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consensus : CCATNA-T-AAATTAATTCCTAGATTTT-CA-TC---C----CCG----C---C--C--G---C---C----C---G--TT-T------T-TT--TA----CCC--GC--CC-C--G---AC---A---T--ATTT-T--AT-T--G----------T-C-----TTG--------T---CCA-G-------A---------T-------------T--------------T-------G---------------ACAAC---G--GGAACC-----GT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--A----A---CGG-C----C---CG-CAT--TT--T-----A-A---C-C--TTT----TGAT-T-T-T----N----N---A-----T------N-----A------T--TT--T-T-N-----T--CAT--TTCA---TGC-C-T----A----------A--AT-A-CG--ACACT--TC--C--G--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------A------------------N--------------A-----------A-A---------T---T-G--C-C---A--------------CCC-C----T---C-CC-----C-----------C---G--C--------CC----C----T----AT---TTT---GAAAC-AAATTTGGA-TGAAAATCTAG-GA-ATTAATAT
Reference ( gi|11 ) : CCATTA-T-AAATGAATTCCTAGACTTG-CA-TC---C----CTG----C---C--T--G---C---C----T---G--TT-A------T-TT--TA----ATC--GC--CC-T--A---TC---A---T--ATGT-T--AT-T--A----------T-C-----TTA--------T---CCA-G-------A---------T-------------T--------------T-------G---------------ACAAT---G--GGAACT-----GT-AA-------T--T---TAC-----C---AA--A----T---TGG-C----C---CA-CAT-ATT--T-----A-A---C-C--TTT----TGAT-T-T-T----C----T---A-----T------T-----A------T--TT--T-T-A-----T--CAT--TTCA---TGC-C-T----A----------A--AT-A-CA--ACACT--TC--C--T--TTTT--GA-----T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------A------------------C--------------A-----------A-A---------T---T-G--C-C---A--------------CCC-C----T---C-CC-----C-----------C---A--C--------CC----C----T----AT---TGT---GAAAC-ACATTTGGA-TAAAAATCTAG-GA-ATAAATGT
gi|1 : CCATTA-T-AAATTA-TTCCTAGATTTT-TA-TT---C----TCA----C---C--C--GCC-C---C----T---G--TT-T------T-TTA-TA----CTC--TCTTCC-C--A---CC---A---T--ATTT-T--AT-T--G----------T-C-----TTG--------T---CTA-G-------A---------T-------------T--------------G-------C---------------ACAGT--------AATT-----ATAAA-------T--A---TATATATAT---AT--A----T---TGG---------------T-ATT--T-----A----------TTT------AT-T-T-C----A----T---T-----T------T-----A------T--TT--T-
gi|31 : gCCATAA-T-AACTTAATTCCTATAATTT-TA-TC---C----CTG----T---C--T--G---C---C----C---C--TG-A------T-TT-------------AC--CC-T--T---CC---A---C--AT------AT-T--G----------C-C-----TTG--------T---CC-------------------------------------------------T-------G---------------ATCAT---G--G--ATTTTTTTAT-AA-------T--T---TGT-----C---AA--A----A---TGA-CGGCAC---CA-CTT-ATT--------A-A---A-C--TTT----TGAT-T-T-T----TA---T---AA----T------G-----A------T--TT--T-T-G-----TTTCAT--TTCA---TGT-C-T----A----------A---T-A-TG--ACATC--TC--C--T--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-gacaacgggaatcgtaaatcgtaatttgccaagccggcaccacgttttaaacattttgatgttgatgatattttgttacattttaggcttaatacaacatttctgtgattatatcagaaaaaaaataaaattgcactcactgtctctgtttttaaacaaatttggataaaaatctagga
gi|36 : CCAT-A-TCAAATTA-TTCCTAGATTTT-AA-TC---C----CTG----T---C--T--G---T---CAT--T---T--TT-T------T-TT--TAC---ATG--TC--CT-T--A---CC---AACGT--ATTT-T--AT-T--G----------T-A-----AAA--------TAAATCATA-------A---------T-------------T--------------T-------T---------------ACAAC---G--GGAACC-----GT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--A----TCAATG------------A-CGT-TTT--A-----A-A---C-C--TTT----AGAT-C-T-T----C----A---A-----T------G-----A------T--TT--C-T------------T--TTCA---TTC-C-T----G----------A--A--A-CA--c
gi|55 : ggCCGTAA-T-AAATTAATTCCTA-ACTTG-C---------------------------------C---C----T---G--AT-A------T-TT--T------TT--AC--CC-T--A---CCCA-A---T--ATAT-T---T-T--A----------T--------TG--------T---CAA-A-------A---------T-------------T--------------G-------T---------------ACAAT---A--GAAACT-----GT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--A----A---TG-----------CACCAT-CTT--TATGCCA-A---C-A--TTT----TGAT-C-T-T----
gi|22 : aggCCATAA-T-AAATTA-TTCCTAGATTTT-TA-TT---CTAA-CCA----C---C---------C---C----T---GGTTT-T------T-TT--TA----CCC--AC--TC-T--G---AC---A---T--ACTT-T--AT-T--G----------T-C-----TTG--------T---TCA-GCTTCTTTA---------T-------------T--------------T-------T---------------ACAAC---G--AGAACT-----GT-AA-------TC-T---TGC-----C---
gi|29 : gCCATTA-T-AAATTAATTACTTAATTTT-CA-TC---C----CCA----CCATC--C--A---C---C----T---T--TT-T------T-TT--T-----------------T--A----C---A---T--ATTT-T--AT-T--T----------T-T-----TTA--------T---AAA-A-------A---------T----------------------------------------------------ATAAG---C--GGAATT-----GT-AA-------TA-T---GAT-----G---AA--A----C---AGA-T----T---CG-CAT-TTT--G-----A-A---C-T--TTT----TGATCT-T-T----CAG--TG--A-----T------TTAATGA------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TTCA---TGC-T-T----A----------gcgttttacaactgcctataatatcacacttccattttaataactaaataataaaacctcatccctgttctgaaacagattaagatgaaaatgaaggaattg
gi|58 : gCCATTA-T-AAATCAATTTCAAGATTTT-CATTC---C----CCA----C---CCAT--T---C---C----T---G--TT-GTGTTTTT-TT--TA----ACCA-GC--CC-T--G---AC---A---T--ATTT-T--AT-T--G----------T-C-----cttctccattttcgtttaaata
gi|13 : gggCCATAG-T-AAATTATTTCCTAGATCTT-TA-TC---CT---CTT----CAA-C--G--G---C---CA---C---C--TT-G------TGTT--TA----CCT--GA--CC-C--A---AT---A---C--ATTT-T--AC-T--G----------T-CAAAAATTA--------T---------------A---------T-------------T--------------TTCG----G---------------ACAAC---A--G-AATC-----GT-CA-------T--T---TGC-----A---AA--A----C---GGT-G----C---TG-TAT--TT--T-----A-A---A-CATTTT----TAAG-T-C-T----T----T-----------------------------T--TT--T-T-------T--CAT--TTCA---TAC-C-T---------------T--AT-A-CA--ACACT--T------T--TGTTAGAA-----T-------A-T-------C-T---GCA-----A----A-------A--------------A------------------T--------------A-----------A-A---------A---A-A--T-A---A----------------------------------------------------A--C------------------------AT---TGTTTAGAAAA-ACATTTGGA-TTCAAACCTAT-GA-ATTAATatttttttccttaacgggacccaattatttgcaaaa
gi|12 : gCCATAG-T-AAATTATTTCCTAGATCTT-TA-TC---CT---CTT----CAA-C--G--G---C---CA---C---C--TT-G------TGTT--TA----CCT--GA--CC-C--A---AT---A---C--ATTT-T--AC-T--G----------T-CAAAAATTA--------T---------------A---------T-------------T--------------TTCG----G---------------ACAAC---A--G-AATC-----GT-CA-------T--T---TGC-----A---AA--A----C---GGT-G----C---TG-TAT--TT--T-----A-A---A-CATTTT----TAAG-T-C-T----T----T-----------------------------T--TT--T-T-------T--CAT--TTCA---TAC-C-T---------------T--AT-A-CA--ACACT--T------T--TGTTAGAA-----T-------A-T-------C-T---GCA-----A----A-------A--------------A------------------T--------------A-----------A-A---------A---A-A--T-A---A----------------------------------------------------A--C------------------------AT---TGTTTAGAAAA-ACATTTGGA-TTCAAACCTAT-GA-ATTAATttatc
gi|84 : gCCATTA-T-AAATTGATTCCTATATTTT-CA-TC---ttatca
gi|42 : CCATAA-T-AAACTGATTCATAGACTT---A-TT---C----CAG----C---C--T--GCT-C---C----C---A--TT-T------T-TT--TG----ACG--GC--TC-C--A---GC---A---ttaattcgcacctattttatta
gi|2 : agaCATTA-T-AAATCAATTCTTAGATTTT-CA-TC---CACATCCA----T---C--C--C---C---CATT-T---T--TT-T------T-TT--TA----CCT--GC--CC-T--G---AC---A---T--ATTT-T--AT-T--G----------T-C-----TCA--------T---TCA-G-------A---------T-------------TGCTGATTTGTTTTTT-------G---------------GCAAC---A--AGCGCC-----AT-AA-------T--T---TGC-----A---AA--A----A---TGG-TG---T---CA-CTT-TTT--G-----A-G---C-C--TTC----TGAT-C-T-T----TAAAATG--A-----T------T-----G------T--CT--T-T----------CAT--GTCA---TAC-C-T----A----------A---T-A-TG--ATACT--TC--C--A--TTTT--AA-----T-------A-T-------T-T---G-------A----A-------A---------------------------------------------------------------------------------C-C---A--------------ACC-C----T---C-CC-----CCCATAAAATTGC---A--CCTGCCTGACT----C----T----AT---ATT---GAAAT-ATATTTGGA-TGAAAAGGAAG-GA-ATAAaaaaaagtttgttgctaaaacagtgttgtgttttaaactttttgatctgtaaatgatattctttcattttatgcctaatacaatacttccacttaat
gi|62 : CATGA-T-AAATGAATTCCTAGATTTT-CA-TC---C----
gi|57 : ttattttgctttacatcaaatagtttttttaagtattagcttaagtttataaagttttaacaaacgtagtaaccatattggaacaaacttCATAA-T-AAGTTAATTCCTATATTTT-CA-TC---C----TCG----C---C--CAAG---CACAC----C---C--TT-T------T-TT--TA----TTT--AC--CCGC--A---CCCCAA---T--ATAT-T--TT-T--A----------T-T-----ATA--------TA--CCG-GT------ATTTTTTTTTT-------------T--------------T-------G---------------ACAAC---G--CAAACT-----GT-AA-------
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gi|7 : ttaaaaaaaacataaatagtttATAA-T-TAATGAATTCCTAGATTTT-CA-TT---T----CCG----G---C--C--G---CTC-C----T---G--TT-T------T-TT--TT----CCC--AC--CC-T--G---AC---A---T--ATTT-A--AA-T--G----------T-T-----TTG--------T---CCA-G-------ATTTTTCTT-T-------------T--------------T-------G---------------ACAGC---A--GAAATT-----TT-AA-------T--T---TGA-----C---AA--A----A---CAG-TG---C---CG-TTT-TTT--TTTTC-A-A---T-C--CTT----TTAT-C-T-T---------T---A-----TAAC---A-----A------T--TT--C-T-T-----T--CAT--TTAG---TGC-C-TC---A----------AACAT-G-CA----ACT--TG--C--A--ATTT--AA-----T-------A-T-------C-T---GA------A----A-------A--------------A------------------A--------------A-----------A-A---------T---T-G--C-C---A-----------------------------CC-----T-----------C---A--C--------CC----C----TTATGAT---TTT---AAAAC-AAATTTGGA-TGAAATTCTAG-GA-ATTAAcagattgttttccttttatttcatgccgaatatgacacttccatttgagaaataaaagataaaattgt
gi|17 : tATTAAT-ATATTAATTCCTAAAGTTT-TA-TC---G----CTG----C---C--C--G---C---C----CAAGG--TT--------T-TT--TG----ACCT-GC--CC-C--A---AC---A---T--ATTTGT--AT-T--G----------T-T-----TTATTGTTGTTT---TTT-G-------G---------T-------------T--------------T-------GGTTTGTTTTTTTTTGACAA----A--GGAACT-----GT-CA-------T--T---CAC-----C---AA--A----T---TGG-TG---C---TG-CAT-TTT--A-----A-A---C-C--TTT----TGTT-T-G-T----T----A---A-----A------T-----G------T--TT--T-TCAT----T--CAT--TTCA---TG--T-T----G----------A--CT-AGCAAGACACT--TC--T--G--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------c
gi|6 : catggtgaATAA-T-AATTAAACTCCTGGATTTT-CA-AT---T----CAG----T---T--T--G---CTC-C----C---G--TT-A------C-T-----------C--GC--CC-T--A---AC---A---CTGATGT-T--GT-C--AAAAAAAAACAT-T-----TT-----------------------------------T-------------G--------------T-------G---------------ACAAC---A--G-AATC-----AT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--AA---C---TGA-G----C---CA-CAT--TT--T----------------TTT----TACA-T-T-T----C----A---A-----T------G-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TTCA---TGAAT-T----AGATAAATACGA--AT-A-CA--ACACT--TA--T--A--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------AC-------------A------------------T--------------A-----------C-A---------T---T-A--A-TAAAA--------------TTA-C----T---C-CC-----C-----------C---A--C--------CC----TGGTAT----AT---T-T---CAAAC-A-GTTTGGA-TAAAACTCCGA-GA-ATTAAT
gi|15 : tATTA-T----TTAATTCCTAGATTTT-CA-TC---C----CTT----T---CCAT--C---C---C----C---A--TT-T------T-TT--TA----CCT--GC--CC-C--A---AC-----------TGT-A--A------------------C-----TTG------------CCA-A-------A---------A-------------A--------------A-------G---------------GCACT---T----AAGT-----AT-AA-------TAAT---TGG-----C---AA--A----A---TGG-TG---C---CA-CATGA----------A-A---C-C--TTT----CATC-T-T-T----A----A---A-----T------G-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TTCA---CAC-C-T----A----------T---T-G-CC--ACAGT--TT--C--G--TTTA--AA-----T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------AAT----------------G--------------A-----------A-A---------T---T-A--------A-----------------------------AC-----C-----------C---A--CAGT-----CC----T----T----ATA--TG----GAAAC-GAATTTGGA-TGAAAATCTAG-GAGATAAttg
gi|63 : ATTA-T-AAATGAATACCTTTATTTT-CA-TCATAT----TCA----C---C---------C---C----T---A--TT-T------T-TTTCTAC---ATT--GC--CC-T--G---AC---A---T--ATTT-T--AT-tt
gi|19 : TCA-T-AAATTAATTGCTAGATTTT-TA-T-----------G----C---T-------------C----C---G--TT--------T-TT--TA----CCC--GT--CC-A--A----C---A---T--ATTT-T--AT-T---------------T-----TTA--------T---TAA-TTT-----A---------T-------------T--------------G-------G---------------ACAAT---A--A-AACT-----AT-AA-------TA-TG--TGT-----C---AAGAA----A---TGA-CA---C---CG-CAT---T--T-----A-A-----------------AA-T-C-T----C----T---A-----AAGGA--T-----G------TG-CT--T-T-A---------AT--TTCA---TAC-A-T----A----------A--AT-A-CA--ACACT--TC--C--G--ATTC--AA-----T-------A-T-------T-T---G-------A----A-------A--------------A------------------agtaaaaaaaaattaaaaagaaacacaccaaaacaatgtaaaata
gi|4 : gA-T-AAATTAATTCCTAGATTT--CA-TT---C----CCA----C---C--T--G---CTC-C----T---G--TT--------T-TT--TA----CCCAAGC--C-----A---AC---A---T--ATTT-T--AT-T--G----------T-C-----TTA--------T---CCA-G-------A---------TCACAGTATTTTTTT--------------T-------T---------------ACAAT---G--GGAACC-----GG-AA-------T--T---GAC-----C---AA--A----A---CAG-CA---C---CA-CGT--TT--T-----A-G---C-T--TTT----TAAT-C-T-TAA--T----A---A-----T------G-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TTCA---TGC-C-T----A----------G--A--A-CA--TGACTTATC--C--A--TTTC--AT-----T-------A-T-------CTT---A-------A----A-------A--------------A------------------C--------------A-----------A-AAAATAAAACT---C-G--C-C---T--------------CTC-C----C---A-CA-----C-----------A---A--C--------CCATTGC----T----AT---TTT---GAAGC-AAATTTGGG-TGAAAATCttttaaaaataaacaattaaaattatatacaaacagcattttgat
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gi|27 : at-AAAT-AATTCCTAGATTTT-CA-TC---C----CTG----C---C--C--A---C---CCT--T---A--TT-A------T-TT--GA----CCT--GC--AC-T--G---CC---A---T--GTTT-T--AT-T--G----------T---------A--------A---AAA-A-------A---------A-------------T--------------T-------G---------------ACAAA---G--AGAACC------T-AAATGAT--T--T---TGC-----C---AA--AATA-T---TG--C----T---CA-AAT--TT--A-----A-A---C-C--ATT----TGAT-T-T-T----G----A---AA----T------G-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAG--TTTA---TTC-C-T----A----------A---T-A-CG--ACACT--TC--C--G--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-------------A----A-------A--------------A------------------ttatgc
gi|3 : -AAATGAATTCCTAGATTTT-CA-TC---gttaa
gi|9 : gctacaacaaattaatttctagattttcatcgccacacccccgccccacccatccctccctgtctcaacatattgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattgttttatactttaaaatgattttctttcattttatgcctaatacaacactctggttttattatctgaaaaattattataaaaaatgaaattgcacccttgacaacctattttt-AAAT-AGTTCCTGGATGTT-TT-TC---T----CTA----C---C--T--G---C---CACAGT------TT-C------T-TT--TA----CCT--GC--CC-T--G---AC---A---T--ATTT-T--ATAC--A----------A-A-----AAA--------T---CAA-A-------T---------T-------------T--------------T-------T---------------ACATC---A--GGAATC-----GT-AA-------T--T---TGCG----A---AA--A----A---CAG-CAT--T---TA--AT-ATT--TA----A-A---C-A--TTT----AGAT-C-T-TTAAAT----T---A-----A------T-----A------T--TC--T-C-------T--CAT--TTC----TAG-C-A----A----------A--AT-A-T---GCACT--TCT-C--TG-TTTT--AA-----T-------T-T-------T-T---G-------A----A-------A--------------A------------------A--------------T-----------A-A---------TAAAT-A--A-A---A--------------CCT-A----TG--CACC-----C-----------T---ATGC--------AT----C----T----AT---TGA---AAAAC-AAATGCGAG-TGAAAATGTAG-AA-CTA
gi|66 : tgAATAAATTCTTACAATTT-CA-TC---C----CCGAACAC---C---------C---C----C---A--TT--------T-TT--TA----CCT--GT--CC-G--A----C---A---T--ATTT-T--AT-T--A----------T-C-----TTG--------C---CC--G-------T---------T-------------TTTTTTTTC------T-------G---------------ACAAT---G--GGAACC-----GT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--A----
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gi|10 : acATGAATTCCTAGATTTT-CA-TC---C----tac
gi|8 : acccatcccgacatattttattgccaaaaattctttttgtttaaaaaaaaaacatcaacagaactgtaatgtttgccaaaaacagaaccgcattaaaaaccagttgatctttaaagggtcatcttttaaatcatgcctaaatatgacatttccattttaaatatttgaaaagttgaaagataaaaaattgttaaagttgcactagttccccaccatcccctgcctctattttgaaatacatttAATTCCTAGA-TTGTCA-TC---C----CAG----C---C--TA-G---C---C----CCA-A--TT-T------T-TT--TT----ACC--CT--CC-TCGA----C---A---T--ATTG-T--AT-T--G----------T-C-----TTG--------T---CTG-G-------A---------T-------------C--------------------------------------ACAAgt
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gi|14 : aacttATTCCTAGATTTT-CA-TC---CT---CTT----C---T--G--G---C---C----C---A--TT-T------T-TT--TATTTTACT--GC--CT-G--A----C---A---T--ATAT-T--TC-T--A----------T-T-----TTG--------------A-G-------A--------------------------------------------------------------ACATT---GTAGGAACC-----TT-AA-------T--T---TGC-----C---GA--A----A---CAG-TG---C---TG-CAT-TTT--A-----A-A---A-C--TTT----AGATCT-T-T----A----A---A-----T------G-----A------TTGTT--T-T-A--------CAT--TTCA---TAC-C-T----A----------A--A--A-CG--A-------C--C--A--TTTA--AA-----T-------A-C-------C-A---A-------A----A-------A--------------AATAAATAAT---------A--------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A---------------------------C-TC-----T-----------G---A--C--------TC----C----T----GT---TTT---GAAAC-AAATTAGGA-TGAAAATGTAG-GA-cgtggattttgttctttttattgattttgtttttgcagcaggaaccataatttaccaacaattttaatatttagatctttccaaagattttgtttcatttcatgtctaatatcacacttctatttcattattcga
gi|26 : catcaatttTCCTAGAATTA-CA-TG---T----CCG----C---C--A--A---CAT-C----C---G--TT--------T-TT--TA----CCC--GC--CC-C--G--------A---T--ATAT-T-----T--A----------T-------TTG--------T---CAA-A-------A--------------------------------------------------------------AAAAT---G--AAAAAC-----GT-------------------------C--------------------T----C---CG-CAT--TT--T-----A-A---A-C-----------AT-T-T------C----T---A-----T------C-------------------T-T-A-----A--AAT--TTCA---TGC-T-T----A----------A---T-A-CA--GCACC--GC--C--G--TTTT--AA-----A-------A-C-------C-T---G-------A----A-------A--------------A---------------------------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A------------------------------C-----C-----------C---G--C--------CC----C----A----AT---TTT---GAAAA-AAA-ATGGA-TGAACATCTAG-GA-A
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gi|1 : atggaatgaaaatataattggtacattaatacgtttcactaacagttgcgccccctttaag---T--AT-T-T--AT-TTCA----------T-T-----TTA--------T-------------------------T-------------T--------------T-------G---------------ACAAC---G--GGAATC-----GT-AAATCGTAAT--T---TGC-----C---AA--G----C---CGG-CA---C---CA-CGT-TTT--A-----A-A---C-A--TTT----TGAT-G-T-T----G--------A-----T------G-----A------TA-TT--T-T-G-----TTACAT--TTTA---GGC-T-T----A----------A---T-A-CA--ACATT--TC--T--G--TGAT--TA-----T-------A-T-------C-A---G-------A----A-------A--------------AAAAAT-------------A--------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A--------------C------------T-CA-----C-----------T---G--T--------CT----C----T----GT---TTT---TAAAC-AAATTTGGA-TAAAAATCTAG-GA-
gi|23 : gccattataaattattcctagatttttattctcacccgcccctgttttttatactctcttcccaccatattttattgtcttgtctagattgcacagtaattataaatatatatatatatattggtattT-T--AT-TG-A----------T-T-----TTG--------T---T---------------------T-------------T--------------T-------G----------------CAGC---A--GGAACC-----AT-AA-------T--T---TAC-----C---AA------------------------CA--AT--TT--T-----A-A---T-A--TTT----AGATCT-T-T----C----CA--A-----A------G-----A------T--TT--TGT-T-----T--CAT--TTCA---TGT-C-T---------------A--AT-A-TC--ACACT--TC--T--A--TTTC--AT-----T-------A-T-------T-C---G-------A----
gi|24 : aacttaattcctagattttcatccctacacacacattgtttttttatccatcccgacatgttttattgtattgtccagatcgtggattttgttcttt-------A---------T-------------T--------------T-------------------------AAT---G--GTGATT-----AT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--A----A---TGG-T----A---C--CAT-ATT--TTA---A-A---C-T--TTT----TGAT-A-T-G----A----T---G-----T------T-----A------T--CT--C-T-T-----T--TAT--CTCG---TGC-C-T----A----------A---T-A-CG--ACACT--TT--C--G--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-T---GAAA----A----A-------A--------------A------------------CAAAAACAACTG---A-----------A-A---------T---T-GTAT-C---A--------------CCC-C----T----------------------------A------------T----C----T----AT---T-------CAC-AAATTTGGA-TGAAAATCTAG-GA-ATCAAT
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gi|35 : atttttc---------T-------------T--------------T-------T---------------ACAAT---G--G-AATC-----GT-AA-------T--TATTTGC-----C---AA--A----A---TG--CTG--C---TG-CAT--TG--T-----A-A---C-A--TTT----TGAT-C-T-T----T----A---A-----A------T-----AACG---T--TC--T-T-------T--CAA--TTCA---TGC-T-T----A----------A---T-A-CA--ACACT--TC--T--A--TTTA--AA-----T-------G-T-------C-T---G-------AAG--A-------A--------------A------------------TA-------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A-----------------------T---C-CC-----C------------------C--------TC----C----T----AT---TTT---AAAAT-AAATTTGCA-T-AAAATATAG-GA-ATTAAT
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gi|30 : catgctaaaattcctagattgtcatcccagcctagccccaattttttttaccctcctcgacatattgtattgtcttgtctggatcacaaaaaaaaagaagaaaattattctttt---------T-------------T--------------T-------T---------------ATAAC---G--A-AACC-----GT-AA-------T--A---TACA----C---AA--AAAAAT---CGG-C----GG--CA-CAT-TTT--A-----A-A---C-C--TTT----TGAT-A-T-C----A----A---A-----T------G-----A------T--TT--C-G-T-----T--CAT--TTCT---TGC-C-T---------------A--AT-A-CG--ACATT--TC--C--G--CTT----------T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------AAAT-----------A------------------C--------------AT----------A-AGTAAGG---T---T-G--CAC---A------------------------------------C-----------C---G--T--------CG----C----T----AT---TAT---TAAACAAAATACGGATTTAAAATCTAG-GA-ATTAATaagaatggaaaaaaataaaattgcacca
gi|28 : tt---------T-------------T--------------T-------T---------------ATAAC---G--A-AACC-----GT-AA-------T--A---TACA----C---AA--AAAAAT---CGG-C----GG--CA-CAT-TTT--A-----A-A---C-C--TTT----TGAT-A-T-C----A----A---A-----T------G-----A------T--TT--C-G-T-----T--CAT--TTCT---TGC-C-T---------------A--AT-A-CG--ACATT--TC--C--G--CTT----------T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------AAAT-----------A------------------C--------------AT----------A-AGTAAGG---T---T-G--CAC---A------------------------------------C-----------C---G--T--------CG----C----T----AT---TAT---TAAACAAAATACGGATTTAAAATCTAG-GA-ATTAATttat
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gi|44 : cctatacatatttaatggtaaaaaacaa-------G---------------ACAAT---G--GGAACT------T--A-------T--T---TGC-----C---AA--G----A---TGG-C----A---C--CAT-GTT--TAA---A-A---G-C--TTT----TGATCT-T-T----G----A---A-----T------G-----AT-----T--TT--T-T-T-----T--CAT--TCCA---TGC-A-T----T----------A--A--A-CA--ACAGT------C--G--TTTT--AA-----T-------G-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------A---------------------------------A-----------A-A---------T---
gi|32 : ttttctgcaGACCT-----AT-AA-------TACT---TAC-----C---AA--A----A---CGG-C----G----A-TAT-ATT--TGT---A-A---C-T--TTT----T----T-T-T----CA---T---C-----T------T-----AAAAGGAT--TT--T-C-T-----T--CAT--TTCA---TGT-C-T----A----------A--AT-A-CA--ACATT--TC--T--G--ATTT--AA-----T-------T-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------AATGGGTAAAT--------A--------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A--------------CCC-C----T-------------------------------C--------TC----C----T----AT---TTT---GAAAT-ATATGTAGA-TACAAATCTAG-GA-CTCAATaaattttgatgacaatcttggaattgatttattatg
gi|10 : acaGAACT-----GT-AA-------TGTT---TGC-----C---AA--AAA--C---AGA-A----C---CG-CAT------T-----A-AAAAC-C--AGT----TGAT-C-T-T---------T---AAAGGGT------C-----A------T--CT--T-T----------TAA--ATCA---TGC-C-T----A----------A--AT-A-TG--ACATT--TC--C--A--TTTT--AAA----T-------A-T-------T-T---G-------A----A-------A--------------A------------------GTTGAAAGATAAA--A-----------A-A---------T---T-G--T-T---AAAGTTGCACTAGTTCCC-CACCAT---C-CC-----C-----------T---G--C--------CT----C----T----AT---TTT---GAAAT-ACATTTGGA-TGAAAATCTAG-GA-ATTCATGttat
gi|56 : acccatcccgacatattttattgccaaaaattctttttgtttaaaaaaaaaacatcaacaACT-----GG-TA-------T--T---TGC-----C---AA--A----A---TAA-TG---C---CG-CAC-TTT--T-----A-A---C-C--ATT----TTATAT-T-T----G----A---A-----T------A-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TTTA---AGC-C-T----T----------A---T-C-CA--ACATT--TC--C--T--TTTT--AA-----T-------A-T-------C-T---A-------A----A-------A------------------------------------------------A-----------A-A---------T---T-
gi|51 : ttttttataacgacACT-----GT-AA-------T--T---TGG-----C---AA--A----A---TTA-C----A---TAGCAT-TTT--A-----A-A---C-C--TTT----TGAT-A-T-T----T----TAA-A-----T------GA----A------T--TT--T-C-AT----T--CAT--TTCA---TGC-G-T-------------------------------T--TC--C--A--TTTT--AT-----T-------A-T-------C-T---GA------A----A-------A--------------A------------------T--------------A-----------A-A---------T---aaac
gi|41 : T-----GT-AA-------T--T---TGC-----C---AA--A----A---TG---------------AT-ACT--G-----ATA---C-C--TTT----T--T-T-A-T----C----T---A-----CAAATGAT-----A------T--TT--T-C-A-----T--CAT-----A---TGT-C-T----G----------T---T-A-TA--ACACT--G----------TTT--GAATATAT-------A-T-------A-T---G-------A----A-------A--------------AA-----------------T--------------A-----------A-A---------T---A-A--T-T---A--------------AAA-T----T---A-C----------------------A--C--------TC----C----T----AA---TTT---GAAAC-AAATCTGGA-TGAAAGTCTAG-GA-ATaataaaaaaaaaaataatccattttatcatcagtctgaaaat
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gi|20 : -AA-------T--T---TAC-----------------------AG-T----C---CG-CGT-TTT--A-----A-A---C-A--TTT----TGATCT-T-T----A----A---A-----T------A-----A------T--TT--TGT-T-----T--CAT--TCCA---TGC-T-T----C----------A---C-G-CA--AGTCT--TC--C--T--TTTA--AA-------------A-T-------T-TAATG-------A----AG------A--------------A------------------A--------------A-----------A-A---------A---T-G--C-----A--------------CTTTC----T---G-CC-----C-----------C---A---------------------------AT---GTT---GAAAC-ATATTTGGA-TGAAAATCTAG-GA-ATtgatttatta
gi|46 : taattaattaatttctagattttcatccatgcctgtttaacccactttggaatacttttataaaaaaaA-------C--T---TGT-----C---AA--A----A---TGG-C------------AT-TTT--A-----A-A---G-T--TTT----TGGCCT-T-T----A----A---A-----T------A-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TCCA---TGC-C-T----A--------------T-A-CG--GTATT--TC--T--G--TTTT--AA-----T-------A-T-------T-T---G-------A----A-------A--------------A------------------T--------------A-----------A-AAAAATAAAAT---T-G--C-----A--------------CCC-C-----------------------------C---A--C--------CC----C----T----AT---TAG---GAAAC-AAATATGGA-TAAAAATtagttta
gi|52 : A-------T--T---TGC-----CTTGAA--A----T----GG-C----G---CAACATTATT--T-----A-A---T-C--TTT----TCATCT-T-T----A----A---A-----T------T-----A------T--G-----------------------CA---TAA-T-T----A----------A--AT-A-TA--ACACT--TC--C--A--TTTT--AT-----T-------A-T-------T-T---G-------A----A-------A--------------A------------------tgattt
gi|34 : tcaacaggacaaatt-------T--T---TAC-----C---AA--A----A---CAG-CG---C---CT-CAT-TTT--A-----A-A---C-C--TTT----CGAT-C-T-G----CA---A---A-----T------T-----A------A--TCAAT-T-------T--CAT--TTCA---TGC-T-T------------------------A--ATACT--TC--C--A--TTTT--AA-----A-------A-T-------C-A---G-------A----A-------A--------------AAAAATAATAT--------A--------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A--------------CCT-C----T----------------------------G--C--------CC----T----T----AT---TTT---GAAAC-AAATGTGGA-TGAAAATCTGG-GA-ATTAAataacacaaaaaaaattgcactcattacagttac
gi|3 : tttttttaacaacacagtcgtgc---AA--A----T---TTGTC----C---CA-ATT-GTT--T-----T-A---TAC--TTTAAAATGAT-T-T-T----C----T--------------------------------------T-------T--CAT--TTTA---TGC-C-T----A----------A---T-A-CA--ACACT------C--TGGTTTT--AT-----T-------A-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------AATTATTATAAAAAAT---G--------------A-----------A-A---------T---T-G----C---A--------------CCC-T----T------------------------G---A--CA-------AC----C----T----AT---T--------------TTT-GA-TGAAAATCTAG-GA-AT
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gi|42 : acaattttaaaatattgtcttgtcaggatcatagattttttttctacattgggttttaaTT--T-----A-AA--C-T--TTT----TGAT-C-TGT----A----A---A-----TGA----T-----A------T--TC--T-T-------T--CAT--TTTA---TGC-C-T---------------A--AT-A-CA--ATACT--TC--C--
gi|49 : agaccataataaactgattcatagacttattccagcctgctcccatttttttgacggctccagcaaaaaaagtttgttgctaaaacagtgttgtgt-----A-A---C-C--TTT----TGATCT-T-T----A----A---A-----T------G-----A------T--TT--TCT-T-----T--CAT--TTTA---TGC-C-T----T----------A--A----------ACT---------G--TTTA--AA-----T-------A-T-------C-T---G-------AACATA-------A--------------A------------------C--------------AATACAAAATATA-A---------T---T-A----C---A--------------TCC-C----T----------------------------G--C--------CC----C----T----AT---TTT---GTTAC-ACATTTCAG-TGAAAATCTAA-GA-acttaat
gi|80 : ttaa-----A-A---C-C--TTT----TGAT-C-T-T---------T---AAAGC-T------T------------T--TT--T-T-------T--CAT--TTCC---TGCAT-T----T----------A--AT-A-CA--ACACT--TC--A--T--TTTtttcatctatta
gi|47 : ttaa---C-T--TTT----TTATCT-T-T----A----T---A-----A------T-----A------A--TT--T-T-C-----TTCCAT--TTCA---TGC-C-C----A----------A---T-A-CA--ACAAA--TC--A--G--CTTT--AA-----T-------G-T-------C-T---GA------A----A-------A--------------A------------------A--------------A-----------A-A---------A---T-G----T---A---------------------------C-CC-----C-----------C---A--C--------TC----C----C----AT---TTA---GAAGC-AAACTTa
gi|50 : aacagtgtcagaattgggTT----TGAT-C-T-T----T----G---A-----A------T-----A------A--TT--C-T-CCT---T--CTT--TTCA---CAA-C-T----A----------A---T-A--G--ACACT--TC--C--A--TTTA--AA-----T-------G-T-------C-T---A-------A----A-------A--------------ATTTTATAAAATAAAAAATC--------------A-----------A-A---------T---T-G--T-C-------------------------------T-CC-----C-----------T---G--C--------CC----C----T----GT---ATT---GACAC-AGATTTGAG-TGAAAATATTG-GA-ATcatgatttttcctaggaaatttta
gi|53 : ---A-----T------T-----T------T--CT--T-T-A---------AT--TTCA---TGT-C-T----G----------G---T-A-TG--ACATT--TT--C--G--TTTC--AA-----T-------A-T-------C-T---GGTAATAAA----A-------A--------------A------------------A--------------A-----------A-G---------T---T------C---A--------------TCC-C----TGAAC-CCACCAAC-----------C---A--G--------CC----C----T----AT---GTT---GAAAC-AAAATTTGA-TGAAAATCTAG-cagtttat
gi|18 : -----T------T-----A------T--TT--T-T-A-----C--CGTAATTCAGCATGT-C-T----ATG--------ACTATCA-CG--AC-CT--TC--C--G--TTTT--AA-----TGTCTGAAA-T-------C-T---G-------A----A-------A--------------A------------------CAAAAAATGGAAATGA-----------A-A---------T---T-G----T---A--------------CCC-C----G---T-TT-----T-----------T---A---------------------------AT---TTT---GAAAC-AAATTTGAA--AGAAATCTGA-GA-ATTAATctattaatataat
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gi|30 : gctacaacaaattaatttctagattttcatcgccacacccccgccccacccatccctccctgtctcaacatattgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattgttttatac----------T-------------T----------------T-------T---A-----------TAAC-G--A-----AAC-C-----GTAA-------T--A---TACAC--AA---AAAAATC-G--GC---GGC-A-CA---T-T--T-T------A--AAC--C--T--T-T-T--G---AT--A---------T-C------AA--A----TGAT-T-T-C--G--T--T--C-A---TTTC-----TT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---TT--TCCGCTT-------------T-------AT-C-------T---G-------A-A------------A--------------AATACATAAGT-----A------------------A---G-G--------------T----------T-G--CAC---A----------------------------------CC---------G-T----------C--G----C--T----A-T---TATTAAA-----CAAAATACGGATTTAAAATCTAGGAATTAATtt
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Reference ( family-1678 ) : CCATAATAAATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--CG--C----C------C-G--C--C--C-------G---T-T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--C--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T-------G---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-G--GC--C-C---G-CA---T-T--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--C-T--T---A-------A--A-T-GA-T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CG------ACA---CTTCC--GTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA-------------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-G--C-C-A--------------CCCC----T---C-C-C-----CC---------G-C----------C--C----C--T----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAATAT
gi|1 : CCATTATAAATTA-TTCCTAGA--TTTT--TAT--------T---C------T--CA--C----C------C-G--C--C--CCT-----G---T-T-T-T---TTAT----A-C----TC-T--CTTCC----CACCATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CTA-G-------A----------T-------------T--------------
gi|1 : gTA-TTT------------CAT--------T--------------------------TT---AT--------------------------T-------------T--------------T-------G---A-----------CAAC-G--GGA----AT-C-----GT------AAATCGTAAT--T---TGC-C--AA---GC----C-G--GCA-C-C---A-CG---T-T--T-T------A--A-A----CA-TT-TTG---A-T--G-T--T---G-------A----T-GA-TAT-T-T--TG-TTAC-A--TTTT-----AG--G-----C---TT----A-A---T-A-CA------ACA---TTTCT--GTGA---T-T--------A-TAT-C-------A---G-------AA-------------A----A--------------A---------------A---A-----------ATAAAAT-----T-G--C---A--------------CTCA------------------CT---------G-T----------C--T----C--T----GT---TTTTAAA-----C-AAATTTGGA-TAAAAATCTAGGAgcacagtaattataaatatatatatatatattggtatttatttatttcattttattttgacaacgggaatcgtaaatcgtaatttgccaagccggcaccacgttttaaacattttgatgttgatgatattttgttacattttaggcttaatacaacatttctgtgattatatcagaaaaaaaataaaattgcactcactgtctctgtttttaaacaaatttggataaaaatctagga
gi|10 : gccattataaattattcctagatttttattctcacccgcccctgttttttatactctcttcccaccatattttattgtcttgtctagattgcacagtaattataaatatatatatatatattggtatttatt----A-C----CC-A--T--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------GCCAAAAATT--C-----TT---TT---T-----------G----------T-------------T--------------T-------A---AAAAAAAAACATCAAC-A--G-A----AC-T-----GT------AA-------TGTT---TGC-C--AA---AAA---C-A--GAA-C-C---G-CA---T-T--A-A------A--AAC----C--AG-TTG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-G-GG-T-CAT-C--T--TT-T-A--AATC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-TG------ACA---TTTCC--ATTT---TAA--------A-TAT-T-------T---G-------AAAAGTTGAAAGAT-A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-G--T-T-AAAGTTGCACTAGTTCCCCACCAT---C-C-C-----CT---------G-C----------C--T----C--T----AT---TTTGAAA-----T-ACATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTCATGT
gi|11 : CCATTATAAATGAATTCCTAGA--CTTG--CAT--------C---C------C--TG--C----C------T-G--C--C--T-------G---T-T-A-T---TT-T----A-A----TC-G--C--CC----TATCATA-TGT------------TAT--------T--------A--------T--C-----TT---AT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T-------G---A-----------CAAT-G--GGA----AC-T-----GT------AA-------T--T---TAC-C--AA---AT----T-G--GC--C-C---A-CA---TAT--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--T-T--T---C-------T--A-T-TA-T-T-T-T--T--AT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CA------ACA---CTTCC--TTTT---T-G--------A-TAT-C-------T---G-------AA-------------A----A--------------C---------------A---A-----------AT----------T-G--C-C-A--------------CCCC----T---C-C-C-----CC---------A-C----------C--C----C--T----AT---TGTGAAA-----C-ACATTTGGA-TAAAAATCTAGGAATAAATGT
gi|12 : CCATAGTAAATTATTTCCTAGA--TCTT--TAT--------C---C------T--CT--T----CAA----C-G--G--C--C-------A---C-C-T-TGTGTT-T----A-C----CT-G--A--CC----CAATACA-TTT------------TAC--------T--------G--------T--CAAAAATT---AT---------------A----------T-------------T--------------TTCG----G---A-----------CAAC----AGA----AT-C-----GT------CA-------T--T---TG--C--AA---AA----C-G--GTG-C-T---G-TA---T-T--T-T------A--A-A----CATTT-TTA---AGT--C-T--T---------------------T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--A-----C---CT------T--AT-A-CA------ACA---CTTTT--GTTA---G-A--------A-TAT-C-------T---GC------AAAAAT---------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------A-A--A-C-A--------------------------------------------------------------------T--T----GT---TTAGAAA-----A-ACATTTGGA-TTCAAACCTATGAATTAAT
gi|13 : gCCATAGTAAATTATTTCCTAGA--TCTT--TAT--------C---C------T--CT--T----CAA----C-G--G--C--C-------A---C-C-T-TGTGTT-T----A-C----CT-G--A--CC----CAATACA-TTT------------TAC--------T--------G--------T--CAAAAATT---AT---------------A----------T-------------T--------------TTCG----G---A-----------CAAC----AGA----AT-C-----GT------CA-------T--T---TG--C--AA---AA----C-G--GTG-C-T---G-TA---T-T--T-T------A--A-A----CATTT-TTA---AGT--C-T--T---------------------T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--A-----C---CT------T--AT-A-CA------ACA---CTTTT--GTTA---G-A--------A-TAT-C-------T---GC------AAAAAT---------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------A-A--A-C-A--------------------------------------------------------------------T--T----GT---TTAGAAA-----A-ACATTTGGA-TTCAAACCTATGAATTAATttatca
gi|14 : gATCAATTTATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------T--CT--T----C------T-GG-C--C--C-------A---T-T-T-T---TT-T----A-TTTTACT-G--C--CT-----GACATA-TAT------------TTC--------T--------A--------T--T-----TT---G------A-G-------A---------------------------------------------------A-----------CATT-GTAGGA----AC-C-----TT------AA-------T--T---TGC-C--GA---AA----C-A--GTG-C-T---G-CA---T-T--T-T------A--A-AA---C--TT-TAG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-GA-T-T-G-T--T--TTAC-A--TTTC-----AT--A-----C---CT----A-A--A--A-CG------AC--------C--ATTT---A-A--------A-TAC-C-------A---A-------AA-------------A----A--------------ATAAATAATA------A---A-----------AT----------T-G--C---A--------------CTCT-----------------------------GAC----------T--C----C--T----GT---TTTGAAA-----C-AAATTAGGA-TGAAAATGTAGGAttatc
gi|15 : cTTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TT--T----C------C-ATCC--C--C-------A---T-T-T-T---TT-T----A-C----CT-G--C--CC----CAAC------------------------------T--------G--------TAAC-----TT---G----CCA-A-------A----------------------------------------------------------------AAA-G--GCACTTAAG-T-----AT------AA-------TAAT---TGG-C--AA---AA----T-G--GTG-C-C---A-CA---T-G--A--------A--A-C----C--TT-TC----A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--TTTC-----AC--A-----C---CT----A-T---T-G-CC------ACA---GTTTC--GTTT---A-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA-------------A----A--------------ATG-------------A---A-----------AT----------T-A--A---A--------------CCCA------------------CA---------G-T----------C--C----T--T----AT---ATGGAAA-----C-GAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAGATAAT
gi|16 : attatATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---A------C--TG--CATCTC------C-A--C--C----------G---T-T-G-T---T----------------------------------TA-TTT------------TA--------------------------------------------------G-------------------------------------------------------G---A-----------CAAT-G--GTA----AC-T-----GT------AA-------T--C---TGC-C--AA---AA----T-G--ACTAC-C---C-CA---C-------------A--C-C----C--TG-TTG---A-C--C-T--TT--A-------A--A-G-GA-T-T-T-TA-T--TT-C-A--TGTC-----AT--G-----C---CT----T-A---T-A-CG------ATA---CTTCT--GTTT---T-A--------A-ACT-C-------T---G-------AA-------------A----A--------------ATTAAGTACA------G---A-----------AT----------T-T--C-TGA--------------CCCC----C---A-C-C-----AC---------G-C----------C--C----T--G----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATTTAGGAACTAATt
gi|17 : acTAATATATTAATTCCTAAA--GTTT--TAT--------C---G------C--TG--C----C------C-G--C--C--CAAG----G---T-T-T-T---TT-G----A-C----CT-G--C--CC----CAACATA-TTTGTATTGTTTTATTGT--------T--------G--------T--T-----TTTTGGT---TTG-G-------T----------T-------------TGTTTTTTTT-----T-------G---A-----------CAA--A--GGA----AC-T-----GT------CA-------T--T---CAC-C--AA---AT----T-G--GTG-C-T---G-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---T-T--TGT--T---A-------A--A-T-G--T-T-T-T--TCATT-C-A--TTTC-----AT--G-----TTGACT----A-G---C-A-AG------ACA---CTTCT--GTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA-------------A----tac
gi|18 : catggtgaatATAATGAATTAATTGCTAAACTTTTT--CAT--------C---C------CGTCA--T----T------C----C--C--C-------G---T-T-T-T---TT-T----A-T----CC-G--C--CC----TGACAAA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----
gi|18 : -C-A--TGTCT----AT--G-----A---CT----A-----TCA-CG------AC----CTTCC--GTTT---T-A--------A-TGT-C-------T---G-------AAATCTGAAAAC---A----A--------------A---------------A---A-----------ATGGAAA-----T-G----A-A--------------ATTG----T---A-C-C-----CC---------G-T----------T--T----T--TA---AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGAA-AG-AAATCTGAGAATTAATaaaaaagatttatttttaccgtaattcagcatgtctatgactatcacgaccttccgttttaatgtctgaaatctgaaaacaaaaaatggaaatgaaattgtaccccgtttttaattttgaaacaaatttgaaagaaatctgagaattaatttatt
gi|19 : ataatgaattaattgctaaactttttcatcccgtcattccccgtttttttatccgccctgacaaattttattgtcaaaaaagatttatttttaccgtaattcagATAAATTAATTGCTAGA--TTTT--TATG-------C---T------C--CG---------------------------------------T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--T--CC-----AACATA-TTT------------TAT--------T--------------------T-----TT---AT---TAA-TTT-----A----------T-------------T--------------G-------G---A-----------CAAT-A--A-A----AC-T-----AT------AA-------TA-TG--TGT-C--AAGA-AA----T-G--ACA-C-C---G-CA---T-T--T-A------A--A------------------A-T--C-TC-T---A-------A--A-G-GA-T-G-TGC--T--TT-A-A--TTTC-----AT--A-----C---AT----A-A--AT-A-CA------ACA---CTTCC--GATT---C-A--------A-TAT-T-------T---G-------AA-------------A----A--------------ttatt
gi|2 : gtcCATTATAAATCAATTCTTAGA--TTTT--CAT--------C---CACAT--C--CA--T----C------C----C--C--C-------A---T-T-T-T---TT-TTTTTA-C----CT-G--C--CC----TGACATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TC---AT---TCA-G-------A----------T-------------TGCTGATTTGTTTTTT-------G---G-----------CAAC-A--AGC----GC-C-----AT------AA-------T--T---TGC-A--AA---AA----T-G--GTG-T-C---A-CT---T-T--T-TG-----A--G-C----C--TT-CTG---A-T--C-T--TTA-A-------A--A-T-GA-T-TGT-C--T--TT-C-A--TGTC-----AT--A-----C---CT------A--AT-A-TG------ATA---CTTCC--ATTT---T-A--------A-TAT-T-------T---G-------AA-------------A--------------------------------------------------------------------C-C-A--------------ACCC----T---C-C-C-----CCCATAAAATTG-CACCTGCCTGAC--T----C--T----AT---ATTGAAA-----T-ATATTTGGA-TGAAAAGGAAGGAATttttaaaaataaacaattaaaattatatacaaacagcattttgat
gi|20 : TAATTAATTAATTTCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------A--TG--C----C------T-G--------------------------T---TT-A----A-C----CC-A--C--TT----TGGAATACTTT------------TAT--------aa
gi|20 : A----C-A--GT--C-C---G-CG---T-T--T-T------A--A-A----CA-TT-TTG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-AA-T-T-T-TG-T--TT-C-A--TTCC-----AT--G-----C---TT----------C-A-CG-------CAAGTCTTCC---TTT---T-A--------A-AAT-T-------TAATG-------AAG------------A----A--------------A---------------A---A-----------AA----------T-G--C---A--------------CTTT------------------CT---------G-C----------C--C----C--A----AT---GTTGAAA-----C-ATATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAGTaaaaaaaaatttacagtccgcgttttaaacattttgatctttaaataattttgtttcattccatgcttcacgcaagtcttccttttaaaatttaatgaagaaaaaaatgcactttctgccccaatgttgaaacatatttggatgaaaatctaggaattagttta
gi|21 : taattaattaatttctagattttcatccatgcctgtttaacccactttggaatacttttataaaaaaaaatttCCATTAAAGATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------T---C------T--CA--T----C------T-A--C--C--CCCT----G---T-T-T-T---TT------A-C----C---------------AAC-----TT------------TAC--------T--------G--------T--T-----TT---GA---CCA-G-------A----------T-------------C------------------------------------------------A----AT-T-----TTTTTTTCAA-------T--A---TGA-C--AA---AG----A-G--AA--C-C---A-------------T------A--A-T----C--TC-CTG---A-T--C-T--TT--AT------A--A-T-GA-T-A-T-T--T--TT----------------------------------------AT---CG------ACA---CATCT--GTTC---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA-------------A----ATTAAAAAAT-----A---------------A---A-----------AC----------T-G--A-G-A--------------CCCT-------------------------------C----------C--C----C--T----TC---TTTGGTA-----T-AAATTTGGA-TAAAAATtta
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gi|22 : gT--G-----C---CT----ATA--AT-A-TC------ACA---CTTCC--ATTT---T-A--------A-TAA-C-------T---A-------AAT------------A----AT-------------A---------------A---A-----------A-------------------------------------------------C-C-----TC---------A-T----------C--C----C--T----GT---TCTGAAA-----C-AGATTAAGA-TGAAAATGAAGGAATTgcgttttacaactgcctataatatcacacttccattttaataactaaataataaaacctcatccctgttctgaaacagattaagatgaaaatgaaggaattg
gi|23 : gccataataaattattcctagatttttattctaaccacccctggttttttttacccactctgacatactttattgtcttgttcagcttctttattttacaacgagaactgtaatcttgccgcgttttacaacAACTTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TA--C----A------C-A--C--A--CATT----G---T-T-T-T---TT-T----A-T----CC-A--T--CC----CGACATG-TTT------------TAT--------T--------G--------T--A-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------g
gi|23 : -TTT------------TAT--------T--------GA-------T--T-----TT---GT---T----------------------T-------------T--------------T-------G---------------CAGC-A--GGA----AC-C-----AT------AA-------T--T---TAC-C--AA---CA----------------------A---T-T--T-T------A--A-T----A--TT-TAG---A-T--C-T--TTCCA-------A--A---GA-T-T-T-TG-T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----T---CT------A--AT-A-TC------ACA---CTTCT--ATTT---C-A--------T-TAT-T-------C---G-------Acgtggattttgttctttttattgattttgtttttgcagcaggaaccataatttaccaacaattttaatatttagatctttccaaagattttgtttcatttcatgtctaatatcacacttctatttcattattcga
gi|24 : aacttaattcctagattttcatccctacacacacattgtttttttatccatcccgacatgttttattgtattgtccagatcgtggattttgttct-------A----------T-------------T--------------T------------------------AAT-G--GTG----AT-T-----AT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----T-G--GTA-C-C---A-TA---T-T--T-T------A--AAC----T--TT-TTG---A-T--A-T--G---A-------T--G-T-TA-T-C-T-C--T--TT-T-A--TCTC-----GT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---CTTTC--GTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA-------------A----A--------------AAACAAAAACAACTG-A---A-----------AT----------T-GTAT-C-A--------------CCCC----T-------------------------------------A--T----C--T----AT---TC----A-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATCAAT
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gi|10 : gccattataaattattcctagatttttattctcacccgcccctgttttttatactctcttcccaccatattttattgtcttgtctagattgcacagtaattataaatatatatatatatattggtatttatt----A-C----CC-A--T--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------GCCAAAAATT--C-----TT---TT---T-----------G----------T-------------T--------------T--------A---AAAAAAAAACATCAAC-A--G-A----AC-T-----GT------AA-------TGTT---TGC-C--AA---AAA---C-A--GAA--C-C-G-CA---T-T--A-A------A--AAC----C--AG-TTG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-G-GG-T-CAT-C--T--TT-T-A--AATC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-TG------ACA---TT--TCCATTT---TAA--------A-TAT-T-------T---G-------AAAAGTTGAAAGATA----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-GTTAAAGTTGCACTAGTTCCC---C-ACCA-------T--C---C--CC---T----G-CC-------T----CT----AT---TTTGAAA-----T-ACATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTCATGT
gi|11 : CCATTATAAATGAATTCCTAGA--CTTG--CAT--------C---C------C--TG--C----C------T-G--C--C--T-------G---T-T-A-T---TT-T----A-A----TC-G--C--CC----TATCATA-TGT------------TAT--------T--------A--------T--C-----TT---AT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAT-G--GGA----AC-T-----GT------AA-------T--T---TAC-C--AA---AT----T-G--GC---C-C-A-CA---TAT--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--T-T--T---C-------T--A-T-TA-T-T-T-T--T--AT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CA------ACA---CT--TCCTTTT---T-G--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------C---------------A---A-----------AT----------T-G-------------------C---C-ACCC-------C--TC--C--CC---C----A-CC-------C----CT----AT---TGTGAAA-----C-ACATTTGGA-TAAAAATCTAGGAATAAATGT
gi|12 : CCATAGTAAATTATTTCCTAGA--TCTT--TAT--------C---C------T--CT--T----CAA----C-G--G--C--C-------A---C-C-T-TGTGTT-T----A-C----CT-G--A--CC----CAATACA-TTT------------TAC--------T--------G--------T--CAAAAATT---AT---------------A----------T-------------T--------------TTCG-----G---A-----------CAAC----AGA----AT-C-----GT------CA-------T--T---TG--C--AA---AA----C-G--GTG--C-T-G-TA---T-T--T-T------A--A-A----CATTT-TTA---AGT--C-T--T---------------------T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--A-----C---CT------T--AT-A-CA------ACA---CT--TTTGTTA---G-A--------A-TAT-C-------T---GC------AAAAAT--------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------A-A-------------------A---C-A----------------------------------------------TT----GT---TTAGAAA-----A-ACATTTGGA-TTCAAACCTATGAATTAAT
gi|13 : gCCATAGTAAATTATTTCCTAGA--TCTT--TAT--------C---C------T--CT--T----CAA----C-G--G--C--C-------A---C-C-T-TGTGTT-T----A-C----CT-G--A--CC----CAATACA-TTT------------TAC--------T--------G--------T--CAAAAATT---AT---------------A----------T-------------T--------------TTCG-----G---A-----------CAAC----AGA----AT-C-----GT------CA-------T--T---TG--C--AA---AA----C-G--GTG--C-T-G-TA---T-T--T-T------A--A-A----CATTT-TTA---AGT--C-T--T---------------------T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--A-----C---CT------T--AT-A-CA------ACA---CT--TTTGTTA---G-A--------A-TAT-C-------T---GC------AAAAAT--------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------A-A-------------------A---C-A----------------------------------------------TT----GT---TTAGAAA-----A-ACATTTGGA-TTCAAACCTATGAATTAATttatca
gi|14 : gATCAATTTATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------T--CT--T----C------T-GG-C--C--C-------A---T-T-T-T---TT-T----A-TTTTACT-G--C--CT-----GACATA-TAT------------TTC--------T--------A--------T--T-----TT---G------A-G-------A----------------------------------------------------A-----------CATT-GTAGGA----AC-C-----TT------AA-------T--T---TGC-C--GA---AA----C-A--GTG--C-T-G-CA---T-T--T-T------A--A-AA---C--TT-TAG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-GA-T-T-G-T--T--TTAC-A--TTTC-----AT--A-----C---CT----A-A--A--A-CG------AC----------CATTT---A-A--------A-TAC-C-------A---A-------AA------------A----A--------------ATAAATAATA------A---A-----------AT----------T-G-------------------C-----ACTC-------T-------------------GACT-------C----CT----GT---TTTGAAA-----C-AAATTAGGA-TGAAAATGTAGGAttatc
gi|15 : cTTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TT--T----C------C-ATCC--C--C-------A---T-T-T-T---TT-T----A-C----CT-G--C--CC----CAAC------------------------------T--------G--------TAAC-----TT---G----CCA-A-------A-----------------------------------------------------------------AAA-G--GCACTTAAG-T-----AT------AA-------TAAT---TGG-C--AA---AA----T-G--GTG--C-C-A-CA---T-G--A--------A--A-C----C--TT-TC----A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--TTTC-----AC--A-----C---CT----A-T---T-G-CC------ACA---GT--TTCGTTT---A-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------ATG-------------A---A-----------AT----------T-A-------------------A-----ACCC-------A----------C---A----G-TC-------C----TT----AT---ATGGAAA-----C-GAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAGATAAT
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gi|17 : acTAATATATTAATTCCTAAA--GTTT--TAT--------C---G------C--TG--C----C------C-G--C--C--CAAG----G---T-T-T-T---TT-G----A-C----CT-G--C--CC----CAACATA-TTTGTATTGTTTTATTGT--------T--------G--------T--T-----TTTTGGT---TTG-G-------T----------T-------------TGTTTTTTTT-----T--------G---A-----------CAA--A--GGA----AC-T-----GT------CA-------T--T---CAC-C--AA---AT----T-G--GTG--C-T-G-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---T-T--TGT--T---A-------A--A-T-G--T-T-T-T--TCATT-C-A--TTTC-----AT--G-----TTGACT----A-G---C-A-AG------ACA---CT--TCTGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----tac
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gi|19 : ataatgaattaattgctaaactttttcatcccgtcattccccgtttttttatccgccctgacaaattttattgtcaaaaaagatttatttttaccgtaattcagATAAATTAATTGCTAGA--TTTT--TATG-------C---T------C--CG---------------------------------------T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--T--CC-----AACATA-TTT------------TAT--------T--------------------T-----TT---AT---TAA-TTT-----A----------T-------------T--------------G--------G---A-----------CAAT-A--A-A----AC-T-----AT------AA-------TA-TG--TGT-C--AAGA-AA----T-G--ACA--C-C-G-CA---T-T--T-A------A--A------------------A-T--C-TC-T---A-------A--A-G-GA-T-G-TGC--T--TT-A-A--TTTC-----AT--A-----C---AT----A-A--AT-A-CA------ACA---CT--TCCGATT---C-A--------A-TAT-T-------T---G-------AA------------A----A--------------ttatt
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gi|20 : TAATTAATTAATTTCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------A--TG--C----C------T-G--------------------------T---TT-A----A-C----CC-A--C--TT----TGGAATACTTT------------TAT--------aa
gi|20 : A----C-A--GT---C-C-G-CG---T-T--T-T------A--A-A----CA-TT-TTG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-AA-T-T-T-TG-T--TT-C-A--TTCC-----AT--G-----C---TT----------C-A-CG-------CAAGTCT--TCC-TTT---T-A--------A-AAT-T-------TAATG-------AAG-----------A----A--------------A---------------A---A-----------AA----------T-G-------------------C-----AC------------T---T--TC---T----G-CC-------C----CA----AT---GTTGAAA-----C-ATATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAGTaaaaaaaaatttacagtccgcgttttaaacattttgatctttaaataattttgtttcattccatgcttcacgcaagtcttccttttaaaatttaatgaagaaaaaaatgcactttctgccccaatgttgaaacatatttggatgaaaatctaggaattagttta
gi|21 : taattaattaatttctagattttcatccatgcctgtttaacccactttggaatacttttataaaaaaaaatttCCATTAAAGATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------T---C------T--CA--T----C------T-A--C--C--CCCT----G---T-T-T-T---TT------A-C----C---------------AAC-----TT------------TAC--------T--------G--------T--T-----TT---GA---CCA-G-------A----------T-------------C-------------------------------------------------A----AT-T-----TTTTTTTCAA-------T--A---TGA-C--AA---AG----A-G--AA---C-C-A-------------T------A--A-T----C--TC-CTG---A-T--C-T--TT--AT------A--A-T-GA-T-A-T-T--T--TT----------------------------------------AT---CG------ACA---CA--TCTGTTC---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----ATTAAAAAAT-----A---------------A---A-----------AC----------T-G-------------------A---G-ACCC-------T---------------------CC-------C----CT----TC---TTTGGTA-----T-AAATTTGGA-TAAAAATtta
gi|22 : aggCCATAATAAATTA-TTCCTAGA--TTTT--TAT--------T---CTAA---C--CA--C----C------C-------C--T-------GGT-T-T-T-T---TT-T----A-C----CC-A--C--TC----TGACATA-CTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---TCA-GCTTCTTTA----------T-------------T--------------T--------T---A-----------CAAC-G--AGA----AC-T-----GT------AA-------TC-T---TGC-C--
gi|22 : gT--G-----C---CT----ATA--AT-A-TC------ACA---CT--TCCATTT---T-A--------A-TAA-C-------T---A-------AAT-----------A----AT-------------A---------------A---A-----------A---------------------------------------------------------C--CT---C----A-TC-------C----CT----GT---TCTGAAA-----C-AGATTAAGA-TGAAAATGAAGGAATTgcgttttacaactgcctataatatcacacttccattttaataactaaataataaaacctcatccctgttctgaaacagattaagatgaaaatgaaggaattg
gi|23 : gccataataaattattcctagatttttattctaaccacccctggttttttttacccactctgacatactttattgtcttgttcagcttctttattttacaacgagaactgtaatcttgccgcgttttacaacAACTTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TA--C----A------C-A--C--A--CATT----G---T-T-T-T---TT-T----A-T----CC-A--T--CC----CGACATG-TTT------------TAT--------T--------G--------T--A-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------g
gi|23 : -TTT------------TAT--------T--------GA-------T--T-----TT---GT---T----------------------T-------------T--------------T--------G---------------CAGC-A--GGA----AC-C-----AT------AA-------T--T---TAC-C--AA---CA---------------------A---T-T--T-T------A--A-T----A--TT-TAG---A-T--C-T--TTCCA-------A--A---GA-T-T-T-TG-T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----T---CT------A--AT-A-TC------ACA---CT--TCTATTT---C-A--------T-TAT-T-------C---G-------Acgtggattttgttctttttattgattttgtttttgcagcaggaaccataatttaccaacaattttaatatttagatctttccaaagattttgtttcatttcatgtctaatatcacacttctatttcattattcga
gi|24 : aacttaattcctagattttcatccctacacacacattgtttttttatccatcccgacatgttttattgtattgtccagatcgtggattttgttct-------A----------T-------------T--------------T-------------------------AAT-G--GTG----AT-T-----AT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----T-G--GTA--C-C-A-TA---T-T--T-T------A--AAC----T--TT-TTG---A-T--A-T--G---A-------T--G-T-TA-T-C-T-C--T--TT-T-A--TCTC-----GT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---CT--TTCGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------AAACAAAAACAACTG-A---A-----------AT----------T-GTA-----------------T---C-ACCC-------C--T-------------------A-------T----CT----AT---TC----A-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATCAAT
gi|25 : aaaaaatagactaaaatCCATAATTAACTGATGGCTAGA--TTTT--AAT--------A---T------C--CA--C----C------T-G--T--C--CCAGG---G---T-T-T-T---TTTT----A-C----TT-G--C--CC----AGACATA-TTT------------CA------------------------------C-----TT---TTA--CAA-A-------A----------A-------------T--------------A--------G---G-----------GAAC-G--GTA----ATAT-----GT------AA-------T--T---TGC-T--AA--------------------------A---T-T--T-TG-----A--A-C----A--TT-TTG---A-A--CTT--T---A-------A--A-T-GA-T-T-T-TA-T--TT-C-A--TTTC-----TT--G-----C---CT----A-tgata
gi|26 : TCCTAGA--ATTA--CAT--------G---T------C--CG--C----CAA----C-A--T--C--C-------G---T-T-T-T---TT------A-C----CC-G--C--CC----CGATATA-TTT------------------------------------------------------------------------A----------T-------------T--------------T--------G---T-----------CAAA-A--AAA----A---------T------GA---------------------AA---AA----C-G--TCT--C-C-G-CA---T-T--T-T------A--A-A----CA-TT-TCT---A-T--C-T--T---A-------A--A-----------------------A--TTTC-----AT--G-----C---TT----A-A---T-A-CA------GCA---CC--GCCGTTT---T-A--------A-AAC-C-------T---G-------AA------------A-------------------A---------------A---A-----------AT----------T-G-----------------------C-A--------------------CC---C----G-CC-------C----CA----AT---TTTGAAA-----A-AAA-ATGGA-TGAACATCTAGGAAttacaaaaaataaaattgaaccccgtgcataatttgaaacaa
gi|27 : AAAT-AATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TG--C----C------C-A--C--C--CTT-----A---T-T-A-T---TT-G----A-C----CT-G--C--AC----TGCCATG-TTT------------TAT--------T--------G--------T-------------AA---AAA-A-------A----------A-------------T--------------T--------G---A-----------CAAA-G--AGA----AC-C------T------AAATGAT--T--T---TGC-C--AA---AA----T-ATTGC---T-C-A-AA---T-T--T-A------A--A-C----C--AT-TTG---A-T--T-T--TG--A-------A--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--GTTT-----AT--T-----C---CT----A-A---T-A-CG------ACA---CT--TCCGTTT---T-A--------A-TAT-C-------------------AA------------A----A--------------
gi|28 : ----------T-------------T--------------T--------T---A-----------TAAC-G--A-A----AC-C-----GT------AA-------T--A---TACAC--AA---AAAAATC-G--GC---GGC-A-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---A-T--A-T--C---A-------A--A-T-GA-T-T-T-C--G--TT-C-A--TTTC-----TT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---TT--TCCGCTT----------------TAT-C-------T---G-------AA------------A----AATACATAAGT----A---------------A---G-----------GT----------T-G-------------------CA--C-A---------------------C---C----G-TC-------G----CT----AT---TATTAAA-----CAAAATACGGATTTAAAATCTAGGAATTAATgttaa
gi|29 : tattttCCATTATAAATTAATTACTTAA--TTTT--CAT--------C---C------C--CA--CCAT-C------C-A--C--C--T-------T---T-T-T-T---TT-T---------------------------TACATA-TTT------------TAT--------T--------T--------T--T-----TT---AT---AAA-A-------A----------T-----------------------------------------A-----------TAAG-C--GGA----AT-T-----GT------AA-------T--A---TGA-T--GA---AA----CAG--AT---T-C-G-CA---T-T--T-TG-----A--A-C----T--TT-TTG---A-T--C-T--TTC-AGTGATTTA--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---TT------A--CT-T-CT------CCA---TT--TTCGTTT---A-A--------A-TAtta
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gi|3 : gT-TTT---A-TA-C-T--TTA-A-------A--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--TTTT-----AT--G-----C---CT----A-A---T-A-CA------ACA---CT--CTGGTTT---T-A--------T-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------ATTATTATAAAAAATGA---A-----------AT----------T-G-----------------------C-ACCC-------T--T----------------G-ACAA-----C----CT----AT---TTT--------------T---GA-TGAAAATCTAGGAATTCATgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattgttttatactttaaaatgattttctttcattttatgcctaatacaacactctggttttattatctgaaaaattattataaaaaatgaaattgcacccttgacaacctatttttgatgaaaatctaggaattcattt
gi|30 : gctacaacaaattaatttctagattttcatcgccacacccccgccccacccatccctccctgtctcaacatattgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattg----------T-------------T--------------T--------T---A-----------TAAC-G--A-A----AC-C-----GT------AA-------T--A---TACAC--AA---AAAAATC-G--GC---GGC-A-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---A-T--A-T--C---A-------A--A-T-GA-T-T-T-C--G--TT-C-A--TTTC-----TT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---TT--TCCGCTT----------------TAT-C-------T---G-------AA------------A----AATACATAAGT----A---------------A---G-----------GT----------T-G-------------------CA--C-A---------------------C---C----G-TC-------G----CT----AT---TATTAAA-----CAAAATACGGATTTAAAATCTAGGAATTAATtt
gi|31 : ttCCATAATAACTTAATTCCTATA--ATTT--TAT--------C---C------C--TG--T----C------T-G--C--C--C-----------C-T-G-A---TT-T----A-C----CC-T--T--CC------ACATA-TT---------------------------------G--------C--C-----TT---GT---CC--------------------------------------------------T--------G---A-----------TCAT-G--G------AT-TTTTTTAT------AA-------T--T---TGT-C--AA---AATGA-C-G--GCA--C-C-A-CT---T-A--T-T------A--A-A----C--TT-TTG---A-T--T-T--TT--AT------A--A-T-GA-T-T-T-T--TGTTT-C-A--TTTC-----AT--G-----T---CT----A-A---T-A-TG------ACA---TC--TCCTTTT---T-A--------A-TAT-C-------ttat
gi|32 : GA----CC-T-----AT------AA-------TACT---TAC-C--AA---AA----C-G--GC---GAT-A-TA---T-T--TGT------A--A-C----T--TT-TTTTTCA-T--C-T--T---A-------A--AAG-GA-T-T-T-T--C--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----T---CT----A-A--AT-A-CA------ACA---TT--TCTGATT---T-A--------A-TTT-C-------T---G-------AA------------A----AATGGGTAAAT----A---------------A---A-----------AT----------T-G-----------------------C-ACCC-------C--T------------------CT-------C----CT----AT---TTTGAAA-----T-ATATGTAGA-TACAAATCTAGGACTCAATc
gi|33 : aca----------T-------------T--------------T--------GT--A-----------CATC-A--GCA----GT-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AC----C-A--G-----------------------------A--G---------TG-TTG---A----C-T--T---A-------A--A-T-GT-T-T-T-T--C--TT-CCA--TTTC------T--A-----T---C-------A--A-----G------ACA---CT--TCCATTT---T-ACTTGTTTAA-TATTC-------T---G-------AA------------A----A--------------ATGAAAAATAAAAATTA---A-----------AT----------T-T-------------------G---C-AC------------T---G--GC---T----GTCC-------C----CT----GT---GTTGAAA-----C-AAATTTGGT-TGAAAATCTAGGAAttat
gi|34 : attttt----------T-------------T--------------T--------A---A-----------CAAC-A--C-A----GT-C-----GT------GC-------T--T---TAC-C--AA---AA----C-A--GCG--C-C-T-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TCG---A-T--C-TG-C---A-------A--A-TTAA-T-C-A-A--T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---TT----A-A----------------TA---CT--TCCATTT---T-A--------A-AAT-C-------A---G-------AA------------A----A--------------A---------------A---A-----------ATAATATAAAATT-G-------------------C-----ACCT-------C--T----------------G-CC-------C----TT----AT---TTTGAAA-----C-AAATGTGGA-TGAAAATCTGGGAATTAA
gi|35 : tttt----------T-------------T--------------T--------T---A-----------CAAT-G--G-A----AT-C-----GT------AA-------T--TATTTGC-C--AA---AA----T-GCTGC---T---G-CA---T-T--G-T------A--A-C----A--TT-TTG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-AA-CGT-T-C--T--TT-C-A--ATTC-----AT--G-----C---TT----A-A---T-A-CA------ACA---CT--TCTATTT---A-A--------A-TGT-C-------T---G-------AA------------G----AAAT-----------A---------------A---A-----------AT----------T-G-----------------------C-A-------------T---C--CC---C------CT-------C----CT----AT---TTTAAAA-----T-AAATTTGCA-T-AAAATATAGGAATTAAT
gi|36 : tCCATATCAAATTA-TTCCTAGA--TTTT--AAT--------C---C------C--TG--T----C------T-G--T--CATT-------T---T-T-T-T---TT-T----A-C----AT-G--T--CCTTACCAACGTA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--A-----AA---ATAAATCATA-------A----------T-------------T--------------T--------T---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AAATCAA----T-G-----------A-CG---T-T--T-TA-----A--A-C----C--TT-TAG---A-T--C-T--T---C-------A--A-T-GA-T-T-TCT--T--TT-C-A--TTCC-----ta
gi|37 : gg-------G---T-T-G-T---TT-T----A-T----CC-G--C--CA----CAGCATA-TTT------------GAT--------T--------G--------TT-C-----TT---GT---TCA-G-------A----------TCGCGATTATTAT-T--------------T--------GTATA-----------CAAC-G--GGA----AT-C-----GT------AA-------T--T---TCC-C--AA---AA----C-G--GTG--C-C-G-CC---T-T--T-TA-----A--A-C----C--TT-TTtgaaaca
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Reference ( family-1678 ) : CCATAATAAATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--CG--C----C------C-G--C--C--C-------G---T-T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--C--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-G--GC---C-C-G-CA---T-T--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--C-T--T---A-------A--A-T-GA-T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CG------ACA---CT--TCCGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-G-------------------C---C-ACCC-------C--T---C--CC---C----G-CC-------C----CT----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAATAT
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gi|23 : gccataataaattattcctagatttttattctaaccacccctggttttttttacccactctgacatactttattgtcttgttcagcttctttattttacaacgagaactgtaatcttgccgcgttttacaacAACTTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TA--C----A------C-A--C--A--CATT----G---T-T-T-T---TT-T----A-T----CC-A--T--CC----CGACATG-TTT------------TAT--------T--------G--------T--A-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------g
gi|23 : -TTT------------TAT--------T--------GA-------T--T-----TT---GT---T----------------------T-------------T--------------T--------G---------------CAGC-A--GGA----AC-C-----AT------AA-------T--T---TAC-C--AA---CA---------------------A---T-T--T-T------A--A-T----A--TT-TAG---A-T--C-T--TTCCA-------A--A---GA-T-T-T-TG-T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----T---CT------A--AT-A-TC------ACA---CT--TCTATTT---C-A--------T-TAT-T-------C---G-------Acgtggattttgttctttttattgattttgtttttgcagcaggaaccataatttaccaacaattttaatatttagatctttccaaagattttgtttcatttcatgtctaatatcacacttctatttcattattcga
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gi|30 : gctacaacaaattaatttctagattttcatcgccacacccccgccccacccatccctccctgtctcaacatattgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattg----------T-------------T--------------T--------T---A-----------TAAC-G--A-A----AC-C-----GT------AA-------T--A---TACAC--AA---AAAAATC-G--GC---GGC-A-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---A-T--A-T--C---A-------A--A-T-GA-T-T-T-C--G--TT-C-A--TTTC-----TT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---TT--TCCGCTT----------------TAT-C-------T---G-------AA------------A----AATACATAAGT----A---------------A---G-----------GT----------T-G-------------------CA--C-A---------------------C---C----G-TC-------G----CT----AT---TATTAAA-----CAAAATACGGATTTAAAATCTAGGAATTAATtt
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gi|72 : TTT---T-G--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------ATAATA--------------A---------------A---ATGATTAACAATAT----------T-G-----------------------C-ACCC-------C--T-------C---C----A-CC-------C----CT----AT---TATGTAA-----C-AAATTT-TA-TGAAAATTTAGGAATttat
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gi|85 : -CT-------C----CT----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTTAA-TGAAAACCTTGGAATTCATttaattcgcacctattttatta
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blockSeqs : CT AA CGCCACAC ATA ATCAAT TGCATCT CATTCCTGTTGTG G A A GTG TTTTT G TTTA A CAC TTACCA C GTATTGTTTTAT ACAAAAAA GTTCTTGTTCAGATCGCGATTATTATTTGTAT AAAAAAAACAT TGTA G CTTA TTTTTT TTTTTC ATGAT GT ATT A TT ATC AAATCGGCGGCA CGT A AT TATGCC AC CATGGT TTC G AT G AA TCAGTGATTT A G A G CC CA A C TTCTT AATTA TGA CATAAAA T AATACA AGT GAA CTTGTTTA AGTAAAA AAT GTAATAA AAGTTGAAAGATAAAAAATTGTTAAAGTTGCACTAGTTCCCCACCATCCCCTG AACCAGC ATTG TATG AAT TAAAT A T
blockSeqs : . . G . ACAT CACCAT CAAGCACACCCT A . C GTG TTA . A . T CG T . . GTCTCATTCAGATTGCTGATTTGTTTTTTG . CCA G . AT . . AA G A . GA AAATCGGCGGCA C G . TTTTC T ACAT T G A T C CAGTTAT T A G C AA GT T C T . A AATGA T . . GAA TGAAGTT . . C ATCTGAAAACAAAAAATGGAAATGAAATTGTACCCCG AA . A A . A T
blockSeqs : . . T . TAA GTCAT TGTCCCAGGG . . . TTA TCT . . . C TA . . . GTCTTATCCAGATCACAGTATTTTTTTTT . CA G . CA . . AC . G . . TGACGGCACCA . . . G . ACAT T . A T G TCCA . A C . C CA . . . . . ATAA . . . . G . . C AAATAAAAAATAAATTAAAATTGCATGCAGGCACCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGAAC TAGCCCCAAT . . . G TT . . . A CA . . . GTTTTTTGGTTTGGTTTGTTTTTTTTTG . TG G . T . . A . . . . TGGCGTCATG . . . G . AAGC C . . A A TTAA . . G . A . . . . . . AGAA . . . . T . . A AAATGAAAAATAAAAATTAAATTTGCACTGGCTGT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGCC CGCCCAAGG . . . . T . . . A CA . . . GTCTTGTCCAGATCACATTTTTTTACG . AG C . T . . C . . . . CAGCATTTAA . . . G . ACC . . . T A TAA . . . . G . . . . . . ATAA . . . . T . . A AATTTTATAAAATAAAAAATCAAATTGTCTCCCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGC TACCCCCTG . . . . T . . . C CA . . . GTTGTCAAAAAAAAACATTTTTGTG . TG T . C . . . . . . . ACAGAACCG . . . A . AAC . . . T G TAT . . . . G . . . . . . CAAA . . . . . . . . ACCAACCCTCCCCCCATAAAATTGCACCTGCCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CTT CACACATTG . . . . T . . . C CA . . . ATATACCGGTATTTTTTTTTTTTG . TA G . C . . . . . . . TGACTACCC . . . A . ACC . . . T . TAA . . . . A . . . . . . AAA . . . . . . . . ATAATAAAATGATTAACAATATTGCACCCCTCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CTT AACGGCCA . . . . T . . . C TG . . . GTTTTGTCCAGATTTTTCTTTTTG . CA G . C . . . . . . . TATTGCTCA . . . A . ACA . . . . . TAT . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . AAATTAAGTACAGAATTTCTGACCCCCACCACG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CTT AACGGCCA . . . . T . . . C TG . . . GTCTTGTTCAGCTTCTTTATTTT . CG G . T . . . . . . . CGGTGCTG . . . . . ACT . . . . . TAT . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . AAAAACAAAAACAACTGAAATTGTATCACCCCT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTT CATCCCCA . . . . G . . . T TG . . . ATCTTGCCCGTTTTTTTTTTCTG . CA G . T . . . . . . . CGGTGCTG . . . . . ACA . . . . . TAT . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . AAACAAAAAATAAAACTCGCCTCTCCCACACAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGC AACATCCG . . . . T . . . C TG . . . GCCAAAAATTCTTTTTGTTTA . TG T . T . . . . . . . CAGTGCTG . . . . . ACC . . . . . TAT . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . AAATTATTATAAAAAATGAAATTGCACCCTTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAT CACCCTTA . . . . T . . . C CG . . . GTCAAAAATTATATTTTCGG . CG T . T . . . . . . . TGGTGCCA . . . . . ACC . . . . . TAG . . . . C . . . . . . GAA . . . . . . . . CATAAACAATACAAAATATAATTACATCCCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGC TGTCATTT . . . . A . . . C AG . . . GTCAAAAATTATATTTTCGG . AA A . C . . . . . . . TGGTGCTG . . . . . ACC . . . . . TA . . . . C . . . . . . TAA . . . . . . . . ACATACATTAATAAAATTACTCCCCCACCCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAT TGCTCCCA . . . . T . . . T CG . . . GTAAAATAAATCATAATTTT . AG G . T . . . . . . . TGACACCG . . . . . ACT . . . . . TA . . . . C . . . . . . TAA . . . . . . . . CATATAAAAGAAAAGTGAAATTGCAACACCGG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC CACCATCG . . . . T . . . C TG . . . ATCTTATCCAGATTTG . CG G . T . . . . . . . TGGTGTCA . . . . . AGT . . . . . TA . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . TTTATAAAATAAAGTTGCACACCTCCTGCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAC TGCTCCCG . . . . G . . . C CA . . . TTTATTAATTTATTGG . GC G . C . . . . . . . TGGTACCA . . . . . GCC . . . . . TA . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . AAATAATAAATAAAACCTATGCACCCTATG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC CGCTCCTG . . . . T . . . C CA . . . CTTTTACAAAAATAG . CG C . T . . . . . . . CGTCTCCG . . . . . ACC . . . . . TA . . . . C . . . . . . CAA . . . . . . . . AAAAAATAATATAAAATTGCACCTCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGC TGCCACAG . . . . T . . . T AG . . . TTCAAAACATTTTTG . TG G . C . . . . . . . CAGATTCG . . . . . ACC . . . . . GA . . . . C . . . . . . TAA . . . . . . . . AGATTTAAAATAAAACTGCACCCCTCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGC TGGCCCA . . . . T . . . T CA . . . GTCATTTTTTTCCTT . CA G . C . . . . . . . CGGCGATA . . . . . ACA . . . . . TA . . . . C . . . . . . AAA . . . . . . . . AAATAAAAAGATAAAATTTCACCTCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGT GCCCTGA . . . . T . . . T CA . . . GTTTTGACCAGATC . CA A . T . . . . . . . CAGCGCCT . . . . . CC . . . . . TG . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . ATCAAATTAGACCTCCTTCCCCCCTAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGT TGCCTG . . . . T . . . C CT . . . GTCTTGTCTGGATC . TG G . C . . . . . . . TGCTGCTG . . . . . CC . . . . . TA . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . AAATAAATAATAAAATTGCACTCTGA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ATC CCTGGT . . . . T . . . C CA . . . GTAACTTGCCAAA . CG T . T . . . . . . . CGGTGCCG . . . . . CC . . . . . TA . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . AAATACATAAGTAAGGTTGCACACCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC CACCTT . . . . T . . . A CG . . . GATTTTGTTTTTG . CG G . C . . . . . . . CAGCACCA . . . . . CC . . . . . TA . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . AAATACATAAGTAAGGTTGCACACCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC CACCCA . . . . C . . . C CA . . . GTAAAAAAAATTG . TA A . C . . . . . . . CAGTGTTG . . . . . TC . . . . . AT . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . AAATGGGTAAATAAAATTGCACCCCT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAC CACCCA . . . . T . . . T CA . . . TTTTTATAAAAAT . TG G . C . . . . . . . CAGCATTG . . . . . TA . . . . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AATAAAAAAATAAAATTGCACCCCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGC TGCTCC . . . . T . . . A TG . . . GCCTTGTCCTG . CA G . C . . . . . . . TGGCGCCG . . . . . CA . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AATTAAAAAATAAAACTGAGACCCT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC CACATT . . . . T . . . T TA . . . GTCAAAATTGT . TG A . C . . . . . . . TTACATAG . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . ACATGAAAGCACATCCCCATCCTCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGC CCCCTA . . . . T . . . A TG . . . ATTTTGAGA . AG A . C . . . . . . . TGGCGCAA . . . . . CT . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAGAAATAAAATTGCACCCATG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC CCCCCA . . . . T . . . C CG . . . CAAATTTTT . TG G . A . . . . . . . TAATGCCG . . . . . AC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AACAAATTGCCACCCCTCCCCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT CACCG . . . . T . . . C TG . . . AGTTTGG . CA G . A . . . . . . . TGTCACCA . . . . . CT . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAAAAGTTCATCCCTGAACCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAC CCCCG . . . . T . . . C CG . . . ATTTG . TA G . T . . . . . . . CTGAGCCA . . . . . CA . . . . . A . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . AAAAAAATAATAGCACTTCCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGG CCCCA . . . . T . . . C TG . . . GG . CG G . T . . . . . . . CAGCGTCG . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAAATAATTAAAATTACA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TGCCC . . . . T . . . C G . . . . CG G . A . . . . . . . CAGTGCCG . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAAATAATTAAAATTACA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAC CCTA . . . . . . . . C A . . . . CA A . T . . . . . . . TGGCCCA . . . . . CT . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATGAAATTAAACCCACAG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CG TG . . . . . . . . C A . . . . TG G . T . . . . . . . CAGTCCG . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAAAATTGCACCCCTCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AG G . T . . . . . . . AGAACCA . . . . . CC . . . . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAAGATTGCAGCCCCCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . AG G . C . . . . . . . TGATACT . . . . . CT . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . GAAAAAAATGCACTTTCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . C . . . . . . . TGATACT . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . GAAATAAAATTGCATCCCC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TG . . C . . . . . . . TGGCAC . . . . . TC . . . . . A . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . AAATGAAATTGCCCCTCTG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CA . . A . . . . . . . CTGTTT . . . . . AC . . . . . A . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . ATAAAACTGTCACATCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . C . . . . . . . CAGCG . . . . . CA . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAAAAAATGTACCCCCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . T . . . . . . . TGCAC . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAAAAATTGCCACCTCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . C . . . . . . . TTGCG . . . . . CG . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAAAAAATAAACA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . TGGC . . . . . CC . . . . . G . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAATAAAAAATAAACA . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . CAG . . . . . TC . . . . . A . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . ATAAAATTACACCCC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TGA . . . . . CC . . . . . G . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . AAAAATTGCACCCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CGG . . . . . CT . . . . . A . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . TAATAAAACCTCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . A . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA . . . . . A . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : T***** C**** ******* CC******* **
originalCons : CCATAATAAATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--CG--C----C------C-G--C--C--C-------G---T-T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--C--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-G--GC---C-C-G-CA---T-T--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--C-T--T---A-------A--A-T-GA-T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CG------ACA---CT--TCCGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-G-------------------C---C-ACCC-------C--T---C--CC---C----G-CC-------C----CT----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAATAT
finalCons : CCATAATAAATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--CG--C----C------C-G--C--C--C-------G---T-T-T-T---TTT-----A-C----CC-GC----CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-G--GC---C-C-G-CA---T-T--T-T------A--ACC-------TT-TTG---A-T--C-T--T---A-------A--A-T-GA-T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CG------ACA---CT--TCCGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-G-------------------C---C-ACCC-------C--T---C--CC---C----G-CC-------C----CT----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAATAT
Alignments
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lowQualScore : 22 22 22222222 666 666666 22222222222 33333333333333333333333333333 1 0 1 444 222222 0 1111 0 22222 000000 0 111111111111 66666666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111 66666 3 7777 7777777 333333 3333333 55 000 2 00 444 66666666666666666666 111 5 11 8 444444 77 444444444 7 333 4 44 9 55 99999999999 00 4 7 7 8 8 4 66 55 0 3 99 22222 99 66666 888 3333333333 6 3 999999 111 99 111 6 11111111 6 6 1111111 111 7777777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6666666 6666 4444 111 99999 5 5
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Reference ( family-1678 ) : CCATAATAAATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--CG--C----C------C-G--C--C--C-------G---T-T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--C--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-G--GC---C-C-G-CA---T-T--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--C-T--T---A-------A--A-T-GA-T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CG------ACA---CT--TCCGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-G-------------------C---C-ACCC-------C--T---C--CC---C----G-CC-------C----CT----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTAATAT
gi|1 : CCATTATAAATTA-TTCCTAGA--TTTT--TAT--------T---C------T--CA--C----C------C-G--C--C--CCT-----G---T-T-T-T---TTAT----A-C----TC-T--CTTCC----CACCATA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----TT---GT---CTA-G-------A----------T-------------T--------------
gi|1 : gTA-TTT------------CAT--------T--------------------------TT---AT--------------------------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAC-G--GGA----AT-C-----GT------AAATCGTAAT--T---TGC-C--AA---GC----C-G--GCA--C-C-A-CG---T-T--T-T------A--A-A----CA-TT-TTG---A-T--G-T--T---G-------A----T-GA-TAT-T-T--TG-TTAC-A--TTTT-----AG--G-----C---TT----A-A---T-A-CA------ACA---TT--TCTGTGA---T-T--------A-TAT-C-------A---G-------AA------------A----A--------------A---------------A---A-----------ATAAAAT-----T-G-------------------C-----AC------------T---C--AC---T----G-TC-------T----CT----GT---TTTTAAA-----C-AAATTTGGA-TAAAAATCTAGGAgcacagtaattataaatatatatatatatattggtatttatttatttcattttattttgacaacgggaatcgtaaatcgtaatttgccaagccggcaccacgttttaaacattttgatgttgatgatattttgttacattttaggcttaatacaacatttctgtgattatatcagaaaaaaaataaaattgcactcactgtctctgtttttaaacaaatttggataaaaatctagga
gi|10 : gccattataaattattcctagatttttattctcacccgcccctgttttttatactctcttcccaccatattttattgtcttgtctagattgcacagtaattataaatatatatatatatattggtatttatt----A-C----CC-A--T--CC----CGACATA-TTT------------TAT--------T--------GCCAAAAATT--C-----TT---TT---T-----------G----------T-------------T--------------T--------A---AAAAAAAAACATCAAC-A--G-A----AC-T-----GT------AA-------TGTT---TGC-C--AA---AAA---C-A--GAA--C-C-G-CA---T-T--A-A------A--AAC----C--AG-TTG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-G-GG-T-CAT-C--T--TT-T-A--AATC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-TG------ACA---TT--TCCATTT---TAA--------A-TAT-T-------T---G-------AAAAGTTGAAAGATA----A--------------A---------------A---A-----------AT----------T-GTTAAAGTTGCACTAGTTCCC---C-ACCA-------T--C---C--CC---T----G-CC-------T----CT----AT---TTTGAAA-----T-ACATTTGGA-TGAAAATCTAGGAATTCATGT
gi|11 : CCATTATAAATGAATTCCTAGA--CTTG--CAT--------C---C------C--TG--C----C------T-G--C--C--T-------G---T-T-A-T---TT-T----A-A----TC-G--C--CC----TATCATA-TGT------------TAT--------T--------A--------T--C-----TT---AT---CCA-G-------A----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CAAT-G--GGA----AC-T-----GT------AA-------T--T---TAC-C--AA---AT----T-G--GC---C-C-A-CA---TAT--T-T------A--A-C----C--TT-TTG---A-T--T-T--T---C-------T--A-T-TA-T-T-T-T--T--AT-C-A--TTTC-----AT--G-----C---CT----A-A--AT-A-CA------ACA---CT--TCCTTTT---T-G--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------C---------------A---A-----------AT----------T-G-------------------C---C-ACCC-------C--TC--C--CC---C----A-CC-------C----CT----AT---TGTGAAA-----C-ACATTTGGA-TAAAAATCTAGGAATAAATGT
gi|12 : CCATAGTAAATTATTTCCTAGA--TCTT--TAT--------C---C------T--CT--T----CAA----C-G--G--C--C-------A---C-C-T-TGTGTT-T----A-C----CT-G--A--CC----CAATACA-TTT------------TAC--------T--------G--------T--CAAAAATT---AT---------------A----------T-------------T--------------TTCG-----G---A-----------CAAC----AGA----AT-C-----GT------CA-------T--T---TG--C--AA---AA----C-G--GTG--C-T-G-TA---T-T--T-T------A--A-A----CATTT-TTA---AGT--C-T--T---------------------T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--A-----C---CT------T--AT-A-CA------ACA---CT--TTTGTTA---G-A--------A-TAT-C-------T---GC------AAAAAT--------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------A-A-------------------A---C-A----------------------------------------------TT----GT---TTAGAAA-----A-ACATTTGGA-TTCAAACCTATGAATTAAT
gi|13 : gCCATAGTAAATTATTTCCTAGA--TCTT--TAT--------C---C------T--CT--T----CAA----C-G--G--C--C-------A---C-C-T-TGTGTT-T----A-C----CT-G--A--CC----CAATACA-TTT------------TAC--------T--------G--------T--CAAAAATT---AT---------------A----------T-------------T--------------TTCG-----G---A-----------CAAC----AGA----AT-C-----GT------CA-------T--T---TG--C--AA---AA----C-G--GTG--C-T-G-TA---T-T--T-T------A--A-A----CATTT-TTA---AGT--C-T--T---------------------T-T-T-T--T--TT-C-A--TTTC-----AT--A-----C---CT------T--AT-A-CA------ACA---CT--TTTGTTA---G-A--------A-TAT-C-------T---GC------AAAAAT--------A----A--------------A---------------A---A-----------AT----------A-A-------------------A---C-A----------------------------------------------TT----GT---TTAGAAA-----A-ACATTTGGA-TTCAAACCTATGAATTAATttatca
gi|14 : gATCAATTTATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------T--CT--T----C------T-GG-C--C--C-------A---T-T-T-T---TT-T----A-TTTTACT-G--C--CT-----GACATA-TAT------------TTC--------T--------A--------T--T-----TT---G------A-G-------A----------------------------------------------------A-----------CATT-GTAGGA----AC-C-----TT------AA-------T--T---TGC-C--GA---AA----C-A--GTG--C-T-G-CA---T-T--T-T------A--A-AA---C--TT-TAG---A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-GA-T-T-G-T--T--TTAC-A--TTTC-----AT--A-----C---CT----A-A--A--A-CG------AC----------CATTT---A-A--------A-TAC-C-------A---A-------AA------------A----A--------------ATAAATAATA------A---A-----------AT----------T-G-------------------C-----ACTC-------T-------------------GACT-------C----CT----GT---TTTGAAA-----C-AAATTAGGA-TGAAAATGTAGGAttatc
gi|15 : cTTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---C------C--TT--T----C------C-ATCC--C--C-------A---T-T-T-T---TT-T----A-C----CT-G--C--CC----CAAC------------------------------T--------G--------TAAC-----TT---G----CCA-A-------A-----------------------------------------------------------------AAA-G--GCACTTAAG-T-----AT------AA-------TAAT---TGG-C--AA---AA----T-G--GTG--C-C-A-CA---T-G--A--------A--A-C----C--TT-TC----A-T--C-T--TT--A-------A--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--TTTC-----AC--A-----C---CT----A-T---T-G-CC------ACA---GT--TTCGTTT---A-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------ATG-------------A---A-----------AT----------T-A-------------------A-----ACCC-------A----------C---A----G-TC-------C----TT----AT---ATGGAAA-----C-GAATTTGGA-TGAAAATCTAGGAGATAAT
gi|16 : attatATTAATTCCTAGA--TTTT--CAT--------C---A------C--TG--CATCTC------C-A--C--C----------G---T-T-G-T---T----------------------------------TA-TTT------------TA--------------------------------------------------G--------------------------------------------------------G---A-----------CAAT-G--GTA----AC-T-----GT------AA-------T--C---TGC-C--AA---AA----T-G--ACTA-C-C-C-CA---C-------------A--C-C----C--TG-TTG---A-C--C-T--TT--A-------A--A-G-GA-T-T-T-TA-T--TT-C-A--TGTC-----AT--G-----C---CT----T-A---T-A-CG------ATA---CT--TCTGTTT---T-A--------A-ACT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------ATTAAGTACA------G---A-----------AT----------T-T-------------------C---TGACCC-------C--C---A--CCA--C----G-CC-------C----TG----AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATTTAGGAACTAATt
gi|17 : acTAATATATTAATTCCTAAA--GTTT--TAT--------C---G------C--TG--C----C------C-G--C--C--CAAG----G---T-T-T-T---TT-G----A-C----CT-G--C--CC----CAACATA-TTTGTATTGTTTTATTGT--------T--------G--------T--T-----TTTTGGT---TTG-G-------T----------T-------------TGTTTTTTTT-----T--------G---A-----------CAA--A--GGA----AC-T-----GT------CA-------T--T---CAC-C--AA---AT----T-G--GTG--C-T-G-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---T-T--TGT--T---A-------A--A-T-G--T-T-T-T--TCATT-C-A--TTTC-----AT--G-----TTGACT----A-G---C-A-AG------ACA---CT--TCTGTTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----tac
gi|18 : catggtgaatATAATGAATTAATTGCTAAACTTTTT--CAT--------C---C------CGTCA--T----T------C----C--C--C-------G---T-T-T-T---TT-T----A-T----CC-G--C--CC----TGACAAA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--C-----
gi|18 : -C-A--TGTCT----AT--G-----A---CT----A-----TCA-CG------AC----CT--TCCGTTT---T-A--------A-TGT-C-------T---G-------AAATCTGAAAAC--A----A--------------A---------------A---A-----------ATGGAAA-----T-G-------------------A---A-ATTG-------T--A---C--CC---C----G-TT-------T----TTA---AT---TTTGAAA-----C-AAATTTGAA-AG-AAATCTGAGAATTAATaaaaaagatttatttttaccgtaattcagcatgtctatgactatcacgaccttccgttttaatgtctgaaatctgaaaacaaaaaatggaaatgaaattgtaccccgtttttaattttgaaacaaatttgaaagaaatctgagaattaatttatt
gi|19 : ataatgaattaattgctaaactttttcatcccgtcattccccgtttttttatccgccctgacaaattttattgtcaaaaaagatttatttttaccgtaattcagATAAATTAATTGCTAGA--TTTT--TATG-------C---T------C--CG---------------------------------------T-T-T---TT-T----A-C----CC-G--T--CC-----AACATA-TTT------------TAT--------T--------------------T-----TT---AT---TAA-TTT-----A----------T-------------T--------------G--------G---A-----------CAAT-A--A-A----AC-T-----AT------AA-------TA-TG--TGT-C--AAGA-AA----T-G--ACA--C-C-G-CA---T-T--T-A------A--A------------------A-T--C-TC-T---A-------A--A-G-GA-T-G-TGC--T--TT-A-A--TTTC-----AT--A-----C---AT----A-A--AT-A-CA------ACA---CT--TCCGATT---C-A--------A-TAT-T-------T---G-------AA------------A----A--------------ttatt
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gi|3 : gCTACAACAAATTAATTTCTAGA--TTTT--CATCGCCACACC---C------C--CGC-C----C------C-A--C--C--C-------A---T-C-C-C---TC--------C----CT-G--T--CT----CAACATA-TT
gi|3 : gT-TTT---A-TA-C-T--TTA-A-------A--A-T-GA-T-T-T-TC-T--TT-C-A--TTTT-----AT--G-----C---CT----A-A---T-A-CA------ACA---CT--CTGGTTT---T-A--------T-TAT-C-------T---G-------AA------------A----A--------------ATTATTATAAAAAATGA---A-----------AT----------T-G-----------------------C-ACCC-------T--T----------------G-ACAA-----C----CT----AT---TTT--------------T---GA-TGAAAATCTAGGAATTCATgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattgttttatactttaaaatgattttctttcattttatgcctaatacaacactctggttttattatctgaaaaattattataaaaaatgaaattgcacccttgacaacctatttttgatgaaaatctaggaattcattt
gi|30 : gctacaacaaattaatttctagattttcatcgccacacccccgccccacccatccctccctgtctcaacatattgtcaaaaaataatttaaaaaggcataccattttggaaaaaataacagtgcctttgtccaaaaaaatataaatttgtcccaattg----------T-------------T--------------T--------T---A-----------TAAC-G--A-A----AC-C-----GT------AA-------T--A---TACAC--AA---AAAAATC-G--GC---GGC-A-CA---T-T--T-T------A--AAC----C--TT-TTG---A-T--A-T--C---A-------A--A-T-GA-T-T-T-C--G--TT-C-A--TTTC-----TT--G-----C---CT------A--AT-A-CG------ACA---TT--TCCGCTT----------------TAT-C-------T---G-------AA------------A----AATACATAAGT----A---------------A---G-----------GT----------T-G-------------------CA--C-A---------------------C---C----G-TC-------G----CT----AT---TATTAAA-----CAAAATACGGATTTAAAATCTAGGAATTAATtt
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gi|36 : tCCATATCAAATTA-TTCCTAGA--TTTT--AAT--------C---C------C--TG--T----C------T-G--T--CATT-------T---T-T-T-T---TT-T----A-C----AT-G--T--CCTTACCAACGTA-TTT------------TAT--------T--------G--------T--A-----AA---ATAAATCATA-------A----------T-------------T--------------T--------T---A-----------CAAC-G--GGA----AC-C-----GT------AA-------T--T---TGC-C--AAATCAA----T-G-----------A-CG---T-T--T-TA-----A--A-C----C--TT-TAG---A-T--C-T--T---C-------A--A-T-GA-T-T-TCT--T--TT-C-A--TTCC-----ta
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gi|39 : ttaaaaaaaacataaatagtttcgtcattaagaattcctgtattttcattccatcccacccattattctaccagcccagacatactttattgtcttgtcc----------T-------------T--------------T--------G---A-----------CATT-A--GAA----AC-------GT------AA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-G--G-----------------T--T-T------A--A-CATGGT--TT-TCT---T-T--C-TAAT---A-------A--A-T-CA-T-T-T-G--T--TT-------------------------------------A--AT-ATCG-------------T--TACATTT---T-A--------A-TAT-C-------T---G-------AA------------A----C--------------ATG-------------A---A-----------A-------------G-------------------CA--C-ATCC-------CCAT---C--CT---C----G-AT-------C----------AT---CTTAAAA-----C--AGTATGGA-TGAAAATATTGGAATTAATt
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gi|44 : ttttctgcaCATAATAAATCAATTCCAAGA--TTGT--CAT--------C---taaattttgatgacaatcttggaattgatttattatg
gi|45 : ttttctgcagacaatgggaacttatttgccaagatggcaccatgtttaaaagcttttgatctttgaatgattttttttcattccatgcattaaacaacagtcgttttaatgtctgaaaaaaataaattttA-------T--T---TGC-C--AA---AA----C-A--GC-------G-C-----------T------A----------------TG-----T--T-T--T---A-------A--A----ACT-T-T-T--T--TT-A-A--TTTC-----TT--G-----C---CT----A-A---T-A-TG------ACA---TG--TCCATTT---A-A--------A-TAT-C-------T---G-------AATTTATAA-----A----AT-------------A---------------A---A-----------GT----------T-G-------------------C-----ACAC-------C--T---C--CTG--C----A-CA-------C----CT----------TTGTAA-----C-AAATTTGGA-TGAAAATTCAGAAAATAAT
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