lowQualScore                  :                                    11111111111111111111                                           1       111111                111                                          1111111                     1111                   
lowQualScore                  :      2           111  8888888    1 66666666666666666666  44444      1 2222    22     11 6   1     2       555555 1    1    22   777        1   2          3  111     11  11  9999999       1  222        6666 33 3 1 1  22      
lowQualScore                  :      .           ...  .......    . ....................  .....      . ....    ..     .. .   .     .       ...... .    .    ..   ...        .   .          .  ...     ..  ..  .......       .  ...        .... .. . . .  ..      
lowQualScore                  :      3           888  6666666    1 99999999999999999999  77777      1 4444    44     44 8   1     6       000000 0    1    88   999        1   1          5  999     55  55  5555555       3  333        5555 77 1 5 5  55      
consensus                     :    CATAGATGCATGCAT--AT---A---ATAA-TA-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TTATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGG--TTT--TTAAAAACA-AAA-TCATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGT
Reference ( gi|8 )            :    CACAGATGCATGCAT--AT---G---ATAA-TG-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TCATA-AGCTTTAATTTAA-----AT-GTTT-AGGG--TTT--ATAAAAACA-AAA-TCATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGT
gi|4                          :    CACAGATGCATGCAT--ATTTTA---ATAA-TA-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TTATA-CGTTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGG--TTT--TTAAAAACA-AAT-TTATCTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTTCAATA---A--A-A-A-TA--TTGC
gi|12                         :   aCATAGATGCATGCAT--AG---T---ATAA-CA-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TCATA-AGCATGAATTTAA-----CA-GTTT-AAAG--TTT---TAAAAACA-AAA-CTATTTTGACAGA---GTTTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----AG-A-A-A-TA--TAGC
gi|9                          :    CATAGATGCATGCAT--AT---C---ATAT-TA--------------------------TGTTGT-G----GAAC-TGCTAA--TTATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AAGG--TTT--TTAAAAATA-AAG-TCATTTCGGCAGA---ATGTC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTCACAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGT
gi|18                         :   aCATAGATGCATCCAT--AT---A---ATAA-CA-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAT--TTATA-A-CTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGG--CTT--TTAAAAACA-AA----ATTTCGGCACA---GTGGC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTTACACT----A--A-A-A-T
gi|23                         :    CATATATACATGCAT--AT---A---GCAT-TA-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TAGTTG--TTATA-AGCTTGAATTTA---------------GGG--TTT--ATTAAAGCA-AAT-TCATTTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AA---TTTGTTATA---A--A-A-A-TA--TATCGtatgg
gi|24                         :    CATAGACGCATGCAT--AT---A---GTGA-TA-------------------AT-----TGTCAT-G----G-------TAA--TTATC-AGCTTTAATTTAA-----CT-GTTT-AGAT--TTT--TTAAAAACA-AAA-TCATTGCGGC--A---GTGCC--AA--TTA----T-TTTT--A-ACTGGTTCGCATG----A--A-A-A-TC--TA
gi|3                          :   aCATAGATGCATGTAT--AT---ATCAATAT-TA-------------------CT-----TATCAT-G----GAAA-C--------TATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTC-AGCA--CTT--TTAAAAACA-AAA-TCATTTCTGCAGA---GTGTC--AA--TTT----TACTTCTCG-AT---TTt
gi|30                         :   aCATAGATGCATGCA--------A---ATAA-TA-------------------AT-----TGTCAT-G----AAAA-TGGTTA--TTATT-AGCTTGGACTTTA-----CT-GTAA-AGGG--TTT--CTAGAAACA-AAA-TAATTTT---------GTGTC--AA--TTA------TTTCTCA-AT---TTTGTAAT----atactcacctatactaaatata
gi|20                         :  taCATAGATGCATGCAG--AT---G---ATAA-TA-------------------ATACA--TGTCCT-G----GAAA-AGGTAG--TTATACAGCTG-AATTGAA-----AT-GTTT-GGGA--TAT--TTAAAAACA-AAA-TCATTT---CAAA-----ATC--AA---------T-TTTTGCA-A------CGCAAT----A--A-A-A-
gi|32                         :    CACAGATGTATACCG--AT---A---ATAA-TG-------------------AA-----TGTTCT-G----GTAA-AAGTAG--TTTTA-AGTTTGAATTGAA-----TT-ATTT-AGAA--TTT--A-AAAA--A-AAA-TCATTACGGTCGA---GCGAC--AAATTTG----T-aagtttagca
gi|41                         : ataCATAGATGCATGCA--------G---ATAA-TA-------------------AT-----TCTCCT-G----GAAA-ACGTAA--CTATT-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTgccaa
gi|15                         :   aCATGGATGCA--CAT--ACA--G---ATAA-TT-------------------ATACATATCTCAT-------AAA-AGGTAA--GTTTA-AGCTTTAATTGGA-----CC-TTTT-AGGA--TTT-----AAAATA-AAA-TCATATCGACCAA---ATG----AG--ACA----T-TTTTGTA-AT---TTTGAATT----A--A-A-G-TG--
gi|6                          :  ataACAGATGCATACAG--AT---G---ATAA-GA-------------------AA-----TGCCCT-G----GAAA-AGGTAA--T--TT-GTCTTGAACTTTA-----CC-ATTT-GGGA--TTT---TAAAAATA-AAATTCATTTCGACCGA---ATGT---AA--T------A-TTTTGCA-AT---TTTTCAATCAAAA--A-A-A-TATTTAGCGT
gi|1                          :      tAGATGCATGCAT--AT---A---ATAA-TATTATTATAAATATAATATAAC-----TGTCAT-G----AAAA-TGGTTA--TTATA-AGCTTGAATTTAACTCTTAT-ATTA-ACGA--AAT--AAAAAAACG-AAA-TAATTTCGGCAGA---GAGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGCGAT----A--A-A-A-
gi|10                         :      tAGATGCATGTAG--AT---A---ATAA-CA-------------------AT-----TGTTCG-G----GAAA-ACGTAA--TTATA-AGCTTGACTTTAA-----AT-GACT-GGCA--TTT--TTTATACCA-AAA-TCACTTCGGCAAA---GTGTC--TA--T------T-TCTTTTA-AT---TTTGAAAT----A--GCA-A-TA--AAACGacattgc
gi|31                         :       AGATGCAT--ATTGAT---G---ATTA-TA-------------------AA-----CGTCCT-T----GAAA-GGGTAAGTTC----AGCTTGAATTCAA-----CC-TCTT-AGGA---TT--ATCAAAA-G-GAA-TCATTTCGGACGA----CGCT--AT--TTG-------TTTGCA-AC---TTTGCAgtt
gi|21                         :        tATGCATGCAT--AT---A---ATAA-TG-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TTGTA-AACTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGG--TTT--TTAAAAACA-AAA-TCATTTCGAC--A---GTGTC--AA--TTT----T-TTTTTCA-AT---TTTGCACT----A--A-ATA-TA--TAGtt
gi|7                          :      tgcATGCATGCAT--AT---A---ATAT-TA-------------------AA-----TTTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TTATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGA--TTTTAAT-AAAACA-AAA-TCATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTT-A-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCG
gi|13                         :      tatATGCATGCAT--AT---A---ATAT-TA-------------------AT-----TTCCGC-A----GAAA-TGGTAA--TAA-A-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTG-AGGG--TTT--TTAAAAACA-AAT-TCATTTTGGCAGG---GTGTC--AA--TTG-------TTTTCA-AT---TTTGTAAA----A--A-G-A-TA--TAGCGTat
gi|19                         :      tatATGCATGCAT--AC---A---ATAT-TA-------------------TT-----TTTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TTATA-AGCTTTAACT-----------GTTT-AGGG--TTT--TTAAAAACA-AAA-TCATTTTGGGAGA---TTGTC--AG--TCG------TTTTCCA-GT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGTt
gi|11                         :      tatATGCATGCAT--AT---A---ACAT-TA-------------------GT-----CTTCAT-G----GAAA-TAGTAA--TTATA-AGCTAAAATTTAT-----CC-TTTA-AGGG--TTT--TTAAAAACA-AAC-TCATTTCGGCAGA---ATATC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGg
gi|17                         :     atatATGCATGAAT--AT---A---AT---TA-------------------AT-----TTTTAT-G----AAAA-TAGTAA--TTATC-AGCTTAAATTTAAC----AT--TTT-AGGGATTTT--A-AAAAACA-AGA-TCATTTCTGAAGA---GTGTC--AA--ATG------TTTTTCA-AT---TTTGTAAT----A--A-A-A-TA--AAGTG
gi|35                         :      tttATGCATGCAT--AT---A---ATAT-CA-------------------GT-----TGTTAT-G----GAAA-TGGTAA--TAATA-AGCTTGAATTTAG-----CT-TTTT-AGGG--TTT--TTAAAAACACAAA-TCTTTTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTT----T-T
gi|27                         :         ATGCAAGTAT--AT---A---CTAT-TA-------------------AC-----TTTCAT-G----GAAA-TGGTAA--TTATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGG--TTA--TTAAAAACA-AAA-TCATTTTGGTAGAACTGTATC--AA--TT-----C-TTTTTAATAT---TTTG
gi|28                         :       atATGCATGCAC--AT---T---TTGA-TA-------------------AC-----TGTCCT-G----GAAAATGTGAA--TT-TA-AGCTTGAAT---A-----CT-GTTT-ACGA--TTT--TCAAAAACA-AAA-TTATTTCGGCCGA---GTGTC--AA--TTA----T-atata
gi|39                         :      tatATGCATGCAT--AT---A---ATAT-TC-------------------AT-----TGTCAT-G----AAAA-TGGTAA--TTACA-AGCTTGGATTTAA-----CT-TCGT-AGGG--TTacaataaaaaaatagtgt
gi|29                         :     atatATACATGCAG--AT---A---ATGA-TA-------------------AA-----TGTCAT-G----GA----------------------TAACTTA---------GTTT-AGGA--TTT--TTTAAAA-A-GAA-TCATTTCGGCCGA---GTGAC--AA--AT-----C-TTTTGCA-AT---TTT
gi|5                          :      atatTGCGTGCAT--AT---A---GTAA-TA-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TGGTAG--TTATA-AGCTTGAATTGAA-----CT-GTTG-AGGGTTTTT--TTAAAAACA-AAA-TAATTTCGGCTGA---GTGTC--AA--T------T-TTTTTCA-GT---TTAGATAT----A--A-A-A-AA--TAGCGTtacccgctctaattttataact
gi|37                         :      aaagTGCATGCAC--AA---A---ATAA-TA-------------------AA-----TA-CAT-G------------TAC--TTATT-AGCTTTAATTTAA-----CT-GTTTGAGAT--TTT--TTAAAAACA-AAA-TCATTTtgt
gi|16                         :             ATGCAT--AT---A---ACAA-TA-------------------AC-----TGTCAT-T----GTAA-AGATTA--TTATT-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGGG--ATT--TTTAAAACA-AAA-TTATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TAAGCAATA---A--A-A-A-TA--CAGCg
gi|22                         :        catagATACAA--AT---A---ATAA-TA-------------------CT-----TGTCATTGATTCGAAA-TAGTTA--TTATA-AGATTGGATTTAA-----CT-GTTT-AGAG--TTT--TTATT--TA-AAA-TCATTTCGGCAGA---GTGTT--AA--TT-----T-TGTTCCA-A----TTTGCTATG---A--A-A-A-TA--TAGCa
gi|34                         :             ATGCAA--AT---G---ATAA-T--------------------AC-----AATCCT-G----GAAC-GGGTAT--TTATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTT-AGAA--TTT--TTAAAAACA-AAAGTCATT-----------------------------T-TTTTGCA-AA---CTTGCAAC----A--A-A-A-
gi|14                         :              TGCAT--AT---A---ACAA-TC-------------------AT-----TGTCAT-G----GAAA-TAATAA--TTATA-AGCTAGAATTTTA-----TT-GTTT-AGTT--TTT--TTAAAA--A-AAA-TAATGTCGGCAGA---ATCTC--AA--TTGTTATT-TTTTTCA-AT---GTTGCAAT----A--AGA-A-TA--TAGCGTaaaat
gi|33                         :            ccTGCAG--AT---A---ATTA-TA-------------------AA-----TGTTCT-G----GAAA-AGGTAA--TTATA-TGCTTGAATTTAA-----CT-G-----GGA--TTT--TTAAAAGCA-AAA-TCATTTCGCCCGA---ATGTCTAAA--GTG----T-g
gi|26                         :              tGTAT--AT---G---ATAAATGTTT----------------AT-----TGT--T-G----GCAT-TTACAG--TTATA-AGCTTGAATTTAA-----CT-GTTA-AAGG--TTT--TCAGAAA-A-AAA-TCATTTCTGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGTAGT----A--A-A-A-TA--TAGTGTcataagtttttttata
gi|25                         :                   --AT---A---ATAA-TA-------------------AT-----TGTCCT-G----TAAG-AGGTAA--TTTTA-AGTTTGAAATTTA-----ATAGTTT-AAAA--TTC---TAAAAACA-AAA------------AA---GTGAC--GA--TT-----T-TTTTTTA-AT---TTTGCAAT----GACA-A-A-TA--AAGCt
gi|40                         :                                                          acagatagacgtaacgagAAA-AGGTTA--TTATA-AACTTGAATTTAA-----AT-ATTT-GGGA--TTT---TAAAAAAC-AAA-TCTTGTTGGTAGA---
gi|36                         :                                                                              A-TGATAA--TTATA-AGCTTGATTTTAA-----CT-GTTT-AGGG--ATT--TTAAAAACA-AAA-TCCTTTCGGC--A---GTGTC--AA--TT
gi|2                          :                                                                                                                 c-GTTA-AGGG--TTT--TTAGAAACA-AAG-TCATTTCAAC--A---GTGTC--AA--TTA------TTTTTAA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-ACTA--TAGCGTtgtaatgaaattat
gi|38                         :                                                        aattaatatagcaggaatgtaatttttaattctatttcaatgttcggtttccaaatatagtagtaGGG--TTT---TAAAAACA-AAA-TCATTTCGGCAGA---GTGTC--AT--TTG-------TTTCCA-GT---TTTGCAATA---A--A-A-A-TA--AAGCGTattt





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                               1111111                     1111                   
lowQualScore                  :                                                                            22    333  111 99999999999999999    2222  33  333      1 2222    22       1   1        1          1 1    11  3333333    1    1  1   1 1         3  111     11  11  7777777       1  222        5555 33 3 1 1  22      
lowQualScore                  :                                                                            ..    ...  ... .................    ....  ..  ...      . ....    ..       .   .        .          . .    ..  .......    .    .  .   . .         .  ...     ..  ..  .......       .  ...        .... .. . . .  ..      
lowQualScore                  :                                                                            66    222  999 55555555555555555    3333  66  000      1 3333    22       0   0        0          0 0    44  2222222    0    0  0   0 0         2  888     55  55  1111111       2  222        9999 55 0 5 5  44      
consensus                     :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGT
Reference ( family-775 )      :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGT
gi|1                          :                                                                    TAGATGCA--TGCAT--AT---AATAATATTATTATAAATATAA----TATAAC---TGTCAT-G----AAAA-TGGTTATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTCTTAT-A-----TTAACGAAATAAA-AAAA-CG-AAA-T-AATTTCGGCAGA---GAGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGCGAT----A--A-A-A-
gi|10                         :                                                                     AGATGCA--TGTAG--AT---A-----------------ATAA----CA--AT---TGTTCG-G----GAAA-ACGTAATT-ATA-AGCTTGAC-TTTAAATGAC-T-GGCA--TT-------TTTT-ATAC-CA-AAA-T-CACTTCGGCAAA---GTGTC--TA--T------T-TCTTTTA-AT---TTTGAAAT----A--GCA-A-TA--AAACGacattgc
gi|11                         :                                                                   ATATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ACAT----TA--GT---CTTCAT-G----GAAA-TAGTAATT-ATA-AGCTAAAA-TTTATCCTTT-A-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAC-T-CATTTCGGCAGA---ATATC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGgtt
gi|12                         :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AG---T-----------------ATAA----CA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATC-ATA-AGCATGAA-TTTAACAGTT-T-AAAG---T-------TTTA-AAAA-CA-AAA-C-TATTTTGACAGA---GTTTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----AG-A-A-A-TA--TAGC
gi|13                         :                                                                    TATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TA--AT---TTCCGC-A----GAAA-TGGTAATA-A-A-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-G-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAT-T-CATTTTGGCAGG---GTGTC--AA--TTG-------TTTTCA-AT---TTTGTAAA----A--A-G-A-TA--TAGCGT
gi|14                         :                                                                            --TGCAT--AT---A-----------------ACAA----TC--AT---TGTCAT-G----GAAA-TAATAATT-ATA-AGCTAGAA-TTTTATTGTT-T-AGTT--TT-------TTTA-AAA---A-AAA-T-AATGTCGGCAGA---ATCTC--AA--TTGTTATT-TTTTTCA-AT---GTTGCAAT----A--AGA-A-TA--TAGCGTt
gi|15                         :                                                                ccCATGGATGCACATACAG--AT---A-----------------ATTA----TAC-ATA--TCTCAT-------AAA-AGGTAAGT-TTA-AGCTTTAA-TTGGACCTTT-T-AGGA--TT-------T----AAAA-TA-AAA-T-CATATCGACCAA---ATG----AG--ACA----T-TTTTGTA-AT---TTTGAATT----A--A-A-G-TG--g
gi|16                         :                                                               ataCATAGATGCA--T------AT---A-----------------ACAA----TA--AC---TGTCAT-T----GTAA-AGATTATT-ATT-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--AT-------TTTT-AAAA-CA-AAA-T-TATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TAAGCAATA---A--A-A-A-TA--CAGC
gi|17                         :                                                                       ATGCA--TGAAT--AT---A-----------------AT------TA--AT---TTTTAT-G----AAAA-TAGTAATT-ATC-AGCTTAAA-TTTAACATTT-T-AGGG--AT-------TTTA-AAAAACA-AGA-T-CATTTCTGAAGA---GTGTC--AA--ATG----T-TTTT-CA-AT---TTTGTAAT----A--A-A-A-TA--AAGTGa
gi|18                         :                                                               tttCATAGATGCA--TCCAT--AT---A-----------------ATAA----CA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTATTT-ATA-A-CTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--CT-------TTTA-AAAA-CA-AA-----ATTTCGGCACA---GTGGC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTTACACT----A--A-A-A-T
gi|19                         :                                                                    TATATGCA--TGCAT--AC---A-----------------ATAT----TA--TT---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTT------TAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTTGGGAGA---TTGTC--AG--TCG------TTTTCCA-GT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGTtatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                           GTT-A-AGGG--TT-------TTTA-GAAA-CA-AAG-T-CATTTCAAC--A---GTGTC--AA--TTA------TTTTTAA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-ACTA--TAGCGTg
gi|20                         : aattaatatagcaggaatgtaatttttaattctatttcaatgttcggtttccaaatatagtagtaCATAGATGCA--TGCAG--AT---G-----------------ATAA----TA--ATACATGTCCT-G----GAAA-AGGTAGTT-ATACAGCT-GAA-TTGAAATGTT-T-GGGA--TA-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTT---CAAA-----ATC--AA---------T-TTTTGCA-A------CGCAAT----A--A-A-A-attt
gi|21                         :                                                                       ATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAA----TG--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-GTA-AACTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGAC--A---GTGTC--AA--TTT----T-TTTTTCA-AT---TTTGCACT----A--A-ATA-TA--TAGaagtttagca
gi|22                         :                                                                        tgcA--TACAA--AT---A-----------------ATAA----TA--CT---TGTCATTGATTCGAAA-TAGTTATT-ATA-AGATTGGA-TTTAACTGTT-T-AGAG--TT-------TTT---ATT-TA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTT--AA--TT-----T-TGTTCCA-A----TTTGCTATG---A--A-A-A-TA--TAGC
gi|23                         :                                                                  CATATATACA--TGCAT--AT---A-----------------GCAT----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TAGTTGTT-ATA-AGCTTGAA---------TT-T-AGGG--TT-------TATT-AAAG-CA-AAT-T-CATTTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AA---TTTGTTATA---A--A-A-A-TA--TATCG
gi|24                         :                                                                  CATAGACGCA--TGCAT--AT---A-----------------GTGA----TA--AT---TGTCAT-G----G-------TAATT-ATC-AGCTTTAA-TTTAACTGTT-T-AGAT--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTGCGGC--A---GTGCC--AA--TTA----T-TTTT--A-ACTGGTTCGCATG----A--A-A-A-TC--TA
gi|25                         :                                                                  aATAGACGTAA-CG-AG--AT---A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCCT-G----TAAG-AGGTAATT-TTA-AGTTTGAAATTTAATAGTT-T-AAAA--TT-------CT-A-AAAA-CA-AAA-------------AA---GTGAC--GA--TT-----T-TTTTTTA-AT---TTTGCAAT----GACA-A-A-TA--AAGCt
gi|26                         :                                                                           acagGTAT--AT---G-----------------ATAAATGTTT--AT---TGT--T-G----GCAT-TTACAGTT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-A-AAGG--TT-------TTCA-GAAA--A-AAA-T-CATTTCTGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGTAGT----A--A-A-A-TA--TAGTGT
gi|27                         :                                                                       ATGCA--AGTAT--AT---A-----------------CTAT----TA--AC---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------ATTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTTGGTAGAACTGTATC--AA--TT-----C-TTTTTAATAT---TTTGt
gi|28                         :                                                                  atTATATGCA--TGCAC--AT---T-----------------TTGA----TA--AC---TGTCCT-G----GAAAATGTGAATT--TA-AGCTTGAA-T---ACTGTT-T-ACGA--TT-------TTCA-AAAA-CA-AAA-T-TATTTCGGCCGA---GTGTC--AA--TTA----T-atata
gi|29                         :                                                                   ATATATACA--TGCAG--AT---A-----------------ATGA----TA--AA---TGTCAT-G----GA-------------TA-A-CTTA----------GTT-T-AGGA--TT-------TTTT-AAAA--A-GAA-T-CATTTCGGCCGA---GTGAC--AA--AT-----C-TTTTGCA-AT---TTTacaataaaaaaatagtgt
gi|3                          :                                                                  CATAGATGCA--TGTAT--AT---ATCA--------------ATAT----TA--CT---TATCAT-G----GAAA-C------T-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-C-AGCA--CT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCTGCAGA---GTGTC--AA--TTT----TACTTCTCG-AT---TTtacccgctctaattttataact
gi|30                         :                                                                 aCATAGATGCA--TGCA--------A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----AAAA-TGGTTATT-ATT-AGCTTGGA-CTTTACTGTA-A-AGGG--TT-------TCTA-GAAA-CA-AAA-T-AATTTT---------GTGTC--AA--TTA------TTTCTCA-AT---TTTGTAAT----atactcacctatactaaatata
gi|31                         :                                                                  taTAGATGCA--T--ATTGAT---G-----------------ATTA----TA--AA---CGTCCT-T----GAAA-GGGTAAGT--TC-AGCTTGAA-TTCAACCTCT-T-AGGA--TT-------ATCA-AAA---G-GAA-T-CATTTCGGACGA----CGCT--AT--TTG-------TTTGCA-AC---TTTGCA
gi|32                         :                                                                  CACAGATGTA--TACCG--AT---A-----------------ATAA----TG--AA---TGTTCT-G----GTAA-AAGTAGTT-TTA-AGTTTGAA-TTGAATTATT-T-AGAA-----------TTTA-AAAA--A-AAA-T-CATTACGGTCGA---GCGAC--AAATTTG----T-tt
gi|33                         :                                                                         ata--TGCAG--AT---A-----------------ATTA----TA--AA---TGTTCT-G----GAAA-AGGTAATT-ATA-TGCTTGAA-TTTAACTG------GGA--TT-------TTTA-AAAG-CA-AAA-T-CATTTCGCCCGA---ATGTCTAAA--GTG----T-gccaa
gi|34                         :                                                                          tA--TGCAA--AT---G-----------------ATAA----TAC-A-----ATCCT-G----GAAC-GGGTATTT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGAA--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAAGT-CATT-----------------------------T-TTTTGCA-AA---CTTGCAAC----A--A-A-A-cataagtttttttata
gi|35                         :                                                                       ATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----CA--GT---TGTTAT-G----GAAA-TGGTAATA-ATA-AGCTTGAA-TTTAGCTTTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CACAAA-T-CTTTTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTT----T-Taaaat
gi|36                         :                                                                                                                                            A-TGATAATT-ATA-AGCTTGAT-TTTAACTGTT-T-AGGG--AT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CCTTTCGGC--A---GTGTC--AA--TT
gi|37                         :                                                                       cTGCA--TGCAC--AA---A-----------------ATAA----TA--AA---TA-CAT-G------------TACTT-ATT-AGCTTTAA-TTTAACTGTT-TGAGAT--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTtgtaatgaaattat
gi|38                         :                                                                                                                                                                                -AGGG--GT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AT--TTG-------TTTCCA-GT---TTTGCAATA---A--A-A-A-TA--AAGCGTg
gi|39                         :                                                                   ATATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TC--AT---TGTCAT-G----AAAA-TGGTAATT-ACA-AGCTTGGA-TTTAACTTCG-T-AGGG--TT-------t
gi|4                          :                                                                  CACAGATGCA--TGCAT--ATTTTA-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-CGTTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAT-T-TATCTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTTCAATA---A--A-A-A-TA--TTGC
gi|40                         :                                                                                                                                         aAAA-AGGTTATT-ATA-AACTTGAA-TTTAAATATT-T-GGGA--TT-------TTAA-AAAA-C--AAA-T-CTTGTTGGTAGA---
gi|41                         :                                                                  CATAGATGCA--TGCA--------G-----------------ATAA----TA--AT---TCTCCT-G----GAAA-ACGTAACT-ATT-AGCTTGAA-TTTAACTGT
gi|5                          :                                                                       aTGCG--TGCAT--AT---A-----------------GTAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAGTT-ATA-AGCTTGAA-TTGAACTGTT-G-AGGGTTTT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-AATTTCGGCTGA---GTGTC--AA--T------T-TTTTTCA-GT---TTAGATAT----A--A-A-A-AA--TAGCGT
gi|6                          :                                                               aaagACAGATGCA--TACAG--AT---G-----------------ATAA----GA--AA---TGCCCT-G----GAAA-AGGTAATTTGT----CTTGAA-CTTTACCATT-T--GGG--AT-------TTTA-AAAA-TA-AAA-TTCATTTCGACCGA---ATGT---AA--T------A-TTTTGCA-AT---TTTTCAATCAAAA--A-A-A-TATTTAGCGTtgt
gi|7                          :                                                                   tTATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TA--AA---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGA--TT-------TTAATAAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTT-A-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCG
gi|8                          :                                                                  CACAGATGCA--TGCAT--AT---G-----------------ATAA----TG--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATC-ATA-AGCTTTAA-TTTAAATGTT-T-AGGG--TT-------TATA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGTat
gi|9                          :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---C-----------------ATAT----TA-------TGTTGT-G----GAAC-TGCTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AAGG--TT-------TTTA-AAAA-TA-AAG-T-CATTTCGGCAGA---ATGTC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTCACAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGT





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Reference ( family-775 )      :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGT
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gi|38                         :                                                                                                                                                                                -AGGG--GT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AT--TTG-------TTTCCA-GT---TTTGCAATA---A--A-A-A-TA--AAGCGTg
gi|39                         :                                                                   ATATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TC--AT---TGTCAT-G----AAAA-TGGTAATT-ACA-AGCTTGGA-TTTAACTTCG-T-AGGG--TT-------t
gi|4                          :                                                                  CACAGATGCA--TGCAT--ATTTTA-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-CGTTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAT-T-TATCTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTTCAATA---A--A-A-A-TA--TTGC
gi|40                         :                                                                                                                                         aAAA-AGGTTATT-ATA-AACTTGAA-TTTAAATATT-T-GGGA--TT-------TTAA-AAAA-C--AAA-T-CTTGTTGGTAGA---
gi|41                         :                                                                  CATAGATGCA--TGCA--------G-----------------ATAA----TA--AT---TCTCCT-G----GAAA-ACGTAACT-ATT-AGCTTGAA-TTTAACTGT
gi|5                          :                                                                       aTGCG--TGCAT--AT---A-----------------GTAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAGTT-ATA-AGCTTGAA-TTGAACTGTT-G-AGGGTTTT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-AATTTCGGCTGA---GTGTC--AA--T------T-TTTTTCA-GT---TTAGATAT----A--A-A-A-AA--TAGCGT
gi|6                          :                                                               aaagACAGATGCA--TACAG--AT---G-----------------ATAA----GA--AA---TGCCCT-G----GAAA-AGGTAATTTGT----CTTGAA-CTTTACCATT-T--GGG--AT-------TTTA-AAAA-TA-AAA-TTCATTTCGACCGA---ATGT---AA--T------A-TTTTGCA-AT---TTTTCAATCAAAA--A-A-A-TATTTAGCGTtgt
gi|7                          :                                                                   tTATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TA--AA---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGA--TT-------TTAATAAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTT-A-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCG
gi|8                          :                                                                  CACAGATGCA--TGCAT--AT---G-----------------ATAA----TG--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATC-ATA-AGCTTTAA-TTTAAATGTT-T-AGGG--TT-------TATA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGTat
gi|9                          :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---C-----------------ATAT----TA-------TGTTGT-G----GAAC-TGCTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AAGG--TT-------TTTA-AAAA-TA-AAG-T-CATTTCGGCAGA---ATGTC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTCACAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGT


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blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   AT            .  .          A    .  . . .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   GT            .  .          A    .  . . .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   GT            .  .          G    .  . . .  . 
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blockSeqs                     :                                                                            .     G    .   .                    .     .   .        . .       A        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   AT            .  .          A    .  . . .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       A        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   AT            .  .          A    .  . . .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   GT            .  .          A    .  . . .  . 
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blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       A        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   GT            .  .          .    .  . . .  . 
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blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   GT            .  .          .    .  . . .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   T             .  .          .    .  . . .  . 
blockSeqs                     :                                                                            .     G    .   .                    .     .   .        . .       A        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         C  .       .   .   G             .  .          .    .  . . .  . 
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blockSeqs                     :                                                                            .     T    .   .                    .     .   .        . .       T        .   .        .          . .    .   .          .    .  .   . .         A  .       .   .   G             .  .          .    .  . . .  . 
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Reference ( family-775 )      :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGT
gi|1                          :                                                                    TAGATGCA--TGCAT--AT---AATAATATTATTATAAATATAA----TATAAC---TGTCAT-G----AAAA-TGGTTATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTCTTAT-A-----TTAACGAAATAAA-AAAA-CG-AAA-T-AATTTCGGCAGA---GAGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGCGAT----A--A-A-A-
gi|10                         :                                                                     AGATGCA--TGTAG--AT---A-----------------ATAA----CA--AT---TGTTCG-G----GAAA-ACGTAATT-ATA-AGCTTGAC-TTTAAATGAC-T-GGCA--TT-------TTTT-ATAC-CA-AAA-T-CACTTCGGCAAA---GTGTC--TA--T------T-TCTTTTA-AT---TTTGAAAT----A--GCA-A-TA--AAACGacattgc
gi|11                         :                                                                   ATATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ACAT----TA--GT---CTTCAT-G----GAAA-TAGTAATT-ATA-AGCTAAAA-TTTATCCTTT-A-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAC-T-CATTTCGGCAGA---ATATC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGgtt
gi|12                         :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AG---T-----------------ATAA----CA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATC-ATA-AGCATGAA-TTTAACAGTT-T-AAAG---T-------TTTA-AAAA-CA-AAA-C-TATTTTGACAGA---GTTTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----AG-A-A-A-TA--TAGC
gi|13                         :                                                                    TATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TA--AT---TTCCGC-A----GAAA-TGGTAATA-A-A-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-G-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAT-T-CATTTTGGCAGG---GTGTC--AA--TTG-------TTTTCA-AT---TTTGTAAA----A--A-G-A-TA--TAGCGT
gi|14                         :                                                                            --TGCAT--AT---A-----------------ACAA----TC--AT---TGTCAT-G----GAAA-TAATAATT-ATA-AGCTAGAA-TTTTATTGTT-T-AGTT--TT-------TTTA-AAA---A-AAA-T-AATGTCGGCAGA---ATCTC--AA--TTGTTATT-TTTTTCA-AT---GTTGCAAT----A--AGA-A-TA--TAGCGTt
gi|15                         :                                                                ccCATGGATGCACATACAG--AT---A-----------------ATTA----TAC-ATA--TCTCAT-------AAA-AGGTAAGT-TTA-AGCTTTAA-TTGGACCTTT-T-AGGA--TT-------T----AAAA-TA-AAA-T-CATATCGACCAA---ATG----AG--ACA----T-TTTTGTA-AT---TTTGAATT----A--A-A-G-TG--g
gi|16                         :                                                               ataCATAGATGCA--T------AT---A-----------------ACAA----TA--AC---TGTCAT-T----GTAA-AGATTATT-ATT-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--AT-------TTTT-AAAA-CA-AAA-T-TATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TAAGCAATA---A--A-A-A-TA--CAGC
gi|17                         :                                                                       ATGCA--TGAAT--AT---A-----------------AT------TA--AT---TTTTAT-G----AAAA-TAGTAATT-ATC-AGCTTAAA-TTTAACATTT-T-AGGG--AT-------TTTA-AAAAACA-AGA-T-CATTTCTGAAGA---GTGTC--AA--ATG----T-TTTT-CA-AT---TTTGTAAT----A--A-A-A-TA--AAGTGa
gi|18                         :                                                               tttCATAGATGCA--TCCAT--AT---A-----------------ATAA----CA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTATTT-ATA-A-CTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--CT-------TTTA-AAAA-CA-AA-----ATTTCGGCACA---GTGGC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTTACACT----A--A-A-A-T
gi|19                         :                                                                    TATATGCA--TGCAT--AC---A-----------------ATAT----TA--TT---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTT------TAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTTGGGAGA---TTGTC--AG--TCG------TTTTCCA-GT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGTtatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                           GTT-A-AGGG--TT-------TTTA-GAAA-CA-AAG-T-CATTTCAAC--A---GTGTC--AA--TTA------TTTTTAA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-ACTA--TAGCGTg
gi|20                         : aattaatatagcaggaatgtaatttttaattctatttcaatgttcggtttccaaatatagtagtaCATAGATGCA--TGCAG--AT---G-----------------ATAA----TA--ATACATGTCCT-G----GAAA-AGGTAGTT-ATACAGCT-GAA-TTGAAATGTT-T-GGGA--TA-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTT---CAAA-----ATC--AA---------T-TTTTGCA-A------CGCAAT----A--A-A-A-attt
gi|21                         :                                                                       ATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAA----TG--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-GTA-AACTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGAC--A---GTGTC--AA--TTT----T-TTTTTCA-AT---TTTGCACT----A--A-ATA-TA--TAGaagtttagca
gi|22                         :                                                                        tgcA--TACAA--AT---A-----------------ATAA----TA--CT---TGTCATTGATTCGAAA-TAGTTATT-ATA-AGATTGGA-TTTAACTGTT-T-AGAG--TT-------TTT---ATT-TA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTT--AA--TT-----T-TGTTCCA-A----TTTGCTATG---A--A-A-A-TA--TAGC
gi|23                         :                                                                  CATATATACA--TGCAT--AT---A-----------------GCAT----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TAGTTGTT-ATA-AGCTTGAA---------TT-T-AGGG--TT-------TATT-AAAG-CA-AAT-T-CATTTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AA---TTTGTTATA---A--A-A-A-TA--TATCG
gi|24                         :                                                                  CATAGACGCA--TGCAT--AT---A-----------------GTGA----TA--AT---TGTCAT-G----G-------TAATT-ATC-AGCTTTAA-TTTAACTGTT-T-AGAT--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTGCGGC--A---GTGCC--AA--TTA----T-TTTT--A-ACTGGTTCGCATG----A--A-A-A-TC--TA
gi|25                         :                                                                  aATAGACGTAA-CG-AG--AT---A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCCT-G----TAAG-AGGTAATT-TTA-AGTTTGAAATTTAATAGTT-T-AAAA--TT-------CT-A-AAAA-CA-AAA-------------AA---GTGAC--GA--TT-----T-TTTTTTA-AT---TTTGCAAT----GACA-A-A-TA--AAGCt
gi|26                         :                                                                           acagGTAT--AT---G-----------------ATAAATGTTT--AT---TGT--T-G----GCAT-TTACAGTT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-A-AAGG--TT-------TTCA-GAAA--A-AAA-T-CATTTCTGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTGTAGT----A--A-A-A-TA--TAGTGT
gi|27                         :                                                                       ATGCA--AGTAT--AT---A-----------------CTAT----TA--AC---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------ATTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTTGGTAGAACTGTATC--AA--TT-----C-TTTTTAATAT---TTTGt
gi|28                         :                                                                  atTATATGCA--TGCAC--AT---T-----------------TTGA----TA--AC---TGTCCT-G----GAAAATGTGAATT--TA-AGCTTGAA-T---ACTGTT-T-ACGA--TT-------TTCA-AAAA-CA-AAA-T-TATTTCGGCCGA---GTGTC--AA--TTA----T-atata
gi|29                         :                                                                   ATATATACA--TGCAG--AT---A-----------------ATGA----TA--AA---TGTCAT-G----GA-------------TA-A-CTTA----------GTT-T-AGGA--TT-------TTTT-AAAA--A-GAA-T-CATTTCGGCCGA---GTGAC--AA--AT-----C-TTTTGCA-AT---TTTacaataaaaaaatagtgt
gi|3                          :                                                                  CATAGATGCA--TGTAT--AT---ATCA--------------ATAT----TA--CT---TATCAT-G----GAAA-C------T-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-C-AGCA--CT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCTGCAGA---GTGTC--AA--TTT----TACTTCTCG-AT---TTtacccgctctaattttataact
gi|30                         :                                                                 aCATAGATGCA--TGCA--------A-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----AAAA-TGGTTATT-ATT-AGCTTGGA-CTTTACTGTA-A-AGGG--TT-------TCTA-GAAA-CA-AAA-T-AATTTT---------GTGTC--AA--TTA------TTTCTCA-AT---TTTGTAAT----atactcacctatactaaatata
gi|31                         :                                                                  taTAGATGCA--T--ATTGAT---G-----------------ATTA----TA--AA---CGTCCT-T----GAAA-GGGTAAGT--TC-AGCTTGAA-TTCAACCTCT-T-AGGA--TT-------ATCA-AAA---G-GAA-T-CATTTCGGACGA----CGCT--AT--TTG-------TTTGCA-AC---TTTGCA
gi|32                         :                                                                  CACAGATGTA--TACCG--AT---A-----------------ATAA----TG--AA---TGTTCT-G----GTAA-AAGTAGTT-TTA-AGTTTGAA-TTGAATTATT-T-AGAA-----------TTTA-AAAA--A-AAA-T-CATTACGGTCGA---GCGAC--AAATTTG----T-tt
gi|33                         :                                                                         ata--TGCAG--AT---A-----------------ATTA----TA--AA---TGTTCT-G----GAAA-AGGTAATT-ATA-TGCTTGAA-TTTAACTG------GGA--TT-------TTTA-AAAG-CA-AAA-T-CATTTCGCCCGA---ATGTCTAAA--GTG----T-gccaa
gi|34                         :                                                                          tA--TGCAA--AT---G-----------------ATAA----TAC-A-----ATCCT-G----GAAC-GGGTATTT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGAA--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAAGT-CATT-----------------------------T-TTTTGCA-AA---CTTGCAAC----A--A-A-A-cataagtttttttata
gi|35                         :                                                                       ATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----CA--GT---TGTTAT-G----GAAA-TGGTAATA-ATA-AGCTTGAA-TTTAGCTTTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CACAAA-T-CTTTTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTT----T-Taaaat
gi|36                         :                                                                                                                                            A-TGATAATT-ATA-AGCTTGAT-TTTAACTGTT-T-AGGG--AT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CCTTTCGGC--A---GTGTC--AA--TT
gi|37                         :                                                                       cTGCA--TGCAC--AA---A-----------------ATAA----TA--AA---TA-CAT-G------------TACTT-ATT-AGCTTTAA-TTTAACTGTT-TGAGAT--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTtgtaatgaaattat
gi|38                         :                                                                                                                                                                                -AGGG--GT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AT--TTG-------TTTCCA-GT---TTTGCAATA---A--A-A-A-TA--AAGCGTg
gi|39                         :                                                                   ATATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TC--AT---TGTCAT-G----AAAA-TGGTAATT-ACA-AGCTTGGA-TTTAACTTCG-T-AGGG--TT-------t
gi|4                          :                                                                  CACAGATGCA--TGCAT--ATTTTA-----------------ATAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-CGTTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGG--TT-------TTTA-AAAA-CA-AAT-T-TATCTTGGCAGA---GTGTC--AA--TTG------TTTTTCA-AT---TTTTCAATA---A--A-A-A-TA--TTGC
gi|40                         :                                                                                                                                         aAAA-AGGTTATT-ATA-AACTTGAA-TTTAAATATT-T-GGGA--TT-------TTAA-AAAA-C--AAA-T-CTTGTTGGTAGA---
gi|41                         :                                                                  CATAGATGCA--TGCA--------G-----------------ATAA----TA--AT---TCTCCT-G----GAAA-ACGTAACT-ATT-AGCTTGAA-TTTAACTGT
gi|5                          :                                                                       aTGCG--TGCAT--AT---A-----------------GTAA----TA--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAGTT-ATA-AGCTTGAA-TTGAACTGTT-G-AGGGTTTT-------TTTA-AAAA-CA-AAA-T-AATTTCGGCTGA---GTGTC--AA--T------T-TTTTTCA-GT---TTAGATAT----A--A-A-A-AA--TAGCGT
gi|6                          :                                                               aaagACAGATGCA--TACAG--AT---G-----------------ATAA----GA--AA---TGCCCT-G----GAAA-AGGTAATTTGT----CTTGAA-CTTTACCATT-T--GGG--AT-------TTTA-AAAA-TA-AAA-TTCATTTCGACCGA---ATGT---AA--T------A-TTTTGCA-AT---TTTTCAATCAAAA--A-A-A-TATTTAGCGTtgt
gi|7                          :                                                                   tTATATGCA--TGCAT--AT---A-----------------ATAT----TA--AA---TTTCAT-G----GAAA-TGGTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AGGA--TT-------TTAATAAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTT-A-AT---TTTGTAATA---A--A-A-A-TA--TAGCG
gi|8                          :                                                                  CACAGATGCA--TGCAT--AT---G-----------------ATAA----TG--AT---TGTCAT-G----GAAA-TGGTAATC-ATA-AGCTTTAA-TTTAAATGTT-T-AGGG--TT-------TATA-AAAA-CA-AAA-T-CATTTCGGCAGA---GTGTC--AA--TTG----T-TTTTTCA-AT---TTTGCAAT----A--A-A-A-TA--TAGCGTat
gi|9                          :                                                                  CATAGATGCA--TGCAT--AT---C-----------------ATAT----TA-------TGTTGT-G----GAAC-TGCTAATT-ATA-AGCTTGAA-TTTAACTGTT-T-AAGG--TT-------TTTA-AAAA-TA-AAG-T-CATTTCGGCAGA---ATGTC--AA--TTG----T-TTTTTTA-AT---TTCACAATA---A--A-A-A-TA--TAGCGT