lowQualScore                  :           1111                                                   2222222222                                        111111111                                                  222222222222222222                                                     111111111111111                                                                                                                       11111     11                                                                  3333333333                  
lowQualScore                  :    6      7777    4                    222   3   11   2222 2 222 1111111111 3    22 11 11             33333    222 777777777  777777777777 33333  2222 2222       11 7777777  111111111111111111   2222    11 44444444        555      333333  1   1 999999999999999 11  2  8 444 444 222      33333      1  5           44444444            333333    1   33 1    2               55  222 33333 3   22   22  7777 3            6666 7      22  333   22     0     333   5555555555  666          4  
lowQualScore                  :    .      ....    .                    ...   .   ..   .... . ... .......... .    .. .. ..             .....    ... .........  ............ .....  .... ....       .. .......  ..................   ....    .. ........        ...      ......  .   . ............... ..  .  . ... ... ...      .....      .  .           ........            ......    .   .. .    .               ..  ... ..... .   ..   ..  .... .            .... .      ..  ...   ..     .     ...   ..........  ...          .  
lowQualScore                  :    0      1111    6                    666   0   88   8888 7 333 9999999999 1    00 88 88             33333    333 333333333  111111111111 44444  9999 9999       88 4444444  111111111111111111   8888    88 77777777        888      888888  3   4 333333333333333 99  8  6 888 888 444      33333      3  9           88888888            888888    3   77 3    7               88  777 77777 1   11   22  8888 2            8888 9      44  000   55     4     222   0000000000  777          1  
consensus                     :  GAGACATGGTA-TAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T---T--TT--A--CAGTAAAG-A--T--GCACAAAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--N--T---TT-T--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CCCTTG-TCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----A-ATGT-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TGTATACC--AA---CTT--TCAAATATAAT---TAC--TTC--AT-AA---CCACAATATCGAC
Reference ( gi|11 )           :  GAAACATGGCA-AAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T---T--TC--A--AAATAAAG-A--T--GCACAAAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--T--T---TG-T--AT-TCTC---A---T---GAAGCA-----CCCTTG-TCTTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----A-ATGA-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TATATACC--AA---CTT--TCAAATATAAT---TAC--ACC--CT-AA---CCACAATATCTACA
gi|13                         :  GAGACATGT----AGGA-GT-GTCACTTGTGTTGCCGT---TAT-AAC--ACA----T-T---T--T---A--CAGTAAAG-A--T--TCACAAAACGATC-----GGTG---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--GCATGA--TA-A----------------AAG----GATC--T--------GCAACAGC---TTTTAC------CA-TGG-AC-G--T--T---TA----AT-TCGC---A---T---AAAACA-----CCCTTG-CTCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATAAA------CAAC-CTC--A-AATA-AATTACAACCCTATT--CA---A-----ATAT---TCA--TC----A-TCTTTCAGAAAG----TGTTTACA--AA---CTT--TCAAATATAAT---TAC--TTC--AT-AA---CCACAATATCGAC
gi|16                         :  cAGACATGGTA-TAGGA-ATTGTCGCTTGCATTGCCAT---TAT-AAC--ATA----G-T---T--TT--A--TAGTAAAA-A--T--GCACAAAACAATC-----TGTT---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTTAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAT------CC-TGG-A--GGTT--T---TG-T----------------T---GGAGCA-----CCCTTG-TCCTACAATGGCTA--------TCTGTCAACATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----A-ATGA-ACA--AC----G-TCTGACAGAAAG----TATATACC--AA---CTT--TCAAATATGAT---TAC--TTC--AT-AA---CCACAATATATt
gi|14                         :  aAGACATGGGA-TAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----G-T---T--TT--A--CAGTAAAG-A--T--GCACAAAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAC----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CAGTGA-G--G--T--T---T--T--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CCATTG-TCCTGCAATGACTA--------TCTGTCAACATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATC--AA---A-----A-ATGA-CCA--AC----A-TCAGACAGAAAG----TATATACC--AA---CTTAATTAAA-ATAAC---TTC--A-----T-AA---CCACAACATTTAC
gi|6                          :  aAGACATGGTA-TAGGA-ATTGTCACTTACATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----G-T---T--TT--A--CAGTAAAG-A--T--GCACACAACGATA-----TGTC---A---------TA------------C-----AT----C----CTGTTAT--A----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-G--G--A--T---TT-T--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CCCTTG-TCCTGCATTGGCTA--------TCTGTCAATTTACTGTGTCAAA-CTC--A-AATT-ACTTACAACCTTATCA-AA---A-----A-ACGT-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TATATACT--AA---CTT--TC-AATTTAAT---AAC--TTC--AT-AA---CCACAATGTATAC
gi|17                         :  aAGACATGGTG-TAGCA--CTGTCACTTGTATTGCTGT---TAT-AAC--ATA----TAT---T--TT--A--CAGTAAAG-A--TCTGCACAAAGTGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----GTGTCAT--A----A--TA-T----------------AAA----GATC--T--------GCAGCAGC---TGATAT------CA-TGG-A--G--G--T---TT-A--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CCCTTA-TCATGCAATGGCTA--------TCTGTGAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-TAGTACATCCTTATT--AA---A-----A-A-GC-TCA--AC----A-TCTGATAGAAAG----TTTTTACC--AAATTCCT--TC--ATA-AAC---CAC--ATT--ATAAA---CCACc
gi|26                         :   AGACATGGTA-AAGGA-ATTGTCACTTGCATTGTCGC---TAT-AAC--ATA----G-T---T--T---A--CAATAAAG-A--T--GCGCAAAACGATC-----TGTT---A---------AA------------C-----TT----C----CTGTCAT--A----C--TA-T----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGTTGC------CA-TGG-G--G--A--T---TT-T--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CCCTTG-TCTTGCAATGGCTA--------TCTGCCAATACA------CAAA-CTT--C-AACATCATTCCAAC
gi|12                         :  aAGACATGGTATAAG---ATTGTTACTGGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----T-T---T------A--CGGTAAA--A--T--GCACACAGCGATC-----TGTC---A---------A-------------C-----AA----C----CAGTCAA--A----A--TA-T----------------AAA----GCTC--T--------GTA--------TGTTAT------CA-AGG-A--T--G--T---AG-T--AT-GCAC---A---T---GAAGCA-----TCTGTG-TCCTGTAATAGCTACACTTGTATTTGTCGATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----A-GTTT-CAA--AT----A-TATGACAGAATA----TTTATACT--AA---AAT--TCATA-AAAAC---TGC--TCCA-AA-AA---CCACAATAtataattacttcataaccacaatatcgacctcatt
gi|4                          :   AGACATGGTA-TAGGA--TT-TCACTTGCATTGCGGT---TAT-AAC--ATA----T-TGTTT--TC--A--T--TAAGG-A--C--GTACAAAGCAATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCA--------------------------------------------T--------GTAACAGT---TAATAC------CA-TGG-G--G--G--T---TT-T--AT-TCGG---A---T---GAAGAA-----CACTTG-CCATGCAATAGCTA--------TCTGTCAATATA------------TG--A-AATATAAT----GCTTTATT--GA---T-----A-ATgcaacctca
gi|7                          : caAGACGTGACA-TAGGATAGTGTTTCTTGCATTGCCAT---TGT-AAC--ATA----T-T---T---------ACATTAAA-A--T--TCAAATAACAATC-----TGTC---AGATCCTGAGAA------------C-----CT----C----TGGTCAT--A-------TGTA----------------GAT----TAAC--T--------GCAACAGCAT-TG-TAT------TA-TAT-A--C--A--T---TT-T---T-TCTC---A---TAGTGAAA-G-----TCCTGT-TCTTG-AACAGTTA--------CCTATCAATATA------CAAA-CTCTTATAATA-TATTA-----TTATT--AAAATA-----A-ATAT-TCA--ACAA--A-CCAAACAGAAAT----T-TATACcataagctccgcctcaaatcaattacaaccttattaaaaatgtccatcatctgtcagaaagtgtataccaactttcaaatataattacttcataac
gi|28                         :   AGACATGATA-TAGGATAGTGTCTCTTGTATTGTCAT---TGT-AAC--ATA----T-T---T---------ACATTAAA-A--T--TCAAAAAACAATC-----TGTC---AGATCTTGAGAG------------C-----GT----C----TGGTTAT--AT---G--T--A----------------GAA----TAAC--T--------GCAACAGCAT-TG-TAT------TA-T---------T--TTCATT-T--CT-TCTC---ATAGT---GAA--A-----TTCCTG-TTCTTCAACAGTTA--------CCTGTCAGTATA------CAAA-CTC--T-TATA-TATTAtctaaaattcatctagaagagctaacttctaaaaccc
gi|2                          :    aACATTATA-TAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCAA---TAT-AAC--AT-----T-T---T--TT--A--CATTAACG-A--T--GCACAAAACAATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--G--T---TT-T--AT-TTGC---A---T---GAAGCA-----CCAATG-TCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAACCTTATA--AA---ATAGATA-ATGT-TCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AA---CTT--TCAAAATTAGT---TAC--TTT--AT-AA----CACAATATCt
gi|10                         :     ACATGATA-TAGGATAGTGTCTCTTGCATTGTCAT---TGT-AAC--ATA----T-T---T------A--CATTAA---A--T--TCAAATAACAATC-----TGTC---AGATCCTGAGAG------------C-----AC----C----TGGTCAT--AT---G--TA-A----------------AAT----GA-C--A--------GCAACAGCATTTTATTA------TA-TAC-A--C--T--T---T------T-TCTC---ATAGT---GAA--A-----TTCCTGTTCTTG-AACAGTTA--------TCTGTCAATATA------CACA-CTC--T-TATA-TGTTA-----TTATT--AA---AAT---A-AAGATTCA--ACAA--A-CCAAGCAGAAAT----T-TATAggcctcatt
gi|9                          :     gCATGGTA-TAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGG---TAT-A-T--ATA----T-T---T--TT--A--CAGTAAAG-T--T--GCACAAAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----TT----T----CTGCCAT--A----A--CA-A----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------AA-TGC-A--G--A--T---TT-T--AT-ACGC---A---T---GAAGCA-----CCCTTG-TCCTGCAATAGCTA--------TATGTCAATTTA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTAAT--AA---A-----A-ATGA-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TATATACC--AA---CTT--TCAAATATAAT---TAC--ACC--AT-AA---CCACAATATCTACaatattctaaaattcatctagaagagctacttctatagcc
gi|15                         : caaggCGTAGTA-TAGGA--TTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--ATA----T-G---T--TT--A--CAGCAAAG-A--T--GTACAACGCGATC-----TGCT---A---------AA------------A-----AT----C----CTGTCAT--A----A--CA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACATC---TAATACTAGTATCA-GGG-A--G--G--T---CT-T--AT-TTGC---A---T---GAAGTA-----CCCTCG-TCTTGCAATGGCTA--------TATGT-------------CAAA-CTG--A-AATA-AATTGCAATCTTATT--AA---A-----ATAT---CAA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TGTATACC--AA---ATT--TCAAATATAAT---GAC--TTC--AT-AA---CCACAATATCGACttc
gi|31                         :  aaggCATGGTA-CAGGT-TTTGCCACTTGTATTGCCGT---TAA-AGTTAATG----T-T---T--TT--ACTAAA-AAAGTT--T--GC-CACATCATTC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----ATGTCA---A--------A-A----------------GAC----GATC--T--------GTACCGGC---CAGGAC---------TGT-AC-T--T--T---TT-T--GT-CCAC---C---G---GAAGCA-----GTCTTG-TAATGCAATTGCTA--------TATGTCGATTTA------CAAc
gi|1                          :    tggATGATA-TAGGA-GT-GTCTTTCGCATTGCCTT---TCTAAAC--ATAACAGT-T---T--T------AACTGAAA-ATTT--GCACACAACATTCCTTAATATCCTGAC--------AG------------C-----AT----C----TGGTCAT--ATT--A--TA-ATTAT------------GCA----GATTAATTGCAATTAGCAACAGC---TTGTAT------TA-C-C-A--G--T--A---TG-TGCAT-TTTC---A---C---AAAGTAAATATCCCTTA-TCCTG-AACAGTGA--------CCTGCCAATgttaaa
gi|21                         :               AGAA-ATTGTCA------TTGCCGT---TAT-AAC--GTA----G-T---T--TT--A--CAATTTAG-A--T--GCACAAAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-AGGG--T--T---T--T--AT-TTGC---A---T---GAAGCA-----TCCATG-TCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACATCCTTATT--AA---A-----A-ATGA-CCA--AC----A-TCT----GAAAG----TATATACC--AA---CTT--TCAAATACAAT---GAC--TTC--AT-AG---CCACAATATCTtcattaacatacatacatgtataagtaactaccaaggtagtattttttcagcaaactaaacagaaatttgttatctaaaaattcatctggaag
gi|18                         :            tatAGGA-ATTGTCACTTGCA-----GT---TAT-AAT--ATA----G-T---T--TT--A--CAGTTAAG-A--T--GCACAAATCAATC-----TGTC---A---------GT------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----AATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CC-TGG-A--G--G--T---TT-T--AT-TCAG---A---T---GGAGCA-----CCATTG-TCCTTCAATAGCTT--------TCTGTCCATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCGTATT--AA---A-----A-ATGA-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TATATACC--AA---CTT--TCAGATATAAT---TAC--A
gi|8                          :    aagacagttatAGGA-ATTGTCACTTGCATTGGCGT---TAT-AAC--AT-----T-T---T--TT--A--CATTAATG-A--T--GCACAAAACAATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--G--T---TT-T--AT-TTGC---A---T---GAAGCA-----CCCATG-TCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAAACTTATA--AA---ATAGATA-ATGT-CCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AA---CTT--TCAAAATTAGT---TAC--TTT--AT-AA----CACAATATCtgtacttcataacc
gi|3                          :       cattatatAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--TTT----T-T---T--TTTTA--AAA-AAAG-A--T--GCACAAAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----T----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--G--T---TT-T--AT-TCGA---A---T---GAAGCA-----CCGTTG-TCTTGTAATGGATT--------TCTGTCAATAAA------CAAA-CTT--A-AATA-AAGAACAACCTTATA--CA---ATTTATA-GTGT-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TGTATACC--AA---CTT--TCAAAAATAGT---TAC--TTC--AT-AA----CACAATATCGACggcct
gi|19                         :   aagactttgtatAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T---T--T---A--CAGTAACA-G--T--GCACTAAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-AT-G--T--T---T--T--AT-TTTC---A---T---GAATCA-----CCCTTG-----------GCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----A-ATGT-CCA--AA----A-TCTGAAAGAAAG----ATTATACC--AT---CTT--TGAAATATAAT---TAC--TTC--AT-AA---GCACAATATCGACctc
gi|27                         :    agcaatgttatAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T---T--T---A--CAGTAACA-G--T--GCACTAAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GTAACAGC---TGACAC------CA-TGG-AT-G--T--T---T--T--AT-TTTC---A---T---GAATCA-----CCCT-----------TGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----A-ATGT-CCA--AA----A-TCTGAAAGAAAG----ATTATACC--AT---CTc
gi|23                         :     agcaatgttatGGA-AGT-TCACGTGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----TAT---T--TT--A--CATTAAAG-A--T--GCACAAAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--AA-A----------------TAG----GATC--T--------ACAACAGC---TGATAC------CA-TGGTT--G--T--T---T--T--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CCCTTG-TCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATACA------CAAA-GTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----A-ATGT-TCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TGTATACC--AA---CTT--TCAAATAT------------------------CCACAATATCGAC
gi|20                         :                 GG-ATTGTCACATGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATT----T-T---T--TT--A--CAGTAAAG-A--T--GCACAAAGCGATC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--G--T---TG-T-----------------------GCA-------GTTG-TCCTGCAATGGCTA--------TCTGTTCATATA------CAAA-CTT--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----A-ATGT-CCATTACATGTA-TATGACAGAAAG----TGTA-ATA--AA---CTT--TCAAATATAAT---TAC--TTCAGCG-AC---CCCCAATATCGACctcaa
gi|25                         :              acaGG-ATTGTCTCTTTCTTTACCTTCTTTAT-AGC--ATA----T-T---T--TT--A--CGGTAAAA-A--T--GCACACAGTAATC-----TGCC---A---------ctca
gi|5                          :     caatgcatattata-ATTGACACTTGCATTGCTGT---TAT-AAC--TTA----T-G---T--TT--A--CAGTAAAG-A--T--GTACAAAACCATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC---TGATAC------CA-TGG-A--G--G--T---TT-T--AT-TCGC---A---T---GAAGCA-----CACTTG-TTCTGCAATGGCTG--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTAAAACCTTATTTAAA---A-----A-AAGT-CCA--AC----A-TCTGACAGAAAG----TGTACGCC--AA---ATT--TCAAATATAATAACTAC--A-----T-AA---CCATAATATCgctgatttcatgagtgctttatctgtatggatcatctctgttctgcaatggctatatgtcaatatacaaacttcaaaataagtcatgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|32                         :                   agacacaaaataagTTGCC-C---TATTAAC--ATA----T-T---TCTTT--A--CAATACAA-G--T--ACACACAAGGATC-----TGTC---A---------AAAGTGCAATAAAGC-----AG----G----CTGCCAT--A----A--TATAT---------------GAC----GACC--T--------GCAATAGC---TGGTgatctcgatt
gi|35                         :                             aacaagacatagtataaacAC--ATA----T-T---TCTTT--A--CAATACAA-G--T--ACACACAAGGATC-----TGTC---A---------AA------------CGCGCAATAAAGCGAGGCTGCCATAAA----A--TA-T----------------GAC----GACC--T--------GCATTAGC---TGGTAT------CA-Tttca
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gi|22                         :                               tggtataggaaaattgttt--ATA----T-T---T--TT--A--TCATAAA--A--T--GCACACAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AGTTA-ACGATCTGTACCGGGATAAA----GATC--T--------GTACCGAC---TGGTAT------CA-T----------------TGCT--ACCTCTCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTA-TTATTTAA----------------TGTCAATATA------C-AA-CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----A-GTCT-CTA--AC----ACTCCAA-AGAAAA----TTTGCACT--AA---AAT--TC--ACATAAT---GAT--AAC--TTCAAAACCCACAAT
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1633 )     :                                                                                                                                                                                                         GAGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GNT---TTTATTCGCA---T---GAAGCACCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGAC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                         GAAACATGGCAAAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--TC--AAAATAAAGA----T--GCACA-AAACGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GTT---TGTATTCTCA---T---GAAGCACCCTTGTCTTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACACC-C--T-AA---CCACAATATCTAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAAGA--TTGTTACTGGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----T-T-T------ACGGTAAA-A----T--GCACA-CAGCGATCTGTCA---------A-------------C-----AA----C----CAGTCAA--A----A--TA-T----------------AAA----GCTCTGTA-------TGTTAT------CAAGGA-TGT---AGTATGCACA---T---GAAGCATCTGTGTCCTGTAATAGCTACACTTGTATTTGTCGATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AGTTTCAA--AT----A-TATGACAGAATATTT----ATACT--AAAATTC--ATA---AA-------AAC------TGCTCCAA--A-AA---CCACAATAGCAACa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                         GAGACATG---TAGGA-GT-GTCACTTGTGTTGCCGT---TAT-AAC--ACA----T-T-T--T---ACAGTAAAGA----T--TCACA-AAACGATCGGTGA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--GCATGA--TA-A----------------AAG----GATCTGCAACAGC--TTTTAC------CATGGA-CGT---TTAATTCGCA---T---AAAACACCCTTGCTCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATAAA------CAAC-CTC--A-AATA-AATTACAACCCTATT---C---A-----AATATTCA--TC----A-TCTTTCAGAAAGTGT----TTACA--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGACctca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                         cAGACATGGGATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----G-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATCTGCCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAC----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CAGTGA-GGT---TTTATTCGCA---T---GAAGCACCATTGTCCTGCAATGACTA--------TCTGTCAACATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATC--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCAGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTT----AATT--AA-------AAT------AACTTC-A--T-AA---CCACAACATt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                         aAGGCGTAGTATAGGA--TTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--ATA----T-G-T--TT--ACAGCAAAGA----T--GTACA-ACGCGATCTGCTA---------AA------------A-----AT----C----CTGTCAT--A----A--CA-A----------------GAG----GATCTGCAACATC--TAATACTAGTATCAGGGA-GGT---CTTATTTGCA---T---GAAGTACCCTCGTCTTGCAATGGCTA--------TATGT-------------CAAA-CTG--A-AATA-AATTGCAATCTTATT---A---A-----AATATCAA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AAATTTC--AAAT--AT-------AAT------GACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGACttac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                         aAGACATGGTATAGGA-ATTGTCGCTTGCATTGCCAT---TAT-AAC--ATA----G-T-T--TT--ATAGTAAAAA----T--GCACA-AAACAATCTGTTA---------AA------------C-----AT----C----CTGTTAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAT------CCTGGA-GGT---TTTGTT-----------GGAGCACCCTTGTCCTACAATGGCTA--------TCTGTCAACATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----AATGAACA--AC----G-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------GAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         aAGACATGGTGTAGCA--CTGTCACTTGTATTGCTGT---TAT-AAC--ATA----TAT-T--TT--ACAGTAAAGA----TCTGCACA-AAGTGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----GTGTCAT--A----A--TA-T----------------AAA----GATCTGCAGCAGC--TGATAT------CATGGA-GGT---TTAATTCGCA---T---GAAGCACCCTTATCATGCAATGGCTA--------TCTGTGAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-TAGTACATCCTTATT--AA---A-----AA-GCTCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTTT----TTACC--A-----------------------AAT------TCCTTC-A--TAAA---CCACATTATata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                          AGACA-GTTATAGGA-ATTGTCACTTGCA-----GT---TAT-AAT--ATA----G-T-T--TT--ACAGTTAAGA----T--GCACA-AATCAATCTGTCA---------GT------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----AATCTGCAACAGC--TGATAC------CCTGGA-GGT---TTTATTCAGA---T---GGAGCACCATTGTCCTTCAATAGCTT--------TCTGTCCATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCGTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AGAT--AT-------AATTACATGTACTTC-A--T-AA---CCaaaccac
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             aATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATCTGCCA---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-TGT---TTTATTTTCA---T---GAATCACCCTTG----------GCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTTTG--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---GCACAATATCGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        agcaACATTATATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCAA---TAT-AAC--AT-----T-T-T--TT--ACATTAACGA----T--GCACA-AAACAATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GGT---TTTATTTGCA---T---GAAGCACCAATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAACCTTATA--AA---ATAGATAATGTTCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AACTTTC--AAAA--TT-------AGT------TACTTT-A--T-AA----CACAATATCGGCc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                   ACAGGA--TTGTCACATGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATT----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATCTATCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GGT---T--------G---T---GCAG-----TTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTTCATATA------CAAA-CTT--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCATTACATGTA-TATGACAGAAAGTGT----A-ATA--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-AGCG-AC---CCCCAATATCGACctcatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                  TATAGAA-ATTGTCA------TTGCCGT---TAT-AAC--GTA----G-T-T--TT--ACAATTTAGA----T--GCACA-AAGCGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGAGGGT---TTTATTTGCA---T---GAAGCATCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACATCCTTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCT----GAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AC-------AAT------GACTTC-A--T-AG---CCACAATATCctca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ATGGTATAGGA-AT----------ATTGT--T---TAT-A-----------T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AGTTA-ACGATCTGTACCGGGATAAA----GATCTGTACCGAC--TGGTAT------CATTGC-TAC---CTC-TCCGCA---T---GAAGCATCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAATta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                      GGA-AGT-TCACGTGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----TAT-T--TT--ACATTAAAGA----T--GCACA-AAACGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--AA-A----------------TAG----GATCTACAACAGC--TGATAC------CATGGT-TGT---TTTATTCGCA---T---GAAGCACCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATACA------CAAA-GTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----AATGTTCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT---------------------------------CCACAATATCGAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                        --ATA----T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AG-TA-ATCGATCTGTACC----GGGTAACGATCTGTACCGGC--TGGTAT------CATTGC-TAC---CTC-TCCGCA---T---GAAGCATCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAActcaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                          tggtataggaaaattgtttCATATTATAGGA--TTGTCTCTTTCTTTACCTTCTTTAT-AGC--ATA----T-T-T--TT--ACGGTAAAAA----T--GCACA-CAGTAATCTGCCA---------
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                caatgATCTGC--CAGC--TGATTT------CATGAG-TGC---TTTATCTGTA---T---GGATCATCTCTGTTCTGCAATGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTTCAA-AATA-AGTCAgctgatttcatgagtgctttatctgtatggatcatctctgttctgcaatggctatatgtcaatatacaaacttcaaaataagtcatgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                caatgcatattataggattgtctctttctttaccttctttatagcatatttttacggtaaaaatgcacacagtaAGACATGGTAAAGGA-ATTGTCACTTGCATTGTCGC---TAT-AAC--ATA----G-T-T--T---ACAATAAAGA----T--GCGCA-AAACGATCTGTTA---------AA------------C-----TT----C----CTGTCAT--A----C--TA-T----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGTTGC------CATGGG-GAT---TTTATTCGCA---T---GAAGCACCCTTGTCTTGCAATGGCTA--------TCTGCCAATACA------CAAA-CTT--C-AACATCATTCCAACtgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aTTCC--AACT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGACtataattacttcataaccacaatatcgacctcatt
gi|27                         :               aagacatggtaaaggaattgtcacttgcattgtcgctataacatagtttacaataaagatgcgcaaaacgatctgttaaacttcctgtcatactatgaggatctgcaacagctgttgccatggggattttattcgcatgaagcacccttgtcttgcaatggctatctgccaatacacaaacttcaacatcaATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATCTGCCA---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTCTGTAACAGC--TGACAC------CATGGA-TGT---TTTATTTTCA---T---GAATCACCCT----------TGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTctcatt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                      agcaAGACATGATATAGGATAGTGTCTCTTGTATTGTCAT---TGT-AAC--ATA--------T--TT--ACATTAAA-A----T--TCAAA-AAACAATCTGTCAGATCTTGAGAG------------C-----GT----C----TGGTTAT-------A--TGTA----------------GAA----TAACTGCAACAGCATTG-TAT------TAT-----TTTCATTTCTTCTCATAGT---GAA--ATTCCTGTTCTTCAACAGTTA--------CCTGTCAGTATA------CAAA-CTC--T-TATA-TATTA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                              aTGGTATAT-A-ATTGTCAGTAACATAACCGT---TTA-AAC--ACA----A-T-C--TT--GGGATAAAAG----T--GCACA-CACCCATCCTT-----------AG------------C-----AA----C----TGGTTAT-------G--TG-A----------------------------GTAAC--------TAT------C--GGA-G-------TAATCGC---------------CCTTGTTCTGTAGTGGTTA--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--G-AACA-AATTACAACCTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                         gAGACTTTGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--TTT----T-T-T--TTTTAAAA-AAAGA----T--GCACA-AAACGATCTGTCA---------AA------------C-----AT----T----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAG----TATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GGT---TTTATTCGAA---T---GAAGCACCGTTGTCTTGTAATGGATT--------TCTGTCAATAAA------CAAA-CTT--A-AATA-AAGAACAACCTTATA--CA---ATTTATAGTGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAA--AT-------AGT------TACTTC-A--T-AA----CACAATATCGACatgtattacattccttaccctaatacc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAT--A----A--TA-C----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAT------CATGGA-GGT---TTTATTAGCT---T---GAAGCATTCTTGTCCTGCAAGGGCAA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTA--A-AA-A-AA-TATAATGTTATTAAAA---A-----AATGTCTA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACT--AAAATTT--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCAC-ATATCGGCctc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                          tGGCATGGTACAGGT-TTTGCCACTTGTATTGCCGT---TAA-AGTTAATG----T-T-T--TT--AC--TAAAAAAGTTT--GC-CA-CATCATTCTATCA---------AA------------C-----AT----C----ATGTCA---A--------A-A----------------GAC----GATCTGTACCGGC--CAGGAC--------TGTACTTT---TTTGTCCACC---G---GAAGCAGTCTTGTAATGCAATTGCTA--------TATGTCGATTTA------CAAat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                         tAGACATAGTATAA---------ACTTGC----CC-----TATTAAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATCTGTCA---------AAAGTGCAATAAAGC-----AG----G----CTGCCAT--A----A--TATAT---------------GAC----GACCTGCAATAGC--TGGTgttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aacaA------CAAAGCGC--A-AATA-AATTAC---TTTATT--AA---A-----G-TTTCAA--AC----A-CCCAACAGACAAT-T----ATACCTGAACT--C--ATAT--AT-------AAT------TGCTT--A--T-AAAAACCACAATATCGttca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                     aAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATCTGTCA---------AA------------CGCGCAATAAAGCGAGGCTGCCATAAA----A--TA-T----------------GAC----GACCTGCATTAGC--TGGTAT------CATttctc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTATT--AA---T-----AGTTTCGC--AC----A-TTTGACAGAAGATTC----ATACC--AAAATCC--ATAT--AT-------ACT------TACTTC-A--A-AAT--CCACAATATCAACtg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA--TT-TCACTTGCATTGCGGT---TAT-AAC--ATA----T-TGT--TT--TCATTAAGGA----C--GTACA-AAGCAATTTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCA------------------------------------------TGTAACAGT--TAATAC------CATGGG-GGT---TTTATTCGGA---T---GAAGAACACTTGCCATGCAATAGCTA--------TCTGTCAATATA------------TG--A-AATATAAT----GCTTTATT--GA---T-----AATcacct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ca-CTC--A-AATC-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--TC----A-TCTGTCAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---cataagctccgcctcaaatcaattacaaccttattaaaaatgtccatcatctgtcagaaagtgtataccaactttcaaatataattacttcataac
gi|5                          : caagacatggtataggatttcacttgcattgcggttataacatattgttttcattaaggacgtacaaagcaatttgtcaaacatcctgtcatgtaacagttaataccatgggggttttattcggatgaagaacacttgccatgcaatagctatctgtcaatatatgaaatataatgctttattgataatcataagctccgcAGACACAAAATAAGA--TTGACACTTGCATTGCTGT---TAT-AAC--TTA----T-G-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GTACA-AAACCATTTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GGT---TTTATTCGCA---T---GAAGCACACTTGTTCTGCAATGGCTG--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTAAAACCTTATTTAAA---A-----AAAGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ACGCC--AAATTTC--AAAT--AT-------AAT------AACTAC-A--T-AA---CCATAATATCGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTACATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----G-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-CAACGATATGTCA---------TA------------C-----AT----C----CTGTTAT--A----A--TA-G----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGG-GAT---TTTATTCGCA---T---GAAGCACCCTTGTCCTGCATTGGCTA--------TCTGTCAATTTACTGTGTCAAA-CTC--A-AATT-ACTTACAACCTTATCA-AA---A-----AACGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACT--AACTTTC---AAT--TT-------AAT------AACTTC-A--T-AA---CCACAATGTtctcgatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                         aAGACGTGACATAGGATAGTGTTTCTTGCATTGCCAT---TGT-AAC--ATA----T-T-T------ACATTAAA-A----T--TCAAA-TAACAATCTGTCAGATCCTGAGAA------------C-----CT----C----TGGTCAT--AT---G--TA------------------GAT----TAACTGCAACAGCATTG-TAT------TATATA-CAT---TTT-TTCTCA---TAGTGAA--AGTCCTGTTCTTGAACAGTTA--------CCTATCAATATA------CAAA-CTCTTATAATA-TATTA-----TTATT--AAAATA-----AATATTCA--ACAA--A-CCAAACAGAAA-TTT----ATACatacc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             CATTATATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGGCGT---TAT-AAC--AT-----T-T-T--TT--ACATTAATGA----T--GCACA-AAACAATCTGTCA---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATCTGCAACAGC--TGATAC------CATGGA-GGT---TTTATTTGCA---T---GAAGCACCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAAACTTATA--AA---ATAGATAATGTCCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AACTTTC--AAAA--TT-------AGT------TACTTT-A--T-AA----CACAATATCGGCtctaaaattcatctagaagagctaacttctaaaaccc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                          AGGCATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGG---TAT-A-T--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGT----T--GCACA-AAACGATCTGTCA---------AA------------C-----TT----T----CTGCCAT--A----A--CA-A----------------GAG----TATCTGCAACAGC--TGATAC------AATGCA-GAT---TTTATACGCA---T---GAAGCACCCTTGTCCTGCAATAGCTA--------TATGTCAATTTA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTAAT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACACC-A--T-AA---CCACAATATCTACct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GCAGTTAACAGACACCCCCTCCCCACCCGGTATCTGACTAAATAAATTTAGAGTATCACATACATTGAACTTACAAGTTGTGTATCTTAATTGTTTCATAACGGGTGGGTGTGGC
Unaligned ( gi|36 ): TATATTATAATTAAAATATAGATTCGACTAACTAATCAGAAATTTATACTCGAAAATTCATCTAGAAGAGCTAACTTCTAAAACC
Unaligned ( gi|38 ): CTGCAGTAGTTAACAAGCATTCCCCGTATCTGACTAACTAAATATTGAGTATCATACACATGAAC






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Reference ( family-1633 )     :                                                                                                                                                                                                         GAGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTNT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGAC
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             aATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-TGTTTTA----TTTTCA---T---GAATCA-----CCCTTG----------GCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTTTG--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---GCACAATATCGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        agcaACATTATATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCAA---TAT-AAC--AT-----T-T-T--TT--ACATTAACGA----T--GCACA-AAACAATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----CCAATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAACCTTATA--AA---ATAGATAATGTTCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AACTTTC--AAAA--TT-------AGT------TACTTT-A--T-AA----CACAATATCGGCc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                   ACAGGA--TTGTCACATGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATT----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTT------------G---T---GCAG----------TTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTTCATATA------CAAA-CTT--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCATTACATGTA-TATGACAGAAAGTGT----A-ATA--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-AGCG-AC---CCCCAATATCGACctcatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                  TATAGAA-ATTGTCA------TTGCCGT---TAT-AAC--GTA----G-T-T--TT--ACAATTTAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGAGGGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----TCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACATCCTTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCT----GAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AC-------AAT------GACTTC-A--T-AG---CCACAATATCctca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ATGGTATAGGA-AT----------ATTGT--T---TAT-A-----------T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AGTTA-ACGATCTGTACCGGGATAAA----GATC--T--------GTACCGAC--TGG---TAT------CATTGC-TACCTC-----TCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAATta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                      GGA-AGT-TCACGTGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----TAT-T--TT--ACATTAAAGA----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--AA-A----------------TAG----GATC--T--------ACAACAGC--TGA---TAC------CATGGT-TGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATACA------CAAA-GTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----AATGTTCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT---------------------------------CCACAATATCGAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                        --ATA----T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AG-TA-ATCGATCTGTACC----GGGTAACGATC--T--------GTACCGGC--TGG---TAT------CATTGC-TACCTC-----TCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAActcaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                          tggtataggaaaattgtttCATATTATAGGA--TTGTCTCTTTCTTTACCTTCTTTAT-AGC--ATA----T-T-T--TT--ACGGTAAAAA----T--GCACA-CAGTAATC-----TGCC---A---------
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caatgATC--T--------GC--CAGC--TGA---TTT------CATGAG-TGCTTTA----TCTGTA---T---GGATCA-----TCTCTGTTCTGCAATGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTTCAA-AATA-AGTCAgctgatttcatgagtgctttatctgtatggatcatctctgttctgcaatggctatatgtcaatatacaaacttcaaaataagtcatgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                caatgcatattataggattgtctctttctttaccttctttatagcatatttttacggtaaaaatgcacacagtaAGACATGGTAAAGGA-ATTGTCACTTGCATTGTCGC---TAT-AAC--ATA----G-T-T--T---ACAATAAAGA----T--GCGCA-AAACGATC-----TGTT---A---------AA------------C-----TT----C----CTGTCAT--A----C--TA-T----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGT---TGC------CATGGG-GATTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCTTGCAATGGCTA--------TCTGCCAATACA------CAAA-CTT--C-AACATCATTCCAACtgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTCC--AACT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGACtataattacttcataaccacaatatcgacctcatt
gi|27                         :               aagacatggtaaaggaattgtcacttgcattgtcgctataacatagtttacaataaagatgcgcaaaacgatctgttaaacttcctgtcatactatgaggatctgcaacagctgttgccatggggattttattcgcatgaagcacccttgtcttgcaatggctatctgccaatacacaaacttcaacatcaATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GTAACAGC--TGA---CAC------CATGGA-TGTTTTA----TTTTCA---T---GAATCA-----CCCT----------TGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTctcatt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                      agcaAGACATGATATAGGATAGTGTCTCTTGTATTGTCAT---TGT-AAC--ATA--------T--TT--ACATTAAA-A----T--TCAAA-AAACAATC-----TGTC---AGATCTTGAGAG------------C-----GT----C----TGGTTAT-------A--TGTA----------------GAA----TAAC--T--------GCAACAGCATTG----TAT------TAT------TTTCATTTCTTCTCATAGT---GAA--A-----TTCCTGTTCTTCAACAGTTA--------CCTGTCAGTATA------CAAA-CTC--T-TATA-TATTA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                              aTGGTATAT-A-ATTGTCAGTAACATAACCGT---TTA-AAC--ACA----A-T-C--TT--GGGATAAAAG----T--GCACA-CACCCATC-----CTT--------------AG------------C-----AA----C----TGGTTAT-------G--TG-A--------------------------------------GTAAC-----------TAT------C--GGA-G----TA----ATCGC--------------------CCTTGTTCTGTAGTGGTTA--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--G-AACA-AATTACAACCTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                         gAGACTTTGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--TTT----T-T-T--TTTTAAAA-AAAGA----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----T----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGAA---T---GAAGCA-----CCGTTGTCTTGTAATGGATT--------TCTGTCAATAAA------CAAA-CTT--A-AATA-AAGAACAACCTTATA--CA---ATTTATAGTGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAA--AT-------AGT------TACTTC-A--T-AA----CACAATATCGACatgtattacattccttaccctaatacc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aAT--A----A--TA-C----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAT------CATGGA-GGTTTTA----TTAGCT---T---GAAGCA-----TTCTTGTCCTGCAAGGGCAA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTA--A-AA-A-AA-TATAATGTTATTAAAA---A-----AATGTCTA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACT--AAAATTT--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCAC-ATATCGGCctc
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                         tAGACATAGTATAA---------ACTTGC----CC-----TATTAAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATC-----TGTC---A---------AAAGTGCAATAAAGC-----AG----G----CTGCCAT--A----A--TATAT---------------GAC----GACC--T--------GCAATAGC--TGG---Tgttaaa
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA--TT-TCACTTGCATTGCGGT---TAT-AAC--ATA----T-TGT--TT--TCATTAAGGA----C--GTACA-AAGCAATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCA--------------------------------------------T--------GTAACAGT--TAA---TAC------CATGGG-GGTTTTA----TTCGGA---T---GAAGAA-----CACTTGCCATGCAATAGCTA--------TCTGTCAATATA------------TG--A-AATATAAT----GCTTTATT--GA---T-----AATcacct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ca-CTC--A-AATC-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--TC----A-TCTGTCAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---cataagctccgcctcaaatcaattacaaccttattaaaaatgtccatcatctgtcagaaagtgtataccaactttcaaatataattacttcataac
gi|5                          : caagacatggtataggatttcacttgcattgcggttataacatattgttttcattaaggacgtacaaagcaatttgtcaaacatcctgtcatgtaacagttaataccatgggggttttattcggatgaagaacacttgccatgcaatagctatctgtcaatatatgaaatataatgctttattgataatcataagctccgcAGACACAAAATAAGA--TTGACACTTGCATTGCTGT---TAT-AAC--TTA----T-G-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GTACA-AAACCATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CACTTGTTCTGCAATGGCTG--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTAAAACCTTATTTAAA---A-----AAAGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ACGCC--AAATTTC--AAAT--AT-------AAT------AACTAC-A--T-AA---CCATAATATCGA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1633 )     :                                                                                                                                                                                                         GAGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTNT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGAC
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                   ACAGGA--TTGTCACATGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATT----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTT------------G---T---GCAG----------TTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTTCATATA------CAAA-CTT--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCATTACATGTA-TATGACAGAAAGTGT----A-ATA--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-AGCG-AC---CCCCAATATCGACctcatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                  TATAGAA-ATTGTCA------TTGCCGT---TAT-AAC--GTA----G-T-T--TT--ACAATTTAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGAGGGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----TCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACATCCTTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCT----GAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AC-------AAT------GACTTC-A--T-AG---CCACAATATCctca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ATGGTATAGGA-AT----------ATTGT--T---TAT-A-----------T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AGTTA-ACGATCTGTACCGGGATAAA----GATC--T--------GTACCGAC--TGG---TAT------CATTGC-TACCTC-----TCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAATta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                      GGA-AGT-TCACGTGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----TAT-T--TT--ACATTAAAGA----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--AA-A----------------TAG----GATC--T--------ACAACAGC--TGA---TAC------CATGGT-TGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATACA------CAAA-GTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----AATGTTCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT---------------------------------CCACAATATCGAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                        --ATA----T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AG-TA-ATCGATCTGTACC----GGGTAACGATC--T--------GTACCGGC--TGG---TAT------CATTGC-TACCTC-----TCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAActcaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                          tggtataggaaaattgtttCATATTATAGGA--TTGTCTCTTTCTTTACCTTCTTTAT-AGC--ATA----T-T-T--TT--ACGGTAAAAA----T--GCACA-CAGTAATC-----TGCC---A---------
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caatgATC--T--------GC--CAGC--TGA---TTT------CATGAG-TGCTTTA----TCTGTA---T---GGATCA-----TCTCTGTTCTGCAATGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTTCAA-AATA-AGTCAgctgatttcatgagtgctttatctgtatggatcatctctgttctgcaatggctatatgtcaatatacaaacttcaaaataagtcatgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                caatgcatattataggattgtctctttctttaccttctttatagcatatttttacggtaaaaatgcacacagtaAGACATGGTAAAGGA-ATTGTCACTTGCATTGTCGC---TAT-AAC--ATA----G-T-T--T---ACAATAAAGA----T--GCGCA-AAACGATC-----TGTT---A---------AA------------C-----TT----C----CTGTCAT--A----C--TA-T----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGT---TGC------CATGGG-GATTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCTTGCAATGGCTA--------TCTGCCAATACA------CAAA-CTT--C-AACATCATTCCAACtgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTCC--AACT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGACtataattacttcataaccacaatatcgacctcatt
gi|27                         :               aagacatggtaaaggaattgtcacttgcattgtcgctataacatagtttacaataaagatgcgcaaaacgatctgttaaacttcctgtcatactatgaggatctgcaacagctgttgccatggggattttattcgcatgaagcacccttgtcttgcaatggctatctgccaatacacaaacttcaacatcaATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GTAACAGC--TGA---CAC------CATGGA-TGTTTTA----TTTTCA---T---GAATCA-----CCCT----------TGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTctcatt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                      agcaAGACATGATATAGGATAGTGTCTCTTGTATTGTCAT---TGT-AAC--ATA--------T--TT--ACATTAAA-A----T--TCAAA-AAACAATC-----TGTC---AGATCTTGAGAG------------C-----GT----C----TGGTTAT-------A--TGTA----------------GAA----TAAC--T--------GCAACAGCATTG----TAT------TAT------TTTCATTTCTTCTCATAGT---GAA--A-----TTCCTGTTCTTCAACAGTTA--------CCTGTCAGTATA------CAAA-CTC--T-TATA-TATTA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                              aTGGTATAT-A-ATTGTCAGTAACATAACCGT---TTA-AAC--ACA----A-T-C--TT--GGGATAAAAG----T--GCACA-CACCCATC-----CTT--------------AG------------C-----AA----C----TGGTTAT-------G--TG-A--------------------------------------GTAAC-----------TAT------C--GGA-G----TA----ATCGC--------------------CCTTGTTCTGTAGTGGTTA--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--G-AACA-AATTACAACCTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                         gAGACTTTGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--TTT----T-T-T--TTTTAAAA-AAAGA----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----T----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGAA---T---GAAGCA-----CCGTTGTCTTGTAATGGATT--------TCTGTCAATAAA------CAAA-CTT--A-AATA-AAGAACAACCTTATA--CA---ATTTATAGTGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAA--AT-------AGT------TACTTC-A--T-AA----CACAATATCGACatgtattacattccttaccctaatacc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aAT--A----A--TA-C----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAT------CATGGA-GGTTTTA----TTAGCT---T---GAAGCA-----TTCTTGTCCTGCAAGGGCAA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTA--A-AA-A-AA-TATAATGTTATTAAAA---A-----AATGTCTA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACT--AAAATTT--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCAC-ATATCGGCctc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                          tGGCATGGTACAGGT-TTTGCCACTTGTATTGCCGT---TAA-AGTTAATG----T-T-T--TT--AC--TAAAAAAGTTT--GC-CA-CATCATTC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----ATGTCA---A--------A-A----------------GAC----GATC--T--------GTACCGGC--CAG---GAC--------TGTACTTTTTTG----TCCACC---G---GAAGCA-----GTCTTGTAATGCAATTGCTA--------TATGTCGATTTA------CAAat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                         tAGACATAGTATAA---------ACTTGC----CC-----TATTAAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATC-----TGTC---A---------AAAGTGCAATAAAGC-----AG----G----CTGCCAT--A----A--TATAT---------------GAC----GACC--T--------GCAATAGC--TGG---Tgttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacaA------CAAAGCGC--A-AATA-AATTAC---TTTATT--AA---A-----G-TTTCAA--AC----A-CCCAACAGACAAT-T----ATACCTGAACT--C--ATAT--AT-------AAT------TGCTT--A--T-AAAAACCACAATATCGttca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                     aAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATC-----TGTC---A---------AA------------CGCGCAATAAAGCGAGGCTGCCATAAA----A--TA-T----------------GAC----GACC--T--------GCATTAGC--TGG---TAT------CATttctc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATT--AA---T-----AGTTTCGC--AC----A-TTTGACAGAAGATTC----ATACC--AAAATCC--ATAT--AT-------ACT------TACTTC-A--A-AAT--CCACAATATCAACtg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA--TT-TCACTTGCATTGCGGT---TAT-AAC--ATA----T-TGT--TT--TCATTAAGGA----C--GTACA-AAGCAATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCA--------------------------------------------T--------GTAACAGT--TAA---TAC------CATGGG-GGTTTTA----TTCGGA---T---GAAGAA-----CACTTGCCATGCAATAGCTA--------TCTGTCAATATA------------TG--A-AATATAAT----GCTTTATT--GA---T-----AATcacct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ca-CTC--A-AATC-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--TC----A-TCTGTCAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---cataagctccgcctcaaatcaattacaaccttattaaaaatgtccatcatctgtcagaaagtgtataccaactttcaaatataattacttcataac
gi|5                          : caagacatggtataggatttcacttgcattgcggttataacatattgttttcattaaggacgtacaaagcaatttgtcaaacatcctgtcatgtaacagttaataccatgggggttttattcggatgaagaacacttgccatgcaatagctatctgtcaatatatgaaatataatgctttattgataatcataagctccgcAGACACAAAATAAGA--TTGACACTTGCATTGCTGT---TAT-AAC--TTA----T-G-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GTACA-AAACCATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CACTTGTTCTGCAATGGCTG--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTAAAACCTTATTTAAA---A-----AAAGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ACGCC--AAATTTC--AAAT--AT-------AAT------AACTAC-A--T-AA---CCATAATATCGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTACATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----G-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-CAACGATA-----TGTC---A---------TA------------C-----AT----C----CTGTTAT--A----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGG-GATTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCATTGGCTA--------TCTGTCAATTTACTGTGTCAAA-CTC--A-AATT-ACTTACAACCTTATCA-AA---A-----AACGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACT--AACTTTC---AAT--TT-------AAT------AACTTC-A--T-AA---CCACAATGTtctcgatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                         aAGACGTGACATAGGATAGTGTTTCTTGCATTGCCAT---TGT-AAC--ATA----T-T-T------ACATTAAA-A----T--TCAAA-TAACAATC-----TGTC---AGATCCTGAGAA------------C-----CT----C----TGGTCAT--AT---G--TA------------------GAT----TAAC--T--------GCAACAGCATTG----TAT------TATATA-CATTTT-----TTCTCA---TAGTGAA--A-----GTCCTGTTCTTGAACAGTTA--------CCTATCAATATA------CAAA-CTCTTATAATA-TATTA-----TTATT--AAAATA-----AATATTCA--ACAA--A-CCAAACAGAAA-TTT----ATACatacc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             CATTATATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGGCGT---TAT-AAC--AT-----T-T-T--TT--ACATTAATGA----T--GCACA-AAACAATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----CCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAAACTTATA--AA---ATAGATAATGTCCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AACTTTC--AAAA--TT-------AGT------TACTTT-A--T-AA----CACAATATCGGCtctaaaattcatctagaagagctaacttctaaaaccc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                          AGGCATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGG---TAT-A-T--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGT----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----TT----T----CTGCCAT--A----A--CA-A----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------AATGCA-GATTTTA----TACGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATAGCTA--------TATGTCAATTTA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTAAT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACACC-A--T-AA---CCACAATATCTACct


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         TA                   CTT   T   TA   TA     G CT  TT        G AGTT CT     C        .        .   GATCCTGAG  AGTGCAATAAAG GCGCA  AAAG GAGG       AA CATG GT  ACGATCTGTACCGGGAT    TAAC    .  .               AT  T      TAGTAT      GG      TTTC      TAG AGT      .                        CACTTGTA            CTGTGT    G   CA T    T               AA  AAT TAGAT        TT  ATGT C             A ATAC     TG       .     A   .         TACATG      A GC A  AAA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         TA                   .     .   .    TA     . CT  .         G .    .      C        .        .   GATCTTGAG  .            .      .    .          .  T    G   ATCGATCTGTACC        .       .  .               AT  A      .           CT      .         TAG .        .                        .                   .         .   TT .    T               TA  .   TTTAT        .   AA   C             T ATAC     .        .     A   .         .           . .  .  C  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         G                    .     .   .    T      . .   .         A .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   A                    .       .  .               .   A      .           T       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             G .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         A                    .     .   .    G      . .   .         G .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   A                    .       .  .               .   A      .           C       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             A .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         A                    .     .   .    G      . .   .         A .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   A                    .       .  .               .   A      .           G       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             A .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         A                    .     .   .    G      . .   .         G .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   G                    .       .  .               .   A      .           G       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             T .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         A                    .     .   .    T      . .   .         A .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   G                    .       .  .               .   A      .           T       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             T .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         A                    .     .   .    T      . .   .         A .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   A                    .       .  .               .   G      .           T       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             T .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                         A                    .     .   .    A      . .   .         A .    .      .        .        .   .          .            .      .    .          .  .    .   T                    .       .  .               .   A      .           G       .         .   .        .                        .                   .         .   .  .    .               .   .   .            .   .    .             T .        .        .     .   .         .           . .  .  .  
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1633 )     :                                                                                                                                                                                                         GAGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTNT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGAC
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                          AGACA-GTTATAGGA-ATTGTCACTTGCA-----GT---TAT-AAT--ATA----G-T-T--TT--ACAGTTAAGA----T--GCACA-AATCAATC-----TGTC---A---------GT------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----AATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CCTGGA-GGTTTTA----TTCAGA---T---GGAGCA-----CCATTGTCCTTCAATAGCTT--------TCTGTCCATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCGTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AGAT--AT-------AATTACATGTACTTC-A--T-AA---CCaaaccac
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             aATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-TGTTTTA----TTTTCA---T---GAATCA-----CCCTTG----------GCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTTTG--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---GCACAATATCGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        agcaACATTATATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCAA---TAT-AAC--AT-----T-T-T--TT--ACATTAACGA----T--GCACA-AAACAATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----CCAATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAACCTTATA--AA---ATAGATAATGTTCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AACTTTC--AAAA--TT-------AGT------TACTTT-A--T-AA----CACAATATCGGCc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                   ACAGGA--TTGTCACATGCATTGCCGT---TAT-AAC--ATT----T-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTT------------G---T---GCAG----------TTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTTCATATA------CAAA-CTT--A-AATA-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCATTACATGTA-TATGACAGAAAGTGT----A-ATA--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-AGCG-AC---CCCCAATATCGACctcatt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                  TATAGAA-ATTGTCA------TTGCCGT---TAT-AAC--GTA----G-T-T--TT--ACAATTTAGA----T--GCACA-AAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGAGGGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----TCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACATCCTTATT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCT----GAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AC-------AAT------GACTTC-A--T-AG---CCACAATATCctca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                              ATGGTATAGGA-AT----------ATTGT--T---TAT-A-----------T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AGTTA-ACGATCTGTACCGGGATAAA----GATC--T--------GTACCGAC--TGG---TAT------CATTGC-TACCTC-----TCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAATta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                      GGA-AGT-TCACGTGCATTGCCGT---TAT-GAC--ATA----TAT-T--TT--ACATTAAAGA----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--AA-A----------------TAG----GATC--T--------ACAACAGC--TGA---TAC------CATGGT-TGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATACA------CAAA-GTC--A-AATA-AATTACAATCTTATT--AA---A-----AATGTTCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT---------------------------------CCACAATATCGAC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                        --ATA----T-T-T--TT--ATCATAAA-A----T--GCACA-CAGCGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----A----ATGTCAT--G----AG-TA-ATCGATCTGTACC----GGGTAACGATC--T--------GTACCGGC--TGG---TAT------CATTGC-TACCTC-----TCCGCA---T---GAAGCA-----TCCTTATTATTTAATG----------------TCAATATA------CAA--CTC--A-AATA-AAGCACATCCTTATT--TA---A-----AGTCTCTA--AC----ACTCCAA-AGAAAATTT----GCACT--AAAATTC--ACATA-AT-------GAT------AACTTC-A--A-AAC--CCACAActcaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                          tggtataggaaaattgtttCATATTATAGGA--TTGTCTCTTTCTTTACCTTCTTTAT-AGC--ATA----T-T-T--TT--ACGGTAAAAA----T--GCACA-CAGTAATC-----TGCC---A---------
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caatgATC--T--------GC--CAGC--TGA---TTT------CATGAG-TGCTTTA----TCTGTA---T---GGATCA-----TCTCTGTTCTGCAATGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTTCAA-AATA-AGTCAgctgatttcatgagtgctttatctgtatggatcatctctgttctgcaatggctatatgtcaatatacaaacttcaaaataagtcatgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                caatgcatattataggattgtctctttctttaccttctttatagcatatttttacggtaaaaatgcacacagtaAGACATGGTAAAGGA-ATTGTCACTTGCATTGTCGC---TAT-AAC--ATA----G-T-T--T---ACAATAAAGA----T--GCGCA-AAACGATC-----TGTT---A---------AA------------C-----TT----C----CTGTCAT--A----C--TA-T----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGT---TGC------CATGGG-GATTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCTTGCAATGGCTA--------TCTGCCAATACA------CAAA-CTT--C-AACATCATTCCAACtgtattgccagtattggtcaacgctcgtatacgattgcaagtattggtcaacgcttgtatacgattgcaagtatt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTCC--AACT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCACAATATCGACtataattacttcataaccacaatatcgacctcatt
gi|27                         :               aagacatggtaaaggaattgtcacttgcattgtcgctataacatagtttacaataaagatgcgcaaaacgatctgttaaacttcctgtcatactatgaggatctgcaacagctgttgccatggggattttattcgcatgaagcacccttgtcttgcaatggctatctgccaatacacaaacttcaacatcaATGTTATAAGA-ATTGTCACTTGCATCGGCGT---TAT-AAC--ATA----T-T-T--T---ACAGTAACAG----T--GCACT-AAGCGATC-----TGCC---A---------AA------------T-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GCTC--T--------GTAACAGC--TGA---CAC------CATGGA-TGTTTTA----TTTTCA---T---GAATCA-----CCCT----------TGGCTA--------TATGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-GATTACAAACTTATT--AA---A-----AATGTCCA--AA----A-TCTGAAAGAAAGATT----ATACC--ATCTctcatt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                      agcaAGACATGATATAGGATAGTGTCTCTTGTATTGTCAT---TGT-AAC--ATA--------T--TT--ACATTAAA-A----T--TCAAA-AAACAATC-----TGTC---AGATCTTGAGAG------------C-----GT----C----TGGTTAT-------A--TGTA----------------GAA----TAAC--T--------GCAACAGCATTG----TAT------TAT------TTTCATTTCTTCTCATAGT---GAA--A-----TTCCTGTTCTTCAACAGTTA--------CCTGTCAGTATA------CAAA-CTC--T-TATA-TATTA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                              aTGGTATAT-A-ATTGTCAGTAACATAACCGT---TTA-AAC--ACA----A-T-C--TT--GGGATAAAAG----T--GCACA-CACCCATC-----CTT--------------AG------------C-----AA----C----TGGTTAT-------G--TG-A--------------------------------------GTAAC-----------TAT------C--GGA-G----TA----ATCGC--------------------CCTTGTTCTGTAGTGGTTA--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--G-AACA-AATTACAACCTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                         gAGACTTTGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGT---TAT-AAT--TTT----T-T-T--TTTTAAAA-AAAGA----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----T----CTGTCAT--A----A--TA-G----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGAA---T---GAAGCA-----CCGTTGTCTTGTAATGGATT--------TCTGTCAATAAA------CAAA-CTT--A-AATA-AAGAACAACCTTATA--CA---ATTTATAGTGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAA--AT-------AGT------TACTTC-A--T-AA----CACAATATCGACatgtattacattccttaccctaatacc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aAT--A----A--TA-C----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAT------CATGGA-GGTTTTA----TTAGCT---T---GAAGCA-----TTCTTGTCCTGCAAGGGCAA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTA--A-AA-A-AA-TATAATGTTATTAAAA---A-----AATGTCTA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ATACT--AAAATTT--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---CCAC-ATATCGGCctc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                          tGGCATGGTACAGGT-TTTGCCACTTGTATTGCCGT---TAA-AGTTAATG----T-T-T--TT--AC--TAAAAAAGTTT--GC-CA-CATCATTC-----TATC---A---------AA------------C-----AT----C----ATGTCA---A--------A-A----------------GAC----GATC--T--------GTACCGGC--CAG---GAC--------TGTACTTTTTTG----TCCACC---G---GAAGCA-----GTCTTGTAATGCAATTGCTA--------TATGTCGATTTA------CAAat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                         tAGACATAGTATAA---------ACTTGC----CC-----TATTAAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATC-----TGTC---A---------AAAGTGCAATAAAGC-----AG----G----CTGCCAT--A----A--TATAT---------------GAC----GACC--T--------GCAATAGC--TGG---Tgttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacaA------CAAAGCGC--A-AATA-AATTAC---TTTATT--AA---A-----G-TTTCAA--AC----A-CCCAACAGACAAT-T----ATACCTGAACT--C--ATAT--AT-------AAT------TGCTT--A--T-AAAAACCACAATATCGttca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                     aAC--ATA----T-T-TCTTT--ACAATACAAG----T--ACACACAAG-GATC-----TGTC---A---------AA------------CGCGCAATAAAGCGAGGCTGCCATAAA----A--TA-T----------------GAC----GACC--T--------GCATTAGC--TGG---TAT------CATttctc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATT--AA---T-----AGTTTCGC--AC----A-TTTGACAGAAGATTC----ATACC--AAAATCC--ATAT--AT-------ACT------TACTTC-A--A-AAT--CCACAATATCAACtg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA--TT-TCACTTGCATTGCGGT---TAT-AAC--ATA----T-TGT--TT--TCATTAAGGA----C--GTACA-AAGCAATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCA--------------------------------------------T--------GTAACAGT--TAA---TAC------CATGGG-GGTTTTA----TTCGGA---T---GAAGAA-----CACTTGCCATGCAATAGCTA--------TCTGTCAATATA------------TG--A-AATATAAT----GCTTTATT--GA---T-----AATcacct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ca-CTC--A-AATC-AATTACAACCTTATT--AA---A-----AATGTCCA--TC----A-TCTGTCAGAAAGTGT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACTTC-A--T-AA---cataagctccgcctcaaatcaattacaaccttattaaaaatgtccatcatctgtcagaaagtgtataccaactttcaaatataattacttcataac
gi|5                          : caagacatggtataggatttcacttgcattgcggttataacatattgttttcattaaggacgtacaaagcaatttgtcaaacatcctgtcatgtaacagttaataccatgggggttttattcggatgaagaacacttgccatgcaatagctatctgtcaatatatgaaatataatgctttattgataatcataagctccgcAGACACAAAATAAGA--TTGACACTTGCATTGCTGT---TAT-AAC--TTA----T-G-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GTACA-AAACCATT-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CTGTCAT--A----A--TA-A----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CACTTGTTCTGCAATGGCTG--------TCTGCCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTAAAACCTTATTTAAA---A-----AAAGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTGT----ACGCC--AAATTTC--AAAT--AT-------AAT------AACTAC-A--T-AA---CCATAATATCGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                          AGACATGGTATAGGA-ATTGTCACTTACATTGCCGT---TAT-AAC--ATA----G-T-T--TT--ACAGTAAAGA----T--GCACA-CAACGATA-----TGTC---A---------TA------------C-----AT----C----CTGTTAT--A----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGG-GATTTTA----TTCGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCATTGGCTA--------TCTGTCAATTTACTGTGTCAAA-CTC--A-AATT-ACTTACAACCTTATCA-AA---A-----AACGTCCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACT--AACTTTC---AAT--TT-------AAT------AACTTC-A--T-AA---CCACAATGTtctcgatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                         aAGACGTGACATAGGATAGTGTTTCTTGCATTGCCAT---TGT-AAC--ATA----T-T-T------ACATTAAA-A----T--TCAAA-TAACAATC-----TGTC---AGATCCTGAGAA------------C-----CT----C----TGGTCAT--AT---G--TA------------------GAT----TAAC--T--------GCAACAGCATTG----TAT------TATATA-CATTTT-----TTCTCA---TAGTGAA--A-----GTCCTGTTCTTGAACAGTTA--------CCTATCAATATA------CAAA-CTCTTATAATA-TATTA-----TTATT--AAAATA-----AATATTCA--ACAA--A-CCAAACAGAAA-TTT----ATACatacc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             CATTATATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGGCGT---TAT-AAC--AT-----T-T-T--TT--ACATTAATGA----T--GCACA-AAACAATC-----TGTC---A---------AA------------C-----AT----C----CCGTCAG--T----A--TA-G----------------GAG----GATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------CATGGA-GGTTTTA----TTTGCA---T---GAAGCA-----CCCATGTCCTGCAATGGCTA--------TCTGTCAATATA------CAAA-CTC--A-AATA-AAATACAAACTTATA--AA---ATAGATAATGTCCA--AC----A-TCTGATAGAAAGTGTATACATACC--AACTTTC--AAAA--TT-------AGT------TACTTT-A--T-AA----CACAATATCGGCtctaaaattcatctagaagagctaacttctaaaaccc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                          AGGCATGGTATAGGA-ATTGTCACTTGCATTGCCGG---TAT-A-T--ATA----T-T-T--TT--ACAGTAAAGT----T--GCACA-AAACGATC-----TGTC---A---------AA------------C-----TT----T----CTGCCAT--A----A--CA-A----------------GAG----TATC--T--------GCAACAGC--TGA---TAC------AATGCA-GATTTTA----TACGCA---T---GAAGCA-----CCCTTGTCCTGCAATAGCTA--------TATGTCAATTTA------CAAA-CTC--A-AATA-AATTACAACCTTAAT--AA---A-----AATGACCA--AC----A-TCTGACAGAAAGTAT----ATACC--AACTTTC--AAAT--AT-------AAT------TACACC-A--T-AA---CCACAATATCTACct
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GCAGTTAACAGACACCCCCTCCCCACCCGGTATCTGACTAAATAAATTTAGAGTATCACATACATTGAACTTACAAGTTGTGTATCTTAATTGTTTCATAACGGGTGGGTGTGGC
Unaligned ( gi|36 ): TATATTATAATTAAAATATAGATTCGACTAACTAATCAGAAATTTATACTCGAAAATTCATCTAGAAGAGCTAACTTCTAAAACC
Unaligned ( gi|38 ): CTGCAGTAGTTAACAAGCATTCCCCGTATCTGACTAACTAAATATTGAGTATCATACACATGAAC