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gi|2                          :                                                                                                                         TATGTAT-TATTA-TATCATAATAAT---AATTGCCTGTAAAAACATAAAACATACGTTTAGAAATATAAA-AA-AAACAAATATTCTAA-------A---------ATACAGAAGTCCACGTGTCTTGTT-----------AA--TGTAA----CAA-----------ATTAC-------AGATAGTGC----TTCTAATAATAGCATAA--ATTGT-ATAAATGACTTACAAGC--AACGCATTAA---TTGATCCAATGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---TTTT---A--T---TA----TTTAATCATGTCA--TCGT--------TATCAT-A---TC-----TA----AAGTTGTAATAGC---A------AGGTC-TTTACTA-ATTTAAGTCCAGTAATGTTCTGGTAAAACTAAGTGTGAGATTAGGACATGTGACTA-TATTTGGCAAGTTAATTGCA-------GTTATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATTCATACATTC-AACAATCAC-----TT-----GCATAACAATG--CT--ACA-GTACATGTACACA-GAC-AA-CAGCTG-AT-CCTTTCAGAAG-----------T-----GCACAGCCA------C------TG---TGATGTTGCACACAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCA-CAGGGGTCACAAACATATTGGACACATGCAATTTAAAGCAG
gi|7                          :                                                             gtaatcgggtcttaatgaagttcaacaccaaatatcatgcttataggatttggtttaattggagaaTATA--A-TACCATAGTAAT---A---GGCTGTAAATACATAAAACATACATATAGAAAAATAAACAA-GA-CATTTATTCTAA-------A---------GTACATATGTCCACGCGCCTCATT-----------AAG-T--AC----AAC---------TAACTAA-------ACAAATGTCACAGTACTTATAATA-----ATTATAGT-ACTGGAGACTAACCAGATAAATACATTA----TTAATCAGT-------ATTGTAAAATAA-TG-ACT------TAT---A--T---AA----T-----------GCATCTT--------CA--TT-AAAGTAA----TT----AAGCTACAA-----------------TC-TTTGCCAGATGGAAGTTCAGTAGCGTTCTACTGAAACTAATTGCGAGACTAAAACATTTGGC-A-TATTT
gi|1                          :   tatatgcttgaagttcacaataaaagaaatttgtcactgtttccttaatgtctatgtaaccggatcttaaattgacaaatgttaaacaccaagtgtacatagtttggttcatctggttgagtattatA--AGTATTATTATATTGATA---GCCTATAAATACATAAAACATACATTAAGAAATATAAA-AAAGA-CAATTATTCTTA---------------------------------------TT-----------AA--T--AC----AAG---------TTACTAC-------ACATGTGTTACAGTACTAATAACAA--CAATTGCAGT-AC---CGACTTATCAGA--AACACGTTAA-A-TTGTTTACTTATCATCATAGTGAAATAA-TG-ATTGA---ATAT---AAAT---TA----T-----------A--TGTC--------T----------TAC----TT----AAGTTGTAAAGGT---A------CGGTC-TT-GCCAGATTGAAATCAAATAGTGTTCTGGTGAAACTAAGTGAGATATTGAGACATGTGACTA-T-------------ATTACACGAAGTCA---TTTATGTAAGTTTAG-----TGAATCTAACAAACACTCA---ATT---AC--------------------ATTCC-ACT--GT--AACAGCGCATGCACATA-GGA-AA-CAGCTG-AT-CTATTCAGAAG-----------T-----G------CA------C------TA---TGACGTCACGTATAAATTAATTCAAAG-ACAGAGTTCA-TAAGTGTC---AACATATCGGACACGGGCACATTAAAGCATGCTTAT--CACAAATTT------AAAATACTAAT-ATGGAATGTAGAACAAGTGCTACAT
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gi|5                          :                                                                                                                                   tataataataatatat---A---GCCTGTTAATACACAAAACATACATTTAGAAATATAAA-AA-GA-CAATCATTCTAA-------ATACATTTTAA-------GTCCAAGCATCTCGTT-----------TA--T--AC----AAA---------TTAC----------AGATGATTCAAAGTACTACTAATAA--TACTTATAGT-ATAAATGACTTACAAGA--AACGCGTTAA-AATTAATAAGTTGT--TTGTTGCGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A--TAGATA----T-----------G--TCTTCTT-----TA--AG-A---TAA----TATTTAAAGTTGATAAAAC---A------AGGTC-TT-GCCATATTGAAGTCCAGTAACGT-CTGGTGAAACTAAAAGCGAGATTGAGACATGCGACTA-TGTTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TA-TTCAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAA----GCATGCATTCAAACAAACAC-----TT-----GCATTCCGACA--CT--ACA-GTACATGTACACA-GAC-AA-CAGCTG-GT-CCATTC---AA-----------T-----G------CA------C------GA---TGACGTAACACATAAATATATA-AAAGTAAAGAGATCA-CAG-GGTTACATGCACATTttcagaaatacatagtcactgtgacgtcacacatacatatatacaaagacagaggtcacaggggtcacaaacaatttaaagcaggcttactacatatttaaaataaaaatatcaatatagaatgtaaaaccagggctaca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                            atagaCGCGTCTCGTT-----------AA--T--GC----AAA---------TTAC-AC-------A--TATTTCGCAGTACTACTACTAA--TAATACGAGTTAAAAATGACTTACCAGA--ACCGCGTTAA-C-CTAATAA------ATTATTGTGAAATAA-TTTATTTA---A-AT---A--T---T-----T-----------C--TCCT--------CA--AT-A----AA----T------AGTTGTAAAGATTTAATTTTGTAGGTC-TTCACTTG-TTGAAGTTCAGTAGCGTTCTGGTGAAATTAAGAGCGAGATTAAGACATGCGAGAC-TATTTGGCGGGTTAACTGCACGGAGT--TA-TTTGAGTTATTTATGTTAGCAGAATCTAATAAACTTGCATGCATTTAAACAATCAC-----TT-----GCATTCCAACG--CT--ACA-ATACATGTAGACA-AAC-AA-CAGCTG-AT-CCATTCAGAAG-----------CCCACAG------CAA-----C------TG---TGACGTCACACATAAATATATAGAAAG-ACAGAGGTCA-CTGGGGTAACAAGCATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTC------AAAATATCAAA-ATAG--AATATAACCAGGGCTACATAatccaaacattgactaacaaatcgattaaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAATA-TTATTTAGTTCTCATAATTGTGAAAAAAATG-ATTAA---ATATGATA--TA--TA----T-----------G--TCTT------------AT-A---TAA----GGT---AA-----AAAAGT---A------------TT-GTCAGGTTGAATTCCAGTAGCATTCTAGTGAAAATAAGTACGAGATTGAGACATGCGACTA-TATTTGGTGGGTTAATTGCATGGAGTTATT-TT------ATTTTAGTAAGTGGAATCTAACCATCATGCATACATTCAAACAATCAA-----TT-----GCATTCCAACC--CT--ACA-ATACATGTACACAAGACTAA-CAG----AT-TCATTCAGAAG-----------T-----G------CA------C------TG---TGATTTCACACCTAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCA-CAGGGGTCACAAACATATCGGACACAAGCAATTTAAAGCAGGCtctatgaattaaataaataaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taattatagtttggtttatttagtgtattatta---A--T---TA----T-----------G--TCTTCTGTACGATA--AT-AATTTAA----TAATTCAAGATGTAAAAGC---A------AGGTC-TT-TTTCAATTGAAGTTCAGTGGCGTTCTCGTGAAACTAAGCGCGAGATTCAGACATGCGACTA-TATTTGGCg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTC-TTCACTTG-TTGAAGTTCAGAAGCGTTCTAGTGAAATAAAGGACGAGATTTAGACATGTGAAAA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGA--CTTA-TTTGAGTTATTTCTATAAGTGGAATCT---------GCGTGCATTCAAACAATCAC-----TT-----GCATTCCAACG--CT--ACA-ATACATGTAGACA-AAC-AA-CAGCTG-GT-CCATTCAGAAA-----------T-----GGACAGCCA------C------TG---TGACATCATACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCA-CGGGGATCACAAAAATATTGGACACGAGCAATTTAAAGCAGATTTAC--TACATATAT------AAAATATCAAT-ATAG--AATATAACCAGGGCTACATacgagcaatttaaagcaggattactacatatttaaaatatcaaaatagaataataatcagggttgtaatgttctttat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tataaatatatattaattttgttGTTCAGTAGCATTCTGGTGAAATTAAGGGCGAGATTTAGACATGCG-CTAATAGTTGGAGGATTAATTGCACGGAGT--TA-TTTGAGTTATTTCTGTAAGTGGAATCTAACAAACATTCATACATTCAAACAATCAC-----ATT----GTATTCTAACG--CTTCAAT-A--CATATAGACA-AAC-GA-CAGCTG-AT-CCAT-CAGAAG-----------T-----G------CA------CAGCCACTGCACTAAGGTCACACATAAATTTATACAAAG-ACAGAGGTCA-CAGGGGTCACAAACATATCGGAAACGAGCACTTTAAAGCAGCCTTACATTACATaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCGGAATCTAACAAACATGCATGCATCCAAACAATCGTCTGCAGTCACTTGCATTCCAACG--CT--ACA-ATACATGAAGACT-GA--AA-CAGCTG-AT-CTAT-CAAAAGAGCACAGCCACT-----G------TA------C------TG---TGACATCACACATAAATATATACAAAA-ACAGAGGTCA----------CAAACATATTGGACACGAGCAATGTAAAGCAGGCTTAA--TACATATTT------AATATATCAAT-ATAG-AATTATAACCAGGACTACATt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCAATGCTGC--AAT-A--CATATACACA-TAC-GG-CAGCTG-TT-CCATTTAAAAC-----------T-----G------CA------C------TG---TGACGTCACACATAATTATATACAAAG-ACTGAGG----------TCACAAATATATTGGAAAGGCGCAATTTAAAGCAAGCTTAC--TATATATCA------AAGATATTAAT-ATGGAAACTATtag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --AAC-ATGCATGCATTCA-AAC-AATCACTTGCATTCCATTCAGAAA-----------T-----A------CATAGTCAC------TG---TGACGTCACACATACATATATACAAAG-ACAGAGGTCA-CAGGGGTCACAAA---------------CAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTTAAAATAAAAATATCAAT-ATAGAATGTAAAACCAGGGCTACAttcacgtgctatatacgtaataacagtatgtgaatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tataataataatatattaatattagcctgtaaatacatcaaacatatattaagaaatataaaaagacaattattctaaaatacacgtccacccgtctcgttaattattctaaaatacacgtcaacgcgtctcgttaatacaaattacagatattgcacattactattactaataattatagtataaatgacttaccaaattaacaaattatcatcaatgtgaaatagtgatttatttatatatataattttgtcttcattatcataatatctaaagtcgtatgagtaaggtctttgttaattgtagtccgttagcgttctggtaaatctaagtaagagatttagacatgcgactatatttggcgggtttattgcatagatttatttaagttatttctgtcagctaaca-CAGCTT-GT-CCATTCAGAAG-----------T-----G------CA------C------TG---TGACATCACAAATAAATATATACAATG-ACAGAGGTCA-CATATGTTACAA----AGTGCACACGAGCAATTTAAAGCAGGCCCAC--TAAATATTT------AAACTATTAAT-ATAGAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaatAGAAGTCACAGGGGATCATAAACATATTGAAAACGAGCAATTTAAAGCAGTCTTAT--TACAAATTC------AAAATATTTAA-ATATAATGTAGAACCAGGCTT-CATAggtgatcagataaataaaataacaattaacatgtgtaaataag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATTTGGCACGAGCAATTTAAAGCAGGATTAC--TACATATTT------AAAATATCAAA-ATAGAATA-ATAATCAGGGTTatatgctatacattaataaaaga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attatgtcttctgtacgataataatttaataattcaagatgtaaaagcaaggtctttttcaattgaagttcagtggcgttctcgtgaaactaagcgcgagattcagacatgcgactCGATTTAAAGCAGGCTAAC--TACATATTT------CGAATGGTAATCCTAACAATTCTAACCAGGGCTACAgtaatgttctttat
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TTTGTTAATGAGCTGTTTCTATAATGTAATATAATATTATTGTAACCAGGTCTTAATTGACGAATGTTCAACACCAAGTATATAATTATAGTTTGGTTTATTTAGTGTATTATTATAATATTAT
Unaligned ( gi|18 ): TTGTAACCGGGTAGATAGTTCAACACCAAGTCTATAGATAGGAGATTTGGTTTTAATTGGAGGATAATTATTATAATATA
Unaligned ( gi|20 ): TTTATTTAATCATTATTTATTAGCTATTTCAATTTAAAGCAAAAATTATTGCAATCAATAAT






Alignments
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consensus                     :                                                                   TATGTATTATAA-TATTATAATAATA---GCCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTATTCTAAA--ATACA------G---TCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAATTACTACANATATTTCACAGTACTANTAATA--ATAATTATAGT-ACAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATNAGTTGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------A--T-A----TGTCTTC--------A--AT-A---TAA----TA----A----AGTTG-TAAAAGC---A------AGGTC-TTGCCAGATTGAAGTCCAGTAGCGTTCTGGTGAAACTAAGTGCGAGATTNAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGACGTCACACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTT------AAAATATCAAT-ATAGAANGTATAACCAGGGCTACATAT
Reference ( family-1130 )     :                                                                   TATGTAT-ATAA-TATCATAATAATA---GCCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTATTCTAAA--ATACA------G---TCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAATTACTACANATATTTCACAGTACTANTAATA--ATAATTATAGT-ANAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATNAGTTATCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------A--T-A----TGTCTTC--------A--AT-A---TAA----TA----A----AGTTG-TAAAAGC---A------AGGTC-TTGCCAGATTGAAGTCCAGTAGCGTTCTGGTGAAACTAAGNGCGAGATTNAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTTGAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGACGTCACACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTT------AAAATATCAAT-ATAGAANNTATAACCAGGGCTACATAT
gi|1                          :                                                                            TAT-TATTATATTGATA---GCCTATAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTAAGAAATATAA--------A-AAAGA-CA------------------ATTATTCT------TA-------------------------TTAA--T---ACAAGTTACTACACATGTGTTACAGTACTAATAACA--ACAATTGCAGT-AC---CGACTTATCAG--AAACACGTTAA-A-TTGTTTACTTATCATCATAGTGAAATAA-TG-ATTGA---ATAT---AAATT------A--T-A----TGTCTT--------------------AC----TT----A----AGTTG-TAAAGGT---A------CGGTC-TTGCCAGATTGAAATCAAATAGTGTTCTGGTGAAACTAAGTGAGATATTGAGACATGTGACTA-T-------------ATTACACGAAGT--CATTTATGTAAGTTTAGT-----GAATCTAACAAA--------CACTCAA-------------------TTACATTCCACTGTAACAGCGCATGCACATA-GGA-AACAGCTGATCTATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTA---TGACGTCACGTATAAATTAATTCAAAG-ACAGAGTTCATAAGTG-TC---AACATATCGGACACGGGCACATTAAAGCATGCTTAT--CACAAATTT------AAAATACTAAT-ATGGAATGTAGAACAAGTGCTACATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaagttgatcgtatctctttaatttatgtctcataatgcaactattaaaacataaccgggtcttaattgacaaagattcaacaccaagtacaaatatttttgtttatttgaagTTGAAGTTCAGAAGCGTTCTAGTGAAATAAAGGACGAGATTTAGACATGTGAAAA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGACT--TATTTGAGTTATTTCTATAAGTGGAATCT---------GCGTGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGTAGACA-AAC-AACAGCTGGTCCATTCAGAAA-----------T-----GGACAGCC-ACTG---TGACATCATACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACGGGGA-TCACAAAAATATTGGACACGAGCAATTTAAAGCAGATTTAC--TACATATAT------AAAATATCAAT-ATAGAA--TATAACCAGGGCTACATAaatattgataaaatgaaataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tataaatatatattaattttgttggtcttcacttgGTTCAGTAGCATTCTGGTGAAATTAAGGGCGAGATTTAGACATGCG-CTAATAGTTGGAGGATTAATTGCACGGAGT--TATTTGAGTTATTTCTGTAAGTGGAATCTAACAAACATTCATACATTCAAACAATC----------ACATTGTATTCTAACGCTTCAATACATATAGACA-AAC-GACAGCTGATCCA-TCAGAAG-----------T-----GCACAGCC-ACTGCACTAAGGTCACACATAAATTTATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGAAACGAGCACTTTAAAGCAGCCTTACATTACATa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCGGAATCTAACAAACATGCATGCATCCAAACAATCGTCTGCAGTCAC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGAAGACT-GA--AACAGCTGATCTAT-CAAAAGAGCACAGCCACT-----G------T-ACTG---TGACATCACACATAAATATATACAAAA-ACAGAGGTC----------ACAAACATATTGGACACGAGCAATGTAAAGCAGGCTTAA--TACATATTT------AATATATCAAT-ATAGAA-TTATAACCAGGACTACATt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T-A----TGTCTTCTGTACGATA--AT-AATTTAA----TA----ATTCAAGATG-TAAAAGC---A------AGGTC-TTTTTCAATTGAAGTTCAGTGGCGTTCTCGTGAAACTAAGCGCGAGATTCAGACATGCGACTA-TATTTGGCtag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atATATTTGGCACGAGCAATTTAAAGCAGGATTAC--TACATATTT------AAAATATCAAA-ATAGAATA-ATAATCAGGGTTacgagcaatttaaagcaggattactacatatttaaaatatcaaaatagaataataatcagggttgtaatgttctttat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attatgtcttctgtacgataataatttaataattcaagatgtaaaagcaaggtctttttcaattgaagttcagtggcgttctcgtgaaactaagcgcgagattcagacatgcgactCCAATGCTGCAATACATATACACA-TAC-GGCAGCTGTTCCATTTAAAAC-----------T-----G------C-ACTG---TGACGTCACACATAATTATATACAAAG-ACTGA---------GG-TCACAAATATATTGGAAAGGCGCAATTTAAAGCAAGCTTAC--TATATATCA------AAGATATTAAT-ATGGAAACTATgtaatgttctttat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAGCTTGTCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGACATCACAAATAAATATATACAATG-ACAGAGGTCACATATG-TTACAAA-GT---GCACACGAGCAATTTAAAGCAGGCCCAC--TAAATATTT------AAACTATTAAT-ATAGAAGGttcacgtgctatatacgtaataacagtatgtgaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatAGAAGTCACAGGGGATCATAAACATATTGAAAACGAGCAATTTAAAGCAGTCTTAT--TACAAATTC------AAAATATTTAA-ATATAATGTAGAACCA-GGCTTCATATgatcagataaataaaataacaattaacatgtgtaaataag
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGATTTAAAGCAGGCTAAC--TACATATTT------CGAATGGTAATCCTAACAATTCTAACCAGGGCTACAatatgctatacattaataaaaga
gi|2                          :                                                                   TATGTATTATTA-TATCATAATAATAATTGCCTGTAAAAACAT-AAA-ACATAC------GTTTAGAAATATAA--------A-AA-AAACA------------------AATATTCTAAA--ATACA------GAAGTCCACGTGTCTTGTTAA--TGTAACAAATTAC---AGATAGTGC----TTCTAATAATAGCATAA--ATTGT-ATAAATGACTTACAAG--CAACGCATTAA---TTGATCCAATGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---TTTT---A---TTATTTAA--TCA----TGTCATC--------G--TT-A---TCA----TATCTAA----AGTTG-TAATAGC---A------AGGTC-TTTACTAATTTAAGTCCAGTAATGTTCTGGTAAAACTAAGTGTGAGATTAGGACATGTGACTA-TATTTGGCAAGTTAATTGC----AGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATTCATACATTC-AACAATC----------AC-TTGCATAACAATGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCTTTCAGAAG-----------T-----GCACAGCC-ACTG---TGATGTTGCACACAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATTGGACACATGCAATTTAAAGCAG
gi|3                          : gtaatcgggtcttaatgaagttcaacaccaaatatcatgcttataggatttggtttaattggagaaTATGTAT-GTAACTACTATAATATTA---GCCAGTAAATACAT-ATA-ACATCT------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTGTTCTAAA--A----------G---TCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACCAATTACTACAGATATTTCACAGTACTAATAATA--GTGATTATAGT-ACAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATTAGTTGTCATTATTTTGAAATAA-TG-ATTAA---ACAT---A---T---------T-A----TGTCTTT--------A--AT-A---TAA----TG----A----AGTTT-CAAAAGT---A------AGGTC-TTACCAGATTGAAGTCCGGTAGCGTTCTGCTGAAACTAAGTGCGAGATTGAGACATGTGACTA-TATTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGTCGTTTTTAAGTTATTTTAGTGAGCTGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AT-GTGTACTCCAACGGTAATGTGCATGTATACA-GAC-AACAGCCGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGGCGTTACATATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCAAAGAAA-TCACAAACATATTGGATACGAGCAATTTCATGCAGACTTAC--TACATATTT------AAAATATTAAT-ATAGAAAATATACCCAGGGTTACATGT
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gi|5                          :                                                                                tataataATAGAA---GCCTGTTAATACAC-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATCATTCTAAA---TACATTTTAAG---TCCAAGCATCTCGTTTA--T---ACAAATTAC---AGATGATTCAAAGTACTACTAATA--ATACTTATAGT-ATAAATGACTTACAAG--AAACGCGTTAA-AATTAATAAGTTGT--TTGTTGCGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------AGAT-A----TGTCTTCTTT-----A--AG-A---TAA----TATTTAA----AGTTGATAAAA-C---A------AGGTC-TTGCCATATTGAAGTCCAGTAACGT-CTGGTGAAACTAAAAGCGAGATTGAGACATGCGACTA-TGTTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTCAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAA----GCATGCATTCAAACAAAC----------AC-TTGCATTCCGACACTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGGTCCATTC---AA-----------T-----G------C-ACGA---TGACGTAACACATAAATATATA-AAAGTAAAGAGATCACA-GGG-TTACATGCACAT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1130 )     :                                                                   TATGTATTATAA-TATTATAATAATA---GCCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTATTCTAAA--ATACA------G---TCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAATTACTACANATATTTCACAGTACTANTAATA--ATAATTATAGT-ACAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATNAGTTGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------A--T-A----TGTCTTC--------A--AT-A---TAA----TA----A----AGTTG-TAAAAGC---A------AGGTC-TTGCCAGATTGAAGTCCAGTAGCGTTCTGGTGAAACTAAGTGCGAGATTNAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGACGTCACACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTT------AAAATATCAAT-ATAGAANGTATAACCAGGGCTACATAT
gi|1                          :                                                                            TAT-TATTATATTGATA---GCCTATAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTAAGAAATATAA--------A-AAAGA-CA------------------ATTATTCT------TA-------------------------TTAA--T---ACAAGTTACTACACATGTGTTACAGTACTAATAACA--ACAATTGCAGT-AC---CGACTTATCAG--AAACACGTTAA-A-TTGTTTACTTATCATCATAGTGAAATAA-TG-ATTGA---ATAT---AAATT------A--T-A----TGTCTT--------------------AC----TT----A----AGTTG-TAAAGGT---A------CGGTC-TTGCCAGATTGAAATCAAATAGTGTTCTGGTGAAACTAAGTGAGATATTGAGACATGTGACTA-T-------------ATTACACGAAGT--CATTTATGTAAGTTTAGT-----GAATCTAACAAA--------CACTCAA-------------------TTACATTCCACTGTAACAGCGCATGCACATA-GGA-AACAGCTGATCTATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTA---TGACGTCACGTATAAATTAATTCAAAG-ACAGAGTTCATAAGTG-TC---AACATATCGGACACGGGCACATTAAAGCATGCTTAT--CACAAATTT------AAAATACTAAT-ATGGAATGTAGAACAAGTGCTACATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaagttgatcgtatctctttaatttatgtctcataatgcaactattaaaacataaccgggtcttaattgacaaagattcaacaccaagtacaaatatttttgtttatttgaagTTGAAGTTCAGAAGCGTTCTAGTGAAATAAAGGACGAGATTTAGACATGTGAAAA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGACT--TATTTGAGTTATTTCTATAAGTGGAATCT---------GCGTGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGTAGACA-AAC-AACAGCTGGTCCATTCAGAAA-----------T-----GGACAGCC-ACTG---TGACATCATACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACGGGGA-TCACAAAAATATTGGACACGAGCAATTTAAAGCAGATTTAC--TACATATAT------AAAATATCAAT-ATAGAA--TATAACCAGGGCTACATAaatattgataaaatgaaataaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tataaatatatattaattttgttggtcttcacttgGTTCAGTAGCATTCTGGTGAAATTAAGGGCGAGATTTAGACATGCG-CTAATAGTTGGAGGATTAATTGCACGGAGT--TATTTGAGTTATTTCTGTAAGTGGAATCTAACAAACATTCATACATTCAAACAATC----------ACATTGTATTCTAACGCTTCAATACATATAGACA-AAC-GACAGCTGATCCA-TCAGAAG-----------T-----GCACAGCC-ACTGCACTAAGGTCACACATAAATTTATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGAAACGAGCACTTTAAAGCAGCCTTACATTACATa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCGGAATCTAACAAACATGCATGCATCCAAACAATCGTCTGCAGTCAC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGAAGACT-GA--AACAGCTGATCTAT-CAAAAGAGCACAGCCACT-----G------T-ACTG---TGACATCACACATAAATATATACAAAA-ACAGAGGTC----------ACAAACATATTGGACACGAGCAATGTAAAGCAGGCTTAA--TACATATTT------AATATATCAAT-ATAGAAT-TATAACCAGGACTACATt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T-A----TGTCTTCTGTACGATA--AT-AATTTAA----TA----ATTCAAGATG-TAAAAGC---A------AGGTC-TTTTTCAATTGAAGTTCAGTGGCGTTCTCGTGAAACTAAGCGCGAGATTCAGACATGCGACTA-TATTTGGCtag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atATATTTGGCACGAGCAATTTAAAGCAGGATTAC--TACATATTT------AAAATATCAAA-ATAGAATA-ATAATCAGGGTTacgagcaatttaaagcaggattactacatatttaaaatatcaaaatagaataataatcagggttgtaatgttctttat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attatgtcttctgtacgataataatttaataattcaagatgtaaaagcaaggtctttttcaattgaagttcagtggcgttctcgtgaaactaagcgcgagattcagacatgcgactCCAATGCTGCAATACATATACACA-TAC-GGCAGCTGTTCCATTTAAAAC-----------T-----G------C-ACTG---TGACGTCACACATAATTATATACAAAG-ACTGA---------GG-TCACAAATATATTGGAAAGGCGCAATTTAAAGCAAGCTTAC--TATATATCA------AAGATATTAAT-ATGGAAACTATgtaatgttctttat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAGCTTGTCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGACATCACAAATAAATATATACAATG-ACAGAGGTCACATATG-TTACAAA-GT---GCACACGAGCAATTTAAAGCAGGCCCAC--TAAATATTT------AAACTATTAAT-ATAGAAGGttcacgtgctatatacgtaataacagtatgtgaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaatAGAAGTCACAGGGGATCATAAACATATTGAAAACGAGCAATTTAAAGCAGTCTTAT--TACAAATTC------AAAATATTTAA-ATATAATGTAGAACCA-GGCTTCATATgatcagataaataaaataacaattaacatgtgtaaataag
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CGATTTAAAGCAGGCTAAC--TACATATTT------CGAATGGTAATCCTAACAATTCTAACCAGGGCTACAatatgctatacattaataaaaga
gi|2                          :                                                                   TATGTATTATTA-TATCATAATAATAATTGCCTGTAAAAACAT-AAA-ACATAC------GTTTAGAAATATAA--------A-AA-AAACA------------------AATATTCTAAA--ATACA------GAAGTCCACGTGTCTTGTTAA--TGTAACAAATTAC---AGATAGTGC----TTCTAATAATAGCATAA--ATTGT-ATAAATGACTTACAAG--CAACGCATTAA---TTGATCCAATGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---TTTT---A---TTATTTAA--TCA----TGTCATC--------G--TT-A---TCA----TATCTAA----AGTTG-TAATAGC---A------AGGTC-TTTACTAATTTAAGTCCAGTAATGTTCTGGTAAAACTAAGTGTGAGATTAGGACATGTGACTA-TATTTGGCAAGTTAATTGC----AGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATTCATACATTC-AACAATC----------AC-TTGCATAACAATGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCTTTCAGAAG-----------T-----GCACAGCC-ACTG---TGATGTTGCACACAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATTGGACACATGCAATTTAAAGCAG
gi|3                          : gtaatcgggtcttaatgaagttcaacaccaaatatcatgcttataggatttggtttaattggagaaTATGTAT-GTAACTACTATAATATTA---GCCAGTAAATACAT-ATA-ACATCT------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTGTTCTAAA--A----------G---TCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACCAATTACTACAGATATTTCACAGTACTAATAATA--GTGATTATAGT-ACAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATTAGTTGTCATTATTTTGAAATAA-TG-ATTAA---ACAT---A---T---------T-A----TGTCTTT--------A--AT-A---TAA----TG----A----AGTTT-CAAAAGT---A------AGGTC-TTACCAGATTGAAGTCCGGTAGCGTTCTGCTGAAACTAAGTGCGAGATTGAGACATGTGACTA-TATTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGTCGTTTTTAAGTTATTTTAGTGAGCTGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AT-GTGTACTCCAACGGTAATGTGCATGTATACA-GAC-AACAGCCGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGGCGTTACATATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCAAAGAAA-TCACAAACATATTGGATACGAGCAATTTCATGCAGACTTAC--TACATATTT------AAAATATTAAT-ATAGAAAATATACCCAGGGTTACATGT
gi|4                          :                                                                        ATAATAA-TATATTAATATTA---GCCTGTAAATACATCAAACATATATTAAGAAATATAAAAAGACAATTATTCTAA-AA-TA-CACGTCCACCCGTCTCGTTAATTATTCTAAA--ATACAC-----G---TCAACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAAT---TACAGATATTGCACATTACTATTACTA--ATAATTATAGT-ATAAATGACTTACC-------------AA-A-TTAACAAATTATCATCAATGTGAAATAG-TG-ATTTATTTATAT---A---T------A--T-AATTTTGTCTTC--------ATTATCA---TAATATCTA----A----AGTCG-TATGAGT---A------AGGTCTTTGTTA-ATTGTAGTCCGTTAGCGTTCTGGTAAATCTAAGTAAGAGATTTAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTTATTGCATAGATT--TATTTAAGTTATTTCTGTCAG------CTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCA----TTCAG---AAATACATA-G-----------------TCA-------------------------------CTG---TGACGTCACACATACATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAA---------------CAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTTAAAATAAAAATATCAAT-ATAGAATGTAAAACCAGGGCTACA
gi|5                          :                                                                                   tataATAGAA---GCCTGTTAATACAC-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATCATTCTAAA---TACATTTTAAG---TCCAAGCATCTCGTTTA--T---ACAAATTAC---AGATGATTCAAAGTACTACTAATA--ATACTTATAGT-ATAAATGACTTACAAG--AAACGCGTTAA-AATTAATAAGTTGT--TTGTTGCGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------AGAT-A----TGTCTTCTTT-----A--AG-A---TAA----TATTTAA----AGTTGATAAAA-C---A------AGGTC-TTGCCATATTGAAGTCCAGTAACGT-CTGGTGAAACTAAAAGCGAGATTGAGACATGCGACTA-TGTTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTCAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAA----GCATGCATTCAAACAAAC----------AC-TTGCATTCCGACACTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGGTCCATTC---AA-----------T-----G------C-ACGA---TGACGTAACACATAAATATATA-AAAGTAAAGAGATCACA-GGG-TTACATGCACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                 CGCGTCTCGTTAA--T---GCAAATTAC---ACATATTTCGCAGTACTACTACTA--ATAATACGAGTTAAAAATGACTTACCAG--AACCGCGTTAA-C-CTAATAA------ATTATTGTGAAATAA-TTTATTTA---A------A---T------A--T-T----TCTCCTC--------A--AT-A----AA----TA----------GTTG-TAAAGATTTAATTTTGTAGGTC-TTCACTTGTTGAAGTTCAGTAGCGTTCTGGTGAAATTAAGAGCGAGATTAAGACATGCGAGAC-TATTTGGCGGGTTAACTGCACGGAGT--TATTTGAGTTATTTATGTTAGCAGAATCTAATAAACTTGCATGCATTTAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGTAGACA-AAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------CCCACAG------CAACTG---TGACGTCACACATAAATATATAGAAAG-ACAGAGGTCACTGGGG-TAACAAGCATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTC------AAAATATCAAA-ATAGAA--TATAACCAGGGCTACATATtatccaaacattgactaacaaatcgattaaaa
gi|7                          :                                                                   TAT-TATTATAA-TACCATAGTAATA---GGCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATATAGAAAAATAA--------ACAA-GA-CA------------------TTTATTCTAAA--GTACATAT---G---TCCACGCGCCTCATTAAG-T---ACAACTAACTAAACAAATGTCACAGTACT--T-ATA--ATAATTATAGT-ACTGGAGACTAACCAGATAAATACATT---A-TTAATCAG-------TATTGTAAAATAA-TG-ACTT----ATAT---A----------A--T-G----CATCTTC--------A--TT-AAAGTAA----TT----A----AGCTA-CAA-----------------TCTTTGCCAGATGGAAGTTCAGTAGCGTTCTACTGAAACTAATTGCGAGACTAAAACATTTGGC-A-TATTTtctatgaattaaataaataaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                       tatatgcttgaagttcacaataaaagaaatttgtcactgtttccttaatgtctatgtaaccggatcttaaattgacaaatgttaaacaccaagtgtacatagtttggttcatctggttgagTAATA-TTATTTAGTTCTCATAATTGTGAAAAAAATG-ATTAA---ATATGATA---T------A--T-A----TGTCTT------------AT-A---TAA----------------G--G-TAAAA------------AAGTA-TTGTCAGGTTGAATTCCAGTAGCATTCTAGTGAAAATAAGTACGAGATTGAGACATGCGACTA-TATTTGGTGGGTTAATTGCATGGAGT--TATTT----TATTTTAGTAAGTGGAATCTAACCATCATGCATACATTCAAACAATC----------AA-TTGCATTCCAACCCTACAATACATGTACACAAGACTAACAG---ATTCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGATTTCACACCTAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACAAGCAATTTAAAGCAGGC
gi|9                          :                                     taattatagtttggtttatttagtgtattattaGTATTATGA-TATTATAATAATA---ATCTGTAAGTACAT-AAA-ACATAC------ATCTAGAATTATAT--------A-TA-GA-CA------------------ATTAATCTAAAGTATACAG-----G---TCCACACGTCTCA-TAACGT---ACACATTACTGAACATATGTCACAGTACTAT---TA--ATAATTAAAGT-AACAATGAC--A-CAT--GAACGCGTT---A-TAAATTATTTATCACTATTGTAAAATAA-TA-Ag


blockSeqs                     :                                                                      G   A    C             ATT              C   C      TAAGAA              TTATTCTA C  .  A  CGTCCACCCGTCTCGTTA           TACATTTTAAG                       CG GTA         TAC G                A     GC           T TA             AT         A AA      C AA G C               A  T     TTT    GAT TTATTTAATCA               CTGTACGATAATAATTTAATAATTCA             A  A   A ATTTAATTTTGT     T  TT  A                                 G        T             A                          CG     G            A  T            ACA                   GTCTGCAGTC  A                               A   T                     AGCACAGCCACTG            A    CAC                           T                A            T                            AT         AAAATA           C      TA
blockSeqs                     :                                                                      G   T    .             .                .   .      .                   .        .  .  .  .                            ATACAGAAG                         G  .           TAC G                A     .            . CA             .          A TA      T GT G C               .  .     .      .   TATAATTT                  CATTATCATAATATCTAA                     T  .   T GCA              T  TA  A                                 G        T             .                          .      G            A  T            ACA                   .           .                               .   .                     TGGACAGC                 .    .                             .                .            C                            .          .                .      AC
blockSeqs                     :                                                                      .   T    .             .                .   .      .                   .        .  .  .  .                            GTACATATG                         .  .           TAA G                T     .            . TA             .          A A       A AT A C               .  .     .      .   TAGATA                    CTTTAAGATAATATTTAA                     T  .   A GCA              .  AC  G                                 C        C             .                          .      A            A  C            ACA                   .           .                               .   .                     TGCACAGC                 .    .                             .                .            T                            .          .                .      GG
blockSeqs                     :                                                                          .    .             .                .   .      .                   .        .  .  .  .                            GTATACAGG                         .  .           TGA G                C     .            . TA             .          A A       A GT G C               .  .     .      .   TATT                      CGTTATCATATCTAA                        T  .   G GTA              .  GT  T                                 T        A             .                          .      A            G  C            ACA                   .           .                               .   .                     TGCACAGC                 .    .                             .                .            T                            .          .                .      TG
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finalCons                     :                                                                   TATGTATTATAA-TATTATAATAATA---GCCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTATTCTAAAGTACACAG---------TCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAATTACTACANATATTTCACAGTACTANTAATA--ATAATTATAGT-ANAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATNAGTTGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---ATATA----------------TGTCTTCTTANATAATATTAA----------------------AGTTG-TAAAAGC---A------AGGTC-TTGCCAGATTGAAGTCCAGTAGCGTTCTGGTGAAACTAAGTGCGAGATTNAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------C-ACTG---TGACGTCACACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTT------AAAATATCAAT-ATAGAANGTATAACCAGGGCTACATAT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TTTGTTAATGAGCTGTTTCTATAATGTAATATAATATTATTGTAACCAGGTCTTAATTGACGAATGTTCAACACCAAGTATATAATTATAGTTTGGTTTATTTAGTGTATTATTATAATATTAT
Unaligned ( gi|18 ): TTGTAACCGGGTAGATAGTTCAACACCAAGTCTATAGATAGGAGATTTGGTTTTAATTGGAGGATAATTATTATAATATA
Unaligned ( gi|20 ): TTTATTTAATCATTATTTATTAGCTATTTCAATTTAAAGCAAAAATTATTGCAATCAATAAT






Alignments
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Reference ( family-1130 )     :                                                                   TATGTATTATAA-TATTATAATAATA---GCCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTATTCTAAAGTACAC----A-GTCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAATTACTACANATATTTCACAGTACTANTAATA--ATAATTATAGT-ANAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATNAGTTGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------A--T-A----TGTCTT-C-T-T--AN-ATA-ATA--T-T-AA-------AGTTG-TAA--AAGC---A------AGGTC-TT-GCCAGATTGAAGTCCAGTAGCGTTCTGGTGAAACTAAGTGCGAGATTNAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------CA-CTG---TGACGTCACACATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTT------AAAATATCAAT-ATAGAANGTATAACCAGGGCTACATAT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atATATTTGGCACGAGCAATTTAAAGCAGGATTAC--TACATATTT------AAAATATCAAA-ATAGAATA-ATAATCAGGGTTacgagcaatttaaagcaggattactacatatttaaaatatcaaaatagaataataatcagggttgtaatgttctttat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attatgtcttctgtacgataataatttaataattcaagatgtaaaagcaaggtctttttcaattgaagttcagtggcgttctcgtgaaactaagcgcgagattcagacatgcgactCCAATGCTGCAATACATATACACA-TAC-GGCAGCTGTTCCATTTAAAAC-----------T-----G------CA-CTG---TGACGTCACACATAATTATATACAAAG-ACTGA---------GG-TCACAAATATATTGGAAAGGCGCAATTTAAAGCAAGCTTAC--TATATATCA------AAGATATTAAT-ATGGAAACTATgtaatgttctttat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAGCTTGTCCATTCAGAAG-----------T-----G------CA-CTG---TGACATCACAAATAAATATATACAATG-ACAGAGGTCACATATG-TTACAAA-GT---GCACACGAGCAATTTAAAGCAGGCCCAC--TAAATATTT------AAACTATTAAT-ATAGAAGGttcacgtgctatatacgtaataacagtatgtgaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaatAGAAGTCACAGGGGATCATAAACATATTGAAAACGAGCAATTTAAAGCAGTCTTAT--TACAAATTC------AAAATATTTAA-ATATAATGTAGAACCA-GGCTTCATATgatcagataaataaaataacaattaacatgtgtaaataag
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGATTTAAAGCAGGCTAAC--TACATATTT------CGAATGGTAATCCTAACAATTCTAACCAGGGCTACAatatgctatacattaataaaaga
gi|2                          :                                                                   TATGTATTATTA-TATCATAATAATAATTGCCTGTAAAAACAT-AAA-ACATAC------GTTTAGAAATATAA--------A-AA-AAACA------------------AATATTCTAAAATACAG----AAGTCCACGTGTCTTGTTAA--TGTAACAAATTAC---AGATAGTGC----TTCTAATAATAGCATAA--ATTGT-ATAAATGACTTACAAG--CAACGCATTAA---TTGATCCAATGTCATTATTGTGAAATAA-TG-ATTTA---TTTT---A---TTATTTAA--TCA----TGTCAT-C-G-T---T-ATC-ATA--TCT-AA-------AGTTG-TAA--TAGC---A------AGGTC-TT-TACTAATTTAAGTCCAGTAATGTTCTGGTAAAACTAAGTGTGAGATTAGGACATGTGACTA-TATTTGGCAAGTTAATTGC----AGT--TATTTAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAAACATTCATACATTC-AACAATC----------AC-TTGCATAACAATGCTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGATCCTTTCAGAAG-----------T-----GCACAGCCA-CTG---TGATGTTGCACACAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATTGGACACATGCAATTTAAAGCAG
gi|3                          : gtaatcgggtcttaatgaagttcaacaccaaatatcatgcttataggatttggtttaattggagaaTATGTAT-GTAACTACTATAATATTA---GCCAGTAAATACAT-ATA-ACATCT------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATTGTTCTAAA----------A-GTCCACGCGTCTCGTTAA--T---ACCAATTACTACAGATATTTCACAGTACTAATAATA--GTGATTATAGT-ACAAATGACTTACCAG--AAACGCGTTAA-A-TTAATTAGTTGTCATTATTTTGAAATAA-TG-ATTAA---ACAT---A---T---------T-A----TGTCTT---T-A--AT-ATA-ATG-------A-------AGTTT-CAA--AAGT---A------AGGTC-TT-ACCAGATTGAAGTCCGGTAGCGTTCTGCTGAAACTAAGTGCGAGATTGAGACATGTGACTA-TATTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGTCGTTTTTAAGTTATTTTAGTGAGCTGAATCTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AT-GTGTACTCCAACGGTAATGTGCATGTATACA-GAC-AACAGCCGATCCATTCAGAAG-----------T-----G------CA-CTG---TGGCGTTACATATAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCAAAGAAA-TCACAAACATATTGGATACGAGCAATTTCATGCAGACTTAC--TACATATTT------AAAATATTAAT-ATAGAAAATATACCCAGGGTTACATGT
gi|4                          :                                                                        ATAATAA-TATATTAATATTA---GCCTGTAAATACATCAAACATATATTAAGAAATATAAAAAGACAATTATTCTAA-AA-TA-CACGTCCACCCGTCTCGTTAATTATTCTAAAATACAC------GTCAACGCGTCTCGTTAA--T---ACAAATTAC---AGATATTGCACATTACTATTACTA--ATAATTATAGT-ATAAATGACTTACCA-------------A-A-TTAACAAATTATCATCAATGTGAAATAG-TG-ATTTATTTATAT---A---T------A--T-AATTTTGTCTT-CAT-T--ATCATA-ATA--TCT-AA-------AGTCG-TAT--GAGT---A------AGGTC-TTTGTTA-ATTGTAGTCCGTTAGCGTTCTGGTAAATCTAAGTAAGAGATTTAGACATGCGACTA-TATTTGGCGGGTTTATTGCATAGATT--TATTTAAGTTATTTCTGTCAG------CTAACAAACATGCATGCATTCAAACAATC----------AC-TTGCATTCCA----TTCAG---AAATACATA-G-----------------TCA-------------------------------CTG---TGACGTCACACATACATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAA---------------CAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTTAAAATAAAAATATCAAT-ATAGAATGTAAAACCAGGGCTACA
gi|5                          :                                                                                   tataATAGAA---GCCTGTTAATACAC-AAA-ACATAC------ATTTAGAAATATAA--------A-AA-GA-CA------------------ATCATTCTAAA-TACATTTTAA-GTCCAAGCATCTCGTTTA--T---ACAAATTAC---AGATGATTCAAAGTACTACTAATA--ATACTTATAGT-ATAAATGACTTACAAG--AAACGCGTTAA-AATTAATAAGTTGT--TTGTTGCGAAATAA-TG-ATTTA---ATAT---A---T------AGAT-A----TGTCTT-C-T-TTAAG-ATA-ATA--T-TTAA-------AGTTGATAA--AA-C---A------AGGTC-TT-GCCATATTGAAGTCCAGTAACGT-CTGGTGAAACTAAAAGCGAGATTGAGACATGCGACTA-TGTTTAGCGGGTTAATTGCACGGAGT--TATTCAAGTTATTTCTGTAAGCGGAATCTAACAA----GCATGCATTCAAACAAAC----------AC-TTGCATTCCGACACTACAGTACATGTACACA-GAC-AACAGCTGGTCCATTC---AA-----------T-----G------CA-CGA---TGACGTAACACATAAATATATA-AAAGTAAAGAGATCACA-GGG-TTACATGCACAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                             CGCGTCTCGTTAA--T---GCAAATTAC---ACATATTTCGCAGTACTACTACTA--ATAATACGAGTTAAAAATGACTTACCAG--AACCGCGTTAA-C-CTAATAA------ATTATTGTGAAATAA-TTTATTTA---A-----------------A--T-A----TTTCTC-C-T-C--A--ATA-A-A--T------------AGTTG-TAA--AGATTTAATTTTGTAGGTC-TT-CACTTGTTGAAGTTCAGTAGCGTTCTGGTGAAATTAAGAGCGAGATTAAGACATGCGAGAC-TATTTGGCGGGTTAACTGCACGGAGT--TATTTGAGTTATTTATGTTAGCAGAATCTAATAAACTTGCATGCATTTAAACAATC----------AC-TTGCATTCCAACGCTACAATACATGTAGACA-AAC-AACAGCTGATCCATTCAGAAG-----------CCCACAG------CAACTG---TGACGTCACACATAAATATATAGAAAG-ACAGAGGTCACTGGGG-TAACAAGCATATCGGACACGAGCAATTTAAAGCAGGCTTAC--TACATATTC------AAAATATCAAA-ATAGAA--TATAACCAGGGCTACATATtatccaaacattgactaacaaatcgattaaaa
gi|7                          :                                                                   TAT-TATTATAA-TACCATAGTAATA---GGCTGTAAATACAT-AAA-ACATAC------ATATAGAAAAATAA--------ACAA-GA-CA------------------TTTATTCTAAAGTACAT----ATGTCCACGCGCCTCATTAAG-T---ACAACTAACTAAACAAATGTCACAGTACT--T-ATA--ATAATTATAGT-ACTGGAGACTAACCAGATAAATACATT---A-TTAATCAG-------TATTGTAAAATAA-TG-ACTT----ATAT---A----------A--T-G----CATCTT-C---------------A--T-T-AA-------A---G-TAATTAAGCT--A------CAATCTTT-GCCAGATGGAAGTTCAGTAGCGTTCTACTGAAACTAATTGCGAGACTAAAACATTTGGC-A-TATTTtctatgaattaaataaataaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                   tatatgcttgaagttcacaataaaagaaatttgtcactgtttccttaatgtctatgtaaccggatcttaaattgacaaatgttaaacaccaagtgtacatagtttggttcatctggttgagTAATA-TTATTTAGTTCTCATAATTGTGAAAAAAATG-ATTAA---ATATGATA---T------A--T-A----TGTCTT---------------ATA--T----A-------AG--G-TAA--AA------------AAGTA-TT-GTCAGGTTGAATTCCAGTAGCATTCTAGTGAAAATAAGTACGAGATTGAGACATGCGACTA-TATTTGGTGGGTTAATTGCATGGAGT--TATTT----TATTTTAGTAAGTGGAATCTAACCATCATGCATACATTCAAACAATC----------AA-TTGCATTCCAACCCTACAATACATGTACACAAGACTAACAG---ATTCATTCAGAAG-----------T-----G------CA-CTG---TGATTTCACACCTAAATATATACAAAG-ACAGAGGTCACAGGGG-TCACAAACATATCGGACACAAGCAATTTAAAGCAGGC
gi|9                          :                                     taattatagtttggtttatttagtgtattattaGTATTATGA-TATTATAATAATA---ATCTGTAAGTACAT-AAA-ACATAC------ATCTAGAATTATAT--------A-TA-GA-CA------------------ATTAATCTAAAGTATAC----AGGTCCACACGTCTCA-TAACGT---ACACATTACTGAACATATGTCACAGTACTAT---TA--ATAATTAAAGT-AACAATGAC--A-CAT--GAACGCGTT---A-TAAATTATTTATCACTATTGTAAAATAA-TA-Ag
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TTTGTTAATGAGCTGTTTCTATAATGTAATATAATATTATTGTAACCAGGTCTTAATTGACGAATGTTCAACACCAAGTATATAATTATAGTTTGGTTTATTTAGTGTATTATTATAATATTAT
Unaligned ( gi|18 ): TTGTAACCGGGTAGATAGTTCAACACCAAGTCTATAGATAGGAGATTTGGTTTTAATTGGAGGATAATTATTATAATATA
Unaligned ( gi|20 ): TTTATTTAATCATTATTTATTAGCTATTTCAATTTAAAGCAAAAATTATTGCAATCAATAAT