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lowQualScore                  :              000   0000000000000000000000 66 66   2222  88  777  0 0 0 33  666 9999999999999999999999999 555 9 8  8888888  444444   9 5 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999  11  5 444444444 333             7 7 4 00  666   111111  00 66666  7 99999  6   8 8  6666    000    99   6666 2222222 8  8  777 777777 66666 22222222 666 8 5555555555555555555555 6  777 2 9    7    3    44 9 9  8 9  11111111 6666666666666  9 9   3  99   9 444 9       
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Reference ( gi|10 )           :       GTTCACG---AAA-----A---------TG-----T--T--TTT----AA-TAA---AA-A-ACG--GT---A---C--AGT--A--G-----T---CT---T-GATT-------TAC-----CAA-ATA---T-------G-T----T-T------CA--A---C-A---C-A-CA---G--TA-A-----AAA--A------A--A-GA--AA-TA-T------T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAA--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGGT-G-GC----GAAA--GTTTC--ATA----T------CG-AT-AT---T------T-----A--------A---A-G---TCG--TT-G-T-T--T---T-AT---TAC-TTAC-TTTAGAAATA-G-G-CT-A-AA--------A-----A-G--G--GA-A-AATTAT--CAC-A---A-AAAATAA
gi|13                         :        TTCACG---AAA-----AATTAT----TT-----T--T--TTT----AA-CAA---AA-A-ACG--GT---A---T----------------T---CT---T-GATT-------CAA-----CAA-ATA---T-------T-T----T-T------AA--A---G-AA--C-A-CA---A--TA-A-----ATA--------------GA--AA-TA-T------T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAG--T-------------T----TC-T-----ATCGGT-G-GC----GAAA--GTTTC--ATA----C------CG-AT-AT---T------T-----T--------A---A-G---TCG--TT-T-T-TC-T---T-AT---TTC-TTAC-TTTAAAAATG-A-T-CT-A-AA--------A-----A-G--A--GA-A-AATAAT--CAC-A---A-AAAA
gi|3                          :   aaattTTCACG---AAA-----AAAAAA----GA-----T--T--TTT----AAACAA---AA-A-ACG--GT---A--------------G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---CTATACTAA-T----T-T------AA--A---C-AAAAC-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--AA-TA-T------T---AGGAAGAACGATA-A-A-G--CAG--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGGT-G-GC----GAAA--GTTTC--ATA----T------TG-AT-AT---T------T-----ATTG-----A---A-G---TCG--TTCT-T-T--T---T-AT---TTC-TTAT-TTCAAAAATG-G-G-CT-A-AA--------A-----A-AT-A--GA-A-AACGAT--CAC-A---C-AAAAAAAgta
gi|6                          :    aaatTTCACGGGAAAA-----A-----------------------------AA-CAA---AA-A-AA--------A---C--GGT--A--G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATACCAT-------G-TACATT-T------AA--A---C-AAAAC-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--AA-TA-T------T---AGGTAAAAAGATG-A-A-G--CAG--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGGT-G-AC----GAAA--GTTTC--ATA----T------TG-AT-AT---T------T-----ATTG-----C---A-G---TCGTTTT-T-T-T--T---T-AT---TAC-TTGT-TTCAAAAATG-G-G-CTGA-AA--------A-----A-G--A--GA-A-AATGATTACAC-A---A-AAA
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gi|19                         :     gatgatACG---AAAT----A---------TT-----A--T--TTT----AA-CAA---AA-A-AA--------A---C--AGT--A--G-----TGTTCT---C-CTTT-------TAT-----CAA-AAA---CA------G-T----T-T----------A---C-CTT-C-A-CA---T--CA-A-----AGA--A------GT-A-GA--AA-TA-T------T---ATGTAGAACGATG-A-A-G--------AA------GT--TA----TC-C-----ATGGGT-G-A-----GAAA--ATGTA--ATA----T------CC-CT-GT---T------T-----A--------A---A-T---AAG--CT-T-T-T--T---T-TC---TTC-TTAC-CTTA-CTATA-G-G-CT-A-AA--------ATGAAGA-A--G--AA-C-AATAAA--CAC-A---A-
gi|32                         :              ---AAA-----A---------TA-----T--T--TA-----AA-CAA---AA-A-ACG--GT---A--------------G-----T---CT---T-GATT-------TG-----------TA---C-------G-T----T-A------AA--A---C-A---A-AACA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--AA-TA-T------T---AGGTAAAAAGTTG-A-A-G--CAG--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGGT-G-GC----GAAA--GTTTC--ATA----T------TG-AT-AT---T------T-----ATTG-----A---A-G---GTG--TT-T-T-T--T---T--------C-TTAT-TTCAAAAATG-G-G-TT-AGAA--------A-----A-G--A--GA-A-AATGAT--CAC-ACACA-AAAA
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gi|29                         :                   A-----A---------T------T--C--TTT----AA-CAT---AA-A--CG--GTCGTA---T--ACT--A--G-----T---TT---C-AAT-----------------AA-ACA---C-------A-TA---T-T------TA--G---CTG---C-C-C----G--TC-A-----AAG--A------ATTA-TC--AA-TT-T------T---ATGTAAAAAGATG-G-A-A--AAG--TGA------AC--TA----TC-T-----GTGGGT-G-GT----TAAA--ATGTC--ATA----T------CA-AT-AT---T------T-----A--------A---A-G---AAG--TT-T-T-TC-T---T-AG---AAC-ATGC-TTTATAAA-G-G-A-CT-A-AA--------A-----T-GA-G--AA-A-AATTGTAACAC-A---A-tga
gi|38                         :                    -----A---------TT-----T--T--TTC----AA-CAA---AT-T-A-G--GT---A---G--TGT--A------------CT---C-GTTT-------TAA-----TAA-ATA---T-------A-T----T-C------TA--A---C-AA--C-A-CA---T--CA-T-----AGA--A------AT-A-GA--AA-TA-A------T----TGTAGAAAGATG-T-A-G--AAG--TCA------GT--TA----TC-C-----TTAGAT-G-GC----GAAC--GTTTC--TTA----T------CG-AT-AT---T------T-----A--------A---ATA---TTG--TT-T-T-C--T---T-AT---TCC-TTAC-TTTAAAAATT-G-G-CT-A-TA--------A-----
gi|35                         :                gttt-----A---------TT-----T--T--TTTGGGGAA-AAA---AT-A-ACG--GT---A---A--TGT--A------------CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---C-------A-T----TGT------CATAA---C-A---C-T-CC---A--TA-C-----AAA--T------T--G-AC--AA-T--T------T---ATATAGAAAGATG-A-A-G--AAA--TAA------GT--TC----TC-C-----GTCGAT-G-GC----AAAG--ATTTC--GTA----T------AG-AA-GT---T------T-----A--------A---A-ttta
gi|46                         :          ctacaaattt-----A---------TG-----T--T--TTA----AA-CAA---AA-A-ACG--GT---AGTTT--GCT--A--G-----T-----------ATT-------AACAAAAACAA-A-A---T-------A-T----T-T------TA--A---CTA---C-A-CA---T--CA-T-----AGA--A------AT-A-TC--AA-T--T------T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAA--TAA------GT--TA----TT-T-----GTGAGT-G-GC----cacgggctaaaaatgaggaaatgataaaaaaacaa
gi|55                         : gaatttttatgattttttt-----A---------TT-----T--T--TTT----AA-CAA---AA-A-A-A--GT---A---G--TGT--A--GAATCTT---CT---C-GTTT-------TAA-----CAA-AT----C-------A-T----T-T------TA--C---C-A-------------------------AA--T------C--A-GA--AG-TA-CCTTTC-T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAG--TAA------GA--TCAGTATC-C-----ATGGGT-A-CC----AAAagcacatacatgtataatacata
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gi|7                          :                              aattttt-----T--T--TTT----AA-CGA---AA-A-ACG--AT---A--------------G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAT-ACA---C-------G-T----T-TAAG---CA--A---C-A---C-A-CA---A--TA-A-----AAA--ACAAAAAAC-A-GA--AA-TA-G------T---ATGTTGAAATATA-A-A-T--AAG--TAA------GT--AT----TC-C-----ATCTGT-G-GC----GAAA--GTTTC--ATA----T------CG-TT-AT---T------T-----A--------A---A-G---TCGGTTT-T-C-T--T---T-AT---TTT-TTAC-TTTAGAAATG-G-A-CT-A-AA--------A-----A-G--A--GA-A-AATAAT--CAC-A---A-AAAATAata
gi|16                         :                    attttcaagaatttttt-----T--T--TTA----AA-TTA---AA-A-ACG--GT---A--------------G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---CCATGTACG-T----T-T------AA--A---C-AAAAC-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--AA-TA-T------T---AGGTAGAAAGATG-A-A-G--CAG--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGTT-G-GT----GAAA--GTTTC--ATA----T------TG-AT-ATCTAT------T-----G--------A---A-G---TGG--TT-T-TCT--T---T-AT---TTT-TAAT-TTCAAAAATG-G-G-CT-A-AA--------A-----A-A--GAAAA-A-AACGAT--CAC-A---C-AAAA
gi|53                         :                                     -----T--T--TTT----A--TGA---AA-T-AT----T---C---T--AGT--G--C-----T---CT---C-G--T-------TAA-----AAA-A-A---C-------A-T----T-G------TA--A---C-AT--C-A-CG---T--CA-T-----AAA--A------AT-A-GA--AA-T--T------T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAG--TAA------GT--CA----TC-C-----ATGGTT-G-GC----AAAA--AAATC--ATA----T------TG-AT-AT---T------T-----T--------A---A-G---aa
gi|37                         :                                    a-----T--T--ATT----AA-CAA---AA-ACATGTAGTG--A---T--A-T--A--G-----T---TT---T----T-------CAC-----AAA-ACA---T-------T-T----T-T------TA--C---C-A---C-A-CATGGG--CA-T-----ATA--C------A--A-----------T------T---TTGTAGAAAGGTA-C-ACGTCAAG--TAA------AT--TT----T--------ATAGG------------AA--ATTTCT-ATA----T------CG-AT-AT---T------T-----A--------G---A-G----AG--TT-T-C-TG-T---T-AT---TTCGTTGT-TTTAGAAA-G-G-G-CT-G-AA--------A-----T-G--A--GA-A-AAGCAC--TAC-A---A-atttatt
gi|42                         :                                           --T--TTT----AA-CAA---AA-A-A---------A---C--GGT--A--G-----T----------G----------TAC------AA-ATA---C-------AAT----T-TAG----CA--A---C-A---C-A-TA---A--TA-G-----AAA--A------T--A-AA---------------T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAG--TAA------GT--TT----TTTC-----ATCGGT-G-GC----GAAA--ACTTC--ATA----T------CG-AT-AT---T------A-----A--------A---A-G---ACG--TT-T-T-TG-T---T-AT---TTC-TTAC-TTgta
gi|30                         :                 acttttacgaaatattaattttattg--T--TTC----AA-CAA---AA-G-A-G--GT---T---G--TGT--A------------CT---C-GTTT-------TAT-----CGA-AAG---C-------A-T----T-T------TA--A---C-AG--C-A-CA---T--CA-T-----GGA--A------A--A-----AA-TT-T------TTTTATGTAGATAAATG-A-A-G--AAA--TAA------GT--TG----TT-T-----ATGAGT-G-GC----AAAA--ATTTC--ATA----T------CA-AT-AT---T------T-----A--------A---A-G---ACA--TT-T-T-TC-T---T-AT---TTC-TTACATATA-AAATG-G-A-CT-G-AA--------A-----ATG--A--GA-A-AATTAT--CAC-A---C-AAAA
gi|15                         :                                           --T--TTT----AA-CAA---TA-A-ACG--GT---A---C--TGT--A------------CT---T-GATT-------TAG-----CAA-ATA---C-------A-T----T-T------TA--AAAAC-A---C-A-CC---A--TA-G-----AAA--T------G----GA--TA-T--T------T---AAGTAGAAAGAT-----------A--TAG------GT--TC----TT-T-----ATCAGT-G-GA----CAAA--CGTTC--GTA----T------AG-AA-AT---C------T-----A--------AGTAA-G---T-A--TT---T-C--T---T-AT---TTC-TTAC-TTTACAAACG-G-G-CT-A-AA--------AT----T-T--C--GA-A-AATGGT--CACAA---A-AAAATAAa
gi|54                         :                             catttttatgattg--T--TTT----CA-CGA---AA-A-AAG--GT---A--------------G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---T-------G-T----T-TATTAAACA--A---C-A---C-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--AA-TA-TAA----T---ATGTAGAAAGATG-A-A-G--AAA--TTA------GT--TT----
gi|44                         :                                           --T--TTT----AA-CAA---AA-A-ACA--AT---A---G--TGT--A------------CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---C-------A-T----T-T------TA--------------A-CA---G-------------A--A------A--A-G-------------------------------TG-A-G-G--TAA--TAG------GT--TC----TC-C-----ATCAAT-T-GT----GAAA---------ATA------------G-AT-AT---T------T-----A--------A---A-T---AAA--TT-G-T-C--T---T-GT---TTC-TTAT-TTTAAAAATT-A-G-TT-A-AA--------A-----T-G--A--GA-A-AATGAT--GAA-A---A-AAAAaaaaatgggctaaaaagaaaaaatgatcacaaaaaataa
gi|26                         :                                          c--T--TTT----AA-CAA---AA-A-A-A--GT---A---T--TGTGTA--G-----T--------T-GTTT-------TAA-----CAA-AAA---T-------A-T----T-T------TA--A---C-AA--C-A-CA------TG-A-----CA---------------GA--TT-TT-T------T---TTGCAGAATTATA-A-A-G--AAG--TAT------GC--TT----TC-G-----ATGGAT-G-GC----AAAA--ATTTA--ATA----C------AG-AT-AT---TGAA---T-----A--------A---A-G-----G--TT-T-T-C--C---T-AT---TA---------TAAAAATG-G-G-CT-A-AA--------A-----ATG--A--GA-A-AATGGT--TAC-AC--A-AAAATAAaataac
gi|22                         :                                  tttttttta--T--TTT----AA-CAA---GACG-ATG--GT---G---C--TCT--A--G-----T------------TT-------TAA-----CAA-ATA---T--------------T-T------TA--A---CTA---T-A--A---A--TC-A-----TAG--A------A--A-TATTAA-TT-T------T---ATGTAGACTGATGGA-A-G--AAAAGTAG------AT--AA----TC-C-----ATGGGT-G-AC----AAAC--ATTTA--AAA----T------CA-AT-AT---T------A-----A--------A---A-G---AAG--TT-T-T-T--TCT-T-AT---TTC-TTAT-TTTATAAA-A-G-G-GT-T-AA--------A-----A-G--T--GACACAATTAT--CAC-A---C-AAAAAAA
gi|9                          :                                           --T--TTT----AA-CAA---AA-A--CG--GT---A---TTGTGT--A--G-----T---TC---T---TT-------TAA-----CAA-AAA---C-------A-T----T-T------TA--A---CAA---C-A-CA---T--C-----------------------A-GA--GATTT-T------T---TTGCAGAAATAAG-A-AGG--AAG--TAC------AT--TT----TC-G-----ATGGAT-G-ACAAAAAAAA--ATT----ATA------------G-AT-AT---T------TAAAA-A--------A---A-G---TTT--TT-G------T---T-AT---TTC-CTTC-TTTAAAAATG-G-A-CT-A-AA--------C-----ATG--A--TA-A-AATGGT--CAC-AT--A-AAAATAA
gi|31                         :                        gctttttacgattgtttta--T--TTC----AA-CAA---AA-A-TCG--GT---A---T--TGTGTA--G-----T---CG---T---TT-------TAA-----CAA-AAA---C-------A-T----T---------A--A---C-A-----A-CA------TA-A-----CA---------------TA--TA-TT-T------T---TTGCAGAAATATG-A-A-G--AAG--AAT------GT--T-----------------GAT-G-GC----AAAA--ATTT---ATA----TAGAATCTG-AT-AT---TAAA---T-----A--------A---A-A---T-----T-A-T-C--C---T-AT---TTC-CTAC-TATAAAAATG-G-G-CT-A-AA--------A-----A-AATA--GA-A-AATGGT--CAC-AC--A-AAAATAAc
gi|45                         :                                     ctttta--T--TTT----AA-CAA---AA-A--CG--GT---A---T--TGTGTA--G-----T--------T-GTTT-------TAA-----CAA-AAA---C-------A-T----T-TAA----CA--A---C-A---C-ATCA---G--------------------------A-GA--TT-TT-T------T----TGCAGAAATATG-A-T-G--AAG--TAC------AT--TT----TT-G-----ATGGAT-G-GC----TAAACGATTTT--ATA------------G-AT-AT---T------T-----
gi|21                         :                          tggctttttacgatttttttttaTC----AA-AAA---AA-A-AAG--GT---A-------GC--A--T-----T---CT---C-ATTT-------TTA-----CAA-AAA---C-------A-A----T-T-------A--A---C-A---TTA-CA---T--TA-T-----AGA--A------A--TTGA--AA-T--T------T---ATGTTGATAGATG-A-A-G--AAA--TAA------AT--TA----TC-C-----ATTGTT-G-GG----GAAA--ATTTT--ATA----T---------GT-TT---C------T-----A--------A---A-G----AA--TT-T-T-T--TCA-T-AT---TTT-TTAC-TTTAAAAATG-G-A-TT-A-AAACTATACCA-----A-T--G--GA-A-AATTAT--CCC-A---A-AATATAAttttttttttttttt
gi|25                         :                                                   ----AA-AAA---AA-A-ACA-------A---C--AGT--ATCG-----CG--CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATC---C-------A-T----T-T------TA--A---C-A-----A-CA-------A-ACCATGGAA--T------A--A-GA--AA-TT-T------T---ATGTAGAAAAATG-A-A-A--AAA--TAA------G------------------A------G-GC----GAAA--ATTTCCCATAGGCCT------AG-AT-AT---T------T-----A--------A---A-G---ATA--TT---T-T--T---C-ATGTTTA--TTAC-TTTAAAAATG-G-GTTT-A-AA--------G-----T-G--A--GA-A-AATGAT--CAC-AC--A-AAAATAA
gi|33                         :                                                aca----AA-CAA---AA-A-AGA--GT---G---T--ACT--A--G-----T----T---T-GA----------AC------AA-ATA---C-------T-T----T-T------AA--G---C-----------------TA-A-----ATATCA------T--A-GA--AA-TA-T------A---ATGTAGAAAAAAT-A-A-G--AAG--TGA------AT--TA----TC-C-----GTAAGT-A-GA----GAAA--TTGTC--AAG----T------TT-AA-AT---TTTGAGGT-----A--------AAC-A-A---TC---TT-A-T-T--T---TGAT---TG---TGCTTTTAAAAAC--G-G-CA-G-AA--------A-----T-T--A--GA-A-AATCAT--CAT-A---A-AAA
gi|24                         :                                                  cttaacA-TCA---AA-A-AAG--GA---A---G--TGT--A------------CT---T-GATT-------TAA-----AAA-TTA---C-------A-C----T-T------TA--A---C-AA--C-A-CA---A--CACA-----AAA--A------AT-A-GA--AT-TT-T------T---ATGTAGAGAGATG-C-A-T--AAA--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGGT-G-GT----GAAA--ATTTC--ATA----T------AG-AT-AT---T------T-----T--------A---A-G---AAG--TT-T-T-TTCT---T-AT---TTC-TTAC-TTTAAAAATG-G-G-CT-A-AA--------A-----T-G--A--GA-A-AATGCTCACAC-A---A-AAAATAta
gi|34                         :                                                       tt-TAA---CA-A-ACA-------A---C--GGT--A--A-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---C-------A-T----T-T------AA--AGAAC-A---C-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--TA-TA-T------T---ACGTAGAAAGATG-A-A-G--AAG--AAA------GT--TC----TC-C-----ATCGTT-G-GG----GAAA--TTTTC--ATA----T------CA-AT-AT---T------T-----A--------A---A-G---TCG--TT-T-T-TC-T---T-TT---TTC-TTAC-TTTAAAAATG-G-G-CTAA-AA--------A-----A-G--A--GA-A-AATGAT--TAA-AC--A-AAAATA
gi|18                         :                                                            A---AA-A-ACG--GT---A---TTGTGT--A--G----------T---T-GTTT-------AAA-----CAA-AAA---CA------A-T----T-T------TA--A---CAA---C-A-CA---T--C-----------------------A-GA--GATTT-T------T---TTGCAGAAATATG-A-A-G--AAG--TAC------GT--TT----TC-G-----ATGGAT-G-GCAA--AAAA--AATAC--ATA------------G-AT-AT---T------T-----A--------A----------CT--TT-T-T-T--TTGCT-AT---TTC-CTAC-TTTAAAAATG-G-A-CT-A-AA--------A-----ATG--A--GG-A-AATGGT--CAT-AC--A-AAAATAA
gi|27                         :                                                           ttttgttttatttgaac---A---C--GGT--A--G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---CCGTGTACG-T----T-TATA---CA--A---A-A---C-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--AA-TA-T------T---AGATAAAAA-ATG-A-A-G--CAG--TAA------GT--TT----TC-C-----ATCGTA-G-GC----GAAA--GTTTC--ATA----T------TG-AT-AT---T------T-----ATTG-----A---A-G---TCG--TT-T-T-TC-T---T-AT---TTC-TTAT-TTCAAAAATG-G-G-CT-A-AA--------A-----ATG--A--GA-A-AATGAT--CAC-AC--ACAAAAT
gi|56                         :                                                                                   gaaaGT--A--G-----T---CT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---T-------G-T----T-TATTTAACA--A---C-A---C-A-CA---A--TA-A-----AAA--T------A----GA--TA-TA-TAA----T---ATGTAGAAAGATG-A-A-T--AAG--TAA------GC--TT----T
gi|4                          :                                                                                aaaaaagGT--A--G-----T---CTATTC-GTTT-------TAA-----TAA-AGA---T-------A-T----T-T------TA--A---CTA---C-A-CA---TCCTA-T-----AAA--T------A--G-AA--AG-T--T------T---ATGTAAAAAGATA-A-A-G--AAG--TAGATCTAGGT--TA----TC-C-----ATAGGT-G-GC----GAAA--ATTTC--ATA----T------AG-AT--T---T------T-----aaaatcggctaaaaagataaaatgaacacaaaaataaca
gi|51                         :                          attttttgtgaaatatttattttttaacaaagaaaattctagattaagtcactgatctagtGT--A--G-----T---CA---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---T-------C-T----T-TATTAAACA--A---C-A---C-A-TA---A--TA-A-----AAA--T------A--A--A--AA-TA-TAA----T---ATGTAGAAAAATG-A-A-A--AAA--TTA------GT--TA----TT-A-----AT---T-G-GC----TAAA--cttatttcttgtttggatcaagtagatctacttatagatcaataa
gi|17                         :                                                                                   ttgaaattttcatgttaacaagT---T-GATT-------TAA-----CAA-ATA---C-------G-C----T-T-------A--A---CTA---C-A-CC---A--TA-A-----GAA--ATT----A--A-AA--CA-AA-A------T---ATGTAGAAATATG-G-A-A--AAG--TCA------GT--TT----TC-A-----ATCGGT-G-GC----GAAAATATTTA--ATA----T------TG-AT-AT---T------T-----A--------A---A-G---ACG--TT-GTT-T--T---T-AT---TTC-TTAC-TTTA-AAATG-A-G-CT-A-AA--------A-----ATG--A--GA-T-AAATAT--CAC-A---A-AAAATAAaagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|41                         :                                                                                             ttggattgtgtaatgtacataaaattgatgAC-----CGA-GTG---T-------G-T----A-G------CA--A---C-A---C-A-AC---G--TA-G-----AAA--T------A--A--A--AG-TT-T------T---ATGTAGAAAGATG-A-G-G--AAG--TAA------GT--TC----TC-C-----ATTAGA-A-GC----GAAA--AAAGC--ATT----T------TG-AT-AC---T------T-----A--------A---A-A---AAG--C----T-C--T---T-AT---TTC-TTAC--TAAAAAATG-G-G-CT-C-A--------------------G--AA-A-AATGCT--AAC-A---A-AAA
gi|49                         :                                                                                                                 ggtagtgaaataaaattcagagTA---A-------G-T----T-TAG----CT--A---C-A---C-A-TC---A--TA-G-----GAA--A------A--T-AA--AT-TA-T------G---ATGTAGAACGATG-A-A-A--AAT--TTA------AT--TA----TC-C-----AT-GGA-G-GC----AATC--ATTT---ATA----T------TG-ATAAT---T------TAAAAAA--------A---A-A---CTG--TT-G-T-T--T---T-A
gi|48                         :                                                                                                                                                                                     tttttaacaaaggtagtgtacaaaaactttt--A-GA--AA-TA-TAAACT-T---ATGGAGAAAGATG-A-A-G--AAG--TAA------GTGATC----TG-CGGTTAAGTGGT-T-GT----AAAA--ATTTA--ATA----T------AG-AC-AT---T------TCG---A--------G---A-A---T-G--TT-T-T-C--T---T-AT---TTC-TTAC-TTTGAAAATG-G-G-AT-A-AA--------A-----T-G--A--GA-A-AATGAG--CAC-A---C-AAAATAaaaaaagg
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                           atgcaccat--A-GA--AA-TA-TATATTGT---ATGTAAAAAGACG-G-A-G--AAG--TAA------AA--TTA---TC-A-----ATGGGT-G-GC----GAAA--TTTTC--ATA----G------CGAAT-AT---T------T-----
gi|47                         :                                                                                                                                                   ttgaattttacgccgaaatattaaattttaacagaaaatgaagagtactagttttaacaaagcct--A-GC--AA-TG-T------T------TAGAAATATG-A-A-G--AAA--TAA------GT--TA----TC-A-----AT--GT-GTGT----ACAA--ATTTG--ATA----T------AG-AT-AC---TG-----T-----AGG------A---A-G-----A--TT-T-T-C--T---T-AT---TTG-TTAC-TTGAAAAAAATG-G-CT-A-AA--------A-----ATG--A--TA-A-AATGAT--CAT-T---A-AAAATAActtactcaa
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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|15                         :                                                                                                    att-----A---------TTG--T-----T---T--T----AA-CAATA-A-A--CG----GTACTG---T--A-------CT---T-GAT----TTAGC-AA-ATAC-------A-----T---T-------T------TA---AAAA----C---A---C-A-CC--A--TA-GA-AAT------G--GATAT------T-----T---AAGTAGAAAGATA------------T-AG------G-T---TCTT-T-------ATCAGT-G-GA--CAAA--C----GTTC--GTA----T------AG-AA-AT---C---TA--------AG-T--A-A-G-------TA----T-TT-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--A-CAAA--CGG-G-CT-A-AA--------ATT--T--CGA-A-AA--TG-GT--CACAA---A-AAAATAAtaa
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gi|33                         :                                                                                                                                       aa----AA-CAAAA-A-A--GA----GTGTAC---T--AG-----T-T---T-GA--------AC-AA-ATAC-------------T---T-------T------TA---A-----------------G-C------TA-AA-TATC-----ATAGAAAT---A--T-----A---ATGTAGAAAAAAT-A-AG--AA--GT-GA------A-T---TATC-C-------GTAAGT-A-GA--GAAA--T----TGTC--AAG----T------TT-AA-AT---T---TT--------GA-G--G-T-AAACAATCT-----T-AT-T--T---T-GA-TTG-TGCTTTT--A-AAAA--C-G-G-CA-G-AA--------A-T--T--AGA-A-AA--TC-AT--CAT-A---A-AAA
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gi|35                         :                                                                                                       -----A---------TTT--T-----T---T--TGGGGAA-AAAAT-A-A--CG----GTAATG---T--A-------CT---T-GAT----TTAAC-AA-ATAC-------A-----T---TG------TCA----TA---A-------C---A---C-T-CC--A--TA-CA-AAT------T-GACAAT------T-----T---ATATAGAAAGATG-A-AG--AA--AT-AA------G-T---TCTC-C-------GTCGAT-G-GC--AAAG--A----TTTC--GTA----T------AG-AA-GT---T---TA--------AA-C--A-C-G-----------------------------------------------------G-G-CT-A-AA--------A-AT-G--AGG-A-AA--TG-AT---A--A---A-AAAACAA
gi|36                         :                                                                                                               ctacaaattt--T-----T---T--T----AC-CAAAA-A-A--AG----TTAGGT---T--A-------CT---A-GAT----TTAATTAA-ACAC-------A-----C---TCTTTCGCT------T------------C---A---C-A-TC--A--TA-GC-AAT------A--TAAACCTAA--T-----T---A---ATAAAGATG-G-AG--AA--GT------------------C-C-------AC--GT-G-GC--CAAA--A----TTTC--AGG----T------CA-AT-GT---TAA-TA--------CA-T--T-T-G-------TAATAGT-TT-TAAT---T-AT-TTC-TTACTTT--ATAACA--TGG-
gi|37                         :                                                                                                                     tcaT--T-----A---T--T----AA-CAAAA-ACA--TGTA--GTGATA---T--AG-----TT--------T----TTCAC-AA-A-AC-------ATT---T---T-------T------TA---C-------C---A---C-A-C---A--TG-GG-CAT------A-TACAAT------T-----T----TGTAGAAAGGTACA-CGTCAA--GT-AA------A-T---TTT----------ATAGG----------AA--A----TTTCT-ATA----T------CG-AT-AT---T---TA--------GA-G--A---G-------T-----T-TC-TG-T---T-AT-TTCGTTGTTTT--A-GAAA---GG-G-CT-G-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--GC-AC--TAC-A---A-cttgaatgcgataaa
gi|38                         :                                                                                                       -----A---------TTT--T-----T---T--C----AA-CAAAT-T-A---G----GTAGTG---T--A-------CT---C-GTT----TTAAT-AA-ATAT-------A-----T---T-------C------TA---A-------C---AA--C-A-CATCA--TA-GA-AAT------A--GAAAT---A--A-----T----TGTAGAAAGATG-T-AG--AA--GT-CA------G-T---TATC-C-------TTAGAT-G-GC--GAAC--G----TTTC--TTA----T------CG-AT-AT---T---TA--------AATA--T-T-G-------T-----T-TT-C--T---T-AT-TCC-TTACTTT--A-AAAA--TTG-G-CT-A-TA--------A-gta
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gi|4                          :                                                                                                                                                     ggaatttttacaaTAGTG---T--AG-----TCTATTC-GTT----TTAAT-AA-AGAT-------A-----T---T-------T------TA---A-------CT--A---C-A-CATCC--TA-TA-AAT------A-GAAAGT------T-----T---ATGTAAAAAGATA-A-AG--AA--GT-AGATCTAGG-T---TATC-C-------ATAGGT-G-GC--GAAA--A----TTTC--ATA----T------AG-A---------------------------------------T-----T-TT-C--T---T-AT-TTC-TTGTTTct
gi|40                         :                                             attttttgtgaaatatttattttttaacaaagaaaattctagattaagtcactgatcA-----A---------TAT--T-----T---T--T----AG-CAAAC-A-A--TG----GTAGTGCGCT--AG-----T-T---T-GA--------AC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------TATCTA-------C---A---C-A-TC--A--TA-GA-AAT------A--TAAAT---T--T-----T---ATGTAGAAAAATG-A-AG--AA--GT-AA------A-T---AATC-G-------ATGGGC-G-AC--GGAA--A----TTTC--ACA----T------CG-AT-A--------TA--------AA-A--A-------------------------T---A-ATATTC-TTACTTC--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-ggatcaagtagatctacttatagatcaataa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                              ---A---C-A-CA--ACGTA-GA-AAT------A-A-AAGT---T--T-----T---ATGTAGAAAGATG-A-GG--AA--GT-AA------G-T---TCTC-C-------ATTAGA-A-GC--GAAA--A----AAGC--ATT----T------TG-AT-AC---T---TA--------AA-A--A-A-G---------------CT-C--T---T-AT-TTC-TTAC-TA--A-AAAA--TGG-G-CT-C-AG--------A---------A-A-AA--TG-CT--AAC-A---A-AAAttgtcatga
gi|42                         :                                                      ggtagtgaaataaaattcagagaccgagtgtgtagcaTTTACG---AAATATTAA---------TTT--TATTGTT---T--T----AA-CAAAA-A-A----------ACGG---T--AG-----TGT---------------AC-AA-ATAC-------A-----A---T-------T------TAGCAA-------C---A---C-A-TA--A--TA-GA-AA---------ATAAAT---A--T-----------GTAGAAAGATG-A-AG--AA--GT-AA------G-T---TTTTTC-------ATCGGT-G-GC--GAAA--A----CTTC--ATA----T------CG-AT-AT---T---AA--------AA-G--A-C-G-------T-----T-TT-TG-T---T-AT-TTC-TTACTT
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actAT---T--T-----T---ACGTAGAAAGG-G-ACAG--AA--GT-AA------A-T---AATA-C-------ACGAGT-G-GC--AAAA--A----TTTG--A--------------A-AT-TT---T---TA--------A-----T-A-A-------T-----TATT-T--T---C-AT-TCA-TTGATTT--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-CT-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-----A-AAAATAA
gi|44                         :                                                                             caaaacgtagtgaactggtttaaacatttttttaccaacacatc--T-----T---T--T----AA-CAAAA-A-A--CA----ATAGTG---T--A-------CT---T-GAT----TTAAC-A---------------------------------------A---A-------T---A---C-A------------------------------T---T--T-----T---A-ACAGAAAAGTG-A-GG--TA--AT-AG------G-T---TCTC-C-------ATCAAT-T-GT--GAAA--A----T-------A------------G-AT-AT---T---TA--------AA-T--A-A-A-------T-----T-GT-C--T---T-GT-TTC-TTATTTT--A-AAAA--TTA-G-TT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AT--GAA-A---A-AAAA
gi|45                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAAAA-A----CG----GTATTG---TGTAG-----T-----T-GTT----TTAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T-------A---A-------C---AA--C-A-CA--T--CA-GA-GAT-------------T---T--T-----T---TTGCAGAAATATG-A-TG--AA--GT-AC------A-T---TTTT-G-------ATGGAT-G-GC--TAAACGA----TTTT--ATA------------G-AT-AT---T---T---------------------------T-----T-TT-T--T---T-TT-TTT-TTaataac
gi|46                         :                                                                                tggctttttacgattttttttta-----A---------TGT--T-----T---T--A----AA-CAAAA-A-A--CG----GTA----------G-----T-T---T-GCTAGTATTAAC-AA-AAAC-------AAAATAT---T-------T------TA---A-------CT--A---C-A-CATCA--TA-GA-AAT------A--TCAAT------T-----T---ATGTAGAAAGATG-A-AG--AA--AT-AA------G-T---TATT-T-------GTGAGT-G-GC--t
gi|47                         :                                                                                                                                                                                            gaatttttatgatttttttC-------G-----T---T-------T------TA---A-------C---AA--C-ATCA--T--T-------T------T-AGCAAT---G--T-----T------TAGAAATATG-A-AG--AA--AT-AA------G-T---TATC-A-------AT--GT-GTGT--ACAA--A----TTTG--ATA----T------AG-AT-AC---TG--TAGG------AA-G--A-----------T-----T-TT-C--T---T-AT-TTG-TTACTTG--A-AAAAAATGG---CT-A-AA--------A-AT-G--ATA-A-AA--TG-AT--CAT-T---A-AAAATAAagcacatacatgtataatacata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                               act---C-A-CC--A--TA-GA-AAT------A--TAAAC------T-----T---ATGGAGAAAGATG-A-AG--AA--GT-AA------G-T---GATC-TGCGGTTAAGTGGT-T-GT--AAAA--A----TTTA--ATA----T------AG-AC-AT---T---TC--------GA-G--AAT-G-------T-----T-TT-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--G-AAAA--TGG-G-AT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AG--CAC-A---C-AAAATAct
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gi|51                         :                                                                                               ttgaatAA-----A---------TTT--T-----CATGT--T----AA-CAA------------------GG---T--AG-----TCA---T-GAT----TTAAC-AA-ATAT-------C-----T---T-------TATTAAACA---A-------C---A---C-A-TA--A--TA-AA-AAT------A-A-AAAT---A--TAA---T---ATGTAGAAAAATG-A-AA--AA--AT-TA------G-T---TATT-A-------AT---T-G-GC--TAAA--A----cttactcaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                            ttgaaattttcatgttaacaaggtagtcatgatttaacaaatatctttattaaacaacacataataaaaataaaaatataatatgtagaaaaatgaaaaaattagttattTAGAAAGATG-A-AG--AA--GG-GA------A-A---TATC-C-------ATGGGT-G-GA--GAAA--A----TGTC--ATA----A------CG-AT-AT---T---TA--------AA-G--A-A-G-------T-----T-TT-TC-T---T-AA-TCC-ATAC-TT--A-AA-----------------------------------A-A-AA--TT-AT--CACGA---A-AAAATAAtaac
gi|53                         :                                                                                                                                             tttttaaagcaccatgaaagtttacattttttct-----TCT---C-G------TTAAA-AA-A-AC-------A-----T---T-------G------TA---A-------C---AT--C-A-CGTCA--TA-AA-AAT------A--GAAAT------T-----T---ATGTAGAAAGATG-A-AG--AA--GT-AA------G-T---CATC-C-------ATGGTT-G-GC--AAAA--A----AATC--ATA----T------TG-AT-AT---T---TT--------AA-G--A----------------------T--T---T-AT-T
gi|54                         :                                                                                                  atttttatgaaatattctagtgc--T-----T---T--T----CA-CGAAA-A-A--AG----GTA----------G-----TCT---T-GAT----TTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTAAACA---A-------C---A---C-A-CA--A--TA-AA-AAT--------AGAAAT---A--TAA---T---ATGTAGAAAGATG-A-AG--AA--AT-TA------G-T---T
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TTAGTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AAA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAAtaaaaatgggctaaaaagaaaaaatgatcacaaaaaataa
gi|55                         :         ttttcacgaaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttattaaacaacacacaataaaaatagaaatataatatgtagaaagatgaagaaa-----A---------TTT--T-----T---T--T----AA-CAAAA-A-A---A----GTAGTG---T--AGAATCTTCT---C-GTT----TTAAC-AA-AT-C-------A-----T---T-------T------TA---C-------C---A--------------------AAT------C-AGAAGT---A--CCTTTCT---ATGTAGAAAGATG-A-AG--AA--GT-AA------GATCAGTATC-C-------ATGGGT-A-CC----AA--A----TTT
gi|56                         :                                                                                                                                   tttacgacatacttAAAA-A-A------------GG---T--AG-----TCT---T-GAT----TTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTTAACA---A-------C---A---C-A-CA--A--TA-AA-AAT--------AGATAT---A--TAA---T---ATGTAGAAAGATG-A-AT--AA--GT-AA------G-C---TTT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTT--A-AAA---TCG-G-CT-A-AA--------A-A--G--ATA-A-AA--TG-AA--CAC-----A-AAAATAAaaaatcggctaaaaagataaaatgaacacaaaaataaca
gi|57                         : aaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttatttaacaacacacaataaaaatagatatataatatgtagaaagatgaataagtaagTTCACG---AAA-----AAAAAAA---GAT--T-----T---T--T----AAACAAAA-A-A--CG----GTA----------G-----TCT---T-GAT----TAAAC-AC-ATACCAT----G-----TACAT-------T------TA---AA------C---AAAAC-A-CA--A--TA-AT-AAT------A--GAAAT---A--T-----T---AGGTAAAAAGATG-A-AG--CA--GT-AA------G-T---TTTC-ca
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gatgatAAAGATG-A-AG--AA--GT-AC------G-T---TCTC-T-------TTCAAT-G-GC--GAAA--A----GTTC--ATA----C------AG-AC-A----T---TA--------AA-C--A-C-G-------T-----T-TT-TC-T---T-AT-TTC-TTACTTC--A-AATA--TTG-G-CT-T-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-GTCACAC-A---A-AAAATAA
gi|6                          :                                                                                           TTCACGGGAAAA-----A--------------------------------AA-CAAAA-A-A--A-------ACGG---T--AG-----TCT---T-GAT----TTAAC-AA-ATACCAT----G-----TACAT-------T------TA---AA------C---AAAAC-A-CA--A--TA-AA-AAT------A--GAAAT---A--T-----T---AGGTAAAAAGATG-A-AG--CA--GT-AA------G-T---TTTC-C-------ATCGGT-G-AC--GAAA--G----TTTC--ATA----T------TG-AT-AT---T---TATTG-----CA-G--T-C-GTT-----T-----T-TT-T--T---T-AT-TAC-TTGTTTC--A-AAAA--TGG-G-CTGA-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-ATTACAC-A---A-AAA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgaaatG--AA--GT-AA------G-T---TATC-C-------AAGGGC-G-GC--GAAC--A----TTTC--ATA----T------CA-AT-AT---T---TG--------AA-G--A-----------T-----T-TT-T--C---T-ATGGTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-TA--------A-------ATA-A-AA--T--AT--CAA-A---A-GAAATAA
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           att-AT---T---TA--------AA-G--A-T-G-------T-----T-TT-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaataatacatttc-AT---T---TA--------AA-G--A-T-G-------T-----T-TT-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAAagctaat
gi|65                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aataatacatttc----TTTC--ATA----T------CA-AT-AT---T---TA--------AT-G--A-A-G-------T-----T-TT-T--C---TGAT-TTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CC-A-AA--------A-GT-G--AGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AATATagctaat
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A----T------CG-AT-AT---C---TA--------AT-G--G-C-G-------T-----T-TT-T--CG--T-AT-TTC-GTACTTT--A-AAAT--TTG-G-TT---AA--------A-A--GTTAGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AAAA
gi|67                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGAAAGATA-A-AG--AA--AT-AA------G-T---TCTC-C-------ATCAGT-G-GC--GAAA--A----TTTC--ATA----T------AG-AT-AT---T---GA--------AA-G--A-A-A-------T-----G-TT-T--C---T-AT-TTgta
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gi|7                          :                                                                                                            t---------TTT--T-----T---T--T----AA-CGAAA-A-A--CG----ATA----------G-----TCT---T-GAT----TTAAC-AT-ACAC-------G-----T---T-------TAAG---CA---A-------C---A---C-A-CA--A--TA-AA-AAACAAAAAACAGAAAT---A--G-----T---ATGTTGAAATATA-A-AT--AA--GT-AA------G-T---ATTC-C-------ATCTGT-G-GC--GAAA--G----TTTC--ATA----T------CG-TT-AT---T---TA--------AA-G--T-C-GGT-----T-----T-TC-T--T---T-AT-TTT-TTACTTT--A-GAAA--TGG-A-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TA-AT--CAC-A---A-AAAATA
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Reference ( family-540 )      :                                                                                          NTTCACG---AAA-----A---------TNT--T-----TT--T----AA-CAA-A-A-A-A--CG--GTA--NTG---T--AG-----T---CT---T-GATTTAAC-AA-ATAC-------G-----T---T-------T------T--A---A-------C---A---C-A-CA--A----TA---G--AAA--------TA-GA-AAT---A-T-----T---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAG-T-AA------G-T---TNTCC-------ATCGGT-G-GC--GAAA--A----TTT-C--ATA----TC-G-AT-AT---T------TA---AA---GA-----C-G--T-T-T---------T-T--T---T-AT-TTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAA
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gi|39                         :                                                                                             gttt---AAA-----A---------TGT--T-----TTAAT----AA-CAC-A-A-A-A--TG--GTA--GCG---T--A----------CT---T-GATTTAAC-AA-AAAC-------A-----T---A-------T------T--A---A-------C---AA--C-A-TA--ACA--TA---G--AAA--------TA--A-AAC---AGT-----T---ACGT-AGAAAGAT-GA-T-G--AAA-T-AA------G-T---TCTAC-------ATTGAT-G-GT--AAAA--A----TTT-C--ATT----AA-G-AT-TC---T------TA---TA---GA-----A-G--T-T-T---------T-T--C---T-CT-TTT-TT--TTT--A-ttta
gi|4                          :                                                                                                                                                  ggaatttttacaaTA--GTG---T--AG-----T---CTATTC-GTTTTAAT-AA-AGAT-------A-----T---T-------T------T--A---A-------CT--A---C-A-CATCC----TA---T--AAA--------TA-GA-AAG---T-T-----T---ATGT-AAAAAGAT-AA-A-G--AAG-T-AGATCTAGG-T---TATCC-------ATAGGT-G-GC--GAAA--A----TTT-C--ATA----T-------------------------A---GA----------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTGTTTct
gi|40                         :                                             attttttgtgaaatatttattttttaacaaagaaaattctagattaagtcactgatcA-----A---------TAT--T-----TT--T----AG-CAA-A-C-A-A--TG--GTA--GTGCGCT--AG-----T----T---T-GA----AC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------T--ATCTA-------C---A---C-A-TC--A----TA---G--AAA--------TA-TA-AAT---T-T-----T---ATGT-AGAAAAAT-GA-A-G--AAG-T-AA------A-T---AATCG-------ATGGGC-G-AC--GGAA--A----TTT-C--ACA----TC-G-AT-A-----------TA---AA---AA-----------------------------T---A-ATATTC-TTACTTC--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-ggatcaagtagatctacttatagatcaataa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                              ---A---C-A-CA--ACG--TA---G--AAA--------TA-AA-AGT---T-T-----T---ATGT-AGAAAGAT-GA-G-G--AAG-T-AA------G-T---TCTCC-------ATTAGA-A-GC--GAAA--A----AAG-C--ATT----TT-G-AT-AC---T------TA---AA---AA-----A-G------C---------T-C--T---T-AT-TTC-TTAC-TA--A-AAAA--TGG-G-CT-C-AG--------A---------A-A-AA--TG-CT--AAC-A---A-AAAttgtcatga
gi|42                         :                                                      ggtagtgaaataaaattcagagaccgagtgtgtagcaTTTACG---AAATATTAA---------TTT--TATTGTTT--T----AA-CAA-A-A-A-AA-CG--GTA--GTG---T--A------------------------C-AA-ATAC-------A-----A---T-------T------T--AGCAA-------C---A---C-A-TA--A----TA---G--AAA---------A-TA-AAT---A-T-----------GT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAG-T-AA------GTT---TTTTC-------ATCGGT-G-GC--GAAA--A----CTT-C--ATA----TC-G-AT-AT---T------AA---AA---GA-----C-G--T-T-T---------T-TG-T---T-AT-TTC-TTACTT
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actAT---T-T-----T---ACGT-AGAAAGG--GACA-G--AAG-T-AA------A-T---AATAC-------ACGAGT-G-GC--AAAA--A----TTT-G--A---------A-AT-TT---T------TA---AT---AA----------T-TAT---------T-T--T---C-AT-TCA-TTGATTT--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-CT-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-----A-AAAATAA
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                          gaatttttatgatttttttC-------G-----T---T-------T------T--A---A-------C---AA--C-A-TC--A----TT---T-------------TA-GC-AAT---G-T-----T------T-AGAAATAT-GA-A-G--AAA-T-AA------G-T---TATCA-------AT--GT-GTGT--ACAA--A----TTT-G--ATA----TA-G-AT-AC---TG-----TAGG-AA---GA----------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTG-TTACTTG--A-AAAAAATGG---CT-A-AA--------A-AT-G--ATA-A-AA--TG-AT--CAT-T---A-AAAATAAagcacatacatgtataatacata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                               act---C-A-CC--A----TA---G--AAA--------TA-TA-AAC-----T-----T---ATGG-AGAAAGAT-GA-A-G--AAG-T-AA------G-T---GATCTGCGGTTAAGTGGT-T-GT--AAAA--A----TTT-A--ATA----TA-G-AC-AT---T------TC---GA---GAA----T-G--T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--G-AAAA--TGG-G-AT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AG--CAC-A---C-AAAATAct
gi|49                         :                                                                                                                     atgT--T-----TT--T----AA-CAA-A---------G--GTA--GTG---T--------------------------AC-AA-AAAC-------T-----T---T-------T------T--A---AGTTTAGCT---A---C-A-CATCA----TA---GGAAAA--------TA--A-ATT---A-T-----G---ATGT-AGAACGAT-GA-A-A--AAT-T-TA------A-T---TATCC-------AT-GGA-G-GC--AATC--A----TTT----ATA----TT-G-ATAAT---T------TA---AA---AAAAAACT-G--T-T-G---------T-T--T---T-A
gi|5                          :                                                                                           TTCACG---AAA-----A---------AAAAAT-----TT--A----AA-CAA-A-A-A-A--CG--GTA------------G-----T---CT---T-ATTTTAAC-AA-ATACCATGTGCG-----T---T-------T------A--A---A-------C---AAAAC-A-TA--A----TA---A--AAA--------TA-GA-AAT---A-T-----T---AGGT-AGAAAGAT-GA-A-G--CAG-T-AA------G-T---TTTCC-------ATCTGT-G-GT--GAAA--G----TTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------TATTGAACTTGAGT---C-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTT-TTATCTC--A-AAAG--TGG-G-CT---AA--------A-A--G--AGA-A-AA--CG-AT--CAC-A---C-AAAAAAAaaaaaagg
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gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttgaaattttcatgttaacaagAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
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gi|54                         :                                                                                                             atttttatgaaa--T-----TT--T----CA-CGA-A-A-A-A--AG--GTA------------G-----T---CT---T-GATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTAAAC--A---A-------C---A---C-A-CA--A----TA---A--AAA--------TA-GA-AAT---A-TAA---T---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAA-T-TA------G-T---T
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gi|43                         :                                                                                                                                             act-A-AAA--CG-TA--GTG---AA------------CT-GGTTTAA-----ACAT-------T-----T---T-------T------T--T---A-------CCA-A---C-A-CA--T----C-A-------------------------TTT--T---ACGT-AGAAAGG--GACA-G--AAG------T-AAA-T---AATAC-------ACGAGT-G-GC--AAAA--A----TTT-G--A---------A-AT-TT---T------TA---AT---AA----------T-TAT---------T-T--T---C-AT-TCA-TTGATTT--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-CT-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-----A-AAAATAA
gi|44                         :                                                                                                                        c--T-----TT--T----AA-CAA-A-AAA--CAATA--GTG---TA--------C---TT-GATTTAAC-AA-ATAC-------A-----T---T-------T------T--A---A-------C---A-----------------------------------------------------------GAAAAGT-GA-G-G--TAA------T-AGG-T---TCTCC-------ATCAAT-T-GT--GAAA--A----T--------A-------G-AT-AT---T------TA---AA---TA-----A-A--T-T-G---------T-C--T---T-GT-TTC-TTATTTT--A-AAAA--TTA-G-TT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AT--GAA-A---A-AAAA
gi|45                         :                                                                                                                        c--T-----TT--T----AA-CAA-A-AA---CGGTATTGTG---TAG-----------TT-GTTTTAAC-AA-AAAC-------A---------T-------T------T--A---A-------CA--A---C-A-CA--T----C-A---G--AGA--------T-------TTT--T---TTGC-AGAAATAT-GA-T-G--AAG------T-ACA-T---TTTTG-------ATGGAT-G-GC--TAAACGA----TTT-T--ATA-------G-AT-AT---T------T---------------------T-T-T---------T-T--T---T-TT-TTT-TTaataac
gi|46                         :                                                                                tggctttttacgattttttttta-----A---------TGT--T-----TT--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GTT---TG--------C---TA-GTATTAAC-AA-AAAC-------AAAATAT---T-------T------T--A---A-------CT--A---C-A-CATCA----T-A---G--AAA--------TA-TC-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAA------T-AAG-T---TATTT-------GTGAGT-G-GC--t
gi|47                         :                                                                                                                                                                                  gaatttttatgatttttttC-------G-----T---T-------T------T--A---A-------C---AA--C-A-TC--A----T-T---T-------------TA-GC-AATGT--T------T-AGAAATAT-GA-A-G--AAA------T-AAG-T---TATCA-------AT--GT-GTGT--ACAA--A----TTT-G--ATA----TA-G-AT-AC---TG-----TAGG-AA---GA----------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTG-TTACTTG--A-AAAAAATGG---CT-A-AA--------A-AT-G--ATA-A-AA--TG-AT--CAT-T---A-AAAATAAagcacatacatgtataatacata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                       act---C-A-CC--A----T-A---G--AAA--------TA-TA-AA-CT--T---ATGG-AGAAAGAT-GA-A-G--AAG------T-AAG-T---GATCTGCGGTTAAGTGGT-T-GT--AAAA--A----TTT-A--ATA----TA-G-AC-AT---T------TC---GA---GAA----T-G--T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--G-AAAA--TGG-G-AT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AG--CAC-A---C-AAAATAct
gi|49                         :                                                                                                                     atgT--T-----TT--T----AA-CAA-A-------GGTA--GTG---T----------------------AC-AA-AAAC-------T-----T---T-------T------T--A---AGTTTAGCT---A---C-A-CATCA----T-A---GGAAAA--------TA--A-ATTAT--G---ATGT-AGAACGAT-GA-A-A--AAT------T-TAA-T---TATCC-------AT-GGA-G-GC--AATC--A----TTT----ATA----TT-G-ATAAT---T------TA---AA---AAAAAACT-G--T-T-G---------T-T--T---T-A
gi|5                          :                                                                                           TTCACG---AAA-----A---------AAAAAT-----TT--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GT--------------C---TT-ATTTTAAC-AA-ATACCATGTGCG-----T---T-------T------A--A---A-------C---AAAAC-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AGAAAGAT-GA-A-G--CAG------T-AAG-T---TTTCC-------ATCTGT-G-GT--GAAA--G----TTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------TATTGAACTTGAGT---C-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTT-TTATCTC--A-AAAG--TGG-G-CT---AA--------A-A--G--AGA-A-AA--CG-AT--CAC-A---C-AAAAAAAaaaaaagg
gi|50                         :                                                                                        aatTTTACGCC-GAA-----A---------TAT--TAAAT-TT--T----AA-CAG-A-AAA--TGA-A--G------AG-----T--------------AC-----TA--------G-----T---T-------T------T--A---A-------C---A---A-A-GC--C----T-A---G--AAA--------TA-TA-TATTG--T---ATGT-AAAAAGAC-GG-A-G--AAG------TAAAA-T---TATCA-------ATGGGT-G-GC--GAAA--T----TTT-C--ATA----GC-GAAT-AT---T------T
gi|51                         :                                                                                                                                                           ttgaatG---TAG-----T-C---AT-GATTTAAC-AA-ATAT-------C-----T---T-------TATTAAAC--A---A-------C---A---C-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-AA-AATATAAT---ATGT-AGAAAAAT-GA-A-A--AAA------T-TAG-T---TATTA-------AT---T-G-GC--TAAA--A----cttactcaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttgaaattttcatgttaacaagAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|52                         :                                                                                                ttgaaattttcatgttaacaaggtagtcatgatttaacaaatatctttattaaacaacacataataaaaataaaaatataatatgtagaaaaatgaaaaaattagttatt-----T---T-------T------T--A---A-------A---G---C-A-CC--A----T-G---A--AAG--------TT-TA-CATTT--T---TTCTTAGAAAGAT-GA-A-G--AAG------G-GAA-A---TATCC-------ATGGGT-G-GA--GAAA--A----TGT-C--ATA----AC-G-AT-AT---T------TA---AA---GA-----A-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AA-TCC-ATAC-TT--A-AA-----------------------------------A-A-AA--TT-AT--CACGA---A-AAAATAAtaac
gi|53                         :                                                                                                                                                          tTA--GTG---C-------T-C---TC-G--TTAAA-AA-A-AC-------A-----T---T-------G------T--A---A-------C---AT--C-A-CGTCA----T-A---A--AAA--------TA-GA-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAG------T-AAG-T---CATCC-------ATGGTT-G-GC--AAAA--A----AAT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------TT---AA---GA--------------------------T--T---T-AT-T
gi|54                         :                                                                                                        atttttatgaaatattc--T-----TT--T----CA-CGA-A-AAA------A--G-G---TAG-----T-C---TT-GATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTAAAC--A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATATAAT---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAA------T-TAG-T---T
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TTAGTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AAA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAAtaaaaatgggctaaaaagaaaaaatgatcacaaaaaataa
gi|55                         :         ttttcacgaaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttattaaacaacacacaataaaaatagaaatataatatgtagaaagatgaagaaa-----A---------TTT--T-----TT--T----AA-CAA-A-AAA---AGTA--GTG---TAGAATCTT-C---TC-GTTTTAAC-AA-AT-C-------A-----T---T-------T------T--A---C-------C---A--------A--A----TCA---G--AAG--------TA-CC---TTTC-T---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-G--AAG------T-AAGATCAGTATCC-------ATGGGT-A-CC----AA--A----TTT-
gi|56                         :                                                                                                                                                   tttacgacatacttG---TAG-----T-C---TT-GATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTTAAC--A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-TATATAAT---ATGT-AGAAAGAT-GA-A-T--AAG------T-AAG-C---TTT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaaaaagCTTT--A-AAA---TCG-G-CT-A-AA--------A-A--G--ATA-A-AA--TG-AA--CAC-----A-AAAATAAaaaatcggctaaaaagataaaatgaacacaaaaataaca
gi|57                         : aaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttatttaacaacacacaataaaaatagatatataatatgtagaaagatgaataagtaagTTCACG---AAA-----AAAAAAA---GAT--T-----TT--T----AAACAA-A-AAA--CGGTA--GT--------------C---TT-GATTAAAC-AC-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T--A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---A--TAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AAAAAGAT-GA-A-G--CAG------T-AAG-T---TTTCca
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gatgatAAAGAT-GA-A-G--AAG------T-ACG-T---TCTCT-------TTCAAT-G-GC--GAAA--A----GTT-C--ATA----CA-G-AC-A----T------TA---AA---CA-----C-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTC-TTACTTC--A-AATA--TTG-G-CT-T-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-GTCACAC-A---A-AAAATAA
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gi|12                         :                                                                                                                        T--T-----T---T--C----AA-CAA-A-CAA---AGTT--TTG-TA-------C----TCGATATAAC-AA-A-AC-------A-----G---T-------T------T--A---A-------C---A----------------T-A---GAAA--------TA-GA-AATA-T--C---ATGC-AGAAAGAAT-C-A-G--AA--AT-AA------G-T---TACCC-------ATGTGT-G-GC--GAAA--A----TTC-C--ATA----TC-G-AT-AC---C------TA---AA---GA-----C-A--TGT-T---------T-C--C---T-AT-TTC-TTATTAT--A-AATA--TGG-G-AT-A-AA--------A-AT-G--AGA-A-AA--TA-AT--AAA-A---A-AAAATA
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gi|16                         :                                                                                                              catttttatgT--T-----T---T--A----AA-TTA-A-AAA--CGGTA--GT-----------C----TTGATTTAAC-AA-ATACCATGTACG-----T---T-------T------A--A---A-------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---AAAA--------TA-GA-AATA-T--T---AGGT-AGAAAGATG-A-A-G--CA--GT-AA------G-T---TTTCC-------ATCGTT-G-GT--GAAA--G----TTT-C--ATA----TT-G-AT-ATCTAT------TG---AA---GT-----G-G--T-T-T---------TCT--T---T-AT-TTT-TAATTTC--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-AAGA--AAA-A-AA--CG-AT--CAC-A---C-AAAA
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gi|34                         :                                                                                                                                     c--T----AA-CAA-A-CAA--CGGTA-------A------TC----TTGATTTAAC-AA-ATAC-------A-----T---T-------TAAA---G--A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---AAAA--------TA-GA-TATA-T--T---ACGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--GA-AA------G-T---TCTCC-------ATCGTT-G-GG--GAAA--T----TTT-C--ATA----TC-A-AT-AT---T------TA---AA---GT-----C-G--T-T-T---------T-TC-T---T-TT-TTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CTAA-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--TAA-AC--A-AAAATAta
gi|35                         :                                                                                                       -----A---------TTT--T-----T---T--TGGGGAA-AAA-A-TAA--CGGTA--ATG-TA-------C----TTGATTTAAC-AA-ATAC-------A-----T---TG------TCA----T--A---A-------C---A---C-T-CC--A----T-A---CAAA--------TT-GACAAT--T--T---ATAT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--AT-AA------G-T---TCTCC-------GTCGAT-G-GC--AAAG--A----TTT-C--GTA----T-------------------------A---GA-----A-G--T------------------------------------TT--A-AACA--CGG-G-CT-A-AA--------A-AT-G--AGG-A-AA--TG-AT---A--A---A-AAAACAA
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gi|40                         :                                         attttttgtgaaatatttattttttaacaaagaaaattctagattaagtcactgatctagtA-----A---------TAT--T-----T---T--T----AG-CAA-A-CAA--TGGTA--GTG-CG-------C----TAGTTTGAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------T--ATCTA-------C---A---C-A-TC--A----T-A---GAAA--------TA-TA-AATT-T--T---ATGT-AGAAAAATG-A-A-G--AA--GT-AA------A-T---AATCG-------ATGGGC-G-AC--GGAA--A----TTT-C--ACA----TC-G-AT-A-----------TA---AA---AA-----------------------------T---A-ATATTC-TTACTTC--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-ggatcaagtagatctacttatagatcaataa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                      ---A---C-A-CA--ACG--T-A---GAAA--------TA-AA-AGTT-T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-G-G--AA--GT-AA------G-T---TCTCC-------ATTAGA-A-GC--GAAA--A----AAG-C--ATT----TT-G-AT-AC---T------TA---AA---AA-----A-G------C---------T-C--T---T-AT-TTC-TTAC-TA--A-AAAA--TGG-G-CT-C-AG--------A---------A-A-AA--TG-CT--AAC-A---A-AAAttgtcatga
gi|42                         :                                                      ggtagtgaaataaaattcagagaccgagtgtgtagcaTTTACG---AAATATTAA---------TTT--TATTGTT---T--T----AA-CAA-A-AAAA-CGGTA--GTG-TA---------------------C-AA-ATAC-------A-----A---T-------T------T--AGCAA-------C---A---C-A-TA--A----T-A---GAAA---------A-TA-AAT---------ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--GT-AA------GTT---TTTTC-------ATCGGT-G-GC--GAAA--A----CTT-C--ATA----TC-G-AT-AT---T------AA---AA---GA-----C-G--T-T-T---------T-TG-T---T-AT-TTC-TTACTT
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gi|50                         :                                                                                        aatTTTACGCC-GAA-----A---------TAT--TAAAT-T---T--T----AA-CAG-A-AAA--TGA-A--GAG-TA------C--------------------TA--------G-----T---T-------T------T--A---A-------C---A---A-A-GC--C----T-A---GAAA--------TA-TA-TATT-G--T---ATGT-AAAAAGACG-G-A-G--AA--GTAAA------A-T---TATCA-------ATGGGT-G-GC--GAAA--T----TTT-C--ATA----GC-GAAT-AT---T------T
gi|51                         :                                                                                               ttgaatAA-----A---------TTT--T-----CATGT--T----AA-CAA---------GGTA--GT-----------C----ATGATTTAAC-AA-ATAT-------C-----T---T-------TATTAAAC--A---A-------C---A---C-A-TA--A----T-A---AAAA--------TA-AA-AATA-TAAT---ATGT-AGAAAAATG-A-A-A--AA--AT-TA------G-T---TATTA-------AT---T-G-GC--TAAA--A----cttactcaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttgAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|52                         :                                                                                                ttgaaattttcatgttaacaaggtagtcatgatttaacaaatatctttattaaacaacacataataaaaataaaaatataatatgtagaaaaatgaaaaaattagttatt-----T---T-------T------T--A---A-------A---G---C-A-CC--A----T-G---AAAG--------TT-TA-CATT-T--T---TTCTTAGAAAGATG-A-A-G--AA--GG-GA------A-A---TATCC-------ATGGGT-G-GA--GAAA--A----TGT-C--ATA----AC-G-AT-AT---T------TA---AA---GA-----A-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AA-TCC-ATAC-TT--A-AA-----------------------------------A-A-AA--TT-AT--CACGA---A-AAAATAAtaac
gi|53                         :                                                                                                                                                             tTA--GTG-C-------TC----TCG--TTAAA-AA-A-AC-------A-----T---T-------G------T--A---A-------C---AT--C-A-CGTCA----T-A---AAAA--------TA-GA-AAT--T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--GT-AA------G-T---CATCC-------ATGGTT-G-GC--AAAA--A----AAT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------TT---AA---GA--------------------------T--T---T-AT-T
gi|54                         :                                                                                                        atttttatgaaatattc--T-----T---T--T----CA-CGA-A-AAA--AGGTA--GT-----------C----TTGATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTAAAC--A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---AAAA--------TA-GA-AATA-TAAT---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--AT-TA------G-T---T
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTAGTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AAA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAAtaaaaatgggctaaaaagaaaaaatgatcacaaaaaataa
gi|55                         :         ttttcacgaaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttattaaacaacacacaataaaaatagaaatataatatgtagaaagatgaagaaa-----A---------TTT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA---AGTA--GTG-TAGAATCTTC----TCGTTTTAAC-AA-AT-C-------A-----T---T-------T------T--A---C-------C---A--------A--A----TCA---GAAG--------TA-CC---TT-TC-T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--GT-AA------GATCAGTATCC-------ATGGGT-A-CC----AA--A----TTT-
gi|56                         :                                                                                                                                    tttacgacatacttA-A-AAA--AGGTA--GT-----------C----TTGATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTTAAC--A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---AAAA--------TA-GA-TATA-TAAT---ATGT-AGAAAGATG-A-A-T--AA--GT-AA------G-C---TTT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTT--A-AAA---TCG-G-CT-A-AA--------A-A--G--ATA-A-AA--TG-AA--CAC-----A-AAAATAAaaaatcggctaaaaagataaaatgaacacaaaaataaca
gi|57                         : aaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttatttaacaacacacaataaaaatagatatataatatgtagaaagatgaataagtaagTTCACG---AAA-----AAAAAAA---GAT--T-----T---T--T----AAACAA-A-AAA--CGGTA--GT-----------C----TTGATTAAAC-AC-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T--A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---ATAA--------TA-GA-AATA-T--T---AGGT-AAAAAGATG-A-A-G--CA--GT-AA------G-T---TTTCca
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gatgatAAAGATG-A-A-G--AA--GT-AC------G-T---TCTCT-------TTCAAT-G-GC--GAAA--A----GTT-C--ATA----CA-G-AC-A----T------TA---AA---CA-----C-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTC-TTACTTC--A-AATA--TTG-G-CT-T-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-GTCACAC-A---A-AAAATAA
gi|6                          :                                                                                           TTCACGGGAAAA-----A--------------------------------AA-CAA-A-AAAAACGGTA--GT-----------C----TTGATTTAAC-AA-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T--A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---AAAA--------TA-GA-AATA-T--T---AGGT-AAAAAGATG-A-A-G--CA--GT-AA------G-T---TTTCC-------ATCGGT-G-AC--GAAA--G----TTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------TATTGCA---GT-----C-GTTT-T-T---------T-T--T---T-AT-TAC-TTGTTTC--A-AAAA--TGG-G-CTGA-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-ATTACAC-A---A-AAA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgaaat-G--AA--GT-AA------G-T---TATCC-------AAGGGC-G-GC--GAAC--A----TTT-C--ATA----TC-A-AT-AT---T------TG---AA---GA----------T-T-T---------T-T--C---T-ATGGTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-TA--------A-------ATA-A-AA--T--AT--CAA-A---A-GAAATAA
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               att-AT---T------TA---AA---GA-----T-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaataatacatttc-AT---T------TA---AA---GA-----T-G--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAAagctaat
gi|65                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aataatacatttc----TTT-C--ATA----TC-A-AT-AT---T------TA---AT---GA-----A-G--T-T-T---------T-T--C---TGAT-TTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CC-A-AA--------A-GT-G--AGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AATATagctaat
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A----TC-G-AT-AT---C------TA---AT---GG-----C-G--T-T-T---------T-T--CG--T-AT-TTC-GTACTTT--A-AAAT--TTG-G-TT---AA--------A-A--GTTAGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AAAA
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gi|21                         :                                                                                                                                tt---T--C----AA-AAA-A-AAA--AGGTA--GCA---TT-------CTCATTTTTAC-AA-AAAC-------A-----A---T-------T----------A---A-------C---A---TTA-CATTA----T-A---G--AAA--------TT-GA-AAT-T--T---ATGT-TGATAGATG-A-A-G--AA--A-T-AA------A-T---TATCC-------ATTGTT-G-GG----GAAA--ATTT-T--ATA----T----GT-TT---C------T-A---AA---GA------A--T-T-T---------T-T--TCA-T-AT-TTT-TTACTTT--A-AAAA--TGG-A-TT-A-AAACTATACCA-A--T--GGA-A-AA--TT-AT--CCC-A---A-AATATAA
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gi|39                         :                                                                                             gttt---AAA-----A---------TGT--T-----T---TAAT----AA-CAC-A-AAA--TGGTA--GCG---TA-------CTTGATTTAAC-AA-AAAC-------A-----T---A-------T------T---A---A-------C---AA--C-A-TA--ACA--T-A---G--AAA--------TA-AA-ACAGT--T---ACGT-AGAAAGATG-A-T-G--AA--A-T-AA------G-T---TCTAC-------ATTGAT-G-GT----AAAA--ATTT-C--ATT----AA-G-AT-TC---T------T-A---TA---GA-----AG--T-T-T---------T-T--C---T-CT-TTT-TT--TTT--A-ttta
gi|4                          :                                                                                                                                                ggaatttttacaaGTA--GTC---TA-------TTCGTTTTAAT-AA-AGAT-------A-----T---T-------T------T---A---A-------CT--A---C-A-CATCC----T-A---T--AAA--------TA-GA-AAGTT--T---ATGT-AAAAAGATA-A-A-G--AA--G-T-AGATCTAGG-T---TATCC-------ATAGGT-G-GC----GAAA--ATTT-C--ATA----T--------------------------A---GA---------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTGTTTct
gi|40                         :                                         attttttgtgaaatatttattttttaacaaagaaaattctagattaagtcactgatctagtA-----A---------TAT--T-----T---T--T----AG-CAA-A-CAA--TGGTA--GTG---CG-------CTAGTTTGAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------T---ATCTA-------C---A---C-A-TC--A----T-A---G--AAA--------TA-TA-AATTT--T---ATGT-AGAAAAATG-A-A-G--AA--G-T-AA------A-T---AATCG-------ATGGGC-G-AC----GGAA--ATTT-C--ACA----TC-G-AT-A-----------T-A---AA---AA----------------------------T---A-ATATTC-TTACTTC--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-ggatcaagtagatctacttatagatcaataa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ---A---C-A-CA--ACG--T-A---G--AAA--------TA-AA-AGTTT--T---ATGT-AGAAAGATG-A-G-G--AA--G-T-AA------G-T---TCTCC-------ATTAGA-A-GC----GAAA--AAAG-C--ATT----TT-G-AT-AC---T------T-A---AA---AA-----AG------C---------T-C--T---T-AT-TTC-TTAC-TA--A-AAAA--TGG-G-CT-C-AG--------A---------A-A-AA--TG-CT--AAC-A---A-AAAttgtcatga
gi|42                         :                                                      ggtagtgaaataaaattcagagaccgagtgtgtagcaTTTACG---AAATATTAA---------TTT--TATTGTT---T--T----AA-CAA-A-AAAA-CGGTA--GTG---TA-------C-----------AA-ATAC-------A-----A---T-------T------T---AGCAA-------C---A---C-A-TA--A----T-A---G--AAA---------A-TA-AAT--------ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------GTT---TTTTC-------ATCGGT-G-GC----GAAA--ACTT-C--ATA----TC-G-AT-AT---T------A-A---AA---GA-----CG--T-T-T---------T-TG-T---T-AT-TTC-TTACTT
gi|43                         :                                                                                                                                                act-A-AAA--CG-TA--GTG---AA-------CT-GGTTTAA-----ACAT-------T-----T---T-------T------T---T---A-------CCA-A---C-A-CA--T----C-A-------------------------TTT--T---ACGT-AGAAAGG-G-ACA-G--AA--G-T-AA------A-T---AATAC-------ACGAGT-G-GC----AAAA--ATTT-G--A---------A-AT-TT---T------T-A---AT---AA---------T-TAT---------T-T--T---C-AT-TCA-TTGATTT--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-CT-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-----A-AAAATAA
gi|44                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA--CAATA--GTG---TA-------CTTGATTTAAC-AA-ATAC-------A-----T---T-------T------T---A---A-------C---A-----------------------------------------------------------GAAAAGTG-A-G-G--TA--A-T-AG------G-T---TCTCC-------ATCAAT-T-GT----GAAA--AT--------A-------G-AT-AT---T------T-A---AA---TA-----AA--T-T-G---------T-C--T---T-GT-TTC-TTATTTT--A-AAAA--TTA-G-TT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AT--GAA-A---A-AAAA
gi|45                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AA---CGGTATTGTG---TA-------GTTGTTTTAAC-AA-AAAC-------A---------T-------T------T---A---A-------CA--A---C-A-CA--T----C-A---G--AGA--------T-------TTT--T---TTGC-AGAAATATG-A-T-G--AA--G-T-AC------A-T---TTTTG-------ATGGAT-G-GC----TAAACGATTT-T--ATA-------G-AT-AT---T------T---------------------T-T-T---------T-T--T---T-TT-TTT-TTaataac
gi|46                         :                                                                                tggctttttacgattttttttta-----A---------TGT--T-----T---T--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GTT---TG-------CTAGTATTAAC-AA-AAAC-------AAAATAT---T-------T------T---A---A-------CT--A---C-A-CATCA----T-A---G--AAA--------TA-TC-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TATTT-------GTGAGT-G-GC----t
gi|47                         :                                                                                                                                                                                gaatttttatgatttttttC-------G-----T---T-------T------T---A---A-------C---AA--C-A-TC--A----T-T---T-------------TA-GC-AATGT--T------T-AGAAATATG-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TATCA-------AT--GT-GTGT----ACAA--ATTT-G--ATA----TA-G-AT-AC---TG-----T-AGG-AA---GA---------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTG-TTACTTG--A-AAAAAATGG---CT-A-AA--------A-AT-G--ATA-A-AA--TG-AT--CAT-T---A-AAAATAAagcacatacatgtataatacata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                      act---C-A-CC--A----T-A---G--AAA--------TA-TA-AA-CT--T---ATGG-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------G-T---GATCTGCGGTTAAGTGGT-T-GT----AAAA--ATTT-A--ATA----TA-G-AC-AT---T------T-C---GA---GAA----TG--T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--G-AAAA--TGG-G-AT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AG--CAC-A---C-AAAATAct
gi|49                         :                                                                                                                     atgT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-------GGTA--GTG---T-----------------AC-AA-AAAC-------T-----T---T-------T------T---A---AGTTTAGCT---A---C-A-CATCA----T-A---GGAAAA--------TA--A-ATTAT--G---ATGT-AGAACGATG-A-A-A--AA--T-T-TA------A-T---TATCC-------AT-GGA-G-GC----AATC--ATTT----ATA----TT-G-ATAAT---T------T-A---AA---AAAAAACTG--T-T-G---------T-T--T---T-A
gi|5                          :                                                                                           TTCACG---AAA-----A---------AAAAAT-----T---T--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GT-------------CTTATTTTAAC-AA-ATACCATGTGCG-----T---T-------T------A---A---A-------C---AAAAC-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AGAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCC-------ATCTGT-G-GT----GAAA--GTTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-ATTGAACTTGAGT---CG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTT-TTATCTC--A-AAAG--TGG-G-CT---AA--------A-A--G--AGA-A-AA--CG-AT--CAC-A---C-AAAAAAAaaaaaagg
gi|50                         :                                                                                        aatTTTACGCC-GAA-----A---------TAT--TAAAT-T---T--T----AA-CAG-A-AAA--TGA-A--GAG---TA-------CTAGTTTTAAC-AA-AGCC---------------------------------------------------------------------T-A---G--AAA--------TA-TA-TATTG--T---ATGT-AAAAAGACG-G-A-G--AA--G-TAAA------A-T---TATCA-------ATGGGT-G-GC----GAAA--TTTT-C--ATA----GC-GAAT-AT---T------T-
gi|51                         :                                                                                               ttgaatAA-----A---------TTT--T-----CATGT--T----AA-CAA---------GGTA--GT-------------CATGATTTAAC-AA-ATAT-------C-----T---T-------TATTAAAC---A---A-------C---A---C-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-AA-AATATAAT---ATGT-AGAAAAATG-A-A-A--AA--A-T-TA------G-T---TATTA-------AT---T-G-GC----TAAA--Acttactcaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|52                         :                                                                                              ttgaaattttcatgttaacaaggtagtcatgatttaacaaatatctttattaaacaacacataataaaaataaaaatataatatgtagaaaaatgaaaaaattagttatt-----T---T-------T------T---A---A-------A---G---C-A-CC--A----T-G---A--AAG--------TT-TA-CATTT--T---TTCTTAGAAAGATG-A-A-G--AA--G-G-GA------A-A---TATCC-------ATGGGT-G-GA----GAAA--ATGT-C--ATA----AC-G-AT-AT---T------T-A---AA---GA-----AG--T-T-T---------T-TC-T---T-AA-TCC-ATAC-TT--A-AA-----------------------------------A-A-AA--TT-AT--CACGA---A-AAAATAAtaac
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Reference ( family-540 )      :                                                                                          NTTCACG---AAA-----A---------TNT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GTG---TA-------CTCGNTTTAAC-AA-ATAC-------G-----T---T-------T------T---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---G--AAA--------TA-GA-AATNT--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------G-T---TNTCC-------ATCGGT-G-GC----GAAA--ATTT-C--ATA----TC-G-AT-AT---T------T-A---AA---GA-----CG--T-T-T---------T-T--T---T-AT-TTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAA
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gi|44                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA--CAATA--GTG---TA-------CTTGATTTAAC-AA-ATAC-------A-----T---T-------T------T---A---A-------C---A-----------------------------------------------------------GAAAAGTG-A-G-G--TA--A-T-AG------G-T---TCTCC-------ATCAAT-T-GT----GAAA--AT--------A-------G-AT-AT---T------T-A---AA---TA-----AA--T-T-G---------T-C--T---T-GT-TTC-TTATTTT--A-AAAA--TTA-G-TT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AT--GAA-A---A-AAAA
gi|45                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AA---CGGTATTGTG---TA-------GTTGTTTTAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T----------A---A-------C---AA--C-A-CA--T----C-A---G--AGA--------T-------TTT--T---TTGC-AGAAATATG-A-T-G--AA--G-T-AC------A-T---TTTTG-------ATGGAT-G-GC----TAAACGATTT-T--ATA-------G-AT-AT---T------T---------------------T-T-T---------T-T--T---T-TT-TTT-TTaataac
gi|46                         :                                                                                tggctttttacgattttttttta-----A---------TGT--T-----T---T--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GTT---TG-------CTAGTATTAAC-AA-AAAC-------AAAATAT---T-------T------T---A---A-------CT--A---C-A-CATCA----T-A---G--AAA--------TA-TC-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TATTT-------GTGAGT-G-GC----t
gi|47                         :                                                                                                                                                      gaatttttatgatttttttA-------CTCGTTTTAAC-AACAT-C-------A-----T---T-------T------T---A---G-------C---A-------------------------------------------ATGT--T------T-AGAAATATG-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TATCA-------AT--GT-GTGT----ACAA--ATTT-G--ATA----TA-G-AT-AC---TG-----T-AGG-AA---GA---------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTG-TTACTTG--A-AAAAAATGG---CT-A-AA--------A-AT-G--ATA-A-AA--TG-AT--CAT-T---A-AAAATAAagcacatacatgtataatacata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                         ---C-A-CC--A----T-A---G--AAA--------TA-TA-AA-CT--T---ATGG-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------G-T---GATCTGCGGTTAAGTGGT-T-GT----AAAA--ATTT-A--ATA----TA-G-AC-AT---T------T-C---GA---GAA----TG--T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--G-AAAA--TGG-G-AT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AG--CAC-A---C-AAAATAct
gi|49                         :                                                                                                                     atgT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-------GGTA--GTG---T-----------------AC-AA-AAAC-------T-----T---T-------T------T---A---AGTTTAGCT---A---C-A-CATCA----T-A---GGAAAA--------TA--A-ATTAT--G---ATGT-AGAACGATG-A-A-A--AA--T-T-TA------A-T---TATCC-------AT-GGA-G-GC----AATC--ATTT----ATA----TT-G-ATAAT---T------T-A---AA---AAAAAACTG--T-T-G---------T-T--T---T-A
gi|5                          :                                                                                           TTCACG---AAA-----A---------AAAAAT-----T---T--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GT-------------CTTATTTTAAC-AA-ATACCATGTGCG-----T---T-------T------A---A---A-------C---AAAAC-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AGAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCC-------ATCTGT-G-GT----GAAA--GTTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-ATTGAACTTGAGT---CG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTT-TTATCTC--A-AAAG--TGG-G-CT---AA--------A-A--G--AGA-A-AA--CG-AT--CAC-A---C-AAAAAAAaaaaaagg
gi|50                         :                                                                                        aatTTTACGCC-GAA-----A---------TAT--TAAAT-T---T--T----AA-CAG-A-AAA--TGA-A--GAG---TA-------CTAGTTTTAAC-AA-AGCC---------------------------------------------------------------------T-A---G--AAA--------TA-TA-TATTG--T---ATGT-AAAAAGACG-G-A-G--AA--G-TAAA------A-T---TATCA-------ATGGGT-G-GC----GAAA--TTTT-C--ATA----GC-GAAT-AT---T------T-
gi|51                         :                                                                                               ttgaatAA-----A---------TTT--T-----CATGT--T----AA-CAA---------GGTA--GT-------------CATGATTTAAC-AA-ATAT-------C-----T---T-------TATTAAAC---A---A-------C---A---C-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-AA-AATATAAT---ATGT-AGAAAAATG-A-A-A--AA--A-T-TA------G-T---TATTA-------AT---T-G-GC----TAAA--Acttactcaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|52                         :                                                                                              ttgaaattttcatgttaacaaggtagtcatgatttaacaaatatctttattaaacaacacataataaaaataaaaatataatatgtagaaaaatgaaaaaattagttatt-----T---T-------T------T---A---A-------A---G---C-A-CC--A----T-G---A--AAG--------TT-TA-CATTT--T---TTCTTAGAAAGATG-A-A-G--AA--G-G-GA------A-A---TATCC-------ATGGGT-G-GA----GAAA--ATGT-C--ATA----AC-G-AT-AT---T------T-A---AA---GA-----AG--T-T-T---------T-TC-T---T-AA-TCC-ATAC-TT--A-AA-----------------------------------A-A-AA--TT-AT--CACGA---A-AAAATAAtaac
gi|53                         :                                                                                                                                                             tTA--GTG---CT-------CTCG--TTAAA-AA-A-AC-------A-----T---T-------G------T---A---A-------C---AT--C-A-CGTCA----T-A---A--AAA--------TA-GA-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------G-T---CATCC-------ATGGTT-G-GC----AAAA--AAAT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-T---AA---GA-------------------------T--T---T-AT-T
gi|54                         :                                                                                                        atttttatgaaatattc--T-----T---T--T----CA-CGA-A-AAA--AGGTA--GT-------------CTTGATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTAAAC---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATATAAT---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--A-T-TA------G-T---T
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TTAGTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AAA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAAtaaaaatgggctaaaaagaaaaaatgatcacaaaaaataa
gi|55                         :         ttttcacgaaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttattaaacaacacacaataaaaatagaaatataatatgtagaaagatgaagaaa-----A---------TTT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA---AGTA--GTG---TAGAATCTTCTCGTTTTAAC-AA-AT-C-------A-----T---T-------T------T---A---C-------C---A--------A--A----TCA---G--AAG--------TA-CC---TTTC-T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------GATCAGTATCC-------ATGGGT-A-CC------AA--ATTT-
gi|56                         :                                                                                                                                    tttacgacatacttA-A-AAA--AGGTA--GT-------------CTTGATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTTAAC---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-TATATAAT---ATGT-AGAAAGATG-A-A-T--AA--G-T-AA------G-C---TTT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTTT--A-AAA---TCG-G-CT-A-AA--------A-A--G--ATA-A-AA--TG-AA--CAC-----A-AAAATAAaaaatcggctaaaaagataaaatgaacacaaaaataaca
gi|57                         : aaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttatttaacaacacacaataaaaatagatatataatatgtagaaagatgaataagtaagTTCACG---AAA-----AAAAAAA---GAT--T-----T---T--T----AAACAA-A-AAA--CGGTA--GT-------------CTTGATTAAAC-AC-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T---A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---A--TAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AAAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCca
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gatgatAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AC------G-T---TCTCT-------TTCAAT-G-GC----GAAA--AGTT-C--ATA----CA-G-AC-A----T------T-A---AA---CA-----CG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTC-TTACTTC--A-AATA--TTG-G-CT-T-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-GTCACAC-A---A-AAAATAA
gi|6                          :                                                                                           TTCACGGGAAAA-----A--------------------------------AA-CAA-A-AAAAACGGTA--GT-------------CTTGATTTAAC-AA-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T---A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AAAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCC-------ATCGGT-G-AC----GAAA--GTTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-ATTGCA---GT-----CGTTT-T-T---------T-T--T---T-AT-TAC-TTGTTTC--A-AAAA--TGG-G-CTGA-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-ATTACAC-A---A-AAA
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gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              att-AT---T------T-A---AA---GA-----TG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaataatacatttc-AT---T------T-A---AA---GA-----TG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAAagctaat
gi|65                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aataatacatttcTTT-C--ATA----TC-A-AT-AT---T------T-A---AT---GA-----AG--T-T-T---------T-T--C---TGAT-TTC-TTACTTT--A-AAAA--TGG-G-CC-A-AA--------A-GT-G--AGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AATATagctaat
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A----TC-G-AT-AT---C------T-A---AT---GG-----CG--T-T-T---------T-T--CG--T-AT-TTC-GTACTTT--A-AAAT--TTG-G-TT---AA--------A-A--GTTAGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AAAA
gi|67                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-GGAAAGATA-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TCTCC-------ATCAGT-G-GC----GAAA--ATTT-C--ATA----TA-G-AT-AT---T------G-A---AA---GA-----AA--T-G-T---------T-T--C---T-AT-TTgta
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-TTC-TTACTTTCAA-AGAA--AGG-G-CT-A-AA--------A-AC-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAA-A---A-GA
gi|7                          :                                                                                                            t---------TTT--T-----T---T--T----AA-CGA-A-AAA--CGATA--GT-------------CTTGATTTAAC-AT-ACAC-------G-----T---T-------TAAG---C---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAAACAAAAAACA-GA-AATAG--T---ATGT-TGAAATATA-A-A-T--AA--G-T-AA------G-T---ATTCC-------ATCTGT-G-GC----GAAA--GTTT-C--ATA----TC-G-TT-AT---T------T-A---AA---GT-----CGGTT-T-T---------C-T--T---T-AT-TTT-TTACTTT--A-GAAA--TGG-A-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TA-AT--CAC-A---A-AAAATA
gi|8                          :                                                                            attttcaagaattttTTTACG---AAATATTTA---------TTT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-TA----GGTT--GTG---TT-------TTCGTTTCAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------T---A---A-------C---AT--C-A-CA--TCT--T-A---G--AAA--------TA-GA-ATTTT--T---ATGT-AGAAAGATA-A-A-G--GA--G-T-AA------G-T---TATTT-------ATTTTTTG-GC----TAAA--ATTT-C--ATA----CC-G-AT-AT---T------C-T---AA---GA-----GG--T-T-T---------T-C--C---C-TC-TTT-TTATCTT--A-AAAA--TGG-A-CC-A-AA--------A-AT-G--AGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AAAATAA
gi|9                          :                                                                                                                     catt--T-----T---T--T----AA-C-A-A-AAA--CGGTATTGTG---TA-------GTTCTTTTAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------T---A---A-------CA--A---C-A-CA--T----C-A---G--AGA--------T-------TTT--T---TTGC-AGAAATAAG-A-AGG--AA--G-T-AC------A-T---TTTCG-------ATGGAT-G-ACAAAAAAAA--ATT-----ATA-------G-AT-AT---T------TAA---AA---AA-----AG--T-T-T---------T-TG-T---T-AT-TTC-CTTCTTT--A-AAAA--TGG-A-CT-A-AA--------C-AT-G--ATA-A-AA--TG-GT--CAC-AT--A-AAAATAA


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blockSeqs                     :                                                                                                 .     TATTTA          A .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T A         . T  CATGTACATTTAAACAAAACACAA                                                G        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TT            .   .        GG   .    C      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . C  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     AAAAAA          T .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T A         . A  TTTTTAAGTTTAGCTACACATCA                                                 G        .         A  .   T .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TA            .   .        .    .    C      .  . . .           CG        .           .       .         .    .        GT   .         .      .    . C  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     TATTAA          T .  .     .   .  .     .         C      .   GTT            T T         . A  AAAATATTTTAACTACACATCA                                                  A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        G        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           CA        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . C  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     TATTTA          T .  .     .   .  .     .         T      .   GTA            C T         . T  CTTTATTAAACAACACATAA                                                    G        .         A  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . T  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     TATA            A .  .     .   .  .     .         G      .   GTT            A T         . A  GTTTATTAAACAACACACAA                                                    G        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    G      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . T  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     TA              A .  .     .   .  .     .         A      .   ATT            C T         . A  GTTTATTTAACAACACACAA                                                    G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . T  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     A               T .  .     .   .  .     .         C      .   GCT            C T         . T  ATATTTAGCTGCCCGTCAA                                                     G        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        T        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        CT   .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     A               T .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            A T         . T  ACTCTTTCGCTTCACATCA                                                     G        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    A      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     A               G .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T A         . T  AGTTTACCTTCACATCAA                                                      C        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           GT        .           .       .         .    .        GT   .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     A               A .  .     .   .  .     .         C      .   GCG            T A         . T  ATTTCAATAACACATCA                                                       G        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TA            .   .        .    .    A      .  . . .           GT        .           .       .         .    .        AC   .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                 .     A               T .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T T         . A  ATTTTAAAAACACACCA                                                       A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        G        .       .       .    CA            .   .        .    .    A      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               G .  .     .   .  .     .         C      .   ATA            T A         . T  ATTTTAACAACAAACCA                                                       A        .         G  .   G .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TT            .   .        .    .    C      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        AT   .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               A .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T A         . T  GTTTTAACAAAACACAA                                                       G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        C        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               A .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            A T         . C  ATTTTAACAGCACATCA                                                       A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    T      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               T .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T A         . T  ATTTAAAGAACACACAA                                                       G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   G   .        C        .       .       .    TT            .   .        .    .    C      .  . . .           CT        .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               T .  .     .   .  .     .         A      .   GTA            C T         . A  ATTGTCATAACACTCCA                                                       A        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   T   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           CG        .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               A .  .     .   .  .     .         C      .   TTA            C T         . A  ATTCTAACAACACATCA                                                       T        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        C        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           GT        .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               T .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T A         . T  ATATTAACAACATAACA                                                       A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   C   .        A        .       .       .    TT            .   .        .    .    C      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                       A               T .  .     .   .  .     .         A      .   GTA            A T         . T  ATTTTAACTACACATCC                                                       C        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   C   .        C        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           C         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                       . .  .     .   .  .     .         A      .   CTA            T A         . T  ATTTTATCTACACATCA                                                       G        .         T  .   C .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TC            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                       . .  .     .   .  .     .         T      .   GCG            T A         . T  AATTTAGCAACACATAA                                                       G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        A        .       .       .    TC            .   .        .    .    T      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         T      .   GTA            A A         . C  ATTGTAACATCACGTCA                                                       G        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   C   .        A        .       .       .    TC            .   .        .    .    T      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   GAA            C T         . T  GTTTAAGCAACACACAA                                                       G        .         A  .   G .  .                    .             .      . .   A   .        T        .       .       .    AA            .   .        .    .    C      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T T         . A  ATTTTAACATCACATCT                                                       T        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        A        .       .       .    TC            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            C A         . G  AATTTTAACAACACAT                                                        G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   C   .        G        .       .       .    TT            .   .        .    .    C      .  . . .           G         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   TTG            A T         . A  TTTTAACTTCACCTCA                                                        G        .         A  .   T .  .                    .             .      . .   T   .        T        .       .       .    TC            .   .        .    .    A      .  . . .           C         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   GTA            T T         . T  AATTAACATTACATTA                                                        G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        C        .       .       .    TA            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         T      .   GCT            T G         . C  TTTTAACTATAAATCA                                                        G        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   C   .        G        .       .       .    TA            .   .        .    .    C      .  . . .           C         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         A      .   GTT            A A         . T  TTTTTTACCAACACAT                                                        G        .         T  .   G .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         A      .   GTA            C T         . A  TTTTAAAGAACACAA                                                         G        .         G  .   C .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   GT             T T         . A  ACTTTAACAACACAA                                                         A        .         T  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    GC            .   .        .    .    C      .  . . .           C         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   .              A T         . T  GTTAAAACAAAACAA                                                         G        .         A  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        T        .       .       .    AC            .   .        .    .    C      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         C      .   .              T T         . A  ATTTTTTACCACACA                                                         A        .         T  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        C        .       .       .    TT            .   .        .    .    T      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         .      .   .              C T         . T  ATTTTAACAACACAT                                                         A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        G        .       .       .    CA            .   .        .    .    T      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .     .   .  .     .         .      .   .              T A         . G  GTATTTACACATCG                                                          A        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TT            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .   .  .     .         .      .   .              C A         . T  GCTTAACTACACCA                                                          A        .         C  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .   .  .     .         .      .   .              T T         . T  CTTTCAACACACAA                                                          G        .         G  .   T .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .   .  .     .         .      .   .              T A         . T  ATTTTAACAACACA                                                          A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        C        .       .       .    TC            .   .        .    .    C      .  . . .           T         .           .       .         .    .        T    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .  .     .         .      .   .              T A         . T  ATTTAACAACACAT                                                          A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   A   .        C        .       .       .    TA            .   .        .    .    G      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                         .     .         .      .   .              T A         . T  TTTTAAGCTAAA                                                            A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        G        .       .       .    TC            .   .        .    .    A      .  . . .           T         .           .       .         .    .        A    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .      .   .              C A         . T  ATTTTACCAAA                                                             A        .         G  .   A .  .                    .             .      . .   T   .        C        .       .       .    CC            .   .        .    .    .      .  . . .           T         .           .       .         .    .        .    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .      .   .              T T         . C  ATTAACAACA                                                              G        .         .  .   T .  .                    .             .      . .   C   .        C        .       .       .    T             .   .        .    .    .      .  . . .           T         .           .       .         .    .        .    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .      .   .              . T         . A  AGTTTAACA                                                               G        .         .  .   T .  .                    .             .      . .   T   .        T        .       .       .    T             .   .        .    .    .      .  . . .           C         .           .       .         .    .        .    .         .      .    . .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .   .              . .         . A  ATTTTAACA                                                               .        .         .  .   . .  .                    .             .      . .   A   .        G        .       .       .    T             .   .        .    .    .      .  . . .           C         .           .       .         .    .                                        
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|43                         :                                                                                                                                                act-A-AAA--CG-TA--GTG---AA-------CT-GGTTTAA-----ACAT-------T-----T---T-------T------T---T---A-------CCA-A---C-A-CA--T----C-A-------------------------TTT--T---ACGT-AGAAAGG-G-ACA-G--AA--G-T-AA------A-T---AATAC-------ACGAGT-G-GC----AAAA--ATTT-G--A---------A-AT-TT---T------T-A---AT---AA---------T-TAT---------T-T--T---C-AT-TCA-TTGATTT--A-AAAA--AGG-G-CG-A-AA--------A-CT-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-----A-AAAATAA
gi|44                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA--CAATA--GTG---TA-------CTTGATTTAAC-AA-ATAC-------A-----T---T-------T------T---A---A-------C---A-----------------------------------------------------------GAAAAGTG-A-G-G--TA--A-T-AG------G-T---TCTCC-------ATCAAT-T-GT----GAAA--AT--------A-------G-AT-AT---T------T-A---AA---TA-----AA--T-T-G---------T-C--T---T-GT-TTC-TTATTTT--A-AAAA--TTA-G-TT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AT--GAA-A---A-AAAA
gi|45                         :                                                                                                                        c--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AA---CGGTATTGTG---TA-------GTTGTTTTAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T----------A---A-------C---AA--C-A-CA--T----C-A---G--AGA--------T-------TTT--T---TTGC-AGAAATATG-A-T-G--AA--G-T-AC------A-T---TTTTG-------ATGGAT-G-GC----TAAACGATTT-T--ATA-------G-AT-AT---T------T---------------------T-T-T---------T-T--T---T-TT-TTT-TTaataac
gi|46                         :                                                                                tggctttttacgattttttttta-----A---------TGT--T-----T---T--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GTT---TG-------CTAGTATTAAC-AA-AAAC-------AAAATAT---T-------T------T---A---A-------CT--A---C-A-CATCA----T-A---G--AAA--------TA-TC-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TATTT-------GTGAGT-G-GC----t
gi|47                         :                                                                                                                                                      gaatttttatgatttttttA-------CTCGTTTTAAC-AACAT-C-------A-----T---T-------T------T---A---G-------C---A-------------------------------------------ATGT--T------T-AGAAATATG-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TATCA-------AT--GT-GTGT----ACAA--ATTT-G--ATA----TA-G-AT-AC---TG-----T-AGG-AA---GA---------T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTG-TTACTTG--A-AAAAAATGG---CT-A-AA--------A-AT-G--ATA-A-AA--TG-AT--CAT-T---A-AAAATAAagcacatacatgtataatacata
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                         ---C-A-CC--A----T-A---G--AAA--------TA-TA-AA-CT--T---ATGG-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------G-T---GATCTGCGGTTAAGTGGT-T-GT----AAAA--ATTT-A--ATA----TA-G-AC-AT---T------T-C---GA---GAA----TG--T-T-T---------T-C--T---T-AT-TTC-TTACTTT--G-AAAA--TGG-G-AT-A-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-AG--CAC-A---C-AAAATAct
gi|49                         :                                                                                                                     atgT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-------GGTA--GTG---T-----------------AC-AA-AAAC-------T-----T---T-------T------T---A---AGTTTAGCT---A---C-A-CATCA----T-A---GGAAAA--------TA--A-ATTAT--G---ATGT-AGAACGATG-A-A-A--AA--T-T-TA------A-T---TATCC-------AT-GGA-G-GC----AATC--ATTT----ATA----TT-G-ATAAT---T------T-A---AA---AAAAAACTG--T-T-G---------T-T--T---T-A
gi|5                          :                                                                                           TTCACG---AAA-----A---------AAAAAT-----T---T--A----AA-CAA-A-AAA--CGGTA--GT-------------CTTATTTTAAC-AA-ATACCATGTGCG-----T---T-------T------A---A---A-------C---AAAAC-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AGAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCC-------ATCTGT-G-GT----GAAA--GTTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-ATTGAACTTGAGT---CG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTT-TTATCTC--A-AAAG--TGG-G-CT---AA--------A-A--G--AGA-A-AA--CG-AT--CAC-A---C-AAAAAAAaaaaaagg
gi|50                         :                                                                                        aatTTTACGCC-GAA-----A---------TAT--TAAAT-T---T--T----AA-CAG-A-AAA--TGA-A--GAG---TA-------CTAGTTTTAAC-AA-AGCC---------------------------------------------------------------------T-A---G--AAA--------TA-TA-TATTG--T---ATGT-AAAAAGACG-G-A-G--AA--G-TAAA------A-T---TATCA-------ATGGGT-G-GC----GAAA--TTTT-C--ATA----GC-GAAT-AT---T------T-
gi|51                         :                                                                                               ttgaatAA-----A---------TTT--T-----CATGT--T----AA-CAA---------GGTA--GT-------------CATGATTTAAC-AA-ATAT-------C-----T---T-------TATTAAAC---A---A-------C---A---C-A-TA--A----T-A---A--AAA--------TA-AA-AATATAAT---ATGT-AGAAAAATG-A-A-A--AA--A-T-TA------G-T---TATTA-------AT---T-G-GC----TAAA--Acttactcaa
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgAA--TTG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAAAAAagagaaaatgatcacaaaaaaaaataac
gi|52                         :                                                                                              ttgaaattttcatgttaacaaggtagtcatgatttaacaaatatctttattaaacaacacataataaaaataaaaatataatatgtagaaaaatgaaaaaattagttatt-----T---T-------T------T---A---A-------A---G---C-A-CC--A----T-G---A--AAG--------TT-TA-CATTT--T---TTCTTAGAAAGATG-A-A-G--AA--G-G-GA------A-A---TATCC-------ATGGGT-G-GA----GAAA--ATGT-C--ATA----AC-G-AT-AT---T------T-A---AA---GA-----AG--T-T-T---------T-TC-T---T-AA-TCC-ATAC-TT--A-AA-----------------------------------A-A-AA--TT-AT--CACGA---A-AAAATAAtaac
gi|53                         :                                                                                                                                                             tTA--GTG---CT-------CTCG--TTAAA-AA-A-AC-------A-----T---T-------G------T---A---A-------C---AT--C-A-CGTCA----T-A---A--AAA--------TA-GA-AAT-T--T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------G-T---CATCC-------ATGGTT-G-GC----AAAA--AAAT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-T---AA---GA-------------------------T--T---T-AT-T
gi|54                         :                                                                                                        atttttatgaaatattc--T-----T---T--T----CA-CGA-A-AAA--AGGTA--GT-------------CTTGATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTAAAC---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATATAAT---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--A-T-TA------G-T---T
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TTAGTTT--A-AAAA--TGG-G-CT-A-AA--------A-A--G--AAA-A-AA--TG-AT--CAC-A---A-AAAATAAtaaaaatgggctaaaaagaaaaaatgatcacaaaaaataa
gi|55                         :         ttttcacgaaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttattaaacaacacacaataaaaatagaaatataatatgtagaaagatgaagaaa-----A---------TTT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-AAA---AGTA--GTG---TAGAATCTTCTCGTTTTAAC-AA-AT-C-------A-----T---T-------T------T---A---C-------C---A--------A--A----TCA---G--AAG--------TA-CC---TTTC-T---ATGT-AGAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AA------GATCAGTATCC-------ATGGGT-A-CC------AA--ATTT-
gi|56                         :                                                                                                                                    tttacgacatacttA-A-AAA--AGGTA--GT-------------CTTGATTTAAC-AA-ATAT-------G-----T---T-------TATTTAAC---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-TATATAAT---ATGT-AGAAAGATG-A-A-T--AA--G-T-AA------G-C---TTT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTTT--A-AAA---TCG-G-CT-A-AA--------A-A--G--ATA-A-AA--TG-AA--CAC-----A-AAAATAAaaaatcggctaaaaagataaaatgaacacaaaaataaca
gi|57                         : aaaaaaggtagtcttgatttaacaaatatgtttatttaacaacacacaataaaaatagatatataatatgtagaaagatgaataagtaagTTCACG---AAA-----AAAAAAA---GAT--T-----T---T--T----AAACAA-A-AAA--CGGTA--GT-------------CTTGATTAAAC-AC-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T---A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---A--TAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AAAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCca
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gatgatAAAGATG-A-A-G--AA--G-T-AC------G-T---TCTCT-------TTCAAT-G-GC----GAAA--AGTT-C--ATA----CA-G-AC-A----T------T-A---AA---CA-----CG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTC-TTACTTC--A-AATA--TTG-G-CT-T-AA--------A-T--G--AGA-A-AA--TG-GTCACAC-A---A-AAAATAA
gi|6                          :                                                                                           TTCACGGGAAAA-----A--------------------------------AA-CAA-A-AAAAACGGTA--GT-------------CTTGATTTAAC-AA-ATACCAT----G-----TACAT-------T------T---A---AA------C---AAAAC-A-CA--A----T-A---A--AAA--------TA-GA-AATAT--T---AGGT-AAAAAGATG-A-A-G--CA--G-T-AA------G-T---TTTCC-------ATCGGT-G-AC----GAAA--GTTT-C--ATA----TT-G-AT-AT---T------T-ATTGCA---GT-----CGTTT-T-T---------T-T--T---T-AT-TAC-TTGTTTC--A-AAAA--TGG-G-CTGA-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TG-ATTACAC-A---A-AAA
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gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              att-AT---T------T-A---AA---GA-----TG--T-T-T---------T-TC-T---T-AT-TTA-TTACTTC--T-TAAA--TGG-A-CT-A-AA--------T-T--T--ACA-A-AA--TG-AT--CAC-AT--A-AAAA
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gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A----TC-G-AT-AT---C------T-A---AT---GG-----CG--T-T-T---------T-T--CG--T-AT-TTC-GTACTTT--A-AAAT--TTG-G-TT---AA--------A-A--GTTAGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AAAA
gi|67                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-GGAAAGATA-A-A-G--AA--A-T-AA------G-T---TCTCC-------ATCAGT-G-GC----GAAA--ATTT-C--ATA----TA-G-AT-AT---T------G-A---AA---GA-----AA--T-G-T---------T-T--C---T-AT-TTgta
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-TTC-TTACTTTCAA-AGAA--AGG-G-CT-A-AA--------A-AC-A--AGA-A-AA--TG-AT--CAA-A---A-GA
gi|7                          :                                                                                                            t---------TTT--T-----T---T--T----AA-CGA-A-AAA--CGATA--GT-------------CTTGATTTAAC-AT-ACAC-------G-----T---T-------TAAG---C---A---A-------C---A---C-A-CA--A----T-A---A--AAAACAAAAAACA-GA-AATAG--T---ATGT-TGAAATATA-A-A-T--AA--G-T-AA------G-T---ATTCC-------ATCTGT-G-GC----GAAA--GTTT-C--ATA----TC-G-TT-AT---T------T-A---AA---GT-----CGGTT-T-T---------C-T--T---T-AT-TTT-TTACTTT--A-GAAA--TGG-A-CT-A-AA--------A-A--G--AGA-A-AA--TA-AT--CAC-A---A-AAAATA
gi|8                          :                                                                            attttcaagaattttTTTACG---AAATATTTA---------TTT--T-----T---T--T----AA-CAA-A-TA----GGTT--GTG---TT-------TTCGTTTCAAC-AA-AAAC-------A-----T---T-------T------T---A---A-------C---AT--C-A-CA--TCT--T-A---G--AAA--------TA-GA-ATTTT--T---ATGT-AGAAAGATA-A-A-G--GA--G-T-AA------G-T---TATTT-------ATTTTTTG-GC----TAAA--ATTT-C--ATA----CC-G-AT-AT---T------C-T---AA---GA-----GG--T-T-T---------T-C--C---C-TC-TTT-TTATCTT--A-AAAA--TGG-A-CC-A-AA--------A-AT-G--AGA-A-AA--TT-AT--CAC-A---A-AAAATAA
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|58 ): CAGATATCGTGCAGCGGCCATTTTTAAATCAGTAAGTGGGACACCACCGTGTTGTATAGCAACAGATGCCTTTATTTTGTGAAATCGAAGAACGCACGGTGCTGGTCTGTTTTTGTTTAATT
Unaligned ( gi|63 ): TTTTACGATTGTTTCATTTCTAAACATGAAAGGTAGTTCGCTAGTTTCAACAAAAATATTTCAACTACTAATCATAAAAATATAAAT
Unaligned ( gi|64 ): ATTTTTACAAAATATTTATTTATAACCAAAAAACAACTAGACTAGTTTTAACACAGACATTTTAAATACACATCATAGATATATAA