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Reference ( gi|3 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGCAGCTTTTTTCATTTCACGGATTTCTTACATGAAAATTTCAGCAAGGACACCCCTAT---TCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAGA-GTAACTGTCATTTTATTCTATATATTCTATACTCTAGCAACCCATTGACGT-TAACGTGGGGCTCATGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAATTTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGTAAAGCATGATTATTACTTGATGTCTTCAATGCCAT-ATAACAAAGTCTAAACGTCATTTCTGTTTCCGTTAGTA---AA---CAA--A-GCATTTAGGAATACTACCGGTTGTTTATTATGGTGTCATCTGAGTCACAAGAAACAA--GTGCAATTGTCAAA-TTT-GTTGTCAGCTAGGACATTAGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGTATCTACAGGACAGAAA-CTGTCGTGGACGCAGG-TTTT-GAAAGGCATCAGAGTTTCTGAGATGGAAGAGTGTCACTAAAAGATGGGAAGAGTAGGGGCCTTAATACCTCTATGGATGTGACATTAGTGACTATTATTAAGGAAGTCAT-ATACAGCG-ACAGT--CGAAAGGAC-A-G-CT-GTTTATACTGCATATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCATTTAGT---TA---TTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGAGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTTC-TTCGATTTCAGGTTCTGGGTATAGAGACATAATGTGTGTGTTGCAGAAGAGG
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gi|19 : ataaaaaaaatctgataaaacctcttttgattttaggttctgcgtagagacataacaagtgcgttttagacgaggaggcctggtgttaacttcgaagatgtattattacaccaggacaacgcgtctgcccaaacggcacagatgactatgctagaaatctgcctgcttggttttgggatagtgaaacaccctgcctactctccagattttgcccctatggacttccgtgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcttttcaggaactgttttatgcggtacatcgtgcagtgtctggttaagaccctgaatggtttacgcttatgttttgtcagtggatcgctcgacacgagatatgtattacacacaaaggagtttacatagagaaatgactgatatacgtattgtgacaggaatacggcgtcacagacgttattttgtgtttgttgacgctctctgtacgtctgttacaggcactgtgtttatgtatttcttgtgcaaacgtcttgacattttcaggtatcgtgtattaaagattggatatcatgtggaatgattttcattaatgtaaaacataacatatagaagtaataaactGGGTGATCCAG----AAATAACCGGATTGctcgtacaaaccctgaaacagtatcaacaaaattagaatatgtacaaacactaaaactg
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gi|25 : catcttcctcaccgatcgccaggggatgatcctccagcatgcagataTGCTGCGTATTATGTAAAAGTGAATTTCATTTGAAATTTGAAACACAAAATAAATCTATTAGT---TA---TTATAATATAACTCTACTAATAATTTATTTGAGATAAAATGCTATTCTTTTTCTTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATTTTctgttgttgttctttttgtttttttaatgcttgcatttttcccccaaattaaatttgttcttaagtaggctttttaatgatttagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaaacacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatataaatacggtataatgataataaattacatgttcagtgtatgctacgtaattgtcatgttaatagaaacgttattaactcatttggcttcaggttctgcatagagacgtaacgcatgagttgcagaggagaaggaccggtatgttaacctcgattatgtattataacaccagaacaacacgcctacccacacagtggagatgactatgctggtgatcgtcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgcctactctccagatttggcccctatggacctacgcgtgttaaatgtcgttaagttagatttgaaggattataggcttggttattttcaggaactgctacgtagctaactactcaaatgttggtgatttttcgaa
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gi|8 : catcttcctcaccgatcgccaggggatgatcctccagcatgcagataatgctgtgtattatggaaaagtaagtttcatttgaaatacaaaataaatcaattagctgtaataatttaactttataagtaatttatttgcgataaaacatttttcttttttaaattctgttgttgttctttttgtttttttaatgcttgcatttttcccccaaattaaatttgttcttaagtaggctttttaatgatttagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaaacacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatataaatacggtataatgataaTAAATTACATGTTCAGTGTATGCTACGTAATTGTCATGTTAAT--AGAAACATT--ATT--AACTCA-TTTGGCTTCAGGTTCTGCG--TAAAGACGTAACGCAAGAGTTGCAGTAGAGaaggaccggtatgttaacctcgattatgtattataacaccagaacaacacgcctacccacacagtggagatgactatgctggtgatcgtcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgcctactctccagatttggcccctatggacctacgcgtgttaaatgtcgttaagttagatttgaaggattataggcttggttattttcaggaactgctacgtagctaactactcaaatgttggtgatttttcgaa
gi|2 : tgatcacagatgaagcttggctctattaatttgatttggaaacaaaaaaaacaaaatccccccgatggtcgccaatacctaagaaagtgaaagtctgcaaaacatccggcaagcaaatgtacatcttcctcaccgatcgccatgggatgattttccatcatgcagagccgataggacagtttgtaaatgatgtgtattatggaaaagtaagtttcatttgaaatacaaaataaatcaattgttatgatataactctcttagtaattaatatgcgattaaacatttttcttttttaatttctgttgttgttctttttgtttttttaaagtttccattttccccaagttaaatttgttcttaagtaggctttatgatgattaagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaagcacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatatatatatacggtttaatgataataaAAT-AATAAAAATCTGATTAAAACTCT-TTTGATTTTAGGCTCTGCG--TAGAGACACAACGCGTGCATTGCAGAAGAGGaagaccggtgtgttaacctcgattatgtagtattaaaccagaacaacacgcctgcccacacagcggagatgactatgctggagatcggtctgcttggatttgggttagtggaacatcctgcctactctcccgatttggcccctacggacctacgcgtgtt
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattattttttcattttttttttttattaaaaaaaaccataaaagtatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccAT-AAAAAAAATCTGA-TAAAACCTCTTTTGATTTTAGGTTCTGCG--TAGAGACATAACAAGTGCGTTTTAGACGAGGaagcccgtattaacctcgaagatgtataattacaccaggacaacgcgactgcccacacggcgcagatgactatgctggggatctgcctgcttggttgttggttaatggaacaccctgcctactctccagatttttacccctatggacttgcgcgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcctttcaggaactgtcttatgcggtacctcgtatagtgtctggtttagactctgaatggtatacggatatgtttggtcagttgatcgcttggtgcgagaaatgtattatactcaaaggagtttacatagagaaaatactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacgtcaccgacgttattttgtgtttgatgatgctccccgcatggctgttacaggcagtttgtttatgtatgtagcttcattgtttcttgtgcaaacgtcttgaaattttcaggtatcgtgtattgaagattggacatcatgtggaatgattttcattaatgtaacacataacatatagaagttagacacccaatccggttatttctggatcacccctcgtatattggtaatgaaatatcgtttaaactaaattattacaaacctgagg
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1122 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-TAT------T-TACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGA-A-TTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAAATCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAA-AAACTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACAGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAAGACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATGTTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAANATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCGC-TAGAGACNTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
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gi|6 : cgcccgggtcgccaacacctaaaaaagaaaaagtctcaagatatccggcaatccagcatgcagtgccgataggacagactgttaatgctgcgtattatggaatagtaagtttcgtttgaaatttaaaatgcaaaaaaaaaatttagttattataacataactctactagtaatttatttgctataaaatgttgttttttaaattacttaatcagtgtatgctacgcaattgtcatgttaatacaaaaattctcattgaaactcattttgcttcaggttcagtgtagatacttaacgagtgcgttgcagaagagggggccccgtgtaaacctcgaaatgtactattacaccaggacaacgcgcctgcctacacgccgcagatgactttgctggagattagcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgtctacttgccagatttggcccctatggacttccgcttgtttcctgttttgaagtctgctttgaagtgttacaggtttttttgctttcaggaactttcttatgtggtacattgtgtagtgtcttgtgtctggtacgagaaatgtattacactcaaaggagttgatatagagaagtaactgatatacatattgtgttacacgatataacccgacgatgctccccgcatttctgttactggcggtgtgtttattcatgtcgtttaattgttgcttgcgcaaacgttttgatatgtttaggtatcaaataataaagattagacagtatgcgtaatgtgtttcattaatttaacacataacacacagaacaaataaactTATACAGCGACAGTCGAAAGGACAG-CTGTTTATACTGCATATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCATTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGAGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTTCTTCGATTTCAGGTTCTGGGTATAGAGACATAATGTGTGTGTTGCAGAAGAGGctcgtacaaggatatcgattagtatttcagaagcactaaacc
gi|6 : GGATGATCCAA----AGATAACCGGATTGaggcctggtgttaacctcgaagatgtaccatttcactaggacaatgcgcctgcccacacatgctgaagattggcatgcttggctttgggttagtgggacatcctgtctactcttcagatttggcccctatggactcccatgtatatcctgtggtgaactcagcttttaagggatacatgtctggttactttaaggaattgtcttatgtggtacatcttgtagtgtctggtttagaccgtaaatggtatatggatatatttgatcaatggatcgctcagcatgagaaatgtataacacttaaaggagattacatagagaaatgactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacatcatcagacgttattttgtgttcgatgacgtccccccatgtctgttacaggcagtatgcttatgtaggttacttcattgtttcttgtgcaaacatcttgaaattttcaggtatcaagtattaaagattggacatcatgcaaactgtttttctttaatgtaacacataacaaacagaagtaatagattcaatccggttatctttggatcatccctcgtat
gi|7 : tatacagcgacagtcgaaaggacagctgtttatactgcatattatggaaaagtaagtttcatttgaaatttgaaatacaaaataaatcatttagttattataatataactctactagtaatttatttgagataaaatattattcttttttaaattatatgttcagtgtatgctacgcaattgtcatgttaataaaaaagatctgattaaaacttcttcgatttcaggttctgggtatagagacataatgtgtgtgttgcagaagaggaggcctggtgttaacctcgaagatgtaccatttcactaggacaatgcgcctgcccacacatgctgaagattggcatgcttggctttgggttagtgggacatcctgtctactcttcagatttggcccctatggactcccatgtatatcctgtggtgaactcagcttttaagggatacatgtctggttactttaaggaattgtcttatgtggtacatcttgtagtgtctggtttagaccgtaaatggtatatggatatatttgatcaatggatcgctcagcatgagaaatgtataacacttaaaggagattacatagagaaatgactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacatcatcagacgttattttgtgttcgatgacgtccccccatgtctgttacaggcagtatgcttatgtaggttacttcattgtttcttgtgcaaacatcttgaaattttcaggtatcaagtattaaagattggacatcatgcaaactgtttttctttaatgtaacacataacaaacagaagtaatagattGGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTCCCCCTGTATCT---TTTTT-ATTTTACGGATTCC-TAAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---GTTCATGCCAAATCTAAAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTTAT-TGTATTCGTA----------ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGTCTCGTGTCGTTTT-AAGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAAAT-GATCAACTTCTAAATGTGA-AATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTTGACGTCAT-ATAACAAAATCTCAACTTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAGCAACAAAATATTAAGGAAAACTACTGGTTGTTTATTACGGCGTTATTTAAGTCAC-AAGAAACGCACGCAATAATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGACAACCGAAACGTATGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGGAAA-AAA-TGTCACAAATGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGG-TCTGAGACCGAAGAGTGTCACAAGAACATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAATACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAGTTAAAGACGTCGTATACAGCAACAGGCGATAGGACAAACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTAATTTGAAATTTGAAACCCAAAATAAATCTGTTAGTTAATATTATAATATAACTCTACTAGTAATTCATTTGCGATAAAATGTTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTctcgtat
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gi|8 : tgatcacagatgaagcttggctctattaatttgatttggaaacaaaaaaaacaaaatccccccgatggtcgccaatacctaagaaagtgaaagtctgcaaaacatccggcaagcaaatgtacatcttcctcaccgatcgccatgggatgattttccatcTAAATTACATGTTCAGTGTATGCTACGTAATTGTCATGTTAAT--AGAAACATT--ATT--AACTCATTTGGCTTCAGGTTCTGCG--TAAAGACGTAACGCAAGAGTTGCAGTAGAGctgttgttgttctttttgtttttttaaagtttccattttccccaagttaaatttgttcttaagtaggctttatgatgattaagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaagcacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatatatatatacggtttaatgataataataaattacatgttcagtgtatgctacgtaattgtcatgttaatagaaacattattaactcatttggcttcaggttctgcgtaaagacgtaacgcaagagttgcagtagagaagaccggtgtgttaacctcgattatgtagtattaaaccagaacaacacgcctgcccacacagcggagatgactatgctggagatcggtctgcttggatttgggttagtggaacatcctgcctactctcccgatttggcccctacggacctacgcgtgtt
gi|9 : tgatcacagatgaagcttggctctattaatttgatttggaaacaaaaaaaacaaaatccccccgatggtcgccaatacctaagaaagtgaaagtctgcaaaacatccggcaagcaaatgtacatcttcctcaccgatcgccatgggatgattttccatcatgcagagccgataggacagtttgtaaatgatgtgtattatggaaaagtaagtttcatttgaaatacaaaataaatcaattgttatgatataactctcttagtaattaatatgcgattaaacatttttcttttttaatttctgttgttgttctttttgtttttttaaagtttccattttccccaagttaaatttgttcttaagtaggctttatgatgattaagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaagcacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatatatatatacggtttaatgataataaTAATGCTGTGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTT-------GAAATACAAAATAAATCAATTAGC---TGTAATAATTTAACTTTATAAGTAATTTATTTGCGATAAAACATTTTTCTTTT--TTAAATTaagaccggtgtgttaacctcgattatgtagtattaaaccagaacaacacgcctgcccacacagcggagatgactatgctggagatcggtctgcttggatttgggttagtggaacatcctgcctactctcccgatttggcccctacggacctacgcgtgtt
gi|9 : catcttcctcaccgatcgccaggggatgatcctccagcatgcagaTAAATTACATGTTCAGTGTATGCTACGTAATTGTCATGTTAAT-AGAAACG---TTATT--AACTCATTTGGCTTCAGGTTCTGCA--TAGAGACGTAACGCATGAGTTGCAGAGGAGctgttgttgttctttttgtttttttaatgcttgcatttttcccccaaattaaatttgttcttaagtaggctttttaatgatttagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaaacacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatataaatacggtataatgataataaattacatgttcagtgtatgctacgtaattgtcatgttaatagaaacgttattaactcatttggcttcaggttctgcatagagacgtaacgcatgagttgcagaggagaaggaccggtatgttaacctcgattatgtattataacaccagaacaacacgcctacccacacagtggagatgactatgctggtgatcgtcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgcctactctccagatttggcccctatggacctacgcgtgttaaatgtcgttaagttagatttgaaggattataggcttggttattttcaggaactgctacgtagctaactactcaaatgttggtgatttttcgaa
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|20 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|22 ): CTTCCTAGATAGTATTATTACGAACGATAAAACGTGGCTATTTCTTTATGACAAGAGACCAAGGAACAATCCAGACAATGGAAGACAGACTCTTCAATCCCTCTTAAGAAAGCACGGCGGACAAAATTCCTTCGAAAACAAATGTAGATATTCTTTATGGACAGGTCGGGGATGA
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Reference ( family-1122 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCTAT---TCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-TAT--------TACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCATA-TAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
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gi|11 : ataaaaaaaatctgataaaacctcttttgattttaggttctgcgtagagacataacaagtgcgttttagacgaggaggcctggtgttaacttcgaagatgtattattacaccaggacaacgcgtctgcccaaacggcacagatgactatgctagaaatctgcctgcttggttttgggatagtgaaacaccctgcctactctccagattttgcccctatggacttccgtgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcttttcaggaactgttttatgcggtacatcgtgcagtgtctggttaagaccctgaatggtttacgcttatgttttgtcagtggatcgctcgacacgagatatgtattacacacaaaggagtttacatagagaaatgactgatatacgtattgtgacaggaatacggcgtcacagacgttattttgtgtttgttgacgctctctgtacgtctgttacaggcactgtgtttatgtatttcttgtgcaaacgtcttgacattttcaggtatcgtgtattaaagattggatatcatgtggaatgGGGTGATCCAG----AATTAA---G--TACCCCTGTATCT---TTTT-CATTTAACAGATTTC-TTGT----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCTAT---TCATACCAAATCTATAACTA----GAACGATTATCATTTCAGACAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-CTT--------T-CTTTAGCAACCCATTGACGT-TTAAGTTGGGCTCATGTCTTTTT-ATGTTTTAAAGTGTAAAATGTAAGCTAAATT-GATCATATCTTAAATGGGATATTTTGGCGCTGAAAAGCATGATTATTACTTTACATTTTCAACATCATA-TAACAAAATCTCAACGTCATTCCTGCTTCCGTAAGTAAACAACAAGGTATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTATGGCATCATTTGAGTCAC-AGGAAACACGTGCAATTAGCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATCCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGACATCTACGGGTAAAAAA-CTGTCACGGAAGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCAGAGACATAAGAGTGTCAATAGAAGATGAGAAGGGGTGGGGGTGTAAGACCTCAATGGATGCAATGTTAGTGACTATAATTAAGGACATTGTATACAGCTACAGctcgtacaaaccctgaaacagtatcaacaaaattagaatatgtacaaacactaaaactg
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gi|21 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattattttttcattttttttttttattaaaaaaaaccataaaagtatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaataataaaaatctgattaaaactcttttgattttaggctctgcgtagagacacaacgcgtgcattgcagaagaggaagcccgtattaacctcgaagatgtataattacaccaggacaacgcgactgcccacacggcgcagatgactatgctggggatctgcctgcttggttgttggttaatggaacaccctgcctactctccagatttttacccctatggacttgcgcgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcctttcaggaactgtcttatgcggtacctcgtatagtgtctggtttagactctgaatggtatacggatatgtttggtcagttgatcgcttggtgcgagaaatgtattatactcaaaggagtttacatagagaaaatactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacgtcaccgacgttattttgtgtttgatgatgctccccgcatggctgttacaggcagtttgtttatgtatgtagcttcattgtttcttgtgcaaacgtcttgaaattttcaggtatcgtgtattgaagattggacatcatgtggaatgATACAGCAACAGGCGATAGGACAAACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTAATTTGAAATTTGAAACCCAAAATAAATCTGTTAGTTAATATTATAATATAACTCTACTAGTAATTCATTTGCGATAAAATGTTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTActcgtatattggtaatgaaatatcgtttaaactaaattattacaaacctgagg
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gi|5 : tGCCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAATAGTAAGTTTCGTTTGAAATTTAAAATGCAAAAAAAA-AATTTAGT---TATTATAACATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCTATAAAATGTTGTT---TT--TTAAATTACTTAATCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-ACAAAAATTCTCATTGAAACTCATTTTGCTTCAGGTTCAGTG--TAGATACTTAACGAGTGCGTTGCAGAAGAGGaatcgtgtcaggtatcgtgtatt
gi|5 : cgcccgggtcgccaacacctaaaaaagaaaaagtctcaagatatccggcaatccagcatgcagtGGGTGATCCAG----AAATAATCAGATTGgggccccgtgtaaacctcgaaatgtactattacaccaggacaacgcgcctgcctacacgccgcagatgactttgctggagattagcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgtctacttgccagatttggcccctatggacttccgcttgtttcctgttttgaagtctgctttgaagtgttacaggtttttttgctttcaggaactttcttatgtggtacattgtgtagtgtcttgtgtctggtacgagaaatgtattacactcaaaggagttgatatagagaagtaactgatatacatattgtgttacacgatataacccgacgatgctccccgcatttctgttactggcggtgtgtttattcatgtcgtttaattgttgcttgcgcaaacgttttgatatgtttaggtatcaaataataaagattagacagtatgcgtaatgtgtttcattaatttaacacataacacacagaacaaataaactcaatctgattatttctggatcacccctcgtacaaggatatcgattagtatttcagaagcactaaacc
gi|6 : cgcccgggtcgccaacacctaaaaaagaaaaagtctcaagatatccggcaatccagcatgcagtgccgataggacagactgttaatgctgcgtattatggaatagtaagtttcgtttgaaatttaaaatgcaaaaaaaaaatttagttattataacataactctactagtaatttatttgctataaaatgttgttttttaaattacttaatcagtgtatgctacgcaattgtcatgttaatacaaaaattctcattgaaactcattttgcttcaggttcagtgtagatacttaacgagtgcgttgcagaagagggggccccgtgtaaacctcgaaatgtactattacaccaggacaacgcgcctgcctacacgccgcagatgactttgctggagattagcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgtctacttgccagatttggcccctatggacttccgcttgtttcctgttttgaagtctgctttgaagtgttacaggtttttttgctttcaggaactttcttatgtggtacattgtgtagtgtcttgtgtctggtacgagaaatgtattacactcaaaggagttgatatagagaagtaactgatatacatattgtgttacacgatataacccgacgatgctccccgcatttctgttactggcggtgtgtttattcatgtcgtttaattgttgcttgcgcaaacgttttgatatgtttaggtatcaaataataaagattagacagtatgcgtaatgtgtttcattaatttaacacataacacacagaacaaataaactTATACAGCGACAGTCGAAAGGACAG-CTGTTTATACTGCATATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCATTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGAGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTTCTTCGATTTCAGGTTCTGGGTATAGAGACATAATGTGTGTGTTGCAGAAGAGGctcgtacaaggatatcgattagtatttcagaagcactaaacc
gi|6 : GGATGATCCAA----AGATAACCGGATTGaggcctggtgttaacctcgaagatgtaccatttcactaggacaatgcgcctgcccacacatgctgaagattggcatgcttggctttgggttagtgggacatcctgtctactcttcagatttggcccctatggactcccatgtatatcctgtggtgaactcagcttttaagggatacatgtctggttactttaaggaattgtcttatgtggtacatcttgtagtgtctggtttagaccgtaaatggtatatggatatatttgatcaatggatcgctcagcatgagaaatgtataacacttaaaggagattacatagagaaatgactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacatcatcagacgttattttgtgttcgatgacgtccccccatgtctgttacaggcagtatgcttatgtaggttacttcattgtttcttgtgcaaacatcttgaaattttcaggtatcaagtattaaagattggacatcatgcaaactgtttttctttaatgtaacacataacaaacagaagtaatagattcaatccggttatctttggatcatccctcgtat
gi|7 : tatacagcgacagtcgaaaggacagctgtttatactgcatattatggaaaagtaagtttcatttgaaatttgaaatacaaaataaatcatttagttattataatataactctactagtaatttatttgagataaaatattattcttttttaaattatatgttcagtgtatgctacgcaattgtcatgttaataaaaaagatctgattaaaacttcttcgatttcaggttctgggtatagagacataatgtgtgtgttgcagaagaggaggcctggtgttaacctcgaagatgtaccatttcactaggacaatgcgcctgcccacacatgctgaagattggcatgcttggctttgggttagtgggacatcctgtctactcttcagatttggcccctatggactcccatgtatatcctgtggtgaactcagcttttaagggatacatgtctggttactttaaggaattgtcttatgtggtacatcttgtagtgtctggtttagaccgtaaatggtatatggatatatttgatcaatggatcgctcagcatgagaaatgtataacacttaaaggagattacatagagaaatgactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacatcatcagacgttattttgtgttcgatgacgtccccccatgtctgttacaggcagtatgcttatgtaggttacttcattgtttcttgtgcaaacatcttgaaattttcaggtatcaagtattaaagattggacatcatgcaaactgtttttctttaatgtaacacataacaaacagaagtaatagattGGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTCCCCCTGTATCT---TTTTT-ATTTTACGGATTCC-TAAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCTGT---TCATGCCAAATCTAAAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTTAT-TGTATTCGTA----------ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGTCTCGTGTCGTTTT-AAGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAAAT-GATCAACTTCTAAATGTGAAATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTTGACGTCATA-TAACAAAATCTCAACTTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAGCAACAAAATATTAAGGAAAACTACTGGTTGTTTATTACGGCGTTATTTAAGTCAC-AAGAAACGCACGCAATAATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGACAACCGAAACGTATGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGGAAAAAA--TGTCACAAATGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGG-TCTGAGACCGAAGAGTGTCACAAGAACATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAATACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAGTTAAAGACGTCGTATACAGCAACAGGCGATAGGACAAACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTAATTTGAAATTTGAAACCCAAAATAAATCTGTTAGTTAATATTATAATATAACTCTACTAGTAATTCATTTGCGATAAAATGTTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTctcgtat
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gi|9 : tgatcacagatgaagcttggctctattaatttgatttggaaacaaaaaaaacaaaatccccccgatggtcgccaatacctaagaaagtgaaagtctgcaaaacatccggcaagcaaatgtacatcttcctcaccgatcgccatgggatgattttccatcatgcagagccgataggacagtttgtaaatgatgtgtattatggaaaagtaagtttcatttgaaatacaaaataaatcaattgttatgatataactctcttagtaattaatatgcgattaaacatttttcttttttaatttctgttgttgttctttttgtttttttaaagtttccattttccccaagttaaatttgttcttaagtaggctttatgatgattaagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaagcacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatatatatatacggtttaatgataataaTAATGCTGTGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTT-------GAAATACAAAATAAATCAATTAGC---TGTAATAATTTAACTTTATAAGTAATTTATTTGCGATAAAACATTTTTCTTTT--TTAAATTaagaccggtgtgttaacctcgattatgtagtattaaaccagaacaacacgcctgcccacacagcggagatgactatgctggagatcggtctgcttggatttgggttagtggaacatcctgcctactctcccgatttggcccctacggacctacgcgtgtt
gi|9 : catcttcctcaccgatcgccaggggatgatcctccagcatgcagaTAAATTACATGTTCAGTGTATGCTACGTAATTGTCATGTTAAT-AGAAACG---TTATTAA--CTCATTTGGCTTCAGGTTCTGCA--TAGAGACGTAACGCATGAGTTGCAGAGGAGctgttgttgttctttttgtttttttaatgcttgcatttttcccccaaattaaatttgttcttaagtaggctttttaatgatttagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaaacacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatataaatacggtataatgataataaattacatgttcagtgtatgctacgtaattgtcatgttaatagaaacgttattaactcatttggcttcaggttctgcatagagacgtaacgcatgagttgcagaggagaaggaccggtatgttaacctcgattatgtattataacaccagaacaacacgcctacccacacagtggagatgactatgctggtgatcgtcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgcctactctccagatttggcccctatggacctacgcgtgttaaatgtcgttaagttagatttgaaggattataggcttggttattttcaggaactgctacgtagctaactactcaaatgttggtgatttttcgaa
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1122 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCTAT---TCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTCTGT--------TACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCATA-TAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
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gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattattttttcattttttttttttattaaaaaaaaccataaaagtatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccGGGTGATCCAG----AAATAACCGGATTG----GGTGTCTAACTTCTATATGTTATGTGTTACATTA-----ATGAAAATaagcccgtattaacctcgaagatgtataattacaccaggacaacgcgactgcccacacggcgcagatgactatgctggggatctgcctgcttggttgttggttaatggaacaccctgcctactctccagatttttacccctatggacttgcgcgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcctttcaggaactgtcttatgcggtacctcgtatagtgtctggtttagactctgaatggtatacggatatgtttggtcagttgatcgcttggtgcgagaaatgtattatactcaaaggagtttacatagagaaaatactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacgtcaccgacgttattttgtgtttgatgatgctccccgcatggctgttacaggcagtttgtttatgtatgtagcttcattgtttcttgtgcaaacgtcttgaaattttcaggtatcgtgtattgaagattggacatcatgtggaatgattttcattaatgtaacacataacatatagaagttagacacccaatccggttatttctggatcacccctcgtatattggtaatgaaatatcgtttaaactaaattattacaaacctgagg
gi|21 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattattttttcattttttttttttattaaaaaaaaccataaaagtatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaataataaaaatctgattaaaactcttttgattttaggctctgcgtagagacacaacgcgtgcattgcagaagaggaagcccgtattaacctcgaagatgtataattacaccaggacaacgcgactgcccacacggcgcagatgactatgctggggatctgcctgcttggttgttggttaatggaacaccctgcctactctccagatttttacccctatggacttgcgcgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcctttcaggaactgtcttatgcggtacctcgtatagtgtctggtttagactctgaatggtatacggatatgtttggtcagttgatcgcttggtgcgagaaatgtattatactcaaaggagtttacatagagaaaatactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacgtcaccgacgttattttgtgtttgatgatgctccccgcatggctgttacaggcagtttgtttatgtatgtagcttcattgtttcttgtgcaaacgtcttgaaattttcaggtatcgtgtattgaagattggacatcatgtggaatgATACAGCAACAGGCGATAGGACAAACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTAATTTGAAATTTGAAACCCAAAATAAATCTGTTAGTTAATATTATAATATAACTCTACTAGTAATTCATTTGCGATAAAATGTTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTActcgtatattggtaatgaaatatcgtttaaactaaattattacaaacctgagg
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gi|5 : cgcccgggtcgccaacacctaaaaaagaaaaagtctcaagatatccggcaatccagcatgcagtGGGTGATCCAG----AAATAATCAGATTGgggccccgtgtaaacctcgaaatgtactattacaccaggacaacgcgcctgcctacacgccgcagatgactttgctggagattagcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgtctacttgccagatttggcccctatggacttccgcttgtttcctgttttgaagtctgctttgaagtgttacaggtttttttgctttcaggaactttcttatgtggtacattgtgtagtgtcttgtgtctggtacgagaaatgtattacactcaaaggagttgatatagagaagtaactgatatacatattgtgttacacgatataacccgacgatgctccccgcatttctgttactggcggtgtgtttattcatgtcgtttaattgttgcttgcgcaaacgttttgatatgtttaggtatcaaataataaagattagacagtatgcgtaatgtgtttcattaatttaacacataacacacagaacaaataaactcaatctgattatttctggatcacccctcgtacaaggatatcgattagtatttcagaagcactaaacc
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gi|9 : tgatcacagatgaagcttggctctattaatttgatttggaaacaaaaaaaacaaaatccccccgatggtcgccaatacctaagaaagtgaaagtctgcaaaacatccggcaagcaaatgtacatcttcctcaccgatcgccatgggatgattttccatcatgcagagccgataggacagtttgtaaatgatgtgtattatggaaaagtaagtttcatttgaaatacaaaataaatcaattgttatgatataactctcttagtaattaatatgcgattaaacatttttcttttttaatttctgttgttgttctttttgtttttttaaagtttccattttccccaagttaaatttgttcttaagtaggctttatgatgattaagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaagcacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatatatatatacggtttaatgataataaTAATGCTGTGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTT-------GAAATACAAAATAAATCAATTAGC---TGTAATAATTTAACTTTATAAGTAATTTATTTGCGATAAAACATTTTTCTTTT--TTAAATTaagaccggtgtgttaacctcgattatgtagtattaaaccagaacaacacgcctgcccacacagcggagatgactatgctggagatcggtctgcttggatttgggttagtggaacatcctgcctactctcccgatttggcccctacggacctacgcgtgtt
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Reference ( family-1122 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
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Reference ( family-1122 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
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gi|9 : tgatcacagatgaagcttggctctattaatttgatttggaaacaaaaaaaacaaaatccccccgatggtcgccaatacctaagaaagtgaaagtctgcaaaacatccggcaagcaaatgtacatcttcctcaccgatcgccatgggatgattttccatcatgcagagccgataggacagtttgtaaatgatgtgtattatggaaaagtaagtttcatttgaaatacaaaataaatcaattgttatgatataactctcttagtaattaatatgcgattaaacatttttcttttttaatttctgttgttgttctttttgtttttttaaagtttccattttccccaagttaaatttgttcttaagtaggctttatgatgattaagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaagcacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatatatatatacggtttaatgataataaTAATGCTGTGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTT-------GAAATACAAAATAAATCAATTAGC---TGTAATAATTTAACTTTATAAGTAATTTATTTGCGATAAAACATTTTTCTTTT--TTAAATTaagaccggtgtgttaacctcgattatgtagtattaaaccagaacaacacgcctgcccacacagcggagatgactatgctggagatcggtctgcttggatttgggttagtggaacatcctgcctactctcccgatttggcccctacggacctacgcgtgtt
gi|9 : catcttcctcaccgatcgccaggggatgatcctccagcatgcagaTAAATTACATGTTCAGTGTATGCTACGTAATTGTCATGTTAAT-AGAAACG---TTATTAA--CTCATTTGGCTTCAGGTTCTGCA--TAGAGACGTAACGCATGAGTTGCAGAGGAGctgttgttgttctttttgtttttttaatgcttgcatttttcccccaaattaaatttgttcttaagtaggctttttaatgatttagaatgtgtctatgttttatacactgtatgtattttttgttttgtaaaacacttatgagcgtattttatatatgaaaagaatgctatataaatacggtataatgataataaattacatgttcagtgtatgctacgtaattgtcatgttaatagaaacgttattaactcatttggcttcaggttctgcatagagacgtaacgcatgagttgcagaggagaaggaccggtatgttaacctcgattatgtattataacaccagaacaacacgcctacccacacagtggagatgactatgctggtgatcgtcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgcctactctccagatttggcccctatggacctacgcgtgttaaatgtcgttaagttagatttgaaggattataggcttggttattttcaggaactgctacgtagctaactactcaaatgttggtgatttttcgaa
blockSeqs : CCAG AAC TC CA . A ATA GAAC A A TATATATTCTAT A T A C T A A A AC A AC T T GGT C CC A G T A G TAA TC G A A T TA A
blockSeqs : . . AT C . A . . . . GTT . . . C T T A . CC . A C T TAT T CG T T G A A TAA . . A A T TA A
blockSeqs : . . TC T . T . . . . GTT . . . C C T T . AC . C C T GGT C GA T T C A T . . . G A C . A
blockSeqs : . . TC A . A . . . . GTA . . . C A T T . AC . C C T GTT T TG G G T A T . . . T A T . C
blockSeqs : . . TC C . A . . . . GTT . . . C . T A . A . . T . GG T CC G T G T T . . . A G A . T
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blockSeqs : . . C C . A . . . . . A . . . G . A . G
blockSeqs : . . C C . A . . A . .
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originalCons : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
finalCons : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATAACGCGCCTGTCCACACGGCACATCCTGAAATCTATGCTGGCGATCGGCCAGCTTGGCTTTAGGTTAGTGGAAACTGCCTACCTGCCTGAGTTGGCACCTGTGGACTGATGTGTGTTTCATGTCGTGAAGTCAGCTTTGAAGGGTTACATGTTTGAATTCTTTCAAGAACGACATTTCGCGGTACATCATAAAGTGTCAGGTTTAGACCCTGAATGGTATACGGATGTGTTTGATCAATGGATCAATTATTTCATGGTAACTTGTTCAATATACTTGAAAATGTTTAAACATATGTAAGTATGTATGTGTTATAGAATAAATA
Unaligned ( gi|17 ): CGAATGAAGGTTCCTCGCTTGCTTAAAGAAGAAGATCAGCAACGCCGAGATGAAAGCTCTACGACGCCTTCTACGGCGTTATGATACGGAGGGAGACAATTGCCTAGATAGAATAATCACGATTGATGAAACACGGCTCCATCACTTTGACCCAGAAACGCAGTCATCTGTTTGGAAAACGCCAAGAATATATCCACCTTAACAGGCAAGAATACAGAAAAGCTCTTGTAAAGAAATGTTCATTTTTTTCTCGACCGACACGGCATGAT
Unaligned ( gi|20 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|22 ): CTTCCTAGATAGTATTATTACGAACGATAAAACGTGGCTATTTCTTTATGACAAGAGACCAAGGAACAATCCAGACAATGGAAGACAGACTCTTCAATCCCTCTTAAGAAAGCACGGCGGACAAAATTCCTTCGAAAACAAATGTAGATATTCTTTATGGACAGGTCGGGGATGA
Unaligned ( gi|23 ): ATGAATTATAGGATAGAATAATCACCATGAACGAAACATGGTTGCATTTCTATTATCAGGAATCAGTTTTCAGTCTGAAAACGTTCAATATCACCACCTCCAGAAATGGCAAGAGTCAATAAACCAGCAATGAAGTACATCTTCATTATGTGCATGGACACACAAGCAATGATC
Unaligned ( gi|27 ): TTTGACCCGGTCTCCATATCGCTATCATAATTATGGAAAACTCCACAAACATCTCTGCTTATAAAATCTCGGCAAACAATTCTGCTTGTAAACAAATGTTTGTAGTCTTTATGGATCGAAATGGCAATGATT
Unaligned ( gi|29 ): TACACCAGAACAACACGCCTGCCCTAACAGCGGAGATGACTAAGCTTGAGATCGGCCTGCTTGGCTTTGGGTTAGTGGAACATCCTGCC
Unaligned ( gi|30 ): TCTTCTTCGCCGATCGCCAGGTGATGATTTTCCAGCATGCAGTGCCGATAA
Unaligned ( gi|31 ): GTTGTGTAAACACCATTTTAAAAAAAATAATT
Alignments
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lowQualScore : .... ... .. .. .... . ... .... . . ............ . . . . . . . . . . .. . . . . .. . . ... . .. . . . . . . ... . .. . . . . .. .
lowQualScore : 3333 888 33 66 1111 4 000 5555 4 4 888888888888 0 0 0 4 3 7 9 7 4 1 11 7 7 1 4 66 3 4 666 0 33 0 0 0 8 5 0 000 3 55 4 7 6 0 22 4
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Reference ( family-1122 ) : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGAAAAGCACGATTATTACTCGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAAGTCTCAACGTCATTCCTGTTTCCGTTAGTAAACAACAAGGCATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTACGGCGTCATTTGAGTCAC-AAGAAACGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATTCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGCATCTACGGGAAAGAAA-CTGTCACGGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACGGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGGCGGGGCCGTAANACCTCTATGGACGCGACGTTAGTGACTACAATTAAGGACGTCGTATACAGCGACAGNCGATAGGACAGACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCANTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGCGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTCNTTTGACTTCAGGTTCTGCG--TAGAGACGTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
gi|1 : CGATAGAACAGATTGTTAATGCTGTGTATTATGGCAAAGTAAGTTTCGTTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCAATTAGT---TATTATAATATAAATTTACTAGCAA-TTATTTGCGATAAAATATTTTTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATACTAGACAATTGTCGTGTGAAT-ACAAA--ATGTGATT-AAACTCTTTTGACTTCAGGTTCTGCT--CAGAGACTTAACGCGTGCGTTGCAGAAGAGG
gi|10 : gcggaagatgggtccctcacttgctctcagattaacataaacaaaaatgtgtaaatgcgtccaggaaattttacagcgttatcgacgtaatggcatcaacctccttgattgcatagtaaccaccgatgaaacatgaatctatttatttgatccagagacgaaagatcaatcccgtcaatggaaaacgcccgggtttccaaaacctaagaaagcgaagatatgcaagacacccggcaagcaaatttacatctcttcgccgatcgcaaggggatgatttctcAT-AAAAAAAATCTGATAAAACCTCTTTTGATTTTAGGTTCTGCG--TAGAGACATAACAAGTGCGTTTTAGACGAGGaggcgcggcgttaacctcgaagatgtattattacaccaggacaacgcgattgcctacacggcgcagatgactatgctggagatcagcctgcttggctttgggttagtggaacaccctgcctactttggcccctatggacttttgtgtgtttcctgtcgtgaaatcagcattgaagggtttcaggtttgattcctttcaggaagtgtcttattcggtacatcatgtagtgtctggtttagaccctgaatggtatacggatatgtttggtctagtggatcgctcggcacgagaaatgtattacactcaaaggagtttacatagagaaatgactgatatatacaattgtgacagagtaacacgacgtcacccgacgttattttgttttttgatgacgagcaagctgacgtctaaagtagaaatatcacatgttcggtactatttgagcagacgtctttgtatatagtttaaacagtaacaaataataa
gi|10 : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGATTGAGTTTATTACT---TCTAT-ATGTTATG----TT-TTACATTAATGAAAATaggcctggtgttaacttcgaagatgtattattacaccaggacaacgcgtctgcccaaacggcacagatgactatgctagaaatctgcctgcttggttttgggatagtgaaacaccctgcctactctccagattttgcccctatggacttccgtgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcttttcaggaactgttttatgcggtacatcgtgcagtgtctggttaagaccctgaatggtttacgcttatgttttgtcagtggatcgctcgacacgagatatgtattacacacaaaggagtttacatagagaaatgactgatatacgtattgtgacaggaatacggcgtcacagacgttattttgtgtttgttgacgctctctgtacgtctgttacaggcactgtgtttatgtatttcttgtgcaaacgtcttgacattttcaggtatcgtgtattaaagattggatatcatgtggaatgattttcattaatgtaaaacataacatatagaagtaataaactcaatccggttatttctggatcacccctcgtacaaaccctgaaacagtatcaacaaaattagaatatgtacaaacactaaaactg
gi|11 : ataaaaaaaatctgataaaacctcttttgattttaggttctgcgtagagacataacaagtgcgttttagacgaggaggcctggtgttaacttcgaagatgtattattacaccaggacaacgcgtctgcccaaacggcacagatgactatgctagaaatctgcctgcttggttttgggatagtgaaacaccctgcctactctccagattttgcccctatggacttccgtgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcttttcaggaactgttttatgcggtacatcgtgcagtgtctggttaagaccctgaatggtttacgcttatgttttgtcagtggatcgctcgacacgagatatgtattacacacaaaggagtttacatagagaaatgactgatatacgtattgtgacaggaatacggcgtcacagacgttattttgtgtttgttgacgctctctgtacgtctgttacaggcactgtgtttatgtatttcttgtgcaaacgtcttgacattttcaggtatcgtgtattaaagattggatatcatgtggaatgGGGTGATCCAG----AATTAA---G--TACCCCTGTATCT---TTTT-CATTTAACAGATTTC-TTGT----ATGAAAATTTCAGCAAGTACACCTCT---ATTCATACCAAATCTATAACTA----GAACGATTATCATTTCAGACAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----CTT----TCTTTAGCAACCCATTGACGT-TTAAGTTGGGCTCATGTCTTTTT-ATGTTTTAAAGTGTAAAATGTAAGCTAAATT-GATCATATCTTAAATGGGATATTTTGGCGCTGAAAAGCATGATTATTACTTTACATTTTCAACATCAT-ATAACAAAATCTCAACGTCATTCCTGCTTCCGTAAGTAAACAACAAGGTATTAAGGAATACTACCGGTTGTTTATTATGGCATCATTTGAGTCAC-AGGAAACACGTGCAATTAGCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATCCGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGACATCTACGGGTAAAAAA-CTGTCACGGAAGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCAGAGACATAAGAGTGTCAATAGAAGATGAGAAGGGGTGGGGGTGTAAGACCTCAATGGATGCAATGTTAGTGACTATAATTAAGGACATTGTATACAGCTACAGctcgtacaaaccctgaaacagtatcaacaaaattagaatatgtacaaacactaaaactg
gi|12 : gagGGGTGATCTAG----AAATAACCGGACTGCCC-TGTATCA---TTTTTCATTTTACGGATTT--TAAC----ATGAATATTTCAGCAACTACACCTCT---ATCCATGCCAAAACTATAACTA----GAACGATTTTCCTTTCAGAAAAAAGTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCGTGTCTTTTTTATGCTTCAAAGTGTAAAATATAAGTTGAATT-GATCCACTT-----------AT-----------AAAGCACGATTATTACTCGACTACTTTGACGTCAT-ATAACAAAATCTCAACTTCATTCTGGTTTTCGTTGGTAAACAACAATACATTAAGGAATACTATTGGTTGTTTATTACGGCGCCATTTAAGTCAC-ATGAAACGCACGCAATTATTAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACAATCGACAACCAAAACGTATGAGATTATACAGCAGGCATCTACGGGAAAAAAA-----CATAAATGCAGGGTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGACCGAAGAGTGTCACTAGAAGATGGGAAGGGACGGGGCCGTAAGACCTCTTTGTACGCAACGTTAGTGACTACAATTTAGGACGTCGTATACAGCGACAGg
gi|13 : agGGATGATCCAG----ACATAATCGGACTGCTCCTGTATAT---TTTAT-ATTTTATAGACTTT-TTAC----AAGAAATGTTCAGTAAATACACCTCT---ATTCATGCCAGATCTGTAAAAA----GTACGATTTTAATTT----------------TCATATTTAT--------------ACTATAGTAACCCATTGACGTATATAGTTGGGCTCGTGTCTTTTT-CTGCTTTAAAGTGTAACATTTAAGTTATATT-GATCAACT---AAATATGATATATTGTCGCTGAAA-GC-CAATTATTACTTGATGTTTTTGACGTTAT-GTAACAAGGTCTCAACGTCATTCCGGTTTCCATTAGTAAACA---AGGCATTAAGGAATACTACCGGTTCCTTATCATGACGTCGTTTGAGTCACAAAAAAAGGCGCGCAATTATCAAATTTTGTTGTCAGCTTGGACATCCGCCAACC-AAATGTATGAGATGATACAGCAGGCATCTACAGGAAGGGAA-ATGTCACGGACACAGGTTTTTGAATGGCATCAGATATTCTGAGACGGAGGAGTGTCACAAGAAAATGGGAAGGGTCGGGGCCGTAATACCTTTATCGACGCGACGTTAGTGATTACAATTAAGGACATCGTGTATATCGAC
gi|14 : gatGGATGATCCAG----AAATAACAGGATTG
gi|15 : tcctgcctactctccagatttggcccctatggacctacgcgtgttaactgtcgttaagttagatttgaagggttataggcttggttatttttaggaactgtcttatgcggtacatcgtgtagtatctggtttagactctgaatggtatacgtatatgtttgattagtggatcgctcggcacgggaaatgtattacactcaaaggagattacatagagaaatgaccgatatacgtattgtaactgtgtaacacaacgtcaaccgatgtctttttgtgtttgatgatgctccccgcatgtctattacaagcaatgttttatatatgtcacttcattgtttcttgtgcaaacgtcttggtactttcaggtatcatgtattaaagatcggacatcatgtggaatagtatcattaattttacacataacataccgaagtcatagactGGTGGTCCAG----AAATAACCGGACTTCCCCTGTATCT---TTTT-CATTTTACGGATTTA-TAAC----ATGAAAATTTCATCAAGTATACCTCT---ATTCACGCCAAATCTAGAACTA----GAACGATTTTTA-------AAAA-GTAATTGTCAT-TTTATTC-----GTT----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTTGGGCTCGTGACTTTTT-ATGCTTTACAGTGTAAATTTTAAGTTAAATTAGATCAACTTCTAAGTGTGA-AATTTGGCGCTAAAAAGCACCATTATTACTTGACGTCTTCGACGTCAT-ATAACAAATTCTCAACGTCAATCCTG-TTCCGTTAGTAAAAACCAAGGCATTAAGGctcgtatacgtaaagatcacggattttagcttaggattataactttaaaatgtgacactattattttaatcagtgaatgtttttatttcattaca
gi|18 : acgagaGGGTGATCCAG----AAATAACCGAACTGCCCCTGTATCT---TTTT-CATTTTACAAATTTC-TTAC----GTGAAA-TTTTAGCAAGTACACCTCT---ATTCATTCCAAATCTATAACTA----GACTGATTTTCATTTCAGAAAAA-A-AATTGTCAT-TTTATTC-----GTA----ACTATAGCAACCCATTGACGT-TAAAGTGGGGCTCATGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAAATTAAAGTTAAATT-GATCACCTTC
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gi|2 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattattttttcattttttttttttattaaaaaaaaccataaaagtatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccGGGTGATCCAG----AAATAACCGGATTG----GGTGTCTAACTTCTATATGTTATGTGTTACATTA-----ATGAAAATaagcccgtattaacctcgaagatgtataattacaccaggacaacgcgactgcccacacggcgcagatgactatgctggggatctgcctgcttggttgttggttaatggaacaccctgcctactctccagatttttacccctatggacttgcgcgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcctttcaggaactgtcttatgcggtacctcgtatagtgtctggtttagactctgaatggtatacggatatgtttggtcagttgatcgcttggtgcgagaaatgtattatactcaaaggagtttacatagagaaaatactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacgtcaccgacgttattttgtgtttgatgatgctccccgcatggctgttacaggcagtttgtttatgtatgtagcttcattgtttcttgtgcaaacgtcttgaaattttcaggtatcgtgtattgaagattggacatcatgtggaatgattttcattaatgtaacacataacatatagaagttagacacccaatccggttatttctggatcacccctcgtatattggtaatgaaatatcgtttaaactaaattattacaaacctgagg
gi|21 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattattttttcattttttttttttattaaaaaaaaccataaaagtatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccaataataaaaatctgattaaaactcttttgattttaggctctgcgtagagacacaacgcgtgcattgcagaagaggaagcccgtattaacctcgaagatgtataattacaccaggacaacgcgactgcccacacggcgcagatgactatgctggggatctgcctgcttggttgttggttaatggaacaccctgcctactctccagatttttacccctatggacttgcgcgtttttcctgtcgtgaaatcagctttgaagggttacaggtttgattcctttcaggaactgtcttatgcggtacctcgtatagtgtctggtttagactctgaatggtatacggatatgtttggtcagttgatcgcttggtgcgagaaatgtattatactcaaaggagtttacatagagaaaatactgatatacgtattgtgactgagtaacacgacgtcaccgacgttattttgtgtttgatgatgctccccgcatggctgttacaggcagtttgtttatgtatgtagcttcattgtttcttgtgcaaacgtcttgaaattttcaggtatcgtgtattgaagattggacatcatgtggaatgATACAGCAACAGGCGATAGGACAAACTGTTAATGCTGCGTATTATGGAAAAGTAAGTTTAATTTGAAATTTGAAACCCAAAATAAATCTGTTAGTTAATATTATAATATAACTCTACTAGTAATTCATTTGCGATAAAATGTTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTActcgtatattggtaatgaaatatcgtttaaactaaattattacaaacctgagg
gi|24 : GGGTGATCTAG----AACTAACAGGACTGCCTCTGTATCT---TTTTTCATTTTACGGATTTT-TTAC----ATGAAACTTTCAGCAAGTACACCTCT---ATACATGCCAAATCTATAACTAGAACGAACGATTTTCAATTCGAAGAAA-GTAATAATCAT-TTTATTT-----GTT----ACCTTAGCAACaattataannnnnnn
gi|25 : cgaTGCTGCGTATTATGTAAAAGTGAATTTCATTTGAAATTTGAAACACAAAATAAATCTATTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAATAATTTATTTGAGATAAAATGCTATTCTTTTTCTTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATTTT
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gi|28 : gagtTTGGTCATTTCCCAATCAAAATGTAAGAAATGATACAGTAGGCATCTACAGGAAAAAAAACTGTCACAGACGCAGGTTTTTGAATGGCATCAGAGGTTCCGAGAGAGAAGAGTGTCACTAGATGACGGGAAG
gi|3 : GGGTGATCCAG----AAATAACCGGACTGCCCCTGCAGCT---TTTTTCATTTCACGGATTTC-TTAC----ATGAAAATTTCAGCAAGGACACCCCT---ATTCATGCCAAATCTATAACTA----GAACGATTTTCATTTCAGAAAGA-GTAACTGTCAT-TTTATTCTATATATTCTATACTCTAGCAACCCATTGACGT-TAACGTGGGGCTCATGTCTTTTT-ATGCTTTAAAGTGTAAATTTTAAGTTAAATT-GATCAACTTCTAAATGTGATATTTTGGCGCTGTAAAGCATGATTATTACTTGATGTCTTCAATGCCAT-ATAACAAAGTCTAAACGTCATTTCTGTTTCCGTTAGTAAACAA---AGCATTTAGGAATACTACCGGTTGTTTATTATGGTGTCATCTGAGTCAC-AAGAAACAAGTGCAATTGTCAAATTT-GTTGTCAGCTAGGACATTAGCCAACCAAAACGTACGAGATGATACAGCAGGTATCTACAGGACAGAAA-CTGTCGTGGACGCAGGTTTT-GAAAGGCATCAGAGTTTCTGAGATGGAAGAGTGTCACTAAAAGATGGGAAGAGTAGGGGCCTTAATACCTCTATGGATGTGACATTAGTGACTATTATTAAGGAAGTCATATACAGCGACAGTCGAAAGGACAG-CTGTTTATACTGCATATTATGGAAAAGTAAGTTTCATTTGAAATTTGAAATACAAAATAAATCATTTAGT---TATTATAATATAACTCTACTAGTAATTTATTTGAGATAAAATATTATTCTTTT--TTAAATTATATGTTCAGTGTATGCTACGCAATTGTCATGTTAAT-AAAAAAGATCTGATTAAAACTTCTTCGATTTCAGGTTCTGGGTATAGAGACATAATGTGTGTGTTGCAGAAGAGG
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Unaligned ( gi|17 ): CGAATGAAGGTTCCTCGCTTGCTTAAAGAAGAAGATCAGCAACGCCGAGATGAAAGCTCTACGACGCCTTCTACGGCGTTATGATACGGAGGGAGACAATTGCCTAGATAGAATAATCACGATTGATGAAACACGGCTCCATCACTTTGACCCAGAAACGCAGTCATCTGTTTGGAAAACGCCAAGAATATATCCACCTTAACAGGCAAGAATACAGAAAAGCTCTTGTAAAGAAATGTTCATTTTTTTCTCGACCGACACGGCATGAT
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Unaligned ( gi|27 ): TTTGACCCGGTCTCCATATCGCTATCATAATTATGGAAAACTCCACAAACATCTCTGCTTATAAAATCTCGGCAAACAATTCTGCTTGTAAACAAATGTTTGTAGTCTTTATGGATCGAAATGGCAATGATT
Unaligned ( gi|29 ): TACACCAGAACAACACGCCTGCCCTAACAGCGGAGATGACTAAGCTTGAGATCGGCCTGCTTGGCTTTGGGTTAGTGGAACATCCTGCC
Unaligned ( gi|30 ): TCTTCTTCGCCGATCGCCAGGTGATGATTTTCCAGCATGCAGTGCCGATAA
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