lowQualScore                  :           1                  222222222         1      11111111     1111                    666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666        1111         11111     1111  1111    66666666666666666666666666         222222222222222222222222222222222222222                             333333333333333333333333333                   1111                                               1  1     1111          2222222222     666666666666666666666666666666                                33333333333333333        1111111                         1            11    11111        3333333333333  11                     1                               
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lowQualScore                  :           .   .  .  .   .    .........  .. .   .  .   ........     ....  ....  .   . .     ........................................................................  .  .  ....         .....   . ....  ....    ..........................       . .......................................  ...   .  .        .     .  ...........................  ...... .    . .  ....     ...   . ..     .   .  .. .    .           .  .     ....   . . .. ..........     ..............................    ..   .  ..     .   . .  .   ................. .  ..  .......      .    .... .  .. .. .      .     ..    .....        .............  ..  ..       .     .   .    ..  .      .       .  .    
lowQualScore                  :           0   0  4  8   4    222222222  99 0   6  0   22222222     1111  9999  1   8 5     111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111  8  5  6666         55555   2 1111  0000    44444444444444444444444444       5 333333333333333333333333333333333333333  000   3  2        2     3  555555555555555555555555555  888888 5    6 5  7777     444   5 11     1   6  11 6    2           5  7     1111   9 3 33 7777777777     222222222222222222222222222222    22   9  33     6   7 3  4   22222222222222222 3  66  8888888      6    5555 8  44 33 5      3     55    33333        9999999999999  44  33       9     1   8    55  9      8       9  7    
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Reference ( gi|9 )            :   CTACACTGCAGGATCATATTACGACCACA---GT--GGCAG-TGCGGC-AAACTTTCTT-TGTCT---CCCAAATGAACCATTGTGGGGT-CA-TTATGA---TGA----------T---GC-GGT-ACA-A----TCTA--G----TGC--AGA-----AGTTTGGGGA---GCAGAATAT-----CAACT---AGATG--GAAG--G---GAC-T--TAA---A-AC---GTTTCTTCGG--TGG-CA-A---CATACA-TAA----CG-A---A---GA---TGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CACGGA----CAA--G-CATC----C-TGATGA-TCCCG---GGAAG---GAACGCTTGTTATCCA-GGA-T-GGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GTCACA----C-A--A---A-GC-GA--C--G---GAATT-CGTTTGTTTGGAT-GACAAACCAGAA-----ACAAT---AACTG-GA--GG---AC--ATACCG-ACCA--GAATGGACACCTCTTCTAT-TTTGC-CGAAGT---AAGATGCGG---------C---TC-TCTGAAATGTCCGCCATACGTGCATGGG-CGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTA
gi|8                          :   CTACACTGCAGGATCATATTACGACCACA---GT--GGCAG-TGCGGC-AAACTTTCTT-TGTCT---CCCAAATGAACCATTGTGGGGT-CA-TTATGA---TGA----------T---GC-GGT-ACA-A----TCTA--G----TGC--AGA-----AGTTTGGGGA---GCAGAATAT-----CAACT---AGATG--GAAG--G---GAC-T--TAA---A-AC---GTTTCTTCGG--TGG-CA-A---CATACA-TAA----CG-A---A---GA---TGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CACGGA----CAA--G-CATC----C-TGATGA-TCCCG---GGAAG---GAACGCTTGTTATCCA-GGA-T-GGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GTCACA----C-A--A---A-GC-GA--C--G---GAATT-CGTTTGTTTGGAT-GACAAACCAGAA-----ACAAT---AACTG-GA--GG---AC--ATACCG-ACCA--GAATGGACACCTCTTCTAT-TTTGC-CGAAGT---AAGATGCGG---------C---TC-TCTGAAATGTCCGCCATACGTGCATGGG-CGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTA
gi|6                          :   CTATGCTGGTGGTTCGCACTACTCCCATACTGGT--GGCGG-TGT----AAATTATTTG-TGTCT---TACCGATGGTCCAATCTACGGA-AA-TGTTGA---AAA----------T---G---GTGACC-AGACCTTTA--G----TGC--TAG-----CGTATACGGT---GCCGAGTAC-----GAGCT---TGATA--GAAG--T---AAT-A--TCG---G-AG---GGTTCATCGG----G-CA-A---AAT-CT-TCA----CC-A---A---GACAATGTCCCGTGCGCCGTGTGCACGAC---AA---C-CAGATCCTCAA------TC----T-TGATGA-TTCCT---GGCCG---AAACGCGTGTTACGCG-GGG-T-GGACCTTGGAGTACAAGGGTTATCTGACCAGT-G-GTTATT---CAG--GTCATG----C-G--G---CTGC-TT--C--A---GAGTT-TGTGTGCCTGGAT-GACCACCCAGTA-----CCCAT---TAATG-GC--GG---AC--ATGCTG-ACCA--GAACGGCAAACTGTTCTAC-TTCGC-AGAAGG---AAGGTGCGG---------A---TC-GCTGGAATGCCCCCCGTATGTTGAAGGG-AAAGAGTTGACATGTGCTGTATGT
gi|1                          : ggCTACGTCGGAGGGTCTTATTACAATGAAA---CT--GGCGG-TGGAGT-AAA-TTACTTATGTTT---GACTGACGCACCAATCTACGGA-CA-TGTTCAGCCTG---------------GC-CG--ACA-ACCG-TCCA--G----TGCCTATA-----CATATGGCG-----CAGAATAT-----CAGTT---CGACA--GCAGTAG---TGC-TAGTGACGTA-ACTGGATTCCTTCAT--CAG--A-G---TCTTCG-CGA----TG-A---T---GA---CGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---T-TAGAT---CTA--G-CGTC----C-TTATGA-TACCT---GGCAG---AAACGCTTGTTATGCG-GGC-T-GGACCTTGGAGTACAACGGTTACCTGACAAGCGGAGCTA-----CGA--TTCACGTTGCC----------GC-GT--C--G---GAGTT-CGTCTGCTTGGAT-GAATATCCGGAA-----CCAGT---TCCAG-GA--GG---TC--ATGCT--ACTACTG-ATGGTAAATTATTTTAC-TTTGC-GGAAGG---CAGATGTGGAGCTGATTCC---TC-GCTTGAATGTCCGCCATATGTGGATGGA-TACGAGCTGTCATGCGCAGTGTGTtcc
gi|2                          : ggCTACATCGGAGGGTCTTACTACAATGAAA---CT--GGCGG-TGGAGT-AAA-TTACTTATGTTT---GACTGACGCACCAATCTACGGA-CA-TGTTCAGCCTGA----------C----C-GAC-AGACG----TATA--G----TGC--CAA-----CGCATATGGC---GGAGGATAT-----CAGTTCGGAGGCA--GAAG--T---G-C-TAGTGACGTA-ACTGGATTCCTTCAT--CAG--A-G---TCTTCG-CGA----TG-A---T---GA---CGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---T-TAGAT---CTA--G-CGAC----C-TAATGA-TACCT---GACAG---AAACGCTTGTTATGCG-GGA-T-GGACCTTGGAGTACAACGGTTAACTGACAAGCGGAGCAA-----CGA--GTCACGTTGCC----------GC-GT--C--G---GAGTT-CGTCTGCTTAGATCGAT--------A-----TCAAT---TAC-------------C--ATGTTA-ATAC--TAACGGCAAGTTGTTTTAC-TTTGC-GGAAGG---CAGATGTGGAGCAGATTCC---TCGTTTG-AATGTCCGCCATATGTGGATGGA-TACGAGCTGTCATGCGCAtcaaaataaaagccgaatattacac
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gi|11                         :       ggttcAGGGTCACATTAC--TCGCA---CTCCGGCGG-CGCCGT-CGATTACCTC-TGCTT---GCTAAGAGAACCGCTTTGGGGG-AAATTACGA---TGA----------C---TC-CCT-CCA-A----ATCG--G----TGC--TTT-----AATGTATGGT---GCCGAATAC-----GAAAT---GAATTCCAAAA--C---TACAT--CAA---AGAT---GTTTCCT-GAAATGGACC-A---C-TACA-TAG----CCCA---ACATGA---CGCGCCGTGTGCTGTATGTAGAAT---GA---AGCGTG----CTA--G-CGCC----A-TCATGA-TCCCG---GCAAG---GAATGAGTGTTA-CGATGGC-T-GGATCCTGGAATACAGTGGTTATTTGTC-AGCCG-GATA-----CTACGGTCAGG----C-A--GC--A-GC-CT--C--C---CAGTA-CATCTGCCTGGAC-GACAAACCGGAA-----ACTGT---TACCG-GA--AG---TC--ATGCC
gi|7                          :        gcaggGGGTCATACTATAGCCATC---AC--GGAGG-AGCCGC-AGATTATGTC-TGTTTGACCCCA---GACCCACAGTGGGGA-TA-CTACGA---AGAGTCTGTCGCTTCCGGC-GGC-AAA-A----TGTATGG----CAC--AGAGTATGAGCTCGGCGACTTGCACAGT----------------GATG--GAGG--------C-T--CG-------C---GTTTTTTGGG--CAA-TA-A---CTTGAG-GGA----CG-A---A---GA---TGCACCCTGTGCCGTTTGCAATTC---TG---T-CAGAT---CAA--C-GATG----T-TGATGC-TACCA---GGACGTATGGAC---TGTTATCCA-GGC-T-GGACGAAAGAATACAGTGGCTACCTTAT-GCCAG-GTTA-----TCA--TTACCA----T-A--ATTCG-GC-CA--CCGA---GAAT---GTCTGTGTAGAC-AACCGACCGGAA-----AGCAT---TATCA-GA--GG---AT--ATACCG-ACCT--GGAAGGTAAAGTGTTCTAT-CTCGT-GGAAGG---GGTATGCGG---------A---TC-ACTGAAATGTCCACCGTATATAGAAGGC-CGCGAGTTGACGTGTGTTGTATGCA
gi|10                         :                 CATA--ACAACCA-A---G----GAAG-TGCTGC-CAATTTTTTA-TGTCT---CCCAACTGAGCCATTGTGGGGA-CA-TTATGA---AGA----------C---GC-GGA-ACA-A----TCTA--G----TGC--TTT-----AGTTTGGGGA---GCAGAATAT-----CAACT---AGATG--GAAG--G---AAC-T--TAA---A-TC---GTTTCTTCGG--TGG-CA-A---CATACG-TGA----CG-A---T---GA---TGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CACGGA----CAA--G-CGTC----C-TGATGA-TCCCG---GGAAG---GAACGCTTGTTATCCA-GGA-T-GGACTTTGGAATATAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----TA----CCACG----C-ATTA---T-GC-TA--C--A---GAATT-TATCTGTTTGGAT-GACAAACCGGAA-----ACAAT---ACCTG-GA--GG---AC--ATGCCG-ACCA--GAATGGACACCTGCTCTAC-TTCGC-AGAAGT---AAGATGCGG---------C---TC-TCTGAACTGCCCACCCTATGTGAATGGT-CGGGAACTGACATGCGCAGTTTGCAca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                               tcacaa--TGA-CA-AGCCCATAAAGCAA----C--A---A---GA---CATGCCATGTGCAGTTTGCGGAACTAAAA---AATCGA----CG---G-C--T----C-TCATGACTCCAGCCCGGAAG---GA----TTGTTA-CCA-ATA-TTGGACGTTAGAATATAACGGTT---T--C-ATCAT-GT---------G--GTCACC----C-G--G---G-GA-GTT-C--A---GAATA-TATTTGCATGGAC-CACCAACCTGAA-----TTCATTCCAGGTG-GA--GGTGTAA--ATAACG-ATCA--------ACATCTGTTGTAT-CTTAT-TGA-GTCTCAA--TGTGG---------A---TC-ACTCCCATGTCCCCCGTATGTGAATGGG-CGCGAATTGTCGTGTGTCGTCTGcaaaa
gi|4                          :                                                                                                           ggttcaggatacattggaggaaatcgttataacgcagacggcactggaaccaatcatctgtgttttccatcagacccaacctggtccaactttgtcgagttcttatagaggttttatatatggcactgaaatcgacaataacgacaacgacacaatattAA----CG-ATCAA---GA---TGTGCCGTGTGCGGTTTGCAGGAC---T------CAGA-----AA--G-CGTCAGCTC-TCATGA-TCCCC---GCACG---AAAGGACTGCTA-CAA-AGATT-GGACGTTCGAATATAACGGTTACATCAT-GG--G-GGCAAACTCCAG--ATTCCA----CGG--A---A-GC-TA--C-------AACTATATATGCATGGAC-CATCAACCTGAGTTTCTCCAAC---A--TG-GC--GGC--ACCAATGACG-ATCA--G------CAC--ATTCTATATCTACAGGAGGC---GCAGTGTGG---------G---TC-ACTCCCGTGTCCACCGTACGTACAGGGC-CGTGAACTAGCCTGCGTTGTGTGTActcaaaatgaatgcttttcaaatttta
gi|3                          :                                                                                                            ttgttcaggttttatcggaggcaaacattacaatgtagaaggaggcggtacaaacaatctgtgccttccatcagatccgacatggctaaaatacgtcgacggcaatgacggtacatacagaggatatgtttatggctcagaaattgacaacggagacgccgataacatcttcgactatgccgtaCCGTGTGTTGTCTGCAG------AA---CGCAGAAGT-CAA----CTTC----CGTGATGA-TACCA---GCCAG---AAACGACTGTTATCCA-GGG-T-GGACGCTCGAATACAATGGCTACATCAT-GTCAA-ATCA-----GAATGATCACC----C--------T-GC-TT--C--GTATGACTA-CATGTGCATAGAT-AACCAGCCAGAGTTTTTACAAC---A--TG-GT--GG--------CACCG-ATGA--CAGCGAGCATATCCTATAT-CTGGT-GGAAGC---CCGATGTGG---------A---TC-ACTCCCATGTCCTCCATATGTACATGGT-CGCGAGTTGA-AT-TGCGTTGTGTctaaataa
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-GA--GG---AC--ATGCCG-ACCA--GAATGGGCACCTGCTCTTC-TTCGC-AGAAGT---AAGATGTGG---------C---TC-TCTGAAATGT-CGCCATAAGTGAATGGT-CGGGAACAGACATGTACActcaaagta
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1816 )     :                                                                                                                                                                               CTACGCCGGAGGGTCNTACTACAACCANANCGGCGGTGCNGC-AAATTNTCTNTGTCTN---CCAGACGANCCANTNTGGGG-ACAT-TNCGA------TG-ACG-------CGG-CA-CA-ATCTAGTGCNNACGTNTGNGGNGCAGAATAT-----CAGCTNGA---CG-----------GAAG--G---GAC-T-----CGA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-CGGCAACNTA-C---GCGACGAAGAC---GTNCCGTGTGCCGTCTGCAGGAC---AA---CG-CGGA----CAAGCG-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGNTGGACNTTGGAATACAACGGTTACCTNAC-GGCGG-G-----TCA--CAA--GT--CACG-C-G--AN---GCNNCG---GAGTTCGTCTGCNTGGA-CGACCAACCGGAA--NCNATNAC---TGG--AGG---ACATGCC-G--ACCA--G-AACGGNCANC-TGTTCTACTTC--GCGGAAGNN--AGATGCGG---------C---TCNCTGNAATGTCCGCCGTATGTGGAT-GGNCGCGAACTGACATGCGCNGTGTGTA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                         tcacaacataGCAGGAGGGTCACATTACTCGCACTCCGGCGGCGCCGT-CGATTACCTCTGCTTG---CTAAGAGAACCGCTTTGGGGGAAAT-TACGA------TG-ACT-------CCC-TC-CA-AATCGGTGCTTTAATGTATGGTGCCGAATAC-----GAAATGAATT-CC-----------AAAA--C---TACAT-----CAA-AGAT---G--TTT--CCTGAAATGGACCACTACATAGC---CCAAC-ATGAC---GCGCCGTGTGCTGTATGTAGAAT---GA---AG-CGTG----CTAGCG-CC----A--TCATG-A-TCCCG---G---CAAG---GAAT-GAGTGTTA-CGATGGCTGGATCCTGGAATACAGTGGTTATTTGTC-AGCCG-G-----ATA--CTACGGT--CAGG-CAG--CA---GCCTCC---CAGTACATCTGCCTGGA-CGACAAACCGGAA--ACTGTTAC---CGG--AAG---TCATGCC-caaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                  CGCTGGAAGTTCCTTTTACAAACATGACGGAGCTGCAGCCGAACTG-ATATGTCTT---CCAAGCCACCCTATGTGGGG--CGTGTTTGA------TGCAGG-------CA--CA-CA-AGGGAATGCGTACGTGTATGGTGTAGAATATAGGGACAACTT-----CA-----------GAGG--GTTTGA--------CAA-A-AC---GAATTTAAAT-------G-CAG--ACTCA-CTAAGTTCCAATGAT---GTTCCCTGTGTATTGTGCAGAAG---TAGTTTA-CGTA----CAACTG-CC----A--TCATGAA-TCCTGCTTG---GAAT---AAA-----TGTTGCACA-GGCTGGAATTTAGAGTACCATGGCTATCTCAT-GGCTG-G-----ACA--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ggttcGAAGAGGAT---ATGCCGTGTGCTGTTTGCAGATC---A--------GAA----AAATCA-TCGG--CCGTGATG-A-AACCT---GCCCGAAG---TCACTGCTT----TCCC-GGATGGTTGCTTGAGTACGGCGGTTATCTGAT-GG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatataccgacagtggcagtggaaacaatgatttatgcataccgtccgatctctcctgatcaaattacaacgatggcgttgaggacgcaagagtatacatatacggaacagagatccacacaacagacgcacaacacatattcgaacacggagttcatCAG-G-----TCA--CAA--A------G-C-----T---GGTTCC---GAGTTTGTCTGCCTTGA-CGAAAACCCAGAA--GGCATTG----TGATCAGA---A-ATACCTT--AGC---G-AATGGAAAAC-TGTTTTACCTG--ACAGAAGCC--GTCTGCGG---------CGGGTCACTTCAATGCCCACCATATGAAAAT-GGCAAGGAACTGACATGTGCAGTGTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tG--AGG---ACATGCC-G--ACCA--G-AATGGGCACC-TGCTCTTCTTC--GCAGAAGTA--AGATGTGG---------C---TCTCTGAAATGT-CGCCATAAGTGAAT-GGTCGGGAACAGACATGctcaaagta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTTT--GTAGAAGTG--AGATGTGG---------C---GCCTTACCTTGTCCACCGTATGT-GATGGGACGTGAACTCCCATGTGTTGTTTGTAtacatttttgcacaaaataatgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                             taCTACATCGGAGGGTCTTACTACAATGAAACTGGCGGTGGAGT-AAATTACTTATGTTTG---ACTGACGCACCAATCTACGG-ACATGTTCAGCC----TG-AC--------CGA-CA-GACGTATAGTGCCAACGCATATGGCGGAGGATAT-----CAGTTCGGAGGCA-----------GAAG--T---G-C-TAGTGACGT-A-ACTGGA--TTC--CTT----CAT-CAG-AGTCTT-C---GCGATGATGAC---GTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---TT-AGAT----CTAGCG-AC----C--TAATG-A-TACCT---G---ACAG---AAAC-GCTTGTTATGCG-GGATGGACCTTGGAGTACAACGGTTAACTGACAAGCGGAG-----CAA--CGA--GT--CACGTT-G--CC---GCGTCG---GAGTTCGTCTGCTTAGATCGAT--------A--TCAATTAC---------------CATGTT-A--ATAC--T-AACGGCAAGT-TGTTTTACTTT--GCGGAAGGC--AGATGTGGAGCAGATTCC---TCGTTTGAATGTCCGCCATATGTGGAT-GGATACGAGCTGTCATGCGCActaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                 gTACAGCAGCACTGGCAGTGGAAC-TAATCATCTATGTCTA---CCccggttcaaaataaaagctgaacattacactactttttatcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attgtattttaggttttattgggggcaaaaagTGCCGTGTGTTGTCTGCAG------AA---CG-CAGAAGT-CAA-CT-TC----CG-TGATG-A-TACCA---G---CCAG---AAAC-GACTGTTATCCA-GGGTGGACGCTCGAATACAATGGCTACATCAT-GTCAA-A-----TCA--GAATGAT--CACC-C-----T---GCTTCGTATGACTACATGTGCATAGA-TAACCAGCCAGAGTTTTTACAACA--TGG--TGG----CA--CC-G--ATGA--C-AGCGAGCA---TATCCTATATCTGGTGGAAGCC--CGATGTGG---------A---TCACTCCCATGTCCTCCATATGTACAT-GGTCGCGAGTTGAATTGCGTTGTGTGttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattttgccgtgtgttgtctgcagaacgcagaagtcaacttccgtgatgataccagccagaaacgactgttatccagggtggacgctcgaatacaatggctacatcatgtcaaatcagaatgatcaccctgcttcgtatgactacatgtgcatagataaccagccagagtttttacaacatggtggcaccgatgacagcgagcatatcctatatctggtggaagcccgatgtggatcactcccatgtcctccatatgtacatggtcgcgagttgaattgcgttgtgtgctccaaataaaaaacccttaaatttgat
gi|4                          :                      attgtattttaggttttattgggggcaaaaagtacagcagcactggcagtggaactaatcatctatgtctaccttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaatttGGCGGTAC----AAACAATCTGTGCCTT---CCATCAGATCCGACATGGCT-AAAA-TACGT------CG-ACGGCAATGACGG-TA-CA--TACAGAGGATATGTTTATGGCTCAGAA-AT-----TGAC--AA---CG-----------GA--------GACGC-----CGATA-AC---A--T----CTT----CGA-CTATGCCGTA-A---ACGATCAAGAT---GTGCCGTGTGCGGTTTGCAGGAC---------T-CAGA-----AAGCG-TCAGCTC--TCATG-A-TCCCC---G---CACG---AAAG-GACTGCTACAAA-GATTGGACGTTCGAATATAACGGTTACATCAT-GG-GG-GCAAACTC---CAG--ATTCCACG---G--AA---GCTACA----ACTATATATGCATGGA-CCATCAACCTGAG--TTT----C---TCC--A-----ACATGGC-GGCACCA--ATGACGATCAGCACATTCTATATCT-ACAGGAGGCGCAG-TGTGG---------G---TCACTCCCGTGTCCACCGTACGTACAG-GGCCGTGAACTAGCCTGCGTTGTGTGTActccaaataaaaaacccttaaatttgat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttgttcaggttttatcggaggcaaacattacaatgtagaagga---GCAAC-AAGAC---ATGCCATGTGCAGTTTGCGGAACTAAAA---AA-TCGA----CG---G-CT----C--TCATG-ACTCCAGCCCG---GAAG---GA-----TTGTTACCAA-TATTGGACGTTAGAATATAACGGTTTCATCAT-G--TG-G-----TCA--C--------C-CG-G-G--GA---G-TTCA---GAATATATTTGCATGGA-CCACCAACCTGAA--TTCATTCCAGGTGG--AGGTGTAAATAAC-G--ATCA---------ACATC-TGTTGTATCTT--ATTGAGTCT--CAATGTGG---------A---TCACTCCCATGTCCCCCGTATGTGAAT-GGGCGCGAATTGTCGTGTGTCGTCTGctaaataa
gi|6                          : ggttcaggatacattggaggaaatcgttataacgcagacggcactggaaccaatcatctgtgttttccatcagacccaacctggtccaactttgtcgagttcttatagaggttttatatatggcactgaaatcgacaataacgacaacgacacaatatttgacaagcccataaaCTATGCTGGTGGTTCGCACTACTCCCATACTGGTGGCGGTGT-AAATTATTTGTGTCTT---ACCGATGGTCCAATCTACGG-AAAT-GTTGAAAATGGTG-AC--------CAG--A-CC--TTTAGTGCTAGCGTATACGGTGCCGAGTAC-----GAGCTTGA---TA-----------GAAG--T---AATAT-----CGG-A-GG---G--TT---CAT----CGG---GCAAAATC-T---TC-ACCAAGACAATGTCCCGTGCGCCGTGTGCACGAC---AA---C--CAGATCCTCAA----TC----T--TGATG-A-TTCCT---G---GCCG---AAAC-GCGTGTTACGCG-GGGTGGACCTTGGAGTACAAGGGTTATCTGAC-CAGTG-G-----TTATTCAG--GT--CATG-C-G--GCT--GCTTCA---GAGTTTGTGTGCCTGGA-TGACCACCCAGTA--CCCATTAA---TGG--CGG---ACATGCT-G--ACCA--G-AACGGCAAAC-TGTTCTACTTC--GCAGAAGGA--AGGTGCGG---------A---TCGCTGGAATGCCCCCCGTATGTTGAA-GGGAAAGAGTTGACATGTGCTGTATGTctcaaaatgaatgcttttcaaatttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                       ggGGGTCATACTATAGCCATCACGGAGGAGCCGC-AGATTATGTCTGTTTGACCCCAGAC---CCACAGTGGGG-ATAC-TACGA------AG-AGT-------CTGTCG-CT--TCCGGCGGCAAAATGTATGGCACAGAGTAT-----GAGCTCGG---CGACTTGCACAGTGATG--GA--GGC-T-----CG-----C---G--TTT--TTT----GGG-CAATAACTTG-A---GGGACGAAGAT---GCACCCTGTGCCGTTTGCAATTC--------TGTCAGA----TCAACGATG----T--TGATG-C-TACCA---G---GACGTATGGAC----TGTTATCCA-GGCTGGACGAAAGAATACAGTGGCTACCTTAT-GCCAG-G-----TTA--TCA--TT--ACCA-T-A--ATTCGGCCACC---GAGAATGTCTGTGTAGA-CAACCGACCGGAA--AGCATTAT---CAG--AGG---ATATACC-G--ACCT--G-GAAGGTAAAG-TGTTCTATCTC--GTGGAAGGG--GTATGCGG---------A---TCACTGAAATGTCCACCGTATATAGAA-GGCCGCGAGTTGACGTGTGTTGTATGCAtcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCACAGTGGCAGTGCGGC-AAACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGTGGGG-TCAT-TATGA------TG-ATG-------CGG-TA-CA-ATCTAGTGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAACATA-C---ATAACGAAGAT---GTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-G-----TCA--CAA--GT--CACA-C-A--AA---GCGACG---GAATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAA--ACAATAAC---TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GCCGAAGTA--AGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCACAGTGGCAGTGCGGC-AAACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGTGGGG-TCAT-TATGA------TG-ATG-------CGG-TA-CA-ATCTAGTGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAACATA-C---ATAACGAAGAT---GTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-G-----TCA--CAA--GT--CACA-C-A--AA---GCGACG---GAATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAA--ACAATAAC---TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GCCGAAGTA--AGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): TTTTAATGTGTGTAAGCCAATCTGATAATACACT






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Reference ( family-1816 )     :                                                                                                                                                                               CTACGCCGGAGGGTCNTATTACAACCA-CACCGGCGGTGCNGC--AAATTATCTNTGTCTN---CCAGACGAACCANTGT--GGGG-ACAT-T----ACGA--TGACG-------C-GG-C-ACA-ATCCAG----TGCNNANGTNTATGGCGCAGAATAT-----CAACTNGA---CG-----------GAAG--G---GAC-T-----CGA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-CGGCAA---CNTA-C---GCGACGANGACGTNCCGTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CG-CGGA----CAAGCG-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGNTGGACNTTGGAATACAACGGTTACCTNAC-GGCGG-GTCA-----CAA--GT--CACG-C-G--AN-GCTTCG---G------AGTTCGTCTGCNTGGA-CGACNAACCGGAANCNATTAC----TGG--AGG---ACATGCC-G--ACCA--G-AACGGNCANC-TGTTCTACTTC--GC-GGAAGNNAGATGCGG---------C---TCNCTNNAATGTCCGCCGTATGTGGAT-GGNCGNGAACTGACATGCGCNGTGTGTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTTT--GT-AGAAGTGAGATGTGG---------C---GCCTTACCTTGTCCACCGTATGT-GATGGGACGTGAACTCCCATGTGTTGTTTGTAtacatttttgcacaaaataatgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                             taCTACATCGGAGGGTCTTACTACAATGA-AACTGGCGGTGGAGT--AAATTACTTATGTTTG---ACTGACGCACCAATCT--ACGG-ACATGT----TCAGCCTGAC--------C-GA-C-AGACGTATAG----TGCCAACGCATATGGCGGAGGATAT-----CAGTTCGGAGGCA-----------GAAG--T---G-C-TAGTGACGT-A-ACTGGA--TTC--CTT----CAT-CAG-AG---TCTT-C---GCGATGATGACGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---TT-AGAT----CTAGCG-AC----C--TAATG-A-TACCT---G---ACAG---AAAC-GCTTGTTATGCG-GGATGGACCTTGGAGTACAACGGTTAACTGACAAGCGGAGCAA-----CGA--GT--CACGTT-G--CC-GCGTCG---G------AGTTCGTCTGCTTAGATCGAT--------ATCAATTAC----------------CATGTT-A--ATAC--T-AACGGCAAGT-TGTTTTACTTT--GC-GGAAGGCAGATGTGGAGCAGATTCC---TCGTTTGAATGTCCGCCATATGTGGAT-GGATACGAGCTGTCATGCGCActaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attgtattttaggttttattgggggcaaaaagTGCCGTGTGTTGTCTGCAG------AA---CG-CAGAAGT-CAA-CT-TC----CG-TGATG-A-TACCA---G---CCAG---AAAC-GACTGTTATCCA-GGGTGGACGCTCGAATACAATGGCTACATCAT-GTCAA-ATCA-----GAATGAT--CACC-C-----T-GCTTCGTATG------ACTACATGTGCATAGA-TAACCAGCCAGAGTTT-TTACAACATGG--TGG----CA--CC-G--ATGA--C-AGCGAGCA---TATCCTATATCTGGT-GGAAGCCCGATGTGG---------A---TCACTCCCATGTCCTCCATATGTACAT-GGTCGCGAGTTGAATTGCGTTGTGTGttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattttgccgtgtgttgtctgcagaacgcagaagtcaacttccgtgatgataccagccagaaacgactgttatccagggtggacgctcgaatacaatggctacatcatgtcaaatcagaatgatcaccctgcttcgtatgactacatgtgcatagataaccagccagagtttttacaacatggtggcaccgatgacagcgagcatatcctatatctggtggaagcccgatgtggatcactcccatgtcctccatatgtacatggtcgcgagttgaattgcgttgtgtgctccaaataaaaaacccttaaatttgat
gi|4                          :                       attgtattttaggttttattgggggcaaaaagtacagcagcactggcagtggaactaatcatctatgtctaccttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaatttGGCGGTAC-----AAACAATCTGTGCCTT---CCATCAGATCCGACAT--GGCT-AAAA-T----ACGT--CGACGGCAATGAC-GG-T-ACA--TACAG----AGGATATGTTTATGGCTCAGAA-AT-----TGAC--AA---CG-----------GA--------GACGC-----CGATA-AC---A--T----CTT----CGA-CTATGC---CGTA-A---ACGATCAAGATGTGCCGTGTGCGGTTTGCAGGAC---------T-CAGA-----AAGCG-TCAGCTC--TCATG-A-TCCCC---G---CACG---AAAG-GACTGCTACAAA-GATTGGACGTTCGAATATAACGGTTACATCAT-GG-GG-G-CAAACTCCAG--ATTCCACG---G--AA-GCTAC----A------ACTATATATGCATGGA-CCATCAACCTGA----GTTTC----TCC--A-----ACATGGC-GGCACCA--ATGACGATCAGCACATTCTATATCT-ACAGGAGGCGCAGTGTGG---------G---TCACTCCCGTGTCCACCGTACGTACAG-GGCCGTGAACTAGCCTGCGTTGTGTGTActccaaataaaaaacccttaaatttgat
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gi|6                          : ggttcaggatacattggaggaaatcgttataacgcagacggcactggaaccaatcatctgtgttttccatcagacccaacctggtccaactttgtcgagttcttatagaggttttatatatggcactgaaatcgacaataacgacaacgacacaatatttgacaagcccataaaCTATGCTGGTGGTTCGCACTACTCCCA-TACTGGTGGCGGTGT--AAATTATTTGTGTCTT---ACCGATGGTCCAATCTACGGAA-ATGT-TGAAAATGG--TGAC--------C-AG---ACC--TTTAG----TGCTAGCGTATACGGTGCCGAGTAC-----GAGCTTGA---TA-----------GAAG--T---AATAT-----CGG-A-GG---G--TT---CAT----CGG---GCAAAATCTT--C---ACCAAGACAATGTCCCGTGCGCCGTGTGCACGAC---AA---C--CAGATCCTCAA----TC----T--TGATG-A-TTCCT---G---GCCG---AAAC-GCGTGTTACGCG-GGGTGGACCTTGGAGTACAAGGGTTATCTGAC-CAGTG-GTTATT---CAG--GT--CATG-C-G--GCTGCTTCA---G------AGTTTGTGTGCCTGGA-TGACCACCCAGTACCCATTAA----TGG--CGG---ACATGCT-G--ACCA--G-AACGGCAAAC-TGTTCTACTTC--GC-AGAAGGAAGGTGCGG---------A---TCGCTGGAATGCCCCCCGTATGTTGAA-GGGAAAGAGTTGACATGTGCTGTATGTctcaaaatgaatgcttttcaaatttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                       ggGGGTCATACTATAGCCATCAC-GGAGGAGCCGC--AGATTATGTCTGTTTGACCCCAGAC---CCACAGT--GGGG-ATAC-T----ACGA--AGAGT-------C-TGTC-GCT--TCCGG----CGGCAAAATGTATGGCACAGAGTAT-----GAGCTCGG---CGACTTGCACAGTGATG--GA--GGC-T-----CG-----C---G--TTT--TTT----GGG-CAATAA---CTTG-A---GGGACGAAGATGCACCCTGTGCCGTTTGCA--AT---TC---TGTCAGA----TCAACGATG----T--TGATG-C-TACCA---G---GACGTATGGAC----TGTTATCCA-GGCTGGACGAAAGAATACAGTGGCTACCTTAT-GCCAG-GTTAT----CA----T--TAC--C----AT-AATTCG---GCCACCGAGAATGTCTGTGTAGA-CAACCGACCGGAAAGCATTAT----CAG--AGG---ATATACC-G--ACCT--G-GAAGGTAAAG-TGTTCTATCTC--GT-GGAAGGGGTATGCGG---------A---TCACTGAAATGTCCACCGTATATAGAA-GGCCGCGAGTTGACGTGTGTTGTATGCAtcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGTGGCAGTGCGGC--AAACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GT--CACA-C-A--AA-GCGACG---G------AATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAAGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGTGGCAGTGCGGC--AAACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GT--CACA-C-A--AA-GCGACG---G------AATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAAGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1816 )     :                                                                                                                                                                               CTACGCCGGAGGGTCNTATTACAACCA-CACT--GGCGGTGCNGCA----AATTATCTNTGTCTN---CCAGACGAACCANTGT--GGGG-ACAT-T----ACGA--TGACG-------C-GG-C-ACA-ATCCAG----TGCNNANGTNTATGGCGCAGAATAT-----CAACTNGA---CG-----------GAAG--G---GAC-T-----CGA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-CGGCAA---CNTA-C---GCGACGANGACGTNCCGTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CG-CGGA----CAAGCG-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGNTGGACNTTGGAATACAACGGTTACCTNAC-GGCGG-GTCA-----CAA--GT--CACG-C-G--AN-GCTTCG---G------AGTTCGTCTGCNTGGA-CGACNAACCGGAANCNATTAC----TGG--AGG---ACATGCC-G--ACCA--G-AACGGNCANC-TGTTCTACTTC--GC-GGAAGNNAGATGCGG---------C---TCNCTNNAATGTCCGCCGTATGTGGAT-GGNCGNGAACTGACATGCGCNGTGTGTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTTT--GT-AGAAGTGAGATGTGG---------C---GCCTTACCTTGTCCACCGTATGT-GATGGGACGTGAACTCCCATGTGTTGTTTGTAtacatttttgcacaaaataatgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                             taCTACATCGGAGGGTCTTACTACAATGA-AACT--GGCGGTGGAGTA----AATTACTTATGTTTG---ACTGACGCACCAATCT--ACGG-ACATGT----TCAGCCTGAC--------C-GA-C-AGACGTATAG----TGCCAACGCATATGGCGGAGGATAT-----CAGTTCGGAGGCA-----------GAAG--T---G-C-TAGTGACGT-A-ACTGGA--TTC--CTT----CAT-CAG-AG---TCTT-C---GCGATGATGACGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---TT-AGAT----CTAGCG-AC----C--TAATG-A-TACCT---G---ACAG---AAAC-GCTTGTTATGCG-GGATGGACCTTGGAGTACAACGGTTAACTGACAAGCGGAGCAA-----CGA--GT--CACGTT-G--CC-GCGTCG---G------AGTTCGTCTGCTTAGATCGAT--------ATCAATTAC----------------CATGTT-A--ATAC--T-AACGGCAAGT-TGTTTTACTTT--GC-GGAAGGCAGATGTGGAGCAGATTCC---TCGTTTGAATGTCCGCCATATGTGGAT-GGATACGAGCTGTCATGCGCActaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attgtattttaggttttattgggggcaaaaagTGCCGTGTGTTGTCTGCAG------AA---CG-CAGAAGT-CAA-CT-TC----CG-TGATG-A-TACCA---G---CCAG---AAAC-GACTGTTATCCA-GGGTGGACGCTCGAATACAATGGCTACATCAT-GTCAA-ATCA-----GAATGAT--CACC-C-----T-GCTTCGTATG------ACTACATGTGCATAGA-TAACCAGCCAGAGTTT-TTACAACATGG--TGG----CA--CC-G--ATGA--C-AGCGAGCA---TATCCTATATCTGGT-GGAAGCCCGATGTGG---------A---TCACTCCCATGTCCTCCATATGTACAT-GGTCGCGAGTTGAATTGCGTTGTGTGttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattttgccgtgtgttgtctgcagaacgcagaagtcaacttccgtgatgataccagccagaaacgactgttatccagggtggacgctcgaatacaatggctacatcatgtcaaatcagaatgatcaccctgcttcgtatgactacatgtgcatagataaccagccagagtttttacaacatggtggcaccgatgacagcgagcatatcctatatctggtggaagcccgatgtggatcactcccatgtcctccatatgtacatggtcgcgagttgaattgcgttgtgtgctccaaataaaaaacccttaaatttgat
gi|4                          :                       attgtattttaggttttattgggggcaaaaagtacagcagcactggcagtggaactaatcatctatgtctaccttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattt--GGCGGTAC---A----AACAATCTGTGCCTT---CCATCAGATCCGACAT--GGCT-AAAA-T----ACGT--CGACGGCAATGAC-GG-T-ACA--TACAG----AGGATATGTTTATGGCTCAGAA-AT-----TGAC--AA---CG-----------GA--------GACGC-----CGATA-AC---A--T----CTT----CGA-CTATGC---CGTA-A---ACGATCAAGATGTGCCGTGTGCGGTTTGCAGGAC---------T-CAGA-----AAGCG-TCAGCTC--TCATG-A-TCCCC---G---CACG---AAAG-GACTGCTACAAA-GATTGGACGTTCGAATATAACGGTTACATCAT-GG-GG-G-CAAACTCCAG--ATTCCACG---G--AA-GCTAC----A------ACTATATATGCATGGA-CCATCAACCTGA----GTTTC----TCC--A-----ACATGGC-GGCACCA--ATGACGATCAGCACATTCTATATCT-ACAGGAGGCGCAGTGTGG---------G---TCACTCCCGTGTCCACCGTACGTACAG-GGCCGTGAACTAGCCTGCGTTGTGTGTActccaaataaaaaacccttaaatttgat
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gi|6                          : ggttcaggatacattggaggaaatcgttataacgcagacggcactggaaccaatcatctgtgttttccatcagacccaacctggtccaactttgtcgagttcttatagaggttttatatatggcactgaaatcgacaataacgacaacgacacaatatttgacaagcccataaaCTATGCTGGTGGTTCGCACTACTCCCA-TACT--GGTGGCGGTGTA----AATTATTTGTGTCTT---ACCGATGGTCCAATCTACGGAA-ATGT-TGAAAATGG--TGAC--------C-AG---ACC--TTTAG----TGCTAGCGTATACGGTGCCGAGTAC-----GAGCTTGA---TA-----------GAAG--T---AATAT-----CGG-A-GG---G--TT---CAT----CGG---GCAAAATCTT--C---ACCAAGACAATGTCCCGTGCGCCGTGTGCACGAC---AA---C--CAGATCCTCAA----TC----T--TGATG-A-TTCCT---G---GCCG---AAAC-GCGTGTTACGCG-GGGTGGACCTTGGAGTACAAGGGTTATCTGAC-CAGTG-GTTATT---CAG--GT--CATG-C-G--GCTGCTTCA---G------AGTTTGTGTGCCTGGA-TGACCACCCAGTACCCATTAA----TGG--CGG---ACATGCT-G--ACCA--G-AACGGCAAAC-TGTTCTACTTC--GC-AGAAGGAAGGTGCGG---------A---TCGCTGGAATGCCCCCCGTATGTTGAA-GGGAAAGAGTTGACATGTGCTGTATGTctcaaaatgaatgcttttcaaatttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                       ggGGGTCATACTATAGCCATCAC---GGAGGAGCCGCA----GATTATGTCTGTTTGACCCCAGAC---CCACAGT--GGGG-ATAC-T----ACGA--AGAGT-------C-TGTC-GCT--TCCGG----CGGCAAAATGTATGGCACAGAGTAT-----GAGCTCGG---CGACTTGCACAGTGATG--GA--GGC-T-----CG-----C---G--TTT--TTT----GGG-CAATAA---CTTG-A---GGGACGAAGATGCACCCTGTGCCGTTTGCA--AT---TC---TGTCAGA----TCAACGATG----T--TGATG-C-TACCA---G---GACGTATGGAC----TGTTATCCA-GGCTGGACGAAAGAATACAGTGGCTACCTTAT-GCCAG-GTTAT----CA----T--TAC--C----AT-AATTCG---GCCACCGAGAATGTCTGTGTAGA-CAACCGACCGGAAAGCATTAT----CAG--AGG---ATATACC-G--ACCT--G-GAAGGTAAAG-TGTTCTATCTC--GT-GGAAGGGGTATGCGG---------A---TCACTGAAATGTCCACCGTATATAGAA-GGCCGCGAGTTGACGTGTGTTGTATGCAtcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGT--GGCAGTGCGGCA----AACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GT--CACA-C-A--AA-GCGACG---G------AATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAAGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGT--GGCAGTGCGGCA----AACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GT--CACA-C-A--AA-GCGACG---G------AATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAAGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1816 )     :                                                                                                                                                                               CTACGCCGGAGGGTCNTATTACAACCA-CACT--GGCGGTGCNGCA----AATTATCTNTGTCTN---CCAGACGAACCANTGT--GGGG-ACAT-T----ACGA--TGACG-------C-GG-C-ACA-ATCCAG----TGCNNANGTNTATGGCGCAGAATAT-----CAACTNGA---CG-----------GAAG--G---GAC-T-----CGA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-CGGCAA---CNTA-C---GCGACGANGACGTNCCGTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CG-CGGA----CAAGCG-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGNTGGACNTTGGAATACAACGGTTACCTNAC-GGCGG-GTCA-----CAA--GT--CACG-C-G--AN-GCTTCG---G------AGTTCGTCTGCNTGGA-CGACNAACCGGAANCNATTAC----TGG--AGG---ACATGCC-G--ACCA--G-AACGGNCANC-TGTTCTACTTC--GC-GGAAGNNAGATGCGG---------C---TCNCTNNAATGTCCGCCGTATGTGGAT-GGNCGNGAACTGACATGCGCNGTGTGTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTTT--GT-AGAAGTGAGATGTGG---------C---GCCTTACCTTGTCCACCGTATGT-GATGGGACGTGAACTCCCATGTGTTGTTTGTAtacatttttgcacaaaataatgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                             taCTACATCGGAGGGTCTTACTACAATGA-AACT--GGCGGTGGAGTA----AATTACTTATGTTTG---ACTGACGCACCAATCT--ACGG-ACATGT----TCAGCCTGAC--------C-GA-C-AGACGTATAG----TGCCAACGCATATGGCGGAGGATAT-----CAGTTCGGAGGCA-----------GAAG--T---G-C-TAGTGACGT-A-ACTGGA--TTC--CTT----CAT-CAG-AG---TCTT-C---GCGATGATGACGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---TT-AGAT----CTAGCG-AC----C--TAATG-A-TACCT---G---ACAG---AAAC-GCTTGTTATGCG-GGATGGACCTTGGAGTACAACGGTTAACTGACAAGCGGAGCAA-----CGA--GT--CACGTT-G--CC-GCGTCG---G------AGTTCGTCTGCTTAGATCGAT--------ATCAATTAC----------------CATGTT-A--ATAC--T-AACGGCAAGT-TGTTTTACTTT--GC-GGAAGGCAGATGTGGAGCAGATTCC---TCGTTTGAATGTCCGCCATATGTGGAT-GGATACGAGCTGTCATGCGCActaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                 gTACAGCAG-CACT--GGCAGTGGAACT----AATCATCTATGTCTA---CCccggttcaaaataaaagctgaacattacactactttttatcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attgtattttaggttttattgggggcaaaaagTGCCGTGTGTTGTCTGCAG------AA---CG-CAGAAGT-CAA-CT-TC----CG-TGATG-A-TACCA---G---CCAG---AAAC-GACTGTTATCCA-GGGTGGACGCTCGAATACAATGGCTACATCAT-GTCAA-ATCA-----GAATGAT--CACC-C-----T-GCTTCGTATG------ACTACATGTGCATAGA-TAACCAGCCAGAGTTT-TTACAACATGG--TGG----CA--CC-G--ATGA--C-AGCGAGCA---TATCCTATATCTGGT-GGAAGCCCGATGTGG---------A---TCACTCCCATGTCCTCCATATGTACAT-GGTCGCGAGTTGAATTGCGTTGTGTGttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattttgccgtgtgttgtctgcagaacgcagaagtcaacttccgtgatgataccagccagaaacgactgttatccagggtggacgctcgaatacaatggctacatcatgtcaaatcagaatgatcaccctgcttcgtatgactacatgtgcatagataaccagccagagtttttacaacatggtggcaccgatgacagcgagcatatcctatatctggtggaagcccgatgtggatcactcccatgtcctccatatgtacatggtcgcgagttgaattgcgttgtgtgctccaaataaaaaacccttaaatttgat
gi|4                          :                       attgtattttaggttttattgggggcaaaaagtacagcagcactggcagtggaactaatcatctatgtctaccttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattt--GGCGGTAC---A----AACAATCTGTGCCTT---CCATCAGATCCGACAT--GGCT-AAAA-T----ACGT--CGACGGCAATGAC-GG-T-ACA--TACAG----AGGATATGTTTATGGCTCAGAA-AT-----TGAC--AA---CG-----------GA--------GACGC-----CGATA-AC---A--T----CTT----CGA-CTATGC---CGTA-A---ACGATCAAGATGTGCCGTGTGCGGTTTGCAGGAC---------T-CAGA-----AAGCG-TCAGCTC--TCATG-A-TCCCC---G---CACG---AAAG-GACTGCTACAAA-GATTGGACGTTCGAATATAACGGTTACATCAT-GG-GG-G-CAAACTCCAG--ATTCCACG---G--AA-GCTAC----A------ACTATATATGCATGGA-CCATCAACCTGA----GTTTC----TCC--A-----ACATGGC-GGCACCA--ATGACGATCAGCACATTCTATATCT-ACAGGAGGCGCAGTGTGG---------G---TCACTCCCGTGTCCACCGTACGTACAG-GGCCGTGAACTAGCCTGCGTTGTGTGTActccaaataaaaaacccttaaatttgat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttgttcaggttttatcggaggcaaacattacaatgtagaagga---GCAAC-AAGACATGCCATGTGCAGTTTGCGGAACTAAAA---AA-TCGA----CG---G-CT----C--TCATG-ACTCCAGCCCG---GAAG---GA-----TTGTTACCAA-TATTGGACGTTAGAATATAACGGTTTCATCAT-GT--G-GTCA-----C--------C-CG-G-G--GA-G-TTCA---G------AATATATTTGCATGGA-CCACCAACCTGAATTCATTCCAGG-TGG--AGGTGTAAATAAC-G--ATCA---------ACATC-TGTTGTATCTT--AT-TGAGTCTCAATGTGG---------A---TCACTCCCATGTCCCCCGTATGTGAAT-GGGCGCGAATTGTCGTGTGTCGTCTGctaaataa
gi|6                          : ggttcaggatacattggaggaaatcgttataacgcagacggcactggaaccaatcatctgtgttttccatcagacccaacctggtccaactttgtcgagttcttatagaggttttatatatggcactgaaatcgacaataacgacaacgacacaatatttgacaagcccataaaCTATGCTGGTGGTTCGCACTACTCCCA-TACT--GGTGGCGGTGTA----AATTATTTGTGTCTT---ACCGATGGTCCAATCTACGGAA-ATGT-TGAAAATGG--TGAC--------C-AG---ACC--TTTAG----TGCTAGCGTATACGGTGCCGAGTAC-----GAGCTTGA---TA-----------GAAG--T---AATAT-----CGG-A-GG---G--TT---CAT----CGG---GCAAAATCTT--C---ACCAAGACAATGTCCCGTGCGCCGTGTGCACGAC---AA---C--CAGATCCTCAA----TC----T--TGATG-A-TTCCT---G---GCCG---AAAC-GCGTGTTACGCG-GGGTGGACCTTGGAGTACAAGGGTTATCTGAC-CAGTG-GTTATT---CAG--GT--CATG-C-G--GCTGCTTCA---G------AGTTTGTGTGCCTGGA-TGACCACCCAGTACCCATTAA----TGG--CGG---ACATGCT-G--ACCA--G-AACGGCAAAC-TGTTCTACTTC--GC-AGAAGGAAGGTGCGG---------A---TCGCTGGAATGCCCCCCGTATGTTGAA-GGGAAAGAGTTGACATGTGCTGTATGTctcaaaatgaatgcttttcaaatttta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                       ggGGGTCATACTATAGCCATCAC---GGAGGAGCCGCA----GATTATGTCTGTTTGACCCCAGAC---CCACAGT--GGGG-ATAC-T----ACGA--AGAGT-------C-TGTC-GCT--TCCGG----CGGCAAAATGTATGGCACAGAGTAT-----GAGCTCGG---CGACTTGCACAGTGATG--GA--GGC-T-----CG-----C---G--TTT--TTT----GGG-CAATAA---CTTG-A---GGGACGAAGATGCACCCTGTGCCGTTTGCA--AT---TC---TGTCAGA----TCAACGATG----T--TGATG-C-TACCA---G---GACGTATGGAC----TGTTATCCA-GGCTGGACGAAAGAATACAGTGGCTACCTTAT-GCCAG-GTTAT----CA----T--TAC--C----AT-AATTCG---GCCACCGAGAATGTCTGTGTAGA-CAACCGACCGGAAAGCATTAT----CAG--AGG---ATATACC-G--ACCT--G-GAAGGTAAAG-TGTTCTATCTC--GT-GGAAGGGGTATGCGG---------A---TCACTGAAATGTCCACCGTATATAGAA-GGCCGCGAGTTGACGTGTGTTGTATGCAtcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGT--GGCAGTGCGGCA----AACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GT--CACA-C-A--AA-GCGACG---G------AATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAAGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTAca
gi|9                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGT--GGCAGTGCGGCA----AACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG-GTCA-----CAA--GT--CACA-C-A--AA-GCGACG---G------AATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACC-G--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAAGATGCGG---------C---TCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTA


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                     T        C      A    C  CT          C   .           C     C        A  A   C T .     C    . TCAGCC        GCGGAACAA                .      TT A  G     T         .         G  CGACTTGCACAGTGATGGAGGCTCGCG                         T     .      GCAAAAT    A AGC        A T     G                 A  TAAAAAA        AGT    G  .  AGCTC       . .    GCCC .      .      . AG         .  C     C           T        G  AGCA  . A  CTACGGTCAGGCAGCA                GTATG         A       C    .    A    G   ACT     AGG    .    A         TT      G     T  AA CC            T   A     CC        CGGG           A  TC       A        AA  .  C  G              A
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Reference ( family-1816 )     :                                                                                                                                                                               CTACGCCGGAGGGTCNTATTACAACCA-CACT--GGCGGTGCNGCA----AATTATCTNTGTCTN---CCAGACGAACCANTGT--GGGG-ACAT-T----ACGA--TGACG-------C-GG-C-ACA-ATCCAG----TGCNNANGTNTATGGCGCAGAATAT-----CAACTNGA---CG-----------GAAG--G---GAC-T-----CGA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-CGGCAA---CNTA-C---GCGACGANGACGTNCCGTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CG-CGGA----CAAGCG-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGNTGGACNTTGGAATACAACGGTTACCTNAC-GGCAG--GTCA-----CAA--GT--CACG---CG--G-N-GCTTCG---GAGTTCGTCTGCNTGGA-CGACNAACCGGAANCNATTAC----TGG--AGG---ACATGCCG--ACCA--G-AACGGNCANC-TGTTCTACTTC--GC-GGAAGNNA---GATGCGG---------NTCNCTNNAATGTCCGCCGTATGTGGAT-GGNCGNGAACTGACATGCGCNGTGTGTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                               CTACGTCGGAGGGTCTTATTACAATGA-AACT--GGCGGTGGAGTA----AATTACTTATGTTTG---ACTGACGCACCAATCT--ACGG-ACATGT----TCAGCCTGGC--------C-GA-CAACC-GTCCAG----TGCCTATACATATGGCGCAGAATAT-----CAGTTCGA---CA-----------GCAGTAG---TGC-TAGTGACGT-A-ACTGGA--TTC--CTT----CAT-CAG-AG---TCTT-C---GCGATGATGACGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---TT-AGAT----CTAGCG-TC----C--TTATG-A-TACCT---G---GCAG---AAAC-GCTTGTTATGCG-GGCTGGACCTTGGAGTACAACGGTTACCTGACAAGCGGA-GCTA-----CGA--TT--CACGT--TG--C-C-GCGTCG---GAGTTCGTCTGCTTGGA-TGAATATCCGGAACCAGTTCC----AGG--AGG---TCATGCT---ACTACTG--ATGGTAAAT-TATTTTACTTT--GC-GGAAGGCA---GATGTGGAGCTGATTCCTCGCTTGAATGTCCGCCATATGTGGAT-GGATACGAGCTGTCATGCGCAGTGTGT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                              ggATAACAACCA--A----GGAAGTGCTGCC----AATTTTTTATGTCTC---CCAACTGAGCCATTGT--GGGG-ACAT-T----ATGA--AGACG-------C-GG-A-ACA-ATCTAG----TGCTTTAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---AAC-T-----TAA-A-TC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---GTGACGATGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCG-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATATAAAGGATACCTAAC-AGCAG--GTCA-----TA----C--CACG---CATTA-T-GCTACA---GAATTTATCTGTTTGGA-TGACAAACCGGAAACAATACC----TGG--AGG---ACATGCCG--ACCA--G-AATGGACACC-TGCTCTACTTC--GC-AGAAGTAA---GATGCGG---------CTCTCTGAACTGCCCACCCTATGTGAAT-GGTCGGGAACTGACATGCGCAGTTTGCAtcaaaataaaagccgaatattacac
gi|11                         :                                                                                                                                                                            tcacaacGCAGGAGGGTCACATTAC--TCG-CACTCCGGCGGCGCCGTC----GATTACCTCTGCTTG---CTAAGAGAACCGCTTT--GGGGGAAAT-T----ACGA--TGACT-------C-CC-T-CCA-AATCGG----TGCTTTAATGTATGGTGCCGAATAC-----GAAATGAATT-CC-----------AAAA--C---TACAT-----CAA-AGAT---G--TTT--CCTGAAATGGACCACTA---CATAGC---CCAAC-ATGACGCGCCGTGTGCTGTATGTAGAAT---GA---AG-CGTG----CTAGCG-CC----A--TCATG-A-TCCCG---G---CAAG---GAAT-GAGTGTTA-CGATGGCTGGATCCTGGAATACAGTGGTTATTTGTC-AGCCG--GATA-----CTACGGT--CAGG---CA--GCA-GCCTCC---CAGTACATCTGCCTGGA-CGACAAACCGGAAACTGTTAC----CGG--AAG---TCATGCCcaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                  CGCTGGAAGTTCCTTTTACAA--A-CA-T--GACGGAGCTGCAGCCGAACTG-ATATGTCTT---CCAAGCCACCCTATGT--GGGGCGTGT-T----------TGATG-------CAGG-C-ACA---CAAGGGAATGCGTACGTGTATGGTGTAGAATATAGGGACAACTT-----CA-----------GAGG--GTTTGA--------CAA-A-AC---GAATTTAAAT-------G-CAG--A---CTCA-CTAAGTTCCAATGATGTTCCCTGTGTATTGTGCAGAAG---TAGTTTA-CGTA----CAACTG-CC----A--TCATGAA-TCCTGCTTG---GAAT---AAA-----TGTTGCACA-GGCTGGAATTTAGAGTACCATGGCTATCTCAT-GGCTG--GACA-----
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggttcGAAGAGGATATGCCGTGTGCTGTTTGCAGATC---A--------GAA----AAATCA-TCGG--CCGTGATG-A-AACCT---GCCCGAAG---TCACTGCTT----TCCC-GGATGGTTGCTTGAGTACGGCGGTTATCTGAT-GG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatataccgacagtggcagtggaaacaatgatttatgcataccgtccgatctctcctgatcaaattacaacgatggcgttgaggacgcaagagtatacatatacggaacagagatccacacaacagacgcacaacacatattcgaacacggagttcatCAG--GTCA-----CAA--A------G---CT--G-G---TTCC---GAGTTTGTCTGCCTTGA-CGAAAACCCAGAAGGCATTG-----TGATCAGA---A-ATACCTT-AGC---G-AATGGAAAAC-TGTTTTACCTG--AC-AGAAGCCGTCTGCGGCGG---------GTCACTTCAATGCCCACCATATGAAAAT-GGCAAGGAACTGACATGTGCAGTGTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tG--AGG---ACATGCCG--ACCA--G-AATGGGCACC-TGCTCTTCTTC--GC-AGAAGTAA---GATGTGG---------CTCTCTGAAATGT-CGCCATAAGTGAAT-GGTCGGGAACAGACATGctcaaagta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTTT--GT-AGAAGTGA---GATGTGG---------CGCCTTACCTTGTCCACCGTATGT-GATGGGACGTGAACTCCCATGTGTTGTTTGTAtacatttttgcacaaaataatgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                             taCTACATCGGAGGGTCTTACTACAATGA-AACT--GGCGGTGGAGTA----AATTACTTATGTTTG---ACTGACGCACCAATCT--ACGG-ACATGT----TCAGCCTGAC--------C-GA-C-AGACGTATAG----TGCCAACGCATATGGCGGAGGATAT-----CAGTTCGGAGGCA-----------GAAG--T---G-C-TAGTGACGT-A-ACTGGA--TTC--CTT----CAT-CAG-AG---TCTT-C---GCGATGATGACGTCCCGTGCGCCGTCTGCCGGAC---AA---TT-AGAT----CTAGCG-AC----C--TAATG-A-TACCT---G---ACAG---AAAC-GCTTGTTATGCG-GGATGGACCTTGGAGTACAACGGTTAACTGACAAGCGGA-GCAA-----CGA--GT--CACGT--TG--C-C-GCGTCG---GAGTTCGTCTGCTTAGATCGAT--------ATCAATTAC----------------CATGTTA--ATAC--T-AACGGCAAGT-TGTTTTACTTT--GC-GGAAGGCA---GATGTGGAGCAGATTCCTCGTTTGAATGTCCGCCATATGTGGAT-GGATACGAGCTGTCATGCGCActaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                 gTACAGCAG-CACT--GGCAGTGGAACT----AATCATCTATGTCTA---CCccggttcaaaataaaagctgaacattacactactttttatcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attgtattttaggttttattgggggcaaaaagTGCCGTGTGTTGTCTGCAG------AA---CG-CAGAAGT-CAA-CT-TC----CG-TGATG-A-TACCA---G---CCAG---AAAC-GACTGTTATCCA-GGGTGGACGCTCGAATACAATGGCTACATCAT-GTCAA--ATCA-----GAATGAT--CACC---C-----T-GCTTCGTATGACTACATGTGCATAGA-TAACCAGCCAGAGTTT-TTACAACATGG--TGG----CA--CCG--ATGA--C-AGCGAGCA---TATCCTATATCTGGT-GGAAGCCC---GATGTGG---------ATCACTCCCATGTCCTCCATATGTACAT-GGTCGCGAGTTGAATTGCGTTGTGTGttctgatccgacatggtctaaccatgtagacggtaacagcgatagttcatatagagggtggatatatgggactgagatacataccgcggacagcgatcatatctttaattttgccgtgtgttgtctgcagaacgcagaagtcaacttccgtgatgataccagccagaaacgactgttatccagggtggacgctcgaatacaatggctacatcatgtcaaatcagaatgatcaccctgcttcgtatgactacatgtgcatagataaccagccagagtttttacaacatggtggcaccgatgacagcgagcatatcctatatctggtggaagcccgatgtggatcactcccatgtcctccatatgtacatggtcgcgagttgaattgcgttgtgtgctccaaataaaaaacccttaaatttgat
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gi|6                          : ggttcaggatacattggaggaaatcgttataacgcagacggcactggaaccaatcatctgtgttttccatcagacccaacctggtccaactttgtcgagttcttatagaggttttatatatggcactgaaatcgacaataacgacaacgacacaatatttgacaagcccataaaCTATGCTGGTGGTTCGCACTACTCCCA-TACT--GGTGGCGGTGTA----AATTATTTGTGTCTT---ACCGATGGTCCAATCTACGGAA-ATGT-TGAAAATGG--TGAC--------C-AG---ACC--TTTAG----TGCTAGCGTATACGGTGCCGAGTAC-----GAGCTTGA---TA-----------GAAG--T---AATAT-----CGG-A-GG---G--TT---CAT----CGG---GCAAAATCTT--C---ACCAAGACAATGTCCCGTGCGCCGTGTGCACGAC---AA---C--CAGATCCTCAA----TC----T--TGATG-A-TTCCT---G---GCCG---AAAC-GCGTGTTACGCG-GGGTGGACCTTGGAGTACAAGGGTTATCTGAC---CAGTGGTTATT---CAG--GT--CATG---CG--G-CTGCTTCA---GAGTTTGTGTGCCTGGA-TGACCACCCAGTACCCATTAA----TGG--CGG---ACATGCTG--ACCA--G-AACGGCAAAC-TGTTCTACTTC--GC-AGAAGGAA---GGTGCGG---------ATCGCTGGAATGCCCCCCGTATGTTGAA-GGGAAAGAGTTGACATGTGCTGTATGTctcaaaatgaatgcttttcaaatttta
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gi|8                          :                                                                                                                                                                               CTACACTGCAGGATCATATTACGACCA-CAGT--GGCAGTGCGGCA----AACTTTCTTTGTCTC---CCAAATGAACCATTGT--GGGG-TCAT-T----ATGA--TGATG-------C-GG-T-ACA-ATCTAG----TGCAGAAGTTTGGGGAGCAGAATAT-----CAACTAGA---TG-----------GAAG--G---GAC-T-----TAA-A-AC---G--TTT--CTT----CGG-TGGCAA---CATA-C---ATAACGAAGATGTTCCTTGTGCCGTCTGCAGAAC---AA---CA-CGGA----CAAGCA-TC----C--TGATG-A-TCCCG---G---GAAG---GAAC-GCTTGTTATCCA-GGATGGACTTTGGAATACAAAGGATACCTAAC-AGCAG--GTCA-----CAA--GT--CACA---CA--A-A-GCGACG---GAATTCGTTTGTTTGGA-TGACAAACCAGAAACAATAAC----TGG--AGG---ACATACCG--ACCA--G-AATGGACACC-TCTTCTATTTT--GC-CGAAGTAA---GATGCGG---------CTCTCTGAAATGTCCGCCATACGTGCAT-GGGCGGGAACTGACATGTGCAGTGTGTAca
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