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Reference ( gi|2 )            :                                                                                   GACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATATG---CAAGAGGAACAACAGCTGGTC-G-AGTACTGTACCTTGTGACACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAAGTAACAAGTACCTGTCAGCTTCTAT----TTGCCAGGAAGCT---CTGTAACC------AA-TGGATCACTTC-ACCGTTGATACCGTAGTGGCGGAGCTTGTAGAGATGGC-GCAGGTGT------GAG--ACTTTGTTGAAG--G------CCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCATC-----GATGTGAT--CTCCC------TCCTC-AGTCCAAGCTG----CG---AGATTTTGGATGGTGAGTATGAG-TTGG--TTCTC-C-GTTGAACGTCACTTCCT---GAATCTATGCTGTTGGTC-AGCTAGAATGTTATGGTAATCTAGATGAC-G-CT-TCAC-T-GA-----CTGTGGTTG------ATGTGCTCCATCAGTTTGCA-GCACACAGAGGTC-AGA--GATATTGGCCTGTAGTTCGC-TGCAGAGGTCCT---GTCCGCC-TTTTTGAAAAACGGTGTTAAA-TG---GCTTT-----CTTCCAGTCT-GCAGGGACTTTTTCCTCAGTCTCAGTGAAGC--GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGGGCAACTCCATTGCAGCTGATGGTAAAATTTTCCATAAGTGGTGTTGGTGAAGTGTCCAAGGTGGGCATGTATGATGTGTCTTCCCCTGTGAAGGATGTGTCTTCCGCTGTGAAGACACTACTGAATTGGTCATTCAGTATTGCGGCCTTGGACTTCGGATCTGAGTGTCCCACACCATTCCTCTTCAGTAGGGAGACCCCGCTGCTATCACATCGTTTGCTGTTGATGAAGGAGTATAACTTCTTTGGGTTCTCGTTTTCAGAGACCATGTCTTGCACATAAGCATTGTAGGCCTGC
gi|12                         :                                                                                    ACAAGACTCT-CCCAAGCATGATAATGATATA---CAGAAGGAACAA--G-TGGCC-G-AGTATTGTGCCTTGTGTCACTACGGAGATGACAGGGGC
gi|3                          :                                                                                      GAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATATA---GAGGAGGAATAACAATGGGCA-G-AGGACACTGCCTTGTG
gi|6                          :                                          tctgtatagggcagtcatctgcgaacagtctcactgtagattcctctACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATATA---CAGGAAGAACAACAGCAGGCC-A-AGTACTGTGCCTTGTGGCACTTCAGAGATGACAGGGGCAGTTGGAGAGGCATGGCCCTC-------AACAAGTACCTGTTGGCTTCTAT----CCACCAGGAAGCTGCTCTGTATCC------AA-TGGATCAGTTC-ACTGCGGATAACGTAGTGACGGAACTTGTAGAGAAGGC-GCAGGTGT------GAG--ACTTTGCCGAAG--G------CCTTACTGAAATCCAGTAGTATGGCGTC-----GATCTTAT--CTCCC------TCCTA-AATCCCAGCTG----CG---TGGTCTTGGATGGTGAGTATGAG-TTGA--GTCCG-C-GTTGAACGTgatttccatattggacggtggctgtagacttgttgagtttgaacacttaggaagtcctctatccacccgaggagattgtgccatttgccaaattactgtagctagaatgcttatcgtctgtggggtaccttgtcagctgccttggagaagtccagtaagatgacgtctgattgacccatggaatccttgctctttgctacatcctggatggggaggattagctgactctcacaggaacgtctcttactgaatccatgttgggtgtcatgtaggatgcaatgttcatcaagatgtctcatgatgtgactgcaaagaatatattccatcatcttacatgttaccaaggttagactgacaggataatcattctcttgctctgtttttctcccctttttcatagccgggaacaatgtttgccaacttccattctggcagtatctttcatggttaagagaagcttggaaaatgacctggaacattggactgatctctacagccagttctttaagcagcctgcaagacactttatcagggcctgttgccttgtgg
gi|1                          :                                                                                         ACCCTGTCCGGG-AGATCGTTGATGTA---GAACAGGAAGAGTAG-TGGTCCA-AGAACTGTGCCCTGTGGCACACCGGAGT-GATAGGAGCGGAGGTTGACATGTGGCCTTC-------AACCAGAACCTG-CTGCCTCTAC----TTGTCAGGAAGCT---CTGAATCC------AGCTCAAT-ACTGG-GCCCCAGATGCTGTAGTGACTCAGCTTG-----AT--CAGCAGTCGTTTGTAAGAG--ATTTTAACAAAG--G------CTTTGCTGAAATCAAGGAGTATGGCGTC-----TATTTGTTAACTGCA------TCT---AATCT----TG----CGGTAAGATCTTGGAGGGTGAGGATGAG-CTGGGATTTGC-A-GT--ATCTTTTCTTGTC---GAAACCATGCTGTTAGTC-TGACAGTATCTACTGAGAGTCAAGTTG-T-GTCA-TGACTT-GG-----CTGTTGATG------ATGTGTTCTAGCATCTTGCA-GCATACAGAGGCA-AGC--AATATTTGCCTATAGTTGGCAGGTAGA-CTTCT---GT-CGCCATTTTTAAATATTGGAGCCACATTT---GCCTG-----TTTCCAATC
gi|16                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttCAGGAAAGTCGTTGATGTGACACAGGAAGATAAACA----GTC-ACAACACTGTGCCTTGTGGAACACCAGAatctgtgaccttgccttcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
gi|5                          :                                                                                                        GTTGTAAATGTA---TAAAAGAAAAAGCAGCC---C-G-AGAACTGCA--TTGAGGGATACCAGAGGTCACAGGTGAAGAGGTAGAGACATTTCCTTCTAC------CATG-ACCTGTTGACTTCTATGGTTCTGACAAGAAGTT---CT-CAATCCATTTAAA-TAGGTTTCCTCTATCA--GATGCCATAATGTTAAAGTTTG---ACTTTGT-CCAA-------------------TGTTGAAA--GTCTTGCCCTTACGAAAGTCAAGGAGCATCTTATCTATCAGATATGTT--CTCCA------TCATCTAGTG-AAGATG----TG---AGATCCTGCAGAGTGAGAATAAG-CTGG--GACTC---GC--AAGATCATTTCTTTGTAAAGCTGTGTTGTTGGTCTAAC-AATACATCATGTTTGTCTATAT------TT-TCA--T-GATTCGTCTGTGCACA------ATGTGCTCAAGGATCTTGCG-GCATGCTAATGTCAAGA--GG-ACTGGCATGCAGTT----TGCAGATATACTATGGTCATCT-TTCTTGCAGATAGGGGTTAt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcatctgtaaacagtcttgtcgcagaactgatcctgtctggctaTGT------GGGGTACCTTGTC--AGCTG------CCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGTCT----GAT-TGA-----CCCATGGAATCCTT-GCTCT---TTG----CT---ACATCCTGGATGGGGAGGATTAG-CTGA--CTCTCACAG--GAACGTCTCTTACT---GAATCCATGTTGGGTGTC-ATGTAGGATGCAATGTTCATCAAGATGTC------TCA--T-GA------TGTGACTGCAAAGAATATATTCCATCATCTTACATGT-TACCAAGGTT-AGACTGACA--GGATAATCATTCTCTTGCTCTGTTTTT---CTCC-CC-TTTTTCATAGCCGG-GAACAA-TG-----TTTGCCAACTTCCATTCTGGCAGTA--TCTTTCAT-GGT-TAAGAGAAGCTTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGcaagagattgtccccagtt
gi|9                          :                                                                                                                                                       tctgtatagggcagtcatctgcgaacagtctcactgtagattcctctgagacgcattcaggtaggtcatttatatagaggaggaataacaatgggcagaggacactgccttgtggatttccatattggacggtggctgtagacttgttgagtttgaacacttaggaagtcctctatccacccgaggagattgtgccatttgccaaattactgtagctagaatgcttatcgtcGCATT-----AATTTGTT--C-CCC------TGC----ATTTAAGCTGTTGGCA---AGTTCTTGTATGGTTAGTAGCAGCTTGG--A-CTCAC-AC-GATCTTGATTTCCT---AAACCCATGTTGAGCATG-AGAGAGAATGTTATGACGATCTAGATGAGAG-ATATGAC-TTGG-----CTATGTGTA------ATGTGCTCTAGTATTTTGCA-GCATATTGAAGTT-AGA--GAAACTGGTCTATAATTGGA-CAC-----TTCT---ATCCCCT-TTCTTGAAAATTTGTG--AAA-TGTGCGCTTG-----TTTCC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTCTTGGATGGTGAGTATGAG-TTGA--CTTTC-T-GTTGAATGTCACTTGCT---GAATCCAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTTACA-GCAGAAGGCGGTA-AGA--GTGACTGGCCTGTAGTTcc
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TAAATCAAACTATCATCAGTGAAGAGGCATACCGGTACTGTTGGCTTGACATGGGATGGCATGTCATTGATGTAAGCAATGAATAAGGAGTGGCCCAATGACACTATCCTGAAGCACCCGATGTAACCGGAGCCGATGTGGAGCAGGAACCATCAAAGACAACTTGTTAGGTACACGCTGTCAAGAAGTTGGTAATCTAGGAGTGCACGCTACCTCGGATTCATAATGATCAAGGTTCTGGAGGAGTCTGGAATATGCCTTACCAAAGTCAAATAGAATGGCGTCAATTTGTGTATTGTTATTAATGCTCTTGGAAAGGTCTTTGATTGTTTTAATAAGTTGTGTTTCGCAGAATCAGTGATGCCAAAATCCATGTTGGCGATCAGTAAGGACACTGAAGGAATCAAACTGTGACATAATGTTGCTAAAGACAACTGTGTTCAAGGACTTTACACGAGTTCGAGGTTAACAACATGGGACGGTAGTTTGATGGAGTAGAATGGTTTCCCTTCTTAAACATTGAAGAGACAAGGGCAGTTTTCAAATCCTCATTAGTGA
Unaligned ( gi|7 ): CAAATGCCTTGCTAAAATCTAGGAGGATGAGGTCTGTTTGCTTACCTTCGCTGCAACTAGCTTAGCAAGTTGTGTTTCACAAGATCTTTTCTCTCTAAAACCATGCTGCATGTCATTTAGGATGTTGTTTCTGTTCAGATGCTTGACTAGGTTTGAGGCTACTATATGCTCAAGCACCTAACAAAGAATGCAGGTGAGAGAAATTGGGCGGTAATTAGCCGCAACTGACCTGTCTCCCTTCTTAAAAAGTGGTGTCACGTTTGCTGTAGTCTATTCTTTTGGTACTTGGCCCTGTTCCAAT
Unaligned ( gi|10 ): CCTGATGCCACCGGAGCAGATGCGGATCAGGAACCATCAAGGACGACACGCTGGGTACGAGCTGACAAAAAAATCGATAATCCAGGAGTGCATGCAACCTCGGATTCCATAGTTAAGTTTCTGGAATGTTGCTATACTAAGGACAAGAAAGATGTCACCAATGTTCGTTTTAATTGTTATTCATGCCCATGGAAAGGTCGTTAATAGTT
Unaligned ( gi|11 ): AAACAAAACAATCATAGTGAAAAAACCTACTTCTAACTTTACGCGGGATGGCATATCATTGATGTAAGCAGGGAATAGGAGTGGCCCAATGACACTACATCGATGCACCCTGGATTTAACAGGAATAAATGT
Unaligned ( gi|13 ): CTCTTGTTTATTGATGGGAACAACATTTACTGATTTCTATTCTGGCGGTATCTTGTCCTGGTTAAGAGATGCATAGAAAATGACC
Unaligned ( gi|14 ): GTCATCCGCAAATAGATATGACAGTTCACAATATCTGGTAGATCGTTTATATAGATCACGAATAGGAGAGGACCAAGGACTG
Unaligned ( gi|15 ): ATGTGTTCCTGTATTTTGCAGCATATTCAAGTTGGTGAAATCAGTCTATAATTAGCAGGGTTATACTGCTCTATC






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Reference ( family-865 )      :                                                                                 NACGAGACTCT-TCCAGGCANGTCGTTGATGT---A--CAG-GAGGAANAA-CAGCNGGCCGAGNACTGTGCCTTGTGG-----CACACCGGAGATGACAGGGGCGGAGGTAGAGACGTGGCCTTCAACAA-G--------ACCTGTCGGCTTCTAT----CCGNCAGGAA---GCTCTGNATCCA-----A-TN---GATCA--CTTCGCCGCGGATGCCGTAGTGACNN-AGCTT-----G----AAT-GC-G--CA-G-C---------GT------GAG--ACT-TTGTCGA--AG--GCCTTGCNGAAGTCNAGNAGTATGGCGT----CT----GATTTGT-T--C------TCCCT----CCT-AATCTA----AGCT----G----CG---AG-ATCTTGGATGGTGAGNATGAGCT-GGNTCTC-CG-C-GAACGTCA---CT--TNCT-GAANCCATGTTGNNNGTCAGANAGNACG-TNATGNT--CGTCNAGATG-CGN--T-----TNAC-T-G--G-CTG----TGN----ATGA-TGTGCTCTAGCATCTTGCA--GCATACNGAGGT-NAGAGANACTGGCCTATAGT----TGGC-CGCAGA-NT--TCT---GTC-----CNCCTTCTTGAAAATCGGNGNNA-AA-TG---GCTTGT----TTCCANTCTGGCAGTA--TCTT-TCAT-GGT-TAAGAGAAGCTTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGG
gi|1                          :                                                                                       ACCCTGTCCGGG-AGATCGTTGATGT---A--GAA-CAGGAAGAG-TAGTGGTCCAAGAACTGTGCCCTGTGG-----CACACCGGAG-TGATAGGAGCGGAGGTTGACATGTGGCCTTCAACCA-GA-------ACCTG-CTGCCTCTAC----TTGTCAGGAA---GCTCTGAATCCA-----GCTC---AAT-A--CTGGGCCCCAGATGCTGTAGTGACTC-AGCTT-----G-----AT-CA-G--CA-GTC---------GTTTGTAAGAG--ATT-TTAACAA--AG--GCTTTGCTGAAATCAAGGAGTATGGCGT----CT-----ATTTGT-TAAC------TGCAT-----CT-AATCT--------T----G----CGGTAAG-ATCTTGGAGGGTGAGGATGAGCTGGGATTTG-CA-G-TATCTTTT---CT--TGTC-GAAACCATGCTGTTAGTCTGACAGTATC-TACTGAG--AGTCAAGTTG-TGT--CA----TGACTT-G--G-CTG----TTG----ATGA-TGTGTTCTAGCATCTTGCA--GCATACAGAGGC-AAGCAATATTTGCCTATAGT----TGGCAGGTAGA-CT--TCT---GTC-----GCCATTTTTAAATATTGGAGCCA-CATTT---GCCTGT----TTCCAATC
gi|11                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttGGCATATCATTGATGT---AAGCAG---GGAATAG-GAGTGGCCCAATGACACTACATCGATG-----CACCCTGGATTTAACAGGatctgtgaccttgccttcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
gi|12                         :                                 aaacaaaacaatcatagtgaaaaaacctacttctaactttacgcgggatACAAGACTCT-CCCAAGCATGATAATGATAT---A--CAG-AAGGAACAA---G-TGGCCGAGTATTGTGCCTTGTGT-----CACTACGGAGATGACAGGGGCaataaatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T----TTCTATTCTGGCGGTA--TCTTGTCCT-GGT-TAAGAGATGCATAGAAAATGACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctcttgtttattgatgggaacaacatttactgaA-TGTGTTCCTGTATTTTGCA--GCATATTCAAGT-TGGTGAAATCAGTCTATAAT----TAGC-
gi|16                         :                                                                                               CAGGAAAGTCGTTGATGTGACA--CAG-GAAGATAAA-CAGTC-AC--AACACTGTGCCTTGTGG-----AACACCAGAagggttatactgctctatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCTTGGATGGTGAGTATGAGTT-GACTTTC-TGTT-GAATGTCA---CT--TGCT-GAATCCATt
gi|2                          :                                                                                  ACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---G--CAA-GAGGAACAA-CAGCTGGTCGAGTACTGTACCTTGTGA-----CACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAA-GTAACAAGTACCTGTCAGCTTCTAT----TTGCCAGGAA---GCTCTGTAACCA-----A-TG---GATCA--CTTCACCGTTGATACCGTAGTGGCGG-AGCTT-----GTAGAGATGGC-G--CAGG-T---------GT------GAG--ACT-TTGTTGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCAT----C-----GATGTGA-T--C------TCCCT----CCTCAGTCCA----AGCT----G----CG---AG-ATTTTGGATGGTGAGTATGAGTT-GGTTCTC-CGTT-GAACGTCA---CT--TCCT-GAATCTATGCTGTTGGTCAGCTAGAATG-TTATGGT--AATCTAGATGACGC--T-----TCAC-T-G--A-CTG----TGG----TTGA-TGTGCTCCATCAGTTTGCA--GCACACAGAGGT-CAGAGATATTGGCCTGTAGT----TCGC-TGCAGAGGT--CCT---GTC-----CGCCTTTTTGAAAAACGGTGTTA-AA-TG---GCTTTC----TTCCAGTCT-GCAGGGACTTTT-TCCTCAGTCTCAGTGAAGC--GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGcc
gi|3                          :                                                                                   gGAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATAT---A--GAG-GAGGAATAA-CAATGGGCAGAGGACACTGCCTTGTGGATTTCCATATTGGA-----------CGG-----------TGGCTGT-----A-G--------ACTTGTTGAGTTTGAA----CACTTAGGAA---GTCCTCTATCCA-----C-CC---GAGGAGATTGTGCCATT--TGCCA-AATTACTGTAGCTA-----G----AAT-GC-T--TA-T-C---------GTCTGTG-GGGT-ACC-TTGTC----AGCTGCCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGT----CT----GATTGAC-C--CATGGAATCCTT----GCT----CT-------TT----G----CT---AC-ATCCTGGATGGGGAGGATTAGCT-GACTCTCACA-G-GAACGTCT---CT--TACT-GAATCCATGTTGGGTGTCATGTAGGATG-CAATGTT--CATCAAGATGTCTC--A-----TGATGT-G--A-CTG----CAA----AGAA-TATATTCCATCATCTTACAT-GT-TACCAAGGT-TAGACTGACAGG---ATAAT----CATT-CTC----TTGCTCT---GTTTTTCTCCCCTTTTTCATAGCCGG-GAAC-AA-TG----TTTGCCAACTTCCATTCTGGCAGTA--TCTT-TCAT-GGT-TAAGAGAAGCTTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGggcaactccattgcagctgatggtaaaattttccataagtggtgttggtgaagtgtccaaggtgggcatgtatgatgtgtcttcccctgtgaaggatgtgtcttccgctgtgaagacactactgaattggtcattcagtattgcggccttggacttcggatctgagtgtcccacaccattcctcttcagtagggagaccccgctgctatcacatcgtttgctgttgatgaaggagtataacttctttgggttctcgttttcagagaccatgtcttgcacataagcattgtaggcctgc
gi|4                          :                                                  tctgtatagggcagtcatctgcgaacagtctcactgtagattcctctGGCATGTCATTGATGT---A---AGCAATGAATAAGGAGTGGCCCAATGACACTATCCTGAAG-----CAC-CC-GATGTAACCGGAGCCGATGTGGAGCAGGAACCATCAAAGACA--------ACTTGTTAGGTACACG----CTGTCAAGAA---GTTGGTAATCTA-----G-GA---GTGCA--CGCTACCTCGGAT-TCATAATGATCA-AGGTT---------------CTG--GA-G-------------------GAG----T-CTG--GAATAT--GCCTTACCAAAGTCAAATAGAATGGCGT----C-----AATTTGTGT--A------TTGTT----ATT-AAT--------GCTCTTGG----AA---AG-GTCTTTGATTGTTTTAATAAGTT-GTGT-TT-CG-CAGAA--TCA---GTGATGCCAAAATCCATGTTGGCGATCAGTAAGGACACTGAAGG---AATCAAACTG-TGA--C-----ATAA-T-GTTG-CTA----AAG----ACAACTGTGTTCAAGGACTTTACAC-GAGT-TCGAGGT-TAACAACATGGGACGGTAGTTTGATGG--AGTAGA-AT----G---GTT-----TCCCTTCTTAAACATTGAAGAGACAA-GG---GC-AGT----TTTCA
gi|5                          :                                        taaatcaaactatcatcagtgaagaggcataccggtactgttggcttgacatgggatGGCTAGTTGTAAATGT---A--TAA-AAGAAAAAG-CAGC---CCGAGAACTG--CATTGAGG-----GATACCAGAGGTCACAGGTGAAGAGGTAGAGACATTTCCTTCTACCATG--------ACCTGTTGACTTCTATGGTTCTGACAAGAA---GTTCTCAATCCATTTAAA-TA---GGTTT--CCTCTAT-CAGATGCCATAATGTTAA-AGTTT-----G----ACT-TT-GTCCA-A-T---------GTT-----GAA--AGTCTTGCC----------CTTACGAAAGTCAAGGAGCATCTTAT----CTATCAGATATGT-T--C------TCCAT----C----ATCTAGTGAAGAT----G----TG---AG-ATCCTGCAGAGTGAGAATAAGCT-GGGACTC--G-C--AAGATCATTTCT--TTGT-AAAGCTGTGTTGTTGGTCTAACAATACA-TCATGTT--TGTCTATATT-TTC--A-----TGAT-T-C--GTCTG----TGC----ACAA-TGTGCTCAAGGATCTTGCG--GCATGCTAATGTCAAGAG-GACTGGCATGCAGT----T----TGCAGATAT--ACTATGGTC-----ATCTTTCTTGCAGATAGGGGTTACAA-GA---GATTGT----CCCCAGTaatcctcattagtga
gi|6                          :                                                tcatctgtaaacagtcttgtcgcagaactgatcctgtctACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---A--CAG-GAAGAACAA-CAGCAGGCCAAGTACTGTGCCTTGTGG-----CACTTCAGAGATGACAGGGGCAGTTGGAGAGGCATGGCCCTCAACAA-GT-------ACCTGTTGGCTTCTAT----CCACCAGGAAGCTGCTCTGTATCCA-----A-TG---GATCA--GTTCACTGCGGATAACGTAGTGACGG-AACTTGTAGAG----AAG-GC-G--CAGG-T---------GT------GAG--ACT-TTGCCGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATGGCGT----C-----GATCTTA-T--C------TCCCT----CCTAAATCCC----AGCT----G----CG---TG-GTCTTGGATGGTGAGTATGAGTT-GAGTCCG-CGTT-GAACGTt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAA--AT--GCCTTGCTAAAATCTAGGAGGATGAGGT----CT----G-TTTGC-T--T------ACCTT----C--------------GCT----G----CA---ACTAGCTT--------AGCA--AGTT-GTGTTTCACA-A-GATCTTTT---CT--CTCT-AAAACCATGCTGCATGTCATTTAGGATG-TTGTTTC--TGTTCAGATG-C----T-----TGAC-T-A--G-GTT----TGAGGCTACTA-TATGCTCAAGCACCTAACAAAGAATGC--AGGT-GAGAGAAATTGGGCGGTAAT----TAGC-CGCA-A-CTGACCT---GTC-----TCCCTTCTTAAAAAGTGGTGTCA-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                       AGGAA---GCTCCTGATCTA-----C-TCCAAGGTC-----TTGTCTTTGACACCATAGTGATAA-AGTTT-----G-----------G--CA-G-CAAGAAATTTGT------GGGGGACT-TTATCAA--AA--ACCTTACTGAAGTC---GAGTATAACATCCAGCT----GCTTT-T-T--A------TTTTTGAGACCT-GAT--------GTT----A----TG-------TCCTGGAGGGTGACGAT-AGTT-AAGTTTCACA-G-GACCTTTT---CT--TCCT-AAAACCATATTGCCTGTCCAACAGGATACTGTTGTTTACAGCAGAAGG-CGG--TAAGAGTGAC-T-G--GCCTGTAGTTAA----GTGA-TGTGTTcgtttgctgtagtctattcttttggtacttggccctgttccaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T----AATTTGT-T--C-------CCCT----GC---ATTTA----AGCT----GTTGGCA---AG-TTCTTGTATGGTTAGTAGCAGCT-TGGACTCACA-C-GATCTTGA---TT--TCCT-AAACCCATGTTGAGCATGAGAGAGAATG-TTATGAC--GATCTAGATG-AGAGATA----TGAC-TTG--G-CTA----TGT----GTAA-TGTGCTCTAGTATTTTGCA--GCATATTGAAGT-TAGAGAAACTGGTCTATAAT----TGGA-C----A-CT--TCT---ATC-----CCCTTTCTTGAAAATT--TGTGA-AA-TGTGCGCTTGT----TTCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-865 )      :                                                                                 NACGAGACTCT-TCCAGGCANGTCGTTGATGT---A--CAG-GAGGAANAA-CAGCGGGCCGAGNACTGTGCCTTGTGGCACNCCGGAGATGACAGGGGCGGANGTAGAGGCGTGGCCNTCAACNA-G--------A-CCTGTCGGCTTCTA----NCTGTCAGGAA---GCTCTNNATCCAN-TN---GATCA--CTTCGCC--NCGGATGCCGTAGTGACNG-AGCTT-----G----AA--TG-C-GCA-G-C---------G-T------GAG--ACT-TTGTCGA--AG--GCCTTACTGAAGTCNAGNAGNATGGCGT----CT----GATTTGT-T--C------TCCCT----C--CT-AA--TCTA-GCT----G----CGAG-ATCTTGGATGGTGAGNATGAGTTGGGTCTCACG-NGAACGTCNCT--TNCT-GAANCCATGTTGNNNGTCAGNCAGGACG-TNATGNTNAT--CNAGATG-CGN--TA----TGAC-T-G--G--CTGTGG----ACGA-TGTGCTCNAGCATCTTGC--A-GCATACCGAGGT-NAGA--GANATTGGCCTGTAGT----TGGC-CGCAGA-NT--TCT---GTC-----CCCCTTCTTGAAAATCGGNGTNA-AA-TG---GCTTGT----T----TCCANTCTGGCGGTA-TCTT--TCCT-GGT-TAAGAGAAGC-T-GGAAAACGACCTGGAACANNGGACTGATNNCTGNAGCCAGCTCTTNAAGCAGCCTGCGNGACGGTACGTTATCAGNNCNTNNTGCCTTGTGG
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gi|11                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttGGCATATCATTGATGT---AAGCAG---GGAATAG-GAGTGGCCCAATGACACTACATCGATGCACCCTGGATTTAACAGGatctgtgaccttgccttcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
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gi|2                          :                                                                                  ACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---G--CAA-GAGGAACAA-CAGCTGGTCGAGTACTGTACCTTGTGACACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAA-GTAACAAGTA-CCTGTCAGCTTCTA----TTTGCCAGGAA---GCTCTGTAACCAA-TG---GATCA--CTTCACC--GTTGATACCGTAGTGGCGG-AGCTT-----GTAGAGA--TGGC-GCA-GGT---------G-T------GAG--ACT-TTGTTGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCAT----C-----GATGTGA-T--C------TCCCT----C--CTCAG--TCCAAGCT----G----CGAG-ATTTTGGATGGTGAGTATGAGTTGGTTCTC-CGTTGAACGTCACT--TCCT-GAATCTATGCTGTTGGTCAGCTAGAATG-TTATGGTAAT--CTAGATGACGC--T-----TCAC-T-G--A--CTGTGG----TTGA-TGTGCTCCATCAGTTTGC--A-GCACACAGAGGT-CAGA--GATATTGGCCTGTAGT----TCGC-TGCAGAGGT--CCT---GTC-----CGCCTTTTTGAAAAACGGTGTTA-AA-TG---GCTTTC----T----TCCAGTCTGCAGGGACTTTT--TCCTCAGTCTCAGTGAAGC---GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGcc
gi|3                          :                                                                                   gGAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATAT---A--GAG-GAGGAATAA-CAATGGGCAGAGGACACTGCCTTGTGGATTTCC--ATAT--------TGGACG-------GTGGCTGT-----A-G--------A-CTTGTTGAGTTTGA----ACACTTAGGAA---GTCCTCTATCCAC-CC---GAGGA--GATTGTG--CCATTTGCCA-AATTACTGTAGCTA-----G----AA--TG-C-TTA-T-C---------G-TCTGTG-GGGT-ACC-TTGTC----AGCTGCCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGT----CT----GATTGAC-C--CATGGAATCCTT----G--CT------CT---TT----G----CTAC-ATCCTGGATGGGGAGGATTAGCTGACTCTCACA-GGAACGTCTCT--TACT-GAATCCATGTTGGGTGTCATGTAGGATG-CAATGTTCAT--CAAGATG-TCT--CA----TGATGT-G--A--CTGCAA----AGAA-TATATTCCATCATCTTAC--ATGT-TACCAAGGT-TAGACTGACA--GG---ATAAT----CATT-CTC----TTGCTCT---GTTTTTCTCCCCTTTTTCATAGCCGGGA-AC-AA-TG----TTTGCCAACT----TCCATTCTGGCAGTA-TCTT--TCAT-GGT-TAAGAGAAGC-TTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGggcaactccattgcagctgatggtaaaattttccataagtggtgttggtgaagtgtccaaggtgggcatgtatgatgtgtcttcccctgtgaaggatgtgtcttccgctgtgaagacactactgaattggtcattcagtattgcggccttggacttcggatctgagtgtcccacaccattcctcttcagtagggagaccccgctgctatcacatcgtttgctgttgatgaaggagtataacttctttgggttctcgttttcagagaccatgtcttgcacataagcattgtaggcctgc
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAA--AT--GCCTTGCTAAAATCTAGGAGGATGAGGT----CT----G-TTTGC-T--T------ACCTT----C--------------GCT----G----CAACTAGCTT--------AGCA--AGTTGTGTTTCACA-AGATCTTTTCT--CTCT-AAAACCATGCTGCATGTCATTTAGGATG-TTGTTTCTGT--TCAGATG-C----T-----TGAC-T-A--GGTTTGAGGCT--ACTA-TATGCTCAAGCACCTAACAAA-GAATGC--AGGT-GAGA--GAAATTGGGCGGTAAT----TAGC-CGCA-A-CTGACCT---GTC-----TCCCTTCTTAAAAAGTGGTGTCA-----C---GTTTGC----TGTAGTCTATTCTTTTGGTA--CTTGGCCCT-G
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-865 )      :                                                                                 NACGAGACTCT-TCCAGGCANGTCGTTGATGT---A--CAG-GAGGAANAA-CAGC-GG-CC----GAGNACTGTGCCTTGTGGCACNCCGGAGATGACAGGGGCGGANGTAGAGGCGTGGCCNTCAACNA-G--------A-CCTGTCGGCTTCTAN----CTGTCAGGAA---GCTCTNNATCCAN-TC---GATCA--CTTCGCCN--CGGATGCCGTAGTGACNG-AGCTT-----G----AATG-C-G--CA-G-C---------GT------GAG--ACT-TTGTCGA--AG--GCCTTACTGAAGTCNAGNAGNATGGCGT----CT----GATTTGT-T--C------TCCCT----C--CT-AA--TCTA-GCT----G----CGAG-ATCTTGGATGGTGAGNATGAGTTGGGTCTCGCG-NGANCGTCNCTTNCTGAANCCATGTTGNNNGTCAGNCAGGACG-TNATGNTNAT--CNAGATG-CGN--CA----TGAC-T-G--G--CTGTGG----ACGA-TGTGCTCNAGCATCTTGC--A-GCATACCGAGGT-NAGA--GANATTGGCCTGTAGT----TGGC-CGCAGA-NT--TCT---GTC-----CCCCTTCTTGAAAATCGGNGTNA-AA-TG---GCTTGT----T----TCCANTCTGNCGGT-ATCTTGTCCT-GGT-TAAGAGAAGC-T-GGAAAACGACCTGGAACANNGGACTGATNNCTGNAGCCAGCTCTTNAAGCAGCCTGCGNGACGGTACGTTATCAGNNCNTNNTGCCTTGTGG
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gi|11                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttGGCATATCATTGATGT---AAGCAG---GGAATAG-GAGT-GGCCC----AATGACACTACATCGATGCACCCTGGATTTAACAGGcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGACTTTCTGT-TGAATGTCACTTGCTGAATCCATt
gi|2                          :                                                                                  ACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---G--CAA-GAGGAACAA-CAGCTGG-TC----GAGTACTGTACCTTGTGACACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAA-GTAACAAGTA-CCTGTCAGCTTCTAT----TTGCCAGGAA---GCTCTGTAACCAA-TG---GATCA--CTTCACCG--TTGATACCGTAGTGGCGG-AGCTT-----GTAGAGATGGC-G--CA-GGT---------GT------GAG--ACT-TTGTTGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCAT----C-----GATGTGA-T--C------TCCCT----C--CTCAG--TCCAAGCT----G----CGAG-ATTTTGGATGGTGAGTATGAGTTGGTTCTC-CGTTGAACGTCACTTCCTGAATCTATGCTGTTGGTCAGCTAGAATG-TTATGGTAAT--CTAGATGACG---CT----TCAC-T-G--A--CTGTGG----TTGA-TGTGCTCCATCAGTTTGC--A-GCACACAGAGGT-CAGA--GATATTGGCCTGTAGT----TCGC-TGCAGAGGT--CCT---GTC-----CGCCTTTTTGAAAAACGGTGTTA-AA-TG---GCTTTC----T----TCCAGTCTGCAGGG-ACTTTTTCCTCAGTCTCAGTGAAGC---GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGcc
gi|3                          :                                                                                   gGAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATAT---A--GAG-GAGGAATAA-CAAT-GG-GCA---GAGGACACTGCCTTGTGGATTTCC--ATAT--------TGGACG-------GTGGCTGT-----A-G--------A-CTTGTTGAGTTTGAA----CACTTAGGAA---GTCCTCTATCCAC-CC---GAGGA--GATTGTGC--CATTTGCCA-AATTACTGTAGCTA-----G----AATG-C-T--TA-T-C---------GTCTGTG-GGGT-ACC-TTGTC----AGCTGCCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGT----CT----GATTGAC-C--CATGGAATCCTT----G--CT------CT---TT----G----CTAC-ATCCTGGATGGGGAGGATTAGCTGACTCTCACA-GGAACGTCTCTTACTGAATCCATGTTGGGTGTCATGTAGGATG-CAATGTTCAT--CAAGATG-TCT--CA----TGATGT-G--A--CTGCAA----AGAA-TATATTCCATCATCTTAC--ATGT-TACCAAGGT-TAGACTGACA--GG---ATAAT----CATT-CTC----TTGCTCT---GTTTTTCTCCCCTTTTTCATAGCCGGGA-AC-AA-TG----TTTGCCAACT----TCCATTCTGGCAGT-ATCTT-TCAT-GGT-TAAGAGAAGC-TTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGggcaactccattgcagctgatggtaaaattttccataagtggtgttggtgaagtgtccaaggtgggcatgtatgatgtgtcttcccctgtgaaggatgtgtcttccgctgtgaagacactactgaattggtcattcagtattgcggccttggacttcggatctgagtgtcccacaccattcctcttcagtagggagaccccgctgctatcacatcgtttgctgttgatgaaggagtataacttctttgggttctcgttttcagagaccatgtcttgcacataagcattgtaggcctgc
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Reference ( family-865 )      :                                                                                 NACGAGACTCT-TCCAGGCANGTCGTTGATGT---A--CAG-GAGGAANAA-CAGC-GG-CC----GAGNACTGTGCCTTGTGGCACNCCGGAGATGACAGGGGCGGANGTAGAGGCGTGGCCNTCAACNA-G--------A-CCTGTCGGCTTCTAN----CTGTCAGGAA---GCTCTNNATCCAN-TC---GATCA--CTTCGCCN--CGGATGCCGTAGTGACNG-AGCTT-----G----AATG-C-G--CA-G-C---------GT------GAG--ACT-TTGTCGA--AG--GCCTTACTGAAGTCNAGNAGNATGGCGT----CT----GATTTGT-T--C------TCCCT----C--CT-AA--TCTA-GCT----G----CGAG-ATCTTGGATGGTGAGNATGAGTTGGGTCTC-GCA-NGANCGTTNCTTCCTGAANCCATGTTGNNNGTCAGNCAGGACG-TNATGNTNAT--CNAGATG-CGN--CA----TGAC-T-G--G--CTGTGG----ACGA-TGTGCTCNAGCATCTTGCA--GCATACCGAGGT-NAGA--GANATTGGCCTGTAGT----TGGC-CGCAGA-NT--TCT---GTC-----CCCCTTCTTGAAAATCGGNGTNA-AA-TG---GCTTGT----T----TCCANTCTGNCGGT-ACCTTGTCCT-GGT-TAAGAGAAGC-T-GGAAAACGACCTGGAACANNGGACTGATNNCTGNAGCCAGCTCTTNAAGCAGCCTGCGNGACGGTACGTTATCAGNNCNTNNTGCCTTGTGG
gi|1                          :                                                                                       ACCCTGTCCGGG-AGATCGTTGATGT---A--GAA-CAGGAAGAG-TAGT-GGTCC----AAGAACTGTGCCCTGTGGCACACCGGAG-TGATAGGAGCGGAGGTTGACATGTGGCCTTCAACCA-G--------AACCTG-CTGCCTCTAC----TTGTCAGGAA---GCTCTGAATCCAGCTC---AAT-A--CTGGGCCC--CAGATGCTGTAGTGACTC-AGCTT-----G----A-TC-A-G--CA-GTC---------GTTTGTAAGAG--ATT-TTAACAA--AG--GCTTTGCTGAAATCAAGGAGTATGGCGT----CT-----ATTTGT-TAAC------TGCAT----C---T-AA--TCTT-GCG----G----TAAG-ATCTTGGAGGGTGAGGATGAGCTGGGATTT-GCA-GTATCTTTTCTTGTCGAAACCATGCTGTTAGTCTGACAGTATC-TACTGAGAGT--CAAGTTG-TGT--CA----TGACTT-G--G--CTGTTG----ATGA-TGTGTTCTAGCATCTTGCA--GCATACAGAGGC-AAGC--AATATTTGCCTATAGT----TGGCAGGTAGA-CT--TCT---GTC-----GCCATTTTTAAATATTGGAGCCA-CATTT---GCCTGT----T----TCCAATC-ATCTGTGACCTTGCCTT-
gi|11                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttGGCATATCATTGATGT---AAGCAG---GGAATAG-GAGT-GGCCC----AATGACACTACATCGATGCACCCTGGATTTAACAGGcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
gi|12                         :                                 aaacaaaacaatcatagtgaaaaaacctacttctaactttacgcgggatACAAGACTCT-CCCAAGCATGATAATGATAT---A--CAG-AAGGAACAA---GT-GG-CC----GAGTATTGTGCCTTGTGTCACTACGGAGATGACAGGGGCaataaatgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T----T----TCTATTCTGGCGGT-ATCTTGTCCT-GGT-TAAGAGATGCAT-AGAAAATGACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctcttgtttattgatgggaacaacatttactgaA-TGTGTTCCTGTATTTTGCA--GCATATTCAAGT-TGGT--GAAATCAGTCTATAAT----TAGC-
gi|16                         :                                                                                               CAGGAAAGTCGTTGATGTGACA--CAG-GAAGATAAA-CAGT-CA-C------AACACTGTGCCTTGTGGAACACCAGAagggttatactgctctatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGACTTTCTGT--TGAATGTCACTTGCTGAATCCATt
gi|2                          :                                                                                  ACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---G--CAA-GAGGAACAA-CAGCTGG-TC----GAGTACTGTACCTTGTGACACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAA-GTAACAAGTA-CCTGTCAGCTTCTAT----TTGCCAGGAA---GCTCTGTAACCAA-TG---GATCA--CTTCACCG--TTGATACCGTAGTGGCGG-AGCTT-----GTAGAGATGGC-G--CA-GGT---------GT------GAG--ACT-TTGTTGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCAT----C-----GATGTGA-T--C------TCCCT----C--CTCAG--TCCAAGCT----G----CGAG-ATTTTGGATGGTGAGTATGAGTTGGTTCTC--CGTTGAACGTCACTTCCTGAATCTATGCTGTTGGTCAGCTAGAATG-TTATGGTAAT--CTAGATGACG---CT----TCAC-T-G--A--CTGTGG----TTGA-TGTGCTCCATCAGTTTGCA--GCACACAGAGGT-CAGA--GATATTGGCCTGTAGT----TCGC-TGCAGAGGT--CCT---GTC-----CGCCTTTTTGAAAAACGGTGTTA-AA-TG---GCTTTC----T----TCCAGTCTGCAGGG-ACTTTTTCCTCAGTCTCAGTGAAGC---GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGcc
gi|3                          :                                                                                   gGAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATAT---A--GAG-GAGGAATAA-CAAT-GG-GCA---GAGGACACTGCCTTGTGGATTTCC--ATAT--------TGGACG-------GTGGCTGT-----A-G--------A-CTTGTTGAGTTTGAA----CACTTAGGAA---GTCCTCTATCCAC-CC---GAGGA--GATTGTGC--CATTTGCCA-AATTACTGTAGCTA-----G----AATG-C-T--TA-T-C---------GTCTGTG-GGGT-ACC-TTGTC----AGCTGCCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGT----CT----GATTGAC-C--CATGGAATCCTT----G--CT------CT---TT----G----CTAC-ATCCTGGATGGGGAGGATTAGCTGACTCTC-ACA-GGAACGTCTCTTACTGAATCCATGTTGGGTGTCATGTAGGATG-CAATGTTCAT--CAAGATG-TCT--CA----TGATGT-G--A--CTGCAA----AGAA-TATATTCCATCATCTTACAT-GT-TACCAAGGT-TAGACTGACA--GG---ATAAT----CATT-CTC----TTGCTCT---GTTTTTCTCCCCTTTTTCATAGCCGGGA-AC-AA-TG----TTTGCCAACT----TCCATTCTGGCAGT-ATCTT-TCAT-GGT-TAAGAGAAGC-TTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGggcaactccattgcagctgatggtaaaattttccataagtggtgttggtgaagtgtccaaggtgggcatgtatgatgtgtcttcccctgtgaaggatgtgtcttccgctgtgaagacactactgaattggtcattcagtattgcggccttggacttcggatctgagtgtcccacaccattcctcttcagtagggagaccccgctgctatcacatcgtttgctgttgatgaaggagtataacttctttgggttctcgttttcagagaccatgtcttgcacataagcattgtaggcctgc
gi|4                          :                                                  tctgtatagggcagtcatctgcgaacagtctcactgtagattcctctGGCATGTCATTGATGT---A---AGCAATGAATAAGGAGT-GG-CCCAATGA-CACTAT--CCTGAAGCACCC--GATGTAACCGGAGCCGATGTGGAGCAGGAACCATCAAAGACA--------A-CTTGTTAGGTACACG----CTGTCAAGAA---GTTGGTAATCTAG-GA---GTGCA--CGCTACCT--CGGAT-TCATAATGATCA-AGGTT---------------CTG--GA-G-------------------GAG----T-CTG--GAATAT--GCCTTACCAAAGTCAAATAGAATGGCGT----C-----AATTTGTGT--A------TTGTT----A--TT-AA--T----GCTCTTGG----AAAG-GTCTTTGATTGTTTTAATAAGTTGTGTTTC-GCA-GAATCAGTGATGCCAAAATCCATGTTGGCGATCAGTAAGGACACTGAAGG-AAT--CAAACTG-TGA--CA----TAA--T-GTTG--CTAAAG----ACAACTGTGTTCAAGGACTTTACAC-GAGT-TCGAGGT-TAAC--AACATGGGACGGTAGTTTGATGG--AGTAGA-AT----G---GTT-----TCCCTTCTTAAACATTGAAGAGACAA-GG---GC-AGT----T----TTCA
gi|5                          :                                        taaatcaaactatcatcagtgaagaggcataccggtactgttggcttgacatgggatGGCTAGTTGTAAATGT---A--TAA-AAGAAAAAG-CAGC----CC----GAGAACTG--CATTGAGGGATACCAGAGGTCACAGGTGAAGAGGTAGAGACATTTCCTTCTACCATG--------A-CCTGTTGACTTCTATGGTTCTGACAAGAA---GTTCTCAATCCAT-TT---AAATAGGTTTCCTCTATCAGATGCCATAATGTTAA-AGTTT-----G----ACTT-T-GTCCA-A-T---------GTT-----GAA--AGTCTTGCC----------CTTACGAAAGTCAAGGAGCATCTTAT----CTATCAGATATGT-T--C------TCCAT----CATCT-AG--TGAA-GAT----G----TGAG-ATCCTGCAGAGTGAGAATAAGCTGGGACTC-GCA-AGATCATTTCTTTGTAAAGCTGTGTTGTTGGTCTAACAATACA-TCATGTTTGT--CTATATT-T-T--CA----TGAT-T-C--GT-CTGTGC----ACAA-TGTGCTCAAGGATCTTGCG--GCATGCTAATGTCAAGA--G-GACTGGCATGCAGT----T----TGCAGATAT--ACTATGGTC-----ATCTTTCTTGCAGATAGGGGTTACAA-GA---GATTGT----C----CCCAGTaatcctcattagtga
gi|6                          :                                                tcatctgtaaacagtcttgtcgcagaactgatcctgtctACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---A--CAG-GAAGAACAA-CAGCAGG-CC----AAGTACTGTGCCTTGTGGCACTTCAGAGATGACAGGGGCAGTTGGAGAGGCATGGCCCTCAACAA-GT-------A-CCTGTTGGCTTCTAT----CCACCAGGAAGCTGCTCTGTATCCAA-TG---GATCA--GTTCACTG--CGGATAACGTAGTGACGG-AACTTGTAGAG----AAGG-C-G--CAGG-T---------GT------GAG--ACT-TTGCCGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATGGCGT----C-----GATCTTA-T--C------TCCCT----C--CT-AAATCCCA-GCT----G----CGTG-GTCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGAGTC-C-GCGTTGAACGTt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAA--AT--GCCTTGCTAAAATCTAGGAGGATGAGGT----CT----G-TTTGC-T--T------ACCTT----C--------------GCT----G----CAACTAGCTT--------AGCA--AGTTGTGTTTC-ACA-AGATCTTTTCTCTCTAAAACCATGCTGCATGTCATTTAGGATG-TTGTTTCTGT--TCAGATG-CT---------TGAC-T-A--GGTTTGAGGCT--ACTA-TATGCTCAAGCACCTAACAAAGAATGC--AGGT-GAGA--GAAATTGGGCGGTAAT----TAGC-CGCA-A-CTGACCT---GTC-----TCCCTTCTTAAAAAGTGGTGTCA-----C---GTTTGC----TGTAGTCTATTCTTTTGGT-ACTTGGCCCT-G
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGGAA---GCTCCTGATCTAC-TCCAAGGTC-----TTGTCT--TTGACACCATAGTGATAA-AGTTT-----G-----------G--CA-G-CAAGAAATTTGT------GGGGGACT-TTATCAA--AA--ACCTTACTGAAGTC---GAGTATAACATCCAGCT----GCTTT-T-T--A------TTTTTGAGAC--CT-GA--T----GTT----A----TG----TCCTGGAGGGTGACGAT-AGTTAAGTTTC-ACA-GGACCTTTTCTTCCTAAAACCATATTGCCTGTCCAACAGGATACTGTTGTTTACAGCAGAAGG-CGG--TAAGAGTGAC-T-G--GC-CTGTAGTTAAGTGA-TGTGTTttccaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T----AATTTGT-T--C-------CCCT----G--C---A--TTTAAGCT----GTTGGCAAG-TTCTTGTATGGTTAGTAGCAGCTTGGACTC-ACA-CGATCTTGATTTCCTAAACCCATGTTGAGCATGAGAGAGAATG-TTATGACGAT--CTAGATG-AGAGATA----TGAC-TTG--G--CTATGT----GTAA-TGTGCTCTAGTATTTTGCA--GCATATTGAAGT-TAGA--GAAACTGGTCTATAAT----TGGA-C----A-CT--TCT---ATC-----CCCTTTCTTGAAAATT--TGTGA-AA-TGTGCGCTTGT----T----TCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): CCTGATGCCACCGGAGCAGATGCGGATCAGGAACCATCAAGGACGACACGCTGGGTACGAGCTGACAAAAAAATCGATAATCCAGGAGTGCATGCAACCTCGGATTCCATAGTTAAGTTTCTGGAATGTTGCTATACTAAGGACAAGAAAGATGTCACCAATGTTCGTTTTAATTGTTATTCATGCCCATGGAAAGGTCGTTAATAGTT
Unaligned ( gi|14 ): GTCATCCGCAAATAGATATGACAGTTCACAATATCTGGTAGATCGTTTATATAGATCACGAATAGGAGAGGACCAAGGACTG






Alignments
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Reference ( family-865 )      :                                                                                 NACGAGACTCT-TCCAGGCANGTCGTTGATGT---A--CAG-GAGGAANAA-CAGC-GG-CC----GAGNACTGTGCCTTGTGGCACNCCGGAGATGACAGGGGCGGANGTAGAGGCGTGGCCNTCAACNA-G--------A-CCTGTCGGCTTCTAN----CTGTCAGGAA---GCTCTNNATCCAN-TC---GATCA--CTTCGCCN--CGGATGCCGTAGTGACNG-AGCTT-----G----AATG-C-G--CA-G-C---------GT------GAG--ACT-TTGTCGA--AG--GCCTTACTGAAGTCNAGNAGNATGGCGT----CT----GATTTGT-T--C------TCCCT----C--CT-AA--TCTA-GCT----G----CGAG-ATCTTGGATGGTGAGNATGAGTTGGGTCTC-GCA-NGANCGTTNCTTCCTGAANCCATGTTGNNNGTCAGNCAGGACG-TNATGNTNAT--CNAGATG-CGN--CA----TGAC-T-G--G--CTGTGG----ACGA-TGTGCTCNAGCATCTTGCA--GCATACCGAGGT-NAGA--GANATTGGCCTGTAGT----TGGC-CGCAGA-NT--TCT---GTC-----CCCCTTCTTGAAAATCGGNGTNA-AA-TG---GCTTGT----T----TCCANTCTGNCGGT-ACCTTGTCCT-GGT-TAAGAGAAGC-T-GGAAAACGACCTGGAACANNGGACTGATNNCTGNAGCCAGCTCTTNAAGCAGCCTGCGNGACGGTACGTTATCAGNNCNTNNTGCCTTGTGG
gi|1                          :                                                                                       ACCCTGTCCGGG-AGATCGTTGATGT---A--GAA-CAGGAAGAG-TAGT-GGTCC----AAGAACTGTGCCCTGTGGCACACCGGAG-TGATAGGAGCGGAGGTTGACATGTGGCCTTCAACCA-G--------AACCTG-CTGCCTCTAC----TTGTCAGGAA---GCTCTGAATCCAGCTC---AAT-A--CTGGGCCC--CAGATGCTGTAGTGACTC-AGCTT-----G----A-TC-A-G--CA-GTC---------GTTTGTAAGAG--ATT-TTAACAA--AG--GCTTTGCTGAAATCAAGGAGTATGGCGT----CT-----ATTTGT-TAAC------TGCAT----C---T-AA--TCTT-GCG----G----TAAG-ATCTTGGAGGGTGAGGATGAGCTGGGATTT-GCA-GTATCTTTTCTTGTCGAAACCATGCTGTTAGTCTGACAGTATC-TACTGAGAGT--CAAGTTG-TGT--CA----TGACTT-G--G--CTGTTG----ATGA-TGTGTTCTAGCATCTTGCA--GCATACAGAGGC-AAGC--AATATTTGCCTATAGT----TGGCAGGTAGA-CT--TCT---GTC-----GCCATTTTTAAATATTGGAGCCA-CATTT---GCCTGT----T----TCCAATC-ATCTGTGACCTTGCCTT-
gi|11                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttGGCATATCATTGATGT---AAGCAG---GGAATAG-GAGT-GGCCC----AATGACACTACATCGATGCACCCTGGATTTAACAGGcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctcttgtttattgatgggaacaacatttactgaA-TGTGTTCCTGTATTTTGCA--GCATATTCAAGT-TGGT--GAAATCAGTCTATAAT----TAGC-
gi|16                         :                                                                                               CAGGAAAGTCGTTGATGTGACA--CAG-GAAGATAAA-CAGT-CA-C------AACACTGTGCCTTGTGGAACACCAGAagggttatactgctctatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGACTTTCTGT--TGAATGTCACTTGCTGAATCCATt
gi|2                          :                                                                                  ACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---G--CAA-GAGGAACAA-CAGCTGG-TC----GAGTACTGTACCTTGTGACACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAA-GTAACAAGTA-CCTGTCAGCTTCTAT----TTGCCAGGAA---GCTCTGTAACCAA-TG---GATCA--CTTCACCG--TTGATACCGTAGTGGCGG-AGCTT-----GTAGAGATGGC-G--CA-GGT---------GT------GAG--ACT-TTGTTGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCAT----C-----GATGTGA-T--C------TCCCT----C--CTCAG--TCCAAGCT----G----CGAG-ATTTTGGATGGTGAGTATGAGTTGGTTCTC--CGTTGAACGTCACTTCCTGAATCTATGCTGTTGGTCAGCTAGAATG-TTATGGTAAT--CTAGATGACG---CT----TCAC-T-G--A--CTGTGG----TTGA-TGTGCTCCATCAGTTTGCA--GCACACAGAGGT-CAGA--GATATTGGCCTGTAGT----TCGC-TGCAGAGGT--CCT---GTC-----CGCCTTTTTGAAAAACGGTGTTA-AA-TG---GCTTTC----T----TCCAGTCTGCAGGG-ACTTTTTCCTCAGTCTCAGTGAAGC---GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGcc
gi|3                          :                                                                                   gGAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATAT---A--GAG-GAGGAATAA-CAAT-GG-GCA---GAGGACACTGCCTTGTGGATTTCC--ATAT--------TGGACG-------GTGGCTGT-----A-G--------A-CTTGTTGAGTTTGAA----CACTTAGGAA---GTCCTCTATCCAC-CC---GAGGA--GATTGTGC--CATTTGCCA-AATTACTGTAGCTA-----G----AATG-C-T--TA-T-C---------GTCTGTG-GGGT-ACC-TTGTC----AGCTGCCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGT----CT----GATTGAC-C--CATGGAATCCTT----G--CT------CT---TT----G----CTAC-ATCCTGGATGGGGAGGATTAGCTGACTCTC-ACA-GGAACGTCTCTTACTGAATCCATGTTGGGTGTCATGTAGGATG-CAATGTTCAT--CAAGATG-TCT--CA----TGATGT-G--A--CTGCAA----AGAA-TATATTCCATCATCTTACAT-GT-TACCAAGGT-TAGACTGACA--GG---ATAAT----CATT-CTC----TTGCTCT---GTTTTTCTCCCCTTTTTCATAGCCGGGA-AC-AA-TG----TTTGCCAACT----TCCATTCTGGCAGT-ATCTT-TCAT-GGT-TAAGAGAAGC-TTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGggcaactccattgcagctgatggtaaaattttccataagtggtgttggtgaagtgtccaaggtgggcatgtatgatgtgtcttcccctgtgaaggatgtgtcttccgctgtgaagacactactgaattggtcattcagtattgcggccttggacttcggatctgagtgtcccacaccattcctcttcagtagggagaccccgctgctatcacatcgtttgctgttgatgaaggagtataacttctttgggttctcgttttcagagaccatgtcttgcacataagcattgtaggcctgc
gi|4                          :                                                  tctgtatagggcagtcatctgcgaacagtctcactgtagattcctctGGCATGTCATTGATGT---A---AGCAATGAATAAGGAGT-GG-CCCAATGA-CACTAT--CCTGAAGCACCC--GATGTAACCGGAGCCGATGTGGAGCAGGAACCATCAAAGACA--------A-CTTGTTAGGTACACG----CTGTCAAGAA---GTTGGTAATCTAG-GA---GTGCA--CGCTACCT--CGGAT-TCATAATGATCA-AGGTT---------------CTG--GA-G-------------------GAG----T-CTG--GAATAT--GCCTTACCAAAGTCAAATAGAATGGCGT----C-----AATTTGTGT--A------TTGTT----A--TT-AA--T----GCTCTTGG----AAAG-GTCTTTGATTGTTTTAATAAGTTGTGTTTC-GCA-GAATCAGTGATGCCAAAATCCATGTTGGCGATCAGTAAGGACACTGAAGG-AAT--CAAACTG-TGA--CA----TAA--T-GTTG--CTAAAG----ACAACTGTGTTCAAGGACTTTACAC-GAGT-TCGAGGT-TAAC--AACATGGGACGGTAGTTTGATGG--AGTAGA-AT----G---GTT-----TCCCTTCTTAAACATTGAAGAGACAA-GG---GC-AGT----T----TTCA
gi|5                          :                                        taaatcaaactatcatcagtgaagaggcataccggtactgttggcttgacatgggatGGCTAGTTGTAAATGT---A--TAA-AAGAAAAAG-CAGC----CC----GAGAACTG--CATTGAGGGATACCAGAGGTCACAGGTGAAGAGGTAGAGACATTTCCTTCTACCATG--------A-CCTGTTGACTTCTATGGTTCTGACAAGAA---GTTCTCAATCCAT-TT---AAATAGGTTTCCTCTATCAGATGCCATAATGTTAA-AGTTT-----G----ACTT-T-GTCCA-A-T---------GTT-----GAA--AGTCTTGCC----------CTTACGAAAGTCAAGGAGCATCTTAT----CTATCAGATATGT-T--C------TCCAT----CATCT-AG--TGAA-GAT----G----TGAG-ATCCTGCAGAGTGAGAATAAGCTGGGACTC-GCA-AGATCATTTCTTTGTAAAGCTGTGTTGTTGGTCTAACAATACA-TCATGTTTGT--CTATATT-T-T--CA----TGAT-T-C--GT-CTGTGC----ACAA-TGTGCTCAAGGATCTTGCG--GCATGCTAATGTCAAGA--G-GACTGGCATGCAGT----T----TGCAGATAT--ACTATGGTC-----ATCTTTCTTGCAGATAGGGGTTACAA-GA---GATTGT----C----CCCAGTaatcctcattagtga
gi|6                          :                                                tcatctgtaaacagtcttgtcgcagaactgatcctgtctACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---A--CAG-GAAGAACAA-CAGCAGG-CC----AAGTACTGTGCCTTGTGGCACTTCAGAGATGACAGGGGCAGTTGGAGAGGCATGGCCCTCAACAA-GT-------A-CCTGTTGGCTTCTAT----CCACCAGGAAGCTGCTCTGTATCCAA-TG---GATCA--GTTCACTG--CGGATAACGTAGTGACGG-AACTTGTAGAG----AAGG-C-G--CAGG-T---------GT------GAG--ACT-TTGCCGA--AG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATGGCGT----C-----GATCTTA-T--C------TCCCT----C--CT-AAATCCCA-GCT----G----CGTG-GTCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGAGTC-C-GCGTTGAACGTt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAA--AT--GCCTTGCTAAAATCTAGGAGGATGAGGT----CT----G-TTTGC-T--T------ACCTT----C--------------GCT----G----CAACTAGCTT--------AGCA--AGTTGTGTTTC-ACA-AGATCTTTTCTCTCTAAAACCATGCTGCATGTCATTTAGGATG-TTGTTTCTGT--TCAGATG-CT---------TGAC-T-A--GGTTTGAGGCT--ACTA-TATGCTCAAGCACCTAACAAAGAATGC--AGGT-GAGA--GAAATTGGGCGGTAAT----TAGC-CGCA-A-CTGACCT---GTC-----TCCCTTCTTAAAAAGTGGTGTCA-----C---GTTTGC----TGTAGTCTATTCTTTTGGT-ACTTGGCCCT-G
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGGAA---GCTCCTGATCTAC-TCCAAGGTC-----TTGTCT--TTGACACCATAGTGATAA-AGTTT-----G-----------G--CA-G-CAAGAAATTTGT------GGGGGACT-TTATCAA--AA--ACCTTACTGAAGTC---GAGTATAACATCCAGCT----GCTTT-T-T--A------TTTTTGAGAC--CT-GA--T----GTT----A----TG----TCCTGGAGGGTGACGAT-AGTTAAGTTTC-ACA-GGACCTTTTCTTCCTAAAACCATATTGCCTGTCCAACAGGATACTGTTGTTTACAGCAGAAGG-CGG--TAAGAGTGAC-T-G--GC-CTGTAGTTAAGTGA-TGTGTTttccaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T----AATTTGT-T--C-------CCCT----G--C---A--TTTAAGCT----GTTGGCAAG-TTCTTGTATGGTTAGTAGCAGCTTGGACTC-ACA-CGATCTTGATTTCCTAAACCCATGTTGAGCATGAGAGAGAATG-TTATGACGAT--CTAGATG-AGAGATA----TGAC-TTG--G--CTATGT----GTAA-TGTGCTCTAGTATTTTGCA--GCATATTGAAGT-TAGA--GAAACTGGTCTATAAT----TGGA-C----A-CT--TCT---ATC-----CCCTTTCTTGAAAATT--TGTGA-AA-TGTGCGCTTGT----T----TCC


blockSeqs                     :                                                                                            .        T           GACAC    CA     T  GG  TGGCCCAAT    TG     A           C  G   T A     G     A GA  AGC      C  G  A GTAACAAGT  .              TGGTT          GCT     GT     TTTAAATAGGTT         TAT T   A          TGT     GTAGAGATGGCGCAGGTGT                           GG   C   TTGAAG                  C  T  T       CTATCA         GTG CTCCCTCCTCAGTCCAA                   CTTGGAAAG                    T  G     A     TG  TT  A G  A   G     T        TTG   AGCT    CAC T   GTA  AG T     CGGTAAGAG      CTAGGT          TTAAGTG C       C           AA      TC    CA  ACT  A     T       TTGATGGAGTAGAAT        ATG   TTTCTC             AC  T TT AATGTGC        CAACT        T    G    .     G    C   C          TT       TGACCTGGA   TT  AC    CT   C         T T         G  A   .    T       GG C GT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-865 )      :                                                                                 NACGAGACTCT-TCCAGGCANGTCGTTGATGT---A--CAGGAG-GAANAAC-AGC-GG-CC----GAGNACTGTGCCTTGTGGCACNCCGGAGATGACAGGGGCGGANGTAGAGGCGTGGCCNTC-------AACNACGACCTGTCGGCTTCTAN----CTGTCAGGAA---GCTCTNNATCCAN-TC---GATCA--CTTCGCCN--CGGATGCCGTAGTGACNG-AGCTT-----G----AATG-C-G--CA-G-C---------GT------GAG--ACT-TTGTCGAAG--GCCTTACTGAAGTCNAGNAGNATGGCGT----CT----GATTTGT-T--C------TCCT-T----N--CT-AA---T--AAGCT----G----CG---AG-ATCTTGGATGGTGAGNATGAGTTGGGTCTC-GCA-NGANCGTTNCTTCCTGAANCCATGTTGNNNGTCAGNCAGGACG-TNATGNTNAT--CNAGATG-CGN--CA----TGAC-T-G--G--CTGTGG----ACGA-TGTGCTCNAGCATCTTGCA--GCATACCGAGGT-NAGA--GANATTGGCCTGTAGTT----GGC-CGCAGA-NT--TCT---GTC-----CCCCTTCTTGAAAATCGGNGTNACAANG---GCTTGT----T----TCCANTCTGNCGGT-ACCTTGTCCT-GGT-TAAGAGAAGC-T-GGAAAACGACCTGGAACANNGGACTGATNNCTGNAGCCAGCTCTTNAAGCAGCCTGCGNGACGGTACGTTATCAGNNCNTNNTGCCTTGTGG
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gi|11                         : ttgtccaggtcttcctttagcttagcagaatcgtttatggacttgatcttccggtagatgaggctgtcatcagaaaagagcctagatgtggagtttGGCATATCATTGATGT---AAGCAG--G-GAATAGG-AGT-GGCCC----AATGACACTACATCGATGCACCCTGGATTTAACAGGcttgtaatcttgccttgaacaagagtgcaagtgctggtgtgatttcatcagccgccttcttcaggaagcatgttggtagtgtctggtcctgctattttgtggggatcaatgacctaggggagtttgtggacaccttatttgccaatgtcaaagtggtgaattttgggatatgaatctccaggcatgagtgggaggtaaatggtgttctctttagtgaagacactaataacctggctgttgaggagagatgcctttgcgtcgttatgtgtaatgccttcactcttgagagaggagagtcagacgccactgcttgcccttcatgaatgtgtatgtacaacttttccgtatctctgctttctgtggcaatgtcccattcatggctgttataggctttc
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gi|16                         :                                                                                               CAGGAAAGTCGTTGATGTGACA--CAGGAA-GATAAAC-AGT-CA-C------AACACTGTGCCTTGTGGAACACCAGAagggttatactgctctatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGACTTTCTGT--TGAATGTCACTTGCTGAATCCATt
gi|2                          :                                                                                  ACGAGACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---G--CAAGAG-GAACAAC-AGCTGG-TC----GAGTACTGTACCTTGTGACACTCCAGAGAAGACAGGGGCGGAAGGAGAAGCGTGGCCCTCGACAAGTAACAAGTACCTGTCAGCTTCTAT----TTGCCAGGAA---GCTCTGTAACCAA-TG---GATCA--CTTCACCG--TTGATACCGTAGTGGCGG-AGCTT-----GTAGAGATGGC-G--CA-GGT---------GT------GAG--ACT-TTGTTGAAG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATAGCAT----C-----GATGTGA-T--C------TCCC-T----C--CTCAG---TCCAAGCT----G----CG---AG-ATTTTGGATGGTGAGTATGAGTTGGTTCTC--CGTTGAACGTCACTTCCTGAATCTATGCTGTTGGTCAGCTAGAATG-TTATGGTAAT--CTAGATGACG---CT----TCAC-T-G--A--CTGTGG----TTGA-TGTGCTCCATCAGTTTGCA--GCACACAGAGGT-CAGA--GATATTGGCCTGTAGTT----CGC-TGCAGAGGT--CCT---GTC-----CGCCTTTTTGAAAAACGGTGTTA-AATG---GCTTTC----T----TCCAGTCTGCAGGG-ACTTTTTCCTCAGTCTCAGTGAAGC---GGTAAAC--------ACAAGGG--TGATGGCTGGAGCCAGCTC-TGAAGCAATTT-CGTGACGGTATGTTATCAGTTCATTGTGCCTTGTGGcc
gi|3                          :                                                                                   gGAGACGCA-TTCAGGTAGGTCATTTATAT---A--GAGGAG-GAATAAC-AAT-GG-GCA---GAGGACACTGCCTTGTGGATTTCC--ATAT--------TGGACG-------GTGGCTGT------------A-GACTTGTTGAGTTTGAA----CACTTAGGAA---GTCCTCTATCCAC-CC---GAGGA--GATTGTGC--CATTTGCCA-AATTACTGTAGCTA-----G----AATG-C-T--TA-T-C---------GTCTGTG-GGGT-ACC-TTGTC--AGCTGCCTTGGAGAAGTCCAGTAAGATGACGT----CT----GATTGAC-C--CATGGAATCCT-T----G--CT-CT---T------T----G----CT---AC-ATCCTGGATGGGGAGGATTAGCTGACTCTC-ACA-GGAACGTCTCTTACTGAATCCATGTTGGGTGTCATGTAGGATG-CAATGTTCAT--CAAGATG-TCT--CA----TGATGT-G--A--CTGCAA----AGAA-TATATTCCATCATCTTACAT-GT-TACCAAGGT-TAGACTGACA--GG---ATAATC----ATT-CTC----TTGCTCT---GTTTTTCTCCCCTTTTTCATAGCCGGG--AACAATG----TTTGCCAACT----TCCATTCTGGCAGT-ATCTT-TCAT-GGT-TAAGAGAAGC-TTGGAAAATGACCTGGAACATTGGACTGATCTCTACAGCCAGTTCTTTAAGCAGCCTGCAAGAC---ACTTTATCAGGGCCTGTTGCCTTGTGGggcaactccattgcagctgatggtaaaattttccataagtggtgttggtgaagtgtccaaggtgggcatgtatgatgtgtcttcccctgtgaaggatgtgtcttccgctgtgaagacactactgaattggtcattcagtattgcggccttggacttcggatctgagtgtcccacaccattcctcttcagtagggagaccccgctgctatcacatcgtttgctgttgatgaaggagtataacttctttgggttctcgttttcagagaccatgtcttgcacataagcattgtaggcctgc
gi|4                          :                                                  tctgtatagggcagtcatctgcgaacagtctcactgtagattcctctGGCATGTCATTGATGT---A---AGCAATGAATAAGGAGT-GG-CCCAATGA-CACTAT--CCTGAAGCACCC--GATGTAACCGGAGCCGATGTGGAGCAGGAACCATC-------AAAGACAACTTGTTAGGTACACG----CTGTCAAGAA---GTTGGTAATCTAG-GA---GTGCA--CGCTACCT--CGGAT-TCATAATGATCA-AGGTT---------------CTG--GA-G-------------------GAG----T-CTG--GAATATGCCTTACCAAAGTCAAATAGAATGGCGT----C-----AATTTGTGT--A------TTGT-T----A--TT-AA---T----GCTCTTGG----AA---AG-GTCTTTGATTGTTTTAATAAGTTGTGTTTC-GCA-GAATCAGTGATGCCAAAATCCATGTTGGCGATCAGTAAGGACACTGAAGG-AAT--CAAACTG-TGA--CA----TAA--T-GTTG--CTAAAG----ACAACTGTGTTCAAGGACTTTACAC-GAGT-TCGAGGT-TAAC--AACATGGGACGGTAGTTTGATGGA--GTAGA-AT--G-----GTT-----TCCCTTCTTAAACATTGAAGAGACAAGG---GC-AGT----T----TTCA
gi|5                          :                                        taaatcaaactatcatcagtgaagaggcataccggtactgttggcttgacatgggatGGCTAGTTGTAAATGT---A--TAAAAG-AAAAAGC-AGC----CC----GAGAACTG--CATTGAGGGATACCAGAGGTCACAGGTGAAGAGGTAGAGACATTTCCTTC-------TACCATGACCTGTTGACTTCTATGGTTCTGACAAGAA---GTTCTCAATCCAT-TT---AAATAGGTTTCCTCTATCAGATGCCATAATGTTAA-AGTTT-----G----ACTT-T-GTCCA-A-T---------GTT-----GAA--AGTCTTGCC--------CTTACGAAAGTCAAGGAGCATCTTAT----CTATCAGATATGT-T--C------TCCA-T----CATCT-AG---TG-AAGAT----G----TG---AG-ATCCTGCAGAGTGAGAATAAGCTGGGACTC-GCA-AGATCATTTCTTTGTAAAGCTGTGTTGTTGGTCTAACAATACA-TCATGTTTGT--CTATATT-T-T--CA----TGAT-T-C--GT-CTGTGC----ACAA-TGTGCTCAAGGATCTTGCG--GCATGCTAATGTCAAGA--G-GACTGGCATGCAGTT--------TGCAGATAT--ACTATGGTC-----ATCTTTCTTGCAGATAGGGGTTACAAGA---GATTGT----C----CCCAGTaatcctcattagtga
gi|6                          :                                                tcatctgtaaacagtcttgtcgcagaactgatcctgtctACTCT-TCCAGGCATGTCGTTGATAT---A--CAGGAA-GAACAAC-AGCAGG-CC----AAGTACTGTGCCTTGTGGCACTTCAGAGATGACAGGGGCAGTTGGAGAGGCATGGCCCTC-------AACAAGTACCTGTTGGCTTCTAT----CCACCAGGAAGCTGCTCTGTATCCAA-TG---GATCA--GTTCACTG--CGGATAACGTAGTGACGG-AACTTGTAGAG----AAGG-C-G--CAGG-T---------GT------GAG--ACT-TTGCCGAAG--GCCTTACTGAAATCCAGTAGTATGGCGT----C-----GATCTTA-T--C------TCCC-T----C--CT-AAATCC--CAGCT----G----CG---TG-GTCTTGGATGGTGAGTATGAGTTGAGTC-C-GCGTTGAACGTt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAAAT--GCCTTGCTAAAATCTAGGAGGATGAGGT----CT----G-TTTGC-T--T------ACCT-T----C---------------GCT----G----CA---ACTAGCTT--------AGCA--AGTTGTGTTTC-ACA-AGATCTTTTCTCTCTAAAACCATGCTGCATGTCATTTAGGATG-TTGTTTCTGT--TCAGATG-CT---------TGAC-T-A--GGTTTGAGGCT--ACTA-TATGCTCAAGCACCTAACAAAGAATGC--AGGT-GAGA--GAAATTGGGCGGTAATT----AGC-CGCA-A-CTGACCT---GTC-----TCCCTTCTTAAAAAGTGGTGTCAC-------GTTTGC----TGTAGTCTATTCTTTTGGT-ACTTGGCCCT-G
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                      AGGAA---GCTCCTGATCTAC-TCCAAGGTC-----TTGTCT--TTGACACCATAGTGATAA-AGTTT-----G-----------G--CA-G-CAAGAAATTTGT------GGGGGACT-TTATCAAAA--ACCTTACTGAAGTC---GAGTATAACATCCAGCT----GCTTT-T-T--A------TTTT-TGAGAC--CT-GA---T----GTT----A----TG-------TCCTGGAGGGTGACGAT-AGTTAAGTTTC-ACA-GGACCTTTTCTTCCTAAAACCATATTGCCTGTCCAACAGGATACTGTTGTTTACAGCAGAAGG-CGG--TAAGAGTGAC-T-G--GC-CTGTAGTTAAGTGA-TGTGTTttccaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T----AATTTGT-T--C------CCCTGC----A--TT------T--AAGCT----GTTGGCA---AG-TTCTTGTATGGTTAGTAGCAGCTTGGACTC-ACA-CGATCTTGATTTCCTAAACCCATGTTGAGCATGAGAGAGAATG-TTATGACGAT--CTAGATG-AGAGATA----TGAC-TTG--G--CTATGT----GTAA-TGTGCTCTAGTATTTTGCA--GCATATTGAAGT-TAGA--GAAACTGGTCTATAATT----GGA-C----A-CT--TCT---ATC-----CCCTTTCTTGAAAATT--TGTGA-AATGTGCGCTTGT----T----TCC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): CCTGATGCCACCGGAGCAGATGCGGATCAGGAACCATCAAGGACGACACGCTGGGTACGAGCTGACAAAAAAATCGATAATCCAGGAGTGCATGCAACCTCGGATTCCATAGTTAAGTTTCTGGAATGTTGCTATACTAAGGACAAGAAAGATGTCACCAATGTTCGTTTTAATTGTTATTCATGCCCATGGAAAGGTCGTTAATAGTT
Unaligned ( gi|14 ): GTCATCCGCAAATAGATATGACAGTTCACAATATCTGGTAGATCGTTTATATAGATCACGAATAGGAGAGGACCAAGGACTG