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gi|14 : aactaaatcacactaaccatattccactatgtggacactaaggtacactatactgctatatgctaaatcaagTTCAAATGCCCATGTCCGCAGCACGTTCCAGCAGACACACACGACTCCCTCTCATTGTTTGTTCCTAGTGGCTCGTGGGAAAGGTGGTCCTGGTTGACGCACAATTTATTGTGACATAAATGGCTCACACACCAACACTTTGGTCCCAGCTCCA---TGCTGTGG----ATTTT-CAA--GCACATGGCAAGCCTGTGTATTAAATATGGACTGCTACGCCTGCATCAATTTGGC-CCGAGCCATCGACACTGTCC-A-TATCCATTTAGGGTTTAACCACTAGTCCAAATGACACACACACCATTCTCACCTACAACACTGCTCTACTCTAGGTTCATTGTAATATACTGTTTGTAAGCTGCCTCCATGTTGCTGAGGCTGACAAAAAGTCTCTAACC-AATAAATGGCCTCAAAACTGCACTCATGGCCCGAGAA---------------AGCACATAAACTTACC---TCTAATTTGTAACTGCATCATTTAATAATCATTATTAAATGCCAATAAACACATGTATATGCAACTTATTTAAAA-ATAATAATTATACCAACCTACCTGCAGAAAATATTA--------------------CC-A------------------AAAATTCCAATTCACTGTTTACAG----CAGCCATCTCCATA
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gi|16 : CACAATTTATTGTGACATAAATGGCTGACACACCAACCCTGTGGTCCCAACTCCA---TGC----CGTTGATTTT-CAA--GCACATGGCAAGCCTGTGAACTAAATATGGACTGCTACGCCTGCACCAATCTGGA-CCAAGAAATCGACACTGTCC-A-TATCCATTTTGGGTTTGACCACTAGTCCAAATGACACACACACCATTCTCACCTACAACACTGCTCTACTCTAGGTTCGTTGTAATGTACTGTTTGTAAGCTGCATCCATGTTGCTGA-------CAAAAGTCTCTAACA-AAAAAATAGCCTCAAAACTGCACTCATGGCCCGTGAA---------------AACACATAAACTTACC---TCTAATTTGCAACTGCATCATTTAATAATCGTTATTAACTGCCAATAAACACATGTATATGTGACTTATTTAAAA-ATAATAATTATATCAACCTTCCTGCAGAAAAGATTA--------------------CC-A------------------AAAATTCCAATACACCGTTCACAG----CAGCCATCTCCATAc
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gi|32 : AGCTCCA---TGCT--GC----TTTTTACAA--ACACATGACAAGTCTGTGCGCTAAATATGGGCT-C--CATTTTCGCCAATTTTGT-TCAAGCAATCAACA-TGTTCAA-TAATCATTCTTTGTTAGAACACTtacttgcacaaaatattac
gi|23 : CATTTTGAGTTTGACCACTAGTCCAAATGACACACACACCATTCTCACCTACAACACTGCTCTACTCTAGGTTCATTGTAATATACTGTTTGTAAGCTGCCTCCATGTTGCTGAGGCTGACAAAAAGTCTCTAACC-AAAAAATGGCCTCAAAACTGCACTCATGGCCCGAGAA---------------AGCACATAAACTTACC---TCTAATTTGTAACTGCATCGTTAACTAATCATTATTAACTGCCAATAAACACATGTATATGCAACTTATTTAAAA-ATAATAATTATATCAACCTACCTGCAGACAACATTA--------------------CC-A------------------AAAATTCCAATTCACTGTTTACAA----CAGCCATCTCCATAggtc
gi|35 : tgctactcttgcatcacaggcctgaaacacaCATTCTTTGTTAGAACACTGGTCCAAAGAACACATACATCATTCTCAGCTACAACACTTTGTTACTCTAGGTTc
gi|28 : AAAAATAGCCTCAAAACTGCATTCATGGCCCGAGAA---------------AACACTTAAACTTACC---TCTTATTTGCAACTGCATCATTTAATAATCGTTATTAACTGCCAATAAACACATGTATATGTGACTTATTTAAAA-ATAATAATTATATTA--------------------GCTACCTGCAGAAAGTATTT-CC-A------------------AAAATTCTAATACAACGTTCACAA----CAGCCATCTCCATA
gi|17 : AATGTCCTCAAAACTGCATTCATGGCCCGAGAA---------------AACACACAAACTTACC---TCTTATTTGCAACTCCAACATTTAGTAATCGTTATTAACTGCCAATAAACACATGTATATGTGACTTATTTAAAA-ATAATAATTATATCAACCTACCTGCAGAAAATATTA--------------------CC-A------------------AAAATTCCAATACACTGTTCACAA----CAGCCATCTCCATAc
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1172 ) : CACGGTCTCGTCTTCTTATTGCGTCAATGGACATTCCG--CCACCGACTAAGAATGCAATGCAAAAGACAGCTAATAAAGTGGCACGAGAAACAGTCAAAGTGACAAAGTTAGATA---TG---GAG---AAGTTACAACTGCTTCAAACAACT-TGTCTGATCTCGGTCTAAGCGGAGAAATCCACGGTTCGTTTGACGGTCGGTACAACTCGCT------TACAATTGTAAGCTGTACGAAACCTGGCCACAACTCATCCCAGGCAATCGGTGTGTTTGCCGAGTCTATGACGGAAAATCATTTCATACTGGATTATGAAATCGAAAACAAACTGTGCTATGTTGGTGCGCATTTACGATCAAA-GGGCTATGATGTGAATTGCCCAGGACACGCAGACTGCACAGCGACCT---TGCCAAATGTAGCTCCACATTCAGAGTACGAGATGGCAAAATCAATAGCTACCAGACTTG-GGCAAAAAGGAGTGAAAGTAAGCATACTAACAACAGACCAGGACGCCCAGGCTCAAAAAGGTTTTCAAGAAATTTATGAAACCA--TTTTTCCAGGTCACAAAATCCTGCAGCAAGCCGATCCAGCGCACATAGGACGGTCACAAGTGCGAAAATGTATTTCTGCAACATTTAGCAAAGA--CATGTTTGTTGGCTGCAGCACACGAGAAGCATCT-AAAAAAGCTCA-GACGATATTTGCACTGGACGTAAAATCAAGATGCAGTTTGATTGTGAAGAAAGTGCTAGAGTTATACTGTGGTGACT----TACCTTCCATGATCAAAGCTGTGAAGAAAGCGTTGAAATCCACAATACAGTGCTATGACGGTGACTGCACAACGTGTCGAAGAAACTCTTTCGTATGTGGGGGAGGCCAAAAGTCGTGCTGGTTCGAACGCTCTGCATTCTTGGCTCCACACAAGATCACCACATTGNGAATGGCTGAAAGTGATAAAGAACTGTTAGAAGATATNCTCAAAATACGCTTATGTGAAAAAGCAATAGAAAGCACACAGTTT-AATTATAACACGCAATCAGTGGAGTCATTTAATGCTACACTATCAAAAAGCGCTCCTAAGAATGTG---------AACTTCTCTCGTAACTATGGTGGAAGATGTGCATCAGCTGTTCTCCGGCACAATAATGGACAAGCTACTGCTTTAATTAAAAAATTGGAGTACATGGGTATTTACCTGTCGAAGAGAACAGGACAGGCAGTTTCAAAAATTGGTGCGGATATGAGAAGTCACCGANAGTACAGGAA-AGACAAGCAGTACAACAGACGTATAATTTTGCGTCGTGGTGAAATGGAGTCTCGCCATCGGTGGTATAGACGTCTCAAAAACAANAGACAATCTGATTACTT--AAAAAAAAGGAGTGACCATAACTACCANANACCTGAATAAAATGCTGGAACTGTGATAAATAGAGACAGAAAATAATAAATTCTGATGATAAAATGTATATAGAATAGAACAGAACAGAATAGAATAGAATATGTTTATATCTATATGCATATCAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT--------GTGACCATTGTATTATATTGTTTTGATAATTATGT------------------TGTGCAATGCATACAAGAAAACATGAAC--AAATTAAAAATTAAACTTNACCTACCTGTGTTCTTCTCATTAAACCTTCCAGAAACAGTAGCTAAATAGACTTCACCTGAATTAAACTAAATCACACTAACCATGTTCCACTATGTGGACACTAACCTACACTACACNGC----TATAT--GCTATACCATGCTAATTGATATGTAAAAATAATTGCAACAAACCGTTAAAACTTGAGCTCCACAAGACACGC--CTTGAACTGCCCATGTCC-----GCGGCAC-----GTTCCAGCAGACACACACGACTC-CCTCTCATTGTTCGTTCCTAGTGGCTCGTGGGAAAGGTGGTCCTGGTTTATGCACAATTTATTGTGACATAAATGGCTNACACACCAACCCTTTGGTCCCAGCTCCATGCTGTTGATTTT-CAA--GCACATGGCAAGCCTGTGNACTAAATATGGACTGCTACGCCTGCGCCAATCTGGNCCGAGCCATCGACACTGTCC-A-TATCCATTTTGGGTTTGACCACTAGTCCAAATGACACACACACCATTCTCACCTACAACACTGCGCTTCTCTAGGTTCGTTGTAATATACTGTTTGTAAGCTGCNTCCATGTTGCTGAGGCTGACAAATAGTCTCTAACC-AAAAAATGGCCTCAAAACTGCACTCATGGCCCG---AGAAAGCACATAAACTTACCTCTNATTTGCAACTGCATCATTTAATAATCGTTATTAACTGCCAATAAACACATGTATATGCGACTTATTTAAAA-ATAATAATTATATCAACCTACCTGCAGAAAATATTACCAAAAATTCCAATNCACCGTTCACAACAGCCATCTCCATA
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gi|26 : ACCATTGTATTATATTGTTTTGATAATTATGA------------------TGTGCAATGCATACAAGAAAACATGAAC--AAATTAAAAATTAAACTTAACCTTCTTGTGTTCT---CATTAAACCTTCCAGAAACAGTAGCTGAATAGACTCCACCTGAATTAAACTAAATCACACTAAGCATGTTCCACAATGTGGACACTAACCTACACTACACAGCTA--TATAT--GCTATACCATGCAAATATATATGTAAAAATAATTGCATCAAACCATTAAAACTT
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Reference ( family-1172 ) : CACGGTCTCGTCTTCTTATTGCGTCAATGGACATTCCG--CCACCGACTAAGAATGCAATGCAAAAGACAGCTAATAAAGTGGCACGAGAAACAGTCAAAGTGACAAAGTTAGATA---TG---GAG---AAGTTACAACTGCTTCAAACAACT-TGTCTGATCTCGGTCTAAGCGGAGAAATCCACGGTTCGTTTGACGGTCGGTACAACTCGCT------TACAATTGTAAGCTGTACGAAACCTGGCCACAACTCATCCCAGGCAATCGGTGTGTTTGCCGAGTCTATGACGGAAAATCATTTCATACTGGATTATGAAATCGAAAACAAACTGTGCTATGTTGGTGCGCATTTACGATCAAA-GGGCTATGATGTGAATTGCCCAGGACACGCAGACTGCACAGCGACCT---TGCCAAATGTAGCTCCACATTCAGAGTACGAGATGGCAAAATCAATAGCTACCAGACTTG-GGCAAAAAGGAGTGAAAGTAAGCATACTAACAACAGACCAGGACGCCCAGGCTCAAAAAGGTTTTCAAGAAATTTATGAAACCA--TTTTTCCAGGTCACAAAATCCTGCAGCAAGCCGATCCAGCGCACATAGGACGGTCACAAGTGCGAAAATGTATTTCTGCAACATTTAGCAAAGA--CATGTTTGTTGGCTGCAGCACACGAGAAGCATCT-AAAAAAGCTCA-GACGATATTTGCACTGGACGTAAAATCAAGATGCAGTTTGATTGTGAAGAAAGTGCTAGAGTTATACTGTGGTGACT----TACCTTCCATGATCAAAGCTGTGAAGAAAGCGTTGAAATCCACAATACAGTGCTATGACGGTGACTGCACAACGTGTCGAAGAAACTCTTTCGTATGTGGGGGAGGCCAAAAGTCGTGCTGGTTCGAACGCTCTGCATTCTTGGCTCCACACAAGATCACCACATTGNGAATGGCTGAAAGTGATAAAGAACTGTTAGAAGATATNCTCAAAATACGCTTATGTGAAAAAGCAATAGAAAGCACACAGTTT-AATTATAACACGCAATCAGTGGAGTCATTTAATGCTACACTATCAAAAAGCGCTCCTAAGAATGTG---------AACTTCTCTCGTAACTATGGTGGAAGATGTGCATCAGCTGTTCTCCGGCACAATAATGGACAAGCTACTGCTTTAATTAAAAAATTGGAGTACATGGGTATTTACCTGTCGAAGAGAACAGGACAGGCAGTTTCAAAAATTGGTGCGGATATGAGAAGTCACCGANAGTACAGGAA-AGACAAGCAGTACAACAGACGTATAATTTTGCGTCGTGGTGAAATGGAGTCTCGCCATCGGTGGTATAGACGTCTCAAAAACAANAGACAATCTGATTACTT--AAAAAAAAGGAGTGACCATAACTACCANANACCTGAATAAAATGCTGGAACTGTGATAAATAGAGACAGAAAATAATAAATTCTGATGATAAAATGTATATAGAATAGAACAGAACAGAATAGAATAGAATATGTTTATATCTATATGCATATCAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT--------GTGACCATTGTATTATATTGTTTTGATAATTATGT------------------TGTGCAATGCATACAAGAAAACATGAAC--AAATTAAAAATTAAACTTNACCTACCTGTGTTCTTCTCATTAAACCTTCCAGAAACAGTAGCTAAATAGACTTCACCTGAATTAAACTAAATCACACTAACCATGTTCCACTATGTGGACACTAACCTACACTACACNGC----TATAT--GCTATACCATGCTAATTGATATGTAAAAATAATTGCAACAAACCGTTAAAACTTGAGCTCCACAAGACACGC--CTTGAACTGCCCATGTCC-----GCGGCAC-----GTTCCAGCAGACACACACGACTC-CCTCTCATTGTTCGTTCCTAGTGGCTCGTGGGAAAGGTGGTCCTGGTTTATGCACAATTTATTGTGACATAAATGGCTNACACACCAACCCTTTGGTCCCAGCTCCATGCTGTTGATTTT-CAA--GCACATGGCAAGCCTGTGNACTAAATATGGACTGCTACGCCTGCGCCAATCTGGNCCGAGCCATCGACACTGTCC-A-TATCCATTTTGGGTTTGACCACTAGTCCAAATGACACACACACCATTCTCACCTACAACACTGCGCTTCTCTAGGTTCGTTGTAATATACTGTTTGTAAGCTGCNTCCATGTTGCTGAGGCTGACAAATAGTCTCTAACC-AAAAAATGGCCTCAAAACTGCACTCATGGCCCG---AGAAAGCACATAAACTTACCTCTNATTTGCAACTGCATCATTTAATAATCGTTATTAACTGCCAATAAACACATGTATATGCGACTTATTTAAAA-ATAATAATTATATCAACCTACCTGCAGAAAATATTACCAAAAATTCCAATNCACCGTTCACAACAGCCATCTCCATA
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gi|26 : ACCATTGTATTATATTGTTTTGATAATTATGA------------------TGTGCAATGCATACAAGAAAACATGAAC--AAATTAAAAATTAAACTTAACCTTCTTGTGTTCT---CATTAAACCTTCCAGAAACAGTAGCTGAATAGACTCCACCTGAATTAAACTAAATCACACTAAGCATGTTCCACAATGTGGACACTAACCTACACTACACAGCTA--TATAT--GCTATACCATGCAAATATATATGTAAAAATAATTGCATCAAACCATTAAAACTT
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