lowQualScore : 1 44 1
lowQualScore : 6 4 5 11 33 2 5
lowQualScore : . . . .. .. . .
lowQualScore : 0 9 0 00 77 7 1
consensus : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
Reference ( gi|1 ) : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGCAAATTAATAGAAATTAATATTTGACATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTT--TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCTACTC
gi|3 : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|2 : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattagtagaaattaatatctaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaaccagatcgactcc
gi|7 : AAACAGACGTTTCTTTTTTCACTATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatatagatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|5 : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatatttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaactttgtgaaattaaaaatcagatcgattc
gi|6 : AAAAAGACATTACTTTTTTCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatgtttaaaatagccaaaattcctgttaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcaggtcgactcc
gi|9 : AAACAGACATTTCTTTTTTCTCCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatttttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcaaatcgactt
gi|11 : AAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatggccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcagatcgactt
gi|4 : AATCAGACATATCTTTTATCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacatagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaattaaaaatcaggtcgactc
gi|10 : AAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagtactacatgtttattttctaatactatatacatgtattataataacaaattttgtgaaattaaaattcagaacgactcc
gi|17 : AAACAGACATTTCTTTTTTCCCCATATCTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttagaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaataaaaaatcaggtcgactc
gi|8 : aAACAGACATTTCTTTTTCCACCATATCTAAG
gi|12 : AACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattaatagaaattaatatttgaaatagcccaaatttctattaatgaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgtttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|13 : AACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatataaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaagtttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgact
gi|14 : CAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTTAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaaaaaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttcttatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaattaaaaatcagatcaact
gi|15 : TTCTTTTTTCACCATATCTAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaagtgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatgtacatgcagtataatatcaaattaaaaatcaggttgactc
gi|8 : ATTATGTCAATTAATAGAAATTAATATTTGAAATAGCCCAAATTTCTATTAATGAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaataaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatatctattaattaaatgtactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaatcaaaaaatcaggttga
gi|3 : aacagacatttctttttccaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAGTAGAAATTAATATCTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAACCAGATCGACTC
gi|2 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATATAGATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCc
gi|7 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATATTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAACTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGATTC
gi|12 : aaacagacgtttcttttttcactatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATATAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAGTTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACT
gi|5 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATGTTTAAAATAGCCAAAATTCCTGTTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTC
gi|9 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATGGCC-AAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAGATCGACTc
gi|11 : aaacagacatttcttttttctccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACATAGCACTATATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCt
gi|13 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAAAAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TTATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTG-AATT-AAAAATCAGATCAACT
gi|4 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGTACTACATGTTTATTTTC-TAATACTATATAC--ATGTATTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAATTCAGAACGACTC
gi|10 : aatcagacatatcttttatcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAGAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTATATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATA-AAAAATCAGGTCGACTCc
gi|15 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATAAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATATCTATTAATTAAATGTACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATCAAAAAATCAGGT
gi|14 : ttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTC-TAATACTATGTAC--ATGCAGTATAATATC----------AAATT-AAAAATCAGGTTGACTCtga
gi|6 : cagacatttcttttttcaccatatcttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATTTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAAATCGACT
gi|16 : aaaaagacattacttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACCACATGTTTGTTTTC-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATA-AAAAATCAGATCGACTCt
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 33 2
lowQualScore : .............................................................................................................................................. . .. .
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 44 5
consensus : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
Reference ( family-2240 ) : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
gi|1 : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGCAAATTAATAGAAATTAATATTTGACATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTT-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCTACTC
gi|10 : AAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAG
gi|10 : ATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAGAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTATATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATA-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttagaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaataaaaaatcaggtcgactc
gi|11 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAG
gi|11 : ATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACATAGCACTATATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacatagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaattaaaaatcaggtcgactc
gi|12 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|12 : ATTATATAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAGTTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatataaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaagtttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgact
gi|13 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|13 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAAAAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTTATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTG-AATT-AAAAATCAGATCAACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaaaaaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttcttatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaattaaaaatcagatcaact
gi|14 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTTAG
gi|14 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATGTAC--ATGCAGTATAATATC----------AAATT-AAAAATCAGGTTGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaagtgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatgtacatgcagtataatatcaaattaaaaatcaggttgactc
gi|15 : cagacatttcttttttcaccatatcttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|15 : ATTATGTAAATAAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATATCTATTAATTAAATGTACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATCAAAAAATCAGGTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaataaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatatctattaattaaatgtactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaatcaaaaaatcaggttga
gi|16 : ttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACCACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATA-AAAAATCAGATCGACTC
gi|17 : AAACAGACATTTCTTTTTTCCCCATATCTAA
gi|2 : aAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|2 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATATAGATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatatagatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|3 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|3 : ATTATGTAAATTAGTAGAAATTAATATCTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAACCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattagtagaaattaatatctaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaaccagatcgactcc
gi|4 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAATCAGACATATCTTTTATCACCATATCTAAGc
gi|4 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGTACTACATGTTTA-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTATTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAATTCAGAACGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagtactacatgtttattttctaatactatatacatgtattataataacaaattttgtgaaattaaaattcagaacgactcc
gi|5 : aatcagacatatcttttatcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGc
gi|5 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATGTTTAAAATAGCCAAAATTCCTGTTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatgtttaaaatagccaaaattcctgttaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcaggtcgactcc
gi|6 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAGACATTACTTTTTTCACCATATCTAAGc
gi|6 : TATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATTTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAAATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatttttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcaaatcgactt
gi|7 : aaaaagacattacttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagAAACAGACGTTTCTTTTTTCACTATATCTAAGt
gi|7 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATATTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAACTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGATTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatatttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaactttgtgaaattaaaaatcagatcgattc
gi|8 : aaacagacgtttcttttttcactatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTCCACCATATCTAAG
gi|8 : ATTATGTCAATTAATAGAAATTAATATTTGAAATAGCCCAAATTTCTATTAATGAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattaatagaaattaatatttgaaatagcccaaatttctattaatgaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgtttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|9 : aacagacatttctttttccaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCTCCATATCTAAG
gi|9 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATGGCC-AAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAGATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatggccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcagatcgactt
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 33 2
lowQualScore : .............................................................................................................................................. . .. .
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 44 5
consensus : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
Reference ( family-2240 ) : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
gi|1 : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGCAAATTAATAGAAATTAATATTTGACATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTT-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCTACTC
gi|10 : AAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAG
gi|10 : ATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAGAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTATATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATA-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttagaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaataaaaaatcaggtcgactc
gi|11 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAG
gi|11 : ATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACATAGCACTATATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacatagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaattaaaaatcaggtcgactc
gi|12 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|12 : ATTATATAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAGTTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatataaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaagtttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgact
gi|13 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|13 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAAAAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTTATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTG-AATT-AAAAATCAGATCAACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaaaaaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttcttatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaattaaaaatcagatcaact
gi|14 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTTAG
gi|14 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATGTAC--ATGCAGTATAATATC----------AAATT-AAAAATCAGGTTGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaagtgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatgtacatgcagtataatatcaaattaaaaatcaggttgactc
gi|15 : cagacatttcttttttcaccatatcttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|15 : ATTATGTAAATAAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATATCTATTAATTAAATGTACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATCAAAAAATCAGGTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaataaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatatctattaattaaatgtactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaatcaaaaaatcaggttga
gi|16 : ttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACCACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATA-AAAAATCAGATCGACTC
gi|17 : AAACAGACATTTCTTTTTTCCCCATATCTAA
gi|2 : aAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|2 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATATAGATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatatagatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|3 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|3 : ATTATGTAAATTAGTAGAAATTAATATCTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAACCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattagtagaaattaatatctaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaaccagatcgactcc
gi|4 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAATCAGACATATCTTTTATCACCATATCTAAGc
gi|4 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGTACTACATGTTTA-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTATTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAATTCAGAACGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagtactacatgtttattttctaatactatatacatgtattataataacaaattttgtgaaattaaaattcagaacgactcc
gi|5 : aatcagacatatcttttatcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGc
gi|5 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATGTTTAAAATAGCCAAAATTCCTGTTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatgtttaaaatagccaaaattcctgttaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcaggtcgactcc
gi|6 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAGACATTACTTTTTTCACCATATCTAAGc
gi|6 : TATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATTTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAAATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatttttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcaaatcgactt
gi|7 : aaaaagacattacttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagAAACAGACGTTTCTTTTTTCACTATATCTAAGt
gi|7 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATATTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAACTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGATTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatatttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaactttgtgaaattaaaaatcagatcgattc
gi|8 : aaacagacgtttcttttttcactatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTCCACCATATCTAAG
gi|8 : ATTATGTCAATTAATAGAAATTAATATTTGAAATAGCCCAAATTTCTATTAATGAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattaatagaaattaatatttgaaatagcccaaatttctattaatgaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgtttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|9 : aacagacatttctttttccaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCTCCATATCTAAG
gi|9 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATGGCC-AAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAGATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatggccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcagatcgactt
blockSeqs : T AG A
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
finalCons : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 33 2
lowQualScore : .............................................................................................................................................. . .. .
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 44 5
consensus : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
Reference ( family-2240 ) : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTC
gi|1 : AAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATGCAAATTAATAGAAATTAATATTTGACATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTT-TAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCTACTC
gi|10 : AAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAG
gi|10 : ATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAGAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTATATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATA-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttagaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaataaaaaatcaggtcgactc
gi|11 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTT-TCACCATATCTAAG
gi|11 : ATTTTGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACATAGCACTATATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGCAGTATAATATCAATTTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacatagcactatatgtttgttttctaatactatatacatgcagtataatatcaatttttgtgaaattaaaaatcaggtcgactc
gi|12 : aaacagacatttctttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|12 : ATTATATAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAGTTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatataaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaagtttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgact
gi|13 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|13 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAAAAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTTATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTG-AATT-AAAAATCAGATCAACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaaaaaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttcttatactatatacatgtagtataataacaaattttgtgaattaaaaatcagatcaact
gi|14 : aacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTTAG
gi|14 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATGTAC--ATGCAGTATAATATC----------AAATT-AAAAATCAGGTTGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaagtgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatgtacatgcagtataatatcaaattaaaaatcaggttgactc
gi|15 : cagacatttcttttttcaccatatcttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|15 : ATTATGTAAATAAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATATCTATTAATTAAATGTACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATCAAAAAATCAGGTTGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaataaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatatctattaattaaatgtactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaatcaaaaaatcaggttga
gi|16 : ttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACCACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATA-AAAAATCAGATCGACTC
gi|17 : AAACAGACATTTCTTTTTTCCCCATATCTAA
gi|2 : aAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|2 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATATAGATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatatagatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|3 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAG
gi|3 : ATTATGTAAATTAGTAGAAATTAATATCTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAACCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattagtagaaattaatatctaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaaccagatcgactcc
gi|4 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAATCAGACATATCTTTTATCACCATATCTAAGc
gi|4 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGTACTACATGTTTA-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTATTATAATAACAAATTTTGTGAAATT-AAAATTCAGAACGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagtactacatgtttattttctaatactatatacatgtattataataacaaattttgtgaaattaaaattcagaacgactcc
gi|5 : aatcagacatatcttttatcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCACCATATCTAAGc
gi|5 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATGTTTAAAATAGCCAAAATTCCTGTTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGGTCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatgtttaaaatagccaaaattcctgttaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcaggtcgactcc
gi|6 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAAAGACATTACTTTTTTCACCATATCTAAGc
gi|6 : TATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATTTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAAATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatttttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcaaatcgactt
gi|7 : aaaaagacattacttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagAAACAGACGTTTCTTTTTTCACTATATCTAAGt
gi|7 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATAGCCCAAATTTCTATTAATAAAATGCACTTTTGTAACACAGCACTACATATTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAACTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGATTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatagcccaaatttctattaataaaatgcacttttgtaacacagcactacatatttgttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaactttgtgaaattaaaaatcagatcgattc
gi|8 : aaacagacgtttcttttttcactatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAGACATTTCTTTTTCCACCATATCTAAG
gi|8 : ATTATGTCAATTAATAGAAATTAATATTTGAAATAGCCCAAATTTCTATTAATGAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTGTTTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATATCAAATTTTGTGAAATT-AAAAATCAGATCGACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattaatagaaattaatatttgaaatagcccaaatttctattaatgaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgtttttctaatactatatacatgtagtataatatcaaattttgtgaaattaaaaatcagatcgactc
gi|9 : aacagacatttctttttccaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAACAGACATTTCTTTTTTCTCCATATCTAAG
gi|9 : ATTATGTAAATTAATAGAAATTAATATTTAAAATGGCC-AAATTTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAACACAGCACTACATGTTTG-TTTTCTAATACTATATAC--ATGTAGTATAATAACAAATTTTGTAAAATT-AAAAATCAGATCGACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattaatagaaattaatatttaaaatggccaaatttctattaataaaatgcactcttgtaacacagcactacatgtttgttttctaatactatatacatgtagtataataacaaattttgtaaaattaaaaatcagatcgactt