lowQualScore : 333 111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 111 222222222 111 222222222 222222222 11 2222 1111111 1 222 111 1 4444444444444 1111
lowQualScore : 66666 2 111 2 5555 5 33 2 111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 2 4 7 2 3 888 66 2 2 2 33 999999999 2 000 33 9999999 2 333333333 888888 0 3 55 666 77 5 555555555 66 66 1111 8888888 0 0 5 7 444 55555 111 0 3 0 4444 6 2 7 2 0 3 2222222222222 9999 6
lowQualScore : ..... . ... . .... . .. . ... .............................................................................. .. . . . . . ... .. . . . .. ......... . ... .. ....... . ......... ...... . . .. ... .. . ......... .. .. .... ....... . . . . ... ..... ... . . . .... . . . . . . ............. .... .
lowQualScore : 77777 8 333 7 7777 3 99 9 444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 99 5 8 6 2 2 000 11 2 5 4 99 000000000 9 444 99 3333333 9 333333333 222222 9 1 55 999 99 7 000000000 99 99 2222 6666666 7 8 0 5 777 99999 777 7 4 5 1111 7 4 1 5 8 3 9999999999999 6666 0
consensus : CAGCTGGGATTCGA-----ATCCAAAACTAATTAC-TTT-GTATG----TT-AATCACTCTACCT--T-TGTAACACTATCTTTTTAAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCACAAA--A-CCCTGATGCCTCATAAAAC-TTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAG-CC-CAANAAAAA-------TTTC-TN--TA--AT-------A-CTGG-------TAA------GCA-AT--AAAAAAATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT--TA--TA----TATATGTAT-------TAATTATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGT-AAATTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAANTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTAATAC-----------ATATA----TAGTATAATATCAAAT
Reference ( gi|4 ) : CAGCTGGGATTTGA-----ATCCAAAACTAATTTG-TTT-GTATG----TT-AATCACTCTACCT--T-TGTAACATTTTCTTTTTAAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--A-CTCTGATGCCTCACAAAAC-TTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAG-CT-CAAAAAAAA-------AATC-TC--TA--AT-------A-CT-G-------TAA------GTA-AT--AAAAAAATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACACCATT--AAA-AAA---------CATAT--TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGT-AA-TTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTAATA------------ATATA----TAGTGTAATATCAAAT
gi|2 : CAGCTGGGATTTTA-----ATACAAAATTAATTAC-TTT-GTATG----TT-AATCACTCTACCT--T-TGTAACACTTTCTTTTTAATTAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTAATGGCTCATAAAAC-TTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAG-CT-CAACAAAAA-------ATTA-TC--TA--AT-------A-CT-A-------TAA------GCA-AT--AAAAAAATATGTTGTACATGCAGCAACAATTATC-TT--AAAGAAA---------CATAT--TATTTA----TATGTGTGT-------TAATCATAGAGATAATTATTGGAGAATAATTTCATTAAAAAACAAATGTTTCACCATATTGAAG
gi|9 : CAGCTGGGATTTGA-----ATCCAAAACTAATTAC-TTT-GTATG----TT-AATCACTCTACCTATC-TATAACACTATCTTTTTAAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTGATGCTTCATAAAA--TTATAATATTAAAAGTAATAT--TGAAAATGTGAGCAG-CT-CAACAAAAA-------GTTC-TC--TA--AT-------A-CA-G-------TAA------GCA-AT--TAAAAAATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAAA--------CATAT--TA--TATATATATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGTATAATTTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaattaaaagttaaaattatttaaataagtcacattttctattcataaaatacactcttgttacacacactcacaacagtacatgttttctattaatatatattataatatca
gi|6 : CAGCTGGGATTCGA-----ATCCAAAACTAATTAC-TTT-GTATG----TT-AATCACTCAACCT--T-TGTAACACTAACTTTTTAAAGAGAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG--A-CCCTTATGACTCATAAAAC-TTAAAATATTAAAAATAAAAT--TGAAAATGTGAGCAG-CT-CAACAAAAA-------TTTC-TG--TA--AT-------A-CT-GA------TAA------CTA-----AAAGCAATAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNN--NN--NN----NNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTTTTTCGCCATATTGAA
gi|20 : tCAGCTCGGATTCGA-----ACCCAAAACTGATTAC-CTT-GTATG----TTAAATCGTTCTACCT--T-TGTAACAGCAGCTTTTTAAAGAGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACAAATGA-CCTTGATGCCTCAT-AAAC-TTAAATTATTAAAAGGAA-ATTGTGAAAATGTGAGCAG-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattgaaagtaaatagtagttaaactagtcccatttctat
gi|33 : CAGCAGGGATTTGA-----ATCCAACACT--------TT-GTATG----TT-AATCACTCTACTT--T-TGTATCAT
gi|36 : tataaaacatagcttCAGCATAGATTCAA-----ATCCAATACC--------TT-GTATG----TT-AATCGCACTACCT--T-TATTACaaaagctgactcttcgttgtaaa
gi|1 : caaaatatgtacagcctAGCTGCGATCTGA-----ATCCAAAACTAATTAC-TTT-GTATA----TT-AATCACTCTACCT--T-TGTA------TCTTTTTAAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCA-AAA--A-CCCTGATGCCTCATGAAAC-TTAAAATATTAAA----------------TGTTAGCAG-CT-CAACAAAAA-------TTTC-TG--TA--AC-------A-CT-GGTAACTGCAA------GCA-AT--AAAAAAATATGTTGTCCATGCAGCAACATACATTATT--AAA-AAA---------CAAATTATA--TA----TATATGTAT-------TATTTATAGAGATATTTAAAAGAGAATAATTCCATTAAAAAACAAC--TTTCACCATATTGAAGcatataaactagaccttt
gi|5 : aaaaaatatagcttaAGCTGAGATTTGA-----ATCCAAAACTAATTAC-TTT-GTATG----TT-TATCACTCTACCT--T-TGTCTCACTATCTTTTTAATGATAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAG-A-CCCTGATGCCTCATAAAAA-TTAAAATATTAAAAGT----------------GAGCAG-CT-CAACAAAAATTACTGTAA-C-AC--TG--GT-------AACT-G-------CAA------GCA-AT--AAAAAA-TATGTTGTCCATGCAGCAACAAACTTTTTTTAAAA-AAA---------CATAT--TA--TATATATATATGTAT-------TAATTAAAGAGATATTAAATAGAGAATTATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTAAAGccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttaaattaaaagttaaaagtatttaaactagtcccattttccgtttatagaaaacactcttgtaacacacactcatagcagcacatgttttttaataatgtatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|3 : taAGCTGGGATTTGA-----ATCCAAAACTAATTAT-TTC-GTATA----TT-AATCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcagttaaaagttaaaagtatttaatttttctatatatgaaatacactcttctgacacattctcacagcagtacttgtt
gi|15 : agattatatcatacatgtactatatattattagaaaacatgtgctgctgtgagtgtattttataaaaagaaaatgggactagtttaaatacttttaatttacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcaatatggtgaaaaagtttttttaatgaaattattctctattaaatatatctataattaatacatatacatatatataaaaatttgtttttttaataatgtttgttgctacatggataacatatttttttattgcttgcagttaccagtgttacagaaatttttgttgaactgctaacattttcaatcttacttttaatattttaagttttatgacacatcagggtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcactttcaaaaaatatagcataAGCTGGTATTTGA-----ATCCAAAATTAATA-A-TTT-GTATG----T--AATCACTCTACCT--T-TGTAACACTATA-TTTTAAAGAG---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG--A-CTC--A----TCA---AAC-TTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TAAAAATGTGAGCAG-CT-C-AACAAAA-------ATTCGTC--TA--AT-------A-CT-G-------TAA------G-A-AT---AAAACATATGTTGTCCATGCAGCGACACACATCATT--AAA-AAA---------CATCT--TT--TA----TTTATaat
gi|34 : taAGCTGGGATATGA-----ATCCAAAATTAATTAC-ATT-GTATG----TT-AATCACTCTACCT--T-TGTAACACTTTCTTTTCAAAGGGAAC-
gi|37 : AGCTGGGATTTGA-----ATCCAAATCT-ATTTACTTT-GTATA----TT-AATCACTCTACCT--T-TATAACACTATCTTTTGAAAAAattgtaaactgca
gi|21 : GCTGGGATTCGA-----ACCCAAAACTGATTAC-CTT-GTATG----TTAAATCGCTCTACTT--T-TGTTACAGCAGCTTTTTAAAGAGAAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--A-CCTTGATGCCTC---AAAC-TTAAATTATTAAAAGGAA-ATTGTGAAAATGTGAGTAG-
gi|39 : gGATTCGA-----ATAAAAAACTAATCAC-TTT-GTATGTTAATT-AATCACTCAACCT--T-
gi|3 : cttcagcctATTTGATTAATATACGAAA-TAATTAG-TTTTGGATT----CA-AATC---CCAGCT--TATGCTATATTTT---TTGAAAGTGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AACCCTGATGTGTCATAAAAC-TTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTTAGCAG-TT-CAACAAAAA-------TTTC-TG--TA--ACACTGGTAA-CT-G-------CAA------GCA-AT--AAAAAAATATGTTATCCATGTAGCAACAAACATTATT--AAA-AAAACAAATTTTTATATA-TA--TG----TATATGTAT-------TAATTATAGATATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAA--AACTTTTTCACCATATTGAAG
gi|29 : agattatatcatacatgtactatatattattagaaaacatgtgctgctgtgagtgtattttataaaaagaaaatgggactagtttaaatacttttaatttacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAG--A-CTCTGATGCCCCATAAAAT-TTAAAATATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATGAGCAG-TT-
gi|24 : AAA--A-CCCTGATGCCCCATAAAAC-TTTAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAG-CC-C---AAAAA-------TGTT-TCTGTA--AC-------A-CTGG-------TAA------ATA-ttgcttaaatttcttaaacaaaatattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaa
gi|23 : AAA--A-CCCAGATGCCCAATAAAAC-TTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAG-CC-GAAATAAAA-------TTTC-TG--TA--AT-------A-CTGG-------TAAATACATGCA-AT--AAAAACATcatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|25 : AAA--A-CCCTGATGCCCCATAAAAAGTTTAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGACCAG-CC-C---AAAAA-------TGTT-TCTGTA--AC-------A-CTGG-------TAA------ATACATGCAAAAAAtgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcaatgttgcAA--A-CCTTGATGCCCCATAAAAC-TTAAAATA-TAAAAGTTGAAT--TCAAAATTTGAGCAA-TC-CAAATAAAA-------TTTC-TG--TA--AT-------A-CTGG-------TAA------AT--AT--AAAAAA
gi|26 : AA--A-CACTAATGCTTCACAAAAC-TTAAA----------TA---T--TGAAAATGTGACCAG-CC-GAAATAAAA-------TTTC-TG--TA--AT-------A-CTGG-------TAA------ATA-cattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|28 : --A-CCCTGATGCCTCATTAAAC-TTAAAATATTAAAA-----AT--TCAAAATGTGAGAAG-CC-CAAATAAAA-------TGTC-TG--TA--AT-------A-CTGG-------TAA------ATA-caagcaataacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntta
gi|8 : gCTGATGCCACATAAAAT-TTAAAGTATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATTAGCAGTCTGCAAAcaagcaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|35 : cAAAAC-TTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAA-CC---AAAATAA-------AATT-TC--TGTTAT-------A-CTGG-------TAA------ATtttcttaaacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattatgtaaataatataaatcgatataaattaatatttgaaatagccaaattttctatttataaaaaacacccttgtaacacacactcacagcactacatgttttctaatataacatgtatatagtataatatctaattttgtgaaattaaaaaccaggttgact
gi|7 : tA---------TATATA-TA--TA----TATATGTATATAAAAATAATTATAGAGGTATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGgcatgcagttaaaacat
gi|19 : CAACTTTTTCACCATATTGTAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatgtaaattaaaagataaaagaatttaaactagtcccattttctatttataaaatacactcttctaacacacactcgcagcagtacatgttttcttataatatatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|16 : AACTTTTTCACCATATTGAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatgtaaattaaaagttaaaagtatttaaactagttccattttctatttatcaatacactcttgtaac
gi|2 : tgatattatactatattattagaaaacatgtactgttgtgagtgtgtgttacaagagtgtattttataactagaaaatgggactagtttaaatacttttaacttttaattacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTATGT-AA-TTAA---AAGT-----TAAA--ATTATTTAAATAAGTCACA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTATTA------------ATATA----TATTATAATATCA
gi|5 : cagctgggattttaatacaaaattaattactttgtatgttaatcactctacctttgtaacactttctttttaattagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagaccctaatggctcataaaacttaaaatattaaaagtaagattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaaattatctaatactataagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattggagaataatttcattaaaaaacaaatgtttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTCAG-TTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAA-----T------T-TTTCTATATATGAAATACACTCTTCTGACAC-A-TTCTCACAGCAGTACTTGTT
gi|30 : taagctgagatttgaatccaaaactaattactttgtatgtttatcactctacctttgtctcactatctttttaatgataacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaagaccctgatgcctcataaaaattaaaatattaaaagtgagcagctcaacaaaaattactgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaatatgttgtccatgcagcaacaaactttttttaaaaaaacatattatatatatatatgtattaattaaagagatattaaatagagaattatttcattaaaaaacaactttttcaccatattaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGT-AA-TTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTAATA--------------ATA----TAGTATAATATCAAAT
gi|16 : TATGT-AA-TTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTAATA------------A--TA----TAGTATAATATCAtaaaaaccaggtcgact
gi|6 : TATGTCAA-TTGA---AAGT-----AAAT--AGTAGTTAAACTAGTCCCA----TTTCTATatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttcaatatggtgaaaaagtt
gi|7 : tcagctgggattcgaatccaaaactaattactttgtatgttaatcactcaacctttgtaacactaactttttaaagagaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagacccttatgactcataaaacttaaaatattaaaaataaaattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaatttctgtaatactgataactaaaagcaataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactttttcgccatattgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGT-AAATTAA---AAGA-----TAAA--AGAATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTCTAACAC-A-CACTCGCAGCAGTACATGTTTTCTTATA------------ATATA----TAGTATAATATCAAAT
gi|8 : atatatatatatatatgtatataaaaataattatagaggtatttaatagagaataatttcattaaaaaacaactttttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTATGT-AA-ATAATATAAATCGATATAAATTAATATTTGAAATAGCCAAA--T-TTTCTATTTATAAAAAACACCCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCACTACATGTTTTCTAATATAACAT------GTATA----TAGTATAATATCTAATaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|22 : cctgatgccacataaaatttaaagtattaaaagttaaattgaaaatattagcagtctgcaaatttcttaaacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatTATGT-AAATTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACAC-A-CACtttgtgaaattaaaaaccaggttgact
gi|19 : tTATGT-AAATTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattggtttcaaatccgatttaattaaacattaa
gi|17 : caactttttcaccatattgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtTATGT-AA-TTAATAGAAAT-----TAA-----TATTCAGAATAG-CCCAGTT-TTTTTATTCATAAAATACATTCTTGTGACAC-C-CACTCACAGCATTACA--TTTTCGCATA------------CTATA----T
gi|14 : cagacatttcttttttcaccatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGT-AAATTAATAGAAAT-----TAA-----TATTTAAAATAGCACAA--A-TTTCTATTAATAAAATACACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAATACTATATACACGTACATA----TAGCATAATATCAAGT
gi|12 : acagatgtttattttttcaccttatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGT-AAATCAATAGAAAT-----TGA-----TATTTAAAATAACCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACACAA-CACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAAAACT----------ATATACATGTAGTATAATATCAAATtaaaaatcaggtcgaca
gi|11 : aaaacagacattgttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGT-AAATTAATAGAATT-----TAA-----TATTTAAAATA-TCCAA--AATTTCTATT---AAAGTCCACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAATACT----------ATATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaatcaggttgact
gi|13 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatATGT-AAATCAA---TAGC-----AAAT--GATATTTAAAATACCCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAATACT----------ATATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtaaaataaaaaatcaggtcga
gi|1 : gagccaacctgatttttaatttcacaaa-AA-TTAA---AAGT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCCGTTTATAGAAAACACTCTTGTAACAC-A-CACTCATAGCAGCACATGTTTTTTAATA------------ATGTA----TAGTATAATATCAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagatatggtgaaaaaaacaatatctgtttt
gi|10 : aaaaaatatagcttaagctgcgatctgaatccaaaactaattactttgtatattaatcactctacctttgtatctttttaaagagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaaccctgatgcctcatgaaacttaaaatattaaatgttagcagctcaacaaaaatttctgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaaatatgttgtccatgcagcaacatacattattaaaaaacaaattatatatatatgtattatttatagagatatttaaaagagaataattccattaaaaaacaactttcaccatattgaagccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattattta-AA-TTAATACAAAT-----TAA-----TATTCAAAATAGCCAAA--T-TTTCTGTTTATGAAATACACTCTTGTAACAC-A-TACTCACAGCACTACATGTTTTCTGATACTACAT------GTATA----TAGTATAATAACTAATaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|3 : cagagatttcttttttcactatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaaattgataaa---AAAT-----TAAA--AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTTTTTATAAAATAC-----------------ACTCACAGCAGCACATGTTTTCTAATA------------ATATA----TAGTtttgtgaaattaaaaaccaggatga
gi|18 : agattatatcatacatgtTATTTAAAATAGCCCAA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAG-A-CACACAAAGCATTACATGTTTTCTTATA------------CTATacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcaatatggtgaaaaagtttttttaatgaaattattctctattaaatatatctataattaatacatatacatatatataaaaatttgtttttttaataatgtttgttgctacatggataacatatttttttattgcttgcagttaccagtgttacagaaatttttgttgaactgctaacattttcaatcttacttttaatattttaagttttatgacacatcagggtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcactttcaaaaaatatagcataagctgggatttgaatccaaaactaattatttcgtatattaatcaaat
gi|40 : ngattaaaacaattatttttcatcatatgttaaccattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCA--T-CTTTTATTTATAAAATACACTCTCGTAACAC-A-CACTCACAACA
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|32 ): ATCCTTTTGGTATGGTGGAAAAAAGCTTTACCAAACTGGGAGCCAGTCTTTAATCAATATATAAACATTGGGTTTCAAATCTGGTTTAATTAAACATTTA
Unaligned ( gi|38 ): AAAAAAGCTTTATCAAACTGGAAGCTAGTCTCAATCGAAATATACACATTGGTTGTAAATTAAACATTTAA
Unaligned ( gi|41 ): AAACAGACATTTCTTTTTTTCACCATATCTAAG
Unaligned ( gi|42 ): ATAAACCATTGTGACCTCTAAATGTTAAATGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 33333333333333 11 111111111 2222 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 11111111 444444444444444444 1111
lowQualScore : 0 2 5555 5 33 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 00 2 2 2 777 55 55 1 55555555555555 2 3 1 11 5 777777777 4444 66 9999 6666666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 666 555 55555 66666666 1 3333 0 2 6 1 6 2 66666 888888888888888888 2222
lowQualScore : . . .... . .. .. ............................................................................... .. . . . ... .. .. . .............. . . . .. . ......... .... .. .... ....... ........................................................................................................................... . ... ... ..... ........ . .... . . . . . . ..... .................. ....
lowQualScore : 3 7 7777 3 77 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 4 1 6 222 88 99 0 77777777777777 9 3 6 99 0 888888888 4444 11 4444 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 999 666 66666 44444444 7 4444 8 2 7 8 5 5 77777 555555555555555555 1111
consensus : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAC-CATAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
Reference ( family-2239 ) : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-CACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAANAAAAATTTCTNTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATTATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAANTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
gi|1 : AGCTGCGATCTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTGTA------TCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-CA-AAA--A-CCCTGATGCCTCAT-GAAACTTAAAATATTAAA----------------TGTTAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACATACATTATT--AAA-AAA---------CAAATTA--TA--TA----TATATGTAT-------TATTTATAGAGATATTTAAAAGAGAATAATTCCATTAAAAAACAAC--TTTCACCATATTGAAG
gi|1 : aaaaaatatagcttaTATTTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCCGTTTATAGAAAACACTCTTGTAACAC-A-CACTCATAGCAGCACATGTTTTTTA-----ATA------------A-----TGTA----TAGTATAATATCAAATccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttaaattaaaagttaaaagtatttaaactagtcccattttccgtttatagaaaacactcttgtaacacacactcatagcagcacatgttttttaataatgtatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|10 : aaaaaatatagcttaagctgcgatctgaatccaaaactaattactttgtatattaatcactctacctttgtatctttttaaagagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaaccctgatgcctcatgaaacttaaaatattaaatgttagcagctcaacaaaaatttctgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaaatatgttgtccatgcagcaacatacattattaaaaaacaaattatatatatatgtattatttatagagatatttaaaagagaataattccattaaaaaacaactttcaccatattgaagccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAATTGATAA---AAAT-----TAATACAAATTAATATTCAAAATAGCCAAA--T-TTTCTGTTTATGAAATACACTCTTGTAACAC-A-TACTCACAGCACTACATGTTTTCTG-----ATACTACAT------G-----TATA----TAGTATAATAACTAATaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|11 : cagagatttcttttttcactatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---TAATAGAATT-----TAA----------TATTTAAAATA-TCCAA--AATTTCTATT---AAAGTCCACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaaccaggatga
gi|12 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---CAATAGAAAT-----TGA----------TATTTAAAATAACCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACACAA-CACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAAAACTATAT-----------A-----CATG----TAGTATAATATCAAATtttgtaaaataaaaaatcaggtcga
gi|13 : aaaacagacattgttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatATGTAAAT---CAA---TAGC-----AAA-T------GATATTTAAAATACCCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaatcaggttgact
gi|14 : gagccaacctgatttttaatttcacaaaTATGTAAAT---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTTAAAATAGCACAA--A-TTTCTATTAATAAAATACACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACTATATACACGTA-----CATA----TAGCATAATATCAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagatatggtgaaaaaaacaatatctgtttt
gi|15 : acagatgtttattttttcaccttatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAGCTGGTATTTGAATCCAAAATTAAT-A-ATTTGTATG----T--AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATA-TTTT--AAAGAGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACTCATCAA--A-CT-----------T-AAAA-------TATTAAAAGTAAGAT--TAAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTCGTCTAATACT-GT------AA------G-A-AT-AAAA-CATATGTTGTCCATGCAGCGACACACATCATT--AAA-AAA---------CATCT----TT--TA----TTTATtaaaaatcaggtcgaca
gi|16 : taTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCA
gi|16 : AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttcaatatggtgaaaaagtt
gi|17 : tgatattatactatattattagaaaacatgtactgttgtgagtgtgtgttacaagagtgtattttataactagaaaatgggactagtttaaatacttttaacttttaattacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTATGTAA-T---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTCAGAATAG-CCCAGTT-TTTTTATTCATAAAATACATTCTTGTGACAC-C-CACTCACAGCATTACA--TTTTCGC-----ATAC-----------------TATA----
gi|18 : cagacatttcttttttcaccatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATTTAAAATAGCCCAA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAG-A-CACACAAAGCATTACATGTTTTCTT-----ATAC-----------------TAT
gi|19 : ngattaaaacaattatttttcatcatatgttaaccattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAACTTTTTCACCATATTGTAG
gi|19 : TATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatgtaaattaaaagttaaaagtatttaaactagttccattttctatttatcaatacactcttgtaac
gi|2 : caactttttcaccatattgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtCAGCTGGGATTTTAATACAAAATTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTT--AATTAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNAAG-A-CCCTAATGGCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAATTATCTAATACT-AT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTACATGCAGCAACAATTATC-TT--AAAGAAA---------CATAT----TATTTA----TATGTGTGT-------TAATCATAGAGATAATTATTGGAGAATAATTTCATTAAAAAACAAATGTTTCACCATATTGAAG
gi|2 : TATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------ATTATTTAAATAAGTCACA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----TTA------------A-----TATA----TATTATAATATCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaattaaaagttaaaattatttaaataagtcacattttctattcataaaatacactcttgttacacacactcacaacagtacatgttttctattaatatatattataatatca
gi|20 : cagctgggattttaatacaaaattaattactttgtatgttaatcactctacctttgtaacactttctttttaattagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagaccctaatggctcataaaacttaaaatattaaaagtaagattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaaattatctaatactataagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattggagaataatttcattaaaaaacaaatgtttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTCGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGTTCTACCT--TTGTAACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CACAAATGA-CCTTGATGCCTCAT--AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGCAG
gi|21 : GCTGGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGCTCTACTT--TTGTTACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNG--A-CCTTGATGCCTC----AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGTAG
gi|22 : gTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACAC-A-CAC
gi|23 : tAAA--A-CCCAGATGCCCAAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AAATACATGCA-ATAAAAA-CATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattggtttcaaatccgatttaattaaacattaa
gi|24 : AAA--A-CCCTGATGCCCCAT-AAAACTTTAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------tgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|25 : AAA--A-CCCTGATGCCCCATAAAAAGTTTAAATA-TAAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGACCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------ATACATGCAAA-AAatacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcaatgttgctAA--A-CACTAATGCTTCAC-AAAACTTAAA----------T---AT--TGAAAATGTGACCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAA
gi|27 : AA--A-CCTTGATGCCCCAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TCAAAATTTGAGCAATCCAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------AT--ATAAAAA-Acannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntta
gi|28 : --A-CCCTGATGCCTCAT-TAAACTTAAAATATTAAAA-----AT--TCAAAATGTGAGAAGCCCAAATAAAATGTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAAcattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|29 : gAAG--A-CTCTGATGCCCCAT-AAAATTTAAAATATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATGAGCAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|3 : TATGTAAAT---TAA----------------A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTTTTTATAAAAT----------------A-CACTCACAGCAGCACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTACAttttgcttaaatttcttaaacaaaatattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaa
gi|3 : agattatatcatacaATACGAAA-TAATTAGTTTTGGATT----CA-AATC---CCAGCT--T----ATGCTATATTTTTTGAAAGTGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNAAA--AACCCTGATGTGTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTTAGCAGTTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGTAACTGCAA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTATCCATGTAGCAACAAACATTATT--AAA-AAAACAAATTTTTATATA---TA--TG----TATATGTAT-------TAATTATAGATATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAA--AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcaatatggtgaaaaagtttttttaatgaaattattctctattaaatatatctataattaatacatatacatatatataaaaatttgtttttttaataatgtttgttgctacatggataacatatttttttattgcttgcagttaccagtgttacagaaatttttgttgaactgctaacattttcaatcttacttttaatattttaagttttatgacacatcagggtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcactttcaaaaaatatagcataagctgggatttgaatccaaaactaattatttcgtatattaatcaaat
gi|30 : agattatatcatacatgtactatatattattagaaaacatgtgctgctgtgagtgtattttataaaaagaaaatgggactagtttaaatacttttaatttacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCAAATattaatcaaat
gi|33 : CAGCAGGGATTTGAATCCAA-------CA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACTT--TTGTATCAtaaaaaccaggtcgact
gi|34 : tataaaacatagcttAGCTGGGATATGAATCCAAAATTAATTA-CATTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTC--AAAGGGAAC-taaaagctgactcttcgttgtaaa
gi|35 : T-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAACCAAAATAAAATTTCTGTTATACTGGT------AAATGCATGCA-GTTAAAA-CATattgtaaactgca
gi|36 : CAGCATAGATTCAAATCCAA-------TA-CCTTGTATG----TT-AATCGCACTACCT--TTATTAC
gi|37 : caaaatatgtacagcctAGCTGGGATTTGAATCCAAATCTATTTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTATAACACTATCTTTTG--AAAAAcatataaactagaccttt
gi|39 : GATTCGAATAAAAAACTAATCA-CTTTGTATGTTAATT-AATCACTCAACCT--T
gi|4 : cttcagcctCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTT-GTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACATTTTCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNAAA--A-CTCTGATGCCTCAC-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAAAAAAAAAATCTCTAATACTG-T------AA------GTA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACACCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGT-AAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTGTAATATCAAAT
gi|40 : CA--T-CTTTTATTTATAAAATACACTCTCGTAACAC-A-CACTCACAACA
gi|5 : aAGCTGAGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-TATCACTCTACCT--TTGTCTCACTATCTTTTT--AATGATAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNTAAAG-A-CCCTGATGCCTCAT-AAAAATTAAAATATTAAAAGT----------------GAGCAGCTCAACAAAAATTACTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-A-TATGTTGTCCATGCAGCAACAAACTTTTTTTAAAA-AAA---------CATAT----TA--TATATATATATGTAT-------TAATTAAAGAGATATTAAATAGAGAATTATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTAAAG
gi|5 : taTATGTCAGT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAA-----T------T-TTTCTATATATGAAATACACTCTTCTGACAC-A-TTCTCACAGCAGTACTTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcagttaaaagttaaaagtatttaatttttctatatatgaaatacactcttctgacacattctcacagcagtacttgtt
gi|6 : taagctgagatttgaatccaaaactaattactttgtatgtttatcactctacctttgtctcactatctttttaatgataacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaagaccctgatgcctcataaaaattaaaatattaaaagtgagcagctcaacaaaaattactgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaatatgttgtccatgcagcaacaaactttttttaaaaaaacatattatatatatatatgtattaattaaagagatattaaatagagaattatttcattaaaaaacaactttttcaccatattaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCAACCT--TTGTAACACTAACTTTTT--AAAGAGAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNAAG--A-CCCTTATGACTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAATAAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAATACTGAT------AA-------C---TAAAAGCAATAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNN----NN--NN----NNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTTTTTCGCCATATTGAA
gi|6 : tTATGTCAAT---TGA---AAGT-----AAA-T------AGTAGTTAAACTAGTCCCA----TTTCTATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattgaaagtaaatagtagttaaactagtcccatttctat
gi|7 : tcagctgggattcgaatccaaaactaattactttgtatgttaatcactcaacctttgtaacactaactttttaaagagaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagacccttatgactcataaaacttaaaatattaaaaataaaattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaatttctgtaatactgataactaaaagcaataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactttttcgccatattgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatA---------TATATA---TA--TA----TATATGTATATAAAAATAATTATAGAGGTATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAG
gi|7 : TATGTAAAT---TAA---AAGA-----TAA-A------AGAATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTCTAACAC-A-CACTCGCAGCAGTACATGTTTTCTT-----ATA------------A-----TATA----TAGTATAATATCAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatgtaaattaaaagataaaagaatttaaactagtcccattttctatttataaaatacactcttctaacacacactcgcagcagtacatgttttcttataatatatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : atatatatatatatatgtatataaaaataattatagaggtatttaatagagaataatttcattaaaaaacaactttttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCCTGATGCCACAT-AAAATTTAAAGTATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATTAGCAGTC---TGCAAATTTCTTAAACAaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : TATGTAAATAA-TAT---AAATCGATATAA-ATT----AATATTTGAAATAGCCAAA--T-TTTCTATTTATAAAAAACACCCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCACTACATGTTTTCTA-----ATAT-----------AACATGTATA----TAGTATAATATCTAATaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattatgtaaataatataaatcgatataaattaatatttgaaatagccaaattttctatttataaaaaacacccttgtaacacacactcacagcactacatgttttctaatataacatgtatatagtataatatctaattttgtgaaattaaaaaccaggttgact
gi|9 : cctgatgccacataaaatttaaagtattaaaagttaaattgaaaatattagcagtctgcaaatttcttaaacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCTATCTATAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNAAG-A-CCCTGATGCTTCAT-AAAA-TTATAATATTAAAAGTAATAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAGTTCTCTAATAC-AGT------AA------GCA-ATTAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATTA-AAA-AAA---------CATATTATATA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGTATAATTTCATtttgtgaaattaaaaaccaggttgact
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|32 ): ATCCTTTTGGTATGGTGGAAAAAAGCTTTACCAAACTGGGAGCCAGTCTTTAATCAATATATAAACATTGGGTTTCAAATCTGGTTTAATTAAACATTTA
Unaligned ( gi|38 ): AAAAAAGCTTTATCAAACTGGAAGCTAGTCTCAATCGAAATATACACATTGGTTGTAAATTAAACATTTAA
Unaligned ( gi|41 ): AAACAGACATTTCTTTTTTTCACCATATCTAAG
Unaligned ( gi|42 ): ATAAACCATTGTGACCTCTAAATGTTAAATGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 33333333333333 11 111111111 2222 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 11111111 444444444444444444 1111
lowQualScore : 0 2 5555 5 33 44 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 2 2 2 777 55 77 1 55555555555555 2 3 1 11 5 777777777 4444 66 9999 6666666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 666 555 55555 66666666 2 3333 0 2 6 1 6 2 66666 888888888888888888 2222
lowQualScore : . . .... . .. .. .............................................................................. .. . . . ... .. .. . .............. . . . .. . ......... .... .. .... ....... ........................................................................................................................... . ... ... ..... ........ . .... . . . . . . ..... .................. ....
lowQualScore : 3 7 7777 3 77 66 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 4 1 6 222 88 88 8 77777777777777 9 3 6 99 0 888888888 4444 11 4444 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 999 666 66666 44444444 7 4444 8 2 7 8 5 5 77777 555555555555555555 1111
consensus : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
Reference ( family-2239 ) : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCATAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
gi|1 : AGCTGCGATCTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTGTA------TCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCA-AAA--A-CCCTGATGCCTCAT-GAAACTTAAAATATTAAA----------------TGTTAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACATACATTATT--AAA-AAA---------CAAATTA--TA--TA----TATATGTAT-------TATTTATAGAGATATTTAAAAGAGAATAATTCCATTAAAAAACAAC--TTTCACCATATTGAAG
gi|1 : aaaaaatatagcttaTATTTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCCGTTTATAGAAAACACTCTTGTAACAC-A-CACTCATAGCAGCACATGTTTTTTA-----ATA------------A-----TGTA----TAGTATAATATCAAATccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttaaattaaaagttaaaagtatttaaactagtcccattttccgtttatagaaaacactcttgtaacacacactcatagcagcacatgttttttaataatgtatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|10 : aaaaaatatagcttaagctgcgatctgaatccaaaactaattactttgtatattaatcactctacctttgtatctttttaaagagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaaccctgatgcctcatgaaacttaaaatattaaatgttagcagctcaacaaaaatttctgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaaatatgttgtccatgcagcaacatacattattaaaaaacaaattatatatatatgtattatttatagagatatttaaaagagaataattccattaaaaaacaactttcaccatattgaagccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAATTGATAA---AAAT-----TAATACAAATTAATATTCAAAATAGCCAAA--T-TTTCTGTTTATGAAATACACTCTTGTAACAC-A-TACTCACAGCACTACATGTTTTCTG-----ATACTACAT------G-----TATA----TAGTATAATAACTAATaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|11 : cagagatttcttttttcactatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---TAATAGAATT-----TAA----------TATTTAAAATA-TCCAA--AATTTCTATT---AAAGTCCACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaaccaggatga
gi|12 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---CAATAGAAAT-----TGA----------TATTTAAAATAACCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACACAA-CACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAAAACTATAT-----------A-----CATG----TAGTATAATATCAAATtttgtaaaataaaaaatcaggtcga
gi|13 : aaaacagacattgttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatATGTAAAT---CAA---TAGC-----AAA-T------GATATTTAAAATACCCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaatcaggttgact
gi|14 : gagccaacctgatttttaatttcacaaaTATGTAAAT---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTTAAAATAGCACAA--A-TTTCTATTAATAAAATACACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACTATATACACGTA-----CATA----TAGCATAATATCAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagatatggtgaaaaaaacaatatctgtttt
gi|15 : acagatgtttattttttcaccttatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAGCTGGTATTTGAATCCAAAATTAAT-A-ATTTGTATG----T--AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATATTTT---AAAGAGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAC--------------------TCAT-CAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TAAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTCGTCTAATACT-GT------AA------G-A-AT-AAAA-CATATGTTGTCCATGCAGCGACACACATCATT--AAA-AAA---------CATCT----TT--TA----TTTATtaaaaatcaggtcgaca
gi|16 : taTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCA
gi|16 : AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttcaatatggtgaaaaagtt
gi|17 : tgatattatactatattattagaaaacatgtactgttgtgagtgtgtgttacaagagtgtattttataactagaaaatgggactagtttaaatacttttaacttttaattacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTATGTAA-T---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTCAGAATAG-CCCAGTT-TTTTTATTCATAAAATACATTCTTGTGACAC-C-CACTCACAGCATTACA--TTTTCGC-----ATAC-----------------TATA----
gi|18 : cagacatttcttttttcaccatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATTTAAAATAGCCCAA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAG-A-CACACAAAGCATTACATGTTTTCTT-----ATAC-----------------TAT
gi|19 : ngattaaaacaattatttttcatcatatgttaaccattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAACTTTTTCACCATATTGTAG
gi|19 : TATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatgtaaattaaaagttaaaagtatttaaactagttccattttctatttatcaatacactcttgtaac
gi|2 : caactttttcaccatattgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtCAGCTGGGATTTTAATACAAAATTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTT--AATTAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTAATGGCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAATTATCTAATACT-AT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTACATGCAGCAACAATTATC-TT--AAAGAAA---------CATAT----TATTTA----TATGTGTGT-------TAATCATAGAGATAATTATTGGAGAATAATTTCATTAAAAAACAAATGTTTCACCATATTGAAG
gi|2 : TATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------ATTATTTAAATAAGTCACA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----TTA------------A-----TATA----TATTATAATATCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaattaaaagttaaaattatttaaataagtcacattttctattcataaaatacactcttgttacacacactcacaacagtacatgttttctattaatatatattataatatca
gi|20 : cagctgggattttaatacaaaattaattactttgtatgttaatcactctacctttgtaacactttctttttaattagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagaccctaatggctcataaaacttaaaatattaaaagtaagattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaaattatctaatactataagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattggagaataatttcattaaaaaacaaatgtttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTCGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGTTCTACCT--TTGTAACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACAAATGA-CCTTGATGCCTCAT--AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGCAG
gi|21 : GCTGGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGCTCTACTT--TTGTTACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--A-CCTTGATGCCTC----AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGTAG
gi|22 : gTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACAC-A-CAC
gi|23 : tAAA--A-CCCAGATGCCCAAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AAATACATGCA-ATAAAAA-CATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattggtttcaaatccgatttaattaaacattaa
gi|24 : AAA--A-CCCTGATGCCCCAT-AAAACTTTAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------tgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|25 : AAA--A-CCCTGATGCCCCATAAAAAGTTTAAATA-TAAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGACCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------ATACATGCAAA-AAatacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcaatgttgctAA--A-CACTAATGCTTCAC-AAAACTTAAA----------T---AT--TGAAAATGTGACCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAA
gi|27 : AA--A-CCTTGATGCCCCAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TCAAAATTTGAGCAATCCAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------AT--ATAAAAA-Acannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntta
gi|28 : --A-CCCTGATGCCTCAT-TAAACTTAAAATATTAAAA-----AT--TCAAAATGTGAGAAGCCCAAATAAAATGTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAAcattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|29 : gAAG--A-CTCTGATGCCCCAT-AAAATTTAAAATATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATGAGCAGTTTTGCTTAAATTTCT-TAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|3 : TATGTAAAT---TAA----------------A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTTTTTATAAAAT----------------A-CACTCACAGCAGCACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTACAacaaaatattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaa
gi|3 : agattatatcatacaATACGAAA-TAATTAGTTTTGGATT----CA-AATC---CCAGCT--T----ATGCTATATTTTTTGAAAGTGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AACCCTGATGTGTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTTAGCAGTTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGTAACTGCAA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTATCCATGTAGCAACAAACATTATT--AAA-AAAACAAATTTTTATATA---TA--TG----TATATGTAT-------TAATTATAGATATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAA--AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcaatatggtgaaaaagtttttttaatgaaattattctctattaaatatatctataattaatacatatacatatatataaaaatttgtttttttaataatgtttgttgctacatggataacatatttttttattgcttgcagttaccagtgttacagaaatttttgttgaactgctaacattttcaatcttacttttaatattttaagttttatgacacatcagggtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcactttcaaaaaatatagcataagctgggatttgaatccaaaactaattatttcgtatattaatcaaat
gi|30 : agattatatcatacatgtactatatattattagaaaacatgtgctgctgtgagtgtattttataaaaagaaaatgggactagtttaaatacttttaatttacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCAAATattaatcaaat
gi|33 : CAGCAGGGATTTGAATCCAA-------CA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACTT--TTGTATCAtaaaaaccaggtcgact
gi|34 : tataaaacatagcttAGCTGGGATATGAATCCAAAATTAATTA-CATTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTC--AAAGGGAAC-taaaagctgactcttcgttgtaaa
gi|35 : T-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAACCAAAATAAAATTTCTGTTATACTGGT------AAATGCATGCA-GTTAAAA-CATattgtaaactgca
gi|36 : CAGCATAGATTCAAATCCAA-------TA-CCTTGTATG----TT-AATCGCACTACCT--TTATTAC
gi|37 : caaaatatgtacagcctAGCTGGGATTTGAATCCAAATCTATTTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTATAACACTATCTTTTG--AAAAAcatataaactagaccttt
gi|39 : GATTCGAATAAAAAACTAATCA-CTTTGTATGTTAATT-AATCACTCAACCT--T
gi|4 : cttcagcctCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTT-GTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACATTTTCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--A-CTCTGATGCCTCAC-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAAAAAAAAAATCTCTAATACTG-T------AA------GTA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACACCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGT-AAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTGTAATATCAAAT
gi|40 : CA--T-CTTTTATTTATAAAATACACTCTCGTAACAC-A-CACTCACAACA
gi|5 : aAGCTGAGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-TATCACTCTACCT--TTGTCTCACTATCTTTTT--AATGATAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAG-A-CCCTGATGCCTCAT-AAAAATTAAAATATTAAAAGT----------------GAGCAGCTCAACAAAAATTACTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-A-TATGTTGTCCATGCAGCAACAAACTTTTTTTAAAA-AAA---------CATAT----TA--TATATATATATGTAT-------TAATTAAAGAGATATTAAATAGAGAATTATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTAAAG
gi|5 : taTATGTCAGT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAA-----T------T-TTTCTATATATGAAATACACTCTTCTGACAC-A-TTCTCACAGCAGTACTTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcagttaaaagttaaaagtatttaatttttctatatatgaaatacactcttctgacacattctcacagcagtacttgtt
gi|6 : taagctgagatttgaatccaaaactaattactttgtatgtttatcactctacctttgtctcactatctttttaatgataacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaagaccctgatgcctcataaaaattaaaatattaaaagtgagcagctcaacaaaaattactgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaatatgttgtccatgcagcaacaaactttttttaaaaaaacatattatatatatatatgtattaattaaagagatattaaatagagaattatttcattaaaaaacaactttttcaccatattaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCAACCT--TTGTAACACTAACTTTTT--AAAGAGAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG--A-CCCTTATGACTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAATAAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAATACTGAT------AA-------C---TAAAAGCAATAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNN----NN--NN----NNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTTTTTCGCCATATTGAA
gi|6 : tTATGTCAAT---TGA---AAGT-----AAA-T------AGTAGTTAAACTAGTCCCA----TTTCTATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattgaaagtaaatagtagttaaactagtcccatttctat
gi|7 : tcagctgggattcgaatccaaaactaattactttgtatgttaatcactcaacctttgtaacactaactttttaaagagaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagacccttatgactcataaaacttaaaatattaaaaataaaattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaatttctgtaatactgataactaaaagcaataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactttttcgccatattgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatA---------TATATA---TA--TA----TATATGTATATAAAAATAATTATAGAGGTATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAG
gi|7 : TATGTAAAT---TAA---AAGA-----TAA-A------AGAATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTCTAACAC-A-CACTCGCAGCAGTACATGTTTTCTT-----ATA------------A-----TATA----TAGTATAATATCAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatgtaaattaaaagataaaagaatttaaactagtcccattttctatttataaaatacactcttctaacacacactcgcagcagtacatgttttcttataatatatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : atatatatatatatatgtatataaaaataattatagaggtatttaatagagaataatttcattaaaaaacaactttttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCCTGATGCCACAT-AAAATTTAAAGTATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATTAGCAGTCT-GC--AAATTTCT-TAAaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : TATGTAAATAA-TAT---AAATCGATATAA-ATT----AATATTTGAAATAGCCAAA--T-TTTCTATTTATAAAAAACACCCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCACTACATGTTTTCTA-----ATAT-----------AACATGTATA----TAGTATAATATCTAATacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattatgtaaataatataaatcgatataaattaatatttgaaatagccaaattttctatttataaaaaacacccttgtaacacacactcacagcactacatgttttctaatataacatgtatatagtataatatctaattttgtgaaattaaaaaccaggttgact
gi|9 : cctgatgccacataaaatttaaagtattaaaagttaaattgaaaatattagcagtctgcaaatttcttaaacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCTATCTATAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTGATGCTTCAT-AAAA-TTATAATATTAAAAGTAATAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAGTTCTCTAATAC-AGT------AA------GCA-ATTAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATTA-AAA-AAA---------CATATTATATA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGTATAATTTCATtttgtgaaattaaaaaccaggttgact
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|32 ): ATCCTTTTGGTATGGTGGAAAAAAGCTTTACCAAACTGGGAGCCAGTCTTTAATCAATATATAAACATTGGGTTTCAAATCTGGTTTAATTAAACATTTA
Unaligned ( gi|38 ): AAAAAAGCTTTATCAAACTGGAAGCTAGTCTCAATCGAAATATACACATTGGTTGTAAATTAAACATTTAA
Unaligned ( gi|41 ): AAACAGACATTTCTTTTTTTCACCATATCTAAG
Unaligned ( gi|42 ): ATAAACCATTGTGACCTCTAAATGTTAAATGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 33333333333333 11 111111111 2222 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 11111111 444444444444444444 1111
lowQualScore : 0 2 5555 5 33 44 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 2 2 2 777 55 77 1 55555555555555 2 3 1 11 5 777777777 4444 66 9999 6666666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 666 555 55555 66666666 2 3333 0 2 6 1 6 2 66666 888888888888888888 2222
lowQualScore : . . .... . .. .. .............................................................................. .. . . . ... .. .. . .............. . . . .. . ......... .... .. .... ....... ........................................................................................................................... . ... ... ..... ........ . .... . . . . . . ..... .................. ....
lowQualScore : 3 7 7777 3 77 66 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 4 1 6 222 88 88 8 77777777777777 9 3 6 99 0 888888888 4444 11 4444 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 999 666 66666 44444444 7 4444 8 2 7 8 5 5 77777 555555555555555555 1111
consensus : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
Reference ( family-2239 ) : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
gi|1 : AGCTGCGATCTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTGTA------TCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCA-AAA--A-CCCTGATGCCTCAT-GAAACTTAAAATATTAAA----------------TGTTAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACATACATTATT--AAA-AAA---------CAAATTA--TA--TA----TATATGTAT-------TATTTATAGAGATATTTAAAAGAGAATAATTCCATTAAAAAACAAC--TTTCACCATATTGAAG
gi|1 : aaaaaatatagcttaTATTTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCCGTTTATAGAAAACACTCTTGTAACAC-A-CACTCATAGCAGCACATGTTTTTTA-----ATA------------A-----TGTA----TAGTATAATATCAAATccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttaaattaaaagttaaaagtatttaaactagtcccattttccgtttatagaaaacactcttgtaacacacactcatagcagcacatgttttttaataatgtatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|10 : aaaaaatatagcttaagctgcgatctgaatccaaaactaattactttgtatattaatcactctacctttgtatctttttaaagagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaaccctgatgcctcatgaaacttaaaatattaaatgttagcagctcaacaaaaatttctgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaaatatgttgtccatgcagcaacatacattattaaaaaacaaattatatatatatgtattatttatagagatatttaaaagagaataattccattaaaaaacaactttcaccatattgaagccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAATTGATAA---AAAT-----TAATACAAATTAATATTCAAAATAGCCAAA--T-TTTCTGTTTATGAAATACACTCTTGTAACAC-A-TACTCACAGCACTACATGTTTTCTG-----ATACTACAT------G-----TATA----TAGTATAATAACTAATaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|11 : cagagatttcttttttcactatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---TAATAGAATT-----TAA----------TATTTAAAATA-TCCAA--AATTTCTATT---AAAGTCCACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaaccaggatga
gi|12 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---CAATAGAAAT-----TGA----------TATTTAAAATAACCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACACAA-CACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAAAACTATAT-----------A-----CATG----TAGTATAATATCAAATtttgtaaaataaaaaatcaggtcga
gi|13 : aaaacagacattgttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatATGTAAAT---CAA---TAGC-----AAA-T------GATATTTAAAATACCCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaatcaggttgact
gi|14 : gagccaacctgatttttaatttcacaaaTATGTAAAT---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTTAAAATAGCACAA--A-TTTCTATTAATAAAATACACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACTATATACACGTA-----CATA----TAGCATAATATCAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagatatggtgaaaaaaacaatatctgtttt
gi|15 : acagatgtttattttttcaccttatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAGCTGGTATTTGAATCCAAAATTAAT-A-ATTTGTATG----T--AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATATTTT---AAAGAGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAC--------------------TCAT-CAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TAAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTCGTCTAATACT-GT------AA------G-A-AT-AAAA-CATATGTTGTCCATGCAGCGACACACATCATT--AAA-AAA---------CATCT----TT--TA----TTTATtaaaaatcaggtcgaca
gi|16 : taTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCA
gi|16 : AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttcaatatggtgaaaaagtt
gi|17 : tgatattatactatattattagaaaacatgtactgttgtgagtgtgtgttacaagagtgtattttataactagaaaatgggactagtttaaatacttttaacttttaattacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTATGTAA-T---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTCAGAATAG-CCCAGTT-TTTTTATTCATAAAATACATTCTTGTGACAC-C-CACTCACAGCATTACA--TTTTCGC-----ATAC-----------------TATA----
gi|18 : cagacatttcttttttcaccatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATTTAAAATAGCCCAA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAG-A-CACACAAAGCATTACATGTTTTCTT-----ATAC-----------------TAT
gi|19 : ngattaaaacaattatttttcatcatatgttaaccattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAACTTTTTCACCATATTGTAG
gi|19 : TATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatgtaaattaaaagttaaaagtatttaaactagttccattttctatttatcaatacactcttgtaac
gi|2 : caactttttcaccatattgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtCAGCTGGGATTTTAATACAAAATTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTT--AATTAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTAATGGCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAATTATCTAATACT-AT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTACATGCAGCAACAATTATC-TT--AAAGAAA---------CATAT----TATTTA----TATGTGTGT-------TAATCATAGAGATAATTATTGGAGAATAATTTCATTAAAAAACAAATGTTTCACCATATTGAAG
gi|2 : TATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------ATTATTTAAATAAGTCACA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----TTA------------A-----TATA----TATTATAATATCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaattaaaagttaaaattatttaaataagtcacattttctattcataaaatacactcttgttacacacactcacaacagtacatgttttctattaatatatattataatatca
gi|20 : cagctgggattttaatacaaaattaattactttgtatgttaatcactctacctttgtaacactttctttttaattagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagaccctaatggctcataaaacttaaaatattaaaagtaagattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaaattatctaatactataagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattggagaataatttcattaaaaaacaaatgtttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTCGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGTTCTACCT--TTGTAACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACAAATGA-CCTTGATGCCTCAT--AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGCAG
gi|21 : GCTGGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGCTCTACTT--TTGTTACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--A-CCTTGATGCCTC----AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGTAG
gi|22 : gTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACAC-A-CAC
gi|23 : tAAA--A-CCCAGATGCCCAAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AAATACATGCA-ATAAAAA-CATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattggtttcaaatccgatttaattaaacattaa
gi|24 : AAA--A-CCCTGATGCCCCAT-AAAACTTTAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------tgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|25 : AAA--A-CCCTGATGCCCCATAAAAAGTTTAAATA-TAAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGACCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------ATACATGCAAA-AAatacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcaatgttgctAA--A-CACTAATGCTTCAC-AAAACTTAAA----------T---AT--TGAAAATGTGACCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAA
gi|27 : AA--A-CCTTGATGCCCCAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TCAAAATTTGAGCAATCCAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------AT--ATAAAAA-Acannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntta
gi|28 : --A-CCCTGATGCCTCAT-TAAACTTAAAATATTAAAA-----AT--TCAAAATGTGAGAAGCCCAAATAAAATGTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAAcattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|29 : gAAG--A-CTCTGATGCCCCAT-AAAATTTAAAATATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATGAGCAGTTTTGCTTAAATTTCT-TAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|3 : TATGTAAAT---TAA----------------A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTTTTTATAAAAT----------------A-CACTCACAGCAGCACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTACAacaaaatattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaa
gi|3 : agattatatcatacaATACGAAA-TAATTAGTTTTGGATT----CA-AATC---CCAGCT--T----ATGCTATATTTTTTGAAAGTGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AACCCTGATGTGTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTTAGCAGTTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGTAACTGCAA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTATCCATGTAGCAACAAACATTATT--AAA-AAAACAAATTTTTATATA---TA--TG----TATATGTAT-------TAATTATAGATATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAA--AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcaatatggtgaaaaagtttttttaatgaaattattctctattaaatatatctataattaatacatatacatatatataaaaatttgtttttttaataatgtttgttgctacatggataacatatttttttattgcttgcagttaccagtgttacagaaatttttgttgaactgctaacattttcaatcttacttttaatattttaagttttatgacacatcagggtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcactttcaaaaaatatagcataagctgggatttgaatccaaaactaattatttcgtatattaatcaaat
gi|30 : agattatatcatacatgtactatatattattagaaaacatgtgctgctgtgagtgtattttataaaaagaaaatgggactagtttaaatacttttaatttacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCAAATattaatcaaat
gi|33 : CAGCAGGGATTTGAATCCAA-------CA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACTT--TTGTATCAtaaaaaccaggtcgact
gi|34 : tataaaacatagcttAGCTGGGATATGAATCCAAAATTAATTA-CATTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTC--AAAGGGAAC-taaaagctgactcttcgttgtaaa
gi|35 : T-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAACCAAAATAAAATTTCTGTTATACTGGT------AAATGCATGCA-GTTAAAA-CATattgtaaactgca
gi|36 : CAGCATAGATTCAAATCCAA-------TA-CCTTGTATG----TT-AATCGCACTACCT--TTATTAC
gi|37 : caaaatatgtacagcctAGCTGGGATTTGAATCCAAATCTATTTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTATAACACTATCTTTTG--AAAAAcatataaactagaccttt
gi|39 : GATTCGAATAAAAAACTAATCA-CTTTGTATGTTAATT-AATCACTCAACCT--T
gi|4 : cttcagcctCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTT-GTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACATTTTCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--A-CTCTGATGCCTCAC-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAAAAAAAAAATCTCTAATACTG-T------AA------GTA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACACCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGT-AAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTGTAATATCAAAT
gi|40 : CA--T-CTTTTATTTATAAAATACACTCTCGTAACAC-A-CACTCACAACA
gi|5 : aAGCTGAGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-TATCACTCTACCT--TTGTCTCACTATCTTTTT--AATGATAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAG-A-CCCTGATGCCTCAT-AAAAATTAAAATATTAAAAGT----------------GAGCAGCTCAACAAAAATTACTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-A-TATGTTGTCCATGCAGCAACAAACTTTTTTTAAAA-AAA---------CATAT----TA--TATATATATATGTAT-------TAATTAAAGAGATATTAAATAGAGAATTATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTAAAG
gi|5 : taTATGTCAGT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAA-----T------T-TTTCTATATATGAAATACACTCTTCTGACAC-A-TTCTCACAGCAGTACTTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcagttaaaagttaaaagtatttaatttttctatatatgaaatacactcttctgacacattctcacagcagtacttgtt
gi|6 : taagctgagatttgaatccaaaactaattactttgtatgtttatcactctacctttgtctcactatctttttaatgataacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaagaccctgatgcctcataaaaattaaaatattaaaagtgagcagctcaacaaaaattactgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaatatgttgtccatgcagcaacaaactttttttaaaaaaacatattatatatatatatgtattaattaaagagatattaaatagagaattatttcattaaaaaacaactttttcaccatattaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCAACCT--TTGTAACACTAACTTTTT--AAAGAGAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG--A-CCCTTATGACTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAATAAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAATACTGAT------AA-------C---TAAAAGCAATAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNN----NN--NN----NNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTTTTTCGCCATATTGAA
gi|6 : tTATGTCAAT---TGA---AAGT-----AAA-T------AGTAGTTAAACTAGTCCCA----TTTCTATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattgaaagtaaatagtagttaaactagtcccatttctat
gi|7 : tcagctgggattcgaatccaaaactaattactttgtatgttaatcactcaacctttgtaacactaactttttaaagagaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagacccttatgactcataaaacttaaaatattaaaaataaaattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaatttctgtaatactgataactaaaagcaataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactttttcgccatattgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatA---------TATATA---TA--TA----TATATGTATATAAAAATAATTATAGAGGTATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAG
gi|7 : TATGTAAAT---TAA---AAGA-----TAA-A------AGAATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTCTAACAC-A-CACTCGCAGCAGTACATGTTTTCTT-----ATA------------A-----TATA----TAGTATAATATCAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatgtaaattaaaagataaaagaatttaaactagtcccattttctatttataaaatacactcttctaacacacactcgcagcagtacatgttttcttataatatatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : atatatatatatatatgtatataaaaataattatagaggtatttaatagagaataatttcattaaaaaacaactttttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCCTGATGCCACAT-AAAATTTAAAGTATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATTAGCAGTCT-GC--AAATTTCT-TAAaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : TATGTAAATAA-TAT---AAATCGATATAA-ATT----AATATTTGAAATAGCCAAA--T-TTTCTATTTATAAAAAACACCCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCACTACATGTTTTCTA-----ATAT-----------AACATGTATA----TAGTATAATATCTAATacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattatgtaaataatataaatcgatataaattaatatttgaaatagccaaattttctatttataaaaaacacccttgtaacacacactcacagcactacatgttttctaatataacatgtatatagtataatatctaattttgtgaaattaaaaaccaggttgact
gi|9 : cctgatgccacataaaatttaaagtattaaaagttaaattgaaaatattagcagtctgcaaatttcttaaacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCTATCTATAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTGATGCTTCAT-AAAA-TTATAATATTAAAAGTAATAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAGTTCTCTAATAC-AGT------AA------GCA-ATTAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATTA-AAA-AAA---------CATATTATATA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGTATAATTTCATtttgtgaaattaaaaaccaggttgact
blockSeqs : G TTAA A AT TG NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAC TG A A T AAG TG CA C AAATACAT C C A TA G ACAAATTTT TATA TT TATA ATAAAAA A TGA TAG CGATA TACAAATT A GTT A G C G C AAACT CTATATACACGTA CATG
blockSeqs : . . A . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G . . T AAG TG CA C AAATACAA . . A A . . A . . . A AA TAG . ATT A AA . G C A G . CTACATG CATG
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G . . T GAA . AT G AAATACAA . . A . . . A . . . A . TAG . T A T . G C G T . TAACATG .
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN G . . T GAA . AT G AACTGCAA . . T . . . . . . . A . TAG . A A A . . C G T . CTA .
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . T TGA . AT G AAATGCAT . . N . . . . . . . A . . . A A A . . C A G . CTA .
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . T TGA . AT G AACTGCAA . . A . . . . . . . A . . . A C A . . C G G . TA .
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . T TGA . CT G AA . . . . . . . . . . A . . . A A T . . C A G . C .
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . T TGA . CA G AA . . . . . . A . . . A A T . . C A G . C .
blockSeqs : . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAC . . . T TAA . AT G AA . . A . . . A C T . . C A G . A .
blockSeqs : . . . . . . . . T AAG . AA G AA . . G . . . A T T . . C G G . A .
blockSeqs : . . . . . . . . T TGA . CA C AA . . A . . . A C T . . C G C . A .
blockSeqs : . . . . . . . T AAG . CA G AA . A . . . T C T . . C G . . A .
blockSeqs : . . . . . . . T AAA . CA G AA . A . . . A C T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TAA . A C AA . . . . . C T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AAT . A . . . . . . C T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . C T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A T . .
blockSeqs : . . . . . T
blockSeqs : .
blockSeqCons : NAA AA************ ****
originalCons : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
finalCons : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGTAA------------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|32 ): ATCCTTTTGGTATGGTGGAAAAAAGCTTTACCAAACTGGGAGCCAGTCTTTAATCAATATATAAACATTGGGTTTCAAATCTGGTTTAATTAAACATTTA
Unaligned ( gi|38 ): AAAAAAGCTTTATCAAACTGGAAGCTAGTCTCAATCGAAATATACACATTGGTTGTAAATTAAACATTTAA
Unaligned ( gi|41 ): AAACAGACATTTCTTTTTTTCACCATATCTAAG
Unaligned ( gi|42 ): ATAAACCATTGTGACCTCTAAATGTTAAATGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 33333333333333 11 111111111 2222 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 11111111 444444444444444444 1111
lowQualScore : 0 2 5555 5 33 44 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 2 2 2 777 55 77 1 55555555555555 2 3 1 11 5 777777777 4444 66 9999 6666666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 666 555 55555 66666666 2 3333 0 2 6 1 6 2 66666 888888888888888888 2222
lowQualScore : . . .... . .. .. .............................................................................. .. . . . ... .. .. . .............. . . . .. . ......... .... .. .... ....... ........................................................................................................................... . ... ... ..... ........ . .... . . . . . . ..... .................. ....
lowQualScore : 3 7 7777 3 77 66 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 4 1 6 222 88 88 8 77777777777777 9 3 6 99 0 888888888 4444 11 4444 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 999 666 66666 44444444 7 4444 8 2 7 8 5 5 77777 555555555555555555 1111
consensus : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
Reference ( family-2239 ) : CAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGACCACAAA--A-CCCTGATGCCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTNAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAACAAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCAGTACATGTTTTCTA-----ATAC-----------A-----TATA----TAGTATAATATCAAAT
gi|1 : AGCTGCGATCTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTGTA------TCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCA-AAA--A-CCCTGATGCCTCAT-GAAACTTAAAATATTAAA----------------TGTTAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACATACATTATT--AAA-AAA---------CAAATTA--TA--TA----TATATGTAT-------TATTTATAGAGATATTTAAAAGAGAATAATTCCATTAAAAAACAAC--TTTCACCATATTGAAG
gi|1 : aaaaaatatagcttaTATTTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCCGTTTATAGAAAACACTCTTGTAACAC-A-CACTCATAGCAGCACATGTTTTTTA-----ATA------------A-----TGTA----TAGTATAATATCAAATccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttaaattaaaagttaaaagtatttaaactagtcccattttccgtttatagaaaacactcttgtaacacacactcatagcagcacatgttttttaataatgtatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|10 : aaaaaatatagcttaagctgcgatctgaatccaaaactaattactttgtatattaatcactctacctttgtatctttttaaagagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaaccctgatgcctcatgaaacttaaaatattaaatgttagcagctcaacaaaaatttctgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaaatatgttgtccatgcagcaacatacattattaaaaaacaaattatatatatatgtattatttatagagatatttaaaagagaataattccattaaaaaacaactttcaccatattgaagccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAATTGATAA---AAAT-----TAATACAAATTAATATTCAAAATAGCCAAA--T-TTTCTGTTTATGAAATACACTCTTGTAACAC-A-TACTCACAGCACTACATGTTTTCTG-----ATACTACAT------G-----TATA----TAGTATAATAACTAATaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtgggggaaaaaagcctcactaaactgtaagccagtctttaatcaaaataaacacattggtttcaaatctggtttaattaaacattaa
gi|11 : cagagatttcttttttcactatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---TAATAGAATT-----TAA----------TATTTAAAATA-TCCAA--AATTTCTATT---AAAGTCCACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaaccaggatga
gi|12 : aaacagacatttcttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATGTAAAT---CAATAGAAAT-----TGA----------TATTTAAAATAACCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACACAA-CACT-ACA----TGTTTGTTTTCTAAAACTATAT-----------A-----CATG----TAGTATAATATCAAATtttgtaaaataaaaaatcaggtcga
gi|13 : aaaacagacattgttttttcaccatatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatATGTAAAT---CAA---TAGC-----AAA-T------GATATTTAAAATACCCCAA--A-TTTCTGTTAATAAAATGCACTGTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACT----------A-----TATACATGTAGTATAATATCAAATtttgtgaaattaaaaatcaggttgact
gi|14 : gagccaacctgatttttaatttcacaaaTATGTAAAT---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTTAAAATAGCACAA--A-TTTCTATTAATAAAATACACTCTTGTAACAC-AGCACT-ACA----TGTTTGTTTTCTA-----ATACTATATACACGTA-----CATA----TAGCATAATATCAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagatatggtgaaaaaaacaatatctgtttt
gi|15 : acagatgtttattttttcaccttatctaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAGCTGGTATTTGAATCCAAAATTAAT-A-ATTTGTATG----T--AATCACTCTACCT--TTGTAACACTATATTTT---AAAGAGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAC--------------------TCAT-CAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TAAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTCGTCTAATACT-GT------AA------G-A-AT-AAAA-CATATGTTGTCCATGCAGCGACACACATCATT--AAA-AAA---------CATCT----TT--TA----TTTATtaaaaatcaggtcgaca
gi|16 : taTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCA
gi|16 : AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttcaatatggtgaaaaagtt
gi|17 : tgatattatactatattattagaaaacatgtactgttgtgagtgtgtgttacaagagtgtattttataactagaaaatgggactagtttaaatacttttaacttttaattacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTATGTAA-T---TAATAGAAAT-----TAA----------TATTCAGAATAG-CCCAGTT-TTTTTATTCATAAAATACATTCTTGTGACAC-C-CACTCACAGCATTACA--TTTTCGC-----ATAC-----------------TATA----
gi|18 : cagacatttcttttttcaccatatttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatTATTTAAAATAGCCCAA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAG-A-CACACAAAGCATTACATGTTTTCTT-----ATAC-----------------TAT
gi|19 : ngattaaaacaattatttttcatcatatgttaaccattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAACTTTTTCACCATATTGTAG
gi|19 : TATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatgtaaattaaaagttaaaagtatttaaactagttccattttctatttatcaatacactcttgtaac
gi|2 : caactttttcaccatattgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtCAGCTGGGATTTTAATACAAAATTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTT--AATTAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTAATGGCTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAATTATCTAATACT-AT------AA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTGTACATGCAGCAACAATTATC-TT--AAAGAAA---------CATAT----TATTTA----TATGTGTGT-------TAATCATAGAGATAATTATTGGAGAATAATTTCATTAAAAAACAAATGTTTCACCATATTGAAG
gi|2 : TATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------ATTATTTAAATAAGTCACA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----TTA------------A-----TATA----TATTATAATATCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtaattaaaagttaaaattatttaaataagtcacattttctattcataaaatacactcttgttacacacactcacaacagtacatgttttctattaatatatattataatatca
gi|20 : cagctgggattttaatacaaaattaattactttgtatgttaatcactctacctttgtaacactttctttttaattagaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagaccctaatggctcataaaacttaaaatattaaaagtaagattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaaattatctaatactataagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattggagaataatttcattaaaaaacaaatgtttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTCGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGTTCTACCT--TTGTAACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACAAATGA-CCTTGATGCCTCAT--AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGCAG
gi|21 : GCTGGGATTCGAACCCAAAACTGATTA-CCTTGTATG----TTAAATCGCTCTACTT--TTGTTACAGCAGCTTTTT--AAAGAGAAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--A-CCTTGATGCCTC----AAACTTAAATTATTAAAAG-GAAATTGTGAAAATGTGAGTAG
gi|22 : gTATGTAAAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTTCCA--T-TTTCTATTTAT-CAATACACTCTTGTAACAC-A-CAC
gi|23 : tAAA--A-CCCAGATGCCCAAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AAATACATGCA-ATAAAAA-CATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattggtttcaaatccgatttaattaaacattaa
gi|24 : AAA--A-CCCTGATGCCCCAT-AAAACTTTAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------tgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|25 : AAA--A-CCCTGATGCCCCATAAAAAGTTTAAATA-TAAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGACCAGCCCAA-AAATGTTTCTGTAACACTGGT------AA------ATACATGCAAA-AAatacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|26 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcaatgttgctAA--A-CACTAATGCTTCAC-AAAACTTAAA----------T---AT--TGAAAATGTGACCAGCCGAAATAAAATTTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAA
gi|27 : AA--A-CCTTGATGCCCCAT-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TCAAAATTTGAGCAATCCAAATAAAATTTCTGTAATACTGGT------AA------AT--ATAAAAA-Acannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntta
gi|28 : --A-CCCTGATGCCTCAT-TAAACTTAAAATATTAAAA-----AT--TCAAAATGTGAGAAGCCCAAATAAAATGTCTGTAATACTGGTAAATACAA------GCA-ATAAcattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|29 : gAAG--A-CTCTGATGCCCCAT-AAAATTTAAAATATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATGAGCAGTTTTGCTTAAATTTCT-TAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|3 : TATGTAAAT---TAA----------------A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTTTTTATAAAAT----------------A-CACTCACAGCAGCACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTACAacaaaatattgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaa
gi|3 : agattatatcatacaATACGAAA-TAATTAGTTTTGGATT----CA-AATC---CCAGCT--T----ATGCTATATTTTTTGAAAGTGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--AACCCTGATGTGTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTTAGCAGTTCAACAAAAATTTCTGTAACACTGGTAACTGCAA------GCA-ATAAAAA-AATATGTTATCCATGTAGCAACAAACATTATT--AAA-AAAACAAATTTTTATATA---TA--TG----TATATGTAT-------TAATTATAGATATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAA--AACTTTTTCACCATATTGAAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcaatatggtgaaaaagtttttttaatgaaattattctctattaaatatatctataattaatacatatacatatatataaaaatttgtttttttaataatgtttgttgctacatggataacatatttttttattgcttgcagttaccagtgttacagaaatttttgttgaactgctaacattttcaatcttacttttaatattttaagttttatgacacatcagggtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttcactttcaaaaaatatagcataagctgggatttgaatccaaaactaattatttcgtatattaatcaaat
gi|30 : agattatatcatacatgtactatatattattagaaaacatgtgctgctgtgagtgtattttataaaaagaaaatgggactagtttaaatacttttaatttacataatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGTAA-T---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTAGTTATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA-------------------ATA----TAGTATAATATCAAATattaatcaaat
gi|33 : CAGCAGGGATTTGAATCCAA-------CA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACTT--TTGTATCAtaaaaaccaggtcgact
gi|34 : tataaaacatagcttAGCTGGGATATGAATCCAAAATTAATTA-CATTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACACTTTCTTTTC--AAAGGGAAC-taaaagctgactcttcgttgtaaa
gi|35 : T-AAAACTTAAAATAT-AAAAGTTGAAT--TGAAAATGTGAGCAACCAAAATAAAATTTCTGTTATACTGGT------AAATGCATGCA-GTTAAAA-CATattgtaaactgca
gi|36 : CAGCATAGATTCAAATCCAA-------TA-CCTTGTATG----TT-AATCGCACTACCT--TTATTAC
gi|37 : caaaatatgtacagcctAGCTGGGATTTGAATCCAAATCTATTTA-CTTTGTATA----TT-AATCACTCTACCT--TTATAACACTATCTTTTG--AAAAAcatataaactagaccttt
gi|39 : GATTCGAATAAAAAACTAATCA-CTTTGTATGTTAATT-AATCACTCAACCT--T
gi|4 : cttcagcctCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTT-GTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCT--TTGTAACATTTTCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA--A-CTCTGATGCCTCAC-AAAACTTAAAATATTAAAAGTAAGAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAAAAAAAAAATCTCTAATACTG-T------AA------GTA-ATAAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACACCATT--AAA-AAA---------CATAT----TA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGT-AAT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTCATAAAATACACTCTTGTAACAC-A-CACTCACAACAGTACATGTTTTCTA-----ATA------------A-----TATA----TAGTGTAATATCAAAT
gi|40 : CA--T-CTTTTATTTATAAAATACACTCTCGTAACAC-A-CACTCACAACA
gi|5 : aAGCTGAGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-TATCACTCTACCT--TTGTCTCACTATCTTTTT--AATGATAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAG-A-CCCTGATGCCTCAT-AAAAATTAAAATATTAAAAGT----------------GAGCAGCTCAACAAAAATTACTGTAACACTGGT------AACTGCAAGCA-ATAAAAA-A-TATGTTGTCCATGCAGCAACAAACTTTTTTTAAAA-AAA---------CATAT----TA--TATATATATATGTAT-------TAATTAAAGAGATATTAAATAGAGAATTATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTAAAG
gi|5 : taTATGTCAGT---TAA---AAGT-----TAA-A------AGTATTTAA-----T------T-TTTCTATATATGAAATACACTCTTCTGACAC-A-TTCTCACAGCAGTACTTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcagttaaaagttaaaagtatttaatttttctatatatgaaatacactcttctgacacattctcacagcagtacttgtt
gi|6 : taagctgagatttgaatccaaaactaattactttgtatgtttatcactctacctttgtctcactatctttttaatgataacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaagaccctgatgcctcataaaaattaaaatattaaaagtgagcagctcaacaaaaattactgtaacactggtaactgcaagcaataaaaaatatgttgtccatgcagcaacaaactttttttaaaaaaacatattatatatatatatgtattaattaaagagatattaaatagagaattatttcattaaaaaacaactttttcaccatattaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatCAGCTGGGATTCGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCAACCT--TTGTAACACTAACTTTTT--AAAGAGAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG--A-CCCTTATGACTCAT-AAAACTTAAAATATTAAAAATAAAAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAATTTCTGTAATACTGAT------AA-------C---TAAAAGCAATAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNN---------NNNNN----NN--NN----NNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTTTTTCGCCATATTGAA
gi|6 : tTATGTCAAT---TGA---AAGT-----AAA-T------AGTAGTTAAACTAGTCCCA----TTTCTATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatgtcaattgaaagtaaatagtagttaaactagtcccatttctat
gi|7 : tcagctgggattcgaatccaaaactaattactttgtatgttaatcactcaacctttgtaacactaactttttaaagagaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagacccttatgactcataaaacttaaaatattaaaaataaaattgaaaatgtgagcagctcaacaaaaatttctgtaatactgataactaaaagcaataaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactttttcgccatattgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatA---------TATATA---TA--TA----TATATGTATATAAAAATAATTATAGAGGTATTTAATAGAGAATAATTTCATTAAAAAACAACTTTTTCACCATATTGAAG
gi|7 : TATGTAAAT---TAA---AAGA-----TAA-A------AGAATTTAAACTAGTCCCA--T-TTTCTATTTATAAAATACACTCTTCTAACAC-A-CACTCGCAGCAGTACATGTTTTCTT-----ATA------------A-----TATA----TAGTATAATATCAAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatgtaaattaaaagataaaagaatttaaactagtcccattttctatttataaaatacactcttctaacacacactcgcagcagtacatgttttcttataatatatagtataatatcaaataaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : atatatatatatatatgtatataaaaataattatagaggtatttaatagagaataatttcattaaaaaacaactttttcaccatattgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCCTGATGCCACAT-AAAATTTAAAGTATTAAAAGTTAAAT--TGAAAATATTAGCAGTCT-GC--AAATTTCT-TAAaaaaaaccaggtctactcatccttttaaatggtggaaaaaagcctaaccaaactgtaagccagtctttaatcaaaatatatacatttgtttcaaatctggtttaattaaacat
gi|8 : TATGTAAATAA-TAT---AAATCGATATAA-ATT----AATATTTGAAATAGCCAAA--T-TTTCTATTTATAAAAAACACCCTTGTAACAC-A-CACTCACAGCACTACATGTTTTCTA-----ATAT-----------AACATGTATA----TAGTATAATATCTAATacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattatgtaaataatataaatcgatataaattaatatttgaaatagccaaattttctatttataaaaaacacccttgtaacacacactcacagcactacatgttttctaatataacatgtatatagtataatatctaattttgtgaaattaaaaaccaggttgact
gi|9 : cctgatgccacataaaatttaaagtattaaaagttaaattgaaaatattagcagtctgcaaatttcttaaacaaaatattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatattcaccatatttaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatCAGCTGGGATTTGAATCCAAAACTAATTA-CTTTGTATG----TT-AATCACTCTACCTATCTATAACACTATCTTTTT--AAAGAGAAC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAG-A-CCCTGATGCTTCAT-AAAA-TTATAATATTAAAAGTAATAT--TGAAAATGTGAGCAGCTCAACAAAAAGTTCTCTAATAC-AGT------AA------GCA-ATTAAAA-AATATGTTGTCCATGCAGCAACAAACATCATTA-AAA-AAA---------CATATTATATA--TA----TATATGTAT-------TAATCATAGAGATATTTAATAGAGTATAATTTCATtttgtgaaattaaaaaccaggttgact
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|32 ): ATCCTTTTGGTATGGTGGAAAAAAGCTTTACCAAACTGGGAGCCAGTCTTTAATCAATATATAAACATTGGGTTTCAAATCTGGTTTAATTAAACATTTA
Unaligned ( gi|38 ): AAAAAAGCTTTATCAAACTGGAAGCTAGTCTCAATCGAAATATACACATTGGTTGTAAATTAAACATTTAA
Unaligned ( gi|41 ): AAACAGACATTTCTTTTTTTCACCATATCTAAG
Unaligned ( gi|42 ): ATAAACCATTGTGACCTCTAAATGTTAAATGA