lowQualScore : 1 1 555555555555 44444444 111 111 11 111 1 444444 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 22222 111111 1111111 111 1 44444444444444 7777777777777 222 2222 2222222 3333333333333333333 222222 22222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 1 1 4444444444444 222222222222222222222222222222222222222 2222222222222 11111 11 11 4444444444444 1 1111111111 22222222222222 1 333333 1111111111 222222222222222222222 1111111 11111 444444 1111 11111111 111 222 11 1 1 1 1 11111111 2222222 111 333333 1111111 2
lowQualScore : 3 0 3 000000000000 3 33333333 0 222 444 1 33 0 222 1 1 1 000000 555 666 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 33333 44 0 888888 8 4 0 2 4 4444444 33 222 1 1 99999999999999 4 0000000000000 555 0 3 9999 1 6666666 1 3 6666666666666666666 0 111111 55 2 11111 3 77 0 88 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 8 66 555 0 5 33 1 9 44 2222222222222 2 2 555555555555555555555555555555555555555 8888888888888 11111 1 55555 00 1 55 11 0000000000000 0 9999 55 0 7777777777 55555555555555 8888 999 4 2 3 5 000000 2 8 3 6 0 555 44 7777 0 44 999 1 3 555 555 5 7777 3 4444444444 44 88888888 3 999999 222222222222222222222 555 9999999 55 888 1 44 11111 999 44 000000 3333 00000000 7777 3 7 999 555 0 11 3 1 0 88 5 1 3 5555 9 0 3 5 555 6666 4 11111111 9999999 2 3 555 55 999 55 7 000000 1 55 1 3 55 666 2 4 3 1 0 3 0000000 3 2 4
lowQualScore : . . . ............ . ........ . ... ... . .. . ... . . . ...... ... ... ......................................................................... .. ..... .. . ...... . . . . . ....... .. ... . . .............. . ............. ... . . .... . ....... . . ................... . ...... .. . ..... . .. . .. . .................................................... . . .. ... . . .. . . .. ............. . . ....................................... ............. ..... . ..... .. . .. .. ............. . .... .. . .......... .............. .... ... . . . . ...... . . . . . ... .. .... . .. ... . . ... ... . .... . .......... .. ........ . ...... ..................... ... ....... .. ... . .. ..... ... .. ...... .... ........ .... . . ... ... . .. . . . .. . . . .... . . . . ... .... . ........ ....... . . ... .. ... .. . ...... . .. . . .. ... . . . . . . ....... . . .
lowQualScore : 2 0 3 000000000000 0 88888888 7 000 777 0 00 4 111 4 6 7 777777 222 444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 55555 66 4 222222 2 5 8 8 0 5555555 77 555 9 0 66666666666666 6 8888888888888 777 7 3 3333 4 9999999 5 3 3333333333333333333 4 000000 00 2 11111 1 00 4 55 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 3 11 111 8 5 99 6 5 22 2222222222222 9 7 888888888888888888888888888888888888888 5555555555555 88888 1 99999 22 5 55 11 0000000000000 3 8888 55 3 5555555555 66666666666666 5555 222 0 1 2 7 111111 8 8 1 2 2 888 66 1111 5 66 444 2 3 888 888 4 1111 3 6666666666 66 44444444 3 666666 444444444444444444444 888 0000000 00 444 0 66 77777 222 66 111111 8888 33333333 1111 6 6 444 111 3 88 0 9 1 00 7 0 6 5555 1 3 1 5 444 5555 4 22222222 2222222 9 3 444 88 666 00 6 000000 4 00 6 6 00 111 4 1 3 3 4 3 8888888 3 4 5
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCNGGTT--GTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTTATG-T-GATGAAGTT---GA----------------AGACAC--------TTNA----TGAN---------GTTGAAG---GT--CA------CAGAC-AGCAAATACGACGACA---C-TTG--TCAATTTCTATCAGTTTTAATTTGGTNTTAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTNAC-GT--A-CATCTAAGTT-AATGAT-ATNC--GATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCANTAAGATAGTATAT-----TGGTGA--A-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGGCT-GAATCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTT----A-TTA-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAATAT--CCAGACA---GCGACGATGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTATA-T--C-TCTGTA--CCC-GATC-TTCTGTTATT----TA---T--ATCCC-TGAATAAT--T--AANAGTCCACCCT--TA-AA-T-----------ACTAAACAGGT--GCTAGTTTTAC----------ACA----------AT-GCACAG----GATG--TG-TTAGGACAAAC-AATT-ANTCATCAGAAGGAA---ACA--T----AAGTGTAAACAA--TC--AACAAAAT-ATGTT---AGGT---TTTAAAATG----AA-CAAT----------A--GGTA-----AT-A-AA------ATA-TA----T---ACA-------ATCAG---CAATATG----TTTTC--ACACTCTAAATTGTTA--T-----AATCAC---TT--AG----NCTT----GAA-G------GTATT----TACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACT-NTTAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAGACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGA-CATCT---GTGA----GAACATGTGCTA--------TAA-TT----A-TTG-GCATGTTGT---CAGTATTGTTATTGAT--AG--AAAATTT-----GAATCCTG--TTAAAATTCA-T--AGAGA-AAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACATGCTGC
Reference ( gi|4 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTT--CTCC-CACGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTCT-AGTTTGAAGTAATATTATGAT-GATGAAGTT---GA----------------AGA-----------TTGA----TGAA---------GTTGAAG---A---CA------CAGAA-AGCAAATACGACGACA---A-TTG--TCAATTTCTATCAGTTTTTATTTGGTGTTAAAGTCAAAC--AGTT-TATT-A-CAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTAACAGT--AACATCTAAGC--AATAAT-ATTA--AATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTAAAATAGTATATA----TGGTGA--A-ATAAACTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGGCTGGAATCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTT----A-TTA-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAATTAT--CCAGCCA---GCTACGCTGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTATA-T--C-TCTGTA--CCC-GATC-TTCTGTTATC----TA---T--ATCTT-TGAATAAT--T--AACAGTCCACTCT--TG-AA-A-----------ACTAAACAGAT--GCTAGCTTTAC----------ACA----------AT-TCACAG----GATA--TG-TTGGGACAAAC-AGT--ATTCATCAAAGGAAA---ACA--T----AAGTGTAAACAA--TC--GACAAAAT-ATGTT---AGGT---TTTGAAATG----AA-CAAT----------A--GGTA-----AT-A-AA------ATA-GA----T---ACA-------ATCAG---CAATATT----TGTTC--ACATTCTAAACTGTTA--T-----AATCAC---TT--AG----GGTT----GAA-G------GTATT----TACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACT-TCTAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATGATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGA-CATGT---GTGA----GAACATGTGCTA--------TAA-GT----A-TTG-GCATGTTGT---CAGTACTGTTATTGAT--TG--AAGATTA-----GAATCCTG--TTAAAATTCA-T--AGAAG-AAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACATGCTGC
gi|5 : CATATATTA-GTCG-TGAATT-ACTTTGT-CGTTGTTG---CTCCGGTTGGCT----GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTTT-AATTTGA-GTAATGTTATTTT-GCTGAAGTT---AATGAAATAGAGGACATTAAA-----------TTGA----TCAC---------GTTGAAG---GT--CA------CAGAC-AGCAAACACGACGACA---C-TTG--TCAATGTCAACCAGTTTTAATTTGGTGTTAAAGTCACAC--AGTT-TATTTA-CACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATTAGAGTTAAACATCTTTGC--AAAGATTATTG--AATCCACTCTT----AATCACA-TTTAATACGTGATGTCC-----AATA----------------A--A-ATAG---TATA--TT-----CAGTGA--ATAA-AACAA-------AA--CA-----TATG-TT----TAGAATA-A-AAAGTT----A-TTGTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATATAA--CCAGCCA---ACGACGATGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTATA-G--A-TCTGTA--TCC-GATC-TTCTGTTATTACAGTA---T--AACCC-TGAAAAAT--T--AACA-TCCATCCA--TA-AA-T-----------ACTTAA-AGGT--GCTAGTTTTAC----------ACA----------AT-GAACGG----TATG--TG-TT-AGACAAATGATT--ATTCATCAGAAGGAA---ACA--T----AAGTGTAAAAAA--TT--AGCAAAAT-AGGTT---AGGT---TTTAAAATG----AA-CAAT----------A--TGTA-----AA-A-AA------ATATCA----TATAACA-------ATCAG---CAAT-TG----TGTTTTGATATTCTAAATTGTTA--T-----AATCAG---TT--AGT---GTTT----GAA-G------GTATT----TGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACT-GTTAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATGACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGA-CATCT---GCGA----GAAAA-GTGCTA--------TGA-TTATTAA-TTG-GCATGTTGT---CAGTATTGTAAGTGAT--AG--GAAATCT-----GAATCATG--TTAAAGTCCA-T--AGTGA-AAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCATAAAAA
gi|13 : TGTATTAAACCG-TGAATT-TTCCTTT------TTATAACTCCGGTT--GTCC--GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTGT-TATTTAAAGTTATGGTGTGAT-GATGAGGTT---GA----------------AGA-----------TTGG----TGAA---------GTTGAAG---A---CA------CAGAC-AGCAAATACGACGACA---C-TTG--TCAATTTCTATCAGTTTTAATTTGATGTTAAAGTCACAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTTATAGT--AATATCTAAGC--AATAAT-ATCA--AATCCGTTCAA----AATCACACTTTAA-CAGCGGTtg
gi|25 : cTGTATTAAGCCGGTAATTT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGTG--T--C-CGTAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTAAAGTCATGTAATGTTTGCTGAAGTTTATGA----------------AGC-----------TTAAAACACGAAATGTATTACGTTGAAG---GT--CA------CAGAA-CACAAATACGACGACA---C-TTG--TCAATATTTATCAGTTTTAATTTGGTGTTAATGTCGCACTAAGTT---TT-A-AATATAAAATctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAAT-ATTTTGT-TATTGTT-T--CTCAGGTT--GTCC--ATGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTTATT-AATCTGCAG--ACACTA----------AATT-----------------------------------TTAA----TG------------TCAAAT---AT--CA------CAGAC-AGCAA-TATGATGGCA---G-TTG--TCAATTTCTATCAGTTTTAATGTGGTTTTAAAATCATAC--AGTT-TATT-AACAAATAAACTTTTAAATCTA-AT-AATG----ATTAAATAAAGTCACAGTATTACAGG--AACATCTAAGA--AGTTAT-AT----AA-CAATTT--------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATACGAAAGTATATT----TGGTGA--A--TAAA--------TTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTTGAATTTG-AATTTATG-TTTAAATAAAATAGA-AA-ATT----A-TAA-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAATTAT--CCAG---------ATGATG----ACAA-GTTCT------A--AAA-ATA-T----------------AATT-TTCTACCATC--------------------AATAAT--TAAAAAAGTCCACCCT--TA-AA-T-----------ACTA-----GT--GCTAGTTTTAC----------CCA----------AT-ACAAAG----GATG--TA-TTAGTA-AAGC-A----ATTAATC--ACCAAA---ATA--T----ATATGTAAACAA--TC--AACAAAAT-ATATG---AGGT---TTTAAAATG----AA-CAAT----------A--------------------------A-GA----T---ACA-------ATCAG---CAATATG----TTTTC--ACACTATAAACTGTTA--A-----ACTCAC---AT--AA----GCTT----TGA-A------TTATT-----------------AACTTAA------TTTA-----TA----TTA----ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAAATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGA-CATCT---GAGG----GAACATGTGCTT--------TAA-CTA---A-TTG-ACATG--------GGTATTGTTATTGATAAAA--AAAATT------GAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAA-AA--GCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----ATAAAATAC-TGCa
gi|10 : gaGAATTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTT--GTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTT------GCTTAAGTT---GA----------------AAAAA---------TTGA----TGAC---------ACTAAATTTTA---CATTATTTCAGTC-AGCAAATACGACGACA---C-GTG--TCAATTTATAACAGTTTTAATTCGGTTTTAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTGGA----------ATCTGAGT--AGTAAT--TTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGATAGTACATC----TGGTTC--ATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGGCTAGAATCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTT----A-TTA-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAATAT--TCAGACATGGACTA---TATCTAAAAA-ATATT------ATTCACTCTC-T--C-TCTatacaatttatactgaagtat
gi|9 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGAATTATCCTCGT--GTTTTTTTA-CTCAGGTT--GTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTT------GCTAAAGTT---GACA--------------AAA-----------TCAA----TGAC---------ACTAAATTTTA---CATTATTTCAGTC-AGCAAATACGACGACA---C-GTG--TCAATTTATAACAGTTTTAATTCGGTTTTAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTGGA----------ATCTGAGT--AGTAAT--TTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGCTAGTACATC----TGGTTC--ATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTGCTAGAATCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTT----A-TTA-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAATAT--TCAGACATGGACTA---TATCT-AAAA-ATATT------ATTCACTCTC-T--C-TCTaacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|12 : caataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagaattataatacaaaggagaagaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacatatttttgtaagtttagcaaactagaggcgatgtttcgaaaggaatcattttaggaaagttttattaaaccagtaagatgaagttatttcagtcagaattgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaTTTT-AATTTCAA-TAATATT--GAT-GA--AAGAT---GA----------------AGACACTAGC----TTTA----TTGT---------GTTGAAT---GTCTCA------CACCATAG--AAT-CGACGACA---C-GTG--TCAATTT---TC---TTTCA------GTTAAAGTCACAC--AGTT-TATC-AACAAATA--TTTTCATATATATGT-AA------ATTACACAAA--TACAGCGTA-C-------CATCTAGCT--AGTAAT-AT----AA--CATT---------TCACA------------------AT-AAAATAGCATAT-----TGGTGA--A--TAAACTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGGCTTGAATCCA-AATTTATG-TT----TAA---T-A-AA-G------------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNNNNN--NNNNNNN---NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN------N--NNNNGTA--------TATAATCCA-GACA---CTG------------------TCCT-CCAATAAT--T--GGAAGTCCTCCCTCATGCAA-ATACCCTTTGATATTAAACTGGT--GCTAGTTTTAC----------ACATAGCACAGACATAACACAG----GATT--TG-TCAGGACAATC-AATTAATT-ATCAGAAAGAA---ATA--T----AAATGCAAACAA--TC--AACAAAAT-GGGTT---AGGT---TTTAAATTG----TA-CAAT----------A--GGTA-----AC-A-AA------ATA-TAGGTGT---ACATTCT---ATCAT---CAATATG----TTTTC--ACACCATAAACTGTTA--T-----AAACAC---TT--AGACCAGACT----TTA-C------GTGCT----TATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTaacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaatgct
gi|3 : atatatttaatatttatac-GATAAAGTT---GA----------------AGACAC--------TAAA----TAAATGTATTAT-GTTGAAG---GT--CA------CAGAC-AGCAAATACGGCGACA---C-TTG--T---------------TTTAATTGTTTCTAAAGT---------TTATGTT-A-AAAATA--GTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT---GT--A---TCTAAGTTTAATGAT-ATAT--GATTCACT-AA----ATTCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTCT-----TTGTG---A-ATAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA----------------------G-TT----CAAA----------------A-TTA-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAATAT--CCAAACA---GTGACTATGTCC-TAAA-caattcgtctgattgatt
gi|2 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatactta-GATAAAGTT---GA----------------AGACACTAAATAAATTTA----TTAT---------GTTGAAG---GT--CA------CAGAC-AGCAAATACGGCGCCA---C-TTGGTTTAATT-------GTTTCTA---------A-----------AGTT-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA-TA-A-TAATCAAATTCACAGT---ATTGT-----ATCTAAGTTAAATGAT-ATAT--GATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTCT-----TTGTG---A-ATAAACTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA----------------------G-TT----CAAA----------------A-TTA-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAATAT--CCAAACA---GTGACTATGTCC-TAAA-ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|7 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaactta-GATAAAGTT---GA----------------AGACACTAAATAAATTTA----TTAT---------GTTGAAG---GT--CA------CAGAC-AGCAAATACGGCGACA---C-TTG-----------------TTTTAATTGTTTCTAAAGTTTAAG--A-------T-A-AAAAT--AGTTTCAAAGATA-ATCAAGA-TA-A-TAATCAAATTCAAAGT---ATTGT-----ATCTTAATTAAATGAT-ATAT--GATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTTCTTT----T--TATAGACTCTTTGTG---A-ATAAACTTAAAT---------------------AATAATACTT----TCCATAATATA-G-TT----CAAA----------------A-TTA-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAATAT--CCAAACA---GTGACAATGTCC-TAAA-ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|1 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaAAGTT---GA----------------AGC-----------TTGA----TGAA---------GTTGAAG---A---CA------CAGAA-AGCAAATACGACGACACTGACTTG--TCAATTTCTATCAGTTTTAATTTGGTATTAAAGTCAAAC--AGTA-TTTT-AACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTAACAGC--AACATCTAAGC--AATAAT-ATTC--AATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTAAAATAATTTATA----TGGTGA--A-TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGGCTGGAATCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTT----ATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAATTGT--TCAGCCA---ACGACGCTGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTATA-T--C-TCTATA--TCC-TATC-TTCTATTATT----TA---T--ATCCC-TGAATAAC--T--AACTGCCCA-TCT--TT-AA-CT----------GCTAGACAGGT--GCTAGTTTTACATAAGTGTAAACA----------AT-CTACAA----AATA--TG-TTTGG-----T-GGT---TTTA-CAATGAACA---ATAGGTAATAAAGTATATACAA--TC--AGC--AAT-ATGTTTTCACAC---TCTGAATTGTTTTAATCACTTAGTCTTTGAA--GGTATTTACAT-A-AA------AGG-GA----------A-------GTGAG---AAATATTTTACTATTA--ACACT-TAA----TTA--TC----AATCAC---TT--ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : gtacTAA----TGAA----------TCGAAG---GT--CA------CAGAC-AGCAAATACGGCGACA---------------CTC-----GTTTTAATT----GTT----TCTAA---AGTT-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT---GT--A---TCTAAGTTAAATGAT-ATAC--GATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAT----AT--CATAAACTCTTTGTGA--A--TAAACTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG------------------------T----TAAAA---------------A-TTT-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|11 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgtgaaaacattccaagTTTTAATTGTTACTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGA-TA-A-TAATCAAATTCACAGT---ATTGT-----ATCTAAGTTAAATGAT-ATAT--GATTCACT-AA----AATCACACTCTaa
gi|19 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgATCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATAAAGTA-TATATT----TGGTGA--A--TAAACTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGGCTGTTATCCA-AATTTATA-TT----TAAAATA-A-AA-GTT----A-TTG-AAGT-------------------------TAATTTC-A-CT--GACTGGTAAATTAT--CT--------------TTCTTT-AAA-----TT------A--AATTAAAGT--T-TCTTT---CTT-G-TCGCTTTGTTAT-----TG------ATCTT-TAAA-------------ATCCACCCT--GT-AA-T-----------ACTTAACTGGT--GCTAGTTTTCC----------ACA----------AT-GCATAG----GAAT--TA-TTAGAACAAAC-AATT-AATCTTCAAAAGTAA---ACG--T----AATTGTCAACAA--TC--AACAAAAT-ATGTT---ATGT---TTTAAAGTG----AA-CAAT----------A--GGTA-----GTAA-AA------ATA-TA----T---ACA-------ATCGG---CAATATttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|15 : A----TGATGATCC-ATGCATTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGGTTAAAATCCA-ACTTTATG-TC----ACGTATA-A-AA--------------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAAA----------------GTTAC--TATCC-AGA---------------------TA-G--CGTCTGCG--TTCAGAAT-TGCT-TTATT----TG---A--GTCTCGTAAAAAATATT--AAATGTCAACTCT--TA-AA-T-----------ACTTAATATAT--ATT-GTTTCAC----------ACG----------AT-ATACAG----GA-ACTTG-CTTGTATAAAC-AATTAATT-ATCAAAAAGAATTTAAA-------AAG-GTAAACAAACTCAAGACATAATTATGTT---GGGC---TTAAAAACG----GA-CAAA----------A--GGTG-----AT-ACAATGTTTTATA-TA----T---ACATTGTATTATAAT---CAATAGG----TTTTC--ACACCTTATACTGCTA--TTAGCAAATTGCG--TT----------TT----GAA-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTggtct
gi|45 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataactagagatggtgatgatgA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGGCTAAAATCGA-A---CGTG-C-------------A-AA-GTT------TTA-AAGTAAATTC-ACAAT-GGCCTGA--CGACAATTgttgtttcattcaccat
gi|14 : AATCCA-AATTTATG-TT----TACATTA-ACAA-GTT----A-TAA-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG--AAATTTTTTCCAGCCA---ACAACAATATCC-AAAAAGTATT------A--CAATATA-T---------A--CC--------TCTGTTATT----TAACAT--CTCTC-TCAATAAT--C--AGAAGTCCACCCT--TA-AA-T-----------ACTGAATTGGT--GCTAGATTTAC----------ACA----------AT-GCACAT----GATG--TG-TTAGGACAAAC-AATT-AATCATCAAAAGAAA---ACA--T----AATTGTAAACAA--TA--AACAAA-T-ATGTT---AGAT---TTTAAAATG----AA-CAAC----------A--GGAA-----AT-A-AT------ATA-TA----T---ACA-------TTGAG---CAATATG----TTTTC--AAACTATAAATTGCTA--T-----TATAAC---TT--AGT---TTTT----GAA-AGTACACGTATT----TACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCT-TTCAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAGACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGA-CATCT---GTGA----GAACATGTGCTA--------TAA-TT----A-acgggcacttatcca
gi|11 : A-A-AA-GTTCAAAA-TTA-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCAGATCT--GACTAGTAAAATAT--CCAAACC---GTGACTATGTCC-TAAA-attattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|18 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaTCT-AAAA-GTATTTTTATCA--GACAGTA-A--C-TATGT---CCT-AAAA-TGTTGTTCTC----TA---TCAATCCT-C---TA-T--T--AAC------TTCT--TT-AA-AT----------ACTAAA---ATTGGTTTG-TTTGC----------ACATAC-------AT-ACATGGCTTTGGTA--TGGTTTAGATA--C--TT--AATCATCAAAAGAAA---ACA--T----AAACGCAA-----------ACAAGAT-ATACT---GG--------AGAATA----CA-C----------------GGTA--------A-AA------ATGTGA----T---GTAC------ACCAAAATCAAAACT----TTTTC--ACGCCTTCAATTGCTA--T-----AATCAG---TT--AG----GCTT----CAACA------GTATA----TATActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|16 : cccgaAA-ATAT-------A--AAATATA-TGAC-TCTGTA--TCA-GATC-TTCTGTTATT----TA---T--ATCCC-TGAATAAT--T--AATTGCCCACCCT--TA-TT-T-----------GCTAAACAGGT--GCTAGTTTTAC----------GCA----------AT-ACACAG----GATG--TG-TTAGAA-AAAT-AATT-AATCATCAGAAGGAA---ACA--T----AAGTGTAAACAA--TC--AACAAAAT-ATGTT---AGGT---TTGAAAATG----AA-CAAT----------A--GGTT-----AT-A-CA------ATA-TA----T---ACA-------ATCAG---CAATATG----TTTTC--ACACCCTAAATTGTTA--T-----AAGCAC---TT--AGT---CTTT----GAA-G------GTATA----AATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACT-GTTAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAGATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGA-CATCT---GTGA----GAACATGTGCTA--------TAA-TTA---A-TTG-ACATGTTGT---CAGTATTGTTGTTGAT--AG--AAAATTT-----GAATCCAA--TTAAAATTCA-T--TGAGA-ACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACATGCCGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|17 : t-T--C-CCTGTA--TCC-GATC-TTCTGTTATT----TA---T--ATCCG-TGAATAAT--T--AACAGTTCACCCT--TA-AACA-----------A--AAACAGGT--GCTAGTTTTTC----------ACA----------AT-GTACAG----GATG--TG-TTAG-ACAAAC-AATTAATT-ATCAGAAGGAA---ATA--T----AAGGGTAAACAA--TC--AACACAAT-ATGTT---AGGT---TTTAGAATG----AA-CAAT----------A--GATG-----AT-A-AA------ATA-TA----T---ACA-------ATCAG---CAATATG----TTTGC--ACACTCTAAATTGCTA--T-----AATCGC---TG--AGT---CTTT----GAC-G------GTATT----TACATGAAAAGGGAA-------------CACT---TAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAAACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGA-CATCT---GTGA----GAACAAGTGCTA--------TAA-TTA---A-TTG-GCAAGTTAT---CACTATTGGTATTGAC--AG--AAAATTT-----GAATCCTG--TAAAAAATCA-T--AGAGA-AAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|22 : tcT--AATTATCA---GAAA---ACA--T----AAAAGCAAACAA------GACA---T-AC--------------------TG----GA-CAAT----------ACAGG-------AT-A-AA------A-------------AC------------G---TA---------TGTAC--AC---CTAAACCATTAAGT-----TATCACACCTTCAAA----TGCTCTTCGAC-A------GTATA----TACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT-CG-CATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTA-AA--ATATT------AGG----ACTTGAC-ATTGAGTATATTAAGTGA----AAGCA-GTATTA--------ACA-GT----A-tgt
gi|1 : gtggtttaaatact---ACA--T----AAGTGTAAACAA--TC--TACAAAAT-ATGTT---TGGTGGTTTTACAATG----AA-CAAT----------A--GGTA-----AT-A-AA------GTA-TA----T---ACA-------ATCAG---CAATATG----TTTTC--ACACTCTGAATTGTTT--T-----AATCAC---TT--AG----TCTTT---GAA-G------GTATT----TACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACT-ATTAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAGATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGA-CATCT---GTGA----GAACATGTGCTA--------TAA-TT----A-TTG-ACATGTTGT---AAATAatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|20 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttTGTTA--T-----AATCAC---TT--AG----TCTTT---GAA-G------ATTTT----TACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGTTT--CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACGACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGA-CAACT---GTTA----AAACAAGAGCTA--------TAATTT----A-TTG-GACTGTTGT---TAGTATTGTTAATGAT--AC--ATAATTT-----GAATACTG--TTAAAATTCA-T--AGAGA-AAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACATGCTGCtatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|13 : atgaagataaatattctgataaaaacaaaatgttctcgatactgttgttTT----GAA-G------GTATT----TACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATT-GTTAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAGACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGA-CATCT---GTGA----GAAGTTGTGCTA--------TAA-TC----AGTTG-GCATGTTGT---CAATCTTGAGTTTGAT--AGAAAAAATT------GAATCCTG--TTAAAATTCA-T--AGAAA-AAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACATGCataaaatatataattctcaaacat
gi|40 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgttatagtaatatctaagcaataatatcaaatccgttcaaaatcacactttaacagcggtctTTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACTAGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGA-CAT--------------AA-----GCTA--------TAA-GG----A-ATACGCACGTTAT---
gi|1 : ctTTTCATAT-ATATGTTTTT-CAGCGC-----ATGATT-TGTT---TT---GATAT-GTTGATGATTAG-C---T---GT-------AACGTATTCTAAAGTCAAATAAAGT----A-TCT-GTATTCTGTATTCAGTTTTGTTATTGAT--AG--AAGATTT-----GAGTCCTG--TTGAAATTCA-T--ATAAG-AAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACATGCTGtgt
gi|37 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaaTAGTTGTCATTTGA-CAATT---GTGA----GATCATATGCTA--------TA--------G-TTG-GCATATTGT---T----CT----TTGCT--TG--AA-ATTAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-T--A-AAG-AAA----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTATTAAAAtataaaacttat
gi|39 : ttTTGACAGTTGA-CATAT---GTTATCTTGAAAATGTGCT---------TGA-------A-TT-----TATTGA---CAGTATTGTCATTGAT--AG--AAAATTT-----AAATC-TGAATGAAAA---A-A--AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAggtcgctgttt
gi|41 : T----A-TTG-GCACATTAT---TAGC-TTGTTATTGTT--AG--AAAATTT-----GAATGCTG--TTAAATGACA-T--AGAGA-AAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCATGAGA
gi|43 : ataATGTTAT---CAGCATTGTTATTGAT--AG--AAAATT------GAATACTG--TTAAATTTAAAT--AGA-G-AAATACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACATcat
gi|47 : TAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT-ATAAACATGCTGC
18 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|44 ): TTTCCGATCTGACTAGTGAAAATTGTTTTGTTAACAAAATACATGTCTTTTGCATGGTTAAGATAAGAAGACATAAAAGCAAACAAGATATACTT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 22 11 33333333 111111111 66666666666666666666666 22222222 1111111 1 1 1111111 11 22222 66666666666666 1111111 1111 2222222 111 11111111 22222222 11 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111 222222222222222222222 11111111111111111111 11111111111111 111 1111 1111111111 3333333 111111 111111 111111111 1111111 11111111111 1111111111111 1111 1111 1111111
lowQualScore : 0 8 1 0 2 88 1 5555 1 55 6 8 5 0 33 8 0 88888888 1 0 3 777777777 11111111111111111111111 1 3 6666 2 2 22222222 3 3 6666 3 0000000 2 2 1 4444444 2 44 5 3 0 66666 2 4 7777 3 33333333333333 9999999 3 5555 1 1111111 0 2 9 111 55555555 33 66666666 3 1 0 2 00 11 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 2 444 88 33 1 5555 555 0 22 6 33 55 333333333 111111111111111111111 55 44 77777777777777777777 888 99999999999999 33 666 2 444 444 7777 2 4444444444 66 333 2222222 5 111111 22 2 44 3 55 444 77 33 44 3 44 44 0 44 55555 222 444444 555 222222222 555 555 5555555 33 2 3 1 3 3 77777 555 22222222222 6 0000000000000 6666 3 111 2 11 3 1 2 0 3 3 55 0 555 0000 0 8888 3 0 0 3 3 2 44 0 3 0 3 0 2 0000000 3 77 4
lowQualScore : . . . . . .. . .... . .. . . . . .. . . ........ . . . ......... ....................... . . .... . . ........ . . .... . ....... . . . ....... . .. . . . ..... . . .... . .............. ....... . .... . ....... . . . ... ........ .. ........ . . . . .. .. . .................................................. . . . ... .. .. . .... ... . .. . .. .. ......... ..................... .. .. .................... ... .............. .. ... . ... ... .... . .......... .. ... ....... . ...... .. . .. . .. ... .. .. .. . .. .. . .. ..... ... ...... ... ......... ... ... ....... .. . . . . . ..... ... ........... . ............. .... . ... . .. . . . . . . .. . ... .... . .... . . . . . . .. . . . . . . ....... . .. .
lowQualScore : 8 0 4 4 7 77 6 3333 0 66 6 7 0 7 44 8 2 99999999 9 4 3 777777777 22222222222222222222222 0 1 5555 1 3 33333333 1 1 5555 5 8888888 4 0 4 6666666 9 99 7 8 2 66666 1 2 2222 5 99999999999999 2222222 1 3333 2 3333333 1 9 4 111 11111111 66 11111111 2 4 1 7 11 00 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111 5 5 5 111 77 44 1 3333 000 3 66 7 00 00 888888888 777777777777777777777 88 66 99999999999999999999 222 66666666666666 44 555 2 777 777 0000 7 3333333333 22 999 3333333 7 888888 11 5 99 7 88 444 88 44 66 3 22 22 4 22 88888 999 333333 000 333333333 000 000 4444444 99 9 1 4 1 1 77777 444 11111111111 2 0000000000000 5555 3 444 4 33 6 8 8 1 5 4 00 4 888 4444 7 8888 1 6 5 3 3 5 66 8 3 1 1 5 4 0000000 1 33 0
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTC-TAATTTGAAGTAATGTTATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACAC----TA-A-----TNA-TG----ACGTTGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTTA-A-GT---A-CATCTAAGTT--AA-TGAT-AT-ACGATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCANTA-ANATAGT-ATA-T-T-GGTGA--A---ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---CCAGACAGCGACNATGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---T--ATCC-CTGAATAATTAANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACAGGTGCTAGT---TT---T----A-CACA----------AT-ACACG-G-----G-ATGTGTTAGGA--CAAACAAT-TANTCATCAAAAGG-AAACATA---AGTG--CAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGTTAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
Reference ( family-2250 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCNGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTC-TAATTTGAAGTAATGTTATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACAC----T--------TNA-TG----ANGTTGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTNAC--GT---A-CATCTAAGTT--AA-TGAT-AT-NCGATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCANTA-AGATAGT-ATA-T-T-GGTGA--A---ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---CCAGACAGCGACGATGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---T--ATCC-CTGAATAATTAANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACAGGTGCTAGT---TT---T----A-CACA----------AT-GCACA-G-----G-ATGTGTTAGGA--CAAACAAT-TANTCATCAGAAGG-AAACATA---AGTG--TAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTNTTAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
gi|1 : AA-GTT---------GAAG---------C----T--------TGA-TG----AAGTTGAAGA-CA--------CAG-AAAGCA-AATACGACGACACTGACTTGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTAT-TAAAGTCAAAC--AGTA-TTTT-AACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTAACA-GC---AACATCTAAGC---AA-TAAT-AT-TCAATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTA-AAATAAT-TTA-TAT-GGTGA--A---TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTTATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAAT----TGT---TCAGCCAACGACGCTGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTAT----A-T--CTCTATATCCT-ATC-TT--CTATTATT----TA---T--ATCC-CTGAATAACTAACTGCCC--------------ATCTTTAACTGC--TAGACAGGTGCTAGT---TT---T----A-CATA----------A------------------GTGT--------AAACAATCTA--CA---------AAATATGTTTGGTGGTTTTACAATGA--ACA-A-------TA--GGT-------AATAAA--------GT---------------A---TAT-------------AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTGAATT-GTT-TT-----AATCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACTATTAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGACATGTTGTAAATAT
gi|1 : gtacTCAGTTTTGTTATTGAT-AG-AAGATTTGAGTCCTG--TTGAAATTCA-TATAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|10 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtatGAATTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGT-----T--GCTTAA-GTT---------GAAA------A-AA----T--------TGA-TG----ACACTAAATTTTACATTATTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG-GA-----------ATCTGAG-T--AG-TAAT-TTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATA-AGATAGT-ACA-TCT-GGTTC--AT--ATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---TCAGACATGGACTATATCTAAAAA-ATATT------ATTCACTCT----C-T--CTCTtataaaacttat
gi|11 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGTTTTAATT-GTTAC-TAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT----GT---A---TCTAAGTT--AAATGAT-AT-ATGAT--------------TCAC----TAA-AATCA-----CACTC-------------T-T-TGTGA--A----TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AA---------------------AA-----G-TT----CAAAAT------------T-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGTT-TTCAGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---CCAAACCGTGACTATGTCC-TAAA-aacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttCCTTTAAATA---TGAAAA-----TTGT---TT---TGTTAA-CACA----------AT-ACATG-GCTTTTGCATG-GTTAAGA--T--AC--T-TTTTTATCAAAAGA-AAGCATA---AAAG--CAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|12 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTACTTT--TAATTTCAA-TAATATT-------GATGAAAGAT---------GAAG------ACAC----TAGCT----TTA-TT----GTGTTGAATGTCT--------CAC-ACCATAGAAT-CGACGACACG----TGTCAATTTTCTTTCAGTT--------------AAAGTCACAC--AGTT-TATC-AACAAATAT--TTTCATATATATGT--AAATTA---CA--CAAA--TACAGCGT-AC---------CATCTA-GCT--AG-TAAT-AT-A--------------------ACATTTCA------------CAATA-AAATAGC-ATA-T-T-GGTGA--A----TAAACTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGG-CTTG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAA--TA-A-AG----------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNN----NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN------N--NNNNGT----A-------TATA-----ATC-----CAGACACT------------GTCC-TCCAATAATTGGAAGTCCTCCCTCATGCAAATACCCTTTGATAT--TAAACTGGTGCTAGT---TT---T----A-CACATAGCACAGACATAACACA-G-----G-ATTTGTCAGGA--CAATCAAT-TAATTATCAGAAAG-AAATATA---AATG--CAAACAATCA--ACA-AAATGGGTTA--GGTT--TTAAATTGTACAATA--GGTAAC-A-A-A------A---TAT----AGGTGT---AC---ATTCT---ATCAT--CAA-TATGTTTTC-ACACCATAAACT-GTT-AT-----AAACAC---TTA------G-AC-CA-GACTTTA-C------GTG----CTTATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTgatata
gi|13 : atatatttaatatttaTGTATTAAACCG-TGAATT-T-----T-CCTTTTTATAACTCCGGTTGTCC--GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTG-TTATTTAAAGTTATGGTGTGAT--GATGAG-GTT---------GAAG------A-------T--------TGG-TG----AAGTTGAAGA-CA--------CAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGATGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTTATA-GTA--A-TATCTAAG-C--AA-TAAT-AT-CAAATCCGTTCAA----AATCACACTTTAA-CAGCGGTcaattcgtctgattgatt
gi|13 : cATATGATATTGATTAATTAAAGTCA-CAGT----GTTAT-A-GTA------A---TAT----C----T---A---------------AG--CAA-TA--------ATA-TC-AAATCCGTTCAA-----AATCACACTTTAACAGCGG-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATTGTTAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAG--ACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGACAT---CTGTGA----GAAGTTGTGCTATAATC----AGTTGGCATGTTGTCAATCTTGAGTTTGAT-AGAAAAAATTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAAAAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACAT-GCctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|14 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatat-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TACATTA-ACAA-GTTATA-A-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG---AAA----TTTTTTCCAGCCAACAACAATATCC-AAAAAGTATT------A--CAATAT----A-T--------ACC--------T--CTGTTATT----TAACAT--CTCT-CTCAATAATCAGAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TGAATTGGTGCTAGA---TT---T----A-CACA----------AT-GCACA-T-----G-ATGTGTTAGGA--CAAACAAT-TAATCATCAAAAGA-AAACATA---ATTG--TAAACAATAA--AC--AAATATGTTA--GATT--TTAAAATGAACAACA--GGAAAT-A-A-T------A---TAT----A----T---AC---A-------TTGAG--CAA-TATGTTTTC-AAACTATAAATT-GCT-AT-----TATAAC---TTA------GTTT-TT-GA----A-AGTACACGTA----TTTACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCTTTCAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAG--ACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-
gi|15 : ACTAGAGATGGTGATG-A-T-GATGATGATCCATGCATTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGG-TT-A-A-AATCCA-ACTTTATG-TC----ACGTATA-A-AA----------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAAAGTTACTAT---CCAGATAGCGTCTGCGTTC-AGA----ATT------G--CTTTATTTGAG-T--CTC-GTAAAAA-ATA-TTAAATGTCA--------------ACTC-TTAAATACTTAATA-TAT--------------ATTGTTTCACACGATATACAGGAACTTGC---TTGTAT----A-AACA----------AT-TAA----------------TTATCA--AAAAGAAT-T-----TAAAAAGGTAAACA-------------AAC--TCAAGACATAATTATGTTG--GGCT--TAAAAACGGACAAAA--GGTGAT-ACA-ATGTTTTA---TAT----A----T---AC---ATTGTATTATAAT--CAA-TAGGTTTTC-ACACCTTATACT-GCT-ATTAGCAAATTGC------------G-TT-TT-GA----A-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTattattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|16 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataAA-ATAT-------A--AAATAT----A-TGACTCTGTATCAG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---T--ATCC-CTGAATAATTAATTGCCC--------------ACCCTTATTTGC--TAAACAGGTGCTAGT---TT---T----A-CGCA----------AT-ACACA-G-----G-ATGTGTTAGAA---AAATAAT-TAATCATCAGAAGG-AAACATA---AGTG--TAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TGAAAATGAACAATA--GGTTAT-A-C-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACCCTAAATT-GTT-AT-----AAGCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TAAATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACTGTTAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATTA---A-TTGACATGTTGTCAGTATTGTTGTTGAT-AG-AAAATTTGAATCCAA--TTAAAATTCA-TTGAGAACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACAT-GCCGgttgtttcattcaccat
gi|17 : t-T--CCCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---T--ATCC-GTGAATAATTAACAGTTC--------------ACCCTTAAACAA---AAACAGGTGCTAGT---TT---T----T-CACA----------AT-GTACA-G-----G-ATGTGTTAG-A--CAAACAAT-TAATTATCAGAAGG-AAATATA---AGGG--TAAACAATCA--ACA-CAATATGTTA--GGTT--TTAGAATGAACAATA--GATGAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTGC-ACACTCTAAATT-GCT-AT-----AATCGC---TGA------G-TCTTT-GA----C-G------GTA----TTTACATGAAAAGGGAA-------------CAC--TTAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAA--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGACAT---CTGTGA----GAACAAGTGCTATAATTA---A-TTGGCAAGTTATCACTATTGGTATTGAC-AG-AAAATTTGAATCCTG--TAAAAAATCA-TAGAGAAAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|18 : tcTCT-AAAA-GTATTTTTATCA--GACAGT----A-A--CTATGT-CCTA-AAA-TG--TTGTTCTC----TA---TCAATCCTCT-----ATTAA-----C--------------TTCTTTAAATAC--TAAA-----ATTGGTTTGTT---T----G-CACAT---------AC-ATACATG-----G-CTTTGGTATGGTTTAGATACT-TAATCATCAAAAGA-AAACATA---AACG--CA-------A--ACA-AGATATACTG--G-------AGAATACAC------GGTAA--A-A-ATGTG--A---TGT----A----C---ACCAAA-------ATCA----AA--ACTTTTTC-ACGCCTTCAATT-GCT-AT-----AATCAG---TTA------G-GC-TT-CA----ACA------GTA----TATATAtgt
gi|19 : cccgaATCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATA-AAGTA-T-ATA-T-TTGGTGA--A----TAAACTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGG-CT-G-TTA-TCCA-AATTTATA-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-G-AAGT-------------------------TAATTTCA--CT--GACTGGTAAAT----TAT---C-------------TTTCT-TTAA---ATT------A--AATTAA----AGT--TTCTTT-CTTG--TCGCT--TTGTTATT----GA---T-------CT------TTAAAA-TCC--------------ACCCTGTAATAC--TTAACTGGTGCTAGT---TT---T----C-CACA----------AT-GCATA-G-----G-AATTATTAGAA--CAAACAAT-TAATCTTCAAAAGT-AAACGTA---ATTG--TCAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--TGTT--TTAAAGTGAACAATA--GGTAGTAA-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCGG--CAA-TATGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|2 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACAC----TAAATAAATTTA-TT----ATGTTGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AATACGGCGCCACT----TG--------------GTTT-AATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT----GT---A---TCTAAGTT--AAATGAT-AT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TA-TCATAGA-CTC-T-T-TGTGA--A----TAAACTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA--------------------------G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---CCAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-gtct
gi|2 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-----TTGT---TT---TGTTAA-CACA----------AT-ACATG-GCTTTTGCATG-GTTAAGA--TA--C--T-TTTTTATCAAAAGA-AAACATA---AAAG--CAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|20 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgccacttggtttaattgtttctaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataattcttttcataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctggtggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaatttt-A-A------A---TATTCTGA----T---A----A-------A--AA--CAA-AATGTTCTCGATACTGTTGTTT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------ATT----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGTTT-CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACG--ACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGACAA---CTGTTA----AAACAAGAGCTATAATTT---A-TTGGACTGTTGTTAGTATTGTTAATGAT-AC-ATAATTTGAATACTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACAT-GCTGCgatatact
gi|22 : atgaagatAAATACT-TAATTATCAGAA----AACATA---A------AAGCAA-----ACA-AGACAT----------------ACTGGACAATACAGG--AT-A-A-A------AACGTAT----G----T---AC---A-------CCTAAACCAT-TAAGTTATC-ACACCTTCAAAT-GCT-------------C---TTC------G-AC------------A------GTA----TATACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT-CGCATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTAAA-----ATATT------AGGAC----TTGACATTataaaatatataattctcaaacat
gi|25 : gtggtttTGTATTAAGCCGGTAATTT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGT-GTCC--GTAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTC-TAATTTAAAGTCATGTAATG-TTTGCTGAA-GTTTAT------GAAGCTTAAAACACGAAAT--------GTA-TT----ACGTTGAAGGTCA--------CAGAACA-CA-AATACGACGACACT----TGTCAATAT-TTATCAGTTTTAATTTGGTGT-TAATGTCGCACTAAGTT-T------TAAATATAgagtatattaagtgaaagcagtattaacagtaatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|3 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACAC----TAAA-----TAAATGTATTATGTTGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT---------TTATGTT-A-AAAATA--GTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT----GT---A---TCTAAGTTT-AA-TGAT-AT-ATGATTCACT-AA----ATTCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TA-TCATAGA-CTC-T-T-TGTGA--A----TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA--------------------------G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAA----TAT---CCAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-aaata
gi|3 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttaCCCTTCAATAT--AAAAT---TGTT--T---TT---T----AACACA----------AT-ACATG-GCTTTTGCATG-GTTA------AAATACT-TTTTTATCAAAAGA-AAACATA---AAAG--CAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|37 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttagataaagttgaagacactaaataaatgtattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttatgttaaaaatagtttcaaagataatcaagattataatcaaattcacagtattgtatctaagtttaatgatatatgattcactaaattcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccaatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTAGTTGTCATTTGACAA---TTGTGA----GATCATATGCTATA-------G-TTGGCATATTGTT--CTTTGC--TTGAA-AT-TAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-TAAAGAAA-----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTAT-TAAAAGGTCGCTGgatatacttga
gi|39 : ttTTGACAGTTGACAT---ATGTTATCTTGAAAATGTGCTTGAATT------------TATTGACAGTATTGTCATTGAT-AG-AAAATTTAAAT-CTGAATGAAAA--AA-AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAttt
gi|4 : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTTCTCC-CACGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTC-TAGTTTGAAGTAATATTATGAT--GATGAA-GTT---------GAAG------A-------T--------TGA-TG----AAGTTGAAGA-CA--------CAG-AAAGCA-AATACGACGACAAT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTTATTTGGTGT-TAAAGTCAAAC--AGTT-TATT-A-CAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTAACA-GT---AACATCTAAGC---AA-TAAT-AT-TAAATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTA-AAATAGT-ATA-TAT-GGTGA--A---ATAAACTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAAT----TAT---CCAGCCAGCTACGCTGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATC----TA---T--ATCT-TTGAATAATTAACAGTCC--------------ACTCTTGAAAAC--TAAACAGATGCTAGC---TT---T----A-CACA----------AT-TCACA-G-----G-ATATGTTGGGA--CAAACAGT--ATTCATCAAAGGA-AAACATA---AGTG--TAAACAATCG--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TTGAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAG----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATTTGTTC-ACATTCTAAACT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-GG-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACTTCTAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATG--ATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGACAT---GTGTGA----GAACATGTGCTATAAGT----A-TTGGCATGTTGTCAGTACTGTTATTGAT-TG-AAGATTAGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACAT-GCTGC
gi|40 : TTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACT--AGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGACATAAGCTATAAG---GAATACGCAC----GTT----A-TTG
gi|41 : ctT----A-TTGGCACATTATTAGC-TTGTTATTGTT-AG-AAAATTTGAATGCTG--TTAAATGACA-TAGAGAAAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT--GAGACAT-t
gi|43 : ataATGTTATCAGCATTGTTATTGAT-AG-AAAATT-GAATACTG--TTAAATTTAAATAGAGAAA-TACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACAT-
gi|44 : TTCCGATCT--GACTAGTGAAA----
gi|45 : tA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGG-CT-A-A-A-ATCG-AAC--GTG-C-------------A-AA-GTT-TT-A-AAGTAAATT-CACAAT-GGCCTGA--CGACAATTACGattgttttgttaacaaaatacatgtcttttgcatggttaagataagaagacataaaagcaaacaagatatactt
gi|47 : AATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAA-GAAAGTTCAT-ATAAACAT-GCTGCggcacttatcca
gi|5 : tCATATATTA-GTCG-TGAATT-ACTTTGT-CGTTGTT--G-CTCCGGTTGGC--TGTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTT-TAATTTGA-GTAATGTTATT-TT-GCTGAA-GTTAATGAAATAGAGG------ACAT----TAAAT----TGA-TC----ACGTTGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AACACGACGACACT----TGTCAATGT-CAACCAGTTTTAATTTGGTGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTTA-CACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATTAGA-GTTAAA-CATCT---TTGCAA-AGATTAT-TGAATCCACTCTT----AATCACA-TTTAATACGTGATGTCCAATA-AAATAGT-A-----------------------------TATT-----CAGTGA--ATAA-AACAA---------A-A---CA-----TATG-TT----TAGAATA-A-AAAGTTATT-GTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATA----TAA---CCAGCCAACGACGATGTCC-AAAA-GTATT------A--CACTAT----A-G--ATCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATTACAGTA---T--AACC-CTGAAAAATTAACA-TCC--------------ATCCATAAATAC--TTAA-AGGTGCTAGT---TT---T----A-CACA----------AT-GAACG-G-----T-ATGTGTTA-GA--CAAATGAT-TATTCATCAGAAGG-AAACATA---AGTG--TAAAAAATTA--GCA-AAATAGGTTA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--TGTAAA-A-A-A------A---TATC---A----TATAAC---A-------ATCAG--CAATTGTGTTTTG-ATATTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAG---TTA------GTGT-TT-GA----A-G------GTA----TTTGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACTGTTAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATG--ACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGACAT---CTGCGA----GAAAA-GTGCTATGATTATTAA-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTAAGTGAT-AG-GAAATCTGAATCATG--TTAAAGTCCA-TAGTGAAAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCAT-AAAAAata
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAAT-ATTTTGT-TATTGTT-T--CTCAGGTTGTCC--ATGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTTAT-TAATCTGCAG--ACACTA-----------A-ATT---------------------------T--------TAA-TG-------TCAAATATCA--------CAG-ACAGCA-A-TATGATGGCAGT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATGTGGTTT-TAAAATCATAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAACTTTTAAATCT-----AATAATG-ATTAAATAAAGTCACAGTATTACAGGA---A-CATCTAAG----AAGTTAT-ATAACAATTT------------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATA-CGAAAGT-ATATT-T-GGTG---A---ATAA--------ATTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTT-G-A-A-TTTG-AATTTATG-TTTAAATAAAATAGA-AA-ATTATA-A-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAAT----TAT---CCAGATGATGACAAGTTCT-AAAA-ATAT-----------------------------------A-ATT-TT--CTACCATC----AA---T--A-------ATTAA--AAAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TA-----GTGCTAGT---TT---T----A-CCCA----------AT-ACAAA-G-----G-ATGTATTAGTA---AAGCAAT-TAATCACCA------AAATATA---TATG--TAAACAATCA--ACA-AAATATATGA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--AG---------------------------A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTATAAACT-GTT-AA-----ACTCAC---ATA------A-GC-TT-TG----A-A------TTA----TTAACTT-AA------------------TTTA-TATTA-----------ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAA--ATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGACAT---CTGAGG----GAACATGTGCTTTAACTA---A-TTGACATG-----GGTATTGTTATTGATAAA-AAAAATTGAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAAAAGCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----AT-AAA---AT-ACTGCtg
gi|7 : ga--GATAAA-GTT---------GAAG------ACAC----TAAATAAATTTA-TT----ATGTTGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TAAG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCAAAGTATT----GT---A---TCTTAATT--AAATGAT-AT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTTC-TTT-TTATAGA-CTC-T-T-TGTG---A---ATAAACTTAAATAATAA-TAC--TT--------------------------TCCATAATATA-G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---CCAAACAGTGACAATGTCC-TAAA-atacaatttatactgaagtat
gi|7 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-----TTGT---TT---TGTTAA-CACA----------AT-ACATG-GCTTTTGCATG-GTTAAGA--TA--C--T-TTTTTATCAAAAGA-AAACATA---AAAG--CAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttaagataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcaaagtattgtatcttaattaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgttctttttatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataatatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgacaatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttT---------GAAA------ACAT----TCCAAG---TAA-TG----AA-TCGAAGGTCA--------CAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----CGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT----GT---A---TCTAAGTT--AAATGAT-AT-ACGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TA-TCATAAA-CTC-T-T-TGTG---A---ATAAACTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG----------------------------T----TAAAA-----------ATT-T-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAA----gatatact
gi|9 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgGAATTATCCTCGT-GTTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGT-----T--GCTAAA-GTT---------GACA------A-AA----T--------CAA-TG----ACACTAAATTTTACATTATTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG-GA-----------ATCTGAG-T--AG-TAAT-TTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATA-AGCTAGT-ACA-TCT-GGTTC--AT--ATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---TCAGACATGGACTATATCT-AAAA-ATATT------ATTCACTCT----C-T--CTCTA-ACATGTATC--T--CTA-----------------ATC-----AATAATAAGAACTCC--------------TTCCTTTAATGC--Ta
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 22 1 11 44444444444 111111111 4444444444444444444444 1111111 1 1 1111111 11 22222 6666666666666666 2222222 1111 1111111 1 1 2222 11 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222222222222222222 222222222222222222 11111111111111 22222 1111 1111111111 1111111111 3333333 111111 1111111 1111111111111 1111 1111 1111111
lowQualScore : 0 8 1 0 2 88 1 5555 1 55 6 8 5 0 4 0 0 22 0 99999999999 3 777777777 888888 0 0000000000000000000000 5 2 3 3 6666 3 0000000 2 2 1 4444444 2 44 5 3 0 66666 2 4 7777 3 2222222222222222 77777 0000000 3333 9999999 3 0 11 777777 2 44 0000 3 1 0 2 00 11 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 2 444 88 33 1 888888888 1 3 1 0 44 66 2 777777777777777777777777777 77 22 555555555555555555 44 666 99999999999999 0 11111 4 2 7777 2 1111111111 4444444444 2 5555555 33 4 33 888888888 22 1 0 1 444 44 33 44 0 2 44 555 44 44 11 3 2 2 444444 555 8888 6666 555 555 5555555 33 2 3 1 3 3 77777 555 99999999999 9 0000000000000 6666 3 111 0 4 11 3 1 2 0 3 3 55 0 555 0000 0 8888 3 0 0 3 3 2 44 0 3 0 3 0 2 0000000 3 77 4
lowQualScore : . . . . . .. . .... . .. . . . . . . . .. . ........... . ......... ...... . ...................... . . . . .... . ....... . . . ....... . .. . . . ..... . . .... . ................ ..... ....... .... ....... . . .. ...... . .. .... . . . . .. .. . .................................................. . . . ... .. .. . ......... . . . . .. .. . ........................... .. .. .................. .. ... .............. . ..... . . .... . .......... .......... . ....... .. . .. ......... .. . . . ... .. .. .. . . .. ... .. .. .. . . . ...... ... .... .... ... ... ....... .. . . . . . ..... ... ........... . ............. .... . ... . . .. . . . . . . .. . ... .... . .... . . . . . . .. . . . . . . ....... . .. .
lowQualScore : 8 0 4 4 7 77 6 3333 3 66 6 7 0 7 5 0 2 00 2 00000000000 3 777777777 888888 4 6666666666666666666666 8 3 1 1 5555 5 8888888 4 0 4 6666666 9 99 7 8 2 66666 1 2 2222 5 5555555555555555 77777 1111111 7777 5555555 1 0 88 000000 3 66 5555 2 4 1 7 11 00 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 111 77 22 9 000000000 3 2 9 6 77 33 0 333333333333333333333333333 00 88 666666666666666666 66 222 66666666666666 2 33333 5 7 0000 7 7777777777 3333333333 7 7777777 77 1 77 000000000 11 0 9 1 111 33 22 22 5 9 22 444 22 22 55 1 9 9 333333 000 9999 1111 000 000 4444444 99 9 1 4 1 1 77777 444 00000000000 2 0000000000000 5555 3 444 7 0 33 6 8 8 1 5 4 00 4 888 4444 7 8888 1 6 5 3 3 5 66 8 3 1 1 5 4 0000000 1 33 0
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACACT---AAA-----TN-A-TN----ACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-ACGATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTA-TA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAATAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTATA-T--C-TCTGTACCC-G-ATC-TTCTGTTATT----TA---TATCCC-TGAATAAT--TAANAGTCC--------------ACCCTTAAATACTAAACA--GGTGCTAGTTT-T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-A--TGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGGAA---ACATAAGTGTAAACAA--TCAA--CAAAAT-ATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTATT----TACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
Reference ( family-2250 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACACT---AA------TN-A-TG----ACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-ACGATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCANTAANATAGTA-TA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAATAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-AAAA-GTATTA--CACTATA-T--C-TCTGTACCC-G-ATC-TTCTGTTATT----TA---TATCCC-TGAATAAT--TAANAGTCC--------------ACCCTTAAATACTAAACA--GGTGCTAGTTT-T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-A--TGTG--TTAGGACAA----ACAATTANTCATCAAAAGGAA---ACATAAGTGCAAACAA--TCAA--CAAAAT-ATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTATT----TACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
gi|1 : AA-GTT---------GAAG---------CT-----------TG-A-TG----AAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACACTGACTTGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTAT-TAAAGTCAAAC--AGTA-TTTT-AACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGC---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-TCAATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTAAAATAATT-TA-TAT-GGTGAA-TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTTATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAATTGT---T-----CAGCCAACGACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTATA-T--C-TCTATATCC-T-ATC-TTCTATTATT----TA---TATCCC-TGAATAAC--TAACTGCCC--------------ATCTTTAACTGCTAGACA--GGTGCTAGTTT-T----A-CATAAGTGTAAACA----------AT-CTACAA-----A-A--TATG--TTTGG-TGGTTTTACAATGAA----CAATAGGTA---ATA-AAGTATATACAA--TCAG--C--AAT-ATGTT
gi|1 : gtac---ACATAAGTGTAAACAA--TCTA--CAAAAT-ATGTTT--GGTGGTT--TTACAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------G---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTGAATT-GTT-TT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------GTATT----TACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACTAT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGACATGTTGTAAATATttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|1 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttTCAGTTTTGTTATTGAT-AG-AAGATTTGAGTCCTG--TTGAAATTCA-TATAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|10 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtatGAATTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTTAAG-TT-GAAAAA-ATT---------GATG------ACACT---AA------AT-T-TT----ACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG--T-AG-TAATTTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGATAGTA-CA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAATAT---T-----CAGACATGGACTATATCTAAAAA-ATATTATTCACTCTC-T--C-TCTtataaaacttat
gi|11 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGTTTTAATT-GTTAC-TAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTCTaacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttTTCACTAAAATCACACTC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AA---------------------AA-----G-TT----CAAAAT------------T-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGTT-TTCAGATCT--GACTAGTAAAATAT---C-----CAAACCGTGACTATGTCC-TAAA-ttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgaCCTTTAAATATGAAA-A-------TTGTTT-TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCA--TG-G--TTAAGATA------C--TTTTTTATCAAAAGAAA---GCATAAAAGCAAACAA--ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|12 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTACTTT-T-AATTTCAA-TAATATT-----------GATGAAAGAT---------GAAG------ACACT---AGCT----TT-A-TT----GTGTTGAATGTCTCAC-ACCATAGAAT-CGACGACACG----TGTCAATTTTCTTTCAGTT--------------AAAGTCACAC--AGTT-TATC-AACAAATAT--TTTCATATATATGT--AAATTA---CA--CAAA--TACAGCGT-----------A-CCATCT-----A-G-CT-AG-TAATAT-A--------------------ACATTTCA------------CAATAAAATAGCA-TA-T-T-GGTGAA--TAAACTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGG-CTTG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAA--TA-A-AG----------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNNNNN---N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNN--NNNNGTA--------TATA------ATC---CAGACACT----------GTCCT-CCAATAAT--TGGAAGTCCTCCCTCATGCAAATACCCTTTGATATTAAACT--GGTGCTAGTTT-T----A-C----------ACATAGCACAGACATAACACAG-----G-A--TTTG--TCAGGACAA----TCAATTAATTATCAGAAAGAA---ATATAAATGCAAACAA--TCAA--CAAAAT-GGGTTA--GGT---T--TTAAATTGTACAATA--GGTAAC-A-A-A------A---TAT----AGGTGT---AC---ATTCT---ATCAT--CAA-TATGTTTTC-ACACCATAAACT-GTT-AT-----AAACAC---TTA------G-AC-CA-GACTTTA-C------GTGCT----TATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTgatata
gi|13 : atatatttaatatttaTGTATTAAACCG-TGAATT-T-----T-CCTTTTTATAACTCCGGTTGTCC--GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTGT-TATTTAAAGTTATGGT----GTGAT--GATGAG-GTT---------GAAG------AT--------------TG-G-TG----AAGTTGAAGA-CACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGATGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTT--ATAGTA--A-T-ATCT-----AAG--C-AA-TAATAT-CAAATCCGTTCAA----AATCACACTTTAA-CAGCGGTcaattcgtctgattgatt
gi|13 : cAT-ATGATATTGAT---TAATTAAAGTCA-CAGT----GTTAT-A-GTA------A---TAT----C----T---A---------------AG--CAA-TA--------ATA-TC-AAATCCGTTCAA-----AATCACACTTTAACAGCGG-TC-TTTGA----A-G------GTATT----TACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATTGT-TAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAG--ACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGACAT---CTGTGA----GAAGTTGTGCTATAATC----AGTTGGCATGTTGTCAATCTTGAGTTTGAT-AGAAAAAATTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAAAAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACAT-GCctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|14 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatat-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TACATTA-ACAA-GTTATA-A-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG---AAATTTTTTC-----CAGCCAACAACAATATCC-AAAAAGTATTA--CAATATA-T---------ACC---------TCTGTTATT----TAACATCTCTC-TCAATAAT--CAGAAGTCC--------------ACCCTTAAATACTGAATT--GGTGCTAGATT-T----A-C----------ACA----------AT-GCACAT-----G-A--TGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGAAA---ACATAATTGTAAACAA--TAAA--C-AAAT-ATGTTA--GAT---T--TTAAAATGAACAACA--GGAAAT-A-A-T------A---TAT----A----T---AC---A-------TTGAG--CAA-TATGTTTTC-AAACTATAAATT-GCT-AT-----TATAAC---TTA------GTTT-TT-GA----A-AGTACACGTATT----TACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCTTT-CAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAG--ACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-
gi|15 : ATTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGG-TT-A-A-AATCCA-ACTTTATG-TC----ACGTATA-A-AA----------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAA-------------------AGTTACTAT--CC-AGA---------------TA-G--CGTCTGCGTTCAG-AAT-TGCT-TTATT----TG---AGTCTCGTAAAAAATATTAAATGTCA--------------ACTCTTAAATACTTAATA--TATATT-GTTT-C----A-C----------ACG----------AT-ATACAG-----G-AACT-TG--CTTGTATAA----ACAATTAATTATCAAAAAGAATTTAAA-AAG-GTAAACAAACTCAAGACATAATTATGTTG--GGC---T--TAAAAACGGACAAAA--GGTGAT-ACA-ATGTTTTA---TAT----A----T---AC---ATTGTATTATAAT--CAA-TAGGTTTTC-ACACCTTATACT-GCT-ATTAGCAAATTGC------------G-TT-TT-GA----A-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTattattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|16 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataactagagatggtgatgatgatgatgatccatgcAA-ATAT-A--AAATATA-TGAC-TCTGTATCA-G-ATC-TTCTGTTATT----TA---TATCCC-TGAATAAT--TAATTGCCC--------------ACCCTTATTTGCTAAACA--GGTGCTAGTTT-T----A-C----------GCA----------AT-ACACAG-----G-A--TGTG--TTAGAA-AA----ATAATTAATCATCAGAAGGAA---ACATAAGTGTAAACAA--TCAA--CAAAAT-ATGTTA--GGT---T--TGAAAATGAACAATA--GGTTAT-A-C-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACCCTAAATT-GTT-AT-----AAGCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTATA----AATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACTGT-TAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATTA---A-TTGACATGTTGTCAGTATTGTTGTTGAT-AG-AAAATTTGAATCCAA--TTAAAATTCA-TTGAGAACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACAT-GCCGgttgtttcattcaccat
gi|17 : t-T--C-CCTGTATCC-G-ATC-TTCTGTTATT----TA---TATCCG-TGAATAAT--TAACAGTTC--------------ACCCTTAAACAA-AAACA--GGTGCTAGTTT-T----T-C----------ACA----------AT-GTACAG-----G-A--TGTG--TTAG-ACAA----ACAATTAATTATCAGAAGGAA---ATATAAGGGTAAACAA--TCAA--CACAAT-ATGTTA--GGT---T--TTAGAATGAACAATA--GATGAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTGC-ACACTCTAAATT-GCT-AT-----AATCGC---TGA------G-TCTTT-GA----C-G------GTATT----TACATGAAAAGGGAA-------------CAC--T-TAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAA--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGACAT---CTGTGA----GAACAAGTGCTATAATTA---A-TTGGCAAGTTATCACTATTGGTATTGAC-AG-AAAATTTGAATCCTG--TAAAAAATCA-TAGAGAAAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|18 : tcCCGATCT--AA------AAGTAT---TTTTATCAGACAGTAACTATGTCC-TAAA-ATGTTG--T-------T--C-TCTAT---C-A-ATC-CTCT----------------------------AT--TAA-----C--------------TTCTTTAAATACTAAA-ATTGGT--TTGTTTGC----A-C----------ATAC---------AT-ACATGGCTTT-G-G--TATGGTTTAG---------ATACTTAATCATCAAAAGAAA---ACATAAACGCA---------AA--CAAGAT-ATACTG--G----------AGAATACAC------GGTAA--A-A-ATGTG--A---TGT----A----C---ACCAAA-------ATCA----AA--ACTTTTTC-ACGCCTTCAATT-GCT-AT-----AATCAG---TTA------G-GC-TT-CA----ACA------GTATA----TATAtgt
gi|19 : cATCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATAAAGTA-TA-TA-T-TTGGTGAA--TAAACTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGG-CT-G-TTA-TCCA-AATTTATA-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-G-AAGT-------------------------TAATTTCA--CT--GACTGGTAAATTAT---C------------------TTTCT-TTAA---ATTA--AATTAAAGT--T-TCTTT-CTT-G--TCGCTTTGTTATT----GA---T----C-T------T--TAAAA-TCC--------------ACCCTGTAATACTTAACT--GGTGCTAGTTT-T----C-C----------ACA----------AT-GCATAG-----G-A--ATTA--TTAGAACAA----ACAATTAATCTTCAAAAGTAA---ACGTAATTGTCAACAA--TCAA--CAAAAT-ATGTTA--TGT---T--TTAAAGTGAACAATA--GGTAGTAA-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCGG--CAA-TATGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|2 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACACT---AAATAAATTT-A-TT----ATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGCCACT----TG--------------GTTT-AATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGAC-TC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA--------------------------G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAATAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-gtct
gi|2 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttaCCCTTAAATATGAAA-A-------TTGTTT-TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCA--TG-G--TTAAGATA------C--TTTTTTATCAAAAGAAA---ACATAAAAGCAAACAA--ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|20 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgccacttggtttaattgtttctaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataattcttttcataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctggtggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaatttt-A-A------A---TATTCTGA----T---A----A-------A--AA--CAA-AATGTTCTCGATACTGTTGTTT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------ATTTT----TACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TT-CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACG--ACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGACAA---CTGTTA----AAACAAGAGCTATAATTT---A-TTGGACTGTTGTTAGTATTGTTAATGAT-AC-ATAATTTGAATACTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACAT-GCTGCgatatact
gi|22 : atgaagatAA----ATACTTAATTATCA---GAAA---ACATAAAAGCAAACAA----GA--CA---T-AC---------------------TGGACAATACAGG--AT-A-A-A------AACGTAT----G----T---AC---A-------CCTAAACCAT-TAAGTTATC-ACACCTTCAAAT-GCT-------------C---TTC------G-AC------------A------GTATA----TACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT--CGCATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTAAA-----ATATT------AGGAC----TTGACATTataaaatatataattctcaaacat
gi|25 : gtggtttTGTATTAAGCCGGTAATTT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGT-GTCC--GTAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTAAAGTCATGTA----ATG-TTTGCTGAA-GTTTAT------GAAGCTTAAAACACG---AAA-----TGTA-TT----ACGTTGAAGGTCACAGAACA-CA-AATACGACGACACT----TGTCAATAT-TTATCAGTTTTAATTTGGTGT-TAATGTCGCACTAAGTT-T------TAAATATAgagtatattaagtgaaagcagtattaacagtaatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|3 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACACT---AAA-----TA-AATGTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT---------TTATGTT-A-AAAATA--GTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TTTAA-TGATAT-ATGATTCACT-AA----ATTCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGAC-TC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA--------------------------G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAATAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-aaata
gi|3 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttaCCCTTCAATATAAAAT-----TGTT--TTT-T----AAC----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCA--TG-G--TTA----AA----ATACTTTTTTATCAAAAGAAA---ACATAAAAGCAAACAA--ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|37 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttagataaagttgaagacactaaataaatgtattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttatgttaaaaatagtttcaaagataatcaagattataatcaaattcacagtattgtatctaagtttaatgatatatgattcactaaattcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccaatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTAGTTGTCATTTGACAA---TTGTGA----GATCATATGCTATA-------G-TTGGCATATTGTT--CTTTGC--TTGAA-AT-TAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-TAAAGAAA-----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTAT-TAAAAGGTCGCTGgatatacttga
gi|39 : ttTTGACAGTTGACAT---ATGTTATCTTGAAAATGTGCTTGAATT------------TATTGACAGTATTGTCATTGAT-AG-AAAATTTAAAT-CTGAATGAAAA--AA-AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAttt
gi|4 : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTTCTCC-CACGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTCT-AGTTTGAAGTAATATT----ATGAT--GATGAA-GTT---------GAAG------AT--------------TG-A-TG----AAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACAAT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTTATTTGGTGT-TAAAGTCAAAC--AGTT-TATT-A-CAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGT---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-TAAATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTAAAATAGTA-TA-TAT-GGTGAA-ATAAACTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CTGG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAATTAT---C-----CAGCCAGCTACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTATA-T--C-TCTGTACCC-G-ATC-TTCTGTTATC----TA---TATCTT-TGAATAAT--TAACAGTCC--------------ACTCTTGAAAACTAAACA--GATGCTAGCTT-T----A-C----------ACA----------AT-TCACAG-----G-A--TATG--TTGGGACAA----ACAG-TATTCATCAAAGGAAA---ACATAAGTGTAAACAA--TCGA--CAAAAT-ATGTTA--GGT---T--TTGAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAG----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATTTGTTC-ACATTCTAAACT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-GG-TT-GA----A-G------GTATT----TACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACTTC-TAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATG--ATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGACAT---GTGTGA----GAACATGTGCTATAAGT----A-TTGGCATGTTGTCAGTACTGTTATTGAT-TG-AAGATTAGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACAT-GCTGC
gi|40 : TTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACT--AGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGACATAAGCTATAAG---GAATACGCAC----GTT----A-TTG
gi|41 : ctT----A-TTGGCACATTATTAGC-TTGTTATTGTT-AG-AAAATTTGAATGCTG--TTAAATGACA-TAGAGAAAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT--GAGACAT-t
gi|43 : ataATGTTATCAGCATTGTTATTGAT-AG-AAAATT-GAATACTG--TTAAATTTAAATAGAGAAA-TACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACAT-
gi|44 : TTCCGATCT--GACTAGTGAAA
gi|45 : tA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGG-CT-A-A-A-ATCG-AAC--GTG-C-------------A-AA-GTT-TT-A-AAGTAAATT-CACAAT-GGCCTGA--CGACAATTACGattgttttgttaacaaaatacatgtcttttgcatggttaagataagaagacataaaagcaaacaagatatactt
gi|47 : AATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAA-GAAAGTTCAT-ATAAACAT-GCTGCggcacttatcca
gi|5 : tCATATATTA-GTCG-TGAATT-ACTTTGT-CGTTGTT--G-CTCCGGTTGGC--TGTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTTT-AATTTGA-GTAATGTT----ATT-TT-GCTGAA-GTTAATGAAATAGAGG------ACATT---AAAT----TG-A-TC----ACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AACACGACGACACT----TGTCAATGT-CAACCAGTTTTAATTTGGTGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTTA-CACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATT--AGAGTTAAA-C-ATCTTTGCAAAGATT-AT-TGA-------ATCCACTCTT----AATCACA-TTTAATACGTGATGTCCAATAAAATAGTA--------------------------TATT-----CAGTGA--ATAA-AACAA---------A-A---CA-----TATG-TT----TAGAATA-A-AAAGTTATT-GTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATATAA---C-----CAGCCAACGACGATGTCC-AAAA-GTATTA--CACTATA-G--A-TCTGTATCC-G-ATC-TTCTGTTATTACAGTA---TAACCC-TGAAAAAT--TAACA-TCC--------------ATCCATAAATACTTAA-A--GGTGCTAGTTT-T----A-C----------ACA----------AT-GAACGG-----T-A--TGTG--TTA-GACAA----ATGATTATTCATCAGAAGGAA---ACATAAGTGTAAAAAA--TTAG--CAAAAT-AGGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--TGTAAA-A-A-A------A---TATC---A----TATAAC---A-------ATCAG--CAATTGTGTTTTG-ATATTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAG---TTA------GTGT-TT-GA----A-G------GTATT----TGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACTGT-TAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATG--ACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGACAT---CTGCGA----GAAAA-GTGCTATGATTATTAA-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTAAGTGAT-AG-GAAATCTGAATCATG--TTAAAGTCCA-TAGTGAAAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCAT-AAAAAata
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAAT-ATTTTGT-TATTGTT-T--CTCAGGTTGTCC--ATGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTT-----ATT------AAT----------------------CT---------GCAG------ACACT---AAA-----TT-T-TA----ATGTCAAATATCACAG-ACAGCA-A-TATGATGGCAGT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATGTGGTTT-TAAAATCATAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAACTTTTAAATCT-----AATAATG-ATTAAATAAAGTCACAGTATTACA-GGA---A-C-ATCT-----AAG----AAGTTATATAACAATTT------------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATACGAAAGTA-TATT-T-GGTG-A-ATAA--------ATTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTT-G-A-A-TTTG-AATTTATG-TTTAAATAAAATAGA-AA-ATTATA-A-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAATTAT---C-----CAGATGATGACAAGTTCT-AAAA-ATAT---------------------------A-ATT-TTCTACCATC----AA---TA-------ATTAA----AAAAGTCC--------------ACCCTTAAATACTA-------GTGCTAGTTT-T----A-C----------CCA----------AT-ACAAAG-----G-A--TGTA--TTAGTA-AA----GCAATTAATCACCA-----AA---ATATATATGTAAACAA--TCAA--CAAAAT-ATATGA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--AG---------------------------A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTATAAACT-GTT-AA-----ACTCAC---ATA------A-GC-TT-TG----A-A------TTATT----AACTT-AA------------------TTTA-TAT-TA-----------ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAA--ATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGACAT---CTGAGG----GAACATGTGCTTTAACTA---A-TTGACATG-----GGTATTGTTATTGATAAA-AAAAATTGAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAAAAGCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----AT-AAA---AT-ACTGCtg
gi|7 : ga--GATAAA-GTT---------GAAG------ACACT---AAATAAATTT-A-TT----ATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TAAG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCAAAGTATT-----GT---A----TCT-----TAA-TT-AAATGATAT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTTC-TTTTTATAGAC-TC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAC--TT--------------------------TCCATAATATA-G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAATAT---C-----CAAACAGTGACAATGTCC-TAAA-atacaatttatactgaagtat
gi|7 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaCCCTTAAATATGAAA-A-------TTGTTT-TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCA--TG-G--TTAAGATA------C--TTTTTTATCAAAAGAAA---ACATAAAAGCAAACAA--ctcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttaagataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcaaagtattgtatcttaattaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgttctttttatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataatatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgacaatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttT---------GAAA------ACATTCCAAG------TA-A-TG----A-ATCGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----CGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-ACGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAAAC-TC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG----------------------------T----TAAAA-----------ATT-T-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAAgatatact
gi|9 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgGAATTATCCTCGT-GTTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTAAAG-TT-GACAAA-ATC---------AATG------ACACT---AA------AT-T-TT----ACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG--T-AG-TAATTTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGCTAGTA-CA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAATAT---T-----CAGACATGGACTATATCT-AAAA-ATATTATTCACTCTC-T--C-TCTA-ACAT-GTATC--TCTA---------------ATC-----AATAAT--AAGAACTCC--------------TTCCTTTAATGCTa
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 22 1 11 44444444444 111111111 33333333 1111111 1 1 1111111 1111 22222 6666666666666666 2222222 11111 111111111 1 2222 11 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555 11 222222222222222222222 33333333333333333 11111111111111 11111 1111 1111111111 3333333 1111 11111 111111 1111111 11111111111 1111111111111 1111 1111 1111111
lowQualScore : 0 8 1 0 2 88 1 5555 1 55 6 8 5 0 4 0 0 22 0 99999999999 3 777777777 888888 444 55555555 1 5 2 3 3 6666 3 0000000 2 2 1 4444444 2 3333 3 0 22222 2 4 7777 3 2222222222222222 77777 0000000 33333 444444444 2 66 11 66666 2 44 0000 3 1 0 2 00 11 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 2 444 11 33 1 5555 444 66666 2 1 66 77 99 1 444444444444444444444 77 44 0 0 22222222222222222 44 888 99999999999999 333 88888 2 777 7777 2 4444444444 44 33 8888888 4 33 3333 1 1 2 99 0 0 55 22222 5555 44 3 44 44 0 44 11 44 222 444444 555 8888 6666 555 555 5555555 33 2 3 1 3 3 77777 555 22222222222 6 0000000000000 6666 3 111 0 4 11 3 1 2 0 3 3 55 0 555 0000 0 8888 3 0 0 3 3 2 44 0 3 0 3 0 2 0000000 3 77 4
lowQualScore : . . . . . .. . .... . .. . . . . . . . .. . ........... . ......... ...... ... ........ . . . . . .... . ....... . . . ....... . .... . . ..... . . .... . ................ ..... ....... ..... ......... . .. .. ..... . .. .... . . . . .. .. . .................................................. . . . ... .. .. . .... ... ..... . . .. .. .. . ..................... .. .. . . ................. .. ... .............. ... ..... . ... .... . .......... .. .. ....... . .. .... . . . .. . . .. ..... .... .. . .. .. . .. .. .. ... ...... ... .... .... ... ... ....... .. . . . . . ..... ... ........... . ............. .... . ... . . .. . . . . . . .. . ... .... . .... . . . . . . .. . . . . . . ....... . .. .
lowQualScore : 8 0 4 4 7 77 6 3333 3 66 6 7 0 7 5 0 2 00 2 00000000000 3 777777777 888888 666 00000000 0 8 3 1 1 5555 5 8888888 4 0 4 6666666 9 4444 8 2 99999 1 2 2222 5 5555555555555555 77777 1111111 77777 999999999 9 88 88 55555 3 66 5555 2 4 1 7 11 00 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 111 77 22 9 0000 777 77777 1 9 33 11 22 9 666666666666666666666 00 66 5 3 00000000000000000 66 222 66666666666666 666 55555 9 333 0000 7 3333333333 33 99 0000000 1 77 7777 7 3 5 88 1 9 22 11111 3333 66 3 22 22 4 22 55 77 999 333333 000 9999 1111 000 000 4444444 99 9 1 4 1 1 77777 444 11111111111 2 0000000000000 5555 3 444 7 0 33 6 8 8 1 5 4 00 4 888 4444 7 8888 1 6 5 3 3 5 66 8 3 1 1 5 4 0000000 1 33 0
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATGTT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAAACAAT-TAATCATCAAAAGA-AAACATAAGT---GCAA----ACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
Reference ( family-2250 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TNACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATGTT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAAACAAT-TAATCATCAAAAGG-AAACATAAGT---GTAA----ACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
gi|1 : AA-GTT---------GAAG-----------CT---TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACACTGACTTGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTAT-TAAAGTCAAAC--AGTA-TTTT-AACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGC---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-T-CAATCCACTCAAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTAAAATAATTTA-TAT-GGTGAA-TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATGTT----T-AAAACA-A-AA-GTTATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAAT----TGT---T-----CAGCCAACGACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTATATCCT-ATC-TT--CTATTATT----TA---TATCCCTGAATAACT--AACTGCCC--------------ATCTTTAACTGC--TAGACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CATA----------A-----------------GTG--T------AAACAATCTA-----CAAA--------ATATGTTTGGTGGTTTTACAATGA--ACA-A-------TA--GGT-------AATAAA--------GTA--------------------T----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTGAATT-GTT-TT-----AATCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACTAT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGACATGTTGTAAATAT
gi|1 : gtacTCAGTTTTGTTATTGAT-AG-AAGATTTGAGTCCTG--TTGAAATTCA-TATAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|10 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtatGAATTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTTAAG-TT-GAAAAA-ATT---------GATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATT-AACAAATACAGTTCCAAATATATA----CATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG-T--AG-TAATTT-AACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGATAGTACA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTT----TTAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCTAAAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTtataaaacttat
gi|11 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGTTTTAATT-GTTAC-TAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-TGATT----------------CACT--AA-AA------TC-----ACAC----TC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AA---------------------AA-----GTT----C-AAAAT------------T-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGTT-TTCAGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACCGTGACTATGTCC-TAAA-aacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttCCTTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-CACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA--CTTT-T--TTATCAAAAGA-AAGCATAAAA---GCAA----ACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|12 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTACTTT-T-AATTTCAA-TAATATT-----------GATGAAAGAT---------GAAG------ACA--CTAGCTTTA-----TTGTGTTGAATGTCTCAC-ACCATAGAAT-CGACGACACG----TGTCAATTTTCTTTCAGTT--------------AAAGTCACAC--AGTT-TATC-AACAAATAT--TTTCATATATATGT--AAATTA---CA--CAAA--TACAGCGT-----------A-CCATCT-----A-G-CT-AG-TAATAT-A---------------------ACATTTCA------------CAATAAAATAGCATA-T-T-GGTGAA--TAAACTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGG-CTTG-A-A-TCCA-AATTTATGTT----T-AA--TA-A-AG----------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNN----NNN---N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNN--NNNNGT----A-------TATA-----ATC-----CAGACACT----------GTCCTCCAATAATT--GGAAGTCCTCCCTCATGCAAATACCCTTTGATAT--TAAACT--GGTGCTAGTTT---T----A-CACATAGCACAGACATAACACAG-----G-ATTTG--TCAGGACAATCAAT-TAATTATCAGAAAG-AAATATAAAT---GCAA----ACAATCA--ACA-AAATGGGTTA--GGTT--TTAAATTGTACAATA--GGTAAC-A-A-A------A---TAT----AGGTGT---AC---ATTCT---ATCAT--CAA-TATGTTTTC-ACACCATAAACT-GTT-AT-----AAACAC---TTA------G-AC-CA-GACTTTA-C------GTG----CTTATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTgatata
gi|13 : atatatttaatatttaTGTATTAAACCG-TGAATT-T-----T-CCTTTTTATAACTCCGGTTGTCC--GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTGT-TATTTAAAGTTATGGT----GTGAT--GATGAG-GTT---------GAAG------AT--------TG-G-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGATGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTT--ATAGTA--A-T-ATCT-----AAG--C-AA-TAATAT-C-AAATCCGTTCAAAA----TCACACTTTAA-CAGCGGTcaattcgtctgattgatt
gi|13 : cATATGATATTGATTAATTAAAGTCA-CAGT----GTTAT-A-GTA------A---TAT----C----T---A---------------AG--CAA-TA--------ATA-TC-AAATCCGTTCAA-----AATCACACTTTAACAGCGG-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATTGT-TAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAG--ACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGACAT---CTGTGA----GAAGTTGTGCTATAATC----AGTTGGCATGTTGTCAATCTTGAGTTTGAT-AGAAAAAATTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAAAAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACAT-GCctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|14 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatat-A-A-TCCA-AATTTATGTT----T-ACATTA-ACAA-GTTATA-A-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG---AAA----TTTTTTC-----CAGCCAACAACAATATCC-AAAAAGTATTA--CAATAT----A-T--------ACC--------T--CTGTTATT----TAACATCTCTCTCAATAATC--AGAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TGAATT--GGTGCTAGATT---T----A-CACA----------AT-GCACAT-----G-ATGTG--TTAGGACAAACAAT-TAATCATCAAAAGA-AAACATAATT---GTAA----ACAATAA--AC--AAATATGTTA--GATT--TTAAAATGAACAACA--GGAAAT-A-A-T------A---TAT----A----T---AC---A-------TTGAG--CAA-TATGTTTTC-AAACTATAAATT-GCT-AT-----TATAAC---TTA------GTTT-TT-GA----A-AGTACACGTA----TTTACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCTTT-CAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAG--ACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-
gi|15 : ATTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGG-TT-A-A-AATCCA-ACTTTATGTC----A-CGTATA-A-AA----------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAAAGTTACTAT---C-----CAGATAGCGTCTGCGTTC----A-GAATTG--CTTTATTTGAG-T--CTC-GTAAAAA-ATA-TTAAATGTCA------------ACTCTTAAATACTT--AATA-TAT--------------ATTGTTTCACACGATATACA--GGAACTTGCTTGTAT----A-AACA----------AT--TA----------AT-TA--TCAA---AAAGAAT-T-----TAAAAAGGTAAAC-----------AA----AC--TCAAGACATAATTATGTTG--GGCT--TAAAAACGGACAAAA--GGTGAT-ACA-ATGTTTTA---TAT----A----T---AC---ATTGTATTATAAT--CAA-TAGGTTTTC-ACACCTTATACT-GCT-ATTAGCAAATTGC------------G-TT-TT-GA----A-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTattattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|16 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataactagagatggtgatgatgatgatgatccatgcAA-ATAT-A--AAATAT----A-TGACTCTGTATCAG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AATTGCCC--------------ACCCTTATTTGC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CGCA----------AT-ACACAG-----G-ATGTG--TTAGAA-AAATAAT-TAATCATCAGAAGG-AAACATAAGT---GTAA----ACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TGAAAATGAACAATA--GGTTAT-A-C-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACCCTAAATT-GTT-AT-----AAGCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TAAATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACTGT-TAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATTA---A-TTGACATGTTGTCAGTATTGTTGTTGAT-AG-AAAATTTGAATCCAA--TTAAAATTCA-TTGAGAACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACAT-GCCGgttgtttcattcaccat
gi|17 : t-T--CCCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCGTGAATAATT--AACAGTTC--------------ACCCTTAAACAA---AAACA--GGTGCTAGTTT---T----T-CACA----------AT-GTACAG-----G-ATGTG--TTAG-ACAAACAAT-TAATTATCAGAAGG-AAATATAAGG---GTAA----ACAATCA--ACA-CAATATGTTA--GGTT--TTAGAATGAACAATA--GATGAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTGC-ACACTCTAAATT-GCT-AT-----AATCGC---TGA------G-TCTTT-GA----C-G------GTA----TTTACATGAAAAGGGAA-------------CAC--T-TAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAA--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGACAT---CTGTGA----GAACAAGTGCTATAATTA---A-TTGGCAAGTTATCACTATTGGTATTGAC-AG-AAAATTTGAATCCTG--TAAAAAATCA-TAGAGAAAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|18 : tcCCGATCT--AA------AAG----TAT---TTTTATCAGACAGTAACTATGTCC-TAAA-ATGTTG--T-----------T--CTCTAT---CA-ATC-CT--CT---------------------------ATT--AA-----C--------------TTCTTTAAATAC--TAAA-ATTGGT--TTGTTTG--C----A-CATAC---------AT-ACATGGCTTT-G-GTATGGTTTAG-----ATACT-TAATCATCAAAAGA-AAACATAAAC---GCA-----------A--ACA-AGATATACTG--G-------AGAATACAC------GGTAA--A-A-ATGTG--A---TGT----A----C---ACCAAA-------ATCA----AA--ACTTTTTC-ACGCCTTCAATT-GCT-AT-----AATCAG---TTA------G-GC-TT-CA----ACA------GTA----TATATAtgt
gi|19 : cA----TCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATAAAGTA-TATA-T-TTGGTGAA--TAAACTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGG-CT-G-TTA-TCCA-AATTTATATT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-G-AAGTTAATTTCAC---------------------------T--GACTGGTAAAT----TAT---C------------------TTTCT-TTAA---ATTA--AATTAA----AGT--TTCTTT-CTTG--TCGCT--TTGTTATT----GA---T----CT------TT--AAAA-TCC--------------ACCCTGTAATAC--TTAACT--GGTGCTAGTTT---T----C-CACA----------AT-GCATAG-----G-AATTA--TTAGAACAAACAAT-TAATCTTCAAAAGT-AAACGTAATT---GTCA----ACAATCA--ACA-AAATATGTTA--TGTT--TTAAAGTGAACAATA--GGTAGTAA-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCGG--CAA-TATGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|2 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGCCACT----TG--------------GTTT-AATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-TGATTCACT-AAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA--------------------------GTT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-gtct
gi|2 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-CACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA--CTTT-T--TTATCAAAAGA-AAACATAAAA---GCAA----ACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|20 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgccacttggtttaattgtttctaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataattcttttcataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctggtggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaatttt-A-A------A---TATTCTGA----T---A----A-------A--AA--CAA-AATGTTCTCGATACTGTTGTTT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------ATT----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TT-CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACG--ACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGACAA---CTGTTA----AAACAAGAGCTATAATTT---A-TTGGACTGTTGTTAGTATTGTTAATGAT-AC-ATAATTTGAATACTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACAT-GCTGCgatatact
gi|22 : atgaagatAAATACT-TAATTATCA---GA-AAACATAA-------AA----GCAA-----ACA-AGACAT----------------ACTGGACAATACAGG--AT-A-A-A------AACGTAT----G----T---AC---A-------CCTAAACCAT-TAAGTTATC-ACACCTTCAAAT-GCT-------------C---TTC------G-AC------------A------GTA----TATACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT--CGCATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTAAA-----ATATT------AGGAC----TTGACATTataaaatatataattctcaaacat
gi|25 : gtggtttTGTATTAAGCCGGTAATTT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGT-GTCC--GTAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTAAAGTCATGTA----ATG-TTTGCTGAA-GTTTAT------GAAGCTTAAAACA--CGAAATGTA-----TTACGTTGAAGGTCACAGAACA-CA-AATACGACGACACT----TGTCAATAT-TTATCAGTTTTAATTTGGTGT-TAATGTCGCACTAAGTT-T------TAAATATAgagtatattaagtgaaagcagtattaacagtaatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|3 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATGTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT---------TTATGTT-A-AAAATA--GTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TTTAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AAAT----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA--------------------------GTT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-aaata
gi|3 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttaCCCTTCAATAT--AAAAT-----TGTT--TTT---T----AACACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTA----AAATACT-TTTTTATCAAAAGA-AAACATAAAA---GCAA----ACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|37 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttagataaagttgaagacactaaataaatgtattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttatgttaaaaatagtttcaaagataatcaagattataatcaaattcacagtattgtatctaagtttaatgatatatgattcactaaattcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccaatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTAGTTGTCATTTGACAA---TTGTGA----GATCATATGCTATA-------G-TTGGCATATTGTT--CTTTGC--TTGAA-AT-TAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-TAAAGAAA-----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTAT-TAAAAGGTCGCTGgatatacttga
gi|39 : ttTTGACAGTTGACAT---ATGTTATCTTGAAAATGTGCTTGAATT------------TATTGACAGTATTGTCATTGAT-AG-AAAATTTAAAT-CTGAATGAAAA--AA-AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAttt
gi|4 : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTTCTCC-CACGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTCT-AGTTTGAAGTAATATT----ATGAT--GATGAA-GTT---------GAAG------AT--------TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACAAT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTTATTTGGTGT-TAAAGTCAAAC--AGTT-TATT-A-CAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGT---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-T-AAATCCACTCAAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTAAAATAGTATA-TAT-GGTGAA-ATAAACTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CTGG-A-A-TCCA-AATTTATGTT----T-AAAACA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAAT----TAT---C-----CAGCCAGCTACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATC----TA---TATCTTTGAATAATT--AACAGTCC--------------ACTCTTGAAAAC--TAAACA--GATGCTAGCTT---T----A-CACA----------AT-TCACAG-----G-ATATG--TTGGGACAAACAG--TATTCATCAAAGGA-AAACATAAGT---GTAA----ACAATCG--ACA-AAATATGTTA--GGTT--TTGAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAG----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATTTGTTC-ACATTCTAAACT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-GG-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACTTC-TAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATG--ATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGACAT---GTGTGA----GAACATGTGCTATAAGT----A-TTGGCATGTTGTCAGTACTGTTATTGAT-TG-AAGATTAGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACAT-GCTGC
gi|40 : TTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACT--AGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGACATAAGCTATAAG---GAATACGCAC----GTT----A-TTG
gi|41 : ctT----A-TTGGCACATTATTAGC-TTGTTATTGTT-AG-AAAATTTGAATGCTG--TTAAATGACA-TAGAGAAAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT--GAGACAT-t
gi|43 : ataATGTTATCAGCATTGTTATTGAT-AG-AAAATT-GAATACTG--TTAAATTTAAATAGAGAAA-TACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACAT-
gi|44 : TTCCGATCT--GACTAGTGAAA----
gi|45 : tA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGG-CT-A-A-A-ATCG-AAC--GTGC--------------A-AA-GTT-TT-A-AAGTAAATT-CACAAT-GGCCTGA--CGACAATTACGattgttttgttaacaaaatacatgtcttttgcatggttaagataagaagacataaaagcaaacaagatatactt
gi|47 : AATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAA-GAAAGTTCAT-ATAAACAT-GCTGCggcacttatcca
gi|5 : tCATATATTA-GTCG-TGAATT-ACTTTGT-CGTTGTT--G-CTCCGGTTGGC--TGTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTTT-AATTTGA-GTAATGTT----ATT-TT-GCTGAA-GTTAATGAAATAGAGG------ACA--TTAAATTGA-----TCACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AACACGACGACACT----TGTCAATGT-CAACCAGTTTTAATTTGGTGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTTA-CACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATT--AGAGTTAAA-C-ATCTTTGCAAAGATT-AT-TGA--------ATCCACTCTTAA----TCACA-TTTAATACGTGATGTCCAATAAAATAGTA-------------------------TATT-----CAGTGA--ATAA-AACAA---------A-A---CA-----TATGTT----T-AGAATA-A-AAAGTTATT-GTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATA----TAA---C-----CAGCCAACGACGATGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-G--ATCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATTACAGTA---TAACCCTGAAAAATT--AACA-TCC--------------ATCCATAAATAC--TTAA-A--GGTGCTAGTTT---T----A-CACA----------AT-GAACGG-----T-ATGTG--TTA-GACAAATGAT-TATTCATCAGAAGG-AAACATAAGT---GTAA----AAAATTA--GCA-AAATAGGTTA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--TGTAAA-A-A-A------A---TATC---A----TATAAC---A-------ATCAG--CAATTGTGTTTTG-ATATTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAG---TTA------GTGT-TT-GA----A-G------GTA----TTTGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACTGT-TAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATG--ACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGACAT---CTGCGA----GAAAA-GTGCTATGATTATTAA-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTAAGTGAT-AG-GAAATCTGAATCATG--TTAAAGTCCA-TAGTGAAAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCAT-AAAAAata
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAAT-ATTTTGT-TATTGTT-T--CTCAGGTTGTCC--ATGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTT-----ATT------AAT----------------------CT---------GCAG------ACA--CTAAATT-T-----TAATGTCAAATATCACAG-ACAGCA-A-TATGATGGCAGT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATGTGGTTT-TAAAATCATAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAACTTTTAAATCT-----AATAATG-ATTAAATAAAGTCACAGTATTACA-GGA---A-C-ATCT-----AAG----AAGTTATATAA-CAATTT------------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATACGAAAGTATATT-T-GGTG-A-ATAA--------ATTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTT-G-A-A-TTTG-AATTTATGTTTAAAT-AAAATAGA-AA-ATTATA-A-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAAT----TAT---C-----CAGATGATGACAA-GTTC-TAAA----------AATAT----A----------------ATT-TT--CTACCATC-----------------AATAATTAAAAAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TA-------GTGCTAGTTT---T----A-CCCA----------AT-ACAAAG-----G-ATGTA--TTAGTA-AAGCAAT-TAATCACCA------AAATATATAT---GTAA----ACAATCA--ACA-AAATATATGA--GGTT--TTAAAATGAACAATA--AG---------------------------A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTATAAACT-GTT-AA-----ACTCAC---ATA------A-GC-TT-TG----A-A------TTA----TTAACTT-AA------------------TTTA-TAT-TA-----------ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAA--ATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGACAT---CTGAGG----GAACATGTGCTTTAACTA---A-TTGACATG-----GGTATTGTTATTGATAAA-AAAAATTGAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAAAAGCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----AT-AAA---AT-ACTGCtg
gi|7 : ga--GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TAAG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCAAAGTATT-----GT---A----TCT-----TAA-TT-AAATGATAT-A-TGATTCACT-AAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTTC-TTTTTATAGACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAC--TT--------------------------TCCATAATATA-GTT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACAATGTCC-TAAA-atacaatttatactgaagtat
gi|7 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-CACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA--CTTT-T--TTATCAAAAGA-AAACATAAAA---GCAA----ACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttaagataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcaaagtattgtatcttaattaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgttctttttatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataatatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgacaatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttT---------GAAA------ACATTCCAAGTA-A-----TGA-ATCGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----CGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-CGATTCACT-AAAA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCC-ATATCATAAACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG---------------------------T----T-AAAA-----------ATT-T-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAA----gatatact
gi|9 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgGAATTATCCTCGT-GTTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTAAAG-TT-GACAAA-ATC---------AATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATT-AACAAATACAGTTCCAAATATATA----CATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG-T--AG-TAATTT-AACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGCTAGTACA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTT----TTAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCT-AAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTA-ACATGTATC--T--CTA---------------ATC----AATAATA--AGAACTCC--------------TTCCTTTAATGC--Ta
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 22 1 11 44444444444 111111111 33333333 1111111 1111111 1111 22222 666666666666666 2222 11111 1111111111111 1 2222 11 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 222222222222222222222 33333333333333333 11111111111111 11111 11111111111111111 1111111111 3333333 1111111111 111111 1111111 1111111111111 1111 1111 1111111
lowQualScore : 0 8 1 0 2 88 1 5555 1 55 6 8 5 0 4 0 0 22 0 99999999999 3 777777777 888888 444 55555555 1 5 2 3 3 6666 1 0000000 5 2 5 1111111 2 3333 3 0 44444 2 6 888 3 555555555555555 77777 3333 9 33333 5555555555555 2 66 11 66666 2 44 0000 3 1 0 2 00 11 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 2 444 11 33 1 5555 444 66666 2 1 66 77 99 1 444444444444444444444 77 44 0 0 22222222222222222 44 888 99999999999999 333 88888 2 777 77777777777777777 4444444444 44 11 7777777 4 33 2222222222 1 66 0 2 44 44 3 44 555 44 44 11 3 2 2 444444 555 8888 6666 555 555 5555555 33 2 3 1 3 3 77777 555 99999999999 9 0000000000000 6666 3 111 0 4 11 3 1 2 0 3 3 55 0 555 0000 0 8888 3 0 0 3 3 2 44 0 3 0 3 0 2 0000000 3 77 4
lowQualScore : . . . . . .. . .... . .. . . . . . . . .. . ........... . ......... ...... ... ........ . . . . . .... . ....... . . . ....... . .... . . ..... . . ... . ............... ..... .... . ..... ............. . .. .. ..... . .. .... . . . . .. .. . ................................................... . . . ... .. .. . .... ... ..... . . .. .. .. . ..................... .. .. . . ................. .. ... .............. ... ..... . ... ................. .......... .. .. ....... . .. .......... . .. . . .. .. . .. ... .. .. .. . . . ...... ... .... .... ... ... ....... .. . . . . . ..... ... ........... . ............. .... . ... . . .. . . . . . . .. . ... .... . .... . . . . . . .. . . . . . . ....... . .. .
lowQualScore : 8 0 4 4 7 77 6 3333 3 66 6 7 0 7 5 0 2 00 2 00000000000 3 777777777 888888 666 00000000 5 8 3 1 1 5555 5 8888888 4 0 7 0000000 9 4444 8 2 88888 1 2 999 5 999999999999999 77777 4444 2 77777 4444444444444 9 88 88 55555 3 66 5555 2 4 1 7 11 00 7 333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 111 77 22 9 0000 777 77777 1 9 33 11 22 9 666666666666666666666 00 66 5 3 00000000000000000 66 222 66666666666666 666 55555 9 333 33333333333333333 3333333333 33 66 4444444 1 77 8888888888 3 88 1 5 33 22 1 22 444 22 22 55 1 9 9 333333 000 9999 1111 000 000 4444444 99 9 1 4 1 1 77777 444 00000000000 2 0000000000000 5555 3 444 7 0 33 6 8 8 1 5 4 00 4 888 4444 7 8888 1 6 5 3 3 5 66 8 3 1 1 5 4 0000000 1 33 0
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
Reference ( family-2250 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
gi|1 : AA-GTT---------GAAG-----------CT---TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACACTGACTTGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTAT-TAAAGTCAAAC--AGTA-TTTT-AACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGC---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-T-CAATCCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTAAAATAATTTA-TAT-GGTGAA-TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAACA-A-AA-GTTATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAAT----TGT---T-----CAGCCAACGACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTATATCCT-ATC-TT--CTATTATT----TA---TATCCCTGAATAACT--AACTGCCC--------------ATCTTTAACTGC--TAGACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CATAAGTGTAAACA----------AT-CTACAA-----A-ATATG--TTTGG-TGGTTTTACAATGAA----CAATAGG-TAATA-AAGTATATACAATCA--GC---AATATGTT
gi|1 : gtacACATAAGTGTAAACAATCT--ACA-AAATATGTTT--GGTGGTT--TTACAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------G---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTGAATT-GTT-TT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACTAT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGACATGTTGTAAATATttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|1 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttTCAGTTTTGTTATTGAT-AG-AAGATTTGAGTCCTG--TTGAAATTCA-TATAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|10 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtatGAATTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTTAAG-TT-GAAAAA-ATT---------GATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG--T-AG-TAATTTAA-CAATTCACCCAAAAATAA----TTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGATAGTACA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----T-AACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCTAAAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTtataaaacttat
gi|11 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGTTTTAATT-GTTAC-TAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-TGATT--------------------CACT--AA-AA------TC-----ACAC----TC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AA---------------------AA-----G-TT----C-AAAAT------------T-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGTT-TTCAGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACCGTGACTATGTCC-TAAA-aacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttCCTTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAGCATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|12 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTACTTT-T-AATTTCAA-TAATATT-----------GATGAAAGAT---------GAAG------ACA--CTAGCTTTA-----TTGTGTTGAATGTCTCAC-ACCATAGAAT-CGACGACACG----TGTCAATTTTCTTTCAGTT--------------AAAGTCACAC--AGTT-TATC-AACAAATAT--TTTCATATATATGT--AAATTA---CA--CAAA--TACAGCGT-----------A-CCATCT-----A-G-CT-AG-TAATAT-A-------------------------ACATTTCA------------CAATAAAATAGCATA-T-T-GGTGAA--TAAACTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGG-CTTG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AA--TA-A-AG----------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNN----NNN---N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNN--NNNNGT----A-------TATA-----ATC-----CAGACACT----------GTCCTCCAATAATT--GGAAGTCCTCCCTCATGCAAATACCCTTTGATAT--TAAACT--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACATAGCACAGACATAACACAG-----G-ATTTG--TCAGGACAA----TCAATTAATTATCAGAAAG-AAATATAAATGCAAACAATCA--ACA-AAATGGGTTA--GGT---T--TTAAATTGTACAATA--GGTAAC-A-A-A------A---TAT----AGGTGT---AC---ATTCT---ATCAT--CAA-TATGTTTTC-ACACCATAAACT-GTT-AT-----AAACAC---TTA------G-AC-CA-GACTTTA-C------GTG----CTTATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTgatata
gi|13 : atatatttaatatttaTGTATTAAACCG-TGAATT-T-----T-CCTTTTTATAACTCCGGTTGTCC--GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTGT-TATTTAAAGTTATGGT----GTGAT--GATGAG-GTT---------GAAG------AT--------TG-G-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGATGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTT--ATAGTA--A-T-ATCT-----AAG--C-AA-TAATAT-C-AAATCCGTTCAA----AA----TCACACTTTAA-CAGCGGTcaattcgtctgattgatt
gi|13 : cATATGATATTGAT---TAATTAAAGTCA-CAGT----GTTAT-A-GTA------A---TAT----C----T---A---------------AG--CAA-TA--------ATA-TC-AAATCCGTTCAA-----AATCACACTTTAACAGCGG-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATTGT-TAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAG--ACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGACAT---CTGTGA----GAAGTTGTGCTATAATC----AGTTGGCATGTTGTCAATCTTGAGTTTGAT-AGAAAAAATTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAAAAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACAT-GCctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|14 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatat-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-ACATTA-ACAA-GTTATA-A-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG---AAA----TTTTTTC-----CAGCCAACAACAATATCC-AAAAAGTATTA--CAATAT----A-T--------ACC--------T--CTGTTATT----TAACATCTCTCTCAATAATC--AGAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TGAATT--GGTGCTAGATT---T----A-C----------ACA----------AT-GCACAT-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAATTGTAAACAATAA--AC--AAATATGTTA--GAT---T--TTAAAATGAACAACA--GGAAAT-A-A-T------A---TAT----A----T---AC---A-------TTGAG--CAA-TATGTTTTC-AAACTATAAATT-GCT-AT-----TATAAC---TTA------GTTT-TT-GA----A-AGTACACGTA----TTTACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCTTT-CAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAG--ACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-
gi|15 : ATTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGG-TT-A-A-AATCCA-ACTTTATG-TC----A-CGTATA-A-AA----------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAAAGTTACTAT---C-----CAGATAGCGTCTGCGTTC----A-GAATTG--CTTTATTTGAG-T--CTC-GTAAAAA-ATA-TTAAATGTCA------------ACTCTTAAATACTT--AATA-TAT--------------ATTGTTTCACACGATATACA--GGAACTTGCTTGTAT----A-A----------ACA----------AT--TA----------AT-TA--TCAA---AA----AGAATT-----TAAAAAGGTAAACA--------AAC--TCAAGACATAATTATGTTG--GGC---T--TAAAAACGGACAAAA--GGTGAT-ACA-ATGTTTTA---TAT----A----T---AC---ATTGTATTATAAT--CAA-TAGGTTTTC-ACACCTTATACT-GCT-ATTAGCAAATTGC------------G-TT-TT-GA----A-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTattattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|16 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataactagagatggtgatgatgatgatgatccatgcAA-ATAT-A--AAATAT----A-TGACTCTGTATCAG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AATTGCCC--------------ACCCTTATTTGC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------GCA----------AT-ACACAG-----G-ATGTG--TTAGAA-AA----ATAATTAATCATCAGAAGG-AAACATAAGTGTAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TGAAAATGAACAATA--GGTTAT-A-C-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACCCTAAATT-GTT-AT-----AAGCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TAAATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACTGT-TAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATTA---A-TTGACATGTTGTCAGTATTGTTGTTGAT-AG-AAAATTTGAATCCAA--TTAAAATTCA-TTGAGAACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACAT-GCCGgttgtttcattcaccat
gi|17 : t-T--CCCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCGTGAATAATT--AACAGTTC--------------ACCCTTAAACAA---AAACA--GGTGCTAGTTT---T----T-C----------ACA----------AT-GTACAG-----G-ATGTG--TTAG-ACAA----ACAATTAATTATCAGAAGG-AAATATAAGGGTAAACAATCA--ACA-CAATATGTTA--GGT---T--TTAGAATGAACAATA--GATGAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTGC-ACACTCTAAATT-GCT-AT-----AATCGC---TGA------G-TCTTT-GA----C-G------GTA----TTTACATGAAAAGGGAA-------------CAC--T-TAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAA--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGACAT---CTGTGA----GAACAAGTGCTATAATTA---A-TTGGCAAGTTATCACTATTGGTATTGAC-AG-AAAATTTGAATCCTG--TAAAAAATCA-TAGAGAAAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|18 : tcCCGATCT--AA------AAG----TAT---TTTTATCAGACAGTAACTATGTCC-TAAA-ATGTTG--T-----------T--CTCTAT---CA-ATC-CT--CT---------------------------ATT--AA-----C--------------TTCTTTAAATAC--TAAA-ATTGGT--TTGTTTG--C----A-C----------ATAC---------AT-ACATGGCTTT-G-GTATGGTTTAG---------ATACTTAATCATCAAAAGA-AAACATAAACGCA-------A--ACA-AGATATACTG--G----------AGAATACAC------GGTAA--A-A-ATGTG--A---TGT----A----C---ACCAAA-------ATCA----AA--ACTTTTTC-ACGCCTTCAATT-GCT-AT-----AATCAG---TTA------G-GC-TT-CA----ACA------GTA----TATATAtgt
gi|19 : cA----TCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATAAAGTA-TATA-T-TTGGTGAA--TAAACTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGG-CT-G-TTA-TCCA-AATTTATA-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-G-AAGTTAATTTCAC---------------------------T--GACTGGTAAAT----TAT---C------------------TTTCT-TTAA---ATTA--AATTAA----AGT--TTCTTT-CTTG--TCGCT--TTGTTATT----GA---T----CT------TT--AAAA-TCC--------------ACCCTGTAATAC--TTAACT--GGTGCTAGTTT---T----C-C----------ACA----------AT-GCATAG-----G-AATTA--TTAGAACAA----ACAATTAATCTTCAAAAGT-AAACGTAATTGTCAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--TGT---T--TTAAAGTGAACAATA--GGTAGTAA-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCGG--CAA-TATGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|2 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGCCACT----TG--------------G-TTTAA-TTGTTTC-TAA----------AGTT-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA-TA-A-TAATCAAATTCACAGTATT-----GT-------ATCT-----AAG-TTAAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCC-ATATCATAGACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA--------------------------G-TT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-gtct
gi|2 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|20 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgccacttggtttaattgtttctaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataattcttttcataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctggtggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaatttt-A-A------A---TATTCTGA----T---A----A-------A--AA--CAA-AATGTTCTCGATACTGTTGTTT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------ATT----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TT-CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACG--ACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGACAA---CTGTTA----AAACAAGAGCTATAATTT---A-TTGGACTGTTGTTAGTATTGTTAATGAT-AC-ATAATTTGAATACTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACAT-GCTGCgatatact
gi|22 : atgaagatAA----ATACTTAATTATCA---GA-AAACATAAAAGCAAACAA--G--ACA----TAC---------------------TGGACAATACAGG--AT-A-A-A------AACGTAT----G----T---AC---A-------CCTAAACCAT-TAAGTTATC-ACACCTTCAAAT-GCT-------------C---TTC------G-AC------------A------GTA----TATACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT--CGCATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTAAA-----ATATT------AGGAC----TTGACATTataaaatatataattctcaaacat
gi|25 : gtggtttTGTATTAAGCCGGTAATTT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGT-GTCC--GTAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTAAAGTCATGTA----ATG-TTTGCTGAA-GTTTAT------GAAGCTTAAAACA--CGAAATGTA-----TTACGTTGAAGGTCACAGAACA-CA-AATACGACGACACT----TGTCAATAT-TTATCAGTTTTAATTTGGTGT-TAATGTCGCACTAAGTT-T------TAAATATAgagtatattaagtgaaagcagtattaacagtaatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|3 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATGTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT---------TTATGTT-A-AAAATA--GTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TTTAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AA----AT----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA--------------------------G-TT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-aaata
gi|3 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttaCCCTTCAATAT--AAAAT-----TGTT--TTT---T----AAC----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTA----AA----ATACTTTTTTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|37 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttagataaagttgaagacactaaataaatgtattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttatgttaaaaatagtttcaaagataatcaagattataatcaaattcacagtattgtatctaagtttaatgatatatgattcactaaattcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccaatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTAGTTGTCATTTGACAA---TTGTGA----GATCATATGCTATA-------G-TTGGCATATTGTT--CTTTGC--TTGAA-AT-TAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-TAAAGAAA-----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTAT-TAAAAGGTCGCTGgatatacttga
gi|39 : ttTTGACAGTTGACAT---ATGTTATCTTGAAAATGTGCTTGAATT------------TATTGACAGTATTGTCATTGAT-AG-AAAATTTAAAT-CTGAATGAAAA--AA-AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAttt
gi|4 : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTTCTCC-CACGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTCT-AGTTTGAAGTAATATT----ATGAT--GATGAA-GTT---------GAAG------AT--------TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACAAT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTTATTTGGTGT-TAAAGTCAAAC--AGTT-TATT-A-CAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGT---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-T-AAATCCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTAAAATAGTATA-TAT-GGTGAA-ATAAACTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CTGG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAACA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAAT----TAT---C-----CAGCCAGCTACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATC----TA---TATCTTTGAATAATT--AACAGTCC--------------ACTCTTGAAAAC--TAAACA--GATGCTAGCTT---T----A-C----------ACA----------AT-TCACAG-----G-ATATG--TTGGGACAA----ACAG-TATTCATCAAAGGA-AAACATAAGTGTAAACAATCG--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTGAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAG----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATTTGTTC-ACATTCTAAACT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-GG-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACTTC-TAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATG--ATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGACAT---GTGTGA----GAACATGTGCTATAAGT----A-TTGGCATGTTGTCAGTACTGTTATTGAT-TG-AAGATTAGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACAT-GCTGC
gi|40 : TTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACT--AGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGACATAAGCTATAAG---GAATACGCAC----GTT----A-TTG
gi|41 : ctT----A-TTGGCACATTATTAGC-TTGTTATTGTT-AG-AAAATTTGAATGCTG--TTAAATGACA-TAGAGAAAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT--GAGACAT-t
gi|43 : ataATGTTATCAGCATTGTTATTGAT-AG-AAAATT-GAATACTG--TTAAATTTAAATAGAGAAA-TACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACAT-
gi|44 : TTCCGATCT--GACTAGTGAAA----
gi|45 : tA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGG-CT-A-A-A-ATCG-AAC--GTG-C--------------A-AA-GTT-TT-A-AAGTAAATT-CACAAT-GGCCTGA--CGACAATTACGattgttttgttaacaaaatacatgtcttttgcatggttaagataagaagacataaaagcaaacaagatatactt
gi|47 : AATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAA-GAAAGTTCAT-ATAAACAT-GCTGCggcacttatcca
gi|5 : tCATATATTA-GTCG-TGAATT-ACTTTGT-CGTTGTT--G-CTCCGGTTGGC--TGTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTTT-AATTTGA-GTAATGTT----ATT-TT-GCTGAA-GTTAATGAAATAGAGG------ACA--TTAAATTGA-----TCACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AACACGACGACACT----TGTCAATGT-CAACCAGTTTTAATTTGGTGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTTA-CACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATT--AGAGTTAAA-C-ATCTTTGCAAAGATT-AT-TGA--------ATCCACTCTT----AA----TCACA-TTTAATACGTGATGTCCAATAAAATAGTA-------------------------TATT-----CAGTGA--ATAA-AACAA---------A-A---CA-----TATG-TT----T-AGAATA-A-AAAGTTATT-GTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATA----TAA---C-----CAGCCAACGACGATGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-G--ATCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATTACAGTA---TAACCCTGAAAAATT--AACA-TCC--------------ATCCATAAATAC--TTAA-A--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-GAACGG-----T-ATGTG--TTA-GACAA----ATGATTATTCATCAGAAGG-AAACATAAGTGTAAAAAATTA--GCA-AAATAGGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--TGTAAA-A-A-A------A---TATC---A----TATAAC---A-------ATCAG--CAATTGTGTTTTG-ATATTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAG---TTA------GTGT-TT-GA----A-G------GTA----TTTGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACTGT-TAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATG--ACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGACAT---CTGCGA----GAAAA-GTGCTATGATTATTAA-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTAAGTGAT-AG-GAAATCTGAATCATG--TTAAAGTCCA-TAGTGAAAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCAT-AAAAAata
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAAT-ATTTTGT-TATTGTT-T--CTCAGGTTGTCC--ATGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTT-----ATT------AAT----------------------CT---------GCAG------ACA--CTAAATT-T-----TAATGTCAAATATCACAG-ACAGCA-A-TATGATGGCAGT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATGTGGTTT-TAAAATCATAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAACTTTTAAATCT-----AATAATG-ATTAAATAAAGTCACAGTATTACA-GGA---A-C-ATCT-----AAG----AAGTTATATAA-CAATTT----------------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATACGAAAGTATATT-T-GGTG-A-ATAA--------ATTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTT-G-A-A-TTTG-AATTTATG-TTTAAAT-AAAATAGA-AA-ATTATA-A-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAAT----TAT---C-----CAGATGATGACAA-GTTC-TAAA----------AATAT----A----------------ATT-TT--CTACCATC-----------------AATAATTAAAAAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TA-------GTGCTAGTTT---T----A-C----------CCA----------AT-ACAAAG-----G-ATGTA--TTAGTA-AA----GCAATTAATCACC-----A-AAATATATATGTAAACAATCA--ACA-AAATATATGA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--AG---------------------------A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTATAAACT-GTT-AA-----ACTCAC---ATA------A-GC-TT-TG----A-A------TTA----TTAACTT-AA------------------TTTA-TAT-TA-----------ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAA--ATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGACAT---CTGAGG----GAACATGTGCTTTAACTA---A-TTGACATG-----GGTATTGTTATTGATAAA-AAAAATTGAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAAAAGCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----AT-AAA---AT-ACTGCtg
gi|7 : ga--GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----T---------------GTTTTAA-TTGTTTC-TAA----------AGTT-TAAG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA-TA-A-TAATCAAATTCAAAGTATT-----GT-------ATCT-----TAA-TTAAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTTC-TTTTTATAGACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAC--TT--------------------------TCCATAATATA-G-TT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACAATGTCC-TAAA-atacaatttatactgaagtat
gi|7 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttaagataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcaaagtattgtatcttaattaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgttctttttatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataatatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgacaatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttT---------GAAA------ACATTCCAAGTA-A-----TGA-ATCGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----CGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-CGATTCACT-AA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCC-ATATCATAAACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG----------------------------T----T-AAAA-----------ATT-T-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAA----gatatact
gi|9 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgGAATTATCCTCGT-GTTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTAAAG-TT-GACAAA-ATC---------AATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATT-AACAAATACAGTTCCAAATATATA----CATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG-T--AG-TAATTT-AACAATTCACCCAA----AAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGCTAGTACA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATG-TT----TTAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCT-AAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTA-ACATGTATC--T--CTA---------------ATC----AATAATA--AGAACTCC--------------TTCCTTTAATGC--Ta
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 22 1 11 44444444444 111111111 33333333 1111111 1111111 1111 22222 666666666666666 2222 11111 1111111111111 1 2222 11 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 222222222222222222222 33333333333333333 11111111111111 11111 11111111111111111 1111111111 3333333 1111111111 111111 1111111 1111111111111 1111 1111 1111111
lowQualScore : 0 8 1 0 2 88 1 5555 1 55 6 8 5 0 4 0 0 22 0 99999999999 3 777777777 888888 444 55555555 1 5 2 3 3 6666 1 0000000 5 2 5 1111111 2 3333 3 0 44444 2 6 888 3 555555555555555 77777 3333 9 33333 5555555555555 2 66 11 66666 2 44 0000 3 1 0 2 00 11 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 2 444 11 33 1 5555 444 66666 2 1 66 77 99 1 444444444444444444444 77 44 0 0 22222222222222222 44 888 99999999999999 333 88888 2 777 77777777777777777 4444444444 44 11 7777777 4 33 2222222222 1 66 0 2 44 44 3 44 555 44 44 11 3 2 2 444444 555 8888 6666 555 555 5555555 33 2 3 1 3 3 77777 555 99999999999 9 0000000000000 6666 3 111 0 4 11 3 1 2 0 3 3 55 0 555 0000 0 8888 3 0 0 3 3 2 44 0 3 0 3 0 2 0000000 3 77 4
lowQualScore : . . . . . .. . .... . .. . . . . . . . .. . ........... . ......... ...... ... ........ . . . . . .... . ....... . . . ....... . .... . . ..... . . ... . ............... ..... .... . ..... ............. . .. .. ..... . .. .... . . . . .. .. . ................................................... . . . ... .. .. . .... ... ..... . . .. .. .. . ..................... .. .. . . ................. .. ... .............. ... ..... . ... ................. .......... .. .. ....... . .. .......... . .. . . .. .. . .. ... .. .. .. . . . ...... ... .... .... ... ... ....... .. . . . . . ..... ... ........... . ............. .... . ... . . .. . . . . . . .. . ... .... . .... . . . . . . .. . . . . . . ....... . .. .
lowQualScore : 8 0 4 4 7 77 6 3333 3 66 6 7 0 7 5 0 2 00 2 00000000000 3 777777777 888888 666 00000000 5 8 3 1 1 5555 5 8888888 4 0 7 0000000 9 4444 8 2 88888 1 2 999 5 999999999999999 77777 4444 2 77777 4444444444444 9 88 88 55555 3 66 5555 2 4 1 7 11 00 7 333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 111 77 22 9 0000 777 77777 1 9 33 11 22 9 666666666666666666666 00 66 5 3 00000000000000000 66 222 66666666666666 666 55555 9 333 33333333333333333 3333333333 33 66 4444444 1 77 8888888888 3 88 1 5 33 22 1 22 444 22 22 55 1 9 9 333333 000 9999 1111 000 000 4444444 99 9 1 4 1 1 77777 444 00000000000 2 0000000000000 5555 3 444 7 0 33 6 8 8 1 5 4 00 4 888 4444 7 8888 1 6 5 3 3 5 66 8 3 1 1 5 4 0000000 1 33 0
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
Reference ( family-2250 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
gi|1 : AA-GTT---------GAAG-----------CT---TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACACTGACTTGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTAT-TAAAGTCAAAC--AGTA-TTTT-AACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGC---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-T-CAATCCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTAAAATAATTTA-TAT-GGTGAA-TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAACA-A-AA-GTTATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAAT----TGT---T-----CAGCCAACGACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTATATCCT-ATC-TT--CTATTATT----TA---TATCCCTGAATAACT--AACTGCCC--------------ATCTTTAACTGC--TAGACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CATAAGTGTAAACA----------AT-CTACAA-----A-ATATG--TTTGG-TGGTTTTACAATGAA----CAATAGG-TAATA-AAGTATATACAATCA--GC---AATATGTT
gi|1 : gtacACATAAGTGTAAACAATCT--ACA-AAATATGTTT--GGTGGTT--TTACAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------G---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTGAATT-GTT-TT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACTAT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGACATGTTGTAAATATttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|1 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttTCAGTTTTGTTATTGAT-AG-AAGATTTGAGTCCTG--TTGAAATTCA-TATAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|10 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtatGAATTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTTAAG-TT-GAAAAA-ATT---------GATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATTAA-CAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG--T-AG-TAATTTAA-CAATTCACCCAAAAATAA----TTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGATAGTACA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----T-AACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCTAAAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTtataaaacttat
gi|11 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGTTTTAATT-GTTAC-TAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-TGATT--------------------CACT--AA-AA------TC-----ACAC----TC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AA---------------------AA-----G-TT----C-AAAAT------------T-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGTT-TTCAGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACCGTGACTATGTCC-TAAA-aacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttCCTTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAGCATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|12 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTACTTT-T-AATTTCAA-TAATATT-----------GATGAAAGAT---------GAAG------ACA--CTAGCTTTA-----TTGTGTTGAATGTCTCAC-ACCATAGAAT-CGACGACACG----TGTCAATTTTCTTTCAGTT--------------AAAGTCACAC--AGTT-TATC-AACAAATAT--TTTCATATATATGT--AAATTA---CA--CAAA--TACAGCGT-----------A-CCATCT-----A-G-CT-AG-TAATAT-A-------------------------ACATTTCA------------CAATAAAATAGCATA-T-T-GGTGAA--TAAACTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGG-CTTG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AA--TA-A-AG----------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNN----NNN---N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNN--NNNNGT----A-------TATA-----ATC-----CAGACACT----------GTCCTCCAATAATT--GGAAGTCCTCCCTCATGCAAATACCCTTTGATAT--TAAACT--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACATAGCACAGACATAACACAG-----G-ATTTG--TCAGGACAA----TCAATTAATTATCAGAAAG-AAATATAAATGCAAACAATCA--ACA-AAATGGGTTA--GGT---T--TTAAATTGTACAATA--GGTAAC-A-A-A------A---TAT----AGGTGT---AC---ATTCT---ATCAT--CAA-TATGTTTTC-ACACCATAAACT-GTT-AT-----AAACAC---TTA------G-AC-CA-GACTTTA-C------GTG----CTTATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTgatata
gi|13 : atatatttaatatttaTGTATTAAACCG-TGAATT-T-----T-CCTTTTTATAACTCCGGTTGTCC--GTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTGT-TATTTAAAGTTATGGT----GTGAT--GATGAG-GTT---------GAAG------AT--------TG-G-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGATGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTT--ATAGTA--A-T-ATCT-----AAG--C-AA-TAATAT-C-AAATCCGTTCAA----AA----TCACACTTTAA-CAGCGGTcaattcgtctgattgatt
gi|13 : cATATGATATTGAT---TAATTAAAGTCA-CAGT----GTTAT-A-GTA------A---TAT----C----T---A---------------AG--CAA-TA--------ATA-TC-AAATCCGTTCAA-----AATCACACTTTAACAGCGG-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATTGT-TAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAG--ACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGACAT---CTGTGA----GAAGTTGTGCTATAATC----AGTTGGCATGTTGTCAATCTTGAGTTTGAT-AGAAAAAATTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAAAAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACAT-GCctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|14 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatat-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-ACATTA-ACAA-GTTATA-A-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG---AAA----TTTTTTC-----CAGCCAACAACAATATCC-AAAAAGTATTA--CAATAT----A-T--------ACC--------T--CTGTTATT----TAACATCTCTCTCAATAATC--AGAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TGAATT--GGTGCTAGATT---T----A-C----------ACA----------AT-GCACAT-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAATTGTAAACAATAA--AC--AAATATGTTA--GAT---T--TTAAAATGAACAACA--GGAAAT-A-A-T------A---TAT----A----T---AC---A-------TTGAG--CAA-TATGTTTTC-AAACTATAAATT-GCT-AT-----TATAAC---TTA------GTTT-TT-GA----A-AGTACACGTA----TTTACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCTTT-CAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAG--ACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-
gi|15 : ATTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGG-TT-A-A-AATCCA-ACTTTATG-TC----A-CGTATA-A-AA----------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAAAGTTACTAT---C-----CAGATAGCGTCTGCGTTC----A-GAATTG--CTTTATTTGAG-T--CTC-GTAAAAA-ATA-TTAAATGTCA------------ACTCTTAAATACTT--AATA-TAT--------------ATTGTTTCACACGATATACA--GGAACTTGCTTGTAT----A-A----------ACA----------AT--TA----------AT-TA--TCAA---AA----AGAATT-----TAAAAAGGTAAACA--------AAC--TCAAGACATAATTATGTTG--GGC---T--TAAAAACGGACAAAA--GGTGAT-ACA-ATGTTTTA---TAT----A----T---AC---ATTGTATTATAAT--CAA-TAGGTTTTC-ACACCTTATACT-GCT-ATTAGCAAATTGC------------G-TT-TT-GA----A-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTattattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|16 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataactagagatggtgatgatgatgatgatccatgcAA-ATAT-A--AAATAT----A-TGACTCTGTATCAG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AATTGCCC--------------ACCCTTATTTGC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------GCA----------AT-ACACAG-----G-ATGTG--TTAGAA-AA----ATAATTAATCATCAGAAGG-AAACATAAGTGTAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TGAAAATGAACAATA--GGTTAT-A-C-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACCCTAAATT-GTT-AT-----AAGCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TAAATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACTGT-TAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATTA---A-TTGACATGTTGTCAGTATTGTTGTTGAT-AG-AAAATTTGAATCCAA--TTAAAATTCA-TTGAGAACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACAT-GCCGgttgtttcattcaccat
gi|17 : t-T--CCCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCGTGAATAATT--AACAGTTC--------------ACCCTTAAACAA---AAACA--GGTGCTAGTTT---T----T-C----------ACA----------AT-GTACAG-----G-ATGTG--TTAG-ACAA----ACAATTAATTATCAGAAGG-AAATATAAGGGTAAACAATCA--ACA-CAATATGTTA--GGT---T--TTAGAATGAACAATA--GATGAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTGC-ACACTCTAAATT-GCT-AT-----AATCGC---TGA------G-TCTTT-GA----C-G------GTA----TTTACATGAAAAGGGAA-------------CAC--T-TAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAA--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGACAT---CTGTGA----GAACAAGTGCTATAATTA---A-TTGGCAAGTTATCACTATTGGTATTGAC-AG-AAAATTTGAATCCTG--TAAAAAATCA-TAGAGAAAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|18 : tcCCGATCT--AA------AAG----TAT---TTTTATCAGACAGTAACTATGTCC-TAAA-ATGTTG--T-----------T--CTCTAT---CA-ATC-CT--CT---------------------------ATT--AA-----C--------------TTCTTTAAATAC--TAAA-ATTGGT--TTGTTTG--C----A-C----------ATAC---------AT-ACATGGCTTT-G-GTATGGTTTAG---------ATACTTAATCATCAAAAGA-AAACATAAACGCA-------A--ACA-AGATATACTG--G----------AGAATACAC------GGTAA--A-A-ATGTG--A---TGT----A----C---ACCAAA-------ATCA----AA--ACTTTTTC-ACGCCTTCAATT-GCT-AT-----AATCAG---TTA------G-GC-TT-CA----ACA------GTA----TATATAtgt
gi|19 : cA----TCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATAAAGTA-TATA-T-TTGGTGAA--TAAACTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGG-CT-G-TTA-TCCA-AATTTATA-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-G-AAGTTAATTTCAC---------------------------T--GACTGGTAAAT----TAT---C------------------TTTCT-TTAA---ATTA--AATTAA----AGT--TTCTTT-CTTG--TCGCT--TTGTTATT----GA---T----CT------TT--AAAA-TCC--------------ACCCTGTAATAC--TTAACT--GGTGCTAGTTT---T----C-C----------ACA----------AT-GCATAG-----G-AATTA--TTAGAACAA----ACAATTAATCTTCAAAAGT-AAACGTAATTGTCAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--TGT---T--TTAAAGTGAACAATA--GGTAGTAA-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCGG--CAA-TATGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|2 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGCCACT----TG--------------G-TTTAA-TTGTTTC-TAA----------AGTT-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA-TA-A-TAATCAAATTCACAGTATT-----GT-------ATCT-----AAG-TTAAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCC-ATATCATAGACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA--------------------------G-TT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-gtct
gi|2 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|20 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgccacttggtttaattgtttctaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataattcttttcataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctggtggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaatttt-A-A------A---TATTCTGA----T---A----A-------A--AA--CAA-AATGTTCTCGATACTGTTGTTT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------ATT----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TT-CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACG--ACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGACAA---CTGTTA----AAACAAGAGCTATAATTT---A-TTGGACTGTTGTTAGTATTGTTAATGAT-AC-ATAATTTGAATACTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACAT-GCTGCgatatact
gi|22 : atgaagatAA----ATACTTAATTATCA---GA-AAACATAAAAGCAAACAA--G--ACA----TAC---------------------TGGACAATACAGG--AT-A-A-A------AACGTAT----G----T---AC---A-------CCTAAACCAT-TAAGTTATC-ACACCTTCAAAT-GCT-------------C---TTC------G-AC------------A------GTA----TATACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT--CGCATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTAAA-----ATATT------AGGAC----TTGACATTataaaatatataattctcaaacat
gi|25 : gtggtttTGTATTAAGCCGGTAATTT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGT-GTCC--GTAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTAAAGTCATGTA----ATG-TTTGCTGAA-GTTTAT------GAAGCTTAAAACA--CGAAATGTA-----TTACGTTGAAGGTCACAGAACA-CA-AATACGACGACACT----TGTCAATAT-TTATCAGTTTTAATTTGGTGT-TAATGTCGCACTAAGTT-T------TAAATATAgagtatattaagtgaaagcagtattaacagtaatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|3 : --GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATGTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT---------TTATGTT-A-AAAATA--GTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TTTAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AA----AT----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTC-T-T-TGTGAA--TAAACTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA--------------------------G-TT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-aaata
gi|3 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttaCCCTTCAATAT--AAAAT-----TGTT--TTT---T----AAC----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTA----AA----ATACTTTTTTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|37 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttagataaagttgaagacactaaataaatgtattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttatgttaaaaatagtttcaaagataatcaagattataatcaaattcacagtattgtatctaagtttaatgatatatgattcactaaattcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccaatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTAGTTGTCATTTGACAA---TTGTGA----GATCATATGCTATA-------G-TTGGCATATTGTT--CTTTGC--TTGAA-AT-TAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-TAAAGAAA-----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTAT-TAAAAGGTCGCTGgatatacttga
gi|39 : ttTTGACAGTTGACAT---ATGTTATCTTGAAAATGTGCTTGAATT------------TATTGACAGTATTGTCATTGAT-AG-AAAATTTAAAT-CTGAATGAAAA--AA-AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAttt
gi|4 : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTTCTCC-CACGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTCT-AGTTTGAAGTAATATT----ATGAT--GATGAA-GTT---------GAAG------AT--------TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACAAT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTTATTTGGTGT-TAAAGTCAAAC--AGTT-TATT-A-CAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGT---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-T-AAATCCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTAAAATAGTATA-TAT-GGTGAA-ATAAACTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CTGG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAACA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAAT----TAT---C-----CAGCCAGCTACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATC----TA---TATCTTTGAATAATT--AACAGTCC--------------ACTCTTGAAAAC--TAAACA--GATGCTAGCTT---T----A-C----------ACA----------AT-TCACAG-----G-ATATG--TTGGGACAA----ACAG-TATTCATCAAAGGA-AAACATAAGTGTAAACAATCG--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTGAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAG----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATTTGTTC-ACATTCTAAACT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-GG-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACTTC-TAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATG--ATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGACAT---GTGTGA----GAACATGTGCTATAAGT----A-TTGGCATGTTGTCAGTACTGTTATTGAT-TG-AAGATTAGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACAT-GCTGC
gi|40 : TTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACT--AGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGACATAAGCTATAAG---GAATACGCAC----GTT----A-TTG
gi|41 : ctT----A-TTGGCACATTATTAGC-TTGTTATTGTT-AG-AAAATTTGAATGCTG--TTAAATGACA-TAGAGAAAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT--GAGACAT-t
gi|43 : ataATGTTATCAGCATTGTTATTGAT-AG-AAAATT-GAATACTG--TTAAATTTAAATAGAGAAA-TACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACAT-
gi|44 : TTCCGATCT--GACTAGTGAAA----
gi|45 : tA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGG-CT-A-A-A-ATCG-AAC--GTG-C--------------A-AA-GTT-TT-A-AAGTAAATT-CACAAT-GGCCTGA--CGACAATTACGattgttttgttaacaaaatacatgtcttttgcatggttaagataagaagacataaaagcaaacaagatatactt
gi|47 : AATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAA-GAAAGTTCAT-ATAAACAT-GCTGCggcacttatcca
gi|5 : tCATATATTA-GTCG-TGAATT-ACTTTGT-CGTTGTT--G-CTCCGGTTGGC--TGTGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTTT-AATTTGA-GTAATGTT----ATT-TT-GCTGAA-GTTAATGAAATAGAGG------ACA--TTAAATTGA-----TCACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AACACGACGACACT----TGTCAATGT-CAACCAGTTTTAATTTGGTGT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTTA-CACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATT--AGAGTTAAA-C-ATCTTTGCAAAGATT-AT-TGA--------ATCCACTCTT----AA----TCACA-TTTAATACGTGATGTCCAATAAAATAGTA-------------------------TATT-----CAGTGA--ATAA-AACAA---------A-A---CA-----TATG-TT----T-AGAATA-A-AAAGTTATT-GTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATA----TAA---C-----CAGCCAACGACGATGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-G--ATCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATTACAGTA---TAACCCTGAAAAATT--AACA-TCC--------------ATCCATAAATAC--TTAA-A--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-GAACGG-----T-ATGTG--TTA-GACAA----ATGATTATTCATCAGAAGG-AAACATAAGTGTAAAAAATTA--GCA-AAATAGGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--TGTAAA-A-A-A------A---TATC---A----TATAAC---A-------ATCAG--CAATTGTGTTTTG-ATATTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAG---TTA------GTGT-TT-GA----A-G------GTA----TTTGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACTGT-TAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATG--ACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGACAT---CTGCGA----GAAAA-GTGCTATGATTATTAA-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTAAGTGAT-AG-GAAATCTGAATCATG--TTAAAGTCCA-TAGTGAAAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCAT-AAAAAata
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAAT-ATTTTGT-TATTGTT-T--CTCAGGTTGTCC--ATGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTT-----ATT------AAT----------------------CT---------GCAG------ACA--CTAAATT-T-----TAATGTCAAATATCACAG-ACAGCA-A-TATGATGGCAGT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATGTGGTTT-TAAAATCATAC--AGTT-TATTAA-CAAATAAACTTTTAAATCT-----AATAATG-ATTAAATAAAGTCACAGTATTACA-GGA---A-C-ATCT-----AAG----AAGTTATATAA-CAATTT----------------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATACGAAAGTATATT-T-GGTG-A-ATAA--------ATTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTT-G-A-A-TTTG-AATTTATG-TTTAAAT-AAAATAGA-AA-ATTATA-A-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAAT----TAT---C-----CAGATGATGACAA-GTTC-TAAA----------AATAT----A----------------ATT-TT--CTACCATC-----------------AATAATTAAAAAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TA-------GTGCTAGTTT---T----A-C----------CCA----------AT-ACAAAG-----G-ATGTA--TTAGTA-AA----GCAATTAATCACC-----A-AAATATATATGTAAACAATCA--ACA-AAATATATGA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--AG---------------------------A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTATAAACT-GTT-AA-----ACTCAC---ATA------A-GC-TT-TG----A-A------TTA----TTAACTT-AA------------------TTTA-TAT-TA-----------ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAA--ATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGACAT---CTGAGG----GAACATGTGCTTTAACTA---A-TTGACATG-----GGTATTGTTATTGATAAA-AAAAATTGAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAAAAGCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----AT-AAA---AT-ACTGCtg
gi|7 : ga--GATAAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----T---------------GTTTTAA-TTGTTTC-TAA----------AGTT-TAAG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA-TA-A-TAATCAAATTCAAAGTATT-----GT-------ATCT-----TAA-TTAAA-TGATAT-A-TGATTCACT-AA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTTC-TTTTTATAGACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAC--TT--------------------------TCCATAATATA-G-TT----C-AAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACAATGTCC-TAAA-atacaatttatactgaagtat
gi|7 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttaagataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcaaagtattgtatcttaattaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgttctttttatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataatatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgacaatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttT---------GAAA------ACATTCCAAGTA-A-----TGA-ATCGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----CGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------T-TATG-A-TAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-A-CGATTCACT-AA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCC-ATATCATAAACTC-T-T-TGTG-A-ATAAACTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG----------------------------T----T-AAAA-----------ATT-T-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAA----gatatact
gi|9 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgGAATTATCCTCGT-GTTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCCATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGTTGCTAAAG-TT-GACAAA-ATC---------AATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTT-AATT-AACAAATACAGTTCCAAATATATA----CATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG-T--AG-TAATTT-AACAATTCACCCAA----AAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGCTAGTACA-TCT-GGTTCATATAA--TTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATG-TT----TTAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCT-AAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTA-ACATGTATC--T--CTA---------------ATC----AATAATA--AGAACTCC--------------TTCCTTTAATGC--Ta
blockSeqs : G A T TC T ATAA C AT G A T G T AG GCTAAAGTT A AATGAAATA CTTAAA ATT AAATTTA T C T A G . C TTTCTTT C T C CGCACTA A TAA C ATCG C T GAT G TAGAGTTAAAC TTGCA TTA A AACA CAAAAATAA T AA AG TATAT C TG CATA A T A AG CC G ATGGTTTGAATTTGAATTTATGTTTAAATAAAATAGAAAATT . T A AGA AA CC T TTAC TTT TTTAT G T AA AG TT C TTGAGTCTCGTAAAAA GC AA ACAGTATAACCCTG AA AAG TCCCTCATGCAAAT GAT ATTG T GTA GTTAAC TAGCACAGAC AA TG CTTTTGC T GT GGACAA T AA T GT AG T TT . AA CA TA A C T TGTTTT ACG TCTG GGTG ATA CAA TTGTATT AC T G A C C TAGCA ACT ACAGCGGTC T AAGTACAC TTAC G TTT A AT T T G C G TA AAG TCTT ATTA G A A C AA A T T AGGTTTA A AA C
blockSeqs : . . T C T ATA C C G A T C . AG ATGTTT . TAT . A AAATGTA T T T . . . C TTATAA T A C CACAC . CAA T TATG G T GAT T TATAGTAAT . TTT G AACA CAAAAATAA . AA AC TACA A G CATA A A . AG CC . ATGGCTAGAATCCACTTTTATGTTTTAACATAGAGTGTT . . . C AA . A . . . T T T A TT N ATGACTCTGTATCAG T . TAACATCTCTCTC . AAG . G CTG A G GTTAAC C A CA CTTTTGC T . GGACAA A AA . AA . . . . . . TT . . . TGTG . C . . . TTCT . . . C . . . . GTTT T CTTTAC . . TTT . AT . T G G A . . G A . . . C . . . T . . A .
blockSeqs : . . T C A TA A T G A T C . AG GTGAT . . . A AAATTTA G A T . . . C TTCTAT T G . CACAC . TAA T ATCA A T AT G AACAGTAAC . ATT A AACA CAAAA . AA AA CATA C T AAA A C . AG CC . ATTGCTAGAATCCACTTTTATGTTTTAACATAGAGTGTT . . . T AA . G . . . N N N N . A AGTTTCTTTCTTG T . TATATCCCTG . TTG . T TTG A . GTTAAC . G CA CTTTTGC T . GAACAA A AA . AT . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . A . . . . GTCT . ACA . . TTT . AT . C G T A . . . A . . . C . . . T . . A .
blockSeqs : . . T C G TA C . G A T T . A ATGAT . . . A TTA T T T . . . C ATTTAT T T . CACAC . TTA A ATCA T T AT T TACAGGAAC . TTA . ATG CAAAA . AT AA TATA . G AA A T . TT . . ATGGCTGTTATCCAAATTTATATTTAAAATAAAAGTT . . . A AA . G . . . C A A G . T ATCTCTGTACCCG T . TATATCCGTG . CAG . T CAG T . AAC . A CA CTTTTGC T . GGACAA A AA . TT . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . T . . . . GTCT . AG . . TTT . AC . C G G A . . . T . . . A . . . T . . T .
blockSeqs : . C T G G A . A T T C . G ATTTT . . . A GTA T C T . . . C TTCTAT T G . CAAAC . TAA T TATA G T AT T TGTA . TT . CAA CTTAA . AA TC ACTC . T AA A T . AG . . ATGGCTGGAATCCAAATTTATGTTTAAAACAAAAGTT . . . C AA . A . . . C T T A . A AGATCTGTATCCG C . TATATCTTTG . CAG . T CAG A . AC . G CA CTTTG T . AGATA A AA . GT . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . C . . . . GTGT . AG . . TTT . AT . T G A A . . . A . . . A . . . T . . G .
blockSeqs : . . G T T A . . . . . . A . . . . A TGA T T T . . . C GTCAAC T T . CACAC . TAA T ATCA G T AT G TGTA . CT . ATG AAAA . AA TC ACTC . T AA A A . AT . . TCGGTTAAAATCCAACTTTATGTCACGTATAAAA . . . C AA . G . . . T T T A . T CTCTCTAACATGT T . GTCCTCC . AAG . T CAG A . AC . A TG G T . GAAAA A AA . GG . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . C . . . . GAC . AG . . TTT . AT . C C A C . . . . . . . C . . . T . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A GG G A T . . . C TTCTAT T G . CATAC . GA A ATCA T A AT G TGTA . TT . ATG AAAT . AA AA TATA . G AA A A . AG . . TTGGCTTGAATCCAAATTTATGTTTAATAAAG . . . T AA . A . . . T T T G . C TCTCTATCA T . ACTCTTA . AAC . T CTG T . AA . G TA G T . GACAA C AA . AC . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . T . . . . GTT . CG . . TTA . AC . T C G A . . . . . . . G . . . G . . A .
blockSeqs : . . . A GA C C T . . . C TTATAA T G . CACAC . GA C TGT T T AA G ACC . T . TAA AAAA . A AA ACTC . G AA A T . AA . . TCGGCTAAAATCGAACGTGCAAAGTT . . . T TA . A . . . T T T G . C ATATA T . GATCT . TA . G CAG A . AC . A TG G T . AGATA A TT . TT . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . G . . . . GGC . AG . . GTT . C . T T G A . . . . . . . A . . . A . . A .
blockSeqs : . . . A TT A T T . . . . . C T . . . TA A TAT G . A T TGT . C . ATG AAAA . A CG ACTC . T AA A T . AG . . AAACATATGTTTAGAATAAAAAGTT . . . C AA . G . . . C G A A . A ATACC . . ATC . AA . A AG T . TC . A TG G T . GACAA T AT . AA . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . T . . . . GTC . AG . . . . . . C G G . . . . . . . . C . . . T . . . .
blockSeqs : . . . A AA T T T . . . . . . T . . . TA T TA G . A T TGT . C . ACG . . T TT TACA . T AA . T . . . . TCCATAATATAGTTCAAA . . . C T . A . . . C G A . . C A . . . . CA . T A A . AC . T CA G T . GTAAA C AT . AA . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . C . . . . GAC . AG . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . .
blockSeqs : . . . . T G C . . . . . . . T . . . GA T T C . . G GA . T . A . . A TC TC . G AA . A . . . . AAGTTCAAAAT . . . C T . G . . . T A T . . . . . . . . . T A A . CC . G CG G . . AGATA C AA . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . GGG . AA . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T T . . . . . . . . T . . . GA C A . . . . GA . . . . . . . AG TA . . . . A . . . . GTTCAAA . . . T T . A . . . T A T T T A . AC . A AA T . . AAA G . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . AGC . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . GTTCAAA . . . T T . A . . . G T A G A T . AC . A TG G . . AA A . . GT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GTTAAAA . . . C T . A . . . . . . T . . . AC . . . . . . G A . . AT
blockSeqs : . . . . . . T . . T . . AA
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : C* ATA* ** AG GTGT******* A** **** TGA* TT** CAAAA******** AA** AC*************** GGACAA**** ***
originalCons : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-TGCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTT----ATG-T--GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATT-A-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAA----AA----TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA-ATAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
finalCons : CATGTATTAAGCCG-TGAATT-TCCTCGTC-GTTTTTATA-CTCAGGTTGTCC--GCGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGTTGTGT-------GATGAA-GTT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTT-TATTGA-CAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAGTT--AA-TGATAT-A-CGATTCACTCAAAA--------TCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGAA--TAAACTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----T-AAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---TAC---------------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT
Alignments
lowQualScore : 111 1 11 1111 2222 1 11 3333333333333 111111111 33333333 1111111 1 1 1111111 11 22222 6666666666666666 2222222 1111 1111111 1111 11 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555 11 222222222222222222222 33333333333333333 11111111111111 11111 11111111111111111 1111111111 3333333 1111111111 111111 1111111 1111111111111 1111 1111 1111111
lowQualScore : 0 8 000 1 1 2 22 9999 1 0000 6 8 5 0 4 0 0 22 66 5555555555555 55 0 555 777777777 888888 444 55555555 1 5 2 3 3 6666 3 0000000 2 2 1 4444444 55 0 1 0 66666 2 4 7777 3 2222222222222222 77777 0000000 3333 9999999 2 8 44 44 3333 33 555 2 2 1 0 2 00 11 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444 2 2 2 444 11 33 1 5555 444 66666 2 1 66 77 99 1 444444444444444444444 77 44 0 0 22222222222222222 44 888 99999999999999 333 88888 2 777 77777777777777777 4444444444 44 11 7777777 4 33 2222222222 1 66 0 2 44 44 3 44 555 44 44 11 3 2 2 444444 555 8888 6666 555 555 5555555 33 2 3 1 3 3 77777 555 99999999999 9 0000000000000 6666 3 111 0 4 11 3 1 2 0 3 3 55 0 555 0000 0 8888 3 0 0 3 3 2 44 0 3 0 3 0 2 0000000 3 77 4
lowQualScore : . . ... . . . .. .... . .... . . . . . . . .. .. ............. .. . ... ......... ...... ... ........ . . . . . .... . ....... . . . ....... .. . . . ..... . . .... . ................ ..... ....... .... ....... . . .. .. .... .. ... . . . . . .. .. . .................................................. . . . ... .. .. . .... ... ..... . . .. .. .. . ..................... .. .. . . ................. .. ... .............. ... ..... . ... ................. .......... .. .. ....... . .. .......... . .. . . .. .. . .. ... .. .. .. . . . ...... ... .... .... ... ... ....... .. . . . . . ..... ... ........... . ............. .... . ... . . .. . . . . . . .. . ... .... . .... . . . . . . .. . . . . . . ....... . .. .
lowQualScore : 8 0 000 4 7 7 33 3333 3 6666 6 7 0 7 5 0 2 00 11 5555555555555 00 4 888 777777777 888888 666 00000000 5 8 3 1 1 5555 5 8888888 4 0 4 6666666 33 3 0 2 66666 1 2 2222 5 5555555555555555 77777 1111111 7777 5555555 9 3 88 22 2222 66 000 9 9 4 1 7 11 00 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 111 77 22 9 0000 777 77777 1 9 33 11 22 9 666666666666666666666 00 66 5 3 00000000000000000 66 222 66666666666666 666 55555 9 333 33333333333333333 3333333333 33 66 4444444 1 77 8888888888 3 88 1 5 33 22 1 22 444 22 22 55 1 9 9 333333 000 9999 1111 000 000 4444444 99 9 1 4 1 1 77777 444 00000000000 2 0000000000000 5555 3 444 7 0 33 6 8 8 1 5 4 00 4 888 4444 7 8888 1 6 5 3 3 5 66 8 3 1 1 5 4 0000000 1 33 0
consensus : CATGTATTAAGCCG-TGAA---TT-TCCTCGT-CGTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-G--CGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGT--TGT----N-T-----GA--TGAAG---TT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTTTATTGACAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-ACGATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGA---A-TAAA-CTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
Reference ( family-2250 ) : CATGTATTAAGCCG-TGAA---TT-TCCTCGT-CGTTTTTATA-CTCAGGTTGTCC-G--CGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTGAAGTAATGT--TGT----G-T-----GA--TGAAG---TT---------GAAG------ACA--CTAAATN-A-----TTACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTNT-TAAAGTCACAC--AGTTTATTGACAAATANAGTTTCAAATATATATCAANATTA-ATTAATCAAAGTCACAGTGTT--A-AGT---A-C-ATCT-----AAG-TT-AA-TGATAT-ACGATTCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCAATAANATAGTATA-T-T-GGTGA---A-TAAA-CTTAAATATTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-G-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCGATCT--GACTGGTAAAA----TAT---C-----CAGACAGCGACNATGTCC-NAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AANAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-ACACGG-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAAGTGCAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-NC-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTTGATTTCGCAAGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTTATTGAT-AG-AAAATTTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAATACCAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGC
gi|1 : AAG---TT---------GAAG-----------CT---TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACACTGACTTGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGGTAT-TAAAGTCAAAC--AGTATTTTAACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGC---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-TCAATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCAATTAAAATAATTTA-TAT-GGTGA---A-TAAAACTTAGACGTTTA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CT-GGA-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTTATTTA-AAGTAAATTTCACAAT-GTCCTGA--TGGTTATTCCGATCT--GACTGATAAAT----TGT---T-----CAGCCAACGACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTATATCCT-ATC-TT--CTATTATT----TA---TATCCCTGAATAACT--AACTGCCC--------------ATCTTTAACTGC--TAGACA--GGTGCTAGTTT---T----A-CATAAGTGTAAACA----------AT-CTACAA-----A-ATATG--TTTGG-TGGTTTTACAATGAA----CAATAGG-TAATA-AAGTATATACAATCA--GC---AATATGTT
gi|1 : gtacACATAAGTGTAAACAATCT--ACA-AAATATGTTT--GGTGGTT--TTACAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------G---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTCTGAATT-GTT-TT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAAGGGAAGTGAGAAATATTTTACTAT-TAACACTTAA-TTATCAATCACTTCAATTTCACACGTTTTTACAATGCTAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATAAAGTTGACATTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-TTGACATGTTGTAAATATttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|1 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttTCAGTTTTGTTATTGAT-AG-AAGATTTGAGTCCTG--TTGAAATTCA-TATAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-AAAAACAT-GCTGatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtattcagttttgttattgatagaagatttgagtcctgttgaaattcatataagaaatattaataaatcaaattaaaattttaaaagaaagttcataaaaacatgctgtataaaacttat
gi|10 : gtacaagttgaagcttgatgaagttgaagacacagaaagcaaatacgacgacactgacttgtcaatttctatcagttttaatttggtattaaagtcaaacagtattttaacaaataaagtttcaaatatatatgatattgattaattaaagtcacagtgtaacagcaacatctaagcaataatattcaatccactcaaaatcacactttaaaagcggtgtcaattaaaataatttatatggtgaataaaacttagacgtttacacagtttataaaataatggctggaatccaaatttatgtttaaaacaaaagttatttaaagtaaatttcacaatgtcctgatggttattccgatctgactgataaattgttcagccaacgacgctgtccaaaagtattacactatatctctatatcctatcttctattatttatatccctgaataactaactgcccatctttaactgctagacaggtgctagttttacataagtgtaaacaatctacaaaatatgtttggtggttttacaatgaacaataggtaataaagtatatacaatcagcaatatgttttcacactctgaattgttttaatcacttagtctttgaaggtatttacataaaagggaagtgagaaatattttactattaacacttaattatcaatcacttcaatttcacacgtttttacaatgctaattaagattatattgaactcaggataaagttgacatttgacatctgtgagaacatgtgctataattattgacatgttgtaaatatatatgtcttaagttccttctgcatttgatttaaatccaattaattcttgttaacactctcagtataaccatacaatgtatgtaaagtatataaatatatgcataattacgtacgtttactttgtaatttcatatatatgtttttcagcgcatgatttgttttgatatgttgatgattagctgtaacgtattctaaagtcaaataaagtatctgtattctgtatGAA---TTATCCTCGT--GTTTTT-TA-CTCAGGTTGTCC-ATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGT--TGC----T-T-----AAGTTGAAAAAATT---------GATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTTAATTAACAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG--T-AG-TAATTTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGATAGTACA-TCT-GGTTC---A-TATA-ATTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATGG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGTAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCTAAAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTtataaaacttat
gi|11 : atgcaataggtttatcaaacaatgagatgtatagcgagagatttataataaaaaggagaaaaaggagaaatacagaaggagtgacaaatttatggacagatagtaacataatttcgtaagtttagcaaactagtggcgatgtttcgaaaggaatcactttaggaatgttttattaaaccagtaagatgaaattatttcagtcagatctgttatgttaaactctaatctaagactgtttgaaacagttagaaGTTTTAATT-GTTAC-TAAAGT----------TTAT-GATAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCGAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTCT------TTGTG---AATAA---------------------------A-CTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AA-AA-------------------------G-TT----CAAAA------------TT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCAGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACCGTGACTATGTCC-TAAA-aacatgtatctctaatcaataataagaactccttcctttaat
gi|11 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttCCTTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAGCATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcctttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaagcataaaagcaaacaagatata
gi|12 : aaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcaggcacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatataaccttgatttaacatgtattacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggacacttgttttaattgttactaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcgagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaaaagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttcagatctgactagtaaaatatccaaaccgtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTACTTT-T-AATTTCAA-TAATAT--TG-----A-T-----GA----AAG---AT---------GAAG------ACA--CTAGCTTTA-----TTGTGTTGAATGTCTCAC-ACCATAGAAT-CGACGACACG----TGTCAATTTTCTTTCAGTT--------------AAAGTCACAC--AGTTTATCAACAAATAT--TTTCATATATATGT--AAATTA---CA--CAAA--TACAGCGT-----------A-CCATCT-----A-G-CT-AG-TAATAT-A--------------------ACATTTCA------------CAATAAAATAGCATA-T-T-GGTGA---A-TAAA-CTTAGATACAAAACACAGTTT--ATTA-AATATTGG-CTTG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAA--TA-A-AG----------AGGTAAATTACACAAA-GTCCTGA--AGGTAATTCCGATCTCCGACTGGTGGNN----NNN---N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNN--NNNNGT----A-------TATA-----ATC-----CAGACACT----------GTCCTCCAATAATT--GGAAGTCCTCCCTCATGCAAATACCCTTTGATAT--TAAACT--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACATAGCACAGACATAACACAG-----G-ATTTG--TCAGGACAA----TCAATTAATTATCAGAAAG-AAATATAAATGCAAACAATCA--ACA-AAATGGGTTA--GGT---T--TTAAATTGTACAATA--GGTAAC-A-A-A------A---TAT----AGGTGT---AC---ATTCT---ATCAT--CAA-TATGTTTTC-ACACCATAAACT-GTT-AT-----AAACAC---TTA------G-AC-CA-GACTTTA-C------GTG----CTTATAT-AAAAGGTTGGTTTGAAATATTgatata
gi|13 : atatatttaatatttaTGTATTAAACCG-TGAA---TT-T-----T-CCTTTTTATAACTCCGGTTGTCC-G--TGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTGT-TATTTAAAGTTATGG--TGT----GAT-----GA--TGAGG---TT---------GAAG------AT--------TG-G-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-ACAGCA-AATACGACGACACT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATTTGATGT-TAAAGTCACAC--AGTTTATTAACAAATAAAGTTTCCAATATATAT-GATATTG-ATTAATTAAAGTCACAGTGTT--ATAGTA--A-T-ATCT-----AAG--C-AA-TAATAT-CAAATCCGTTCAA----AATCACACTTTAA-CAGCGGTcaattcgtctgattgatt
gi|13 : cATATGATATTGAT---TAATTAAAGTCA-CAGT----GTTAT-A-GTA------A---TAT----C----T---A---------------AG--CAA-TA--------ATA-TC-AAATCCGTTCAA-----AATCACACTTTAACAGCGG-TC-TTTGA----A-G------GTA----TTTACAT-CAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTATTGT-TAATTTTTAA-TAATTAATCACTTTGATTTCCCAGGTTTTTACAATGCTTATTAAG--ACTGTATTGAACTCCGAATATAG-------CTGACAT---CTGTGA----GAAGTTGTGCTATAATC----AGTTGGCATGTTGTCAATCTTGAGTTTGAT-AGAAAAAATTGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAAAAATACTGATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGGAAGTTCAT--AAAACAT-GCctttgaaggtatttacatcaaagggaagtttgaaatattttattgttaatttttaataattaatcactttgatttcccaggtttttacaatgcttattaagactgtattgaactccgaatatagctgacatctgtgagaagttgtgctataatcagttggcatgttgtcaatcttgagtttgatagaaaaaattgaatcctgttaaaattcatagaaaaaatactgataaatcaaattaaaattttaaaaggaagttcataaaacatgc
gi|14 : ctgtattaaaccgtgaattttcctttttataactccggttgtccgtgagtagacaagaagatgcggtgagcgagtattttgttatttaaagttatggtgtgatgatgaggttgaagattggtgaagttgaagacacagacagcaaatacgacgacacttgtcaatttctatcagttttaatttgatgttaaagtcacacagtttattaacaaataaagtttccaatat-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TACATTA-ACAA-GTTATA-A-AAGCAAATTT-ACAAA-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GTCTG---AAA----TTTTTTC-----CAGCCAACAACAATATCC-AAAAAGTATTA--CAATAT----A-T--------ACC--------T--CTGTTATT----TAACATCTCTCTCAATAATC--AGAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TGAATT--GGTGCTAGATT---T----A-C----------ACA----------AT-GCACAT-----G-ATGTG--TTAGGACAA----ACAATTAATCATCAAAAGA-AAACATAATTGTAAACAATAA--AC--AAATATGTTA--GAT---T--TTAAAATGAACAACA--GGAAAT-A-A-T------A---TAT----A----T---AC---A-------TTGAG--CAA-TATGTTTTC-AAACTATAAATT-GCT-AT-----TATAAC---TTA------GTTT-TT-GA----A-AGTACACGTA----TTTACAT-AAAAGGGAAATTTGAAATA-CTTGCTTT-CAATACTTCA-TTATTATTCACTTTGATTTTGCAAGTTTTTACAATACTCATAAAG--ACAATATTGATCGCATGATATAGTTCACATATGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATT----A-
gi|15 : -T-GATGATCCA-TGCA-TTTAGATATTAA-CACAGTTT--AAAG-AATTTCGG-TT-A-A-AATCCA-ACTTTATG-TC----ACGTATA-A-AA----------AAATAAATTTCACAAAAGTCCTAA--CGATAATTCAGGTCT--GACTAACAAAGTTACTAT---C-----CAGATAGCGTCTGCGTTC----A-GAATTG--CTTTATTTGAG-T--CTC-GTAAAAA-ATA-TTAAATGTCA------------ACTCTTAAATACTT--AATA-TAT--------------ATTGTTTCACACGATATACA--GGAACTTGCTTGTAT----A-A----------ACA----------AT--TA----------AT-TA--TCAA---AA----AGAATT-----TAAAAAGGTAAACA--------AAC--TCAAGACATAATTATGTTG--GGC---T--TAAAAACGGACAAAA--GGTGAT-ACA-ATGTTTTA---TAT----A----T---AC---ATTGTATTATAAT--CAA-TAGGTTTTC-ACACCTTATACT-GCT-ATTAGCAAATTGC------------G-TT-TT-GA----A-G------GTATTACTTTACAT-GAATGGAAAGTTTGAAATATTTattattattcctcaatttaagtctctaagctaaataacccatacccgatcagtca
gi|16 : taaactacatctcgagaatactctttcagagggagacgataactagagatggtgatgatgaAA-ATAT-A--AAATAT----A-TGACTCTGTATCAG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCCTGAATAATT--AATTGCCC--------------ACCCTTATTTGC--TAAACA--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------GCA----------AT-ACACAG-----G-ATGTG--TTAGAA-AA----ATAATTAATCATCAGAAGG-AAACATAAGTGTAAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TGAAAATGAACAATA--GGTTAT-A-C-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACCCTAAATT-GTT-AT-----AAGCAC---TTA------G-TCTTT-GA----A-G------GTA----TAAATAT-AAAAGAGAAG---------TTTTACTGT-TAATACTTTA-TAATCAGTCACTTTGATTTCTCAAGTTTTTACAATGATAATTAAG--ATTATATTGAACTCAGGATATAGTTGACAGTTGACAT---CTGTGA----GAACATGTGCTATAATTA---A-TTGACATGTTGTCAGTATTGTTGTTGAT-AG-AAAATTTGAATCCAA--TTAAAATTCA-TTGAGAACATACTAATAA-ATCAAATTAAAA-----------TAAAAATAAGTTTAT-AAAAACAT-GCCGgttgtttcattcaccat
gi|17 : t-T--CCCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATT----TA---TATCCGTGAATAATT--AACAGTTC--------------ACCCTTAAACAA---AAACA--GGTGCTAGTTT---T----T-C----------ACA----------AT-GTACAG-----G-ATGTG--TTAG-ACAA----ACAATTAATTATCAGAAGG-AAATATAAGGGTAAACAATCA--ACA-CAATATGTTA--GGT---T--TTAGAATGAACAATA--GATGAT-A-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTGC-ACACTCTAAATT-GCT-AT-----AATCGC---TGA------G-TCTTT-GA----C-G------GTA----TTTACATGAAAAGGGAA-------------CAC--T-TAACACTTAA-ATATCAATCACTTTGAATTC-------TTTACAATGCTAATTAAA--ACTATATTGAACTCAGGATATAGTTGAAATTTGACAT---CTGTGA----GAACAAGTGCTATAATTA---A-TTGGCAAGTTATCACTATTGGTATTGAC-AG-AAAATTTGAATCCTG--TAAAAAATCA-TAGAGAAAATACTAATAA-ATCAAATT----TT-------T---AAAGAAA
gi|18 : tcCCGATCT--AA------AAG----TAT---TTTTATCAGACAGTAACTATGTCC-TAAA-ATGTTG--T-----------T--CTCTAT---CA-ATC-CT--CT---------------------------ATT--AA-----C--------------TTCTTTAAATAC--TAAA-ATTGGT--TTGTTTG--C----A-C----------ATAC---------AT-ACATGGCTTT-G-GTATGGTTTAG---------ATACTTAATCATCAAAAGA-AAACATAAACGCA-------A--ACA-AGATATACTG--G----------AGAATACAC------GGTAA--A-A-ATGTG--A---TGT----A----C---ACCAAA-------ATCA----AA--ACTTTTTC-ACGCCTTCAATT-GCT-AT-----AATCAG---TTA------G-GC-TT-CA----ACA------GTA----TATATAtgt
gi|19 : cATCACACTTTAA-AAGCGATGTCCAATAAAGTA-TATA-T-TTGGTGA---A-TAAA-CTTAGATATTAA-CA----TT--ATAAGAATAATGG-CT-G-TTA-TCCA-AATTTATA-TT----TAAAATA-A-AA-GTTATT-G-AAGTTAATTTCAC---------------------------T--GACTGGTAAAT----TAT---C------------------TTTCT-TTAA---ATTA--AATTAA----AGT--TTCTTT-CTTG--TCGCT--TTGTTATT----GA---T----CT------TT--AAAA-TCC--------------ACCCTGTAATAC--TTAACT--GGTGCTAGTTT---T----C-C----------ACA----------AT-GCATAG-----G-AATTA--TTAGAACAA----ACAATTAATCTTCAAAAGT-AAACGTAATTGTCAACAATCA--ACA-AAATATGTTA--TGT---T--TTAAAGTGAACAATA--GGTAGTAA-A-A------A---TAT----A----T---AC---A-------ATCGG--CAA-TATGctatatagagttatcatggtattttcgcgctcttaaaattttggatattttttaagttttaacgaacagaaagaaacaataaagttatgagagtttggact
gi|2 : -----GA--TAAAG---TT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGCCACT----TG--------------GTTT-AATT--GTTTCTAAAGT----------TTAT-GATAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTC-T-T-TGTGA---A-TAAA-CTTAAATAATAA-TTCTTTTC--ATAA-AATA--------------------------G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGG--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-gtct
gi|2 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|20 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttattttttaggttcttttcattaggttgtcaaataagtttaatgttggccattacagtactccaccattttttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaattgaaatatctaaaacaccattttctgtaggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacataactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatatatatatacccttaatttaacatgtataacactgtgaaaacattccaggtaatgaatggttgtggttgtaaacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgccacttggtttaattgtttctaaagtttatgataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcacagtattgtatctaagttaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataattcttttcataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctggtggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaatttt-A-A------A---TATTCTGA----T---A----A-------A--AA--CAA-AATGTTCTCGATACTGTTGTTT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-TC-TTTGA----A-G------ATT----TTTACAT-AAAAGGGAAGTTTGAAATATTTTACTGT-TT-CACTTAA-TTATTAATAAATTT----TCGCA-TTTTTTACAATGCTAATTACG--ACTATATTGAGTTCCGGATATATTTGACATTTGACAA---CTGTTA----AAACAAGAGCTATAATTT---A-TTGGACTGTTGTTAGTATTGTTAATGAT-AC-ATAATTTGAATACTG--TTAAAATTCA-TAGAGAAAAAACCAATGC-AAC-AACTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTTAT-AAAAACAT-GCTGCgatatact
gi|22 : atgaagatAA----ATACTTAATTATCA---GA-AAACATAAAAGCAAACAA--G--ACA----TAC---------------------TGGACAATACAGG--AT-A-A-A------AACGTAT----G----T---AC---A-------CCTAAACCAT-TAAGTTATC-ACACCTTCAAAT-GCT-------------C---TTC------G-AC------------A------GTA----TATACAT-AAAACGAAAATTTGAAATATTTT--CGCATAATACTTGATTTAT-AATCAGTTTGAGCTAATAAGAGTTTACAATAGTAATTAAA-----ATATT------AGGAC----TTGACATTataaaatatataattctcaaacat
gi|25 : gtggtttTGTATTAAGCCGGTAAT---TT-TCTTTGTTCGTTTTT-TA-CTCCGGT-GTCC-G--TAAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCGAGTATTTTCT-AATTTAAAGTCATGTAATGT----T-T-----GC--TGAAG---TTTAT------GAAGCTTAAAACA--CGAAATGTA-----TTACGTTGAAGGTCACAGAACA-CA-AATACGACGACACT----TGTCAATAT-TTATCAGTTTTAATTTGGTGT-TAATGTCGCACTAAGTTT-----TAAATATAgagtatattaagtgaaagcagtattaacagtaatatttttataaatattttaaaatgtttcaacaaatattttcataaaaattactc
gi|3 : GT--TGT----A-TACTTAGA--TAAAG---TT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATGTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------TTAT-GTTAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGATTA---TAATCAAATTCACAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TTTAA-TGATAT-ATGATTCACT-AA----ATTCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAGACTC-T-T-TGTGA---A-TAAA-CTTAAATAATAA-TAC--TTTCCATAA-AATA--------------------------G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCAATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACTATGTCC-TAAA-aaata
gi|3 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtgCCCTTCAATAT--AAAAT-----TGTT--TTT---T----AAC----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTA----AA----ATACTTTTTTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttcaatataaaattgttttttaacacaatacatggcttttgcatggttaaaatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatacttga
gi|37 : gctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgacctaatatataagcgtaatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacattttattcattgtaacttataaattaaccacttcatttctaagtttaaatgcttgagctgaatattttgaagttattttttaaggttcttttcattaggttgtcacattagtttaatgttggccattacagtactccgccatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatctaaaacaccattttctgcaggttacattctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtacctcttatgtactgaaattccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattatacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtgttacactgtgaaaacattccaggtaatgaatgcttgtggttgtatacttagataaagttgaagacactaaataaatgtattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttatgttaaaaatagtttcaaagataatcaagattataatcaaattcacagtattgtatctaagtttaatgatatatgattcactaaattcacactttaaaagcggtgtccatatcatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataaaatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccaatctgactagtaaaatatccaaacagtgactatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttTAGTTGTCATTTGACAA---TTGTGA----GATCATATGCTATA-------G-TTGGCATATTGTT--CTTTGC--TTGAA-AT-TAAAGTTGAATAATA--TCAAAATACA-TAAAGAAA-----AATAATATT---TT----TT-------TATAAAAGTAATTTTAT-TAAAAGGTCGCTGgatatacttga
gi|39 : ttTTGACAGTTGACAT---ATGTTATCTTGAAAATGTGCTTGAATT------------TATTGACAGTATTGTCATTGAT-AG-AAAATTTAAAT-CTGAATGAAAA--AA-AAAAGCAAATATTTATAT-ATCAAATTAAAGTT-------T-TGAAGGTAAttt
gi|4 : CATGTATTAAGCCG-TGAA---TT-TCCTTGT-CGTCATTATA-CTCAGGTTCTCCCA--CGAGTAGACAAGAAGATGTGGTGAGCAATCATTTTCT-AGTTTGAAGTAATAT--TAT----GAT-----GA--TGAAG---TT---------GAAG------AT--------TG-A-----TGAAGTTGAAGA-CACAG-AAAGCA-AATACGACGACAAT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTTATTTGGTGT-TAAAGTCAAAC--AGTTTATT-ACAAATAAAGTTTCAAATATATAT-AATATTA-ATTAATTAAAGTCACAGTGTA--ACAGT---AAC-ATCT-----AAG-C--AA-TAATAT-TAAATCCACTCAA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCATTAAAATAGTATA-TAT-GGTGA---AATAAA-CTTAGACGTTAA-CACAGTTT--ATAA-AATAATGG-CTGG-A-A-TCCA-AATTTATG-TT----TAAAACA-A-AA-GTTATT-A-AAGTAAATTTGACAAT-GTCCTGA--CGGTAATTCCTATCT--GACTGGTAAAT----TAT---C-----CAGCCAGCTACGCTGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-T--CTCTGTACCCG-ATC-TT--CTGTTATC----TA---TATCTTTGAATAATT--AACAGTCC--------------ACTCTTGAAAAC--TAAACA--GATGCTAGCTT---T----A-C----------ACA----------AT-TCACAG-----G-ATATG--TTGGGACAA----ACAG-TATTCATCAAAGGA-AAACATAAGTGTAAACAATCG--ACA-AAATATGTTA--GGT---T--TTGAAATGAACAATA--GGTAAT-A-A-A------A---TAG----A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATTTGTTC-ACATTCTAAACT-GTT-AT-----AATCAC---TTA------G-GG-TT-GA----A-G------GTA----TTTACAT-AAAGGGGAAGTTAAAAATATTTTACTTC-TAATACTTAA-CTATCAATCACTTTCATTTCACAAGTTTTTACAATGCTAATTATG--ATTATATTGAATTCAGGGTATAGTTGACAATTGACAT---GTGTGA----GAACATGTGCTATAAGT----A-TTGGCATGTTGTCAGTACTGTTATTGAT-TG-AAGATTAGAATCCTG--TTAAAATTCA-TAGAAGAAATATTAATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAAAGAAAGTTCATAAAAAACAT-GCTGC
gi|40 : TTAA-TTAGTAATCGCTTTCATTTTGCACGTTTTTACAATGTTACT--AGTAACTACATTGTACTCAGGATATAGTTGACCTTTGACATAAGCTATAAG---GAATACGCAC----GTT----A-TTG
gi|41 : ctT----A-TTGGCACATTATTAGC-TTGTTATTGTT-AG-AAAATTTGAATGCTG--TTAAATGACA-TAGAGAAAAAGCCAATAA-ATCTAATTAAAAGT-------T-T-AAAGAAAGTTCAT--GAGACAT-t
gi|43 : ataATGTTATCAGCATTGTTATTGAT-AG-AAAATT-GAATACTG--TTAAATTTAAATAGAGAAA-TACCAATGA-ATCAAATTGAAAAT-------T-TAAAAGAAAGTTCAT-GAGAACAT-
gi|44 : TTCCGATCT--GACTAGTGAAA----
gi|45 : tA-CACATTTT--GTAA-CATGTCGG-CT-A-A-A-ATCG-AAC--GTG-C-------------A-AA-GTT-TT-A-AAGTAAATT-CACAAT-GGCCTGA--CGACAATTACGattgttttgttaacaaaatacatgtcttttgcatggttaagataagaagacataaaagcaaacaagatatactt
gi|47 : AATAA-ATCAAATTAAAATT-------T-TAAA-GAAAGTTCAT-ATAAACAT-GCTGCggcacttatcca
gi|5 : tCATATATTA-GTCG-TGAA---TT-ACTTTGT-CGTTGTTG---CTCCGGTTGGCT-G--TGAGTAGACAAGAAGATGCGGTGAGCAAGTACTTTTT-AATTTGA-GTAATGT--TAT----T-TT----GC--TGAAG---TTAATGAAATAGAGG------ACA--TTAAATTGA-----TCACGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AACACGACGACACT----TGTCAATGT-CAACCAGTTTTAATTTGGTGT-TAAAGTCACAC--AGTTTATTTACACATACAGTTTCAAATATATAT------TG-ATTAATTAAAGTCACACTATT--AGAGTTAAA-C-ATCTTTGCAAAGATT-AT-TGA-------ATCCACTCTT----AATCACA-TTTAATACGTGATGTCCAATAAAATAGTAT----------------------------ATT-----CAGTGA--ATAA-AACAA---------A-A---CA-----TATG-TT----TAGAATA-A-AAAGTTATT-GTAAGTAAATTGTACAAA-GTCTTGA--CAGTAATTCCAATCT--TATCGGTAATA----TAA---C-----CAGCCAACGACGATGTCC-AAAA-GTATTA--CACTAT----A-G--ATCTGTATCCG-ATC-TT--CTGTTATTACAGTA---TAACCCTGAAAAATT--AACA-TCC--------------ATCCATAAATAC--TTAA-A--GGTGCTAGTTT---T----A-C----------ACA----------AT-GAACGG-----T-ATGTG--TTA-GACAA----ATGATTATTCATCAGAAGG-AAACATAAGTGTAAAAAATTA--GCA-AAATAGGTTA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--TGTAAA-A-A-A------A---TATC---A----TATAAC---A-------ATCAG--CAATTGTGTTTTG-ATATTCTAAATT-GTT-AT-----AATCAG---TTA------GTGT-TT-GA----A-G------GTA----TTTGCAT-AAAAGGGAAGGTTGGAATATTTTACTGT-TAACACTTAT-TTATTAATCGCTTTTATTTCGAAAG-TTTTGCAATGCTAATTATG--ACTATAGCGAAATTTGGATAAAGTTTACATGTGACAT---CTGCGA----GAAAA-GTGCTATGATTATTAA-TTGGCATGTTGTCAGTATTGTAAGTGAT-AG-GAAATCTGAATCATG--TTAAAGTCCA-TAGTGAAAATACCAATAA-ATCAAAACAAAA-T-------T-TAAAAAAAAAATCAT-AAAAAata
gi|6 : ATTAAACTG-CGAAATATT-TTGTTAT-TGTTT------CTCAGGTTGTCC-A--TGAATTAACAGGAGGTTGCAGTGAGCAAGTATTT-----ATT------AAT-------------------------------CT---------GCAG------ACA--CTAAATT-T-----TAATGTCAAATATCACAG-ACAGCA-A-TATGATGGCAGT----TGTCAATTT-CTATCAGTTTTAATGTGGTTT-TAAAATCATAC--AGTTTATTAACAAATAAACTTTTAAATCT-----AATAATG-ATTAAATAAAGTCACAGTATTACA-GGA---A-C-ATCT-----AAG----AAGTTATATAACAATTT------------TCACA----AA-AAGCCCTGTCCAATACGAAAGTATATT-T-GGTGA---A-TAA---------ATTAA-TACAATAT--ATAA-AATAATGGTTT-G-A-A-TTTG-AATTTATG-TTTAAATAAAATAGA-AA-ATTATA-A-AAGTAAATTCCACAAA-ATTCTGAAGAGGTTATTCCAATCT--GATTAGTAAAT----TAT---C-----CAGATGATGACAA-GTTC-TAAA----------AATAT----A----------------ATT-TT--CTACCATC-----------------AATAATTAAAAAAGTCC--------------ACCCTTAAATAC--TA-------GTGCTAGTTT---T----A-C----------CCA----------AT-ACAAAG-----G-ATGTA--TTAGTA-AA----GCAATTAATCACC-----A-AAATATATATGTAAACAATCA--ACA-AAATATATGA--GGT---T--TTAAAATGAACAATA--AG---------------------------A----T---AC---A-------ATCAG--CAA-TATGTTTTC-ACACTATAAACT-GTT-AA-----ACTCAC---ATA------A-GC-TT-TG----A-A------TTA----TTAACTT-AA------------------TTTA-TAT-TA-----------ATC-ATCACTTTGAATTTGCAAGTTTTTACAATGCTAA-TAAA--ATGATATT-AACTCAGGATTTAGTTGACAGTTGACAT---CTGAGG----GAACATGTGCTTTAACTA---A-TTGACATG-----GGTATTGTTATTGATAAA-AAAAATTGAATCATG--TTAAAATACA-TCAAGAAAAAGCCAATAA-ATCAAA-TAAAATTAGGTTTAT-TAAAAAAA-----AT-AAA---AT-ACTGCtg
gi|7 : ga-----GA--TAAAG---TT---------GAAG------ACA--CTAAATA-AATTTATTATGTTGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----TGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------TTAA-GATAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGAT-A-AT-AATCAAATTCAAAGTATT-----GT---A----TCT-----TAA-TT-AAATGATAT-ATGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTTC-TTTTTATAGACTC-T-T-TGTGA---A-TAAA-CTTAAATAATAA-TAC--TT--------------------------TCCATAATATA-G-TT----CAAA------------ATT-A-AATTGAATTTCACAAA-GTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTAAAA----TAT---C-----CAAACAGTGACAATGTCC-TAAA-atacaatttatactgaagtat
gi|7 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttaCCCTTAAATAT--GAAA-A-------TTGTTT---TGTTAA-C----------ACA----------AT-ACATGGCTTTTGCATG-G--TTAAGATA------CTTTT--TTATCAAAAGA-AAACATAAAAGCAAACAActcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttcccttaaatatgaaaattgttttgttaacacaatacatggcttttgcatggttaagatacttttttatcaaaagaaaacataaaagcaaacaagatatact
gi|8 : attagttcaatgttggccattacagtactccatcatattttttttaaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacacttgtaatatctaaaacaccattttctgcaggttacgttttagtaagtgttcttagggattcaaattgggtacctcttatgtactgaaaatccataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgtacgagatatgtatagatatacccttaatttaacatgtattacactgtgaaaacattctaggtaatgaatggttgtggttaaatacttagataaagttgaagacactaaataaatttattatgttgaaggtcacagacagcaaatacggcgacacttgttttaattgtttctaaagtttaagataaaaatagtttcaaagataatcaagataataatcaaattcaaagtattgtatcttaattaaatgatatatgattcactaaaatcacactttaaaagcggtgttctttttatagactctttgtgaataaacttaaataataatactttccataatatagttcaaaattaaattgaatttcacaaagtcctgatggttttccgatctgactagtaaaatatccaaacagtgacaatgtcctaaactcaagttaagttctacatagtgatctattaaattttT---------GAAA------ACATTCCAAGTA-A-----TGA-ATCGAAGGTCACAG-ACAGCA-AATACGGCGACACT----CGT---------------TTTAATT--GTTTCTAAAGT----------TTAT-GATAAAAATAGTTTCAAAGATA-ATCAAGA--A-AATAATCATATTCGCAGTATT-----GT---A----TCT-----AAG-TT-AAATGATAT-ACGATTCACT-AA----AATCACACTTTAA-AAGCGGTGTCCA-TATCATAAACTC-T-T-TGTGA---A-TAAA-CTTAAATAATAA-TAT--TTTCCATAA-AATAG----------------------------T----TAAAA-----------ATT-T-AATTGAATTTCACAAA-TTCCTGA--TGGT-TTTCCGATCT--GACTAGTGAAA----gatatact
gi|9 : ctaatttgtcttacctaagaaatatttacatttaatgaaataatatataagcgtatttaacatgcattgttgataaccgttttcagacgttttattcattataacttataaattaaccacttcatttcttagtttaaatgcttgagctaaatattttgaagttatttttgttaagttcttttcattaagttgtcaaattagtttaatgttggccataacagtactccgccatatatttttttttagaaaatcagagtttttgtgtgtattttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaagtgtaatatctaaaacaccattttctgccggttacgttctagtaagtgttcttagggattcaaatcgggtaactcttatgtactgaaaatctataaaaacttgcacacaactctgattaacatctcattgcacgagatatatatagatatacccttaatttaacatgtattacattgGAA---TTATCCTCGT--GTTTTTTTA-CTCAGGTTGTCC-ATACGA-T-GACAAGAAAA---GGTGAGCGATTTTATTCTTAATTTGAA-TAATGT--TGCTAAAG-TT----GA--CAAAA---TC---------AATG------ACA--CTAAATT-------TTACATTA----TTTCAG-TCAGCA-AATACGACGACACG----TGTCAATTT-ATAACAGTTTTAATTCGGTTT-TAAAGTCACAC--AGTTAATTAACAAATACAGTTCCAAATATAT----ACATTAGATCGACTAAAGTAACAGTG----G-A---------ATCT-----GAG--T-AG-TAATTTAACAATTCACCCAAAAATAATTATACATTAA-AAGCGGTGTCCAATAAGCTAGTACA-TCT-GGTTC---A-TATA-ATTAAATATATA-CACAGTGT--ATAA-AACAATTG-CTAG-A-A-TCCA-CTTTTATGTTT----TAACATA-G-AGTGTTATT-A-ATGGAAATTTCACAAA-GTCCTGA--CGGCAAACCTGATCT--AACTTGTAAAA----TAT---T-----CAGACATGGACTATATCT-AAAA-ATATTATTCACTCT----C-T--CTCTA-ACATGTATC--T--CTA---------------ATC----AATAATA--AGAACTCC--------------TTCCTTTAATGC--Ta
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TCCCTTATCATATCATAAACAGTTATTGACAATGGCTTATATGTAAATATAATTTTCACAATACTTGCAATAACTTTTGATGTGAAAATAACAGTTGTAATGCAATAGTTAATCAAATAATGAGATGTAAAGCGAGAGAATGATAATGGAAATGAAGGAGTTAAAGACAGAATGACAGATTTATGGACATATATTAGCAATATTTCGCAAGTTACGCTAGATAGATGCAATATTTCGAAAGAAATCACTTTAAGAAAGTTTGAGTAACTCAGTTTGAATAAGAACTGTTTAGCGCTAATCTAAGAATGTTTGAAAAGGTTAGAAGATTTAA
Unaligned ( gi|23 ): AATTCACTATCTCATTAAATATATCGTTCCAGTTAATTCACTTTCTAATAAAATATATCGTTCAAGCTAATTCACTATTTACTATCTACAAGCACAGTTTAATCAAAACACAGATTAATTGTAAATATATATGTTTTAAGTTCCTTCTACATTTCAACAAAATCCATTTAATTCTTTTTTTCACTCTCAGTCTAACTATACCATGTATGTAAAGTATATGGGCACATGTGTATAAACAAACGTTAACTTTGTAAT
Unaligned ( gi|24 ): CATATATTTAAATGAAATTATATATTATAACCGTGATATAACATGTATTGTTAATAAAATGTTTTCTGACGTCTTATTTATTATCAATTGACCACTCCATTTCAAATGCCACACTTAATTATTTCGCTAATATATGGTAAAGCTATTTAGGAGGTACTTGACGTTAGGTTGTCAAATTTGTTGAATGTAAGCCATATGCAAACAATACGCATTTCTGTCTCATATATCTATATTTTGTACAA
Unaligned ( gi|26 ): AATATATTTATAATGCTATTTATGTACTTTTTACATTGGAACAAAATTCATTTAATTTTGTTTTCACCCTCAGTCTACTCATATTCTATATGCAAATATATACAGATGTGTATATACGTACCATTGTACGTTTACATTGTAATTACACATATTTGTCTTTAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTGGATATTGATGATTAACTGTCATGTATGCTAAATTCAAATAAAGTATTCTGTATTC
Unaligned ( gi|27 ): CGTACACTTATAATATATAAAACACCATTTGATACATTCTGTGTTCTAGTAAGTGTTTAGGATAAAACAAGCTTCTTAGATAATCACTGAAAATTCATAAAAAATGCACATAACTCTAATTAACATCTCATTGTATAAATAAACCATTGATTTAAAATATATTACACTGTAAAACCATTCCAGGTAATGAAAAGTTGTCTGAAATTTATTCAAAAACAATTGTTTATTGCAATATA
Unaligned ( gi|28 ): ATATATATAATTATTTATGTACCGTTTGCATTTGAAACCCCATCCGCATTTGTTTCTTGTTTTCACTCTCAGTCTATCCTTCATTGTATGTAAAGTATATAGAGAGGTGTGTGTATATGTACCATCATCAGTTCACATTGTAAATGCAAATATATGTTTTCAGCTCATGATTTGTTTTGTTATGATATGTTGCTGATAAGCTGCAATGTATGTTAACTGAAGTCCAAATGA
Unaligned ( gi|29 ): TAGCTCAATTTAAGTCTCTATGTTCAATTTCCCATACCTGATCAGTCAATAATTTTTAATACAGCCTGGTAGTTTTGGCTGTCAAAATAACAACACATGGGCACCTTTGATGCAGTATGGTTCAAACAAGAAGGCATATTTTAAACTTGTTGAAAAATCTGTTTCACAAAATGCTCTTTGTGTTTTAGTATTGAATTGACAATGCCAAGGTCATTTAAT
Unaligned ( gi|30 ): TAGTTTTAGCATGTTTTATTGTCAGTAAATACACAAATGGTTACGACCACAAGTTTTGACAACTTAGATTGGATTTTTCCTTCGTCATAACATCAACAGTAATTGATAATTGCTTATGTTCACAATATATACTAGCACTAACGCGTGATGTGATAGAACAAATGTTATGCTAAAGAAAATTAAATGAAGATACGTTTAGCGAGAGAA
Unaligned ( gi|31 ): TAATATTTAAAACACCAACTTTTGAAATCTACATTTTAGGATAAAATAAACTTCGCTGGGATTCAAACCTAGAACCTCTCATGAAATGAAAGTGCATAAAACACCAACCCTTATTAAAAGCTTGTCAATGAGTTAATTACGTTAACACAGCATATATGTGTTAACACCATTGTGTATGTATGTGTTAATACATGTGTAAACAT
Unaligned ( gi|32 ): TCTAGCGATAACATTTGATGTGAAAATAACAGATCTAATGCAAAAGCTAATCAAATAATGAGATGTATAGCGAGAGAATGATTATAGAAATGAAAGAATGACAGATTTATGGACAGATTGTAGCAAAGTTTCATAAGTTAGATGCAATGTTTCGAAAGGAATTACTTTAAGAAAGTTTAAGTAAACCAGTATGAAATAA
Unaligned ( gi|33 ): CTAATTTGTTTAACCTTATTAATTACATTTAAATTAAATAATATATAAGCGTTATTTAACATGTATTGTTAACAAATGTTTTCTGACGTTTTAATCAGTATTACTTTATCAATTAATCGTTTCATTTCTTAGTTAAAATGCTCAAACTAAATATTTTGAAATATGTGTTAGCGTTAGTTTTGAGGTT
Unaligned ( gi|34 ): GGGATTCAAATCTGGTACCTCTCATGCACTGAAAGTCCATACCCTCCCCTCCCACCCCTTTAAAGCTTGAGTGAATTAACAATTTTTAAATTGTACACTCTAATTAACATCTCATTGTGTGGATATACCATAATTCTAAAATATGTTACTCTGTCAAAAACAATCAAGTAATGAATAGGTGTC
Unaligned ( gi|35 ): GTTTAAACATACTTTATTGTCAATAAGTATATATCGGTTCTTCCCTCATTATATCATAAACAGTAGTTGACAATAGCTTTTGTATAGTTATGCATATTCATAATACTTGCAATCTTGATCTGATAAAATTTAATATCAATCAGGTAAATAAAT
Unaligned ( gi|36 ): GCTAATTTGTCTTACCTAAGAAATATTTACATTTAATGAAATAATATATAAGCGTAATTTAACATGCATTGTTGATAACAGTTTTCAGACGTTTTATTCATTATAACTTATAAATTAACCACTTCATTTCTAAGTTTAAATGCTTGAGCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTAATATTTTAAACATTATCTTTATGATAAAACAAGCGTCTAAGGGATTCAAATCAGGTACTCCTAATGAACTCCTAATGAACTGAAAATCCATAAAAAACACCACCTGTTAAGCTTCAGTGACTTCGTTAGTTTAC
Unaligned ( gi|42 ): AATATATGGAAACAATGATAATGTAATTTTACAATTCATACATCACATATACACATTTGGACATAATTTAATTTTATTTTAAATGTAAATAAATGAATAACTGTTACATGT
Unaligned ( gi|46 ): TTGTAGTTTTTCAGCGCATGATTTGTTTATTTAGTTCAAGATGTTGATCATTAGCTGT