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gi|8 : GTCATGTTGAACACATATGTACTTATTTGTAGC---TTTTTTTTAATTCGCCGAAGGAAAATATAGATTTGATAAAATAGTACAAGTAGTTGATAGAGTTGGTTTAATATATACATATACCTT----TCTGTTACTTCAGAGGATCATTTTTGTTTATTACAAACACA-GAAAA-CAGAGTCAACAAAGTCAAATCCCCGATATTTTTTGCCCTTCTGTATACAAATAAGGTTATAAAGAATCCGGTTATAAGG-ATTGGCAG-----------------------ATAACTTTACGCT--AAT-GACTATACTGTTTTATGTTT------ATATACTTCAAGAGT
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originalCons : GTCATGGTGAACTCGTATGTACTTATTTGTAGC---TTTT-TTTAATTCGCCGGNGGAAAACATGGATTTGATAAAATAATACAAGTTGTTGATAGAGTTGGTTTAATATATACATATACCTT----TCTGTTACTTCAGAGGCTCATTTTTGTTTATTACAAACAAA-GAAAA-CATAGTCAACAAAGTCAAATCCCCGATA---TTTGCCCTTCTGTATAAAAATAAGGTTATAAAGAATCCGGTTACAAGGAATTGTCAGATACAGGCATGTTTTT--GTTAAATAACTTTACGTT--AAT-GAATATACTGTTTTAAGTTT------ATATATTTAAAGAGTTACTGTAGCTGGCAATATACTTAGTACGTTATCCAAGGACAAAACAGTNACTGCACAGTTTGATGTAGTTTAAGAAAATGGGATTACAGTCAGTGTTCAGCAAAGTCTTCCTCGTCACA---GAGAAGATTGAAAACATTAGGATCCATCTGATTATTTGCAATTTGCTTTGTTCCTGCAATATCGTAGGGCTTATCCTTAA-CGGTGTAGCTGCGAGATA--CATAA-----AACACTGT-----ACA---TGGCGCA-CTGTACATGC---CCC--C----CA--ACACACACATACACACCGGCGTAGCTACAC---------------GAAGGCACT--------------G--------------C--------------AC--TTTTCCCAGAAAAAA-ANAAGT-C-C-TAAGTAATTGATA----TATG-TTTTACATAGA
finalCons : GTCATGGTGAACTCGTATGTACTTATTTGTAGC---TTTT-TTTAATTCGCCGGNGGAAAACATGGATTTGATAAAATAATACAAGTTGTTGATAGAGTTGGTTTAATATATACATATACCTT----TCTGTTACTTCAGAGGCTCATTTTTGTTTATTACAAACAAA-GAAAA-CATAGTCAACAAAGTCAAATCCCCGATA---TTTGCCCTTCTGTATAAAAATAAGGTTATAAAGAATCCGGTTACAAGGAATTGTCAGATACAGGCATGTTTTT--GTTAAATAACTTTACGTT--AAT-GAATATACTGTTTTAAGTTT------ATATATTTAAAGAGTTACTGTAGCTGGCAATATACTTAGTACGTTATCCAAGGACAAAACAGTNACTGCACAGTTTGATGTAGTTTAAGAAAATGGGATTACAGTCAGTGTTCAGCAAAGTCTTCCTCGTCACA---GAGAAGATTGAAAACATTAGGATCCATCTG---ATTTGCAATTTGCTTTGTTCCTGCAATATCGTAGGGCTTATCCTTAA-CGGTGTAGCTGCGAGATA--CATAA-----AACACTGT-----ACA---TGGCGCA-CTGTACATGC---CCC--C----CA--ACACACACATACACACCGGCGTAGCTACAC---------------GAAGGCACTGCAGCCCCC---------------------------------------TTTTCCCAGAAAAAA-ANAAGTCCC--TAAGTAATTGATA----TATG-TTTTACATAGA
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lowQualScore : ... . . . . . . . . . . . . .... . . .. . . . ... . . . . .. .. . . . . ...... . . . . .. ...... . ... . ... ... . . . . .. . ..... ..... ... . . . .... .. .... .. . .... ......................................... . . ..... . .... .
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Reference ( family-580 ) : GTCATGGTGAACTCGTATGTACTTATTTGTAGC---TTTT-TTTAATTCGCCGGNGGAAAACATGGATTTGATAAAATAATACAAGTTGTTGATAGAGTTGGTTTAATATATACATATACCTT----TCTGTTACTTCAGAGGCTCATTTTTGTTTATTACAAACAAA-GAAAA-CATAGTCAACAAAGTCAAATCCCCGATA---TTTGCCCTTCTGTATAAAAATAAGGTTATAAAGAATCCGGTTACAAGGAATTGTCAGATACAGGCATGTTTTT--GTTAAATAACTTTACGTT--AAT-GAATATACTGTTTTAAGTTT------ATATATTTAAAGAGTTACTGTAGCTGGCAATATACTTAGTACGTTATCCAAGGACAAAACAGTNACTGCACAGTTTGATGTAGTTTAAGAAAATGGGATTACAGTCAGTGTTCAGCAAAGTCTTCCTCGTCACA---GAGAAGATTGAAAACATTAGGATCCATCTG---ATT---TGCAATTTGCTTTGTTCCTGCAATATCGTAGGGCTTATCCTTAA-CGGTGTAGCTGCGAGATA--CATAA-----AACACTGT-----ACA---TGGCGCA-CTGTACATGC---CCC--C----CA--ACACACACATACACACCGGCGTAGCTACACGAAGGCACT----GC---A-------G-CC---------C---C----C-------TTTTCCCAGAAAAAA-ANAAGTCCCTAAGTAATTGATA----TATG-TTTTACATAGA
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gi|10 : atgtgaccttgaacttcgacctattggtagttttcttgttcttgcgaacgttacatttATG--CA-AA-----AACATTGTGTTTTAAA---TAATGCA-A-GTGTATGC---CCA--C----C----CGCGT-CAAACACACCGGCATAGCTTAACGTGGGTACT----GA---A-------GACCAAGA-----C---CGGCAC-------TTTTCACAGAAAAAA-TCA-------GAGTAATTGATATAATTATG-TTTTACATAG
gi|11 : ---CTC--C----CA--ACACACATATACACACCGGTGTAGCTACACGAAGGCACT----GCA--A-------G-CCAAGG-----C---CTGAAC-------TTTTCCCAGAAAAAT-AAAAGTCTCTAAGTATTTGATA----TATG-TTTTTTATAGAc
gi|12 : CC--C----CA--A---ACACACACACACCGGCGTAGCTACACTTAGGCGCT----GA---A-------G-TTGAAGGTCTGC---A----C-------TTTTCCCAT--AAAA-ATAA------AAGTAATTGA-A----TATA-TTTTACATAG
gi|13 : caGCGTAGCTGT-ATATG--CACAAGCCCCAACAC-AT-----ACACGCTGGTGTAGCTGTACACGC---CCC--CACCACA--ACACACACA--CACACCGGCGTAGCTGTAC
gi|14 : CCGGCTTAGCTACATGTAGGCACT----TC---AG------G-CC---------CGGAC----CTGCATATTTTTTTAAGAAAAAATAAAAATGTGTAAGTAATCG--A----TATG-TTTTACAT
gi|15 : CTTGA-CGGTGCAGCTGCAAGATATACATAA-----AACACTGT-----ACA---TGGCACA-
gi|16 : gcgtta-CTGTACATGC---CCCTGC----CATAACACACACACACACACCGGCGAAGCT
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