lowQualScore : 1
lowQualScore : 5 2
lowQualScore : . .
lowQualScore : 1 8
consensus : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
Reference ( gi|4 ) : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAATACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGATACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|3 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAATACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGATACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|8 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTTATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTACTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAA
gi|5 : cACTCGGAACACCTTGGTTATTACTATGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTAAATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|2 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTATGTAATGACCTCGGAAATAATACGGGGGCCACCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTCACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAGCCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|7 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTTACACATGGCCGGACTACATTCAAAACTGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTTAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|9 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACAC----CCGGACTACATTCATAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|1 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTTATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGAGCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAAACTAACACATGGCCGGACTACATTTAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAAAGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|6 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCACCATATTGCTGTGATCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTTACACATGGCCGGACTACATTCAAAATTGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATTTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAATTGAA
gi|11 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGG--------------TGCG--------TTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAATTAA
gi|12 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGG-CCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGTCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAATGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAA
gi|13 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTACTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAA
gi|14 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGAGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCAGACTACATTCAAA
gi|15 : ACTCGGAACACCTTGGCTATAACTACGTAATAA---------TAATATGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAA
gi|18 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACAGGGGCCGCC
gi|19 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTA
gi|21 : cATTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAct
gi|20 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTAATACGTAA
gi|22 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTAC
gi|23 : cGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAA
gi|10 : CTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGTCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCAGACTACATTAAAAATGGAGACTTTCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTTAAGAATATAAACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|16 : AATACGGGGGCCGCCATACTGCTGTGATCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACAAACACATGGTCGGACTACATTCAAAAT
gi|17 : GGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACAAACACATGGCCGGACTA
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
Reference ( family-1328 ) : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|1 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTTATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGAGCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAAACTAACACATGGCCGGACTACATTTAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAAAGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|10 : cCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGTCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCAGACTACATTAAAAATGGAGACTTTCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTTAAGAATATAAACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|11 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGG--------------TGCG--------TTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAATTAA
gi|12 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGG-CCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGTCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAATGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAA
gi|13 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTACTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAA
gi|14 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGAGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCAGACTACATTCAAA
gi|15 : ACTCGGAACACCTTGGCTATAACTACGTAATAA---------TAATATGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAA
gi|16 : AATACGGGGGCCGCCATACTGCTGTGATCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACAAACACATGGTCGGACTACATTCAAAAT
gi|17 : GGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACAAACACATGGCCGGACTA
gi|18 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACAGGGGCCGCC
gi|19 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTA
gi|2 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTATGTAATGACCTCGGAAATAATACGGGGGCCACCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTCACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAGCCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAGct
gi|20 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTAATACGTAA
gi|21 : cATTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTA
gi|22 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTAC
gi|23 : cGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAA
gi|3 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAATACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGATACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|4 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAATACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGATACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|5 : ACTCGGAACACCTTGGTTATTACTATGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTAAATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|6 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCACCATATTGCTGTGATCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTTACACATGGCCGGACTACATTCAAAATTGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATTTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAATTGAA
gi|7 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTTACACATGGCCGGACTACATTCAAAACTGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTTAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|8 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTTATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTACTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAA
gi|9 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACAC----CCGGACTACATTCATAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
blockSeqCons :
originalCons : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
finalCons : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
Reference ( family-1328 ) : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|1 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTTATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGAGCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAAACTAACACATGGCCGGACTACATTTAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAAAGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|10 : cCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGTCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCAGACTACATTAAAAATGGAGACTTTCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTTAAGAATATAAACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|11 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGG--------------TGCG--------TTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAATTAA
gi|12 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGG-CCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGTCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAATGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAA
gi|13 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTACTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAA
gi|14 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGAGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCAGACTACATTCAAA
gi|15 : ACTCGGAACACCTTGGCTATAACTACGTAATAA---------TAATATGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAA
gi|16 : AATACGGGGGCCGCCATACTGCTGTGATCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACAAACACATGGTCGGACTACATTCAAAAT
gi|17 : GGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACAAACACATGGCCGGACTA
gi|18 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACAGGGGCCGCC
gi|19 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTA
gi|2 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTATGTAATGACCTCGGAAATAATACGGGGGCCACCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTCACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAGCCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAGct
gi|20 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTAATACGTAA
gi|21 : cATTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTA
gi|22 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTAC
gi|23 : cGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAA
gi|3 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAATACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGATACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|4 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAATACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGATACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|5 : ACTCGGAACACCTTGGTTATTACTATGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTAAATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|6 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCACCATATTGCTGTGATCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTTACACATGGCCGGACTACATTCAAAATTGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATTTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAATTGAA
gi|7 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTTACACATGGCCGGACTACATTCAAAACTGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTTAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG
gi|8 : ACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTTATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACACATGGCCGGACTACATTCAAAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTACTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAA
gi|9 : cACTCGGAACACCTTGGCTATTACTACGTAATAACCTCGGAAATAATACGGGGGCCGCCATATTGCTGTGACCCGGCCTTTCTGCCGAGTACCAGACTAACAC----CCGGACTACATTCATAATGGAGACTATCAACCTGAAAACGTGCTCATTATGTTTACTAAAGAATAGAGACATGTATAATGTTATTGGCAGAAAAAGCTTTGAAATAAAG