTGAAACAATATGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTCGCTGAATAGACGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTtagactcaaagtactaata
gi|3                          :                                                                      TTTTCAGAGATATCTTCCTTAAA----GGGACTGTCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATT-CATATGCAATGCTATTA-GAATCCC--CATAAACGTTACCACCAAACTTTATTTCATTACCTATTAAATTATTAGATTTGCTTTTTC-TCAA--ATTAATAATTTTACAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCGATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTC-TGTTTACATCTTTTTACATAGTTAAGAAA-ACAGG-AT--GAAGTCGAGATTCTTGG--CCTACCGTTATTT---ATCCAAGTAGTACGAGC--TTGTTTC-ATTTTGTTATGTAACGAGGATAAGTCGTTA---TT-----CTAGTAGTGTTTTAAAATATTTCTAAACTTTGCCTTCGGGAAACACATATCAGA--AGCTTTCAATAAAGG--GATTACAAGTGTGTCATATAAATTATCAATTTTTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGT-AGTCGACTTTTC-CCATTT-AGTTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA----CACTCAGACTCAACATGCTGT-----ATAGAGACTGCACA---------TACAATTGGTC---TATGAGTTGAAACATTTACTGCATCGTCATC-TAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGT--GTTAATGTTCTTCACATATAATTATATAATCTATCAAAGA--TT----CATTAAC----AAGATCATATGACAC--ATA-GG---TCGAATTAGCACCAGTACATAGACC-CAAGGTATTAACAAAAAGTAAATTGTGTACATTTA---AA--AACGACTGAATGCAA--T-TA--CCTCTTACGTCAAC--ATTCT-TAGTGAATTT-TCT---AGAGTTAATATGAGTGTTAATGTCTCCCATAA--TC----ATAATTCGACCTTTG--TGCATA-TACATGTTTATTATATGAGATAGTTTT-TCAATATAATT---TTTAT--ATCG-CT-C---TA----------CAGAG---TAATTACTGCTTGGTAGATATACCTGGAATATGT-ACATATTACA-TTTTGAGAGCATTCATATTGTATACCAATAATTCTGTAATCATA-AC-----ATG--GCAATGGTACAATTTTA------TTACACAATACATTATTCCATAATAAT-GCCACTCCCCCTTTTCGTAC--TGTACACATAAGCGGTGAA-CGCAAGTCATTTTCACATACAGAGTGACTTTTGCATTTACTATCAATTTTATC---TAAAAAGTACAAATCAGAT-TCACGCA---ACCAATGCTCCGAGATAGCACATA-T-ATCAATATTCTTATCATTTAAAGTATCACACAAATATGAGCTACTTGACAAAATACCAGTAGCGTTCCATGTCATAATGTTTA--TTGAGT----TAGC---CATTTGGAAGTGTATTCTACTTATT---CATCAACCCCATACAGGTTCAA-------GT--AGGGATTTTAGTCAGTAACATCTGTCCTCTGATACAGTGTTT-CTGTGTCCTCACAAT-TACT-TTG------GTT-ACCACGATT-T--TTCCATTTATTCTGAACCCCACCTGATCTACGCCATCTATTTGCACACTTAAGTTTAGACCGTGGCAACCATTTGCTACATTCAATACCATT--AGGCCAAAAGGAGGAATTTTCTACCA-------GGTGAGCGT--TAC-CGTCATCCTCAACATTTA-AC-CGTATCACAGCTGA----GT-CAAACTTATCG----TT-TCT---ATAGACG-GACACTTTTGTAACCTTTGGACATCGCTTAGCAACA-TATCTT-GCGATAATATCT-T-----CT--GTGATTGATGGCTTAAATCCCCCAATAAACAAGCTGATTGGTCGTTTAC--ATATATGTTCAACAAAATC-----CGAC-TCATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTTCCTATTTTGAGTTTTATTCGAAGTAGTCTGCTATAATAGCC-ATCAGGTTTATGTCTATTGGTACGTTATGGAAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTCATTTAACCGGCTTAGCCGAAACTTat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCCGAAACTTTCTT-TTGCTACCA-TACCCATATAGTGGTCCTGTGGCATTGGAGTATCAGCA-ATGCCATGGTCATCAATGCTGACATTTTTACACGAAATG--ATTATTTTCCTGAACATCA---------TCAAAACGAGCAACAATATCAGGTCTGTTTAACATGTCATTATCAACGATTATGTTTCAACATATATTTACGTCAAGTGAACCATTAGGCATGTGACGATACTGCGAAGCAATCTTAACATTGATTTGTTCAGTCCTTGATGAGGTTCCCAGAC----TATTGGCTGAACAGTCGTGGACAGAACTGCATGGGAATTGCCACGTTGCAAATTGACATTTTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTAC---TTGGCAGTAGCATAACCACGT--CTATGTGAACTTTTAGCCACAGTTACAGTATTATCCTGTGACAAAA-CAACTGAGTGAGTCTCATTTTTGCACGCACTTTAACTAACAT------CAGGTCCA----CATTCATATTTT-GATA-ACGATTTAATGTCTTGTTTCGAATTCCTGTTTGGCTATTTTTCGAAAGAAACTTATTTTCTGTTTGAAAAGT-TTGAT--ATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTtcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcatgggaattgccacgttgcaaattgacattttcataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|5                          :       acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttaATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATTT---TTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATTTTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCATGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATAT------GAGATATATGTATCTGAATT--AGTATCATGGGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGA-CAATCAT--CAACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---
gi|6                          : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAATTGATCGAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATAACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT-----------TCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATTT---TTGCCGTCGGCTGTTTATAATCTTCCAAAGTGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTTGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCCCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTTG-A--TTTTTATAT------GAGATATAAATATCTGAATT--AGTATCATGAGGTCTACC---ATTTGCGACCCAGGCTTTACGG-CAATCAT--CGACTTT--------ACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGTTTT-AATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGTATATATGTATATGACGAACT---AATTAAAGATGAT-ACGAGTGTCTGGTATAGAACATCAAGTCC--ATTTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCA---------ACATTTTA--CTA---------CAACGTGT-------CAGA-CTCCGAGTGGTCAACTTTT--CCAATTTAATTCTTGGTACTGAAT---AA-TAT-GAGATACATTCATGCTCAA---GATGAGG--TGCAGATG-TGTAGAGACTATACATACA---AGTCGTCTATGCGCGGACACGATAACCGCATCGCCATC-TATAATTTCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaaccacttactgttcatttcagcaccctgatctagttcgcgattaactagttttgaatagtttccaacagctatcctgtgaattttttgaaattctcattctgcattttcatagttatcaaatgatgacaaagtcgagattcttggccaacccttacctttccaaaaagtgtgagcttgtttcattttgttatgtacgaagtcaagtcgttaatccagtagggtttgaagaattttcttaattttgccttcagaatacacgtatcaaagccttcaagaaagtgattacaaatgcgtcgtaaaacttaattaatttgtaattaatagacagtggcagtcgcagttaaattcctggtcactatatcattgtGACACATTTAAGGCATTATCATCCAATA-TTTCACA----TATAATAACATAATCCATA--TGTTCA-ATGACATAACGATATGATCTATTAATGA--TTCATTGTTTA-CC---A---TCATAGGAAACAAAGGTAGATTTC--ACT----CTAGTACACGTATCCAAGAAAATTA-------------------TAGTTT-TGAATCAATA-CGGTA-CTAAATTAAATGCTTCTATCATCGAGTGGTTTTAT---GAATTTATCT-GTA---TCAAGATAAGCATTTATATCGCCCACTATTACAATAATAACACTGTCCCTG--T--AT--TA----------AT----GA-A---CTAA----ATCATTACATCTTTCAACATATT-CATATAG----CTTTGCAAAACAATCATTACTATTTGGGAAACAGACTTGTAAGACATAATATGAAGCCATTTGCTGAACATTCAAATTGG--ATTTACAGTTTTTTCATCACCAACAGGCAATGAAGTAAT--TATATTG---GAATGTCT---------ATTATTCCATA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatttCATAGCTATCGTCAATAA-ATG--CACGCTATTGTGTGAACTTTT------TGTAACA-TATCATCCTTTGT-AAAAGCAACCAAGCGA--CTCATTT-GGCACAT-CTTGAGTTGATATCATCTCCAGATTTGAAACCATTTATAATTTGGTTACCCGATTTAATATATTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAATTAGTTTTATGTTT--AAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAAgaattcaaatataatgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): GTGGTTTGGCACGTTTAAGACAGTGTTGTCCACAGTTTCATATTTAACAACACAATCTCGTATGGTCATTTGGTAAAGTGAAATTAGTTATAATAATTGTTTTTACCACTATAGGAAACAAACATATAGTTCGCTCCTGTATGTATATCCGATGGATTTATAG
Unaligned ( gi|15 ): AAATTCCTGAGCACTATATCATTATCTGACATACTACTATAGTCTACAAGATTCTGAGTAGTCGACTTTTAGTTCTTTGTACTGGATAATGTGGGATAAACTCAGGCCCAATGTG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                            222              1     11  11                                    11                                                        11                                       111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111                                                                                        222222222                  1111                                 1                 1                          111      1      111                        3333333333   111    111                                            2222                   11                                   333333          222           11      111                 111111         11          2222                           1    11    11             111     1   11111         222                             22222222              111      333333333333  111   1      333333      111     11                1   11    1                                    1                                                          222222                             777777777777         1                                   222                                                             111               11          111                        111                                                                                        2222222    111           111    666666666666666666666666        2222222  11                    3333333     11                  1                                         22222          2222    1       1      1  1     22222222                             11  11                           22222222222222                         2222           3333333333333    1111   1   111111    222222                                 1    2222222       2222                                                                 11                                                            33333   1                        1                 66666666666                                                                                 111                                                  1  444444        66666666666666                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11                            5555555            111     11         33                                     1111111                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :        1                           1    1            1                     333              2     88  88                               2    33       1              8      8      0       0           11                              1        444                                                                                                                              8      8 88                                                                                                                           0                                              111             6                             99   1 1  55            0           0        666666666       22     6   4444  0        2   1   3       88    3     55          3             6    1   6   111    1 6      444       66    1          1111111111   444    444                   1 2         6            1111    9 0       55   33      33   1    22                 777777  22  55  888        0  33 22   222      1          555555   3     11  22 1 2  1111 0         66  44    9 4 0 0    33 33 33     0       888     0   88888  1      111         1  2                22222222              444  3   000000000000  000   0 2    111111      777 1   33    3   2 999 3 0   33    0   0     1   1        1             0          6    0            3  444    1 1     1     1  9  666666  3  1 1 444   1  8888888    000000000000         0   7                    6          333       6           1           0                      22     777               22  2       777                        222             0 1     8              4 1           1   1     1              1   0   0    3333333    777    1      777    111111111111111111111111        6666666  11                    2222222     33        7         3     7    6   7        6         7 7     77777          8888    3       3      3  3     88888888            1              1 88  11         0 22        3     44444444444444    3                  6 8888  1        0000000000000    7777   0   333333    888888     1  1           0 1   66     0    0000000       0000   55                 0                 0     0       7          88        7        7             0                            33333   3       7                3                 33333333333                                                                        6        777                                  7    3     6    2  555555        00000000000000                  6                                                       0                                                                                                          7                 1                                                                        1           1          1     1     1    1            1  1      2 0        6   88     7                      6666666            777     44      0  33       7     0 7                3    9999999           1   6    6                                                                           7                                             1                        1                    1                         1         1  
lowQualScore                  :        .                           .    .            .                     ...              .     ..  ..                               .    ..       .              .      .      .       .           ..                              .        ...                                                                                                                              .      . ..                                                                                                                           .                                              ...             .                             ..   . .  ..            .           .        .........       ..     .   ....  .        .   .   .       ..    .     ..          .             .    .   .   ...    . .      ...       ..    .          ..........   ...    ...                   . .         .            ....    . .       ..   ..      ..   .    ..                 ......  ..  ..  ...        .  .. ..   ...      .          ......   .     ..  .. . .  .... .         ..  ..    . . . .    .. .. ..     .       ...     .   .....  .      ...         .  .                ........              ...  .   ............  ...   . .    ......      ... .   ..    .   . ... . .   ..    .   .     .   .        .             .          .    .            .  ...    . .     .     .  .  ......  .  . . ...   .  .......    ............         .   .                    .          ...       .           .           .                      ..     ...               ..  .       ...                        ...             . .     .              . .           .   .     .              .   .   .    .......    ...    .      ...    ........................        .......  ..                    .......     ..        .         .     .    .   .        .         . .     .....          ....    .       .      .  .     ........            .              . ..  ..         . ..        .     ..............    .                  . ....  .        .............    ....   .   ......    ......     .  .           . .   ..     .    .......       ....   ..                 .                 .     .       .          ..        .        .             .                            .....   .       .                .                 ...........                                                                        .        ...                                  .    .     .    .  ......        ..............                  .                                                       .                                                                                                          .                 .                                                                        .           .          .     .     .    .            .  .      . .        .   ..     .                      .......            ...     ..      .  ..       .     . .                .    .......           .   .    .                                                                           .                                             .                        .                    .                         .         .  
lowQualScore                  :        0                           0    0            0                     333              0     33  33                               5    88       2              0      0      8       8           00                              4        000                                                                                                                              0      0 88                                                                                                                           8                                              777             7                             22   0 0  66            8           8        777777777       77     7   2222  3        5   8   5       33    3     77          3             7    0   7   777    4 0      000       22    0          2222222222   000    000                   0 5         7            2222    8 2       55   88      55   0    22                 222222  88  88  000        6  88 22   000      4          000000   2     22  44 0 5  2222 2         22  00    8 2 2 0    88 55 88     2       000     0   55555  0      000         0  0                55555555              222  0   888888888888  222   0 5    555555      555 0   88    2   5 222 0 0   55    0   2     0   0        2             0          5    8            2  888    2 0     2     0  8  000000  2  0 0 222   2  8888888    000000000000         0   3                    7          333       7           0           7                      00     555               55  5       555                        222             6 4     8              6 4           4   0     0              4   8   8    2222222    555    2      555    000000000000000000000000        0000000  00                    5555555     88        3         3     3    7   3        7         3 3     77777          3333    3       3      3  3     77777777            0              0 00  22         2 00        2     22222222222222    2                  5 0000  0        8888888888888    2222   0   555555    888888     0  0           2 0   88     0    0000000       0000   00                 2                 8     2       3          33        3        3             7                            33333   3       3                3                 33333333333                                                                        7        777                                  3    7     7    0  000000        00000000000000                  7                                                       7                                                                                                          3                 0                                                                        0           0          0     0     0    0            0  0      5 7        7   33     3                      7777777            777     00      7  33       3     7 3                7    3333333           0   7    7                                                                           3                                             0                        0                    0                         0         0  
consensus                     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA-GATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--A--ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TNTTT--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACA----ATTATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AG---CGGA--ATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-CGCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
Reference ( family-2464 )     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA---TCATATGAAACGAATGAGTCGAACTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTNTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--A--ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TNTTT--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTCAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAA---ATTATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AG---CGNA--ATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-TGCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTAGTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATCTCCAGGTTCGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
gi|1                          : GACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAATTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAGTTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTTGTCAACTTCGCGGTTTAGTAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGAATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCAACCCAGGCTTTACGACGATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTAA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTTA-CA---TCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTATACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--TGTCCT-TGG---A-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--A--ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TATTT--ACCGATTCCTGAAATCTTTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACATTGCTAGCGGGTTTA-AC--------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGACGCGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGAAACAGTC---AAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTG---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGACTATT-ATTGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGTTTCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-AACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---TCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGATTTTCGGGTCATCTAGCAG---AG---CGGA--ATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTC-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTTAGGCCCCTCTTCCTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAGTCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-ATTGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCACTGCTCACATTTTTACACGACA-TGTTTTTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACAGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGGCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCATCTGGCGAGTAAGTATCGCCAGTGGGTAATGCTGATTGATTGACAGAAAACGAGCCGTCATAGTTGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACAC------TATCATCATGTG-A-AAAATAGACCGAGTGAGACTCATTTTGGCACACATTTGAGTTAATCTCATTTCCAGGTTTGGAACCATTTATAGTTTGAATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTATTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAATACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCTCAACGCCGGTTAGCTTGTCCGACTCAATCCTTTCAATACACATGTTAATCTGTTCTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTATGTGACAAACT---GATTAACGATGGT-ACTAGTGTCTCATATAGAACATCAATTCC--AT--------ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCG---------ACATTTTTGTCTAA-TGA----CAAAGTGTACTGTAGAAGAACCTCGTG--GTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAGAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTGCAGA--------AAACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACATAGCTATCGTC-AATAAATGCACctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGAATCAATCCTATAAGAAATGTAGGTC----CTTTTTAAAGAGCCAGTGCTCAGAGATACCACTAATATATTTATGGTTTTTTTTTTTAA---ATCACATTAGTACAAACAGCTGGACAAGACGCCAGTGGCATTCCATGTTAATATA-TCTAACTG--TTTCGCAACAGACATTGAGATGT---GTGGGTT-AGTCCACG------------GGGTACCGTTAACTTATAAATGGGTTATgctatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgtttaccttgcagttttaagtcaaaatcagcagttaaatggctactgtacACCCATGGCTTACATGTTACACCACTG--GGCCAGAAATAACGGTCATC-AGTAA---TGTTACGAGGCATTCTCGTCATCTTCAACATTGA-CACGAATTACAACCGAGTTTCCACA----TATTG---GTTCTCT------GAAAATTGTTACTTTTGTGACTTCTGGGCCACGTTTTGTAATATAATT-------AGTCATTACAGACACTGTAATCGACGACTGAAAACCCCTCACATAGAAGCGCTTTGTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGA-A-ATCAACACTATTGTTTCTTCAGATATTACGTGAATAACAGCAACTAGACATAATGCCTATTGAATTCAAGGTTGATATGTTTAAAGTA--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACAC-------AT--GTGGGTTGTAGTCCGTGATA-------TCGGA--CCGctgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaatatacacatgtgggttgtagtccgtgatatcggaccg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cagaaatcaacactattgtttcttcagatattacgtgaataacagcaactagacataatgcctattgaattcaaggttgatatgtttaaagtactgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaataATATGTTCTATCAAATA------TTCATTACCAGGATTATATGACAT--ATAGATCGAATTAGCACCAGTACATA-GACT-CAA---AGT--ACTAATA
gi|2                          :                                                                                                                            acaacgtttaaatgttattcacgcatatttCCCCAGTGCAT-TGTTAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCGTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATTATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGTCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTAT-GAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACATATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTT-CCA---TCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTTACCAA--TGTCCT-TGG---A-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--A--ATAT-AGA-AGTTCT-G----ATAATT---TATTT--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGCTTTTTGAATATTCAAA-TGAACACCTTTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACACTGCTAGCGTGTTTA-A-A-------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCAGACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATAATCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGATACAGTC---TAAAAAGAGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTACAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCT--C-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGAAGTTCGGGTCATCTAGCAG---AG---CGGA--ATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTA-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTAAGGCCCCTCTTTCTGGCA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTCCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGCAGCTTCTTGTTGCTATCAA-TGCCCGTAAAACGGTCCTGTGACATCGGATTATT----------T--TTA-CA-CG---ACATGTTT--------------TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAACCATTAACAACAGTTATGTTTGGACAAATATTACCGTCACGTGAAACAATATGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTCGCTGAATAGACGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGT
gi|3                          :                                                                      TTTTCAGAGATATCTTCCTTAAA----GGGACTGTCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATT-CATATGCAATGCTATTA-GAATCCC--CATAAACGTTACCACCAAACTTTATTTCATTACCTATTAAATTATTAGATTTGCTTTTTC-TCAA--ATTAATAATTTTACAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCGATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTC-TGTTTACATCTTTTTACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTAGTAGTGTTTTAAAATATTTCTAAACTTTGCCTTCGGGAAACACATATCAGA--AGCTTTCAATAAAGG--GATTACAAGTGTGTCATATAAATTATCAATTTTTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGT-AGTCGACTTTTC-CCATTT-AGTTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA----CACTCAGACTCAACATGCTGT-----ATAGAGACTGCACA---------TACAATTGGTC---TATGAGTTGAAACATTTACTGCATCGTCATC-TAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGT--GTTAATGTTCTTCACATATAATTATATAATCTATCAAAGA------TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATAGGTCGAATTAGCACCAGTACATAGA--C-CCAAGGTATTAACAAAAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAA--T-TA--CCTCTTACGTCAA--CATTCT-TAGTGAA-TTTTCTAGA---GTTAATATGAGTGTTAATGTCTCCCATAA--TC----ATAATTCGACCTTTG--TGCATATACATGTTTATTATATGAGATAGTTTT-TCAATATAATT---TTTAT--ATCG-----------C-TCT--ACAG-AGTAATTACTGCTTGGTAGATATACCTGGAATATGT-ACATATTACA-TTTTGAGAGCATTCATATTGTATACCAATAATTCTGTAATCATA-AC-----ATG--GCAATGGTACAATTTTA------TTACACAATACATTATTCCATAATAAT-GCCACTCCCCCTTTTCGTAC--TGTACACATAAGCGGTGAA-CGCAAGTCATTTTCACATACAGAGTGACTTTTGCATTTACTATCAATTTTATC---TAAAAAGTACAAATCAGAT-TCACGCA---ACCAATGCTCCGAGATAGCACATA-T-ATCAATATTCTTATCATTTAAAGTATCACACAAATATGAGCTACTTGACAAAATACCAGTAGCGTTCCATGTCATAATGTTTA--TTGAGT----TAGC---CATTTGGAAGTGTATTCTACTTATT---CATCAACCCCATACAGGTTCAA-------GT--AGGGATTTTAGTCAGTAACATCTGTCCTCTGATACAGTGTTT-CTGTGTCCTCACAAT-TACT-TTG------GTT-ACCACGATT-T--TTCCATTTATTCTGAACCCCACCTGATCTACGCCATCTATTTGCACACTTAAGTTTAGACCGTGGCAACCATTTGCTACATTCAATACCATT--AGGCCAAAAGGAGGAATTTTCTACCAGGTGAG---CGT----TAC-CGTCATCCTCAACATTTAAC-CGTATCACAGCTGA----GT-CAAACTTATC----GTT-TCTATAGACGGAC------ACTTTTGTAACCTTTGGACATCGCTTAGCAACA-TATCTTGCGATAATATCT----TCT--GTGATTGATGGCTTAAATCCCCCAATAAACAAGCTGATTGGTCGTTTAC--ATATATGTTCAACAAAATC-----CGAC-TCATCagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattctagtagtgttttaaaatatttctaaactttgccttcgggaaacacatatcagaagctttcaataaagggattacaagtgtgtcatataaattatcaatttttgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgctgtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttactgcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtgttaatgttcttcacatataattatataatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatagacccaaggtattaacaaaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagtgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttattatatgagatagtttttcaatataatttttatatcgctctacagagtaattactgcttggtagatatacctggaatatgtacatattacattttgagagcattcatattgtataccaataattctgtaatcataacatggcaatggtacaattttattacacaatacattattccataataatgccactcccccttttcgtactgtacacataagcggtgaacgcaagtcattttcacatacagagtgacttttgcatttactatcaattttatctaaaaagtacaaatcagattcacgcaaccaatgctccgagatagcacatatatcaatattcttatcatttaaagtatcacacaaatatgagctacttgacaaaataccagtagcgttccatgtcataatgtttattgagttagccatttggaagtgtattctacttattcatcaaccccatacaggttcaagtagggattttagtcagtaacatctgtcctctgatacagtgtttctgtgtcctcacaattactttggttaccacgatttttccatttattctgaaccccacctgatctacgccatctatttgcacacttaagtttagaccgtggcaaccatttgctacattcaataccattaggccaaaaggaggaattttctaccaggtgagcgttaccgtcatcctcaacatttaaccgtatcacagctgagtcaaacttatcgtttctatagacggacacttttgtaacctttggacatcgcttagcaacatatcttgcgataatatcttctgtgattgatggcttaaatcccccaataaacaagctgattggtcgtttacatatatgttcaacaaaatccgactcatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttcagagatatcttccttaaagggactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccccataaacgttaccaccaaactttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttacaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagcgatcctatgaactcttcgaaattctctgtttacatctttttacatagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattACGTTCCTATTTTGAGTTTTATTCGAAGTAGTCTGCTATAATAGCC-ATCAGGTTTATGTCTATTGGTACGTTATGGAAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTCATTTAACCGGCTTAGCCGAAACTTat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCCGAAACTTTCTT-TTGCTACC-A-TACCCATATAGTGGTCCTGTGGCATTGGAGTATCAGCAATGCCATGGTCATCAATGCTGACATTTTTACACGA-AATGA--TTATTTTCCTGAACATCA---------TCAAAACGAGCAACAATATCAGGTCTGTTTAACATGTCATTATCAACGATTATGTTTCAACATATATTTACGTCAAGTGAACCATTAGGCATGTGACGATACTGCGAAGCAATCTTAACATTGATTTGTTCAGTCCTTGATGAGGTTCCCAGAC----TATTGGCTGAACAGTCGTGGACAGAACTGCATGGGAATTGCCACGTTGCAAATTGACATTTTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTACTTGGCAGTAGCATAACCACGT--CTATGTGAACTTTTAGCCACAGTTACAGTATTATCCTGTG-ACAAAAC-AACTGAGTGAGTCTCATTTTTGCACGCACTTTAACTAACATCAGGTCCA----------CATTCATATTTT-GATA-ACGATTTAATGTCTTGTTTCGAATTCCTGTTTGGCTATTTTTCGAAAGAAACTTATTTTCTGTTTGAAAAGTTTG-ATATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTtcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcatgggaattgccacgttgcaaattgacattttcataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|5                          :       acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttaATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATTTTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCATGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---
gi|6                          : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAATTGATCGAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATAACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT-----------TCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAATCTTCCAAAGTGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTTGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCCCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTTG-A--TTTTTATATGAGATATAAATATCTGAATTAGTATCATGAGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGGCAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGTTTT-AATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGTATATATGTATATGACGAACT---AATTAAAGATGAT-ACGAGTGTCTGGTATAGAACATCAAGTCC--ATTTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCA---------ACATTTTA--CTA---------CAACGTGT-------CAGA-CTCCGAGTGGTCAACTTTT--CCAATTTAATTCTTGGTACTGAAT---AA-TAT-GAGATACATTCATGCTCAA---GATGAGG--TGCAGATG-TGTAGAGACTATACATACA---AGTCGTCTATGCGCGGACACGATAACCGCATCGCCATC-TATAATTTCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaccacttactgttcatttcagcaccctgatctagttcgcgattaactagttttgaatagtttccaacagctatcctgtgaattttttgaaattctcattctgcattttcatagttatcaaatgatgacaaagtcgagattcttggccaacccttacctttccaaaaagtgtgagcttgtttcattttgttatgtacgaagtcaagtcgttaatccagtagggtttgaagaattttcttaattttgccttcagaatacacgtatcaaagccttcaagaaagtgattacaaatgcgtcgtaaaacttaattaatttgtaattaatagacagtggcagtcgcagttaaattcctggtcactatatcattgtGACACATTTAAGGCATTATCATCCAATA-TTTCACA----TATAATAACATAATCCATA--TGTTCA-ATGACATAACGATATGATCTATTAATGA--TTCATTGTTTACCA---TCATAGGAAACAAA--GGTAGATTTCACTCTAGTACACGTA--TCCAAGAAAAT-------------------TATAGTTTTGAATCAATA-CGGTA-CTAAATTAAATGCTTCTATCATCGAGTGGTTTTATGA---ATTTATCTGTA----TCAAGATAAGCATTTATATCGCCCACTATTACAATAATAACACTGTCCCT------GTA-----TT--A--AT----GA-A---CTAA----ATCATTACATCTTTCAACATATTCAT-ATAGC-TTTGCAAAACAATCATTACTATTTGGGAAACAGACTTGTAAGACATAATATGAAGCCATTTGCTGAACATTCAAATTGG--ATTTACAGTTTTTTCATCACCAACAGGCAATGAAGTAAT--TATATTG---GAATGTCT---------ATTATTCCATAG-AAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatttTCGTCAATAA-ATG--CACGCTATTGTGTGAACTTTTTGTAACA-------TATCATCCTTTGTA-AAAGC-AACCAAGCGA--CTCATTT-GGCACAT-CTTGAGTTGATATCATCTCCAGATTTGAAACCATTTATAATTTGGTTACCCGATTTAATATATTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAATTAGTTTTATGTTTAAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAAtcaaatataatgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): GTGGTTTGGCACGTTTAAGACAGTGTTGTCCACAGTTTCATATTTAACAACACAATCTCGTATGGTCATTTGGTAAAGTGAAATTAGTTATAATAATTGTTTTTACCACTATAGGAAACAAACATATAGTTCGCTCCTGTATGTATATCCGATGGATTTATAG
Unaligned ( gi|15 ): AAATTCCTGAGCACTATATCATTATCTGACATACTACTATAGTCTACAAGATTCTGAGTAGTCGACTTTTAGTTCTTTGTACTGGATAATGTGGGATAAACTCAGGCCCAATGTG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                            222              1     11  11                                    11                                                        11                                       111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111                                                                                        222222222                  1111                                 1                 1                          111      1      111                        3333333333   111    111                                            2222                   11                                   333333         3333            11      111                 111111         11          2222                           1    11    11             111     1   11111         222                             22222222              111      222222222      1  2222222       111    11111          1     1         1                                    1                                                          222222                             666666666666         1                                   222                                                             111               11          111                        111                                                                                        2222222    111           111    666666666666666666666666        2222222  11                    3333333     11                  1                                         22222          2222    1       1      1  1     22222222                             11  11                           111   22222                            2222           3333333333333    1111   1   111111    222222                                 1    2222222       2222                                                                 11                                                            33333   1                        1                 66666666666                                                                                 111                                                  1  4444444        66666666666666                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11                            5555555            111     11         33                                     11                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :        1                           1    1            1                     333              2     88  88                               2    33       1              8      8      0       0           11                              1        444                                                                                                                              8      8 88                                                                                                                           0                                              111             6                             99   1 1  55            0           0        666666666       22     6   4444  0        2   1   3       88    3     55          3             6    1   6   111    1 6      444       66    1          1111111111   444    444                   1 2        6             1111    9 0       55   33     3 0   1    22                 777777  22  0  6666         0  33 22   222      1          555555   3     11  22 1 2  1111 0         66  44    9 4 0 0    33 33 33     0       888     0   88888  0      111         1  2                22222222              444  3   666666666   3  0  1111111       777 1  88888  99    0 5 4   0   0     0   0     1   1        1             0          6    0            3  444    1 1     1     1  9  666666  3  1 1 444   1  8888888    444444444444         0   7                    6          333       6           1           0                      22     777               22  2       777                        222             0 1     8              4 1           1   1     1              1   0   0    3333333    777    1      777    111111111111111111111111        6666666  11                    2222222     33        7         3     7    6   7        6         7 7     77777          8888    3       3      3  3     88888888            1              1 88  11         0 22        3     777   55555  9    3                  6 8888  1        0000000000000    7777   0   333333    888888     1  1           0 1   66     0    0000000       0000   55                 0                 0     0       7          88        7        7             0                            33333   3       7                3                 33333333333                                                                        6        777                                  7    3     6    2  4444444        00000000000000                  6                                                       0                                                                                                          7                 1                                                                        1           1          1     1     1    1            1  1      1 0        6   88     7                      6666666            777     44      0  33       7     0 7                1    00    3           1   6    6                                                                          88                                             1                        1                    1                         1         1  
lowQualScore                  :        .                           .    .            .                     ...              .     ..  ..                               .    ..       .              .      .      .       .           ..                              .        ...                                                                                                                              .      . ..                                                                                                                           .                                              ...             .                             ..   . .  ..            .           .        .........       ..     .   ....  .        .   .   .       ..    .     ..          .             .    .   .   ...    . .      ...       ..    .          ..........   ...    ...                   . .        .             ....    . .       ..   ..     . .   .    ..                 ......  ..  .  ....         .  .. ..   ...      .          ......   .     ..  .. . .  .... .         ..  ..    . . . .    .. .. ..     .       ...     .   .....  .      ...         .  .                ........              ...  .   .........   .  .  .......       ... .  .....  ..    . . .   .   .     .   .     .   .        .             .          .    .            .  ...    . .     .     .  .  ......  .  . . ...   .  .......    ............         .   .                    .          ...       .           .           .                      ..     ...               ..  .       ...                        ...             . .     .              . .           .   .     .              .   .   .    .......    ...    .      ...    ........................        .......  ..                    .......     ..        .         .     .    .   .        .         . .     .....          ....    .       .      .  .     ........            .              . ..  ..         . ..        .     ...   .....  .    .                  . ....  .        .............    ....   .   ......    ......     .  .           . .   ..     .    .......       ....   ..                 .                 .     .       .          ..        .        .             .                            .....   .       .                .                 ...........                                                                        .        ...                                  .    .     .    .  .......        ..............                  .                                                       .                                                                                                          .                 .                                                                        .           .          .     .     .    .            .  .      . .        .   ..     .                      .......            ...     ..      .  ..       .     . .                .    ..    .           .   .    .                                                                          ..                                             .                        .                    .                         .         .  
lowQualScore                  :        0                           0    0            0                     333              0     33  33                               5    88       2              0      0      8       8           00                              4        000                                                                                                                              0      0 88                                                                                                                           8                                              777             7                             22   0 0  66            8           8        777777777       77     7   2222  3        5   8   5       33    3     77          3             7    0   7   777    4 0      000       22    0          2222222222   000    000                   0 5        7             2222    8 2       55   88     2 2   0    22                 222222  88  8  4444         6  88 22   000      4          000000   2     22  44 0 5  2222 2         22  00    8 2 2 0    88 55 88     2       000     0   55555  2      000         0  0                55555555              222  0   000000000   2  0  2222222       555 0  55555  00    2 0 0   0   8     0   2     0   0        2             0          5    8            2  888    2 0     2     0  8  000000  2  0 0 222   2  8888888    888888888888         0   3                    7          333       7           0           7                      00     555               55  5       555                        222             6 4     8              6 4           4   0     0              4   8   8    2222222    555    2      555    000000000000000000000000        0000000  00                    5555555     88        3         3     3    7   3        7         3 3     77777          3333    3       3      3  3     77777777            0              0 00  22         2 00        2     555   00000  2    2                  5 0000  0        8888888888888    2222   0   555555    888888     0  0           2 0   88     0    0000000       0000   00                 2                 8     2       3          33        3        3             7                            33333   3       3                3                 33333333333                                                                        7        777                                  3    7     7    0  3333333        00000000000000                  7                                                       7                                                                                                          3                 0                                                                        0           0          0     0     0    0            0  0      0 7        7   33     3                      7777777            777     00      7  33       3     7 3                0    33    7           0   7    7                                                                          00                                             0                        0                    0                         0         0  
consensus                     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
Reference ( family-2464 )     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
gi|1                          : GACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAATTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAGTTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTTGTCAACTTCGCGGTTTAGTAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGAATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCAACCCAGGCTTTACGACGATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTAA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTTAC-----ATCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTATACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--TGTCCT-TGG---A-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TATT--T--ACCGATTCCTGAAATCTTTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACATTGCTAGCGGGTTTA-AC--------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGACGCGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGAAACAGTC---AAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTG---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGACTATT-ATTGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGTTTCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-AACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---TCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGATTTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTC-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTTAGGCCCCTCTTCCTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAGTCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-ATTGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-CTGCTCACATTTTTACACGACA-TGTTTTTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACAGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGGCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCATCTGGCGAGTAAGTATCGCCAGTGGGTAATGCTGATTGATTGACAGAAAACGAGCCGTCATAGTTGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACAC------TATCATCATGTG-A-AAAATAGACCGAGTGAGACTCATTTTGGCACACATTTGAGTTAATCTCATTTCCAGGTTTGGAACCATTTATAGTTTGAATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTATTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAATACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCTCAACGCCGGTTAGCTTGTCCGACTCAATCCTTTCAATACACATGTTAATCTGTTCTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTATGTGACAAACT---GATTAACGATGGT-ACTAGTGTCTCATATAGAACATCAATTCC--AT--------ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCG---------ACATTTTTGTCTAA-TGA----CAAAGTGTACTGTAGAAGAACCTCGTG--GTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAGAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTGCAGA--------AAACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACATAGCTATCGT-CAATAAATGCACctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTGAATCAATCCTATAAGAAATGTAGGTC----CTTTTTAAAGAGCCAGTGCTCAGAGATACCACTAATATATTTATGGTTTTTTTTTTTAA---ATCACATTAGTACAAACAGCTGGACAAGACGCCAGTGGCATTCCATGTTAATATA-TCTAACTG--TTTCGCAACAGACATTGAGATGT---GTGGGTT-AGTCCACG------------GGGTACCGTTAACTTATAAATGGGTTATgctatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgtttaccttgcagttttaagtcaaaatcagcagttaaatggctactgtacACCCATGGCTTACATGTTACACCACTG--GGCCAGAAATAACGGTCATC-AGTAA---TGTTACGAGGCATTCTCGTCATCTTCAACATTGA-CACGAATTACAACCGAGTTTCCACA----TATTG---GTTCTCT------GAAAATTGTTACTTTTGTGACTTCTGGGCCACGTTTTGTAATATAATT-------AGTCATTACAGACACTGTAATCGACGACTGAAAACCCCTCACATAGAAGCGCTTTGTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGA-A-ATCAACACTATTGTTTCTTCAGATATTACGTGAATAACAGCAACTAGACATAATGCCTATTGAATTCAAGGTTGATATGTTTAAAGTA--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAC-------AT--GTGGGTTGTAGTCCGTGATA-------TCGGA--CCGctgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaatatacacatgtgggttgtagtccgtgatatcggaccg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cagaaatcaacactattgtttcttcagatattacgtgaataacagcaactagacataatgcctattgaattcaaggttgatatgtttaaagtactgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaataATATGTTCTATCAAATA------TTCATTACCA-GGATTATATGACAT--ATAGATCGAATTAGCACCAGTACATA-GACT-CAA---AGT--ACTAATA
gi|2                          :                                                                                                                            acaacgtttaaatgttattcacgcatatttCCCCAGTGCAT-TGTTAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCGTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATTATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGTCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTAT-GAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACATATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTT-CC----ATCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTTACCAA--TGTCCT-TGG---A-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TATT--T--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGCTTTTTGAATATTCAAA-TGAACACCTTTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACACTGCTAGCGTGTTTA-A-A-------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCAGACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATAATCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGATACAGTC---TAAAAAGAGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTACAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCT--C-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGAAGTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTA-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTAAGGCCCCTCTTTCTGGCA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTCCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGCAGCTTCTTGTTGCTATCAA-TGCCCGTAAAACGGTCCTGTGACATCGGATTATT----------T--TTA-CA-C-G---ACATGTTT--------------TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAACCATTAACAACAGTTATGTTTGGACAAATATTACCGTCACGTGAAACAATATGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTCGCTGAATAGACGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGT
gi|3                          :                                                                      TTTTCAGAGATATCTTCCTTAAA----GGGACTGTCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATT-CATATGCAATGCTATTA-GAATCCC--CATAAACGTTACCACCAAACTTTATTTCATTACCTATTAAATTATTAGATTTGCTTTTTC-TCAA--ATTAATAATTTTACAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCGATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTC-TGTTTACATCTTTTTACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTAGTAGTGTTTTAAAATATTTCTAAACTTTGCCTTCGGGAAACACATATCAGA--AGCTTTCAATAAAGG--GATTACAAGTGTGTCATATAAATTATCAATTTTTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGT-AGTCGACTTTTC-CCATTT-AGTTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA----CACTCAGACTCAACATGCTGT-----ATAGAGACTGCACA---------TACAATTGGTC---TATGAGTTGAAACATTTACTGCATCGTCAT-CTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGT--GTTAATGTTCTTCACATATAATTATATAATCTATCAAAGA------TTCATTAACAAG-ATCATATGACAC--ATAGGTCGAATTAGCACCAGTACATAGA--C-CCAAGGTATTAACAAAAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAA--T-TA--CCTCTTACGTCAA--CATTCT-TAGTGAA-TTTTCTAGA---GTTAATATGAGTGTTAATGTCTCCCATAA--TC----ATAATTCGACCTTTG--TGCATATACATGTTTATTATATGA-------GATAGTT---TTTCAAT--AT-AATTTTT-ATATC-GCTCTACAG-AGTAATTACTGCTTGGTAGATATACCTGGAATATGT-ACATATTACA-TTTTGAGAGCATTCATATTGTATACCAATAATTCTGTAATCATA-AC-----ATG--GCAATGGTACAATTTTA------TTACACAATACATTATTCCATAATAAT-GCCACTCCCCCTTTTCGTAC--TGTACACATAAGCGGTGAA-CGCAAGTCATTTTCACATACAGAGTGACTTTTGCATTTACTATCAATTTTATC---TAAAAAGTACAAATCAGAT-TCACGCA---ACCAATGCTCCGAGATAGCACATA-T-ATCAATATTCTTATCATTTAAAGTATCACACAAATATGAGCTACTTGACAAAATACCAGTAGCGTTCCATGTCATAATGTTTA--TTGAGT----TAGC---CATTTGGAAGTGTATTCTACTTATT---CATCAACCCCATACAGGTTCAA-------GT--AGGGATTTTAGTCAGTAACATCTGTCCTCTGATACAGTGTTT-CTGTGTCCTCACAAT-TACT-TTG------GTT-ACCACGATT-T--TTCCATTTATTCTGAACCCCACCTGATCTACGCCATCTATTTGCACACTTAAGTTTAGACCGTGGCAACCATTTGCTACATTCAATACCATT--AGGCCAAAAGGAGGAATTTTCTACCAGGTGAGC-----GT--TAC-CGTCATCCTCAACATTTAAC-CGTATCACAGCTGA----GT-CAAACTTATC----GTT-TCTATAGACGGAC------ACTTTTGTAACCTTTGGACATCGCTTAGCAACA-TATCTTGCGATAATATCT----TCT--GTGATTGATGGCTTAAATCCCCCAATAAACAAGCTGATTGGTCGTTTAC--ATATATGTTCAACAAAATC-----CGAC-TCATCagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattctagtagtgttttaaaatatttctaaactttgccttcgggaaacacatatcagaagctttcaataaagggattacaagtgtgtcatataaattatcaatttttgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgctgtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttactgcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtgttaatgttcttcacatataattatataatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatagacccaaggtattaacaaaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagtgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttattatatgagatagtttttcaatataatttttatatcgctctacagagtaattactgcttggtagatatacctggaatatgtacatattacattttgagagcattcatattgtataccaataattctgtaatcataacatggcaatggtacaattttattacacaatacattattccataataatgccactcccccttttcgtactgtacacataagcggtgaacgcaagtcattttcacatacagagtgacttttgcatttactatcaattttatctaaaaagtacaaatcagattcacgcaaccaatgctccgagatagcacatatatcaatattcttatcatttaaagtatcacacaaatatgagctacttgacaaaataccagtagcgttccatgtcataatgtttattgagttagccatttggaagtgtattctacttattcatcaaccccatacaggttcaagtagggattttagtcagtaacatctgtcctctgatacagtgtttctgtgtcctcacaattactttggttaccacgatttttccatttattctgaaccccacctgatctacgccatctatttgcacacttaagtttagaccgtggcaaccatttgctacattcaataccattaggccaaaaggaggaattttctaccaggtgagcgttaccgtcatcctcaacatttaaccgtatcacagctgagtcaaacttatcgtttctatagacggacacttttgtaacctttggacatcgcttagcaacatatcttgcgataatatcttctgtgattgatggcttaaatcccccaataaacaagctgattggtcgtttacatatatgttcaacaaaatccgactcatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttcagagatatcttccttaaagggactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccccataaacgttaccaccaaactttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttacaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagcgatcctatgaactcttcgaaattctctgtttacatctttttacatagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattACGTTCCTATTTTGAGTTTTATTCGAAGTAGTCTGCTATAATAGCC-ATCAGGTTTATGTCTATTGGTACGTTATGGAAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTCATTTAACCGGCTTAGCCGAAACTTat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCCGAAACTTTCTT-TTGCTACC-A-TACCCATATAGTGGTCCTGTGGCATTGGAGTATCAGCAATGCCATGGTCATCAAT-GCTGACATTTTTACACGA-AATGA--TTATTTTCCTGAACATCA---------TCAAAACGAGCAACAATATCAGGTCTGTTTAACATGTCATTATCAACGATTATGTTTCAACATATATTTACGTCAAGTGAACCATTAGGCATGTGACGATACTGCGAAGCAATCTTAACATTGATTTGTTCAGTCCTTGATGAGGTTCCCAGAC----TATTGGCTGAACAGTCGTGGACAGAACTGCATGGGAATTGCCACGTTGCAAATTGACATTTTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTACTTGGCAGTAGCATAACCACGT--CTATGTGAACTTTTAGCCACAGTTACAGTATTATCCTGTG-ACAAAAC-AACTGAGTGAGTCTCATTTTTGCACGCACTTTAACTAACATCAGGTCCA----------CATTCATATTTT-GATA-ACGATTTAATGTCTTGTTTCGAATTCCTGTTTGGCTATTTTTCGAAAGAAACTTATTTTCTGTTTGAAAAGTTTG-ATATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTtcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcatgggaattgccacgttgcaaattgacattttcataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|5                          :       acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttaATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATTTTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCATGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---
gi|6                          : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAATTGATCGAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATAACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT-----------TCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAATCTTCCAAAGTGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTTGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCCCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTTG-A--TTTTTATATGAGATATAAATATCTGAATTAGTATCATGAGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGGCAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGTTTT-AATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGTATATATGTATATGACGAACT---AATTAAAGATGAT-ACGAGTGTCTGGTATAGAACATCAAGTCC--ATTTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCA---------ACATTTTA--CTA---------CAACGTGT-------CAGA-CTCCGAGTGGTCAACTTTT--CCAATTTAATTCTTGGTACTGAAT---AA-TAT-GAGATACATTCATGCTCAA---GATGAGG--TGCAGATG-TGTAGAGACTATACATACA---AGTCGTCTATGCGCGGACACGATAACCGCATCGCCAT-CTATAATTTCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaccacttactgttcatttcagcaccctgatctagttcgcgattaactagttttgaatagtttccaacagctatcctgtgaattttttgaaattctcattctgcattttcatagttatcaaatgatgacaaagtcgagattcttggccaacccttacctttccaaaaagtgtgagcttgtttcattttgttatgtacgaagtcaagtcgttaatccagtagggtttgaagaattttcttaattttgccttcagaatacacgtatcaaagccttcaagaaagtgattacaaatgcgtcgtaaaacttaattaatttgtaattaatagacagtggcagtcgcagttaaattcctggtcactatatcattgtGACACATTTAAGGCATTATCATCCAAT-ATTTCACA----TATAATAACATAATCCATA--TGTTC-AATGACATAACGATATGATCTATTAATGA--TTCATTGTTTACC----ATCATAGGAAACAAA--GGTAGATTTCACTCTAGTACACGTA--TCCAAGAAAAT-------------------TATAGTTTTGAATCAATA-CGGTA-CTAAATTAAATGCTTCTATCATCGAGTGGTTTTATGA---ATTTATCTGTA----TCAAGATAAGCATTTATATCGCCCACTATTACAATAATAACACTGTCCCT------GTA-----TT--AAT----GAA---CTAAATCATTACATCTT--TCAACATATTCAT-ATAGC-TTTGCAAAACAATCATTACTATTTGGGAAACAGACTTGTAAGACATAATATGAAGCCATTTGCTGAACATTCAAATTGG--ATTTACAGTTTTTTCATCACCAACAGGCAATGAAGTAAT--TATATTG---GAATGTCT-----AT----TATTCCATAG-AAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatttTCGTCAATAA-ATG--CACGCTATTGTGTGAACTTTTTGTAACA-------TATCATCCTTTGTA-AAAGC-AACCAAGCGA--CTCATTT-GGCACAT-CTTGAGTTGATATCATCTCCAGATTTGAAACCATTTATAATTTGGTTACCCGATTTAATATATTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAATTAGTTTTATGTTTAAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAAtcaaatataatgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): GTGGTTTGGCACGTTTAAGACAGTGTTGTCCACAGTTTCATATTTAACAACACAATCTCGTATGGTCATTTGGTAAAGTGAAATTAGTTATAATAATTGTTTTTACCACTATAGGAAACAAACATATAGTTCGCTCCTGTATGTATATCCGATGGATTTATAG
Unaligned ( gi|15 ): AAATTCCTGAGCACTATATCATTATCTGACATACTACTATAGTCTACAAGATTCTGAGTAGTCGACTTTTAGTTCTTTGTACTGGATAATGTGGGATAAACTCAGGCCCAATGTG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                            222              1     11  11                                    11                                                        11                                       111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111                                                                                        222222222                  1111                                 1                 1                          111      1      111                        3333333333   111    111                                            2222                   11                                   333333         3333            11      111                 111111         11          2222                           1    11    11             111     1   11111         222                             22222222              111      222222222      1  2222222       111    11111          1     1         1                                    1                                                          222222                             666666666666         1                                   222                                                             111               11          111                        111                                                                                        2222222    111           111    666666666666666666666666        2222222  11                    3333333     11                  1                                         22222          2222    1       1      1  1     22222222                             11  11                           111   22222                            2222           3333333333333    1111   1   111111    222222                                 1    2222222       2222                                                                 11                                                            33333   1                        1                 66666666666                                                                                 111                                                  1  4444444        66666666666666                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11                            5555555            111     11         33                                     11                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :        1                           1    1            1                     333              2     88  88                               2    33       1              8      8      0       0           11                              1        444                                                                                                                              8      8 88                                                                                                                           0                                              111             6                             99   1 1  55            0           0        666666666       22     6   4444  0        2   1   3       88    3     55          3             6    1   6   111    1 6      444       66    1          1111111111   444    444                   1 2        6             1111    9 0       55   33     3 0   1    22                 777777  22  0  6666         0  33 22   222      1          555555   3     11  22 1 2  1111 0         66  44    9 4 0 0    33 33 33     0       888     0   88888  0      111         1  2                22222222              444  3   666666666   3  0  1111111       777 1  88888  99    0 5 1   0   0     0   0     1   1        1             0          6    0            3  444    1 1     1     1  9  666666  3  1 1 444   1  8888888    444444444444         0   7                    6          333       6           1           0                      22     777               22  2       777                        222             0 1     8              4 1           1   1     1              1   0   0    3333333    777    1      777    111111111111111111111111        6666666  11                    2222222     33        7         3     7    6   7        6         7 7     77777          8888    3       3      3  3     88888888            1              1 88  11         0 22        3     777   55555  9    3                  6 8888  1        0000000000000    7777   0   333333    888888     1  1           0 1   66     0    0000000       0000   55                 0                 0     0       7          88        7        7             0                            33333   3       7                3                 33333333333                                                                        6        777                                  7    3     6    2  4444444        00000000000000                  6                                                       0                                                                                                          7                 1                                                                        1           1          1     1     1    1            1  1      1 0        6   88     7                      6666666            777     44      0  33       7     0 7                1    00    3           1   6    6                                                                          88                                             1                        1                    1                         1         1  
lowQualScore                  :        .                           .    .            .                     ...              .     ..  ..                               .    ..       .              .      .      .       .           ..                              .        ...                                                                                                                              .      . ..                                                                                                                           .                                              ...             .                             ..   . .  ..            .           .        .........       ..     .   ....  .        .   .   .       ..    .     ..          .             .    .   .   ...    . .      ...       ..    .          ..........   ...    ...                   . .        .             ....    . .       ..   ..     . .   .    ..                 ......  ..  .  ....         .  .. ..   ...      .          ......   .     ..  .. . .  .... .         ..  ..    . . . .    .. .. ..     .       ...     .   .....  .      ...         .  .                ........              ...  .   .........   .  .  .......       ... .  .....  ..    . . .   .   .     .   .     .   .        .             .          .    .            .  ...    . .     .     .  .  ......  .  . . ...   .  .......    ............         .   .                    .          ...       .           .           .                      ..     ...               ..  .       ...                        ...             . .     .              . .           .   .     .              .   .   .    .......    ...    .      ...    ........................        .......  ..                    .......     ..        .         .     .    .   .        .         . .     .....          ....    .       .      .  .     ........            .              . ..  ..         . ..        .     ...   .....  .    .                  . ....  .        .............    ....   .   ......    ......     .  .           . .   ..     .    .......       ....   ..                 .                 .     .       .          ..        .        .             .                            .....   .       .                .                 ...........                                                                        .        ...                                  .    .     .    .  .......        ..............                  .                                                       .                                                                                                          .                 .                                                                        .           .          .     .     .    .            .  .      . .        .   ..     .                      .......            ...     ..      .  ..       .     . .                .    ..    .           .   .    .                                                                          ..                                             .                        .                    .                         .         .  
lowQualScore                  :        0                           0    0            0                     333              0     33  33                               5    88       2              0      0      8       8           00                              4        000                                                                                                                              0      0 88                                                                                                                           8                                              777             7                             22   0 0  66            8           8        777777777       77     7   2222  3        5   8   5       33    3     77          3             7    0   7   777    4 0      000       22    0          2222222222   000    000                   0 5        7             2222    8 2       55   88     2 2   0    22                 222222  88  8  4444         6  88 22   000      4          000000   2     22  44 0 5  2222 2         22  00    8 2 2 0    88 55 88     2       000     0   55555  2      000         0  0                55555555              222  0   000000000   2  0  2222222       555 0  55555  00    2 0 0   0   8     0   2     0   0        2             0          5    8            2  888    2 0     2     0  8  000000  2  0 0 222   2  8888888    888888888888         0   3                    7          333       7           0           7                      00     555               55  5       555                        222             6 4     8              6 4           4   0     0              4   8   8    2222222    555    2      555    000000000000000000000000        0000000  00                    5555555     88        3         3     3    7   3        7         3 3     77777          3333    3       3      3  3     77777777            0              0 00  22         2 00        2     555   00000  2    2                  5 0000  0        8888888888888    2222   0   555555    888888     0  0           2 0   88     0    0000000       0000   00                 2                 8     2       3          33        3        3             7                            33333   3       3                3                 33333333333                                                                        7        777                                  3    7     7    0  3333333        00000000000000                  7                                                       7                                                                                                          3                 0                                                                        0           0          0     0     0    0            0  0      0 7        7   33     3                      7777777            777     00      7  33       3     7 3                0    33    7           0   7    7                                                                          00                                             0                        0                    0                         0         0  
consensus                     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
Reference ( family-2464 )     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
gi|1                          : GACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAATTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAGTTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTTGTCAACTTCGCGGTTTAGTAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGAATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCAACCCAGGCTTTACGACGATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTAA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTTAC-----ATCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTATACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--TGTCCT-TGG---A-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TATT--T--ACCGATTCCTGAAATCTTTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACATTGCTAGCGGGTTTA-AC--------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGACGCGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGAAACAGTC---AAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTG---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGACTATT-ATTGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGTTTCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-AACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---TCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGATTTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTC-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTTAGGCCCCTCTTCCTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAGTCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-ATTGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-CTGCTCACATTTTTACACGACA-TGTTTTTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACAGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGGCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCATCTGGCGAGTAAGTATCGCCAGTGGGTAATGCTGATTGATTGACAGAAAACGAGCCGTCATAGTTGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACAC------TATCATCATGTG-A-AAAATAGACCGAGTGAGACTCATTTTGGCACACATTTGAGTTAATCTCATTTCCAGGTTTGGAACCATTTATAGTTTGAATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTATTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAATACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCTCAACGCCGGTTAGCTTGTCCGACTCAATCCTTTCAATACACATGTTAATCTGTTCTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTATGTGACAAACT---GATTAACGATGGT-ACTAGTGTCTCATATAGAACATCAATTCC--AT--------ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCG---------ACATTTTTGTCTAA-TGA----CAAAGTGTACTGTAGAAGAACCTCGTG--GTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAGAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTGCAGA--------AAACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACATAGCTATCGT-CAATAAATGCACctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTGAATCAATCCTATAAGAAATGTAGGTC----CTTTTTAAAGAGCCAGTGCTCAGAGATACCACTAATATATTTATGGTTTTTTTTTTTAA---ATCACATTAGTACAAACAGCTGGACAAGACGCCAGTGGCATTCCATGTTAATATA-TCTAACTG--TTTCGCAACAGACATTGAGATGT---GTGGGTT-AGTCCACG------------GGGTACCGTTAACTTATAAATGGGTTATgctatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgtttaccttgcagttttaagtcaaaatcagcagttaaatggctactgtacACCCATGGCTTACATGTTACACCACTG--GGCCAGAAATAACGGTCATC-AGTAA---TGTTACGAGGCATTCTCGTCATCTTCAACATTGA-CACGAATTACAACCGAGTTTCCACA----TATTG---GTTCTCT------GAAAATTGTTACTTTTGTGACTTCTGGGCCACGTTTTGTAATATAATT-------AGTCATTACAGACACTGTAATCGACGACTGAAAACCCCTCACATAGAAGCGCTTTGTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGA-A-ATCAACACTATTGTTTCTTCAGATATTACGTGAATAACAGCAACTAGACATAATGCCTATTGAATTCAAGGTTGATATGTTTAAAGTA--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAC-------AT--GTGGGTTGTAGTCCGTGATA-------TCGGA--CCGctgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaatatacacatgtgggttgtagtccgtgatatcggaccg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cagaaatcaacactattgtttcttcagatattacgtgaataacagcaactagacataatgcctattgaattcaaggttgatatgtttaaagtactgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaataATATGTTCTATCAAATA------TTCATTACCA-GGATTATATGACAT--ATAGATCGAATTAGCACCAGTACATA-GACT-CAA---AGT--ACTAATA
gi|2                          :                                                                                                                            acaacgtttaaatgttattcacgcatatttCCCCAGTGCAT-TGTTAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCGTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATTATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGTCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTAT-GAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACATATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTTGTT-CC----ATCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTTACCAA--TGTCCT-TGG---A-TTGTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TATT--T--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGCTTTTTGAATATTCAAA-TGAACACCTTTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACACTGCTAGCGTGTTTA-A-A-------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCAGACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATAATCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGATACAGTC---TAAAAAGAGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTACAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCT--C-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGAAGTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTA-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTAAGGCCCCTCTTTCTGGCA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTCCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGCAGCTTCTTGTTGCTATCAA-TGCCCGTAAAACGGTCCTGTGACATCGGATTATT----------T--TTA-CA-C-G---ACATGTTT--------------TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAACCATTAACAACAGTTATGTTTGGACAAATATTACCGTCACGTGAAACAATATGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTCGCTGAATAGACGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGT
gi|3                          :                                                                      TTTTCAGAGATATCTTCCTTAAA----GGGACTGTCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATT-CATATGCAATGCTATTA-GAATCCC--CATAAACGTTACCACCAAACTTTATTTCATTACCTATTAAATTATTAGATTTGCTTTTTC-TCAA--ATTAATAATTTTACAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCGATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTC-TGTTTACATCTTTTTACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTAGTAGTGTTTTAAAATATTTCTAAACTTTGCCTTCGGGAAACACATATCAGA--AGCTTTCAATAAAGG--GATTACAAGTGTGTCATATAAATTATCAATTTTTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGT-AGTCGACTTTTC-CCATTT-AGTTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA----CACTCAGACTCAACATGCTGT-----ATAGAGACTGCACA---------TACAATTGGTC---TATGAGTTGAAACATTTACTGCATCGTCAT-CTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGT--GTTAATGTTCTTCACATATAATTATATAATCTATCAAAGA------TTCATTAACAAG-ATCATATGACAC--ATAGGTCGAATTAGCACCAGTACATAGA--C-CCAAGGTATTAACAAAAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAA--T-TA--CCTCTTACGTCAA--CATTCT-TAGTGAA-TTTTCTAGA---GTTAATATGAGTGTTAATGTCTCCCATAA--TC----ATAATTCGACCTTTG--TGCATATACATGTTTATTATATGA-------GATAGTT---TTTCAAT--AT-AATTTTT-ATATC-GCTCTACAG-AGTAATTACTGCTTGGTAGATATACCTGGAATATGT-ACATATTACA-TTTTGAGAGCATTCATATTGTATACCAATAATTCTGTAATCATA-AC-----ATG--GCAATGGTACAATTTTA------TTACACAATACATTATTCCATAATAAT-GCCACTCCCCCTTTTCGTAC--TGTACACATAAGCGGTGAA-CGCAAGTCATTTTCACATACAGAGTGACTTTTGCATTTACTATCAATTTTATC---TAAAAAGTACAAATCAGAT-TCACGCA---ACCAATGCTCCGAGATAGCACATA-T-ATCAATATTCTTATCATTTAAAGTATCACACAAATATGAGCTACTTGACAAAATACCAGTAGCGTTCCATGTCATAATGTTTA--TTGAGT----TAGC---CATTTGGAAGTGTATTCTACTTATT---CATCAACCCCATACAGGTTCAA-------GT--AGGGATTTTAGTCAGTAACATCTGTCCTCTGATACAGTGTTT-CTGTGTCCTCACAAT-TACT-TTG------GTT-ACCACGATT-T--TTCCATTTATTCTGAACCCCACCTGATCTACGCCATCTATTTGCACACTTAAGTTTAGACCGTGGCAACCATTTGCTACATTCAATACCATT--AGGCCAAAAGGAGGAATTTTCTACCAGGTGAGC-----GT--TAC-CGTCATCCTCAACATTTAAC-CGTATCACAGCTGA----GT-CAAACTTATC----GTT-TCTATAGACGGAC------ACTTTTGTAACCTTTGGACATCGCTTAGCAACA-TATCTTGCGATAATATCT----TCT--GTGATTGATGGCTTAAATCCCCCAATAAACAAGCTGATTGGTCGTTTAC--ATATATGTTCAACAAAATC-----CGAC-TCATCagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattctagtagtgttttaaaatatttctaaactttgccttcgggaaacacatatcagaagctttcaataaagggattacaagtgtgtcatataaattatcaatttttgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgctgtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttactgcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtgttaatgttcttcacatataattatataatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatagacccaaggtattaacaaaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagtgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttattatatgagatagtttttcaatataatttttatatcgctctacagagtaattactgcttggtagatatacctggaatatgtacatattacattttgagagcattcatattgtataccaataattctgtaatcataacatggcaatggtacaattttattacacaatacattattccataataatgccactcccccttttcgtactgtacacataagcggtgaacgcaagtcattttcacatacagagtgacttttgcatttactatcaattttatctaaaaagtacaaatcagattcacgcaaccaatgctccgagatagcacatatatcaatattcttatcatttaaagtatcacacaaatatgagctacttgacaaaataccagtagcgttccatgtcataatgtttattgagttagccatttggaagtgtattctacttattcatcaaccccatacaggttcaagtagggattttagtcagtaacatctgtcctctgatacagtgtttctgtgtcctcacaattactttggttaccacgatttttccatttattctgaaccccacctgatctacgccatctatttgcacacttaagtttagaccgtggcaaccatttgctacattcaataccattaggccaaaaggaggaattttctaccaggtgagcgttaccgtcatcctcaacatttaaccgtatcacagctgagtcaaacttatcgtttctatagacggacacttttgtaacctttggacatcgcttagcaacatatcttgcgataatatcttctgtgattgatggcttaaatcccccaataaacaagctgattggtcgtttacatatatgttcaacaaaatccgactcatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttcagagatatcttccttaaagggactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccccataaacgttaccaccaaactttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttacaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagcgatcctatgaactcttcgaaattctctgtttacatctttttacatagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattACGTTCCTATTTTGAGTTTTATTCGAAGTAGTCTGCTATAATAGCC-ATCAGGTTTATGTCTATTGGTACGTTATGGAAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTCATTTAACCGGCTTAGCCGAAACTTat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCCGAAACTTTCTT-TTGCTACC-A-TACCCATATAGTGGTCCTGTGGCATTGGAGTATCAGCAATGCCATGGTCATCAAT-GCTGACATTTTTACACGA-AATGA--TTATTTTCCTGAACATCA---------TCAAAACGAGCAACAATATCAGGTCTGTTTAACATGTCATTATCAACGATTATGTTTCAACATATATTTACGTCAAGTGAACCATTAGGCATGTGACGATACTGCGAAGCAATCTTAACATTGATTTGTTCAGTCCTTGATGAGGTTCCCAGAC----TATTGGCTGAACAGTCGTGGACAGAACTGCATGGGAATTGCCACGTTGCAAATTGACATTTTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTACTTGGCAGTAGCATAACCACGT--CTATGTGAACTTTTAGCCACAGTTACAGTATTATCCTGTG-ACAAAAC-AACTGAGTGAGTCTCATTTTTGCACGCACTTTAACTAACATCAGGTCCA----------CATTCATATTTT-GATA-ACGATTTAATGTCTTGTTTCGAATTCCTGTTTGGCTATTTTTCGAAAGAAACTTATTTTCTGTTTGAAAAGTTTG-ATATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTtcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcatgggaattgccacgttgcaaattgacattttcataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|5                          :       acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttaATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATTTTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCATGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---
gi|6                          : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAATTGATCGAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATAACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT-----------TCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAATCTTCCAAAGTGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTTGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCCCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTTG-A--TTTTTATATGAGATATAAATATCTGAATTAGTATCATGAGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGGCAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGTTTT-AATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGTATATATGTATATGACGAACT---AATTAAAGATGAT-ACGAGTGTCTGGTATAGAACATCAAGTCC--ATTTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCA---------ACATTTTA--CTA---------CAACGTGT-------CAGA-CTCCGAGTGGTCAACTTTT--CCAATTTAATTCTTGGTACTGAAT---AA-TAT-GAGATACATTCATGCTCAA---GATGAGG--TGCAGATG-TGTAGAGACTATACATACA---AGTCGTCTATGCGCGGACACGATAACCGCATCGCCAT-CTATAATTTCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaccacttactgttcatttcagcaccctgatctagttcgcgattaactagttttgaatagtttccaacagctatcctgtgaattttttgaaattctcattctgcattttcatagttatcaaatgatgacaaagtcgagattcttggccaacccttacctttccaaaaagtgtgagcttgtttcattttgttatgtacgaagtcaagtcgttaatccagtagggtttgaagaattttcttaattttgccttcagaatacacgtatcaaagccttcaagaaagtgattacaaatgcgtcgtaaaacttaattaatttgtaattaatagacagtggcagtcgcagttaaattcctggtcactatatcattgtGACACATTTAAGGCATTATCATCCAAT-ATTTCACA----TATAATAACATAATCCATA--TGTTC-AATGACATAACGATATGATCTATTAATGA--TTCATTGTTTACC----ATCATAGGAAACAAA--GGTAGATTTCACTCTAGTACACGTA--TCCAAGAAAAT-------------------TATAGTTTTGAATCAATA-CGGTA-CTAAATTAAATGCTTCTATCATCGAGTGGTTTTATGA---ATTTATCTGTA----TCAAGATAAGCATTTATATCGCCCACTATTACAATAATAACACTGTCCCT------GTA-----TT--AAT----GAA---CTAAATCATTACATCTT--TCAACATATTCAT-ATAGC-TTTGCAAAACAATCATTACTATTTGGGAAACAGACTTGTAAGACATAATATGAAGCCATTTGCTGAACATTCAAATTGG--ATTTACAGTTTTTTCATCACCAACAGGCAATGAAGTAAT--TATATTG---GAATGTCT-----AT----TATTCCATAG-AAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatttTCGTCAATAA-ATG--CACGCTATTGTGTGAACTTTTTGTAACA-------TATCATCCTTTGTA-AAAGC-AACCAAGCGA--CTCATTT-GGCACAT-CTTGAGTTGATATCATCTCCAGATTTGAAACCATTTATAATTTGGTTACCCGATTTAATATATTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAATTAGTTTTATGTTTAAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAAtcaaatataatgc


blockSeqs                     :        C                           T    C            A                     GAG              C     GA  GT                               C    AG       T              A      G                          AC                              T        TGC                                                                                                                              T      C TC                                                                                                                                                                          TTC             T                             TG   C T  CA                                 CTGAGCATG       TG     C   TTAC           G   A   A       TG    A     GA          T             C    C   A   ATA    T G      CAT       AA    C          GACTATACAT   ATT    GTC                   A A        C             TCTT    T         CA   AA     T     A    AA                 GCTT    CA     AGG             GA TA   CGA      A          GACT     G     TA  TA T C  AATT           TT  TT    T A   T    AT AG TG             GTG     A   TGAA          AGA         T  A                TTACAATA              GGT  A   TACATGTTT   A  T  AGTTCT        ACA A  AAT    CG      G A   .         C         A   G        A             A          G                 T  AAC    T T     A     C  T  AGGCAA  A  G C GAA   C  CTAGCGT    ACACAATACATT         T   A                    G          AAG       G           A                                  AT     CTA               AG  C       AGA                        TAT               T     G              C A           A   G     G              T            TTTCG      AGA    G      GTA    ACTTATTCATCAACCCCATAC           TTAACTT  AA                    TCTGTCC     TA        A         C     A    C   A        G         A A     ATTTA          CACC    C       T      G  C     AGTTTAGA            T              A CA  GG           AA        T     GTG   TACGA  C    T                  G ACGA  T        GTTTCCACA        GCAA   C   AGTTAT    ATTGTT     T  G             G   TG     T    TTGCGAT       ACAG   CT                                                 T          CA        A        A                                          GTCTG   T       T                T                 TACATGTATGC                                                                        G        AA                                   A    T     G    T  ATGCTG         ACACGAAATGA                     G                                                                                                                                                                  A                 A                                                                        T           C          G     T     T    A            T  A      C          C   AC     T                      GTTACAG            AC      A          GT       T       A                G    GA    A           T   G    C                                                                          AT                                             A                        A                    C                         T         C
blockSeqs                     :                                                                            .                .     .   .                                C    .        A              .      .                          .                               T        .                                                                                                                                .      . T                                                                                                                                                                           .               .                             .    G A  CA                                 .               GA     .   .              G   T   A       A     A     GA          T             C    C   .   .      T T      .         AA    T          AA           .      .                     A A        .             .       A         CC   .      T     T    TT                 TTCA    TG     AAG             AA TG   CGA      G          TATC     A     TA  TG T G  .              TG  TC    A T   .    .  AA .              T       .   AT            .           A  G                AC                    G    C   GT          A  .  ACTA          .   T  TCA    AT      . T   .         .         T   T        T             .          A                 T  TAT    A A     G     A  A  T       A  C A GGT   A  GAAT       AAA                  .   .                    .          .         .           T                                  TA     .                 G   C       .                          A                 T     T              A A           T   G     T              T            AGT        .      A      .      GTTAGTCCACG                     .        .                     .           .         .         .     .    .   .        .         . .     T              .       .       .      .  .     TT                  A              T CA  G            TC        T     .     .      A    T                  A TTA   A        GTCAAACT         G      .   ATAGAC    .          A  C             T   TC     .    CAGC          G      CG                                                 .          .         .        .                                          .       .       .                .                 .                                                                                  .        A                                    .    .     .    .  CG             .                               .                                                                                                                                                                  .                 T                                                                                                                                                  .   .      .                      .                  TA      A          .        .       .                C    .     .           A   .    .                                                                          G                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                        .    .        A              .      .                          .                               A        .                                                                                                                                .      . T                                                                                                                                                                           .               .                             .    C T  .                                  .               TA     .   .              G   T   T       A     .     GA          .             C    T   .   .      C .      .         .     G          AC           .      .                     T C        .             .       .         .    .      .     C    CG                 .       CA     .               .  TA   AGA      A          TGT      G     .   AA A .  .              .   .     . G   .    .  T  .              C       .   A             .           A  A                TC                    .    .   TT          .  .  .             .   C  T      A       . T   .         .         T   T        G             .          .                 .  G      A A     T     A  .  A       .  T A T     T  TTA        ATT                  .                                                                                            TT     .                 .   .       .                          A                 A     A              T T           T   T     T              A            T          .      T      .      CAGTCG                          .        .                     .           .                                                                                                                                T              A .   .            AG        .     .     .      .    .                  . CGT   C        CCCG             .      .   .         .          T  A             G   AG     .    .             .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .      .                          .                               A        .                                                                                                                                .      . .                                                                                                                                                                           .               .                             .    T .  .                                  .               GA     .   .              .   C   A       A     .     C           .             .    C   .   .      C .      .         .     G          T            .      .                     C C        .                                                                         .       GT     .               .  .    T        T          GAC      .     .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T                 A     .              T A           A   A     A              A                                                                            .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .               .                             .    .                                       .               A      .   .              .   .   .       .     .     .           .             .    .   .   .                                                                                    G C        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CC****                                 CGA                                **
originalCons                  : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTT--TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGTTAACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
finalCons                     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTAT--ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCAT-CAATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGACC----TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--T-CAAGGGAGT--ACTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAA--CGTCCT-TGG---A-TTGTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--AC----ATAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCT-GATAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): GTGGTTTGGCACGTTTAAGACAGTGTTGTCCACAGTTTCATATTTAACAACACAATCTCGTATGGTCATTTGGTAAAGTGAAATTAGTTATAATAATTGTTTTTACCACTATAGGAAACAAACATATAGTTCGCTCCTGTATGTATATCCGATGGATTTATAG
Unaligned ( gi|15 ): AAATTCCTGAGCACTATATCATTATCTGACATACTACTATAGTCTACAAGATTCTGAGTAGTCGACTTTTAGTTCTTTGTACTGGATAATGTGGGATAAACTCAGGCCCAATGTG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                            222              1     11  11                                    11                                                        11                                       111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111                                                     33                                 222222222                  1111                                 1                 1                          111      1      111                        3333333333   111    111                                            2222                   11                                   555555         3333            11      111                 2222           33333333333333333                           1    11    11             111     1   111   11      222                             11   2222              11      222222222      1  1111    1     111    11111          1     1         1                                    1                                                          222222                             666666666666         1                                   222                                                             111               11          111                        111                                                                                        2222222    111           111    666666666666666666666666        2222222  11                    3333333     11                  1                                         22222          2222    1       1      1  1     22222222                             11  11                           111   22222                            2222           3333333333333    1111   1   111111    222222                                 1    2222222       2222                                                                 11                                                            33333   1                        1                 66666666666                                                                                 111                                                  1  4444444        66666666666666                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11                            5555555            111     11         33                                     11                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :        1                           1    1            1                     333              2     88  88                               2    33       1              8      8      0       0           11                              1        444                                                                                                                              8      8 88                                                                                                                           0                                              111             6                             99   1 1  33            0           0        666666666       22     6   4444  0        2   1   3       88    3     55          3             6    1   6   111    1 6      444       66    1          1111111111   444    444                   1 2         6            1111    9 0       55   33      33   1    22                 888888  22  0  1111         0  33 22   222      1          5555  8    3   88888888888888888 0         66  44    9 4 0 0    33 33 33     0       888     0   777   00      111         1  2                33   1111              88  33  666666666   3  0  8888    0     777 1  88888  99    0 5 1   0   0     0   0     1   1        1             0          6    0            3  444    1 1     1     1  9  666666  3  1 1 444   1  8888888    444444444444         0   7                    6          333       6           1           0                      22     777               22  2       777                        222             0 1     8              4 1           1   1     1              1   0   0    3333333    777    1      777    111111111111111111111111        6666666  11                    2222222     33        7         3     7    6   7        6         7 7     77777          8888    3       3      3  3     88888888            1              1 88  11         0 22        3     777   55555  9    3                  6 8888  1        0000000000000    7777   0   333333    888888     1  1           0 1   66     0    0000000       0000   55                 0                 0     0       7          88        7        7             0                            33333   3       7                3                 33333333333                                                                        6        777                                  7    3     6    2  4444444        00000000000000                  6                                                       0                                                                                                          7                 1                                                                        1           1          1     1     1    1            1  1      1 0        6   88     7                      6666666            777     44      0  33       7     0 7                1    00    3           1   6    6                                                                          88                                             1                        1                    1                         1         1  
lowQualScore                  :        .                           .    .            .                     ...              .     ..  ..                               .    ..       .              .      .      .       .           ..                              .        ...                                                                                                                              .      . ..                                                                                                                           .                                              ...             .                             ..   . .  ..            .           .        .........       ..     .   ....  .        .   .   .       ..    .     ..          .             .    .   .   ...    . .      ...       ..    .          ..........   ...    ...                   . .         .            ....    . .       ..   ..      ..   .    ..                 ......  ..  .  ....         .  .. ..   ...      .          ....  .    .   ................. .         ..  ..    . . . .    .. .. ..     .       ...     .   ...   ..      ...         .  .                ..   ....              ..  ..  .........   .  .  ....    .     ... .  .....  ..    . . .   .   .     .   .     .   .        .             .          .    .            .  ...    . .     .     .  .  ......  .  . . ...   .  .......    ............         .   .                    .          ...       .           .           .                      ..     ...               ..  .       ...                        ...             . .     .              . .           .   .     .              .   .   .    .......    ...    .      ...    ........................        .......  ..                    .......     ..        .         .     .    .   .        .         . .     .....          ....    .       .      .  .     ........            .              . ..  ..         . ..        .     ...   .....  .    .                  . ....  .        .............    ....   .   ......    ......     .  .           . .   ..     .    .......       ....   ..                 .                 .     .       .          ..        .        .             .                            .....   .       .                .                 ...........                                                                        .        ...                                  .    .     .    .  .......        ..............                  .                                                       .                                                                                                          .                 .                                                                        .           .          .     .     .    .            .  .      . .        .   ..     .                      .......            ...     ..      .  ..       .     . .                .    ..    .           .   .    .                                                                          ..                                             .                        .                    .                         .         .  
lowQualScore                  :        0                           0    0            0                     333              0     33  33                               5    88       2              0      0      8       8           00                              4        000                                                                                                                              0      0 88                                                                                                                           8                                              777             7                             22   0 0  00            8           8        777777777       77     7   2222  3        5   8   5       33    3     77          3             7    0   7   777    4 0      000       22    0          2222222222   000    000                   0 5         7            2222    8 2       55   88      55   0    22                 000000  88  8  6666         6  88 22   000      4          8888  0    2   66666666666666666 2         22  00    8 2 2 0    88 55 88     2       000     0   555   22      000         0  0                88   2222              00  22  000000000   2  0  0000    0     555 0  55555  00    2 0 0   0   8     0   2     0   0        2             0          5    8            2  888    2 0     2     0  8  000000  2  0 0 222   2  8888888    888888888888         0   3                    7          333       7           0           7                      00     555               55  5       555                        222             6 4     8              6 4           4   0     0              4   8   8    2222222    555    2      555    000000000000000000000000        0000000  00                    5555555     88        3         3     3    7   3        7         3 3     77777          3333    3       3      3  3     77777777            0              0 00  22         2 00        2     555   00000  2    2                  5 0000  0        8888888888888    2222   0   555555    888888     0  0           2 0   88     0    0000000       0000   00                 2                 8     2       3          33        3        3             7                            33333   3       3                3                 33333333333                                                                        7        777                                  3    7     7    0  3333333        00000000000000                  7                                                       7                                                                                                          3                 0                                                                        0           0          0     0     0    0            0  0      0 7        7   33     3                      7777777            777     00      7  33       3     7 3                0    33    7           0   7    7                                                                          00                                             0                        0                    0                         0         0  
consensus                     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGA--GCTTTTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATGACTC-AAGGGAGTTAA-CTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAAC--GTCCT-TGG---ATT-GTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--ACA----TAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCTGA-TAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
Reference ( family-2464 )     : GACACCTNAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCNACAANTATCTCAGAATTNACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTAT--ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---CGTTCA-ACTCAA---GTTGTGGAACACANATACTGCAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACNGCGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGANATAANAATATGATCTATTAAAGA--CC--TTCGTTACCA-G-ATCATATGAAACGAATGGGTCGAATTAGCGCCAGTACACATG--TC-AAGGGAGT--A-CTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCGGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAAC--GTCCT-TGG---ATT-GTCTAGAAGAGTTGAGATGNGCGTTTACATCTCCCATTA--ACA----TAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCTGA-TAATT---TNTT--T--ACCGATTCCTGANATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACNACTNGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAACATTCAAATTGAACACCTATNATTCTATCGTCNTCTAC-----NTGAAGNANTGANACATTGCTAGCGTGTTTA-ACAAT----TATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATANTCACATACAGCGTGACATTTATATTTGCTATCGANNCAGTC---TAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGTCATTTAANATATCACATAAATACGAGCAGCTGGACATGATNCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAC---CATTAAGAAGT---TTCTGCT-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--CCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCANGGCCTGCATGTTACNCCATTGGAGGCCAGAAGTNNGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCGTCATCCTCAACATTTAGCTCG-ATNACAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTACGAAA------ACCTTNGTNACTTTTGGGCCCCNCTTCGTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAGCTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCACGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-A-TGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-C-GCT-ACATTTTTACACGA-A-TG---TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACGGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGNCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCNTCTGGCGAGTANGTATCGCCAGNGGGTANTGCTGNTTGANTGACAGAAAACGNGCNGTCGTANTCGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACA-------TATCATCCTGTG-A-AAAAC-GACCGAGCGAG-CTCATTTTGGCACGCACTTGAGTTAATATCATNTCCAGGTTTGGAACCATTTATANTTTGGATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTGTTCGTAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAANACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCNCAACGCCGGTTAGCTTGTCCNACTCAATCCTTTCAATACACATGTTNATCTGTTCTNAA
gi|1                          : GACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAATTTTGG--CT--CATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAGTTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTTGTCAACTTCGCGGTTTAGTAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGAATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCAACCCAGGCTTTACGACGATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTAA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGA--GCTTTTTGTTAC-----ATCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTATACATG--TC-AAGGGAGTTAA-CTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTCACCAAT--GTCCT-TGG---ATT-GTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--ACA----TAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCTGA-TAATT---TATT--T--ACCGATTCCTGAAATCTTTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACATTGCTAGCGGGTTTA-AC--------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACAC---CGGGGACGCGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGAAACAGTC---AAAAAAGTGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCTG---AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAACA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGACTATT-ATTGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGTTTCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-AACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---TCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGATTTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTC-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTTAGGCCCCTCTTCCTGACA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAGTCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTTCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCGGAAATACGCGCCGACAGCTTCTTGTTGCTATC-ATTGCCCGTAAAGCGGTCCTGTGACATCGGATTATCAGCAACGCCATGGTCACCA-CTGCTCACATTTTTACACGACA-TGTTTTTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAGCCATTAACAACAGTTATGTTTGGACATATATTACCGTCACGTGAAACAATAGGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTGGCTGAATAGGCGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGTTCTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCATCTGGCGAGTAAGTATCGCCAGTGGGTAATGCTGATTGATTGACAGAAAACGAGCCGTCATAGTTGGCAGTAGCATG--CACGCTACTGTGTGAACTTTTAGTAACAC------TATCATCATGTG-A-AAAATAGACCGAGTGAGACTCATTTTGGCACACATTTGAGTTAATCTCATTTCCAGGTTTGGAACCATTTATAGTTTGAATACCCGATTTAATGTCTTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAACTAGTTTTCTGTTTAAATTATTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGCCTTTTAATACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCTCAACGCCGGTTAGCTTGTCCGACTCAATCCTTTCAATACACATGTTAATCTGTTCTAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTATGTGACAAACT---GATTAACGATGGT-ACTAGTGTCTCATATAGAACATCAATTCC--AT--------ACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCG---------ACATTTTTGTCTAA-TGA----CAAAGTGTACTGTAGAAGAACCTCGTG--GTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAGAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACACATACTGCAGA--------AAACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACATAGCTATCGTC-AATAAATGCACctg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTGAATCAATCCTATAAGAAATGTAGGTC----CTTTTTAAAGAGCCAGTGCTCAGAGATACCACTAATATATTTATGGTTTTTTTTTTTAA---ATCACATTAGTACAAACAGCTGGACAAGACGCCAGTGGCATTCCATGTTAATATA-TCTAACTG--TTTCGCAACAGACATTGAGATGT---GTGGGTT-AGTCCACG------------GGGTACCGTTAACTTATAAATGGGTTATgctatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgtttaccttgcagttttaagtcaaaatcagcagttaaatggctactgtacACCCATGGCTTACATGTTACACCACTG--GGCCAGAAATAACGGTCATC-AGTAA---TGTTACGAGGCATTCTCGTCATCTTCAACATTGA-CACGAATTACAACCGAGTTTCCACA----TATTG---GTTCTCT------GAAAATTGTTACTTTTGTGACTTCTGGGCCACGTTTTGTAATATAATT-------AGTCATTACAGACACTGTAATCGACGACTGAAAACCCCTCACATAGAAGCGCTTTGTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAGA-A-ATCAACACTATTGTTTCTTCAGATATTACGTGAATAACAGCAACTAGACATAATGCCTATTGAATTCAAGGTTGATATGTTTAAAGTA--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACAC-------AT--GTGGGTTGTAGTCCGTGATA-------TCGGA--CCGctgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaatatacacatgtgggttgtagtccgtgatatcggaccg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cagaaatcaacactattgtttcttcagatattacgtgaataacagcaactagacataatgcctattgaattcaaggttgatatgtttaaagtactgttcaagagaataattgagtttcagcttcttttgcgaacgaacaatactcacattcaataATATGTTCTATCAAATA------TTCATTACCA-GGATTATATGACAT--ATAGATCGAATTAGCACCAGTACATA-GACTC-AA---AGT--A-CTAATA
gi|2                          :                                                                                                                            acaacgtttaaatgttattcacgcatatttCCCCAGTGCAT-TGTTAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCGTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATTATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGTCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTAT-GAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---TGTTTA-ACTCAA---GTTGTGGAACACATATACTACAGA--------ACACA---GGCC---TATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-AATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATCAGTT--TGCTCTTGTGAAATAAAAATATGATCTATTAAAGA--GCTTTTTGTT-CC----ATCATATGAAACGAATGAGTT--ACTAGCGCCAGTACACATG--TC-AAGGGAGTTAA-CTGATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAA--TAGA--CTTCTGTTACCAAT--GTCCT-TGG---ATT-GTTTAGAAGAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTA--ACA----TAACTCTACCCCTGGTTGAGTA-----GT--AATATA-GAAGTTCTGA-TAATT---TATT--T--ACCGATTCCTGAAATC-TTTTTAAAG-AATGGTTACAACTGGGTAAGTAAACTTGTAAGATAT-ACATAAAACAGCTTTTTGAATATTCAAA-TGAACACCTTTTATTCTATCGTCCTCTAT-----TTGAAGGACTGAAACACTGCTAGCGTGTTTA-A-A-------ATTCCATAA-GATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCAGACAC---CGGGGAAGCGCAAGTCATAATCACATACAGCATGACATTTATATTTGCTATCGATACAGTC---TAAAAAGAGTAAATC-GATCTCTCTAA---GCCAGTGCTCAGAGATACCGCAAA-A-ATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTACAGCTGGACATGATTCCAGTTGCATTCCATGTTAAAATGTTCAAATTA--T----CAAT---CATTAAAAAGT---TTCT--C-AGT---CG------------GGGTACAG-------AT--ATGGGTTATAGTCCGTAATA-------TCTGA--TCGTGTGTACTGTCTATT-ATAGTACACTCTTGACGTGCGTTGACTAGGATCATAATTCC---T-TTCTGATCGC----TGGT-TACGGCG-ATATTT-CA-ATTTA---TT---CCTTGTTACCCAAGGCCTGCATGTTACTC--TTGGAGGCCAGAAGTTCGGGTCATCTAGCAG---AGC-----GGAATACTCATCATCCTCAACATTTAGCTTA-ATAATAGCTGA----CC-CG----TATCGCAAGTT-TCTAGTTATGAAA------ACCTTAGTCACTTTAAGGCCCCTCTTTCTGGCA-AATTCAGC---AATCTTT---GTCTCGGTGATCGACGGCTTGAAGCCCCCAATATAGAAACTTTTTGTCCGATTTCTGATATATGTC--GTAAAATCATCGTCGACATCATCCGTTTCCATGTCCCTATTTTGAGTTTTAGGCGAAGTA-----CTA-AATTTCCTATCCGGTTTATGTCTA-TAATTCGTTATAGTAGG-----------TATGTACTGTGATTTAGCCGGCCTAGCAGAAACCTCAGCATAGCTATCAGAAATACGCGCCGGCAGCTTCTTGTTGCTATCAA-TGCCCGTAAAACGGTCCTGTGACATCGGATTATT----------T--TTA-CA-C-G---ACATGTTT--------------TTATTTACCTGGACATCAGCGGTATAGTTAAAACGATTCACATTATCACCGCTATTTAACAAACCATTAACAACAGTTATGTTTGGACAAATATTACCGTCACGTGAAACAATATGCATGGGACGATGCTGCGAAGCAGTCTCAACGTTGATTTGTTCAATTCTTGATGACGTTTCCAGACAGACGACTCGCTGAATAGACGTAGACAGAGCTGCATGGGAAATGTCACGTTGCAACATGACGT
gi|3                          :                                                                      TTTTCAGAGATATCTTCCTTAAA----GGGACTGTCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATT-CATATGCAATGCTATTA-GAATCCC--CATAAACGTTACCACCAAACTTTATTTCATTACCTATTAAATTATTAGATTTGCTTTTTC-TCAA--ATTAATAATTTTACAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCGATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTC-TGTTTACATCTTTTTACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTAGTAGTGTTTTAAAATATTTCTAAACTTTGCCTTCGGGAAACACATATCAGA--AGCTTTCAATAAAGG--GATTACAAGTGTGTCATATAAATTATCAATTTTTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGT-AGTCGACTTTTC-CCATTT-AGTTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA----CACTCAGACTCAACATGCTGT-----ATAGAGACTGCACA---------TACAATTGGTC---TATGAGTTGAAACATTTACTGCATCGTCATC-TAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGT--GTTAATGTTCTTCACATATAATTATATAATCTATCAAAGA------TTCATTAACAAG-ATCATATGACAC--ATAGGTCGAATTAGCACCAGTACATA-GACCC-AAGGTATT--AACAAAAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAA--T-TA--CCTCTTACGTCAAC--ATTCT-TAGTGAATT-TTCTAGA---GTTAATATGAGTGTTAATGTCTCCCATAA--TCA----TAATTCGACCTTTG--TGCATATACATGTTTATTATATGA------GA-TAGTT---TTTCAAT--AT-AATTTTT-ATATC-GCTCTACAG-AGTAATTACTGCTTGGTAGATATACCTGGAATATGT-ACATATTACA-TTTTGAGAGCATTCATATTGTATACCAATAATTCTGTAATCATA-AC-----ATG--GCAATGGTACAATTTTA------TTACACAATACATTATTCCATAATAAT-GCCACTCCCCCTTTTCGTAC--TGTACACATAAGCGGTGAA-CGCAAGTCATTTTCACATACAGAGTGACTTTTGCATTTACTATCAATTTTATC---TAAAAAGTACAAATCAGAT-TCACGCA---ACCAATGCTCCGAGATAGCACATA-T-ATCAATATTCTTATCATTTAAAGTATCACACAAATATGAGCTACTTGACAAAATACCAGTAGCGTTCCATGTCATAATGTTTA--TTGAGT----TAGC---CATTTGGAAGTGTATTCTACTTATT---CATCAACCCCATACAGGTTCAA-------GT--AGGGATTTTAGTCAGTAACATCTGTCCTCTGATACAGTGTTT-CTGTGTCCTCACAAT-TACT-TTG------GTT-ACCACGATT-T--TTCCATTTATTCTGAACCCCACCTGATCTACGCCATCTATTTGCACACTTAAGTTTAGACCGTGGCAACCATTTGCTACATTCAATACCATT--AGGCCAAAAGGAGGAATTTTCTACCAGGTGAGC-----GT--TAC-CGTCATCCTCAACATTTAAC-CGTATCACAGCTGA----GT-CAAACTTATC----GTT-TCTATAGACGGAC------ACTTTTGTAACCTTTGGACATCGCTTAGCAACA-TATCTTGCGATAATATCT----TCT--GTGATTGATGGCTTAAATCCCCCAATAAACAAGCTGATTGGTCGTTTAC--ATATATGTTCAACAAAATC-----CGAC-TCATCagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattctagtagtgttttaaaatatttctaaactttgccttcgggaaacacatatcagaagctttcaataaagggattacaagtgtgtcatataaattatcaatttttgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgctgtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttactgcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtgttaatgttcttcacatataattatataatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatagacccaaggtattaacaaaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagtgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttattatatgagatagtttttcaatataatttttatatcgctctacagagtaattactgcttggtagatatacctggaatatgtacatattacattttgagagcattcatattgtataccaataattctgtaatcataacatggcaatggtacaattttattacacaatacattattccataataatgccactcccccttttcgtactgtacacataagcggtgaacgcaagtcattttcacatacagagtgacttttgcatttactatcaattttatctaaaaagtacaaatcagattcacgcaaccaatgctccgagatagcacatatatcaatattcttatcatttaaagtatcacacaaatatgagctacttgacaaaataccagtagcgttccatgtcataatgtttattgagttagccatttggaagtgtattctacttattcatcaaccccatacaggttcaagtagggattttagtcagtaacatctgtcctctgatacagtgtttctgtgtcctcacaattactttggttaccacgatttttccatttattctgaaccccacctgatctacgccatctatttgcacacttaagtttagaccgtggcaaccatttgctacattcaataccattaggccaaaaggaggaattttctaccaggtgagcgttaccgtcatcctcaacatttaaccgtatcacagctgagtcaaacttatcgtttctatagacggacacttttgtaacctttggacatcgcttagcaacatatcttgcgataatatcttctgtgattgatggcttaaatcccccaataaacaagctgattggtcgtttacatatatgttcaacaaaatccgactcatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttttcagagatatcttccttaaagggactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccccataaacgttaccaccaaactttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttacaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagcgatcctatgaactcttcgaaattctctgtttacatctttttacatagttaagaaaacaggatgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattACGTTCCTATTTTGAGTTTTATTCGAAGTAGTCTGCTATAATAGCC-ATCAGGTTTATGTCTATTGGTACGTTATGGAAGGTACATGTATGCTATGTGCTGTCATTTAACCGGCTTAGCCGAAACTTat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCCGAAACTTTCTT-TTGCTACC-A-TACCCATATAGTGGTCCTGTGGCATTGGAGTATCAGCAATGCCATGGTCATCAAT-GCTGACATTTTTACACGA-AATGA--TTATTTTCCTGAACATCA---------TCAAAACGAGCAACAATATCAGGTCTGTTTAACATGTCATTATCAACGATTATGTTTCAACATATATTTACGTCAAGTGAACCATTAGGCATGTGACGATACTGCGAAGCAATCTTAACATTGATTTGTTCAGTCCTTGATGAGGTTCCCAGAC----TATTGGCTGAACAGTCGTGGACAGAACTGCATGGGAATTGCCACGTTGCAAATTGACATTTTCATAGGTGAGATAGTCCGAGTCATCTTCTAGCGAGTACGTATCGCCAAGGGGTATTGCTATTTGAATGACAGAAAACGTGCAGTCGTACTTGGCAGTAGCATAACCACGT--CTATGTGAACTTTTAGCCACAGTTACAGTATTATCCTGTG-ACAAAAC-AACTGAGTGAGTCTCATTTTTGCACGCACTTTAACTAACATCAGGTCCA----------CATTCATATTTT-GATA-ACGATTTAATGTCTTGTTTCGAATTCCTGTTTGGCTATTTTTCGAAAGAAACTTATTTTCTGTTTGAAAAGTTTG-ATATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTtcttttgctaccatacccatatagtggtcctgtggcattggagtatcagcaatgccatggtcatcaatgctgacatttttacacgaaatgattattttcctgaacatcatcaaaacgagcaacaatatcaggtctgtttaacatgtcattatcaacgattatgtttcaacatatatttacgtcaagtgaaccattaggcatgtgacgatactgcgaagcaatcttaacattgatttgttcagtccttgatgaggttcccagactattggctgaacagtcgtggacagaactgcatgggaattgccacgttgcaaattgacattttcataggtgagatagtccgagtcatcttctagcgagtacgtatcgccaaggggtattgctatttgaatgacagaaaacgtgcagtcgtacttggcagtagcataaccacgtctatgtgaacttttagccacagttacagtattatcctgtgacaaaacaactgagtgagtctcatttttgcacgcactttaactaacatcaggtccacattcatattttgataacgatttaatgtcttgtttcgaattcctgtttggctatttttcgaaagaaacttattttctgtttgaaaagtttgatataattcaaaattgtcttcacatgattt
gi|5                          :       acgttcctattttgagttttattcgaagtagtctgctataatagccatcaggtttatgtctattggtacgttatggaaggtacatgtatgctatgtgctgtcatttaaccggcttaATGGAGTGTATAACTGTC--TAAAGTAATTACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATTTTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCATGCGAAAATTTG-TTTTTG-AT-TTTTTATATGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGAT-ACTAGTGTCTCGTATAGAACATCAATTCC--ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGG-AGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG---
gi|6                          : GACACCTCAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTTACAACTATCTCAGAATTAACATTTGTCATTTTATTCTCA---ATGTCTGCTTTAAACTTTGG--CT--CATAGTTTAATTGATCGAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATAACCCCAGTGCAT-TGTAAT-TTGTTCTGCATTTCTACAAAAACGTT-----------TCATTTCATTACCTACAGAATAACACGATT---TTTGCCGTCGGCTGTTTATAATCTTCCAAAGTGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTTGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCCCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTTG-A--TTTTTATATGAGATATAAATATCTGAATTAGTATCATGAGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGGCAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGTTTT-AATAATGCCTAAATTTAGCTTTTGGTATATATGTATATGACGAACT---AATTAAAGATGAT-ACGAGTGTCTGGTATAGAACATCAAGTCC--ATTTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCA---------ACATTTTA--CTA---------CAACGTGT-------CAGA-CTCCGAGTGGTCAACTTTT--CCAATTTAATTCTTGGTACTGAAT---AA-TAT-GAGATACATTCATGCTCAA---GATGAGG--TGCAGATG-TGTAGAGACTATACATACA---AGTCGTCTATGCGCGGACACGATAACCGCATCGCCATC-TATAATTTCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaccacttactgttcatttcagcaccctgatctagttcgcgattaactagttttgaatagtttccaacagctatcctgtgaattttttgaaattctcattctgcattttcatagttatcaaatgatgacaaagtcgagattcttggccaacccttacctttccaaaaagtgtgagcttgtttcattttgttatgtacgaagtcaagtcgttaatccagtagggtttgaagaattttcttaattttgccttcagaatacacgtatcaaagccttcaagaaagtgattacaaatgcgtcgtaaaacttaattaatttgtaattaatagacagtggcagtcgcagttaaattcctggtcactatatcattgtGACACATTTAAGGCATTATCATCCAATA-TTTCACA----TATAATAACATAATCCATA--TGTTCA-ATGACATAACGATATGATCTATTAATGATTCA--TTGTTTACCA----TCATAGGAAACAAA--GGTAGATTTCACTCTAGTACACGTA--TCCAAGAAAAT--------------------TATAGTTTTGAATCAATA-CGGTA-CTAAATTAAATGCTTCTATCATCGAGTGGTTTTATGA---ATTTATCTGTA----TCAAGATAAGCATTTATATCGCCCACTATTACAATAATAACACTGTCCCTG------TA-----TT--AAT----GAA---CTAAATCATTACATCTT--TCAACATATTCAT-ATAGC-TTTGCAAAACAATCATTACTATTTGGGAAACAGACTTGTAAGACATAATATGAAGCCATTTGCTGAACATTCAAATTGG--ATTTACAGTTTTTTCATCACCAACAGGCAATGAAGTAAT--TATATTG---GAATGTCT-----AT----TATTCCATAG-AAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatttTCGTCAATAA-ATG--CACGCTATTGTGTGAACTTTTTGTAACA-------TATCATCCTTTGTA-AAAGC-AACCAAGCGA--CTCATTT-GGCACAT-CTTGAGTTGATATCATCTCCAGATTTGAAACCATTTATAATTTGGTTACCCGATTTAATATATTGTCTCGATTTCCTATTTGACACCTTTTCGAGAGAAATTAGTTTTATGTTTAAATTGTTCATAGATAATTCAAAATTGTCTTCACATGATTTTACATTGTCTTTTAAAACTTTGATTTCATTCTTTAATCTCACAACGCTGGTTAGCTTGTCCCACTCAATCCTTTCAATATACATGTTTATCTGTTCTCAAtcaaatataatgc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): GTGGTTTGGCACGTTTAAGACAGTGTTGTCCACAGTTTCATATTTAACAACACAATCTCGTATGGTCATTTGGTAAAGTGAAATTAGTTATAATAATTGTTTTTACCACTATAGGAAACAAACATATAGTTCGCTCCTGTATGTATATCCGATGGATTTATAG
Unaligned ( gi|15 ): AAATTCCTGAGCACTATATCATTATCTGACATACTACTATAGTCTACAAGATTCTGAGTAGTCGACTTTTAGTTCTTTGTACTGGATAATGTGGGATAAACTCAGGCCCAATGTG