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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-TTCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGA-GAATAA--CA-GTCA-TATTT----------------CTAAGAAGA-AA------
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGACCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGG--AAATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaac---AAGTGTATTGTCTGGGATGT-ATTCTTCGACCCGCAACA-----AT---CAAGGAAGAATAAATTG-GTAACCGTTTG-------A----TAGTTGACAAGATAA------Aagcatagaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gttACACACTCATTGACGAGGA-AAATAAATGA-GTTACCATTTG-------G----TAGCTGgaagtattggtgtgga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-GAATAGTTGATGTAACCATTTACCATGACG----AAG-TAAAAATA-AATGTATTGTACA---GGTATTAA--CAA-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAA---ATGATTATATACA---CATAAAGTAAGCTGAAT-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaccatgtatcatctgtgtccttgtgtgaacacatgccagttgctgtctgtctctattttacatgatgttgctcttatacccgttgatattgttttatatttattactcagtttggttgaatgaagaaagtattcctcgtacaaatacattgaatcttcctaagccaggtaagttatcaaaaattattgtttctgattgttaaacctatctgcaggcatgcatgcttgactgtgtattggcatataagattcagatataattaaacaaggtcattacatt-GTTACTATT-G-------GTCTCAA--TGAAAAAA-AAC-----ATGTGTTCATTGCATACACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTTA--TATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAA---ACGGTTACATATATATC--AAAG-TAGCT-AA-ACCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGTCGGTTT
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatcca---TGTGG--TTGATTTACAGT----TCATCTTCTTTTAGTTTACAT----TCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATATTTACATTTGCAAGTTGTATAGGTAT---AGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-AT-TATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAG-AAACTAT-CGGAGTAGTTCAACCACC------------TGACTGTCT---------T----A---AAAATGATGTTT---AT-TTAAGTTTGCT--TTTT-------AACCGATCAAACGCTT---TCT------C--------T-----AGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAGTT--------ATGGTG---ACA----CTTTCTCT--GTT--T--CTACATGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatgtttacagtgcaatttctttaaattaacatagattaaGCAC-----G---AGTAGTTTCCCGAGGT----TAT------C----------AAT----A----GCAT-A-GA-AATTACGGCACCATTCCAGCCATGATGGACGTAATGTCACCATTTCTCTGAGTGATAGAAAAG-AT-TGCAGTAAATGTACTATCTGAAAGAATATATGGCT-TGCC--------TTAAAAAAGAAAAG-ACATTT--AATGTTG----CTTTCGTTTT-------AATCGACCAAACACTT---TCT------TTTGTAAACC-----AA-G----AAAG---TCATTCCTCAGTTATACAGAGTTCATA-ATTATGGTG---agaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






Alignments
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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGACTGAGAATGAGAGCGNTGTGTGCGAGTCACCGTCGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GNAGC--TGAAA-AAAAACATA-----CA---AAT---ANAAAN----ACAA-ATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTTACAGTGCAATAAACA-AATCTTTCTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AAT-C--AGTCGCTTAGA---GAATACTTCCTGGAAAT-CAGAAACTA-TA-CAGAAAGTCGAT-TTTNAA-AATATA----T-TTCNAACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAG-AC-GTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATNTGACACTGGTCGATTTT-ATTGTCCATAGTATCGTCTGNCAAA-ACGTTC----T-TATATGGTNACG-AT-GCAGTACATTCGAGGGTTCTTGGACAATTAC-TA-ACGTGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACGTCAGACAAATCACCAGTACT-GCAACAATGNTTGCTTGGTAACATCAGANTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGC-CTNTTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTATTNCATANTTTAAGACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAGACANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGT-ACAA-G-C-GCAGAGAGGTACCATTCCGNAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGA--ACAAA-TG-TGTTTCA---TGTGATTGAGTTATTNCTCATTACTAG-T-TGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTC------TGCTTTCGTATATCATGATTTATNTGGNTAAGCCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGNAACNATCTTCTAATTTACATTCTTTGTAA--ACTTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCATCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCAGCCATAGTNGACGTAATGTCACCGTTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGACTGTGTCTT-AA-----AAAGAAAATATATTCT-AATTT-TATT----TT-------TTAATCGACCAAACGCT--TTCT------T--------CAATG----AAGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGTTCATAATTATNGTGACA----CNTTCACTGTT----TCT--NTAC-CGC----A-CTGTGCTTT---CGACTTCTTC
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------C--TAAGA-AGAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGT--TGACA-AGAagcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GTTACTATT------G-------GTCTCAATGAAA-AAAAACATG-----TGTTCATT---GCATAC----ACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTTA--TATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AAA-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAAT-CATAAATGT-TA-CAGAAGGTCGGT-TTCCAtaaagaagtattggtgtgga
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaTTCAAGCCTTATGAAATTGGTTTACAGTGCAACT-TCTTCTAATTTACAT--------A--ACTT---------CATT-GTAAA-AT--TT-A-CATCT-GCGAGTTGCATGGGTA-----ATCATCTGGAGT----TAT------TGATTCGATATTATCTGAA----GCAT-AGAA-A--T-ATGGCACCAATCTGGTCATAATAGACGTTAAGTCATCGTTTCTCTGGCTGTTAGAAACTATTGCAGTAGTTCAACCACCTGAATTAATATATTACTTTGTCCT-AA-----AAAGAAAGGATATTCT-AA-TT-TATT----TTTATGTTGTTAATTGACCAAACGCTGCGTCTCGTTAAT--------CAAT-----AAGG---TCAGTCTTCAATTACATAATGTCC-CAATCATCATGACGGTGTCACTTACTATT----TCT--TAAC-CTC----ATCTGTGCCTT---CGAatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccattcaagccttatgaaattggtttacagtgcaacttcttctaatttacataacttcattgtaaaatttacatctgcgagttgcatgggtaatcatctggagttattgattcgatattatctgaagcatagaaatatggcaccaatctggtcataatagacgttaagtcatcgtttctctggctgttagaaactattgcagtagttcaaccacctgaattaatatattactttgtcctaaaaagaaaggatattctaatttatttttatgttgttaattgaccaaacgctgcgtctcgttaatcaataaggtcagtcttcaattacataatgtcccaatcatcatgacggtgtcacttactatttcttaacctcatctgtgccttcgatgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|21                         : tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGC--TGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A-TCAAAATGCAGGTAAATCAAAA-AGACAGATT-CGATAAATTCTTATACAACATAATAAAT--AT--GTCAAAA-G-C-CGAGAGAGGTACCAC-----------GGTTCCGAATAGTATAGTGA-----GTCCATACACACAGC--ACAAAATG--GTCTTC---TGGGTTTCTATTATAACTC-TTATGA----TGTA------ACATGCATTGCAAAGCGTTTAATATCAATGTTGAGTC------TGTTTTCGTATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T-T-GTGGGTTGCACGAGTA-----GTTTCCCGAGGT----TAT------C----------AAT----A----GCAT-A-GA-AATT-ACGGCACCATTCCAGCCATGATGGACGTAATGTCACCATTTCTCTGAGTGATAGAAAAGATTGCAGTAAATGTACTATCTGAAAGAATATATGGCT-TGCCTTAAA-----AAAGAAAAGACATT-T-AATGT-TGCTTTCGTT-------TTAATCGACCAAACACT--TTCT------TTTGTAAACCAA-G----AAAG---TCATTCCTCAGTTATACAGAGTTCATAATTATGGTGTTA----CTCCCAAAGTCAAAATTT--CTACACGCCTCGA-TTGTGTTTT---ctttaagtataatttgaattagttcacctacgccttatgactggtcagattgttgggaggttaggcgagacgcagcttgagttattattttgctaaagtgacatgtccatccaacccggatgtgattggtttacagagaatttgatttttaactgaacttttgtgggttgcacgagtagtttcccgaggttatcaatagcatagaaattacggcaccattccagccatgatggacgtaatgtcaccatttctctgagtgatagaaaagattgcagtaaatgtactatctgaaagaatatatggcttgccttaaaaaagaaaagacatttaatgttgctttcgttttaatcgaccaaacactttcttttgtaaaccaagaaagtcattcctcagttatacagagttcataattatggtgttactcccaaagtcaaaatttctacacgcctcgattgtgttttgatgagaagtttttttacaaagatgacagcaattatatctttatttgttatctgtttctatcatacctaattctgtctgcagattttctctgacttatatggcaaattagtttcatattgtaaccaacggtaaataaatatatgaaaaccaccgagttttcaatatgctatttaagttcatcttcgttttcgaaatacatttgtcttcatgtattcagctaaacccgttatattcattctgtatcaagacttttatcagtctttgaacttgctttgtaatggtatatataagactctgatgataatgtactttctatctgagttgataattcaatagaaacacgtttctattgaaagcagtccagctttgttatggctgtgtacgtacatgtgaaaatataaaataattttaaaggacatattcgaacaatgctccgcatgagacaaaggaaaattaagtctcgatatacaacaagtatactagaattttaatttgactattcatctcgaattatttattattaaaaaaaaatataattcctttcaaacaatgtaaaattcgcatagctaattaacaaaatgtgatattctatttttaatccaattaggatattcaaaaagtaattatatatatcttagattaagattgacacaagagtactaacaaacaataacattaaagtagagctttataaatgacattctttggatattcaagaaattgccgattgacttgttttttatggggatttttcatccgaaatataaagtgatgctagtgcaacacttgactagtactgatggtcaggaaatggtctatacgtatatactaaacgtttccaagtgactgatccgagactaaaagggatccggtttactatactatttcacacttacga
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATATTATAATaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgagtttaattttctgagctcttaaa---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCT-TCTTTTAGTTTACATTCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACC------------TGAC--TGTCTT-AA-----AAATGATGTTTATT-T-AAGTT-TGCT----TT-------TTAACCGATCAAACGCT--TTCT------C--------TAGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG-------TTATGGTGACA----CTTTCTCTGTT----TCT--ACA--TGC------CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCaagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgagtttaattttctgagctcttaaacaaagcactcagtatcattgttgagtctacatgtacttccgtatattataataagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgaATATGTTTTATATAGTGGTAATATACTAAATTGACTGAGAAGGTGAGTGATGTGTGCAAGTCACCGTTGATTAATTTGTTAATATTGTA---AAGTGTTTATT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCATAACACACTCACTGACGGGAAGAATAAATGC-ATAATCATT-----TT-------TTAGC--TGAAA-AAA---ATA------A---AAT---AAAGAcacaaagttgactgcgatcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG---TAAAA-ATAAATGTATTGTACA---GGT---ATTAA------CAA-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAAT-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGT-CAGAAACTA-Tagtgtttgtgg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






Alignments
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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGATTGAGAATGAGAGCGTTGTGTGCGAGTCACCATTGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GNAGCTGAAA-AAAAACGTA-----CG---AA---TANAAAC----ACAACATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTNACAGTGCAATANACA-AATCCTTTTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AAT-C--AATCGCTTNGA---GAATACTTCCTGGAAATCAGAAA---CTATATCAGAAAGTC-GT-TTTNAA-AATAT-AT-TTCT---AACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAGACCGTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATATGACACTGGTTGGTTTT-ATTGTCCATAGTATCGTCTGNCAAA-ACGTTC----T-TATATGGTG-ACGAT-GCA-GTA------CATTCAAGGGTTCTTGGACAATTAC-ATAACATGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACATCAGATAAATCACCANTACT-GCAACAATGATTGCTTGGTAACATCAGAGTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGCCTNTTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTNTTTCATANTTTAANACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAAATANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGT-ACAA-G-C-GCAGAGAGGTACCATTCCGTAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGA--ACAAA-TGTTGTTTCA---TGTGATTGAGTTATTTCTCATTACTAGTTTGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTC------TGCTTTCGTATATCATGATTC--ATNATT-AG-CCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGCAACNATCTTTTAATTNACATTCTTTGTAA--ACTTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCACCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCANCCNTAGTNGACGTAATGTCACCATTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGAC-T-TGTCTT-AA-----AAANAAAATATATTCT-AAT-TTAT-T----TT-------TT-AATCGATCAAACGCT--TTCT------T--------CAATG----AAGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGT-----TCATAATTATNGTGACACTTTCACTG------TTTCT--NC--GCCGCAACTGTGCTTT---CGACTCNTTC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactgATTTCCTTGCCTAATTC-AGTAAGTGCACTCGTGTAAGTGCTA---CATACAGTAAAACA-TCGGAGTGCAGCTACAGCAATACAAACATATA-CATTTAATGCATATTCATCTT--CAGGA--ATACGT-ACAA-ATC-GCAAAGAGGTACCATTCCGTAAATATGATTCCGAGTAGTTCGATGACCGAAACTCATTCACACAAAACACAAA-TGATGTTTCA---TATGATTGAGTTTTTACTTACCACTTGTATGTA------CTATGCAT-GCAAAGTGTTCAGAATCATTATTTAGTC------TGCTTCCATGTATCATAATT----TGAGTAAG-TCATCCCATTTCTTTGCTTAAG---TGTGA--CTTGTTTAGAATTTAACAAT-TTTTAATTTACATTCTTTGTAAACACTTGTGAATGTGCCTTTAGAAGCATG-TTCA-CGT-T-GCCAGCTGCATGGGTA-----ATCATCTGAAGT----TAT------C----------TTT----A----GCAT-ACAA-A--C-ATGCCACCATTCTACCCCTAGTCGACATCATGTCGCCGCTAATATTGGTATTGGACACTATTGCAATAGTTCAACCATCGGAATAAATGCATGAC-TGTGTTTT-AGATAATAAATAAAATACATTC------------------------------TCAAGTAAA-------------------------CAATG----AAGA---TCATTCGTCAATTATATGTAGT-----TCATTATTCTAGTGTCACTTTCACCG------TTTCT--ACATGCCGCAATTGTGCTTT---GGAtccttgcctaattcagtaagtgcactcgtgtaagtgctacatacagtaaaacatcggagtgcagctacagcaatacaaacatatacatttaatgcatattcatcttcaggaatacgtacaaatcgcaaagaggtaccattccgtaaatatgattccgagtagttcgatgaccgaaactcattcacacaaaacacaaatgatgtttcatatgattgagtttttacttaccacttgtatgtactatgcatgcaaagtgttcagaatcattatttagtctgcttccatgtatcataatttgagtaagtcatcccatttctttgcttaagtgtgacttgtttagaatttaacaatttttaatttacattctttgtaaacacttgtgaatgtgcctttagaagcatgttcacgttgccagctgcatgggtaatcatctgaagttatctttagcatacaaacatgccaccattctacccctagtcgacatcatgtcgccgctaatattggtattggacactattgcaatagttcaaccatcggaataaatgcatgactgtgttttagataataaataaaatacattctcaagtaaacaatgaagatcattcgtcaattatatgtagttcattattctagtgtcactttcaccgtttctacatgccgcaattgtgctttggaggatagctgagatgataaattacttt
gi|11                         : gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactggaatagttgatgtaaccattaaccatggtgaagtaaaaatgtgcgtattgtacaggttttaacaaattctaactgccatacaacagcaagattcagtgctaattatcaaacatcggttgctttacagtgcaataatcaaatattttggaactccaaataattatatacacataaagtcagctaaagcagtcgttttgagaatagttccttgaaatcagaaactattgcagacagtcatatttaaaaatatatttccaacaggtagttttgtaccgttaataaagaatgtgtcaagactagtgtttggaaaataacacttcataagtgatgcattagactatataagtacatagttccgttcgtaaaatacgtataaggtgacgatgcagtacctagggtttttaaacaattgttgaacagacaggcttctgacacaaacacacatcagataaatcaccattactgcaacaatgATATTTATTATATAGTGAAAATATTCTAAATTAATTGAGATTGAGAGTGTTGTGTGCGAggatagctgagatgataaattacttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGTTCCTTTACAGTGCAACATATGTAGTCCTTCTGTGGTTCAAAGTATAACAAAAACAT-AAAGTTAACT-AAT------TCACTTAAG---GCATAAAATCTGGAAATACGAAAAGGTTA---CAGAAAGTT-AT-TTTGGATAATACAAT-TTCTTCAAACACGAGG--CTGTAT-----GTAT------TG----AACTTGTAATTAGAAAATAACCCATT--AAAGGTGATGCATTAGGCTATTTGA----AGTTGATTTTCA--ATCTACAGGAGTGTCTTATAAA-ACATTCAGTAC-AATATGGTG-AC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------CTAAGA-AGAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGTTGACA-AGAagcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA-AA-AACATG-----TGTTCAT---TGCATAC----ACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTT--ATATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AAA-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGTC-GG-TTTtaaagaagtattggtgtgga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaGGTCGGTTTCCATT--CCACAGTATTGTCTGATAAA-ACGTTC-----------AGTGTACG-T-GCATGTATGGCGACATTTGAGGGTACTTGGCCAAATAC-CTTATATGAGACAGA---GCTTCTAGCACTAACTGA-CTACGCCTCATACACATCACCAGTGTTTGCAACAATGTTTGATTGGTATCATCAACATACTTAACTTAGGCCAAGATATATTTTCTTGTCTTTCCT-AGTAAA--CA---ACGTAAGTGATATTACATGTTTTGAGACAGTTGG-ATGCAGGAAAAGCAACAAATAAAGATTGCTTTAAATTCTTATACAATAT--CATAA--ATAAAT-ATAATG-G-GCAGCGAAGCACC-TGGCGAAAACAAGGTTCCAGATGGTATGGTGACCGAAACACATACATACAGA--ACAA----------CAAACTGTGATTGAATTGTCTGTC-TTA------TGTAAACAATCTAT--AT-GCGAAACTTTCAGTATCATTGTTCTGTC------ccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccattcaagccttatgaaattggtttacagtgcaacttcttctaatttacataacttcattgtaaaatttacatctgcgagttgcatgggtaatcatctggagttattgattcgatattatctgaagcatagaaatatggcaccaatctggtcataatagacgttaagtcatcgtttctctggctgttagaaactattgcagtagttcaaccacctgaattaatatattactttgtcctaaaaagaaaggatattctaatttatttttatgttgttaattgaccaaacgctgcgtctcgttaatcaataaggtcagtcttcaattacataatgtcccaatcatcatgacggtgtcacttactatttcttaacctcatctgtgccttcgatgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|21                         :                                                                                                         tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGCTGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATATTATAA-TA--AGAGTT-AGTCCA-CCCACaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgagtttaattttctgagctcttaaa---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCT-TCTTTTAGTTTACATTCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACCTGA--------------C-TGTCTT-AA-----AAATGATGTTTATTTA-AGT-TTGC-T----TT-------TT-AACCGATCAAACGCT--TTCT------C--------TAGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG------------TTATGGTGACACTTTCTCTG------TTTCT--AC--A-TGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgagtttaattttctgagctcttaaacaaagcactcagtatcattgttgagtctacatgtacttccgtatattataataagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgaATATGTTTTATATAGTGGTAATATACTAAATTGACTGAGAAGGTGAGTGATGTGTGCAAGTCACCGTTGATTAATTTGTTAATATTGTA---AAGTGTTTATT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCATAACACACTCACTGACGGGAAGAATAAATGC-ATAATCATT-----TT-------TTAGCTGAAA-AAAAcacaaagttgactgcgatcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG-TAAAA-ATAAATGTATTGTACA---GG---TATTAAC----A--A-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAAT-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTATtaaaataaagaagtgtttgtgg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






Alignments
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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGATTGAGAATGAGAGCGTTGTGTGCGAGTCACCATTGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GNAGCTGAAA-AAAAACGTA-----CG---AAT---ANAAAC----ACAACATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTNACAGTGCAATANACA-AATCCTTTTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AA-T-C--AATCGCTTNGA---GAATACTTCCTGGAAATCAGAAA---CTATATCAGAAAGT-CGT-TTTNAA-AATAT-AT-TTCT---AACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAGACCGTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATATGACACTGGTTGGTTTT-ATTGTCCATAGTATCGTCTGNCAAA-ACGTTC----T-TATATGGTG-ACGAT-GCA-GTA------CATT-AAGGGTTCTTGGACAATTAC-ATAACATGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACATCAGATAAATCACCANTACT-GCAACAATGATTGNTTGGTAACATCAGAGTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGCCTATTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTATTTCATANTTTAANACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAAATANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGT-ACAA-G-C-GCAGAGAGGTACCATTCCGTAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGA--ACAAA-TGTTGTTTCA---TGTGATTGAGTTATTTCTCATTACTAGTTTGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTC------TGCTTTCGTATATCATGATTNATA--GTTAG-CCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGCAACNATCTTTTAATTNACATTCTTTGTAA--ACTTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCACCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCANCCNTAGTNGACGTAATGTCACCATTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGAC-T-TGTCTT-AA-----AAANAAAATATATTCT-AAT-TTAT-T----TT-------TT-AATCGATCAAACGCT--TTCT------T--------CAATG----AAGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGT-----TCATNATTATGGTGTCACTTTCACTG------TTTCT--AC--GCCGCAACTGTGCTTT---CGACTCNTTC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactgATTTCCTTGCCTAATTC-AGTAAGTGCACTCGTGTAAGTGCTA---CATACAGTAAAACA-TCGGAGTGCAGCTACAGCAATACAAACATATA-CATTTAATGCATATTCATCTT--CAGGA--ATACGT-ACAA-ATC-GCAAAGAGGTACCATTCCGTAAATATGATTCCGAGTAGTTCGATGACCGAAACTCATTCACACAAAACACAAA-TGATGTTTCA---TATGATTGAGTTTTTACTTACCACTTGTATGTA------CTATGCAT-GCAAAGTGTTCAGAATCATTATTTAGTC------TGCTTCCATGTATCATAATTTG-A--GTAAG-TCATCCCATTTCTTTGCTTAAG---TGTGA--CTTGTTTAGAATTTAACAAT-TTTTAATTTACATTCTTTGTAAACACTTGTGAATGTGCCTTTAGAAGCATG-TTCA-CGT-T-GCCAGCTGCATGGGTA-----ATCATCTGAAGT----TAT------C----------TTT----A----GCAT-ACAA-A--C-ATGCCACCATTCTACCCCTAGTCGACATCATGTCGCCGCTAATATTGGTATTGGACACTATTGCAATAGTTCAACCATCGGAATAAATGCATGAC-TGTGTTTT-AGATAATAAATAAAATACATTC------------------------------TCAAGTAAA-------------------------CAATG----AAGA---TCATTCGTCAATTATATGTAGT-----TCATTATTCTAGTGTCACTTTCACCG------TTTCT--ACATGCCGCAATTGTGCTTT---GGAtccttgcctaattcagtaagtgcactcgtgtaagtgctacatacagtaaaacatcggagtgcagctacagcaatacaaacatatacatttaatgcatattcatcttcaggaatacgtacaaatcgcaaagaggtaccattccgtaaatatgattccgagtagttcgatgaccgaaactcattcacacaaaacacaaatgatgtttcatatgattgagtttttacttaccacttgtatgtactatgcatgcaaagtgttcagaatcattatttagtctgcttccatgtatcataatttgagtaagtcatcccatttctttgcttaagtgtgacttgtttagaatttaacaatttttaatttacattctttgtaaacacttgtgaatgtgcctttagaagcatgttcacgttgccagctgcatgggtaatcatctgaagttatctttagcatacaaacatgccaccattctacccctagtcgacatcatgtcgccgctaatattggtattggacactattgcaatagttcaaccatcggaataaatgcatgactgtgttttagataataaataaaatacattctcaagtaaacaatgaagatcattcgtcaattatatgtagttcattattctagtgtcactttcaccgtttctacatgccgcaattgtgctttggaggatagctgagatgataaattacttt
gi|11                         : gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactggaatagttgatgtaaccattaaccatggtgaagtaaaaatgtgcgtattgtacaggttttaacaaattctaactgccatacaacagcaagattcagtgctaattatcaaacatcggttgctttacagtgcaataatcaaatattttggaactccaaataattatatacacataaagtcagctaaagcagtcgttttgagaatagttccttgaaatcagaaactattgcagacagtcatatttaaaaatatatttccaacaggtagttttgtaccgttaataaagaatgtgtcaagactagtgtttggaaaataacacttcataagtgatgcattagactatataagtacatagttccgttcgtaaaatacgtataaggtgacgatgcagtacctagggtttttaaacaattgttgaacagacaggcttctgacacaaacacacatcagataaatcaccattactgcaacaatgATATTTATTATATAGTGAAAATATTCTAAATTAATTGAGATTGAGAGTGTTGTGTGCGAggatagctgagatgataaattacttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGTTCCTTTACAGTGCAACATATGTAGTCCTTCTGTGGTTCAAAGTATAACAAAAACAT-AAAGTTAACT-AA-T------TCACTTAAG---GCATAAAATCTGGAAATACGAAAAGGTTA---CAGAAAGT-TAT-TTTGGATAATACAAT-TTCTTCAAACACGAGG--CTGTAT-----GTAT------TG----AACTTGTAATTAGAAAATAACCCATT--AAAGGTGATGCATTAGGCTATTTGA----AGTTGATTTTCA--ATCTACAGGAGTGTCTTATAAA-ACATTCAGTAC-AATATGGTG-AC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------CTAAGA-AGAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGTTGACA-AGAagcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA-AA-AACATG-----TGTTCATT---GCATAC----ACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTT--ATATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AA-A-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGT-CGG-TTTtaaagaagtattggtgtgga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaGGTCGGTTTCCATT--CCACAGTATTGTCTGATAAA-ACGTTC-----------AGTGTACG-T-GCATGTATGGCGACATTTGAGGGTACTTGGCCAAATAC-CTTATATGAGACAGA---GCTTCTAGCACTAACTGA-CTACGCCTCATACACATCACCAGTGTTTGCAACAATGTTTGATTGGTATCATCAACATACTTAACTTAGGCCAAGATATATTTTCTTGTCTTTCCT-AGTAAA--CA---ACGTAAGTGATATTACATGTTTTGAGACAGTTGG-ATGCAGGAAAAGCAACAAATAAAGATTGCTTTAAATTCTTATACAATAT--CATAA--ATAAAT-ATAATG-G-GCAGCGAAGCACC-TGGCGAAAACAAGGTTCCAGATGGTATGGTGACCGAAACACATACATACAGA--ACAA----------CAAACTGTGATTGAATTGTCTGTC-TTA------TGTAAACAATCTAT--AT-GCGAAACTTTCAGTATCATTGTTCTGTC------ccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccattcaagccttatgaaattggtttacagtgcaacttcttctaatttacataacttcattgtaaaatttacatctgcgagttgcatgggtaatcatctggagttattgattcgatattatctgaagcatagaaatatggcaccaatctggtcataatagacgttaagtcatcgtttctctggctgttagaaactattgcagtagttcaaccacctgaattaatatattactttgtcctaaaaagaaaggatattctaatttatttttatgttgttaattgaccaaacgctgcgtctcgttaatcaataaggtcagtcttcaattacataatgtcccaatcatcatgacggtgtcacttactatttcttaacctcatctgtgccttcgatgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|21                         :                                                                                                         tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGCTGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TCAAAATGCAGGTAAATCAAAA-AGACAGATT-CGATAAATTCTTATACAACATAATAAAT--AT--GTCAAAA-G-C-CGAGAGAGGTACCAC-----------GGTTCCGAATAGTATAGTGA-----GTCCATACACACAGC--ACAAAATG--GTCTTC---TGGGTTTCTATTATAACTC-TTATGA---TGTA------ACATGCATTGCAAAGCGTTTAATATCAATGTTGAGTC------TGTTTTCGTATA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATATTATAA-TAAGA--GTTAGTCCA-CCCACaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgagtttaattttctgagctcttaaa---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCT-TCTTTTAGTTTACATTCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACCTGA--------------C-TGTCTT-AA-----AAATGATGTTTATTTA-AGT-TTGC-T----TT-------TT-AACCGATCAAACGCT--TTCT------C--------TAGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG------------TTATGGTGACACTTTCTCTG------TTTCT--AC--A-TGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgagtttaattttctgagctcttaaacaaagcactcagtatcattgttgagtctacatgtacttccgtatattataataagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgaATATGTTTTATATAGTGGTAATATACTAAATTGACTGAGAAGGTGAGTGATGTGTGCAAGTCACCGTTGATTAATTTGTTAATATTGTA---AAGTGTTTATT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCATAACACACTCACTGACGGGAAGAATAAATGC-ATAATCATT-----TT-------TTAGCTGAAA-AAAAcacaaagttgactgcgatcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG-TAAAA-ATAAATGTATTGTACA---GGT---ATTAAC----A--A-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAA-T-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTATtaaaataaagaagtgtttgtgg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






Alignments
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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGATTGAGAATGAGAGCGTTGTGTGCGAGTCACCATTGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GNAGCTGAAA-AAAAACGTA-----CG---AAT---ANAAAC----ACAACATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTNACAGTGCAATANACA-AATCCTTTTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AA-T-C--AATCGCTTNGA---GAATACTTCCTGGAAATCAGAAA---CTATATCAGAAAGT-CGT-TTTNAA-AATAT-AT-TTCT---AACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAGACCGTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATATGACACTGGTTGGTTTT-ATTGTCCATAGTATCGTCTGNCAAA-ACGTTC----T-TATATGGTG-ACGAT-GCA-GTA------CATT-AAGGGTTCTTGGACAATTAC-ATAACATGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACATCAGATAAATCACCANTACT-GCAACAATGATTGNTTGGTAACATCAGAGTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGCCTATTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTATTTCATANTTTAANACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAAATANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGT-ACAA-G-C-GCAGAGAGGTACCATTCCGTAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGA--ACAAA-TGTTGTTTCA---TGTGATTGAGTTATTTCTCATTACTAGTTTGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTC------TGCTTTCGTATAT------CATGATTTA-A--GTTAG-CCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGCAACNATCTTTTAATTNACATTCTTTGTAA--ACTTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCACCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCANCCNTAGTNGACGTAATGTCACCATTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGAC-T-TGTCTT-AA-----AAANAAAATATATTCT-AAT-TTAT-T----TT-------TT-AATCGATCAAACGCT--TTCT------T--------CAATG----AAGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGT-----TCATNATTATGGTGTCACTTTCACTG------TTTCT--AC--GCCGCAACTGTGCTTT---CGACTCNTTC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactgATTTCCTTGCCTAATTC-AGTAAGTGCACTCGTGTAAGTGCTA---CATACAGTAAAACA-TCGGAGTGCAGCTACAGCAATACAAACATATA-CATTTAATGCATATTCATCTT--CAGGA--ATACGT-ACAA-ATC-GCAAAGAGGTACCATTCCGTAAATATGATTCCGAGTAGTTCGATGACCGAAACTCATTCACACAAAACACAAA-TGATGTTTCA---TATGATTGAGTTTTTACTTACCACTTGTATGTA------CTATGCAT-GCAAAGTGTTCAGAATCATTATTTAGTC------TGCTTCCATGTAT------CATAATTTG-A--GTAAG-TCATCCCATTTCTTTGCTTAAG---TGTGA--CTTGTTTAGAATTTAACAAT-TTTTAATTTACATTCTTTGTAAACACTTGTGAATGTGCCTTTAGAAGCATG-TTCA-CGT-T-GCCAGCTGCATGGGTA-----ATCATCTGAAGT----TAT------C----------TTT----A----GCAT-ACAA-A--C-ATGCCACCATTCTACCCCTAGTCGACATCATGTCGCCGCTAATATTGGTATTGGACACTATTGCAATAGTTCAACCATCGGAATAAATGCATGAC-TGTGTTTT-AGATAATAAATAAAATACATTC------------------------------TCAAGTAAA-------------------------CAATG----AAGA---TCATTCGTCAATTATATGTAGT-----TCATTATTCTAGTGTCACTTTCACCG------TTTCT--ACATGCCGCAATTGTGCTTT---GGAtccttgcctaattcagtaagtgcactcgtgtaagtgctacatacagtaaaacatcggagtgcagctacagcaatacaaacatatacatttaatgcatattcatcttcaggaatacgtacaaatcgcaaagaggtaccattccgtaaatatgattccgagtagttcgatgaccgaaactcattcacacaaaacacaaatgatgtttcatatgattgagtttttacttaccacttgtatgtactatgcatgcaaagtgttcagaatcattatttagtctgcttccatgtatcataatttgagtaagtcatcccatttctttgcttaagtgtgacttgtttagaatttaacaatttttaatttacattctttgtaaacacttgtgaatgtgcctttagaagcatgttcacgttgccagctgcatgggtaatcatctgaagttatctttagcatacaaacatgccaccattctacccctagtcgacatcatgtcgccgctaatattggtattggacactattgcaatagttcaaccatcggaataaatgcatgactgtgttttagataataaataaaatacattctcaagtaaacaatgaagatcattcgtcaattatatgtagttcattattctagtgtcactttcaccgtttctacatgccgcaattgtgctttggaggatagctgagatgataaattacttt
gi|11                         : gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactggaatagttgatgtaaccattaaccatggtgaagtaaaaatgtgcgtattgtacaggttttaacaaattctaactgccatacaacagcaagattcagtgctaattatcaaacatcggttgctttacagtgcaataatcaaatattttggaactccaaataattatatacacataaagtcagctaaagcagtcgttttgagaatagttccttgaaatcagaaactattgcagacagtcatatttaaaaatatatttccaacaggtagttttgtaccgttaataaagaatgtgtcaagactagtgtttggaaaataacacttcataagtgatgcattagactatataagtacatagttccgttcgtaaaatacgtataaggtgacgatgcagtacctagggtttttaaacaattgttgaacagacaggcttctgacacaaacacacatcagataaatcaccattactgcaacaatgATATTTATTATATAGTGAAAATATTCTAAATTAATTGAGATTGAGAGTGTTGTGTGCGAggatagctgagatgataaattacttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGTTCCTTTACAGTGCAACATATGTAGTCCTTCTGTGGTTCAAAGTATAACAAAAACAT-AAAGTTAACT-AA-T------TCACTTAAG---GCATAAAATCTGGAAATACGAAAAGGTTA---CAGAAAGT-TAT-TTTGGATAATACAAT-TTCTTCAAACACGAGG--CTGTAT-----GTAT------TG----AACTTGTAATTAGAAAATAACCCATT--AAAGGTGATGCATTAGGCTATTTGA----AGTTGATTTTCA--ATCTACAGGAGTGTCTTATAAA-ACATTCAGTAC-AATATGGTG-AC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------CTAAGA-AGAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGTTGACA-AGAagcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA-AA-AACATG-----TGTTCATT---GCATAC----ACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTT--ATATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AA-A-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGT-CGG-TTTtaaagaagtattggtgtgga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaGGTCGGTTTCCATT--CCACAGTATTGTCTGATAAA-ACGTTC-----------AGTGTACG-T-GCATGTATGGCGACATTTGAGGGTACTTGGCCAAATAC-CTTATATGAGACAGA---GCTTCTAGCACTAACTGA-CTACGCCTCATACACATCACCAGTGTTTGCAACAATGTTTGATTGGTATCATCAACATACTTAACTTAGGCCAAGATATATTTTCTTGTCTTTCCT-AGTAAA--CA---ACGTAAGTGATATTACATGTTTTGAGACAGTTGG-ATGCAGGAAAAGCAACAAATAAAGATTGCTTTAAATTCTTATACAATAT--CATAA--ATAAAT-ATAATG-G-GCAGCGAAGCACC-TGGCGAAAACAAGGTTCCAGATGGTATGGTGACCGAAACACATACATACAGA--ACAA----------CAAACTGTGATTGAATTGTCTGTC-TTA------TGTAAACAATCTAT--AT-GCGAAACTTTCAGTATCATTGTTCTGTC------ccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccattcaagccttatgaaattggtttacagtgcaacttcttctaatttacataacttcattgtaaaatttacatctgcgagttgcatgggtaatcatctggagttattgattcgatattatctgaagcatagaaatatggcaccaatctggtcataatagacgttaagtcatcgtttctctggctgttagaaactattgcagtagttcaaccacctgaattaatatattactttgtcctaaaaagaaaggatattctaatttatttttatgttgttaattgaccaaacgctgcgtctcgttaatcaataaggtcagtcttcaattacataatgtcccaatcatcatgacggtgtcacttactatttcttaacctcatctgtgccttcgatgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|21                         :                                                                                                         tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGCTGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TCAAAATGCAGGTAAATCAAAA-AGACAGATT-CGATAAATTCTTATACAACATAATAAAT--AT--GTCAAAA-G-C-CGAGAGAGGTACCAC-----------GGTTCCGAATAGTATAGTGA-----GTCCATACACACAGC--ACAAAATG--GTCTTC---TGGGTTTCTATTATAACTC-TTATGA---TGTA------ACATGCATTGCAAAGCGTTTAATATCAATGTTGAGTC------TGTTTTCGTATACTTTAAGTATAATTTG-A--ATTAGTTCA-CCTACGCCT------------TATGA--CTGGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T-T-GTGGGTTGCACGAGTA-----GTTTCCCGAGGT----TAT------C----------AAT----A----GCAT-A-GA-AATT-ACGGCACCATTCCAGCCATGATGGACGTAATGTCACCATTTCTCTGAGTGATAGAAAAGATTGCAGTAAATGTACTATCTGAAAGAATATATGGC-T-TGCCTTAAA-----AAAGAAAAGACATT-T-AATGTTGC-TTTCGTT-------TT-AATCGACCAAACACT--TTCT------TTTGTAAACCAA-G----AAAG---TCATTCCTCAGTTATACAGAGT-----TCATAATTATGGTGTTACTCCCAAAGTCAAAATTTCTACAC--GCCTCGATTGTGTTTT---cagattgttgggaggttaggcgagacgcagcttgagttattattttgctaaagtgacatgtccatccaacccggatgtgattggtttacagagaatttgatttttaactgaacttttgtgggttgcacgagtagtttcccgaggttatcaatagcatagaaattacggcaccattccagccatgatggacgtaatgtcaccatttctctgagtgatagaaaagattgcagtaaatgtactatctgaaagaatatatggcttgccttaaaaaagaaaagacatttaatgttgctttcgttttaatcgaccaaacactttcttttgtaaaccaagaaagtcattcctcagttatacagagttcataattatggtgttactcccaaagtcaaaatttctacacgcctcgattgtgttttgatgagaagtttttttacaaagatgacagcaattatatctttatttgttatctgtttctatcatacctaattctgtctgcagattttctctgacttatatggcaaattagtttcatattgtaaccaacggtaaataaatatatgaaaaccaccgagttttcaatatgctatttaagttcatcttcgttttcgaaatacatttgtcttcatgtattcagctaaacccgttatattcattctgtatcaagacttttatcagtctttgaacttgctttgtaatggtatatataagactctgatgataatgtactttctatctgagttgataattcaatagaaacacgtttctattgaaagcagtccagctttgttatggctgtgtacgtacatgtgaaaatataaaataattttaaaggacatattcgaacaatgctccgcatgagacaaaggaaaattaagtctcgatatacaacaagtatactagaattttaatttgactattcatctcgaattatttattattaaaaaaaaatataattcctttcaaacaatgtaaaattcgcatagctaattaacaaaatgtgatattctatttttaatccaattaggatattcaaaaagtaattatatatatcttagattaagattgacacaagagtactaacaaacaataacattaaagtagagctttataaatgacattctttggatattcaagaaattgccgattgacttgttttttatggggatttttcatccgaaatataaagtgatgctagtgcaacacttgactagtactgatggtcaggaaatggtctatacgtatatactaaacgtttccaagtgactgatccgagactaaaagggatccggtttactatactatttcacacttacga
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATAT------TATAATAAG-A--GTTAGTCCA-CCCACaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgagtttaattttctgagctcttaaa---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCT-TCTTTTAGTTTACATTCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACCTGA--------------C-TGTCTT-AA-----AAATGATGTTTATTTA-AGT-TTGC-T----TT-------TT-AACCGATCAAACGCT--TTCT------C--------TAGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG------------TTATGGTGACACTTTCTCTG------TTTCT--AC--A-TGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgagtttaattttctgagctcttaaacaaagcactcagtatcattgttgagtctacatgtacttccgtatattataataagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgaATATGTTTTATATAGTGGTAATATACTAAATTGACTGAGAAGGTGAGTGATGTGTGCAAGTCACCGTTGATTAATTTGTTAATATTGTA---AAGTGTTTATT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCATAACACACTCACTGACGGGAAGAATAAATGC-ATAATCATT-----TT-------TTAGCTGAAA-AAAAcacaaagttgactgcgatcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG-TAAAA-ATAAATGTATTGTACA---GGT---ATTAAC----A--A-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAA-T-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTATtaaaataaagaagtgtttgtgg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






Alignments
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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGATTGAGAATGAGAGCGTTGTGTGCGAGTCACCATTGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GNAGCTGAAA-AAAAACGTA-----CG---AAT---ANAAAC----ACAACATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTNACAGTGCAATANACA-AATCCTTTTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AA-T-C--AATCGCTTNGA---GAATACTTCCTGGAAATCAGAAA---CTATATCAGAAAGT-CGT-TTTNAA-AATAT-AT-TTCT---AACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAGACCGTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATATGACACTGGTTGGTTTT-ATTGTCCATAGTATCGTCTGNCAAA-ACGTTC----T-TATATGGTG-ACGAT-GCA-GTA------CATT-AAGGGTTCTTGGACAATTAC-ATAACATGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACATCAGATAAATCACCANTACT-GCAACAATGATTGNTTGGTAACATCAGAGTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGCCTATTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTATTTCATANTTTAANACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAAATANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGT-ACAA-G-C-GCAGAGAGGTACCATTCCGTAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGA--ACAAA-TGTTGTTTCA---TGTGATTGAGTTATTTCTCATTACTAGTTTGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTCTGC------TTTCGTATAT------CATAATTCG-A--GTTA---GTCCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGCAACNATCTTTTAATTNACATTCTTTGTAA--ACTTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCACCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCANCCNTAGTNGACGTAATGTCACCATTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGAC-T-TGTCTT-AA-----AAANAAAATATATTCT-AAT-TTAT-T----TT-------TT-AATCGATCAAACGCT--TTCT------T--------CAATG----AAGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGT-----TCATNATTATGGTGTCACTTTCACTG------TTTCT--AC--GCCGCAACTGTGCTTT---CGACTCNTTC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactgATTTCCTTGCCTAATTC-AGTAAGTGCACTCGTGTAAGTGCTA---CATACAGTAAAACA-TCGGAGTGCAGCTACAGCAATACAAACATATA-CATTTAATGCATATTCATCTT--CAGGA--ATACGT-ACAA-ATC-GCAAAGAGGTACCATTCCGTAAATATGATTCCGAGTAGTTCGATGACCGAAACTCATTCACACAAAACACAAA-TGATGTTTCA---TATGATTGAGTTTTTACTTACCACTTGTATGTA------CTATGCAT-GCAAAGTGTTCAGAATCATTATTTAGTCTGC------TTCCATGTAT------CATAATTTG-A--GTAA---GT-CATCCCATTTCTTTGCTTAAG---TGTGA--CTTGTTTAGAATTTAACAAT-TTTTAATTTACATTCTTTGTAAACACTTGTGAATGTGCCTTTAGAAGCATG-TTCA-CGT-T-GCCAGCTGCATGGGTA-----ATCATCTGAAGT----TAT------C----------TTT----A----GCAT-ACAA-A--C-ATGCCACCATTCTACCCCTAGTCGACATCATGTCGCCGCTAATATTGGTATTGGACACTATTGCAATAGTTCAACCATCGGAATAAATGCATGAC-TGTGTTTT-AGATAATAAATAAAATACATTC------------------------------TCAAGTAAA-------------------------CAATG----AAGA---TCATTCGTCAATTATATGTAGT-----TCATTATTCTAGTGTCACTTTCACCG------TTTCT--ACATGCCGCAATTGTGCTTT---GGAtccttgcctaattcagtaagtgcactcgtgtaagtgctacatacagtaaaacatcggagtgcagctacagcaatacaaacatatacatttaatgcatattcatcttcaggaatacgtacaaatcgcaaagaggtaccattccgtaaatatgattccgagtagttcgatgaccgaaactcattcacacaaaacacaaatgatgtttcatatgattgagtttttacttaccacttgtatgtactatgcatgcaaagtgttcagaatcattatttagtctgcttccatgtatcataatttgagtaagtcatcccatttctttgcttaagtgtgacttgtttagaatttaacaatttttaatttacattctttgtaaacacttgtgaatgtgcctttagaagcatgttcacgttgccagctgcatgggtaatcatctgaagttatctttagcatacaaacatgccaccattctacccctagtcgacatcatgtcgccgctaatattggtattggacactattgcaatagttcaaccatcggaataaatgcatgactgtgttttagataataaataaaatacattctcaagtaaacaatgaagatcattcgtcaattatatgtagttcattattctagtgtcactttcaccgtttctacatgccgcaattgtgctttggaggatagctgagatgataaattacttt
gi|11                         : gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactggaatagttgatgtaaccattaaccatggtgaagtaaaaatgtgcgtattgtacaggttttaacaaattctaactgccatacaacagcaagattcagtgctaattatcaaacatcggttgctttacagtgcaataatcaaatattttggaactccaaataattatatacacataaagtcagctaaagcagtcgttttgagaatagttccttgaaatcagaaactattgcagacagtcatatttaaaaatatatttccaacaggtagttttgtaccgttaataaagaatgtgtcaagactagtgtttggaaaataacacttcataagtgatgcattagactatataagtacatagttccgttcgtaaaatacgtataaggtgacgatgcagtacctagggtttttaaacaattgttgaacagacaggcttctgacacaaacacacatcagataaatcaccattactgcaacaatgATATTTATTATATAGTGAAAATATTCTAAATTAATTGAGATTGAGAGTGTTGTGTGCGAggatagctgagatgataaattacttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGTTCCTTTACAGTGCAACATATGTAGTCCTTCTGTGGTTCAAAGTATAACAAAAACAT-AAAGTTAACT-AA-T------TCACTTAAG---GCATAAAATCTGGAAATACGAAAAGGTTA---CAGAAAGT-TAT-TTTGGATAATACAAT-TTCTTCAAACACGAGG--CTGTAT-----GTAT------TG----AACTTGTAATTAGAAAATAACCCATT--AAAGGTGATGCATTAGGCTATTTGA----AGTTGATTTTCA--ATCTACAGGAGTGTCTTATAAA-ACATTCAGTAC-AATATGGTG-AC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------CTAAGA-AGAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGTTGACA-AGAagcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA-AA-AACATG-----TGTTCATT---GCATAC----ACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTT--ATATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AA-A-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGT-CGG-TTTtaaagaagtattggtgtgga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaGGTCGGTTTCCATT--CCACAGTATTGTCTGATAAA-ACGTTC-----------AGTGTACG-T-GCATGTATGGCGACATTTGAGGGTACTTGGCCAAATAC-CTTATATGAGACAGA---GCTTCTAGCACTAACTGA-CTACGCCTCATACACATCACCAGTGTTTGCAACAATGTTTGATTGGTATCATCAACATACTTAACTTAGGCCAAGATATATTTTCTTGTCTTTCCT-AGTAAA--CA---ACGTAAGTGATATTACATGTTTTGAGACAGTTGG-ATGCAGGAAAAGCAACAAATAAAGATTGCTTTAAATTCTTATACAATAT--CATAA--ATAAAT-ATAATG-G-GCAGCGAAGCACC-TGGCGAAAACAAGGTTCCAGATGGTATGGTGACCGAAACACATACATACAGA--ACAA----------CAAACTGTGATTGAATTGTCTGTC-TTA------TGTAAACAATCTAT--AT-GCGAAACTTTCAGTATCATTGTTCTGTCccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccattcaagccttatgaaattggtttacagtgcaacttcttctaatttacataacttcattgtaaaatttacatctgcgagttgcatgggtaatcatctggagttattgattcgatattatctgaagcatagaaatatggcaccaatctggtcataatagacgttaagtcatcgtttctctggctgttagaaactattgcagtagttcaaccacctgaattaatatattactttgtcctaaaaagaaaggatattctaatttatttttatgttgttaattgaccaaacgctgcgtctcgttaatcaataaggtcagtcttcaattacataatgtcccaatcatcatgacggtgtcacttactatttcttaacctcatctgtgccttcgatgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|21                         :                                                                                                         tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGCTGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TCAAAATGCAGGTAAATCAAAA-AGACAGATT-CGATAAATTCTTATACAACATAATAAAT--AT--GTCAAAA-G-C-CGAGAGAGGTACCAC-----------GGTTCCGAATAGTATAGTGA-----GTCCATACACACAGC--ACAAAATG--GTCTTC---TGGGTTTCTATTATAACTC-TTATGA---TGTA------ACATGCATTGCAAAGCGTTTAATATCAATGTTGAGTCTGT------TTTCGTATACTTTAAGTATAATTTG-A--ATTA---GTTCA-CCTACGCCT------------TATGA--CTGGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-T-GTGGGTTGCACGAGTA-----GTTTCCCGAGGT----TAT------C----------AAT----A----GCAT-A-GA-AATT-ACGGCACCATTCCAGCCATGATGGACGTAATGTCACCATTTCTCTGAGTGATAGAAAAGATTGCAGTAAATGTACTATCTGAAAGAATATATGGC-T-TGCCTTAAA-----AAAGAAAAGACATT-T-AATGTTGC-TTTCGTT-------TT-AATCGACCAAACACT--TTCT------TTTGTAAACCAA-G----AAAG---TCATTCCTCAGTTATACAGAGT-----TCATAATTATGGTGTTACTCCCAAAGTCAAAATTTCTACAC--GCCTCGATTGTGTTTT---cagattgttgggaggttaggcgagacgcagcttgagttattattttgctaaagtgacatgtccatccaacccggatgtgattggtttacagagaatttgatttttaactgaacttttgtgggttgcacgagtagtttcccgaggttatcaatagcatagaaattacggcaccattccagccatgatggacgtaatgtcaccatttctctgagtgatagaaaagattgcagtaaatgtactatctgaaagaatatatggcttgccttaaaaaagaaaagacatttaatgttgctttcgttttaatcgaccaaacactttcttttgtaaaccaagaaagtcattcctcagttatacagagttcataattatggtgttactcccaaagtcaaaatttctacacgcctcgattgtgttttgatgagaagtttttttacaaagatgacagcaattatatctttatttgttatctgtttctatcatacctaattctgtctgcagattttctctgacttatatggcaaattagtttcatattgtaaccaacggtaaataaatatatgaaaaccaccgagttttcaatatgctatttaagttcatcttcgttttcgaaatacatttgtcttcatgtattcagctaaacccgttatattcattctgtatcaagacttttatcagtctttgaacttgctttgtaatggtatatataagactctgatgataatgtactttctatctgagttgataattcaatagaaacacgtttctattgaaagcagtccagctttgttatggctgtgtacgtacatgtgaaaatataaaataattttaaaggacatattcgaacaatgctccgcatgagacaaaggaaaattaagtctcgatatacaacaagtatactagaattttaatttgactattcatctcgaattatttattattaaaaaaaaatataattcctttcaaacaatgtaaaattcgcatagctaattaacaaaatgtgatattctatttttaatccaattaggatattcaaaaagtaattatatatatcttagattaagattgacacaagagtactaacaaacaataacattaaagtagagctttataaatgacattctttggatattcaagaaattgccgattgacttgttttttatggggatttttcatccgaaatataaagtgatgctagtgcaacacttgactagtactgatggtcaggaaatggtctatacgtatatactaaacgtttccaagtgactgatccgagactaaaagggatccggtttactatactatttcacacttacga
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATAT------TATAATAAG-A--GTTA---GTCCA-CCCACaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgagtttaattttctgagctcttaaaTTCA-A--GTGACATGTCCATCCAAA--CATTATGCTGA---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCT-TCTTTTAGTTTACATTCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACCTGA--------------C-TGTCTT-AA-----AAATGATGTTTATTTA-AGT-TTGC-T----TT-------TT-AACCGATCAAACGCT--TTCT------C--------TAGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG------------TTATGGTGACACTTTCTCTG------TTTCT--AC--A-TGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgagtttaattttctgagctcttaaacaaagcactcagtatcattgttgagtctacatgtacttccgtatattataataagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgATATGTTTTATATAGTGGTAATATACTAAATTGACTGAGAAGGTGAGTGATGTGTGCAAGTCACCGTTGATTAATTTGTTAATATTGTA---AAGTGTTTATT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCATAACACACTCACTGACGGGAAGAATAAATGC-ATAATCATT-----TT-------TTAGCTGAAA-AAAAcacaaagttgactgcgatcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG-TAAAA-ATAAATGTATTGTACA---GGT---ATTAAC----A--A-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAA-T-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTATtaaaataaagaagtgtttgtgg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






Alignments
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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGATTGAGAATGAGAGCGTTGTGTGCGAGTCACCATTGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GNAGCTGAAA-AAAAACGTA-----CG---AAT---ANAAAC----ACAACATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTNACAGTGCAATANACA-AATCCTTTTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AA-T-C--AATCGCTTNGA---GAATACTTCCTGGAAATCAGAAA---CTATATCAGAAAGT-CGT-TTTNAA-AATAT-AT-TTCT---AACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAGACCGTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATATGACACTGGTTGGTTTT-ATTGTCCATAGTATCGTCTGNCAAA-ACGTTC----T-TATATGGTG-ACGAT-GCA-GTA------CATT-AAGGGTTCTTGGACAATTAC-ATAACATGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACATCAGATAAATCACCANTACT-GCAACAATGATTGNTTGGTAACATCAGAGTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGCCTATTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTATTTCATANTTTAANACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAAATANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGT-ACAA-G-C-GCAGAGAGGTACCATTCCGTAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGA--ACAAA-TGTTGTTTCA---TGTGATTGAGTTATTTCTCATTACTAGTTTGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTCTGC------TTTCGTATAT------CATAATTCG-A--GTTA---GTCCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGCAACNATCTTTTAATTNACATTCTTTGTAA--ACTTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCACCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCANCCNTAGTNGACGTAATGTCACCATTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGAC-T-TGTCTT-AA-----AAANAAAATATATTCT-AAT-TTAT-T----TT-------TT-AATCGATCAAACGCT--TTCT------T--------CAATG----AAGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGT-----TCATNATTATGGTGTCACTTTCACTG------TTTCT--AC--GCCGCAACTGTGCTTT---CGACTCNTTC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactgATTTCCTTGCCTAATTC-AGTAAGTGCACTCGTGTAAGTGCTA---CATACAGTAAAACA-TCGGAGTGCAGCTACAGCAATACAAACATATA-CATTTAATGCATATTCATCTT--CAGGA--ATACGT-ACAA-ATC-GCAAAGAGGTACCATTCCGTAAATATGATTCCGAGTAGTTCGATGACCGAAACTCATTCACACAAAACACAAA-TGATGTTTCA---TATGATTGAGTTTTTACTTACCACTTGTATGTA------CTATGCAT-GCAAAGTGTTCAGAATCATTATTTAGTCTGC------TTCCATGTAT------CATAATTTG-A--GTAA---GT-CATCCCATTTCTTTGCTTAAG---TGTGA--CTTGTTTAGAATTTAACAAT-TTTTAATTTACATTCTTTGTAAACACTTGTGAATGTGCCTTTAGAAGCATG-TTCA-CGT-T-GCCAGCTGCATGGGTA-----ATCATCTGAAGT----TAT------C----------TTT----A----GCAT-ACAA-A--C-ATGCCACCATTCTACCCCTAGTCGACATCATGTCGCCGCTAATATTGGTATTGGACACTATTGCAATAGTTCAACCATCGGAATAAATGCATGAC-TGTGTTTT-AGATAATAAATAAAATACATTC------------------------------TCAAGTAAA-------------------------CAATG----AAGA---TCATTCGTCAATTATATGTAGT-----TCATTATTCTAGTGTCACTTTCACCG------TTTCT--ACATGCCGCAATTGTGCTTT---GGAtccttgcctaattcagtaagtgcactcgtgtaagtgctacatacagtaaaacatcggagtgcagctacagcaatacaaacatatacatttaatgcatattcatcttcaggaatacgtacaaatcgcaaagaggtaccattccgtaaatatgattccgagtagttcgatgaccgaaactcattcacacaaaacacaaatgatgtttcatatgattgagtttttacttaccacttgtatgtactatgcatgcaaagtgttcagaatcattatttagtctgcttccatgtatcataatttgagtaagtcatcccatttctttgcttaagtgtgacttgtttagaatttaacaatttttaatttacattctttgtaaacacttgtgaatgtgcctttagaagcatgttcacgttgccagctgcatgggtaatcatctgaagttatctttagcatacaaacatgccaccattctacccctagtcgacatcatgtcgccgctaatattggtattggacactattgcaatagttcaaccatcggaataaatgcatgactgtgttttagataataaataaaatacattctcaagtaaacaatgaagatcattcgtcaattatatgtagttcattattctagtgtcactttcaccgtttctacatgccgcaattgtgctttggaggatagctgagatgataaattacttt
gi|11                         : gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactggaatagttgatgtaaccattaaccatggtgaagtaaaaatgtgcgtattgtacaggttttaacaaattctaactgccatacaacagcaagattcagtgctaattatcaaacatcggttgctttacagtgcaataatcaaatattttggaactccaaataattatatacacataaagtcagctaaagcagtcgttttgagaatagttccttgaaatcagaaactattgcagacagtcatatttaaaaatatatttccaacaggtagttttgtaccgttaataaagaatgtgtcaagactagtgtttggaaaataacacttcataagtgatgcattagactatataagtacatagttccgttcgtaaaatacgtataaggtgacgatgcagtacctagggtttttaaacaattgttgaacagacaggcttctgacacaaacacacatcagataaatcaccattactgcaacaatgATATTTATTATATAGTGAAAATATTCTAAATTAATTGAGATTGAGAGTGTTGTGTGCGAggatagctgagatgataaattacttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGTTCCTTTACAGTGCAACATATGTAGTCCTTCTGTGGTTCAAAGTATAACAAAAACAT-AAAGTTAACT-AA-T------TCACTTAAG---GCATAAAATCTGGAAATACGAAAAGGTTA---CAGAAAGT-TAT-TTTGGATAATACAAT-TTCTTCAAACACGAGG--CTGTAT-----GTAT------TG----AACTTGTAATTAGAAAATAACCCATT--AAAGGTGATGCATTAGGCTATTTGA----AGTTGATTTTCA--ATCTACAGGAGTGTCTTATAAA-ACATTCAGTAC-AATATGGTG-AC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------CTAAGA-AGAAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGTTGACA-AGAagcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA-AA-AACATG-----TGTTCATT---GCATAC----ACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTT--ATATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AA-A-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGT-CGG-TTTtaaagaagtattggtgtgga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaGGTCGGTTTCCATT--CCACAGTATTGTCTGATAAA-ACGTTC-----------AGTGTACG-T-GCATGTATGGCGACATTTGAGGGTACTTGGCCAAATAC-CTTATATGAGACAGA---GCTTCTAGCACTAACTGA-CTACGCCTCATACACATCACCAGTGTTTGCAACAATGTTTGATTGGTATCATCAACATACTTAACTTAGGCCAAGATATATTTTCTTGTCTTTCCT-AGTAAA--CA---ACGTAAGTGATATTACATGTTTTGAGACAGTTGG-ATGCAGGAAAAGCAACAAATAAAGATTGCTTTAAATTCTTATACAATAT--CATAA--ATAAAT-ATAATG-G-GCAGCGAAGCACC-TGGCGAAAACAAGGTTCCAGATGGTATGGTGACCGAAACACATACATACAGA--ACAA----------CAAACTGTGATTGAATTGTCTGTC-TTA------TGTAAACAATCTAT--AT-GCGAAACTTTCAGTATCATTGTTCTGTCccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccattcaagccttatgaaattggtttacagtgcaacttcttctaatttacataacttcattgtaaaatttacatctgcgagttgcatgggtaatcatctggagttattgattcgatattatctgaagcatagaaatatggcaccaatctggtcataatagacgttaagtcatcgtttctctggctgttagaaactattgcagtagttcaaccacctgaattaatatattactttgtcctaaaaagaaaggatattctaatttatttttatgttgttaattgaccaaacgctgcgtctcgttaatcaataaggtcagtcttcaattacataatgtcccaatcatcatgacggtgtcacttactatttcttaacctcatctgtgccttcgatgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
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gi|21                         :                                                                                                         tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGCTGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TCAAAATGCAGGTAAATCAAAA-AGACAGATT-CGATAAATTCTTATACAACATAATAAAT--AT--GTCAAAA-G-C-CGAGAGAGGTACCAC-----------GGTTCCGAATAGTATAGTGA-----GTCCATACACACAGC--ACAAAATG--GTCTTC---TGGGTTTCTATTATAACTC-TTATGA---TGTA------ACATGCATTGCAAAGCGTTTAATATCAATGTTGAGTCTGT------TTTCGTATACTTTAAGTATAATTTG-A--ATTA---GTTCA-CCTACGCCT------------TATGA--CTGGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-T-GTGGGTTGCACGAGTA-----GTTTCCCGAGGT----TAT------C----------AAT----A----GCAT-A-GA-AATT-ACGGCACCATTCCAGCCATGATGGACGTAATGTCACCATTTCTCTGAGTGATAGAAAAGATTGCAGTAAATGTACTATCTGAAAGAATATATGGC-T-TGCCTTAAA-----AAAGAAAAGACATT-T-AATGTTGC-TTTCGTT-------TT-AATCGACCAAACACT--TTCT------TTTGTAAACCAA-G----AAAG---TCATTCCTCAGTTATACAGAGT-----TCATAATTATGGTGTTACTCCCAAAGTCAAAATTTCTACAC--GCCTCGATTGTGTTTT---cagattgttgggaggttaggcgagacgcagcttgagttattattttgctaaagtgacatgtccatccaacccggatgtgattggtttacagagaatttgatttttaactgaacttttgtgggttgcacgagtagtttcccgaggttatcaatagcatagaaattacggcaccattccagccatgatggacgtaatgtcaccatttctctgagtgatagaaaagattgcagtaaatgtactatctgaaagaatatatggcttgccttaaaaaagaaaagacatttaatgttgctttcgttttaatcgaccaaacactttcttttgtaaaccaagaaagtcattcctcagttatacagagttcataattatggtgttactcccaaagtcaaaatttctacacgcctcgattgtgttttgatgagaagtttttttacaaagatgacagcaattatatctttatttgttatctgtttctatcatacctaattctgtctgcagattttctctgacttatatggcaaattagtttcatattgtaaccaacggtaaataaatatatgaaaaccaccgagttttcaatatgctatttaagttcatcttcgttttcgaaatacatttgtcttcatgtattcagctaaacccgttatattcattctgtatcaagacttttatcagtctttgaacttgctttgtaatggtatatataagactctgatgataatgtactttctatctgagttgataattcaatagaaacacgtttctattgaaagcagtccagctttgttatggctgtgtacgtacatgtgaaaatataaaataattttaaaggacatattcgaacaatgctccgcatgagacaaaggaaaattaagtctcgatatacaacaagtatactagaattttaatttgactattcatctcgaattatttattattaaaaaaaaatataattcctttcaaacaatgtaaaattcgcatagctaattaacaaaatgtgatattctatttttaatccaattaggatattcaaaaagtaattatatatatcttagattaagattgacacaagagtactaacaaacaataacattaaagtagagctttataaatgacattctttggatattcaagaaattgccgattgacttgttttttatggggatttttcatccgaaatataaagtgatgctagtgcaacacttgactagtactgatggtcaggaaatggtctatacgtatatactaaacgtttccaagtgactgatccgagactaaaagggatccggtttactatactatttcacacttacga
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATAT------TATAATAAG-A--GTTA---GTCCA-CCCACaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgagtttaattttctgagctcttaaaTTCA-A--GTGACATGTCCATCCAAA--CATTATGCTGA---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCT-TCTTTTAGTTTACATTCTTTATGA--TCTTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACCTGA--------------C-TGTCTT-AA-----AAATGATGTTTATTTA-AGT-TTGC-T----TT-------TT-AACCGATCAAACGCT--TTCT------C--------TAGTAAACCAAGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG------------TTATGGTGACACTTTCTCTG------TTTCT--AC--A-TGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG-TAAAA-ATAAATGTATTGTACA---GGT---ATTAAC----A--A-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTAT-T-AAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAA-T-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTATtaaaataaagaagtgtttgtgg


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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT






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Reference ( family-1811 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATTTATTATATAGTGGAAATATACTAAATTGATTGAGAATGAGAGCGTTGTGTGCGAGTCACCATTGATTAATATGTTGATATTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCACAACACACTCATTGACGGGGAGAATAAATGA-GTNACCATT-----TG-------GTAGC--TGA-AA---AA-AA-A----CGTATT---CANNN---AA-ACACAACATTCCAACTGCCATACAACAGCAAGATTCAGTGCTAATTAT-TTAAATATCGGTTGCTTNACAGTGCAATANACA-AATCCTTTTGCGCTCCAAATAATTATATACACAT-AAAGTCAGCT-AA-T-C--AATCGCTTNGA---GAATACTTCCTGGAAATCAGAAA---CTATATCAGAAAGTC-GT-TTTNAA-AATAT-AT-TTCT---AACAGGAAGTTTTGTACCGTTAATATAGACCGTGTCAAAACTAGTGATTGGAAAATAA--CATTTCACAAGTGATGCATTAGGCTATATGAC----GTTGGTTTT-ATTNTCCATAGTATCGTCTGNCAAAACNTTC----T-TATATGGTG-ACGAT-GCA-GTA------CATT-AAGGGTTCTTGGACAATTACNTNACATGAAACAGACGAGCTTCTGACACGAACTGAACT-CACATCAGATAAATCACCANTACT-GCAACAATGATTGNTTGGTAACATCAGAGTACNTAATTTAGACTAAGNTATATTTCCTTGCCTATTTC-AGTAAATGCACTCGTGTAAGTGCTNTTTCATANTTTAANACA-TCGGAATGCAGGTAAAGCAACACAAATANATT-CATTAAATTCTTATACAACAT--CAAGT--ATAGGTACAA-GT-GC--AGAGAGGTACCATTCCGTAAACATGGTTCCGAGTAGTTCGGTGACCGAAACTCATACACACAGAACA--AA-TG--GTTTCA---TGTGATTGAGTTATTTCTCATTACTAGTTTGTA------CTATGCAT-GCAAAGCGTTCAGNATCATTGTTNAGTC------TGCTTTCGTATAT------CATAATTCG-A--GTTA---GTCCATCCCACTTCTTTGTTCAAG---TGTGA--CTGGTTTANAGTGCAACTTCTTTTAATTNACATTCTTTGTAAAC--TTGTGAATGTGCNTTTGGAAACATA-TT-A-CGT-T-GCGAGTTGCATGGGTA-----GTCACCTGAAGT----TAT------C----------TAT----A----GCAT-A-AA-A--C-ACGGCACCATTCCANCCNTAGTNGACGTAATGTCACCATTNCTCTGGGTGTTAGAAACTATCGCAGTAGTTCAACCATCTGAATGAATATATGGCTNTGTCTT-AAAAANAAAATATATT-T--AA-T-TTGC-TT---TT------TTAATCGATCAAACGCTTTCTCTTGTAAACC---A---AGA---TCATTCCTCAATTATATAAAGT-----TCATNATTATGGTGTCACTTTCACTG------TTTCT--TNGCCGCAACTGTGCTTT---CGACTCNTTC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactgATTTCCTTGCCTAATTC-AGTAAGTGCACTCGTGTAAGTGCTA---CATACAGTAAAACA-TCGGAGTGCAGCTACAGCAATACAAACATATA-CATTTAATGCATATTCATCTT--CAGGA--ATACGTACAA-ATCGC--AAAGAGGTACCATTCCGTAAATATGATTCCGAGTAGTTCGATGACCGAAACTCATTCACACAAAACACAAA-TGATGTTTCA---TATGATTGAGTTTTTACTTACCACTTGTATGTA------CTATGCAT-GCAAAGTGTTCAGAATCATTATTTAGTC------TGCTTCCATGTAT------CATAATTTG-A--GTAA---GTC-ATCCCATTTCTTTGCTTAAG---TGTGA--CTTGTTTAGAATTTAACAATTTTTAATTTACATTCTTTGTAAACACTTGTGAATGTGCCTTTAGAAGCATG-TTCA-CGT-T-GCCAGCTGCATGGGTA-----ATCATCTGAAGT----TAT------C----------TTT----A----GCAT-ACAA-A--C-ATGCCACCATTCTACCCCTAGTCGACATCATGTCGCCGCTAATATTGGTATTGGACACTATTGCAATAGTTCAACCATCGGAATAAATGCATGACTGTGTTTT-AGATAATAAATA-----------------------------------------AAATACATTCTCAAGTAAACA---ATGAAGA---TCATTCGTCAATTATATGTAGT-----TCATTATTCTAGTGTCACTTTCACCG------TTTCTACATGCCGCAATTGTGCTTT---GGAtccttgcctaattcagtaagtgcactcgtgtaagtgctacatacagtaaaacatcggagtgcagctacagcaatacaaacatatacatttaatgcatattcatcttcaggaatacgtacaaatcgcaaagaggtaccattccgtaaatatgattccgagtagttcgatgaccgaaactcattcacacaaaacacaaatgatgtttcatatgattgagtttttacttaccacttgtatgtactatgcatgcaaagtgttcagaatcattatttagtctgcttccatgtatcataatttgagtaagtcatcccatttctttgcttaagtgtgacttgtttagaatttaacaatttttaatttacattctttgtaaacacttgtgaatgtgcctttagaagcatgttcacgttgccagctgcatgggtaatcatctgaagttatctttagcatacaaacatgccaccattctacccctagtcgacatcatgtcgccgctaatattggtattggacactattgcaatagttcaaccatcggaataaatgcatgactgtgttttagataataaataaaatacattctcaagtaaacaatgaagatcattcgtcaattatatgtagttcattattctagtgtcactttcaccgtttctacatgccgcaattgtgctttggaggatagctgagatgataaattacttt
gi|11                         : gatcaacaatgttttggtcgtaattttgatcattaatcaatgatatgtgtggttagttgcatctatatcaccttagttaaaggcattattaattagtctttgtatgtatatgtgtgtgttgtcagcggttcgagctcggagtctatcggcgttttatgtcctgctgccaatccgcacatgtctttctgtctatttccctctctgtcttgcatatcttcctgatgccgaacgttatgctctccatgaattagctgtgtccttgtgtcggtgtgcatctgtctctactttacatgatgttgatcttataaccgttgatattattttgcatttattactcagatggtttgcctgaagaacgtcgtcgtttaacaaatgaagcaaatgaagacattcaacaaaagattgaaataagtatgttattaaaatattaaaattgtttgtgtctgattgtcacaccaatatgcggacatgcatgattgactgtgtatttgcatatcttatttagatatagataaacaaattatcagacactgagtaatggtcaatatctatttccttacattgaagagtacgtctgaaaattacggtgcatatgtttttcaaatgcaatattctgtacattaatatagtttatataatgattaagcaaattaaagaaaagtatcgacggatatttatctttaaaaatactacaagatatttgaatgtacattttatgtttagaactgacccattgaccatttaataacaacattgagtatacagctacatgtattttcttttactggaatcatcaattttaataagactttctagtgaatgtctttgactctaaaaacataacaatttggtaagacgtttcaaagtcattacactggaatagttgatgtaaccattaaccatggtgaagtaaaaatgtgcgtattgtacaggttttaacaaattctaactgccatacaacagcaagattcagtgctaattatcaaacatcggttgctttacagtgcaataatcaaatattttggaactccaaataattatatacacataaagtcagctaaagcagtcgttttgagaatagttccttgaaatcagaaactattgcagacagtcatatttaaaaatatatttccaacaggtagttttgtaccgttaataaagaatgtgtcaagactagtgtttggaaaataacacttcataagtgatgcattagactatataagtacatagttccgttcgtaaaatacgtataaggtgacgatgcagtacctagggtttttaaacaattgttgaacagacaggcttctgacacaaacacacatcagataaatcaccattactgcaacaatgATATTTATTATATAGTGAAAATATTCTAAATTAATTGAGATTGAGAGTGTTGTGTGCGAggatagctgagatgataaattacttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGGTTCCTTTACAGTGCAACATATGTAGTCCTTCTGTGGTTCAAAGTATAACAAAAACAT-AAAGTTAACT-AA-T------TCACTTAAG---GCATAAAATCTGGAAATACGAAAAGGTTA---CAGAAAGTT-AT-TTTGGATAATACAAT-TTCTTCAAACACGAGG--CTGTAT-----GTAT------TG----AACTTGTAATTAGAAAATAACCCATT--AAAGGTGATGCATTAGGCTATTTGAA----GTTGATTTTCA--ATCTACAGGAGTGTCTTATAAAACATTCAGTAC-AATATGGTG-AC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cTATATATTGAAAATATACTAAATGTCCTAAGAATGAGAGCAATGTGTGCGAGTCATCATCGATTAATATGTTGATGTTGTA---AAGTGTGCGGT--GGGAT-T-TCCTCCTCGACCCACA--ACACTCGTTGACGGGGAGAATAA--CA-GTCA-TATT-----T------------C--TAA-GA---AG-AA-A----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagacacaaatacttgtttgatacaaatgATATGTAAACAATGTA---CAGTGTGCGAT--GGGATGA-CCC----CGACCTATAACACACTTATTGACGGGGA-AATAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acaaatccactgtgtaaacaatatcactatttacatttttccaagtatgatatactttatacgaatgagaaggagtgaaagagagacaataaaagctttaacGTT---AAGTGTATTGTCTGGGATGTATTCT--TCGACCCGCAACA-----ATCAA--GGAAGAATAAATTG-GTAACCGTT-----TG-------ATAGT--TGACAAGATAA-AG-A----AGTATT---agcatagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -GTTACTATT------G-------GTCTCAATGA-AA---AAAAACA----TGTGTT---CATTG---CATACACAA-ATTTCACTTTTCATACAAAAGCAAGACTCGGCACTAACTACGTT--ATATCGGCTCCTTTACAGTGCCATCAACA-AATCTTTCTGCATTCCAAACGGTTACATATATATCAAAGT-AGCT-AA-A-CCGAGTCACTTAGAGCTGAA-AC--CCTGGAAATCATAAA---TGTTA-CAGAAGGTC-GG-TTTggtgtgga
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gi|21                         :                                                                                                         tatggatcagtcgatgcaaatggaacttatagaaatatagataaatataagtacagcatccttgtgtgtgcattaccagaattcggcataatcaacaaagaagggatatatttctctacaattaggatgcatatgtcctgttatttgcaaaaattctgttcatttacatgatattatatgaatcataataaagttagctctgaagggtcacatttacaaaaaccattagttgtctgaatgtcgattttcagcatgtttagaattgatttttaataggcacattctgagtcgatttgttctgggaataattgcattttattacatttttttttttaaatgcacagttttgaaggtaatcatgggttactatcaaatatttggttccttttgtttgtttctacaaagcatgtaaatttatttattttttttatagttcagtcttgatgctttgctttaactgaagtcattaataaaaaacaactcttcctcgcgcatgtttattgaccgcccccctccccccccccccccaaaaaaaaaacaacaaaaaacaacagttgatcgcgatgaattcacagccaatctcttggattttgttttagctgctgttactattggtctcaatgaaaaaaaacatgtgttcattgcatacacaaatttcacttttcatacaaaagcaagactcggcactaactacgttatatcggctcctttacagtgccatcaacaaatctttctgcattccaaacggttacatatatatcaaagtagctaaaccgagtcacttagagctgaaaccctggaaatcataaatgttacagaaggtcggtttccattccacagtattgtctgataaaacgttcagtgtacgtgcatgtatggcgacatttgagggtacttggccaaataccttatatgagacagagcttctagcactaactgactacgcctcatacacatcaccagtgtttgcaacaatgtttgattggtatcatcaacatacttaacttaggccaagatatattttcttgtctttcctagtaaacaacgtaagtgatattacatgttttgagacagttggatgcaggaaaagcaacaaataaagattgctttaaattcttatacaatatcataaataaatataatgggcagcgaagcacctggcgaaaacaaggttccagatggtatggtgaccgaaacacatacatacagaacaacaaactgtgattgaattgtctgtcttatgtaaacaatctatatgcgaaactttcagtatcattgttctgtcatccgtgagttctgtcttccgcattgcggctgaccgggttgttaggagagatgccgattgagttgcttccttgctcaactgacatatccaACACACTCATTGACGAGGAAAATAAATGA-GTTACCATT-----TG-------GTAGC--TGtgaggtatccttccacatagttgactgtgacaatatctttatttatttatttctactatatctagtttctgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-TCAAAATGCAGGTAAATCAAAA-AGACAGATT-CGATAAATTCTTATACAACATAATAAAT--AT--GT-CAA-AA-GCCGAGAGAGGTACCAC-----------GGTTCCGAATAGTATAGTGA-----GTCCATACACACAGCACA--AAATG--GTCTTC---TGGGTTTCTATTATAACTC-TTATGA---TGTA------ACATGCATTGCAAAGCGTTTAATATCAATGTTGAGTC------TGTTTTCGTATACTTTAAGTATAATTTG-A--ATTA---GTTCA-CCTACGCCT------------TATGA--CTGGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-T-GTGGGTTGCACGAGTA-----GTTTCCCGAGGT----TAT------C----------AAT----A----GCAT-A-GA-AATT-ACGGCACCATTCCAGCCATGATGGACGTAATGTCACCATTTCTCTGAGTGATAGAAAAGATTGCAGTAAATGTACTATCTGAAAGAATATATGGCT-TGCCTTAAAAAAGAAAAGACATT-T--AA-TGTTGC-TTTCGTT------TTAATCGACCAAACACTTTCTTTTGTAAACC---A---AGAAAGTCATTCCTCAGTTATACAGAGT-----TCATAATTATGGTGTTACTCCCAAAGTCAAAATTTCTACACGCCTCGATTGTGTTTT---cagattgttgggaggttaggcgagacgcagcttgagttattattttgctaaagtgacatgtccatccaacccggatgtgattggtttacagagaatttgatttttaactgaacttttgtgggttgcacgagtagtttcccgaggttatcaatagcatagaaattacggcaccattccagccatgatggacgtaatgtcaccatttctctgagtgatagaaaagattgcagtaaatgtactatctgaaagaatatatggcttgccttaaaaaagaaaagacatttaatgttgctttcgttttaatcgaccaaacactttcttttgtaaaccaagaaagtcattcctcagttatacagagttcataattatggtgttactcccaaagtcaaaatttctacacgcctcgattgtgttttgatgagaagtttttttacaaagatgacagcaattatatctttatttgttatctgtttctatcatacctaattctgtctgcagattttctctgacttatatggcaaattagtttcatattgtaaccaacggtaaataaatatatgaaaaccaccgagttttcaatatgctatttaagttcatcttcgttttcgaaatacatttgtcttcatgtattcagctaaacccgttatattcattctgtatcaagacttttatcagtctttgaacttgctttgtaatggtatatataagactctgatgataatgtactttctatctgagttgataattcaatagaaacacgtttctattgaaagcagtccagctttgttatggctgtgtacgtacatgtgaaaatataaaataattttaaaggacatattcgaacaatgctccgcatgagacaaaggaaaattaagtctcgatatacaacaagtatactagaattttaatttgactattcatctcgaattatttattattaaaaaaaaatataattcctttcaaacaatgtaaaattcgcatagctaattaacaaaatgtgatattctatttttaatccaattaggatattcaaaaagtaattatatatatcttagattaagattgacacaagagtactaacaaacaataacattaaagtagagctttataaatgacattctttggatattcaagaaattgccgattgacttgttttttatggggatttttcatccgaaatataaagtgatgctagtgcaacacttgactagtactgatggtcaggaaatggtctatacgtatatactaaacgtttccaagtgactgatccgagactaaaagggatccggtttactatactatttcacacttacga
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgattttgtccatccatatattgcgtctgatcgagttggaaggatagacataatgagttattgttttacgcaaatgccatgtccatcaaaatctgatgtaatCAAAGCACTCAGTATCATTGTTGAGTCTACATGTACTTCCGTATAT------TATAATAAG-A--GTTA---GTCCA-CCCACaatctttgattttcttatataattatgtctgcatatatacttggtctgagaaggcaaactgcatatagtagtcaagagttaagaagtaaatgcaaatcaccaggtatccaatttgacatttaatttaatatacgtttttcgactttctttgactttatgtatacagcaaagtttttttaaaaaaacggtatgcaccaatacttttatcattctttgaactgctttgtagtggtatatacaacatcccaatgttttgataccatcttatctgagttgtatatttgataaattcatgtgtgtattgaaagcagtcaagctttgattttttttatgtacattatcaaataacgttgtaggaaacctttggacaatgatccacactagacaaaagcaactcagtctcattattcatacagttttcaacaagaatatcttaaatttaaccagagtccaataattcatttaggataatgtgttatacttccgctatttcaaaatatcaaagtcctttcgcacaacgtaaaattcactattttatattaagtgtagtattttactttagtccaattgagatgcttagaaatggaatcacaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgagtttaattttctgagctcttaaaTTCA-A--GTGACATGTCCATCCAAA--CATTATGCTGA---TGTGG--TTGATTTACAGTTCATCTTCTTTTAGTTTACATTCTTTATGATC--TTGAGAATGTGCGTTTGGAAGCATA-TTTA-CAT-TTGCAAGTTGTATAGGTATAGTAGTCATCTGAAGT----TAT------C----------CAA----A----ACGT-A-AA-A--TTATTGCACCATTCCAGTCAAAGTGTACGTAAAGTCACTATTTCTCTGAATGTCAGAAACTATCGGAGTAGTTCAACCACCTGA--------------CTGTCTT-AAAAATGATGTTTATT-T--AAGT-TTGC--T---TT------TTAACCGATCAAACGCTTTCTCTAGTAAACC---A---AGAACGTAACTCCTCAAATATATAAAG------------TTATGGTGACACTTTCTCTG------TTTCT--ACA-TGC--CTGTGCTTTTAATGACTTCTTCgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgttcaagtgacatgtccatccaaacattatgctgatgtggttgatttacagttcatcttcttttagtttacattctttatgatcttgagaatgtgcgtttggaagcatatttacatttgcaagttgtataggtatagtagtcatctgaagttatccaaaacgtaaaattattgcaccattccagtcaaagtgtacgtaaagtcactatttctctgaatgtcagaaactatcggagtagttcaaccacctgactgtcttaaaaatgatgtttatttaagtttgctttttaaccgatcaaacgctttctctagtaaaccaagaacgtaactcctcaaatatataaagttatggtgacactttctctgtttctacatgcctgtgcttttaatgacttcttccacaaagttgactgcgatcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgagtttaattttctgagctcttaaacaaagcactcagtatcattgttgagtctacatgtacttccgtatattataataagagttagtccacccacgcctcaagactgatcaggttgttaggagggaggcagcatgggttgctgttttgATATGTTTTATATAGTGGTAATATACTAAATTGACTGAGAAGGTGAGTGATGTGTGCAAGTCACCGTTGATTAATTTGTTAATATTGTA---AAGTGTTTATT--GGGATGT-TCCTCCTCGACCCATAACACACTCACTGACGGGAAGAATAAATGC-ATAATCATT-----TT-------TTAGC--TGA-AA---AA-AA-cacaaagttgactgcgatcat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagaacaaaataatttcaaaaaatatatatcaaattcattcaaaataagcaataaaattgctttaaaaatatgactatagaaacatttgagcaacgttggtcacttgcaaagcgcataattaatgtttaatcaatttggggtagccatgtactatgttatatatattacaaccgatacattgatgatgccagttcctttacttagtgattttacaaacctcatctgcgtcgccttgcaatccaccctctctccgagacccaagtttacgcgaaaactcattattgttaaggacattcagtaatacataaacatagccatacaaatacatatgtacgGAATAGTTGATGTAACCATT-----TACCATGACGAAG---TAA-AA---AT-AA-A----TGTATTGTACAGGT---AT-TAACAA-ATTTCAACTGCCATACAACAGCAAGATTTAGTACTAATTA--TTAAATATCGGTTGCTTAACAGCGCGGTAAACA-AATCTGTATGCGCTTCAAATGATTATATACACAT-AAAGTAAGCTGAA-T-C--AATCGCTCAGA---GAATACTTAATGGACGTCAGAAA---CTATtaaaataaagaagtgtttgtgg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): AAATTTATTTATCCAATTATTTATCTAGGGTAATTTGTTATACTTCCTATTTATAAAATATTTCGAATTAAGTAAGATTTACCCTTTTTATACATAAGTGTACTATTTGTTTAATCCAATTAAGATACTCAAAGTAGGAAATACACATCTCTTAGTTTAATATCGACAGAATATTCCAAACATTACAATGAAAAGTATTAGAGAGCAATAATTCATATACATGTCGTTCGTTTTACTGATTTGTTGCTTTTTGGGGGACTTTTAACCCTAATGATATTTAAAGTACTGAAGTTCAGGAATATGTCTGTGTGTAGATACATGTAGAAGACGTTCCCAAAGGATAGACCTTTTCTTTAATGCTATATGGGATGTTTTGACATATATATTTTCTTATCGACTCCGTCGTGATCAGAGTTTCACTATATGGCAGATAAGAATATCTTCAGGTGAGGGTTAGATCATGAA
Unaligned ( gi|13 ): TTGCTTCATGTAAACAGCCAAGTATGGTAGTCTAATTTGGTACCAAGATCTTGACCATTCTTTGAACTTGCTTTGTAATAGTATATACATGTATATTTGATAGGAATATTTATTATTGAAAACCGCCCAACTTTGTTTTGGCTGCTCATGTAAGTATCTTTGAATGAATCATTCGAACAATGATCCCCACACGAAAAAAGGAAATTCAATCTCAATATACATGTGGTAAGCAGAGTCCAGTTATTCATCAAGGATAAATCATAACACTTTACTTCCGTTATTTAAAAAATCAAACCACGTAAAATTCACACATTTTATACATTTGGTGTACTATTTATCTTTTATCAAATTAAGATGTTCAAAAAGGAAATACAC
Unaligned ( gi|14 ): ATTTTCAAATAATGATCTGCACTATACAGAGAACATTTAATCCCGATATATGTACAGTATTCAAATCAGACAATTTATATTTAAGCAGTGTCAGTTATTTATCCAGGATCATTTGTTAAACCTCTGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCAACTTCATATTACTCACATATTTTATACATATTACTATATATATTTTAATATAGTAAAGATTTAAAAAAAAAACTACACTTTTCTTAGTTAAATATCGGCAGATTTTTGCAAACAAAACAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): AATATGGATATAGCAATATTTGACCAATGTTAGTCACTTGCTTGTTAAACCCACCATTAATGTTTAATTGATTTTG
Unaligned ( gi|20 ): ACATGTGCCATGGGATGACAACGGCCAGTAACACACTAACATGTTACAGCCGGGAAATAAAAGCAT