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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTAAAAGTTTGCGTTATACCTTAAAATTAATTG-------------------TTAAAATTTAGTGATACGGTTTTCTTCG
gi|5                          : cacagtgaataaaccaatattgcgatttaagattgcgaccgagacggtactcgttcttatgttttcgatcgagttatacgatattcgaccgagaggtactgtcttcgacagacgtattttatcagcggtgtcatcaatttgaagtataaagatggtatgtcttattttaaattaaatatacatataagcaaatagtacattcttttataaaaatgttgttaaaattatatgataggtacattttatagcatagtgataggtcaaataacaatatttgtttgtttccgcttacactatcacatattattgatAAA-GTTAGCGTTATACCCTAAAATTAAT-------CT--TTAAAA---GTTA-------GTGATGCTGTTATCTTTGCAAGTTGATATGATTTTCTTTCTATCTCATCCATGCTTGGTACTGGTTT-AGGAAGAACT--GATTAATCTA--GTTT----TGTTTTTA-----------AATGGTATTTAGGAAATCAGTTCTGTTTCCGAAGATAAGTGT--TTAA-AAATTACGAAATAAGGTATATCTTATGATA-TTAGGCTAAATTACAGGATACTATAATTT--TAAAAGTGA-CTAAGAAGACAGTAAACAATGTCGTTAGGTTATCAA-----TGTG---TGCACT-------GCAGTTTTAAATACAA------AA-CATATAATTAAATAATGAAGTATTTAT---AACAAc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgTGATATGGTTTTCGTTCCAACTCATCTGCACTTGAAA-CTGTTTTCGGG--AAATCTGATAAAGCTATTGTTTT--------TCC-----------AATGG----TA----------TTTA---AT---GATAGGAA-----AACACCTGTTGAAACTATATGTATCTTATGATT-TGAATCTAAATTACAGG-T-----AGTTTGATACAGATGA-CAAAGGCGACTGTTAACAATGCC-TTCGGTTATA-A-----TGTG---TATACT-------GC-------------AGTTTTAAA-TGCGAAAAGAA-TAATGAAATAT---TGCCAACAACATAGAAAACATACCCTGCGATACAGAAAGCTTAATTTGAGTGCTGAAACGAGAAACTTTGCTTATACGA------CATTTTCATCATTAATACCACTTGATTTA--CAAAAGATAAAATACATTGAAACAA-TGTACAGCG------TGGCGC--CCAAAGAAACGAATAAGAACAGCTACTCCTGATAAAGGAAATGACGAT--------------GCGAATATACGTTCCAGTGACAAACCCCGCATTCT--GTTAGTACCTTAAAACTGTTCACGCTAAATCTCAGATAAGTCTTCAA--T--GCGCCATTCTTC-AG--AT----ATAATTCTGATCCATA-AAAAAA--G--TAGTATCAGATGCAATTT-GAACATTCATTTTATGTTTT-TCATGGATGAATTGTAGAGAATTTACACTT-A---ATCTGTTATC-ATAATTTTACATTTAAAACACGAAATGGTATTTCCTTGTTTGAAATAATAAATATATG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cGATACGGCGTTCGTTTTAATTCATTTGCTCTTGATA-CGGTTTTCGGGA-AAAT--AATAAATCTA--GTTTTTA----TTTTTGAATTGAATTAAACAA----TAGGAAATCAGTTTTGTCTCT---GCTGGTTATTGTTTCTACATGTTGATATTAGACATTTCTAATAAATGTCAGG-TAAACTGCAGG-G----TAATATGATAAGAGTGATCCAGGGAGA-TGTTAACAATGTCATTCGAGTATATAATATGTGTGCAATGCACTTTTAAATGC-------------G------AAACACATAATACAATATTGGAGCATGCATGCCAATAGCATTC-GAATATACCCTTCAATACAGAAAGCTAAATTTGAGTGCTGAAATAGGAAAGTTTGGTTTTACGAAATTGACATTTTCCTTATAAAAACCGTTTGAAACCAACAAAAGAGGAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGCTCCAGCAAA-----GTTCCAGTGACAA-CTCTG--CTCTCCGCCATTATCT-AAACC--------CTGATTCTCAGACAAGTCTAAAA--TTCGGCTC-TTCCTC-GGGAATGGCAATAGCCTTGCTCCGTC-TAGAAAATAAATAGTATCACTTGTACTTT--------CATCTTATGTTGT-GGGTAGATGAATCATAGATAATACACAGTTCATTATTATTTTCCT-AT--TTTCATAGTgacaaagacattgcgatcaacaaataatggctttttatcatcacatttaatttgtcaaacgaaatatttttttattataaacacgcaacattgctatcaaatgcttccgttctgctccagcaaagttccagtgacaactctgctctccgccattatctaaaccctgattctcagacaagtctaaaattcggctcttcctcgggaatggcaatagccttgctccgtctagaaaataaatagtatcacttgtactttcatcttatgttgtgggtagatgaatcatagataatacacagttcattattattttcctattttcatagtaaaaagtgagaaaaaaatttcgattataaattataatatatcaataaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatacggcgttcgttttaattcatttgctcttgatacggttttcgggaaaataataaatctagtttttatttttgaattgaattaaacaataggaaatcagttttgtctctgctggttattgtttctacatgttgatattagacatttctaataaatgtcaggtaaactgcagggtaatatgataagagtgatccagggagatgttaacaatgtcattcgagtatataatatgtgtgcaatgcacttttaaatgcgaaacacataatacaatattggagcatgcatgccaatagcattcgaatatacccttcaatacagaaagctaaatttgagtgctgaaataggaaagtttggttttacgaaattgacattttccttataaaaaccgtttgaaaccaacaaaagaggaaagacaaagacattgcgatcaacaaataatggctttttatcatcacatttaatttgtcaaacgaaatatttttttattataaacacgcaacattgctatcaaatgcttccgttcTTATTT-AAATTTTT--ATTTTA--TTT-----AAATCTAAAA--T--AGACCCTTTCTCAGG--ATGAACATAGTCCTGCTCCATCTAAAAAA-TAAATAGTATCAAATG--------AACCTTCATTTTATGTTTTTGGATGGGTGAATTGTAGATAATTCA-GC-T-A-----------TCAATTATTTTATAGTTAGAA-ATGAAATGTTATTTTCTTGTTTTCAAAATTAAATTaaaaagtgagaaaaaaatttcgattataaattataatatatcaataaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttTCTT-ATACTGAATCTCAGATAAGTCTAGAAGTT--GA-CAATTCTTC-GG--AT----ATAGTTTTGAACTATC-AAGAAA-AA--TAGTATCAAATATAATTTTAAAAATTCATTTTATGTTTT-GGGTTGATGAATTATAGAGAATTCATACTT-AAT-TTTTTGTTT--ATTATTTTACAGTTAAAACATGAAATGGTATTTCCGTGTTTTCAATCATAAATTTATGAAgaaaaaaaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -GA--AC----ATAGTCCTGCTCCATCTAAAAAA-TAAATAGTATCAAATG--------AACCTTCATTTTATGTTTTTGGATGGGTGAATTGTAGATAATTCA-GC-T-A-----------TCAATTATTTTATAGTTAGAA-ATGAAATGTTATTTTCTTGTTTTCAAAAATAAATTctgaaaaatatata
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATTTGAGCAGGGATGTCACCTGTTTTGATGTATAAAAAGTGATTTGTTATATGATTTTTAAGAATATCTGCATATTAACAAATAATAATATATAGTTCTATAAACATGTTGTAAAAATTATACGATAGGAATTGTAAACAGATAGGTAAAATAACAATATTTCATTTTTACTGATGTGAATTACCATGAAAATGCATATACATGCATTAGAAGTGAAATTTGTTTCCGCTAACACCAACGCATTTTATCGAT
Unaligned ( gi|9 ): TTCTATAAACATTATACGATAAGTTATTGCATACAGATAGTTAAATTAACACTATTTCAGTTTTACATGTGAATTGCCATAAAAAGGCATTAAATATTTTTATTGCTATTATGTGGTTTATATGATGTATAAGTATTGAACATTATTTGTTTCCGCTAATACTAACACATGTT
Unaligned ( gi|11 ): AAGTAAACTTAATTTTTTTCAAATTTTAATATTTATATATATAATTATTGTATGTTTAGAAACATGCTTTTTACAAAAAAACAACAACAA
Unaligned ( gi|12 ): AATAATAGAATAATTAAATTATAAAAGTTTTCGACCGAGACGGTATTCACTCTCATGATTTCGATCATACTATACGTTGTTCCACAG
Unaligned ( gi|13 ): TTATAATAAAGATTTTTTAGAAAAATAAATACGATATTTGGTTTGTATATGATTGAA
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTACAGGCTATATCATAAACACCTCCAGTCTCTAATGCTAGCATA
Unaligned ( gi|15 ): GAAATGGGTTTTATCAATTTCACAAAATTTTGAATACAAATTTGCACA
Unaligned ( gi|16 ): AATATGCATTAACAAAATAAAATTGCAAAAATACTTTT






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Reference ( family-12381 )    :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTCTAAAAGTTNGCGTTATACCCTAAAATTAATTGCTT-------TAAAA---GTTAAAATTTAGTGATGCNGTTNTCTTCGCAAGTTGATACGGTTTTCGTTCTAACTCATCCGCGCTTGATACGGTTTTCGGGA-AA-A-TGATAAATCTAGTTT--T------T----------T---TTNAACGG----TAGGAAATCAGTTTTGTCTCC---GATAGGTATT--TAACACATGTCGAAATTAGATATATCTTATGA-TTTNAGGCTAAATTACAGG-T----TAATTTGATAAAAGTGA-CNAAGGAGACTGTTAACAATGTCGTTCG-GT-TAT-A-ATGTGTG-------CACT-------GC-------------G------AA-CGCGTAATNAAATAATGAAGTAT-CATGCCAACAACATNNAGAACATACCCTNCGATACAGAAAGCTNAATTTGAGTGCTGAAACGGGAAANTTTGNTTNTACGAAATTGACATTTTCNTCATNAANACCGCTTGANNCNAACAAAAGANGAAATACAT-TGAAACAATGTACAG--------CGTGGCGCCCAAAGAAACGAATAAGAACAGCTACTCCTGATAAAGGAAATGACGAT-------TGCTCCAGCGAATATACGTTCCAGTGACAAACCCCGCACTCTCCGCCATTATC-TAAANCTNTT-ATNCTGAATCTCAGATAAGTCTAAAA-T--GGNCCATTCCTC-GG--ATG---A---TAGTCCTGCTCCATCTAAAAAATAAATAGTATCAAATGTAATTT--AACNTTCATTTTATGTTTTTGGATGGATGAATTGTAGATAATTCAC-GCTT-ATT-TT-TTT---TCAATTATTTT-ATAGTTAGAACATGAAATGNTATTTCCTTGTTTTCAANAATAAATTTATGAA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GATACGGCGTTCGTTTTAATTCATTTGCTCTTGATACGGTTTTCGGGA-AA-A-TAATAAATCTAGTTT--T------TATTTTTGAATTGAATTAAACAA----TAGGAAATCAGTTTTGTCTCT---GCTGGTTATTGTTTCTACATGTTGATATTAGACATTTCTAATAAATGTCAGG-TAAACTGCAGG-G----TAATATGATAAGAGTGATCCAGGGAGA-TGTTAACAATGTCATTCGAGTATAT-A-ATATGTGTGCAATGCACTTTTAAATGC-------------G------AAACACATAATACAATATTGGAGCATGCATGCCAATAGCATTC-GAATATACCCTTCAATACAGAAAGCTAAATTTGAGTGCTGAAATAGGAAAGTTTGGTTTTACGAAATTGACATTTTCCTTATAAAAACCGTTTGAAACC-AACAAAAGAGGAAAGACA-AAGAgaaaaaaaacaca
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GATACGGCGTTCGTTTTAATTCATTTGCTCTTGATACGGTTTTCGGGA-AA-A-TAATAAATCTAGTTT--T------TATTTTTGAATTGAATTAAACAA----TAGGAAATCAGTTTTGTCTCT---GCTGGTTATTGTTTCTACATGTTGATATTAGACATTTCTAATAAATGTCAGG-TAAACTGCAGG-G----TAATATGATAAGAGTGATCCAGGGAGA-TGTTAACAATGTCATTCGAGTATAT-A-ATATGTGTGCAATGCACTTTTAAATGC-------------G------AAACACATAATACAATATTGGAGCATGCATGCCAATAGCATTC-GAATATACCCTTCAATACAGAAAGCTAAATTTGAGTGCTGAAATAGGAAAGTTTGGTTTTACGAAATTGACATTTTCCTTATAAAAACCGTTTGAAACC-AACAAAAGAGGAAAGACA-AAGAgaaaaaaaacaca
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gi|5                          :                                                                                                                                    cacagtgaataaaccaatattgcgatttaagattgcgaccgagacggtactcgttcttatgttttcgatcgagttatacgatattcgaccgagaggtactgtcttcgacagacgtattttatcagcggtgtcatcaatttgaagtataaagatggtatgtcttattttaaattaaatatacatataagcaaatagtacattcttttataaaaatgttgttaaaattatatgataggtacattttatagcatagtgataggtcaaataacaatatttgtttgtttccgcttacactatcacatattattgatTGAAAGTTAGCGTTATACCCTAAAATTAAT-------CT--TTAAAA---GTTA--------GTGATGCTGTTATCTTTGCAAGTTGATATGATTTTCTTTCTATCTCATCCATGCTTGGTACTGGTTTAGGAA-GA-ACTGATTAATCTAGTTTTGT------T----------T---TTAAATGGTATTTAGGAAATCAGTTCTGTTTCCGAAGATAAGTGT--TTAA-AAATTACGAAATAAGGTATATCTTATGA-TATTAGGCTAAATTACAGGATACTATAATTT--TAAAAGTGA-CTAAGAAGACAGTAAACAATGTCGTTAG-GT-TATCA-ATGTGTG-------CACT-------GCAGTTTTAAATACAA------AA-CATATAATTAAATAATGAAGTATTTAT---AACAA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATT-TAAATTTTT---------ATTTTATTTAAATCTAAAA-T--AGACCCTTTCTCAGG--ATG---AACATAGTCCTGCTCCATCTAAAAAATAAATAGTATCAAATG--------AACCTTCATTTTATGTTTTTGGATGGGTGAATTGTAGATAATTCA--GC----T-A-------------TCAATTATTTT-ATAGTTAGAA-ATGAAATGTTATTTTCTTGTTTTCAAAATTAAATTctgaaaaatatata


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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GATACGGCGTTCGTTTTAATTCATTTGCTCTTGATACGGTTTTCGGGA-AA-A-TAATAAATCTAGTTT--T------TATTTTTGAATTGAATTAAACAA----TAGGAAATCAGTTTTGTCTCT---GCTGGTTATTGTTTCTACATGTTGATATTAGACATTTCTAATAAATGTCAGG-TAAACTGCAGG-G----TAATATGATAAGAGTGATCCAGGGAGA-TGTTAACAATGTCATTCGAGTATAT-A-ATATGTGTGCAATGCACTTTTAAATGC-------------G------AAACACATAATACAATATTGGAGCATGCATGCCAATAGCATTC-GAATATACCCTTCAATACAGAAAGCTAAATTTGAGTGCTGAAATAGGAAAGTTTGGTTTTACGAAATTGACATTTTCCTTATAAAAACCGTTTGAAACC-AACAAAAGAGGAAAGACA-AAGAgaaaaaaaacaca
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gi|5                          :                                                                                                                                    cacagtgaataaaccaatattgcgatttaagattgcgaccgagacggtactcgttcttatgttttcgatcgagttatacgatattcgaccgagaggtactgtcttcgacagacgtattttatcagcggtgtcatcaatttgaagtataaagatggtatgtcttattttaaattaaatatacatataagcaaatagtacattcttttataaaaatgttgttaaaattatatgataggtacattttatagcatagtgataggtcaaataacaatatttgtttgtttccgcttacactatcacatattattgatTGAAAGTTAGCGTTATACCCTAAAATTAAT-------CT--TTAAAA---GTTA--------GTGATGCTGTTATCTTTGCAAGTTGATATGATTTTCTTTCTATCTCATCCATGCTTGGTACTGGTTTAGGAA-GA-ACTGATTAATCTAGTTTTGT------T----------T---TTAAATGGTATTTAGGAAATCAGTTCTGTTTCCGAAGATAAGTGT--TTAA-AAATTACGAAATAAGGTATATCTTATGA-TATTAGGCTAAATTACAGGATACTATAATTT--TAAAAGTGA-CTAAGAAGACAGTAAACAATGTCGTTAG-GT-TATCA-ATGTGTG-------CACT-------GCAGTTTTAAATACAA------AA-CATATAATTAAATAATGAAGTATTTAT---AACAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaTCTTATA-C----TGAATCTCAGATAAGTCTAGAAGT--TGACAATTCTTC-GG--AT----ATAGTTTTGAACTATC--AAGAA-AAATAGTATCAAATATAATTTTAAAAATTCATTTTATGTTTT-GGGTTGATGAATTATAGAGAATTCATAC-TT--AATT-TTTTG--T---TTATTATTTT-ACAGTTAAAACATGAAATGGTATTTCCGTGTTTTCAATCATAAATTTATGAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATTT-AAATTTTT-------------ATTTTATTTAAATCTAAAA-T--AGACCCTTTCTCAGG--ATGAACATAGTCCTGCTCCATCTAAAAAATAAATAGTATCAAATG--------AACCTTCATTTTATGTTTTTGGATGGGTGAATTGTAGATAATTCA--------------GCTA--T---CAATTATTTT-ATAGTTAGAA-ATGAAATGTTATTTTCTTGTTTTCAAAATTAAATTctgaaaaatatata
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATTTGAGCAGGGATGTCACCTGTTTTGATGTATAAAAAGTGATTTGTTATATGATTTTTAAGAATATCTGCATATTAACAAATAATAATATATAGTTCTATAAACATGTTGTAAAAATTATACGATAGGAATTGTAAACAGATAGGTAAAATAACAATATTTCATTTTTACTGATGTGAATTACCATGAAAATGCATATACATGCATTAGAAGTGAAATTTGTTTCCGCTAACACCAACGCATTTTATCGAT
Unaligned ( gi|9 ): TTCTATAAACATTATACGATAAGTTATTGCATACAGATAGTTAAATTAACACTATTTCAGTTTTACATGTGAATTGCCATAAAAAGGCATTAAATATTTTTATTGCTATTATGTGGTTTATATGATGTATAAGTATTGAACATTATTTGTTTCCGCTAATACTAACACATGTT
Unaligned ( gi|11 ): AAGTAAACTTAATTTTTTTCAAATTTTAATATTTATATATATAATTATTGTATGTTTAGAAACATGCTTTTTACAAAAAAACAACAACAA
Unaligned ( gi|12 ): AATAATAGAATAATTAAATTATAAAAGTTTTCGACCGAGACGGTATTCACTCTCATGATTTCGATCATACTATACGTTGTTCCACAG
Unaligned ( gi|13 ): TTATAATAAAGATTTTTTAGAAAAATAAATACGATATTTGGTTTGTATATGATTGAA
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTACAGGCTATATCATAAACACCTCCAGTCTCTAATGCTAGCATA
Unaligned ( gi|15 ): GAAATGGGTTTTATCAATTTCACAAAATTTTGAATACAAATTTGCACA
Unaligned ( gi|16 ): AATATGCATTAACAAAATAAAATTGCAAAAATACTTTT