lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111 1 11111 1 222 1 11 4444444444444444444 1 22222222222222 2222222222222222222 111111 33333 7777777777777777777777777777777 111111 11111111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222 1 22222222 222222 1 5555555555555555555555 333333333333333333333333 2222222 666666666666666666666 1111111111 111 222222 111111111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 22 1 1111 7777777777777777777777777777777777777777777 3333333333 666666666666666666666666666666 1111 22 44444444 111 11111 11111
lowQualScore : 6 6 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0000000 5 0 3 3 77777 33 0 33 000 33 44 44 888 5 33 1111111111111111111 0 777 22222222222222 0000000000000000000 000000 00000 1111111111111111111111111111111 999999 777 0 0 55 4 55555555 1 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 5555555 2 88 1 2 11111111 2 33 2 2 3 111111 3 4444 2 4 44 55 8888888888888888888888 555 333333333333333333333333 2 4 8888888888 22 4444 22 555555 2 2 555 4444 333 333 2222222 2 2 999 111111111111111111111 33 444 2 33 5555555555 2 333 44444 000000 666 2 888 2 33 444 777777777777777 3 2 2 99999999 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 888888 77 3 555 44 33 6 3 5 44 8888 2 33 5 33 9999999999999999999999999999999999999999999 2 2 2 2 2 777 2222222222 1 999999999999999999999999999999 3333 3 33 3 3 00000000 000 77777 5 4 00000 2 5
lowQualScore : . . ............................................................................................................................................................................................................. ....... . . . . ..... .. . .. ... .. .. .. ... . .. ................... . ... .............. ................... ...... ..... ............................... ...... ... . . .. . ........ . . .......................................................................................................................................................................................................................................................................... . . ....... . .. . . ........ . .. . . . ...... . .... . . .. .. ...................... ... ........................ . . .......... .. .... .. ...... . . ... .... ... ... ....... . . ... ..................... .. ... . .. .......... . ... ..... ...... ... . ... . .. ... ............... . . . ........ ......................................................................................................................................................................................... ...... .. . ... .. .. . . . .. .... . .. . .. ........................................... . . . . . ... .......... . .............................. .... . .. . . ........ ... ..... . . ..... . .
lowQualScore : 0 0 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000000 6 8 4 1 99999 99 9 99 777 99 22 22 444 0 66 3333333333333333333 5 888 22222222222222 8888888888888888888 555555 22222 6666666666666666666666666666666 888888 000 7 4 55 1 00000000 2 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 3 9999999 9 33 3 7 33333333 4 22 7 2 4 999999 2 5555 1 0 88 55 7777777777777777777777 888 444444444444444444444444 1 2 8888888888 88 2222 88 888888 0 0 555 2222 555 555 7777777 0 1 777 666666666666666666666 22 111 5 44 3333333333 5 222 88888 444444 444 5 999 7 77 777 222222222222222 6 5 5 33333333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888 88 1 444 22 88 5 1 2 99 2222 9 99 7 99 3333333333333333333333333333333333333333333 9 9 9 9 9 999 4444444444 7 555555555555555555555555555555 3333 1 88 8 3 44444444 555 99999 3 0 00000 2 7
consensus : TTTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTGAGCT-TAAGGATGTT----G---G-CT---CG--------TCAAAATGAAAGT-A--AT-T---AN-G--TA--TTT---------TTTTA-AT----TC---AGTT-----AAA-A------C--A-TA---TTTATT-----A--TTAT-CTAAGATGAA----AT---T---GAC-A-TGA----G-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG-TTTTTGTGCTAT--TTAAT--TTTTAA--GA--TGATACC--TA--CGT-CAAAATCTAATATT----TT--GTT-------AATTTTG--ATAAAA-NT-AGG--T---CATTAAGATA--------TC-AT-TA---TAT------TATACATATGAAACTGAAC----ATTA--GAA-----A---T------CATAATAA--AA---ATGGATAAC--ANATATTTT--N--ATCT-TT--A--A--AAA----TA----CACT--GA-A-A-CTA---ATGTTT--C---T-TAACA---T-N-T---T----GC-T--T---TAG---AAAA---A--AA----TC----ANC-AAT------AC-CC--CATC--C--NCTT-TN--GTA-TA---ATTT-T-T---TTA-AC---AN--AAAC------NCAT-TACA---AA-A----TA-A-----A-GT--T-----ANT--TA----G-ACTT-T------TTT-A-TATTTTAG-TTT-CCTTT---NG-T-CCA-ATGTAAGCACTTTC-AGA-A--TTTATAAAGAAA-A--TCA-TAGGTT-GC-CGTGCATTTTA----AA-GAA-ATA--TT--TG-C----AAATT------A-CCTTAAAT---AGTG--CA-------T-NATN--T--GGTG-T-T----------AT--TTTA----A--A------AA-T-G---T----T---TA---TA----TA-T-TGA-TAACATCAGAAAATAA-TTAAN--GT-TA--------T--GTT---TTAG-T--TT----------AAA-AN-TAGTC---TAA---TNCATA--CT-A--NCATA-CAC--TTG---TA-C-------------AACT-TT-TC-----G--AAAN--A-A-----C----------------------AAAC---------------AAGA---TAT-----------------------TC-----------T--------A---T---------A----------A---------TTA---CT-----C----C--------------T--------AC------CCC-CTAT-T---TT--TCTTGGTAAGAAA-ATGATGCCAAAAGTT--GAA-A--A-A--AATAT-------C-------------G-----A----TT-T-TT-T-GTT-A-A-A-A-A---TGGA-C--------ATGTTTGTGGC----TTAAATCG-TT--CAATGT-------ATCCATAT-TC-AT-AAGACTGCAACAA-AAATNATGGTTT--CTTA----AAAGAAATAC-A-----ACTTCAATTT-AAGAT
Reference ( gi|1 ) : TCTCTTTAAATTAAAGACTGATTCATTTGAGTT-TAAGGATATT----T---G-TT---CG--------TCAAAATGAAAGT-C--AT-T---AT-G--TA--TTT-A-------TTTTA-AT----TA---AGGT-----AAA-A------C--G-TA---TCTATT-----A--T-AT-CTAAGATGGA----AT---T---AAC---TGA----GCAAAAGGTAT-------GTTTCCATGTTCG-TTTTCATTTTAT--TTTAT--TTTTAA--CA--TGATACC--TA--CAT-CAACATCTGATATG----CT--GTT-------AATGTTG--ATAAAA-AT-AGG--T---CATTAAGATA--------CC-AT-TA---TAT------TATACATTCAACACTGAAC----ACTA--GAA-----A---T------CGTAACAG--GA---ATGGATAAC--ACATATTCT--T--ATCT-TT--A--A--AAA----TA----CGTT--GA-A-ATCTA---ATATTT--C---TATAACAAAAT-A-T---T----AC-T--T---TAG---AAAA---A--AA----TC----ACC-AAT------AC-CT--CATC--C--CCTT-TG--GTA-TA---ATTTCTGT---TTA-AC---CT--GAAC------TCAT-TACA---AA-A----TA-A-----A-GT--T-----ACT--TA----G-ACTTAT------TTT-AATATTTTAG-TTT-CCTTA---TG-T-CCA-GTGTTAGCACTTTC-A-A-A--TGTATAAAGAAA-A--TTA-TAGGCT-GC-TGTGCATTGTA----AA-GAA-ATA--TT--T--T----AATTT------T-TTTTAAAT---AGTT--CA-------T-TATA--T--GGTG-T-T----------AT--TTTA----A--A------AA-T-G---T----T---TA---TA----TA-T-TGA-TAACATCAGGAAATAA-CTAGA--GT-T---------T--GTT---TTAG-T--TT----------AAA-AT-TAGTC---TAA---TTCATA--CT-A--ACATA-CAC--TTG---TA-C-------------AACT-TT-TT-----G--AAAT--A-A-----C----------------------GAAC---------------AAGA---TAT-----------------------TC-----------T--------A---T---------G----------A---------TTA---CT-----C----A--------------T--------AC------CCC-GTAT-T---TT--TCGCGGTAAGTAA-ATGATGCCAAAAGTT--GGA-A--A-A--AATAT-------T-------------G-----A----TT-T-TT-TGGTT-A-A-A-A-A---TGGA-A--------ATGTTTGTGGC----GATAATCG-TT--AAATTG-------ATCCATAT-TA-AT-AAATCTGCAATAA-ATGTTATGGTTT--TTTA----GAAGAGATAC-A-----ACTTTAATTT-AAGAT
gi|15 : TTTCTTTAAGTTAA-----------TTTGAATTCTAAAAAAATTAGGAT---G-TTACTCG--------CCAAAATGAAAGA-A--A------AT-A--GA--TTT---------TTTTA-TTGAAATA---AGTT-----AAA-AAA----C--A-TA---TTTATT-----A--TTGT-CTAAGATGAA----ATGAAT---AAC----GA------AAAGGGTAC-------GTTGCCTTGTCCGTTTTTTGTGCTAC--TTAAA--TTTTAA--GA--TGATTCA--TA--TGT-CAAAATAAAATATT----TT--AAA-------AACTTTG--ATAACA-TG-AAG--T---CATTAATATAAGTTTTTTTT-AT-TATTCTAT------TATACATATGAAACTGAAC----
gi|9 : tGACTGAGT-ATTTA---T-TAAGGATGTT----G---G-CT---CG--------TCATAATTAA-GT-A--AT-A---AG-A--TC--TTT---------TTTTA-AT----TC---AATT-----AAATAT-----C--A-TT---TTTATT-----A--TTAT-CTAAGATGAA----AT---TTAGAAC----GA------AAAATGTAT-------ATTAGGGTACTTG-TATTTGTGCTAT--TTAAT--GTTTAG--GA--TGATGCT--TA--CG---AA---CTTATAT------T--GTTTAGTA--AATTTTG--ATAACATGT--GG--T---CCTTGAAATA--------TC-AA-TG---TAT------TATTCATAAGAAACTCAACTT--AATAATGAGT----A---T------TATAACAA--AA---ATTGATCAC--TTATATTTTAAT--ATTT-GT--A--G--ACA----CA----CCTT--GA-A-AACT----ATGTTT--T---Tttaaaatgagcatcaaaataaaaaaccccaggataactcttgtatatcactttgcttttaagtaagaaaaaaacaacatattggcttaaccccatccactt
gi|21 : gttGCT-TAAGGATGTT----G---G-CT---CGTGACATTCTTAAAATGAAACT-A--AT-TAGAATAG--T---TTT-A-------ATTTA-AT----TA---AA-------AAA-G------C--A-TA---TGCATC-----A--TCAT-CTA------C----AC---T---AACAAATGATCACGAAAAAGGTATATTGTCCGTTGCCTTGCTTG-CTTTAGTGTTGT--TTAAT--TCTTAA--GT--TGATGCT--TA--CAT-CAA-ATGCAATATT----GT--ATT-------GCTTTTG--TTAAAA-TT-AGA--A---CAATATG--A--------CCAAA-TA---TGT------TAtctcttatatcacgttaatcctactcttatgttttcttagtaagaaaatgatgtcaaacatttaaaatatatatatttttgttataaactcgacgtgtttctgtctttaaacattcattgtaccgaaatccataatactgttaaaagaaacacaacttcagtttaagacattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa
gi|3 : tgT-TCAGGATGTT----G---A-CT---CA--------TCAAAAC-AACGT-A--AT-T---AA-GACTA--TTTCA-------ATTCA-GT----TA---A--------AAA-A------C--A-TA---TGTATT-----A--TTAT-CTAAGAC------------T---GAT---TGC----G-AAAAAATGT-------G---CCGTGCTCG-TTTTTGAGTTAT--TTCAA--TTATAA--GA--TCATagtatatgtatgaaattaatcttataaaatgacaaaacataaaatta
gi|4 : T-TAAGGATGTT----G---G-CT---CG--------TCAACATGAAATA-A--AT-T---A--G---A--TTT---------TTTTA-AT----TATTCAGTT-----AAA-AATAATAT--G-TA---T-TATTTATAAA--T-AT-CTAAGATGAA----ATGA-T---AAC----GA----G--AAAGCTAT-------GTTGCCATGATCG-GTTTTGTGCGAT--TTAAT--TTTAAA--GT--TGATACA--TA--CG----ACATC--ATTTT----TTTAGTT-------TATTTTTTTATGAAA-AT--GG--TGACCATGAAGATA--------TC-AT-TA---TAT------TAAACATATGAAACTGAACTT--AATAATGAGC----A---T------CATAACAA--AA---ATTAATAACTAAAATAATCT--T----TT-TT--A------------TA----C-TT------------------TTT--C---T-----------------T----GC-T--T---TAG---AAAA---A--AT----TC----ATC-G------------T--CACA--T--CCTA-TG------CA---ATTTTTATATGTTATAC---AT--G------------T-TG-----GG-A----TA-A-------------------T--TA----G-ACTT-T------TTT-A-TATTTTAG-CTT-CCTTT---GG-T-CCA-ATGTAAGCACTTTC-AGA-A--TTTATAAAAAAA-AAATCA-TAGGTT-GC-CGTGCATTTTA----AA-GAA-ATAAATG--T--C----AAATA------A-CATTAAATC--AG-----A-------A-TATAATT--AATG-T-T----------ATGTTTTA----GTTA------AA-T-A---TAGTCT---TA---TA----TA-T-Ttaagatacaattctattatatacatgaaagtgaactttaataagtctcataatcaaaatgcatagcaactatttttatctttgaaaaataaaaacactgaaactgaagttttactctgctatgttttgtgctttagaaaaaaaaaatcagctctacccacctactctttaagtattttaacattaaaacttttaaaaaaatataaatttggatattcagacttttttataattaagtttcctatggttgaatgttatataaagggtatcataggttgacgtgcattttaaagtaatatttgtcaaattatcttaaatagtgcataaactgatgttgttttaaaagtgtttataactatatgatattaaataagtgttatgctttagtgtaaaattagtataataatactatcatacacttggaaaactttttgaaatataaaaacaagaatttattataaaaatatttttttatcccatctacaattacctctaccccttattttcatggtaataaaatgatgccatgagttaaaaaaacaatatcgaaacaattgttatggtcaacacatggacatgtgtgtggtttaaattgtatctatatccataagactgactgaaagatattttaatttaagatataaaattcacacttatgaaaatct
gi|8 : acT-TAAAGATGTTGCC-T---GGCT---CG--------TCAAAATGAAAGT-A--AT-T---AG-A--TA--TCT---------TTTTA-AT----TC---AG------------------C--A-TA---TTTATT-----T--T-TTGTTAAGATTAA----AT---T---GATCA-TGA------AAAGAATTT-------GTTACCGTGTTCG-TTTTTTTTTTGCCATTTATTATTTTAA---A--TGATATC--CA--CTT-CAAAGTCTAATATT----TT--GTA-------AATTTTC--ATAAAT-TTGAGA--T---CGTTAAAGGG--------TC---------TGT------TATACAAATGAAACTGAACTTAAATTG--AGC-----A---T------CATAATA---AA---ATGAATAGG--AAATATTTT--A--ATAT-TT--GGCA--AAA----TA----CACT--GA-ACATTTATATATATTTG-C---TTTAG-A-----G-T---T----GT-T--T---TA----AAAA---A--AA----TA----ACC-CCT------AC-CC--CGTctattgtacacttgtatatctttttcaaatgataaaaagattttctcttttgagcatatatttattcagctaagagttacccgtaacccctatttttcttggtaataaaatgatgaaaactattttatttgttaaaaaatgaacatatttgtggcttaaaccgataaaaacagaaaacgatttcttaaaagaaataaaacttcaatccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|25 : T-TAAGAATGTT----TCTGG-CT---CA--------TCAAA------GT-A--AT-T---A--G---A--TTT-T-------TTTTA-AT----TC---AGTT-----AAA-A-------------------ATT-----G--T-AT-TTA------------T---T---A-----TG------------GTAT-------GTTGCTGTGTTCA-TTTTTATTCTAT--TTAAT--TTATAA--GA--TGACACC--TA--CGT-CAACATTGAATATT----TT--GTT-------AATTTTG--ATAAAA-A--AGGGAT---CATTAACATA--------TC--T-TA---Tatgtttcttggcaggaaaatgatgccaaaattagatagaaataataaaaaatgaacacatttatggcttaaatctttgaatgtatccgtgttcataatactgcaataaagataataatttcttaaaagaaacacgattttaatttaagatataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|5 : tacT-TAAAGATG----------G-CT---CG--------T-AAAATGAAAATACAAATAG---AT-C--TAACTTT-T-------TTTTGTAT----TA---TGTT-----AAA-A------C--A-TATTTTCTATT-----A--T-CT--TAAAA-GAAAAAGATAA-T---GAC---TGC----G-AAAAGATAT-------GATGCCGTGCTTG-TTTTAGTACTGT--TTAAT--TTTTAA---A--TGATACC--TA--CGTACA--ATTTTATATC----TT--G-T-------A--GTTG----AAAA-TT-AGgaaactgatcttaaaaatgagca
gi|36 : T-TAAGGATCTT----G---A-CT---TA--------T-ACAATGAAATA-C--A------GT-G--TA--ATT-AAAAAATTTTTTA-AT----TC---AGTTGCATCATA-A------T--A-TA---TTAATT-----A--TTAT-TTAAGATGAA----AT---T---GATCA-TGA------AAAAGGTAA-------GTTGCCATGCTTG-TTTTtatgataataaaattggatagcacgaatgctaatttttaaaaaaatacacagagcactaagttttcccttataattatattcttacattcagtagaaaaaattctttggccatacctaccaactttttatggtatttttgtaactgaaacatataaagattttaattgggataattaagattccttttatttcagtatcctttggtcctgtgaaagcactttcaaaacgtcataggttttcggtcattttaaagaattatttgtcaaattaccttaaatattccatattttgtgtttcaactgatgattcaatgcttcaactctttgacataaattaatgttaagttttagtttagaaatagtccaatatatatcatatacttatacatatattattcataactgttcgaaataaaacaacaaaactttctcctttgaaaaaaaatattttatttacttttccgactctcaattttaattggttatataataagatgcaaaagttcagaaacaaaaatagatttaaaaaaattggaaaaaatattatatttgtggcttaaattgttcatgtatccatattcagagg
gi|28 : GATGTT----G---G-CT---CG--------TAAAAAAAAAAAA-A--AA-T---A--A--TT--TTT---------TTTTA-AT----TC---AGTT-----AAA-AA-----T--GATA---TTTGTT-----A--TTAT-TTGAGATGAT----GT---T---GATCA-TGA------AATAAGTAT-------GTTACCATGCTTT-TTATCCTGCTAT--TCAAT--ATATAA--GA--TGGTACC--TA--TGT-CAAAATCTAACATtgt
gi|34 : gttcagtgagtattcagctcttatggacaGGAAGT-A--AT-T---AG-A--TA--TTT---------TTTTA-AT----TC---AGTT-----AAA-AAT----C--A-TA---TTTAAT-----AATT-AT-CCTAGATAAA----AT---T---GATAA-TAA------AAAAGGTAT-------GTTACTA-GCTCT-TTTTTGTGCTTT--TTAAT--TTTTAA--AA--TGTCACC--TA--CGA-CAA
gi|41 : --TTT---------TTTTA-AT----TC---AATT-----AAA-A------CCCA-CA---TTTGTT-----T--TTAT-CTAAGATGAC----AT---T---AAT---AAA----GAAAAAGGTAT-------GCTa
gi|2 : T-------GTTGTCATGCTCG-TTTTTGTGCTAA--TTCAT--TTTCAA--GA--TGATACC--AA--CAT-CAAAATCGAACATT----TT--GTA-------AATTTTA--ATAAAA-AT----------------GAGA--------AC-AT-TC---TAT------TATACATATGAAACTGAAC------TT--GAA-----A---TGAA---CATAATGGTAAA---ATAGATTAC--AAATGT--------ATGT-TT--A--ATAAGA----TG----CAGT--GA-A--TATT---ATGTTT--C---T-TA-TATATT-T-T---T----GC-T--T---TAG---AAA-------------TT----ATCGAAT------AT-------TC--C--CCTT-T----CA-TA----TTTTTGT---ATATATTTTCT--TAACAAATGTTTAT-GA-A---AA-A----TATA-----A-TT--T-----ATT--TAATAAG-A--TAT------TTT-A-TATTTTGA-TTT-CTCT----TGAT-CCA-GTGTTAGAACTTTCTG-A-A--TTCAAAAAGAAA-A--TTA-AAGGCT-GT-CATGCATTTGA----AA-GAA-ATA--TT--TGGG----AGATT------A-TTTTAGA----AGTG--CA-------T-ATTT--T--GGTGTT-T----------AT--T-----------------AA-C-G---T----T---TA---TG-----A-T-TGC-TTTAATCTG---ATA----------T-T---------T--GTT---ACAA-T--TTTTGAAAATACAAA-AT-AAG------AA---TTTCTA---T-A--AAA-A-CA-----G---CA-T-------------A--T-TTATT-----GGCAAAT--A-GTTTTCC----------------------TAACCGCTAT---------AAGA---TATATACACA----------------TT-----------T--------A---T---------A---------------------TA---CT-----A----G--------------T--------A---------C-GTAT-A---TC--T----GCAAGAAA-ATGACGACAAAAG-T--GGA-AACA-A--AATAT-------T------------------------TTGC-TT-T--TT-A-A-A-A-A---TGTA-C--------ATGTTTGTGGC----TTAAATCA-TT--CAAT---------ATCTA----TA-AT-A---CTACCACAA-AAATTAT-GTTT--CTTA----AACGCAAAAC-A-----ACCTTGATTG-AACATgaggtcactaatgca
gi|6 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccataaggttgttggctcgtgaaaatttaagttattagattttTTGCCATGCTCG-TTTTTATGCTTT--TTAAT--CTTTAA--GA--TAATACC-----------AAAATCTAATATT----TT--GTT-------AATTTTC--ATAAAA-TG-AGA--T---AATTAAGAT----------T-AT-C----TAT------TGCACATATGAAACTGAAC-----TTA--AAA-----A---tcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|23 : TGT--TTCAT--TTTAAA--GA--TGATACC--TA--CAT-TAAAATCT-AT------------TT-------ATTTTT----TAAAA-AT-AAG--T-----TTAAGCTA--------TC-AT-TA---TGTCATATATATATATTCAA-A-TGA------ACTA--AAACGTGCA---T------TATAAAGA--AA---ATAGATA----ACATATTTT--TAAATCT-TTGAA--A--AAA----TA----CCAT--GG-A-AACTA---TTTTTT--C---TTTTACACGTT-T-T---T----GC-T--T---AAG---AAAA---G--AA----aaatatgtttgttttagaaaaaaaaacatcggcaatacacctaccactttttattactatattttttcacaaaaacacaacacataaaaatagatgtttgaatagttagatgattttatattttagttaacctttggtccaatataagcattttcagaatttattaagaaagtcacaggctgtcgtttttataaaagtaatatttgtcgaatgaccttaaacagtgcatatttaagtgtttaaaatgtttatatttgaaaacataaaaatgttacgtttaagttttaaaaaacgtaatgcatactatcatacacttgaacaactttttttttgaaaagaaaaaacaatattttatcgcttggaaaaatatttatatctctaaaatgtactcgtacaccctatgtttcttggtatcacgtcaaaagatgaacaaaaatcgaatgtttttgttaaatgatagaaaaagatatatttgtggcttaaaatgttcaatgtattcatagccataagactgcagcaaggacaatagttt
gi|17 : gcTAT--TTT-T--TTTTAATTCAGTTAAT-CCAGTATTCAT-CATGATCTAAATTGAAAACT--GCTCACGAAAAATGCTG--ATTAAA-CTGAAG--T---AATTAAGATA--------TT-AT-TA---TAT------TATATATTTAA-ATTG-AC----CCTA--CAAAAGG-A---G------CATAATAG--TACATATGGTTAAT--ACATATATT--G--GTCT-TTGAA--A--AAA----TA----CACT--GAGA-ATCAA---ATTTTTA-C---TCTTAC-ATAT-ACT---T----GT-T--T---TAA---CAAATTCA--AA----TT----A---AATAAAATAAC-CA--CATA--C--AGCT-TG--GTA-TAACTATTTCTTT---TTattgtcgactatatcccaacaacatattgtatgtttttttaaacgaaaattcataaaaaaaaat
gi|3 : -AGA--T---CATTAAGATA--------CA-AT-TC---TAT------TATATACATGAAAGTGAAC----TTTA--ATA-----AGTCT------CATAATCA--AA---ATGCATAGC--AACTATTTT--T--ATCT-TTG-A--A--AAA----TAAAAACACT--GA-A-A-CTG---AAGTTTTAC---TCTGCTA---T-G-T---TTTGTGC-T--T---TAG---AAAA---A--AAAAA-TC----AGC-TCT------AC-C---CACCTAC--TCTT-TAA-GTA-T-----------T---TTA-AC---ATTAAAAC------TT-T-TAAA---AA-AATA-TA-A-----A-TT--TGGAT-ATT--CA----G-ACTT-T------TTT-A-TAATTAAG-TTT-CCT-A---TGGT-TGA-ATGTTA------------------TATAAAGGGT-A--TCA-TAGGTT-GA-CGTGCATTTTA----AA-GTA-ATA--TT--TGTC----AAATT------A-TCTTAAAT---AGTG--CA-------T-AAAC--T--GATG-T-T----------GT--TTTA----A--A------AG-T-G---T----T---TA---TAAC--TA-T---A-TGATATT---AAATAA-GT-----GT-TA--------T--GCT---TTAG-T--GT----------AAA-AT-TAGTA---TAA----TAATA--CT-A--TCATA-CAC--TTG---GA-A-------------AACT-TT-TT-----G--AAAT--ATA-----A----------------------AAAC---------------AAGAATTTATTATAAAAATATTTTTTTATCCCATC-----------T--------A---C---------A----------A---------TTA---CC-----T----C--------------T--------AC------CCC-TTA--T---TT--TCATGGTAATAAA-ATGATGCCATGAGTT--AAA-A--A-AACAATAT-------C-------------GAAACAA----TT-G-TTATGGTC-A-ACA-C-A---TGGA-C--------ATGTGTGTGGT-------------TT--AAATTGT------ATCTATAT-CC-AT-AAGACTG-ACTGA-AAGATAT--TTTAATTTA--------AGATAT-A-----Atattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|18 : ttcaggatgttgactcatcaaaacaacgtaattaagactatttcaattcagttaaaaaacatatgtattattatctaagactgattgcgaaaaaatgtgccgtgctcgtttttgagttatttcaattataC-ATATG---TAT------TGTACATATGATACTGAAC-----TTA--AAA-----A---TGAGCACCATAATAA--AA---ATGGATAAC--AAATATTTT--A--ATAT-TT--G--ATAAAA----TA----CACT--GA-A-AACT------------------------------T---T----GC-T--T---TAG---AAAA---ATCAG----TG----ACT-ATT-------C-CC--CATC--C--ACTT-TTTTGCA-TGT--ATTT---T---TTA-AC---AA--AAAC------ACAT--A-A---AA-A----TA-------------T-----A-----A----G-GCTT---------TT-CATATTTTAG-TTT-CATTT---GG-T-CGA-ATGT----A------A-A-A--TTTATAAAGAAA-A--TTA-TA---T-AC-TGAGCAaattcacacttatgaaaatct
gi|5 : atataaataaaTGAAA----ATTA--GTA---------T------GATAATAA--AA---TTGGATAGC--ACGAATGCT--A--ATTT-TT--A--A--AAAAA--TA----CACA--GA-G-CACTA---AGTTTT--CCCTTATAATTATATTC-T---T----ACAT--TCAGTAG---AAAA---A--AT----TCTTTGGCC-A-T------AC-CTACCAAC--T--TTTTATG--GTA-T------TTTTGT-----A-AC----T--GAAA-------CAT--ATA---AA-GATTTTA-ATTG--G-GA--T-----AAT--TAA---G-ATTCCT------TTT-A---TTTCAG-TAT-CCTTT---GG-T-CCT-GTGAAAGCACTTTC-A-A-A------------AC-G--TCA-TAGGTT-TT-CGGTCATTTTA----AA-GAA-TTA--TTTGT--C----AAATT------A-CCTTAAAT---ATTC--CA---------TATT--T--TGTG-T-TTCAACTGATGAT--TC----------------AA-T-GC--T----T---CA---AC----TC-T-T---TGACAT----AAAT----TAAT--GT-TA--------A--GTT---TTAG-T--TT----------AGA-AA-TAGTC---CAA---T--ATA---T-A--TCATA-TAC--TTA---TA-CATATATTATTCATAACT-GT-TC-----G--AAATAAA-A-----CAACA------------------AAACTTTCTCCTTTGAAAAAAAA---TAT-----------------------TT-----------T--------A---T------------------------------TTA---CT-----T----T--------------TCCG-----AC------TCT-CAAT-T---TTAATTG-GTTATATAATAAGATG-CAAAAGTTC-AGA-A--ACA--AAAAT-------A-------------G-----A----T----------TT-A-A-A-A-AAATTGGA-AAAAATATTATATTTGTGGC-------------TT--AAATTGTTCATGTATCCATAT-Taaagtagaaacgtctcacttatggatccgacatttattcatctatgtttatgttacaca
gi|20 : ttaaagatggctcgtaaaatgaaaatacaaatagatctaacttttttttgtattatgttaaaacatattttctattatcttaaaagaaaaagataatgactgcgaaaagatatgatgccgtgcttgttttagtactgtttaatttttaaatgatacctacgtacaattttatatcttgtagtA---ATTGATAAC--GCATATGTT--A--ATCT-TT--G--A--AAAACTGTA----CTGT--GA-A-GT--------GTTT--------TAA-AATAC-A-T---T----AC-TCGT---TA--------------------------------T------AC-TC--CATC--CATTCTT-TC--ATA-TG----TTTCCGT-----A-AC-------AAAA------CCACATACA---CATA----TA-A------------------CT--TC----G-AATTATAACACTTTT-TATATCTGAA-TTT-ACATC---TAAT-CCT-ATGTGAGTTCTTCA-A-A-A--TTTATAAATAAG-A--TTT-TAGCTT-TG-TTTGCATTTCA----AA-GAA-ATA--TT--T--T----cagagg
gi|6 : ataatgcataagaaattgatcttaccaaatgaaccatattaagtttaaT--T--ATCTATT--G--C--ACA----TA-------T--GA-A-A-CTG---A-ACTT-------A-AAAAAAAT-A-TGTTT----GT-T--T---TAG---AAAA---A--AAAACATC----GGC-AAT------ACACC--TACCA-C--TTTT-TA--TTACTAT--ATTT---T---TTC-AC---AA--AAAC------ACAA-CACATAAAA-A----TA-G-----ATGT--TTGAATAGT--TA----G-A-TGAT------TTT-A-TATTTTAG-TTAACCTTT---GG-T-CCA-ATATAAGCATTTTC-AGA-A--TTTATTAAGAAA-G--TCA-CAGGCT-GT-CGTTT-TTATA----AAAGTA-ATA--TTTGT--C----GAATG------A-CCTTAAAC---AGTG--CA-------TATTTA-----AGTG-T-T-----------T----------A--A------AA-T-G---T----T---TA---TA----T--T-TGA-AAACATAA--AAAT----------GT-TA--------C--GTT---TAAGTT--TT----------AAA-A---AACG---TAA---TGCATA--CT-A--TCATA-CAC--TTG---AA-C-------------AACT-TT-TTTTTTGA--AAAG--A-A-----A----------------------AAAC---------------A--A---TAT-----------------------TT-----------T--------A---TCGCTTG---G----------AAAAATAT--TTATATCT-----CTAAAA--------------TGTACTCGTAC------ACC-CTAT-G---TT--TCTTGGT-------ATCACGTCAAAAGAT--GAA-C--A-A--AA-AT-------C-------------GA----A----TG-T-TT-TTGTT-A-A-ATG-A---TAGA-AAAAGAT--ATATTTGTGGCT---TAAAAT-G-TT--CAATGT-------ATTCATAG-CC-AT-AAGACTGCAGCAA-caaa
gi|16 : ttgccatgctcgtttttatgctttttaatctttaagataataccaaaatctaatattttgttaattttcataaaatgagataattaaga--A--A--AAC----TA----CTTTACGA-A---CTA---ACGTTTT-C---TCTGACATATT-A-T---T----GT-T--T---TAGAAAAAAA---A--AA----TT----AGC-AAT------AC-C---CACC--C--ACTT-TT--G-A-T----ATCTATTT---TTA-AC---AA--AAAT------ACA--TACAC--AA-A----TATA-----A-GT--TTGG--AGTAGTA----GTACTTCT------TT---ACATTTTAA-TT----TTA---T--T-CTA--TGTGAGCTCATTC-A-ACA--TTTATCAAGAAA-A--TCC-CAAGTTCGC--GCGCATTCTA----AA-GAT-TCG--TT--T--TTTACAAATT------A-TTTCAAAA---AGTGAATA-------T-CATA--T--TGCA-A-T----------AT--TTT-----A--A------AG-T-----T----T---TA---TA----T--T-TGA-CAACACCA--AAAAAA-TTATA--TA-TCCAA-----C--GTT---TTTG-C--TT----------AAA-AA-TAGTCCTACAA---TATATA--AT-C--TTATG-CGC--TT----TATC-------------AACT-TT-TT-----G--Aggacaatagttt
gi|7 : aT------AC-C---CATC--A--GTTT-TT---TA-TA----TTT---T---TTA-AC-------AAA---------AG-TACA---AA-A----TA-ACTGAGA-GG--T-----AAT--TA----C-ACT-GT------TTT-G-TGCTTTAG-TTT-CCTTT---CG-T-CCT-ATGTAAGCCCTTTC-ATG-A--TTTTTACCGAAA-A--GCA-TGTGTT-TG-TGTGCATTTTA----AA-G------------T--C----AAATT------A-CCTTAAAT---AGTG--CAAACTTTGT-TATAA-T--TATA-TAT----------AT--ATTA----A--A---------T-A---T----T---TA---TA----TG-T--GG-TAACATCAGAAAATAA-TT-GATCGT-T---------T--GTT---TTAG-G--TA----------AAACAA-TAGTT---AAA---TATATA--CT-A--CCAAA-TAT--TTG---TA-C-------------AACT-TT-TT-----GA-AAAG--A-A-----C------------------------AC---------------AAAA---TTTTA---------------------TC-----------TTTGAAATAA---T---------GTCCACTTAGCA---------TTA---CC-----T----C--------------C--------AT------CCC-CTAT-T---TT--T---GGCAAGGTA-ATGATGTCAAAGGCT--GAA-C--ATA--AATAT-------CAAATAAAAAAGGAA-----A----TT-T-GT-T--TT-T-A-A-A-G---TGGA-C--------ATTATTGTGGCTTAAAATAATGG-TTTGAGGT---------ATACATAT-AC-AT-AACACTGC-ATAATACTATATAGTTT--CGTA----AAATAAATGC-T-----ACTTCTATTT-AAGAT
gi|10 : aaaacacgaaccgaaactttgtatgttcgtacatgaattgtacatgaatttgctt---TTA-AC---CA--AAAA------GCAT-GA-A---AA-A----TA-T-----ATGTGAT-----AAT--TA----T-ACTT-T------GTT-A-TATTTTAG-TTT-CCTTT---GG-T-TCA-TTGTAAGCACTTTC-A-G-A---------------A--TTAAT-----------TGCACTTTA----AA-GAA-ATA--TT--TGTC----AAATA------A-CTATAAAT---AGTG--CA-------T--ATG--TT-GATA-C-T----------GT--TTTA----A--A------AA-T-A---T----T---TA---TA----T--T-TGA-TAACATCACAAAATAA-TTAAT--GTAA---------T--GTT---TCAG-T--TT----------AAA-AA-TATTC---TAA---AACCTG--CT-A--TTATA-CAC--ATG---TA-C-------------AACA-TT-TT-----T--AAAT--G-A-----CAAAACATGATTTTTTCTCTTTTGAAC---------------AA-A---TAT-----------------------T------------T--------A---TTCCGCTTAAA----------G---------TTA---CC-----C----T--------------T--------AC------CCCTTTTT-T---TT--TCTTGGTAAGAAA-ACGATGCCAAAAGTT--AAA-A--A-A--AATCTAAAAAAAA-------------G-----G----TA-T------GTTAA-A-A-A-A---TGAA-C--------ATGTTTGTGGC----TTAAATCG-TT--CAATGT-------ACCGACAT-TC-AT-ATGACTGTAACAA-A--ACATGGTTattaaattcatcaatatgaatagatgaaacttttctagcgaacatc
gi|13 : atttatctcgA---AA-A----TA-A-----C--T--T-----A-T--TA----C-ACTTTT------TTTCAATAGTTTAGCTTT-CTTTAATTTG-G-TCATATGTAAGCACTTTC-A-G-AACTCT-TAACGAAA-A--TCA-TAGGTTTGC--ATGCATTTAA----AA-GAA-ATG--TT--TGTC----AAATA------A-CCTTAAAT---AGTG--CA-------T-AGTT--T--GATG-T-G----------AT--TTCA----A--A------AA-T-G---T----T---TA---TA----T--T-TGA-TAACATATGGAAATAG-TCAAT--GT-TA--------T--GCT---TTAG-T--TT----------AA-----CAG-C---TTA---CTAATA--CT-A--TCATT-TGC--TTG---TA-C-------------ATGT-TT-TT-----G--AAAaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaactaacgagccaacatccttaacaa
gi|12 : ttataaaaagaaagtagtaagaatatttgattttgatcttgcaaaacaattaaatgaaattaaaattggtatctaacatgtcgttaatctttgaaaaagctgaactgataagcattaactataccccaaccaatcaatataaacacacata------TTT-A-TATGTTAG-TTT-CTTT----TG-TTCCT-ATGTAAGTACTTTC-AGA-A--TTTATGAAGAAA-A--TGA-TAAGTTTGTATGTACACTGTATTTTAA-AAACATA--TT--TG-T----GA---------------AAAC---ACCTA-CA-------T-ATTT--T--GGTG-C-T----------AT--TTTT----A--A------AA-T-G---T----T---TA---TA----T--T-TGA-TAACATTAGAAAATAA-TTAAT--GT-TATAATATTAT--TTT---TTAG-T--TA----------AAA-GT-AATTT---TAA-----AAAA--AG-A--AAAAA-CAAAATTA---TT-T-------------A----TT-TT-----G--AAAA--A-A-----T------------------------------------------ATT---TAT-----------------------TC-----------C--------ACT-T---------A----------AAG-------TTA---CC-----C----C--------------C--------AA------CCC-ATAT-TATGTT--TCTAGATACGAAA-ATGATGCCAAAAAATCAAAA-A--A-A--AATAT-------T-------------G-----AAACATT-T-TT-TTGTT-A-A-A-A-AA--TGGA-C--------ATTTTTGTGGC----TTAAATTG-TT--CAATAT-------ATCCATAT-AC-GC-AAGACTGCAACAA-AAATAACAGTTC--ATTA----AAAGATTTAT-ATGTGTA-TTTAGTTTCAAGATata
gi|29 : G-T-CCA-ATGTTAACACTTTC-AGA-A--TGTATAAAAAAACA--TT----GGCT-GT-CCTGCATTTTA----GA-GAA-ATA--TT--TG-T----A------------CTTTAAAT---AATG--CA-------T--ATG--TT-GGTG-T-T----------AT--TTCA----A--A------AC-T-A---T----T---TA---TA----T--C-TGA-TAATATCAGAATATAA-ataaagtaaataaacatcgatatctgaaaacttcctaaaccaacacca
gi|24 : ttaatgttaacactatttgaagtatgtttacactttctgaagtatagcctg-T-TCA-GTGTTAGCACTTTC-AGA-A--T-TAAAAAGAAA-A--TAA-TAGGTT-GC-CATGTATTTTA----AA-GAA-ATA--TT--TA-T----AAAAT------TATCTTAAAT---AGTG--CA-------T--ATT--TTAGATG-T-C----------AT--TTTA----A--A------AA-T-G---T----T---TA---TAATATTA-TATGA-TAACATCAGAAAATAA-TTAAA--TT-A---------T--GTT---TTAG-T--TT----------AAG-AA-TAGTC---TAG---TACATA--CT-A--ACATA-CAC--TTG---CA-C-------------AACT-TT-TC-----A--AAAT--A-A-----TA---------------------AAAC---------------GAGA---TTT-----------------------Tt
gi|11 : taacaaatttttttatatattgtA-ATGTAAGCATTTTC-GGA-A--TTCATAAAGGAA-A--TAA-CAGATTTGC--ATGCATTTTA----AA-G--------------------AACTC------T-TTTCAAAT---AA----CA-------T-GAAA--C--GGTG-CAT----------AT--TTTA----A--A------CG-T-G---T----T---T----TA----TA-T-T---TGATATCAGAAAATAA-TCAA----------------T--GTTAAGCTAG-T--TT----------AAA-AA-AAGCC---CAA---TACATC--CTAA--ACATT-CTA--TTG---TA-C-------------AACT-TT-TC-----G--AAAA--G-A-----CA---------------------AAAC---------------AAGA---TTT-----------------------TC-----------T--------ATTTT---------G----------AATAAAATATTTA---TTC----C----ACTTAAAGCTGTCCCT--------AT------TCC-CTAT-T---TT--TCTAGATGGGAAA-ATGATGCCAAAAGCT--GAA-A--A-A--A--AT-------C-------------G-----A----TT-TATT-TATTT-C-G-A-A-T---TAAA-C--------ATGTTTATGGT----T-TAAACATTT--CAATGC-------ATCGATAT-AC-AT-AAGACTGCAACAA-AAATAATTA-TT--TTTA----AAAGAAATAC-A-----ACTTCAATTT-
gi|22 : aaaattcattggctataccccaaccatttttttattttgtcacaaaaccacata-A-A--TGTATGAAGCAA-A--TCA-TAGGCT-GC------ATTTTA----AA-GAC-ATG--TT--TG-T----CAAAT------T-ACTTAAAT---AGTG--CA-------T--ATG--TT-AGTG-A-T----------AT--TTAA----A--A------AAAT-G---T----T---TA---CA----T--T-TGG-TAACATCTGAAAATAA--TAAA---------------T--GTT---AT-G-T--TT----------TAA-AC-TAGTC---TAA---ATCATA--GT-A--TCACA-CAC--TTG---TA------------------------------G--AAA--------------------------------------------------------A---TAT---------------------------------------------------------------------------------------T-----T----A--------------T--------AC------CCC-CTAT-T---AT--TCCTGGTCAG-AA-A------------------A-A--A-A--AATAT-------C-------------G-----A------------TAAAT-A-A-A-A-A---T-GA-A--------ATGTTTGTGAC----TTAAATCG-TC--CTATGT-------ATCCATAT-CC-AT-AAAtactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|38 : g--TGTATAAAGAAT-T--TCA-AAGGTT-AC------ATTTTA----AA-GAA-ATA--TT--TGTC----AAATT------A-CCTTATAT---TGTA--CA-------T-AGTT--T--GGCG-T-T----------AA--TTTT----A--A------AA-T-G---T----T---GA---TA----TGTT-TGA-TAAAATCTGGAAAAAA-aca
gi|39 : TA-TAGGTT-GC-CTTGCATTTTA----AA-AAA-AAAA-TG--T--C----CATTT------A-CGTTAAAA---AGTT--AA-------T--AT---T----TT-T-T----------AT--TTTACTTTA--A------AA-TAG---T----T---TA---TA----T--T-TGA-TGGCATCAGAAAATAA-GTAAT--AT-TA--------T--GTT---gttatgt
gi|14 : -TATGTATTTTA----AA-GAA-ATA--CA--T--G----TATTTGTCAAAT-CCATAAAC---AGTG--CA-------T-ATTT--T--TATG-C-T----------AT--TTTA----A--A------AA-T-G---T----T---TA---TA----T--T-TGA-TAACAATAAAAAATAATTTA-----T-T---------TAAGTT---TTAG-T--AT----------AAA-GA-TA-------------TCATA--TT-A--A
gi|30 : taagtagtttctATTTTA----AA-GAACATC--TG--T--C----AAATT------A-----AAAT---ATTG--CA-------T-GTTT--T--GGTG-T-T----------AT--TTGA----A--A------AA-C-A---T----T---TA---CA----T--T-TGA-TAAAATCAGAAAATGA-ATAAG--GT-TA--------A--GTT---TTGG-T--TT----------AAG----TAGTC---TAATACTTCTTAGTCT-ATTACGTATTTC--TTG---TA-C-------------AACT-TT-TC-----A--AAAaaagaaaaaaaatccctcttttgaaaaaatatctattttacttaaatccctcttttgaaaaaatatctattttacttactgtttccctacccccatatttttcttgataagaaaatgatgccaatagttgaaaaaatactttttaaaaaatggatacatgtttgtgacttaaatcgttcattgtatccatatgtatatgactgcaacaaaaatactggtttctttaaagtaatacaaacgttatttattttatg
gi|8 : A-ATA--TT--T--TGT--AAATT------T-TCATAAATTTGAGAT--CG-------T-TAAA--G--GGT--C-T----------GT--TATA----C--A------AA-T-GAAAC----T---GAACTTA----AA-T-TGAGCATCATAATAAAATGA-ATAGG--AA-A---------T--ATT---TTAA-TATTTGGC-------AAA-AT--ACAC---TGA------ACA--TT-T--ATATA-TAT--TTGCTTTA-G-------------AGTTGTT-TT-----A--AAA-----------------------------------------------------AAAA---TA-----------------------------------------------------------------------------------A---CC-----C----C--------------T--------AC------CCC-GTAT-G---TT--TCTTGGCAGGAAA-ATGATGCCAAAA-TT--AGATA--G-A--AATA-------------------------------------------ATA-A-A-A-A-A---TGAA-C--------ACATTTATGGC----TTAAATCT-TT--GAATGT-------ATCCGTGT-TC-AT-AATACTGCAATAA-AGATAATAATTT--CTTA----AAAGAAACAC-G-----ATTTTAATTT-AAGATagaaaaaagaa
gi|4 : ttaaagatgttgcctggctcgtcaaaatgaaagtaattagatatctttttaattcagcatatttattttttgttaagattaaattgatcatgaaaagaatttgttaccgtgttcgttttttttttgccatttattattttaaatgatatccacttcaaagtct----------AT--TTTA----A--AGAAATAAA-T-G---T----CAAATA----A----CA-T-TAA-----ATCAGAATATAA-TTAAT--GT-TA--------T--GTT---TTAG-T--T------------AA-ATATAGTC---TTA---TATATT--CT-A--TTGTA-CAC--TTG---TA-T-------------ATCT-TT-TT-----C--AAAT--G-A-----T----------------------AAA----------------AAGA---TTT-----------------------TCTCTTTTGAGCAT--------A---T---------A----------T---------TTA---TT-----C----AGCTAAGAGT-----T--------ACCCGTAACCC-CTAT-T---TT--TCTTGGTAATAAA-ATGATG---------------A--A-A--ACTAT-------T------------------------TT-A-TT-TGTTA-A-A-A-A-A---TGAA-C--------ATATTTGTGGC-------------TT--AAACCG-------A--------TA-A--AAA----CAG-AA-A----ACGATTT--CTTA----AAAGAAATAA-A-----ACTTCAATataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|14 : acttaaggatgttggctcgtcaacatgaaataaattagatttttttaattattcagttaaaaataatatgtattatttataaatatctaagatgaaatgataacgagaaagctatgttgccatgatcggttttgtgcgatttaattttaaagttgatacatacgacatcatttttttagtttatttttttatgaaaatggtgaccatgaagatatcattatattaaacatatgaaactgaacttaataatgagcatcataacaaaaattaataactaaaataatcttttttatactttttcttgctttagaaaaaattcatcgtcacatcctatgcaatttttatatgttatacatgttgggataattagacttttttatattttagcttcctttggtccaatgtaagcactttcagaatttataaaaaaaaaatcataggttgccgtgc-TT-TT-----G--AAAA--A-A-----T-----------------------ATC----------------------TAT-----------------------TT-----------T--------A---C------------------------------TTA---CTGTTTCC----C--------------T--------AC------CCCCATAT-T---TT--TCTTGATAAGAAA-ATGATGCCAATAGTT---GA-A--A-A--AAT-----------------------------A----CT-T-TT-TA----A-A-A-A-A---TGGATAC-------ATGTTTGTGAC----TTAAATCG-TT---CATTGT------ATCCATATGTATAT-GA--CTGCAACAA-AAATACTGGTTT--CTTT----AAAGTAATACAA-----ACGTT-ATTT-ccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|9 : taagtagtttcttatgtattttaaagaaatacatgtatttgtcaaatccataaacagtgcatatttttatgctattttaaaaatgtttatatttgataacaataaaaaataatttatttaagttttagtataaagatatcatattaaaaagaaaaaaaatccctcttttgaaaaaatatctattttacttaaatccctc---------TTA---AT-----C----C--------------T--------AC------TCT--TATGT---TT--TCTTAGTAAGAAA-ATGATGTCAAACATT---TA-A--A-A--TATAT---------------------------A----TA-T-TT-TTGTT-ATA-A-A-C---TCGA-C--------GTGTTTCTG-----------TCT-TT--AAAC---------ATTCATTG-TA-CCGAAATCCATAATA------------CT--GTTA----AAAGAAACAC-A-----ACTTCAGTTT-AAGAttttatg
gi|37 : gttgactgagtatttattaaggatgttggctcgtcataattaagtaataagatctttttttaattcaattaaatatcatttttattattatctaagatgaaatttagaacgaaaaatgtatattagggtacttgtatttgtgctatttaatgtttaggatgatgcttacgaacttatattgtttagtaaattttgataacatgtggtccttgaaatatcaatgtattattcataagaaactcaacttaataatgagtattataacaaaaattgatcacttatattttaatatttgtagacacaccttgaaaactatgttttttctcttatatcacgA-A--A-A--AATGT-------T-------------G-----AAACATC-T-TT-TTGTT-A-A-G-ATA---TGGA-C--------AT-TTT-TGGC----TTAAATTG-TT--CAATGT-------TTTCATAT-TC-AT-GAGACTGCAACAA-AGATAATCACTT--CTTATTAAAAAGAAATAC-A-----ACTTcattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTTTCGGAAAGACTAAACAAGATTTCGTTGATGAAAACAATATATATTCCGCCTGAGATACCTCTCTGGTTTTCTGTATAAGAAAATGATGTCAAAGGTTGACTGAATTAAAAATGGTAAAAGAATGGACGAGTTTGTGGCTTGAAAAAATTTCAATGTACACATATCCTTAAGACTGCAACGAAGACAATAGCTAGCTTCTTTAAAGAAATACAACATTACCAAGATTACATTATTTACCCTTATATGCTTAGTAAATATTCTAAATAAAACTTGCAGAACAT
Unaligned ( gi|26 ): AAATATGTATTGTTATCCCTATCACCTATTTTTTCTAGGTAAATTATATTGCTAAAAATGGAACGTTTTATTTTTTAATTTGTTTAATGTTTCCATAGTCATACGATTGTCATAATTATTTCTGGAAGAAACTACAACTTTTATTGAAGATATCAAATACATAAACATGGCATCTGGAAACTTCCTAGCCAACA
Unaligned ( gi|27 ): TGCCGCGTTAAAGTTACCCCACCATTCCTTGGTATGAATACACTGCAAAGATTTGAAAAAAATCTAAACAAATGGATTTTGTTATGGATTACAGATGGACACGTTTATGGTTTAAGCGTATTCACATGATAAGACTTCAATAAAATAATGGTTTCTAAACATTATGATTAAAATTCATGAACATAAAAATCTG
Unaligned ( gi|31 ): TGGGGTAAATACACTTTTTTGTATTTAAGTTTCTTTGATCCCATAAATGAACTTTCAAAATTCATACAATATAAATTATATGCTTGAGTACATTTTTAATTAATAAATACCCTAAATGTGTGCATAGTTTTGTGTTATAACACATAGTCTGATACACACTGATTGTACA
Unaligned ( gi|32 ): TTTTGAAAATATAAGTACATCTGGCTTACATTGTTCAGTATATCAGTATCCACAAAACTGTAACAAAGATAATAGTTTCTTAAAATAAATATATCAACTGAAGATCATAGTAAAACATTACAAAACGTGAAATCTGAAATTTTCTTAGCCAATATCCTTTA
Unaligned ( gi|33 ): AAAATGGATAACATATATGTTAATCTCTGGAACAAAATACACATTCTATCTATTGTCTATGCATCACTCACACCACCACTGTTTGATATGTTTTTGAAACTATCACACACAAAAATTTTAACTGGATAATTGCACTTTTTCTA
Unaligned ( gi|35 ): TTTTAAAATGAGCATCACAATAAAAATGGCCAAGAAATATTTTAATATTTGAAAAATGTACTCAGAACTAGGTATATCTGTAATGTATTCTTGTTTGAAGTTGAAAAATCATTGGCTATACTCTATCTACGTTTT
Unaligned ( gi|40 ): TTCTTGAAAACTGGGCATTTCGGTGACTCAAATTGTTCCACGAATCAATATCCATTATAAAACTTCATCAAAGATAAGTGTTTCCTAAGATGTTTAATGTAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11 1111111 111111111 222222222 222222 3333333333 1111111111111 1111111111111111111 44444444444444444444444444444444444 2222222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111 11111 11111 11 111111 111111111111111 1111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 2222 0 33 7777777 44 6666 77777777 555555555 0 888888 44 888888888 2 2 6666 555 77777 2 999999 2 2 2 2 9999999 555 33 333 77777 1111111111 55 9999999 1 2 444 2 0 33 2 44 44 44 0 3333333333333 77777 444 6666666666666666666 66666 5555 77777777777777777777777777777777777 66666666 66666 44 2 1 5555 33 11 4 0 2 2 2222222222 33 33 88888 33 2 2 5 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6 33 2 111111 2 2 666 2 88888 1 1 2 2 22 2 2 22 1 6666666 1111 1 333 555 44444 99999 1 1 555 1 22 44444 555 1 9999999999 22 44444 1 99999999999 555555 1 555 4444 333 22 3333333 6666 66 1 2 333 1 2 333 00 2 33 22 2 77777777 888 33 2 1 444 33 444444 33 33 444 444 666666666666666 0 2 1111111111 2 8888 3 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 666666 000 2 666 33 2 2 66 4444 33 2 2 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 2 9999999 2 2 333 11111111 2 4444 4444 4 0 3 11 0 7777777777 5555 444 3 4
lowQualScore : .... . .. ....... .. .... ........ ......... . ...... .. ......... . . .... ... ..... . ...... . . . . ....... ... .. ... ..... .......... .. ....... . . ... . . .. . .. .. .. . ............. ..... ... ................... ..... .... ................................... ........ ..... .. . . .... .. .. . . . . .......... .. .. ..... .. . . . ................................................................................................................................................................................................................................ . .. . ...... . . ... . ..... . . . . .. . . .. . ....... .... . ... ... ..... ..... . . ... . .. ..... ... . .......... .. ..... . ........... ...... . ... .... ... .. ....... .... .. . . ... . . ... .. . .. .. . ........ ... .. . . ... .. ...... .. .. ... ... ............... . . .......... . .... . . ................................................................................................................................................................................................. ...... ... . ... .. . . .. .... .. . . .. ........................................................ . . ....... . . ... ........ . .... .... . . . .. . .......... .... ... . .
lowQualScore : 0000 2 22 2222222 22 5555 00000000 222222222 8 888888 22 666666666 7 9 1111 000 11111 9 777777 9 9 9 9 3333333 000 44 777 66666 6666666666 88 3333333 6 9 777 9 1 22 5 66 66 22 2 7777777777777 77777 111 7777777777777777777 77777 7777 55555555555555555555555555555555555 77777777 22222 88 7 9 7777 44 22 5 9 5 5 9999999999 44 44 66666 44 7 5 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 77 5 777777 5 5 555 4 22222 8 7 1 8 88 0 0 22 9 5555555 5555 8 222 777 55555 11111 8 8 222 9 66 55555 555 9 8888888888 55 88888 9 33333333333 555555 9 222 0000 333 66 8888888 7777 55 9 0 555 2 0 555 77 1 88 99 1 66666666 000 22 4 8 111 22 222222 22 44 111 111 999999999999999 6 2 9999999999 2 2222 4 5 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 111 4 555 22 6 4 55 7777 11 4 4 22 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 2 4444444 2 2 999 11111111 2 5555 5555 3 4 2 22 6 5555555555 7777 777 1 0
consensus : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TTTTA-AT----T---CAGTT-----AAA-A---C--A-TATT-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGATG-A-A-AT--T--GA-CA-CGA-G-AAAAGG-TAT-------GTTGCCGTGCTCGTTTTT-GT---GCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TAT---ATTATACATATG-----AAACTGA----AC-----TTA-----AA--A-----A---T------CATAA----TA--A-----AAATG-GATA-ACANA----TA--TTTTAATCT-T-T--A----A--AA--A--TA----CAC--TG-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-A------C---A---TN-TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---GC-N-A-T-------A--C-CCCATC-CA--C--TTTT--GTATA--AT-T-TT--TTTAACAA--AAACACAT--ACA---A----A-A---TA-A-----A-GT--T-----ANT--T-A----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-----TTTGGTCCAATGTAAGCACTT-TCAGAATTTAT--A-AAGA-AAAT-CATA-GGT-------TGCCGTGC-ATTTT---AAAGA---A-----ATATTT-GTC-AA-A-TTACCTTAAAT---A-GTG--CATAAT-TT-G-G-TGTT----------A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---A----TA-T-TGA-TAACA---TCAGAAAAT-A---ATTA-A-TGTT--A-TG--------TTTTAGT--TTA--AA-AATAGTC---T--AA---TACATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-TTTTC---------G-AA----AAA-AC----A-----------------A---------A-C---------------A-AGA---TAT--T-----------------------C--------------T-----A-------T---------A-------------A-----T-TAC---C-----C---------C---------------T-----AC------CCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAA-AGTT--GA----A--A-A-A--AAT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGGA--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCCATAAGACTGCAACAAAAAT-AA----TGGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
Reference ( family-851 ) : TTTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTGAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTANGT---A--TTT-TTTTA-AT----T---CAGTT-----AAA-A---C--A-TATT-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGATG-A-A-AT--T--GA-CA-TGA-G-AAAAGG-TAT-------GTTGCCGTGCTCGTTTTT-GT---GCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TAT---ATTATACATATG-----AAACTGA----AC----ATTA-----GA--A-----A---T------CATAA----TA--A-----AAATG-GATA-ACANA----TA--TTTTNATCT-T-T--A----A--AA--A--TA----CAC--TG-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-A------C---A---TN-TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---NC-A-A-T-------A--C-CCCATC-CN--C--TTTN--GTATA--AT-T-TT--TTTAACAN--AAACNCAT-TACA---A----A-A---TA-A-----A-GT--T-----ANT--T-A----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-----TTTNGTCCAATGTAAGCACTT-TCAGAATTTAT--A-AAGA-AAAT-CATA-GGT-------TGCCGTGC-ATTTT---AAAGA---A-----ATATTT-G-C-AA-A-TTACCTTAAAT---A-GTG--CATNAT-NT-G-G-TGTT----------A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---A----TA-T-TGA-TAACA---TCAGAAAAT-A---ATTA-A-NGTT--A-TG--------TTTTAGT--TTA--AA-ANTAGTC---T--AA---TNCATA--CTAN-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-TTTTC---------G-AA----ANA-AC----A-----------------A---------A-C---------------A-AGA---TAT--T-----------------------C--------------T-----A-------T---------A-------------A-----T-TAC---T-----C---------C---------------T-----AC------CCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAA-AGTT--GA----A--A-A-A--AAT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGGA--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATTCATAAGACTGCAACAAAAAT-NA----TGGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
gi|1 : TCTCTTTAAATTAAAGACTGATTCATTTGAGT---T--TAAGGA----TATT---T----GTTCGT--------CAAAATGAAA------GTC--ATTATGT---A--TTTATTTTA-AT----T---AAGGT-----AAA-A---C--G-TATC-T-ATT-A-T-------ATCT---AAGATG-G-A-AT--T--AA-C--TGA-GCAAAAGG-TAT-------GTTTCCATGTTCGTTTTC-AT---TTTATTTTAT-TTTTAACATGATACCTACATCAACATCTGATATGCT--G--TTAA--TGTTGATAAAAAT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------CCAT-TAT---ATTATACATTCA-----ACACTGA----AC----ACTA-----GA--A-----A---T------CGTAA----CA--G-----GAATG-GATA-ACACA----TA--TTCTTATCT-T-T--A----A--AA--A--TA----CGT--TG-A-A-ATCT--A---ATATT----T---C-TATA-A------CAAAA---TA-TT----A-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---CC-A-A-T-------A--C-CTCATC-CC--C--TTTG--GTATA--AT-T-TCTGTTTAACCT--GAACTCAT-TACA---A----A-A---TA-A-----A-GT--T-----ACT--T-A----G-AC-TTATTTTA--ATATTTTAGTTT-CC-----TTATGTCCAGTGTTAGCACTT-TCA-AATGTAT--A-AAGA-AAAT-TATA-GGC-------TGCTGTGC-ATTGT---AAAGA---A-----ATATTT---T-AA-T-TTTTTTTAAAT---A-GTT--CATTAT-AT-G-G-TGTT----------A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---A----TA-T-TGA-TAACA---TCAGGAAAT-A---ACTA-G-AGTT----TG--------TTTTAGT--TTA--AA-ATTAGTC---T--AA---TTCATA--CTAA-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-TTTTT---------G-AA----ATA-AC----G-----------------A---------A-C---------------A-AGA---TAT--T-----------------------C--------------T-----A-------T---------G-------------A-----T-TAC---T-----C---------A---------------T-----AC------CCC-G-TAT-T---TTTCGCGGTAAGTAAAT--GATGCCAAA-AGTT--GG----A--A-A-A--AAT--------AT----T-------------G-----A-----T-T-T-T-TTG---G-TT-A-A-------A-A-A---TGGA--------AATG-TTTGTGGCGA----T----AATCGTTAAATTGATCCATATTAATAAATCTGCAATAAATGT-TA----TGGTTTTTT----AG---AAGAGA-TACAACTTTA-ATTTAAGAT
gi|10 : TTAACCA--AAAAGCAT-GA-A---A----A-A---TA-T-----ATGTGAT-----AAT--T-A----T-AC-TT-TGTT---ATATTTTAGTTT-CC-----TTTGGTTCATTGTAAGCACTT-TCAGAATT-------------AAT---------------------TGC-ACTTT---AAAGA---A-----ATATTT-GTC-AA-A-TAACTATAAAT---A-GTG--CAT-ATGTT-G-A-TACT----------G--TT-----T-TA----A------A------AAT-A---T----T---T--A---T---A----T--T-TGA-TAACA---TCACAAAAT-A---ATTA-A-TGTA--A-TG--------TTTCAGT--TTA--AA-AATATTC---T--AA---AACCTG--CTAT-TATACA---CATG---TA-C-------------AACATTTTT---------A-AATGACAAA-AC----ATGATTTTTTCTCTTTTGA---------A-C---------------A-A-A---TAT--T--------------------------------------T-----A-------TTCCGCTTAAA-------------G-----T-TAC---C-----C---------T---------------T-----AC------CCCTT-TTT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAC--GATGCCAAA-AGTT--AA----A--A-A-A--AAT--------CTAAAAA-------------A-----A-----A-G-G-T-AT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGAA--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTACCGACATTCATATGACTGTAACAAAA---CA----TGGTT
gi|10 : atttatctcg---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------TAaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaactaacgagccaacatccttaacaa
gi|11 : atttatctcgttaaccaaaaagcatgaaaaatatatgtgataattatactttgttatattttagtttcctttggttcattgtaagcactttcagaattaattgcactttaaagaaatatttgtcaaataactataaatagtgcatatgttgatactgttttaaaaatatttatatttgataacatcacaaaataattaatgtaatgtttcagtttaaaaatattctaaaacctgctattatacacatgtacaacatttttaaatgacaaaacatgattttttctcttttgaacaaatatttattccgcttaaagttacccttacccctttttttttcttggtaagaaaacgatgccaaaagttaaaaaaaatctaaaaaaaaggtatgttaaaaaatgaacatgtttgtggcttaaatcgttcaatgtaccgacattcatatgactgtaacaaaacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaacAATGTAAGCATTT-TCGGAATTCAT--A-AAGG-AAAT-AACA-GAT-------TTGCATGC-ATTTT---AAAGA---A-----CTCTTT-T-C-AA-A-TAACATGAAAC---G-GTG--CAT-------------------------A--TT-----T-TA----A------A------CGT-G---T----T---T------T---A----TA-T-T---TGATA---TCAGAAAAT-A---ATCA-A-TGTT--A-AG--------CT--AGT--TTA--AA-AAAAGCC---C--AA---TACATC--CTAAACATTCT---ATTG---TA-C-------------AAC-TTTTC---------G-AA----AAG-AC----A-----------------A---------AAC---------------A-AGA---TTT--T-----------------------C--------------T-----ATTTTGAAT---------A-------------AAATATT-TAT---T-----C---------CACTTAAAGCTGTCCCT-----AT------TCC-C-TAT-T---TTTCTAGATGGGAAAAT--GATGCCAAA-AGCT--GA----A--A-A-A--A----------AT----C-------------G-----A-----T-T-TAT-TT----ATTT-C-G-------A-A-T---TAAA--------CATG-TTTATGGTTT----A----AACATTTCAATGCATCGATATACATAAGACTGCAACAAAAAT-AA----TTATTT-TT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAcaa
gi|12 : aaaattcattggctataccccaaccatttttttattttgtcacaaaaccacataTTT---ATATGTTAGTTT-CT-----TTTGTTCCTATGTAAGTACTT-TCAGAATTTAT--G-AAGA-AAAT-GATA-AGTTTGTATGTACACTGT-ATTTT---AAAAA---C-----ATATTT-G-TGAA-A-ACACC------------TA--CATATT-TT-G-G-TGCT----------A--TT-----T-TT----A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---A----T--T-TGA-TAACA---TTAGAAAAT-A---ATTA-A-TGTT--A-TAATATTATTTTTTAG---TTA--AA-AGTAATT---TTAAA---AAAAGA--A-AA-AACAAA---ATTA---TT-T-------------A----TTTT---------G-AA----AAA-AT----------------------------------------------------ATT---TAT--T-----------------------C--------------C-----ACT-----T---------A-------------AAG---T-TAC---C-----C---------C---------------C-----AA------CCC-A-TAT-TATGTTTCTAGATACGAAAAT--GATGCCAAA-AAATCAAA----A--A-A-A--AAT--------AT----T-------------G-----AAACATT-T-T-T-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGGA--------CATT-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTCAATATATCCATATACGCAAGACTGCAACAAAAAT-AA----CAGTTCATT----AA---AAGAtactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|13 : A--TTTTGATCT-TGC--A----A--AACAA--TT----AAA--TG-A-A-A-TT--A---AAATTGGTAT---C-T--A-A------C---A---TG-TC----GTTAATCT--TT------GAAA----AAGCTGAACTGATAAGCA----TT---A---AC-T-A-T-------A--C-CCCAAC-C----------------A--A---------TCAATAT--AAACACACATA-A---A----A-A---T--A-----A-CT--T-----A-T--T-A----C-AC-TT-TTTTTCAATAGTTTAGCTT-TCTTTAATTTGGTCATATGTAAGCACTT-TCAGAACTCTT--A-ACGA-AAAT-CATA-GGT-------TTGCATGC-ATTTA---AAAGA---A-----ATGTTT-GTC-AA-A-TAACCTTAAAT---A-GTG--CATAGT-TT-G-A-TGTG----------A--TT-----T-CA----A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---A----T--T-TGA-TAACA---TATGGAAAT-A---GTCA-A-TGTT--A-TG--------CTTTAGT--TTA--A----CAGCT---T--AC---TA-ATA--CTAT-CATTTG---CTTG---TA-C-------------ATG-TTTTT---------G-AA----Atttatatgtgtatttagtttcaagatataaagtaaataaacatcgatatctgaaaacttcctaaaccaacacca
gi|14 : ttataaaaagaaagtagtaagaatatttgAATACATGTATTTGTCA-AATCCAT--A-AACA-G--TGCATA---T-------TTTTATGCTATTTT---AAA-A---ATGTTTATATTT-G------A-TAACAATAAAA---A-ATA--ATTTAT-TT-AAG-TTTT----------A--GT-----A-TA----A------A------GAT-A---T----C--------------A----TA-T-TAA--AA-------AGAAAA---------A-A-AATC--CCTC--------TTTTGA-----A--AA-AATA-TC---T--AT---TT--TA--CTTA-AATCC----CT------------------------C-TTTT----------G-AA----AAA-AT----A-----------------T-----------C-----------------------TAT--T-----------------------T--------------T-----A-------C-----------------------------T-TAC---TGTTTCC---------C---------------T-----AC------CCC-CATAT-T---TTTCTTGATAAGAAAAT--GATGCCAAT-AGTT--GA----A--A-A-A--A-----------T------------------------A-----C-T-T-T-TT----A----A-A-------A-A-A---TGGATA------CATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTTCATTGTATCCATATGTATATGACTGCAACAAAAAT-AC----TGGTTTCTT----TA---AAGTAA-TACAAata
gi|15 : taagtagtttcttatgtattttaaagaTTTCTTTAAGTTAA-T-TTGAAT--TCTAAAAAAAT--TA-GGA----TGTT---A-----CTCGC--------CAAAATGAAA------GAA--AATAG-----A--TTT-TTTTA-TTGAAAT---AAGTT-----AAA-AAA-C--A-TATT-T-ATT-ATT-------GTCT---AAGATG-A-A-AT-----GA--A-TAACG-AAAAGGGTAC-------GTTGCCTTGTCCGTTTTTTGT---GCTACTTAAA-TTTTAAGATGATTCATATGTCAAAATAAAATATTTT--A--AAAA--CTTTGATAACATG-AAG--T---CATTA-----ATA-TAAGTTTTTTTTAT-TATTCTATTATACATATG-----AAACTGA----AC-----TTA------A--A-----A---T------GAGCA----TC--A-----AAA---------------------------------T--A----A--AA--A---A----CCC--CA-G-G-A--T--A---ACTCT----T---G-TATA-T------C---A---CT-TT----G-----CT--TTTAAGTAAGAA----AA-----------AA--A-----C---A---AC-ATA-TTGGCTTAA--C-CCCATC-CA--C--TTacgttatttattttatg
gi|16 : t-A-A-CT--A---ACGTT----TT--C-TCTG-A------C---A---TA-TTATT-G-----TT--TT------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TT---A---GC-A-A-T-------A--C-CC-ACC-CA--C--TTTT--G-ATA--TC-TATT--TTTAACAA--AAATACAT--ACAC--A----A-A---TATA-----A-GT--TTGG--AGTAGT-A----GTAC-TT-CTTT---ACATTTTAATTT-TA-----TTCT-----ATGTGAGCTCAT-TCAACATTTAT--C-AAGA-AAAT-CCCA-AGT-------TCGCGCGC-ATTCT---AAAGATTCG-----TTTTTT-A-C-AA-A-TTATTTCAAAA---A-GTGAATATCAT-AT-T-G-CAAT----------A--TT-----T-T-----A------A------AGT-----T----T---T--A---T---A----T--T-TGA-CAACA---CCAAAAA---A---ATTATA-TATCCAA-CG--------TTTTTGC--TTA--AA-AATAGTCCTAC--AA---TATATA--ATCT-TATGCG---CTT----TATC-------------AAC-TTTTT---------G-A
gi|17 : aaaaactactttacg--TTT-TTTTA-AT----T---CAGTT-----AAT-C---C--AGTATT-C-ATC-ATG-------ATCT---AAATTGAA-A-AC--T--GCTCA-CGA-A-AAA
gi|17 : tattAA--TGCTGATTAAACTGAAG--T---AATTA-----AGA-TA--------TTAT-TAT---ATTATATAT-TT-----AAATTGACCCTAC----AAAA-----GG--AGC---A---T------AATAG----TA--C-----ATATG-GTTA-ATACA----TA--TATTGGTCT-T-TGAA----A--AA--A--TA----CAC--TG-A-G-A-ATCAA---ATTTT----TACTC-T-TACA------T---A---TACTT----G-----TT--TT------A--A----CA-----------AA--T----TC---A------A-A-T---------------------------------TA-A--AT----------AAAAT--AACCACAT--ACA---GCTT-G-G---TA-T-----A-AC--T-----ATT--T---------C-TT-TTTT---AT--TTTAGTTT-TC-----TTAGGCCCTATGTAAGCCCTT-TAAAAAtgctgattaaactgaagtaattaagatattattatattatatatttaaattgaccctacaaaaggagcataatagtacatatggttaatacatatattggtctttgaaaaaatacactgagaatcaaatttttactcttacatatacttgttttaacaaattcaaattaaataaaataaccacatacagcttggtataactatttcttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|18 : tatttttttttaattcagttaatccagtattcatcatgatctaaattgaaaactgctcacgaaaCATATGT---ATTGTACATATG-----ATACTGA----AC-----TTA-----AA--A-----A---TGAGCACCATAA----TA--A-----AAATG-GATA-ACAAA----TA--TTTTAATAT-T-T--G----ATAAA--A--TA----CAC--TG-A-A-A----------------------------------------A---CT-TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------A--------TC---A---GT-G-ACT-------ATTC-CCCATC-CA--C--TTTTTTGCATG--TA-T-TT--TTTAACAA--AAACACAT--A-A---A----A-A---TA-------------T-----A------A----G-GC-TT-TTC----ATATTTTAGTTT-CA-----TTTGGTCGAATGTAA-----------AATTTAT--A-AAGA-AAAT-TATA-gtata
gi|19 : atataaataaa-TTTTC---------G-GA----AAG-ACT---A-----------------A---------A-C---------------A-AGA---T-T--T-----------------------CGTTGATGAAAACAAT-----A-------T---------AT------------A-----T-TCC---G-----C---------C---------------TGAGATAC------CTCTC-TGG-T---TTTCTGTATAAGAAAAT--GATGTCAAA-GGTT--GACTGAATTA-A-A--AAT--------G---------------------------------------------G-TA-A-A-------AGA-A---TGGA--------CGAG-TTTGTGGCTTGAAAA----AAT--TTCAATGTACACATATCCTTAAGACTGCAACGAAGAC-AATAGCTAGCTTCTT----TA---AAGAAA-TACAACtactgagcaaaagtagaaacgtctcacttatggatccgacatttattcatctatgtttatgttacaca
gi|2 : --TAAGGT----TGTT---G----GCTCGT--------GAAAATTTAA------GTT--ATTAG-----A--TTT-TTattaccaagattacattatttacccttatatgcttagtaaatattctaaataaaacttgcagaacat
gi|2 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccaT-------GTTGTCATGCTCGTTTTT-GT---GCTAATTCAT-TTTCAAGATGATACCAACATCAAAATCGAACATTTT--G--TAAA--TTTTAATAAAAAT-GAG----------A-----A--------------CAT-TCT---ATTATACATATG-----AAACTGA----AC-----TT------GA--A-----A---TGAA---CATAA----TGGTA-----AAATA-GATT-ACAAA----TG--T----ATGT-T-T--A----ATAAG--A--TG----CAG--TG-A-ATA-TT--A----TGTT----T---C-T-TATA------T---A---TT-TTT---G-----CT--TT------AGAA----A---------------------TT---A---TCGA-A-T-------ATTC-CCCTTT-CA--TATTTTT--GTATAT-AT-T-TT--CTTAACAA--ATGTTTAT-GA-A---A----A-A---TATA-----A-TT--T-----ATT--T-AATAAG-A--TA-TTTT---ATATTTTGATTT-CT-----CTTGATCCAGTGTTAGAACTT-TCTGAATTCAA--A-AAGA-AAAT-TAAA-GGC-------TGTCATGC-ATTTG---AAAGA---A-----ATATTT-G-G-GAGA-TTATTTTAGA----A-GTG--CATATT-TT-G-G-TGTTT---------A--TTAACGTT-TA----T------G------ATT-G---C----T---TTAA---TCTGA----TA-T-TTG-TTACAATTTTTGAAAAT-ACAAAATA-A-GA----A-T---------TTCTA-----TA--AA-AACAGCA---T--AT---T---TA--TTGG-CAAATA---GTTT---TC-CT------------AAC-----C---------G-CT----ATA-AG----A-----------------T---------A-T---------------ATACA---CAT--T--------------------------------------T-----A-------T---------A---------------------TAC---T-----A---------G---------------T-----AC------G-----TAT-A---TCT----GCAAGAAAAT--GACGACAAA-AGTG--GA----A--ACA-A--AAT--------AT----T-------------------------T-T-G-C-TT----T-TT-A-A-------A-A-A---TGTA--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCATTCA--------ATATCTATAATACTACCACAAAAAT-TA----T-GTTTCTT----AA---ACGCAA-AACAACCTTG-ATTGAACATgttgtcatgctcgtttttgtgctaattcattttcaagatgataccaacatcaaaatcgaacattttgtaaattttaataaaaatgagaacattctattatacatatgaaactgaacttgaaatgaacataatggtaaaatagattacaaatgtatgtttaataagatgcagtgaatattatgtttcttatatatttttgctttagaaattatcgaatattcccctttcatatttttgtatatattttcttaacaaatgtttatgaaaaatataatttatttaataagatattttatattttgatttctcttgatccagtgttagaactttctgaattcaaaaagaaaattaaaggctgtcatgcatttgaaagaaatatttgggagattattttagaagtgcatattttggtgtttattaacgtttatgattgctttaatctgatatttgttacaatttttgaaaatacaaaataagaatttctataaaaacagcatatttattggcaaatagttttcctaaccgctataagatatatacacatttatatactagtacgtatatctgcaagaaaatgacgacaaaagtggaaacaaaatattttgctttttaaaaatgtacatgtttgtggcttaaatcattcaatatctataatactaccacaaaaattatgtttcttaaacgcaaaacaaccttgattgaacattcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|20 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccataaggttgttggctcgtgaaaatttaagttattagatttt---ATAATGCATAAG-----AAATTGA----TCTT--ACCA-----AATGA-----A---C------CATAT----TA--AGTTTAAAATT-GATA-ACGCA----TA--TGTTAATCT-T-T--G----A--AA--AACTG----TAC--TG-T-G-A-----A---GTGTT----T---T-A-AA-A------T---A---CA-TT----A-----CTCGTT------A---------------------------------------------T-------A--C-TCCATC-CATTC--TTTC--ATATG---T-T-TC--CGTAACAA--AACCACAT--ACA---C----ATA---TA-A-----C-TT--CG----AAT--T-AT---A-ACACT-TTTT---ATATCTGAATTT-ACA----TCTAATCCTATGTGAGTTCTT--CAAAATTTAT--A-AATA-AGAT-TTTA-GCT-------TTGTTTGC-ATTTC---AAAGA---A-----ATATTT-T-C-AA-A-tcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|21 : GC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGTGACATTCTTAAAATGAAA------CTA--ATTAGA----A--TAG-TTTTA-AT----T---TAATT-----AAA-AAAGC--A-TATG-C-ATC-ATC-------ATCT---ACACTA-ACA-AA--T--GATCA-CGA---AAAAGG-TATATTGTCCGTTGCCTTGCTTGCTTTA-GT---GTTGTTTAAT-TCTTAAGTTGATGCTTACATC-AAATGCAATATTGT--A--TTGC--TTTTGTTAAAATT-AGA--A---CAATATGACCAAA-TA--------T-GT-TA----AGTATATGTATG-----AAATT-A----AT----CTTA-----TA--A-----A-----------ATGA----CA--A-----AA
gi|22 : tgGAATGTAT--G-AAGC-AAAT-CATA-GGC-------TGC------ATTTT---AAAGA---C-----ATGTTT-GTC-AA-A-TTA-CTTAAAT---A-GTG--CAT-ATGTT-A-G-TGAT----------A--TT-----TAAA----A------A------AAT-G---T----T---T--A---C---A----T--T-TGG-TAACA---TCTGAAAAT-A---ATAA-A-TGTT--A-TG--------TTTT----------AA-ACTAGTC---T--AA---ATCATA--GTAT-CACACA---CTTG---TA---------------------------------G-AA----A-----------------------------------------------------------A---TAT--T--------------------------------------T-----A-----------------------------------------------------------------------------T-----AC------CCC-C-TAT-T---ATTCCTGGTCAGAA----------------------A----A--A-A-A--AAT--------AT----C-------------G-----A-------------TA----A-AT-A-A-------A-A-A---TGAA---------ATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTCCTATGTATCCATATCCATAAAACcataaaatta
gi|23 : ---GCTGTTTCAT-TTTAAAGATGATACCTACATTAAAATCTA----TTT--A--TT----TTT---TAAAAAT-AAG--T-----TTA-----AGC-TA--------TCAT-TAT---GTCATATATATATATTCAAA-TGA----AC------TA-----AA--ACGTGCA---T------TATAA----AG--A-----AAATA-GATA-ACATA----TT--TTTAAATCT-T-TGAA----A--AA--A--TAC---CAT--GG-A-A-A-CT--A---TTTTT----T---CTT-TT-A------C---ACGTTT-TT----G-----CT--TA------AGAA----AA-----------GA--AATTGTC---G---AC-T-A-T-------A--T-CCCAAC-AA--CA-TATT--GTATG--TT-T-TT--TTAAACGA--AAATTCAT----A---A----A-A---AA-A-----A-AT--a
gi|24 : -A----A-AT-TT-TTTT---ATATATT-GTTT-C--------------AGTGTTAGCACTT-TCAGAATTAA---A-AAGA-AAAT-AATA-GGT-------TGCCATGT-ATTTT---AAAGA---A-----ATATTT-A-T-AA-AATTATCTTAAAT---A-GTG--CATATT-TT-A-GATGTC----------A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---AATATTA-TATGA-TAACA---TCAGAAAAT-A---ATTA-A-A-TT--A-TG--------TTTTAGT--TTA--AG-AATAGTC---T--AG---TACATA--CTAA-CATACA---CTTG---CA-C-------------AAC-TTTTC---------A-AA----ATA-ATA---A-----------------A---------A-C---------------G-AGA---TTT--T-----------------------
gi|25 : taacC---T--TAAGAA----TGTTTCTG----GCTCAT--------CAAA------------GTA--ATTAGAT------TTT-TTTTA-AT----T---CAGTT-----AAA-A---------ATTGT-ATTTATT-------AT---------------------------------------GG-TAT-------GTTGCTGTGTTCATTTTT-AT---TCTATTTAAT-TTATAAGATGACACCTACGTCAACATTGAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAAA--AGGGAT---CATTA-----ACA-TA--------TC-T---------------TATG-----AAACTGA----TC-----TTA-----AA--A-----A---T------
gi|26 : ta--------------T-----A-------T---------T-------------G-----T-TAT---C-----C---------C---------------T-----AT------CAC-C-TAT-TT--TTTCTAGGTAA-ATTAT--ATTGCTAAA-AATG--GA----A--gagca
gi|26 : aaatatg-TT----G-CT-A-A-------A-A-A---TGGA---------ACGTTTTATTTTTT----A----ATTTGTTTAATGTTTCCATAGTCATACGATTGT--C----AT-AA----TTATTTC-T----GG---AAGAAACTACAACTTTT-ATTGAAGATcgttttattttttaatttgtttaatgtttccatagtcatacgattgtcataattatttctggaagaaactacaacttttattgaagatatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|27 : aaatatgtattgttatccctatcacctattttttctaggtaaattata---------------T-----AC------CCCAC-CAT-T---C--CTTGGTATGAATAC--ACTGCAAAG-ATTT--GA----A--A-A-A--AATCTAAACAAAT----G-------------G-----A-----T-T-T-TGTTATGGA-TT-A-C-------A-G-A---TGGA--------CACG-TTTATGGTTT----A------------AGCGTATTCACA-TGATAAGACTTCAAT-AAAAT-AA----TGGTTTC-T----AA---Aatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|28 : tgccgcgttaaagtGTTCA-G--TGAGT-ATTC-AGC---TCTTATGGACAGATGTT---G----GCTCGT--------AAAAAAAAAA------AAA--AATAATT------TTT-TTTTA-AT----T---CAGTT-----AAA-A---ATGA-TATT-T-GTT-ATT-------ATTT---GAGATG-A-T-GT--T--GATCA-TGA-A-ATAAG--TAT-------GTTACCATGCTTTTTATC-CT---GCTATTCAAT-ATATAAGATGGTACCTATGTCAAAATCTAACATcattatgattaaaattcatgaacataaaaatctg
gi|29 : ---TG-A-----A-GTA-T-----GTT--T-A----C-AC-TT-TCTG---A-AGTATAG----CC-----T--GGTCCAATGTTAACACTT-TCAGAATGTAT--A-AAAA-AA---CATT-GGC-------TGTCCTGC-ATTTT---AGAGA---A-----ATATTT-G---------TACTTTAAAT---A-ATG--CAT-AT-GTTG-G-TGTT----------A--TT-----T-CA----A------A------ACT-A---T----T---T--A---T---A----T--C-TGA-TAATA---TCAGAATAT-A---AT
gi|3 : ttaatgttaacactatt---T--TCAGGA----TGTT---G----ACTCAT--------CAAAAC-AAC------GTA--ATTAAG----A--CTA-TTTCA-AT----T---CAGTT-----AAA-AAA-C--A-TATG-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGAC----------T--GA-T--TGC-G-AAAAA---AT-------GT-GCCGTGCTCGTTTTT-GA---GTTATTTCAA-TTATAAGATCAT
gi|3 : TTTT--GAGTTA---TTTCAATTATA---AGA--T---CATTA-----AGA-TA--------CAAT-TCT---ATTATATACATG-----AAAGTGA----AC----TTTA-----AT--A-----AGTCT------CATAA----TC--A-----AAATG-CATA-GCAAC----TA--TTTTTATCT-T-TG-A----A--AA--A--TAAAAACAC--TG-A-A-A-CT--G---AAGTT----TTA-C-TCTG-C------T---A---TG-TTTTGTG-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TC---A---GC-T-C-T-------A--C-CC-ACC-TA--C--TCTT-----TA--AG-T-AT--TTTAACATTAAAACTT-T-TAAA---A----A-AATATA-A-----A-TT--TGGAT-ATT--C-A----G-AC-TT-TTTT---ATAATTAAGTTT-CC-----TATGGTTGAATGTTA---------------TAT--A-AAGG-GTAT-CATA-GGT-------TGACGTGC-ATTTT---AAAGT---A-----ATATTT-GTC-AA-A-TTATCTTAAAT---A-GTG--CATAAA-CT-G-A-TGTT----------G--TT-----T-TA----A------A------AGT-G---T----T---T--A---T---AAC--TA-T---A-TGATA---TT---AAAT-A---AGT-----GTT--A-TG--------CTTTAGT--GTA--AA-ATTAGTA---T--AA---TA-ATA--CTAT-CATACA---CTTG---GA-A-------------AAC-TTTTT---------G-AA----ATATAA----A-----------------A---------A-C---------------A-AGAATTTAT--TATAAAAATATTTTTTTATCCCATC--------------T-----A-------C---------A-------------A-----T-TAC---C-----T---------C---------------T-----AC------CCC-T-TA--T---TTTCATGGTAATAAAAT--GATGCCATG-AGTT--AA----A--A-A-AACAAT--------AT----C-------------GAAACAA-----T-TGT-TATG----G-TC-A-AC------A-C-A---TGGA--------CATG-TGTGTGGTTT----A----AAT-------TGTATCTATATCCATAAGACTG--ACTGAAA---------GATATTTT----AATTTAAGATA-TA-AAATTCACACTTATGAtaagatacaattctattatatacatgaaagtgaactttaataagtctcataatcaaaatgcatagcaactatttttatctttgaaaaataaaaacactgaaactgaagttttactctgctatgttttgtgctttagaaaaaaaaaatcagctctacccacctactctttaagtattttaacattaaaacttttaaaaaaatataaatttggatattcagacttttttataattaagtttcctatggttgaatgttatataaagggtatcataggttgacgtgcattttaaagtaatatttgtcaaattatcttaaatagtgcataaactgatgttgttttaaaagtgtttataactatatgatattaaataagtgttatgctttagtgtaaaattagtataataatactatcatacacttggaaaactttttgaaatataaaaacaagaatttattataaaaatatttttttatcccatctacaattacctctaccccttattttcatggtaataaaatgatgccatgagttaaaaaaacaatatcgaaacaattgttatggtcaacacatggacatgtgtgtggtttaaattgtatctatatccataagactgactgaaagatattttaatttaagatataaaattcacacttatgaaaatct
gi|30 : ttcaggatgttgactcatcaaaacaacgtaattaagactatttcaattcagttaaaaaacatatgtattattatctaagactgattgcgaaaaaatgtgccgtgctcgt-ATTTT---AAAGA---A------CATCT-GTC-AA-A-TTA----AAAT---A-TTG--CATGTT-TT-G-G-TGTT----------A--TT-----T-GA----A------A------AAC-A---T----T---T--A---C---A----T--T-TGA-TAAAA---TCAGAAAAT-G---AATA-A-GGTT--A-AG--------TTTTGGT--TT----A-AGTAGTC---T--AATACTTCTTAGTCTAT-TACGTATTTCTTG---TA-C-------------AAC-TTTTC------------A----AAA-AG----A-----------------A---------A-A---------------A-AGA---aaatct
gi|31 : --T-A----C-AC-TT-TTTT---GTATTTAAGTTT--C-----TTTGATCCCATAAATGAACTT-TCAAAATTCAT--ACAATATAAAT-TATATGCT-------TG-AGTAC-ATTTT---TAATT---A-----ATA--------AA----TACCCTAAAT---GTGTG--CATAGT-TT-T-G-TGTT----------A--Ta
gi|32 : tggggtaaaTGGCTT----A----CATTGTTCAGTATATCAGTATCCACAAAACTGTAACAAAGAT-AA----TAGTTTCTT----AA---AATAAA-TATA---TCA-ACTGAAGATaacacatagtctgatacacactgattgtaca
gi|33 : ttttgaaaatataagtacatc--A-----AAATG-GATA-ACATA----TA--TGTTAATCT-C-T--GGAACA--AA--A--TA----CAC--catagtaaaacattacaaaacgtgaaatctgaaattttcttagccaatatccttta
gi|34 : GGAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TTTTA-AT----T---CAGTT-----AAA-AAT-C--A-TATT-TAATA-ATT-------ATCC---TAGATA-A-A-AT--T--GA-TA-ATA-A-AAAAGG-TAT-------GTTACTA-GCTCTTTTTT-GT---GCTTTTTAAT-TTTTAAAATGTCACCTACGACAAAattctatctattgtctatgcatcactcacaccaccactgtttgatatgtttttgaaactatcacacacaaaaattttaactggataattgcactttttcta
gi|35 : -----A---T------CACAA----TA--A-----AAATG-GCCA-AGAAA----TA--TTTTAATAT-T-TG-A----A--AA--A--TG----TAC--TC-AGA-A-CT--AG--GTATA----T---C-TGTA-A------T---G---TA-TT----------CTTGTT------TGAAGTTGAA-----------AA--A----TC---ATTGGC-T-A-T-------A--C-TCTATC-TA--C--GTT
gi|36 : ttttaaaatgagc---T--TAAGGA----TCTT---G----ACTTAT---------ACAATGAAATACAGTGTA--ATTAAAA---A--ATT-TTTTA-AT----T---CAGTTGCATCATA-A---T--A-TATT-A-ATT-ATT-------ATTT---AAGATG-A-A-AT--T--GATCA-TGA---AAAAGG-TAA-------GTTGCCATGCTTGTTTTT-GT---tt
gi|37 : A----A--A-A-A--AAT--------GT----T-------------G-----AAACATC-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------G-ATA---TGGA--------CAT--TTT-TGGCTT----A----AATTGTTCAATGTTTTCATATTCATGAGACTGCAACAAAGAT-AA----TCACTTCTTATTAAA---AAGAAA-TACAACTT
gi|38 : atgcTAT--A-AAGA-ATTT-CAAA-GGT-------TAC------ATTTT---AAAGA---A-----ATATTT-GTC-AA-A-TTACCTTATAT---T-GTA--CATAGT-TT-G-G-CGTT----------A--AT-----T-TT----A------A------AAT-G---T----T---G--A---T---A----TGTT-TGA-TAAAA---TCTGGAAA---------A-A-AGTT--A-TG--------T
gi|39 : tgATA-GGT-------TGCCTTGC-ATTTT---AAAAA---A-----AAAATG-T-C-CA-T-TTACGTTAAAA---A-GT-----TAAT-AT-T-T-T-TT----------A--TT-----T-TACTTTA------A------AATAG---T----T---T--A---T---A----T--T-TGA-TGGCA---TCAGAAAAT-A---AGTA-A-TATT--A-TG--------TT
gi|4 : tC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAACATGAAA------TAA--ATTAG-----A--TTT-TTTTA-AT----TATTCAGTT-----AAA-A---ATAA-TATG-T-ATT-ATTTATAAATATCT---AAGATG-A-A-AT-----GA-TAACGA-G-AAA-GC-TAT-------GTTGCCATGATCGGTTTT-GT---GCGATTTAAT-TTTAAAGTTGATACATACG---ACATC--ATTTTTTTAG--TTTATTTTTTTATGAAAAT--GG--TGACCATGA-----AGA-TA--------TCAT-TAT---ATTAAACATATG-----AAACTGA----AC-----TTA---------------------------ATAA----TG--A-----GCAT--CATA-ACAAA----AA--TT----------------------A--A--TA-----AC--TA-A-A-A--T--A---ATCTT----T---T-T-TATA------CTTTT---TC-TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--T----TC---A---TC-------------G--T-CACATC-C---------T--ATGCA--AT-T-TT--T-----------ATATGT-TATA---C----ATG---TT-G-----G-GA--T-----AAT--T-A----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGCTT-CC-----TTTGGTCCAATGTAAGCACTT-TCAGAATTTATAAA-AAAA-AAAT-CATA-GGT-------TGCCGTGC-ATTTT---AAAGA---A-----ATAAAT-GTC-AA-A-TAACATTAAATC--A-GAA--TATAAT--T-A-A-TGTT----------ATGTT-----T-TA----GTT----A------AAT-A---TAGTCT---T--A---T---A----TA-T-T
gi|4 : a----------A--TT-----T-TA----A------AGAAATAAAT-G---T----CAAAT--A-------A----CA-T-TAA-----A---TCAGAATAT-A---ATTA-A-TGTT--A-TG--------TTTTAG---TTA--AA-TATAGTC---T--TA---TATATT--CTAT-TGTACA---CTTG---TA-T-------------ATC-TTTTT---------C-AA----ATG-AT----A-----------------A---------A-----------------A-AGA---TTT--T-----------------------CTCTTTTGAGCA---T-----A-------T---------A-------------T-----T-TAT---T-----CAGCTAAGAGT---------------T-----ACCCGTAACCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAATAAAAT--GATG---------------------A-A-A--ACT--------AT------------------------------T-T-TAT-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGAA--------CATA-TTTGTGGCTT----A----AACCG------------------ATAAA-----AACAGAAA---A----CGATTTCTT----AA---AAGAAA-TAAAACTTCA-ATctattgtacacttgtatatctttttcaaatgataaaaagattttctcttttgagcatatatttattcagctaagagttacccgtaacccctatttttcttggtaataaaatgatgaaaactattttatttgttaaaaaatgaacatatttgtggcttaaaccgataaaaacagaaaacgatttcttaaaagaaataaaacttcaatccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|41 : acttaaggatgttggctcgtcaacatgaaataaattagatttttttaattattcagttaaaaataatatgtattatttataaatatctaagatgaaatgataacgagaaagctatgttgccatgatcggttttgtgcgatttaattttaaagttgatacatacgacatcatttttttagtttatttttttatgaaaatggtgaccatgaagatatcattatattaaacatatgaaactgaacttaataatgagcatcataacaaaaattaataactaaaataatcttttttatactttttcttgctttagaaaaaattcatcgtcacatcctatgcaatttttatatgttatacatgttgggataattagacttttttatattttagcttcctttggtccaatgtaagcactttcagaatttataaaaaaaaaatcataggttgccgtgc--TTT-TTTTA-AT----T---CAATT-----AAA-A---CCCA-CATT-T-GTT-TTT-------ATCT---AAGATG-A-C-AT--T--AA-TA-AAG-A-AAAAGG-TAT-------GCTGccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|5 : ---T--TAAAGA----TG----------GCTCGT---------AAAATGAAA------ATACAAATAGATCTAACTTTT-TTTTGTAT----T---ATGTT-----AAA-A---C--A-TATT-T-TCT-ATT-------ATCTTAAAAGAAA-A-AGATAAT--GA-C--TGC-G-AAAAGA-TAT-------GATGCCGTGCTTGTTTTA-GT---ACTGTTTAAT-TTTTAA-ATGATACCTACGT-ACAATTTTATATCTT--G---TAG----TTG--AAAATT-AG--------------------------------------T---ATGATA---ATA-----AAATTGG----AT----AGCA-----CG--A-----A---T------GCTAATTTTTA--A-----AAA---AATACACAGAGCACTAAGTTTTC--CC-T-T--A----T--AA--T--TA----TA------------------------T----T---C-T-T--A------C---A---TT-CA----G----------T------AGAA----AA-----------AA--T----TCTTTG---GC-C-A-T-------A----CCTACC-AA--C--TTTT---TATGGTAT-T-TT--TGTAACTG--AAACATAT-AAAG---ATTTTA-A---TT-G-----G-GA--T-----AAT--TAA----G-AT-TC-CTTT----TATTTCAGTAT-CC-----TTTGGTCCTGTGAAAGCACTT-TCAAAAC---------------GT-CATA-GGT-------TTTCGGTC-ATTTT---AAAGA---A-----TTATTT-GTC-AA-A-TTACCTTAAAT---A-TTC--CAT-AT-TT-T-G-TGTTTCAACTGATGA--TT-----C---------------------AAT-GC--T----T---C--A---A---C----TC-T-T---TGACA---T-A-------A---ATTA-A-TGTT--A-AG--------TTTTAGT--TTA--GA-AATAGTC---C--AA---T--ATA---TAT-CATATA---CTTA---TA-CATATATTATTCATAAC-TGTTC---------G-AAAT--AAA-ACAACAA-----------------A---------A-CTTTCTCCTTTGAAAAA-AAA---TAT--T-----------------------T--------------T-----A-------T-----------------------------T-TACTTTT-----C---------C---------------G-----AC------TCT-C-AAT-T---TTAATTGGTTATATAATAAGATG-CAAA-AGTTCAGA----A--A-C-A--AAA--------AT----A-------------G-----A-----T---------------TT-A-A-------A-A-AAATTGGAAAAAATATTATA-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTC-ATGTATCCATATTCAaggtcactaatgca
gi|6 : TTGCCATGCTCGTTTTT-AT---GCTTTTTAAT-CTTTAAGATAATACC------AAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTCATAAAATG-AGA--T---AATTA-----AGATTA--------TC-----T---ATTGCACATATG-----AAACTGA----AC-----TTA-----AA--A-----A---gagg
gi|6 : --A-----AAATGAGATA-ATTAA----GA--TT---ATCTAT-T--G----C--AC--A--TA---------TG-A-A-A-CTG-A---A------------C-T-TA-AAAAAAAT---A---TG-TTT---G-----TT--TT------AGAA----AA-----------AA--AAACATC---G---GC-A-A-T-------A--CACCTACCACT--T--TTTA--TTACT--ATAT-TT--TTTCACAA--AAACACAA-CACATAAA----A-A---TA-G-----ATGT--TTGAATAGT--T-A----G-AT-GA-TTTT---ATATTTTAGTTAACC-----TTTGGTCCAATATAAGCATTT-TCAGAATTTAT--T-AAGA-AAGT-CACA-GGC-------TGTCGT----TTTTATAAAAGT---A-----ATATTT-GTC-GA-A-TGACCTTAAAC---A-GTG--CAT-AT-TTAA-G-TGTT-------------T--------------A------A------AAT-G---T----T---T--A---T---A----T--T-TGA-AAACA---T---AAA----------A-A-TGTT--A-CG--------TTTAAGT--TTT--AA-AA-AACG---T--AA---TGCATA--CTAT-CATACA---CTTG---AA-C-------------AAC-TTTTTTTTTGAAAAG-AA----AAA-AC----A-----------------ATATTTTATCG-CTTGGA----------A-AAA---TAT--TTATATCT----------------C--------------T-----A-------A---------A-------------A-----TGTAC---T-----C---------G---------------T-----AC------ACC-C-TAT-G---TTTCTTGGT------AT--CACGTCAAA-AGAT--GA----A--C-A-A--AA---------AT----C-------------GA----A-----TGT-T-T-TT----G-TT-A-AATGATAGA-A-A---AAGA--------TATA-TTTGTGGCTT----A----AAATGTTCAATGTATTCATAGCCATAAGACTGCAGCAAGGAC-AA----TAGTTTaaatatgtttgttttagaaaaaaaaacatcggcaatacacctaccactttttattactatattttttcacaaaaacacaacacataaaaatagatgtttgaatagttagatgattttatattttagttaacctttggtccaatataagcattttcagaatttattaagaaagtcacaggctgtcgtttttataaaagtaatatttgtcgaatgaccttaaacagtgcatatttaagtgtttaaaatgtttatatttgaaaacataaaaatgttacgtttaagttttaaaaaacgtaatgcatactatcatacacttgaacaactttttttttgaaaagaaaaaacaatattttatcgcttggaaaaatatttatatctctaaaatgtactcgtacaccctatgtttcttggtatcacgtcaaaagatgaacaaaaatcgaatgtttttgttaaatgatagaaaaagatatatttgtggcttaaaatgttcaatgtattcatagccataagactgcagcaaggacaatagttt
gi|7 : ttgccatgctcgtttttatgctttttaatctttaagataataccaaaatctaatattttgttaattttcat-CCCATC-AG--T--TTTT---TATA-----T-TT--TTTAACAA--AAG------TACA---A----A-A---TA-ACTGAGA-GG--T-----AAT--T-A----C-AC-TG-TTTT---GTGCTTTAGTTT-CC-----TTTCGTCCTATGTAAGCCCTT-TCATGATTTTT--A-CCGA-AAAG-CATG-TGT-------TTGTGTGC-ATTTT---AAAG-----------T-------C-AA-A-TTACCTTAAAT---A-GTG--CAAACT-TT-G-T-TATA----------A--TT-----A-TAT---ATATATTA------AAT-A---T----T---T--A---T---A----TG---TGG-TAACA---TCAGAAAAT-A---ATTG-ATCGTT----TG--------TTTTAGG--TAA--AACAATAGTT---A--AA---TATATA--CTAC-CAAATA---TTTG---TA-C-------------AAC-TTTTT---------GAAA----AGA-AC--------------------------------A-C---------------A-AAA---TTTTAT-----------------------C--------------TTTGAAA-------T---------AATGTCCACTTAGCA-----T-TAC---C-----T---------C---------------C-----AT------CCC-C-TAT-T---T---TTGGCAAGGTAAT--GATGTCAAA-GGCT--GA----A--C-ATA--AAT--------AT----CAAATAAAAAAGGAA-----A-----T-T-T-G-TT----T-TT---A-------A-A-G---TGGA--------CATT-ATTGTGGCTT----AAAATAATGGTTTGAGGTATACATATACATAACACTGC-ATAATACTATA----TAGTTTCGT----AA---AATAAA-TGCTACTTCT-ATTTAAGAT
gi|8 : aaaacacgaaccgaaactttgtatgttcgtacatgaattgtacatgaatttgcttta---T--TAAAGA----TGTT---GCCTGGCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TCT-TTTTA-AT----T---CAG---------------C--A-TATT-T-ATT-TTT-------TGTT---AAGATT-A-A-AT--T--GATCA-TGA-A-AAGAAT-T-T-------GTTACCGTGTTCGTTTTT-TTTTTGCCATTTATTATTTTAA-ATGATATCCACTTCAAAGTCTAATATTTT--G--TAAA--TTTTCATAAATTTGAGA--T---CGTTA-----AAG-GG--------TC-----T---GTTATACAAATG-----AAACTGA----ACTTAAATTG-----AG--C-----A---T------CATAA----T---A-----AAATG-AATA-GGAAA----TA--TTTTAATAT-T-T--GGC--A--AA--A--TA----CAC--TG-A-ACATTT--ATATATATT----TG--C-T-TT-A------G---A----G-TT----G-----TT--TT------A-AA----AA-----------AA--A----TA---A---CC-C-C-T-------A--C-CCCGTattaaattcatcaatatgaatagatgaaacttttctagcgaacatc
gi|8 : C-ACTTC---AAAGTCT-A-----ATATTTTG-T-AA-A-TTTTCATAAATTTGA-GAT--CGTTAA-AG-G-G-T-CT----------G--TT-----A-TA----C------A------AAT-GAAAC----T---G--AACTT---A----AA-T-TGAGCATCA---TAATAAAATGA---AT---A-GGAA--A-TA--------TTTTAATATTTGGCAA-AATACAC---T--GA----ACAT---TTAT--ATATA---TTTGCTTTA-G-------------AGT-TGTTT---------T-AA----AAA-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-------------A-----T-AAC---C-----C---------C---------------T-----AC------CCC-G-TAT-G---TTTCTTGGCAGGAAAAT--GATGCCAAA-ATTA--GA----T--A-G-A--AAT--------A---------------------------------------------A-TA-A-A-------A-A-A---TGAA--------CACA-TTTATGGCTT----A----AATCTTTGAATGTATCCGTGTTCATAATACTGCAATAAAGAT-AA----TAATTTCTT----AA---AAGAAA-CACGATTTTA-ATTTAAGATatgtttcttggcaggaaaatgatgccaaaattagatagaaataataaaaaatgaacacatttatggcttaaatctttgaatgtatccgtgttcataatactgcaataaagataataatttcttaaaagaaacacgattttaatttaagatataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : ttaaagatgttgcctggctcgtcaaaatgaaagtaattagatatctttttaattcagcatatttattttttgttaagattaaattgatcatgaaaagaatttgttaccgtgttcgttttttttttgccatttattattttaaatgatatc-GACTGAGT-ATTTA------T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CATAATTAA-------GTA--ATAAGAT---C--TTT-TTTTA-AT----T---CAATT-----AAATAT--C--A-TTTT-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGATG-A-A-AT--TTAGA--A-CGA---AAAATG-TAT-------ATTAGGGTACTTGTATTT-GT---GCTATTTAAT-GTTTAGGATGATGCTTACG--AACTTATATTGTTTA--G--TAAA--TTTTGATAACATG-TGG--T---CCTTG-----AAA-TA--------TCAA-TGT---ATTATTCATAAG-----AAACTCA----AC-----TTAATAATGA--GT----A---T------TATAA----CA--A-----AAATT-GATC-ACTTA----TA--TTTTAATAT-T-T--G----T--AG--A--CA----CACCTTGAA-A-A-CT------ATGTT----T---T-T-Tataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : gtt-----T-TAA---T-----C---------C---------------T-----AC------TCT---TATGT---TTTCTTAGTAAGAAAAT--GATGTCAAACATTT--------A--A-A-A--TAT--------AT------------------------A-----TAT-T-T-TT----G-TT-ATA-------A-A-C---TCGA--------CGTG-TTTCTGTCTT----T----AAACATTCATTGTACCGAAATCCATAATACTG------------------------TT----AA---AAGAAA-CACAACTTCA-GTTTAAGActcttatatcacgttaatcctactcttatgttttcttagtaagaaaatgatgtcaaacatttaaaatatatatatttttgttataaactcgacgtgtttctgtctttaaacattcattgtaccgaaatccataatactgttaaaagaaacacaacttcagtttaagacattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): TTCTTGAAAACTGGGCATTTCGGTGACTCAAATTGTTCCACGAATCAATATCCATTATAAAACTTCATCAAAGATAAGTGTTTCCTAAGATGTTTAATGTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11 111111 111111111 111111 222222 333333333 1111111111111 111111111111111111 44444444444444444444 11111111 2222222222 1111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222 11111 4444444444444444444444444 111111 1111 1111 1111111111111 11 11111111111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 2222 0 33 999999 44 6666 77777777 555555555 0 888888 44 0 777777 2 2 2 2 555 77777 2 999999 2 2 2 2 9999999 555 2 2 555 55555 000000000 0 9999999 1 555 2 2 0 33 2 44 44 444 3333333333333 77777 1 3 777777777777777777 33 66666 2 33 2 999 2 77777777777777777777 00000000 66666 33 1 444 2 1 2 2 2222222222 33 33 2222222 33 2 2 4 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 1 3 66666 2 777777777777777 33 33 0 2 2 00000 2 6666666666666666666666666 6 33 2 111111 2 2 444 2 2 33 66666 1 0 0 22 2 2 0 2 6666666 0000 333 555555 0 22 1 1 2 2 3333 44444 1 22 55555 2 6666 5555555555555 2 2 4444 333 22 555 22 88 4444 333 333 2 55 22 77777777 77777777777777 333 2 44444444444444444444 7777 55 2 444 444 666666666666666 0 2 2 1111111111 8888 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 222222222222 55555 000 2 666 33 2 66 4444 33 2 2 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 8888888 2 2 333 22 77777777 2 4444 4444 4 3 333 0 33 0 2 777777 5555 444 3 4
lowQualScore : .... . .. ...... .. .... ........ ......... . ...... .. . ...... . . . . ... ..... . ...... . . . . ....... ... . . ... ..... ......... . ....... . ... . . . .. . .. .. ... ............. ..... . . .................. .. ..... . .. . ... . .................... ........ ..... .. . ... . . . . .......... .. .. ....... .. . . . ............................................................................................................................... . . . ..... . ............... .. .. . . . ..... . ......................... . .. . ...... . . ... . . .. ..... . . . .. . . . . ....... .... ... ...... . .. . . . . .... ..... . .. ..... . .... ............. . . .... ... .. ... .. .. .... ... ... . .. .. ........ .............. ... . .................... .... .. . ... ... ............... . . . .......... .... ... .............................................................................................................................................................. . ............ ..... ... . ... .. . .. .... .. . . .. . ........................................................... . ....... . . ... .. ........ . .... .... . . ... . .. . . ...... .... ... . .
lowQualScore : 0000 2 22 000000 22 5555 00000000 222222222 8 888888 22 8 555555 7 7 7 9 000 11111 9 777777 9 9 9 9 3333333 000 9 9 555 88888 222222222 8 3333333 6 000 9 9 1 22 5 66 66 444 7777777777777 77777 4 1 777777777777777777 77 77777 7 77 5 444 5 55555555555555555555 99999999 22222 11 0 777 9 7 7 7 3333333333 44 44 1111111 44 5 4 7 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 9 3 66666 4 111111111111111 44 77 5 7 7 22222 9 1111111111111111111111111 6 77 5 777777 5 5 444 5 5 99 22222 6 4 5 99 1 1 8 0 8888888 4444 333 555555 3 66 8 5 0 0 9999 55555 9 66 00000 0 2222 2222222222222 0 0 2222 555 88 222 66 88 0000 555 555 1 00 99 66666666 11111111111111 888 4 00000000000000000000 6666 66 4 111 111 444444444444444 6 2 2 4444444444 2222 222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 999999999999 99999 111 4 555 22 6 55 7777 11 4 4 22 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 9999999 1 1 777 99 66666666 1 2222 2222 3 5 555 4 11 9 2 888888 3333 444 1 0
consensus : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-----AAA-A---C--A-TATT-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-CA-CGAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTT-TGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAATTTTG--ATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATT--ATACATATG-----AA-ACTGAA--C-TTA---A-A---A-G---A---T------CATAATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-T-T--G----A--AA--A--TA----C--AC--TG-A-A-A-CT--A---ATGTT----T--C-T-TA-A------C---A---T-N--TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TTT--TTAACA--AAAACACA-T-ACA---AA-A----TA-A-----A-GT--T-----ANT--T-A----G-AC-TT-TTTT---A-TATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATA--TTTT-G--GTGTT-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
Reference ( family-851 ) : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-----AAA-A---C--A-TATT-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-CA-CGAG-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTT-TGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAATTTTG--ATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATT--ATACATATG-----AA-ACTGAA--C-TTA---A-A---A-----A---T------CATAATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-T-T--A----A--AA--A--TA----C--AC--TG-A-A-A-CT--A---ATGTT----T--C-T-TA-A------C---A---T-N--TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TTT--TTAACA--AAAACACA-T-ACA---AA-A----TA-A-----A-GT--T-----ANT--T-A----G-AC-TT-TTTT---A-TATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATA--ATTT-G--GTGTT-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----TGGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
gi|1 : TCTCTTTAAATTAAAGACTGATTCATTTGAGT---T--TAAGGA----TATT---T----GTTCGT--------CAAAATGAAA------GTC--ATTATGT---A--TTTATT-TT-A-ATT---AAGGT-----AAA-A---C--G-TATC-T-ATT-AT--------ATCT---AAGA-TG-G-A-AT--T--AA-C--TGAGCAAAAGGTAT-------GTTTCCATGTTCG---TTTT-CATTTTATTTTAT-TTTTAACATGATACCTACATCAACATCTGATATGCT--G--TTAATGTTG--ATAAAAAT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------CCAT-TA---TATT--ATACATTCA-----AC-ACTGAA--CACTA---G-A---A-----A---T------CGTAACA--G-----GAA-----TG-GATAACACATAT---TCTTATCT-T-T--A----A--AA--A--TA----C--GT--TG-A-A-ATCT--A---ATATT----T--C-TATA-A------C---AAAAT-A--TT----A-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---C---CA-AT-------AC-CTCATCCC--C--T-TTG--GTAT-A--AT-T-TCTGTTTAACC--TGAACTCA-TTACA---AA-A----TA-A-----A-GT--T-----ACT--T-A----G-AC-TTATTTT---AATATTTTAGTTT-CC-TTA-----TGTCCAGTGTTAGCACTTTCA-AATGTAT--A-AAGA-AAATTATA-GGC-------TGCTGTGCATTGT---AAAGAAATA------TTT----TAATTTTTTTTAAAT-A-GTTCATT--ATAT-G--GTGTT-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGGAAATA---ACTA-GA--GTT---TG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-ATTAG----------TC---T----AATT---CATA--CTAA-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-T-AAC----G-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------G-----------------A--------------T-TA------C-----TCAT-----ACCCC-G-TAT-T---TTTCGCGGTAAGTAAAT--GATGCCAAAAGTT--GG----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----A-----T-T-T-T-TTG---G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------AATG-TTTGTGGCGA----T----AATCGTTAAATTGATCCATATTA---ATAAATCTGCAAT--AAATGTT-A----TGGTTTTTT----AG---AAGAGA-TACAACTTTA-ATTTAAGAT
gi|10 : --TTAACC--AAAAAGCA-T-GAA---AA-A----TA-T-----ATGTGAT-----AAT--T-A----T-AC-TT-TGTT---A-TATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTTCATTGTAAGCACTTTCAGAATT-------------AAT--------------------TGCACTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATAACTATAAAT-A-GTGCATA--TGTT-G--ATACT-G--TT-----T-TA----A------A------AAT-A-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TCACAAAATA---ATTA-AT--GTA--ATG--------TTTCAGT--------------TTA--AA-AATAT----------TC---T----AAAA---CCTG--CTAT-TATACA---CATG---TA-C-------------AACAT-TTTT---------AAATGACA-A-AAC----ATGATTTTTTCTCTTTTGA---------A-C---------------AA-A---TAT--T--------------------------------------T---------A--TTCCGCTTAAA-----------------G--------------T-TA------C-----CCTT-----ACCCCTT-TTT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAC--GATGCCAAAAGTT--AA----A--A-A-A--A-AT--------CTAAAAA-------------A-----A-----A-G-G-T-AT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTACCGACATTC---ATATGACTGTAAC--AAAA--C-A----TGGTT
gi|10 : atttatctcg---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------TAaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaactaacgagccaacatccttaacaa
gi|11 : atttatctcgttaaccaaaaagcatgaaaaatatatgtgataattatactttgttatattttagtttcctttggttcattgtaagcactttcagaattaattgcactttaaagaaatatttgtcaaataactataaatagtgcatatgttgatactgttttaaaaatatttatatttgataacatcacaaaataattaatgtaatgtttcagtttaaaaatattctaaaacctgctattatacacatgtacaacatttttaaatgacaaaacatgattttttctcttttgaacaaatatttattccgcttaaagttacccttacccctttttttttcttggtaagaaaacgatgccaaaagttaaaaaaaatctaaaaaaaaggtatgttaaaaaatgaacatgtttgtggcttaaatcgttcaatgtaccgacattcatatgactgtaacaaaacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaac----AA-----------AA--T----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-CCCAACCA--T--T-TTT--TTA--------T-TTT--GTCACA--AAACCACA-T-Acaa
gi|11 : AATGTAAGCATTTTCGGAATTCAT--A-AAGG-AAATAACA-GAT-------TTGCATGCATTTT---AAAGAACTC------TTT-T--CAAATAACATGAAAC-G-GTGCATA-------------------TT-----T-TA----A------A------CGT-G-T----T---T---T---A--TA-T----T--TGATA---TCAGAAAATA---ATCA-AT--GTT--AAG--------CT--AGT--------------TTA--AA-AAAAG----------CC---C----AATA---CATC--CTAAACATTCT---ATTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-GAC----A-----------------A---------AAC---------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TATTTTGA--A--T---------A-----------------AAATATTTATTCCACT-TAAAGCTGT-----CCCT-----ATTCC-C-TAT-T---TTTCTAGATGGGAAAAT--GATGCCAAAAGCT--GA----A--A-A-A--A-----------AT----C-------------G-----A-----T-T-TAT-TT----ATTT-C-G-------A-A-T---TAA--A--------CATG-TTTATGGTTT----A----AACATTTCAATGCATCGATATAC---ATAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----TTATTT-TT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAaatgtaagcattttcggaattcataaaggaaataacagatttgcatgcattttaaagaactcttttcaaataacatgaaacggtgcatattttaaacgtgttttatatttgatatcagaaaataatcaatgttaagctagtttaaaaaaagcccaatacatcctaaacattctattgtacaacttttcgaaaagacaaaacaagattttctattttgaataaaatatttattccacttaaagctgtccctattccctatttttctagatgggaaaatgatgccaaaagctgaaaaaaatcgatttatttatttcgaattaaacatgtttatggtttaaacatttcaatgcatcgatatacataagactgcaacaaaaataattatttttaaaagaaatacaacttcaatttatactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|12 : aaaattcattggctataccccaaccatttttttattttgtcacaaaaccacataTTT---A-TATGTTAGTTT-CT-TTT-----GTTCCTATGTAAGTACTTTCAGAATTTAT--G-AAGA-AAATGATA-AGTTTGTATGTACACTGTATTTT---AAAAACATA------TTTGT--GAAAACACC----------TACATA--TTTT-G--GTGCT-A--TT-----T-TT----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TTAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATAATATTATTTTTTAG---------------TTA--AA-AGTAA----------TT---TTA--AAAA---AAGA--A-AA-AACAAA---ATTA---TT-T-------------A-----TTTT---------GAA----A-A-AAT---------------------------------------------------ATT---TAT--T-----------------------C--------------C---------ACTT---------A-----------------AAG------------T-TA------C-----CCCC-----AACCC-A-TAT-TATGTTTCTAGATACGAAAAT--GATGCCAAAAAATCAAA----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----AAACATT-T-T-T-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGG--A--------CATT-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTCAATATATCCATATAC---GCAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----CAGTTCATT----AA---AAGAtactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|13 : AT---TTTGATCT-TGC--A----A--AACAA--TT----A--AA--TG-A-A-A-TT--A---AAATTGGTAT--C-T--A-A------C---A---T-G--TC----GTTAATCT--TT------GAAA----AAGCTGAACTGATAAGCA----TT---A---A---CT-AT-------AC-CCCAACCA--A--T-C---------A--AT-----------ATA--AACACACA-T-A-A---AA-A----TA-A-----C--T--T-----A-T--T-A----C-AC-TT-TTTTTCAA-TAGTTTAGCTT-TC-TTTAATTTGGTCATATGTAAGCACTTTCAGAACTCTT--A-ACGA-AAATCATA-GGT-------TTGCATGCATTTA---AAAGAAATG------TTTGT--CAAATAACCTTAAAT-A-GTGCATA--GTTT-G--ATGTG-A--TT-----T-CA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TATGGAAATA---GTCA-AT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------TT------AACAG----------CT---T----ACTA----ATA--CTAT-CATTTG---CTTG---TA-C-------------ATG-T-TTTT---------GAA----A-A-tttatatgtgtatttagtttcaagatataaagtaaataaacatcgatatctgaaaacttcctaaaccaacacca
gi|14 : ttataaaaagaaagtagtaagaatatttgTGTATTTT---AAAGAAATACATGTATTTGT--CAAAT--CCATAAAC-A-GTGCATA--TTTT-T--ATGCT-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---ATAAAAAATA---ATTT-AT---TT--AAG--------TTTTAGTATAAAGATATCATATTA--AA-AAGAAAAAAAATCCCTC---TTTTGAAAA---AATAT-CTAT-TTTAC-----TTA---AA-T-------------CCC-TCTTTT---------GAA----A-A-AAT----------------------A---------T-C----------------------TAT--T-----------------------T--------------T---------A--C------------------------------------------T-TA------CTGTTTCCCT-----ACCCC-CATAT-T---TTTCTTGATAAGAAAAT--GATGCCAATAGTT--G-----A--A-A-A--A-AT----------------------------------A-----C-T-T-T-TT----A----A-A-------A-A-A---TGGATA--------CATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTTCATTGTATCCATATGT---ATATGACTGCAAC--AAAAATA-C----TGGTTTCTT----TA---AAGTAA-TACAAta
gi|15 : taagtagtttcttaTTTCTTTAAGTTAA-T-TTGAAT--TCTAAAAAAAT--TA-GGA----TGTT---A-----CTCGC--------CAAAATGAAA------GAA--AATAGAT---T--TTT-TTATTGA-AAT---AAGTT-----AAA-AAA-C--A-TATT-T-ATT-ATT-------GTCT---AAGA-TG-A-A-AT--G--AA-TAACGA--AAAGGGTAC-------GTTGCCTTGTCCG---TTTTTTGTGCTACTTAAA-TTTTAAGATGATTCATATGTCAAAATAAAATATTTT--A--AAAACTTTG--ATAACATG-AAG--T---CATTA-----ATA-TAAGTTTTTTTTAT-TATTCTATT--ATACATATG-----AA-ACTGAA--C-TTA---A-A---ATGAGCA---T------CAAAATA--A-----AAAACCCCAG-GATAACacgttatttattttatg
gi|15 : t-TA-T------C---A---C-T--TT----G-----CT--TTTAAGTAAGAA----AA-----------AA--A-----C---A---A---CATATTGGCTTAAC-CCCATCCA--C--T-Ttcttgtatatcactttgcttttaagtaagaaaaaaacaacatattggcttaaccccatccactt
gi|16 : ttttctttaagttaatttgaattctaaaaaaattaggatgttactcgccaaaatgaaagaaaatagatttttttattgaaataagttaaaaaacatatttattattgtctaagatgaaatgaataacgaaaagggtacgttgccttgtccgttttttgtgctacttaaattttaagatgattcatatgtcaaaataaaatattttaaaaactttgataacatgaagtcattaatataagttttttttattattctattatacatatgaaactgaacttaaaatgagcatcaaaataaaaaaccccaggataactcttgta-A-A-CT--A---ACGTT----TT-C-TCTG-A------C---A---T-A--TTATT-G-----TT--TT------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TT---A---G---CA-AT-------AC-CC-ACCCA--C--T-TTT--G-AT-A--TC-TATTT--TTAACA--AAAATACA-T-ACAC--AA-A----TATA-----A-GT--TTGG--AGTAGT-A----GTAC-TT-CTTT---A-CATTTTAATTT-TA-TT----------CTATGTGAGCTCATTCAACATTTAT--C-AAGA-AAATCCCA-AGT-------TCGCGCGCATTCT---AAAGATTCG------TTTTTTACAAATTATTTCAAAA-A-GTGAATATCATAT-T--GCAAT-A--TT-----T-T-----A------A------AGT---T----T---T--AT---A--T--T----TGACAACA---CCAAAAA--A---ATTATAT--ATCCAACG--------TTTTTGC--------------TTA--AA-AATAG----------TCCTAC----AATA---TATA--ATCT-TATGCG---CTT----TATC-------------AAC-T-TTTT---------GA
gi|17 : aaaaactactttacgAT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-----AAT-C---C--AGTATT-C-ATC-ATG-------ATCT---AAAT-TGAA-A-AC--T--GCTCA-CGAA-AAA
gi|17 : tAATGCTG--ATTAAACTGAAG--T---AATTA-----AGA-TA--------TTAT-TA---TATT--ATATAT-TT-----AA-ATTGAC--C-CTAC--A-A---AAGG--A---G------CATAATA--GTAC--ATA-----TG-GTTAATACATAT---ATTGGTCT-T-TGAA----A--AA--A--TA----C--AC--TG-A-G-A-ATCAA---ATTTTTAC-T--C-T-TACA------T---A---TAC--TT----G-----TT--TT------AACA----AATTC--------AA--A----TT---A--------A-ATAAAATA-AC-CACATACA--G--C-TTG--GTAT-A--AC-T-ATT--Ttgctgattaaactgaagtaattaagatattattatattatatatttaaattgaccctacaaaaggagcataatagtacatatggttaatacatatattggtctttgaaaaaatacactgagaatcaaatttttactcttacatatacttgttttaacaaattcaaattaaataaaataaccacatacagcttggtataactatttcttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|18 : tatttttttttaattcagttaatccagtattcatcatgatctaaattgaaaactgctcacgaaaCATATG---TATT--GTACATATG-----AT-ACTGAA--C-TTA---A-A---A-----A---TGAGCACCATAATA--A-----AAA-----TG-GATAACAAATAT---TTTAATAT-T-T--G----ATAAA--A--TA----C--AC--TG-A-A-A---------------------------------------A---C-T--TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------A--------TC---A---GTGACT-AT-------TC-CCCATCCA--C--T-TTTTTGCAT-G--TA-T-TTT--TTAACA--AAAACACA-T-A-A---AA-A----TA-------------T-----A------A----G-GC-TT-TTC----A-TATTTTAGTTT-CA-TTT-----GGTCGAATGTAA----------AATTTAT--A-AAGA-AAATTATA-cttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|19 : atataaataaa-T-TTTC---------GGA----A-A-GACT---A-----------------A---------A-C---------------AAGA---T-T--T-----------------------CGTTGATGAAAACAAT---------A--T---------AT----------------A--------------T-TC------C-----GCCTGAGATACCTCTC-TGG-T---TTTCTGTATAAGAAAAT--GATGTCAAAGGTT--GACTGAATTA-A-A--A-AT--------G---------------------------------------------G-TA-A-A-------AGA-A---TGG--A--------CGAG-TTTGTGGCTTGAAAA----AAT--TTCAATGTACACATATCC---TTAAGACTGCAAC--GAAGACA-ATAGCTAGCTTCTT----TA---AAGAAA-TACAACtactgagcaaaagtagaaacgtctcacttatggatccgacatttattcatctatgtttatgttacaca
gi|2 : --TAAGGT----TGTT---G----GCTCGT--------GAAAATTTAA------GTT--ATTAGAT------TTT-TG-TT-attaccaagattacattatttacccttatatgcttagtaaatattctaaataaaacttgcagaacat
gi|2 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccaT-------GTTGTCATGCTCG---TTTT-TGTGCTAATTCAT-TTTCAAGATGATACCAACATCAAAATCGAACATTTT--G--TAAATTTTA--ATAAAAAT-GAG----------A-----A--------------CAT-TC---TATT--ATACATATG-----AA-ACTGAA--C-TTG---A-A---ATG---A---A------CATAATGGTA-----AAA-----TA-GATTACAAATGTATGTTTAAT-------------A--AG--A--TG----C--AG--TG-A-ATA-TT--A----TGTT----T--C-T-TATA------T---A---T-T--TTT---G-----CT--TT------AGAA----AT-----------TA-------TC---G---A---AT-AT-------TC-CCCTTTCA--TATT-TTT--GTAT-AT-AT-T-TTC--TTAACA--AATGTTTA-T-GAA---AA-A----TATA-----A-TT--T-----ATT--T-AATAAG-A--TA-TTTT---A-TATTTTGATTT-CT-CTT-----GATCCAGTGTTAGAACTTTCTGAATTCAA--A-AAGA-AAATTAAA-GGC-------TGTCATGCATTTG---AAAGAAATA------TTTGG--GAGATTATTTTAGA--A-GTGCATA--TTTT-G--GTGTTTA--TTAACGTT-TA----T------G------ATT-G-C----T---TTAATCTGA--TA-T----TTGTTACAATTTTTGAAAATACAAAATA-AG--A----AT---------TTCTA-----------------TA--AA-AACAG----------C----------ATA---TTTA--TTGG-CAAATA---GTTT---TC-CT------------AAC-C-GCTA---------TAA----G-A-TAT----A-----------------T---------A-C---------------A------CAT--T--------------------------------------T---------A--T---------A----------------------------------TA------C-----TAGT-----ACG-----TAT-A---TCT----GCAAGAAAAT--GACGACAAAAGTG--GA----A--ACA-A--A-AT--------AT----T-------------------------T-T-G-C-TT----T-TT-A-A-------A-A-A---TGT--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCATTCA--------ATATCT---ATAATACTACCAC--AAAAATT-A----T-GTTTCTT----AA---ACGCAA-AACAACCTTG-ATTGAACATgtcatgctcgtttttgtgctaattcattttcaagatgataccaacatcaaaatcgaacattttgtaaattttaataaaaatgagaacattctattatacatatgaaactgaacttgaaatgaacataatggtaaaatagattacaaatgtatgtttaataagatgcagtgaatattatgtttcttatatatttttgctttagaaattatcgaatattcccctttcatatttttgtatatattttcttaacaaatgtttatgaaaaatataatttatttaataagatattttatattttgatttctcttgatccagtgttagaactttctgaattcaaaaagaaaattaaaggctgtcatgcatttgaaagaaatatttgggagattattttagaagtgcatattttggtgtttattaacgtttatgattgctttaatctgatatttgttacaatttttgaaaatacaaaataagaatttctataaaaacagcatatttattggcaaatagttttcctaaccgctataagatatatacacatttatatactagtacgtatatctgcaagaaaatgacgacaaaagtggaaacaaaatattttgctttttaaaaatgtacatgtttgtggcttaaatcattcaatatctataatactaccacaaaaattatgtttcttaaacgcaaaacaaccttgattgaacattcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|20 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccataaggttgttggctcgtgaaaatttaagttattagattttATA--ATGCATAAG-----AA-ATTGAT--C-TTACCAA-ATG-A-----A---C------CATATTA--AGTTTAAAA-----TT-GATAACGCATAT---GTTAATCT-T-T--G----A--AA--AACTG----T--AC--TG-T-G-A-----A---GTGTT----T--T-A-AA-A------T---A---C-A--TT----A-----CT--C----------------------------------------------G---TT-AT-------AC-TCCATCCATTC--T-TTC--ATAT-G---T-T-TCC--GTAACA--AAACCACA-T-ACA---CATA----TA-A-----C-TT--CG----AAT--T-AT---A-ACACT-TTTT---A-TATCTGAATTT-ACATCT-----AATCCTATGTGAGTTCTT-CAAAATTTAT--A-AATA-AGATTTTA-GCT-------TTGTTTGCATTTC---AAAGAAATA------TTT-T--CAAAtcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|21 : GC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGTGACATTCTTAAAATGAAA------CTA--ATTAGA----A--TAG-TT-TT-A-ATT---TAATT-----AAA-AAAGC--A-TATG-C-ATC-ATC-------ATCT---ACAC-TA-ACA-AA--T--GATCA-CGA--AAAAGGTATATTGTCCGTTGCCTTGCTTG---CTTT-AGTGTTGTTTAAT-TCTTAAGTTGATGCTTACATC-AAATGCAATATTGT--A--TTGCTTTTG--TTAAAATT-AGA--A---CAATATGACCAAA-TA--------T-GT-TA----AGT--ATATGTATG-----AA-ATTAAT--C-TTAT--A-A---A-----A---TGA----CAAAACAT-A-----AAA-----T
gi|22 : tgGAATGTAT--G-AAGC-AAATCATA-GGC-------TGC-----ATTTT---AAAGACATG------TTTGT--CAAATTAC-TTAAAT-A-GTGCATA--TGTT-A--GTGAT-A--TT-----TAAA----A------A------AAT-G-T----T---T--AC---A--T--T----TGGTAACA---TCTGAAAATA---ATAA-AT--GTT--ATG--------TTTT----------------------AA-ACTAG----------TC---T----AAAT---CATA--GTAT-CACACA---CTTG---TA----------------------------------GAA----A-----------------------------------------------------------A---TAT--T--------------------------------------T---------A----------------------------------------------------------------T-----ACCCC-C-TAT-T---ATTCCTGGTCAGAA---------------------A----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-------------TA----A-AT-A-A-------A-A-A---TGA--A---------ATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTCCTATGTATCCATATCC---ATAAAACta
gi|23 : GCTGTTTCAT-TTTAAAGATGATACCTACATTAAAATCTA----TTT--A--TT--TTT-----TAAAAAT-AAG--T-----TTA-----AGC-TA--------TCAT-TA---TGTC--ATATATATATATTCAA-A-TGAA--C--TA---A-A---ACGTGCA---T------TATAAAG--A-----AAA-----TA-GATAACATATTT---TTAAATCT-T-TGAA----A--AA--A--TAC---C--AT--GG-A-A-A-CT--A---TTTTT----T--CTT-TT-A------C---ACGTT-T--TT----G-----CT--TA------AGAA----AA-----------GA--AATTGTC---G---A---CT-AT-------AT-CCCAACAA--CA-T-ATT--GTAT-G--TT-T-TTT--TAAACG--AAAATTCA-T-AAA---AA-A-----A-A-----A-a
gi|24 : -A----A-AT-TT-TTTT---A-TATATT-GTTT-C---------------AGTGTTAGCACTTTCAGAATTAA---A-AAGA-AAATAATA-GGT-------TGCCATGTATTTT---AAAGAAATA------TTTAT--AAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATA--TTTTAG--ATGTC-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--ATA--A--TA-TTATATGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-A---ATT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AG-AATAG----------TC---T----AGTA---CATA--CTAA-CATACA---CTTG---CA-C-------------AAC-T-TTTC---------AAA----A-T-AATA---A-----------------A---------A-C---------------GAGA---TTT--T-----------------------t
gi|25 : taacC---T--TAAGAA----TGTTTCTG----GCTCAT--------CAAA------------GTA--ATTAGAT------TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-----AAA-A---------ATTGT-ATTTATT-------AT---------------------------------------GGTAT-------GTTGCTGTGTTCA---TTTT-TATTCTATTTAAT-TTATAAGATGACACCTACGTCAACATTGAATATTTT--G--TTAATTTTG--ATAAAAA--AGGGAT---CATTA-----ACA-TA--------TC-T-----------------TATG-----AA-ACTGAT--C-TTA---A-A---A-----A---T------
gi|26 : ta--------------T---------A--T---------T-----------------G--------------T-TA------T-----CCCT-----ATCAC-C-TAT-TT--TTTCTAGGTAA-ATTAT--ATTGCTAAAAATG--GA----A--gagca
gi|26 : aaatatg-TT----G-CT-A-A-------A-A-A---TGG--A---------ACGTTTTATTTTTT----A----ATTTGTTTAATGTTTCCATAGTC---ATACGATTGT--C------ATA-A----TTATTTC-T----GG---AAGAAACTACAACTTTT-ATTGAAGATcgttttattttttaatttgtttaatgtttccatagtcatacgattgtcataattatttctggaagaaactacaacttttattgaagatatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|27 : aaatatgtattgttatccctatcacctattttttctaggtaaattataT-----ACCCCAC-CAT-T---C--CTTGGTATGAATAC--ACTGCAAAGATTT--GA----A--A-A-A--A-ATCTAAACAAAT----G-------------G-----A-----T-T-T-TGTTATGGA-TT-A-C-------A-G-A---TGG--A--------CACG-TTTATGGTTT----A------------AGCGTATTCACAT-G---ATAAGACTTCAAT---AAAATA-A----TGGTTTC-T----AA---Aatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|28 : tgccgcgttaaagtGTTCA-G--TGAGT-ATTCA-GC---TCTTATGGACAGATGTT---G----GCTCGT--------AAAAAAAAAA------AAA--AATA-AT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-----AAA-A---ATGA-TATT-T-GTT-ATT-------ATTT---GAGA-TG-A-T-GT--T--GATCA-TGAA-ATAAG-TAT-------GTTACCATGCTTT---TTAT-CCTGCTATTCAAT-ATATAAGATGGTACCTATGTCAAAATCTAACATcattatgattaaaattcatgaacataaaaatctg
gi|29 : ----TG-A-----A-GTA-T-----GTT--T-A----C-AC-TT-TCTG---A--AGTATAG----CC-T-------GGTCCAATGTTAACACTTTCAGAATGTAT--A-AAAA-AA--CATT-GGC-------TGTCCTGCATTTT---AGAGAAATA------TTTGT--------ACTTTAAAT-A-ATGCATA--TGTT-G--GTGTT-A--TT-----T-CA----A------A------ACT-A-T----T---T--AT---A--T--C----TGATAATA---TCAGAATATA---AT
gi|3 : ttaatgttaacactatt---T--TCAGGA----TGTT---G----ACTCAT--------CAAAAC-AAC------GTA--ATTA-AG---A--CTA-TT-TC-A-ATT---CAGTT-----AAA-AAA-C--A-TATG-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGACTG-A----T--T--G-----CGAA-AAAA----T-------GT-GCCGTGCTCG---TTTT-TGAGTTATTTCAA-TTATAAGAT
gi|3 : TTTT--GAGTTA-TTTCA--ATTATA---AGA--T---CATTA-----AGA-TA--------CAAT-TC---TATT--ATATACATG-----AA-AGTGAA--C-TTT---A-AT--A-----AGTCT------CATAATC--A-----AAA-----TG-CATAGCAACTAT---TTTTATCT-T-TG-A----A--AA--A--TAAAAAC--AC--TG-A-A-A-CT--G---AAGTT----TTAC-TCTG-C------T---A---T-G--TTTTGTG-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TC---A---G---CT-CT-------AC-CC-ACCTA--C--T-CTT-----T-A--AG-T-ATT--TTAACATTAAAACTTT-T-AAA---AA-AATA-TA-A-----A-TT--TGGAT-ATT--C-A----G-AC-TT-TTTT---A-TAATTAAGTTT-CC-TAT-----GGTTGAATGTTA--------------TAT--A-AAGG-GTATCATA-GGT-------TGACGTGCATTTT---AAAGTAATA------TTTGT--CAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATA--AACT-G--ATGTT-G--TT-----T-TA----A------A------AGT-G-T----T---T--AT---AACTA-T------ATGATA---TT---AAATA------A-GT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------GTA--AA-ATTAG----------TA---T----AATA----ATA--CTAT-CATACA---CTTG---GA-A-------------AAC-T-TTTT---------GAA----ATA-TAA----A-----------------A---------A-C---------------AAGAATTTAT--TATAAAAATATTTTTTTATCCCATC--------------T---------A--C---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CTCT-----ACCCC-T-TA--T---TTTCATGGTAATAAAAT--GATGCCATGAGTT--AA----A--A-A-AACA-AT--------AT----C-------------GAAACAA-----T-TGT-TATG----G-TC-A-AC------A-C-A---TGG--A--------CATG-TGTGTGGTTT----A----AAT-------TGTATCTATATCC---ATAAGACTG--ACTGAAAGATA-----------TTTT----AATTTAAGATA-TA-AAATTCACACTTATGAcattaagatacaattctattatatacatgaaagtgaactttaataagtctcataatcaaaatgcatagcaactatttttatctttgaaaaataaaaacactgaaactgaagttttactctgctatgttttgtgctttagaaaaaaaaaatcagctctacccacctactctttaagtattttaacattaaaacttttaaaaaaatataaatttggatattcagacttttttataattaagtttcctatggttgaatgttatataaagggtatcataggttgacgtgcattttaaagtaatatttgtcaaattatcttaaatagtgcataaactgatgttgttttaaaagtgtttataactatatgatattaaataagtgttatgctttagtgtaaaattagtataataatactatcatacacttggaaaactttttgaaatataaaaacaagaatttattataaaaatatttttttatcccatctacaattacctctaccccttattttcatggtaataaaatgatgccatgagttaaaaaaacaatatcgaaacaattgttatggtcaacacatggacatgtgtgtggtttaaattgtatctatatccataagactgactgaaagatattttaatttaagatataaaattcacacttatgaaaatct
gi|30 : ttcaggatgttgactcatcaaaacaacgtaattaagactatttcaattcagttaaaaaacatatgtattattatctaagactgattgcgaaaaaatgtgccgtgctcgtATTTT---AAAGAA-CA------TCTGT--CAAATTA----AAAT-A-TTGCATG--TTTT-G--GTGTT-A--TT-----T-GA----A------A------AAC-A-T----T---T--AC---A--T--T----TGATAAAA---TCAGAAAATG---AATA-AG--GTT--AAG--------TTTTGGT--------------TT----A-AGTAG----------TC---T----AATACTTCTTAGTCTAT-TACGTATTTCTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC-----------A----A-A-AAG----A-----------------A---------A-A---------------AAGA---aaatct
gi|31 : --T-A----C-AC-TT-TTTT---G-TATTTAAGTTT-C--TTT-----GATCCCATAAATGAACTTTCAAAATTCAT--ACAATATAAATTATATGCT-------TG-AGTACATTTT---TAATTAATA--------------AA--TACCCTAAAT-GTGTGCATA--GTTT-T--GTGTT-A--Ta
gi|32 : tggggtaaaTGGCTT----A----CATTGTTCAGTATATCAGTATCC---ACAAAACTGTAAC--AAAGATA-A----TAGTTTCTT----AA---AATAAA-TATA---TCA-ACTGAAGATaacacatagtctgatacacactgattgtaca
gi|33 : ttttgaaaatataagtacatc--A-----AAA-----TG-GATAACATATAT---GTTAATCT-C-T--GGAACA--AA--A--TA----C--AC-----A-----------------T----T--C-T----A------T---C---T-A--TT----G-----TC--T---------------AT-----------GC--A----TC---A---C---TC-AC-------A---CCA-CCA--C--TGTTT--G-AT----AT-G-TTT--TTGAAA--CTATCACA-C-ACA---AA-AATTTTA-ACT---G-GA--T-----AAT--T-G----C-AC-TT-TTTcatagtaaaacattacaaaacgtgaaatctgaaattttcttagccaatatccttta
gi|34 : GGAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-----AAA-AAT-C--A-TATT-TAATA-ATT-------ATCC---TAGA-TA-A-A-AT--T--GA-TA-ATAA-AAAAGGTAT-------GTTACTA-GCTCT---TTTT-TGTGCTTTTTAAT-TTTTAAAATGTCACCTACGACAAActa
gi|35 : -TTA---A-A---ATGAGCA---T------CACAATA--A-----AAA-----TG-GCCAAGAAATAT---TTTAATAT-T-TG-A----A--AA--A--TG----T--AC--TC-AGA-A-CT--AG--GTATA----T--C-TGTA-A------T---G---T-A--TT----------CTTGTT------TGAAGTTGAA-----------AA--A----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-TCTATCTA--C--G-TTT--
gi|36 : tt---T--TAAGGA----TCTT---G----ACTTAT---------ACAATGAAATACAGTGTA--ATTAAAA---A--ATT-TT-TT-A-ATT---CAGTTGCATCATA-A---T--A-TATT-A-ATT-ATT-------ATTT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GATCA-TGA--AAAAGGTAA-------GTTGCCATGCTTG---TTTT-TGTt
gi|37 : A----A--A-A-A--A-AT--------GT----T-------------G-----AAACATC-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------G-ATA---TGG--A--------CAT--TTT-TGGCTT----A----AATTGTTCAATGTTTTCATATTC---ATGAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TCACTTCTTATTAAA---AAGAAA-TACAACTT
gi|38 : atgcTAT--A-AAGA-ATTTCAAA-GGT-------TAC-----ATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTATAT-T-GTACATA--GTTT-G--GCGTT-A--AT-----T-TT----A------A------AAT-G-T----T---G--AT---A--TGTT----TGATAAAA---TCTGGAAA--------A-AA--GTT--ATG--------T
gi|39 : tgATA-GGT-------TGCCTTGCATTTT---AAAAAAAAA------AT-GT--CCATTTACGTTAAAA-A-GTTAATA--TTTT-------TT-A--TT-----T-TACTTTA------A------AATAG-T----T---T--AT---A--T--T----TGATGGCA---TCAGAAAATA---AGTA-AT--ATT--ATG--------TT
gi|4 : tC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAACATGAAA------TAA--ATTAGAT-------TT-TT-TT-A-ATTATTCAGTT-----AAA-A---ATAA-TATG-T-ATT-ATTTATAAATATCT---AAGA-TG-A-A-AT-----GA-TAACGAG-AAA-GCTAT-------GTTGCCATGATCG---GTTT-TGTGCGATTTAAT-TTTAAAGTTGATACATACG---ACATC--ATTTTTTTAG--TTTATTTTTTTATGAAAAT--GG--TGACCATGA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATT--AAACATATG-----AA-ACTGAA--C-TTA---------------------------ATAATG--A-----GCA-----T--CATAACAAAAAT---T----------------------A--A--TA-------AC--TA-A-A-A--T--A---ATCTT----T--T-T-TATA------CTTTT---T-C--TT----G-----CT--TT------AGAA----AA-----------AA--T----TC---ATC-G---TC-AC-------AT-CCTATGCA--A--T-TTT---TAT----AT-G-TT--------------ATACA-T----------G----TT-G-----G-GA--T-----AAT--T-A----G-AC-TT-TTTT---A-TATTTTAGCTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTATAAA-AAAA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------AATGT--CAAATAACATTAAATCA-GAATATA--A-TT-A--ATGTT-ATGTT-----T-TA----GTT----A------AAT-A-TAGTCT---T--AT---A--TA-T----T
gi|4 : aCATA--GGTT-GCCGTGC--A--TT-----T-TA----A------AGAAATAAAT-G-T----CAAAT--A----A--CA-T----TAA----A---TCAGAATATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------T-A--AA-TATAG----------TC---T----TATA---TATT--CTAT-TGTACA---CTTG---TA-T-------------ATC-T-TTTT---------CAA----A-T-GAT----A-----------------A---------A-----------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TCTTTTGAGCA--T---------ATATTTATTCAGCTAAGAG--------------T-TA------C-----CCGT-----AACCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAATAAAAT--GATG--------------------A-A-A--A-CT--------AT------------------------------T-T-TAT-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATA-TTTGTGGCTT----A----AACCG---------------------ATAAA-----AAC--AGAA--A-A----CGATTTCTT----AA---AAGAAA-TAAAACTTCA-ATctattgtacacttgtatatctttttcaaatgataaaaagattttctcttttgagcatatatttattcagctaagagttacccgtaacccctatttttcttggtaataaaatgatgaaaactattttatttgttaaaaaatgaacatatttgtggcttaaaccgataaaaacagaaaacgatttcttaaaagaaataaaacttcaatccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|40 : acttaaggatgttggctcgtcaacatgaaataaattagatttttttaattattcagttaaaaataatatgtattatttataaatatctaagatgaaatgataacgagaaagctatgttgccatgatcggttttgtgcgatttaattttaaagttgatacatacgacatcatttttttagtttatttttttatgaaaatggtgaccatgaagatatcattatattaaacatatgaaactgaacttaataatgagcatcataacaaaaattaataactaaaataatcttttttatactttttcttgctttagaaaaaattcatcgtcacatcctatgcaatttttatatgttatacatgttgggataattagacttttttatattttagcttcctttggtccaatgtaagcactttcagaatttataaaaaaaaaat-T-T-C-TT----G----A-A-------A-A-C---TGG--G--------CATT-TCGGTGACTC----A----AATTGTTCCACGAATCAATATCCATTATAAAACTTCATC--AAAGATA-A----GTGTTTCCT----AA---GAccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|41 : --TTT-TT-TT-A-ATT---CAATT-----AAA-A---CCCA-CATT-T-GTT-TTT-------ATCT---AAGA-TG-A-C-AT--T--AA-TA-AAGA-AAAAGGTAT-------GCTGtgtttaatgtat
gi|5 : ---T--TAAAGA----TG----------GCTCGT---------AAAATGAAA------ATACAAATAGATCTAACTTTT-TT-TT-GTATT---ATGTT-----AAA-A---C--A-TATT-T-TCT-ATT-------ATCTTAAAAGA-AA-A-AGATAAT--GA-C--TGCG-AAAAGATAT-------GATGCCGTGCTTG---TTTT-AGTACTGTTTAAT-TTTTAA-ATGATACCTACGT-ACAATTTTATATCTT--G---TAG--TTG----AAAATT-AG----------TA-----TGA-TA----------AT-AA---AATTGGATA-GCACG-----AATGCT-AATTT-TTA---A-A---A-----A-------------AATA--C-----ACA--------GAGCAC-TAAGT---TTT--CCC-T-T--A----T--AA--T--TA----T--A------------------------T----T--C-T-T--A------C---A---T-T--CA----G----------T------AGAA----AA-----------AA--T----TCTTTG---G---CC-AT-------A--CCTACCAA--C--T-TTT---TAT-GGTAT-T-TTT--GTAACT--GAAACATA-T-A-A---AG-ATTT-TA-ATTG--G-GA--T-----AAT--TAA----G-AT-TC-CTTT-----TATTTCAGTAT-CC-TTT-----GGTCCTGTGAAAGCACTTTCAAAAC---------------GTCATA-GGT-------TTTCGGTCATTTT---AAAGAATTA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-TTCCATA--TTTT-G------T-G--TT-----T-CA----ACTG---ATGATTCAAT-GCT----T---C--AA---C--TC-T----T--TGACA---T-A------A---ATTA-AT--GTT--AAG--------TTTTAGT--------------TTA--GA-AATAG----------TC---C----AATA---TA-----TAT-CATATA---CTTA---TA-CATATATTATTCATAAC-T-GTTC---------GAAAT--A-A-AACAACAA-----------------A---------A-CTTTCTCCTTTGAAAAAAAA---TAT--T-----------------------T--------------T---------A--T------------------------------------------T-TA------CTTT--TCCG-----ACTCT-C-AAT-T---TTAATTGGTTATATAATAAGATG-CAAAAGTTCAGA----A--A-C-A--A-AA--------AT----A-------------G-----A-----T---------------TT-A-A-------A-A-AAATTGG--AAAAAATATTATA-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTC-ATGTATCCATATTC---Aaggtcactaatgca
gi|6 : TTGCCATGCTCG---TTTT-TATGCTTTTTAAT-CTTTAAGATAATACC------AAAATCTAATATTTT--G--TTAATTTTC--ATAAAATG-AGA--T---AATTA-----AGATTA--------TC--------TATT--GCACATATG-----AA-ACTGAA--C-TTA---A-A---A-----A---gagg
gi|6 : --A-----AAA-----TGAGATAATTAAGAT---T---ATCTAT-T--G----C--AC--A--TA-----------TG-A-A-A-CTG-A---A-----------C-T-TA-AAAAAAAT---A---T-G--TTT---G-----TT--TT------AGAA----AA-----------AA--AAACATC---G---G---CA-AT-------ACACCTA-CCA--C--T-TTT---TATTACTATAT-TTT--TTCACA--AAAACACAAC-ACATAAAA-A----TA-G-----ATGT--TTGAATAGT--T-A----G-AT-GA-TTTT---A-TATTTTAGTTAACC-TTT-----GGTCCAATATAAGCATTTTCAGAATTTAT--T-AAGA-AAGTCACA-GGC-------TGTCGT---TTTTATAAAAGTAATA------TTTGT--CGAATGACCTTAAAC-A-GTGCATA--TTTA-A--GTGTT----T--------------A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGAAAACA---T---AAA---------A-AT--GTT--ACG--------TTTAAGT--------------TTT--AA-AA-AA----------CG---T----AATG---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---AA-C-------------AAC-T-TTTTTTTTGAAAAGAA----A-A-AAC----A-----------------ATATTTTATCG-CTTGGA----------AAAA---TAT--TTATATCT----------------C--------------T---------A--A---------A-----------------A--------------TGTA------C-----TCGT-----ACACC-C-TAT-G---TTTCTTGGT------AT--CACGTCAAAAGAT--GA----A--C-A-A--A-A---------AT----C-------------GA----A-----TGT-T-T-TT----G-TT-A-AATGATAGA-A-A---AAG--A--------TATA-TTTGTGGCTT----A----AAATGTTCAATGTATTCATAGCC---ATAAGACTGCAGC--AAGGACA-A----TAGTTTaaatatgtttgttttagaaaaaaaaacatcggcaatacacctaccactttttattactatattttttcacaaaaacacaacacataaaaatagatgtttgaatagttagatgattttatattttagttaacctttggtccaatataagcattttcagaatttattaagaaagtcacaggctgtcgtttttataaaagtaatatttgtcgaatgaccttaaacagtgcatatttaagtgtttaaaatgtttatatttgaaaacataaaaatgttacgtttaagttttaaaaaacgtaatgcatactatcatacacttgaacaactttttttttgaaaagaaaaaacaatattttatcgcttggaaaaatatttatatctctaaaatgtactcgtacaccctatgtttcttggtatcacgtcaaaagatgaacaaaaatcgaatgtttttgttaaatgatagaaaaagatatatttgtggcttaaaatgttcaatgtattcatagccataagactgcagcaaggacaatagttt
gi|7 : ttgccatgctcgtttttatgctttttaatctttaagataataccaaaatctaatattttgttaattttcat----A--AA--A--CA----CGAAC--CG-A-A-A-CT--TTGTATGTT----C--G-T----A------C---A---T-GAATT----G-----T-------------AC----AT-----------GA--A----TT---T---G---CT-TT-------AC-CC-ATC-A--G--T-TTT--TTAT-A-----T-TTT--TTAACA--AAAG-----T-ACA---AA-A----TA-ACTGAGA-GG--T-----AAT--T-A----C-AC-TG-TTTT---G-TGCTTTAGTTT-CC-TTT-----CGTCCTATGTAAGCCCTTTCATGATTTTT--A-CCGA-AAAGCATG-TGT-------TTGTGTGCATTTT---AAA---------------GT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCAAA--CTTT-G--TTATA-A--TT-----A-TAT---ATATATTA------AAT-A-T----T---T--AT---A--TG------TGGTAACA---TCAGAAAATA---ATTG-ATC-GTT---TG--------TTTTAGG--------------TAA--AACAATAG----------TT---A----AATA---TATA--CTAC-CAAATA---TTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-AGAAC--------------------------------A-C---------------AAAA---TTTTAT-----------------------C--------------TTTGAA----A--T---------AATGTCCACTTAGC----A--------------T-TA------C-----CTCC-----ATCCC-C-TAT-T---T---TTGGCAAGGTAAT--GATGTCAAAGGCT--GA----A--C-ATA--A-AT--------AT----CAAATAAAAAAGGAA-----A-----T-T-T-G-TT----T-TT---A-------A-A-G---TGG--A--------CATT-ATTGTGGCTT----AAAATAATGGTTTGAGGTATACATATAC---ATAACACTGC-AT--AATACTATA----TAGTTTCGT----AA---AATAAA-TGCTACTTCT-ATTTAAGAT
gi|8 : ---T--TAAAGA----TGTT---GCCTGGCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TCT-TT-TT-A-ATT---CAG---------------C--A-TATT-T-ATT-TTT-------TGTT---AAGA-TT-A-A-AT--T--GATCA-TGAA-AAGAATT-T-------GTTACCGTGTTCGTTTTTTT-TTTGCCATTTATTATTTTAA-ATGATATCCACTTCAAAGTCTAATATTTT--G--TAAATTTTC--ATAAATTTGAGA--T---CGTTA-----AAG-GG--------TC--------TGTT--ATACAAATG-----AA-ACTGAA--C-TTA---A-ATTGAGC---A---T------CATAAT---A-----AAA-----TG-AATAGGAAATAT---TTTAATAT-T-T--GGC--A--AA--A--TA----C--AC--TG-A-ACATTT--ATATATATT----TG-C-T-TT-A------G---A-----G--TT----G-----TT--TT------A-AA----AA-----------AA--A----TA---A---C---CC-CT-------AC-CCCGTattaaattcatcaatatgaatagatgaaacttttctagcgaacatc
gi|8 : T---A--AA-T----TGA--GCA---TCATAATAAA---ATGA-ATAGGAA--ATA--------TTTTAATAT------------TTGGCAA-AATAC----------AC---T----GA-A---CAT---TTAT--ATATA---TTTGCTTTA-G-------------AGT-T-GTTT---------TAA----A-A-AA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-----------------A--------------T-AA------C-----CCCT-----ACCCC-G-TAT-G---TTTCTTGGCAGGAAAAT--GATGCCAAAATTA--GA----T--A-G-A--A-AT--------A---------------------------------------------A-TA-A-A-------A-A-A---TGA--A--------CACA-TTTATGGCTT----A----AATCTTTGAATGTATCCGTGTTC---ATAATACTGCAAT--AAAGATA-A----TAATTTCTT----AA---AAGAAA-CACGATTTTA-ATTTAAGATatgtttcttggcaggaaaatgatgccaaaattagatagaaataataaaaaatgaacacatttatggcttaaatctttgaatgtatccgtgttcataatactgcaataaagataataatttcttaaaagaaacacgattttaatttaagatataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : ttaaagatgttgcctggctcgtcaaaatgaaagtaattagatatctttttaattcagcatatttattttttgttaagattaaattgatcatgaaaagaatttgttaccgtgttcgttttttttttgccatttattattttaaatgatatccacttcaaagtctaatattttgtaaattttcataaatttgagatcgttaaagggtctgttatacaaatgaaactgaact-GACTGAGT-ATTTA------T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CATAATTAA-------GTA--ATAAGAT---C--TTT-TT-TT-A-ATT---CAATT-----AAATAT--C--A-TTTT-T-ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--TTAGA--A-CGA--AAAATGTAT-------ATTAGGGTACTTG---TATT-TGTGCTATTTAAT-GTTTAGGATGATGCTTACG--AACTTATATTGTTTA--G--TAAATTTTG--ATAACATG-TGG--T---CCTTG-----AAA-TA--------TCAA-TG---TATT--ATTCATAAG-----AA-ACTCAA--C-TTA---ATA---ATGAGTA---T------TATAACA--A-----AAA-----TT-GATCACTTATAT---TTTAATAT-T-T--G----T--AG--A--CA----C--ACCTTGAA-A-A-CT------ATGTT----T--T-T-Tataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : gtt--------------T-TA------A-----TCCT-----ACTCT---TATGT---TTTCTTAGTAAGAAAAT--GATGTCAAACATT--TA----A--A-A-T--ATAT--------AT------------------------A-----T-T-T-T-T-----G-TT-ATA-------A-A-C---TCG--A--------CGTG-TTTCTGTCTT----T----AAACATTCATTGTACCGAAATCC---ATAATACTG--------------------------TT----AA---AAGAAA-CACAACTTCA-GTTTAAGActcttatatcacgttaatcctactcttatgttttcttagtaagaaaatgatgtcaaacatttaaaatatatatatttttgttataaactcgacgtgtttctgtctttaaacattcattgtaccgaaatccataatactgttaaaagaaacacaacttcagtttaagacattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11 111111 111111111 111111 222222 111111 222222 111 111111111111111111 444444444444444444 11111 1111111 11111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222 11111 4444444444444444444444444444 111111 1111 1111111111111 11 11111111111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 2222 0 33 999999 44 6666 77777777 555555555 0 888888 44 0 777777 2 2 2 2 444 2 66666 2 777777 2 2 000000 5 8888888 444 2 2 666 55555 111111 3 2 3 0 9999999 1 777 2 0 33 2 44 44 44 0 222 8888888 88888 2 3 555555555555555555 77777 2 777 33 111111111111111111 33 555 55 00000 66666 2 1 444 1 2 5555555 99 11111111 555555 2 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 3 3 66666 2 777777777777777 33 33 0 5 00000 2 6666666666666666666666666666 6 33 444444 2 2 666 2 33 66666 1 0 0 22 2 2 0 2 6666666 0000 333 555555 22 1 1 2 2 1 66666 22 1 22 55555 2 6666 5555555555555 2 2 4444 333 22 555 22 88 4444 333 333 2 55 22 77777777 77777777777777 333 2 44444444444444444444 7777 55 2 444 444 666666666666666 0 2 2 1111111111 8888 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 222222222222 55555 000 2 666 33 2 66 4444 33 2 2 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 8888888 2 2 333 22 77777777 2 4444 4444 4 3 333 1 33 2 2 666666 5555 444 3 4
lowQualScore : .... . .. ...... .. .... ........ ......... . ...... .. . ...... . . . . ... . ..... . ...... . . ...... . ....... ... . . ... ..... ...... . . . . ....... . ... . . .. . .. .. .. . ... ....... ..... . . .................. ..... . ... .. .................. .. ... .. ..... ..... . . ... . . ....... .. ........ ...... . ............................................................................................................................................ . . . ..... . ............... .. .. . . ..... . ............................ . .. ...... . . ... . .. ..... . . . .. . . . . ....... .... ... ...... .. . . . . . ..... .. . .. ..... . .... ............. . . .... ... .. ... .. .. .... ... ... . .. .. ........ .............. ... . .................... .... .. . ... ... ............... . . . .......... .... ... .............................................................................................................................................................. . ............ ..... ... . ... .. . .. .... .. . . .. . ........................................................... . ....... . . ... .. ........ . .... .... . . ... . .. . . ...... .... ... . .
lowQualScore : 0000 2 22 000000 22 5555 00000000 222222222 8 888888 22 8 555555 7 7 7 7 777 7 77777 7 111111 7 7 333333 3 7777777 777 7 7 333 88888 111111 4 7 4 8 3333333 6 999 9 1 22 5 66 66 22 2 333 1111111 33333 3 3 444444444444444444 11111 7 333 77 777777777777777777 99 000 99 66666 22222 7 0 777 1 7 3333333 44 88888888 444444 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 8 3 66666 4 111111111111111 77 77 5 3 22222 9 1111111111111111111111111111 6 77 222222 5 5 999 5 99 22222 6 4 5 99 1 1 8 0 8888888 4444 333 555555 66 8 5 0 0 1 44444 66 9 66 00000 0 2222 2222222222222 0 0 2222 555 88 222 66 88 0000 555 555 1 00 99 66666666 11111111111111 888 4 00000000000000000000 6666 66 4 111 111 444444444444444 6 2 2 4444444444 2222 222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 999999999999 99999 111 4 555 22 6 55 7777 11 4 4 22 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 9999999 1 1 777 99 66666666 1 2222 2222 3 5 555 8 11 1 4 999999 3333 444 1 0
consensus : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-C-A-CGAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---G-----AT--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------C---A---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ANT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
Reference ( family-851 ) : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-C-A-CGAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---G-----AT--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------C---A---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ANT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
gi|1 : TCTCTTTAAATTAAAGACTGATTCATTTGAGT---T--TAAGGA----TATT---T----GTTCGT--------CAAAATGAAA------GTC--ATTATGT---A--TTTATT-TT-A-ATT---AA-GGT-----AAA-A---C--G-TATC-T------ATT-A-T-------ATCT---AAGA-TG-G-A-AT--T--AA-C---TGAGCAAAAGGTAT-------GTTTCCATGTTCG---TTTTCATTTTATTTTAT-TTTTAACATGATACCTACATCAACATCTGATATGCT--G--TTAA--TGTTGATAAAAAT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------CCAT-TA---TATTATACATTCA-----ACACTGAACACT---A--G----A---A---------AT--CGT---AACA--G-----GAA-----TG-GATAACACATAT---TCTTATCT-TTA----A--AAA--TA----C---GT--T---G-A-A-ATCT--A---ATATT----T---C-TATA-----A------CAAAA---T-A--TT----A-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---C---CA-AT-------AC-CTCATCCC--C--T-TTG--GTAT-A--AT-T-TCTGTTTAACC--TGAACTCATTACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ACT--TA----G-AC-TTATTTTA--ATATTTTAGTTT-CC-TTA-----TGTCCAGTGTTAGCACTTTCA-AATGTAT--A-AAGA-AAATTATA-GGC-------TGCTGTGCATTGT---AAAGAAATA------TT--T--TAATTTTTTTTAAAT-A-GTTCATTATAT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGGAAATA---ACTA-GA--GTT---TG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-ATTAG----------TC---T----AATT---CATA--CTAA-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-T-AAC----G-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------G-----------------A--------------T-TA------C-----TCAT-----ACCCC-G-TAT-T---TTTCGCGGTAAGTAAAT--GATGCCAAAAGTT--GG----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----A-----T-T-T-T-TTG---G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------AATG-TTTGTGGCGA----T----AATCGTTAAATTGATCCATATTA---ATAAATCTGCAAT--AAATGTT-A----TGGTTTTTT----AG---AAGAGA-TACAACTTTA-ATTTAAGAT
gi|10 : TTAACC--AAAAAGCA-TGAA---AA-A----T---A-T-----ATGTGAT-----AAT--TA----T-AC-TT-TGTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTTCATTGTAAGCACTTTCAGAATT-------------AAT--------------------TGCACTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATAACTATAAAT-A-GTGCATATGTT-G--ATAC--T-G--TT-----T-TA----A------A------AAT-A-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TCACAAAATA---ATTA-AT--GTA--ATG--------TTTCAGT--------------TTA--AA-AATAT----------TC---T----AAAA---CCTG--CTAT-TATACA---CATG---TA-C-------------AACAT-TTTT---------AAATGACA-A-AAC----ATGATTTTTTCTCTTTTGA---------A-C---------------AA-A---TAT--T--------------------------------------T---------A--TTCCGCTTAAA-----------------G--------------T-TA------C-----CCTT-----ACCCCTT-TTT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAC--GATGCCAAAAGTT--AA----A--A-A-A--A-AT--------CTAAAAA-------------A-----A-----A-G-G-T-AT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTACCGACATTC---ATATGACTGTAAC--AAA
gi|10 : atttatctcg---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------TAacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaactaacgagccaacatccttaacaa
gi|11 : atttatctcgttaaccaaaaagcatgaaaaatatatgtgataattatactttgttatattttagtttcctttggttcattgtaagcactttcagaattaattgcactttaaagaaatatttgtcaaataactataaatagtgcatatgttgatactgttttaaaaatatttatatttgataacatcacaaaataattaatgtaatgtttcagtttaaaaatattctaaaacctgctattatacacatgtacaacatttttaaatgacaaaacatgattttttctcttttgaacaaatatttattccgcttaaagttacccttacccctttttttttcttggtaagaaaacgatgccaaaagttaaaaaaaatctaaaaaaaaggtatgttaaaaaatgaacatgtttgtggcttaaatcgttcaatgtaccgacattcatatgactgtaacaaaacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaac----AA-----------AA--T----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-CCCAACCA--T--T-TTT--TTA--------T-TT--TGTCACA--AAACCACA-TAcaa
gi|11 : AATGTAAGCATTTTCGGAATTCAT--A-AAGG-AAATAACA-GAT-------TTGCATGCATTTT---AAAGAACTC------TTT-T--CAAATAACATGAAAC-G-GTGCATATTTT-------------------------A----A------A------CGT-G-T----T---T---T---A--TA-T----T--TGATA---TCAGAAAATA---ATCA-AT--GTT--AAG--------CT--AGT--------------TTA--AA-AAAAG----------CC---C----AATA---CATC--CTAAACATTCT---ATTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-GAC----A-----------------A---------AAC---------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TATTTTGA--A--T---------A-----------------AAATATTTATTCCACT-TAAAGCTGT-----CCCT-----ATTCC-C-TAT-T---TTTCTAGATGGGAAAAT--GATGCCAAAAGCT--GA----A--A-A-A--A-----------AT----C-------------G-----A-----T-T-TAT-TT----ATTT-C-G-------A-A-T---TAA--A--------CATG-TTTATGGTTT----A----AACATTTCAATGCATCGATATAC---ATAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----TTATTT-TT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAaatgtaagcattttcggaattcataaaggaaataacagatttgcatgcattttaaagaactcttttcaaataacatgaaacggtgcatattttaaacgtgttttatatttgatatcagaaaataatcaatgttaagctagtttaaaaaaagcccaatacatcctaaacattctattgtacaacttttcgaaaagacaaaacaagattttctattttgaataaaatatttattccacttaaagctgtccctattccctatttttctagatgggaaaatgatgccaaaagctgaaaaaaatcgatttatttatttcgaattaaacatgtttatggtttaaacatttcaatgcatcgatatacataagactgcaacaaaaataattatttttaaaagaaatacaacttcaatttatactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|12 : aaaattcattggctataccccaaccatttttttattttgtcacaaaaccacataTTT---ATATGTTAGTTT-CT-TTT-----GTTCCTATGTAAGTACTTTCAGAATTTAT--G-AAGA-AAATGATA-AGTTTGTATGTACACTGTATTTT---AAAAACATA------TTTGT--GAAAACACC----------TACATATTTT-G--GTGC--T-A--TT-----T-TT----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TTAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATAATATTATTTTTTAG---------------TTA--AA-AGTAA----------TT---TTA--AAAA---AAGA--A-AA-AACAAA---ATTA---TT-T-------------A-----TTTT---------GAA----A-A-AAT---------------------------------------------------ATT---TAT--T-----------------------C--------------C---------ACTT---------A-----------------AAG------------T-TA------C-----CCCC-----AACCC-A-TAT-TATGTTTCTAGATACGAAAAT--GATGCCAAAAAATCAAA----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----AAACATT-T-T-T-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGG--A--------CATT-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTCAATATATCCATATAC---GCAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----CAGTTCATT----AA---AAGAtactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|13 : AT---TTTGATCT-TGC----A--AAA--CA----ATTAAA--T---G-A-A-A-TT--A---AAATTGGTAT---C-T--A-----A------C---A---T-G--TC----GTTAATC-T--T---T------GAAA----AAGCTGAACTGATAAGCA----TT---A---A---CT-AT-------AC-CCCAACCA--A--T-C---------A--AT-----------ATA--AACACACA-TA-A---AA-A----T---A-A-----C--T--T-----A-T--TA----C-AC-TT-TTTTTCAATAGTTTAGCTT-TC-TTTAATTTGGTCATATGTAAGCACTTTCAGAACTCTT--A-ACGA-AAATCATA-GGT-------TTGCATGCATTTA---AAAGAAATG------TTTGT--CAAATAACCTTAAAT-A-GTGCATAGTTT-G--ATGT--G-A--TT-----T-CA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TATGGAAATA---GTCA-AT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------TT------AACAG----------CT---T----ACTA----ATA--CTAT-CATTTG---CTTG---TA-C-------------ATG-T-TTTT---------GAA----A-A-tttatatgtgtatttagtttcaagatataaagtaaataaacatcgatatctgaaaacttcctaaaccaacacca
gi|14 : ttataaaaagaaagtagtaagaatatttgTGTATTTT---AAAGAAATACATGTATTTGT--CAAAT--CCATAAAC-A-GTGCATATTTT-T--ATGC--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---ATAAAAAATA---ATTT-AT---TT--AAG--------TTTTAGTATAAAGATATCATATTA--AA-AAGAAAAAAAATCCCTC---TTTTGAAAA---AATAT-CTAT-TTTAC-----TTA---AA-T-------------CCC-TCTTTT---------GAA----A-A-AAT----------------------A---------T-C----------------------TAT--T-----------------------T--------------T---------A--C------------------------------------------T-TA------CTGTTTCCCT-----ACCCC-CATAT-T---TTTCTTGATAAGAAAAT--GATGCCAATAGTT--G-----A--A-A-A--A-AT----------------------------------A-----C-T-T-T-TT----A----A-A-------A-A-A---TGGATA--------CATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTTCATTGTATCCATATGT---ATATGACTGCAAC--AAAAATA-C----TGGTTTCTT----TA---AAGTAA-TACAAta
gi|15 : taagtagtttcttaTTTCTTTAAGTTAA-T-TTGAAT--TCTAAAAAAAT--TA-GGA----TGTT---A-----CTCGC--------CAAAATGAAA------GAA--AATAGAT---T--TTT-TTATTGA-AAT---AA-GTT-----AAA-AAA-C--A-TATT-T------ATT-ATT-------GTCT---AAGA-TG-A-A-AT--G--AA-TAA-CG-A-AAAGGGTAC-------GTTGCCTTGTCCGT--TTTTTGTGCTACTTAAA-TTTTAAGATGATTCATATGTCAAAATAAAATATTTT--A--AAAA--CTTTGATAACATG-AAG--T---CATTA-----ATA-TAAGTTTTTTTTAT-TATTCTATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---AT--G-----AG--CATCAAAATA--A-----AAAACCCCAG-GATAACacgttatttattttatg
gi|15 : t------C---A---C-T--TT----G-----C-T--T---TTAAGTAAGAA----AA-----------AA--A-----C---A---A---CATATTGGCTTAAC-CCCATCCA--C--T-Ttcttgtatatcactttgcttttaagtaagaaaaaaacaacatattggcttaaccccatccactt
gi|16 : ttttctttaagttaatttgaattctaaaaaaattaggatgttactcgccaaaatgaaagaaaatagatttttttattgaaataagttaaaaaacatatttattattgtctaagatgaaatgaataacgaaaagggtacgttgccttgtccgttttttgtgctacttaaattttaagatgattcatatgtcaaaataaaatattttaaaaactttgataacatgaagtcattaatataagttttttttattattctattatacatatgaaactgaacttaaaatgagcatcaaaataaaaaaccccaggataactcttgtatat-A-A-CT--A---ACGTT----TT--C-TCTG-----A------C---A---T-A--TTATT-G-----T-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TT---A---G---CA-AT-------AC-CC-ACCCA--C--T-TTT--G-AT-A--TC-TATT--TTTAACA--AAAATACA-TACAC--AA-A----T---ATA-----A-GT--TTGG--AGTAGTA----GTAC-TT-CTTT---ACATTTTAATTT-TA-TT----------CTATGTGAGCTCATTCAACATTTAT--C-AAGA-AAATCCCA-AGT-------TCGCGCGCATTCT---AAAGATTCG------TTTTTTACAAATTATTTCAAAA-A-GTGAATATCAT-A--TTGCAAT-A--TT-----T-T-----A------A------AGT---T----T---T--AT---A--T--T----TGACAACA---CCAAAAA--A---ATTATAT--ATCCAACG--------TTTTTGC--------------TTA--AA-AATAG----------TCCTAC----AATA---TATA--ATCT-TATGCG---CTT----TATC-------------AAC-T-TTTT---------GA
gi|17 : aaaaactactttacgAT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAT-C---C--AGTATT-C------ATC-ATG-------ATCT---AAAT-TGAA-A-AC--T--GCTC-A-CGAA-AAA
gi|17 : tAA--TGCTGATTAAACTGAAG--T---AATTA-----AGA-TA--------TTAT-TA---TATTATATAT-TT-----AAATTGACC-CTACAA--A----A---G---G-----AG--CAT---AATA--GTAC--ATA-----TG-GTTAATACATAT---ATTGGTCT-TTGAA--A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-G-A-ATCAA---ATTTTTAC-T---C-T-TAC----A------T---A---TAC--TT----G-----T-T--T---T------AACA----AATTC--------AA--A----TT---A--------A-ATAAAATA-AC-CACATACA--G--C-TTG--GTAT-A--AC-T-AT--TTtgctgattaaactgaagtaattaagatattattatattatatatttaaattgaccctacaaaaggagcataatagtacatatggttaatacatatattggtctttgaaaaaatacactgagaatcaaatttttactcttacatatacttgttttaacaaattcaaattaaataaaataaccacatacagcttggtataactatttcttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|18 : tatttttttttaattcagttaatccagtattcatcatgatctaaattgaaaactgctcacgaaaCATATG---TATTGTACATATG-----ATACTGAAC-TT---A--A----A---A---ATGAGCAC--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACAAATAT---TTTAATAT-TTG----ATAAAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A--------------------------------------------A---C-T--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------A--------TC---A---GTGACT-AT-------TC-CCCATCCA--C--T-TTTTTGCAT-G--TA-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TA-A---AA-A----T---A-------------T-----A-----A----G-GC-TT-TTC----ATATTTTAGTTT-CA-TTT-----GGTCGAATGTAA----------AATTTAT--A-AAGA-AAATTATA-cttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|19 : atataaataaa-T-TTTC---------GGA----A-A-GACT---A-----------------A---------A-C---------------AAGA---T-T--T-----------------------CGTTGATGAAAACAAT---------A--T---------AT----------------A--------------T-TC------C-----GCCTGAGATACCTCTC-TGG-T---TTTCTGTATAAGAAAAT--GATGTCAAAGGTT--GACTGAATTA-A-A--A-AT--------G---------------------------------------------G-TA-A-A-------AGA-A---TGG--A--------CGAG-TTTGTGGCTTGAAAA----AAT--TTCAATGTACACATATCC---TTAAGACTGCAAC--GAAGACA-ATAGCTAGCTTCTT----TA---AAGAAA-TACAACtactgagcaaaagtagaaacgtctcacttatggatccgacatttattcatctatgtttatgttacaca
gi|2 : --TAAGGT----TGTT---G----GCTCGT--------GAAAATTTAA------GTT--ATTAGAT------TTT-TG-TT-G---T---CATGCT-------------C--G-TTTT-TGTGCTAATTCATT-------TTC----AAGA-TG-A-T-AC--C--AA-C-A-TCAA-AAattaccaagattacattatttacccttatatgcttagtaaatattctaaataaaacttgcagaacat
gi|2 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccaT-------GTTGTCATGCTCG---TTTTTGTGCTAATTCAT-TTTCAAGATGATACCAACATCAAAATCGAACATTTT--G--TAAA--TTTTAATAAAAAT-GAG----------A-----A--------------CAT-TC---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---G--A----A---AT--G-----AA--CAT---AATGGTA-----AAA-----TA-GATTACAAATGTATGTTTAAT----------A--AGA--TG----C---AG--T---G-A-ATA-TT--A----TGTT----T---C-T-TAT----A------T---A---T-T--TTT---G-----C-T--T---T------AGAA----AT-----------TA-------TC---G---A---AT-AT-------TC-CCCTTTCA--TATT-TTT--GTAT-AT-AT-T-TT--CTTAACA--AATGTTTA-TGAA---AA-A----T---ATA-----A-TT--T-----ATT--TAATAAG-A--TA-TTTT---ATATTTTGATTT-CT-CTT-----GATCCAGTGTTAGAACTTTCTGAATTCAA--A-AAGA-AAATTAAA-GGC-------TGTCATGCATTTG---AAAGAAATA------TTTGG--GAGATTATTTTAGA--A-GTGCATATTTT-G--GTGT--TTA--TTAACGTT-TA----T------G------ATT-G-C----T---TTAATCTGA--TA-T----TTGTTACAATTTTTGAAAATACAAAATA-AG--A----AT---------TTCTA-----------------TA--AA-AACAG----------C----------ATA---TTTA--TTGG-CAAATA---GTTT---TC-CT------------AAC-C-GCTA---------TAA----G-A-TAT----A-----------------T---------A-C---------------A------CAT--T--------------------------------------T---------A--T---------A----------------------------------TA------C-----TAGT-----ACG-----TAT-A---TCT----GCAAGAAAAT--GACGACAAAAGTG--GA----A--ACA-A--A-AT--------AT----T-------------------------T-T-G-C-TT----T-TT-A-A-------A-A-A---TGT--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCATTCA--------ATATCT---ATAATACTACCAC--AAAAATT-A----T-GTTTCTT----AA---ACGCAA-AACAACCTTG-ATTGAACATtcgaacattttgtaaattttaataaaaatgagaacattctattatacatatgaaactgaacttgaaatgaacataatggtaaaatagattacaaatgtatgtttaataagatgcagtgaatattatgtttcttatatatttttgctttagaaattatcgaatattcccctttcatatttttgtatatattttcttaacaaatgtttatgaaaaatataatttatttaataagatattttatattttgatttctcttgatccagtgttagaactttctgaattcaaaaagaaaattaaaggctgtcatgcatttgaaagaaatatttgggagattattttagaagtgcatattttggtgtttattaacgtttatgattgctttaatctgatatttgttacaatttttgaaaatacaaaataagaatttctataaaaacagcatatttattggcaaatagttttcctaaccgctataagatatatacacatttatatactagtacgtatatctgcaagaaaatgacgacaaaagtggaaacaaaatattttgctttttaaaaatgtacatgtttgtggcttaaatcattcaatatctataatactaccacaaaaattatgtttcttaaacgcaaaacaaccttgattgaacattcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|20 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccataaggttgttggctcgtgaaaatttaagttattagattttATAATGCATAAG-----AAATTGATC-TT---ACCA----A---ATG-A-----AC--CAT---ATTA--AGTTTAAAA-----TT-GATAACGCATAT---GTTAATCT-TTG----A--AAAACTG----T---AC--T---G-T-G-A-----A---GTGTT----T---T-A-AA-----A------T---A---C-A--TT----A-----C-T--C-------------------------------------------------G---TT-AT-------AC-TCCATCCATTC--T-TTC--ATAT-G---T-T-TC--CGTAACA--AAACCACA-TACA---CATA----T---A-A-----C-TT--CG----AAT--TAT---A-ACACT-TTTT---ATATCTGAATTT-ACATCT-----AATCCTATGTGAGTTCTT-CAAAATTTAT--A-AATA-AGATTTTA-GCT-------TTGTTTGCATTTC---AAAGAAATA------TTT-T--CAAAtcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|21 : GC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGTGACATTCTTAAAATGAAA------CTA--ATTAGA----A--TAG-TT-TT-A-ATT---TA-ATT-----AAA-AAAGC--A-TATG-C------ATC-ATC-------ATCT---ACAC-TA-ACA-AA--T--GATC-A-CGAA-AAA-GGTATATTGTCCGTTGCCTTGCTTG---CTTTAGTGTTGTTTAAT-TCTTAAGTTGATGCTTACATC-AAATGCAATATTGT--A--TTGC--TTTTGTTAAAATT-AGA--A---CAATATGACCAAA-TA--------T-GT-TA----AGTATATGTATG-----AAATTAATC-TT---A--T----A---A---A-----ATGACAA---AACAT-A-----AAA-----T
gi|22 : tgGAATGTAT--G-AAGC-AAATCATA-GGC-------TGC-----ATTTT---AAAGACATG------TTTGT--CAAATTAC-TTAAAT-A-GTGCATATGTT-A--GTGA--T-A--TT-----TAAA----A------A------AAT-G-T----T---T--AC---A--T--T----TGGTAACA---TCTGAAAATA---ATAA-AT--GTT--ATG--------TTTT----------------------AA-ACTAG----------TC---T----AAAT---CATA--GTAT-CACACA---CTTG---TA----------------------------------GAA----A-----------------------------------------------------------A---TAT--T--------------------------------------T---------A----------------------------------------------------------------T-----ACCCC-C-TAT-T---ATTCCTGGTCAGAA---------------------A----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-------------TA----A-AT-A-A-------A-A-A---TGA--A---------ATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTCCTATGTATCCATATCC---ATAAAACta
gi|23 : GCTGTTTCAT-TTTAAAGATGATACCTACATTAAAATCTA----TTT--A--TT----TTT---TAAAAAT-AAG--T-----TTA-----AGC-TA--------TCAT-TA---TGTCATATATATATATTCAAA-TGAAC-TA---A--A----A---C---GTGC--AT--TAT---AAAG--A-----AAA-----TA-GATAACATATTT---TTAAATCT-TTG----A--AAA--AA----T---AC--CATGG-A-A-A-CT--A---TTTTT----T---CTT-TT-----A------C---ACGTT-T--TT----G-----C-T--T---A------AGAA----AA-----------GA--AATTGTC---G---A---CT-AT-------AT-CCCAACAA--CA-T-ATT--GTAT-G--TT-T-TT--TTAAACG--AAAATTCA-TAAA---AA-A--------A-A-----A-a
gi|24 : A----A-AT-TT-TTTT---ATATATT-GTTT-C---------------AGTGTTAGCACTTTCAGAATTAA---A-AAGA-AAATAATA-GGT-------TGCCATGTATTTT---AAAGAAATA------TTTAT--AAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATATTTTAG--ATGT--C-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--ATA--A--TA-TTATATGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-A---ATT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AG-AATAG----------TC---T----AGTA---CATA--CTAA-CATACA---CTTG---CA-C-------------AAC-T-TTTC---------AAA----A-T-AATA---A-----------------A---------A-C---------------GAGA---TTT--T-----------------------t
gi|25 : taacC---T--TAAGAA----TGTTTCTG----GCTCAT--------CAAA------------GTA--ATTAGAT------TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---------ATTGT------ATTTATT-------AT----------------------------------------GGTAT-------GTTGCTGTGTTCA---TTTTTATTCTATTTAAT-TTATAAGATGACACCTACGTCAACATTGAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAAA--AGGGAT---CATTA-----ACA-TA--------TC-T---------------TATG-----AAACTGATC-TT---A--A----A---A---
gi|26 : ta--------------T---------A--T---------T-----------------G--------------T-TA------T-----CCCT-----ATCAC-C-TAT-TT--TTTCTAGGTAA-ATTAT--ATTGCTAAAAATG--GA----A--atgagca
gi|26 : aaatatg-TT----G-CT-A-A-------A-A-A---TGG--A---------ACGTTTTATTTTTT----A----ATTTGTTTAATGTTTCCATAGTC---ATACGATTGT--C------ATA-A----TTATTTC-T----GG---AAGAAACTACAACTTTT-ATTGAAGATcgttttattttttaatttgtttaatgtttccatagtcatacgattgtcataattatttctggaagaaactacaacttttattgaagatatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|27 : aaatatgtattgttatccctatcacctattttttctaggtaaattataT-----ACCCCAC-CAT-T---C--CTTGGTATGAATAC--ACTGCAAAGATTT--GA----A--A-A-A--A-ATCTAAACAAAT----G-------------G-----A-----T-T-T-TGTTATGGA-TT-A-C-------A-G-A---TGG--A--------CACG-TTTATGGTTT----A------------AGCGTATTCACAT-G---ATAAGACTTCAAT--AAA-ATA-A----TGGTTTC-T----AA---Aatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|28 : tgccgcgttaaagtGTTCA-G--TGAGT-ATTCA-GC---TCTTATGGACAGATGTT---G----GCTCGT--------AAAAAAAAAA------AAA--AATA-AT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---ATGA-TATT-T------GTT-ATT-------ATTT---GAGA-TG-A-T-GT--T--GATC-A-TGAA-ATAAG-TAT-------GTTACCATGCTTT---TTATCCTGCTATTCAAT-ATATAAGATGGTACCTATGTCAAAATCTAACATcattatgattaaaattcatgaacataaaaatctg
gi|29 : ----T---G-A-----A-GTA-T-----GTT--TA----C-AC-TT-TCTG---A-AGTATAG----CC-T-------GGTCCAATGTTAACACTTTCAGAATGTAT--A-AAAA-AA--CATT-GGC-------TGTCCTGCATTTT---AGAGAAATA------TTTGT--------ACTTTAAAT-A-ATGCATATGTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-CA----A------A------ACT-A-T----T---T--AT---A--T--C----TGATAATA---TCAGAATATA---AT
gi|3 : ttaatgttaacactatt---T--TCAGGA----TGTT---G----ACTCAT--------CAAAAC-AAC------GTA--ATTA-AG---A--CTA-TT-TC-A-ATT---CA-GTT-----AAA-AAA-C--A-TATG-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGACTG-A----T--T--G------CGAA-AAAA----T-------GT-GCCGTGCTCG---TTTTTGAGTTATTTCAA-TTATAAGAT
gi|3 : TTTT--GAGTTA---TTTCAATTATA---AGA--T---CATTA-----AGA-TA--------CAAT-TC---TATTATATACATG-----AAAGTGAAC-TTT--A--AT---A---A---GT----CT--CAT---AATC--A-----AAA-----TG-CATAGCAACTAT---TTTTATCT-TTG----A--AAAA-TAAAAAC---AC--T---G-A-A-A-CT--G---AAGTT----TTA-C-TCTG-----C------T---A---T-G--TTTTGTG-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TC---A---G---CT-CT-------AC-CC-ACCTA--C--T-CTT-----T-A--AG-T-AT--TTTAACATTAAAACTTT-TAAA---AA-AATA-T---A-A-----A-TT--TGGAT-ATT--CA----G-AC-TT-TTTT---ATAATTAAGTTT-CC-TAT-----GGTTGAATGTTA--------------TAT--A-AAGG-GTATCATA-GGT-------TGACGTGCATTTT---AAAGTAATA------TTTGT--CAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATAAACT-G--ATGT--T-G--TT-----T-TA----A------A------AGT-G-T----T---T--AT---AACTA-T------ATGATA---TT---AAATA------A-GT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------GTA--AA-ATTAG----------TA---T----AATA----ATA--CTAT-CATACA---CTTG---GA-A-------------AAC-T-TTTT---------GAA----ATA-TAA----A-----------------A---------A-C---------------AAGAATTTAT--TATAAAAATATTTTTTTATCCCATC--------------T---------A--C---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CTCT-----ACCCC-T-TA--T---TTTCATGGTAATAAAAT--GATGCCATGAGTT--AA----A--A-A-AACA-AT--------AT----C-------------GAAACAA-----T-TGT-TATG----G-TC-A-AC------A-C-A---TGG--A--------CATG-TGTGTGGTTT----A----AAT-------TGTATCTATATCC---ATAAGACTG--ACTGAAAGATA-----------TTTT----AATTTAAGATA-TA-AAATTCACACTTATGAcattaagatacaattctattatatacatgaaagtgaactttaataagtctcataatcaaaatgcatagcaactatttttatctttgaaaaataaaaacactgaaactgaagttttactctgctatgttttgtgctttagaaaaaaaaaatcagctctacccacctactctttaagtattttaacattaaaacttttaaaaaaatataaatttggatattcagacttttttataattaagtttcctatggttgaatgttatataaagggtatcataggttgacgtgcattttaaagtaatatttgtcaaattatcttaaatagtgcataaactgatgttgttttaaaagtgtttataactatatgatattaaataagtgttatgctttagtgtaaaattagtataataatactatcatacacttggaaaactttttgaaatataaaaacaagaatttattataaaaatatttttttatcccatctacaattacctctaccccttattttcatggtaataaaatgatgccatgagttaaaaaaacaatatcgaaacaattgttatggtcaacacatggacatgtgtgtggtttaaattgtatctatatccataagactgactgaaagatattttaatttaagatataaaattcacacttatgaaaatct
gi|30 : ttcaggatgttgactcatcaaaacaacgtaattaagactatttcaattcagttaaaaaacatatgtattattatctaagactgattgcgaaaaaatgtgccgtgctcgtATTTT---AAAGAA-CA------TCTGT--CAAATTA----AAAT-A-TTGCATGTTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-GA----A------A------AAC-A-T----T---T--AC---A--T--T----TGATAAAA---TCAGAAAATG---AATA-AG--GTT--AAG--------TTTTGGT--------------TT----A-AGTAG----------TC---T----AATACTTCTTAGTCTAT-TACGTATTTCTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC-----------A----A-A-AAG----A-----------------A---------A-A---------------AAGA---aaatct
gi|31 : --TA----C-AC-TT-TTTT---GTATTTAAGTTT-C--TTT-----GATCCCATAAATGAACTTTCAAAATTCAT--ACAATATAAATTATATGCT-------TG-AGTACATTTT---TAATTAATA--------------AA--TACCCTAAAT-GTGTGCATAGTTT-T--GTGT--T-A--Ta
gi|32 : tggggtaaaTGGCTT----A----CATTGTTCAGTATATCAGTATCC---ACAAAACTGTAAC--AAAGATA-A----TAGTTTCTT----AA---AATAAA-TATA---TCA-ACTGAAGATaacacatagtctgatacacactgattgtaca
gi|33 : ttttgaaaatataagtacatc--A-----AAA-----TG-GATAACATATAT---GTTAATCT-CTGGAACA--AAA--TA----C---AC--------A-----------------T----T---C-T--------A------T---C---T-A--TT----G-----T-C--T------------------AT-----------GC--A----TC---A---C---TC-AC-------A---CCA-CCA--C--TGTTT--G-AT----AT-G-TT--TTTGAAA--CTATCACA-CACA---AA-AATTTT---A-ACT---G-GA--T-----AAT--TG----C-AC-TT-TTTcatagtaaaacattacaaaacgtgaaatctgaaattttcttagccaatatccttta
gi|34 : GGAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-AAT-C--A-TATT-TA-----ATA-ATT-------ATCC---TAGA-TA-A-A-AT--T--GA-T-A-ATAA-AAAAGGTAT-------GTTACTA-GCTCT---TTTTTGTGCTTTTTAAT-TTTTAAAATGTCACCTACGACAAActa
gi|35 : -TT---A--A----A---ATGAGC----AT--CAC---AATA--A-----AAA-----TG-GCCAAGAAATAT---TTTAATAT-TTGA---A--AAA--TG----T---AC--T---C-AGA-A-CT--AG--GTATA----T---C-TGTA-----A------T---G---T-A--TT----------C-TTGT---T------TGAAGTTGAA-----------AA--A----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-TCTATCTA--C--G-TTT--
gi|36 : tt---T--TAAGGA----TCTT---G----ACTTAT---------ACAATGAAATACAGTGTA--ATTAAAA---A--ATT-TT-TT-A-ATT---CA-GTTGCATCATA-A---T--A-TATT-A------ATT-ATT-------ATTT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GATC-A-TG-A-AAAAGGTAA-------GTTGCCATGCTTG---TTTTTGTt
gi|37 : A----A--A-A-A--A-AT--------GT----T-------------G-----AAACATC-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------G-ATA---TGG--A--------CAT--TTT-TGGCTT----A----AATTGTTCAATGTTTTCATATTC---ATGAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TCACTTCTTATTAAA---AAGAAA-TACAACTT
gi|38 : atgcTAT--A-AAGA-ATTTCAAA-GGT-------TAC-----ATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTATAT-T-GTACATAGTTT-G--GCGT--T-A--AT-----T-TT----A------A------AAT-G-T----T---G--AT---A--TGTT----TGATAAAA---TCTGGAAA--------A-AA--GTT--ATG--------T
gi|39 : tgATA-GGT-------TGCCTTGCATTTT---AAAAAAAAA------AT-GT--CCATTTACGTTAAAA-A-GTTAATATTTT-------T--T-A--TT-----T-TACTTTA------A------AATAG-T----T---T--AT---A--T--T----TGATGGCA---TCAGAAAATA---AGTA-AT--ATT--ATG--------TT
gi|4 : tC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAACATGAAA------TAA--ATTAGAT-------TT-TT-TT-A-ATTATTCA-GTT-----AAA-A---ATAA-TATG-T------ATT-ATTTATAAATATCT---AAGA-TG-A-A-AT-----GA-T-AACGAG-AAA-GCTAT-------GTTGCCATGATCG---GTTTTGTGCGATTTAAT-TTTAAAGTTGATACATACG---ACATC--ATTTTTTTAG--TTTATTTTTTTATGAAAAT--GG--TGACCATGA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTAAACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--ATAATG---A---GC----AT--CAT---AACA--A-----AAA-----TT-AATAACTAAAA------TAATCT-TTT---------T--TA----T---AC--T----------------------TT----T-----------------------------T-C--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--T----TC---ATC-G---TC-AC-------AT-CCTATGCA--A--T-TTT---TAT----AT-G-TT--------------ATACA-T---------G----T---T-G-----G-GA--T-----AAT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGCTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTATAAA-AAAA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------AATGT--CAAATAACATTAAATCA-GAATATA-ATT-A--ATGT--T-ATGTT-----T-TA----GTT----A------AAT-A-TAGTCT---T--AT---A--TA-T----T
gi|4 : aCATAGGTT-GCCGTGC----A--TT-----T-TA----A------AGAAATAAAT-G-T----CAAAT--A----A--CA-T----TAA----A---TCAGAATATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------T-A--AA-TATAG----------TC---T----TATA---TATT--CTAT-TGTACA---CTTG---TA-T-------------ATC-T-TTTT---------CAA----A-T-GAT----A-----------------A---------A-----------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TCTTTTGAGCA--T---------ATATTTATTCAGCTAAGAG--------------T-TA------C-----CCGT-----AACCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAATAAAAT--GATG--------------------A-A-A--A-CT--------AT------------------------------T-T-TAT-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATA-TTTGTGGCTT----A----AACCG------------ATA--------AAAAC----------AGAAA-A----CGATTTCTT----AA---AAGAAA-TAAAACTTCA-ATctattgtacacttgtatatctttttcaaatgataaaaagattttctcttttgagcatatatttattcagctaagagttacccgtaacccctatttttcttggtaataaaatgatgaaaactattttatttgttaaaaaatgaacatatttgtggcttaaaccgataaaaacagaaaacgatttcttaaaagaaataaaacttcaatccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|40 : acttaaggatgttggctcgtcaacatgaaataaattagatttttttaattattcagttaaaaataatatgtattatttataaatatctaagatgaaatgataacgagaaagctatgttgccatgatcggttttgtgcgatttaattttaaagttgatacatacgacatcatttttttagtttatttttttatgaaaatggtgaccatgaagatatcattatattaaacatatgaaactgaacttaataatgagcatcataacaaaaattaataactaaaataatcttttttatactttttcttgctttagaaaaaattcatcgtcacatcctatgcaatttttatatgttatacatgttgggataattagacttttttatattttagcttcctttggtccaatgtaagcactttcagaatttataaaaaaaaaat-T-T-C-TT----G----A-A-------A-A-C---TGG--G--------CATT-TCGGTGACTC----A----AATTGTTCCACGAATCAATATCCATTATAAAACTTCATC--AAAGATA-A----GTGTTTCCT----AA---GAccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|41 : --TTT-TT-TT-A-ATT---CA-ATT-----AAA-A---CCCA-CATT-T------GTT-TTT-------ATCT---AAGA-TG-A-C-AT--T--AA-T-A-AAGA-AAAAGGTAT-------GCTGtgtttaatgtat
gi|5 : ---T--TAAAGA----TG----------GCTCGT---------AAAATGAAA------ATACAAATAGATCTAACTTTT-TT-TT-GTATT---AT-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------TCT-ATT-------ATCTTAAAAGA-AA-A-AGATAAT--GA-CTG-CGAA-AA--GATAT-------GATGCCGTGCTTG---TTTTAGTACTGTTTAAT-TTTTAA-ATGATACCTACGT-ACAATTTTATATCTT--G---TAG----TTG--AAAATT-AGaggtcactaatgca
gi|5 : -----AT--GAT---AATA--A-----AAT-----TG-GATAGCACGAAT---GCTAATTT-TTA----A--AAAAATA----C---AC--A---G-A-GCA-CT--A---A-GTT----TTCCC-T-TATAATTA------T---A---T-TC-TT----A-----CAT--TCAGT------AGAA----AA-----------AA--T----TCTTTG---G---CC-AT-------AC-CT-ACCAA--C--T-TTT---TAT-GGTAT-T-TT--TGTAACT--GAAACATA-TA-A---AG-A----TTTTA-ATTG--G-GA--T-----AAT--TAA---G-AT-TC-CTTT----TATTTCAGTAT-CC-TTT-----GGTCCTGTGAAAGCACTTTCAAAAC---------------GTCATA-GGT-------TTTCGGTCATTTT---AAAGAATTA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-TTCCATATTTT-G--------T-G--TT-----T-CA----ACTG---ATGATTCAAT-GCT----T---C--AA---C--TC-T----T--TGACA---T-A------A---ATTA-AT--GTT--AAG--------TTTTAGT--------------TTA--GA-AATAG----------TC---C----AATA---TA-----TAT-CATATA---CTTA---TA-CATATATTATTCATAAC-T-GTTC---------GAAAT--A-A-AACAACAA-----------------A---------A-CTTTCTCCTTTGAAAAAAAA---TAT--T-----------------------T--------------T---------A--T------------------------------------------T-TA------CTTT--TCCG-----ACTCT-C-AAT-T---TTAATTGGTTATATAATAAGATG-CAAAAGTTCAGA----A--A-C-A--A-AA--------AT----A-------------G-----A-----T---------------TT-A-A-------A-A-AAATTGG--AAAAAATATTATA-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTC-ATGTATCCATATTC---Atatgataataaaattggatagcacgaatgctaatttttaaaaaaatacacagagcactaagttttcccttataattatattcttacattcagtagaaaaaattctttggccatacctaccaactttttatggtatttttgtaactgaaacatataaagattttaattgggataattaagattccttttatttcagtatcctttggtcctgtgaaagcactttcaaaacgtcataggttttcggtcattttaaagaattatttgtcaaattaccttaaatattccatattttgtgtttcaactgatgattcaatgcttcaactctttgacataaattaatgttaagttttagtttagaaatagtccaatatatatcatatacttatacatatattattcataactgttcgaaataaaacaacaaaactttctcctttgaaaaaaaatattttatttacttttccgactctcaattttaattggttatataataagatgcaaaagttcagaaacaaaaatagatttaaaaaaattggaaaaaatattatatttgtggcttaaattgttcatgtatccatattcagagg
gi|6 : ttaaagatggctcgtaaaatgaaaatacaaatagatctaacttttttttgtattatgttaaaacatattttctattatcttaaaagaaaaagataatgactgcgaaaagatatgatgccgtgcttgttttagtactgtttaatttttaaatgatacctacgtacaattttatatcttgtagttgaaaattagtTTGCCATGCTCG---TTTTTATGCTTTTTAAT-CTTTAAGATAATACC------AAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTCATAAAATG-AGA--T---AATTA-----AGATTA--------TC--------TATTGCACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---A-----Agagg
gi|6 : --A-----AAA-----TGAGATAATTAAGAT---T---ATCTATTG----C--ACA--TA------------T---G-A-A-A-CTG-A---A------------C-T-TA-----AAAAAAAT---A---T-G--TTT---G-----T-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAACATC---G---G---CA-AT-------ACACCTA-CCA--C--T-TTT---TATTACTATAT-TT--TTTCACA--AAAACACAACACATAAAA-A----T---A-G-----ATGT--TTGAATAGT--TA----G-AT-GA-TTTT---ATATTTTAGTTAACC-TTT-----GGTCCAATATAAGCATTTTCAGAATTTAT--T-AAGA-AAGTCACA-GGC-------TGTCGT---TTTTATAAAAGTAATA------TTTGT--CGAATGACCTTAAAC-A-GTGCATATTTA-A--GTGT--T----T--------------A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGAAAACA---T---AAA---------A-AT--GTT--ACG--------TTTAAGT--------------TTT--AA-AA-AA----------CG---T----AATG---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---AA-C-------------AAC-T-TTTTTTTTGAAAAGAA----A-A-AAC----A-----------------ATATTTTATCG-CTTGGA----------AAAA---TAT--TTATATCT----------------C--------------T---------A--A---------A-----------------A--------------TGTA------C-----TCGT-----ACACC-C-TAT-G---TTTCTTGGT------AT--CACGTCAAAAGAT--GA----A--C-A-A--A-A---------AT----C-------------GA----A-----TGT-T-T-TT----G-TT-A-AATGATAGA-A-A---AAG--A--------TATA-TTTGTGGCTT----A----AAATGTTCAATGTATTCATAGCC---ATAAGACTGCAGC--AAGGACA-A----TAGTTTaatatgtttgttttagaaaaaaaaacatcggcaatacacctaccactttttattactatattttttcacaaaaacacaacacataaaaatagatgtttgaatagttagatgattttatattttagttaacctttggtccaatataagcattttcagaatttattaagaaagtcacaggctgtcgtttttataaaagtaatatttgtcgaatgaccttaaacagtgcatatttaagtgtttaaaatgtttatatttgaaaacataaaaatgttacgtttaagttttaaaaaacgtaatgcatactatcatacacttgaacaactttttttttgaaaagaaaaaacaatattttatcgcttggaaaaatatttatatctctaaaatgtactcgtacaccctatgtttcttggtatcacgtcaaaagatgaacaaaaatcgaatgtttttgttaaatgatagaaaaagatatatttgtggcttaaaatgttcaatgtattcatagccataagactgcagcaaggacaatagttt
gi|7 : ttgccatgctcgtttttatgctttttaatctttaagataataccaaaatctaatattttgttaattttcat----A--AAA--CA----CGA-AC--C---G-A-A-A-CT--TTGTATGTT----C---G-T--------A------C---A---T-GAATT----G-----T-----------------AC----AT-----------GA--A----TT---T---G---CT-TT-------AC-CC-ATC-A--G--T-TTT--TTAT-A-----T-TT--TTTAACA--AAAG-----TACA---AA-A----T---A-ACTGAGA-GG--T-----AAT--TA----C-AC-TG-TTTT---GTGCTTTAGTTT-CC-TTT-----CGTCCTATGTAAGCCCTTTCATGATTTTT--A-CCGA-AAAGCATG-TGT-------TTGTGTGCATTTT---AAA---------------GT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCAAACTTT-G--TTAT--A-A--TT-----A-TAT---ATATATTA------AAT-A-T----T---T--AT---A--TG------TGGTAACA---TCAGAAAATA---ATTG-ATC-GTT---TG--------TTTTAGG--------------TAA--AACAATAG----------TT---A----AATA---TATA--CTAC-CAAATA---TTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-AGAAC--------------------------------A-C---------------AAAA---TTTTAT-----------------------C--------------TTTGAA----A--T---------AATGTCCACTTAGC----A--------------T-TA------C-----CTCC-----ATCCC-C-TAT-T---T---TTGGCAAGGTAAT--GATGTCAAAGGCT--GA----A--C-ATA--A-AT--------AT----CAAATAAAAAAGGAA-----A-----T-T-T-G-TT----T-TT---A-------A-A-G---TGG--A--------CATT-ATTGTGGCTT----AAAATAATGGTTTGAGGTATACATATAC---ATAACACTGC-AT--AATACTATA----TAGTTTCGT----AA---AATAAA-TGCTACTTCT-ATTTAAGAT
gi|8 : ---T--TAAAGA----TGTT---GCCTGGCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TCT-TT-TT-A-ATT---CA-G---------------C--A-TATT-T------ATT-TTT-------TGTT---AAGA-TT-A-A-AT--T--GATC-A-TGAA-AAGAATT-T-------GTTACCGTGTTCGTTTTTTTTTTGCCATTTATTATTTTAA-ATGATATCCACTTCAAAGTCTAATATTTT--G--TAAA--TTTTCATAAATTTGAGA--T---CGTTA-----AAG-GG--------TC--------TGTTATACAAATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----ATTGA---GC----AT--CAT---AAT---A-----AAA-----TG-AATAGGAAATAT---TTTAATAT-TTGGC--A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-ACATTT--ATATATATT----TG--C-T-TT-----A------G---A-----G--TT----G-----T-T--T---T------A-AA----AA-----------AA--A----TA---A---C---CC-CT-------AC-CCCGTattaaattcatcaatatgaatagatgaaacttttctagcgaacatc
gi|8 : T---A--AA-T----TGA--GCA---TCATAATAAA---ATGA-ATAGGAA--ATA--------TTTTAATAT------------TTGGCAA-AATAC----------AC---T----GA-A---CAT---TTAT--ATATA---TTTGCTTTA-G-------------AGT-T-GTTT---------TAA----A-A-AA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-----------------A--------------T-AA------C-----CCCT-----ACCCC-G-TAT-G---TTTCTTGGCAGGAAAAT--GATGCCAAAATTA--GA----T--A-G-A--A-AT--------A---------------------------------------------A-TA-A-A-------A-A-A---TGA--A--------CACA-TTTATGGCTT----A----AATCTTTGAATGTATCCGTGTTC---ATAATACTGCAAT--AAAGATA-A----TAATTTCTT----AA---AAGAAA-CACGATTTTA-ATTTAAGATatgtttcttggcaggaaaatgatgccaaaattagatagaaataataaaaaatgaacacatttatggcttaaatctttgaatgtatccgtgttcataatactgcaataaagataataatttcttaaaagaaacacgattttaatttaagatataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : ttaaagatgttgcctggctcgtcaaaatgaaagtaattagatatctttttaattcagcatatttattttttgttaagattaaattgatcatgaaaagaatttgttaccgtgttcgttttttttttgccatttattattttaaatgatatccacttcaaagtctaatattttgtaaattttcataaatttgagatcgttaaagggtctgttatacaaatgaaactgaact-GACTGAGT-ATTTA------T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CATAATTAA-------GTA--ATAAGAT---C--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-ATT-----AAATAT--C--A-TTTT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--TTAGA---A-CG-A-AAAATGTAT-------ATTAGGGTACTTG---TATTTGTGCTATTTAAT-GTTTAGGATGATGCTTACG--AACTTATATTGTTTA--G--TAAA--TTTTGATAACATG-TGG--T---CCTTG-----AAA-TA--------TCAA-TG---TATTATTCATAAG-----AAACTCAAC-TT---A--ATAATG---A---GT----AT--TAT---AACA--A-----AAA-----TT-GATCACTTATAT---TTTAATAT-TTG----T--AGA--CA----C---ACCTT---GAA-A-A-CT------ATGTT----T---T-T-Tataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : gtt--------------T-TA------A-----TCCT-----ACTCT---TATGT---TTTCTTAGTAAGAAAAT--GATGTCAAACATT--TA----A--A-A-T--ATAT--------AT------------------------A-----T-T-T-T-T-----G-TT-ATA-------A-A-C---TCG--A--------CGTG-TTTCTGTCTT----T----AAACATTCATTGTACCGAAATCC---ATAATACTG--------------------------TT----AA---AAGAAA-CACAACTTCA-GTTTAAGActcttatatcacgttaatcctactcttatgttttcttagtaagaaaatgatgtcaaacatttaaaatatatatatttttgttataaactcgacgtgtttctgtctttaaacattcattgtaccgaaatccataatactgttaaaagaaacacaacttcagtttaagacattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11 111111 111111111 111111 222222 111111 222222 111 111111111111111111 444444444444444444 11111 1111111 11111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222 11111 4444444444444444444444444444 111111 1111 1111111111111 11 11111111111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 2222 0 33 999999 44 6666 77777777 555555555 0 888888 44 0 777777 2 2 2 2 444 2 66666 2 777777 2 2 000000 5 8888888 444 2 2 666 55555 111111 3 2 3 0 9999999 1 777 2 0 33 2 44 44 44 0 222 8888888 88888 2 3 555555555555555555 77777 2 777 33 111111111111111111 33 555 55 00000 66666 2 1 444 1 2 5555555 99 11111111 555555 2 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 3 3 66666 2 777777777777777 33 33 0 5 00000 2 6666666666666666666666666666 6 33 444444 2 2 666 2 33 66666 1 0 0 22 2 2 0 2 6666666 0000 333 555555 22 1 1 2 2 1 66666 22 1 22 55555 2 6666 5555555555555 2 2 4444 333 22 555 22 88 4444 333 333 2 55 22 77777777 77777777777777 333 2 44444444444444444444 7777 55 2 444 444 666666666666666 0 2 2 1111111111 8888 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 222222222222 55555 000 2 666 33 2 66 4444 33 2 2 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 8888888 2 2 333 22 77777777 2 4444 4444 4 3 333 1 33 2 2 666666 5555 444 3 4
lowQualScore : .... . .. ...... .. .... ........ ......... . ...... .. . ...... . . . . ... . ..... . ...... . . ...... . ....... ... . . ... ..... ...... . . . . ....... . ... . . .. . .. .. .. . ... ....... ..... . . .................. ..... . ... .. .................. .. ... .. ..... ..... . . ... . . ....... .. ........ ...... . ............................................................................................................................................ . . . ..... . ............... .. .. . . ..... . ............................ . .. ...... . . ... . .. ..... . . . .. . . . . ....... .... ... ...... .. . . . . . ..... .. . .. ..... . .... ............. . . .... ... .. ... .. .. .... ... ... . .. .. ........ .............. ... . .................... .... .. . ... ... ............... . . . .......... .... ... .............................................................................................................................................................. . ............ ..... ... . ... .. . .. .... .. . . .. . ........................................................... . ....... . . ... .. ........ . .... .... . . ... . .. . . ...... .... ... . .
lowQualScore : 0000 2 22 000000 22 5555 00000000 222222222 8 888888 22 8 555555 7 7 7 7 777 7 77777 7 111111 7 7 333333 3 7777777 777 7 7 333 88888 111111 4 7 4 8 3333333 6 999 9 1 22 5 66 66 22 2 333 1111111 33333 3 3 444444444444444444 11111 7 333 77 777777777777777777 99 000 99 66666 22222 7 0 777 1 7 3333333 44 88888888 444444 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 8 3 66666 4 111111111111111 77 77 5 3 22222 9 1111111111111111111111111111 6 77 222222 5 5 999 5 99 22222 6 4 5 99 1 1 8 0 8888888 4444 333 555555 66 8 5 0 0 1 44444 66 9 66 00000 0 2222 2222222222222 0 0 2222 555 88 222 66 88 0000 555 555 1 00 99 66666666 11111111111111 888 4 00000000000000000000 6666 66 4 111 111 444444444444444 6 2 2 4444444444 2222 222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 999999999999 99999 111 4 555 22 6 55 7777 11 4 4 22 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 9999999 1 1 777 99 66666666 1 2222 2222 3 5 555 8 11 1 4 999999 3333 444 1 0
consensus : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-C-A-CGAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---G-----AT--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------C---A---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ANT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
Reference ( family-851 ) : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-C-A-CGAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---G-----AT--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------C---A---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ANT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
gi|1 : TCTCTTTAAATTAAAGACTGATTCATTTGAGT---T--TAAGGA----TATT---T----GTTCGT--------CAAAATGAAA------GTC--ATTATGT---A--TTTATT-TT-A-ATT---AA-GGT-----AAA-A---C--G-TATC-T------ATT-A-T-------ATCT---AAGA-TG-G-A-AT--T--AA-C---TGAGCAAAAGGTAT-------GTTTCCATGTTCG---TTTTCATTTTATTTTAT-TTTTAACATGATACCTACATCAACATCTGATATGCT--G--TTAA--TGTTGATAAAAAT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------CCAT-TA---TATTATACATTCA-----ACACTGAACACT---A--G----A---A---------AT--CGT---AACA--G-----GAA-----TG-GATAACACATAT---TCTTATCT-TTA----A--AAA--TA----C---GT--T---G-A-A-ATCT--A---ATATT----T---C-TATA-----A------CAAAA---T-A--TT----A-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---C---CA-AT-------AC-CTCATCCC--C--T-TTG--GTAT-A--AT-T-TCTGTTTAACC--TGAACTCATTACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ACT--TA----G-AC-TTATTTTA--ATATTTTAGTTT-CC-TTA-----TGTCCAGTGTTAGCACTTTCA-AATGTAT--A-AAGA-AAATTATA-GGC-------TGCTGTGCATTGT---AAAGAAATA------TT--T--TAATTTTTTTTAAAT-A-GTTCATTATAT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGGAAATA---ACTA-GA--GTT---TG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-ATTAG----------TC---T----AATT---CATA--CTAA-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-T-AAC----G-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------G-----------------A--------------T-TA------C-----TCAT-----ACCCC-G-TAT-T---TTTCGCGGTAAGTAAAT--GATGCCAAAAGTT--GG----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----A-----T-T-T-T-TTG---G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------AATG-TTTGTGGCGA----T----AATCGTTAAATTGATCCATATTA---ATAAATCTGCAAT--AAATGTT-A----TGGTTTTTT----AG---AAGAGA-TACAACTTTA-ATTTAAGAT
gi|10 : TTAACC--AAAAAGCA-TGAA---AA-A----T---A-T-----ATGTGAT-----AAT--TA----T-AC-TT-TGTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTTCATTGTAAGCACTTTCAGAATT-------------AAT--------------------TGCACTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATAACTATAAAT-A-GTGCATATGTT-G--ATAC--T-G--TT-----T-TA----A------A------AAT-A-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TCACAAAATA---ATTA-AT--GTA--ATG--------TTTCAGT--------------TTA--AA-AATAT----------TC---T----AAAA---CCTG--CTAT-TATACA---CATG---TA-C-------------AACAT-TTTT---------AAATGACA-A-AAC----ATGATTTTTTCTCTTTTGA---------A-C---------------AA-A---TAT--T--------------------------------------T---------A--TTCCGCTTAAA-----------------G--------------T-TA------C-----CCTT-----ACCCCTT-TTT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAC--GATGCCAAAAGTT--AA----A--A-A-A--A-AT--------CTAAAAA-------------A-----A-----A-G-G-T-AT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTACCGACATTC---ATATGACTGTAAC--AAA
gi|10 : atttatctcg---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------TAacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaactaacgagccaacatccttaacaa
gi|11 : atttatctcgttaaccaaaaagcatgaaaaatatatgtgataattatactttgttatattttagtttcctttggttcattgtaagcactttcagaattaattgcactttaaagaaatatttgtcaaataactataaatagtgcatatgttgatactgttttaaaaatatttatatttgataacatcacaaaataattaatgtaatgtttcagtttaaaaatattctaaaacctgctattatacacatgtacaacatttttaaatgacaaaacatgattttttctcttttgaacaaatatttattccgcttaaagttacccttacccctttttttttcttggtaagaaaacgatgccaaaagttaaaaaaaatctaaaaaaaaggtatgttaaaaaatgaacatgtttgtggcttaaatcgttcaatgtaccgacattcatatgactgtaacaaaacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaac----AA-----------AA--T----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-CCCAACCA--T--T-TTT--TTA--------T-TT--TGTCACA--AAACCACA-TAcaa
gi|11 : AATGTAAGCATTTTCGGAATTCAT--A-AAGG-AAATAACA-GAT-------TTGCATGCATTTT---AAAGAACTC------TTT-T--CAAATAACATGAAAC-G-GTGCATATTTT-------------------------A----A------A------CGT-G-T----T---T---T---A--TA-T----T--TGATA---TCAGAAAATA---ATCA-AT--GTT--AAG--------CT--AGT--------------TTA--AA-AAAAG----------CC---C----AATA---CATC--CTAAACATTCT---ATTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-GAC----A-----------------A---------AAC---------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TATTTTGA--A--T---------A-----------------AAATATTTATTCCACT-TAAAGCTGT-----CCCT-----ATTCC-C-TAT-T---TTTCTAGATGGGAAAAT--GATGCCAAAAGCT--GA----A--A-A-A--A-----------AT----C-------------G-----A-----T-T-TAT-TT----ATTT-C-G-------A-A-T---TAA--A--------CATG-TTTATGGTTT----A----AACATTTCAATGCATCGATATAC---ATAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----TTATTT-TT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAaatgtaagcattttcggaattcataaaggaaataacagatttgcatgcattttaaagaactcttttcaaataacatgaaacggtgcatattttaaacgtgttttatatttgatatcagaaaataatcaatgttaagctagtttaaaaaaagcccaatacatcctaaacattctattgtacaacttttcgaaaagacaaaacaagattttctattttgaataaaatatttattccacttaaagctgtccctattccctatttttctagatgggaaaatgatgccaaaagctgaaaaaaatcgatttatttatttcgaattaaacatgtttatggtttaaacatttcaatgcatcgatatacataagactgcaacaaaaataattatttttaaaagaaatacaacttcaatttatactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|12 : aaaattcattggctataccccaaccatttttttattttgtcacaaaaccacataTTT---ATATGTTAGTTT-CT-TTT-----GTTCCTATGTAAGTACTTTCAGAATTTAT--G-AAGA-AAATGATA-AGTTTGTATGTACACTGTATTTT---AAAAACATA------TTTGT--GAAAACACC----------TACATATTTT-G--GTGC--T-A--TT-----T-TT----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TTAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATAATATTATTTTTTAG---------------TTA--AA-AGTAA----------TT---TTA--AAAA---AAGA--A-AA-AACAAA---ATTA---TT-T-------------A-----TTTT---------GAA----A-A-AAT---------------------------------------------------ATT---TAT--T-----------------------C--------------C---------ACTT---------A-----------------AAG------------T-TA------C-----CCCC-----AACCC-A-TAT-TATGTTTCTAGATACGAAAAT--GATGCCAAAAAATCAAA----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----AAACATT-T-T-T-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGG--A--------CATT-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTCAATATATCCATATAC---GCAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----CAGTTCATT----AA---AAGAtactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|13 : AT---TTTGATCT-TGC----A--AAA--CA----ATTAAA--T---G-A-A-A-TT--A---AAATTGGTAT---C-T--A-----A------C---A---T-G--TC----GTTAATC-T--T---T------GAAA----AAGCTGAACTGATAAGCA----TT---A---A---CT-AT-------AC-CCCAACCA--A--T-C---------A--AT-----------ATA--AACACACA-TA-A---AA-A----T---A-A-----C--T--T-----A-T--TA----C-AC-TT-TTTTTCAATAGTTTAGCTT-TC-TTTAATTTGGTCATATGTAAGCACTTTCAGAACTCTT--A-ACGA-AAATCATA-GGT-------TTGCATGCATTTA---AAAGAAATG------TTTGT--CAAATAACCTTAAAT-A-GTGCATAGTTT-G--ATGT--G-A--TT-----T-CA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TATGGAAATA---GTCA-AT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------TT------AACAG----------CT---T----ACTA----ATA--CTAT-CATTTG---CTTG---TA-C-------------ATG-T-TTTT---------GAA----A-A-tttatatgtgtatttagtttcaagatataaagtaaataaacatcgatatctgaaaacttcctaaaccaacacca
gi|14 : ttataaaaagaaagtagtaagaatatttgTGTATTTT---AAAGAAATACATGTATTTGT--CAAAT--CCATAAAC-A-GTGCATATTTT-T--ATGC--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---ATAAAAAATA---ATTT-AT---TT--AAG--------TTTTAGTATAAAGATATCATATTA--AA-AAGAAAAAAAATCCCTC---TTTTGAAAA---AATAT-CTAT-TTTAC-----TTA---AA-T-------------CCC-TCTTTT---------GAA----A-A-AAT----------------------A---------T-C----------------------TAT--T-----------------------T--------------T---------A--C------------------------------------------T-TA------CTGTTTCCCT-----ACCCC-CATAT-T---TTTCTTGATAAGAAAAT--GATGCCAATAGTT--G-----A--A-A-A--A-AT----------------------------------A-----C-T-T-T-TT----A----A-A-------A-A-A---TGGATA--------CATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTTCATTGTATCCATATGT---ATATGACTGCAAC--AAAAATA-C----TGGTTTCTT----TA---AAGTAA-TACAAta
gi|15 : taagtagtttcttaTTTCTTTAAGTTAA-T-TTGAAT--TCTAAAAAAAT--TA-GGA----TGTT---A-----CTCGC--------CAAAATGAAA------GAA--AATAGAT---T--TTT-TTATTGA-AAT---AA-GTT-----AAA-AAA-C--A-TATT-T------ATT-ATT-------GTCT---AAGA-TG-A-A-AT--G--AA-TAA-CG-A-AAAGGGTAC-------GTTGCCTTGTCCGT--TTTTTGTGCTACTTAAA-TTTTAAGATGATTCATATGTCAAAATAAAATATTTT--A--AAAA--CTTTGATAACATG-AAG--T---CATTA-----ATA-TAAGTTTTTTTTAT-TATTCTATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---AT--G-----AG--CATCAAAATA--A-----AAAACCCCAG-GATAACacgttatttattttatg
gi|15 : t------C---A---C-T--TT----G-----C-T--T---TTAAGTAAGAA----AA-----------AA--A-----C---A---A---CATATTGGCTTAAC-CCCATCCA--C--T-Ttcttgtatatcactttgcttttaagtaagaaaaaaacaacatattggcttaaccccatccactt
gi|16 : ttttctttaagttaatttgaattctaaaaaaattaggatgttactcgccaaaatgaaagaaaatagatttttttattgaaataagttaaaaaacatatttattattgtctaagatgaaatgaataacgaaaagggtacgttgccttgtccgttttttgtgctacttaaattttaagatgattcatatgtcaaaataaaatattttaaaaactttgataacatgaagtcattaatataagttttttttattattctattatacatatgaaactgaacttaaaatgagcatcaaaataaaaaaccccaggataactcttgtatat-A-A-CT--A---ACGTT----TT--C-TCTG-----A------C---A---T-A--TTATT-G-----T-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TT---A---G---CA-AT-------AC-CC-ACCCA--C--T-TTT--G-AT-A--TC-TATT--TTTAACA--AAAATACA-TACAC--AA-A----T---ATA-----A-GT--TTGG--AGTAGTA----GTAC-TT-CTTT---ACATTTTAATTT-TA-TT----------CTATGTGAGCTCATTCAACATTTAT--C-AAGA-AAATCCCA-AGT-------TCGCGCGCATTCT---AAAGATTCG------TTTTTTACAAATTATTTCAAAA-A-GTGAATATCAT-A--TTGCAAT-A--TT-----T-T-----A------A------AGT---T----T---T--AT---A--T--T----TGACAACA---CCAAAAA--A---ATTATAT--ATCCAACG--------TTTTTGC--------------TTA--AA-AATAG----------TCCTAC----AATA---TATA--ATCT-TATGCG---CTT----TATC-------------AAC-T-TTTT---------GA
gi|17 : aaaaactactttacgAT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAT-C---C--AGTATT-C------ATC-ATG-------ATCT---AAAT-TGAA-A-AC--T--GCTC-A-CGAA-AAA
gi|17 : tAA--TGCTGATTAAACTGAAG--T---AATTA-----AGA-TA--------TTAT-TA---TATTATATAT-TT-----AAATTGACC-CTACAA--A----A---G---G-----AG--CAT---AATA--GTAC--ATA-----TG-GTTAATACATAT---ATTGGTCT-TTGAA--A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-G-A-ATCAA---ATTTTTAC-T---C-T-TAC----A------T---A---TAC--TT----G-----T-T--T---T------AACA----AATTC--------AA--A----TT---A--------A-ATAAAATA-AC-CACATACA--G--C-TTG--GTAT-A--AC-T-AT--TTtgctgattaaactgaagtaattaagatattattatattatatatttaaattgaccctacaaaaggagcataatagtacatatggttaatacatatattggtctttgaaaaaatacactgagaatcaaatttttactcttacatatacttgttttaacaaattcaaattaaataaaataaccacatacagcttggtataactatttcttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|18 : tatttttttttaattcagttaatccagtattcatcatgatctaaattgaaaactgctcacgaaaCATATG---TATTGTACATATG-----ATACTGAAC-TT---A--A----A---A---ATGAGCAC--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACAAATAT---TTTAATAT-TTG----ATAAAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A--------------------------------------------A---C-T--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------A--------TC---A---GTGACT-AT-------TC-CCCATCCA--C--T-TTTTTGCAT-G--TA-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TA-A---AA-A----T---A-------------T-----A-----A----G-GC-TT-TTC----ATATTTTAGTTT-CA-TTT-----GGTCGAATGTAA----------AATTTAT--A-AAGA-AAATTATA-cttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|19 : atataaataaa-T-TTTC---------GGA----A-A-GACT---A-----------------A---------A-C---------------AAGA---T-T--T-----------------------CGTTGATGAAAACAAT---------A--T---------AT----------------A--------------T-TC------C-----GCCTGAGATACCTCTC-TGG-T---TTTCTGTATAAGAAAAT--GATGTCAAAGGTT--GACTGAATTA-A-A--A-AT--------G---------------------------------------------G-TA-A-A-------AGA-A---TGG--A--------CGAG-TTTGTGGCTTGAAAA----AAT--TTCAATGTACACATATCC---TTAAGACTGCAAC--GAAGACA-ATAGCTAGCTTCTT----TA---AAGAAA-TACAACtactgagcaaaagtagaaacgtctcacttatggatccgacatttattcatctatgtttatgttacaca
gi|2 : --TAAGGT----TGTT---G----GCTCGT--------GAAAATTTAA------GTT--ATTAGAT------TTT-TG-TT-G---T---CATGCT-------------C--G-TTTT-TGTGCTAATTCATT-------TTC----AAGA-TG-A-T-AC--C--AA-C-A-TCAA-AAattaccaagattacattatttacccttatatgcttagtaaatattctaaataaaacttgcagaacat
gi|2 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccaT-------GTTGTCATGCTCG---TTTTTGTGCTAATTCAT-TTTCAAGATGATACCAACATCAAAATCGAACATTTT--G--TAAA--TTTTAATAAAAAT-GAG----------A-----A--------------CAT-TC---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---G--A----A---AT--G-----AA--CAT---AATGGTA-----AAA-----TA-GATTACAAATGTATGTTTAAT----------A--AGA--TG----C---AG--T---G-A-ATA-TT--A----TGTT----T---C-T-TAT----A------T---A---T-T--TTT---G-----C-T--T---T------AGAA----AT-----------TA-------TC---G---A---AT-AT-------TC-CCCTTTCA--TATT-TTT--GTAT-AT-AT-T-TT--CTTAACA--AATGTTTA-TGAA---AA-A----T---ATA-----A-TT--T-----ATT--TAATAAG-A--TA-TTTT---ATATTTTGATTT-CT-CTT-----GATCCAGTGTTAGAACTTTCTGAATTCAA--A-AAGA-AAATTAAA-GGC-------TGTCATGCATTTG---AAAGAAATA------TTTGG--GAGATTATTTTAGA--A-GTGCATATTTT-G--GTGT--TTA--TTAACGTT-TA----T------G------ATT-G-C----T---TTAATCTGA--TA-T----TTGTTACAATTTTTGAAAATACAAAATA-AG--A----AT---------TTCTA-----------------TA--AA-AACAG----------C----------ATA---TTTA--TTGG-CAAATA---GTTT---TC-CT------------AAC-C-GCTA---------TAA----G-A-TAT----A-----------------T---------A-C---------------A------CAT--T--------------------------------------T---------A--T---------A----------------------------------TA------C-----TAGT-----ACG-----TAT-A---TCT----GCAAGAAAAT--GACGACAAAAGTG--GA----A--ACA-A--A-AT--------AT----T-------------------------T-T-G-C-TT----T-TT-A-A-------A-A-A---TGT--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCATTCA--------ATATCT---ATAATACTACCAC--AAAAATT-A----T-GTTTCTT----AA---ACGCAA-AACAACCTTG-ATTGAACATtcgaacattttgtaaattttaataaaaatgagaacattctattatacatatgaaactgaacttgaaatgaacataatggtaaaatagattacaaatgtatgtttaataagatgcagtgaatattatgtttcttatatatttttgctttagaaattatcgaatattcccctttcatatttttgtatatattttcttaacaaatgtttatgaaaaatataatttatttaataagatattttatattttgatttctcttgatccagtgttagaactttctgaattcaaaaagaaaattaaaggctgtcatgcatttgaaagaaatatttgggagattattttagaagtgcatattttggtgtttattaacgtttatgattgctttaatctgatatttgttacaatttttgaaaatacaaaataagaatttctataaaaacagcatatttattggcaaatagttttcctaaccgctataagatatatacacatttatatactagtacgtatatctgcaagaaaatgacgacaaaagtggaaacaaaatattttgctttttaaaaatgtacatgtttgtggcttaaatcattcaatatctataatactaccacaaaaattatgtttcttaaacgcaaaacaaccttgattgaacattcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|20 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccataaggttgttggctcgtgaaaatttaagttattagattttATAATGCATAAG-----AAATTGATC-TT---ACCA----A---ATG-A-----AC--CAT---ATTA--AGTTTAAAA-----TT-GATAACGCATAT---GTTAATCT-TTG----A--AAAACTG----T---AC--T---G-T-G-A-----A---GTGTT----T---T-A-AA-----A------T---A---C-A--TT----A-----C-T--C-------------------------------------------------G---TT-AT-------AC-TCCATCCATTC--T-TTC--ATAT-G---T-T-TC--CGTAACA--AAACCACA-TACA---CATA----T---A-A-----C-TT--CG----AAT--TAT---A-ACACT-TTTT---ATATCTGAATTT-ACATCT-----AATCCTATGTGAGTTCTT-CAAAATTTAT--A-AATA-AGATTTTA-GCT-------TTGTTTGCATTTC---AAAGAAATA------TTT-T--CAAAtcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|21 : GC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGTGACATTCTTAAAATGAAA------CTA--ATTAGA----A--TAG-TT-TT-A-ATT---TA-ATT-----AAA-AAAGC--A-TATG-C------ATC-ATC-------ATCT---ACAC-TA-ACA-AA--T--GATC-A-CGAA-AAA-GGTATATTGTCCGTTGCCTTGCTTG---CTTTAGTGTTGTTTAAT-TCTTAAGTTGATGCTTACATC-AAATGCAATATTGT--A--TTGC--TTTTGTTAAAATT-AGA--A---CAATATGACCAAA-TA--------T-GT-TA----AGTATATGTATG-----AAATTAATC-TT---A--T----A---A---A-----ATGACAA---AACAT-A-----AAA-----T
gi|22 : tgGAATGTAT--G-AAGC-AAATCATA-GGC-------TGC-----ATTTT---AAAGACATG------TTTGT--CAAATTAC-TTAAAT-A-GTGCATATGTT-A--GTGA--T-A--TT-----TAAA----A------A------AAT-G-T----T---T--AC---A--T--T----TGGTAACA---TCTGAAAATA---ATAA-AT--GTT--ATG--------TTTT----------------------AA-ACTAG----------TC---T----AAAT---CATA--GTAT-CACACA---CTTG---TA----------------------------------GAA----A-----------------------------------------------------------A---TAT--T--------------------------------------T---------A----------------------------------------------------------------T-----ACCCC-C-TAT-T---ATTCCTGGTCAGAA---------------------A----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-------------TA----A-AT-A-A-------A-A-A---TGA--A---------ATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTCCTATGTATCCATATCC---ATAAAACta
gi|23 : GCTGTTTCAT-TTTAAAGATGATACCTACATTAAAATCTA----TTT--A--TT----TTT---TAAAAAT-AAG--T-----TTA-----AGC-TA--------TCAT-TA---TGTCATATATATATATTCAAA-TGAAC-TA---A--A----A---C---GTGC--AT--TAT---AAAG--A-----AAA-----TA-GATAACATATTT---TTAAATCT-TTG----A--AAA--AA----T---AC--CATGG-A-A-A-CT--A---TTTTT----T---CTT-TT-----A------C---ACGTT-T--TT----G-----C-T--T---A------AGAA----AA-----------GA--AATTGTC---G---A---CT-AT-------AT-CCCAACAA--CA-T-ATT--GTAT-G--TT-T-TT--TTAAACG--AAAATTCA-TAAA---AA-A--------A-A-----A-a
gi|24 : A----A-AT-TT-TTTT---ATATATT-GTTT-C---------------AGTGTTAGCACTTTCAGAATTAA---A-AAGA-AAATAATA-GGT-------TGCCATGTATTTT---AAAGAAATA------TTTAT--AAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATATTTTAG--ATGT--C-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--ATA--A--TA-TTATATGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-A---ATT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AG-AATAG----------TC---T----AGTA---CATA--CTAA-CATACA---CTTG---CA-C-------------AAC-T-TTTC---------AAA----A-T-AATA---A-----------------A---------A-C---------------GAGA---TTT--T-----------------------t
gi|25 : taacC---T--TAAGAA----TGTTTCTG----GCTCAT--------CAAA------------GTA--ATTAGAT------TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---------ATTGT------ATTTATT-------AT----------------------------------------GGTAT-------GTTGCTGTGTTCA---TTTTTATTCTATTTAAT-TTATAAGATGACACCTACGTCAACATTGAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAAA--AGGGAT---CATTA-----ACA-TA--------TC-T---------------TATG-----AAACTGATC-TT---A--A----A---A---
gi|26 : ta--------------T---------A--T---------T-----------------G--------------T-TA------T-----CCCT-----ATCAC-C-TAT-TT--TTTCTAGGTAA-ATTAT--ATTGCTAAAAATG--GA----A--atgagca
gi|26 : aaatatg-TT----G-CT-A-A-------A-A-A---TGG--A---------ACGTTTTATTTTTT----A----ATTTGTTTAATGTTTCCATAGTC---ATACGATTGT--C------ATA-A----TTATTTC-T----GG---AAGAAACTACAACTTTT-ATTGAAGATcgttttattttttaatttgtttaatgtttccatagtcatacgattgtcataattatttctggaagaaactacaacttttattgaagatatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|27 : aaatatgtattgttatccctatcacctattttttctaggtaaattataT-----ACCCCAC-CAT-T---C--CTTGGTATGAATAC--ACTGCAAAGATTT--GA----A--A-A-A--A-ATCTAAACAAAT----G-------------G-----A-----T-T-T-TGTTATGGA-TT-A-C-------A-G-A---TGG--A--------CACG-TTTATGGTTT----A------------AGCGTATTCACAT-G---ATAAGACTTCAAT--AAA-ATA-A----TGGTTTC-T----AA---Aatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|28 : tgccgcgttaaagtGTTCA-G--TGAGT-ATTCA-GC---TCTTATGGACAGATGTT---G----GCTCGT--------AAAAAAAAAA------AAA--AATA-AT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---ATGA-TATT-T------GTT-ATT-------ATTT---GAGA-TG-A-T-GT--T--GATC-A-TGAA-ATAAG-TAT-------GTTACCATGCTTT---TTATCCTGCTATTCAAT-ATATAAGATGGTACCTATGTCAAAATCTAACATcattatgattaaaattcatgaacataaaaatctg
gi|29 : ----T---G-A-----A-GTA-T-----GTT--TA----C-AC-TT-TCTG---A-AGTATAG----CC-T-------GGTCCAATGTTAACACTTTCAGAATGTAT--A-AAAA-AA--CATT-GGC-------TGTCCTGCATTTT---AGAGAAATA------TTTGT--------ACTTTAAAT-A-ATGCATATGTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-CA----A------A------ACT-A-T----T---T--AT---A--T--C----TGATAATA---TCAGAATATA---AT
gi|3 : ttaatgttaacactatt---T--TCAGGA----TGTT---G----ACTCAT--------CAAAAC-AAC------GTA--ATTA-AG---A--CTA-TT-TC-A-ATT---CA-GTT-----AAA-AAA-C--A-TATG-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGACTG-A----T--T--G------CGAA-AAAA----T-------GT-GCCGTGCTCG---TTTTTGAGTTATTTCAA-TTATAAGAT
gi|3 : TTTT--GAGTTA---TTTCAATTATA---AGA--T---CATTA-----AGA-TA--------CAAT-TC---TATTATATACATG-----AAAGTGAAC-TTT--A--AT---A---A---GT----CT--CAT---AATC--A-----AAA-----TG-CATAGCAACTAT---TTTTATCT-TTG----A--AAAA-TAAAAAC---AC--T---G-A-A-A-CT--G---AAGTT----TTA-C-TCTG-----C------T---A---T-G--TTTTGTG-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TC---A---G---CT-CT-------AC-CC-ACCTA--C--T-CTT-----T-A--AG-T-AT--TTTAACATTAAAACTTT-TAAA---AA-AATA-T---A-A-----A-TT--TGGAT-ATT--CA----G-AC-TT-TTTT---ATAATTAAGTTT-CC-TAT-----GGTTGAATGTTA--------------TAT--A-AAGG-GTATCATA-GGT-------TGACGTGCATTTT---AAAGTAATA------TTTGT--CAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATAAACT-G--ATGT--T-G--TT-----T-TA----A------A------AGT-G-T----T---T--AT---AACTA-T------ATGATA---TT---AAATA------A-GT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------GTA--AA-ATTAG----------TA---T----AATA----ATA--CTAT-CATACA---CTTG---GA-A-------------AAC-T-TTTT---------GAA----ATA-TAA----A-----------------A---------A-C---------------AAGAATTTAT--TATAAAAATATTTTTTTATCCCATC--------------T---------A--C---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CTCT-----ACCCC-T-TA--T---TTTCATGGTAATAAAAT--GATGCCATGAGTT--AA----A--A-A-AACA-AT--------AT----C-------------GAAACAA-----T-TGT-TATG----G-TC-A-AC------A-C-A---TGG--A--------CATG-TGTGTGGTTT----A----AAT-------TGTATCTATATCC---ATAAGACTG--ACTGAAAGATA-----------TTTT----AATTTAAGATA-TA-AAATTCACACTTATGAcattaagatacaattctattatatacatgaaagtgaactttaataagtctcataatcaaaatgcatagcaactatttttatctttgaaaaataaaaacactgaaactgaagttttactctgctatgttttgtgctttagaaaaaaaaaatcagctctacccacctactctttaagtattttaacattaaaacttttaaaaaaatataaatttggatattcagacttttttataattaagtttcctatggttgaatgttatataaagggtatcataggttgacgtgcattttaaagtaatatttgtcaaattatcttaaatagtgcataaactgatgttgttttaaaagtgtttataactatatgatattaaataagtgttatgctttagtgtaaaattagtataataatactatcatacacttggaaaactttttgaaatataaaaacaagaatttattataaaaatatttttttatcccatctacaattacctctaccccttattttcatggtaataaaatgatgccatgagttaaaaaaacaatatcgaaacaattgttatggtcaacacatggacatgtgtgtggtttaaattgtatctatatccataagactgactgaaagatattttaatttaagatataaaattcacacttatgaaaatct
gi|30 : ttcaggatgttgactcatcaaaacaacgtaattaagactatttcaattcagttaaaaaacatatgtattattatctaagactgattgcgaaaaaatgtgccgtgctcgtATTTT---AAAGAA-CA------TCTGT--CAAATTA----AAAT-A-TTGCATGTTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-GA----A------A------AAC-A-T----T---T--AC---A--T--T----TGATAAAA---TCAGAAAATG---AATA-AG--GTT--AAG--------TTTTGGT--------------TT----A-AGTAG----------TC---T----AATACTTCTTAGTCTAT-TACGTATTTCTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC-----------A----A-A-AAG----A-----------------A---------A-A---------------AAGA---aaatct
gi|31 : --TA----C-AC-TT-TTTT---GTATTTAAGTTT-C--TTT-----GATCCCATAAATGAACTTTCAAAATTCAT--ACAATATAAATTATATGCT-------TG-AGTACATTTT---TAATTAATA--------------AA--TACCCTAAAT-GTGTGCATAGTTT-T--GTGT--T-A--Ta
gi|32 : tggggtaaaTGGCTT----A----CATTGTTCAGTATATCAGTATCC---ACAAAACTGTAAC--AAAGATA-A----TAGTTTCTT----AA---AATAAA-TATA---TCA-ACTGAAGATaacacatagtctgatacacactgattgtaca
gi|33 : ttttgaaaatataagtacatc--A-----AAA-----TG-GATAACATATAT---GTTAATCT-CTGGAACA--AAA--TA----C---AC--------A-----------------T----T---C-T--------A------T---C---T-A--TT----G-----T-C--T------------------AT-----------GC--A----TC---A---C---TC-AC-------A---CCA-CCA--C--TGTTT--G-AT----AT-G-TT--TTTGAAA--CTATCACA-CACA---AA-AATTTT---A-ACT---G-GA--T-----AAT--TG----C-AC-TT-TTTcatagtaaaacattacaaaacgtgaaatctgaaattttcttagccaatatccttta
gi|34 : GGAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-AAT-C--A-TATT-TA-----ATA-ATT-------ATCC---TAGA-TA-A-A-AT--T--GA-T-A-ATAA-AAAAGGTAT-------GTTACTA-GCTCT---TTTTTGTGCTTTTTAAT-TTTTAAAATGTCACCTACGACAAActa
gi|35 : -TT---A--A----A---ATGAGC----AT--CAC---AATA--A-----AAA-----TG-GCCAAGAAATAT---TTTAATAT-TTGA---A--AAA--TG----T---AC--T---C-AGA-A-CT--AG--GTATA----T---C-TGTA-----A------T---G---T-A--TT----------C-TTGT---T------TGAAGTTGAA-----------AA--A----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-TCTATCTA--C--G-TTT--
gi|36 : tt---T--TAAGGA----TCTT---G----ACTTAT---------ACAATGAAATACAGTGTA--ATTAAAA---A--ATT-TT-TT-A-ATT---CA-GTTGCATCATA-A---T--A-TATT-A------ATT-ATT-------ATTT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GATC-A-TG-A-AAAAGGTAA-------GTTGCCATGCTTG---TTTTTGTt
gi|37 : A----A--A-A-A--A-AT--------GT----T-------------G-----AAACATC-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------G-ATA---TGG--A--------CAT--TTT-TGGCTT----A----AATTGTTCAATGTTTTCATATTC---ATGAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TCACTTCTTATTAAA---AAGAAA-TACAACTT
gi|38 : atgcTAT--A-AAGA-ATTTCAAA-GGT-------TAC-----ATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTATAT-T-GTACATAGTTT-G--GCGT--T-A--AT-----T-TT----A------A------AAT-G-T----T---G--AT---A--TGTT----TGATAAAA---TCTGGAAA--------A-AA--GTT--ATG--------T
gi|39 : tgATA-GGT-------TGCCTTGCATTTT---AAAAAAAAA------AT-GT--CCATTTACGTTAAAA-A-GTTAATATTTT-------T--T-A--TT-----T-TACTTTA------A------AATAG-T----T---T--AT---A--T--T----TGATGGCA---TCAGAAAATA---AGTA-AT--ATT--ATG--------TT
gi|4 : tC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAACATGAAA------TAA--ATTAGAT-------TT-TT-TT-A-ATTATTCA-GTT-----AAA-A---ATAA-TATG-T------ATT-ATTTATAAATATCT---AAGA-TG-A-A-AT-----GA-T-AACGAG-AAA-GCTAT-------GTTGCCATGATCG---GTTTTGTGCGATTTAAT-TTTAAAGTTGATACATACG---ACATC--ATTTTTTTAG--TTTATTTTTTTATGAAAAT--GG--TGACCATGA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTAAACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--ATAATG---A---GC----AT--CAT---AACA--A-----AAA-----TT-AATAACTAAAA------TAATCT-TTT---------T--TA----T---AC--T----------------------TT----T-----------------------------T-C--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--T----TC---ATC-G---TC-AC-------AT-CCTATGCA--A--T-TTT---TAT----AT-G-TT--------------ATACA-T---------G----T---T-G-----G-GA--T-----AAT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGCTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTATAAA-AAAA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------AATGT--CAAATAACATTAAATCA-GAATATA-ATT-A--ATGT--T-ATGTT-----T-TA----GTT----A------AAT-A-TAGTCT---T--AT---A--TA-T----T
gi|4 : aCATAGGTT-GCCGTGC----A--TT-----T-TA----A------AGAAATAAAT-G-T----CAAAT--A----A--CA-T----TAA----A---TCAGAATATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------T-A--AA-TATAG----------TC---T----TATA---TATT--CTAT-TGTACA---CTTG---TA-T-------------ATC-T-TTTT---------CAA----A-T-GAT----A-----------------A---------A-----------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TCTTTTGAGCA--T---------ATATTTATTCAGCTAAGAG--------------T-TA------C-----CCGT-----AACCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAATAAAAT--GATG--------------------A-A-A--A-CT--------AT------------------------------T-T-TAT-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATA-TTTGTGGCTT----A----AACCG------------ATA--------AAAAC----------AGAAA-A----CGATTTCTT----AA---AAGAAA-TAAAACTTCA-ATctattgtacacttgtatatctttttcaaatgataaaaagattttctcttttgagcatatatttattcagctaagagttacccgtaacccctatttttcttggtaataaaatgatgaaaactattttatttgttaaaaaatgaacatatttgtggcttaaaccgataaaaacagaaaacgatttcttaaaagaaataaaacttcaatccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|40 : acttaaggatgttggctcgtcaacatgaaataaattagatttttttaattattcagttaaaaataatatgtattatttataaatatctaagatgaaatgataacgagaaagctatgttgccatgatcggttttgtgcgatttaattttaaagttgatacatacgacatcatttttttagtttatttttttatgaaaatggtgaccatgaagatatcattatattaaacatatgaaactgaacttaataatgagcatcataacaaaaattaataactaaaataatcttttttatactttttcttgctttagaaaaaattcatcgtcacatcctatgcaatttttatatgttatacatgttgggataattagacttttttatattttagcttcctttggtccaatgtaagcactttcagaatttataaaaaaaaaat-T-T-C-TT----G----A-A-------A-A-C---TGG--G--------CATT-TCGGTGACTC----A----AATTGTTCCACGAATCAATATCCATTATAAAACTTCATC--AAAGATA-A----GTGTTTCCT----AA---GAccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|41 : --TTT-TT-TT-A-ATT---CA-ATT-----AAA-A---CCCA-CATT-T------GTT-TTT-------ATCT---AAGA-TG-A-C-AT--T--AA-T-A-AAGA-AAAAGGTAT-------GCTGtgtttaatgtat
gi|5 : ---T--TAAAGA----TG----------GCTCGT---------AAAATGAAA------ATACAAATAGATCTAACTTTT-TT-TT-GTATT---AT-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------TCT-ATT-------ATCTTAAAAGA-AA-A-AGATAAT--GA-CTG-CGAA-AA--GATAT-------GATGCCGTGCTTG---TTTTAGTACTGTTTAAT-TTTTAA-ATGATACCTACGT-ACAATTTTATATCTT--G---TAG----TTG--AAAATT-AGaggtcactaatgca
gi|5 : -----AT--GAT---AATA--A-----AAT-----TG-GATAGCACGAAT---GCTAATTT-TTA----A--AAAAATA----C---AC--A---G-A-GCA-CT--A---A-GTT----TTCCC-T-TATAATTA------T---A---T-TC-TT----A-----CAT--TCAGT------AGAA----AA-----------AA--T----TCTTTG---G---CC-AT-------AC-CT-ACCAA--C--T-TTT---TAT-GGTAT-T-TT--TGTAACT--GAAACATA-TA-A---AG-A----TTTTA-ATTG--G-GA--T-----AAT--TAA---G-AT-TC-CTTT----TATTTCAGTAT-CC-TTT-----GGTCCTGTGAAAGCACTTTCAAAAC---------------GTCATA-GGT-------TTTCGGTCATTTT---AAAGAATTA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-TTCCATATTTT-G--------T-G--TT-----T-CA----ACTG---ATGATTCAAT-GCT----T---C--AA---C--TC-T----T--TGACA---T-A------A---ATTA-AT--GTT--AAG--------TTTTAGT--------------TTA--GA-AATAG----------TC---C----AATA---TA-----TAT-CATATA---CTTA---TA-CATATATTATTCATAAC-T-GTTC---------GAAAT--A-A-AACAACAA-----------------A---------A-CTTTCTCCTTTGAAAAAAAA---TAT--T-----------------------T--------------T---------A--T------------------------------------------T-TA------CTTT--TCCG-----ACTCT-C-AAT-T---TTAATTGGTTATATAATAAGATG-CAAAAGTTCAGA----A--A-C-A--A-AA--------AT----A-------------G-----A-----T---------------TT-A-A-------A-A-AAATTGG--AAAAAATATTATA-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTC-ATGTATCCATATTC---Atatgataataaaattggatagcacgaatgctaatttttaaaaaaatacacagagcactaagttttcccttataattatattcttacattcagtagaaaaaattctttggccatacctaccaactttttatggtatttttgtaactgaaacatataaagattttaattgggataattaagattccttttatttcagtatcctttggtcctgtgaaagcactttcaaaacgtcataggttttcggtcattttaaagaattatttgtcaaattaccttaaatattccatattttgtgtttcaactgatgattcaatgcttcaactctttgacataaattaatgttaagttttagtttagaaatagtccaatatatatcatatacttatacatatattattcataactgttcgaaataaaacaacaaaactttctcctttgaaaaaaaatattttatttacttttccgactctcaattttaattggttatataataagatgcaaaagttcagaaacaaaaatagatttaaaaaaattggaaaaaatattatatttgtggcttaaattgttcatgtatccatattcagagg
gi|6 : ttaaagatggctcgtaaaatgaaaatacaaatagatctaacttttttttgtattatgttaaaacatattttctattatcttaaaagaaaaagataatgactgcgaaaagatatgatgccgtgcttgttttagtactgtttaatttttaaatgatacctacgtacaattttatatcttgtagttgaaaattagtTTGCCATGCTCG---TTTTTATGCTTTTTAAT-CTTTAAGATAATACC------AAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTCATAAAATG-AGA--T---AATTA-----AGATTA--------TC--------TATTGCACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---A-----Agagg
gi|6 : --A-----AAA-----TGAGATAATTAAGAT---T---ATCTATTG----C--ACA--TA------------T---G-A-A-A-CTG-A---A------------C-T-TA-----AAAAAAAT---A---T-G--TTT---G-----T-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAACATC---G---G---CA-AT-------ACACCTA-CCA--C--T-TTT---TATTACTATAT-TT--TTTCACA--AAAACACAACACATAAAA-A----T---A-G-----ATGT--TTGAATAGT--TA----G-AT-GA-TTTT---ATATTTTAGTTAACC-TTT-----GGTCCAATATAAGCATTTTCAGAATTTAT--T-AAGA-AAGTCACA-GGC-------TGTCGT---TTTTATAAAAGTAATA------TTTGT--CGAATGACCTTAAAC-A-GTGCATATTTA-A--GTGT--T----T--------------A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGAAAACA---T---AAA---------A-AT--GTT--ACG--------TTTAAGT--------------TTT--AA-AA-AA----------CG---T----AATG---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---AA-C-------------AAC-T-TTTTTTTTGAAAAGAA----A-A-AAC----A-----------------ATATTTTATCG-CTTGGA----------AAAA---TAT--TTATATCT----------------C--------------T---------A--A---------A-----------------A--------------TGTA------C-----TCGT-----ACACC-C-TAT-G---TTTCTTGGT------AT--CACGTCAAAAGAT--GA----A--C-A-A--A-A---------AT----C-------------GA----A-----TGT-T-T-TT----G-TT-A-AATGATAGA-A-A---AAG--A--------TATA-TTTGTGGCTT----A----AAATGTTCAATGTATTCATAGCC---ATAAGACTGCAGC--AAGGACA-A----TAGTTTaatatgtttgttttagaaaaaaaaacatcggcaatacacctaccactttttattactatattttttcacaaaaacacaacacataaaaatagatgtttgaatagttagatgattttatattttagttaacctttggtccaatataagcattttcagaatttattaagaaagtcacaggctgtcgtttttataaaagtaatatttgtcgaatgaccttaaacagtgcatatttaagtgtttaaaatgtttatatttgaaaacataaaaatgttacgtttaagttttaaaaaacgtaatgcatactatcatacacttgaacaactttttttttgaaaagaaaaaacaatattttatcgcttggaaaaatatttatatctctaaaatgtactcgtacaccctatgtttcttggtatcacgtcaaaagatgaacaaaaatcgaatgtttttgttaaatgatagaaaaagatatatttgtggcttaaaatgttcaatgtattcatagccataagactgcagcaaggacaatagttt
gi|7 : ttgccatgctcgtttttatgctttttaatctttaagataataccaaaatctaatattttgttaattttcat----A--AAA--CA----CGA-AC--C---G-A-A-A-CT--TTGTATGTT----C---G-T--------A------C---A---T-GAATT----G-----T-----------------AC----AT-----------GA--A----TT---T---G---CT-TT-------AC-CC-ATC-A--G--T-TTT--TTAT-A-----T-TT--TTTAACA--AAAG-----TACA---AA-A----T---A-ACTGAGA-GG--T-----AAT--TA----C-AC-TG-TTTT---GTGCTTTAGTTT-CC-TTT-----CGTCCTATGTAAGCCCTTTCATGATTTTT--A-CCGA-AAAGCATG-TGT-------TTGTGTGCATTTT---AAA---------------GT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCAAACTTT-G--TTAT--A-A--TT-----A-TAT---ATATATTA------AAT-A-T----T---T--AT---A--TG------TGGTAACA---TCAGAAAATA---ATTG-ATC-GTT---TG--------TTTTAGG--------------TAA--AACAATAG----------TT---A----AATA---TATA--CTAC-CAAATA---TTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-AGAAC--------------------------------A-C---------------AAAA---TTTTAT-----------------------C--------------TTTGAA----A--T---------AATGTCCACTTAGC----A--------------T-TA------C-----CTCC-----ATCCC-C-TAT-T---T---TTGGCAAGGTAAT--GATGTCAAAGGCT--GA----A--C-ATA--A-AT--------AT----CAAATAAAAAAGGAA-----A-----T-T-T-G-TT----T-TT---A-------A-A-G---TGG--A--------CATT-ATTGTGGCTT----AAAATAATGGTTTGAGGTATACATATAC---ATAACACTGC-AT--AATACTATA----TAGTTTCGT----AA---AATAAA-TGCTACTTCT-ATTTAAGAT
gi|8 : ---T--TAAAGA----TGTT---GCCTGGCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TCT-TT-TT-A-ATT---CA-G---------------C--A-TATT-T------ATT-TTT-------TGTT---AAGA-TT-A-A-AT--T--GATC-A-TGAA-AAGAATT-T-------GTTACCGTGTTCGTTTTTTTTTTGCCATTTATTATTTTAA-ATGATATCCACTTCAAAGTCTAATATTTT--G--TAAA--TTTTCATAAATTTGAGA--T---CGTTA-----AAG-GG--------TC--------TGTTATACAAATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----ATTGA---GC----AT--CAT---AAT---A-----AAA-----TG-AATAGGAAATAT---TTTAATAT-TTGGC--A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-ACATTT--ATATATATT----TG--C-T-TT-----A------G---A-----G--TT----G-----T-T--T---T------A-AA----AA-----------AA--A----TA---A---C---CC-CT-------AC-CCCGTattaaattcatcaatatgaatagatgaaacttttctagcgaacatc
gi|8 : T---A--AA-T----TGA--GCA---TCATAATAAA---ATGA-ATAGGAA--ATA--------TTTTAATAT------------TTGGCAA-AATAC----------AC---T----GA-A---CAT---TTAT--ATATA---TTTGCTTTA-G-------------AGT-T-GTTT---------TAA----A-A-AA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-----------------A--------------T-AA------C-----CCCT-----ACCCC-G-TAT-G---TTTCTTGGCAGGAAAAT--GATGCCAAAATTA--GA----T--A-G-A--A-AT--------A---------------------------------------------A-TA-A-A-------A-A-A---TGA--A--------CACA-TTTATGGCTT----A----AATCTTTGAATGTATCCGTGTTC---ATAATACTGCAAT--AAAGATA-A----TAATTTCTT----AA---AAGAAA-CACGATTTTA-ATTTAAGATatgtttcttggcaggaaaatgatgccaaaattagatagaaataataaaaaatgaacacatttatggcttaaatctttgaatgtatccgtgttcataatactgcaataaagataataatttcttaaaagaaacacgattttaatttaagatataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : ttaaagatgttgcctggctcgtcaaaatgaaagtaattagatatctttttaattcagcatatttattttttgttaagattaaattgatcatgaaaagaatttgttaccgtgttcgttttttttttgccatttattattttaaatgatatccacttcaaagtctaatattttgtaaattttcataaatttgagatcgttaaagggtctgttatacaaatgaaactgaact-GACTGAGT-ATTTA------T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CATAATTAA-------GTA--ATAAGAT---C--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-ATT-----AAATAT--C--A-TTTT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--TTAGA---A-CG-A-AAAATGTAT-------ATTAGGGTACTTG---TATTTGTGCTATTTAAT-GTTTAGGATGATGCTTACG--AACTTATATTGTTTA--G--TAAA--TTTTGATAACATG-TGG--T---CCTTG-----AAA-TA--------TCAA-TG---TATTATTCATAAG-----AAACTCAAC-TT---A--ATAATG---A---GT----AT--TAT---AACA--A-----AAA-----TT-GATCACTTATAT---TTTAATAT-TTG----T--AGA--CA----C---ACCTT---GAA-A-A-CT------ATGTT----T---T-T-Tataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : gtt--------------T-TA------A-----TCCT-----ACTCT---TATGT---TTTCTTAGTAAGAAAAT--GATGTCAAACATT--TA----A--A-A-T--ATAT--------AT------------------------A-----T-T-T-T-T-----G-TT-ATA-------A-A-C---TCG--A--------CGTG-TTTCTGTCTT----T----AAACATTCATTGTACCGAAATCC---ATAATACTG--------------------------TT----AA---AAGAAA-CACAACTTCA-GTTTAAGActcttatatcacgttaatcctactcttatgttttcttagtaagaaaatgatgtcaaacatttaaaatatatatatttttgttataaactcgacgtgtttctgtctttaaacattcattgtaccgaaatccataatactgttaaaagaaacacaacttcagtttaagacattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa
blockSeqs : GAC A AAAAAA CT CAGA GCCTG GACATTCTT TACAGT CA CTAACT . A G T ATT T GCATC T AAGC G G GTGCTA C TATAAAT TAA C A CA AAT TAAC A . G ATTGTCC T TTT A TC A TA AG TT CTG TGACC TGACC T T AGTTTTTTTTATTATTC TATTC . ACA CC AAATGAGC GA CAA GT GTTTA ACCCC A C ATG C A GAACA AC AAAAC CATG A AATTAAAATTGGTATCTAACATGTCGTTAATCTTTGAAAAAGCTGAACTGATAAGCATTAACTAT A C A TAT G TATTACTATAT . TT A CATAA T ATATAAATTTGGAT A AG ATAAG A . TCA A CA AATTT A AA C T T TTGTATG TGCA ATA CATGTA TA A T C T T GCCG AA T TG AACGT A CTTT CTGATGATTC A C AGTC AAA TA CTG AC GT TATA ATT CAA T AG CA ATATTATT ATAAAGATATCATA GGC C AAAAAATCCCTCTTTTG CTTC GT A TTT CTT CATATATTATTCAT A C TTTTTGAAAA TGAC TA AAAACAAGAATTTATTATAAAAATATTTTTTTATCCCATCTACAA G AAGCTGT GAGAT TT G ATG AA C CA CTGA TT C T AC T CTAAACAAATGGATTTTGTTATGGATT T ATGATAG G T AAT AT AAAAATAT T GAAA AAAT C T ATT A TG A T TAGCTA ATTA TTT C C
blockSeqs : TT A GC . . TCTG T . . T . . . . . . . . AAC . . A T . . . . AG TTA TCAC A . A . A T . TC G . . . TTG GATC . G . TTATTA . . T . TAATGAGC . . T TAC . . A . C . AAA AA ATTA CTT . GCACTAAGTTTTCCCTTATAATTATATTCTTACATTCAGTAGAAAAAATTCTTTGGCCAT . C A TTC . TTGCATGTAT . . . CAC . ATTTTAACTGGAT G . GT . . . . C . A . . . . . ACAC . . . A A . . T AGA . . . . . T AGAAATA . . . . . A . A . . . . C . . AT A . TCCTAC C T . . . TC . . T AT AG TAAAAAGATTTTCTCTTTTGAGCATATATTTATTCAGCTAAGAG . CTGTTT . CA . T . C CA . . . . . . ATCAAATAAAAAAGGAAATTTGTTTTT . C . . . . . . . . A A . A . A . TT . . . .
blockSeqs : G . . . . G C . . T . . . . . . . . ATG . . . . . . . . A G TCAC A . A . T . . TC C . . . TG TC . A . TCATTA . . . . TAATGAGT . . . . . . A . A . ATA A CGA T . GAATCAAATTTTTACTCTTACATATACTTGTTTTAACAAATTCAAATTAAATAAAATA . C T CA . GTATATATT . . . AA . TTTTAATTGGGAT T . TA . . . . T . T . . . . . TGCA . . . C C . . T GA . . . . . . TATATTA . . . . . . . A . . . . . . . . A . TTTTA C . . . . CT . . C . A CATGATTTTTTCTCTTTTGAACAAATATTTATTCCGCTTAAAG . CTTT . TC . . . C . . . . . . . ATCGAAACAATTGTTATGGTC . . . . . . . . . . T A . A . A . CA . . . .
blockSeqs : . . A G . . A . . . . . . . . AAC . . . . . . . . A T TCAT A . A . G . . TT T . . . AT TA . G . CAATTC . . . . AATGAGC . . . . . . C . C . GCA . C T . GAACTAGGTATATCTGTAATGTATTCTTGTTTGAAGTTGAAAAATCATTGGCTAT . C C T . TATGGTATT . . . AA . TAGATGTTTGAAT A . AG . . . . C . T . . . . . CGCG . . . A C . . G GG . . . . . . TTA . . . . . . . A . . . . . . . . A . TCT A . . . . C . . T . A CAAAACAAGATTTTCTATTTTGAATAAAATATTTATTCCAC . C . AC . . . C . . . . . . . ATTGAAACATTTTTTTGTTA . . . . . . . . . . C G . A . G . TG . . . .
blockSeqs : . . G C . . T . . . . . . . . ATC . . . . . . . . T C TCAT A . A . A . . TC G . . . TT AC . C . TCATTA . . . . ATTGAGC . . . . . . T . C . AA . C T . AACTGAAGTTTTACTCTGCTATGTTTTGTGCTTTAGAAAAAAAAAATCAGCTCT . C T A . GATATCTA . . . CA . TAACTGAGAGGT T . T . . . . A . T . . . . . GTCA . . . T C . . T GA . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . A . CCC A . . . . C . . T . A CAATATTTTATCGCTTGGAAAAATATTTATATCTCTAAAA . C . C . . . T . . . . . . . CTAAAAAAAAGGTATGTTA . . . . . . . . . . C C . A . A . TT . . . .
blockSeqs : . . G A . . A . . . . . . . . ATA . . . . . . . . T T TAAC A . A . G . . TC T . . . AT TC . G . TCAATG . . . . ACGTGC . . . . . . A . C . A . C T . AACTAACGTTTTCTCTGACATATTATTGTTTTAGAAAAAAAAAATTAGCAAT . C T C . GTATAACT . . . AA . TATAAGTTTGG T . C . . . . A . A . . . . . TGTT . . . T T . . T TA . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . A . CTT T . . . . T . . T . A CACAAAATTTTATCTTTGAAATAATGTCCACTTAGCA . C . A . . . A . . . . . . . GTTGAAACATCTTTTTGTT . . . . . . . . . . C C . C . G . TG . . . .
blockSeqs : . . G C . . A . . . . . . . . CCC . . . . . . . . A T CTGC A . A . A . . AC T . . . AT TA . G . CATTC . . . . AATGA . . . . . . T . C . A . T T . AACTATTTTTTCTTTTACACGTTTTTGCTTAAGAAAAGAAATTGTCGACTAT . C T C . GTATGTTT . . . AA . TATATGTGAT A . G . . . . T . A . . . . . GCCA . . . T T . . T AT . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . A . TCT T . . . . C . . T . A CAACAAAACTTTCTCCTTTGAAAAAAAATATTTTAT . C . C . . . C . . . . . . . ATCGATTTATTTATTT . . . . . . . . . . T C . A . G . TA . . . .
blockSeqs : . . G C . . A . . . . . . . . TC . . . . . . . . A T TCAT G . A . A . . TC T . . . TT TC . G . TGTTA . . . . TAAGT . . . . . . A . A . A . T T . AACTGAACTTAAAAAAAATATGTTTGTTTTAGAAAAAAAAACATCGGCAAT . C T G . ATATGTT . . . CA . TATAATTT A . A . . . . C . T . . . . . GTCC . . . T C . . T GG . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . A . TCT C . . . . T . . C . A CTAAACAAGATTTCGTTGATGAAAACAATATATA . T . C . . . C . . . . . . . ATCGAATGTTTTTGTT . . . . . . . . . . T T . A . G . TC . . . .
blockSeqs : . . G C . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . A T CAT A . . . A . . T T . . . TG TC . A . TCT . . . . AATG . . . . . . A . C . A . C T . ACATTTATATATATTTGCTTTAGAGTTGTTTTAAAAAAAATAACCCCT . C A C . GATATG . . . CA . TAACTTCG A . C . . . . C . A . . . . . GACG . . . T T . . T AG . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . A . TAT C . . . . C . . A . A TATTTATTCCACTTAAAG . C . T . . . C . . . . . . . ATTTTATTTGTTA . . . . . . . . . . T C . A . G . CG . . . .
blockSeqs : . . G C . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . C T TAA A . . . G . . . T . . . TG T . A . TC . . . . AATG . . . . . . C . T . A . T T . ATATTATGTTTCTTATATATTTTTGCTTTAGAAATTATCGAATAT . T C C . TATATG . . . A . TGAAGTAT G . G . . . . C . A . . . . . GCCT . . . T C . . T GG . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . A . TCT T . . . . A . . C . T TATACACATTTATA . C . C . . . T . . . . . . . ATTTTGCTTTTT . . . . . . . . . . C C . A . G . GT . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A T TAA . . . . A . . . . . . . A . . . . TC . . . . AGG . . . . . . A . C . A . T A . AACTTTGTATGTTCGTACATGAATTGTACATGAATTTGCTTT . T T C . TTATAT . . . A . TTGGGAT A . C . . . . C . A . . . . . GCCG . . . T C . . A GA . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . A . TCT T . . . . C . . T . A TATCTATTTTAC . C . C . . . T . . . . . . . ATATTTTTGTT . . . . . . . . . . T T . A . G . TA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A T AC . . . . G . . . . . . . . . AAA . . . . . . A . A . C . C T . TTTTCTTGCTTTAGAAAAAATTCATCGTCAC . T T C . TAAGT . . . A . TAACTT . . C . . . . C . C . . . . . TTCG . . . T C . . T GG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . TCC C . . . . T . . C . T ATATTTA . C . C . . . C . . . . . . . ATCGATAAAT . . . . . . . . . . T C . A . A . TA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . AAA . . . . . . T . A . A . C C . AAACTTTGCTTTAGAAAAATCAGTGACTAT . C C A . TTAT . . . . . TAT . . G . . . . C . A . . . . . GTCG . . . T G . . G TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . CGT T . . . . C . . T . A AA . C . C . . . T . . . . . . . ACTTTTTA . . . . . . . . . . T T . . . G . TA . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C T . GAAGTGTTTTAAAATACATTACTCGTTAT . . T C . AAT . . . . G . . . . . . T . . . . . TGTG . . . A A . . G GG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA C . . . . C . . C . A . A . G . . . . . . . . . . . ATAGATTT . . . . . . . . . . G C . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . TTCTATCTATTGTCTATGCATCACTCAC . . T C . C . . . . . . A . . . . . GAG . . . T C . . T AA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . G . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . GGTA . . . . . . . . . . C A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T . . . . . GC . . . G C . . G AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . AATA . . . . . . . . . . C T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AC . . . T C . . T GT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : AC**** TCAC** AATGAGC*********** TATATATT******* ** TAACTGGAT******************* *** **
originalCons : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-A---C--A-TATT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GA-C-A-CGAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--A----A---A---G-----AT--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------C---A---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTT--GTAT-A--AT-T-TT--TTTAACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A-A-----A-GT--T-----ANT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--TA-T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
finalCons : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CA-GTT-----AAA-AAC----A-TATT-T------ATT-ATT-------ATCT---AAGA-TG-A-A-AT--T--GATCAC--GAA-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-TT---A--AAATGAGC-----------AT--CAT---AATA--A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------C---A---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA--C--T-TTTTATATATT-------TT--TTTAACA--AAAACACA-TACA---AA-ATAACTGGAT-------------------ANT--TA----G-AC-TT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-TTT-----GGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGT-------TGCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A------AAT-G-T----T---T--AT---A--T--T----TGATAACA---TCAGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CTAT-CATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------A-C---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--------------T-TA------C-----CCCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11 111111 111111111 111111 22222222222 11111 111 111111111111111111 1111111 11111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111 11111 3333333333333333333333333333 111111 11111111111 1111111 11111111111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 2222 0 33 999999 44 6666 77777777 555555555 0 888888 44 0 777777 2 2 2 2 555 44444444444 5 2 9999999 2 2 4 1 22222 2 22 9999999 1 777 2 0 33 2 44 44 44 2 222 8888888 88888 2 3 555555555555555555 77777 2 33 2 66 5 2 2 66666 66666 2 1 444 1 2 5555555 99 11111111 555555 2 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 5 3 3333 2 222222222222 7777777 33 2 5 11111 5 4444444444444444444444444444 6 222222 2 666 4 55555 2 0 22 2 2 0 2 77777777777 333 555555 22 1 2 2 2 55555 22 1 22 55555 2 6666 888888 2 2 2 4444 22 2222222 2 333 55 555555555 333 2 55 22 77777777 77777777777777 333 2 44444444444444444444 7777 55 2 444 444 666666666666666 0 2 2 1111111111 8888 333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55555 000 2 666 33 2 66 4444 33 2 2 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 8888888 2 2 333 22 77777777 2 4444 4444 4 3 333 1 33 2 2 666666 5555 444 3 4
lowQualScore : .... . .. ...... .. .... ........ ......... . ...... .. . ...... . . . . ... ........... . . ....... . . . . ..... . .. ....... . ... . . .. . .. .. .. . ... ....... ..... . . .................. ..... . .. . .. . . . ..... ..... . . ... . . ....... .. ........ ...... . . ....................................................................................................................................... . . . .... . ............ ....... .. . . ..... . ............................ . ...... . ... . ..... . . .. . . . . ........... ... ...... .. . . . . ..... .. . .. ..... . .... ...... . . . .... .. ....... . ... .. ......... ... . .. .. ........ .............. ... . .................... .... .. . ... ... ............... . . . .......... .... ... .................................................................................................................................................................................. ..... ... . ... .. . .. .... .. . . .. . ........................................................... . ....... . . ... .. ........ . .... .... . . ... . .. . . ...... .... ... . .
lowQualScore : 0000 2 22 000000 22 5555 00000000 222222222 8 888888 22 8 555555 7 7 7 9 000 11111111111 7 9 3333333 9 9 8 1 88888 9 44 3333333 6 999 9 1 22 5 66 66 22 1 333 1111111 33333 3 3 444444444444444444 11111 7 77 5 99 0 5 5 22222 22222 7 0 777 1 7 3333333 44 88888888 444444 5 4 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 3 8888 5 222222222222 8888888 77 1 3 33333 7 1111111111111111111111111111 2 222222 5 999 7 99999 4 8 99 1 1 8 0 33333333333 333 555555 66 8 0 0 2 22222 66 9 66 00000 0 2222 555555 0 0 0 2222 88 8888888 0 777 00 999999999 555 1 00 99 66666666 11111111111111 888 4 00000000000000000000 6666 66 4 111 111 444444444444444 6 2 2 4444444444 2222 222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 99999 111 4 555 22 6 55 7777 11 4 4 22 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 9999999 1 1 777 99 66666666 1 2222 2222 3 6 555 8 11 1 4 999999 3333 444 1 0
consensus : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTTAAA----A-A--C-A-TATTT-ATTATT-------ATCTAAGATG-A-AATTGATNACGA----A-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-T--T-A--A-AA-TGAGCATCATAATA-A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------CA---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA-C--TTTT-T---AT----A--TATTTT---TTT-AACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A--A----TT--G---G-A-TAATTA----G-ACTT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-----TTTGGTCCNATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGTT-------GCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A-AAT-G-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATAACAT-----C--AGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CT-ATCATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------AC---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--T----TA------C-----C-------------CCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
Reference ( family-851 ) : TCTCTTTAAGTTAA-GACTGAGT-ATTTAAGC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTTAAA----A-A--C-A-TATTT-ATTATT-------ATCTAAGATG-A-AATTGATCACGA----A-AAAAGGTAT-------GTTGCCGTGCTCG---TTTTTGTGCTATTTAAT-TTTTAAGATGATACCTACGTCAAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAANT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-T--T-A--A-AA-TGAGCATCATAATA-A-----AAA-----TG-GATAACANATAT---TTTAATCT-TTG----A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-CT--A---ATGTT----T---C-T-TA-----A------CA---T-N--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---G---CN-AT-------AC-CCCATCCA-C--TTTT-T---AT----A--TATTTT---TTT-AACA--AAAACACA-TACA---AA-A----T---A--A----CT--G---G-A-TANTTA----G-ACTT-TTTT---ATATTTTAGTTT-CC-----TTTGGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTAT--A-AAGA-AAATCATA-GGTT-------GCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCATATTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A-AAT-G-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATAACAT-----C--AGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-AATAG----------TC---T----AATA---CATA--CT-ATCATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-AAC----A-----------------A---------AC---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------A-----------------A--T----TA------C-----C-------------CCT-----ACCCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAT--GATGCCAAAAGTT--GA----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-----T-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTATCCATATCC---ATAAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TNGTTTCTT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAAGAT
gi|1 : TCTCTTTAAATTAAAGACTGATTCATTTGAGT---T--TAAGGA----TATT---T----GTTCGT--------CAAAATGAAA------GTC--ATTATGT---A--TTTATT-TT-A-ATT---AAGGTAAA----A----C-G-TATCT-ATTAT--------ATCTAAGATG-G-AATTAACT--GA----GCAAAAGGTAT-------GTTTCCATGTTCG---TTTTCATTTTATTTTAT-TTTTAACATGATACCTACATCAACATCTGATATGCT--G--TTAA--TGTTGATAAAAAT-AGG--T---CATTA-----AGA-TA--------CCAT-TA---TATTATACATTCA-----ACACTGAACAC--T-A--G-AA------ATCGTAACA-G-----GAA-----TG-GATAACACATAT---TCTTATCT-TTA----A--AAA--TA----C---GT--T---G-A-A-ATCT--A---ATATT----T---C-TATA-----A------CAAAAT-A--TT----A-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--A----TC---A---C---CA-AT-------AC-CTCATCC--C--CTTT-G---GT----A--TAATTTCTGTTT-AACC--TGAACTCATTACA---AA-A----T---A--A--------A---G-T-TACTTA----G-ACTTATTTTA--ATATTTTAGTTT-CC-----TTATGTCCAGTGTTAGCACTTTCA-AATGTAT--A-AAGA-AAATTATA-GGCT-------GCTGTGCATTGT---AAAGAAATA------TT--T--TAATTTTTTTTAAAT-A-GTTCATTATAT-G--GTGT--T-A--TT-----T-TA----A------A-AAT-G-T----T--T-------ATATAT---TG--ATAACAT-----C--AGGAAATA---ACTA-GA--GTT---TG--------TTTTAGT--------------TTA--AA-ATTAG----------TC---T----AATT---CATA--CT-AACATACA---CTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-T-AAC----G-----------------A---------AC---------------AAGA---TAT--T-----------------------C--------------T---------A--T---------G-----------------A--T----TA------C-----T-------------CAT-----ACCCC-G-TAT-T---TTTCGCGGTAAGTAAAT--GATGCCAAAAGTT--GG----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----A-----T-T-T-T-TTG---G-TT-A-A-------A-A-A---TGG--A--------AATG-TTTGTGGCGA----T----AATCGTTAAATTGATCCATATTA---ATAAATCTGCAAT--AAATGTT-A----TGGTTTTTT----AG---AAGAGA-TACAACTTTA-ATTTAAGAT
gi|10 : ---AT----T--TATCTC---GTT-AACC--AAAAAGCA-TGAA---AA-A----T---A--T----AT--GT--G-A-TAATTA----T-ACTT-TGTT---ATATTTTAGTTT-CC-----TTTGGTTCATTGTAAGCACTTTCAGAATT-------------AAT--------------------TGCACTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATAACTATAAAT-A-GTGCATATGTT-G--ATAC--T-G--TT-----T-TA----A------A-AAT-A-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATAACAT-----C--ACAAAATA---ATTA-AT--GTA--ATG--------TTTCAGT--------------TTA--AA-AATAT----------TC---T----AAAA---CCTG--CT-ATTATACA---CATG---TA-C-------------AACAT-TTTT---------AAATGACA-A-AAC----ATGATTTTTTCTCTTTTGA---------AC---------------AA-A---TAT--T--------------------------------------T---------A--TTCCGCTTAAA-----------------G--T----TA------C-----C-------------CTT-----ACCCCTT-TTT-T---TTTCTTGGTAAGAAAAC--GATGCCAAAAGTT--AA----A--A-A-A--A-AT--------CTAAAAA-------------A-----A-----A-G-G-T-AT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCGTTCAATGTACCGACATTC---ATATGACTGTAAC--AAA
gi|10 : ---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------TAacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaactaacgagccaacatccttaacaa
gi|11 : atttatctcgttaaccaaaaagcatgaaaaatatatgtgataattatactttgttatattttagtttcctttggttcattgtaagcactttcagaattaattgcactttaaagaaatatttgtcaaataactataaatagtgcatatgttgatactgttttaaaaatatttatatttgataacatcacaaaataattaatgtaatgtttcagtttaaaaatattctaaaacctgctattatacacatgtacaacatttttaaatgacaaaacatgattttttctcttttgaacaaatatttattccgcttaaagttacccttacccctttttttttcttggtaagaaaacgatgccaaaagttaaaaaaaatctaaaaaaaaggtatgttaaaaaatgaacatgtttgtggcttaaatcgttcaatgtaccgacattcatatgactgtaacaaaacatggttaagatatgaaatctgttgtaatgaaaatctaaaaac----AA-----------AA--T----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-CCCAACCA-T--TTTT-T------------TATTTT---GTC--ACA--AAACCACA-TAcaa
gi|11 : AATGTAAGCATTTTCGGAATTCAT--A-AAGG-AAATAACA-GATT-------TGCATGCATTTT---AAAGAACTC------TTT-T--CAAATAACATGAAAC-G-GTGCA----------------T-A--TT-----T-TA----A------A-CGT-GTT----T--T-------ATAT-T---TG--AT---AT-----C--AGAAAATA---ATCA-AT--GTT--AAG----------CTAGT--------------TTA--AA-AAAAG----------CC---C----AATA---CATC--CTAAACATTCT---ATTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC---------GAA----A-A-GACA---A-----------------A---------AC---------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------T---------A--TTTTG-----A-----------------A--TAAAATATTTATTC-----CACTTAAAGCTGTCCCT-----ATTCC-C-TAT-T---TTTCTAGATGGGAAAAT--GATGCCAAAAGCT--GA----A--A-A-A--A-----------AT----C-------------G-----A-----T-T-TAT-TT----ATTT-C-G-------A-A-T---TAA--A--------CATG-TTTATGGTTT----A----AACATTTCAATGCATCGATATAC---ATAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----TTATTT-TT----AA---AAGAAA-TACAACTTCA-ATTTAaatgtaagcattttcggaattcataaaggaaataacagatttgcatgcattttaaagaactcttttcaaataacatgaaacggtgcatattttaaacgtgttttatatttgatatcagaaaataatcaatgttaagctagtttaaaaaaagcccaatacatcctaaacattctattgtacaacttttcgaaaagacaaaacaagattttctattttgaataaaatatttattccacttaaagctgtccctattccctatttttctagatgggaaaatgatgccaaaagctgaaaaaaatcgatttatttatttcgaattaaacatgtttatggtttaaacatttcaatgcatcgatatacataagactgcaacaaaaataattatttttaaaagaaatacaacttcaatttatactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|12 : aaaattcattggctataccccaaccatttttttattttgtcacaaaaccacataTTT---ATATGTTAGTTT-CT-----TTTGTTCCTATGTAAGTACTTTCAGAATTTAT--G-AAGA-AAATGATA-AGTTTGTATGTACACTGTATTTT---AAAAACATA------TTTGT--GAAAACACCT----------ACATATTTT-G--GTGC--T-A--TT-----T-TT----A------A-AAT-G-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATAACAT-----T--AGAAAATA---ATTA-AT--GTT--ATAATATTATTTTTTAG---------------TTA--AA-AGTAA----------TT---TTA--AAAA---AAGA--A--AAAACAAA---ATTA---TT-T-------------A-----TTTT---------GAA----A-A-AAT--------------------------------------------------ATT---TAT--T-----------------------C--------------C---------ACTT---------A-----------------AAGT----TA------C-----C-------------CCC-----AACCC-A-TAT-TATGTTTCTAGATACGAAAAT--GATGCCAAAAAATCAAA----A--A-A-A--A-AT--------AT----T-------------G-----AAACATT-T-T-T-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGG--A--------CATT-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTCAATATATCCATATAC---GCAAGACTGCAAC--AAAAATA-A----CAGTTCATT----AA---AAGAtactataaaattcataaacatcatcaaaatctgaaaacttcctaaccaacat
gi|13 : AT---TTTGATCT-TGC----A--AAA--CA----ATTAAA--T---G-A-A-A-TT--A---AAATTGGTAT---C-T--A-----A------CA---T-G--TC----GTTAATC-T--T---T------GAAA----AAGCTGAACTGATAAGCA----TT---A---A---CT-AT-------AC-CCCAACCA-------------ATCA--A--TAT-------------A--AACACACA-TA-A---AA-A----T---A--A----CT----------TA-TTA----C-ACTT-TTTTTCAATAGTTTAGCTT-TCTTTAATTTGGTCATATGTAAGCACTTTCAGAACTCTT--A-ACGA-AAATCATA-GGTT-------TGCATGCATTTA---AAAGAAATG------TTTGT--CAAATAACCTTAAAT-A-GTGCATAGTTT-G--ATGT--G-A--TT-----T-CA----A------A-AAT-G-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATAACAT-----A--TGGAAATA---GTCA-AT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------TT------AACAG----------CT---T----ACTA----ATA--CT-ATCATTTG---CTTG---TA-C-------------ATG-T-TTTT---------GAA----A-A-tttatatgtgtatttagtttcaagatataaagtaaataaacatcgatatctgaaaacttcctaaaccaacacca
gi|14 : ttataaaaagaaagtagtaagaatatttgTGTATTTT---AAAGAAATACATGTATTTGT--CAAAT--CCATAAAC-A-GTGCATATTTT-T--ATGC--T-A--TT-----T-TA----A------A-AAT-G-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATAACAA-----T--AAAAAATA---ATTT-AT---TT--AAG--------TTTTAGTATAAAGATATCATATTA--AA-AAGAAAAAAAATCCCTC---TTTTGAAAA---AATAT-CT-ATTTTAC-----TTA---AA-T-------------CCC-TCTTTT---------GAA----A-A-AAT----------------------A---------TC----------------------TAT--T-----------------------T--------------T---------A--C------------------------------T----TA------CTGTTTC-------------CCT-----ACCCC-CATAT-T---TTTCTTGATAAGAAAAT--GATGCCAATAGTT--G-----A--A-A-A--A-AT----------------------------------A-----C-T-T-T-TT----A----A-A-------A-A-A---TGGATA--------CATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTTCATTGTATCCATATGT---ATATGACTGCAAC--AAAAATA-C----TGGTTTCTT----TA---AAGTAA-TACAAta
gi|15 : taagtagtttcttaTTTCTTTAAGTTAA-T-TTGAAT--TCTAAAAAAAT--TA-GGA----TGTT---A-----CTCGC--------CAAAATGAAA------GAA--AATAGAT---T--TTT-TTATTGA-AAT---AAGTTAAA----AAA--C-A-TATTT-ATTATT-------GTCTAAGATG-A-AATGAATAACG-----A-AAAGGGTAC-------GTTGCCTTGTCCGT--TTTTTGTGCTACTTAAA-TTTTAAGATGATTCATATGTCAAAATAAAATATTTT--A--AAAA--CTTTGATAACATG-AAG--T---CATTA-----ATA-TAAGTTTTTTTTAT-TATTCTATTATACATATG-----AAACTGAAC-T--T-A--A-AA-TGAGCATCAAAATA-A-----AAAACCCCAG-GATAACacgttatttattttatg
gi|15 : t-TA-----T------CA---C-T--TT----G-----C-T--T---TTAAGTAAGAA----AA-----------AA--A-----C---A---A---CATATTGGCTTAAC-CCCATCCA-C--TTtcttgtatatcactttgcttttaagtaagaaaaaaacaacatattggcttaaccccatccactt
gi|16 : ttttctttaagttaatttgaattctaaaaaaattaggatgttactcgccaaaatgaaagaaaatagatttttttattgaaataagttaaaaaacatatttattattgtctaagatgaaatgaataacgaaaagggtacgttgccttgtccgttttttgtgctacttaaattttaagatgattcatatgtcaaaataaaatattttaaaaactttgataacatgaagtcattaatataagttttttttattattctattatacatatgaaactgaacttaaaatgagcatcaaaataaaaaaccccaggataactcttgta-A-A-CT--A---ACGTT----TT--C-TCTG-----A------CA---T-A--TTATT-G-----T-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TT---A---G---CA-AT-------AC-CC-ACCCA-C--TTTT-G---AT----A--TCTATT---TTT-AACA--AAAATACA-TACACA-AATA----T---A--AGT--TT--G---G-AGTAGT-A----GTACTT-CTTT---ACATTTTAATTT-TA-----TT-----CTATGTGAGCTCATTCAACATTTAT--C-AAGA-AAATCCCA-AGTT-------CGCGCGCATTCT---AAAGATTCG------TTTTTTACAAATTATTTCAAAA-A-GTGAATATCAT-A--TTGCAAT-A--TT-----T-T-----A------A-AGT---T----T--T-------ATAT-T---TG--ACAACAC-----C--AAAAA--A---ATTATAT--ATCCAACG--------TTTTTGC--------------TTA--AA-AATAG----------TCCTAC----AATA---TATA--AT-CTTATGCG---CTT----TATC-------------AAC-T-TTTT---------GA
gi|17 : aaaaactactttacgAT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTT-AA----T-C--C-AGTATTC-ATCATG-------ATCTAAATTGAA-AACTGCTCACGA----A-AAA
gi|17 : tAA--TGCTGATTAAACTGAAG--T---AATTA-----AGA-TA--------TTAT-TA---TATTATATAT-TT-----AAATTGACC-C--T-ACAA-AA-GGAGCATAATAGTA-C-----ATA-----TG-GTTAATACATAT---ATTGGTCT-TTGAA--A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-G-A-ATCAA---ATTTTTAC-T---C-T-TAC----A------TA---TAC--TT----G-----T-T--T---T------AACA----AATTC--------AA--A----TT---A--------A-ATAAAATA-AC-CACATACAGC--TTGG-T---AT----AACTATTTC---TTT-tgctgattaaactgaagtaattaagatattattatattatatatttaaattgaccctacaaaaggagcataatagtacatatggttaatacatatattggtctttgaaaaaatacactgagaatcaaatttttactcttacatatacttgttttaacaaattcaaattaaataaaataaccacatacagcttggtataactatttcttttttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|17 : tatttttttttaattcagttaatccagtattcatcatgatctaaattgaaaactgctcacgaaaTATTTTAGTTT-TC-----TTAGGCCCTATGTAAGCCCTTTAAAAAtttattttagttttcttaggccctatgtaagccctttaaaaagtata
gi|18 : tatttttttttaattcagttaatccagtattcatcatgatctaaattgaaaactgctcacgaaaaatgctgattaaactgaagtaattaagatattattatattatatatttaaattgaccctacaaaaggagcataatagtacatatggttaatacatatattggtctttgaaaaaatacactgagaatcaaatttttactcttacatatacttgttttaacaaattcaaattaaataaaataaccacatacagcttggtataactatttctttttCATATG---TATTGTACATATG-----ATACTGAAC-T--T-A--A-AAATGAGCACCATAATA-A-----AAA-----TG-GATAACAAATAT---TTTAATAT-TTG----ATAAAA--TA----C---AC--T---G-A-A-A-----------------------------------------A---C-T--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------A--------TC---A---GTGACT-AT-------TC-CCCATCCA-C--TTTT-TTGCAT----G--TATTTT---TT--AACA--AAAACACA-TA-A---AA-A----T---A-------------------TA---A----G-GCTT-TTC----ATATTTTAGTTT-CA-----TTTGGTCGAATGTAA----------AATTTAT--A-AAGA-AAATTATA-gtata
gi|19 : atataaataaa-T-TTTC---------GGA----A-A-GACT---A-----------------A---------AC---------------AAGA---T-T--T-----------------------CGTTGATGAAAACAAT---------A--T---------AT----------------A--T----TC------C-----G-------------CCTGAGATACCTCTC-TGG-T---TTTCTGTATAAGAAAAT--GATGTCAAAGGTT--GACTGAATTA-A-A--A-AT--------G---------------------------------------------G-TA-A-A-------AGA-A---TGG--A--------CGAG-TTTGTGGCTTGAAAA----AAT--TTCAATGTACACATATCC---TTAAGACTGCAAC--GAAGACA-ATAGCTAGCTTCTT----TA---AAGAAA-TACAACtactgagcaaaagtagaaacgtctcacttatggatccgacatttattcatctatgtttatgttacaca
gi|2 : --TAAGGT----TGTT---G----GCTCGT--------GAAAATTTAA------GTT--ATTAGAT------TTT-TG-TT-attaccaagattacattatttacccttatatgcttagtaaatattctaaataaaacttgcagaacat
gi|2 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccaT-------GTTGTCATGCTCG---TTTTTGTGCTAATTCAT-TTTCAAGATGATACCAACATCAAAATCGAACATTTT--G--TAAA--TTTTAATAAAAAT-GAG----------A-----A--------------CAT-TC---TATTATACATATG-----AAACTGAAC-T--T-G--A-AA-TGAACATAATGGTA-A-----AA------TA-GATTACAAATGTATGTTTAAT----------A--AGA--TG----C---AG--T---G-A-ATA-TT--A----TGTT----T---C-T-TAT----A------TA---T-T--TTT---G-----C-T--T---T------AGAA----AT-----------TA-------TC---G---A---AT-AT-------TC-CCCTTTCA-TATTTTTGT---AT----A--TATTTT---CTT-AACA--AATGTTTA-TGAA---AA-A----T---ATAA----TT----------TATTTAATAAG-A-TA-TTTT---ATATTTTGATTT-CT-----CTTGATCCAGTGTTAGAACTTTCTGAATTCAA--A-AAGA-AAATTAAA-GGCT-------GTCATGCATTTG---AAAGAAATA------TTTGG--GAGATTATTTTAGA--A-GTGCATATTTT-G--GTGT--TTA--TTAACGTT-TA----T------G-ATT-G-C----T--TTAATCTGATAT-T---TGTTACAATTT-----T--TGAAAATACAAAATA-AG--A----AT---------TTCTA-----------------TA--AA-AACAG----------C----------ATA---TTTA--TT-GGCAAATA---GTTT---TC-CT------------AAC-C-GCTA---------TAA----G-A-TAT----A-----------------T---------AC---------------A------CAT--T--------------------------------------T---------A--T---------A-------------------------TA------C-----T-------------AGT-----ACG-----TAT-A---TCT----GCAAGAAAAT--GACGACAAAAGTG--GA----A--ACA-A--A-AT--------AT----T-------------------------T-T-G-C-TT----T-TT-A-A-------A-A-A---TGT--A--------CATG-TTTGTGGCTT----A----AATCATTCA--------ATATCT---ATAATACTACCAC--AAAAATT-A----T-GTTTCTT----AA---ACGCAA-AACAACCTTG-ATTGAACATgtcatgctcgtttttgtgctaattcattttcaagatgataccaacatcaaaatcgaacattttgtaaattttaataaaaatgagaacattctattatacatatgaaactgaacttgaaatgaacataatggtaaaatagattacaaatgtatgtttaataagatgcagtgaatattatgtttcttatatatttttgctttagaaattatcgaatattcccctttcatatttttgtatatattttcttaacaaatgtttatgaaaaatataatttatttaataagatattttatattttgatttctcttgatccagtgttagaactttctgaattcaaaaagaaaattaaaggctgtcatgcatttgaaagaaatatttgggagattattttagaagtgcatattttggtgtttattaacgtttatgattgctttaatctgatatttgttacaatttttgaaaatacaaaataagaatttctataaaaacagcatatttattggcaaatagttttcctaaccgctataagatatatacacatttatatactagtacgtatatctgcaagaaaatgacgacaaaagtggaaacaaaatattttgctttttaaaaatgtacatgtttgtggcttaaatcattcaatatctataatactaccacaaaaattatgtttcttaaacgcaaaacaaccttgattgaacattcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|20 : ctttctttatttaactgtttactttggaaacaagtcatgttagattccataaggttgttggctcgtgaaaatttaagttattagattttATAATGCATAAG-----AAATTGATC-T--T-ACCA-AA-TGAAC--CATATTA-AGTTTAAAA-----TT-GATAACGCATAT---GTTAATCT-TTG----A--AAAACTG----T---AC--T---G-T-G-A-----A---GTGTT----T---T-A-AA-----A------TA---C-A--TT----A-----C-T--C-------------------------------------------------G---TT-AT-------AC-TCCATCCA-T--TCTT-TC--AT----A--TGTTTC---CGT-AACA--AAACCACA-TACA---CATA----T---A--A----CTTCG---A-A-TTATAA----C-AC-T-TTTT---ATATCTGAATTTACA-----TCTAATCCTATGTGAGTTC-TTCAAAATTTAT--A-AATA-AGATTTTA-GCTT-------TGTTTGCATTTC---AAAGAAATA------TTT-T--CAAAtcgcatagatgaacatttgaaaacttccttacagacatcttt
gi|21 : GC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGTGACATTCTTAAAATGAAA------CTA--ATTAGA----A--TAG-TT-TT-A-ATT---TAATTAAA----A-AAGC-A-TATGC-ATCATC-------ATCTACACTA-ACAAATGATCACGA----A-AAA-GGTATATTGTCCGTTGCCTTGCTTG---CTTTAGTGTTGTTTAAT-TCTTAAGTTGATGCTTACATC-AAATGCAATATTGT--A--TTGC--TTTTGTTAAAATT-AGA--A---CAATATGACCAAA-TA--------T-GT-TA----AGTATATGTATG-----AAATTAATC-TTAT-A--A-AA-TGA----CAAAACATA-----AAA-----T
gi|22 : tgGAATGTAT--G-AAGC-AAATCATA-GGCT-------GC-----ATTTT---AAAGACATG------TTTGT--CAAATTA-CTTAAAT-A-GTGCATATGTT-A--GTGA--T-A--TT-----TAAA----A------A-AAT-G-T----T--T-------ACAT-T---TG--GTAACAT-----C--TGAAAATA---ATAA-AT--GTT--ATG--------TTTT----------------------AA-ACTAG----------TC---T----AAAT---CATA--GT-ATCACACA---CTTG---TA----------------------------------GAA----A----------------------------------------------------------A---TAT--T--------------------------------------T---------A--------------------------------------------------------------------T-----ACCCC-C-TAT-T---ATTCCTGGTCAGAA---------------------A----A--A-A-A--A-AT--------AT----C-------------G-----A-------------TA----A-AT-A-A-------A-A-A---TGA--A---------ATG-TTTGTGACTT----A----AATCGTCCTATGTATCCATATCC---ATAAAACta
gi|23 : GCTGTTTCAT-TTTAAAGATGATACCTACATTAAAATCTA----TTT--A--TT-----TTT--TAAAAAT-AAG--T-----TTA-----AGC-TA--------TCAT-TA---TGTCATATATATATATTCAAA-TGAAC-T----A--A-AA-CGTGCATTATAAAG-A-----AAA-----TA-GATAACATATTT---TTAAATCT-TTG----A--AAA--AA----T---AC--CATGG-A-A-A-CT--A---TTTTT----T---CTT-TT-----A------CACGTT-T--TT----G-----C-T--T---A------AGAA----AA-----------GA--AATTGTC---G---A---CT-AT-------AT-CCCAACAA-C--ATAT-T---GT----A--TGTTTT---TTTAAACG--AAAATTCA-TAAA---AA-A----A---A--A----a
gi|24 : A----A-ATTT-TTTT---ATATATT-GTTT-C--------------AGTGTTAGCACTTTCAGAATTAA---A-AAGA-AAATAATA-GGTT-------GCCATGTATTTT---AAAGAAATA------TTTAT--AAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATATTTTAG--ATGT--C-A--TT-----T-TA----A------A-AAT-G-T----T--TATA----ATAT-TATATG--ATAACAT-----C--AGAAAATA---ATTA-A---ATT--ATG--------TTTTAGT--------------TTA--AG-AATAG----------TC---T----AGTA---CATA--CT-AACATACA---CTTG---CA-C-------------AAC-T-TTTC---------AAA----A-T-AATA---A-----------------A---------AC---------------GAGA---TTT--T-----------------------t
gi|25 : taacC---T--TAAGAA----TGTTTCTG----GCTCAT--------CAAA------------GTA--ATTAGAT------TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTTAAA----A-A--TTG-TATTT-A---TT-------AT---------------------------------GGTAT-------GTTGCTGTGTTCA---TTTTTATTCTATTTAAT-TTATAAGATGACACCTACGTCAACATTGAATATTTT--G--TTAA--TTTTGATAAAAA--AGGGAT---CATTA-----ACA-TA--------TC-T---------------TATG-----AAACTGATC-T--TAA--A-AA-TGAGCA
gi|26 : ta--------------T---------A--T---------T-----------------G--T----TA------T-----C-------------CCT-----ATCAC-C-TAT-TT--TTTCTAGGTAA-ATTAT--ATTGCTAAAAATG--GA----A--
gi|26 : aaatatg-TT----G-CT-A-A-------A-A-A---TGG--A---------ACGTTTTATTTTTT----A----ATTTGTTTAATGTTTCCATAGTC---ATACGATTGT--C------ATA-A----TTATTTC-T----GG---AAGAAACTACAACTTTT-ATTGAAGATcgttttattttttaatttgtttaatgtttccatagtcatacgattgtcataattatttctggaagaaactacaacttttattgaagatatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|27 : aaatatgtattgttatccctatcacctattttttctaggtaaattataT-----ACCCCAC-CAT-T---C--CTTGGTATGAATAC--ACTGCAAAGATTT--GA----A--A-A-A--A-ATCTAAACAAAT----G-------------G-----A-----T-T-T-TGTTATGGA-TT-A-C-------A-G-A---TGG--A--------CACG-TTTATGGTTT----A------------AGCGTATTCACAT-G---ATAAGACTTCAAT--AAA-ATA-A----TGGTTTC-T----AA---Aatcaaatacataaacatggcatctggaaacttcctagccaaca
gi|28 : tgccgcgttaaagtGTTCA-G--TGAGT-ATTCA-GC---TCTTATGGACAGATGTT---G----GCTCGT--------AAAAAAAAAA------AAA--AATA-AT---T--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTTAAA----A-A--TGA-TATTT-GTTATT-------ATTTGAGATG-A-TGTTGATCATGA----A-ATAA-GTAT-------GTTACCATGCTTT---TTATCCTGCTATTCAAT-ATATAAGATGGTACCTATGTCAAAATCTAACATcattatgattaaaattcatgaacataaaaatctg
gi|29 : -A-TGTTTA----C-ACTT-TCTG---A-AGTATAG----CC-----T--GGTCCAATGTTAACACTTTCAGAATGTAT--A-AAAA-AA--CATT-GGCT-------GTCCTGCATTTT---AGAGAAATA------TTTGT--------ACTTTAAAT-A-ATGCATATGTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-CA----A------A-ACT-A-T----T--T-------ATAT-C---TG--ATAATAT-----C--AGAATATA---AT
gi|3 : ttaatgttaacactatttgaagt---T--TCAGGA----TGTT---G----ACTCAT--------CAAAAC-AAC------GTA--ATTA-AG---A--CTA-TT-TC-A-ATT---CAGTTAAA----A-AA-C-A-TATGT-ATTATT-------ATCTAAGAC-------TGATTGCGA----A-AAAA----T-------GT-GCCGTGCTCG---TTTTTGAGTTATTTCAA-TTATAAGATCAT
gi|3 : TTTT--GAGTTA---TTTCAATTATA---AGA--T---CATTA-----AGA-TA--------CAAT-TC---TATTATATACATG-----AAAGTGAAC-T--T-T--A-A--TAAGTCTCATAATC-A-----AAA-----TG-CATAGCAACTAT---TTTTATCT-TTG----A--AAAA-TAAAAAC---AC--T---G-A-A-A-CT--G---AAGTT----TTA-C-TCTG-----C------TA---T-G--TTTTGTG-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAAA-TC---A---G---CT-CT-------AC-CC-ACCTA-C--TCTT-T---AA----G--TATTTT-------AACATTAAAACTTT-TAAA---AA-AATA-T---A--AAT--TT--G---G-A-TATTCA----G-ACTT-TTTT---ATAATTAAGTTT-CC-----TATGGTTGAATGTTA--------------TAT--A-AAGG-GTATCATA-GGTT-------GACGTGCATTTT---AAAGTAATA------TTTGT--CAAATTATCTTAAAT-A-GTGCATAAACT-G--ATGT--T-G--TT-----T-TA----A------A-AGT-G-T----T--T-------ATAA-C---TAT-ATGATAT-----T-----AAATA------A-GT--GTT--ATG--------CTTTAGT--------------GTA--AA-ATTAG----------TA---T----AATA----ATA--CT-ATCATACA---CTTG---GA-A-------------AAC-T-TTTT---------GAA----ATA-TAA----A-----------------A---------AC---------------AAGAATTTAT--TATAAAAATATTTTTTTATCCCATC--------------T---------A--C---------A-----------------A--T----TA------C-----C-------------TCT-----ACCCC-T-TA--T---TTTCATGGTAATAAAAT--GATGCCATGAGTT--AA----A--A-A-AACA-AT--------AT----C-------------GAAACAA-----T-TGT-TATG----G-TC-A-AC------A-C-A---TGG--A--------CATG-TGTGTGGTTT----A----AAT-------TGTATCTATATCC---ATAAGACTG--ACTGAAAGATA-----------TTTT----AATTTAAGATA-TA-AAATTCACACTTATGAtaagatacaattctattatatacatgaaagtgaactttaataagtctcataatcaaaatgcatagcaactatttttatctttgaaaaataaaaacactgaaactgaagttttactctgctatgttttgtgctttagaaaaaaaaaatcagctctacccacctactctttaagtattttaacattaaaacttttaaaaaaatataaatttggatattcagacttttttataattaagtttcctatggttgaatgttatataaagggtatcataggttgacgtgcattttaaagtaatatttgtcaaattatcttaaatagtgcataaactgatgttgttttaaaagtgtttataactatatgatattaaataagtgttatgctttagtgtaaaattagtataataatactatcatacacttggaaaactttttgaaatataaaaacaagaatttattataaaaatatttttttatcccatctacaattacctctaccccttattttcatggtaataaaatgatgccatgagttaaaaaaacaatatcgaaacaattgttatggtcaacacatggacatgtgtgtggtttaaattgtatctatatccataagactgactgaaagatattttaatttaagatataaaattcacacttatgaaaatct
gi|30 : ttcaggatgttgactcatcaaaacaacgtaattaagactatttcaattcagttaaaaaacatatgtattattatctaagactgattgcgaaaaaatgtgccgtgctcgtATTTT---AAAGAA-CA------TCTGT--CAAATTA----AAAT-A-TTGCATGTTTT-G--GTGT--T-A--TT-----T-GA----A------A-AAC-A-T----T--T-------ACAT-T---TG--ATAAAAT-----C--AGAAAATG---AATA-AG--GTT--AAG--------TTTTGGT--------------TT----A-AGTAG----------TC---T----AATACTTCTTAGTCT-ATTACGTATTTCTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTC-----------A----A-A-AAG----A-----------------A---------AA---------------AAGA---aaatct
gi|31 : --G---G-G-TAAATA----C-ACTT-TTTT---GTATTTAAGTTT--C-----TTTGATCCCATAAATGAACTTTCAAAATTCAT--ACAATATAAATTATATGCTT-------G-AGTACATTTT---TAATTAATA--------------AA--TACCCTAAAT-GTGTGCATAGTTT-T--GTGT--T-A--Ta
gi|32 : tgTGGCTT----A----CATTGTTCAGTATATCAGTATCC---ACAAAACTGTAAC--AAAGATA-A----TAGTTTCTT----AA---AATAAA-TATA---TCA-ACTGAAGATaacacatagtctgatacacactgattgtaca
gi|33 : ttttgaaaatataagtacatc-A-----AAA-----TG-GATAACATATAT---GTTAATCT-CTGGAACA--AAA--TA----C---AC----------------------AT-------T---C-T--------A------TC---T-A--TT----G-----T-C--T------------------AT-----------GC--A----TC---A---C---TC-AC-------AC-C--A-CCA-C--TGTT-T---G-----A--TATGTT---TTT-GAAA--CTATCACA-CACA---AA-AATTTT---A--A----CT--G---G-A-TAATTG----C-ACTT-TTTcatagtaaaacattacaaaacgtgaaatctgaaattttcttagccaatatccttta
gi|34 : GGAA------GTA--ATTAGAT---A--TTT-TT-TT-A-ATT---CAGTTAAA----A-AT-C-A-TATTTAATAATT-------ATCCTAGATA-A-AATTGATAAT-A----A-AAAAGGTAT-------GTTACTA-GCTCT---TTTTTGTGCTTTTTAAT-TTTTAAAATGTCACCTACGACAAActa
gi|35 : -T--T-A--A-AA-TGAGCATCACAATA-A-----AAA-----TG-GCCAAGAAATAT---TTTAATAT-TTGA---A--AAA--TG----T---AC--T---C-AGA-A-CT--AG--GTATA----T---C-TGTA-----A------TG---T-A--TT----------C-TTGT---T------TGAAGTTGAA-----------AA--A----TC---ATTGG---CT-AT-------AC-TCTATCTA-C--GTTT-T---
gi|36 : tt---T--TAAGGA----TCTT---G----ACTTAT---------ACAATGAAATACAGTGTA--ATTAAAA---A--ATT-TT-TT-A-ATT---CAGTTGCATCATA-A--T-A-TATTA-ATTATT-------ATTTAAGATG-A-AATTGATCATG-----A-AAAAGGTAA-------GTTGCCATGCTTG---TTTTTGT
gi|37 : A----A--A-A-A--A-AT--------GT----T-------------G-----AAACATC-T-T-T-TT----G-TT-A-A-------G-ATA---TGG--A--------CAT--TTT-TGGCTT----A----AATTGTTCAATGTTTTCATATTC---ATGAGACTGCAAC--AAAGATA-A----TCACTTCTTATTAAA---AAGAAA-TACAACTT
gi|38 : atgcTAT--A-AAGA-ATTTCAAA-GGTT-------AC-----ATTTT---AAAGAAATA------TTTGT--CAAATTACCTTATAT-T-GTACATAGTTT-G--GCGT--T-A--AT-----T-TT----A------A-AAT-G-T----TGAT-------ATGT-T---TG--ATAAAAT-----C--TGGAAA--------A-AA--GTT--ATG--------T
gi|39 : tgATA-GGTT-------GCCTTGCATTTT---AAAAAAAAA------AT-GT--CCATTTACGTTAAAA-A-GTTAATATTTT-------T--T-A--TT-----T-TACTTTA------A-AATAG-T----T--T-------ATAT-T---TG--ATGGCAT-----C--AGAAAATA---AGTA-AT--ATT--ATG--------TT
gi|4 : tC---T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CAACATGAAA------TAA--ATTAGAT-------TT-TT-TT-A-ATTATTCAGTTAAA----A-A--T-AATATGT-ATTATTTATAAATATCTAAGATG-A-AAT-GATAACGA----G-AAA-GCTAT-------GTTGCCATGATCG---GTTTTGTGCGATTTAAT-TTTAAAGTTGATACATACG---ACATC--ATTTTTTTAG--TTTATTTTTTTATGAAAAT--GG--TGACCATGA-----AGA-TA--------TCAT-TA---TATTAAACATATG-----AAACTGAAC-T--T-A--ATAA-TGAGCATCATAACA-A-----AAA-----TT-AATAACTAAAA------TAATCT-TTT---------T--TA----T---AC--T----------------------TT----T--------------------------T-C--TT----G-----C-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--T----TC---ATC-G---TC-AC-------AT-CCTATGCA-A--TTTT-T---AT----A--TGTT----------------------A-TAC-------A----T---G--T----TG--G---G-A-TAATTA----G-ACTT-TTTT---ATATTTTAGCTT-CC-----TTTGGTCCAATGTAAGCACTTTCAGAATTTATAAA-AAAA-AAATCATA-GGTT-------GCCGTGCATTTT---AAAGAAATA------AATGT--CAAATAACATTAAATCA-GAATATA-ATT-A--ATGT--T-ATGTT-----T-TA----GTT----A-AAT-A-TAGTCT--T-------ATAT-
gi|4 : aCATAGGTT-GCCGTGC----A--TT-----T-TA----A------A-GAA-A-T----A--A-------ATGT-C---AA--ATAACATTAAATC--AGAATATA---ATTA-AT--GTT--ATG--------TTTTAGT--------------T-A--AA-TATAG----------TC---T----TATA---TATT--CT-ATTGTACA---CTTG---TA-T-------------ATC-T-TTTT---------CAA----A-T-GAT----A-----------------A---------A----------------AAGA---TTT--T-----------------------C--------------TCTTTTGAGCA--T---------ATATTTATTCAGCTAAGAG--T----TA------C-----C-------------CGT-----AACCC-C-TAT-T---TTTCTTGGTAATAAAAT--GATG--------------------A-A-A--A-CT--------AT------------------------------T-T-TAT-TT----G-TTAA-A-------A-A-A---TGA--A--------CATA-TTTGTGGCTT----A----AACCG------------ATA--------AAAAC----------AGAAA-A----CGATTTCTT----AA---AAGAAA-TAAAACTTCA-ATattctattgtacacttgtatatctttttcaaatgataaaaagattttctcttttgagcatatatttattcagctaagagttacccgtaacccctatttttcttggtaataaaatgatgaaaactattttatttgttaaaaaatgaacatatttgtggcttaaaccgataaaaacagaaaacgatttcttaaaagaaataaaacttcaatccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|40 : acttaaggatgttggctcgtcaacatgaaataaattagatttttttaattattcagttaaaaataatatgtattatttataaatatctaagatgaaatgataacgagaaagctatgttgccatgatcggttttgtgcgatttaattttaaagttgatacatacgacatcatttttttagtttatttttttatgaaaatggtgaccatgaagatatcattatattaaacatatgaaactgaacttaataatgagcatcataacaaaaattaataactaaaataatcttttttatactttttcttgctttagaaaaaattcatcgtcacatcctatgcaatttttatatgttatacatgttgggataattagacttttttatattttagcttcctttggtccaatgtaagcactttcagaatttataaaaaaaaaat-T-T-C-TT----G----A-A-------A-A-C---TGG--G--------CATT-TCGGTGACTC----A----AATTGTTCCACGAATCAATATCCATTATAAAACTTCATC--AAAGATA-A----GTGTTTCCT----AA---GAccgcagtcatgaaatatgaaaactaacgagtcaacgtccttaata
gi|41 : --TTT-TT-TT-A-ATT---CAATTAAA----A-C--CCA-CATTT-GTTTTT-------ATCTAAGATG-A-CATTAATAAAG-----A-AAAAGGTAT-------GCTGtgtttaatgtat
gi|5 : ---T--TAAAGA----TG----------GCTCGT---------AAAATGAAA------ATACAAATAGATCTAACTTTT-TT-TT-GTATT---ATGTTAAA----A----C-A-TATTT-TCTATT-------ATCTTAAAAG-A-AAAAGATAATGACTGCG-AAAAGATAT-------GATGCCGTGCTTG---TTTTAGTACTGTTTAAT-TTTTAA-ATGATACCTACGT-ACAATTTTATATCTT--G---TAG----TTG--AAAATT-AGaggtcactaatgca
gi|5 : -A--A-AA-TTAGTATGATAATA-A-----AAT-----TG-GATAGCACGAAT---GCTAATTT-TTA----A--AAAAATA----C---AC--A---G-A-GCA-CT--A---A-GTT----TTCCC-T-TATAATTA------TA---T-TC-TT----A-----CAT--TCAGT------AGAA----AA-----------AA--T----TCTTTG---G---CC-AT-------AC-CT-ACCAA-C--TTTT-T---AT----GG-TATTTT---TGT-AACT--GAAACATA-TA-A---AG-A----TTTTA--A----TT--G---GGA-TAATTAA---G-ATTC-CTTT----TATTTCAGTAT-CC-----TTTGGTCCTGTGAAAGCACTTTCAAAAC---------------GTCATA-GGTT-------TTCGGTCATTTT---AAAGAATTA------TTTGT--CAAATTACCTTAAAT-A-TTCCATATTTT-G--------T-G--TT-----T-CA----A------CTGAT-G-A----T--TCA-----ATGC-T---T----CAAC-T-----CTTTGACATAA---ATTA-AT--GTT--AAG--------TTTTAGT--------------TTA--GA-AATAG----------TC---C----AATA---TA-----T-ATCATATA---CTTA---TA-CATATATTATTCATAAC-T-GTTC---------GAAAT--A-A-AACAACAA-----------------A---------ACTTTCTCCTTTGAAAAAAAA---TAT--T-----------------------T--------------T---------A--T------------------------------T----TA------CTTT--T-------------CCG-----ACTCT-C-AAT-T---TTAATTGGTTATATAATAAGATG-CAAAAGTTCAGA----A--A-C-A--A-AA--------AT----A-------------G-----A-----T---------------TT-A-A-------A-A-AAATTGG--AAAAAATATTATA-TTTGTGGCTT----A----AATTGTTC-ATGTATCCATATTC---Atatgataataaaattggatagcacgaatgctaatttttaaaaaaatacacagagcactaagttttcccttataattatattcttacattcagtagaaaaaattctttggccatacctaccaactttttatggtatttttgtaactgaaacatataaagattttaattgggataattaagattccttttatttcagtatcctttggtcctgtgaaagcactttcaaaacgtcataggttttcggtcattttaaagaattatttgtcaaattaccttaaatattccatattttgtgtttcaactgatgattcaatgcttcaactctttgacataaattaatgttaagttttagtttagaaatagtccaatatatatcatatacttatacatatattattcataactgttcgaaataaaacaacaaaactttctcctttgaaaaaaaatattttatttacttttccgactctcaattttaattggttatataataagatgcaaaagttcagaaacaaaaatagatttaaaaaaattggaaaaaatattatatttgtggcttaaattgttcatgtatccatattcagagg
gi|6 : ttaaagatggctcgtaaaatgaaaatacaaatagatctaacttttttttgtattatgttaaaacatattttctattatcttaaaagaaaaagataatgactgcgaaaagatatgatgccgtgcttgttttagtactgtttaatttttaaatgatacctacgtacaattttatatcttgtagttgTTGCCATGCTCG---TTTTTATGCTTTTTAAT-CTTTAAGATAATACC------AAAATCTAATATTTT--G--TTAA--TTTTCATAAAATG-AGA--T---AATTA-----AGATTA--------TC--------TATTGCACATATG-----AAACTGAAC-T--T-A--A-AA-gagg
gi|6 : -A-----AAA-----TGAGATAATTAAGAT---T---ATCTATTG----C--ACA--TA------------T---G-A-A-A-CTG-A---A------------C-T-TA-----AAAAAAATA---T-G--TTT---G-----T-T--T---T------AGAA----AA-----------AA--AAACATC---G---G---CA-AT-------ACACCTA-CCA-C--TTTT-T---ATTACTA--TATTTT---TTC-A-CA--AAAACACAACACATAAAA-A----T---A--GATGTTT--G---A-A-TAGTTA----G-ATGA-TTTT---ATATTTTAGTTAACC-----TTTGGTCCAATATAAGCATTTTCAGAATTTAT--T-AAGA-AAGTCACA-GGCT-------GTCGT---TTTTATAAAAGTAATA------TTTGT--CGAATGACCTTAAAC-A-GTGCATATTTA-A--GTGT--T----T--------------A------A-AAT-G-T----T--T-------ATAT-T---TG--AAAACAT----------AAA---------A-AT--GTT--ACG--------TTTAAGT--------------TTT--AA-AA-AA----------CG---T----AATG---CATA--CT-ATCATACA---CTTG---AA-C-------------AAC-T-TTTTTTTTGAAAAGAA----A-A-AAC----A-----------------ATATTTTATCGCTTGGA----------AAAA---TAT--TTATATCT----------------C--------------T---------A--A---------A-----------------A--TG---TA------C-----T-------------CGT-----ACACC-C-TAT-G---TTTCTTGGT------AT--CACGTCAAAAGAT--GA----A--C-A-A--A-A---------AT----C-------------GA----A-----TGT-T-T-TT----G-TT-A-AATGATAGA-A-A---AAG--A--------TATA-TTTGTGGCTT----A----AAATGTTCAATGTATTCATAGCC---ATAAGACTGCAGC--AAGGACA-A----TAGTTTaaaatatgtttgttttagaaaaaaaaacatcggcaatacacctaccactttttattactatattttttcacaaaaacacaacacataaaaatagatgtttgaatagttagatgattttatattttagttaacctttggtccaatataagcattttcagaatttattaagaaagtcacaggctgtcgtttttataaaagtaatatttgtcgaatgaccttaaacagtgcatatttaagtgtttaaaatgtttatatttgaaaacataaaaatgttacgtttaagttttaaaaaacgtaatgcatactatcatacacttgaacaactttttttttgaaaagaaaaaacaatattttatcgcttggaaaaatatttatatctctaaaatgtactcgtacaccctatgtttcttggtatcacgtcaaaagatgaacaaaaatcgaatgtttttgttaaatgatagaaaaagatatatttgtggcttaaaatgttcaatgtattcatagccataagactgcagcaaggacaatagttt
gi|7 : ttgccatgctcgtttttatgctttttaatctttaagataataccaaaatctaatattttgttaattttcat----A--AAA--CA----CGA-AC--C---G-A-A-A-CT--TTGTATGTT----C---G-T--------A------CA---T-GAATT----G-----T-----------------AC----AT-----------GA--A----TT---T---G---CT-TT-------AC-CC-ATCAG-T--TTTT-T---AT----A--T---TT---TTT-AACA--AAAG-----TACA---AA-A----T---A--A----CT--GAGAG-G-TAATTA----C-ACTG-TTTT---GTGCTTTAGTTT-CC-----TTTCGTCCTATGTAAGCCCTTTCATGATTTTT--A-CCGA-AAAGCATG-TGTT-------TGTGTGCATTTT---AAA---------------GT--CAAATTACCTTAAAT-A-GTGCAAACTTT-G--TTAT--A-A--TT-----A-TAT---ATATATTA-AAT-A-T----T--T-------ATAT-G---TG--GTAACAT-----C--AGAAAATA---ATTG-ATC-GTT---TG--------TTTTAGG--------------TAA--AACAATAG----------TT---A----AATA---TATA--CT-ACCAAATA---TTTG---TA-C-------------AAC-T-TTTT---------GAA----A-AGAAC--------------------------------AC---------------AAAA---TTTTAT-----------------------C--------------TTTGAA----A--T---------AATGTCCACTTAGC----A--T----TA------C-----C-------------TCC-----ATCCC-C-TAT-T---T---TTGGCAAGGTAAT--GATGTCAAAGGCT--GA----A--C-ATA--A-AT--------AT----CAAATAAAAAAGGAA-----A-----T-T-T-G-TT----T-TT---A-------A-A-G---TGG--A--------CATT-ATTGTGGCTT----AAAATAATGGTTTGAGGTATACATATAC---ATAACACTGC-AT--AATACTATA----TAGTTTCGT----AA---AATAAA-TGCTACTTCT-ATTTAAGAT
gi|8 : ---T--TAAAGA----TGTT---GCCTGGCTCGT--------CAAAATGAAA------GTA--ATTAGAT---A--TCT-TT-TT-A-ATT---CAG--------------C-A-TATTT-ATTTTT-------TGTTAAGATT-A-AATTGATCATGA----A-AAGAATT-T-------GTTACCGTGTTCGTTTTTTTTTTGCCATTTATTATTTTAA-ATGATATCCACTTCAAAGTCTAATATTTT--G--TAAA--TTTTCATAAATTTGAGA--T---CGTTA-----AAG-GG--------TC--------TGTTATACAAATG-----AAACTGAAC-T--T-A--A-AT-TGAGCATCATAAT--A-----AAA-----TG-AATAGGAAATAT---TTTAATAT-TTGGC--A--AAA--TA----C---AC--T---G-A-ACATTT--ATATATATT----TG--C-T-TT-----A------GA-----G--TT----G-----T-T--T---T------A-AA----AA-----------AA--A----TA---A---C---CC-CT-------AC-CCCGTattaaattcatcaatatgaatagatgaaacttttctagcgaacatc
gi|8 : AGCAT-----C--ATAATAAA---ATGA-ATAGGAA--ATA--------TTTTAATAT------------TTGGCAA-AATAC----------AC---T----GA-A---CAT---TT-AT-ATATA---TTTGCTTTA-G-------------AGT-T-GTTT---------TAA----A-A-AA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-----------------A--T----AA------C-----C-------------CCT-----ACCCC-G-TAT-G---TTTCTTGGCAGGAAAAT--GATGCCAAAATTA--GA----T--A-G-A--A-AT--------A---------------------------------------------A-TA-A-A-------A-A-A---TGA--A--------CACA-TTTATGGCTT----A----AATCTTTGAATGTATCCGTGTTC---ATAATACTGCAAT--AAAGATA-A----TAATTTCTT----AA---AAGAAA-CACGATTTTA-ATTTAAGATatgtttcttggcaggaaaatgatgccaaaattagatagaaataataaaaaatgaacacatttatggcttaaatctttgaatgtatccgtgttcataatactgcaataaagataataatttcttaaaagaaacacgattttaatttaagatataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : ttaaagatgttgcctggctcgtcaaaatgaaagtaattagatatctttttaattcagcatatttattttttgttaagattaaattgatcatgaaaagaatttgttaccgtgttcgttttttttttgccatttattattttaaatgatatccacttcaaagtctaatattttgtaaattttcataaatttgagatcgttaaagggtctgttatacaaatgaaactgaacttaaattg-GACTGAGT-ATTTA------T--TAAGGA----TGTT---G----GCTCGT--------CATAATT-AA------GTA--ATAAGAT---C--TTT-TT-TT-A-ATT---CAATTAAAT---A-T--C-A-TTTTT-ATTATT-------ATCTAAGATG-A-AATTTAGAACG-----A-AAAATGTAT-------ATTAGGGTACTTG---TATTTGTGCTATTTAAT-GTTTAGGATGATGCTTACG--AACTTATATTGTTTA--G--TAAA--TTTTGATAACATG-TGG--T---CCTTG-----AAA-TA--------TCAA-TG---TATTATTCATAAG-----AAACTCAAC-T--T-A--ATAA-TGAGTATTATAACA-A-----AAA-----TT-GATCACTTATAT---TTTAATAT-TTG----T--AGA--CA----C---ACCTT---GAA-A-A-CT------ATGTT----T---T-T-Tataaaatttgcacacacacgaaaatctgaaaacttcctagccaaaatccgtaata
gi|9 : gtt--T----TA------A-----T-------------CCT-----ACTCT---TATGT---TTTCTTAGTAAGAAAAT--GATGTCAAACATT--TA----A--A-A-T--ATAT--------AT------------------------A-----T-T-T-T-T-----G-TT-ATA-------A-A-C---TCG--A--------CGTG-TTTCTGTCTT----T----AAACATTCATTGTACCGAAATCC---ATAATACTG--------------------------TT----AA---AAGAAA-CACAACTTCA-GTTTAAGActcttatatcacgttaatcctactcttatgttttcttagtaagaaaatgatgtcaaacatttaaaatatatatatttttgttataaactcgacgtgtttctgtctttaaacattcattgtaccgaaatccataatactgttaaaagaaacacaacttcagtttaagacattaaatccgaagttttaaaattctgaaaactagcgtgccaacattcttaa