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Reference ( gi|12 )           :                                                                                             CAAAATGGCATCTAG---GAGAGGATTT--GGA--AGATC--T--TG-GAATAGAGAATGT---GACGAATATTTTGACTATTCGTGT---G---CA--TTGTGCACAGCA--GAGG-GGAAAAA-T--GTGGAGGCGACCAACTTCTGTGTGGAGTGTG---AGGAATATTTCTGTGTTAAATG--TG-TC-A-G-----GTATCACCA-TAGA---G-----CT---G-GCA-AA-ATGAAA--ACACA-CACGATCCAGGACCAGGCGGGGAT-----GAAGAC--CCG-G-GGCCTACA----GCAAACAACTTCCCAG-C-CCAC---GGAGAAATG--CCAACTG--CACCAT-------G----GGAAC---ATCCTG---GA--C-ACATTCTGC-GTGC--GG-CATGATGCGGTATGCTGCAGTA-CATGTGTAACATTAT--T--TCACAAGTAAG
gi|10                         :                                                                                              AACATGGCGTCTGG---GGGAGGATTG--GGA--AGATC--T--TG-GAAGAGAGAATGT---GACGAATATTTTGACTATTCGTGT---G---CA--TTATGCACAACA--GATG-GGAAAAA-T--GTGGAGGCGACCAACTTCTGTGTGGAATGTG---AAGAATATTTCTGTGTTAAATG--TG-TC-A-A-----GTATAACCA-TAGA---G-----TT---G-GCA-AA-CTGAAA--ACACA-CACGATCCTTGACCAGGCGGGGAT-----GAAGGC--CCG-G-GACCCACA----GCAAACAACTTCCCAG-C-CCAC---GGAGAAATG--TCAGCTG--CATCAT-------G----GGAAC---ATCCTC---GA--C-ACATTCTGC-GTGC--GG-CATGATATGGTATGCTGCGGTA-CATGTGTGTCATTAT--T--TCACAAGTAGG
gi|13                         :                                                                                             aAAAATGGCGACTGG---GGGAGGATTT--GGA--AGATC--T--TG-GAATAGAGAATGT---GACAATTATTTCGACTATTCTTGT---A---CA--CCTTGCTCAGCA--GATG-ATAAAAA-T--GTGGAAGCGACGAACTTCTGTGTGGAGTGTG---AGGAATATTTCTGTGTTAAATG--TG-TT-A-A-----GTATAACCA-TAGA---T-----TT---G-GCA-AA-CTGAAA--ACACA-CACGATCCTGGACCAGGCGGTGAT-----GAAGGC--CCG-C-GGCCCACA----GCAAACAACTTCACAG-C-CCAC---GGAAAAATG--TCAGCTG--CACCAT-------G----GGAAC---ATCCTG---GA--C-ACATTCTGC-GTGC--GG-CATGATGCGGTATGCTGCGGCA-CATGTGTAACATTAT--T--TCACAAGTAGG
gi|14                         :                                                                                              AAAATGGCGACTAA---AGGAGGAGTT--GAACAACAT---T--TG-GAA-GGACAATGC---GATGAATATTTTGATAATTCTTGT---A---CA--TCATGCTCAGCA--GAGG-GGAAAAA-T--GTTGAGGCGACTAAGTTCTGTGTGGAGTGTG---AAGAATATTTTTGTGTCGGATG--TG-TC-C-A-----GTTTAACCA-TAGA---T-----TT---G-GCA-AG-ATGAAA--ACACA-CATGATCTTAGGCTGTGAAGGGAT-----GAAGGC--CCA-G-GGTCTAGG----GCAAACAACTTCCCAG-C-CCAC---TGAGAAATG--CCAGCTG--CATCAT-------G----GGAAC---ATCCTG---GA--C-ACATTCTGC-GTGC--AG-CATGATGCAGTGTGCTGTAGTA-CCTGCGTCTCCTTAT--T--TCACAAGTAGGt
gi|15                         :                                                                                              AAAATGGCGACTGG---AGGATGTTTT--GAA--CGTTC--TATTG---ATAAAGGTTGT---GACGAGTTTTATGATTATTCTTGT---A---CA--CCGTGCTCCGCG--GAAG-GGAAGAA-C--GTAGAGGCCATTAACTACTGTATGGAATGTG---ATGAATATGTATGTGTAAAATG--TT-TA-A-C-----ATATCATAA-CAGA---T-----TT---G-TCA-AA-ATGAGA--TCACATCA-AATCCTTGATCAGATGGCAAT-----GAAGAC--CAG-G-AGACCACA----ACAGTCACCGTCC-AGTC-CCAC---GGAGAGATG--TGAACTT--CACCAT-------G----GAAAC---ATTCTG---GA--C-ACATTCTGT-GTGA--CA-CACGATGCAGTGTGCTGCGGTA-CATGTGTCTCCTTGT--T--CCACAAGTAA
gi|11                         :                                                                                              AAAATGGCGACAAGCTCGA---GATTTTCGG----GCTC--T--GC-GTATAAAGGTTCT---GAGGCTTATTATGACTTTTGGTGTTTCC---CA---TGTGGAAAG----GATG-GCAGACA-C--CTGGAAGCAGTGAACGGCTGTTTGGACTGTGCCCAGA---ACTTCTGTTCTGTATG--TC-TC-C-A-----ATATCACAA-CAAG---A-----TTCAGG-GC-----ATGACT--AGACA-CAAGATAGTGGACAAAGCAGGGAT-----GCAGGC--CAG-T-GTTTTACA----GAGTGTTGGTTCCCTG-C-CTGT---AGAGACATGTTCCA--TT--CACCCT-------G----GCAACCAAAT--TG---AG--CTATATTGT-T-GTGC---T-CATGGTTTTGT---CTGCAGTGCCGTCTGCATCACAAT--TGATCATAGGTCAG
gi|17                         :                                                                                              tAAATGGCGTCCAA---GGGGGCGTTT--GTT--AGATCGGT--TG-----ACAAAA-GTTCAGAGGAATTATATGACTTTACGTGTTC-G---CC--TTGTTC----TA--AAGGAGGACAAACT--GTGGAGGCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAATATTTCTGTTCTGGTTG--CG-TT-G-A-----GGATCACAA-TAAGTTCG-----CT---GTGC------TGAGG--ACACA-TAAACTTTTGGACAAGGCTGGAAT-----GAGGGC--CCG-G-AAACCACA----ACAAGTATTGTCTCTG-C-CAAC---AGAACGATG--T--ACGGATCACCAT-------G----GTAA------CCTGATTGA--T-ACATACTGC-G-GT--AACCATGATGTCGTCTGCTGTCCTA-CGTGTGT
gi|16                         :                                                                                               AAATGGCGTCCAT---GGGGGCGTTT--GTT--AGATCGGT--TG-----ACAAAA-GTTCAGAGGAATTATATGACTTTACGTGTTC-G---CC--TTGTTC----TA--AAGG-AGGACAA-TCTGTGGAGGCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAATATTTCTGTTCTGGTTG--CG-TT-G-A-----GGATCACAA-TAAGTTCG-----CT---GTGC------TGAGG--ACACA-TAAACTTTTGGACAAGGCTGGAAT-----GAGAGC--CCG-G-AAACCACA----ACAAGTATTGTCTCTG-C-CAAC---AGAACGATG--TAAGGAT--CACCAT-------G----GTAA------CCTGATTGA--T-ACATACTGC-G-GT--AATCATGATGTCGTCTGCTGTCCCA-CGTGTGTgtctgtgagtcataggta
gi|26                         :                                                                                                        CTGG---GGGAGGATTT--GTA--AGGTCCAT--TG---ACAAAGGCTGC---GATGTGTATTATGACTATTgtctgtgagtcataggtaa
gi|8                          :                                                                                                                              --AGATCCAT--TGAGAACGGAG---GG---GAGGAGTATTTTGACTTTGCTTGC---GGTCCA---TGTG----GCAAGGACG-GCAGACA-T--ATTGAGGCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTG---CGCAGAACTTCTGTAATAAATG--TC-TC-A-AAGACCATAACACCAGTA-A---G-----TT---C-GCA-GGTCTTAAA--AGTCA-CAAGATTCTTGATAAAGCTGGTATTCTGGGAAGTC---------GTCTGCA----G-------TTTCCC-G-CGTTACTTTCGTCAGATG-----ACTG--CACGATACACCCAG----GCAAG---CCCGTT---GA--C-ATGTACTGTGGTAC---G-CATGATGACATATTCTGCGGAG-CATGTATTGCA--AT--CGATCACAGGTA
gi|3                          :                                                                                                                             acataatggctaccgggggcaaatattcc---GACGAATCCTTCGATTTTATGTGT---T---CACGTTGTGTGAA--A--AAGA-ACAGAAA-T--ATAGAGGCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCC---AGGACTTTTATTGTTCTTCGTG--TG-TC-G-A-----GTGTCATGA-TAGt
gi|1                          :    agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtaatggcgacgggtggtagtttaagacggacagtgaaaggttcg---GACGAATCTTTCGATT--TAGTGT---GTT-CACCTTGTGTGAA--A--AAGA-ACATAAA-T--AGAGAGGGTACACAGTACTGTGTGGATTGCC---ATGACTTCTATTGTTCTACGTG--TG-TC-A-A-----GTGTCACcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|9                          : aatcgaaaatattcgattatattactgacttagcgctaaacagggtcatctgctgtataggttatcatatatgcacacgcacatgacagccatcacgtgactgcatgtttgttgtcgcatattaagtaaaaatggcgacgggttatagttttaggcggacagtgaaaggttcgTTCGTGT---G---CA----AAACATAGCA---------AACAA-C--A-GGAGGCAGTGAAGAGCTGTCTGGACTGTGCCCAGG---ACTTCTGTG----ATGTTTG-TCTACA-----ATATCACAA-CA-A---G-----TT---T-GAAGGA-ATGAGG--AAACA-CAGGATTGTGAACAAAGCTGGGAT-----GCAG-T--CCG-ATGTTCTACAAGGTGC---TGGTTTTCCTG-C-CAGT---AGGGAGATGTTCTA--TA--CACCCT-------GAGAAGGAA----ATC------GA--G-CTATTTTGCTGTGC---T-CATAATGCCGTCTGCTGTGCTG-TATGTATCACCATAT--A--TCACAGGTAAGgaggaccttcccgtattatccggacataggatacttgacaagtcagactcggagttccctacagatggatccaaggtgacattgccgacggaaaaatgcagtattcacactaagttgatggatatgtattgtcaaaaccatgatcagataggatgccatgtgtgtatggccgttaaacacaggtagtaacatttatannnnnnnnnnatgtgtagtatatttgactaacttttatatacatatatt
gi|18                         :                                                                                                                                         ataaaatggcaacaaactcaagttttatgcgctctgcagataagagttctgaagtctattatgacttttcctgttcAACAG-T--GTTCAAGCAGTTAAATTCTGTGAGGACTGTT---TGGAGTATTTTTGTTCTGGTTG--TGTTC-A-T-----G-ATCATAA-CA-A---GTTCCACT---T-GC------TGGAAGGACACA-CACaa
gi|19                         :                                                                                                                                       aaatggcgtcaaaaagaccgcttgataacgattttgcaagatcctggttctttaagtgttcaccttgttttagaaaaaatagt-T--GTGGAGGCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTG---ACGAATATTTTTGTGTTAAATG--TG-TC-A-A-----ATCTCACCA-TAAA---T-----AT---G-GCA-AG-ATGAAA--ACACA-CCAGATCCTGGACAAGGCAAAAAT-----GAAGACGACTATG-GGACAAAA----ACAAGCAGCTACCCCA-C-TTAC---GGAGAGATG--TGAGCTG--CACCAT-------G----GGAAC---ACCCTG---GA--T-ACGTTCT---GTGCCAAA-CATGATGCAGTGTGCTGCAGTA-CGTGTGTCTCCTTGT--T--TCACAAGTAAGttttgaacaatgatgaaatgagatccttccgctcgaagccgtgtaaagaacatcctcgtcagatgattgatagatactgtgattaccatgctgttgttttctgcctcgattgtaaatcaaagtatcacaggtaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                               CTGTGTGGAGTGCG---AAGAAAGCTTCTGCTTTAAATG--TC-TT-C-A-----ATATCA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacaTTCCCTG-C-TTAT---AGAGATATGTTCCAA--A--CACCCT-------G----GCAAC---CCCATT---GAGTC-ATATTGTG--GTGC--T--CATGATGTCGTCTGCTGtgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcagaaatgtcagcatcatcgtggcaaaattattgatacattctgtggaaaccatgatgtagtctgctgtcctatctgtatagcagtcagtcacaggtaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acagagtgttag-C-CCAC---GGAGCAATG--TCCTCAG--CATCAA-------G----GCAAA---GTCCTT---GA--A-AAGTACTGT-G-GC--AACCATGACACATTATGCTGggctgtctgtatcacgattgaacacaggtgaggg
gi|7                          :                                                                                                                                                 actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaAGAAATG--TCAGCAT--CATCGT-------G----GCAAA---ATTATT---GA--T-ACATTCTGT-GGAA--AC-CATGATGTAGTCTGCTGTCCTA-TCTGTATAGCAGTCA--G--TCACAGGTAAtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                    cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcTCCTA---GA--C-ATGTTCTGT-GGAA--CT-CATGATGTCGTGTGCTGCGGAG-CATGTGC--CGTTCTAAT--TCACAGGTA
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): CATAGTTTTACTTTCGTTTTCATTTACGGGAAATAAAAATCAGGTCATTATCGGTTAGTCATATACACAACAACAGTTTCACAATATTTAAACCGAGGCCAACAAAATGGCGACAGGGCGTACAATCCAGAGTGCATCAGATGAAATATTTGATTTGCATTGTTCTACATGCACGTTGAATCACAGGACTAGAGAAGCTACGAAATATTGCGAGGACTGCCTGGACTTTTATTGTGACACGTGTGTCCAGGTTCACAGTGACGTGCCAGCATTAAAGCGCCATAAGATAGTTGGAAAGTCAGCATTCCCGACGAAAGTATTGAGAAATTTAACGACCGTGCCGACAGATAAATGCCCGCTCCACCCGACAAAGCTCCTCGATATGTTCTGTCGGAACGACGACGAGATTGGATGTCACGCATGTATGGCCGTTAAACACAGGTATTAATTGATTTTATTAATATAACACACCTAAATGAATATATAATT
Unaligned ( gi|4 ): CAAAATGGCGGCATCAGGAAGTAACGGGCGAACGATTCAGAGTACGTCTGATGAAACATTTGAGTTTCTGTGTTCGCCGTGTAAAATGAAAAACAGGACTAGAGAAGCTATGCTTTATTGTGTGGACTGCGTGGACTATTATTGTAGCACGTGTGTTGAGTTTCACGGGGACATACCGGCATTAAAATGTCATAAGATACTTGGAAAGTCCGACTTTCCGACCGCGGCATCCAGAAATCTAACGATTGTTCCGACGGACAGATGTCCACTCCATCCAACAAAACTGTTGGATATGTTCTGTCAGAATGACGACGAGATCGGATGTCACGCCTGTATGGCCGTTAAACACAGGTATTTATCGTGACTATTTAATTAAAGGAGTGTTTGACAATAACACAAATTTAGATAATATAGAATCG
Unaligned ( gi|5 ): TTCGGACGAAACTTTTGATTTAGTGTGTTCGCCTTGTGTGAAAAAGAACAGAAACAAACAGGTGTGTTCGCCTTGTGTGAACAAAGACAAAAATACAGAGAACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTCGCGACTATTACTGTTATACGTGTGTCGAGTTCCACAGTGATATACCTGCATTAGCCAGACATAAAATACTCAGTCGGTCAGATTTCCCGACAGACGGATCAATAGTGACATTGCCGACGGAGAGATGTCGTAAACATCCTACTATGCCAGTGCTCATGTACTGCCAAAACCACGACCAGACCAGCTGTCCTGTTTGTATGGCTGTTAAACACAGGTAAATTAATATGATGTCTAACTTTTATATATCATACGGTATTAAATTGATATTGATTGTAACATATT
Unaligned ( gi|20 ): ATGACTCAGTGTTTACGTATTGAAGGGGTAATGGCAGTGATATACCTGCATTATCCGGACATAAGATACTCGGTCGGTCAGAATTCCCGACAGGTATTTCAAAGGTATTGGTGCCACTGCCGACGGAGAGATGCAGTACACATCCTACTAAACTGATGGACATGTACTGTCAAAATAATGATCAGATAGGCTGCCATGTCTGTATGACCGTAAAACACAGGTAAATACATTTATTTATCAGTAAATGTTTAG
Unaligned ( gi|21 ): TGTAGGAAAATAAGCAAGAAAACTGTGGAATCAGACTTTTACTGCACCGACTGCTAGCTGTTCTTCTGTGAAACATGCATGGAATTTCACAGCTTTATTCCAGCATTAGAGAATCACATAGTTTTAGGAAAAGATCAAATTCAAAGTTGGGGGAAAAGGTAAG
Unaligned ( gi|23 ): TAGCGAAATCGAAACTACCGGATCAATTTTACCAGGAATACAAACTAGGTCAACGCTGCACTATAGTATCAATATCATATGACTCAGTGTTTACGTATTGAAGGGGTAATGG
Unaligned ( gi|25 ): CAGCTTAAGGTCCGTGTTTGTATGGCCGTTAAGCACAGGTAAGTTATATCTATACATAATGTAGTATTTTTATATACTAT






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Reference ( family-2247 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   NAAAATGGCGNCCGGGGG-AGGATTTGNA--AGAT---C--T--TG-GA------ATAGAGAA-TGT---GACGAA-TNTTNTGACTNTTCGTGT--G---CA--TCGTGCG-CAGCAGAGGGNAAAAAT--G--TGGAG--GCGGCGAACTNCTGTGTGGANTGTGAGGAATATTTCTGTNCTG---AATGTGTC--GAGTATCAC-----NATA-----GAGTTGGC-AAG-ATG----AAAACA-CACANGAT-CCTGG----ACAAGGCGGGGAT-----GAAGGC--C-CG-GGGNCCACAG--CAAGCANCT-TCCCNGC-CCAC---GGAGAGATGT--CAGC----TGCA-CCATGGNAACATCCTG---GA--CACGTTCTGCGTGC--A-N-CATGATGCNGTNTGCTGCGGTACG--TGTGTNNCNTTATT--T--CACAGGTAAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---GACGAA-TCTTTCGA--TTTAGTGT--GTT-CA--CCTTGTG-TGAAAAAGAACATAAAT--A--GAGAG--GGTACACAGTACTGTGTGGATTGCCATGACTTCTATTGTTCTA---CGTGTGTC--AAGTGTCAC-----GA
gi|10                         :                                                                                                       aatcgaaaatattcgattatattactgacttagcgctaaacagggtcatctgctgtataggttatcatatatgcacacgcacatgacagccatcacgtgactgcatgtttgttgtcgcatattaagtaaaaatggcgacgggttatagttttaggcggacagtgaaaggttcgAACATGGCGTCTGGGGG-AGGATTGGGA--AGAT---C--T--TG-GA------AGAGAGAA-TGT---GACGAA-TATTTTGACTATTCGTGT--G---CA--TTATGCA-CAACAGATGGGAAAAAT--G--TGGAG--GCGACCAACTTCTGTGTGGAATGTGAAGAATATTTCTGTGTTA---AATGTGTC--AAGTATAAC-----CATA-----GAGTTGGC-AAA-CTG----AAAACA-CACACGAT-CCTTG----ACCAGGCGGGGAT-----GAAGGC--C-CG-GGACCCACAG--CAAACAACT-TCCCAGC-CCAC---GGAGAAATGT--CAGC----TGCA-TCATGGGAACATCCTC---GA--CACATTCTGCGTGC--G-G-CATGATATGGTATGCTGCGGTACA--TGTGTGTCATTATT--T--CACAAGTAGGggaccttcccgtattatccggacataggatacttgacaagtcagactcggagttccctacagatggatccaaggtgacattgccgacggaaaaatgcagtattcacactaagttgatggatatgtattgtcaaaaccatgatcagataggatgccatgtgtgtatggccgttaaacacaggtagtaacatttatannnnnnnnnnatgtgtagtatatttgactaacttttatatacatatatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aAAAATGGCATCTAGGAG-AGGATTTGGA--AGAT---C--T--TG-GA------ATAGAGAA-TGT---GACGAA-TATTTTGACTATTCGTGT--G---CA--TTGTGCA-CAGCAGAGGGGAAAAAT--G--TGGAG--GCGACCAACTTCTGTGTGGAGTGTGAGGAATATTTCTGTGTTA---AATGTGTC--AGGTATCAC-----CATA-----GAGCTGGC-AAA-ATG----AAAACA-CACACGAT-CCAGG----ACCAGGCGGGGAT-----GAAGAC--C-CG-GGGCCTACAG--CAAACAACT-TCCCAGC-CCAC---GGAGAAATGC--CAAC----TGCA-CCATGGGAACATCCTG---GA--CACATTCTGCGTGC--G-G-CATGATGCGGTATGCTGCAGTACA--TGTGTAACATTATT--T--CACAAGTAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   cAAAATGGCGACTGGGGG-AGGATTTGGA--AGAT---C--T--TG-GA------ATAGAGAA-TGT---GACAAT-TATTTCGACTATTCTTGT--A---CA--CCTTGCT-CAGCAGATGATAAAAAT--G--TGGAA--GCGACGAACTTCTGTGTGGAGTGTGAGGAATATTTCTGTGTTA---AATGTGTT--AAGTATAAC-----CATA-----GATTTGGC-AAA-CTG----AAAACA-CACACGAT-CCTGG----ACCAGGCGGTGAT-----GAAGGC--C-CG-CGGCCCACAG--CAAACAACT-TCACAGC-CCAC---GGAAAAATGT--CAGC----TGCA-CCATGGGAACATCCTG---GA--CACATTCTGCGTGC--G-G-CATGATGCGGTATGCTGCGGCACA--TGTGTAACATTATT--T--CACAAGTAGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACTAAAGG-AGGAGTTGAACAACAT------T--TG-GA------A-GGACAA-TGC---GATGAA-TATTTTGATAATTCTTGT--A---CA--TCATGCT-CAGCAGAGGGGAAAAAT--G--TTGAG--GCGACTAAGTTCTGTGTGGAGTGTGAAGAATATTTTTGTGTCG---GATGTGTC--CAGTTTAAC-----CATA-----GATTTGGC-AAG-ATG----AAAACA-CACATGAT-CTTAG----GCTGTGAAGGGAT-----GAAGGC--C-CA-GGGTCTAGGG--CAAACAACT-TCCCAGC-CCAC---TGAGAAATGC--CAGC----TGCA-TCATGGGAACATCCTG---GA--CACATTCTGCGTGC--A-G-CATGATGCAGTGTGCTGTAGTACC--TGCGTCTCCTTATT--T--CACAAGTAGGt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACTGGAGG-ATGTTTTGAA--CGTT---C--TATTG---------ATAAAGGT-TGT---GACGAG-TTTTATGATTATTCTTGT--A---CA--CCGTGCT-CCGCGGAAGGGAAGAAC--G--TAGAG--GCCATTAACTACTGTATGGAATGTGATGAATATGTATGTGTAA---AATGTTTA--ACATATCAT-----AACA-----GATTTGTC-AAA-ATG----AGATCA-CATCAAAT-CCTTG----ATCAGATGGCAAT-----GAAGAC--C-AG-GAGACCACAA--CAGTCACCG-TCCAGTC-CCAC---GGAGAGATGT--GAAC----TTCA-CCATGGAAACATTCTG---GA--CACATTCTGTGTGA--C-A-CACGATGCAGTGTGCTGCGGTACA--TGTGTCTCCTTGTT--C--CACAAGTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGCGTCCATGGG-GGCGTTTGTT--AGAT---CGGT--TG-----------ACAAAA--GTTCAGAGGAA-TTATATGACTTTACGTGT--T---CG--CCTTGTT-C--TAAAGGAGGACAATCTG--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTGTGGAATATTTCTGTTCTG---GTTGCGTT--GAGGATCAC-----AATA------AGTTCGCTGTG-CTG----AGGACA-CATAAACT-TTTGG----ACAAGGCTGGAAT-----GAGAGC--C-CG-GAAACCACAA--CAAGTATTG-TCTCTGC-CAAC---AGAACGATGT--AAGG----ATCA-CCATGGTAA---CCTGATTGA--TACATACTGCGGTA--A-T-CATGATGTCGTCTGCTGTCCCACG--TGTGTGTCTGTGAG--T--CATAGGTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGCGTCCAAGGG-GGCGTTTGTT--AGAT---CGGT--TG-----------ACAAAA--GTTCAGAGGAA-TTATATGACTTTACGTGT--T---CG--CCTTGTT-CTAAAGGAGGACAAACT--G--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTGTGGAATATTTCTGTTCTG---GTTGCGTT--GAGGATCAC-----AATA------AGTTCGCTGTG-CTG----AGGACA-CATAAACT-TTTGG----ACAAGGCTGGAAT-----GAGGGC--C-CG-GAAACCACAA--CAAGTATTG-TCTCTGC-CAAC---AGAACGATGTA-CGGA----T-CA-CCATGGTAA---CCTGATTGA--TACATACTGCGGTA--A-C-CATGATGTCGTCTGCTGTCCTACG--TGTGTGTCTGTGAG--T--CATAGGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--G--TGGAG--GCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTGACGAATATTTTTGTGTTA---AATGTGTC--AAATCTCAC-----CATA-----AATATGGC-AAG-ATG----AAAACA-CACCAGAT-CCTGG----ACAAGGCAAAAAT-----GAAGACGAC-TATGGGACAAAAA--CAAGCAGCT-ACCCCAC-TTAC---GGAGAGATGT--GAGC----TGCA-CCATGGGAACACCCTG---GA--TACGTTCT--GTGCCAA-A-CATGATGCAGTGTGCTGCAGTACG--TGTGTCTCCTTGTT--T--CACAAGTAAG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-TCCCTGC-TTAT---AGAGATATGTTCCAA------ACA-CCCTGGCAACCCCATT---GAGTCATATTGTG-GTGC----T-CATGATGTCGTCTGCTGGGCT--G--TCTGTATCACGATT--GAACACAGGTGAG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acagagtgttagAGAGATGT--ACGA----TTCA-CTGCCACAAAGTCCTA---GA--CATGTTCTGTG-GA--A-CTCATGATGTCGTGTGCTGCGGAGCA--TGTGCCGTTCTAAT--T--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             cCTGGGGG-AGGATTTGTA--AGGT---CCAT--TG---------ACAAAGGC-TGC---GATGTG-TATTATGACTATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT--A--AGAC------------GG------ACAGTGAAAGGTTCGGACGAA-TCCTTCGATTTTATGTGT--T---CACGTTGTGTG-AA--AAAGAACAGAAAT--A--TAGAG--GCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCCAGGACTTTTATTGTTCTT---CGTGTGTC--GAGTGTCAT-----GATA-----G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                 agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtAGAGTA-CGTCT-GATGAA-ACATTTGAGTTTCTGTGT--T---CG--CCGTGTA-----AAATGAAAAACAG--GACTAGAGAAGCTATGCTTTATTGTGTGGACTGCGTGGACTATTATTGTAGCA---CGTGTGTT--GAGTTTCACGGGGACATA--------CCGGC-----ATT----AAAATGTCATAAGATACTTGG----A-AAGTCCGACTT-----TCCGAC--CGCG-GCATCCAGAAATCTAACGATTGTTCCG-----AC---GGACAGATGT--CCAC----TCCATCCAACAAAAC-TGTTG---GA--TATGTTCTGT---C--A-G-AATGACGcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caaaatggcggcatcaggaagtaacgggcgaacgattcGTGTTCG---CC--TTGTGTG--AACAAAGA-CAAAAAT--A--CAGAG--AACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTCGCGACTATTACTGTTATA---CGTGTGTC--GAGTTCCAC-----AGTacgagatcggatgtcacgcctgtatggccgttaaacacaggtatttatcgtgactatttaattaaaggagtgtttgacaataacacaaatttagataatatagaatcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                    ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtGG-AGAATCTGAA--GGATTTTC--T--TG-TACGCTAGACAGAGGT-TCT---GAGGAAATGTT-TGACTTTGTTTGT--T---CA--CCGTGTGATAGAAGAGGTAACAAACCAG--TACAG--GCATTAAACTACTGTACAGACTGTGATGAA-----CTGTATTGTAAAACATGCCTGGAGTTTCAgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 actagatC-CCAC---GGAGCAATGT--CCTC----AGCA-TCAAGGCAAAGTCCTT---GA--AAAGTACTGTG-GCA-A-C-CATGACACATTATGCTGT--CACGTTTGTGTATCCCTAAA--C--CACAGGTtgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          :                                                                                                                                actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaGAAG--CCAGTAAAC-ACTGTGTGGAGTGCGAAGAAAGCTTCTGCTTTA---AATGTCTT--CAATATCA------TGCA-----AAGTT-TC-AA--ATGCTAAAGAAC--CACACTGT-TTTAGATGTACAAGATGGAGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacaAGAAATGT--CAGC----ATCA-TCGTGGCAAAATTATT---GA--TACATTCTGTGGAA--A-C-CATGATGTAGTCTGCTGTCCTATC--TGTATAGCAGTCAG--T--CACAGGTAAgattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcagaaatgtcagcatcatcgtggcaaaattattgatacattctgtggaaaccatgatgtagtctgctgtcctatctgtatagcagtcagtcacaggtaa
gi|8                          : cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATTCC--AGAT---CCAT--TGAGA------ACGGAG----GG---GAGGAG-TATTTTGACTTTGCTTGC--GGTCCA--T-GTG-G-CAA-GGACGGCAGACAT--A--TTGAG--GCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTGCGCAGAACTTCTGTAATA---AATGTCTC--AAAGACCAT-----AACACCAGTAAGTTCGC-AGGTCTT----AAAAGT-CACAAGAT-TCTTG----ATAAAGCTGGTATTCTGGGAAGTC---------GTCTGCAG----------T-TTCCCGCGTTACTTTCGTCAGATGA--CTGCACGATACA-CCCAGGCAAGCCCGTT---GA--CATGTACTGTG-GT--ACG-CATGATGACATATTCTGCGGAGCA--TGTATTGCA--ATCGAT--CACAGGTA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|9 ): ATAAAATGGCAACAAACTCAAGTTTTATGCGCTCTGCAGATAAGAGTTCTGAAGTCTATTATGACTTTTCCTGTTCTTCGTGTGCAAAACATAGCAAACAACAGGAGGCAGTGAAGAGCTGTCTGGACTGTGCCCAGGACTTCTGTGATGTTTGTCTACAATATCACAACAAGTTTGAAGGAATGAGGAAACACAGGATTGTGAACAAAGCTGGGATGCAGTCCGATGTTCTACAAGGTGCTGGTTTTCCTGCCAGTAGGGAGATGTTCTATACACCCTGAGAAGGAAATCGAGCTATTTTGCTGTGCTCATAATGCCGTCTGCTGTGCTGTATGTATCACCATATATCACAGGTAAGAA
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Unaligned ( gi|20 ): ATGACTCAGTGTTTACGTATTGAAGGGGTAATGGCAGTGATATACCTGCATTATCCGGACATAAGATACTCGGTCGGTCAGAATTCCCGACAGGTATTTCAAAGGTATTGGTGCCACTGCCGACGGAGAGATGCAGTACACATCCTACTAAACTGATGGACATGTACTGTCAAAATAATGATCAGATAGGCTGCCATGTCTGTATGACCGTAAAACACAGGTAAATACATTTATTTATCAGTAAATGTTTAG
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Reference ( family-2247 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   NAAAATGGCGNCCGGGGG-AGGATTTGNA--AGATC--T--TG-GA------ACAGAGAA-TGT---GACGAATNTTT-TGACTNTNCGTGTNCAC--C--GTGC-G-CAGCA--GAGG--GNAAAAAT--GTGGAGGCNACNAACTNCTGTGTGGANTGTGAGGAATATTTCTGTNTT---AAATGTGTC--GAGTATCACNATA-----GAGTTGGC-AAG-ATG----AAAACACACANGATCCTGG----ACNAGGCGGGGAT-----GAAGGC--CCG-GGGNCCACAGCAAACAACTTCCCNGC-CCAC---GGAGAGATGT--CAGC----TGCAC--CATGGNAACATCCTG---GA--CACGTTCTGCGTGC--A-N-CATGATG--C-GGTNTGCTGCGGTACG--TGTGTNT--CNTTATT--T--CACAGGTAAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGAC-GGGTT-ATAGTTT-TA--GG--------CG-GA-------CAGTGAAAGGTTCGGACGAATCTTT-CGATTTAGTGTGTTCAC--C--TTGT-G-TGAAA--AAGA--ACATAAAT--AGAGAGGGTACACAGTACTGTGTGGATTGCCATGACTTCTATTGTTCT---ACGTGTGTC--AAGTGTCACGA
gi|10                         :                                                                                                                                                    aatcgaaaatattcgattatattactgacttagcgctaaacagggtcatctgctgtataggttatcatatatgcacacgcacatgacagccatcacgtgactgcatgtttgttgtcgcatattaagtaAACATGGCGTCTGGGGG-AGGATTGGGA--AGATC--T--TG-GA------AGAGAGAA-TGT---GACGAATATTT-TGACTATTCGTGTGCAT--T--ATGC-A-CAACA--GATG--GGAAAAAT--GTGGAGGCGACCAACTTCTGTGTGGAATGTGAAGAATATTTCTGTGTT---AAATGTGTC--AAGTATAACCATA-----GAGTTGGC-AAA-CTG----AAAACACACACGATCCTTG----ACCAGGCGGGGAT-----GAAGGC--CCG-GGACCCACAGCAAACAACTTCCCAGC-CCAC---GGAGAAATGT--CAGC----TGCAT--CATGGGAACATCCTC---GA--CACATTCTGCGTGC--G-G-CATGATA--T-GGTATGCTGCGGTACA--TGTGTGT--CATTATT--T--CACAAGTAGGggaccttcccgtattatccggacataggatacttgacaagtcagactcggagttccctacagatggatccaaggtgacattgccgacggaaaaatgcagtattcacactaagttgatggatatgtattgtcaaaaccatgatcagataggatgccatgtgtgtatggccgttaaacacaggtagtaacatttatannnnnnnnnnatgtgtagtatatttgactaacttttatatacatatatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aAAAATGGCATCTAGGAG-AGGATTTGGA--AGATC--T--TG-GA------ATAGAGAA-TGT---GACGAATATTT-TGACTATTCGTGTGCAT--T--GTGC-A-CAGCA--GAGG--GGAAAAAT--GTGGAGGCGACCAACTTCTGTGTGGAGTGTGAGGAATATTTCTGTGTT---AAATGTGTC--AGGTATCACCATA-----GAGCTGGC-AAA-ATG----AAAACACACACGATCCAGG----ACCAGGCGGGGAT-----GAAGAC--CCG-GGGCCTACAGCAAACAACTTCCCAGC-CCAC---GGAGAAATGC--CAAC----TGCAC--CATGGGAACATCCTG---GA--CACATTCTGCGTGC--G-G-CATGATG--C-GGTATGCTGCAGTACA--TGTGTAA--CATTATT--T--CACAAGTAAG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACTAAAGG-AGGAGTTGAACAACAT---T--TG-GA------A-GGACAA-TGC---GATGAATATTT-TGATAATTCTTGTACAT--C--ATGC-T-CAGCA--GAGG--GGAAAAAT--GTTGAGGCGACTAAGTTCTGTGTGGAGTGTGAAGAATATTTTTGTGTC---GGATGTGTC--CAGTTTAACCATA-----GATTTGGC-AAG-ATG----AAAACACACATGATCTTAG----GCTGTGAAGGGAT-----GAAGGC--CCA-GGGTCTAGGGCAAACAACTTCCCAGC-CCAC---TGAGAAATGC--CAGC----TGCAT--CATGGGAACATCCTG---GA--CACATTCTGCGTGC--A-G-CATGATG--C-AGTGTGCTGTAGTACC--TGCGTCT--CCTTATT--T--CACAAGTAGGt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACTGGAGG-ATGTTTTGAA--CGTTC--TATTG---------ATAAAGGT-TGT---GACGAGTTTTA-TGATTATTCTTGTACAC--C--GTGC-T-CCGCG--GAAG--GGAAGAAC--GTAGAGGCCATTAACTACTGTATGGAATGTGATGAATATGTATGTGTA---AAATGTTTA--ACATATCATAACA-----GATTTGTC-AAA-ATG----AGATCACATCAAATCCTTG----ATCAGATGGCAAT-----GAAGAC--CAG-GAGACCACAACAGTCACCGTCCAGTC-CCAC---GGAGAGATGT--GAAC----TTCAC--CATGGAAACATTCTG---GA--CACATTCTGTGTGA--C-A-CACGATG--C-AGTGTGCTGCGGTACA--TGTGTCT--CCTTGTT--C--CACAAGTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGCGTCCATGGG-GGCGTTTGTT--AGATCGGT--TG---------ACAAAAGT-TCA---GAGGAATTATA-TGACTTTACGTGTTCGC--C--TTGT-T-C--TA--AAGG--AGGACAATCTGTGGAGGCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTGTGGAATATTTCTGTTCT---GGTTGCGTT--GAGGATCACAATA------AGTTCGCTGTG-CTG----AGGACACATAAACTTTTGG----ACAAGGCTGGAAT-----GAGAGC--CCG-GAAACCACAACAAGTATTGTCTCTGC-CAAC---AGAACGATGT--AAGG----ATCAC--CATGGTAA---CCTGATTGA--TACATACTGCGGTA--A-T-CATGATG--T-CGTCTGCTGTCCCACG--TGTGTGT--CTGTGAG--T--CATAGGTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGCGTCCAAGGG-GGCGTTTGTT--AGATCGGT--TG---------ACAAAAGT-TCA---GAGGAATTATA-TGACTTTACGTGTTCGC--C--TTGT-T-CTAAA--GGAG--GACAAACT--GTGGAGGCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTGTGGAATATTTCTGTTCT---GGTTGCGTT--GAGGATCACAATA------AGTTCGCTGTG-CTG----AGGACACATAAACTTTTGG----ACAAGGCTGGAAT-----GAGGGC--CCG-GAAACCACAACAAGTATTGTCTCTGC-CAAC---AGAACGATGTA-CGGA----T-CAC--CATGGTAA---CCTGATTGA--TACATACTGCGGTA--A-C-CATGATG--T-CGTCTGCTGTCCTACG--TGTGTGT--CTGTGAG--T--CATAGGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T--GTGGAGGCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTGACGAATATTTTTGTGTT---AAATGTGTC--AAATCTCACCATA-----AATATGGC-AAG-ATG----AAAACACACCAGATCCTGG----ACAAGGCAAAAAT-----GAAGACGACTATGGGACAAAAACAAGCAGCTACCCCAC-TTAC---GGAGAGATGT--GAGC----TGCAC--CATGGGAACACCCTG---GA--TACGTTCT--GTGCCAA-A-CATGATG--C-AGTGTGCTGCAGTACG--TGTGTCT--CCTTGTT--T--CACAAGTAAG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTGC-CGAC---GGAGAGATG---CAG-----TACACATCCTACTAAACTGATG---GA--CATGTACTGT---C--A-A-AATAATGATCAGATAGGCTGC--CATG--TCTGTATGACCGTAAA--A--CACAGGTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgactcagtgtttacgtattgaaggggtaatggcagtgatatacctgcattatccggacataagatactcggtcggtcagaattcccgacaggtatttcaaaggtattggtgccaTTCCCTGC-TTAT---AGAGATATGTTCCAA------ACAC--CCTGGCAACCCCATT---GAGTCATATTGTG-GTGC----T-CATGATG--T-CGTCTGCTGGGCT--G--TCTGTAT--CACGATT--GAACACAGGTGAGatacatttatttatcagtaaatgtttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acagagtgttagAGAGATGT--ACGA----TTCAC--TGCCACAAAGTCCTA---GA--CATGTTCTGTG-GA--A-CTCATGATG--T-CGTGTGCTGCGGAGCA--TGTGCCG--TTCTAAT--T--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             cCTGGGGG-AGGATTTGTA--AGGTCCAT--TG---------ACAAAGGC-TGC---GATGTGTATTA-TGACTAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT--A--AGAC---------GG------ACAGTGAAAGGTTCGGACGAATCCTT-CGATTTTATGTGTTCACGTT--GTGT-G-AA--A--AAGA--ACAGAAAT--ATAGAGGCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCCAGGACTTTTATTGTTCT---TCGTGTGTC--GAGTGTCATGATA-----Gt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtGTGTTCGC--CTTGTGT-G--AACA--AAGA---CAAAAAT--ACAGAGAACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTCGCGACTATTACTGTTAT---ACGTGTGTC--GAGTTCCACAGTcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                    ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtGA-AGGATTT--------TC--T--TG-TACGCTAGACAGAGGT-TCT---GAGGAAATGTT-TGACTTTGTTTGTTCAC--C--GTGT-GATAGAA--GAGG--TAACAAACCAGTACAGGCATTAAACTACTGTACAGACTGTGATGAA-----CTGTATTGTAAAACATGCCTGGAGTTTCAgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actagatggagaatctC-CCAC---GGAGCAATGT--CCTC----AGCAT--CAAGGCAAAGTCCTT---GA--AAAGTACTGTG-GCA-A-C-CATGACA--C-ATTATGCTGT--CACGTTTGTGTAT--CCCTAAA--C--CACAGGTtgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          :                                                            actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaACGGCTATTTATGACATTTATTGCTCAC--C--CTGCCG-AAGGA--ACGGCAGTATAA-----CAGAAGCCAGTAAACACTGTGTGGAGTGCGAAGAAAGCTTCTGCTTT---AAATGTCTT--CAATATCA-TGCA-----AAGTT-TC-AA--ATGCTAAAGAAC-CACACTGTTTTAGATGTACAAGATGGAGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccAGAAATGT--CAGC----ATCAT--CGTGGCAAAATTATT---GA--TACATTCTGTGGAA--A-C-CATGATG--T-AGTCTGCTGTCCTATC--TGTATAG--CAGTCAG--T--CACAGGTAAgattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcagaaatgtcagcatcatcgtggcaaaattattgatacattctgtggaaaccatgatgtagtctgctgtcctatctgtatagcagtcagtcacaggtaa
gi|8                          : cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATTCC--AGATCCAT--TGAGA------ACGGAG----GG---GAGGAGTATTT-TGACTTTGCTTGCGGTC--C--ATGT-G---GCAAGGACG--GCAGACAT--ATTGAGGCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTGCGCAGAACTTCTGTAAT---AAATGTCTC--AAAGACCATAACACCAGTAAGTTCGC-AGGTCTT----AAAAGTCACAAGATTCTTG----ATAAAGCTGGTATTCTGGGAAGTC--------GTCTGCAG--------TTTCCCGCGTTACTTTCGTCAGATGA--CTGCACGATACAC--CCAGGCAAGCCCGTT---GA--CATGTACTGTG-GT--ACG-CATGATG--A-CATATTCTGCGGAGCA--TGTATTG--CA--ATCGAT--CACAGGTA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): TGTAGGAAAATAAGCAAGAAAACTGTGGAATCAGACTTTTACTGCACCGACTGCTAGCTGTTCTTCTGTGAAACATGCATGGAATTTCACAGCTTTATTCCAGCATTAGAGAATCACATAGTTTTAGGAAAAGATCAAATTCAAAGTTGGGGGAAAAGGTAAG
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T--GTGGAGGCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTG---ACGAATATTTTTGTGTT---AAATGT--GTC--AA--ATCTCACCATA-----AATAT---GGC-AA--G-A-TGAA-AACAC-A-CCAGATC-CTGG----ACAAGGCAAAAAT-----GAAGACGACTATGGGACAAAAACA---AGC-AGC--T-A-----CCCCAC-TTAC---GGAGAGATGT--GAGC----TGCAC--CATGGGAA--C---ACCCTG---GA--T-A-CG-----TTCT----GTGCCAA-A-CATGATG--C-AGTGTG-CTGCAGTA-CG--TGTGTCT---CCTTGTT--T--CACAAGTAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACAGGG---------CG--TACAATC---------------CAG----AGTGCATCAGATGAAATATT-TGA-TTTGCATTGTTCTA--C--ATGC-A-CGTTGAATCA--CAGG--ACTAG-A-------GAAGCTACGAAATATTGCGAGGACTGCC---TGGACTTTTATTGTGAC---ACGTGT--GTC--CA--GGTTCACAGT------GACGT---GCC-AG--C-A-TTAA-AGCGCCA-TAAGATAGTTGG----A-AAGTCAGCATT----------C--CCG----ACGAAAGTATTGAGA-AAT--T-TAACGACCGTGC-CGAC---AGATAAATGC--CCGC----TCCAC--C-CGACAAAGC----TCCTC---GA--T-A-TG-----TTCTGTC-G-GA--A-C-GACGACG--A-GATTGG-ATGT--CA-CG--CATGTATGGCCGTTAAA-----CACAGGTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catagttttactttcgttttcatttacgggaaataaaaatcaggtcattatcggttagtcatatacacaacaacagtttcacaatatttaaaccgaggccaacCTGC-CGAC---GGAGAGATG---CAG-----TACACATCCTACTAA--A---CTGATG---GA--C-A-TG-----TACTG-T----C--A-A-AATAATGATCAGATAGG-CTGC--CA-TG--TCTGTATGA-CCGTAAA--A--CACAGGTAAttaattgattttattaatataacacacctaaatgaatatataatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgactcagtgtttacgtattgaaggggtaatggcagtgatatacctgcattatccggacataagatactcggtcggtcagaattcccgacaggtatttcaaaggtattggtgcca--T-T-----CCCTGC-TTAT---AGAGATATGTTCCAA------ACAC--CCTGGCAA--C---CCCATT---GAGTC-A-TA-----TTGTG---GTGC----T-CATGATG--T-CGTCTG-CTGGGCT---G--TCTGTAT---CACGATT--GAACACAGGTGAGatacatttatttatcagtaaatgtttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acagagtgttagAGAGATGT--ACGA----TTCAC--TGCCACAA--A---GTCCTA---GA--C-A-TG-----TTCTG-T-G-GA--A-CTCATGATG--T-CGTGTG-CTGCGGAG-CA--TGTGCCG---TTCTAAT--T--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             cCTGGGGG-AGGATTTG--TAAGGTCCATTG---------ACAA----AGGCTGC--GATGTGTATTA-TGACTAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT----AAGAC-------GG------ACAGTGAAAGGTTCG--GACGAATCCTT-CGATTTTATGT-GTTCACGTT--GTGT-G-A-----A--A--AAGA--ACAGA-AAT--ATAGAGGCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCC---AGGACTTTTATTGTTCT---TCGTGT--GTC--GA--GTGTCATGATA-----GCATTCC-TGC-AT--T-A-TCCG-GACAT-A-AAC--TA-CTCG----GTCAGTC-AGAATTTCC-GACGGA--T---GGATCCA-AG-A---AGC-TGG--TGT-----CATTGC-CGAC---GGAGAGGTG---CAG-----TGCACATCCTACTAA--A---CTGGTG---GA--C-A-TG-----TATTG-T-CAAA--A-T-CATGATC--A-GATAGG-CTGT--CA-CG--TCTGTATGA-CTGTGAA--A--CACAGGTAAt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtGT-GTTCGC--CTTGTGT-G-------AACA--AAGA---CAAA-AAT--ACAGAGAACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTC---GCGACTATTACTGTTAT---ACGTGT--GTC--GA--GTTCCACAGTacaaattattgtaatat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                    ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtGA-AGGATTT--------TC--TTG-TACGCTAGACAG----AGGTTCT--GAGGAAATGTT-TGACTTTGTTT-GTTCAC--C--GTGT-GAT-----AGAA--GAGG--TAACA-AACCAGTACAGGCATTAAACTACTGTACAGACTGTG---ATGAA-----CTGTATTGTAAAACAT--GCCTGGA--GTTTCAgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actagatggagaatctC-CCAC---GGAGCAATGT--CCTC----AGCAT--CAAGGCAA--A---GTCCTT---GA--A-A-AG-----TACTG-T-G-GCA-A-C-CATGACA--C-ATTATG-CTGT--CA-CGTTTGTGTAT---CCCTAAA--C--CACAGGTtgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          :                                                            actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaACGGCTATTTATGACATTTATT-GCTCAC--C--CTGCCG-A-----AGGA--ACGGCAGTATA-A-----CAGAAGCCAGTAAACACTGTGTGGAGTGCG---AAGAAAGCTTCTGCTTT---AAATGT--CTT--CA--ATATCA-TGCA-----AAGTT----TC-AAATG-C-TAAAGAAC-C-A-CACTGTT-TTAGATGTACAAGATGGAGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccAGAAATGT--CAGC----ATCAT--CGTGGCAA--A---ATTATT---GA--T-A-CA-----TTCTG-T-GGAA--A-C-CATGATG--T-AGTCTG-CTGTCCTA-TC--TGTATAG---CAGTCAG--T--CACAGGTAAgattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcagaaatgtcagcatcatcgtggcaaaattattgatacattctgtggaaaccatgatgtagtctgctgtcctatctgtatagcagtcagtcacaggtaa
gi|8                          : cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATT--CCAGATCCATTGAGA------ACGG----AGGG-----GAGGAGTATTT-TGACTTTGCTT-GCGGTC--C--ATGT-G--------GCAAGGACG--GCAGA-CAT--ATTGAGGCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTG---CGCAGAACTTCTGTAAT---AAATGT--CTC--AA--AGACCATAACACCAGTAAGTT---CGC-AG--GTC-TTAA-AAGTC-A-CAAGATT-CTTG----ATAAAGCTGGTATTCTGGGAAGTC--------GTCTGCAG--------------T-T-----TCCCGCGTTACTTTCGTCAGATGA--CTGCACGATACAC--CCAGGCAA--G---CCCGTT---GA--C-A-TG-----TACTG-T-G-GT--ACG-CATGATG--A-CATATT-CTGCGGAG-CA--TGTATTG---CAATCGA--T--CACAGGTA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aAAAATGGCGACAAGCTC-GAGATTTT--CGGGCT---C--TGC-GT------ATAA----AGGT--TCT--GAGGCTTATTA-TGACTTTTGGT-GTTTC--C--C--ATGT-G-G-----AAAG--GATG--GCAGA-CAC--C--TGGAA--GCAGTGAACGGCTGTTTGGACTGTGCCCAGA---ACTTCTGTTCT---GTATGT--CTC--CA--ATATCACA-----ACA-----AGATTCAGGGC-A---------TGAC-TAGA-C-ACAAGAT-A-GTGG----ACAAAGCAGGGATGCAGGC--CAG-TG--T---TTTACAG------------A-GT-GTTGGTT-----CCC----TG--CCTGTAGAGACATGTTCCA---------TTCA-C--CCTGGCAA--CCAAAT--TG---AG--CTA-TA-----TTGT--T-GTGC----T-C-ATGGT-------TTTGTCTGCAGTGCCGT--CTGCATCA-CAATTGAT--CATAGGTCAG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tAAAATGGCATCTAGGAG-AGGATTTG--GAAGAT---C--TTG-GA------ATAG----AGAA--TGT--GACGAATATTT-TGACTATTCGT-GTGCA--T--T--GTGC-A-C-----AGCA--GAGG--GGAAA-AAT--G--TGGAG--GCGACCAACTTCTGTGTGGAGTGTG---AGGAATATTTCTGTGTT---AAATGT--GTC--AG--GTATCACC-----ATA-----GAGCT---GGC-A--A--A-A-TGAA-AACA-C-ACACGAT-C-CAGG----ACCAGGCGGGGATGAAGAC--CCG-GG--G---CCTACAG-------CA---A-AC-AAC--TT-----CCC----AG--CCCACGGAGAAATGC--CAA---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ATCCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-C-GTGC--G-G-C-ATGATG--C-GGTATG-CTGCAGTA-CAT--GTGTAA---CATTATTT--CACAAGTAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   cAAAATGGCGACTGGGGG-AGGATTTG--GAAGAT---C--TTG-GA------ATAG----AGAA--TGT--GACAATTATTT-CGACTATTCTT-GTACA--C--C--TTGC-T-C-----AGCA--GATG--ATAAA-AAT--G--TGGAA--GCGACGAACTTCTGTGTGGAGTGTG---AGGAATATTTCTGTGTT---AAATGT--GTT--AA--GTATAACC-----ATA-----GATTT---GGC-A--A--A-C-TGAA-AACA-C-ACACGAT-C-CTGG----ACCAGGCGGTGATGAAGGC--CCG-CG--G---CCCACAG-------CA---A-AC-AAC--TT-----CAC----AG--CCCACGGAAAAATGT--CAG---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ATCCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-C-GTGC--G-G-C-ATGATG--C-GGTATG-CTGCGGCA-CAT--GTGTAA---CATTATTT--CACAAGTAGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACTAAAGG-AGGAGTTGAACAACAT------TTG-GA------A-GG----ACAA--TGC--GATGAATATTT-TGATAATTCTT-GTACA--T--C--ATGC-T-C-----AGCA--GAGG--GGAAA-AAT--G--TTGAG--GCGACTAAGTTCTGTGTGGAGTGTG---AAGAATATTTTTGTGTC---GGATGT--GTC--CA--GTTTAACC-----ATA-----GATTT---GGC-A--A--G-A-TGAA-AACA-C-ACATGAT-C-TTAG----GCTGTGAAGGGATGAAGGC--CCA-GG--G---TCTAGGG-------CA---A-AC-AAC--TT-----CCC----AG--CCCACTGAGAAATGC--CAG---C----TGCA-T--CATGGGAA--C---ATCCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-C-GTGC--A-G-C-ATGATG--C-AGTGTG-CTGTAGTA-CCT--GCGTCT---CCTTATTT--CACAAGTAGGt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACTGGAGG-ATGTTTTG--AACGTT---CTATTG---------ATAA----AGGT--TGT--GACGAGTTTTA-TGATTATTCTT-GTACA--C--C--GTGC-T-C-----CGCG--GAAG--GGAAG-AAC--G--TAGAG--GCCATTAACTACTGTATGGAATGTG---ATGAATATGTATGTGTA---AAATGT--TTA--AC--ATATCATA-----ACA-----GATTT---GTC-A--A--A-A-TGAG-ATCA-C-ATCAAAT-C-CTTG----ATCAGATGGCAATGAAGAC--CAG-GA--G---ACCACAA-------CA---G-TC-ACC--GT-----CCA----GT--CCCACGGAGAGATGT--GAA---C----TTCA-C--CATGGAAA--C---ATTCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-T-GTGA--C-A-C-ACGATG--C-AGTGTG-CTGCGGTA-CAT--GTGTCT---CCTTGTTC--CACAAGTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGCGTCCATGGG-GGCGTTTG--TTAGAT---CGGTTG---------ACAA----AAGT--TCA--GAGGAATTATA-TGACTTTACGT-GTTCG--C--C--TTGT-T-C-------TA--AAGG--AGGAC-AATCTG--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAATATTTCTGTTCT---GGTTGC--GTT--GA--GGATCACA-----ATA------AGTT---CGCTG--T--G-C-TGAG-GACA-C-ATAAACT-T-TTGG----ACAAGGCTGGAATGAGAGC--CCG-GA--A---ACCACAA-------CA---A-GT-ATT--GT-----CTC----TG--CCAACAGAACGATGT--AAG---G----ATCA-C--CATGGTAA--------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTG-C-GGTA--A-T-C-ATGATG--T-CGTCTG-CTGTCCCA-CGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGGCGTCCAAGGG-GGCGTTTG--TTAGAT---CGGTTG---------ACAA----AAGT--TCA--GAGGAATTATA-TGACTTTACGT-GTTCG--C--C--TTGT-T-C-----TAAA--GGAG--GACAA-ACT--G--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAATATTTCTGTTCT---GGTTGC--GTT--GA--GGATCACA-----ATA------AGTT---CGCTG--T--G-C-TGAG-GACA-C-ATAAACT-T-TTGG----ACAAGGCTGGAATGAGGGC--CCG-GA--A---ACCACAA-------CA---A-GT-ATT--GT-----CTC----TG--CCAACAGAACGATGTA-CGG---A----T-CA-C--CATGGTAA--------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTG-C-GGTA--A-C-C-ATGATG--T-CGTCTG-CTGTCCTA-CGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T--G--TGGAG--GCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTG---ACGAATATTTTTGTGTT---AAATGT--GTC--AA--ATCTCACC-----ATA-----AATAT---GGC-A--A--G-A-TGAA-AACA-C-ACCAGAT-C-CTGG----ACAAGGCAAAAATGAAGACGACTATGG--G---ACAAAAA-------CA---A-GC-AGC--TA-----CCC----CA--CTTACGGAGAGATGT--GAG---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ACCCTG---GA--T-A-CG-----TTCT----GTGCCAA-A-C-ATGATG--C-AGTGTG-CTGCAGTA-CGT--GTGTCT---CCTTGTTT--CACAAGTAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAAATGGCGACAGGG---------CG--TACAAT---C---------------CAG----AGTG--CATCAGATGAAATATT-TGA-TTTGCATTGTTCT--A--C--ATGC-A-CGTTGAATCA--CAGG--ACTAG-A---------GAA--GCTACGAAATATTGCGAGGACTGCC---TGGACTTTTATTGTGAC---ACGTGT--GTC--CA--GGTTCACA-----GT------GACGT---GCC-A--G--C-A-TTAA-AGCG-CCATAAGAT-AGTTGG----A-AAGTCAGCATT-----C--CCG---------ACGAAAG-------TATTGA-GA-AAT--TTAACGACCG----TG--CCGACAGATAAATGC--CCG---C----TCCA-C--C-CGACAAAGC----TCCTC---GA--T-A-TG-----TTCTGTC-G-GA--A-C-G-ACGACG--A-GATTGG-ATGT--CA-CGC--ATGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        catagttttactttcgttttcatttacgggaaataaaaatcaggtcattatcggttagtcatatacacaacaacagtttcacaatatttaaaccgaggccaacC----TG--CCGACGGAGAGATG---CAG--------TACA-CATCCTACTAA--A---CTGATG---GA--C-A-TG-----TACTG-T----C--A-A-A-ATAATGATCAGATAGG-CTGC--CA-TGT--CTGTATGA-CCGTAAAA--CACAGGTAAttaattgattttattaatataacacacctaaatgaatatataatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atgactcagtgtttacgtattgaaggggtaatggcagtgatatacctgcattatccggacataagatactcggtcggtcagaattcccgacaggtatttcaaaggtattggtgcca--TT-----CCC----TG--CTTATAGAGATATGTTCCAA---------ACA-C--CCTGGCAA--C---CCCATT---GAGTC-A-TA-----TTGTG---GTGC----T-C-ATGATG--T-CGTCTG-CTGGGCT---GT--CTGTAT---CACGATTGAACACAGGTGAGatacatttatttatcagtaaatgtttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acagagtgttagAGAGATGT--ACG---A----TTCA-C--TGCCACAA--A---GTCCTA---GA--C-A-TG-----TTCTG-T-G-GA--A-CTC-ATGATG--T-CGTGTG-CTGCGGAG-CAT--GTGCCG---TTCTAATT--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             cCTGGGGG-AGGATTTG--TAAGGT---CCATTG---------ACAA----AGGC--TGC--GATGTGTATTA-TGACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT----AAGAC----------GG------ACAGTGAAAGGT--TCG--GACGAATCCTT-CGATTTTATGT-GTTCA--CGTT--GTGT-G-A-----A--A--AAGA--ACAGA-AAT--A--TAGAG--GCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCC---AGGACTTTTATTGTTCT---TCGTGT--GTC--GA--GTGTCATG-----ATA-----Gatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                              agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtCAG----AGTACGTCT--GATGAAACATT-TGAGTTTCTGT-GTTCG--C--C--GTGT-A----------A--AATG--AAAAA-CAG--GACTAGAGAAGCTATGCTTTATTGTGTGGACTGCG---TGGACTATTATTGTAGC---ACGTGT--GTT--GA--GTTTCACGGGGACATA--------CC---GGC-A---------TTAA-AATGTC-ATAAGATAC-TTGG----A-AAGTC-----CGACTTT--CCG---------ACCGCGG-------CATCCA-GA-AAT--CT-----AACGAT-TGTTCCGACGGACAGATGT--CCA---C----TCCATC--CAACAAAA--C----TGTTG---GA--T-A-TG-----TTCTG-T-CAGA--A-T-G-ACGACG--A-GATCGG-ATGT--CA-CGC--CTGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTAcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaaatggcggcatcaggaagtaacgggcgaacgatt--GACGAAACTTT-TGATTTAGTGT-GTTCG--C--C--TTGT-G-T-----GAAA--AAGA--ACAGA-AAtttatcgtgactatttaattaaaggagtgtttgacaataacacaaatttagataatatagaatcg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttcgGT-GTTCG--C--CTTGTGT-G-------AACA--AAGA---CAAA-AAT--A--CAGAG--AACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTC---GCGACTATTACTGTTAT---ACGTGT--GTC--GA--GTTCCACA-----GTcaaacaggtgtgttcgccttgtgtgaacaaagacaaaaatacagagaacaaaaagtattgtgtgaattgtcgcgactattactgttatacgtgtgtcgagttccacagtgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggt----TG--CCGACGGAGAGATGT--Cgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                       ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtgtgttcgccttgtgtgaacaaagacaaaaatacagagaacaaaaagtattgtgtgaattgtcgcgactattactgttatacgtgtgtcgagttccacagtgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacatGG-AGAATCTG--AAGGATTTTC--TTG-TACGCTAGACAG----AGGT--TCT--GAGGAAATGTT-TGACTTTGTTT-GTTCA--C--C--GTGT-GAT-----AGAA--GAGG--TAACA-AACCAG--TACAG--GCATTAAACTACTGTACAGACTGTG---ATGAA-----CTGTATTGTAAAACAT--GCCTGGA--GTTTCAgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actagat--CCCACGGAGCAATGT--CCT---C----AGCA-T--CAAGGCAA--A---GTCCTT---GA--A-A-AG-----TACTG-T-G-GC--A-A-CCATGACA--C-ATTATG-CTGT--CA-CGTTTGTGTAT---CCCTAAAC--CACAGGTtgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          :                                                      actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaGGG--TTC--CACGGCTATTTATGACATTTATT-GCTCA--C--C--CTGCCG-A-----AGGA--ACGGCAGTATA-A-------CAGAA--GCCAGTAAACACTGTGTGGAGTGCG---AAGAAAGCTTCTGCTTT---AAATGT--CTT--CA--ATATCA-T-----GCA-----AAGTT----TC-A--AATG-C-TAAAGAAC--C-ACACTGT-T-TTAGATGTACAAGATGGAGA
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gi|8                          : cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATT--CCAGAT---CCATTGAGA------ACGG----AGGG-------GAGGAGTATTT-TGACTTTGCTT-G--CGGTC--C--ATGT-G--------GCAAGGACG--GCAGA-CAT--A--TTGAG--GCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTG---CGCAGAACTTCTGTAAT---AAATGT--CTC--AA--AGACCATA-----ACACCAGTAAGTT---CGC-A--G--GTC-TTAA-AAGT-C-ACAAGAT-T-CTTG----ATAAAGCTGGTAT-----T--CTG-GGAAG---TC----G-------TC---T-GC-AGT--TT-----CCCGCGTTA--CTTTCGT-CAGATGA--CTG---CACGATACA-C--CCAGGCAA--G---CCCGTT---GA--C-A-TG-----TACTG-T-G-GT--ACG-C-ATGATG--A-CATATT-CTGCGGAG-CAT--GTATTG---CAATCGAT--CACAGGTA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          tAAAATGGCATCTAGGAG-AGGATTTG--GAAGAT---C--TTG-GA------ATAG----AG-AA--TGTGACGAATATTT-TGACTATTCGT-GTGCA--T--T--GTGC-A-C-----AGCA--GAGG--GGAAA-AAT--G--TGGAG--GCGACCAACTTCTGTGTGGAGTGTG---AGGAA---TATTTCTGTGTTAAATGTGTCAGGTATCAC---C-----ATA-----GAGCT---GGC-A--A--A-A-TGAA-AACA-C-ACA-------CGAT-C-CAGGACCAGGCGG--GGAT-----GA-AG--AC--CCG-GGG---CCTACAG-------CA---A-AC-AACT----T-----CCC---AG--CCCACGGAGAAATGC--CAA---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ATCCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-C-GTGC--G-G-C-ATGATG--C-GGTATGC--TGCAGTACAT--GTGTAA---CATTATTT--CACAAGTAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          cAAAATGGCGACTGGGGG-AGGATTTG--GAAGAT---C--TTG-GA------ATAG----AG-AA--TGTGACAATTATTT-CGACTATTCTT-GTACA--C--C--TTGC-T-C-----AGCA--GATG--ATAAA-AAT--G--TGGAA--GCGACGAACTTCTGTGTGGAGTGTG---AGGAA---TATTTCTGTGTTAAATGTGTTAAGTATAAC---C-----ATA-----GATTT---GGC-A--A--A-C-TGAA-AACA-C-ACA-------CGAT-C-CTGGACCAGGCGG--TGAT-----GA-AG--GC--CCG-CGG---CCCACAG-------CA---A-AC-AACT----T-----CAC---AG--CCCACGGAAAAATGT--CAG---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ATCCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-C-GTGC--G-G-C-ATGATG--C-GGTATGC--TGCGGCACAT--GTGTAA---CATTATTT--CACAAGTAGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAATGGCGACTAAAGG-AGGAGTTGAACAACAT------TTG-GA------A-GG----AC-AA--TGCGATGAATATTT-TGATAATTCTT-GTACA--T--C--ATGC-T-C-----AGCA--GAGG--GGAAA-AAT--G--TTGAG--GCGACTAAGTTCTGTGTGGAGTGTG---AAGAA---TATTTTTGTGTCGGATGTGTCCAGTTTAAC---C-----ATA-----GATTT---GGC-A--A--G-A-TGAA-AACA-C-ACA-------TGAT-C-TTAGGCTGTGAAG--GGAT-----GA-AG--GC--CCA-GGG---TCTAGGG-------CA---A-AC-AACT----T-----CCC---AG--CCCACTGAGAAATGC--CAG---C----TGCA-T--CATGGGAA--C---ATCCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-C-GTGC--A-G-C-ATGATG--C-AGTGTGC--TGTAGTACCT--GCGTCT---CCTTATTT--CACAAGTAGGt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAATGGCGACTGGAGG-ATGTTTTG--AACGTT---CTATTG---------ATAA----AG-GT--TGTGACGAGTTTTA-TGATTATTCTT-GTACA--C--C--GTGC-T-C-----CGCG--GAAG--GGAAG-AAC--G--TAGAG--GCCATTAACTACTGTATGGAATGTG---ATGAA---TATGTATGTGTAAAATGTTTAACATATCAT---A-----ACA-----GATTT---GTC-A--A--A-A-TGAG-ATCA-C-ATC-------AAAT-C-CTTGATCAGATGG--CAAT-----GA-AG--AC--CAG-GAG---ACCACAA-------CA---G-TC-ACCG----T-----CCA---GT--CCCACGGAGAGATGT--GAA---C----TTCA-C--CATGGAAA--C---ATTCTG---GA--C-A-CA-----TTCTG-T-GTGA--C-A-C-ACGATG--C-AGTGTGC--TGCGGTACAT--GTGTCT---CCTTGTTC--CACAAGTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATGGCGTCCATGGG-GGCGTTTG--TTAGAT---CGGTTG---------ACAA----AA-GT--TCAGAGGAATTATA-TGACTTTACGT-GTTCG--C--C--TTGT-T-C-------TA--AAGG--AGGAC-AATCTG--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAA---TATTTCTGTTCTGGTTGCGTTGAGGATCAC---A-----ATA------AGTT---CGCTG--T--G-C-TGAG-GACA-C-ATA-------AACT-T-TTGGACAAGGCTG--GAAT-----GA-GA--GC--CCG-GAA---ACCACAA-------CA---A-GT-ATTG----T-----CTC---TG--CCAACAGAACGATGT--AAG---G----ATCA-C--CATGGTAA--------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTG-C-GGTA--A-T-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TGTCCCACGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATGGCGTCCAAGGG-GGCGTTTG--TTAGAT---CGGTTG---------ACAA----AA-GT--TCAGAGGAATTATA-TGACTTTACGT-GTTCG--C--C--TTGT-T-C-----TAAA--GGAG--GACAA-ACT--G--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAA---TATTTCTGTTCTGGTTGCGTTGAGGATCAC---A-----ATA------AGTT---CGCTG--T--G-C-TGAG-GACA-C-ATA-------AACT-T-TTGGACAAGGCTG--GAAT-----GA-GG--GC--CCG-GAA---ACCACAA-------CA---A-GT-ATTG----T-----CTC---TG--CCAACAGAACGATGTA-CGG---A----T-CA-C--CATGGTAA--------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTG-C-GGTA--A-C-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TGTCCTACGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T--G--TGGAG--GCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTG---ACGAA---TATTTTTGTGTTAAATGTGTCAAATCTCAC---C-----ATA-----AATAT---GGC-A--A--G-A-TGAA-AACA-C-ACC-------AGAT-C-CTGGACAAGGCAA--AAAT-----GA-AG--ACGACTATGGG---ACAAAAA-------CA---A-GC-AGCT----A-----CCC---CA--CTTACGGAGAGATGT--GAG---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ACCCTG---GA--T-A-CG-----TTCT----GTGCCAA-A-C-ATGATG--C-AGTGTGC--TGCAGTACGT--GTGTCT---CCTTGTTT--CACAAGTAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAATGGCGACAGGG---------CG--TACAAT---C---------------CAG----AGTGCA-TCAGATGAAATATT-TGA-TTTGCATTGTTCT--A--C--ATGC-A-CGTTGAATCA--CAGG--ACTAG-A---------GAA--GCTACGAAATATTGCGAGGACTGCC---TGGAC---TTTTATTGTGACACGTGTGTCCAGGTTCAC---A-----GTG-----ACGT-----GC-C--A--G-CATTAA-AGCG-CCATA-------AGAT-AGTTGGA-AAGTCAG--CATT-------------C--CCG-------ACGAAAG-------TATTGA-GA-AATT----TAACGACCG---TG--CCGACAGATAAATGC--CCG---C----TCCA-C--C-CGACAAAGC----TCCTC---GA--T-A-TG-----TTCTGTC-G-GA--A-C-G-ACGACG--A-GATTGGA--TGT--CACGC--ATGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        catagttttactttcgttttcatttacgggaaataaaaatcaggtcattatcggttagtcatatacacaacaacagtttcacaatatttaaaccgaggccaacC---TG--CCGACGGAGAGATG---CAG--------TACA-CATCCTACTAA--A---CTGATG---GA--C-A-TG-----TACTG-T----C--A-A-A-ATAATGATCAGATAGGC--TGC--CATGT--CTGTATGA-CCGTAAAA--CACAGGTAAttaattgattttattaatataacacacctaaatgaatatataatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgactcagtgtttacgtattgaaggggtaatggcagtgatatacctgcattatccggacataagatactcggtcggtcagaattcccgacaggtatttcaaaggtattggtgccaT----T-----CCC---TG--CTTATAGAGATATGTTCCAA---------ACA-C--CCTGGCAA--C---CCCATT---GAGTC-A-TA-----TTGTG---GTGC----T-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TG-GGC-TGT--CTGTAT---CACGATTGAACACAGGTGAGatacatttatttatcagtaaatgtttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acagagtgttagAGAGATGT--ACG---A----TTCA-C--TGCCACAA--A---GTCCTA---GA--C-A-TG-----TTCTG-T-G-GA--A-CTC-ATGATG--T-CGTGTGC--TGCGGAGCAT--GTGCCG---TTCTAATT--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cCTGGGGG-AGGATTTG--TAAGGT---CCATTG---------ACAA----AG-GC--TGCGATGTGTATTA-TGACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT----AAGAC----------GG------ACAGTGAAAG-GT--TCGGACGAATCCTT-CGATTTTATGT-GTTCA--CGTT--GTGT-G-A-----A--A--AAGA--ACAGA-AAT--A--TAGAG--GCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCC---AGGAC---TTTTATTGTTCTTCGTGTGTCGAGTGTCAT---G-----ATA-----Gatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagt-------CA---A-GA-AGCTGGTGT-----CAT---TG--CCGACGGAGAGGTG---CAG--------TGCA-CATCCTACTAA--A---CTGGTG---GA--C-A-TG-----TATTG-T-CAAA--A-T-C-ATGATC--A-GATAGGC--TGT--CACGT--CTGTATGA-CTGTGAAA--CACAGGTAAcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|4                          :    agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtaatggcgacgggtggtagtttaagacggacagtgaaaggttcggacgaatccttcgattttatgtgttcacgttgtgtgaaaaagaacagaaatatagaggctacacagtactgtgtggagtgccaggacttttattgttcttcgtgtgtcgagtgtcatgatagcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatcCAG----AG-TACGTCTGATGAAACATT-TGAGTTTCTGT-GTTCG--C--C--GTGT-A----------A--AATG--AAAAA-CAG--GACTAGAGAAGCTATGCTTTATTGTGTGGACTGCG---TGGAC---TATTATTGTAGCACGTGTGTTGAGTTTCAC---GGGGACATA--------CC---GGC-A---------TTAA-AATGTC-ATA-------AGATAC-TTGGA-AAGTC-------C-----GA-CT--TT--CCG-------ACCGCGG-------CATCCA-GA-AATC----T-----AACGATTGTTCCGACGGACAGATGT--CCA---C----TCCATC--CAACAAAA--C----TGTTG---GA--T-A-TG-----TTCTG-T-CAGA--A-T-G-ACGACG--A-GATCGGA--TGT--CACGC--CTGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTAacaaattattgtaatat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caaaatggcggcatcaggaagtaacgggcgaacgatt--TCGGACGAAACTTT-TGATTTAGTGT-GTTCG--C--C--TTGT-G-T-----GAAA--AAGA--ACAGA-AAtttatcgtgactatttaattaaaggagtgtttgacaataacacaaatttagataatatagaatcg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tGT-GTTCG--C--CTTGTGT-G-------AACA--AAGA---CAAA-AAT--A--CAGAG--AACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTC---GCGAC---TATTACTGTTATACGTGTGTCGAGTTCCACAGTG-----ATA-----TACCT----GC-ATTA--G-C-C-----AGA-C-ATA-------AAAT-A-CT---C-AGTCGGTCAGATTTCCCGACAG--AC------GGA---TCAATAG-------TG---A--C-A---------------T---TG--CCGACGGAGAGATGT--Ccaaacaggtgtgttcgccttgtgtgaacaaagacaaaaatacagagaacaaaaagtattgtgtgaattgtcgcgactattactgttatacgtgtgtcgagttccacagtgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                           ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtGG-AGAATCTG--AAGGATTTTC--TTG-TACGCTAGACAG----AG-GT--TCTGAGGAAATGTT-TGACTTTGTTT-GTTCA--C--C--GTGT-GAT-----AGAA--GAGG--TAACA-AACCAG--TACAG--GCATTAAACTACTGTACAGACTGTG---ATGAACTGTAT---TGTAAAACATGCCTGGAGTTTCAgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actagat--CCCACGGAGCAATGT--CCT---C----AGCA-T--CAAGGCAA--A---GTCCTT---GA--A-A-AG-----TACTG-T-G-GC--A-A-CCATGACA--C-ATTATGC--TGT--CACGTTTGTGTAT---CCCTAAAC--CACAGGTtgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          : actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaAGATGGCTAC-------AGGATTTT--CTCGAT---CAATTG--A------TCTG-----G-GT--TCC-ACGGCTATTTATGACATTTATT-GCTCA--C--C--CTGCCG-A-----AGGA--ACGGCAGTATA-A-------CAGAA--GCCAGTAAACACTGTGTGGAGTGCG---AAGAA---AGCTTCTGCTTTAAATGTCTTCAATATCA----T-----GCA-----AAGTT----TC-A--AATG-C-TAAAGAAC--C-ACACTGTTTTAGA-----TGTACAAGATGG--AGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cAGAAATGT--CAG---C----ATCA-T--CGTGGCAA--A---ATTATT---GA--T-A-CA-----TTCTG-T-GGAA--A-C-C-ATGATG--T-AGTCTGC--TGTCCTATCT--GTATAG---CAGTCAGT--CACAGGTAAgattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcagaaatgtcagcatcatcgtggcaaaattattgatacattctgtggaaaccatgatgtagtctgctgtcctatctgtatagcagtcagtcacaggtaa
gi|8                          :        cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATT--CCAGAT---CCATTGAGA------ACGG----AG-GG-----GAGGAGTATTT-TGACTTTGCTT-G--CGGTC--C--ATGT-G--------GCAAGGACG--GCAGA-CAT--A--TTGAG--GCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTG---CGCAG---AACTTCTGTAATAAATGTCTCAAAGACCAT---A-----ACACCAGTAAGTT---CGC-A--G--GTC-TTAA-AAGT-C-ACA-------AGAT-T-CTTGATAAAGCTG--GTATTCTGGGA-AGTCGT--CTG-CAG---TTTCCCG-------C------GT-TACT----T-----TC-----G--TC-------AGATGA--CTG---CACGATACA-C--CCAGGCAA--G---CCCGTT---GA--C-A-TG-----TACTG-T-G-GT--ACG-C-ATGATG--A-CATATTC--TGCGGAGCAT--GTATTG---CAATCGAT--CACAGGTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acatAG----AG--T--TCTGAAGTCTATTA-TGACTTTTCCT-GTTCT--T--C--GTGT-G-C-----AAAA--CATA--GCAAACAAC--A---GGAG--GCAGTGAAGAGCTGTCTGGACTGTGCCCAGGA------CTTCTGTGATGTTTGTCTACAATATCAC---A-----ACA------AGTT---TGA-A--G--G-AATGAG-GAAA-C-ACA-------GGAT-T-GTGAACAAAGCTG--GGAT-----GC-AG--TC--CGA-TGT---TCTACAA-------GG---T-GCTGGTT----T-----TCC---TG--CCAGTAGGGAGATGT--TCT---A----TACA-C--CCTGAGAA-----------G---GA--A-ATCGAGCTATTTTG-CTGTGC----T-C-ATAATG--C-CGTCTGC--TGT-GC-TGT--ATGTATCA-CCATATAT--CACAGGTAAGt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAATGGCGTCAAAAAGACCGCTTGATAACGATTTTGCAAGATCCTGGTTCTTTAAGTGTTCACCTTGTTTTAGAAAAAATAGTAACAGTGTTCAAGCAGTTAAATTCTGTGAGGACTGTTTGGAGTATTTTTGTTCTGGTTGTGTTCATGATCATAACAAGTTCCACTTGCTGGAAGGACACACACTTTTGAACAATGATGAAATGAGATCCTTCCGCTCGAAGCCGTGTAAAGAACATCCTCGTCAGATGATTGATAGATACTGTGATTACCATGCTGTTGTTTTCTGCCTCGATTGTAAATCAAAGTATCACAGGTAA
Unaligned ( gi|21 ): TGTAGGAAAATAAGCAAGAAAACTGTGGAATCAGACTTTTACTGCACCGACTGCTAGCTGTTCTTCTGTGAAACATGCATGGAATTTCACAGCTTTATTCCAGCATTAGAGAATCACATAGTTTTAGGAAAAGATCAAATTCAAAGTTGGGGGAAAAGGTAAG
Unaligned ( gi|23 ): TAGCGAAATCGAAACTACCGGATCAATTTTACCAGGAATACAAACTAGGTCAACGCTGCACTATAGTATCAATATCATATGACTCAGTGTTTACGTATTGAAGGGGTAATGG
Unaligned ( gi|25 ): CAGCTTAAGGTCCGTGTTTGTATGGCCGTTAAGCACAGGTAAGTTATATCTATACATAATGTAGTATTTTTATATACTAT






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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATGGCGTCCATGGG-GGCGTTTG--TTAGAT---CGGTTG---------ACAA----AA-GT--TCAGAGGAATTATA-TGACTTTACGT-GTTCG--C--C--TTGT-T-C-------TA--AAGG--AGGAC-AATCTG--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAA---TATTTCTGTTCTGGTTGCGTTGAGGATCAC---A-----ATA------AGTT---CGCTG--T--G-C-TGAG-GACA-C-ATA-------AACT-T-TTGGACAAGGCTG--GAAT-----GA-GA--GC--CCG-GAA---ACCACAA-------CA---A-GT-ATTG----T-----CTC---TG--CCAACAGAACGATGT--AAG---G----ATCA-C--CATGGTAA--------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTG-C-GGTA--A-T-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TGTCCCACGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATGGCGTCCAAGGG-GGCGTTTG--TTAGAT---CGGTTG---------ACAA----AA-GT--TCAGAGGAATTATA-TGACTTTACGT-GTTCG--C--C--TTGT-T-C-----TAAA--GGAG--GACAA-ACT--G--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAA---TATTTCTGTTCTGGTTGCGTTGAGGATCAC---A-----ATA------AGTT---CGCTG--T--G-C-TGAG-GACA-C-ATA-------AACT-T-TTGGACAAGGCTG--GAAT-----GA-GG--GC--CCG-GAA---ACCACAA-------CA---A-GT-ATTG----T-----CTC---TG--CCAACAGAACGATGTA-CGG---A----T-CA-C--CATGGTAA--------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTG-C-GGTA--A-C-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TGTCCTACGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T--G--TGGAG--GCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTG---ACGAA---TATTTTTGTGTTAAATGTGTCAAATCTCAC---C-----ATA-----AATAT---GGC-A--A--G-A-TGAA-AACA-C-ACC-------AGAT-C-CTGGACAAGGCAA--AAAT-----GA-AG--ACGACTATGGG---ACAAAAA-------CA---A-GC-AGCT----A-----CCC---CA--CTTACGGAGAGATGT--GAG---C----TGCA-C--CATGGGAA--C---ACCCTG---GA--T-A-CG-----TTCT----GTGCCAA-A-C-ATGATG--C-AGTGTGC--TGCAGTACGT--GTGTCT---CCTTGTTT--CACAAGTAAG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAATGGCGACAGGG---------CG--TACAAT---C---------------CAG----AGTGCA-TCAGATGAAATATT-TGA-TTTGCATTGTTCT--A--C--ATGC-A-CGTTGAATCA--CAGG--ACTAG-A---------GAA--GCTACGAAATATTGCGAGGACTGCC---TGGAC---TTTTATTGTGACACGTGTGTCCAGGTTCAC---A-----GTG-----ACGT-----GC-C--A--G-CATTAA-AGCG-CCATA-------AGAT-AGTTGGA-AAGTCAG--CATT-------------C--CCG-------ACGAAAG-------TATTGA-GA-AATT----TAACGACCG---TG--CCGACAGATAAATGC--CCG---C----TCCA-C--C-CGACAAAGC----TCCTC---GA--T-A-TG-----TTCTGTC-G-GA--A-C-G-ACGACG--A-GATTGGA--TGT--CACGC--ATGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        catagttttactttcgttttcatttacgggaaataaaaatcaggtcattatcggttagtcatatacacaacaacagtttcacaatatttaaaccgaggccaacC---TG--CCGACGGAGAGATG---CAG--------TACA-CATCCTACTAA--A---CTGATG---GA--C-A-TG-----TACTG-T----C--A-A-A-ATAATGATCAGATAGGC--TGC--CATGT--CTGTATGA-CCGTAAAA--CACAGGTAAttaattgattttattaatataacacacctaaatgaatatataatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgactcagtgtttacgtattgaaggggtaatggcagtgatatacctgcattatccggacataagatactcggtcggtcagaattcccgacaggtatttcaaaggtattggtgccaT----T-----CCC---TG--CTTATAGAGATATGTTCCAA---------ACA-C--CCTGGCAA--C---CCCATT---GAGTC-A-TA-----TTGTG---GTGC----T-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TG-GGC-TGT--CTGTAT---CACGATTGAACACAGGTGAGatacatttatttatcagtaaatgtttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acagagtgttagAGAGATGT--ACG---A----TTCA-C--TGCCACAA--A---GTCCTA---GA--C-A-TG-----TTCTG-T-G-GA--A-CTC-ATGATG--T-CGTGTGC--TGCGGAGCAT--GTGCCG---TTCTAATT--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cCTGGGGG-AGGATTTG--TAAGGT---CCATTG---------ACAA----AG-GC--TGCGATGTGTATTA-TGACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT----AAGAC----------GG------ACAGTGAAAG-GT--TCGGACGAATCCTT-CGATTTTATGT-GTTCA--CGTT--GTGT-G-A-----A--A--AAGA--ACAGA-AAT--A--TAGAG--GCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCC---AGGAC---TTTTATTGTTCTTCGTGTGTCGAGTGTCAT---G-----ATA-----Gatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagt-------CA---A-GA-AGCTGGTGT-----CAT---TG--CCGACGGAGAGGTG---CAG--------TGCA-CATCCTACTAA--A---CTGGTG---GA--C-A-TG-----TATTG-T-CAAA--A-T-C-ATGATC--A-GATAGGC--TGT--CACGT--CTGTATGA-CTGTGAAA--CACAGGTAAcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|4                          :    agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtaatggcgacgggtggtagtttaagacggacagtgaaaggttcggacgaatccttcgattttatgtgttcacgttgtgtgaaaaagaacagaaatatagaggctacacagtactgtgtggagtgccaggacttttattgttcttcgtgtgtcgagtgtcatgatagcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatcCAG----AG-TACGTCTGATGAAACATT-TGAGTTTCTGT-GTTCG--C--C--GTGT-A----------A--AATG--AAAAA-CAG--GACTAGAGAAGCTATGCTTTATTGTGTGGACTGCG---TGGAC---TATTATTGTAGCACGTGTGTTGAGTTTCAC---GGGGACATA--------CC---GGC-A---------TTAA-AATGTC-ATA-------AGATAC-TTGGA-AAGTC-------C-----GA-CT--TT--CCG-------ACCGCGG-------CATCCA-GA-AATC----T-----AACGATTGTTCCGACGGACAGATGT--CCA---C----TCCATC--CAACAAAA--C----TGTTG---GA--T-A-TG-----TTCTG-T-CAGA--A-T-G-ACGACG--A-GATCGGA--TGT--CACGC--CTGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTAacaaattattgtaatat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caaaatggcggcatcaggaagtaacgggcgaacgatt--TCGGACGAAACTTT-TGATTTAGTGT-GTTCG--C--C--TTGT-G-T-----GAAA--AAGA--ACAGA-AAtttatcgtgactatttaattaaaggagtgtttgacaataacacaaatttagataatatagaatcg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tGT-GTTCG--C--CTTGTGT-G-------AACA--AAGA---CAAA-AAT--A--CAGAG--AACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTC---GCGAC---TATTACTGTTATACGTGTGTCGAGTTCCACAGTG-----ATA-----TACCT----GC-ATTA--G-C-C-----AGA-C-ATA-------AAAT-A-CT---C-AGTCGGTCAGATTTCCCGACAG--AC------GGA---TCAATAG-------TG---A--C-A---------------T---TG--CCGACGGAGAGATGT--Ccaaacaggtgtgttcgccttgtgtgaacaaagacaaaaatacagagaacaaaaagtattgtgtgaattgtcgcgactattactgttatacgtgtgtcgagttccacagtgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                           ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtGG-AGAATCTG--AAGGATTTTC--TTG-TACGCTAGACAG----AG-GT--TCTGAGGAAATGTT-TGACTTTGTTT-GTTCA--C--C--GTGT-GAT-----AGAA--GAGG--TAACA-AACCAG--TACAG--GCATTAAACTACTGTACAGACTGTG---ATGAACTGTAT---TGTAAAACATGCCTGGAGTTTCAT---G-----gtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actagat--CCCACGGAGCAATGT--CCT---C----AGCA-T--CAAGGCAA--A---GTCCTT---GA--A-A-AG-----TACTG-T-G-GC--A-A-CCATGACA--C-ATTATGC--TGT--CACGTTTGTGTAT---CCCTAAAC--CACAGGTcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          : actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaAGATGGCTAC-------AGGATTTT--CTCGAT---CAATTG--A------TCTG-----G-GT--TCC-ACGGCTATTTATGACATTTATT-GCTCA--C--C--CTGCCG-A-----AGGA--ACGGCAGTATA-A-------CAGAA--GCCAGTAAACACTGTGTGGAGTGCG---AAGAA---AGCTTCTGCTTTAAATGTCTTCAATATCAT---G------CA-----AAGTT----TC-A--AATG-C-TAAAGAAC--C-ACACTGTTTTAGA-----TGTACAAGATGG--AGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cAGAAATGT--CAG---C----ATCA-T--CGTGGCAA--A---ATTATT---GA--T-A-CA-----TTCTG-T-GGAA--A-C-C-ATGATG--T-AGTCTGC--TGTCCTATCT--GTATAG---CAGTCAGT--CACAGGTAAgattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcagaaatgtcagcatcatcgtggcaaaattattgatacattctgtggaaaccatgatgtagtctgctgtcctatctgtatagcagtcagtcacaggtaa
gi|8                          :        cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATT--CCAGAT---CCATTGAGA------ACGG----AG-GG-----GAGGAGTATTT-TGACTTTGCTT-G--CGGTC--C--ATGT-G--------GCAAGGACG--GCAGA-CAT--A--TTGAG--GCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTG---CGCAG---AACTTCTGTAATAAATGTCTCAAAGACCAT---A-----ACACCAGTAAGTT---CGC-A--G--GTC-TTAA-AAGT-C-ACA-------AGAT-T-CTTGATAAAGCTG--GTATTCTGGGA-AGTCGT--CTG-CAG---TTTCCCG-------C------GT-TACT----T-----TC-----G--TC-------AGATGA--CTG---CACGATACA-C--CCAGGCAA--G---CCCGTT---GA--C-A-TG-----TACTG-T-G-GT--ACG-C-ATGATG--A-CATATTC--TGCGGAGCAT--GTATTG---CAATCGAT--CACAGGTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acatAG----AG--T--TCTGAAGTCTATTA-TGACTTTTCCT-GTTCT--T--C--GTGT-G-C-----AAAA--CATA--GCAAACAAC--A---GGAG--GCAGTGAAGAGCTGTCTGGACTGTGCCCAGGA------CTTCTGTGATGTTTGTCTACAATATCAC---A-----ACA------AGTT---TGA-A--G--G-AATGAG-GAAA-C-ACA-------GGAT-T-GTGAACAAAGCTG--GGAT-----GC-AG--TC--CGA-TGT---TCTACAA-------GG---T-GCTGGTT----T-----TCC---TG--CCAGTAGGGAGATGT--TCT---A----TACA-C--CCTGAGAA-----------G---GA--A-ATCGAGCTATTTTG-CTGTGC----T-C-ATAATG--C-CGTCTGC--TGT-GC-TGT--ATGTATCA-CCATATAT--CACAGGTAAGt


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A     .  G    GG       CCATTGAGA             .     TACG   T  G    A   .       T   .    A   .  A     GATAGA       .     GG     .   GAC       .   A TG  C G         C    CCC    A            TC  T       C   A    AGTG        TACCTGCATTAGC                 A     . .   .          AC       A    A G     TCTGG  .  G   .    GGAC     T    TATTGAGAAATT              .       A    .   T           TACGGA         T  . AT C   C  AGC     CC  ATT  CT   .  .         CGTGCGG       .      TG     C   .    AG     .       GGC AA  TTT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T     .  G    TC       CAATTGA               .     AA     T  C    A   .       T   .    C   .  A     CGAAGG       .     GC     .   CAG       .   G CC  C T         G    .      A            GT  A       A   A    C           AAGTTTCAAATGC                 C     . .   .          C        C    G G     .      .  G   .    TGTT     T    CATCCAGAAATC              .       T    .   C           TTCCAA         G  . .  A   G  CA      CC  .    C    .  .         CGTGCGG       .      TT     A   .    GG     .       CA  AT  GAT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T     .  G    GG       CTTGGA                .     GT     T  C    A   .       T   .    A   .  G     ACAAC        .     GG     .   G         .   G CG  C T         G    .      A            GT  A       A   A    A           GAGTTGGCAAAC                  A     . .   .          A        C    G G     .      .  A   .    GGGC     C    GGTGCTGGTT                .       A    .   C           TCAGC          G  . .  A   G  CA      CC  .    C    .  .         CGTGCGG       .      CG     A   .    AG     .       GA  AT  TTT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T     .  G    GG       CTGCGT                .     AA     C  T    A   .       T   .    A   .  T     GGAAA        .     AT     .   C         .   G CT  G T         G    .      A            GT  G       C   T    C           AGATTCAGGGCA                  A     . .   .          C        T    A T     .      .  G   .    CGGC     T    CAAACAACT                 .       A    .   C           TTCCA          G  . .  A   G  CA      TC  .    C    .  .         CGTGCAG       .      CG     G   .    GG     .       GA  CT  TTT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T     .  G    GA       CTTGGA                .     AA     T  C    T   .       T   .    A   .  A     ACAGC        .     GG     .   G         .   C TT  C A         A    .      A            GT  A       A   A    C           GAGCTGGCAAAA                  A     . .   .          C        C    G G     .      .  G   .    GGGT     C    AGTGTTGGT                 .       A    .   C           CCAAC          T  . .  A   A  CA      CC  .    C    .  .         TGTGACA       .      CA     G   .    CC     .       CA  CT  TTT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C     .  C    GT       CTTGGA                .     AA     A  G    T   .       A   .    A   .  G     TCAGC        .     GG     .   G         .   A TC  C T         C    .      A            TC  G       G   A    C           GATTTGGCAAAC                  G     . .   .          C        A    T C     .      .  A   .    GAGA     C    CAAACAACT                 .       G    .   A           TCAGC          T  . .  A   T  CA      CC  .    C    .  .         CGGTAAT       .      CA     C   .    CC     .       .   TG  TTC  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C     .  C    GT       CTATTG                .     GT     A  G    T   .       A   .    G   .  T     TCAGC        .     AG     .   G         .   A TC  C T         C    .      A            TC  G       G   A    A           GATTTGGCAAGA                  G     . .   .          C        A    T G     .      .  G   .    GAAA     C    CAAACAACT                 .       T    .   A           CCAGC          G  . .  A   T  CA      CC  .    T    .  .         CGGTAAC       .      TC     C   .    AG     .       .   TG  AGT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A     .  G    GT       CGGTTG                .     GT     A  T    T   .       G   .    G   .  T     TCCGC        .     GA     .   G         .   C TT  C T         A    .      A            GT  A       A   C    A           GATTTGTCAAAA                  G     . .   .          T        A    A G     .      .  G   .    GAAA     A    CAAACAACT                 .       T    .   T           TGAAC          C  . .  A   G  AC      CC  .    T    .  .         TCGGAAC       .      TC     G   .    GG     .       .   CT  AGT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T     .  A    GT       CGGTTG                .     GT     C  T    A   .       A   .    T   .  A     TCTAA        .     AC     .   G         .   T CG  A A         C    .      C            GA  C       C   T    A           AGTTCGCTGTGC                  A     . .   .          T        A    A A     .      .  A   .    GGAT     G    CAGTCACCG                 .       C    .   G           TAAGG          A  . .  C   C  CC      GA  .    T    .  .         TGGAACT       .      CA     T   .    GG     .       .   GT  TTT  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G     .  G    GA       CCATTG                .     GC     G  C    C   .       C   .    A   .  G     GTGAA        .     AC     .   G         .   T CA  G A         G    .      C            TC  C       G   G    C           AGTTCGCTGTGC                  A     . .   .          C        A    G C     .      .  T   .    CAGT     C    CAAGTATTG                 .       T    .   G           TGAGC          A  . .  C   T  AG      CA  .    T    .  .         TCAAAAT       .      AG     A   .    CC     .       .   CG  AAA  
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): AAATGGCGTCAAAAAGACCGCTTGATAACGATTTTGCAAGATCCTGGTTCTTTAAGTGTTCACCTTGTTTTAGAAAAAATAGTAACAGTGTTCAAGCAGTTAAATTCTGTGAGGACTGTTTGGAGTATTTTTGTTCTGGTTGTGTTCATGATCATAACAAGTTCCACTTGCTGGAAGGACACACACTTTTGAACAATGATGAAATGAGATCCTTCCGCTCGAAGCCGTGTAAAGAACATCCTCGTCAGATGATTGATAGATACTGTGATTACCATGCTGTTGTTTTCTGCCTCGATTGTAAATCAAAGTATCACAGGTAA
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Unaligned ( gi|23 ): TAGCGAAATCGAAACTACCGGATCAATTTTACCAGGAATACAAACTAGGTCAACGCTGCACTATAGTATCAATATCATATGACTCAGTGTTTACGTATTGAAGGGGTAATGG
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Reference ( family-2247 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            NAAAATGGCGACCGGGGG-AGGATTTGNAAGATCTNNN---------GA---CAG----AGGN--TCNGACGAATNTTTTGACTTTNCGTGTTCG--C--C--GTGCG-CAGCA--GAGGGNAAA-AAT--G--TGGAG--GCNACGAACTNCTGTGTGGANTGTG---AGGAA---TATTTCTGTNNTANATGTGTCGAGTATCAC---GAT-A-----G-ATTTG-----GCGAG-AT---GAAAAC---A-CACAAGAT-CCTGGACAAGGCGG--GGAT-----GA-AGGC--CCG-GG--G---NCCACAG-------CA---A-GC-ANC--T----TCCC----TG--CCNACGGAGAGATGT--CAG---C----TNCA-C--CATGGNAAC---ATCCTG---GA--C-A-CG-----TTCTGC-GTGC--A-N-C-ATGATG--C-GGTNTGC--TGCGGCACGT--GTGTAT---CNNTANNT--CACAGGTAAG
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAATGGCGACTGGAGG-ATGTTTTGAACGTTCTATT---------GA---TAA----AGGT--TGTGACGAGTTTTATGATTATTCTTGTACA--C--C--GTGCT-CCGCG--GAAGGGAAG-AAC--G--TAGAG--GCCATTAACTACTGTATGGAATGTG---ATGAA---TATGTATGTGTAAAATGTTTAACATATCAT---AAC-A-----G-ATTTG-----TCAAA-AT---GAGATC---A-CATCAAAT-CCTTGATCAGATGG--CAAT-----GA-AGAC--CAG-GA--G---ACCACAA-------CA---G-TC-ACC--G----TCCA----GT--CCCACGGAGAGATGT--GAA---C----TTCA-C--CATGGAAAC---ATTCTG---GA--C-A-CA-----TTCTGT-GTGA--C-A-C-ACGATG--C-AGTGTGC--TGCGGTACAT--GTGTCT---CCTTGTTC--CACAAGTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATGGCGTCCATGGG-GGCGTTTGTTAGATCGGTT---------GA---CAA----AAGT--TCAGAGGAATTATATGACTTTACGTGTTCG--C--C--TTGTT-C--TA--AAGGAGGAC-AATCTG--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAA---TATTTCTGTTCTGGTTGCGTTGAGGATCAC---AAT-A-----A-GTTCG-----CTGTG-CT---GAGGAC---A-CATAAACT-TTTGGACAAGGCTG--GAAT-----GA-GAGC--CCG-GA--A---ACCACAA-------CA---A-GT-ATT--G----TCTC----TG--CCAACAGAACGATGT--AAG---G----ATCA-C--CATGGTAA------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTGC-GGTA--A-T-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TGTCCCACGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATGGCGTCCAAGGG-GGCGTTTGTTAGATCGGTT---------GA---CAA----AAGT--TCAGAGGAATTATATGACTTTACGTGTTCG--C--C--TTGTT-CTAAA--GGAGGACAA-ACT--G--TGGAG--GCAGTCAACTTCTGTGAAGACTGTG---TGGAA---TATTTCTGTTCTGGTTGCGTTGAGGATCAC---AAT-A-----A-GTTCG-----CTGTG-CT---GAGGAC---A-CATAAACT-TTTGGACAAGGCTG--GAAT-----GA-GGGC--CCG-GA--A---ACCACAA-------CA---A-GT-ATT--G----TCTC----TG--CCAACAGAACGATGTA-CGG---A----T-CA-C--CATGGTAA------CCTGATTGA--T-A-CA-----TACTGC-GGTA--A-C-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TGTCCTACGT--GTGTGT---CTGTGAGT--CATAGGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--G--TGGAG--GCCATTAACTTCTGTGTGGAATGTG---ACGAA---TATTTTTGTGTTAAATGTGTCAAATCTCAC---CAT-A-----A-ATATG-----GCAAG-AT---GAAAAC---A-CACCAGAT-CCTGGACAAGGCAA--AAAT-----GA-AGACGACTATGG--G---ACAAAAA-------CA---A-GC-AGC--T----ACCC----CA--CTTACGGAGAGATGT--GAG---C----TGCA-C--CATGGGAAC---ACCCTG---GA--T-A-CG-----TTCT---GTGCCAA-A-C-ATGATG--C-AGTGTGC--TGCAGTACGT--GTGTCT---CCTTGTTT--CACAAGTAAG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C----TG--CCGACGGAGAGATG---CAG--------TACA-CATCCTACTAAA---CTGATG---GA--C-A-TG-----TACTGT----C--A-A-A-ATAATGATCAGATAGGC--TGC--CATGT--CTGTATGA-CCGTAAAA--CACAGGTAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgactcagtgtttacgtattgaaggggtaatggcagtgatatacctgcattatccggacataagatactcggtcggtcagaattcccgacaggtatttcaaaggtattggtgcca--T----TCCC----TG--CTTATAGAGATATGTTCCAA---------ACA-C--CCTGGCAAC---CCCATT---GAGTC-A-TA-----TTGTG--GTGC----T-C-ATGATG--T-CGTCTGC--TG-GGC-TGT--CTGTAT---CACGATTGAACACAGGTGAGatacatttatttatcagtaaatgtttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acagagtgttagAGAGATGT--ACG---A----TTCA-C--TGCCACAAA---GTCCTA---GA--C-A-TG-----TTCTGT-G-GA--A-CTC-ATGATG--T-CGTGTGC--TGCGGAGCAT--GTGCCG---TTCTAATT--CACAGGTAgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cCTGGGGG-AGGATTTGTAAGGTCCATT---------GA---CAA----AGGC--TGCGATGTGTATTATGACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATGGCGACGGGTGGTAG--TTT--AAGA----CG---------GA---CAGTGAAAGGT--TCGGACGAATCCTTCGATTTTATGTGTTCA--CGTT--GTGTG-AA--A--AAGAACAGA-AAT--A--TAGAG--GCTACACAGTACTGTGTGGAGTGCC---AGGAC---TTTTATTGTTCTTCGTGTGTCGAGTGTCAT---GAT-A-----GCATTatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagt-------CA---A-GA-AGC--TGGTGTCAT----TG--CCGACGGAGAGGTG---CAG--------TGCA-CATCCTACTAAA---CTGGTG---GA--C-A-TG-----TATTGT-CAAA--A-T-C-ATGATC--A-GATAGGC--TGT--CACGT--CTGTATGA-CTGTGAAA--CACAGGTAAcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatccaagaagctggtgtcattgccgacggagaggtgcagtgcacatcctactaaactggtggacatgtattgtcaaaatcatgatcagataggctgtcacgtctgtatgactgtgaaacacaggtaaacaaattattgtaatat
gi|4                          : agaaaccgaaaccacccgattatatttacggagaatgcaaaactaggtcatcgctgtgttcgtgtagtaagttacgtgctacacaactgcactcgcattgaggaagtaatggcgacgggtggtagtttaagacggacagtgaaaggttcggacgaatccttcgattttatgtgttcacgttgtgtgaaaaagaacagaaatatagaggctacacagtactgtgtggagtgccaggacttttattgttcttcgtgtgtcgagtgtcatgatagcattcctgcattatccggacataaactactcggtcagtcagaatttccgacggatggatc---CAG----AGTACGTCTGATGAAACATTTGAGTTTCTGTGTTCG--C--C--GTGTA-----A--AATGAAAAA-CAG--GACTAGAGAAGCTATGCTTTATTGTGTGGACTGCG---TGGAC---TATTATTGTAGCACGTGTGTTGAGTTTCAC---GG--G-----G-ACATA-----CCGGC-AT---TAAAAT---GTCATAAGATACTTGGA-AAGTC-------C-----GA-CTTT--CCG---------ACCGCGG-------CATCCA-GA-AAT--C----TAACGAT-TGTTCCGACGGACAGATGT--CCA---C----TCCATC--CAACAAAAC----TGTTG---GA--T-A-TG-----TTCTGT-CAGA--A-T-G-ACGACG--A-GATCGGA--TGT--CACGC--CTGTATGGCCGTTAAA---CACAGGTAacaaattattgtaatat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caaaatggcggcatcaggaagtaacgggcgaacgatt--TCGGACGAAACTTTTGATTTAGTGTGTTCG--C--C--TTGTG-TGAAA--AAGAACAGA-AAtttatcgtgactatttaattaaaggagtgtttgacaataacacaaatttagataatatagaatcg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tGTGTTCG--C--CTTGTGTG--AACA--AAGA-CAAA-AAT--A--CAGAG--AACAAAAAGTATTGTGTGAATTGTC---GCGAC---TATTACTGTTATACGTGTGTCGAGTTCCACAGTGAT-A-----T-ACCTGCATTAGCCAG---------------A-CATAAAAT-ACT---C-AGTCGGTCAGATTTCCCGACAGAC------GG--A---TCAATAG-------TG---A--C-AT----------------TG--CCGACGGAGAGATGT--Ccaaacaggtgtgttcgccttgtgtgaacaaagacaaaaatacagagaacaaaaagtattgtgtgaattgtcgcgactattactgttatacgtgtgtcgagttccacagtgatatacctgcattagccagacataaaatactcagtcggtcagatttcccgacagacggatcaatagtgacattgccgacggagagatgtcgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                             ttcggacgaaacttttgatttagtgtgttcgccttgtgtgaaaaagaacagaaacaaacaggtGG-AGAATCTGAAGGATTTTCTTGTACGCTAGA---CAG----AGGT--TCTGAGGAAATGTTTGACTTTGTTTGTTCA--C--C--GTGTGATAGAA--GAGGTAACA-AACCAG--TACAG--GCATTAAACTACTGTACAGACTGTG---ATGAACTGTAT---TGTAAAACATGCCTGGAGTTTCAT---GCA-A-----G-CTTTC-----CCG-G-ACTCAGAGACC---A-TAC-AGTT-ATTGGACA--------GGAT-----AA-AGgtaaacatcctactatgccagtgctcatgtactgccaaaaccacgaccagaccagctgtcctgtttgtatggctgttaaacacaggtaaattaatatgatgtctaacttttatatatcatacggtattaaattgatattgattgtaacatatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actagat--CCCACGGAGCAATGT--CCT---C----AGCA-T--CAAGGCAAA---GTCCTT---GA--A-A-AG-----TACTGT-G-GC--A-A-CCATGACA--C-ATTATGC--TGT--CACGTTTGTGTAT---CCCTAAAC--CACAGGTtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacacccacggagcaatgtcctcagcatcaaggcaaagtccttgaaaagtactgtggcaaccatgacacattatgctgtcacgtttgtgtatccctaaaccacaggt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actagatggagaatctgaaggattttcttgtacgctagacagaggttctgaggaaatgtttgactttgtttgttcaccgtgtgatagaagaggtaacaaaccagtacaggcattaaactactgtacagactgtgatgaactgtattgtaaaacatgcctggagtttcatgcaagctttcccggactcagagaccatacagttattggacaggataaagtggatagttggggcagaaagaaggctacacattcatctctgagtataaagaagaaccaatctacaAGAAATGT--CAG---C----ATCA-T--CGTGGCAAA---ATTATT---GA--T-A-CA-----TTCTGT-GGAA--A-C-C-ATGATG--T-AGTCTGC--TGTCCTATCT--GTATAG---CAGTCAGT--CACAGGTAA
gi|8                          :          cagatggctacaggattttctcgatcaattgatctgggttccacggctatttatgacatttattgctcaccctgccgaaggaacggcagtataacagaagccagtaaacactgtgtggagtgcgaagaaagcttctgctttaaatgtcttcaatatcatgcaaagtttcaaatgctaaagaaccacactgttttagatgtacaagatggagagattgaccattcctctgcatcgcctaagaacacatctacatgtagaagtttttgttcagcaactcAATGGCTACCGGGGG-CAAATATTCCAGATCCATT---------GAGAACGG----AGGG-----GAGGAGTATTTTGACTTTGCTTG--CGGTC--C--ATGTG---GCAAGGACGGCAGA-CAT--A--TTGAG--GCAGTGAAAGGGTGTGTAGAATGTG---CGCAG---AACTTCTGTAATAAATGTCTCAAAGACCAT---AAC-ACCAGTA-AGTTC-----GCAGGTCT---TAAAAG---T-CACAAGAT-TCTTGATAAAGCTG--GTAT-----------T--CTG-GGAAG---TC----G-------TC---T-GC-AGT--T----TCCCGCGTTA--CTTTCGT-CAGATGA--CTG---CACGATACA-C--CCAGGCAAG---CCCGTT---GA--C-A-TG-----TACTGT-G-GT--ACG-C-ATGATG--A-CATATTC--TGCGGAGCAT--GTATTG---CAATCGAT--CACAGGTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         acatAAAATGGCAACAAACTC-AAGTTTTATGCGCTCTGCA---------GA---TAA----GAGT--TCTGAAGTCTATTATGACTTTTCCTGTTCT--T--C--GTGTG-CAAAA--CATAGCAAACAAC--A---GGAG--GCAGTGAAGAGCTGTCTGGACTGTGCCCAGGA------CTTCTGTGATGTTTGTCTACAATATCAC---AAC-A-----A-GTTTG-----AAGGA-AT---GAGGAA---A-CACAGGAT-TGTGAACAAAGCTG--GGAT-----GC-AGTC--CGA-TG--T---TCTACAA-------GG---T-GCTGGT--T----TTCC----TG--CCAGTAGGGAGATGT--TCT---A----TACA-C--CCTGAGAA---------G---GA--A-ATCGAGCTATTTTGCTGTGC----T-C-ATAATG--C-CGTCTGC--TGT-GC-TGT--ATGTATCA-CCATATAT--CACAGGTAAGt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): CATAGTTTTACTTTCGTTTTCATTTACGGGAAATAAAAATCAGGTCATTATCGGTTAGTCATATACACAACAACAGTTTCACAATATTTAAACCGAGGCCAACAAAATGGCGACAGGGCGTACAATCCAGAGTGCATCAGATGAAATATTTGATTTGCATTGTTCTACATGCACGTTGAATCACAGGACTAGAGAAGCTACGAAATATTGCGAGGACTGCCTGGACTTTTATTGTGACACGTGTGTCCAGGTTCACAGTGACGTGCCAGCATTAAAGCGCCATAAGATAGTTGGAAAGTCAGCATTCCCGACGAAAGTATTGAGAAATTTAACGACCGTGCCGACAGATAAATGCCCGCTCCACCCGACAAAGCTCCTCGATATGTTCTGTCGGAACGACGACGAGATTGGATGTCACGCATGTATGGCCGTTAAACACAGGTATTAATTGATTTTATTAATATAACACACCTAAATGAATATATAATT
Unaligned ( gi|18 ): AAATGGCGTCAAAAAGACCGCTTGATAACGATTTTGCAAGATCCTGGTTCTTTAAGTGTTCACCTTGTTTTAGAAAAAATAGTAACAGTGTTCAAGCAGTTAAATTCTGTGAGGACTGTTTGGAGTATTTTTGTTCTGGTTGTGTTCATGATCATAACAAGTTCCACTTGCTGGAAGGACACACACTTTTGAACAATGATGAAATGAGATCCTTCCGCTCGAAGCCGTGTAAAGAACATCCTCGTCAGATGATTGATAGATACTGTGATTACCATGCTGTTGTTTTCTGCCTCGATTGTAAATCAAAGTATCACAGGTAA
Unaligned ( gi|21 ): TGTAGGAAAATAAGCAAGAAAACTGTGGAATCAGACTTTTACTGCACCGACTGCTAGCTGTTCTTCTGTGAAACATGCATGGAATTTCACAGCTTTATTCCAGCATTAGAGAATCACATAGTTTTAGGAAAAGATCAAATTCAAAGTTGGGGGAAAAGGTAAG
Unaligned ( gi|23 ): TAGCGAAATCGAAACTACCGGATCAATTTTACCAGGAATACAAACTAGGTCAACGCTGCACTATAGTATCAATATCATATGACTCAGTGTTTACGTATTGAAGGGGTAATGG
Unaligned ( gi|25 ): CAGCTTAAGGTCCGTGTTTGTATGGCCGTTAAGCACAGGTAAGTTATATCTATACATAATGTAGTATTTTTATATACTAT