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Reference ( gi|3 ) : ATTTGGTGGCATTGTTTTTCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACAACTTAATT--TTG-G-----CGAATATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGT--TTCTAATTA--C-GATAAATAA-CATAAT-TAAAATAAATCACTGTAAGTG-C-TACTTACTGCCACC----A-------CTTATC----TA----------------GTTAACTA--------TT--G---CG-AAAGCTATC----TAGTTATC----TAGTTAAC-TAACG-CGATAAGT--TTC-----CAGTTA-C-GA----TAAATA------TCTTAACGCAAAAAGATGCCTAT-TTACTG---ATCTGCA--ACTGCCACCACATATC-TACTT-AGCTAA------------CTGGATAACTAGATAATGTTCGTG----TTA-CCAGTTATTTAATATTCGGAAGACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTTCCTTTTTCTCAGAAAGCACCGAGTGGTTACGATTGG-CTGTGGAGCAGCGCAGATGGTTGAGGAAAGTTTAGATATAACTATGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGTGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTTTTTTTGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTAGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTGCATTTCGTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTACCGGTAACGGTTGATGGCGGTAGTGATTGAAGATGAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCTATTGTATTCCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTAAATAACAGTATATACACCTTCATACAATCATATAAGTGTAACAGGAAAAAACACTTGT--T-----------CATCGCATGTCCGCAGATATACACTA----TAGTAATATAGTACAGA---GTTGCATAGTCACTGCTATTTAACATATTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAA-TGATAAAAAT--GTT----TTTTTACTTTAGAAC--TACATTGTGAATGTTGAAATTCGAAAA-CTAAAGAAAGAAACTAAGGTACGCTGCTCCTAATTCCTAACTAGTAACTCATAACCCGTTAACTCATATTTCATAACTAAAAAGTGTTTAATGAACT---------GT------ACCA-TATGTTACTAGCACATGTAACCTATAGTAACCAAT-T-AAA-----AACA-ATACTTTTTTGCGGGTATTTTTT-A-TCTTAGCAACACTCTCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTAATAATAGCCACATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGACTTTACA------TA-AATAATAGTTATTTAAAAATTTGA-ATAAAACGCTTTCCATATAAGTTCAGTGTA------AGAC---ACACTTACA-----GGCGTAACAATATTT
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-863 ) : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAATTA--AAAT---AAATNNCTGT-TAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTT-TCCAGTTACGATAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GG-ANAAACA-CTCG-TTAGT------A-AATA---A--CATCGCATGTC----CGCAG-AT---ATACACTATAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA--TN--AGTTAGAAGTCCTGCTTAA--------------GCA-------------------------C-----CATA------CGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTGCTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAA-C-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-------ATA-------NATGTTACTAGC--ACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTTTTTA-------ATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACAAGTT---TTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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consensus : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAT-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-TN--AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC---A-----T-A-----------A---T---C-CA-A---------CCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAA-C-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
Reference ( family-863 ) : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAC-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGNTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-TN--AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC---A-----T-------------A---T---C-CA-----------CCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAA-C-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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consensus : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAACTA--AAAT---AAATNNCTGT-TAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACGCGATAAGTT-TCCAGTTACGATAAATATCTTAACGCGAAAAGNTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-TN--AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC-AT-A------------AG-----------TC-C----A-G-A--CCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAA-C-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
Reference ( family-863 ) : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAATTA--AAAT---AAATNNCTGT-TAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTT-TCCAGTTACGATAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-TN--AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC-AT-A------------A------------TC-C----A-A----CCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAA-C-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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consensus : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAT-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATAA---CATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA--TTAGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----T-----------C-C--AGA-T-CCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAATC-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
Reference ( family-863 ) : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAC-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGNTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATAA---CATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA--TNAGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----T-----------C-C--AGA---CCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAA-C-C--GAAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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consensus : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAACTA--AAAT---AAATNNCTGT-TAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACGCGATAAGTT-TCCAGTTACGATAAATATCTTAACGCGAAAAGNTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-T--T-AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----------TC--C--AG-A-TCCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAACNCG-AAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
Reference ( family-863 ) : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAATTA--AAAT---AAATNNCTGT-TAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTT-TCCAGTTACGATAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-T--T-AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----------TC--C--AG-A-TCCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAATCCG-AAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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consensus : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAT-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-T--T-AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----------TC--C--AG-A-TCCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAACNCG-AAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
Reference ( family-863 ) : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAC-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGNTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-T--T-AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----------TC--C--AG-A-TCCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAACNCG-AAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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gi|5 : taacctctatgaaaagtttatgtcgcctgtgatggtttagaacggtagtgattgaagatgaacacttggtgtaaagttcagccattgtatttaaatttgtatattcaataaacgtacttttacaacataaacattcgtttagtaaataacagtttatacgcattcataaaatcatcaagtgtaacaggagaaacacttgtagttgaagaaaatacatcgcatatctgccgatatacactatagtaatatagtacatagttgtatagtctgattaacatacttgtctgaagtggtacttgttcatgtttaagttaaaatgataaaaagttagttagaagtcctgcttaggctttaagtgttatgcacgtccgcatatccgcgcgtcgcgtctggggaccgaaacgctacattacttaaggactacattgtgaatgttgaaactcgaaaactaaacaatgaaactaaagtacgctgcgactaatttctaatccattaactcctatttcataacttaaaagtgtttattgcgctttaataaaattaattaaaaaacaatacattttggtgggtattttttaatcttggcaacactccactagtaataagttttgaattgatatcagccgcatggattaaacaagaacagataagttgtcttcacatgtatacgataaagcggatagattttgcttaacggattaacgtgtagaaatgtacccggcagAAATGTTT--GTGCAGCC--T----GTTGAAATCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGATGTAAAGTTCAGCTGTGGTATTTCAATTTATA-------------TAATTAAACAACATAAACATCCGTTTAATA-TA--AAA--CA--C-TATAT-ACACATT-CA-TACAATCATATAAGTGT----A-ACA---GGAGAAACA-CTTGTA-ATT------GAAGAAATACATCGAATGTCCGCAG-ATATGCAC------------TATAGTACAAA---ATCGCATACTCACTGCTAACTAACATACTTGTCTGAAGTAGTAATAGTTCCTGTTTGAAGTTAAAA-TGATAAGAAA-T--T-AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAGTGTAATGCACATC--CGTAG-AGTCCACGCGTCGCGTTTAGCGGCCGACACCGCTGTATTACTTAGGAACTACATTGCGGTTATTGAAACTTGAAAAACCGATGAACGAAACTTAAGCACGC--TTTCT--------GCGAC-----------------------TA--ACTCCTATTG-CATAACTAAGAA-GTGTTTACTGCGC-TTTA-----------AGA-------A-A-AATAC-----CATGT------TAGTAGC--AT----------ATACTTTTTAGCGGGTC-TT-------TTTAATCTTAGCAATACGTCCCTAGTAAGA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAATTGTAAACCAAGTGGCT---TTCAAACAAGA----ACAGA------TA-AGTTAATAAt
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gi|6 : aacatatatgaaattgttgtgctgccagtaacagtcgaagacaTGA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAGTAATTATTTTTAAACATGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACAagttgtcatcacatgtatgataaagtagattgactttgcttaacagattaacgtgtaataatgtacctggctgataaaacaagtacattaaaacatgattttacataaatagtaattatttttaaacatgaataaaacgatttccatataagttcactgtaagataaacttacaggtgtaacaa
gi|7 : aacatatatgaaattgttgtgctgccagtaacagtcgaagacagtagtgattgaagataaacacttggtgtaaagttcagtcattgtatttcaatttgtatattcattaaacgttattacacaacataaacctctctttagtaaataacaatatatagtattacactatagtaatatagtacaaaattgcatagtcactgctaattaatatacttatctgaagttgtaattgttcctgtttgaaattaaaattgataggagttagttagaagtcctgcttcagcactatacgttgcgcctagtggccaaaaccgctgcactgcttaagaactacatcgtgaatattgaaacaggaaaactaaagaacgaaactaaagtacgccttctgtgactaactcctaacctgtaaactcctatttcataacttaaaagtgttaaatgtgctttaataaaaataccatgttactagcacatgtgacctatagtaaccaactaaagaacaatatattttggtgggtcttttttaatcttggcaacactcccctagtaacaagttttgaattgataatagccgcatggattaattgtaaagctggtggctttcaaacaagaacagataggtaaataaagttgtcatcacatgtatgataaagtagattgactttgcttaacagattaacgtgtaataatgtacctggcATGGTGACATAGTTCTGCCAACAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACTTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTATCACGATAAGTTTTTAATTA--CGGTAAATAA-CATAAT-TAAAATAAATCACTGTTAGTG-CAAC--TTACTGCCACCACTTACCTAGTTAACTATTGCG-AAAACTATCTAGTTA--------ACTAACGCGATATGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTACCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTAATTAATATTCGGAATACTTCGGTATTTACTCAATAAATCACATTAAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGAGCAGATGGCTGATGGAACTTTAAATATAATTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTTATGTCTTT-AGTTAAATAAGCTTGGTTTACATTTCAATTAGCCGGCATATGTTGTTTTGGGATATTGTTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGCAGCATCTATGAAATGTTT-TGTCCTACCGGTATCGGTTGAAGGCGGTTGTGATTGAAGATAAACACTTAGTGTAATGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATGATACAACATAAAa
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gi|8 : gcatctatgaaatgttttgtcctaccggtatcggttgaaggcggttgtgattgaagataaacacttagtgtaatgttcagccattgtatttcaatttgtTGA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAA-ATGATTTAAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGT--TTTTC--ATAAGTTTCTTGTA--------AGATA-CAC-TTACA-----GGTGTAACGATAtttgtaaagctgatggctttccaacaagaacagataagttaataaagtggtcatcacaggtacgataagcggatagattttgctaaacggattaacgtttatagatgtacctggctgataaaacaagtacattaaaaatgatttaacataaataataattattttaaaatttgaataaaacgtttttcataagtttcttgtaagatacacttacaggtgtaacgatat
gi|9 : gcatctatgaaatgttttgtcctaccggtatcggttgaaggcggttgtgattgaagataaacacttagtgtaatgttcagccattgtatttcaatttgtatattcaataaacgtaatgatacaacataaaaatgttgcatagtcacagctatttaacatatttgtctaaagttgttattgttcctgtttgaagttaaaatgataaaaatgttagttagaaatcctgattaagcattaagcacgttcgcagaatccacgcgtcgcgcctatcggcggaaaccgctgcattacttaagtactacactgtggatgttcaaatccgaaaactaaataatgaaactaaggtacgctgcgactaacccgttaactcatatttcatatttaaaagtgtttaatgaactttaccatgttactagagcatatgacctatagtaaccaattataaacaatatttttggcgggtattttttatcttagcaacactcccctggtaacaagttttgaatagataatagccgcatggattatttgtaaagctgatggctttccaacaagaacagataagttaataaagtggtcatcacaggtacgataagcggatagattttgctaaacggattaacgtttatagatgtacctggcTATGGTGGCATAGTTCTGCCACTAGTTATCCACTTAACTAATGTGATAAGTTTCTAGTAAACCACTTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTCACATGATATGTTTCTAATTA--CAATAAAAAA-CATAAT-CAAAATAAAT-------------CAC--TTACTGCCATCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAACTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CAA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGATACCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCTCATATCT-------------GATAACTAGATAATGTTGGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGATTTTTACTCAGTAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCTGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAAGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTT--TATTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATGTTTTCTAATGT-TTTTAGTAAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATACCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTt
blockSeqs : A . A . C . C TA TGC T T TAC A G A A T G T A C A TT T CA . T A C T AT C T A TC T GT GT TTG A A ACAC T A AAC TATTAC ATT T T TGTAGTTGAAGAA AAAT TTGCATGTACGCAG AACG AAT T G T G G GTG TTTAAGTGTTATGCACGTCCGCATAT C A CTGC AATTCCTA C TCTAAA TA GG A G C A GAAAAAAATAAATACC T C A G G C AA A G T A TTTTTTT T TGT ATG G GCT T T AG GATAGG C T TA A GT C TATAACTC T A GGACT C
blockSeqs : C . T . T . T C GTA A . A . A T T . . A A C A . T GG . C . . . T T A A AT . . . GC . T TG A A AGT AC ATT A . CGTTTAGTA A TCGCATGTCCGCAG . . T T T . . GTT ATAAGTGTAATGCACATCCGTAGAGT A . CC . C . . . C . . . ATAAAATCACC A A A G A C T A . A C . A . TTG G . G T . . . . AA A . C . . . . A
blockSeqs : T . T . C . A T TAC A . A . C T T . . T . C G . T GG . T T G C T AT . . . G . A CA G A AAC AC G C . CGTTTAGTA A TCGCATATCTGCCG . . G G T . . A ATTAAGCATGTTCGCAGAAT T . CT . A . . . A . . . ATAAAAATACC T C A C G A T A . T C . A . TTG . . T C . . . . TA A . C . . . . A
blockSeqs : T . T . T . A T CAC T . C . C T . . . A T C T A TC . . . G . C TG T A AGT AC . T . TGTAATTG A TCGAATGTCCGCAG . . A G . . . T ATTAAGCACGTTCGCAGAAT T . CC . G . . . C . . . CCAT T C A G A C T A . A A . A . . . . T T . . . . GA A . C . . . .
blockSeqs : T . . . T . A T CAC . . C . C . T C A A TT . . . A . A CA A A AGT AC . A . CTTTAGTA A ATATATAGT . . T G . . . T A T . . . C . . . C . . . AGAA T C A G G C T A . T A . A . . . . A T . . . . TT A . T . . . .
blockSeqs : . A . A T . . . C . T G T T TC . . . G . A CA A . AGT G . G . GCTAATT A AT . . T G . . . T A A . . . C . . . C . . . ATA T A A G G C T T . A C . . . . . . T T . . . . TA . . . . . . .
blockSeqs : . G T A TC . . . G . A CA A . AAC A . G . GCTAATT . . . . . . . . C . . . C . . . A . . . CC . . A A . . . . . T C . . . . . . A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C T A CT . . . C . A TG G . . A . T . TGTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : C . . T . . . A . A TG T . . A . T . TGT . . . . T . . . . .
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blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
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originalCons : ATATGGTGGCATAGTTCTGCCACCAGTTATCCACTTAACTAACGCGATAAGTTTCTAGTTAACCACNTAATTTTC-GCGAAAATTATCTAGTTATCTAGTTAACTAACACGATAAGTTTCTAATTA--CGATAAANAA-CATAAT-TAAAATAAATNNCTGTTAGTG-CCAN--TTACTGCCACCACTTATCTAGTTAACTATTGCG-AAAANTATCTAGTTATCTAGNTAACTAACGCGATAAGTTTCCAGTTA-CGA-TAAATATCTTAACGCGAAAAGTTGCCTATTTACTGCTCTGCAACTGCCACCACATATCTACTTAGCTAACTGGATAACTAGATAATGTTCGTGTTACCAGTTATTTAATATTCGGAATACTTCGGTTTTTACTCAATAAATCACA--AAGCATTCCCTTTTTCTCAGAAAGGGCCGAGTGGTTACGATTGG-TTGTAAAGCAGCGCAGATGGTTGAGGGAAGTTTAAATATAACTAAGGATGTTTACTTTTATTTTAATGCTGAGACCATATAGTTTATGTGTTGTCTAGTATATTTTCTAATGTCTTTTAGTTAAATTAGCTTGGTTTACATTTCCATTAGCCGGCATCTGTTGTTTTGGGATATTGCTTTTTATTGTTTTGCTTCATTTCTTGTGGATTTTGTAACATCTATGAAATGTTT-TGTCCTGCCGGTAACGGTTGAAGGCGGTAGTGATTGAAGATAAACACTTGGTGTAAAGTTCAGCCATTGTATTTCAATTTGTATATTCAATAAACGTAATTATACAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACATT-CG-TATANTCATATAAGCGT----ACACA---GCANAAACA-CTCGTT-AGT------NAATA---ACATCGCATGTCCGCAG-ATATACACTA----TAGTAATATAGTACAAA---GTTGCATAGTCACTGCTAATTAACATACTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAATTGATAA-AAA-T--T-AGTTAGAAGTCCTGCTTAAGC----------A-T--AAG-----------TC--C--AG-A-TCCACGCGTCGCGCCTAGCGGCCGAAACCGCTGCACTACTTAAGAACTACATTGTGAATGTTGAAACNCG-AAAACTAAAGAACGAAACTAAAGTACGC--CTTCT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCCTATTT-CATAACTAAAAA-GTGTTTAATGCGC-TTTA-----------ATA-------C-ATGTTACTAGCACATGTGACCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACNTTTTGGCGGGTCTTT-------TTTAATCTTGGCAACACTCCCCTAGTAACA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---TAAAACAAGT-ACA---TTAAAACATGATTTTAC--A------TA-AA-TAATAATTATTTTAAAATTTGAATAAAACGA--TTTCCATATAAGTTCACTGTA--------AGATA-AAC-TTACA-----GGTGTAACANTACTT
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10 : atttatgacaggtttgtgccgcaggtaacggttgaagacggtagtgattgaagataaacacttggtgtaaagtttagtcattgaatttcaatttgtatattcattaaacgtacacaacataaacaatcgtttagtaaataacaatatatacactatagcaatatagtacaaaattgcacagtcactgctaattaatatacttgtgtgaagtgttattgttcttgttttaaattaaaattgataggagtaagttagaagtcctgcttaagcaccatacgtcgcgcctagcggccgaaaccgctgcactgcttaagaactacattgtgaatgttgaaacacgaaaactgaagaacgaaactaaagtacgccttctgcgaataactcctaacctgttaactcctatttcataactaaaaaatgtttaatgcgctttaataaaatcaccatgttactagcactctgacatatagtaaccaataaaaaaacaatacattttggcgggtcttttgtaatcttgacaacactccccttgtaacaagttttgaattgataatagttgcatggattaattgtaaagctggtgactttcatcacatgtacgataaagcggataggttttgctaaacggcttaacgtgtataattgtacctggcCTATGAAATGTTT-TGTCCTACCGGTAACAGTTGAAGGCGGTAGTGATTGCCAATAAACACTTGGTGTAAAGTTATGCCATTGTATTTCAATTTGTATAATCAATAAATGTAATGATAAAACATAAACATCCGTTTAGTA-AA--TAA--CA--G-TATAT-ACACTTT-CA-TAGAATCATATAAGTGT----G-ACA---GGGAAAACA-CTTGT-------------------ACATTGCATGTACGCAG-ATATACACTA----TAGTAATAAAGTATAGA---GTTGCATTATCACTGCCATTTAACATATTTGTCTGAAGTTGTTATTGTTCCTGTTTGAAGTTAAAA-TGATAA-AAA-TG-TGAG-TTAGAAGTCCTGATTA-AGCAT-----T------AA-------GCATG-TTCGC-----AGAA-TCTACG--CGTTGCGTCTTTCGGCAGAAACCACTACATTACCTAAGAACAACATTGTGAATGTT----GAAATCTG-AAAACTAAAGAATTCAACTAAGGTACG------CT--------GCGACTAACTCCTA------AC--CCGTTA--ACTCATATTA-CATAACTAAAAG-GTGTTTAATGAAC-T--------------------------ATGTTACTAGCACATGTGGCCTATAGTAACCAAT-TAAA-AACAATACTTTTTGGTGGGTATTT-------TTT-ATCTTAGCAACACTCCACTAGTAAGA---AGTTTTGAATTGATAATAGCCGCATGGATTAA---Tctgataatcggcttagtttatttctgtaacttaacgaaataaagtagaccaaaacagcattttagttttgaattgtatatgagacatatagaactgtttttacgtgtaaagcagcatactgtacaacagctttttgtgcattttagatatggatggatatcgtccatagtatcaacctcaacattacaataccttctttttatcatgagttgatttaataaacgaatttatgttcaaacaaaccggaagtagtcgcggttcatattagcctttacgttgcgtattgaccacgttaagttcgtattgaccgcgttaagttcgtattgacagagttcggttcgtatcggccaagtccgcgtcatatgatggcatatttcctctctaacaagacttgtacaataaagttgataaataatgtggtatattaacttgttttggaatggtgcgtgtttgtaccatcattataataataattcgaattcattacgctgtgtaactaatgaattggttcgttcgatagtgtttatcacttatgtcttaccaaatacgtcttgtattcgcggtcatcttggtctaaattccttatttaataaaattagacagctactagcgggggtttggccttcacaaccctgttaccatatacaacttatatatcgaaccccataaaaccacaactgtggtctagtggtagag
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