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gi|2 : ----GATTTTC--AACAAATGAAG--GTGATATCGCTA-AAAT-TTGGAATTGCT-CAGAATTAATTAA-TTTATCAGAA-TTATTATTTAT---CAGATAGGCTTTGTCATAGGATGTGATTGTTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCGTAAATCGTT-G-AAAACAATTGTTAAAAATATTTGCTGTTTGAGTC---GGACAAGTTATAGGATTTCCATCATCACCAT-CTA--AATAGTGTGTTTGA--A---------------CTAGATAAATCATGAAGGCTGTTCCACAACTGTTTTGGATTACGTTTGTT--CGAGTTAATAGTTTC-ATTGAAA--TAA----TTTTGGTTTGCTTGAAGTATAAGAGTT----TTAACCGTC--TGACGCCAATATGTTTAACTATCAGTATC-TT-TT-TTCTAATGAAAACAATTTCGT--TGTTTTATTGCATCCAGA-ATTTCAATAT-TTATCCAA---TTCGATTGATT----------------TTT-----TT-------TTC------TTTACTCGTTTCTTT-CT----------TTTTT-GGG---GCATGTCTTTCTAATACGGTTTGATACATTTCATTGAATAAGTC---AAATGACTCATCTGGGTT---GTCGTTTATGTTATTTATTGACCACGGTTG-TTCTGTGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCATTGAAGGATT----TCATAGACCTGTAATTTATTGTTTTATGCACTGTACCTT-------TAAGATAATTACCTACCTTGCGAGTAATGCATATAGGATAATGATCACTggttgacttattttcgttactccaatgcggtttgaaacataacactgaataaatcaaatgaatcatctgggttgtcgtcgtacatgtccgttattaacgattgttgttctgagagatcgtttataaacttcttcttcgaatgcgttcatagataatttattgttttatgcatggactttttacattaataattacgttacgggtaatgcatatatgacactgatcacttaattagtacattgtgatattttgtggcatatttgaaaacgaatcgtctgcaaatgtaacataacaacttgtaacttgggtaggtattgtgacatttacagactgtttacgatgaaatcaagctaggtttt
gi|7 : TTGGCAAAGTAGTCATTAAATGTATTAGCAGT---AATTTCTGGATCTAAAATTGGGTTTCCTTCTTCATCAT-TTA--TTAAATGGGTTTGATGATTAG-TCGTTTGGCTCAAGAC--ATTTTTAAGGTTCTTCCATAACTGTTTGGGATTTTTTTTATT--TTCATTTATTGTTT---TTGAAAAGTAGGAT-TTTT--TTTGCTTCATGGATCATAGTCTTAATTAAATTTC--T---ACTGA-GTTTGTAATTTTCTGTGTC-TC-CTGTTTTTTTGAAA--TAGTCTCT--AAGTTTCATGGATTCAGATATATCAATAT-TAAACCAGtatagagtatgtagggacattaaaattagctgtattttgtggcatgtttgaaaacgcttgatctaccaatgtagtggaattacttgttacacggataggtttagttaccaactccgtaagatttatagactcagtgagatcaagccaggtttttgaatagccatcttttcttaataaaatgaaagtcaccaagtactatgcattctttttcttctgacaatgatgtctccaaagatattgtgatattttttttagccaatcaacttttgatgaaggtggtctgtatgtataacagacaagcatttatttagtgcttggtttttaatttcaagacaaacgaactcaattgaatatgtttcaatgtcagttct
gi|3 : attttgtggtgaattcaagcatttattcaaggttggtagtATAAGTTTGCCATTGTCAT-ATGTTATGAATTGTG--TTTGGT-GTTTGGTGGCTTT--CCCAGACAGATCTTTAAGATTTTTCCATAGTTTCTTTGGATTATTTTTGTTTTCT-GTTA-TAGTTGT-TTTGTAA--AAAGATTTTTTTGAAAGATTGAT-TATA---GTT----TTTA-CTTCATTG-CGTCAGAATTTGTACATATCCACATT-TC-TT-TTCTT-----------TTTGTGATGATCTCTTG----------TTTTGAT-T-GCATCTAAAAT------------------------A-GTTT---TATTAAACAAATCGGGCTGATTTAGT--TGT-TTAACACG---CTGTGATTTT-TTAAAAGCATGATTATCTAAAACAGATTTAAACAGATTACTAAATGTTTC---TAAAGCATCATTTGGGTC---ATCATAGATATCTAGTAGAGACCATGGTTGATTCTG-GAGATTTGTTAG-AAAGTT-TGCCTCATTGAATGTTTTGAAAC-TACA---GTAATAAATCACTTTGTGCACAGGGCCTTTCTCCCCTTTGCCCCCTAATTTCCT----GGTAAAACATACAGGATAATGATCACgctggctgtttgggatgcttgacacgctttttctttttaggggcatgattatttaaaatgctaataaatatatctaaaaagtattgaagtgcatcatctgggtcatcaaaaatatctataacagaccatggttgattttgaagctcttgaagaaatgcttcttcattaaattgtttcatgcatctgtagttaatgatattaggtttattgcctttttctggtttctgtattaatttccgtgtcatgcatattgggtaa
gi|11 : aggaagcattggtgtcctctatgcagttgtcatacgatttgaatataatagcaaagaagtcattgaacgtctcagcagcacattgggagtctataTC-ATTGAAA--TAA----TTTTGTTCAGCTTAAAGTATAAGAGTT----TTTACCTTC--TAACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTTT-TT-TTCTAATGAAAATTCGTTT-------TTTATAACATCTAGA-ATTTCAATAT-TTATTTA------------ATT------CGGCT-GA----TTAATTTTC---------------TTTACTCGTTTCTT--------TCTT----TTT-GGG---GCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACGTTTCATTGAACAAGTC---AAATGTCTCATCTGGGTG---TTCATATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCATTGAAGGATT----TCAAATACCTGTAATTTATTGTTTTATGTACTGAACCTT-------AAAGATAATTAACTACCTTGCaaatgaatagtctttcacaaaaacatttaatatatttgatggttgatttgtataaatatgatctattataactgaagttgtttctgttactcttgtaggtttatcaactagttgttgtaggtgaaatgtatccatcaatagggtgaaatttcttgtttgtgagttggttagtagaatattaaacttaaagtcccctgataaagttatttctttatgttctccataaatctgttcaagtaatgttttgattttatttatccattcagttgttgaggattggaggtctgtatacgtaaccaaatataaatgatttttgttttgaatgcttgatctccaactacatagcttcaatttcatctctctcaaattctatccttcttcttcaactgaattcagtatttacatacactatt
gi|5 : TCAGTATATCAT------TTTC--T--ATTATATGGCATCTAGA-ATT-CTGCATTTCTACAATTTGGTTGACTTATT--T--------TCGTTACT-------------------------CCAATGCGGTTTGAAACATAACACTGAATAAATC---AAATGAATCATCTGGGTTGTCGTCGTACATGTCCGTTATTAACGATTGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTTATAAACT--T-CTTCTTCGAATGCGT----TCATAGA----TAATTTATTGTTTTATGCA-TGGACTTT-------TTACATTAATAATTACGTTACGGGTAATGCATATATGACACTGATCACT
gi|7 : atcctgtatgtttcgctatgtttatcaacaaatgaacgtgatatcgctaaacttaatggctgcggattaatatttgtcagatgaggattgtaataccatgtgactacaggaatatctaggtggaacgtctcatgacagttggaaaatagttgctgaaaacagtaactgattcagccggacaagtgtttttcatcattatcctctaaatagcgtttgaattagtggttttattccagctattccacaagtattttgtattacgtttgttaaaattaatatatcgattgtagtaattttgtttggcttgaagtttttaaccttctgtcgccaaaacttacaaAATAG-TC-TCTA-AGTTTCA-----TG------GATTCAGATATATCAATATTAAACCAGGCTGGCTG-TTTGGG--ATGCTTGACACGCTT-TTTCTTTTTAGGG---GCATGATTATTTAAAATGCTAATAAATATATC--TAAA-AAGTATTGAAGTGCATCATCTGGGTC---ATCAAAAATATCTATAACAGACCATGGTTGATTTTGA-AGCTC-TTGAAGAAA-TGCTTCTTCATTAAATTGTT----TCATGCATCTGTAGTTAATtaattagtacattgtgatattttgtggcatatttgaaaacgaatcgtctgcaaatgtaacataacaacttgtaacttgggtaggtattgtgacatttacagactgtttacgatgaaatcaagctaggtttt
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|1 : CTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTTCTATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTCTTTCTGCTAAACGTGTACATTTTCAATTTATGA---ACA--GTACGTCATGGTCAACTAAAGCAAAAGCCTTGGACAAATCAAGATATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAAAATGGTGTGCTCTAAAA-CCAGATTGAC-AAAAGTA----------TACCAGTTTATTATCTTCCATGTATTTTCTAAGATACA-TAC--------T-A-TTATG-T-CT---AGA-ATTAACGATATAATTGGAAGAATTGATAGAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCTCTTATTGTGAATTGGGAAATTGTTTG-CTCGTTT-AAATAATTCAGGAAATGTATTAGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGGTAGTAT-TGGTGCT------ATAACC-AAGACTGACA-TTTTAAGAAACTTG-ACACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TTTGT--CGAGAAGTTGTAATT----GATTGTC--AACAAATGAAGGTGATATCGATGGAATTTGTAATTGCT-CAGAATTAACTTACTTATCATAATTAATATTTATCAGATGAGGATTGTCATAAGATGTTACTGTTGGGTTGTCTCGATGTGACACTTCATAAACCGTTGG-AAAATAACTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAATC-GGAC---ATGTTATAGGATTTCCGTCATCATCAT-CTA---AATAGTGAGTTTGA--GTTTG-TGATTTTAA-TCCAGATAAATCATAAAGGCTGTTCCACATCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAGTTAATAGTTTC-ATTGTAA--TA--G--TTTTGGTTA---GCTTGGCGTATAAGAGTTTTAAGC----TTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTT-TT-TT-CTTATGAAAATTATTT-TGTTA-A-TTT-ATTGCATCCAGA-ATTTCAATATTCATCCAGAATTTCAAT--ATTCATCCAGAATTTCAA-TATTCATCCAA-TTCGGTTGATTTATT--TTTCT--TTACT---CGTTTCTTTCT----T-----TTTTT--G-GCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATTTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTTGTCGTATATGTCAATTATTGACCATTGTTG-TTCTAAGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTACA---TAGATATGTAATTAATTGTTTTATGCACTGGACCTTGT-------AGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCAAATAGAATAATGATCACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgaagttataccagaaacttgagtataatgagttctattttctaaatatgaggaaaaccattttatcgtctttctgctaaacgtgtacattttcaatttatgaacagtacgtcatggtcaactaaagcaaaagccttggacaaatcaagatataatgtaccaacaatttcatttttatctatagctgtaagccagtcatccaatatttttgtgagagccgtttgacaaaaatggtgtgctctaaaaccagattgacaaaagtataccagtttattatcttccatgtattttctaagatacatactattatgtctagaattaacgatataattggaagaattgatagaggcctataatttgatttatcatttttcggtctcttattgtgaattgggaaattgtttgctcgtttaaataattcaggaaatgtattagtgtctaaactactattaaatatctttggtagtattggtgctataaccaagactgacattttaagaaacttgacactcaggccgtctgatcctgtagattttgctttgtcgagaagttgtaattgattgtcaacaaatgaaggtgatatcgatggaatttgtaattgctcagaattaacttacttatcataattaatatttatcagatgaggattgtcataagatgttactgttgggttgtctcgatgtgacacttcataaaccgttggaaaataactgttaaaaatatttgctgtttgaatcggacatgttataggatttccgtcatcatcatctaaatagtgagtttgagtttgtgattttaatccagataaatcataaaggctgttccacatctgttttggattacgtttgttcgagttaatagtttcattgtaatagttttggttagcttggcgtataagagttttaagcttctgacgccaatatgtgtaactatcagtatcttttttcttatgaaaattattttgttaatttattgcatccagaatttcaatattcatccagaatttcaatattcatccagaatttcaatattcatccaattcggttgatttatttttctttactcgtttctttctttttttggcatgtctatctaatacggtttgaaacatttcattgaataagtcaaatgactcgtctgggttgtcgtatatgtcaattattgaccattgttgttctaagagatcattaataaactgtgcttcattgaatgattacatagatatgtaattaattgttttatgcactggaccttgtagataattaactaccttgcgggtaatgcaaatagaataatgatcact
gi|10 : ataacattgttgacttgaatatgccaagacagcgtattatcaatcataactccaagtaattgttcatgtatacttatatcattagcttcatctttgtaataaattaggtgagagtcattacatatgtggttaactttttatatgcttttggaagaaatatacattactttagattttgctgcattgatagacatgcaattacctacacaccatgcatcaacattattgagatctgctgtttagcatttaacgacatttagaagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGATATAGTGTACCAACAATTTCATTCTTATATATAGCTGTAAGTATGTCATCCAAT-AATTGTGTGAGGGCTGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATAGAC-AAATATGTTTTATGTTTTAACAGTTT-TTTTCT--CATGTA-TTTCTAAGATGTA-TAC--------C-----------------------AACGATACAATGGGAAGACTGGAAATAGGCATATAATTTGATT-TA----TTTTCGGTCCTTTTTTGCG-----------GT---------TTT-AAATAATTTAGGAAATGTATTGGTATCTAA-------ACTATTA-TAAAA------AAATCTTTGTTAGTAT-TGGATCT------CAAACA-AAGACTGACATTTTTAAAAAACCTG-ACACTTAGACCGTCTGATCCTGTTGATTTTGC--GATGT--CAAGAGCTTGTAGTTGG--GGT----------GATGAGGGTGATGTCACCGGAATGTAGAACTGC
gi|11 : TC-ATTGAAA--TA--A--TTTTGTTCA---GCTTAAAGTATAAGAGTTTTTACC----TTCTAACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTT-TT-TTTCTAATGAAAA----TT-CGTT--T-TTT-ATAACATCTAGA-AT-----------TTCA-A-------T--ATT----------------TATTTA----A-TTCGGCTG-ATTAAT--TTTCT--T---TACTCG-------TT----TCTTTCTTTTTGGG-GCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACGTTTCATTGAACAAG---TCAAATGTCTCATCTGG---GTGTTCATATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCATTGAAGGATTTCA---AATACCTGTAATTTATTGTTTTATGTACTGAACCTTAA-------AGATAATTAACTACCTTGCac
gi|12 : ATGTACCAACAATCTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCAAAT-ATTTTTGTGAAAGCCGTTTGACAAGAATGGTGTGCTCTAAAA-CCAGATTGACAAAAAATA----------GAACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATATATTAA--------T-GTG-ACGTT-CT---AGA-ATAAATGCTATAATCGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-AATCATTTATCAGTCCCTTTTTGAGAATTGGGACAATTTTTG-CTCGTTT--AATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTTA-------ACTACTATT-TAACTATACATACTTTTGTTAGTAT-TAGAGCT------ATAACT-TAGGCTGACA-TTT
gi|14 : tagtACATTGTCGACTTCGGTATGCCCAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTGATGTCAATAGCTTCGTCTTTGTAATGAATTATGTGAGAGTCATTACATATGCGGTTAACTTT------GCATTTGGGAGAA-ATTTGCATTACTTAAGATTTCACTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCCACATACCATGCATCAACATTATTGAGATTCGCTGATAAGCATTTAACAACACTTGGAAGA
gi|15 : ttAATATTGTCGACTTGGGTATGCCAAAACAGCGTATTATTAATCATAACTCAATGTAATTTTTCATGTATATCTATGCTAATAGCTTTATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTAATTACATATGCGGCTAATTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTTCTTAAGATT------------TAGAT----------TTAGTTACACACCATTTATCAACATTATCAAGGTCCACTGTTAAGCATTTTACATTATTTGGAAGGGA
gi|17 : taaAGTTTAATTT--TCAATGTAATTTTTAA-ATACA-AAG--------C-A-G-ACG-TTCC---AGA-ACTAATGATACAAATGGAATAATTGGTATATGTCTATAATTT-ATTAGACCG-TTTTCGGACCCTTTTAATGAAATGGGACAAGATTTG-CCAGCTT-AACTAACT
gi|18 : attATAACATTGTCGACTTAAGTATGCCAAGACAGCGTATAATAAATCATAACTTCAAGTAATTATTCATGTATACTTATGCTAATAGCTTCATCTTTGTAATTATTTAGGTGAGGGTCGTTGCATACGCAATTAACTTT-------CTTTTTGAAGAA-AT
gi|19 : tATAACATTTTCGACTTGAGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAACTTCATCTTTGTAATGA---------------------ACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAAAATATGTACATTACTT
gi|2 : t----GATTTTC--AACAAATGAAGGTGATATCGCTAAAATTTGGAATTGCT-CAGAATTAATTAATTTATCAGAATTATTATTTATCAGATAGGCTTTGTCATAGGATGTGATTGTTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCGTAAATCGTTG--AAAACAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGATTTCCATCATCACCAT-CTA---AATAGTGTGTTTGA----------------A--CTAGATAAATCATGAAGGCTGTTCCACAACTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAGTTAATAGTTTC-ATTGAAA--TA--A--TTTTGGTTT---GCTTGAAGTATAAGAGTTTTAACC----GTCTGACGCCAATATGTTTAACTATCAGTATCTT-TT-TT-CTAATGAAAACAA-TTTCGTT--G-TTTTATTGCATCCAGA-ATTTCAATATTTATCCA-A--TTC-G---ATT------GATTTTT-----TTT-------TC-------TTTACTCGTTTCT--T---T---C--------------T-----TTTTTGGG-GCATGTCTTTCTAATACGGTTTGATACATTTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCATCTGG---GTTGTCGTTTATGTTATTTATTGACCACGGTTG-TTCTGTGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCATTGAAGGATTTCA---TAGACCTGTAATTTATTGTTTTATGCACTGTACCTTTA-------AGATAATTACCTACCTTGCGAGTAATGCATATAGGATAATGATCACTa
gi|20 : ATCAAGAAAAAATGTACCAACAATATTATTGTTATCAAT-GCTtatagagtatgtagggacattaaaattagctgtattttgtggcatgtttgaaaacgcttgatctaccaatgtagtggaattacttgttacacggataggtttagttaccaactccgtaagatttatagactcagtgagatcaagccaggtttttgaatagccatcttttcttaataaaatgaaagtcaccaagtactatgcattctttttcttctgacaatgatgtctccaaagatattgtgatattttttttagccaatcaacttttgatgaaggtggtctgtatgtataacagacaagcatttatttagtgcttggtttttaatttcaagacaaacgaactcaattgaatatgtttcaatgtcagttct
gi|20 : CAAT-ATTATTGTTATCAATGCTTGACAAGAATGATTTGTTCGAAAT-ACAGATTGTC-ATGAACA----------AAACAGCGTGCATTCTTCtgacaagaatgatttgttcgaaatacagattgtcatgaacaaaacagcgtgcattcttcgaaatgagtgttacatgcctttcaatat
gi|21 : atcaagaaaaaatgtaccaaAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTG-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGCT------ATAACA-GACGCTGACA-TTTTAAAAAACTTG-GCACCCAGGCTGTCTGATCCTGTAGATTTTAC--TATgaaatgagtgttacatgcctttcaatat
gi|22 : ACATTGTCGACTTAGGTGTGCCAAGACAGCGTATTATCA
gi|23 : tAATAGCTTCATCTTTGTAATAAATTAGATGAGAGTCATTACATA----ATTA----T------GCTGTTGAAGGAA-ATATACATTA--GTAAAGTTTGCAGCATTGAGAAACgaatgatcaatgatttaaaacatcagcatatttggtccaatttttataatttaattttcatcatagtaa
gi|24 : ATAACATGGTTGAGTTGGGTATGCTAAGAAAGCATATCATCATTTGTGACTCTAAGT-ATTGTTCATGTATACTTATATTAATAGTTTCAga
gi|25 : GATTTCGGAATGACAAAACAGTGTATTATCAATCATAGCTCCAAGTAA--TTTAATGTTTATTTA
gi|26 : GTTTGACAAAAACGATTTGTTCCAAAG-TCAGGTTGTT-TAGAACA----------AAACAGcagcacatcgtc
gi|27 : AACATTGTCGAATTGGGTATGCCAGGACAGCGTATTATCAATCATCACTCCAcatgc
gi|3 : aATAAGTTTGCCATTGTCAT-ATGTTATG-AATTGTG--TTTGGT-GTTTGGTGGCTTT---CCCAGACAGATCTTTAAGATTTTTCCATAGTTTCTTTGGATTATTTTTGTTTTCTG--TTA-TAGTTGT-TTTGTAA--AA--AGATTTT-TTTGAAAGATTGA-TTATA---GTTTTTACT----TCATTGCGTCAGAATTTGTACATATCCACATTTC-TT-TT-CTT-----------TT-TGT---G-ATG-ATC---TCTTG---TTTTGAT-TGCATCTA-AA---------AT--------AGTTT----TATTAA-ACAAATCGGGCTGATTTAGT--TGTTTAAC---A---CG-------CTGTGAT-----TTTTTAAAAGCATGATTATCTAAAACAGATTTAAACAGATTACTAAATGTT---TCTAAAGCATCATTTGG---GTCATCATAGATATCTAGTAGAGACCATGGTTGATTCTG-GAGATTTGTTAG-AAAGTT-TGCCTCATTGAATGTTTTGAAACTACA---GTAATAAATCACTTTGTGCACAGGGCCTTTCTCCCCTTTGCCCCCTAATTTCCT----GGTAAAACATACAGGATAATGATCAC
gi|4 : aggaagcattggtgtcctctatgcagttgtcatacgatttgaatataatagcaaagaagtcattgaacgtctcagcagcacattgggagtctataATAACATTGTTGACTTGGGTATGCCAGGACAGCGTATTATCAATCATAATTCGAAGTAATTTTTCATGTATACTTATATTAATAGCTTCATCTTTGTAATGGATTA--------------CATATGCGATTAACTTT------GCTTTTGGAAGTT-ATATACATCACTTTAAATTTTGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCCGCATTTTTGAGATCCGCTGTAAAGCA-TTAACAACATTTGGAAGAGAaaatgaatagtctttcacaaaaacatttaatatatttgatggttgatttgtataaatatgatctattataactgaagttgtttctgttactcttgtaggtttatcaactagttgttgtaggtgaaatgtatccatcaatagggtgaaatttcttgtttgtgagttggttagtagaatattaaacttaaagtcccctgataaagttatttctttatgttctccataaatctgttcaagtaatgttttgattttatttatccattcagttgttgaggattggaggtctgtatacgtaaccaaatataaatgatttttgttttgaatgcttgatctccaactacatagcttcaatttcatctctctcaaattctatccttcttcttcaactgaattcagtatttacatacactatt
gi|4 : TGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTTATATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGTGTAATTTGTACATTTTCAATTTTTGA---AC-AAGTACGTCATGGTCAACTACGTCAAAAGCTTTGGGCAAATCGAGATATAATGTACCAACAATTTCATGTTTATATATAGCTGTAAGCCA-TCATCAAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTGTGCTCTAAAA-TCAGAT-------------------------CAGTTTATTTTCTTCCACGTATTTTATAAGATGTA-TGCAAACTATAC-T-G-ACGTT-CT---AGA-ATTATTGATTTAATGGGAATAATTGATATAGACTTAaatatttgaaactgagaggttagtattgtctgttaacatatcaacgacagtattttagtacagtattttgcacagataatggcataatatgaatatcaaaaataaaaggggcctaagacggagccctgaggtacaccagcttttactattataggaactttgaagttataccagaaacttgagtataatgagttatattttctaaatatgaggaaaaccattttatcgtatttctgtgtaatttgtacattttcaatttttgaacaagtacgtcatggtcaactacgtcaaaagctttgggcaaatcgagatataatgtaccaacaatttcatgtttatatatagctgtaagccatcatcaaatatttttgtgagagccgtttgacaagaatggtgtgctctaaaatcagatcagtttattttcttccacgtattttataagatgtatgcaaactatactgacgttctagaattattgatttaatgggaataattgatatagacttaattaaggaaatgtatttgtgtctaaactactattaaatatatcgttggtattggagctgtaacaacggctaacattttaagaaacttggcactcaggccgtctggtcctgtagatta
gi|4 : ataacattgttgacttgggtatgccaggacagcgtattatcaatcataattcgaagtaatttttcatgtatacttatattaatagcttcatctttgtaatggattacatatgcgattaactttgcttttggaagttatatacatcactttaaattttgctgcattgatagacatgcgattagctacacaccatgcatccgcatttttgagatccgctgtaaagcattaacaacatttggaagagaaatatttgaaactgagaggttagtattgtctgttaacatatcaacgacagtattttagtacagtattttgcacagataatggcataatatgaatatcaaaaataaaaggggcctaagacggagccctgaggtacaccagcttttactattataggaacttTAATTAAGGAAATGTATTTGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATATC-GTTGGTAT-TGGAGCT------GTAACA-ACGGCTAACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGGTCCTGTAGATTattaaggaaatgtatttgtgtctaaactactattaaatatatcgttggtattggagctgtaacaacggctaacattttaagaaacttggcactcaggccgtctggtcctgtagatta
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gi|6 : atcctgtatgtttcgctatgtttatcaacaaatgaacgtgatatcgctaaacttaatggctgcggattaatatttgtcagatgaggattgtaataccatgtgactacaggaatatctaggtggaacgtctcatgacagttggaaaatagttgctgaaaacagtaactgattcagccggacaagtgtttttcatcattatcctctaaatagcgtttgaattagtggttttattccagctattccacaagtattttgtattacgtttgttaaaattaatatatcgattgtagtaattttgtttggcttgaagtttttaaccttctgtcgccaaaacttacaatcagtatatcattttctattatatggcatctagaattctgcatttctacaatttggttgacttattttcgttacAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATTT--CGAGAAGTTGTAGTT----G----------C------------TATTGCTGGAATTTGGGATTGCT-CAGAATCAATTAATTTACCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGTTTGTCATAGGATGTGATTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACTGTTGA-AAAATAATTGTTAAAAACACTTTCTGT--TTGTGTC-GGAA---AAGTTATAGGATTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTGAGTTTGA--ACTTG-TGATTTTAA-TCTAGATAAATCATGAAGGCTGTTCCACATCTCTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGTAA--TA--G--TTTTGTTTA---ACTTGAAGTTTAAGAGTATTAAGT----TTCTGACGCCAATAAGTGTAATTATCAGTATCTT-TT-TT-CATATGAAAACTATTT-CGTT--GTTTT-ATGGCATCCAGA-ATTTTAATATTTATCCA-A--TTCGGTTGATTTGT------TTTC-----TTTA-C----TC-----G-TTT--C--TTTCT--T---T---C--------------------TTTTTGGG-GCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATTGCATCGAGTAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTTGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTTTGAGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCTTTGAATGATTTCA---TAGACCAGTAATTAATTTTTTTATGCACTCGATATTTA-------AGATAATTAACTAACTTGCGGGCAATGCAAATAGGATAATGATCACTtaattagtacattgtgatattttgtggcatatttgaaaacgaatcgtctgcaaatgtaacataacaacttgtaacttgggtaggtattgtgacatttacagactgtttacgatgaaatcaagctaggtttt
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Reference ( family-1827 ) : ATAACATTGTCGACTTGGGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAGCTTCATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTCATTACATACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTACTTTAGATTTCGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCAACATTATTGAGATCCGCTGTTAAGCATTTAACAACATTTGGAAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTT-TATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGCTAAACTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTAAGTCGAAAGCCTTGGACAAATCAAGANATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATTGNC-AAAAATA----------NAACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATGTAT----AC---CA----G-ACG-T-CTAGA-ATTAACGATACAATTGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCCCTTTTTGTGAATTGGGANANNNTTTG-CT-CGTTTAAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGC------TATAACAAAGGCTGACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATGT--CGAGAAGTTGTAGTT----GATT-TC--AACAAATGAAGGTGATATCGCTGGAATTTGGAATTGCTCAGAATTAATTAATTTATCAGAATTANTATTTATCAGATGGGGNTTGTCATAGGATGTGACTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACCGTTGG-AAAATAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGNTTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTG-GTTTGA--ATTTG-TGGTTTT-A-TCCAGACAAATCATNAAGGCTGTTCCACANCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGNAA--TA--A--TTTTGTTTN---GCTTGAAGTATAAGAGTTTTAAC----CTTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATC-TC-TT-TTCTTATGAAAACTA-TTCGTT--G-TTT-ATNGCATCCAGA-ATTTCAATATTCATCCAAA--TTC-G-T--ATTTG-T----GAT---TTC--TATTNA-CCAA-TCCGGCTG-TTTA-T---TTTCTT---T----CG-------CT----TTTTTTGGG-GCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATNTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTCGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTTCATAGAC--CTGTAATTNAT--TGT----TTTA-TGCA-----CTGGACCTT-------TNAGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCATATAGGATAATGATCACT
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Reference ( family-1827 ) : ATAACATTGTCGACTTGGGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAGCTTCATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTCATTACATACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTACTTTAGATTTCGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCAACATTATTGAGATCCGCTGTTAAGCATTTAACAACATTTGGAAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTT-TATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGCTAAACTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTAAGTCGAAAGCCTTGGACAAATCAAGANATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATTGNC-AAAAATAN----------AACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATGTAT----AC---CA----G-ACG-T-CTAGA-ATTAACGATACAATTGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCCCTTTTTGTGAATTGGGANANNNTTTG-CT-CGTTTAAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGC------TATAACAAAGGCTGACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATGT--CGAGAAGTTGTAGTT----GAT--TC---AACAAATGAAGGTGATATCGCTGGAATTTGGAATTGCTCAGAATTAATTAATTTATCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGNTTGTCATAGGATGTGACTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACCGTTGG-AAAATAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGNTTTCCATCATCATCAT---CTA--AATAGTG-GTTTGA--ATTTG-TGGTTTT-A-TCCAGATAAATCATNAAGGCTGTTCCACANCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGNAA--TA--A--TTTTGTTTN---GCTTGAAGTATAAGAGTTTTAAC----CTTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTC-TT-TT-CTTATGAAAATTA-TTTC---GTT-GTTT--ATNGCATCCAGA-ATTTCAATATTTATC---CAAA--TTC-G--T-ATTCG--T----GATT---T--C--TNTTTA-CCA--TCG--TG-TTTAT-------------T---TTCTTTCTTTTTTGGGGCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATNTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTCGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTTCATAGAC--CTGTAATTNAT--TGT----TTTA-TGCA-----CTGGACCTT-------TNAGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCATATAGGATAATGATCACT
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Reference ( family-1827 ) : ATAACATTGTCGACTTGGGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAGCTTCATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTCATTACATACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTACTTTAGATTTCGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCAACATTATTGAGATCCGCTGTTAAGCATTTAACAACATTTGGAAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTT-TATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGCTAAACTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTAAGTCGAAAGCCTTGGACAAATCAAGANATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATTGNC-AAAAATA----------NAACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATGTAT----AC---CA----G-ACG-T-CTAGA-ATTAACGATACAATTGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCCCTTTTTGTGAATTGGGANANNNTTTG-CT-CGTTTAAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGC------TATAACAAAGGCTGACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATGT--CGAGAAGTTGTAGTT----GAT--TC---AACAAATGAAGGTGATATCGCTGGAATTTGGAATTGCTCAGAATTAATTAATTTATCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGNTTGTCATAGGATGTGACTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACCGTTGG-AAAATAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGNTTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTG-GTTTGA--ATTTG-TGGTTTT-A-TCCAGATAAATCATNAAGGCTGTTCCACANCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGNAA--TA--A--TTTTGTTT---AGCTTGAAGTATAAGAGTTTTAAC----CTTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTC-TT-TT-CTTATGAAAATTA-TTTCGTTGTTTT-ATNGCATCCAGA-ATTTCAATATTTATC---CAA---TTC-G--TG-TT-G---T---GATTT--T---TNTTTA-CCA--TCG--------------CTTTAC---T---TTCTTTCTTTTTTGGGGCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATNTCATTGAATAAG---TCAAATGNCTCGTCTGGGT---CGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTTCATAGAC--CTGTAATTNAT--TGT----TTTA-TGCA-----CTGGACCTT-------TNAGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCATATAGGATAATGATCACT
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Reference ( family-1827 ) : ATAACATTGTCGACTTGGGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAGCTTCATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTCATTACATACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTACTTTAGATTTCGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCAACATTATTGAGATCCGCTGTTAAGCATTTAACAACATTTGGAAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTT-TATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGCTAAACTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTAAGTCGAAAGCCTTGGACAAATCAAGANATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATTGNC-AAAAATA----------NAACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATGTAT----AC---CA----G-ACG-T-CTAGA-ATTAACGATACAATTGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCCCTTTTTGTGAATTGGGANANNNTTTG-CT-CGTTTAAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGC------TATAACAAAGGCTGACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATGT--CGAGAAGTTGTAGTT----GAT--TC---AACAAATGAAGGTGATATCGCTGGAATTTGGAATTGCTCAGAATTAATTAATTTATCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGNTTGTCATAGGATGTGACTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACCGTTGG-AAAATAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGNTTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTG-GTTTGA--ATTTG-TGGTTTT-A-TCCAGATAAATCATNAAGGCTGTTCCACANCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGNAA--TA--A--TTTTGTTT---AGCTTGAAGTATAAGAGTTTTAACC----TTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTC-TT-TT-CTTATGAAAATTA-TTTCGTTGTTTT-ATNGCATCCAGA-AT--TTCAATATTTATCCAA---TTCGGTTGATT-------ANTTT---TN-TTTA-CCA--TCG--------------CTTTAC---TTTCTTTCTTTTTTGGGGCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATNTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTCGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTTCATAGAC--CTGTAATTNAT--TGT----TTTA-TGCA-----CTGGACCTT-------TNAGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCATATAGGATAATGATCACT
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gi|20 : CAAT-ATTATTGTTATCAATGCTTGACAAGAATGATTTGTTCGAAAT-ACAGATTGTC-ATGAACAA----------AACAGCGTGCATTCTTCtgacaagaatgatttgttcgaaatacagattgtcatgaacaaaacagcgtgcattcttcgaaatgagtgttacatgcctttcaatat
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gi|22 : ACATTGTCGACTTAGGTGTGCCAAGACAGCGTATTATCA
gi|23 : tAATAGCTTCATCTTTGTAATAAATTAGATGAGAGTCATTACATA----ATTA----T------GCTGTTGAAGGAA-ATATACATTA--GTAAAGTTTGCAGCATTGAGAAACgaatgatcaatgatttaaaacatcagcatatttggtccaatttttataatttaattttcatcatagtaa
gi|24 : ATAACATGGTTGAGTTGGGTATGCTAAGAAAGCATATCATCATTTGTGACTCTAAGT-ATTGTTCATGTATACTTATATTAATAGTTTCAga
gi|25 : GATTTCGGAATGACAAAACAGTGTATTATCAATCATAGCTCCAAGTAA--TTTAATGTTTATTTA
gi|26 : GTTTGACAAAAACGATTTGTTCCAAAG-TCAGGTTGTT-TAGAACAA----------AACAGcagcacatcgtc
gi|27 : AACATTGTCGAATTGGGTATGCCAGGACAGCGTATTATCAATCATCACTCCAcatgc
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gi|4 : TGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTTATATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGTGTAATTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTACGTCAAAAGCTTTGGGCAAATCGAGATATAATGTACCAACAATTTCATGTTTATATATAGCTGTAAGCCA-TCATCAAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTGTGCTCTAAAA-TCAGAT-------------------------CAGTTTATTTTCTTCCACGTATTTTATAAGATGTATGCAAAC---TATACTG-ACGTT-CTAGA-ATTATTGATTTAATGGGAATAATTGATATAGACTTAaatatttgaaactgagaggttagtattgtctgttaacatatcaacgacagtattttagtacagtattttgcacagataatggcataatatgaatatcaaaaataaaaggggcctaagacggagccctgaggtacaccagcttttactattataggaactttgaagttataccagaaacttgagtataatgagttatattttctaaatatgaggaaaaccattttatcgtatttctgtgtaatttgtacattttcaatttttgaacaagtacgtcatggtcaactacgtcaaaagctttgggcaaatcgagatataatgtaccaacaatttcatgtttatatatagctgtaagccatcatcaaatatttttgtgagagccgtttgacaagaatggtgtgctctaaaatcagatcagtttattttcttccacgtattttataagatgtatgcaaactatactgacgttctagaattattgatttaatgggaataattgatatagacttaattaaggaaatgtatttgtgtctaaactactattaaatatatcgttggtattggagctgtaacaacggctaacattttaagaaacttggcactcaggccgtctggtcctgtagatta
gi|4 : ataacattgttgacttgggtatgccaggacagcgtattatcaatcataattcgaagtaatttttcatgtatacttatattaatagcttcatctttgtaatggattacatatgcgattaactttgcttttggaagttatatacatcactttaaattttgctgcattgatagacatgcgattagctacacaccatgcatccgcatttttgagatccgctgtaaagcattaacaacatttggaagagaaatatttgaaactgagaggttagtattgtctgttaacatatcaacgacagtattttagtacagtattttgcacagataatggcataatatgaatatcaaaaataaaaggggcctaagacggagccctgaggtacaccagcttttactattataggaacttTAATTAAGGAAATGTATTTGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATATC-GTTGGTAT-TGGAGC------TGTAACAACGGCTAACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGGTCCTGTAGATTattaaggaaatgtatttgtgtctaaactactattaaatatatcgttggtattggagctgtaacaacggctaacattttaagaaacttggcactcaggccgtctggtcctgtagatta
gi|5 : ataacattgttgacttgggtatgccaggacagcgtattatcaatcataattcgaagtaatttttcatgtatacttatattaatagcttcatctttgtaatggattacatatgcgattaactttgcttttggaagttatatacatcactttaaattttgctgcattgatagacatgcgattagctacacaccatgcatccgcatttttgagatccgctgtaaagcattaacaacatttggaagagaaatatttgaaactgagaggttagtattgtctgttaacatatcaacgacagtattttagtacagtattttgcacagataatggcataatatgaatatcaaaaataaaaggggcctaagacggagccctgaggtacaccagcttttactattataggaactttgaagttataccagaaacttgagtataatgagttatattttctaaatatgaggaaaaccattttatcgtatttctgtgtaatttgtacattttcaatttttgaacaagtacgtcatggtcaactacgtcaaaagctttgggcaaatcgagatataatgtaccaacaatttcatgtttatatatagctgtaagccatcatcaaatatttttgtgagagccgtttgacaagaatggtgtgctctaaaatcagatcagtttattttcttccacgtattttataagatgtatgcaaactatactgacgttctagaattattgatttaatgggaataattgatatagactATCCTGTATGTTTCGC--TATGT--T---------TA------------TC---AACAAATGAACGTGATATCGCTA-AACTT--AATGGCTGCGGATTAAT------------------ATTTGTCAGATGAGGATTGTAATACCATGTGACTACAGGAATATCTAGGTGGAACGTCTCAT-GACAGTTGG-AAAATAGTTGCTGAAAACAGTAACTGA--TTCAGCC-GGAC---AAGT-----GTTTTTCATCATTATCCT-CTA---AATAGC--GTTTGA--ATTAG-TGGTTTT-A-TTC--------CA-----GCTATTCCACAAGTATTTTGTATTACGTTTGTTA---AAATTAATA-TATCGATTGTAG--TA--A--TTTTGTTT---GGCTTGAAGT-------TTTTAACC----TTCTGTCGCCAAAACTT---ACAATCAGTATATCATT-TT-CT-------ATTA------------T-ATGGCATCTAGA-A---TTCTGCATTTCTACAA---TTTGGTTGACTTAT------TT----TC-GTTA-Ca
gi|5 : TCCAATGCGGTTTGAAACATAACACTGAATAAA---TCAAATGAATCATCTGGGTTGTCGTCGTACATGTCCGTTATTAACGATTGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTTATAAACT--T-CTTCTTCGAATGCGTTCATAGA------TAATTTAT--TGT----TTTA-TGCA------TGGACTTT-------TTACATTAATAATTACGTTACGGGTAATGCATATATGACACTGATCACTtccaatgcggtttgaaacataacactgaataaatcaaatgaatcatctgggttgtcgtcgtacatgtccgttattaacgattgttgttctgagagatcgtttataaacttcttcttcgaatgcgttcatagataatttattgttttatgcatggactttttacattaataattacgttacgggtaatgcatatatgacactgatcacttaattagtacattgtgatattttgtggcatatttgaaaacgaatcgtctgcaaatgtaacataacaacttgtaacttgggtaggtattgtgacatttacagactgtttacgatgaaatcaagctaggtttt
gi|6 : atcctgtatgtttcgctatgtttatcaacaaatgaacgtgatatcgctaaacttaatggctgcggattaatatttgtcagatgaggattgtaataccatgtgactacaggaatatctaggtggaacgtctcatgacagttggaaaatagttgctgaaaacagtaactgattcagccggacaagtgtttttcatcattatcctctaaatagcgtttgaattagtggttttattccagctattccacaagtattttgtattacgtttgttaaaattaatatatcgattgtagtaattttgtttggcttgaagtttttaaccttctgtcgccaaaacttacaatcagtatatcattttctattatatggcatctagaattctgcatttctacaatttggttgacttattttcgttacAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATTT--CGAGAAGTTGTAGTT----G-----------C------------TATTGCTGGAATTTGGGATTGCTCAGAATCAATTAATTTACCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGTTTGTCATAGGATGTGATTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACTGTTGA-AAAATAATTGTTAAAAACACTTTCTGT--TTGTGTC-GGAA---AAGTTATAGGATTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTGAGTTTGA--ACTTG-TGATTTT-AATCTAGATAAATCATGAAGGCTGTTCCACATCTCTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGTAA--TA--G--TTTTGTTT---AACTTGAAGTTTAAGAGTATTAAGT----TTCTGACGCCAATAAGTGTAATTATCAGTATCTT-TT-TT-CATATGAAAACTA-TTTCGTTGTTTT-ATGGCATCCAGA-AT--TTTAATATTTATCCAA---TTCGGTTGATTTGT------TT----TC-TTTA-C----TCGTT-------TCTTTCT------------TTCTTTT-TGGGGCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATTGCATCGAGTAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTTGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTTTGAGAGATC-ATTAATAAACTG-TGCTTCTTTGAATGATTTCATAGAC--CAGTAATTAAT--TTT----TTTA-TGCA-----CTCGATATT-------TAAGATAATTAACTAACTTGCGGGCAATGCAAATAGGATAATGATCACTtaattagtacattgtgatattttgtggcatatttgaaaacgaatcgtctgcaaatgtaacataacaacttgtaacttgggtaggtattgtgacatttacagactgtttacgatgaaatcaagctaggtttt
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blockSeqs : G T T C . . . A T . . C G . T C TTCAGTAA G ACCA . . G T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . C A G . . . T . A A T A . . A T . . . TT . . . . G . . A A TG TTTCTTTACTCGTTTCT TG T . AC G . A . A A G G T T A . . . . . A A A C
blockSeqs : . . T . . . . . T . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . GT A . CA A . T . . T . . . . A . . . . . C . . .
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finalCons : ATAACATTGTCGACTTGGGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAGCTTCATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTCATTACATACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTACTTTAGATTTCGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCAACATTATTGAGATCCGCTGTTAAGCATTTAACAACATTTGGAAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTT-TATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGCTAAACTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTAAGTCGAAAGCCTTGGACAAATCAAGANATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATTGNC-AAAAATAN----------AACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATGTATAGCGGACGTT-------------CTAGA-ATTAACGATACAATTGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCCCTTTTTGTGAATTGGGANANNNTTTG-CT-CGTTTAAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGC------TATAACAAAGGCTGACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATGT--CGAGAAGTTGTAGTTCG------------AACAAATGAAGGTGATATCGCTGGAATTTGGAATTGCTCAGAATTAATTAATTTATCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGNTTGTCATAGGATGTGACTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACCGTTGG-AAAATAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGNTTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTG-GTTTGA--ATTTG-TGGTTTT-A-TCCAGATAAATCATNAAGGCTGTTCCACANCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGNAA--TA--A--TTTTGTTT---AGCTTGAAGTATAAGAGTTTTAACC----TTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTC-TT-TT-CTTATGAAAATTA-TTTCGTTGTTTT-ATNGCATCCAGA-AT--TTCAATATTTATCCAA---TTCGGCTGATTTAT------TT----TN-TTTA-CCA--TCGCT-------TTTTTCT------------TTCTTTTTAGGGGCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATNTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTCGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTTCATAGAC--CTGTAATTNAT--TGT----TTTA-TGCA-----CTGGACCTT-------TNAGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCATATAGGATAATGATCACT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AGTATATAGTGACATTAACATAAGCTATATTTTGTGGTATGTTTAAAAATGCCTGATCTATCAATGTAGCGGAATTACTTATTACTCGGGTAGGTGTTGTTACCAACTGCGTAAGATTAATAACCATCTGATCTTAATAAATCAACGTTAAAGTCACCAAGTACTATGCAATCTTTTTTCTTCTGACAATGATTTCTCCAAATATATTGTGATATTTTTTAGCCAATCAACTTTTGACGAAGGTGGTCTGTATGTATAACAGACAAGCATTTTCTTAGTGTTTGGTAGTTTAATTTCAAGACAAATTAACTCAAATGA
Unaligned ( gi|16 ): AGAGGGATAGAAGAGAGGTTTTGAATATCCATCTGATCTTAATAAATCTACGTAAAAAAGAGGTTTTTTTTTCGGTCAGCGATTTCTCCAAAGACATTGTGTTGGTTTTTAGCTAATCAACTGTTGATGACGATAATCTGTTTGTATAACAGACAAACATTTGTTTAGTGGCTGAATTTCAAGAATGAATTCGATTGCATCAGGTTCAATGTCAGTTCTT
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Reference ( family-1827 ) : ATAACATTGTCGACTTGGGTATGCCAAGACAGCGTATTATCAATCATAACTCCAAGTAATTTTTCATGTATACTTATGTTAATAGCTTCATCTTTGTAATGAATTAGGTGAGAGTCATTACATACGCGGTTAACTTT------GCTTTTGGAAGAA-ATATACATTACTTTAGATTTCGCTGCATTGATAGACATGCGA----TTAGCTACACACCATGCATCAACATTATTGAGATCCGCTGTTAAGCATTTAACAACATTTGGAAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTTATACCAGAAACTTGAGTATAATGAGTT-TATTTTCTAAATATGAGGAAAACCATTTTATCGTATTTCTGCTAAACTTGTACATTTTCAATTTTTGA---ACAAGTACGTCATGGTCAACTAAGTCGAAAGCCTTGGACAAATCAAGANATAATGTACCAACAATTTCATTTTTATCTATAGCTGTAAGCCAGTCATCCAAT-ATTTTTGTGAGAGCCGTTTGACAAGAATGGTTTGCTCTAAAA-CCAGATTGNC-AAAAATA----------NAACAGTTTATTTTCTTCCATGTATTTTCTAAGATGTA-TAGCG---------G--ACGTTCTAGAATTAACGATACAATTGGAAGAATTGATATAGGCCTATAATTTGATT-TATCATTTTTCGGTCCCTTTTTGTGAATTGGGANANNNTTTG-CT-CGTTTAAATAATTTAGGAAATGTATTGGTGTCTAA-------ACTACTA-T-TAA------ATATCTTTGTTAGTAT-TGGAGC------TATAACAAAGGCTGACA-TTTTAAGAAACTTG-GCACTCAGGCCGTCTGATCCTGTAGATTTTGC--TATGT--CGAGAAGTTGTAGT---TC----------G--AACAAATGAAGGTGATATCGCTGGAATTTGGAATTGCTCAGAATTAATTAATTTATCAGAATTATTATTTATCAGATGGGGNTTGTCATAGGATGTGACTGCTGGGTTGTCTCGATGTGACGTTTCATAAACCGTTGG-AAAATAATTGTTAAAAATATTTGCTGT--TTGAGTC-GGAC---AAGTTATAGGNTTTCCATCATCATCAT-CTA---AATAGTG-GTTTGA--ATTTG-TGGTTTT-A-TCCAGATAAATCATNAAGGCTGTTCCACANCTGTTTTGGATTACGTTTGTTC---GAATTAATAGTTTC-ATTGNAA--TA--A--TTTTGTTT---AGCTTGAAGTATAAGAGTTTTAACC----TTCTGACGCCAATATGTGTAACTATCAGTATCTC-TT-TT-CTTATGAAAATTA-TTTCGTTGTTTT-ATNGCATCCAGA-AT--TTCAATATTTATCCA----------ATTCGGCT-GATTTATTT---TN-TTTA-CCA--TCGCT-------TTTTTC------------TTTCTTTTTAGGGGCATGTCTATCTAATACGGTTTGAAACATNTCATTGAATAAG---TCAAATGACTCGTCTGG---GTCGTCGTATATGTCAATTATTGACCACGGTTG-TTCTGAGAGATC-GTTAATAAACTG-TGCTTCATTGAATGATTTCATAGAC--CTGTAATTNAT--TGT----TTTA-TGCA-----CTGGACCTT-------TNAGATAATTAACTACCTTGCGGGTAATGCATATAGGATAATGATCACT
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