lowQualScore : 1111111111111111 1111111111111111111111111111111111 222222222222222222222 1111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111111111111 1 1 44444444444444444444 222 2222 2222 1 88888888888888888888888888888888 2 1 22 2222222 1 1 22 1 33 1 33 1 1 11 444444444444444444444444444444 3333 33333333 11 222222222 11 0000000000000000000000000000000000 333 1 7777777777777777777777777 44444444 22222 555555555 111111 1 22 2 1 11 55 1 8888 4444 555555555555555555555 1 11 1 1 11111111 4 222 1 1 1 2 11 1 11 444444444 11 1 1 22 1 11 11 11 11 111 22 1 1 1 22222 2 0000000000 22 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 1
lowQualScore : 7 8888888888888888 6 6 6 6 6 5 66666666666666666666 111 7 8888 5555 5 00000000000000000000000000000000 0 0 1 33 6 0 6666666 2 0 2 7 2 0 2 3 66 55 3 3 11 6 99 00 0 00 2 6 9 3 7 1 1 3 44 6 444444444444444444444444444444 6666 2 3 2 3 66666666 0 3 2 6 7 8 11 222222222 11 7777777777777777777777777777777777 8 6 1 3 0 1 9 555 0 0 9 2222222222222222222222222 77777777 55555 6 7 555555555 7 4 888888 4 2 5 77 88 3 7 6 22 6 55 6 7 6 5555 6 6 0000 000000000000000000000 7 55 4 5 4 0 1 9 7 22222222 6 0 333 0 6 0 5 5 6 0 3 3 88 6 6 7 88 6 000000000 55 5 0 0 3 88 2 2 3 6 2 33 33 555 22 88 5 999 4 99 2 3 2 3 11 0 4 3 44 1 0 6 77777 6 1 3333333333 22 6 6 9 9 3 6 6 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 6 88888 7 6
lowQualScore : . ................ . . . . . . .................... ... . .... .... . ................................ . . . .. . . ....... . . . . . . . . .. .. . . .. . .. .. . .. . . . . . . . . .. . .............................. .... . . . . ........ . . . . . . .. ......... .. .................................. . . . . . . . ... . . . ......................... ........ ..... . . ......... . . ...... . . . .. .. . . . .. . .. . . . .... . . .... ..................... . .. . . . . . . . ........ . . ... . . . . . . . . . .. . . . .. . ......... .. . . . . .. . . . . . .. .. ... .. .. . ... . .. . . . . .. . . . .. . . . ..... . . .......... .. . . . . . . . ............................................................ . . ..... . .
lowQualScore : 0 0000000000000000 0 0 0 0 0 0 77777777777777777777 777 3 3333 3333 0 77777777777777777777777777777777 0 0 2 00 5 2 5555555 2 0 5 0 0 2 0 2 55 00 0 0 00 5 88 00 0 00 5 0 8 2 0 0 0 3 33 7 000000000000000000000000000000 0000 5 0 5 2 22222222 8 2 5 0 8 0 00 666666666 00 0000000000000000000000000000000000 2 6 0 8 8 4 0 222 6 8 6 0000000000000000000000000 33333333 00000 0 3 000000000 3 7 333333 7 5 0 55 00 0 0 0 00 0 00 0 0 0 0000 0 0 0000 000000000000000000000 0 55 0 5 0 7 0 0 0 33333333 7 0 333 7 7 7 0 0 0 7 3 7 33 0 0 0 33 0 000000000 00 0 7 7 3 33 0 5 0 0 5 88 55 888 22 00 8 888 8 33 0 0 0 0 00 3 3 0 00 7 3 0 77777 7 0 3333333333 33 0 0 0 0 3 7 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 00000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACAGGCTGTGGGGCA----------------ATGCGGGATAACAGA-GGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAA-GAAATCCACTTTATGCCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAATGGAAAT----AATA-T--TTAAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAAT-CAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGG-T-NAAGT-ANATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTAT-GGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGCGCTTGTG-AAAACTATAAAAA-GGACGAAAATAC-T----TAAATA---TATTTCA----T-A-AAAAAATATACTCAGAAATTAAGNCNATTTGTAATTAACNTGCGCAGAAATANAATTCGTTATCAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGCAAAATAACTNATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGA--A----TTAC--AAAAAATATAG------------CA-TAC---------------AAACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCGCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGCTCTCGCAGC--------------AGGGGG--GTGGGGGAGGGG---GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAA-CTATATTCTCTGNAACTGTTAATTAACGTGCAAACA--CTTTGATTCTTTAAATCGTNAAAGAAAAGTTNATCCCAAAAANNCTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGANNTGCAANCCAATTNAAACATGTATCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTG-CTTAAT-CTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGAAGTCGTTACGCGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCGTAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTT-ACCCGATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAANAGACAAGAA--ATAAAGACAA-NAAATGTCCCCAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACNNTGCGNTNATCTNGAATANGTACAGTCATGAGNAATCCNNGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATA--A-T-C---TTATTTTAATATAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTT--GA-AAATG----GT----CGGAT--AAAATGAT---CCAA-TTTCTCAAAAA-----AAAATCTTCATTT
Reference ( gi|1 ) : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGGGGCACACAT---------CAATATGGGATAACAGAAGGTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAA-AGAATCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAATGGAAAT----AATAAT--TTAAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AAT-CAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCG-T-AAAAT-ACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTAT-GCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAA-AGACGAAAATACTT----TAAATATATTATTTCA----T-A-AAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATAAAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGA--A----TAAC--AAAAAATATAG------------CA-TA----------------AAACAGGTCTTATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGCTCTCGCAGC--------------AGGAGG--GTGGGGGAGGGG---GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATT--AC-A-CTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCCC--AAAATCTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCG--ATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACAATATATTTAGACGTGCTTCTTATATATATGGGATTACAGAAAGAAGTATAAAATATTATAAAATGCTGCATATGCGCCTCACTAACATACATTTGCCATGCGAACAATATTTTTTTACAATATTTCAAGATACGATTTATATCATATCAAACATTCATAATTTAAACATATTGTTCATTCAATTAACCATTAAAATGTATATCATTTATGTGCACTATATCCCAACACCCCGTGGAGAATCACCCTTAGGACATTTGCTTCTTCCCTTTAATTCCCAAATATACAAATTGTCAGTTAATCAGTAATTATCAGCCAGCATTTACTACAACGGATTGAAAAGATTGATGAACACTTTACTTCAGTTGCAATTGGATTAAAATCATTAATGAATTATAAATTAAAAAAGGTATAATTAAAATAACAGGTTTCAAGTTTCAATTCTATTTAAAATATGCACTAAAACTGTAATTAATCAAGAGACTGAAATTATATCAAGGGCACTTTCGCGCCAATTTAGAAAATCATTTAGAAACGACATTTGATCATATATGCTAGACAGAAGACACTAGAGAGGAAATACAGATTACACCATAGTAGGTATCCTCCAGGAGAGGCCAAATGTGACCGATGCATTATTTGTCACAGCTCACACTCACCTTTTAATTGCTCATTGATTAGTTAGAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGT-TT-TTTTTTAAATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTA-TTG-ACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAA---TTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTC--AACGAATG----GC----CA-----AAAATGAC---CCTGCTTTTTTAAAAA-AAATAAAATCATTATTT
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCAATGTGGGATTACAGATGGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAA-GAAATCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAATGG-AAT----AATATT--TTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AAT-CAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGGTT-AAAGT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTAT-GGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAAT-GGACGAAAATACAT----TAAATA---TATTTCA----T-A-AAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTT
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACAGGCTGTGGGGCA----------------ATGCGGGATAACAGAATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATATTTTTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATA-TATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGG-TTAAAGT-AGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGT-------------CCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATAT-GGCCCC-AAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAA-GGACGAAAATAC------TAAATA---TATTTCA----TAA-AAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|7 : CCCTCGTCACAGGCTGTGGGGTA----------------ATGTGGGATAACATT-GGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAA-----------------------GATGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAATGCAAAT----AATA-T--TTAAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAAT-CAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGG-T-TAAATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG--CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|9 : ----ATATAAT-CAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATATGGT-T-TAAGT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTAT-G-GCCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTACCCCGTTAATG-AAACCCTCACACATAAAC-AAATTATTTGTACCAAATTTATCAATT-AGAATT-ACAAAAAATATAttacat
gi|2 : cTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATAAAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGA--A----TTAC--AAAACATATAG------------CA-TACAATAGGTCATA----AAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGCATTCGCAGC--------------AGGGTG--GT-GGTGAGGGGTGTATGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACgcatataacaagtcttattgtgtgattta
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTGTATAAA-TAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGA--A----TTAC--AAAAAATATAG------------CA-TACGTACATCAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-GAATATA-TCTTGGGGC--------------AGA--------GGGGAGAGG---GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTATA-A----AC-AGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAAT-CC--AAATTCT-CAA
gi|10 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCAAAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGA--AGTTATGACCAAAAAAATATAGTATACAACAGGTCA-TA----------------AAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGCTCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGG--GTGGGGGGGGGaaatcgt
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCAAAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATTA-ATTA----CAAA--AAAAAATATAG------------CATTA----------------CAGCAGATCATAAAACATGTCTAATTGAG-T-----GATAAAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGA--A----TTAC--AAAAAATATAG------------CA-TA----------------TAACAAGTCTTATTGTGTGATTTA
gi|8 : catataatcagaatgtgtgccaaaccgtgctgtaaaactttaaaacttacgcagaacaaacttgaattagtaatgtttaggatatggtttaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaagtattctattttgctggtatataagttatgtccatagcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcaacattggcgtatacatccctttaaattgctatggccccgggacattgatgtgtactgataataaaaatacacatacatccataatcaagttatcatttacgaagatgctcttaagATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGCTCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG---G-GGACTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAA-CTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCCCAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGG
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAA-CTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|5 : AACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTTTTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCATT---------TTTTTAAAATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATA-TTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAA-ACT-C---TTATTTTAA--TAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTT--GAAATATG----GTGTTGGAGAT--AAAAT-AC---CCAA--TTCTCAAAAA-----AAAATCTTCATTTca
gi|4 : ACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTT-ACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAA-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATA--AATTC---TTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTT--GA--AATAAGGTGT----CG-----GAGATAATATATCCACTTTCTCAAAAACAAATtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|6 : cAAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC-TTTT--TTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAT--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTT--ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTT-ACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGA-TAAATGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCAAAAT---GATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATG--TAGTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATA-----AACCCTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGG----GT----CGGATATAAAATG-T---CCAG-TTTCTCAAAAA-----AAAATCTTCATTTtcttcaatttgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAA-CAAATGTCCCCAACAGTCTCCCAGG-TGGATATGAT-ATGATGATATttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT
Unaligned ( gi|17 ): TTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATGTATCAAGTTCCCCAAAAAAAATCCTCAATGTGTATAGAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111 1111111111111
lowQualScore : 66666666666666666 3333333 222 111 1 222222 1 1 3333333 555555555555 2222 1 2 1 33 222 1 22222222 22222 22222222222222222222222222222 44444444444444 2222 4444444444 22222 44 111 1 11 4444 11 1111111111111 3333333333 111 11 11 11 11 1 111 1 1 11 11111 1 66666 1 4444444444444 2222222 222 1111 1111
lowQualScore : 88888888888888888 2222222 2 444 000 3 4 0 0 0 1 0 888888 3 0 0 2222222 111111111111 6666 0 1 8 1 8 8 1 11 0 0 0 6 0 2 0 44 333 3 1 1 1 1 0 0 99999999 44 8 1 6 99 6 88888 6 77777777777777777777777777777 1 6 888 7 6 77777777777777 2222 4444444444 00000 3 3 3 3 1 2 3 11 1 1 6 444 2 4 88 4 2222 88 3 88 0000000000000 4 22 11 1 0 7 1 1 2 0 7777777777 2 777 3 2 33 33 33 2 33 2 2 2 0 777 0 0 6 0 1 11 1 8 7 55 33 22 1 1 1 1 5 1 222 88888 5 33333 3 33 0 0 3 0 1 0 8888888888888 3333333 1 000 1111 7777 8 8
lowQualScore : ................. ....... . ... ... . . . . . . . ...... . . . ....... ............ .... . . . . . . . .. . . . . . . . .. ... . . . . . . . ........ .. . . . .. . ..... . ............................. . . ... . . .............. .... .......... ..... . . . . . . . .. . . . ... . . .. . .... .. . .. ............. . .. .. . . . . . . . .......... . ... . . .. .. .. . .. . . . . ... . . . . . .. . . . .. .. .. . . . . . . ... ..... . ..... . .. . . . . . . ............. ....... . ... .... .... . .
lowQualScore : 88888888888888888 5555555 0 000 222 5 2 2 2 8 0 0 888888 2 0 0 5555555 222222222222 5555 6 0 0 0 0 0 0 66 6 6 0 0 8 0 0 00 333 3 0 0 0 0 7 8 00000000 88 0 0 7 22 7 33333 7 88888888888888888888888888888 0 0 777 3 7 00000000000000 0000 5555555555 00000 2 2 2 2 0 0 2 22 0 0 7 000 0 0 55 0 5555 00 0 55 0000000000000 0 00 33 0 7 3 0 2 5 2 5555555555 5 555 0 0 88 22 88 0 88 0 5 5 0 222 0 0 5 6 0 00 0 0 6 66 22 00 0 0 0 0 8 0 888 55555 5 55555 2 22 8 0 0 8 4 8 6666666666666 2222222 4 000 2222 0000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGG-TTAA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCCCAAAAA-TCTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAAT-CCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTT-ACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAANAAA-TGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAAAC-T-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGA---A--ATATGGTGTCG--G--ANAAAATGTATCC-ANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
Reference ( family-205 ) : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATGCCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGG-TNAA-GT-ANATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGCGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGNCNATTTGTAATTAACNTGCGCAGAAATANAATTCGTTATCAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGCA-AAATAACTNATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCGCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGNAACTGTTAATTAACGTGCAAACA--CTTTGATTCTTTAAATCGTNAAAGAAAAGTTNATCCCAAAAANNCTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGANNTGCAANCCAATTNAAACATGTATCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTG-CTTAAT-C-TGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGAAGTCGTTACGCGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCGTAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTT-ACCCGATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAANAGACAAGAA--ATAAAGACAANAAA-TGTCCCCAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACNNTGCGNTNATCTNGAATANGTACAGTCATGAGNAATCCNNGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA---T-CTTATTTTAATATAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGA---A--A-ATG--GTCG--G--ATAAAATG-ATCC-AATTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
gi|1 : TTCCCCTCGTCACA---------T-------GCTGTGGGGCACACATCAATATGGGATAACAGAAG-GTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAAAGAA-TCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAAT-G------GAAATAATAATTT-AAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCG-TAAA-AT-ACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTATGCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAAAGACGAAAATACTTTAAATATATTATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTT
gi|1 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TAAC-----AAAAAATATAGCA-TA----------------AA-----------ACAGGTCTTATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGC-TCTCGCAGC--------------AGGAGGGTG--GGGGAGGGG-----GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATT--AC-ACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCCCAAAA--TCTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCG--ATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|1 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAAT-CCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC--TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGTTTT-TTTTTAA-ATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTA-TTG-ACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAAAAAA-TGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAATTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTCAAC--G--A-ATG--GCCA-------AAAATG-ACCCTGCTTTTTTAAAAAAAATAAAA-TCATT-ATTTtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|10 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCA-AAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGAAGTTATGACCAAAAAAATATAGTA-TAC---------------AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTG--GGGGGGGG
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCA-AAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATT--AA-TTACAAA--AAAAAATATAGCATTACAGCAGATCATA----AA-----------ACATGTCTAATTGAGTGA--TA----------------AAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC-
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAACAAA-TGTCCCCAACAGTCTCC-CAGGTGGATATGAT-ATGATGATATca
gi|17 : TTTGGAATAATGTGGTTGA---A--ATATGGTGTCG--G--AGATAATGTAT-C-AAGTTCCCCAAAA----AAAA-TCCTC-gttttagttcaaatatattttgaaaaat
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATTACAGATG-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAAT-G------GAA-TAATA-TTTTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGG-TTAAAGT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAATGGACGAAAATACATTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTTatgtgtatagaa
gi|2 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAACATATAGCA-TAC---------------AATAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-ATTCGCAGC--------------AGGGTGGT---GGTGAGGGGTGTATGTT--CTTTGGTTAATAGA-----ACannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-ATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATA-TTT-TTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATATATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGGTTAAA-GT-AGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTG-------------GTCCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATATGG-CCCCAAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC--TAAATA---TATTTCATAAAAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTT
gi|3 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGT--GTATAAATAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACGTACATCAGGTCATAAA-----------ACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-G--AATATATCTTGGGGC--------------AGAGGGG--------AGAGG-----GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTA-----TAAACAGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAATCC---AAATTCT-CAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|4 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAAT-CCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTT-ACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAAAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATAAAT-T-CTTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGA---AATA-AGGT-GTCG--G--AGATAATATATCC-ACTTTCTCAAAAA----CAAATTCTTCAATTTaaatcgt
gi|5 : cAACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATAC-TGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTT-TTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCATT-------T-TTTTAAA-ATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATA-TTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAAAC-T-CTTATTTTA--ATAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGA---A--ATATGGTGTTGGAG--ATAAAAT--ACCC-AA-TTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|6 : AAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG-------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC--TTTT--TTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAT--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTT--ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTT-ACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGATAAA-TGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCA-AA--ATGATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATGT--AGTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATAAAC-C-CTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATA--A-GGG--GTCG--GATATAAAATG--TCC-AGTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|7 : CCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGTA-------ATGTGGGATAACATT-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGA-----------------------TGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAAT-G------CAAATAATA-TTT-AAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAATCAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGG-TTAA-ATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG-CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTTttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
gi|8 : ATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG-----GGGA-CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCCCAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGtacat
gi|9 : C--ATATAATCAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATATGGT-TTAA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGG-CCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTACCCCGTTAATG-AAA
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAT----------------A-----------ACAAGTCTTATTGTGTGATTTAccctcacacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaattacaaaaaatatagcatataacaagtcttattgtgtgattta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666 3333333 222 111 1 222222 1 1 3333333 555555555555 2222 1 2 1 33 222 1 22222222 22222 22222222222222222222222222222 44444444444444 2222 4444444444 22222 4444444 222 11 2222 11 4444444444444 111 11 1 11 11 1 11 2 11 11111 1 1 1 1 11 1 1111
lowQualScore : 88888888888888888 2222222 444 000 3 0 0 0 0 1 0 888888 3 0 0 2222222 111111111111 6666 0 1 8 8 8 11 0 0 0 6 0 3 44 333 3 0 99999999 44 8 6 99 6 88888 6 77777777777777777777777777777 1 6 444 7 6 77777777777777 2222 4444444444 00000 3 3 7 3 1 3 66 1 3333333 000 1 88 1 4444 22 1 88 9999999999999 1 1 7 1 2 0 3 2 2 777 1 33 0 3 33 33 2 2 0 1 33 0 1 0 11 1 8 7 55 33 3 5 0 88888 5 0 0 0 3 1 0 0 1 0 1 0 1 0 11 1 6 0 8 11 0 7777 8 8
lowQualScore : ................. ....... ... ... . . . . . . . ...... . . . ....... ............ .... . . . . . .. . . . . . . .. ... . . ........ .. . . .. . ..... . ............................. . . ... . . .............. .... .......... ..... . . . . . . .. . ....... ... . .. . .... .. . .. ............. . . . . . . . . . ... . .. . . .. .. . . . . .. . . . .. . . . .. .. . . . ..... . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . .. . .... . .
lowQualScore : 88888888888888888 5555555 000 222 5 8 2 2 8 0 0 888888 2 0 0 5555555 222222222222 5555 6 0 0 0 0 66 6 6 0 0 8 3 00 333 3 8 00000000 88 0 7 22 7 33333 7 88888888888888888888888888888 0 0 222 3 7 00000000000000 0000 5555555555 00000 2 2 0 2 2 2 55 2 3333333 333 0 55 0 5555 00 0 55 5555555555555 0 0 3 2 5 2 5 5 5 555 0 88 0 2 88 88 5 5 0 0 22 0 0 6 00 0 0 6 66 22 0 2 8 55555 5 0 2 0 2 2 8 0 0 8 4 8 4 6 00 0 6 6 0 88 8 0000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTT-AA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAANAAA-TGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGG--AGATAATGTATCC-ANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
Reference ( family-205 ) : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTT-AA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTT-ACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAANAAA-TGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGG--ANAAAATGTATCC-ANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
gi|1 : TTCCCCTCGTCACA---------T-------GCTGTGGGGCACACATCAATATGGGATAACAGAAG-GTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAAAGAA-TCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAAT-G------GAAATAATAATTT-AAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCGTA-AA-AT-ACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTATGCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAAAGACGAAAATACTTTAAATATATTATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTT
gi|1 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TAAC-----AAAAAATATAGCA-TA----------------AA-----------ACAGGTCTTATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGC-TCTCGCAGC--------------AGGAGGGTG--GGGGAGGGG-----GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATTA--CA-CTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAA-T-CTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCGATAT--ACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|1 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC--TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGTTTT-TTTTTAA-ATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTATTG-ACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAAAAAA-TGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAATTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTCAACGAATG--GCC-----AAAAATG-ACCCTGCTTTTTTAAAAAAAATAAAA-TCATT-ATTTtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|10 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCA-AAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGAAGTTATGACCAAAAAAATATAGTA-TAC---------------AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTG--GGGGGGGG
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCA-AAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATT--AA-TTACAAA--AAAAAATATAGCATTACAGCAGATCATA----AA-----------ACATGTCTAATTGAGTGA--TA----------------AAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC-
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAACAAA-TGTCCCCAACAGTCTCC-CAGGTGGATATGAT-ATGATGATATca
gi|17 : TTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGG--AGATAATGTATCA-AGTTCCCC-AAAA----AAAA-TCCTC-gttttagttcaaatatattttgaaaaat
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATTACAGATG-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAAT-G------GAA-TAATA-TTTTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGGTT-AAAGT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAATGGACGAAAATACATTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTTatgtgtatagaa
gi|2 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAACATATAGCA-TAC---------------AATAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-ATTCGCAGC--------------AGGGTGGT---GGTGAGGGGTGTATGTT--CTTTGGTTAATAGA-----ACannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-ATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATA-TTT-TTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATATATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGGTTAAA-GT-AGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTG-------------GTCCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATATGG-CCCCAAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC--TAAATA---TATTTCATAAAAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTT
gi|3 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGT--GTATAAATAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACGTACATCAGGTCATAAA-----------ACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-G--AATATATCTTGGGGC--------------AGAGGGG--------AGAGG-----GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTA-----TAAACAGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAATCCAAATTCTCAAAAAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|4 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTT-TTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTT-ACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAAAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ATT-CTTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGTGTCGG--AGATAATATATCC-ACTTTCTCAAAAA----CAAATTCTTCAATTTgt
gi|5 : cAACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTT-TTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCATT-------T-TTTTAAA-ATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATATTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAA-ACT-CTTATTTTA--ATAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGG--AGATAAAATACCC-AA-TTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|6 : AAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC--TTTT-TTT-A--TAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAT--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA--TAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTTACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGATAAA-TGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCA-AA--ATGATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATGTA--GTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATAA-ACC-CTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGGGTCGGATATAAAATG--TCC-AGTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|7 : CCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGTA-------ATGTGGGATAACATT-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGA-----------------------TGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAAT-G------CAAATAATA-TTT-AAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAATCAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGGTT-AA-ATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG-CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTTttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
gi|8 : ATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG-----GGGA-CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCC-------CAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGtacat
gi|9 : C--ATATAATCAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATATGGTTT-AA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGG-CCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTAC
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAT----------------A-----------ACAAGTCTTATTGTGTGATTTAcccgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaattacaaaaaatatagcatataacaagtcttattgtgtgattta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666 3333333 222 111 1 222222 1 1 3333333 555555555555 2222 1 1 2 1 33 222 1 22222222 22222 22222222222222222222222222222 44444444444444 2222 4444444444 22222 4444444 1 11 2222 11 4444444444444 111 1 3333 11 1 11 11 11111 1 1 1 1 1111
lowQualScore : 88888888888888888 2222222 444 000 3 0 0 0 0 1 0 888888 3 0 0 2222222 111111111111 6666 0 1 6 8 11 0 0 0 6 0 3 44 333 3 0 99999999 44 8 6 99 6 88888 6 77777777777777777777777777777 1 6 444 7 6 77777777777777 2222 4444444444 00000 3 3 3 3 1 3 66 1 3333333 7 3 1 88 1 4444 22 1 88 9999999999999 1 1 7 1 2 0 3 2 2 777 1 0 0000 33 3 2 0 1 33 3 3 1 0 11 99 7 55 33 3 5 0 88888 5 0 0 0 3 1 0 0 1 0 1 0 1 0 5 111 8 11 0 7777 8 8
lowQualScore : ................. ....... ... ... . . . . . . . ...... . . . ....... ............ .... . . . . .. . . . . . . .. ... . . ........ .. . . .. . ..... . ............................. . . ... . . .............. .... .......... ..... . . . . . . .. . ....... . . . .. . .... .. . .. ............. . . . . . . . . . ... . . .... .. . . . . .. . . . . .. .. . .. .. . . . ..... . . . . . . . . . . . . . . . ... . .. . .... . .
lowQualScore : 88888888888888888 5555555 000 222 5 8 2 2 8 0 0 888888 2 0 0 5555555 222222222222 5555 6 0 0 0 66 6 6 0 0 8 3 00 333 3 8 00000000 88 0 7 22 7 33333 7 88888888888888888888888888888 0 0 222 3 7 00000000000000 0000 5555555555 00000 2 2 2 2 2 2 55 2 3333333 3 3 0 55 0 5555 00 0 55 5555555555555 0 0 3 2 5 2 5 5 5 555 0 0 8888 88 2 5 0 0 22 2 2 0 6 00 00 6 66 22 0 2 8 55555 5 0 2 0 2 2 8 0 0 8 4 8 4 6 0 888 0 88 8 0000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTT--ATAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACAT--AAAAATATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATATATCC-ANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
Reference ( family-205 ) : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTT---ATAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACAT--AAAAATATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-NAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATGTATCC-ANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
gi|1 : TTCCCCTCGTCACA---------T-------GCTGTGGGGCACACATCAATATGGGATAACAGAAG-GTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAAAGAA-TCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAAT-G------GAAATAATAATTT-AAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCGTAAA-AT-ACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTATGCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAAAGACGAAAATACTTTAAATATATTATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTT
gi|1 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TAAC-----AAAAAATATAGCA-TA----------------AA-----------ACAGGTCTTATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGC-TCTCGCAGC--------------AGGAGGGTG--GGGGAGGGG-----GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATT--AC-ACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------C-AAAAT-CTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCG--ATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|1 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC-TTTTTTTTT--ATAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACAT--AAAAATATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGTTTT-TTTTTAA-ATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTATTG-ACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAATTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTCAACGAATG--GCCAAA---AATG-ACCCTGCTTTTTTAAAAAAAATAAAA-TCATT-ATTTtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|10 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCA-AAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGAAGTTATGACCAAAAAAATATAGTA-TAC---------------AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTG--GGGGGGGG
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCA-AAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATT--AA-TTACAAA--AAAAAATATAGCATTACAGCAGATCATA----AA-----------ACATGTCTAATTGAGTGA--TA----------------AAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC-
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAA-CAAATGTCCCCAACAGTCTCC-CAGGTGGATATGAT-ATGATGATATca
gi|17 : TTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATGTATCA-AGTTCCCC-AAAA----AAAA-TCCTC-gttttagttcaaatatattttgaaaaat
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATTACAGATG-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAAT-G------GAA-TAATA-TTTTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAATGGACGAAAATACATTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTTatgtgtatagaa
gi|2 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAACATATAGCA-TAC---------------AATAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-ATTCGCAGC--------------AGGGTGGT---GGTGAGGGGTGTATGTT--CTTTGGTTAATAGA-----ACannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-ATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATA-TTT-TTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATATATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGGTTAAAGT-AGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTG-------------GTCCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATATGG-CCCCAAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC--TAAATA---TATTTCATAAAAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTT
gi|3 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGT--GTATAAATAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACGTACATCAGGTCATAAA-----------ACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-G--AATATATCTTGGGGC--------------AGAGGGG--------AGAGG-----GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTA-----TAAACAGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAATCCAAATTCTCAAAAAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|4 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTT---ATAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACAT--AAAAATATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTTACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAA-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ATT-CTTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGTGTCGGAGATAATATATCC-ACTTTCTCAAAAA----CAAATTCTTCAATTTgt
gi|5 : cAACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTTTTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCAT-------TT-TTTTAAA-ATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATATTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAA-ACT-CTTATTTTA--ATAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAAAATACCC-AA-TTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|6 : AAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC-TTTTTTT----ATAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACAT--AAAATTATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA--TAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTTACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGA-TAAATGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCA-AA--ATGATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATGTA--GTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATAA-ACC-CTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGGGTCGGATATAAAATGTCC-AGTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|7 : CCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGTA-------ATGTGGGATAACATT-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGA-----------------------TGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAAT-G------CAAATAATA-TTT-AAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAATCAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGGTTAA-ATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG-CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTTttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
gi|8 : ATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG-----GGGA-CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCC-------CAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGtacat
gi|9 : C--ATATAATCAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATATGGTTTAA-GT-ACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGG-CCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTAC
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAT----------------A-----------ACAAGTCTTATTGTGTGATTTAcccgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaattacaaaaaatatagcatataacaagtcttattgtgtgattta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666 3333333 222 111 1 222222 1 1 3333333 555555555555 2222 1 2 1 33 222 1 22222222 22222 22222222222222222222222222222 44444444444444 2222 4444444444 22222 4444444 222 11 2222 11 4444444444444 111 11 11 11 1 11 1 11 11111 1 1 1 1 1111
lowQualScore : 88888888888888888 2222222 444 000 3 0 0 0 0 1 0 888888 3 0 0 2222222 111111111111 6666 0 1 3 0 11 0 0 0 6 0 3 44 333 3 0 99999999 44 8 6 99 6 88888 6 77777777777777777777777777777 1 6 444 7 6 77777777777777 2222 4444444444 00000 3 3 7 3 1 3 66 1 3333333 000 1 88 1 4444 22 1 88 9999999999999 1 1 7 1 2 0 3 2 2 777 1 33 3 33 33 2 2 0 1 33 5 1 0 11 99 7 55 33 3 5 0 88888 5 0 0 0 3 1 0 0 1 0 1 0 1 0 88 11 0 7777 8 8
lowQualScore : ................. ....... ... ... . . . . . . . ...... . . . ....... ............ .... . . . . .. . . . . . . .. ... . . ........ .. . . .. . ..... . ............................. . . ... . . .............. .... .......... ..... . . . . . . .. . ....... ... . .. . .... .. . .. ............. . . . . . . . . . ... . .. . .. .. . . . . .. . . . .. .. . .. .. . . . ..... . . . . . . . . . . . . . . .. .. . .... . .
lowQualScore : 88888888888888888 5555555 000 222 5 8 2 2 8 0 0 888888 2 0 0 5555555 222222222222 5555 6 0 2 8 66 6 6 0 0 8 3 00 333 3 8 00000000 88 0 7 22 7 33333 7 88888888888888888888888888888 0 0 222 3 7 00000000000000 0000 5555555555 00000 2 2 0 2 2 2 55 2 3333333 333 0 55 0 5555 00 0 55 5555555555555 0 0 3 2 5 2 5 5 5 555 0 22 2 88 88 5 5 0 0 22 5 0 6 00 00 6 66 22 0 2 8 55555 5 0 2 0 2 2 8 0 0 8 4 8 4 6 22 88 8 0000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
Reference ( family-205 ) : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
gi|1 : TTCCCCTCGTCACA---------T-------GCTGTGGGGCACACATCAATATGGGATAACAGAAG-GTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAAAGAA-TCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAAT-G------GAAATAATAATTT-AAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCGT-AAAATACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTATGCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAAAGACGAAAATACTTTAAATATATTATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTT
gi|1 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TAAC-----AAAAAATATAGCA-TA----------------AA-----------ACAGGTCTTATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGC-TCTCGCAGC--------------AGGAGGGTG--GGGGAGGGG-----GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATTA--CA-CTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAA-T-CTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCGATAT--ACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|1 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGTTTT-TTTTTAA-ATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTA-TTGACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAATTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTCAACGAATG--GCCAAAAATGAC---CCTGCTTTTTTAAAAAAAATAAAA-TCATT-ATTTtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|10 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCA-AAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGAAGTTATGACCAAAAAAATATAGTA-TAC---------------AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTG--GGGGGGGG
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCA-AAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATT--AA-TTACAAA--AAAAAATATAGCATTACAGCAGATCATA----AA-----------ACATGTCTAATTGAGTGA--TA----------------AAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC-
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAA-CAAATGTCCCCAACAGTCTCC-CAGGTGGATATGAT-ATGATGATATca
gi|17 : TTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATGTATCAAGTTCCCC-AAAA----AAAA-TCCTC-gttttagttcaaatatattttgaaaaat
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATTACAGATG-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAAT-G------GAA-TAATA-TTTTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAATGGACGAAAATACATTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTTatgtgtatagaa
gi|2 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAACATATAGCA-TAC---------------AATAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-ATTCGCAGC--------------AGGGTGGT---GGTGAGGGGTGTATGTT--CTTTGGTTAATAGA-----ACannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-ATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATA-TTT-TTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATATATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGGTTAAAGTAGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTG-------------GTCCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATATGG-CCCCAAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC--TAAATA---TATTTCATAAAAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTT
gi|3 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGT--GTATAAATAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACGTACATCAGGTCATAAA-----------ACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-G--AATATATCTTGGGGC--------------AGAGGGG--------AGAGG-----GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTA-----TAAACAGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAATCCAAATTCTCAAAAAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|4 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTTACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAA-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ATT-CTTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGTGTCGGAGATAATATATCCACTTTCTCAAAAA----CAAATTCTTCAATTTgt
gi|5 : cAACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTTTTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCATT-------T-TTTTAAA-ATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATATTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAA-ACT-CTTATTTTA--ATAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAAAATACCCAA-TTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|6 : AAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC-TTTTTTT--A--TAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAT--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA--TAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTTACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGA-TAAATGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCA-AA--ATGATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATGTA--GTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATAA-ACC-CTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGGGTCGGATATAAAATGTCCAGTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|7 : CCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGTA-------ATGTGGGATAACATT-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGA-----------------------TGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAAT-G------CAAATAATA-TTT-AAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAATCAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGGTTAAATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG-CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTTttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
gi|8 : ATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG-----GGGA-CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCC-------CAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGtacat
gi|9 : C--ATATAATCAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATAT-GGTTTAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGG-CCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTAC
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAT----------------A-----------ACAAGTCTTATTGTGTGATTTAcccgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaattacaaaaaatatagcatataacaagtcttattgtgtgattta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666 3333333 222 111 1 222222 1 1 3333333 555555555555 2222 1 2 1 33 222 1 22222222 22222 22222222222222222222222222222 44444444444444 2222 4444444444 22222 4444444 222 11 2222 11 4444444444444 111 11 11 11 1 11 1 11 11111 1 1 1 1 1111
lowQualScore : 88888888888888888 2222222 444 000 3 0 0 0 0 1 0 888888 3 0 0 2222222 111111111111 6666 0 1 3 0 11 0 0 0 6 0 3 44 333 3 0 99999999 44 8 6 99 6 88888 6 77777777777777777777777777777 1 6 444 7 6 77777777777777 2222 4444444444 00000 3 3 7 3 1 3 66 1 3333333 000 1 88 1 4444 22 1 88 9999999999999 1 1 7 1 2 0 3 2 2 777 1 33 3 33 33 2 2 0 1 33 5 1 0 11 99 7 55 33 3 5 0 88888 5 0 0 0 3 1 0 0 1 0 1 0 1 0 44 11 0 7777 8 8
lowQualScore : ................. ....... ... ... . . . . . . . ...... . . . ....... ............ .... . . . . .. . . . . . . .. ... . . ........ .. . . .. . ..... . ............................. . . ... . . .............. .... .......... ..... . . . . . . .. . ....... ... . .. . .... .. . .. ............. . . . . . . . . . ... . .. . .. .. . . . . .. . . . .. .. . .. .. . . . ..... . . . . . . . . . . . . . . .. .. . .... . .
lowQualScore : 88888888888888888 5555555 000 222 5 8 2 2 8 0 0 888888 2 0 0 5555555 222222222222 5555 6 0 2 8 66 6 6 0 0 8 3 00 333 3 8 00000000 88 0 7 22 7 33333 7 88888888888888888888888888888 0 0 222 3 7 00000000000000 0000 5555555555 00000 2 2 0 2 2 2 55 2 3333333 333 0 55 0 5555 00 0 55 5555555555555 0 0 3 2 5 2 5 5 5 555 0 22 2 88 88 5 5 0 0 22 5 0 6 00 00 6 66 22 0 2 8 55555 5 0 2 0 2 2 8 0 0 8 4 8 4 6 88 88 8 0000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
Reference ( family-205 ) : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
gi|1 : TTCCCCTCGTCACA---------T-------GCTGTGGGGCACACATCAATATGGGATAACAGAAG-GTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAAAGAA-TCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAAT-G------GAAATAATAATTT-AAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCGT-AAAATACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTATGCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAAAGACGAAAATACTTTAAATATATTATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTT
gi|1 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TAAC-----AAAAAATATAGCA-TA----------------AA-----------ACAGGTCTTATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGC-TCTCGCAGC--------------AGGAGGGTG--GGGGAGGGG-----GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATTA--CA-CTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAA-T-CTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCGATAT--ACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|1 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGTTTT-TTTTTAA-ATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTA-TTGACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAATTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTCAACGAATG--GCCAAAAATGAC---CCTGCTTTTTTAAAAAAAATAAAA-TCATT-ATTTtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|10 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCA-AAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGAAGTTATGACCAAAAAAATATAGTA-TAC---------------AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTG--GGGGGGGG
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCA-AAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATT--AA-TTACAAA--AAAAAATATAGCATTACAGCAGATCATA----AA-----------ACATGTCTAATTGAGTGA--TA----------------AAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC-
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAA-CAAATGTCCCCAACAGTCTCC-CAGGTGGATATGAT-ATGATGATATca
gi|17 : TTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATGTATCAAGTTCCCC-AAAA----AAAA-TCCTC-gttttagttcaaatatattttgaaaaat
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATTACAGATG-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAAT-G------GAA-TAATA-TTTTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAATGGACGAAAATACATTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTTatgtgtatagaa
gi|2 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAACATATAGCA-TAC---------------AATAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-ATTCGCAGC--------------AGGGTGGT---GGTGAGGGGTGTATGTT--CTTTGGTTAATAGA-----ACannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-ATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATA-TTT-TTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATATATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGGTTAAAGTAGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTG-------------GTCCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATATGG-CCCCAAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC--TAAATA---TATTTCATAAAAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTT
gi|3 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGT--GTATAAATAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACGTACATCAGGTCATAAA-----------ACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-G--AATATATCTTGGGGC--------------AGAGGGG--------AGAGG-----GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTA-----TAAACAGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAATCCAAATTCTCAAAAAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|4 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTTACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAA-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ATT-CTTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGTGTCGGAGATAATATATCCACTTTCTCAAAAA----CAAATTCTTCAATTTgt
gi|5 : cAACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTTTTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCATT-------T-TTTTAAA-ATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATATTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAA-ACT-CTTATTTTA--ATAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAAAATACCCAA-TTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|6 : AAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC-TTTTTTT--A--TAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAT--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA--TAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTTACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGA-TAAATGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCA-AA--ATGATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATGTA--GTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATAA-ACC-CTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGGGTCGGATATAAAATGTCCAGTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|7 : CCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGTA-------ATGTGGGATAACATT-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGA-----------------------TGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAAT-G------CAAATAATA-TTT-AAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAATCAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGGTTAAATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG-CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTTttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
gi|8 : ATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG-----GGGA-CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCC-------CAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGtacat
gi|9 : C--ATATAATCAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATAT-GGTTTAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGG-CCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTAC
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAT----------------A-----------ACAAGTCTTATTGTGTGATTTAcccgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaattacaaaaaatatagcatataacaagtcttattgtgtgattta
blockSeqs : TGCTGTGTCGCACACAT . TG AAA A G C AAATTC A . T ATCATTG GCGAATCATATC TCTC T A C AT C A A AT . A AAAAATTA CT T G CA G GACCA T CGTACATCAGGTCATAAA C T CCA T A GTGTGTGTGTGTGT AGAG TGTATGTT TTATA T A A T G A TG T AAATTCT AAA A AT A . AA T AT . T G A A G T C C TGT C AT T CA AA G G G T TA T T AT TA N NN TG N N ATA A . . A T A C T T TG GT . T A
blockSeqs : G . AT AA A C . . A . . . . TC T A C TT . T . . . . . TA . . . . AAA . CAACAGGTCATAAA C G ACG T . . TG GGGA . T A G T A A AT G . AT T . T G A A C . A T T . . G G . A A T G . C A TA NN G C AAT A . . A A . A C A TA CT . . .
blockSeqs : G . G . . T . . . . . . . . T C T AG . T . TT . . . . . . CAGCAGATCATAAA C A CCC T . . T GT . . A A . T . . A A . . . C . A . . . . . . . T . . A . A A T TG C . A . . . . T . A C T AA GT . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . CAATAGGTCATAAA T A CCA . . . . . . T . A . T A AA A . . .
blockSeqs : . . . . . TA . . . . .
blockSeqCons : CAACAGGTCATAAA*************** NA ****
originalCons : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC---------------AA-----------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
finalCons : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACAACAGGTCATAAA---------------ACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT
Alignments
lowQualScore : 66666666666666666 3333333 222 111 1 222222 1 1 3333333 555555555555 2222 1 2 1 33 222 1 22222222 22222 1111 44444444444444 2222 4444444444 22222 4444444 1 11 2222 11 4444444444444 111 11 11 11 1 11 1 11 11111 1 1 1 1 1111
lowQualScore : 88888888888888888 2222222 444 000 3 0 0 0 0 1 0 888888 3 0 0 2222222 111111111111 6666 0 1 3 0 11 0 0 0 6 0 3 44 333 3 0 99999999 44 8 6 99 6 88888 6 4444 1 3 1 6 444 7 6 77777777777777 2222 4444444444 00000 3 3 3 3 1 3 66 1 3333333 7 3 1 88 1 4444 22 1 88 9999999999999 1 1 7 1 2 0 3 2 2 777 1 33 3 33 33 2 2 0 1 33 5 1 0 11 99 7 55 33 3 5 0 88888 5 0 0 0 3 1 0 0 1 0 1 0 1 0 44 11 0 7777 8 8
lowQualScore : ................. ....... ... ... . . . . . . . ...... . . . ....... ............ .... . . . . .. . . . . . . .. ... . . ........ .. . . .. . ..... . .... . . . . ... . . .............. .... .......... ..... . . . . . . .. . ....... . . . .. . .... .. . .. ............. . . . . . . . . . ... . .. . .. .. . . . . .. . . . .. .. . .. .. . . . ..... . . . . . . . . . . . . . . .. .. . .... . .
lowQualScore : 88888888888888888 5555555 000 222 5 8 2 2 8 0 0 888888 2 0 0 5555555 222222222222 5555 6 0 2 8 66 6 6 0 0 8 3 00 333 3 8 00000000 88 0 7 22 7 33333 7 2222 0 2 0 0 222 3 7 00000000000000 0000 5555555555 00000 2 2 2 2 2 2 55 2 3333333 3 3 0 55 0 5555 00 0 55 5555555555555 0 0 3 2 5 2 5 5 5 555 0 22 2 88 88 5 5 0 0 22 5 0 6 00 00 6 66 22 0 2 8 55555 5 0 2 0 2 2 8 0 0 8 4 8 4 6 88 88 8 0000 0 0
consensus : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC----AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
Reference ( family-205 ) : TTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATAACAGA-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAAANAATAAAAT-G------GAAATAATA-TTT-AAAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATATC--ATATAATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATNAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTTAAAATCTGACAGTGCTTGTG-AAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC-TTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTGTA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAC----AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCNCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGTG--GGGGAGGGG-----GTG--CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------CAAAAAT-CTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTNTAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATCGATATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGANTAATCATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATNNTNGATTTGATTTGAGTAACAGAACATGTAATGNTCTGTCTTAATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACCAGATNTATAAACTAATTAAAACATGTGTCATGTACTTATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGANGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACGTTATACAGAAATATTTTATAAAACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTNA-ATAAATTTTAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTATTTTACCCNATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCAACAATCTCCACGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACCGTGCGGTAATCTGGAATATGTACAGTCACGAGAAATCCCGAAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ACT-CTTATTTTAATATAAATAATATCATTGGAAAGCTTAAT-ANAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAANATATCCANTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTT
gi|1 : TTCCCCTCGTCACA---------T-------GCTGTGGGGCACACATCAATATGGGATAACAGAAG-GTAGTGTCGATGTCCAATACGTACCTGAAAGAA-TCCTCTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACAGGGAATAAAAT-G------GAAATAATAATTT-AAAAAAAAGTACGTCTATAA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAATTTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATCCGT-AAAATACATATATTTAAAGAGTAACGATAAAATACGTTTTATAATCTAGGTATACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACCTGAACGGGTAATCTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTGCAATTGCTATGCCCCCCGAGACATTGGTGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGATGCTCTAAAAATCTGATAGTGTTTGTG-AAAACTATAAAAAAGACGAAAATACTTTAAATATATTATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGAAACTTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATAAAATTCGTTATTAAATGTGTT
gi|1 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCCCGTTAATGGAACCCTCATACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TAAC-----AAAAAATATAGCA-TAA----AACAGGTCTTA------------TTGTGTGACTTATGGGGATACTGGGATTAAAATAACATAAACCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTTACGC-TCTCGCAGC--------------AGGAGGGTG--GGGGAGGGG-----GTGTTCTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGGTATGTCTATGTATATATT--AC-ACTATATTCTCTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACATTCTTTGATTCTTTAAATCGTAAAAGAAAAGTTCATCC-------C-AAAAT-CTACAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTTTAGTTTATTTTAGTTTGTATGATATCG--ATATACATAATACAGTTTAACCAAACAGATTAATTATAAATATATCCATAATTTGAAAAAGATATAACACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTTTAATGAATTTTATTGAATGTAATTTTGGATTTA--TTAAGTAACAGAACATGTAATGATCTGTCTTAATCATGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|1 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACCAGATATATAAACTAATTAAAACATGTGTTATGTGCATATTGGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTG-GATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACGTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAAAGTTATACAGAAATATGTTATAAGACTATCGATTC-TTTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATGATATCCTTTTTAATTCCTTATACTTAATAAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAAAATTGTTGTTTT-TTTTTAA-ATAAATTTTAAGCAATTATATGTGCGTGTACGTA-TTGACCCCATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCACGAACAGACAAGAA--ATAAAGACAA-AAAATGTCCCCGATAATCTCCCCGGACGGGCGTCATAATAACGACATAAATTACCATGCGGTAATCTGGAATATGGACAGTAACGAGAAATCCCGAAGGTAGCCGATGTTTTCCGATTTGTAAAAAA--A--TATAGTAGTGTTTCT-AAAAAGTGTAAAAAGGACCAAAAAGATAAGAGTAATTATTTTAATCTAAATGACATCACTGGGAAGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTAATAAGTACAAA---AGAATA----GGTCAACGAATG--GCCAAAAATGAC---CCTGCTTTTTTAAAAAAAATAAAA-TCATT-ATTTtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagaaccagatatataaactaattaaaacatgtgttatgtgcatattggcatttaccaaatgaaaacatggtttctgtcttaatcctgaaggctggattaattgttataagatatgtaattcgacgtcgttacacgaaacgtctgcataaacaccagtgtttgaagaaaagttatacagaaatatgttataagactatcgattctttttttttataataacagttatttattccttcttaagaagtcttatgcataatgatatcctttttaattccttatacttaataaaatacataaaaatataaatacaatgaccataaaattgttgtttttttttaaataaattttaagcaattatatgtgcgtgtacgtattgaccccataacacaatttaaattgctttataacttcacgaacagacaagaaataaagacaaaaaatgtccccgataatctccccggacgggcgtcataataacgacataaattaccatgcggtaatctggaatatggacagtaacgagaaatcccgaaggtagccgatgttttccgatttgtaaaaaaatatagtagtgtttctaaaaagtgtaaaaaggaccaaaaagataagagtaattattttaatctaaatgacatcactgggaagcttaatacaatatcttgttatgctaataagtacaaaagaataggtcaacgaatggccaaaaatgaccctgcttttttaaaaaaaataaaatcattattt
gi|10 : ttcccctcgtcacatgctgtggggcacacatcaatatgggataacagaaggtagtgtcgatgtccaatacgtacctgaaagaatcctctttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacagggaataaaatggaaataataatttaaaaaaaagtacgtctataataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaactttaaattttacgcggaacaaaattgtatcaataaggtttaggatatccgtaaaatacatatatttaaagagtaacgataaaatacgttttataatctaggtatactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatacctgaacgggtaatctcgatttgcgacattttcgtatacatcccttgcaattgctatgccccccgagacattggtgtatactgataataaaaatacacatatatccataatcaagttatcatttacgaggatgctctaaaaatctgatagtgtttgtgaaaactataaaaaagacgaaaatactttaaatatattatttcataaaaaaatatactcagaaattaagaaactttgtaattaacgtgcgcagaaataaaattcgttattaaatgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtttataaaataactcattttaccccgttaatggaaccctcatacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaataacaaaaaatatagcataaaacaggtcttattgtgtgacttatggggatactgggattaaaataacataaaccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgtttacgctctcgcagcaggagggtgggggagggggtgttctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatggtatgtctatgtatatattacactatattctctgaaactgttaattaacatgcaaacattctttgattctttaaatcgtaaaagaaaagttcatcccaaaatctacaattaattcatttcgcctttgattgctatttttagtttattttagtttgtatgatatcgatatacataatacagtttaaccaaacagattaattataaatatatccataatttgaaaaagatataacacgttttatttaaggtaacaaataattttaatgaattttattgaatgtaattttggatttattaagtaacagaacatgtaatgatctgtcttaatcatggtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaatatatttagacgtgcttcttatatatatgggattacagaaagaagtataaaatattataaaatgctgcatatgcgcctcactaacatacatttgccatgcgaacaatatttttttacaatatttcaagatacgatttatatcatatcaaacattcataatttaaacatattgttcattcaattaaccattaaaatgtatatcatttatgtgcactatatcccaacaccccgtggagaatcacccttaggacatttgcttcttccctttaattcccaaatatacaaattgtcagttaatcagtaattatcagccagcatttactacaacggattgaaaagattgatgaacactttacttcagttgcaattggattaaaatcattaatgaattataaattaaaaaaggtataattaaaataacaggtttcaagtttcaattctatttaaaatatgcactaaaactgtaattaatcaagagactgaaattatatcaagggcactttcgcgccaatttagaaaatcatttagaaacgacatttgatcatatatgctagacagaagacactagagaggaaatacagattacaccatagtaggtatcctccaggagaggccaaatgtgaccgatgcattatttgtcacagctcacactcaccttttaattgctcattgattagttagTTT-TCGTTCCAGTATGTA--------TGTACTCTGCA-AAATAATTAATTTTACCCCGAAAATGAAACCCTCCGACATAAACAAATTATTTATACCAAATTTG-TTCAAATAAGAAGTTATGACCAAAAAAATATAGTA-TAC----AACAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTGATGGGGATACTGGAATTAAAATTGTATACCACATGCTATGAACATATCTTTGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-TCTCGCAGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTGGGTG--GGGGGGGG
gi|11 : TTATCCTTCCAGTATACA--------TGTAGTTAGCA-AAATAACTAATTTCACCCCATTAATGAAACCCTCACACAAATATAAATTATTTGTATCAAATTTAGTC--AATT--AA-TTACAAA--AAAAAATATAGCATTAC----AGCAGATCATAAAACATGTCTAATTGAGTGA--TA----------------AAAATGACATAACGCGTGCTGTGAACATATGTTGATGACATATTTTATTGTCAACGC-
gi|14 : GTTAATAAATTATAACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTGCAGATGGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGGAGCTGTTAATTAACGTGCAAACATGCTTTGATTCTATAAATCGTTAAAGAA
gi|15 : TTAAATGTCTTTCTAACTTCGTGAAAAAACAAGAA--ATAAAGACAA-CAAATGTCCCCAACAGTCTCC-CAGGTGGATATGAT-ATGATGATATca
gi|17 : TTTGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTCGGAGATAATGTATCAAGTTCCCC-AAAA----AAAA-TCCTC-gttttagttcaaatatattttgaaaaat
gi|2 : TTCCCCTCGTCACATGCTGTGTCGCACACATGCTGTGGGGCA-------ATGTGGGATTACAGATG-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAA-TCCACTTTATACCTCACTGATGGGCAAATTAAACACTTGAGAACACAGAATAAAAT-G------GAA-TAATA-TTTTAAAAAAACGTACGTCTATTA-------TAAATT------------ATA----ATA-AATCAGAATATGTGCCAAACTGTGCTATGAAATTTTAAAACCTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAGGTTTAGGATATCGGTTAAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACGTTTCATTATCTAGGATTACTGTTTTACTGGTATATAATTTATGTCCACAGCTGTAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCGACATTTTCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGGCCCCCGAGACATTGATGTATACTGATAATAAAAATACACATATATCCA-AA-------ATCTTTTACGAGGATGCTGTTAAAATCTGACAGTGCTTGTA-AAAACTATAAAATGGACGAAAATACATTAAATA---TATTTCAT-AAAAAAATATACTCAGAAATTAAGACAATTTGTAATTAACGTGCGCAGAAATACAATTTGTTATCAAATGTGTTatgtgtatagaa
gi|2 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTATCGTTCCAGTATATAAAAAATTATGTAGTTTATA-AAATAACTCATTTTACCTTGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTATCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAACATATAGCA-TAC----AATAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTGACTTATTGGGATACTGGGATTAAAATAACATACCCCATGCTATGAACATATCTTGGGGCCATATTTTATTGTTAACGC-ATTCGCAGC--------------AGGGTGGT---GGTGAGGGGTGTATGTT--CTTTGGTTAATAGA-----ACannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatataaaaaattatgtagtttataaaataactcattttaccttgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtatcaaatttatcaattagaattacaaaacatatagcatacaataggtcataaaacatgtctaattgtgtgacttattgggatactgggattaaaataacataccccatgctatgaacatatcttggggccatattttattgttaacgcattcgcagcagggtggtggtgaggggtgtatgttctttggttaatagaac
gi|3 : agtcctttaaatattttgactcgaagtaaacaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcccctcgtcacatgctgtgtcgcacacatgctgtggggcaatgtgggattacagatggtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaatccactttatacctcactgatgggcaaattaaacacttgagaacacagaataaaatggaataatattttaaaaaaacgtacgtctattataaattataataaatcagaatatgtgccaaactgtgctatgaaattttaaaacctacgcggaacaaaattgtataaataaggtttaggatatcggttaaagtacatatatttaaagtgtaacgataaaatacgtttcattatctaggattactgttttactggtatataatttatgtccacagctgtaaagattgcttttatactggaacgggtaaactcgatttgcgacattttcgtatacatccctttaaattgctatggcccccgagacattgatgtatactgataataaaaatacacatatatccaaaatcttttacgaggatgctgttaaaatctgacagtgcttgtaaaaactataaaatggacgaaaatacattaaatatatttcataaaaaaatatactcagaaattaagacaatttgtaattaacgtgcgcagaaatacaatttgttatcaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCCCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGCA-------ATGCGGGATAACAGA-ATGTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGAAAATCCACTTTATGCTTTACTGATGGACAAATTAAACACTTGAGAACAAACAATAAAATCGAAATTCGAAATAATA-TTT-TTAAAAACGTACGTCTATAA-------TAAATTGCGAATCATATCATATCTCATATATTCAGAATATGTACCAAACTGTGCTATGAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATAAATAAAGTTTAGGTTATCGGTTAAAGTAGATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAGGTATACTATTTTACTG-------------GTCCACAGATGTAAAGAGTGCTTTTATACTGGAACGGGTAAGCTCAATTTGCGACATTGCCGTATGCATCCCTTTAAATTGATATGG-CCCCAAGACATTGATGTAAACTGATAATAAAAATACACATATATCCAAAATCAAGTTATCATTTACGAAGATTCTCTTAAAATCTGATAGTGCTTGTGAAAAACTATAAAAAGGACGAAAATAC--TAAATA---TATTTCATAAAAAAAATATACTCAGAAATTAAGCCCATTTGTAATTAACTTGCGCAGAAATAAAATTCTTTATTAAATGTGTT
gi|3 : TTTATCGTTCCAGTATATA--------TGTAGT--GTATAAATAACTCATTTTGCCCCGTTAATGAAACCCTTACACATAAACAAATTATTTGTACCATTTTTT-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TACGTACATCAGGTCATAAAACATGTCTAATTGTGTAACTTATGGGGATACTGTGATAAGAAT------------------AACATA--------CCACATGCTAT-G--AATATATCTTGGGGC--------------AGAGGGG--------AGAGG-----GT---CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACAGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATGATATGTCCATGTA-----TAAACAGCTATATTC-CTGAAACTGTTAATTAACATGCAAACAATCTTTGATTCTTTAAACCGTGAAAGAAAAATTAATCCAAATTCTCAAAAAT-Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcgttccagtatatatgtagtgtataaataactcattttgccccgttaatgaaacccttacacataaacaaattatttgtaccatttttttcaattagaattacaaaaaatatagcatacgtacatcaggtcataaaacatgtctaattgtgtaacttatggggatactgtgataagaataacataccacatgctatgaatatatcttggggcagaggggagagggtctttggttaatagaacatgtgacagtttatatcggtggcttaattacaaatgatatgtccatgtataaacagctatattcctgaaactgttaattaacatgcaaacaatctttgattctttaaaccgtgaaagaaaaattaatccaaattctcaaaaatcgt
gi|4 : ttcccctcgtcacaggctgtggggcaatgcgggataacagaatgtagtatcgatgtccaatatgtactttaagaaaatccactttatgctttactgatggacaaattaaacacttgagaacaaacaataaaatcgaaattcgaaataatatttttaaaaacgtacgtctataataaattgcgaatcatatcatatctcatatattcagaatatgtaccaaactgtgctatgaaactttaaaacttacgcggaacaaaattgtataaataaagtttaggttatcggttaaagtagatatatttaaagtgtaacgataaaatacattttataatctaggtatactattttactggtccacagatgtaaagagtgcttttatactggaacgggtaagctcaatttgcgacattgccgtatgcatccctttaaattgatatggccccaagacattgatgtaaactgataataaaaatacacatatatccaaaatcaagttatcatttacgaagattctcttaaaatctgatagtgcttgtgaaaaactataaaaaggacgaaaatactaaatatatttcataaaaaaaatatactcagaaattaagcccatttgtaattaacttgcgcagaaataaaattctttattaaatgtgttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAGATGTACAAACCAATTTAAACATGTGTTATGTACTTTTTAGCATTTACCAAATGAAAACATGGTTTCTGTCTTAATCCTGAAGGCTGCGATTAATTGTTATAAGATAT---GTAATTCGACCTCGTTACACGAAACGTCTGCATAAACACCTGTGTTTGAAGAAACGTTATACATAAATATTTTATAAAACTATCGATTC--TTTTTTTTA--TAATAACAGTTATTTATTCCTTCTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACGTCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATGAAATACATAAAAA--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTTGTTTTTTATATAAATTTAAAGCAATTCTATGTGCGTGTACGTA-TTTACCCTATAACACAATTTAAATTG--------CTTCATGAACAGACAAGAAATATAAAGACAA-AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATAAAAAAATA--TATAGTAGTGATTTT-AAAAAGTGGAAAAAGGACCAAAGAGATAA-ATT-CTTATTTTAATATAAATAATATTATTGGCATGCTTAAT-ACAATATCTTGTTATGCTGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGTGTCGGAGATAATATATCCACTTTCTCAAAAA----CAAATTCTTCAATTTgt
gi|5 : cAACCAAAATTGTAATTTA-TTAAAAAATGTATCCTGTTCTTATTGACATTTACCAAATGAAAACATGGTTTTTGACTTAATACTGAAGGCTGCAATTAATTGTTTTAAGATATTGTGTAATTCAAAGTTGTTACACAAAACATTTGCAAAAACACAAGTGTTTGAAGAAACGTTCTACAGAAATATTTTATAAAACTTTTGAATCATTTTTTTTTACATAAAAACAGTTATTTATTCCTTCTAAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTGCTAATACTAAGTAAAATACATAAAAAAATATAAATGTAATGACCGTAGCATT-------T-TTTTAAA-ATAAATTTTAACCAATTCTTTGTGCATCTACATATTTTACCCGATAGCACAAATTAAATTGCTTTATAACTTCATGAAAAGACAAGAA--ATAAAGACAATAAAATGTCCCAAACAATCTCCATGGGTGGGCGTCATAATGATGATATAAATTACAGTGCGGTTATCTGGAATAAGTACAGTCATGAGTAATCCCGAAGGTTGCCAATGTTTGCCGACTTGTAAACAA--A--TATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTTTAAAGGACCAAAAAGATAA-ACT-CTTATTTTA--ATAAATAATATCAATGGAAAGCTTAATAAAAATATCTTGTTATGCAGATAAGTACAAATTCGGAATAATGTGGTTGAAATATGGTGTTGGAGATAAAATACCCAA-TTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTgtatagaacatatagagaagctaggtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccaaaaattaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaactcgtagaggacattttaaataacactttgtgataagtacacatttcatattttaaacggttattgattgatgaagattcaactaaaatcgtccttctttgtttatagtaaaaatattatcggattttctcgcgacacagaaattgaaagttttgt
gi|6 : AAACATGTATCATGTACTCATTGGCATTTACCAAATGAAAACATG------------------AAGGCTGCGATTACTTGTTATAAAATAT---GTAATTCAAAGTCGTTACGCGAAACATCTGCATAAACACCAGTGTTTGAAGAAACATTATACAGAAATATTTTATAAAACTATTGATTC-TTTTTTT--A--TAATAACAGTTATTTATTCCTTTTTAAGAAGTCTTATGCATAATAACATCCTTTTTAATTCCTAATACTTAATAAAATACATAAAAT--TATAAATACAATGACCATAGAATTGTTGTGTT-TTTTTTA--TAAATTTTAAGCAATTCTATGTGTATGTACATATTTTACCCAATAACACAATTTAAATTGCTTTATAACTTCGTGAACTGACAAGAA--ATAAAGACGA-TAAATGTCGCCATTAATCTCCATGGGTGGGCGTCA-AA--ATGATATAAATTACCCTGCGTTAATCTCGAATATGTA--GTCATGAGAAATCCATGAGGTTGCCGATGTTTGCCGACTTGTAAAAAA--AATTATAGTAGTGTTTCTAAAAAAGTGTAAAAAGGACCTAAGTGATAA-ACC-CTTATTTTAATAGAAATAATATCATCGGAAAGCTTAAT-AAAGTATCTTGCTATGCTGATAAGTACAAATTTGGAATAATGTGGTTGAAATAAGGGGTCGGATATAAAATGTCCAGTTTCTCAAAAA----AAAA-TCTTC-ATTTtgtatagaacatatagaggaattgagtgattgtcttaaatcttaaaaaggaccgaaaattaataaatttaaaattatggaaaaataaccaacttgaagaggacattttaaacaacattttatgataagtacaaatttaaaacggttattgatctatgaagattaaactaaaatagtccttctttgtttatagtaaaaacattatcatattttcacgcgacacctgtatcgaaagtt
gi|7 : CCCTCGTCACA---------G-------GCTGTGGGGTA-------ATGTGGGATAACATT-G-GTAGTATCGATGTCCAATATGTACTTTAAGA-----------------------TGGGCAAATTAAACACTTAATAACAAATAATAAAAT-G------CAAATAATA-TTT-AAAAAAACGAACGTCTATAAATCATTGCGAATC------------ATATC--ATATAATCAGAATTTGTGCCAAATTGTACTATAAAACTTTAAAACTTACGCGGAACAAAATTGTATCAATAAGGTTTAGGATATTGGTTAAATTAAATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTATGTATACTATTCCACTGGTATATATTTTATGTCCACAGCTGGAAAGATTGCTTTTATACTGGAACGGATAAACTCGATTTGCGACATTGTCGTAAACATCCCTTTAAATTGCTATAG-CCCCGAGACATTGATGTATATTGATAATAAAAATACACATATATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAGGTTGCTCTTttgtatagaacatatagagaaaatggatgattgtcttaatcgtaaaaaggaccaaaaactaattaatttaaaattatgaaaaaataatcaacgtgcagaagacattttaaacaacattttgtgataagtaaaaatttgatattttaaacggttattgatttataaagattaaactaaaactgtccttctttgtttagagtaaaaatattttcagattttcacgcaacaccgatatcg
gi|8 : ATGGGGGTAATTGAATTAAAATAACATACCACATGCTATGAACATA-CTTGGGGCCATATTTTATTGTTCACGC-TCTCGCAGC--------------AGGGGGGAGAGGGGGAGAGG-----GGGA-CTTTGGTTAATAGA-----ACATGTGACTGTTTATATCGGTGGCTTAATTACAAATTGTATGTCCATGTATATATTAAACAACTATATTCTCTGTAACTGTTAATTAACATGCA-------------TCTTTAAATTGTAAAATAAAAGTTCATCC-------CAAAAAAACTGCAATTAATTCATTTCGCCTTTGATTGCTATTTATAGTTTATCTTAGTTTGCGTGATATTGATATATATATAATACAGTTTAACCAAACAGAATAATCATAAATATATCCATAATTTG----AGATATAGCACGTTTTATTTAAGGTAACAAATAATTCTAATGAATTTTATTGAATGTAATAATTGATTTGATTTGAG-------------AATGTTCTGTCTTAATCATGGtacat
gi|9 : C--ATATAATCAGAATGTGTGCCAAACCGTGCTGTAAAACTTTAAAACTTACGCAGAACAAACTTGAATTAGTAATGTTTAGGATAT-GGTTTAAGTACATATATTTAAAGTGTAACGATAAAATACATTTTATAATCTAAGTATTCTATTTTGCTGGTATATAAGTTATGTCCATA------------GCTTTTATACTGGAACGGGTAAACTCGATTTGCAACATTGGCGTATACATCCCTTTAAATTGCTATGG-CCCCGGGACATTGATGTGTACTGATAATAAAAATACACATACATCCATAATCAAGTTATCATTTACGAAGATGCTCTTAAGATTTTAC
gi|9 : ATTTTACCCCGTTAATGAAACCCTCACACATAAACAAATTATTTGTACCAAATTTA-TC--AATTAGAA-TTAC-----AAAAAATATAGCA-TAT----AACAA------------GTCTTATTGTGTGATTTAcccgttaatgaaaccctcacacataaacaaattatttgtaccaaatttatcaattagaattacaaaaaatatagcatataacaagtcttattgtgtgattta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATCTTAAAAAAGACCAAAAATTAATTTATCTTAAATTATGAAAAAATAACTTGTAGTGGACATTTTAACAACATTTTATGATAAGTATAGATTTGATATTTTAAACGGTTATTGATTGATGAAGATTTATCTAAAATCGTCCTTCTTTGTTTATAGTAAAAATATTATCGGATTTTCACGCGACACAGATATCGAAGGTTGGGT
Unaligned ( gi|13 ): TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|16 ): GTTATTGAACATAAATGACGATTCATTTAGATGTTGTTCAAGCTATTATCGGATTTTCAAGTAACACCGATATTGAAAGTTGGGT