lowQualScore : 1111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 222 333333333333333333 1 1111 1111 111 222222 1111 111 33333333333333333333 11111 111 333333333333 5555555555555555555555555555555 1 1111111111 3333333333333333333333 111 1 11111111 1 111111 111 22222222222222222222 33 11 44444444444444444444444 11111111111 22222222222222222222222222 3333 111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777 1111111111 3333333333333333333333333333333333 2222222222222 2222 222 1 111111 11111111 1 333333333333 11111 1111 2222 9999999999999999999999999999999999999999 222222222 111 44444444444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 2 555555
lowQualScore : 1 1 3 3 6666 1 0 0 000 99999 0 3 3 88 2 3 888888888888888888 44 44 3 3 3 7777 7 7777 44 2 111 0 6666666 666666 1111 222 33 2 88888888888888888888 555 99999 000 444444444444 7 33 4444444444444444444444444444444 3 3 0 1111111111 3 4 3 3 666 5555555555555555555555 4 222 0 3 3 88888888 2 2 777777 77 666 5 5 33333333333333333333 777 4 4 66 4 99 3 66 4 66 33 77 3 44444444444444444444444 00000000000 99999999999999999999999999 1111 4 000 2 4 777 222222 777 6666666666666666666666666666666666666666666 66 6 5 9999999999 4444444444444444444444444444444444 2 44 3 2 0000000000000 555 4444 0 1 111 666 4 55 7777 1 888888 3 4 55555555 1 3 5 5 3 5 3 3 777777777777 66666 55 1111 33 55 55 2 0 6 1111 5 66 2 6 5555555555555555555555555555555555555555 999999999 2 4 000 55 4 00000000000 55 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 99 55 7 5 6 000000 9 6
lowQualScore : . . . . .... . . . ... ..... . . . .. . . .................. .. .. . . . .... . .... .. . ... . ....... ...... .... ... .. . .................... ... ..... ... ............ . .. ............................... . . . .......... . . . . ... ...................... . ... . . . ........ . . ...... .. ... . . .................... ... . . .. . .. . .. . .. .. .. . ....................... ........... .......................... .... . ... . . ... ...... ... ........................................... .. . . .......... .................................. . .. . . ............. ... .... . . ... ... . .. .... . ...... . . ........ . . . . . . . . ............ ..... .. .... .. .. .. . . . .... . .. . . ........................................ ......... . . ... .. . ........... .. ................................................................................... . .. .. . . . ...... . .
lowQualScore : 9 1 0 1 5555 4 5 7 222 11111 2 6 6 99 0 8 555555555555555555 66 66 3 8 3 3333 3 6666 88 9 333 8 3333333 444444 1111 222 66 9 44444444444444444444 000 44444 222 333333333333 4 88 7777777777777777777777777777777 6 6 5 4444444444 6 9 6 6 444 7777777777777777777777 4 888 1 4 9 33333333 9 0 999999 66 444 0 5 99999999999999999999 888 4 4 11 1 99 9 11 7 44 33 66 0 66666666666666666666666 99999999999 55555555555555555555555555 1111 4 000 7 4 888 888888 888 2222222222222222222222222222222222222222222 11 4 2 4444444444 8888888888888888888888888888888888 3 22 1 7 2222222222222 444 5555 7 1 444 444 2 55 7777 5 111111 6 6 00000000 9 3 5 4 3 7 3 4 555555555555 88888 00 4444 22 55 55 6 2 0 1111 0 99 5 0 8888888888888888888888888888888888888888 777777777 2 2 222 55 0 22222222222 55 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 55 88 5 0 7 000000 0 0
consensus : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAAAT----ATCGAATTAATGCAGGATACCAT-T-AA-----AGT-AG-TTTGTGTTGCGGAATA---T--ATTACG--C--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AATTCN-ATCCATATCT--AATGTCCACATTGTGTTTCAAT-ATC-TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAA-GGG----AGG---------TAATG---TCCG----ATGGACNCTTCC--TN-TGA-NT-TTTGAAA-TAG-CTTCA---A---GTCA--G--A---C-A--GTG-T-TTTTGAAAAT-------ATAA-TTGG-AAAA-C---AAT-------NTAAAT---------TTGAAAAA-AAT-ATATCACCATGCAAATTA---CC---TCCTTCTGTAAAC-----CTGATTCATTCAGTTTCCAA-CTGACGAAA-NTTTG-AANTNT-------TTCG---GAG-GGGTT-AAA--TATTCATGAGCTCACG--GGCCAGTAACGTA-GGAAAACAGGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGC---------------------TTATGGT--GTTA-ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAAG-GATGGAAT-TATT--CATCC-T---GT------ACT---AT--------ATA------TA--TNANGTA--C----AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT--------CGNA--GATCCATGTCGTTATCATTT-ACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT----TGAC-G---ACAAG---AATA-CA-GGTGTTAGGATAACATCTG--TTTTAA-GA----TTATCGA---GTATG-ATCTATAAAA-GT---NTATTA-ACAAGTATTAACAC-TGTGC-AAATATATAACCGCACCAAAGA--T------AATC-----A--AAC----TTTCAA--T--CACCAACAATGGCCTGTGTN--A-AGT--ACNTCAGGAGGT-TTTNGATACCAA-T--TCAGA-CAA---AAN-------CTGGCATAATCTNTCT-TAATTTATAATGTACAATTN--TT--TCATC-AA----TA----TTGTTCTCT--C------------------TCCT--CATN---NG------------C-----TT-------------------TTTT-----A-CATTGACT-AAACCCTTTT--ATGTCTGATTCGCAAAAC---TAATTTTGTTATGT
Reference ( gi|1 ) : TATTGCTGTGTATGTGTTTGACTTCAACT----ATTGAATTAATGCAGGATACCAT-A-AA-----AAT-AG-TTAGTGCTGTGGAATA---T--AT-ATG--C--A--T--GGGCTGATAATTGAATGATGTATA-AATTTA-ATCAATATAT--AATGTTCACATTGTGTTTCAAT-ATC-TGATACATATTTATAAT----A--CTG----AATTCT----CTACCTGGGTATTAAA-GAA----AAT---------TTATG---TCCC----ATGGACCCTTCC--TG-TGA-TT-TTTGAAA-TAG-TTCCA---A---ATCA--G--A---A-A--GTG-T-TTTGGAAAATAAAAAAAATTA-TTAG-AAAA-C---AAT-------GTAGAT---------TTGAAAAA-AAT-ATATCACCATCCAAATTA---TC---TCCTTCTTTAAAA-----CTGATTCATTCAGTTTTCTA-CTGATGAAA-CTTTG-AATTTT-------TTTA---GAA-GGGTT-AAA--TATTTATGAGCTCACATTGACCAGTAATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAAAAGCATGGTAAACATGC---------------------TTATGGT--ATTA-ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTAAAAAATGATGGAAT-TATT--TATTC-T---GT------ACT---AT--------ATA------T---T-------------AC------AGT--AGATTTGA----------TAAAA------------------CT--------CATA--GATCCATGTTGTTATCATTC-ACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT----TGAC-G---ACAAG---AATA-AC-GGTGTTAGGA-AACATCTG--TTGTAA-GA----TTATCGA---GTGTG-ATCTATAAAA-GT---ATATTA-ATAAGTATTGACAC-TATGC-AAATATATAACGACACCAAAGG--A------AATC-----A--AAC----TTTCAA--T--CACCAATAATAGCCTGTGCT--A-AGT--ACCTCGGGAGGTATTTAGATACCAATT--TCAGATCAA---AAT-------TTGGCATAATTTTTTTATAATTTATAATGTACGATTG--TT--TCATC-AA----TAA---TTGTTCTCT--C------------------TTCT--CATA---AG------------C-----TT-------------------TTTT-----A-CATTGACT-AAACACTTTT--ATGTTTGATTTGC-AAAC---T--TTTTTTTGTGTT
gi|9 : ATTAATGTTGATGCGTTTGACTTAAAAA----ATCAAATTAATACAGGGTAC-AT-A-TATCATTAAT-AG-T-AGATTTGCGTAATA---T--AC-ATGTGC--A--T--GAACTGATAATTGAATGACGTTTA-AAATCT-ATCCATACCT--TATGTCCAAATGTTATTTCATT-ATC-AGA-ACATATTTATAAT----A--CTG----GTTACT----CTACCAGGGTATAAAACGGA----GGTCCAGAGCTGTAATG---TCCG----ATGAATGGTTCC--CGTTGA-AT-TTTGAAA-CAGATTTCA---A---GTCA--G--GGATA-A--TTG-T-TTT-GAAAAT-------ATAA-CTGA-AGAA-T---AAT--------TGCAT---------TTGACCAA-AA--ATACCACCATGCAAATTA---GC---TGCTCCTGTATAC-----CTAATTCAT----TTTTCCAGCTGAAGAAA-ATTCG-AA--AT-------TTTG---AAA-GGGAT-TAT--TATTCTCGAGATCACG-TGGTCAGTAATGTT-AGAAACTAGTCTGACCCAGAAAGCGCATGGCAAACATAA---------------------TTAT
gi|22 : atggtattttacttaaaTTGCTTTGTATGCGTTTAACTTCAAAT----ATTGAATTAATGCAGGATACCAT-T-AG-----ATT-AG-TTAGTGCTATGGAATA---T--GT-ATG--CGCA--T--GGACTGACGATTAAATGGTGTCTA-AATTCT-ACCAATAGCT--AATGTTCACATTGTGTTTCAAT-ATC-TAATACATATTTATAAT----A--TTGTTTTTTTTTT----CTACCTGGGTATTAAA-GAG----AGG---------CAATG---TCTT----ATAGACGGTTCC--CA-TGATTT-TTTGAAA-TAG-TTCC
gi|24 : TTGCTTTGAATACATTGGACTTGAAAT----ATCGAA------------ACCAT-TTAA-----AAT-AG-TATGTGTTGCTGAATA---TTGAT-GCG--C--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AATCTA--TCAATAT---------------TGTGTTTCAAT-ATA-TAATACATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAA-GGG----AGG---------TAATG---TCCG----GTGGAC
gi|26 : cggtattTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAAAT----ATCGAA------------ACCATTA-AA-----AAT-AG-TGTGTGTTGCTGAATA---TTGAT-GCG--C--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AATCTA--TCAATAT---------------TGTGTTTCAAT-ATA-TAATATATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAA-GGG----AGG---------TAATGGATTCCA----ATGGAgattc
gi|15 : TACTTTGTATGTGTTTGACTTCAAAT----ATCAAATAAATGTAGGATACCTT-T-AA-----AATTAA-TTTGTGTTGTGGAATAGT-T--AT-GCA--C--A--T--GGACTGATAATTAAATGATACCTT-AATTC---TCCTTATGTCCAATGTCAACATTGTGTTTCAAT-ATA-TAACACATATTTATGAT----A--CTG----GTTTCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----NNN---------NNNNN---NNNN----NNNNNNNNNNNN--NN-NNN-NN-NNNNNNN-NNN-NNNNN---N---NNNN--N--N---C-A--ATG-TGTTTG----AT----AAGATAA-TTGG-TAAA-C---ATT-------TTTAGT---------TTAAAAA------ATATCACCATGCAAATTACACTCAGGTCCTTTTATAAtttt
gi|37 : tagtcTGCTTCGTATACGTTTGGCTTCCAAT----ATCGAATTAACGTAGGATA
gi|35 : gtactcTGCTTTGTATACGTTTTACTTGAAAT----ATC-AATTAATGCAG--TACCAT-
gi|39 : tatattcTGCTTTGCATGCGTTTAACTTCAGAT----ATTGAATGAATGC
gi|13 : tcGTATTCGTTTGAATGCAACTGAATACTAAATTAATGCAGGAAACAATTA-AA-----GGA-AG-TTTGTGTTGCGGAA-AGGTT--AC-GCG--C--A--T--GGATTGATAATTGAATG--GTTGA-AATATATATCTATATTT--AATGTCCACAGTGTGTTTCATT-ATC------CACATTTGCAAT----A--CTG----GATACT----TTGTTTGGGTAATAAA-GGGGTGTAAT---------GTACG---TTTG----GTGGATCCTTA-------GA-GT-TTTGAAA-CAG-------------------G--A---ACA--GTA-T-CTTTGACAATAAAA---------CAG-AAAAGC---AAT-------TTTAGT---------TTGGAAAA-A---ATACCATCGTGC-AATTA--------ACCTTCTCCAAAGTGGACCTGATTCATTCAATTTCAAA-CTGACGAAC-ATTTGAAATTAT-------TTTA---ACATTGACT-AAACCTATTTA
gi|2 : GTATT--ACTTCAAAT----ATTGAATTTATGCAAGATACCAT-T-AA-----AGT-AG-TCATTACTTTGTAATA---T--TTTAT---C--A--T--GGACTGATAATTAAATGGAGTCTA-CATTCT-ATCAAAACCT--AATGTTCACGTTGT-TTTCAAT-ATC-TAATACATATTTACAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTACTAAA-GGG----AGG---------TAATG---TCCG----ATAGACGGTTCCCATG-TG--TT-TTT-AAA-TAG-TTTCA---A---CACA--G--G---A-ACAGTG-T-TTTGGAAAATA--------TA-TAAGGAAAA-C---AAT-------TTTAAT---------TTGAAAAA-AAA-A-ATTACCATGCAAGTTA---CC---TCCTG---TATAC-----CTGATACGTTCAGTGTCCAA-CTGACAAAA-CTGTG-ATTTTT-------TTCG---GAA-GGGTTTAAA--TATTCATGATCTCACAT-GGCCAGTTATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAACCGCATGACAAACGTGC---------------------TCATTGT--ATCA-ATTTAGCAATTTACT--TTTT-----------GTTGAAAAA-GACTGAAT-TATTCACATTG-T---AT------ACT---CC--------A--------------------------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAGA------------------CT--------GTTA--GATCCATGTCGTTACCATTC-ACTGC------TGGTAGTAACTAT----TGAC-G---ACAA----AATA-ACAGGTGTTAGAC-AACATCTG--TTTAAA-GA----TTAACGA---ATATG-TTCCATAAAA--T---ATATAA-ATAAGTATTAACCC-TGTTC-AAATAAATAACAGCACCAA--G--AT-----AATC-----A--AAC----TTTTTA--G--CACCAACAATGACCTCTGTTAAA-AGT--ACCTCAGGAG------AG-------------------A---AAT-------TTGGCATAATCTTTCTCTAATTAATAATGTACAATTG--TT--TCACC-AA----TA-----TGTTCTCT--C------------------TCTT--TATC---AG------------A-----TT-------------------GTCT-----A--ATT
gi|10 : TTGACTTCAAAT----ATCGAAATAATGCAGGAAATCAT-T-AA-----AGT-AG-CTTGTGTTGTCGAAT----T--ATTATG--CTCA--T--CGACTCATAATTGAATGACGCCTA-AATTCA-AGCCATATCT--AATGTCTACATTATGTTTCAAT-AAC-GTATACAT-----------------------AATTCT----CTA---G-----TAAA-GGG----AGG---------TAATG---TCCG----ATGGGTTCTTCC--TC-TG-------TAAAT-TAG-CT-------------A--G--A---C-A--GTG-T-TTTTGAAAAT-------ATAA-TTTG-AAAA-C---AATTTAATG-GTAGAT---------TGGTAGTA-AGT-AT
gi|3 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTTCAAAT----ATCGAATCAGTGCAGGAAACCAT-T-AA-----AGT-AG-TTTGTGTTGTCGAAT----T--ATTATG--CCCA--TTAAAAC--ATAGTTGAATGATGTCTA-AATTCT-ATCCATATCT--AATGTCCATATTATGTTTCAAT-AAC-GTATACATAT-----------------------TTCT----CTA-------GTCAAG-GGA----GGT---------AT-TG---TCTG----ATGGGCTCTTCC--TC-TG-------TAAAT-TAG-CT-------------A--G--A---C-A--GTG-T-TTTTGAAAAT-------ATAA-TTTG-AAAA-C---AATTTGAATGGTAGAT---------Ttgacaataatacagatggtagaataacatcttatttgaaattaccgaatatgatctgtgttaagt
gi|20 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCAAAT----ATCAATTTAATGCAGGATACCAT-T-AA-----GAT-AAATTA-TGCT----------------------C--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTT-AATTAA-ATCCATATGT--AATGTGAACACTAAATTTCAAT-AACGTTA-ACATATTCATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTA-------AACAAA-GGA----GG----------TAATG---TCCG----ATGGG---TTAA--T--TAA-TG-TT--AAATTAG-CTTTAC--G---GTCAGGG--A---C-A--GTG-T-TTTTTAAAAT----ATAACTG-TTAA-ACAA-TTTAAATG------GTAGGTTGGTAGTAGTTAATAAA-AATAATATTGGCGTTAGGA-TA---TC---ACCTTATTTGAAA-----ggtagtaattattgacaataatacaggtgttagaataacattttatttgaaattatcaaatatgatctattaagtttaatattaacaagtataaacactgtgcaaatatataatcacactaaagataatctttcaatcaaaggtttaatcatcagcactggcccgtgtaaaatacatcaggaggttttcgataccaagttagcataatttatctaatttataatgtacaattctttcatcaatatgttcgctctcctcatatgagtaatttccattccttccggcgtcatttttctgacattgacttaatttttttcatgtctgattcgcaaaaccggttttgttatgtccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|6 : ATGCAAGATACCAT-T-AA-----AGT-AG-TTTGTGTTGTCGAAT----T--GTTATG--CTCA--T--GGACTGATAATTGAATGATTTCTATAATTT--ATCCATCTAC--TATATCTACATTATGTTTCAAT-AAC-GTATACATATTTATAAT----A--CTG----GTGTCT----CTA-------A-TAAA-GGG----AGG---------TTATG---TCCG----AAGGGTTCCTCC--TT-TGA-AT-TTT-AAT-TAGCCTTCA---A---GTCAGTG--A---C-A--GTGTT-TTTTGAAAAT-------ATAA-CTTG-AACA-C---AAT-------TTAAAT---------
gi|12 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTGTAGAATT---T--TTTATG--C--ACAT--GGACTGATAATTAAATGGTGTCTA-AATTAT-ATCTATATCC--AATGTCCACATTGTGTTTCAATGACG-TG-TACATATTCATACT----T--CTG----GTTACT----CTACAACGGTAATAAG-GGG----AGG---------TAATG---TCCG----ATGGCTTCTTCC--TC-TGA-AT-TTTGTAT-AAG-CTTTATTGACTTATCAGGG--A---A-A--GTG-T-TTTTGAAAAT-------ATAA-CTGG-CAAA-C---AAT-------TTCAAT---------TTTAAAAATAAT-GCCTCA--ATGCAAATTA---AC---TTCTCGTGT--AA-----CTGA--CATTggtagattggtagtaataaatgacacgaatacatgtgttaggataacatctttttgaaatgatcgaaaatgatctattaagttttataacaaatattaacactgtgcaaatatataagcacaataaagataaccttccaaacagtgttacaatcaccaatactgacctgtgttaagtacatcaggaggttttcgataccaggc
gi|4 : atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaaatattgaatgga--AAAGTTCATATTATGTTTCAAT-ATC-TAATACATATTTATAAT----A--TTG----TTTTTTTTT-CTACCTGGGTATTAGA-GGG----AGG---------TAATG---TCCG----ATAGACGGTTCC--CA--AA-TTGTTTTAAA-TAG-TTTCA---A---GTCA--G--G---A-ACAGTG-T-TTTGAAAAGTA-------TTA-TTGG-AAAA-C---AAT-------CTAAAT---------CTGGAAAA-GAA-ATATCATCATGCAAATCA---CC---TCCTTCTATAAAC-----CTGATTCATTCAGTTTCCAA-TTAACGAAA-C--------TTT-------TTCA---GAA-GGGTT-AAA--TATGCATGAGCTCA----GA--A--AGCGCATGGAAAACGTGCT-------------TATGG------------------------------------T--ATTT-ATTTAGCAATATACT--TTTT-----------GCTAAAAAA-GTTTGAAT-TATT--TACCC-T---GT------ACT---TT--------ATA------T---TAATGTAAGTTCCAAC------AGT--AAATTTAA----------TACAA------------------CT--------CATA--GTCCCATGTCGTTATCATTC-ACTGC-T-GATTTGTAGTAACAAT----TAAC-G---ACAAG---GATA-ttt
gi|5 : tatataaagagcactttgaaatcAAT-ATT-TAATACATATTTATAATTATGATTCTG----GTTTCT----CTACACCGGTTTTAAA-AGA----AGG---------TTATG---TCCGGTAGATGGTCTCTTCA------G-----TTTAAAA-TAGCTTTTA---A---GTCA--GGGA---C-A--GGG-T-TTTTGAAAATA--------TAGCTGG-AAAA-C---AAA-------ACA-AT---------TCGAAAAA-AAT-AC--CACCATGCAAATTA---CC---TTCTTCAATAAAC-----CTGGTGCATTC-GTTTCCAA-CTG-CAAAA-----A-AATTGTAGAAAAGTACA---GAG-AGGTG-AAA--TATCCATGAACTCACG-TGGCCAGTAACGTA-TG-AAACAGGCTAACTCAGAAAGAGCATGTGAAACATGCTTGCTTGTATAGAAGAAATTTTTGTGGTAAATGATATTAAGCAATTTTTT--TTTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAGG-AATGGAAT-GATT--CATCC-T---GT------ACT---AT--------ATA------A---TCACGTACACTCCAAC------AGT--AGATTTAACAACAGTTACTAAAATGTTTTATGTTGATAAAACT--------CAAA--GATTTATGGTTTTATAATTC-AATAC-C-GATTGTTAGTAATAAT----T----G---ACAAG---AATA-CA-GGTAT----A-AA-ATCTG--TTTTAA-GA----TTATCGA---GGATG-ATCTAT-AAA-GT---GTATTA-ACAAATATTAACAC-TGTGC-AAcatctataacgtttattattaagtactaatactgtgcaaatatataaccgcaccaaagataatcatactttaaatcaccaacaatgacctgagttaagtacacctcaggaggtttttagatatcaattcaaaaaaaaaattggcataatctatttctaattcaatatgcataagatttgctttttaacattgactgaacccttttatgtctgattcacaaaa
gi|19 : atatattcatatctgatgacaC---TGCTGCTGTGAAC-----CGGGTTCATT---TTTTAAA-CGAATTAAA-CTTTG-ACATCT-------TTTG---GAG-GGGTT-AAA--T
gi|17 : aagaaaaatgg-----CTGATTCATTCATTTTGCAA-CTAACGAAA-ATTTT-AAATAT-------TTCG---GAG-GGGTT-AAC--TATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTAT---------------------TTATGGT--GTT--------CA------------T-----------G-TAAAAACGGATGGAAT-TATT--CAACC-T---GT------ACT---ATA-------ATA------TAGATATATAATTCA---AC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT--------CGAA--GATCCATGTCGCTATCTTTT-ACTAC-T-GATTGGTAGTAACAAC----TGAC-G---ACAAG---AAtgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaatacacgtgtaataacaagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|16 : agacaggaacagtgttttttaaaaactataactggaaaacaattgatttac-----CTGATTCATTCATTTTGCAA-CTAACGAAA-ATTTT-AAATAT-------TTCG---GAG-GGGTT-AAC--TATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTAT---------------------TTATGGT--GTTA---------------------T-----------G-TAAAAACGGATGGAAT-TATT--CAACC-T---GT------ACT---ATA-------ATA------TAGATATATAATTCA---AC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT--------CAAA--GATCCATGTCGCTATCTTTT-ACTAC-T-GATTGGTAGTAGCAAC----T
gi|7 : gaaatagctataaagacaggaaaagtgttttttaaaaaaaaaataactggaaaacaattgatttacAAATCTTTG-A-TTTT-------TTTATCGGAA-GGGTT-AAA--TATTCATGAGCTCACAC-GGCTAGTAATGAA-GGAAAACATGCTATCTCAGAAAGCGCATGGTAAATGTGC---------------------TTATGGT--TTTG-ATTTAGGAATTTATT--TTGT-----------CTTGAAAAG-GATGGAAA-AATT--AATCC-T---GT------ACT---AT--------ATAGTGATGTA--T-------------ACTGGAAAAGA--AAATTTAA----------TAAAA------------------CT--------CATA--GATTCATGTCGTTATCATTC-ACTGC-T-GATTGGTAGGAACAAT----TGAC-G---ACAAG---AATA-CA-GGTGTAAGGC-AACATCTG--TTTTAA-GA----TTATCGA---GTATG-ATCTAT-AAA-GT---ATACCA-ATAAGTATTAGCGC-TGTGC-AGATATATAACCGCAGCAAAGA--T------AATC-----C--AAC----TTGCAA--TGGTATCAATA
gi|8 : a---------------------TTGTGGT--A--A-ATTTAACAAGTT-TTGATTTG-----------GTTCAAGGGT-ATGGAGT-TATT--CATCC-T---AT------ACT---AT--------ATA------T---TGATGTATACTCCAAC------AGT--AGATTTGA----------TAAGA------------------CT--------C---------CACGTT---ATCATTT-ACTACCT-GTTTGGTAGTATTAAT------ATTG---TCAAG---AATA-AA-AATGTAAGGATAACATCTG--TTTTAA-GA----TT---GA---GAATT-ATTTATAAA--GT---TTATTA-A---GTAGTAACAT-TGTGC-AAATATATAACCATAT----------------ATC-----G--AAC----TTTAAA--T--CATTTGAAATGGCCTGTG-T--ATAGT--ACCTAAGGAGGGTTTTGGATAACTAGA--CCTGATCGAGTTAATACAGAAGCTAGTTTAATCTCTTT----TCTATAATGTACAACTGGTTT--CCACCTCA----TAGGTTTTGCTTTCT--TAATATATGGATTATTTGATTCT--TGTA---GG------------CATTCATT-------------------TTTT-----AGCAATGACTAAAACA-TTTG--A----TGATGGGCAAAAC---TAATTTTGTTATGTtcaattttagaataaaacttggcatgatatatctgtaatttaaaatgaacaattttttcatcaatatgttctctctcctcttcagatttactttttaacattgactaaacccttttatgtctgattcgcaaaactagttttttttatgtcgtgttt
gi|19 : acaagacaTATAAT--GTTA-ATAAAGCAAATTAGT--TTTG-----------GCTAAAG------GGAATATACT--TATTCATCAAAT------ACT---ATTCATTGACATA------TAA-TCCA----------AC------AGT--A---TCAT----------TAAAA------------------CT--------AGAA--GTTGCATGGTGTTATTTTTTTATTAC-T-GATTGGTAGTAACAATATTCTCAC-GAATACACGTGTAATA-ACAAGTATTAACA-AAcgctttt
gi|28 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaataGGTGGAAT-TATT--CATCC-T---GTTTTAGTACTTGTAC--------ATA------T---TGATGTAAA-----ACCCGAA-AGTGAAAATT--A----------TAAAA------------------CTAAATGTTCCATGTTATTCCATGTTGTTATCATTT-ACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT----TGTA-T---ATAAG---AATgcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|38 : ggttgaaggtgTCTATGTTGTTATCATTT-ACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT----Tgt
gi|11 : atCACGTTGTTATCACTT-GTAAC-T-AATTGATAGTAAAAAT---------G---ACAAG---AGTACAC-G-TCCTA---------CT------TAA-GA----TTCTCGA---GTTTG-ATCTATAAAG-GT----TATCA-AAAAGTATTAGCAT-TGTGC-AATTATATAACCACCCCAA-----A------AAT------A--ATC----TTTCAATTT--CATCAGTA
gi|14 : tTTGTTATCATTT-ACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT----TGTA-T---ATAAG---AA--------TGTTAGG----CATCTGTATTATAA--A----T-----A---ATATG-ATAAATAAAG-TT---ACTTTA-ACTAATATTTCGAC-TGTGCAAAATATATCACATCATCACAGA--C------ACTA-----A--AAC----TT------T--TACCAACCATGGCCTGTGTA--A-AGT--ACCTCAGGCGG-ATTTGGATACC--TTGACCTGACC-----AAT-------CTGGCATAATCTCTCT----TTTATTATGTATATCTT--TT--TCATC-AA----CAA-----GTTCTCT--C------------------CTTT--TATGTTTTG------------C-----TT-------------------TCTT-------CTTTAGCT-Atgttctctctcctcatatgatttgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|10 : ATTT-AATGG-TAGATTGGTAGTAAGTAT----T----G---ACAAT---AATA-CA-GATGGTAGAATAACATCTT--ATTTGA-AA----TTACCGA---ATATG-ATCTGTgttttcattcctccaggcatcacttctttccaacatagtcaaaagatttttatatttgattcgccttgcaacactagtattggtatgtgg
gi|3 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacttcaaatatcgaaataatgcaggaaatcattaaagtagcttgtgttgtcgaattattatgctcatcgactcataattgaatgacgcctaaattcaagccatatctaatgtctacattatgtttcaataacgtatacataattctctagtaaagggaggtaatgtccgatgggttcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaaca-GATTGGTAGTAATTAT----TGAC-------AAT---AATA-CA-GGTGTTAGAATAACATTTT--ATTTGA-AA----TTATCAA---ATATG-ATCTATTAA--GTTTAATATTA-ACAAGTATAAACAC-TGTGC-AAATATATAATCACACTAAAGATAATCTTTCAATC-----A--AAG----GTTTAA--T--CATCAGCACTGGCCCGTGTA--A-AAT--ACATCAGGAGGT-TTTCGATACCAA-------G------------------TTAGCATAATTTATCTA--ATTTATAATGTACAATTC--TT--TCATC-AA----TA-----TGTTCGCT--C------------------TCCT--CATATG-AGTAATTTCCATTCC-----TTCCGGCGTCA----------TTTTTCTG-A-CATTGACT-TAATTTTTTTC-ATGTCTGATTCGCAAAAC---CGGTTTTGTTATGTgttaagt
gi|6 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttcaaatatcgaatcagtgcaggaaaccattaaagtagtttgtgttgtcgaattattatgcccattaaaacatagttgaatgatgtctaaattctatccatatctaatgtccatattatgtttcaataacgtatacatatttctctagtcaagggaggtattgtctgatgggctcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaatttgaatggta-GATTGGTAGTAATAA-------AT-G---ACACG---AATA-CA-TGTGTTAGGATAACATCTT--TT-TGA-AA----TGATCGA---AAATG-ATCTATTAAG-TT---TTAT-A-ACAAATATTAACAC-TGTGC-AAATATATAAGCACAATAAAGA--T------AACCTTCC-A--AACAGTGTTACAA--T--CACCAATACTGACCTGTGTT--A-AGT--ACATCAGGAGGT-TTTCGATACCAccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|4 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaagataccattaaagtagtttgtgttgtcgaattgttatgctcatggactgataattgaatgatttctataatttatccatctactatatctacattatgtttcaataacgtatacatatttataatactggtgtctctaataaagggaggttatgtccgaagggttcctcctttgaattttaattagccttcaagtcagtgacagtgttttttgaaaatataacttgaacacaatttaaatggtaATTTG--TAGTAACAA----TTAACGACAAGGATACATCTATAAC--GT---TTATTA-TTAAGTACTAATAC-TGTGC-AAATATATAACCGCACCAAAGA--T------AATC-----A--TAC----TTTAAA--T--CACCAACAATGACCTGAGTT--A-AGTACACCTCAGGAGGTTTTTAGATATCAA-T--TCAAAAAAA---AAA-------TTGGCATAATCTATTTCTAATTCA----ATATG-----------CAT--AA----GAT---TTG--------C------------------TTTT--TA-------------------------------------------------------A-CATTGACT-GAACCCTTTT--ATGTCTGATTCAC-AAAggc
gi|18 : tatataaagagcactttgaaatcaaagttcatattatgtttcaatatctaatacatatttataatattgtttttttttctacctgggtattagagggaggtaatgtccgatagacggttcccaaattgttttaaatagtttcaagtcaggaacagtgttttgaaaagtattattggaaaacaatctaaatctggaaaagaaatatcatcatgcaaatcacctccttctataaacctgattcattcagtttccaattaacgaaactttttcagaagggttaaatatgcatgagctcagaaagcgcatggaaaacgtgcttatggtatttatttagcaatatactttttgctaaaaaagtttgaattatttaccctgtactttatattaatgtaagttccaacagtaaatttaatacaactcatagtcccatgtcgttatcattcactgctgG--TTTTAA-AAAAACTCATTGA------TG-ATTT-TAAAATGC---ATGTTATATAAAT---GATATAGATG--GGATATGTAACCACAGCATATA--T------AATC-----A--AAC----ATTTAT--T--TATCAACAATGGTCTGTGTA--A-AGT--ACATAAAGAGG--TTTGGAAA--AAGT--TCAAAACAC---AAA-------CTGGCATAATCTCTCT----TTTAAAATGTGCAACTA--TTTCTCCTC-AAACGTT-----TTGTTTTCT--T------------------CTTT--AGTA---AA------------T-----TTAAATTCCTTCAGGCATTCATTTTCTTTAA-CATTGACT-AAACTTTTTT--ATGTCTGATTCACAAAAC---TAATTTTGTTATGTa
gi|19 : ATACAC-GT---GTAATA-ACAAGTATTAACAA-AGCGC-AAATATATAACCACACCACAAA--T------ATTC-----A--AAC----Tc
gi|27 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaAA-GT---TTAAAA-AGAAGTATCAATAC-TTTTC-AAATATATAACCACGCTAAAGA--T------AATCTTTCGATCAACG---TTTCAA--T---ACTAACATTGGCCTGTGTA--A-AGT--ACATCAGGA-GT-TTTCGCTACCA-------AG------------------CTAGCATAATC------TAATTTATAATGTCCAATTA--TT--TCATC-AG----TA-----TGTTCTCT--C------------------TCCT--CA
gi|7 : atattGGTATC--AATATCAATT--TTAGAATAA---AAC-------TTGGCATGATATATCTGTAATTTAAAATGAACAATTT--TT--TCATC-AA----TA-----TGTTCTCT--C------------------TCCT--CTTC---AGATTTA-------C-----TT-------------------TTTA-----A-CATTGACT-AAACCCTTTT--ATGTCTGATTCGCAAAACTAGT--TTTTTTTATGTagtt
gi|23 : aaaatctttgatttttttatcggaagggttaaatattcatgagctcacacggctagtaatgaaggaaaacatgctatctcagaaagcgcatggtaaatgtgcttatggttttgatttaggaatttattttgtcttgaaaaggatggaaaaattaatcctgtactatatagtgatgtatactggaaaagaaaatttaataaaactcatagattcatgtcgttatcattcactgctgattggtaggaacaattgacgacaagaatacaggtgtaaggcaacatctgttttaagattatcgagtatgatctataaagtataccaataagtattagcgctgtgcagatatataaccgcagcaaagataatccaacttgcaatTAATTTATTATGTACAATTG--CT--TTATC-GA----TA-----TGTCCTCT--C------------------TCCT--TATA---TG------------A-----TT-------------------Tcgtgttt
gi|11 : tc--TT--TCTTC-AAG---TAA---TT-TTCTATTCC------------------TTCTGGCATC---CA------------T-----TC-------------------TTTT-----AACATTGACT-AAAT-CTTTTGTATGCCTGATTTGC-AAAC---actttcttcttatagtaattttaattccttccggcatattttttttaacatcgacttggcttttttattatgtctgattcgcaaaactaattttgttcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GTATATAACCACATCACATATAATCAAACTTCCGGTGTAATGATCCCCAGGAGGGTTTGGATACTTGGGCATGAACACTTCAAAACACAATCTTTCTTAGGTAATTTTCATTCCTTGAAGCATTCAATTTTTCTCATATTGACCAACACTGTCTATGTCTGATTTGCAAAACTTGTTTTGTTATGTCACTTTTACCATTTCTCAAAAGTATTTTGGACAGCAATCATCATTTGCAGTTAAAGTTGTTGTTGTCGGCAGCGTCACCTTTAAGTTGATGTTATGTAACAGTGG
Unaligned ( gi|25 ): ATTTTAACATTGACTAAACCTATTTATACCCAGTTTGTAAAACTAGTTCTGTGATGTTGCATTAACCCTTTCCCAAGCAAAAAGAGTTTATTTGTTAAAGAGAGCAAAACATTTTGCAGTCAATAATGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTGTCGTCGTTGTTAATGATGATAGTGATGGATA
Unaligned ( gi|29 ): GAAACATTTAATCATGTAATCACCGCCTGCTACTGCTCATGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGATGGTGTTGGTGATAATAATGACAATGGAGATACAAC
Unaligned ( gi|30 ): CTTCTTAAAAACCATGATTTTTATTCCTCCAGGCATCCCTTCTTTTAACATTGAGTAAAACATTTTATGTCGGATTCACAAACCTA
Unaligned ( gi|31 ): TGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGTTGATAACGGTGATTATGATGGTATGTGTGCTTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): GTTATTCTTTCCCAAGCAAAGAGTTTGTTTCCTTGTTGTTATCTAAGGATAAAAGAGCATTTTGGATAGC
Unaligned ( gi|33 ): TTAAAGCATTACCTGGCTTGATGACGGGCTGGCCTGAAATGAACCAGAAATTACTGA
Unaligned ( gi|34 ): TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTATTTGATGATATGACTGGAGAGACACTGTG
Unaligned ( gi|36 ): GNNNNNNNNNNTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1111 1111111111 1111 333333333333333333333 11111 11111 22 111111 22222222222222222222222 11111111111111111111111 111111 888888888888888888888888888888888888888888 1111111111 333333333333333333333333333333333 11111111111 111111 11111111 11111111 888888888888888888888888888888888 111111 2222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 2 6666 888888 3 3 3 3 3 44 88 5555555555555555 44 44 3 6666 888 33 11 1 8888 5555 33 5555 0000 999 66 1111111111 444 1111 888 88888888 3 2 1 55 666666666666666666666 2 9999999999 2 7 3 4 55555 1 44 00000 2 2 55 2 555 4 55 4444 33 6 55 4 66 2 5 2 1 55 0 111111 22222222222222222222222 44 99999999999999999999999 1 55 4 2 111111 4 333333333333333333333333333333333333333333 55 4 7777777777 222222222222222222222222222222222 1 3 2 2 22222222222 3 3 000000 0 3 7777 0 3 66 4 66666 3 2 3 0 3 5 0 0 11111111 3 44444444 9999 88888888 1 666 55 2 9999 2 111111111111111111111111111111111 2 8888 7 888888 2 999 33 6666 33 66 2 777 3333333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 3 3 3 666 777
lowQualScore : . .... ...... . . . . . .. .. ................ .. .. . .... ... .. .. . .... .... .. .... .... ... .. .......... ... .... ... ........ . . . .. ..................... . .......... . . . . ..... . .. ..... . . .. . ... . .. .... .. . .. . .. . . . . .. . ...... ....................... .. ....................... . .. . . ...... . .......................................... .. . .......... ................................. . . . . ........... . . ...... . . .... . . .. . ..... . . . . . . . . ........ . ........ .... ........ . ... .. . .... . ................................. . .... . ...... . ... .. .... .. .. . ... ....... ........................................................................................................ . . . . ... ...
lowQualScore : 6 1111 888888 3 3 3 3 3 66 44 0000000000000000 22 22 1 5555 777 77 44 2 0000 7777 77 7777 3333 555 11 7777777777 777 3333 888 11111111 1 5 0 88 666666666666666666666 9 4444444444 1 0 0 4 00000 9 11 00000 3 7 55 6 888 4 00 5555 44 3 55 4 99 0 0 5 0 00 2 555555 99999999999999999999999 11 33333333333333333333333 4 88 0 6 555555 0 444444444444444444444444444444444444444444 55 8 5555555555 555555555555555555555555555555555 2 1 9 5 44444444444 1 8 111111 4 3 1111 8 5 99 0 33333 1 6 1 2 1 6 2 4 22222222 1 33333333 6666 88888888 2 000 00 3 2222 3 666666666666666666666666666666666 4 5555 5 777777 3 333 99 1111 99 88 9 999 3333333 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 6 6 6 444 555
consensus : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCC--ATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCG----ATGGACGCTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-CT-TC-A---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGAAAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-C-----TCCTCCT--GTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGG-TTAAATATTCATGAGCTCACGT-GGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT-------ATATA-TGATGT---A----C------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------A-ATC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AA-TT--A---GA-CA--AAANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAATT--NTT--T----C--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------T--TTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTTTGTTATGT
Reference ( family-1691 ) : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCNATCC--ATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCG----ATGGACNCTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-CT-TC-A---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTGGAAAACAATNTAAATTTGAAAAA-AATATATCACCATGCAAATTAC-C-----TCCTTCT--GTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGG-TTAAATATTCATGAGCTCACG--GGCCAGTAACGTA-GGAAAACAGGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAA-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT-------ATATA-TNANGT---A----C------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCGCACCAAAGAT--------A-ATC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--NAAGT--ACNTCAGGAGG-T-TTTNGATA------CC------AA-TTC-A---GA-CA--AAANCT----GGCATAATCTNTC-T-TAATTTATAATGTACAATT--NTT--T----C--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNNG--------------C-----TT---------T--TTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAA-TTTTGTTATGT
gi|1 : ATTGCTGTGTATGTGTTTGACTTCAA----CTATTGAATTAATGCAGGATAC------CATA-AA-AA-T-A-GT--TAGTGCTGTGGAATA--T--AT--ATGC--A--T--GGGCTGATAATTGAATGATGTATA-AAT-TTAATCA--ATATATA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TGATACATATTTATAAT----A--CTG----AATTCT----CTACCTGGGTATTAAAGAAAA----------TTTATG---TCCC----ATGGACCCTTCCT-GTGA-TT-TTTGAAATAG-TT-CC-A---A---ATCA--G--AAAGTG-TTTTGGAAAA--TAAAAAAAATTATTAGAAAACAATGTAGATTTGAAAAA-AATATATCACCATCCAAATTAT-C-----TCCTTCT--TTAAAACTGATTCATTCAGTTTTCTACTG-ATGAAAC-TT-TG-AATTTTTT--TAGAAGGG-TTAAATATTTATGAGCTCACATTGACCAGTAATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAAAAGCATGGTAAACATGCT------TATGG----------TAT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTAAAAA-ATGATGGAATTATTTATTCT------GTAC-TAT-------ATAT----------------T------AC------AGT--AGATTTGA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATCCATGTTGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-AACGGTGTTAGGA-AACATCTGTTGTA-AGA----TTATCGAGTGTGATCTATAAAA-GTATA---TTA-ATAAGTATTG-ACACTATGCAAA-TATATAACGACACCAAAGGA--------A-ATC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAATAATAGCCTGTGC--TAAGT--ACCTCGGGAGG-TATTTAGATA------CC------AATTTC-A---GATCA--AAATTT----GGCATAATTTTTT-TATAATTTATAATGTACGATT--GTT--T----C--AT--C-AA---TAA----TTGTTCTCT-----------------C------------------TTC--T-----C-----A---TAAG--------------C-----TT---------T--TTT----A-CATTGACTAAACACT-TT-T-AT---GTTTGATTTGC-AAACT---TTTTTTTGTGT
gi|10 : tTTGACTTCAA----ATATCGAAATAATGCAGGAAAT------CATT-AA-AG-T-A-GC--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCTCA--T--CGACTCATAATTGAATGACGCCTA-AAT-TCAAGCC--ATATCTA--ATGTCTACATTATGTTTCAATA--------ACGTATACATAA-----------------TTCT----CTA---G-----TAAAGGGAG----------GTAATG---TCCG----ATGGGTTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-CT---------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTAAt
gi|10 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTAATGG-TAGATTGGTAGTAAGTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGATGGTAGAATAACATCTTATTTG-AAA----TTACCGAATATGATCTGTtggtagattggtagtaagtattgacaataatacagatggtagaataacatcttatttgaaattaccgaatatgatctgtgttaagt
gi|11 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacttcaaatatcgaaataatgcaggaaatcattaaagtagcttgtgttgtcgaattattatgctcatcgactcataattgaatgacgcctaaattcaagccatatctaatgtctacattatgtttcaataacgtatacataattctctagtaaagggaggtaatgtccgatgggttcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaCACGTTGTTA-TCACTTGTAAC-T-AATTGATAGTAAAAAT-----GA----CAAGAGT-ACACGTCCTA-------------CTTA-AGA----TTCTCGAGTTTGATCTATAAAG-GT-TA---TCA-AAAAGTATTA-GCATTGTGCAAT-TATATAACCACCCCAAAAAT--------A-AT-----------C----TTTCAATTTCATCAgttaagt
gi|11 : tTT--T----C--AT--C-AG---T-A----T-GTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATG--------------A-----TT---------T--gtatgttctctctcctcatatgatttgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|11 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaaTCTCTC-C-TCAT--ATGATTTGCCCTT---TT--T----C--TT--C-AAG--T-A----ATTTTCTATTC---------------C------------------TTC--TGG---C-----A---TCCA--------------T-----TC---------T--TTT----AACATTGACTAAATCTT-TTGT-AT---GCCTGATTTGCAAAgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|12 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaatttcatcagtatgttcTGTTGTAGAATT--T--TT-TATGC--ACAT--GGACTGATAATTAAATGGTGTCTA-AAT-TATATCT--ATATCCA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATGAC--GTGTACATATTCATACT----T--CTG----GTTACT----CTACAACGGTAATAAGGGGAG----------GTAATG---TCCG----ATGGCTTCTTCCT-CTGA-AT-TTTGTATAAG-CT-TT-ATTGACTTATCAGGG--AAAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGCAAACAATTTCAATTTTAAAAATAATGCCTCA--ATGCAAATTAA-C-----TTCTCGT--GTAA--CTGA--CATTcataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|13 : atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaaatattgaatggaGTATTCGTTTGAATGCAACTGAATACTAAATTAATGCAGGAAAC------AATT-AA-AG-G-AAGT--TTGTGTTGCGGAA-A--G--GT-TACGCGCA--T--GGATTGATAATTGAATG--GTTGA-AATATATATCT--ATATTTA--ATGTCCACAGTGTGTTTCATTATC-------CACATTTGCAAT----A--CTG----GATACT----TTGTTTGGGTAATAAAGGGGT----------GTAATG---TACGTTTGGTGGA----TCCT-TAGA-GT-TTTGAAACAG------------------G--A--ACAGTA-TCTTTGACAA--T-------AAAACAGAAAAGCAATTTTAGTTTGGAAAA-AATAC--CATCGTGCAATTAAC-C-----TTCTCCAAAGTGGACCTGATTCATTCAATTTCAAACTG-ACGAACA-TT-TGAAATTATTT--ttt
gi|14 : TTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-------GTTAGG----CATCTGTATTATAAA----T-----AATATGATAAATAAAG-TTACT---TTA-ACTAATATTT-CGACTGTGCAAAATATATCACATCATCACAGAC--------A-CTA-----A--AAC----TTTTA------CCAACCATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGCGG-A-TTTGGATA------CC---------TTG-ACCTGA-C---CAATCT----GGCATAATCTCTC-T----TTTATTATGTATATCT--TTT--T----C--AT--C-AA---C-A-----AGTTCTCT-----------------C------------------CTT--T-----T-----ATGTTTTG--------------C-----TT---------T--CTT------CTTTAGCTAtaacattgactaaacctattta
gi|15 : TACTTTGTATGTGTTTGACTTCAA----ATATCAAATAAATGTAGGATAC------CTTT-AA-AA-TTA-AT--TTGTGTTGTGGAATAGTT--AT--GCAC--A--T--GGACTGATAATTAAATGATACCTT-AAT-TC--TCCTTATGTCCA--ATGTCAACATTGTGTTTCAATATA--TAACACATATTTATGAT----A--CTG----GTTTCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNN---NNNN----NNNNNNNNNNNNN-NNNN-NN-NNNNNNNNNN-NN-NN-N---N---NNNN--N--NCAATG-TGTTTGATAA--G-------ATAATTGGTAAACATTTTTAGTTTAAAAA-----ATATCACCATGCAAATTACACTCAGGTCCTTTT--ATAAgttttcattcctccaggcatcacttctttccaacatagtcaaaagatttttatatttgattcgccttgcaacactagtattggtatgtgg
gi|16 : tagtcGAAATAG-CTATA-A---A---GACA--GGAAAAGTG-TTTTTTAAAA------------------AAAA-AAT---AACTGGAAAAC-AAT---------TG---ATT-------------------TA--CCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGG-TTAACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TA--------------------------T-----------GTAAAAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TATAATATAGATATA-TAATTC---A-----------AC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CAAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAGCAAC-T
gi|17 : ---A---GACA--GGAACAGTG-TTTTTTAAAAACT-------ATAACTGGAAAACAAT
gi|17 : ACCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGG-TTAACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TC------AT---GTAA---------------------------AAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TATAATATAGATATA-TAATTC---A-----------AC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAACAAC-TGACGA----CAAGAAtgatttacctgattcattcattttgcaactaacgaaaattttaaatatttcggaggggttaactattcattagctcacaggccagtaatgtaagaaaacaggctaattcagaaaaggcatggttaacgtatttatggtgttcatgtaaaaacggatggaattattcaacctgtactataatatagatatataattcaacagtatatttaataaaactcgaagatccatgtcgctatcttttactactgattggtagtaacaactgacgacaagaa
gi|18 : agacaggaacagtgttttttaaaaactataactggaaaacaattgatttGTTTTA-AAAAAACTCATTGA---TGATTT-TAAAATGCATG---TTATATAAATGATATAGA-TGGG---A-TATGTAACCACAGCATATAT--------A-ATC-----A--AAC----ATTTAT--TTATCAACAATGGTCTGTGT--AAAGT--ACATAAAGAGG-T-TTGGAAAA--------------AG-TTCAA---AA-CA--CAAACT----GGCATAATCTCTC-T----TTTAAAATGTGCAACT--ATTTCT----C--CT--C-AAACGT-T----TTGTTTTCTTCTTTAGTAAATTTAAAT------------------TCC--TTCAGGC-----A---TTCA--------------T-----TT---------T--CTTTA--A-CATTGACTAAACTTT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAACTAA-TTTTGTTATGT
gi|19 : -C-----TGCTGCT--GTGAACCGGGTTCATT---TTTTAAACGA-ATTAAAC-TT-TG-ACATCTTT--TGGAGGGG-TTAAATc
gi|19 : aagaaaaatgg------TATAA----------TGT--TA------ATAAAGCAAATTAGT--TTTG-----------GCTAAAGG-G-AATATACTTATTCATCAA------ATAC-TATTCATTG-ACATA-TAATCC---A-----------AC------AGT--A---TCAT----------TAAAA------------------CT----------AGAAGTTGCATGGTGTTATTTTTTTATTAC-T-GATTGGTAGTAACAAT------ATTCTCACGAAT-ACACGTGT---AATAACAtgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaatacacgtgtaataacaagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|19 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaataATACAC-GTGTA---ATA-ACAAGTATTA-ACAAAGCGCAAA-TATATAACCACACCACAAAT--------A-TTC-----A--AAC----Tagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|2 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaACTTCAA----ATATTGAATTTATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GTCATTACTTTGT--AATA--T--TT-TAT-C--A--T--GGACTGATAATTAAATGGAGTCTA-CAT-TCTATCA--AAACCTA--ATGTTCACGTTGT-TTTCAATATC--TAATACATATTTACAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTACTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCG----ATAGACGGTTCCC-ATGT-GT-TTTTAAATAG-TT-TC-A---A---CACA--GGAACAGTG-TTTTGGAAAA--T-------ATATAAGGAAAACAATTTTAATTTGAAAAA-AA-AAATTACCATGCAAGTTAC-C-----TC---CT--GTATACCTGATACGTTCAGTGTCCAACTG-ACAAAAC-TG-TG-ATTTTTTT--CGGAAGGGTTTAAATATTCATGATCTCACAT-GGCCAGTTATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAACCGCATGACAAACGTGCT------CATTG----------TAT--CA------ATTTAGCAATTTACT--TTTT-----------GTTGAAAA-A-GACTGAATTATTCA-----------CAT-TGT-------ATACT-CCA------------------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAGA------------------CT----------GTTAGATCCATGTCGTTA-CCATTCACTGC------TGGTAGTAACTAT-TGACGA----CAA-AATAACAGGTGTTA-GACAACATCTGTTTAA-AGA----TTAACGAATATGTTCCATAAAA--TATA---TAA-ATAAGTATTA-ACCCTGTTCAAA-TAAATAACAGCACC-AAGAT--------A-ATC-----A--AAC----TTTTTA--GCACCAACAATGACCTCTGTTAAAAGT--ACCTCAGGAG---------------------------------A---G------AAATTT----GGCATAATCTTTC-TCTAATTAATAATGTACAATT--GTT--T----C--AC--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCT--T-----T-----A---TCAG--------------A-----TT---------G--TCT----A--ATT
gi|20 : gtattTCAA----ATATCAATTTAATGCAGGATAC------CATT-AA-GA-T-A-AA--TTATGCT--------------------C--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTT-AAT-TAAATCC--ATATGTA--ATGTGAACACTAAATTTCAATAACGTTA--ACATATTCATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTA-------AACAAA-GGAG----------GTAATG---TCCG----ATGGG---TTA---ATTA-AT-GTTAAATTAG-CT-TT-AC--G---GTCAGGG--ACAGTG-TTTTTTAAAA--T-------ATAACTGTTAAACAATTTAAAT
gi|21 : -TATATAACCACATCACATAT--------A-ATC-----A--AAC----TT-------------------CCGGTGT--AATGA--TCCCCAGGAGG-G-TTTGGATA------C-----------TT-G---GG-CATGAACACTTCAAAACACAATCTTTC-T-TAG---GTAATTTTCA-TT--CCT--TGAAGC--ATT-C-AA---T--------------T-----------------T------------------TTC--T-----C-----A---T-----------------------------------------------ATTGACCAA-CACTGTC-T-AT---GTCTGATTTGCAAAACTTG-TTTTGTTATGTggtaggttggtagtagttaataaaaataatattggcgttaggatatcaccttatttgaaa
gi|22 : gTTGCTTTGTATGCGTTTAACTTCAA----ATATTGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AG-AT-T-A-GT--TAGTGCTATGGAATA--T--GTATGCGC--A--T--GGACTGACGATTAAATGGTGTCTA-AAT-TCTACCA--ATAGCTA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTGTTTTTTTTTT----CTACCTGGGTATTAAAGAGAG----------GCAATG---TCTT----ATAGACGGTTCCC-ATGATTT-TTTGAAATAG-TT-CC-cacttttaccatttctcaaaagtattttggacagcaatcatcatttgcagttaaagttgttgttgtcggcagcgtcacctttaagttgatgttatgtaacagtgg
gi|23 : -TAATTTATTATGTACAATT--GCT--T----T--AT--C-GA---T-A-----TGTCCTCT-----------------C------------------TCC--T-----T-----A---TATG--------------A-----TT---------T--
gi|23 : tcTCTCTCCT-TA---TATGATTTAC--TT--TCT--T----CTTATAGT-AA---T-T----TTAATTCCT-----------------T------------------CCG--G-----C-----A---TATT--------------T-----TT---------T--TTA----A-CATCGACTTGGCTTT-TT-T-ATTATGTCTGATTCGCAAAACTAA-TTTTGTTactttcttcttatagtaattttaattccttccggcatattttttttaacatcgacttggcttttttattatgtctgattcgcaaaactaattttgttcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|24 : tctaatttattatgtacaattgctttatcgatatgtccTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATTTAA-AA-T-A-GT--ATGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC---------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATACATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCG----GTGGACGATTCcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|25 : cggtattT---------T--TTA----A-CATTGACTAAACCTA-TT-T-AT---ACCCAGTTTGTAAAACTAG-TTCTGTGATGT
gi|26 : aTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATT-AA-AAAT-A-GT--GTGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC---------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATATATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATGGATTCCA----ATGGAtgcattaaccctttcccaagcaaaaagagtttatttgttaaagagagcaaaacattttgcagtcaataatgttgttgttgctgctgctgctgctgctgttgttgttgttgtcgtcgttgttaatgatgatagtgatggata
gi|27 : AA-GTTTA---AAA-AGAAGTATCA-ATACTTTTCAAA-TATATAACCACGCTAAAGAT--------A-ATCTTTCGATCAACG---TTTCAA--T-ACTAACATTGGCCTGTGT--AAAGT--ACATCAGGAG--T-TTTCGCTA------CC------AA-------------------GCT----AGCATAATCT-------AATTTATAATGTCCAATT--ATT--T----C--AT--C-AG---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---tttt
gi|28 : atatt-----------GTTGAAGGTG-GGTGGAATTATTCATCCTGTTTTAGTACTTGT-------ACATATTGATGTAAAA----C------CCGAA---AGTGAAAATT--A----------TAAAA------------------CTAAATGTTCCATGTTATTCCATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-agtt
gi|3 : gACTTCAA----ATATCGAATCAGTGCAGGAAAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCCCA--TTAAAAC--ATAGTTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCC--ATATCTA--ATGTCCATATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTT-----------------------CT----CTA-----GTC---AAGGGAG----------GTATTG---TCTG----ATGGGCTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-CT---------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTGAATgt
gi|3 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGGTGTTAGAATAACATTTTATTTG-AAA----TTATCAAATATGATCTATTAA--GTTTAATATTA-ACAAGTATAA-ACACTGTGCAAA-TATATAATCACACTAAAGATAATCTTTCA-ATC-----A--AAG----GTTTAA--TCATCAGCACTGGCCCGTGT--AAAAT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------AA-GT------------------T----AGCATAATTTATC---TAATTTATAATGTACAATT--CTT--T----C--AT--C-AA---T-A-----TGTTCGCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATGAGTAATTTCCATTCC-----TTCCGGCGTCAT--TTTTCTGA-CATTGACTTAATTTT-TT-TCAT---GTCTGATTCGCAAAACCGG-TTTTGTTATGTggtagattggtagtaattattgacaataatacaggtgttagaataacattttatttgaaattatcaaatatgatctattaagtttaatattaacaagtataaacactgtgcaaatatataatcacactaaagataatctttcaatcaaaggtttaatcatcagcactggcccgtgtaaaatacatcaggaggttttcgataccaagttagcataatttatctaatttataatgtacaattctttcatcaatatgttcgctctcctcatatgagtaatttccattccttccggcgtcatttttctgacattgacttaatttttttcatgtctgattcgcaaaaccggttttgttatgtccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|30 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttcaaatatcgaatcagtgcaggaaaccattaaagtagtttgtgttgtcgaattattatgcccattaaaacatagttgaatgatgtctaaattctatccatatctaatgtccatattatgtttcaataacgtatacatatttctctagtcaagggaggtattgtctgatgggctcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaatttgaatggta-A----TTTTTATTC-----------------C------------------TCCAGG-----C-----A---TCC---------------C-----TT---------C--TTTTA--A-CATTGAGTAAAACAT-TT-T-AT---GTCGGATTCACAAACCTAccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|35 : cttcttaaaaaccatgTGCTTTGTATACGTTTTACTTGAA----ATATC-AATTAATGCAG--TAC------CAT
gi|37 : tatattcTGCTTCGTATACGTTTGGCTTCCA----ATATCGAATTAACGTAGGATA
gi|38 : gtactcTCTATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-T
gi|39 : atTGCTTTGCATGCGTTTAACTTCAG----ATATTGAATGAATGC
gi|4 : tcATCAA--A-GTTCATATTATGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTG----TTTTTTTTT-CTACCTGGGTATTAGAGGGAG----------GTAATG---TCCG----ATAGACGGTTCCC-A-AA-TTGTTTTAAATAG-TT-TC-A---A---GTCA--GGAACAGTG-TTTTGAAAAG--T-------ATTATTGGAAAACAATCTAAATCTGGAAAA-GAAATATCATCATGCAAATCAC-C-----TCCTTCT--ATAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAATTA-ACGAAAC-TT---------TTT--CAGAAGGG-TTAAATATGCATGAGCTCA-G--AA-----AGCGCATGGAAAACGTGCT-------------TATGGTA-------------------------------T--TT------ATTTAGCAATATACT--TTTT-----------GCTAAAAA-A-GTTTGAATTATTTACCCT------GTAC-TTT-------ATAT--TAATGT---AAGTTCCA----AC------AGT--AAATTTAA----------TACAA------------------CT----------CATAGTCCCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTTGTAGTAACAAT-TAACGA----CAAGGAT-ACA--TCT----ATAAC----GTTT-----A----TTATTAAGTAC------TAATA-CTGT--------GCAAATAT-------------------ATAACCGCACCAAAGAT--------A-ATC-----A--TAC----TTTAAA--TCACCAACAATGACCTGAGT--TAAGTACACCTCAGGAGGTT-TTTAGATA------TC------AA-TTCAA---AA-AA--AAAATT----GGCATAATCT--------ATTTCTAAT------------------------T--C-AA---T-A-----TG-----------------------------------------------------C-----A---TAAG--------------A-----TT---------TGCTTTTTA-A-CATTGACTGAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAA
gi|5 : tatataaagagcactttgaaATTC--ATATCTG--ATG---ACA---------AATATT--TAATACATATTTATAATTATGATTCTG----GTTTCT----CTACACCGGTTTTAAAAGAAG----------GTTATG---TCCGGTAGATGGTCTCTTC------A-GT-TT-AAAATAG-CT-TTTA---A---GTCA--GGGACAGGG-TTTTTGAAAA--T-------ATAGCTGGAAAACAAAACAA-TTCGAAAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAC-C-----TTCTTCA--ATAAACCTGGTGCATTC-GTTTCCAACTGCAAAAAAA-TTGTA-GAAAAGTA--CAGAGAGG-TGAAATATCCATGAACTCACGT-GGCCAGTAACGTA-TG-AAACAGGCTAACTCAGAAAGAGCATGTGAAACATGCTTGCTTGTATAGAAGAAATTTTTGTGGTAAATGATATTAAGCAATTTTTT--TTTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAG-G-AATGGAATGATTCATCCT------GTAC-TAT-------ATA-A-TCACGT---A----CACTCCAAC------AGT--AGATTTAACAACAGTTACTAAAATGTTTTATGTTGATAAAACT----------CAAAGATTTATGGTTTTA-TAATTCAATAC-C-GATTGTTAGTAATAAT-T---GA----CAAGAAT-ACAGGT------ATAAAATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGGATGATCTAT-AAA-GTGTA---TTA-ACAAATATTA-ACACTGTGCAA
gi|6 : atatATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--GT-TATGCTCA--T--GGACTGATAATTGAATGATTTCTATAAT-T-TATCC----ATCTACTATATCTACATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTTATAAT----A--CTG----GTGTCT----CTA-------A-TAAAGGGAG----------GTTATG---TCCG----AAGGGTTCCTCCT-TTGA-AT-TTT-AATTAGCCT-TC-A---A---GTCAGTG--ACAGTGTTTTTTGAAAA--T-------ATAACTTGAACACAATTTAAAT
gi|6 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATAA----ATGA----CACGAAT-ACATGTGTTAGGATAACATCT-TTTTG-AAA----TGATCGAAAATGATCTATTAAG-TTTTA---T-A-ACAAATATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAAGCACAATAAAGAT--------A-ACCTTCC-A--AACAGTGTTACAA--TCACCAATACTGACCTGTGT--TAAGT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------Aggtagattggtagtaataaatgacacgaatacatgtgttaggataacatctttttgaaatgatcgaaaatgatctattaagttttataacaaatattaacactgtgcaaatatataagcacaataaagataaccttccaaacagtgttacaatcaccaatactgacctgtgttaagtacatcaggaggttttcgataccaggc
gi|7 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaagataccattaaagtagtttgtgttgtcgaattgttatgctcatggactgataattgaatgatttctataatttatccatctactatatctacattatgtttcaataacgtatacatatttataatactggtgtctctaataaagggaggttatgtccgaagggttcctcctttgaattttaattagccttcaagtcagtgacagtgttttttgaaaatataacttgaacacaatttaaatggtaAAATCTT-TG-ATTTTTTTATCGGAAGGG-TTAAATATTCATGAGCTCACAC-GGCTAGTAATGAA-GGAAAACATGCTATCTCAGAAAGCGCATGGTAAATGTGCT------TATGG----------TTT--TG------ATTTAGGAATTTATT--TTGT-----------CTTGAAAA-G-GATGGAAAAATTAATCCT------GTAC-TAT-------ATA-G-TGATGT---A----T------ACTGGAAAAGA--AAATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATTCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGGAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTAAGG-CAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTAT-AAA-GTATA---CCA-ATAAGTATTA-GCGCTGTGCAGA-TATATAACCGCAGCAAAGAT--------A-ATC-----C--AAC----TT------------GCAATG----GTAT--CAA-T--A--TCA----A-T-TTTAGA----------------------------A-TA--AAACTT----GGCATGATATATC-TGTAATTTAAAATGAACAATT--TTT--T----C--AT--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----CTTCAGA---TTTA--------------C-----TT---------T--TTA----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAGTTTTTTTTATGTggc
gi|8 : aT------TGTGG----------TA----A------ATTTAACAAGTT-TTGATTTG-----------GTTCAAGG-G-TATGGAGTTATTCATCCT------ATAC-TAT-------ATAT--TGATGT---A----T------ACTCCAACAGT--AGATTTGA----------TAAGA------------------CT----------C-------CA---CGTTA-TCATTTACTACCT-GTTTGGTAGTATTAATAT--TGT----CAAGAAT-AAAAATGTAAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TT---GAGAATTATTTATAAA--GTTTA---TTA-A---GTAGTA-ACATTGTGCAAA-TATATAACC---------AT--------ATATC-----G--AAC----TTTAAA--TCATTTGAAATGGCCTGTGT--ATAGT--ACCTAAGGAGGGT-TTTGGATAACTAGACCTGATCGAG-TTA-A---TA-CA--GAAGCT----AGTTTAATCTCTT-T-T---CTATAATGTACAACTGGTTT--C----C--AC--CTCA---T-AGGTTTTGCTTTCT-----------------TAATATATGGATTATTTGATTC--T-----T-----G---TAGG--------------CATTCATT---------T--TTT----AGCAATGACTAAAACAT-TT-G-A-------TGATGGGCAAAACTAA-TTTTGTTATGTcgtgttt
gi|9 : acaagacaTTG-ATGCGTTTGACTTAAA----AAATCAAATTAATACAGGGTACATATATCATT-AATAG-T-A-GA--TT----TGCGTAATA--T--ACATGTGC--A--T--GAACTGATAATTGAATGACGTTTA-AAA-TCTATCC--ATACCTT--ATGTCCAAATGTTATTTCATTATC---AGAACATATTTATAAT----A--CTG----GTTACT----CTACCAGGGTATAAAACGGAGGTCCAGAGCTGTAATG---TCCG----ATGAATGGTTCCCGTTGA-AT-TTTGAAACAGATT-TC-A---A---GTCAGGG--ATAATT-GTTTTGAAAA--T-------ATAACTGAAGAATAAT-TGCATTTGACCAA-AA-ATACCACCATGCAAATTAG-C-----TGCTCCT--GTATACCTAATTCATT---TTTCCAGCTG-AAGAAAA-TT-CG-AAAT-TTT--GAAAGGGA-TT-ATTATTCTCGAGATCACGT-GGTCAGTAATGTT-AGAAACTAGTCTGACCCAGAAAGCGCATGGCAAACATAAT------TATcgctttt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAAACATTTAATCATGTAATCACCGCCTGCTACTGCTCATGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGATGGTGTTGGTGATAATAATGACAATGGAGATACAAC
Unaligned ( gi|31 ): TGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGTTGATAACGGTGATTATGATGGTATGTGTGCTTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): GTTATTCTTTCCCAAGCAAAGAGTTTGTTTCCTTGTTGTTATCTAAGGATAAAAGAGCATTTTGGATAGC
Unaligned ( gi|33 ): TTAAAGCATTACCTGGCTTGATGACGGGCTGGCCTGAAATGAACCAGAAATTACTGA
Unaligned ( gi|34 ): TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTATTTGATGATATGACTGGAGAGACACTGTG
Unaligned ( gi|36 ): GNNNNNNNNNNTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1111 1111111111 333333333333333333333 1111 11111 11111 111 111111 22222222222222222222222 11111111111111111111111 111111 111111 888888888888888888888888888888888 1111111111 333333333333333333333333333333333 11111111111 111111 11111111 8888888888888888888888888888888888 222222 22222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 2222222
lowQualScore : 2 6666 888888 3 3 3 3 3 44 88 5555555555555555 44 44 3 3 0 5 33 11 1 8888 5555 33 5555 0000 999 66 1111111111 444 777 8888888 3 2 1 55 666666666666666666666 2 9999999999 2 4 4 9999 1 44 2 33333 3 555 55 44444 33 6 55 4 555 5 1 1 55 0 111111 22222222222222222222222 44 99999999999999999999999 1 55 4 2 111111 4 111111 3 111111111111111111111111111111111 55 4 7777777777 222222222222222222222222222222222 1 3 2 2 22222222222 3 3 000000 0 3 7777 0 3 66 4 66666 3 2 3 0 3 0 11111111 6666 77777777 9999 88888888 1 555 55 1 9999 3 3333333333333333333333333333333333 2 8888 6 000000 1 0 3 999 33 33 5555 11111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 000000000 0000000 1 3 3 3 666 4 9999
lowQualScore : . .... ...... . . . . . .. .. ................ .. .. . . . . .. .. . .... .... .. .... .... ... .. .......... ... ... ....... . . . .. ..................... . .......... . . . .... . .. . ..... . ... .. ..... .. . .. . ... . . . .. . ...... ....................... .. ....................... . .. . . ...... . ...... . ................................. .. . .......... ................................. . . . . ........... . . ...... . . .... . . .. . ..... . . . . . . ........ .... ........ .... ........ . ... .. . .... . .................................. . .... . ...... . . . ... .. .. .... ........... ................................................................................. ......... ....... . . . . ... . ....
lowQualScore : 6 1111 888888 3 3 3 3 3 66 44 0000000000000000 22 22 1 1 8 9 77 44 2 0000 7777 77 7777 3333 555 11 7777777777 777 888 1111111 1 5 0 88 666666666666666666666 9 4444444444 1 4 4 8888 9 11 3 00000 9 888 00 00000 44 3 55 4 444 0 0 0 00 2 555555 99999999999999999999999 11 33333333333333333333333 4 44 0 6 555555 0 555555 8 000000000000000000000000000000000 55 8 5555555555 555555555555555555555555555555555 2 1 9 5 44444444444 1 8 111111 4 3 1111 8 5 99 0 33333 1 6 1 2 1 4 22222222 5555 88888888 6666 88888888 2 333 00 4 2222 5 3333333333333333333333333333333333 4 5555 5 666666 5 8 1 333 99 99 1111 77777777777 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777777777 3333333 8 6 6 6 444 4 4444
consensus : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-CT-TC-A---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCCT--GTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTGACGAAAN-TTTG-----AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT---A----T------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
Reference ( family-1691 ) : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGCTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-CT-TC-A---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCCT--GTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTGACGAAAN-TTTG-----AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACG-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT---A----C------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
gi|1 : ATTGCTGTGTATGTGTTTGACTTCAA----CTATTGAATTAATGCAGGATAC------CATA-AA-AA-T-A-GT--TAGTGCTGTGGAATA--T--AT--ATGC--A--T--GGGCTGATAATTGAATGATGTATA-AAT-TTAATCAATATATA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TGATACATATTTATAAT----A--CTG----AATTCT----CTACCTGGGTATTAAAGAAAA----------TTTATG---TCCCATGGACCCTTCCT-GTGA-TT-TTTGAAATAG-TT-CC-A---A---ATCA--G--AAAGTG-TTTTGGAAAA--TAAAAAAAATTATTAGAAAACAATGTAGATTTGA-AAAA-AATATATCACCATCCAAATTAT-CTCCTTCT--TTAAAACTGATTCATTCAGTTTTCTACTGATGAAAC-TTTG-----AATTTTTT--TAGAAGGGTT-AAATATTTATGAGCTCACATTGACCAGTAATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAAAAGCATGGTAAACATGCT------TATGG----------TAT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTAAAAA-ATGATGGAATTATTTATTCT------GTAC-TAT------ATAT-----------------T------AC------AGT--AGATTTGA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATCCATGTTGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-AACGGTGTTAGGA-AACATCTGTTGTA-AGA----TTATCGAGTGTGATCTATAAAA-GTATA---TTA-ATAAGTATTG-ACACTATGCAAA-TATATAACGACACCAAAGGA--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAATAATAGCCTGTGC--TAAGT--ACCTCGGGAGG-TATTTAGATA------CC------AATTTCAG-ATC--A--A--AATTT----GGCATAATTTTTT-TATAATTTATAATGTACGAT-T--GTT--TC--AT--C-AA---TAA----TTGTTCTCT-----------------C------------------TTC--T-----C-----A---TAAG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACACT-TT-T-AT---GTTTGATTTGC-AAACT---TTT----TTTTGTGT
gi|10 : tTTGACTTCAA----ATATCGAAATAATGCAGGAAAT------CATT-AA-AG-T-A-GC--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCTCA--T--CGACTCATAATTGAATGACGCCTA-AAT-TCAAGCCATATCTA--ATGTCTACATTATGTTTCAATA--------ACGTATACATAA-----------------TTCT----CTA---G-----TAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGGTTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-CT---------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTAAt
gi|10 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTAATGG-TAGATTGGTAGTAAGTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGATGGTAGAATAACATCTTATTTG-AAA----TTACCGAATATGATCTGTtggtagattggtagtaagtattgacaataatacagatggtagaataacatcttatttgaaattaccgaatatgatctgtgttaagt
gi|11 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacttcaaatatcgaaataatgcaggaaatcattaaagtagcttgtgttgtcgaattattatgctcatcgactcataattgaatgacgcctaaattcaagccatatctaatgtctacattatgtttcaataacgtatacataattctctagtaaagggaggtaatgtccgatgggttcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaCACGTTGTTA-TCACTTGTAAC-T-AATTGATAGTAAAAAT-----GA----CAAGAGT-ACACGTCCTA-------------CTTA-AGA----TTCTCGAGTTTGATCTATAAAG-GT-TA---TCA-AAAAGTATTA-GCATTGTGCAAT-TATATAACCACCCCAAAAAT--------AA----T-----------C----TTTCAATTTCATCAgttaagt
gi|11 : tTT--TC--AT--C-AG---T-A----T-GTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATG--------------A-----TT---------Tgtatgttctctctcctcatatgatttgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|11 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaaTCTCTC-C-TCAT--ATGATTTGCCCT-T---TT--TC--TT--C-AAG--T-A----ATTTTCTATTC---------------C------------------TTC--TGG---C-----A---TCCA--------------T-----TC---------TTTT----AACATTGACTAAATCTT-TTGT-AT---GCCTGATTTGCAAACATAG-GTTAATGTGTTAAGTgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|12 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaatttcatcagtatgttcTGTTGTAGAATT--T--TT-TATGC--ACAT--GGACTGATAATTAAATGGTGTCTA-AAT-TATATCTATATCCA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATGAC--GTGTACATATTCATACT----T--CTG----GTTACT----CTACAACGGTAATAAGGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGCTTCTTCCT-CTGA-AT-TTTGTATAAG-CT-TT-ATTGACTTATCAGGG--AAAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGCAAACAATTTCAATTTTA-AAAATAATGCCTCA--ATGCAAATTAA-CTTCTCGT--GTAA--CTGA--CATTtgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|13 : atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaaatattgaatggaGTATTCGTTTGAATGCAACTGAATACTAAATTAATGCAGGAAAC------AATT-AA-AG-G-AAGT--TTGTGTTGCGGAA-A--G--GT-TACGCGCA--T--GGATTGATAATTGAATG--GTTGA-AATATATATCTATATTTA--ATGTCCACAGTGTGTTTCATTATC-------CACATTTGCAAT----A--CTG----GATACT----TTGTTTGGGTAATAAAGGGGT----------GTAATG---TACGTTTGGTGGATCCT-TAGA-GT-TTTGAAACAG------------------G--A--ACAGTA-TCTTTGACAA--T-------AAAACAGAAAAGCAATTTTAGTTTGG-AAAA-AATAC--CATCGTGCAATTAAC-CTTCTCCAAAGTGGACCTGATTCATTCAATTTCAAACTGACGAACA-TTTGA----AATTATTT--ttt
gi|14 : TTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-------GTTAGG----CATCTGTATTATAAA----T-----AATATGATAAATAAAG-TTACT---TTA-ACTAATATTT-CGACTGTGCAAAATATATCACATCATCACAGAC--------AC----TA-----A--AAC----TTTTA------CCAACCATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGCGG-A-TTTGGATA------CC--------TT---G-A-CCTG--ACCAATCT----GGCATAATCTCTC-T----TTTATTATGTATATC-T--TTT--TC--AT--C-AA---C-A-----AGTTCTCT-----------------C------------------CTT--T-----T-----ATGTTTTG--------------C-----TT---------TCTT------CTTTAGCTAtaacattgactaaacctattta
gi|15 : TACTTTGTATGTGTTTGACTTCAA----ATATCAAATAAATGTAGGATAC------CTTT-AA-AA-TTA-AT--TTGTGTTGTGGAATAGTT--AT--GCAC--A--T--GGACTGATAATTAAATGATACCTT-AAT-TCTCCTTATGTCCA--ATGTCAACATTGTGTTTCAATATA--TAACACATATTTATGAT----A--CTG----GTTTCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NN-NNNNNNNNNN-NN-NN-N---N---NNNN--N--NCAATG-TGTTTGATAA--G-------ATAATTGGTAAACATTTTTAGTTT---AAAA-AAT--ATCACCATGCAAATTACACTCgttttcattcctccaggcatcacttctttccaacatagtcaaaagatttttatatttgattcgccttgcaacactagtattggtatgtgg
gi|16 : tagtcGAAATAG-CTATA-A---A---GACA--GGAAAAGTG-TTTTTTAAAA------------------AAAA-AAT---AACTGGA-AAAC-AAT---------TG---ATT--------------TA--CCTGATTCATTCATTTTGCAACTAACGAAAA-TTTT-----AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TA--------------------------T-----------GTAAAAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TAT------A-ATA-TAGATAT---A----TAATTCAAC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CAAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAGCAAC-Taggtccttttataa
gi|17 : ---A---GACA--GGAACAGTG-TTTTTTAAAAACT-------ATAACTGGAAAACAATT
gi|17 : ACCTGATTCATTCATTTTGCAACTAACGAAAA-TTTT-----AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TC------AT---GTAA---------------------------AAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TAT------A-ATA-TAGATAT---A----TAATTCAAC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAACAAC-TGACGA----CAAGAAgatttacctgattcattcattttgcaactaacgaaaattttaaatatttcggaggggttaactattcattagctcacaggccagtaatgtaagaaaacaggctaattcagaaaaggcatggttaacgtatttatggtgttcatgtaaaaacggatggaattattcaacctgtactataatatagatatataattcaacagtatatttaataaaactcgaagatccatgtcgctatcttttactactgattggtagtaacaactgacgacaagaa
gi|18 : agacaggaacagtgttttttaaaaactataactggaaaacaattgatttGTTTTA-AAAAAACTCATTGA---TGATTT-TAAAATGCATG---TTATATAAATGATATAGA-TGGG---A-TATGTAACCACAGCATATAT--------AA----TC-----A--AAC----ATTTAT--TTATCAACAATGGTCTGTGT--AAAGT--ACATAAAGAGG-T-TTGGAAAA--------------AGTTCAAA-A-C--A--C--AAACT----GGCATAATCTCTC-T----TTTAAAATGTGCAAC-T--ATTTCTC--CT--C-AAACGT-T----TTGTTTTCTTCTTTAGTAAATTTAAAT------------------TCC--TTCAGGC-----A---TTCA--------------T-----TT---------TCTTTA--A-CATTGACTAAACTTT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAACTAA-TTT----TGTTATGT
gi|19 : -CTGCTGCT--GTGAACCGGGTTCATT---TTTTAAACGAATTAAAC-TTTG-----ACATCTTT--TGGAGGGGTT-AAATc
gi|19 : aagaaaaatgg------TATAA----------TGT--TA------ATAAAGCAAATTAGT--TTTG-----------GCTAAAGG-G-AATATACTTATTCATCAA------ATAC-TATTCATTGACATA-T-AATCC---A-----------AC------AGT--A---TCAT----------TAAAA------------------CT----------AGAAGTTGCATGGTGTTATTTTTTTATTAC-T-GATTGGTAGTAACAAT------ATTCTCACGAAT-ACACGTGT---AATAACAtgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaatacacgtgtaataacaagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|19 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaataATACAC-GTGTA---ATA-ACAAGTATTA-ACAAAGCGCAAA-TATATAACCACACCACAAAT--------AT----TC-----A--AAC----Tagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|2 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaACTTCAA----ATATTGAATTTATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GTCATTACTTTGT--AATA--T--TT-TAT-C--A--T--GGACTGATAATTAAATGGAGTCTA-CAT-TCTATCAAAACCTA--ATGTTCACGTTGT-TTTCAATATC--TAATACATATTTACAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTACTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATAGACGGTTCCC-ATGT-GT-TTTTAAATAG-TT-TC-A---A---CACA--GGAACAGTG-TTTTGGAAAA--T-------ATATAAGGAAAACAATTTTAATTTGA-AAAA-AA-AAATTACCATGCAAGTTAC-CTCCT-----GTATACCTGATACGTTCAGTGTCCAACTGACAAAAC-TGTG-----ATTTTTTT--CGGAAGGGTTTAAATATTCATGATCTCACA-TGGCCAGTTATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAACCGCATGACAAACGTGCT------CATTG----------TAT--CA------ATTTAGCAATTTACT--TTTT-----------GTTGAAAA-A-GACTGAATTATTCA-----------CAT-TGT------ATAC------TCC---A-----------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAGA------------------CT----------GTTAGATCCATGTCGTTA-CCATTCACTGC------TGGTAGTAACTAT-TGACGA----CAA-AATAACAGGTGTTA-GACAACATCTGTTTAA-AGA----TTAACGAATATGTTCCATAAAA--TATA---TAA-ATAAGTATTA-ACCCTGTTCAAA-TAAATAACAGCACC-AAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTTTA--GCACCAACAATGACCTCTGTTAAAAGT--ACCTCAGGAG--------------------------------AG---------A--AATTT----GGCATAATCTTTC-TCTAATTAATAATGTACAAT-T--GTT--TC--AC--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCT--T-----T-----A---TCAG--------------A-----TT---------GTCT----A--ATT
gi|20 : gtattTCAA----ATATCAATTTAATGCAGGATAC------CATT-AA-GA-T-A-AA--TTATGCT--------------------C--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTT-AAT-TAAATCCATATGTA--ATGTGAACACTAAATTTCAATAACGTTA--ACATATTCATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTA-------AACAAA-GGAG----------GTAATG---TCCGATGGG---TTA---ATTA-AT-GTTAAATTAG-CT-TT-AC--G---GTCAGGG--ACAGTG-TTTTTTAAAA--T-------ATAACTGTTAAACAATTTAAAT
gi|21 : -TATATAACCACATCACATAT--------AA----TC-----A--AAC----TT-------------------CCGGTGT--AATGA--TCCCCAGGAGG-G-TTTGGATA------C---------TT--GG-G-C--ATGA--ACACTTCAAAACACAATCTTTC-T-TAG---GTAAT------------TT--TC--AT-------------------------------------------------------------TCC--TTGAAGC-----A---TTCA--------------A-----TT---------TTTCTC--A-TATTGACCAA-CACTGTC-T-AT---GTCTGATTTGCAAAACTTG-TTT----TGTTATGTggtaggttggtagtagttaataaaaataatattggcgttaggatatcaccttatttgaaa
gi|22 : gTTGCTTTGTATGCGTTTAACTTCAA----ATATTGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AG-AT-T-A-GT--TAGTGCTATGGAATA--T--GTATGCGC--A--T--GGACTGACGATTAAATGGTGTCTA-AAT-TCTACCAATAGCTA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTGTTTTTTTTTT----CTACCTGGGTATTAAAGAGAG----------GCAATG---TCTTATAGACGGTTCCC-ATGATTT-TTTGAAATAG-TT-CC-cacttttaccatttctcaaaagtattttggacagcaatcatcatttgcagttaaagttgttgttgtcggcagcgtcacctttaagttgatgttatgtaacagtgg
gi|23 : -TAATTTATTATGTACAAT-T--GCT--TT--AT--C-GA---T-A-----TGTCCTCT-----------------C------------------TCC--T-----T-----A---TATG--------------A-----TT---------T
gi|23 : tcTCTCTCCT-TA---TATGATTTAC--T-T--TCT--TCTTATAGT-AA---T-T----TTAATTCCT-----------------T------------------CCG--G-----C-----A---TATT--------------T-----TT---------TTTA----A-CATCGACTTGGCTTT-TT-T-ATTATGTCTGATTCGCAAAACTAA-TTT----TGTTactttcttcttatagtaattttaattccttccggcatattttttttaacatcgacttggcttttttattatgtctgattcgcaaaactaattttgttcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|24 : tctaatttattatgtacaattgctttatcgatatgtccTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATTTAA-AA-T-A-GT--ATGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATACATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGGTGGACGATTCcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|25 : cggtattT---------TTTA----A-CATTGACTAAACCTA-TT-T-AT---ACCCAGTTTGTAAAACTAG-TTC----TGTGATGT
gi|26 : aTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATT-AA-AAAT-A-GT--GTGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATATATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATGGATTCCAATGGAtgcattaaccctttcccaagcaaaaagagtttatttgttaaagagagcaaaacattttgcagtcaataatgttgttgttgctgctgctgctgctgctgttgttgttgttgtcgtcgttgttaatgatgatagtgatggata
gi|27 : AA-GTTTA---AAA-AGAAGTATCA-ATACTTTTCAAA-TATATAACCACGCTAAAGAT--------AA----TCTTTCGATCAACG---TTTCAA--T-ACTAACATTGGCCTGTGT--AAAGT--ACATCAGGAG--T-TTTCGCTA------CC------AA--------------------GCT----AGCATAATCT-------AATTTATAATGTCCAAT-T--ATT--TC--AT--C-AG---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---tttt
gi|28 : atatt-----------GTTGAAGGTG-GGTGGAATTATTCATCCTGTTTTAGTACTTGT------ACATATT-GATGTAAAA----C------CCGAA---AGTGAAAATT--A----------TAAAA------------------CTAAATGTTCCATGTTATTCCATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-agtt
gi|3 : gACTTCAA----ATATCGAATCAGTGCAGGAAAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCCCA--TTAAAAC--ATAGTTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCATATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTT-----------------------CT----CTA-----GTC---AAGGGAG----------GTATTG---TCTGATGGGCTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-CT---------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTGAATgt
gi|3 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGGTGTTAGAATAACATTTTATTTG-AAA----TTATCAAATATGATCTATTAA--GTTTAATATTA-ACAAGTATAA-ACACTGTGCAAA-TATATAATCACACTAAAGATAATCTTTCAA----TC-----A--AAG----GTTTAA--TCATCAGCACTGGCCCGTGT--AAAAT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------AAGT--------------------T----AGCATAATTTATC---TAATTTATAATGTACAAT-T--CTT--TC--AT--C-AA---T-A-----TGTTCGCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATGAGTAATTTCCATTCC-----TTCCGGCGTCATTTTTCTGA-CATTGACTTAATTTT-TT-TCAT---GTCTGATTCGCAAAACCGG-TTT----TGTTATGTggtagattggtagtaattattgacaataatacaggtgttagaataacattttatttgaaattatcaaatatgatctattaagtttaatattaacaagtataaacactgtgcaaatatataatcacactaaagataatctttcaatcaaaggtttaatcatcagcactggcccgtgtaaaatacatcaggaggttttcgataccaagttagcataatttatctaatttataatgtacaattctttcatcaatatgttcgctctcctcatatgagtaatttccattccttccggcgtcatttttctgacattgacttaatttttttcatgtctgattcgcaaaaccggttttgttatgtccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|30 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttcaaatatcgaatcagtgcaggaaaccattaaagtagtttgtgttgtcgaattattatgcccattaaaacatagttgaatgatgtctaaattctatccatatctaatgtccatattatgtttcaataacgtatacatatttctctagtcaagggaggtattgtctgatgggctcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaatttgaatggta-A----TTTTTATTC-----------------C------------------TCCAGG-----C-----A---TCC---------------C-----TT---------CTTTTA--A-CATTGAGTAAAACAT-TT-T-AT---GTCGGATTCACAAACCTAccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|35 : cttcttaaaaaccatgTGCTTTGTATACGTTTTACTTGAA----ATATC-AATTAATGCAG--TAC------CAT
gi|37 : tatattcTGCTTCGTATACGTTTGGCTTCCA----ATATCGAATTAACGTAGGATA
gi|38 : gtactcTCTATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-T
gi|39 : atTGCTTTGCATGCGTTTAACTTCAG----ATATTGAATGAATGC
gi|4 : tcATCAA--A-GTTCATATTATGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTG----TTTTTTTTT-CTACCTGGGTATTAGAGGGAG----------GTAATG---TCCGATAGACGGTTCCC-A-AA-TTGTTTTAAATAG-TT-TC-A---A---GTCA--GGAACAGTG-TTTTGAAAAG--T-------ATTATTGGAAAACAATCTAAATCTGG-AAAA-GAAATATCATCATGCAAATCAC-CTCCTTCT--ATAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAATTAACGAAAC-TT------------TTT--CAGAAGGGTT-AAATATGCATGAGCTCAGA-AAGC-------GCATGGAAAACGTGCT-------------TATGGTA-------------------------------T--TT------ATTTAGCAATATACT--TTTT-----------GCTAAAAA-A-GTTTGAATTATTTACCCT------GTAC-TTT------ATAT--T-AATGT---AAGTTCCA----AC------AGT--AAATTTAA----------TACAA------------------CT----------CATAGTCCCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTTGTAGTAACAAT-TAACGA----CAAGGAT-ACA--TCT----ATAAC----GTTT-----A----TTATTAAGTAC------TAATA-CTGT--------GCAAATAT-------------------ATAACCGCACCAAAGAT--------AA----TC-----A--TAC----TTTAAA--TCACCAACAATGACCTGAGT--TAAGTACACCTCAGGAGGTT-TTTAGATA------TC------AATTCAAA-A-A--A--A--AAATT----GGCATAATCT--------ATTTCTAAT-T-CAATAT--G-----C--AT----AA---G-A----TT----------------------------------------------------------------TGC---------------------TT---------TTTA----A-CATTGACTGAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAA
gi|5 : tatataaagagcactttgaaTATTCATATCTG--ATG---ACA---------AATATT--TAATACATATTTATAATTATGATTCTG----GTTTCT----CTACACCGGTTTTAAAAGAAG----------GTTATG---TCCGGTAGATGGTCTCT--TCA-GT-TT-AAAATAG-CT-TTTA---A---GTCA--GGGACAGGG-TTTTTGAAAA--T-------ATAGCTGGAAAACAAAA-CAATTCGA-AAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAC-CTTCTTCA--ATAAACCTGGTGCATTC-GTTTCCAACTGCAAAAAA-ATTGTAGAAAAGTA-----CAGAGAGGTG-AAATATCCATGAACTCACG-TGGCCAGTAACGTA-TG-AAACAGGCTAACTCAGAAAGAGCATGTGAAACATGCTTGCTTGTATAGAAGAAATTTTTGTGGTAAATGATATTAAGCAATTTTTT--TTTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAG-G-AATGGAATGATTCATCCT------GTAC-TAT------ATA-A-T-CACGT---A----CACTCCAAC------AGT--AGATTTAACAACAGTTACTAAAATGTTTTATGTTGATAAAACT----------CAAAGATTTATGGTTTTA-TAATTCAATAC-C-GATTGTTAGTAATAAT-T---GA----CAAGAAT-ACAGGT------ATAAAATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGGATGATCTAT-AAA-GTGTA---TTA-ACAAATATTA-ACACTGTGCAA
gi|6 : ataATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--GT-TATGCTCA--T--GGACTGATAATTGAATGATTTCTATAAT-T-TATCC--ATCTACTATATCTACATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTTATAAT----A--CTG----GTGTCT----CTA-------A-TAAAGGGAG----------GTTATG---TCCGAAGGGTTCCTCCT-TTGA-AT-TTT-AATTAGCCT-TC-A---A---GTCAGTG--ACAGTGTTTTTTGAAAA--T-------ATAACTTGAACACAATTTAAAT
gi|6 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATAA----ATGA----CACGAAT-ACATGTGTTAGGATAACATCT-TTTTG-AAA----TGATCGAAAATGATCTATTAAG-TTTTA---T-A-ACAAATATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAAGCACAATAAAGAT--------AACCTTCC-----A--AACAGTGTTACAA--TCACCAATACTGACCTGTGT--TAAGT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------Aggtagattggtagtaataaatgacacgaatacatgtgttaggataacatctttttgaaatgatcgaaaatgatctattaagttttataacaaatattaacactgtgcaaatatataagcacaataaagataaccttccaaacagtgttacaatcaccaatactgacctgtgttaagtacatcaggaggttttcgataccaggc
gi|7 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaagataccattaaagtagtttgtgttgtcgaattgttatgctcatggactgataattgaatgatttctataatttatccatctactatatctacattatgtttcaataacgtatacatatttataatactggtgtctctaataaagggaggttatgtccgaagggttcctcctttgaattttaattagccttcaagtcagtgacagtgttttttgaaaatataacttgaacacaatttaaatggtaAAATCTTTG-----ATTTTTTTATCGGAAGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-CGGCTAGTAATGAA-GGAAAACATGCTATCTCAGAAAGCGCATGGTAAATGTGCT------TATGG----------TTT--TG------ATTTAGGAATTTATT--TTGT-----------CTTGAAAA-G-GATGGAAAAATTAATCCT------GTAC-TAT------ATA-G-T-GATGT---A----T------ACTGGAAAAGA--AAATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATTCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGGAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTAAGG-CAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTAT-AAA-GTATA---CCA-ATAAGTATTA-GCGCTGTGCAGA-TATATAACCGCAGCAAAGAT--------AA----TC-----C--AAC----TT------------GCAATG----GTAT--CAA-T--A--TCA----A-T-TTTAGA-------------------------A-T--A--A--AACTT----GGCATGATATATC-TGTAATTTAAAATGAACAAT-T--TTT--TC--AT--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----CTTCAGA---TTTA--------------C-----TT---------TTTA----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAGTTTT----TTTTATGTggc
gi|8 : aT------TGTGG----------TA----A------ATTTAACAAGTT-TTGATTTG-----------GTTCAAGG-G-TATGGAGTTATTCATCCT------ATAC-TAT------ATAT--T-GATGT---A----T------ACTCCAACAGT--AGATTTGA----------TAAGA------------------CT----------C-------CA---CGTTA-TCATTTACTACCT-GTTTGGTAGTATTAATAT--TGT----CAAGAAT-AAAAATGTAAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TT---GAGAATTATTTATAAA--GTTTA---TTA-A---GTAGTA-ACATTGTGCAAA-TATATAACCATAT----------------A----TC-----G--AAC----TTTAAA--TCATTTGAAATGGCCTGTGT--ATAGT--ACCTAAGGAGGGT-TTTGGATAACTAGACCTGATCGAGTT--AATA-C--A--G--AAGCT----AGTTTAATCTCTT-T----TCTATAATGTACAAC-TGGTTT--CC--AC--CTCA---T-AGGTTTTGCTTTCT-----------------TAATATATGGATTATTTGATTC--T-----T-----G---TAGG--------------CATTCATT---------TTTT----AGCAATGACTAAAACAT-TT-G-A-------TGATGGGCAAAACTAA-TTT----TGTTATGTcgtgttt
gi|9 : acaagacaTTG-ATGCGTTTGACTTAAA----AAATCAAATTAATACAGGGTACATATATCATT-AATAG-T-A-GA--TT----TGCGTAATA--T--ACATGTGC--A--T--GAACTGATAATTGAATGACGTTTA-AAA-TCTATCCATACCTT--ATGTCCAAATGTTATTTCATTATC---AGAACATATTTATAAT----A--CTG----GTTACT----CTACCAGGGTATAAAACGGAGGTCCAGAGCTGTAATG---TCCGATGAATGGTTCCCGTTGA-AT-TTTGAAACAGATT-TC-A---A---GTCAGGG--ATAATT-GTTTTGAAAA--T-------ATAACTGAAGAATAA-TTGCATTTGACCAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAG-CTGCTCCT--GTATACCTAATTCATT---TTTCCAGCTGAAGAAAA-TTCG-----AAAT-TTT--GAAAGGGATT--ATTATTCTCGAGATCACG-TGGTCAGTAATGTT-AGAAACTAGTCTGACCCAGAAAGCGCATGGCAAACATAAT------TATcgctttt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAAACATTTAATCATGTAATCACCGCCTGCTACTGCTCATGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGATGGTGTTGGTGATAATAATGACAATGGAGATACAAC
Unaligned ( gi|31 ): TGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGTTGATAACGGTGATTATGATGGTATGTGTGCTTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): GTTATTCTTTCCCAAGCAAAGAGTTTGTTTCCTTGTTGTTATCTAAGGATAAAAGAGCATTTTGGATAGC
Unaligned ( gi|33 ): TTAAAGCATTACCTGGCTTGATGACGGGCTGGCCTGAAATGAACCAGAAATTACTGA
Unaligned ( gi|34 ): TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTATTTGATGATATGACTGGAGAGACACTGTG
Unaligned ( gi|36 ): GNNNNNNNNNNTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1111 1111111111 111111111 333333333333333333333333 1111 11111 11 111111 22222222222222222222222 11111111111111111111111 111111 111111 77777777777777777777777777777 1111111111 333333333333333333333333333333333 11111111111 111111 11111111 8888888888888888888888888888888888 222222 22222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 2222222
lowQualScore : 2 6666 888888 3 3 3 3 3 44 88 5555555555555555 44 44 3 3 0 5 33 11 1 8888 5555 33 5555 0000 999 66 1111111111 444 0 000000000 2 1 555555555555555555555555 2 9999999999 2 4 4 9999 1 44 2 33333 3 555 4 55 4444 33 6 55 4 33 5 1 1 55 0 111111 22222222222222222222222 44 99999999999999999999999 1 55 4 2 111111 4 111111 3 55555555555555555555555555555 55 4 7777777777 222222222222222222222222222222222 1 3 2 2 22222222222 3 3 000000 0 3 7777 0 3 66 4 66666 3 2 3 0 3 0 11111111 6666 77777777 9999 88888888 1 555 55 1 9999 3 3333333333333333333333333333333333 2 8888 6 000000 1 0 3 999 33 33 5555 11111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 000000000 0000000 1 3 3 3 666 4 9999
lowQualScore : . .... ...... . . . . . .. .. ................ .. .. . . . . .. .. . .... .... .. .... .... ... .. .......... ... . ......... . . ........................ . .......... . . . .... . .. . ..... . ... . .. .... .. . .. . .. . . . .. . ...... ....................... .. ....................... . .. . . ...... . ...... . ............................. .. . .......... ................................. . . . . ........... . . ...... . . .... . . .. . ..... . . . . . . ........ .... ........ .... ........ . ... .. . .... . .................................. . .... . ...... . . . ... .. .. .... ........... ................................................................................. ......... ....... . . . . ... . ....
lowQualScore : 6 1111 888888 3 3 3 3 3 66 44 0000000000000000 22 22 1 1 8 9 77 44 2 0000 7777 77 7777 3333 555 11 7777777777 777 9 444444444 5 0 888888888888888888888888 9 4444444444 1 4 4 8888 9 11 3 00000 9 888 4 00 5555 44 3 55 4 44 0 0 0 00 2 555555 99999999999999999999999 11 33333333333333333333333 4 44 0 6 555555 0 555555 8 55555555555555555555555555555 55 8 5555555555 555555555555555555555555555555555 2 1 9 5 44444444444 1 8 111111 4 3 1111 8 5 99 0 33333 1 6 1 2 1 4 22222222 5555 88888888 6666 88888888 2 333 00 4 2222 5 3333333333333333333333333333333333 4 5555 5 666666 5 8 1 333 99 99 1111 77777777777 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777777777 3333333 8 6 6 6 444 4 4444
consensus : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-C-T-TCA---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT-A--T------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
Reference ( family-1691 ) : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-C-T-TCA---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT-A--T------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
gi|1 : ATTGCTGTGTATGTGTTTGACTTCAA----CTATTGAATTAATGCAGGATAC------CATA-AA-AA-T-A-GT--TAGTGCTGTGGAATA--T--AT--ATGC--A--T--GGGCTGATAATTGAATGATGTATA-AAT-TTAATCAATATATA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TGATACATATTTATAAT----A--CTG----AATTCT----CTACCTGGGTATTAAAGAAAA----------TTTATG---TCCCATGGACCCTTCCT-GTGA-TT-TTTGAAATAG-T-T-CCA---A---ATCA--G--AAAGTG-TTTTGGAAAA--TAAAAAAAATTATTAGAAAACAATGTAGATTTGA-AAAA-AATATATCACCATCCAAATTAT-CTCCTTC--TTTAAAACTGATTCATTCAGTTTTCTACTG-ATGAAAC-TT-TG-AATTTTTT--TAGAAGGGTT-AAATATTTATGAGCTCACATTGACCAGTAATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAAAAGCATGGTAAACATGCT------TATGG----------TAT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTAAAAA-ATGATGGAATTATTTATTCT------GTAC-TAT------ATAT-------------T------AC------AGT--AGATTTGA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATCCATGTTGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-AACGGTGTTAGGA-AACATCTGTTGTA-AGA----TTATCGAGTGTGATCTATAAAA-GTATA---TTA-ATAAGTATTG-ACACTATGCAAA-TATATAACGACACCAAAGGA--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAATAATAGCCTGTGC--TAAGT--ACCTCGGGAGG-TATTTAGATA------CC------AATTTCAG-ATC--A--A--AATTT----GGCATAATTTTTT-TATAATTTATAATGTACGAT-T--GTT--TC--AT--C-AA---TAA----TTGTTCTCT-----------------C------------------TTC--T-----C-----A---TAAG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACACT-TT-T-AT---GTTTGATTTGC-AAACT---TTT----TTTTGTGT
gi|10 : tTTGACTTCAA----ATATCGAAATAATGCAGGAAAT------CATT-AA-AG-T-A-GC--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCTCA--T--CGACTCATAATTGAATGACGCCTA-AAT-TCAAGCCATATCTA--ATGTCTACATTATGTTTCAATA--------ACGTATACATAA-----------------TTCT----CTA---G-----TAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGGTTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-C-T--------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTAAt
gi|10 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTAATGG-TAGATTGGTAGTAAGTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGATGGTAGAATAACATCTTATTTG-AAA----TTACCGAATATGATCTGTtggtagattggtagtaagtattgacaataatacagatggtagaataacatcttatttgaaattaccgaatatgatctgtgttaagt
gi|11 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacttcaaatatcgaaataatgcaggaaatcattaaagtagcttgtgttgtcgaattattatgctcatcgactcataattgaatgacgcctaaattcaagccatatctaatgtctacattatgtttcaataacgtatacataattctctagtaaagggaggtaatgtccgatgggttcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaCACGTTGTTA-TCACTTGTAAC-T-AATTGATAGTAAAAAT-----GA----CAAGAGT-ACACGTCCTA-------------CTTA-AGA----TTCTCGAGTTTGATCTATAAAG-GT-TA---TCA-AAAAGTATTA-GCATTGTGCAAT-TATATAACCACCCCAAAAAT--------AA----T-----------C----TTTCAATTTCATCAgttaagt
gi|11 : tTT--TC--AT--C-AG---T-A----T-GTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATG--------------A-----TT---------Tgtatgttctctctcctcatatgatttgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|11 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaaTCTCTC-C-TCAT--ATGATTTGCCCT-T---TT--TC--TT--C-AAG--T-A----ATTTTCTATTC---------------C------------------TTC--TGG---C-----A---TCCA--------------T-----TC---------TTTT----AACATTGACTAAATCTT-TTGT-AT---GCCTGATTTGCAAACATAG-GTTAATGTGTTAAGTgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|12 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaatttcatcagtatgttcTGTTGTAGAATT--T--TT-TATGC--ACAT--GGACTGATAATTAAATGGTGTCTA-AAT-TATATCTATATCCA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATGAC--GTGTACATATTCATACT----T--CTG----GTTACT----CTACAACGGTAATAAGGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGCTTCTTCCT-CTGA-AT-TTTGTATAAG-C-T-TTATTGACTTATCAGGG--AAAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGCAAACAATTTCAATTTTA-AAAATAATGCCTCA--ATGCAAATTAA-CTTCTCG--TGTAA--CTGA--CATTtgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|13 : atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaaatattgaatggaGTATTCGTTTGAATGCAACTGAATACTAAATTAATGCAGGAAAC------AATT-AA-AG-G-AAGT--TTGTGTTGCGGAA-A--G--GT-TACGCGCA--T--GGATTGATAATTGAATG--GTTGA-AATATATATCTATATTTA--ATGTCCACAGTGTGTTTCATTATC-------CACATTTGCAAT----A--CTG----GATACT----TTGTTTGGGTAATAAAGGGGT----------GTAATG---TACGTTTGGTGGATCCT-TAGA-GT-TTTGAAACAG------------------G--A--ACAGTA-TCTTTGACAA--T-------AAAACAGAAAAGCAATTTTAGTTTGG-AAAA-AATAC--CATCGTGCAATTAAC-CTTCTCCAAAGTGGACCTGATTCATTCAATTTCAAACTG-ACGAACA-TT-TGAAATTATTT--ttt
gi|14 : TTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-------GTTAGG----CATCTGTATTATAAA----T-----AATATGATAAATAAAG-TTACT---TTA-ACTAATATTT-CGACTGTGCAAAATATATCACATCATCACAGAC--------AC----TA-----A--AAC----TTTTA------CCAACCATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGCGG-A-TTTGGATA------CC--------TT---G-A-CCTG--ACCAATCT----GGCATAATCTCTC-T----TTTATTATGTATATC-T--TTT--TC--AT--C-AA---C-A-----AGTTCTCT-----------------C------------------CTT--T-----T-----ATGTTTTG--------------C-----TT---------TCTT------CTTTAGCTAtaacattgactaaacctattta
gi|15 : TACTTTGTATGTGTTTGACTTCAA----ATATCAAATAAATGTAGGATAC------CTTT-AA-AA-TTA-AT--TTGTGTTGTGGAATAGTT--AT--GCAC--A--T--GGACTGATAATTAAATGATACCTT-AAT-TCTCCTTATGTCCA--ATGTCAACATTGTGTTTCAATATA--TAACACATATTTATGAT----A--CTG----GTTTCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NN-NNNNNNNNNN-N-N-NNN---N---NNNN--N--NCAATG-TGTTTGATAA--G-------ATAATTGGTAAACATTTTTAGTTT---AAAA-AAT--ATCACCATGCAAATTACACTCgttttcattcctccaggcatcacttctttccaacatagtcaaaagatttttatatttgattcgccttgcaacactagtattggtatgtgg
gi|16 : tagtcGAAATAG-C-TATAA---A---GACA--GGAAAAGTG-TTTTTTAAAA------------------AAAA-AAT---AACTGGA-AAAC-AAT---------TG---ATT--------------TA--CCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TA--------------------------T-----------GTAAAAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TAT------A-ATA-TAGATAT-A--TAATTCAAC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CAAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAGCAAC-Taggtccttttataa
gi|17 : ---A---GACA--GGAACAGTG-TTTTTTAAAAACT-------ATAACTGGAAAACAATT
gi|17 : ACCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TC------AT---GTAA---------------------------AAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TAT------A-ATA-TAGATAT-A--TAATTCAAC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAACAAC-TGACGA----CAAGAAgatttacctgattcattcattttgcaactaacgaaaattttaaatatttcggaggggttaactattcattagctcacaggccagtaatgtaagaaaacaggctaattcagaaaaggcatggttaacgtatttatggtgttcatgtaaaaacggatggaattattcaacctgtactataatatagatatataattcaacagtatatttaataaaactcgaagatccatgtcgctatcttttactactgattggtagtaacaactgacgacaagaa
gi|18 : agacaggaacagtgttttttaaaaactataactggaaaacaattgatttGTTTTA-AAAAAACTCATTGA---TGATTT-TAAAATGCATG---TTATATAAATGATATAGA-TGGG---A-TATGTAACCACAGCATATAT--------AA----TC-----A--AAC----ATTTAT--TTATCAACAATGGTCTGTGT--AAAGT--ACATAAAGAGG-T-TTGGAAAA--------------AGTTCAAA-A-C--A--C--AAACT----GGCATAATCTCTC-T----TTTAAAATGTGCAAC-T--ATTTCTC--CT--C-AAACGT-T----TTGTTTTCTTCTTTAGTAAATTTAAAT------------------TCC--TTCAGGC-----A---TTCA--------------T-----TT---------TCTTTA--A-CATTGACTAAACTTT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAACTAA-TTT----TGTTATGT
gi|19 : -CTGCTGC--TGTGAACCGGGTTCATT---TTTTAAACGA-ATTAAAC-TT-TG-ACATCTTT--TGGAGGGGTT-AAATc
gi|19 : aagaaaaatgg------TATAA----------TGT--TA------ATAAAGCAAATTAGT--TTTG-----------GCTAAAGG-G-AATATACTTATTCATCAA------ATAC-TATTCATTGACATA-T-AATCC-A---------AC------AGT--A---TCAT----------TAAAA------------------CT----------AGAAGTTGCATGGTGTTATTTTTTTATTAC-T-GATTGGTAGTAACAAT------ATTCTCACGAAT-ACACGTGT---AATAACAtgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaatacacgtgtaataacaagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|19 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaataATACAC-GTGTA---ATA-ACAAGTATTA-ACAAAGCGCAAA-TATATAACCACACCACAAAT--------AT----TC-----A--AAC----Tagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|2 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaACTTCAA----ATATTGAATTTATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GTCATTACTTTGT--AATA--T--TT-TAT-C--A--T--GGACTGATAATTAAATGGAGTCTA-CAT-TCTATCAAAACCTA--ATGTTCACGTTGT-TTTCAATATC--TAATACATATTTACAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTACTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATAGACGGTTCCC-ATGT-GT-TTTTAAATAG-T-T-TCA---A---CACA--GGAACAGTG-TTTTGGAAAA--T-------ATATAAGGAAAACAATTTTAATTTGA-AAAA-AA-AAATTACCATGCAAGTTAC-CTCCT-----GTATACCTGATACGTTCAGTGTCCAACTG-ACAAAAC-TG-TG-ATTTTTTT--CGGAAGGGTTTAAATATTCATGATCTCACA-TGGCCAGTTATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAACCGCATGACAAACGTGCT------CATTG----------TAT--CA------ATTTAGCAATTTACT--TTTT-----------GTTGAAAA-A-GACTGAATTATTCA-----------CAT-TGT------ATAC------TCC-A---------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAGA------------------CT----------GTTAGATCCATGTCGTTA-CCATTCACTGC------TGGTAGTAACTAT-TGACGA----CAA-AATAACAGGTGTTA-GACAACATCTGTTTAA-AGA----TTAACGAATATGTTCCATAAAA--TATA---TAA-ATAAGTATTA-ACCCTGTTCAAA-TAAATAACAGCACC-AAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTTTA--GCACCAACAATGACCTCTGTTAAAAGT--ACCTCAGGAG--------------------------------AG---------A--AATTT----GGCATAATCTTTC-TCTAATTAATAATGTACAAT-T--GTT--TC--AC--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCT--T-----T-----A---TCAG--------------A-----TT---------GTCT----A--ATT
gi|20 : gtattTCAA----ATATCAATTTAATGCAGGATAC------CATT-AA-GA-T-A-AA--TTATGCT--------------------C--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTT-AAT-TAAATCCATATGTA--ATGTGAACACTAAATTTCAATAACGTTA--ACATATTCATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTA-------AACAAA-GGAG----------GTAATG---TCCGATG---GGTTA---ATTA-AT-GTTAAATTAG-C-T-TTAC--G---GTCAGGG--ACAGTG-TTTTTTAAAA--T-------ATAACTGTTAAACAATTTAAAT
gi|21 : -TATATAACCACATCACATAT--------AA----TC-----A--AAC----TT-------------------CCGGTGT--AATGA--TCCCCAGGAGG-G-TTTGGATA------C---------TT--GG-G-C--ATGA--ACACTTCAAAACACAATCTTTC-T-TAG---GTAAT------------TT--TC--AT-------------------------------------------------------------TCC--TTGAAGC-----A---TTCA--------------A-----TT---------TTTCTC--A-TATTGACCAA-CACTGTC-T-AT---GTCTGATTTGCAAAACTTG-TTT----TGTTATGTggtaggttggtagtagttaataaaaataatattggcgttaggatatcaccttatttgaaa
gi|22 : gTTGCTTTGTATGCGTTTAACTTCAA----ATATTGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AG-AT-T-A-GT--TAGTGCTATGGAATA--T--GTATGCGC--A--T--GGACTGACGATTAAATGGTGTCTA-AAT-TCTACCAATAGCTA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTGTTTTTTTTTT----CTACCTGGGTATTAAAGAGAG----------GCAATG---TCTTATAGACGGTTCCC-ATGATTT-TTTGAAATAG-T-T-CCcacttttaccatttctcaaaagtattttggacagcaatcatcatttgcagttaaagttgttgttgtcggcagcgtcacctttaagttgatgttatgtaacagtgg
gi|23 : -TAATTTATTATGTACAAT-T--GCT--TT--AT--C-GA---T-A-----TGTCCTCT-----------------C------------------TCC--T-----T-----A---TATG--------------A-----TT---------T
gi|23 : tcTCTCTCCT-TA---TATGATTTAC--T-T--TCT--TCTTATAGT-AA---T-T----TTAATTCCT-----------------T------------------CCG--G-----C-----A---TATT--------------T-----TT---------TTTA----A-CATCGACTTGGCTTT-TT-T-ATTATGTCTGATTCGCAAAACTAA-TTT----TGTTactttcttcttatagtaattttaattccttccggcatattttttttaacatcgacttggcttttttattatgtctgattcgcaaaactaattttgttcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|24 : tctaatttattatgtacaattgctttatcgatatgtccTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATTTAA-AA-T-A-GT--ATGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATACATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGGTGGACGATTCcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|25 : cggtattT---------TTTA----A-CATTGACTAAACCTA-TT-T-AT---ACCCAGTTTGTAAAACTAG-TTC----TGTGATGT
gi|26 : aTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATT-AA-AAAT-A-GT--GTGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATATATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATGGATTCCAATGGAtgcattaaccctttcccaagcaaaaagagtttatttgttaaagagagcaaaacattttgcagtcaataatgttgttgttgctgctgctgctgctgctgttgttgttgttgtcgtcgttgttaatgatgatagtgatggata
gi|27 : AA-GTTTA---AAA-AGAAGTATCA-ATACTTTTCAAA-TATATAACCACGCTAAAGAT--------AA----TCTTTCGATCAACG---TTTCAA--T-ACTAACATTGGCCTGTGT--AAAGT--ACATCAGGAG--T-TTTCGCTA------CC------AA--------------------GCT----AGCATAATCT-------AATTTATAATGTCCAAT-T--ATT--TC--AT--C-AG---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---tttt
gi|28 : atatt-----------GTTGAAGGTG-GGTGGAATTATTCATCCTGTTTTAGTACTTGT------ACATATT-GATGTAA--A------ACCCGAA-AGTGAAAATT--A----------TAAAA------------------CTAAATGTTCCATGTTATTCCATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-agtt
gi|3 : gACTTCAA----ATATCGAATCAGTGCAGGAAAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCCCA--TTAAAAC--ATAGTTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCATATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTT-----------------------CT----CTA-----GTC---AAGGGAG----------GTATTG---TCTGATGGGCTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-C-T--------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTGAATgt
gi|3 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGGTGTTAGAATAACATTTTATTTG-AAA----TTATCAAATATGATCTATTAA--GTTTAATATTA-ACAAGTATAA-ACACTGTGCAAA-TATATAATCACACTAAAGATAATCTTTCAA----TC-----A--AAG----GTTTAA--TCATCAGCACTGGCCCGTGT--AAAAT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------AAGT--------------------T----AGCATAATTTATC---TAATTTATAATGTACAAT-T--CTT--TC--AT--C-AA---T-A-----TGTTCGCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATGAGTAATTTCCATTCC-----TTCCGGCGTCATTTTTCTGA-CATTGACTTAATTTT-TT-TCAT---GTCTGATTCGCAAAACCGG-TTT----TGTTATGTggtagattggtagtaattattgacaataatacaggtgttagaataacattttatttgaaattatcaaatatgatctattaagtttaatattaacaagtataaacactgtgcaaatatataatcacactaaagataatctttcaatcaaaggtttaatcatcagcactggcccgtgtaaaatacatcaggaggttttcgataccaagttagcataatttatctaatttataatgtacaattctttcatcaatatgttcgctctcctcatatgagtaatttccattccttccggcgtcatttttctgacattgacttaatttttttcatgtctgattcgcaaaaccggttttgttatgtccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|30 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttcaaatatcgaatcagtgcaggaaaccattaaagtagtttgtgttgtcgaattattatgcccattaaaacatagttgaatgatgtctaaattctatccatatctaatgtccatattatgtttcaataacgtatacatatttctctagtcaagggaggtattgtctgatgggctcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaatttgaatggta-A----TTTTTATTC-----------------C------------------TCCAGG-----C-----A---TCC---------------C-----TT---------CTTTTA--A-CATTGAGTAAAACAT-TT-T-AT---GTCGGATTCACAAACCTAccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|35 : cttcttaaaaaccatgTGCTTTGTATACGTTTTACTTGAA----ATATC-AATTAATGCAG--TAC------CAT
gi|37 : tatattcTGCTTCGTATACGTTTGGCTTCCA----ATATCGAATTAACGTAGGATA
gi|38 : gtactcTCTATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-T
gi|39 : atTGCTTTGCATGCGTTTAACTTCAG----ATATTGAATGAATGC
gi|4 : tcATCAA--A-GTTCATATTATGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTG----TTTTTTTTT-CTACCTGGGTATTAGAGGGAG----------GTAATG---TCCGATAGACGGTTCCC-A-AA-TTGTTTTAAATAG-T-T-TCA---A---GTCA--GGAACAGTG-TTTTGAAAAG--T-------ATTATTGGAAAACAATCTAAATCTGG-AAAA-GAAATATCATCATGCAAATCAC-CTCCTTC--TATAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAATTA-ACGAAAC-TT---------TTT--CAGAAGGGTT-AAATATGCATGAGCTCAGA-AAGC-------GCATGGAAAACGTGCT-------------TATGGTA-------------------------------T--TT------ATTTAGCAATATACT--TTTT-----------GCTAAAAA-A-GTTTGAATTATTTACCCT------GTAC-TTT------ATAT--T-AATGT-AAGTTCCA--AC------AGT--AAATTTAA----------TACAA------------------CT----------CATAGTCCCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTTGTAGTAACAAT-TAACGA----CAAGGAT-ACA--TCT----ATAAC----GTTT-----A----TTATTAAGTAC------TAATA-CTGT--------GCAAATAT-------------------ATAACCGCACCAAAGAT--------AA----TC-----A--TAC----TTTAAA--TCACCAACAATGACCTGAGT--TAAGTACACCTCAGGAGGTT-TTTAGATA------TC------AATTCAAA-A-A--A--A--AAATT----GGCATAATCT--------ATTTCTAAT-T-CAATAT--G-----C--AT----AA---G-A----TT----------------------------------------------------------------TGC---------------------TT---------TTTA----A-CATTGACTGAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAA
gi|5 : tatataaagagcactttgaaTATTCATATCTG--ATG---ACA---------AATATT--TAATACATATTTATAATTATGATTCTG----GTTTCT----CTACACCGGTTTTAAAAGAAG----------GTTATG---TCCGGTAGATGGTCTCT--TCA-G--TTTAAAATAG-CTT-TTA---A---GTCAGGG--ACAGGG-TTTTTGAAAA--T-------ATAGCTGGAAAACAA-AACAATTCGA-AAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAC-CTTCTTC--AATAAACCTGGTGCATTC-GTTTCCAACTGCAAAAAAA-TTGTA-GAAAAGTA--CAGAGAGGTG-AAATATCCATGAACTCACG-TGGCCAGTAACGTA-TG-AAACAGGCTAACTCAGAAAGAGCATGTGAAACATGCTTGCTTGTATAGAAGAAATTTTTGTGGTAAATGATATTAAGCAATTTTTT--TTTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAG-G-AATGGAATGATTCATCCT------GTAC-TAT------ATA-A-T-CACGT-A--CACTCCAAC------AGT--AGATTTAACAACAGTTACTAAAATGTTTTATGTTGATAAAACT----------CAAAGATTTATGGTTTTA-TAATTCAATAC-C-GATTGTTAGTAATAAT-T---GA----CAAGAAT-ACAGGT------ATAAAATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGGATGATCTAT-AAA-GTGTA---TTA-ACAAATATTA-ACACTGTGCAA
gi|6 : ataATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--GT-TATGCTCA--T--GGACTGATAATTGAATGATTTCTATAAT-T-TATCC--ATCTACTATATCTACATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTTATAAT----A--CTG----GTGTCT----CTA-------A-TAAAGGGAG----------GTTATG---TCCGAAGGGTTCCTCCT-TTGA-AT-TTT-AATTAGCC-T-TCA---A---GTCAGTG--ACAGTGTTTTTTGAAAA--T-------ATAACTTGAACACAATTTAAAT
gi|6 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATAA----ATGA----CACGAAT-ACATGTGTTAGGATAACATCT-TTTTG-AAA----TGATCGAAAATGATCTATTAAG-TTTTA---T-A-ACAAATATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAAGCACAATAAAGAT--------AACCTTCC-----A--AACAGTGTTACAA--TCACCAATACTGACCTGTGT--TAAGT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------Aggtagattggtagtaataaatgacacgaatacatgtgttaggataacatctttttgaaatgatcgaaaatgatctattaagttttataacaaatattaacactgtgcaaatatataagcacaataaagataaccttccaaacagtgttacaatcaccaatactgacctgtgttaagtacatcaggaggttttcgataccaggc
gi|7 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaagataccattaaagtagtttgtgttgtcgaattgttatgctcatggactgataattgaatgatttctataatttatccatctactatatctacattatgtttcaataacgtatacatatttataatactggtgtctctaataaagggaggttatgtccgaagggttcctcctttgaattttaattagccttcaagtcagtgacagtgttttttgaaaatataacttgaacacaatttaaatggtaAAATCTT-TG-ATTTTTTTATCGGAAGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-CGGCTAGTAATGAA-GGAAAACATGCTATCTCAGAAAGCGCATGGTAAATGTGCT------TATGG----------TTT--TG------ATTTAGGAATTTATT--TTGT-----------CTTGAAAA-G-GATGGAAAAATTAATCCT------GTAC-TAT------ATA-G-T-GATGT-A--T------ACTGGAAAAGA--AAATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATTCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGGAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTAAGG-CAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTAT-AAA-GTATA---CCA-ATAAGTATTA-GCGCTGTGCAGA-TATATAACCGCAGCAAAGAT--------AA----TC-----C--AAC----TT------------GCAATG----GTAT--CAA-T--A--TCA----A-T-TTTAGA-------------------------A-T--A--A--AACTT----GGCATGATATATC-TGTAATTTAAAATGAACAAT-T--TTT--TC--AT--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----CTTCAGA---TTTA--------------C-----TT---------TTTA----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAGTTTT----TTTTATGTggc
gi|8 : aT------TGTGG----------TA----A------ATTTAACAAGTT-TTGATTTG-----------GTTCAAGG-G-TATGGAGTTATTCATCCT------ATAC-TAT------ATAT--T-GATGT-A--T------ACTCCAACAGT--AGATTTGA----------TAAGA------------------CT----------C-------CA---CGTTA-TCATTTACTACCT-GTTTGGTAGTATTAATAT--TGT----CAAGAAT-AAAAATGTAAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TT---GAGAATTATTTATAAA--GTTTA---TTA-A---GTAGTA-ACATTGTGCAAA-TATATAACCATAT----------------A----TC-----G--AAC----TTTAAA--TCATTTGAAATGGCCTGTGT--ATAGT--ACCTAAGGAGGGT-TTTGGATAACTAGACCTGATCGAGTT--AATA-C--A--G--AAGCT----AGTTTAATCTCTT-T----TCTATAATGTACAAC-TGGTTT--CC--AC--CTCA---T-AGGTTTTGCTTTCT-----------------TAATATATGGATTATTTGATTC--T-----T-----G---TAGG--------------CATTCATT---------TTTT----AGCAATGACTAAAACAT-TT-G-A-------TGATGGGCAAAACTAA-TTT----TGTTATGTcgtgttt
gi|9 : acaagacaTTG-ATGCGTTTGACTTAAA----AAATCAAATTAATACAGGGTACATATATCATT-AATAG-T-A-GA--TT----TGCGTAATA--T--ACATGTGC--A--T--GAACTGATAATTGAATGACGTTTA-AAA-TCTATCCATACCTT--ATGTCCAAATGTTATTTCATTATC---AGAACATATTTATAAT----A--CTG----GTTACT----CTACCAGGGTATAAAACGGAGGTCCAGAGCTGTAATG---TCCGATGAATGGTTCCCGTTGA-AT-TTTGAAACAGAT-T-TCA---A---GTCAGGG--ATAATT-GTTTTGAAAA--T-------ATAACTGAAGAATAA-TTGCATTTGACCAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAG-CTGCTCC--TGTATACCTAATTCATT---TTTCCAGCTG-AAGAAAA-TT-CG-AAAT-TTT--GAAAGGGATT--ATTATTCTCGAGATCACG-TGGTCAGTAATGTT-AGAAACTAGTCTGACCCAGAAAGCGCATGGCAAACATAAT------TATcgctttt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAAACATTTAATCATGTAATCACCGCCTGCTACTGCTCATGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGATGGTGTTGGTGATAATAATGACAATGGAGATACAAC
Unaligned ( gi|31 ): TGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGTTGATAACGGTGATTATGATGGTATGTGTGCTTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): GTTATTCTTTCCCAAGCAAAGAGTTTGTTTCCTTGTTGTTATCTAAGGATAAAAGAGCATTTTGGATAGC
Unaligned ( gi|33 ): TTAAAGCATTACCTGGCTTGATGACGGGCTGGCCTGAAATGAACCAGAAATTACTGA
Unaligned ( gi|34 ): TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTATTTGATGATATGACTGGAGAGACACTGTG
Unaligned ( gi|36 ): GNNNNNNNNNNTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1111 1111111111 111111111 333333333333333333333333 1111 11111 11 111111 22222222222222222222222 11111111111111111111111 111111 111111 77777777777777777777777777777 1111111111 333333333333333333333333333333333 11111111111 111111 11111111 8888888888888888888888888888888888 222222 22222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 2222222
lowQualScore : 2 6666 888888 3 3 3 3 3 44 88 5555555555555555 44 44 3 3 0 5 33 11 1 8888 5555 33 5555 0000 999 66 1111111111 444 0 000000000 2 1 555555555555555555555555 2 9999999999 2 4 4 9999 1 44 2 33333 3 555 4 55 4444 33 6 55 4 33 5 1 1 55 0 111111 22222222222222222222222 44 99999999999999999999999 1 55 4 2 111111 4 111111 3 55555555555555555555555555555 55 4 7777777777 222222222222222222222222222222222 1 3 2 2 22222222222 3 3 000000 0 3 7777 0 3 66 4 66666 3 2 3 0 3 0 11111111 6666 77777777 9999 88888888 1 555 55 1 9999 3 3333333333333333333333333333333333 2 8888 6 000000 1 0 3 999 33 33 5555 11111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 000000000 0000000 1 3 3 3 666 4 9999
lowQualScore : . .... ...... . . . . . .. .. ................ .. .. . . . . .. .. . .... .... .. .... .... ... .. .......... ... . ......... . . ........................ . .......... . . . .... . .. . ..... . ... . .. .... .. . .. . .. . . . .. . ...... ....................... .. ....................... . .. . . ...... . ...... . ............................. .. . .......... ................................. . . . . ........... . . ...... . . .... . . .. . ..... . . . . . . ........ .... ........ .... ........ . ... .. . .... . .................................. . .... . ...... . . . ... .. .. .... ........... ................................................................................. ......... ....... . . . . ... . ....
lowQualScore : 6 1111 888888 3 3 3 3 3 66 44 0000000000000000 22 22 1 1 8 9 77 44 2 0000 7777 77 7777 3333 555 11 7777777777 777 9 444444444 5 0 888888888888888888888888 9 4444444444 1 4 4 8888 9 11 3 00000 9 888 4 00 5555 44 3 55 4 44 0 0 0 00 2 555555 99999999999999999999999 11 33333333333333333333333 4 44 0 6 555555 0 555555 8 55555555555555555555555555555 55 8 5555555555 555555555555555555555555555555555 2 1 9 5 44444444444 1 8 111111 4 3 1111 8 5 99 0 33333 1 6 1 2 1 4 22222222 5555 88888888 6666 88888888 2 333 00 4 2222 5 3333333333333333333333333333333333 4 5555 5 666666 5 8 1 333 99 99 1111 77777777777 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777777777 3333333 8 6 6 6 444 4 4444
consensus : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-C-T-TCA---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT-A--T------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
Reference ( family-1691 ) : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-C-T-TCA---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT-A--T------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
gi|1 : ATTGCTGTGTATGTGTTTGACTTCAA----CTATTGAATTAATGCAGGATAC------CATA-AA-AA-T-A-GT--TAGTGCTGTGGAATA--T--AT--ATGC--A--T--GGGCTGATAATTGAATGATGTATA-AAT-TTAATCAATATATA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TGATACATATTTATAAT----A--CTG----AATTCT----CTACCTGGGTATTAAAGAAAA----------TTTATG---TCCCATGGACCCTTCCT-GTGA-TT-TTTGAAATAG-T-T-CCA---A---ATCA--G--AAAGTG-TTTTGGAAAA--TAAAAAAAATTATTAGAAAACAATGTAGATTTGA-AAAA-AATATATCACCATCCAAATTAT-CTCCTTC--TTTAAAACTGATTCATTCAGTTTTCTACTG-ATGAAAC-TT-TG-AATTTTTT--TAGAAGGGTT-AAATATTTATGAGCTCACATTGACCAGTAATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAAAAGCATGGTAAACATGCT------TATGG----------TAT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTAAAAA-ATGATGGAATTATTTATTCT------GTAC-TAT------ATAT-------------T------AC------AGT--AGATTTGA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATCCATGTTGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-AACGGTGTTAGGA-AACATCTGTTGTA-AGA----TTATCGAGTGTGATCTATAAAA-GTATA---TTA-ATAAGTATTG-ACACTATGCAAA-TATATAACGACACCAAAGGA--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAATAATAGCCTGTGC--TAAGT--ACCTCGGGAGG-TATTTAGATA------CC------AATTTCAG-ATC--A--A--AATTT----GGCATAATTTTTT-TATAATTTATAATGTACGAT-T--GTT--TC--AT--C-AA---TAA----TTGTTCTCT-----------------C------------------TTC--T-----C-----A---TAAG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACACT-TT-T-AT---GTTTGATTTGC-AAACT---TTT----TTTTGTGT
gi|10 : tTTGACTTCAA----ATATCGAAATAATGCAGGAAAT------CATT-AA-AG-T-A-GC--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCTCA--T--CGACTCATAATTGAATGACGCCTA-AAT-TCAAGCCATATCTA--ATGTCTACATTATGTTTCAATA--------ACGTATACATAA-----------------TTCT----CTA---G-----TAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGGTTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-C-T--------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTAAt
gi|10 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTAATGG-TAGATTGGTAGTAAGTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGATGGTAGAATAACATCTTATTTG-AAA----TTACCGAATATGATCTGTtggtagattggtagtaagtattgacaataatacagatggtagaataacatcttatttgaaattaccgaatatgatctgtgttaagt
gi|11 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacttcaaatatcgaaataatgcaggaaatcattaaagtagcttgtgttgtcgaattattatgctcatcgactcataattgaatgacgcctaaattcaagccatatctaatgtctacattatgtttcaataacgtatacataattctctagtaaagggaggtaatgtccgatgggttcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaCACGTTGTTA-TCACTTGTAAC-T-AATTGATAGTAAAAAT-----GA----CAAGAGT-ACACGTCCTA-------------CTTA-AGA----TTCTCGAGTTTGATCTATAAAG-GT-TA---TCA-AAAAGTATTA-GCATTGTGCAAT-TATATAACCACCCCAAAAAT--------AA----T-----------C----TTTCAATTTCATCAgttaagt
gi|11 : tTT--TC--AT--C-AG---T-A----T-GTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATG--------------A-----TT---------Tgtatgttctctctcctcatatgatttgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|11 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaaTCTCTC-C-TCAT--ATGATTTGCCCT-T---TT--TC--TT--C-AAG--T-A----ATTTTCTATTC---------------C------------------TTC--TGG---C-----A---TCCA--------------T-----TC---------TTTT----AACATTGACTAAATCTT-TTGT-AT---GCCTGATTTGCAAACATAG-GTTAATGTGTTAAGTgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|12 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaatttcatcagtatgttcTGTTGTAGAATT--T--TT-TATGC--ACAT--GGACTGATAATTAAATGGTGTCTA-AAT-TATATCTATATCCA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATGAC--GTGTACATATTCATACT----T--CTG----GTTACT----CTACAACGGTAATAAGGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGCTTCTTCCT-CTGA-AT-TTTGTATAAG-C-T-TTATTGACTTATCAGGG--AAAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGCAAACAATTTCAATTTTA-AAAATAATGCCTCA--ATGCAAATTAA-CTTCTCG--TGTAA--CTGA--CATTtgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|13 : atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaaatattgaatggaGTATTCGTTTGAATGCAACTGAATACTAAATTAATGCAGGAAAC------AATT-AA-AG-G-AAGT--TTGTGTTGCGGAA-A--G--GT-TACGCGCA--T--GGATTGATAATTGAATG--GTTGA-AATATATATCTATATTTA--ATGTCCACAGTGTGTTTCATTATC-------CACATTTGCAAT----A--CTG----GATACT----TTGTTTGGGTAATAAAGGGGT----------GTAATG---TACGTTTGGTGGATCCT-TAGA-GT-TTTGAAACAG------------------G--A--ACAGTA-TCTTTGACAA--T-------AAAACAGAAAAGCAATTTTAGTTTGG-AAAA-AATAC--CATCGTGCAATTAAC-CTTCTCCAAAGTGGACCTGATTCATTCAATTTCAAACTG-ACGAACA-TT-TGAAATTATTT--ttt
gi|14 : TTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-------GTTAGG----CATCTGTATTATAAA----T-----AATATGATAAATAAAG-TTACT---TTA-ACTAATATTT-CGACTGTGCAAAATATATCACATCATCACAGAC--------AC----TA-----A--AAC----TTTTA------CCAACCATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGCGG-A-TTTGGATA------CC--------TT---G-A-CCTG--ACCAATCT----GGCATAATCTCTC-T----TTTATTATGTATATC-T--TTT--TC--AT--C-AA---C-A-----AGTTCTCT-----------------C------------------CTT--T-----T-----ATGTTTTG--------------C-----TT---------TCTT------CTTTAGCTAtaacattgactaaacctattta
gi|15 : TACTTTGTATGTGTTTGACTTCAA----ATATCAAATAAATGTAGGATAC------CTTT-AA-AA-TTA-AT--TTGTGTTGTGGAATAGTT--AT--GCAC--A--T--GGACTGATAATTAAATGATACCTT-AAT-TCTCCTTATGTCCA--ATGTCAACATTGTGTTTCAATATA--TAACACATATTTATGAT----A--CTG----GTTTCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NN-NNNNNNNNNN-N-N-NNN---N---NNNN--N--NCAATG-TGTTTGATAA--G-------ATAATTGGTAAACATTTTTAGTTT---AAAA-AAT--ATCACCATGCAAATTACACTCgttttcattcctccaggcatcacttctttccaacatagtcaaaagatttttatatttgattcgccttgcaacactagtattggtatgtgg
gi|16 : tagtcGAAATAG-C-TATAA---A---GACA--GGAAAAGTG-TTTTTTAAAA------------------AAAA-AAT---AACTGGA-AAAC-AAT---------TG---ATT--------------TA--CCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TA--------------------------T-----------GTAAAAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TAT------A-ATA-TAGATAT-A--TAATTCAAC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CAAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAGCAAC-Taggtccttttataa
gi|17 : ---A---GACA--GGAACAGTG-TTTTTTAAAAACT-------ATAACTGGAAAACAATT
gi|17 : ACCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TC------AT---GTAA---------------------------AAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TAT------A-ATA-TAGATAT-A--TAATTCAAC------AGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAACAAC-TGACGA----CAAGAAgatttacctgattcattcattttgcaactaacgaaaattttaaatatttcggaggggttaactattcattagctcacaggccagtaatgtaagaaaacaggctaattcagaaaaggcatggttaacgtatttatggtgttcatgtaaaaacggatggaattattcaacctgtactataatatagatatataattcaacagtatatttaataaaactcgaagatccatgtcgctatcttttactactgattggtagtaacaactgacgacaagaa
gi|18 : agacaggaacagtgttttttaaaaactataactggaaaacaattgatttGTTTTA-AAAAAACTCATTGA---TGATTT-TAAAATGCATG---TTATATAAATGATATAGA-TGGG---A-TATGTAACCACAGCATATAT--------AA----TC-----A--AAC----ATTTAT--TTATCAACAATGGTCTGTGT--AAAGT--ACATAAAGAGG-T-TTGGAAAA--------------AGTTCAAA-A-C--A--C--AAACT----GGCATAATCTCTC-T----TTTAAAATGTGCAAC-T--ATTTCTC--CT--C-AAACGT-T----TTGTTTTCTTCTTTAGTAAATTTAAAT------------------TCC--TTCAGGC-----A---TTCA--------------T-----TT---------TCTTTA--A-CATTGACTAAACTTT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAACTAA-TTT----TGTTATGT
gi|19 : -CTGCTGC--TGTGAACCGGGTTCATT---TTTTAAACGA-ATTAAAC-TT-TG-ACATCTTT--TGGAGGGGTT-AAATc
gi|19 : aagaaaaatgg------TATAA----------TGT--TA------ATAAAGCAAATTAGT--TTTG-----------GCTAAAGG-G-AATATACTTATTCATCAA------ATAC-TATTCATTGACATA-T-AATCC-A---------AC------AGT--A---TCAT----------TAAAA------------------CT----------AGAAGTTGCATGGTGTTATTTTTTTATTAC-T-GATTGGTAGTAACAAT------ATTCTCACGAAT-ACACGTGT---AATAACAtgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaatacacgtgtaataacaagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|19 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaataATACAC-GTGTA---ATA-ACAAGTATTA-ACAAAGCGCAAA-TATATAACCACACCACAAAT--------AT----TC-----A--AAC----Tagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|2 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaACTTCAA----ATATTGAATTTATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GTCATTACTTTGT--AATA--T--TT-TAT-C--A--T--GGACTGATAATTAAATGGAGTCTA-CAT-TCTATCAAAACCTA--ATGTTCACGTTGT-TTTCAATATC--TAATACATATTTACAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTACTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATAGACGGTTCCC-ATGT-GT-TTTTAAATAG-T-T-TCA---A---CACA--GGAACAGTG-TTTTGGAAAA--T-------ATATAAGGAAAACAATTTTAATTTGA-AAAA-AA-AAATTACCATGCAAGTTAC-CTCCT-----GTATACCTGATACGTTCAGTGTCCAACTG-ACAAAAC-TG-TG-ATTTTTTT--CGGAAGGGTTTAAATATTCATGATCTCACA-TGGCCAGTTATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAACCGCATGACAAACGTGCT------CATTG----------TAT--CA------ATTTAGCAATTTACT--TTTT-----------GTTGAAAA-A-GACTGAATTATTCA-----------CAT-TGT------ATAC------TCC-A---------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAGA------------------CT----------GTTAGATCCATGTCGTTA-CCATTCACTGC------TGGTAGTAACTAT-TGACGA----CAA-AATAACAGGTGTTA-GACAACATCTGTTTAA-AGA----TTAACGAATATGTTCCATAAAA--TATA---TAA-ATAAGTATTA-ACCCTGTTCAAA-TAAATAACAGCACC-AAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTTTA--GCACCAACAATGACCTCTGTTAAAAGT--ACCTCAGGAG--------------------------------AG---------A--AATTT----GGCATAATCTTTC-TCTAATTAATAATGTACAAT-T--GTT--TC--AC--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCT--T-----T-----A---TCAG--------------A-----TT---------GTCT----A--ATT
gi|20 : gtattTCAA----ATATCAATTTAATGCAGGATAC------CATT-AA-GA-T-A-AA--TTATGCT--------------------C--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTT-AAT-TAAATCCATATGTA--ATGTGAACACTAAATTTCAATAACGTTA--ACATATTCATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTA-------AACAAA-GGAG----------GTAATG---TCCGATG---GGTTA---ATTA-AT-GTTAAATTAG-C-T-TTAC--G---GTCAGGG--ACAGTG-TTTTTTAAAA--T-------ATAACTGTTAAACAATTTAAAT
gi|21 : -TATATAACCACATCACATAT--------AA----TC-----A--AAC----TT-------------------CCGGTGT--AATGA--TCCCCAGGAGG-G-TTTGGATA------C---------TT--GG-G-C--ATGA--ACACTTCAAAACACAATCTTTC-T-TAG---GTAAT------------TT--TC--AT-------------------------------------------------------------TCC--TTGAAGC-----A---TTCA--------------A-----TT---------TTTCTC--A-TATTGACCAA-CACTGTC-T-AT---GTCTGATTTGCAAAACTTG-TTT----TGTTATGTggtaggttggtagtagttaataaaaataatattggcgttaggatatcaccttatttgaaa
gi|22 : gTTGCTTTGTATGCGTTTAACTTCAA----ATATTGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AG-AT-T-A-GT--TAGTGCTATGGAATA--T--GTATGCGC--A--T--GGACTGACGATTAAATGGTGTCTA-AAT-TCTACCAATAGCTA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTGTTTTTTTTTT----CTACCTGGGTATTAAAGAGAG----------GCAATG---TCTTATAGACGGTTCCC-ATGATTT-TTTGAAATAG-T-T-CCcacttttaccatttctcaaaagtattttggacagcaatcatcatttgcagttaaagttgttgttgtcggcagcgtcacctttaagttgatgttatgtaacagtgg
gi|23 : -TAATTTATTATGTACAAT-T--GCT--TT--AT--C-GA---T-A-----TGTCCTCT-----------------C------------------TCC--T-----T-----A---TATG--------------A-----TT---------T
gi|23 : tcTCTCTCCT-TA---TATGATTTAC--T-T--TCT--TCTTATAGT-AA---T-T----TTAATTCCT-----------------T------------------CCG--G-----C-----A---TATT--------------T-----TT---------TTTA----A-CATCGACTTGGCTTT-TT-T-ATTATGTCTGATTCGCAAAACTAA-TTT----TGTTactttcttcttatagtaattttaattccttccggcatattttttttaacatcgacttggcttttttattatgtctgattcgcaaaactaattttgttcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|24 : tctaatttattatgtacaattgctttatcgatatgtccTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATTTAA-AA-T-A-GT--ATGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATACATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGGTGGACGATTCcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|25 : cggtattT---------TTTA----A-CATTGACTAAACCTA-TT-T-AT---ACCCAGTTTGTAAAACTAG-TTC----TGTGATGT
gi|26 : aTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATT-AA-AAAT-A-GT--GTGTGTTGCTGAATA--TTGAT--GCGC--A--T--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATATATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTTTTAAAGGGAG----------GTAATGGATTCCAATGGAtgcattaaccctttcccaagcaaaaagagtttatttgttaaagagagcaaaacattttgcagtcaataatgttgttgttgctgctgctgctgctgctgttgttgttgttgtcgtcgttgttaatgatgatagtgatggata
gi|27 : AA-GTTTA---AAA-AGAAGTATCA-ATACTTTTCAAA-TATATAACCACGCTAAAGAT--------AA----TCTTTCGATCAACG---TTTCAA--T-ACTAACATTGGCCTGTGT--AAAGT--ACATCAGGAG--T-TTTCGCTA------CC------AA--------------------GCT----AGCATAATCT-------AATTTATAATGTCCAAT-T--ATT--TC--AT--C-AG---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---tttt
gi|28 : atatt-----------GTTGAAGGTG-GGTGGAATTATTCATCCTGTTTTAGTACTTGT------ACATATT-GATGTAA--A------ACCCGAA-AGTGAAAATT--A----------TAAAA------------------CTAAATGTTCCATGTTATTCCATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-agtt
gi|3 : gACTTCAA----ATATCGAATCAGTGCAGGAAAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--AT-TATGCCCA--TTAAAAC--ATAGTTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCATATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTT-----------------------CT----CTA-----GTC---AAGGGAG----------GTATTG---TCTGATGGGCTCTTCCT-CTG-------TAAATTAG-C-T--------------A--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTGAATgt
gi|3 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGGTGTTAGAATAACATTTTATTTG-AAA----TTATCAAATATGATCTATTAA--GTTTAATATTA-ACAAGTATAA-ACACTGTGCAAA-TATATAATCACACTAAAGATAATCTTTCAA----TC-----A--AAG----GTTTAA--TCATCAGCACTGGCCCGTGT--AAAAT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------AAGT--------------------T----AGCATAATTTATC---TAATTTATAATGTACAAT-T--CTT--TC--AT--C-AA---T-A-----TGTTCGCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TATGAGTAATTTCCATTCC-----TTCCGGCGTCATTTTTCTGA-CATTGACTTAATTTT-TT-TCAT---GTCTGATTCGCAAAACCGG-TTT----TGTTATGTggtagattggtagtaattattgacaataatacaggtgttagaataacattttatttgaaattatcaaatatgatctattaagtttaatattaacaagtataaacactgtgcaaatatataatcacactaaagataatctttcaatcaaaggtttaatcatcagcactggcccgtgtaaaatacatcaggaggttttcgataccaagttagcataatttatctaatttataatgtacaattctttcatcaatatgttcgctctcctcatatgagtaatttccattccttccggcgtcatttttctgacattgacttaatttttttcatgtctgattcgcaaaaccggttttgttatgtccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|30 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttcaaatatcgaatcagtgcaggaaaccattaaagtagtttgtgttgtcgaattattatgcccattaaaacatagttgaatgatgtctaaattctatccatatctaatgtccatattatgtttcaataacgtatacatatttctctagtcaagggaggtattgtctgatgggctcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaatttgaatggta-A----TTTTTATTC-----------------C------------------TCCAGG-----C-----A---TCC---------------C-----TT---------CTTTTA--A-CATTGAGTAAAACAT-TT-T-AT---GTCGGATTCACAAACCTAccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|35 : cttcttaaaaaccatgTGCTTTGTATACGTTTTACTTGAA----ATATC-AATTAATGCAG--TAC------CAT
gi|37 : tatattcTGCTTCGTATACGTTTGGCTTCCA----ATATCGAATTAACGTAGGATA
gi|38 : gtactcTCTATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-T
gi|39 : atTGCTTTGCATGCGTTTAACTTCAG----ATATTGAATGAATGC
gi|4 : tcATCAA--A-GTTCATATTATGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTG----TTTTTTTTT-CTACCTGGGTATTAGAGGGAG----------GTAATG---TCCGATAGACGGTTCCC-A-AA-TTGTTTTAAATAG-T-T-TCA---A---GTCA--GGAACAGTG-TTTTGAAAAG--T-------ATTATTGGAAAACAATCTAAATCTGG-AAAA-GAAATATCATCATGCAAATCAC-CTCCTTC--TATAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAATTA-ACGAAAC-TT---------TTT--CAGAAGGGTT-AAATATGCATGAGCTCAGA-AAGC-------GCATGGAAAACGTGCT-------------TATGGTA-------------------------------T--TT------ATTTAGCAATATACT--TTTT-----------GCTAAAAA-A-GTTTGAATTATTTACCCT------GTAC-TTT------ATAT--T-AATGT-AAGTTCCA--AC------AGT--AAATTTAA----------TACAA------------------CT----------CATAGTCCCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTTGTAGTAACAAT-TAACGA----CAAGGAT-ACA--TCT----ATAAC----GTTT-----A----TTATTAAGTAC------TAATA-CTGT--------GCAAATAT-------------------ATAACCGCACCAAAGAT--------AA----TC-----A--TAC----TTTAAA--TCACCAACAATGACCTGAGT--TAAGTACACCTCAGGAGGTT-TTTAGATA------TC------AATTCAAA-A-A--A--A--AAATT----GGCATAATCT--------ATTTCTAAT-T-CAATAT--G-----C--AT----AA---G-A----TT----------------------------------------------------------------TGC---------------------TT---------TTTA----A-CATTGACTGAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAA
gi|5 : tatataaagagcactttgaaTATTCATATCTG--ATG---ACA---------AATATT--TAATACATATTTATAATTATGATTCTG----GTTTCT----CTACACCGGTTTTAAAAGAAG----------GTTATG---TCCGGTAGATGGTCTCT--TCA-G--TTTAAAATAG-CTT-TTA---A---GTCAGGG--ACAGGG-TTTTTGAAAA--T-------ATAGCTGGAAAACAA-AACAATTCGA-AAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAC-CTTCTTC--AATAAACCTGGTGCATTC-GTTTCCAACTGCAAAAAAA-TTGTA-GAAAAGTA--CAGAGAGGTG-AAATATCCATGAACTCACG-TGGCCAGTAACGTA-TG-AAACAGGCTAACTCAGAAAGAGCATGTGAAACATGCTTGCTTGTATAGAAGAAATTTTTGTGGTAAATGATATTAAGCAATTTTTT--TTTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAG-G-AATGGAATGATTCATCCT------GTAC-TAT------ATA-A-T-CACGT-A--CACTCCAAC------AGT--AGATTTAACAACAGTTACTAAAATGTTTTATGTTGATAAAACT----------CAAAGATTTATGGTTTTA-TAATTCAATAC-C-GATTGTTAGTAATAAT-T---GA----CAAGAAT-ACAGGT------ATAAAATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGGATGATCTAT-AAA-GTGTA---TTA-ACAAATATTA-ACACTGTGCAA
gi|6 : ataATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAAT---T--GT-TATGCTCA--T--GGACTGATAATTGAATGATTTCTATAAT-T-TATCC--ATCTACTATATCTACATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTTATAAT----A--CTG----GTGTCT----CTA-------A-TAAAGGGAG----------GTTATG---TCCGAAGGGTTCCTCCT-TTGA-AT-TTT-AATTAGCC-T-TCA---A---GTCAGTG--ACAGTGTTTTTTGAAAA--T-------ATAACTTGAACACAATTTAAAT
gi|6 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATAA----ATGA----CACGAAT-ACATGTGTTAGGATAACATCT-TTTTG-AAA----TGATCGAAAATGATCTATTAAG-TTTTA---T-A-ACAAATATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAAGCACAATAAAGAT--------AACCTTCC-----A--AACAGTGTTACAA--TCACCAATACTGACCTGTGT--TAAGT--ACATCAGGAGG-T-TTTCGATA------CC------Aggtagattggtagtaataaatgacacgaatacatgtgttaggataacatctttttgaaatgatcgaaaatgatctattaagttttataacaaatattaacactgtgcaaatatataagcacaataaagataaccttccaaacagtgttacaatcaccaatactgacctgtgttaagtacatcaggaggttttcgataccaggc
gi|7 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaagataccattaaagtagtttgtgttgtcgaattgttatgctcatggactgataattgaatgatttctataatttatccatctactatatctacattatgtttcaataacgtatacatatttataatactggtgtctctaataaagggaggttatgtccgaagggttcctcctttgaattttaattagccttcaagtcagtgacagtgttttttgaaaatataacttgaacacaatttaaatggtaAAATCTT-TG-ATTTTTTTATCGGAAGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-CGGCTAGTAATGAA-GGAAAACATGCTATCTCAGAAAGCGCATGGTAAATGTGCT------TATGG----------TTT--TG------ATTTAGGAATTTATT--TTGT-----------CTTGAAAA-G-GATGGAAAAATTAATCCT------GTAC-TAT------ATA-G-T-GATGT-A--T------ACTGGAAAAGA--AAATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATTCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGGAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTAAGG-CAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTAT-AAA-GTATA---CCA-ATAAGTATTA-GCGCTGTGCAGA-TATATAACCGCAGCAAAGAT--------AA----TC-----C--AAC----TT------------GCAATG----GTAT--CAA-T--A--TCA----A-T-TTTAGA-------------------------A-T--A--A--AACTT----GGCATGATATATC-TGTAATTTAAAATGAACAAT-T--TTT--TC--AT--C-AA---T-A-----TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----CTTCAGA---TTTA--------------C-----TT---------TTTA----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAGTTTT----TTTTATGTggc
gi|8 : aT------TGTGG----------TA----A------ATTTAACAAGTT-TTGATTTG-----------GTTCAAGG-G-TATGGAGTTATTCATCCT------ATAC-TAT------ATAT--T-GATGT-A--T------ACTCCAACAGT--AGATTTGA----------TAAGA------------------CT----------C-------CA---CGTTA-TCATTTACTACCT-GTTTGGTAGTATTAATAT--TGT----CAAGAAT-AAAAATGTAAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TT---GAGAATTATTTATAAA--GTTTA---TTA-A---GTAGTA-ACATTGTGCAAA-TATATAACCATAT----------------A----TC-----G--AAC----TTTAAA--TCATTTGAAATGGCCTGTGT--ATAGT--ACCTAAGGAGGGT-TTTGGATAACTAGACCTGATCGAGTT--AATA-C--A--G--AAGCT----AGTTTAATCTCTT-T----TCTATAATGTACAAC-TGGTTT--CC--AC--CTCA---T-AGGTTTTGCTTTCT-----------------TAATATATGGATTATTTGATTC--T-----T-----G---TAGG--------------CATTCATT---------TTTT----AGCAATGACTAAAACAT-TT-G-A-------TGATGGGCAAAACTAA-TTT----TGTTATGTcgtgttt
gi|9 : acaagacaTTG-ATGCGTTTGACTTAAA----AAATCAAATTAATACAGGGTACATATATCATT-AATAG-T-A-GA--TT----TGCGTAATA--T--ACATGTGC--A--T--GAACTGATAATTGAATGACGTTTA-AAA-TCTATCCATACCTT--ATGTCCAAATGTTATTTCATTATC---AGAACATATTTATAAT----A--CTG----GTTACT----CTACCAGGGTATAAAACGGAGGTCCAGAGCTGTAATG---TCCGATGAATGGTTCCCGTTGA-AT-TTTGAAACAGAT-T-TCA---A---GTCAGGG--ATAATT-GTTTTGAAAA--T-------ATAACTGAAGAATAA-TTGCATTTGACCAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAG-CTGCTCC--TGTATACCTAATTCATT---TTTCCAGCTG-AAGAAAA-TT-CG-AAAT-TTT--GAAAGGGATT--ATTATTCTCGAGATCACG-TGGTCAGTAATGTT-AGAAACTAGTCTGACCCAGAAAGCGCATGGCAAACATAAT------TATcgctttt
blockSeqs : T CTGA ATATAT T T A T A CA TC AGGTTACGCGC CA TA T A C CT CT A GTTA TATG TT TTTT AGNN CAA AA GTCCAGAGCT GAT ATGATTT A T CTTTATTGACTTATCAGGG T ACT A C T GCCT T CA T CCAAA A CAA C TC TGA AT A AT T T T G A AG TGCTTG AAGAAATTTTTGTGGTAAATGAT AA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG A GT . A GTTTTA T TCATTG C TATAGATATATAATTCAAC GA T CAACAGTTAC TGTTTTATGTTGATAAAACTCAA A T C A TGTATA A G TAGAAT T AAAC A AT A ATATT T A T A AATCTTTC CCTT TTTCGATC AGTG TCAATTTC G TAA AC C GTT G ACTAGACCTGATCGAGTTAATACAG T TCAA C TCTAA T A GGT TC TT AGT TAGGTTT TAATATATGGATTATTTGATTCTTGTAGGCATTCA CCGGCGTCA TTCTGA T G G C TAT T AATG
blockSeqs : T . . . . . . . . TA TATTATGCTC . . . . T . CC T GT . . . TTT TTT AA . . GTTGAAT G T CTATAAAGACAGGA . T C . . AAAT C A T CGT G CAT . A GTA AA A . . A . G A AG . TGTTA TT GTTTTGATTTG A C . A . . . T TATAGATATATAATTCAAC . T . CTAAATGTTCCATGT A . . . TGACGA . C TAGAAT . . A G A TC . C . . . . A G TTATTT G A . A GGT G TCAATTCAAAAAAA A . C TGTAA G . T . . CT ACGTTT TCTTTAGTAAATTTAAATTCCTTCAGGCATTCAT . TTAA T . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . CG AGTTATGCAC . . . . T . CC T TA . . . . NNN NN . . CTGAAT G A CTTTACGGTCAGGG . T T . . ATAT C C C GCT A CAT . A TT AA A . . T . T G CC . TGTTC TT ATTAGTTTTG G C . T . . . C TATTGATGTAAAACCCGAA . G . CTCAA T . . . TGACGA . C TAGGAT . . A G G TT . T . . . . A . TTTAGC A A . C GA G CCTTGACCTGACC T . C CTCA G . A . . C GTAA CTCCTCATATGAGTAATTTCCATTCC . CTCA C . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . TG ATGTATGCGC . . . . T . CA T TA . . . . CCT AC . . TAGAGT N N CTTTTAAGTCAGGG . T T . . AC T C G TCT T CAG . A TT CA C . . C . T A GA . TGTTA TA TTTACTTTTT G G . T . . . T TTAATGTAAGTTCCAAC . A . CTCGA A . . . TGTATA . G AAGGAT . . A C A TT . C . . . . A . TTAATC G A . C GT C AGTTCAAAACAC A . T TTAG G . G . . C TAT CTCCTCTTCAGATTTAC . TTAA T . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . TG ATTGATGCGC . . . . A . TC A TA . . . . CCT AA . . NNNNNN G A CCTTCAAGTCAGTG . G T . . AT C C C TCA A CAG . C TG TT T . . T . G T GC . TATCA TT TATACTTTTT A A . C . . . T ATCACGTACACTCCAAC . A . CTAGA T . . . TAACGA . G TAGAC . . A A T AT . T . . . . A . TAAATC G A . A GG C CTTGGGCATGA G . T CTTA G . G . . C TTT TCCTTCTGGCATCCAT . TAA T . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . CT ATTGATGCGC . . . . C . GA T TA . . . . CCT AT . . ATGTGT T A ATTTCAAGTCAGGG . T A . . AC C C C CCT A CG . C TG AA A . . . . T A GC . TTTTG TT TTTATTTTGT G A . T . . . T GTGATGTATACTGGAAA . G . CTGTT T . . . TGACGA . G AAGGC . . T A T TA . G . . . . A . ACAATC A A . A GT A CCAAGT A . C TAA T . T . . C GAT TCCTTGAAGCATTCAA . TAG T . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . CT TATTATGCCC . . . . A . TC T TA . . . . CCT TT . . ATTAAT A T TTTCAACACAGGA . T G . . AC . G T . T . . C TG TT T . . . . G . . . TTT . T G G . T . . . T TTGATGTATACTCCAAC . A . CTCAT A . . . ATTCT . T TAGG . . A A G AA . C . . . . A . TAAATC A T . C GT C CCAA C . A AA G . A . . C CA CCTTTTATGTTTTGC . TA A . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . TC TGTTATGCTC . . . . C . CC T GT . . . . CCT TT . . AAATTG G A TTTCAAGTCAGGA . T A . . . . . G . . . . A CG AA . . . . TAA . . C A . T . . . . TATAATCCAAC . G . CTCAT A . . . ATTGT . G AAT . . T A G TT . C . . . . A . TCAAT G T . A AT A ATAA G . A T G . C . . C TA CTCCAGGCATCCC . AA C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TC ATACATGTGC . . . . C . TC A TA . . . . CAC AT . . TTGAAT A T NNNNNNNNNNN . T C . A . . . . . . G . . . . . . CTCCAAC . . . CTC . . . . TGAC . A TA . . A G T CC . C . . . . A . TTA . C . C T G AGA . . C T G . G . . C TA CTCCTCATATGA . AA C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CG TTTTTATGC . . . . C . CT T TA . . . . CCA TT . . TCAG T A CTAG . T A . . . TGAC . . AT . . . A A TT . C . . . . C . . . A . . . . . A G . T . . C TA CTCTTTATCAGA . AA A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T ATTTTATC . . . . C . CC T GT . . . . . AT . . CTG A A CTAG . T G . . . ATGA . . AT . . . . T T . T . . . . G . . . T . . . . . C TA CTCCTTATATGA . AA
blockSeqs : . . . C . . . . . . . A A . . . . . C . . CTG G T GA . T . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA TCCGGCATATTT . T
blockSeqs : . . . . T . . . . . . A . . . A . . . . GA . . . . TGC .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ANTTATGCGC****** CTTTCAAGTCAGGG********** T********* AC** T* TATGATGTATANTCCAAC*********** TAGGAT GT** CCAA****************************** TTAA** TA*********
originalCons : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATA--T--AT-TACGC--A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAG-C-T-TCA---A---GTCA--G--ACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATACATCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATA-T-GATGT-A--T------AC------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGG-T-TTTGGATA------CC------AATT--AG-A-C--A--A--AANCT----GGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AA---T-A----TTGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
finalCons : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATANTTATGCGC------A--T--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT----CTACCTGGGTATTAAAGGGAG----------GTAATG---TCCGATGGACGGTTCCT-NTGA-NT-TTTGAAATAGCTTTCAAGTCAGGG----------ACAGTG-TTTTTGAAAAT---------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA-AATAC--CACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACAT-GGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TAT------ATATATGATGTATANTCCAAC-----------AGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AA----TC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGAGGT--TTTGGATACCAA------------------------------AANCT----GGCATAATCTCTCTTAA--TTTATAATGTACAAT-T--NTT--TC--AT--C-AATA---------TGTTCTCT-----------------C------------------TCC--T-----C-----A---TNCG--------------C-----TT---------TTTT----A-CATTGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAAACATTTAATCATGTAATCACCGCCTGCTACTGCTCATGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGATGGTGTTGGTGATAATAATGACAATGGAGATACAAC
Unaligned ( gi|31 ): TGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGTTGATAACGGTGATTATGATGGTATGTGTGCTTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): GTTATTCTTTCCCAAGCAAAGAGTTTGTTTCCTTGTTGTTATCTAAGGATAAAAGAGCATTTTGGATAGC
Unaligned ( gi|33 ): TTAAAGCATTACCTGGCTTGATGACGGGCTGGCCTGAAATGAACCAGAAATTACTGA
Unaligned ( gi|34 ): TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTATTTGATGATATGACTGGAGAGACACTGTG
Unaligned ( gi|36 ): GNNNNNNNNNNTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG
Alignments
lowQualScore : 1111111111 11111111111111 11 11111 11 111111 22222222222222222222222 11111111111111111111111 111111 222222 1111111111 333333333333333333333333333333333 11111111111 111111 11111111 11111111 111 999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111 222222222 11111111111111
lowQualScore : 2 6666 888888 3 3 3 3 3 44 88 44 6 2 44 0 3 3 0 5 33 11 1 7777 0 5555 33 5555 777 999 66 1111111111 444 0 8888888 3 2 1 55555555555555 2 9999999999 2 4 00 66 4 44 2 33333 3 555 4 55 4444 33 6 55 4 33 5 1 1 55 0 111111 22222222222222222222222 44 99999999999999999999999 1 55 4 2 111111 4 6 444444 0 2 55 4 7777777777 222222222222222222222222222222222 1 3 2 2 22222222222 3 3 000000 0 3 7777 0 3 66 4 66666 3 2 3 0 3 0 11111111 44444444 9999 88888888 1 555 55 1 3 111 3 000000000000000000000000000000000000000000000000 1 111111111 1 999 33 33 2 8888 99 33 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 000000000 444444444 88888888888888 1 3 3 3 666 4 9999
lowQualScore : . .... ...... . . . . . .. .. .. . . .. . . . . . .. .. . .... . .... .. .... ... ... .. .......... ... . ....... . . . .............. . .......... . . .. .. . .. . ..... . ... . .. .... .. . .. . .. . . . .. . ...... ....................... .. ....................... . .. . . ...... . . ...... . . .. . .......... ................................. . . . . ........... . . ...... . . .... . . .. . ..... . . . . . . ........ ........ .... ........ . ... .. . . ... . ................................................ . ......... . ... .. .. . .... .. .. . ................................................................... ......... ......... .............. . . . . ... . ....
lowQualScore : 6 1111 888888 3 3 3 3 3 66 44 22 2 1 22 2 1 1 8 9 77 44 2 5555 1 7777 77 7777 333 555 11 7777777777 777 9 1111111 1 5 0 44444444444444 9 4444444444 1 4 66 11 4 11 3 00000 9 888 4 00 5555 44 3 55 4 44 0 0 0 00 2 555555 99999999999999999999999 11 33333333333333333333333 4 44 0 6 555555 0 2 777777 1 4 55 8 5555555555 555555555555555555555555555555555 2 1 9 5 44444444444 1 8 111111 4 3 1111 8 5 99 0 33333 1 6 1 2 1 4 22222222 33333333 6666 88888888 2 333 00 4 6 777 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 0 888888888 5 333 99 99 9 9999 66 99 9 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 777777777 555555555 11111111111111 8 6 6 6 444 4 4444
consensus : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATANTT-ATGCGCAT--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT---CTACCTGGGTATTAAAGGGAGGT----------AATG---TCCGATGGACGGTTCCTNT-GA-NT-TTTGAAATAGCTT--TCAA---GTCAGGGACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA--A--ATA-CCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TATATATA-T-GATGTATANTCCAACAGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AATC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGA-GG-T-TTTGGAT------A----C-----------C---------------AA-------AANTTGGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAATT--NTT--TC--ATC-AA----TA--TGTT--CT-CT-----------------CTCC-----------T-----C-----A---TNCG--------------CTT---------TTT-T----A--CAT--------------TGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
Reference ( family-1691 ) : NATTGCTTTGTATGCGTTTGACTTCAA----ATATCGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGCGGAATANTT-ATGCGCAT--GGACTGATAATTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--CTG----GTTTCT---CTACCTGGGTATTAAAGGGAGGT----------AATG---TCCGATGGACGGTTCCTNT-GA-NT-TTTGAAATAGCTT--TCAA---GTCAGGGACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGAAAACAATTTNAATTTGA-AAAA--A--ATA-CCACCATGCAAATTAC-CTCCTCC--TGTAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAACTG-ACGAAAN-TT-TG-AANTNTTT--CGGAGGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-TGGCCAGTAATGTA-GGAAAACANGCTAACTCAGAAAGNGCATGGTAAACGTGCT------TATGG----------TGT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTGAAAG-G-GATGGAATTATTCATCCT------GTAC-TATATATA-T-GATGTATANTCCAACAGT--AGATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGNAGATCCATGTCGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTTAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTATAAAA-GTNTA---TTA-ACAAGTATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAACCACACCAAAGAT--------AATC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAACAATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGA-GG-T-TTTGGAT------A----C-----------C---------------AA-------AANCTGGCATAATCTCTC-T-TAATTTATAATGTACAATT--NTT--TC--ATC-AA----TA--TGTT--CT-CT-----------------CTCC-----------T-----C-----A---TNCG--------------CTT---------TTT-T----A--CAT--------------TGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAG-TTT----TGTTATGT
gi|1 : ATTGCTGTGTATGTGTTTGACTTCAA----CTATTGAATTAATGCAGGATAC------CATA-AA-AA-T-A-GT--TAGTGCTGTGGAATA--T-ATATGCAT--GGGCTGATAATTGAATGATGTATA-AAT-TTAATCAATATATA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TGATACATATTTATAAT----A--CTG----AATTCT---CTACCTGGGTATTAAAGAAAATT----------TATG---TCCCATGGACCCTTCCTGT-GA-TT-TTTGAAATAG-TT--CCAA---ATCA--GAAAGTG-TTTTGGAAAA--TAAAAAAAATTATTAGAAAACAATGTAGATTTGA-AAAA--AATATA-TCACCATCCAAATTAT-CTCCTTC--TTTAAAACTGATTCATTCAGTTTTCTACTG-ATGAAAC-TT-TG-AATTTTTT--TAGAAGGGTT-AAATATTTATGAGCTCACATTGACCAGTAATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAAAAGCATGGTAAACATGCT------TATGG----------TAT--TA------ATTTAGCAATTTATT--TTTT-----------GTTAAAAA-ATGATGGAATTATTTATTCT------GTAC-TATATAT--T--------------ACAGT--AGATTTGA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATCCATGTTGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGTAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-AACGGTGTTAGGA-AACATCTGTTGTA-AGA----TTATCGAGTGTGATCTATAAAA-GTATA---TTA-ATAAGTATTG-ACACTATGCAAA-TATATAACGACACCAAAGGA--------AATC-----A--AAC----TTTCAA--TCACCAATAATAGCCTGTGC--TAAGT--ACCTCGGGA-GG-TATTTAGAT------A----CCAATTTCAGATC---------------AA-------AATTTGGCATAATTTTTT-TATAATTTATAATGTACGATT--GTT--TC--ATC-AA----TAATTGTT--CT-CT-----------------CTTC-----------T-----C-----A---TAAG--------------CTT---------TTT-T----A--CAT--------------TGACTAAACACT-TT-T-AT---GTTTGATTTGC-AAACT---TTT----TTTTGTGT
gi|10 : tTTGACTTCAA----ATATCGAAATAATGCAGGAAAT------CATT-AA-AG-T-A-GC--TTGTGTTGTCGAATTATT-ATGCTCAT--CGACTCATAATTGAATGACGCCTA-AAT-TCAAGCCATATCTA--ATGTCTACATTATGTTTCAATA--------ACGTATACATAA-----------------TTCT---CTA---G-----TAAAGGGAGGT----------AATG---TCCGATGGGTTCTTCCTCT-G-------TAAATTAGCT---------------AGACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTAAt
gi|10 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTTAATGG-TAGATTGGTAGTAAGTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGATGGTAGAATAACATCTTATTTG-AAA----TTACCGAATATGATCTGTtggtagattggtagtaagtattgacaataatacagatggtagaataacatcttatttgaaattaccgaatatgatctgtgttaagt
gi|11 : taagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacttcaaatatcgaaataatgcaggaaatcattaaagtagcttgtgttgtcgaattattatgctcatcgactcataattgaatgacgcctaaattcaagccatatctaatgtctacattatgtttcaataacgtatacataattctctagtaaagggaggtaatgtccgatgggttcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaCACGTTGTTA-TCACTTGTAAC-T-AATTGATAGTAAAAAT-----GA----CAAGAGT-ACACGTCCTA-------------CTTA-AGA----TTCTCGAGTTTGATCTATAAAG-GT-TA---TCA-AAAAGTATTA-GCATTGTGCAAT-TATATAACCACCCCAAAAAT--------AAT-----------C----TTTCAATTTCATCAgttaagt
gi|11 : tTT--TC--ATC-AG----TA--TGTT--CT-CT-----------------CTCC-----------T-----C-----A---TATG--------------ATT---------Tgtatgttctctctcctcatatgatttgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|11 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaaTCTCTC-C-TCAT--ATGATTTGCCCTT---TT--TC--TTC-AAG---TAA-TTTT--CT-ATTC---------------CTTC-----------TGG---C-----A---TCCA--------------TTC---------TTT-T----AA-CAT--------------TGACTAAATCTT-TTGT-AT---GCCTGATTTGCAAACATAG-GTTAATGTGTTAAGTgccctttttcttcaagtaattttctattccttctggcatccattcttttaacattgactaaatcttttgtatgcctgatttgcaaacataggttaatgtgttaagttgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|12 : tcacgttgttatcacttgtaactaattgatagtaaaaatgacaagagtacacgtcctacttaagattctcgagtttgatctataaaggttatcaaaaagtattagcattgtgcaattatataaccaccccaaaaataatctttcaatttcatcagtatgttcTGTTGTAGAATTTTTTATGCACAT--GGACTGATAATTAAATGGTGTCTA-AAT-TATATCTATATCCA--ATGTCCACATTGTGTTTCAATGAC--GTGTACATATTCATACT----T--CTG----GTTACT---CTACAACGGTAATAAGGGGAGGT----------AATG---TCCGATGGCTTCTTCCTCT-GA-AT-TTTGTATAAGCTTTATTGACTTATCAGGGAAAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAACTGGCAAACAATTTCAATTTTA-AAAAT-A--ATG-CCTCAATGCAAATTAA-CTTCTCG--TGTAA--CTGA--CATTtgcttttggacgcgaatcatcatttgcaggcaatattgttgttattgctatgatgatgtataaaatgatgttagtagtggtgacaatggatgtgatgttattacttaatcatctttatgtttatgttctattgataactaagcggcttcatgagtaaaagacgaaaccatatacccgta
gi|13 : atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaaatattgaatggaGTATTCGTTTGAATGCAACTGAATACTAAATTAATGCAGGAAAC------AATT-AA-AG-G-AAGT--TTGTGTTGCGGAAAGGTT-ACGCGCAT--GGATTGATAATTGAATG--GTTGA-AATATATATCTATATTTA--ATGTCCACAGTGTGTTTCATTATC-------CACATTTGCAAT----A--CTG----GATACT---TTGTTTGGGTAATAAAGGGGTGT----------AATG---TACGTTTGGTGGATCCTTA-GA-GT-TTTGAAA-----------------CAGGAACAGTA-TCTTTGACAA--T-------AAAACAGAAAAGCAATTTTAGTTTGG-AAAA--A--ATA-CCATCGTGCAATTAAC-CTTCTCCAAAGTGGACCTGATTCATTCAATTTCAAACTG-ACGAACA-TT-TGAAATTATTT--ttt
gi|14 : TTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-------GTTAGG----CATCTGTATTATAAA----T-----AATATGATAAATAAAG-TTACT---TTA-ACTAATATTT-CGACTGTGCAAAATATATCACATCATCACAGAC--------ACTA-----A--AAC----TTTTA------CCAACCATGGCCTGTGT--AAAGT--ACCTCAGGC-GG-A-TTTGGAT------A----C-----------CTT-------------GACCTGACCAATCTGGCATAATCTCTC-T----TTTATTATGTATATCT--TTT--TC--ATC-AA----CA--AGTT--CT-CT-----------------CCTT-----------T-----T-----ATGTTTTG--------------CTT---------TCT-T-------CTT--------------TAGCTAtaacattgactaaacctattta
gi|15 : TACTTTGTATGTGTTTGACTTCAA----ATATCAAATAAATGTAGGATAC------CTTT-AA-AA-TTA-AT--TTGTGTTGTGGAATAGTT-ATGCACAT--GGACTGATAATTAAATGATACCTT-AAT-TCTCCTTATGTCCA--ATGTCAACATTGTGTTTCAATATA--TAACACATATTTATGAT----A--CTG----GTTTCTA--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNN--NNNN---NNNNNNNNCAATG-TGTTTGATAA--G-------ATAATTGGTAAACATTTTTAGTTT---AAAA--A--ATA-TCACCATGCAAATTACACTCgttttcattcctccaggcatcacttctttccaacatagtcaaaagatttttatatttgattcgccttgcaacactagtattggtatgtgg
gi|16 : tagtcGAAATAGCTA--TAAA---GACAGGAAAAGTG-TTTTTTAAAA------------------AAAA-AAT---AACTGGA-AAAC--A--AT--------TG---ATT--------------TA--CCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TA--------------------------T-----------GTAAAAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TATA-ATA-TAGATATATAATTCAACAGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CAAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAGCAAC-Taggtccttttataa
gi|17 : A---GACAGGAACAGTG-TTTTTTAAAAACT-------ATAACTGGAAAACAATT
gi|17 : ACCTGATTCATTCATTTTGCAACTA-ACGAAAA-TT-TT-AAATATTT--CGGAGGGGTT-AACTATTCATTAGCTCACA--GGCCAGTAATGTA-AGAAAACAGGCTAATTCAGAAAAGGCATGGTTAACGTATT------TATGG----------TGT--TC------AT---GTAA---------------------------AAAC-G-GATGGAATTATTCAACCT------GTAC-TATA-ATA-TAGATATATAATTCAACAGT--ATATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CGAAGATCCATGTCGCTA-TCTTTTACTAC-T-GATTGGTAGTAACAAC-TGACGA----CAAGAAgatttacctgattcattcattttgcaactaacgaaaattttaaatatttcggaggggttaactattcattagctcacaggccagtaatgtaagaaaacaggctaattcagaaaaggcatggttaacgtatttatggtgttcatgtaaaaacggatggaattattcaacctgtactataatatagatatataattcaacagtatatttaataaaactcgaagatccatgtcgctatcttttactactgattggtagtaacaactgacgacaagaa
gi|18 : agacaggaacagtgttttttaaaaactataactggaaaacaattgatttGTTTTA-AAAAAACTCATTGA---TGATTT-TAAAATGCATG---TTATATAAATGATATAGA-TGGG---A-TATGTAACCACAGCATATAT--------AATC-----A--AAC----ATTTAT--TTATCAACAATGGTCTGTGT--AAAGT--ACATAAAGA-GG---TTTGGAA------AAAGTT-----------C---------------AAAACAC--AAACTGGCATAATCTCTC-T----TTTAAAATGTGCAACT--ATTTCTC--CTC-AAACGTTT--TGTT--TT-CTTCTTTAGTAAATTTAAATTCC-----------TTCAGGC-----A---TTCA--------------TTT---------TCT-TTA--A--CAT--------------TGACTAAACTTT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAACTAA-TTT----TGTTATGT
gi|19 : -CTGCTGC--TGTGAACCGGGTTCATT---TTTTAAACGA-ATTAAAC-TT-TG-ACATCTTT--TGGAGGGGTT-AAATc
gi|19 : aagaaaaatgg------TATAA----------TGT--TA------ATAAAGCAAATTAGT--TTTG-----------GCTAAAGG-G-AATATACTTATTCATCAA------ATAC-TATTCAT--T-GACATATAATCCAACAGT--A---TCAT----------TAAAA------------------CT----------AGAAGTTGCATGGTGTTATTTTTTTATTAC-T-GATTGGTAGTAACAAT------ATTCTCACGAAT-ACACGTGT---AATAACAtgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaatacacgtgtaataacaagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|19 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaataATACAC-GTGTA---ATA-ACAAGTATTA-ACAAAGCGCAAA-TATATAACCACACCACAAAT--------ATTC-----A--AAC----Tagtattaacaaagcgcaaatatataaccacaccacaaatattcaaact
gi|2 : aagaaaaatggctgctgctgtgaaccgggttcattttttaaacgaattaaactttgacatcttttggaggggttaaattgcaatatataatgttaataaagcaaattagttttggctaaagggaatatacttattcatcaaatactattcattgacatataatccaacagtatcattaaaactagaagttgcatggtgttatttttttattactgattggtagtaacaatattctcacgaACTTCAA----ATATTGAATTTATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GTCATTACTTTGT--AATATTTTAT---CAT--GGACTGATAATTAAATGGAGTCTA-CAT-TCTATCAAAACCTA--ATGTTCACGTTGT-TTTCAATATC--TAATACATATTTACAAT----A--CTG----GTTTCT---CTACCTGGGTACTAAAGGGAGGT----------AATG---TCCGATAGACGGTTCCCAT-GT-GT-TTTTAAATAG-TT--TCAA---CACAGGAACAGTG-TTTTGGAAAA--T-------ATATAAGGAAAACAATTTTAATTTGA-AAAA--A--AAAATTACCATGCAAGTTAC-CTCCT-----GTATACCTGATACGTTCAGTGTCCAACTG-ACAAAAC-TG-TG-ATTTTTTT--CGGAAGGGTTTAAATATTCATGATCTCACA-TGGCCAGTTATGTA-GGAAAACATGCTAGCTCAGAAACCGCATGACAAACGTGCT------CATTG----------TAT--CA------ATTTAGCAATTTACT--TTTT-----------GTTGAAAA-A-GACTGAATTATTCA---------------CAT----------TGTATACTCCAACAGT--AGATTTAA----------TAAGA------------------CT----------GTTAGATCCATGTCGTTA-CCATTCACTGC------TGGTAGTAACTAT-TGACGA----CAA-AATAACAGGTGTTA-GACAACATCTGTTTAA-AGA----TTAACGAATATGTTCCATAAAA--TATA---TAA-ATAAGTATTA-ACCCTGTTCAAA-TAAATAACAGCACC-AAGAT--------AATC-----A--AAC----TTTTTA--GCACCAACAATGACCTCTGTTAAAAGT--ACCTCAGGA-GA-------------------------------------------------GA-------AATTTGGCATAATCTTTC-TCTAATTAATAATGTACAATT--GTT--TC--ACC-AA----TA--TGTT--CT-CT-----------------CTCT-----------T-----T-----A---TCAG--------------ATT---------GTC-T----A---AT--------------T
gi|20 : gtattTCAA----ATATCAATTTAATGCAGGATAC------CATT-AA-GA-T-A-------------------AATT-ATGCTCAT--GGACTGATAATTGAATGATGTCTT-AAT-TAAATCCATATGTA--ATGTGAACACTAAATTTCAATAACGTTA--ACATATTCATAAT----A--CTG----GTTTCT---CTA-------AACAAA-GGAGGT----------AATG---TCCGATG---GGTTA--AT-TA-AT-GTTAAATTAGCTT--TACG---GTCAGGGACAGTG-TTTTTTAAAA--T-------ATAACTGTTAAACAATTTAAAT
gi|21 : -TATATAACCACATCACATAT--------AATC-----A--AAC----TT-------------------CCGGTGT--AATGA--TCCCCAGGA-GG-G-TTTGGAT------A----C--------------------------------------TTGGGCATGAACACT--T-CAA-----AAC--ACAAT---CTT--TC--TTA-GG----TA---ATT--TT-CA-----------------TTCC-----------TTGAAGC-----A---TTCA--------------ATT---------TTT-CTC--A--TAT--------------TGACCAA-CACTGTC-T-AT---GTCTGATTTGCAAAACTTG-TTT----TGTTATGTggtaggttggtagtagttaataaaaataatattggcgttaggatatcaccttatttgaaa
gi|22 : gTTGCTTTGTATGCGTTTAACTTCAA----ATATTGAATTAATGCAGGATAC------CATT-AG-AT-T-A-GT--TAGTGCTATGGAATATGT-ATGCGCAT--GGACTGACGATTAAATGGTGTCTA-AAT-TCTACCAATAGCTA--ATGTTCACATTGTGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTGTTTTTTTTTT---CTACCTGGGTATTAAAGAGAGGC----------AATG---TCTTATAGACGGTTCCCAT-GATTT-TTTGAAATAGTTcacttttaccatttctcaaaagtattttggacagcaatcatcatttgcagttaaagttgttgttgtcggcagcgtcacctttaagttgatgttatgtaacagtgg
gi|23 : -TAATTTATTATGTACAATT--GCT--TT--ATC-GA----TA--TGTC--CT-CT-----------------CTCC-----------T-----T-----A---TATG--------------ATT---------Tcc
gi|23 : tcTCTCTCCT-TA---TATGATTTAC--TT--TCT--TCTTAT--AG----TAA-TTTTAATT-CC-----------------TTCC-----------GG----C-----A---TATT--------------TTT---------TTT-A----A--CAT--------------CGACTTGGCTTT-TT-T-ATTATGTCTGATTCGCAAAACTAA-TTT----TGTTactttcttcttatagtaattttaattccttccggcatattttttttaacatcgacttggcttttttattatgtctgattcgcaaaactaattttgttcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|24 : tctaatttattatgtacaattgctttatcgatatgtccTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATTTAA-AA-T-A-GT--ATGTGTTGCTGAATATTG-ATGCGCAT--AAGCTGATATTTGAATGATGTGAA-AAT--CTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATACATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT---CTACCTGGGTTTTAAAGGGAGGT----------AATG---TCCGGTGGACGATTCcaatcgcttttggatagaaatcatcatttacagtttatattgtcgttgttgttgtt
gi|25 : cggtattT---------TTT-A----A--CAT--------------TGACTAAACCTA-TT-T-AT---ACCCAGTTTGTAAAACTAG-TTC----TGTGATGT
gi|26 : aTTGCTTTGAATACATTGGACTTGAA----ATATCGAA------------AC------CATT-AA-AAAT-A-GT--GTGTGTTGCTGAATATTG-ATGCGCAT--AAGCTGATATTTGAATGATGT-GA-AAA-TCTATC-------A--AT------ATTGTGTTTCAATATA--TAATATATATTCATGCT----A--CTG----GTTTCT---CTACCTGGGTTTTAAAGGGAGGT----------AATGGATTCCAATGGAtgcattaaccctttcccaagcaaaaagagtttatttgttaaagagagcaaaacattttgcagtcaataatgttgttgttgctgctgctgctgctgctgttgttgttgttgtcgtcgttgttaatgatgatagtgatggata
gi|27 : AA-GTTTA---AAA-AGAAGTATCA-ATACTTTTCAAA-TATATAACCACGCTAAAGAT--------AATCTTTCGATCAACG---TTTCAA--T-ACTAACATTGGCCTGTGT--AAAGT--ACATCAGGA-G--T-TTTCGCT------A----C-----------C---------------AA---------GCTAGCATAATCT-------AATTTATAATGTCCAATT--ATT--TC--ATC-AG----TA--TGTT--CT-CT-----------------CTCC-----------T-----C-----A---tttt
gi|28 : atatt-----------GTTGAAGGTG-GGTGGAATTATTCATCCTGTTTTAGTACTTGTACATATT-GATGTAAAACCCGAAAGTGAAAATT--A----------TAAAA------------------CTAAATGTTCCATGTTATTCCATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-TGTATA----TAAGAAT-agtt
gi|3 : gACTTCAA----ATATCGAATCAGTGCAGGAAAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAATTATT-ATGCCCATTAAAAC--ATAGTTGAATGATGTCTA-AAT-TCTATCCATATCTA--ATGTCCATATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTT-----------------------CT---CTA-----GTC---AAGGGAGGT----------ATTG---TCTGATGGGCTCTTCCTCT-G-------TAAATTAGCT---------------AGACAGTG-TTTTTGAAAA--T-------ATAATTTGAAAACAATTTGAATgt
gi|3 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATTAT-TGAC-------AATAAT-ACAGGTGTTAGAATAACATTTTATTTG-AAA----TTATCAAATATGATCTATTAA--GTTTAATATTA-ACAAGTATAA-ACACTGTGCAAA-TATATAATCACACTAAAGATAATCTTTCAATC-----A--AAG----GTTTAA--TCATCAGCACTGGCCCGTGT--AAAAT--ACATCAGGA-GG-T-TTTCGAT------A----C-----------C------------------------AAGTTAGCATAATTTATC---TAATTTATAATGTACAATT--CTT--TC--ATC-AA----TA--TGTT--CG-CT-----------------CTCC-----------T-----C-----A---TATGAGTAATTTCCATTCCTTCCGGCGTCATTT-TTCTGA--CAT--------------TGACTTAATTTT-TT-TCAT---GTCTGATTCGCAAAACCGG-TTT----TGTTATGTggtagattggtagtaattattgacaataatacaggtgttagaataacattttatttgaaattatcaaatatgatctattaagtttaatattaacaagtataaacactgtgcaaatatataatcacactaaagataatctttcaatcaaaggtttaatcatcagcactggcccgtgtaaaatacatcaggaggttttcgataccaagttagcataatttatctaatttataatgtacaattctttcatcaatatgttcgctctcctcatatgagtaatttccattccttccggcgtcatttttctgacattgacttaatttttttcatgtctgattcgcaaaaccggttttgttatgtccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|30 : tgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttcaaatatcgaatcagtgcaggaaaccattaaagtagtttgtgttgtcgaattattatgcccattaaaacatagttgaatgatgtctaaattctatccatatctaatgtccatattatgtttcaataacgtatacatatttctctagtcaagggaggtattgtctgatgggctcttcctctgtaaattagctagacagtgtttttgaaaatataatttgaaaacaatttgaatggta-----C-----A---TCC---------------CTT---------CTT-TTA--A--CAT--------------TGAGTAAAACAT-TT-T-AT---GTCGGATTCACAAACCTAccattttggataggaataatcaatactgttgttgttactat
gi|35 : cttcttaaaaaccatgatttttattcctccaggTGCTTTGTATACGTTTTACTTGAA----ATATC-AATTAATGCAG--TAC------CAT
gi|37 : tatattcTGCTTCGTATACGTTTGGCTTCCA----ATATCGAATTAACGTAGGATA
gi|38 : gtactcTCTATGTTGTTA-TCATTTACTGC-T-GATTGATAGTAGCACT-T
gi|39 : atTGCTTTGCATGCGTTTAACTTCAG----ATATTGAATGAATGC
gi|4 : tcATCAA--A-GTTCATATTATGTTTCAATATC--TAATACATATTTATAAT----A--TTG----TTTTTTTTTCTACCTGGGTATTAGAGGGAGGT----------AATG---TCCGATAGACGGTTCCCA--AA-TTGTTTTAAATAG-TT--TCAA---GTCAGGAACAGTG-TTTTGAAAAG--T-------ATTATTGGAAAACAATCTAAATCTGG-AAAAGAA--ATA-TCATCATGCAAATCAC-CTCCTTC--TATAAACCTGATTCATTCAGTTTCCAATTA-ACGAAAC-TT---------TTT--CAGAAGGGTT-AAATATGCATGAGCTCAGA-AAGC-------GCATGGAAAACGTGCT-------------TATGGTA-------------------------------T--TT------ATTTAGCAATATACT--TTTT-----------GCTAAAAA-A-GTTTGAATTATTTACCCT------GTAC-TTTATAT--T-AATGTAAGTTCCAACAGT--AAATTTAA----------TACAA------------------CT----------CATAGTCCCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTTGTAGTAACAAT-TAACGA----CAAGGAT-ACA--TCT----ATAAC----GTTT-----A----TTATTAAGTAC------TAATA-CTGT--------GCAAATAT-------------------ATAACCGCACCAAAGAT--------AATC-----A--TAC----TTTAAA--TCACCAACAATGACCTGAGT--TAAGTACACCTCAGGA-GGTT-TTTAGAT------A----T-----------CAATTCAAAAA-----AA-------AAATTGGCATAATCT--------ATTTCTAAT--------------------TC-AA----TA--TG----------------------------CA-----------TAA---G-----A---TTTG--------------CTT---------TTT-A----A--CAT--------------TGACTGAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCACAAAA
gi|5 : tatataaagagcactttgaaTATTCATATCTG--ATG---ACA---------AATATT--TAATACATATTTATAATTATGATTCTG----GTTTCT---CTACACCGGTTTTAAAAGAAGGT----------TATG---TCCGGTAGATGGTCTCT-T-CA-GT-TT-AAAATAGCTT--TTAA---GTCAGGGACAGGG-TTTTTGAAAA--T-------ATAGCTGGAAAACAA-AACAATTCGA-AAAA--A--ATA-CCACCATGCAAATTAC-CTTCTTC--AATAAACCTGGTGCATTC-GTTTCCAACTGCAAAAAAA-TTGTA-GAAAAGTA--CAGAGAGGTG-AAATATCCATGAACTCACG-TGGCCAGTAACGTA-TG-AAACAGGCTAACTCAGAAAGAGCATGTGAAACATGCTTGCTTGTATAGAAGAAATTTTTGTGGTAAATGATATTAAGCAATTTTTT--TTTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAG-G-AATGGAATGATTCATCCT------GTAC-TATATA-A-T-CACGTACACTCCAACAGT--AGATTTAACAACAGTTACTAAAATGTTTTATGTTGATAAAACT----------CAAAGATTTATGGTTTTA-TAATTCAATAC-C-GATTGTTAGTAATAAT-T---GA----CAAGAAT-ACAGGT------ATAAAATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGGATGATCTAT-AAA-GTGTA---TTA-ACAAATATTA-ACACTGTGCAA
gi|6 : ataATGCAAGATAC------CATT-AA-AG-T-A-GT--TTGTGTTGTCGAATTGTT-ATGCTCAT--GGACTGATAATTGAATGATTTCTATAAT-T-TATCC--ATCTACTATATCTACATTATGTTTCAATAAC--GTATACATATTTATAAT----A--CTG----GTGTCT---CTA-------A-TAAAGGGAGGT----------TATG---TCCGAAGGGTTCCTCCTTT-GA-AT-TTT-AATTAGCCT--TCAA---GTCAGTGACAGTGTTTTTTGAAAA--T-------ATAACTTGAACACAATTTAAAT
gi|6 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GATTGGTAGTAATAA----ATGA----CACGAAT-ACATGTGTTAGGATAACATCT-TTTTG-AAA----TGATCGAAAATGATCTATTAAG-TTTTA---T-A-ACAAATATTA-ACACTGTGCAAA-TATATAAGCACAATAAAGAT--------AACCTTCC-A--AACAGTGTTACAA--TCACCAATACTGACCTGTGT--TAAGT--ACATCAGGA-GG-T-TTTCGAT------A----C-----------C---------------Aggtagattggtagtaataaatgacacgaatacatgtgttaggataacatctttttgaaatgatcgaaaatgatctattaagttttataacaaatattaacactgtgcaaatatataagcacaataaagataaccttccaaacagtgttacaatcaccaatactgacctgtgttaagtacatcaggaggttttcgataccaggc
gi|7 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcaagataccattaaagtagtttgtgttgtcgaattgttatgctcatggactgataattgaatgatttctataatttatccatctactatatctacattatgtttcaataacgtatacatatttataatactggtgtctctaataaagggaggttatgtccgaagggttcctcctttgaattttaattagccttcaagtcagtgacagtgttttttgaaaatataacttgaacacaatttaaatggtaAAATCTT-TG-ATTTTTTTATCGGAAGGGTT-AAATATTCATGAGCTCACA-CGGCTAGTAATGAA-GGAAAACATGCTATCTCAGAAAGCGCATGGTAAATGTGCT------TATGG----------TTT--TG------ATTTAGGAATTTATT--TTGT-----------CTTGAAAA-G-GATGGAAAAATTAATCCT------GTAC-TATATA-G-T-GATGTATACTGGAAAAGA--AAATTTAA----------TAAAA------------------CT----------CATAGATTCATGTCGTTA-TCATTCACTGC-T-GATTGGTAGGAACAAT-TGACGA----CAAGAAT-ACAGGTGTAAGG-CAACATCTGTTTTA-AGA----TTATCGAGTATGATCTAT-AAA-GTATA---CCA-ATAAGTATTA-GCGCTGTGCAGA-TATATAACCGCAGCAAAGAT--------AATC-----C--AAC----TT------------GCAATG----GTAT--CAA-T--A--TCA-----A-T-TTTAGA-------A----------------T---------------AA-------AACTTGGCATGATATATC-TGTAATTTAAAATGAACAATT--TTT--TC--ATC-AA----TA--TGTT--CT-CT-----------------CTCC-----------T-----CTTCAGA---TTTA--------------CTT---------TTT-A----A--CAT--------------TGACTAAACCCT-TT-T-AT---GTCTGATTCGCAAAACTAGTTTT----TTTTATGTggc
gi|8 : aT------TGTGG----------TA----A------ATTTAACAAGTT-TTGATTTG-----------GTTCAAGG-G-TATGGAGTTATTCATCCT------ATAC-TATATAT--T-GATGTATACTCCAACAGT--AGATTTGA----------TAAGA------------------CT----------C-------CA---CGTTA-TCATTTACTACCT-GTTTGGTAGTATTAATAT--TGT----CAAGAAT-AAAAATGTAAGGATAACATCTGTTTTA-AGA----TT---GAGAATTATTTATAAA--GTTTA---TTA-A---GTAGTA-ACATTGTGCAAA-TATATAACCATAT----------------ATC-----G--AAC----TTTAAA--TCATTTGAAATGGCCTGTGT--ATAGT--ACCTAAGGAGGG-T-TTTGGATAACTAGA----C-----------CTGATCGAGTTAATACAG-------AAGCTAGTTTAATCTCTT-T----TCTATAATGTACAACTGGTTT--CC--ACCTCA----TA--GGTT--TTGCT-----------------TTCTTAATATATGGAT-----T-----A---TTTG--------------ATT---------CTTGT----AGGCATTCATTTTTTAGCAATGACTAAAACAT-TT-G-A-------TGATGGGCAAAACTAA-TTT----TGTTATGTcgtgttt
gi|9 : acaagacaTTG-ATGCGTTTGACTTAAA----AAATCAAATTAATACAGGGTACATATATCATT-AATAG-T-A-GA--TT----TGCGTAATATAC-ATGTGCAT--GAACTGATAATTGAATGACGTTTA-AAA-TCTATCCATACCTT--ATGTCCAAATGTTATTTCATTATC--AGA-ACATATTTATAAT----A--CTG----GTTACT---CTACCAGGGTATAAAACGGAGGTCCAGAGCTGTAATG---TCCGATGAATGGTTCCCGTTGA-AT-TTTGAAACAGATT--TCAA---GTCAGGGATAATT-GTTTTGAAAA--T-------ATAACTGAAGAATAA-TTGCATTTGACCAAA--A--ATA-CCACCATGCAAATTAG-CTGCTCC--TGTATACCTAATTCATT---TTTCCAGCTG-AAGAAAA-TT-CG-AAAT-TTT--GAAAGGGATT--ATTATTCTCGAGATCACG-TGGTCAGTAATGTT-AGAAACTAGTCTGACCCAGAAAGCGCATGGCAAACATAAT------TATcgctttt
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAAACATTTAATCATGTAATCACCGCCTGCTACTGCTCATGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGATGGTGTTGGTGATAATAATGACAATGGAGATACAAC
Unaligned ( gi|31 ): TGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGTTATTGTTGATAACGGTGATTATGATGGTATGTGTGCTTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): GTTATTCTTTCCCAAGCAAAGAGTTTGTTTCCTTGTTGTTATCTAAGGATAAAAGAGCATTTTGGATAGC
Unaligned ( gi|33 ): TTAAAGCATTACCTGGCTTGATGACGGGCTGGCCTGAAATGAACCAGAAATTACTGA
Unaligned ( gi|34 ): TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGTATTTGATGATATGACTGGAGAGACACTGTG
Unaligned ( gi|36 ): GNNNNNNNNNNTGCTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG