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gi|27 : AAATGAGTCTTTACCGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTT
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gi|6 : atTTTT-GGCAAAATCCCGTGTAAA----AAA-GGT--TAATCTATCACAAT-AAAATATTCTATAAA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAACAAGTATTC--AATTAATGTGACGTTGAACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGTATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTCATTTCCAATGAGGTCTTTGGTACTATAC--TTACTAGGAGTATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AAATT-TGATAAACATAATATAAAGTTGAAGACTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACAAGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTGTTTTTATCAC-AAATTT--TGTAT-AA-AAATATTACAATT-AAAAACAT-TGAACATATGTAGTCAACAAGTGCAATAAATTAACTATGCTTTCCTAGTTCTGTCTAATAAATGGGTCATGGCAGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTTTCTTAATGTCAGCAAGCAATGCATTTCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTGGGTACACTAAAATTATATA
gi|7 : tactttGTTTT-GGCAAAATCCAGTGTAAA----AA--GTTAATGATCTTGCACAAT-AAAATACTCTATAGA------AAA-CTATCGTT----ACTTA------AATG-AAA-TGAATT-ACAAGTCTC-AAAGAAGTATT------TAATGCAACATTGGGCATACACTATAGT---GTGTAATAAACCTTTGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAGCAGTATACATTAT-AAAA-TTGCAAT-T-AAATT-AAATAAACACATTATTAAGTTGAAGCCTTTGGAATTTTGAAATTAC-CTCATGGAATGTTCCCATAATATATTTGTTGTTTAC-AAATAT-ATTATTTTTATCAC--ATTTC-TTTTATAAA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGTGCATATCTAGTCAACAAGTGCACTAGATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTGTCTTATAGGTGGGTCTTGTCAGAA-CTTTAAAAGTGACTAATTTTATT-A-TTATTTTAACGTCAGCAAGCAATGCATTCCAATCATTTATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTT
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Reference ( family-1908 ) : TACTGTTTT-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCACAAT-AAAATATTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAAGAAGTATTC--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAAGAGTATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AA-TT-AAATAAACACAATATAAAGTTGAAGACTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCAC-AA-ATTT-GTGTAT-AA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGAGCATATCTAGTCAACAAGTGCAATAAATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTGTCTAATAAATGGGTCTTGACAGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTTTCTTAATGTCAGCAGGCAATGCATTCCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTGGGTACACTAAAATTATATAAATTTGCCCTAGTGGAATAAGAGTGCACATCTTTAACAAAAACGAAATTTTCTTTCATATATGAA-GGACACTTGTC-GTTTACAATTTTAAAAACATGGTTAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTCAAT-A--AAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGTTGACACTTTCTCTAGGTCCCATACCATTAATGAATCTAACAATTTTATTTTGACAGATTTGGAGTTTGTTTCTTAACCCTTCGTTTAAGCTTGG-------------GTACCGAGAAGAACATGAANAGTCCAAATGACATTGTATCAGAGCAGAACATAAATATTTTC--GTTTTAAAATCTAAGAATCTTGCTTGTCTATTCANAAATTT
gi|1 : TACTGTTTT-GACAAAATCCAATGTAAA----AA--GTTAATGATCTATCACAAT-AAACTATTCTATAGA------AA--CTATGGTA----ACTTA------AATA-AAA-TAAATG-GCAAATCCC-AAAGAAGTATTC--AGTTAATGCAACATTCGGTAGACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAAGAGTATACATTAC-AAAA-TTGTAAT-T-AA-TT-AAATAAACACAGTATCAAATTGAAGACTTCGGAATTTGGTAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCAC-AT-TTTT-TTTTAT-AA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGAGCATATCTTGTCAACAAGTTCAATAAATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTATCTAATGAGTGGGTCTTGACAGAA-CTTTAAAAGTGACTAATTGTATTAA-TGTTCTTAACGTAAGCAGGCAATGCACTCCAATCATTGATTGAACTGTAAAAGAAGGTAACATTCTCTTTCCCATAGTATTTTGGTACACTAAAATTATATACATTTGCGCTAGTGGAATAACAGTGCAGATCTTTAACAAAAACAAAATGTTCGTTCATATATGCA-GTATACTTGTC-ATTTACAATTTTAAACACAAGGTTAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTTAATCAGCAAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGATAACACTTTCTTTAGGTCCCATTCCAATAATGAATCTAACAATTATATTTTGACAGGTTTGGATTTTGTTTCTTAACTCGTTTTTTAAACTTGG-------------GTACTGAGAAGAATATGAACATTCCAAATGACATTGTATCAGGGCAGAACAAAAATATTTTC------TAGAATTTAAGAATCTTGCTTGTCTATTCAAAAATTT
gi|10 : TACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-GAAATGTTCTATGGA------ATA-CTATAGTC----ACTTA------AATC-AAA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATGAATGCTACATTGGACAAACATAATATT---GTGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TTGCAATAC-AA-TT-AAATAAACACAAT-CAAA--------TTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCAC-AA-A-TT-GTGCATAAA-AA-TATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAATACAATAAATAAACCAAGCTTTCCTAGtagaa
gi|11 : tacTACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-AAAATGTTCTATGGA------AAA-CTATAGTA----ACTTA------AATC-ATA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATTAATGCTACATTGGACAAACAAAATATT---ATGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTACTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TT----T-T-AA-T----------ACAATAAAATTTTGAAAACTTTGGTATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCAC-AA-A-TT-GTGTAT-AA-AACTATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAAAACAATAAATAAACAAAGCTTTCCTAGCTCTGT
gi|12 : TACTGTTTT-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCA-AAT-AAAATATTCTATAGATTTTTAAAA-ATATGGTT----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTCCAAAGAAGTATTC--TATAAATGTATCATTGAACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGAATTGTCCA-TAAAGCCCGAAAGCT----------GAGACCCTTGGTACTATAC--TTACTACTAGTATACATTAC-ACAG-TTGCAAT-T-AAATT-AAATAAACACAATATAAAGTTGAAGACTCTGTAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCAC-AA-ATTT--TGTATAAA-AA-TATCTCAATT-AAAA-CAT-TGGGCATATCTAGTCAACAAGTG
gi|13 : tacATTTGATCAA-TTTTCTTAATATCAGCAGGTAATGCATTCCAAACATTGATTGCACCGTAAAAGAATGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTCAGTACACTAAAATTCTATAAATTTGCCATAGTGGAATAAGAATGCACGTCTTTAACAAAAATGAATTCTTCTTTCATATATGGA-GGACACTTGTCTGTTTACAATTTTAAAAACATGGTTAAGATGTAATTGCTAATTTATATTTTTTACATTCAAC-A--AAGACATATCAGCATTAGACTACCATTGTTGGCACTTTCTCTATGTCCCACACCA
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gi|15 : tTGTTTT-GGTAAAATCAAA-GTAAATGTTAAA-GTTAATGATCTATCACAAT-AAAATATACTACAG-------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAGAG-GAAAATCTC-AAGGACGTATTCTGAA-TAATGCAATATTAGGAAAACATAATAGT---GTGTAATGA-CCTTGGATTACCCA-TAAAGTCTGAAGGATTTTTACTAATGTGGTCCTTGGTGTTATACTTTTACTAAGAAGATACATTACAAAAA-TTGCAAT-T-AA-gagggttgtcccaaaatagtgtgacaaactttataaaca
gi|16 : tTCCTTGGTACTATAC--TTACTAATAGTATTCATTAC-AAAA-TTGGAAT-T-AAATT-TAATAAACATAATAAAAAATTGAAGACTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCATATAC-AAATAT-ATTATTATTATCAC-AA-ATTTAATGTA--AA-AA-TATTA-------------------CATATCTAGTCAGCAAGTGCAATAAATAAACTATGTTTTCCTAGC
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gi|18 : TACTGTTTC-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTA-----------CAAT-AAAATGTTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----A-----------ATG-AAA-TGAATG-GCAAACATC-AAAGAAGTATTC--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCAGAAGGCTTATTTCCAATG
gi|19 : tacATTGTTTT-GAAAAAATGCAGTGTAAA----AAG-G------ATCTATCACAATAAAAAAATTTTA-AAA------AAA-CTATGGCA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATA-GGAAATCTC-AAAGAAGTATCC--AATTAATGCAACATTGGTTATATATAAT--T---GTATA
gi|2 : taTGTTTT-TGCAGAATCCAAAGTAAA----ACA-GTAACTGATC-------AT-AA-------TATAGA------AA--CTATGGTA----ACT-G------AATG-AAAATGAGTG-A-AAATCTC-AAAGAAGTATTT--AAT-AATGCAACATTGGACAAACATCATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGCTC-TTGGTATAAAAC--TAACTAAGAATATACACTAC-AAAAATTGTAAT-C-AA-TTTAAATAAACATAAGATAAAATTGAAGACTTTGGAATT-AAAAGTTACTCA-ATGGAATGTTTCCATGATAAATTTGACGTTTAT-AAATAT-AGTATTATTATCAC-AATATTA-GTATA--AA-AA-TGTTACAGTT-TAAA-CAT-TGAACATATCGAGTCAACAAGTGCAATAAATAAACTATGTTTTTCTAGCTCTGTCAAAAAAGTGGGTCTTGACAGAA-CTTTTAAAGTGACGTATTTTATCAA-ATTTCTTAATACCAGCAGGCAATACATTCCATTCATTGATTGCACTGTAATAATAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTGGGTACATTAGAATTATATA--TTTGCCCCAGTGGAATAAGAGTGCACATATTTAACAAAAACAAAGTCTTCTTTCATATATGAA-AGACACTTGCC-ATTTACAATTTTGAAAACATGGTTAAGACGCAATTGTTTATTTCTGTTTTCTACATTCAAT-A--AAGACATATCAGTA--AGACCACTATTGCTGACCCTTTCTCTAGGTCACATACCATTAATGAGTCTAACCATTTTATTTTGACATATTTGGAGTTTGTTTCTGAAGCCTGTGTTTAAGCTTAGAACATAGTACATAGTACATAGAAGAACTTGGAAAGTCCAAATTACATTGTATCAGAGCAGAACATAAATATTATCTAGTTTTAAAATCTAAGAACCTGGCTTGTCTGTACATAAATTTcatgttttttaattg
gi|20 : tTACTGTTTC-GACAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCATAAT-AAAATAGTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTAA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAAGAAGAATTC--AATTAATGCAACATTGGATATACATAATAaa
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gi|22 : cTTTT-GGCAAAATCCAGTGTAAA----AAA-GTTAAT---CTATCAAAAT-AAAGTATTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAAAAAGTATTC--AATTAATGCAA
gi|23 : ATTTGCCGTTTAC-AAATAT-AGTATTATTATCAC-AA-A-GT-GTGTAT-AG-AG-TATTACGATT-TAAA-CAC-TG
gi|24 : TATTGTTTT-GGCGAAATCCAATGTAAA----AAA-GCTAATGATC--------T-AAAATATTCTATAG-------AAA-CTATGGTA----ATTTC------AATG-AAA-TGAGTG-GAAAATCCC-Atattgttgtatcatttgcaaacataattaattcgaataagccgaact
gi|25 : atTTCAATAAGGTCCTTGGAACTATAC--TTACTAAGAGTAAACATTAC-AAAA-TTGCAAT-TGAA-TT-AAATAAACACAATATA
gi|26 : AAATATTCTATAGA------AAAACTATGGTA----ATCCA------AATG-AAA-TGAATG-GCAA
gi|27 : AAATGAGTCTTTACCGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTT
gi|3 : TACTGTTTT-GACAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTTATGATCTATCACAAT-AAAACATTATATAGA------AAA-ATATGGTA----ACTAA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAAGAAGTATTT--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATAAT---GAGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAACCCGAAGGCGTATTTTC-----------------T-TAC--TTACTGAGAGTTTACACTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AAATT-AAATAAAAACAATATCAAGTAGAAGACTTTGGAATTTAGAAGTTAC-CACATAGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATATTATTATTATTATCACAAA-ATTT-GTATA--AA-AA-TAATACAATT-AAAA-CAT-TGAGAATGTCTAGTCAACAAGTGCAAAAAATAAACTATGCTTGCCTAGCTCTGTCTAATAAATGGGTCTTGACAGAA-CTTTT----TACCTAATCTTATTAA-CTTTCTTAATGTCAGCAGGCAATGCAATCCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGA-------ATTCTCTTTCCCATATTATTTGGATATACTAAAAT---------------------AATAAGAGTGCACATCTTTAACAAAAACAAAATTTTCGTTTATATATGAA-GGACACTTGTC-ATTTAAAATTTTATAAACTTGGTAAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTTAAT-A--AAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGTTGACACTTTCTCTAGGTTCCGTACCATTAATGAATCTTATAATTTTATTTTGATAGATATGGAGTTTGTTTCTTAACCCTTCGTTTAAGCTTGG-------------GTACCAAGACGAACATGACTAGTCTAAATGACATTGTATCAGAGCAGAATATAAATATTTTCTTGTTTTAAAATCTAAGAATCTTGTTTGTCTATTTAGACAT
gi|4 : acACTGTTTT-GGCAAAATCCAGTGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCACAAT-AAAATATTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTTT------AATG-AAA-TAAATG-GCAGGTCTC-AAAGGGGTGTTC--AATTAATTCAACATTGGACATACATAATAGT---GTGTAATAT-TCTTGGACTGCCAA-TAAAGCCAGAAGGCTTTTTTCCAATGAGGTTCTTGGTACAATAC--TTACTAAGAGTATGCATTAC-AAAA-TTGCAAT-TAAA-TT-AGATAAACATAATATAAAGTTTAAGACTTTGGAATTCGGAAGCCAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCTGTTTAC-AAATAT-TTTATTTTTATCAA-AA-ATTT--TGTATAAA-AA-TGTTACAATTAAAAA-CAT-TGAGCATATCTAATCAACAACTGCAATAAATAAACTATAATATCCTAGCTCTGTCAAATAAATGGGTCTTGACAGAA-CCTTTAAAGTGACTAATTTTCTT-A-TTTTTTTAATGTCAGCAGGCAATGCATTCCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGGAGGTTACA------TTCCCATAGTATTTGGGTACACTAAAATTATATAAATTTGCCCTAGAAGAATAAGAGTGCACATCTTTAACAAAAACGAAATTCTCTTTCATATTTGAA-GGACACTTGTC-ATTTACAATTTTAAAAAgaa
gi|5 : ccTATTGTTTT-GGCAGAATCTAATGTAAA----AG--GTTAATGATCTATCACAAT-AAAATGTATTATA-A------AAA-CTATGG-----------------------------GTG-GAAAATCTC-AAAGAAGAATTC--TATTTATGCAACATTGGACATACATAATAGT---GAGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATAAGGTCCTTAGTACTATAC--T-A-TAAGAATATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AA-AT-AAATAAATACAATATAAAGTTGAAGACTTTTAAACTTGAAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCATTTAC-AGATAT-CTTATTATTATCAT-GA-ATTT--TGTATAAA-AA-TATTACATCT-A---------------ATCTAGTCAAC-------------AAACTATGCATCTCTAG--CTGTCCACTAAGTTGGTCTTGACAGAATTTTTTAAAGTGACTAA-TTTACCAG-TTTTCTAAATATCGGAAAGTAATGCATTCCAATGATTGATTACACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCAATAGTATAACGTTGTACTAAAATTATATAAATTTCCCCTAGTGGAATAATAGTGTACATTTTTAACAAAAA-GAAAGTTTCTTTCATATATGAAGGGATGTTTGCC-GTTTACAATTTTAAAAACATGGTTGAGACATAATTGCTTATTACT
gi|6 : atTTTT-GGCAAAATCCCGTGTAAA----AAA-GGT--TAATCTATCACAAT-AAAATATTCTATAAA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAACAAGTATTC--AATTAATGTGACGTTGAACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGTATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTCATTTCCAATGAGGTCTTTGGTACTATAC--TTACTAGGAGTATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AAATT-TGATAAACATAATATAAAGTTGAAGACTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACAAGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTGTTTTTATCAC-AA-ATTT--TGTAT-AA-AAATATTACAATT-AAAAACAT-TGAACATATGTAGTCAACAAGTGCAATAAATTAACTATGCTTTCCTAGTTCTGTCTAATAAATGGGTCATGGCAGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTTTCTTAATGTCAGCAAGCAATGCATTTCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTGGGTACACTAAAATTATATA
gi|7 : tactttGTTTT-GGCAAAATCCAGTGTAAA----AA--GTTAATGATCTTGCACAAT-AAAATACTCTATAGA------AAA-CTATCGTT----ACTTA------AATG-AAA-TGAATT-ACAAGTCTC-AAAGAAGTATT------TAATGCAACATTGGGCATACACTATAGT---GTGTAATAAACCTTTGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAGCAGTATACATTAT-AAAA-TTGCAAT-T-AAATT-AAATAAACACATTATTAAGTTGAAGCCTTTGGAATTTTGAAATTAC-CTCATGGAATGTTCCCATAATATATTTGTTGTTTAC-AAATAT-ATTATTTTTATCAC----ATTTCTTTTATAAA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGTGCATATCTAGTCAACAAGTGCACTAGATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTGTCTTATAGGTGGGTCTTGTCAGAA-CTTTAAAAGTGACTAATTTTATT-A-TTATTTTAACGTCAGCAAGCAATGCATTCCAATCATTTATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTT
gi|8 : atatgTACTGTTTT-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAAAGTTAATGATCTATTACAAT-AAAACATTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAA----------------GAAGTATAG--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATAAT---ATGTAATAT-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGTTCCTTAGTACTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-A-AA-TT-AAATACACATAATATAAAG--------------ATTTGGAAGTTAC-CACATAGAATTAATCCATAATATATT------------AATAT-ATTATTTTTATCAC-AA-ATTT--TGTAT-AACAA-TACTACAATT-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAGTGC----AATAAACTATGCTTTTCTGGCTCTGTCTAATAAATGGGTCTTGACAGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAATTTTTCTAAATGTCAGCAGGCAATGTATTCTAATCATTGATTGCACTGTAAAAGA
gi|9 : acTACTGTTTTTGGCAAAATCCAGTGTAAA----AAA-GTTTATGGTATATCACAAT-AAAATATTCTATTGA------AAA-CTATGGCATTAAACTTACCGGTAAATG-AAA-CAAATG-GCAACTCTC-AAAGAAGTATTC--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATATT---GTGTAATAA-TCTTCAATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTTCAATGAGGTCCTTCGTACTATAC--TTACTAGGAGTATACATTAC-AAAG-TTGCAAT-TAAA-TT-AAATAAACATAATATAAAGTTGAAGAC--TGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCTATAATATATTTGCAGTTTCCTGGGTAT-ATTG--------AC--A-ATAT-G-GTTT-AA-AA--AT--CATTT-AGAA--ATGTGAACATctttgctgcaagataaacatctccattctcccat
Alignments
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lowQualScore : . .... .. . . . ...... . .... ...... . . . . . .. ... . . .. . . . . . . . . . . . .. .. .. . . . . . . . . . . . . .. .... .. . . ............. .. . ... .
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Reference ( family-1908 ) : TACTGTTTT-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCACAAT-AAAATATTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAAGAAGTATTC--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAAGAGTATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AA-TT-AAATAAACACAATATAAAGTTGAAGACTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A-TTT-GTGTAT-AA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGAGCATATCTAGTCAACAAGTGCAATAAATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTGTCTAATAAATGGGTCTTGACAGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTTTCTTAATGTCAGCAGGCAATGCATTCCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTGGGTACACTAAAATTATATAAATTTGCCCTAGTGGAATAAGAGTGCACATCTTTAACAAAAACGAAATTTTCTTTCATATATGAA-GGACACTTGTC-GTTTACAATTTTAAAAACATGGTTAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTCAAT-A--AAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGTTGACACTTTCTCTAGGTCCCATACCATTAATGAATCTAACAATTTTATTTTGACAGATTTGGAGTTTGTTTCTTAACCCTTCGTTTAAGCTTGG-------------GTACCGAGAAGAACATGAANAGTCCAAATGACATTGTATCAGAGCAGAACATAAATATTTTC-T-GTTTTAAAATCTAAGAATCTTGCTTGTCTATTCANAAATTT
gi|1 : TACTGTTTT-GACAAAATCCAATGTAAA----AA--GTTAATGATCTATCACAAT-AAACTATTCTATAGA------AA--CTATGGTA----ACTTA------AATA-AAA-TAAATG-GCAAATCCC-AAAGAAGTATTC--AGTTAATGCAACATTCGGTAGACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAAGAGTATACATTAC-AAAA-TTGTAAT-T-AA-TT-AAATAAACACAGTATCAAATTGAAGACTTCGGAATTTGGTAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAT-T-TTT-TTTTAT-AA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGAGCATATCTTGTCAACAAGTTCAATAAATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTATCTAATGAGTGGGTCTTGACAGAA-CTTTAAAAGTGACTAATTGTATTAA-TGTTCTTAACGTAAGCAGGCAATGCACTCCAATCATTGATTGAACTGTAAAAGAAGGTAACATTCTCTTTCCCATAGTATTTTGGTACACTAAAATTATATACATTTGCGCTAGTGGAATAACAGTGCAGATCTTTAACAAAAACAAAATGTTCGTTCATATATGCA-GTATACTTGTC-ATTTACAATTTTAAACACAAGGTTAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTTAATCAGCAAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGATAACACTTTCTTTAGGTCCCATTCCAATAATGAATCTAACAATTATATTTTGACAGGTTTGGATTTTGTTTCTTAACTCGTTTTTTAAACTTGG-------------GTACTGAGAAGAATATGAACATTCCAAATGACATTGTATCAGGGCAGAACAAAAATATTTTC-------TAGAATTTAAGAATCTTGCTTGTCTATTCAAAAATTT
gi|10 : TACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-GAAATGTTCTATGGA------ATA-CTATAGTC----ACTTA------AATC-AAA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATGAATGCTACATTGGACAAACATAATATT---GTGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TTGCAATAC-AA-TT-AAATAAACACAAT-CAAA--------TTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A--TT-GTGCATAAA-AA-TATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAATACAATAAATAAACCAAGCTTTCCTAGtagaa
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gi|13 : tacATTTGATCAA-TTTTCTTAATATCAGCAGGTAATGCATTCCAAACATTGATTGCACCGTAAAAGAATGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTCAGTACACTAAAATTCTATAAATTTGCCATAGTGGAATAAGAATGCACGTCTTTAACAAAAATGAATTCTTCTTTCATATATGGA-GGACACTTGTCTGTTTACAATTTTAAAAACATGGTTAAGATGTAATTGCTAATTTATATTTTTTACATTCAAC-A--AAGACATATCAGCATTAGACTACCATTGTTGGCACTTTCTCTATGTCCCACACCA
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gi|26 : AAATATTCTATAGA------AAAACTATGGTA----ATCCA------AATG-AAA-TGAATG-GCAA
gi|27 : AAATGAGTCTTTACCGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTT
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Alignments
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lowQualScore : . .... .. . . . ...... . .... ...... . . . . . .. ... . . .. . . . . . . . . . . . .. .. .. . . . . . . . . . . . . .. .... .. . . ............. .. . ... .
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Reference ( family-1908 ) : TACTGTTTT-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCACAAT-AAAATATTCTATAGA------AAA-CTATGGTA----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTC-AAAGAAGTATTC--AATTAATGCAACATTGGACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAAGAGTATACATTAC-AAAA-TTGCAAT-T-AA-TT-AAATAAACACAATATAAAGTTGAAGACTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A-TTT-GTGTAT-AA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGAGCATATCTAGTCAACAAGTGCAATAAATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTGTCTAATAAATGGGTCTTGACAGAA-CTTTTAAAGTGACTAATTTTATTAA-TTTTCTTAATGTCAGCAGGCAATGCATTCCAATCATTGATTGCACTGTAAAAGAAGGTTACATTCTCTTTCCCATAGTATTTGGGTACACTAAAATTATATAAATTTGCCCTAGTGGAATAAGAGTGCACATCTTTAACAAAAACGAAATTTTCTTTCATATATGAA-GGACACTTGTC-GTTTACAATTTTAAAAACATGGTTAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTCAAT-A--AAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGTTGACACTTTCTCTAGGTCCCATACCATTAATGAATCTAACAATTTTATTTTGACAGATTTGGAGTTTGTTTCTTAACCCTTCGTTTAAGCTTGG-------------GTACCGAGAAGAACATGAANAGTCCAAATGACATTGTATCAGAGCAGAACATAAATATTTTC-T-GTTTTAAAATCTAAGAATCTTGCTTGTCTATTCANAAATTT
gi|1 : TACTGTTTT-GACAAAATCCAATGTAAA----AA--GTTAATGATCTATCACAAT-AAACTATTCTATAGA------AA--CTATGGTA----ACTTA------AATA-AAA-TAAATG-GCAAATCCC-AAAGAAGTATTC--AGTTAATGCAACATTCGGTAGACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTACTATAC--TTACTAAGAGTATACATTAC-AAAA-TTGTAAT-T-AA-TT-AAATAAACACAGTATCAAATTGAAGACTTCGGAATTTGGTAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAT-T-TTT-TTTTAT-AA-AA-TATTACAATT-AAAA-CAT-TGAGCATATCTTGTCAACAAGTTCAATAAATAAACTATGCTTTCCTAGCTCTATCTAATGAGTGGGTCTTGACAGAA-CTTTAAAAGTGACTAATTGTATTAA-TGTTCTTAACGTAAGCAGGCAATGCACTCCAATCATTGATTGAACTGTAAAAGAAGGTAACATTCTCTTTCCCATAGTATTTTGGTACACTAAAATTATATACATTTGCGCTAGTGGAATAACAGTGCAGATCTTTAACAAAAACAAAATGTTCGTTCATATATGCA-GTATACTTGTC-ATTTACAATTTTAAACACAAGGTTAAGACGTAATTGCTTATTTCTATTTTCTACATTTAATCAGCAAGACATATCAGCA--AGACTACCATTGATAACACTTTCTTTAGGTCCCATTCCAATAATGAATCTAACAATTATATTTTGACAGGTTTGGATTTTGTTTCTTAACTCGTTTTTTAAACTTGG-------------GTACTGAGAAGAATATGAACATTCCAAATGACATTGTATCAGGGCAGAACAAAAATATTTTC-------TAGAATTTAAGAATCTTGCTTGTCTATTCAAAAATTT
gi|10 : TACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-GAAATGTTCTATGGA------ATA-CTATAGTC----ACTTA------AATC-AAA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATGAATGCTACATTGGACAAACATAATATT---GTGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TTGCAATAC-AA-TT-AAATAAACACAAT-CAAA--------TTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A--TT-GTGCATAAA-AA-TATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAATACAATAAATAAACCAAGCTTTCCTAGtagaa
gi|11 : tacTACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-AAAATGTTCTATGGA------AAA-CTATAGTA----ACTTA------AATC-ATA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATTAATGCTACATTGGACAAACAAAATATT---ATGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTACTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TT----T-T-AA-T----------ACAATAAAATTTTGAAAACTTTGGTATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A--TT-GTGTAT-AA-AACTATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAAAACAATAAATAAACAAAGCTTTCCTAGCTCTGT
gi|12 : TACTGTTTT-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTAATGATCTATCA-AAT-AAAATATTCTATAGATTTTTAAAA-ATATGGTT----ACTTA------AATG-AAA-TGAATG-GCAAATCTCCAAAGAAGTATTC--TATAAATGTATCATTGAACATACATAATAGT---GTGTAATAA-CCTTGAATTGTCCA-TAAAGCCCGAAAGCT----------GAGACCCTTGGTACTATAC--TTACTACTAGTATACATTAC-ACAG-TTGCAAT-T-AAATT-AAATAAACACAATATAAAGTTGAAGACTCTGTAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGCCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A-TTT--TGTATAAA-AA-TATCTCAATT-AAAA-CAT-TGGGCATATCTAGTCAACAAGTG
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gi|10 : TACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-GAAATGTTCTATGGA------ATA-CTATAGTC----ACTTA------AATC-AAA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATGAATGCTACATTGGACAAACATAATATT---GTGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCAAAGGCTTATTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TTGCAATAC-AA-TT-AAATAAACACAAT-CAAA--------TTTTGGAATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A--TT-GTGCATAAA-AA-TATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAATACAATAAATAAACCAAGCTTTCCTAGtagaa
gi|11 : tacTACTGTTTG-GGCAAAATCCAATGTAAA----AAA-GTTGAT-ATATATCACAAT-AAAATGTTCTATGGA------AAA-CTATAGTA----ACTTA------AATC-ATA-TGAATG-TCAAATT---AAACAAGTATTT--AATTAATGCTACATTGGACAAACAAAATATT---ATGTA-TAA-CATTGGATTGCCCA-TAAAGCCCGAAGGCTTACTTCCAATGAGGTCCTTGGTATTATAC--TTACTAAGAATATACATTAC-AAAA-TT----T-T-AA-T----------ACAATAAAATTTTGAAAACTTTGGTATTTGGAAGTTAC-CACATGGAATGTTTCCATAATATATTTGTCGTTTAC-AAATAT-ATTATTATTATCACAA-A--TT-GTGTAT-AA-AACTATTACAATC-AAAA-CAT-TGAGAATATCTAGTCAACAAAAACAATAAATAAACAAAGCTTTCCTAGCTCTGT
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