lowQualScore : 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 77777777777777777777777777777777 1 3333333333333333333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222 111 111 1111 777777777777777777777
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lowQualScore : . .... ................................ . . .. . . . . . . . .. .... . ................... .. .. .. ... ... ........ . .. . .. ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. . . . .... .... .................................................................. . .... .. . . . ............ ... . . . ... ... . . .... . .....................
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Reference ( gi|4 ) : GTAGTGATTAAC-TAGGA----TG-TT--TGGGC------AC--AG---GATTGCGTT-TCGTTTTCAATCGTG-CAT-T-GTGG-ATTA--AATTACA-G--A-A-C--C--AGA--CT--G--GACCGTGC--T--GCTGC--GCAT---G----C---T-CAG--T-AA--AAT----ATCCAA----A--A---GT--------T-TGCAAC-----------C----ACCG------AA-----C-TA-A-GTTGC-G-GT--T-----CAA---C-AATA-------TAA----A--CC----GC--ATA-G-----T-------------GAC-----T--T---T--T-TA-T-------GTA---AAT----T---TA-AC----------CAA----G-------TG--T---GTGATA-AC---TA--TGACA--GCTGC--A---T----TA----AAAA-CAAA--T---TA-CTC-----G---GT--T---G--G--A--AAAA-T-A-TG----T-AT--T-TT--AGT-C------TA----G----T-----T----TA---G----GTGAACATGC-AACTTTAC-TGA-CC-C--AAA--A--C---A----ACTTTAC--TG-----ACCCAA----AATTCA-ATTTTA-----T-----AG--GGCCATTTGGTGGAC----ATA----CCACCCA-TC--AT--------CT-AC---TTTACC--T----------A--ATTCA---------------ACCCTATTA----AA--CTTGCTTACTGAACT---CT-CC---TTTG-G-A-TACCTTTGACAGAAGTTAGC--TTATATTCAGC-TAGTATT-CCTAA-ATAGTACATA
gi|3 : GTAGTGCTTGGC-TAGGAAACATGGTT--TATTT------A--------GACTGTGTT-TCATTTTCGATCATG-CTT-T-GTGG-ATTATTCGTTTTA-----------C--AGT--CT--A--GACCCTGC--T--GCTGC--ACAT---G----C---T-CAG--A-AA--AAA----ATCTAA----A--A--------------------------------------CCC------AA-----C-TA-G-GTTGT-G-G---------CAG---C-AGTAACCGCACCAC----A--CC----GTGGATA-G-----TTTATTATATTCCAGGCATACAT--T---T--T-TA-T-------ATA---AAT----TGATTA-A------------AA----T-------TG--TATTGTGATATACG--CA--TGGTA--GTTTC--A---T----AT----AAAT-TAGA--T---TA-TTC-----ATTTGTGAT---G--G--G--GAAA-T-C-TT----T-AT--T-TT--ATT-C------CA----GCCTGT-----T----TG---T----GTGAACATGC-AAGTTTAG-TGA-C----------------------ACT------------------A----AATTTG-GTTTT------T-----CC--AGTCAT---GT-GAC----AAA----CCA-CGA-T---AC--------CT-AT---TTTACC--TTCCTCCTAAAA--AAACA---------------ACCCTATGA----AA--CTAGCTT
gi|7 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctacTAGTGTTTTAA-TAGGA----CG-TA--TGGGC------ATTTAA----ACTGC-TT-CCGGCTTCGATCATG-CAT-T-GTGG-TTTA--AATAACA-G--G-A-------AGA--GCAAA--GA-TGTGC--T--ACTGC--GCAT---G----C---T-CAG--T-AA--AAA----AT--AG----A--A--------------------------------------------------------TA-C-GTTGC-G-GC--T-----TAA---C------------TAACCGCA--CC----CC--ACC-G-----C-------------GAC-----TAGTCTAT--T-TA-CTGG----GCA---TAT----TG--TA-TT-------------------------TG--T---GCGAGA-AA---CA--TAATA--GTTGC--G---T----CA----CAAT-TAAA--T---T---T----------GC--T---G--G--A--GGAA---A-TGTCTTT-AT--T-TT--AGT-C------AA----G----TTCGC-T----TA---C----GTGAAT-TGC-GATTTTAT-Tgtttac
gi|17 : aatgaaagataacaagtattcgcattggtttcggtttgctagtattacattaaaataggaaactgtataactaactggagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatctttaTAGTGTCTCAC-TAAGA----TA-CAAATGGGC------ATT-AA---GAATACGCT-CTCTTTTTTATCATA-CCT-T-TTAG-GTTA--AAAAATG-G--A-A-CTAC--AGT--CT--A--GATTTTGC--T--GCTGC--TCAT---G----A---T-CAG--T-GA--AA---------AA----A--A-----------------CAACA----------A----ACCA------AA-----C-TA-T-ATTGC-cggtcaatcagctatccatgtagtggacataatgacctatttc
gi|14 : gctgtagtattggctgatattggagaggtagtcagatctcaacaTAGCAGTTGAC-TAGGA----CA-------GGC------ATTTAG----ACTGTGTTGTTTTTTTCAGTTATG-TCTAT-AAAG-ATTA--AATTACA-G--A-A-T--C--AAAA-CT--C--AGCAGTGT--T--GC--C--GCTT-------------------------------------A----A--A---GC--------T-GGCA-------------------CTG------TA-----C-GATA-GCTAG-T-GTA-T-----CTA---CTAATA-------TAAT---A--TCCTGGGC--ATA-A-----T---------------T-----T--T---T--TATA-T-------GTA---AAT----C----A-AT----------TAATATTG-------TA--T---TTG---------TG--TGATA--GTTGC--A---T-----A----AAAA-AAAA--T----A-TTT-----G---GA------A--A--A--AAAA-T-C-TT----T-AT--T-TT--AGT-C------aactgaaatcgtaatattctggggatttattttgatgtaatggactactgttgtttgataagcaggatcaaattattcattt
gi|25 : ttagttgttgatttaaactttttgattataaacattattggagaggtctttggagagatctgacctctctaTAGTGTTTTAA-TAGGA----CG-TA--TGGGC------ATTTAA----ACTGC-TC-CCGGCTTCGATCATG-CAT-T-GTTG-TTTA--AATAACA-G--G-A-c
gi|2 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatatttaAATGGTTGAC-CAGGG----TA-CG--TAGAC------ATTTAG----ACAGTGTT-TCGTTTTCGATCATG-C-T-T-ATGA-ATAA--AAGTACA-GA-A-A-A--A--AGT--CA--A--GATCGTGC--T--GCTGC--GCAT---G----CGTAT-TAC--T-AA---------ATCCAA----A--A---CCCAACCACAT-TGCGAC-----------A----ACCC------AA-----C-TA-C-GATGC-G-GCA-TGA---CAG---C-AACAC------TAC----A--CCGTT-GC---TA-GTTTATT-------------AAC-----T--TA--TG-T-TA-TATTGTTGGCATATAGT----T---TA-ATATAAATATCACAT----T-------TG--T---GTGACA-AC---CA--TGACG--GTTGC--A---T----TC----AACATTAGA--T---AA-TTC-----G---TT--C-------------AAA-C-C-TT----T-AT--T-TT--ATT-C------CA----G----T-----A----TA---ATAATGTTAACATGC-GAGTTC-C-TGA-CC-C--AAAT-T--T---G----ATTTTA----------AC--------AACTCG-AC-------------------GGTCGTTAGGTGGAC----ATA----C--CTAA-AC--A--------------------ACC--T----------A--AATTA---------------ACCCTATCAGTCTAG--CTTGGTTTCTTTAC-------CG---TTTG-G---TTCTTTTTAAAGAAGCCAAC----GTATTCAATATATTGTT-TTCAACACACTACATagagccaaaaaa
gi|8 : cagacGTAATTAAAATAAGA----CG-CA--TGGTCCTAGTTAC--AGTTAGACTGTGTT-CCGTTTTCGGTCATG-AAT-T-GTGGAATTA--TA-TACA-A--A-A-A--T--ACA--CTTCA--GACAGTGT--T--GCTGA--GCAT---G--------T-CGG--T-AA--AAA----AATCAAAAT-A--A---TT--------T-TG---------------------CCG--------------------GCTGC----------------------AT--------TAA----A---T----GC--ATA-------T-------------AA---------T---T--T-TA-----------------------------------------CAT----G-------TG--T---GTGACA-----------GGTA--GTTGCTGA---TTTCATA----AAAATCAAA--T---AA-TCT-----T---GC--T---G-------------T-T-TG------AT--T-GT--AAT-C------CATATTG----T-----T----TA---T----AAGAACATTT-GAGTTGAC-TAG-CC----------------------TCTTAC--TGGATTTAACCAA-------TCA-A----A-----T---------GGACATTTGGTGT-C----GTA----CCACCAA-CC--AC--------TT-AT---CTTACT--A----------A--AATCAAACAAGTTTACGACCACCCTATTA----GAATCTTG-TTACAGAAgtactc
gi|20 : GTGTTTGAA-TAGGT----TG-CA--TGGGC------ACTTAG----ACTGCATT---------AA--GT----T-T-CTGG-ATCG--AATTACA-G--A-AACA-C--AGT--CT--A--GATCCTAC--T--GCAGT--GCAT---G----C---C-CAG--T-AA--AAA----ATCCAA----A--A---accaacttgtccaattgacgggtacttct
gi|18 : acaactacttattggagaggttggaaaggtctt---GACTGCGTT-CCGTTTTCGAGCATGTCA--T-GCGG-AGTA--TATCACATC--A-A-CA-C--AAA--CC--T--GCTTATGA--T--GCTGC--GCAT---G----T---T-CAT--T-AC--AAC----A-CCAC----A--A-------------T-TCCAAT-----------CGATGACTC------AA-----C-T-----TTGCTA-GT--TATTTACTATTGC-AATATTT----TAA-------------GT--ATA-T-----T---------------------C--T---T--T-TA-T-------GTT---AAT----A---TA-TC----------AAA----GTTGTTTTTA--T---GTGTTA-GC---T---TTATA--GTTGC--A---T----TA----ATAT-CAAG--T---TA-TTC---------CT--T---G--A--G--AAAA-T---TGT---T-AT--T-TT--AGC-C------CATT--G----T-----T----TA---ctcaacaatgctctggcaaaactagcaaatgtttttcatgcaaatgaatgaatcttgtatttatgtacatgcatttgcattaaaattggatttt
gi|29 : ---GACTGTGTA-CGGTTTTCTATCATG-CCT-T-GTGG-ATAT--TATTACA-G--A-A-A--C--ACAACCT--A--GACCATGC--TAAACTGT--CCAT---G----C---C-CAG--T-AA--CAA----ATACAA----ttta
gi|23 : ttata---GACTGTATT-TCGTTTCCAACAATG-CCG-T-GTGG-CTTT--ATTTACA-G--A-A-A--TGAAGT--CT--A--GATGGTAC--T--GATTG--GCAT---G----C---G-TAG--T-AA--AAtaccaattttgttttggctaaactagcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|15 : aACTGCGTT-CCGTTTTCGATCACT-CCT-T-GTGG-GTCA--ATTTACA-G--A-A-------ATA--CT--GTTTAGTTTG---T--GCAGT--GCATTTAG----T---T-CAG--T-AAATAATTCAAATCCCA----A--ATACAT--------TGTGCAAA-----------CTTA-GCCGT-----AA-----CGCACA-GCGGC-GCGTTAT-----TGA---CTAATG-------CA------------------ATA-T-----C-------------GA----------------T-TA-T-------GTA---AATGGC-T---TA-A--------------------------TGC-T---GT-----AC----A--TGACA--GCTGC--A---T----TA----Aaaaataaataaattgtttcaaaactagccacaccgcaccatcgcggccagctggttaactaatggaatcttctgaacatatctatttaaatcaatgagttaatattgtatttgtgagataagcatgatagctacaataa
gi|45 : ggtgccttcagacctcttcatggtgctggacatttaaTGTGTT-CCATTTTCAATCATG-TCT-A-GTGG-ATTA--ATTTACA-GA-A-A-CA-C--AGT--CT--A--GATTGTGC--T--GCTGT--GCAG---G----C---T-CAG--T-AA--AAA----ATttttgccacattaaattcctttgactgtcaaagtggattagttcaatgtaatagtgtta
gi|16 : cTGCATT-CCATTTTCAACCATG-CCT-T-GCGA-ATTA--AATTACA-GAAA-A-T--C--AGT--CA--A--GATTGTGCCAT--G-TAA--ACAT---G----T---TGAAG--TAAA--AAA----ATCCCA----A--A---
gi|10 : cTT-CCGTTTTCCATCGTG-CCT-C-ATAG-ATTG--AATTACA-G--ATA-CA-C--AGT--CC--G--GATTGTGC--T--GCTGC--GCAT---GCATAC---T-CAGT-T-AA--AAA----ACACAACTACA--T---GTAAA-----T-TGCAGCTAAACTAGTTTC----ACCAC-----AATGCTGC-TA-A-TTT-----AT--T-----TAC---T-AACG-------TAAT---ATTCT----GC--TTATG-----T-------------ATT-----T--T---T--T-TA-T-------GTA---AA---------TAGAC----------TAATATTG-------TGTTT---GTGA-G-ACAGGCG--TGATA--ATTAT--A---T----TA----AAAT-CAAA--T---TA--TT-----A---GT--T---G--G--GATAAAA-T-C-TT----T-AT--T-TCTGAGT-C------TA---------T-----C----TA---G---------TATAC-A---TAAC-TGA-CC-C--CAA--ATTT---G----ATTTTAC--CA-----ATCcccattaaaattatggctaacttttatggctagttaattaactatgtaatattctgggcaaatagcttttatgtaaatggatttatattgtatttctgtgataagcgtgatatttgcttaaaatagtctcgtctgtatacctgaacatgcaaatttaccaaccctaaaaactgactttaccaatcagg
gi|19 : gctgggaaatcatcagagaggttgaatatgatacatgaccatttaggctgtgttaaGCTTTCGATCATG-TAT-TTGTTG-GTAA--AATTACA-G--A-A-CA-C--AGT--AT--A--GATTGTGA--T--ACTGT--ATA----------------AG--T-TA--ATT----CTCCAA----A--A---a
gi|40 : caccctTTTAGATTACG-C-T-T-ATGG-ATAA--CATTACATA--A-A-CA-C--AGT--CT--A--GATCGTGC--A--ACTGC--GCAT---G----C---T-CAT--T-AA--AA-----ATCCAA----G--A---ctgaactgctaaatagccgcaccttaccgtatctaattcatttactaatataatattctggccatatatttgtatgcaaacagataaatgctgtatatgtgtgataatgatcgcattaaaatgaaagttttggtttacatgaacagacgagttt
gi|44 : gtagaccgctacatagtcttaggcaAATCATG-CCT-T-GTTG-ATTA--T-TTAAA-G--A-A-A--C--AGT--TT--A--GATTGTGC--T--GCTGG--GCAC---A----C---T-TAGTTT-AA--AAcccagctcctttttaatgaagggaat
gi|11 : TG-CGT-T-GTGA-AATA--AATTACA-T--A-A-A--T--ACA--CT-------CCA-GC--T--ACTGTGAGCAT---A----C---C-AGG--T-AA--AA---------AA----A--A---AT--------T-cccagctgtaatatgcctaaactagccagatggaacttcaccac
gi|5 : aG-CAT-T--TAG-ACTG--CCTTACA-A--A-AACA-C--AGT--CT--A--AATCATGT--T--ACTGG--GCGT---A----A---T-CAG--T-AC--AAA----ATCCAA----A----------------------------------------ACCC------AA-----T-TA-T-GTTGCGG-GC--T-----AAA---C-AGCC-------AGC----A--CC----TC--ACA-G-----T-------------GGC-----TG-G---T--T-TA-T-------TTACT-AAT----G---TA-Aataatgcccctgcattaaatacatttaatattatatttgtgtgatacgtatgttagttggctagctggttgtataccatttaaatactcgttttgtattgtggtatagactgtttataagaacatgcaggttgactgacctcaaccttgaatttaccgatctaattgaaatttgttgaatacaccacccttcaattattttactaaaaaaaacctattgaactcgtatacgacctttcatttaaattttttttttttaatgaaaccaacttgtccaagctgcgggtacttct
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gi|9 : attatacttaaatataggcatgtgttgaaacttgtcgcgaTTACA-G--A-A-A--C--ACAATCT--A--GACTGTGC--T--GCTAC--ATTT---G----C---T-CAG--T-AA--AAA----ATCCAA----CCCA---GT--------C------C-----------C----ATAGTTTATTAA-----C-TA-A---TGT--------------AA---T-ATTC-------TGA-------------GC--ATA-------T--------------AT-----T--TA--T--T-TA-C-------GTA---AATAT--T---TG-AT----------T--------------TG--T---GTGGTA-AG---TG--CGATA--A-TGC--AATGT----TA----AAAA-CAAA--T---TA-TTT-----A---CT--G---G--G--A--AAAA-A-ACTT----T-AT--T-CT--AGT-C------CA----A----T-----T----T---------GT--ACATGC-ATGTTTAC-TAAGCC-C--AAATGT--C---A------TTT----TG-------CCAA-------TCA-G----------------AC--GATAACTTGGTGAAT----ATA----CT-TCCATTC--AC--------AT-A----TTTACCAAA----------A--ATTTATTT------------ACCATGTTA----AA--ATAACTGACCAAGCTAACTT-CC---TCTG-----TATTTTTTTCA-AGGTCAACATTTATAtacgtcactgctaaactagccgtactgcaccgcggctagtgtattaataatgtaataatttggtcatctattttttatgtaatggattaacattgtatttctatattaagcatgttatgtgcattcaaatcaa
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Reference ( family-1148 ) : GTAGTGNTTGANTAGGACGCA--TGG--------GC-ATTTAGGACTGCGTT----CCGTTTTCGATCATGC-CT-TGTGG-ATTAAATTAC-A-G-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------T-CCAA--------A---A-T---------T----TG-C-A--A--A-----CCG-A--A-C--T--A-NG--------T---------TG-C-GGC-------T--CA---------A----C-AAT---A-------TAA-------A--C---C-----G--C--ATA-G-----T-------------GAC-----T--T---T--T-T--A-T-------GTA---AAT----T---TA--AT--A------------G-------T------G------T---G-T------GATA-AN-CA--TGACA--GTTG-----C--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--TTATTC-----GNTT---G-----G----A--AAAA---TN-TTT-ATT-TT--AGTC---C----A----G----T-----TTA-C----GT---GAACATGCGA-GTTTAC-TGA-CC-C----AA----C---G----ATTTT-AC--TG-----ACC-CAA--A-T--TCGA---TT----TTA------T--A--GG-CCATTTGGTGGAC----AT----A----CCACCCNT-CATCT-A--TTTTA-CC----------NAA-A--TCA----ACCCTATTAAACTNGCT-TGCTGA-NCT---CT-CC---TTTGGA----TTCTTTTT-AAAGAAGTCAAC--TTATA-TTCAATATANTNTTGTTCAACACANTACAT
gi|1 : --T---T--T-T--A-T-------GTA---AAAGAAAT---TA--AT--ATTGCGT------G-------T------G------T---G-T------GGTA-AA-CA--TGCCA--GTTA-----C--A---TT-A----AA-T-TCA---AA--TTATT------ATTT---GAT---A----A--AAAG---TG-TTT-ACC-TT--AGTC---T----AGTTTG----T-----TTA-C----CT---GAACGTGCGA-ATTTAC-T------C----AA----CTTTG----ATTTT-AC--T-----------AA--G-T--TC----------------------------------------------AT----A----CCACCTAT--ATCT-A--TTTTA-TC----------AAA-A--TCA----ACTTTATTTAACTAGCT-TGGTGA-CCT---CC-TA---TTTGGA----TTCTTAAT-AAAAAA
gi|10 : aaatcccataaaaaacatatcatttgttggttgacagttttctgttgactaaattagctgcactgtaccgcaactagtttatgtactaatacataAGAGGTTGAATATGATACA--TGA--------CC-ATTTAGG-CTGTGTTAATTCCGTTTTCCATCGTGC-CT-CATAG-ATTGAATTAC-A-G-ATA-C-A-CAGTCCGGATT-GTGC--T--GCTGCGCAT---GCATACT-CA---GTT-AAA------AAA--------------C-ACAACTACATGTA---A-A---------T----TG-C----A--G-----CTA-A--A-C--T--A-GT--------TTCACCACAATG-C-TGC-------T--AATTTATTT--A----CTAAC---G-------TAAT------ATTC---T-----G--C--TTATG-----T-------------ATT-----T--T---T--T-T--A-T-------GTA---AATAGA-C---TA--AT--A------------T-------T------G------T---G-TTTGTGAGACA-GG-CG--TGATA--ATTA-----T--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--TTATTA-----GTTG---G-----G----AT-AAAA---TC-TTT-ATT-TCTGAGTC---T----A---------T-----CTA------GT---ATACATA--------AC-TGACCC-C----AAATT-T---G----ATTTT-AC--CA-----ATC-aaaaaattgttgagtgctgaatcctgctatttgacctgccacttgctgaagtgcctaacaatacatacatcctgtttcattggtgaacgtcatgttactaaaattagatgtggtttcccagtacgcagttatgcacacgtaacaaaatataactgtcatcaatatgctactaggatataaaacttcatatagcatgataaacagcattccaaaatagcggtgtaaatttgccattcacgtcaaaataatttgaaact
gi|11 : gctgggaaatcatcagATGC-GT-TGTGA-AATAAATTAC-ATA-A-A-T-A-CACTCCAG--C--TAC--T--G-TGAGCAT---A----CC-AG---G-T-AAA------AA-------------------AA--------A---A-T---------T----a
gi|11 : --T-T--A-A-------ATA---CAT----T---TA--AT--A------------T-------TATATTTG------T---G-T------GATA-CG-TA--TGTTA--GTTGGCTAGCTGG---TT-G----TATA-CCATTTAA--ATACTC-----GTTT---T-----G-------------------T-ATT-GT--GGTA---T----A----GACTGT-----TTA-T----AA---GAACATGCAG-GTTGAC-TGA-CCTC----AA----CCTTG----AATTT-AC--CG-----ATC-TAA-------TTGA---------------------A-------ATTTGTTGAAT----AC----A----CCACCCTT-CAATT-A--TTTTA-CT----------AAA-A---AA----AACCTATTGAACTCGTA-TAC-GA-CCT---TT-CA---TTTAAATTTTTTTTTTTT-AATGAAACCAAC--TTGTataatgcccctgcattaaatacatttaatattatatttgtgtgatacgtatgttagttggctagctggttgtataccatttaaatactcgttttgtattgtggtatagactgtttataagaacatgcaggttgactgacctcaaccttgaatttaccgatctaattgaaatttgttgaatacaccacccttcaattattttactaaaaaaaacctattgaactcgtatacgacctttcatttaaattttttttttttaatgaaaccaacttgtccaagctgcgggtacttct
gi|12 : atgcgttgtgaaataaattacataaatacactccagctactgtgagcataccaggtaaaaaaaaattataatgcccctgcaTAGATT-TTGCG-T--GTT-CGCAT---G----CG-CT---G-T-AAA------AA---------------------------------------------T----TA-C-A--A--A-----CCA-A--AAC--A--A-TG--------T---------TG-T-GGC-------T--TA---------G----CTAAC-----------TGG-------A--C---T-----G--C--G---G-----C-------------AAG-----T--T---TGTT-T--ACT-------GTT---GTT----T---T----------------------------T------G------T---G-C------AATA-AA-TA--TGA----GTTG-----C--A---TC-A----AC-A-TCT---AA--TTATTT-----GGTT---G-----G----GG-AAAA---TC-TTT------C--AGTC---C----A----G----T-----TC--C----GT------TATGTGA-----AC---A-CG-C----AA----C---------------------------C-AAA--A-T--ACGA---TTATCCTCA------T--AT-GG-TCATTTGATTGACTTGAATTTGAA----ACACATTTACAT---A--TTT-A-CC----------AAA-AA-TCA----ACCCTTCTAAACTAGCT-TGCTGA-TTT---TTATC---TTTGGA----TTCTTTTT-AAAGATGTCAAC----ATG-TTTAA---AGTTTTGTTTAAccaagctgcgggtacttct
gi|13 : T---A-------TTA-------A--C---CTGG--G--C--ATA-------T-------------AA---------T---T--T-T--A-TT------GTACATAATGGA-T---TA--AC--G------------T-------T------T------T---A-T------G-TA-AG-CA--TGACT--GTTG-----C--A---TT-A----AA-A-TCAAATAA--TTAGTCAAATAGTTT---G-----G----A--AAAA---TT-TTA-AGT-TT--AGTC---T----AGTTTG----T-----TTA-T----GC---AAACATACAC-ATCAAC-TGA-CC-T----TA----A---A----AT-----C--TG-----ATT-TAA-------TCAA---TC----AGA------C--A---G-CCATTTGGTGG-------------------ACCCAT-TGCAT-A--TTTTG-AA----------AAA-A--TCA----ACCCTAATATATTAACT-TGCTGGCCCT---TT-CC---TTTGAA----TTGTTTTT-AAAGAAGTCAAC--TCATT-TTC------TTTTTGTTatgtagttgtctaaag
gi|14 : gTAGCAGTTGACTAGGACA------G--------GC-ATTTAG-ACTGTGTTG---TTTTTTTCAGTTATGT-CTATAAAG-ATTAAATTAC-A-G-A-ATC-A-AAACTCAG--CAGTGT--T--GC--CGCTT--------------------------------------------------AA--------A---G-C---------T----GG-C-A-----------CTG-T--A-CGAT--A-GC--------T---------AG-T-GTA-------T--CT---------A----CTAAT---A-------TAAT------A--T---CCTGG-G--C--ATA-A-----T---------------T-----T--T---T--TAT--A-T-------GTA---AATCAA-T---TA--AT--A------------T-------T------G------T-------------ATT-TG-TG--TGATA--GTTG-----C--A---TA-A----AA-A---A---AA--ATATT---------T---G-----G----A--AAAAAAATC-TTT-ATT-TT--AGTC---C----ttaattctaatcacatctgatattgctatat
gi|15 : ttagttgttgatttaaactttttgattataaacattattggagaggtctttggagagatctgacctctcta--TGG--------AC-ATTTAA-ACTGCGTT----CCGTTTTCGATCACTC-CT-TGTGG-GTCAATTTAC-A-GAA-A-T-A-CTGTTTAGTTT-G-----T--GCAGTGCATTTAG----TT-CA---G-T-AAATAATTCAAA--------------TCCCAA--------ATACA-T---------TG---TG-C-A--A--ACTTAGCCGTA--A-CG-C--A-CA-------------------G-C-GGC---------------------G----C-GTT---A-------TTG-------A--CTAAT-----G--CA-ATA-T-----C-------------GA----------------T-T--A-T-------GTA---AATGGC-T---TA--AT--G------------C-------T------G------T------------------A-CA--TGACA--GCTG-----C--A---TT-A----A
gi|16 : ggtgccttcagacctcttcatggtgcCTGCATT----CCATTTTCAACCATGC-CT-TGCGA-ATTAAATTAC-A-G-A-A-A-ATCAGTCAAGATT-GTGCCAT--G-TAAACAT---G----TTGAA---G-TAAAA------AAA--------------T-CCCA--------A---A-C---------C----CA-T-T--A--A---------A--A-T--T--A-TGGCTAACTTT---------TA-T-GGCTAGTTAAT--TA---------A----C-TAT---G-------TAAT------A--T---TCTGG-G--C--A-A-A-----T-------------AGC--------T---T--T-T--A-T-------GTA---AATGGA-T---TT--AT--A------------T-------T------GTATTTCT---G-T------GATA-AG-CG--TGATA--TTTG-----C------TT-A----AA-A-T-----AG--T--CTC-----GTCT---G-------------------------T-A------------------------------------TA-C----CT---GAACATGCAA-ATTTAC-CAA-CC-CTAAAAA----CT--G----ACTTT-AC--CA-----ATC-ttttgccacattaaattcctttgactgtcaaagtggattagttcaatgtaatagtgtta
gi|17 : TAGTGTCTCACTAAGATACAAATGG--------GC-ATT-AAGAATACGCT----CTCTTTTTTATCATAC-CT-TTTAG-GTTAAAAAAT-G-G-A-A-CTA-CAGTCTAGATT-TTGC--T--GCTGCTCAT---G----AT-CA---G-T-GAA------AAA--------------A-ACAA--------------------------------C-A--A--A-----CCA-A--A-C--T--A-TA--------T---------TG-C-AAC-------T--GA---------AATCGT-AAT---A-------T------------T---C------------TG-G-----G-------------GAT-----T--TA--T--T-TTGA-T-------GT----AATGGA-C---TA--CT--G------------T-------T------G------T---T-T------GATA-AG-CA--GG--------------------------------A-TCA---AA--TTATTC-----ATTT---agg
gi|18 : gctgtagtattggctgatattggagaggtagtcagatctcaacaGACTGCGTT----CCGTTTTCGAGCATGT-CA-TGCGG-AGTATATCAC-ATC-A-A-C-A-CAAACCTGCTT-ATGA--T--GCTGCGCAT---G----TT-CA---T-T-ACA------ACA----------------CCAC--------A---A-T---------T-------C-C--A--A-----TCG-ATGA-C--TCAA-CT--------T---------TG-C-TAG-------T--TATTTACTATTG----C-AAT---ATTT----TAA--------------------G--T--ATA-T-----T---------------------C--T---T--T-T--A-T-------GTT---AAT----A---TATCAA--A------------GTTGTTTTT------A------T---G-T------G-TT-AG-CT--TTATA--GTTG-----C--A---TT-A----AT-A-TCA---AG--TTATTC------CTT---G-----A----G--AAAA---TT-GTT-ATT-TT--AGCC---C----ATT--G----T-----TTA-
gi|19 : ----CTGCTTTCGATCATGTATT-TGTTG-GTAAAATTAC-A-G-A-A-C-A-CAGTATAGATT-GTGA--T--ACTGTATA-------------A---G-T-TAA------TTC--------------T-CCAA--------A---A-C---------TGAACTG-CTA--A--ATAG--CCG-C--A-CCTT--ACCG--------TA--------TC-T-AAT-------T--CATTT------A----CTAAT---A-------TAATATTCTGG--C---C-----A--T--ATA-----------------------------T--T---T--G-T--A-T-------GCA---AACAGA-T---AA--AT--GCTGTAT------A-------T------G------T---G-T------GATA-----A--TGA-----TCG-----C--A---TT-A----AA-A-TGA---AA--GT-TTT-----GGTT---ttta
gi|2 : caccAATGGTTGACCAGGGTACG--TAG--------AC-ATTTAG-ACAGTGTT----TCGTTTTCGATCATGC--T-TATGA-ATAAAAGTAC-A-G-A-A-A-A-AAGTCAAGATC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CG-TA---T-T-ACT------AAA--------------T-CCAA--------A---A-CCCAACCACAT----TG-C-GACA--A-----CCC-A--A-C--T--A-CG--------A---------TG-C-GGCA------TGACA---------G----C-AAC---AC------TAC-------A--C---CGTT--G--C---TA-GTTTATT-------------AAC-----T--TA--TG-T-T--A-TATTGTTGGCATATAGT----T---TA--AT--ATAAATATCACATT-------T------G------T---G-T------GACA-AC-CA--TGACG--GTTG-----C--A---TTCA----AC-A-TTA---GA--TAATTC-----GTTC------------------AAA---CC-TTT-ATT-TT--ATTC---C----A----G----TATAA-TAA-T----GT---TAACATGCGA-GTTC-C-TGA-CC-C----AAATT-T---G----ATTTT-A----------AC----A--A-C--TCGA---C--------------------GG-TCGTTAGGTGGAC----AT----A----CC-----T-AAAC--A------A-CC----------TAA-A--TTA----ACCCTATCAGTCTAGCT-TGGTT--TCT---TTACCG--TTTGG-----TTCTTTTT-AAAGAAGCCAAC----GTA-TTCAATATATTGTT-TTCAACACACTACATtacatgaacagacgagttt
gi|20 : cagacGTGTTTGAATAGGTTGCA--TGG--------GC-ACTTA-GACTGCATT----AAGTTTC---------------TGG-ATCGAATTAC-A-GAA-A-C-A-CAGTCTAGATC-CTAC--T--GCAGTGCAT---G----CC-CA---G-T-AAA------AAA--------------T-CCAA--------A---A-C---------T----C--------------------A--A-C--A--A-TG--------C---------TC-T-GG-----------CA---------A----A-ACT---A------------------------------G--C--A-A-A-----T-------------G-T-----T--T---T--T-C--A-T-------GCA---AATGAA-T---GA--AT--C------------T-------T------G------T---ATT------TATG-TA-CA--TG-CA--TTTG-----C--A---TT-A----AA-A-TTG---GA--TTgtactc
gi|21 : acaactacttattggagaggttggaaaggtctt---AG--TTATTC-----TTTT---G-----GG---A--AAAA---TG-TGC-ATT-TT--AATG---C----A----G----TTGC--TTA-C----GT---GAACATGAGA---CCAC-TGA-CC-CCG--AAAT--T---G----ATTTT-AC--TA-----A--------------------------TTA------T--AT-GG-TCATTTGGTGTAC----GT----A----CCACCTTT-CATCC-A--TTTTA-CC----------AAAGA--TAT----AACCTATTAAACTAGAT-TGCAAA-CCG---CT-TC---TTTGGA----CTCTTTTT-AAAGGAGCCAAtt
gi|22 : tttgtgtaaatgggttagtatagtattgtcttatacgagtgatAT----T---AA--AT--T------------G-------T------A------T---T-T------G-TA-AG-TA--TGATA--ATTG-----A--A---TT-A----AA-A-TTA---A------CTC-----GTTG---G-----G----A--AAGA---TTCTTT-ATT-TT--AGTCACGC----GCTT-G----T-----TTA-C----GT---GAACATGCGA-GTAAAT-TGA-CC-TT---AA----TT--G----GTGTT-AT--C------------A--A-T--CAGA---T--------------------GG-CCATTAGTT--AC----AT----A----CCACCCTT-CATAT-A--TATTA-AC----------AAA-A--TTC----ATC--ATTATA--AGCT-TGCTGA-CTT---CA-CC---TTT
gi|23 : atattgttcatcttaattgGACTGTATT----TCGTTTCCAACAATGC-CG-TGTGG-CTTTATTTAC-A-GAA-A-T-G-AAGTCTAGATG-GTAC--T--GATTGGCAT---G----CG-TA---G-T-AAA------AAAAATAAATAAATTGTT-TCAA--------A---A-C---------T----AGCC-A--C--A-----CCG-C--A-C--C--A-----------T---------CG-C-GGCCAGCTGGT--TA---------A----CTAAT---G-------GAA-------T--C---TTCTGAA--C--ATA-------T---------------C-----T--A---T--T-T--A-A-------ATC---AATGAG-T---TA--AT--A------------T-------T------G------T---A-TTTGTGAGATA-AG-CA--TGATA--GCTA-----C--A---AT-A----Aaaa
gi|24 : aTGA-ATTAAATAAC-GCA-A-A-C-A-CAGTCTATATC-GTGC--T--GCTGC-TAC---G-----T-CA---C-T-G---------------------------CTAA--------A---C-T----------------------A--G-----CCG-T--A-C--T--G-CA--------C---------CG-C-GGCTAGTGTAT--TA---------A----T-AATGTAA-------TAA-------T--T---T-----GGTC--AT--------C-------------TAT-----T--T---T--T-T--A-T-------GT----AATGGA-T---TA--AC--A------------T-------T------GTATTTCT---A-T------ATTA-AG-CA--TGTTA--TGTG-----C--A---TT-C----AA-A-TCA---A
gi|25 : attatacttaaatataggcatgtgttgaaacttgtcgcgaTAGTGTTTTAATAGGACGTA--TGG--------GC-ATTTA-AACTGC-TC----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTTG-TTTAAATAAC-A-G-G-A-
gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta-------T------G------T---G-T------AATA-AC-CA--TGCCA--GTTG-----C--A---TT-A----CA-A-ACG---AATCTTAAGC-----AAT----------G----A--AAAC---TG-TTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----TTA-T----GT---CAACAAGCGA-TATTCC-GGA---------AA----T---ATTTCATCTT-ACATTA-----ACC-CAATTA-TAATTGATATTT----TTA------C--A---A-CCATT-------C----AT----A----CTACCATT-CTTAC-A--CTTTG-CC----------GAA-agagccaaaaaa
gi|28 : ttTA---AAC----T---TAT-AT---------------T-------T------G------T---G-T------GGTT-AG-CA--TGATA--GATG-----C--A---TT-G----GA-A-TCA---CA--TGCTTC-----GTTT---A-----A----ATAGAAA---TG-T-----------AGCC---T----A----G----T-----TT-------GT---TGATATGTAC-GTTTAA-TGA-CC-C----AAAACTT---G----ATTTT-AC--T------------A--A-T--TAGA---T--------------------GG-CCATTTGATGGAC----AA----G----CCACCCTT-CATTT-A--TTTTA-AC----------AAA-A--TCA----ACCtctattatta
gi|29 : atGACTGTGTA----CGGTTTTCTATCATGC-CT-TGTGG-ATATTATTAC-A-GAA-A-C-A-CAACCTAGACC-ATGC--TAAACTGTCCAT---G----CC-CA---G-T-AAC------AAA--------------T-ACAATACC----A---A-T---------T----Ttcacaa
gi|3 : ttataGTAGTGCTTGGCTAGGAAACA--TGG--------TTTATTTAG-ACTGTGTT----TCATTTTCGATCATGC-TT-TGTGG-ATTA--TT-C-G-T-T-T-T-A-CAGTCTAGACC-CTGC--T--GCTGCACAT---G----CT-CA---G-A-AAA------AAA--------------T-CTAA--------A---A---------------------------------CCC-A--A-C--T--A-GG--------T---------TG-T-GGC-----------A---------G----C-AGT---AACCGCACCAC-------A--C---C-----G--TGGATA-G-----TTTATTATATTCCAGGCATACAT--T---T--T-T--A-T-------ATA---AAT----TGATTA--AA--A------------T-------T------G------TATTG-T------GATATACGCA--TGGTA--GTTT-----C--A---TA-T----AA-A-TTA---GA--TTATTC-----ATTT---GTGATGG----G--GAAA---TC-TTT-ATT-TT--ATTC---C----A----GCCTGT-----TTG-T----GT---GAACATGCAA-GTTTAG-TGA-C----------------------------AC--T-----------AA--A-T--TTGG---TT----TTT------C--C--AG-TCAT---GT-GAC----AA----A----CCA--CGA-TACCT-A--TTTTA-CCTTCCTCCTAAAAA-A--ACA----ACCCTATGAAACTAGCT-TGTTtgttttggctaaactagcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|30 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctacA---TT-TTT-ATT-TC--ATTC---C----ACTTTG----T-----TTG-C----GT---GAACATTCAG-GTTTAC-TGA-CA-C----------C---G----AGTTTGACA-TA-----ACC---A--G-T--TAGA---T--------------------GA-CCGTTTGATGGAC----AT----G----CTATCCTT-CACCT-A--GCTTA-CC----------A--------------------------------GCTAG-TCT---CT-AC---TTGGGA----TTATTTTT-AAAGAAtac
gi|31 : aacagtttgcaagacggtcaatttt----G----T-----TTA-C----GT---GAACATGCGAGGTTTAC-TGA-CC-C----CA--------A----ATTTT-AT--T--------T-CAA--------CAA---TT----TGA------T--A---G-TCAGTTGGTGAAC----AT----A----CTATTCTT-CACCTGG--TTTTA-C
gi|31 : gcgttgcagtttGA-TAT---CT-CA---TTTGAA----TTTTTTTTTAAAAAACCCAAC--ATGTA-TTaagatatctcatttgaatttttttttaaaaaacccaacatgtattgtttaaagtgaatacac
gi|33 : gcgttgcagtttgtttacgtgaacatgcgaggtttactgaccccaaattttatttcaacaatttgatagtcagttggtgaacatactattcttcacctggttttacaa--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--TTATTC-----GTTT---T-----GAAAAA--AAAA---TC-ATT-A-T-TT--AGTC---C----A----G----T-----TTG-CTTATGT---AAACATACA-----TATGTGA-CC------------------------TT-A--------------CAA--A-T--TCAA---TG----TT-----------------CATTTGGTGGAC----AT----T----CCATCCTT-Cgtttaaagtgaatacac
gi|34 : -------T------G------C---G-T------GATA-GG-CA--TCATA--GCTA-----C--A---TT-A----AC-A-TCA---AA--TTATTC-----GTTG---A-----G----A--AAAAC--TA-TTG-ACT-TT--AGTC---A----A----G----TTTGTCTTA-C----GT---TAACGTGCGA-TTTTcaataagcttcaccacttctcctttttggttattttcaaagaagca
gi|35 : gtaatattcagggcatatttctattatgaacaatgatctatatcgtattT-TT--AGTC---C----A----G----T-----TTG-T----CTATTGAACATACAA-GTTTAC-TAG-CC-CT---GA----C---AT---ATTTG-AA--TT-----ACC---A--A-T--CAGA---T--------------------GA-CCATTTGGTTGAC----AT----A----CC-TTCTT-CACAT-A--TTTGAACC----------AAA-AA-TTA----AGCCTATAAAAATAGCT-TGCTCA-CTT---CA-CC---TTTGGA----ATATATTT-AAgtttttgtggacaaacaa
gi|36 : AT-----T--C---T--T-T--A-T-------GTA---AATCAA-T---TA--AT--A------------T-------T------G------T-------------ATA-TG-TG--TTACA--GTTG-----A--A---CG-A----AA-A-TCA---TA--TTATT------ATTT---G-----G--------GAT---TA-TTT-GTT-TT--AGTA---CTGTTT----G----T-----TTA-T----GT---GAGCATGAAA-ATCTAC-AGA-CC---------------------------------------CC-CAA--A-T--TTGA---TT----TTA------c
gi|38 : catatattctcatat----T-----TTAAC----AT---GACCATGTGA-GTTAAC-TGA-CC-C----CA----T--------ATTTG-AT--TT-----ATC---A--A-T--CAGA---T--------------------GG-ACGTTT-GTGGAC----AC----A----ACATCCAT-GA--T-A--TTATA-CC----------AAA----------------ACTGAACTAGAT-TGTTGA-CAT---TT-CC---TTTGAA----ATCCCTTccag
gi|39 : tgttTTTC-A-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATA-GTGC--T--GCTGTGCAT---G----CT--AGATG-T-ACA------AGT--------------T-CCAA----------------------------------A--A--A-----CCA-A--A----T--A-GG--------T---------TG-C-GAC-------T--ata
gi|4 : tattacagatctgcagacctcgttgactgggatgcaggggtaataagaatgtGTAGTGATTAACTAGGATGTT--TGG--------GC-AC--AGGATTGCGTT----TCGTTTTCAATCGTGC-AT-TGTGG-ATTAAATTAC-A-G-A-A-C---CAGACTGGACC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------ATA--------------T-CCAA--------A---AGT---------T----TG-C-A--ACCA-----CCG-A--A-C--T--A-AG--------T---------TG-C-GGT-------T--CA---------A----C-AAT---A-------TAA-------A--C---C-----G--C--ATA-G-----T-------------GAC-----T--T---T--T-T--A-T-------GTA---AAT----T---TA--ACCAA------------G-------T------G------T---G-T------GATA-AC-TA--TGACA--GCTG-----C--A---TT-A----AA-A-ACA---AA--TTACTC-----GGTT---G-----G----A--AAAA---TA-TGT-ATT-TT--AGTC---T----A----G----T-----TTA-G----GT---GAACATGCAA-CTTTAC-TGA-CC-C----AAAA--C---A----ACTTT-AC--TG-----ACC-CAA--AAT--TCAA---TT----TTA------T--A--GGGCCATTTGGTGGAC----AT----A----CCACCCAT-CATCT-A--CTTTA-CC----------TAA-T--TCA----ACCCTATTAAACTTGCT-TACTGA-ACT---CT-CC---TTTGGA----TACCTTTG-ACAGAAGTTAGC--TTATA-TTCAGC-TAGTATTCCT-AA-ATAGTACATgcattag
gi|40 : TTTAGATTACGC--T-TATGG-ATAACATTAC-ATA-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--A--ACTGCGCAT---G----CT-CA---T-T--AA------AAA--------------T-CCAA--------G---A-a
gi|41 : gtagaccgctacatagtcttaggca-------T------G------T---G-T------GATA-AC-CA--TAATA--TATG-----C--A---TT-GTATTAA-A-TCA---AA--TTATTC-----GTTG---G-----GT---G--AAAA---TC-TTT-ATTATTGCAGTT---T---------G----T-----TTA-C----GT---GAACcccagctcctttttaatgaagggaat
gi|42 : tttcttattgaaatggattaaaattgttttG-----ACCACAC--A-T--TTGA---TT----TTACCAATCT--AATGA-ACAGTAGGTGGAC----AT----A----CCGCCCTG-CAT----------A-AA----------AAA-A--ACACACGACCCAATTGAACAAACT-TGTTGA-CAT---CT-TC---TTTGGA----TTCTTTTT-Actac
gi|43 : --GG-TCATTTGGGTGAC----AT----A----CCACCTAG-TAT------------------------GAA-A--CC------CTCTA--AAACT--------TGA-TTT---CT-------TTGGA----GTATTTTT-AAAGAATCCAAC--TTGTtaa
gi|44 : tgatcccgagattgatcttaccaatccaatATCATGC-CT-TGTTG-ATTAT-TTAA-A-G-A-A---A-CAGTTTAGATT-GTGC--T--GCTGGGCAC---A----CT-TA---G-T-TTA------AAA--------------C-CCAGCTGT----A---A-T---------A----TG-C-------------CTA-A--A-C--T--A-
gi|45 : aCTGTGTT----CCATTTTCAATCATGT-CT-AGTGG-ATTAATTTAC-A-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATT-GTGC--T--GCTGTGCAG---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------T-gccagatggaacttcaccac
gi|46 : --GG-CCATTTGGTGGAC----AG----A----CAACCTTT-AACCT-A--TTTTA-TC--------------------------------AAACTAGCT-TGCATA-CAT---CT-------TTGGA----TTCTTTTT-AAAGAAGCCAA
gi|5 : TTAC-A-A-A-AAC-A-CAGTCTAAATC-ATGT--T--ACTGGGCGT---A----AT-CA---G-T-ACA------AAA--------------T-CCA-----------------------------------A--A--A-----CCC-A--A-T--T--A-TG--------T---------TG-CGGGC-------T--AA---------A----C-AGC---C-------AGC-------A--C---C-----T--C--ACA-G-----T-------------GGC-----TG-G---T--T-T--A-T-------TTACT-AAT----G---TA--AT--A------------
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15 : ttagttgttgatttaaactttttgattataaacattattggagaggtctttggagagatctgacctctcta--TGG--------AC-ATTTAA-ACTGCGTT----CCGTTTTCGATCACTC-CT-TGTGGG-TCAATTTACA-GAA-A-T-A-CTGTTTAGTTT-G-----T--GCAGTGCATTTAG----TT-CA---G-T-AAATAA--------------TTCAA--------A------------T----CC-C-----A--A--A---------------------T--A-C-A--------T-T-GT-GCAAAC-------T-------TA---------G----CCGTAAC---G---CACA-------G--CGGC-----G--CGTTA-T-----TG---ACTAATGCAATAT-CGAT-T--A-T-------G-----------------TA---AATGG----C-T----------T-AA-----T----G------------C-----T------G------T----------------------ACA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----A
gi|16 : ggtgccttcagacctcttcatggtgcCTGCATT----CCATTTTCAACCATGC-CT-TGCGAA-TTAAATTACA-G-A-A-A-ATCAGTCAAGATT-GTGCCAT--G-TAAACAT---G----TTGAA---G-TAAAAAAA--------------TCCCA--------AA-C---------C----CA-T-----T--A--A-----------A----A-T--T--A-T-GGCTAACTTT-T-AT-G---GCTAGTTAAT-------TA---------A----C---TAT---G---TA-AT------A--T--TCTGG-G--CA--A-A-----TA---GC----------T-T--T-T--A-T-------G-----------------TA---AATGG----A-T----------T-TA-----T----A------------T-----T------GTATTTCT------G-T------GATA-A-GCG--TG--ATATTTG-----C------TT-A----AA-AT-----AG--T-----CTC-----GT-C-----TG------------------------T-A----------------------------------------T----A-C----CTGAACATGCAAA-TTTAC-CAA-CC-CTAAAA--A----CT--G----AC-T-TT--A-C-C--Attttgccacattaaattcctttgactgtcaaagtggattagttcaatgtaatagtgtta
gi|17 : TAGTGTCTCACTAAGATACAAATGG--------GC-ATT-AAGAATACGCT----CTCTTTTTTATCATAC-CT-TTTAGG-TTAAAAAATG-G-A-A-CTA-CAGTCTAGATT-TTGC--T--GCTGCTCAT---G----AT-CA---G-T-GAAAAA--------------AACAA-----------------------------C-----A--A--A---CCA-----A----A-C--T--A-T-A--------T-T-GC-A---AC-------T-------GA---------AATCGT---AAT---A---T-------------T--C-----------TG-G-----GG---ATT---------TAT--T-TTGA-T-------G-----------------T----AATGG----A-C----------T-AC-----T----G------------T-----T------G------T------T-T------GATA-A-GCA--GG--------------------------------ATCA---AA--T---TATTC-----AT-T-----Tatcagg
gi|18 : gctgtagtattggctgatattggagaggtagtcagatctcaacaGACTGCGTT----CCGTTTTCGAGCATGT-CA-TGCGGA-GTATATCACATC-A-A-C-A-CAAACCTGCTT-ATGA--T--GCTGCGCAT---G----TT-CA---T-T-ACAACA---------------CCAC--------AA-T---------T-------C-----C--A--A---TCG-----ATG--A-C--TCAA-C-T--------T-T-GC-T---AG-------T-------TATTTACTATTG----C---AAT---ATTTTA-A-------------------G--TA-TA-T-----T------C---------T-T--T-T--A-T-------G-----------------TT---AATAT----A-T----------C-AA-----A----G------------T-----T------GTTTTTAT------G-T------G-TT-A-GCT--TT--ATAGTTG-----C--A---TT-A----AT-ATCA---AG--T---TATTC------C-T-----TG--A----G-AAA---A---T-TGTT-ATT-TT--AGCC---C----ATT--G----T-----T----T----A-
gi|19 : ----CTGCTTTCGATCATGTATT-TGTTGG-TAAAATTACA-G-A-A-C-A-CAGTATAGATT-GTGA--T--ACTGTATA-------------A---G-T-TAATTC--------------TCCAA--------AA-C---------TGAACTG-CT----A--A--ATAGCCG-----C----A-CCTT--ACC-G--------TAT-CT-A---AT-------T-------CATTT------A----CT--AAT---A---TA-ATATTCTGG--C--C-----A--TA-TA--------------T---------T-T--G-T--A-T-------G-----------------CA---AACAG----A-T----------A-AATGCTGT----A------------TA----T------G------T------G-T------GATA-----A--TG--A---TCG-----C--A---TT-A----AA-ATGA---AA--G---TTTTG-----GT-T-----Tttta
gi|2 : caccAATGGTTGACCAGGGTACG--TAG--------AC-ATTTAG-ACAGTGTT----TCGTTTTCGATCATGC--T-TATGAA-TAAAAGTACA-G-A-A-A-A-AAGTCAAGATC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CG-TA---T-T-ACTAAA--------------TCCAA--------AA-CCCAACCACAT----TG-C-----GACA--A---CCC-----A----A-C--T--A-C-G--------A-T-GC-G---GCA------TGA-----CA---------G----C---AAC---AC--TA-C-------A--C--CGTT--G--C--TA-GTTTATTA---ACT---------TATG-T-T--A-TATTGTTGG-----------------CA---TATAG----T-T----------T-AA-----T----ATAAATATCACATT-----T------G------T------G-T------GACA-A-CCA--TG--ACGGTTG-----C--A---TTCA----AC-ATTA---GA--T---AATTC-----GT-T-----C-----------AA---A---C-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----A----G----TATAA-T----A----A-T----GTTAACATGCGAG-TTC-C-TGA-CC-C----A--AATT-T---G----AT-T-TT--A------AC----A--A-C--TCGA---C-----------------------G---GTCGTTAGGTGGAC----AT----A----CC-----TA--AAC--A-------ACC----------TAA-A--TTA----ACCCTATCAGTCTAGCT--T--GGTTT-CTT---TA-CCG-TTTGG-----TTCTTTTTAAAGAAGCCAAC----GTA-TTCAA-TA-TATTGTT-TTCAACACACTACATacatgaacagacgagttt
gi|20 : cagacGTGTTTGAATAGGTTGCA--TGG--------GC-ACTTA-GACTGCATT----AAGTTTC---------------TGGA-TCGAATTACA-GAA-A-C-A-CAGTCTAGATC-CTAC--T--GCAGTGCAT---G----CC-CA---G-T-AAAAAA--------------TCCAA--------AA-C---------T----C--------------------------A----A-C--A--A-T-G--------C-T-CT-G---G----------------CA---------A----A---ACT---A--------------------------G--CA--A-A-----TG----TT---------T-T--T-C--A-T-------G-----------------CA---AATGA----A-T----------G-AA-----T----C------------T-----T------G------T------ATT------TATG-T-ACA--TG---CATTTG-----C--A---TT-A----AA-ATTG---GA--T---Tgtactc
gi|21 : acaactacttattggagaggttggaaaggtctt-T--T-T--G-T-------G-----------------TA---AATGG----G-T----------T-AG-----T----A------------TAGTATT------G------T------C-T------TATA-C-GAG--TG--ATAGTT----------------------------------------ATTC-----TT-T-----TG--GG---A-AAA---A---T-GTGC-ATT-TT--AATG---C----A----G----T-----TGCT-T----A-C----GTGAACATGAGA---CCAC-TGA-CC-CCGA-A--A----TT--G----AT-T-TT--A-C-T--A----------------A---TTA------T---A--------T-G---GTCATTTGGTGTAC----GT----A----CCACCTTTC--ATCC-A--TTTT-ACC----------AAAGA--TAT----AACCTATTAAACTAGAT--T--GCAAA-CCG---CT-TC--TTTGGA----CTCTTTTTAAAGGAGCCAAtt
gi|22 : -T--T-C--A-T-------C-----------------TT---AATTG----A-T----------T-AA----------A------------T-----T------G------T------A-TTT----G-TA-A-GTA--TG--ATAATTG-----A--A---TT-A----AA-ATTA---A---------CTC-----GT-T-----GG--G----A-AAG---A---TTCTTT-ATT-TT--AGTCACGC----GCTT-G----T-----T----T----A-C----GTGAACATGCGAG-TAAAT-TGA-CC-T----T--A-------------AT-TGGT--G-T-T--ATC---A--A-T--CAGA---T-----------------------G---GCCATTAGTT--AC----AT----A----CCACCCTTC--ATAT-A--TATT-AAC----------AAA-A--TTC----ATC--ATTATA--AGCT--T--GCTGA-CTT---CA-CC--TTT
gi|23 : atattgGACTGTATT----TCGTTTCCAACAATGC-CG-TGTGGC-TTTATTTACA-GAA-A-T-G-AAGTCTAGATG-GTAC--T--GATTGGCAT---G----CG-TA---G-T-AAAAAAAATAAATAAATTGTTTCAA--------AA-C---------T----AGCC-----A--C--A---CCG-----C----A-C-------C-A--------T-C-GC-G---GCCAGCTGGT-------TA---------A----CT--AAT---G---GA-A-------T--C--TTCTGAA--CA-TA-------T-----CT---------A-T--T-T--A-A-------A-----------------TC---AATGA----G-T----------T-AA-----T----A------------T-----T------G------T------A-TTTGTGAGATA-A-GCA--TG--ATAGCTA-----C--A---AT-A----Aaaa
gi|24 : aTGAA-TTAAATAACGCA-A-A-C-A-CAGTCTATATC-GTGC--T--GCTGC-TAC---G-----T-CA---C-T-G---------------------CTA--------AA-C---------T----------------A--G---CCG-----T----A-C--T--G-C-A--------C-C-GC-G---GC-------TAGTGTATTA---------A----T---AATGTAA---TA-A-------T--T--T-----GGTCA-T--------CT---ATT---------T-T--T-T--A-T-------G-----------------TA---A-TGG----A-T----------T-AA-----C----A------------T-----T------G------T------A-TTTCTATATTA-A-GCA--TG--TTATGTG-----C--A---TT-C----AA-ATCA---A
gi|25 : attatacttaaatataggcatgtgttgaaacttgtcgcgaTAGTGTTTTAATAGGACGTA--TGG--------GC-ATTTA-AACTGC-TC----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTTGT-TTAAATAACA-G-G-A-
gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta------------T-----T------G------T------G-T------AATA-A-CCA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----CA-AACG---AATCT---TAAGC-----AA-T---------G----A-AAA---C---T-GTTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----T----T----A-T----GTCAACAAGCGAT-ATTCC-GGA---------A--A----T---ATTTCAT-C-TT--A-CATTAACC-CAATTA-TAATTGATATTTT------T---A--------C-A---ACCATT-------C----AT----A----CTACCATTCTTAC---A--CTTT-GCC----------GAA-agagccaaaaaa
gi|28 : tA-----T----A------------T-----TT-----G------T------G-T------GGTT-A-GCA--TG--ATAGATG-----C--A---TT-G----GA-ATCA---CA--T---GCTTC-----GT-T-----TA--A----A-TAG---A----------AAT-GT--AGCC---T----A----G----T-----T----T-----------GTTGATATGTACG-TTTAA-TGA-CC-C----A--AAACTT---G----AT-T-TT--A-C-T--A--------A-T--TAGA---T-----------------------G---GCCATTTGATGGAC----AA----G----CCACCCTTC--ATTT-A--TTTT-AAC----------AAA-A--TCA----ACCtctattatta
gi|29 : attaaacttGACTGTGTA----CGGTTTTCTATCATGC-CT-TGTGGA-TATTATTACA-GAA-A-C-A-CAACCTAGACC-ATGC--TAAACTGTCCAT---G----CC-CA---G-T-AACAAA--------------TACAA--------TA-C---------tcacaa
gi|3 : ttataGTAGTGCTTGGCTAGGAAACA--TGG--------TTTATTTAG-ACTGTGTT----TCATTTTCGATCATGC-TT-TGTGGA-TT--ATT-CG-T-T-T-T-A-CAGTCTAGACC-CTGC--T--GCTGCACAT---G----CT-CA---G-A-AAAAAA--------------TCTAA--------AA-C---------------------------------CC------A----A-C--T--A-G-G--------T-T-GT-G---G----------------CA---------G----C---AGT---AAC-CG-C-------A--C--C-----A--CA-CC-G-----TGGATAGT---------T-TA-T-T--A-T-------ATTCCAGGCATACATTTTTA---TATAA----A-T----------T-GA-----TTAAAA------------T-----T------GTAT---T------G-T------GATATACGCA--TG--GTAGTTT-----C--A---TA-T----AA-ATTA---GA--T---TATTC-----AT-TTGTGATG--G----G-GAA---A---T-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----AGCCTG----T-----T----T----G-T----GTGAACATGCAAG-TTTAG-TGA-C---------------------------------A-C-T-------AA--A-T--TTGG---TTT------TTCCA--------------GTCAT---GT-GAC----AA----A----CCACGAT----ACCT-A--TTTT-ACCTTCCTCCTAAAAA-A--ACA----ACCCTATGAAACTAGCT--T--GTTTA-Ccaattttgttttggctaaactagcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|30 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctac---A---T-TTTT-ATT-TC--ATTC---C----ACTTTG----T-----T----T----G-C----GTGAACATTCAGG-TTTAC-TGA-CA-C------------C---G----AG-T-TTG-A-CAT--AAC-CAG----T--TAGA---T-----------------------G---ACCGTTTGATGGAC----AT----G----CTATCCTTC--ACCT-A--GCTT-ACC----------A-----------------------------------GCTAG-TCT---CT-AC--TTGGGA----TTATTTTTAAAGAA
gi|31 : aacagtttgcaagacggtcaatttt----G----T-----T----T----A-C----GTGAACATGCGAGGTTTAC-TGA-CC-C----C--A--------A----AT-T-TT--A-T-T----T-CAA--------CAA---TTT------G---A--------T-A---GTCAGTTGGTGAAC----AT----A----CTATTCTTC--ACCTGG--TTTT-A-C----------AAG-A--T------ATCTCATT-----------------------------------TGAAT---TTTTTTTTAAAAAACCCAAC--ATGTA-TT
gi|33 : gcgttgcagttt--A---TT-A----AA-ATCA---AA--T---TATTC-----GT-T-----TT--GAAAAA-AAA---A---T-CATT-A-T-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----G-CTTATGTAAACATACA-----TATGTGA-CC----------------------------TT--A----------CAA--A-T--TCAA---TGT------T--------------------CATTTGGTGGAC----AT----T----CCATCCTT-----------------CC----------AA-------------------TAAGCT---T--C--ACC-A-CTT---CT-CCTTTTTGG-----TTATTTTCAAAGAAGCgtttaaagtgaatacac
gi|34 : ------------T-----T------G------C------G-T------GATA-G-GCA--TC--ATAGCTA-----C--A---TT-A----AC-ATCA---AA--T---TATTC-----GT-T-----GA--G----A-AAA---AC--T-ATTG-ACT-TT--AGTC---A----A----G----TTTGTCT----T----A-C----GTTAACGTGCGAT-TTTa
gi|35 : gtaatattcagggcatatttctattatgaacaatgatctatatcgtatT-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----G-TCTA-TTGAACATACAAG-TTTAC-TAG-CC-CT---G--A----C--------ATAT-TTGAA-T-T--ACC---A--A-T--CAGA---T-----------------------G---ACCATTTGGTTGAC----AT----A----CC-TTCTTC--ACAT-A--TTTGAACCA---------AAA-A--TTA----AGCCTATAAAAATAGCT--T--GCTCA-CTT---CA-CC--TTTGGA----ATATATTTAAgtttttgtggacaaacaa
gi|36 : ---ATT---------C-T--T-T--A-T-------G-----------------TA---AATCA----A-T----------T-AA-----T----A------------T-----T------G------T----------------ATA-T-GTG--TT--ACAGTTG-----A--A---CG-A----AA-ATCA---TA--T---TATT------AT-T-----TG--G-------GA---T---T-ATTT-GTT-TT--AGTA---CTGTTT----G----T-----T----T----A-T----GTGAGCATGAAAA-TCTAC-AGA-CC----------------------------------------CC-CAA--A-T--TTGA---TTT------T---A--------c
gi|38 : catatattctcatat----T-----T----T----AAC----ATGACCATGTGAG-TTAAC-TGA-CC-C----C--A----T--------AT-T-TG--ATT-T--ATC---A--A-T--CAGA---T-----------------------G---GACGTTT-GTGGAC----AC----A----ACATCCATG--A--T-A--TTAT-ACC----------AAA----------------ACTGAACTAGAT--T--GTTGA-CAT---TT-CC--TTTGAA----ATCCCTTccag
gi|39 : tgttTTTCA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATA-GTGC--T--GCTGTGCAT---G----CT--AGATG-T-ACAAGT--------------TCCAA-----------------------------------A--A--A---CCA-----A----A----T--A-G-G--------T-T-GC-G---AC-------T-------ata
gi|4 : tattacagatctgcagacctcgttgactgggatgcaggggtaataagaatgtGTAGTGATTAACTAGGATGTT--TGG--------GC-AC--AGGATTGCGTT----TCGTTTTCAATCGTGC-AT-TGTGGA-TTAAATTACA-G-A-A-C---CAGACTGGACC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAAATA--------------TCCAA--------AAGT---------T----TG-C-----A--ACCA---CCG-----A----A-C--T--A-A-G--------T-T-GC-G---GT-------T-------CA---------A----C---AAT---A---TA-A-------A--C--C-----G--CA-TA-G-----TG---ACT---------T-T--T-T--A-T-------G-----------------TA---AAT--------T----------T-AA-----CCA--A------------G-----T------G------T------G-T------GATA-A-CTA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----AA-AACA---AA--T---TACTC-----GG-T-----TG--G----A-AAA---A---T-ATGT-ATT-TT--AGTC---T----A----G----T-----T----T----A-G----GTGAACATGCAAC-TTTAC-TGA-CC-C----A--AAA--C---A----AC-T-TT--A-C-TG-ACC-CAA--AAT--TCAA---TTT------T---ATA------G-G---GCCATTTGGTGGAC----AT----A----CCACCCATC--ATCT-A--CTTT-ACC----------TAA-T--TCA----ACCCTATTAAACTTGCT--T--ACTGA-ACT---CT-CC--TTTGGA----TACCTTTGACAGAAGTTAGC--TTATA-TTCAGCTAGTATTCCT----AA-ATAGTACATgcattag
gi|40 : TTTAGATTACGC--T-TATGGA-TAACATTACATA-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--A--ACTGCGCAT---G----CT-CA---T-T--AAAAA--------------TCCAA--------GA-C---------a
gi|41 : gtagaccgctacatagtcttaggcaT---------T-C--T-T--A-T-------T-----------------GA---AATGG----A-T----------T-AA-----A----A------------T-----T------G------TTTTTGTG-T------GATA-A-CCA--TA--ATATATG-----C--A---TT-GTATTAA-ATCA---AA--T---TATTC-----GT-T-----GG--GT---G-AAA---A---T-CTTT-ATTATTGCAGTT---T---------G----T-----T----T----A-C----GTGAACccagctcctttttaatgaagggaat
gi|42 : t--ACCACAC--A-T--TTGA---TTT------T---ACCAATCTAATG---AACAGTAGGTGGAC----AT----A----CCGCCCTGC--A----------T-AAA----------AAA-A--ACACACGACCCAATTGAACAAACT--T--GTTGA-CAT---CT-TC--TTTGGA----TTCTTTTTActac
gi|43 : g-T--ACC---A--A-T--CCAA---T-----------------------G---GTCATTTGGGTGAC----AT----A----CCACC-----------------T-AGT----------ATG-A----A----ACCCTCTAAAACT-----------TGA-TTT---CT------TTGGA----GTATTTTTAAAGAATCCAAC--TTGTtaa
gi|44 : tgatcccgagattgatctATCATGC-CT-TGTTGA-TTAT-TTAAA-G-A-A---A-CAGTTTAGATT-GTGC--T--GCTGGGCAC---A----CT-TA---G-T-TTAAAA--------------CCCA
gi|45 : aCTGTGTT----CCATTTTCAATCATGT-CT-AGTGGA-TTAATTTACA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATT-GTGC--T--GCTGTGCAG---G----CT-CA---G-T-AAAAAA--------------Tgctgtaatatgcctaaactagccagatggaacttcaccac
gi|46 : -G---GCCATTTGGTGGAC----AG----A----CAACCTTTA--ACCT-A--TTTT-ATC----------AAA----------------------CTAGCT--T--GCATA-CAT---CT------TTGGA----TTCTTTTTAAAGAAGCCAA
gi|5 : TTACA-A-A-AAC-A-CAGTCTAAATC-ATGT--T--ACTGGGCGT---A----AT-CA---G-T-ACAAAA--------------TCCAA--------AA-CCCAATTATGT----TG-CGGGCTA--A--A---CAGCCAGCA----C-C--TC-A-CAG--------T-G-GCTG---GT-------T-------TATTT------A----CT--AAT---G---TA-AT------A--T--TCTGG-G--TA-CA-G-----AT---ATT---------T-G--T-T--A-T-------G-----------------TA---AATGA----A-TTTTTATTGCAT-AA-----T----T------------T-----T------G------T------G-C------GATA-A-ATAATTACCATTGTTG-----C--A---TTAA----AA-ATCA---AA--T---TAATC-----GTAA-----AG--G----A-AAA---AG--T-CTTT-ATA-CC--AGTC---C----ATTT-G----T-----T----G----A-C----ATGATCATGTGAG-TTTAT-T------C----A--A-------------AT-T---------T--ACC---A--A-T--CAGA-----T------G---A--------A--------ATTTGGTGGAC----AT----ATATTTCATCCTTT--ATCT-A--TTTT-ATC-----------AA-A--CCA----ACCAAATTAAATTATATAATCAACTCA-CCC---CT-----TTTAGA--------TTTTAAAGAAAC
gi|6 : tattggaggtcttcggatctctctaaagtggttgatcaggcagcgggcatcagcatttagactgcc------G------T------G-T------AATA-A-ACA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----AG-TTCA---AA--T---TATTC------T-T-----TG--GTA--A-AAA---G---T-GTTT-ATC-TT--AGTC---T----AGTTTG----T-----T----T----A-C----CTGAACATGCGAA-TTTAC-T------C----A--A----CTTTG----AT-T-TT--A-C----------------------------------T---A--------A-G---GTC---------------AT----A----CCACCCAT---ATCT-ATTTTTT-TTC----------AAA-A--TCA----ACTTCTTTTAACTAGCT--T--GGTGA-CCT---CC-TT--TTTGGA----TTCTT----AATAAAACAAC--TTATacattg
gi|7 : TAGTGTTTTAATAGGACGTA--TGG--------GC-ATTTAA-ACTGC-TT----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTGGT-TTAAATAACA-G-G-A---A-GAGCAAAGAT--GTGC--T--ACTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAAAAA--------------T--AG--------AA-----------------------------------------------------T--A-C-G--------T-T-GC-G---GC-------T-------TA---------A----C-------------TA-ACCGC---A--C--C-----C--CA-CC-G-----CG---ACTA--------G-T--C-T--A-T-------T-----------------T----ACTGGGCATA-T----------T--G-----T----AT-----------T-----T------G------T------G-C------GAGA-A-ACA--TA--ATAGTTG-----C--G---TC-A----CA-ATTA---AA--T---T-TGC--------------TG--G----A-GGA---AATGT-CTTT-ATT-TT--AGTC---A----A----G----TTCGC-T----T----A-C----GTGAAT-TGCGAT-TTTAT-Tcgagtgctgaatcctgctatttgacctgccacttgctgaagtgccttacaatacatacatcctgtttcattggtgaaggtcatgttactaaaactagatgtggtttcccaatacgcagttatgtacacttaacaaaatataactgtcatcaatatgctactaggatataaaactgcatataccatgataaatagcattccgaatagcggtgttaatctgccacacacgtcaaaacttcatctaaaacta
gi|8 : aatgaaagataacaagtattcgcattggtttcggtttgctagtattacattaaaataggaaactgtataactaactggagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatctttaAATAAGACGCA--TGGTCCTAGTTAC-AGTTAG-ACTGTGTT----CCGTTTTCGGTCATGA-AT-TGTGGAATTATAT-ACA-A-A-AAT-A-CACTTCAGACA-GTGT--T--GCTGAGCAT---G-----T-CG---G-T-AAAAAA--------------ATCAA--------AA-T-----------------------------------------A----A-T--T---------------T-T-GCCG---GC-------T------------------G----C---A-T-------TA-A-------A--T--------G--CA-TA-------TA---A-----------T-T--T-T--A-C-------------------------------ATG---------------------------------------------------T------G------T------G-T------GACA-G-GTAGTTG--CTGATTT-----C--A---TA-A----AA-ATCA---AA--T---AATC---------T-----TG--C----------------T-GTTTGATT-GT--AATC---C----ATATTG----T-----T----T----A-T----AAGAACATTTGAG-TTGAC-TAG-CC-T----CTTA----CTG-G----AT-T-TA--A-C-C--AAT-CAA--A-T---------------------------------G---GACATTTGGTGT-C----GT----A----CCACCAACC--ACTT-A--TCTT-ACT----------AAA-A--TC-------------AAACAAGTT--T--AC-GA-CCA---CC-CT--ATTAGA----ATCTTGTTACAGAAACCAAC--TTG---TCCAA-Tcggtcaatcagctatccatgtagtggacataatgacctatttc
gi|9 : gtaattaaTTACA-G-A-AAC-A-CAATCTAGACT-GTGC--T--GCTACATTT---G----CT-CA---G-T-AAAAAA--------------TCCAA-----------C---------C-------C-----A--G--T---CCC-----A---------T--A-G-T--------T-T-A---------------T-------TA---------A----CT--AAT---G---TA-AT------A--T--TCTGA-G--CA-TA-------T----ATT---------TAT--T-T--A-C-------G-----------------TA---AATAT------T----------T-GA-----T-----------------T-----T------G------T------G-T------GGTA-A-GTG--CG--ATAAT-G-----C--AATGTT-A----AA-AACA---AA--T---TATTT-----AC-T-----GG--G----A-AAA---A---AACTTT-ATT-CT--AGTC---C----A----A----T-----T----T-----------GT--ACATGCATG-TTTAC-TAAGCC-CA---A--A----T---GTC--AT-T-TT--G-C-C--AAT-CAG--A-----CGA------------T---A-----------------ACTTGGTGAAT----AT----A----CTTCCATTC--ACAT-A---TTT-ACC----------AAA-AATTTATTT-ACCATGTTAAAATAACT--G--ACCAA-GCTAACTT-CC--TCTGTA----TT-TTTTTCAAG--GTCAACATTTATACCTTAT-TA-TATTATtgacgggtacttct
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACTTATCCAGTACAGAATCCTGCTAGATGACCTTTTTGACACCCCAATCAATAAGCAATATTTGCCAAAATCGCATAACGATACATTACACCATTAATGTTCCATTTGGTCGATAGCGGTCACATTACCTTTGTGTTACTAAACTTAGAGATGTTTTCCCGATACATAATTAAGTAAATCAAAC
Unaligned ( gi|32 ): ATACGGCTTGTTTATTTATTAATGTGATATTCGCAGCATGTACTTTTATGTTAATGGAAAAATATTGTATTTTTTGTAATTTAGTTGAATAAAATAAAATTATTAATTGGGAAAAATGGTTATTTTAGTTAAGTTTTTACTAACTTCAAAGTTGATTTCCAATCCG
Unaligned ( gi|37 ): TTTGCGGTTACCTAAGCCGCATCGCACCGCAGTTAGTTGATTTACCAATGTACTATTCAGGGCAATATATTTCTTGTGTAATTTAATTAATAATGTATGTATATGGTATGTATGAAAGTTGTCTTAAATCCAAATTATTATTTTGA
Unaligned ( gi|47 ): CGGCTAGTTTATTTACTAATGATATATTTTTATGCAAAAAGATTACTATTGTATATGTGTGAATAAAC
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Reference ( family-1148 ) : GTAGTGNTTGANTAGG--ACG--CA--TGG--------GC-ATTTAGGACTGCGTT----CCGTTTTCGATCATGC-CT-TGTGGA-TTAAATTACA-G-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------TCCA---------AAA--C----------T-------------G--C-----A-----A--AC-----CG-----A----A-C-T--AC-G--------TTGC-GGC-------T-------TA-----------------A--C--T-----A---AT---A---TAA-------A--CC-----G--CATA-G-----TGAC-T-T-T--T-T--A-T-------GTA---AATGG----A-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T------GT------G-ATA-A-GCA--TG--ATAGTTG-----C--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----T-G--G----A-AAA---A---T-CTTT-ATT-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----A-C----GT---GAACATGCGA-GTTTAC-TGA--C-C-C----A--A----C---G--ATT-TT-A-C-T--ACCCA--AA-TTCGAT-------GGCCATTTGGTGGAC----AT----AC----CACCCTTCACCT-A--TTTTA-CC----------AAA-A--TCA----ACCCTATTAAACTAGCT--T--GCTGA-CCT---CT-CC--TTTGGA----TTCTTTTTAAAGAAGCCAAC--TTGTA-TTCAA-TA-TATTNTTGTTCAACACANTACAT
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gi|15 : ttagttgttgatttaaactttttgattataaacattattggagaggtctttggagagatctgacctctcta--TGG--------AC-ATTTAA-ACTGCGTT----CCGTTTTCGATCACTC-CT-TGTGGG-TCAATTTACA-G-A-AAT-A-CTGTTTAGTTT-GTGC--A--GT---GCATTTAG----TT-CA---G-T-AAATAATTCAAA--------------TCCC---------AAA--TACATTG----T-------------G--C-----A-----A--ACTTAGCCGT----A----A-CGC--AC-A----------GC-GGCGCGTTA-T-------TG-----------------A--C--T-----A---AT---G---CAA----------------------TA-T-----CGA---------T-T--A-T-------GTA---AATGG----C-TT----------AA-----T--G------------C-----T------G------T----------------------ACA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----A
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gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta------------T-----T------G------T------GT------A-ATA-A-CCA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----CA-A-ACG---AATCT---TAAGC-----AAT----------G----A-AAA---C---T-GTTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----T----T----A-T----GT---CAACAAGCGA-agagccaaaaaa
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gi|11 : ATA-A-----TGCC-C-C-T--G-C--A-T--------TA---AATAC----A-TTT---------AA-----T--A------------T-----TATATTTG------T------GT------G-ATA-C-GTA--TG--TTAGTTGGCTAGCTGG---TT-G----TATA-CCATTTAA--A---TACTC-----GTT-----T-T--G---------------------T-ATT-GT--GGTA---T----A----GACTGT-----T----T----A-T----AA---GAACATGCAGG-TTGAC-TGA--C-CTC----AA----CCTTG--A-AT-T--TA-C-C-------G-------ATCTAAT-------TGAAATTTGTTGAAT----AC----AC----CACCCTTCAATT-A--TTTTA-CT----------AAA-A---AA----AACCTATTGAACTCGTA--T--AC-GA-CCT---TT-CA--TTTAAATTTTTTTTTTTTAATGAAACCAAC--TTGTaaattataatgcccctgcattaaatacatttaatattatatttgtgtgatacgtatgttagttggctagctggttgtataccatttaaatactcgttttgtattgtggtatagactgtttataagaacatgcaggttgactgacctcaaccttgaatttaccgatctaattgaaatttgttgaatacaccacccttcaattattttactaaaaaaaacctattgaactcgtatacgacctttcatttaaattttttttttttaatgaaaccaacttgtccaagctgcgggtacttct
gi|12 : atgcgttgtgaaataaattacataaatacactccagctactgtgagcataccaggtaaaaaaaaattTAGATT-TTGCG-T--GTT-CGCAT---G----CG-CT---G-T-AAA------AA---------------------------------T----------T-------------A--C-----A-----A--AC-----CA-----A----AAC-A--AT-G--------TTGT-GGC-------T-------TA-----------------G--C--T-----A---AC-------TGG-------A--CT-----G--CG---G-----CAAG-T-T-TGTT-T--ACT-------GT------TG-------TT-----------------T---------------T-----T------G------T------GC------A-ATA-A-ATA--TG--A--GTTG-----C--A---TC-A----AC-A-TCT---AA--T---TATTT-----GGT-----T-G--G----GGAAA---A---T-CTTT------C--AGTC---C----A----G----T-----TCCGTT----A-T----GT---GAACACGCAA---------------C-C----AAAATAC---G--A-TT-A--T-------------CC------TCATAT-------GGTCATTTGATTGACTTGAATTTGAAA----CACATTT-ACAT-A--TTT-A-CC----------AAA-AA-TCA----ACCCTTCTAAACTAGCT--T--GCTGA-TTT---TTATC--TTTGGA----TTCTTTTTAAAGATGTCAAC--ATG---TTTAA-----AGTTTTGTTTAAccaagctgcgggtacttct
gi|13 : T---A---TTA-------A--CCTGG--G--CATA-------TAA----T-T--T-T--A-TT------GTACATAATGG----A-TT----------AA-----C--G------------T-----T------T------T------AT------G--TA-A-GCA--TG--ACTGTTG-----C--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--TAATTAGTCAAATAGTT-----T-G--G----A-AAA---A---T-TTTA-AGT-TT--AGTC---T----A----G----T-----T----TGTTTA-T----GC---AAACATACACA-TCAAC-TGA--C-C-T----TA----A---A--A-TC-T--GA-T-TTA-----ATC--A-A-TCAGAC-------AGCCATTTGGTGGAC-----------C----CA----TTGCAT-A--TTTTG-AA----------AAA-A--TCA----ACCCTAATATATTAACT--T--GCTGGCCCT---TT-CC--TTTGAA----TTGTTTTTAAAGAAGTCAAC--TCATT-TTC--------TTTTTGTTatgtagttgtctaaag
gi|14 : gTAGCAGTTGACTAGG--AC--A------G--------GC-ATTTAG-ACTGTGTTG---TTTTTTTCAGTTATGT-CTATAAAGA-TTAAATTACA-G-A-ATC-A-AAACTCAG--CAGTGT--T--GC--CGCTT-----------------------------AAA--------------GCTG---------GCA--C----------T-------------G--T-----A---------------CG-----ATA--G-C-T--A--G--------T-GT-ATC-------T--------------------------A--C--T-----A---AT---A---TAAT------A--TCCTGG-G--CATA-A-----T--T-T-T-T--TAT--A-T-------GTA---AATCA----A-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T----------------ATT-T-GTG--TG--ATAGTTG-----C--A---TA-A----AA-A---A---AA--A---TATT--------------T-G--G----A-AAAAAAA---T-CTTT-ATT-TT--AGTC---C----ttaattctaatcacatctgatattgctatat
gi|15 : ttagttgttgatttaaactttttgattataaacattattggagaggtctttggagagatctgacctctcta--TGG--------AC-ATTTAA-ACTGCGTT----CCGTTTTCGATCACTC-CT-TGTGGG-TCAATTTACA-G-A-AAT-A-CTGTTTAGTTT-GTGC--A--GT---GCATTTAG----TT-CA---G-T-AAATAATTCAAA--------------TCCC---------AAA--TACATTG----T-------------G--C-----A-----A--ACTTAGCCGT----A----A-CGC--AC-A----------GC-GGCGCGTTA-T-------TG-----------------A--C--T-----A---AT---G---CAA----------------------TA-T-----CGA---------T-T--A-T-------GTA---AATGG----C-TT----------AA-----T--G------------C-----T------G------T----------------------ACA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----A
gi|16 : ggtgccttcagacctcttcatggtgcCTGCATT----CCATTTTCAACCATGC-CT-TGCGAA-TTAAATTACA-G-A-A-A-ATCAGTCAAGATT-GTGCCAT--G-TAAACAT---G----TTGAA---G-TAAAA------AAA--------------TCCC---------AAA--C----------C----------------C-----ATT---A--A-------------A----A-T-T--AT-GGCTAACTTTTAT-GGCTAG----T-------TA-----------------A--T--T-----AACTAT---G---TAAT------A--TTCTGG-G--CA-A-A-----TAGC---T-T--T-T--A-T-------GTA---AATGG----A-TT----------TA-----T--A------------T-----T------GTATTTCT------GT------G-ATA-A-GCG--TG--ATATTTG-----C------TT-A----AA-A-T-----AG--T-----CTC-----GTC-----T-G------------------------T-A----------------------------------------T----A-C----CT---GAACATGCAAA-TTTAC-CAA--C-C-CTAAAAA----CT--G--A-CT-T--TA-C-C-------Attttgccacattaaattcctttgactgtcaaagtggattagttcaatgtaatagtgtta
gi|17 : TAGTGTCTCACTAAG--AT--ACAAATGG--------GC-ATT-AAGAATACGCT----CTCTTTTTTATCATAC-CT-TTTAGG-TTAAAAAATG-G-A-A-CTA-CAGTCTAGATT-TTGC--T--GCTGCTCAT---G----AT-CA---G-T-GAA------A-------------------A---------AAA--C----------A-------------A--C-----A-----A--AC-----CA-----A----A-C-T--AT-A--------TTGC-AAC-------T-------GA-----------------AATCG-T-----A---AT---A---T------------TC----------TG-G-----GGAT-T-TAT--T-TTGA-T-------GT----AATGG----A-CT----------AC-----T--G------------T-----T------G------T------TT------G-ATA-A-GCA--GG--------------------------------A-TCA---AA--T---TATTC-----ATT-----T-atcagg
gi|18 : gctgtagtattggctgatattggagaggtagtcagatctcaacaGACTGCGTT----CCGTTTTCGAGCATGT-CA-TGCGGA-GTATATCACATC-A-A-C-A-CAAACCTGCTT-ATGA--T--GCTGCGCAT---G----TT-CA---T-T-ACA------ACA---------------CCA---------CAA--T----------T----------------C-----C-----A--AT-----CG-----ATG--A-C-TCAAC-T--------TTGC-TAG-------T-------TATTT--------------A--C--TATTGCA---AT---ATTTTAA-----------------G--TATA-T-----T----C-T-T--T-T--A-T-------GTT---AATAT----A-TC----------AA-----A--G------------T-----T------GTTTTTAT------GT------G--TT-A-GCT--TT--ATAGTTG-----C--A---TT-A----AT-A-TCA---AG--T---TATTC------CT-----T-G--A----G-AAA---A---T-TGTT-ATT-TT--AGCC---C----ATT--G----T-----T----T----A-
gi|19 : ----CTGCTTTCGATCATGTATT-TGTTGG-TAAAATTACA-G-A-A-C-A-CAGTATAGATT-GTGA--T--ACTGTATA-------------A---G-T-TAA------TTC--------------TCCA---------AAA--C----------T-------------G--------------A--AC-----TGCT---A----A-A-T--A--G--------CCGC-ACC-------T-------TACCGTATCTAATTCATTTA--C--T-----A---AT---A---TAATATTCTGG--CC-----A--TATA------------T-T-T--G-T--A-T-------GCA---AACAG----A-TA----------AATGCTGT--A------------TA----T------G------T------GT------G-ATA-----A--TG--A---TCG-----C--A---TT-A----AA-A-TGA---AA--G---TTTTG-----GTT-----T-ttta
gi|2 : caccAATGGTTGACCAGG--GT--ACG--TAG--------AC-ATTTAG-ACAGTGTT----TCGTTTTCGATCATGC--T-TATGAA-TAAAAGTACA-G-A-A-A-A-AAGTCAAGATC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CG-TA---T-T-ACT------AAA--------------TCCA---------AAA--CCCAACCACATT-------------G--C-----GAC---A--AC-----CC-----A----A-C-T--AC-G--------ATGC-GGC-------A-------TG-----------------A--CAGC-----A---AC---AC--TAC-------A--CCGTT--G--C-TA-GTTTATTAAC-T-TATG-T-T--A-TATTGTTGGCA---TATAG----T-TT----------AA-----T--ATAAATATCACATT-----T------G------T------GT------G-ACA-A-CCA--TG--ACGGTTG-----C--A---TTCA----AC-A-TTA---GA--T---AATTC-----GTT-----C------------AA---A---C-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----A----G----TATAA-T----A----A-T----GT---TAACATGCGAG-TTC-C-TGA--C-C-C----AAATT-T---G--A-TT-T--TA-----------AC-----AACTCGAC-------GGTCGTTAGGTGGAC----AT----AC----C-----TAAAC--A------A-CC----------TAA-A--TTA----ACCCTATCAGTCTAGCT--T--GGTTT-CTT---TA-CCG-TTTGG-----TTCTTTTTAAAGAAGCCAAC----GTA-TTCAA-TA-TATTGTT-TTCAACACACTACATacatgaacagacgagttt
gi|20 : cagacGTGTTTGAATAGG--TT--GCA--TGG--------GC-ACTTAG-ACTGCATT----AAGTTTC---------------TGGA-TCGAATTACA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATC-CTAC--T--GCAGTGCAT---G----CC-CA---G-T-AAA------AAA--------------TCCA---------AAA--C----------T--------------------------------------C------A----A-C-A--AT-G--------CTCT-GGC-------A-------AA-----------------A--C--T-----A--------------------------------G--CA-A-A-----TG-T-T-T-T--T-C--A-T-------GCA---AATGA----A-TG----------AA-----T--C------------T-----T------G------T------AT------TTATG-T-ACA--TGC-AT--TTG-----C--A---TT-A----AA-A-TTG---GA--T---Tgtactc
gi|21 : acaactacttattggagaggttggaaaggtctt-T--T-T--G-T-------GTA---AATGG----G-TT----------AG-----T--A------------TAGTATT------G------T------CT------T-ATA-C-GAG--TG--ATAGTT-----------------------------------------ATTC-----TTT-----T-G--GG---A-AAA---A---T-GTGC-ATT-TT--AATG---C----A----G----T-----TGCT-T----A-C----GT---GAACATGAGA---CCAC-TGA--C-C-CCGA-AA----TT--G--A-TT-T--TA-C-T-------A-------ATTATAT-------GGTCATTTGGTGTAC----GT----AC----CACCTTTCATCC-A--TTTTA-CC----------AAAGA--TAT----AACCTATTAAACTAGAT--T--GCAAA-CCG---CT-TC--TTTGGA----CTCTTTTTAAAGGAGCCAAtt
gi|22 : -T--T-C--A-T-------CTT---AATTG----A-TT----------AA--------A------------T-----T------G------T------ATTT----G--TA-A-GTA--TG--ATAATTG-----A--A---TT-A----AA-A-TTA---A---------CTC-----GTT-----G-G--G----A-AAG---A---TTCTTT-ATT-TT--AGTCACGC----GCTT-G----T-----T----T----A-C----GT---GAACATGCGAG-TAAAT-TGA--C-C-T----TA-----------A-TTGG--TG-T-T-------ATC----AATCAGAT-------GGCCATTAGTT--AC----AT----AC----CACCCTTCATAT-A--TATTA-AC----------AAA-A--TTC----ATC--ATTATA--AGCT--T--GCTGA-CTT---CA-CC--TTT
gi|23 : atattgGACTGTATT----TCGTTTCCAACAATGC-CG-TGTGGC-TTTATTTACA-G-A-AAT-G-AAGTCTAGATG-GTAC--T--GATTGGCAT---G----CG-TA---G-T-AAA------AAAAATAAATAAATTGTTTCA---------AAA--C----------T-------------AGCC-----A-----C--AC-----CG-----C----A-C-----C-A--------TCGC-GGCCAGCTGGT-------TA-----------------A--C--T-----A---AT---G---GAA-------T--CTTCTGAA--CATA-------T--C-T-A-T--T-T--A-A-------ATC---AATGA----G-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T------ATTTGTGAG-ATA-A-GCA--TG--ATAGCTA-----C--A---AT-A----Aaaa
gi|24 : aTGAA-TTAAATAACGCA-A-A-C-A-CAGTCTATATC-GTGC--T--GCTGC-TAC---G-----T-CA---C-T-G---------------------------CT---------AAA--C----------T----------------------------A--GC-----CG-----T----A-C-T--GC-A--------CCGC-GGC-------TAGTGTATTA-----------------A-----T-----A---ATGTAA---TAA-------T--TT-----GGTCAT--------CTAT-T-T-T--T-T--A-T-------GTA---A-TGG----A-TT----------AA-----C--A------------T-----T------G------T------ATTTCTATA-TTA-A-GCA--TG--TTATGTG-----C--A---TT-C----AA-A-TCA---A
gi|25 : attatacttaaatataggcatgtgttgaaacttgtcgcgaTAGTGTTTTAATAGG--AC--GTA--TGG--------GC-ATTTAA-ACTGC-TC----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTTGT-TTAAATAACA-G-G-A-
gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta------------T-----T------G------T------GT------A-ATA-A-CCA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----CA-A-ACG---AATCT---TAAGC-----AAT----------G----A-AAA---C---T-GTTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----T----T----A-T----GT---CAACAAGCGAagagccaaaaaa
gi|28 : tA-----T--A------------T-----TT-----G------T------GT------G-GTT-A-GCA--TG--ATAGATG-----C--A---TT-G----GA-A-TCA---CA--T---GCTTC-----GTT-----T-A--A----A-TAG---A----------AAT-GT--AGCC---T----A----G----T-----T----T-----------GT---TGATATGTACG-TTTAA-TGA--C-C-C----AAAACTT---G--A-TT-T--TA-C-T-------A-------ATTAGAT-------GGCCATTTGATGGAC----AA----GC----CACCCTTCATTT-A--TTTTA-AC----------AAA-A--TCA----ACCtattccggaaatatttcatcttacattaacccaattataattgatatttttacaaccattcatactaccattcttacactttgccgaatctattatta
gi|29 : attaaacttGACTGTGTA----CGGTTTTCTATCATGC-CT-TGTGGA-TATTATTACA-GAA-A-C-A-CAACCTAGACC-ATGC--TAAACTGTCCAT---G----CC-CA---G-T-AAC------AAA--------------TACA---------A---------------T-------------------------------AC-----C------A----A-T-T--TT-G--------TTTT-GGC-------T-------AA-----------------A--C--T-----A---tcacaa
gi|3 : ttataGTAGTGCTTGGCTAGG--AA--ACA--TGG--------TTTATTTAG-ACTGTGTT----TCATTTTCGATCATGC-TT-TGTGGA-TT--ATT-CG-T-T-T-T-A-CAGTCTAGACC-CTGC--T--GCTGCACAT---G----CT-CA---G-A-AAA------AAA--------------TCTA---------AAA--C----------CCAACTAGGTTGTGG--C-----AGCAGTA--AC-----CG-----C----A-C-C--AC-A--------CCGT-GGA-------T-------AG-----------------T--T--T-----A---TT---A---TAT-------T--CCAG---G--CAT----------ACAT-T-T--T-T--A-T-------ATA---AATTG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------GTAT---T------GT------G-ATATACGCA--TG--GTAGTTT-----C--A---TA-T----AA-A-TTA---GA--T---TATTC-----ATTTGTGAT-G--G----G-GAA---A---T-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----AGCCTG----T-----T----T----G-T----GT---GAACATGCAAG-TTTAG-TGA--CAC-T----AA-----------A-TT-TGGTT-T-T-------TCC--A-----------------GTCAT---GT-GAC----AA----AC----CACGAT--ACCT-A--TTTTA-CCTTCCTCCTAAAAA-A--ACA----ACCCTATGAAACTAGCT--T--GTTTA-Cgcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|30 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctac---A---T-TTTT-ATT-TC--ATTC---C----ACTTTG----T-----T----T----G-C----GT---GAACATTCAGG-TTTAC-TGA--C-A-C----------C---G--AGTT-T--GA-CAT-------AAC--C-AGTTAGAT-------GACCGTTTGATGGAC----AT----GC----TATCCTTCACCT-A--GCTTA-CC----------A-----------------------------------GCTAG-TCT---CT-AC--TTGGGA----TTATTTTTAAAGAA
gi|31 : aacagtttgcaagacggtcaatttt----G----T-----T----T----A-C----GT---GAACATGCGAGGTTTAC-TGA--C-C-C----CA--------A--A-TT-T--TA-T-T-------TCA--ACAATTTGAT-------AGTCAGTTGGTGAAC----AT----AC----TATTCTTCACCTGG--TTTTA--C----------AAG-A--T------ATCTCATT-----------------------------------TGAAT---TTTTTTTTAAAAAACCCAAC--ATGTA-TT
gi|33 : gcgttgcagttt--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----T-T--GAAAAA-AAA---A---T-CATT-A-T-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----G-CTTATGT---AAACATACA-----TATGTGA--C-C------------------------T--TA-------------C--A-AATTCAAT-------GTTCATTTGGTGGAC----AT----TC----CATCCTT---------------CC----------AA-------------------TAAGCT---T--C--ACC-A-CTT---CT-CCTTTTTGG-----TTATTTTCAAAGAAGCgtttaaagtgaatacac
gi|34 : ------------T-----T------G------C------GT------G-ATA-G-GCA--TC--ATAGCTA-----C--A---TT-A----AC-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----G-A--G----A-AAA---AC--T-ATTG-ACT-TT--AGTC---A----A----G----TTTGTCT----T----A-C----GT---TAACGTGCGAT-TTTa
gi|35 : gtaatattcagggcatatttctattatgaacaatgatctatatcgtatT-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----G-T----CTATTGAACATACAAG-TTTAC-TAG--C-C-CT---GA----C---AT-A-TT-T--GAAT-T-------ACC--A-A-TCAGAT-------GACCATTTGGTTGAC----AT----AC----C-TTCTTCACAT-A--TTTGAACC----------AAA-AA-TTA----AGCCTATAAAAATAGCT--T--GCTCA-CTT---CA-CC--TTTGGA----ATATATTTAAgtttttgtggacaaacaa
gi|36 : AT-T-C-T--T-T--A-T-------GTA---AATCA----A-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T----------------ATA-T-GTG--TT--ACAGTTG-----A--A---CG-A----AA-A-TCA---TA--T---TATT------ATT-----T-G--G-------GA---T---T-ATTT-GTT-TT--AGTA---CTGTTT----G----T-----T----T----A-T----GT---GAGCATGAAAA-TCTAC-AGACCC-C-C----AAATT-T---G--A-TT-T--TA-C-C-------Ac
gi|38 : catatattctcatat----T-----T----T----AAC----AT---GACCATGTGAG-TTAAC-TGA--C-C-C----CA----T------A-TT-T--GA-T-TT------ATC--A-A-TCAGAT-------GGACGTTTG-TGGAC----AC----AA----CATCCATGA--T-A--TTATA-CC----------AAA-A--C-------------TGAACTAGAT--T--GTTGA-CAT---TT-CC--TTTGAA----ATCCCTTg
gi|39 : tgttTTTCA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATA-GTGC--T--GCTGTGCAT---G----CT--AGATG-T-ACA------AGT--------------TCCA---------A--------------------------------------A-----A--AC-----CA-----A----A---T--AG-G--------TTGC-GAC-------T-------ata
gi|4 : tattacagatctgcagacctcgttgactgggatgcaggggtaataagaatgtGTAGTGATTAACTAGG--AT--GTT--TGG--------GC-AC--AGGATTGCGTT----TCGTTTTCAATCGTGC-AT-TGTGGA-TTAAATTACA-G-A-A-C---CAGACTGGACC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------ATA--------------TCCA---------AAAGTT----------T-------------G--C-----A-----ACCAC-----CG-----A----A-C-T--AA-G--------TTGC-GGT-------T-------CA-----------------A--C--------A---AT---A---TAA-------A--CC-----G--CATA-G-----TGAC-T-T-T--T-T--A-T-------GTA---AAT--------TT----------AA-----CCAA------------G-----T------G------T------GT------G-ATA-A-CTA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----AA-A-ACA---AA--T---TACTC-----GGT-----T-G--G----A-AAA---A---T-ATGT-ATT-TT--AGTC---T----A----G----T-----T----T----A-G----GT---GAACATGCAAC-TTTAC-TGA--C-C-C----AAAA--C---A--A-CT-T--TA-C-TG------ACCCAA-AATTCAATTTTATAGGGCCATTTGGTGGAC----AT----AC----CACCCATCATCT-A--CTTTA-CC----------TAA-T--TCA----ACCCTATTAAACTTGCT--T--ACTGA-ACT---CT-CC--TTTGGA----TACCTTTGACAGAAGTTAGC--TTATA-TTCAGCTAGTATTCCT----AA-ATAGTACATgcattag
gi|40 : TTTAGATTACGC--T-TATGGA-TAACATTACATA-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--A--ACTGCGCAT---G----CT-CA---T-T--AA------AAA--------------TCCA---------AGA--C----------a
gi|41 : gtagaccgctacatagtcttaggca-T-T-C--T-T--A-T-------TGA---AATGG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------G------TTTTTGTGT------G-ATA-A-CCA--TA--ATATATG-----C--A---TT-GTATTAA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----G-G--GT---G-AAA---A---T-CTTT-ATTATTGCAGTT---T---------G----T-----T----T----A-C----GT---GAACccagctcctttttaatgaagggaat
gi|42 : t---G--A-TT-T--TA-C-C-------A-------ATCTAAT-------GAACAGTAGGTGGAC----AT----AC----CGCCCTGCA----------TA-AA----------AAA-A--ACACACGACCCAATTGAACAAACT--T--GTTGA-CAT---CT-TC--TTTGGA----TTCTTTTTActac
gi|43 : gaccacacattt-T-------ACC--A-A-TCCAAT-------GGTCATTTGGGTGAC----AT----AC----CACC---------------TA-GT----------ATG-A----A----ACCCTCTAAAACT-----------TGA-TTT---CT------TTGGA----GTATTTTTAAAGAATCCAAC--TTGTtaa
gi|44 : tgatcccgagattgatctATCATGC-CT-TGTTGA-TTAT-TTAAA-G-A-A---A-CAGTTTAGATT-GTGC--T--GCTGGGCAC---A----CT-TA---G-T-TTA------AAA--------------CCC-----------AG--C----------T-------------G--T-----A-----A--
gi|45 : aCTGTGTT----CCATTTTCAATCATGT-CT-AGTGGA-TTAATTTACA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATT-GTGC--T--GCTGTGCAG---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------Ttatgcctaaactagccagatggaacttcaccac
gi|46 : -------GGCCATTTGGTGGAC----AG----AC----AACCTTTAACCT-A--TTTTA-TC----------AAA----------------------CTAGCT--T--GCATA-CAT---CT------TTGGA----TTCTTTTTAAAGAAGCCAA
gi|5 : AGTGGTTGATCAGGCAGCGGGCA--TCA--------GC-ATTTA-GACTGCCTT----
gi|5 : tattggaggtcttcggatctctctaaTTACA-A-A-AAC-A-CAGTCTAAATC-ATGT--T--ACTGGGCGT---A----AT-CA---G-T-ACA------AAA--------------TCCA---------AAA--CCCAATTATGTT-------------G--CGGGCTA-----A--AC-----AGCCAGCA----C-C-TC-ACAG--------TGGCTGGT-------T-------TATTT--------------A--C--T-----A---AT---G---TAAT------A--TTCTGG-G--TACA-G-----ATAT-T-T-G--T-T--A-T-------GTA---AATGA----A-TTTTTATTGCATAA-----T--T------------T-----T------G------T------GC------G-ATA-A-ATAATTACCATTGTTG-----C--A---TT-A----AA-AATCA---AA--T---TAATC-----GTA-----AAG--G----A-AAA---AG--T-CTTT-ATA-CC--AGTC---C----ATTT-G----T-----T----G----A-C----AT---GATCATGTGAG-TTTAT-T--------C----AA-----------A-TT-T---------------ACC--A-A-TCAGAT-------GAA-ATTTGGTGGAC----AT----ATATTTCATCCTTTATCT-A--TTTTA-TC-----------AA-A--CCA----ACCAAATTAAATTATATAATCAACTCA-CCC---CT-----TTTAGA--------TTTTAAAGAAACacaaaaacacagtctaaatcatgttactgggcgtaatcagtacaaaatccaaaacccaattatgttgcgggctaaacagccagcacctcacagtggctggtttatttactaatgtaatattctgggtacagatatttgttatgtaaatgaatttttattgcataattttgtgcgataaataattaccattgttgcattaaaaatcaaattaatcgtaaaggaaaaagtctttataccagtccatttgttgacatgatcatgtgagtttattcaaatttaccaatcagatgaaatttggtggacatatatttcatcctttatctattttatcaaaccaaccaaattaaattatataatcaactcaccccttttagattttaaagaaacacattg
gi|6 : tattggaggtcttcggatctctctaaagtggttgatcaggcagcgggcatcagcatttagactgcc------G------T------GT------A-ATA-A-ACA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----AG-T-TCA---AA--T---TATTC------TT-----T-G--GTA--A-AAA---G---T-GTTT-ATC-TT--AGTC---T----AGTTTG----T-----T----T----A-C----CT---GAACATGCGAA-TTTAC-T--------C----AA----CTTTG--A-TT-T--TA-C-T-------A----A------------------------GGT---C----AT----AC----CACCCAT-ATCT-ATTTTTTT-TC----------AAA-A--TCA----ACTTCTTTTAACTAGCT--T--GGTGA-CCT---CC-TT--TTTGGA----TTCTT----AATAAAACAAC--TTATacattg
gi|7 : TAGTGTTTTAATAGG--AC--GTA--TGG--------GC-ATTTAA-ACTGC-TT----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTGGT-TTAAATAACA-G-G-A---A-GAGCAAAGAT--GTGC--T--ACTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------T--A---------GAA--------------------------------------------------------------------T--AC-G--------TTGC-GGC-------T-------TA-----------------A--C--T-----A---AC-------CGC-------A--CC-----C--CACC-G-----CGAC-TAG-T--C-T--A-T-------TT----ACTGGGCATA-TT-----------G-----T--AT-----------T-----T------G------T------GC------G-AGA-A-ACA--TA--ATAGTTG-----C--G---TC-A----CA-A-TTA---AA--T---T-TGC-------------T-G--G----A-GGA---AATGT-CTTT-ATT-TT--AGTC---A----A----G----TTCGC-T----T----A-C----GT---GAAT-TGCGAT-TTTAT-T-------------------C---G--G-TC------------------------AATCAGCT-------ATCCATGTAGTGGAC----AT----A------A----TGACCT-A--TTTcgagtgctgaatcctgctatttgacctgccacttgctgaagtgccttacaatacatacatcctgtttcattggtgaaggtcatgttactaaaactagatgtggtttcccaatacgcagttatgtacacttaacaaaatataactgtcatcaatatgctactaggatataaaactgcatataccatgataaatagcattccgaatagcggtgttaatctgccacacacgtcaaaacttcatctaaaacta
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gi|20 : cagacGTGTTTGAATAGG--TT--GCA--TGG--------GC-ACTTAG-ACTGCATT----AAGTTTC---------------TGGA-TCGAATTACA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATC-CTAC--T--GCAGTGCAT---G----CC-CA---G-T-AAA------AAA--------------TCCA---------AAA--C----------T--------------------------------------C------A----A-C-A--AT-G--------CTCT-GGC-------A-------AA-----------------A--C--T-----A--------------------------------G--CA-A-A-----TG-T-T-T-T--T-C--A-T-------GCA---AATGA----A-TG----------AA-----T--C------------T-----T------G------T------AT------TTATG-T-ACA--TGC-AT--TTG-----C--A---TT-A----AA-A-TTG---GA--T---Tgtactc
gi|21 : acaactacttattggagaggttggaaaggtctt-T--T-T--G-T-------GTA---AATGG----G-TT----------AG-----T--A------------TAGTATT------G------T------CT------T-ATA-C-GAG--TG--ATAGTT-----------------------------------------ATTC-----TTT-----T-G--GG---A-AAA---A---T-GTGC-ATT-TT--AATG---C----A----G----T-----TGCT-T----A-C----GT---GAACATGAGA---CCAC-TGA--C-C-CCGA-AA----TT--G--A-TT-T--TA-C-T-------A-------A--TTAT----AT--GGTCATTTGGTGTAC----GT----AC----CACCTTTCATCC-A--TTTTA-CC----------AAAGA--TAT----AACCTATTAAACTAGAT--T--GCAAA-CCG---CT-TC--TTTGGA----CTCTTTTTAAAGGAGCCAAtt
gi|22 : -T--T-C--A-T-------CTT---AATTG----A-TT----------AA--------A------------T-----T------G------T------ATTT----G--TA-A-GTA--TG--ATAATTG-----A--A---TT-A----AA-A-TTA---A---------CTC-----GTT-----G-G--G----A-AAG---A---TTCTTT-ATT-TT--AGTCACGC----GCTT-G----T-----T----T----A-C----GT---GAACATGCGAG-TAAAT-TGA--C-C-T----TA-----------A-TTGG--TG-T-T-------A--TC--AA--TCAG----AT--GGCCATTAGTT--AC----AT----AC----CACCCTTCATAT-A--TATTA-AC----------AAA-A--TTC----ATC--ATTATA--AGCT--T--GCTGA-CTT---CA-CC--TTT
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gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta------------T-----T------G------T------GT------A-ATA-A-CCA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----CA-A-ACG---AATCT---TAAGC-----AAT----------G----A-AAA---C---T-GTTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----T----T----A-T----GT---CAACAAGCGAagagccaaaaaa
gi|28 : tA-----T--A------------T-----TT-----G------T------GT------G-GTT-A-GCA--TG--ATAGATG-----C--A---TT-G----GA-A-TCA---CA--T---GCTTC-----GTT-----T-A--A----A-TAG---A----------AAT-GT--AGCC---T----A----G----T-----T----T-----------GT---TGATATGTACG-TTTAA-TGA--C-C-C----AAAACTT---G--A-TT-T--TA-C-T-------A-------A--TTAG----AT--GGCCATTTGATGGAC----AA----GC----CACCCTTCATTT-A--TTTTA-AC----------AAA-A--TCA----ACCtattccggaaatatttcatcttacattaacccaattataattgatatttttacaaccattcatactaccattcttacactttgccgaatctattatta
gi|29 : attaaacttGACTGTGTA----CGGTTTTCTATCATGC-CT-TGTGGA-TATTATTACA-GAA-A-C-A-CAACCTAGACC-ATGC--TAAACTGTCCAT---G----CC-CA---G-T-AAC------AAA--------------TACA---------A---------------T-------------------------------AC-----C------A----A-T-T--TT-G--------TTTT-GGC-------T-------AA-----------------A--C--T-----A---tcacaa
gi|3 : ttataGTAGTGCTTGGCTAGG--AA--ACA--TGG--------TTTATTTAG-ACTGTGTT----TCATTTTCGATCATGC-TT-TGTGGA-TT--ATT-CG-T-T-T-T-A-CAGTCTAGACC-CTGC--T--GCTGCACAT---G----CT-CA---G-A-AAA------AAA--------------TCTA---------AAA--C----------CCAACTAGGTTGTGG--C-----AGCAGTA--AC-----CG-----C----A-C-C--AC-A--------CCGT-GGA-------T-------AG-----------------T--T--T-----A---TT---A---TAT-------T--CCAG---G--CAT----------ACAT-T-T--T-T--A-T-------ATA---AATTG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------GTAT---T------GT------G-ATATACGCA--TG--GTAGTTT-----C--A---TA-T----AA-A-TTA---GA--T---TATTC-----ATTTGTGAT-G--G----G-GAA---A---T-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----AGCCTG----T-----T----T----G-T----GT---GAACATGCAAG-TTTAG-TGA--CAC-T----AA-----------A-TT-TGGTT-T-T-------T--CCA------------------GTCAT---GT-GAC----AA----AC----CACGAT--ACCT-A--TTTTA-CCTTCCTCCTAAAAA-A--ACA----ACCCTATGAAACTAGCT--T--GTTTA-Cgcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|30 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctac---A---T-TTTT-ATT-TC--ATTC---C----ACTTTG----T-----T----T----G-C----GT---GAACATTCAGG-TTTAC-TGA--C-A-C----------C---G--AGTT-T--GA-CAT-------A--ACC-AG--TTAG----AT--GACCGTTTGATGGAC----AT----GC----TATCCTTCACCT-A--GCTTA-CC----------A-----------------------------------GCTAG-TCT---CT-AC--TTGGGA----TTATTTTTAAAGAA
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Reference ( family-1148 ) : GTAGTGNTTGANTAGG--AC--GCA--TGG--------GC-ATTTAGGACTGCGTT----CCGTTTTCGATCATGC-CT-TGTGGA-TTAAATTACA-G-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------TCCA---------AAA--C----------T-------------G--C-----A-----A--AC-----CG-----A----A-C-T--AC-G--------TTGC-GGC-------T-------TA-----------------A--C--T-----A---AT---A---TAA-------A--CC-----G--CATA-G-----TGAC-T-T-T--T-T--A-T-------GTA---AATGG----A-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T------GT------G-ATA-A-GCA--TG--ATAGTTG-----C--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----T-G--G----A-AAA---A---T-CTTT-ATT-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----A-C----GT---GAACATGCGAG-TTTAC-TGA--C-C-C----AA----C---G--A-TT-T--TA-C-T-------A--CCA-AA--TCAG----AT--GGCCATTTGGTGGAC----AT----AC----CACCCTTCACCT-A--TTTTA-CC----------AAA-A--TCA----ACCCTATTAAACTAGCT--T--GCTGA-CCT---CT-CC--TTTGGA----TTCTTTTTAAAGAAGCCAAC--TTGTA-TTCAA-TA-TATTNTTGTTCAACACANTACAT
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gi|11 : gctgggaaatcatcagATGC-GT-TGTGAA-ATAAATTACATA-A-A-T-A-CACTCCAG--C--TAC--T--G-TGAGCAT---A----CC-AG---G-T-AAA------AAA--------------atca
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gi|15 : ttagttgttgatttaaactttttgattataaacattattggagaggtctttggagagatctgacctctcta--TGG--------AC-ATTTAA-ACTGCGTT----CCGTTTTCGATCACTC-CT-TGTGGG-TCAATTTACA-G-A-AAT-A-CTGTTTAGTTT-GTGC--A--GT---GCATTTAG----TT-CA---G-T-AAATAATTCAAA--------------TCCC---------AAA--TACATTG----T-------------G--C-----A-----A--ACTTAGCCGT----A----A-CGC--AC-A----------GC-GGCGCGTTA-T-------TG-----------------A--C--T-----A---AT---G---CAA----------------------TA-T-----CGA---------T-T--A-T-------GTA---AATGG----C-TT----------AA-----T--G------------C-----T------G------T----------------------ACA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----A
gi|16 : ggtgccttcagacctcttcatggtgcCTGCATT----CCATTTTCAACCATGC-CT-TGCGAA-TTAAATTACA-G-A-A-A-ATCAGTCAAGATT-GTGCCAT--G-TAAACAT---G----TTGAA---G-TAAAA------AAA--------------TCCC---------AAA--C----------C----------------C-----ATT---A--A-------------A----A-T-T--AT-GGCTAACTTTTAT-GGCTAG----T-------TA-----------------A--T--T-----AACTAT---G---TAAT------A--TTCTGG-G--CA-A-A-----TAGC---T-T--T-T--A-T-------GTA---AATGG----A-TT----------TA-----T--A------------T-----T------GTATTTCT------GT------G-ATA-A-GCG--TG--ATATTTG-----C------TT-A----AA-A-T-----AG--T-----CTC-----GTC-----T-G------------------------T-A----------------------------------------T----A-C----CT---GAACATGCAAA-TTTAC-CAA--C-C-CTAAAAA----CT--G--A-CT-T--TA-C-C--------------AA--TCAG----ttttgccacattaaattcctttgactgtcaaagtggattagttcaatgtaatagtgtta
gi|17 : TAGTGTCTCACTAAG--AT--ACAAATGG--------GC-ATT-AAGAATACGCT----CTCTTTTTTATCATAC-CT-TTTAGG-TTAAAAAATG-G-A-A-CTA-CAGTCTAGATT-TTGC--T--GCTGCTCAT---G----AT-CA---G-T-GAA------A-------------------A---------AAA--C----------A-------------A--C-----A-----A--AC-----CA-----A----A-C-T--AT-A--------TTGC-AAC-------T-------GA-----------------AATCG-T-----A---AT---A---T------------TC----------TG-G-----GGAT-T-TAT--T-TTGA-T-------GT----AATGG----A-CT----------AC-----T--G------------T-----T------G------T------TT------G-ATA-A-GCA--GG--------------------------------A-TCA---AA--T---TATTC-----ATT-----T-g
gi|18 : gctgtagtattggctgatattggagaggtagtcagatctcaacaGACTGCGTT----CCGTTTTCGAGCATGT-CA-TGCGGA-GTATATCACATC-A-A-C-A-CAAACCTGCTT-ATGA--T--GCTGCGCAT---G----TT-CA---T-T-ACA------ACA---------------CCA---------CAA--T----------T----------------C-----C-----A--AT-----CG-----ATG--A-C-TCAAC-T--------TTGC-TAG-------T-------TATTT--------------A--C--TATTGCA---AT---ATTTTAA-----------------G--TATA-T-----T----C-T-T--T-T--A-T-------GTT---AATAT----A-TC----------AA-----A--G------------T-----T------GTTTTTAT------GT------G--TT-A-GCT--TT--ATAGTTG-----C--A---TT-A----AT-A-TCA---AG--T---TATTC------CT-----T-G--A----G-AAA---A---T-TGTT-ATT-TT--AGCC---C----ATT--G----T-----T----T----A-
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gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta------------T-----T------G------T------GT------A-ATA-A-CCA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----CA-A-ACG---AATCT---TAAGC-----AAT----------G----A-AAA---C---T-GTTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----T----T----A-T----GT---CAACAAGCGAagagccaaaaaa
gi|28 : tA-----T--A------------T-----TT-----G------T------GT------G-GTT-A-GCA--TG--ATAGATG-----C--A---TT-G----GA-A-TCA---CA--T---GCTTC-----GTT-----T-A--A----A-TAG---A----------AAT-GT--AGCC---T----A----G----T-----T----T-----------GT---TGATATGTACG-TTTAA-TGA--C-C-C----AAAACTT---G--A-TT-T--TA-C-T-------A-------A--TTAG----AT--GGCCATTTGATGGAC----AA----GC----CACCCTTCATTT-A--TTTTA-AC----------AAA-A--TCA----ACCtattccggaaatatttcatcttacattaacccaattataattgatatttttacaaccattcatactaccattcttacactttgccgaatctattatta
gi|29 : attaaacttGACTGTGTA----CGGTTTTCTATCATGC-CT-TGTGGA-TATTATTACA-GAA-A-C-A-CAACCTAGACC-ATGC--TAAACTGTCCAT---G----CC-CA---G-T-AAC------AAA--------------TACA---------A---------------T-------------------------------AC-----C------A----A-T-T--TT-G--------TTTT-GGC-------T-------AA-----------------A--C--T-----A---tcacaa
gi|3 : ttataGTAGTGCTTGGCTAGG--AA--ACA--TGG--------TTTATTTAG-ACTGTGTT----TCATTTTCGATCATGC-TT-TGTGGA-TT--ATT-CG-T-T-T-T-A-CAGTCTAGACC-CTGC--T--GCTGCACAT---G----CT-CA---G-A-AAA------AAA--------------TCTA---------AAA--C----------CCAACTAGGTTGTGG--C-----AGCAGTA--AC-----CG-----C----A-C-C--AC-A--------CCGT-GGA-------T-------AG-----------------T--T--T-----A---TT---A---TAT-------T--CCAG---G--CAT----------ACAT-T-T--T-T--A-T-------ATA---AATTG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------GTAT---T------GT------G-ATATACGCA--TG--GTAGTTT-----C--A---TA-T----AA-A-TTA---GA--T---TATTC-----ATTTGTGAT-G--G----G-GAA---A---T-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----AGCCTG----T-----T----T----G-T----GT---GAACATGCAAG-TTTAG-TGA--CAC-T----AA-----------A-TT-TGGTT-T-T-------T--CCA------------------GTCAT---GT-GAC----AA----AC----CACGAT--ACCT-A--TTTTA-CCTTCCTCCTAAAAA-A--ACA----ACCCTATGAAACTAGCT--T--GTTTA-Cgcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|30 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctac---A---T-TTTT-ATT-TC--ATTC---C----ACTTTG----T-----T----T----G-C----GT---GAACATTCAGG-TTTAC-TGA--C-A-C----------C---G--AGTT-T--GA-CAT-------A--ACC-AG--TTAG----AT--GACCGTTTGATGGAC----AT----GC----TATCCTTCACCT-A--GCTTA-CC----------A-----------------------------------GCTAG-TCT---CT-AC--TTGGGA----TTATTTTTAAAGAA
gi|31 : aacagtttgcaagacggtcaatttt----G----T-----T----T----A-C----GT---GAACATGCGAGGTTTAC-TGA--C-C-C----CA--------A--A-TT-T--TA-T-T-------T--CAACAA--TTTG----AT--AGTCAGTTGGTGAAC----AT----AC----TATTCTTCACCTGG--TTTTA--C----------AAG-A--T------ATCTCATT-----------------------------------TGAAT---TTTTTTTTAAAAAACCCAAC--ATGTA-TT
gi|33 : gcgttgcagttt--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----T-T--GAAAAA-AAA---A---T-CATT-A-T-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----G-CTTATGT---AAACATACA-----TATGTGA--C-C------------------------T--TA---------------CA-AA--TTCA----AT--GTTCATTTGGTGGAC----AT----TC----CATCCTT---------------CC----------AA-------------------TAAGCT---T--C--ACC-A-CTT---CT-CCTTTTTGG-----TTATTTTCAAAGAAGCgtttaaagtgaatacac
gi|34 : ------------T-----T------G------C------GT------G-ATA-G-GCA--TC--ATAGCTA-----C--A---TT-A----AC-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----G-A--G----A-AAA---AC--T-ATTG-ACT-TT--AGTC---A----A----G----TTTGTCT----T----A-C----GT---TAACGTGCGAT-TTTa
gi|35 : gtaatattcagggcatatttctattatgaacaatgatctatatcgtatT-TT--AGTC---C----A----G----T-----T----T----G-T----CTATTGAACATACAAG-TTTAC-TAG--C-C-CT---GA----C---AT-A-TT-T--GAAT-T-------A--CCA-A---TCAG----AT--GACCATTTGGTTGAC----AT----AC----C-TTCTTCACAT-A--TTTGAACC----------AAA-AA-TTA----AGCCTATAAAAATAGCT--T--GCTCA-CTT---CA-CC--TTTGGA----ATATATTTAAgtttttgtggacaaacaa
gi|36 : AT-T-C-T--T-T--A-T-------GTA---AATCA----A-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T----------------ATA-T-GTG--TT--ACAGTTG-----A--A---CG-A----AA-A-TCA---TA--T---TATT------ATT-----T-G--G-------GA---T---T-ATTT-GTT-TT--AGTA---CTGTTT----G----T-----T----T----A-T----GT---GAGCATGAAAA-TCTAC-AGACCC-C-C----AAATT-T---G--A-TT-T--TA-C-C-------A--c
gi|38 : catatattctcatat----T-----T----T----AAC----AT---GACCATGTGAG-TTAAC-TGA--C-C-C----CA----T------A-TT-T--GA-T-TT------A--TCA-A---TCAG----AT--GGACGTTTG-TGGAC----AC----AA----CATCCATGA--T-A--TTATA-CC----------AAA-A--C-------------TGAACTAGAT--T--GTTGA-CAT---TT-CC--TTTGAA----ATCCCTTg
gi|39 : tgttTTTCA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATA-GTGC--T--GCTGTGCAT---G----CT--AGATG-T-ACA------AGT--------------TCCA---------A--------------------------------------A-----A--AC-----CA-----A----A---T--AG-G--------TTGC-GAC-------T-------ata
gi|4 : tattacagatctgcagacctcgttgactgggatgcaggggtaataagaatgtGTAGTGATTAACTAGG--AT--GTT--TGG--------GC-AC--AGGATTGCGTT----TCGTTTTCAATCGTGC-AT-TGTGGA-TTAAATTACA-G-A-A-C---CAGACTGGACC-GTGC--T--GCTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------ATA--------------TCCA---------AAAGTT----------T-------------G--C-----A-----ACCAC-----CG-----A----A-C-T--AA-G--------TTGC-GGT-------T-------CA-----------------A--C--------A---AT---A---TAA-------A--CC-----G--CATA-G-----TGAC-T-T-T--T-T--A-T-------GTA---AAT--------TT----------AA-----CCAA------------G-----T------G------T------GT------G-ATA-A-CTA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----AA-A-ACA---AA--T---TACTC-----GGT-----T-G--G----A-AAA---A---T-ATGT-ATT-TT--AGTC---T----A----G----T-----T----T----A-G----GT---GAACATGCAAC-TTTAC-TGA--C-C-C----AAAA--C---A--A-CT-T--TA-C-T-------GACCCA-AAATTCAATTTTATAGGGCCATTTGGTGGAC----AT----AC----CACCCATCATCT-A--CTTTA-CC----------TAA-T--TCA----ACCCTATTAAACTTGCT--T--ACTGA-ACT---CT-CC--TTTGGA----TACCTTTGACAGAAGTTAGC--TTATA-TTCAGCTAGTATTCCT----AA-ATAGTACATgcattag
gi|40 : TTTAGATTACGC--T-TATGGA-TAACATTACATA-A-A-C-A-CAGTCTAGATC-GTGC--A--ACTGCGCAT---G----CT-CA---T-T--AA------AAA--------------TCCA---------AGA--C----------a
gi|41 : gtagaccgctacatagtcttaggca-T-T-C--T-T--A-T-------TGA---AATGG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------G------TTTTTGTGT------G-ATA-A-CCA--TA--ATATATG-----C--A---TT-GTATTAA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTT-----G-G--GT---G-AAA---A---T-CTTT-ATTATTGCAGTT---T---------G----T-----T----T----A-C----GT---GAACccagctcctttttaatgaagggaat
gi|42 : t---G--A-TT-T--TA-C-C-------A-------A--TCTA----AT--GAACAGTAGGTGGAC----AT----AC----CGCCCTGCA----------TA-AA----------AAA-A--ACACACGACCCAATTGAACAAACT--T--GTTGA-CAT---CT-TC--TTTGGA----TTCTTTTTActac
gi|43 : gaccacacattt-T-------A--CCA-A---TCCA----AT--GGTCATTTGGGTGAC----AT----AC----CACC---------------TA-GT----------ATG-A----A----ACCCTCTAAAACT-----------TGA-TTT---CT------TTGGA----GTATTTTTAAAGAATCCAAC--TTGTtaa
gi|44 : tgatcccgagattgatctATCATGC-CT-TGTTGA-TTAT-TTAAA-G-A-A---A-CAGTTTAGATT-GTGC--T--GCTGGGCAC---A----CT-TA---G-T-TTA------AAA--------------CCC-----------AG--C----------T-------------G--T-----A-----A--
gi|45 : aCTGTGTT----CCATTTTCAATCATGT-CT-AGTGGA-TTAATTTACA-G-A-AAC-A-CAGTCTAGATT-GTGC--T--GCTGTGCAG---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------Ttatgcctaaactagccagatggaacttcaccac
gi|46 : --GGCCATTTGGTGGAC----AG----AC----AACCTTTAACCT-A--TTTTA-TC----------AAA----------------------CTAGCT--T--GCATA-CAT---CT------TTGGA----TTCTTTTTAAAGAAGCCAA
gi|5 : AGTGGTTGATCAGGCAGCGGGCA--TCA--------GC-ATTTA-GACTGCCTT----
gi|5 : tattggaggtcttcggatctctctaaTTACA-A-A-AAC-A-CAGTCTAAATC-ATGT--T--ACTGGGCGT---A----AT-CA---G-T-ACA------AAA--------------TCCA---------AAA--CCCAATTATGTT-------------G--CGGGCTA-----A--AC-----AGCCAGCA----C-C-TC-ACAG--------TGGCTGGT-------T-------TATTT--------------A--C--T-----A---AT---G---TAAT------A--TTCTGG-G--TACA-G-----ATAT-T-T-G--T-T--A-T-------GTA---AATGA----A-TTTTTATTGCATAA-----T--T------------T-----T------G------T------GC------G-ATA-A-ATAATTACCATTGTTG-----C--A---TT-A----AA-AATCA---AA--T---TAATC-----GTA-----AAG--G----A-AAA---AG--T-CTTT-ATA-CC--AGTC---C----ATTT-G----T-----T----G----A-C----AT---GATCATGTGAG-TTTAT-T--------C----AA-----------A-TT-T---------------A--CCA-A---TCAG----AT--GAA-ATTTGGTGGAC----AT----ATATTTCATCCTTTATCT-A--TTTTA-TC-----------AA-A--CCA----ACCAAATTAAATTATATAATCAACTCA-CCC---CT-----TTTAGA--------TTTTAAAGAAACacaaaaacacagtctaaatcatgttactgggcgtaatcagtacaaaatccaaaacccaattatgttgcgggctaaacagccagcacctcacagtggctggtttatttactaatgtaatattctgggtacagatatttgttatgtaaatgaatttttattgcataattttgtgcgataaataattaccattgttgcattaaaaatcaaattaatcgtaaaggaaaaagtctttataccagtccatttgttgacatgatcatgtgagtttattcaaatttaccaatcagatgaaatttggtggacatatatttcatcctttatctattttatcaaaccaaccaaattaaattatataatcaactcaccccttttagattttaaagaaacacattg
gi|6 : tattggaggtcttcggatctctctaaagtggttgatcaggcagcgggcatcagcatttagactgcc------G------T------GT------A-ATA-A-ACA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----AG-T-TCA---AA--T---TATTC------TT-----T-G--GTA--A-AAA---G---T-GTTT-ATC-TT--AGTC---T----AGTTTG----T-----T----T----A-C----CT---GAACATGCGAA-TTTAC-T--------C----AA----CTTTG--A-TT-T--TA-C-T-------A------------AG----GT----------------C----AT----AC----CACCCAT-ATCT-ATTTTTTT-TC----------AAA-A--TCA----ACTTCTTTTAACTAGCT--T--GGTGA-CCT---CC-TT--TTTGGA----TTCTT----AATAAAACAAC--TTATacattg
gi|7 : TAGTGTTTTAATAGG--AC--GTA--TGG--------GC-ATTTAA-ACTGC-TT----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTGGT-TTAAATAACA-G-G-A---A-GAGCAAAGAT--GTGC--T--ACTGCGCAT---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------T--A---------GAA--------------------------------------------------------------------T--AC-G--------TTGC-GGC-------T-------TA-----------------A--C--T-----A---AC-------CGC-------A--CC-----C--CACC-G-----CGAC-TAG-T--C-T--A-T-------TT----ACTGGGCATA-TT-----------G-----T--AT-----------T-----T------G------T------GC------G-AGA-A-ACA--TA--ATAGTTG-----C--G---TC-A----CA-A-TTA---AA--T---T-TGC-------------T-G--G----A-GGA---AATGT-CTTT-ATT-TT--AGTC---A----A----G----TTCGC-T----T----A-C----GT---GAAT-TGCGAT-TTTAT-T-------------------C---G--G-TC------------------------AA--TCAG----CT--ATCCATGTAGTGGAC----AT----A------A----TGACCT-A--TTTcgagtgctgaatcctgctatttgacctgccacttgctgaagtgccttacaatacatacatcctgtttcattggtgaaggtcatgttactaaaactagatgtggtttcccaatacgcagttatgtacacttaacaaaatataactgtcatcaatatgctactaggatataaaactgcatataccatgataaatagcattccgaatagcggtgttaatctgccacacacgtcaaaacttcatctaaaacta
gi|8 : aatgaaagataacaagtattcgcattggtttcggtttgctagtattacattaaaataggaaactgtataactaactggagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatctttaAATAAG--AC--GCA--TGGTCCTAGTTAC-AGTTAG-ACTGTGTT----CCGTTTTCGGTCATGA-AT-TGTGGAATTATAT-ACA-A-A-AAT-A-CACTTCAGACA-GTGT--T--GCTGAGCAT---G-----T-CG---G-T-AAA------AAA--------------ATCA---------AAA--T--------------------------------------------------------A----A-T-T--------------TTGCCGGC-------T-------GC-----------------A--T--T-----A---A----A---T-------------------G--CATA-------TAA----T-T--T-T--A-C--------------ATG------------------------------------------------T------G------T------GT------G-ACA-G-GTAGTTG--CTGATTT-----C--A---TA-A----AA-A-TCA---AA--T---AATC--------T-----T-G--C----------------T-GTTTGATT-GT--AATC---C----ATATTG----T-----T----T----A-T----AA---GAACATTTGAG-TTGAC-TAG--C-C---------------------TC-T--TA-C-TGGATTTAA--CCA-A---TCAA----AT--GGACATTTGGTGT-C----GT----AC----CACCAACCACTT-A--TCTTA-CT----------AAA-A--TC-------------AAACAAGTT--T--AC-GA-CCA---CC-CT--ATTAGA----ATCTTGTTACAGAAACCAAC--TTG---TCCAA-Tc
gi|9 : gtaattaaTTACA-G-A-AAC-A-CAATCTAGACT-GTGC--T--GCTACATTT---G----CT-CA---G-T-AAA------AAA--------------TCCA---------A----C----------C----------------C-----A-----G--TC-----CC-----A--------T--AG-T--------TTA------------T-------TA-----------------A--C--T-----A---AT---G---TAAT------A--TTCTGA-G--CATA-------T-AT-T-TAT--T-T--A-C-------GTA---AATAT------TT----------GA-----T---------------T-----T------G------T------GT------G-GTA-A-GTG--CG--ATAAT-G-----C--AATGTT-A----AA-A-ACA---AA--T---TATTT-----ACT-----G-G--G----A-AAA---A---AACTTT-ATT-CT--AGTC---C----A----A----T-----T----T-----------GT-----ACATGCATG-TTTAC-TAAG-C-C-CA---AA----T---GTCA-TT-T--TG-C-C--------------AA--TCAG----AC--GATAACTTGGTGAAT----AT----AC----TTCCATTCACAT-A---TTTA-CC----------AAA-AATTTATTT-ACCATGTTAAAATAACT--G--ACCAA-GCTAACTT-CC--TCTGTA----TT-TTTTTCAAG--GTCAACATTTATACCTTAT-TA-TATTATtgacgggtacttct
blockSeqs : G C CAGCGG AA TCCTAGTT T G G AT A A T A . TC T CA CA AA TTA C G GAT . A TAATTC TCCAAAACCCAATTATGTTGCGGGCTAAACAGCCAGCACCTCACAGTGGCTGGTTTATTTACTAATGTAATATTCTGGGTACAGATAT A A GT A TG C ATTGTTG ACAT GGCATA AATATAAATATCACAT AGTAT ATATTT TGTTTGTGA T TAC AT CC GCTAG TG ATG C TATT T A TTT TC AAT CAAATAG TGTGAT . AAAAA AAA ATGTC G A TG CTGTT GCCT ACTG TTGTC CCGT GTTT CTTAT ATT GG G GACC A T AAAACAACTTTACTGACCCAAAAT TTTT AG T TTGA TTGA ATTT C C AT G TTT AC TTCCTCCTAA G ATTTATTT CTA AA CA TG C AAC CCTT TTTT T ATT AC GCTAGT T G C . G
blockSeqs : T C AC . . . G . G . . T . . AT . C G . . C . . . . . AATAAATAAATTGTTTCAAAACTAGCCACACCGCACCATCGCGGCCAGCTGGTTAACTAATGGAATCTTCTGAACATATC . A G . . . T A GA TTTATTGCATAATT A T TATTTCTGT . G GT C . . . . . . . . . . AG AA . TAA . TTC . . GC ACGC CTTT . ATAA GCT . AC . G . GAC . . AACCTTGAATTTACCGATCTAA . . C . . . C T CA . T C . . ACACACG CTT . . TG . . ATC T C T T ATAT G . .
blockSeqs : G C AT . . . G . C . . C . . CT . T . . . T . . . . . TCCAAAACCCAACCACATTGCGACAACCCAACTACGATGCGGCATGACAGCAACACTACACCGTTGCTAGTTTATTAAC . A . . . . . A CA AATGCTGTA . . TTTTTATGT . C . . . . . . . . . . . . CG G . AT . CTA . . . T GTTT . TCGC . . T . A . AAG . . TGACATATTTGAATTACCAA . . T . . . C A CA . T C . . ATCA CTA . . TT . . CCG . G A A TTAT C .
blockSeqs : T A GT . . . G . C . . T . . AC . T . . . T . . . . . TCCAAAACTGAACTGCTAAATAGCCGCACCTTACCGTATCTAATTCATTTACTAATATAATATTCTGGCCATATA . . . . . . . A GA AACCAA . . TATTTGTGA . A . . . . . . . . . . . . TG T . GG . GTC . . . T TATT . . . . T . A . GA . . TAAAATCTGATTTAATCAA . . T . . . C C AC . T A . . ATTA CTA . . AA . . CA . C T A . A
blockSeqs : T A TT . . . G . C . . . . . AT . T . . . A . . . . . TCTAAAACCCAACTAGGTTGTGGCAGCAGTAACCGCACCACACCGTGGATAGTTTATTATATTCCAGGCATACA . . . . . . . A AA TAATA . . TATTTCTAT . A . . . . . . . . . . . . CG T . GA . AAC . . . C CTT . . . . T . G . GA . . TAAAAACTGACTTTACCAA . . C . . . C C TC . T C . . TCA CTA . . TG . . CC . C A A
blockSeqs : C C AC . . . G . C . . . . . AC . T . . . T . . . . . TCCCAAACCCATTAAAATTATGGCTAACTTTTATGGCTAGTTAATTAACTATGTAATATTCTGGGCAAATAGC . . . . . . . A GC AATA . . TTTTTGTGT . T . . . . . . . . . . . . CA T . TG . TC . . . T TTT . . . . C . G . AA . . TCTTACTGGATTTAACCAA . . C . . . C C TA . T C . . TTA CTA . . TT . . TC . A T .
blockSeqs : A C AA . . . . . C . . . . . AC . T . . . C . . . . . TCCCAAATACATTGTGCAAACTTAGCCGTAACGCACAGCGGCGCGTTATTGACTAATGCAATATCGA . . . . . . . T GA AACG . . TATTGT . A . . . . . . . . . . . . GG T . A . TC . . . C TT . . . . T . G . GA . . AAATTTGATTTTAACAAC . . T . . . T C TT . T A . . TAT TCA . . TA . . CC . T T
blockSeqs : G T AT . . . . . C . . . . . AC . T . . . C . . . . . CCACAATTCCAATCGATGACTCAACTTTGCTAGTTATTTACTATTGCAATATTTTAAGTATATT . . . . . . . A GA AATA . . TATTT . A . . . . . . . . . . . . CG T . A . TT . . . C . . . . . C . G . GA . . CGAAATTGATTTTACTAA . . C . . . T C CC . T A . . TTC CTA . . TC . . AC . A T
blockSeqs : T A AC . . . . . A . . . . . AT . C . . . C . . . . . CTAAACTAGCCGTACTGCACCGCGGCTAGTGTATTAATAATGTAATAATTTGGTCATCTAT . . . . . . . A TA AATG . . TGT . A . . . . . . . . . . . . CT T . G . TC . . . C . . . . . C . G . GA . . AAAACTTGATTTTACTAA . . T . . . T C CC . G C . . TCA CTA . . TG . . CC . A T
blockSeqs : A AC . . . . . C . . . . . AC . C . . . C . . . . . TCCAAAAGTTTGCAACCACCGAACTAAGTTGCGGTTCAACAATATAAACCGCATAGTGAC . . . . . . . A GA TATA . . TGC . A . . . . . . . . . . . . CG T . A . TT . . . C . . . . . T . T . GA . . CGAGTTTGACATAACCAG . . T . . . T G CC . T C . . ACA CAA . . TG . . CC . C .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . T . G . . . C . . . . . GCTGGCACTGTACGATAGCTAGTGTATCTACTAATATAATATCCTGGGCATAATT . . . . . . . A GT ACTG . . TAT . T . . . . . . . . . . . . CA T . A . CC . . . T . . . . . T . G . GA . . CAAATTTTATTTCAACAA . . C . . . T C CA . T C . . TCA CTC . . TG . . CC . C
blockSeqs : . . A . . . . . A . C . . . C . . . . . AAAACAACAAACCAAACTATATTGCAACTGAAATCGTAATATTCTGGGGAT . . . . . . . T AA AAAG . . TTT . C . . . . . . . . . . . . CG C . A . TG . . . T . . . . . C . A . GA . . CATATTTGATTTATCAA . . A . . . C C TC . T C . . CCA AAA . . TG . . TC . C
blockSeqs : . . C . . . . . C . C . . . C . . . . . TCCAACCCAGTCCCATAGTTTATTAACTAATGTAATATTCTGAGCATATAT . . . . . . . C GG AATC . . TGT . A . . . . . . . . . . . . CA T . G . TG . . . C . . . . . C . G . GA . . AAATGTCATTTTGCCAA . . C . . . C A CC . C C . . TCA TCT . . AT . . TT . A
blockSeqs : . . C . . . . . C . C . . . C . . . . . TTACAAACCAAAACAATGTTGTGGCTTAGCTAACTGGACTGCGGCAAG . . . . . . . A GA AGTA . . TGT . A . . . . . . . . . . . . CG G . A . TC . . . C . . . . . C . C . GA . . TAATTGGTGTTATCAA . . A . . . C T TC . T A . . AA ATG . . TC . . CT . C
blockSeqs : . A . . . . . A . A . . . C . . . . . TAGAATACGTTGCGGCTTAACTAACCGCACCCCACCGCGAC . . . . . . . A AG AATA . . TAT . A . . . . . . . . . . . . CG T . A . TT . . . C . . . . . T . G . AG . . AAATTTGGTTTTTCCA . . T . . . C G TC . T G . . TC A . . TG . . CC . C
blockSeqs : . A . . . . . C . C . . . C . . . . . TCCAAAACTCAACAATGCTCTGGCAAAACTAGCAAATGT . . . . . . . A GA AACA . . TCT . A . . . . . . . . . . . . CG T . A . TC . . . A . . . . . T . A . GA . . AACTTTGATTTTACTA . . C . . . T C CC . T T . . T . . . CA . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . C . C . . . A . . . . . ATCAAAATAATTTTGCCGGCTGCATTAAATGCATATAA . . . . . . . A GA AAAA . . TGT . A . . . . . . . . . . . . CG G . A . TA . . . C . . . . . G . T . GA . . AAAATACGATTATCC . . A . . . C C CT . T T . . C . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . T . . . C . . . . . . . . . . . . A AA AATA . . TGT . G . . . . . . . . . . . . CG T . A . TA . . . T . . . . . C . G . AG . . AAATTTACCAA . . C . . . C . CA . . T . . A . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . T . . . C . . . . . . . . . . . . A GA AAAA . . CGT . T . . . . . . . . . . . . TA T . . . TC . . . T . . . . . C . G . . . . TTACAAA . . A . . . C . . . . C . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . . A AA GTAT . . TGT . A . . . . . . . . . . . . C G . . . TG . . . C . . . . . C . . . . . . CGGTCAA . . T . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T AAA . . TGC . A . . . . . . . . . . . . A T . . . TG . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . TGT . A . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . TGC . A . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TGT . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . TGT . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . .
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|22 : -T--T-C--A-T-------CTT---AATTG----A-TT----------AA--------A------------T-----T------G------T------ATTT----G--TA-A-GTA--TG--ATAATTG-----A--A---TT-A----AA-A-TTA---A---------CTC-----GTTG-G-----G----A-AAG---A---TTCTTT-ATT-TT--AGTCACGC----GCTT-G----T-----T---T----A-C----GT---GAACATGCGAG-TAAATTGA-CCT-TAA-----TTGGTGTTA-----TCAA---TCAG----AT--GGCCATTAGTT---AC----AT----AC----CACCCTTCATAT-A--TATT-AAC----------AAA-A--TTC----ATC--ATTATA--AGCT--T--GCTGA-CTT---CA-CC--TTT
gi|23 : atattgGACTGTATT----TCGTTTCCAACAATGC-CG-TGTGGC-TTTATTTACAGAAATG-AAGTCTAGATG-GTAC--T--GATTGGCAT---GC----G-TA---GT-AAA------AAAAATAAATAAATTGTTTCAA---------AA--C----------T----------------AGCC-----A----C--AC-----CG-----C----A-C-----C-A--------TCGC-GGCCAGCTGGT----TA-----------------A--C--T-----A---AT---G---GAA-------T--CTTCTGAA--CATA-------T--C-T-A-T--T-T--A-A-------ATC---AATGA----G-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T------ATTTGTGAG-ATA-A-GCA--TG--ATAGCTA-----C--A---AT-A----Aaaa
gi|24 : aTGAA-TTAAATAACGCAAACA-CAGTCTATATC-GTGC--T--GCTGC-TAC---G-----T-CA---CT-G---------------------------CTA---------AA--C----------T------------------------------A--GC-----CG-----T----A-C-T--GC-A--------CCGC-GGCTAGTGTAT----TA-----------------A-----T-----A---ATGTAA---TAA-------T--TT-----GGTCAT--------CTAT-T-T-T--T-T--A-T-------GT----AATGG----A-TT----------AA-----C--A------------T-----T------GTATTTCT------AT------A-TTA-A-GCA--TG--TTATGTG-----C--A---TT-C----AA-A-TCA---A
gi|25 : attatacttaaatataggcatgtgttgaaacttgtcgcgaTAGTGTTTTAATAGG--AC--GTA--TGG--------GC-ATTTAA-ACTGC-TC----CCGGCTTCGATCATGC-AT-TGTTGT-TTAAATAACAGGAA
gi|27 : aatgaaagataacaagtattcgcaatggtttcggtttgctagtataacattaaaataggaaactatataactaacttgagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatattta------------T-----T------G------T------GT------A-ATA-A-CCA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----CA-A-ACG---AATCT---TAAGC-----AAT--------G----A-AAA---C---T-GTTC-TTT-CC--GGTT---T----A----A----T-----T---T----A-T----GT---CAACAAGCGAT-ATTCCGGA-----AAT---ATTTCATCTTA-----Cgagccaaaaaa
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gi|29 : attaaacttGACTGTGTA----CGGTTTTCTATCATGC-CT-TGTGGA-TATTATTACAGAAACA-CAACCTAGACC-ATGC--TAAACTGTCCAT---GC----C-CA---GT-AAC------AAA--------------TACAA------------------------T---------------------------------AC-----C------A----A-T-T--TT-G--------TTTT-GGC-------T----AA-----------------A--C--T-----A---tcacaa
gi|3 : ttataGTAGTGCTTGGCTAGG--AA--ACA--TGG--------TTTATTTAG-ACTGTGTT----TCATTTTCGATCATGC-TT-TGTGGA-TTA--TT-C-GTTTTA-CAGTCTAGACC-CTGC--T--GCTGCACAT---GC----T-CA---GA-AAA------AAA--------------TCTAA---------AA--C----------CCAACTAGGTTGTGGCAG--C-----AGT--A--AC-----CG-----C----A-C-C--AC-A--------CCGT-GGA-------T----AG-----------------T--T--T-----A---TT---A---TAT-------T--CCAG---G--CATA----------CAT-T-T--T-T--A-T-------ATA---AATTG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------G------TATT---GT------G-ATATACGCA--TG--GTAGTTT-----C--A---TA-T----AA-A-TTA---GA--T---TATTC-----ATTT-GTGATGG----G-GAA---A---T-CTTT-ATT-TT--ATTC---C----AGCCTG----T-----T---T----G-T----GT---GAACATGCAAG-TTTAGTGA-CAC-TAA---ATTTGGTTTTT-----CCAG---TCA-------------------TGTGAC----AA----AC----CACGAT--ACCT-A--TTTT-ACCTTCCTCCTAAAAA-A--ACA----ACCCTATGAAACTAGCT--T--GTTTA-Cgcaacaatgaaccatgggtatttaataaagttcactttataaacattg
gi|30 : tagttgtaactggttctgtatggttgtattgtatttattattggagacgtcttcagaacatatctac---A---T-TTTT-ATT-TC--ATTC---C----ACTTTG----T-----T---T----G-C----GT---GAACATTCAGG-TTTACTGA-CAC-CGA---GTTTGACATAA-----CCAG---TTAG----AT--GACCGTTTGATG-GAC----AT----GC----TATCCTTCACCT-A--GCTT-ACC----------A-----------------------------------GCTAG-TCT---CT-AC--TTGGGA----TTATTTTTAAAGAA
gi|31 : aacagtttgcaagacggtcaatttt----G----T-----T---T----A-C----GT---GAACATGCGAGGTTTACTGA-CCC-CAA---ATTTTATTTCA-----ACAA---TTTG----AT--AGTCAGTTGGTG-AAC----AT----AC----TATTCTTCACCTGG--TTTT-A-C----------AAG-A--T------ATCTCATT-----------------------------------TGAAT---TTTTTTTTAAAAAACCCAACATGTATT
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gi|33 : atacggcttgtttattta--A---TT-A----AA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTTT-T-----GAAAAA-AAA---A---T-CATT-A-T-TT--AGTC---C----A----G----T-----T---T----G-CTTATGT---AAACATAC------------------AT---ATGTGACCTTA-----CAAA---TTCA----AT--GTTCATTTGGTG-GAC----AT----TC----CATCCTT---------------CC----------AA-------------------TAAGCT---T--C--ACC-A-CTT---CT-CCTTTTTGG-----TTATTTTCAAAGAAGCcg
gi|34 : ------------T-----T------G------C------GT------G-ATA-G-GCA--TC--ATAGCTA-----C--A---TT-A----AC-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTTG-A-----G----A-AAA---AC--T-ATTG-ACT-TT--AGTC---A----A----G----TTTGTCT---T----A-C----GT---TAACGTGCGAT-TTTa
gi|35 : gtaatattcagggcatatttctattatgaacaatgatctatatcgtatT-TT--AGTC---C----A----G----T-----T---T----G-T----CTATTGAACATACAAG-TTTACTAG-CCC-TGACATATTTGAATT-A-----CCAA---TCAG----AT--GACCATTTGGTT-GAC----AT----AC----C-TTCTTCACAT-A--TTTGAACCA---------AAA-A--TTA----AGCCTATAAAAATAGCT--T--GCTCA-CTT---CA-CC--TTTGGA----ATATATTTAAgtttttgtggacaaacaa
gi|36 : AT-T-C-T--T-T--A-T-------GTA---AATCA----A-TT----------AA-----T--A------------T-----T------G------T----------------ATA-T-GTG--TT--ACAGTTG-----A--A---CG-A----AA-A-TCA---TA--T---TATT------ATTT-G-----G-------GA---T---T-ATTT-GTT-TT--AGTA---CTGTTT----G----T-----T---T----A-T----GT---GAGCATGAAAA-TCTACAGACCCC-CAA---ATTTGATTTTA-----CCAc
gi|38 : catatattctcatat----T-----T---T----AAC----AT---GACCATGTGAG-TTAACTGA-CCC-CAT---ATTTGA-TTTA-----TCAA---TCAG----AT--GGACGTTT-GTG-GAC----AC----AA----CATCCATGA--T-A--TTAT-ACC----------AAA----------------ACTGAACTAGAT--T--GTTGA-CAT---TT-CC--TTTGAA----ATCCCTTg
gi|39 : tgttTTTCAGAAACA-CAGTCTAGATA-GTGC--T--GCTGTGCAT---GC----T--AGATGT-ACA------AGT--------------TCCAA--------------------------------------------------A----A--AC-----CA-----A----A---T--AG-G--------TTGC-GAC-------T----ata
gi|4 : tattacagatctgcagacctcgttgactgggatgcaggggtaataagaatgtGTAGTGATTAACTAGG--AT--GTT--TGG--------GC-AC--AGGATTGCGTT----TCGTTTTCAATCGTGC-AT-TGTGGA-TTAAATTACAG-AAC--CAGACTGGACC-GTGC--T--GCTGCGCAT---GC----T-CA---GT-AAA------ATA--------------TCCAA---------AAGTT----------T----------------G--C-----A----ACCAC-----CG-----A----A-C-T--AA-G--------TTGC-GGT-------T----CA-----------------A--C--------A---AT---A---TAA-------A--CC-----G--CATA-G-----TGAC-T-T-T--T-T--A-T-------GTA---AAT--------TT----------AA-----CCAA------------G-----T------G------T------GT------G-ATA-A-CTA--TG--ACAGCTG-----C--A---TT-A----AA-A-ACA---AA--T---TACTC-----GGTT-G-----G----A-AAA---A---T-ATGT-ATT-TT--AGTC---T----A----G----T-----T---T----A-G----GT---GAACATGCAAC-TTTACTGA-CCC-AAA---A--CAACTTTACTGACCCAAAATTCAATTTTATAGGGCCATTTGGTG-GAC----AT----AC----CACCCATCATCT-A--CTTT-ACC----------TAA-T--TCA----ACCCTATTAAACTTGCT--T--ACTGA-ACT---CT-CC--TTTGGA----TACCTTTGACAGAAGTTAGCTTATATTC-AGCTAGTATTCCT-AA-ATAGTACATgcattag
gi|40 : TTTAGATTACGC--T-TATGGA-TAACATTACATAAACA-CAGTCTAGATC-GTGC--A--ACTGCGCAT---GC----T-CA---TT--AA------AAA--------------TCCAA---------GA--C----------a
gi|41 : gtagaccgctacatagtcttaggca-T-T-C--T-T--A-T-------TGA---AATGG----A-TT----------AA-----A--A------------T-----T------G------TTTTTGTGT------G-ATA-A-CCA--TA--ATATATG-----C--A---TT-GTATTAA-A-TCA---AA--T---TATTC-----GTTG-G-----GT---G-AAA---A---T-CTTT-ATTATTGCAGTT---T---------G----T-----T---T----A-C----GT---GAACccagctcctttttaatgaagggaat
gi|42 : tGA-CCA-CAC---ATTTGATTTTA-----CCAA---TCTA----AT--GAACAGTAGGTG-GAC----AT----AC----CGCCCTGCA----------T-AAA----------AAA-A--ACACACGACCCAATTGAACAAACT--T--GTTGA-CAT---CT-TC--TTTGGA----TTCTTTTTActac
gi|43 : TGATCCC-GAG---ATT-GATCTTA-----CCAA---TCCA----AT--GGTCATTTGGGT-GAC----AT----AC----CACC---------------T-AGT----------ATG-A----A----ACCCTCTAAAACT-----------TGA-------TT-TC--TTTGGA----GTATTTTTAAAGAATCCAACTTGTtaa
gi|44 : ATCATGC-CT-TGTTGA-TTAT-TTAAAGAAACA---GTTTAGATT-GTGC--T--GCTGGGCAC---AC----T-TA---GT-TTA------AAA--------------CCC-----------AG--C----------T----------------G--T-----A----A--
gi|45 : aCTGTGTT----CCATTTTCAATCATGT-CT-AGTGGA-TTAATTTACAGAAACA-CAGTCTAGATT-GTGC--T--GCTGTGCAG---GC----T-CA---GT-AAA------AAA--------------Ttatgcctaaactagccagatggaacttcaccac
gi|46 : --GGCCATTTGGTG-GAC----AG----AC----AACCTTTAACCT-A--TTTT-ATC----------AAA----------------------CTAGCT--T--GCATA-CAT---CT------TTGGA----TTCTTTTTAAAGAAGCCAA
gi|5 : AGTGGTTGATCAGGCAGCGGGCA--TCA--------GC-ATTTA-GACTGCCTT----
gi|5 : tattggaggtcttcggatctctctaaTTACAAAAACA-CAGTCTAAATC-ATGT--T--ACTGGGCGT---AA----T-CA---GT-ACA------AAA--------------TCCAA---------AA--CCCAATTATGTT----------------G--CGGGCTA----A--AC-----AGCCAGCA----C-C-TC-ACAG--------TGGCTGGT-------T----TATTT--------------A--C--T-----A---AT---G---TAAT------A--TTCTGG-G--TACA-G-----ATAT-T-T-G--T-T--A-T-------GTA---AATGA----A-TTTTTATTGCATAA-----T--T------------T-----T------G------T------GC------G-ATA-A-ATAATTACCATTGTTG-----C--A---TT-A----AA-AATCA---AA--T---TAATC-----GTAAAG-----G----A-AAA---AG--T-CTTT-ATA-CC--AGTC---C----ATTT-G----T-----T---G----A-C----AT---GATCATGTGAG-TTTATT-----C-AAA----------TTTA-----CCAA---TCAG----AT--GAA-ATTTGGTG-GAC----AT----ATATTTCATCCTTTATCT-A--TTTT-ATC-----------AA-A--CCA----ACCAAATTAAATTATATAATCAACTCA-CCC---CT-----TTTAGA--------TTTTAAAGAAACacaaaaacacagtctaaatcatgttactgggcgtaatcagtacaaaatccaaaacccaattatgttgcgggctaaacagccagcacctcacagtggctggtttatttactaatgtaatattctgggtacagatatttgttatgtaaatgaatttttattgcataattttgtgcgataaataattaccattgttgcattaaaaatcaaattaatcgtaaaggaaaaagtctttataccagtccatttgttgacatgatcatgtgagtttattcaaatttaccaatcagatgaaatttggtggacatatatttcatcctttatctattttatcaaaccaaccaaattaaattatataatcaactcaccccttttagattttaaagaaacacattg
gi|6 : tattggaggtcttcggatctctctaaagtggttgatcaggcagcgggcatcagcatttagactgcc------G------T------GT------A-ATA-A-ACA--TG--CCAGTTG-----C--A---TT-A----AG-T-TCA---AA--T---TATTC------TTT-G-----GTA--A-AAA---G---T-GTTT-ATC-TT--AGTC---T----AGTTTG----T-----T---T----A-C----CT---GAACATGCGAA-TTTACT---C----AA---CTTTGATTTTA-----CTAA-----------------------GGT----C----AT----AC----CACCCAT-ATCT-ATTTTTT-TTC----------AAA-A--TCA----ACTTCTTTTAACTAGCT--T--GGTGA-CCT---CC-TT--TTTGGA----TTCTT----AATAAAACAACTTATacattg
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gi|8 : aatgaaagataacaagtattcgcattggtttcggtttgctagtattacattaaaataggaaactgtataactaactggagatgtagcattcaaatgatataaaatataattggagatatctttaAATAAG--AC--GCA--TGGTCCTAGTTAC-AGTTAG-ACTGTGTT----CCGTTTTCGGTCATGA-AT-TGTGGAATTATAT-ACAAAAATA-CACTTCAGACA-GTGT--T--GCTGAGCAT---G-----T-CG---GT-AAA------AAA--------------ATCAA---------AA--T----------------------------------------------------------A----A-T-T--------------TTGCCGGC-------T----GC-----------------A--T--T-----A---A----A---T-------------------G--CATA-------TAA----T-T--T-T--A-C--------------ATG------------------------------------------------T------G------T------GT------G-ACA-G-GTAGTTG--CTGATTT-----C--A---TA-A----AA-A-TCA---AA--T---AATC--------TT-G-----C----------------T-GTTTGATT-GT--AATC---C----ATATTG----T-----T---T----A-T----AA---GAACATTTGAG-TTGACTAG-CCT-CTT---ACTGGATTTAA-----CCAA---TCAA----AT--GGACATTTGGTG-T-C----GT----AC----CACCAACCACTT-A--TCTT-ACT----------AAA-A--TC-------------AAACAAGTT--T--AC-GA-CCA---CC-CT--ATTAGA----ATCTTGTTACAGAAACCAACTTGTc
gi|9 : gtaattaaTTACAGAAACA-CAATCTAGACT-GTGC--T--GCTACATTT---GC----T-CA---GT-AAA------AAA--------------TCCAA-------------C----------C-------------------C-----A----G--TC-----CC-----A--------T--AG-T--------TTA------------T----TA-----------------A--C--T-----A---AT---G---TAAT------A--TTCTGA-G--CATA-------T-AT-T-TAT--T-T--A-C-------GTA---AATAT------TT----------GA-----T---------------T-----T------G------T------GT------G-GTA-A-GTG--CG--ATAAT-G-----C--AATGTT-A----AA-A-ACA---AA--T---TATTT-----ACTG-G-----G----A-AAA---A---AACTTT-ATT-CT--AGTC---C----A----A----T-----T---T-----------GT-----ACATGCATG-TTTACTAA-GCC-CAA---ATGTCATTTTG-----CCAA---TCAG----AC--GATAACTTGGTG-AAT----AT----AC----TTCCATTCACAT-A---TTT-ACC----------AAA-AATTTATTT-ACCATGTTAAAATAACT--G--ACCAA-GCTAACTT-CC--TCTGTA----TT-TTTTTCAAG--GTCAAC----ATTT-ATACCTTATTATccaattgacgggtacttct
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTAACTTATCCAGTACAGAATCCTGCTAGATGACCTTTTTGACACCCCAATCAATAAGCAATATTTGCCAAAATCGCATAACGATACATTACACCATTAATGTTCCATTTGGTCGATAGCGGTCACATTACCTTTGTGTTACTAAACTTAGAGATGTTTTCCCGATACATAATTAAGTAAATCAAAC
Unaligned ( gi|37 ): TTTGCGGTTACCTAAGCCGCATCGCACCGCAGTTAGTTGATTTACCAATGTACTATTCAGGGCAATATATTTCTTGTGTAATTTAATTAATAATGTATGTATATGGTATGTATGAAAGTTGTCTTAAATCCAAATTATTATTTTGA
Unaligned ( gi|47 ): CGGCTAGTTTATTTACTAATGATATATTTTTATGCAAAAAGATTACTATTGTATATGTGTGAATAAAC
Unaligned ( gi|48 ): TTTGTTGCGACATTCTAAAACGAATATGTTTTGATCTTATAATTCTGAT