lowQualScore : 222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 444444444444444 1111111 22222222222222222222222 222222222222 22222 1 666666666666 1
lowQualScore : 222 11 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 999999999999999 5 6666666 999999 2 2 5 77 2 2 66666666666666666666666 3 66666 5555 2 5 2 2 3 888888888888 55555 2 777777777777 5
lowQualScore : ... .. . ....................................................................... . . ............... . ....... ...... . . . .. . . ....................... . ..... .... . . . . . ............ ..... . ............ .
lowQualScore : 000 44 0 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 6 444444444444444 0 0000000 666666 9 9 3 33 7 0 88888888888888888888888 2 77777 7777 7 0 7 9 1 888888888888 88888 3 888888888888 0
consensus : GTGACATCATAAGTAAACAATGTAGAC-TGANATCAACCT------AACTC---ATTCGCGAN---C-TGN--TC----ACGGTTTACATTGTTT---GGCTCTCAGTCAGTTCA----------GTCT-T-ANA--AACAC------CC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--C-A-----A--AN-----ACAAGGA-----TG----GA-AGA-GT-CTATT-ACAGAAA---ANCANN---AGGTTA----CGGGTGTAA---A-CT-CACACAAGATTAA
Reference ( gi|2 ) : GTGACATCATAAGTTAACAATGCAGAC-TAAGGTCAACCT------AAC-----ATTCACAAG---C-TGT--TT----AGGGTTTACAGCATGT---GGCTCTCAGTCAGCTCA----------ATCT-T-AAA--AACAC------CC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGATC--C-A-----A--AT-----ATGAGGA-----TG----GA-AAA-GT-CTATT-ACAGAAA---AACAAG---AGGTTA----CAGGTATAA---AACTGT---TAACATTAA
gi|18 : GTGACATCATAAGTAAACAATGTAGAC-TGATATCAACC
gi|7 : TGATATCATAA---AACAAT-CA-ACGTAAACTC---CT--------C-----TCCTGCAAT---C-TGA--TT----AGGGTTTA---CATGTTTGAGCTCTTGGTCAG--------------ATCT-C-ATA--AACTC------AC-C---------ATG-GGAACGGAACTGTCTGC-A-----A--ATTG---ATAACAA-----TG----GA-AGA-GTACTA
gi|3 : aaGACACCATATGTATACAATGTAGAC--GGGATCAGCTTGTGAGTAACTCTTGATTTATTAATTTC-TGT--CTGATCAGGATTTA-----------GGTGCTCAGCCAGTT------------GTCT-T-GTT--ATTCT------CC-TT-C-T--TAATG-ATAATGAACTGG-C--T-A-----A--ATCAATAACAAGGC-----TG----GA-AGA-GT-CTATT-ACAGAAA---TACAGA---AGGTTgt
gi|1 : caaaAACA--GCATAC-T--TGTAAATAT------AACTC---ATCTGCAGC---C-TGT--TT----GCAGTTTACATTGTTT---GGCTCTCAGTCA-TTCATTTGTTTTCTGTTT-T-GAA----CAC------TC-CTAC-T--AAATG-GTAATGGATCTGTC--T-G-----A--AA-----ACAAGGA-----TG----GT-AGA-GT-CTATT-AAAGAAA---TTCATT---AGATTA----CGG
gi|6 : aatgtcaacatctgcaaataatgtacgccaggACAAGGTAGAG-CCAGATCAA----------AC-----AGTGAGAAG---CGTGTCCTC----AGAATCTACATTGTTT---GGCTTTATATCAGTTAA----------TTCT-TTAAA--AACAC------CC-C--T-T--AAGTACATAATGGAATGGTC--T-AAAAACA--AT-----A-GAAAATGATCTG----GAGAGA-GT--TATA-ATAAAAA---AACACA---AAATTA----
gi|12 : T------AAC-------TCATGGG---C-TGA--TC----ATGTTCTACATTATTT---GGCCTTTATTATGTAAA----------ATTT-TCAAA--AAAGG------CC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGACC--C-A-----A--At
gi|10 : agctagggataag---C-TGA--TC----ACAGTTTACAT--TGT---TG-TGTCAGTCAGTATT----------GTTT-T-ATT--AACAC------CC-CT-T-TCTAAATG-CAAATGAAATGGCC--C-A-----A----------CAAGCA-----TG----GA-AGA-GT-CTATT--CAGCAA---
gi|9 : aaggtT---GTCTTTCTGTCAGTTC-------------TT-T-ACATGAACAA------CC-CT-T-TCTAAATG-ATAATGAAATAGTG--T-A-----A-----------GAGCA-----AG----GA-AGA-
gi|5 : aacaacaagcaggcggatcttgaactatattgttGCTCA----------GTCTAT-ACA--CATACTTATTCCC-CT-TCT--AAATG-ATAATGCAAGGGTC--C-A-----C--AA-----ACAACTA-----TG----GA-AGA-GT-CCATT-ATAAAGA---TTCACC---AAGTTA-----AGGAGTAA---ATCTGtaagttagagggagtata
gi|4 : cctgcaagaagcccttgctctctttaatatctgaccagaatgtgtattgtttggtATAC------CCTCT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--A-A-----A--CA-----ATAATTA-----TG----GA-AGA-GT-CCATT-ACAG-AA---ATCAAGC--AAATTA----AGGGT-TAACTGAACTCCACATAAAATTAAagaa
gi|11 : ttatattgtttgactctatgtgagttaattattattatCAC------CC-CT-TCT--ATATA-ATAATGGAAT-ATT--C-A-----ATAAT-----GTAGGGA-----TG----GA-AGA-GT-TCATT-GTAGAAA---tccatttacacagaatacataccctatataggtgg
gi|14 : cattgtttcccttttggtctatattcatattatAC------CC-CT-C-C--AAATG-ATAATGGAGTGATC--CGA-----A--AT------CAAGGA-----TG----GA-AGA-GT-CTATT-ACAGAAATTCAGCAAG---ttcagcaaattta
gi|13 : acattgtttggctattattattagtC------TC-TT-T-T--TAATG-AT---GGAATGGTC--T-----------T-----ATAAC-A-----TGCTTTGA-AGA-GT-CTATT-ATAG
gi|8 : ttgtttgttgctcagtcagataattgttgttattC-TT-T-C--AAATT-ATTATGGAATAATC--T-A-----A--AT-----ATAAGGA-----TG----GA-AGA-GT-CTATT-ATAGGAAATCAGCAAATTCAGGGTAGTGTCAGGTACAG---A----T---CAAGATTAAcagttcagtaa
gi|15 : C-TT-C-T--AAATG-ATTATTGAATATTC--C-A-----A--AG-----ACAAGGG-----TG----AA-AGA-GT-CAATA-ACAGAAATTCAACAtcaatccacaagtgaatatattctgttatatggtgaa
gi|17 : -T--AAGTG-ATAATGGAATGGTC--T-A-----A--AA-----ACAATAA-----TG----GA-AGA-GT-TCATT-ACA
gi|16 : TGAAGTGATC--C-C-----A--AA-----GCAAGGA-----TA----GA-AAAAGT-CTATTCACAGAAA---
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GCAATGTTGACCCAGGTCAGTCAGCAAGTTTCTTGAT
Alignments
lowQualScore : 1 11111 55555555555555555555555555 33333333333333333333333333 11111111 11 22222222 44444444
lowQualScore : 0 55555 0 33333333333333333333333333 222 1 7 3 33 3 33333333333333333333333333 3333 2 2 5 66 2 33 2 11111111 2 99999999 2 2 2 2 00 22 0 5 5 66666666 0 2 22222222
lowQualScore : . ..... . .......................... ... . . . .. . .......................... .... . . . .. . .. . ........ . ........ . . . . .. .. . . . ........ . . ........
lowQualScore : 0 88888 8 66666666666666666666666666 777 0 6 1 99 1 22222222222222222222222222 3333 7 7 0 99 5 22 4 44444444 5 11111111 7 7 7 9 22 00 7 0 0 00000000 8 5 00000000
consensus : GTGACATCAT-AAGTAAACAATGTAGACTGAGATCAACCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTC-A-GTTCA---NT-CTT-A-----TN--A-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CA-AA--A-----ACAA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTCAGCAAGTT-ANGG--GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
Reference ( family-793 ) : GTGACATCAT-AAGTAAACAATGTAGACTGANATCAACCT------AACTC---ATTCG-------CGANCTGNTCACGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTC-A-GTTCA---GT-CTT-A-----NA--A-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CA-AA--N-----ACAA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAAANCANNAGGTT-ACGG--GT---GTAAACT-CACA---CAAGATTAA
gi|1 : T------AACTC---ATCTG-------CAGCCTGTTTGCAGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTC-A--TTCATTTGT-TTT-CTGTTTTG--A-ACACTC-CTAC-T--AAATG-GTAATGGATCTGTC--TG-AA--A-----ACAA-GGA--------T-GGT-AGAGT-CTATT-AAAGAAATTCATTAGATT-ACGG--
gi|10 : aatgtcaacatctgcaaataatgtacgccaggaacagcatacttgtaaataGGTCTGATCACAGTTTACATTGTTGTG-----TCAGTC-A-GTATT---GT-TTT-A-----TT--A-ACACCC-CT-T-TCTAAATG-CAAATGAAATGGCC--CA-A----------CAA-GCA--------T-GGA-AGAGT-CTATT--CAGCAA
gi|11 : aaCATTGTT-TC-CCTTTTGGTCTATATTCA----T-ATT-A-----T------CACCC-CT-TCT--ATATA-ATAATGGAATATTC--AATAA--T-----GTAG-GGA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-GTAGAAATTCAGCAAATT-
gi|12 : T------AACTC---AT-----------GGGCTGATCATGTTCTACATTATT-TG-GCCTTTATTA-T-GTAAA---AT-TTTCA-----AA--A-AAGGCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGACC--CA-AA--ta
gi|13 : agctagggataagTTGTT-TG-TTGCTCAGTC-A-GATAA---TT-GTT-G-----TT--A-TT-CTC-TT-T-T--TAATG-AT---GGAATGGTC--TT-AT--A-----ACAT-GCT--------T-TGA-AGAGT-CTATT-ATAG
gi|14 : ACATTGTT-TG-GCTATTA------------------TT-A-----TT--A-GTACCC-CT-C-C--AAATG-ATAATGGAGTGATC--CG-AA--A-----TCAA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTCAGCAAGcagttcagtaa
gi|15 : C-TT-C-T--AAATG-ATTATTGAATATTC--CA-AA--G-----ACAA-GGG--------T-GAA-AGAGT-CAATA-ACAGAAATTCAACA
gi|16 : TGAAGTGATC--CC-AA--A-----GCAA-GGA--------TAGAA-AAAGT-CTATTCACAGAAA
gi|17 : -T--AAGTG-ATAATGGAATGGTC--TA-AA--A-----ACAA-TAA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-ACAttctgaacatagtcaagc
gi|18 : GTGACATCAT-AAGTAAACAATGTAGACTGATATCAACC
gi|2 : GTGACATCAT-AAGTTAACAATGCAGACTAAGGTCAACCT------AAC-----ATTCA-------CAAGCTGTTTAGGGTTTACAGCATG-TG-GCTCTCAGTC-A-GCTCA---AT-CTT-A-----AA--A-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGATC--CA-AA--T-----ATGA-GGA--------T-GGA-AAAGT-CTATT-ACAGAAAAACAAGAGGTT-ACAG--GT---ATAAA
gi|3 : GACACCAT-ATGTATACAATGTAGAC-GGGATCAGCTTGTGAGTAACTCTTGATTTATTAATTTCTGTCTGATCAGGATTTA---------G-GTGCTCAGCC-A-GTT-----GT-CTT-G-----TT--A-TTCTCC-TT-C-T--TAATG-ATAATGAACTGG-C--TA-AA--TCAATAACAA-GGC--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATACAGAAGGTT-actgttaacattaa
gi|4 : caaaTTATATTGTT-TG-ACTCTATGTG-A-GTTAA---TT-ATT-A-----TT--ATATACCCTCT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--AA-AC--A-----ATAA-TTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ACAGAAATCAAGCAAATT-AAGG--GTTAACTGAACTCCACA---TAAAATTAA
gi|5 : ATCTGACCAGAATGTGTATTGTT-TG-GTGCTCAGTC-T-ATACAC--ATACTT-A-----TT-------CCC-CT-TCT--AAATG-ATAATGCAAGGGTC--CA-CA--A-----ACAA-CTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ATAAAGATTCACCAAGTT-AAGG--A----GTAAAtccatttacacagaatacataccctatataggtgg
gi|6 : cctgcaagaagcccttgctctctttaatTCAGAATCTACATTGTT-TG-GCTTTATATC-A-GTTAA---TT-CTTTA-----AA--A-ACACCC-C--T-T--AAGTACATAATGGAATGGTC--TA-AA--A-----ACAATAGAAAATGATCT-GGAGAGAGT--TATA-ATAAAAAAACACAAAATT-Atctgagaa
gi|7 : acaaggtagagccagatcaaacagtgagaagcgtgtccTGATATCATAAAACAATCAACGTAAACT--------CCT--------CTC---CT--G-------CAATCTGATTAGGGTTTACA-TGTT-TGAGCTCTTGGTC-A-G-------AT-CTC-A-----TA--A-ACTCAC-C---------ATG-GGAACGGAACTGTCTGCA-AATTG-----ATAA-CAA--------T-GGA-AGAGTACTAt
gi|8 : aaC-TT-T-C--AAATT-ATTATGGAATAATC--TA-AA--T-----ATAA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ATAGGAAATCAGCAAATTCAGGGTAGT---GTCAGGT--ACAGATCAAGATTAAgt
gi|9 : TATATTGTT-TG-TCTTTCTGTC-A-GTTC-------TTT-A-----CATGA-ACAACC-CT-T-TCTAAATG-ATAATGAAATAGTG--TA-AG--A-----GCAA-GGA--------tcaatccacaagtgaatatattctgttatatggtgaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GCAATGTTGACCCAGGTCAGTCAGCAAGTTTCTTGAT
Alignments
lowQualScore : 1 11 55555555555555555555555555 2222222222222222 22222222 11 222
lowQualScore : 0 11 555555 99 11111111111111111111111111 0 0 1 3 33 0 1 3333333333333333 6 1 3333 2 2 99999 2 33 99999 33 2 99999999 2 2 2 2 55 3 5 1 66666666 0 1 77 111
lowQualScore : . .. ...... .. .......................... . . . . .. . . ................ . . .... . . ..... . .. ..... .. . ........ . . . . .. . . . ........ . . .. ...
lowQualScore : 0 00 666666 88 11111111111111111111111111 3 7 4 1 99 7 2 5555555555555555 2 0 5555 7 7 33333 5 22 11111 44 5 11111111 7 7 7 9 00 6 0 0 00000000 8 0 55 000
consensus : GTGACATCAT-AAGTAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCAGTTNAN-T-C--------TT-ATNA-ACACCC-CT-T--T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTT-AAGG--GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
Reference ( family-793 ) : GTGACATCAT-AAGTAAACAATGTAGA--CTGAGATCA-ACCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTCAGTTCAN-T-C--------TT-ATNA-ACACCC-CT-T--T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTT-ANGG--GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
gi|1 : T------AACTC---ATCTG-------CAGCCTGTTTGCAGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTCA-TTCAT-T-TGTTTTCTGTT-TTGA-ACACTC-CTAC--T--AAATG-GTAATGGATCTGTC--TGAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGT-AGAGT-CTATT-AAAGAAATTC--ATTA-GATT-ACGG--
gi|10 : aatgtcaacatctgcaaataatgtacgccaggaacagcatacttgtaaataGTCTGATCACAGTTTACATTGTTGTG-----TCAGTCAGTATTG-T-T--------TT-ATTA-ACACCC-CT-TTCT--AAATG-CAAATGAAATGGCC--C--------AAC--AA-GCA--------T-GGA-AGAGT-CTATT--CAGCAA
gi|11 : aagCATTGTT-TC-CCTTTTGGTCTAT--AT-T-C--------AT-ATTA-TCACCC-CT-TC-T--ATATA-ATAATGGAATA-TT--CAAT-----AATGTAG-GGA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-GTAGAAATTC--AGCA-AATT-
gi|12 : T------AACTC---AT-----------GGGCTGATCATGTTCTACATTATT-TG-GCCTTTATTATGTAAAA-T-T--------TTCAAAA-AAGGCC-CT-T--T--AAATG-ATAATGGAATGACC--CAAA-----ta
gi|13 : agctagggataagTTGTT-TG-TTGCTCAGTCAGATAAT-T-G--------TT-GTTA-TT-CTC-TT-T--T--TAATG-AT---GGAATGGTC--TTAT-----AAC--AT-GCT--------T-TGA-AGAGT-CTATT-ATAGCAGTTC--AGTA-A
gi|14 : ACATTGTT-TG-GCT------------AT-T-A--------TT-ATTA-GTACCC-CT-C--C--AAATG-ATAATGGAGTGATC--CGAA-----ATC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AG
gi|15 : C-TT-C--T--AAATG-ATTATTGAATATTC--CAAA-----GAC--AA-GGG--------T-GAA-AGAGT-CAATA-ACAGAAATTC--AACA-
gi|16 : TGAAGTGATC--CCAA-----AGC--AA-GGA--------TAGAA-AAAGT-CTATTCACAGAAATTCTGAACATAGTC-AAG
gi|17 : --T--AAGTG-ATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AA-TAA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-ACAc
gi|18 : GTGACATCAT-AAGTAAACAATGTAGA--CTGATATCA-ACC
gi|2 : GTGACATCAT-AAGTTAACAATGCAGA--CTAAGGTCA-ACCT------AAC-----ATTCA-------CAAGCTGTTTAGGGTTTACAGCATG-TG-GCTCTCAGTCAGCTCAA-T-C--------TT-AAAA-ACACCC-CT-T--T--AAATG-ATAATGGAATGATC--CAAA-----TAT--GA-GGA--------T-GGA-AAAGT-CTATT-ACAGAAAAAC--AAGA-GGTT-ACAG--GT---ATAAA
gi|3 : GACACCAT-ATGTATACAATGTAGA--C-GGGATCA-GCTTGTGAGTAACTCTTGATTTATTAATTTCTGTCTGATCAGGATTTA---------G-GTGCTCAGCCAGTT--G-T-C--------TT-GTTA-TTCTCC-TT-C--T--TAATG-ATAATGAACTGG-C--TAAATCAATAAC--AA-GGC--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATAC--AGAA-GGTT-actgttaacattaa
gi|4 : caaaTTATATTGTT-TG-ACTCTATGTGAGTTAAT-T-A--------TT-ATTATATACCCTCT-T--T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--AAAC-----AAT--AA-TTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ACAGAAATCA--AGCA-AATT-AAGG--GTTAACTGAACTCCACA---TAAAATTAA
gi|5 : TCTGACCAGAATGTGTATTGTT-TG-GTGCTCAGTCTATACACATAC--------TT-ATT-----CCC-CT-TC-T--AAATG-ATAATGCAAGGGTC--CACA-----AAC--AA-CTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ATAAAGATTC--ACCA-AGTT-AAGG--A----GTAAAtccatttacacagaatacataccctatataggtgg
gi|6 : cctgcaagaagcccttgctctctttaataAAACAATGTAGATTCTGAGGACACGCTT--------CTC---ACT-----------GTTTGATCTGGCTCTACCTTGTtctgagaa
gi|6 : TCAGAATCTACATTGTT-TG-GCTTTATATCAGTTAAT-T-C--------TTTAAAA-ACACCC-CT-T-----AAGTACATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AATAGAAAATGATCT-GGAGAGAGT--TATA-ATAAAAAggctttatatcagttaattctttaaaaacaccccttaagtacataatggaatggtctaaaaacaatagaaaatgatctggagagagttataataaaaaaacacaaaattat
gi|7 : acaaggtagagccagatcaaacagtgagaagcgtgtccTGATATCATAAAACAATCAACGTAAA--CT---------CCT--------CTC---CT--G-------CAATCTGATTAGGGTTTACA-TGTT-TGAGCTCTTGGTCAG----A-T-C--------TC-ATAA-ACTCAC-C----------ATG-GGAACGGAACTGTCTGCAAATT---GAT--AA-CAA--------T-GGA-AGAGTACTAaacacaaaattat
gi|8 : aaC-TT-T--C--AAATT-ATTATGGAATAATC--TAAA-----TAT--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ATAGGAAATC--AGCA-AATTCAGGGTAGT---GTCAGGT--ACAGATCAAGATTAAgt
gi|9 : G-------CAGGCGGATCTTGAACTATATTGTT-TG-TCTTTCTGTCAGTTC-T-T-T--------AC-ATGA-ACAACC-CT-T--TCTAAATG-ATAATGAAATAGTG--TAAG-----AGC--AA-GGA--------tcaatccacaagtgaatatattctgttatatggtgaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GCAATGTTGACCCAGGTCAGTCAGCAAGTTTCTTGAT
Alignments
lowQualScore : 1 11 55555555555555555555555555 22222222222222 222222222 11 222
lowQualScore : 0 11 555555 99 11111111111111111111111111 0 0 1 3 33 2 7 33333333333333 44 6 1 3333 2 2 9999 2 33 99999 33 2 99999999 2 2 2 2 55 3 999999999 0 1 77 111
lowQualScore : . .. ...... .. .......................... . . . . .. . . .............. .. . . .... . . .... . .. ..... .. . ........ . . . . .. . ......... . . .. ...
lowQualScore : 0 00 222222 44 11111111111111111111111111 3 7 4 1 99 2 0 33333333333333 55 2 0 5555 7 7 3333 5 22 11111 44 5 11111111 7 7 7 9 00 6 000000000 8 0 55 000
consensus : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GTTNAN-T-CTT-ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
Reference ( family-793 ) : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GTTNAN-T-CTT-ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
gi|1 : T------AACTC---ATCTG-------CAGCCTGTTTGCAGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTCATTCATTTGTTTTC-T-GTT-TTGA-ACACTC-CTAC-T--AAATG-GTAATGGATCTGTC--TGAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGT-AGAGT-CTATT-AAAGAAATTC--ATTA-GATTACGG---
gi|10 : aatgtcaacatctgcaaataatgtacgccaggaacagcatacttgtaaataGTCTGATCACAGTTTACATTGTTGTG-----TCAGTCA-------GTATTG-T-TTT-ATTA-ACACCC-CT-T-TCTAAATG-CAAATGAAATGGCC--CAA--------C--AA-GCA--------T-GGA-AGAGT-CTATT--CAGCAA
gi|11 : aagCATTGTT-TC-CCTTTTGGTC---------TATAT-T-CAT-ATTA-TCACCC-CT-TCT--ATATA-ATAATGGAATA-TT--CAAT-----AATGTAG-GGA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-GTAGAAATTC--AGCA-AATT
gi|12 : T------AACTC---AT-----------GGGCTGATCATGTTCTACATTATT-TG-GC-CTTTATTAT------GTAAAA-T-TTTCAAAA-AAGGCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGACC--CAAA-----ta
gi|13 : agctagggataagTTGTT-TG-TTGCTCAGTCA-------GATAAT-T-GTT-GTTA-TT-CTC-TT-T-T--TAATG-AT---GGAATGGTC--TTAT-----AAC--AT-GCT--------T-TGA-AGAGT-CTATT-ATAGCAGTTC--AGTA-A
gi|14 : ACATTGTT-TG-GCT-------------------AT-T-ATT-ATTA-GTACCC-CT-C-C--AAATG-ATAATGGAGTGATC--CGAA-----ATC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AG
gi|15 : C-TT-C-T--AAATG-ATTATTGAATATTC--CAAA-----GAC--AA-GGG--------T-GAA-AGAGT-CAATA-ACAGAAATTC--AACA-
gi|16 : TGAAGTGATC--CCAA-----AGC--AA-GGA--------TAGAA-AAAGT-CTATTCACAGAAATTCTGAACATAGTCAAG
gi|17 : -T--AAGTG-ATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AA-TAA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-ACAc
gi|18 : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGATATCA-ACC
gi|2 : GTGACATCATAAG-TTAACAATGCAGA--CTAAGGTCA-ACCT------AAC-----ATTCA-------CAAGCTGTTTAGGGTTTACAGCATG-TG-GCTCTCAGTCA-------GCTCAA-T-CTT-AAAA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGATC--CAAA-----TAT--GA-GGA--------T-GGA-AAAGT-CTATT-ACAGAAAAAC--AAGA-GGTTACAG---GT---ATAAA
gi|3 : GACACCATATG-TATACAATGTAGA--C-GGGATCA-GCTTGTGAGTAACTCTTGATTTATTAATTTCTGTCTGATCAGGATTTA---------G-GTGCTCAGCCA-------GTTG---T-CTT-GTTA-TTCTCC-TT-C-T--TAATG-ATAATGAACTGG-C--TAAATCAATAAC--AA-GGC--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATAC--AGAA-GGTTactgttaacattaa
gi|4 : caaaTTATATTGTT-TG-ACTCTATGTGA-------GTTAAT-T-ATT-ATTATATACCCTCT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--AAAC-----AAT--AA-TTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ACAGAAATCA--AGCA-AATTAAGG---GTTAACTGAACTCCACA---TAAAATTAA
gi|5 : TCTGACCAGAATGTGTATTGTT-TG-GTGCTCAGTCT-------ATACACATACTT-ATT-----CCC-CT-TCT--AAATG-ATAATGCAAGGGTC--CACA-----AAC--AA-CTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ATAAAGATTC--ACCA-AGTTAAGG---A----GTAAAtccatttacacagaatacataccctatataggtgg
gi|6 : cctgcaagaagcccttgctctctttaataAAACAATGTAGATTCTGAGGACACGCTT--------CTC---ACT-----------GTTTGATCTGGCTCTACCTTGTtctgagaa
gi|6 : TCAGAATCTACATTGTT-TG-GCTTTATATCA-------GTTAAT-T-CTTTAAAA-ACACCC-CT-T----AAGTACATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AATAGAAAATGATCT-GGAGAGAGT--TATA-ATAAAAAggctttatatcagttaattctttaaaaacaccccttaagtacataatggaatggtctaaaaacaatagaaaatgatctggagagagttataataaaaaaacacaaaattat
gi|7 : acaaggtagagccagatcaaacagtgagaagcgtgtccTGATATCATAAAACAATCAACGTAAA--CT---------CCT--------CTC---CT--G-------CAATCTGATTAGGGTTTACA-TGTT-TGAGCTCTTGGTCA-------G----A-T-CTC-ATAA-ACTCAC-C---------ATG-GGAACGGAACTGTCTGCAAATT---GAT--AA-CAA--------T-GGA-AGAGTACTAaacacaaaattat
gi|8 : aaC-TT-T-C--AAATT-ATTATGGAATAATC--TAAA-----TAT--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ATAGGAAATC--AGCA-AATTCAGGGTAGT---GTCAGGT--ACAGATCAAGATTAAgt
gi|9 : G-------CAGGCGGATCTTGAACTATATTGTT-TG-TCTTTCTGTCA-------GTTC-T-T-TAC-ATGA-ACAACC-CT-T-TCTAAATG-ATAATGAAATAGTG--TAAG-----AGC--AA-GGA--------tcaatccacaagtgaatatattctgttatatggtgaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GCAATGTTGACCCAGGTCAGTCAGCAAGTTTCTTGAT
Alignments
lowQualScore : 1 11 55555555555555555555555555 22222222222222 222222222 11 222
lowQualScore : 0 11 555555 99 11111111111111111111111111 0 0 1 3 33 2 7 33333333333333 44 6 1 3333 2 2 9999 2 33 99999 33 2 99999999 2 2 2 2 55 3 999999999 0 1 77 111
lowQualScore : . .. ...... .. .......................... . . . . .. . . .............. .. . . .... . . .... . .. ..... .. . ........ . . . . .. . ......... . . .. ...
lowQualScore : 0 00 222222 44 11111111111111111111111111 3 7 4 1 99 2 0 33333333333333 55 2 0 5555 7 7 3333 5 22 11111 44 5 11111111 7 7 7 9 00 6 000000000 8 0 55 000
consensus : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GTTNAN-T-CTT-ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
Reference ( family-793 ) : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GTTNAN-T-CTT-ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
gi|1 : T------AACTC---ATCTG-------CAGCCTGTTTGCAGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTCATTCATTTGTTTTC-T-GTT-TTGA-ACACTC-CTAC-T--AAATG-GTAATGGATCTGTC--TGAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGT-AGAGT-CTATT-AAAGAAATTC--ATTA-GATTACGG---
gi|10 : aatgtcaacatctgcaaataatgtacgccaggaacagcatacttgtaaataGTCTGATCACAGTTTACATTGTTGTG-----TCAGTCA-------GTATTG-T-TTT-ATTA-ACACCC-CT-T-TCTAAATG-CAAATGAAATGGCC--CAA--------C--AA-GCA--------T-GGA-AGAGT-CTATT--CAGCAA
gi|11 : aagCATTGTT-TC-CCTTTTGGTC---------TATAT-T-CAT-ATTA-TCACCC-CT-TCT--ATATA-ATAATGGAATA-TT--CAAT-----AATGTAG-GGA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-GTAGAAATTC--AGCA-AATT
gi|12 : T------AACTC---AT-----------GGGCTGATCATGTTCTACATTATT-TG-GC-CTTTATTAT------GTAAAA-T-TTTCAAAA-AAGGCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGACC--CAAA-----ta
gi|13 : agctagggataagTTGTT-TG-TTGCTCAGTCA-------GATAAT-T-GTT-GTTA-TT-CTC-TT-T-T--TAATG-AT---GGAATGGTC--TTAT-----AAC--AT-GCT--------T-TGA-AGAGT-CTATT-ATAGCAGTTC--AGTA-A
gi|14 : ACATTGTT-TG-GCT-------------------AT-T-ATT-ATTA-GTACCC-CT-C-C--AAATG-ATAATGGAGTGATC--CGAA-----ATC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AG
gi|15 : C-TT-C-T--AAATG-ATTATTGAATATTC--CAAA-----GAC--AA-GGG--------T-GAA-AGAGT-CAATA-ACAGAAATTC--AACA-
gi|16 : TGAAGTGATC--CCAA-----AGC--AA-GGA--------TAGAA-AAAGT-CTATTCACAGAAATTCTGAACATAGTCAAG
gi|17 : -T--AAGTG-ATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AA-TAA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-ACAc
gi|18 : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGATATCA-ACC
gi|2 : GTGACATCATAAG-TTAACAATGCAGA--CTAAGGTCA-ACCT------AAC-----ATTCA-------CAAGCTGTTTAGGGTTTACAGCATG-TG-GCTCTCAGTCA-------GCTCAA-T-CTT-AAAA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGATC--CAAA-----TAT--GA-GGA--------T-GGA-AAAGT-CTATT-ACAGAAAAAC--AAGA-GGTTACAG---GT---ATAAA
gi|3 : GACACCATATG-TATACAATGTAGA--C-GGGATCA-GCTTGTGAGTAACTCTTGATTTATTAATTTCTGTCTGATCAGGATTTA---------G-GTGCTCAGCCA-------GTTG---T-CTT-GTTA-TTCTCC-TT-C-T--TAATG-ATAATGAACTGG-C--TAAATCAATAAC--AA-GGC--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATAC--AGAA-GGTTactgttaacattaa
gi|4 : caaaTTATATTGTT-TG-ACTCTATGTGA-------GTTAAT-T-ATT-ATTATATACCCTCT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--AAAC-----AAT--AA-TTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ACAGAAATCA--AGCA-AATTAAGG---GTTAACTGAACTCCACA---TAAAATTAA
gi|5 : TCTGACCAGAATGTGTATTGTT-TG-GTGCTCAGTCT-------ATACACATACTT-ATT-----CCC-CT-TCT--AAATG-ATAATGCAAGGGTC--CACA-----AAC--AA-CTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ATAAAGATTC--ACCA-AGTTAAGG---A----GTAAAtccatttacacagaatacataccctatataggtgg
gi|6 : cctgcaagaagcccttgctctctttaataAAACAATGTAGATTCTGAGGACACGCTT--------CTC---ACT-----------GTTTGATCTGGCTCTACCTTGTtctgagaa
gi|6 : TCAGAATCTACATTGTT-TG-GCTTTATATCA-------GTTAAT-T-CTTTAAAA-ACACCC-CT-T----AAGTACATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AATAGAAAATGATCT-GGAGAGAGT--TATA-ATAAAAAggctttatatcagttaattctttaaaaacaccccttaagtacataatggaatggtctaaaaacaatagaaaatgatctggagagagttataataaaaaaacacaaaattat
gi|7 : acaaggtagagccagatcaaacagtgagaagcgtgtccTGATATCATAAAACAATCAACGTAAA--CT---------CCT--------CTC---CT--G-------CAATCTGATTAGGGTTTACA-TGTT-TGAGCTCTTGGTCA-------G----A-T-CTC-ATAA-ACTCAC-C---------ATG-GGAACGGAACTGTCTGCAAATT---GAT--AA-CAA--------T-GGA-AGAGTACTAaacacaaaattat
gi|8 : aaC-TT-T-C--AAATT-ATTATGGAATAATC--TAAA-----TAT--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ATAGGAAATC--AGCA-AATTCAGGGTAGT---GTCAGGT--ACAGATCAAGATTAAgt
gi|9 : G-------CAGGCGGATCTTGAACTATATTGTT-TG-TCTTTCTGTCA-------GTTC-T-T-TAC-ATGA-ACAACC-CT-T-TCTAAATG-ATAATGAAATAGTG--TAAG-----AGC--AA-GGA--------tcaatccacaagtgaatatattctgttatatggtgaa
blockSeqs : A TT TAAGGT CG GTGAGTAACTCTTGATTTATTAATTT G G AG T A TGTAAAA AC C T TATA T . TCT C TG TCAAT GT T AAATGATC A G A C TG T GTTAAC G . GAT
blockSeqs : . . TGAGGA A AACATTCA T . C G G ATACACA T T T ACA . . TCT . . TT . . . . . . . . . GTAGTG
blockSeqs : . . GGGAT G AACTCAT G . G T T GTATTG C . A TCA . . CT . . . . . . . . . . . . AG
blockSeqs : . T . CTCACT A . T T A GATAAT T . T AAG . . CT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : CTCCTG A . G G A GCTCAA G . T GTA . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . G T A GTTAAT A . A ACA . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . G G T GTTAAT C . T TTC . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . A T A TATAT C . T ACA . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . G T T GTTCT A . T ACT . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G T G GTTG C . A ACA . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . T AT C . A TT . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GA T . G . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : AACTCACT****************** GTTAAT********
originalCons : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AACTC---ATTCG-------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GTTNAN-T-CTT-ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
finalCons : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCTAACTCACT------------------CAGTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCAGTTAAT--------T-CTT-ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GCAATGTTGACCCAGGTCAGTCAGCAAGTTTCTTGAT
Alignments
lowQualScore : 1 11 66666666666666666666666666666666 333333333333333 222222222 11 222
lowQualScore : 0 11 555555 99 88888888888888888888888888888888 0 3 33 2 7 111111111111111 5555 44 555 1 3333 2 2 5 66 2 33 99999 33 2 99999999 2 2 2 2 55 3 999999999 0 1 77 111
lowQualScore : . .. ...... .. ................................ . . .. . . ............... .... .. ... . .... . . . .. . .. ..... .. . ........ . . . . .. . ......... . . .. ...
lowQualScore : 0 00 222222 44 99999999999999999999999999999999 9 1 99 2 0 222222222222222 5555 22 444 0 5555 7 7 0 99 5 22 11111 44 5 11111111 7 7 7 9 00 6 000000000 8 0 55 000
consensus : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AAC--TC---A-CT-CA---------GTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GT-TA-A-TT--C-T--T---ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
Reference ( family-793 ) : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGAGGTCA-GCCT------AAC--TC---A-CT-CA---------GTCTGATCAGGGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCGGTCA-------GT-TA-A-TT--C-T--T---ATNA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--CAAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AGTTAAGG---GT---GTAAANTCCACAGATCAAGATTAA
gi|1 : T------AAC--TC---ATCTGCA---------GCCTGTTTGCAGTTTACATTGTT-TG-GCTCTCAGTCATTCATTTGT-T----TT--C-TGTT---TTGA-ACACTC-CTAC-T--AAATG-GTAATGGATCTGTC--TGAA-----AAC--AA-GGA--------T-GGT-AGAGT-CTATT-AAAGAAATTC--ATTA-GATTACGG---
gi|10 : aatgtcaacatctgcaaataatgtacgccaggaacagcatacttgtaaata---------GTCTGATCACAGTTTACATTGTTGTG-----TCAGTCA-------GT----A-TTGTT-T--T---ATTA-ACACCC-CT-T-TCTAAATG-CAAATGAAATGGCC--CAA--------C--AA-GCA--------T-GGA-AGAGT-CTATT--CAGCAA
gi|11 : aagCATTGTT-TC-CCTTTTGGTC-----------TATA-TT--C-A--T---ATTA-TCACCC-CT-TCT--ATATA-ATAATGGAATA-TT--CAAT-----AATGTAG-GGA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-GTAGAAATTC--AGCA-AATT
gi|12 : T------AAC--TC---A-T---G---------GGCTGATCATGTTCTACATTATT-TG-GC-CTTTATTAT------GT-AA-AATT--T-T--C---AAAA-AAGGCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGACC--CAAA-----ta
gi|13 : agctagggataagTTGTT-TG-TTGCTCAGTCA-------GA-TA-A-TT--G-T--T---GTTA-TT-CTC-TT-T-T--TAATG-AT---GGAATGGTC--TTAT-----AAC--AT-GCT--------T-TGA-AGAGT-CTATT-ATAGCAGTTC--AGTA-A
gi|14 : ACATTGTT-TG-GCT---------------------A-TT--A-T--T---ATTA-GTACCC-CT-C-C--AAATG-ATAATGGAGTGATC--CGAA-----ATC--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATTC--AGCA-AG
gi|15 : C-TT-C-T--AAATG-ATTATTGAATATTC--CAAA-----GAC--AA-GGG--------T-GAA-AGAGT-CAATA-ACAGAAATTC--AACA-
gi|16 : TGAAGTGATC--CCAA-----AGC--AA-GGA--------TAGAA-AAAGT-CTATTCACAGAAATTCTGAACATAGTCAAG
gi|17 : -T--AAGTG-ATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AA-TAA--------T-GGA-AGAGT-TCATT-ACAc
gi|18 : GTGACATCATAAG-TAAACAATGTAGA--CTGATATCA-ACC
gi|2 : GTGACATCATAAG-TTAACAATGCAGA--CTAAGGTCA-ACCT------AACATTC---A----CA---------AGCTGTTTAGGGTTTACAGCATG-TG-GCTCTCAGTCA-------GC-TC-A-AT--C-T--T---AAAA-ACACCC-CT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGATC--CAAA-----TAT--GA-GGA--------T-GGA-AAAGT-CTATT-ACAGAAAAAC--AAGA-GGTTACAG---GT---ATAAA
gi|3 : GACACCATATG-TATACAATGTAGA--C-GGGATCA-GCTTGTGAGTAAC--TCTTGA-TT-TATTAATTTCTGTCTGATCAGGATTTA---------G-GTGCTCAGCCA-------GT-TG----T--C-T--T---GTTA-TTCTCC-TT-C-T--TAATG-ATAATGAACTGG-C--TAAATCAATAAC--AA-GGC--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ACAGAAATAC--AGAA-GGTTactgttaacattaa
gi|4 : caaaTTATATTGTT-TG-ACTCTATGTGA-------GT-TA-A-TT--A-T--T---ATTATATACCCTCT-T-T--AAATG-ATAATGGAATGGTC--AAAC-----AAT--AA-TTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ACAGAAATCA--AGCA-AATTAAGG---GTTAACTGAACTCCACA---TAAAATTAA
gi|5 : TCTGACCAGAATGTGTATTGTT-TG-GTGCTCAGTCT-------ATACACA-TA--C-T--T---ATT-----CCC-CT-TCT--AAATG-ATAATGCAAGGGTC--CACA-----AAC--AA-CTA--------T-GGA-AGAGT-CCATT-ATAAAGATTC--ACCA-AGTTAAGG---A----GTAAAtccatttacacagaatacataccctatataggtgg
gi|6 : cctgcaagaagcccttgctctctttaataAAACAATGTAGATTCTGAGGACACGCTT--------C--TC---A-CT------------GTTTGATCTGGCTCTACCTTGTtctgagaa
gi|6 : TCAGAATCTACATTGTT-TG-GCTTTATATCA-------GT-TA-A-TT--CTT--T---AAAA-ACACCC-C--T-T--AAGTACATAATGGAATGGTC--TAAA-----AAC--AATAGAAAATGATCT-GGAGAGAGT--TATA-ATAAAAAggctttatatcagttaattctttaaaaacaccccttaagtacataatggaatggtctaaaaacaatagaaaatgatctggagagagttataataaaaaaacacaaaattat
gi|7 : acaaggtagagccagatcaaacagtgagaagcgtgtccTGATATCATAAAACAATCAACGTAAA--CT---------CCT--------C--TC-----CTGCA---------ATCTGATTAGGGTTTACA-TGTT-TGAGCTCTTGGTCA-------G---A----T--C-T--C---ATAA-ACTCAC-C---------ATG-GGAACGGAACTGTCTGCAAATT---GAT--AA-CAA--------T-GGA-AGAGTACTAaacacaaaattat
gi|8 : aaC-TT-T-C--AAATT-ATTATGGAATAATC--TAAA-----TAT--AA-GGA--------T-GGA-AGAGT-CTATT-ATAGGAAATC--AGCA-AATTCAGGGTAGT---GTCAGGT--ACAGATCAAGATTAAgt
gi|9 : TATATTGTT-TG-TCTTTCTGTCA-------GT-T--------C-T--TTACATGA-ACAACC-CT-T-TCTAAATG-ATAATGAAATAGTG--TAAG-----AGC--AA-GGA--------tcaatccacaagtgaatatattctgttatatggtgaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GCAATGTTGACCCAGGTCAGTCAGCAAGTTTCTTGAT