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Reference ( gi|10 ) : TATTAAT--ATACGCAGGGATTGTT-TC--------TAAAAGC------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA-TGGATTTTTG--T-T---C----------TT-------TG------A-------TG---------C-TA--AT---TAT----T------G------C---GTAAGAGTT---GTT--G----TTTTT---GC-TTG----TAA-----C-TA---A-------ATT---------G-AA--TG-C----T--G--------ATT------------A-G------------TC-AGG------CAGCT------A-A-T----------G-----AAAC-T-G-------------GC--C-TATG-----CCAACT-TACCAGCATGACT----GTCAAA-G------AC--A------A------A--T-------A--------A-CTC-A--A----TC--CCTTG------C------CAGG----G-----T-----TAA------------A---------T---CAGG-------C--TCCT---T----GGACTA------TTTC-A--GATTA----TT--AT-AT--TA--T-ATA--G-------AAAAC-C-T--A----C--TAC---AAATTAATCACGATTTTCA-TTGT-TAATTGATCA---TATG-AA-ATG---GCTGATA-AATCGATT-C-AT-AA---TT-C--AGCTCTGATTCCTAA
gi|9 : TATTAAT--ATACGCAGGGATTGTT-TC--------TAAAAGC------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA-TGGATTTTTG--T-T---C----------TT-------TG------A-------TG---------C-TA--AT---TAT----T------G------C---GTAAGAGTT---GTT--G----TTTTT---GC-TTG----TAA-----C-TA---A-------ATT---------G-AA--TG-C----T--G--------ATT------------G-G------------TC-GGG------CAGCT------A-A-T----------G-----AAAC-T-G-------------GC--C-TATG-----CCAACT-TACCAACATGACT----GTCAAA-G------AC--A------A------A--T-------A--------A-CTC-T--A----TC--CCTTG------C------CAGG----G-----T-----TAAATGGGGG-----A---------T---CAGA-------C--TCTT---T----GGACTA------TTTC-A--GATTA----TT--AT-AT--TG--T-ATA--G-------AAAAC-C-T--A----T--TAT---AGATTAATCATGATTTTCA-TTGT-TAATTGATCA---TATG-AA-ATGT--CCCGATA-AATCGATT-C-AT-AA---TT-C--AGCTCTGATTCCT
gi|6 : TATTAATCAATA------AATTGTT-GC--------CAAAAGC------CAC-TG--G--C---ACCTT------CAT----C----ACTAGTGGGCCTTTG--T-T---T----------AA-------TG------A-------TAAATTATA--C-TA--AT---TAC----T------GATACTGT---GTAAGAGTT---GTT--G----T------------------AA-----A-TA---A-------ATT---------G-AA--GG-C----T--G--------ATTGG----------A-G------------TC-A---------AGCT------A-AGTCAG-------G-----CAACATAG-------------GCAACATAGG-----CCAACT-TACCAAAATGACT----GACAAA-G------AC--A------A------AGGTGAA----A--------A-CTC-T--A----TC--CTATG------C------CATG----G-----G-----AAA------------A---------T---AAAGAATCCAAC--TCCA---G----GGACCA------TTTTTG--GGTTA----TT--AT-CT--------ATA--G-------AAAAT-C-T--G----G--TAC---GAATTTATTGTGAATTTAA-TCGT-TAATTGATTG---TCTG-AA--------CTG-TACAATTAA-T-C-AA-AACT-TT-C--AGCTACGATCCC
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gi|41 : ggttaattgATTTAT--ATAAGCAA--ATTGTT-AC--------CAAAAGCAGCCAACAC-T----------A---T------CAT----TG---ACAA-AGGATTTTTA--T-T---C----------
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gi|19 : taaatcacgaaTT-AC--------CAAAAGC------TGT-CG--A--C---ACAAT------CAT----CG---ATGA-CGGATTTTTA--T-T---C----------ATCAAAGAATC------A-------TA---------C-AA--AT---TAT----T------G------T---GGAAGAGTT---GTC--G----CTACA---GT-GTA----TAA-----C-TA---G-------ACT---------GTAAGTTGAC----T--GAGCGAA--ATTA-----------A-G------------TC-ACG------CAGCT------A-A-T----------C-----AAAT-T-GTTTTAATGAACTCAC--C-TAGG-----TCAACT-TACAAACATGACT----GACGAA-GATGAAAAC--A------A------A--C-------A--------A-CTA-G--ATTATTC--CCTTT------T------CAGT----G-----A-----AAA------------A---------TAA-AAAG----------------------GGATGA------TTTT------TTG----T----T-AT--TA--T-ACA--G-------AAAAC-A-T--A----T---------AATTAAgtcaacaaa
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gi|31 : ttaattgattaatcactgaattgtta---A---T------CAT----CG---ATAA-TGGATTTATA--T-T---T----------GTCAAA---TT------A-------TA---------C-TA--AT---TAC----T------G------T---GTAAAAGTT---GTC--A----TTCTT---CC-TAG-----AATATTCC-TA---A-------ACT---------G-AC--CA-C----T--G--------ATT------------G-G------------AC-Atactcctgggaccatttcgagttattacatatagaaatcctattatagattaatcgcaattgtaattgctaatcgatcgttgtaaatacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
gi|38 : gtttcaattaatcaagacattattacctagacctgatgacaca---T------CAT----TG---ATGA-TGGATTTATT--T-T---T----------GT-------CG------A-------TAAATCATA--C-TA--AT---TAT----T------G------T---GTAATAGTT---GTC--A----TTCTT---CC-TTA----Taaattaagtgtgactgccaattaaa
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gi|35 : tgaaaagcagcagaagtgataactATTTTTA--T-T---CG---------TT-------TACAAAGAA-------TA---------C-TT--AT---TAT----T------G------T---GTAAGAGTT---TTT--G----TTCTT----C-ATA----TAA-----C-TA---A-------AAT---------G-AA--TG-C----T--G--------ATT------------A-G------------agtttcagggaaaaataaaaaaaaaatttttttaaggagcaatttgggtcattataaattttaattgttaattgctcgactgaaatggctcattaatcaattcaaatttcacctatgattc
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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lowQualScore : 222222 8 11 0 00 4 4 22222222 4 3 55555555555 3 99999999999999999999 7777 222 6666666666666666666 2 8888888888888888888888888888888888888888888888 77 555555 6666 666666 77 66666666666666 88 333 7777 333 333 7777 3 333 22222 3333333 88 8 8888 77 22222222222 000000 444444444444444444444444444 4 000000 88888 666666 6 00000 6666666666666 44444444444444444 3333 5 5 6 88888888888888 4444444444444 66 99999999999999999999999999999999999 1 11 66666666 5 5 5 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 333 3333333 222222 33 2 3 88 444444444 2222222 7 7 55 33333 333 3 88 9 4 4 4 5 666 5 33 7 7
consensus : TATTAAT-T-CG-CNA--A-A--TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA-TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-A-TGT-C---CGATTAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
Reference ( family-1789 ) : TATTAAT-T-CG-CAA--A-A--TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA-TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-A-TGT-C---TGATTAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|1 : TATCAAT---CG-CCA--A-A--TTG-TTAC-CA--------A-AG-G----C------CGC-TGAAG--C---AA--T------CAT----CA---AT------------------GG-TGGATTTTTG--TT-CGTT-------G---------ACAAATTATA---------CTT--TT------TAC----T------GT--AT--------------AAGA--GTT---GTC-----TTA---TTGG--TT----TATAAC-TATTAA-----A-------A--CGAATAC----T--G-----------AT------TGGATGAAATCT-A-G------------TC-AGG------CAGCTTTTCAA------A-TT-----GTGTGTTAAAG---AAT----------TCA----CCCATGTTGGTCCA-AGTTA---ACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A-------G-----AC----------------------------------------------AA-----------G----------T-----A-------A------A-----A--------T-------CA-ACAATAT--CC----GGCATTACTGACCA------TTTCTGG-------ATAT--TA--T-GTAG-------AAAAT-T-T--TC-----TG---TAAA-T--TAATCACATTTTTAGTTATTA-TTAATCGTCTG-AA-A-TGG-C---TGAT-AATTGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|10 : tttcTATTAATATACG-CAG--GGA--TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA-TGGATTTTTG--TT-CTTT-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTT---TTG---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TG-----A-------------AAC----------TGG----CCTA----TG-CCA-ACTTACCAGCATGACTGTCAA-A-------G------AC------A------A--A------TA-----AC--T---C-------------AA-TC--CCTT--------G-C-CA-GG-----------G----------T-----T-------A------A-----A--------T-------CAGGC----T--CCT---TG-------GACTA------TTTCAGATTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AC-----TA---CAAA-T--TAATCACGATTTTCATTGTTAATTGATCATATG-AA-A-TGG-C---TGATAAATCGATTC-ATAA-TTC-AGC-TCTGATTCCTAAca
gi|11 : ATTAAT-T--A-CAA--A-A--TTG-TTAC-CT--------A-AA-G----C------C-C--------C---A---TT-----CAT----TG---A-------------------------ATT------------------------------A-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--TT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TAGAAA-TG---A-----A-------C--TGACCAC----T--G-----------AT------TGAACAAAAATTAA-G------------TC-TGT------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCC----CCAA----GG-CAA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--AGATGCATG-----AC--T---T-------------GA-AC--TCTT--------TTC-CA-GG-----------A----------A-----A-------AGA----A-----A--------T-------CAGAC----T--C------------------A------TTT---GTTATT--ATAT----------AC-------AAAACTC-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATTGTGATTTTAATTGTTAATTGATCGTCTG-AA-A-TGT-C---TGATTAATCAATTA-AAAATTTC-AGC-TCAGATTCCCAA
gi|12 : ttgttctgATCAAT-T-TC-CAA--A----TTG-TTGC-CA--------A-A--G----T------CAC-TG--A------------------AT----TG---AT------------------CA-TTGAT----G--TA-CATC-------G---------A-------TGAA-------TTACAGT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GGCC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------G-GATGAAAGTTAATTC-AGG------TAGCT-----A------A-TT-----A-------------AAA----------TCG----TTCA----CA-CCG-ACTTTCCAACATGACTGAAAA-A-------G------AT------A------A--AGG----CGATT--AC--T---C-------------TA-TC--GCTT--------T------------------------------------------------------------------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTAAGGGATATT--ATA---AA--T-ATAA-------AA----C-TAGAT-----TACATTAAA-A--TATTTGCAATTTTAATCCATAATTTATCATCTG-AA-T-TGT-A---TGATTAATca
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gi|15 : ttgtaccgATTAAT---CG-CCA--A-A--TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAG-TG--AAAC---AA--T------CAT----CG---GC------------------AT-TGGAGTTTTA--TT-CATC-------A---------A-------C------------A--A--------AC----T------TT--GT--------------AATA---TT----TC----TTAC---TTC---TT----TATAAT-GA---T-----A-------T--TGAATTT----TCGG-----------AT------T------------G-GAAAAA-------TC-CGA------AAGCT-----A------A-TC-----A-------------AATTATGTTTAAGTCG----CCTA----GA-CCA-ATTTACCAACGTGAGTGACAA----------------AC------G------AT-A------AG-----ACAAA---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CA-AT-----------G----------A-----A-------A------A-----G--------T-------AATA-----------------------GACTA------TTTTGGGT-------TAT--CA--T-AGAG-------AGAAT-CAT--AC-----TA---TACA-T--AAATCACGATTTTAATTGTTAATCCATCATCTG-AA-A-TGT-T---ATATTGAT
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gi|20 : ccgataaattcatAC----T--CCA---AG-------GAC-A------TTTTTGGGTATT--GTAT--------ATAG-------AAAAC-C-T--GT-----TG---TAGA-T--TAATCGTGATTT-GATTGCTAATCGATCCTCTG-AA-A-TGT-C---CGATTAATC--TTGTACGATTTC-AGC-TCCGATTCCCAActccaaggacatttttgggtattgtatatagaaaacctgttgtagattaatcgtgatttgattgctaatcgatcctctgaaatgtccgattaatcttgtacgatttcagctccgattcccaactc
gi|21 : ccgataaattcattattaaccaaattgttacactggcacgattactgacgatggagttttgtactcagatgaataatactaattattgcgtaagagttgttgttcttccttaatactaaattgaacactgattggacgaaacttatgtcaggcacctaATTAAT---CA-CTG--A-A--TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--T--C---ACAAT------TGT----TG---AT------------------AA-TAAAATTTTA--TT-CTTA-------G---------A-------TGACTTATATACTA--AT------TAT----TATACATGT--AT--------------ATGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TATCAC-TA---ACGCTGA-------T--TGGACGA----A--A-----------AT------TA-----------A-G------------TC-AGG------TAACT-----ctc
gi|21 : ttaattgAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGAGTTATT--ACAT--------ATAG-------AAATC-C-T--AT-----TA---TAGA-T--TAATCGCAATTGTAATTGCTAATCGATCGT-TGTAA-A-Ttactcctgggaccatttcgagttattacatatagaaatcctattatagattaatcgcaattgtaattgctaatcgatcgttgtaaatacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
gi|22 : ttaattgattaatcactgaattgttacactgtcacaattgttgataataaaattttattcttagatgacttatatactaattattatacatgtatatgagttgttgttcttccttatcactaacgctgattggacgaaaattaagtcaggtaacttATTAAT-T--G-CCA--A-A--TTG-TTAC-CA--------A-AA-T----G------CAC-TG--G--C---A---C------CAT-----------------------------GA-TGGAAGATTGAATG-AAT--------G---------A-------TA---------CTA--GG------TAT----T------GT--GT--------------AATA--GCT---GTT----GTTT---TCC---CT----TATAAA-TA---A-----AACACGGAT--TGGATGA-------A-----------AT------T------------G-G------------TC-AGG------AAGCT-----ACATGTAA-TC-----A-------------AAC----------TCG----CTCT----GG-TCA-ACTTGCGAACATGATGGACAA-A-------G------AT------G------A--AAG----CA-----AA--T-----------------TACTT--CCTT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAATCAAAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTTGGGT-------TAT--TA--T-ATAG-------AAAacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
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gi|26 : ttattctgattaattgttacagacgcaatcattgacaaccaatgatttttactaattgagcaatggctgttcttcttgagtgctgattagacaaaattaagtccggcagctaatcaagtA--A-A--TTCCTTGC-CA--------A-AA-G----T------CAC-TG--G--C---A-----------------CG---AT------------------CA-TTG-TTTTTG--T---------------------------------------------------------------------GT--GC--------------AAGA--CTT---TTC----GTCC---TTC---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TAGAAAC----T--A-----------A--------------------A-G------------TC-AGA------AAGGT-----A------A-TC-----C-------------AAT------------------ATG----GG-------TTACAAA-------GACGA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----GC--T---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CT-GG-----------GAAACATAA--A-----A-------A------A-----G--------T-------CAGAC----A--CCT---AG-------GTCC-----------------------AT--CA--T-ATAG-------GGAAC-C-T--AC-----TA---TACA-T--TGATCG
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gi|3 : ctgataaatcatATTAAT---CG-CCA--A-A--TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----T------CAT-CG--G--C---ACAAT------CAT----TG---AT------------------GA-TGGACTTTTA--CTACAT--------G---------A-------TGAATAATA--CTT--AT------TAC----T------TT--GT--------------AAGA--GTT---ACC----ATTC---TTA---CT----TATAA-------------A-------T---GAATGC----T--G-----------AT------TGGACAAAAATTAA-G------------TC-AGG------CAGCT-----T------A-TCTGAATA-------------AACC---------TCG----TCTA----GG-CCATA--TGTCAACATGACTGACAA-A-------G------AT------GTAGATTA--A------TG-----AA--T---C-------------TA-TT--CCTT--------T-C-TA-GGTAAAAAT----A----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--TCT---GG-------CATCA------TTTCAGAATATT--ACAAAATA--T-ATAA-------AAAA---------------A---TAAAAT--TAATCAGGTTTCTTATCATTAATTGATCATCTG-AA-ATTGA-C----GACAAATTGATT--AAAATTTC-ATC-TTCAATTtg
gi|30 : gttctg-------------TA-TC--TCTT--------T-C-CA-GG-----------A----------A-----A-------A------A----------------------------------------GA-------AACCA------T--CGTGTTATT--ACA----A----ACCG-------AAAAC-C-T--AT-----AC---TAAA-T--CGATCGCTATTTTAATCATTAAGTGATTGCCT--AA-A-TGT-CCGATGATCAATCGATTT-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
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gi|32 : gtttca----------A-----A-------A------A-----G--------T-------CTGGT----T--CCT---GT-------GACCA------TATCAGGCTATT--ATGT--------ACAG-------AAAAC-C-G--AT-----TA---TAAA-C--TAATCATGATTTAAATCCTTAATCAATTGTCTG-AA-T-TGT-C---TGATTAATTAATTA-AAAATTTCAAGC-GCTGGTTCCCAAaaattaagtgtgactgccaattaaa
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Reference ( family-1789 ) : TATTAAT-T-CGCNAA---A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
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gi|18 : aatacctgaattatacG---AT------------------GA--TGGATTTTTA--TT-GGCC-------A---------A-------CGAATAATA--CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GCT----GTTC---TTC---CT----TGAAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------CGGACGAAAACTAA-G------------TC-TGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAA----------T------TTTA----TG---A-ACTCACCAACATAACTGGCAG-A-------G------AT------G------A--A------GA-----AC-----------------------A-------GT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAA-AAAAT----T--TTTTTAAG-------GAGCA------ATTTGGGTCATT--ATA----A--------------------------AT-----T---------T--TAATTG------------TTAATTGCTCGACTG-AA-ATGG-CTCAT---TAATCAATT--CAAATTTC-ACC-TATGATTC
gi|19 : tgaaaagcagcagaagtgataactCTAA---A-TT----AC-CA--------A-AA-G----C------TGT-CG--A--C---ACAAT------CAT----CG---AT------------------GA--CGGATTTTTA--TT-CATC-------A---------AAGAATCATA---------CAA--AT------TAT----T------GT--GG--------------AAGA--GTT---GTC----G--C---TACAG-TG----TATAAC-TA---G-----A-------C--TGTAAGT----T--G-----------AC------TGAGCGAAATTA-A-G------------TC-ACG------CAGCT-----A------A-TC-----AAATTGTTTTAATGAAC----------TCA----CCTA----GG-TCA-ACTTACAAACATGACTGACGA-A-------GATGAAAAC------A------A--A------CA-----AC--TAGAT--T-------------ATTC--CCTT--------T-T-CA-GT-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------AAAAA-------------GG-------GATGA------TTTT---TTGT----TAT--TA--T-ACAG-------AAAAC-A-T--AT------------AA-T--TAA
gi|2 : aATTAAT---CTCAAA---G-TTG-TTAA-CA--------A-AA-G----C------CCCCTT--G--C---A---C------CAT----CAGCCAC------------------AA--TAGATTTTTG--CT-AGCC-------G---------A-------TG-----------A--AT------TATAAACT------GT--GT--------------GATA--GTT---GTC----GTCC---TAC---CT----TATAAA-TA---A----------------TGAACAC----T--G-----------AT------T------------G-GGTGAAAATTATGTC-AGG------GAGCT-----A------T-TC-----A-------------AAC----------TTG----CCCA----GG-AGA-ACTAACCAGCATGGTTGACAA-A-------G------AC------G------AAGA------TG-----AA--TGA-T--T-------------A-CA--CATT--------T-C-TA-GG-----------GAAACATAAAAA-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----A--CCT---GG-------GACCA------TTTTGGGTAA----ATA---TA--T-ATAG-------AAAACAG-T--AT-----TA---TAAA-T--CAATTGTGATTTTAATCCTTAA-CAACCATTTG-AA-GTGT--TGAT---TAATCAATTA-AATATTTC-AGC-ATGGATTCCCActgaaatgtt
gi|20 : ggttaattgTATTAA------CCAA---A-TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--G--C---ACGAT------TAC----TG---AC------------------GA--TGGAGTTTTG--TA-C-TCA------G---------A-------TGAATAATA--CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TAATAC-TA---A-----A-------T--TGAACAC----T--G-----------AT------T------------G-GACGAAACTTATGTC-AGG------CACCT-----A------A-
gi|20 : ccgataaattcatAC----T--CCA---AG-------GAC-A------TTTTTGGGTATT--GTAT--------ATAG-------AAAAC-C-T--GT-----TG---TAGA-T--TAATCGTGATTT-GATTGCTAATCGATCCTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATC--TTGTACGATTTC-AGC-TCCGATTCCCAActccaaggacatttttgggtattgtatatagaaaacctgttgtagattaatcgtgatttgattgctaatcgatcctctgaaatgtccgattaatcttgtacgatttcagctccgattcccaactc
gi|21 : ccgataaattcattattaaccaaattgttacactggcacgattactgacgatggagttttgtactcagatgaataatactaattattgcgtaagagttgttgttcttccttaatactaaattgaacactgattggacgaaacttatgtcaggcacctaATTAAT---CACTGA---A-TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--T--C---ACAAT------TGT----TG---AT------------------AA--TAAAATTTTA--TT-CTTA-------G---------A-------TGACTTATATACTA--AT------TAT----TATACATGT--AT--------------ATGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TATCAC-TA---ACGCTGA-------T--TGGACGA----A--A-----------AT------TA-----------A-G------------TC-AGG------TAACT-----ctc
gi|21 : ttaattgAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGAGTTATT--ACAT--------ATAG-------AAATC-C-T--AT-----TA---TAGA-T--TAATCGCAATTGTAATTGCTAATCGATCGT-TGTAA-ATtactcctgggaccatttcgagttattacatatagaaatcctattatagattaatcgcaattgtaattgctaatcgatcgttgtaaatacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
gi|22 : ttaattgattaatcactgaattgttacactgtcacaattgttgataataaaattttattcttagatgacttatatactaattattatacatgtatatgagttgttgttcttccttatcactaacgctgattggacgaaaattaagtcaggtaacttATTAAT-T--GCCAA---A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-T----G------CAC-TG--G--C---A---C------CAT-----------------------------GA--TGGAAGATTGAATG-AAT--------G---------A-------TA---------CTA--GG------TAT----T------GT--GT--------------AATA--GCT---GTT----GTTT---TCC---CT----TATAAA-TA---A-----AACACGGAT--TGGATGA-------A-----------AT------T------------G-G------------TC-AGG------AAGCT-----ACATGTAA-TC-----A-------------AAC----------TCG----CTCT----GG-TCA-ACTTGCGAACATGATGGACAA-A-------G------AT------G------A--AAG----CA-----AA--T------T-------------ACTT--CCTT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAATCAAAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTTGGGT-------TAT--TA--T-ATAG-------AAAacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
gi|23 : atcATTAAT-T--GTGAA---A-TTG-TTTC-CAGAAAGTTAA-AA-G----C------TAC-CT--G--C---ACGAT------AAT----TG---ACAATGGATGTTTGTTTGTCGA--TGGATT------------------------------A-------TA---------CTT--AT------TAT----T------GT--GT--------------ATGA--GTT---GTC----ATTT---TTT---CT----TATAAA-T----A-----A-------T--TGAACAC----T--G-----------AT------TTGACAAAAGTTAA-G------------TC-AGG------CATCT-----T------A-TC-----A-------------AAC----------TCC----TCTA----GG-TCA-ACTTAACAAAATG-CTGACAA-A-------G------A
gi|24 : tcagTAACATT---A-----A-------T--TGAATAA----A--G-----------AT------T------------A-A------------ACTAAG------CAGTT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TC--------------------ACTTACCAACATGACTGACAG-ACAAG---G------AC------G------A--A------TG-----CC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-TA-GG----------------------------A-------A------A-----A--------T-------AAAAA----TATCCT---GG-------GAACA------TTTCGTGTTACT--ATA----A----ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATTGCTATTTTAATCGTTTATCAACAGTCTG-AA-TTGT-CTCAT---TCATTGATTA-AATATTTT-AGC-TCTGAATCCAAAatatttatgatcgtttattttcctatagtgataat
gi|25 : actaaatt--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-AATTTTTTTTTAAA----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----G--TTT---GG-------GATAA------TTTAGGATTATT--GTAT----------AG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--AAATTGTGATTTT
gi|26 : ttattctgattaattgttacagacgcaatcattgacaaccaatgatttttactaattgagcaatggctgttcttcttgagtgctgattagacaaaattaagtccggcagctaatcaagtAA---A-TTCCTTGC-CA--------A-AA-G----T------CAC-TG--G--C---A-----------------CG---AT------------------CA--TTG-TTTTTG--T---------------------------------------------------------------------GT--GC--------------AAGA--CTT---TTC----GTCC---TTC---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TAGAAAC----T--A-----------A--------------------A-G------------TC-AGA------AAGGT-----A------A-TC-----C-------------AAT------------------ATG----GG-------TTACAAA-------GACGA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----GC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CT-GG-----------GAAACATAA--A-----A-------A------A-----G--------T-------CAGAC----A--CCT---AG-------GTCC-----------------------AT--CA--T-ATAG-------GGAAC-C-T--AC-----TA---TACA-T--TGATCG
gi|27 : gCTA----AG-CCA-CTTTACCAACATGACTGATAA-A-------G------AT------G------A--A------TG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CC------------CACA-AA-----------A----------A-----ATAAAATGA------A-----A--------T-------GAGAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTGAGGTTATT--ATA---TA--C-ATAT-------AAACC-C-TA-ATATCGGTA---TAAA-T--TAATCCCGATTTTAACTGCAAATCGATCATCTG-AA-ATGT-CTGAT---TAAACGTTTA-AAAATTTC-GGC-TCTGATTTCCAA
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gi|29 : TTAAT---CTCCAA---A-TTG-TTAT-GA--------A-AA-A----T------CAC-AG--A--TCA-A---T------CAT----CA---AC------------------AA--TAGATTTTTG--TC-TGTC-------A---------A-------TGAATTATA--CTA--TT------TAT----T------GTGAGTCAAGTGAATGATAAAAGA--ATT---TTC----ATGCAAGGTT---CT----TATAAA-TA---A-----A-------T--TGAAGAC----T--GAACGGACAAAAAT------TA-----------A-G------------TC-ACG------CAATT-----A------A-TC-----A-------------tac
gi|3 : ctgataaatcatATTAAT---CGCCAA---A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----T------CAT-CG--G--C---ACAAT------CAT----TG---AT------------------GA--TGGACTTTTA--CTACAT--------G---------A-------TGAATAATA--CTT--AT------TAC----T------TT--GT--------------AAGA--GTT---ACC----ATTC---TTA---CT----TATAA-------------A-------T---GAATGC----T--G-----------AT------TGGACAAAAATTAA-G------------TC-AGG------CAGCT-----T------A-TCTGAATA-------------AACC---------TCG----TCTA----GG-CCATA--TGTCAACATGACTGACAA-A-------G------AT------GTAGATTA--A------TG-----AA--T---C--T-------------A-TT--CCTT--------T-C-TA-GGTAAAAAT----A----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--TCT---GG-------CATCA------TTTCAGAATATT--ACAAAATA--T-ATAA-------AAAA---------------A---TAAAAT--TAATCAGGTTTCTTATCATTAATTGATCATCTG-AA-ATTG-ACGAC---AAATTGATT--AAAATTTC-ATC-TTCAATTtg
gi|30 : gttctg--T-------------A-TC--TCTT--------T-C-CA-GG-----------A----------A-----A-------A------A----------------------------------------GA-------AACCA------T--CGTGTTATT--ACA----A----ACCG-------AAAAC-C-T--AT-----AC---TAAA-T--CGATCGCTATTTTAATCATTAAGTGATTGCCT--AA-ATGT-CCGATGATCAATCGATTT-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|31 : tatgccaatcactatatatctcttaggccaatcactataATTAAT---CAAGAC---A-TTA-TTAC-CT--------A-GA-C----C------TGA-TG--A--C---ACAAT------CAT----CG---AT------------------AA--TGGATTTATA--TT-TGTC-------A---------AATTA---TA---------CTA--AT------TAC----T------GT--GT--------------AAAA--GTT---GTC----ATTC---TTC---CTAGAATATTCC-TA---A-----A-------C--TGACCAC----T--G-----------AT------T------------G-G------------AC-Acact
gi|32 : gtttca----------A-----A-------A------A-----G--------T-------CTGGT----T--CCT---GT-------GACCA------TATCAGGCTATT--ATGT--------ACAG-------AAAAC-C-G--AT-----TA---TAAA-C--TAATCATGATTTAAATCCTTAATCAATTGTCTG-AA-TTGT-CTGAT---TAATTAATTA-AAAATTTCAAGC-GCTGGTTCCCAAaaattaagtgtgactgccaattaaa
gi|33 : ttacatgaaaaataTATTA-T-T-TGTAAA---A-TTG-TTAC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TA--G--C---A---TGAT---CAT----CG---AT------------------GC--TGGATTTTTG--TT-TGTC-------G---------A-------TGAATTATA--CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GCT----CTTC---TTC---CT----TATAAC-TT---A----------------TAAACAC----T--G-----------Acac
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gi|7 : gttctgTA--AT------TAT----T------GT--GA--------------AAGA--GTT---TTC----ATTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----tctgtttatgcactgaccctaattattaattattgtgaaagagttttcattcttccttataactaaggccaacttaccaatatgaccaacaaagacaaaagactctatccctttcaagaaaaaaatatgaagttcagattcctgggaaaatttccagttattaaaaatgtatataaataacctattgtaagtaataatggctttaaatgttaattgattatctgaaatgtctgtttaatcaatttagaatttcagcatcaattcccaac
gi|7 : gttctgattaattgccaaattgttatccaaagcaactggcatgatcatcgatgatggatttttttcttacatgaattatactaactattgttctgtttatgcactgaccctaattatA----GG-CCA-ACTTACCAATATGACCAACAA-A-------G------AC------A------A--A------AG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-AA-GA-----------A----------A-----A-------A------A-----ATATGAAGTT-------CAGAT----T--CCT---GG-------GAAAA------TTTCCAGTTATTAAAAATG-TA--T-ATAA-------ATAAC-C-T--AT-----TG---TAAG-TAATAATGGC---TTTAAATGTTAATTGATTATCTG-AA-ATGT-CTGTT---TAATCAATTT-AGAATTTC-AGC-ATCAATTCCCAAggccaacttaccaatatgaccaacaaagacaaaagactctatccctttcaagaaaaaaatatgaagttcagattcctgggaaaatttccagttattaaaaatgtatataaataacctattgtaagtaataatggctttaaatgttaattgattatctgaaatgtctgtttaatcaatttagaatttcagcatcaattcccaac
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consensus : TATTAAT-CGC-CAA---A-TTG-TTAC-CAA-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA-TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
Reference ( family-1789 ) : TATTAATTCGC-CAA---A-TTG-TTAC-CAA-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA-TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|1 : TATCAAT-CGC-CAA---A-TTG-TTAC-CAA-AG-G----C------CGC-TGAAG--C---AA--T------CAT----CA---ATGG-TGGATTTTTG--TT-CGTT-------G---------ACAAATTATA---------CTT--TT------TAC----T------GT--AT--------------AAGA--GTT---GTC-----TTA---TTGG--TT----TATAAC-TATTAA-----A-------A--CGAATAC----T--G-----------AT------TGGATGAAATCT-A-G------------TC-AGG------CAGCTTTTCAA------A-TT-----GTGTGTTAAAG---AAT----------TCA----CCCATGTTGGTCCA-AGTTA---ACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A-------G-----AC------------------------------------------------AA-----------G----------T-----A-------A------A-----A--------T-------CA-ACAATAT--CC----GGCATTACTGACCA------TTTCTGG-------ATAT--TA--T-GTAG-------AAAAT-T-T--TC-----TG---TAAA-T--TAATCACATTTTTAGTTATTA-TTAATCGTCTG-AA-ATGG-CTGAT----AATTGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|10 : tttcTATTAATATACGCAGGG-A-TTG-TTTC-TAA-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA-TGGATTTTTG--TT-CTTT-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTT---TTG---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TG-----A-------------AAC----------TGG----CCTA----TG-CCA-ACTTACCAGCATGACTGTCAA-A-------G------AC------A------A--A------TA-----AC--T---C--A-------------A-TC--CCTT--------G-C-CA-GG-----------G----------T-----T-------A------A-----A--------T-------CAGGC----T--CCT---TG-------GACTA------TTTCAGATTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AC-----TA---CAAA-T--TAATCACGATTTTCATTGTTAATTGATCATATG-AA-ATGG-CTGAT---AAATCGATTC-ATAA-TTC-AGC-TCTGATTCCTAAca
gi|11 : ATTAATT-AC-AAA---A-TTG-TTAC-CTA-AA-G----C------C-C--------C---A---TT-----CAT----TG---A-------ATT------------------------------A-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--TT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TAGAAA-TG---A-----A-------C--TGACCAC----T--G-----------AT------TGAACAAAAATTAA-G------------TC-TGT------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCC----CCAA----GG-CAA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--AGATGCATG-----AC--T---T--G-------------A-AC--TCTT--------TTC-CA-GG-----------A----------A-----A-------AGA----A-----A--------T-------CAGAC----T--C------------------A------TTT---GTTATT--ATAT----------AC-------AAAACTC-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATTGTGATTTTAATTGTTAATTGATCGTCTG-AA-ATGT-CTGAT---TAATCAATTA-AAAATTTC-AGC-TCAGATTCCCAA
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gi|20 : ccgataaattcatAC----T--CCA---AG-------GAC-A------TTTTTGGGTATT--GTAT--------ATAG-------AAAAC-C-T--GT-----TG---TAGA-T--TAATCGTGATTT-GATTGCTAATCGATCCTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATC--TTGTACGATTTC-AGC-TCCGATTCCCAActccaaggacatttttgggtattgtatatagaaaacctgttgtagattaatcgtgatttgattgctaatcgatcctctgaaatgtccgattaatcttgtacgatttcagctccgattcccaactc
gi|21 : ccgataaattcattattaaccaaattgttacactggcacgattactgacgatggagttttgtactcagatgaataatactaattattgcgtaagagttgttgttcttccttaatactaaattgaacactgattggacgaaacttatgtcaggcacctaATTAAT-CAC-TGA---A-TTG-TTAC---------------------AC-TG--T--C---ACAAT------TGT----TG---ATAA-TAAAATTTTA--TT-CTTA-------G---------A-------TGACTTATATACTA--AT------TAT----TATACATGT--AT--------------ATGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TATCAC-TA---ACGCTGA-------T--TGGACGA----A--A-----------AT------TA-----------A-G------------TC-AGG------TAACT-----ctc
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gi|22 : ttaattgattaatcactgaattgttacactgtcacaattgttgataataaaattttattcttagatgacttatatactaattattatacatgtatatgagttgttgttcttccttatcactaacgctgattggacgaaaattaagtcaggtaacttATTAATT-GC-CAA---A-TTG-TTAC-CAA-AA-T----G------CAC-TG--G--C---A---C------CAT-----------GA-TGGAAGATTGAATG-AAT--------G---------A-------TA---------CTA--GG------TAT----T------GT--GT--------------AATA--GCT---GTT----GTTT---TCC---CT----TATAAA-TA---A-----AACACGGAT--TGGATGA-------A-----------AT------T------------G-G------------TC-AGG------AAGCT-----ACATGTAA-TC-----A-------------AAC----------TCG----CTCT----GG-TCA-ACTTGCGAACATGATGGACAA-A-------G------AT------G------A--AAG----CA-----AA--T------T-------------ACTT--CCTT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAATCAAAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTTGGGT-------TAT--TA--T-ATAG-------AAAacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
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gi|8 : gttctgattaattgccaaattgttatccaaagcaactggcatgatcatcgatgatggatttttttcttacatgaattatactaactattgttctgtttatgcactgaccctaattattaattattgtgaaagagttttcattcttccttataactaTATTGATTCAT-CAACAAA-TCG-TTAC-CAA-AA-A----C------CAC-TG---------------------------------------GAT---------------------A---------A-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGATTGTT----TT----GTTC---TTCACACT----T----C-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------G-GACGAAACTTAAATC-AAGA-----CAGCC-----C------A-TC-----A-------------AAC----------CTG----TCTA----GG-CCA-ACTTTACAATATGACTGACAATA-------AAAACT-AC------G------A--A------AG-----AC--T---TTGT-------------A-TA--ATTTAGAGACAAT-T-AA-AG-----------A----------A-----A-------A------AAAAAGA--------T-------CTGAC----T--CCT---GG-------GACTATTCTTTTTTCGA--CATT--ATAA--TA--TAAAAG-------AAAAC-G-T---T-----TA---TCAA-T--CATTTGCGATTTTGAAAGTTATAAGGTCGTCTA-AA-AAAA-TTGAT---TAATAAATTT-AGAAATTC-AGC-c
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Reference ( family-1789 ) : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|1 : TATCAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AG-G----C------CGC-TGAAG--C---AA--T------CAT----CA---AT------------------GG--TGGATTTTTG--TT-CGTT-------G---------ACAAATTATA---------CTT--TT------TAC----T------GT--AT--------------AAGA--GTT---GTC-----TTA---TTGG--TT----TATAAC-TATTAA-----A-------A--CGAATAC----T--G-----------AT------TGGATGAAATCT-A-G------------TC-AGG------CAGCTTTTCAA------A-TT-----GTGTGTTAAAG---AAT----------TCA----CCCATGTTGGTCCA-AGTTA---ACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A-------G-----AC------------------------------------------------AA-----------G----------T-----A-------A------A-----A--------T-------CA-ACAATAT--CC----GGCATTACTGACCA------TTTCTGG-------ATAT--TA--T-GTAG-------AAAAT-T-T--TC-----TG---TAAA-T--TAATCACATTTTTAGTTATTA-TTAATCGTCTG-AA-ATGG-CTGAT----AATTGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|10 : tttcTATTAATATACGCAGGGA-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CTTT-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTT---TTG---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TG-----A-------------AAC----------TGG----CCTA----TG-CCA-ACTTACCAGCATGACTGTCAA-A-------G------AC------A------A--A------TA-----AC--T---C--A-------------A-TC--CCTT--------G-C-CA-GG-----------G----------T-----T-------A------A-----A--------T-------CAGGC----T--CCT---TG-------GACTA------TTTCAGATTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AC-----TA---CAAA-T--TAATCACGATTTTCATTGTTAATTGATCATATG-AA-ATGG-CTGAT---AAATCGATTC-ATAA-TTC-AGC-TCTGATTCCTAAca
gi|11 : ATTAAT---TACAAA-A-TTG-TTAC-CT--------A-AA-G----C------C-C--------C---A---TT-----CAT----TG---A--------------------------ATT------------------------------A-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--TT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TAGAAA-TG---A-----A-------C--TGACCAC----T--G-----------AT------TGAACAAAAATTAA-G------------TC-TGT------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCC----CCAA----GG-CAA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--AGATGCATG-----AC--T---T--G-------------A-AC--TCTT--------TTC-CA-GG-----------A----------A-----A-------AGA----A-----A--------T-------CAGAC----T--C------------------A------TTT---GTTATT--ATAT----------AC-------AAAACTC-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATTGTGATTTTAATTGTTAATTGATCGTCTG-AA-ATGT-CTGAT---TAATCAATTA-AAAATTTC-AGC-TCAGATTCCCAA
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gi|14 : gttttgATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-AA--------A-AAAG------------AC-T-----------------------T----TG---TT------------------GA--TGAATT------------------------------A-------TA---------CAA--AT------TAT----T------GA--GT--------------AAGA--GAT---GTC----AGTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TAAATGC----C--G-----------AT------TGGACGAAAGTTAA-G------------TC-CGG------CATCT-----T------A-TC-----A-------------AAC----------TCA----TTAA----CG-CCA-ACTTGCCAAC------GACAA-A-------G------AC------A------C--A------CA-----AC--T---C--TTTCAAAGATGAATA-TC--TCTT--------T-C-CA-GG----------------------------A-------A------A-----A--------T-------TAAAT----T-----------------AA-------------AAGATA------AT--TA--T-GTAG-------AAA-C-C-T--AT-----TA---TAAA-T------CGTAATTTT----GTTAATCAATTGTTTA-AA-ATGT-CCAGT---TAATTGATTC-AAAATTTC-AGC-TCCGATTTCCAAa
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gi|21 : ccgataaattcattattaaccaaattgttacactggcacgattactgacgatggagttttgtactcagatgaataatactaattattgcgtaagagttgttgttcttccttaatactaaattgaacactgattggacgaaacttatgtcaggcacctaATTAAT---CACTGA-A-TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--T--C---ACAAT------TGT----TG---AT------------------AA--TAAAATTTTA--TT-CTTA-------G---------A-------TGACTTATATACTA--AT------TAT----TATACATGT--AT--------------ATGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TATCAC-TA---ACGCTGA-------T--TGGACGA----A--A-----------AT------TA-----------A-G------------TC-AGG------TAACT-----ctc
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gi|22 : ttaattgattaatcactgaattgttacactgtcacaattgttgataataaaattttattcttagatgacttatatactaattattatacatgtatatgagttgttgttcttccttatcactaacgctgattggacgaaaattaagtcaggtaacttATTAAT---TGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-T----G------CAC-TG--G--C---A---C------CAT-----------------------------GA--TGGAAGATTGAATG-AAT--------G---------A-------TA---------CTA--GG------TAT----T------GT--GT--------------AATA--GCT---GTT----GTTT---TCC---CT----TATAAA-TA---A-----AACACGGAT--TGGATGA-------A-----------AT------T------------G-G------------TC-AGG------AAGCT-----ACATGTAA-TC-----A-------------AAC----------TCG----CTCT----GG-TCA-ACTTGCGAACATGATGGACAA-A-------G------AT------G------A--AAG----CA-----AA--T------T-------------ACTT--CCTT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAATCAAAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTTGGGT-------TAT--TA--T-ATAG-------AAAacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
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gi|26 : ttattctgattaattgttacagacgcaatcattgacaaccaatgatttttactaattgagcaatggctgttcttcttgagtgctgattagacaaaattaagtccggcagctaatcaagtAA-A-TTCCTTGC-CA--------A-AA-G----T------CAC-TG--G--C---A-----------------CG---AT------------------CA--TTG-TTTTTG--T---------------------------------------------------------------------GT--GC--------------AAGA--CTT---TTC----GTCC---TTC---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TAGAAAC----T--A-----------A--------------------A-G------------TC-AGA------AAGGT-----A------A-TC-----C-------------AAT------------------ATG----GG-------TTACAAA-------GACGA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----GC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CT-GG-----------GAAACATAA--A-----A-------A------A-----G--------T-------CAGAC----A--CCT---AG-------GTCC-----------------------AT--CA--T-ATAG-------GGAAC-C-T--AC-----TA---TACA-T--TGATCG
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gi|7 : gttctgattaattgccaaattgttatccaaagcaactggcatgatcatcgatgatggatttttttcttacatgaattatactaactattgttctgtttatgcactgaccctaattatA----GG-CCA-ACTTACCAATATGACCAACAA-A-------G------AC------A------A--A------AG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-AA-GA-----------A----------A-----A-------A------A-----ATATGAAGTT-------CAGAT----T--CCT---GG-------GAAAA------TTTCCAGTTATTAAAAATG-TA--T-ATAA-------ATAAC-C-T--AT-----TG---TAAG-TAATAATGGC---TTTAAATGTTAATTGATTATCTG-AA-ATGT-CTGTT---TAATCAATTT-AGAATTTC-AGC-ATCAATTCCCAAggccaacttaccaatatgaccaacaaagacaaaagactctatccctttcaagaaaaaaatatgaagttcagattcctgggaaaatttccagttattaaaaatgtatataaataacctattgtaagtaataatggctttaaatgttaattgattatctgaaatgtctgtttaatcaatttagaatttcagcatcaattcccaac
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lowQualScore : 444 1 9 9 4 4 00000000 4 3 88888888888 3 55555555555555555555 7777 111 0000000000000000000 99 8888888888888888888888888888888888888888888888 77 555555 6666 666666 77 66666666666666 88 333 7777 333 333 7777 3 333 22222 3333333 88 8 8888 77 22222222222 000000 444444444444444444444444444 4 000000 88888 666666 6 00000 6666666666666 44444444444444444 3333 5 5 6 88888888888888 4444444444444 66 11111111111111111111111111111111111111 1 11 66666666 5 5 5 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00000000 333 3333333 222222 33 2 3 88 444444444 2222222 7 7 55 33333 333 3 88 9 4 4 5 6 666 5 33 7 7
consensus : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
Reference ( family-1789 ) : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|1 : TATCAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AG-G----C------CGC-TGAAG--C---AA--T------CAT----CA---AT------------------GG--TGGATTTTTG--TT-CGTT-------G---------ACAAATTATA---------CTT--TT------TAC----T------GT--AT--------------AAGA--GTT---GTC-----TTA---TTGG--TT----TATAAC-TATTAA-----A-------A--CGAATAC----T--G-----------AT------TGGATGAAATCT-A-G------------TC-AGG------CAGCTTTTCAA------A-TT-----GTGTGTTAAAG---AAT----------TCA----CCCATGTTGGTCCA-AGTTA---ACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A-------G-----AC------------------------------------------------AA-----------G----------T-----A-------A------A-----A--------T-------CA-ACAATAT--CC----GGCATTACTGACCA------TTTCTGG-------ATAT--TA--T-GTAG-------AAAAT-T-T--TC-----TG---TAAA-T--TAATCACATTTTTAGTTATTA-TTAATCGTCTG-AA-ATGG-CTGAT----AATTGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|10 : tttcTATTAATATACGCAGGGA-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CTTT-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTT---TTG---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TG-----A-------------AAC----------TGG----CCTA----TG-CCA-ACTTACCAGCATGACTGTCAA-A-------G------AC------A------A--A------TA-----AC--T---C--A-------------A-TC--CCTT--------G-C-CA-GG-----------G----------T-----T-------A------A-----A--------T-------CAGGC----T--CCT---TG-------GACTA------TTTCAGATTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AC-----TA---CAAA-T--TAATCACGATTTTCATTGTTAATTGATCATATG-AA-ATGG-CTGAT---AAATCGATTC-ATAA-TTC-AGC-TCTGATTCCTAAca
gi|11 : ATTAAT---TACAAA-A-TTG-TTAC-CT--------A-AA-G----C------C-C--------C---A---TT-----CAT----TG---A--------------------------ATT------------------------------A-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--TT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TAGAAA-TG---A-----A-------C--TGACCAC----T--G-----------AT------TGAACAAAAATTAA-G------------TC-TGT------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCC----CCAA----GG-CAA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--AGATGCATG-----AC--T---T--G-------------A-AC--TCTT--------TTC-CA-GG-----------A----------A-----A-------AGA----A-----A--------T-------CAGAC----T--C------------------A------TTT---GTTATT--ATAT----------AC-------AAAACTC-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATTGTGATTTTAATTGTTAATTGATCGTCTG-AA-ATGT-CTGAT---TAATCAATTA-AAAATTTC-AGC-TCAGATTCCCAA
gi|12 : ttgttctgATCAAT---TTCCAA-A-TTG-TTGC-CA--------A-A--G----T------CAC-TG--A------------------AT----TG---AT------------------CA--TTGAT----G--TA-CATC-------G---------A-------TGAA-------TTACAGT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GGCC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------G-GATGAAAGTTAATTC-AGG------TAGCT-----A------A-TT-----A-------------AAA----------TCG----TTCA----CA-CCG-ACTTTCCAACATGACTGAAAA-A-------G------AT------A------A--AGG----CGATT--AC--T---C--T-------------A-TC--GCTT--------T------------------------------------------------------------------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTAAGGGATATT--ATA---AA--T-ATAA-------AA----C-TAGAT-----TACATTAAA-A--TATTTGCAATTTTAATCCATAATTTATCATCTG-AA-TTGT-ATGAT---TAATca
gi|13 : cgataaatcaATTAAT---AACCAA-A-TTG-TTACACA--------ACAA-A------------AC-TG--G--A---A---T------GAT----CA---TC------------------GT--TGAAT---------------------A---------A-------CG---------CTA--AT------TAT----T------AT--GT--------------AAGA--CTT---GT-------TC---TTT---AT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACAC----T--G-----------AT------TGGAAGAA-----A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------CAA----CCTA----GG-CAA-ACTTACCAACATGTCTGACAA-A-------G------ATAAAGATG------A--A------AG-----AT--A---T--T-------------A-TC--CCGT--------T-T-TA-GG-----------G----------A-------------------------------------------C-TAT----T--TCT---TG-------AATTA------TTTCGGGTTATT--ACAA--TAA-T-ATAG-------AAA----------------------------TAACAGCGATTTTTATCATTAAACTATCAT--G-AA-ATGT-CTGAT---TAATCAATAA-GAAATTTC-AAC-TCTGATTCTCAAtatacca
gi|14 : gttttgATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-AA--------A-AAAG------------AC-T-----------------------T----TG---TT------------------GA--TGAATT------------------------------A-------TA---------CAA--AT------TAT----T------GA--GT--------------AAGA--GAT---GTC----AGTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TAAATGC----C--G-----------AT------TGGACGAAAGTTAA-G------------TC-CGG------CATCT-----T------A-TC-----A-------------AAC----------TCA----TTAA----CG-CCA-ACTTGCCAAC------GACAA-A-------G------AC------A------C--A------CA-----AC--T---C--TTTCAAAGATGAATA-TC--TCTT--------T-C-CA-GG----------------------------A-------A------A-----A--------T-------TAAAT----T-----------------AA-------------AAGATA------AT--TA--T-GTAG-------AAA-C-C-T--AT-----TA---TAAA-T------CGTAATTTT----GTTAATCAATTGTTTA-AA-ATGT-CCAGT---TAATTGATTC-AAAATTTC-AGC-TCCGATTTCCAAa
gi|15 : ttgtaccgATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAG-TG--AAAC---AA--T------CAT----CG---GC------------------AT--TGGAGTTTTA--TT-CATC-------A---------A-------C------------A--A--------AC----T------TT--GT--------------AATA---TT----TC----TTAC---TTC---TT----TATAAT-GA---T-----A-------T--TGAATTT----TCGG-----------AT------T------------G-GAAAAA-------TC-CGA------AAGCT-----A------A-TC-----A-------------AATTATGTTTAAGTCG----CCTA----GA-CCA-ATTTACCAACGTGAGTGACAA----------------AC------G------AT-A------AG-----ACAAA---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-AT-----------G----------A-----A-------A------A-----G--------T-------AATA-----------------------GACTA------TTTTGGGT-------TAT--CA--T-AGAG-------AGAAT-CAT--AC-----TA---TACA-T--AAATCACGATTTTAATTGTTAATCCATCATCTG-AA-ATGT-TATAT---TGAT
gi|16 : tggATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAG-TG--AAAC---AA--T------CAT----CG---GC------------------AT--TGGAGTTTTA--TT-CATC-------A---------A-------C------------A--A--------AC----T------TT--GT--------------AATA---TT----TC----TTAC---TTC---TT----TATAAT-GA---T-----A-------T--TGAATTT----TCGG-----------AT------T------------G-GAAAAA-------TC-CGA------AAGCT-----A------A-TC-----A-------------AATTATGTTTAAGTCG----CCTA----GA-CCA-ATTTACCAACGTGAGTGACAA----------------AC------G------AT-A------AG-----ACAAA---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-AT-----------G----------A-----A-------A------A-----G--------T-------AATA-----------------------GACTA------TTTTGGGT-------TAT--CA--T-AGAG-------AGAAT-CAT--AC-----TA---TACA-T--AAATCACGATTTTAATTGTTAATCCATCATCTG-AA-ATGT-TATAT---TGAT
gi|17 : ggA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------GATAAATCG---AT------------------GA--TGGATGTTTG--A--AGTC-------A---------A-------TGAATTATA--CTA--AT------TGT----T-------T---T--------------AAGA--TTT---GTC----GTTC---TTC---AT----TATGAC-TA---A-----A-------T--TAAACAC----T--A-----------AT------TGGATGAAAATTAA-G------------TA-AAG------CAGTA-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TTA----CCTG----GG-TCA-ATTTACCAACATTACTGACAA-A-------G------AC------A------A--A------TG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CTTT--------T-T-CA-GG-----------G----------G-----A-------A------A-----A--------TAAA----AAGA-----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCTGGTTAAT--ATAA--TAGTT-A-AGAAATTTCAAAAC-C-T--AT-----TG---TCAT-T--TAATTGTGATTTTAATTGTTAAT
gi|18 : aatacctgaattatacG---AT------------------GA--TGGATTTTTA--TT-GGCC-------A---------A-------CGAATAATA--CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GCT----GTTC---TTC---CT----TGAAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------CGGACGAAAACTAA-G------------TC-TGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAA----------T------TTTA----TG---A-ACTCACCAACATAACTGGCAG-A-------G------AT------G------A--A------GA-----AC-----------------------A-------GT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAA-AAAAT----T--TTTTTAAG-------GAGCA------ATTTGGGTCATT--ATA----A--------------------------AT-----T---------T--TAATTG------------TTAATTGCTCGACTG-AA-ATGG-CTCAT---TAATCAATT--CAAATTTC-ACC-TATGATTC
gi|19 : tgaaaagcagcagaagtgataact-TTAC-CA--------A-AA-G----C------TGT-CG--A--C---ACAAT------CAT----CG---AT------------------GA--CGGATTTTTA--TT-CATC-------A---------AAGAATCATA---------CAA--AT------TAT----T------GT--GG--------------AAGA--GTT---GTC----G--C---TACAG-TG----TATAAC-TA---G-----A-------C--TGTAAGT----T--G-----------AC------TGAGCGAAATTA-A-G------------TC-ACG------CAGCT-----A------A-TC-----AAATTGTTTTAATGAAC----------TCA----CCTA----GG-TCA-ACTTACAAACATGACTGACGA-A-------GATGAAAAC------A------A--A------CA-----AC--TAGAT--T-------------ATTC--CCTT--------T-T-CA-GT-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------AAAAA-------------GG-------GATGA------TTTT---TTGT----TAT--TA--T-ACAG-------AAAAC-A-T--AT------------AA-T--TAA
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gi|20 : ggttaattgTATTAA------CCAA-A-TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--G--C---ACGAT------TAC----TG---AC------------------GA--TGGAGTTTTG--TA-C-TCA------G---------A-------TGAATAATA--CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TAATAC-TA---A-----A-------T--TGAACAC----T--G-----------AT------T------------G-GACGAAACTTATGTC-AGG------CACCT-----A------A-
gi|20 : ccgataaattcatAC----T--CCA---AG-------GAC-A------TTTTTGGGTATT--GTAT--------ATAG-------AAAAC-C-T--GT-----TG---TAGA-T--TAATCGTGATTT-GATTGCTAATCGATCCTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATC--TTGTACGATTTC-AGC-TCCGATTCCCAActccaaggacatttttgggtattgtatatagaaaacctgttgtagattaatcgtgatttgattgctaatcgatcctctgaaatgtccgattaatcttgtacgatttcagctccgattcccaactc
gi|21 : ccgataaattcattattaaccaaattgttacactggcacgattactgacgatggagttttgtactcagatgaataatactaattattgcgtaagagttgttgttcttccttaatactaaattgaacactgattggacgaaacttatgtcaggcacctaATTAAT---CACTGA-A-TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--T--C---ACAAT------TGT----TG---AT------------------AA--TAAAATTTTA--TT-CTTA-------G---------A-------TGACTTATATACTA--AT------TAT----TATACATGT--AT--------------ATGA--GTT---GTT----GTTC---TTC---CT----TATCAC-TA---ACGCTGA-------T--TGGACGA----A--A-----------AT------TA-----------A-G------------TC-AGG------TAACT-----ctc
gi|21 : ttaattgAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGAGTTATT--ACAT--------ATAG-------AAATC-C-T--AT-----TA---TAGA-T--TAATCGCAATTGTAATTGCTAATCGATCGT-TGTAA-ATtactcctgggaccatttcgagttattacatatagaaatcctattatagattaatcgcaattgtaattgctaatcgatcgttgtaaatacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
gi|22 : ttaattgattaatcactgaattgttacactgtcacaattgttgataataaaattttattcttagatgacttatatactaattattatacatgtatatgagttgttgttcttccttatcactaacgctgattggacgaaaattaagtcaggtaacttATTAAT---TGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-T----G------CAC-TG--G--C---A---C------CAT-----------------------------GA--TGGAAGATTGAATG-AAT--------G---------A-------TA---------CTA--GG------TAT----T------GT--GT--------------AATA--GCT---GTT----GTTT---TCC---CT----TATAAA-TA---A-----AACACGGAT--TGGATGA-------A-----------AT------T------------G-G------------TC-AGG------AAGCT-----ACATGTAA-TC-----A-------------AAC----------TCG----CTCT----GG-TCA-ACTTGCGAACATGATGGACAA-A-------G------AT------G------A--AAG----CA-----AA--T------T-------------ACTT--CCTT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAATCAAAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTTGGGT-------TAT--TA--T-ATAG-------AAAacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
gi|23 : atcATTAAT---TGTGAA-A-TTG-TTTC-CAGAAAGTTAA-AA-G----C------TAC-CT--G--C---ACGAT------AAT----TG---ACAATGGATGTTTGTTTGTCGA--TGGATT------------------------------A-------TA---------CTT--AT------TAT----T------GT--GT--------------ATGA--GTT---GTC----ATTT---TTT---CT----TATAAA-T----A-----A-------T--TGAACAC----T--G-----------AT------TTGACAAAAGTTAA-G------------TC-AGG------CATCT-----T------A-TC-----A-------------AAC----------TCC----TCTA----GG-TCA-ACTTAACAAAATG-CTGACAA-A-------G------A
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gi|25 : actaaatt--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-AATTTTTTTTTAAA----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----G--TTT---GG-------GATAA------TTTAGGATTATT--GTAT----------AG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--AAATTGTGATTTT
gi|26 : ttattctgattaattgttacagacgcaatcattgacaaccaatgatttttactaattgagcaatggctgttcttcttgagtgctgattagacaaaattaagtccggcagctaatcaagtAA-A-TTCCTTGC-CA--------A-AA-G----T------CAC-TG--G--C---A-----------------CG---AT------------------CA--TTG-TTTTTG--T---------------------------------------------------------------------GT--GC--------------AAGA--CTT---TTC----GTCC---TTC---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TAGAAAC----T--A-----------A--------------------A-G------------TC-AGA------AAGGT-----A------A-TC-----C-------------AAT------------------ATG----GG-------TTACAAA-------GACGA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----GC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CT-GG-----------GAAACATAA--A-----A-------A------A-----G--------T-------CAGAC----A--CCT---AG-------GTCC-----------------------AT--CA--T-ATAG-------GGAAC-C-T--AC-----TA---TACA-T--TGATCG
gi|27 : gCTA----AG-CCA-CTTTACCAACATGACTGATAA-A-------G------AT------G------A--A------TG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CC------------CACA-AA-----------A----------A-----ATAAAATGA------A-----A--------T-------GAGAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTGAGGTTATT--ATA---TA--C-ATAT-------AAACC-C-TA-ATATCGGTA---TAAA-T--TAATCCCGATTTTAACTGCAAATCGATCATCTG-AA-ATGT-CTGAT---TAAACGTTTA-AAAATTTC-GGC-TCTGATTTCCAA
gi|28 : ----GG-TCA-ACTTACCAACATGACTGATAA-A-------G------ACAAATATG------A--A------CA-----AC--T--------------------A-TTAACCTT--------C-C-CA-GA-----------GTAA-------A-----A-------A------G-----A--------A-------CAGACAT--T--TCT---G---------ACCA------TTTCGGGTTATT--ATGG--T---T-ATAG-------AAACC-C-T--AT-----AA---TAAA-T--TAATCGCAATTTCAATATCTAATCGATCATCTG-CA-ATGT-CTAAT---TAATCAATT--AAAATTTC-TAT-GCCACTTCCC
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gi|3 : ctgataaatcatATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----T------CAT-CG--G--C---ACAAT------CAT----TG---AT------------------GA--TGGACTTTTA--CTACAT--------G---------A-------TGAATAATA--CTT--AT------TAC----T------TT--GT--------------AAGA--GTT---ACC----ATTC---TTA---CT----TATAA-------------A-------T---GAATGC----T--G-----------AT------TGGACAAAAATTAA-G------------TC-AGG------CAGCT-----T------A-TCTGAATA-------------AACC---------TCG----TCTA----GG-CCATA--TGTCAACATGACTGACAA-A-------G------AT------GTAGATTA--A------TG-----AA--T---C--T-------------A-TT--CCTT--------T-C-TA-GGTAAAAAT----A----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--TCT---GG-------CATCA------TTTCAGAATATT--ACAAAATA--T-ATAA-------AAAA---------------A---TAAAAT--TAATCAGGTTTCTTATCATTAATTGATCATCTG-AA-ATTG-ACGAC---AAATTGATT--AAAATTTC-ATC-TTCAATTtg
gi|30 : gttctg--T-------------A-TC--TCTT--------T-C-CA-GG-----------A----------A-----A-------A------A----------------------------------------GA-------AACCA------T--CGTGTTATT--ACA----A----ACCG-------AAAAC-C-T--AT-----AC---TAAA-T--CGATCGCTATTTTAATCATTAAGTGATTGCCT--AA-ATGT-CCGATGATCAATCGATTT-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|31 : tatgccaatcactatatatctcttaggccaatcactataATTAAT---CAAGAC-A-TTA-TTAC-CT--------A-GA-C----C------TGA-TG--A--C---ACAAT------CAT----CG---AT------------------AA--TGGATTTATA--TT-TGTC-------A---------AATTA---TA---------CTA--AT------TAC----T------GT--GT--------------AAAA--GTT---GTC----ATTC---TTC---CTAGAATATTCC-TA---A-----A-------C--TGACCAC----T--G-----------AT------T------------G-G------------AC-Acact
gi|32 : gtttca----------A-----A-------A------A-----G--------T-------CTGGT----T--CCT---GT-------GACCA------TATCAGGCTATT--ATGT--------ACAG-------AAAAC-C-G--AT-----TA---TAAA-C--TAATCATGATTTAAATCCTTAATCAATTGTCTG-AA-TTGT-CTGAT---TAATTAATTA-AAAATTTCAAGC-GCTGGTTCCCAAaaattaagtgtgactgccaattaaa
gi|33 : ttacatgaaaaataTATTATT---TGTAAA-A-TTG-TTAC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TA--G--C---A---TGAT---CAT----CG---AT------------------GC--TGGATTTTTG--TT-TGTC-------G---------A-------TGAATTATA--CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GCT----CTTC---TTC---CT----TATAAC-TT---A----------------TAAACAC----T--G-----------Acac
gi|34 : taat----T--CCT---GT-------GACCA------TTTGGAGTTATT--ATAT--AAA-T-GCGG-------AACAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--GCATCGTGACTGTACTCG--ACTAGAGTGTC---AACATAT-CTGGT---TAATCGATTA-AACACTTT-AGC-TCCAATTCCcaggatgaa
gi|35 : ATTAAT---CACAAA-A-CTG-TTAC-CA--------A-AA---------------------------------------------------------------------------T--ATTTTTA--TT-CGTTTACAAAGA---------A-------TA---------CTT--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---TTT----GTTC---TTC---A-----TATAAC-TA---A-----A-------A--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------ag
gi|36 : aggttaatcaAT---CGCTAG-AGTTG-TTAC-CA--------A---------------------G--G--T---AA--T------CA------G---AC------------------AAATTGGATTT-----------------------------------------------------AT-------AT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GCC----AATC---TT----------TGTAAC-TA---A-----A-------C--TGAACAA----T--G-----------AA------T------------G-G------------TC-Agtaatat
gi|37 : tgttattccgacgc-ATAG-------AAAAC-C-TT-AC-----TA---TAAT-T--TAATCACGATTTTAATCATC-ATAGATCTTCAA-AA-ATGT-CAGAT---TAATCGATTA-TAAATTTT-CAC-TCTGATTGCCAAaattgggtcaggca
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gi|39 : ttgttccaattaatcaatcactagattgc---TAAA-T--TACTCGCGATTTTAGTAGACTGCCGATCGGCT--AA-ATGT-CCGAT---C-GTCGATAA-ATGGTTTT-GGTGTCCGATTCCCAA
gi|4 : cttTTACT---TGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-GCTGCC------CAC-----G--CA--A---T------CAT----CA---AC------------------AG--TGTTTTTTTA--TT-CAGT-------GACATAATTTA-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--GC--------------AAGA--ATTAAAGTTGGAAGTTT---TCC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACAC----A--G-----------AT------T------------G-GACGAAA------TT-AAGAAATTACATCT-----A------A-T------A-------------AAC----------TGG----CCTA----GG-CCA-AT------ACATAACTCACAA-AGATGAATG------AT------G------A--A------CA-----AT--T---T--C-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----AAAT-----T-------CAGAC----A--TCT---GC-------AACCA------TTTCCGGTTA-T--A------A--A-ATAG-------AAAAC-C-T--GT-----TA---TGAA-A--TAATTGCAATTTTAATTGTTAATTGATAGTCAG-AA-ATGT-CAGAT---TAATCAATTC-AATTTTTT-AGC-TCTATTTCCCAAcaa
gi|40 : ATTAAT---TGCCAA-AATTG-TTAC-AA--------A-AA-A----C------TGC-CG--A--CACGA---T------CAT----CG---AT------------------AA--TTGAAGTTTA--TT-TGTC-------G---------G-------TG-----------A--AT------TAT----
gi|41 : gttccgCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----CAGCCAACAC-T----------A---T------CAT----TG---AC------------------AA--AGGATTTTTA--TT-CATC-------T---------A-------TG---------actta
gi|42 : tgttctaatcaattgatttatataag--AT------TAT----C------GT--AT--------------AATG--ATT---GCC----ACAC---ATC---CT----TAAAAC-TA---A-----A-------TGCTGAATG--------G-----------ACAAAAGAA------------A-G------------TC-GGA------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------Aa
gi|43 : AAT---CACGAA-A-TTG-CTTC-CA--------A-AA-C----C------GGC-CG--A--CGCGA---T------CAT----CG---GT------------------GA--TGGATATTCA--TC-CGTC-------A---------A-------
gi|44 : taATCGTTTG-AA-ATGT-TCCAT---TA-TGAATTA-AAACTTTC-AGT-ATAGATTCCCAAcaaa
gi|45 : a-----A-------------AAC----------TTG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTcactgccctccatt
gi|5 : actagtgt-G----C------CAC-AG--G--C---A---TGTACATCAT----TG---AC------------------AA--TGGATGATTG--TT-TGGC-------A---------A-------TGGATTATA--CAA--AT------CAT----G------GT--TT--------------AACA--GTT---GTA----GTTC---TCT---CT----CAAAAG-TC---A-----A-------T--TGAATGCCTATT--GGGCGAAAA---AT------T------------ATG------------CC-AGG------CAGCT-----T------G-TC-----A-------------AAC----------TCT----CTTG----GG-ACA-----------ATGACTTACAA-A-------G------AC------A------A--C------TG-----AC--T---T--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------AGTAACA-------A------AATG--A--------T-------CAGCT----T--CCT---GG-------GACCA------TT--------TT--AAGT--TA--T-AGAA-------AAAAC-C-T--GT-----TA---TAAA-T--TAATTGCGATTTTAATTG-TAATTAATTGCCTG-AC-TTCT-TTAAT---TAATCAATTG-AAAATTTC-AGT-TCCAATTCCC
gi|6 : tctgtatttaatatgtattgcgatgcaagtctTATTAAT---CAATAA-A-TTG-TTGC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---ACCTT------CAT----C----AC------------------TAG-TGGGCCTTTG--TT-TAAT-------GATAAATT--A-------TA---------CTA--ATTACTGATAC----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTT----G--------------------TAAA-TA---A-----A-------T--TGAAGGC----T--G-----------AT------TGG----------A-G------------TC-A---------AGCT-----A------AGTC-----AGGC----------AACA---------TAGGCAACATA----GG-CCA-ACTTACCAAAATGACTGACAA-A-------G------AC------A------A--A------GGTGAAAAC--T---C--T-------------A-TC--CTAT--------G-C-CATGG-----------G----------A-----A-------AATAAAGA-----A--------T-------CCAAC----T--CCA---GG-------GACCAT-----TTTTGGGTTATT--A-----TC--T-ATAG-------AAAAT-C-T--GG-----TA---CGAA-T--TTATTGTGAATTTAATCGTTAATTGATTGTCTG-AA-CTGT-ACAAT---TAATC----A-AAACTTTC-AGC-TACGA-TCCCAAcac
gi|7 : cATTAAT---TGCCAA-A-TTG-TTAT-CC--------A-AA-G----C------AAC-TG--G--CATGA---T------CAT----CG---AT------------------GA--TGGATTTTT---TT-CTTA-------C---------A-------TGAATTATA--CTA--AC------TAT----T------GT--c
gi|7 : gttctgTA--AT------TAT----T------GT--GA--------------AAGA--GTT---TTC----ATTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----tctgtttatgcactgaccctaattattaattattgtgaaagagttttcattcttccttataactaaggccaacttaccaatatgaccaacaaagacaaaagactctatccctttcaagaaaaaaatatgaagttcagattcctgggaaaatttccagttattaaaaatgtatataaataacctattgtaagtaataatggctttaaatgttaattgattatctgaaatgtctgtttaatcaatttagaatttcagcatcaattcccaac
gi|7 : gttctgattaattgccaaattgttatccaaagcaactggcatgatcatcgatgatggatttttttcttacatgaattatactaactattgttctgtttatgcactgaccctaattatA----GG-CCA-ACTTACCAATATGACCAACAA-A-------G------AC------A------A--A------AG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-AA-GA-----------A----------A-----A-------A------A-----ATATGAAGTT-------CAGAT----T--CCT---GG-------GAAAA------TTTCCAGTTATTAAAAATG-TA--T-ATAA-------ATAAC-C-T--AT-----TG---TAAG-TAATAATGGC---TTTAAATGTTAATTGATTATCTG-AA-ATGT-CTGTT---TAATCAATTT-AGAATTTC-AGC-ATCAATTCCCAAggccaacttaccaatatgaccaacaaagacaaaagactctatccctttcaagaaaaaaatatgaagttcagattcctgggaaaatttccagttattaaaaatgtatataaataacctattgtaagtaataatggctttaaatgttaattgattatctgaaatgtctgtttaatcaatttagaatttcagcatcaattcccaac
gi|8 : gttctgattaattgccaaattgttatccaaagcaactggcatgatcatcgatgatggatttttttcttacatgaattatactaactattgttctgtttatgcactgaccctaattattaattattgtgaaagagttttcattcttccttataactaATTCAT---CAACAA-A-TCG-TTAC-CA--------A-AA-A----C------CAC-TG----------------------------------------------------------GAT---------------------A---------A-------TA---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGATTGTT----TT----GTTC---TTCACACT----T----C-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------G-GACGAAACTTAAATC-AAGA-----CAGCC-----C------A-TC-----A-------------AAC----------CTG----TCTA----GG-CCA-ACTTTACAATATGACTGACAATA-------AAAACT-AC------G------A--A------AG-----AC--T---TTGT-------------A-TA--ATTTAGAGACAAT-T-AA-AG-----------A----------A-----A-------A------AAAAAGA--------T-------CTGAC----T--CCT---GG-------GACTATTCTTTTTTCGA--CATT--ATAA--TA--TAAAAG-------AAAAC-G-T---T-----TA---TCAA-T--CATTTGCGATTTTGAAAGTTATAAGGTCGTCTA-AA-AAAA-TTGAT---TAATAAATTT-AGAAATTC-AGC-c
gi|9 : tttcaatttattgTATTAATATACGCAGGGA-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CTTT-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTT---TTG---CT----TGTAAC-TA---A-----A-------T--TGAATGC----T--G-----------AT------T------------G-G------------TC-GGG------CAGCT-----A------A-TG-----A-------------AAC----------TGG----CCTA----TG-CCA-ACTTACCAACATGACTGTCAA-A-------G------AC------A------A--A------TA-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------G-C-CA-GG-----------GTT--------A-----A-------ATGGGG-G-----A--------T-------CAGAC----T--CTT---TG-------GACTA------TTTCAGATTATT--ATAT--TG--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAGA-T--TAATCATGATTTTCATTGTTAATTGATCATATG-AA-ATGTCCCGAT---AAATCGATTC-ATAA-TTC-AGC-TCTGATTCCcgggat
blockSeqs : ATA G G C A GAAAGTTA C A CAGCCAA C GCATGTACAT AAAT GCC CAATGGATGTTTGTTTGTC AT ATTCTTAGATGACTTATATA CA TACTGA AAAC ATACAT GA CAAGTGAATGATAA TT AAA GGAA AAG ACA AGAA A . CGCTG ACACGGA GC CTAT CG AACGGACAAAA AAAAGA GAACAAAAATTAAG T AAATTA . CATGTA G TGAAT AATTGTTTTAATG TATGTTTAAGTCG . . T T GATGAATG AAAGATG AG CAACTCTTTCAAAGATGAAT T AA AGAGACAA T A T TTTTTTTTTAAAAAAAAT ATAT TTA . TTCTTT CA T AA ATAGTT AAATTTC T A AG ATCGG CAT A AA T T C C T GAT G GT A G
blockSeqs : ATA G A . . . . . CTGCC . AAACAAT . . C G ATTCAGTGACATAATTTATA . . . . . . . . . . AG . . . . . . . CG GGCGAAAA . GGATGAAAGTTAAT . A . . . . GGC TATGTTTAAGTCG . . . . GATGAAA AAATATG T GATGCATGACTTG C . . . . . GAAACATAAAAAAAAAT CATT . . T AG T . AAATAT . A A A . . . . T . . . T . A C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . AAACAAT . . T . ATTGGCCAACGAATAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGACGAAAGTTAAG . . . . . . . ATAGGCAA . . . . AAAACT GTAGATT T GGCGATTACTCT . . . . . . GAAACATAAAAAAGT CT . . . CG T . ATAAT . . . T . . . . C . . . T . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . ACACAAT . . C . ATTCATCAAAGAATCATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGATGAAAATTAAG . . . . . . . CTCG . . . . CAAGG A . GGTGAAAACTCT . . . . . . GAGTAACAAAATGAT CT . . . TG T . TAAAT . . . . . . . . C . . . T . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . GCACGAT . . T . GTACTCAGATGAATAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGACGAAAACTAAG . . . . . . . TGG . . . . G G . CAACTAGATT . . . . . . AAAAAATATGAAGTT CT . . . TG A . TGTAT . . . . . . . . T . . . C . A C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . TCACAAT . . C . GTCTGTCAATGAATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGGTGAAAATTATG . . . . . . . TCC . . . . G A . AGACAAACT . . . . . . GAAAAATAAAAAAT TT . . . CT T . ATATA . . . . . . . . T . . . A . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCACGAT . . C . ACTACATGATGAATAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGACGAAACTTATG . . . . . . . TCG . . . . G A . AGACAAACT . . . . . . AAATAAAATGAAAT TT . . . TG T . TTAT . . . . . . . . T . . . A . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCACAAT . . T . GTTTGTCGATGAATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGACAAAAGTTAAG . . . . . . . CAA . . . . G G . TGAATGATT . . . . . . TAAAAATAAAAAAT TT . . . TG T . TTAT . . . . . . . . C . . . T . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . ACACAAT . . T . ATTCGTTTACAAAGAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGACAAAAATTAAG . . . . . . . TCA . . . . G G . AGACTTTGT . . . . . . GTTAAATGGGGGAT CA . . . TT T . TCAT . . . . . . . . T . . . T . A T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCATGAT . . T . TTTTGTCGATAAATCATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGACGAAACTTAAA . . . . . . . TTA . . . . G A . AGCAAATT . . . . . . GAAAAATAAAAAA CT . . . CG C . TCAT . . . . . . . . T . . . C . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . ACACGAT . . C . GTTTGGCAATGGATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAGCGAAATTAAG . . . . . . . TCA . . . . G G . TAACTCA . . . . . . GAAAATAAAGAAT CT . . . TG T . TTAT . . . . . . . . C . . . T . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . ACGCGAT . . C . GTTTAATGATAAATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAAGAAAG . . . . . . . TTG . . . . G A . AGATATT . . . . . . AAAAAAAAAGAT CT . . . CG T . TTAT . . . . . . . . T . . . T . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . GCACCTT . . T . GAAGTCAATGAATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGACGAAA . . . . . . . TCG . . . . G G . TGACTCT . . . . . . GGAAAATAAA CG . . . AG T . TCAT . . . . . . . . A . . . T . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . GCATGAT . . T . TTCTTACATGAATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAAAAA . . . . . . . TCC . . . . G G . TGCCTCT . . . . . . GTAAAAAGAA CA . . . GA T . TTAT . . . . . . . . C . . . C . G C . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . ATCAAT . . C . ATTTGTCAAATTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAAAAA . . . . . . . TGG . . . . G G . CGGCTCT . . . . . . GAAAAAAATT CT . . . CG T . TTGT . . . . . . . . C . . . C . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GTAAT . . T . GTACATCGATGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGAG . . . . . . . TTG . . . . G G . TGACTCT . . . . . . AAAAGAAAT CT . . . CA T . AAT . . . . . . . . C . . . T . A G . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCAAT . . T . GAATGAATGATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . . . . . TCT . . . . G G . TGAATCT . . . . . . GTTAAAT TT . . . CG T . TAT . . . . . . . . C . . . T . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCAT . . T . GTTCTTTGATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . . . . . CTG . . . . G G . CAATTTC . . . . . . GAAAAGT CA . . . CA T . TAC . . . . . . . . C . . . A . A T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . CATT . . C . GCTAGCCGATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . . . . TGG . . . . G A . TGACTTT . . . . . . GAAAAGT TT . . . GG T . GTT . . . . . . . . A . . . C . A T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GAAT . . T . ATTTGTCGGTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . TC . . . . G A . AGACTCT . . . . . . GAAAAAT CT . . . CC T . TCT . . . . . . . . T . . . A . A C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCAT . . C . ATTCATCTATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . T . . . . G A . TAACTCT . . . . . . AAAAT TT . . . TG T . AA . . . . . . . . T . . . C . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCAC . . T . GTTCTTTGATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . G G . CAACT . . . . . . AAAAT CT . . . CC T . T . . . . . . . . C . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCAC . . C . ATTCATCAAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . A . GAAC . . . . . . AAAAA CT . . . CG . . A . . . . . . . . T . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . GCAT . . T . ATTCATCAAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA T . . . CA . . T . . . . . . . . A . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GCA . . C . AACG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . T A . . . A . . T . . . . . . . . T . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . AT . . C . AATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . T . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : *** *** GGACGAAATAAG*************** ***** ************* **** CGACTCT******************************* CT****** *******
originalCons : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------T------------A-G------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C--T-------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
finalCons : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---AC------------------GA--TGGATTTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TTC---CT----TATAAC-TA---A-----A-------T--TGAACGC----T--G-----------AT------TGGACGAAATAAG---------------TC-AGG------CAGCT-----A------A-TC-----A-------------AAC----------TCG----CCTA----GG-CCA-ACTTACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--ACGACTCT-------------------------------A-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGACT------CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--ATAT--TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---TAAA-T--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
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lowQualScore : 444 1 8 8 3 55 88888888 3 2 88888888888 44444444444444444444444 6666 111 33 88 777 5555555555555555555555555555555555555555555555 66 444444 5555 555555 77 33333333333333 77 222 11111 222 2 999 7777 222 3 0 55 88 88888888 4 4 4 66666 333333 888888888888888888888888 7 2222222222 77 3333 5 5 6 88888888888888 4444444444444 66 99999999999999999999999999999999999 1 11 66666666 5 5 5 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 333 3333333 222222 33 2 3 88 88 66666666 2222222 7 7 55 33333 333 3 88 9 4 4 5 6 666 5 33 7 7
consensus : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA--TGGAT--TTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TT-C---CT----TATAAC---TAAATT-GAACGCT--GATTGGA--CGAAA-T-T----A-AGTCAGG-CAGC-T-----A------ATC----------A-------------AA-C----------TCGCCTA----GG-CCAACT-TACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--AT--AT-TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---T-AAAT--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
Reference ( family-1789 ) : TATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA--TGGAT--TTTTG--TT-CGTC-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GT--GT--------------AAGA--GTT---GTC----GTTC---TT-C---CT----TATAAC---TAAATT-GAACGCT--GATTGGA--CGAAA---T----A-AGTCAGG-CAGC-T-----A------ATC----------A-------------AA-C----------TCGCCTA----GG-CCAACT-TACCAACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A------CG-----AC--T---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------T-------CAGAC----T--CCT---GG-------GACCA------TTTCGGGTTATT--AT--AT-TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AT-----TA---T-AAAT--TAATCGCGATTTTAATCGTTAATCGATCGTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATCGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|1 : TATCAAT---CGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AG-G----C------CGC-TGAAG--CA--A---T------CAT----CA---ATGG--TGGAT--TTTTG--TT-CGTT-------GACAAATT--A-------TA---------CTT--TT------TAC----T------GT--AT--------------AAGA--GTT---GTC-----TTA---TTGG---TT----TATAACTATTAAAAC-GAATACT--GATTGGA--TGAAA---T----CTAGTCAGG-CAGC-TTTTCAA------ATTGTGTGTTAAAG-------------AA-T----------TCACCCATGTTGGTCCAAGT-T---AACATGACTGACAA-A-------G------AC------G------A--A-------G-----AC----------------------------------------------AA-----------G----------T-----A-------A------A-----A--------T-------CA-ACAATAT--CC----GGCATTACTGACCA------TTTCTGG-------AT--AT-TA--T-GTAG-------AAAAT-T-T--TC-----TG---T-AAAT--TAATCACATTTTTAGTTATT-ATTAATCGTCTG-AA-ATGG-CTGA----TAATTGATTA-AAAATTTC-AGC-TCCGATTCCCAA
gi|10 : tttcTATTAATATACGCAGGGA-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAC-TG--G--C---A---T------CAT----CG---ACGA--TGGAT--TTTTG--TT-CTTT-------G---------A-------TG---------CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GTT----GTTT---TT-G---CT----TGTAAC---TAAATT-GAATGCT--GATT--------------------AGTCAGG-CAGC-T-----A------ATG----------A-------------AA-C----------TGGCCTA----TG-CCAACT-TACCAGCATGACTGTCAA-A-------G------AC------A------A--A------TA-----AC--T---C-------------AA-TC--CCTT--------G-C-CA-GG-----------G----------T-----T-------A------A-----A--------T-------CAGGC----T--CCT---TG-------GACTA------TTTCAGATTATT--AT--AT-TA--T-ATAG-------AAAAC-C-T--AC-----TA---C-AAAT--TAATCACGATTTTCATTGTTAATTGATCATATG-AA-ATGG-CTGAT---AAATCGATTC-ATAA-TTC-AGC-TCTGATTCCTAAca
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gi|15 : ttgtaccgATTAAT---CGCCAA-A-TTG-TTTC-TA--------A-AA-G----C------CAG-TG--AAAC---AA--T------CAT----CG---GCAT--TGGAG--TTTTA--TT-CATC-------A---------A-------C------------A--A--------AC----T------TT--GT--------------AATA---TT----TC----TTAC---TT-C---TT----TATAAT---GATATT-GAATTTTCGGATTGGA------A--------A-AATCCGA-AAGC-T-----A------ATC----------A-------------AA-TTATGTTTAAGTCGCCTA----GA-CCAATT-TACCAACGTGAGTGACAA----------------AC------G------AT-A------AG-----ACAAA---C-------------TA-TC--CCTT--------T-C-CA-AT-----------G----------A-----A-------A------A-----G--------T-------AATA-----------------------GACTA------TTTTGGGT-------T--AT-CA--T-AGAG-------AGAAT-CAT--AC-----TA---T-ACAT--AAATCACGATTTTAATTGTTAATCCATCATCTG-AA-ATGT-TATAT---TGAT
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gi|18 : aatacctgaattatacG---ATGA--TGGAT--TTTTA--TT-GGCC-------A---------A-------CGAATAATA--CTA--AT------TAT----T------GC--GT--------------AAGA--GTT---GCT----GTTC---TT-C---CT----TGAAAC---TAAATT-GAACGCT--GATCGGA--CGAAAAC-T----A-AGTCTGG-CAGC-T-----A------ATC----------A-------------AA-A----------T--TTTA----TG---AACT-CACCAACATAACTGGCAG-A-------G------AT------G------A--A------GA-----AC---------------------A-------GT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAA-AAAAT----T--TTTTTAAG-------GAGCA------ATTTGGGTCATT--AT--A---A--------------------------AT-----T---------T--TAATTG------------TTAATTGCTCGACTG-AA-ATGG-CTCAT---TAATCAATT--CAAATTTC-ACC-TATGATTC
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gi|20 : ccgataaattcatAC----T--CCA---AG-------GAC-A------TTTTTGGGTATT--GT--AT-------ATAG-------AAAAC-C-T--GT-----TG---T-AGAT--TAATCGTGATTT-GATTGCTAATCGATCCTCTG-AA-ATGT-CCGAT---TAATC--TTGTACGATTTC-AGC-TCCGATTCCCAActccaaggacatttttgggtattgtatatagaaaacctgttgtagattaatcgtgatttgattgctaatcgatcctctgaaatgtccgattaatcttgtacgatttcagctccgattcccaactc
gi|21 : ccgataaattcattattaaccaaattgttacactggcacgattactgacgatggagttttgtactcagatgaataatactaattattgcgtaagagttgttgttcttccttaatactaaattgaacactgattggacgaaacttatgtcaggcacctaATTAAT---CACTGA-A-TTG-TTAC-----------------------------AC-TG--T--C---ACAAT------TGT----TG---ATAA--TAAAA--TTTTA--TT-CTTA-------G---------A-------TGACTTATATACTA--AT------TAT----TATACATGT--AT--------------ATGA--GTT---GTT----GTTC---TT-C---CT----TATCAC---T-------AACGCT--GATTGGA--CGAAAAT-T----A-AGTCAGG-TAAC-T-----ctc
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gi|22 : ttaattgattaatcactgaattgttacactgtcacaattgttgataataaaattttattcttagatgacttatatactaattattatacatgtatatgagttgttgttcttccttatcactaacgctgattggacgaaaattaagtcaggtaacttATTAAT---TGCCAA-A-TTG-TTAC-CA--------A-AA-T----G------CAC-TG--G--C---A---C------CAT-----------GA--TGGAA--GATTGAATG-AAT--------G---------A-------TA---------CTA--GG------TAT----T------GT--GT--------------AATA--GCT---GTT----GTTT---TC-C---CT----TATAAA---TAAA-----ACACG--GATTGGA--TGAAA---T----T-GGTCAGG-AAGC-T-----ACATGTAATC----------A-------------AA-C----------TCGCTCT----GG-TCAACT-TGCGAACATGATGGACAA-A-------G------AT------G------A--AAG----CA-----AA--T-----------------TACTT--CCTT--------T-T-CA-GG-----------G----------A-----A-------A------A-----A--------TAAAAAATCAAAC----T--CCT---GG-------GACCT------TTTTGGGT-------T--AT-TA--T-ATAG-------AAAacaatattttctcactaatcatttttttttttatt
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